Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LR698976 | Campylobacter lanienae isolate MGYG-HGUT-02308 chromosome 1 | 2 crisprs | cas9,cas1,cas2,cas4,c2c9_V-U4,DEDDh,WYL | 0 | 0 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_LR698976_1 | 195281-195369 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LR698976_1
|
1 spacers
spacers of NZ_LR698976_1
>1.1|195305|41|NZ_LR698976|CRISPRCasFinder ACAAATAACTATTTAAGGTTATTTGGCTATTACTCTAAATT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LR698976_1
The CRISPR arrays of NZ_LR698976_1 >merge|NZ_LR698976|1|195281-195369|CRISPRCasFinder GGTTAATTATTTCAAATTTTCGCCACAAATAACTATTTAAGGTTATTTGGCTATTACTCTAAATTGGTTAATTATTCCAAATTTTCGCC >NZ_LR698976|1|1|195281-195369|CRISPRCasFinder GGTTAATTATTTCAAATTTTCGCC ACAAATAACTATTTAAGGTTATTTGGCTATTACTCTAAATT GGTTAATTATTCCAAATTTTCGCC
>NZ_LR698976.1|WP_096013910.1|192308_192842_+|DUF2393-family-protein MSYFNLFHILVLIIIIVLFIGFTALIILKEKRVKVAISFLIVNVTVMSCITVISMMLIDKYTKVAVIENLMGKRTLINESISYSGIIRNVGYGYINSCVINIELINTPVEKLEASAFEARGFFDTYISGSRGPKSSQKGEFLIVKDLKSGEYKSFSFTMPYPSHFNNHSTNYTLNCK >NZ_LR698976.1|WP_096027901.1|191784_192309_+|DUF2393-family-protein MINNLSTTIKFYINNFGFYDYVAISWVILLFFALLVLALYLLFKKPLLALFIFIFDFGGLGAGLFYSLKFIDDTMRPRELVIAPLRQLSYSDTLIADINLTNTSKRAFKICRVKLSFHNIGQNRIQDFKFRLSPFHTQTTIIQDIMPSQMKEIKFIIKDFRPQNYNTILNSECF >NZ_LR698976.1|WP_100590368.1|191057_191795_+|bifunctional-phosphoribosyl-AMP-cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP-diphosphatase-HisIE MSVIVNWDKIDGLLPVVVQEYSSGEVLMLAYMNQEALELTQSSNLAHYYSRTKSQIWKKGQESGNFQIVKSISLDCDNDALLLKVEQIGNAACHTGAKSCFFNHLNLEKNSDLDLNKTIKYDILDHLYHIALDRKLNPSDKSYISKLYSKSPDSYLKKMAEESCELNLAIKELQRFKLYSNLNLENFGEHKPNDPKYDIIYEAADLLFHMIIALADCDIHPNAILDELKRREGVSGIIEKNSRDK >NZ_LR698976.1|WP_096016677.1|189962_191048_+|hypothetical-protein MPADLNDYFNKKNSNSNSDDKKPNFNFKKPNVPNLSGGLGKFSGIIYALIAIIVILVVAKPFVVINSGEVGIKSTAGKFDPNPLQPGFHFFLPFIQEVRTVDTKVRQINYTSTEGRNEANLRGSGIETKDTISVLDSRGLPVSMDITVQYRLNPQNAPQTIAAWGFSWENKIIDPVVRNVVRNVTGKYTAEELPERRNDIAAAIDMGIRSDIDKQPNQPVELASVQLREIILPPKVKEQIERVQIAKQEAERTKYEVERANQEALKKAALAKGTAEAVKIEAQGRADAVKIEADAQAYSNSQIARSLTNNLLELKQIETQKGFNEALKTNQDAKIFLTPGGAVPNIWVDTKDKQKQISAQN >NZ_LR698976.1|WP_100590367.1|189027_189951_+|branched-chain-amino-acid-transaminase MALPEAEHIWYDGKLVKWHEATIHVLTHSLHYGNAVFEGVRAYMTPKGLAILSLEAHTKRLFESAKVCGIKIPFTQEEINQAHVNLLKSNTYTDNVYIRPIVFLGYGKMGVSHIGCPTNVAIAAWQWGAYMGEEALEKGIKVKISSWIKPAPFSMMAKAKASANYFNSQMANFEAREAGCDEALLLDPQGFISEGSGECFFIVKDGVIITPPNDTSLESITQKNVIQVVKDLGYTLLRQRITRDEAYNADEAFFTGTAAEVTPISSIDGRIIGNGKRGPISKALQEAYFDLVMGKNPKYENLLTYIN >NZ_LR698976.1|WP_096025813.1|187941_188934_+|UDP-glucose-4-epimerase-GalE MNILITGGAGYIGSHVLKALLEKNSDKITVIDNFYSGSRDALVALESVGKFEFIKCDLADTALLEEIFSTHKFDAIIHFAAYIEVFESMQNPLKYYLNNTANTANLINLALKFGVKKFIFSSTAATYGEPENGVVCENSPQNPINPYGNSKLMSEQILKDAAAANSDFKFGILRYFNVAGASLDGLIGQNYPNATHLIKVATQTITGKRANMSIFGRDYDTKDGTCIRDYIHIEDLADAHLAVLDYLDDNDSDIFNVGYGHGFSVLEVINMAKKISGVDFEVMDAPRRLGDPAILIADSSKLRNLTSWKPKKDSLETIISSALEWEKKIF >NZ_LR698976.1|WP_096023810.1|187452_187926_+|UDP-4-amino-4,-6-dideoxy-N-acetyl-beta-L-altrosamine-N-acetyltransferase MLERIIDKIKLVNFKDFNSSEIELVYKWRNDPKIAKYMVNKHIDLKEHLSFIKSLKNSSDKRYFLVYQSGEPIGVVSFVNISEISCEFGIYANPNLRQMGDILMSVIIDYAFDILKVSKILAKAYKDNLKAINLYQKFKFEIYENSDLMVYFCRKAK >NZ_LR698976.1|WP_096013903.1|187235_187472_+|hypothetical-protein MRKLAILCLVVAALNAVIYYEPKTKEQKEGYKYGQTMRMLGFEKWECNKFKNIDEVKFEWCEYGWVDKSEEIDARKDY >NZ_LR698976.1|WP_100591035.1|186477_187236_+|DNA-ligase MLLKEYKDENLTGWVMSEKYDGVRAIWDGKVLKSRSGKIINAPTKFINELPDFALDGELWSGVGEFEFIASTVLDETPDDRAWDKIKYMVFDLPKFDGNLYQKMDYLNNFLKANPSEFIRVIEQIEIKDNNHAFAFLDELVASGAEGVVVRDPNAKYISGRSSSILKLKKWHDSECEIVAINEGKGRLKRTMGSLNCVDIFSKIEFKIGSGFSDEMRANPPKIGTIITYKFQNLTKNNKPRFPIFLRIKRSE >NZ_LR698976.1|WP_172618491.1|185618_186428_+|3'-5'-exonuclease MSGYICVFDCETIPDSDSLRVAYGYDGDDESVAKMALKAQKEQSGSEFLPVCFHKVVTISAVIADEFGRFKRVSTIAGSSEKEKISEFIKFINEHNPRLISYNGRGFDLPMLMIRAMRYNLDASEYFNTNDRANGKDKWCNYRSRYDGIFHLDLLDHISDFKAVSGLKLDLLCSSLNLPGKYDVCGDEVMSLYYNNKQDKIDEYCESDVLNTYWLFLKYELLRGKLNIDDYIDYLNLMSEYLKDKKPDMSYTPVFCQYIQNEFDRIKVD >NZ_LR698976.1|WP_096013912.1|195551_195752_+|4-oxalocrotonate-tautomerase-family-protein MPIINIKLADPMPSRQKLDEIAVKITDIMVNDLGKKPERVVINFDEIRSDATYFGGKSVQAMKEGK >NZ_LR698976.1|WP_100590369.1|195751_196261_+|thioredoxin-dependent-thiol-peroxidase MEAKNPNFTQEDLERKVTLKAGDKAPEFELENADGVKISLKDFKGKNVILYFYPKDNTPGCTTEACEFSANYDEFIANDCVIVGISPDSPKSHAGFTLKHSLRHILLSDMDKEVAKAYGVWQVRKNYGKEYLGIVRTTFIIDKDGKISKVYKSVKAAGHALKVLDELTK >NZ_LR698976.1|WP_100590370.1|196267_197341_+|epoxyqueuosine-reductase-QueH MLVHICCSVDSHYFIAELKKLYPNERIIGYFYDPNIHPYSEFLLRFQDVKRSSKKLGVEVICGEYEYEEWLKGTKGLEDEPEKGKRCAYCFDFRVGNSAKEAIKLGCKKITTTLLMSPKKDFKQLESALNNAIKGTNLEAIAVDLRKNGGTQKQFELAKNDKLYHQNYCGCIYGLIKQRHNETVIDELCEPLGAQIQPGSIGYRLKLYKKVRKLEKSKIKFDLIREKILNYRLRFGSLKADNIAIPSYFLFYSHFRLKSSKFSIEKSSNFVAINKDDIKLISLAKFNKLGRFKYKNTLELIYNPPKLNQELKIRKKIVKSKFDISPIIVIDEIKTAKYTLQADSEIFPASIEAIKVK >NZ_LR698976.1|WP_096015425.1|197441_197888_+|3-hydroxyacyl-ACP-dehydratase-FabZ MIDVVEIQKILPHRYPFLLIDRVVELEPNKHIKGYKNVTIAEQVFQGHFPGHPIYPGVMIIEGMAQAGGILAFKSIAEKEQINAEDKVVYFMSIDGAKFRSPVRPGDRLEYRLEVLKHRGNIWVLGGQAYVDDTLVAEAELKAMIVDK >NZ_LR698976.1|WP_096016180.1|197901_198687_+|acyl-ACP--UDP-N-acetylglucosamine-O-acyltransferase MQIHSTAVVEDGAILGDGCVIEPYAFVSSKAVLGDNVIIKQGARIIGDTHIGKGGKIYSYAIVGDIPQDISHSIEDTGGVRIGDNVTIREFATINSGTKKGDGYTNIGDNNFIMAYTHIAHDCRLGDGIILANGVTLAGHVVIDDYAVIGGLTPVHQFVHIGESCMIAGASALSQDIVPFCLAEGNRAYIRSLNLVGIRRRFDKDIVEQINKAYKFLFRSGGGLKDRALELLDQNPTLEARKMCEFIINTKRGIPLDKGRD >NZ_LR698976.1|WP_096022965.1|198686_199901_+|ATP-dependent-Clp-protease-ATP-binding-subunit-ClpX MARKCSFCGESEADDRKLLANESDSSFICEFCVDAAYNAVHGEEIGQRASLNANYKDITPKILKGVLDDYVIGQERAKKVFSVGVYNHYKRIFKQHSIDDDTEISKSNILLIGPTGSGKTLMAQTLARFLDVPIAICDATSLTEAGYVGEDVENILTKLLNAAGGDVERAQQGIVFVDEIDKIARMGENRSITRDVSGEGVQQALLKIIEGSVVNIPPKGGRKHPNQDFIQIDTTNILFVCGGAFDGLKDIIERRLGKNVLGFNQEKRGKNEKSNLLSLVEPDDLVHFGLIPELIGRLHAITTLNEITIDDMVNILTQPKNALLKQYEKLFAIDGARLKFEDEAIKEVANQAIKRKTGARGLRSIMEDVMIDIMYDLPELNGYDVIISKSVIDGEAKPLLMKAK >NZ_LR698976.1|WP_096013918.1|199910_200945_+|rod-shape-determining-protein MILDQLVGLFSSDMGIDLGTANTLVLVKDKGIVINEPSVVAVQREKYGKQKILAVGHDAKEMVGKTPGDIEAIRPMRDGVIADFDMTEKMIRHFIEKTHRRKTFLRPRIIISVPYGLTQVERKAVRESALSAGAREVFLIEEPMAAAIGANLPIREPQGSLVVDIGGGTTEIGVVSLGGLVISKSIRTAGDKLDASIVNYVKEKYNLLIGERNGEEIKIKIGSAMQLPKELSMVVKGRDQVSGLLSRIELTSEDIREAMREPLKEIADALKTVLENMPPDLAGDIVERGVVLTGGGALIRGLDKYLADIVKLPVYVADEPLLAVARGTGKALEEIGLLQQLINE >NZ_LR698976.1|WP_096017643.1|200937_201684_+|rod-shape-determining-protein-MreC MNKIKFILIIICLGFISFYLSDYARSVVINSTNFVLSLYQDTRDFIAQTIEEHFNQADEIKALREQNAELEHSATLLSAFAYKLDALLSEQNSTRFNPDVKLVRALSYMNIGDHDKIWIDFDEFDEDRIYGLISQGKTAGIVVNKDGNPLALLQTDPKSTFSVSIGEEHIAGIAMGNGSGITIKFIAQWLNPKVGDEVYTSGLDGIFFGGVPVGKISKVYEEELYKSAIVETDLKIQVPSYLYIITNQ >NZ_LR698976.1|WP_100590371.1|201840_205095_+|carbamoyl-phosphate-synthase-large-subunit MPKREDIKTILLIGSGPIIIGQACEFDYSGTQAAKTLKELGYRVVLINSNPATIMTDPDFADATYIEPITKESISRIIQKESVDAILPTMGGQVALNVAMELYENNMLGNVKFLGANPEAIKKGEDRVAFKEAMIKIGMDLPKSMYAYNMQEALNAANEIGFPLIIRASYTLGGAGSGVAYNIDEFRDIAESGIEASPINEILIEESLLGWKEYEMEVIRDRADNCIIVCSIENFDPMGVHTGDSITIAPALTLTDKEYQYMRDASFKILREIGVDTGGSNVQFAINPKNGRMTVIEMNPRVSRSSALASKATGYPIAKVATMLAVGFTLDEIKNDITGTPASFEPVIDYIVTKIPRFTFEKFPGSNPYLGTAMKSVGEVMAIGRSFKESVQKALCSLEKDYSGFNHLSLSDDELVFGLRNAHENRILYIAQAFRNGKSVEEVYELTKIDRWFLTQIYEIIEFENLIDMDILNDKELLRKAKTWGFSDKMIAYLINYKDNLELSQNDIYYARMRHKIALEYSEVDTCAGEFLALTPYLYSSTNITPNLPNLPLNSNNKKVLIIGGGPNRIGQGIEFDYCCVHASYALRDLGITTIMYNCNPETVSTDYDTSDILYFEPIDFEHLRAVIERENPDGVIVHFGGQTPLKFSKRLSMIGAKIIGTTARVIDIAEDRKKFSEFIRSIAVAQPDNDTATSESEALEKAGKIGYPVLVRPSYVLGGRAMRRVHSESELKEYMSEAVKVSNNSPVLLDKFLQDATELDVDAISDGKDVYIGAIMEHIEEAGIHSGDSASILPPQNLSQDIIDQVEKCTKDIALKLGVIGLMNIQFAVYDNKLYIIEVNPRASRTVPFVSKATGLPMAKVATRVMWQGNLKEALEFYDQFKVVKFDGEIYKPSLNGVVCVKESVFPFNKLSGADLILGPEMKSTGEVMGISDSFEKSFVKSQIAAKNNLPSGGTVFISLADADKNRGIELAKKFENLGFEIVATGGTYKTLAQAGVKCEMVYKISEGRPNIEDRLKNGDIALAVNTSDNKSSTSDAVKIRQAVLRFKIPYFTNMNAALVAASSISSNEAALEVKSLQEYLKK >NZ_LR698976.1|WP_141082139.1|205405_206386_+|hypothetical-protein MKEKLIRFLRIILFDAFKSRWAWRRVPTQWYFKYMTSKRKLNIINTKLPPEYEMIYKKSADPFYKDTLVIVFSQGSFWSGGSYFKSNFIDIKYTSEYINTFLKSKCGYGNVNFLHHIDELVNYLIERIREFGYTRVIIFGGSSTGRAALLYSQILSGKCAFTQFYTIACAPASDHSEKIYNISDVHIKDHIVNIRKYGPVDVLKHKLQLPRQNLFIYVIIGKFNERDYKNAQSFSDCKYLKIFDDIKTHIHQVTFMMFLDHKYVDDNKKMLNLVRRHQGAEKIDEDNNKAVEIVNQIFYQDGKSLQNLNILIDELITTGKITSLYK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_LR698976_2 | 262649-264001 | TypeII |
NA
Consensus repeat of NZ_LR698976_2
|
18 spacers
spacers of NZ_LR698976_2
>2.1|262686|37|NZ_LR698976|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATAATTTGTCTAGGCTAAAATTAGCTACTATATCTG >2.2|262760|35|NZ_LR698976|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTCTACATTTTCATTATAAGCTTGCTCTAATTC >2.3|262832|34|NZ_LR698976|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAGTGATGATTTTCCAAAATCGCTTAAAATACC >2.4|262903|37|NZ_LR698976|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCCCAATATTTGCCTTTTAAAACATCCTTAACTACAT >2.5|262977|35|NZ_LR698976|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCAAAGTGGAGCCTATAAAAATACAATTAGAAAC >2.6|263049|37|NZ_LR698976|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAAATGCGTTTATTTTCTCTCTAGGGCTTGATTTTT >2.7|263123|38|NZ_LR698976|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCATTTATGTTAAATGGATATTCCGTGAGCCACATTAA >2.8|263198|35|NZ_LR698976|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAAAGCAACATTAGCTCTAAGAAAACCAGTATCA >2.9|263270|36|NZ_LR698976|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAAATATCACTATGCGAGTATATGTAGAAGCTAAT >2.10|263343|37|NZ_LR698976|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGATATAAGCTCCAAAATACTCTAGGCACGGACGCCC >2.11|263417|35|NZ_LR698976|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATAGATAATTATTGCCCCCATTCCCAAAACTCCA >2.12|263489|37|NZ_LR698976|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCATCGTCACTCTCTCGCCTTTCAGCAAAATTTGGC >2.13|263563|35|NZ_LR698976|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATATGGGGAGTAAAAATCAAATAGCTAAAGAGCT >2.14|263635|35|NZ_LR698976|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCAATTGATGGGGTAAGTGTGAGTTATCAAAATA >2.15|263707|37|NZ_LR698976|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTAAAGTCCGTCAAGAAAAAATGTCAAAAAAGTTAA >2.16|263781|35|NZ_LR698976|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCTAATTTGTCCCGCACTGCCTAAAGCTTGAGAT >2.17|263853|38|NZ_LR698976|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAATTTCTTTAATTACTTCACGTCTGTCTAGCGTTTCA >2.18|263928|37|NZ_LR698976|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATATTAAGCTTCATACCAGTAAGACAGGGGGATATAT |
cas4,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LR698976_2
The CRISPR arrays of NZ_LR698976_2 >merge|NZ_LR698976|2|262649-264001|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACAATAATTTGTCTAGGCTAAAATTAGCTACTATATCTGGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACTTTTCTACATTTTCATTATAAGCTTGCTCTAATTCGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACATAGTGATGATTTTCCAAAATCGCTTAAAATACCGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACTCCCAATATTTGCCTTTTAAAACATCCTTAACTACATGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACCTCAAAGTGGAGCCTATAAAAATACAATTAGAAACGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACACAAATGCGTTTATTTTCTCTCTAGGGCTTGATTTTTGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACTCATTTATGTTAAATGGATATTCCGTGAGCCACATTAAGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACTAAAAGCAACATTAGCTCTAAGAAAACCAGTATCAGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACTTAAATATCACTATGCGAGTATATGTAGAAGCTAATGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACGGATATAAGCTCCAAAATACTCTAGGCACGGACGCCCGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACTATAGATAATTATTGCCCCCATTCCCAAAACTCCAGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACAGCATCGTCACTCTCTCGCCTTTCAGCAAAATTTGGCGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACTATATGGGGAGTAAAAATCAAATAGCTAAAGAGCTGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACCTCAATTGATGGGGTAAGTGTGAGTTATCAAAATAGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACATTAAAGTCCGTCAAGAAAAAATGTCAAAAAAGTTAAGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACTGCTAATTTGTCCCGCACTGCCTAAAGCTTGAGATGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACTAATTTCTTTAATTACTTCACGTCTGTCTAGCGTTTCAGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAATATATTAAGCTTCATACCAGTAAGACAGGGGGATATATGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC >NZ_LR698976|2|1|262649-264001|PILER-CR GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC AATAATTTGTCTAGGCTAAAATTAGCTACTATATCTG GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TTTTCTACATTTTCATTATAAGCTTGCTCTAATTC GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC ATAGTGATGATTTTCCAAAATCGCTTAAAATACC GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TCCCAATATTTGCCTTTTAAAACATCCTTAACTACAT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC CTCAAAGTGGAGCCTATAAAAATACAATTAGAAAC GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC ACAAATGCGTTTATTTTCTCTCTAGGGCTTGATTTTT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TCATTTATGTTAAATGGATATTCCGTGAGCCACATTAA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TAAAAGCAACATTAGCTCTAAGAAAACCAGTATCA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TTAAATATCACTATGCGAGTATATGTAGAAGCTAAT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC GGATATAAGCTCCAAAATACTCTAGGCACGGACGCCC GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TATAGATAATTATTGCCCCCATTCCCAAAACTCCA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC AGCATCGTCACTCTCTCGCCTTTCAGCAAAATTTGGC GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TATATGGGGAGTAAAAATCAAATAGCTAAAGAGCT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC CTCAATTGATGGGGTAAGTGTGAGTTATCAAAATA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC ATTAAAGTCCGTCAAGAAAAAATGTCAAAAAAGTTAA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TGCTAATTTGTCCCGCACTGCCTAAAGCTTGAGAT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TAATTTCTTTAATTACTTCACGTCTGTCTAGCGTTTCA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAT ATATTAAGCTTCATACCAGTAAGACAGGGGGATATAT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC >NZ_LR698976|2|2|262649-264001|CRISPRCasFinder GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC AATAATTTGTCTAGGCTAAAATTAGCTACTATATCTG GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TTTTCTACATTTTCATTATAAGCTTGCTCTAATTC GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC ATAGTGATGATTTTCCAAAATCGCTTAAAATACC GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TCCCAATATTTGCCTTTTAAAACATCCTTAACTACAT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC CTCAAAGTGGAGCCTATAAAAATACAATTAGAAAC GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC ACAAATGCGTTTATTTTCTCTCTAGGGCTTGATTTTT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TCATTTATGTTAAATGGATATTCCGTGAGCCACATTAA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TAAAAGCAACATTAGCTCTAAGAAAACCAGTATCA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TTAAATATCACTATGCGAGTATATGTAGAAGCTAAT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC GGATATAAGCTCCAAAATACTCTAGGCACGGACGCCC GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TATAGATAATTATTGCCCCCATTCCCAAAACTCCA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC AGCATCGTCACTCTCTCGCCTTTCAGCAAAATTTGGC GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TATATGGGGAGTAAAAATCAAATAGCTAAAGAGCT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC CTCAATTGATGGGGTAAGTGTGAGTTATCAAAATA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC ATTAAAGTCCGTCAAGAAAAAATGTCAAAAAAGTTAA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TGCTAATTTGTCCCGCACTGCCTAAAGCTTGAGAT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TAATTTCTTTAATTACTTCACGTCTGTCTAGCGTTTCA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAT ATATTAAGCTTCATACCAGTAAGACAGGGGGATATAT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC >NZ_LR698976|2|1|262649-264001|CRT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC AATAATTTGTCTAGGCTAAAATTAGCTACTATATCTG GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TTTTCTACATTTTCATTATAAGCTTGCTCTAATTC GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC ATAGTGATGATTTTCCAAAATCGCTTAAAATACC GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TCCCAATATTTGCCTTTTAAAACATCCTTAACTACAT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC CTCAAAGTGGAGCCTATAAAAATACAATTAGAAAC GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC ACAAATGCGTTTATTTTCTCTCTAGGGCTTGATTTTT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TCATTTATGTTAAATGGATATTCCGTGAGCCACATTAA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TAAAAGCAACATTAGCTCTAAGAAAACCAGTATCA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TTAAATATCACTATGCGAGTATATGTAGAAGCTAAT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC GGATATAAGCTCCAAAATACTCTAGGCACGGACGCCC GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TATAGATAATTATTGCCCCCATTCCCAAAACTCCA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC AGCATCGTCACTCTCTCGCCTTTCAGCAAAATTTGGC GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TATATGGGGAGTAAAAATCAAATAGCTAAAGAGCT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC CTCAATTGATGGGGTAAGTGTGAGTTATCAAAATA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC ATTAAAGTCCGTCAAGAAAAAATGTCAAAAAAGTTAA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TGCTAATTTGTCCCGCACTGCCTAAAGCTTGAGAT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TAATTTCTTTAATTACTTCACGTCTGTCTAGCGTTTCA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAT ATATTAAGCTTCATACCAGTAAGACAGGGGGATATAT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC
>NZ_LR698976.1|WP_100590404.1|261877_262444_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MILVSHIRQFIFCPRIFYFYNFCHFSPKYPEYVKHGSEFHAYQDELFKSRKFLKFRLNFKKAHKNLYLENEKFGGVLDLVFECDDEIIVVEFKNQSKPILSKGAKMQLIAYSKLASKHFKKPFHRVILCYSNNLKFKIFEIYKEDLAYFDKTLTQIQDLLEKGYFPQSSASITACAQCEFKNYCDDRE >NZ_LR698976.1|WP_141080632.1|261598_261868_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MDYLIAYDIEDNKNRSKVFEMLKDFGLRAVQKSVFFGELSNAEKIEIKIFLSRYCDKNDKVIITKFDLKFEDLIGYEKSDFEKLEFHII >NZ_LR698976.1|WP_100590403.1|260643_261597_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKHLVLNSFGLFLGLKSQRLVVYKNREIIKEIALKSLKTISINSNGINISSDLVFACSIRGIKIFYANFTNFSATHTLYEHKGVNVLKEQFASATNGKDIILAKELIIGKIKNQRSTILYFSRNFTAKQKENILASFQKALQILKNKNLNKDEIFGIEGSVANAYFEYLKQNGLFADSFEIRTKRNSTEITNQALNYGYAILLNFVYKSIINAGLNPYFGVLHSMRSSKPSLALDIMEEYRSFVVDRNIIKLRSSLKNSLEQDDKRLIASNILNTMRKKLIYNHRKLTLESIIQRQIYKISAFFCDNKKYKSYIFRW >NZ_LR698976.1|WP_147525226.1|258494_260663_+|hypothetical-protein MEKIVEHNSNFSFKAPFDTSTISTNFNYLTQLGDIIFDEKSRGFAKTCKFHTLENLIRSSAKSAIASRLASNSARLINGKIEMYLDRLAHEIIKKIDFTDIYNIQINVEMNKFNFESNLSKLGLAKERQKDEESFICPYSGAKISQINCEYDHILPRSKGLYNSLTNLIPTSSTSNQIKSNTKYLLSNLDENYLKYIFAKTQTTDLNSFKTFIDENISKIDENDFTNFRNLSFFEQIAFRHALFLDTDDNSFKKALRLLKLDTIKTHSNGTQKRFINILIEKISKLTKSEIDINFIDSKLVSSTRKDLAQNDTSIAKQEFQDSHSHCVDASIVFYLANSKIIKGQIEPDYDYFKDIYPKNSDIILPQSKQYLELNQKSQKSKKLFDDSVYSLVYEGKFDEKQKKILTQYELLKENGFVDTHKVFELIFKSFKDKDTSVLKDIKFLDNYLKSYIRKDIFSIFFNEKGELKEAKELKSATKNIDKFYTILSQNQDKIYTIKLDEKAKEKKTLQRNKVIELYKEIFYTKNAKPRARDKNRVTFSLPVYAKDTKYAIKRNSGFAGLKNKDIATKTYIDIDSREILKIPYYSTNVLPIRISDILVILSLQSKNAKQIYKVKIADNLPKQIISLDFILSQANRHEVLVSFDKSKLEIQNINDDNDENAFIQKYLCDDFKEFLGKPRDNKIEIIKNNDDILAIKYCVESTSKANKEIIVKALSDEAPSA >NZ_LR698976.1|WP_100590401.1|256917_257883_+|hypothetical-protein MKSLSINIDMGAINNGIFIATCQDDKIIDKNAFDIKFDKGKLNFSKIDRTLRRHTRRSFDRDRFVLRLLGEILPLENLSNNQKEKLFGLFKNRGFNYLNVNFNAEIDSDSLEILNALDGYYFKDCRVLSDFENSISKIFNELENDEILVFLDDQAQILNQAKEQKNKILNKNINAILEFLESIKNESFKNNKHRKSYLKDIKNEIENSFKDIILKLKIFKNSQEFYYFIGNIANFQTRILRRYFNAKFDLVFDDAKLKKNILRNINYLDFISTDEKANKSRILENLNAFSTLEFLKNTEPIITIHLMKTPKTKNLNLAKPL >NZ_LR698976.1|WP_100590400.1|255513_256074_-|c-type-cytochrome MKISNLIYLSIIPMLAWGQDSYIIEADGEFGKELKNLVEKHAKDNNLSVKIYEKSDSTEDYETGRFLNIGVDKRANYNSSKGKELYDKQCKSCHGDKGSKKAMGVSERLSDISGDEIADSIAGYRGDAQYGGNLKYLMAPIATKLNLRDLGHIIAYLKGDNAFIVDDDSDSGEMRTTPTKQGSYLE >NZ_LR698976.1|WP_100590399.1|254374_255493_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLSLIALAAAIAISSAATKEIKIGVIMPITGSVAAYGQTAWAGIKLANQLEPTLKNGDKISLVLVDNKGDKVETATATTRLVSEDKVSGLIGAMVTGNTQQVLQIADEKKVPMIAPAATADKLLDRSKYGARVTFMDSFQGTSFASWAIKQDMKNAILIIDQSTSYSIGLARAFKKEFEKQGGKILKELKISSGDKDFKAIVSQINSLNPDLVYMPFYHPEAALLVRQARQIGIKSQFASGDGVSNDTFIELAGDASNGYLYTDAFDSSNPPTAKSKAFIEAYTKANGNGNVPGFSALGADSYYLMIDAMNRCADATDKECINKEIKNTKNFEGVSGIINIDKKGNAERSIVIKEIASGKAMYKDTVNPN >NZ_LR698976.1|WP_100590398.1|253247_254186_+|thioredoxin-disulfide-reductase MLDVAIIGGGPAGLSAGLYATRGGLKNVVMFEKGMPGGQITNSSEMENYPGVATVMDGMSFMSPWLEQCTRFGLKHEMAAVEKVSKNSDGSFTITLEGGKTEQAKAVIVCTGSTPKRAGFKGEDEFFGKGVSTCATCDGFFYKNKEVAVLGGGDTAIEEAEYLTRICSKVYLIHRRDTFRAAPSSVEKVKKNEKIELILNATIDEVYGDSAAGVKGVKVKLADGSIRDLAVPGIFTFVGLNVRNEVLKDGDKFICDILPSGQVKVDLKMQTSIPGLFAAGDLRQDAPKQVVSAAADGAVAALSAMSYIESLH >NZ_LR698976.1|WP_086287782.1|252814_253129_+|thioredoxin MGKYIELTAENFNIAKEGVALVDFWAPWCGPCRMLAPVIDELAEEFDGKAKICKVNTDEVQDLAVEYGVRSIPTLLFFKDGEIKETLIGAQSKTAIAEKLNSLL >NZ_LR698976.1|WP_096018522.1|252304_252643_+|YraN-family-protein MGLKEYLFGHAAEKKAAKYLATKGYKILGLNYKTKFGEIDIIATSRSTLHFIEVKASTKDYETIYRVTKSKLEKIIKAIDFYILSNGLDMPYQIDLVCINGDEIELVENISY >NZ_LR698976.1|WP_100590405.1|264104_264458_-|hypothetical-protein MQNTYLDRVSEALTLLNRLDNFKPPTNGNGNAVKSYSIKLFILLFTIAKHEGETQAFYAELLGWTTANTSIHARYLYDNGFISKAYDDRDTRNLARKLFITPKGREFIENLLRKERN >NZ_LR698976.1|WP_100590406.1|264469_265441_-|hypothetical-protein MAIIKAQGGIIEAHHADPIWVREHFKHDIELLRTGELPKKSEVEIAKANELLLRIWAVWGIALLACIAYGYNPWFIAVIVIGFIFCIGATGAISGHNSGRSLWLTARNNGFRYDSDSDVTYIAQLQLMGLSLIPKELKEKAEADCRILKGHTMYRYPITYEKIHLSRRCNNWLNAKISFKLVDRVRTIEVTTKDRKVVIEIAKLKKYEKYIQGMGGFTNNFEMDGRSFNKLFSSKTVYNNASISLYTLYERHKGELGIVKKPQAFRELHITIHPKTGDNNYRLEKTVEDWEIVELVDERFNPDVYRALEDDKALDKAIKAELI >NZ_LR698976.1|WP_096014874.1|266001_266253_+|hypothetical-protein MNFKQRKKNEKKFSDWCFSSWIFNGCATLTEAYSDTVNSINETAREINAKNEQNRNKNNKSTNTNNKYEALSEDGDTGFGTVY >NZ_LR698976.1|WP_167368916.1|266293_266449_+|hypothetical-protein MIELFKNIGLGIFVNGAFAWQFGEATVKGFLAIIEGIAIMAIAIYIEKRSK >NZ_LR698976.1|WP_096017684.1|267145_267787_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLKALNLSHKFDYLLFNDINLDIRPATTTAIMGVSGSGKSTILHILSTLLSPTDGEVIYNDKSLYKLSSDELLKIRRYDFGIIFQAHYLFKGFNGFENIELATILSGQKINLNLLKALKIDKVVNQKIGELSGGQQQRVSIARVLAKNPKIIFADEPTGNLDQTTAKEVMSVIFDYVKTNNAALVLVTHDKDIAKLCDIKYQLSNQHLTQYQI >NZ_LR698976.1|WP_086226836.1|267789_268854_-|elongation-factor-Ts MEISANMVKELRESTGAGMMDCKKALQEANGDMQKAVDILREKGLGKAAKKADRLASEGLVSVVVSSDNKTATITEINSETDFVAKNATFVDLVKNTTLHVQTNAITTIDELKESSIGGVKFEEFFQSQIATIGENLVVRRFETIKASKNGIVAGYIHSNSRVGVLIGAACDSEATASKIGDFLRNLCMHAAAMKPQVISYKEFSPDFVEKEYLALKGELEKENEELVRLKKPLHKIPEFASRAQLSDEVIAKATEKLKEELRKQGKPEAIWDKILPGQIERYIADNTQLDQRLTLLGQFYVMDDKKTIEQVIAEEAKKLGGEIEIVSYVRFEVGEGLEKKTEDFAAEVAAQMA >NZ_LR698976.1|WP_086225552.1|268853_269630_-|30S-ribosomal-protein-S2 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
78739 : 85866
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LR698976|78739:85866|DBSCAN-SWA GATGAAAAAGTGCTTTGATATTAATAAACTAAATTTACATTATGGGACATTTCACGCATTAAAAAATATCAATATGGAGATTGCTAAAGGCGAAGTTACAGCCTTTATAGGCCCTAGTGGGTGTGGTAAATCTACATTTATCAAAACCCTTAATCGTATGAATGATTTAGTAGAGGGTTGTAAGATTGAAGGGGGGATATTGTTTCATGATAGGGATATTTATAGCAAAGATTATGATATAAATTTGCTTAGAAAGCGTGTAGGGATGGTATTTCAAAAGCCAAATCCATTTGCTATGAGTATATATGATAATATCACTTTTGGCCCTAAGACTCATGGCATAAAAGATAAAGATACCCTAGATGGCATAGTAGAAAAGAGCTTAAAAGACGCTGCTTTGTGGGATGATTTAAAAGATAGATTATATAGCTCGGCTTTAGGGCTTAGTGGCGGCCAGCAACAAAGATTATGTATCGCTAGAACCTTAGCTGTAGATCCAGAAGTTATCTTGATGGATGAGCCAACTAGCGCACTTGATCCTATATCCACGGCCAAAATAGAGGAGTTAGTCTTAAAGCTCAAAAAAGATTATACAATCATAATAGTAACTCATAATATGCAACAAGCTCACAGAATTTCGGATAAAACGGCGTTTTTTTTGATGGGCGAAGTGATCGAATATGATGATACAAAAAAGATATTTAACAAACCAAAAAACAAAAAAACTCAAGATTATGTTATGGGGAAATTTGGGTAAGTTTGCTATAATTTGGTAAATTTAAAGGAATTTAAGTGATCTATGTCTTAGAAGATGAAGGGGCGATTTTAGATCTTATTTGCTATGCTTTAAAATCCCAAAATATCCCAGTAAAAGGCTTTAGTCTAGCTAAGGATTTTTATAAAGCCTTAAAAGATCAAATCCCTCAAATTCTAGTGCTTGATGTTATGCTTCCAGATGGCGATGGATTTGAGATTTTAAAAGATCTTAAAAATAGTGCTAAATATAAAGATATTTGTGTTTTGATGCTTACAGCTCTTGATAGTGAGATAAATAAGGTCAAAGGCCTTGATCTAGGTGCTGATGACTATATCGCAAAACCTTTTGGAGTGATGGAGCTTTTGGCTCGTATTAGGGTGATTTCTAGACGCAAAGCCAAAGAAGAGCCAAATAGCGATATAAGCTTTAATGGATTGGAGTTTTCATATAAAAATCATATTGTTAAAGTTAATGGCAAGCCTTTGGAATTAACCTTAAAAGAATTTGAATTACTTGGGTTTTTATTACAAAATCCAAATCAAGTTTTTAGCCGTGATATGCTTTTAGAGATGATATGGGGCTATAGCTATGATAAAGAGAGTAGAACGATAGATATGCATATTAAAACACTAAGAAAAAAGCTTGGTAATATGTCAGATATGATTAGGACAATTCACGGAGTTGGTTATAAGTTAGTAAGAGAGTAGGATGCAAAAAAGGGTATTTTATTTCATTATTTTTTCTACATTAGCACTAGCTTTATTTATCAATATATTTTTGATATTTTCTATAGAATCTGTGCTTAAAAATGAGCTTTTTGATAGATTGAAAAATTATGCTTATAGCATTAAAAGTGAGGTTTTATCATCTATCCAAAATGGCTCTATACAAAGCTTAAAAGACCTAGATGAGACTTATAGAATTAGCATAATTGACCAAAATGGAGTTGTGATATATGATAATTTTGCCAATAATCTAAATTTGGATAATCACAGCAATAGAGCCGAGTTTAAAGAGGCGATAGAATATGGAGAATCCACAAATATACGCTATTCTAATACACTTTTAAAGCGAAATTTATATTATGGGCTTAAAATCTCTAATGAAAAAGGGGAATTTGTTTTAAGAATTTCAAAAGAACAAGATTATCTATATGCGATATTTATGAGCTTTATACCTTATATTGTTGCTGAGATTATAGCGGTGCTGATATTTTCATTTTTATTAGCTAAATACCTTACGCATATAATTTTACGCCCAATTTACAATATAGATTTAAAGAATTTAGATGAGAATTTACCATATCCAGAGCTTAGAGTTTTGATAGAAACTCTCAAAAAACAAAACAAAATTATCAAAAGCCAATTTAAACATCTAAAACAAAAAAGACAAGAGCTACAATCTCTAACCAAAGGTATGAAAGATGGCCTTATCATCATCAATCGCTCCGGAGAGATACTAAGCATAAATCCAAGCGCTCAAAAATACTTTGCTAATTTAGCCAAACATACTAATATATCTCAAATTCAAAATGATCTATTTTTAAAGCTTTTATTACAAAATTTAAGAGATTTCAAAGATGGCAAGATATCTTGCGAGATAAGAGAGCAGATAGTGTTTATGCAAGAGACTTTGGTGGAGTGTGAGATTGTCTTTTCGCCGATTTTTTCGCAAAAAGGCAAATTCAAAGGGCTAATTATCGTTATTTGCGATATTACAGAGCTTAAAAGAAACCAAAATTTAAGCAAAGAATTTAGCGCTAATGTAACTCACGAGCTTAAAACCCCGCTAACTTCTATAATGGGAAATGCCGAGATGATTAGAAATAATCTTGTAAAAAGTGATGATATTCCGCATTTTATAGATACAATTTATAATGAATCTAAAAGATTATTACACCTAATAGAAGATATTTTGAAATTATCATTTTTAGATGAATCCCATACCAAAAATATCCCATTTTCCAAAGTAGAGCTTAAAAATCTACTCTTAAAAGTCTATTCTAACTTAAAAAGCGTAGCCAAAAAATATGATATTGAGTTTAAATTTGAGCTTGAAGAGGCCTATATCCACGGCTCAAAAGAGCTATTAGAACACGCTATTTTCAATCTATGTGATAACGCTATTAAATACAATCACCCAGGTGGCTATGTCAAAATCAAGATAAGAAATTTGCAAGATTGCGTAGAGCTTAGCATTAAAGATAGTGGCATAGGAATTGAGCCAAGCTCACAAGAGCGGATATTTGAGAGATTTTATTGCGTGGATAAAAGTTATAGCAAAAAAGTAGGTGGCACAGGATTAGGACTATCAATAGTTAAATCAGTTTTAAATATGCACCACGCCAAAGTAAAATTAAAAAGCCAAAAAGATATAGGAAGTGAGTTTATAATCATCTTTCAAAAATCTTAGTTAAAAACCACTAAGCAAATTTAAATAAATTTCAAATTAATATCCAAATTTTATCGGTGTATTAGCTTTTTTAAGATACAATTACCCCATTTGTATAATCAAAATCACAAGGAAAATTATGGACGAAAATAAGAAAAAAAGTCTTGATTTAGCCCTTAAACAGATAGATAAAGCTTTTGGCAAGGGGACTATTTTAAGACTAGGAGATAAGGAGATTGAGCCTATTGATAGTATTAGCACCGGCTCAATAGGTCTTGATATCGCCCTTGGAATTGGTGGAGTACCAAAGGGTAGAATTATCGAAATTTACGGCCCTGAAAGCTCTGGTAAGACCACTCTTACATTGCATTTGATAGCTGAATGCCAAAAAGCTGGTGGCGTGTGTGCTTTTGTGGATGCCGAGCATGCTTTAGATGTCAAATATGCCAAAAATTTAGGTATAGATACTGATAACTTATATATATCTCAACCTGATTTTGGCGAACAAGCTCTTGATATTGTAGAGACTCTAGCTAGAAGTGGGGCAGTGGATCTAATCATAGTTGATAGCGTAGCAGCACTCACGCCAAAAAGCGAGATAGAAGGCGATATGGGAGATCAGCATGTAGGTCTTCAAGCAAGATTAATGAGTCAAGCCTTAAGAAAGCTTACTGGTATCGTCCATAAAATGGGAACTACGGTTGTATTTATCAACCAAATTCGTATGAAAATTGGCGCTATGGGTTATGGCACGCCAGAGACTACAACAGGCGGTAATGCGCTTAAATTCTACGCTTCAGTTCGCCTAGATGTCCGCAAGGTCGCCACACTTAAGCAGAGCGACGAGCCAATTGGAAATAGAGTTAAGGTAAAAGTAGTTAAAAATAAAGTAGCACCACCATTTAAAGTAGCTGAATTTGATATAATGTTTGGCGAGGGAATCAGCAAAGAAGGTGAGATCGTAGATTATGGAGTTAAGCTAGATATAATCGATAAAAGTGGTGCTTGGTTTAGCTATGAAAGCACCAAAATAGGCCAAGGTAGAGAAAATGCCAAGGCGTTTTTAAAAGAGAATTTAAATATAGCCGAAGAGATCACAACTAAAATCCGTGAAAATATAGGCGATAGCATGATGAGTAGTGCAGATGATGAAAATGAAAGCGAGGAAGAGTAATGCCAGTAATTAAAGATATAAAAGCGATAGAAGTTTTGGATAGTCGTGGAAATCCTACGATAAAAGCCTTCGTAACACTATGCGATGGAAGCACAGGCTCAGCAATAGTCCCAAGTGGTGCTAGCACCGGTAAAAGAGAGGCTTTAGAGCTTAGAGATGGCGGAGAAGCATATGGTGGCAAGGGCGTTTTAAAGGCTATTAAAAATGTAAATTCAATGATAGCAGAAGAGCTTTGCGGTAAAGACGCTTTAAACCAAAAAGCGATTGATGATGCTCTAATCGCACTAGATGGTACTGATAATTTTAGCAAAATCGGTGCTAATGCAGCTCTTGGCGTATCCATGGCAGTAGCTAGAGCGGCGGCAAATTCGAGCAAACTTCCGCTATATAAATATCTTGGCGGGGCTAATGCTTCTATTCTTCCTGTGCCGATGTTTAATATCATAAATGGCGGAGCTCATGCTAATAATAGCGTGGATTTTCAAGAATTTATGATTATGCCTTTTGGTTTTAACAAATTTAGCGATGCTCTAAGAGCTGTAGCAGAGATATATCAAACACTTAAAAAATTATTAAATGACGCCGGCCATAGCACCGCTGTTGGTGATGAGGGTGGATTTGCGCCAAATTTAAAAGACAATGAAGAGCCATTAGAGTTAATAACTCAAGCTATTATAAAAGCCGGATATAAACCAAATGAACAGATCAAACTAGCTCTTGATGTCGCCGCTAGCGAGCTATATGATGGTAAGGTCTATAAGCTAGAAGGCAAGGAATTTACAAGTCAAGAGATGGTAGAAAAATACGCAAAATTGTGCGAAAAATATCCGATAGTATCAATTGAAGATGGCCTTAGCGAAGATGACTGGGATGGATGGAGAGTGCTAACAGATAGGCTGGGAGATAAAATTCAATTAGTTGGCGATGATCTATTTGTAACAAATGAGAAGATTCTAAAAGAAGGAATCCAAAAAGGCATAGCAAACGCAGTATTAATCAAGCCAAATCAGATTGGCACAGTTAGCCAAACTATGCAAACAGTCCGCCTAGCTCAAAGAAATGGTTACCACTGTATAATGAGTCATAGAAGCGGTGAGAGTGAAGATAGCTTTATAGCTGATTTTGCTGTAGCTCTAAATACCGGCCAGATAAAGACAGGCGCCACAAGCAGAAGCGAAAGAAACGCAAAATATAATCGCTTATTAGAGATTGAGTGCGAAACAAGCGAATATCTAGGCGATAGAATTTGAATCCAATTTTGGTCGAGCTAGATTATAAAAAATCTAGCTCATTTAGAAGAGTTGTCGCATACTTTTTGCTTATATTAGTTACGATAATATTTGCTATTTATGTTGGCAATGTCTTTTTTGGCAGTCGCTCAGCATCTGTCTTATATGATCTAAAAGAGCAAAAAGATAACTTAAATAGCGAAGTAAAGAGATATCAAGAGTTAAATTCAGCTTTACAAAAAGAGTATTTTGAGTTAATCGGGCTAGACCCAGATAGTTATAAGTGAGTAAAAGATGAAAAGAGTTATTTTATTAGCAAGTTGTGCTATGGTGCTGTTAGCTAGAGAGAATCCATTTGTCCCAGATGATATCAATACCACTACGCTAAACTCTACAAATATCAGCCAAAACTCTCCAAAACTAGATAAAATCATAGCCAAATTTCCAAGTGATGCTAGAGAGTTAGTGAGTGCGACTTTTAATTACAAATCCATAGATGGTAGTATAAAGCAAAAGAGTATTGATATTAATGCAAGTTTTGATTGGCATGATGATATCATCATCTCATCGCAATCCCCAGTGACAAATGAGACTACCCCAGCCCTTGATGTATCAGTTACTACCACAGATGAACAGACCAAACAAGCCGCAGCCAAAAAGGCCGCACCAAAGCCACTTAGCGTCCCACCTAAGATAGAACCGCCACTAGATAGTGTCTCATTTATGGATTTTATCAAATTCGATATTTTTAACTCAAAAATCGAAATTATCAATCAAGATAGATTGATAAGGGATTTTATCATCAATAAACCGGATAAAATTGTTATGGATTTTCATAAAAATAGCGAATTCAATACCCAAACCATAAGAGTCTATAAAGGCCCATTAAAAAAGATAACAATTGGAGCTCATAAAGATTATTATAGAGTTGTATTATTCTTAGATGGCAACTACCACTACGGGCTTCGCCAAAGTGGCAATGGATATACTCTCACACTTAGATAATTATGCCTAGCATTTGCGGCGTAGATGAAGCTGGTAGGGGTGCTTTGGCCGGTGAGTTGGTGGTATGTGGATGTGCTTTTAAGGCTGATGTGAGTGAGCTTGGATTAACTGATTCTAAAAAGCTCACCCCCAAAAAAAGAGAGCAGATATACCAAAATTTGATTTTGAAATCGAATTTTATAACTATATATTTTAATAACAAAATTATAGACCAAATCGGTCTTAGCGAATGTTTAAGAGCTGCTTTGAGAGTGGTGAAATTTCACTTTAAAGATCATTTGATAATCTATGATGGTAATTGTGATTATGGTATTAAGGGGATTAGCACGATGATCAAAGCCGATGCGAAAATCCCACAAGTAAGCGCAGCTAGCATAATAGCCAAGGTAAGCCGAGATAGACAGATGAGATCTTTTGATAGCTTATACCCAAATTTTGGCTATGCCAAGCACAAAGGCTATGGAGTTAAGGCTCATATAGAGGCACTTAGACGATTTGGATCAAATGATTTAACTAGACTTAGCTTTAAGCCAAAAGCCCTTGAAAGCTCACTTTTTAGGGATGAAATTTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LR698976|78739:85866|82025_83060_+|WP_096013822.1|DBSCAN-SWA MDENKKKSLDLALKQIDKAFGKGTILRLGDKEIEPIDSISTGSIGLDIALGIGGVPKGRIIEIYGPESSGKTTLTLHLIAECQKAGGVCAFVDAEHALDVKYAKNLGIDTDNLYISQPDFGEQALDIVETLARSGAVDLIIVDSVAALTPKSEIEGDMGDQHVGLQARLMSQALRKLTGIVHKMGTTVVFINQIRMKIGAMGYGTPETTTGGNALKFYASVRLDVRKVATLKQSDEPIGNRVKVKVVKNKVAPPFKVAEFDIMFGEGISKEGEIVDYGVKLDIIDKSGAWFSYESTKIGQGRENAKAFLKENLNIAEEITTKIRENIGDSMMSSADDENESEEE >NZ_LR698976|78739:85866|85296_85866_+|WP_100590298.1|DBSCAN-SWA MPSICGVDEAGRGALAGELVVCGCAFKADVSELGLTDSKKLTPKKREQIYQNLILKSNFITIYFNNKIIDQIGLSECLRAALRVVKFHFKDHLIIYDGNCDYGIKGISTMIKADAKIPQVSAASIIAKVSRDRQMRSFDSLYPNFGYAKHKGYGVKAHIEALRRFGSNDLTRLSFKPKALESSLFRDEI >NZ_LR698976|78739:85866|83059_84310_+|WP_100590297.1|DBSCAN-SWA MPVIKDIKAIEVLDSRGNPTIKAFVTLCDGSTGSAIVPSGASTGKREALELRDGGEAYGGKGVLKAIKNVNSMIAEELCGKDALNQKAIDDALIALDGTDNFSKIGANAALGVSMAVARAAANSSKLPLYKYLGGANASILPVPMFNIINGGAHANNSVDFQEFMIMPFGFNKFSDALRAVAEIYQTLKKLLNDAGHSTAVGDEGGFAPNLKDNEEPLELITQAIIKAGYKPNEQIKLALDVAASELYDGKVYKLEGKEFTSQEMVEKYAKLCEKYPIVSIEDGLSEDDWDGWRVLTDRLGDKIQLVGDDLFVTNEKILKEGIQKGIANAVLIKPNQIGTVSQTMQTVRLAQRNGYHCIMSHRSGESEDSFIADFAVALNTGQIKTGATSRSERNAKYNRLLEIECETSEYLGDRI >NZ_LR698976|78739:85866|78739_79495_+|WP_100590295.1|DBSCAN-SWA MKKCFDINKLNLHYGTFHALKNINMEIAKGEVTAFIGPSGCGKSTFIKTLNRMNDLVEGCKIEGGILFHDRDIYSKDYDINLLRKRVGMVFQKPNPFAMSIYDNITFGPKTHGIKDKDTLDGIVEKSLKDAALWDDLKDRLYSSALGLSGGQQQRLCIARTLAVDPEVILMDEPTSALDPISTAKIEELVLKLKKDYTIIIVTHNMQQAHRISDKTAFFLMGEVIEYDDTKKIFNKPKNKKTQDYVMGKFG >NZ_LR698976|78739:85866|79530_80202_+|WP_086233894.1|DBSCAN-SWA MIYVLEDEGAILDLICYALKSQNIPVKGFSLAKDFYKALKDQIPQILVLDVMLPDGDGFEILKDLKNSAKYKDICVLMLTALDSEINKVKGLDLGADDYIAKPFGVMELLARIRVISRRKAKEEPNSDISFNGLEFSYKNHIVKVNGKPLELTLKEFELLGFLLQNPNQVFSRDMLLEMIWGYSYDKESRTIDMHIKTLRKKLGNMSDMIRTIHGVGYKLVRE >NZ_LR698976|78739:85866|84583_85294_+|WP_096013825.1|DBSCAN-SWA MKRVILLASCAMVLLARENPFVPDDINTTTLNSTNISQNSPKLDKIIAKFPSDARELVSATFNYKSIDGSIKQKSIDINASFDWHDDIIISSQSPVTNETTPALDVSVTTTDEQTKQAAAKKAAPKPLSVPPKIEPPLDSVSFMDFIKFDIFNSKIEIINQDRLIRDFIINKPDKIVMDFHKNSEFNTQTIRVYKGPLKKITIGAHKDYYRVVLFLDGNYHYGLRQSGNGYTLTLR >NZ_LR698976|78739:85866|84306_84576_+|WP_096029736.1|DBSCAN-SWA MNPILVELDYKKSSSFRRVVAYFLLILVTIIFAIYVGNVFFGSRSASVLYDLKEQKDNLNSEVKRYQELNSALQKEYFELIGLDPDSYK >NZ_LR698976|78739:85866|80203_81907_+|WP_100590296.1|DBSCAN-SWA MQKRVFYFIIFSTLALALFINIFLIFSIESVLKNELFDRLKNYAYSIKSEVLSSIQNGSIQSLKDLDETYRISIIDQNGVVIYDNFANNLNLDNHSNRAEFKEAIEYGESTNIRYSNTLLKRNLYYGLKISNEKGEFVLRISKEQDYLYAIFMSFIPYIVAEIIAVLIFSFLLAKYLTHIILRPIYNIDLKNLDENLPYPELRVLIETLKKQNKIIKSQFKHLKQKRQELQSLTKGMKDGLIIINRSGEILSINPSAQKYFANLAKHTNISQIQNDLFLKLLLQNLRDFKDGKISCEIREQIVFMQETLVECEIVFSPIFSQKGKFKGLIIVICDITELKRNQNLSKEFSANVTHELKTPLTSIMGNAEMIRNNLVKSDDIPHFIDTIYNESKRLLHLIEDILKLSFLDESHTKNIPFSKVELKNLLLKVYSNLKSVAKKYDIEFKFELEEAYIHGSKELLEHAIFNLCDNAIKYNHPGGYVKIKIRNLQDCVELSIKDSGIGIEPSSQERIFERFYCVDKSYSKKVGGTGLGLSIVKSVLNMHHAKVKLKSQKDIGSEFIIIFQKS |
8 | Bacillus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
102945 : 112947
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LR698976|102945:112947|DBSCAN-SWA AATGGCAAGCAACCACCAAAGAGAAGAATTACATAAAGCGATATGGTCCATCGCTGATGATTTGAGAGGTTCAGTAGATGGCTGGGATTTTAAGCAGTATGTGCTAGGTATTATGTTTTATAGATATATATCAGAAAATATAGCAAATTATATAAATGAAGGGGAGAGAGCAGCAGGCGAAGCTACTTTTGATTATGCGAATTTAAAAGATTGCGAGGCCGAATTTGAAAGGGATAATCTTGTCACAGAAAAGGGATTTTTCATTCGTCCTTCAGAGTTGTTTTGTAATGTGATTAAATCAGCTAAAAGCGATAGCGCTACATTCACAGATAGCGAGGGCAAAACTAAAAATATAAAAGATAATTTAAATGAATATTTAGAAATGATATTTAACAATATCGAAAACTCCGCCAAAGGCACGCAGAGTGAAGATGACTTTTCTGGGTTATTTGATGATATAGATGTCAATAGCAATAAGCTAGGCGCCACAGTTGCTAAAAGAAATGAAAAACTTCTAAAAATATTAGATGGAATAGCTGGGATAAATTTAGACTATAAGGATAATGATATAGACGCATTTGGGGATGCTTATGAGTTTTTAATGTCCATGTATGCTTCAAATGCTGGTAAATCAGGTGGAGAGTTCTACACACCACAAGAGGTTAGCGAACTACTTACCAAACTCGCTATTTTGGATAAAAAAGAGGTTAATAAGGTTTATGATCCAGCTTGTGGAAGCGGGTCATTGCTTTTGAAATCTGCGAAAATTTTAGGCAAAGAAAATGTAAGAAACGGCTTTTATGGTCAAGAGATAAATTTGACTACCTATAACCTTTGTAGGATTAATATGTTTTTACACGATATTGGTTATGATAAATTTAACATAGCTTGCGAAGATACTTTGACCATGCCTAAACACTGGGATGATGAGCCATTTGAGGTGATAGTATCTAATCCGCCATACTCTATCAAATGGGCTGGAGATGATAATGCTATTTTGATAAATGATGAGCGCTACTCTCCGGCTGGAGTTTTAGCGCCCAAATCAAAAGCGGATTTTGCCTTTATAATGCACTCATTATCGTGGCTAGCATCTAATGGCACAGCTTCTATAGTATGCTTTCCTGGGATATTATATCGAGGCGGAGCAGAACAAAAGATTAGAAGATATTTAATTGATAATAATTTTATAGACTCGATTATCCAACTACCTGATAATCTCTTTTTTGGGACAAGTATAGCAACTTGTATAATGGTATTAAAAAAGGGTAAAAAAGATAATAGCACACTCTTTATAAACGCTTCCAAAGAGTGCGTCAAAGTAACTAATAACAATAGATTAACCGATAAAAATATAGATAATATAGTTAAAATATTTAAAGATAGAAAAGATATTAACCACATTGCCAAATTAATCCCAAATAAAGAGATAACAGACAATAACTACAATCTATCAGTATCAACCTATGTAGAACAAGAAGACACAAGAGAAAAAATAGATATAGTAAAGCTAAATAATGAAATAGCCCAAATAGTAGCTAGAGAAAACGAGCTTCGCAAGGAAATAGATAAAATCATCTTAGAAATCGAGGCGTAATCTGTGAGTAAATTAGAAGAATTAATCAATAAATTATGCCCGAATGGGGTGGAATTTAAAAAAATTGAAGAAGTATGTGATAATGTTTTTGCTGGTGGTACACCAAGAACATCAAATAAAGATTATTATGGCGGAAATATTCCTTGGCTAAGATCAGGTGAGATAAATTTTAATATAATAGATGATGCTGAAATTAAAATTACAGAAAAAGGCCTTAATGAATCTTCTGCAAAATGGATAAAGGAATATTCTGTTTTAATTGCAATGACTGGGGCGACAGTTGCTAGGAGTGCCGTTAATATAAAAAGAATAACTGCAAATCAATCTGTATGCGCAATGGAACCTTCTGAAATAGTTAATTATAAATTTTTATATTATTATGTAGAAAGTATGTATAACAATATAAAAGGAATGGCTCAAGGTGCTTTAACAAGTATAAATCTATCAATTATAAAATCAATAAGTATTCCTGTGCCTCCGTTGGAAGTGCAATGTGAAATTGTCCGTATATTGGATAATTTCACATTGCTTTCAGCAGAGCTTTCAGCAGAGCTTTCAGCTAGGCAAAAGCAATATGAGTATTATTCAAAAGAATTATTCAATTTTAATGATGATGTTGAATTTATTAGTTTAGAATCAATTGCGGATATAGGTACGGGTAGTAGTAATACAAATGAAGCAGTTGAAGATGGACAATATCCATTTTATGTTCGTTCTCAACAAGTGTATTATAAAAATAATTATGAGTACGATGATAATTCTATAATAACATCAGGTGATGGAGTAGGAGTTGGAAAAATATTTCATTACACTGATGGAAAATATGCATTACATCAAAGAGCATACAGAATTAATATAACAAACAATAAAGTAAATTCAAAATATTTTTATTATTATATGAAGTCAACATTTTATGATTATATACAAAAAAATGCTTTTAATTCTTCTGTAACATCTATTAGGAGACCTATGTTAAATAAGTATCCAATACCTATACTATCATTAGAAAAACAAAATAAGATAGTAAATATTTTAGAAAAATTTGACAAATTATGTAACGACCTTTCTGAAGGTCTTCCCGCTGAAATAGAAGCAAGAAAAAAGCAATATGAGTATTATAGAGATAAATTATTAACTTTTAAGGAGTTAAAAAGTTAATAAATGAAAGATAAGAAAGGATGATTTTGGAAGAAAATAGCATTATAATCTATACGCCAGAAGATGGTAGCACTAAAATAGATGTTAGATTAATCGATGAAACAGTGTGGTTGTCGCAACAACAAATGGCAGTTTTGTATGATACAACTAAGCAAAATATAAGTTTGCATATAAAAAATATTTTTGAAGAAGGAGAGTTAAACGAAAGCTCAACTATCAAGGAAATCTTGACAGTTCAAAAAGAAGGCAATAGAAATGTTGAAAGAAATGTAAAATATTATAATTTAGATATGATAATTTCACTTGGATATAGGATAAAATCCAAAGTAGCAACTAATTTTAGAAGATGGGCGACTCAAAAGTTAAAAGAGTATTTGATAAAAGGTTTTACTATAGATGATGAAAGACTAAAAGGAAATGGCGGTGGGAGCTATTGGAAAGAATTATTAGATAGAATTAGAGATATTCGTTCTTCTGAAAAAGTGCTTTATAGACAAGTTTTGGATCTTTATGCGACTAGTGTTGATTATGATCCAAAAAGCGAAGAATCAATCGAATTTTTTAAAATAGTACAAAACAAGCTACATTATGCTACACATGGTCATACCGCAGCTGAGATTATTTATCAAAGAGCTGATGCCAAAAAAGAATTTATGGGATTAAAAAATTTTAAAGGCAAATTTCCTGTGTGGAGTGATGCAAAAATAGCCAAAAATTACTTAGATGAAAATGAATTAAAAGTTTTGAATAATCTAGTTTCAGGTTATTTTGATTTAGCAGAAATCAATGCTTTTGAACATAAACCAATGTATATGAGTGATTATATTTCAATGTTAGACTCCGTGCTTACATCTGGAAACAGACAAATATTAACCGGTGCGGGAAATATAAGCCACGAACAAGCTTTAAAAAAAGCTAAAAACGAATATTTAAAATACCAAAATAACGAACTATCCCCAGTTGAAAAAGAGTATATAAAAAGTTTAAAAAAAGCCGAAAAAGAAGCTAAAAATCAAATAAGAAAAATAGGAAAATAATATGAATAAATACAATATAGTTATGGAAATGAGCAATTCTACTGTGGTGGCTGAGTATGAGCCATTAAAGAAAAAATCTGATAGTTATCAAAGCGAAGCAGCCTTAGAAAATGAATTTATAAAAATGCTTAGTGAGCAAGGCTATGAATATCTAAAAATCAATGATTCAAAGGCACTTATCAGTAACCTTAGAGCTCAATTAGAGATATTAAATGATTATAAATTTAGTGATAATGAATGGGATAGATTTTATAAAAATAGTATCGCTAATAACAATGATGGAATAGTCCAAAAAACCAAAAAAATCCAAGAAGATCATATCCAAGTATTAAAAAAAGATGATGGAACGAGTAGAAATATCTATCTAATTGATAAGAAAAATATCCATAATAATATATTACAAGTTATTAACCAATATGTAGAAAAGGGCGGAAACTATGAAAATCGCTATGATGTTTCGATTTTGGTCAATGGATTGCCTTTGATTCATATAGAGTTAAAAAGACGGGGAGTAGCCTTAAAAGAAGCATTTAATCAGATTAATAGATATCAAAGAGATAGCTTCTGGGCTGGTAGTGGGCTATATGAGTATATACAAATATTTGTAATTTCAAATGGCACAAATACAAAATACTATTCTAACACCACAAGAGAGAGCCATATAAAAGAAAAAACCCAAACACAAAATAGAAGCAAGAAAACAAGCAATAGCTTTGAATTTACTTCATACTGGGCTGATGCGAGTAATAAGGTAATACCCGATTTAGTGGATTTTACTAAGACATTTTTTTCAAAGCATACGATACTAAATATATTAACCAAATATTGCGTATTTACGGCTGAAGAGTTATTGCTGGTGATGCGTCCATATCAAATAGCCGCCACTGAAAGAATACTAAATAAAATTCAAATAAGCACAAATTATAAAAAAATGGGAACGATAGAAGCTGGTGGCTACATATGGCATACCACAGGCTCTGGCAAGACCTTGACATCATTTAAGACCGCTCAACTAGCAAGTAAATTAGACTATATAGATAAGGTGCTGTTTGTAGTTGATAGAAAAGATTTGGATTATCAGACGATGCGAGAGTATGATAGGTTCGAAAAGGGTGCGGCAAATGGCAATAGAAATACCAAAATACTACAAAAACAGATTGAAGATGATAACGCTAAAATCATAGTTACAACTATCCAAAAGTTAAGCG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CAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LR698976|102945:112947|102945_104541_+|WP_100590310.1|DBSCAN-SWA MASNHQREELHKAIWSIADDLRGSVDGWDFKQYVLGIMFYRYISENIANYINEGERAAGEATFDYANLKDCEAEFERDNLVTEKGFFIRPSELFCNVIKSAKSDSATFTDSEGKTKNIKDNLNEYLEMIFNNIENSAKGTQSEDDFSGLFDDIDVNSNKLGATVAKRNEKLLKILDGIAGINLDYKDNDIDAFGDAYEFLMSMYASNAGKSGGEFYTPQEVSELLTKLAILDKKEVNKVYDPACGSGSLLLKSAKILGKENVRNGFYGQEINLTTYNLCRINMFLHDIGYDKFNIACEDTLTMPKHWDDEPFEVIVSNPPYSIKWAGDDNAILINDERYSPAGVLAPKSKADFAFIMHSLSWLASNGTASIVCFPGILYRGGAEQKIRRYLIDNNFIDSIIQLPDNLFFGTSIATCIMVLKKGKKDNSTLFINASKECVKVTNNNRLTDKNIDNIVKIFKDRKDINHIAKLIPNKEITDNNYNLSVSTYVEQEDTREKIDIVKLNNEIAQIVARENELRKEIDKIILEIEA >NZ_LR698976|102945:112947|111376_112201_-|WP_100590315.1|DBSCAN-SWA MKNILIILLFSFISLYANIDDFKTATWNMQGSSASSEAKWSISIAQMFSGANGIDVLAIQEAGTLPATAEPTGREFRAFGTSVVVTEHVWNIGTRLRPDLIFIYYARTDLGGNRVNLALASRRQADEVFLRPPPTTASRPMLGIRINNDAFFSIHALANGGADASAIVHNIDLFFQSTPTLANTNWIIMGDFNREPVDLLSTFELELRLRTRIVTNNAITQISARRTLDYAVVGNSNRAIAPAPLPPISASTFFSGFRTHIASDHFPVTFRRFP >NZ_LR698976|102945:112947|105719_106736_+|WP_100590312.1|DBSCAN-SWA MILEENSIIIYTPEDGSTKIDVRLIDETVWLSQQQMAVLYDTTKQNISLHIKNIFEEGELNESSTIKEILTVQKEGNRNVERNVKYYNLDMIISLGYRIKSKVATNFRRWATQKLKEYLIKGFTIDDERLKGNGGGSYWKELLDRIRDIRSSEKVLYRQVLDLYATSVDYDPKSEESIEFFKIVQNKLHYATHGHTAAEIIYQRADAKKEFMGLKNFKGKFPVWSDAKIAKNYLDENELKVLNNLVSGYFDLAEINAFEHKPMYMSDYISMLDSVLTSGNRQILTGAGNISHEQALKKAKNEYLKYQNNELSPVEKEYIKSLKKAEKEAKNQIRKIGK >NZ_LR698976|102945:112947|110621_111380_-|WP_100590314.1|DBSCAN-SWA MKIAIKISLISLISIFIISCSGAKIDQPKQDMSFLKLDSSKGFAGDISKAPDETKAPDRAPLLNDKIKTPILTSSNNQDGFDPFTLPLSLRSLDTGMPLVVNLGKSDETFNYNLREVKAFEPTIIDEIKRVDSFAHLSLEYVQFVSANDINSCLGIDESGFFALKNCIGDLDRKKFETVFQLIPLLSDAVEIRSLVLGGKECISTFFNPNLEPWQRVGILRCELREGFSVDLAKLWAIMPEIKQAAIIQPVD >NZ_LR698976|102945:112947|104544_105699_+|WP_100590311.1|DBSCAN-SWA MSKLEELINKLCPNGVEFKKIEEVCDNVFAGGTPRTSNKDYYGGNIPWLRSGEINFNIIDDAEIKITEKGLNESSAKWIKEYSVLIAMTGATVARSAVNIKRITANQSVCAMEPSEIVNYKFLYYYVESMYNNIKGMAQGALTSINLSIIKSISIPVPPLEVQCEIVRILDNFTLLSAELSAELSARQKQYEYYSKELFNFNDDVEFISLESIADIGTGSSNTNEAVEDGQYPFYVRSQQVYYKNNYEYDDNSIITSGDGVGVGKIFHYTDGKYALHQRAYRINITNNKVNSKYFYYYMKSTFYDYIQKNAFNSSVTSIRRPMLNKYPIPILSLEKQNKIVNILEKFDKLCNDLSEGLPAEIEARKKQYEYYRDKLLTFKELKS >NZ_LR698976|102945:112947|112197_112947_-|WP_100590316.1|DBSCAN-SWA MRNLLFMLFISLIFISCSSSKSPYYPPIMDDNFTHNSLKTPIFNKLDLADPSNPLANTTPSNNQSNSSNQPPQITQPPLLTAPATLGSSPSLGSKSTPLTIINPKGGSAITVWALAPGNWLWGYTLDNSKEFGRARSWQVLNLGNDIALIINFLTNTCIHDEGGGITHRNCDINNKSQQWQLSAMDNGAIQIKSSASSKCITTDLGSLTQTGSYYSLAMRECNFKPNFNQQWVFIPEAAPTSPLLGYQQ >NZ_LR698976|102945:112947|109929_110475_+|WP_096015336.1|DBSCAN-SWA MKKFGFVASALMLASSSLLAANMTIFDPKSVDHIEIKVDLLGQDKNTPVGSVIAVKTNYGVAFFPDLKGLEPGLHGFHVHANPDCGATDKGLGMKAGGHWDPANSGNHSLPWDDKGHKGDLPALYVASDGTATNPVLSPKIKDLSELKDHSLMVHIGGDNHSDHPKALGGGGARMACGVIK >NZ_LR698976|102945:112947|106737_109761_+|WP_100590313.1|DBSCAN-SWA MNKYNIVMEMSNSTVVAEYEPLKKKSDSYQSEAALENEFIKMLSEQGYEYLKINDSKALISNLRAQLEILNDYKFSDNEWDRFYKNSIANNNDGIVQKTKKIQEDHIQVLKKDDGTSRNIYLIDKKNIHNNILQVINQYVEKGGNYENRYDVSILVNGLPLIHIELKRRGVALKEAFNQINRYQRDSFWAGSGLYEYIQIFVISNGTNTKYYSNTTRESHIKEKTQTQNRSKKTSNSFEFTSYWADASNKVIPDLVDFTKTFFSKHTILNILTKYCVFTAEELLLVMRPYQIAATERILNKIQISTNYKKMGTIEAGGYIWHTTGSGKTLTSFKTAQLASKLDYIDKVLFVVDRKDLDYQTMREYDRFEKGAANGNRNTKILQKQIEDDNAKIIVTTIQKLSEFVKRNPKHPAFQKHLVLIFDECHRSQFGGMHISIAKSFKNYHLFGFTGTPIFAKNATNKSNPNFCTTEQAFGDKLHTYTIVDAINDGNVLPFRIDYVNTIKKKDEIKDKEVARIDEAGALADDKRVKKIVEYIIEHFDQKTKRSSYYDLKGQRMSGFNSMFAVASIEMAKKYYLEFKKQLEEKQKDLTIATIFSFSANEEDRADGIIDDEGFETELLDKSSREFLDFAISEYNKKFKTNFSSEGNGFQDYYKDLSDKVKKREVDLLIVVNMFLTGFDATTLNTLWVDKNLKQHGLIQAFSRTNRILNSVKSYGNIVCFRDLQDETNDAIALFGDKNASGIVLLRSFEDYYYGYDDDKKHIMGYEEKIAQLIQKYPPDEQIIGESAKRDFIISFGSILRLRNILSSFDKFKGMEILSEEDFRDYLSEYEDLNDEFKSKSEDSESIKDDLVFEMELVRQLEVNIDYILMLVTKYHKSNCKNQEIRSSIDKAIRASMSLRSKKDLIDGFINKINADTDVMTDWAKFVKEQKESDLKDLIKDENLKESETRKFIDSSFRDGQVKTIGTDIEKILPPMGRFNGGNRNERKQAIIEKLLKFFDKYFGLGI |
8 | Enterobacteria_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
142779 : 159796
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LR698976|142779:159796|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LR698976|142779:159796|148520_149270_+|WP_100590316.1|DBSCAN-SWA MRNLLFMLFISLIFISCSSSKSPYYPPIMDDNFTHNSLKTPIFNKLDLADPSNPLANTTPSNNQSNSSNQPPQITQPPLLTAPATLGSSPSLGSKSTPLTIINPKGGSAITVWALAPGNWLWGYTLDNSKEFGRARSWQVLNLGNDIALIINFLTNTCIHDEGGGITHRNCDINNKSQQWQLSAMDNGAIQIKSSASSKCITTDLGSLTQTGSYYSLAMRECNFKPNFNQQWVFIPEAAPTSPLLGYQQ >NZ_LR698976|142779:159796|144460_145789_+|WP_100590338.1|DBSCAN-SWA MAKVALCISGAFRGENFIEYLNDTIGKFKSLNPDVFIASWDSYKIWPGVGGLGVGWIRNWYSQDIIEFAPKEFIGSNSDFKKLFPEVYKILEKEIDKHIDNDLLEKIKRLDNVKSIKLSNEQEYLKQYPSNLEIVNSTKMFYGFWQVVNLLLEYETKNNFYYDYIIVLRPDKIYSIDFDLKFIETLQQDNEIICEEYDWGMMDISLYGKRYAMIELLSLFDKASRYRHLDYFKYFPSGICCAPIGFLDHSILVRCVKFIGLKINNTNFIKYNKIDYNPRIPNIQKALLKDLENIDTNRDQDYILFFDILNCPKLLSTRLATQIIKNHLSYKLGEAMIANSKSLLGYIKMPFKLNHIKKEHNNEQKSYEKIIKKHPNLKLPPLETYPDYNEAIKIKNHLSYKLGEALIKANNKGFITGGGGYWLLFEIRRIIKEHKKAKNENR >NZ_LR698976|142779:159796|154249_155278_-|WP_100590346.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_LR698976|142779:159796|145775_146117_+|WP_086304115.1|DBSCAN-SWA MKIDNLDSMIRGWFVGDFEPNVLKSDQVEVGVKSYKKGDYEERHYHKIATEITVITKGKVKMNGVIYSEGDIITIAPFEDTDFEALEDSQNVVVKIPAAKNDKYLGKYGENNE >NZ_LR698976|142779:159796|150087_150849_+|WP_100590341.1|DBSCAN-SWA MKIAIKISLISLISIFIISCSGAKIDQPKQDMSFLKLDSSKGFAGDISKAPDETKAPDRIKISDLNDKPNLKSNNSNNQDGFDPFTLPLSLRSLDTGMPLVVNLGKSDETFNYNLREVKAFEPTIIDDIKRVDSFANLGLEYVQFVSANDINECLGIDESGFFALKNCIGDLDRKKFETVFQLIPLLSDAVEIRSLVLGGKECISTFFNPNLEPWQRVGINRCELREGFSVDLAKLWAIMPEIKQAAIIQPVD >NZ_LR698976|142779:159796|142779_143415_+|WP_100590336.1|DBSCAN-SWA MSQIKAVIFDMDGVLIEAKDWHYEALNRALRLFGLEISYLEHLTTFDGLPTKKKLEILSVDRKLPKSLHNFINQIKQLYTMEIVYQSCKPRFYHQYALSKLHKEGYKMAVCSNSIYNTIDVMMQKAALNPYLDFYISNEDVKHGKPDPEMYNKAIAKFGLKPNECMIVEDNENGIKAARASGANVMIVKEVSDVNYENIKEHIFKFQKGDL >NZ_LR698976|142779:159796|153287_154226_-|WP_100590345.1|DBSCAN-SWA MSKKVLITGGAGYIGSVLTPILLEKGYEVCVIDNLMFDQISLLSCSHNKNFTFINGDAMDENLIKQEVAKADIIIPLAALVGAPLCKRNPKLAKMINYEAVKMISDFASPSQIFIYHNTNSGYGIGEKDAMCTEESPLRPISEYGIDKVHAEQYLLDKGNCVTFRLATVFGISPRMRLDLLVNDFTYRAYKDKFIVLFEEHFRRNYIHVRDVVKGFIHGIENYDKMKGQAYNMGLSSANLTKRQLAETIKKYIPDFYIHSASIGEDPDKRDYLVSNAKLEATGWKPDNTLEDGIEELLRAFKMMKVNRFANV >NZ_LR698976|142779:159796|146846_147515_+|WP_100590339.1|DBSCAN-SWA MVQKRLAIQFFGHTRTYKKTYDSFFKYIVEPNQQDGWEIDIFIHTWDMSSSSSGSWHEGQDIFDIYPLSQSDIDDIKQIYNPKAILIEHLEDGIHGVVESKKRGNRLRERYEIENNIKYDYFLYTRLDVLFATPLNISKYIDFYIVDDMMKYFKLPEKHCFCPFNPFVRMPVIDMRHINEGDIVFSQTIRMMHLRHTFIQKFLQFLSIINCIEIFSYKEEIL >NZ_LR698976|142779:159796|157548_158676_-|WP_100590349.1|DBSCAN-SWA 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MENLNSYIKEHFQESILVKEQILKDENLITLIKNASLEVIKAYKNGNKTLLAGNGGSAADAQHIAGEFVSRFYFDRPGIASIALTTDTSILTAIGNDYGYENLFARQVQAQGVKGDVFIGISTSGNSANIIEALKVCKEKEIISIGLTGQSGGKMADLCDYCIKVPSNCTPRIQESHIVIGHIICAIVEEEIFGKGFK >NZ_LR698976|142779:159796|150928_151609_-|WP_100590342.1|DBSCAN-SWA MNSPKEAIILCGGLGTRLKSVLPNLPKPMAPVKNKPFLAFILEYLKRQNIKKVILAVSYKYEIIQNYFQNSYLDMEIVYSIEDEPLDTGGAIVKALKLVDQNSVYILNGDTIFDINLNNLKLDDSKICIALKHMNNFDRYGSVNIDKNHNITAFNEKKFTPDGFINGGIYLITKDIFDIFNLQNKFSFEEFFQNNFLALKARACVFDDYFIDIGIPQDYQAFIDIN |
20 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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