Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048764 | Campylobacter jejuni strain ZH003 chromosome, complete genome | 0 crisprs | DEDDh,WYL,c2c9_V-U4,csa3 | 0 | 0 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
442956 : 453764
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP048764|442956:453764|DBSCAN-SWA 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TAAATCATCTTTTGCTCTAAAATACTCGCTTACTTTTTCAAAAACATTACCTAAAAATCCTGCTTGTTGATTTTCATAGGTTAAATGTCTTTCTTGTCTCCATTGTGTCAATCTTTCTTTAATTTCGTTAAATTGTATTTCTGTCATTTTCACTCCCTACATTCTAATAAATCCGCATTTTCATGAATATTACCTATGATTTCGATATTTGCAATATCTTTCATAAAGCATTGAAGTTCTTTATTTTTCAATATTCTAAAACCAAGAAAATTATCAATTCCTATACAACCTATGCTTACTTTTTTAGGTAATTTTTTAATCATACCTTTATCCAGAAGCTCATGTTTAAATATATAAACATATTTAATAACATCCCCTTCATAAATCTTTTTTCCGTTTTTATCAAAATAGCCAGTCCATAGCTCAATTTCATAATCTATAGTAGGTTTTTCATAGGTTAATTGATTAAATACGCTAGTTATAAAACCTAACGACTCTATTATACTTCCTGCTTCATAGGTTTTAGAATTATTGTTCCAAATCCTAAAATCAAAATCTTTTAGTTTCATTTTTAACTCCTTAGTATTTTTTTCCATTTTTCTTCGTATTTTTCATAATTTTTCCAATAATTAAGCTCTTTTTCTAATTTATTTAAAACAGCTTCAAACGCTGAATTTTTACCTATTTTTTCGGCAAATAAACTCATTTCCCATTCTTTAAAACAAACAATATCATAATCCTTGGCTAAGATTTTTCTAAGTTCAAGTAGTTCTTTTTCACTAAGCTTTCTTTTAAAGCTTAACTGCTTTTTCTTTTCTAAGTCGTATTTAAGGGCTTTGATTTTGTTTTCATATTTTTCCTTTTGTTGTGCTAATTGTGATTTGTAGCCGATTTTTTGATGATGATTTAAATAATTAAGCCTTTGATTTTCATCGCTTAGGGTTTTAAATCTAGCTTTTTCTTGTTCTTGTTCTAGACTTCTAAGCTTTTCTTTCATTTGATAAAAAGCAAAAACTAAAACTTTTTTAGCATTTCTAACACTTTCGCTATTTTTCATATAAGTTAAAAGTAGCGTTGCTTGCTGTTCATTTAAGAAATAAATCTTTTTGTTAGTCTTTGCTATTTTTTGAAGTTCAAAGCCTAGTTCCCCAAAACATTCTAAATCTTGCTTGTAATTTCTTATAAGTTTTTGTATGGAATTTATATCTACTTTAGATATTGTAGAAATTTTATTTTGGTCTGTAACTAAACCGCCATTTAAAGAATAAACTAAATCATTCATAATATAATCCTTTTTCAATGTTTAATTATTGAAATAATACTATATTAATAATGATTTGTCAATACTATTTAATTATTTTTTCATAAAGATAATAATGATGTAGCATTGAAATTAGATTAACGCTCGGATTTTAAATCCGTTCGTTTTTAATATCATCAATAAAAAGATACATTATATACTGGTTTAAAGACACTCCAGCTTTTTCAGCTTTTTTTTCTAGTTTGTCTTTTAGCTCATTTGGAATTTTAATCTGTAAATTATAACTTCCCTTGCTTTCTTTCTCTTCTGCCATTTTCTTTTTATCCTTTTCTATATCTTTTTTTGTTGCGTTTGGATTTGTAATCATAATATCAGGATGATTTTTTTCAGCTTCATCCAAAAGCCACATATATGCTGTATTCTTATCCATCTCTAAATTATTATTTTCACAATATTTGTAAAATTTTTCGTAATATTTTTCTTTATTTGGATTTAAAAATTTTGTTGGATGTTCATCCATAAATTTTTTACTTATTTCAATAAAGTCTTTTTCATTCATAATTTTTCCTTTCTTTAATTTGATAATTTTATCAAAATTTTACTTAAGCAAATAGACTTCTTTCTATATGTTTAAACATAATTTCATTAGCACTTTTAAAAAAGTCTTTTTTAATCTCAAAGCCATAAGCTTTGCGGTTTAAATTTGTCGCTGCTAAAAGAGTGCTACCACTTCCAGCACATGGATCTATAACAACATCACCTGCATCTGTAAAAATAGTGATTAATCTTTCTAGTAATTTAACAGGCTTTTGTGTGGGATGTACTTTAGGAATGCCTTCATCTTTTTGCCAATCCATGCAGTTATAAATCATCTTTCCATCATTGTTAAATTTTGGAAGTTTTTCACGATATAAGATTAAAGCATATTCACAATTTCCAACTATTTTCATATTTGCTTTTAAAACTTGAGATGATCCTTGTTTTCTAAAAACCAAATTTATATAATGATTAAAGCCATATTTTTTAGCTACTTCAATTAACATTGTTTGTTGTTCAAAAGAGCAAAAAACAATCATGCAAGGACTTTTACCGCATTCTTTAGGTTCTTTTATAAGCATTTTTGAGCAAAAGTGCATAAATTCGCTAACTCTAAAATCATTATCTGTATCAAAAAACGCCTTGTTTGCTTTTTTGCTTTCTCCATTTTTATTATCCCCATTTATATACCATTCAGGAGATGAAGCATAAGCATTGTTGCCTAAATTATAAGGAATATCAGCTATTACGAGCTGTGCTTTTGGTATATTATATCTTTTAAAATTTTGAAAATGGTCGTTATATAAATTTGGTTTCATTGGCATTTTTTCTTTCTCTAATATATTTTTTAAGACTATTTATTAAAGCGTTGTAATTTCTTTGAGAAGGATTTAGAGCAAAACTGCAAATATCGTTTATTAAAATATAAAGTTTAAAATCCTTTTGAGATATTAAACTTAAATATATTACAATACCTTTATAACATTCTACAGGTCTTTCCATTGAAATAAATCTCTCGCATCTTTTTACATAAAACTCACATTTTTCTAAGTCTTGTATCTCATATCCTTTAAACTTGCTACGAATAGCATATTTTAAAGCATTACCTATGTGAAAAATAATTCTTTTTTCAGGCATAATATTAAACATTTCTTCCAAAAAGTCTAAATTTTCAAATCCAAAACCTTTATAATGCGGTGGATTATTTACTAAATCTACTCTAAATTCTTTTTCTTTCATAATTATCCTTGTTTAGCCTTTTCACACATCTTTATAAAATCATAAATATTAGTATTAAAAATAGCATTTCCGCTTTTAAATTTTAAAGGTATTTTTTTAAGTAGTTTGATTTTATAAATAGTATTTGAAGTATCTATAAAAGAGCAAGTATCGCTCAACTTTAATATTAATGCGTATTCGCTCATATTTGAGTAAATGTCGGCACTCGCATTTAGTGCTATAAATACAAAAAGATTATTTTTTCATTTTTCACCCATTAAAAATTTTTCAACATCTTCAAAAGCTTTAACAATAAGCTTTTTTTCATGAAAGAAATTTCTTCCACTTGGCTTACTTTTGTAAATTTTGTAAGCCTTTCTGAGTTCTTTTTTACTTATATGATTTTTATAATTTATTTTCTCGATTTTTATTTCATTTTGTTTAGCAAATTCGCAAAAGCAACTTCTCCTCTCGCTAAATGGAACGATTTTTACAATTTCAAGATAATTAGAACGGCAAACTTTCATCATCATCTCCTATTTCGATATATTTTTCATTGTTATTGTTTTTTACTTCATTTCCATAAGGATTATAGCTTTGATTTTCTTTTGGAATAAATGATTTATTATTGTCGTTATTTAAAGATTTATGCCTTGCTTTAAAAGATTTTATAGATAAAGGCTCTTTATTATTTTGAAACTCATCCATGCTTTGCATTTTTTCATTAAAAATTCTATCAAGAAAGATTTTGTTAGCAAGTTCTCCATTTTTACTTAAATATTCTTCTGTTCCAAAACCTAAAACTAAAAGTTTATTAACTAAAGAATTTAGATAAATAACTTCAGTCTGCACCCCAAAAACATTCTCATTTCCCTTTTCGCTAAAATCAAGTTCATCAATTCCAAAGAATTTCATAATAGCATTTAATTGTCTAAATCCTAAATAATTTTCTTTTTCTCCATTTTTATTGATATAGCTAAAATCGTTATTTTTAGCTACAAAAAGATTAAAAATAGCTAGTTTTTGCTCTTTTCTGGTTAAAAATTCAAAACAAATAAAAGTATTATTGCTTCCATCGCTTGCCAATTTATCATATAAAAAGGCTTTGCGGAAAACTCCGCTATAAAGCCCACCTTCACTTAAATACTCTACGCTTGGCGAATAATTTGCCACTTCAAAACTTGCCTTAAATGCTGGTAACATTATAATTCTCCTTTTAATTGTGTTAAAAATTCATCTTTATTACTTAGAACTTCTTGTATTTTTTCACTTGTAAATAAAGAATGTTTTTTTATAAAATTGTTTTGCTCTTGGGTGTTTAAACCATTATCACTCATAAATTTTCTAAGTTCAGCACCTAAAGCTTTTATCTCTTTTGCTTTATTTTCTATAGCTTTTTCATCACTACCCCAAACTTTTAAATCTTCATTTGGATTTAAAAATCGCTTTTCCTTTATTGTTTCTAATTCACTCTCATCAAGCATTCCAAGTCCGCAAATACTTAAGGTTACACGCCTTTTTGCTTTTGTGATAGCTTTCATTATTGCGTTTGCTAAATTATCGCCACCTAAATTTTTAATATTTAAAGCACCTGTATCGCAATCAGTTCTTCCATCTGGTGTTGCTGCGTAGGCTGTAACCATATAAATATCGCCAACTTGTGCCACTTCTGTTTTTGTAATACTTACTTTTCTTATTTGTCTTAGCTGATCTGTTGCTGATTTATTTGCATATAAAGTAAGTTTGCCATTTAATACTATGTATTCAAAAGGCTTTGTAAGCATGTTTAAGTTTAAACTTTCACAAAGATTTTTAACATAACTCGCTCGTTCTACATCACTAAGTTTTGATAAATCACCTTTTACCAAAGCCAACTCATAAGGATTAAAATTTATTTCTAATTTATTTTCTTCTTTTAATACAACTTCATTACTCATTTTATGCTCCTTTTTTGATTTTTAAACACATTGAAGTACTTTCCTTATAAAATTCTTTAGGCACAGTAATATTTTTTTGCTCTAAAAAGCCCTTATAATCAATTGTAGTTCTACTTTGCGGATAAATTGTAATATCCAAACATCTTGCTTTTTCTCCATTTGCTAAGGCTATGAGTTCTTTTTTAAGACTTTCTAGCTTTTCTTTAATAGGTTTAATCGTGTTTTCAAGCCTTATAATTTCAATCGTTAGATTTTTTGCTTTAGTATCTTCAAGCTCTTTATATTCGCTTTTTTGATCTATGATATAATCTAATATAAATTGCTTTATATTTTTAACCAACCATTCTTGATAAGCTTCATCTTTTGAAACTTCGCACTCTACAATCTCTTCTTCTTTATTCATGGCTACAAAAATGCATTTTTCTTTACCACTGATATAGAGTTGAAATTGCACTTGAGCGTAGTATTTATCACTTGGCTTTTTATTTCTTTTGATAAAATCATACTCATCTTGCGAATATTTAAACTCATAAACAACCCCATTTTCATCAATACCATCTAAGCTCGCTATAAACATTTCATTTTCTAGACTTTGCAAAACTACAGGAGTGATACTCACAGAATGTAAAAACTCAACTCTAGCTCTAATCAAAGCTTCATAGTTATTGCCTTTTTTCATAGCTTCATTTTGATAAACTTCTTTAAGTCCCAAGATGATATCTTTTGCTTCTTCTTTGGAATTAAAAGCACCTTTGATACCTACGCAAGATGCTACCATCGATGCACCTATTTTTCCTTTTCTAAAATTTAACCATTCATGGCTACCTTGTTCTAAGTTAATTATTCTGCAATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP048764|442956:453764|452909_453764_-|WP_002874354.1|DBSCAN-SWA MNCRIINLEQGSHEWLNFRKGKIGASMVASCVGIKGAFNSKEEAKDIILGLKEVYQNEAMKKGNNYEALIRARVEFLHSVSITPVVLQSLENEMFIASLDGIDENGVVYEFKYSQDEYDFIKRNKKPSDKYYAQVQFQLYISGKEKCIFVAMNKEEEIVECEVSKDEAYQEWLVKNIKQFILDYIIDQKSEYKELEDTKAKNLTIEIIRLENTIKPIKEKLESLKKELIALANGEKARCLDITIYPQSRTTIDYKGFLEQKNITVPKEFYKESTSMCLKIKKGA >NZ_CP048764|442956:453764|445319_446522_+|WP_032593176.1|integrase|DBSCAN-SWA MLTQKDIDNLEIKDKRYMISVGEPKELYVRVNPTGKKVFYLRASKFKNFITIGECQKGVLNVTNAREKAKDLLKSMYDGKFIGKNDKVMTLEKANFLYVDIKSKKLNSATIKKEQSIFKKYIIPTLGQKDINELKKDDFLPIYDLMQKKGIYETINKNISLLCRIFEISRQRGDLKTDIILQLKDLKKFYNEANHNKVKHFKAIVEEQEIKNMLECMKEYKNHPRTNTTIINAIYFTLLTAQRSKNIRFAKWSDIDFENNLWIIKADEMKVRTNGDNIIPLNKYALKVLEIQRILNGDKKYIFANNNGTISENFAVRFFKFYNLEHTIHGYRSTFRSVYTNKSNELIQQGISKDIAEMILHHISGNEIERAYNRAKAIDLRVKLMQWYGNYLNSLCEFCF >NZ_CP048764|442956:453764|450994_451177_-|WP_167843378.1|DBSCAN-SWA MSEYALILKLSDTCSFIDTSNTIYKIKLLKKIPLKFKSGNAIFNTNIYDFIKMCEKAKQG >NZ_CP048764|442956:453764|451234_451498_-|WP_167843447.1|DBSCAN-SWA MKVCRSNYLEIVKIVPFSERRSCFCEFAKQNEIKIEKINYKNHISKKELRKAYKIYKSKPSGRNFFHEKKLIVKAFEDVEKFLMGEK >NZ_CP048764|442956:453764|449818_450571_-|WP_070286490.1|DBSCAN-SWA MKPNLYNDHFQNFKRYNIPKAQLVIADIPYNLGNNAYASSPEWYINGDNKNGESKKANKAFFDTDNDFRVSEFMHFCSKMLIKEPKECGKSPCMIVFCSFEQQTMLIEVAKKYGFNHYINLVFRKQGSSQVLKANMKIVGNCEYALILYREKLPKFNNDGKMIYNCMDWQKDEGIPKVHPTQKPVKLLERLITIFTDAGDVVIDPCAGSGSTLLAATNLNRKAYGFEIKKDFFKSANEIMFKHIERSLFA >NZ_CP048764|442956:453764|446681_447224_-|WP_032593178.1|DBSCAN-SWA MGILKRLDETIIIENDRKSEKELVEYCILEGISLNNANLENINLSGLDFNNAFINGASFKNANLNDISSKNASFIDCDFSGASFHFCNFLRTEFENCIFENVDLRDCIGDMKNIFSVVVDTYVMTFTKTMMNLGCDTKTIKEWRNLSVNDLEDEEQKWLWNYYKDTIFEIIDKRLGVENG >NZ_CP048764|442956:453764|446518_446689_-|WP_002864902.1|DBSCAN-SWA MVKKYFREKELSEYLGVSITSLFKLRQDGKIPYIRIGKSIRYEIKEIEKWLKAKRH >NZ_CP048764|442956:453764|452173_452908_-|WP_032582841.1|DBSCAN-SWA MSNEVVLKEENKLEINFNPYELALVKGDLSKLSDVERASYVKNLCESLNLNMLTKPFEYIVLNGKLTLYANKSATDQLRQIRKVSITKTEVAQVGDIYMVTAYAATPDGRTDCDTGALNIKNLGGDNLANAIMKAITKAKRRVTLSICGLGMLDESELETIKEKRFLNPNEDLKVWGSDEKAIENKAKEIKALGAELRKFMSDNGLNTQEQNNFIKKHSLFTSEKIQEVLSNKDEFLTQLKGEL >NZ_CP048764|442956:453764|449367_449529_-|WP_002810092.1|DBSCAN-SWA MAEEKESKGSYNLQIKIPNELKDKLEKKAEKAGVSLNQYIMYLFIDDIKNERI >NZ_CP048764|442956:453764|442956_445032_+|WP_002779472.1|DBSCAN-SWA MSRSTPLKKVRNIGIAAHIDAGKTTTSERILFFTGMSHKIGEVHDGAATMDWMEQEKERGITITSAATTCFWKDHQINLIDTPGHVDFTIEVERSMRVLDGAVAVFCSVGGVQPQSETVWRQANKYGVPRIVFVNKMDRIGANFYNVEDQIRNRLKANPVPLQIPIGAEDNFKGVIDLVTMKALVWEDDTKPTDYVEKEIPAELKEKAEEYRTKMIEAVSETSDELMEKYLGGEELSLEEIKTGIKAGCLSLSIVPMLCGTAFKNKGVQPLLDAVVAYLPAPDEVANIKGEYEDGTEVSVKSTDDGEFAGLAFKIMTDPFVGQLTFVRVYRGCLESGSYAYNSTKDKKERIGRLLKMHSNKREEIKVLYAGEIGAVVGLKDTLTGDTLASEKDKVILERMDFPDPVISVAVEPKTKADQEKMSIALNKLAQEDPSFRVSTDEESGQTIISGMGELHLEIIVDRMLREFKVEAEVGQPQVAYRETIRKTVEQEYKYAKQSGGRGQYGHVFLRLEPLEPGSGYEFVNDIKGGVIPKEYIPAVDKGVQEALQNGVLAGYPVEDVKVTVYDGSYHEVDSSEMAFKLAASMGFKEGARKAGAVILEPMMKVEVETPEDYMGDVIGDLNKRRGQVNSMDERGGNKIITAFCPLAEMFGYSTDLRSQTQGRATYSMEFDHYDEVPKNVADEIIKKRNG >NZ_CP048764|442956:453764|450551_450992_-|WP_038402054.1|DBSCAN-SWA MKEKEFRVDLVNNPPHYKGFGFENLDFLEEMFNIMPEKRIIFHIGNALKYAIRSKFKGYEIQDLEKCEFYVKRCERFISMERPVECYKGIVIYLSLISQKDFKLYILINDICSFALNPSQRNYNALINSLKKYIRERKNANETKFI >NZ_CP048764|442956:453764|448526_449237_-|WP_167843377.1|DBSCAN-SWA MNDLVYSLNGGLVTDQNKISTISKVDINSIQKLIRNYKQDLECFGELGFELQKIAKTNKKIYFLNEQQATLLLTYMKNSESVRNAKKVLVFAFYQMKEKLRSLEQEQEKARFKTLSDENQRLNYLNHHQKIGYKSQLAQQKEKYENKIKALKYDLEKKKQLSFKRKLSEKELLELRKILAKDYDIVCFKEWEMSLFAEKIGKNSAFEAVLNKLEKELNYWKNYEKYEEKWKKILRS >NZ_CP048764|442956:453764|447415_448102_-|WP_032593184.1|DBSCAN-SWA MTEIQFNEIKERLTQWRQERHLTYENQQAGFLGNVFEKVSEYFRAKDDLERVEVLCDIAVFFFNAFDFKYRAVSSNMNCYTFSDVVVYNIYSLFGARTDNLCVVENENALDLENHLNLTMFEIEQLCKNLDFDFYKCMLEKIKEIESRTGFYDERLKKFVDKICAFSKDEALSNVSKDFGFLGNSIIYKLTQEDKNFWFITCKEIETNLQIDYKVKKIYKADYKSCRL >NZ_CP048764|442956:453764|448104_448524_-|WP_032593187.1|DBSCAN-SWA MKLKDFDFRIWNNNSKTYEAGSIIESLGFITSVFNQLTYEKPTIDYEIELWTGYFDKNGKKIYEGDVIKYVYIFKHELLDKGMIKKLPKKVSIGCIGIDNFLGFRILKNKELQCFMKDIANIEIIGNIHENADLLECRE >NZ_CP048764|442956:453764|451478_452174_-|WP_002783960.1|DBSCAN-SWA MLPAFKASFEVANYSPSVEYLSEGGLYSGVFRKAFLYDKLASDGSNNTFICFEFLTRKEQKLAIFNLFVAKNNDFSYINKNGEKENYLGFRQLNAIMKFFGIDELDFSEKGNENVFGVQTEVIYLNSLVNKLLVLGFGTEEYLSKNGELANKIFLDRIFNEKMQSMDEFQNNKEPLSIKSFKARHKSLNNDNNKSFIPKENQSYNPYGNEVKNNNNEKYIEIGDDDESLPF |
15 | Campylobacter_phage(62.5%) | integrase | attL 439135:439149|attR 450151:450165 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
473619 : 481305
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP048764|473619:481305|DBSCAN-SWA AATGGCTTTACCTTCAATGGGACATACCTCACCCGCAACTGAAAATGTTAAGTTAAAACAATCAATATATGAAACGATTATTAAAATTGGAGCTACTGAAACACCAATTTTAAATAAAATAGGTACTTCAAAGGTTACAAATCCTTTAACTCATAGTTGGATTACTGATACTTTTGAAGAACCAAAAAAGAATGCAAATTTAGAGTTAAGTAAATTTGTAGGTGAAACAAAAAACACAGCTCAAAAAACTACAAATGCTACTCAAATATTCATTACTGAAGCTATGGTATCAAAAGCTTTATTAAAAGCAAATCAATATGGTGGAAATGAAATGGAGTATCAAATAGGCAAAAAAACCAAAGAACATAAAATGGATATGGAATATGCTTTATTTGGTCTAGGCAGAGATAGTGATGTAAAAAAATCAGTTTTCAAAGATTATGTTCAAGCACAAGAAGCAACAAGTGGAGAAATGGCTGGACTTTTTCATTATATCGCTAAAGGAAAATATAGCTTTGCTGATGGAAAGCGTGGAAATGTATTAGCTTTTGATGAAACAGGAGATTGGAGCGGAACTGCAACAGAACTAACAGAAGATAAACTTAATCAAATTTTGCAAACCATTTGGAATAGCGGAGTTACGCCTAAAGATGTCTTTTTAGGAGCTGACTTAAAAGGAGCTATTAACAAATTTGCTACAAGAATTTTAGGCAATGAAACAAAACTAGCAGGACAAGTAGTAAGCCTTGAAACAGATTTTGGAACGGTAAATTTCCATATGCATAGATTATTAAGCCCTAAATATGGTTTGGGCGATGTTTTAATTGCTGGAGATTTTGAGTATATGAAACATGGGCTTTATATTCCTACTATGATTGAAGATGTTCCAACTGATATTACTGCAAAAGCAAAAAGATTTTATACGCAAAGCACTTTAGAAGTAAGAAATGCTGATGCTTTTGCTATAGGAGTGGGATTAACTAGCGGAAATAATGCAAAGGCTAAAGCGGTTTTAAAAGCAGCAAAAGGTGCATAATGCTTTGTGCTACGGCTAAAAAACTCATTATCGCTAAAGTTAAAAATTCTTACAAAATGATAGAAGATGATGAAGTTTTGAAAGCCTATTTTATGGAAGCATTTTATTATATTTTATCAAAATGTGTTCCTAGTGTTCTTTTAAAAAATGTAGAACAAGGCGAAAAAGTTTTTAGGCAAGTTAGAAATAATCATTTTTTGATTATTCCTGATGAGCCTGATTTTGACAATGAAAAAGAACATTTAATGATAGATGAAGCACTTAGTTTTGCTGTGATTAATTATGTTTGTTATTTGATTACAAGATGCGAAGAAAAAGACTTTCTGGCATTATGTGACAAGATAATTAATGAGTATATAGCTAATGATGGCAAGGAGCTTGATGATGAAAGAACATGGTTGTGAGTGTAATTTTACAAATAAATTTAATCGAGCTTTGAGTTATAAAGACTATGCTCAAAGTATAAATAGTGCTGATTTTATAGCTTATTTAGATGATAAAAAATGGCTTTTAGCCATGGATGATCTGCTTTTCTTTTGTGAAAAGAGAATCAAAGATAGTGATTATTATGAAGGTTAAAAATGGGAACAAGCTTAAATGAGTTAAAAACAGGTAGAGAAAAACTTGAGATTATAAATCAAGTTTTGGCAAGAATTTCAAATGTTGCTACTGCTTTGGATAATACCAGAATAGAAGAAATTGTAGGACTAAAAGAACAAGTTAATAATTTTTATAATCAAATTTTAGAGCTTAAAAATTTAGTTGTAAAAAATAGCGAGCTTACTCAAAGCAATACTGATTTTACTAAAAACAAAAGAAATGAAATTGAAAAAATAAGCAATGAAATAAAAAATACTTTAAATAATATAGAAGAAATCTACAACAACATTATAAAATCAGAAAAAGATATAAGCAATGGAGTTAATTTTGTTAAAGACAAATATCCTGAACTTAATGAGTTTAATAAAAATTTTGAAATTATAAAAATAAAACTTGAAGAATATTACAACATAGCTGTTGATTTTAATGCAGGTCTTAAAAAAATAGAGGAAAACAAAAATCTTACCAAATCCTATTTAGATTTATCCATAGAACTTAAGCAACAAATCTTACAAGAATTAGAACACGCACAAAGTATTAAAGAAGATTTGCATTCTAATATAGAGCTTGTAAATAAACTTGTTTCAAATATCGTGGCAACAAAAAATGAAATTATATCCATAACAAATGATTTTAAAAATGTAAAATCAGAAGTTCAAAATATAGTTAATAATGCTGAAGCAACAATAAAGCTTAAAATAAACACTATTCTTTTTGAAAATCAAAGATTAAATCAAAATATGATTGATCTACTAAAGCGTTGCGAGAAGCTAGAGGATGAAATAGTAGGAAAATATGAAGATATTTTAAAAATAGAAGATCTTATAAACTCATCAACTGGAATTATAAATGATTTGAGAGAAGCAGTAAAACAAAGCGAACAAATAAGCGAAGATATGAGAAGTTTTACAGCTATCATCAAAGACTTTAAAACAGAAATTTCTAATCTAAAAGCAGATTTAGAAAGCTATGGCGAAAGATTAAAAGGACAACTTGATTTAAAATTAGCACAAGCAAACTCAAGTGTAGATGCTAAGATTTCAAGCATTGAGACTCTAAAAAATCAAATTGAAGCATATGTAGAAGCTAATAAAAATACCGTAGATGTGGCTTTAGCTAACTTTATAGAAAGATCTAAAATAGCTAATGAAGATTTAGGAAGATTGGCTGAAGTAGCAAGAACAGAACTCGCTAATGATAAAACAGCTATTGAAAGCTATTTGCTAGAACTTAAAAAAAGTATCGTTGATGAAATGAAAGAAGTGTCAAATAGCGTTACAGATGAAACAAGTGGAATATTAGCTCAAAAAAACCAAATAGAGCTTATCATGGCACAAGGAAAATCAGATTTAGATACTTTAATCAACAACTTTAACTCAAATTATCAAAACAAACTTAACGAATTTAATTCTAATACTAATGAGAAATTAGCTTCTATTAATTCACTCAGTGAAGAAAGTATAACAAATATACAAAATAAAACAGATGAAAATATAAGCAGATTAGATACAGCCAGCGAAGAAAAACTAGCTAAATTTGATGAAATTATAAAAGATAATTTGGGTGGAATTTATTCTCACATTTTTTCAATCGAAAATGTTTTATTTGATAAAAAAATAATTAAATTAAGTTATAAGGAGTAAAGAATGGCGGACTTAGAGCAAGTTGTAAATGATTTAAATTTGGCATCACAAAGCTTGCAAGAGTTAAGAGAAAAATATGATGGTGCTTTAGATTTACTAGATAATAAAAATACAGAAATAACAGGTGCGCTAGATAGTGCAAAATCTGATGCGCTACAAGAAATACAAACTATAAGCGATACAGCTACAAGTCAAATTTCGCAGTTAAAAGACACATCCTTAAATTTGGTCAACGAAGCTAAAAATACAGCTACAACTGAAATATCAAATAAAAAGGAAGAGCATAAACAAGAGTTAGAAACTAAGAAGAATGAATACATGAGTGAAATTGATGCAAAAGCTAATGAGTATGATATTGCCAATATTAATGCGCAAGTTCAAGCTATGGATACCAAAATAACCGAGCAGATCAATGGTGCAAAAACGGAATTAAATTCGAAAATAGACAATAAGGTAACAAAAACTGGAGATGAAACCATAGCAGGTGTAAAAACATTCTCAGCACCACCTGTATCAGCAACTAATCCTACTGCTAACAATCAAGTAGCAAACAAATCATATGTAGATACAGTCGGAAATAGCAAAGTTGCATTAAGCGGAAATCAAACCATAGCAGGTGTAAAAACATTCTCAGCACCACCTGTATCAGCAACTAATCCTACTGCTAACAATCAAGTAGCAAACAAATCATATGTAGATACAGTCGGAAATAGCAAAGTTGCATTAAGCGGAAATCAAACCATAGCAGGTGTAAAAACATTCTCAGCACCACCTGTATCAGCAACTAATCCTACTGCTAACAATCAAGTAGCAAACAAATCATATGTAGATACAGTCGGAAATAGCAAAGTTGCATTAAGCGGAAATCAAACCATAGCAGGTGTAAAAACATTCTCAGCACCACCTGTATCAGCAACTAATCCTACTGCTAACAATCAAGTAGCAAACAAATCATATGTAGATTATGGCGGCGGAATTAAGAACTTAGGAAATCAAACAGCACCGAAAATAGATTTAAGACAAGCTCAGCATTTTATCTTAACAATGACAGCCAGAGGAGCTATTGGTATAGCAAATTGGGGTGGAGCAGGTAAAAGTGGAACCATCACTGTCAATAATGCTCAAAATATCACTGCTTTTTCGGCACCTTTTAAATTTAGAGTAGCTCAAAGTGGATTTAGTGGCACTGAAACTTTTGCTTATTTTTGCATAGCTTCGAATAATGTAAGATTAGTAAGGACTTAAAATGAACTGCCTCCTTCTTTCTAATAATGGCATAGCACTAAATTTACCTCCATCTTTAGGAGGCTCGGTTGCAAATTATAATTATATGTTAAAGCTAGACATGATTTATAAACAAGCAGTGGTATTGCCATCAAATATTAATAATAAAGAAGTGGTTATGTTAGGCGAAGTTTGGACGACTAGAAATATGTATAATAAAACTTCTGCAAATACTTTGCATATCACATGGAACAATTTTAACTCTAGTGTAGAATTGCATGCTTTAAGTAAATATTACACTGCCAATGCAAAAATCAAAGTAGAGAAAAAATTCAATTTTGGAAATATAAATAACTTACAAATAATGCTAAGTTCTTATCAAAGTGGTAGTGCAAATGCAAGTGCTGGTTGGAACTTAAATGATGGGAATAGATTAAATCCAAGAGCAAATTTAACATTATACTGGAATTAAGAAAGGATAAATATGTTTTATGATTTAAAAAATAAAAGTTTAAAATATGATGATATTTTTTTAAAAGATGTAAAAATACAAAACGAAGAAGGTGAAATTGATGCACAAGATACTTATTTTTTAAGTGCTTGCGATGATAAGCTTTTAAAAGAGCTTGGTTTTGCTAAAGTTAAAGAAGAAGAAATCCCAAGTTTTAATGAAAAAATTGAAGAACTTCGCCAAATTCAAACTTATGATGAAGAAAATAATCTTTATATTATTTCTTATGAGATTAAAGAAAAAGCATTAGAAGAGTTAAAAGAATTAAAATTAGAAGAACTAAAAGCTATAAAAGAAGAAAAGCTTTTGTTTATGCCTTTTAAAAATACTATATTTCAAATTGACACGGAAGCAAAAATTAATATTAGCGGAAAAGTTAGCGAGATAATGTTAGCAAATCTCAATAATACTCCTTTGGAAAATATTGCTTGGATTGATAAAGATAATAAAATCATTACATTTAACAAAGAAGAATTTTTAGAATTTGGGGTTGGTATCGCTAAATATACTGAAAGTATTATTTTTAAAAATGATGAACTAAGAAATAAAGTGAAAAATGCTACATCTTTAGAAGAATTAAATTTAATTGCATGGGAGAGTGAAAAATGAGTACTGAAAATATAATAAAAGAAGGTGCTATACTCGGTTCTTTAAGTGGATCTGCATTATTAGGATTGATGGTTTTTGTCTTAGCTGGGATTGCATGGCATTTATATAAAACTTTACATAAAGAAGCTGGGGAAAGAACAAAAGAACTTATAAGTGAAACCAAAAATACTAATGTTCTTATTAGAGAACAAATTGCAGTATCCAGAGCAAGCAATGATAGCTTAATCAAATTTATACAAACGCATTGCTCTAAAACTAACGATAAGCTAGAAGCTATAGAAACAGATCTTATGCGAATGGATGAAAGGCTTGTTAAGCTTACTCAAATAAGAAATGATGAGTTAAGAATGATTTATAAAAGAAAGGAAAACGAATGAAAATTGCATTTTATAAAGTTAAAGAAAATGACAAATCTACTTTTCTTGATAAAGCAATAGCTTTTTTTACTTCATCTTGGAAAGAAAGATTAAATGGAGATTTTTTAAATTCCTATTCTCACTGTGAAATAATCTTAGACAATTTAATGATTAGCTCAAGTCCTAGAGATAAAGGAGTAAGAATAAAAGAATTTAAAGACACTGGCAGATGGGATTTTATAGAAATCAATGATATAAATGAGACAAAAATAAAAGAATTTCTTTACTCTCAAATAGGAAAAAAATATGATTTTTTAGGAATTTTGGGCTTTTTCACATTCACAAAAGATAGTGAAGACAAATGGTTTTGTTCTGAAATCATAATAAGAGCGTTGCAAATAGGTGGTTTGGTTAAGCTAGGAGATATGAATGCAGGAAGTTCAAGTCCTAATAGATTATATAAAAAACTAAAGGATACAAATGAAAATTAAAATCATTAGAAGATACACTGGAAAAACTTGTGTTATAGGCAAATTTAAAGTTTTTAATGATGATGATAAATTGCTATTTGAATGCTTTTCTTTAGAAGAGGATAAAGAAGGAGTTGAAAGAAACAAGGATTTGAGAATACCAGAAGGCATTTACGATTTAAAAAGGCATTCTCCTTCAAGATTTGAAAACACTTTAAGAAGTATCACAAAAAAAGATGATGATACAATGATTAATGTGTTTAATGAAAAAGTCCCATTTGATAGACATATTTTAATACACTGGGGCAATACAGACAAAGACACACAAGGTTGTATCTTGCTGGGGCTTACTAAAGATAATAATAATGAAAGTGTCGGTCAAAGCAGACAAGCTTGTAAAGAATTTTATGATTTGGTGTATGGTAAAAATCTTGAAGACATTAAATTAGAAATAACAAATGAGTTAGCATAGAAAGGAGAAAGAAATTTAAGTAGGTTACCAAATAATCCCCTAAAAGGGGACAAGACTAATAAGCCTTGACAATAATTATACATAAGAGTATAATTATAACGATTATTTGGTGATATGCAGTCATAAAAATCACCCACTTTCAAGGGTAAAATTTAGCCATAGGGGGCTAGACCTACGGCTAACCCTTAGGGGTATTATATAAAAACCTTACTTAAACTTCTAAAACAAAATATGATAAATCTTTTATTTGGAAATGCAAAGCTTTATATCGCTTTAGTATTAATGGCAATCTTAGCAGGATATTTTTATCTAAGACTTGATAGCACAAAGGCCAAATTAGAAAAAAGTCGAAGTGATTTAGCTTCGGCTTTAAAAGTCAATGAAAATAATCAAGAAAAATTAAAAGAATTAAATCAAATTCATAAAACAGAATTAAAGGCTTTAAATGAAGCAAACAATCAAAAAAATCAAGTACAAGAAAGGGTGCAATATGTTAAAGAATACATTTATAAAAGCAATGAAAATAATATTACCAAGCTTTTTAACGATGTCGTTGATAGGTTGTGGGATGCAAACTCAACAAGTAGTAACCAAAATAGAAATTCAAAAAGTTAGAATTCCGCAAGAGTTATTAACATTAAGTCCCCTTGAAAAGCCAAAGGCAAAAAATGAACTAGATATTTTAAATGCTTATTCTATGCTTTTTTACAAATACAAACAGTGTGAAATTCAGATAAGCAAAATAAAGGAGCTAAATAATGAGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP048764|473619:481305|480770_481154_+|WP_060787636.1|DBSCAN-SWA MINLLFGNAKLYIALVLMAILAGYFYLRLDSTKAKLEKSRSDLASALKVNENNQEKLKELNQIHKTELKALNEANNQKNQVQERVQYVKEYIYKSNENNITKLFNDVVDRLWDANSTSSNQNRNSKS >NZ_CP048764|473619:481305|473619_474654_+|WP_052773615.1|DBSCAN-SWA MALPSMGHTSPATENVKLKQSIYETIIKIGATETPILNKIGTSKVTNPLTHSWITDTFEEPKKNANLELSKFVGETKNTAQKTTNATQIFITEAMVSKALLKANQYGGNEMEYQIGKKTKEHKMDMEYALFGLGRDSDVKKSVFKDYVQAQEATSGEMAGLFHYIAKGKYSFADGKRGNVLAFDETGDWSGTATELTEDKLNQILQTIWNSGVTPKDVFLGADLKGAINKFATRILGNETKLAGQVVSLETDFGTVNFHMHRLLSPKYGLGDVLIAGDFEYMKHGLYIPTMIEDVPTDITAKAKRFYTQSTLEVRNADAFAIGVGLTSGNNAKAKAVLKAAKGA >NZ_CP048764|473619:481305|475235_476897_+|WP_167843385.1|DBSCAN-SWA MGTSLNELKTGREKLEIINQVLARISNVATALDNTRIEEIVGLKEQVNNFYNQILELKNLVVKNSELTQSNTDFTKNKRNEIEKISNEIKNTLNNIEEIYNNIIKSEKDISNGVNFVKDKYPELNEFNKNFEIIKIKLEEYYNIAVDFNAGLKKIEENKNLTKSYLDLSIELKQQILQELEHAQSIKEDLHSNIELVNKLVSNIVATKNEIISITNDFKNVKSEVQNIVNNAEATIKLKINTILFENQRLNQNMIDLLKRCEKLEDEIVGKYEDILKIEDLINSSTGIINDLREAVKQSEQISEDMRSFTAIIKDFKTEISNLKADLESYGERLKGQLDLKLAQANSSVDAKISSIETLKNQIEAYVEANKNTVDVALANFIERSKIANEDLGRLAEVARTELANDKTAIESYLLELKKSIVDEMKEVSNSVTDETSGILAQKNQIELIMAQGKSDLDTLINNFNSNYQNKLNEFNSNTNEKLASINSLSEESITNIQNKTDENISRLDTASEEKLAKFDEIIKDNLGGIYSHIFSIENVLFDKKIIKLSYKE >NZ_CP048764|473619:481305|479237_479618_+|WP_002810252.1|DBSCAN-SWA MSTENIIKEGAILGSLSGSALLGLMVFVLAGIAWHLYKTLHKEAGERTKELISETKNTNVLIREQIAVSRASNDSLIKFIQTHCSKTNDKLEAIETDLMRMDERLVKLTQIRNDELRMIYKRKENE >NZ_CP048764|473619:481305|474653_475058_+|WP_002796938.1|DBSCAN-SWA MLCATAKKLIIAKVKNSYKMIEDDEVLKAYFMEAFYYILSKCVPSVLLKNVEQGEKVFRQVRNNHFLIIPDEPDFDNEKEHLMIDEALSFAVINYVCYLITRCEEKDFLALCDKIINEYIANDGKELDDERTWL >NZ_CP048764|473619:481305|480077_480539_+|WP_057990447.1|DBSCAN-SWA MKIKIIRRYTGKTCVIGKFKVFNDDDKLLFECFSLEEDKEGVERNKDLRIPEGIYDLKRHSPSRFENTLRSITKKDDDTMINVFNEKVPFDRHILIHWGNTDKDTQGCILLGLTKDNNNESVGQSRQACKEFYDLVYGKNLEDIKLEITNELA >NZ_CP048764|473619:481305|479614_480088_+|WP_002792595.1|DBSCAN-SWA MKIAFYKVKENDKSTFLDKAIAFFTSSWKERLNGDFLNSYSHCEIILDNLMISSSPRDKGVRIKEFKDTGRWDFIEINDINETKIKEFLYSQIGKKYDFLGILGFFTFTKDSEDKWFCSEIIIRALQIGGLVKLGDMNAGSSSPNRLYKKLKDTNEN >NZ_CP048764|473619:481305|478143_478593_+|WP_002873427.1|DBSCAN-SWA MNCLLLSNNGIALNLPPSLGGSVANYNYMLKLDMIYKQAVVLPSNINNKEVVMLGEVWTTRNMYNKTSANTLHITWNNFNSSVELHALSKYYTANAKIKVEKKFNFGNINNLQIMLSSYQSGSANASAGWNLNDGNRLNPRANLTLYWN >NZ_CP048764|473619:481305|476900_478142_+|WP_167844568.1|DBSCAN-SWA MADLEQVVNDLNLASQSLQELREKYDGALDLLDNKNTEITGALDSAKSDALQEIQTISDTATSQISQLKDTSLNLVNEAKNTATTEISNKKEEHKQELETKKNEYMSEIDAKANEYDIANINAQVQAMDTKITEQINGAKTELNSKIDNKVTKTGDETIAGVKTFSAPPVSATNPTANNQVANKSYVDTVGNSKVALSGNQTIAGVKTFSAPPVSATNPTANNQVANKSYVDTVGNSKVALSGNQTIAGVKTFSAPPVSATNPTANNQVANKSYVDTVGNSKVALSGNQTIAGVKTFSAPPVSATNPTANNQVANKSYVDYGGGIKNLGNQTAPKIDLRQAQHFILTMTARGAIGIANWGGAGKSGTITVNNAQNITAFSAPFKFRVAQSGFSGTETFAYFCIASNNVRLVRT >NZ_CP048764|473619:481305|475038_475233_+|WP_002782214.1|DBSCAN-SWA MKEHGCECNFTNKFNRALSYKDYAQSINSADFIAYLDDKKWLLAMDDLLFFCEKRIKDSDYYEG >NZ_CP048764|473619:481305|478605_479241_+|WP_002789149.1|DBSCAN-SWA MFYDLKNKSLKYDDIFLKDVKIQNEEGEIDAQDTYFLSACDDKLLKELGFAKVKEEEIPSFNEKIEELRQIQTYDEENNLYIISYEIKEKALEELKELKLEELKAIKEEKLLFMPFKNTIFQIDTEAKINISGKVSEIMLANLNNTPLENIAWIDKDNKIITFNKEEFLEFGVGIAKYTESIIFKNDELRNKVKNATSLEELNLIAWESEK >NZ_CP048764|473619:481305|481107_481305_+|WP_002796174.1|DBSCAN-SWA MQTQQVVTKIEIQKVRIPQELLTLSPLEKPKAKNELDILNAYSMLFYKYKQCEIQISKIKELNNE |
12 | Campylobacter_phage(87.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1369499 : 1376513
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP048764|1369499:1376513|DBSCAN-SWA ATCAAGTAAATAAATAATTACAAAAAATTTGATAATCCTCAGGTATACCAATATCTATAAAATAATCATCAAAAATTTGGGTTTGTATTTTTAATGATTTATAGTTTTCTTGCAAAAACTCTTCAAAAGAAAATTTCTTCTCTAAACTAAATTCATCAAAAATATCTTTTTTGAGTAAGTATATACCACCATTGATTAAACCCTGCTTTTTAAACACCTTTTCTTCAAAAGATGTCACAATACCTTGCTCATCAACATTTACAGTGCCATATCTATCAAAATTTTGCATTTGTTTTAAGGCTATGCAAATTTTACTACCATTTAAAACAAGCTTTTTTAAATCAATGTCAAAGAAAGTATCTCCATTTACAACATAGACTTCATTTTTTACCAATTTTAAAGCATCTTTTATAGCTCCACCTGTACCCAAAAGCTCTTTTTCGATGTTATAGTGTATTTTCATACCATGAAATTCATCTTTAAAATACTCTTGAATCAGTTCATATTTATACGAAACACTTAGAATAATCTCAGTAATTCCTTGCTTTTTCAAATGCTCTAAAACAAAAGCTAAAAAGGGTTTCCCATTGATCGGAGCCATAGGCTTTGGAAGATCTTGCACTACACTTCTAAGCCTAGTACCAAGACCTCCAGCCAAAACTATAGCTTGCAATCAAACCCCTTGCCAAAAAGCTCTTCTTCTACTATAGCACAGATAATATGCCCTATCAAAATATGTGCTTCTTGAATTCTTGGCGTACAAGATGATGGCACTTTGATACAATAATCACAAAGTTCATTCATAGCTCCGCCACTAACTCCGGTTAAACCTATGCTTAAAATTCCTTTTTCTTTACAAACCTCCAAAGCTTTTAAGATGTTTTTACTATTTCCACTTGTAGAAATTCCTATAAAAACATCCCCACTCACACCTTGAGCTTGCACCTGTCTAGCAAATAAATTTTCATAGCCATAATCATTGCCAATAGCTGTTAATATACTAGTATCCGTTGTTAAAGCTATACTTGCAATACCTGGCCTATCAAAGTAAAATCTACTTACAAACTCCCCTGCTATGTGCTGTGCATCAGCTGCGCTTCCTCCATTGCCTGCTAGTAAGGTTTTATGGCCATTTTTGTAAGCGCTGATAACTTTTAAAGATACTTCTTTGATCAAATTGATCATATTATCATCATTTAATATTTTATTTTTAACATCAATCGAATCACTAAAATGAGATTTTATATATAGATTTAAATTTTCCATGATTTTGCCCCCTCTTTTGTAAAATAAAATTCCTGCACATAGCCTTGCTGTTCATTTAAAATTTTTTTAAGCTTATATTTTTTCACAGGATCTACCATAAAAAACATAAATCCTCCAGCACCTGCTCCGCTTGTCTTGCCACTATAAGCACCATTTTCCATAGCTAAATGATAAATCCTTTCAAGCTCATCATTGCTAACGATTTCGGAAATAATCTTTTTTGATTGCCAAGATTTACCTAAAATTTGTGCTATTTTTTCAAAATCAGCTCTAAATAACGCTTCTTTCATATCTAACGCATCTTGTTTTATCGCATGCATAGCATTAAGTGAGTTTTCATCTCCTAACTTTCCCTTTTTATGCTCTTCTATGTCCTTTGCTTCTCTAGTGATATTTGTAAAATAAAGCAAAACCCTAGCTTCAAGCTCACTTGCTATCCAGTTTTTAATGCGTAAAGGATTGACTATAACTCTTTTTTGATTATAAAATTCCATAAAATTAAATCCACCAAAAGTCGCAGCGTATTGATCTTGTGCACCCCCTACTATAGCCATATCTTCCCTTTCTATCTCATAAGCCAAACGAGCGATTTCATACTCACCTAAAGGAAGATTGAGCCATTCTGCAAATGCTTTGATGATACCTACTACCAAAGTAGAACTACCCCCTAGTCCACTACCACTTGGTACATCTGAATAAGTATGCAAAGAAAAACTTAAAGGTCTTTTAACATAGTCTTTTATCAAGCGATTATAAATCGCTTTGTAAAGATCTAATTTACCATCATTTTCTAAAAACTCTTTACTTTGATACTCTACTTTTATGCCAGTATCAGAAGAATCAAAAATGATTTTTTGATCATTTCTTTCTGTCAAAGTACAATGCACATAAAGAGATACTGTCGCGTTTAAAACATAACCTGTGTATTGATCACAATATAAATTTATATCAGTACCCCCACCGGCCAAACCTAAACGCAAAGGTGTTTGAGAACGGATTATCATAATTTACTACCTATTAAGTGGGATTCTGCCCATGGAGATTTCTTTTCTCCAATGATTTAGCAAATCTTCAAACATTTTTCTAGTTGGAATTTCTGGCTTCCAATTGATATAACTTTTGATTTTAGTATTGTCAAACATTTGATAGTCTGCATCAATAGGACGTAATCTTTCTTCATCTTGCTCCACTTTGATATCTTTTCTTGTAGAAAAACCTAAAAGTATATCAATAACTTCAGGAAGTTTAAAGGCTTCTTCACCGGCTATGTTAAAAGCTTCTCCACAAGGAACATTGCCTTTTTCACTTTCTAATGAAAGTAGATAATAAGCTCTTATAGCATCACGACAATCCTGAAAGGTTCTTACACTAGATAAGTTTCCTACTTTTACAACAGGCTCTTGATACCCTGCTTCGATCAAGGCGATCTGCTTTGCAACAGTGCTTTCAAAAAACACATCGGAGCGTCTTGGGCCGCTATGAGTTCCCATTCTGGTAACATATGTTTTTATACCATAGGCCTCACCGTAAAATCTTCCTAAATAGTCCGTGCCAATTTTACTTATACTATAAGGGCTTGCACCATGAAAAGTCGTATCTTCATTTAGCTTGATACCCACTTTTGCCCTGCCATAAACTTCACTAGAAGAGCAAACATGCACCACAGGATCATAGCCATCTTTAGCTTTTAATAATCTGATATTTTCTAAAATATTTGCTGTGCCTATGATATTTGTCTGTAGAGTTTCTATGGGTATATCAAAAGAAGTTTTTGGGTAAGACTGTGCAGCTAGATGAAAGATCACATCAGGTCTTTTGCTTTCAAAAAGCTTTTGAATACTTGAGTAATCGTTTAAATCAGCGTAAAAAATGCTGATCCTATCTTTTTTGTTTATCCTGTCGCTTAAATGATAGATATTATCCATTGGCTCTTGCCAACGCATCATGCCTATAACATCATAGTCTGTATTTTCTAGTAAAAAATCTGCCATTTGCGAGCCAACTTGCCCTGTAAAACCAGTAATTAATGCTGTTTTTTTCATAGATTATCCAATACTTTTTTAAATAAATTAATTTGTTCACTAATGTTAAACTGATGATTCCCTACAAAAAACCCTCTTTCGTGAATATATTTTGCATTTTTAAGCTCATTATGAATTTCGTAATCAAAGTATTTAATCACTTCATTTTGAGTAAAATCACCCGTAGCTATAGGACGATACTCTATGCCATTTTCTTCTAATTTTTTAATAATATCTTTTCTTTGCAATTTAGAATTTGGTCTAATCACTAATGAAAATCCAAACCAAGAGCTACTTCCGATTTCTTTTTGTATAATAAATTCGGGATGATTTTGAAAATACTCGCAAAATAATTTAGCATTTTCCCTGCGGTGTTTTAAAAACATAGGTAATTTTTTAAGTTGCTCTATGCCTATAGCTCCACTCATTTCTACAGGACGCACATTGTATCCTGGTAATACAAAACGAAATGATTCGCTAAACCAATCATTGCTTTTATTGGCCACTAAATTTTCTTTTGGTAAATTTCTCGTCCAACCATGCGCTCTTAAACAAAGCAATATATGATACAATTCCTCATCATCTGTAACAACAAAACCGCCTTCCATCGTAGCCATGTGATGAGAAAAAAATGTCGAGAAAGTTCCCATGATACCAAAAGTTCCAGCTTGATTTCCTTTATACTCTGCGCCCATTGATTCGCAGTTATCTTCTAGTAAGATAATATCTTTTTCTTTTATAAGATCATTAATCGCATCAAAATCATTAGGATTGCCTAATAAATTTACAACCATAATCATTTTTGTTTTATCGCTAATAGCACTACTTAATGCTTCCAAATCATAATTTAGTGTTTCTAGATCTATATCTACAAATTTTAACTTCAAACCATACTGATAAAGTGGATAATAAGTAGTACTCCATGATACAGCAGGGACTATTACTTCATCTCCTCTTTTTAACTTAGGATTTTTAGTATAAAACAATGCTGCTGTTGCTATCAAATTTGCAGTAGAACCTGAGCTTGTCATAACAGCATACTTAGAACCCACAAATTTGGCAAAATCTTTTTCGAATTCAGCTACTTTTTTACCCATAGTAAACATATCGCTTTTAATAACATCTTGTATTGCTTGTAATTCTTTCTCATCCCAAGTAGATGAAGCTAAAGAATATTTCATTTTTCCTCCTTATTTTTTTTTAAATACCAATTATATAACTTTTTTATCCCATCTGCAAGGCTAATTTTATGATGCCAACCCAATGAATGCATTTTAGAACAATCCGTAAAACGATTTAAAGCACCTTCAGGTTTGGTCTTATCAAAAAAAACATTCCCACTATATCCCACAACATCTTTTACAATAAACGCCAATTCCCCAATAGAAGTATTGCAGCTTGGGCTAATATTAATATGCGTGTTTTTGATTTCCAAATCTGACGGTTTATATAAATCCTTAAAATTAATATTATTCATAGTAAAAATACATGCTTCAGTCAAATCATCAACATGTAAAAACTCTCTTTTTGCGTTACCACTCCCCCATATTATCAAACTATTGTTATTAATCCCAAATTGATTTAAATAATTTTCAGCTTCTTCTAAATTTTTAATTTTTAAATCGCGCAGTATCTCTTCATACCTCTTTTCCATTAGTAATCTAGCCAAATGAAATTTTCGTATTAATGCTGGTACAACATGAGCTTTTTCCAAATCAAATCGATCGTTTTCACCATATAAATTAGTAGGCACTAGTGAAATAAAATTTGTATTATACTGAATATTATATGCTTCACACATTTTAAGACCTGCTATCTTGGCAATAGCATAAGATTCATTTGAATAATCCAATTCTCCCTTCATTAAATCTGATTCTCGAACCTCATTTAAATCCTTTGGATATATAGAAGTAGAAGCAATAAAAATTAGTTTTTTTACTCCGTGTAAATAAGATTGATGTATGATATTGTTTTGAATTTGAAGATTTTGAAAAATAAAATCAGCTTTATGATTTTTATTGTCTAATATTCCACCAACCTTAGCAGCACACAAAAAAACATACTCTGGCTGATTATTCTTAAAAAAAGAATTAACATCTGACATATTTAATAAATTTAGCTCGGAATGACTTTTAAAAATTAGATTATTATAGTTATTCCTTTTTAAATATTTAACAATTGAAGATCCTACCATTCCGGAACTTCCAGCTATATAAATCTTAGATTCTTTTTGTAGCATAATCTTTATCCTTATCCAAAAGCTAAACACTCTTTAGCATCTTTATAATCTTTTTTAAAGCTCTTACTCCTTGATTATTATACCAATTTTTATATGCAAAAATCGCCATTTTTCCTAAATGCCTATATAACCTTTTATTTATACGATTTTCTTGAAAAAATAAATGATTTTTTTTTATTATAAACAACATAACCAGCATATAAAAAATATTGTTTTTTAATTTATACATTGCAAATCCCAATTTATAACTTAAGAAATTATTAATTTTATAATTTACAACAGTTTGTCTCATATTATCTATCTCTTGTGATAAATTTTCAATTTTATAATCAGTGTTATTTTTTGCCTCTAATTGTTTTTTTAATATAGGTACTTCTATGCCTGTTTTCATAAATTCAAATTTTCTAAAAACGTGTATTCCGCATTTTCTTCTAAAGGCACTTTTATAATCTTGAGAAAAAATATTGTCAAAAAAAGCAACAAGTTTCTTTTCGTAAAAATCTACAGGATTAAAATCATTTAAAAAAACAGGTTCTTTAAGCATACTAGAATAGGCATTATAATCATTGTCAATATACTTAATATAATCTATCAACTCATCCCAACTAGAAAAATCATGCGCATTAATAAAACTTTTTAGATTAATCTTATAATCTATCAAGCTCTCTGATATTCTTGGTATATATTGATTTATCTCTCGTGTTTTGTATCTCATGCCTTGTTCTACTATTTCATTCGATATACCCCCCCCCTCTACTTCTTTTATGCCTCCTTTATTCGCCAACTCATTTTCACCACTCCTTAAACTAATATCACCCCAATATATAGGAATACAACCACCAGCATAAGCTTGAAATAGCTTTTCAGTAATATAACCAGGAGAACTACCATTTTCAAAACAAATATTAAATTTATAATTTTTTAGCCACCTATTCTTACTATCTGAAAAATTTCCATAACGATTTCCGATAGGACCGCCGATATTATTTAAATGCCTACCACCAGAATCTACTTTCTTATATAAAGACAATTTTTTAAAAAATAAATCTCTTGGGGTAAATTCTATTCTAGAAGGATCAGTAACCATATATGCACAAAATTTATCTCTTTGAAAATCTGGATTAATATGTTTTACCATAGCCTTTTTTATATCATCTGCATGATATAAAAAATAAAAAGGAAATCTTAAATGTCTATCTTGAAAATCTATGAAATCAAAATCTATACCATAATCTGCTATACTCCAATCAGTTTGAATATATTCACTAGTCAAAGATATTCTAATACATTCATAATTTAAGTGTTCATAATTATTTCGATAACCAAAAGGTCCATAAATTAGGTAGTCTGGCTTATCACTAAATAAAATTTCATATTTATGTGATAATCTATTGATTAATAGACGAATAATAAAATTGTTATAAAAATCACCTTCATTCATTTTTCCATTATACCAATTATCTACATATTTTAGATAGATTTTTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP048764|1369499:1376513|1370158_1370764_-|WP_052774153.1|DBSCAN-SWA MENLNLYIKSHFSDSIDVKNKILNDDNMINLIKEVSLKVISAYKNGHKTLLAGNGGSAADAQHIAGEFVSRFYFDRPGIASIALTTDTSILTAIGNDYGYENLFARQVQAQGVSGDVFIGISTSGNSKNILKALEVCKEKGILSIGLTGVSGGAMNELCDYCIKVPSSCTPRIQEAHILIGHIICAIVEEELFGKGFDCKL >NZ_CP048764|1369499:1376513|1371774_1372806_-|WP_052774152.1|DBSCAN-SWA MKKTALITGFTGQVGSQMADFLLENTDYDVIGMMRWQEPMDNIYHLSDRINKKDRISIFYADLNDYSSIQKLFESKRPDVIFHLAAQSYPKTSFDIPIETLQTNIIGTANILENIRLLKAKDGYDPVVHVCSSSEVYGRAKVGIKLNEDTTFHGASPYSISKIGTDYLGRFYGEAYGIKTYVTRMGTHSGPRRSDVFFESTVAKQIALIEAGYQEPVVKVGNLSSVRTFQDCRDAIRAYYLLSLESEKGNVPCGEAFNIAGEEAFKLPEVIDILLGFSTRKDIKVEQDEERLRPIDADYQMFDNTKIKSYINWKPEIPTRKMFEDLLNHWRKEISMGRIPLNR >NZ_CP048764|1369499:1376513|1370751_1371771_-|WP_126656000.1|DBSCAN-SWA MMIIRSQTPLRLGLAGGGTDINLYCDQYTGYVLNATVSLYVHCTLTERNDQKIIFDSSDTGIKVEYQSKEFLENDGKLDLYKAIYNRLIKDYVKRPLSFSLHTYSDVPSGSGLGGSSTLVVGIIKAFAEWLNLPLGEYEIARLAYEIEREDMAIVGGAQDQYAATFGGFNFMEFYNQKRVIVNPLRIKNWIASELEARVLLYFTNITREAKDIEEHKKGKLGDENSLNAMHAIKQDALDMKEALFRADFEKIAQILGKSWQSKKIISEIVSNDELERIYHLAMENGAYSGKTSGAGAGGFMFFMVDPVKKYKLKKILNEQQGYVQEFYFTKEGAKSWKI >NZ_CP048764|1369499:1376513|1369499_1370171_-|WP_052774154.1|DBSCAN-SWA MQAIVLAGGLGTRLRSVVQDLPKPMAPINGKPFLAFVLEHLKKQGITEIILSVSYKYELIQEYFKDEFHGMKIHYNIEKELLGTGGAIKDALKLVKNEVYVVNGDTFFDIDLKKLVLNGSKICIALKQMQNFDRYGTVNVDEQGIVTSFEEKVFKKQGLINGGIYLLKKDIFDEFSLEKKFSFEEFLQENYKSLKIQTQIFDDYFIDIGIPEDYQIFCNYLFT >NZ_CP048764|1369499:1376513|1375046_1376513_-|WP_052774149.1|DBSCAN-SWA MKKIYLKYVDNWYNGKMNEGDFYNNFIIRLLINRLSHKYEILFSDKPDYLIYGPFGYRNNYEHLNYECIRISLTSEYIQTDWSIADYGIDFDFIDFQDRHLRFPFYFLYHADDIKKAMVKHINPDFQRDKFCAYMVTDPSRIEFTPRDLFFKKLSLYKKVDSGGRHLNNIGGPIGNRYGNFSDSKNRWLKNYKFNICFENGSSPGYITEKLFQAYAGGCIPIYWGDISLRSGENELANKGGIKEVEGGGISNEIVEQGMRYKTREINQYIPRISESLIDYKINLKSFINAHDFSSWDELIDYIKYIDNDYNAYSSMLKEPVFLNDFNPVDFYEKKLVAFFDNIFSQDYKSAFRRKCGIHVFRKFEFMKTGIEVPILKKQLEAKNNTDYKIENLSQEIDNMRQTVVNYKINNFLSYKLGFAMYKLKNNIFYMLVMLFIIKKNHLFFQENRINKRLYRHLGKMAIFAYKNWYNNQGVRALKKIIKMLKSV >NZ_CP048764|1369499:1376513|1373962_1375024_-|WP_052774150.1|DBSCAN-SWA MLQKESKIYIAGSSGMVGSSIVKYLKRNNYNNLIFKSHSELNLLNMSDVNSFFKNNQPEYVFLCAAKVGGILDNKNHKADFIFQNLQIQNNIIHQSYLHGVKKLIFIASTSIYPKDLNEVRESDLMKGELDYSNESYAIAKIAGLKMCEAYNIQYNTNFISLVPTNLYGENDRFDLEKAHVVPALIRKFHLARLLMEKRYEEILRDLKIKNLEEAENYLNQFGINNNSLIIWGSGNAKREFLHVDDLTEACIFTMNNINFKDLYKPSDLEIKNTHINISPSCNTSIGELAFIVKDVVGYSGNVFFDKTKPEGALNRFTDCSKMHSLGWHHKISLADGIKKLYNWYLKKNKEEK >NZ_CP048764|1369499:1376513|1372802_1373966_-|WP_052774151.1|DBSCAN-SWA MKYSLASSTWDEKELQAIQDVIKSDMFTMGKKVAEFEKDFAKFVGSKYAVMTSSGSTANLIATAALFYTKNPKLKRGDEVIVPAVSWSTTYYPLYQYGLKLKFVDIDLETLNYDLEALSSAISDKTKMIMVVNLLGNPNDFDAINDLIKEKDIILLEDNCESMGAEYKGNQAGTFGIMGTFSTFFSHHMATMEGGFVVTDDEELYHILLCLRAHGWTRNLPKENLVANKSNDWFSESFRFVLPGYNVRPVEMSGAIGIEQLKKLPMFLKHRRENAKLFCEYFQNHPEFIIQKEIGSSSWFGFSLVIRPNSKLQRKDIIKKLEENGIEYRPIATGDFTQNEVIKYFDYEIHNELKNAKYIHERGFFVGNHQFNISEQINLFKKVLDNL |
7 | Synechococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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