Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053292 | Clostridium butyricum strain 16-3 chromosome 1, complete sequence | 6 crisprs | DEDDh,cas3,csa3,DinG,csx1 | 1 | 1 | 11 | 0 |
NZ_CP053293 | Clostridium butyricum strain 16-3 chromosome 2, complete sequence | 2 crisprs | DEDDh,RT,WYL,csa3 | 0 | 2 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP053292_1 | 278668-278756 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053292_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053292_1
>1.1|278692|41|NZ_CP053292|CRISPRCasFinder TGAAATACTTATAATTTAATTTTAGACTTTACATATCTTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053292_1
The CRISPR arrays of NZ_CP053292_1 >merge|NZ_CP053292|1|278668-278756|CRISPRCasFinder GTCTTATATTAACAATTGTATATTTGAAATACTTATAATTTAATTTTAGACTTTACATATCTTATGTCTTATATGAACAATTGTATATT >NZ_CP053292|1|1|278668-278756|CRISPRCasFinder GTCTTATATTAACAATTGTATATT TGAAATACTTATAATTTAATTTTAGACTTTACATATCTTAT GTCTTATATGAACAATTGTATATT
>NZ_CP053292.1|WP_002582350.1|276529_278173_+|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase-family-protein MIKRLKKTSALIVLATTLATIVPVGNTQIRAEAADKYSNEFSNNYNIESLENNISLASEETSEDKQIAGKITQYINGKYPGATVKVQSPKYIKLTITKSIAEKMATQICSSNDTIRQILKNEPNLVKPGASQDEVNKIVDSMTDEQIESVKPKVYNAVYQTILAFDGQSVPVYGYEVVSGDQIEDTGYFVGGKIGALIMQKEGKPLCVSTEFIKDLNNQITNKILEEIKQKISEIIQNSGITEIIDKVLKKVNSVVSDVTDTIEDLSDAIDDLTDSIKDKADDIDDAWDKVFDRFDNDEGWGKKDGYMYYYDKDGISLKGVQKIDGKTYYFNRIDGAMETGWQIVDGKRCYFDEKKGYQLFLQWVQDGEDWYFLSDQGPVKKSEWVNDNGRKYYLKSDGKMTKDWLKIDDDWYYFNGSNGAMEYSTWKYSNDKWYYLNQDGKAANDWTYINENWYYFRENSCSMETGWFRADGSWYYSDSTGAMKTGWIQGDDGWYYLDDTSGKMKKNEWGYSNGSWYYFNINGAMVTKARYIDGVKYNFNSDGRMA >NZ_CP053292.1|WP_043852458.1|274944_275937_+|transposase MIERDWKFEKIKKYKENALRENIYNKENVKKYKECPYCGSKSFIKYGNYNRIQRYKCKNEECKKTFSNTTNSVWKYLKHKPEKWFEFIELMGEHTTLNECAAKLEISIVTAFYWRHKIFHAIENNYKPEKFDEVVYVDTYYTEKCYKGSRNKNYTYADKVKNKFDKMYGLVPRNVSVLIAEERGKMPLIRRTENDETIVNNFNNNVLKIAAKDCYMRTDYFTNKKLKNNLLQYNKKLSNETKKKYGLKIIGNRIEDKIKEDKKKNIMAYLTAWLSRCKGIATKYINHYYNFYSLIDSEKVFDYMSIFFDLLKNGSYTSVEVLRTNHVEDY >NZ_CP053292.1|WP_043852457.1|272235_274473_+|cadherin-like-beta-sandwich-domain-containing-protein MRAKFNFKRVFAYLLIFAMTFSFVQMGQANPVKAATSGSKEVNDSFKFIIGDASSGTTKDVDMDYSGDLVLRSVTLSQTYTIMPQAGYNIESVKSSSDKMKITKAVSGTTNTFTIGTIKDYSNFKLTVKVKNSSGEINTYDIRIEFNIDSSLEFNKLRITVDNDDPVTLTYTQCDSEGIYYYEESNPEAKKAKIEMFDDSNNAMSFKVNGGTNKTVNLVGGDNTIELTVTSAGYSKVYTLVITKKGVAKLKSLVPSTGSLSPSFNSDTTEYTVTVPTTQETIAFTPTAVDNSSTIKVKKITVASGKKSQDIKLDEGENEIPIVVTNKDGDVTTYKVTVTRTEKFRSANLKSLKLTSGTLSPTFNKGVYQYTTIVENTVSSVGVTPVAEDTNATIEVNGKEIPSGATSPYINLDEGGNVINVTVTDSKGNDNTYVIMITRKYSKNNVNLSSLSVTDGTFSPKFDPEIYAYSVKVPRNIEEVRIKFETQNEKSKVTINGVEYKSGQQSDKIKLDLGANTVVVKVVSEDNKSTVNYTLSIIRDKVQGTLNEWVLVGGEWMYYDGDGIPAKNRWVKYDNQWYHVDVNGYMNKDGWLFDGGKWYYLDPNGIMLYGWIKDTGFWYYLRESGEMVEDSWTMLDGNWYFFNQYGQMQTGWTLYKGKWYYLDDHGVMQKGWITYDKNKYYLDDDGTMRTGWLYNGKVWYYFESSGRMVTGWQTIGNRSYYFDSKGAMKTGMLFLDGRWINLDSL >NZ_CP053292.1|WP_043852456.1|270737_271715_+|substrate-binding-domain-containing-protein MKKLLSLLMVFVLMFTALGCSKNGSKGTSIGNTKVFASIADDDKFKQTIVSGMESYADENNVDLDVAIAHNNVEAQVQQIKDAKTKEYDVIVCILVESDTAQQIINAAGDIPVIFANVEPDSGRLKSDKYIYVGSDENEAAKYTFESLKEYFKDKKSFNAVLFEGSMDSKSASVRTESLKSQLKKNGFDVNYVFQDDAGWDREKAKKMFEAFLKLNVSYDCIISNNDEMALGVIDAMEENGIDPSKVPILGLDATPEACKAISNGKMSFSIKQSGEGQGESVIKAAQALKNGDKISEIENGDSSGKYIWYPYSKVDKSNVQQYMR >NZ_CP053292.1|WP_043852455.1|268716_270723_+|methyl-accepting-chemotaxis-protein MWHAKINKKGGKYIPIKYKILSVILPVIILAIGGLITVSYNKSSKIIEENSYSMLESSVKNQTIQIENWLENNLQTFNTIKKSLGSTQYSQEELKKILNQYYNFNSNFLDGLYISDLQGNVISADNSQMKFENATSSQWFKEGLTHIKMRYGEAHDDYAGNKVISATGLIVDNDNNPVGVIGADVTLNRISIIVNSLIEMDDAQSFLVNKDTGMVLASSDSLEPYTILGENNENLLYSKIAQSIESGQHSEQEIENNIVDMHDVKNTSWILVSYVPKSSILSSMFTLRNYMVIIAIVALAVLVLITHRTINYIINPVNDISKKIVKMAEGDFSIDIDVKSNDEIAVMSQSLKNFIESMRVMLNDIKDISMEQKNQSFESKNISEHLFDSSKQQAESMNNLNIVVGEMAEATNQIADTATSLAGIACETNDNGNKVKDKMIETVKMSEVGKKDMEHVEISIRTIETSIKELKDVIDEVGKSSEEINSIVSIIGEIAESTNLLALNASIEAARAGEAGKGFSVVASEIGTLANNSTSSVNDIAKLINNINKLISNVVSKVNESVNHVNESSELITDSVRKFDNIYNTINESDKLVADMLKKVEEVGKAADNMAAISEEQAASSEEISSTSQDMLEHSQNITQSSYNVAKGADVLSDIAKQLESEVEKFKL >NZ_CP053292.1|WP_043852454.1|266730_268248_+|cadherin-like-beta-sandwich-domain-containing-protein 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MIKRMNKLTALMVAATAVASIVPAVSASAAAKLEVQEGNIDAAVAYGDGKYVYDGYLTDDDESGLYFNNGTKDSFLENDEDYEFGSEKYGTKYTIVENDGEDYLLDLSSGKVLDDESIEDLRNNVELKLRTTLKKADDRYATVNNKIVFENNDEIAQVLGNQFGDVWYSYGVKSADSDKTLYGFANESGKYIDASALANMTVSTTDSAVRVTEFDKEKNDAMVSLAEAPKVIAQDSSYLYAITKVNVTIAGEADGTRTYIQKISKAQGDTKDGAYMPKSVDSYEISSNFYIDKDNDDTAKAEELLLDENNMVRVIKDTIYVTTVSEDGKVYVNTIKLKKEKVTKNDGTKKLDVYVAVKDQDDDEKIEGGANAVSIDAEGNTWAVNKGKIYKFNGTEFVEVYTCDRTIDHLDVYDENNLIAWNKENEVFATVQTKDGNGTDEGDKEETKAGWVTNADGTWSYNKADGTKTTGWLLDGSTWYYFNANGVMQTGWVNVNGTWYYLNPVSNGYKGAMQTGWLNDNGTWYYLQSNGAMKTGWLNDNGTWYYLNSNGSMKTGWLLDTDGNWYYLQSNGAMAKNTTVDGYKLGSNGAWIR >NZ_CP053292.1|WP_043852453.1|261696_263700_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein/permease MKLVQLKNINKYYDGSKKNRFHALKDIDISFERGEFIAIIGESGSGKSTLMNLIGGLDSDYSGDIIVEGNNINTYNQKQLDIYRKDKVGFIFQSFNLIPHLSVLDNVTIPMIISGASKSSRVKSGREILKKVGLEKYEDKKPDKLSGGQKQRVAIARALVNNPHIIIADEPTGSLDSHNTDQILNLINEIVKEGKLVIMVTHSEKVASCADRIVEIKDGVIVKDIRNKQIKEYEADLSYGEKYENGKRLNSNLHIKRKNKNLSVFSAVKLALINMKEKFLRNILISLGASIGIMGVVLMLGFGNGIKTYFNNAMDNYVNPLVIEVNMPEADEEFKDSDNIIDIPKMNSGTAFEEEDFEKLKSIENVDSVEKGYNVIAMGANSVSTDHGGCNIIRLATVSSGILESSLSSGNIPKEGEILINKSVADKLGENIIGQKVKLSILIGETKVKNEFIVSGIYEGAYGDFNSMIKCAFINYSDLEKIYTQNNRELKPNTAYITSSGENYTDGIKLKAEEMGYTGSSQEQMTNLFNEMISITTYVLSGIAAISLVVSSIMILVVLYMSVVERIKEIGILKAVGARKKDIRRIFVSEAFLIGIFSGLGGVGISIVIMKLINRMSLQIFSVDLLLIDTNHIITGICLSVIISIIAGLLPAAKASRLDPVDSLRRE >NZ_CP053292.1|WP_043852452.1|261193_261700_+|VanZ-family-protein MKNKFVLIAICFLCFGFILFNSSQISTVSNTRSREVVNNLIKVVSKTKAGEILLYKVNETELNLIVRKIAHAFEFFLLGIVLCFTFRYFKIDDNNLLIYTLFTVLFVAVIDEFFKIFIQNRTSSVVDVLIDFGGGILANTLFFIFSSARGKHYKKTTHMKRFVMEKNR >NZ_CP053292.1|WP_085951511.1|259713_261047_+|IS3-family-transposase MSNKIFTEEEIAILSKNKYVKKVSNKGITYTDEFKRIFIVENNNGKFPRQIFEEHDFNIEILGMKRVESSGKRWRSAFRRNGVSQLQDTRKFNTGRPSEKELSIEEKYEKLQAKIKLLQAENELLKKLGNDGKGRENKEVNLLVSEKFIVIKSIVEKYKIKNKISYLCGLSGVSRSGYYNYFSLKSMSKRNAQESKDQESYKNVVAAFEFKNRKKGARQIKMTLQKFFGINYNLKRIRRIMKKYNIICPHRKANPYRRMMKATKEHTVLPNLLNRDFKQGIPAKVLLTDITYLFYKDGQKAYLSTILDASTNEILSHNLSKSLKINIVTQTIDNLFNTPLTLHKDAFIHSDQGAHYTSPIFQKKLKEKGIGQSMSRRGNCWDNAPQESFFGHLKDETTIKECETFEDLIKEIDDYIAYHNNYRAQWNLKKMTPVDYRNHLLNVA >NZ_CP053292.1|WP_002582349.1|278825_281831_+|Ig-like-domain-containing-protein MKRDLIKKLICCMAITACISSTMPVDVYAATWMNDNMGNYYFYESNTYAVGWRNIDGTVYYFDASGVMQKGWIKYGDSWYYLDNNGALKTGWINYNGEWYYSNSAGIMQTGILLIDGQTYYFGNNGVMKKGNVIINGQFYTIGVNGAIVSNAVPVPDKVFDRNNNCIQQINSVDSTTIMTPDGSKYDNPIVDQSEDGDYEEPARKFTVTFRDENGQELKTKSITDGDTVKMYEPDDENGKGDEDRNFIEWNTKRDGSGKSYDSDEKVKVTKDLTLYARWEELEEQTLVSSISITGSNEVEIGKTTQLTAEVKPSDATNTKVKWSIVDNADGTASGKASIDQNGVLTGLENGLGKITVKAEAMDKSNVSTTKVITVVEAKNLIESIKINGPDTISEDGAVVKLTADVSPETASNANVSWKITDGSEYAEIDRDTGELKALADGKVTVMASAKDGSGISATKTINITGQSVKATKIQVSGYENVKTVSTGKKLQMVARIYPDNVASANDEVEWSAVYTSGEKIGEQVSINEGTIGVIGDAAGQRLKYAVLNPEYRGKVEVTARSKNDSSILGKTTITVVKDAESVDIKAIDTSGNDITNKPEITTNAGKLNLKAVLNPSDTTDTSSVKWSMELVNGDGEDTEASNYATLTASETSAVIAAKKNGEIKVIATANDSSKAIGEITIKIDGQKIYAKEISLYQDGDESKPVKEGYEFNIQKGASITVEGKVGPDNATNKNIEWSVLGAKDYVTSKIDGNKLTITANKDLSSEMAAVRIKAVADNIIKEFKINVYENIQGVNISTPSAVVLGQDFKATSTLFPVNVNGDKIKLSVVTKMDDGSLTGSAFINGEVEVSRNTTTATITPVNTGTIKLKAVATLNDSEQTYTTGEINILNPIDNIIIEGTNNSFTLENGQTRNANLTAKVNGAPAGGYSSFLKWEIKSQPSNVIAKVDGNTGIVSVTRTGDIAVGSQVIVRVSANYDSTKYSEFIIGVSNAPVVDSTATS >NZ_CP053292.1|WP_043852459.1|282042_283092_+|InlB-B-repeat-containing-protein MRNKFLNKLIAVSIALTAVTVMIPMKTEAAWINNYYGGFAYSNGYYLSTGWNMINGTWYYFNSLGVMQTGWLNSNGTWYYLDQSGAMQTGVIQVEGKIYLLGPSGGMQTGSNIINGKMYYFGPDGVCMGTDVPTPLKGYDYYGNPVQPYVPSQISNPNAVMDSNIPLENGQKIEEQYRVYYKDDDGDLILTKRIDADTKITLYEPDKAGYEFIEWNTKKNGNGTSYDAGDKVKLTGDLTLYAQWDEVEIDDDSDEDTIKVTGITLGAVGYTGTTINISVGDTVQFTRKISPSTATNTKVTWSVKNGSTGKAEITSTGKLTALQPGTVTVRATATDGSKVFKEMTVIIEN >NZ_CP053292.1|WP_002582347.1|284135_285731_+|peptide-chain-release-factor-3 MADYIKEIEKRRTFAIISHPDAGKTTLTEKFLLYGGAIRLAGSVKARKASKHAVSDWMEIEKQRGISVTSSVMQFNYNDHCINILDTPGHQDFSEDTYRTLMAADSAVMVVDAAKGIEDQTRKLFQVASLREMPIFTFVNKMDREARDPFQLLDDIENELGIKTYPMNWPIGSGKEFKGVYERDNNRIIAFNGGNHGQNEVEAIEGTPDDPKFREILGEALHDKLMEDIELLDIAGDELDLEAVRNGELTPVFFGSALTNFGVEPFLEHFLEMTTAPLARHSSVGDIDPFEDKFSAFVFKIQANMNKAHRDRIAFMRICSGKFNKGEDVYHMQGGKKIKLAQPQQFMAQDREIVEEAYAGDIIGVFDPGIFSIGDTLCAASKKFKFEGIPTFAPEHFARVRPVDTMKRKQFVKGCTQIAQEGAIQVFKEIHIGMEEIIVGVVGVLQFEVLEYRLKNEYNVDIKMDRLDYRYVRWIEDQSIDMDSLNLTSDTKKVKDMKDRNLLIFQNDWGISWALDHNKDLVLSAVGKNDD >NZ_CP053292.1|WP_043853481.1|286073_288314_+|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MILGLVPTLSVQAATTDFKIISKTEVTAAQAKKWAQSKGATDTFADLAKLYWKYAEECGGVNPGIAYVQAAKETGYGRFGGVLDESYNNPCGMKTSSGGGDYDKEAHQRFNSWDEGVQAHMDHLALYAGADGYPKANTYDPRHFVTIKGRATTTNSLGGKWAPSATYGEEIGKLYMSLMDSAGVTFEKDEDEDLWEDVEDEEDTSAAPNPGTVEKKPADLSIEEAIKLPEKITNDTSGTDSSQGSGNDSPNITSTIGWKNVDGNWYYYKSDETKAFGWIKPDSNWYYLDDADGKMVRGWLKNNNKWYYLDESGAMITGWKLIDSKWYLFDKNGIMTTGVQNDGNSSYYLDKSGAMIEEQGWKKVEDKWIYLEKGGKIKLGWLKENNAWYYLQGDGSMVNGLKRIDGQVYSFYDNGTMQTGWKSVNSNWYYFKSSGEMATGWTYDGDTCYYLYDNGAMAKGWITIGDLWYLLSSSGVMQTGWVTSNGDTYYLDKSTGRMVTNTTVDGYKIGKDGKRKGKVNQGDSNSNNSNSNNSNSNNSQTGPGSAGKVIYVDAGHDYGKDSGAVATINGVTYSETDLNMQVADKLKTSLENRGYTVIMTRNLGERPSFSSLTESLSYRVNKANNANADLFISIHHNSAGETAKGIETLYSEVSQDDAFGGQYDSTRIAKSKSLASEINNNIASSLDLTNRGGKSQNLYVCRNTKMPAVLVEVGFITNAEEAVRCSDPSSQQRVAEAIAAVVSKHY >NZ_CP053292.1|WP_043852460.1|288867_290880_+|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MKIRERLASFFIALFVAFSFIPSMKVMADTVADINIISDTKVTVAQAEKWAKSKGATDTFISLAELYFKYADECGNVNPGIAYVQAAKETGYGKFGGVLDESYHNPCGMKTSSGGGDYDPNAHQKFNSWDEGVQAHLDHLALYAGADGYPKSDTFDPRHFVTIKGKAPTVNSLGGKWAPSTVYGEEVNSLYRDLLKSAGVTIGSEEIPNEDNSGNNYGSNSGSGSNSNGSNNSGTPGGSTNVQPPKDTVEPQGLPVNKPIAITADNSTNISSNIGWKLEGGSWYYYRSDGSKATGWIKPDANWYYLYSDGVMANGWVQLGSTWYYLQSSGAMKLGWLKDGSKWYYLQGNGAMVTGFNSIDGKTYFLDSSGTMRVSWFKISGQWYYFNTDGSMLTGWIRPDGNWYYLFSNGIMASGWLARDGELYCLSESGVMQTGWVYEKGGYYYFHPTSGKMLRDTVVDGWEIGPDGKRGDRVGGGSSKLIVIDPGHNFGGDDGAYGYHSGVTYSERDLNMQVALKLKTKLEAYGYQVVMTRNESDRETLSVSESLAKRVNLANSLNADFFVSLHHNSAGSESANGVETYYSSNASNSNNISISRNMATKINNAIVGKTGQYNRGAKDGNLYVCRNTNMPSVLVELGFVSNPTEAAKCATWTNQDLAASAIAEAIASSI >NZ_CP053292.1|WP_027636894.1|291222_291621_+|hypothetical-protein MNWFRKFMYGRYGVDELSMVLVGVSIALLLLSSLLPRSLSILSLIAYIPMVIYIFRIFSKNIFKRQQENYKYISFKNSMLSKAKKYKGKIQGAKTHKYFKCPSCGQELRVPKGNGKITITCPKCKTSFKAKS >NZ_CP053292.1|WP_043852461.1|292021_295093_+|cadherin-like-beta-sandwich-domain-containing-protein MKKIVKRLLALLIVFASMFSFLPLQFGDNGQEANAANDSSVDISYADLSLRVVGGTSILDKKTDDTVGKLPYYNTSDGENTFDLTISDFSKTENQIKEELLKKYPEGGSGETTYVSNAYMNIISLNNIKLATRSGAEIPEGRDALDDLEIKMEKITPSGALNRFGVRFDNMPLGVDRIDYNLLGTVQKIKYTVNKETSTVTLEKSGTYDNVNLSESIDSFIINNGKDFVGKNVESFTLDQYVGKRDLIDSEETKYNNKAPLLYTAEAEADETIKMRYTWEVPDSLTALNYKMKFTMDLFNTHDNTNVYVNGTKGQGQAIDSNTISGFLNDLSNNDQFVVIKTKNGTDIAKSYSAEIRFPKKKTENDFSLIEAGVLKAEYANDSSVKAYIGKKFTETAKTDADGNRYVEYKGTITIDPKARMVCLRPKVVSGVNVEYELYNNYTVNGITKAAKAYELINGQAYIDFNLGDENELELQIKDASTQKLLAKYIYTVKQRDDAEKAFNENFIFDDNNSNTYLTREGSKEKISFKVGKSENRSTFDLYTKDKNEVKITLDPDGITNSNEYFKVWTSDTLDGNNFTEAQASIDNEFDINSGIRDTDLYVDISKAKRIMVQAYYDEVTEKDGVYTLVKSYSLGSKYIFFIPANINSSDTDDNQKSDNAVLSNIKVKGQTLYNLDEDKNGFSIDSRNYRVTVPKDQTTAVLTVVPEDENVKSIVATVSGTDTSYELYPGEETEFMLNSSGITDLEITVTAQNGKKTEVYNLSIINNSKGGSSKLKDLILSSGDFKFDSDVYTTKVQVEQSVNKISITPIAEDSKAKITINGQKFTGKPISVSLAGKQTTEVDIEVESEDGESTTTYTLKIKRVSVISDDDSDNNQGTTEDIYYDYDNDCWVDTTKYDEWGTIKNRVMYFDKRGRQVKDRWIYTGKKWYYLNEAGYRATGWKIDDETGQRYYMDNVTGEMKMGWMNLNGSWYYLGTTGLMHTGWLWLNNNWYYFTENGEMITNQSMVIDGKMYRFATDGRIY >NZ_CP053292.1|WP_002581275.1|295465_296797_+|IS3-family-transposase MSKITFDKETIELLNENPYVVKVSEKSITYSDEFKRLFIEEYLKGKTPKIIFNDAGFDTQILGQRRYEQAAARWIRSYRKEGIVGLRDTRKENSGRPSEKQLSKDDIIQKQEAKIKLLEEQLELLKKLDVTERRLVNSSVNLEGKEIFKLIYETITNNSYKNMVSYFCDLLNVSRSGYYNYLNTLDNQILMENKDLEARDNILMAYNYKGYSKGSRSIKMVLENELSIIYSRKKIQRIMRKYNIKCPIRKANPYRRMAKATKEHTVVPNLLERNFKQGVPGKVLLTDITYLPYGNNHMAYLSTIKDGSSNDILAYHVSDSIKLDIAITTINKLITHHKDDLHESAFVHSDQGFHYTSPKFQKLLKDNNLGQSMSRRGNCWDNAPQESFFGHMKDEIDFQSCNTLEELIDMIDDYIDYYNNYRYQWNLKKMTPKQYRNHLLLAS >NZ_CP053292.1|WP_058229321.1|297051_298044_+|hypothetical-protein MIERDWEFEKIKKYKENVLRENIYNKENVKKYKECPYCGSKSFIKYGNYNRIQRYKCKNEECKKTFSNTTNSVWKYLKHKPEKWFEFIELMGEHTTLNECAAKLEISIVTAFYWRHKIFHAIENNYKPEKFDEVVYVDTYYTEKCYKGSRNKNYTYADKVKNKFDKMYGLVPRNVSVLIAEERGKMPLIRRTENDETIINNFNNNVLKIAAKDCYMRTDYFTNKKLKNNLLQYNKKLSNATKKKYGLKIIGNRIEDKIKEDKKKNIMAYLTAWLSRCKGIATKYINHYYNFYSLIDSEKVFDYMSIFFDLLKNGSYTSVEVLRTNHIEDY >NZ_CP053292.1|WP_003423843.1|298652_300503_+|phosphotransferase 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP053292_2 | 281941-282027 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053292_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053292_2
>2.1|281965|39|NZ_CP053292|CRISPRCasFinder TAAAGCAAAATTTTGAATTAAAAGACCATAATTACTAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053292_2
The CRISPR arrays of NZ_CP053292_2 >merge|NZ_CP053292|2|281941-282027|CRISPRCasFinder TAACTACAAATGTAATAATATTAATAAAGCAAAATTTTGAATTAAAAGACCATAATTACTAGATAACTACAAATGTAATAATATTAA >NZ_CP053292|2|2|281941-282027|CRISPRCasFinder TAACTACAAATGTAATAATATTAA TAAAGCAAAATTTTGAATTAAAAGACCATAATTACTAGA TAACTACAAATGTAATAATATTAA
>NZ_CP053292.1|WP_002582349.1|278825_281831_+|Ig-like-domain-containing-protein MKRDLIKKLICCMAITACISSTMPVDVYAATWMNDNMGNYYFYESNTYAVGWRNIDGTVYYFDASGVMQKGWIKYGDSWYYLDNNGALKTGWINYNGEWYYSNSAGIMQTGILLIDGQTYYFGNNGVMKKGNVIINGQFYTIGVNGAIVSNAVPVPDKVFDRNNNCIQQINSVDSTTIMTPDGSKYDNPIVDQSEDGDYEEPARKFTVTFRDENGQELKTKSITDGDTVKMYEPDDENGKGDEDRNFIEWNTKRDGSGKSYDSDEKVKVTKDLTLYARWEELEEQTLVSSISITGSNEVEIGKTTQLTAEVKPSDATNTKVKWSIVDNADGTASGKASIDQNGVLTGLENGLGKITVKAEAMDKSNVSTTKVITVVEAKNLIESIKINGPDTISEDGAVVKLTADVSPETASNANVSWKITDGSEYAEIDRDTGELKALADGKVTVMASAKDGSGISATKTINITGQSVKATKIQVSGYENVKTVSTGKKLQMVARIYPDNVASANDEVEWSAVYTSGEKIGEQVSINEGTIGVIGDAAGQRLKYAVLNPEYRGKVEVTARSKNDSSILGKTTITVVKDAESVDIKAIDTSGNDITNKPEITTNAGKLNLKAVLNPSDTTDTSSVKWSMELVNGDGEDTEASNYATLTASETSAVIAAKKNGEIKVIATANDSSKAIGEITIKIDGQKIYAKEISLYQDGDESKPVKEGYEFNIQKGASITVEGKVGPDNATNKNIEWSVLGAKDYVTSKIDGNKLTITANKDLSSEMAAVRIKAVADNIIKEFKINVYENIQGVNISTPSAVVLGQDFKATSTLFPVNVNGDKIKLSVVTKMDDGSLTGSAFINGEVEVSRNTTTATITPVNTGTIKLKAVATLNDSEQTYTTGEINILNPIDNIIIEGTNNSFTLENGQTRNANLTAKVNGAPAGGYSSFLKWEIKSQPSNVIAKVDGNTGIVSVTRTGDIAVGSQVIVRVSANYDSTKYSEFIIGVSNAPVVDSTATS >NZ_CP053292.1|WP_002582350.1|276529_278173_+|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase-family-protein MIKRLKKTSALIVLATTLATIVPVGNTQIRAEAADKYSNEFSNNYNIESLENNISLASEETSEDKQIAGKITQYINGKYPGATVKVQSPKYIKLTITKSIAEKMATQICSSNDTIRQILKNEPNLVKPGASQDEVNKIVDSMTDEQIESVKPKVYNAVYQTILAFDGQSVPVYGYEVVSGDQIEDTGYFVGGKIGALIMQKEGKPLCVSTEFIKDLNNQITNKILEEIKQKISEIIQNSGITEIIDKVLKKVNSVVSDVTDTIEDLSDAIDDLTDSIKDKADDIDDAWDKVFDRFDNDEGWGKKDGYMYYYDKDGISLKGVQKIDGKTYYFNRIDGAMETGWQIVDGKRCYFDEKKGYQLFLQWVQDGEDWYFLSDQGPVKKSEWVNDNGRKYYLKSDGKMTKDWLKIDDDWYYFNGSNGAMEYSTWKYSNDKWYYLNQDGKAANDWTYINENWYYFRENSCSMETGWFRADGSWYYSDSTGAMKTGWIQGDDGWYYLDDTSGKMKKNEWGYSNGSWYYFNINGAMVTKARYIDGVKYNFNSDGRMA >NZ_CP053292.1|WP_043852458.1|274944_275937_+|transposase MIERDWKFEKIKKYKENALRENIYNKENVKKYKECPYCGSKSFIKYGNYNRIQRYKCKNEECKKTFSNTTNSVWKYLKHKPEKWFEFIELMGEHTTLNECAAKLEISIVTAFYWRHKIFHAIENNYKPEKFDEVVYVDTYYTEKCYKGSRNKNYTYADKVKNKFDKMYGLVPRNVSVLIAEERGKMPLIRRTENDETIVNNFNNNVLKIAAKDCYMRTDYFTNKKLKNNLLQYNKKLSNETKKKYGLKIIGNRIEDKIKEDKKKNIMAYLTAWLSRCKGIATKYINHYYNFYSLIDSEKVFDYMSIFFDLLKNGSYTSVEVLRTNHVEDY >NZ_CP053292.1|WP_043852457.1|272235_274473_+|cadherin-like-beta-sandwich-domain-containing-protein MRAKFNFKRVFAYLLIFAMTFSFVQMGQANPVKAATSGSKEVNDSFKFIIGDASSGTTKDVDMDYSGDLVLRSVTLSQTYTIMPQAGYNIESVKSSSDKMKITKAVSGTTNTFTIGTIKDYSNFKLTVKVKNSSGEINTYDIRIEFNIDSSLEFNKLRITVDNDDPVTLTYTQCDSEGIYYYEESNPEAKKAKIEMFDDSNNAMSFKVNGGTNKTVNLVGGDNTIELTVTSAGYSKVYTLVITKKGVAKLKSLVPSTGSLSPSFNSDTTEYTVTVPTTQETIAFTPTAVDNSSTIKVKKITVASGKKSQDIKLDEGENEIPIVVTNKDGDVTTYKVTVTRTEKFRSANLKSLKLTSGTLSPTFNKGVYQYTTIVENTVSSVGVTPVAEDTNATIEVNGKEIPSGATSPYINLDEGGNVINVTVTDSKGNDNTYVIMITRKYSKNNVNLSSLSVTDGTFSPKFDPEIYAYSVKVPRNIEEVRIKFETQNEKSKVTINGVEYKSGQQSDKIKLDLGANTVVVKVVSEDNKSTVNYTLSIIRDKVQGTLNEWVLVGGEWMYYDGDGIPAKNRWVKYDNQWYHVDVNGYMNKDGWLFDGGKWYYLDPNGIMLYGWIKDTGFWYYLRESGEMVEDSWTMLDGNWYFFNQYGQMQTGWTLYKGKWYYLDDHGVMQKGWITYDKNKYYLDDDGTMRTGWLYNGKVWYYFESSGRMVTGWQTIGNRSYYFDSKGAMKTGMLFLDGRWINLDSL >NZ_CP053292.1|WP_043852456.1|270737_271715_+|substrate-binding-domain-containing-protein MKKLLSLLMVFVLMFTALGCSKNGSKGTSIGNTKVFASIADDDKFKQTIVSGMESYADENNVDLDVAIAHNNVEAQVQQIKDAKTKEYDVIVCILVESDTAQQIINAAGDIPVIFANVEPDSGRLKSDKYIYVGSDENEAAKYTFESLKEYFKDKKSFNAVLFEGSMDSKSASVRTESLKSQLKKNGFDVNYVFQDDAGWDREKAKKMFEAFLKLNVSYDCIISNNDEMALGVIDAMEENGIDPSKVPILGLDATPEACKAISNGKMSFSIKQSGEGQGESVIKAAQALKNGDKISEIENGDSSGKYIWYPYSKVDKSNVQQYMR >NZ_CP053292.1|WP_043852455.1|268716_270723_+|methyl-accepting-chemotaxis-protein MWHAKINKKGGKYIPIKYKILSVILPVIILAIGGLITVSYNKSSKIIEENSYSMLESSVKNQTIQIENWLENNLQTFNTIKKSLGSTQYSQEELKKILNQYYNFNSNFLDGLYISDLQGNVISADNSQMKFENATSSQWFKEGLTHIKMRYGEAHDDYAGNKVISATGLIVDNDNNPVGVIGADVTLNRISIIVNSLIEMDDAQSFLVNKDTGMVLASSDSLEPYTILGENNENLLYSKIAQSIESGQHSEQEIENNIVDMHDVKNTSWILVSYVPKSSILSSMFTLRNYMVIIAIVALAVLVLITHRTINYIINPVNDISKKIVKMAEGDFSIDIDVKSNDEIAVMSQSLKNFIESMRVMLNDIKDISMEQKNQSFESKNISEHLFDSSKQQAESMNNLNIVVGEMAEATNQIADTATSLAGIACETNDNGNKVKDKMIETVKMSEVGKKDMEHVEISIRTIETSIKELKDVIDEVGKSSEEINSIVSIIGEIAESTNLLALNASIEAARAGEAGKGFSVVASEIGTLANNSTSSVNDIAKLINNINKLISNVVSKVNESVNHVNESSELITDSVRKFDNIYNTINESDKLVADMLKKVEEVGKAADNMAAISEEQAASSEEISSTSQDMLEHSQNITQSSYNVAKGADVLSDIAKQLESEVEKFKL >NZ_CP053292.1|WP_043852454.1|266730_268248_+|cadherin-like-beta-sandwich-domain-containing-protein MRKLREGIAATVLALYSLIGIEMLSGSLTCVEAYAKNIEDKPYLKDIYVGLGYDIEFIKDKYEYIVDVDKDVEDIYVKTRPENDNDIIKINGKVITKDDKFKKDLSLEMGKNKVVIEVIKNNDNNEKEYTDNDDDFSEDDVQNDKDKYGSAQDKTVYTLYIYRGGADEVYLKNITLDKSNIGYFVNKKNYNIESDENGQLVKLEVETFGDEYSVFVNGNKLDFTNSLSLKFKGIGKYTITLDVVDDETKRKSTYVLNIYRGIPVTPNVSDSINSVLKPNQWVIVNGRWRYNDAVGQPLKNTWFFDMNYDSYFYFNGRGNMKTGWINEGGNTYYLGNDGMMRTGWVEYEGKWYYLDMNGVMRTDWVKNNGEWYYLDQDGSMKTGWIVDKENWYYLNNDGSMETGWILDYKKWYYLSQNGAMKTGWAQYKDDWYYLNNDGSMKSGEWVEYKDKWYYINYSGTMRCGWLYKDDKYYYFNEDGSMRTESIVLDGYLYNFNEDGSVNFND >NZ_CP053292.1|WP_002582356.1|264510_266292_+|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase-family-protein MIKRMNKLTALMVAATAVASIVPAVSASAAAKLEVQEGNIDAAVAYGDGKYVYDGYLTDDDESGLYFNNGTKDSFLENDEDYEFGSEKYGTKYTIVENDGEDYLLDLSSGKVLDDESIEDLRNNVELKLRTTLKKADDRYATVNNKIVFENNDEIAQVLGNQFGDVWYSYGVKSADSDKTLYGFANESGKYIDASALANMTVSTTDSAVRVTEFDKEKNDAMVSLAEAPKVIAQDSSYLYAITKVNVTIAGEADGTRTYIQKISKAQGDTKDGAYMPKSVDSYEISSNFYIDKDNDDTAKAEELLLDENNMVRVIKDTIYVTTVSEDGKVYVNTIKLKKEKVTKNDGTKKLDVYVAVKDQDDDEKIEGGANAVSIDAEGNTWAVNKGKIYKFNGTEFVEVYTCDRTIDHLDVYDENNLIAWNKENEVFATVQTKDGNGTDEGDKEETKAGWVTNADGTWSYNKADGTKTTGWLLDGSTWYYFNANGVMQTGWVNVNGTWYYLNPVSNGYKGAMQTGWLNDNGTWYYLQSNGAMKTGWLNDNGTWYYLNSNGSMKTGWLLDTDGNWYYLQSNGAMAKNTTVDGYKLGSNGAWIR >NZ_CP053292.1|WP_043852453.1|261696_263700_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein/permease MKLVQLKNINKYYDGSKKNRFHALKDIDISFERGEFIAIIGESGSGKSTLMNLIGGLDSDYSGDIIVEGNNINTYNQKQLDIYRKDKVGFIFQSFNLIPHLSVLDNVTIPMIISGASKSSRVKSGREILKKVGLEKYEDKKPDKLSGGQKQRVAIARALVNNPHIIIADEPTGSLDSHNTDQILNLINEIVKEGKLVIMVTHSEKVASCADRIVEIKDGVIVKDIRNKQIKEYEADLSYGEKYENGKRLNSNLHIKRKNKNLSVFSAVKLALINMKEKFLRNILISLGASIGIMGVVLMLGFGNGIKTYFNNAMDNYVNPLVIEVNMPEADEEFKDSDNIIDIPKMNSGTAFEEEDFEKLKSIENVDSVEKGYNVIAMGANSVSTDHGGCNIIRLATVSSGILESSLSSGNIPKEGEILINKSVADKLGENIIGQKVKLSILIGETKVKNEFIVSGIYEGAYGDFNSMIKCAFINYSDLEKIYTQNNRELKPNTAYITSSGENYTDGIKLKAEEMGYTGSSQEQMTNLFNEMISITTYVLSGIAAISLVVSSIMILVVLYMSVVERIKEIGILKAVGARKKDIRRIFVSEAFLIGIFSGLGGVGISIVIMKLINRMSLQIFSVDLLLIDTNHIITGICLSVIISIIAGLLPAAKASRLDPVDSLRRE >NZ_CP053292.1|WP_043852452.1|261193_261700_+|VanZ-family-protein MKNKFVLIAICFLCFGFILFNSSQISTVSNTRSREVVNNLIKVVSKTKAGEILLYKVNETELNLIVRKIAHAFEFFLLGIVLCFTFRYFKIDDNNLLIYTLFTVLFVAVIDEFFKIFIQNRTSSVVDVLIDFGGGILANTLFFIFSSARGKHYKKTTHMKRFVMEKNR >NZ_CP053292.1|WP_043852459.1|282042_283092_+|InlB-B-repeat-containing-protein MRNKFLNKLIAVSIALTAVTVMIPMKTEAAWINNYYGGFAYSNGYYLSTGWNMINGTWYYFNSLGVMQTGWLNSNGTWYYLDQSGAMQTGVIQVEGKIYLLGPSGGMQTGSNIINGKMYYFGPDGVCMGTDVPTPLKGYDYYGNPVQPYVPSQISNPNAVMDSNIPLENGQKIEEQYRVYYKDDDGDLILTKRIDADTKITLYEPDKAGYEFIEWNTKKNGNGTSYDAGDKVKLTGDLTLYAQWDEVEIDDDSDEDTIKVTGITLGAVGYTGTTINISVGDTVQFTRKISPSTATNTKVTWSVKNGSTGKAEITSTGKLTALQPGTVTVRATATDGSKVFKEMTVIIEN >NZ_CP053292.1|WP_002582347.1|284135_285731_+|peptide-chain-release-factor-3 MADYIKEIEKRRTFAIISHPDAGKTTLTEKFLLYGGAIRLAGSVKARKASKHAVSDWMEIEKQRGISVTSSVMQFNYNDHCINILDTPGHQDFSEDTYRTLMAADSAVMVVDAAKGIEDQTRKLFQVASLREMPIFTFVNKMDREARDPFQLLDDIENELGIKTYPMNWPIGSGKEFKGVYERDNNRIIAFNGGNHGQNEVEAIEGTPDDPKFREILGEALHDKLMEDIELLDIAGDELDLEAVRNGELTPVFFGSALTNFGVEPFLEHFLEMTTAPLARHSSVGDIDPFEDKFSAFVFKIQANMNKAHRDRIAFMRICSGKFNKGEDVYHMQGGKKIKLAQPQQFMAQDREIVEEAYAGDIIGVFDPGIFSIGDTLCAASKKFKFEGIPTFAPEHFARVRPVDTMKRKQFVKGCTQIAQEGAIQVFKEIHIGMEEIIVGVVGVLQFEVLEYRLKNEYNVDIKMDRLDYRYVRWIEDQSIDMDSLNLTSDTKKVKDMKDRNLLIFQNDWGISWALDHNKDLVLSAVGKNDD >NZ_CP053292.1|WP_043853481.1|286073_288314_+|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MILGLVPTLSVQAATTDFKIISKTEVTAAQAKKWAQSKGATDTFADLAKLYWKYAEECGGVNPGIAYVQAAKETGYGRFGGVLDESYNNPCGMKTSSGGGDYDKEAHQRFNSWDEGVQAHMDHLALYAGADGYPKANTYDPRHFVTIKGRATTTNSLGGKWAPSATYGEEIGKLYMSLMDSAGVTFEKDEDEDLWEDVEDEEDTSAAPNPGTVEKKPADLSIEEAIKLPEKITNDTSGTDSSQGSGNDSPNITSTIGWKNVDGNWYYYKSDETKAFGWIKPDSNWYYLDDADGKMVRGWLKNNNKWYYLDESGAMITGWKLIDSKWYLFDKNGIMTTGVQNDGNSSYYLDKSGAMIEEQGWKKVEDKWIYLEKGGKIKLGWLKENNAWYYLQGDGSMVNGLKRIDGQVYSFYDNGTMQTGWKSVNSNWYYFKSSGEMATGWTYDGDTCYYLYDNGAMAKGWITIGDLWYLLSSSGVMQTGWVTSNGDTYYLDKSTGRMVTNTTVDGYKIGKDGKRKGKVNQGDSNSNNSNSNNSNSNNSQTGPGSAGKVIYVDAGHDYGKDSGAVATINGVTYSETDLNMQVADKLKTSLENRGYTVIMTRNLGERPSFSSLTESLSYRVNKANNANADLFISIHHNSAGETAKGIETLYSEVSQDDAFGGQYDSTRIAKSKSLASEINNNIASSLDLTNRGGKSQNLYVCRNTKMPAVLVEVGFITNAEEAVRCSDPSSQQRVAEAIAAVVSKHY >NZ_CP053292.1|WP_043852460.1|288867_290880_+|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MKIRERLASFFIALFVAFSFIPSMKVMADTVADINIISDTKVTVAQAEKWAKSKGATDTFISLAELYFKYADECGNVNPGIAYVQAAKETGYGKFGGVLDESYHNPCGMKTSSGGGDYDPNAHQKFNSWDEGVQAHLDHLALYAGADGYPKSDTFDPRHFVTIKGKAPTVNSLGGKWAPSTVYGEEVNSLYRDLLKSAGVTIGSEEIPNEDNSGNNYGSNSGSGSNSNGSNNSGTPGGSTNVQPPKDTVEPQGLPVNKPIAITADNSTNISSNIGWKLEGGSWYYYRSDGSKATGWIKPDANWYYLYSDGVMANGWVQLGSTWYYLQSSGAMKLGWLKDGSKWYYLQGNGAMVTGFNSIDGKTYFLDSSGTMRVSWFKISGQWYYFNTDGSMLTGWIRPDGNWYYLFSNGIMASGWLARDGELYCLSESGVMQTGWVYEKGGYYYFHPTSGKMLRDTVVDGWEIGPDGKRGDRVGGGSSKLIVIDPGHNFGGDDGAYGYHSGVTYSERDLNMQVALKLKTKLEAYGYQVVMTRNESDRETLSVSESLAKRVNLANSLNADFFVSLHHNSAGSESANGVETYYSSNASNSNNISISRNMATKINNAIVGKTGQYNRGAKDGNLYVCRNTNMPSVLVELGFVSNPTEAAKCATWTNQDLAASAIAEAIASSI >NZ_CP053292.1|WP_027636894.1|291222_291621_+|hypothetical-protein MNWFRKFMYGRYGVDELSMVLVGVSIALLLLSSLLPRSLSILSLIAYIPMVIYIFRIFSKNIFKRQQENYKYISFKNSMLSKAKKYKGKIQGAKTHKYFKCPSCGQELRVPKGNGKITITCPKCKTSFKAKS >NZ_CP053292.1|WP_043852461.1|292021_295093_+|cadherin-like-beta-sandwich-domain-containing-protein MKKIVKRLLALLIVFASMFSFLPLQFGDNGQEANAANDSSVDISYADLSLRVVGGTSILDKKTDDTVGKLPYYNTSDGENTFDLTISDFSKTENQIKEELLKKYPEGGSGETTYVSNAYMNIISLNNIKLATRSGAEIPEGRDALDDLEIKMEKITPSGALNRFGVRFDNMPLGVDRIDYNLLGTVQKIKYTVNKETSTVTLEKSGTYDNVNLSESIDSFIINNGKDFVGKNVESFTLDQYVGKRDLIDSEETKYNNKAPLLYTAEAEADETIKMRYTWEVPDSLTALNYKMKFTMDLFNTHDNTNVYVNGTKGQGQAIDSNTISGFLNDLSNNDQFVVIKTKNGTDIAKSYSAEIRFPKKKTENDFSLIEAGVLKAEYANDSSVKAYIGKKFTETAKTDADGNRYVEYKGTITIDPKARMVCLRPKVVSGVNVEYELYNNYTVNGITKAAKAYELINGQAYIDFNLGDENELELQIKDASTQKLLAKYIYTVKQRDDAEKAFNENFIFDDNNSNTYLTREGSKEKISFKVGKSENRSTFDLYTKDKNEVKITLDPDGITNSNEYFKVWTSDTLDGNNFTEAQASIDNEFDINSGIRDTDLYVDISKAKRIMVQAYYDEVTEKDGVYTLVKSYSLGSKYIFFIPANINSSDTDDNQKSDNAVLSNIKVKGQTLYNLDEDKNGFSIDSRNYRVTVPKDQTTAVLTVVPEDENVKSIVATVSGTDTSYELYPGEETEFMLNSSGITDLEITVTAQNGKKTEVYNLSIINNSKGGSSKLKDLILSSGDFKFDSDVYTTKVQVEQSVNKISITPIAEDSKAKITINGQKFTGKPISVSLAGKQTTEVDIEVESEDGESTTTYTLKIKRVSVISDDDSDNNQGTTEDIYYDYDNDCWVDTTKYDEWGTIKNRVMYFDKRGRQVKDRWIYTGKKWYYLNEAGYRATGWKIDDETGQRYYMDNVTGEMKMGWMNLNGSWYYLGTTGLMHTGWLWLNNNWYYFTENGEMITNQSMVIDGKMYRFATDGRIY >NZ_CP053292.1|WP_002581275.1|295465_296797_+|IS3-family-transposase MSKITFDKETIELLNENPYVVKVSEKSITYSDEFKRLFIEEYLKGKTPKIIFNDAGFDTQILGQRRYEQAAARWIRSYRKEGIVGLRDTRKENSGRPSEKQLSKDDIIQKQEAKIKLLEEQLELLKKLDVTERRLVNSSVNLEGKEIFKLIYETITNNSYKNMVSYFCDLLNVSRSGYYNYLNTLDNQILMENKDLEARDNILMAYNYKGYSKGSRSIKMVLENELSIIYSRKKIQRIMRKYNIKCPIRKANPYRRMAKATKEHTVVPNLLERNFKQGVPGKVLLTDITYLPYGNNHMAYLSTIKDGSSNDILAYHVSDSIKLDIAITTINKLITHHKDDLHESAFVHSDQGFHYTSPKFQKLLKDNNLGQSMSRRGNCWDNAPQESFFGHMKDEIDFQSCNTLEELIDMIDDYIDYYNNYRYQWNLKKMTPKQYRNHLLLAS >NZ_CP053292.1|WP_058229321.1|297051_298044_+|hypothetical-protein MIERDWEFEKIKKYKENVLRENIYNKENVKKYKECPYCGSKSFIKYGNYNRIQRYKCKNEECKKTFSNTTNSVWKYLKHKPEKWFEFIELMGEHTTLNECAAKLEISIVTAFYWRHKIFHAIENNYKPEKFDEVVYVDTYYTEKCYKGSRNKNYTYADKVKNKFDKMYGLVPRNVSVLIAEERGKMPLIRRTENDETIINNFNNNVLKIAAKDCYMRTDYFTNKKLKNNLLQYNKKLSNATKKKYGLKIIGNRIEDKIKEDKKKNIMAYLTAWLSRCKGIATKYINHYYNFYSLIDSEKVFDYMSIFFDLLKNGSYTSVEVLRTNHIEDY >NZ_CP053292.1|WP_003423843.1|298652_300503_+|phosphotransferase MLEDRLEILKILNENFNINQRELSKRTNMSLGKVNSVLKEFTEDNFIDRIVNNRGILYKVTDKGMKFLEESIANAKNTRLKLHEEEKKIVKQAVILAAGRAEHFGKPVGLLEIEDFKLIDRTLNILKENGITKIVLVTGYESEQFEEYFKNSRNIKIVKSDIYKWTGTMHSLSLAKEYIDDDFLLIENDLIFEKRAIKELSESPNRDCILFTNESGSGDEAFVEIRDNHLYKMSKDIHQFNRIDGEMIGLTKVSYKLYEMMLEEFKGNVNPYLNYEYVLLDVARNYNIGFVKIDDLAWGDADSIKEYEKIKNYLYPTIRRRELNYEINNIKSIVCEAFKVEDEDITEVTPAGGMTNKNYRICVKGTRYILRVAGTGTEQMINRNTEMFNSAIASEKGFNVEVPYFNLETGVKISKFIENAETLTHRSVKKEENLRQVTKILRDLHESEDFRMDNEFNMFRELEKYEEILRKDEGQFFDDYAEVREKVMALEEELQRCDRVFVPSHNDLVSENLVKDTEGRIYLIDWEYSGINDDMWDLAALSLENEFSEDDIELMFRLYFNGEEPDENSRRRLLIHQICQDTLWAVWTLIKEAEGDDFGTYGIDRYNRAKEYLKKL >NZ_CP053292.1|WP_003407822.1|300694_301393_+|NTP-transferase-domain-containing-protein MRAILMAAGMGTRLRPLTENTPKSLIEVNGMPLLERQIINLREIGVEEIIVLTGYLHEKFDDIVKKYNLIKVVNDKYDVYNNIYTMYLVRDYLKDAFVIDADNYITRNFLPKVQPKTSVYYSACKENITGEWILKYTETGRIYDVEIAPKNSKASYIMSGASYWTEKDGKIISEKVKKAVEEDKLFDIYWDNIAVENYDNMNVYIEKINSDDIFEIDTLEDLDYLKSKLNNM |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053292_3 | 338004-338090 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053292_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053292_3
>3.1|338027|41|NZ_CP053292|CRISPRCasFinder TAAGTATTATTTTGGGAAAGAAAAAGTCTAAGAATAAATAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053292_3
The CRISPR arrays of NZ_CP053292_3 >merge|NZ_CP053292|3|338004-338090|CRISPRCasFinder TAATGAATTTTTAGATTAATGTTTAAGTATTATTTTGGGAAAGAAAAAGTCTAAGAATAAATAGTAGTGAATTTTTAGATTAATGTT >NZ_CP053292|3|3|338004-338090|CRISPRCasFinder TAATGAATTTTTAGATTAATGTT TAAGTATTATTTTGGGAAAGAAAAAGTCTAAGAATAAATAG TAGTGAATTTTTAGATTAATGTT
>NZ_CP053292.1|WP_043852477.1|336375_337959_+|ABC-transporter-permease-subunit MSDFFMNLYLKKSEVISLLLEHIQLTLLAVLIAVVIGVPLGIFITNYKKLAKIVIGFANLVQAIPSLAILGFLIPVVGIGSVPAIIMVVLYSMLPIIKNTYTGISNINPDMIESAKGVGMTNIQILKIVKIPLAMPMIMAGIRISGVTAVGLMTIAAFVGAGGLGYLVFSGIQTVDNNLILFGAIPAAILALIIDYITSKIEYAVMPNGIRKSDGTMKVKRGNKGRKKKNKIIALVTSIILIVIILFSTNVFNKSSNKIVIASKNFTEQIILGNMLEQLIEAKTDIDVETKLNLGGTQVAYSALKSGSVDLYVEYTGTAYVNLLDIKDGNTNPDEVYDKVNEIFKEKENIEFLDPLGFNNTYALAVRKDTAEKYNLKSISDLEKVSEEFLMGPTIEFANREDGLLGLDKAYNLNFKKVKPIDGGLRYTALMNNESDVIDAFTTDGLLDKFGLKVLEDDKNFFPPYYAAPLIRMDTLKEHPELEEVLNLLSNKITDEKMRKLNYEVDVNGRDPKVVANEFLVSEGYIN >NZ_CP053292.1|WP_043852476.1|335248_336376_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIEFKNIKKSYKSKIILENFNLSIDSGKLVVLIGASGCGKTTLLKMINRLISITEGEILINGKDINNMDPIKLRRGIGYVIQQTGLFPHMTVKENIEIIPRLMKISERKIERKTIELLNMVGLDPDEYLYRYPAELSGGQQQRVGVARAFATDAEIILMDEPFSALDPITRTELQEQLFNIQKEYNKTIVFVTHDMDEAINIADMICILKDGKIIQYDTPENILKNPENDYVEEFVGKNKIWAKPEFIKAEDVMINRPATVSIKRSLLQAREIMREKTVDSLLIVDKEGMLLGYVTLSDIQKIDNKSILVGEVMRRSPEYVTEDTNLLDLLEKFTGLKRGYLPVCNENGKLMGLVTRSTLISVLSSQYIDIGGDN >NZ_CP053292.1|WP_043852475.1|334475_335105_-|GntR-family-transcriptional-regulator MNNLSIPTYKKIALDIANKIQLNNILEGDILHGRSTLSSKYNVSPETIRRSMILLEDVEVVKTIKGKGILVLSREKAISFLNRNKSIDSIRSYKTEIDKLLNNRKEIENQLLKSIQGIIDYSSRFNEVNNIIPLEFVVPENCLYIGKTVGEIMFWQNTGATLIAVKRNDELLLSPGPYISLNPNDILIVVGNDNIRNSVPQFLYPKNNL >NZ_CP053292.1|WP_002579052.1|333566_334289_+|MEDS-domain-containing-protein MREICNNCKIKGRIKEYKEKLNKSIENRNGDLLDDEVVLLSQFLDNFVYKCVYCNKNIKDLSKLNLRDVFGTHTTLYYYGEQHLLVNLYFYINEGIKNNELIYISMEEDLYNKLLDFFRINNISTENIKFRNVKELILGHKKGGFNGLVETAMGILGSSNIEKYNGLRWIGQPSFAIKGTSENDFLEMEEDLNKFIKNMNVALLCVYDAYDYMHKGKIINKKVIEESFKTHSFVLNNYVS >NZ_CP053292.1|WP_002579051.1|332987_333326_+|P-II-family-nitrogen-regulator MKKLEIVINSEKLEDLKKILSDCNANGVMISNVMGYGNQKGYKTIYRGTEYSVNLLPKVKVETVVPADVAEKIIDKVLKEISTGNYGDGKIFIYDADDIVRIRTGERGKDAL >NZ_CP053292.1|WP_043852474.1|331365_332943_+|ammonium-transporter MKKSLKLLGIILFLGALALTFALAISPTSGSDPTGAAYIATTGNETITDVATTANKAYYGANYVWVMITGFMVFFFQCGFAMVETGFCRGKNAAHTMTMNFMVFLVGAIGYFLTGFAIQFGGSGGAAGLGTGGSALNAMLSIPGLGGILGYKGFMLSGNGIYDPGIFALFFFQMVFMDTTVTIPTGALAERVKYSAVIILSFFISMFLYPLFGNWVWGGGFLATLGQNFGLGHGVVDFAGSAVVHSMGGMIALSSAIVIGPRIGKFKKDGTARPFPGHDIPMAIIGTIILFFCWFSFNSGSTLNSSDFRLAVVATNTMIAGAVGGLVAMFYMWIKYGKPDPSMTANGALAGLVAITAPCAFVNGPCAFFIGGIAGYLVCISVAFVENKLKLDDPVGAISVHCVNGVWGIIALGLFADGAYGDGINGVAGGVRGLFYGDPSQLVAQLIAVAVLVIWGFGVSYIFLKVLDKVWGLRVKPEEELAGLDIPEMGVSAYPDIQLIKSPELDYYSADNIEIKQIKTFKEKV >NZ_CP053292.1|WP_043852473.1|330978_331305_+|hypothetical-protein MKFINSNDDSILSKKIAVYFLQCVSLMIVFLGMFFSIFSAINHISIKVLSVNISGIVFGVLVFYLGIKYYLSVCNLKEKLLKNKYKFSWSNFNFQKGRKISSFIKGKF >NZ_CP053292.1|WP_002579048.1|329181_330594_+|glycoside-hydrolase-family-1-protein MFHKKLKNFPKDFLWGASTSAYQVEGASLEYGKGPSVQDIKKIPEGTPDFKVSSDHYHHYKEDVALFAEMGFKAYRFSISWARLIPNGVGEINPQGIEFYGNLIDECLKYGIEPIVTMYHFDLPAALQTKGGWSNRETIDAFVNFAKVMFENYGDRVKYWLTINEQNMMTLVGDVIGTLDGIETDNVQKELYKQNHHMLIAQAKAMKLCHDMCPNGKIGPAPNISAVYPASSKPEDILAASNCSAIRNWLYLDMAVHGRYNPTAWNYMVEKGIEPTIEDGDMEALRSGHPDFIAFNYYNTATVEAFPGEITNERSGGDQQSGHGEQGMFKGVSNPNLQKTEFGWEIDPVGFRNTLREVYERYALPLIITENGLGAYDKLEENDTINDDYRINYLRKHIEQAQLAISDGVDLIGYCPWSAIDLISTHEGFKKRYGFIYVNRDEFDLKDLRRIRKKSFFWYQNVIKTNGEEL >NZ_CP053292.1|WP_043852472.1|327246_328740_-|leucine-rich-repeat-protein MLRLSRKLSKLILIAMSINIINTTNVFATENNSNITISNGIVTISSNVTEIDSSTFSENNNITKVIIPSNVKKIGEGCFSNFKNLKEVIIEDGVKEIGSNAFIGCENLEKINIPSSITVVGDFAFIGCSKLKDVDFQSKTTNIGGSTFLYTAWLDKMRDDNGLVIINNSVISGKNTSDSLTIPDGVKIINSHAFEGCNTLKEINIPDSVVEIRDSAFEACSNLSKVKLSNKLETIGENAFSDCKLQSVNIPSTLKSVQLYSFNSDITVTGAVDLYNSLIKPLKTAKEDNLNILLRNKPYGWGKATESGDKIFYKNSKGELQTGWMDLDGKKYYFYSNGQLATGFIDLNGTKYYFDPSSGNNLGNLVVGWKNINNNWYYFNQSGDGDKVAGFMGTSWLYDDGNWYYMYSDGTMATGFINLNGAYYYLNNSGSMVTGWQYLQNSWYYFNKSDDGGLEGLMKKGWNRINGNWYYFNYSDGKMAHDTWIDGYYVNSSGTCV >NZ_CP053292.1|WP_033127508.1|325781_327020_+|IS256-family-transposase MTKKIDTNFDYNEEIKKCKTIDDVMGKNGLIQKLVKDVLENILEGEMEEHLGRNKYERTESNNQSNRNYRNGYSSKNLRSSFGDVDLDVPRDRNAEFEPQIIKKYETVCTELDKKIISLYAKGMSTSDIQSEIEDLYGIKISPSMVSKITDKVLASATEWQNRALDKIYPIVYLDAMYFKVRSNGKIINKAVYICLGYTMDGYKDILGIWVDEAEGAKFWLGICNDLKNRGVKEILIACMDGLKGLPQAIKTVFPSVNIQTCIVHQIRNSIKYIASKDKKAFMKDLKEVYKASTEELALAQLDNLKSLWGDKYAIVIDSWYNNWSNLSTFFDFSPSIRKMIYTTNALEGFNRQIRKFTKVRVIFPTDESLNKCVYLATMEIIEKWSQPTPNWGATLAELSIIFEDQLKDELA >NZ_CP053292.1|WP_043852478.1|338207_339968_-|1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate-synthase MYLEKINSPEDVKNLSINEMNELSSEIRQVLLKKLSEHGGHIGPNLGIVELTVALHHVFNSPQDKIVYDVSHQSYIHKMLTGRRDAFINSEKYDDVSGYTNPLESEHDFFNIGHTSTSVSLACGLAKARDLKDEKDNIIAIIGDGSLSGGEAYEGLNNAAEAGTNMIIIVNDNDMSIAENHGGLYKNLKELRDTNGKCECNFFKSMGLDYYYVNDGHDFDQLISVFNKVKDTDHPVVIHIHTIKGKGFELAETNKEQWHWGMPFVLETGDSKFPMGDAEDYGDLTAKYLLNEMKQDPTVAVITSGTPGVLGFSPERRAEAGRQFIDVGIAEEHAVALASGMAANGGKPVYGVYSTFLQRTYDQISQDLCINNNPAVILVTLASVYGMNDVTHLGLYDIGMMSNIPNLVYLAPTCKEEYFAMLKWSMNQQDHPVAIRIPAMGVINSGNEDNTDYSELNKYQVTKQGKDVAVIALGDFYQLGQSLVEKLSSENGIEATLINPKYITGLDEELLETLKKEHKLVITLEDGILEGGFGERIARYYGSSDVKVLNYGIKKEFLDRYVPDELMKKNRITPEQMAEDIMNILK >NZ_CP053292.1|WP_002579057.1|340417_340813_+|hypothetical-protein MNFIRGWGDEASMKSFLKSTLGFGIAAIILNTLWGVITSRIGLKGGWICGFILTGTLWYVNHYLGVVENRKESAFIDMGFAVATCSFSRDFLKSGLEGIVTSAPTFICVIIGGTIAGVVAGIIKRHQKQGE >NZ_CP053292.1|WP_002579058.1|340814_341150_+|hypothetical-protein MNSFGALTTIFGSAIFSFGVIMYWDKFVSLLGAFGGFIAAMLIPGTMWILNHGAENHLIKQSGSIWIDMAWAVGIGVLISSIMQGGSLRKSKWIMLSAIIGGFIGGFLINM >NZ_CP053292.1|WP_003424017.1|341230_342658_+|6-phospho-beta-glucosidase MAFNKDFLWGGAVAAHQLEGGWNEGGKGPSTADVMTAGAHGVPREITDGVIEGLNYPNHEAIDFYHRYKEDIALFAEMGFKCFRTSIAWSRIFPNGDELEPNEEGLKFYDDMFDELLKYNIEPVITLSHFEIPYGIVKNYGGWRNRKVIDMFVRYATAVMERYKDKVKYWMTFNEINNQKQTGVDIFPWTCSGIIYEEGDNREEIMYQAAHHELVASALVVKKGHEINPDFKIGCMVSFVPIYPYSCNPDDMMLQVEAMHDRYFFSDVHARGHYGAYAIKEWERKGYNIKMEPEDVQILKEGTVDYIGFSYYMSNAVKSDAQNTEDLLSGHSASVKNPYVKASDWGWQIDPVGLRYSLNTLYERYELPLFIVENGFGAIDVKEEDGSCNDDYRIEYLKAHIQEMEKAIEVDGVDLMGYTPWGCIDLVSFTTGEMKKRYGFIYVDKDNDGNGTLNRSKKKSFDWYKNVIATNGEEL >NZ_CP053292.1|WP_003424018.1|343125_344460_+|extracellular-solute-binding-protein MRLKKVLSLVVTGLLATSFIACGSSSSNSQTASGGSNKIVVWTLSDDLKQFAEHYQEENPGKEVEVTVIAPADYPTKVTTALRGKAETPDIIVGEPQMIPNFMEAGFFEDLSQEPYNAEQYKDKIVDYVYQAGKDETGKVRALSYQMTPGGITYRRDIAKAVWGNDDPAFIGEKFKDVTTITQTAKELKDKGYRIFADTGNLRWFVYGNDPQPWVKDNKLMMTDDRLAYVDAAVKLYQDKLVAFAPEWSAAWYQSMSAPIPVDTDGKELDQVDPNSEKTEVFSYALPTWGTLIIRDNAKDNIGKFGVTTGPNSYFSGGTFMGISSYSKNKEAAWDFLKYCTVTESTSDWWIEKSKGDVVSYIPSLESHKDMENEAFGGQKTYDFWLAESKKIDYSLVTKYDDQIGKFFGQAIESVQKGQMSKEDALKDFYKNVKTVYPEIEVPN >NZ_CP053292.1|WP_043853483.1|344618_345569_+|sugar-ABC-transporter-permease MNTVPETKSNIFSRKKSLGDINKWGYAFIFPFLVVFIVFSIYPIFKTLYLSFTNFTGFGQAEFVGIQNYTRVLKDGLFWGAFKNTLKIWSVNVILQFGLAFLLTIIFSDIKYKMKGLPIFRALFYLPNLIAATSVAFLFKALLDWQFGSLNQLLVKLGLITTKINWLGQPGTATIVVAVIGAWMWFGNAFIVLMAGVQGISKDYFEAATIDGAGRWTTFTKITLPLLKPILLYVAITSLIGGLQIFDIPFLITDGLGAPNGALNTVVMYLYNTAFKYNNIGYAAAIAYALFFIIAIFSAFTFKSMYGDSKKAKEGK >NZ_CP053292.1|WP_003424020.1|345568_346396_+|carbohydrate-ABC-transporter-permease MFTKIKKSIIYIGLILLSVICLGPFLIMMVNSTRSSQEIINSFSLIPGNSLQSNWKIMSDYFNIFSGLKNSLFISVCVTVLSGYFSALTAYGLAIYKFKGRNVVFTTILVLMMVPAQLGLLGFYDLINGLGLMDSYIPLIIPAIASPFTVFFLRQYIVSVLPSSIIEAARMDGASELSTFHRIGLPIMMPGIATMSIGTFIASWNNYLMPLVLLVSPKKFTLPVMMGSLSASKDITANMGATYVSVAVSVVPIMIAFCFFSKYIISSISAGGVKE >NZ_CP053292.1|WP_043852479.1|346565_349706_+|hypothetical-protein MKADKIVKVDYIDESKYYTIENYDKKLPFASFMAGVAGIHGIPMWSFYVNRGQAISSIGIRDKDNCIMEFFPANEAYKMVYTNGFRTFIKVIYENKEEVIEPFGVTTSDLIERTIKIKNNELKLIEINNEKNLKTEVTYFTIPNEDFAALSRKVEVTNLNDENIKVEILDGLTSVLPYGSKNIEYKEIGNTLRSWMEGYIIDGNTAIYKVRSSTGDSTKMDEVKNGYFYCAFNHSEKSIKPIVDPEKIFGFDTSLKEPVEFYENSISSLSKEDKCYNKVPCAFAGNTEELEPQKSIVIYSYIGYMNSIEKISTAQEKIINKEYFEEKCEEGNEIIDNTLKCVETESAYPLFDEYIKQCYMDNVLRGGYPLKIGGKIYYVYSRKHGDLERDYNFFSIEPNFYSQGNGNFRDVNQNRRMDNYIHPFVGTENIKLFNELIQLDGYNPLKISGKKLYVKDENKKEVLNLIDKDSSSLEEFLNKKFTVGDIYAELIKFDDYNDEDIEKLLNNIVALTEEDNEADFGEGFWIDHWTYNLDLIEEYLNIYPDKLKELLIEDKGYKFFNSPEYVLPREERYELDNEKVRQYVCLGKKGNVQPWVSDRNGNVYKVNLLTKLVMLAGTKFMSLDNMGFGIEMEGGKPGWNDAMNGLPGLLGSSFAETAELQRLLLFIRQNLNVVEGSLQVPLEFYTAMTELNGVLSDALDNKVTQFDYWNKVSNIKEVYRASTNYEVSGENKEIYVCELEDLLNKMIEKINIGIKDIKKLNDGKIPTFMYYDVVKYELNEKNQVKPLEFKVNFLPMFLEGAARYLKIVKNIEEKHEIYDTTINSDVYDKKLKMYKTSESLEAVSFEIGRARTFTPGWLERESVFMHMEFKYILELIKSGLYDEFFESIKSAMPPFMDPEVYGRSILENSSFIASSSNPDEHNHGRGFVARLSGTTVEMLNIWKLMMVGNKLFTYKDEVLTFELNPILSKDFFKDGIIKTTLLGSIKLTYINPENKNTFGEDRGIVNKLKIVDFDGNKYEFYGNKICGEIAAKIRDNQIKEIEAVIL >NZ_CP053292.1|WP_043852480.1|349723_351067_+|glucosylceramidase MKKYNVYETYKDGKEKLELKKLDDIALKSESNHNACIKVNTGNKFQKILGFGGALTESSSYALSKLDDDVRKKVLKSYYDKEEGIGYKFGRIHINSCDFSLENYTYVEENDLTLDTFTLERDEKYVLPLVREVKEISEGDLTILASPWSPPSYMKTNGEMNHGGKLKEECKQLWADYYVKYIEKMKEKDIDIWAVTVQNEPAAIQTWDSCEYTAEEERDFVKYYLGPTFHNNNLQDKKIIIWDHNRDIAYERAKVVLEDEEAAKYVYGTGLHWYVSEEFANVSKIHNEFPDKHLIFTEGCQEGGVHLGSWDTGERYGRNIIGDFNNYMEAWMDWNIALDETGGPNHVGNLCDSPVIIDTKEKNVIYNSSFYYIAHFSKFIKENAIRVESTVEGEKVYCLSCINEDNTICSVIMNESDDIKIVDLEIDGDKVSLQLKPHSIYTIKEVK >NZ_CP053292.1|WP_003424023.1|351318_352332_+|LacI-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MSTIYEIAKIAGVSPTTVSKVLNDYPDVSDKTRAKIKKILEEENFYPNSQAQNLSTKKTWTLGIVYFENLGVGLSHPFFSGVIEAFKNQADSHGYSLLFGSKNNRLGNDTFLEYFKYINVDGIAIICTDPSDKETLQLIDSDFPIVVIDMFSSNTSTVTSDSAQGCRLAINYLYNLGHRKIAHIEGISKEDNWPSSIRKEYYIRAMKDLNLDVPDEYIVDGVNFDVSGGYEAMKKLLELEEMPTAVFASCDKLAIGAIDAIKEAGLSVPEDISIIGFDDIELAKYVTPKLTTIRQDCTSVGKAAVDLLVEQINAKAKLKINKVIPVELIERESCRKI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053292_4 | 1527787-1527870 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053292_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053292_4
>4.1|1527811|36|NZ_CP053292|CRISPRCasFinder ATAATGCAAAGAGGATGGGTTTATAGTAATAATTCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053292_4
The CRISPR arrays of NZ_CP053292_4 >merge|NZ_CP053292|4|1527787-1527870|CRISPRCasFinder TGGTATTATCTAAATGAAGATGGAATAATGCAAAGAGGATGGGTTTATAGTAATAATTCATGGTATTATCTAAATGAATATGGA >NZ_CP053292|4|4|1527787-1527870|CRISPRCasFinder TGGTATTATCTAAATGAAGATGGA ATAATGCAAAGAGGATGGGTTTATAGTAATAATTCA TGGTATTATCTAAATGAATATGGA
>NZ_CP053292.1|WP_002580023.1|1525693_1527064_-|hypothetical-protein MNSKYTDLFHELIQAYYDGNFDETLSRIMVCHESSPQETFKIITSLCGVNIEFDNNYIYNLKKAITMYSVNKRIVEKLECSGVNCIKSKDDKFTCEAACPFNAIKYDTTNKTTYISKDICINCGICVDSCKGGRILDKVEFIPVMNLIKENKTVIAAVAPAINGQFGDNVTMDMLREAFIKIGFSDMIEVAFAADILSIKEACEFDKHVNKDGDLMITSCCCPMWVGMLKKVYTSLVKDLSPSISPMIAAGRIIKKINPDAKVVFIGPCIAKKAEAKENDLKDVIDFVLTFAELDEIFKALKIDLSSLKGIPSKDYTSRGGRMYARSGGVSTAVSDIIEELYPDKFKSFKSSTASGVKECKEILEKALNKELDSNFIEGMGCKGGCVGGPKTLIPLEKGKQQVDNFAFDSPIKVPLHSETLDNILKEIGINSIDDFKDKQKMSLFERDFNSNNVKK >NZ_CP053292.1|WP_052501780.1|1522396_1525624_+|sensor-histidine-kinase MIIINKLKNTILKISVIFFILNLFTSISVIKAEAYSNIVFKNITIEDGLAQATVECMIQDSRGYMWFGTNDGLSRYNGHEFEVYRNEIGVDNSIVNNYIVCMNEDRDGNLWIGTIDGASKINLSTNEITNYKNSSGLSNNNVTEILVTKDGEILLATIDGLNIYDKTNDRFTRIFNNEYIKDQEIYSLDEDINGDIWLGGSKNITKINLKNNTCEDFSDINKEYEKINDCAYKVLCDDKYIWVGTISNGLYKINIETSQTETINLSNSKISSNNIHTIMKDKNGIMWIGTDSGLVKYDSKNDEYNTYVNKAYDKYSLVDDYVYSVIQDRSGLIWVGTYAGVSMFEPENKIEHYKVDPLSHSSINENLIHGIYEDDDGLIWIGTNTKGVNVLDRKNENIYDISEFTNGTALSSNSINDISGHANKIFIATNNGLNIYDKNTRKISVYNEKQGLNAKKIRNITYDDSGVLWIGTTNGINILNLETDEITDLNYILDKYSLDDRYSECIFKDSEGFYWLGSFLNGGLIKIDPYNNTAIQYKHEGKDGDLSNNTVRTIIEDDEKNIWVGTSGGLNKLDKETGKFKTYTTSDGLANNNIYGIVIDETGNLWMSTNLGISKLDREKDRFFNLNITDGLQSNEFNGHSYGKLKSGELIFGGINGLNIFNPDEILNNMYIPRVEFDRFRVNGRTIDTLQDAKLNYNENTIGIKFFLPDYKNIKNIQYYYSLEGAGNDWSLVNTNELVLSNLGSGTYIFRVKARNSSGIFSEESSFKFTIKPPFWRSAEFILIYILIGVSLVVLIVKSKNTKMRLLDDMVSKRTRELSDEMEKNTELLNKIINLEKRKNAYLVNISHDLRTPLNVLSSIHQLINQLNKSEAGIEREKLDYYMNIFGKNVDRLLKLINDLIDSSKIEHGNYHINIGKYNIVYIVEDTALSLKDYVESKNIELIIDPEVEECFIECDSNEIERCIINLVNNAAKFTDEGGRILVSVVELENEVKIMVSDTGIGIDEKHLETVFDRFNQVIDSNKETKGGSGLGLTITKLIVGLHNGRIFAESEINVGSKFTIILPKKQPKEKVEKI >NZ_CP053292.1|WP_024040152.1|1520040_1522077_+|penicillin-binding-transpeptidase-domain-containing-protein MDKKKNLYMLVGVLIVVVPLVICTIIYMGYSYTHKPENKWQEYTELLQNKEYDKMYDLIDSTAQAKISREDFVARNKNIYEGIEAKDINITIKSISKEDNDTLINYNTKMDTIAGELEFDNSVKIASELGKGHTIKWTSKNIFPDLGENDKVRVKTLKGRRGNITDRNGQLIATDSYLSNVGVVPGKLGDNKEESITKIANILQCSTETINKALSANYITDDMFVPIKDIPYGDAKVVDLLKVPGVMIKEKDSRVYPLGKDTAHITGYVQSINGDELEQNKDKDYTENSLIGKSGLEKMYEDFLRGIDGAEIYIQNSEGEKKSVVLSKDARNGEDLKLTIDINVQKKVNEELGSDKGCAVVMNPENGQVLALSSTPSYDPNDFILGMSQEKWNTLNNNEDKPLFNRFQATSVPGSALKPIIAAIGVDSGSVKPDQVRKISGLAWQKDESFGNYYVTRTSNIEEVNLESALVYSDNIYFAQIAMDMGSNLIEEKLKGFGFGEKIPFEFALYNSQYSNDGKIKEGAQLADTGYGQGEVMVNPVHLTSMYSMFLNQGNIIEPHLVIDNKNNNIIWKKSAVSKESAQVVLNDLIQIVENPVGTGHEAYNSKLKIAGKTGTAEIKNSQTDTSGTELGWFVGMTTEGDNKVLVTMMIEDVKGRGGSHYVVPKVKDVIESVSLKQ >NZ_CP053292.1|WP_003411894.1|1519616_1519880_+|late-competence-development-ComFB-family-protein MKKITNCMEISVEECLDKLLEESNGCKCEKCRYDMMAIALNNLKPYYVTTHLGEVITKIKNMEQQSEANIVVEVTKAIKKVHMSPKH >NZ_CP053292.1|WP_043852793.1|1518144_1519461_+|[cytidine(C)-cytidine(C)-adenosine-(A)]-adding-enzyme MNYKLKIPSDVQYIINVLIENGYEGYMVGGCVRDLLINREPNDYDITTNAKPEVVARLFDKVILTGLKHGTVTVIINKVQYEVTTYREDGEYKDSRHPENVKFVTDIKNDLSRRDFTINAMAYNKEKGLIDYFDGLSDLKNKVIRTVGNPEKRFTEDSLRMLRAVRFAVQLDFKIEESIIQSIKILNNNLEFISKERIREEFNKIILKDPKGLKLLHECSILKYIADDLDKAYDYYINDKIKCYNLYEHLILSSCNIKKDLSLRLTMLFHDLGKLKDWNNKLEKVDNIFLESACMAEKILRSLKYDNGTIKKVKTLITYMHSDLEDKVSIKKLLNIIDVELFEDLIKVKKAHIMSENIEEVKSLNIEKLYCDILEKNECFRIRDMKINGEDIIKIGVKKGKDVGTMLNYLLCKVIEDNNLNYKKKLLELAEDKLSMNI >NZ_CP053292.1|WP_002580018.1|1517158_1518055_+|MurR/RpiR-family-transcriptional-regulator MEELNNENSKDLMRLIQGKFIRLSKGQKLIAEYILKNYDKAAFMTAAKLGNAVGVSESTVVRFAIEVGFSGYPKLQKALQELIKNKLTTVQRLELRNDYFSDGDALKGVLKADMENIRATLEKINQNTFQDVVQHIFEAKRIYIIGLRSSTALAEFLGFYLNIILQNVKVVSYGISDVFEQMINVGEGDLVIGIGFPRYAAKTIDALEFSQDRGAKVVALTDSLLSPLATKADYTLIAQSNMASFVDSLVAPLSVINALIIAVGMREKENISNVFSNLELIWKNYNVYSINNKNVADD >NZ_CP053292.1|WP_043852792.1|1516273_1516990_+|rRNA-pseudouridine-synthase MEERLQKYMASCGIASRRKCEELILLGKVKVNGNIIEELGFKVNPLKDIVEYDGRVITKEERKVYIMLNKPEDVITSVKDEKDRKTVIDIVKVNERIFPIGRLDYDSSGLILLTNDGELYNKIIHPRVELDKKYVAVVKGEVSLDDKEKFESGIDIGGYITAPAKLKMLEYSHRKDLSTIEVCIHEGKNRQIRKMCSAINHEVMSLKRVSIGNIRLGQLKKGEYRYLNDEEMKYLMSL >NZ_CP053292.1|WP_043852790.1|1514649_1516098_+|TrkH-family-potassium-uptake-protein MNYKAVLSILGNVVKYMVALLFVPLLIALYYGEGDAKSFLLTILIGAPIGFILSNIKAEKKAIYAKEGFLIVGFAWIIISAIGALPFVISGAIPSFIDAFFETVSGFTTTGATILTAIEGLPKGILFWRSFTHWIGGMGFLIFMLALIPSLGSNSIHLLKAESPGPSPGKIVPKIKETAKILYLIYFALTLIEGILLNCAGMNLYDAVIHAMGTAGTGGFSNMNASIAAFNSPAIEWIITIFMLIFGINFALYFQILKGNFKGFFKNEELRYYLLIIVSAFILITVNIISLNGGDIILSIRQSAFQVSSIVTSTGFATVDFNFWPTLSKLIIVMLMFVGAMAGSTGGGIKTVRIVIMLKAIKREINKIIHPKRVNSVKIDGKTVDEDIIHGVFLFIGAYIIISLIAIFIISFDNFDVVTTVTSVITTMSNIGPGLEVVGPAGNFAAFSPLSKLVLSFCMLAGRLEIYPMLIMFSPSIWRKNH >NZ_CP053292.1|WP_002580015.1|1513280_1514660_+|Trk-system-potassium-transporter-TrkA MMNIIIVGAGKVGYAIAKNLSTGNDNVTIIDNKMTALERINNNLDVMCVKGNCTSLKVLNEAGIEEADLLISVTNSDELNMLCSLAGKKLGAKHTVARVRNPGYDEDITLLTEAVGIDLVINPEKAAAGEISKLIKYPSVCSIDNFANGRVNMVGFDITEDTGLENKKISELGYLRGNVLFCGIERNGEMIVPKGDYIFEKDDHVYVIGEHKDIQEIFKKFGKYRRKVRSSMIIGGGRIGYYLTKIVSEAGVHCKLIENDFNKCEELAELIPNSVIINGDGLDQELLLSESLEEADSFITLTGRDEDNLIASLFAAKNGVKNIITKVTRDNYNEIAKTIGINSTINPKSVTANKIIKYVRTLKNRKKCPIENVYKICNEKAEAIEFIVKENAQYINIKIKNLNFKYDSLIATIVRENKTIIPSGDDILKPGDRVVVVTKDTNLLSLSGIFVGGGKNNEL >NZ_CP053292.1|WP_002580014.1|1512424_1513009_-|hypothetical-protein MRYILDIKECEFLGKGHEGSVYLTPEGYALKIFLKKKKAKEEVSILELVKTSKFFPKVIFIAGNMILREYVDGVTLFEHLKKNGISYKLSCEIIDLIEDFKKMKFKRLNIRNAHIFVDKNENIKVIDPRKIFTKNTPYPKDIIKILVHLNIFDDFLKNVAQYRSDLLQYYVDAYNYYVYMSKKSMHIDMHAEIC >NZ_CP053292.1|WP_002580026.1|1529836_1530439_-|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MKKYYYLFLFTALISILLLSCQFIPSLKSNKSISPNNNSFDIHSNDANQNSDSTNNYENSNNNSDDFVIPCSNAVHITIREFINNQQCSSYLVKENETLNDILMKYNSTCAPNASLKLIKELNNITSTNDVKAGTTLKIPETTMKNGSIYTISQGDTWSKICEKYYPVYDIDSIMKLLIFINDYKNDILPLGDTIFLPKI >NZ_CP053292.1|WP_002580027.1|1530702_1531200_+|hypothetical-protein MFEFNIGDKVVYPNQGVGVIDLIEEKEFKGKKEKYYKIHLINNTMKLSLPLSRVKSANMRHISDSKTLDSKLNNIKYYVKEVDKLAKTNYKERNEIYSTKVKSGTLEDLLEIISNLTELKTIHDLNSMEKTILRNTKRILIDEIAQSKKISLDEAGYLLDIFMNS >NZ_CP053292.1|WP_002580028.1|1531337_1532264_+|LD-carboxypeptidase MIRPKPLKKGDTIGIIGTCSPPKKERIDPAIKWIKSLGLEVVIGRSVNENHGYLCGEDKVRADDLNYMFHNKDIKGIFIARGGYGAARILNMIDYDNIKKNPKILAGYSDVTALHIAINQKCKMITFHTPMPCTEFYTDIDDYTVESFKDSIFKINYTKKVVNPDKCKSFEGLVKGNACGRITGGNLSIIASLMGTPYEINTKNKILFLEDIDESPYKIDRMLTQLRLANKFKDAAGIILGSWTGCDVKDTSRSLSLNEVFNEIIIPEKRPTIMNIACGHTLPTMSIPLGSNISINADSLEILNIDTD >NZ_CP053292.1|WP_002580029.1|1532308_1533229_-|DMT-family-transporter MNNYKGIIYAILSSIAFGIMPIFAKIAYKNGSNPTSSLLFRFLISGLILLLYLNFKKVSIKISVKQFLLLFFIGMFGYTITTITLFVSYNYLDSGLATALHYIYPALVCIFSFILYKENITKEKIFSLVLSIIGVYSLIAFESKTLNILGILLALFSGLAYALNVISLSFKSIKSIDNRVVTMYICFGASLGMIIYGAFTESLTFTINLEMMISYLGLSIISTIASMLFLLKAIKLIGSTSASILATFEAVVSIIMGIIFLNEKLTFALILGTSLIIISTTILAREKSPKPCDQYNKLSNAIDINH >NZ_CP053292.1|WP_002580030.1|1533389_1534001_-|hypothetical-protein MNFLSALLLSTAINIDTLKISFSSKNDSSVPLNLKILFASIFTTFITFLAFCFGKIIDIYFTHSLSNIFGSVLLGFVGVYYLIEHIRIQKDNDGYDTSFYVNNFKKHKNLIELNNPYIYSDSFKNLFNISIALSLNNILPSIAGSLTNINLPLTILFNFLICIFFYIAGNFIYNKKFIKYIKTNHYIITSILLIILSVFESFH >NZ_CP053292.1|WP_002580031.1|1534377_1536045_+|2-isopropylmalate-synthase MLNYKKYKRFETIKLKDRTWPDNEITKAPIWCSVDLRDGNQALINPMTVEEKIEFFNLLVKLGFKEIEIGFPSASQIEYDFLRRLVDENLIPDDVMVQVLTQARPHLIKRTFESLRNVKKAIVHIYNSTSVLQRDVVFNMSKEEIKEIAVEGTKLVKEYAKDFEGEILLEYSPESFTGTEVDYALDVCEAVMDTWEASKDNKVIINLPATVEMDTPNVFADQIEWMCRNFKDRERVILSVHPHNDRGTGVADSELALLAGADRIEGTLFGNGERTGNVDVLNIAYNMFSHGVNPQLDIENINEIIEVYERCVKIPVHVRHPYAGNLVFTAFSGSHQDAINKGMKKYNERHGNIWEVPYLPIDPSDLGREYEALVRINSQSGKGGVAFVMDHCYGFKLPKTMQKEFADIIQKMSEVKGEISPSEVMDAFTKEYLDLDVPFKLLKCTFTDISEMDGSEDTKADVIVVYNGEQRVLEGIGNGPIDSFKKALAESSLINVKIIDYTEHAMSTGSEAKAASYVYMERLDNKKKTFGVGTDSNITRASIKSMMSAINRLYK >NZ_CP053292.1|WP_002580032.1|1536147_1537209_+|histidinol-phosphate-transaminase MSIYWNDHVKTLEPYVPGEQPKDKKYIKLNTNENPYGPSPKVIDAIKNAVCDDLKLYPDPTCSNLSMEIAKYYHINDDEIFIGNGSDEILAFVFMTFFQKDRKVLFPDISYTFYNVYAEMFNVNYEHIKLDDKFNIPLEGFYKDNGGIIFPNPNAPTGKYIETNKIIEVLEKNKNSVVIVDEAYIDFGGKSMVEYIETYPNLLVIQTFSKSRSLAGLRVGFAIGNSQLIEGLNRVKNSFNSYTIDRLALIGAAEAIKDKNYFDVTTKKIIRTREDTVKKLENLNFEILDSKANFIFVKHKEFSGKYLYETLKENGVLVRHFNKERIEDYLRITIGTDEEMSLLIANLKKILKY >NZ_CP053292.1|WP_002580033.1|1537353_1538886_+|leucine-rich-repeat-domain-containing-protein MTYKKNRLLALGIITIGLSFISTNANAEIKKTEVYEETMQNEKLLANDTSIKEKTQSDYKIKRNWLTEEVASQLNKDFKDLTTEDFEHIIKIDFRYKKIDDTIPDEIALLKNLQYLDLNYCRLYGDIPEEIANMTNLTHLDLGDNKLGKLPESLEKKIIDGDYPYCDVEGNQLRLEKGWHLLKGNWTYIDRYGERLTGVQTIDKVTYDFGEQGFIKEGWEQVDNIWHYYDRVSGMIKNDWKLINSKWYYFNADGIMVTGLQNIQGTKFCFAPSGEMLTGFQNIGGYNYSFCESGGMQYGLVNVNGKQYYFDETTGIMATNTEKVINGKKYIFAADGSGSIKSNVWIDNYTYIQANGQTVNTYYDYSHSNTNYQLFKYMTDLGNQISVDRTAVALHGGITSNNCVYFASEALRRVGVGIPTSTCNTYELENELKYMGFVPCYDLSQLKPGDIVFTNNYSHVYIFMCWDTDGYAYIVDNQSYNFDNKVLHKRQVYQDTSITDRATHFYYYPN >NZ_CP053292.1|WP_002580034.1|1539075_1540125_+|M42-family-metallopeptidase MNINVNKEYLLNTLKEILQENSPTGFCFEIIDKIETIVSGFGYSFERNNKGCGIITIEGKENSKTIGLSAHVDTLGCMVRSITESGKLKFTLLGGPLVPTLDGEYCNIRTREGKIYSGTFLSTSPAAHVFEDAKSKKRDPENMEIRIDEVVSSKKDVIDLGIRPGDFVFIDPKPVITESGFVKSRFIDDKGSVACLLTILEMFKKNNVIPDYTTKIIISTYEEVGHGASSIPKDITEIISVDMGCIGDDLSCSEYDVSICAKDSGGPYDYNMVTDLVNLAEANKLNYAVDIYPFYGSDVGAALRGGNDIRGALIGPGVSASHGMERTHYKALENTVKLIYHYLTKETLR >NZ_CP053292.1|WP_043852798.1|1540165_1541260_-|tyrosine-type-recombinase/integrase MNLEYNITYRQKDKGWQFIISYKLDNKWKQKSKQGFRTKSDAKPAAEKMLKELKHQLRNKNSILDTNYDSITFKELSKLYIDHISLYRENNTINAYQYSFNKFKSLNTLKVKDIKKLHIQKTVDDIFKSEKIQSKTINTYVNRIKLLLKYYIENYDSSYELFKNVQLPNDKIESSKKALTKQELDDLLIELKSKKNGRYYIAALIAGTCGLRCGEILGLTWGDIDFKNNTLKVNKQWKVNKKTKTHDFGALKSKKSYRIVPVPAPTVKELLEYRKVAIPDINNRIIPCTGGSIKKFLNPILNDIAGISIHELRHTYATLLIGNGIDFKTAAQLLGHDVQQTLKTYSHVTDEMLNKATEKISKIF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP053292_5 | 2129154-2129376 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053292_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053292_5
>5.1|2129209|113|NZ_CP053292|CRISPRCasFinder TTAAGGAAACCCGACTCACATTCGTTCCCTGGGTAAGTTCGACTAACCAAATATAAAATTTGGAGTGTCGCTTTGCTCCTTTTTATAAGGAAACCCGACTCACATTCGTTCCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053292_5
The CRISPR arrays of NZ_CP053292_5 >merge|NZ_CP053292|5|2129154-2129376|CRISPRCasFinder TGGGTAAGTTCGACTAGCCAAATATAAAATTTGGAGTGTCGCTTTGCTCCTTTTTTTAAGGAAACCCGACTCACATTCGTTCCCTGGGTAAGTTCGACTAACCAAATATAAAATTTGGAGTGTCGCTTTGCTCCTTTTTATAAGGAAACCCGACTCACATTCGTTCCCTGGGTAAGTTCGACTAGCCAAATATAAAATTTGGAGTCTCACTTAAGGCATTAAT >NZ_CP053292|5|5|2129154-2129376|CRISPRCasFinder TGGGTAAGTTCGACTAGCCAAATATAAAATTTGGAGTGTCGCTTTGCTCCTTTTT TTAAGGAAACCCGACTCACATTCGTTCCCTGGGTAAGTTCGACTAACCAAATATAAAATTTGGAGTGTCGCTTTGCTCCTTTTTATAAGGAAACCCGACTCACATTCGTTCCC TGGGTAAGTTCGACTAGCCAAATATAAAATTTGGAGTCTCACTTAAGGCATTAAT
>NZ_CP053292.1|WP_002580485.1|2128697_2128976_-|Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln)-amidotransferase-subunit-GatC MKVTIDEVKYIGKLAKLNFSDEEAEKFAGEFEGILENFKYLNELDLEINEDEKKELKPIVRKDEVKKFECTDLFRNVKDKQDTYIRVPKIIE >NZ_CP053292.1|WP_002580484.1|2127242_2128682_-|Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln)-amidotransferase-subunit-GatA MKLTLKEMVSKIKSRELTSEELVSYYLKNLLEKEPKVNGFLTVMADEALAKAKEIDNRIANGEKLGALAGIPIGIKDNICTEGVKTTCASRMLEDFVPPYNATVVKKLLEEDAVIIGKTNMDEFAMGSSTENSAFKKTANPRDLSRVPGGSSGGSAAVVAADMCPVSLGSDTGGSIRQPASFCGVVGLKPTYGLVSRFGLVAFGSSLDQIGPFSQNVEDSAYMLNIIAGTDLYDSTSIRELKHIDYTESLKDGVKGMKIGVPEEFFGEGLDEEIKEAVKKSIEILKENGAEVEMFSLPIMKDGLAAYYIMSSAEASTNLSRYDGVRYGYRPEKFDSVDELMEKSRTEGFGQEVKRRIMIGTYALSSGYYDAYYNKADKFRTKLKHDLSKTFKKYDLILGPVSPVLPFKLGEKNSDPLAMYLADIYTINVNLAGIPAISIPGGVSKEGLPIGIQLMGDMLCEEKIFKAAYSLEQSLKVEL >NZ_CP053292.1|WP_002580483.1|2125790_2127230_-|Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln)-amidotransferase-subunit-GatB MNLETVIGLEIHAELKSKTKIFCSCSTKFGAKPNENTCPICTGVPGTLPVLNEEVVNLAIKAGTALGCKINKFNKMDRKNYFYPDLPKNYQTSQFDIPICSGGTVEYDYEGKHVKVRLNRIHIEEDAGKLVHVEGEPISLIDYNRVGVPLAEIVTEPDMRSVGEAVEFLRILKSILEYSEVSDCRMEQGSLRCDANISLRPVGSQEYGTKVELKNINSFRELEKALKKEEKRQRELISFNEGHKIVQETRRWDAAKGKTISMRSKEQAHDYRYVVEPDLPPIIIYDNQIEEIRKSLPEMPDEKRERFLNEYKLSEKEVEILISDIVLSRFFESVVKEGITPKMGANWILGDILRILNEKKLDTDQMPLNAENFAKLLKVVNEGKISNNIGREVLDEIFDENKDPMKIIEEKGLMQISSTDELEKLIDEVIAANPQSVEDYKAGKTQSAGFLMGQVMKKSQGKANPKVCKELIDEKLSKL >NZ_CP053292.1|WP_002580482.1|2125368_2125734_+|YccF-domain-containing-protein MSCLGNIIWFIFGGFFNALGWFACGIFWCITIIGIPIGIQCFKMGKLQLAPFGKEVIDSESSGLTSFVLNILWIIFGGFELCIANLLSALLLCITIVGIPFAAQSLKMAKLSLMPFGKEII >NZ_CP053292.1|WP_002580481.1|2124932_2125226_+|acetolactate-synthase-small-subunit MINTNFYLIELLVRNHAGVMSHITGLFARRAFNLEGILCAQVGDGTTSKMFLLVKNDFVLDQIIKQLEKLYDVLEVAIHQDYDVSVFKNLDKVLKIN >NZ_CP053292.1|WP_043853062.1|2123206_2124940_+|biosynthetic-type-acetolactate-synthase-large-subunit MKYNGAEIVIKLLENQGVEYISGIPGGFNLPIYDALYKSKIKHILARHEQGAGFIAQGISRTTNTAGVCFATSGPGATNLLTAIADAKLDSIPLVAITGQVPLSAIGTDAFQEVDAYGLTIPITKHNFLVRNIHDLFTIIPEAFRIALEGRPGPVLVDIPKNIQTQVIELETFPHSAYSQSNRSETENYDDTINNDHINKCNKKIFKRSTLECMAELINNSHRPIIYAGGGVIRANASEELCEFAKKNSIPVTLSLMGLGAFPSDDILNLGMLGMHGAPYTNYLMNEADLILAFGIRFDDRATGNIQKFCPNASIIHVDIDPSEINKVKNSNLSMVADIKEFLKEMIPLINSKTRLSWIKRVGCFKEKYPLPSYENPLHPANIIPYIASKVSSDTIISTDVGEHQMWTAQRYPFKKPKTLLTSGGLGTMGFGLPVAIGASLVNTDKAILCFSGDGSILMNIQELATLADFNLNVKVIILTNHHLGLVRQQQNLFYNEHYIASQFISNPDFATIAKGFGINSCDLATENDPLKKLDEILSKSGPWVINIPIEECENVLPMVAPGKSNLEMIGSGELND >NZ_CP053292.1|WP_002580479.1|2121511_2122528_-|FUSC-family-protein MKKKIISKTLTFICILLFISLFKHIFGDANSPVGITTVIAVLILMSENLTVSPIKNFMKLLLINIIIGMGAFIASQNIYWGVIIDFSVLWFIGYYFSVNLTKTIILPFGLQYLFILYDPVYGENLIKRFGALAFAPFLIMLIQYLIYGRNKKIEVEKSDILEFSKSDDTYEKVKILGIEFKVNKIRAYYALRLSLLIAITAFINGRFLLPNGIQEGKWMVYSIFSLTELFGENCRIKSKKRIQGTIIGALIVLILFMFIKSTPLRGLIILIAGYLNSYFEDYRDTMVCVTVSTVASVALTNGTLLTAIERILFVSIGILISLIGNKLIFSDFKKGEIE >NZ_CP053292.1|WP_003426586.1|2120852_2121440_-|NUDIX-domain-containing-protein MEEMIDIYDENFNKIGVKSRFDVHKYGFKHKVVQCYIINKIDNSKWIYFQQRSFDKDNYPGFYDIACAGHIDSGEQASSSMIRELQEEIGLRVEKSQLNYAGTKLENKNHGNILDDEICELYVLSIENENFVLGEEVEDMVKVLFNDYKSWINEQYKVLKVFSIKHKKYLELNEKNICGHIRDYNKDFLKVIENI >NZ_CP053292.1|WP_043853061.1|2119332_2120676_-|MATE-family-efflux-transporter MSKDMTIGNPSKILFYFAIPMVLGNILQQLYNIVDSMIVGNFVGADALAAVGASYPITFVLITVANGAGIGCGVVISQYFGGRMLEKVKTSIFTSIIFISIFSCILMVLGIIFADWILSVMNTPKNIFYDSSSYMKIYFMGVVFLFIYNIVTSCFNALGNSKTPLMFLLCSAILNILLDLLFVIKFNMGVRGTAFATLISQGISALLSLSFLLKKIKMIKTDTTVKKFDIRILKKISKIAVPSILQQSIVSIGNLFVQALVNSYGAVVIAGYAAATKIDSMTILPMSNMSNAVSTFTGQNIGAGKIERIKKGYKSALIMIGIFCVFAASLLFLAGHQLIGMFVDSVSNQGVITIGTQYLKIVSVFYFFMGLMVITNGVLRGSGDMKMFLASTLTNLSTRIIFAYGLASFIGQGAIWWAVPFGWIFASTVSVIRYKSGKWKNSTVIRF >NZ_CP053292.1|WP_043853060.1|2118091_2119093_-|right-handed-parallel-beta-helix-repeat-containing-protein MKKVRNLCLIAALSLIAVGGSSFYQIPVNAATTIEVSNSGTSLKDALAKAKSGDIVNITGTVKSGTVNVPAGVTITGEKGKSKIDFSSTSGSSGKGFVIKSDGASIKNLDVYGAADNGIYIEGSKNNITNVNVYKNKDAGVQLSNGAANNTLTKVYSYSNADQTGENADGFAIKLHSGEGNKLIECTAEGNSDDGYDLYAAHGAVTFIRCKAINNGNCDGIKGDGNGFKLGGVDNKTSGVAAHLDPLNHELTDCIAIGNTGSGFDRNNQNGVVKMTNCTGENNGEYNFNFPLKGKPSALGYEVTFGKAIMNGCTSINGGNVITGASLTDCTGF >NZ_CP053292.1|WP_002580487.1|2131399_2131570_-|hypothetical-protein MKRKILTISIGVLLLFSGVYYYNCKEISEKYDENSCESNINRIEMHPLDSLKYKFL >NZ_CP053292.1|WP_003406209.1|2131970_2132453_-|hypothetical-protein MFIDFNDIMFGLRNGRYVYIGSGSSREVYDLENGYVVKVAKNKAGIEQNRAEYYISANDSSGIFAKVIEASSDYGLLIMRKAKKIKDIRFVWNYFNAGNKHEFYESPHMQRLKNKYKLLLGDFEKASSWGIIKGRPVIIDYGFTRYVERKYYRRFYEEDL >NZ_CP053292.1|WP_002580489.1|2132666_2133752_-|aspartate-semialdehyde-dehydrogenase MEKKLRVGIIGATGMVGQRFACLLENHPWFDIVALAASKRSSGLTYEEAVGDRWKMPTAMPEKYKKMVIMDADNVEEVCSKVDFVFCAVSLNKEETKKLEERYAKCETPVVSNNSANRHTDDVPMIIPEINGEHAKVIESQRKRLGTTRGFIAVKPNCSIQSYVPALNALKEFGLEEVVVSTYQAISGAGKTFNEWPEMLDNVIPYIGGEEEKSEIEPLKIWGTVENDIIVDAKTPVISAQCIRVPVLDGHLATISVKFKNKPTEKQIIDAWNNYKASDMVLNLPSAPKQFIRYMEEDNRPQTHLDRDYENGMGISMGRLREDKIFDYKFVGLSHNTLRGAAGGGVLSAEYLTAAGYITAK >NZ_CP053292.1|WP_033128060.1|2134138_2135032_+|LysR-family-transcriptional-regulator MDFKQLNAFLTISKLQSFTKAADALGYAQSTITTQIKLLECELDVKLFERIGKTTTLTHEGKKLLPYAKQILKLSTDIKSTVSNENKPTGTLTIGAAESLCVLRLPEILKEYKHLYPDVDVSLKFGSCADFRHYLSENLIDVAFSLGVKIDSDEFISDVELKEPMLLLAYPGHDLIKKREIFPIDIKDESLILTETGCSYRAAFERILKDNGIKPNITLETGSVQAIKQFTMSGLGITFLPEIAVKDEVKAGKLIPLNWAGPDLNIISQVIYHKDKWISPALKEFISLSHRFLKQNL >NZ_CP053292.1|WP_043853063.1|2135141_2136173_-|hypothetical-protein MKYIKRFVAWAILSLIIQVGALFILDRVIFKQSSAFESKKIELDKPYEDKINIKIPKDADEIKVSYNGKYMSYSKGDKLNMIETKSGKDKSIETENKGEVMYYEWLYERDMIVILEKVNKKGKDKIQLVTYNPKNSATTLVTEICDFKSGMKIKNVTESVFTSVYYVYVSNNEGYDRCYRIDINNDKFDVPLKGAGMENMKVIPHKDRLIYDDVVNSSIYATSPNTKLKFNTNNKLRLIGIDRNDVIYIGEVSGDKICGIVYGKIDESTSKWNSIKLDSPANSSDIFFNSKSEIMVNNILEEKIKNITTGKEYPYTGKFIDVKDDFIALDDNGKLVFQKIKDN >NZ_CP053292.1|WP_033128061.1|2136494_2137175_-|M50-family-metallopeptidase MENLALKNVVVIISYFLIYIYVLRYIQCYSWGALKMISRSVYKIFSMIGAPAHEAAHAVAALIFGFRITNINIFKHVKFMAPSNLRGIIGGFVVSIAPAVFNIIIFTVICSKSDNIYFNFVMFLILISCIAPSNSDIKGMLPVMIIGIIIIVVVTYALGWAVPSINVYIKNSILLVGKFYALYLAVLTIIVTIKGCFINRTINPFYILKLYKNLVVNGLTIMAKAS >NZ_CP053292.1|WP_003406298.1|2137459_2138197_-|tetratricopeptide-repeat-protein MENNEIQKKIDLFLNEHKIKIQGGQINTEKDMSLLLSRIAKSEIDKGNYEKGLYFAVNSFKFDKKNLYSVFLQGLGFRFTGQYEDAIKAFKYCNSRKHDLASLANIGFCFAELKDSEKALDIFNKIIENITEEEESNNAQLMALVYECMGNIYLSREDVLEFDSTDKLKINYKLAVKYYKNSLRLNRVNHVLLNKLAACYYHFDDERKALYCYEEAVKVAPEEKNYEEAVKELRNAGVIPDVVEF >NZ_CP053292.1|WP_002580494.1|2138431_2138878_-|Hsp20/alpha-crystallin-family-protein MFGLIPIRTNNATDKGGALSDFFNDFFNDDFLSPMGIGIDMSKFNADVRETENEYLVCAELPGVNKNDINLDFKNNNLIITAKREEVHDDSKDSYIRKERSYGQFSRSFYFDNVKQDKIRAKFENGELKVILPKELKSKENSSNIFIE >NZ_CP053292.1|WP_002580495.1|2139286_2139520_+|hypothetical-protein MEINFSKVHEEKEMYAVLKASVINGKEIESQLLGIYESEDDVKKAKKKLSVDGHKTVVKVKVHIDPIEYLGDIDNIK >NZ_CP053292.1|WP_002580496.1|2139676_2140141_-|hypothetical-protein MQVNLSDLIEAIEFENDMLSHYYNKDTGVIIYKEDMETASYFAEDIDRVDSMEEWEKELIEGLYDLKKNPENYIKLPDKEELNELKIMINFCSSFSDIELPKLEEFNDEGKMLHEVKNIIRNKGLINEWYDYREYSEREIAIEWCKKNNIQYIE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP053292_6 | 3113457-3113530 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053292_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053292_6
>6.1|3113481|26|NZ_CP053292|CRISPRCasFinder GTGAAACTCCAAATTTTACATTTGGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053292_6
The CRISPR arrays of NZ_CP053292_6 >merge|NZ_CP053292|6|3113457-3113530|CRISPRCasFinder CAGTTGAACTTTCTCAGCGAGCAAGTGAAACTCCAAATTTTACATTTGGTCAGTTGAACTTTCTCAGGCGAGCA >NZ_CP053292|6|6|3113457-3113530|CRISPRCasFinder CAGTTGAACTTTCTCAGCGAGCAA GTGAAACTCCAAATTTTACATTTGGT CAGTTGAACTTTCTCAGGCGAGCA
>NZ_CP053292.1|WP_162830838.1|3112005_3113133_-|rod-shape-determining-protein-RodA MFKQFKLDIKLIKDIDKTLLFSMIALVLYGILNIYLCTKGGKYDGFAFKQFVWLIISLVVLYIFLSIDYTIMMNYVPLFYWGSVILLIATMFFGSEINGAKGWIRLGPLSLQASEIAKIGIILMLAKKLDEMDGKINDVKNFFTLVFYTAVPVLFIIIQPDMGMTMVCFFIVLGIFFVAGLDMKIIGGGLASLVIAIIVVINSSFIPAYQKSRFTGFLNPEADYAGNGYHLTQSLIGIGSGGILGSRPSLKADAATGYAAQNVPEVHTDFIFSAIAEQLGLLGAAFLLILYGFLIYEMISIARTSKDICGSVICVGIVSYFLFAILQNIGMTIGLLPITGITLPLISYGGSSLLTTVISVGLVLNVGMRRKKIHF >NZ_CP053292.1|WP_043665694.1|3111395_3111875_-|hypothetical-protein MGNYSSAYEEYYKNINNKSITKESGNRGPFLNRGVNNTQSNKFQSRNTEEIYYFSKDYWIRRIERELAGSLALLACFMGLKYTNIKNVQDFYKWCKQNVVSEFNYDQSVEVLNSMEIGTFKTKDFKIGTFQIEDLKSENLKTEMKNFKEYINKLQGEKV >NZ_CP053292.1|WP_002582221.1|3110396_3111251_-|site-2-protease-family-protein MKKWIVILLVEFLALMWIADFQASVIISFLWIILHEFSHILTAKRFGCTFNKINISIWGVKADLIDFDELLEKDKLVVYLAGPVFNITMSIVLFCLYSVFKLNYLKSSIIINLCLGAFNLLPAYPLDGARILEILLSKKFLYKKSKKITECISIIISGVLFILFNIMLLLHKVNISLFLASILMGYTTFLEKEKTMYIIMDDMIKKVRRLKKYNYMENKSISVYYKKGLVNVLTLVDKNKFNSFYILDDDMRLITIIHEDELIMALKEYGNITLEDYIKIRNNH >NZ_CP053292.1|WP_052501820.1|3108215_3110198_-|S-layer-homology-domain-containing-protein MTSTAFAAELDSKNFEQAIVNVKSIVSISDDYKNFSHSSREISNGNNSVTVWDLEWETDDEKGGYISAKVDSYGNLCAYNNYNNKTDTSGLAKVSKEKAESTAKEFLGKAMPEFSKDMKLVNGNIYSDEYYFVYQQYVNDIPVNFIKVNVGVNKFSGEISSYLGLKPGTKKLDYPQVDNVIGIENAEKIYIDKIQNDLCYYSTYDYKEKKNNTVALYSFDSNKAVDAKSGEIVSLDNYRFNEYLDKNSGSNSVTEADSAGLSEVEKDEVNKVSGLISKEKAQEIINENSDLLSSMKIEDIVLRKTYRGDSYLWQLSFDGGNAEINASTGEIIGFYIYKPSESKENKVTKEEAKNKAEALLNRLAKDKFNQTKLIDDYDTSESSEYNFDYIREIDGKGYMSNVLSVSVDKNTGNIISYSNTWDNNISLPDISQSISKTDAFNKYNEPENFGLQYVLNENNTVRLVYNFSGEDMVYYIDSVSGKKIDRWGNEYKSNKVPEYSDIQGHWCEKTVKELLDSGYYIPGDKFNPDTNISQINFFRYMLSLNASDYSDDELYNILIDRGIIKEEEKNTLGAVTNKDAAKFITRYLGYEKLATNSKIFNNQFKDSIDDEYLGYANICYGLDIIKGDSKGNFNGDKNMTNAEAAVYIYNLVSQNNKVYL >NZ_CP053292.1|WP_043853349.1|3106138_3107992_-|TIGR03960-family-B12-binding-radical-SAM-protein MNRVSDDILFKVEKPARYIGGELNEIIKDPKEVDIRFAFCFPDVYEVGMSHLGSRILYHTINLREDTYCERTFAPWPDMEELMRENDIPLFTLETKDALNDFDILGFTLQYEMSYTNVLNMIDMCNIPIRASERSENDPIVMAGGPCAYNPEPLYDIVDFFEIGEGEEMMNDVLDVYKKYKGKGKKKEFLREIAKIEGIYVPSLYDVVYNEDGTIKSFEPKFEDVPKTVKKRIINNYTKVQFPTDIIVPYTEIVHDRVVLELFRGCTNGCRFCQAGMIYRPVREKTKEDLLDLTRELIKNTGYEEVSLSSLSTCDYSDIKGLVDDLMNEHEEKRVGVALPSIRVDAFSVDILKSIQKVRKTGLTFAPEAGSQRMRDIINKGLTEEKILDAATSAFESGWKTLKLYFMVGLPYEELDDCRGIGELAEKIVYRYKTAKKENNNKGLRLTVSTSILVPKPFTPFQWAPMARIEDVNQKINAVKDSIKSKCIVYNYHEQKTSVMESVFARGDRRLCEVLIKAFEKGARFDGWNQYFKYDIWQESLKECGLNEDFYAFRERSYDEILPWDFIDIGVNRKYLERENEKAKKAELTQNCRKGCTGCGVNVNFKEGECFEGAILS >NZ_CP053292.1|WP_003429484.1|3105453_3106155_-|DUF2344-domain-containing-protein MRYLVKFTKEENIKFISHLDVLKTIQKNIRRAELPIEYSQGFNPHMTTSIAQPLSVGVYSSGEYLDMVLVDEMNEDEIIARLNATAPGGIKYISALAIPYKEGEKKVPQAMAMIDGARYTIKVKYSDVSNLEEEIKKILQKDEWNIIKKTKKGEKETNIKAMIKEFKFWVKDNALVMNTLISTGSREHLSADLLVKYIQENTSNAITDSFVDVKREEMYFYKNDKLVPLYKCV >NZ_CP053292.1|WP_043853348.1|3103865_3105314_-|Rne/Rng-family-ribonuclease MKEIFIERRENILRIAVKVNNELVESIVEEQNDEPIIGEIYKARVKNILPAINSIFIDMGLSKEGYMYYGNDLKDANIKKGDDILVEVVKEPINDKGAKLSHKVSIPGKYVVLNCYNQGISFSKRITDEIRKKEILDNIKPLDDVSITIRTEGINTDINILQKEIDKLYGEFENIKRKMKYSNELKKLYGEDPTLNRLLRNSYNDENTKIYVDNDSDFEKILKFIGEEKELQVEKYNGYRNLFDCYGIEKELIKLRHNKVNLHCGGYIVIDKTEAMYVIDVNSGKNIKERNFNKTILETNLEAAKEIGKQIRLRNLSGIIVVDFIDMRDRKQKEIVMSELYSSLKEDKGNVKIFPFTELDLVQIARRRQGKSIYEYMEEECLRCKGRGIILKLSYIEGLIRNEIIRMKEENSIDSFKIEIDSVYKDRIKDDIFSFIKEIDGLDNEIYLDYVDGIEGYRIEPLLFQTQKENLKKLKITEIEKA >NZ_CP053292.1|WP_002582216.1|3103408_3103720_-|50S-ribosomal-protein-L21 MYAVLKTGGKQYRVQEGDVIYVEKLDAEVDSTVELEEVLAVGTDAGIKVGAPVVAGAKVVAKVAAQGKAKKVIVFKYKAKKDYRRKNGHRQPYTKLVIEKIEA >NZ_CP053292.1|WP_003429480.1|3103017_3103404_-|ribosomal-processing-cysteine-protease-Prp MVEVKVREKSNKIIGFVINGHALSDDRDFSSDSALVGEAFDLICNSVAVLSQSVIIGIDEVLKLNCTYEMKDGYLNLDLQDFTSEEIEKTQVLLRTFEKSLESVILGFDALVGKKKRMEYITLIKEEV >NZ_CP053292.1|WP_033127396.1|3102713_3103013_-|50S-ribosomal-protein-L27 MLIMNLQLFAHKKGVGSTKNGRDSESKRLGVKSADGQFVLAGNILVRQRGTKIHPGENVGKGKDDTLFAKIDGVVRFERLGRDKKKASVYPVNVEAIAE >NZ_CP053292.1|WP_002582224.1|3113533_3113800_-|cell-division-topological-specificity-factor-MinE MGFFKSLNSKPTPKQVAKDRLKLILIHDRGEIAPDIIEKIREEILGVISKYIDIQIDDVEISVNKNVEEGDNSSALVANIPIKNLKGR >NZ_CP053292.1|WP_043853351.1|3113814_3114615_-|septum-site-determining-protein-MinD MGVSIVITSGKGGVGKTTTTANIGTALASLGKKVVVIDGDTGLRNLDVLLGLENRIVYTIIDVIEGRCRLKQGLIKDKRFQNLCLLPTAQTKDKDDISPQDMLRIVNELKEEFDYVLIDSPAGIEQGFENAVIGADRAVVVVNPEITSVRDADRVIGKLDAKGLEDHGVIINRLNYEMTKNGDMLDVSDIIETLSIELLGVVPDDKNITVSTNRGEPIVLDEEAIAGHAFKNIARRIIGEEVPLLELHTTVNEGFFKSFLKLFKRS >NZ_CP053292.1|WP_002582226.1|3114636_3115296_-|septum-site-determining-protein-MinC MYNNDGILIKGNRDGINTTINMSKFSSFEDMITLLIKKLSKGKQFYQGTTLILRIDLKLLNEKNYEELKEILLSKIGLKDIVFEDLEKEAEDINQKENKVFTGVYEGKTKFIRKTVRSGQSVNYRGNIVIIGDVNSGAEVYATGNVVVLGRIQGKVSAGTNGNNKAIIAAFLLQPELLKISNIIAMSPDDTEKPNYPELAKIKDGTIIVEPYLPNKYIY >NZ_CP053292.1|WP_035761770.1|3115505_3116189_-|DNA/RNA-nuclease-SfsA MKYDKITKGRFISRPNRFIANVEIDGINEVCHVKNTGRCKELLIPGSTTVYVQESDNPNRKTKYSLIGVLKDDKKINMDSQVTNKVVHEWILKGNIFENVKLIKPEKKYKNSRFDFYVETENEKAFIEVKGVTLEENGVVRFPDAPTERGVKHINELCECIDDGYKAYIIFVIQMKDVLYFTPNDDTHKAFGDALRIAHKKGVQVLAVNCYVSEDSIDICDYVEVRL >NZ_CP053292.1|WP_043853352.1|3116576_3119573_-|penicillin-binding-protein MIVNKPVKKKKISRYTVLCIIMGIIFGAITLRLLYLQVFSYEEYKEKANTTSTRFVSESAPRGEIYDSNGVTLATNVRTYSLTYTETDVTQKNFYSTMSELFKILDESNENIQDTMLLKVKDDGTMYFDYLSSDKDSQNYSELRFKKDRGFNEPIQNKLFPEITEFSDEQTNKINEELLKITPEESFYMLVKNYNLIELIDPEYNSTKEKKEAYKNMTGEEITQKILDAGYSLNDLRKYMLVKDTIKIQSLKGYKSVTIASNIKKDTVLIIKQKLNDMPGIDVSSVLIRDYPYNNLASSVLGYVSTINSAEEEKYSMRGYDVSTDLIGKAGIESAFEEQLKAVKGGKTVKVNSSGRVTEKLFELESYPGNNVHLTIDSNMQYVAEQALADGIKEIQQNGTDTDGYRFRNATRGALVAVDVKSGKILSLVSYPDYNPNLFTIPGTLTSEESKQYFNPDLETFGKELINRMNLNKTVDDLFPKDSKGVRQDNNDLYPRPFYNYATMSLIPPGSTFKPLTSIAGLESDVITPSTTINDTGKFNIHPEVFGKGFAPECLQYTNYGAGHGNLNVAGALEVSCNFFFYETAYRLYMLNGGNLNALDSLAKYAWGFGLGVDPNGSEKAATGIEIKENFGQTYNFTSWKKQAINYAKFELVDYLEKGDYKGMGYVFIPFDIRYSEDDNEEVKNAKKAIKDKMEETLAKVGTDDFSNINQNDFTKEIKKYVQIIMDNSDVYKQRVSDYEASGKTVNLDSQANIVAEVIAKFTLNDKPVEIISPAQLIYASIGQGMNNYTPLQLASYISTLVNGGTRYKLHLVDKVTDNDGNVVQEFKPEVLGEMHLDKNDVEAVKYGMSKVNSDDSGTAASKWQGFPITTGGKTGTADFAENQKERGRAPYATYVSFAPLDDPEIAVVAVVFDGGHGGSIAGAVRAVFEEYFKDRILAGDPNYASKSESFRKYVLGNPLTKNKENSTENNSSNNSTNNSQSNSATGNISNQTVPATD >NZ_CP053292.1|WP_002582233.1|3119569_3120061_-|rod-shape-determining-protein-MreD MERLILILVSIGLAILDNSIIPFFSIHEGYPSLLFTFAIAYSLVNKREKSVFIGIVTGILQDIFFFNGFGVNCFLNLLLCFLASVIGEGMIKNKKLVPVVSMFIITILKYMGVFAIFCILNIKVDLSKGLYMAVYNAVVMFFGYKYIINIYDDEYTKQRWRFK >NZ_CP053292.1|WP_002582234.1|3120073_3120922_-|rod-shape-determining-protein-MreC MKLLKNKLAVTIIVLSVTFLGLIAYTVKKENRSIIESGAGSALNPVQRLLYSATNQVKETLDFFLNFSEVKSQNKELVDENEDLKNKLAEYSDLKEENDRFREMLNFAEERNNYNYIGCDIIGYSGGSFNDGYIVNKGTNDNIAKGMVVITNKGLVGQVTSVGSNWSIVQTLANENIAVSVMVESTRDATGYLTGYKDSQNRNLAKVYDLPMDSEVKEGDVIMTSGVGMVYPKEIRIGEVISVEEDKVKVMKSAIIKPYVDFNKLEELFIVSPKDTREVKYD >NZ_CP053292.1|WP_002582235.1|3120929_3121949_-|rod-shape-determining-protein MGFFGSGKDMGIDLGTANTLVFVKGKGIVLREPSVVAMNNMTKKTLAVGSEAKLMIGRTPGNIVAIRPLKDGVIADFDTAQTMMKNLIEKVSTKNAFKSPRIIVCYPSGVTEVEKRAIEEATKLSGARDVILMEEPMAAAIGAGLPVSEPTGSMIVDIGGGTTEVAIISLGGIVTSKSLRVAGDELDQSIISYIKKEFNLMVGERTAEQVKMEIGSAYKLDGEEEMIMEIKGRDMISGLPKIVEISESQVREALKEPVYQIIESIKTTLEKTPPELAADIMEKGIMLAGGGAYLRGLDVLINKETNMPVHIAEAPLDCVVLGAGKALEDFDKISRDQRG >NZ_CP053292.1|WP_003429495.1|3121972_3122662_-|DNA-repair-protein-RadC MNNSLNIRNIPEYERPKEKLLTYGAETLNNSELLAIILGSGVKGENAIELSNRILNEFDDLDGILTADYNEIISINGIKSGKASQIMALSELFKRFRTLRAGKRNIKITSPKDLADLLMGEMSYLNQEVLKVITLSTKNTVIDAKDVFIGSLNNSIVHPREIFKRAITSHSASVIICHNHPSGDPTPSREDINITLRIKECGKIIGIPLIDHIIIGNNTFVSLKEKGLI >NZ_CP053292.1|WP_043853353.1|3122707_3123274_-|Maf-like-protein MKIILASASERRQELLGRLVDDFKIEVSKFDEDTVPFEGDIDKYVKAVALGKALDVESRINEEAIIISADTVVVQNDNILGKPKDKHDAFKMLKSLQGKSHFVYSGIVVINTKTNKTKQESLGTKVTFSEISDEEILEYIETKEPLDKAGSYGIQGRGGVFVKGIEGCYYNVVGLPLNKLKSMLDEVK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053292_6 | 6.1|3113481|26|NZ_CP053292|CRISPRCasFinder | 3113481-3113506 | 26 | NZ_CP053292.1 | 288517-288542 | 1 | 0.962 |
NZ_CP053292_6 | 6.1|3113481|26|NZ_CP053292|CRISPRCasFinder | 3113481-3113506 | 26 | NZ_CP053292.1 | 21925-21950 | 2 | 0.923 |
NZ_CP053292_6 | 6.1|3113481|26|NZ_CP053292|CRISPRCasFinder | 3113481-3113506 | 26 | NZ_CP053292.1 | 27562-27587 | 2 | 0.923 |
NZ_CP053292_6 | 6.1|3113481|26|NZ_CP053292|CRISPRCasFinder | 3113481-3113506 | 26 | NZ_CP053292.1 | 1117047-1117072 | 2 | 0.923 |
NZ_CP053292_6 | 6.1|3113481|26|NZ_CP053292|CRISPRCasFinder | 3113481-3113506 | 26 | NZ_CP053292.1 | 2815396-2815421 | 2 | 0.923 |
NZ_CP053292_6 | 6.1|3113481|26|NZ_CP053292|CRISPRCasFinder | 3113481-3113506 | 26 | NZ_CP053292.1 | 3858813-3858838 | 2 | 0.923 |
1. spacer 6.1|3113481|26|NZ_CP053292|CRISPRCasFinder matches to position: 288517-288542, mismatch: 1, identity: 0.962
gtgaaactccaaattttacatttggt CRISPR spacer gtgaaactccaaattttatatttggt Protospacer ******************.*******
2. spacer 6.1|3113481|26|NZ_CP053292|CRISPRCasFinder matches to position: 21925-21950, mismatch: 2, identity: 0.923
gtgaaactccaaattttacatttggt CRISPR spacer gtgagaatccaaattttacatttggt Protospacer ****.* *******************
3. spacer 6.1|3113481|26|NZ_CP053292|CRISPRCasFinder matches to position: 27562-27587, mismatch: 2, identity: 0.923
gtgaaactccaaattttacatttggt CRISPR spacer gtgagaatccaaattttacatttggt Protospacer ****.* *******************
4. spacer 6.1|3113481|26|NZ_CP053292|CRISPRCasFinder matches to position: 1117047-1117072, mismatch: 2, identity: 0.923
gtgaaactccaaattttacatttggt CRISPR spacer gtaaaactccaaattttatatttggt Protospacer **.***************.*******
5. spacer 6.1|3113481|26|NZ_CP053292|CRISPRCasFinder matches to position: 2815396-2815421, mismatch: 2, identity: 0.923
gtgaaactccaaattttacatttggt CRISPR spacer gtgagaatccaaattttacatttggt Protospacer ****.* *******************
6. spacer 6.1|3113481|26|NZ_CP053292|CRISPRCasFinder matches to position: 3858813-3858838, mismatch: 2, identity: 0.923
gtgaaactccaaattttacatttggt CRISPR spacer gtgagaatccaaattttacatttggt Protospacer ****.* *******************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053292_6 | 6.1|3113481|26|NZ_CP053292|CRISPRCasFinder | 3113481-3113506 | 26 | NC_049978 | IAS virus, complete genome | 44110-44135 | 4 | 0.846 |
1. spacer 6.1|3113481|26|NZ_CP053292|CRISPRCasFinder matches to NC_049978 (IAS virus, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
gtgaaactccaaattttacatttggt CRISPR spacer ataaaactcctaatattacatttggt Protospacer .*.******* *** ***********
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
906061 : 916153
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP053292|906061:916153|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP053292|906061:916153|906061_909808_+|WP_043852620.1|DBSCAN-SWA MSNIRSVFVEKKSGFNVEAQSLLRDFKENLGLANLEDVRIVNKYLISEVSEEYYKKSLHTIFAELTVDKIYEEKLPINEGEIAFGVEFLPGQYDQRADSASECLALLSAEDKVEIKSAKIVILKGKISKNDLDKIKKYYINPVDSREVDIESKELASISNMPKDVQVLNGFTKKTIAELEEFHNDLGLAMSIDDIAMIQEYFKEEKRDPSITEIKVIDTYWSDHCRHTTFSTVLEDIHIEEGTYTEPIKKSYEEYLKSREYVYGQKHKEKTLMDIAVIAMKELRKRGKLNDLDISEEINACSINVKVETDKGMEDYLVMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCLGGAIRDPLSGRTYVYQAMRVTGAADPTVAIKDTMEGKLPQRKIVLGAAHGYSSYGNQIGLATGQVQEVYHPNYAAKRMEVGAVIASAPKENVVREEPSLGDVIILLGGRTGRDGVGGATGSSKEHTVDSINECGAEVQKGNAPTERKLQRLFRNPKVAKMIKRCNDFGAGGVSVAIGELCRGLDIDLDKVPKKYEGLDGTELAVSESQERMAVVVTKENADEFIRLSNEENLEATLVANVTDTDRLRLFWRGKNIVDLKRTFLDTNGATQKTEVTVKAPGAYPYNVKDINVKEEWINNLKKLNVASQQGLSERFDATIGGGTVLMPFGGKYAKTPAEGMAAKIVVPNGESKDATIMTFGLNPELGMWSPYHMAYYSVIESVTKLAAMGGNFRKAHLTFQEYFEKLGKDSNRWGKPFAALLGAYEAQMALEIAAIGGKDSMSGSFGDLDVPPTLVSFAVGVEKAKKIISPEFKNVGSKLILLTVETCSDGTINMDKYKKNLDVLYSLIQDEKVISASSVKFGGVSECITKMALGNRIGAEIENLTKEELFGFNYGCILAEVCEDVNVEEAFNESEYKVVGKTIAESIITSREYDFKFDICSLEKNYEEKLKSVYPIETKEVNKKIETPLFEAKSYASPKVKIARPKVVIPVFPGNNCEYDCERAFRNAGADVTQVVFRNITKDALNESIDRLAKEISTAQILMVPGGFSAGDEPDGSGKFIANALRNEKIAYEVMELLKNRDGLALGICNGFQALIKLGLVPYGEIVDIKEDMATLTYNNINRHMSSIIRTRVTSNKSPWFSEVNPGDIHSVAISHGEGRFVAPESLIKELIANGQVATQYVDLEGNVSLDMPYNPNGSMYGIEGITSPDGRVLGKMAHSERSGEDIFKNIPGNYDQKIFESGVKYFK >NZ_CP053292|906061:916153|910065_910545_+|WP_002579500.1|DBSCAN-SWA MEVAIFFGSKSDTEIMKGAANALKEFGITYKAFVLSAHRVPEKLEETLEEVERQGCKVIIAGAGLAAHLPGVIASKTILPVIGIPVKAALEGVDALYSIVQMPKSIPVATVGINNSYNAGMLAVQMLSVNNEEIKNKLKEYRVNMKKKFIEDNAEGVEL >NZ_CP053292|906061:916153|912863_913868_+|WP_003428501.1|DBSCAN-SWA MVTSYKEAGVNIEEGYRSVKLIKEYAAKTMSEYVLNGLGSFAGMVELPSGYEKPVLVSGTDGVGTKLEIAFKNNKYDTVGIDCVAMCVNDILCHGAKPLFFLDYIACGKLEAEVSSDLVKGIADGCLDSDCALIGGETAEMPGFYSDGEYDMAGFAVGIADKDKIINGSKIKEGDKLIGIASSGIHSNGYSLVRKLFPDLNEDFNGEPVWKTLLTPTKIYVKPVLKLLESYEIKGMAHVTGGGFIENVPRMFNGGEFTAVINKNSYPLPEIFERIIEKGVDKDHMYNTFNMGIGFVLAVDEKDVTSIIKALGEMGEKAYEIGHVTSGGEGVCLK >NZ_CP053292|906061:916153|910544_911252_+|WP_002579501.1|DBSCAN-SWA MEKLEMLYEGKAKQIFRTDKDDEVIVYYKDDATAFNGEKKGQIHDKGVMNNNITSILFEQLEAQGIKTHFIKKLNDREQLCKKVEIVPLEVIVRNVAAGSMAKRLGLEEGTALKTTVFEFSYKDDSLGDPLINSYHAVAIGAATFEEIDIILEMTAKINNILKNAFAKENINLIDFKIEFGKTADGEIVLADEISPDTCRFWDATTGEKLDKDRFRRDLGNVEDAYIEILKRISK >NZ_CP053292|906061:916153|911359_912772_+|WP_002579502.1|DBSCAN-SWA MTKSDFELIMDPSLDKFKDECGVFGVYANKPIDVASMTYYGLYALQHRGQESAGIAVADGEKIEVHKGLGLITDAFKEDDLQKLKGHIAVGHVRYSTAGGKGIENAQPIVTTSKIGSIAMAHNGNLVNDDVIKELLEDAGQIFHTSTDSEVIACLIARSAKKGLAKAVVDAMSAIRGSFALTIMSQNKLIGARDPHGIRPLSLGKIDEGYILTSESCALDAIGAELVRDIEPGEIVIIDENGIESYRYSENTVCQTCAFEYIYFARPDSKIDGLDVHTSRVRAGEQLYKEHPVDADIVIAVPDSGIPAAIGYAKASGIPYDTGFIKNRYVGRTFISPSQEIRERAVAVKLNPLKINLEGKRVVLIDDSIVRGTTSKHLIDSLRKAGVKEINFLIASPSVKYPCYFGIDTPYRSELIAANNSVEEIRDIIGADYLGYLSEEGVKISCTGKEGFCMGCFNGVYPVATPIETE >NZ_CP053292|906061:916153|914644_916153_+|WP_002579505.1|DBSCAN-SWA MKKRALISVFDKDGVLDFAKFLVSKDVEIVSTGGTYRYLKENGIDVIEINEVTNFPEMLDGRVKTLHPLVHAGILAIRDDEEHMNTLKERNIHTIDYVVVNLYPFFEKVKEDLTFEEKVEFIDIGGPTMLRAAAKNFQDVVVISNKNDYAKVMEEINEHNEVSYKFKKKLAGKVFNLMSAYDAAISNFMLADDEEEYPEYLSVSYKRMQSLRYGENSHQSAAVYSSTMLDGAMNTFETLNGKELSYNNFKDVDIAWKCANEFDEPACCALKHNTPCGVAVGNDSYEAYMKAYEVDPTSIFGGIIGFNRKVDKKTAEEMVKIFLEVVAAPDYDDDALEVLKSKKNLRVLKFNNVPKAEKYMVTVDGAMLVQEEDRKLVDEIKVVTEKVPTDEEMKDLLFGMKVVKYVKSNAIVTAHNGVAVGIGGGQVNRIWPTEDALKRGKGATILASDAFFPFRDVVDEAAKYGIKAIVQPGGSMRDQESIDACNEHGIAMIFTGYRHFKH >NZ_CP053292|906061:916153|913855_914464_+|WP_003428500.1|DBSCAN-SWA MFKIAVLASGGGTDFQSIIDAVESKYLNVKIEMLIASKDGIFAIERAKNHGIETHVVSRKEYGEKASDKILELVEDKVDLIVLAGFLSILDGKILDEFENRIINIHPSLIPSFCGPGMYGLKVHEAAVNSGVKYSGCTVHFVNKDVDGGAILLQDVVPVYFEDDAESLQKRILEKEHILLPEAIKLISEGKVEFINGKAKLH |
7 | Prochlorococcus_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1540165 : 1546585
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP053292|1540165:1546585|DBSCAN-SWA TTTAAAAAATTTTCGAGATTTTTTCAGTAGCTTTATTTAACATCTCATCAGTAACATGGCTATAGGTTTTTAAGGTTTGTTGAACATCATGACCTAATAGCTGTGCTGCTGTCTTAAAATCAATACCATTACCAATTAATAAAGTTGCATATGTGTGTCTTAACTCATGAATTGATATTCCAGCAATATCATTTAGAATAGGGTTCAAAAATTTCTTGATCGAACCTCCAGTACAAGGAATAATTCTATTATTTATGTCTGGTATAGCGACTTTTCTGTATTCTAGTAATTCTTTTACAGTAGGAGCGGGTACTGGAACTATTCTGTATGATTTTTTACTTTTTAATGCACCAAAATCATGTGTTTTAGTTTTCTTATTAACTTTCCATTGTTTATTAACTTTTAAAGTATTATTCTTAAAATCTATATCTCCCCAAGTCAAACCTAATATTTCACCACATCTTAACCCACAAGTTCCAGCAATTAATGCTGCAATGTAATAACGACCATTCTTCTTAGATTTCAATTCTATAAGCAAATCATCTAATTCTTGTTTCGTTAATGCTTTTTTTGATGATTCAATTTTGTCATTGGGAAGCTGAACATTTTTAAATAGTTCATAACTTGAATCATAGTTTTCAATATAGTATTTTAATAATAACTTTATGCGATTAACATAAGTATTAATAGTTTTAGATTGTATTTTTTCACTTTTAAAGATATCATCAACTGTTTTCTGGATGTGTAACTTTTTTATATCTTTAACTTTTAAAGTATTTAAACTTTTAAATTTATTAAATGAATATTGATAAGCATTGATAGTGTTATTTTCTCTATATAAAGATATATGATCTATATATAGTTTAGATAATTCTTTAAAAGTAATAGAATCATAATTAGTATCTAAAATAGAATTTTTATTTCTTAATTGATGTTTTAATTCTTTTAACATTTTTTCTGCTGCTGGTTTGGCGTCAGATTTAGTTCTAAAGCCCTGTTTACTTTTTTGCTTCCATTTATTATCTAATTTATAACTGATTATAAATTGCCATCCTTTATCTTTTTGTCTATAGGTAATATTGTATTCTAAATTCATCAAATCAACTCCGATTCATTAATTAATTTATTAAAATCTGTTAATTACTCTTTAGAACCTTTTGCATCTTAATTGATATTATGCAATTATCTTTATAATTTATATGAATATATCTCAATTTAGAATAAAGTTCTGTGTATTTTTCTTCAGTTTCAATAGACTCAAATTTGATATTTATCACCTCCTTTCAGTACATATGTTCTTTTTAAATGTAAAGAATATTGCTTATTAGGGGGCTTCAAGGGTTCTATAATTTAATGAACCATTATTACTGTAATCTCTTATGAAATAAAAGCAAGGTTCAAATTGTAAATAACAAGTACCAACTTGTATTCCAGTTCCATATTTTTTTTTCCAATTTTCTAATATATCGAAAAATGTTTCAACAGATACATGAACATATTCAGCAATTTCATGCATAGCGAAAGCATTGTTCCTTATTGCTTCAACTACATCATTTGGCTCGACAATTATATTAAAACCTTCACGTCGTGCTACATTCTCTAATTTTCTATTGATTACACTATTTTGATTCAATATATTTCCATGAGTAGTTTTATAATGTCCTAGTTCTTCAGCTAAAACTTCATACTTATCTATTTCTGACATTCTGCTATTAATGTATATTATATTATTCAAACATCTGCCACTTTTTTTATCAGTGCCAAAGTCAATTTCTCTAACTTCAGCACCTAAATTTTCTGCTTTAACAATTAGCTTTTCATATTCTGTCATTAACAACGCCTCATCTGTTATTTACTATTTCGTTTGTTTATATCAGCTAAAATTCTTCTATCAGCTTCAGATATTTCATCATCTGTTAAATTGTCATTATGAGCAGCAACTGTTTCAAAATCATCATATGTTATTTTCTTATTGTTAAGTTCAACCATATTATCTTTAGTTGCTGTTATTTCATCAGTAATAGTATTTAAATATCTATTTATTTCTGTAAGTTCAGCAACTCTTTTATTAGCTTCTTTTTTGCCTAATGCATTTAATTTATTGTAGTTTTCTAATAATGTTGTTTCTTCTTTAGATAATTTATTAAAGTTATACGATTCCTCTTTTTCTAATCCTAGTAGATAATCTAAAGTTACATTGAAATATTTTGTTAATATTCTTGCATTGGCTAAAGACGGTTCAGCTTTTCCGTTTTCCCATTTAGATATAGTACTCTTAGCGATAGAAACATCATAAACATTATTTAAATCTTCGCACATCTTATCCATAGATATTTGTTTTTGTTCTCTAAGTCCTTTTAATATATATTTCATTTCAATCATAATAACACCTCGTTGACTTTCATATATTGAAATTATAGCACTAATGTTTTTCTTTGTGAACAATTTTTTGAAAATATTTATAAAAAGTTGTTGACATAGAAACAAAAAGAGAATATATTATAGACAAGGAGTTTCCGAAACGCCAACAAAATGACAAAGGAAGTGATTAAATGTTGCAAATGAGAGAACCATATTATAAGTTTAAGGGGTATTTAGCTGAAAATAATATACAACAAAAGGAAATAGCTAAAATGTTAGATATTTCTCAAGCTACATTCAGCAAAAAGTTAAATGGAAAAAGTGGAGACTTTACTATCCAAGATTTAAAGAAAATATGTACAAGATTAAAAATCGAAGCAGAAATTTTTTTTAATAATTAAGTTTCCAAAACGCTAACAAAGAAAGAAGGGAAAGCATGAATAATTTGATGATTTTTGAAAACAAACAAGTAGAAGTATTTGAATGGAAAGGACAAGTTTTATTTAATCCAAAGCATGTTGCAGATTGCCTTGACATTTCAGATGTTAATAGTAGCATTAGAAATTTCAATGATAATCAAGTTGTTAAATTAACAAATTCTAAAATGCACAATATGCAGTTTAGAAAATTACACAACACAGGAGAAAATTTCTTGACTGAAAGTGGAGTGTACAAGTTAATATTTAAATCTAAAAAGGCGGAAGCAGAAAGATTTCAAGATTGGGTTACAGATGAAGTTTTACCACATATAAGAAAAACAGGATCTTATCAAATTCCTAAAATGTCAAAAGAACTTGAAGCAATTCTTATGATTGATGGCAAGCAACAGAAGATGGATGAGAGAATAACAAAGTTGGAAAATAATACAACAATAGATTATTCACAGCAAGAAGATTTGAGGGAATTAGCTAATAAAAAGATTGTTGCAATTTTAGGCGGAACAGATGCACCAGCTTATAGAGAACTTAATAAAAAAGTGTTTAGCAACTTTTGGAGAGATTATAAAAGAAAGCTTAATGTTAATTCATACAAGAATACATTAGTTAAAGATTATGACATAGGTAGACAAGCTATTATAAATTGGAATCCTAGTAAAGAAGTCAAATTTATGATAGATGGTTGCAATGCTCAAATAAGAATGTAGGAGGAATAGGTTATGGAAAAGACTCTGTTTTCTAGAAAGGACTTAATGGAACGATGGGGAGTTAGTTATCAGAGCATTGTCAATTATGAAAACAATGGGATATTAACTAGAAATCCTAAGTTTGATAATCCAATGTATTATTTAGAAGAAATTTTAAAGATAGAATCTCTTACTGGAGAACTCAATCCATTATCACCATTAGAAAGACGAAGATTAGAAAGAAGAATTGAAGAATTAGAGAAAGAAAGAGATTTATGGAAAGGTAAAGTTGACATTATAAAAACAGCATTAGTTTAACATAATAAATAAAAAGTAATTCTTTAAGATATAAAAGTATCCCAAATTTAAATATATATTAGAAATATTGAAAAACTAAATATGAAAATACAATTTAAGACTTATTTTCTATCAATATTTAATTATTTTGGAGGAGTTAATATGGGTAAGCTAAAAGAATCTGACTGGGAATTTATATCAGATAACGAACCTGATGAAGAAACAATAGAAGAATTTCATAGAAGTTTAGCTCAAGACTATATTGATATGTATGGTGTTGATAATATGAAAAGAGTTTTAGAAATGGTTAAACAGAAAAATGCATAAGATAACAGGCTGAATAGCCTTAGATATTAGCTTAACATAATAAATAAAAATCAAGGAGGACAACCATGGACAAGATTTTAGAATTAGAAAAAAGGATTGCTGACCTTGAAGATCAAGTTCAAAATCAGCAAAAAGAATTTTATAAAGCATTAGCATTTTTGTTTGATAGGTCTGAATACAAAGAATTAATCAAACAAGGGAAATGTGATTATCCTAAAATGCTTACAGATGCTTTAAAAGAAACTTTTAATATTTAACGACCGTATTCAGCTTCTTCTTTAAGGAACTCAAACAGTAAACGAGAAGAAACTTCTAAAGAAATATTAGCAATTTTTCGTTCTTCATCAGTTTTGAATAATACATCAAATTCTTTAGAAACAGATTGCTGATATTTATCAATAATTTTAAGTTTTCTCTCAAATCGTTCATCTATGGAAGTACCAATTTTTATGGATTCGGTTTTAGAGAACATAAAAACACCATCCTTTCAAACATATTTCAGCTTGGCAGAGCTGATAAGTTAATTATATGAAAGTTAGGTAAGAATAACAAATTAAATAGGAGGATATTATGAACAATAAACAAGCTATAGAGCAATTAAAATCATTGAGAGAATTCCAATACAAATTTATTAATTATGACATATTCGTAGATACAGAAACAATCAAAAATGATGTAGAAGCCATAAGTATAGCAATAAAAGTACTAGAAGAAACTGCTCAAGAAGTACCAGTTCAAGAGCAGTTAACTAAAAAAGATATTGAATGTATTTATAGACATTTACAAATGTTTATACAAAGAGAGAATAAACACAATGTTCCAGATGCTTGTGAAGTATGCAATAGTCACTGTAGCAATGAGGAACATATTCTCAATCAATGGGATTCATTTGATAAGTTATCTAATTTAATAATTCAATATGGGCACTTACCTGTATAAGTACATCTAATGGTTTTAAACATAAAGACACCCCCGCCAACAATATTTTACTGTAAGTTTAAATAAATATAAAAATAAGGAGATATGAAACATGAAATATAGAGTAATAAAAATCATAAGTGATACAGAAATTTTGGTTAATGCAGGAGCTAATCGAGGAATTAAGGAAGGAAATATATTAACAATAAGAGGAAAAGATGAAGAAATAATTGATCCTTTTAGCAATGAAAGTTTAGGCTATCTTCCAGTTAATAAAGCGCAAGTACGAGTTTATACAGTATATGAAAATATGTGTATTTGTAAGCCTACACTAGCGTTCAAATTTGAAGTAGCGAGATTAAATGTAGAAGTACCATTCCAAATTTGCACTGAAGATGATGATGTAATTCGCATAGGTGATTTTGTTGTTAAGGGATAGGAGGAGACAGTAATGAATAATAGACAAGTTATAGAGAACTTAAAAGATTTGCCAGAAGAAAAAACGGTATTTAAGTTTTTAACTTTACTAAAGTCTAATGTAACATACGAGCAATTCAAAGATATTTTAGCTATAGCAGATCAAGATATTAAATTTAATCGAGTCATGTTTGGAAAAACAACTAAACCATTAGAATATAAAAAAATATGTGTGAGATGTGCGATTGTAGTTTTAAAAATAGGAGGAGCATTATGAAGAAGATTTTAGATAAAGAATTTAAGGATGTACCAAAGCATCTTGAAATCGAAATGTATTCAACAAAGATATATAAGAAGGACTTAATAGCAAGTATGATTGTAACTCTTATAATTATATGTTTAATACTCGGCTTAAGCGTCGCAATATTTAGCTTAATATTCTAAAAGGTGATTATTTATGAATGTCAAGTGTAGTAAATGTAATTTAAGTTGGAATGTAAGTATAAAGGCTGATTTAAGCAAACCTTACTTATGTCCAGTTTGCAGAAGAAAAGAAAAAAGGGAAGTTGAGAAAAGAAAGTGAGGTGCTTATATGATTTATGCATTATATAAAGGAGATGAAATATTAGGAGTAGGCACAATATATGAATTGGCATCAATGTTTAATGTACAACTTAGAACAATTCAATATTATAGGACAGAGGCATATAAGAAAAAACTAGCTAAAAGAAAAACTAAATCTGCAAAGATATTGGTTGAAATTGATGGATAGGAGATAAATATGGTATGGTATTTGAGTTTTTAAGTCAGCTAAAATCAGAAACTACAGAAAGTCAGTTCAAAGAAATATTACAAGCTACAGAGCAGGATATTAAATTTAATAGAGTATCTTTTGGTAAGACAACAAGTCCTATTGTATTTATAGAAATATGTGAAAGATGTGCTTGTTTAATTAAGAGGTTAGGAGGTACAGTATGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP053292|1540165:1546585|1544525_1544744_-|WP_002581843.1|DBSCAN-SWA MFSKTESIKIGTSIDERFERKLKIIDKYQQSVSKEFDVLFKTDEERKIANISLEVSSRLLFEFLKEEAEYGR >NZ_CP053292|1540165:1546585|1544107_1544272_+|WP_155394921.1|DBSCAN-SWA MGKLKESDWEFISDNEPDEETIEEFHRSLAQDYIDMYGVDNMKRVLEMVKQKNA >NZ_CP053292|1540165:1546585|1542012_1542543_-|WP_043853515.1|DBSCAN-SWA MEMKYILKGLREQKQISMDKMCEDLNNVYDVSIAKSTISKWENGKAEPSLANARILTKYFNVTLDYLLGLEKEESYNFNKLSKEETTLLENYNKLNALGKKEANKRVAELTEINRYLNTITDEITATKDNMVELNNKKITYDDFETVAAHNDNLTDDEISEADRRILADINKRNSK >NZ_CP053292|1540165:1546585|1542725_1542926_+|WP_052501817.1|DBSCAN-SWA MREPYYKFKGYLAENNIQQKEIAKMLDISQATFSKKLNGKSGDFTIQDLKKICTRLKIEAEIFFNN >NZ_CP053292|1540165:1546585|1545302_1545629_+|WP_002581845.1|DBSCAN-SWA MKYRVIKIISDTEILVNAGANRGIKEGNILTIRGKDEEIIDPFSNESLGYLPVNKAQVRVYTVYENMCICKPTLAFKFEVARLNVEVPFQICTEDDDVIRIGDFVVKG >NZ_CP053292|1540165:1546585|1546199_1546379_+|WP_043852801.1|DBSCAN-SWA MIYALYKGDEILGVGTIYELASMFNVQLRTIQYYRTEAYKKKLAKRKTKSAKILVEIDG >NZ_CP053292|1540165:1546585|1545641_1545884_+|WP_002581846.1|DBSCAN-SWA MNNRQVIENLKDLPEEKTVFKFLTLLKSNVTYEQFKDILAIADQDIKFNRVMFGKTTKPLEYKKICVRCAIVVLKIGGAL >NZ_CP053292|1540165:1546585|1544337_1544529_+|WP_027634962.1|DBSCAN-SWA MDKILELEKRIADLEDQVQNQQKEFYKALAFLFDRSEYKELIKQGKCDYPKMLTDALKETFNI >NZ_CP053292|1540165:1546585|1544842_1545211_+|WP_052501781.1|DBSCAN-SWA MNNKQAIEQLKSLREFQYKFINYDIFVDTETIKNDVEAISIAIKVLEETAQEVPVQEQLTKKDIECIYRHLQMFIQRENKHNVPDACEVCNSHCSNEEHILNQWDSFDKLSNLIIQYGHLPV >NZ_CP053292|1540165:1546585|1540165_1541260_-|WP_043852798.1|integrase|DBSCAN-SWA MNLEYNITYRQKDKGWQFIISYKLDNKWKQKSKQGFRTKSDAKPAAEKMLKELKHQLRNKNSILDTNYDSITFKELSKLYIDHISLYRENNTINAYQYSFNKFKSLNTLKVKDIKKLHIQKTVDDIFKSEKIQSKTINTYVNRIKLLLKYYIENYDSSYELFKNVQLPNDKIESSKKALTKQELDDLLIELKSKKNGRYYIAALIAGTCGLRCGEILGLTWGDIDFKNNTLKVNKQWKVNKKTKTHDFGALKSKKSYRIVPVPAPTVKELLEYRKVAIPDINNRIIPCTGGSIKKFLNPILNDIAGISIHELRHTYATLLIGNGIDFKTAAQLLGHDVQQTLKTYSHVTDEMLNKATEKISKIF >NZ_CP053292|1540165:1546585|1545880_1546051_+|WP_002581847.1|DBSCAN-SWA MKKILDKEFKDVPKHLEIEMYSTKIYKKDLIASMIVTLIIICLILGLSVAIFSLIF >NZ_CP053292|1540165:1546585|1541488_1541995_-|WP_043852799.1|DBSCAN-SWA MTEYEKLIVKAENLGAEVREIDFGTDKKSGRCLNNIIYINSRMSEIDKYEVLAEELGHYKTTHGNILNQNSVINRKLENVARREGFNIIVEPNDVVEAIRNNAFAMHEIAEYVHVSVETFFDILENWKKKYGTGIQVGTCYLQFEPCFYFIRDYSNNGSLNYRTLEAP >NZ_CP053292|1540165:1546585|1546393_1546585_+|WP_043852802.1|DBSCAN-SWA MVFEFLSQLKSETTESQFKEILQATEQDIKFNRVSFGKTTSPIVFIEICERCACLIKRLGGTV >NZ_CP053292|1540165:1546585|1543681_1543966_+|WP_027636009.1|DBSCAN-SWA MEKTLFSRKDLMERWGVSYQSIVNYENNGILTRNPKFDNPMYYLEEILKIESLTGELNPLSPLERRRLERRIEELEKERDLWKGKVDIIKTALV >NZ_CP053292|1540165:1546585|1542973_1543669_+|WP_027636010.1|DBSCAN-SWA MIFENKQVEVFEWKGQVLFNPKHVADCLDISDVNSSIRNFNDNQVVKLTNSKMHNMQFRKLHNTGENFLTESGVYKLIFKSKKAEAERFQDWVTDEVLPHIRKTGSYQIPKMSKELEAILMIDGKQQKMDERITKLENNTTIDYSQQEDLRELANKKIVAILGGTDAPAYRELNKKVFSNFWRDYKRKLNVNSYKNTLVKDYDIGRQAIINWNPSKEVKFMIDGCNAQIRM |
15 | Clostridioides_phage(33.33%) | integrase | attL 1534804:1534821|attR 1549997:1550014 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1569824 : 1577836
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP053292|1569824:1577836|DBSCAN-SWA TATGGTACCTGTAAAGAATACAGCAAAAGATTTATGGCAACCTAAACGAAGAATAGAGGTTACTTATAAAAGGTCATTAAGACAAATAGTAAAGAAGATGAATAAAGAGCTTAAAGGTTTATCAAGTACATCAGAAATAATTAAAGTATTAAGAAAGTTTGCAGATACTCCAGAATTTAAAAAATATGCTGAGAAAACTGCTATGAAGATGATAACAAGTATTTTTACTGATGCTGGTAAAACATGGAGGGAAGCAGCAAAAAGAAATTCTAGAGGAAGGGGTATTTATAAAGCATTAAAGAACGAATTAAATGGCCCCTTGGGAATAGCAGTAAAAGAACAGGTGTGGAAAAATGCTGAATTAATAAAAAGTATTCCATTGGAGGTAGCAAAAGACGTTACAGAATATGCGGCTAAAAAGGCTTATGACGGAATGAGAGCTTCAGATATAGCACAAGATTTATTAAAGGATATTCCAACAATATCTGAGAAGAAAGCTAATTTAATTGCAAGAACTGAGGTAAGCAAAGCTAGTACTGAATTAACAAGGGCTAGGTCAGAGAATTTAGGAATTAGATGGTATATATGGCGCACATCAGAAGACCAGAGAGTTAGAAGTTCTCATGACCATATGGATGGGGTAATAATATGTTGGGATAACCCACCTAGTCCTGAAAAACTTATCAAAGTAAAATCTAGCTTGGGTTATTATCACGCAGGAGAATGTCCTAATTGTAGATGTTATCCAGAGCCTATAGTAAAATTAGATTTTATTACTTGGCCAGCTAAGGTTTATTATCAAGGAAAGATACAAAGAATGAGTAAGAAACAATTTGAGATGATAGCATAAATTTTGATAAGAAAATGAGAAAAATTTGAGAAAAAAGAGAAATAGGAAGTAGTATAATAATTATAGTGGAATAAAAAAGGAATATAAAACGAATAATTTATAAAAAAATAAATGATAAAATGAATATAAGTAGTGAAGCACTTAGAGGAAACCTAAGTGTTATTTTTATGTTCAAAATTCCAAGTGATTGGAGAAATGAGGTAATACATGAAAGAGATATTAGGGAAAATAGATAATGCATTAGCTAATGATAAAATATCAAGCTTTTCTATTCATATTGAGAAAGTAGGAAGTGTATTAGTAGCAGATATTGAAGTGAGTAAAAAGGCTACATCAGAAAGCTTATTTTCTTCAGGTGGAACACATATAGCAGGAGAAAGAGGTCAAAGCAAAAAGAATACTGGAGAATGTGATTCAAAAACTAAGGTTAAAGCATTAAAAGTTACACCAGAGATATATGACAGACCAGTTGAACCAGAATTTTTTGAAGCATTTCAACAAAGAATAATCATACCGAGTTCTATTGAATTTGGATTTATAGTATTAGGTTCTGCTAAAACTGCATGTGTAGGAGATTACATTATATATAAAGATGGAAAATTTGATGTATGTAATAAAGAGTTTTTTGATAAACATTATTTTTGCTAATTAAAGTCTAATAAATAGGCTTTTTATTTTGCTTTGAAAGGGGGTGAAACACATGGCAAAAGCATTTTTTGGCTCAAAAATATCAAATAACATGACAAAGACACCAGAAGGATTCTTAATATGTCACAATGTACCGATTGCACGTACTGGATGGTATGAGTACTTAGAAAGTGAATTAAAAGATAATGGAAGTCCTACTGAAACAATTCAAGTTTATAGAGGACCAAATGAGGTTTTTTCTTCTGCTGCAATAGCAAGCTTTGAGGGAAAACCAGTTACAGATGAACATCCTCCAGAAATGGTAGTTACACCCGATACATCTAAGAAATATACAGAAGGTGCAGCGCAGAATGTAAGAAGAAGTACAGAAGAAAAAGATTTATTAATTGCAGATTTGATTATATATGATCAAGAATTAATAAAACAGGTTGAAGATGGGAAAAGAGAAATAAGCTGTGGATATGAATGCGACTATGTAGTAGCTGAAGGTACGTACTGTCAGACTAATATAAGAGGAAATCATATAGCAGTAGTTGATGCAGGAAGAGCAGGACATAGAGTAAGGATTAAAGATTCTGAAATAAAAAATAAAAACAATATAGATTCGAAAGGAGACAAAAAAAGTATGAGTAAAACATTAAAGAACTTAACTAAAAAGAAAGAAAGACCAGTAAGCAAGTTTTTAACTGCTGTTGGATTAAAGCATATTGCTACAGATGCAGAACCAGAAGATATAGCAGATGTAGTTGATGCTCTATCAGAAGAGAATGCAAATGATGAGGAAGAAGAAGTATCACCATCAGCAACTCAAGCAGATGGTGAAGAGGGGAAAGAGAATGATGTAATGGCAGCAGTAAATGCATTGGCTGAACAGGTATCGGCATTATCTCAAACAGTTACTGCTTTGGCTAATCAGGAAAAGAAAGAACACACATCAGACGAAATAATTGATGATATGATTAATGAACTTGGTGGAGATAATACAAATGATGAGGAACAGGATCAATGTGATGAAGACCAGATTGACGAAGAAGAATCAGTTACCATTCCAGTTGAAAATATCGATGAAGATACAGTTGAGAATGATGAAGAAGAAGAATCAAAAATAAGCAATGATACTGCTGTTAAAATAGCTGCTTTAAATGCTATTAAGCCAGTAATTGCACAAATCAAAGATCCAGTACAAAGAAAAAAGGCATGCGATTCACTTAAAAAACAATTCTTAGGAACCAAGCAAAAGAAGAAAAAAAATGTAGATGGATATTCAAAAATTATGAATACAAAGAGAAATTCTGCAAAACAAAGAATGAATAATGATGCCAGAACAAATTCAAATGTACAAGAGATTGGAGATAGTATATATTCAAAATTTAATGCTAATGCACCAAAGGGAGGTAATCAATAATGCCAGGATATGCAATTGGTAAAAGTTTAAATTTAGGTTATGAAGGTAATGTATCAAGATCTGTAGATGCAATTATTACAGCAAGAAAAGCAAAAGAAAAAATAGGATTTGGTAAACCTTGTATTCTGAATCAAGATAATACTTATTCACCATTTGGAGCTAGTAATACAGCAGGACAATTTGTTGGTGTTGCAGTAAGAGAAGTTAAACAAGCTATTTCTTATACTGAGTCAGTAAATGCTTATGAAGCTAATGAGAGATGCGATGTTATTAGCAGGGGTACTGTGAATGTAAAAATAAATAATGGAACACCAACAGCTGGAGGAAAGGTTTATATCAGAACTGTAGTAAACGAAGATGTGTCAAAAGGTATTGTTGGAGAATTTGAAGCTGTTGCTGATACAGGAAAAACAATTGAATTAACAAATGCTATATTTACTACTGGTAAAGTAGATGCAAATGGAATAGCAGAAATTACAATTTTAAGCAGAAATGCTTAGCAGAGGAGGGAATATATATGCCAAAAATAATAGATTCTTTTAATAATCAATCATTTAATGTTGCAGGAAATGCAGGAGTAATTTTAAATAAAAAACAAATTGATTCCGGAATGGCTTTCTTAACAGGAGAACTAGAAAAAAGAGATAACACTCTTAATGAACCATTAACAAGTACTACATATGCGAGGGATATAGTAATTAATACAGGCGGTGGCTGGGTTGAAACTACTTCTAATATGTATGCAGATTATGCTGGAAGTGGTGATAACACTAATGGACTTATTAGAGGTCAATCTAATAATATTCCTATAATCCAAACAAATGTTACTAAAGATGTTTACAAGGTTTATCCTTGGTCAAATGTTTTGAAAGTAAATTACATTGATCAACAAAAATTACAAGGTATAGGAAGACCATTAGATAATATGTTAGATAATGGTATTAAGTTAAACTATAATAAAACTTTAGACTATATGACATATGAAGGTATCCCTGAAGATCAAGTTTATGGATTAATAAATAATCCAGAAATAACTGCAACATTAGTAAGTACTGGAGCAGGTGGTAACACAACATGGGAGACTAAGACTGCAGATGAAATATTAATGGATATTAATTTATTAATAACTAAAACATGGGCACAAAGTGAGTATGATTTAAGTGGAATGGCTAATCATATCTTACTTCCACCTGAAAAGTTTACTTTATTAGCTACTAGAAAAGTATCAGAAGCAGCCGATAAAACTATTTTGAAGTATGTAATGGAGAATAATATTGCGGCTCAAAAGGGACAAAACTTAGTTATTGATGAATGTAGGTGGTGCATAGGTGCTGGAACTTCTAAAAAACATAGAATGTTAGCATATGTAAATGCTAAAAACAGGACAGAGTTAGATTTACCAGTCCCAATTACAAGAGCAATGACAGAAGCAAGTGGTAAAGATTTATGTTACTACACACCTTTTGTTGCTAACATTGGACAAGTTAAGTTTTTGTATCTTCAATGTGCAATGTATGGAGATGGAATTTAAAAATTAATATAAAAAGTCTTGGAGTAAAATCTGAGACTCTTATTTTTTAATTATTAATTAGATTTGGAGGAAACATATATGATTACAGTATTTGCAAATAAATCACTACTTTTTAGAAATCCTAAAACAGGTGAAGAAGCTCATGTTAAGAGTAAAGAGTTGGGAAGACAATTACCAGATTGGATTGTAAATGATCCATTATTTGATTTAGCTATAGCTGATGGAAGTTTGACTGCTATGACAGATAAAAATATTAATAAAAAAATAGAAAATGGTGATTTTAATAAACCAGGAAGCTTTGAAAAAGAAGTAAATAAAGATAAAACTTTAGATCAGATGGAAGTTGAAGAATTAAAAGCTTATGCAGAAGAAAGAGGAATTGATATTGGAAAGGCTACAAGTCAATCAGGAATTTTAGAAAAGATAAAAGAAACTGAATCTCCTGAAGAATAATAGAAGGTGGTTTAATGAATGATAATTTGTCGATAGTAACTGGAGCAAGCAATCTAAAACCTGGTACTAATCCACCATTTACGTTAGAAGATTTTTATTCTATATATCCACAGTTCGGTAAAGACACTGAAGGAAAGCAAGCTATTCCAGAATTTATGATTGAATCATACATTGAGCTTGCTAATAATTGCATAAAGCAAACTAGATGGCATAAGTCGTGGAAAATTGGAATGAGTTTATATATAGCACATTTTTGTACTTTATATGCTCAAAGTATATGCGATGTAAATCAAGGAGTTAATGGAATAAGTGAATCAGGTAAAACTAAAGGTTTAGATACATCCATAAGTGTAGGAGGGGTTTCTGTAAGTACTGATTATTCTGCTACAAATAATGTGTCAGGATATACAGGATGGCAATTAACTTCATATGGTCAGCAATTAATACAACTTGCAAGACTTTATGGTAAGGGCAATATGATGGTTAGATAGGAGGAAGATGGATGCTTAATGGATTTTGCAATATATCAATAGATAGAGATTTAACAGATGATATATTAAAATCTTTAAATGACCTATCAAAGAAAACCATATGTATAGGTATTCCAGATAGTACAGAACATGAAAATAGCAAGATTACAAATGCAGAATTAATGTATGTACATACTAATGGGGCAAGAAATAGAGATATGATAAAGTCAATGCAGCATGATATTGATAGTGGAATGCCATATAGTGAAGCACATGAATTATATGTCCATGAAAATGGTTCACCATTATGGAATATTCCTCCAAGACCTATAATAGAACCAGCAATGGATAATGGTAAAGAACAGATGGCAGATTTAATGAAAGATGTTGCAATAGATGCATTAGAAGGTAAAAATATTCAAACTGGATTAGACAATGTAGGAATGCAAGGACAGAACATTGCAAGAGATTGGTTTACGAATCCAGCTAATAATTGGGCTGCTAATAGTGAAGATACTGTGAAAAAGAAAGGCAGCGATAGACCATTAATTGATACCTCAGAATTAAGAAAATCTATTACTTATGTAGTAAAGGATGGTGAGTAAAGTGATTAATCTTTCTCGTGTAATAAATGATACTAGAATAAGCCAGGAATTCAAAGTTTTTAGAAAAACTGGAGAATGGATTAAAGGAAGGTTTGAGGAAAAAGAAACTCAAATTGATATGAATGGTGTAATTGTACCTGCTACAAATAAGGAAGTAGAAATGATTCCAGAAGGTGATAGAGTAAAAGGAGCTATATCTATACATTCGACTAAGAGACTGTATACTACTCATTTGGAAGAGGATGGAGAAGGTACATCAGATGAAATAGAATGGGAAAATGAAAGATATAAAGTTTATTCTCTTGGAAGTTATTCAAAGTATGGATTTTATTCAGCAATAGGTATGAGGTTGGTGAGTAACTAGTGGAAGATATAGTTTTAAAACTTAGAGAAATAGAAGATTTTTTTCAAGAAATAACCTGTGAAATGCTAGGAATTGATCTAAGTAAAAAAGAAAATCAGAATAAAGTTAGAATTGCATGGCCAACAGGAGGAGCTCCAGGATGGAAAATAAATGATGATATATGTTTTCTTAGAATTACTCCAGTTGATGATTCAATGACTAGGCAACTTAATATCTGTTATGATCCTGTCAAAAATAATGAACCTTATACTAAAAAGCAGGTAGGATATACAAGAGTTCATAAGATTAATTGGACTCTATATGGTCCTAATTCATATGATAATGCAGATATTATAAGGCACTTAATATTTGATAATAATTATATGAAAAAGTTTAAAGAAAAGAATTTATTTCTTATAACAGATGTACCTATGCCAACAAGATTACCAGAATTATATAACAATCAATGGTGGGAAAGAACAGATTTCAGTGCAACATTCAATGAAGGCGTTACAAGAGTATCTGAAGTTCCTTATATAACAAGTGCAGAAATAGTTTTAAAACATAATAGATAGGAGGAAACATAATGTCGACATTACCCTTAAATGATATATGTGATATAAATGTAAGCGTTGGACCAGCAAGTGCTGTAAGAACAAACTTTAATTTAGGATTAATAGTTGGTAAATCTGACATAATTAAAATTGAAGATAGAGTAAAAACTTATCAAAAAATGGATGATTTAACTGCAGATGGATGGAAGGGAACAGAACCTGAATTCTTATCGGCTCAGAAATATTTTTCTCAAAGCCCACGTCCTTCAAGAGTAGCAATAGGACGTTGGAATTATCCAGAAGAAGGTAAAAAAGAAACAGTAGTTGAAGCAGTAACAGCATGTAGAAATTCCAATACAGAGTGGTATGGAGTACATGTGTGCGATATAACTAAAACTGAAATAATTGAATTAGCAAAATATATTGATTCAGCAAGTCCTGAATCTTATTTATTTTATACAACAAGTGATAGTGATGTAATTACTAATAGTGAAGATAATATTTTTAGTGCTTTAAAGAAAAATGGTGTTCATAGAGCATTAGGTCAATATTCTACTAAAACAGCAAATGCTGCTGTAGGAATAATGGGTGTTGCTATGGGAAGAAATACAAGTACTGCTGGAAGTGCATATACATTAGCTCATAAAACAATTGTTGGAATAGAAGCAGAACCGATTAAATCAACTGAACTTACTATAATTAAAAATAATAATGGGAATGTATATGTAAATCGTGGTTCTGTATATAACTTATTTGAAATGGGTGTTTCATCAGATGGAACTAATTTTGATGAAATACTTAACTTAGATATGCTATCAAATAATATTCAAACTGCAGTTGTAAGTGCTTTAGCAAGATCTGCGAAAATACCCCAGACTGATCCTGGTATGGACAATTTATTAAATACTATAACTGAACCGCTTGAAAAGGCTAGAGAAATTGGTTTTATTGCGCCAGGTGTATGGAATACAGAAAGTATTTTAACTGTAGAAAAAGGTGATACACTTCCAAGAGGATACGTAATTATTGCGGATAGCGTAGATAGTCAATCACAGGCTGATAGAGAAGCAAGGAAGGCACCACCAGTTTATATATTAATTAAATGTGCTGGAGCAATACAGTACGTAGCTGTAAAACTCTATGTAAATAGATAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP053292|1569824:1577836|1573243_1574257_+|WP_043852825.1|DBSCAN-SWA MPKIIDSFNNQSFNVAGNAGVILNKKQIDSGMAFLTGELEKRDNTLNEPLTSTTYARDIVINTGGGWVETTSNMYADYAGSGDNTNGLIRGQSNNIPIIQTNVTKDVYKVYPWSNVLKVNYIDQQKLQGIGRPLDNMLDNGIKLNYNKTLDYMTYEGIPEDQVYGLINNPEITATLVSTGAGGNTTWETKTADEILMDINLLITKTWAQSEYDLSGMANHILLPPEKFTLLATRKVSEAADKTILKYVMENNIAAQKGQNLVIDECRWCIGAGTSKKHRMLAYVNAKNRTELDLPVPITRAMTEASGKDLCYYTPFVANIGQVKFLYLQCAMYGDGI >NZ_CP053292|1569824:1577836|1574335_1574710_+|WP_043852827.1|DBSCAN-SWA MITVFANKSLLFRNPKTGEEAHVKSKELGRQLPDWIVNDPLFDLAIADGSLTAMTDKNINKKIENGDFNKPGSFEKEVNKDKTLDQMEVEELKAYAEERGIDIGKATSQSGILEKIKETESPEE >NZ_CP053292|1569824:1577836|1570880_1571321_+|WP_043852823.1|DBSCAN-SWA MKEILGKIDNALANDKISSFSIHIEKVGSVLVADIEVSKKATSESLFSSGGTHIAGERGQSKKNTGECDSKTKVKALKVTPEIYDRPVEPEFFEAFQQRIIIPSSIEFGFIVLGSAKTACVGDYIIYKDGKFDVCNKEFFDKHYFC >NZ_CP053292|1569824:1577836|1569824_1570673_+|WP_043852821.1|DBSCAN-SWA MVPVKNTAKDLWQPKRRIEVTYKRSLRQIVKKMNKELKGLSSTSEIIKVLRKFADTPEFKKYAEKTAMKMITSIFTDAGKTWREAAKRNSRGRGIYKALKNELNGPLGIAVKEQVWKNAELIKSIPLEVAKDVTEYAAKKAYDGMRASDIAQDLLKDIPTISEKKANLIARTEVSKASTELTRARSENLGIRWYIWRTSEDQRVRSSHDHMDGVIICWDNPPSPEKLIKVKSSLGYYHAGECPNCRCYPEPIVKLDFITWPAKVYYQGKIQRMSKKQFEMIA >NZ_CP053292|1569824:1577836|1571373_1572726_+|WP_052501788.1|DBSCAN-SWA MAKAFFGSKISNNMTKTPEGFLICHNVPIARTGWYEYLESELKDNGSPTETIQVYRGPNEVFSSAAIASFEGKPVTDEHPPEMVVTPDTSKKYTEGAAQNVRRSTEEKDLLIADLIIYDQELIKQVEDGKREISCGYECDYVVAEGTYCQTNIRGNHIAVVDAGRAGHRVRIKDSEIKNKNNIDSKGDKKSMSKTLKNLTKKKERPVSKFLTAVGLKHIATDAEPEDIADVVDALSEENANDEEEEVSPSATQADGEEGKENDVMAAVNALAEQVSALSQTVTALANQEKKEHTSDEIIDDMINELGGDNTNDEEQDQCDEDQIDEEESVTIPVENIDEDTVENDEEEESKISNDTAVKIAALNAIKPVIAQIKDPVQRKKACDSLKKQFLGTKQKKKKNVDGYSKIMNTKRNSAKQRMNNDARTNSNVQEIGDSIYSKFNANAPKGGNQ >NZ_CP053292|1569824:1577836|1576714_1577836_+|WP_043852833.1|DBSCAN-SWA MSTLPLNDICDINVSVGPASAVRTNFNLGLIVGKSDIIKIEDRVKTYQKMDDLTADGWKGTEPEFLSAQKYFSQSPRPSRVAIGRWNYPEEGKKETVVEAVTACRNSNTEWYGVHVCDITKTEIIELAKYIDSASPESYLFYTTSDSDVITNSEDNIFSALKKNGVHRALGQYSTKTANAAVGIMGVAMGRNTSTAGSAYTLAHKTIVGIEAEPIKSTELTIIKNNNGNVYVNRGSVYNLFEMGVSSDGTNFDEILNLDMLSNNIQTAVVSALARSAKIPQTDPGMDNLLNTITEPLEKAREIGFIAPGVWNTESILTVEKGDTLPRGYVIIADSVDSQSQADREARKAPPVYILIKCAGAIQYVAVKLYVNR >NZ_CP053292|1569824:1577836|1576148_1576703_+|WP_043852832.1|DBSCAN-SWA MEDIVLKLREIEDFFQEITCEMLGIDLSKKENQNKVRIAWPTGGAPGWKINDDICFLRITPVDDSMTRQLNICYDPVKNNEPYTKKQVGYTRVHKINWTLYGPNSYDNADIIRHLIFDNNYMKKFKEKNLFLITDVPMPTRLPELYNNQWWERTDFSATFNEGVTRVSEVPYITSAEIVLKHNR >NZ_CP053292|1569824:1577836|1572725_1573226_+|WP_043852824.1|DBSCAN-SWA MPGYAIGKSLNLGYEGNVSRSVDAIITARKAKEKIGFGKPCILNQDNTYSPFGASNTAGQFVGVAVREVKQAISYTESVNAYEANERCDVISRGTVNVKINNGTPTAGGKVYIRTVVNEDVSKGIVGEFEAVADTGKTIELTNAIFTTGKVDANGIAEITILSRNA >NZ_CP053292|1569824:1577836|1575786_1576149_+|WP_043852831.1|DBSCAN-SWA MINLSRVINDTRISQEFKVFRKTGEWIKGRFEEKETQIDMNGVIVPATNKEVEMIPEGDRVKGAISIHSTKRLYTTHLEEDGEGTSDEIEWENERYKVYSLGSYSKYGFYSAIGMRLVSN >NZ_CP053292|1569824:1577836|1574724_1575201_+|WP_043852828.1|DBSCAN-SWA MNDNLSIVTGASNLKPGTNPPFTLEDFYSIYPQFGKDTEGKQAIPEFMIESYIELANNCIKQTRWHKSWKIGMSLYIAHFCTLYAQSICDVNQGVNGISESGKTKGLDTSISVGGVSVSTDYSATNNVSGYTGWQLTSYGQQLIQLARLYGKGNMMVR >NZ_CP053292|1569824:1577836|1575212_1575785_+|WP_043852830.1|DBSCAN-SWA MLNGFCNISIDRDLTDDILKSLNDLSKKTICIGIPDSTEHENSKITNAELMYVHTNGARNRDMIKSMQHDIDSGMPYSEAHELYVHENGSPLWNIPPRPIIEPAMDNGKEQMADLMKDVAIDALEGKNIQTGLDNVGMQGQNIARDWFTNPANNWAANSEDTVKKKGSDRPLIDTSELRKSITYVVKDGE |
11 | Acinetobacter_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1583606 : 1589960
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP053292|1583606:1589960|DBSCAN-SWA TATGGGAGATGGATGGAAAAGTACTTTAAGAGTTGCATGTCCTGGAATAATACAATCATTTGATTCTAATGAACAGACAGTAATTGTTCAATTAGCATTAAGAGAACAGATATCTGATTATGAATATAATAAGCACTGGACGGATATTCCGTTACTTCTAGATGTTCCGATAGTTGTTCCACGTGCAGGAGGATATTCGCTTACAATGCCTATAAAGCATGGTGATGAGTGTTTAGTTATATTTGGTGATATGTGTATAGATTCTTGGTGGGAACTTGGAGGAGTACAAAATCAGTTGGAAAATAGAAGGCATGACTTAAGTGATGGTTTTGCAATACTTGGAGTATGGTCTCAACCACGAGTATTGCAAAATTATTCAACAGATTCGTGCCAACTTAGAAATGAATCAGGGACAAGTTGTATTGAACTAAAGGATAATGAAATAAATATTAACTCTCAAAAAGTTAATATTAATGGAATTAGTTTTAGTGAGCATAAGCATAACTTTAATGATTCTTCAACATCAACTCCAATAGGAGGAATTTAAATGAGATATAGAATGTTAGATATAGATGGAGATTATCAATTTGGTAAGGGACAACAGAATTTTACTTATGGAACTTATGCAGTAGCACAAGCAATAAAAACACGCTTAAAATTATTAAAAGGTGAATGGTGGGAAAATACTTCAGAAGGTCTACCGTTGTTTGAACAAATAATAGGTGCTAATGGAAGCCAAGAGGATTTATATATTGTTGACTCTATTATAAAAGAAAGAATAATAGGAACAGAAAATGTAAAATCAATTCAAAGTTTCAAAAGTGAATATATAAATAGAACTTATACTTTTTCTTGTGTTGTAAATACAAAGTTTGGAGAAGTAACAGTGACTATGTAGAAAGGAGATGTGTATATGACTTATTTTGCTCCGTATATTGATGAAACAGGATTTCATATGCCTACCTACATTGATATAAGAGATAAGCAGATAGATGATGCAAAAAATATATTTGGACAGGATATTTATCTTGGAGAAGATAGTCAAGATTATCAGTATATATGTACAGTAGCTGAAAAAATATACGATGCATTTCAAGTTGCACAGCAGGTATATAATAATCGTGCTCCTAATTCAGCGATTGGGGCCGGACTTGATAGTATAGTTAAAATTAATGGTATTAAGAGAAAAGCAGCAACTTATAGTAAGTGTAATGTTACAGTTATGGGTACTGCAGGCATAGAAATTAAAAATGGAATAGTAGTTGATAAAGGTAATATTAAATGGGATTTGCCAGCTTCAGTTAAAATTCCCGATACTGGAAAGATAGTAGTAGAAGCAGTATGCCAAATAGAAGGTCCAATTGTATCTAATCCTGGAGACCTTACAGGGATATACAATCCTACTTATGGTTGGAATGGTGTATATAATTATGAAAATGGTTCTTTAGGATCTAAAAAAGAAGATGATTTAAAATTGAGAAAGAGGCAATCGGATAGTACTGCTCAACCATCCAGAAGTATCTTAGACGGAACTTCTGGCGCTGTAGCTAAAGTTGATGGAGTAACAAGATCATATGTGTATGAAAATGATACAAATTTAGTTGATTCTCTTGGATTACCACCACATTCAATTACTGTTGTAGTAGAAGGTGGAACAGATGAAGATATAGCAAGAGCAATACATATTCATAAAGGTCCAGGATGCTATAGTAATGGAGATGTTAGAATTGATGTTACTGATTCTAAAGGACAAATTTCATCTATTGGATTTTATAGAGCTAAATATGTAGATATTGATGTGACCGTTAATATAAAGGCTTTAGATAATTACACAACTGCTATTACAGATAATATTAAAAAAAGTATAGAATCATATTTAAATAGCATGAAAATCGAGAATAAGAAGTTAGTTGTTTCATCTTTATGGGGTGTATCACTTCAAGCTATGTCTGATTTATCAAATCCGACATTTTCTATAACTTCAATTACTGCTTCAAGACATGGAAAAATTCAATCAACTGATGATATTGAATTAGCGTTTAATGAGACTTGCCGAGGTAATGTTAATTATATTATTGCTAATGTATTGTAGGTGATTTTATGGCGATAGATAAATATTTAAATAGTGTAACATCTCAACATAGAGATAAGAAAAAATTTATAGCATGGTTAAGTAGTAGTTTGACTATTATAGACCATGCTTATATTATGACTAAAAACATAGATAATGATTTTGATTTAGATAATGCGCTTGGAGTTCAATTAGATATGCTTGGTCAATCTATAGGAAGAAAACGTATGTTAACATTCCAGCCTTTGAATGACCATAATCCTGTAATGGATGATGAAACCTACAGACTTGTATTAAAAGCTAAGGTTGCTATGAATAACTGGGATGGAAAAACAGAATCTGCATATGAAATATGGGATAACACATTTAAAGATATAGGCCTGCAAATACAAGATAATCAAGATATGAGCATGACAGCTTATGTTACCGGATATGTTAATCAGATAAGGCAAGATTTAATTCAACATGGTTATATAGTTCCAAAACCTGAAGGTGTAAAAATTAACTATATAGGTAAAACACCTATAAATTTTAATAAGTATTCATATATAGTTGTATCAAGTCAGCAGACAACAACTATTAATATGATATTTGATCCTGTAGAACTAATATCTATGAAAGAAATTTCTAGAATTACTGTACAAGGTATAAATATTAATACAATAAGGTGCGAAGGAGGAAAATAAATGGCAATATTTAACAATATGTCAATAACCAATAAAGGACAGATATTATATGCTAAGGCACAAGCTGGTACTAAATTAAATTTTACAAAAATTATGGTTGGTTCTGGTCAGATTGAAAATAGAAATCCAGCAACATTATTAGCTTTACTTGAGCCTAAATTCAGTATAGGAATACAGTCAATAACCCCTAACACTGAATTAAAGACAGCTACAATTTCAGCTACTATTAATAATAGCGAAGTAACTGAAGCTGTATATATTTGTGAAATCGGATTATATGCAGAAGATCCAGATGATGGAGAAATATTATATGCATATGGAAGTGCAGGAACATATGGTGATTATTATGCGCCAGCAAGTCAAGGTGCATATAGTTGGAATTATCAAATTAATGCGGCTATTGGTAATGCAGCTAATGTTACTATTGAGTTAAGTAACTTATCTTATGATTATGCTGTTATTAATTCAAATACAACATTTACAGTTATAGGCGGCGGTAATCAAAAGGAAATTAATAAAAGTATAGATAATAAAATATCTGAACTTACTAAAAAATCGAATGATTTGACAAGTGATAGTTATCCAATAGTAGAAGCAACAGGAACAAATGCTTATATAGGAGCAAGTGCAAGAATAAAAGCAGTAGGAAAGGGTACAAGATGTACGCTATTTGTTGGAACAGCAAGTAATGGTAATTGTAGTTTAAACTTAAATAATTCTGGAGCAGCAGCCATTAAGGACAGCAATGGAAATGTAGTTACAAATATGAAAGCTAATATTCCTTATAATCTCTGTCATAATGGCTCGGATTTTATATTACAGGGTAAAGGAGGTGGTGGAAACTTAATCCCTAAGTATTTATTAGCTGGTTATTATGGAGAAGGTGATAATGGACGAGTAGATGGTGCTATGGTTAATAGAGGTGCACCGACATCTAATTTAAATTGTGGAGGAGTTGTTAATTTACAGGAAGGTTATTATGCTGGTGGACAAATTATAGCTAATAGTTTAGCAAGTCAAACTCCAGCAAATGCAACTGCTGCACAAATTTTAGCTGGATATAGTGCTTGGGTTAATGGGATTAAAATAAGTGGAAATGCTACAATACAAAGTTTGGGTGGAAGTACTTTTGTTAGCGGAACAGGGTCTGTAACATTAACAGAGAAACAAAGTCGTATATTGGTAGATTTCTCTGCAAAAGTTCCTTCTACTGTTAGAGTTATTTGGGGCAAATTCACTTCTGGAAGTTCATTCTATTTTGTTAACTTTAGAAGTGAAACTAGTGGAACTTTCAAGCCAATAGTATGGGATAAGTATTATAGCAAATATGCAGATGAAAATCCAGTTGCTATCACTGGAATTAATCTGGGAGATGGAGATTCATCTCATACTTGGTCTGCTGGAACTTATACTTATACTTGGTATGCGATTTAAAAAGGAGTAATAATTCATGAAAACATTAATAGTTTATGATTCGAAAGGAAATTTAGTTTTTACACAAACAAATGCATTAGAGAAATATAACTGTATTGTAGAAGATGTAGCCGATAATAAAGAAATTATTGGAGTAGATATATCCACAAGAAAGTGTATAACAGTAGATAGACAAGCAACTACAGAAGAAAAAGAACAACTTAAGAGAGAATTAAATGAAAAGAATATTGAATTAGAAAATACAAAGCAGGAATTGTTAAAAACACAGGCTGCTGTAGTGGATGTAACTTATAATAATTTATTAAAATAGAGAGGAAGATGTAAAATGACTAAAATTTTAGAAAACTTAATTAACAACAAATATTATTCAACAAAGGAAGAAGTAGAACAGAAGCTAAATGTATTTTTTGCATTTAATGTTCTTACTCAAGAAGAATATACAAAATTAATGCAGCTTGCAGACGAAAAGTACAAAGAAACTACTACAGAAGAAGCAGTTACAACAGAGTAGAATGTAATCAAATAAAAGGTTAATAGGAGAAAAGTTTAAGCACCAGTAGGTGTTTTTATTTTGCTCAAAAATCCAAGCGTTTGGAAATATGAAAAGGAAGGTGACACATGAATGAGCAGGAGACTATACAAGAAATTAAAGAAAGGTTAGTGAGAATTGAAATACTGTTAGAAAAAATACAGAAAACTGGGATGAAAAAATTAAAGTAGCAAATCACAGAATTTCAGATTTAGAGGATACTATTAAGTGGATTTCTAGAACTGCAATAGGTGGAGTTATAACAGGATTAATAGGCATATTATTTGCCTTAATAAAATAATAGAAATGAGGAATGTAAACATGGAAATGAATTTAATGGAGTATGTGCCAAGTCACTTAGCAATTTTAATTGCATGTATTTATGTTGTAGGAGTATTTCTTAAGAAGTTAAATAGTGTACCAGATAAGTATATTACTATAATTCTTATGCTGTTTGGAATTACTTTTGCTGTGTTACTAAGTATAATAAACGCTCAATATAAAATAGCTTTAGATGTAATTGTTAATGGTATATTACAGGGGATATGCTGTTGGGGGATATCTGTAGGAATTAACCAGACAGCAAAGCAGTTAAGCAAAAACGATTAATTAAAGGAGTAGCCAGTTAGGTTACTCTTTCACATTATATAATATAAATTTAATAAGGAAGTGTTATATATGAAATTTGGAATAGATTTAGGACATGGAGTAGGTAAAGATCGTGGAGCAGTAGGAAATATTGCAGAAGAAACAATAATTAATTCTGTAGGAAGTTTTGTTATAAGCAAATTAAAAGCATTAGGACATAGTGTTATTGAATTAAGACCAGACAGTGCCACTAGCGTTCAAGATAGCTTATATCAACGTTATACTAAAGCAGATTATTACAATGTAGATATGTGCGTAAGTATACATGCTAATGCAGGTGGTGGAATTGGAACAGAAGTATTTACATATGGTGCTAAAGAAGTACCACAGGCAAGAGATGTATTAAATAATATTGCGAACTTAGGATTTAGAAACAGAGGAATAAAAGATGGCTTAAGTTTGGCTATGGTTAAAAGGCCAAAGGCAACAGCTATGCTTATAGAAATATGCTTTGTAGATAGCACAGATGTGAATTTATATAATACACTTGGACCAGAAGTAATTGCTACAGAAATAGTATTAGGGTTAACAGGAGAAGTTGTTTGTACTACAAAAGGTGAATGGATACTTGATAATACTGGTTGGTGGTACAAACATATAGATGGTAGTTATACATCTAATGGATGGGAGAAAATAGATAATAAGTGGTACTTATTCAATGCTCAAGGCTATATGCTTTATTCATGGCAATATAGCTGTGGAGGGAATTGGTACTATTTAGGCAGTAGTGATGATGGTTCCATGAAAACAGAATGGGTGCTTACTGATGGAAAATGGTACTACATGAATGCTGATGGTGCAATGCAAGTAGGTTGGCAGAAGATAGATAATAACTGGTACTATTTTGGTAATTCTGGAGCTATGCAGACAGGCTGGATAAAAGACGATAGCAAAGATTATTTACTGTATTCTAATGGAACCATGGCATGCAATACTGTAGCTTATGGATATAGATTTGATTCAGATGGAGTTGCTACTAAAATTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP053292|1583606:1589960|1588646_1588934_+|WP_043852848.1|holin|DBSCAN-SWA MEMNLMEYVPSHLAILIACIYVVGVFLKKLNSVPDKYITIILMLFGITFAVLLSIINAQYKIALDVIVNGILQGICCWGISVGINQTAKQLSKND >NZ_CP053292|1583606:1589960|1588121_1588307_+|WP_043852847.1|DBSCAN-SWA MTKILENLINNKYYSTKEEVEQKLNVFFAFNVLTQEEYTKLMQLADEKYKETTTEEAVTTE >NZ_CP053292|1583606:1589960|1589003_1589960_+|WP_043852849.1|DBSCAN-SWA MKFGIDLGHGVGKDRGAVGNIAEETIINSVGSFVISKLKALGHSVIELRPDSATSVQDSLYQRYTKADYYNVDMCVSIHANAGGGIGTEVFTYGAKEVPQARDVLNNIANLGFRNRGIKDGLSLAMVKRPKATAMLIEICFVDSTDVNLYNTLGPEVIATEIVLGLTGEVVCTTKGEWILDNTGWWYKHIDGSYTSNGWEKIDNKWYLFNAQGYMLYSWQYSCGGNWYYLGSSDDGSMKTEWVLTDGKWYYMNADGAMQVGWQKIDNNWYYFGNSGAMQTGWIKDDSKDYLLYSNGTMACNTVAYGYRFDSDGVATKI >NZ_CP053292|1583606:1589960|1584152_1584503_+|WP_043852842.1|DBSCAN-SWA MRYRMLDIDGDYQFGKGQQNFTYGTYAVAQAIKTRLKLLKGEWWENTSEGLPLFEQIIGANGSQEDLYIVDSIIKERIIGTENVKSIQSFKSEYINRTYTFSCVVNTKFGEVTVTM >NZ_CP053292|1583606:1589960|1583606_1584152_+|WP_169512800.1|DBSCAN-SWA MGDGWKSTLRVACPGIIQSFDSNEQTVIVQLALREQISDYEYNKHWTDIPLLLDVPIVVPRAGGYSLTMPIKHGDECLVIFGDMCIDSWWELGGVQNQLENRRHDLSDGFAILGVWSQPRVLQNYSTDSCQLRNESGTSCIELKDNEININSQKVNINGISFSEHKHNFNDSSTSTPIGGI >NZ_CP053292|1583606:1589960|1584518_1585697_+|WP_043852843.1|plate|DBSCAN-SWA MTYFAPYIDETGFHMPTYIDIRDKQIDDAKNIFGQDIYLGEDSQDYQYICTVAEKIYDAFQVAQQVYNNRAPNSAIGAGLDSIVKINGIKRKAATYSKCNVTVMGTAGIEIKNGIVVDKGNIKWDLPASVKIPDTGKIVVEAVCQIEGPIVSNPGDLTGIYNPTYGWNGVYNYENGSLGSKKEDDLKLRKRQSDSTAQPSRSILDGTSGAVAKVDGVTRSYVYENDTNLVDSLGLPPHSITVVVEGGTDEDIARAIHIHKGPGCYSNGDVRIDVTDSKGQISSIGFYRAKYVDIDVTVNIKALDNYTTAITDNIKKSIESYLNSMKIENKKLVVSSLWGVSLQAMSDLSNPTFSITSITASRHGKIQSTDDIELAFNETCRGNVNYIIANVL >NZ_CP053292|1583606:1589960|1587812_1588106_+|WP_043852846.1|DBSCAN-SWA MKTLIVYDSKGNLVFTQTNALEKYNCIVEDVADNKEIIGVDISTRKCITVDRQATTEEKEQLKRELNEKNIELENTKQELLKTQAAVVDVTYNNLLK >NZ_CP053292|1583606:1589960|1585705_1586362_+|WP_043852844.1|DBSCAN-SWA MAIDKYLNSVTSQHRDKKKFIAWLSSSLTIIDHAYIMTKNIDNDFDLDNALGVQLDMLGQSIGRKRMLTFQPLNDHNPVMDDETYRLVLKAKVAMNNWDGKTESAYEIWDNTFKDIGLQIQDNQDMSMTAYVTGYVNQIRQDLIQHGYIVPKPEGVKINYIGKTPINFNKYSYIVVSSQQTTTINMIFDPVELISMKEISRITVQGININTIRCEGGK |
8 | Burkholderia_phage(33.33%) | plate,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1688560 : 1695854
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP053292|1688560:1695854|DBSCAN-SWA TTTAAGCGCCTTTTGGCTTTTCTGAAGCTGATGATATTTGCCCTTTTTGTTCGGCCTCAAGTTCTTTACGATAGGATTCAACTTCATAATCAATATCATTTAATTCAGAACTTTCAGTAGTAGCAGCTTCTTCAGTGTTTCTCATTTGTTTTAAAACACTATGTTTAAAACTATTCATAATTGAATTTCTAAGATCTTCAGGTATTTCAAAATAACTTTTTATAAGATCAAGTTCTAGTTGAGTTGCGCCTTTAGATTTAATGTATTCATCTAATGAAAAAGTATCTGATTCAATTTTTTCAGATCCAGTACCATTTAATAGCCACTCTTCATTTATAGAAAATTCTTTACTAATTAACTTTATTAATGAAGTTTTTTGCTCAGGCTTTGCAAGTCTATTTAATTCTATATTAGAAATAACAGAACGTGTAACACCTAGCCTTTGTGCAAATTCATTTTGTGTTAAATTTTGATCATTTCTTATTTTTTTTATTCTTTCATGCATATCCAACAATACTCACCTCCTAATAAAAATACTATCATACAGAAATGTGTTAGTCAACGCAAAAATAACAAAAAAATACATTCAATGTGTTGACAGGAACAATTTTGGATATTATAATGTATTTATCAACACAAAACAAATAAATAAATGTGTTGCATGCTTAAATAAACACATCTTTAGATAACGAGCGACTACAAAGTCTATGTAGTATAGTCCAGTTCGTAAAAAGTTAGTAGAAGAAAAAATTAAAATATATAAATAACAAAAGGAGGATAAAATTATGGAAGTTATTTTAAAAAAAGAAGATAAAAAAGAGACAAATGAAATCTTTGAATTTATTAAAACCTTAAATCCTGAAGAGCAGAAAGCTTTTAAATATGTTATTGATGGGTTTAAGATTGCTAGAGCAATTGGAAAGGGGGTGAATTAGTTGGATAATGAATTAAAAGAACAAATTATAGAAACATTAAAAAGTTATTTAGAATATTCAGAGACTATGTTTGAAAGTGTAAAAAAAGATATAGAAAATGGAGAAGAAATATCTTCTGAACGTGCTAACAATATAAATGATTGTGTAAGAACAATACATCATATTGTTAGCATCGTTGAAAAAGTAAAAGAAACTGCTCCTGAAGTACCAGTTCAAGAGCAGTGGTGGGAAAAAGTTAAACTAGGATTTGCAGAAGAGATGGCTAACTATGTAGCCAGTCGTGGTAAAGTGCAAGAAGATCTAAAGTAATTTTTGCATTATTTGCTAATATGCTTTTTAAATCTTCTGGATCTAAGGAATTTAAATCACATTTTTTGAAAGTTGATTTATTTACAATAGTCATGAAAGTTTCTTGATCAATAGAAGATAAAAAATCATCAAAGTCTTTAGTCATAAATAAACACCTCCTTTCAACATAATTTTACCATAGTTGGAATATTAGGTGTAGATTTTAGGGGTGAAAGGGGGGGGAATTAGGTGGAAAAGGAAAAAGAAACTGCTCCTGAAGTACCAGTTCAAGAGCAGTTATCAAAATATAATGAAATTCATGTAAATAGTAATGAATTTATAAAATTAATTACTATGTTGCAAGTAATATTGAAACCAATAAATTTTGACAAAGATACCGATATTATAATCAATTACAAATTAAAATCACAAACTATAGTTTTTGAATATTTTAAATCTGAGTAATAATGGCATTCTTTGGCCAATGAACTAATTCTTCTATAGGTATAGAAGAATCCCAAAATACTTCATATAGACCTATATTCTTGAAATCTACACTAAGAATAAAACATAGATTATATTCACAGAAATATGAAAATTACTATTTTGTAAATGAATCAGAAGGAATTTATATTTATAGCCTAAATGGCATTAAAGTAAGAGCACCCAATTAATTTTTTTACAATGTAATGTAATTCAGTTGAATAAATGGGGGAGTGAGGACATGGAAAATAATAAAACAGAAGAAATGACAGTAGAAAAGGCATGGGACATTTTACACAGTAGAGGAATTTACACTATTGAAGAATTAGATGAAGAACTAAAGAAAACTAAGTTAGAAATAGGAATGTTCACAATGCCTTTTGCAAAAGAAAATGTAAAAGAAGCTTAATAATATATTTGGAGGGTTAAGAATGAAAAGTATAGGAATTGTAAGAAAAGTAGACGAGCTTGGAAGAATTGTTATTCCAATGGAATTAAGAAGAACATTAGGAATAGCAGAAAAGGATGCAGTTGAAATATTTGTAGATGGAGAACAAATAATAATGAAGAAATATAATCCATCATGCATATTCTGTGGAGAAGCAAGAAATGTAATTAGTTATAAAGGGAAAAATATTTGTACAGATTGTTTAGACGAAATTAAGAATCGTAAATGATGGGCAGGTGTGAAGTAGTATGTTAAATCCATATGATTATTATATTACACCAGAAGAATATGAAATTGCAAAAGCAAATGGAATATGTAGAGCTACTTTAGAGGATAGAATAAGAAGACTAGCATGGGATAAGGAACAAGCCATATCAATGGCTCCAAGAAAGCAGAGAAGAATAGATAAACGGTTTATTAAGATTGCTAAAGAAAATGGAATTTGTTACTCAACGCTTAAATATAGAATTAATATTATTAATTTAGATCCAGAAGTAGCAGCAACTAAGAAACTACAAGATTATAAAGAGCGAGCAAAGATTATGAGTGAAAGGAATAGAAAATATCCTGCTGAATATCGAGAATTAGCAAGAAAAAATGGAATTTCAGAGAGAGCTTTTTATCATAGATTAAAAAGTGGATGGAGTATAGAAGATGCAGCGACTATACCATTAATGACACGAAGTCAAATTGGGAAAATGACAAAAGAAAAGAATAAGAAATATATAGATAGATTGTTTTTAAACAGAAAGAAAAATGTTAATATATGAAAATTTTAAAGACACAAAAAAATGTGCTTTGCGACCAAACATAAGCACATTCAAAAGTTATGAGACTATACTCAACATAATTTAATTATAGTCTCATAACTAAATAGTGTCAATTTTTTTGAAGCTTTTTTAAGGTTTTTATAGGGCTTGTAATAGGTATTATTATCTGGGACACCTAATATTTTACAAAATATACTGAGGTAGAAATATGAAGAAGAGACTATATGATAATTATGATTATGAAAATATATATGATAAAGATTTAAAGAGTGAAGACTTAGAAGATTTAAGAATAAATAATAATTATGTTTATGTAAGGAAGACAGTAAAAAGTAAAAAATATATTGAGTGTTCTATATATCCATCATGGAAATGTAAATGTGATATGCCACGGGCAAAAAAGAAAAAAGAAAGTAGTAAAAAACAAAAAAAACTAAATTTGAAAAATAGAATTAAGAACATTACAAGATATCTACATACTAATTTTACTACTGATGATTTATTTATGACATTAACTTATAGGGACATGAAAGGTATAGATGAAGATAGAGCATATAAAGATATAACAAATTTTATAAGTAGAGTAAGAAGATGGATGAAAAGAAACAAGATAACTAAAGAACTTAAATACATGTATATAATATCATATGATAATGACCCAAATTCTGAAAAAAAGATAAGAATACATCATCACATAGTAATTAGTGGAGTAGATAGAGATGTAGCAGAAAAATTATGGGGTAAAGGTATAGCAAATGCAAGAAAATTACAAGAAGGAGATTTTGGATTCAGTCAATTAGGAAAGTATTTTGCGGAGCAGGAGCAAAACCCTAATGAAAAAAATAATATAACTAAAGCATCAAGAAGAGGAAAGCGATTTGGACATTCTTTAAATTTAAAGAAACCCAAAATAACAAAAGATAGAACAACACTTACAAGAAGAAAAGCTGAAATTATAGCTGTAAATGAAAATGATTATAAAGAATTTTTTGAAAGTAAATATCCCGGATGTAGATTTGTAGATTGCAAAGCACATATAAGTGATGATTTTGCTGGAGTATATTTATACGCAAGATTGATTAAAGAAGAAGAGGTGAAAAGGGAATGAGTGAAGCAAGTGAACAGGCAGCATTATTTCAATGGGCACAATTAGCAAGACAAAAGTATAAAGAGTTAGAACTTTTATACCATGTTCCTAATGGTGGAAAGCGTGAAGCAAAAGAAGGAGCAGCATTAAAAAGGCAAGGTGTAAAAGCTGGTGTACCAGATATATGTTTGCCAGTTGCAAAAGATGGATTCTTTGGATTGTATATAGAGTTAAAAGTAGGAAGAAATAAGACAAGTCCCATGCAAGAGATTTGGATTAAAAGATTACGAGATATGAACTATAAAGTAGAGGTTTGCTATGGATGGAATAATGCTAGAGAAGTTATAGAGAGTTATTTAGATACAGAAGATACTTTAACTAAGATACTTTAGCTATAAAATTTATAGGGGGGACAAGGTATGAAATATAAAAAAATGACCCCTCATGAATTTGCACAAAAGACAGTTAGAGATATTGAAATTAAAAGGAAAAGAGCAGAAGAAGGAAAGAAACAAGCTGGAATGCATCGGGCAGAAAATAAAGACAGAATACAAAGGCGATTATCACATTTAAGATGATTAATGAGTTCAAATTTAAAAATAAATATGAGAAGAGGTTTTTTTAATGAAAGTAATTTCAATTATTAATTTAAAAGGTGGAGTTGGAAAGACAATAACTAGTATAAACATATGTAATATATTGGCTGTAAATTATAACAAAAAAGTTTTAATTATAGATAATGATAAACAAGGAAATGCAAGTAAGTTTTTTGAGGTATTTAATGAAAATGAAGAATGTGGTACTGCAAAAATGTTAGCAGATAAACGTGTAAGAGCAGAAGATGCAATAAGACAAACTAAGAATTCTAACATTGATATTATAACTGCCAATATGGGACTTTTTGTTGAGAATTGGCAGTTAAGTAAAGATGATGAAAGTGAAGATAAGTATATTAAATATAAACAAGTATTAGATCAAGTAAAAGATAAGTATGATTTTTGTATAATAGATAATCCTCCAGATATTGCATTGAATGTAATAAATGCATTAGTAGTTGCTGATGATGTAATAGTACCAATTAAATTAGATGAATGGGCACTTGATGGTCTTGATATTATATCTGAAAAAATAGAAGAAGCCAAAACATTTAATAAAAATATTAAGTTAATGGGATGTCTAATAACAGTATTTCGAAAAAATGATATTAATGTTTTAGCGGAGGAGTGGATAAGAGAAAAAACTGAGTACCCAGTATTTGATACAAAAATAAGATATACAGAAAAAGTTGATGAAAGCATATTCTTTCATAAAGGGATTACGGAGCATAGCAGAAGATGCGGTGCTGCTATTGATTACCTAAAATTTATTGATGAATATTTAAATAAAATCAAGGAGGAATAATACATGGCTGTTACTGGAAAGTTTACTTTAAACGACATCATGAAAAATAAGTCAACTAATGATAAAGATATTAATATCACTGGATATAGAACAATAAAATTAAGTCCATATGATGTTATACCTTCACAAAGTAATTTTTATAGTCAAGAAAATATTGAAGAATTAGCAGATACATTTTTATTGGTAGGTCAACAGCAGCCTACAGTACTGGGAAAAGTTGATGGAGAGTTCAGAATTTTAAGCGGCCATAGAAGAAATAAAGCTAATATATTCAATATAGAACGAGGATATAAGCAATTTGAAAAAGTTGAGTACTTGTATAAAGAAATGACAGAAGCGTTTTTTGAACTTTCACTTATAGTAGGAAATGCATTTACAAGAAAGTTGACACCTTATGAAGAGGCAGAACAAATACAAAGGTTAAAGGAAGCATTAATTAAAGCTCGTGATGAAGATGGGTTAGAGATAAAAGGTAAATTGAGAAATATAATAGCCGAATTACTCGATATTAGTAGCACACAAGTAGCAAGAATGGAAGCAATTAATAATAATTTAGTTGGAGAAGCAAAGGAACAGTTTAAAGATGGAAAATTAAACACTACCTCTGCATATGAAACAAGTAAATTATCAGCGCAAGAGCAAAAAGACATAGTGCAGAAAGTTGCAAGAGGTGAAGACGTTAAAGCTAAAGAAATAGCACAAATGGTTTTGAATAAGAAAAAATCTGAAATAGAAAAGGTGTCCGAATCGGACACCAAAGAAAATGAAAATTTGGCAATAGTTGATTTGGAAACTGGTGAGATAGTAGAACAAAAGACACCTAATTATTTAAATGAAAATATACTTAACATAATACAAAAAATGTCTTTAAATGAAATGGCAGATTTTATATGCAGTAGATGTAATGGCGGAAATGGGTGTGCTGGTTTTTGCGATTTAGCAATACAGTGTACAGAAGAAAATAAACATTCAACATGTATTAAGTGGCTAAGTACACAAACAATTATTTAATATCATTTATTTGTTGACTGGTTAAATAGCAATTAAGAGAGTTAAAATCCTCTTCATTACAATCAAAGATGGAGGAATGAAAAATGAATAAAGTAGTTTTAATAGGAAGATTAACTAAAGATCCTGAACTTAGATTTACACCTGGAAGTGGTGCAGCAGTAACAACTTTAACATTAGCAATTGATAGATATAATCCAAAGACTAACCAAAATGAAGCTGATTTTATTCCTATAGTAATATGGGGTAAACAAGCTGAAAACACTGCAAATTATATGAGTAAAGGCGGACAAGTTGCTATTAGCGGAAAAATTCAAACTAGAAGTTATGATGCTAAAGATGGTACTAAGAGATATATTACTGAAGTAGTAGCAGATCAATTTGGTGGTGTTCAGTTTCTAGGGAATAAGGGTGAAGTAAATCAGAATGATGGTTCTAATAATTTTGGAAATATGAATCAAGATATATTTGAAGAGGATATAACACCAGTAGATGGAGGGGACATGCCTTTTTAACAATGGAGGAATAGTATGAATCCACAAGATATAATGGATCAAATTAAAAAGGCACAAAGAGAACTTAGTGAATTGAATACAAAGTTGTTTAGGTATGGACAGGAAAAAGAGTATGCAGAGCAGCAATATAAAATTCAATTAAGTAAGAAGCTGTTGCAGCTAAGAACTGAAAAATGTGCAACAACGATTGTTAATGATATAGCAAAAGGTGATGAAAGAATAAGCAACTTAAGATTAAAAAGAGGATTAGCAGAAAATAAGTATACAGTATGTCAGGAAGCATTAAGAAATAAGAGGTTGGAACTGGATTGCTTAAGAAGTTTATTGACATGGCATAGGGTAGAGCTTAATAACAGTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP053292|1688560:1695854|1690031_1690247_+|WP_043852892.1|DBSCAN-SWA MEKEKETAPEVPVQEQLSKYNEIHVNSNEFIKLITMLQVILKPINFDKDTDIIINYKLKSQTIVFEYFKSE >NZ_CP053292|1688560:1695854|1688560_1689070_-|WP_052501795.1|DBSCAN-SWA MDMHERIKKIRNDQNLTQNEFAQRLGVTRSVISNIELNRLAKPEQKTSLIKLISKEFSINEEWLLNGTGSEKIESDTFSLDEYIKSKGATQLELDLIKSYFEIPEDLRNSIMNSFKHSVLKQMRNTEEAATTESSELNDIDYEVESYRKELEAEQKGQISSASEKPKGA >NZ_CP053292|1688560:1695854|1693194_1693971_+|WP_043852900.1|DBSCAN-SWA MKVISIINLKGGVGKTITSINICNILAVNYNKKVLIIDNDKQGNASKFFEVFNENEECGTAKMLADKRVRAEDAIRQTKNSNIDIITANMGLFVENWQLSKDDESEDKYIKYKQVLDQVKDKYDFCIIDNPPDIALNVINALVVADDVIVPIKLDEWALDGLDIISEKIEEAKTFNKNIKLMGCLITVFRKNDINVLAEEWIREKTEYPVFDTKIRYTEKVDESIFFHKGITEHSRRCGAAIDYLKFIDEYLNKIKEE >NZ_CP053292|1688560:1695854|1689494_1689803_+|WP_043852890.1|DBSCAN-SWA MDNELKEQIIETLKSYLEYSETMFESVKKDIENGEEISSERANNINDCVRTIHHIVSIVEKVKETAPEVPVQEQWWEKVKLGFAEEMANYVASRGKVQEDLK >NZ_CP053292|1688560:1695854|1691691_1692591_+|WP_043852895.1|DBSCAN-SWA MKKRLYDNYDYENIYDKDLKSEDLEDLRINNNYVYVRKTVKSKKYIECSIYPSWKCKCDMPRAKKKKESSKKQKKLNLKNRIKNITRYLHTNFTTDDLFMTLTYRDMKGIDEDRAYKDITNFISRVRRWMKRNKITKELKYMYIISYDNDPNSEKKIRIHHHIVISGVDRDVAEKLWGKGIANARKLQEGDFGFSQLGKYFAEQEQNPNEKNNITKASRRGKRFGHSLNLKKPKITKDRTTLTRRKAEIIAVNENDYKEFFESKYPGCRFVDCKAHISDDFAGVYLYARLIKEEEVKRE >NZ_CP053292|1688560:1695854|1692989_1693148_+|WP_043852898.1|DBSCAN-SWA MKYKKMTPHEFAQKTVRDIEIKRKRAEEGKKQAGMHRAENKDRIQRRLSHLR >NZ_CP053292|1688560:1695854|1692587_1692962_+|WP_043852896.1|DBSCAN-SWA MSEASEQAALFQWAQLARQKYKELELLYHVPNGGKREAKEGAALKRQGVKAGVPDICLPVAKDGFFGLYIELKVGRNKTSPMQEIWIKRLRDMNYKVEVCYGWNNAREVIESYLDTEDTLTKIL >NZ_CP053292|1688560:1695854|1695509_1695854_+|WP_043852904.1|DBSCAN-SWA MNPQDIMDQIKKAQRELSELNTKLFRYGQEKEYAEQQYKIQLSKKLLQLRTEKCATTIVNDIAKGDERISNLRLKRGLAENKYTVCQEALRNKRLELDCLRSLLTWHRVELNNS >NZ_CP053292|1688560:1695854|1693974_1694982_+|WP_043852902.1|DBSCAN-SWA MAVTGKFTLNDIMKNKSTNDKDINITGYRTIKLSPYDVIPSQSNFYSQENIEELADTFLLVGQQQPTVLGKVDGEFRILSGHRRNKANIFNIERGYKQFEKVEYLYKEMTEAFFELSLIVGNAFTRKLTPYEEAEQIQRLKEALIKARDEDGLEIKGKLRNIIAELLDISSTQVARMEAINNNLVGEAKEQFKDGKLNTTSAYETSKLSAQEQKDIVQKVARGEDVKAKEIAQMVLNKKKSEIEKVSESDTKENENLAIVDLETGEIVEQKTPNYLNENILNIIQKMSLNEMADFICSRCNGGNGCAGFCDLAIQCTEENKHSTCIKWLSTQTII >NZ_CP053292|1688560:1695854|1690961_1691483_+|WP_043852894.1|DBSCAN-SWA MLNPYDYYITPEEYEIAKANGICRATLEDRIRRLAWDKEQAISMAPRKQRRIDKRFIKIAKENGICYSTLKYRINIINLDPEVAATKKLQDYKERAKIMSERNRKYPAEYRELARKNGISERAFYHRLKSGWSIEDAATIPLMTRSQIGKMTKEKNKKYIDRLFLNRKKNVNI >NZ_CP053292|1688560:1695854|1695065_1695494_+|WP_043852903.1|DBSCAN-SWA MNKVVLIGRLTKDPELRFTPGSGAAVTTLTLAIDRYNPKTNQNEADFIPIVIWGKQAENTANYMSKGGQVAISGKIQTRSYDAKDGTKRYITEVVADQFGGVQFLGNKGEVNQNDGSNNFGNMNQDIFEEDITPVDGGDMPF >NZ_CP053292|1688560:1695854|1689756_1689948_-|WP_043852891.1|DBSCAN-SWA MTKDFDDFLSSIDQETFMTIVNKSTFKKCDLNSLDPEDLKSILANNAKITLDLLALYHDWLHS >NZ_CP053292|1688560:1695854|1690696_1690942_+|WP_043852893.1|DBSCAN-SWA MKSIGIVRKVDELGRIVIPMELRRTLGIAEKDAVEIFVDGEQIIMKKYNPSCIFCGEARNVISYKGKNICTDCLDEIKNRK >NZ_CP053292|1688560:1695854|1690506_1690674_+|WP_155394927.1|DBSCAN-SWA MENNKTEEMTVEKAWDILHSRGIYTIEELDEELKKTKLEIGMFTMPFAKENVKEA >NZ_CP053292|1688560:1695854|1689344_1689494_+|WP_155394926.1|DBSCAN-SWA MEVILKKEDKKETNEIFEFIKTLNPEEQKAFKYVIDGFKIARAIGKGVN |
15 | Clostridium_phage(22.22%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1699539 : 1757106
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP053292|1699539:1757106|DBSCAN-SWA GGTGAGTACAGTGAAAAGAAAGAAAATAAAGTTAAATGTAAAGTTTGCTAAAGACAAAGTTGTATGTGCTAAGTCTCCAATAGAATGCAAACTATGTAGAAACATTAGCACATGTGAACTAATGGAACTGTATTACTATCCCTATGATGGAGCTGAGGACTGCATGAAGCATAGAAGTTATAAGAGAGAACGAGGAGCAATAAGGCAGAACAGTTATGAATAAACGCTTTAAGGTACTTACTAGGGGGTAGGCGTATAACGGGTCTAGCGATGCCCAGTTTTCATCTCTTTATGAAAAAAAATTTTTCGGTACTTCCTTCCGCTTTTTATATTTGAAATTATTTAATTTTAATCAAAAAATATGTGAAAAAATATTATTTAAAAAAGAGGTGATTTTTAAAATTGAATGTAAATCAGAAAGAGCTTGCAACTATTTTAGGAATCACATCTAGAAGAGTTAGACAATTAAGAGAAGAAGGCTTCTTTTCATTTGCTGAAAATGGTAAAAAATATTCGTTAGAAAAATGTGTTCAAGAGTACATTGAATATAAGGTAAAAGCGGAAACGAATTCGGGTACATCTATAGATGTTGAAAGAGAAAAAGCAGAGCATGAACAAATTAAGAAAAATATTTCGAAATTAAAGCTTAGAAAATTAAAAAAAGAACTTCATGAAGCTTCAGATGTTGAATTGTTTTTGAGTGAGATGCTTATTAATTTCAGAAATAGACTATTATCAATTCCAAGTAAAGTTGCAGTACAAATACTAGGAGAAGAAGATGTAAATAGAATTATAGAAATACTGCAGAAAGAAATGTACGAAACATTAGATGAACTATCTGAATATAATCCAGACGAGATAAATAGAGAAAAAAACTATGATTATGAGGATGATGAAGATGAATGCTAAATATTAAAAATAGGTGATAATTATGGGAAATGAAAGGATACGTTCTAAAGAAAAGACAAGTAATTTATTTAGGAGAGTATTAAAACGTACTCTGTCAAAACCTGAACAACTTACAGTAAGCCAGTGGGCTGAAAAATATAGAGTGTTAGATGAATCCAGCTCACTCCCTGGTAAATGGTCAAATGATGTTACTCCTTATTTAGTTGAAATAATGGATTCATTTAATGATCCGTACATAGAACATATAAATTTCTGTAAACCAACTCAGGTTGGAGGAACGGAAGCATTAATAAATGAACTCGGATGGATTGTTACTCAAAATCCTAGCCCAACTATGATTGTTTATCCTACAGATGATTTAGCTAAAGATGTTTCAAATGATAAATTAAAACCAGCTTTTAGAAAAAGTCCAAGCATAAGAGAAAGATTTTATGAAAATCAATCTAAGGAATTAGGATTAAAGTTTAAGGGAATGAATGTTTATCTTAGAGGTGCTAATTCACCAAGTAAACTGGCATCAAAAGCAATAAAGTTTTTGATGTTTGATGAAATTGACAAAATGGGTGGAGCTTCAAAGAAGGAAGCATCTCCTTACGATTTGGCGCTTGAAAGAACAAAGACATTTAAACATTCAAAGAAAATATATTCATGTTCTACACCTACTTTAAAAGATAACTATGTTTGGAAATTACATGAATCTGCTGAAGAACAAAGACATTATTTTGTTCCATGTCCTCATTGTGGTGAGTTTATTGAACTTAAATGGATTCAGGTAATATTTGATAAAGATAAGGAAAGTAAACTGACTATAGCAGAACGGGCAGCTACTGCTAAATATGTATGTCAGGAATGTGGATGTATTATTGAAGATAGAGAAAAACCAAAGATGTTAAGGAATGGCCAATGGAGAAGTATAAATAAAAAATGTATTGGTAAACCAAAAACAGTATCATTTTGGTTGAATTCACTTTATAGCATATTTGTAACATGGGAAGATATGGCTAAAAAATTTTTAGAGTCTAGAAATGATCCAGATGAACTTCAGAACTTTGTGAATTCATGGTTGGCTGAACCTTGGGAAGATACAAAGTTGAAAACTACTGCTGATTTAGTTCTTGAGAGACAGACAGACTATAAACAGTACATTATTCCAGATTGGGCTAAACTTCTTACAGCAGGAGTGGATGTACAAGAAAATTGTTTGTATTGGAGTATAAGAGCATTTGGGAATTATATAACAAGTCAAAATATATGTCATGGTCAAGCTTTTTCTTTTAGGGAAATAGAAAAAATTATGAATCTTGAATATTGTAAGAAAGATGGAACTAAAATGCTTGTTAATTTAACATTAATAGACTCTGGATATGATTCTGATTCAGTTTATGATTTTGCTGCATCTAATTCAGAATGGTGCCTGCCAGTAAAAGGTGCATCTAATGCGCAGCTGTCACATTATAAATTATCAAAAGTTAATAAAACTGATTCTAAAGCCTATGGAATGAATTTAGTTATAGTTGATGGTGGTAAATATAAGGATATGATTGCTGGACGTATGAAGAAGGAAAATGGAATTGGGTCATGGATGGTTTACAAAGGATGTGATAGAGAATATGCTGAACAAGTTACTGCTGAACATAAGGTGAATGTTAAGAATGGAAATAAGAAGAGTCAACAGTGGGTATTAAAAAAGAGCCATGCAGACAACCATTATTTAGATGCTGAAGTTTATGCTATAGCTGCTGCAGATATAATGGGAGTAAGGACTTTGCATTTAGAAGATGAAGCTCCACAGCAACATAAAAAACAAGAAGAGCAATATGCTCCAGAGGAAAGCTGGATAAAAAGTAATGAAGAATGGATTTAAAGGTGGTGTGTTTTATGGCGGATGATAATAAACTTACAACGCAGGAAATGTTAGAAGAAGTAGATAAGGCTATATATAATGTTTTGGTTGGAGGACAATCATATAAAATTGGTTCCAGACAATTAACTAGAGCAGATTTAAGGATGCTTAAAGAAATGAAAGATGATTTAATGGCACAGGTAGCACAAAATGACAGTCAGTTGTTAGATGATACTTATGTTGCTGTATTTTCTGGAAGGTAGGTGGTTAAATTGAACTGGTTAGATGGTGTTATAAGTTTTGTTTCACCTGAATGGGGGGTTAAAAGAGAAGCTTATAGACAATATTTAGATGAGATTAGAAATTATGATGCTGGGAGTTATGGAAGAACAAATTCTAACTGGAAATCTACAAATCAGTCTGCAGAAATGACGGATAGATATTATAGAGATAATGTAAGAGCTAGATGTAGGGATTTAGAAAGAAACTCTGATATTATGAATTCGGTTGTTGGAGCATTTAAAAGAAATATTATCGGTGGGGGATATACCCTGCAAGCAAAAACATCAGATGATGATATAAACAAAAGCATAGAAGAATTATGGAAAGTTTGGTGCAAGAAAAATAACTGTGATGTTACAGGTACACAGAGTTTTAACCAAATGATAAGGATGGCAGTAGAACGTAAGAAGATAGATGGAGTAATAATATTCTTAAAAAGATATACAAAGGATGGAATTATTCCGTTTCAATTACAGGCTATTGAAGTAGATGAACTTGATATATCTCAGATGGTTCCTAAAAACAATAAGAATAAGGTTGTAGGAGGAATTGAGTACAATGAATATAACAAGGCTGTAGGATATTGGATAAAACAATACAGTATAGATGGATTTACAATAGAAAGTCCAATCTATATTGAAGCTAAGTATGTAATATTCTACTATTCTAAAAAAAGGCCAAGTCAAGTGAGAGAAATGTCAGACATGGCTCCTACAATCACAAGAATAAGAGATGCTAATGAATTTATGACTGCGGTATCTGTAAAAGAAAGAATAGCAGCATGCTTATCAGTATTTATAAAGAAAACACTTCCTACAACGGGAATAGGAGGTAGGAACAATATAATTCAATCAAAAAATGATTATGAAGGCAAGACCATTTCGCCGGGAATGATCAAGGAACTTAATGCTGGTGATGAGATACAAGTTGTAAATCCATCTGGTCAAAGTGCAGATGCAACTGGATATATTAAACTTCAACAAAGGTTGATAGGCGCTGGACAAGGAATAAGTTATGAAGCTACATCTAGAGATATGTCAGAAACAAATTATTCTTCCGCAAGACAGGGAACTATAGAAGATGAATTGACGTATGATGAAGATGTTGAGTTGCTTATAGAAAATGTTATAGATGAAGTGTATGAAACTTTTATTATATCGGCATATTTAAGCGGTAAAATTGATTTCAAGGAATTCTGGAATAACAAAGAAATTTATCTAAAACATGAATGGATTAAAGCTCCAAAGAGGTGGATAGATCCACTTAAAGAAGCAAATGCAAATAAAATTGCATTACAAACTGGTCAAAAAACATTCAAACAAATTGCAGCAGAAAACGGTAAGGATTGGAAAGAACAGATTGATGAATTCAATGAAGTATTACAATATGCTAAAGACCAAGGAATTGATTTAGGAGGTGTGATATTTGGAAAGAAGGGGGAAGAACTTTATTATGAGGGACAGTGATGAAAAAAACAAGTCAACAAGGGAACTCTTAGTAAATTCTATAAGAGCATTAAAAGGTGAAGGTAATGAAAGAAAATTTGAACTAAGCTTTTCATCAGAGGAACCATATGAAAGATGGTGGGGGACTGAAATTTTAGATCATTCAGATGGAGCAGTCGATTTAACTAGATTAAGTGAAATCGGCTGCTTGTTATTTAATCACAATAGAGATGCTGTTATAGGAAAAGTTAATAAAGTATGGCTTGAAGATAAAAGAGGAAAATCAGAAGTTGAGTTTGATACTGATGAAGAATCAGAAAAAATATATCAAAAAGTTAAATCAGGAACATTAAAAGGTGTTTCAGTTGGATATTGCATTGACTCATGGGAAGAAGTTTCAGCAAATAAAAGTTCTGCTGATGGAAAGTTCATAGGTCCATGTTCAGTTGCTAGGAAATGGACACCATTTGAAATTTCAATTGTAAGTGTGCCTGCAGACCCTACTGTTGGAGTAGGAAGAC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62 | Faecalibacterium_phage(28.57%) | head,tRNA,plate,holin,integrase,protease,tail,portal,terminase | attL 1724078:1724096|attR 1758105:1758123 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2057449 : 2064291
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP053292|2057449:2064291|DBSCAN-SWA TCTAAGCTAATTCATCTTTTAATTGATCTTCAAATATTATTGATAGCTCCGCTAGCGTAGCACCCCAATTTGGAGTAGGTTGACTCCATTTTTCTATTATTTCCATCGTAGCTAAGTAAACACACTTATTTAACGATTCATCTGTAGGAAAGATCACTCTAACCTTAGTAAATTTACGTATTTGACGATTAAACCCTTCAAGTGCATTGGTAGTATATATCATCTTTCTTATGCTTGGAGAGAAATCAAAAAATGTTGATAGATTACTCCAATTATTATACCAAGAATCAATAACTATAGCGTATTTATCACCCCACAAAGATTTTAAATTGTCTAGCTGCGCCAACGCAAGTTCTTCAGTTGATGCTTTGTAAACTTCTTTTAAATCCTTCATAAATGCCTTTTTATCCTTTGAAGCTATATATTTGATTGAATTTCTAATTTGGTGAACAATACATGTTTGAATATTTACTGATGGAAATACTGTTTTAATAGCTTGTGGTAATCCTTTTAAACCATCCATACATGCAATTAATATTTCTTTAACTCCTCTATTTTTTAAGTCATTACAAATTCCTAACCAGAACTTAGCACCTTCTGCTTCATCAACCCATATACCTAAAATATCTTTATAGCCATCCATTGTATATCCTAAACAAATGTAAACAGCTTTATTAATTATCTTTCCATTACTTCTAACTTTAAAGTACATAGCATCTAAATAAACGATAGGATATATTTTATCCAAAGCTCTATTTTGCCATTCGGTAGCGCTAGCAAGTACTTTATCTGTTATTTTAGATACCATCGATGGAGATATTTTTATTCCATATAGATCTTCAATCTCTGATTGGATATCACTTGTACTCATACCTTTAGCATATAAAGATATAATTTTTTTATCTAACTCAGTACAGACAGTTTCATATTTCTTTATAATTTGAGGTTCGAATTCTGCATTTCTATCACGTGGTACGTCTAAGTCGACGTCACCGAAGGAGCTTCGTAGATTTTTACTGCTATACCCGTTTCTATAGTTTCTATTGCTTTGATTATTTGATTCTGTACGCTCATATTTATTTCTTCCAAGATGCTCTTCCATTTCGCCTTCTAATATATTTTCAAGGACATCTTTTACAAGTTTCTGTATTAGCCCATTCTTACCCATAACATCATCGATGGTTTTACATTTTTTTATTTCTTCATTGTAGTCAAAGTTAGTATCAATTTTTTTTGTCATAATAATTCCTCCTAAACTTATATGTTTTATTATTCCAAAACTACCAACTGTTCATACAAAAAAACAGTAGATAGATTTTGTTTTTACACAAATCTATCTACTGTCCCCTTTAATTATATTACTAGTTGTGCCAGTTAAATTTAACAAAATAATGGACATAAGTCTATTACTTACATCCATATAATCCTATAATTTATTTTATAACACTATTAGCTCCCTTAATCATAAGTTCCAATTCCCTATCTGGCTGCCATTCAATTATTATCTTTCTAGCAGCTTGAAACATCTTTACCGAAGTATTCTTATATGAATTAACATCCATAACTCTTTTAAAGTCACGCCATATACTACTAAATGCTTTTTTATTTAATTCCTTGTAAGCTGGTGTATTCTTTCCACCAAGTATTGCAACAACTTTCTTGATTGCTAATGTTCTAAGTTCTTCCTGCTGACTGTAATCAATAGTCATATTATTTTCCAACTTTTCAACTCTATCTGTAATTTCAAGTGTACGTTTATCTATGCAAAATATAGCTTTAAGTTCTGGTGACATATCCTGATCACTAATTGAATAACTTCCTTTTTTTCTTATCTGTGGAAGCACATCTACTGCAAGCCACTTTTGAAATTCTTGAGCTGCTTCATTATTTGCTTTCATTCCAAGTAGATAAAATAATGATTCAGGAATATAATCATCTTTCCCAACAAGTTGGGAAAAGTGTAATTCATTTAAATAAGCATTTACAGTTTCCCATCTTACATAGACTTTACCACTTTTTATTTGTACCCACCCTAATCCTCTTGCAGCATCTTCAGCATTAATTGATATGCTACCATCATCATTGAGTATTGTCCTAACTTCCCCAAATTCTTCTGAAGTAAACACATTTATTATATTATTGTTCTCCATATAACATCACCTCTCATATTTTTATTTATTCAAGGATTTTCTACACACCCTACATACATATAAATTTTTATATTCACTTATATCTTGTTCACCACCACAGAATATGCAACCATTTCTATATTTTTTAACAATAACATGACTTCCTGCATCAATAATTGTTACAAAATCTTTATCATTGATTTCATGCCTTTTTCTTATTTCCTTTGGTATAACTATTCTTCCTAAATCATCTAACTTTCTTATAATCCCTGGTCCAAACATATCAATCTCTCCTTTTATATATCATGTACTTGCTTGTACACTTATTTAATTTATTTATTTCAATCTATAATTATTAAGTACTGTTTTTTCTACTTCAACAATATAGTCCTTACACAATTCATAAATTCTAGACCCTACCCCTTCATCAAAATCAAGAAGCTTATCTACTGAAAATTCACTACTTACTATAATAGGCATAAAATTTAAATATCTATAATTGATGATTTCAAATATTATGTTAATATCACTTTCATTTACCTTCCCTTTGAAGAGGTCATCAATAAGAAGAATCTCACAAGTCTGATATTTTGAAATACTTCTTCTATAATATTCTTCATCAATCATGTTCTGTTTAATCTTTGTGATAACATCTCTGTAAGGCATATACATAACATCAATTTTTCTTTTTAAAAAGTTTATGGCGAGTGCTATAGTAAGATGACTTTTGCCACTACCAACCTGTCCACATAACATAATGCTATTTCTTCTCTTTTCTCTGATCTCATCAAACTCATTAAAATAAACTGTTGCAGTATCTTTCATATTTCCTGACGCTTCATTCCATACTTCAAAATTTGCAAATTTATAGTTAATCATTTCAGGATTAATACCACATGATCTCCAATGATCTTTAATCCTCTCCTTATTCTGACAATCACATTGAAGTGCCAAAGGCTGTGCATGATCCTGTCTTTTAAGAATCCATCCACTATCTCTACATCTATTGCATTTATATGAGGGCTGATCCAAGATTTTTTCTTTCTTCTTCCGTAAGCTCTCTGCATTTCTTTGGTTTGATTCCTTTAAATTGTTTTGAATCTGCTCTACTACCCTTTCCATTTGACTTTGCCCCATTGTTTATTCCTCCCACATCATCTTCTGGATACCCTTCTTTTCTCCAGTTTCTAAGTATTCCATTAATATATCTCATATTCCCCTTAGTCTTTCCAGTCTCTATAGCCTCATCAATTGCTTTTCTCACATTTTCCTCACCATGAGTAGATATGGCAAGCCTTAAGCTTCCAATGTCAAGACCTCCCATTATTCCAGTAACCTGTTCATAATGCTGCAATAACTTTATGGCCGCTGTACTCAAAATTGAATTGCATTCTTTTTCAGACTTAACTTTCCCAGTATCTCGAGAAGCATTTTTTTCATCAATTCCTTCGCTATTTTCAATCTCTATCTTATTCTGCTTCTTAGTCTTATTCTCTTTCTTATTCTGTTCCATTACTGTAATGTTACTTTGAATATCCGTAACATTACCTGTAATATCACAATTAATATCATTTGTAGCCCCTTTAAATTCATCCTGTATATCATCATTATTTTGTGTACTAATAATCTCAGAATTATTTTTATCTTCATCTATATTAATTTCTGTAACGTTCTTCTTGTTACTTTCTTCACTCTCTTTTTTCTTTGCCCTATGCTTGGCCACTCTATCACAATTTTGTTTCTTTAGTTTTTCTAACTCATCAACATTCTGATGCTTGGCCCAATTCTTTACTCTAAATATTCTATCTTCTGTTACTTCAAGCATTTCTAATTTTTTTAATACCTTAAATGCAAGTTTCACCTCTTCAAAAGCTCTATCAAATTCTATAGCCAGAGTTTTCATTGTATATGGCATTGATTCATTTATATATAAACATCCATTCATATTACTTTGACCTGCAAGTAATAAAGATCTCATCCATACATAATTTATCAAGTCCTTAGCTTCCATTGAATTTATTATCTTAAGTTTTGGATCATTAAACATATCAATTGCAATTTTAATCCACTTTGCATCTGCCATTATACTCACACTCCCAGCTATAAAACTTTTTAAACTGTGCTAATCCTTTAAATGATGGAGTAATTTCAATTAGATTACATACTAATATATAATAAGTAAAAATTTTAAAATCCATTGTGAATCCTCCAAAAACTTGTATCTGAACTACACTTTTTTTCATTAAATTTATCATTATTATCGTTGCTCACATATTCCAATAATTAAGACCTATCTTGGTTTCTTATAATATAAATTATATAACTACTCAAATTACAAATACTTTTAAACTCTTTGCACTTATCATGTTATATTCTCTCAATAATTCCTTCAGCTCCATGTTTTCTTTCTGCAACTCATTCTTTTCATTTTCAAGACGTCTTTTTTCTAATGGTGAAAATTTTTCTATCTGAATACCCTCTAGTTCTGCTATATATTTAGGATGAAACATCATTCCTGGAACTCCATTACATGGAGATAAAATCCCTTCCTTAATATATCTTCTTATAGTTCCTTCATCTTTCTGCCATCTTATGCTTAAATCTTTTACAGATAATAATTTAACATCCATAATACCCCTCAAACACATAATAATTTTTATATAATTAATCTACTTTAATATATTTCATACTAATAGAATATCTAAATATATTCATATTAATTATTCTCCTGTCGTTGCATTTTTGATATTTTAGTTTCAATAAAGATATCCAAGTCATTTTCTAACTCCAATTTTTCCACAATATGAACTATCTCCTTCAAAGTAAATTGTGTTCGATTATTTATCTTTGAACTTAAGCTCTGTTGAGTTATCCCTAATTCTAAAGCCATTTTCTTTTGAGTATATTTTTTCTCAATCATTTTCCCTTTTAACCTATATGAATCCATGAAGTTTCCTCCTTTCGTTGCATATTTATAAAAAGAATAATATCATTTAAGCAACATTAAGTCAACCTTATTTATACTTATTTGCAAATTTTTCACATTTTCTATTGCATATATGAAATAATATTTGATAATATATGTATAGGAGATGATTATATGAAACATATAGATAAAATTAATAGCATAGCTGAAAATGTAAAACATAGAAGAATTGAATTAAAACTCTCTTATCAGGATTTAGCATCTAAAACTGGATTAAGCAAATCAACATTGCAACGATATGAAAGTGGCGCAATAAAAAATATACCCTTAGATAAATTTCAGTTACTTGCAGATGCATTAGAAATTGATCCTGAAATATTGCTTGGACTGAATAAAGAAAATCTAGTTTCAACTAATAGAAATCTTACAAAGAGCGAAGAATTATTACTTGAAAATTTTAATAAATTAAATGATTCTGGTAAAAATAAACTTATAGAATATAGTAATGATTTAAACTGTAATATCAAATATATTTGTACTGATAAAGCAATTAATGCAGAGGTTTTTGCAAATAATTTCAATGAGATAATTAAAATTATTCATAATCTTTGTAACAACTTGGATGAAGGTGCTAATAAATCTGATGATAAAAAATAAACAAGATTATCGAAAGGATTTGATATTTTGGAATATAACATTACTTATAGAGAAAAAAATGCTGGTTTGCAGGCTATAATTTCTTATAAAACAGAACTTGGAAAATGGAAACAGAAAAGCAAACAGGGCTTCCCCAATTCAAGAGAAGGAAAGAGAAAAGCTAAAAAATGGGCAGATGAAACATTGCAGACAATAAAAAATAATCTTGCAAATGATATCAACCTAGATTATGAAAATATTACATGGAAAGATTTTTGTGACATCTATATAAAACATTTAACTGTACATATGCAGCCAAAAACAATACGTGCTTATAAACTCTCATTATTACATTTTGAGGATCTCAATGATATTGAAATTTCTAAGCTCAGGCCATTCCATATACAAAACTGTGTAGATGTCCTTGTACAAAGTAACTTAAAGCATAGCAGTATAAAATCATATCTTGCAAAAGTAAAATCAATATTAAATGCTGCTATAAACAAATATAATATTATCATTACAAATCCAGCAAGAAATATTATTTTTCAAGGAAATAAAGATCCATTGGATAAAAGAGCTCTTACAATTGCTGAACTTGAAGATCTTCTTATTAAAATGTCCAAAATAAAAGAATATCAAGAGTTTTATATTATGTCACTTTTCGCTGGTAAATGTGGATTAAGACTTGGTGAAACCATGGGAGTAAAATGGAGTGATATTGATTTTAAAAATAATGTTCTATTGGTAAGACAGCAATGGAAATTGCTTGATGAAAAAGAACATTACGGCTTTGGTCCGTTAAAAACACTTAATTCTAAAAGAGATGTTCCTCTTCCCCTTGCTGTAAAGAAAGCACTGATTCAATATGATTCACTAAAACCAAGAAATATAGATAATAGAGTTGTGCGCTTAAAAAGCGTTAATGGTGTAGGAAGTAATATTCAGAGGATCTTTAGAAAAGTTGGATATGAAATCAGCATCCATGAATTAAGACACACCTATGCTACTCTTTTAATATCAAATGGTATTGATTTTAAAACTGCTGCCCAATTACTTGGGCACACAGTTGAAATGACTATGAGAACATACAGCCATGTTACTGACGATATGATTCAAAAAGCTGCTAAAATAATTAATCAGATTATGTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP053292|2057449:2064291|2059913_2060561_-|WP_043853565.1|DBSCAN-SWA MLKRQDHAQPLALQCDCQNKERIKDHWRSCGINPEMINYKFANFEVWNEASGNMKDTATVYFNEFDEIREKRRNSIMLCGQVGSGKSHLTIALAINFLKRKIDVMYMPYRDVITKIKQNMIDEEYYRRSISKYQTCEILLIDDLFKGKVNESDINIIFEIINYRYLNFMPIIVSSEFSVDKLLDFDEGVGSRIYELCKDYIVEVEKTVLNNYRLK >NZ_CP053292|2057449:2064291|2058881_2059598_-|WP_043853041.1|DBSCAN-SWA MENNNIINVFTSEEFGEVRTILNDDGSISINAEDAARGLGWVQIKSGKVYVRWETVNAYLNELHFSQLVGKDDYIPESLFYLLGMKANNEAAQEFQKWLAVDVLPQIRKKGSYSISDQDMSPELKAIFCIDKRTLEITDRVEKLENNMTIDYSQQEELRTLAIKKVVAILGGKNTPAYKELNKKAFSSIWRDFKRVMDVNSYKNTSVKMFQAARKIIIEWQPDRELELMIKGANSVIK >NZ_CP053292|2057449:2064291|2062293_2062524_-|WP_033128322.1|DBSCAN-SWA MDSYRLKGKMIEKKYTQKKMALELGITQQSLSSKINNRTQFTLKEIVHIVEKLELENDLDIFIETKISKMQRQENN >NZ_CP053292|2057449:2064291|2057449_2058688_-|WP_033127508.1|transposase|DBSCAN-SWA MTKKIDTNFDYNEEIKKCKTIDDVMGKNGLIQKLVKDVLENILEGEMEEHLGRNKYERTESNNQSNRNYRNGYSSKNLRSSFGDVDLDVPRDRNAEFEPQIIKKYETVCTELDKKIISLYAKGMSTSDIQSEIEDLYGIKISPSMVSKITDKVLASATEWQNRALDKIYPIVYLDAMYFKVRSNGKIINKAVYICLGYTMDGYKDILGIWVDEAEGAKFWLGICNDLKNRGVKEILIACMDGLKGLPQAIKTVFPSVNIQTCIVHQIRNSIKYIASKDKKAFMKDLKEVYKASTEELALAQLDNLKSLWGDKYAIVIDSWYNNWSNLSTFFDFSPSIRKMIYTTNALEGFNRQIRKFTKVRVIFPTDESLNKCVYLATMEIIEKWSQPTPNWGATLAELSIIFEDQLKDELA >NZ_CP053292|2057449:2064291|2062677_2063160_+|WP_033128321.1|DBSCAN-SWA MKHIDKINSIAENVKHRRIELKLSYQDLASKTGLSKSTLQRYESGAIKNIPLDKFQLLADALEIDPEILLGLNKENLVSTNRNLTKSEELLLENFNKLNDSGKNKLIEYSNDLNCNIKYICTDKAINAEVFANNFNEIIKIIHNLCNNLDEGANKSDDKK >NZ_CP053292|2057449:2064291|2060589_2061660_-|WP_043853042.1|DBSCAN-SWA MADAKWIKIAIDMFNDPKLKIINSMEAKDLINYVWMRSLLLAGQSNMNGCLYINESMPYTMKTLAIEFDRAFEEVKLAFKVLKKLEMLEVTEDRIFRVKNWAKHQNVDELEKLKKQNCDRVAKHRAKKKESEESNKKNVTEINIDEDKNNSEIISTQNNDDIQDEFKGATNDINCDITGNVTDIQSNITVMEQNKKENKTKKQNKIEIENSEGIDEKNASRDTGKVKSEKECNSILSTAAIKLLQHYEQVTGIMGGLDIGSLRLAISTHGEENVRKAIDEAIETGKTKGNMRYINGILRNWRKEGYPEDDVGGINNGAKSNGKGSRADSKQFKGIKPKKCRELTEEERKNLGSALI >NZ_CP053292|2057449:2064291|2061637_2061775_-|WP_169512798.1|DBSCAN-SWA MDFKIFTYYILVCNLIEITPSFKGLAQFKKFYSWECEYNGRCKVD >NZ_CP053292|2057449:2064291|2059619_2059859_-|WP_033128325.1|DBSCAN-SWA MFGPGIIRKLDDLGRIVIPKEIRKRHEINDKDFVTIIDAGSHVIVKKYRNGCIFCGGEQDISEYKNLYVCRVCRKSLNK >NZ_CP053292|2057449:2064291|2063187_2064291_+|WP_043853043.1|integrase|DBSCAN-SWA MEYNITYREKNAGLQAIISYKTELGKWKQKSKQGFPNSREGKRKAKKWADETLQTIKNNLANDINLDYENITWKDFCDIYIKHLTVHMQPKTIRAYKLSLLHFEDLNDIEISKLRPFHIQNCVDVLVQSNLKHSSIKSYLAKVKSILNAAINKYNIIITNPARNIIFQGNKDPLDKRALTIAELEDLLIKMSKIKEYQEFYIMSLFAGKCGLRLGETMGVKWSDIDFKNNVLLVRQQWKLLDEKEHYGFGPLKTLNSKRDVPLPLAVKKALIQYDSLKPRNIDNRVVRLKSVNGVGSNIQRIFRKVGYEISIHELRHTYATLLISNGIDFKTAAQLLGHTVEMTMRTYSHVTDDMIQKAAKIINQIM >NZ_CP053292|2057449:2064291|2061904_2062207_-|WP_033128323.1|DBSCAN-SWA MDVKLLSVKDLSIRWQKDEGTIRRYIKEGILSPCNGVPGMMFHPKYIAELEGIQIEKFSPLEKRRLENEKNELQKENMELKELLREYNMISAKSLKVFVI |
10 | Clostridium_phage(25.0%) | transposase,integrase | attL 2057397:2057410|attR 2064292:2064305 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2629994 : 2671033
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP053292|2629994:2671033|DBSCAN-SWA TCTATTTATCTTTTCCTGTCTGTTTTATAAGCTGATTAGTATATACTGTAGCTCCTGTAACCAATACTCCTTGAATTACTGCATTAGCATTTACTCCGATAATTCCCATACTTCCTGCAATACCAAAAACAAGTAGTATTAAAGGTATATATTTATCACTTATTTTATCAGTATTCTTTATAATCATTCCAATTATATAAAGAACAGGTATTAAGATAAGTGCATTCTGTGTGATATATTGTGATACATCCATAATTATCACCACACTTTCTTTTGTATATTTATTACAGTTTCCTGTGCTATATTATATGAATAATACTATACTTGTGTTAACTTATTATTTATTCTTTATATTTAAATAATATTAATAAAATGCTATAATTATATATATGTTAACTATTATGAAAGGGGTATTTATATGACTATTATAGACATTCTTCTTGAACATATTCATGATAAAAATCCATATGAAAGACAAGCTTTAGAAATTATACGTGATTCGTATATAAGTTCTGTAAATGATAATTATACATTAATTGTGGATCCAAATGGAGAATTGCTTGTTAGAATACCAAGCATGGAAAAACGTGATGAATTTGTATACAATAAACTTACTGAATACAGTTATCCACTGATAATGTGTATGAACATAGACGAAATAAATAACACTGAATATTATTCATACATAAAAGCTAAATTCTTGGAATGTTATAAGGACAAGCTTCATGTTTTTTTCAAGGATGTTATTACAGTAAACAAATTAAAAGATGATATAGTAAAAACAAAAAAGAAAATTGAATATATCACATACTTTACAATTATTGGTGTAATTTTAAGTGGACTATCTTTATGTATTTTTAATGTTGAAAATACAACTAAATATATACTTGCCATAGGAATTATTTTACTTTTTGGATGTGCACTATATCTTCAATTAACAAAAGAAAATACAATAAAAAAATTAATAGATGGATATATCTCAACAATTTACACAGACTGGTATAATACTGTTTTAAGAAAACATTATACTTTTTTATGCAATTTTATGGGGTAATGTTTTTTTATATTATTAATACTTAAATTTTATTATTTGAATTTATTTTAATATTTTTCAAAATTAAAGTCTGTTTATCAAAATTTCATATAATTTTGATAAACAGACTTATTTTTTAACTATATATAGACTTTTAAAAAGCACCATAAATACACTTATATTTTGTTTATAAACACCACTTAACTATAGCTTTAAAACCTTTAATATTCTCTTCTATATTTCCTTTAAAAATTCCAGAACCAGAAACTAAAACATTGGCACCTGCATTAATTACTGACTCTGCATTGCTAAGCTTAATCCCACCATCTACTTCAATATCAATATTTAAATTTCGTTCATTAAGCTTTTTTCTTAGTCTAGATATCTTATTAGTCATTGTTTCTATATATTCTTGACCTCCAAAACCCGGATTTACAGTCATTAAAAGAATCATATCCAAATCTTCCAATATATACTCTAAAACATCTATATTAGTTCCAGGATTTATGGCTACACAGGCTCTTTTCCCACATTCTTTTATCTTCTGAATGGTTCTATGAATATGAGTACTCGCCTCTGCATGTACTGTTATAATATCTGCTCCTGAAAGCGCAGCTTCTTCTATATATTTGTCTGGATTCTGAACCATTAAATGAACATCAAATATCATTTTAGTATATTTTCTTATACTTTTTATTACAGGGAATCCCAATGATATGCTTGGAACATATAATCCATCCATAACATCAATATGAACATAATCTGCGCCTGCCCTATCAATAATTTCTAGTTCAGAACCTAATTTCGAAAAATCTGCTGATAATATTGAAGGGGCTATTTTTATAATATTACTTGTTTTTGAATTACTTATATTCATATTATTTACCAAATGCGTTTCTATAGTCTTCTTTGAATTTTTCAATTCCCTTATCTGTCAATGGATGTTTTATCATTTGAACTATCACATTGTATGGAATTGTAGCTATATTAGATCCAGCCTTTGCACAATCCAATATATGAATTGGGTTTCTTACACTTGCTGATATTATTTCAGCATCAATATCATGAATTGCAAATATTTCTGCAATATCTTCTATTAATTTAATTCCTTCACTTCCAATATCATCTAACCTTCCTAAGAAAGGACTCACATAACTTGCACCAGCCCTTGCTGCAAGAAGCGCTTGTACTGCTGAAAATATTAAAGTCACATTTGTTTTGATTCCCTCCTTACTTAATACTTTAACCGCCTTTAATCCTTCTTCACACATTGGAATCTTAACTACCATATTTTCATGAATTTTCGCTATCTCACGCGCTTCTTTAATCATCCCTTCACATTCCATTGAGATAACTTCACCACTTATAGGACCATCTACTATACTTGTTATTTCCTTTATAACCTCATTAAAGTCTTTTCCCTCTCTTGCAATAAGAGATGGATTTGTTGTTACTCCACATATAACGCCTAAATCATTAGCTTTTCTTATTTCATCAACATTAGCTGTATCTACAAATATTTTCATTATATAACTCTCCTATTCATATCTCGTGTACCCACTTGTACACTTTTTTATTTAATAATTTCTTTAATACTTTCTGATATTGCATCACTTGTAAGCTTAAATTTCTCCATAAGCTCATCAGGTGTTCCTGATTCTCCAAATTTATCTTCAATTCCAATCATCTTTACTTTACATGGATATTTATCACATACAACAGAAGATACCATAGATCCAAGTCCACCTATAATAGAATGTTCTTCTGCTGTTACAATACCTTTAGTTTCCTTTGCTGCTTTTATAATAATCTCTTTATCTATAGGTTTTATTGTTGATATGTTTATAACGCGTACATGTATTCCTTCTGATTCAAGGTATTTTGCTGCTTCAATTGCTTTTTGAACCATCATTCCAGTAGCAATTATTGCTGCATCATCACCTTTTTTAATTTCAGTTCCCTTTCCAATTTCAAATTTATAGCTATCATCAAAAATATCTTCTGTATTGCATCTTCCAAATCTCAAATAAACAGGTCCTTCCATCATAGCAGCTGCCTTAGTAGCTTCCATTGCTTCCCTGTGATCTGCTGGTACTATAACTGTCATATTAGGTAGTGAACACATCAGTGCAATATCTTCAATAGATTGATGAGATCCTCCATCTTCTCCTACAGTTATCCCTGCGTGAGTCGCAGCAATTTTAACATTAGCTTTTGGATAACATATTGAATTGCGTATTATTTCAAATGCTCTTCCAGTAGCAAATACTGCAAAAGTGCTTGCAAAAGGAACTAGACCAATATTAGACATTCCAGCTGCCATCCCCATTAAATTCTGTTCTGCAATTCCAGCATTGAAGAATCTATCTGGAAATTCTTTTTTAAATCCATTTGTCTTTGTAGACTTTGAAAGATCTGCATCTAACACTACAATATTTTTATTTTCATAACCAATTTGAATCAATGCTTCACCATATGACTCCCTAGTTGCCTTTCCCATGATAAAACCCTCCTTAAAATTATGCTAAAATCTCTTCTATAGCTCTATTTTTTTCTTCTTCATTTGGTGCCGCTCCATGCCATTCAACTTTATTTTCCATAAAACTCACACCTTTCCCTTTAATAGTTTTGGCTATTATAACATTGGGCTTATCTATGCATTTTTCTGCTTCTAAAAATGCCTTATTGATACTTTCAAAATCATTTCCATCATTACAAGAGATTACATTCCACCCAAAGCTTTCAAATTTTTTGTCTATTGGGTTAATAGTAATTACTTCTTCATTTTTTCCATCTATCTGCAATCCATTATTGTCTATAATAGCAATTAGATTATTAAGTTTGTAATGTCCTGCTGCCATAGCAGCCTCCCATACAAGACCTTCTTGAAGCTCACCATCTCCAAGTAGAACATACACTTTTGATTTTTTTTCTAACATTTTAAGTCCTAATGACATTCCAACTGCATTAGAAATTCCCTGTCCTAAAGATCCTGTAGATACATCTATACCATTAATATGTTTAGAATCTGGATGACCTTGTAATAAGCCACCAATTTTTCTCAAACTCATAAGTTGCTCTTTATTAAAGTAACCTTTCTCAGCTAGCACAGAATAAAGTGCTGGCGCTGCATGTCCTTTACTTAAAACAAATCTATCACGGCAGTCATCTTTTGATTTTTCAGGACTTACATTCATCTTTTCATAATATAGATATGTTAGTATTTCTGAACAAGATAATGATCCTCCTGGATGTCCAGACTTTGCTTCATAGATCATTTCTATAATATTTTTTTTAACTTGCTTTATTACTAAATCTAATTTGCCTTTATCCATAAATCACTCAACCTTTCATAACATACATGTTGATGTTAATTTCTTTTAGTATCTAGATAATTAAACAGCTTTCATATTTTCACATAAAGCTTTTCTAAATTTATCATCAATAAAATATTTAGTTTCTTTAATTACATCTTTCCAATCATCATTGCCTGTATACCAAAATTCTACTGTAAATTTTCTTACACCAAGATCCCATGACTTTTTTATAATTTCTTCAAAATTAACATGTCCTTTTCCAAAAGTAACTTCTCTAAATTTTCCCGGAACAGTTTCCTTTAAATGAACAGCAGCTATATGTCCTTTTCCAGATTCAAAATCTTCACTAGGCGTAAGTCCATATTCCAAAGCCGCATTAGTCACATTTCCGCAATCAGGATATATCTGAAGATATGGAGAGTTTATTTCTTTGACAAACGTCATCGCCTTTCCAACAGTATTCATGAATTCTGTTTCCATTGTTTCAAATGCAAGAATAACACCTTTACTAGCTGCCATTTCAACTGCCTTTTTTAAATTTTCCTTAAAGTGTTTTCTTGTAACTTCATTTCCTTCTTCATAATAAACATCATATCCTGCAAGCTGTATTATCTTTATTCCAAGGTCATCTGCAAGCTCAATTGCGTTTT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MIFGYARVSTVEQNLYRQIDALKEAGADEIIEEKMTGTKADRPQLNRLLDKLRTGDIMLVADLTRLSRSTKDLFDLVEKIEKKGANIKSLKESWLDTTTPQGKLMFTLIAGISEFERELISQRTKEGLAAARARGRKGGRKEKLDDTKKKAIYDLYVQKNTRIMDICDMFEITKPTLYKVVKEISEKSGK |
46 | Clostridium_phage(74.07%) | capsid,plate,holin,integrase,portal,terminase | attL 2625748:2625763|attR 2672744:2672759 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_9 |
2677465 : 2684146
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP053292|2677465:2684146|DBSCAN-SWA ATCATTCCCATCCAAGCATCTTTTTCTCTAAGCTGTCATAATCATATTCTCTCGGCTTAAAATTATTAAATCCTGTAGGTTTTAAACTTTCTGACTGTTTATAATTGCAATCTGATCTATTTTTAAAATTATCCTCAAGTACCTTGAGAAAATTATTAGGTCTTATAAACCAGTCAAATGTTATAGTCCAATTATTTTTATTCTGGCCTTTCAAGAAATTACTTGATCTAATATTTGATATAGCCTTTAAAATATTATCAATTCCGTACTCCTTAATCCTAGCTCTTAATAATTTATGTCTTGTTGTTCCAGCATTAACTGAAAAAATCTTTTGTAAATTCAATGAATTCCATGCATGTACTATTTGTTGCACGTCAGTGCTACATACTATATCTTTAGATATAGTATTATCTAATGTATTATTAATTGTATTATTAAGTACTGTATTATTATCTTTGACGTTTTTGCGTATAGGGGTATGCTCAATTTTGCTTAAACCCTCCTCACATTCTTGCTTATAGGTATGCTCATTTTTGCGTATAGGTGTTGCAGAATTAATATATATCTTTCTTCCTACAATTTCCTTACCTTCATATACAAGTTCTACGTTTATATACCCTTCTTCATTTAGGTTTTTAATTAGCCTTGATATAGTAGATTTACTAACCTCATACAACTCAGCAAAGTATGAATTTGAAGCCCAGCAGTAACCTTTTTCATTTGCTAGAGCTGTTAGTTCCCCATAAAGGAGTTTTGCTTTATCTTTTAAATTTTTGTTATATCTTACGTCTGCTGGGATAACAGCATAGTATGCTCTTTTTTCTTCCATATGTGCTCCTCCTTTATCAGTGATGAAACCATAAATAAGTATTAATATTAATCTTGTAAGCTTTCTTAGGTTTCAATGTTGATTCTCCATAACAAATTTCATTTACTTTTTTTAATTGATTGCTATAGTCATTAGTATTAATTTCAATTTTAAGAATGTTCTTCTGACCTTTAAGATATATTTCTAAAGTTCTATGTTTAAGCTCTATTTCACATACTCTAAAGCAACCCTTTATATAAGACATATTAATTACTAAATCTATTTTTTCTGACTGCGTAATCATTTCTTTTAACTCGTCAATTTTATTTTCAATTTCATTAACTTCTGTTTTTATTTCTTTTTTCTGTTCAGTTTCATCAGCATTTTTCGCACAATCAGATACAACAATGCAACTCTCTGAATGTGATTCAGAATACATTTCATCAATCAATTGTTTATCATGCTTGTTTTCAACTGGCTGCTTTATACCATTAATAAGTGTTTCAACTTCTTCCTTATGCTCCTTACAGTTAAGGTCTTTAATTTCATCATTAATTATCTCCTGCTCTTCTTCTGTAAGACTACTAAGTGTATGTGCCTGTGTAACTGTTATATCTTCGCTATTAAGCTTTTCTTTAAGTGGTTCAATTAAATCCTTATCTATCTTTTGATAACGTCCAACTTGGACTCCTGAGATTCCTAAATGCTTACCTATAAGATCTCTTGTCTTTCCTTGAAGCTTTTCACCACTTTTTCTCTTCTCTGTATATATCTCTTGCAGTCTTTTTATTCCCTGCATCTTTTCCTGTAAATTTAATTCTCTTTGTTGCATATTTGCCTGTATAAGCATTACCTCAGCATCTAACTCTGTAACGTCATCTTTTACAATCCGGCATGGAACTTTTTTATAATCAATTTCTCTAAGTGCTCTAAATCTTCTTTCTCCTGAAAGAATTTCATATTTACCATCATTTCTTTTTCTTACAACCACATTATGCATAAGTCCATATTCTTTAATAGATTCTGCAAGTTCTTCTATTTCTCTTATTCCATAAAAGTTATTTTCAGAAGGAACTAGAAGGTCAATATCTAGCTCCTGTACAAATCCATCATCTGTATTATTAATATTATTAACTCTACTTGCTATACCCTTTAAATAAGACGACATTGCATTTCCTCCACAAATTTGATATAGTCCTTAGATGCATTAGCATTTTTATTCATGTAAATAACTGGCTTAGATTCAAATGTGCTTTTAATAACATCTACGTTATCTCTAATTGTCTGTTTAAACATTAAGTCTCCCAGCTCTTCTTTAAGCTCTCCTTTGATTTCTTTATTAATCCTTGTAGCTTTATCCATTGTTATTAAAATCCCTAAAACATTTAAGTTTGAATTAAATTCTTCCTTAACTTCTTGTATACTGCTCATAAGATATTCAAATCCATCTAAGGAAAACTTGTCTATTTTAAGTGGTACAATAACGTAATCACTTGCAACTAATGCATTTATAGATAACATTCCCAAACTTGGTGGGCAGTCTATTAAAACATAATCAAAAGTGTTAGTACTTTTACTTTGAAGCCATTTCTTTATGCGTGTTTCTCTTGCTCTTTTCATATCTGAAATTATTTCAGATTCACTCATTATCAAACTGATATTGGCAGGTATAAGCCACACATTATCAAACACAGTTCCTTGTACAGCAACATCTTCACCATTAAGAATTTCATATGTTCCTTTTAAATTAGGATTATACATGTGGAGATTCTTTGTTGCATTGCTCTGCGGGTCCATATCTATAATTAATACTTTTTTACCTTCTCTCCCTAATTGTGCAGCAACATTAACACAGCTAGTTGTCTTAGCAACTCCACCTTTTATATTTAAAAAACTTATTATTTTCATTCTTTACATCTCCTTTAATATGTCTTATAATGGAGATACGGATTGCAGTCCGTATCATAAAATTAGGTAACAAACATTTTATTGAACCTTTACCAGAAGGTTCTTTTCTTTTGCCAGAATTACTTGTGCAATAGCTTTCTGCAAATCTTTAGCTTTACAGCTTATAACAAAGCTTCCCATCAATCTCACCTCCTTCAAATAAAATCAAGGTGCTATTCATTTTCTGTTAATTTGATTATAGTTTTTAATAATTCATGTACTTCTTTTGAACTATATTTTTTTTCTGTCATTTCTTTATCATCTTGTACTTCACATACTCCCCTAAACCAACCTTCTGCTGTATATAGAGCGTATTGTGGATATGAATCCTTTTTAATGAACTTAATTAATTCTTCCATGTTAATCCTCCTACCATGTATTTTAAATTTCTCTATGTTCTTTAGATACTTTATCTAACCATTGAGTTAATAAAGCCTTATTTATAAGAACCTTGTTTCCATTCTTAAAAAATGGAAAATCAGTATTAGGCTTAGCGATTAATTCTCTTATCTTATCTTTATTTACATCCATAAACTGTGAACACTCTAAAACAGTTAAAGTCGCCTTCTCTTGTTTAGGTACTCTTAATGCATCCCTTATTTCTATTAAAATTTCTTCCATAATGTGACCTCCTTAGTAATTTCCTAGTTTTTCGACCGCTATTATTAATTCAGTTGTAAGCCCTGAGAGTTTCTTTAAATTAGTTACTATATAATCAATTGATGGTTTTTCATCCTCTGTTATTTTTCCATCTGCTATAACATCAAGCAACATTTTACTCATTTTGTTTTCTGATCCAAGCAAATTAAAAATTCCTATTGATAGTTTGTAAATATTATTGATGTTTTCTTGGCTTACTGGACTTATAGTAAGTTTTCCTATTGGACATTCATTGCAGCAATAATAATTTAAAAGTTCAGACGCATTATATACATCTGCCATCTTACAAACAATATCTACTGGTATTTGTTTACAAAGCCCTAACTCATAATTTAATAATGAGTCTTTGCTTACTCCTAAAATTTCGCTTGCACCTTCCATACTCTTAAATTTTTCATTAAATTCTGCTGCTTGTTTTCTTGCTACTCTATAAGCTGAATTATTGTTTTTTCCTTTTACCATTATTGTTTCCTTTCTCCCATTCCTCTTTTTATTTTGCATGTTTTAGCCTTACTTCATTTTTATTTAAAACATTATTTTTCAATAATATATGTAATGAAATTACATATTTTAAAACAAAAATCGGACTAGCTTTCTATGTTGTATCCAAATTATGTATTGTATAATCAAATTAACTCATAGTTGTTTTATTCTACAAAAAAAATTTCCTCAATTGTTGTTTTATAAAATTTGGATAAAAGATATGCTACTTCAATAGATGGTTTGCGTTTTCCAGTTTCAAGCATCCCATAATAGCTTGTTGTCTTATTTATAGCCTTTGCTACTTCTTTTTGAGATAAATTATTTTTATTTCTAAACGATAGTAGTTTATTATTCAATTTAACACCTCCAAACAACTTTAAGTTGATTACTATATTTTTATATTACACAACTAAAAGTTGTTTGTCAATATAAAAAACAACAATTTGTTAAACTTATTTTATTTTACAACTCAAAGTTGTATAATTAGATAAAATATCGTTAGAGATGATTTATAATCCTCTTAAAAGATATTTATTATATTAATAAAGGTGATTTTATTATGTTGTTACAAGATAGATTAAAAGAACTTAGAACAGGAAAAGGTTTATTACAAAAAGATATCGCAAAACTCCTTAGTATAACGGCAAGTGCTTATGGATATTATGAACAAGGAAAGCGTGTTCCAGATTCCGATACTATAAAAAAATTAGCTGAATTTTATAATGTATCTTTAGATTATTTAATTGGTAATTCTGATATAAAGGAATCAGCTGATAAAATAATAGAAAAAGAAACTTTAAATATCCCAAAAGAATATAAAGATAAATATAAAGTAACTTCTAGAGATAAAAAACAGTATCTTGAAGAAATGAAAAAAGCTAATGAAGCATTTTTTATGAATGATGAACTTAATGAGGAAGCTAAAAAAGAAATGTTAGACTTAATGTCTGAATTATTTTGGGAAGCTAAATCTCTAAACAAGAGAAAAAAGTAATAAGGTGGGGATTTAGTGATAGATTATAAAAAGAAGGTTAAAAGCCTCATAAGAAAGTATAAAACTAGAGACCCTTATACTATAGCCAAGGAGCTTGGGATTATAGTTAAATTAGTAGAACTATCTCCCTATTCTCCAAAAGGCATATTTAAAAAGGTATTGAGAAGAAAATTTATTATTATAAATATTACTAGGGTAACAGATGAATTTGATTTTAGAGCTGTTATGGCTCACGAATTAGGACATGCAATAAGGCATTGTAGTGATTCAACATTTTTCTTACATGACCACACCTTATATAGGCGTGGAAAATTTGAAATAGAAGCTAATGAATTTGCTGCTGAATTGTTAATTGATGAAACTAAAATTGAAAAATTATATTTAGAGAATTTTTCAGCAGAGCAACTAGCATGTGCTTATGAAGTTTCTGCTGAATTAATTAAATATAAATTCACATGTAAATAAAAAAGTGTTCGTCATGAACACCTTATAATAAAAATAAAATTTGTTAATAATAACTTTAGTGTTCCAGTTGCTTTTAGTAGACTGGTTATTTTACAAACAAAAAAGAACATACATTCTCGTTGTAAAGGAGTGATTTTTTGGCAACAAAGACAAACTACACAACAAATGGTAATGATTATTATAGAATCACAATTGATATTGGAATAGATGCAAATGGAAAAAGAATCCGCAAAACCTTTTATGGAAAAAGTAAAAAAGATGCTGAACAAAAGAAACAAGATTATATAAACAAAATGAATAGTGGCATTAAAGACACCAAAACTTTATGGCTGGCACAAACCATGAAAAGCTGGCTATTTGAAGTTGTTAAAATGTCTGGTAATATAAAACCTACCACATTTGCAAGATATGAAGGTTTGTATAGAAATTATATAGAAAATTCTCCTATTGCTTGTATAAGCCTAGATACTTTACAGCCTATTCATATACAAAGATATTATAATAAACTTTTTAAAAACAATAAAAGTAGCAATCAAATTAATTACATTAATAAATTTTTGAAACAATTTTTAAATTATTCTGTTGATTGTGGTTATATGCTCAGAAACCCTTGTGATGGTAAAAAAGTTGTTATTCCTAAAAAAGAAGTTAAAGAAGCCCCTAAAAAAGATGTACCTGTTTTTAGTGATGAAGATCTTAAAAAGATTATTACAGCCCCAGATAGTAAAATAAAATATATTTCTTTAATTTCTCTAGCAACTGGCATGAGACGTGGTGAAATTATTGGATTAAAGGAATCAGATATTTCCTATAAAACAAATGAGATTTATATAAGAAGAACTGTTGCAACTACAACTATATTTGATTATGATAATAATAAGAGTAAAAAAACAATAGTACAAGAACCTAAAACTAAAAATTCTGTTAGAGATATTCATCTTCCAAAATCTTTAGTTAACATTATAAAAAAATCAATTAGTCTTAAGATTGAAGAAATGAAAAAAGCTGGAGATAGTTACAATAAAGATAACTTGGATTATATATTTCTAAGCGAATTAGGGAATCTTATAAACGCTGGTAATTTAGATAAAACTTGGGCTAAATTTTTAAGAGAATTGGATATACCTCATAAAAAATTCCATGCCCTTAGACACACATATGCAACTAAACAATTTGAAGCTGGCAAACCCCTTAAAACTGTATCTATTCTTTTAGGACATAGCAGTATAGAAATAACTGCAAATACTTATACACATGTATTAAAAAAAGAAAAAGAAAGTGTTTTAGATGTCCTTAATTCATTAGAAAATGATACTATAATATAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP053292|2677465:2684146|2680852_2681341_-|WP_043853236.1|DBSCAN-SWA MVKGKNNNSAYRVARKQAAEFNEKFKSMEGASEILGVSKDSLLNYELGLCKQIPVDIVCKMADVYNASELLNYYCCNECPIGKLTISPVSQENINNIYKLSIGIFNLLGSENKMSKMLLDVIADGKITEDEKPSIDYIVTNLKKLSGLTTELIIAVEKLGNY >NZ_CP053292|2677465:2684146|2681921_2682356_+|WP_043853238.1|DBSCAN-SWA MLLQDRLKELRTGKGLLQKDIAKLLSITASAYGYYEQGKRVPDSDTIKKLAEFYNVSLDYLIGNSDIKESADKIIEKETLNIPKEYKDKYKVTSRDKKQYLEEMKKANEAFFMNDELNEEAKKEMLDLMSELFWEAKSLNKRKK >NZ_CP053292|2677465:2684146|2679424_2680180_-|WP_043853233.1|DBSCAN-SWA MKIISFLNIKGGVAKTTSCVNVAAQLGREGKKVLIIDMDPQSNATKNLHMYNPNLKGTYEILNGEDVAVQGTVFDNVWLIPANISLIMSESEIISDMKRARETRIKKWLQSKSTNTFDYVLIDCPPSLGMLSINALVASDYVIVPLKIDKFSLDGFEYLMSSIQEVKEEFNSNLNVLGILITMDKATRINKEIKGELKEELGDLMFKQTIRDNVDVIKSTFESKPVIYMNKNANASKDYIKFVEEMQCRLI >NZ_CP053292|2677465:2684146|2682371_2682821_+|WP_043853239.1|DBSCAN-SWA MIDYKKKVKSLIRKYKTRDPYTIAKELGIIVKLVELSPYSPKGIFKKVLRRKFIIINITRVTDEFDFRAVMAHELGHAIRHCSDSTFFLHDHTLYRRGKFEIEANEFAAELLIDETKIEKLYLENFSAEQLACAYEVSAELIKYKFTCK >NZ_CP053292|2677465:2684146|2681526_2681718_-|WP_043853237.1|DBSCAN-SWA MNNKLLSFRNKNNLSQKEVAKAINKTTSYYGMLETGKRKPSIEVAYLLSKFYKTTIEEIFFVE >NZ_CP053292|2677465:2684146|2677465_2678293_-|WP_043853231.1|DBSCAN-SWA MEEKRAYYAVIPADVRYNKNLKDKAKLLYGELTALANEKGYCWASNSYFAELYEVSKSTISRLIKNLNEEGYINVELVYEGKEIVGRKIYINSATPIRKNEHTYKQECEEGLSKIEHTPIRKNVKDNNTVLNNTINNTLDNTISKDIVCSTDVQQIVHAWNSLNLQKIFSVNAGTTRHKLLRARIKEYGIDNILKAISNIRSSNFLKGQNKNNWTITFDWFIRPNNFLKVLEDNFKNRSDCNYKQSESLKPTGFNNFKPREYDYDSLEKKMLGWE >NZ_CP053292|2677465:2684146|2678309_2679440_-|WP_043853232.1|DBSCAN-SWA MSSYLKGIASRVNNINNTDDGFVQELDIDLLVPSENNFYGIREIEELAESIKEYGLMHNVVVRKRNDGKYEILSGERRFRALREIDYKKVPCRIVKDDVTELDAEVMLIQANMQQRELNLQEKMQGIKRLQEIYTEKRKSGEKLQGKTRDLIGKHLGISGVQVGRYQKIDKDLIEPLKEKLNSEDITVTQAHTLSSLTEEEQEIINDEIKDLNCKEHKEEVETLINGIKQPVENKHDKQLIDEMYSESHSESCIVVSDCAKNADETEQKKEIKTEVNEIENKIDELKEMITQSEKIDLVINMSYIKGCFRVCEIELKHRTLEIYLKGQKNILKIEINTNDYSNQLKKVNEICYGESTLKPKKAYKININTYLWFHH >NZ_CP053292|2677465:2684146|2680600_2680840_-|WP_043853235.1|DBSCAN-SWA MEEILIEIRDALRVPKQEKATLTVLECSQFMDVNKDKIRELIAKPNTDFPFFKNGNKVLINKALLTQWLDKVSKEHREI >NZ_CP053292|2677465:2684146|2682958_2684146_+|WP_043853240.1|integrase|DBSCAN-SWA MATKTNYTTNGNDYYRITIDIGIDANGKRIRKTFYGKSKKDAEQKKQDYINKMNSGIKDTKTLWLAQTMKSWLFEVVKMSGNIKPTTFARYEGLYRNYIENSPIACISLDTLQPIHIQRYYNKLFKNNKSSNQINYINKFLKQFLNYSVDCGYMLRNPCDGKKVVIPKKEVKEAPKKDVPVFSDEDLKKIITAPDSKIKYISLISLATGMRRGEIIGLKESDISYKTNEIYIRRTVATTTIFDYDNNKSKKTIVQEPKTKNSVRDIHLPKSLVNIIKKSISLKIEEMKKAGDSYNKDNLDYIFLSELGNLINAGNLDKTWAKFLRELDIPHKKFHALRHTYATKQFEAGKPLKTVSILLGHSSIEITANTYTHVLKKEKESVLDVLNSLENDTII >NZ_CP053292|2677465:2684146|2680392_2680578_-|WP_043853234.1|DBSCAN-SWA MEELIKFIKKDSYPQYALYTAEGWFRGVCEVQDDKEMTEKKYSSKEVHELLKTIIKLTENE |
10 | Clostridium_phage(57.14%) | integrase | attL 2680415:2680429|attR 2684905:2684919 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
3153872 : 3217945
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP053292|3153872:3217945|DBSCAN-SWA 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58 | Clostridium_phage(21.43%) | protease,coat | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_11 |
3676094 : 3682730
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP053292|3676094:3682730|DBSCAN-SWA CATGAATAATGAAATAATACAGATAGATATAGATAAAGTGATTCCCAATATATATCAACCACGTAAATATTTTAATGAAGAGTCTATTGAAGAATTATCCGAGTCAATTAAACAATATGGAATAATTCAGCCACTTACAGTCAGAAAAAGAGGGGATGTTTACGAATTAGTTGCAGGTGAAAGAAGACTTAGAGCAGCTAAATTGGCTAATTTAAATAAGGTTCCTTGTAATATAGTAGACATAACAGATACAGAGTCTGCTGAAATTGCACTATTAGAAAATTTACAGAGAGAAGATTTAAATTATATTGAAGAAGCAGAAGCATATTATAATTTAATACATGATCATAGTTTTACTCAGGATGAGTTAGCAAAAAGGATGGGAAAAAAACAGTCTACAATTGCTAATAAGTTAAGATTATTAAAATTAAGTACTGAAGTTAGAGGAATATGCTTAAATAATAAATTAACTGAAAGACATGCTCGATCACTACTTACTCTTCCAAATGAAGAGTTACAACTAAAAATAATTAAAAAAGTAATAAATGACGGATTAAATGTAAAAAAGACAGAGGAATTAATAAATAAAGAATTACTTAAAATTTCTAGCGAAGAATTAAAGAAAAAGAGAAAAAATACCAAAAATGTACTTCCAGCAAAATTATATGTTAACACTATAAAGCAGGTTTTTGAAAAATTCGATATACCAGCAGAGTATGGATATAAAGATGAAGAGGAATTTTTAGAGCTAACAATAAAGATTCCAAAACCAAAGAAATAGATAATTTTATTTTTATAAGGCACAGAATTGTGCCTTAATTTTTTCTCATAAAAATGAATAATATTTTTATTGTGAAATACAATATATTTTTTAACCAATTTAAGACTATTTATTCTTTTTTATAACATAATTCTTTTATTATGGGACAAATATATATATAATATTAATATATGGGAAGGGGGGAATGCTCTTTTTGGGCTTATAATTATGAAGACGATATGTATTTTCAATCAAAAAGGTGGAGTTGGAAAAACTACTACTAATATAAATTTATGCTCTTATTTAGCAATGGAAGGTTTCAAAGTTTTAACAATAGACATAGATCCACAAGGGAACACAACAAGTGGATTAGGTATAGATAAGAACAACTTAGATTGTTCTATATATGATGTATTGATTTCTGATGTTTCTATGAAAGAATCAATAGTACAAAGTGATTTAGTTAATAACTTATTTATATCTCCATCAACAATGGAATTAGCTGGGGCAGAAGTTGAATTAATTAATAAAAGTGACAGAGAAAATATTATGAAAAACAAGCTAAAGGAAATAGAAGATGAATATGATTATGTATTCATAGATTGCCCACCGTCATTAGGTGTATTAACTATAAATGCGCTGACTTGTGCTGATTCAGTTTTAATTCCTATGCAATGTGAGTTTTACGCGCTAGAAGGTGTAAGCCAATTAATGAATACTGTACAATTAGTTAAGAAATCCTTAAATAAGAAGCTCGAAATTGAGGGGGTTCTTATGACTATGTTTGATTATAGAACTAACCTTAGTAATGAAGTTTTAAAGGAAGTTCAGAAATATTTTAAGGACAAAGTGTATAAAACTACAATAGCACGAAATATAAGATTAGCAGAAGCACCGAGCTTTGGATTGCCAATAGTTTTGTATGATAATAAGTGTAAGGGTGCTGAAGCATATACGAACTTAACCAAAGAATTCTTAAAAAGACAGTAGGTGAAGTAAAAGGATGGGAAAGAAATTTGCTTTAGGTAAGGGATTAAGTGCGCTTATTCCTGAAGATTTAGTAGAATCAGAACAACAGGATGAAAAAGGGAAGATGCTAATTCCTTTAAATGAAATAAGAAATGATAATAATCAGCCTAGAAAAGCATTTGATAATGATAAGATAGCTGAATTAACAGAATCTATAAAAACTCATGGAATAATTCAACCTCTTATCCTTAGGAAATCAGATGATGGACTTTATGTAATTGTTGCAGGAGAAAGACGTTGGAGAGCGGCTAAGATGGCAGGGTTAAAAGATGTACCAGCAATAGTTATGGAGCTCAGCGAAAAGGATGTATTAGAAATTTCTTTAATAGAGAATATACAACGACAAGATTTAAATCCAATAGAAGAAGCGTCAGCTTACAAAAAATTATTGAGTGATTTTAATTTAACTCAGGAAGATTTAAGTAAGCGAATAGGTAAATCACGAACGGCTATTACTAATACAATGAGGTTAATGAATCTAGATATAAGAGTTCAACAGTATATAATTGAAGGAATTATTACTGAGGGACACGGAAGAGCACTTCTCGGAATAAAAGATAAAGAGATTCAATATGAATTATCTCAAAAAGTTATTGATGAAAATTTATCTGTAAGAGAATTGGAAAGATTGGTAAAAAGAATACTTGAAGGCAAAACTTCAGAAGAAAAAGAAACAAATAATGAATTAAATCCTTATTATAAGGAAATAAAAAATCAACTTCAAAGTTATTTTGGAACAAAAGTAAATATATCTAATAAAAATAATAAAGGTAAAATAGAAATTGAATATTACTCACAAGATGATTTGCAAAGAATATTAGATATTATTGATATTTAATGTTTCACGTGAAACAATTATGAAAGGAATGACAGTAAATTGGAAGCATTAATTAATTCGATTAATGAATTTATGCCATATATTATAATAGGAATGGCAGTAATAATAGTATTATTATTTATAATAATTTTATTTTTATTTAAAACTATTGGTAAAGTTGAAGATAAGTATAGAAGGTTTATGAAAGGAACTAATAGTAAGAATCTAGAAGAAATGCTGTTAGAAAGAATAGAGAGTGTAGAAGAAGTAAAAGAAATATCTGAAAAAGCAATCAAGGAATGTGAGAGATTAGAAGTTAAAATGGAAGAGTGCATACAAAAGGTTGCTATAATGAGATATAAAGCTTTTGAAGATGTTGGAAGTGATTTGAGTTTTTCCATTGCATTATTAGATGACAAAAATGACGGTGTTATATTAACTGGAATATATGGAAGACAAGAAAGTACAACTTATGCAAAACCAGTTGATAAAGGAATTTCAAGATATGATCTTTCAGAAGAAGAATTATATGTATTAAATGAAGCTTGTAATAAATATGAAGTTAATAAAAAGAAGAAGTAAGTATTAAAATGGATCCTGTGTCAAGGACACTATAAAAAAAGTGTTATGAAGCTAATAAAAGATGATTTCTATATTGTTTAGGAGTCATCTTTTTTAGATTCCACTGATATCTGTAATTATTATAATAGTCGATGTAGTCATCAATCATATCAATAAGTTCTTCAAGTGTATTACATGATTGAAAGTCTATTTCATCTTTCATATGCCCGAAGAAGGATTCTTGAGGCGCATTGTCCCAACAGTTGCCACGACGAGACATTGATTGACCAAGATTATTATCCTTTAGAAGTTTTTGGAATTTTGGACTAGTATAATGGAATCCTTGATCTGAATGAACAAATGCACTTTCATGTAAGTCATCTTTATGGTGCGTTATTAATTTATTTATAGTAGTTATAGCAATATCAAGTTTTATAGAATCTGAAACATGATAAGCTAGAATATCGTTGCTACTACCATCTTTGATGGTAGACAAATAAGCCATATGATTATTTCCATATGGCAAGTATGTAATATCCGTCAATAATACCTTTCCCGGCACTCCTTGCTTAAAATTACGTTCTAATAAGTTTGGAACTACTGTATGTTCTTTGGTTGCTTTTGCCATTCGGCGGTACGGGTTGGCTTTTCTAATAGGACATTTAATATTATATTTTCTCATAATACGTTGAATTTTCTTTCTACTATAAATTATAGAAAGCTCATTTTCTAAAACCATTTTTATAGAACGGGATCCTTTGCTATAACCTTTGTAATTATAAGCCATAAGAATATTGTCTCTAGCTTCCAAATCTTTATTTTCCATTAATATTTGATTATCAAGTGTATTTAGATAATTATAATATCCCGAGCGTGAAACATTTAAAAGATCACAGAAATATGAAACCATATTTTTATAGCTATTATTAGTGATAGTTTCATATATTAACTTAAATATCTCCTTACCTTCTAGATTTACGCTGCTGTTTACCAGCCTCCTTTCTGTCACGTCTAATTTTTTTAACAGTTCTAATTGCTCCTCTAATAACTTAATTTTAGCTTCTTGTTTTTGAATAATATCATCTTTAGATAATTGCTTTTCACTTGGTCGTCCAGAGTTTTCTTTCCTAGTATCTCTTAATCCTACAATACCCTCTTTTCTATAAGATCTTATCCATCTAGCTGCCGCTTGTTCGTATCTTCTTTGGCCAAGGATTTGTGTATCAAAACCAGCGTCATTAAAAATAATTTTAGGTGTTTTTCCTTTTAAATATTCTTCTATAAATAATCGCTTAAACTCGTCAGAGTAAGTTATAGATTTTTCACTTACTTTAACTACATAAGGATTTTCATTCAGTAATTCAATAGTTTCTTTATCAAATGTTATCTTACTCATGTTTTTCCTCCAATATAGATATTATTATTATACAAAAAAGTACCTATAAACGAGACACTTTTTTTCAAAGTGTCCTGTTCATAGGTACCATTTTATATGAAAATATACTTACTTCTTCTTTTTTAATAATCTTATTAGAAGATATTATTTATAATATTGTTAGTTTATACATTAGAATTCAAATTTATATAAGTTCTAAGTAGTTTGTAATGAAAAAACATAAATAGTTTACATAACTTTATTTAAATTGTTTCACGTGAAACAATTTAAATATGAAAAATATAAAATGGTTAATGTAGAGAAATAATGTTATCAGAAGTTGTATCTTTATTATCAAGTGCAAAATGGTAAATACCTCTAGAAATAGAATCTGCCAGATTCATCACTGTATAAAGTCTAGTATTTTGTAAAACTAAAAATTCAAAACTTCCAGAAATATTAACAATTCCAGTTATATTCATCTCACCAATAGGGGGAAGATCCTTGTTTAAAGCTAATCCAGGGTGTAAAGGACCTTTTTTTATAAATATTTTTCCGATGTTAGTTAATGATCCCAAACAAGAATCAATTGCAATAATATAAGGATTTGAAAAGTAGCAGCTTATTTTTTCTAGAATATTAGAAAGATTTTTTGCATGGACTGGGTTTTCTAAAGTCCCATAGATATAAATATTATCAACTGAAAGATGTTTTAATTTATATCCAATAATAGGACCTAATGAATCTCCGGTAGATCTATCCGTACCGATGCACAAAATTACAATGGGGCGGTTGTTAACTATTGATTTCAATTCTTTTGTTAAGTATTCTTTTATTTTTATATAAGCAGTTGGTAAAGATGAATCAACAGAAAAATTATCACACATATAATAAACCTCCTTTATTAGATTTATTTCCAATAAAGGAGGTTTTATTCAAATAACTATTTATTTAGTGATATTTTATTTAAAGTTTTTAGCGTAAAGTCAATTTCTTCTTTTTTATTGAAATAGCTAACACTTAATCTCACGGTACCATTTGGATAACTTCCGATGGTTTTATGAGCTAATGGAGCACAATGAAGACCACATCGTGTTTTTATACCACTATTTTCTAGTAAATAACCAAGCTCAGAGGAATCCAAAGATTTAATATTTATTGAAATACAAGTAGTTATGTTTTTACCAGTTGAATCACCGTAAATTATTATATCTTTTATATTTTGTAGACCATCTAGTAAATAATTTATAAGATAATGATTATGTTCATATATTGTTTTTAATCCTGTAGAATTTATGAATTTTATACCTTCTGATAGACCAACAATACCTGGCATATTATGAGTTCCGCATTCAAATTTATCAGGAAGAAAATCAGGTTGATCTAAAGAATAGGATAAGCTTCCTGTTCCGCCATGTAATATACTTTTACAAGAGTCGTTTAATTTGTCATCAATTATGAATCCTCCGATTCCTTGAGGCCCAAGAAGGCTTTTATGTCCGGTAAAAGCAATAGCGTTAGCATTTACAGAATTTATGTTAAGTTCTAGAACACCAGCTCCTTGTGATGAATCTACAATAAAAAATACATTTTTTTCTTTACAGATTTTACCGACTTCGGCTATATTCTGAATTGATCCAGTTACATTTGAAGCTTGGGTCAATACTACTAATTTTGTATCAGATGTTATTTTAGATCTAAAATCTGAAACGTTAATAAATCCAGATTCATCAGCATCAATTATATCGAGATTTATATTTAATAGTTCTTTACAGTTTATAAGAGGACGTAAAACGGAATTGTGTTCCATAGAAGATGTTATAACGTGGTCTCCTTGCTTAATTAGTCCTTTTATTAACATATTTAATGAAGTTGTAACGTTGTTTGTAAAAATAACATTACTAGGTGACGAAAAACCAAAAAAGTCACTTACAATTTCACGTGCTTCATATAAAAATCGATTACTTTGAAGAGTATTTGTATAATTACCTCTTCCGGCATTACCACCAACATTTAACATGTAGTTATACATACCATCAATTACTTGCTTTGGTTTTGGAAAGGTGGTAGAAGAATTGTCTAAATAAACGTCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP053292|3676094:3682730|3679324_3680656_-|WP_002581275.1|transposase|DBSCAN-SWA MSKITFDKETIELLNENPYVVKVSEKSITYSDEFKRLFIEEYLKGKTPKIIFNDAGFDTQILGQRRYEQAAARWIRSYRKEGIVGLRDTRKENSGRPSEKQLSKDDIIQKQEAKIKLLEEQLELLKKLDVTERRLVNSSVNLEGKEIFKLIYETITNNSYKNMVSYFCDLLNVSRSGYYNYLNTLDNQILMENKDLEARDNILMAYNYKGYSKGSRSIKMVLENELSIIYSRKKIQRIMRKYNIKCPIRKANPYRRMAKATKEHTVVPNLLERNFKQGVPGKVLLTDITYLPYGNNHMAYLSTIKDGSSNDILAYHVSDSIKLDIAITTINKLITHHKDDLHESAFVHSDQGFHYTSPKFQKLLKDNNLGQSMSRRGNCWDNAPQESFFGHMKDEIDFQSCNTLEELIDMIDDYIDYYNNYRYQWNLKKMTPKQYRNHLLLAS >NZ_CP053292|3676094:3682730|3678759_3679281_+|WP_043853458.1|DBSCAN-SWA MEALINSINEFMPYIIIGMAVIIVLLFIIILFLFKTIGKVEDKYRRFMKGTNSKNLEEMLLERIESVEEVKEISEKAIKECERLEVKMEECIQKVAIMRYKAFEDVGSDLSFSIALLDDKNDGVILTGIYGRQESTTYAKPVDKGISRYDLSEEELYVLNEACNKYEVNKKKK >NZ_CP053292|3676094:3682730|3676094_3676874_+|WP_003406676.1|DBSCAN-SWA MNNEIIQIDIDKVIPNIYQPRKYFNEESIEELSESIKQYGIIQPLTVRKRGDVYELVAGERRLRAAKLANLNKVPCNIVDITDTESAEIALLENLQREDLNYIEEAEAYYNLIHDHSFTQDELAKRMGKKQSTIANKLRLLKLSTEVRGICLNNKLTERHARSLLTLPNEELQLKIIKKVINDGLNVKKTEELINKELLKISSEELKKKRKNTKNVLPAKLYVNTIKQVFEKFDIPAEYGYKDEEEFLELTIKIPKPKK >NZ_CP053292|3676094:3682730|3677856_3678720_+|WP_043853456.1|DBSCAN-SWA MGKKFALGKGLSALIPEDLVESEQQDEKGKMLIPLNEIRNDNNQPRKAFDNDKIAELTESIKTHGIIQPLILRKSDDGLYVIVAGERRWRAAKMAGLKDVPAIVMELSEKDVLEISLIENIQRQDLNPIEEASAYKKLLSDFNLTQEDLSKRIGKSRTAITNTMRLMNLDIRVQQYIIEGIITEGHGRALLGIKDKEIQYELSQKVIDENLSVRELERLVKRILEGKTSEEKETNNELNPYYKEIKNQLQSYFGTKVNISNKNNKGKIEIEYYSQDDLQRILDIIDI >NZ_CP053292|3676094:3682730|3677078_3677843_+|WP_169512805.1|DBSCAN-SWA MMKTICIFNQKGGVGKTTTNINLCSYLAMEGFKVLTIDIDPQGNTTSGLGIDKNNLDCSIYDVLISDVSMKESIVQSDLVNNLFISPSTMELAGAEVELINKSDRENIMKNKLKEIEDEYDYVFIDCPPSLGVLTINALTCADSVLIPMQCEFYALEGVSQLMNTVQLVKKSLNKKLEIEGVLMTMFDYRTNLSNEVLKEVQKYFKDKVYKTTIARNIRLAEAPSFGLPIVLYDNKCKGAEAYTNLTKEFLKRQ >NZ_CP053292|3676094:3682730|3681578_3682730_-|WP_043853460.1|DBSCAN-SWA MDVYLDNSSTTFPKPKQVIDGMYNYMLNVGGNAGRGNYTNTLQSNRFLYEAREIVSDFFGFSSPSNVIFTNNVTTSLNMLIKGLIKQGDHVITSSMEHNSVLRPLINCKELLNINLDIIDADESGFINVSDFRSKITSDTKLVVLTQASNVTGSIQNIAEVGKICKEKNVFFIVDSSQGAGVLELNINSVNANAIAFTGHKSLLGPQGIGGFIIDDKLNDSCKSILHGGTGSLSYSLDQPDFLPDKFECGTHNMPGIVGLSEGIKFINSTGLKTIYEHNHYLINYLLDGLQNIKDIIIYGDSTGKNITTCISINIKSLDSSELGYLLENSGIKTRCGLHCAPLAHKTIGSYPNGTVRLSVSYFNKKEEIDFTLKTLNKISLNK >NZ_CP053292|3676094:3682730|3680946_3681522_-|WP_002582832.1|protease|DBSCAN-SWA MCDNFSVDSSLPTAYIKIKEYLTKELKSIVNNRPIVILCIGTDRSTGDSLGPIIGYKLKHLSVDNIYIYGTLENPVHAKNLSNILEKISCYFSNPYIIAIDSCLGSLTNIGKIFIKKGPLHPGLALNKDLPPIGEMNITGIVNISGSFEFLVLQNTRLYTVMNLADSISRGIYHFALDNKDTTSDNIISLH |
7 | Leptospira_phage(16.67%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP053293_1 | 568625-568736 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053293_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053293_1
>1.1|568655|51|NZ_CP053293|CRISPRCasFinder AACAAAATTCAACTCCTTTTTACTATTATTTTTATTAAAAATTGCGTTTCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053293_1
The CRISPR arrays of NZ_CP053293_1 >merge|NZ_CP053293|1|568625-568736|CRISPRCasFinder GACCAAAACCCACCGTTCGCGAGGGTAAAAAACAAAATTCAACTCCTTTTTACTATTATTTTTATTAAAAATTGCGTTTCGTGACTTGTATTTCCGTTCGCAAGGGTAAAAA >NZ_CP053293|1|1|568625-568736|CRISPRCasFinder GACCAAAACCCACCGTTCGCGAGGGTAAAA AACAAAATTCAACTCCTTTTTACTATTATTTTTATTAAAAATTGCGTTTCG TGACTTGTATTTCCGTTCGCAAGGGTAAAAA
>NZ_CP053293.1|WP_003411363.1|566701_568165_-|hypothetical-protein MDKDDRLFKEDMIKLFKNVYEVLVKKEKFTDFYETLDNDLANLKDTGKREVIYKNLTNSIKRTKTRWLNKYVNGSNNSLSEDIEYAEHFYKRVLEGVYEPDKFVMIYGVNNIDEYKKKMFNELYTWRDNEDALLSSYKYIGTFQKRSITLAFRSDILKLYYDFLTNNAKSVITIPSVLSNFSIDTTNKKDYLKDDEKEFLDDNLSLEGTIDRLIVNKENQQKLLMKLEKQVYLRIEEGKDSLDIITQIALLKAIKQLNSLDTRIISHYYTHFYNIVADKSVDKYIGDLVSELGLSDSKKNTDAVIKSLLKIGSIRLESENYEGREIKGTLFEVSISERDGRKFAQVFLGGFLRTLIIMDSSFNFNKDVFDLLSNDAQQIAIWLQNRRLKMVLESEDFKDVIAIQRFTDAILMSTKSIYKKRDRIINALDELKQYKLIVKNYEYIKKNYEFVISYIELPESVIKKIKNKEFKTGELIEGQIHADYTVE >NZ_CP053293.1|WP_003430651.1|564753_565677_-|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MEILKTPQEYLYKNLVKKSEDLEATILELKKTIDDKNIIYKDYEKRTKHEEVKNEVLANISHEFKTPVNVIYSAVQTQDLIKNTANIEELLKYNKIIKQNCNRLTRLINNFIDTTRFEKENVKTEFTCENIVEITEYLTMCVVPFANSKKLNLIFDTSDEELYSLIDKELYDRMILNLLSNAIKYSRINGNIKVMIKDDNKFIKITIEDDGIGIDKYHLKDIFSIFERVDKSYSRNTEGSGLGLNIAKKIIDIHNGNISIESIKEKGTSVIVSIPKCSEKYVDNISHRLQDNTYVKYEVEVEMSDIY >NZ_CP053293.1|WP_043853806.1|563722_564493_-|cobalt-ECF-transporter-T-component-CbiQ MERKIDSYAYKSKLRKINPAFKVIFAFLTLLICIIADNIYVSLAIIVSMGFITIFKGGIKFHEYMSLMSIPVVFMILGSIAIAFGVSMSPIGDYNLHLCGFYLYTSDENIMKTMEIVMKAFGAISAMYMMTLSTNTSEIISVLRKAHIPKIIIELMNMIYRFIFILIDVQCKMKNSAQSRLGYIDFKTSCYSFGSTASKLLIVSLKKANTYYNAMESRCYNGDMLFLEEEKKVKTIHVVLACIYFSILIFIWYIAK >NZ_CP053293.1|WP_002581760.1|562870_563713_-|energy-coupling-factor-ABC-transporter-ATP-binding-protein MDDKIKEIILQIKELCYSYMGEKNTLNNINLNIHRGEKIAVLGSNGAGKSTFFLNINGVLTPKSGKIIYKGKAITKKNLNELRKNIGIVFQDADNQIIASTVLAEVSFGPMNLKLPKDEVIKRVNEALDYMNISEFKERPPHYLSGGEKKRVSIADIIAMKSEVIIFDEPTAALDPLNAEMLEEVLKKLSLENKTLLISTHDVDFAYRWADRVVVFSKGGIIGDGTPLEIFKNEKILKNSNLKRPIMLDVYETLIEKRILTNDNLYPKNINEFKKIFNKY >NZ_CP053293.1|WP_002581761.1|561554_562301_-|energy-coupling-factor-ABC-transporter-permease 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053293_2 | 568819-568909 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053293_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053293_2
>2.1|568849|31|NZ_CP053293|CRISPRCasFinder TACTTATAAACGTGATAACTTGGTTCACAAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053293_2
The CRISPR arrays of NZ_CP053293_2 >merge|NZ_CP053293|2|568819-568909|CRISPRCasFinder TTACTAAAATCACCGTTCGCAAGGGTAAAATACTTATAAACGTGATAACTTGGTTCACAAGTTACAAAAATCACCGTTCGCAAGGGTAAAA >NZ_CP053293|2|2|568819-568909|CRISPRCasFinder TTACTAAAATCACCGTTCGCAAGGGTAAAA TACTTATAAACGTGATAACTTGGTTCACAAG TTACAAAAATCACCGTTCGCAAGGGTAAAA
>NZ_CP053293.1|WP_003411363.1|566701_568165_-|hypothetical-protein MDKDDRLFKEDMIKLFKNVYEVLVKKEKFTDFYETLDNDLANLKDTGKREVIYKNLTNSIKRTKTRWLNKYVNGSNNSLSEDIEYAEHFYKRVLEGVYEPDKFVMIYGVNNIDEYKKKMFNELYTWRDNEDALLSSYKYIGTFQKRSITLAFRSDILKLYYDFLTNNAKSVITIPSVLSNFSIDTTNKKDYLKDDEKEFLDDNLSLEGTIDRLIVNKENQQKLLMKLEKQVYLRIEEGKDSLDIITQIALLKAIKQLNSLDTRIISHYYTHFYNIVADKSVDKYIGDLVSELGLSDSKKNTDAVIKSLLKIGSIRLESENYEGREIKGTLFEVSISERDGRKFAQVFLGGFLRTLIIMDSSFNFNKDVFDLLSNDAQQIAIWLQNRRLKMVLESEDFKDVIAIQRFTDAILMSTKSIYKKRDRIINALDELKQYKLIVKNYEYIKKNYEFVISYIELPESVIKKIKNKEFKTGELIEGQIHADYTVE >NZ_CP053293.1|WP_003430651.1|564753_565677_-|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MEILKTPQEYLYKNLVKKSEDLEATILELKKTIDDKNIIYKDYEKRTKHEEVKNEVLANISHEFKTPVNVIYSAVQTQDLIKNTANIEELLKYNKIIKQNCNRLTRLINNFIDTTRFEKENVKTEFTCENIVEITEYLTMCVVPFANSKKLNLIFDTSDEELYSLIDKELYDRMILNLLSNAIKYSRINGNIKVMIKDDNKFIKITIEDDGIGIDKYHLKDIFSIFERVDKSYSRNTEGSGLGLNIAKKIIDIHNGNISIESIKEKGTSVIVSIPKCSEKYVDNISHRLQDNTYVKYEVEVEMSDIY 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>NZ_CP053293.1|WP_043853804.1|558618_559482_-|NAD(P)/FAD-dependent-oxidoreductase MERYDLAIIGSGPAGVSAALNAKIRKKNFIIFGSKELSNKLTKAEKINNYLGFYGKSGAQIRDEFIKHMESMDISITEEKINNIYAMGDYFTLMVNDKMYEASAIILATGVNFGRPFKGEEELLGKGVGYCATCDAPLYKDKIVTIIAYNKHEEDEVNFISTIASKVYYIPMYKEKVEVDEKVQIINDIPVEIIGKERVEKLILKNSEIETDGIFILRDSVSPSQLVPGLELDENNVKVDRKMTTNLQGCFAAGDIVGAPYQYIKAAGEGNIAALSAVSYIDNLNKK >NZ_CP053293.1|WP_043853927.1|558073_558496_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIB MIKILICCLGGFSSSAMVKKVKSEIIENNLQKEMSVDFSPFMNANKLYHEYDVIMVCPHTRYEVNGFVKKHYDLNIPIYVLPPKMYGQMNAKELYIDAVDIIDGYNDSKTNPWHFKGEEEIMTVQRACSYRHFKKLSKLK >NZ_CP053293.1|WP_002581756.1|569188_570301_+|hypothetical-protein 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MKKELYIAVDPGFDTVKVIANGQFFKFPFNTEKTDEKRISNMTVADDFILYRNKDNETWRIGQYARELIFEKKDSSDIEDKMKSFYSEKRFVSDEFTIGLRTAIAMAVLRLNLYKHLKDIKIYIMVALPHSVRDNYSTQVKSILCGSHDYFVKIGKEEEEEYTFVIEEDNIFTVSQTVASILGETSDDEGNIDEDKFYYLSDGPTLVIDGGFYTIGEVAVDRGGSINEEKTFSDINHAMKNINMEIAKELENQRPDIKYYVIEYLMTKNEGKLKYLKNGKAQIIDLNVLKKEKIKEMSSRFIESLNAKYNNLLDFNYVLVTGGTGARYYEHLKEYYVGKGIVEEDRLILTNNILNGKRFDIEYAIAAGAYKGLKGKVAVLVEQ >NZ_CP053293.1|WP_002581751.1|576456_577149_+|hypothetical-protein MKSERIGLRFSKKDEDIISWFLMLRENKIEQSFAVKALLKAFFLQETINGGSIKIRHNVKMEPTSIAINEIDLNDDIIKMKTKGIKLASFTKDIIRLYINISDIDKAPQISELQQIHTKYKLKYLNNIVYEQSQEIKVNIESLPEFKKNIINNIKNENNMIAEESNSNDKDINSNYENLVKEKSNMDMNFQSSSKITFFDEESKNLQEVSKSEKDKKVKSKKRNPLLAQI >NZ_CP053293.1|WP_003430862.1|577219_577729_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MNYKYMNELKKFDNIDEFEKMDFVLLSNDVISNTIDNNLQKLLFAKRITISELSRKTGVSKQVISSSIVKNTKIDLDSAIKISRVLKTPIEDIFMLKKNSWVDVYIVNGKTVYLNMKTLTMVSSEEKNMYIKTHKVKYYNPIDDCLSYKKLNENYNELFIKVGKRIEQL >NZ_CP053293.1|WP_002581749.1|578057_579272_-|sodium/glutamate-symporter MELNFNIYETMALVSIVLYIGKYIRNKFSILSQYCIPPSVIGGFTFALLILIFKLTNICVINLDTLLQNIFMTAFFTSIGFTASIKVLKQGGIKVITFLCLAILLVILQNIVGVTLASIFKLTPLLGLCTGSIPMIGGHGTAGSFGPILENLGITGATTVSVASATFGLIMGSIIGGLVAKALIHNYKLKTIRDEYSEKPPSEVGDYNEENHNILSFKKLTNGACLLFIAMGIGSVVSDFIQKTGLTFPSYIGAMIVAAIIRNIYDFTDKEIVEKEIETLGGLSLSFFLTMALMGLKLWQLFDLALPLMIMLFAQVILVGLFAYFITYKVMGKNYEAAVFASATCGFGMGATPNAIANMDELTNRYGFVHTPYFVVPIVGCLFIDFVNSGIITIFINFISYNIY >NZ_CP053293.1|WP_003430865.1|580265_582176_+|threonine--tRNA-ligase MLINIKLKDGSIKEIEDNSTVFDLAQSISRNLGKSALVGEVNGCLVDLNYKLKNNDEVNILSYDSEKAVEVIRHSSAHIMAQAVKRLYKNAKLAIGPSIANGFYYDFDIDTPIIKEDLEKIEKEMNKIVKENLKFERIDVSKEEALKIMKDNDEIYKVELINDLPEGEKISLYKQGDYIDLCRGPHIPSTKYAKAFKLISVAGAYWRGNEKNKMLQRVYGIAFSNLKELEIHLHNLEEAKKRDHRKLGKELKLFTFAEEGPGFPFFLPKGVILKNSLIDFWRKIHYEAGYVEVETPIMLNKKLWETSGHWYHYKENMYTSMIDDEEFALKPMNCPGGMIVYKSDSHSYRDFPMRVGELGRVHRHELSGALHGLMRVRAFTQDDAHIFMLPEQIKSEIKGVVELIDKVYSIFGFKYHVELSTRPEDSMGSDEEWQMAEDSLRGALDELNLQYVINEGDGAFYGPKIDFHLEDSIGRTWQCGTIQLDFQLPQRFELEYVGSDNEKHRPIVIHRVIFGSIERFIGILIEHFAGKFPTWLAPVQVKVLPISDKFNNYCDEVVKQFYENGIRIEIDQRNEKIGYKIREARNERVPYIVIIGEKEEEEGNVSLRSRKNGDEGSINVIDLIERINNEIKNKYI >NZ_CP053293.1|WP_003430867.1|582296_583145_-|pentapeptide-repeat-containing-protein MKYTIDELYSKELKCHCENCFGLCCTALFFSACDGFPQNKDAGKPCINLKQDFTCSIHNTLFKKRLKGCISYECFGAGQKIAQKTFNKISWRKDPQSASKMFDTFLIIRQIHEMLWYLVQSYTLEKNNKIKSKIESLIDDTIKVSLWDVDKLLNLDLESYRDKVNVYLKTTSETIRKKFKVYSTNSLSTSKKQIQGKNFLGKDLTKYNLCGADFRGALLIASNLSYSDLSGADFIGADLRDTNLSSSDLSRSIFLTQAQINSAKGDLKTKLPPMIVRPSYWI |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053293_1 | 1.1|568655|51|NZ_CP053293|CRISPRCasFinder | 568655-568705 | 51 | NZ_CP039703 | Clostridium butyricum strain 29-1 plasmid p-butyl_plas_29-1, complete sequence | 379362-379412 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053293_1 | 1.1|568655|51|NZ_CP053293|CRISPRCasFinder | 568655-568705 | 51 | NZ_CP013238 | Clostridium butyricum strain CDC_51208 plasmid pNPD4_2, complete sequence | 493938-493988 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053293_1 | 1.1|568655|51|NZ_CP053293|CRISPRCasFinder | 568655-568705 | 51 | NZ_CP039706 | Clostridium butyricum strain 4-1 plasmid p-butyl_plas_4-1, complete sequence | 296581-296631 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053293_1 | 1.1|568655|51|NZ_CP053293|CRISPRCasFinder | 568655-568705 | 51 | NZ_CP033246 | Clostridium butyricum strain CFSA3987 plasmid pCFSA3987, complete sequence | 882019-882069 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053293_1 | 1.1|568655|51|NZ_CP053293|CRISPRCasFinder | 568655-568705 | 51 | NZ_CP033248 | Clostridium butyricum strain CFSA3989 plasmid pCFSA3989, complete sequence | 882034-882084 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053293_1 | 1.1|568655|51|NZ_CP053293|CRISPRCasFinder | 568655-568705 | 51 | NZ_AP019717 | Clostridium butyricum strain NBRC 13949 plasmid pCBU1, complete sequence | 331611-331661 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053293_2 | 2.1|568849|31|NZ_CP053293|CRISPRCasFinder | 568849-568879 | 31 | NZ_CP039703 | Clostridium butyricum strain 29-1 plasmid p-butyl_plas_29-1, complete sequence | 379188-379218 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053293_2 | 2.1|568849|31|NZ_CP053293|CRISPRCasFinder | 568849-568879 | 31 | NZ_CP039706 | Clostridium butyricum strain 4-1 plasmid p-butyl_plas_4-1, complete sequence | 296775-296805 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053293_2 | 2.1|568849|31|NZ_CP053293|CRISPRCasFinder | 568849-568879 | 31 | NZ_CP033246 | Clostridium butyricum strain CFSA3987 plasmid pCFSA3987, complete sequence | 882213-882243 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053293_2 | 2.1|568849|31|NZ_CP053293|CRISPRCasFinder | 568849-568879 | 31 | NZ_CP033248 | Clostridium butyricum strain CFSA3989 plasmid pCFSA3989, complete sequence | 882228-882258 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053293_2 | 2.1|568849|31|NZ_CP053293|CRISPRCasFinder | 568849-568879 | 31 | NZ_AP019717 | Clostridium butyricum strain NBRC 13949 plasmid pCBU1, complete sequence | 331805-331835 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053293_2 | 2.1|568849|31|NZ_CP053293|CRISPRCasFinder | 568849-568879 | 31 | NZ_CP013238 | Clostridium butyricum strain CDC_51208 plasmid pNPD4_2, complete sequence | 493764-493794 | 1 | 0.968 |
1. spacer 1.1|568655|51|NZ_CP053293|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039703 (Clostridium butyricum strain 29-1 plasmid p-butyl_plas_29-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aacaaaattcaactcctttttactattatttttattaaaaattgcgtttcg CRISPR spacer aacaaaattcaactcctttttactattatttttattaaaaattgcgtttcg Protospacer ***************************************************
2. spacer 1.1|568655|51|NZ_CP053293|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013238 (Clostridium butyricum strain CDC_51208 plasmid pNPD4_2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aacaaaattcaactcctttttactattatttttattaaaaattgcgtttcg CRISPR spacer aacaaaattcaactcctttttactattatttttattaaaaattgcgtttcg Protospacer ***************************************************
3. spacer 1.1|568655|51|NZ_CP053293|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039706 (Clostridium butyricum strain 4-1 plasmid p-butyl_plas_4-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aacaaaattcaactcctttttactattatttttattaaaaattgcgtttcg CRISPR spacer aacaaaattcaactcctttttactattatttttattaaaaattgcgtttcg Protospacer ***************************************************
4. spacer 1.1|568655|51|NZ_CP053293|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033246 (Clostridium butyricum strain CFSA3987 plasmid pCFSA3987, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aacaaaattcaactcctttttactattatttttattaaaaattgcgtttcg CRISPR spacer aacaaaattcaactcctttttactattatttttattaaaaattgcgtttcg Protospacer ***************************************************
5. spacer 1.1|568655|51|NZ_CP053293|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033248 (Clostridium butyricum strain CFSA3989 plasmid pCFSA3989, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aacaaaattcaactcctttttactattatttttattaaaaattgcgtttcg CRISPR spacer aacaaaattcaactcctttttactattatttttattaaaaattgcgtttcg Protospacer ***************************************************
6. spacer 1.1|568655|51|NZ_CP053293|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP019717 (Clostridium butyricum strain NBRC 13949 plasmid pCBU1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aacaaaattcaactcctttttactattatttttattaaaaattgcgtttcg CRISPR spacer aacaaaattcaactcctttttactattatttttattaaaaattgcgtttcg Protospacer ***************************************************
7. spacer 2.1|568849|31|NZ_CP053293|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039703 (Clostridium butyricum strain 29-1 plasmid p-butyl_plas_29-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tacttataaacgtgataacttggttcacaag CRISPR spacer tacttataaacgtgataacttggttcacaag Protospacer *******************************
8. spacer 2.1|568849|31|NZ_CP053293|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039706 (Clostridium butyricum strain 4-1 plasmid p-butyl_plas_4-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tacttataaacgtgataacttggttcacaag CRISPR spacer tacttataaacgtgataacttggttcacaag Protospacer *******************************
9. spacer 2.1|568849|31|NZ_CP053293|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033246 (Clostridium butyricum strain CFSA3987 plasmid pCFSA3987, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tacttataaacgtgataacttggttcacaag CRISPR spacer tacttataaacgtgataacttggttcacaag Protospacer *******************************
10. spacer 2.1|568849|31|NZ_CP053293|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033248 (Clostridium butyricum strain CFSA3989 plasmid pCFSA3989, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tacttataaacgtgataacttggttcacaag CRISPR spacer tacttataaacgtgataacttggttcacaag Protospacer *******************************
11. spacer 2.1|568849|31|NZ_CP053293|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP019717 (Clostridium butyricum strain NBRC 13949 plasmid pCBU1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tacttataaacgtgataacttggttcacaag CRISPR spacer tacttataaacgtgataacttggttcacaag Protospacer *******************************
12. spacer 2.1|568849|31|NZ_CP053293|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013238 (Clostridium butyricum strain CDC_51208 plasmid pNPD4_2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.968
tacttataaacgtgataacttggttcacaag CRISPR spacer tacttataaacgtgataacttcgttcacaag Protospacer ********************* *********
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation |
---|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|