Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP050063 | Spirosoma sp. BT328 chromosome, complete genome | 0 crisprs | DEDDh,cas3,csa3,WYL | 0 | 0 | 4 | 0 |
1. NZ_CP050063
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
1505916 : 1574849
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP050063|1505916:1574849|DBSCAN-SWA CATGGCCAAAGCTCCTAAGGAATCCAGACCTACCGCTGCCGTTGTGCTGGACACCCGGCGGCAAAAACTGGACGGCACCTATCCGCTTCGTCTTCGGGTCACTTACCAGCGGGAACGAAAGTATTATAGTATCAAGCTGACTGATTTAACCCAGACTGAATGGGATAAACTAAGCGGGGAGCGGTTACGTGATGATAAACTCCGTGAAATCCGGGACAAGATCAAGACCTACGAGAGCGATGCGGATTCGGTCTTAAAGGATATGGACCGGTTTACGTTCGCCCGGTTTGAAAAGCTTTATTTCGATGATCACACCACGGACGCCAGCCAGAAAGCGCAGGACGTGTATCATGCCTTTGAGGAGCAGATCAAAAGACTTAGCCAGCAGGGGAGTGCCTCAACGGCTTCGATCTATCAGACGACGCTGAACTCTCTGAAAGCGTTCAAACCCCGCCTGCGCTTTGAGGAAATCACGCCCACGTTTCTGGAAAAGTATGACGACTATCTGACCTCTCGGGGTAAGTCGGTGACGACGGTGAGTATCTACCTGCGCAATATCCGAACCATGGTCAATGCGGCCAAGGCAAAAGGTCTCATCGCAGCCAATGAATATCCTTTTGGTAAGAACCGGTACGAGGTTCCTGCGGCCCGAAATGTCAAGAAAGCCCTGACGTTGGCTGAGATCGAGAAGATCTATCACTATCAGACCGAAACGGGTAGCATAGCGGATAGGGCGAAAGACTTCTGGTTTTTCTCCTACCTCTGCAATGGCATCAATGTAAAGGATATCTGCCGCCTGCGCTGGAAGGATATTGATGGGGACCGGGTAAGCTTCATTCGGGCAAAAACCGCCCGTACCAAGCGTCGGAATCAAAAAGCAGTCGTTGTTATTCTGACCGATGTGGCCCGTGCTATTCTGGATAAGTGGGCGAATAAGCAACAGACGCCTGACGGCTATGTTTTTCCTATACTGCCAGCGGATGTTACGCCACAGCGGGAACGGGAACTCGTGCAGTATCTGACGCGCTCAATCAATAAGTATGTGGGACGTATCGCCATAGAATTAGGCATTGACAAGCCTGTTACTACTTATACGGCCCGGCATTCATTCAGCACCGTATTGAAGCGTTCCGGGGCTCCAATTGAGTTCATTAGTGAAAGCCTGGGGCATCACGATCTACGAACAACAGAGAACTATCTGGATAGCTTTGAGGATGACGTGAAACGGCAATACGCGAATAATCTCCTAAACTTTAAATCTTAATTTATAATGTCTTCGATCAATAACAGAGGGAGTTATATAGCAGAGCTAATACATGAATTAACGAATATAGACATAGATAGCTCAAATATAGATAGATACGGGCACTTCGTAGATGAATCAAATACAAATATTATAGCTATAAGGGCTAGTCGTTATTCATCTAGAATAGATGGCATTGAGGCTTATGATTACTATATTAATAATATTGTAGAACAGGTTCTAACCGAATTAGCGTTTATCTCATTCGAGGAGTGTCAGCGCTTCTTAAAACGTCTTGCACTAATTTCAGAGAAATTTTCTAAAGCATGGACTCTTTATTTTGAGCATCTCCATTTCTTCTATGAGGGTAATTTCTCTGCTCAAAATTTTGAACTTAACTTCTTTCACCTTTTCAATATTCCCATAAATAATAAAGGGTTAGGTGGCGTAAATTTTTTTAATCTAAAAACTACTGATGATTTCTGGTCTGACTTGCATGATGCTTTAATGTATAAGGAAGGAGCACTTCTTCATATCACTGAAGATCTTAAAGCAATTTTTGATATTCCTAATTCTACTAATGTAACAGACGAGGATCGAAAACAAAAGGATTTAGATGTATCCAGAAGTGATGGAGTGCTAGAAGCATTTTTTGAATCCACATCAAAATACAAAAAGATAATGGAACTGCTGGTTCAGCATAAGTATTGCCATCCCCTCACTTATATATGGAGTGACACAGCGACGGGCAGTAAAGGATATTTGGCTGCACTAATTAAATCTTTGCGCTTACAAGGATACTATATTAAAACACCGACACACGAAGAAATTCAAAAAATAGCTCAAAACACATTTAGGTACCCAATTAGCTTAGAAACTATTAAAAAAGCGAATCCTGAGGACTTTGATTTGACTTTCATCCCGCCAGCATCTACTGTTGAATAATACCCTCATTACCCAATTTACACTTGTGTAATTGGGTAATGAAATTTTTGTTTTATCCATTTTTTCTCTAATTTCTTTGTGTCCGAACTTATATAAAGCCGGACTATGAATGACATACTTCTTTCGCCAGTTAGATTAGGTGAGTGTCTTAGCCCCCTATTAACTGGACAGATTTTCTGAAAAGGTTGTGTTATAAACTACTTGTGCTTCCTCCCATTTTTGCTGAGGTGTTATAAAGCCAATGGAACGGTGAAGCCGACAGTAGTTGTAATGGAAAAAATAACGCTTCAACATTTCTTTCGCTTCATAGTAGCTAGCAAATTCATTGCGTTCAATCACATCATGCTCCAAAATGCTGTGGAAGGCTTCAATATAGGAATTCTCCTCCGGCGTGGCAATGTGGGTAAATTCCTGCTTGACCTCTGAACTTTTCAAAAAGTTACGTACTGAATGGGCAATGAACTGGCTACCGTTATCATTGCGTAGAATGACACCTTTCAGTTCATGGTTTTGGTTTACGCGTCGAAGCAGGTTGATCAGATCAAGTTGGCGAATACTACCCTGGAAGACCCAGTCTAAAATTTTGCGGGTATAAACATCCATAACACTCAATAAATAGCGGCCCGCCGCAGCGGTAGTTCCGCCGTTCGCCCTGCACCCAGACGTATTTAATATCCCAGCATAGGTATTCTAATGGCTTAGTAGCTTCGATCCGTTTGAACTTAACAAACTCCCGCTTGCCCATCGTCGGATAGATCATCCTGCCTAAGAGCAAATTATGCTCCTGCATGAGCCGGTATACCGCGCGGCGGCCGCCTTTTTCTTATTGATCAGATATTCTTTTTTCAGCTCATAGGTGATGTATTCGTAGCCCAGCGCATTGAATTCAACATTTAGTAATTGCCGGATACTCAGCACTACTTGTTGATTATCAACCCACGATCCATCCAACTTCATGGTCATCCGGCTAGGTCGTGCCCCAGGCCTGCCTGATTGGGGTTGGTAATAATATACACTGCGAGGCAGGTCAAGCCACTGACATAACAGGGTACGATTAACGCGTGTCTCAAACTGTTTCATCAGGGCTAGCTTCTCCTGGATTGAATAGGTGTTTTTTTTAGCAGCTCACTTTTAATCTCCAATTCCAAAGCTTGCTTAGCCACAATCCGCTTCAAACGTTCATTCTCTTCTTCGAGTGCTCGAAGCTGGGGATCGATACGTGTATAGGAGTCCTTGAGTCCTTCTTTGCCTTTGCTTAAATATTTCAATCGCCACTTACGCAGTAAGGAAGGGGATAAATTGTACTTGCGACACGTCTCGGCGTGGCCGTCACGGATGGCTTCTTGAACGATAGAATAGCGGTCCTCGGGAGTAAAACTTCGCCTTATTTTGCTCATGATTTCTGAATGTAGTAGGACTAAACTGGTTTTACAATTTTGTCCAGCCATTCAGGGGGTTAAGACAATACCAAGTATCAGCAGGTTGTTGAGCGTATCCGGGCCGAGTCGGACAAGACAAAACGTGACCTGGACAAAGCCACCTTACCCGCCATTACGCCCAGTGGTGATTTCGAGTACCGGTCTGCCAGTAAGCTTAAACCCAATGGACACAGCGGGTTAATTCAGTTTGACATTGACCTCAAAGACAACCCGCACATCCGCAACTACGCTGACCTGAAGGCTCAGATTGCTAAACTACCCTTTGTGGCCTACTGCGGGCTCTCTGTGTCAGGTACGGGCTACTGGGGCCTGGTACCCATTGCTTTCCCGGAGCGGCATGGCCAGCACTTTGATGCCTTGAAGCGGGTGTTTGCCCATTACAAAATCAATCTGGATGACAAGCCTCGTAACGTGGCCAGTCTGCGTGGGTACTCCTATGACCCAGCCGGGTATTTCTCTAGTCAGGTGATGTTGTTTGAACTCTATGATGAGCCCAAGCCTCAACCCGCCCGTAGTTTTGATTACAGCCGGTTTCAGGATCAGGATGATTCGGCCCTAATAAGTCGTATTGTTCGCTACGCCGAATCCGCCAGTGAGGGTAACCGACATGCTACACTGTTCAGTGCTTCCCGGTTGGCGGGAGGGTATATAGCCGCTGGACGACTGGACGAACAAACCGTGGTATATGCCCTGGAGACCATCGCCAGTGAGTGGCCCATGCATAGTAAGTCGCAGAAAACAATTCGGGATGGTATCCGCTATGGACAAACCGCACCAATCTATCCGGAAGAACGCACCATCCCACTAACAATACATAAAAAAACGTGCACTCCACCTGCCTACAAAACCTACAAAAGGACTCCACCACCCCGCCCCCGGCTCAGATTCAACCCGGAAGAGGGCGAACTATTAGACGTGGTGATTCCCGACAGCTCGCCCTGGGATGACCACAAGCGAGGTGAAGGAACAAGTACGTACAGTCTGGTCGATAGTCCCAACCGGGAGGAGTTTGCCCGCCTGCTGAGCATTGCCCCTGATCAATTACCCCTGTATCAATTCAATTCAAAATCAACTCAAGCATGATACCCACCCATACCGACGAGAAATACGAATACTATCTGGATTACTTCCAGGGCACACCCGTAAAGATCCTGCGCGATCGCCAAACGGGTGAGATCCTCTTCGACGCCGGCAGTGTGGCCGAATGCTTAGGTTATAAATCCACCCAGGCTATGATGAGTGATAACCGGGTACTGGATACGATCTATGAGCACATGCAGCAAACTGGCGTGTCTCCTTTACGAAAAGTTTAACCTATCCTGCTATGCAAATCAATATAGACCCGGCCGACGATGCGCCCGGACCTCAGCCGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP050063|1505916:1574849|1513787_1513979_-|WP_167206179.1|DBSCAN-SWA MLPRPSIKQQFLTVYFEPLSREVRSFRYNLEERFELARERYEAEHRHQLPFSFVTFYRYYCQR >NZ_CP050063|1505916:1574849|1520170_1522174_-|WP_167218755.1|DBSCAN-SWA MLTAPASATPGSANTIIGLQAGNSITSGSANTFIGRQAGYSTTEGNLNTFLGDATGYSNTTGFRNTFLGYQSGNNNATGYQNTFVGSDAGYSNTTGFFNTFLGQGSGNKNTTGADNTFVGANGGNNNTTGGQNMFAGSAAGQSNTTGASNSFIGAGAGFSNTTGASNTFIGGRSGFSNSTGTLNTFIGVESGYTNTTGINNSFIGNNAGKANSQGSANTFVGSNAGAANTTAFANSFLGYSAGSNTTTGINNTYMGYVTGQSNTYGYANSFYGAFTGGLNSRGYSNSYYGTSAGYNGDSGHDNCFFGAGAGFGIYKTPNIGVVSASNNCLFGSKAGYNNDGDYNVIVGDSAGFNNQVSGNVMVGSRAGRANKTGLQNTYLGFQSGYNAVTNSNTFMGYQSGYTTTTGTGNTFFGTSSGRGNSTGNNNTFVGNGAGPASSNSDDNVYIGFNTGNHDSGSRNTFLGTGADAIAQNLTNATAIGAGATVAINDAVVLGNQANVGIGTSAPTARLEVNSGVDNESGVRLSRLTANSPVQVAATDKLLTVDATGKLVLTSTGHYSVRSVADWSDKVFMAGYKLRSLTEVDQYIQANQHLPGVPSAVEVVEQGIDAAKMDAKLLEKIEELTLYSIQLEKQLAKENQEQQAINQKQQAKIDQLEQMVKQLLEKK >NZ_CP050063|1505916:1574849|1544215_1544404_+|WP_167206229.1|DBSCAN-SWA 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59 | Erwinia_phage(50.0%) | protease,transposase,terminase,integrase | attL 1505844:1505866|attR 1529875:1529897 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
2674547 : 2736574
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP050063|2674547:2736574|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP050063|2674547:2736574|2705870_2707232_+|WP_167207754.1|DBSCAN-SWA MYKSVHFLLWIFLFSLASSTATAQPTQPSTVLPERERARVIDDILDDRFTNFLPKLMRREGLDMWIIISREYNEDPVLRTMLPSTWLSARRRTIIVFFDNGKEVEKLAIARYDVGNLLKGAWDIDVRPNQWEALAKIIEDRKPKKIGLNMSTNYGHADGLSFSEHEEFLKKLPADYQKRLVSAEKVAVGWLETRTEKEMAIYPLICRLSHQIIQEGFSEQVIQPGVTTTDDVVWWFRQRITSLGLDTWFHPTVDVQRADEQDFNHLRTFSKRPDKQVIMPGDLLHVDFGITYLRLNTDQQQHAYVLRPGETDVPESIKAAFKQGNRLQDILIEQFKSGKTGNQMLLAALDQSQKEGIKGTIYSHPIGVHGHAAGPTIGLWDQQKGVPGPGDYPLLANTAYSIELNAAVEIPEWKKVVRIMLEEDGFFDGQTFRYIDGRQTEIYTIPRKLGYVK >NZ_CP050063|2674547:2736574|2721229_2721820_-|WP_167207774.1|DBSCAN-SWA MNSLNQSNATVANETAETAKSLRKLYFLRAAFSILWVILVLAFAKTNAGIATILFIIYPVWDVIATFLDIKANPPGAPKKMQFLNAVISSTTTVAVALALQKGIPEALIVFGVWAILTGLVQLILGLSRRKQLGGQWPMIISGGQSMLAGGSFIAMANAPNSGITTLAGYAAFGAFYFILAAYRLSKSIKTAPVGA |
54 | Leptospira_phage(50.0%) | protease,transposase,integrase | attL 2674897:2674911|attR 2679757:2679771 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
3655446 : 3679469
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP050063|3655446:3679469|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP050063|3655446:3679469|3677878_3678886_-|WP_167209047.1|transposase|DBSCAN-SWA MQFHYFIGIDVSKNTLDWAIYTPTGLVGQFQSDNSPKAVSKAVKQLVALPQFALATSICCLEHTGIYNAHVLEVFYQEGFRLWLEASIQIKQAGGLQRGKSDAIDAVRIAEYAYRFRDRLRIWQPTRSVLKQLTELSQLRHRLQSVINQLAVPLTEQKRFGDRALPHQLKGHCGDSLKALKKDLEQVEASLKSLIQNDAELKTLFSLLTSVPGVGTIVATEIIIATDEFKTITEPKKLACHAGVAPFEHRSGSSVRGRTRVNHHARKSLKTLLHLASMAAVKSKGELQLYYQRKVAQGKNRMLILNAVRNKLIHRVYAVVRRNEKYDKNYKPTLA >NZ_CP050063|3655446:3679469|3677485_3677974_+|WP_167209045.1|transposase|DBSCAN-SWA MEQRLLHRIAHYLGLQPSIRSSAGPPMRENSRRYGSRRVLEELKEQGVKPGRHRVRRLRQEQDWQAIQPRSFVPKTTDSRPGLMACANRLIKLGKPTAPNQAWVGDITYLPLSDGAWAYLASWMEWSDFYGSSKGWLIIFIIFFISADYSIDPMNELIADSV >NZ_CP050063|3655446:3679469|3655446_3656967_-|WP_167209017.1|transposase|DBSCAN-SWA 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18 | Rhodococcus_phage(50.0%) | transposase,integrase | attL 3652797:3652812|attR 3679477:3679492 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
7349066 : 7406231
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP050063|7349066:7406231|DBSCAN-SWA 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59 | Riemerella_phage(16.67%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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