Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053078 | Staphylococcus aureus strain SA01 plasmid pSA01-04, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP053075 | Staphylococcus aureus strain SA01 chromosome, complete genome | 9 crisprs | cas3,DinG,DEDDh,csa3,RT,WYL | 8 | 3 | 10 | 4 |
NZ_CP053077 | Staphylococcus aureus strain SA01 plasmid pSA01-03, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 3 | 0 |
NZ_CP053076 | Staphylococcus aureus strain SA01 plasmid pSA01-tet, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053075_1 | 430073-430174 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053075_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053075_1
>1.1|430096|56|NZ_CP053075|CRISPRCasFinder AAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053075_1
The CRISPR arrays of NZ_CP053075_1 >merge|NZ_CP053075|1|430073-430174|CRISPRCasFinder TTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTATATATGAATTGAGTATTAAATTTG >NZ_CP053075|1|1|430073-430174|CRISPRCasFinder TTATGAATTGAGTATTAAATTTG AAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTAT ATATGAATTGAGTATTAAATTTG
>NZ_CP053075.1|WP_001792089.1|429297_429396_+|hypothetical-protein MQLNVNMMKFDRWHKGICKQIVLNLVEKGEKG >NZ_CP053075.1|WP_000991014.1|427824_429213_-|L-cystine-transporter MNAFLTLINIIVLVIFIVILHMMARKHISFAKRVFTALGIGIVFGVLLHLVYGTHSNVITSTSDWFNIVGQGYVALLQMIVMPLIFISIVAAFTKIQIGEKFAKIGSLIFIFLIGTVTIAAIVGVVYALVFGLDASTINLGNAEQAHGSEIAKQAKDLTAHTLPQQILELLPKNPFLDFTGQRATSTIAVVIFASFIGFAYLRVARKQPDHGELLKRAIDAIYSLVMAIVTFVLRLTPYGVLAIMANTLSTSDFGAIWTLGKFLIASYAALITMYIIHLIILSLLGISPIRYVKKTLEVLIFAFTSRSSAGALPLNVQTQTRRLGVPEGIANFAATFGLSIGQNGCAGIYPAMLAIMVAPVANVEIDLQFIVTLIAVVIISSFGVAGVGGGATFASILVLSTLNLPVALAGVLISVEPLIDMGRTALNVNDSMLAGTGTAKLTKHWDKDTFESNDNAALTSH >NZ_CP053075.1|WP_001287099.1|426989_427745_+|NADPH-dependent-oxidoreductase MSDYVYNLVKKHHSVRKFKNKPLSEDVVKKLVEAGQSASTSSFLQAYSIIGIDDEKIKENLREVSGQPYVVENGYLFVFVIDYYRHHLVDQHAETDMENAYGSTEGLLVGAIDAALVAENIAVTAEDMGYGIVFLGSLRNDVERVREILDLPDYVFPVFGMAVGEPADDENGAAKPRLPFDHVFHHNKYHADKETQYAQMADYDQTISEYYDQRTNGNRKETWSQQIEMFLGNKARLDMLEQLQKSGLIQR >NZ_CP053075.1|WP_000052781.1|425928_426498_-|peroxiredoxin MSLINKEILPFTAQAFDPKKDQFKEVTQEDLKGSWSVVCFYPADFSFVCPTELEDLQNQYEELQKLGVNVFSVSTDTHFVHKAWHDHSDAISKITYTMIGDPSQTITRNFDVLDEATGLAQRGTFIIDPDGVVQASEINADGIGRDASTLAHKIKAAQYVRKNPGEVCPAKWEEGAKTLQPGLDLVGKI >NZ_CP053075.1|WP_000930514.1|424389_425913_-|alkyl-hydroperoxide-reductase-subunit-F MLNADLKQQLKQLLELMEGNVEFVASLGSDEKSKELKELLTEISDMSPRLSLSEKSLKRTPSFSVNRPGEETGVTFAGIPLGHEFNSLVLAILQVSGRAPKEKQSIIDQIKNLEGSFHFETFISLTCQKCPDVVQALNLMSVINPNITHSMIDGAVFREESENIMAVPAVFLNGEEFGNGRMTIQDILSKLGSTADASEFENKEPYDVLIVGGGPASGSAAIYTARKGLRTGIVADRIGGQVNDTAGIENFITVKETTGSEFSSNLAAHIDQYDIDAMTGIRATDIEKTDEAIKVTLENGAVLESKTVIIATGAGWRKLNIPGEEQLINKGVAFCPHCDGPLFENKDVAVIGGGNSGVEAAIDLAGIVNHVTLFEFASELKADNVLQDRLRSLSNVDIKTNAKTTEVVGEDHVTGIRYEDMSTGEEHLLNLDGIFVQIGLLPNTSWLKDAVELNERGEIVIDRNNNTNVPGIFAAGDVTDQKNKQIIISMGAGANAALNAFDYIIRN >NZ_CP053075.1|WP_000746679.1|423319_423946_-|NDxxF-motif-lipoprotein MKKRLLLSTFLASALILTGCASDQSDNEDHHTSTGIHAPKSAKKLETKDIFNSDKKNSDISDAEMKQAIEKYLSVNSDILDNKYIMQHKLDKQIDSQTKVTEKQAETLSHLSNLAVKNDLHFKKFVTENNIPKEYKKPVELMMNYFKALNSTIANVDEDIEKLSYQPQNKINVVDVPTKYAGDVNKKQQDKIKDFLKSKGIKSDVIDK >NZ_CP053075.1|WP_000868256.1|422666_423050_-|hypothetical-protein MKVRITFIILAILSTIVCLFLAAMHPTGPNTVTFEQPYLFTLNIILMVLVALPSLVLAIYDYMSFRISSAILQFLGAISWFFLSLILSLTQFTPFTLASFITSIILFISAIITLAIGGKSVDKNDSH >NZ_CP053075.1|WP_000158375.1|422019_422601_+|histidine-phosphatase-family-protein MTIYLVRHGESKSNYDNKHFRSYFCGQLDVPLTDTGTKSADDLCDYFKEKQIKHVYVSDLLRTQQTFEHIFPYDIASTTTPLLRERSLGVFEGEYKDEISANPKYEKYFNDPNFKDFRHSFSQKAPEGESYEDVYQRVEHFMNHVVNEDTQKDDIVIVAHQVVIRCLMVYFNKVSREEAVDLKVENCKPYIIE >NZ_CP053075.1|WP_000211677.1|421632_421842_-|hypothetical-protein MTTQSFIFMNIILLDGATQRHPFFICQILAFLFPKFPHINLLLFYPILSTFSNIIIHIDHFHANKKDDN >NZ_CP053075.1|WP_000466748.1|421342_421594_+|GlsB/YeaQ/YmgE-family-stress-response-membrane-protein MFGFIGMLIVGGLIGWAAGAIMGKDIPGGILGNIIAGIIGSWVGGKLFGQWGPELGSIYILPALIGSIILIAIVTLILRAMRK >NZ_CP053075.1|WP_000956137.1|430190_431147_-|hypothetical-protein MLTKEFAQRVELSEKQVRKIVQHLEERGYQLSKTEYRGREATDFKEEDIELFKDIADKVKQTNSYDLAFDELEKEKDFLQVIVKNDDKNLPTNQNVAQLVEDLRLEIQKMREERHLLGQMMNQVHQQQQELKELQNQLTSKIDSNSESLKAIQTSQEAIQEAQASQAKVLAESTNKVEKNAVTEDKADSKDSKVAGVNTSTDAKTDTKAENAGDGTATKVDKEDQISATEAIEKASVEQSKNENAAETSNKEATVDADAQHDAEQQVAEAHAEASKQATSNDSLEAKAENDSTASQSEMSEPKPQEEKKGFFARLFNL >NZ_CP053075.1|WP_114283422.1|431264_431927_-|hypothetical-protein MEFKTIQSVKDPHYNEALKLYDTKLNLSLTEDKRIIKRSLENNKTQNDYVFIVGLENDVVVSLATAHYEATTNSAFLIYLFAKDLPNHDELMTQTLHQIEHELNLLSNLVHSRSINFLMMEVPKEPADLTQDNGLIIEHRRQFLYEHQFERQTEIDYIHPTNDGHTKKVDLFLKKNIKLTKDIYGTSVKSNYILKYVFANGIAREIIYALLEEMDLRKPF >NZ_CP053075.1|WP_000763767.1|432069_432477_-|general-stress-protein MADITVVNDTGELYNVINQKKSEGYLESELTIISKSKLHLNDLHDSEISLISTSGTFSDRMTKLLTGEDGEHAVLSRYNLAPDELEKYKQLILDDKMLVVAVRDKSSHKEVQEHNSAYEEIDITHFAEASKGPKA >NZ_CP053075.1|WP_000421410.1|432988_433567_+|xanthine-phosphoribosyltransferase MELLGQKVKEDGVVIDEKILKVDGFLNHQIDAKLMNEVGRTFYEQFKDKGITKILTIEASGIAPAIMAALHFDVPCLFAKKAKPSTLTDGYYETSIHSFTKNKTSTVIVSKEFLSEEDTVLIIDDFLANGDASLGLYDIAQQANAKTAGIGIVVEKSFQNGHQRLEEAGLTVSSLCKVASLEGNKVTLVGEE >NZ_CP053075.1|WP_000793023.1|433566_434835_+|purine-permease MKNLILSVQHLLAMYAGAILVPIIVGTSLKFTPEQIAYLVTVDIFMCGVATFLQANKVTGTGLPIVLGCTFTAVAPMILIGQTKGIDVLYGSLFLSGILVIIIAPFFSHLVKFFPPVVTGSVVTIIGINLMPVAMNYLAGGQGAKDYGDVKNILLGLMTLIIILVLQRFTTGFIKSIAILIGLVLGTIGAGLLGMVDINQVNHAGWLGIPVPFRFSGFSFDVTSTLVFFIVAIVSLIESTGVYHALSEITGKKLERKDFRKGYTAEGLAIVLGSIFNSFPYTAYSQNVGLVSLSGAKKNNVIYGMVVLLLICGCIPKLGALANIIPLPVLGGAMIAMFGMVMAYGVSILGHIDFKNQNNLLIIAVSVGLGTGISAVPQAFKGLGEQFAWLTQNGIVLGAISAIILNFFFNGIKYKQTEENVK >NZ_CP053075.1|WP_000264071.1|434872_436339_+|IMP-dehydrogenase MWESKFAKESLTFDDVLLIPAQSDILPKDVDLSVQLSDKVKLNIPVISAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVIHKNMGVEEQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEESVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKIVDVMTQENLITAPVNTTLEEAEKILQKHKIEKLPLVKDGRLEGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEHGRLLVAAAIGISKDTDIRAQKLVEAGVDVLVIDTAHGHSKGVIDQVKHIKKTYPEITLVAGNVATAEATKDLFEAGADIVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATEARKHGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEIFQGRQYKVYRGMGSLGAMEKGSNDRYFQEDKAPKKFVPEGIEGRTAYKGALQDTIYQLMGGVRAGMGYTGSHDLRELREEAQFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSF >NZ_CP053075.1|WP_000424963.1|436363_437905_+|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISIEEIKKMNPKGIILSGGPNSVYEEGSFTIDPEIYNLGIPVLGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIINAKSDELFAGLPAEQTVWMSHSDKVIEIPEGFEVIADSPSTDYAAIEDKKRRIYGVQFHPEVRHTEYGNDLLNNFVRRVCDCKGQWTMENFIEIEIEKIRQRVGDRRVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVNAKDRFMNKLKGVSDPEQKRKIIGNEFVYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMEFELIEPINTLFKDEVRKLGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLEIVRESDAILRQVIREEGLEREIWQYFTVLPNIQSVGVMGDYRTYDHTVGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPSTIEWE >NZ_CP053075.1|WP_000551643.1|438017_438554_-|hypothetical-protein MHNKNEFNKKLKDFIGSDKRMALVKGYINEYKLTTVLRALNNSDYTKGTIHTRSIGNLKQIVDNRIIPKNITQNKIFKLSNLTLEVNLYERNTIYHGDFAIYYPVESALIIETDTPRLINHINNNPVQKIFIITTNDWSFNTLELEKIVDETIIYDLKQEDPKQYEILYKNKHGKLPY >NZ_CP053075.1|WP_000041880.1|438945_439650_-|type-II-toxin-antitoxin-system-PemK/MazF-family-toxin MSKNINQANSKLNTSNKKLKQAYSKSDSKNMKVIYMPHWLEFYSIAIHSDVTSNKKRYYKSFSRGTVVYVKLGSNIGSEFSGNHFCVILDNKDNKGKETVTIVPLSSKGNKNYLKLNESVLNLTATDLKKQIIDISSKVQALTQKYRDIDIKLSTEDKKLLSNLNQKANELYRVIGVYSKHKGKDTYVNISAITTISKRRISKINDSDPTGTIIISEDDMNEIEKQLKIKFFSN >NZ_CP053075.1|WP_000159787.1|440048_440321_-|transposase MTKERRTFSSEFKLQMVRLYKNGKLKNEIIRKYDLKPSIISNSIKQHQNTGPFNHQDNLKSDEKELIKLRKEVQHLKMEHDVLKQILKLI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053075_2 | 777841-777923 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053075_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053075_2
>2.1|777868|29|NZ_CP053075|CRISPRCasFinder CGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGAACG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053075_2
The CRISPR arrays of NZ_CP053075_2 >merge|NZ_CP053075|2|777841-777923|CRISPRCasFinder CCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGAACGCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGG >NZ_CP053075|2|2|777841-777923|CRISPRCasFinder CCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGG CGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGAACG CCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGG
>NZ_CP053075.1|WP_000197262.1|777149_777692_+|5'-3'-deoxyribonucleotidase MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >NZ_CP053075.1|WP_000663030.1|775752_776811_+|histidinol-phosphate-transaminase MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEYFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_CP053075.1|WP_000180991.1|773998_775513_+|ABC-transporter-permease/substrate-binding-protein MTNFFDILSERKGQLFSTMIEHIQISFIALLIATAIAVPLGILLTKTKTISEIVMNIAAILQTIPSLALLGLMIPLFGIGRVPAIIALVVYALLPILRNTYTGIKEVDPSLIEAAKGIGMKPFRRLTKVELPIAMPVIMAGVRTAMVLIIGTATLAALIGAGGLGDLILLGIDRNNASLILLGAIPAALLAIIFDLILRFMAKLSYKKLLMTLGVIVMIIILAIAIPMFAQKGDKITLAGKLGSEPSIITNMYKILIEEETKNTVEVKDGMGKTAFLFNALKSDDIDGYLEFTGTVLGELTKEPLKSKEEKKVYEQAKQSLEKKYQMTMLKPMKYNNTYALAVKRDFAKQHNIRTIGDLNKVKDQLKPGFTLEFNDRPDGYKAVQKAYNLNLDNIRTMEPKLRYQAINKGNINLIDAYSTDAELKQYDMVVLKDDKHVFPPYQGAPLFKESFLKKHPEIKKPLNKLENKISDEDMQMMNYKVTVKNEDPYTVAKDYLKAKGLIK >NZ_CP053075.1|WP_000589248.1|773028_774006_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKFKNVTKRYGKHVAVDNISFNINEGEFFVLIGPSGCGKTTTLKMINRLIHLSEGYIYFKDKPISDYPVYEMRWDIGYVLQQIALFPHMTIKENIAQVPQMKKWKEKDIDKRVDELLDMVGLEPEKYKNRKPDELSGGQRQRVGVIRALAADPPVILMDEPFSALDPISREKLQDDLIELQTKIKKTIIFVTHDIQEAMKLGDKICLLNEGHIEQIDTPEGFKNNPQSEFVKQFMGSHLEDDAPCVEENAIIRDLDIMKPIDEVTSMSAYPIVYDNQPIEVLYQHLSESERVIVMQEDSVGQYVIDRKDIFKYLSQKKEVAQHD >NZ_CP053075.1|WP_000983677.1|771025_772807_+|DNA-helicase-RecQ MMQQTLSHYFGYETFRPGQEEIISKVLDHRNVLGVLPTGGGKSICYQVPGLLLGGTTIVISPLISLMKDQVDQLKAMGIQAAFLNSSLTQKEQQRIEKALSNGEIQFLYVAPERFENRYFLNMLQRIKIHLVAFDEAHCISKWGHDFRPSYQNVISKVFTLPQDFTIIALTATATVEVQQDIREKLNIAQTDQIKTSTKRRNLIFKVNPTYQRQKFILDYIKTHDEDAGIIYCSTRKQVEELQEALESQKIESVIYHAGLSNKEREEAQNDFLFDRVKVVVATNAFGMGIDKSNVRFVIHYNMPGDLESYYQEAGRAGRDGLKSECILLFSERDINLHEYFITVSQADDDYKDKMGEKLTKMIQYTKTKKCLEATIVHYFEPNEKLEECEQCSNCVQQDKSYNMTQEAKMIISCIARMKQQESYSVIIQVLRGESTDYIKYKGYDQISTHGLMKGYTTSELSHLIDELRFKGFLNENDEILMCDTSIKKLLSNEVEVFTTPFKQKATEKVFINTVEGVDRVLFSQLVEVRKKLSDKLTIAPVSIFSDYTLEEFAKRKPASKQDMINIDGVGSYKLKHYCPAFLETIQNYKAKV >NZ_CP053075.1|WP_000525106.1|769130_771014_+|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MGMEAYKIEHLNKSYADKTIFDNLDLSISEGEKIGLVGINGTGKSTLLKVIGGIDDDFTANVMHPNQYRIRYSSQKQDLNEDMTVFDAVLSSDTTTLRIIKQYEQAVQAYADDQSDKLFKRMIDAQDAMDQHDAWDYNAEIKTILSKLGIHDTTKYIKELSGGQQKRVVLAKTLIEQPDLLLLDEPTNHLDFESISWLINYVKQYPHTVLFVTHDRYFLNEVSTRIIELNRGKLASYPGNYESYIEMRAEREVTLQKQQQKQRALYKEELAWMRAGAKARTTKQQARINRFNDLENEVNQQYKDDKGELNLAYSRLGKQVFELEDLSKAINDKVLFEHLTEIIQKGERIGVVGPNGAGKTTLLNILSGEDQQFEGKLKTGQTVKVAYFKQTDETLDRDIRMIDYLREESEVAKEKDGTSVSITQLLERFLFPSATHGKKVYKLSGGEQKRLYLLRLLVHQPNVLLLDEPTNDLDTETLTILEDYIHTFGGTVITVSHDRYFLNKVAQSYWFIHDGQMEKIIGTFEDYESYKKSLDKNKSTLKQQSKSYTTVRKKNGLSYKEKLEYEQLMKRIEQAEVRMEEIDVLMIEASADYGKIKELNEEKEQLEIQYDLDITRWSELEEIKEQQ >NZ_CP053075.1|WP_000098285.1|766920_768861_+|polyglycerol-phosphate-lipoteichoic-acid-synthase-LtaS MSSQKKKISLFAFFLLTVITITLKTYFSYYVDFSLGVKGLVQNLILLMNPYSLVALVLSVFLFFKGKKAFWFMFIGGFLLTFLLYANVVYFRFFSDFLTFSTLNQVGNVESMGGAVSASFKWYDFVYFIDTLVYLFILIFKTKWLDTKAFSKKFVPVVMAASVALFFLNLAFAETDRPELLTRTFDHKYLVKYLGPYNFTVYDGVKTIENNQQKALASEDDLTKVLNYTKQRQTEPNPEYYGVAKKKNIIKIHLESFQTFLINKKVNGKEVTPFLNKLSSGKEQFTYFPNFFHQTGQGKTSDSEFTMDNSLYGLPQGSAFSLKGDNTYQSLPAILDQKQGYKSDVMHGDYKTFWNRDQVYKHFGIDKFYDATYYDMSDKNVVNLGLKDKIFFKDSANYQAKMKSPFYSHLITLTNHYPFTLDEKDATIEKSNTGDATVDGYIQTARYLDEALEEYINDLKKKGLYDNSVIMIYGDHYGISENHNNAMEKLLGEKITPAKFTDLNRTGFWIKIPGKSGGINNEYAGQVDVMPTILHLAGIDTKNYLMFGTDLFSKGHNQVVPFRNGDFITKDYKYVNGKIYSNKNNELITTQPADFEKNKKQVEKDLEMSDNVLNGDLFRFYKNPDFKKVNPSKYKYETGPKANSKK >NZ_CP053075.1|WP_000022323.1|765442_766447_+|biotin-dependent-carboxyltransferase-family-protein MSIIIEKSGLFSSFQDFGRRGYEHDGVIPCGALDTLAHEIANRLVANDKNEATLEMTNKMATIRFTEPTLIALAGGNVKAYTEHMTISPYKLYLLDKGDVLKFRETSYTSRVYLAVGGGFELDAWLGSNSTDFNVKIGGFKGRTLQDGDEIKLKRDYTARHHKLFENLAHTKQTDWGIDGYALSFNYMSDVFHVVKNKGTEDFKEDAIQRFVKHDYKVTSKANRMGMMLEGEKIKAFYEDMPPYQTVKKGTIQIKRDGTPIILLNDHYTLGSYPQIGTIASYHLTKLAQKPQGSRLKFQFIDILTAEKNLVKYSNWLNQLFHGIEYRMQLEMMK >NZ_CP053075.1|WP_000708689.1|764748_765459_+|allophanate-hydrolase-subunit-1 MKIYSQGDQAIVVAIEKEVSKSLTEDLLTLRSYLIEQNYPFIIEIVPSESDMMIVYDARDMIKHHNIQSPFLYMKALIESIHLNIKHDFNQQDLIEIPIVYGSKYGPDIESLLKHYKIKLETFIELHSKTQYFVSMMGYSPGFPYLTGLNKKLYINHTSKQKKFIPAGSVVLEGKKCGIVTTDTINDWLVIGYTPLSLFNPKESDFARLKLGDNIKFRPINENELDVGAFKDVNHN >NZ_CP053075.1|WP_001797134.1|764454_764661_+|hypothetical-protein MIIVYIVLLLILVYVNYRLVNRLLSENRIYVVRLIVTITTVISFILVYALIHELMPFVVRAMDLMYHQ >NZ_CP053075.1|WP_000429006.1|778570_779488_-|diacylglycerol-kinase-family-lipid-kinase MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMSHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_CP053075.1|WP_031760357.1|779578_779680_+|hypothetical-protein MVITDIDVYRVGRENIVIAVYNEHIKLLFILIS >NZ_CP053075.1|WP_000193751.1|779757_781263_-|peptide-MFS-transporter MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NZ_CP053075.1|WP_000930018.1|781605_782106_-|NADPH-dependent-7-cyano-7-deazaguanine-reductase-QueF MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNNLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_CP053075.1|WP_001068501.1|782125_782992_-|DMT-family-transporter MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFLYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSSREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFVLFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NZ_CP053075.1|WP_000692521.1|783792_784191_+|class-Ib-ribonucleoside-diphosphate-reductase-assembly-flavoprotein-NrdI MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_CP053075.1|WP_153906561.1|784153_786259_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-alpha MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSISFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGIAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_CP053075.1|WP_000562498.1|786376_787348_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-beta MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_CP053075.1|WP_000499195.1|787528_787684_+|hypothetical-protein MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLWSKNATINEKYYQ >NZ_CP053075.1|WP_000876318.1|787722_788694_+|ABC-transporter-permease MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP053075_3 | 818790-818868 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053075_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053075_3
>3.1|818814|31|NZ_CP053075|CRISPRCasFinder CTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053075_3
The CRISPR arrays of NZ_CP053075_3 >merge|NZ_CP053075|3|818790-818868|CRISPRCasFinder TGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCT >NZ_CP053075|3|3|818790-818868|CRISPRCasFinder TGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCT CTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGCC TGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCT
>NZ_CP053075.1|WP_000662677.1|815616_818463_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNIDLSEQDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIDVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGIDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDK >NZ_CP053075.1|WP_000229241.1|813623_815609_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrB MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVDGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >NZ_CP053075.1|WP_000638419.1|813118_813355_+|CsbA-family-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >NZ_CP053075.1|WP_000538141.1|812471_813122_+|HD-domain-containing-protein MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENE >NZ_CP053075.1|WP_000753318.1|811458_812298_+|CHAP-domain-containing-protein MKKTLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQHGTQVKTPVQHNYVSNVQAQTQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKAVKSPVRKASQAKKVVKQPVQQASKKVVVKQAPKQAVAKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTLEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH >NZ_CP053075.1|WP_001792175.1|811203_811311_+|hypothetical-protein MCLLKQHMQCAFSNITYGDFQGIELIVENVLNYMV >NZ_CP053075.1|WP_010956549.1|809939_811050_+|peptide-chain-release-factor-2 MELSEIKRNIDKYNQDLTQIRGSLDLENKETNIQEYEEMMAEPNFWDNQTKAQDIIDKNNALKAIVNGYKTLQAEVDDMDATWDLLQEEFDEEMKEDLEQEVINFKAKVDEYELQLLLDGPHDANNAILELHPGAGGTESQDWANMLFRMYQRYCEKKGFKVETVDYLPGDEAGIKSVTLLIKGHNAYGYLKAEKGVHRLVRISPFDSSGRRHTSFASCDVIPDFNNDEIEIEINPDDITVDTFRASGAGGQHINKTESAIRITHHPSGIVVNNQNERSQIKNREAAMKMLKSKLYQLKLEEQAREMAEIRGEQKEIGWGSQIRSYVFHPYSMVKDHRTNEETGKVDAVMDGDIGPFIESYLRQTMSHD >NZ_CP053075.1|WP_001790092.1|809666_809771_+|hypothetical-protein MLWEESFYFTSVKYFKKCEEVVKRCYVLSFKKSV >NZ_CP053075.1|WP_000506531.1|807093_809625_+|preprotein-translocase-subunit-SecA MGFLSKILDGNNKEIKQLGKLADKVIALEEKTAILTDEEIRNKTKQFQTELADIDNVKKQNDYLDKILPEAYALVREGSKRVFNMTPYKVQIMGGIAIHKGDIAEMRTGEGKTLTATMPTYLNALAGRGVHVITVNEYLSSVQSEEMAELYNFLGLTVGLNLNSKTTEEKREAYAQDITYSTNNELGFDYLRDNMVNYSEDRVMRPLHFAIIDEVDSILIDEARTPLIISGEAEKSTSLYTQANVFAKMLKQDEDYKYDEKTKAVHLTEQGADKAERMFKVENLYDVQNVDVISHINTALRAHVTLQRDVDYMVVDGEVLIVDQFTGRTMPGRRFSEGLHQAIEAKEGVQIQNESKTMASITFQNYFRMYNKLAGMTGTAKTEEEEFRNIYNMTVTQIPTNKPVQRNDKSDLIYISQKGKFDAVVEDVVEKHKAGQPVLLGTVAVETSEYISNLLKKRGIRHDVLNAKNHEREAEIVAGAGQKGAVTIATNMAGRGTDIKLGEGVEELGGLAVIGTERHESRRIDDQLRGRSGRQGDKGDSRFYLSLQDELMIRFGSERLQKMMSRLGLDDSTPIESKMVSRAVESAQKRVEGNNFDARKRILEYDEVLRKQREIIYNERNSIIDEEDSSQVVDAMLRSTLQRSINYYINTADDEPEYQPFIDYINDIFLQEGDITEDDIKGKDAEDIFEVVWAKIEAAYQSQKDILEEQMNEFERMILLRSIDSHWTDHIDTMDQLRQGIHLRSYAQQNPLRDYQNEGHELFDIMMQNIEEDTCKFILKSVVQVEDNIEREKTTEFGEAKHVSAEDGKEKVKPKPIVKGDQVGRNDDCPCGSGKKFKNCHGK >NZ_CP053075.1|WP_000617735.1|806107_806680_+|ribosome-associated-translation-inhibitor-RaiA MIRFEIHGDNLTITDAIRNYIEEKIGKLERYFNDVPNAVAHVKVKTYSNSATKIEVTIPLKNVTLRAEERNDDLYAGIDLINNKLERQVRKYKTRINRKSRDRGDQEVFVAELQEMQETQVDNDAYDDNEIEIIRSKEFSLKPMDSEEAVLQMNLLGHDFFVFTDRETDGTSIVYRRKDGKYGLIQTSEQ >NZ_CP053075.1|WP_000958224.1|819126_820059_+|HPr-kinase/phosphorylase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >NZ_CP053075.1|WP_000513305.1|820064_820904_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPSEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >NZ_CP053075.1|WP_001224793.1|820911_821397_+|acetyltransferase MRKFLSKTHHHTNPLWRVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >NZ_CP053075.1|WP_000057543.1|821404_822844_+|tetratricopeptide-repeat-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYQNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >NZ_CP053075.1|WP_000134963.1|822910_823846_+|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >NZ_CP053075.1|WP_000369730.1|824731_825643_+|RNase-adapter-RapZ MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLENMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >NZ_CP053075.1|WP_001248939.1|825639_826635_+|YvcK-family-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >NZ_CP053075.1|WP_000006551.1|826745_827690_+|DNA-binding-protein-WhiA MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >NZ_CP053075.1|WP_001049165.1|828253_828841_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >NZ_CP053075.1|WP_000070831.1|830687_831317_+|DUF4887-domain-containing-protein MSNQNYDYNKNEDGSKKKMSTTAKVVSIATVLLLLGGLVFAIFAYVDHSNKAKERMLNEQKQEQKEKRQKENAEKERKKKQQEEKEQNELDSQANQYQQLPQQNQYQYVPPQQQAPTKQRPAKEENDDKASKDESKDKDDNASQDKSDDNQKKTDDNKQPAQPKPQPQQPTPKPNNNQQNNQSNQQAKPQAPQQNSQSTTNKQNNANDK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP053075_4 | 824245-824514 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053075_4
|
4 spacers
spacers of NZ_CP053075_4
>4.1|824281|22|NZ_CP053075|CRT CCTGTAGAATTTCTTTTCGAAA >4.2|824339|23|NZ_CP053075|CRT TCTGTAGAAATTGGAAATCCAAT >4.3|824398|22|NZ_CP053075|CRT CCTGTAGAATTTCTTTTCGAAA >4.4|824456|23|NZ_CP053075|CRT TCTGTAGAAATTGGAAATCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053075_4
The CRISPR arrays of NZ_CP053075_4 >merge|NZ_CP053075|4|824245-824514|CRT GCTTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTTTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGGAAATCCAATTTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGGAAATCCAATTTCTCTGTGTTGGGGCCCCTGACTAGAGTTGAAAAA >NZ_CP053075|4|1|824245-824514|CRT GCTTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATTG CCTGTAGAATTTCTTTTCGAAA TTCTCTTTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTG TCTGTAGAAATTGGAAATCCAAT TTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATTG CCTGTAGAATTTCTTTTCGAAA TTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTG TCTGTAGAAATTGGAAATCCAAT TTCTCTGTGTTGGGGCCCCTGACTAGAGTTGAAAAA
>NZ_CP053075.1|WP_000134963.1|822910_823846_+|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >NZ_CP053075.1|WP_000057543.1|821404_822844_+|tetratricopeptide-repeat-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYQNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >NZ_CP053075.1|WP_001224793.1|820911_821397_+|acetyltransferase MRKFLSKTHHHTNPLWRVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >NZ_CP053075.1|WP_000513305.1|820064_820904_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPSEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >NZ_CP053075.1|WP_000958224.1|819126_820059_+|HPr-kinase/phosphorylase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >NZ_CP053075.1|WP_000662677.1|815616_818463_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNIDLSEQDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIDVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGIDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDK >NZ_CP053075.1|WP_000229241.1|813623_815609_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrB MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVDGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >NZ_CP053075.1|WP_000638419.1|813118_813355_+|CsbA-family-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >NZ_CP053075.1|WP_000538141.1|812471_813122_+|HD-domain-containing-protein MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENE >NZ_CP053075.1|WP_000753318.1|811458_812298_+|CHAP-domain-containing-protein MKKTLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQHGTQVKTPVQHNYVSNVQAQTQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKAVKSPVRKASQAKKVVKQPVQQASKKVVVKQAPKQAVAKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTLEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH >NZ_CP053075.1|WP_000369730.1|824731_825643_+|RNase-adapter-RapZ MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLENMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >NZ_CP053075.1|WP_001248939.1|825639_826635_+|YvcK-family-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >NZ_CP053075.1|WP_000006551.1|826745_827690_+|DNA-binding-protein-WhiA MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >NZ_CP053075.1|WP_001049165.1|828253_828841_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >NZ_CP053075.1|WP_000070831.1|830687_831317_+|DUF4887-domain-containing-protein MSNQNYDYNKNEDGSKKKMSTTAKVVSIATVLLLLGGLVFAIFAYVDHSNKAKERMLNEQKQEQKEKRQKENAEKERKKKQQEEKEQNELDSQANQYQQLPQQNQYQYVPPQQQAPTKQRPAKEENDDKASKDESKDKDDNASQDKSDDNQKKTDDNKQPAQPKPQPQQPTPKPNNNQQNNQSNQQAKPQAPQQNSQSTTNKQNNANDK >NZ_CP053075.1|WP_000654030.1|832129_833143_+|sugar-binding-transcriptional-regulator MKDLLQAQQKLIPDLIDKMYKRFSILTTISKNQPVGRRSLSEHMDMTERVLRSETDMLKKQDLIKVKPTGMEITAEGEQLISQLKGYFDIYADDNRLSEGIKNKFQIKEVHVVPGDADNSQSVKTELGRQAGQLLEGILQEDAIVAVTGGSTMACVSEAIHLLPYNVFFVPARGGLGENVVFQANTIAASMAQQAGGYYTTMYVPDNVSETTYNTLLLEPSVINTLDKIKQANVILHGIGDALKMAHRRQSPEKVIEQLQHHQAVGEAFGYYFDTQGQIVHKVKTIGLQLEDLESKDFIFAVAGGKSKGEAIKAYLTIAPKNTVLITDEAAAKIILE >NZ_CP053075.1|WP_000279415.1|833195_834206_+|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MAVKVAINGFGRIGRLAFRRIQEVEGLEVVAVNDLTDDDMLAHLLKYDTMQGRFTGEVEVVDGGFRVNGKEVKSFSEPDASKLPWKDLNIDVVLECTGFYTDKDKAQAHIEAGAKKVLISAPATGDLKTIVFNTNHQELDGSETVVSGASCTTNSLAPVAKVLNDDFGLVEGLMTTIHAYTGDQNTQDAPHRKGDKRRARAAAENIIPNSTGAAKAIGKVIPEIDGKLDGGAQRVPVATGSLTELTVVLEKQDVTVEQVNEAMKNASNESFGYTEDEIVSSDVVGMTYGSLFDATQTRVMSVGDRQLVKVAAWYDNEMSYTAQLVRTLAYLPELSK >NZ_CP053075.1|WP_001074756.1|834344_835535_+|phosphoglycerate-kinase MAKKIVSDLDLKGKTVLVRADFNVPLKDGEITNDNRIVQALPTIQYIIEQGGKIVLFSHLGKVKEESDKAKLTLRPVVEDLSKKLDKEVVFVPETRGEKLEAAIKDLKEGDVLLVENTRYEDLDGKKESKNDPELGKYWASLGDVFVNDAFGTAHREHASNVGISTHLETAAGFLMDKEIKFIGGVVNDPHKPVVAILGGAKVSDKINVIKNLVNIADKIIIGGGMAYTFLKAQGKEIGISLLEEDKIDFAKDLLEKHGDKIVLPVDTKVAKEFSNDAKITVVPSDSIPADQEGMDIGPNTVKLFADELEGAHTVVWNGPMGVFEFSNFAQGTIGVCKAIANLKDAITIIGGGDSAAAAISLGFENDFTHISTGGGASLEYLEGKELPGIKAINNK >NZ_CP053075.1|WP_001260089.1|835656_836418_+|triose-phosphate-isomerase MRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTAVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGETSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHETDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETDEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSEDQLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGASLKVEDFVQLLEGAK >NZ_CP053075.1|WP_001085505.1|836420_837938_+|2,3-bisphosphoglycerate-independent-phosphoglycerate-mutase MAKKPTALIILDGFANRESEHGNAVKLANKPNFDRYYNKYPTTQIEASGLDVGLPEGQMGNSEVGHMNIGAGRIVYQSLTRINKSIEDGDFFENDVLNNAIAHVNSHDSALHIFGLLSDGGVHSHYKHLFALLELAKKQGVEKVYVHAFLDGRDVDQKSALKYIEETEAKFNELGIGQFASVSGRYYAMDRDKRWEREEKAYNAIRNFDAPTYATAKEGVEASYNEGLTDEFVVPFIVENQNDGVNDGDAVIFYNFRPDRAAQLSEIFANRAFEGFKVEQVKDLFYATFTKYNDNIDAAIVFEKVDLNNTIGEIAQNNNLTQLRIAETEKYPHVTYFMSGGRNEEFKGERRRLIDSPKVATYDLKPEMSAYEVKDALLEELNKGDLDLIILNFANPDMVGHSGMLEPTIKAIEAVDECLGEVVDKILDMDGYAIITADHGNSDQVLTDDDQPMTTHTTNPVPVIVTKEGVTLRETGRLGDLAPTLLDLLNVEQPEDMTGESLIKH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP053075_5 | 867760-867841 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053075_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053075_5
>5.1|867784|34|NZ_CP053075|CRISPRCasFinder ATTGAGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053075_5
The CRISPR arrays of NZ_CP053075_5 >merge|NZ_CP053075|5|867760-867841|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGAGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCATCCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA >NZ_CP053075|5|4|867760-867841|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAA ATTGAGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCAT CCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA
>NZ_CP053075.1|WP_000932225.1|866777_867656_+|DUF1963-domain-containing-protein MLNIQDVSHLSKKEQKAYNRFVESVENGNLPVLPCIEMDLKEMQEETLSQSKIGGMPFLKSFKDIPLDENNVPMVLLAQINLNDLPEQQELFPVNEGILQFWISSEDQMYGMSENLKGNNINSRLVYIKEPITDLSLENIQVHLKSLDADNEDIPFSGAFSIEFRLSKQTITCTDYKYDEDVLALWNKVNPSFALKSMFGGYDELMEPVCNTFTAKEPFNQLGGYPYFDQIDPRTNDQELKMYDRVLLQIDSTRDGNSSIIWGDLGIANILVKSTDLEAMKFDDYMYSWDCS >NZ_CP053075.1|WP_000290491.1|866218_866599_+|glycine-cleavage-system-protein-GcvH MAVPNELKYSKEHEWVKVEGNVATIGITEYAQSELGDIVFVELPETDDEINEGDTFGSVESVKTVSELYAPISGKVVEVNEELEDSPEFVNESPYEKAWMVKVEISDESQLEALLTAEKYSEMIGE >NZ_CP053075.1|WP_000589549.1|865704_866061_+|arsenate-reductase-family-protein MIKFYQYKNCTTCKKAAKFLDEYGVSYEPIDIVQHTPTINEFKTIIANTGVEINKLFNTHGAKYRELDLKNKLQTLSDDEKLELLSSDGMLVKRPLAVMGDKITLGFKEDQYKETWLA >NZ_CP053075.1|WP_001147952.1|865240_865561_-|thioredoxin-family-protein MQAIKSNESFKSIINSDTPVIVKFEAGWCPDCRAMDLWIDPIVEQYNDYQWYTVNRDELEDVVVENEVMGIPSLLVFKNGDKIAHLHSANAKSPEQVESFLAETFK >NZ_CP053075.1|WP_000422908.1|864550_865090_+|nitroreductase MELQQAIANRRSVKKFKRDMHIDDALLYQAIEKAADAPNHGMREPWRVVHVPKDRLGDMSKDISKFAFPNELDKQQCHYDAVTKLGGMLLLILKTDPRQRQNDENYFAFGAYAQNLMLLLYEAGIGTCWKSPLYIYDPKVRKTLGIKKDEVLAGFLYLTDLEEDMPKAPRKNRNLITLY >NZ_CP053075.1|WP_000150011.1|863751_864468_+|type-I-3-dehydroquinate-dehydratase MTHVEVVATIAPQLSIEETLIQKINHRIDAIDVLELRIDQIENVTVDQVAEMITKLKVMQDSFKLLVTYRTKLQGGYGQFINDLYLNLISDLANINGIDMIDIEWQADIDIEKHQRIIKHLQQYNKEVVISHHNFESTPPLDELQFIFFKMQKFNPEYVKLAVMPHNKNDVLNLLQAMSTFSDTMDCKVVGISMSKLGLISRTAQGVFGGALTYGCIGEPQAPGQIDVTDLKAQVTLY >NZ_CP053075.1|WP_000974460.1|863181_863604_-|organic-hydroperoxide-resistance-protein MAIHYETKATNVGGRKGHVYTDDRALDIDIVPPAQADGKATNPEQLFAAGYASCFNGAFDLILKQNKVRDAHPEVTLTVRLEDDSDSESPKLSVSIDATIKNVISQEEAEKYLQMAHEFCPYSKATQGNINVDLNVNVVD >NZ_CP053075.1|WP_000569884.1|862288_862783_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MIEIKTLTNNDFNEYKRLVSTVNEEFTQDSHYSQTMTDTLIHDILNQGSPKCIVFGCYENETLIATAALEQIRYVGKEHKSLIKYNFVTNNDKSINSELINFIINYARQNNYESLLTSIVSNNIGAKVFYSALGFDILGFEKNAIKIGNTYFDEHWLFYDLINK >NZ_CP053075.1|WP_000255551.1|861516_862134_-|amino-acid-transporter MVTAIIHGFILAIGLILPLGAQNVFIFNQGANQPKYRYVLPAIITAGLSDSLLIIIAVVGVSIIIMSLPVLQAIIYIVGLIFLMYMAWTIWHDKPSTDGEAQIISPMKQVSFALSVSLLNPHAILDTIGVIGSSAALYSGSNKIAFTIACISVSWLWFFLLAILGKMVGSIDKTGKLLTIINKISSIIIIIVALMILQKLIQLLF >NZ_CP053075.1|WP_001140693.1|860862_861444_+|histidine-phosphatase-family-protein MAKTLYLMRHGQTLFNFKGLIQGFGDSPLTELGIAQAQKARSYYETKGINFDLYASSTQERASDTLENVAPNQSYQRFKGLKEWHFGIFEGESVYLFDNLYKPEDLFGDRIVPFKGEARQQVEERIVKTLHDIMSQTKNNALVVSHGTIMGVFLRYCLKLDEALKHNIGNCNILKFEYDNGTFKFVELIDPNL >NZ_CP053075.1|WP_001018962.1|868183_868570_+|topiosmerase MAIVNKVIIVEGKSDKKRVQQVIAEPVNIICTHGTMSIDKLDDMIESLYDKQVFVLADSDDEGDRIRNWFKRYLSESEHIFIDKTYCQVANCPKQYLAHVLSKHGFTCKKETPLLPNINNERLVLVNE >NZ_CP053075.1|WP_001065801.1|868562_868859_+|thioredoxin-family-protein MNNSLDIKDVTTFYEEDKHLIFGYTPTCGTCKVSERMLDIANEILQLPLLKIDLNFYPQFCKDMQIMSTPILLLMNKDKEVKRIYAFKSVTDLLENLK >NZ_CP053075.1|WP_000571213.1|869108_870134_+|methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIELKEVVKEYRTKNKEVLAVDHVNLSIRAGSIYGVIGFSGAGKSTLIRMFNHLEAPTSGEVIIDGDHIGQLSKNGLRAKRQKVSMIFQHFNLLWSRTVLKNIMFPLEIAGVPRRRAKQKALELVELVGLKGREKAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPTVLLCDEATSALDPQTTDEILDLLLKIREQQNLTIVLITHEMHVIRRICDEVAVMESGKVIEHGPVTQVFENPQHTVTKRFVKEDLNDDFETSLTELEPLEKDAYIVRLVFAGSTTTEPIVSSLSTAYDIKINILEANIKNTKNGTVGFLVLHIPYISSVDFGKFEKELIERQVKMEVLRHG >NZ_CP053075.1|WP_000520231.1|870126_870822_+|ABC-transporter-permease MGKSFSEIINEMITMPNIQWPEVWTAIVETLYMTVVSTIFAFILGLILGVLLFLSAKGKSIGARLFYSIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSLILGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTWIVIRKVLLPEAMPALVSGITVTAIALVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWLTNKLDKR >NZ_CP053075.1|WP_000732325.1|870839_871661_+|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGNKSGSDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYDLDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGDVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFSPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK >NZ_CP053075.1|WP_000270271.1|871803_873024_-|site-specific-integrase MWYEKFTNKHGETKYRYYEKYKDPLTNKWRRVSVVLNKNGKQSQKEAQRRLNERIEAKLNDNTPTTLKSLTFHVACDEWFQNYIKTSGSKRTTIKTKLSKLNTLKKFVDEDILINKITLSYAQQVFDEMDSKGYVYQVNKDALSIFKNVFEYTRRIYKLQDLEFLKDITLNKRIKSYDEVKAKRNKYLELNEIQSIIKDINMKAQKMHSGIHKRFYLFVALMTEFQALNGMRIGEMLAIKNEDIDFDNKSLNINGTIHWFHDESGGFGVKDTTKTESSYRTIGLSSRSCEILKKAILENKKDSKWNDGYLNRNFVFTNHKGNPMQTERFNKILRESAKDVGIEKEISSHILRHSHISLLSQQGVSLKAIMDRVGHSDHRTTLSIYSHVTEQMDKDMMNKLEQVKLG >NZ_CP053075.1|WP_025173845.1|873037_874426_-|SAP-domain-containing-protein MKKIFYCFLLIFSILMLFGGINEVTQNKLTFIDIFMFAIFISLIVFSIVKLFKHNHLDYKSNKSNTNHKNISNSKTTQFNTVQSNDHIRKNNITHDIETNNTKKVKQVKSITNNKTNTLNKDQVKLNENVQENNQDLVIDVKDDNNNNYHYDLNANDILILHLNKNREVGKEVKNHFYLLENQINVDEILNKLINLNYLDIKSNFDVSLFYLKVPELKEILREYKLKLSGNKPELIERIKTNIDENAIKLPQVYVPTSKGNKIIGETEYILHFYNSPIISLGSAHKMAKEVLNIDDKIEYIYFYLLQQNQKSNNSDHRTANIINSLVLYYKKTNKDKDVIRKYTNYATYLSVTQGIHSAAFLYSSEENIIDRLFIYFNYHLEYYENMLFIDNVSRRLFKNLFYEDIKSFEDTDKNFCDEICELLFAQIYNNRNITLNNLPTINYVLEKIKKENEIRMTKYDF >NZ_CP053075.1|WP_001661454.1|874452_875025_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MQQNSLEDFSNILKNFRKAEDLTLDTLSKYLGVSDVYVSKLENGKRFPSKNILFWYVLFMDQSQMHDDIEKLLTIFSENKKISYEQLRTEYDEFVKKFREKQKKHSSKIQRKEIKLTMNEFNQYQIEEIDEPYFDLKWLLNQSEYKLFYSGIDNKNSLGFNEVLSESDKKMLSEIVNSVIQRIYNDENQK >NZ_CP053075.1|WP_000560872.1|875196_875418_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MIAKVNYLKRLIAFEGLSLKDFASEIEVNSNFLNSIVNGKRTTSPKTANKIAKRLNVDIKDIFIFIEEKEEVK >NZ_CP053075.1|WP_000124597.1|875418_875691_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MARTKLKDIPTKENTISEPKQVVVKPLFAKPNALASIFGISYSSTNRILKEWEKDPKGVDDLYYSLSSTMTVISIPRFEEYMKKRHKKWM |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP053075_6 | 1291205-1291289 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053075_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053075_6
>6.1|1291231|33|NZ_CP053075|CRISPRCasFinder TGGGCCCCAACACAGAGAAATTGGATTCCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053075_6
The CRISPR arrays of NZ_CP053075_6 >merge|NZ_CP053075|6|1291205-1291289|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTGTGGGCCCCAACACAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTG >NZ_CP053075|6|5|1291205-1291289|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTG TGGGCCCCAACACAGAGAAATTGGATTCCCAAT TTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTG
>NZ_CP053075.1|WP_000368338.1|1289208_1291032_+|elongation-factor-4 MDNEQRLKRRENIRNFSIIAHIDHGKSTLADRILENTKSVETRDMQDQLLDSMDLERERGITIKLNAVRLKYEAKDGNTYTFHLIDTPGHVDFTYEVSRSLAACEGAILVVDAAQGIEAQTLANVYLALDNELELLPVINKIDLPAAEPERVKQEIEDMIGLDQDDVVLASAKSNIGIEEILEKIVEVVPAPDGDPEAPLKALIFDSEYDPYRGVISSIRIVDGVVKAGDKIRMMATGKEFEVTEVGINTPKQLPVDELTVGDVGYIIASIKNVDDSRVGDTITLASRPASEPLQGYKKMNPMVYCGLFPIDNKNYNDLREALEKLQLNDASLEFEPESSQALGFGYRTGFLGMLHMEIIQERIEREFGIELIATAPSVIYQCILRDGSEVTVDNPAQMPDRDKIDKIFEPYVRATMMVPNDYVGAVMELCQRKRGQFINMDYLDDIRVNIVYELPLAEVVFDFFDQLKSNTKGYASFDYEFIENKESNLVKMDILLNGDKVDALSFIVHRDFAYERGKALVEKLKTLIPRQQFEVPVQAAIGQKIVARTNIKSMGKNVLAKCYGGDISRKRKLLEKQKAGKAKMKAVGNVEIPQDAFLAVLKMDDE >NZ_CP053075.1|WP_001274017.1|1288611_1288863_-|30S-ribosomal-protein-S20 MANIKSAIKRVKTTEKAEARNISQKSAMRTAVKNAKTAVSNNADNKNELVSLAVKLVDKAAQSNLIHSNKADRIKSQLMTANK >NZ_CP053075.1|WP_001282563.1|1287592_1288567_+|DNA-polymerase-III-subunit-delta MSDNIVAIYGDVPELVEKQSAEIISQFLKSDRDDFNFVKYNLYETEIAPIVEETLTLPFFSDKKAILVKNAYIFTGEKAPKDMAHNVDQLIEFIEKYDGENLIVFEIYQNKLDERKKLTKTLKKHARLKKIEQMSEEEIKKWIQSKLNENFKDIKRDALDLFIELTGINFNIVSQEIEKLILFLGDRPTINKQDVNQIINRSLEQNVFLLTEYIQKRKKEQAIHLVKDLITMKEEPIKLLALITSNYRLFYQCKILSQKGYSGQQIAKTIGVHPYRVKLALGQVRHYQLDELLNIVDACAETDYKLKSSYMDKQLILELFILSL >NZ_CP053075.1|WP_170172349.1|1285334_1287536_+|DNA-internalization-related-competence-protein-ComEC/Rec2 MLYVALSMIVGVLWNSSKVLSTFLFILLLYITYRKNKIVYAPISLFLIIFYSWYLHYSQQAIFNYINYIERNSQFNERAQVIQIQRQGSDTYKGRLSLKNEIYPFFLTDKKNFDLKKIESRNCIVKGQFKVNENKFVTLKLQSIVVQSCLESNRSNLIEKHKQFIMNRIYDSGIKFPDRIMALITGDVKEINEQFKERVKEIGIYHLLAVSGSHIAAIVFLIYQPLKRLNLPLFVIKGITIIVLTLYAQYTNYAPSAVRAIIMTTLVLLITKQIKIKGIQLLAFAFIIMFILNPLVVYDIGFQFSFIISFFIMLLFPFLQQLSKLQSLFIITFIAQLASFIVAIPNFHQLQWVGFLSNLIFVPYYSIILFPLSILFFITSHFIVGLTPLNYLVDLSFNFHDWLLDLFTRIKQSHFSVPKFNDWIFIIFIISVYYIFWLLAKRKYILVTFWTIIILTLLITFPTNSHHKITMLNVGQGDSILYEGGKNQNVLIDTGGKVIDDTKQPSYSISKYHILPTLNERGINELEYLILTHPHNDHIGEVEYIISHIKIKHIVIYNKGYSSNTLMLLSKLSHKYNIKLMDVRQVSSFKLGDSSFLFFDSFIPNSRDKNEYSIITMITYQNKKVLLMGDASKNNESLLLKKYNLPEIDILKVGHHGSKTSSSKEFIEMIKPKISLISSGKNNMYHLPNIEVVKRLQRIRSRIYNSQQNGQVTIDLDDNLKVDSNSYGNASGL >NZ_CP053075.1|WP_000439693.1|1284868_1285330_+|ComE-operon-protein-2 MERIKWEEYFMAQSHLLALRSTCQRLSVGATIVKDNRIIAGGYNGSVAGEVHCIDEGCLIEDGHCIRTIHAEMNALLQCAKQGVSTEGATIYVTHFPCLNCTKSIIQAGIKRIYYAEDYHNHEYATKLLKQSGIEFKKIPFSPEYVAKYLTKG >NZ_CP053075.1|WP_001802022.1|1284090_1284777_+|ComEA-family-DNA-binding-protein MVLLYQFLLRYKDFLTQWKLYIISAVVLIMVLIGFIFWRQDDYTSRNFENKDTALKQSTSENNSLSKLEDVQVKDGDNSKNKGPVYVDVKGAVKHPNVYKMTSKDRVVDLLDKAQLLDDADVSRINLSEKLTDQKMIFIPHKGQKNVEPQIEVNSVHVKNGNTNNTKVNLNTASVSELMSVPGVGQAKANAIVEYRNQQGAFQEIDDLKKVKGFGSKTFDKLKSYFTI >NZ_CP053075.1|WP_000084829.1|1283334_1284051_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MSQYAEMSLVYDQLTQDQPYEKWFEIVKNHCKDESNILDIGCGTGSLTVQLEALGNVTGMDLSVDMLTVAAQKSANVNWLEGDMTSFDLQQQFDIITIFCDSLNYLQDETAVIETFINVYHHLTDSGVFIFDVHTVYKMMTLFNNQSYIDDKGDIFLAWDAVQGDLPLSVYHDMTFFIRHEDETYSRFDESHFQRTFDEKTYLSWLAQVGFKHVETFTDFNIDEHNEDAERLFFIAKK >NZ_CP053075.1|WP_001088020.1|1282978_1283332_+|ribosome-silencing-factor MNSQELLAIAVDAIDNKKGEDTISLEMKGISDMTDYFVVTHGNNERQVQAIARAVKEVANEQNIEVKRMEGYNEARWILIDLADVVVHVFHKDERNYYNIEKLYQDAPLESYGQVAY >NZ_CP053075.1|WP_001019324.1|1282393_1282978_+|HD-domain-containing-protein MNIEKAKRLAKEKLPEKRYNHSLRVAETAIKLAEIYDGDTSKVELAGVLHDFCKYDDLGKMYQIVRQYELGNDLLSYGSEILHGPVCAAIMEHEYGINDEEVLMAIKYHTTGRQQMTKTEKLIFIADYIEPGRTIPGVDDIRDMAYNQGSLDKTIYEISKRTVLFLIQKDITVYNKTIDCLNYYNYSDERIKDD >NZ_CP053075.1|WP_170172348.1|1281834_1282404_+|nicotinate-(nicotinamide)-nucleotide-adenylyltransferase MKKIVLYGGQFNPIHTAHMIVAIEVFHELQPDEFYFLPSFMSPLKKHNNFIDVQHRLTMIQMIIDELGFGDICDDEIKRGGQSYTYDTIKAFKEQHKDSELYFVIGTDQYNQLEKWYQIEYLKEMVTFVVVNRDKNSQNVENAMIAIQIPRVDISSTMIRQRVSEGKSIQVLVPKSVENYIKGEGLYEH >NZ_CP053075.1|WP_000218103.1|1291597_1292722_+|oxygen-independent-coproporphyrinogen-III-oxidase MTVQSAYIHIPFCVRICTYCDFNKYFIQNQPVDEYLDALITEMSTAKYRNLKTMYVGGGTPTALSINQLERLLKAIRDTFTITGEYTFEANPDELTKEKVQLLEKYGVNRISMGVQTFKPELLSVLGRTHNTEDIYTSVLNAKNAGIKSISLDLMYHLPKQTIEDFEQSLDLALDMDIQHISSYGLILEPKTQFYNMYRKGLLKLPNEDLGADMYQLLMSKIEQSPFHQYEISNFALDGHESEHNKVYWFNEEYYGFGAGASGYVDGVRYTNINPVNHYIKAINKESKAILVSNKPSLTERMEEEMFLGLRLNEGVSSSRFKKKFDQSIESVFGQTINNLKEKELIVEKNDAIALTKRGKVIGNEVFEAFLIND >NZ_CP053075.1|WP_000627144.1|1292822_1293800_+|heat-inducible-transcription-repressor-HrcA MITDRQLSILNAIVEDYVDFGQPVGSKTLIERHNLNVSPATIRNEMKQLEDLNYIEKTHSSSGRSPSQLGFRYYVNRLLEQTSHQKTNKLRRLNQLLVENQYDVSSALTYFADELSNISQYTTLVVHPNHKQDIINNVHLIRANPNLVIMVIVFSSGHVEHVHLASDIPFSNDKLNTISNFVTNKLTEFNQNLQDDIVSFVQSEQEEIFINKLINTMNNHISNQSNSIYMGGKVKLIDALNESNVSSIQPILQYIESNRIAELLQDISSPNINVKIGNEIDDSLSDISIVTSQYHFDETLKGQIAVIGPTAMHYQNVIQLLNRIW >NZ_CP053075.1|WP_000182211.1|1293831_1294458_+|nucleotide-exchange-factor-GrpE MTNKDESVEKNTESTVEETNIKQNIDDSVEQAEESKGHLQDEAIEETSDENVIEEIDPKDQKINELQQLADENEEKYLRLYAEFENYKRRIQKENEINKTYQAQRVLTDILPAIDNIERALQIEGDDETFKSLQKGVQMVHESLINALKDNGLEVIKTEGEAFDPNIHQAVVQDDNPDFESGEITQELQKGYKLKDRVLRPSMVKVNQ >NZ_CP053075.1|WP_170172350.1|1294526_1296359_+|molecular-chaperone-DnaK MSKIIGIDLGTTNSCVTVLEGDEPKVIQNPEGSRTTPSVVAFKNGETQVGEVAKRQAITNPNTVQSIKRHMGTDYKVDIEGKSYTPQEISAMILQNLKNTAESYLGEKVDKAVITVPAYFNDAERQATKDAGKIAGLEVERIINEPTAAALAYGLDKTDKDEKVLVFDLGGGTFDVSILELGDGVFEVLSTAGDNKLGGDDFDQVIIDYLVAEFKKENGVDLSQDKMALQRLKDAAEKAKKDLSGVSQTQISLPFISAGENGPLHLEVNLTRSKFEELSDSLIRRTMEPTRQAMKDAGLTNSDIDEVILVGGSTRIPAVQEAVKKEIGKEPNKGVNPDEVVAMGAAIQGGVITGDVKDVVLLDVTPLSLGIEILGGRMNTLIERNTTIPTSKSQIYSTAVDNQPSVDVHVLQGERPMAADNKTLGRFQLTDIPPAERGKPQIEVTFDIDKNGIVNVTAKDLGTNKEQRITIQSSSSLSDEEIDRMVKDAEVNAEADKKRREEVDLRNEADSLVFQVEKTLTDLGENIGEEDKKSAEEKKGALKTALEGQDIEDIKSKKEELEKVIQELSAKVYEQAAQQQQQAQGANAGQNNDSTVEDAEFKEVKDDDKK >NZ_CP053075.1|WP_001119021.1|1296494_1297634_+|molecular-chaperone-DnaJ MAKRDYYEVLGISKDASKDEIKKAYRKLSKKYHPDINKEEGADEKFKEISEAYEVLSDDNKRASYDQFGHDGPQGFGGQGFNGSDFGGFSGFGGGGFEDIFSSFFGGGRQRDPNAPQKGDDLQYTMTLTFEEAVFGTTKEISIRKDVTCETCHGDGAKPGTSKKTCSYCNGAGHVAVEQNTILGRVRTEQVCPKCNGSGQEFEEACPTCHGKGTENKTVKLEVKVPEGVDNEQQIRLAGEGSPGVNGGPAGDLYVVFRVKPSETFKRDGDDIYYKLNVSFPQAALGDEIKIPTLNNEVMLTIPAGTQTGKQFRLKEKGIKNVHGYGYGDLYVDIKVVTPTKLTDRQKELMKEFAQLNGEEINEQPSNFKDRAKRFFKGE >NZ_CP053075.1|WP_001104607.1|1297637_1298576_+|50S-ribosomal-protein-L11-methyltransferase MNWTELSIIINHEAVELATNILENHGSNGVVIEDSDDLINQPEDKYGEIYALKKEDYPDKGVRLKAYFNEMTYDDKLRQQIKDELLNLDELDQHNIQFSEQIIAETDWENEWKNYFHPFRASKKFTIVPSWETYAKEADEELCIELDPGMAFGTGDHPTTSMCLKAIETYVLPQHSVIDVGTGSGILSIASHLIGVKRIKALDIDEMAVSVAKENFRRNHCETLIEAVPGNLLKDETEKFDIVIANILAHIIDEMIEDAYNTLNEGGYFITSGIIKEKYEGIQSHMERVGFKIISEQHDNGWVCLVGQKVSE >NZ_CP053075.1|WP_001190120.1|1298577_1299330_+|16S-rRNA-(uracil(1498)-N(3))-methyltransferase MQRYFIDQNADVSQRFFITKKEDIHHITNVMRYDVGSKIILTFNDQTVYLCEIADITSDKIAVDLKEKQNINTELPVDVTICSGLIKADKYEWLLQKATELGASSFIAVSMERSIVKLNEAKVVKKIERWQKIIKEAAEQSYRLVIPSIQFESNLKLICDTIDNYDYILIAYEEEAKDGELSNFKQTLQQFKAQDKVLMIFGPEGGLSENEISLFSNTSTVVGLGPRILRAETAPLYALSAISYEKELMG >NZ_CP053075.1|WP_000108667.1|1299336_1300683_+|tRNA-(N(6)-L-threonylcarbamoyladenosine(37)-C(2))--methylthiotransferase-MtaB MSTVAFHTLGCKVNHYETEAIWQLFKEANYERVDFEANADVFVINTCTVTNTGDKKSRQIIRRAIRQNPDAVICVTGCYAQTSSAEIMEIPGVDVVVGTQDRHKLLGYIDEFRKERQPINGVGNIMKNRKYEELDVPYFTDRTRASLKIQEGCNNFCTFCIIPWARGLMRSRDPEKVVEQATQLVNSGYKEIVLTGIHTGGYGQDLKDYNLAQLLRDLETINGLERIRISSIEASQLTDEVIDVLERSTKVVRHLHIPLQSGSDTVLKRMRRKYTMDRFSERLTKLHKALPDLAVTSDVIVGFPGETEAEFQETYDFIVKHKFSELHVFPYSPRIGTPAARMDDQIDEEIKNERVHKLITLSNQLGKLYASKFDQDVLEVIPEEQGDTEGTLVGYADNYMKVQFEGDESLIGQIVKVKITQANYPLNEGQAIKVVDFATNKSDREVLV >NZ_CP053075.1|WP_000048060.1|1300975_1301152_+|30S-ribosomal-protein-S21 MSKTVVRKNESLEDALRRFKRSVSKSGTIQEVRKREFYEKPSVKRKKKSEAARKRKFK >NZ_CP053075.1|WP_001802667.1|1301395_1302079_+|hypothetical-protein MTTILESTAGDTWVEQVSNIIVQPIFTLILTCLTFLGFVYQLYSKKINAAGIIATLSLLILFLGFLIQGNVNMHSILIFSIGVILVVIELFVVGAVIGIIGMILITISITTLGDNLLFMLANVIVALILTIVEWVILVKIFNRKIPFLDKVILKDSTNSESGYNSHDNRSHLVGKTAQTVTDLRPAGIIFCENERIDAVSDGNFILRNKTVKILEVEGTRVVVREVD |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP053075_7 | 2280984-2281064 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053075_7
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1 spacers
spacers of NZ_CP053075_7
>7.1|2281008|33|NZ_CP053075|CRISPRCasFinder ATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTT |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053075_7
The CRISPR arrays of NZ_CP053075_7 >merge|NZ_CP053075|7|2280984-2281064|CRISPRCasFinder CAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTCAACTTTAGTTGTTAGGGGCTTCT >NZ_CP053075|7|6|2280984-2281064|CRISPRCasFinder CAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTT ATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTT CAACTTTAGTTGTTAGGGGCTTCT
>NZ_CP053075.1|WP_000495669.1|2279875_2280967_+|hypothetical-protein MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYAQTIAIYSQFGQKPPVDAYLKVIAVLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKDKKVVTEPKNTKVENGKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >NZ_CP053075.1|WP_000019734.1|2278632_2279610_+|CDF-family-zinc-efflux-transporter-CzrB MSHSHHHDHMHSHVTTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALVAFIYAEKNATTTKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH >NZ_CP053075.1|WP_000003759.1|2278310_2278631_+|Zn(II)-responsive-metalloregulatory-transcriptional-repressor-CzrA MSEQYSEINTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL >NZ_CP053075.1|WP_001024092.1|2277493_2278159_-|SDR-family-oxidoreductase MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHCVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFDGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNHQEFQIISGEQDIKDALTQFEIEKD >NZ_CP053075.1|WP_001127960.1|2276119_2277058_-|class-I-mannose-6-phosphate-isomerase MPLFLQPILKTKLWGGQRLSEFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGTSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIVIGTLAESREEVANHVQHGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDITYRLYDFNRQDNQYNDRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYV >NZ_CP053075.1|WP_000808817.1|2275858_2276089_-|hypothetical-protein MKQFLYIALVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQISASLKFSALLINVLPLCGTFVASN >NZ_CP053075.1|WP_000123398.1|2273813_2275187_-|EVE-domain-containing-protein MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRMSNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVKKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD >NZ_CP053075.1|WP_001123303.1|2272943_2273357_-|thiol-disulfide-oxidoreductase-DCC-family-protein MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYQFATLKGEVGQQFFKQHPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIKLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD >NZ_CP053075.1|WP_000070866.1|2272300_2272744_-|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLENAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS >NZ_CP053075.1|WP_000160304.1|2271469_2272180_+|purine-nucleoside-phosphorylase MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGTYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKAKNVADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNDAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE >NZ_CP053075.1|WP_001802298.1|2281400_2281505_-|hypothetical-protein MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISTQDHKK >NZ_CP053075.1|WP_001792784.1|2282184_2282343_+|hypothetical-protein MSKSSDALFNSLTQSFELIEGVYNELVTDNLKIVMYKPRKESTSGRINRRFK >NZ_CP053075.1|WP_000370925.1|2283000_2283858_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINQLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQITNLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAKHFLAD >NZ_CP053075.1|WP_000908182.1|2283925_2284708_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLIQLDQIGRMKQGKTILKNISWQIAKGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATTGGVNLFGKMPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEVRNEAHHLLKLVGISAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLNILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITGNFTKILLLKDGESVQQGLIDDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE >NZ_CP053075.1|WP_000334463.1|2284939_2286745_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing) 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>NZ_CP053075.1|WP_000648741.1|2291576_2292683_+|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKAVHFGAGNIGRGFIGYILTDNNVKVTFADVNEEIINALAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFAPFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVLDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFAGKATVLDAVKDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAGYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTADQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS >NZ_CP053075.1|WP_001048267.1|2293001_2300447_-|DUF1542-domain-containing-protein 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|
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053075_8 | 2293306-2293391 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053075_8
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053075_8
>8.1|2293332|34|NZ_CP053075|CRISPRCasFinder TTGCATATCTTTAGCTTTATTGTTTGCAACTGGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053075_8
The CRISPR arrays of NZ_CP053075_8 >merge|NZ_CP053075|8|2293306-2293391|CRISPRCasFinder CCAACTGATTTTTGCGTATCATTAGTTTGCATATCTTTAGCTTTATTGTTTGCAACTGGGCCAACTGATTTTTGCGTATCATTAGT >NZ_CP053075|8|7|2293306-2293391|CRISPRCasFinder CCAACTGATTTTTGCGTATCATTAGT TTGCATATCTTTAGCTTTATTGTTTGCAACTGGG CCAACTGATTTTTGCGTATCATTAGT
>NZ_CP053075.1|WP_000648741.1|2291576_2292683_+|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKAVHFGAGNIGRGFIGYILTDNNVKVTFADVNEEIINALAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFAPFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVLDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFAGKATVLDAVKDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAGYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTADQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS >NZ_CP053075.1|WP_001292149.1|2291142_2291577_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA >NZ_CP053075.1|WP_000927371.1|2288998_2291131_+|BglG-family-transcription-antiterminator MLLSTREKEMIALLIKYHSQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVEAYLTSFSLTLERANKKGLRIAGADSDLNDLKQSIAQHQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELDLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLGQIYDVTFNQAEIAFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVNKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFIVLHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLEQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIDSPYLTVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFQETHDKSSNMIDKDDVHVETKDVDGNTSFENEQTSYLTSVFEKHLSDEKSEQLLHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDVINDPTSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMILITVLEEPLTLPSIQNDNQTIKYMISMFIPDNDFMASLVSDLSEFLSLKLESIDTFMENPQELETLLRNKFLERIKKQFI >NZ_CP053075.1|WP_000083807.1|2287425_2288964_+|PTS-mannitol-transporter-subunit-IICB 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>NZ_CP053075.1|WP_000370925.1|2283000_2283858_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINQLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQITNLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAKHFLAD >NZ_CP053075.1|WP_001792784.1|2282184_2282343_+|hypothetical-protein MSKSSDALFNSLTQSFELIEGVYNELVTDNLKIVMYKPRKESTSGRINRRFK >NZ_CP053075.1|WP_001802298.1|2281400_2281505_-|hypothetical-protein MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISTQDHKK >NZ_CP053075.1|WP_000495669.1|2279875_2280967_+|hypothetical-protein MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYAQTIAIYSQFGQKPPVDAYLKVIAVLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKDKKVVTEPKNTKVENGKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >NZ_CP053075.1|WP_000521495.1|2300724_2302080_-|phosphoglucosamine-mutase MGKYFGTDGVRGVANQELTPELAFKLGRYGGYVLAHNKGEKHPRVLVGRDTRVSGEMLESALIAGLISIGAEVMRLGIISTPGVAYLTRDMGAELGVMISASHNPVADNGIKFFGSDGFKLSDEQENEIEALLDQENPELPRPVGNDIVHYSDYFEGAQKYLSYLKSTVDVNFEGLKIVLDGANGSTSSLAPFLFGDLEADTETIGCSPDGYNINEKCGSTHPEKLAEKVVETESDFGLAFDGDGDRIIAVDENGQIVDGDQIMFIIGQEMHKNQELNNDMIVSTVMSNLGFYKALEQEGIKSNKTKVGDRYVVEEMRRGNYNLGGEQSGHIVMMDYNTTGDGLLTGIQLASVIKMTGKSLSELAGQMKKYPQSLINVRVTDKYRVEENVDVKEVMTKVEVEMNGEGRILVRPSGTEPLVRVMVEAATDEDAERFAQQIADVVQDKMGLDK >NZ_CP053075.1|WP_000894032.1|2302106_2303039_-|YbbR-like-domain-containing-protein MLESKWGLRFIAFLLALFFFLSVNNVFGNIFNTGNLGQKSSKTIQDVPVEILYNTKDLHLTKAPETVNVTISGPQSKIIKIENPEDLRVVIDLSNAKAGKYQEKYQVKGLADDIHYSVKPKLANITLENKVTKKMTVQPDVSQSDIDPLYKITKQEVSPQTVKVTGGEEQLNDIAYLKATFKTNKKINGDTKDVAEVTAFDKKLNKLNVSIQPNEVNLQVKVEPFSKKVKVNVKQKGSLADDKELSSIDLEDKEIEIFGSRDDLQNISEVDAEVDLDGISESTEKTVKINLPEHVTKAQPSETKAYINVK >NZ_CP053075.1|WP_000347896.1|2303040_2303850_-|TIGR00159-family-protein MDFSNFFQNLSTLKIVTSILDLLIVWYVLYLLITVFKGTKAIQLLKGILVIVIGQQISMILNLTATSKLFDIVIQWGVLALIVIFQPEIRRALEQLGRGSFLKRYTSNTYSKDEEKLIQSVSKAVQYMAKRRIGALIVFEKETGLQDYIETGIAMDSNISQELLINVFIPNTPLHDGAMIIQGTKIAAAASYLPLSDSPKISKSLGTRHRAAVGISEVSDAFTVIVSEETGDISVTFDGKLRRDISNEIFEELLAEHWFGTRFQKKGVK >NZ_CP053075.1|WP_000167864.1|2304038_2304947_-|arginase MTKTKAIDIIGAPSTFGQRKLGVDLGPTAIRYAGLISRLKQLDLDVYDKGDIKVPAVNIEKFHSEQKGLRNYDEIIDVNQKLNKEVSASIENNRFPLVLGGDHSIAVGSVSAISKHYNNLGIIWYDAHGDLNIPEESPSGNIHGMPLRILTGEGPKELLELNSNVIKPENIVLIGMRDLDKGERQFIKDHNIKTFTMSDIDKLGIKEVIENTIEYLKSRNVDGVHLSLDVDALDPLETPGTGTRVLGGLSYRESHFALELLHQSHLISSMDLVEVNPLIDSNNHTAEQAVSLVGTFFGETLL >NZ_CP053075.1|WP_000958531.1|2311141_2312206_-|P-loop-NTPase MLTVDQVKELVGEIKDPIIDVPLKETEGIVEVSIKEEKEHVSVKLAMAQLGGAPQLDLQMAVVNALKENGAKTVGIRFETLPEEKVNQFKPKEENKPKTIEGLLSQNNPVEFIAIASGKGGVGKSTVAVNLAVALAREGKKVGLVDADIYGFSVPDMMGIDEKPGIKGKEVIPVERHGVKVISMAFFVEENAPVIWRGPMLGKMLTNFFTEVKWGDIEYLILDLPPGTGDVALDVHTMLPSSKEIIVTTPHPTAAFVAARAGAMAKHTDHSILGVIENMSYFESKETGNKEYVFGKGGGTKLADELNTQLLGELPLEQPSWNPKDFAPSIYQSDDRLGKIYSSIAQKVIAATNK >NZ_CP053075.1|WP_170172398.1|2312353_2313796_-|multidrug-efflux-MFS-transporter-LmrS MAKVELTTRRRNFIVAVMLISAFVAILNQTLLNTALPSIMRELNINESTSQWLVTGFMLVNGVMIPLTAYLMDRIKTRPLYLAAMGTFLLGSIVAALAPNFGVLMLARVIQAMGAGVLMPLMQFTLFTLFSKEHRGFAMGLAGLVIQFAPAIGPTVTGLIIDQASWRVPFIIIVGIALVAFVFGLVSISSYNEVKYTKLDKRSVMYSTIGFGLMLYAFSSAGDLGFTSPIVIGALIISMVIIYLFIRRQFNITNVLLNLRVFKNRTFALCTISSMIIMMSMVGPALLIPLYVQNSLSLSALLSGLVIMPGAIINGIMSVFTGKFYDKYGPRPLIYTGLTILTITTIMLCFLHTDTSYTYLIVVYAIRMFSVSLLMMPINTTGINSLRNEEISHGTAIMNFGRVMAGSLGTALMVTLMSFGAKIFLSTSPSHLTATEIKQQSIAIGVDISFAFVAVLVMAAYVIALFIREPKEIESNRRKF >NZ_CP053075.1|WP_000636857.1|2314118_2314592_-|multidrug-efflux-transporter-SepA MIVNYLKHKFYNLLTTMIVLFIFVLSGAIFLTFLGFGLYGLSRILIYFRLGDFTYNRSMYDNLLYYGSYIIFGYFIIFAVEHLMDYFRKMLPENAYFRGATFHLISYTVATTLFYFIIHLNYVYINIDFWVIMVIIGFLYVCKLQFYPESKNLNNRK >NZ_CP053075.1|WP_001237506.1|2314690_2316034_-|MFS-transporter MRLKSIITVIALILIMFMSAIESSIISLALPTIKQDLNAGNLISLIFTAYFIALVIANPIVGELLSRFKIIYVAIAGLLLFSIGSFMCGLSTNFTMLIISRVIQGFGSGVLMSLSQIVPKLAFEIPLRYKIMGIVGSVWGISSIIGPLLGGGILEFATWHWLFYINIPIAIIAIILVIWTFHFPEEETVAKSKFDTKGLTLFYVFIGLIMFALLNQQLLLLNFLSFILAIVVAMCLFKVEKHVSSPFLPVVEFNRSITLVFITDLLTAICLMGFNLYIPVYLQEQLGLSPLQSGLVIFPLSVAWITLNFNLHRIEAKLSRKVIYLLSFTLLLVSSIIISFGIKLPVLIAFVLILAGLSFGYIYTKDSVIVQEETSPLQMKKMMSFYGLTKNLGASIGSTIMGYLYAIQSGIFGPNLHNVLSAVAVISIGLIVLWVVFFKEQSSQSKE >NZ_CP053075.1|WP_000047255.1|2316210_2316894_-|hemolysin-III-family-protein MSKSTKKSNDTIVETFKDIIPLSFGEEIGNAASHGVAALLTLLVLPYAAVHSYIAHGTLASVSMSIYVISIFMMFISSTIYHSMQNETPHKYILRIIDHSMIYVAISGTYTPILLTVVGGWIGWTVFILLWGTTLWGILYKSIAVKVNQKLSLIVYLVMGWVGIILLPIIFIRTSWIFILFIFLGGVSYTIGAWFYAQKNRPYFHMIWHIFIVIASLLHLIAILYFM >NZ_CP053075.1|WP_000884735.1|2316912_2318100_-|UDPGP-type-1-family-protein MLDKNQLAKYKQDHLCEYEKIMSNNEKEALEEKVASLDLDFIAKLYNDLYINKKTIDDVSAVSEVKYDIKSQMSDDEIKRLEEQGLQAIKEGQFAVLLMAGGQGTRLGYKGPKGSFEIEGVSLFELQANQLKTLNHQSGHTIQWYIMTSDINHEETLAYFEAHSYFGYDQEAIHFFKQDNIVALSEEGKLILNQQGRIMETPNGNGGVFKSLDKAGYLEEMSNNGVKYIFLNNIDNVLVKVLDPLFAGFTVEHDYDITSKTIQPKPGESVGRLVNVDCKDTVLEYSELDPEVANQFNNANIGIHAFKLGFILNAVNRELPYHLAIKNLKQLDENFGVIEQPTLKFELFYFDIFTYGTSFVTLQVPREEEFSPLKNKEGKDSVATATEDLRRMGLI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053075_9 | 2401300-2401380 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP053075_9
|
1 spacers
spacers of NZ_CP053075_9
>9.1|2401325|31|NZ_CP053075|CRISPRCasFinder CACATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP053075_9
The CRISPR arrays of NZ_CP053075_9 >merge|NZ_CP053075|9|2401300-2401380|CRISPRCasFinder TCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTG >NZ_CP053075|9|8|2401300-2401380|CRISPRCasFinder TCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTG CACATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCT TCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTG
>NZ_CP053075.1|WP_001792132.1|2401072_2401258_+|hypothetical-protein MFRFISFGQLVVYSTTFIPKKDILQLNDLECDINVKEPLKINYVVIFGSGTEITFSQNLFR >NZ_CP053075.1|WP_000066900.1|2400596_2400947_-|HTH-type-transcriptional-regulator-SarV MSNKVQRFIEAERELSQLKHWLKTTHKISIEEFVVLFKVYEAEKISGKELRDTLHFEMLWDTSKIDVIIRKIYKKELISKLRSETDERQVFYFYSTSQKKLLDKITKEIEVLSVTN >NZ_CP053075.1|WP_000184404.1|2399283_2400495_+|MFS-transporter MTNQGSLNKSPIFTKSFTINFFVNFIVYLCMYLLLVVIAGYSKQAFDASDSLAGLVVGLFIVGSLIGRFATGKFVNQIGPKRLLFIGLIALIITQLLYFIDGSLAFLIFVRLINGIATAVVTTATGTIAAYVTPVNRKSEGISLFSLSLVLGTAIGPFLGMLLITKYAIDLLFIICVILGILGLIISLFIKVDFEVTNNKTETDVINKPRFSIHQFIAKEAIPVAVIMLLIGVTYASILTYLQAFALERHLVTAASYFFICYAIASLITRPIAGRLMDDKNENIIVYPAFIMLFLSFVCLISSYQSWLILLAGACLGLGYGNLSSAMQSIAIKVSPPIKYGIATSTFYVGLDAGVGFGPSFLGLFTHMFSYSEIFGFMAALAIITMLVYFLIHGRHVTRNAMN >NZ_CP053075.1|WP_000951058.1|2398850_2399291_+|winged-helix-DNA-binding-protein MLSQEFFNSFITIYRPYLKLAEPILEKHNIYYGQWLILRDIAKHQPTTLIEISHRRAIEKPTARKTLKALIENDLITVENSLEDKRQKFLTLTPKGHELYEIVCLDVQKLQQAVVAKTNISQDQMQETINVMNQIHEILLKEAHND >NZ_CP053075.1|WP_000600967.1|2397924_2398689_-|VOC-family-protein MILKFDHIIHYIDQLDRFSFPGDVIKLHSGGYHHKYGTFNKLGYINENYIELLDVENNEKLKKMAKTIEGGVAFATQIVQEKYEQGFKNICLRTNDIEAVKNKLQSEQVEVVGPIQMERDTHKDGKVKWQLLYIMNQDDDEIKPPFFIQWEESDSMRTKKLQKYFQKQFSIETVIVKSKNRSQTVSNWLKWFDMDIVEENDHYTDLILKNDDIYFRIEDGKVSKYHSVIIKDAQATSPYSIFIRGAIYRFEPLV >NZ_CP053075.1|WP_001549681.1|2397681_2397933_+|hypothetical-protein MRTIILSLFIIMNIVAIIMTLSQPLTVNYFSLRVILIFFTFILSIFFILIKSSRLNNILTILSIVLVIIHMGILAHSTYVYLY >NZ_CP053075.1|WP_000413862.1|2396027_2397293_-|lipid-II:glycine-glycyltransferase-FemX MEKMHITNQEHDAFVKSHPNGDLLQLTKWAETKKLTGWYARRIAVGRDGEVQGVAQLLFKKVPKLPYTLCYISRGFVVDYSNKEALNALLDSAKEIAKAEKAYAIKIDPDVEVDKGTDALQNLKALGFKHKGFKEGLSKDYIQPRMTMITPIDKNDDELLNSFERRNRSKVRLALKRGTTVERSDREGLKTFAELMKITGERDGFLTRDISYFENIYDALHEDGDAELFLVKLDPKENIAKVNQELNELHAEIAKWQQKMETSEKQAKKAQNMINDAQNKIAKNEDLKRDLEALEKEHPEGIYLSGALLMFAGSKSYYLYGASSNEFRDFLPNHHMQYTMMKYAREHGATTYDFGGTDNDPDKDSEHYGLWAFKKVWGTYLSEKIGEFDYILNQPLYQLIEQVKPRLTKAKIKISRKLKRK >NZ_CP053075.1|WP_001161085.1|2392245_2392563_+|hypothetical-protein MQFYLILLAILYLIVSFISIFKMEVVFTRILRIIMGVLLLFVLALTTMSFPKENWWVFIVLLLLVGNVEVTGFKMLKKDLKGVNILNLMSLFIFVIYFILTIVLF >NZ_CP053075.1|WP_000051210.1|2391836_2392001_+|hypothetical-protein MSLENQLAELKYDYVRLQGDLEKRESLNLDTSALVRQLKDIENEIRNVRAQMQD >NZ_CP053075.1|WP_000139181.1|2390795_2391704_-|AEC-family-transporter MTEQFTMIILLIALGYFLKRINFIKATDSQVIATLVLNVTLPSLVIVNLNSAELKLSFSILPILMIIYGIVAKMIAVWFFRKYDNHMRGSVGMMTGAMNIGLFAYPLIEVIWPKTGLIYFGMADIGGAFVMFGITYFVGSYFSEGSDQFDFKYLGKKLLQSVPLVTYIVMFILNINHIHLPHVAIDFFSILSHANMPLSMILLGVMLNFTLERKYIPATIKYLCLHYGLALVAGLLVHVLLPVSDDMIKTTLLVTWMFPVGVAIISYGIQFKYRTLPFIGMTTNLTIIISIIILYVYQAVFV >NZ_CP053075.1|WP_170172401.1|2401523_2402546_-|GTP-3',8-cyclase-MoaA MVEQIKDKLGRPIRVLRLSVTDRCNFRCDYCMPKEVFGDDFVFLPKNELLTFDEMARIAKVYAELGVKKIRITGGEPLMRRDLDVLIAKLNQIDGIEDIGLTTNGLLLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDDTLFQSINNRNIKATTILEQIDYATSIGLNVKVNVVIQKGINDDQIIPMLEYFKDKHIEIRFIEFMDVGNDNGWDFSKVVTKDEMLTMIEQHFEIDPVEPKYFGEVAKYYRHKDNGVQFGLITSVSQSFCSTCTRARLSSDGKFYGCLFATVDGFNVKAFIRSGVTDEELKEQFKALWQIRDDRYSDERTAQTVANRQRKKINMNYIGG >NZ_CP053075.1|WP_000643986.1|2402565_2403165_-|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase-MobA MKAIILAGGHSVRFGKPKAFAEVNGETFYSRVIKTLESTNMFNEIIISTNAQLATQFKYPNVVIDDENHNDKGPLAGIYTIMKQHPEEELFFVVSVDTPMITGKAVSTLYQFLVSHLIENHLDVAAFKEDGRFIPTIAFYSPNALGAITKALHSDNYSFKNIYHELSTDYLDVRDVDAPSYWYKNINYQHDLDALIQKL >NZ_CP053075.1|WP_000866971.1|2403171_2403405_-|molybdopterin-converting-factor-subunit-1 MKVLYFAEIKDILQKAQEDIVLEQALTVQQFEDLLFERYPQINNKKFQVAVNEEFVQKSDFIQPNDTVALIPPVSGG >NZ_CP053075.1|WP_000808495.1|2403410_2403857_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaE MKQFEIVIEPIQTEQYREFTINEYQGAVVVFTGHVREWTKGVKTEYLEYEAYIPMAEKKLAQIGDEINEKWPGTITSIVHRIGPLQISDIAVLIAVSSPHRKDAYRANEYAIERIKEIVPIWKKEIWEDGSKWQGHQKGNYEEAKREE >NZ_CP053075.1|WP_000602950.1|2403870_2404356_-|molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-protein-B MILQIVGYKKSGKTTLMRHIVSFLKTHGYTVATIKHHGHAKEDIQLQDSDVDHMKHFEAGADQSIVQGFQYQQTVTRVDNQNLTQIIEKSVTIDTNIVLVEGFKNADFEKVVVYRDEEELQVLQQLSNVCYSINVREHEDFTAFEQWLLNKIKNDCDTQLT >NZ_CP053075.1|WP_000259717.1|2404352_2405612_-|molybdopterin-molybdotransferase-MoeA MVVEKRNPIPVKEAIQRIVNQQSSMPAITVALEKSLNHILAEDIVATYDIPRFDKSPYDGFAIRSVDSQGASGQNRIEFKVIDHIGAGSVSDKLVGDHEAVRIMTGAQIPNGADAVVMFEQTIELEDTFTIRKPFSKNENISLKGEETKTGDVVLKKGQVINPGAIAVLATYGYAEVKVIKQPSVAVIATGSELLDVNDVLEDGKIRNSNGPMIRALAEKLGLEVGIYKTQKDDLDSGIQVVKEAMEKHDIVITTGGVSVGDFDYLPEIYKAVKAEVLFNKVAMRPGSVTTVAFADGKYLFGLSGNPSACFTGFELFVKPAVKHMCGALEVFPQIIKATLMEDFTKANPFTRFIRAKATLTSAGATVVPSGFNKSGAVVAIAHANCMVMLPGGSRGFKAGHTVDIILTESDAAEEELLL >NZ_CP053075.1|WP_000134526.1|2405674_2406169_+|cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase-MoaC MTEFTHINQQGHAKMVDVSDKQITKRTAVAHSSITVNETIFKQISNNTNTKGNVLNTAQIAGIMAAKNTSTIIPMCHPLPLTGIDVHFSWDETNAPLYTLNIQTTVSTTGKTGVEMEALTAASATALTIYDMTKAVDKGMIIGETYLESKSGGKSGDFQRQSGQ >NZ_CP053075.1|WP_000503822.1|2406170_2406677_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaB MGEHQNVKLNRTVKAAVLTVSDTRDFVTDKGGQCVRQLLQADDVEVSDAHYTIVKDEKVAITTQVKKWLEEDIDVIITTGGTGIAQRDVTIEAVKPLLTKEIEGFGELFRYLSYVEDVGTRALLSRAVAGTVNNKLIFSIPGSTGAVKLALEKLIKPELNHLIHELTK >NZ_CP053075.1|WP_000076930.1|2406707_2407712_-|ThiF-family-adenylyltransferase MSQERYSRQILFKQIGEIGQSKINQKCALIIGMGALGTHVAEGLVRAGIAKLIIVDRDYIEFSNLQRQTLFTEEDALKMMPKVVAAKKHLLALRSDVDIDGCIAHVDYYFLETHGQDVDVIIDATDNFETRQLINDFAYKHRIPWIYGGVVQSTYTEAAFIPGKTPCFNCLVPQLPALNLTCDTVGVIQPAVTMATSLQLRDAMKVLTEQPIDTKITYGDIWEGSHYSFGFSKMQRSDCTTCGDVPSYPYLNKNEQRYATLCGRDTVQYENASITHDILVQFLKQHQLNYRSNSYMVMFEFKGHRIVAFKGGRFLIHGMTRTSDATHLMNLLFG >NZ_CP053075.1|WP_000913024.1|2407881_2408487_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MLKINVKYQLKNTLIRINIDDTEPKIYAVRGPSGIGKTTVLNMIAGLRKADEAIIEVNGQLLTDTTKNVNVKIQQRRIGYLFQDYQLFPNMTVYKNITFMAEPSKHIDQLIQTLNINHLMKQYPMTLSGGEAQRVALARALSTKPDLILLDEPFSSLDDTTKDESITLVKRIFNEWQIPIIFVTHSNYEAEQMAHEIITIG |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053075_3 | 3.1|818814|31|NZ_CP053075|CRISPRCasFinder | 818814-818844 | 31 | NZ_CP053075.1 | 273651-273681 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053075_4 | 4.1|824281|22|NZ_CP053075|CRT | 824281-824302 | 22 | NZ_CP053075.1 | 776882-776903 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053075_4 | 4.1|824281|22|NZ_CP053075|CRT | 824281-824302 | 22 | NZ_CP053075.1 | 867833-867854 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053075_4 | 4.1|824281|22|NZ_CP053075|CRT | 824281-824302 | 22 | NZ_CP053075.1 | 1276658-1276679 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053075_4 | 4.1|824281|22|NZ_CP053075|CRT | 824281-824302 | 22 | NZ_CP053075.1 | 1561087-1561108 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053075_4 | 4.1|824281|22|NZ_CP053075|CRT | 824281-824302 | 22 | NZ_CP053075.1 | 2028829-2028850 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053075_4 | 4.1|824281|22|NZ_CP053075|CRT | 824281-824302 | 22 | NZ_CP053075.1 | 150440-150461 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053075_4 | 4.1|824281|22|NZ_CP053075|CRT | 824281-824302 | 22 | NZ_CP053075.1 | 150498-150519 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053075_4 | 4.1|824281|22|NZ_CP053075|CRT | 824281-824302 | 22 | NZ_CP053075.1 | 273576-273597 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053075_4 | 4.1|824281|22|NZ_CP053075|CRT | 824281-824302 | 22 | NZ_CP053075.1 | 273686-273707 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053075_4 | 4.1|824281|22|NZ_CP053075|CRT | 824281-824302 | 22 | NZ_CP053075.1 | 654031-654052 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053075_4 | 4.1|824281|22|NZ_CP053075|CRT | 824281-824302 | 22 | NZ_CP053075.1 | 1291192-1291213 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053075_4 | 4.3|824398|22|NZ_CP053075|CRT | 824398-824419 | 22 | NZ_CP053075.1 | 776882-776903 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053075_4 | 4.3|824398|22|NZ_CP053075|CRT | 824398-824419 | 22 | NZ_CP053075.1 | 867833-867854 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053075_4 | 4.3|824398|22|NZ_CP053075|CRT | 824398-824419 | 22 | NZ_CP053075.1 | 1276658-1276679 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053075_4 | 4.3|824398|22|NZ_CP053075|CRT | 824398-824419 | 22 | NZ_CP053075.1 | 1561087-1561108 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053075_4 | 4.3|824398|22|NZ_CP053075|CRT | 824398-824419 | 22 | NZ_CP053075.1 | 2028829-2028850 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053075_4 | 4.3|824398|22|NZ_CP053075|CRT | 824398-824419 | 22 | NZ_CP053075.1 | 150440-150461 | 0 | 1.0 |
NZ_CP053075_4 | 4.3|824398|22|NZ_CP053075|CRT | 824398-824419 | 22 | NZ_CP053075.1 | 150498-150519 | 0 | 1.0 |
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59. spacer 9.1|2401325|31|NZ_CP053075|CRISPRCasFinder matches to position: 654086-654116, mismatch: 2, identity: 0.935
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053075_4 | 4.2|824339|23|NZ_CP053075|CRT | 824339-824361 | 23 | AP014226 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S44-C3, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 28490-28512 | 3 | 0.87 |
NZ_CP053075_4 | 4.2|824339|23|NZ_CP053075|CRT | 824339-824361 | 23 | AP014225 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S41-C89, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 24653-24675 | 3 | 0.87 |
NZ_CP053075_4 | 4.4|824456|23|NZ_CP053075|CRT | 824456-824478 | 23 | AP014226 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S44-C3, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 28490-28512 | 3 | 0.87 |
NZ_CP053075_4 | 4.4|824456|23|NZ_CP053075|CRT | 824456-824478 | 23 | AP014225 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S41-C89, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 24653-24675 | 3 | 0.87 |
NZ_CP053075_8 | 8.1|2293332|34|NZ_CP053075|CRISPRCasFinder | 2293332-2293365 | 34 | JN882286 | Cronobacter phage vB_CsaP_GAP52, complete genome | 23034-23067 | 8 | 0.765 |
NZ_CP053075_8 | 8.1|2293332|34|NZ_CP053075|CRISPRCasFinder | 2293332-2293365 | 34 | CP030544 | Staphylococcus aureus strain ER04166.3 plasmid unnamed2, complete sequence | 7567-7600 | 8 | 0.765 |
1. spacer 4.2|824339|23|NZ_CP053075|CRT matches to AP014226 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S44-C3, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer actgtagaaaatggaaatccaac Protospacer ********* ***********.
2. spacer 4.2|824339|23|NZ_CP053075|CRT matches to AP014225 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S41-C89, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer actgtagaaaatggaaatccaac Protospacer ********* ***********.
3. spacer 4.4|824456|23|NZ_CP053075|CRT matches to AP014226 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S44-C3, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer actgtagaaaatggaaatccaac Protospacer ********* ***********.
4. spacer 4.4|824456|23|NZ_CP053075|CRT matches to AP014225 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S41-C89, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer actgtagaaaatggaaatccaac Protospacer ********* ***********.
5. spacer 8.1|2293332|34|NZ_CP053075|CRISPRCasFinder matches to JN882286 (Cronobacter phage vB_CsaP_GAP52, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ttgcatatctttagctttattgtttgcaactggg CRISPR spacer ttgcatatctttagctttatagcttttatatgct Protospacer ******************** *.** .* **
6. spacer 8.1|2293332|34|NZ_CP053075|CRISPRCasFinder matches to CP030544 (Staphylococcus aureus strain ER04166.3 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ttgcatatctttagctttattgtttgcaactggg CRISPR spacer ttgaataactttagctttattgttataaacagta Protospacer *** *** **************** *** * .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
329512 : 370257
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP053075|329512:370257|DBSCAN-SWA 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69 | Staphylococcus_phage(94.12%) | holin,capsid,head,terminase,tail,portal,protease,integrase | attL 329402:329419|attR 370754:370771 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
755959 : 763781
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP053075|755959:763781|DBSCAN-SWA ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTTACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTACGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTGTTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTGCGGTTTTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTTGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCGTGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAACGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAGTAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCGAGTGGGACAACAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCGATGACTGGTACTAAACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAGCCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGCGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTTACTTATGTGCTCTACAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTATATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGGTAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCTGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCGCCTAAAGTTAATACAGAGGCAACAGCACCAACTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACTCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGTCAAAATAAGAGGAGGGCATTTTTTTAGGTGAGAAAATATTTATCTGAACTAGATAACACTATAAAACACTTCTGATATTTTGAACTAAGAATATCAGAAGTGTTTTATAGTTTTGGTATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTGTTATTATTTTCAGCAGTTTCATCTAAGCTATTAAATGTTGAAATAAACAACATAATACCACCAATGATGAAAATTGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATCGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATAAAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTACTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCCACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACGCATTGTGTAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCAGGTGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGTGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGATTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCCTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACAACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGGCTAAAGTTCACTAAGAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAGTACCTGCTTCTTCACAAGGAATGTGATGTGCAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP053075|755959:763781|755959_757015_-|WP_000244415.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NZ_CP053075|755959:763781|759894_760608_-|WP_001062972.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_CP053075|755959:763781|761032_761701_-|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >NZ_CP053075|755959:763781|757014_757701_-|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >NZ_CP053075|755959:763781|759211_759796_-|WP_000604990.1|DBSCAN-SWA MILYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >NZ_CP053075|755959:763781|758491_758932_-|WP_001093562.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAVASVLTLGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >NZ_CP053075|755959:763781|760611_761031_-|WP_170172331.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGTCQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NZ_CP053075|755959:763781|762052_762646_+|WP_000604514.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHIRFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NZ_CP053075|755959:763781|762629_763781_+|WP_001217796.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQFESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >NZ_CP053075|755959:763781|757675_758149_-|WP_001037807.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
775752 : 790395
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP053075|775752:790395|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP053075|775752:790395|787722_788694_+|WP_000876318.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >NZ_CP053075|775752:790395|775752_776811_+|WP_000663030.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEYFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_CP053075|775752:790395|789633_790395_+|WP_000616840.1|DBSCAN-SWA MIQVENLTKTINNQMILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDNGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMNIQIEHIRNQRICLYFKD >NZ_CP053075|775752:790395|782125_782992_-|WP_001068501.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFLYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSSREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFVLFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NZ_CP053075|775752:790395|783792_784191_+|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_CP053075|775752:790395|787528_787684_+|WP_000499195.1|DBSCAN-SWA MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLWSKNATINEKYYQ >NZ_CP053075|775752:790395|781605_782106_-|WP_000930018.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNNLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_CP053075|775752:790395|777149_777692_+|WP_000197262.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >NZ_CP053075|775752:790395|788680_789637_+|WP_001245577.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >NZ_CP053075|775752:790395|786376_787348_+|WP_000562498.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_CP053075|775752:790395|784153_786259_+|WP_153906561.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSISFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGIAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_CP053075|775752:790395|778570_779488_-|WP_000429006.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMSHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_CP053075|775752:790395|779578_779680_+|WP_031760357.1|DBSCAN-SWA MVITDIDVYRVGRENIVIAVYNEHIKLLFILIS >NZ_CP053075|775752:790395|779757_781263_-|WP_000193751.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR |
14 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
871803 : 935564
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP053075|871803:935564|DBSCAN-SWA 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93 | Staphylococcus_phage(82.5%) | holin,capsid,head,terminase,tail,portal,coat,integrase,plate | attL 878846:878864|attR 910502:910520 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1020291 : 1073808
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP053075|1020291:1073808|DBSCAN-SWA 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53 | Streptococcus_phage(33.33%) | tRNA,transposase,bacteriocin,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1093733 : 1102206
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP053075|1093733:1102206|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP053075|1093733:1102206|1096299_1096971_+|WP_000666806.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLATEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NZ_CP053075|1093733:1102206|1095330_1096035_+|WP_000174053.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIASDEDIEILKSKALKINNVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >NZ_CP053075|1093733:1102206|1100608_1101637_+|WP_000030811.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_CP053075|1093733:1102206|1093733_1094216_+|WP_000861572.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGINIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >NZ_CP053075|1093733:1102206|1096963_1099153_+|WP_000032741.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGNEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSKTQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NZ_CP053075|1093733:1102206|1101639_1102206_+|WP_000238669.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNKDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDCGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_CP053075|1093733:1102206|1099131_1100616_+|WP_000483720.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAINDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NZ_CP053075|1093733:1102206|1094202_1095327_+|WP_001010413.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVVVLDPSEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITFFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSGRKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NZ_CP053075|1093733:1102206|1096034_1096298_+|WP_000848350.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1232587 : 1241630
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP053075|1232587:1241630|DBSCAN-SWA CATGAATGAGCGTATGGTTGATCAATCAATGCATAGTGAAGAAACTGATTTCGAATTGTCGCTTAGACCTACGAGATTACGACAATATATTGGTCAAAATTCAATAAAAAGTAATTTAGAAGTATTTATTAAAGCGGCTAAACTTCGTCATGAACCATTAGATCATGTATTGCTTTTTGGCCCCCCTGGATTAGGTAAGACAACATTATCTAATATCATTGCCAATGAAATGGAAGTTAATATACGTACAGTATCAGGGCCTTCATTAGAAAGACCTGGTGATTTGGCTGCAATTTTATCAGGACTTCAACCTGGAGATGTATTGTTTATTGATGAAATACACAGACTGAGTAGTGTTGTTGAAGAAGTGTTATACCCTGCAATGGAAGATTTCTTTTTAGATATTATCATTGGTAAAGGCGATGAGGCTAGAAGTATCCGTATCGACTTACCTCCATTCACTTTGGTAGGTGCAACAACGCGAGCTGGCAGCTTAACAGGTCCACTAAGGGATCGATTTGGTGTGCACTTAAGATTAGAATATTATAATGAATCAGATTTAAAAGAAATCATTATTAGAACAGCTGAGGTTTTAGGCACAGGTATTGATGAAGAAAGTGCCATTGAACTTGCTAAACGTTCTAGAGGGACTCCAAGAGTAGCAAATCGACTATTGAAGCGGGTAAGAGACTTCCAGCAAGTGAATGAAGATGAACAAATATACATTGAAACAACGAAGCACGCATTAGGTTTACTTCAAGTTGATCAACACGGACTAGATTACATTGATCATAAAATGATGAACTGTATTATTAAGCAGTATAATGGTGGACCTGTTGGTTTAGATACGATTGCCGTAACAATTGGTGAAGAACGTATTACAATTGAGGACGTTTATGAGCCATTTCTTATTCAGAAAGGCTTTTTAGAACGTACGCCACGTGGCAGAAAAGCAACACCATTAGCTTATGAACATTTTGCAAAGTCGAATGAGGAGAGAGGATAACGTGAATATTGAAGAATTTGACTATGACTTACCAGAATCATTAATTGCTCAAACGCCTTTAAAAGATCGTGATCATAGTCGTTTATTAGTCATGGATAGAGAAACTGGTGAAATGAAACATTTACATTTCAAAGATATCATTGAGTATTTTAGACCTGGTGATACATTAGTGCTTAACGATACGCGAGTAATGCCAGCTAGACTTTTTGGTTTAAAAGAAGAAACTGGTGCAAAAGTTGAAATGTTAATGTTAACTCAAATTGAAGGTAATGATTGGGAAGTCTTACTGAAACCAGCTAAGCGTATTAAAGTTGGTAATAAATTGAATTTTGGTAATGGCAAAATTATAGCTGAGTGCATAAAAGAAATGGATCAAGGTGGACGCATCATGCGTTTACATTATGAAGGTATTTTACAAGAAAGATTAGATGAATTAGGGGAAATGCCACTGCCACCATACATCAAAGAACGTTTAGATGATCCAGATCGTTATCAAACAGTTTACGCTAAAGAAAGTGGTTCAGCGGCAGCACCAACAGCAGGATTACATTTTACTGATGAGTTATTAACTGAAATTAAAAATAAAGGCGTTAATATCGCATTTGTTACATTACATGTTGGGTTAGGTACGTTTAGACCGGTGAGCGTCGATGATGTGAATGACCACGAAATGCATAGTGAATATTATCAAATGACACAAGAAACAGCTGATTTATTAAATGATACTAAGTCCAAAGGACATCGCATTATATCAGTTGGTACAACTTCAACACGTACACTTGAAACAATTCGACGCGATCATGATAAATTTGTTGAAACGAGTGGCTGGACTAATATATTTATTTATCCAGGATTTGATTTTAAAGCAATTGATGGCCAGATTACTAATTTTCATTTACCAAAATCAACATTAGTTATGCTAGTATCAGCGTTTAGTACTCGTGAAAATGTTCTGAATGCTTATAAAACAGCAGTAAATTTAGAATATAGATTCTTTAGTTTTGGCGATGCAATGTTAATTATATAAAAAGAATGTGAGGATTTTGAATATGCCTGCAGTAACATACGAACACATTAAAACTTGTAAACAATCAGGTGCGCGTTTAGGTATCGTGCACACACCACACGGTTCATTTGAAACACCTATGTTTATGCCAGTTGGTACTAAAGCAACCGTTAAAACAATGAGTCCAGAAGAGTTAAGACAAATTGAAGCAAAAATCATTTTGGGCAACACATATCATTTGTGGTTACAACCCGGAAATGATATTATCAAACACGCTGGGGGATTACATAAATTCATGAATTGGGATGGTCCGATTCTTACAGATTCAGGCGGTTTCCAAGTGTTTAGTTTAAGTAATTTACGTAAAATTACAGAAGAAGGCGTGGAATTTAGACATCATACTAATGGGTCTAAATTATTTTTGAGTCCTGAGAAATCAATGCAAATTCAAAATGATTTAGGATCTGATATTATGATGGCATTTGATGAATGTCCACCGATGCCTGCTGAATATGATTATGTAAAAAAATCTATTGAACGTACAACACGTTGGGCGAAAAGATGTCTAGATGCACACCAAAGACCTGAAGATCAAGCATTGTTCGGCATTATACAAGGTGGCGAATATGAAGATTTAAGAGAACAAAGTGCAAAGGATTTAGTAGAATTAGATTTTCCTGGTTATGCAATCGGCGGTTTGTCAGTTGGTGAACCTAAACCGGTTATGTATAAAATGGTTGAACATACAGAGCAGTTTATGCCTAAAGATAAACCAAGATATTTAATGGGTGTAGGATCTCCAGATGCGTTAATCGAATGTAGTATTCGCGGCATGGATATGTTTGATTGTGTCTTACCGACACGTATTGCCAGAAATGGTACTTGTATGACATCGCAAGGTCGTTTAGTTATTAAAAATGCAAAATTTGCAGATGATTTAAGACCGTTAGATGAGAATTGTGACTGTTATACATGTCAAAACTATTCAAGAGCGTATATACGTCATTTAATCAAGGCAGAGGAAACTTTTGGTATTCGTCTTACTACTATTCATAATTTACATTTTCTGCTAAAATTAATGGAAGATATAAGACAAGCCATTCGAGAAGATCGTCTTTTAGATTTCAAAGAAGAATTCTTCGAGCAATATGGATTAAATGTTGAGAACCCAAAAAACTTTTAAGCAAGAGGAGCGTATAAAATGCAATTTTCATTACTAATATATATAGTCGTAATTTTTGCGGTTATGTATTTCTTGATGATCAGACCACAACAAAAACGTGCGAAACAGCATCGTGAGTTGATTAATAACATTCAATCTGGTCAAAGAATTACAACTATTGGTGGTATTAAAGGTACTGTTAAAGCAGTAGATGAAACAACTGTTGTTATTACAGTTAATGGTCATGGTACTGAATTAACTTTCGAAAAACCTGCTATTAAACAAGTTGACCCTTCATAACGAGAAGTGGTATTAAAAAGGATGAAACGAATAGCGTTTCATCCTTTTTAAGTTATAAGTAGTATGTAGAATAGCTTATTTTTATTCCAAAAAAAGAAATTGTGATACATAATAATTGTTAAATTTAAATTAAATATATCTATGACTATTTTTACTCCCTGCTCTAGTATGTTAATATGTATAAGGCTAATAAATTTTGTAAGAAAGATTTAACTTGCGTTATAAAATAGTATTCAAGTATTCTAAATACATACGTAAATAATGAGGTGTTCATGTGAAGAAAAGTAGTAGAATAATTGCGTTCTTGCTTTTAGTCGTATTGTTGTTTGCCGGAATGGCTGCAACTTATAAAAGTGTTATAAAGAATGTCAATTTAGGACTTGATTTGCAAGGTGGATTTGAGGTGCTTTATCAAGTCGATCCTTTAAATAAAGGCGACAAAATAGATAAAAAAGCCTTACAATCAACAGCGCAAACATTAGAAAATCGTGTTAACGTTTTAGGTGTTTCGGAACCTAAAATTCAAGTTGAAGAACCTAATAGAATTAGAGTTCAACTTGCTGGTGTAACAGACCAGAATGAAGCACGTAAAATTTTATCTTCTCAAGCTAATTTAACAATTCGCGATGCAGAAGATAAAGTAAAATTAAGCGGTTCTGATATTAAACAGGGATCTGCCAAACAAGAATTTAAACAGGAAACAAACCAGCCTACAGTTACTTTTAAAGTAAAAGACAAAAACAAATTTAAAAAAGTAACGGAAGAAATCTCTAAGAAACGTGATAATGTCATGGTTGTTTGGTTAGATTTCAAAAAAGGTGACAGCTATAAAAAAGAAGCACAAAAGAAAAACCCTAAATTTATTTCTGCAGCAAGTGTTGATCAACCAATCAATTCTGATAGCGTAGAAATCTCGGGTGGATTTAAAGGACAAGAAGGCGTTAAAAAAGCAAAACAAATCGCCGAATTGTTAAATGCAGGTTCTTTACCAGTTGACTTGAAAGAAATTTATTCAAACTCAGTAGGTGCCCAATTTGGTCAAGATGCATTAGATAAAACTGTGTTTGCATCGTTTATTGGTGTAGCATTAATTTATTTATTCATGCTTGGATTCTACCGATTACCTGGTTTAGTAGCGATTATTGCATTGACAACTTATATCTATCTAACGTTAGTAGCATTTAATTTCATTTCCGGGGTTCTAACTTTACCAGGATTAGCGGCGTTGGTATTAGGTGTAGGTATGGCTGTAGATGCCAATATTATCATGTATGAGCGTATTAAGGATGAACTTCGAATAGGTAGAACGATAAAGCAAGCCTTTTCTAAAGCAAACAAAAGTTCATTCCTAACAATTTTTGATTCTAACTTAACAACAGTTATCGCCGCAGCAGTATTATTCTTCTTCGGTGAAAGTTCAGTTAAAGGTTTCGCGACAATGTTATTATTAGGTATTCTAATGATCTTTGTTACAGCCGTGTTCTTATCAAGATTCTTATTATCATTACTTGTTTCATCAAATATAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP053075|1232587:1241630|1234641_1235781_+|WP_001112045.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NZ_CP053075|1232587:1241630|1236334_1238614_+|WP_000749795.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >NZ_CP053075|1232587:1241630|1232587_1233592_+|WP_001005768.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERG >NZ_CP053075|1232587:1241630|1235799_1236060_+|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >NZ_CP053075|1232587:1241630|1238816_1241090_+|WP_170172345.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESITSDTDVNHDALQLSDMTKAIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKKGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >NZ_CP053075|1232587:1241630|1233593_1234619_+|WP_001019178.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP053075|1232587:1241630|1241111_1241630_+|WP_000364542.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1862851 : 1929959
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP053075|1862851:1929959|DBSCAN-SWA 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61 | Staphylococcus_phage(95.35%) | tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2038826 : 2138652
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP053075|2038826:2138652|DBSCAN-SWA 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108 | Staphylococcus_phage(73.85%) | tRNA,holin,capsid,head,terminase,tail,portal,protease,integrase,plate | attL 2038162:2038186|attR 2140938:2140962 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2181762 : 2201906
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP053075|2181762:2201906|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP053075|2181762:2201906|2194893_2195391_-|WP_000342539.1|DBSCAN-SWA MDDMQVYIANLGKYNEGELVGAWFTFPIDFEEVKEKIGLNDEYEEYAIHDYELPFTVDEYTSIGELNRLWEMVSELPEELQSELSALLTHFSSIEELSEHQEDIIIHSDCDDMYDVARYYIEETGALGEVPASLQNYIDYQAYGRDLDLSGTFISTNHGIFEIVY >NZ_CP053075|2181762:2201906|2199693_2201013_+|WP_001557163.1|transposase|DBSCAN-SWA MCNDTLELLRIKDENIKYINQEIDVIIKGKKATVVNAVLTYKPSACYCCGVKNEGQIHKHGKRVSRITLLKTQGYNTYLNLAKQRFKCLECNGTFTAKTSIVDESCFISRCVTQKVIEEATKVKTEIDTAEDNCISPSTVSRIRTKAANSLRIKPFNCLPEHIAMDEFKSVKNVTGSMSFIFIDNDTHDVIDILENRTTRFLRAYFERFDLKNRQQVKTVTIDMYEPYVRLFRDLFPNAAIIFDRFHIVQHLNRELNKYRVQVMNEYRNKKGPNYTIFKNNWKVLLMDTSKTIFSKYRWNKSFKAYKRSSDIVEFMLSKDDILRRSYELVQGLRKDLRLCNWPKFINRLNSVSKKSVSKGVWKVVKYYRKHQRMLRNTIYYPAFNNGAIEGINNKIKLIKRISFGYRNFNNFKARIMMIFSLYKGEKKKTTKPNNGLAA >NZ_CP053075|2181762:2201906|2197154_2198540_-|WP_000813488.1|DBSCAN-SWA MKQRGKRIRPSGKDLVFHFTIASLLPVFLLVVGLFHVKTIQQINWQDFNLSQADKIDIPYLIISFSVAILICLLVAFVFKRVRYDTVKQLYHRQKLAKMILENKWYESEQVKTEGFFKDSAGRTKEKITYFPKMYYRLKNGLIQIRVEITLGKYQDQLLHLEKKLESGLYCELTDKELKDSYVEYTLLYDTIASRISIDEVEAKDGKLRLMKNVWWEYDKLPHMLIAGGTGGGKTYFILTLIEALLHTDSKLYILDPKNADLADLGSVMANVYYRKEDLLSCIETFYEEMMKRSEEMKQMKNYKTGKNYAYLGLPAHFLIFDEYVAFMEMLGTKENTAVMNKLKQIVMLGRQAGFFLILACQRPDAKYLGDGIRDQFNFRVALGRMSEMGYGMMFGSDVQKDFFLKRIKGRGYVDVGTSVISEFYTPLVPKGYDFLEEIKKLSNSRQSTQATCEAEVAGVD >NZ_CP053075|2181762:2201906|2181762_2182980_-|WP_001291561.1|integrase|DBSCAN-SWA MSEKRRDNKGRILKTGESQRKDGRYLYKYIDSFGEPQFVYSWKLVATDRVPAGKRDCISLREKIAELQKDIHDGIDVVGKKMTLCQLYAKQNAQRPKVRKNTETGRKYLMDILKKDKLGVRSIDSIKPSDAKEWAIRMSENGYAYQTINNYKRSLKASFYIAIQDDCVRKNPFDFQLKAVLDDDTVPKTVLTEEQEEKLLAFAKADKTYSKNYDEILILLKTGLRISEFGGLTLPDLDFENRLVNIDHQLLRDTEIGYYIETPKTKSGERQVPMVEEAYQAFKRVLANRKNDKRVEIDGYSDFLFLNRKNYPKVASDYNGMMKGLVKKYNKYNEDKLPHITPHSLRHTFCTNYANAGMNPKALQYIMGHANIAMTLNYYAHATFDSAMAEMKRLNKEKQQERLVA >NZ_CP053075|2181762:2201906|2195771_2196977_-|WP_000398284.1|DBSCAN-SWA MEGFLLNEQTWLQHLKEKRLAYGLSQNRLAVATGITRQYLSDIETGKVKPSEDLQQSLWEALERFNPDAPLEMLFDYVRIRFPTTDVQQVVENILQLKLSYFLHEDYGFYSYSEHYALGDIFVLCSHELDKGVLVELKGRGCRQFESYLLAQQRSWYEFFMDVLVAGGVMKRLDLAINDKTGILNIPVLTEKCQQEECISVFRSFKSYRSGELVRKEEKECMGNTLYIGSLQSEVYFCIYEKDYEQYKKNDIPIEDAEVKNRFEIRLKNERAYYAVRDLLVYDNPEHTAFKIINRYIRFVDKDDSKPRSDWKLNEEWAWFIGNNRERLKLTTKPEPYSFQRTLNWLSHQVAPTLKVAIKLDEINQTQVVKDILDHAKLTDRHKQILKQQSVKEQDVITTKK >NZ_CP053075|2181762:2201906|2185578_2187498_-|WP_000691727.1|DBSCAN-SWA MKIINIGVLAHVDAGKTTLTESLLYNSGAITELGSVDKGTTRTDNTLLERQRGITIQTGITSFQWENTKVNIIDTPGHMDFLAEVYRSLSVLDGAILLISAKDGVQAQTRILFHALRKMGIPTIFFINKIDQNGIDLSTVYQDIKEKLSAEIVIKQKVELYPNMCVTNFTESEQWDTVIEGNDDLLEKYMSGKSLEALELEQEESIRFHNCSLFPVYHGSAKNNIGIDNLIEVITNKFYSSTHRGPSELCGNVFKIEYTKKRQRLAYIRLYSGVLHLRDSVRVSEKEKIKVTEMYTSINGELCKIDRAYSGEIVILQNEFLKLNSVLGDTKLLPQRKKIENPHPLLQTTVEPSKPEQREMLLDALLEISDSDPLLRYYVDSTTHEIILSFLGKVQMEVISALLQEKYHVEIELKEPTVIYMERPLKNAEYTIHIEVPPNPFWASIGLSVSPLPLGSGMQYESSVSLGYLNQSFQNAVMEGIRYGCEQGLYGWNVTDCKICFKYGLYYSPVSTPADFRMLAPIVLEQVLKKAGTELLEPYLSFKIYAPQEYLSRAYNDAPKYCANIVDTQLKNNEVILSGEIPARCIQEYRSDLTFFTNGRSVCLTELKGYHVTTGEPVCQPRRPNSRIDKVRYMFNKIT >NZ_CP053075|2181762:2201906|2196999_2197152_-|WP_000879507.1|DBSCAN-SWA MLAGVAIATPALNPPYLTGGYKSTGNSQKNIRKSFGYKGFTKFQRMSNGL >NZ_CP053075|2181762:2201906|2189801_2191979_-|WP_000804748.1|DBSCAN-SWA MKPSIVNRIKSNWTLKRLGKVAMTVAFTLVIAIFLLAMLGTVVQAAGLVDDTVNVANEYSRYPLENYQLDFYVDNSWGWLPWNWSDGIGKQVMYGLYAITNFIWTISLYVSNATGYLVQEAYSLDFISATADSIGKNMQTLAGVSANGFSTEGFYVGFLLLLILVLGVYVAYTGLIKRETTKAIHAIMNFVLVFILSASFIAYAPDYIKKINDFSSDISNASLSLGTKIVMPHSDSQGKDSVDLIRDSLFSIQVQQPWLLLQYNSSDIESIGIDRVESLLSTSPDSNNGEDREKIVAEEIEDRSNTNLTITKTINRLGTVFFLFVFNIGISIFVFLLTGIMIFSQVLFIIYAMFLPVSFILSMIPSFDGMSKRAITKLFNTILTRAGITLIITTAFSISTMLYTLSAGYPFFLIAFLQIVTFAGIYFKLGDLMSMFSLQSNDSQSVGSRVMRKPRMLMHAHMHRLQRKLGRSMTTLGAGSAIVTGKKGQSGSGSSARTQADHSRPDGKEKSTLGKRIGQTIGTVADTKDRMVDTASGLKEQVKDLPTNARYAVYQGKSKVKENVRDLTSSISQTKADRASGRKEQQEQRRKTIAKRRSEMEQVKQKKQPASSVHERPTTRQEQYHDEQTSKQSNIQTSYKESQQAKQERPAVKSDFSSPKVERQGNTVQEKTVQKPATSTTTADRTSQRPITKERPSTVQRVPLQNTRSRPPIKTATIKKVGKKP |
21 | Streptococcus_phage(94.44%) | transposase,integrase | attL 2173116:2173130|attR 2192440:2192454 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP053075.1|WP_000681968.1|2077484_2077661_-|hypothetical-protein |
2077484_2077661_-
Protein sequences of NZ_CP053075.1|WP_000681968.1|2077484_2077661_-|hypothetical-protein>NZ_CP053075.1|WP_000681968.1|2077484_2077661_-|hypothetical-protein MKHLTKIFVVLAIILFIIGYYLQATNHESQGIKLLLAAIMFMICAFISRSNDRRKNSK |
58 aa aa | NA | NA | NA | 2038826-2138652 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 4.2|824339|23|NZ_CP053075|CRT matches to NZ_CP053075 position: 2133769-2133791, mismatch: 2 tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer tctgttgaaattgggaatccaat Protospacer ***** ********.******** 2. spacer 4.4|824456|23|NZ_CP053075|CRT matches to NZ_CP053075 position: 2133769-2133791, mismatch: 2 tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer tctgttgaaattgggaatccaat Protospacer ***** ********.******** |
|||||||||||||||||||||
NZ_CP053075.1|WP_000990056.1|2077903_2078002_-|hypothetical-protein |
2077903_2078002_-
Protein sequences of NZ_CP053075.1|WP_000990056.1|2077903_2078002_-|hypothetical-protein>NZ_CP053075.1|WP_000990056.1|2077903_2078002_-|hypothetical-protein MMWWQEGMMTLITGGLLIIFRLWLELKWKNKK |
32 aa aa | NA | NA | NA | 2038826-2138652 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 4.2|824339|23|NZ_CP053075|CRT matches to NZ_CP053075 position: 2133769-2133791, mismatch: 2 tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer tctgttgaaattgggaatccaat Protospacer ***** ********.******** 2. spacer 4.4|824456|23|NZ_CP053075|CRT matches to NZ_CP053075 position: 2133769-2133791, mismatch: 2 tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer tctgttgaaattgggaatccaat Protospacer ***** ********.******** |
|||||||||||||||||||||
NZ_CP053075.1|WP_000771849.1|2122225_2122375_-|hypothetical-protein |
2122225_2122375_-
Protein sequences of NZ_CP053075.1|WP_000771849.1|2122225_2122375_-|hypothetical-protein>NZ_CP053075.1|WP_000771849.1|2122225_2122375_-|hypothetical-protein MKLLRRLFNKKHENLIDVWHGNQWLKVKESKLKKYKVVSDREGKKYLIK |
49 aa aa | NA | NA | NA | 2038826-2138652 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 4.2|824339|23|NZ_CP053075|CRT matches to NZ_CP053075 position: 2133769-2133791, mismatch: 2 tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer tctgttgaaattgggaatccaat Protospacer ***** ********.******** 2. spacer 4.4|824456|23|NZ_CP053075|CRT matches to NZ_CP053075 position: 2133769-2133791, mismatch: 2 tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer tctgttgaaattgggaatccaat Protospacer ***** ********.******** |
|||||||||||||||||||||
NZ_CP053075.1|WP_000435352.1|2122389_2122833_-|hypothetical-protein |
2122389_2122833_-
Protein sequences of NZ_CP053075.1|WP_000435352.1|2122389_2122833_-|hypothetical-protein>NZ_CP053075.1|WP_000435352.1|2122389_2122833_-|hypothetical-protein MEQITLTKEELKEIIAKEVRNAIKGEKPISSGAIFNKVRINNDDLEEINKKLDFTKDLSLGRLRKLNHPIPLKKYQHGFESIHQKAYVQDVHDHIRKLTLSIFGVTLNSDLSESEYNLAAKIYRDIKDYYLYIYEKRVSELTIDDFE |
147 aa aa | NA | NA | NA | 2038826-2138652 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 4.2|824339|23|NZ_CP053075|CRT matches to NZ_CP053075 position: 2133769-2133791, mismatch: 2 tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer tctgttgaaattgggaatccaat Protospacer ***** ********.******** 2. spacer 4.4|824456|23|NZ_CP053075|CRT matches to NZ_CP053075 position: 2133769-2133791, mismatch: 2 tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer tctgttgaaattgggaatccaat Protospacer ***** ********.******** |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
0 : 5638
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP053077|0:5638|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP053077|0:5638|980_1391_+|WP_000872163.1|DBSCAN-SWA MKWSLEQNFHGNAPNLKPQKIQGCLGFLKSLGWENWNQSYQTLDIGELYFSLLLDDKGHVITYMHEGGNGGGRHRIFTGKVCGAEYVRAARLTQFRLNKQKLAYYKNNWYLSNKLKILFKKVNCFKLFVSYILFMF >NZ_CP053077|0:5638|2795_3479_-|WP_000277644.1|protease|DBSCAN-SWA MYKNLNNIHQSHYLALIYIILLIIIPRYAILPFSNKLNINYDIINEWYFFVITTILMIYAIKIFKVKLQKDWLNIKNKKIGVFLTGIVGFFLILLLNVILILIINQGRPVKSVNQNAIENISFLSQFFAPLLIVIIGPILEELLFRVYILEVLKNKIKLLPAILISISSFTVIHMHSLTEDWKTLIPYFSIGIVTVFIYLKKHNFYYILSIHVLNNLVAQIAIWFLQ >NZ_CP053077|0:5638|737_971_+|WP_001002995.1|DBSCAN-SWA MNEKEIGIAFLNHFTQVEAYLEALGVPENHIADIKPIVIQNYPYERFLFDDLGDVTNVIIPFSKVIGSNLFGNIGYK >NZ_CP053077|0:5638|3653_3992_-|WP_001022435.1|DBSCAN-SWA MNIKQFDILYIDLNPTRGREKHNVRPCLVINNQMSIDGTNFVWVLPITTRGLRYPTDIQLKTKKGLVSGVIDTVQIRALDLKARQYNYKDELQDNLKNDILKAIKTYLKPTL >NZ_CP053077|0:5638|3988_4258_-|WP_001129937.1|DBSCAN-SWA MAKSLKDLNKTSERVFKNGNSKAISLSKKTIRLANFDIGDTVEVQKMNGGLFITKKKESIEDRIKNFFQSGGKYTELEVDWEERVGREI >NZ_CP053077|0:5638|1542_2217_-|WP_001106066.1|transposase|DBSCAN-SWA MNYFRYKQFNKGVITVAVGYYLRYALSYRDISEILRERGVNVHHSTVYRWVQEYAPIVYQIWKKKHKKAYYKWRIDETYIKIKGKWNYLYRAIDAEGHTLDIWLRKKRDHQSAYAFIKRLIKQFGKPQMIITDQAPSTKVAMTKIVKVFKLNPNCHCTSKYLNNLIEQDHRHIKVRKTRYQSLNTAKNTLKGIECIYGLYKKNRRSLQIYGFSPCYEISHMLAS >NZ_CP053077|0:5638|4828_5638_+|WP_170172431.1|DBSCAN-SWA MNYIKYIHSVDGTTLYVKVNENVNSRANIIICHGLAEHLDRYDEISNYLQEKNFNIIRFDQRGHGRSGGKRTFYSNVNEIVEDLDAVINFTKEHYKGNIYLIGHSMGGYGSVLYSTKNPGKINGLIISGAVTRYNQKTFGDIDDTIDRNKYINYEIGEGVCSDTFELEKYRLDALTEKKVSYGLIYTVLEGVKGLVENAQYFDDNILILHGKDDGLVHYSDSLDFYKNISSSKKELHIYDGLQHEIFNERKKNKEIFSEIANWINNDLT |
7 | Staphylococcus_phage(50.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
10242 : 12279
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP053077|10242:12279|DBSCAN-SWA CCTAATTAAAATCACGTTTGATACGATATACTGTTGATCTACTTACACCTGTTTTTCTCGCAATTTCATTACCTGATAACTCTGTATTATTGTATAGATACATAACATAGTTCTTTACGTCTTTCGTAACACCTGGTCGCCCGCCTTTTCTTCCTCTAGCTTTCGCTTCGTTTAAACCTTCAAGAGTTCTTTCTCTATTTAAATCTGTTTCCAGTTCTGCAAAGCCACTCATTACAGTAAATATCATTTTTCCTAGTGGGCTATTCATATTAAAATTTCCATCTAATATTTTTAATTCTATATTGTGTTCCTGTAGCCAACTTGCTAAATTTATTAATTGTTTAGTTGTGCGTCCTAATCTATCAATTTTAGTCACAACTAATACATCATCTTCCCTTAAATATTTTAAGCACTCATCTAATTTACTTCTATTTGTTTTCTTGCCACTTACTTTTTCAGAAAATATTTTAATACAACCTTCAGCCTTTAATAAGTTAATTTGTGTTTCTAAGCTTTGACTGATTGTTGAAACTCTTGCATAGCCTATTTTAGCCAAAATATCGCCTACTTCCTTTATAAATAGCTTTAATATGAACGATTGTGTGTGCGTTTACGTATAATGGGCTTCAAAATATTTTTTCGCGGCGTCTGAGGGCTTCTCTCAGCTTGGTCAAAAACCCTTTTTACCTTTAATTTTGACACTTTGATTTTAACACATATTTTGACCAGGCACGAATATAGTTAAAGGCTTATAGAATTTATTCAGTTCTACAAGCCTTTAATCCTTACAAATAGCACTTATTCAAGCATATTTTTTATTATTTTATTTTACTTATTGAAATATATTATTTTCTAATGTCATACCCTGGTCAAAACCGATCGGTTTTGACTAGGTTATGTTAGAAACAGTACTTTTTGACTGTCTATAAAACGGAGGTTTATAGACAACAGTAACTAAAATATATTATAAAGTACGAAGAAGGATAGTAAATCCCTTATATTTAAGGTGTTTATTATCCTTTTTATATTTAATACAATGTCTATTTACTTATCTATAAATCAATGTATATAATATACTTAAAAAAAGGTTTTATAGACATTAGTAAGGAGGGGAAAATGGCTAAAATCGGTTATGCTAGAGTTTCAACTAAAGATCAAAACTTAGGTTCTGTTGTAAAGTTAGAAAAAGTATAGCTAATCATCATTTTATCATGTCAGTGTTCGTTTAACTAGCTAACACTGAAATGATAAAAAAGGAAATTAGATGTTTTTCTAACTTTGCAACAGAACCAGAATTTCCTTTATTCAATAAGGAGTTTGGGCATCTTGAAAGAGATACTATTGTTGGTCGTCGTCATGGTAGTGCAATCATTACTTTGGTAGAAAGAGTCTCCAAGATGATTATCACCTTGCGACCCTTAGGTCGTAAGGCAACCGATATAGAAAATGCTCTGCACTCAATGTTTTCAGCTTTACCTTCTCATATATTTAAATCAATTACTTTTGATTGTGGTAAGGAGTTTTCAAACTGGAAAACAATATGCAACTGTCATGATATATCTATATTTTTTGCTGATCCAGGCACGCCATCACAGAGAGGCTTAAATGAACATTCTAACGGAATACTTAGACGCAGTGGATTAGATAAAGAACTAGATTTCAATTTAGTAACAGACAATCATATCATCAGTGTTGCTCAAAAAATCAATCATCGTCCTAGAAAATCTTTAGGTTATAGAACACCATTGGAAGTATTTATGAGTTTCATCGAAGATGATAAACTGTCCAGCTTAATTTGATAATCTAAAATCTTAAAAAATAAAGGAATAATAACAAAAGTACACAAAGTCATTTTCCAATCCAATATAAAAAGCATAATTATGGAACCAATAATTGTTAATACATTAGGTAAAGTAATGGGAACCTTATGTGATATAAAAGTATTTATAACCTTTGTATCGTCTACTATCCTACTTAATAATTCTCCACTTTCACTCGAATCAAAAAAATAACTATGCTCAAAAAAGGTATGTTTAAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP053077|10242:12279|11973_12279_-|WP_015379478.1|DBSCAN-SWA MKHTFFEHSYFFDSSESGELLSRIVDDTKVINTFISHKVPITLPNVLTIIGSIIMLFILDWKMTLCTFVIIPLFFKILDYQIKLDSLSSSMKLINTSNGVL >NZ_CP053077|10242:12279|10242_10797_-|WP_001062591.1|DBSCAN-SWA MAKIGYARVSTISQSLETQINLLKAEGCIKIFSEKVSGKKTNRSKLDECLKYLREDDVLVVTKIDRLGRTTKQLINLASWLQEHNIELKILDGNFNMNSPLGKMIFTVMSGFAELETDLNRERTLEGLNEAKARGRKGGRPGVTKDVKNYVMYLYNNTELSGNEIARKTGVSRSTVYRIKRDFN |
2 | Enterobacteria_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_3 |
15758 : 16550
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP053077|15758:16550|DBSCAN-SWA CCTATCCTTCTATTAATTCTATTCTTTCAATCAATTCTTTATATATCGCTTCTAACATATGCAAAACTCTTTTATCATGAACATCTTTATCCCTAATACCTTCTGCACCGAATTTCTTAATTCTTTCTCTTTGAAATATTTGATTTTTAAACAGAGCATTTGAAAAAGTCTTTTTAGATATTTCCAATATATATTCATCAATATTACCATTTTTCTTGATTAATACAGGTATCGCACCTATTAATTCAAACGGTAAATTTGATTCTTTTTTTCTATCTCTTAAAAAATTAACAAATGATAAACTGCTTTCATACGCTGATTGTTGTGTCTGGAATACCATAGCAATGTAGTCGCTTGCATATACAGCATTATTTGTAAAATCTGAATTTATCGTTGGTGGTACATCTATAAAAATGTAGTCAAAATTATAATTTTTTTTAATTTGATCAATAACCGTTTTAAGTATATATCGCTTTTTTATAATATCTGTTTTTGCAATAATATCTGACAAATTAGCTAGTGAAGAATCTGCAGGTAATAAAGATAATTTCGTTGATAAATTTATAATACTATCTTCTAATTCCCCTGTTTTAAGAGCATCTATAAATGTTTGTTTTTCATCTATTGCTTCTGGATATGTTCTTTTCATAATTTGGGTAGCGTTCCCCTGAGGATCAAAATCAACTAATAGAATTCTTTTATCATACCTTTCAGAGCCAATATATGATAATAAAGTTGATACAGTAGTTTTTCCTACCCCTCCTTTAAAATTACCAATAGTTATAACTGACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP053077|15758:16550|15758_16550_-|WP_000111526.1|DBSCAN-SWA MSVITIGNFKGGVGKTTVSTLLSYIGSERYDKRILLVDFDPQGNATQIMKRTYPEAIDEKQTFIDALKTGELEDSIINLSTKLSLLPADSSLANLSDIIAKTDIIKKRYILKTVIDQIKKNYNFDYIFIDVPPTINSDFTNNAVYASDYIAMVFQTQQSAYESSLSFVNFLRDRKKESNLPFELIGAIPVLIKKNGNIDEYILEISKKTFSNALFKNQIFQRERIKKFGAEGIRDKDVHDKRVLHMLEAIYKELIERIELIEG |
1 | Enterococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
5429 : 20938
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP053076|5429:20938|DBSCAN-SWA TATGTGTCCTAATAGTAGCATTTATTCAGATGAAAAATCAAGGGTTTTAGTGGACAAGACAAAAAGTGGAAAAGTGAGACCATGGAGAGAAAAGAAAATCGCTAATGTTGATTACTTTGAACTTCTGCATATTCTTGAATTTAAAAAGGCTGAAAGAGTAAAAGATTGTGCTGAAATATTAGAGTATAAACAAAATCGTGAAACAGGCGAAAGAAAGTTGTATCGAGTGTGGTTTTGTAAATCCAGGCTTTGTCCAATGTGCAACTGGAGGAGAGCAATGAAACATGGCATTCAGTCACAAAAGGTTGTTGCTGAAGTTATTAAACAAAAGCCAACAGTTCGTTGGTTGTTTCTCACATTAACAGTTAAAAATGTTTATGATGGCGAAGAATTAAATAAGAGTTTGTCAGATATGGCTCAAGGATTTCGCCGAATGATGCAATATAAAAAAATTAATAAAAATCTTGTTGGTTTTATGCGTGCAACGGAAGTGACAATAAATAATAAAGATAATTCTTATAATCAGCACATGCATGTATTGGTATGTGTGGAACCAACTTATTTTAAGAATACAGAAAACTACGTGAATCAAAAACAATGGATTCAATTTTGGAAAAAGGCAATGAAATTAGACTATGATCCAAATGTAAAAGTTCAAATGATTCGACCGAAAAATAAATATAAATCGGATATACAATCGGCAATTGACGAAACTGCAAAATATCCTGTAAAGGATACGGATTTTATGACCGATGATGAAGAAAAGAATTTGAAACGTTTGTCTGATTTGGAGGAAGGTTTACACCGTAAAAGGTTAATCTCCTATGGTGGTTTGTTAAAAGAAATACATAAAAAATTAAACCTTGATGACACAGAAGAAGGCGATTTGATTCATACAGATGATGACGAAAAAGCCGATGAAGATGGATTTTCTATTATTGCAATGTGGAATTGGGAACGGAAAAATTATTTTATTAAAGAGTAGTTCAACAAACGGGCCAGTTTGTTGAAGATTATATGCTATAATTGTTATTAAAAGGATTGAAGGATGCTTAGGAAGACGAGTTATTAATAGCTGAATAAGAACGGTGCTCTCCAAATATTCTTATTTAGAAAAGCAAATCTAAAATTATCTGAAAAGGGAATGAGAATAGTGAATGGACCAATAATAATGACTAGAGAAGAAAGAATGAAGATTGTTCATGAAATTAAGGAACGAATATTGGATAAATATGGGGATGATGTTAAGGCTATTGGTGTTTATGGCTCTCTTGGTCGTCAGACTGATGGGCCCTATTCGGATATTGAGATGATGTGTGTCATGTCAACAGAGGAAGCAGAGTTCAGCCATGAATGGACAACCGGTGAGTGGAAGGTGGAAGTGAATTTTGATAGCGAAGAGATTCTACTAGATTATGCATCTCAGGTGGAATCAGATTGGCCGCTTACACATGGTCAATTTTTCTCTATTTTGCCGATTTATGATTCAGGTGGATACTTAGAGAAAGTGTATCAAACTGCTAAATCGGTAGAAGCCCAAACGTTCCACGATGCGATTTGTGCCCTTATCGTAGAAGAGCTGTTTGAATATGCAGGCAAATGGCGTAATATTCGTGTGCAAGGACCGACAACATTTCTACCATCCTTGACTGTACAGGTAGCAATGGCAGGTGCCATGTTGATTGGTCTGCATCATCGCATCTGTTATACGACGAGCGCTTCGGTCTTAACTGAAGCAGTTAAGCAATCAGATCTTCCTTCAGGTTATGACCATCTGTGCCAGTTCGTAATGTCTGGTCAACTTTCCGACTCTGAGAAACTTCTGGAATCGCTAGAGAATTTCTGGAATGGGATTCAGGAGTGGACAGAACGACACGGATATATAGTGGATGTGTCAAAACGCATACCATTTTGAACGATGACCTCTAATAATTGTTAATCATGTTGGTTACGTATTTATTAACTTCTCCTAGTATTAGTAATTATCATGGCTGTCATGGCGCATTAACGGAATAAAGGGTGTGCTTAAATCGGGCCATTTTGCGTAATAAGAAAAAGGATTAATTATGAGCGAATTGAATTAATAATAAGGTAATAGATTTACATTAGAAAATGAAAGGGGATTTTATGCGTGAGAATGTTACAGTCTATCCCGGCATTGCCAGTCGGGGATATTAAAAAGAGGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATTTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAAGCTTATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGAAAATGGAGTTATTTATATCGTGCCATTGATGCAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTCATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACCGTCATATTAAAGTAAGAAAGACAAGGTATCAAAGTATCAATACAGCAAAGCATACTTTAAAAGGTATTGAATGTATTTACGCTCTATATAAAAAGAACCGCAGGTCTCTTCAGATCTACGGATTTTTGCCATGCCACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCCAGTTTATGCATCCCTTAACTTACTTATTAAATAATTTATAGCTATTGAAAAGAGATAAGAATTGTTCAAAGCTAATATTGTTTAAATCGTCAATTCCTGCATGTTTTAAGGAATTGTTAAATTGATTTTTTGTAAATATTTTCTTGTATTCTTTGTTAACCCATTTCATAACGAAATAATTATACTTCTGTTTATCTTTGTGTGATATTCTTGATTTTTTTCTATTTAATCTGATAAGTGAGCTATTCACTTTAGGTTTAGGATGAAAATATTCTCTTGGAACCATACTTAATATAGAAATATCAACTTCTGCCATTAAAAGTAATGCCAATGAGCGTTTTGTATTTAATAATCTTTTAGCAAACCCGTATTCCACGATTAAATAAATCTCATTAGCTATACTATCAAAAACAATTTTGCGTATTATATCCGTACTTATGTTATAAGGTATATTACCAAATATTTTATAGGATTGGTTTTTAGGAAATTTAAACTGCAATATATCCTTGTTAAAAACTTGAAAATTATCGTGATCAACAAGTTTATGTTCTGTAGTTTTGCATAATTTATGGTCTATTTCAATGGCAGTTACGAAATTACACCTTTGTACTAATTCAAGGGTAAAATGGCCTTTTCCTGAGCCGATTTCAAAGATATTATCATGTTCATTTAATCTTATATTTGTCATTATTTTATCTATATTATGTTTCGAAGTAATAAAGTTTTGACTGTGTTTTATATTTTTCTCGTTCATTATAACCCTCTTTAATTTGGTAATGAATTTTGCTTATTAACGATTCATTATAACCACTTATTTTTTGTTTGGTTGATAATGAACTGTGCTGATTACAAAAATACTAAAAATGCCCATATTTTTTCCTCCTTATAAAATTAGTATAATTATAGCACGAGCTCTGATAAATATGAAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATTTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCTCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAAGCTTATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGAAAATGGAGTTATTTATATCGTGCCATTGATGCAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTCATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACCGTCATATTAAAGTAAGAAAGACAAGGTATCAAAGTATCAATACAGCAAAGCATACTTTAAAAGGTATTGAATGTATTTACGCTCTATATAAAAAGAACCGCAGGTCTCTTCAGATCTACGGATTTTTGCCATGCCACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAGCGAACACTGACATGATAAATTAGTGGTTAGCTATATTTTTTTACTTTGCAACAGAACCATATATTTTATAAACGCTTTTGATTCCTTGTCTGACATAGTCCGTTCACTACCGGATAAAATTTCACTGACTTTTTTAGAATCATTAGATTCTACAGCATCTTCAAATTTATTTATTTGTCCTAGGGCATCTGTTTTTCTAACTACAAATACAATTATTAAAGCAATTAAGATAATTATTAGTAATAAGAAACCATATATATATGGCTTCTTATTACGTGTCTTTTCATTTTCCATACGCATTACCCTTTATATCAATGTAGTAGCAAGTTATTTATTACTATTAAACCACGATGAAATTTTATTCTTGATTTCATCTAACTTATTATTAACTTTATTTAATTCTTCTTCCATTTTTTCATTGTTACCATTATCTTGTTGGGTTTTTGCGTCTTTCAAATTATTAATTGTGTTCTGATAATCTTCTGCAACTTTATTTAATTTGTCTGTATCTGCTTGTTGTTTTAGGCTATCAACTTTATTTTGTAATTCTGCAATTTTTGAATTTGTATCATCATTGCTATTCTCAATACTATCTTTTGTAGATTGAATTTGATCACGAATTTCTTGGTCTTGTTCTTCTACTTTTTGGCCATTATTTGGATAAAGTCCGTATAATTGTGTAAAAGTAAAAAGGCCATATAACAGTCCTTTTACGGTACAATGTTTTTAACGACAAAAACATACCCAGGAGGACTTTTACATGACCCAAGTACATTTTACACTGAAAAGCGAAGAGATTCAAAGCATTATTGAATATTCTGTAAAGGGTGACGTTTCTAAAAATATTTTAACAACGGTATTTAATCAACTAATGGAAAATCAACGAACAGAATATATTCAAGCAAAAGAATATGAACGAACAGAAAACCGACAAAGTCAACGAAATGGCTATTATGAGCGCAGCTTTACGACACGTGTAGGCACGCTAGAATTAAAAGTACCCAGAACACGTGATGGCCATTTTTCACCCACAGTGTTTGAACGTTATCAACGAAACGAAAAAGCCCTCATGGCTTCAATGTTGGAAATGTATGTATCAGGCGTTTCAACTCGTAAAGTATCAAAAATTGTGGAAGAACTTTGTGGTAAATCCGTCTCTAAGTCCTTCGTTTCTAGCTTAACAGAACAGCTAGAACCTATGGTTAACGAGTGGCAGAATCGTTTATTATCAGAAAAAAATTATCCTTACTTAATGACCGATGTACTCTATATAAAAGTACGAGAAGAAAATCGAGTACTCTCAAAAAGCTGTCATATAGCGATTGGAATAACCAAAGATGGCGACCGTGAAATTATCGGCTTCATGATTCAAAGTGGCGAAAGCGAAGAGACCTGGACAACATTTTTTGAATACCTAAAAGAACGCGGTTTACAAGGTACGGAACTCGTTATTTCTGATGCGCACAAAGGATTAGTCTCTGCCATTAGAAAATCCTTCACCAACGTAAGTTGGCAAAGATGCCAAGTTCACTTCCTAAGAAATATCTTTACCACCATTCCTAAAAAAAATTCAAAATCTTTCAGAGAAGCTGTTAAAGGAATTTTTAAGTTCACAGATATTAACTTAGCGCGTGAGGCTAAAAATCGATTGATTCATGATTATATCGATCAACCAAAATATTCAAAAGCTTGCGCATCATTGGATGATGGATTCGAAGACGCCTTTCAATATACCGTACAAGGAAATTCCCACAATCGACTAAAGAGTACCAATCTAATTGAACGACTGAATCAAGAAGTACGCAGAAGAGAAAAGATTATTCGCATCTTCCCCAATCAAACATCAGCCAATCGCTTAATTGGAGCCGTTCTTATGGACCTACATGATGAATGGATTTATTCTTCAAGAAAATACATCAATTTTGATAAGTAGAAATGGTAAAAACATTGTATAGCATTTTACACAGGAGTCTGGACTTGACTCACTTCCTTTATTATTTTTCATTTTTTTAAACTATTTAATACTAATGTCTTTTATAATAGCTTTTCATATATTATATAATCAATCTTTATAAGTCCTTTTATAAATTTCTTTTCTACCATTTTCGATAAATTCCTGTTTAATATTTTTAATTCCATAAACAATAGTTTCAATAGGATAATATTCTTCAACTATATCTTGATATTCTTTTGCTTTCTCAATATCTATATTTCCATACATTCTTAATATATCTTCTCCAAAATTTGTTCCTATTTCTTCTTCACTATCTTCAAGTAAGTATATAAAATCACAATATTCATCTATAATTCCAGAATCTCCAAAATCAATTATTCCAGTTAATCTATTATTGCCATCTAACAATAGATGATTACAACTAAAATCATTATGGCATAAACACTTTTTACCCTCAAAAACTGTTGTTGCATTTAGTCTTTCCATAAAACTTTCTATATAATCTTTTTCTATATCAGTTAAATCATTATAAATAGTTTCACGCAACAATATATACTCTTCTAATACATTTTGTTTATTATCAATAGTACATTCACTAATATCTGTATAATCTAAACCGTGCATTTGTCTTAAAAAACTGGCAATATCTCGTTTTAACAAATTTTGTTCTTCTTCTGACATAGTAGAATAAATTTCTGGTGTTAAAAAAGTTCCTTTAATTTCTTTATAACCTAGTATAGATAATTCATCACTAATATACGAATATTCAATATTAGGAATTTTTACATTAGTTTCTAAATTTGTATTTAAAAAATTATATATTGCTTTTTCTTTTGCATAACCTTTTTTCTTATTAGTACTAAATTTTGTTTTAAAAATGTATTCATTATTAACTAAATATGCCACACTATCATAACCACTACCGATTATTTCAATACTATCTACTTTGAAATTATCAAAGTAATGCTCAATTAAATATTTCATTGCCTTAACATTTGTGGCATTATCATCATATCTATATTCCATTAAATAACAATCTTCTTTTTTGCCCTCGTGTAATTCATGTTCTGGCAAATCTTCAATAATTCTAAAACCAGATTTTTGGTATGCCCTTATTGCTCTTGGATTATTTTTATGAGGGTCTAAAATAACTGCATTAGCATTTCTTTCTTTTTTCAAAAATTCAAAAATCAATTTAATATATCTTGTACCAATTCCTTTACTCCAATAATTTGGCTCTCCTATAAATTGATCCATACCATAGACTATCTCATCAGTTTTTGGATAATGATAATCAGTATATAACTCATCATACATTTTATATATTTGTCCATATCCAATAGGAACATTGTTATATTCAATAATTACTCTAAAAACTTCATCTTCCCAAGGCTCTGTATAATGTTTTTTTAATGATTCTAATGTATATTTTTTATCTCTACCACCATAAAATTCTAATACTCTTTCATCAGTTAACCATTTTAACATCAAAGGAAAATCATCATCTATTAAAGTTCTTATACATATTTCATTTTCAACTATATTCATTTATTTATCACCTTTTTCATAATCATATACATATACTATTTCATCTTTATAATCATTTTTACCACCTAATTTTTCATATACATGGCAAGCTCTAGGATTACCTTTATCAGTTATTAAAAACATTTCAGAACAACCAATCTCTTTAGAATATTCCTTAATAAAAGATAATAATTTTGAACCATAACCTTTGTCTTGATAGTTAGGTAACATTCCTATTGAGTGTAAATAAAACATTGTTTTTCCATCAGGTCTTAAAAGTGTATAGCAATATGCAAATCCTATAATTTTATTATTTTCTTTAGCTATAAACCCAAATGAACTGGTATCATTAAGAAATCCTTTTAAATTATCAATATCAAAAACCATATTATCATCAATTAAAACTTCTTCCATAAACTCAGTCAAGTCCAGACTCCTGTGTAAAATGCTATACAATGTTTTTACCATTTCTACTTATCAAAATTGATGTATTTTCTTGAAGAATAAATCCATTCATCATGTAGGTCCATAAGAACGGCTCCAATTAAGCGATTGGCTGATGTTTGATTGGGGAAGATGCGAATAATCTTTTCTCTTCTGCGTACTTCTTGATTCAGTCGTTCAATTAGATTGGTACTCTTTAGTCGATTGTGGGAATTTCCTTGTACGGTATATTGAAAGGCGTCTTCGAATCCATCATCCAATGATGCGCAAGCTTTTGAATATTTTGGTTGATCGATATAATCATGAATCAATCGATTTTTAGCCTCACGCGCTAAGTTAATATCTGTGAACTTAAAAATTCCTTTAACAGCTTCTCTGAAAGATTTTGAATTTTTTTTAGGAATGGTGGTAAAGATATTTCTTAGGAAGTGAACTTGGCATCTTTGCCAACTTACGTTGGTGAAGGATTTTCTAATGGCAGAGACTAATCCTTTGTGCGCATCAGAAATAACGAGTTCCGTACCTTGTAAACCGCGTTCTTTTAGGTATTCAAAAAATGTTGTCCAGGTCTCTTCGCTTTCGCCACTTTGAATCATGAAGCCGATAATTTCACGGTCGCCATCTTTGGTTATTCCAATCGCTATATGACAGCTTTTTGAGAGTACTCGATTTTCTTCTCGTACTTTTATATAGAGTACATCGGTCATTAAGTAAGGATAATTTTTTTCTGATAATAAACGATTCTGCCACTCGTTAACCATAGGTTCTAGCTGTTCTGTTAAGCTAGAAACGAAGGACTTAGAGACGGATTTACCACAAAGTTCTTCCACAATTTTTGATACTTTACGAGTTGAAACGCCTGATACATACATTTCCAACATTGAAGCCATGAGGGCTTTTTCGTTTCGTTGATAACGTTCAAACACTGTGGGTGAAAAATGGCCATCACGTGTTCTGGGTACTTTTAATTCTAGCGTGCCTACACGTGTCGTAAAGCTGCGCTCATAATAGCCATTTCGTTGACTTTGTCGGTTTTCTGTTCGTTCATATTCTTTTGCTTGAATATATTCTGTTCGTTGATTTTCCATTAGTTGATTAAATACCGTTGTTAAAATATTTTTAGAAACGTCATCCTTTACAGAATATTCAATAATGCTTTGAATCTCTTCGCTTTTCAGTGTAAAATGTACTTGGGTCATGTAAAAGTCCTCCTGGGTATGTTTTTGTCGTTAAAAACATTGTACCGTAAAAGGACTGTTATATGGCCTTTTTACTTTTACACAATTATACGGACTTTATCATTATTTGATTGGCCATTATCAATTTGTTCTTGTGATGTATCATTATTATCTGTAGGTTGTTGCTCATTTCCATTGCTACATGATTTAAACAACAATATTACTAAACCAATCAATAATACTACAATGACTGCTACTAACCATTTATTTTTTCTTTTAGCTTTAGTGTTCTCTTGCTGCTGTTCTAAATCACGTCTAAAATCACGTTCATTATAGTAATCTTCCGGTCGATTTCTTGTTGATATATTTTCATTATATGAATCTTTATTTTTTTCAACTCTACTTAAATTATCATTAACATAATCATGATATAATAATTTAAATTTCAAACCGAAAACTTTTATCGAATCTTCATCAGTTATTGTGTTTGTATAAAATTGACTGTTTACTCTACCATGTTTATCTAAAGCAATGATTCTTCCATCATTCTCTATTTTTAAAATTTTAGGGTACTCTCTGAAATCTCCTGATTTACTCATAACGATTACCTCCATAATAAATTAATTATCTATATCTTTATATATTCCACTTTGATAATCTTTTTTTATTCTATATATGGTTTGTCTTGATAATCCTACTTTTTTAGCAATTTTACTAATTGCCATACCTTGATCTAAAAAACTAACAACACGATAATATACTGCCTGTTTATGTGGGTCTTTAGCAATAGGACTATATAATTTGGGTCGCCCTTTATATATACCTTTAGATTTTGCAACAGCTATTCCATCAGCCTGTCTACGTCTGCTATCATTTCGTTCTTGTTCTGAAATCATTGCCAGTAATTGAATAATTAAATTTTTTAAGAATTTATCTAACAATTCATTACCGATAATTTCATTCATCATTGGTAGGCTTGTAATTATTAATCTAACATTTTTTTCTTTAAGAAAATCTACTGTTTTAATTACTTCATCATAATTTCTGCCTAGCCTATCTAATGCATCGACTATTAAAGTATCTTCTTCTCGTACAAAATTCATTACTTCTTGAAATACTGGTCTTTCTTTAATATTTTTTCCTGATTGTTTTTCAGTAAATATTTTTTCTGCACCATTTGCTTTCAGTACTTCAATTTGTCTATCTAAATTCTGATTTTTAGATGATACTCGGGCATAACCAATTTTCAAAATCTCACCACCTTTTTGTTACACCCTAATCATACAATTTAAACCTTAAAAAAACAACATTTCTCACTGACTGATTAGGGTTTACTCTAAATCAACAATACACATAATAAAACACCTCACAAATAAATATGAGGTGTTTTATATGGTTAGAAAGATAACGCTATGCTATTTCCTTATATCCTATAAATTTACTACGACAGTAATAACAATATATTTATAATTTTGAGTTTAAGTGTGTTGTTTTACTGTACGATTAAATAATATAAATGTTAACAAACAACAAAGTGCAATTATAATTGTACAACCAATAAGGATATTACTGTAAAGGTTGGTGGAAAAAGTAATGAATTCTGAAAGGAAATTATAATTTAAAAATTGTGTTGATAGTAATCCGCCCATTATTATAATGCCTGTGCCTTCTGATAAAAAACTAGTAAAATTTAATAAGCTCATACCAGAACCGACTTCTTCATGAGAAAGGCTACTAGAAACTATCGTTGATATAACAGTTTTTGTAAATGAAAGTCCTCCCATGACAAAAATGAAAGAGATGGTTGTTACCCACAAATTTAATTCAACAAAAAATGCAATAACAAGAAAACTAATAGATATAAATAGCGAACCTATAACAAAGACAAACAAAGCACCTTTTTTATCTACTAAGTATCCACCAATATATCCAAATATAATAACACTTATAGTACCAGGAAGAATAACATTGTTCCCAATTGTCGCGGCGTTTATATGGTAAAGAGCTTTCATCATATAAGGAACCATTGAGATAAATCCGGCTACAGTAGCAAATATAAGAGCTCCTGAAATCAATCCAAAAATAAATGATGGGTTCTTCCGCAAAGCTGGGTCAATAAAAGGATGGGTAACTTTTACAATATGTTTAATAAAAATGATAAAGAAAATAACAAAGGTTATTAAATAAAACCATTTGTAACTTGTTGTAAATAACATAAAGCTTATGATACTTATAGACATTAAAAGGATCCCTAATATATCTAAATCTCCTTTTTGAGATTCGCCAGGTTCCATGATTTTATTAAGAAAAGGAATGGTTATTAATGTGAAAATAGGTATTATAAGTAAATATGACCAATGAATATAATGAGTTACAACGCCTCCTATTGAAGGCCCTATTCCTTCACCCAATGCAACAATTGATCCTATAAATCCAAATGCCTTCCCTTGTTTTGCTTTAGTTATATTACGTGATACGACAACCATAACAAGAGAAGGAAACGCAGCAGAACCTATTCCTTGTATTAACCTACCTAAAATTAAAATTAAAAAATGTTTATGACCAAAAAATCCAATTAATGAGCCTAAGCAACTTAAAATAATCCCTAAAATAAGTAGTTTTTTAATGCTTACTTGATCAGATAATTTGCCGTATACTGCTGTACCAATTGAAAAAGTTAGCATGTAGGCAGTATTAACCCAATTAGTAATAGCAGGTGAAGTATTAAAAGAAATAGCTATATCAGGAAGTGAAACGTTTAAAACCATTTCATTTAATACGCTAAAAAATGAAAGAATACAGAGCCAAAATAAAATATTATAACTTAAGCTTTTAATTTTATTGTTTATATAGTTCAACTTTTACCTCTTTTGCTCGAGGTGATTGAAGTTTAAGGGGTTAGTTATTCTTTCACCTCAAATAAATTCCCCAATTTTTATATAAGCACTTCATATGAATCCTCCTCTATTATTATGACTCTAATATATCATTTTTTTATCGTAACAACAACAATGTCCACCACCGGCTTATATAAGACAAGTTAAATAGTTAGTTAACATAATAGGTCGTTATCAGAACTACACAAACATCTTCTGTAAAAAACCTTTTTTGCGTTGTTTTAATACACCAATTTTACTCGATTGTTTTTCTATTAATTCATCTAGTTCATTGAAAAAATCTCCTATTTTTTCTTGTTCAGAATTTTTTGGCACCATCACTTTGAGCTTATCAAAACCTGACATTCGAAGAGATTTAACTGTTGATCCAACAGCATATTTTAAGAAATGATTATTTTGTAATGACAGATAATAGTAAAGATAATTATTATTAATATTAATATCGTAAATACTATAAGCTCTTTGATGTAAGGAGTATTTCCCACTAAAGTATCTTGGTAAAAATTTACTTCCTTCACCTGGATATATAATCGCTGTTTCATCAAAATCAAAAGTATTTAAATATTTAACTTCTACAGAGCGGTCAAAAAATTTAAATTTTCCATCTTGTATATTATCTTGAACATTTTTACTTCCAGTCTTAACTTTAGCTATTTGCATAAGTTTTTTTATTTCCCATTCTGGATAATCATTCCCATTCTCATCTTTAAATCTTAATTCCTGTGAAAAAATCTTTTGCATATATCCCTTTTTCTGTTCTTCTAATTTCGCTAACTTTTGTTCCTCTAATTCAATTTGTCGGTCAAGTTTGCTGAAAAATTCACCGATTTTTTGTTGTTCCTGTTGTTCAGGATAATTAATTTCTACTTTAGCTATTTCATTCTTGTTAATTTTTTTGGGAAATGCTATATGCAATGTCTTTCTCCATAATTCATTTTGAACTGATTGAGAACGAATTAATGATTCTAGAAAATAAGAATTTAATTTCTTTGGTTTTAATAATGCTAAACTTACATAGTAGGCTAAATATTCGTTTGTTTCTACAACATTTGGTGTCCCAACATCTCCTATACGAGTCATTAAAACATCACCGAATTCCGGACGAATTTTAAATTCCTTTTCAAATGCTTCTTTAGAAATAAATTTATTAGAATTTAAGGTTTTTATATTTTCAACAGATAGAAATTTAATACCTTCACTTGTATATTTCGGTGTTTGATGAGTTCCATCATAAACATTCGCAACAGTTCCTAATTTACTATTTTCCCACTCCCCTTCAAACTCTGGGAATCTTAATTCTGGTACATTCTTCAGTTCATTAGTCATGTGTCACCACTCCTAATTCTTTTAAGAAGCCTTCTATTTCTTGCTCAACTGCTTTAATTTCATCATCGATACTATTTAAGTCTTTTTGAACTTGTTCTAAATCAATAGGTTCTTCTTCTTCAAATGTATCGACATATCTTGGAATATTAAGGTTATAGTCATTTTCTGCGATTTCTTCTAAACTTGCCGCATAACTATATTTATCTAATGTTTCGCGGTTTTTATACGTTTCAACAATTTTTTCTACATCTTCGGTTGTTAAATGGTTTTGATTTTTTCCTTTTTCAAATGATTGCGAGGCATCAATAAACAGTACATTATCATCAGCTTCACGACATTTTTTAAATACTAATATGCTTGTCGGTATCGATGTCCCAAAGAATAAGTTGGATGGTAAACCAATAATTGCGTCTAAATAATTTTTTTCTTTAATTAAATACTGACGAATAACACCTTCAGCTGCGCCACGGAATAATACACCATGTGGTAAAACAACAGCCATTGTGCCATTATCATCTAAGTGGTAAATCATATGTTGAATGAATGCAAAATCTGCTTTTGATTTAGGTGCTAATTTCCCATAATTACTAAAACGTGGGTCTTCTAAGAATTGTGGATCTGAGCTCCATTTCGCACTATAAGGTGGATTTGCAACAACAGCTTCAAAACGTTCGTCTGAAATAGCCGGATCTTCTATCGTATCCCCATTTTCAATCTTAAAATTCGCATAGTTAACATCATGTAATAACATGTTCATACGAGCTAAGTTATACGTTGTACTATTGTACTCTTGACCATAATATTGACGTACATTAGCTTCACGCCCAACACGAAGGAGTAATGACCCCGATCCACATGTAGGGTCATAAACGCTCTTAATATCTTTCTTATTTGCGGTTACAATTTTAGCTAAAATTGTTGAAACTTGTTGTGGTGTATAGAATTCGCCAGCTTTTTTACCCGAGCTTGCTGCGAATTGACCAATTAAGTACTCATAAGCATCACCTAACATATCGATTTCCATATCACTATGAACAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP053076|5429:20938|19381_20938_-|WP_170172427.1|DBSCAN-SWA MSITEKQRQQQAELQKNLWSIADDLRGNMDANEFKNYILGMIFYRFLSEKIEEQAQILLAEDNIDYETAMADEDYRPVLEQEFISRIGYVIEPQYLFGHLVKKIEKQAFEMEDLSNAIKNIENSTRGHDSEDDFIHLFDDLDLNSSRLGNSNAARTKLISKVMMKISTLPFVHSDMEIDMLGDAYEYLIGQFAASSGKKAGEFYTPQQVSTILAKIVTANKKDIKSVYDPTCGSGSLLLRVGREANVRQYYGQEYNSTTYNLARMNMLLHDVNYANFKIENGDTIEDPAISDERFEAVVANPPYSAKWSSDPQFLEDPRFSNYGKLAPKSKADFAFIQHMIYHLDDNGTMAVVLPHGVLFRGAAEGVIRQYLIKEKNYLDAIIGLPSNLFFGTSIPTSILVFKKCREADDNVLFIDASQSFEKGKNQNHLTTEDVEKIVETYKNRETLDKYSYAASLEEIAENDYNLNIPRYVDTFEEEEPIDLEQVQKDLNSIDDEIKAVEQEIEGFLKELGVVTHD >NZ_CP053076|5429:20938|7668_8343_+|WP_113589581.1|transposase|DBSCAN-SWA MNYFRYKQFNKDVITVAVGYYLRYALSYRDISEILRERGVNVHHSTVYRWVQEYAPILYQIWKKKHKKAYYKWRIDETYIKIKGKWSYLYRAIDAEGHTLDIWLRKQRDNHSAYAFIKRLIKQFGKPQKVITDQAPSTKVAMAKVIKAFKLKPDCHCTSKYLNNLIEQDHRHIKVRKTRYQSINTAKHTLKGIECIYALYKKNRRSLQIYGFLPCHEISIMLAS >NZ_CP053076|5429:20938|12125_13565_-|WP_001028144.1|DBSCAN-SWA 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MNYFRYKQFNKDVITVAVGYYLRYALSYRDISEILRERGVNVHHSTVYRWVQEYASILYQIWKKKHKKAYYKWRIDETYIKIKGKWSYLYRAIDAEGHTLDIWLRKQRDNHSAYAFIKRLIKQFGKPQKVITDQAPSTKVAMAKVIKAFKLKPDCHCTSKYLNNLIEQDHRHIKVRKTRYQSINTAKHTLKGIECIYALYKKNRRSLQIYGFLPCHEISIMLAS >NZ_CP053076|5429:20938|10823_11996_+|WP_113805443.1|transposase|DBSCAN-SWA MTQVHFTLKSEEIQSIIEYSVKGDVSKNILTTVFNQLMENQRTEYIQAKEYERTENRQSQRNGYYERSFTTRVGTLELKVPRTRDGHFSPTVFERYQRNEKALMASMLEMYVSGVSTRKVSKIVEELCGKSVSKSFVSSLTEQLEPMVNEWQNRLLSEKNYPYLMTDVLYIKVREENRVLSKSCHIAIGITKDGDREIIGFMIQSGESEETWTTFFEYLKERGLQGTELVISDAHKGLVSAIRKSFTNVSWQRCQVHFLRNIFTTIPKKNSKSFREAVKGIFKFTDINLAREAKNRLIHDYIDQPKYSKACASLDDGFEDAFQYTVQGNSHNRLKSTNLIERLNQEVRRREKIIRIFPNQTSANRLIGAVLMDLHDEWIYSSRKYINFDK >NZ_CP053076|5429:20938|18243_19389_-|WP_170172426.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP053076|5429:20938|8422_9157_-|WP_014158488.1|DBSCAN-SWA MNEKNIKHSQNFITSKHNIDKIMTNIRLNEHDNIFEIGSGKGHFTLELVQRCNFVTAIEIDHKLCKTTEHKLVDHDNFQVFNKDILQFKFPKNQSYKIFGNIPYNISTDIIRKIVFDSIANEIYLIVEYGFAKRLLNTKRSLALLLMAEVDISILSMVPREYFHPKPKVNSSLIRLNRKKSRISHKDKQKYNYFVMKWVNKEYKKIFTKNQFNNSLKHAGIDDLNNISFEQFLSLFNSYKLFNK |
16 | Staphylococcus_phage(63.64%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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