Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053690 | Arthrobacter citreus strain NEB 577 plasmid pAciIRM, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP053688 | Arthrobacter citreus strain NEB 577 chromosome, complete genome | 3 crisprs | cas3,DinG,csa3,RT,DEDDh,WYL | 2 | 2 | 10 | 0 |
NZ_CP053689 | Arthrobacter citreus strain NEB 577 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | RT,csa3 | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053688_1 | 881264-883499 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053688_1
|
28 spacers
spacers of NZ_CP053688_1
>1.1|881286|50|NZ_CP053688|CRT AGGAATAACAGGTGCAACAGGAGCAACCGGATCAACTGGAACAACCGGCC >1.2|881358|50|NZ_CP053688|CRT AGGAATAACAGGTGCAACAGGAGCAACCGGACCTACAGGAGCAACCGGCT >1.3|881430|68|NZ_CP053688|CRT AGGAGTAACAGGTGCAACAGGAGAAACCGGACCTACAGGAGCAACAGGCTCGACGGGAATAACGGGCT >1.4|881520|68|NZ_CP053688|CRT AGGAATAACAGGTGCAACAGGAGAAACCGGATCAACTGGAACAACAGGCCCGACGGGAATAACAGGCT >1.5|881610|50|NZ_CP053688|CRT CGGAATAACAGGTGCAACAGGAGAAACCGGCCCGACGGGAATAACGGGCT >1.6|881682|68|NZ_CP053688|CRT AGGAGAAACCGGACCTACAGGAGCAACAGGCTCGACGGGAATTACGGGCTCGACAGGAGTAACAGGCC >1.7|881772|68|NZ_CP053688|CRT AGGAGAAACCGGATCAACTGGAGCAACCGGCCCGACGGGAATAACGGGCTCGACGGGAATAACAGGTG >1.8|881862|86|NZ_CP053688|CRT TGGAACAACCGGCCCGACAGGATTAACGGGCTCGACAGGGATTACAGGAGCAACCGGGATAACAGGAGCAACCGGAATAACAGGTG >1.9|881970|50|NZ_CP053688|CRT CGGAATAACAGGCTCGACAGGAGTAACGGGCCCGACCGGAATAACCGGTC >1.10|882042|68|NZ_CP053688|CRT CGGAATAACAGGCCCAACAGGAGTAACAGGCTCGACAGGGATAACAGGAGCAACCGGAATAACAGGTC >1.11|882132|68|NZ_CP053688|CRT TGGAACAACCGGCCCGACGGGAATAACAGGCTCGACAGGAGTAACGGGCCCGACGGGAATAACGGGCT >1.12|882222|41|NZ_CP053688|CRT CGGATCAACTGGAGCAACCGGCCCGACGGGAATAACAGGCT >1.13|882285|41|NZ_CP053688|CRT CGGAATAACGGGCTCAACTGGAACAACCGGCCCGACGGGAA >1.14|882348|41|NZ_CP053688|CRT GGGTTCGACGGGAATAACCGGCCCGACGGGAATAACGGGTT >1.15|882411|68|NZ_CP053688|CRT GGGAATAACAGGAGCAACGGGAATAACAGGAGCAACAGGAGAAACCGGCCCGACGGGAATAACAGGCT >1.16|882501|50|NZ_CP053688|CRT GGGAATAACAGGAGCAACCGGAATAACGGGCTCAACTGGAACAACCGGCC >1.17|882573|50|NZ_CP053688|CRT TGGAGTAACGGGTTCGACGGGAATAACGGGCTCAACTGGAACAACCGGCC >1.18|882645|50|NZ_CP053688|CRT TGGAGCAACGGGTTCGACGGGAATAACCGGCCCGACGGGAATAACGGGTC >1.19|882717|68|NZ_CP053688|CRT CGGAGTAACGGGCTCAACTGGAGCAACGGGTTCTACGGGAATAACAGGCTCGACGGGAATAACGGGTT >1.20|882807|68|NZ_CP053688|CRT AGGAATAACAGGTGCAACCGGAATAACAGGAGCAACAGGAGAAACCGGCTCAACTGGAACAACCGGCC >1.21|882897|50|NZ_CP053688|CRT TGGAGCAACGGGTTCGACGGGAATAACAGGCCCGACGGGAATAACGGGTC >1.22|882969|68|NZ_CP053688|CRT CGGAGTAACGGGCTCAACTGGAACAACCGGCCTGACCGGAATAACAGGCTCGACCGGAGTAACGGGCT >1.23|883059|50|NZ_CP053688|CRT TGGAGCAACGGGTTCTACGGGAATAACCGGCCCGACGGGAGTAACGGGTC >1.24|883131|50|NZ_CP053688|CRT CGGAGTAACCGGCCCAACGGGAATAACGGGAGCGACGGGGGTAACCGGCC >1.25|883203|59|NZ_CP053688|CRT TGGCAGAACCGGCTCAACAGGAGTAACTGGAATAACGGGAGCAACGGGAGCAACGGGTC >1.26|883284|77|NZ_CP053688|CRT AGGGGATAGAGGAGCGTCGGGTCCAACAGGAACCACAGGCTCGACCGGAGTAACCGGCCCAACGGGAATAACGGGTC >1.27|883383|41|NZ_CP053688|CRT AGGCCCAACAGGGGAAAAAGGTACGCCGGGAGCAACAGGAG >1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT AGGAGCAACAGGAGCAACAGGTGTAACAGGAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053688_1
The CRISPR arrays of NZ_CP053688_1 >merge|NZ_CP053688|1|881264-883499|CRT CGACCGGAATAACGGGCTCGACAGGAATAACAGGTGCAACAGGAGCAACCGGATCAACTGGAACAACCGGCCCGACGGGAATAACGGGCTCGACAGGAATAACAGGTGCAACAGGAGCAACCGGACCTACAGGAGCAACCGGCTCGACGGGAATAACGGGCTCGACAGGAGTAACAGGTGCAACAGGAGAAACCGGACCTACAGGAGCAACAGGCTCGACGGGAATAACGGGCTCGACCGGAGTAACAGGCCCGACAGGAATAACAGGTGCAACAGGAGAAACCGGATCAACTGGAACAACAGGCCCGACGGGAATAACAGGCTCGACAGGAATAACAGGCCCGACCGGAATAACAGGTGCAACAGGAGAAACCGGCCCGACGGGAATAACGGGCTCGACAGGAATAACAGGTGCAACAGGAGAAACCGGACCTACAGGAGCAACAGGCTCGACGGGAATTACGGGCTCGACAGGAGTAACAGGCCCGACCGGAATAACAGGTGCAACAGGAGAAACCGGATCAACTGGAGCAACCGGCCCGACGGGAATAACGGGCTCGACGGGAATAACAGGTGCAACCGGAATAACGGGCTCAACTGGAACAACCGGCCCGACAGGATTAACGGGCTCGACAGGGATTACAGGAGCAACCGGGATAACAGGAGCAACCGGAATAACAGGTGCAACAGGAGAAACAGGAGCAACCGGAATAACAGGCTCGACAGGAGTAACGGGCCCGACCGGAATAACCGGTCCAACAGGAGAAACAGGAGCAACCGGAATAACAGGCCCAACAGGAGTAACAGGCTCGACAGGGATAACAGGAGCAACCGGAATAACAGGTCCAACAGGAGCAACCGGAGCAACTGGAACAACCGGCCCGACGGGAATAACAGGCTCGACAGGAGTAACGGGCCCGACGGGAATAACGGGCTCGACAGGAATAACAGGAGCAACCGGATCAACTGGAGCAACCGGCCCGACGGGAATAACAGGCTCGACGGGAATAACAGGAGCAACCGGAATAACGGGCTCAACTGGAACAACCGGCCCGACGGGAATAACGGGCTCGACTGGAGCAACGGGTTCGACGGGAATAACCGGCCCGACGGGAATAACGGGTTCGACGGGAATAACAGGAGCAACGGGAATAACAGGAGCAACGGGAATAACAGGAGCAACAGGAGAAACCGGCCCGACGGGAATAACAGGCTCGACGGGAATAACAGGCTCGACGGGAATAACAGGAGCAACCGGAATAACGGGCTCAACTGGAACAACCGGCCCGACGGGAATAACGGGCTCGACTGGAGTAACGGGTTCGACGGGAATAACGGGCTCAACTGGAACAACCGGCCCGACGGGAATAACGGGCTCGACTGGAGCAACGGGTTCGACGGGAATAACCGGCCCGACGGGAATAACGGGTCCGACGGGAATAACGGGCTCGACCGGAGTAACGGGCTCAACTGGAGCAACGGGTTCTACGGGAATAACAGGCTCGACGGGAATAACGGGTTCTACGGGAATAACGGGCTCGACAGGAATAACAGGTGCAACCGGAATAACAGGAGCAACAGGAGAAACCGGCTCAACTGGAACAACCGGCCCGACGGGAATAACGGGCTCGACTGGAGCAACGGGTTCGACGGGAATAACAGGCCCGACGGGAATAACGGGTCCGACGGGAATAACGGGCTCGACCGGAGTAACGGGCTCAACTGGAACAACCGGCCTGACCGGAATAACAGGCTCGACCGGAGTAACGGGCTCGACGGGAATAACGGGCTCGACTGGAGCAACGGGTTCTACGGGAATAACCGGCCCGACGGGAGTAACGGGTCCGACGGGAATAACGGGCTCGACCGGAGTAACCGGCCCAACGGGAATAACGGGAGCGACGGGGGTAACCGGCCCGACGGGAATAACGGGAGCCACTGGCAGAACCGGCTCAACAGGAGTAACTGGAATAACGGGAGCAACGGGAGCAACGGGTCCGACAGGAGTAACAGGAGCAACAGGGGATAGAGGAGCGTCGGGTCCAACAGGAACCACAGGCTCGACCGGAGTAACCGGCCCAACGGGAATAACGGGTCCAACCGGAGCAACCGGAGCAACAGGCCCAACAGGGGAAAAAGGTACGCCGGGAGCAACAGGAGCAACAGGAGCAACAGGAGCAACAGGAGCAACAGGAGCAACAGGTGTAACAGGAGTAACTGGAGCCACTGGCAGAAC >NZ_CP053688|1|1|881264-883499|CRT CGACCGGAATAACGGGCTCGAC AGGAATAACAGGTGCAACAGGAGCAACCGGATCAACTGGAACAACCGGCC CGACGGGAATAACGGGCTCGAC AGGAATAACAGGTGCAACAGGAGCAACCGGACCTACAGGAGCAACCGGCT CGACGGGAATAACGGGCTCGAC AGGAGTAACAGGTGCAACAGGAGAAACCGGACCTACAGGAGCAACAGGCTCGACGGGAATAACGGGCT CGACCGGAGTAACAGGCCCGAC AGGAATAACAGGTGCAACAGGAGAAACCGGATCAACTGGAACAACAGGCCCGACGGGAATAACAGGCT CGACAGGAATAACAGGCCCGAC CGGAATAACAGGTGCAACAGGAGAAACCGGCCCGACGGGAATAACGGGCT CGACAGGAATAACAGGTGCAAC AGGAGAAACCGGACCTACAGGAGCAACAGGCTCGACGGGAATTACGGGCTCGACAGGAGTAACAGGCC CGACCGGAATAACAGGTGCAAC AGGAGAAACCGGATCAACTGGAGCAACCGGCCCGACGGGAATAACGGGCTCGACGGGAATAACAGGTG CAACCGGAATAACGGGCTCAAC TGGAACAACCGGCCCGACAGGATTAACGGGCTCGACAGGGATTACAGGAGCAACCGGGATAACAGGAGCAACCGGAATAACAGGTG CAACAGGAGAAACAGGAGCAAC CGGAATAACAGGCTCGACAGGAGTAACGGGCCCGACCGGAATAACCGGTC CAACAGGAGAAACAGGAGCAAC CGGAATAACAGGCCCAACAGGAGTAACAGGCTCGACAGGGATAACAGGAGCAACCGGAATAACAGGTC CAACAGGAGCAACCGGAGCAAC TGGAACAACCGGCCCGACGGGAATAACAGGCTCGACAGGAGTAACGGGCCCGACGGGAATAACGGGCT CGACAGGAATAACAGGAGCAAC CGGATCAACTGGAGCAACCGGCCCGACGGGAATAACAGGCT CGACGGGAATAACAGGAGCAAC CGGAATAACGGGCTCAACTGGAACAACCGGCCCGACGGGAA TAACGGGCTCGACTGGAGCAAC GGGTTCGACGGGAATAACCGGCCCGACGGGAATAACGGGTT CGACGGGAATAACAGGAGCAAC GGGAATAACAGGAGCAACGGGAATAACAGGAGCAACAGGAGAAACCGGCCCGACGGGAATAACAGGCT CGACGGGAATAACAGGCTCGAC GGGAATAACAGGAGCAACCGGAATAACGGGCTCAACTGGAACAACCGGCC CGACGGGAATAACGGGCTCGAC TGGAGTAACGGGTTCGACGGGAATAACGGGCTCAACTGGAACAACCGGCC CGACGGGAATAACGGGCTCGAC TGGAGCAACGGGTTCGACGGGAATAACCGGCCCGACGGGAATAACGGGTC CGACGGGAATAACGGGCTCGAC CGGAGTAACGGGCTCAACTGGAGCAACGGGTTCTACGGGAATAACAGGCTCGACGGGAATAACGGGTT CTACGGGAATAACGGGCTCGAC AGGAATAACAGGTGCAACCGGAATAACAGGAGCAACAGGAGAAACCGGCTCAACTGGAACAACCGGCC CGACGGGAATAACGGGCTCGAC TGGAGCAACGGGTTCGACGGGAATAACAGGCCCGACGGGAATAACGGGTC CGACGGGAATAACGGGCTCGAC CGGAGTAACGGGCTCAACTGGAACAACCGGCCTGACCGGAATAACAGGCTCGACCGGAGTAACGGGCT CGACGGGAATAACGGGCTCGAC TGGAGCAACGGGTTCTACGGGAATAACCGGCCCGACGGGAGTAACGGGTC CGACGGGAATAACGGGCTCGAC CGGAGTAACCGGCCCAACGGGAATAACGGGAGCGACGGGGGTAACCGGCC CGACGGGAATAACGGGAGCCAC TGGCAGAACCGGCTCAACAGGAGTAACTGGAATAACGGGAGCAACGGGAGCAACGGGTC CGACAGGAGTAACAGGAGCAAC AGGGGATAGAGGAGCGTCGGGTCCAACAGGAACCACAGGCTCGACCGGAGTAACCGGCCCAACGGGAATAACGGGTC CAACCGGAGCAACCGGAGCAAC AGGCCCAACAGGGGAAAAAGGTACGCCGGGAGCAACAGGAG CAACAGGAGCAACAGGAGCAAC AGGAGCAACAGGAGCAACAGGTGTAACAGGAG TAACTGGAGCCACTGGCAGAAC
>NZ_CP053688.1|WP_172444416.1|879704_880040_+|DUF3992-domain-containing-protein MCNGLSCCSTKNIFQDKVCTTWQVNTPGIITIYTNNIAPIISATGYVKNDTGTDNIVVNFLRGGTVIDTLNVPPQSSVGFSEKLFDEIQVDTTGLTGSVEGEFCITVRYSM >NZ_CP053688.1|WP_172444415.1|879304_879679_+|DUF3992-domain-containing-protein MSSCNCSTTTLSCCPEKIFVQDQVCTPWQAVGDATAVTIPLFQNNINQNIIGTGFVKYEVGSATLPIQIVSLNTAGGTINTETVTLGSSLAFTIRRFDVIQAIIPIGADILFQGEFCITTRYSV >NZ_CP053688.1|WP_172444414.1|877275_878871_-|peptide-chain-release-factor-3 MANKELMNEVAKRRIFGIISHPDAGKTTLTEKLLLHGGAIREAGTVKAQKNSKYAKSDWMEIEKQRGISVTSSVMQFEYDEKMVSIMDTPGHNDFGEDTYRVLTSVDSAVMVIDAAKGIEAQTKKLFQVCRMRGIPIFTFMNKLDRQAKDPLELMEELEEVLGMPSVAVTWPIGSGMQFEGVYDRLENEVHLFRKDEVIKLGSEGVHGPELEARLEQSNLENLRDEVDLLEGAGNEFNLDLVQSGELTPVFFGTALVDFGVTPFLNHFLDMSPSPGPRKTVNGEVNPTDEVFSGFIFKIQANMNPAHRDRIAFLRICSGVFERGMNVMLSRTGKQIKLSQSTQLMANDRETIDRAYAGDVIGIYDSGTYQIGDTITSGKQKLFFEPLPTFPPELFLRVSPVNSLKSKHFHKGVEQLAQEGAIQVYKNEFNEVILGAVGQLQFEVFEYRLKNEYGSDIRKDHVDYNIARWVKTDDVKGLKKYQDMRNMLVYDRFERPLFLFANEFTFNRFKERHEELELVEALDVNNEIQVD >NZ_CP053688.1|WP_172444413.1|876650_877058_+|hypothetical-protein MKASDLKKRLTDQQAKAAYLLVLNDFEGGQQTQEEIAQEVGVSRRTLLEWRRKSDFIAYQSALSDQHLEAYRSKADKMLIELIEKGYTKALDLYYTLLGRKVTKSETTEVRQTTTYMSDDDIQAELEKLSKSIGG >NZ_CP053688.1|WP_172444412.1|876322_876637_+|hypothetical-protein MRVQPLDIGKLRDKYATDLTLLSESVGVFSGLTGTAMLDCFTKIERAIDADEYDAMDLVRELYVNIEFFLDRPALYDWLVEESLAVIDDEEEAKAHYETIKHLI >NZ_CP053688.1|WP_172444411.1|874181_876116_+|phage-tail-tape-measure-protein MSFNLVAQLGLRDNGFASGLRRAQRSMSGLKTGVGGVVASFGALAAGAGVAATAMSSVKKAMDFESQMSSIKALTNSSSAEMAQFQKLALDAGAATKYSALEAAQGIEELSKAGLSVATIKAGGLRSALDLATAGGLNLAEASEIMSTSLNSFSKDSMTAADAANILAGTANASATDVHDLKYSLSMVAAVASGVGLSLRDTSAALGVLANKGLKGSDAGTSLKSLLLQLQPTTKKTAKLFNVLGLETDKTGNAFYDAKGNIKSMAEIAGVLHDKFKDLTNGERTATFKEAFGTDAIRAATILYEAGSKGVKDFNKEMTKVTALSVAKEKMDNAAGAVEQFKGALETLQISVLLPLMPTIRKAATNAADFMSNLKPATIKEWGDNIKNAGEKLYNFAKFIYDNWKPIKEAFIALSVGIIAAKVAMIGFDIAAMANPLGLIVAAVFACAAAFIYLYRNWDTVKAKAIELWNKLGPFKGLLLGLIGPIGLLIGAGIALKNNWSNVWSTIQRGAATAVNSVIGKINALIRTINLIPGVNVPIIPKVSWGNTKAGSYVSGGIQSSSHITRKSHHAGLSNVPYDGYAANLHRGERVLTAVENNEYKKNGGKSGVVNLTVNYQATGHTEQDAKNLMYTMARLIEKEGAWA >NZ_CP053688.1|WP_172444410.1|873819_874185_+|hypothetical-protein MEELNAKFRARSQRLVELSIAANHIVNKGLSKTGRVSTNLIRGLEDFKLSLDAMRDDPRYKSIAQLNIEFVNEVVSFAKAINAGNTEIAEDHLRNSVDLHQKSDDLINALVDEMDEGSEVV >NZ_CP053688.1|WP_172444409.1|873488_873782_+|hypothetical-protein MNSHIFLNEMRIKLSDGSSFTEEDLKTLATAASKVGSIESRVIFASVKQRFNSQPKQDDKTKLFLDGLERLKENGAVSDEDYETQKKLILEEGIEGA >NZ_CP053688.1|WP_172444408.1|872937_873489_+|hypothetical-protein MKFNFIDQFIEEREKRQVKHEELIVQEGKALSDLEAAKREFELCMMNSIENGKDATEELDGLEKKIADANKSYERCKKATEVFSALATEKITASDVFVEFNEKFYPEYKEKIFQPAVNKIEQCKKDYFAAMDEYNSVLKDFESELNKSQRNLSSFYYYKLNRLENELNVQQAEKIFMQQWEVR >NZ_CP053688.1|WP_172444407.1|872522_872948_+|hypothetical-protein MRPYLKISKREVENLSIYCAIFFGSDGQPCDAICGPFENEETFLEGVETIVQYHGFYNYEVASDIIPFLHYYRGMPGITVHYKYEMSEFDDLVNQELPLLRELHEFPPIIPKRRPSKFNAWIYRLIKKKITNLEEMFEYEI >NZ_CP053688.1|WP_172444417.1|884101_884560_+|DUF3992-domain-containing-protein MKPKRPDIPNLPNLPSFSSPLSPPPPLPPVPPPVPPTPPSPIPMPSKCDPCIPIDLCGNIFIQEVLCQPVVLWELGSNLNALATISIFNSEGSTGPITIEINSNSTHIIAVLPGNTSSYTSKNIKSVKILPSSESPIYLEGKYCITGRILEK >NZ_CP053688.1|WP_172444418.1|884727_885099_+|GntR-family-transcriptional-regulator MKPTLDESQPIFQQIAVMIMDEIIDGRIKEGEQVPSTNELSRFFNINPATARKGLQALVDKEIIFKQRGVGMFVSEGAKEKLILERKLQFYEEYVAPLLKEANRIHLDEEMVIDLIKRKNVSN >NZ_CP053688.1|WP_172444419.1|885111_885990_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIEIKNLTYAYNNTPVLTGFNFSESEPRIIALWGRNGAGKTTLMSLLAGHYRPDQGSIKILGQEPYNNLNALENICYIQENHPFGHNWRIGDLLRFGKYFHPNWDQEFAEHLVELFELPPRKKIEKFSKGMKTAAQIILGLASNAKITILDEPTNGLDAVRRKQFYDALMESYEENPRIILLSTHHIEEIQPLCETMVVVDDGKSLFYEQMEVMREKGIILSGEMDVIKEVTKNVSILESSKISSTQKVMIDELFTAEWKKIAETNQLTIEKASLQDYLINKTLNKNKGVKK >NZ_CP053688.1|WP_172444420.1|885986_886688_+|hypothetical-protein MRSIQGTYQLVFDEFKWYFKLFSLITLFLTVVYLLISVIFKIPLQTGAALFGPTYGGICTFAVAALVIPFQVAIGLGSTRKQFLKSYNVMAVVMVITSITYLNILYFIMNALLVKGINSFRFFHPARLVSSEYHFFTYYWVDLMIGFIILGLPAFIAVLVRRLGILYFLMTLVILSIVITFISISGVSSTLFSWILTIKPINLFSLIGLLGIVLQFLTFPMMKNAPLKMKGRN >NZ_CP053688.1|WP_172444421.1|887008_887692_+|hypothetical-protein MNKIKLMYDITKTMKKKEQVKVNLDAEILKNGQKTAFFGGEFDKDLTKHSFHPFQHRGKRPFGPGFRNRGFFEQGGNGEFQNSEFCQENIKHDELKEHKFPSKFKMGFSRASMFFGLLSSIEVQETENGATLMLDSKDIPEDLKESFKEMRENRKKFMMGMQRANCSNKNPMSFLQDVEDPNFVVKANVNANKEIESLTVYAKGLKNHENTPQEVLELKYQSTFTWK >NZ_CP053688.1|WP_172444422.1|887962_889090_+|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MTWRQNSKKERLHFTSNHRGHKPHRNDIRKFVRFFRIFIPITICLNIIGLFTVFSWIGRPAQFGIVIIVLLIGFIGSRFQRNFEGKIVHPIEKLKKGMSEVAEGNLDIEVKVDTHNDVGHLISSFNQMVRKLKESEQLKQEYEENRKLLVTNISHDLKTPITSIQGYIEVLQDGTILSDKKKSQYLDVIWKNAQYMNKLIDDLFLFSKLDMQKLDFDIEEVEINPFMADLSEEYKFDFHERGLEYIFSDLTEHTKVVKVDRKRLHQSIQNIVSNSLKYGDNENLQLEMILSSFKNEIKITIRDNGQGITKANLERIFERFYRVEDARTKNLESTGLGLSISKELIEAMGGKIEVESELGIGTSFHIYLRVMNTTN >NZ_CP053688.1|WP_172444423.1|889102_889786_+|response-regulator-transcription-factor MNILIVEDDLNIAELEKDYLGLNGYDVTIETDGSLGSKEALTGNYDLLIVDLMLPNKNGFEIIKEVREKYEIPIIVVSAKNEDISKIRGLDYGADDYLTKPFSPAELLARVKSHLNRYKRLKGHSNVVSLISIRGLDIDATSHKVSIRGKEVSFTTKEYDLLLFLAQNANVVFTKEHLFDRIWGDDSLGDTATVAVHIQKIRKKIEKDPSNPEYIETLWGTGYRFNK >NZ_CP053688.1|WP_172444424.1|890337_894438_+|S8-family-serine-peptidase MKTLSGKIFQATSVLALASSTILGTTMVTKKPVYAVSSEAESILKSLTMEQRAALKQLNIAESKTGLRLSGDIDLSSDKDVSVIVEFKERPAKVAQLEKATEGESITLKKAKENVTKSHVRFKQQLQEKMGKKSKSSKDKYRIKYTYQNAFNGVSLTLPANQIKDLLKMDTVKAVYSDSTVQITPPTESAEAKDETKVDSLPFLKIDKLHEEGITGKNIKIGVIDTGIDYNHPDLKDAYKGGYDFVDNDNDPMETTYNQWKTSKKAEIVNGSTYYTEHGTHVSGTIAGRAKNNSEYKVTGVAPDSDLYVYRVLGPYGSGSNSAVIAGIDRSVKDGMNVINLSLGSTLNDPLEATSLAIDNAVLNGVTAVVAAGNAGDSLYTLGSPGAAALALTVGASSASTNVTTFASEFSVNGKGTNSILQLMTKKWTDNFTNMSGKTFDIVNVGEGGATDYTGKNVQGKIAFVARGTYALVDKMNYAKQNGAVGVIIYNNNASEGQIPYYLGESNDNIPVLSMTNIDGLATKDLFTNGTPSVTFGNIGEAIIPGDDLASFSSRGPSGTLYDIKPEVTAPGVDVLSTVPSYINNKTDVTDYSSAYMRMSGTSMATPHVSGITALLLQAHPDYTPADIKTVLMNTADPLRSKYSVFEVGAGRVDPYEAIYSPVELAVQDTTPFIRNNEKVMIDEQTGGLSYGFIPANKNDISKKTNILITNHSEKAQKYTVSVEYNVGARGSLDVDANGVSITVPKSIKIDPKSQEKIAVKLSIPASANKGTYEGYIHVVNDKDPNNHYQIPFGFRLVEEGFEYFRAHSPSISTNRATNPYSVKASDLDFKLNSPMKTMDFILQDAKTNKDLGIIGTANISGAGVDQDYYLQQAFAGRYFPFTGNSKKPFGPTSVLANDGLYKLKVIGTDADGKQFTKTDQIYIDNNRPTFTLDDTNAIPKGDLPFVQLTPGQKTVTLSGSIIDNEATVMENSGMNVTQATNNVWYGPNSPTIGIATDAFGKFSKEISVDSSNPVSVLQFVAADRAGNSTMAKVIYYMKPGAQYIYAKPNKASFNMGDQLTYTFYAHGLQNAKDLTLKFDYTSRYFNSVVINKNKALSEDTQFTATSSGTTSKSNTINIKAPGDGLNGDMPLFDMQVETNSNEYVNVNSIFFSVTSSTYKDNNGKTVNPYTQVGYLPSYSAYSTATAKLNAEALLNANGSFNFSIDYTTIGADVKAKDSKGILYNGEVQKNGNVVFNKLPISEQVYTVIVDVPGHFTTYTPMEIGRKDREINIGENISYPTVREYAGDINRDNVIDLMDALYLQTYWGTSKRSADLNFDKKVDAKDFALFEKNYLLQNQYVENAPKPVQKYKGKTLEDIKSELGLK >NZ_CP053688.1|WP_172444425.1|894752_895856_+|amidohydrolase/deacetylase-family-metallohydrolase MKDHFVLQNVKMINGSSVDIIVENRKIVDIVTAGTGNGQNLVDYNHKVYVSSGWIDMHVHAFAEFEPYGDDVDEIGYKTGVTTIIDAGSTGADNLTKLVNSCKSSKTNVFAFLNISRIGLERIDELSNLNWLDEELLIKTIAEHKDFIVGLKARISKSVVGSNGVEPLKIARKFSKETDLPLMVHIGSGPPNINDVLDLLENKDIITHYLNGKSNNLFDESGRPLPKLLDAIDRGVHLDVGHGNASFSFKTAMHAKEYGIKFNTISTDIYRKNRLNGPVYNMANVLTKFLYLGYSLEEIINAVTVNAAKWLKKPELGRISIGDLANLTLFTVEDEQTSLIDSEGDEKITEQKIVVKGVVINGEHIEC >NZ_CP053688.1|WP_172444426.1|895833_896940_+|DgaE-family-pyridoxal-phosphate-dependent-ammonia-lyase MENTLNAKYGLKRVINASGRMSILGVSAPTDTVMEAMKTGGQNYVEISDLVDKAGAHIAGLLKSEAAVVVNSASSGIALSVAAIVTEGNRRKSERLHQEPIQKNEIVMLKGHNVQYGAPVETMIFLGGGKLVEVGYANEGKAEHIADAINENTAAVLYVKSHHAVQKNMISVEEAWEVAKAKNVPLIVDAAAEEDLEKYVKVSDLAIYSGSKAIEGPTSGIVAGKQKYIDWLKVQLHCIGRSMKVGKETTFGLLQALDEYFVKTDNSENEKASLQVLKSLESIDGLKITIVQDEAGRAIFRARIQIDPVVTNTTAKEVNDQLRNGNIAIYTRDYGVRQGFFDIDPRPLQADDIYVIEARLRAILGGNE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP053688_2 | 1046822-1046896 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053688_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053688_2
>2.1|1046845|29|NZ_CP053688|CRISPRCasFinder GCGAAATCTAAAAAAGTGTTACTCATAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053688_2
The CRISPR arrays of NZ_CP053688_2 >merge|NZ_CP053688|2|1046822-1046896|CRISPRCasFinder GTGTTCATGAGTAATTAAAACAAGCGAAATCTAAAAAAGTGTTACTCATAAAGTGTTCATGAGTAAGTAAAACAA >NZ_CP053688|2|1|1046822-1046896|CRISPRCasFinder GTGTTCATGAGTAATTAAAACAA GCGAAATCTAAAAAAGTGTTACTCATAAA GTGTTCATGAGTAAGTAAAACAA
>NZ_CP053688.1|WP_172444553.1|1045486_1046707_+|sugar-efflux-transporter MVRRIKDLFAIKGYSLFVICLLFVGIGLSITTPYLSLYCTKYLGMSTGAFGIFMAVISLSGVLVNSIIAERSDRGLDRKWIILFAMISSAIGYASYLIFHNYFILLVFVGVFNGLGAASMPQIFASAQESANASQSKDKTLALSTLRSLVSLGFLIGPLIGTLILSAKGYDGLFLGTSSIYVMIAFLVFFFLEKRKQSENNVKKKNKTVVSRAKRKQLRLPFIAFILLFAVSSINWINTPLFIVNELHGTNRDVGFVVSLCAGLEIPIMLILGVLSKKISNHMLMIYGCFIGLAYYLILSVSTHTWELIIAQLLQATYIAIVMGNGISYFNDLLPNSPGFSASIYANCSTIGSLVGNLGGGMFAQLAGFRNVYFLCLFFVVCSLFILWRSKNNVEMEISTSQSQSV >NZ_CP053688.1|WP_172447606.1|1044530_1045346_+|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MSKENLSSIKKAQQQGHIIMILSGRSPSSIHDEMTKYELNCPIGGHNGSALYVDGKLIELNSLRRNQIQKLALEVEKEALPYNISTKKGIFAPRNWNERFEQVISSGRVPEEYFENKHFKMFTTPPTVYGHSLFNNVQEVINNDDFSILKFLILALDPKQKERLQKSLRLIDGTFLTSSSPFNLEFTHQHGNKGYRLKAMATYFKIPLENTIAIGDEKNDIPMFNIAGLSIAMENAEEEVKLSSDLVTLSNDENGVAYAFEKYIFKESNVL >NZ_CP053688.1|WP_172444552.1|1043354_1044251_-|AraC-family-transcriptional-regulator MSEINYSKQNELTELIERYTSHEGVNETVIDSLFFIRESNITEPKYRVYKPSLCIVVSGVKELLLANESYKYGPGNYLVASVDLPVTGQVIESTPNSPYLAFRLEFSPNQIVEILTETKISTNSKENAKRAIFVSQLEVSLLDAVIRLVRLLDSPEDIPILAPIFKKEILYRVLRGQHGGILQQIAIEGSTTNRISEVIEQIKMNFYKSLRIEELADIANMSVSSLHRHFKEVTAMSPLQFQKHLRLQEARLLLMSESSDAAEIAFRVGYESPSQFSREYSRLFGFPPKEDIKRLRAK >NZ_CP053688.1|WP_172444551.1|1042622_1043291_+|S8-family-serine-peptidase MKHVAPFNSRGPAWLTFDIKPEITAPGVNVYSTIPFYMDGGNGNYDYSYDRYSGISMASPHVAGVVALLKAAHPNLSQLDIKSILMNTAENDIPANVENVEVEVKVPGHLSTKLQINEINDLINSKYAGSFIKLPNTMLTPGDIHGDDVIDVLDAVEIKKYLGTENRSADINFDGTVNKQDMWSVYLYYLAINDAILNAPQPKETYNGETLQDNMNELGIKF >NZ_CP053688.1|WP_172444550.1|1041449_1042598_+|toxic-anion-resistance-protein MSFSMQVVNEEEIKAVIEEQVKPVPEELVKLKEAAEANVAMIMELNTVSKETFDQRKEILQKVEAFGLQTMKSSANKNSLLKVSLGQLAKSGDEGGQVAKGLADLQLQLKDLDPGAIDFAKTGFLGKLFNPIRSYFQRFEKADIAIADIVKSLDKGKKVLENDNTTLEHEQLSLRMLSKTLEKEIQLGTLMDESIENQIEKAKVEGEEQEKIKFITEEVLYPLRQRVMDLQQMLVVNHQGDMSYEVVIRNNRELIRGVERAKTVTISALNTAVTVASALYNQKIVLQKITALNRTTNTIIEGTSRLLKEQGVAIQKQAMESAVSVETLKTSFTNVISAFESISTFKQEALPKMRQTILEFQELAEVGSQQIQRLEKGDRLGL >NZ_CP053688.1|WP_172444549.1|1039742_1041431_+|VWA-domain-containing-protein MKKMKKSKFFFASIIVIVIVFLLVYIGVNLTSDKKVVKITDKNKSQQLEKMISNIDISKVKPIKGQIDLNTADVASELPDISKFPVSVENTTENYVEIFSSTEKSSDGKNGWLNEVASKFNNAKFNLNGHQVSVKIRNIASGTATDFIKSSKYVPDAFTPSNELWGQMITASGVKTETISSRLVGNVPGIVISKAKYDELMKKYGKVDTKTVIDAMTKNELSMGYTDPFTSSTGLNFLVTALNSFDSKDVLSETAVKGFESFQANVPFIASTTLQMSDAAESGVLDAFVLEYQSYVNLPDLKNRYEFIPFGVRHDSPLYALGDLPKDKIDILNKFAEFTGQSNLQELAKKDGFNGLNNYTSELKAIDGNTLTAAQKLWKGKKNTSNPIAAVFVADVSGSMDGKPLNELKESLLKGQKYLGRDNSIGLISYSADVTINLPIAKYDANQQSKFVGAVSSLDAGGDTATNDAILVAINMLKEEMKKNPNVRPLIFVLTDGETNHGHSLKNVKGIIKAYKIPIYTIGYNANIKALESISNINEAANINADSDDVIYKIRNLFNVQL >NZ_CP053688.1|WP_172444548.1|1038999_1039734_+|hypothetical-protein MTKGLKLVGLIAFISILNVIVFSPGLIGIQLTNSSAFQTAFGVSFIIANIFVLIFSMFHLYFKSAEVKPIRKLKTNEDYVEALSRFKNSKVLKDDIITSIEQIQRMKKKKGLFNSLLSNRFSPTEITYSKFAAVVDEVETLFYLTIRNILNKISTFDESEYRKIKGKDGFRYSKSLLQEKINLYNEYFEFIQRAVEMNEEILVNIDKLILEISRLDEIGIDEIENMECMKEIDSLIQQTKHYRQ >NZ_CP053688.1|WP_172444547.1|1038165_1038501_+|IDEAL-domain-containing-protein MNLNIDTILKTGDWVKGISMGGELVIGFIESFTIQDEIVKVNVITSDNEKTVGKTINMLNKNVKKLPDSKVTNKEQISFLIDLALSTGDEEWFEELSSQLKSMRQLVSGLK >NZ_CP053688.1|WP_172444546.1|1037623_1038037_+|Rrf2-family-transcriptional-regulator MNSDFTLAIHSLTYLALQPDRMSTSDAISESACVHAVRIRKVLSLLKKHGFIKSKEGTGGGFIFATDLNEVNLWDIYLITSEGALQPKCPESNEKCVVGANMQNVLFNIFLGAEEHLGGYLKQYTIKDIIDHIKYEK >NZ_CP053688.1|WP_172444545.1|1037119_1037518_+|transcriptional-regulator-Spx MVNLYLTPSCTSCRKAKAWLDEHNIEYSVKNIMNESLTLEEIKSILRMTETGTDEIISNKSKTFQELNINIESLPLNELYQLIINNPKMLRMPIIQDEKRLQIGYNEEEIRSFLPRKLRTVSFNKLQKVANS >NZ_CP053688.1|WP_088044491.1|1047106_1047307_+|cold-shock-protein MEHGKVKWFNAEKGFGFIERENGDDVFVHFSAIQSEGFKSLDEGQAVTFEVEQGQRGAQATNVKKA >NZ_CP053688.1|WP_098118288.1|1047543_1047756_-|hypothetical-protein MSKENLLKSLRLATRGNFFLINIKNSLENDTDLIKKLAKELEQDGLIKLKECTQQEDSLFLSGILKYASN >NZ_CP053688.1|WP_172444554.1|1047950_1048643_+|response-regulator-transcription-factor MNDSVNILVVEDDEDINRLLCDIIVKNGFIPKAAYSGTEALIHLEIQNWDLVLLDLMLPGLSGEELLNKITEETNIPVMIISAKLEMKTKIDILRSGADDYITKPFDIEEVSARIESCLRRYRRIAKIGVNNQIRHKDLLIDMDSKKVSVNEIELKLTAIEYEILCLLLSSPNKVFTKANLFESVWHEEFYGDDNTINVHMSNIRSKLTKANPTEEYIETIWGMGYRLKT >NZ_CP053688.1|WP_172444555.1|1048789_1049713_+|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MNEFILKTNQLSKKYQNKLALNKVNLSIKKGAIYGFIGQNGAGKSTLIRLITGLGYPTTGSFELFGENSERGLIEARKRVGTIIEGPALYPHLTAAENLEAHRLLKGIPGKECIKKTLKLVGLEDTGKKKVKNFSLGMKQRLGLAIALLGDPEFLILDEPINGLDPMGVVEIRELLKKLNKEYGITILISSHILSELHLLATHYGIIHEGVLLEELSLKELDEKCKHFLHIKVDNPNKAATVIERFFNTQNFEVLPDGSIKLFEYVDRAREVSKSLTSEGLIIEEFMPMGEDLEAYFTTRIGGVNRG >NZ_CP053688.1|WP_172444556.1|1049705_1050452_+|ABC-transporter-permease MDNLLKSELYKLKKDRSFRTLVLILILFSVLYPFTTKVSSAAKLTLDEYYIYNILSINNDIIKLLPCIFAGFFITSEYSTGTMKSIASSGNSRLRIYFSKLTMFSIGSIIILLILPVFMTTTAGVYFDFNGTTDWVYILKTFGLIAIYGAAFASVMTIVATVFTDNGKTIGFLLMFFALINSLLDFIASKLTFLKTIINNSVFILYPGIYKFNELDDSELFTLIIVPILTFIVLGVLGSLIFRKKEIK >NZ_CP053688.1|WP_172447607.1|1050473_1051373_+|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MNYVTIIVSLLLLFFLTRYFLLKKEIKRTHRQIHELNKHAMDKKIDLKYFDKDIENLAVEINKQVDLTRKSKAEKRLSENELKQAISYISHDIRTPMTSILGYIQFLESEEITTEMRKEYTNIIKNSAQRLKVLLEDFFELSIIDQIDYPMKLEKIKLNQLILEVLLGFYEEFNKRNLEPTIEIPNTEIMIMADSSAVKRVIENLIINAIKHSCGNINICLEKSKASTQLTISNSVNELGESDLQRMFDRFYKADQTRTGKGTGLGLPIAKSLMEKMNGNISAEYKENKLFMKCEWFKM >NZ_CP053688.1|WP_172444557.1|1051661_1052141_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MTLNLTQMNKQDFQRFLDLATVNFAKDKVKNGSWKEETALDQSKAAFQSLLPEGEKTETNYLKNIVLNEQVIGYIWYSINVKQEPNYAYLYEILIYPEHRGHGYGKEAMSVCIKEINELGIEDVLLHVFGHNQGALKLYQQLGFEITDYNLKVSSARFK >NZ_CP053688.1|WP_172444558.1|1052237_1053638_-|PLP-dependent-aminotransferase-family-protein MPVNSFENYPMSWKPDKQSLKRPYYHSIALLLEQDIINGFLAPGTKLPPQRELADYLDINFTTITRAYKICEVKGLIYAITGSGTFVAPNAARSITISTDKTANYIDLGFVASFEQTNSIVTEAIQKVVNKNYLDQLLNYNDPTGIPHQKAAALNWMEAFGIKATQENVAIVSGTQNALTLALASLFEPGNRIATDFYTFSNFIELAKMLHIQLIPIPGDQYGMMPDELEKQCSQLNIHGIFLMPSCSNPTTVMISDIRKHELASIIRKYRLILIEDDIHAFLTAGIIADYQQPMYNLVPEQSVYICGTSKSICSGLRVAYMVFGEALREKISHGIFNINVKTSSLDVEVITELILSGKAHEIVHQKKQLAETVNDLYSSYFPLNKSRHPLCFYRWLPIHGHSNGICFEANLNKLGIRVFHSDRFLSGHDSSEKYVRIALSSTHSLDELDTGLKVLSQYLDHQMES >NZ_CP053688.1|WP_172444559.1|1053861_1054575_+|azaleucine-resistance-protein-AzlC MKNENKIWIAFRAAFPHTIPIFAGFLFLGIAYGVFMNSLGFSAIYPILMGLTIFAGSMEFIAANLLLISFNPINALLLTLMVNARHLFYGISMLDKYKGTGKKKYYLIFGLCDESFSINYNVDIPENVDKSWFMFFVTFLNHLYWVIGASIGGIFGSLVKFNTKGLDFVMTALFIVIFIEQWMKETKHLSAIVGVGLSAICLLIFGGNNFIIPAMLTILVTLSVLRRKPSEKVEVSV >NZ_CP053688.1|WP_172444560.1|1054571_1054904_+|AzlD-domain-containing-protein MTMNLTQQIMTIAMVVLGTVLTRFLPFIIFPAGKPTPKYVQYLGKVLPPAVIGLLVVYCFKNVNILSGNHGVPEFIAVLVVVFLHVWKKMMLLSIAGGTIVYMILVQLVF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP053688_3 | 3607983-3608082 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053688_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053688_3
>3.1|3608006|54|NZ_CP053688|CRISPRCasFinder ATAACACCAGCGGTTTTTGTTCATGGCTGCGTCTGCGTAAAGCAGCGTTATTCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053688_3
The CRISPR arrays of NZ_CP053688_3 >merge|NZ_CP053688|3|3607983-3608082|CRISPRCasFinder TTCACGGCGACCTGATTTTGTGCATAACACCAGCGGTTTTTGTTCATGGCTGCGTCTGCGTAAAGCAGCGTTATTCGTTCATACCGACGTGCCTTTGTAC >NZ_CP053688|3|2|3607983-3608082|CRISPRCasFinder TTCACGGCGACCTGATTTTGTGC ATAACACCAGCGGTTTTTGTTCATGGCTGCGTCTGCGTAAAGCAGCGTTATTCG TTCATACCGACGTGCCTTTGTAC
>NZ_CP053688.1|WP_172446466.1|3607063_3607501_-|DUF1934-family-protein MKGQQGIPVSIEFETLIKDPHGRDKISFQANGLYYKKEDISYLLFEEKHEDRKVKATMKIGKGEVTIIRNGGVMMRHQYRVNETTEGTFSNELGVFQTKAYTKKLQFLVSEVPLKGVLQLGYKLFVGDENAGSYNITVSIKEATI >NZ_CP053688.1|WP_172446465.1|3605396_3607067_-|arginine--tRNA-ligase MNTLEQVKSRLKDEIEAAVLKAGLATEEQLPQVVLETPKDKTHGDFSTNMAMQLARVAKKAPRMIAEELINSFDQSKASIQKVEIAGPGFINFYMDNSYLTDLIPSIIKSGTEYGQTNFGNGEKILVEFVSANPTGDLHLGHARGAAFGDSLCNVLNKAGYAVTREYYINDAGNQINNLALSVEARYMQALGMEKEMPADGYHGADIIEIGKTLAGEFGDRYMNEPEEDRYKFFREYGLKLEMEKLQRDLRNFRVDFDVWYSETSLYENGKVLEALADLNERGETYEEEGATWFRSTTYGDDKNRVLIKSDGSYTYLTPDIAYHRDKLSRGADKLIDILGADHHGYIPRMKAAIQALGYNADTLEVEIIQMVQLYQDGEKVKMSKRTGKAVTLRDLMEEVGIDATRYFFAMRGCDSHLDFDMDLAVSKSNENPVYYSQYAHARVCSILRQGEEMGIVYSGEADYSLVSSEKEYELLKKLGEFPAAVSLAASKRTPHHITNYVFDLAGTFHSFYNAEKVLDAENVEKSKARLALMKAAQVTLQNALALVGVSAPEKM >NZ_CP053688.1|WP_172446464.1|3603916_3605128_-|hypothetical-protein MKKLLVHTTATALLLSQLGFSSSVFAAENESASKTDLNHKEEAPALVKGDFFYFVKTTVEKIQLLLTTDKVKEAELLAEFAQERIHEARELIKEGKEDLAKETIKEALGQMENAQGQLEGKLPTITEPTTTEKTTAEDNATTKPAEASTEVEKQGTEKEDTEKHEKQKLTKEQKEIAKIQHHLNNNLLVLADVLDKVKNPKAKAAIAKNIEKSFNKISERLEKVLKHEEKNSTALKPVITIQYPDGSTENSDTPEVITTITKIEDVNDTDVKNVNEDVKDTDVKNVNEDDQGENDDKDDAAEVSTKPVKVEHKEEHHQHISKKVKVAKVKKVKVEKEEKAERHEVKKHEAKKHEVKKHEVTNHRNRGEHENRGNHKGNEKHEWKKNENSNDQGENHGNGHDED >NZ_CP053688.1|WP_172447737.1|3603011_3603728_-|RNA-polymerase-sigma-I-factor MFQTLYKRKEKIEDIVLTIQQSSSKELDDFIIQYSPFISKTVSTICGRYITNQEDEYSIGLSAFHEAIKLYSYKKGASFLTFAKLIIKRELIDYFRKESKYQLLTLEQNGSENIHKQYDDHVYSSYIKNFDEINRKEEIIHFSEMLKQFGITLETLVEVSPKHEDTREHIFSVVDIIASDEEMLAFLYKKKKLPMNKLETKVNISRKTLDKHRKYIIAMCIISVNDYIYLQNYLKRGN >NZ_CP053688.1|WP_172446463.1|3601917_3603009_-|anti-sigma-factor-domain-containing-protein MNNGIVLEVNHSSVVVLTANGEYLKCKKLLSSYSIGEEIQFPSSAIISNNKIKINIPKLIPVVIASALILMSFLFVNWNNKKALAAGRVTIDSGAKVSLILDKQLNVIGLKGHNEQGKKVIDKIDNWKQEPLQSVMDDLVGEMEKSKVIQPDDQIKLTGEMKKEFKNKQSELNNELKDIQETNNHIKIPNSKDLDQPKIQPKIKTQLQTQNKQVSSFNSHSAKVTRGEKNGKDKPSVKSPKVENNRANNHRYSKEDRNNRQQKAHWGNKQSQWNNRHQEEHRDSSKQNQNKQNNKYEKHQDKKKNQYNYEREVKRNNNYQSRKGQNDRCHRCSNRDKGNENKNNEYDHRHNNSWNNNNEKGSD >NZ_CP053688.1|WP_172446462.1|3601493_3601862_+|nuclear-transport-factor-2-family-protein MNYQDALQQYIIATNTHDFDQVKKYIHKDATYWFSNKSCTNLLDIQQYFENAWNLIQDEVYRATNVNWLTTDENSASCTYQYHYEGYMNGKFVKGHGRATNVFMKDAVGDWKVIHEHLSSHA >NZ_CP053688.1|WP_172446461.1|3600396_3601353_+|UV-DNA-damage-repair-endonuclease-UvsE MIIRFGYVSHALSLYNCSPAKTLTLTRYKTLDQDERLEKLISVTTQNLENTYRALHYNVGQQIPLYRMSSSMVPLATHPDVEFDYINIFHKQFKEIGDFIKKHELRVSFHPNQFTLFTSEKPHITDNAVIDMEYHFKVLEAMGVSNQSVINIHIGGAYGNKDLAINRFYENIKKLPSHIKKQMTLENDDKTYNTSETLMVCKNEGIPLVFDYHHHMANLCEEPLEELLPLIFSTWDHTNLKPKIHISSPKSEKEFRSHSDLIDLDFIKPFFDIARSIGSDIDIMIESKKKDIALLQLMEDLSKLRGYKRISGGMIEVK >NZ_CP053688.1|WP_172446460.1|3599160_3600354_+|cardiolipin-synthase MILCICLFALLILILLASLDLYFGYKAFHKYDKACPFKNRYSETMLITDGNVLYENLLKDINEASSSISMLFYIVRNDDTSEKFLSLLEKKAHEGLQVRLLVDWIGSFGLKRKRIEKLKKNGVKVLFNRRTGFPYTLYRFQHRNHRKITVIDQKTGYFGGFNIGKEYIGFDEDLGYWRDYHIRMTGEGVKDLHVQFLIDWVRSGGKSFTLTDEKDLVKGKIEHHFYSSDFIRIENLYKKLIDKAEKHIFIGTPYFIPTKKLMDALLAAQKRGVRICVMVPEKEDHRLVKEASFPHLLLILEGGGEVFHYQKGFFHAKVLLIDDRCCDVGSVNFDRRSLCINDEWSCIFASESFILEIKKIFMKDLERSKSYPIQHYKKTTLSWKCRKLLSKLLSPLM >NZ_CP053688.1|WP_172446459.1|3596839_3598948_-|4Fe-4S-dicluster-domain-containing-protein MDHALLYLNALGFVAITVYAIYLFIYLIKTRLAYIKLGKKEEFERNFKDRFQKIWVNVFGQKKLLKDKKSGFIHLLFFYGFILVQAGALDFILRGLVPGVHLPLGPLYGAFTFFEEIVALLILVAVVWAFHRRYIEKLVRLKRGWKSGLVLIFIGLLMLSTLFGNGMGIIWSGEGTSFHEPIASLVATIFGGISKPLAISFFYVAWWTHLISLLTFLVYVPQSKHAHLLAGPANVYFNRLSKAGKLEKIDFEDETQETFGVGKISDFRQSQLIDLYACVECGRCTNVCPATATGKMLSPMDLILKLRDHLTETGAVVTSRAPWVPTVAFSKTKGNQLAFSSQGNQETAATLEYSPSLIGDVITEEEIWACTTCRNCEDQCPVMNEHVEKIIDLRRYLVLTEGKMQPDAQRAMTNIERQGNPWGLNRKDRENWRELDESIHIPTVKEAKKAGEEIEYLFWVGSMGAYDNRSQKIALAFAKLMNEAGIKFAILGNKEKNSGDTPRRLGQEFLFQELASNNIAEIEKAEVSKLVTIDPHAYNTFKNEYPDFGLSVEVYHHTELLSQWVKEGRLKPVHRVDEVITYHDSCYLGRYNEVYEAPRDILRAIPGVKLVEMERKRETGMCCGAGGGLMWMEEHVGNRINVTRTEQALAVSPNVIGTGCPYCLTMLSDGTKAKEVEESVKTLDIAELLVISIFGDKQSQAS >NZ_CP053688.1|WP_172446458.1|3595506_3596688_-|acetyl-CoA-C-acetyltransferase MSKTVIVSAVRTPFGRFGGMLKGFSAAELGGIAIKETLNRVNHPLESIDDVIMGSVLQGGQGQLPSRQALRNAGLPWETRSETINKVCASGMRSVMLADLLIRSGESKRIVAGGMESMSNAPYYQTNLRWGNKMGHSELKDGLLVDGLTCSFTGVHMGTYGSEVAKLEDISREQQDEWALRSQQLAVESIKTGRFEEEIVTIESVGKKGVVTKIEVDECPREDTTIEKLAKLNPAFDRDGTITAGNAPGLNDGAAALLIMSEEEAKQNGFTPLATIVATDSMAVEAKDFPRTPGYVIQKLLQKTNKNISDIDLFEINEAFAAVALASAKIADIPLEKINVNGGAIALGHPIGASGARIIVTLIHALKQRGGGLGIAAICSGGGQGDAILVEVH >NZ_CP053688.1|WP_172446467.1|3608208_3608463_+|hypothetical-protein MKTIAQQSSSKLFFIGLGIGILALSSIFLIYLYAFLVPFVVGIVLWFFIKRKAIMFGSFTAALIGLLALIGFIVYMMLFGHFGP >NZ_CP053688.1|WP_172446468.1|3608570_3609797_-|MFS-transporter MSNLANSKSQKTNLNQKPSLLNQPKAIWAVGFACIIAFMGIGLVDPILPAIAEKMHASKSDVTLLFTSYNLVMAIAMLITGFISSRIGIKWTLLLGILIIAVFAGLGGNSSGIWQLVWLRGGWGLGNALFVATALSAIVSLSRSGVAQSIILYETAIGLGISVGPLLGGELGSISWRGPFFGVACLMVIAFLSLSVMMPKTPITQNTKRASFLDPFRALKHRSLLTLGITAFLYNFGFFTLLAFSPFYMGLKEHGLGFVFLGWGLLLAITSVFMAPKLQKKFGTLKSMYAMLTLFAITLIIMGVGTDTNSVIIVCVIIAGAFLGNNNTLITTAVMQAAPVERSTASAAYSFLRFLGGAIAPYLAGKLAEWYNPHVPFYVGGCFVLVSVLFLFINKKHLLHIDKAESAH >NZ_CP053688.1|WP_172446469.1|3609824_3610244_-|MerR-family-transcriptional-regulator MLYKIDEVAKECNLTKRSIRYYEEIGLIPPPERSEGGFRLYSDEHIERLKKIMNVRDVLGFSLQEVQDYMAISEAFEEFRLQYRENKEKMNEDERKQKLLEAEEILSQQLNMIDEKLKKMNDIRSEMNEMYQRVRSALE >NZ_CP053688.1|WP_172446470.1|3610514_3611630_-|PepSY-domain-containing-protein MKKGVRKFILTLHLVCSLVFGLFIIAVCATGSVLVFGDQIEHVLNPQYFKPASSERNVGINEAEKIFLDHYRGFEISRMDVPSKLSNVYHANMSKGHNEIDAYVDPSNGKLLGNFDREASFVSFVKDLHTHLLLDDIGETIVGIVAIAFIIILITGIYLWYPGIKRMFKSLKIKWNKSQMARNLSLHNFIGVITLPFLLVVAITGMLYPFQEKIEESLKLKFTSNYPEELKSVDNGKNKIGLDAMTAEIKKLHPEGELYKLRLPSDKEGVIEAQLSDGTYDPEGKGNTSEFFDQFTGKHLGSFSKNNETAYDKFFVWRQSLHRGTYGGVFVKTIYALVGIAPLGLGITGITMWALKRRNKAKKMKKLQKAA >NZ_CP053688.1|WP_098118979.1|3611812_3612685_-|agmatinase MRFDEAYSGNVFIKSHPSFEESKAVIYGMPMDWTVSFRPGSRFGPTRIREVSIGLEEYSPYQDKELEEVKYFDAGDIPLPFGNAQRSLDMIEDYIDGLLAEGKFPLGMGGEHLVSWPVMKAMYKKYPDLAIIHFDAHTDLRDSYEGEPLSHSTPIKKVCDLIGPKNVYSFGIRSGMKEEFEWAKEVGMNLFKFEVLEPLKKVLPTLAGRPVYVTIDIDVLDPAHAPGTGTLEAGGITSKEMIDSILAIANSDINVVGADLVEVAPVYDHAEQTQVAASKFIREILLGWVK >NZ_CP053688.1|WP_025671010.1|3612698_3613526_-|spermidine-synthase MELWFTEKQTKNFGITAKINKTLHTEQTEFQKLDMVETEEFGNMLILDGMVMTTQKDEFVYHEMVAHVPLFTHPNPENVLVVGGGDGGVIREVLKHPSVKKATLVEIDGKVIEYSKIYLPEIAGKLEDPRVEVKVDDGFMHIANSENVYDVIMVDSTEPVGPAVNLFTKGFYAGISKALKEDGIFVAQTDNPWFTPELITQVQRDVREIFPITRLYIANIPTYPSGMWTFTIGSKKHDPLEVEENRFFDIETKYYTKELHKAAFVLPKFVADLTK >NZ_CP053688.1|WP_172446471.1|3613817_3615836_+|transglycosylase-domain-containing-protein 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MGSFFQYPLKDIPLILLVVAISLSVHEFAHAYVAYKFGDDTAKKQGRLTLSPFKHLDIFGTIAIIILGFGWARPVPVNRHNFKKPRIAGILTTAAGPISNFILATLGLIVYALLLKHGFFHSFPEALTITLNSFFSIFIQMNIVLFVFNLIPLPPLDGYRIIEDLAPNDIRAKMSQYEQYGAFVFLVLVLTPLDNYTIQPIFEVAIPSVFHWINSIVTTLIM >NZ_CP053688.1|WP_098118983.1|3617479_3617665_+|4-oxalocrotonate-tautomerase MPYVTVKMLEGRSEEQKKALVEKVTAAVSETTGAPTEKIVVFIEEMTKNHYAVAGKRLSDE |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
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NZ_CP053688_1 | 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT | 883446-883477 | 32 | NZ_CP053688.1 | 4886982-4887013 | 2 | 0.938 |
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NZ_CP053688_1 | 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT | 883446-883477 | 32 | NZ_CP053688.1 | 4887009-4887040 | 2 | 0.938 |
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9. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to position: 4887018-4887049, mismatch: 2, identity: 0.938
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10. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to position: 4887027-4887058, mismatch: 2, identity: 0.938
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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NZ_CP053688_1 | 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT | 883446-883477 | 32 | NZ_CP009336 | Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence | 68776-68807 | 2 | 0.938 |
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NZ_CP053688_1 | 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT | 883446-883477 | 32 | NZ_CP009336 | Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence | 130578-130609 | 3 | 0.906 |
NZ_CP053688_1 | 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT | 883446-883477 | 32 | NZ_CP012101 | Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-2, complete sequence | 131075-131106 | 3 | 0.906 |
NZ_CP053688_1 | 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT | 883446-883477 | 32 | NZ_CP009336 | Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence | 68866-68897 | 4 | 0.875 |
NZ_CP053688_1 | 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT | 883446-883477 | 32 | MN693798 | Marine virus AFVG_250M119, complete genome | 11463-11494 | 4 | 0.875 |
NZ_CP053688_1 | 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT | 883446-883477 | 32 | NZ_CP009336 | Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence | 68929-68960 | 5 | 0.844 |
NZ_CP053688_1 | 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT | 883446-883477 | 32 | AP014420 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C24-MedDCM-OCT-S43-C167, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***, 5 ordered pieces | 10322-10353 | 5 | 0.844 |
NZ_CP053688_1 | 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT | 883446-883477 | 32 | NZ_CP009336 | Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence | 73996-74027 | 7 | 0.781 |
NZ_CP053688_1 | 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT | 883446-883477 | 32 | CP037991 | Bacillus mycoides strain TH26 plasmid unnamed1, complete sequence | 472792-472823 | 7 | 0.781 |
NZ_CP053688_1 | 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT | 883446-883477 | 32 | NC_010180 | Bacillus mycoides KBAB4 plasmid pBWB401, complete sequence | 116706-116737 | 7 | 0.781 |
NZ_CP053688_1 | 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT | 883446-883477 | 32 | MN694697 | Marine virus AFVG_250M792, complete genome | 19470-19501 | 7 | 0.781 |
NZ_CP053688_1 | 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT | 883446-883477 | 32 | MN693590 | Marine virus AFVG_25M199, complete genome | 14301-14332 | 7 | 0.781 |
NZ_CP053688_1 | 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT | 883446-883477 | 32 | KP793114 | Lactococcus phage 936 group phage Phi17, complete genome | 8744-8775 | 7 | 0.781 |
NZ_CP053688_1 | 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT | 883446-883477 | 32 | KP793132 | Lactococcus phage 936 group phage PhiM1127, complete genome | 9472-9503 | 7 | 0.781 |
NZ_CP053688_1 | 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT | 883446-883477 | 32 | KP793135 | Lactococcus phage 936 group phage Phi.16, complete genome | 9193-9224 | 7 | 0.781 |
NZ_CP053688_1 | 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT | 883446-883477 | 32 | MN693816 | Marine virus AFVG_250M124, complete genome | 30608-30639 | 7 | 0.781 |
NZ_CP053688_1 | 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT | 883446-883477 | 32 | KP793127 | Lactococcus phage 936 group phage Phi40, complete genome | 9293-9324 | 7 | 0.781 |
NZ_CP053688_1 | 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT | 883446-883477 | 32 | NC_049447 | Lactococcus phage MV10L, complete genome | 8709-8740 | 7 | 0.781 |
NZ_CP053688_1 | 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT | 883446-883477 | 32 | KP793120 | Lactococcus phage 936 group phage PhiL.18, complete genome | 8719-8750 | 7 | 0.781 |
NZ_CP053688_1 | 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT | 883446-883477 | 32 | KF437907 | Phormidium phage MIS-PhV1A, complete genome | 8767-8798 | 8 | 0.75 |
NZ_CP053688_1 | 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT | 883446-883477 | 32 | NZ_CP034838 | Rahnella aquatilis strain KM12 plasmid pKM12v1, complete sequence | 87196-87227 | 8 | 0.75 |
NZ_CP053688_1 | 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT | 883446-883477 | 32 | NZ_CP034839 | Rahnella aquatilis strain KM25 plasmid pKM12v2, complete sequence | 87196-87227 | 8 | 0.75 |
NZ_CP053688_2 | 2.1|1046845|29|NZ_CP053688|CRISPRCasFinder | 1046845-1046873 | 29 | NZ_CP009336 | Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence | 260054-260082 | 8 | 0.724 |
NZ_CP053688_1 | 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT | 883446-883477 | 32 | NZ_CP023451 | Rhizorhabdus dicambivorans strain Ndbn-20 plasmid p2, complete sequence | 26577-26608 | 9 | 0.719 |
NZ_CP053688_1 | 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT | 883446-883477 | 32 | NZ_CP015989 | Sphingobium sp. EP60837 plasmid pEP2, complete sequence | 129977-130008 | 9 | 0.719 |
NZ_CP053688_1 | 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT | 883446-883477 | 32 | KX856662 | Klebsiella phage KP-Rio/2015, complete genome | 15781-15812 | 9 | 0.719 |
NZ_CP053688_1 | 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT | 883446-883477 | 32 | NZ_CP009336 | Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence | 90207-90238 | 10 | 0.688 |
NZ_CP053688_1 | 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT | 883446-883477 | 32 | MH649200 | Myoviridae sp. isolate ctce54, complete genome | 3493-3524 | 10 | 0.688 |
1. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NC_007103 (Bacillus cereus E33L plasmid pE33L466, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
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2. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009967 (Bacillus cereus E33L plasmid pBCO_1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
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3. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
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4. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
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5. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
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6. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
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7. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
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8. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
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9. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
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10. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
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11. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
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12. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
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13. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
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14. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
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15. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
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16. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
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17. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
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18. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
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19. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
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20. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
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21. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
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22. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
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23. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
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24. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
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25. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
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26. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
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27. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
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28. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
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29. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
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30. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
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31. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NC_007103 (Bacillus cereus E33L plasmid pE33L466, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.906
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32. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NC_007103 (Bacillus cereus E33L plasmid pE33L466, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.906
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34. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NC_007103 (Bacillus cereus E33L plasmid pE33L466, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.906
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35. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NC_007103 (Bacillus cereus E33L plasmid pE33L466, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.906
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36. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NC_007103 (Bacillus cereus E33L plasmid pE33L466, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.906
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37. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009967 (Bacillus cereus E33L plasmid pBCO_1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.906
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38. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009967 (Bacillus cereus E33L plasmid pBCO_1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.906
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39. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009967 (Bacillus cereus E33L plasmid pBCO_1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.906
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40. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.906
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41. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP012101 (Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.906
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42. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
aggagcaacaggagcaacaggtgtaacaggag CRISPR spacer aggagcaacaggagcaacaggagcaacagggc Protospacer ********************* *.******.
43. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to MN693798 (Marine virus AFVG_250M119, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
aggagcaacaggagcaacaggtgtaacaggag CRISPR spacer cgtagcaacaggagcaacaggagcaacaggag Protospacer * ****************** *.********
44. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
aggagcaacaggagcaacaggtgtaacaggag CRISPR spacer gggagcaacaggagcaacaggagcaacagggc Protospacer .******************** *.******.
45. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to AP014420 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C24-MedDCM-OCT-S43-C167, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***, 5 ordered pieces) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
aggagcaacaggagcaacaggtgtaacaggag CRISPR spacer gggagcaacaggagcaacaggtggatcagacg Protospacer .********************** * ***. *
46. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
aggagcaacaggagcaacaggtgtaacaggag CRISPR spacer aggagaaacaggagcgacaggtgtacaggtaa Protospacer ***** *********.********* .* *.
47. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to CP037991 (Bacillus mycoides strain TH26 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
aggagcaacaggagcaacaggtgtaacaggag CRISPR spacer aggtctaacaggagcaacgggagtaacaggtc Protospacer *** .************.** ********
48. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NC_010180 (Bacillus mycoides KBAB4 plasmid pBWB401, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
aggagcaacaggagcaacaggtgtaacaggag CRISPR spacer cggtccaacgggagcaacaggtataacaggcc Protospacer ** ****.************.*******
49. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to MN694697 (Marine virus AFVG_250M792, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
aggagcaacaggagcaacaggtgtaacaggag CRISPR spacer aggagcaacaggagctacaggtgatgtagatg Protospacer *************** ******* ..**. *
50. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to MN693590 (Marine virus AFVG_25M199, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
aggagcaacaggagcaacaggtgtaacaggag CRISPR spacer aggcgcaacaggcgcaacaggtgcggctggat Protospacer *** ******** **********...* ***
51. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to KP793114 (Lactococcus phage 936 group phage Phi17, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
aggagcaacaggagcaacaggtgtaacaggag CRISPR spacer agaaataacaggagctacaagtgtaacagcac Protospacer **.*..********* ***.********* *
52. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to KP793132 (Lactococcus phage 936 group phage PhiM1127, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
aggagcaacaggagcaacaggtgtaacaggag CRISPR spacer agaaataacaggagctacaagtgtaacagcac Protospacer **.*..********* ***.********* *
53. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to KP793135 (Lactococcus phage 936 group phage Phi.16, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
aggagcaacaggagcaacaggtgtaacaggag CRISPR spacer agaaataacaggagctacaagtgtaacagcac Protospacer **.*..********* ***.********* *
54. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to MN693816 (Marine virus AFVG_250M124, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
aggagcaacaggagcaacaggtgtaacaggag CRISPR spacer aggagcgacaggagcaactggtgctgctggaa Protospacer ******.*********** ****. .* ***.
55. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to KP793127 (Lactococcus phage 936 group phage Phi40, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
aggagcaacaggagcaacaggtgtaacaggag CRISPR spacer agaaataacaggagctacaagtgtaacagcac Protospacer **.*..********* ***.********* *
56. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NC_049447 (Lactococcus phage MV10L, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
aggagcaacaggagcaacaggtgtaacaggag CRISPR spacer agaaataacaggagctacaagtgtaacagcac Protospacer **.*..********* ***.********* *
57. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to KP793120 (Lactococcus phage 936 group phage PhiL.18, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
aggagcaacaggagcaacaggtgtaacaggag CRISPR spacer agaaataacaggagctacaagtgtaacagcac Protospacer **.*..********* ***.********* *
58. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to KF437907 (Phormidium phage MIS-PhV1A, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aggagcaacaggagcaacaggtgtaacaggag CRISPR spacer aggagcaacaggagctacgggtgctgttggtg Protospacer *************** **.****. .. ** *
59. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP034838 (Rahnella aquatilis strain KM12 plasmid pKM12v1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aggagcaacaggagcaacaggtgtaacaggag CRISPR spacer aggaacaacaggcgcaacaggtggattctgcg Protospacer ****.******* ********** * . * *
60. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP034839 (Rahnella aquatilis strain KM25 plasmid pKM12v2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aggagcaacaggagcaacaggtgtaacaggag CRISPR spacer aggaacaacaggcgcaacaggtggattctgcg Protospacer ****.******* ********** * . * *
61. spacer 2.1|1046845|29|NZ_CP053688|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
gcgaaatctaaaaaagtgttactcataaa CRISPR spacer aaagaggataaaaaagtattactcataaa Protospacer . ..*. *********.***********
62. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP023451 (Rhizorhabdus dicambivorans strain Ndbn-20 plasmid p2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aggagcaacaggagcaacaggtgtaacaggag CRISPR spacer ccgagcaacaggagcaagaggagtatcccgca Protospacer *************** *** *** * * .
63. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP015989 (Sphingobium sp. EP60837 plasmid pEP2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aggagcaacaggagcaacaggtgtaacaggag CRISPR spacer ccgagcaacaggagcaagaggagtatcccgca Protospacer *************** *** *** * * .
64. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to KX856662 (Klebsiella phage KP-Rio/2015, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aggagcaacaggagcaacaggtgtaacaggag CRISPR spacer aggagcagcaggagcagcaggtgcctgcatag Protospacer *******.********.******. . **
65. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
---------aggagcaacaggagcaacaggtgtaacaggag CRISPR spacer acctgctggaggagcaacaggagcaacaggag--------- Protospacer ********************* *
66. spacer 1.28|883446|32|NZ_CP053688|CRT matches to MH649200 (Myoviridae sp. isolate ctce54, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aggagcaacaggagcaacaggtgtaacaggag CRISPR spacer attttcaacagaagcaacaggtgttacataca Protospacer * ******.************ *** . .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
568900 : 620091
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP053688|568900:620091|DBSCAN-SWA TATGGAACTATTCGAAAAAGCAAAGCCAATATTAGAGATACTAATAAAAAATGGTTTTGAAGCTTATTTTGTCGGAGGTTGTGTAAGAGATAAAATAATTCAAAGAGATGTAGGGGATATTGATATCGCTACTTCTGCCTTACCAGAAGAAGTTATGTCCATATTTCCAAAAACTGTTCCGACAGGGCTACAGCATGGTACGGTTTTAGTGATTCATAATGGTGAACAATATGAGATTACAACATTCAGAACTGAATCTACTTATCATGATAATCGAAGACCTTCTGAAGTGACATTTGTAAAATCAATTGAAGAAGATTTAAAACGAAGAGATTTTACAATGAATGCAATCGCGATGACACCGAATAACGACATAATCGACCCTTTTAATGGTGCAAATGATATAAACGATGGCTTAATACGTTGTGTCGGGGATGCTAAAGAAAGATTCCAAGAAGATGCTCTTCGAATGTTAAGAGGCATACGTTTTGTAAGTCAATTAGATTTTCGTTTAAATGATGAAACGTATAATGCTATTCATTCAAATAAAGAATTAATTGAAAATATTGCAATTGAAAGAATTTCAGTTGAAATAGAAAAAATGTTGCTAGGAAAGTCACCTAAAAAAGCAATCGACCTTTTAATAAAAACAAAGTTATTAAATCATCTTCCAAGTTTTCAATATTGCACTACTCAATTTTTAGAACTATTAGAACTTCCAATCCAATCTTTAAAAGATGTCGAAGAATTTTGGGCTTTAATTTTATATAAATGCAATTTTGAAAATCCGGAAAAAATTTTACGAAGTTGGAAGATGTCTAATGGTCGAATTAAACAAATATTAAACATTTATGATCTGCTAATTGAAACTAAAATTGAATGGAGCAATACTAAGTTATATCAAGTTGGATTAACGGATGCAATAAAATATGAGCGTTTACAATTAGTTCTAGACCACTTGAATGCAAATGAACTAGATGAAAAAATTTTAAAGAGTCTATATAATAAATTACCGATTTATTCAAAGTCCGATTTGAGCTTTACAGGTAATGATTTATTAGAATGGTCACAAATAAAAGGCGGACCGTGGTTGAAAGAAGTAATAAGCGAAATAGAATATCTTATTGTTGAGAATCAACTTGAGAATAACCAACTTGCTGTTAAGGAGTGGTTTGGAAATTGGCTTCAAAAGTAAAAGAAAGAATTTTACAGTTATTCACAGAAAATAGTAATGAATATTTATCAGGACAGTTTTTGAGTGATGAATTAGGAATTTCACGTACTGCAATATGGAAATACATGAAAGAGTTACAAGAAGAGGGAATAGAAGTTGAAGCGGTAAGGAAGGTCGGTTATAAGATAACAGGAAAATCAGATCGATTGACTTCAACTGATATTCAACTTGGTTTAGAAACGAAAAAGTTTGGACGAAACGTAGTCTATCATGAAGAAACAAATTCTACTCAAACGATCGCAAACGAATTGGTTTTAAATGATGCACCAGAAGGTACGATTGTTTTAGCTGAACGTCAATTATTAGGTCGTGGAAGATTGCAGCGAAACTGGTTAACTTCAGATGGAAAAGCAATTGCTATGAGTGTTATTTTAAGGCCAGCTATTTCACCAAGGGTAGCCCCTCAATTAACATTATTAACTGCTGTCGTTATTGCCTCAGCAATTGAAAAAGTGACAGGGTTACATCCTAATATAAAATGGCCAAATGATATTCTAATTAATAATAAAAAGGTTTGTGGGATCTTAACCGAAATGCAAGGGGATGCTGATTGCATTAAAAGTGTCGTGATCGGTATAGGAATCAATGTCAATCAAGTTGAAGAAGATTACCCTTTAGAACTAGCGGATATCGCAACATCCTTACGCATTGAAAAAGGACAAACCTTTATGCGAGCATATTTAATTCAAGTTATTTTATCTGAATTTGAGAAGTTCTATGAAATATTTTTGGAAAAAGGATTTAAACCGATTAAACTTTTATGGGAAAGTTATGCGATTTCATTAGGGAAACAAATCAAAGCAACTACTTTAAATGAGGAAATCGTCGGTAAAGCCATTGGTATCACGGATGAAGGGCAATTACTAATTGAAGATCATTTAGGAAATGTTCATACAATTTATTCAGCAGATATATCAATTAATAAATAATTGATAAAATTAAACAATGTTTAAACAACTCTCTTTCTCACCTAGGAAGAGAGTTATTTGTATACAAAAATTTGTCCCAATTTTATTTGTAAATAATACCAAGTTTTTTCTTTACTAAATTGGTATTATTACTATAAACTGTATGGGGAGGGTCATGTTTTTTTCTTTTGACTCTTCATGGGTGGTATCTGAATAGGGTCAAACAATCTTTAGTATCCTAAGAAGAACTACACCAAGTTTTAAAAAATCTAATTTAAAAATGTGTTCTGCCTTGATCCTATAAGGACTGGGACAGAGGAATGAGCTGGTTTACAATTTTCCTTTGTTCTCTTTTTGAGCAAAGGTTTTTTATTGTAGCCCCATTTCCTCTTCATTTAAAAGGAGGAAAAAAGATGAAAACAACAAAAGATTTTTTGAAAATGAAAGAGAATAATGAACCAATCGTGATGATTACAGCTTACGATTATCCTTCAGCATTGTTATCTGAAGCAAGCGAAGTAGACATGATCTTAGTCGGTGACTCCCTTGGGAATGTTGTCCTTGGGTATGATTCGACAATAAAAGTGACTGTTAACGACATGATTCATCATTCAAAAGCTGTTAAAAGAGGGGCGAAAAATACATTTATCGTTACTGATATGCCGTTCATGTCATACCACTTCTCAAAAGAAGAGGCCTTGCGCAGTGCTTGTCGCATAATGCAAGAAGGAGATGCACATGCTGTAAAGCTCGAAGGTGCAGATGATAATGTATTAGAAGTAATTAAAGCCTTAACGATTGCAGGTGTACCAGTTGTAGCTCACTTAGGATTAACTCCTCAATCAGTTGGTGTACTAGGAGGGTACAAAGTTCAAGCTCGTGATTCCGAAAGTGCGATGAAATTATTTAATGACGCAAAGAAATGTGAAGAAGCAGGAGCATTTGCAATCGTACTTGAATGTGTTCCAAAGCAAATTGCAAAGGATATTACTAAAGACCTTTCAATCCCGACAATTGGAATTGGAGCTGGCGTTGATACTGATGGCCAAGTACTTGTTTATCATGATTTAATAACATATGGTGTCGGTCGAGTGGCGAAATTTGTAAAACAATATGCAAATGTATCTGAGACAATTGAAAATGCAATTGCGTCTTATGTACAAGAAGTTAAATCTAGACAATTTCCAGATACGAAACATTCGTTTACAATGAAAGAAGAACAGTTAAAGGCATTATACGGGGGAAGTTCGCAATGAAAGTGTTTAACACAATAAAAGATTTAAGAAATGAACTTAAAAGTCTCAGAAAAGGTGAAAAATCAATTGGATTTGTACCAACAATGGGTTTTTTACATGAGGGACATGTTTCATTATTAGAAGAAGCTAGAAAAAATAATGATATCGTTGTATTGAGTATATTTGTTAATCCTACTCAATTTGGTCCAAATGAAGATTTTGATCGATACCCAAGAGACTTTGAACGAGATGAAAAAATTGCACTAAATGCTGGAGTAGATTGCCTCTTTTATCCAACAGTTGAAGAAATGTATCCAAATGATTTAAAATCAACATTGAAAGTTACAAAGCGAGTAGATGTTCTTTGTGGTGAAAAAAGGCCCGGACATTTTGATGGCGTTGCATTAGTTGTATCAAAATTATTTAATATTGTGCAACCAGACCAAGCTTATTTTGGATTAAAAGATGCTCAACAGGTCGCTGTAATTGAGGGACTAGTTGAAGATTTCAATATACCTGTTAAAATTAATCCTGTTCCAACTATTAGGGAAGAAGACGGATTAGCTAAAAGTTCACGAAATGTATATTTATCAGAAAATGAAAGAAAAGAAGCACCAGCTTTATATAAAAGTCTACAAAAAGCAGTTGAGGATATAAATAATGGGAATTTAGATCCTGAACAACTGAAACAAAGTATTATTACTACAATACAAAATGAAACATCTGGAGAAGTAGATTATGTAAGTATTTATTCTTATCCAGAATTAGAAACGATAAATAAAATAAATGGAAAAATTATTATTGCATTAGCAGTGAAGTTTACAAATGCTCGTCTAATCGATAATATTATTGTTTCTATTTAGGTAGAACAACTAGGGGGAAATGACATGATTCGCACAATGATGAGAGCAAAACTTCATAGAGCAACTGTAACAGAAGCAAATTTAAATTATGTTGGTAGTATTACGATTGACCAAGATTTAATGGATGCTGTCGATATACTTGAAAATGAAAAAGTACAAATTGTAAATAATAATAACGGTGCTCGTCTTGAGACATACGTAATTCCAGGGAGACGTGGAAGTGGTATAATTTGCCTTAACGGAGCTGCGGCACGATTAGTCCAAGAGGGCGATAAAGTAATCATTATTGCTTATGGTCAAGTTGAAGAGGAGAAACTTGATCAACATGAACCAAAAATTGCATTTCTAAATGATTCAAATGAGATTGTCGAAATGATTGGCAAAGAAATCGCAGGGACAATTAAGTAATAAAAAAACGGGGCCTTTCGACTAGAATTTTTAGGCTTTAGTAAAGCTTGAAGATGAGTATAGTTTACAAAAACGTTTAGTCTGGAATCCCCTTCTTTAGGGTGTGTAGACGAAAGTCTAATAAAATTGATTTCCAGACTGATTGAAAGCAAGCATCTGGCAGGCAGTTTTGGAATCCCCTTCTTTAGGGGATTTTTTTGTTGTTTGTATTGTTTAATCCATTTTATACAAAATAATCATTATAAAGAGAACTTGGAGGTGGCAACATATGAATAAGTTTGTGGTCGTTGACCTAGAAACAACTGGAAATAATAATAGAGGTCAAGATCGAATTATTCAAATTGCAGCCTTT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55 | Paenibacillus_phage(21.74%) | integrase,coat,head,capsid,holin,portal,tRNA,tail,protease,terminase | attL 585174:585190|attR 594528:594544 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
861251 : 868045
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP053688|861251:868045|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP053688|861251:868045|865160_865445_+|WP_172444396.1|DBSCAN-SWA MEIISKLQKEIHDGIFWIGHKVGDSIKEHVFPKVQEEVSNQVINITAAPLLLIGMKVSLVIIGFGFICIVIGKPTWARKCIGMGTLSFLGLQLF >NZ_CP053688|861251:868045|863964_864786_+|WP_172444394.1|DBSCAN-SWA MLLGIDAGNNEVKVATQYGVYAFNSCLGDYHERRIETKFQDEMIVEYKGVTYFAGELAEKESYYPRRSMGASKANEDVKIRILIAVFRFSNEYSNTVIVGQPIERHLPAEKAKIKEMLIGEHTVKLNGQSKTFKIDQVVIALEGASCFFGWFTDTSTFRIIDCGSGTVNVATIREWDQVDKESFTLNFGANSTRTNNLNAMAQSIVSETSKYFQPNDFILLVGGAAKAVYPAVQSAYPLTRLAIPSFLGKRVEPKFANSIGFYNLGKELLNNG >NZ_CP053688|861251:868045|861251_862118_+|WP_172444390.1|integrase|DBSCAN-SWA MLRYLNAYLRDSKIEGISPNTLDARRKDIKHFFNWCETDDVEEIDRNLVKDYIYACQERNLKAGTINTRLQIIRGFFNWLVEEEIIKRNPTDKIKNVKKEITVIKPYNVGEIKSMLDFYRGKRFQDVRNKTIITLFAETGIRNAELCHIKLGDIYENEIRIKGKGNKERFVPISEVLHKQLFRYQLVREKQLHSDDCPYLFFSNRGTMISYTVTRNVLRKACEAIGLDARILTHNFRRFYATSMLDHVDLFTVSKLLGHTEISTTQRYVEGTEQRVILERGRKHSPLS >NZ_CP053688|861251:868045|867625_868045_+|WP_172444399.1|DBSCAN-SWA MTKINLAMQFRKESDQFPFFVIVDEPHQFNRSSKLWESMAVESRKWRVSFTWLFHYWEQIPKQARTAIKNALPHYTLYPTSKETWKAFAEEVAPFDLAECMALERYHAINILRVDGGNLKPFICHMAAPPSERKKETMS >NZ_CP053688|861251:868045|865457_865895_+|WP_172444397.1|DBSCAN-SWA MAKVEYIKFSEFMDGSWKLPKAKSNTMLPTILGGSTLGVAASMMVNKVSAFASTLADQGIYPGIPVSTDIQHKVANAFDPLFALMGGLAYPLCFLTISGGCVLIMIGQKHKGIHLIKWAAIGFIGLQFAPGIMQILMQVAAAMKQ >NZ_CP053688|861251:868045|864778_865009_+|WP_172444395.1|DBSCAN-SWA MARVMKGVSFNLSDPIDVKTLEFSMKSGNFSKFVKRLLEKEMTKEMPIQLDQIVVKQIDLPTQSTEKKGPNPKNFI >NZ_CP053688|861251:868045|862610_863048_-|WP_172444391.1|DBSCAN-SWA MKFNKTFTVIFVLLLALLSACSGGEKTATKEPKYKEIPQSAIQSTIDDMKTREHIKDATFEVNGDKIEMKLVVDDASFLDKNTARDYADSYLRTISIYVEDSNPTKDSYGKVYDGYYVHIVVEDTQGMEAIEGDILPGYPGVTWQ >NZ_CP053688|861251:868045|863139_863481_-|WP_172444392.1|DBSCAN-SWA MQDRINYYIKRLERIHREVYDEERKMVELQKELTLLKVANELRISELFMTGKVDGTNEQMRKAQVLHHTEEMHGDIAIYENLYAEQRAIFNAKKREADDLQYIVRLIETTSRQ >NZ_CP053688|861251:868045|865891_867616_+|WP_172444398.1|DBSCAN-SWA MKHFKITPDARLLNDKVEHLTQSLCVYKTLYQRMKEKEQNFFSYEIMLNKKNPFISYTVNDSTSELLEKAVLSAYPNVTLTEINDPIELKPSAIKTMGYKNHYFLALKVDRRSDWLQYLFEVLPLMKEEEKALVQVVANPLHYDWNIGVKEAYERFKKGDLPLKFQFDRKLIGSLALKTTASIVLGAHNLVTELIGGEPEEYDLFATERATLLKDGQLRSETVQKMKYGGYNVQISIAIECDEKRSETLMRAIETAFLAFDGDNRLDSEKRSLKHYNIMKERKISKFINNYFSSHELARITVLPPKYLQEKYNIENIKIQETQISPKLLKEGLLIGDSIYKGNIVNVLMPIKNWDELCLPYSVIGGMGQGKTAGYGANRIVEAVNNGFGALFIDPAKKQVTAELKKVLSPDQYEIFNISELKPSFDWCEAKYSPYAKGILADTVLSFFEDTLEDSVQTERYLRAFVIGMKTTKMSEIFKIMEDKVYLLEVISEMEEGIHKSTLKQYAKESEAMRMKLIKPIYNRMDMIMGDPFLMDCFKSDNELDFVKILSQKKAFIFDVSKSDGLTPKQINLI >NZ_CP053688|861251:868045|863572_863776_-|WP_172444393.1|DBSCAN-SWA MKNKLKVIFAERKIKQTEFADKVGINNSTLSLIVSKEDHSPTLKVAMRIAKTLDLKVEDIWELDDEN |
10 | Bacillus_phage(50.0%) | integrase | attL 858048:858062|attR 868373:868387 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1412961 : 1470058
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP053688|1412961:1470058|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP053688|1412961:1470058|1430342_1432775_-|WP_172444867.1|DBSCAN-SWA MQSSEKLYNIPLEDILGDRFGRYSKYIIQERALPDARDGLKPVQRRILYSMHVEGNLQDKPYRKSAKTVGNVIGNYHPHGDTSVYDAMVRLSQDWKLRNVLVQMHGNNGSIDGDPPAAMRYTEARLSAIASELLRDIDKETVDFVPNFDDTSMEPVVLPSMFPNLLVNGSTGISAGYATEIPSHHLGEVIDATIMRIENKNCSVDDLMTVIHGPDFATGGIIQGVDGIKKAYETGKGKIIIRSRVHTEDIRGGKQALIITEIPSEVNKANLVKKMDEVRLDRKVDGITEVRDETDRTGLRIVIELKKDANNEAILNYLYKNTELQIPYNFNMVAIYNRTPKQMSLPAILDAYIEHQKEVITNRSKFDLKKAKARQHVVEGLMKALSILDEVISTIRSANDKRDAKDKLIAQFEFTELQAEAIVMLQLYRLTNTDITALQEEADELDKKIKQLEAILNSETKLLSVIKTDLKKIKLKYADDRRSTIQGAIEEIKIAREDIIAQEDVIVTVTSEGYVKRTSPRSFSASNGKDYGMKEGDRLIYQVESTTTDTLILFTSKGNYLYLPIHEMQDIRWKDMGQHVANIIPIERDESILSATVVNNFEENKEFILFVTKNGIVKRTSIQQLKVQRYSKPLVGMSIKSDDALIFAGVTSETSRVLLATSAGYTLIFNVEEISIQGLRAGGVKGINLKENDIVVSADIISEEVKEIFCATHRAAIKKMKLDTIPQSSRGTRGVKVLRDLKNNPHLLIGVYAVNQNDMFALLSKSGQFETIDPTDLRNSDQYSNGSFIMDTDDSGDIKTIIRYKKEENN >NZ_CP053688|1412961:1470058|1457959_1460578_-|WP_172444897.1|DBSCAN-SWA 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61 | Bacillus_phage(34.62%) | head,capsid,holin,portal,tRNA,tail,protease,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1473884 : 1488698
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP053688|1473884:1488698|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP053688|1473884:1488698|1473884_1475396_-|WP_172444916.1|DBSCAN-SWA MNGQDIKNSILQLAIQGKLVEQKEKEGTAKELIEKIKAEKEQLIREGKIRKEKPFPKIKEDEIPFNVPENWEWVRFGDLGSYKKGPFGSALTKSMFVPKGTDTVKVYEQKNAIQKSVDLGHYYITREYFESKMKGFELSPGDIIVSCAGTIGETYVMPDDFEQGIINQALMQMKLMPSVYVEYFLLYFDFILKKTARKSSKGSAIKNIPPFQELKNYVVAIPPLEEQKRIVAKIEELMPYVEKYDKAYSEVEELNKKFPEDMQKSILQYAIQSKLVEQREEEGSAEELYEQIQEEKKKLIEEGKIKKTKPLLKISEDEIPFDIPENWKWVRLDQVCKYIQRGKSPKYSDVKKYPVVAQKCNQWSGFSLEKAKFIDPKTISTYTEERILQDGDLMWNSTGLGTLGRVAIYEKAKNPYELAVADSHVTVIRPFKQYLNFKYLYYYIANPSVQNVIEQQSEGSTKQKELATNTVKNYIVPLPPLEEQKRIVEKIEELLPYSKKLMK >NZ_CP053688|1473884:1488698|1485645_1485846_-|WP_129692472.1|DBSCAN-SWA MKSLNLDFIKKRRIELSISHEHMAKNFGFANSSTYWKYENGNYKFKAEQLPQLARYLNCKIVDFFN >NZ_CP053688|1473884:1488698|1480008_1480392_-|WP_172444919.1|DBSCAN-SWA MNVEQLSFLNDIDEKKVRKAVIKQLKRFKAIRVAVQNKDEQLTEGVIDPFPIIFDNEKEKRLKVKQVERALLFALDDIERTIIERKYLSSNREKDIHIYMDLGINKDQFYEYKKQAIFSIAEALNIV 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19 | Bacillus_phage(26.67%) | integrase | attL 1477734:1477748|attR 1491847:1491861 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1626353 : 1685387
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP053688|1626353:1685387|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP053688|1626353:1685387|1668989_1670195_-|WP_172445090.1|DBSCAN-SWA MSQAAARVSEVKSEKQPLVIWVLFFACIISFMGLGLVDPILPAIGAQMHASPSQVSLLFTSYNAIMGISMIFTGMVSSEIGIKWTLIAGVCLVILFSALSGSSSSISQIIWFRVGWGLGNALFIATALSAIVSLSNSGPLKSIILYEAAIGLGISVGPLLGGELGAITWRGPFYGVSVLMVIVLIALLIKMPNLPKSDKKISILDPLKALTNRGLFTLGLTAFLYNIGFFTLLAFTPFILAEMGLKEHGLGYVFLGWGIALAFTSVLVAPRMQEYIGAIKSMCWVLFLFALTLISMGIGVDSELWLITAVVIAGLFLGANNTLITTSVMNVSTVDRGVASAAYNFVRFLGGAVGPWLAPKLAESFNPRVPFYVGGAFVLIGVLTVWANKKHLSHVDHIEGH >NZ_CP053688|1626353:1685387|1661452_1661674_-|WP_056470298.1|DBSCAN-SWA MKTSINIQDQFLNQLRKDNLAVTVFLLNGFQIKGKVKSFDNFTVLLDVEGKQQLIYKHAISTFVPSKNVQIEM >NZ_CP053688|1626353:1685387|1639853_1640279_-|WP_172445064.1|DBSCAN-SWA MKKPYIILIIVTVSAMFLAGFYYERMNIKSNNEIWIGYNYTKFGKNEISFKPMYIERQSGINQLEEIFLYSKIIDHPTVDLAKYDIQLSFKSPVDQSVEYSSLLWFTKSGAIIKLNGFNGFRSVNIDNAESIKKIIKYTEF >NZ_CP053688|1626353:1685387|1642363_1643740_-|WP_172445068.1|DBSCAN-SWA 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60 | Bacillus_phage(40.0%) | transposase,protease,tRNA,integrase | attL 1647228:1647245|attR 1664740:1664757 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2626066 : 2635479
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP053688|2626066:2635479|DBSCAN-SWA GTTAATTTGCCTTGAAATTATAAAGTGGTTTAATAACTTTGATTACTTCTATTGCGTCCTTTGTATTTTCAATAATTTCGTTCATTTCCTTATAAGCCATTGGACTTTCATCAAGCGTACTTTCTAAAACTGATGTACTCCAAACATCCTTCATTGTTTTTTTAAACTCATCAAGGGAAAGTGTAGCTTTTGCTTTTGTACGACTCAGAATTCGACCAGCACCATGAGGAGCAGAATAATTCCAATCTGGATTACCTTTTCCAATTGCTATTAAACTCCCATCTCGCATATTAATCGGAATTAATACTTTTTCACCTTTTTGAGCAGAAATTGCCCCTTTACGAAGAATCATATTTTCAAGATCAATATAATTATGCACGGTCGTAAATTGTTCTACAACGGTTAAATCCATATTCTGCACAATCTCATCCATCATTGCCTTACGGTTCCATAAAGCATATTCTTGGGCAATTGCCATATCGTTCATATAGCGATCAAACCATTCTCCTTCTAAATAGGCTAAATCCTTTGGAATATATTGAGGCGGATTATTTTTTAATGCAGTCTCAATTTCTTTTTCACGGCCTTCATTCTTTAATTGCTGAACGATCTTTGAACGATTTTCTGACTGACTTTTTAATAACCCATAGGCTTTTTTCTGATAAAATTCCGCTACAACCTTGCCTAAATTTCGGCTTCCAGAATGAATAACGAAATAAATATTTCCATCCTCATCCGCATTACATTCAATAAAATGATTTCCACCACCAAGTGACCCCAAACTTAGCTTTGTTCTAGTTTCATTTAACTCTTTAAAACAATAAAGCTTAGAAAAATCAATATTTTTCACAAAAGCATGCTTATTATTACGAATTGAAAACCCGGATGGAACATGTTTACGGATGACCTGGTCTAGCTTTTGAAAATCAATTTCTTTTTGAGAGATTCTTATTGTTTCCATTCCGCAACCTATATCGTACTTTAACCTCTAATTTCTTAGAGAGTGGACTATACCTTCACTACAATCATCGGAGTATGCAGCTCCTAATGTAGGCCCGCCGTGTTAATTATTCCTTTATTTTTATATGGAATAATTCCGCACAATTGTCTGCTAATAATGTGCAAGTCTCTGAACCATTTGACTACGTCACCATAGCCTCTGGCTGCTGATTGCCCTCGACTTATTTACGTTAGGGTTTCCAGCAATTGAGCGAGTTTTTTAACGTTGGAGCCGTTCTAGTTAACCCCAACGAGATTTGGAACAATTTTATCTTGAATCGTCATCGTAGTCCCAATCGTACATCCCTTCCCTGCATGAGTATCAGGCATAATTCTAATTTTCGAATTTTTCACGAACTCTTGATTACATAGTTCAATAATTTGCCCAATGGCACCTTGATCAACATTATCTGTAAATATTTTAGCTTCATTAAATGAGCCGTTAACTGTAAGCATTATGTTCTCCTTTCCATTTGCTATTGTTTTATTCCTTTTATATTAGGCTAATCCACTACATTAAGTAAAACTGTTATAAAACATATATATAATTTAAGCAATAACTACCAAAACAGTATTAAACGTAGCACCTCCCTAATTAATAAAGTTTGTCAGTATTAGCTTACAATGATTGTTCTTCAAACGTTTAATTGTTAATTGCAGAACTATAAAATGTAAATTTCCCCAATATGCATCTTCATTTACCTAGTTTTACTGCCGTAATTTCAAGACGATTTTCAGTTAAAAGAATCGAAAACGTTAAAAATAAACAAAAAAATTTCCCGATACAAATACTTTTTAAATTGGCTTACAATTGACATATGGAAATGCACATATCTATTATTCATATTTCCGGGATTATACTAATATGAGTTCTCTAAATTCAACGAATAAGAAAAAAATTCCTTATCAACTTGATAACCATTTTTTTCATACAAAGCTTGTGCCGATCTATTATCAATCGCTGTTTGTAAATCCAATGCCTTCGCTTTTGTATTGATTGCAAATCCTTTAGCGGCATCTAACAGCATTTGTGCTACTCCCTTTTTCCTTGCTGCTTCAGTCACAAATAAGTCATTTAATATCCACAATTTTTTCATTGATACTGAAGAGAAAGTAGGATATAACTGAGTAAACCCTAAAGATTCCTCTCCTTCTTTAACAATAAAAATAACGGAATCTTTATTATTAATTCTTTCTGTAATAAAATTTATCGCTTCATCTACATTACTTTCTTGTTTATAAAACTGTCTATACTGATCAAATAGCTTTGCAACTTCTACAATATGTTCTGAATTTGCTTGAACTACTTCCAATTTTGTCACCTCTACTATCATTAAACTTATTTAGTATTTAGTTCTTTCCATTTCAAAAAAATCCTTTAATGATCACAAAAGCACATTACATCTTTTATTACTTTTTCTAGAAAAGGTAATAATAAATTCCAAATGAAATATTAATTTTCCAAAATTTAGGTTTTCATATGAATTAACTTATAATAATATTGAAGATGAAAAACTAATTTGATTTAATTCACTATGTGAAGAATTTAACATTCTAATTACTTGGGGTGATTTGAAAATGAATAAAAAAGCGCTCATTATTATTGATTATACGAATGACTTTGTAGCAGATGCTGGTTCATTAACTTGTGGTAAGCCAGCTCAGGAAATTGAACAAAGTATTCTTCAATTAACAAAAACTTTCATTGAAGATCAAGATTATGTTGTATTTGCTGTAGATGTCCATGATGAAAATGATCCGTTTCATCCTGAAACAAAATTATTTCCACCTCATAATATTAGACATACTAAAGGAAGAGATTTATATGGTGGCTTAATGGATTTATACAATTCATCAAAAGGTAAATCAACTATTCAATGGATTGATAAGACTCGTTATTCCGCATTTGCAGGAACTGACCTTGAGATAAAACTAAATGAAAGAGGAATTAATGAACTTCATTTAATTGGGGTTTGTACTGATATTTGTGTATTACATACAGCAGTCGATGCTTATAATAAGGGGTATAAAATAGTCGTTCACGAGCAGGCAGTTGCAAGCTTTAATGCAGCTGGTCATGAATGGGCATTAAGTCATTTTAAAAATACTTTAGGGGCGGAAATAAGATGAATTACAACTTTCACGATGATAGCCTTGCACTTCACACAGACCTTTATCAAATTAATATGGCAGAAACATATTGGGGAGACAATATTCACAATAAAAATGCTATTTTTGAACTATATTTTCGAAAACTCCCATTCGGGAATGGATATGCGATATTTGCAGGTTTAGAAAAAATAATTAGTTATCTGCAAAACTTCAAATTTAGTAGTACAGATCTTGTATATTTAAAAGAAGAACTTGGATATGAAGATGAATTTATTCAATATTTGTCTGGTGTAAAATTCACAGGTTCCATTAGATCAATTCAAGAAGGTGAATTAGTTTTTGGTAATGAACCTATTTTAAGAATTGAGGCCCCGTTATTAGAGGCTCAATTAATTGAAACTGCCTTATTAAACATCGTTAATTACCAAACTTTAATTGCTACAAAAGCGTCACGTATTAAGCATATTGTCGGTAATGACACTCTTATGGAATTTGGTACTAGACGTGCTCAAGAATTTGATGCAGCAATTTGGGGAGCAAGAGCTGCTTTTATTGGTGGATTTCATGCGACTAGTAATGTTCGTGCTGGTAAATTATTTAATATTCCTGTTTCAGGTACACATGCACATGCGCTCGTGCAAGCTTATCGAGATGAATACATAGCTTTCAAAAAATATGCAGATCGTCATTACAACTGTACATTTTTAGTAGATACTTACGATACCCTTAAAAGTGGAGTCCCTAATGCGATTAAGGTTGCTAAAGAGCTAGGTGATAAAATTAACTTTGCAGCGATCCGGTTAGATAGTGGTGATTTAGCTTATTTATCAAAAGAAGCTAGAAAAATGCTCGATGAAGCTGGCTTCGTAAATACGAAAATTGTTGCTTCGAATGATTTAGATGAATATACAATCTTAAATTTAAAATCACAAGGAGCTAAAATTGATTCTTGGGGTATCGGAACAAAGCTTATTACAGCATATGATCAACCGGCTCTTGGAGCAGTTTATAAATTAGTAAGTATTGAAGATGAAAACGATAAGATGATTGATACAATAAAAATTTCTCAAAATCCTGAAAAAGTAACAACACCAGGACTCAAGAAATTGTATCGAATTATTAATACGGTTAACCATCACGCTGAGGCTGATTATATTGCCCTTGAAGATGAAGATCCACAGTCAGAGGAAAAAATTAAGTTATTCCATCCAGTTCATCCTTACATTAGTAAGTTTGTTACTAATTTTGAAGCTAGAGAGCTTCATCACCAAATTTTTACAAAAGGCGAATTAGTTTATAAAATGCCTGCGATTAAAGACATTCAAGATTTTGCTGAAAACAATTTAAGTGTACTTTGGGAAGAATACAAGCGTGCATTAAACCCAGAAGAATATCCAGTAGACTTAAGTCAAAAATGCTGGGATAACAAAATGGAAAAAATAGCAGAAGCTAGAAAGAAAACAGAGGAAATGAAAAATGGCTAAAATTGGGATTTACGGCAGTTCGTTTGATCCAATCACAAACGTTCATTTATGGACTGCTAGTACAATTGCTCATCGTTGTCAATTAGACAAAGTAATATTTTTACCTTGCTCTTCAAAAAGAAGGGATAAACAATTACATAATACTGATGAACATCGTTGGAATATGTTAAATTTGGCAATTCAAAATAACACAAAATTTATTGCAGACGATTATGAAATGAGTAAAGAGGCTTGGGAAGTCTTTACTTACTATACAATGAATCATTTTAAAGCTAAGTATAGTGAAGATGAAGTTTACTTCATAATGGGAGCTGACCTTCTAGAAGATATTGCAGAAGGAAAATGGAAATACGGTGATCAATTAGTTTCTGAAAATAAATTCATTGTTATGGCGCGTGATGGAAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP053688|2626066:2635479|2627924_2628377_-|WP_172445750.1|DBSCAN-SWA MEVVQANSEHIVEVAKLFDQYRQFYKQESNVDEAINFITERINNKDSVIFIVKEGEESLGFTQLYPTFSSVSMKKLWILNDLFVTEAARKKGVAQMLLDAAKGFAINTKAKALDLQTAIDNRSAQALYEKNGYQVDKEFFSYSLNLENSY >NZ_CP053688|2626066:2635479|2632203_2632347_+|WP_141437756.1|DBSCAN-SWA MMWILFFILLILWVLGYFTFHIAGGLIHIVLIIAIIVFIVNLFRRKK >NZ_CP053688|2626066:2635479|2629190_2630660_+|WP_172445752.1|DBSCAN-SWA MNYNFHDDSLALHTDLYQINMAETYWGDNIHNKNAIFELYFRKLPFGNGYAIFAGLEKIISYLQNFKFSSTDLVYLKEELGYEDEFIQYLSGVKFTGSIRSIQEGELVFGNEPILRIEAPLLEAQLIETALLNIVNYQTLIATKASRIKHIVGNDTLMEFGTRRAQEFDAAIWGARAAFIGGFHATSNVRAGKLFNIPVSGTHAHALVQAYRDEYIAFKKYADRHYNCTFLVDTYDTLKSGVPNAIKVAKELGDKINFAAIRLDSGDLAYLSKEARKMLDEAGFVNTKIVASNDLDEYTILNLKSQGAKIDSWGIGTKLITAYDQPALGAVYKLVSIEDENDKMIDTIKISQNPEKVTTPGLKKLYRIINTVNHHAEADYIALEDEDPQSEEKIKLFHPVHPYISKFVTNFEARELHHQIFTKGELVYKMPAIKDIQDFAENNLSVLWEEYKRALNPEEYPVDLSQKCWDNKMEKIAEARKKTEEMKNG >NZ_CP053688|2626066:2635479|2626066_2627026_-|WP_172445749.1|DBSCAN-SWA METIRISQKEIDFQKLDQVIRKHVPSGFSIRNNKHAFVKNIDFSKLYCFKELNETRTKLSLGSLGGGNHFIECNADEDGNIYFVIHSGSRNLGKVVAEFYQKKAYGLLKSQSENRSKIVQQLKNEGREKEIETALKNNPPQYIPKDLAYLEGEWFDRYMNDMAIAQEYALWNRKAMMDEIVQNMDLTVVEQFTTVHNYIDLENMILRKGAISAQKGEKVLIPINMRDGSLIAIGKGNPDWNYSAPHGAGRILSRTKAKATLSLDEFKKTMKDVWSTSVLESTLDESPMAYKEMNEIIENTKDAIEVIKVIKPLYNFKAN >NZ_CP053688|2626066:2635479|2634843_2635479_-|WP_172445756.1|DBSCAN-SWA MKRFILLTLMAILGISGCSQQATSVNAKSDTKFTVELVKCIDGDTARFTTVGTTRFLYIDTPESTRTIEPFGKEASAYTCNLLENAKTIELEYDGPKKDKYNRTLAWVWIDGRLIQKEIIKKGYVEKFYDYGDYSYESELRSLQATAQKRGVGLWSKNKVNQTNTNNVSKGKTFKNCTDLRKVYPNGVPKGNKAYQEKMDRDHDHYACESD >NZ_CP053688|2626066:2635479|2627301_2627520_-|WP_098811617.1|DBSCAN-SWA MLTVNGSFNEAKIFTDNVDQGAIGQIIELCNQEFVKNSKIRIMPDTHAGKGCTIGTTMTIQDKIVPNLVGVN >NZ_CP053688|2626066:2635479|2632478_2633987_+|WP_172445754.1|DBSCAN-SWA MTVSMEPPISMEQMLQTIRTGLPKTLEPKHIIIVGAGISGLVAASLLKAAGHEVTILEGNNRIGGRIYTNRSFYANQYMENGAMRIPSIHLLVLEYIKKFNLTLEEFINSTPKDIIYVNNVRTIQKLYEENPDILNFPTSPSEKGKTAEYLAGYAMQPVTDFIKKNPKKNWEIVIKLLDRYSMEYYLKYNPYGRTLSVGAIDMIKVMLGMEGFPELSFTALLREVMILFTPGLKFYEIKGGNDHLPYSFLPEIQDNLYYNQKMKKIEQHDSYVTIHTEDTQTSQQYNVTGDLAIITIPFSLLNFVEVIPRDLFSYNKYKAIRQLHYVPSTKIGLQFRTRFWEKEGNIGGKMISDLPVRYSYFPSQSVGSEGPGVILASYTWEDNASIWDSLTEKEQIENALEDLSRIYGKEIYSEYITGNTFSWAENPFSGGAFAIFKPDQQTEIAPYISTPEGMIHFAGDHTSTAPGWIQGAIESGIRVAYEVNDLPKSEANENFETHEQG >NZ_CP053688|2626066:2635479|2634199_2634613_-|WP_172445755.1|DBSCAN-SWA MIKFFKRLFSKEKTNQVTLPLKETRSLSKVEIEYIINEFTDKQNKLVDDMRNNSINHADIEFNELITNRITNNLKYRIPFLAIELVYLNNVLRGKKVKYIKYKLFHQVKDIETTEITDMVINQGYSFVPSVGYLKIG >NZ_CP053688|2626066:2635479|2631278_2632100_+|WP_172445753.1|DBSCAN-SWA MNNLQKEIVEEMKVKPVISPKEEIRISVNFLKSYLKKHPFLNGFVLGISGGQDSTLTGKLAQIAVDELNSEQTEKVYLFIAIRLPYGVQMDEEDCQEALKFIQPTKTFTVNIKAAVDASVNTLKDIGIELTDFAKGNEKARERMKAQYSVAAMNGCVVLGTDHSAEAITGFYTKFGDGGADLTPLFRLNKRQGKMLLKELNCPAKLYEKVPTADLEEDRPQLADEVALGVTYDDIDDYLEGKEINSDSQAKIESWFNKSRHKRQMPYTVFDKF >NZ_CP053688|2626066:2635479|2630652_2631282_+|WP_098117108.1|DBSCAN-SWA MAKIGIYGSSFDPITNVHLWTASTIAHRCQLDKVIFLPCSSKRRDKQLHNTDEHRWNMLNLAIQNNTKFIADDYEMSKEAWEVFTYYTMNHFKAKYSEDEVYFIMGADLLEDIAEGKWKYGDQLVSENKFIVMARDGIDMLKTISRSPLLRNNDNGSRFHLIDKGLAMEISSTYIREEFAKGGEPRYLLPEECYAYIKKYNLYQKENED >NZ_CP053688|2626066:2635479|2628642_2629194_+|WP_172445751.1|DBSCAN-SWA MNKKALIIIDYTNDFVADAGSLTCGKPAQEIEQSILQLTKTFIEDQDYVVFAVDVHDENDPFHPETKLFPPHNIRHTKGRDLYGGLMDLYNSSKGKSTIQWIDKTRYSAFAGTDLEIKLNERGINELHLIGVCTDICVLHTAVDAYNKGYKIVVHEQAVASFNAAGHEWALSHFKNTLGAEIR |
11 | Bacillus_virus(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
3999491 : 4036428
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP053688|3999491:4036428|DBSCAN-SWA 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MLSLYAMGLLIAGGFTGILIVVACGPQSVKDKFNSLLWNPEEDEM |
49 | Paenibacillus_phage(20.83%) | integrase,head,capsid,portal,tRNA,tail,protease,terminase | attL 4007652:4007669|attR 4031656:4031673 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_8 |
4042837 : 4056415
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP053688|4042837:4056415|DBSCAN-SWA GTTGAAACCATTTAAAACACATAGACAACAGCTAACCATTCTTCGTGATAGAGGATTAATTATTAGTAATGGTTCTAAAGCAATGCGTATATTAGAACGTGAGAATTATTATGGATTAATAAATGGCTATAAGAACTTCTTTTTACAAGTTGATGCAAACGGACGCTGTATTACTCCTGAAATATATAAGCCCGGCGCCAAGTTTGAAGAAATTTATGAATTATACTCTTTGGATAGGGATTTTAGAAATCTATTCTTAGAATATTTACTGAAATTTGAGACAAGTATAAAATCTGAAATTTCATATAGATTTACTGAGTCTTATCAGAGTCAAAATTCATATCTAGATATAAAAAACTATTCTCGCGATCCCAAAAAACTAAAAGACGTATTAGGTGTAATGTCGTCTATATCTTATACAATTTCTAAATATGGAAAAGCAAGAAATCAAAATCCTATAAAACACTACTTAGATCAACATGACGGTGTTCCTCTGTGGGTACTCGTAAATTATCTAACGTTCGGCAACATTCAATATTTTTACCTTTCACTAAATTTTTCAATTCAAAATACAATATCTCGTGATTATGCAATTCATTTTAATAGAGACTATGGAACGCAAATTCACTTCACGCCTGATATGTTAGAAAACATTTTAAAAACTTTTAATTTTTTTAGAAATGTTTGTGCGCATGAGGAAAGATTATACAGTTTTAAGATTCATAAACCCTCAAGGAGTTCAGATATTGCAAACGCGCTTAATATACCTGTCAATTTACTAGATAAAGGGAATTTATTTACAGTTATTTCTTCCTTAAAGTTAGTACTTCCAAAAAAGGAACATAAAGAATTAGTTCGCAAATTTAAAAAGTTAATAAGTGAATATTCTAATAAATTCTCATCAACTAGTATTAATGACATTTTATTAAAAATGGGTTTTGATAGTACTTGGGAAAGCTACTTTTAATTAAATAAACAAAAGAAAAAGCCACTTGTATAAGAGGCTTTTTTAATTTTATTTTTTATCTCCAGGAACACTAATAGCAGATTCCTTCACACTTTGAAAACCACATACCAGTCATTTATTTCTTCAAAAAATATTAATCTAAAATGAAAAACCCTGTTACCGTTTGGTAGCAGGGTTGTTTATTTACATTAATTAGATAAAAGGAATTTGAGAACTATCAATCTTTTCAATATCAAATTTTGAATCATCGTCCATCCTTCTATACACTCCATTTAGTCCAGCGTAGATACAATCAGCACCATAATTTAATTTGATTAAAGCATGATACAATGTGTGAGCATCCTTAATTGGTATATAAAACTTATAAAGTAACACTATATAGTTTGAATTTGAATCGACCATATTAATATTATTTTGCAACACATAATTTTCTAATAATTGGTCTAAAGGTGCTCTATTAATCCGTGTGTTAATAACTTCAGGCATTTGAAAATAATTAAGCCTAGTCAGCATATTCTCATACTCCCAACAAGATAGCACTCCCTTTTGGGCTAATATATTAGGATTTCTACTATATGTTGGTTTTATTAAACGCAATGGTATTCTAATTGTAGTATCTTTCAGATACTCTATATGCTCATAATTTAATGCCCATAAAACCATGTACTCATTTTTATTTTCTTCACTTTTAGTTAATGCCCCAGATGCTGCAAAATATAATGATGTCATGTGACTTAAGCTCCAGTCGATAAGTCGTGTTGGAACACCATAATGCTGTGCTAAAGTAGCTAATTCTAGTAACTCATCTGGTATCCATTTACTGCTTATTTTTCCATTTAAGAAAGAAGGAAATTTGTTCAGTACATCATTTCGCATAAATGGTATATCTGGTGTAGGTATTCCTCTCTCATCAGCTAGTGTATAGAATTTTTTAAGTAGATGTAATTCAGATTGTTGTTGAAAAAATTCTATATCAAATTGCTCTTCTGTAAGGGTGTAATTACTTAAAGCGTTTAACTTAATCTTTTTATCTTCTCGAAGTGCACTTGGGATTAACTGATATGAATTACTGGATTCTCCTCTAAATACATGGCCCCTTAATAAACTTCCGTATTTCCCAAAAGGTGATAATTCTTGAAATAACTCCTTAACATTCTCAAAGTATACTTCTTTAATAAAGTAATCCTCAATGTTCATACACCTTATTCCTCTCAATTTAAAGATACAAACTTCTTTTTCTATTTCGCTAATTATTGCATTTTCCCTTTTACTACAAGATATTTACAAAAATAACCCTGCTACCAAACGGTAACAGGGTTATTTTTACATATATTAACAACTCCATTTTTGTATGAAAATATGAAACTTAACTAATAGTAAGAAATAGGAAAGATGCAAAGGAAAGAGGTGATAAGTAAATGAACTGGTTCAATTTATTTCATTACACTATCGATCTAATCGATTGCATCTTGAACTTAGTAAGTATATTTGTCAATTAGCTCTTAAGTTTTATTTAATACCTGCCGAGGTAATTACACTTAATTACGCATCTTTCCTAAATTCTTCTCTGTAAAGGTTATAAATAAAATATATTTGCTTATCTTATTTATAACCTTATTATTGTTTAACTTCGCATTGTTAATACATTTTTTGTATTACAAATCAAAACACTTTTTGTATGAATTAACGGAACACTTTGTTCATGGTGTTTTTGAGTCGTATAATGAAGTTGATTTATGTTTATTTTATTTTTTATCTTCAGGAATACTTAAAGCCGTTTCCCTCACAATTCCATTCTCAATCCTCAATGCAATCGTCCCAATCCACCTATCCATATCCGGCACCATTTCTGGACCTTCTAATTTGCAAGTAAAATACCTAATATGAACAGATTCCTTTGTGTCTTTACTGATCACTGGACAAGCAAGTATATTTCCAAGTCTTTTTAATGCAGCTTCTTTTTTCATGCCAATTATTTCTTTCTTGATGAATGATTCGTAGTAGTTTTTTAGTGGGAACATGATGACACCTCACAAACAGTATACATAAAAAATAACCCCTAAAGAAATAGGGGCATTAATCTAATGGACTGTTGGTGAAAGAATTTATATCGTAGTGATCTGCACCATCTTGATATAGATTCACTGTCATTTTAAATGTTTGCCCGGCTTTTACATCAGTGATGTTGGTCATGTTGGTATCTATTTTAGTTCCTTTTTTATCGTAGACGTTTAAATCTAATTCAATGTAATCAAAATCAATTTTACTAGTGTTTTTGAATGTATACGTTACTGTATATTCAAATTCATTCCTTTTCACAACTGGTTTGGGTGCATTTTTAAGTATTTCTTTTAATGCTTTCTTTTCTTCTTTATTTTTTGAACTAATTTCGGTAGCTGTATCTTTAACTGCTTTACCTACTACGAACACACTTGCAACACAGCCTCCAATTCCTAAGATAACTCCAATTGAAAAAATCCATAAAATTACTTTAAAAAATTTCTTCATTTTTTAGTCTCCCTTAAGGTTGTTAATTTGTACTTAATGTATATTCGTTATTAAGTACAAAATTACTCAAATAAAAAATAACCCACGTAAGTGAGTTATTCTTCATCTGTATACATCTCATCAACTGTACAACTTAATAATTTAGCTAACCTAAATAATTTATCAGCTGGTGGGTATAATTCTCCTTTGATCCACTTACTGAAATGCTGTGGTGTTACTCCAATTTCCTTTGCAATAAAGCCTTTCTTAAAGCCTTTTTTTAATATGATCTTTTCTAGATTACATTTCATTTATATCACCAATTATCTAATTCTAGTACTATTCATTATTTCCTTTTTTTAATTTTTCACTTACAAAAAATGAATTTATATCTTCATGGACAGACAATATTAGACGAATACCTACATATCATTCTAAATATACGGTAAGTGAAAACATCGAAACACACTTGCACCGTACATTAAAGTTGTTATTGCTGTAAGGTTTGTAGCAATTTTTTACTCTTCGTTTGAAGTGCAACTATTACTTACAGTAATAAAAGGAGGGGTGGCGAATGATCTTTGAATTGCTAAGCACAACTAGTGCTTTAGGTGTAAGTGCTTTAGCAACTTATTATAAAAAAAATTTCAGTAAAGATGGCGATAAGATTTTAAAGATTGCAGAGAATTGTGGTTTGTACAAAAAAGATGATTGTTTGAGATTATTCAGACGAACTTACAACAAAAAAGAAAAATATACCGAATATGTTTTTAAAATTCCATTAGGACTAGAATTGAAAGATTTTACTGATAAGTATGGTAAGTTCAAAGATGGATTAAACAATAAGAGCATGAATGTTGTAAGTTTAAATGATTTTAAGAATCTAACATTTGATAAAACAATAATCCAACAAATACAAGCGATTTTTAATAAGCGAATTCAGTTAAATAAAGAAATTACTATGAGCTATGACGGTATGTTAATTATGAAAGTGTTTGATGAAGGGTTAAAAGAGTTGTATCCAATTGCACAGCCGATTATGAAAAAATGTAAACCTTGGACTATTAAATTGGGTAAAGGCCTGGGAAAAGAGATAACGCATAATTTTGAAGAAAGTCCACACATATTAGTTGGTGGAGCAACTGACATGGGTAAAAGTAATATTTTGAATCTAATTATTTCTACATTAATTTTAAATCATGAAGATGAAGCTGAATTTACATTAATCGATTTAAAAGGGGGATTGGAATTTTCGACTTATGAATGTATCAAGCAAACAATGAACTTTGCCACAAATGCAGAGGAAGCTTATATTGCTTTAAATAATGTGGTGGTGGATATGGAAGAAACGTTCCAGGAGCTAAGAAGAAAAGGGAAAAAGAATGTTAAAGAATTAGGATCTAAAAAGCGTCATTTTGTAATTATTGATGAAGCAGCAGAACTTTCTTCTGCTGGTGAACAAGATAAAGAAGAAAAAGCTTTGAAAATTGAATGTGAAAATCTAATAAAAGACATAGCAAGACGAGGGAGAGCAAGTGGAATTCGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP053688|4042837:4056415|4049883_4050180_+|WP_172446751.1|DBSCAN-SWA MKNQSEIINKKFSYRRNPKHPIFVTGTYGLYTYKAKVLNNSIKEGIANGRVIQLKVLSNGLELVFYDEGWYYGKDYLSIYVPIVKKLERIKRKEGIKR >NZ_CP053688|4042837:4056415|4052409_4052814_+|WP_172446753.1|DBSCAN-SWA MGRKNNFKITEPMLNEYYDLSQKKKDIENQLEELQKVFHGYFDHQVGTNEKGEIIVNNLKLERIIRKREKFDEEMTVNKLEELNLSDLIQIVKRPDGDKIKSAINLGLLNEKDLDGCITINSSQAIYVKTLKTK >NZ_CP053688|4042837:4056415|4050623_4050860_+|WP_172447764.1|DBSCAN-SWA MDEIKELQEKVAEIKERLAVAESTIRKVEQKIERIESNTSWTIRLIIGAIIMAVIRIILKGGYLILKVTSLYILLWQM >NZ_CP053688|4042837:4056415|4046406_4046601_-|WP_172446747.1|DBSCAN-SWA MKCNLEKIILKKGFKKGFIAKEIGVTPQHFSKWIKGELYPPADKLFRLAKLLSCTVDEMYTDEE >NZ_CP053688|4042837:4056415|4054096_4054444_-|WP_172446755.1|DBSCAN-SWA MNWIYLVIAGMSEIAWAFGLKYSDGFTNVIPTILTIAGIVFSFYLFSKAVREIPIGTAYAVFTGIGAAGTVIIGMLFLDEAASTLKIILVITLLSGIVGLKLTSNDKKTEKGDAA >NZ_CP053688|4042837:4056415|4045879_4046311_-|WP_172446746.1|DBSCAN-SWA MKKFFKVILWIFSIGVILGIGGCVASVFVVGKAVKDTATEISSKNKEEKKALKEILKNAPKPVVKRNEFEYTVTYTFKNTSKIDFDYIELDLNVYDKKGTKIDTNMTNITDVKAGQTFKMTVNLYQDGADHYDINSFTNSPLD >NZ_CP053688|4042837:4056415|4053775_4054096_-|WP_098120708.1|DBSCAN-SWA MAWLFLFIAGLGEVGFVIFMKLSNNFKKLNYSILCILSGWTSFYLLSKALKVIPVGTGYTIWTGIGAAGSVLIGMLFFNESREWKRLFFITLVIGSVVGLKIISPH >NZ_CP053688|4042837:4056415|4042837_4043803_+|WP_172446743.1|DBSCAN-SWA MKPFKTHRQQLTILRDRGLIISNGSKAMRILERENYYGLINGYKNFFLQVDANGRCITPEIYKPGAKFEEIYELYSLDRDFRNLFLEYLLKFETSIKSEISYRFTESYQSQNSYLDIKNYSRDPKKLKDVLGVMSSISYTISKYGKARNQNPIKHYLDQHDGVPLWVLVNYLTFGNIQYFYLSLNFSIQNTISRDYAIHFNRDYGTQIHFTPDMLENILKTFNFFRNVCAHEERLYSFKIHKPSRSSDIANALNIPVNLLDKGNLFTVISSLKLVLPKKEHKELVRKFKKLISEYSNKFSSTSINDILLKMGFDSTWESYF >NZ_CP053688|4042837:4056415|4048748_4049225_+|WP_172446749.1|DBSCAN-SWA MFRKKETYTIKEFMNRGKEVVYEDTCVEMPLTNWEIRKAKEMGLITGFTLPVILAPLVKGSKALAASTYVDPAGAVEVAGKVDMYHKMIVAFDPLIGLVQALAYPVCMVVVLGGALFIMIGNKEKGFTMMQGAGLGYVLVQMTPIILNILVDAMKAVV >NZ_CP053688|4042837:4056415|4054861_4056415_+|WP_172447765.1|DBSCAN-SWA MDGVTVLQQHDTIVVLDFGSQYNQLIARRIREFGVYSELRPHTITAEEIKQMGAKGIVFSGGPNSVYGENAFFCDEAIFDLEIPILGICYGMQLMTQHFGGTVAKADNREYGKAELNIQNPSALLKDLPTDHVVWMSHGDKVTQQPEGFVVDATSASCPIAAMSNEARKMYGVQFHPEVRHSEYGNDLLKNFVFNICECEANWSMKNYIEVELENIRNTVGDKKVLCALSGGVDSSVVAVLIHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKDEAEGVMKTFSEGFHMNVIKVDAKERFLSKLAGVSDPEQKRKIIGNEFIYVFDDEAARLEGMDFLAQGTLYTDIIESGTATAQTIKSHHNVGGLPEDMQFTLIEPLNALFKDEVRAVGTELGIPDSIVWRQPFPGPGLGIRVLGEITDQKLEIVRESDAILREEIALAGLDKEIWQYFTVLPDIRSVGVMGDERTYDYTVGIRAVTSIDGMTADWARVDWDVLQKISTRIVNEVKHVNRIVYDITSKPPATIEWE >NZ_CP053688|4042837:4056415|4045548_4045824_-|WP_172446745.1|DBSCAN-SWA MFPLKNYYESFIKKEIIGMKKEAALKRLGNILACPVISKDTKESVHIRYFTCKLEGPEMVPDMDRWIGTIALRIENGIVRETALSIPEDKK >NZ_CP053688|4042837:4056415|4052962_4053721_+|WP_172446754.1|DBSCAN-SWA MAYWRNDFISMNKYTRPSIKLKGVKKIVIHWTANPGASAQSHQRYFNGSAIKNKTYASAHIFVDSKEAICIIPLDEVAYHANDHYERNSSGGVYRGVPELAPNANKLSIGVEMCLEKDGTVSQYTITRAVRVVAELCKMFKLDANDIVRHYDITHKPCPKTFIDHPERFNEFKAQVNAVLNPPKQQADSIPYPGILNMGSKGESVKHVQQKLNITADGIFGPVTESAVKKFQASNGLVVDGIVGKNTWSKLF >NZ_CP053688|4042837:4056415|4049228_4049879_+|WP_172446750.1|DBSCAN-SWA MKVNITCRYGEISKSHPHGHTGIDFSFPEGSPIQAIKSGVAHVVDYGNKNIGKGVIIKHSDGSKDIYGHLSEINIKEGQHIYAGDEIGLTGNTGHSTGPHLHFGMKDVQGHYIDPSYHINGILNQAQTHHWYDFLTTAKGVLYNIAVDPKGWVYEQVIKFIEGAWIDVLQNCISALPFCAIVGGSVYILVNLFSKKLAKASFISTIIYGMIISNMG >NZ_CP053688|4042837:4056415|4051323_4052175_-|WP_172446752.1|DBSCAN-SWA MFIEPMLLQNADKPFDSNNHYFELKSNGVRVMLERQDGKNKLFNRNGTEITERIPELENIDLDDCYLDGVLVCYCDGKEDFEAVTNRVSFIQENKILQGSKQFPLTYIAFDILRHKNKNLIKEPLSYRKNILSKTLVDQDSIKKSFYIESEGTMFFEQIKTLGLEGIVAKSKDSTYIPAHRSLSWLKIINWRYGNYYITGYKKQGMGLLISEAINGEFVNVGLVEFGMNTGQKTAFFSITKHIKTGEDKNYIYVEPFVRCVIKSRGQLNNGELIEPIFHDFIV >NZ_CP053688|4042837:4056415|4043995_4045000_-|WP_172446744.1|DBSCAN-SWA MNIEDYFIKEVYFENVKELFQELSPFGKYGSLLRGHVFRGESSNSYQLIPSALREDKKIKLNALSNYTLTEEQFDIEFFQQQSELHLLKKFYTLADERGIPTPDIPFMRNDVLNKFPSFLNGKISSKWIPDELLELATLAQHYGVPTRLIDWSLSHMTSLYFAASGALTKSEENKNEYMVLWALNYEHIEYLKDTTIRIPLRLIKPTYSRNPNILAQKGVLSCWEYENMLTRLNYFQMPEVINTRINRAPLDQLLENYVLQNNINMVDSNSNYIVLLYKFYIPIKDAHTLYHALIKLNYGADCIYAGLNGVYRRMDDDSKFDIEKIDSSQIPFI >NZ_CP053688|4042837:4056415|4048116_4048734_+|WP_172446748.1|DBSCAN-SWA MHHSKVKRLHREEAILQSLKKLDYLTTSQIQILHDLKSERNAQRVLKQMSDYVNVVKQGQYIYFLNAKGREIVDCKKVRKSTGNFLHFVMRNALYIAYGMPSNWKNEIKISSKGATRKDTVVNVADALFKYQDTYHVVEVDNEQSMSNNRKKIEKYDQLINRKAFGEVPPVMIWITTTELRRNQLTDLCSKCGISSQVFTANDFI |
16 | Bacillus_phage(22.22%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
4101465 : 4109808
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP053688|4101465:4109808|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP053688|4101465:4109808|4109244_4109808_+|WP_172446783.1|DBSCAN-SWA MKKIAVFASGNGSNFQAILDATVSGELNAEVKLLVCDRQNAYCIERAKQANIPSFNFTAKDYESKEQYEGEIIAHLKELNVEFIVLAGYMRLIGSTILDSFPGKIVNIHPSFLPLFPGKDAIGQALLAGVESTGVTVHYVDEGMDTGPIIAQEEILIEKGDSKESLEQKVHNVEHVLYVKTLNKLFS >NZ_CP053688|4101465:4109808|4103588_4103843_+|WP_098118149.1|DBSCAN-SWA MFKVRVFVTLRESVLDPQGIAVKNALHSMNFSEVEDVRIGKYMELLIDKNVADLDTTVKEMCEKLLANIVIEDYRYEVEEVVAQ >NZ_CP053688|4101465:4109808|4103839_4104523_+|WP_172446779.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDVDMYHAIKDELGEEVEYVWHDLTNLDEFDGILLPGGFSYGDYLRSGAIAGFANVMDAVKKAAAEGKPVFGVCNGFQILTEAGLLPGTLRRNEKLKFMCKQVELVVENNESMFTTGYEKGQVITVPIAHGEGNYYCDQETYESLKANNQIIFRYQNNPNGSLDDIAGIVNEKGNVLGMMPHPERAVDALLGSADGLQLFRSIVRNWRENHVVTS >NZ_CP053688|4101465:4109808|4104506_4106726_+|WP_172446780.1|DBSCAN-SWA MSLLLEPNPIQIENDRIYTTMGLTDEEFQLVKSIIGRNPNYTELGLFSVMWSEHCSYKNSKPLLRKFPISGEHVLQGPGEGAGIVDIGDEQAVVFKIESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPVALLNSLRFGELETPRVKYLFEEVVAGIAGYGNCIGIPTVGGEINFDPCYEGNPLVNAMCVGLINHKDIKKGQAHGAGNTVMYVGASTGRDGIHGATFASEELSDASDEKRPAVQVGDPFMEKLLLEACLEVVQNDALVGIQDMGAAGLTSSSAEMASKAGMGIEMNLDLVPQREAGMTAYEMMLSESQERMLLVVEKGREQEIVDLFEKYDLHAVSVGVVTDDKMLRLLHKGEVVANLPVDALAEEAPVYHKPSTEPAYYGEFQAMENYIPEINDSKETLKQLLSQPTIASKEWVYGQYDYMVRTNTVVAPGSDAAVIRIRDTKKALAMTTDCNARYLYLDPEVGGKIAVAEAARNVICSGARPLAITDCLNFGNPEKPEIFWQLEKATDGMSEACNVLSTPVIGGNVSLYNETNGEAVYPTPVVGMVGLIEDVEHITTQNFKTAGDLIYVIGAAEAEFGGSELQKLLNGKIFGKAPSIDLAIESSRQEQILAAIQAGVVASAHDLSEGGLAVAIAESTFGQSEVGATITIEGNEVVSLFSETQSRFLLSVKPEHKEQFEALVDAKLIGTVTEETSVTVRNEKNETVLHASVEELKQAWKEAIPCLLK >NZ_CP053688|4101465:4109808|4102878_4103601_+|WP_172446778.1|DBSCAN-SWA MVEQVMLYEGKAKRIFSTENPEIVRVEYKNSATAFNGEKKAEIAGKGRLNNAITSLLFSKLLEAGIASHFVEKTSELEQLVKRVTIVPIEVVVRNIVAGSLSKRMGLDEGVKLEKPIIEFYYKRDDLGDPIINEDHIAALKLATTEDLETIRDIAFRVNNVLVELFNECNVRLVDFKLEFGKLNDGTILLADEISPDTCRLWDKDTNAKFDKDVFRRDLGNLTDGYEEILKRLGGLSCSK >NZ_CP053688|4101465:4109808|4101465_4102761_+|WP_172446777.1|DBSCAN-SWA MIERYSRPEMATIWTEENKFKAWLEVEILACEAWAELGDIPKEDVKVLREKASFDINRIYEIEQETRHDVVAFTRAVSETLGDERKWVHYGLTSTDVVDTALSYLLRQANAILLNDLENFIGILETKAKEHKYTVMMGRTHGVHAEPTTFGLKLALWTEEMKRNLERFKNAIETVRVGKISGAVGTFANTPPFVEEYVCEKLGIQAAPISTQTLQRDRHAHYMATLSLIATSIEKFATEVRGLQKSETREVEEFFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENMTGLARVIRGHMVTAYENVSLWHERDISHSSAERIILPDATILLNYMLNRFGNIVKNLTVFPENMKRNMDRTYGLIYSQRVLLALIEKGMSREEAYDTVQPKTMEAWETQVQFKELVESEGKITSLLSQEEIDDCFDYNYHLSQVDTIFERLGLN >NZ_CP053688|4101465:4109808|4108207_4109245_+|WP_172446782.1|DBSCAN-SWA MANAYKQAGVDIEAGYEAVNRMKKHVQKTMRQEVLGGLGGFGGMFDLSKFNYKEPVLVSGTDGVGTKLKLAFQMDRHDTIGIDAVAMCVNDIVVQGAEPLFFLDYLAVGKAVPERIEHIVKGVSDGCIQAGCSLIGGETAEMPGFYPEDEYDIAGFAVGIADKSKLVTGLSIKEGDFLLGISSNGIHSNGYSLVRKVLLEKGGLALDQHIDQLGHTLGEELLRPTKIYVKPILNVLKKTEVKGMAHITGGGFIENIPRMLPEGIGAEIDYGSWPIQPIFDLLEEIGELKREEMFNIFNMGIGMVLAVSEENLHEIINLLEEDGEKVFIIGRTTSGEGVTFGGGSL >NZ_CP053688|4101465:4109808|4106710_4108123_+|WP_172446781.1|DBSCAN-SWA MLAEIKGLNEECGIFGIWGHIDAAQISYYGLHSLQHRGQEGAGIVVTDGNKLEGAKGLGLITEVFSKGQLNDLHGKAAIGHVRYATAGGGGYENVQPLLFQSHTGSIALAHNGNLVNASRLRKDLEMQGSIFQTTSDTEVLAHLIKRNGSAPLKDSIKASLNMIKGAFAYLVLTQDAMYVALDPNGFRPLALAKLGDAYVVASETCAFDVVGAKYIRDVNPGELLIISDNGIETDQFTSSVNHSICSMEYIYFSRPDSNIDNINVHAARKSMGRVLAKEAPVEADVVIGVPDSSISAAVGYAEESGIPYELGLIKNRYVARTFIQPSQELREQGVKMKLSPVRSIVEGKRVVMVDDSIVRGTTSRRIVQMLRDAGALEVHVRIGAPPLKNPCYYGIDTSTREELIAATNTIEEICQEIGADTLEFISLEGLLNAIGRNHEGPNRGQCTACFTGRYPTVIYDENELVHSQN |
8 | Synechococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
4325007 : 4332909
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP053688|4325007:4332909|DBSCAN-SWA AATGAAAATTACTGTTGCAGGAACAGGTTATGTTGGATTATCAAATGCAATTCTATTAGCCCAACATAATGAGGTAATAGCACTTGATATTATTCAAGAAAAAGTAGATATGATTAATAATAGAATATCTCCTATTATTGATAATGAAATTGAAGTATTTTTGACAACTAAAGAACTTAAATTAACTGCAACTACAGATAGTTATTTAGCTTTCAAAGATGCAGAATATGTAGTTATTGCTACACCAACGAACTACGACCCCGATAAGAACTATTTCAATACTAGATCTGTTGAAGCCGTTATTGCTAATGTACTATCTATTAATCCAGATGCTATAATGGTGATAAAATCAACAGTTCCAGTAGGGTATACAGAGTTAGTAAAAGAGAAGTTTGATACAGAGAATATTATTTTCTCCCCCGAGTTTTTAAGAGAAGGAAATGCACTTTTTGATAATTTAAATCCTTCAAGAATTGTCGTTGGAGAACAATCCGAAAGAGCAGTAGTATTTTCTAATTTATTAGTTGAAGGTGCAATAAAAGAAAATATAGATGTTTTATTTACTAACTCAACAGAAGCTGAAGCTATTAAACTATTTGCCAACACTTATCTTGCAATGAGAGTCGCATTTTTTAATGAGCTAGATTCGTATGCAGAGATAAGAGGATTAGATACGAAACAAATTATAGATGGCGTTGGCCTTGACCCGCGAATAGGGAACCACTATAATAATCCTTCCTTTGGATATGGTGGCTACTGCTTACCTAAAGATACAAAACAATTATTAGCCAATTATTCGGATATCCCAAATAATATTATGACAGCTATAGTTGATGCAAATAGAACTAGAAAAGACCATATAGCAGATATGATAATTAATAAAACTCCTAAGGTTGTAGGTATTTATAGACTTACCATGAAAACAGAATCAGATAACTTTAGACAATCCGCGATTCAAGGCGTTATGAAACGCATTAAGGCCAAGGGCATTGAAGTGATTGTATATGAGCCAGCATTAAATGAAGAGAAATTCTTTAATTCTAAAGTAACTAATGATTTAGACGAGTTTATAAAAGTTTCCGATGTAATCGTGGCTAATAGATTATCAGATGATTTAAGAAATGTTGAGCTTAAGGTATATACGAGAGATTTATTCAGCAGAGATTGATCATTACCTTACTAGAACAAATTAAATCAAATCAAAACCATTAGAACTAGCTTATACAAATACTGGAATTTGGTAAAATTCACATGCGAGAAGAACTAGATGCAGGAACAAACCGTCTAAACTTATCCACAGTAAGAAAAGCACCAGAAGGACTAGTTCGGTTCATTGAAAAACAAAGTATATTTGAAAGATTATACCTAACATCGGTTTTAACATTTGCCGTTCTTTATTAGGTGTATTCAGTGGTATTGTACTAAGGGTAAAAGCAATCGGAATAAAAGGATTCAAAGTATACGTTCCTGATGGAGTACAACTACCTCTTGCAGAATTAGATGTATTAACTAGTTTCGTAGTTCAGCTTGAAGTAGAATTAATCTAATAGATAATTCATGGAAAGCATCAAGACCATCGGGTAACAAGCCGAAGATTAAATTCTATTTTGGCGTTAAAGGAAATTCTTTAGAAAATAGCAGTGAAAAATTAGAATCAATTAAGAGGGATTTATTAAGTCGCTTTGATCAGTAAGTGAATAAATTTAAATTTATTAAAAGCACGACCTTTTTTTAGAGGTCGTGTAATTTTTTTGTTTAAATTTAGTAAAAAAGACAACTCTGATTTACTCCCAATTTAACTACATATTAAAAGGAGAATAACCTTGTCCAGATCAAAAAAACACTCAAAGAAAAAAATGTCCACTGCAAAAAAAGTACTATTAATCATAGTTAGTGTAATACTTGTAATTGGCTTAGGAATAGGCGGATACGCATATTCAATCTACCACAATGTAAATAAAACATCAGATGCAATCTATCAAGGAATAAAGAAAACGGACAAACGAAAAGAAGATTTAAGTGTTGAAAAGAAAGAGCCTTTCTCAATTTTACTACTAGGTGTTGACCATCGTCCTGGTGATAAAGGTCGTTCGGATTCGATGATTGTGTTAACAGTTAATCCAAAAACAAGTACAACTAAAATGGTAAGTATTCCACGTGATACGAGAACTGATATTGTTGGAAAAGATAAAGTAGATAAGATTAACCATGCTTATGCGTTTGGTGGAATCCAAATGTCTGTTAACACGGTTGAAAATTTCTTGAACATTCCGATTGACTATTATCTTGAGGTAAATATGGAAGGGTTTAAGGATATTGTTGAAGCAGTTGATGGGGTAGACGTTAATAATGATTTAGACTTTACTTATGAAGGCGTGCACTTTACGAAGGGGCAACTTCATTTAAATGGTGTAGATGCGTTAAAGTTCTCTCGTATGCGTAAGTTAGACAAACGAGGAGATTTTGGGCGTCAGCTTCGTCAAAGACAAGTGATTGAAGCGGTTGTTAAAAAAGGAGCAACCATCTCTTCTCTAACAAACTATCAATCTGTATTACAAGCGATTCAAAAAAATGTAGTGACGAATATTAGTTTGAAGGATATGGTTTCAATCCAAAAAGATTATCGTACGGCTGCGAAAAATGTTACTGAAACCCAAATTACAGGTGAGAGTAAGAAGATTGACGGAATCTGGTATGTAATTGTATCGAAAGAAGAACAAGATAAAGTATCAACTGAATTGCGTCAACATTTGGAATTACCTTAAGAAGTGAATAAATAACGAAACCTTCAAATAAACATCGTTAAAAATTATATTTTTAGCGGTGTTTATTTTTTTATGTCTTTTTATATTTATGACTCTACTAATTTCTTCTAAAATTCACCCCAAAATACTCATTCCTCCCAAATTAGAGTTTTACCTACACACACCCTTATTCATCAACATAATAATATATATATTCCTAAAATTATGAGTAAAAATGTTTAGGAGGTCTTGACGATTAAAGGCATTATACTTGCAGGTGGTAGTGGTACGCGACTTTATCCATTGACGATGGTGACTAGTAAGCAGCTATTGCCTGTGTATGATAAACCAATGATTTATTATCCGTTATCTACTTTGATGCTGGCGGGGATTAGAGAGATTTTAATTATTTCGACTCCAGAGGATTTGCCTCGATTTGAGGCGTTGTTAGGTGATGGGTCTCAGTTTGGCATTTCTTTGCAATATAAGGTACAGCCTAGTCCGGATGGGTTGGCTCAAGCTTTTATTATTGGTGAAGAGTTTATTGGAAATGATTCTGTTGCGATGATACTAGGTGACAATATTTATTATGGTAGTGGGTTGCGTAGTATTTTGAAAAAAGCAGCGTTGAAAGAAAACGGAGCGACAGTGTTCGGTTATCATGTTCAGGATCCTGAGCGATTTGGGGTTGTGGAGTTTGATGCGTCCGGGAAAGTTTTAAGTATTGAAGAAAAGCCTGTTGCTCCGAAGTCGAATTATGCAGTGACTGGGTTGTATTTTTATGATAATCGTGTCGTTGAAATGGCTAAAAACGTAAAACCATCTCATCGTGGTGAGTTAGAGATTACTTCTGTCAATGAAGCTTATTTAAGCTTGGGCGAATTAGATGTAGAGCTTTTAGGGCGCGGTTATACATGGTTAGATACTGGTACGCATGAGAGCTTGGTTTCGGCAACGAATTTTGTAAAGACAATTGAGGAGCATCAAGGGATTAAAATTTCTGCTCCGGAAGAAGTTGCTTATATTAATGGATGGATTAATAAGGAGCAATTATTACGTTTAAGTGAGCATCTGAATAAAACGAGTTATGGACAATATTTACGAAAAGTTGCAAGTGGCGAGATTAAATATTAAGGAGTCATTATCTTTGAAGATTACAGAAACTTTTTTAAAGGGTATTGTAGTTATTGAACCGACTGTTTTTGGTGATCACCGTGGTTGGTTTATGGAAACATATAATGATTCAAAAATGAAGGATTTTGGCATGGATTTACATTTTGTTCAAGATAATCAATCGTTTTCAGCGATGAAGGGAACTTTACGTGGCTTGCATTATCAATTATCTCCAAAAGCACAAACGAAATTAGTGCGGTGTACAAGGGGCTCGATTTTTGATGTAGTTGTAGATATTCGAAAAGGGAGTCCGACATACGGGGAATGGTTTGGGATTGAATTAAGTGCTGAAAATAAAAAGCAATTATTAGTACCAAAAGGGTTTGCTCATGGTTTTATGACATTAACGGATGATGTGGAAGTTCAATATAAAGTAGATGAGTTATATGCACCTGAGTGTGATCGAGGGATCAACTGGAATGACCCTGACATAAAGGTCGAATGGCCAATCAATCTTTCTCCATTATTATCAGCAAAAGACAAAACTGCTCCATTATTAAAGGATGCTGAAATTAATTTTGTTTATAAGGAGCAATAAAATGAAGATTTTAGTAACTGGTTACGGCGGGCAACTCGGGTACGATGTCGTTAAGGAATGCGAACGACATGGTTTAAATGTTAAAGGCTGCGGTCGAAAAGAGCTTGATATTACGAAGAAAGAATCAGTATTCGCTTTAGTAGATTCATATAAACCTGATGTAATTATTCATTGTGCTGCTTACACAGCGGTCGATAAAGCTGAAGATGATAAAGTGAATTGCTGGAATGTAAATGTTGAAGGCACGAGATATTTAGCTGAAGCTGCAAAAAAGCAAAATGCAAAATTTGTTTATATTAGTACAGACTATGTATTTCATGGAAAAGGTGAAAATCCTTTTACCGAAGAGGACCAACCTGAACCGATTGGTTATTATGGTTTAACAAAGTATGAAGGAGAAAAAATTGTTCAGTCTTTAATCGAAAAGTATTTTATCCTTCGCATTTCGTGGGTATTCGGGATTAATGGGAATAATTTTATAAAGACGATGTTAAAACTATCAGAGTCTAGAAATGAATTAAATGTAGTAGGTGATCAAATCGGTTCACCGACATATACTGTTGATTTGGCTAAATTAATAGTAGAACTTATCAAAACTAACAAATACGGAATTTATCATACTACAAATGATGGCTATACTAGTTGGGCAGAATTTGCGGAAGAAATTTTCAAACAAGCCGACCGTAAAATGTTAGTCAATTCAATTGCAACCGAAGAATACCCTACTCGGGCTTCTCGACCAAAGAATTCAAGATTATCGAAACAAAAGCTAGTTGAAAATGGATTCACTCCTTTACCTTCATGGCAAGATGCACTAGCAAGATTTTTAGTTCAATTGAAATCTAGTTCAATTAGAGACGGGGTACAGTAATAAATGAAAGTAGCGATTACAGGTGGTGCCGGGTTTATCGGTGGCAACTTTGTTCAATATATGTTGAGTAACTATCCTTCCTATTCGATTTATAATTTAGATGTTTTAACATATGCAGGTGATTTAACGAAGCATAAAAACATCGAAAAAAATGAGAACTATCATTTTGTAAAAGTCGATATTACGAATCGTGAAGAGATTGTAAAATTATTTAATAAAGAAAAGTTCGATTATGTCGTCCATTTTGCAGCGGAAAGCCATGTGGATCGCTCAATTGCCGAGCCAGAAATATTCGTCAAAACAAATGTGTTAGGAACCCAAGTTTTATTAGATGCTTCTAAAGCAATTAGTATCAAAAAATTCGTTCACGTATCAACTGATGAAGTATATGGTGAATTGGATTTCGATCCTACAACATTTTTTACTGAAGAGACTCCGTTACAACCAAATAGTCCGTACTCCGCAAGCAAAGCATCATCTGACTTTCTAGTTCGTGCCTATCATGAAACATTCGGATTCCCTATGAATATCACACGCTGCTCAAATAACTACGGTCCATATCACTTCCCGGAAAAGCTAATCCCATTAACCATTTCACGTGTTGTAAATAACCAAAAGGTTCCTGTTTACGGGACTGGAGAAAACATTCGAGACTGGCTACATGTGCTAGACCATTGTGCAGCAATCGATTTAGTTTTGCATAAAGGACAAAATGGAGAAGTTTACAATATAGGTGGGCATAACGAACGTACGAATTTAGAAGTCGTTAAAACAATAATTTCAACTCTTGGAAAATCAGAAGACTTAATTGAATTTGTTCAAGACCGCTTAGGTCACGACAAGAGATACGCAATAGACCCTAGTAAATTAGAAAAACTTGGATGGAAACCTACTTATAATTTCGATACTGGAATTGCTCAAACTGTTCAGTGGTATTTGGATAATAAGGAATGGTGGGAAGCGGTTGTTTCTGGTGAGTATAGGAAGTATTTTGATGAGCAGTATTCCCTAGAATAAGGATCTTGTTGTTTTTAAGGCGTTTTTACTTTAAAAAGTAAAGCGTCTTTTTTATATTTTGTTACTTACGAAGCAATTTCGTTAATCGACAAATAGCCATTGGAATAAATTCTTATTCTGGTTATTTTATTTTTTAAATATGAGAAATATTTCACTTGATATTATATTAATCTAACTTTAATTGAAATTTAATTTTAAAAAGTACTGATTTTTTGTGACATTTTTTATGTTATAATACATTTTGTAGCATAAAATGACATTTATTTTACAAATTTTATTAAAAACATTACAAAAACTTAATATTATATTTTACTTTAGAATAATTTTCTGAATAATTTGTTTGTTGAAAAATAAATTAATGTAATTTTTTTCAGAAAGTTAAAATGGTGGGAGAAATTAAGTTTTAATAAAGGGGGAAAACGGGTGAATCAACCATTAATTTCTGTTATTTTACCTATTTATAATGTCGAAAGTTATATCAATGAATGTTTACATTCATTATTAAATCAAACGATTGGGTATGAAAAGTTAGAAGTGATTATGGTGAATGATTGCTCGTCCGATCGTACCCCAATTTTGATTGATGAGTATGCAAGTAAGTATCCAAACTTTAAAGCAATTCATTTCACGGAGAATTCTGGTGCTCCTGGTAAACCGAGGAATGTTGGAATTGAAAATGCAACAGGTATGTATACGATCTTTTTAGATCCAGATGATGTTTTACCTTTAGATGCATACGAAAAATTAATTAATGTAATTGAAAACAGTGAGTCTGATTTTGTAATGGGTAAGATGATCAGCTTTGATGATCAAACGAAGCGTAGACACGAACATGTTACATTTAAACAATATCAATTACAAAAGAAATATATTGATGTGAATATAGAGGATGCTCCTTTTTTCTATCAAGTTAAAACAGCAGTTTATTTAAAATTAGTAAAAACTGAATTCTTGCGACAAAATAATATTAATTTTATCGAGGGTATGAAAAATGGAGAAGATAAATATTATGATATTCAATTATTCTCTAAAGCTAAAAAGTTCAGCTATATTCCTGAAGTAATTTATTTATATCGCGGAAGAAACGATGAGAAAAATCTATCTTTAACACAAAGAGATATTATTAGTACGGTCCAAAATGATGTGAAATCGGCTTTGTTAATAAAACCTTTACTTTCAAAAAAAGATTTCAAATATTTTCAGATTAACGTATTTAGATCAATTTTTTGGAAAACCGGTGACGCAGACTTTAAAAATTTACCAAAAGAACAACAGTATGCCCTTTTTAATTTAGTAAAAGATGTAGCAATTGGATATGACCCTGATTTAGCTAAAGACTATATGGAAGTAGAAGAGCCAATCCTTAGTTTGATTAGCTCTGGACATATTGAGGAAGCTTTAGATTATAATCTTTTATTAATTTCTAGAAGATGGTGGTATAAAGTCAACATTGAATTAGCGAAAGATTATAAGAAGTCGAGAAAAATTAAGAATAGTAATTTTTGGAAAGTGACAAATCCATTACGAAAAGTTATAAGTCTTGTAAAGAGGGTGTCGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP053688|4325007:4332909|4331796_4332909_+|WP_172447783.1|DBSCAN-SWA MLPIYNVESYINECLHSLLNQTIGYEKLEVIMVNDCSSDRTPILIDEYASKYPNFKAIHFTENSGAPGKPRNVGIENATGMYTIFLDPDDVLPLDAYEKLINVIENSESDFVMGKMISFDDQTKRRHEHVTFKQYQLQKKYIDVNIEDAPFFYQVKTAVYLKLVKTEFLRQNNINFIEGMKNGEDKYYDIQLFSKAKKFSYIPEVIYLYRGRNDEKNLSLTQRDIISTVQNDVKSALLIKPLLSKKDFKYFQINVFRSIFWKTGDADFKNLPKEQQYALFNLVKDVAIGYDPDLAKDYMEVEEPILSLISSGHIEEALDYNLLLISRRWWYKVNIELAKDYKKSRKIKNSNFWKVTNPLRKVISLVKRVS >NZ_CP053688|4325007:4332909|4328005_4328884_+|WP_172447782.1|DBSCAN-SWA MKGIILAGGSGTRLYPLTMVTSKQLLPVYDKPMIYYPLSTLMLAGIREILIISTPEDLPRFEALLGDGSQFGISLQYKVQPSPDGLAQAFIIGEEFIGNDSVAMILGDNIYYGSGLRSILKKAALKENGATVFGYHVQDPERFGVVEFDASGKVLSIEEKPVAPKSNYAVTGLYFYDNRVVEMAKNVKPSHRGELEITSVNEAYLSLGELDVELLGRGYTWLDTGTHESLVSATNFVKTIEEHQGIKISAPEEVAYINGWINKEQLLRLSEHLNKTSYGQYLRKVASGEIKY >NZ_CP053688|4325007:4332909|4325007_4326174_+|WP_172446937.1|DBSCAN-SWA MKITVAGTGYVGLSNAILLAQHNEVIALDIIQEKVDMINNRISPIIDNEIEVFLTTKELKLTATTDSYLAFKDAEYVVIATPTNYDPDKNYFNTRSVEAVIANVLSINPDAIMVIKSTVPVGYTELVKEKFDTENIIFSPEFLREGNALFDNLNPSRIVVGEQSERAVVFSNLLVEGAIKENIDVLFTNSTEAEAIKLFANTYLAMRVAFFNELDSYAEIRGLDTKQIIDGVGLDPRIGNHYNNPSFGYGGYCLPKDTKQLLANYSDIPNNIMTAIVDANRTRKDHIADMIINKTPKVVGIYRLTMKTESDNFRQSAIQGVMKRIKAKGIEVIVYEPALNEEKFFNSKVTNDLDEFIKVSDVIVANRLSDDLRNVELKVYTRDLFSRD >NZ_CP053688|4325007:4332909|4329462_4330332_+|WP_172446939.1|DBSCAN-SWA MKILVTGYGGQLGYDVVKECERHGLNVKGCGRKELDITKKESVFALVDSYKPDVIIHCAAYTAVDKAEDDKVNCWNVNVEGTRYLAEAAKKQNAKFVYISTDYVFHGKGENPFTEEDQPEPIGYYGLTKYEGEKIVQSLIEKYFILRISWVFGINGNNFIKTMLKLSESRNELNVVGDQIGSPTYTVDLAKLIVELIKTNKYGIYHTTNDGYTSWAEFAEEIFKQADRKMLVNSIATEEYPTRASRPKNSRLSKQKLVENGFTPLPSWQDALARFLVQLKSSSIRDGVQ >NZ_CP053688|4325007:4332909|4328897_4329461_+|WP_172446938.1|DBSCAN-SWA MKITETFLKGIVVIEPTVFGDHRGWFMETYNDSKMKDFGMDLHFVQDNQSFSAMKGTLRGLHYQLSPKAQTKLVRCTRGSIFDVVVDIRKGSPTYGEWFGIELSAENKKQLLVPKGFAHGFMTLTDDVEVQYKVDELYAPECDRGINWNDPDIKVEWPINLSPLLSAKDKTAPLLKDAEINFVYKEQ >NZ_CP053688|4325007:4332909|4330335_4331349_+|WP_172446940.1|DBSCAN-SWA MKVAITGGAGFIGGNFVQYMLSNYPSYSIYNLDVLTYAGDLTKHKNIEKNENYHFVKVDITNREEIVKLFNKEKFDYVVHFAAESHVDRSIAEPEIFVKTNVLGTQVLLDASKAISIKKFVHVSTDEVYGELDFDPTTFFTEETPLQPNSPYSASKASSDFLVRAYHETFGFPMNITRCSNNYGPYHFPEKLIPLTISRVVNNQKVPVYGTGENIRDWLHVLDHCAAIDLVLHKGQNGEVYNIGGHNERTNLEVVKTIISTLGKSEDLIEFVQDRLGHDKRYAIDPSKLEKLGWKPTYNFDTGIAQTVQWYLDNKEWWEAVVSGEYRKYFDEQYSLE >NZ_CP053688|4325007:4332909|4326862_4327771_+|WP_172447781.1|DBSCAN-SWA MSTAKKVLLIIVSVILVIGLGIGGYAYSIYHNVNKTSDAIYQGIKKTDKRKEDLSVEKKEPFSILLLGVDHRPGDKGRSDSMIVLTVNPKTSTTKMVSIPRDTRTDIVGKDKVDKINHAYAFGGIQMSVNTVENFLNIPIDYYLEVNMEGFKDIVEAVDGVDVNNDLDFTYEGVHFTKGQLHLNGVDALKFSRMRKLDKRGDFGRQLRQRQVIEAVVKKGATISSLTNYQSVLQAIQKNVVTNISLKDMVSIQKDYRTAAKNVTETQITGESKKIDGIWYVIVSKEEQDKVSTELRQHLELP |
7 | Escherichia_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
61626 : 134022
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP053689|61626:134022|DBSCAN-SWA CCTATGCCGCAACCTGCTCCCGATATTTTATCGGGGGCAGGTTATTTAGTTTTATTTGAATTCGTTCATTGTTATAATAATAAATATATTCTTTCACAATCTCAATGATTTTGGAGTTGGTCGCTGCGTAATCTTGAGAATAGAAGGCTTCTGTCTTCAAATGTGAGAAGAATGATTCGATTTGAACATTATCGTAGCACACTCCTTTTTGGGACATGCTTTGGATAATGTTCTTTTCTTTTACGTATGCCTGAAATTTGGGCGATGTATAGAGACCTCCTTGATCAGAATGTAGAATAACCTTGTTAATTTTCCTTTTCTCCAAAGCTTGATCTACTGTATCGTAGGCTAACTTTAGATTGGGAGAATCACTTATTACGGCGCTTATTACCTCGTTATTAAATCCATCAATAATAGCTGATAAATATAAATGCTTTTCTCCAAATGTTAGTGTCGATACATCTGTATACCACTTTTGGTTTGGAGCTTTAGCTTTAAACTTTCTTTTAATTAAATCTTACATTTTCACACTTTCAGAAGGTTTATAGTGCACAAACTTTCTTCTTCTGATTTTCGCAAATAACCCAATTTCTCGCATTAATCTTCTAACTTTCTTCCGATTAATTCGCAAACCGTGAACTGTCTTTAATTCACCTGTAACTCGTCGGTAACCATACCTTTTCTTATGTTTCTTATATATTTTTTTAATCAATTTAATTAATTTCTGATCATCATTTGAAAGCTTTTGTTTTTTCCAACGGTAATAACTACTTTTTGGGATCTCAAGAAACTTTAACATTTCTCGAATAGGATATTTTGTCTTTAGTTCCTCTAATACCTTTACAATACCTGTCTTCGTTAATTTTTTGAGATCCCTTTTAACTTTCCCAGTAATTCATTTTGCATCTCAAGTTGCCTAATCCTTAATTTAAGTGCTTCAACTTCCGAAAGTTCTTCTATCCCTTTATTAAAAGTATATTGTTTACCCACTGGCTGATTAAATCGATGTGTCTCTCCAGCACGATACCACTTCATCCATGTCTTAATTTGTGAAACATTTTTTATTCCTAACGTTTCCATAATTTCTTTATTCGGGCAGCCATCCTCTTTCATTTTTACAGCTTTCCATTTTACAACTGGATCATAATGAACTCTTGTCCCCATAAAAAATACACCTCTTATGAAATATAGTTTAACTATACGACATAAAAGGTGTTTTTTCTTGTGTCCCACTTAGAGGGTTCACTCTATAATCGGATATAGGGTTTTTGAGGTTGGGGTTCCTATTCTTAGGAAACTTAGGAATGCTAAATAGGATGCAACTACAGGATTGCGACCTAATAATAGTATTAGCAAATATTTTATTTCTATTCAAAAAGCTTAATCATGTAGGTATATTAACTGTTTCATTAGAAGTGTATATTGATAATAAAATATTTTTTTAGTTATTGAAAGAGTCTCAGCTCTAGTGGTAGACGTATTAAACATTAGTTGTATATTTTATTGATTTTTTTCGAGTTATCTTAAAATCAGTTTTATATTTATACTACTTAAATTTGCTACCCCTTCTGCGTTCAAACTGTTTTACAAGAGATACCTCAAATTTAGGCAATTTCTTTATAGGCTGAAAACTATGTCATCGTATAGATTAAGATATAATGAATTTATACATATCATCATTTTTATCCTTATCGTCATAAAATACATCTAACTTTTTCTATCAATTTTATATTCTAAGAAATTATGTATCTCGTTACCCTAATTATAAATATATATGATATTATATATGTCTAAATATAATTCAAAAATGAAATAGATATATAACATATTTTCAAATTCATCACTATTTATATCATATTATTATATTTCGTCACCATTCACAAGCAGTTGACAAAGTTTCCTCGATATCAGCTAAAAAAAACTGGTTAGGCAATGTCTATCTAACTGCAGGTTCGGGTAGTGTCCTTTATGCTTTTTCATTAGAAGCTCTTCGATGGTATTGACTATTGATAGTTCAGTTACCTAATCTTGTACGAAGTTCGTGTTCCTTAGGTTGGAAACCTTAATCTACCCCTTACTACTGCCGTTATGGTTCAGAACTTGCACCTTATAGATTGTGTTCATGCTGGGTACACATAGAAAAAGAGAAGTCGATAAACAACTTCTCTTCATGCCTTGAGTATTGTAATCCTAATTGAGTTAATACGTTATCTAATGTAACTCCTTTATAAGCAGTTTTTGCTTTTGGCGCATTTGATACAGTCGGATTTTTTAGTCCAAAGTTTTCAATAATATAATCCATATCTTTTTTATCTACTACTTTATCAAAGTTAAAATCTGCAGTTGCTTTGTTTGTACCCCAATATGTTTGTACTGCTAATGCATCTAGAATATCGATCACATTATCTTTGTTTACATCTCCTGCTGCTGCAGTTGGTAAATTAAAGGCTAATCTTTTTCCAACTACTTCACCACGTACATTATTTGATAATACAACTTGTTTGTTCATAGTGAAATGACCTGGTACATCAACAGTTAAGGTATAAGGAGTTACGTCAGCTTTTAGACCTTCAATGATATAGGGGTAAGTCCGAGATAAGTCCAAAAAGCGCCATACAGGTGTAAAAAAATGTAAAGAGGGCACAAAAGCCCTCGTTAAGCTGTTTTAAACTCTAACCCAAGCTTTCCATCTAAAGGTTGAGGTGGTTCTTCTAAATCAATAACGTAGTCGCCAAATCTTTTAATATGTTCCGTAAGATAAGGACTAAGTACACTTAGATCTTCCGGGTCTACGTAATACCCTTCTCGCTTTAACTGGCGTATCACCACAGTCAAATCCACGACATTTTGAAAAATAACTGCATTTGCTACTAGGTCTCCGTACTTAATGGACTTTTCCTGTTGTTCAGGATCGTTGTCGGAAATAATACCATGCCCACCAAAGAATAACCATTTGGAAAATCCGTTATAGGCCTCTACTTTGTTAGTGGTAGCAGTGATTGTCCTGCGCAAATCGATATCAGAAATGTATTGGAGTAAGAAAACCGTGCGTACGACACGTCCCAACTCTCTGAATGCCTGATAGAGCTTGTTTTTTTGACTGTAATTCCCAAGCTTTCTCAACAACATAGCAGAAGAGATTTTCCCATGCTTAATAGACAAGACCACCCGTAATAGGTCTTTCCAATGTAATTCGATTAAATCCCAGTCGATCGTATCGCTAAAAAGAGAATCGATGTGCTTATATTTCATTTCAGTGCAAGGCCGGAAAAAAGTGAGCTTTTTGAAATTCCGAATTCTAGGCATCAGTTTGATACCCAGCAGATGAGATAAACCAAATACTAGCGTAGATTGGCCTTGTGTGTCGGCGTGAATAGTGTCTGTTTGCACATCCGACTCGTTTTTCAGCAAACCATCAAGGATATAAACGGCTTCCCATACTCCGCAGGGGATGAAATGACTGAAAAGAGCAATGTAGTTGTCTGAAATGTGGTGGTACGCAATCCCACCATAGCCCCCATAGCGAATATGGTATTCGGCCAATAAGTTCTCTTCATAAATATCGTATTTGGTTCCATCGGCCGCAGCAGATTCACCTTTTCCCCAAAGCTTGGGTAAATCAAACTCATGATGATAATGGTTTATGATATCTTTCAAAGCTTGGTCAATTTTTCTTGACGTAATATGCCTTTGATTTGTATAAGATAGGACATTACCGGTCACATCCGTCCTCATATGCCGAGCTGCTTGAACCGGTCCTAAATTGCATCCATAAGCAAAAGTAGTTAAGATGTATCGTTCACGTGGATTTTTTAGCTTTGGATCGGACCCGGAAGATGGCCCGAAATGGCGTGTCCAATTAACCCAGTGTTCGACATTGCATAAGACATCAATCAAATTTCTTTCGGGGAGACGTTCTTTAATCATCTCCTCTAATTCTTTCAATGACTTTTTGTATTCACGTTTCTTCACTTTTTTTAAAATAGGCTCACCAGCTTCGTTGATGCTCACATGCTCATTATCAGGGAAGTACTGGTCAATTTGTTTCGAAACCTCGATCATCCATGATTTCAATCCTTTTACAAAGTCTACCTCATTTTCAGGGAAACCTAATTCGCGACAGTATTCCGGTATTAAAGGTTCACACTCTTCCCAAGGAAGCAATTGTTTTCGATAGTCAGCATATGACTCGGACTCCGGGACACAAATATCGCCAGATTTTAGTTCTGTTGCAATACAAGAGAAGACACAAGCCTCTAAGTGCCGACGGTGAACAAGCCAACCTCCAACTCTTTGTTTTACCCGAACCATCCTGCGCCATTGATCAGAGGCAAACGAGAGATCCACTTCATCGGGTAGCCAATCCGTGCGCTTGTTCCTGTTTTCTATAACAAATTCAAGCGCATGCATCAAGGATTGATCTTGAGAGGTAGATGTAAACTGCAACAGATCAGCAAGCCTGAAAAGAGTAGACCGACTCAATATAACCATGTTTCTTGATTGTTTCGATGATCCCAGAACGAGTTGCTTCCGTTCCAAGCCCTTCCACTTCTTTTAAAATCTCCATTTCTTCTTTATTTTCAACTGATTTACCGCATGTTTTCATCACTGAAATCAATTGACCTTCTGTATAAGGTTTAGGTGCAGTTGTAGTTCCTTCTTTTAATTTCACAACACTTACTACTCTTTCATTTTTTTGAAGTACTGGTAAGGCTTGTGAGCCTTCATTATTGGTTTGATTCTCATTTTTTTCATCATTTTTAAATAATTCTTTCCAACCTTTACTTATTTTTGAGCTACCAGTTGTCTCAAATTCAAGACCTTTGACATCTGTCACGACTTTTGTCTCCTCATAAATGTAATCCGAATGGAACATTGCAAGTGTTGTTCTTAATATTTCAAGGTAAATATTCTTTTCGTCTCCTGTTAAGCCCTGTAAAGTACTTTCAGAAGGAATAGTTTTAGTTGGAATAATGGCGTAATGCTCCTGGACTTTCGAA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60 | Bacillus_phage(36.36%) | transposase,integrase,protease | attL 119719:119743|attR 141195:141219 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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