Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP021889 | Thiomicrorhabdus sp. aks77 | 2 crisprs | cas3,DEDDh,csa3,PD-DExK,DinG,cas2,cas1,cas5,cas7,cas6e,cse2gr11,cas8e,WYL,PrimPol | 0 | 9 | 9 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_AP021889_1 | 1112602-1112727 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_AP021889_1
|
1 spacers
spacers of NZ_AP021889_1
>1.1|1112636|58|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder ACAGGAGAATTTTGATGAGCAAAGTAAGCGCCAATTTACCCACATCTAAAATTCTTGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP021889_1
The CRISPR arrays of NZ_AP021889_1 >merge|NZ_AP021889|1|1112602-1112727|CRISPRCasFinder ATAAAGTTCGTTATTCTTCTATGTGTTTTCAATCACAGGAGAATTTTGATGAGCAAAGTAAGCGCCAATTTACCCACATCTAAAATTCTTGGATAAAGTTCGTTATTCTTCTATGTGTTTTCAATC >NZ_AP021889|1|1|1112602-1112727|CRISPRCasFinder ATAAAGTTCGTTATTCTTCTATGTGTTTTCAATC ACAGGAGAATTTTGATGAGCAAAGTAAGCGCCAATTTACCCACATCTAAAATTCTTGG ATAAAGTTCGTTATTCTTCTATGTGTTTTCAATC
>NZ_AP021889.1|WP_173271490.1|1101806_1112468_+|tandem-95-repeat-protein MSNSIATILNVQNSVLVYDQAGNPKIVEVADLLATGDTIQTGADGSIRLRLEGGQEVTIGANQTLVLTSNMLEDGAKTEQDSAVRPQSLEDVLAEIENPEGGDLLDNLEATAAGGAADAGGAMSLTIYSISESQDAQYQEEGGVPQVARIVETTDPVTFEGDAFAAQDALVTEEGLLLANTPPVANNDLLVTEEDQPLTFTDEQLLANDIDADGDDLTVIGITQPVNGQLVDNGDGTYTYTPDENYNGDDSFSYTVTDGNGNTSEATVGITVNPVNDATAINPDTAVTNEDTPVVIDVLANDTDIDGPVSPVASVTNGANGTVAINADGTLTYTPNADFNGSDQFTYTNEEGNTASVTVTVNPINDATVINPDTAVTNEDTPVVIDVLANDTDIDGPVSPVASVTNGANGTVAINADGTVTYTPNADFNGSDQFTYTNEEGNSATVSVTVNPINDATAINPDTAVTNEDTPVVIDVLANDTDIDGPVSPVASVTNGANGTVAINADGTLTYTPNADFNGSDQFTYTNEEGNSATVSVTVNPINDATAINPDTAVTNEDTPVVIDVLANDTDIDGPVSPVASVTNGANGTVAINADGTVTYTPNADFNGSDQFTYTNEEGNSATVSVTVNPINDATAINPDTVVTNEDTPVVIDVLANDTDIDGPVSPVASVTNGANGTVAINADGTVTYTPNADFNGSDQFTYTNEEGNSATVSVTVNPINDATAINPDTAVTNEDTSVVIDVLANDTDIDGPVSPVASVTNGANGTVAINADGTVTYTPNADFNGSDQFTYTNEEGNSATVSVTVNPINDATAINPDTAVTNEDTPVVIDVLANDTDIDGPVSPVASVTNGANGTVAINADGTVTYTPNVDFNGSDQFTYTNEEGNSATVSVTVNPINDATVINPDTAVTNEDTPVVIDVLANDTDIDGPVSPVASVTNGANGTVAINADGTVTYTPNADFNGSDQFTYTNEEGNSATVSVTVNPINDATAINPDTAVTNEDTPVVIDVLANDTDIDGPVSPVASVTNGANGTVAINADGTVTYTPNADFNGSDQFTYTNEEGNTTTVDVRVNPVNDSPESTEISDQTNLDSESVNLDVSGNFSDADGDTLTYSASGLPEGLSINSSTGVISGTIASDASDATDDNNNTQAYSVTVTASDGSAPVASETFTWTVNNTIPEFISGSDTAETASNVDVYEFSADEGTTSGTVVGTVTASDADSDANKVYSIEGGNEAGLFSINASTGQISVTQDIDDAELGEYSLTVKVDDLEGGTDTATVNIRLDNVDDNPESTEISDQTNLDSESVNLDVSGNFSDADGDTLTYSASGLPEGLSINSSTGVISGTIASDASDATDDNNNTQAYSVTVTASDGSAPVASETFTWTVNNTIPEFISGSDTAETASNVDVYEFSADEGTTSGTVVGTVTASDADSDANKVYSIEGGNEAGLFSINASTGQISVTQDIDDAELGEYSLTVKVDDLEGGTDTATVNIRLDNVDDNPESTEISDQTNLDSESVNLDVSGNFSDADGDTLTYSASGLPKGLSINSSTGVISGTIASDASDATDDNNNTQAYSVTVTASDGSAPVASETFTWTVNNTIPEFISGSDTAETASNVDVYEFSADEGTTSGTVVGTVTASDADSDANKVYSIEGGNEAGLFSINASTGQISVTQDIDDAELGEYSLTVKVDDLEGGTDTATVNIRLDNVDDNPESTEISDQTNLDSESVNLDVSGNFSDADGDTLTYSASGLPEGLSINSSTGVISGTIASDASDATDDNNNTQAYSVTVTASDGSAPVASETFTWTVNNTIPEFISGSDTAETASNVDVYEFSADEGTTSGTVVGTVTASDADSDANKVYSIEGGNEAGLFSINASTGQISVTQDIDDAELGEYSLTVKVDDLEGGTDTATVNIRLDNVDDNPESTEISDQTNLDSESVNLDVSGNFSDADGDTLTYSASGLPEGLSINSSTGVISGTIASDASDATDDNNNTQAYSVTVTASDGSAPVASETFTWTVNNTIPEFISGSDTAETASNVDVYEFSADEGTTSGTVVGTVTASDADSDANKVYSIEGGNEAGLFSINASTGQISVTQDIDDAELGEYSLTVKVDDLEGGTDTATVNIRLDNVDDNPESTEISDQTNLDSESVNLDVSGNFSDADGDTLTYSASGLPKGLSINSSTGVISGTIASDASDATDDNNNTQAYSVTVTASDGSAPVASETFTWTVNNTIPEFISGSDTAETASNVDVYEFSADEGTTSGTVVGTVTASDADSDANKVYSIEGGNEAGLFSINASTGQISVTQDIDDAELGEYSLTVKVDDLEGGTDTATVNISLDNVNDNPVIGEGQLATVSEANLVDGSSPDSNALIDSMGNYISVSDSDGGDDIFVNGTKVYDAETGLTGTSVDTTNGTGQLLFTAFSGGELQYTYTLKDNVLENNVVSHTDSVTVSTSESSFTPVVINIATIGDDAPSVTPVSFGTIEDGNSVSSISLAQVFGADGGGDVDFNSSINGMPVFSNGDQVYFNGQELTWSLDSNGDVLTAVTAGNQTAITITLNQSTGNYSIDVADGTFYLAGDEITFDIGGLSGSSADAYAIGTDGIDILITSANSSGAVSTNTSGAGGVGYVGAASQWVDGSSGESVTFSFYDSLASSGPLTGQAAIDNALTDSNIAGVNTFSVSVNTQSGVATNLTLDFIAVDGTQGTLDVAVGSNGPGTPYTISVDTAHISWDSGSDLAIASVTFNADGVDFRVGGDFSLTEISPSDINLSVPVVITDADNDSSGGSITGTITSDGVAATAIAADTAPIAVDDVISIEESVSQTVTTGSDLVLMIDHSASVSSSQMATLKSSIEGLFNSGAVHSVFITSFAKDGTFHDSGENGGWYTNLTDAMTAINSINTTGSDSYGTDYDAALKTVTDNFVAPPSGGGKLVSMFISDGSPNENNETGSDGIIESDTNGGSVGEESAWINFLSSNGFDTSFAVGYGGLSNSDIGHLEPIAWSSGETASTYDATDTSASDADTNDAADDSNVIILDDISDLALTLTSVITPTPNQMSGNLLGNDSDGGDGWGTPELVSVTHGASTYTFVDAADSHTFTTNAGSFTVSGDGSYTFTALNDVAADMSDTLSYLVQDADGSQATANVNLTTTDVAIVPPAATLIKTFDGNAVELVDSNDSGLHSISYQLNGIATEANIDISSYNASNHNGKIELYKDSAKVGDFDLDSYSYSSGSTSITVTQSGGFDEIRVINTDNDKDFSVDNVSAEVMVDSSPLLNGTLVDGIVEGIAYSTSSGLTGFTDENGGFSYYQGDQITFSIGNVVLGSFGSTALSDGHVFLQEIAGTSLQDVNDEYVENMAVLLQTIDSNANAYDGIVISPEMHEQFSDDSFDLSTISGDQLAQILVENGFTPISEDSAMQHVQDMIVDYTDMDDSDFDMRIVDAESDDGMLDYAALDSITASSTAGEAFVGTEVDLTDLLNVDDDGAVNLPINSESVEDLPENAQDLLVLDVNQTNANLTDLNTETGELVVDNTGNGGMDVTTKEIVDDLLNHGKDS >NZ_AP021889.1|WP_173271488.1|1101001_1101352_-|transposase MTDSLSTLPTVKKIRRRYSREFKQQVLSACEDPNTSIAQVARDYGINANQIQNWKRQLKKTASSQAAFIPLVLNDLPPSPPHVLLVELPAPQGKIAVHWPVTELAKLSAFVKSVQS >NZ_AP021889.1|WP_173271486.1|1100675_1101005_-|IS66-family-insertion-sequence-element-accessory-protein-TnpB MIRIDHYWLATEPLDMRAGPDTALARVIAVFGEAKPHHAYLFANKRGNRMKVLVHDGLGIWLCARRLNQGKFHWAERWRGESVTLSPEQCLALVQGLPWQRLETSLALS >NZ_AP021889.1|WP_173271484.1|1099104_1100658_-|IS66-family-transposase MKTLLNLNQLSAHQLRTLAAQLLVQVEEKDQRIAANTKALQQKELKIDQLTYELAYLRRLKFSHKSEQISALQMTLLDEVTDADIAAIESELESLKDKTDTAQPKKKPKRQPLPENLPRLDIRHDPESTTCSCGCQLRHIGEDVSEKLDYLPGTFQVERHIRSKWACDACETLIQKPMPPQIIDKGLPTSGLLAHLLIAKYADHLPLYRQAQIFERAGVKLPSSTLAEWVGVCGVQLEPVAQALKDFLLTQPVLHADETPVPMLKPGNKKTHKAYLWAYTNPANAQHKAVYYHFSEGRNGKFAREVLQDWKGLLVCDDYPGYKASFKQGVSEVGCMAHARRKFVELHESGKSTIAIQAIELMGQLYAIEKEIQPLAPEERQTIRQQKSKPIMDLLLKWLQVHREKVPKGGATEKAIHYSLKRWDALSRYLGDGRLPIDNNWVENQIRPWALGRKNWLFAGSLRSGQRAANIMSLIQSAKNNGLDPYAYLKEVLERLPTHKASQIDQLLPHNWQPSNR >NZ_AP021889.1|WP_173271482.1|1094187_1098729_+|hypothetical-protein MKIASNQTIVIPNSNLAGQAQSFDNAVQAQTLNDVLGLLNQEGDILENLEETAAGAADNGGATTLTLYSISESQDEQYQEEGGVPQVSRIVETTDPVTLDDETTVTAEAQQANEGVATETLPIQEEPVPEEPVPEEPVPEEPVPEEPVPEEPVPEEPVPEEPVPEEPVPADTQGPSLEITEQDGTVTFQFSEAVKDFTQDDVQITGGSLSDFTQVDGDTWTATFTPDASFEGTAQISVADNTYTDLSDNNGTGAQLELGVDTQGPSLEITEQDGTVTFQFSEAVKDFTQDDVQITGGSLSDFTQVDGDTWTATFTPDASFEGTAQISVADNTYTDLSDNNGTGAQLELGVDTQGPSLEITEQDGTVTFQFSEAVKDFTQDDVQITGGSLSDFTQVDGDTWTATFTPDASFEGTAQISVADNTYTDLSDNNGTGAQLELGVDTQGPSLEITEQDGTVTFQFSEAVKDFTQDDVQITGGSLSDFTQVDGDTWTATFTPDANFEGTAQISVADNTYTDLSDNNGTGAQLELGVDTQGPSLEITEQDGTVTFQFSEAVKDFTQDDVQITGGSLSDFTQVDGDTWTATFTPDASFEGTAQISVADNTYTDLSDNNGTGDELNLPISENKTPYIKVDNDSYPDNQPGIDEVFESGLALGSLVGQKPVVAVGEIRLFDADGLGDLTEIRFGGEAGTLVSMTQLEALALGNMASISIADAGLTYGSLSITAYDSTTGVIAYEYTLNTAVENSQESDDFSESFSIEVADQKGWSDSVQASIKIIDDKPEIDPEAFDVSGSYDLNALFGADGAGTIVFSADLHAQAVTDKDGQPVYFNGSALKWNLVDGVLTAVSEAGDTAITVTLNPTDNNYTIEIADGVFGLTPANNLLGVESFTGGNSGFFGLFNNLLGILATSLDGTVNTNQGYVGVADQWIDQGETLTLSFFDGMVKPADIKPNDLVLGDILGESSFAGVSAFSALIDFQGNSTGNEVIELLLTMIDGSQVTYMANVIDGAIEVVASKLPVVAVNFIGCDDFDYRVGALSVVETQPEEVNLAIPVTIEDGDQDVVDALIEGTIPSQVTPVISNDPPQVFIEGSGGLFGLLGIEFNPLIDLGFEQKLAVYDSADNITQVEISYSSLASFNFNAIFGNPGQPFYLDTSESGLTVTVESSSGMLGMINTSYKVTITKPGGDGVNQSMTNAELNELLATFQVNNSNTFFAADLMSNLSIRAVDANGDADSESLSQLISVESNLLSAVTKKSVFADDIVEGLAFETNSGIKGLTDENGAFSYRDGDSVAFKIGDVLIGVASAEDLAAGYVFLQDLADVSRSDLNSEYVENMAVFLQTLDANANPADGILITPEVHQQLAGQSIDLATASEQELQQFLLDNGFENIVTEVDAMAHVQATLMNLTDMTAAAFDLHIPDSELALISQGFDYANIDIATPPADFIESMALEDMSIFDVVQNDFTEVVFDYLESADDQEEQNELDSLDSVKIFSKTTFGRNETMEEVIQSHLDDTTNL >NZ_AP021889.1|WP_173271480.1|1091968_1093816_-|TolC-family-outer-membrane-protein MFYSTATNSFVFRKGVKLLALAGLLTSAQAFAAPVATISDNSLNETIKFAIENNPEVQAAWHNFLSSQQDTNSANSELRPNVDLFADYSLQHKSYTTNENYHGASGRLTVTQMLYDGQRTAKNIEGFKNAELVSYFQLLDSVESIALQTYTAYQDVLRFRKLTAIAQQNYDNHLDVYGKIAAGVETGATRRADLEQISGRLALAESNLLTEKANLHDVSSRFLRIVGQIPAQNLNAMDFDSGAIPSNFQSVMDSAYKHNAAFHAAIRNIEAKRSDVNKERAGFKPNLDLRGEYGAQTYDLQGESNGIQDGKIALEFRYNLYNGHRTDALVQKAMEEVNRAQYQREKVCVDMRQEMQISFNDVRKLNDQLPILQQHLDASDKVRVAFKDQFSIGQRTLLDLLDTEIEFFQASRSYANALFDRNISIAKTLAKMGELLNTLAITRDGVPSLADLGSEPIPVDPATTCPILEVPDFSAAIERPKPISLPSKFEVPSPQNEAGNTYRLEVNFKFNSSIIDDKYENDIKALAEFLQNNSETKVEIQGHASLEGPEAYNQWLSERRAQAVANELTNKFNIPRSRVTSLGFGETKPLVNATTPEANNVNRRVESKITLILAE >NZ_AP021889.1|WP_173271478.1|1089611_1091753_-|type-I-secretion-system-permease/ATPase 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>NZ_AP021889.1|WP_173269095.1|1117126_1117477_-|transposase MTDTLSTLPTVKKIRRRYSREFKQQVLTACEDPNTSIAQVARDYGINANQIQNWKRQLKKRHASQAAFIPLVLNDLPPSSPQTLLVELPAPQGKIAVHWPVTELAKLSAFVKSVQS >NZ_AP021889.1|WP_173271496.1|1117702_1119277_-|IS66-family-transposase MKTMPNLHQLSADQLRTLAAQLFIQVETQEARLQEKDQRIAANTKALQQKELKIDQLTYELAYLRRLKFSHKSEQISALQMTLLDEVTDVDISAIESELDALRDKTDTAQPKKKPKRQPLPENLPRLDIRHDPESTTCSCGCQLRHIGEDVSEKLDYLPGSFQVERHIRSKWACDACETLIQKPMPPQIIDKGLPTSGLLAHLLIAKYADHLPLYRQAQIFERAGVKLPSSTLAEWVGVCGVQLEPVAQALKDFLLTQPVLHADETPVPMLKPGNKKTHKAYLWAYTNPANAQHKAVYYHFSEGRNGKFAREVLQDWKGLLVCDDYPGYKASFKQGVTEVGCMAHARRKFVELHESGKSTIAIQAIELMGQLYAIEKEIQPLAPEERQTIRQQKSKPIMDLLLKWLQVHREKVPKGGATEKVIHYSLKRWDALSRYLGDGRLPIDNNWVENQIRPWALGRKNWLFAGSLRSGQRAANIMSLIQSAKNNGLDPYAYLKDVLERLPTHKASQIDQLLPHNWQPSNR >NZ_AP021889.1|WP_173271498.1|1119294_1119624_-|IS66-family-insertion-sequence-element-accessory-protein-TnpB MIRIDHYWLATEPMDMRAGPDTALARVIAVFGEAKPHHAYLFANKRGNRMKILIHDGLGIWLCARRLNQGKFHWAELWRGESVTLSPEQCLALVQGLPWQRLETSLSLS >NZ_AP021889.1|WP_173271500.1|1119620_1119971_-|transposase MTDTLSTLPTVKKIRRRYSREFNQQVLTACEDPNTSIAQVARDYGINANQIQNWKRQLKKRHASQAAFIPLVLNDLPPSSPQTLLVELPAPQGKIAVHWPVTELAKLSAFVKSVQS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_AP021889_2 | 1929949-1931867 | TypeI-E |
I-B,III-A,III-B
Consensus repeat of NZ_AP021889_2
|
31 spacers
spacers of NZ_AP021889_2
>2.1|1929977|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT CATTTTAAGATTTTGGCCAGCTCCCAGAATCGG >2.2|1930038|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAACGCTAGTTTGCTCAGGGTCAGAAGTAATA >2.3|1930099|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCGCTTGGTTTGGATTTAGCCGACACGCTAACG >2.4|1930160|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGATGATGACGGTGACGAGTATAAATGGATATG >2.5|1930221|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GACTTCAATCAATCGATTCTGCAAACGGCCATA >2.6|1930282|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATACAGTGCATCTAATATTTTATTTTCAAATTA >2.7|1930343|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCCAGCCGCCTATTGTCGAATTGCCGCCTCAAA >2.8|1930404|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAGAGTTTGAAAACAAAATTCGCCAAAAAGAAA >2.9|1930465|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AACTACTACCAGCTGGCACCTATCCGGCGATCA >2.10|1930526|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGTGATAAGTCATCCGGCTTGAAACTTGATTTG >2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTGAATCTACTATATATATATATAGAATTATTA >2.12|1930648|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAATCAAAATAAAAGAGATGGGCGATAATCACA >2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTTGAAATGCTGGAGATGATGAACCCAAGAG >2.14|1930770|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCCTAATTGCTGTTGCGGTCATGTACTCCACCA >2.15|1930831|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAACCCGGCAAGAGGCATGGCGCGCAATTGGA >2.16|1930892|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGGTTATGCCGCGCTAAGTGAATATCACGGTTA >2.17|1930953|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AACTACTCTGATCTTGAAGATCACGAGAAGGAG >2.18|1931014|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCTTCTGCTGCATCCTCTAAAGCCCAAATCTGA >2.19|1931075|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGGCACCTATCCGGCGATCATTGTTGAGTCTGA >2.20|1931136|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATATCAATGTATCGTCCCTCAAAAATGGACTGA >2.21|1931197|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAACTGTCCTGTATTGCTTGGCTAATATCTTTG >2.22|1931258|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTCACGGTCTGAAACTGTAGCCACTTGCACA >2.23|1931319|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTGTAATGTCGCACTGCATTTATGAACTCCTA >2.24|1931380|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAGGCCCGCAAGGGCAAAATGGTCAATGGCGTA >2.25|1931441|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGTTATGTACCTCAAACCCATGCTCTTTCAAAA >2.26|1931502|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAAAGTATCAAAGCAAATCGAAGAAGCAAAGG >2.27|1931563|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCAAGGCAGATTTCCCTCCACCACCCGATGTAA >2.28|1931624|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTCTATGGCAGCAAAATACTCTAATGCCGCTTG >2.29|1931685|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTATCTCAAGCTTGCAAGAGTCACCTAGCCGA >2.30|1931746|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTATAAAGCAGATCAATACCGCTTTGCTTATGA >2.31|1931807|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGTATGTAGCGACACTAGATAGTCGCACACGCA |
cas2,cas1,cas5,cas7,cas6e,cse2gr11,cas8e,cas3,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP021889_2
The CRISPR arrays of NZ_AP021889_2 >merge|NZ_AP021889|2|1929949-1931867|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAACATCCCCACTGGCGTGGGGAAGACCATTTTAAGATTTTGGCCAGCTCCCAGAATCGGGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGACAAAACGCTAGTTTGCTCAGGGTCAGAAGTAATAGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGACGCGCTTGGTTTGGATTTAGCCGACACGCTAACGGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGACCGATGATGACGGTGACGAGTATAAATGGATATGGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGACGACTTCAATCAATCGATTCTGCAAACGGCCATAGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGACATACAGTGCATCTAATATTTTATTTTCAAATTAGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGACGCCAGCCGCCTATTGTCGAATTGCCGCCTCAAAGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGACCAGAGTTTGAAAACAAAATTCGCCAAAAAGAAAGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGACAACTACTACCAGCTGGCACCTATCCGGCGATCAGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGACTGTGATAAGTCATCCGGCTTGAAACTTGATTTGGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGACGTGAATCTACTATATATATATATAGAATTATTAGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGACCAATCAAAATAAAAGAGATGGGCGATAATCACAGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGACTTTTTGAAATGCTGGAGATGATGAACCCAAGAGGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGACGCCTAATTGCTGTTGCGGTCATGTACTCCACCAGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGACAAAACCCGGCAAGAGGCATGGCGCGCAATTGGAGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGACAGGTTATGCCGCGCTAAGTGAATATCACGGTTAGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGACAACTACTCTGATCTTGAAGATCACGAGAAGGAGGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGACGCTTCTGCTGCATCCTCTAAAGCCCAAATCTGAGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGACTGGCACCTATCCGGCGATCATTGTTGAGTCTGAGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGACATATCAATGTATCGTCCCTCAAAAATGGACTGAGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGACAAACTGTCCTGTATTGCTTGGCTAATATCTTTGGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGACTTTTCACGGTCTGAAACTGTAGCCACTTGCACAGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGACTTTGTAATGTCGCACTGCATTTATGAACTCCTAGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGACGAGGCCCGCAAGGGCAAAATGGTCAATGGCGTAGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGACTGTTATGTACCTCAAACCCATGCTCTTTCAAAAGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGACTTAAAGTATCAAAGCAAATCGAAGAAGCAAAGGGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGACCCAAGGCAGATTTCCCTCCACCACCCGATGTAAGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGACGTCTATGGCAGCAAAATACTCTAATGCCGCTTGGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGACGTTATCTCAAGCTTGCAAGAGTCACCTAGCCGAGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGACTTATAAAGCAGATCAATACCGCTTTGCTTATGAGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGACAGTATGTAGCGACACTAGATAGTCGCACACGCAGAAACACCCCCACGGGCGTGGGGAAGAC 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>NZ_AP021889.1|WP_173272986.1|1929678_1929816_+|hypothetical-protein MWIEHIGTIGMIAVVVLIAAHFAVHFFFKWKKRKQKQQQQQQQRD >NZ_AP021889.1|WP_173272984.1|1927995_1929573_-|SulP-family-inorganic-anion-transporter MNPSQPFNWRTYKNDTLSGITVALALVPEAVAFAFVAGVHPLVGLYAAVIVGMITAIFGGRPGMITAAAGSLAVVMMHLVMEHGAAFLFLAVIMMGVFQIIIGLMKWGRFIRMVPSSVMLGFVNGLALIILVAQFTQFKDVDGNWLSGDALTMMVAIIAATLAIIYLLPKVTKAVPSALAAIVLVAVVVALFDLNAITVGDKAAVSGTLESLIFGDGTQGGFQGLSWVTTLPEGFWSLTTLWIVLPYALILTIIGSTESLLTMTLIDDITETRGKANKECIALGSANCVAGSFGTMGGCALIGQSMINVKSGGTGRWSGITASFVLLLMIVAISPLIEMVPIGALVGLMFFVVIATFNWSSLQIMRGMTKADAFVVVVVTVLTVMFDLAVAVISGVIIAALVFAWQHAQRILITTSQETVDGKLIKIYQLQGPLFFASAKNFMDSFDPKNDPECVHIDFMHSRVYDHTGVEAVENLTQKYKAAGKKLTLKHLSPECQTLLHNARDLIEVNVSEDPHYHVSMSGKR >NZ_AP021889.1|WP_173272982.1|1927320_1927734_-|hypothetical-protein MLKIMPVLSVVLFLSLTFSAQAKDFTPADPVVKLMPVLMDNLNLFELTPEQMQQVRSISRKSFADLEYLNAEYHLVKTELRDLLFDPKPHPAAEQKLIESLAKMEAKRLVLTVDCAEGLKAILSPEQFAELIELATF 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>NZ_AP021889.1|WP_173273000.1|1936051_1937551_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse1/CasA MSENRFNLIDEPWIPVVDVGRVSLKEIFSNPNLKALGGNPVQKIALTKLLLAIAQSANTPADNQAWKTLGSEGLAKACLAYLEKWHDRFYLYGEKPFLQMPAIAKAAIQPFGAVLPEIATGNTTVHTQIQQEKDLDDADKALLVLQLMGFGLGGKKTDNTAVLTTGYSGKTKENGKGMTGKPGSSIGFMGFLHNFLQGQNLQASIWLNLFTQEQINQIRVLEAGLGQAPWEQMPIGEADEIAQKISQSLIGRLIPLGRFVLLAESGLHYSEGIAHAGYKDGMSDPSVSVNYSGKDPKAIWVDTEKRPWRMLTALLSFMATQQKEVFTCSQLEFCLPRGAKQTNQIAIWSGGLRVSSNAGEQYVSGSDDSLESTITVPTEHLGAIWFAHLQAEMTELDSLAKTLYGCVLSYFKHQLVDGKNQAAQATNLFWQLCESRFQDLVNGAEYEEQRYILRKVFAGFVIQAFENYCPKETARQLDAWAQSRPNLSKYLAQPNKEVA >NZ_AP021889.1|WP_173273001.1|1937569_1938547_-|virulence-RhuM-family-protein MKAQNQMQLFTTPDGAVSLEVTLNQDTVWLNQTQLIDLFGRDQSVISRHINNVFKEGEVDKQSNMQKMHIANSDKPVIYYSLDVIISVGYRVKSLRGTQFRIWAAQILKQHLLQGYTLNQQRFEENAQALEQAIELVRKAARSTELTLESGRGLVDIVSRYTQTFLWLQRYDEGLLDQPDGQPGGNLPAIDEAESSLAELKQNLMAKGQASSLFAEARGDGLSAILGNLDQTAFGEPAYPTIESKAAHLLYFVVKNHPFNDGNKRSGAFLFVDFLHRNGRLFDAKQQPVINDTGLAALTLLVAESDPKQKNILIKLIMNMLSPQA >NZ_AP021889.1|WP_173274293.1|1938550_1941106_-|CRISPR-associated-helicase-Cas3' MSNETNVPLPACLAKTWKQSEGSVLAGRDVLTHCLIVGTVAQKLIAQMPDWLKEAYFPEGSALVVACHDDGKVSPTFQHKIYKNLSATPEDIWAVLKSHTLDENAQWGGHAGVSQVTLEHLDAGKYIAEIAGQHHGWSPNIGARQAIAEVFGGQPWLSQRIVLIEQLKTALKQDFPAVENAIQAKLLAGLTTVSDWIGSGSLFDDPNEDWQLKIEQAIEQAGFVAPKIKQNLSFAQLFGFEPRQAQTALIELANQPGVYVLEAPMGLGKTEAALYAAYQLLAQNKATGLYFALPTQLTSEKIHERVDAFLKTILEEDSLHTSPLLLHGQAWLKAQMGEDAAPGGEWFSQGKKGILAPFAVGTIDQALMAVLHVKHGFVRTFGLAGKVVILDEVHTYDAYTGTVMDELVDTLRQLHCTVIILSATLTQERRQALLKTPVVEQAYPLISGVAHDTLTEITIEQMEAKSVAIHIEADTQAAIEEALSRAEQGQQVLWIENTVAEAQAVFLTLSAQASGLNIATGLLHSRFTQSHRQINEHQWVTAYGKAGWAERNQQGRILVGTQVLEQSLDIDADFLVTRLAPTDMILQRLGRLWRHDNPNRHAQAQCEVWLLAPALAQAIENPKQAFGHSAWVYATYVLCRTLQLWQDLSQVNLPQDIRTLIEATYQTRTETDSLATYLHELETQRKKLRSLALQGMSAIGRAKPDEAVTTRYSEQETVEVLLLKQVELNQTHQNQLGTWLTFSDDHREFYPHNGRAFGHKKWRELAAKLQLSLVKIAIHQTPKAVKQKNLAWLKDYLYLGYPDEQADAAIRIALIREDDQLITLDGSPQINEKYTLSYNDWLGYQTLKTEG >NZ_AP021889.1|WP_173273003.1|1941222_1942194_-|WYL-domain-containing-protein MKKSLRQEKLYNYLLSLNQAVAVAVLAEHFACSLKTIRRDIEELAECKKSPWYIFENKVYIDQEQKKRFQIEDNWLSSEELNGLIALYHSVDNLSNGALQGLLNPVKERIIGAISQQQSANKLPKSPIKIIEIANRQLDPQLFQQLHRCIAQRTVITVLYWKRSDDQQQIRTLSPQQLVRYKDNWYVDAYCHQVNDLRSFALDAIIKVTESLPSQYRQIEPREIDRHFQQSYGIFSGQATQTASLHFDEYITRWVEHEIWHPQQISEKQPDGSLIMHLPYHHDIELIQDILKHGSNVKVLAPQDLKDKVKQRLAQAWEAYQSE |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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NZ_AP021889_2 | 2.10|1930526|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1930526-1930558 | 33 | NZ_CP048288 | Paenibacillus sp. 14171R-81 plasmid unnamed2 | 46528-46560 | 7 | 0.788 |
NZ_AP021889_2 | 2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1930709-1930741 | 33 | MN693653 | Marine virus AFVG_250M591, complete genome | 2702-2734 | 8 | 0.758 |
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NZ_AP021889_2 | 2.26|1931502|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1931502-1931534 | 33 | NC_022111 | Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence | 992506-992538 | 8 | 0.758 |
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NZ_AP021889_2 | 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1930587-1930619 | 33 | NZ_CP040614 | Campylobacter sp. CFSAN093246 plasmid unnamed, complete sequence | 21792-21824 | 9 | 0.727 |
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NZ_AP021889_2 | 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1930587-1930619 | 33 | NZ_CP014345 | Campylobacter jejuni strain RM3194 plasmid unnamed, complete sequence | 17871-17903 | 9 | 0.727 |
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NZ_AP021889_2 | 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1930587-1930619 | 33 | NZ_CP014345 | Campylobacter jejuni strain RM3194 plasmid unnamed, complete sequence | 27894-27926 | 9 | 0.727 |
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NZ_AP021889_2 | 2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1930709-1930741 | 33 | NC_011737 | Gloeothece citriformis PCC 7424 plasmid pP742402, complete sequence | 162505-162537 | 9 | 0.727 |
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NZ_AP021889_2 | 2.25|1931441|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1931441-1931473 | 33 | MN419153 | Vibrio phage ICP1_2017_F_Mathbaria, complete genome | 68481-68513 | 9 | 0.727 |
NZ_AP021889_2 | 2.6|1930282|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1930282-1930314 | 33 | NZ_CP007650 | Lactobacillus salivarius strain JCM1046 plasmid pCTN1046, complete sequence | 20649-20681 | 10 | 0.697 |
NZ_AP021889_2 | 2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1930709-1930741 | 33 | NZ_KP763470 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium strain L946 plasmid pSTM_Phi, complete sequence | 101233-101265 | 10 | 0.697 |
NZ_AP021889_2 | 2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1930709-1930741 | 33 | NZ_CP026134 | Klebsiella pneumoniae strain F5 plasmid pF5_2, complete sequence | 112167-112199 | 10 | 0.697 |
NZ_AP021889_2 | 2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1930709-1930741 | 33 | NZ_CP027108 | Cronobacter sakazakii strain CS-931 plasmid pCsaCS931a, complete sequence | 315-347 | 10 | 0.697 |
NZ_AP021889_2 | 2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1930709-1930741 | 33 | NZ_CP014707 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Anatum strain USMARC-1735 plasmid pSAN1-1735, complete sequence | 32626-32658 | 10 | 0.697 |
NZ_AP021889_2 | 2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1930709-1930741 | 33 | NZ_CP027045 | Klebsiella pneumoniae strain 1_GR_13 plasmid IncFIB, complete sequence | 59345-59377 | 10 | 0.697 |
NZ_AP021889_2 | 2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1930709-1930741 | 33 | NZ_CP026146 | Klebsiella pneumoniae strain F132 plasmid pF132_1, complete sequence | 9793-9825 | 10 | 0.697 |
NZ_AP021889_2 | 2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1930709-1930741 | 33 | NZ_CP026150 | Klebsiella pneumoniae strain F138 plasmid pF138_1, complete sequence | 106130-106162 | 10 | 0.697 |
NZ_AP021889_2 | 2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1930709-1930741 | 33 | NZ_CP026138 | Klebsiella pneumoniae strain F77 plasmid pF77_2, complete sequence | 82217-82249 | 10 | 0.697 |
NZ_AP021889_2 | 2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1930709-1930741 | 33 | NZ_CP028544 | Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain SCKP020143 plasmid p2_020143, complete sequence | 30550-30582 | 10 | 0.697 |
NZ_AP021889_2 | 2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1930709-1930741 | 33 | NZ_CP032225 | Klebsiella pneumoniae strain AR_0046 plasmid unnamed3, complete sequence | 57184-57216 | 10 | 0.697 |
NZ_AP021889_2 | 2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1930709-1930741 | 33 | NZ_KY515226 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Derby strain S701 plasmid AnCo3, complete sequence | 3925-3957 | 10 | 0.697 |
NZ_AP021889_2 | 2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1930709-1930741 | 33 | CP052264 | Klebsiella pneumoniae strain E16KP0288 plasmid pE16K0288-2, complete sequence | 78436-78468 | 10 | 0.697 |
NZ_AP021889_2 | 2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1930709-1930741 | 33 | CP053410 | Salmonella enterica strain 2014K-0203 plasmid unnamed, complete sequence | 97742-97774 | 10 | 0.697 |
NZ_AP021889_2 | 2.17|1930953|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1930953-1930985 | 33 | CP000877 | Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU02, complete sequence | 61259-61291 | 10 | 0.697 |
1. spacer 2.6|1930282|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF360958 (Salicola phage SCTP-2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
atacagtgcatctaatattttattttcaaatta CRISPR spacer caagattgaatctaatattttattatcaaattc Protospacer * * ** *************** *******
2. spacer 2.10|1930526|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP048288 (Paenibacillus sp. 14171R-81 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
tgtgataagtcatccggcttgaaacttgatttg CRISPR spacer ttcgatttctcatccggcttgaaactggctttg Protospacer * .*** ***************** * ****
3. spacer 2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693653 (Marine virus AFVG_250M591, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
tttttgaaatgctggagatgatgaacccaagag CRISPR spacer attatgaaatgctggagttgatgaagctagaaa Protospacer ** ************* ******* *.*..*.
4. spacer 2.19|1931075|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP049317 (Caballeronia sp. SBC2 plasmid pSBC2-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
tggcacctatccggcgatcattgttgagtctga CRISPR spacer ggggacctacccggcgatcattgttgtgctcaa Protospacer ** *****.**************** *....*
5. spacer 2.19|1931075|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP049157 (Caballeronia sp. SBC1 plasmid pSBC1_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
tggcacctatccggcgatcattgttgagtctga CRISPR spacer ggggacctacccggcgatcattgttgtgctcaa Protospacer ** *****.**************** *....*
6. spacer 2.26|1931502|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_022111 (Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
ttaaagtatcaaagcaaatcgaagaagcaaagg CRISPR spacer ctgtaatttcaaagcaaatagaaaaagcaaaga Protospacer .*. *.* *********** ***.********.
7. spacer 2.8|1930404|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP049906 (Diaphorobacter sp. HDW4B plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
cagagtttgaaaacaaaattcgccaaaaagaaa CRISPR spacer aagagtttgaaaacaagattcgccaagggctgc Protospacer ***************.*********... .
8. spacer 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP028373 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni strain huA17 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtgaatctactatatatatatatagaattatta CRISPR spacer ttatagttactataaatatatataaaattatag Protospacer *. * .******* *********.****** .
9. spacer 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP028373 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni strain huA17 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtgaatctactatatatatatatagaattatta CRISPR spacer ttatagttactataaatatatataaaattatag Protospacer *. * .******* *********.****** .
10. spacer 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP028373 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni strain huA17 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtgaatctactatatatatatatagaattatta CRISPR spacer ttatagttactataaatatatataaaattatag Protospacer *. * .******* *********.****** .
11. spacer 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP018901 (Campylobacter coli strain YH502 plasmid pCOS502, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtgaatctactatatatatatatagaattatta CRISPR spacer ttatagttactataaatatatataaaattatag Protospacer *. * .******* *********.****** .
12. spacer 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP040614 (Campylobacter sp. CFSAN093246 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtgaatctactatatatatatatagaattatta CRISPR spacer ttatagttactataaatatatataaaattatag Protospacer *. * .******* *********.****** .
13. spacer 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP040614 (Campylobacter sp. CFSAN093246 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtgaatctactatatatatatatagaattatta CRISPR spacer ttatagttactataaatatatataaaattatag Protospacer *. * .******* *********.****** .
14. spacer 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP014745 (Campylobacter jejuni strain OD267 plasmid pCJDM67 L, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtgaatctactatatatatatatagaattatta CRISPR spacer ttatagttactataaatatatataaaattatag Protospacer *. * .******* *********.****** .
15. spacer 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP017026 (Campylobacter coli plasmid pCC14983A-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtgaatctactatatatatatatagaattatta CRISPR spacer ttatagttactataaatatatataaaattatag Protospacer *. * .******* *********.****** .
16. spacer 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP017026 (Campylobacter coli plasmid pCC14983A-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtgaatctactatatatatatatagaattatta CRISPR spacer ttatagttactataaatatatataaaattatag Protospacer *. * .******* *********.****** .
17. spacer 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP014345 (Campylobacter jejuni strain RM3194 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtgaatctactatatatatatatagaattatta CRISPR spacer ttatagttactataaatatatataaaattatag Protospacer *. * .******* *********.****** .
18. spacer 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP014345 (Campylobacter jejuni strain RM3194 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtgaatctactatatatatatatagaattatta CRISPR spacer ttatagttactataaatatatataaaattatag Protospacer *. * .******* *********.****** .
19. spacer 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP014345 (Campylobacter jejuni strain RM3194 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtgaatctactatatatatatatagaattatta CRISPR spacer ttatagttactataaatatatataaaattatag Protospacer *. * .******* *********.****** .
20. spacer 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP014743 (Campylobacter jejuni strain WP2202 plasmid pCJDM202, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtgaatctactatatatatatatagaattatta CRISPR spacer ttatagttactataaatatatataaaattatag Protospacer *. * .******* *********.****** .
21. spacer 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP044166 (Campylobacter coli strain AR-0416 plasmid pAR-0416) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtgaatctactatatatatatatagaattatta CRISPR spacer ttatagttactataaatatatataaaattatag Protospacer *. * .******* *********.****** .
22. spacer 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP044166 (Campylobacter coli strain AR-0416 plasmid pAR-0416) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtgaatctactatatatatatatagaattatta CRISPR spacer ttatagttactataaatatatataaaattatag Protospacer *. * .******* *********.****** .
23. spacer 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP044166 (Campylobacter coli strain AR-0416 plasmid pAR-0416) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtgaatctactatatatatatatagaattatta CRISPR spacer ttatagttactataaatatatataaaattatag Protospacer *. * .******* *********.****** .
24. spacer 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP044176 (Campylobacter coli strain AR-0411 plasmid pAR-0411, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtgaatctactatatatatatatagaattatta CRISPR spacer ttatagttactataaatatatataaaattatag Protospacer *. * .******* *********.****** .
25. spacer 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP044176 (Campylobacter coli strain AR-0411 plasmid pAR-0411, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtgaatctactatatatatatatagaattatta CRISPR spacer ttatagttactataaatatatataaaattatag Protospacer *. * .******* *********.****** .
26. spacer 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP044176 (Campylobacter coli strain AR-0411 plasmid pAR-0411, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtgaatctactatatatatatatagaattatta CRISPR spacer ttatagttactataaatatatataaaattatag Protospacer *. * .******* *********.****** .
27. spacer 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP017417 (Campylobacter jejuni strain MTVDSCj13 plasmid pMTVDSCj13-2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtgaatctactatatatatatatagaattatta CRISPR spacer ttatagttactataaatatatataaaattatag Protospacer *. * .******* *********.****** .
28. spacer 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP025282 (Campylobacter coli strain YH503 plasmid pCOS503, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtgaatctactatatatatatatagaattatta CRISPR spacer ttatagttactataaatatatataaaattatag Protospacer *. * .******* *********.****** .
29. spacer 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP025282 (Campylobacter coli strain YH503 plasmid pCOS503, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtgaatctactatatatatatatagaattatta CRISPR spacer ttatagttactataaatatatataaaattatag Protospacer *. * .******* *********.****** .
30. spacer 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP025282 (Campylobacter coli strain YH503 plasmid pCOS503, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtgaatctactatatatatatatagaattatta CRISPR spacer ttatagttactataaatatatataaaattatag Protospacer *. * .******* *********.****** .
31. spacer 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP048772 (Campylobacter jejuni strain ZS007 plasmid pCJ145K, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtgaatctactatatatatatatagaattatta CRISPR spacer ttatagttactataaatatatataaaattatag Protospacer *. * .******* *********.****** .
32. spacer 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP048772 (Campylobacter jejuni strain ZS007 plasmid pCJ145K, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtgaatctactatatatatatatagaattatta CRISPR spacer ttatagttactataaatatatataaaattatag Protospacer *. * .******* *********.****** .
33. spacer 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP048772 (Campylobacter jejuni strain ZS007 plasmid pCJ145K, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtgaatctactatatatatatatagaattatta CRISPR spacer ttatagttactataaatatatataaaattatag Protospacer *. * .******* *********.****** .
34. spacer 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP048772 (Campylobacter jejuni strain ZS007 plasmid pCJ145K, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtgaatctactatatatatatatagaattatta CRISPR spacer ttatagttactataaatatatataaaattatag Protospacer *. * .******* *********.****** .
35. spacer 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP048772 (Campylobacter jejuni strain ZS007 plasmid pCJ145K, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtgaatctactatatatatatatagaattatta CRISPR spacer ttatagttactataaatatatataaaattatag Protospacer *. * .******* *********.****** .
36. spacer 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP044174 (Campylobacter jejuni strain AR-0412 plasmid pAR-0412, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtgaatctactatatatatatatagaattatta CRISPR spacer ttatagttactataaatatatataaaattatag Protospacer *. * .******* *********.****** .
37. spacer 2.11|1930587|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP044174 (Campylobacter jejuni strain AR-0412 plasmid pAR-0412, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtgaatctactatatatatatatagaattatta CRISPR spacer ttatagttactataaatatatataaaattatag Protospacer *. * .******* *********.****** .
38. spacer 2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_011737 (Gloeothece citriformis PCC 7424 plasmid pP742402, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
tttttgaaatgctggagatgatgaacccaagag CRISPR spacer tttttgtaatgcttgagatgatgaattaatttt Protospacer ****** ****** ***********.. *
39. spacer 2.25|1931441|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY883636 (Vibrio phage JSF1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
tgttatgtacctcaaacccatgctctttcaaaa CRISPR spacer gaatactcacttcaaacccattctctttcaaat Protospacer . **. .**.********** **********
40. spacer 2.25|1931441|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY883637 (Vibrio phage JSF2, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
tgttatgtacctcaaacccatgctctttcaaaa CRISPR spacer gaatactcacttcaaacccattctctttcaaat Protospacer . **. .**.********** **********
41. spacer 2.25|1931441|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to HQ641348 (Vibrio phage ICP1_2006_D, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
tgttatgtacctcaaacccatgctctttcaaaa CRISPR spacer gaatactcacttcaaacccattctctttcaaat Protospacer . **. .**.********** **********
42. spacer 2.25|1931441|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to HQ641349 (Vibrio phage ICP1_2006_C, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
tgttatgtacctcaaacccatgctctttcaaaa CRISPR spacer gaatactcacttcaaacccattctctttcaaat Protospacer . **. .**.********** **********
43. spacer 2.25|1931441|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY883635 (Vibrio phage JSF6, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
tgttatgtacctcaaacccatgctctttcaaaa CRISPR spacer gaatactcacttcaaacccattctctttcaaat Protospacer . **. .**.********** **********
44. spacer 2.25|1931441|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN419153 (Vibrio phage ICP1_2017_F_Mathbaria, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
tgttatgtacctcaaacccatgctctttcaaaa CRISPR spacer gaatactcacttcaaacccattctctttcaaat Protospacer . **. .**.********** **********
45. spacer 2.6|1930282|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP007650 (Lactobacillus salivarius strain JCM1046 plasmid pCTN1046, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
atacagtgcatctaatattttattttcaaatta CRISPR spacer aagacatgtatctaatattttatttacaaaagt Protospacer * . .**.**************** ****
46. spacer 2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KP763470 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium strain L946 plasmid pSTM_Phi, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
tttttgaaatgctggagatgatgaacccaagag CRISPR spacer atttcgaactgctggagatgatgaagttcatcc Protospacer ***.*** **************** .. *
47. spacer 2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP026134 (Klebsiella pneumoniae strain F5 plasmid pF5_2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
tttttgaaatgctggagatgatgaacccaagag CRISPR spacer attttgaattactggagatgatgaagttcatcc Protospacer ******* *.************** .. *
48. spacer 2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP027108 (Cronobacter sakazakii strain CS-931 plasmid pCsaCS931a, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
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49. spacer 2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP014707 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Anatum strain USMARC-1735 plasmid pSAN1-1735, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
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50. spacer 2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP027045 (Klebsiella pneumoniae strain 1_GR_13 plasmid IncFIB, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
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51. spacer 2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP026146 (Klebsiella pneumoniae strain F132 plasmid pF132_1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
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52. spacer 2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP026150 (Klebsiella pneumoniae strain F138 plasmid pF138_1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
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53. spacer 2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP026138 (Klebsiella pneumoniae strain F77 plasmid pF77_2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
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54. spacer 2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP028544 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain SCKP020143 plasmid p2_020143, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
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55. spacer 2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP032225 (Klebsiella pneumoniae strain AR_0046 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
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56. spacer 2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KY515226 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Derby strain S701 plasmid AnCo3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
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57. spacer 2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP052264 (Klebsiella pneumoniae strain E16KP0288 plasmid pE16K0288-2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
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58. spacer 2.13|1930709|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP053410 (Salmonella enterica strain 2014K-0203 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
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59. spacer 2.17|1930953|33|NZ_AP021889|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP000877 (Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU02, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
aactactctgatcttgaagatcacgagaaggag CRISPR spacer taataatctgatcttgaagaacacgagtgccta Protospacer * ** ************** ****** . .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
13189 : 74945
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_AP021889|13189:74945|DBSCAN-SWA TCTAGGATGCGGTGTGATTCCACGGCAGAAGTGCTTCGAACTGCTCGAGGGTGTCGCAGTTGGGGAGGTCTCGGAAGAGATCGGTGAGATAGGCTTGGGGTTCGAGTCCGTTGGCTTTGGCGGTTTCAATCAAGCTGTACAGCATCGCACTGGCTTTGGCGCCTTTAACCGATTGGCTAAAGAGCCAGTTCTTGCGTCCAATCGCGAAGGGACGAATGGCATTCTCAACCGGGTTGTTGTCGATATTCAATCGCCCATTCGTGGTGAAGATTTGAAGCTTTTCCCAGTTTTTCGCAAGATAGCTCAAGGCCTCACCGAGTTTGCTTTTGGGCACGGTGCTGTTGAGGCTTTTATCCAACCACGTTTTGAGCTGTTCTAAAACCCGCAGGCTTTCGGTTTGCCGGATCTCGAGTCGTTTATTTGGTGGTTGGTCTTTGATGTGTTGTTCAATTTGATAGAGCTTTTGAATGAGATTGAGTGCCATGTCCGCCTTGCCGGTTTTATTCTTAGGCAGTACTTTTTTGGCATCCATAAACTTACGTCTGGCATGGGCCCAACAACCTAGATGGGTAATCTGTTCCGTTGCACCGATTTTGTGATAACCCGCATAGTCATCGGTTTGTAGGAAGCCTTTAAACTCAGGCAATAAATTCATGGCGGTTTGTGTGGTGCGATCCGGTGCATAGTCGAATAACACCACTGGGTGTTTTTGATCGCCCGTCTTGCGTACCCACATGTAACTGTGGCTCTCTGCGGTTTTCCCCACCTCATTCAACACTTGCACACGCGTTTCATCCATGTGCACATAACCACTGTCGAGCAGATGATCTTGCAGTAGGTTGTACAGTGGCTGACAGAGTTGGACCCCCTTAATCATCCAGTTGGCCATCGTTTGGCGTGACAGTTCGACCTCTAAACGTTCAAAGGCTTTTTCTTGACGATACAGCGGTACGCCATCTTGGTATTTCGCTGTGGCAATGTAGGCAAGTAACCCAGGACCCGCAATGCTTTTGGGAATCGGCTGTTTGGGCATGGACGCTAACTTAAGCGAACCGTCACACCCTGGGCAGGCGTATTTTTTACGCACTAACTGACGAACAATGATTTTGGCAGGAATAATTTCTAATTGCTCAGAGACCTCTTCACCGATTTCTTTGAACTCTGAGCCGCAGTCACATTTCTCACCGACCGGTAAGCGATGTTCAACACGTTGACGGGGTAGATTCTTTGGTAAGGGTTTACGACCAGCTTTTGACTTTTCTTTTGGTAGGTCATTCGATGATTTAGAAACGCTGTTTTTAAGTACTGAGCTGTCTTCGACTTCTGGCTCATTAAACAACTCGGCTTGATCCGGGTGTTTTTCACTGCTTTTATAGAATTGACGAACCTTAAAGAACATGACTAATTCAGACAGGCGACTGACTTCCGTTGATAAGGTGTCGATGTGCTGGTCTTTTTGCAAAACCAAGGCTTTTAAGGCATCGATATCATCGGGTAAATCGTGAGCAGTCAGAGGTGTTTTCATGGGCGGGTAAGATACCCGAATTAGCTCACGTTGTCATAGAAAAGTGACTCATGCGGTTGTTGAAAAATATCCAAGCCATCGAGTAACTGATTGAGCTGTTTGCCGGTAACTTCAATCGAATCCTTTGTTTCCTGAGGATTGAGCCATTTAAACTTGTGTTTCTCTAATCGCTTGTACCAGAGCACAAAGCCATTGCGCTCCCAGTAGAGGAGTTTGACCTTATCGCGAGAACGGTTGCAAAACACAAACAGTGCACCATTCATGGGAGAATGTCCCAGCTCAGCTTCCACAATGGCCGCCAGTCCATTAATGGATTTACGCATATCCACCGGATCCCGATAGACAAAGACGTGTGCATCAAAGCTTGGTCTAAGCATGACGATTCAACTCGGTGATTAATTGCGCTAATTGCACCACGGAACACTCAAATACCAATCCTTTTGCCTTGACTGCAATGCTGGTTGAGCACGGTTCAGGCTGATCGTGAATCACCATCGGCAAAAAGGCAGAAGATTCTTTGATGGGTTCTTGGCTTAAGTTTCGAAGCCTACGTCGCCAAGTATAAAAGGTTGAAATCGCCAAGCCTTGCTGCTGGCAAAATGCCCGTTGTGAAAGACCACTGGCTTGCCAATCGGCAATCCGCTGCACCCAAAGTTCGTGTTTGCTCATCAAAATTCTCCTGTGATTGAAAACACATAGAAGAATAACGAACTTTATTCAGGAATTTTAGATGTGGGTAAATTGACGCTTACCTACAAACCGATGACTATGCGGGTTATCACAAAATCGGTGTAACCGAACAGATTACCGTAACTATCCGGTAAACACCTCTTACCAACCACACTTATCTGTGAATAATTAGGTGCCCACGTATTTTAAATGGGCACTTATTATGACAGACACACTATCAACGCTTCCCACAGTCAAAAAGATTCGCCGTCGCTACTCACGGGAATTCAAACAGCAGGTTTTGACCGCTTGCGAGGACCCTAACACCTCGATTGCACAAGTGGCTCGAGACTACGGCATCAATGCCAATCAAATACAGAACTGGAAGCGTCAGCTTAAAAAGCGCCATGCTTCCCAAGCGGCATTTATTCCGCTGGTCTTGAACGATCTGCCGCCGTCATCGCCTCAAACGCTCTTGGTCGAACTGCCTGCACCTCAAGGCAAGATTGCTGTGCACTGGCCTGTCACAGAATTGGCCAAATTAAGCGCCTTTGTCAAGTCGGTGCAGTCATGATTCGCATTGATCATTATTGGCTGGCGACTGAACCCATGGATATGCGTGCAGGACCCGATACCGCATTAGCTCGTGTCATTGCCGTGTTTGGTGAGGCCAAACCCCATCATGCGTATCTGTTTGCCAATAAGCGTGGCAATCGAATGAAGATACTGATCCACGATGGCTTAGGCATCTGGCTGTGTGCTCGACGTTTGAATCAAGGTAAATTCCATTGGGCTGAGCTGTGGCGGGGCGATTCCGTGACACTCTCCCCTGAACAATGTCTGGCACTGGTGCAGGGCTTGCCTTGGCAACGGCTCGAGACTTCCTTATCACTGAGTTAGTCTTTATAATCCGCGGCATGAAAACAATGCCAAACCTCCATCAACTCTCTGCTGACCAGTTACGAACACTGGCGGCGCAGTTGTTGGTTCAGGTTGAAGAAAAAGACCAGCGCATCGCCGCCGATGCCAAAGCCATTCAACAAAAAGAGCTTAAAATCGATCAACTCACCTATGAGTTAGCCTATCTCAGACGTTTAAAATTCTCACACAAAAGTGAACAGATCAGCGCCTTACAGATGACACTGTTGGATGAAGTGACCGATGCCGACATTGCCGCGATTGAATCGGAACTGGATGCGCTTAGAGACAAAACCGACACAGCGCAACCAAAGAAAAAACCTAAGCGTCAGCCGCTACCCGAACACCTACCTCGTCTTGACATCCGTCATGATCCCGAATCCACCACCTGTTCATGTGGCTGTCAATTACGCCATATTGGTGAAGACGTCAGTGAAAAGCTGGATTATCTGCCCGGGACGTTTCAAGTTGAACGTCATATTCGCTCCAAATGGGCGTGCGATACCTGTGAAACTCTGATTCAAAAACCGATGCCCCCACAAATCATTGATAAAGGTCTGCCCACCTCTGGGTTACTCGCACATCTGCTCATCGCCAAATACGCTGATCACTTACCGCTGTATCGTCAAGCTCAGATCTTTGAACGGGCCGGTGTTAAATTACCCAGTTCCACTTTAGCCGAATGGGTCGGCGTCTGTGGTGTTCAACTTGAACCGGTGGCTCAAGCACTCAAAGACTTTTTGCTGACGCAACCGGTCTTGCACGCCGATGAAACCCCAGTGCCCATGCTCAAGCCGGGGAATAAGAAAACCCATAAAGCCTATCTGTGGGCCTACACCAATCCAGCCAATGCACAACATAAGGCGGTGTATTACCACTTCAGTGAAGGACGAAACGGCAAGTTCGCAAGAGAGGTGCTACAGGATTGGAAAGGATTGTTGGTGTGTGATGACTATCCTGGGTACAAAGCCAGTTTTAAACAAGGCGTGAGCGAAGTGGGCTGTATGGCGCATGCCCGTCGTAAGTTCGTGGAACTGCATGAAAGCGGCAAAAGCACGATTGCCATTCAAGCCATTGAACTAATGGGACAACTTTACGCCATTGAAAAAGAGATTCAACCCTTAGCCCCAGAGGAACGACAGATAATCCGGCAGCAAAAATCCAAACCGATCATGGACTTGCTGCTCAAATGGCTGAAGGTCCATCGAGAAAAAGTGCCCAAAGGTGGGGCAACGGAAAAAGCGATTCACTATAGCTTGAAACGTTGGGATGCCTTAAGCCGATACCTTGGAGATGGCCGCCTGCCCATCGATAATAACTGGGTAGAAAATCAAATCCGACCTTGGGCGTTAGGTCGCAAGAACTGGCTGTTTGCCGGCAGTCTACGCAGTGGTCAACGTGCGGCGAATATTATGAGCTTGATTCAATCAGCTAAAAACAATGGTCTGGATCCTTACGCCTATCTCAAAGACGTGCTTGAACGCTTACCCACCCATAAAGCCAGTCAAATCGACCAACTCCTACCGCACAATTGGCAACCTAGCAATCGGTGATTGCCGGACGCTTACAAATAAGCGAATAATTTGTTCACAAAAAAACCGAGTTGGATGCCCCAAACTCGGTTTTTTTACGCCTCAGAAAACACAGATTTGAATCCCTAACCTAGAAAAGCCTTGGAATCCAGCAAGGTTAAAGTCTGTTGTCGCCCGCTAATTTTAGCAATCGGTAAATCGGCAAGCTTGCCCGTTTGCAAAGCTTGATACCACAACTGGGTAACCTCAAATTTTGCCGAACCGGTAATCAATTTTAAAATCTTAGCCGCCGAATTAATCCGCTGGTAAGACAAACTGAGTCGCTCATTCGGTGCTTTAGGCGATTGTGTTTCGCT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55 | uncultured_virus(25.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
700446 : 709811
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_AP021889|700446:709811|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_AP021889|700446:709811|703645_704020_+|WP_173274229.1|DBSCAN-SWA MSDKNNIQAKSFAFSVRIVKLYQFLSKEHKEYVLSKQLLRSGTSVGANVNEAQAAQTKADFVSKMSIASKEAREAKYWLDLLSETQYLNKNEPHVQSLLEQSEELIKILTSIVKTAQQNLKNEK >NZ_AP021889|700446:709811|707868_708852_+|WP_173270838.1|DBSCAN-SWA MVRQVKVSIVIPVFNVEKYLDKCLNSALNQDYPNIEVVAINDGSEDKSLEILNSYSETWTNLKVFSQNNQGLSVARNTGIEKSTGDYVMFLDSDDYIALNTVSTLINYISQYGVNTVFFSGCAFNDGHSDELARYFDYERPVELHQKKMPSEQLFIELNKQNKYSVSACLYLTLKNNLSDLRFYPAIYHEDNLFTTQLLLKDKSAEAMCVSDVLFYRRVRPGSIMTEAKSMKHVEGYIIVSEQLLKVSKKIPRNSEAFVALMKFVQKCIYASSSDLIRQRVSWLSLKYRLKLILLLFKTRRIDITSKSYLLVVFPFLSHLKKLIKTK >NZ_AP021889|700446:709811|706420_707860_+|WP_173270836.1|DBSCAN-SWA MNLKSKTISGVSWNALGNVIRQIVTVLTLIFMARILSPDDYGVYAILMIFVSFMAIFASMGLGQAIIYKDSPSQSFLSSIFYFNLGLNSILSILLFLLASLIASFFDKDGLEELVELISIIFIISSLSLINKTMLEKQMKFKLVVIVEIIALLASALIGLVSAYQQFGVYSLVIMAITNAFVLSTGFLIVYKWLPSLSFSFSHIQTILSYSANLTGFTFINYFSRQSDQFLIGKFLGSTSLGIYSMAYKIMLYPLQNISHVIIRVLFPAFSEIKNDHEKFREGYLKAISFIALITFPLMAGLLVTAESFVSLVLGPQWQEMAILLMVLAPVGMVQSITTTTGSIYMAKGTTGAMFRIGLANAVVTVSAFAIGVFFGLVGIVLAYAIANLIMLIPNFYYPWKQIKLSVIEGLLRLFPFFITSMLMAAFVYLVGIYVNHLEFSIFIGFILQVILGAVFYLVSLYLFYRKILLHLLYQFKRV >NZ_AP021889|700446:709811|700446_702375_+|WP_173270827.1|DBSCAN-SWA MCGIVGGVAERNISTILLEGLKRLEYRGYDSSGMALLKVNGRKDETPNVEIIRYRALGKIASLQQKMQSGSQTERGRVGIAHTRWATHGVPSENNAHPHICNNQVAVVHNGIIENYQALKTLQIAAGYRFTSQTDTEVIAHCIYHHLQAIVPSLGQIKGVQATPVELLQAVQKTLSLLEGAYAIGVISPCTPDTLIAARKGSPLVIGVGFGEYFIASDVSALLPVTQRFIFLEEGDVALIQKDALQIFDVNGCLAERKEVLSQQSVSASGLNGHRHYMHKEIFEQPQAVVDTLEGRIANQEVLVDSFGASAAQVFERISQVQIIACGTSYHAGLVAKYWFEDILRLPCQVEVASEYRYRNPVIANNTLVVTISQSGETADTLAALKQIQALKDSRTELFIPTLTICNVPESSLIRASDLTFLTHAGPEIGVASTKAFTTQLVALALLLVAIGKTQKCLTAHREGLIVKGLIKLPGLISDCLAHEADIKLLAQSFADKHHAIFLGRGTMYPIAMEGALKLKEISYIHAEAYPAGELKHGPLALIDETMPVIAIAPHDELIEKLKSNLQEVSARGGQMIVFEDERSGVSSESNFNVIKATTNVGRITAPITFNIALQLLSYHVALIKGTDVDQPRNLAKSVTVE >NZ_AP021889|700446:709811|705178_706183_+|WP_173270833.1|DBSCAN-SWA MTTLTTQLDFYRDIKAMLYSARNKAYQAINQTMTQAYWEIGCRIVEQEQQGQARAEYGVMLIKNLSDELSKEFGKGFSVDNLKNMRRFYQCFPKSETASHQFTLSWSHYIFLTRINNTSERSFYEVEANNNHWSLKELKRQFNSGLFERLQLSTQKDKVQQLAAQGQVIETPGDLVKDPYILEFVGLPIQASYSESELEQRLIDKLESFLLELGKGFTFVARQKKITIDEKHFYIDLVFYNRLLKCFVVIDLKIGELKHQDLGQLMMYVNYFDRTEKQQDENPTIGIVLCKDKSKALVEMTLPENNSQLFASQYQTLLPNKEELKALLKEAIDD >NZ_AP021889|700446:709811|702404_703616_+|WP_173270829.1|DBSCAN-SWA MKIAVAGTGYVGLSLAVLLAQHHEVVALDIVPEKIDLLNKKISPIVDVEITDFLNNKTLNFTATLDKQQAYQDAEFVVIATPTDYDTITNIFNTKSIEAVVKDVIEINPNATIVIKSTIPVGYTDALKQQLKIQHPTVNIEIFFSPEFLREGKALYDNLYPSRIIVGEQTERAEVFANLLVEGAAKPAAEIPVLFTDATEAEAVKLFSNTYLAMRVSYFNELDTYCETHGLSTKQVIEGVGLDPRIGAHYNNPSFGYGGYCLPKDTKQLLANFQDVPQNMIRAIVDANTTRKDFIADQIIAKANASQNPVVGVHRLIMKQGSDNFRASAIQGIMKRIKAKGIQVVVYEPVLTEQGQTDFFHSKVIADLNEFKAVSNVIVANRLVDEIMDVQNKVYTRDLFGKD >NZ_AP021889|700446:709811|704016_705114_+|WP_173270831.1|DBSCAN-SWA MNQKLNIKNSTLNILITGAAGFIGFYLIQALKQYGHNMVGIDNLNDYYDPQLKLDRLKALGFNGEDVEKMAEGKHLKLNIQNLEFINLDLADRAGIENLFKTHQFDVVVNLGAQAGVRYSIDNPHAYVDSNLVGFVNILEGCRHSQVKHLVYASSSSVYGMNVKQPFSTDDRVDYPISLYAATKKSNELMAHTYSHLYGIPTTGLRFFTVYGPMGRPDMAYFKFTKAILEGKTIDVYNNGEMQRDFTYIDDIVEGVMRVMERPPSLDDEKLIIQNSKLNITAAKASYKVYNIGNNQPVTLSRFITAIEDACGKKAKENLMPMQAGDVPITYADVDDLIADTGFKPSTSIEEGIGKFVEWYKEYYK >NZ_AP021889|700446:709811|708890_709811_+|WP_173270840.1|DBSCAN-SWA MLTSMKPDKKLVTVIVPTYGRSNELSNAIQSVLKQTYRNIELIIVDDNSCIKNRNAVKSVVSSFANDRDIIYLGDGINRGGAGARNLGLDIAKGEYVTFLDDDDFFSENKIEKQVQHIEKNNLDVSVCDMNFSQNGKFLDVSNCYARVNSLKDFIINGNCYTPMILARKDVLKTVNGFTKTPRFQDHLLMLKILAKEYKVGHIKEKLFTHSNHNGMRITYSSGSAIGFKKKFDEESKYLKLLNSGELQQYQFSKNLVEMKILRSTRSFLDLAKLTSKSFCNIRSFNQFYAYVKCLIRNVFFPNRHF |
8 | Paramecium_bursaria_Chlorella_virus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
862955 : 922254
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_AP021889|862955:922254|DBSCAN-SWA 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54 | Leptospira_phage(42.86%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1043468 : 1159895
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_AP021889|1043468:1159895|DBSCAN-SWA 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92 | Leptospira_phage(20.69%) | integrase,tRNA,transposase | attL 1045367:1045398|attR 1050215:1050246 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1190099 : 1200495
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_AP021889|1190099:1200495|DBSCAN-SWA ATTATCCTTTAGAAATCGGCTTGTATTTGATGCGATGCGGTTGCGCTGCATCAGCCCCTTTACGGCGTTTTAGGTCCGCTTCGTAATCCGAGAAGTTACCCTCAAACCACTCAACATGCGAATCACCTTCAAAGGCAAGCATATGTGTGGCAATTCGGTCTAGGAACCAGCGATCGTGGGAGATGACGACTGCACAACCAGCAAATTCAAGCAGGGCTTCTTCAAGCGCGCGCAAAGTTTCAACGTCAAGATCGTTGGTCGGTTCATCCAGTAATAATACATTGCCGCCAGTGCGCAAGGTTTTGGCAAGATGAACACGATTGCGTTCACCTCCCGATAACTGGCCAATTTTCTTCTGTTGGTCGCCGCCACGGAAGTTAAAACGTGAGCAGTAAGCGCGTGAGTTGACTTCGATATTACCAACCATGAAGACTTCATCACCTTCGGAAATTTCTTCCCAGACGGTTTTTTTATCATCTAACGCATCACGGCTTTGGTCAACATAGGAAAGTTGTACCGTGTCGCCAAAGACCACTGAGCCAGAAGTGGGTTGTTCTTGGCCTGTCAGCATTTTAAACAGCGTAGATTTACCGGCACCGTTGGCACCGATAATACCGACGATACCCCCTTGCGGTAGGCGGAAAGAGAGATTGTCAATCAGTAGACGGTCGCCAAAAGATTTTGACATATTGGTGACTTCGATCACTTTTTCACCCAATCGTTCTGCCACCGGAATGAAAATTTCATTGGTTTCATTACGCTTTTGGTGTTCTTGCGAGCTGAGTTCTTCAAAACGCGCCAAGCGCGCTTTAGATTTGGCGTGGCGGCCTTTAACGCCTTGACGAACCCATTCTAATTCGCTTTTGATGGTTTTCATCCGTGCAGCTTCAGATTTCGCTTCACGTTCCAAGCGTTTTTCTTTCTGCTCTAGCCAGCTTGAGTAGTTGCCTTCATAAGGAATCCCTTCGCCACGATCTAACTCAAGAATCCATTCTGCCGCATTGTCTAGGAAGTAACGGTCATGCGTGATAGCCACTACCGTGCCAGGAAACTCAAGTAAAAAGCGCTCTAACCACGCAATCGACTCGGCATCCAAATGGTTGGTCGGCTCGTCCAATAACAGCATGTCGGGTTTATCTAACAGTAGTTTACAAAGCGCAACGCGGCGCTTTTCGCCACCAGAAAGCTTGGATACATCGGCATCCCAAGCAGGTAAGCGCAGTGCATCGGCCGCGATTTCTAGGTTGCGGTCAAGATTGTGGCCGTCTTTGGCTTGGATTAAGTCTTCAATTTCGCCCTGCTTTTTGGCAAGGGCGTCAAAATCGGCATCTGGCTCTGCATAAGCGGCGTAGACGGCATCGAGTTCTGCCAAGGCATTTTTGACATCAAGCACGGCCTCTTCGATGTTACCGCGTACGTCTTTGCTTTCGTCTAGTTGCGGTTCTTGCGGTAGATAGCCAACTTTAATCCCTGGTTGTGGGCGCGCTTCGCCAACGATGTCGGTATCAATGCCGGCCATAATGCGTAGAAGAGTGGATTTACCGGAACCGTTTAAGCCTAAAACGCCAATCTTTGCACCCGGAAAAAACGATAGGGAAATGTCTTTTAAAATGTGTCGGTTCGGTGGGACAACCTTGCCCACACGGTTCATGGTATACACAAATTGTGCCATGGAAAATCCTTAAGTTGAATAACGTACAGTGAGTAAATCGTTGCGCAAGTTTACCGAGAATCGAAAAGCAGTTAAAGCTTCTTGTTTTGGCTTTTTGGCAGAATCGCCAAATTTTGTGCGTTAAATTTGCGGCCTAGTGCAAAAAAAGGGTAAAATTTGCGCTTTGAAAATCGTGGGTTCGTGCTACGTTGCCACGGATTCGATCTACTTTTAAATGGAGTGTTAACCATGTTTACTAAATCCATGACCATTGCTGGCTATGATGATTTGATTGCCGATGCGATTAAAAATGAAGAGAACCGTCAGGAGTCTCACATCGAACTAATCGCTTCTGAAAACTACACCAGCCCTCGTGTAATGGAAGCGCAAGGTTCCTATTTCACCAATAAGTATGCTGAAGGTTATCCCGGCAAACGTTATTACGGTGGTTGTGAGTTTGCAGACATTGTTGAACAGGCCGCGATTGATCGTGCAAAAGAACTATTTGGCGCAGATTACGCTAACGTACAGCCTCATTCTGGCTCGCAAGCAAATGCAGCGGTTTACATGGCATTATGTGAGCCGGCTGATACTGTTTTAGGAATGAGTTTGGCGCATGGTGGTCACTTGACGCACGGTTCGCACGTTAGCTTCTCGGGTAAAATCTATAACGCTGTACAGTACGGTATTGATCCTGTGAGTGGTCAAATTGACTACGATGAAGTTCAAAAACTGGCGGATGAGCATAAGCCTAAAATGATTATCGCCGGTTTCTCTGCGTATTCACAAGTTATTGATTGGTCTAAATTCCGTGCTATCGCCGATTCGGTTGGTGCTTACCTGTTTGTCGATATGGCGCACGTTGCCGGTCTTATTGCTGGTGGTGAATATCCTAACCCAGTTCCGTTTGCCGATGTGGTCACCACGACGACACATAAAACTTTGCGTGGTCCTCGCGGTGGTTTGATTTTGGCGAAAGCGAATCCTGAGATTGAGAAGAAATTAAATTCAGCCATTTTCCCTGGCGGTCAAGGCGGTCCTTTGGTTCACGTGATGGCGGCGAAAGCGGTTGCTTTTAAAGAGTGTCTTGAACCTTCATGGAAAGAGTACTGTGTTAACGTCATTAAAAACGCCAAAGCGATGGCTGAAGTGTTTAAGGCGCGTGGTTGCGATGTGGTTTCTGGTGGGACAGAAAACCACCTTTTCTTGGTCAGTTTGATTGAAAAAGGGTTGACTGGTAAGTTGGTTGATGCCGCTTTGGATGCAGCGCACATCACGATCAACAAAAACTCGGTGCCTAATGATCCGATGTCGCCGTTCGTGACTTCCGGTATTCGTGTTGGTACGGCAGCCGCAACCACTCGCGGCTTTGATGTGGCCGATTGTACAAACTTGGCAACTTGGATGTGTGATGTGATTGACGCTTGTGATCAAGAAAACAATACGTGGGATGAGGTTGTTGTCAGCCGCGTACGCGAGAAAGTTTCTGCTTTGTGCGCGAAAAAACCAGTCTACAAGTAAGGTTTATAGCGCTTGCTGCGACGCCTATGTGACAAAAGGTTCACATGTTTAGCAGTGATGTGATATAAATTCTGCCTACAGAGAAAACCACCAAATCTGGTGGTTTTTTCACATCTAAGCACAATATAAATAAGCATTTGCTTAAGGGTATGAAAGTCGCTCTGAATAAACTTTGGCGAACGCCGTGCATAATCGAGTTTTTGTATCGCAAACGGCATTTGGCTTTTTGAATATTACGATTCAATAGACAAGGGCACAGTGTCCATTTATATTGCGCTTGGGAAAACCCTAATTGATTAATGTTGAGAGATGCCTATGCACTGTCCATTTTGTAATGCGCCTGATACCAAAGTGGTTGACTCGCGTTTGGCAACCGAAGGTGTGCAAGTGCGTAGACGGCGCGAGTGCTTGCAATGCGGCGAGCGTTTCACCACTTATGAATCAGCCGAGTTGTCCTTGCCGCGTGTTATTAAAAGCGACGGTAATCGAGAACGCTTTAATGAAGAAAAAATTCGCAGTGGTTTGATTAAGGCTTTGGAAAAGCGCCCGGTGAAAAGCGAGGCGATTGATAAGGTTGTGAATCGCATTATGAAGCAAGCGATGACTGAGGGTGTGCGCGAGTTGCCATCCAGTACGATTGGCGAATGGTTGATGAATGAATTAAGCTCTTTAGATCAAGTCGCTTATGTGCGTTTTGCTTCAGTGTATCGTTCTTTTCAAGATGTGAATGCTTTTCGTGAAGAGATTGAGCGTTTAATGGTCACGACAACCGCTAAATCTTAGGGTAAAGGAACGAAGGTGACTGTAACCGAGCAAGATAAGATTTTCATGCAACAGGCGCTGGATTTGGCGTTAAAAGGGCGTTATTCGACTAAGCCTAATCCGGCGGTTGGTTGTGTTTTGGTGCGCGACCATGTCGTCCTTGCTGAAGGTTGGCATCAAAAGGCCGGGCAGCCACATGCTGAACGTGTTGCTTTGGCGAATGCCGCCGCGCAAGGGGTTGATGTAAAAGGGGCAACCGCTTATGTCACGCTTGAGCCCTGTTCGCACCATGGGCGCACACCGCCTTGTGCTGACGGTCTAATCGAGGCGAAAGTCTCCCGTGTGGTGATCGGTATGCTCGATCCTAATCCATTGGTGGCAGGCCAAGGTGTGCAACGCTTAGAGGCTGCTGGAATTGAGGTGCTGGTTGGGGTCTTAGCTGAGCAAGCTGAAGCCTTAAATTGTGGGTTTTTGCAACGGATGCGTGATGGCTTGCCATATGTGCGCGTCAAAATCGCAGCCAGTTTGGATGGTCGTACTGCGATGGCAGACGGCACCAGTCAATGGATAACCGGTGCTCAAGCGCGTTTGGAAGTCCATAAAATGCGTGCTCAAGCCGGTGCGGTGATTATTGGAATCGGCACGGTGTTGATGGATGATCCAAGCATGACGGTGCGTTTGACTACACAACAATTGAACGAACTCGGCTTAAGTTCGGAAGGGGTACATCCTTTACGAGTCGTGCTTGATCCGCATTTGAGTATGCCGTTACAGGCTAAAATGCTGCAATTGCCTGGGCGTACAATTTTGATGACCAGTAAAGAATCGGTAGAAAGTAATCCGGCGATGGTTGAGCAGCTTTTAGCACAGCGTGCCGAGATTGTGGCGGTTGCGGCTCAGGATGATCGCTTGGATATAGAATCGATCTTGCACTATCTGGCGGATGAAGAGCAGATTAACGATGTTATGGTGGAAACCGGCGCGGTGGCTGCGGGTGCTTTTGTCGAATCAGGTTATGTAAATGAGATTCACGCTTTCATTGCACCGCTGTTGATGGGGCATCAAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_AP021889|1190099:1200495|1197281_1197743_+|WP_173271642.1|DBSCAN-SWA MKMIEGNLSAQDMKIGFVVTRWNSFIVDHLVKGSVETIERHGGSAENITQVMVPGAFEVPLAVEKMAASGKYDAIVALGAVIQGGTPHFDFVAGEAVKGISQVMLKHGVPVAFGILTVNSIEQAIERSGTKMGNKGEEATLAAIEMVNVLKQI >NZ_AP021889|1190099:1200495|1197742_1198231_+|WP_173271644.1|DBSCAN-SWA MNISDSILPGQGVEIEENEAPLSPRSQARRAAMQALYQWQMTNTEVLKIMQQFSEDGYLEKVDFDFFKDLLYSITGDAEELDALFAEFIDRDLKRLDPVERAILRIGVYELRSKIEIPYRVVINEAVELAKRFGADEGHKFVNGVLDKVAKQLRELEVSVQA >NZ_AP021889|1190099:1200495|1194098_1195250_+|WP_173274254.1|DBSCAN-SWA MQQALDLALKGRYSTKPNPAVGCVLVRDHVVLAEGWHQKAGQPHAERVALANAAAQGVDVKGATAYVTLEPCSHHGRTPPCADGLIEAKVSRVVIGMLDPNPLVAGQGVQRLEAAGIEVLVGVLAEQAEALNCGFLQRMRDGLPYVRVKIAASLDGRTAMADGTSQWITGAQARLEVHKMRAQAGAVIIGIGTVLMDDPSMTVRLTTQQLNELGLSSEGVHPLRVVLDPHLSMPLQAKMLQLPGRTILMTSKESVESNPAMVEQLLAQRAEIVAVAAQDDRLDIESILHYLADEEQINDVMVETGAVAAGAFVESGYVNEIHAFIAPLLMGHQARPMFELPSVQQMADKLSFTIQQMDKLGDDIRLILTAKKTIRSDNHLPSD >NZ_AP021889|1190099:1200495|1191998_1193270_+|WP_173271632.1|DBSCAN-SWA MFTKSMTIAGYDDLIADAIKNEENRQESHIELIASENYTSPRVMEAQGSYFTNKYAEGYPGKRYYGGCEFADIVEQAAIDRAKELFGADYANVQPHSGSQANAAVYMALCEPADTVLGMSLAHGGHLTHGSHVSFSGKIYNAVQYGIDPVSGQIDYDEVQKLADEHKPKMIIAGFSAYSQVIDWSKFRAIADSVGAYLFVDMAHVAGLIAGGEYPNPVPFADVVTTTTHKTLRGPRGGLILAKANPEIEKKLNSAIFPGGQGGPLVHVMAAKAVAFKECLEPSWKEYCVNVIKNAKAMAEVFKARGCDVVSGGTENHLFLVSLIEKGLTGKLVDAALDAAHITINKNSVPNDPMSPFVTSGIRVGTAAATTRGFDVADCTNLATWMCDVIDACDQENNTWDEVVVSRVREKVSALCAKKPVYK >NZ_AP021889|1190099:1200495|1193585_1194053_+|WP_173271635.1|DBSCAN-SWA MHCPFCNAPDTKVVDSRLATEGVQVRRRRECLQCGERFTTYESAELSLPRVIKSDGNRERFNEEKIRSGLIKALEKRPVKSEAIDKVVNRIMKQAMTEGVRELPSSTIGEWLMNELSSLDQVAYVRFASVYRSFQDVNAFREEIERLMVTTTAKS >NZ_AP021889|1190099:1200495|1196049_1197165_+|WP_173271640.1|DBSCAN-SWA MPLNTIEELIEDYKQGKMVILMDDEDRENEGDLLVSAQTVTPEDINFMARYGRGLICLTMTRDRCNQLHLPLMVHNNTDPHGTNFTVSIEAAQGVTTGISAADRAVTVRTAVKAGAGPQDIVTPGHIFPLMAQPGGVLTRAGHTEAGCDLARLSGFEPASVIVEIMNEDGSMARRDDLEAYAAEHQLKIGTIADLIQYRLKNEKTIERVSECKLPTQYGEFRLIGYQDILDQKAHFALVYGKVDTDAPVAVRVHMLDTLCDVFGSQRPECGWSLQAAMQQIVAEGAGAIIVLRKHEDATELLDKIQHYQMKDLGVKIPESSHPDDTKTYGLGAQIIADLGMRKLNVIGSAMKMTALSGFGLEVCQVLEKKG >NZ_AP021889|1190099:1200495|1190099_1191770_-|WP_173271630.1|DBSCAN-SWA MAQFVYTMNRVGKVVPPNRHILKDISLSFFPGAKIGVLGLNGSGKSTLLRIMAGIDTDIVGEARPQPGIKVGYLPQEPQLDESKDVRGNIEEAVLDVKNALAELDAVYAAYAEPDADFDALAKKQGEIEDLIQAKDGHNLDRNLEIAADALRLPAWDADVSKLSGGEKRRVALCKLLLDKPDMLLLDEPTNHLDAESIAWLERFLLEFPGTVVAITHDRYFLDNAAEWILELDRGEGIPYEGNYSSWLEQKEKRLEREAKSEAARMKTIKSELEWVRQGVKGRHAKSKARLARFEELSSQEHQKRNETNEIFIPVAERLGEKVIEVTNMSKSFGDRLLIDNLSFRLPQGGIVGIIGANGAGKSTLFKMLTGQEQPTSGSVVFGDTVQLSYVDQSRDALDDKKTVWEEISEGDEVFMVGNIEVNSRAYCSRFNFRGGDQQKKIGQLSGGERNRVHLAKTLRTGGNVLLLDEPTNDLDVETLRALEEALLEFAGCAVVISHDRWFLDRIATHMLAFEGDSHVEWFEGNFSDYEADLKRRKGADAAQPHRIKYKPISKG >NZ_AP021889|1190099:1200495|1198301_1199339_+|WP_173271647.1|DBSCAN-SWA MEFDLINCYFAPLGLSQSSEQAALDGTDIGIGDDGAVLSVPAGKQLVVVTDTLVSGVHFPENTCAYDVAWKALAVNLSDLAAMAATPFAYSLGLSLPTECATNQDWMADFALGFADLVASTGLSIALIGGDTTRSKVLTLTVSAKGWVDYGQAILRSGAQEGDYIVVSGVLGEGALGLQVALHQIPMGLSAQQKQAALDYLNRPQPQLLLGELLSGVAHSAIDISDGLLQDLGHILKSSNKKQRLLGETKVLGAHIELDRLPLSAGMQALFAENENWAWPLSGGDDYQLCFTISAEALAPLLAVAQQNTIPLSVIGQINDRGKIEASLRGQPFALDAMLAGFQHF >NZ_AP021889|1190099:1200495|1195394_1196048_+|WP_173271637.1|DBSCAN-SWA MFTGIIAAEGSISKIEPRNGDWKVTIHTGKLDMSDVALGDSIAANGICLTAIEFGRDYYVADVSGETLSVTTAAEWQSGTPVNLEKALRLQDRLGGHLVSGHVDGVGRVKSIAQDARSWRYQIEAPLGICKYIAAKGSICINGISLTVNKVEGCVFDVNIVPHTRQETTIKHFQVGTKVNLEVDLLARYLERMLHAPSQEQPTTNITEQFLAENGFK >NZ_AP021889|1190099:1200495|1199424_1200495_-|WP_173271650.1|DBSCAN-SWA MSKYQTDDLRIKNITEVRSPRELHELYPMSDFASSTVYDTRQQIHNILAGRDDRLLVIIGPCSIHDPAAARDYAAQLKGQIETHKEDLLIVMRVYFEKPRTTVGWKGLINDPNLDESFEINKGLGLARKLLCDINNLGVPAATEFLDLISPQYISDLISWGAIGARTTESQGHRELASGLSCPVGFKNGTDGSFRIAVDAIRAANNPHIFMSLTKDGHSAIFETNGNHDCHVILRGGNDGPNYEAPFVAEAVKQLKDANVQSKLMIDCSHANSQKDHNRQMIVAKSIQEQLENGNPEIMGAMVESHLVGGRQDVHPGKQLNYGQSITDACIDWDTSLELLNMLAQGVRSRREKTAR |
10 | Staphylococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1536880 : 1583607
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_AP021889|1536880:1583607|DBSCAN-SWA TTTAAAAATTAAACAGACGTTTTGGCTTGATTAACTGATTCTTCTCATGCCATTCACCGACACCAATAAACACGCCATTATGGTCATAGAAGCGCACTAACCCCCCTTCGGGTTGGGCTAAACGCAACATTCCACCCTGCAAGACATGAGCCGCTTGGGCTTGCGCCAAATCAAGGCGTGGCAAATGGGCCAGAGCAATGTCCAAAGGCTGTAAACACGCTTCTTTTTGCTGCTCAATCTGCTCTAATGTCAACATTGCATCGCCTGATAGGCTGCCGGTTTGCGTGCGATGCAAGGCGGTCAAATGACCAAGGGTACCTAGCGCCTTAGCAATATCTTCACCCAAGGTACGCACGTAGGTGCCTTTCGAACAATGCACATCAAAGACCACCTCGTTAGCGCTAAAGCGAATCAGCTCCAGCGCATAAATGGTGATGGGTCTGGCTGGACGCTCAATTTCAATTCCTTGACGAGCATACCAATACAGCGGCTTCCCCTGATGCTTTAACGCCGAATACATCGGTGGAATTTGCTCAATCTGCCCAACAAAACCAGCCAAACAAGAACGAATAAGGTCGGCATTTAATTCCACTACCGCTGCCGTTTGCACAATCGTGCCTTCGGTGTCGCCGGTATCACTCTGCTCGCCCAGCTTGAGGGTTGCGGTATAGCGCTTGTCGGAATCCAACAAAAGCCCAGACACCTTAGTCGCTTCACCTAAACAGATGGGTAGCAACCCAGTGGCAAAAGGATCCAACGCGCCAGTGTGCCCGGCTTTTTGGGCATTAAAAATCCGTCGCACCTTTTGCAGAACATCATTTGATGAACCACCTGCGGCTTTATTCAGCAGCACAATACCATGCACCGCTTGTTTCGGGGGATTACGATGTTGAGCCATTATTTTTTGTTCAGTGCTTTATTAATCAAATCTTCGATGTACTGAACATTTTCCGGAACAGTATCAAAATAAAAACGTAAATGGGGAACGATGCGTAAATTCAAACGCTTGCCGATTTCCGAACGAAAAAATCCCGTTGCTTTTTCTAAGGCTTGCAAGGTTTCCGCCACTTCTGGATCGCCAGAATTATGACCAATCATTGAAAAGTGGATTTTCGCAACACTCAAATCTTTCGAGATTTGGCATTCTGTTAAAGTCATCCGCTGAAAACGCGGATCTTTCGCCTCTTGCACTAACAACATCGCCAAGGTTTTACGTATTTCCAAAGCAACGCGAGTGGGACGACTAACCGGTGAGTTCGCCATAATTTTTTCCTATCATTTCTGGTTTAGAAAGACAAATGCCCCGTCCTAAGACGAGGCACTGGCCTTCGTTACTGTAAAACAGCAATAAGCTTAGTCAAGCGTACGTTTGACTTCGATGCGCTCAAAGCACTCGATCTGATCGCCAACGCGGACGTCGTTGTAATCTTTAACCCCGATACCGCACTCCATTCCTTGTCGAACTTCGTTAACATCGTCTTTAAAGCGACGCAGTGATTCAAGATGACCTTCATAGATAACCACGTTATCACGCAAAACACGAATCGGGTTATTACGTTTAACCGTACCGTCAATGATCATACAGCCTGCAATAGCACCGATTTTCGGTGCCTTAAAGACATCACGAACATCAGCCACACCAACGATATCTTCGCGGAAATCTGGTGCCAATTTACCTTCAACAGCGCTTTTCACTTCGTCAACGATTTCATAGATAACGCTGTAGTATTTCAAGTTAATACCTTCGTTATCAATGATGCGTTTTGCCGACGCATCCGCTCGGACGTTAAAGCCAACAATCAAGGCCTCAGAAGCCAAGGCCAAGTTCGCATCGGTTTCGGTGATTCCACCCACACCGGTGGCGATAACATTGACTTTCACTTCTTCGTTAGAGAGTTTTGTCAAGGCATCAGAAATGGCTTCAATCGAACCTTGAACATCCGCTTTAAGGATGATGTTAATGTTTTGAATATCGCCTTCTGCCATCTTGTTGAACATATTGTCCAGCTTCGATTTCTGCTGACGCGCAATTTTCAATTCTTTGTGCTTAGCTTGACGATACATCGCTGCTTCACGTGCTTTACGCTCAGTTTCAACGGTAATCATCTCATCACCGGCCACCGGAACACTTGACATACCAAGAATTTCGACCGGAATCGATGGACCCGCTTCTTCAATCACTTCGCCAGTATCACTGATCAACGCACGAACACGACCGTATTCCATACCACAAAGCGCGATATCACCTTTGCGTAAAGTTCCACTCTGTACCAAAACCGTTGCAACCGGGCCACGACCTTTATCAAGGCGGGATTCAATGACCACACCCTTAGCAGGACCTTGCGTCGGCGCTTCCAATTCCAAGATTTCCGCTTGCAATGAAATAGCGTCTAAAAGGTTATCGACACCCATACCGGTTTTTGCCGATACTGGAACAAATTGAACGTCACCGCCCCACTCTTCAGGAACCACTTCTTCCGCTACCAACTCTTGTTTAACACGCTCAGGGTTGGCTGCTTCTTTATCCATTTTGTTAATGGCAACAACAATTCCCACCCCTGAAGCACGTGCGTGTTGAATCGCTTCTTTGGTCTGCGGCATAACACCGTCATCCGCAGCAACAACGATAACAACAACGTCGGTTACCTTAGCACCACGGGCACGCATTGCCGTAAAGGCCGCGTGTCCTGGCGTGTCAATAAAAGTTAAACCACCCATATCGGTATCAACGTGATAGGCACCGATGTGCTGTGTAATGCCACCGGCTTCACCGTGCGCAACTTTTGCTTTACGGATGTAATCCAAAAGTGAGGTTTTACCATGGTCAACGTGCCCCATGATGGTGACAACCGGCGAACGTTTAACCGTAGCACCGTGGTATTCTTGACCTGTGACTTCGTCTTCGATGGTGGTCTCTGTGAACGCGACCGCTTTATGCCCCATCTCACCAACAATCAACATCGCCGTTTCTTGGTCTAGCACCTGATTGATGGTCGCCATAGTGCCAAGTTCCATCATCATATATTTAATGATTTCACCCGACTTAACAGACATTGCATCAGCCAAAGCCGCCAAAGTCATGCTTTCCGACACTTTTACTTCTTTAATAACGGGTGCTGTTGGTTTTTGGAAAGCATGCTGATTATCTTGCTTATGGCGCGAATGACGTTTTTGACCACGACGCATACGCATCTGTCCTTCATCTTCAACCTTAACGCGCTTGCCTTCTTTTTTCTTTTCAACCACTGCGGCTTTCTTGCCACGACCGCCATCAACCACCGCGTGTTTTTCACGGTTTTCTTGATGCTTTTTATCTTTCTTTTTCTTAGTCGCTTTAGAGTGATCTTCTTTGGCAGCTAAAGGCGCAGAATCCACTTTCTTCTCACCGTTTTCGTCAACCGCTTCATCAGTAACCTCATCGGACACGGCAACAACACCTACTTCATTGTCAACATTCACAATTTCAGCCACAGGCGATTCCAACACCACGTCTGGCGCAGCAGCAACGACCGGCTCAACCACTTCTTCTTTAACTTCTTCTGCAACCACTTCGGACTTTTTAACATAAGTGCGTTTTTTGCGTACTTCAACGTTCACTGTACGCTTACCCGTAGAGATGTTTAACGTCTGTTTGCGACGCAAAGTCACTTTATTTGGTGCTTCTTCCGTTGATTCACCATGCAAACTTTTCAGATAACTCAGTAGGGTTCGTTTTTCTTCTTCGGTAATCGAGTCGCTATCACTCTTGCCTTTCACGCCAGATGCGCCCAACTGTTCCACGAGCTTATCAACAGAAAGGTTGAGTGTTTCTGCAAACTTCTTTATTGTAACTTCAGCCATTAACCTATCCCTTGTTATTCAAACCATGGTGCGCGCGCTGCCATAATTAACGCCGCTGCCCGTTCTTCATCAATTTCTAAAATATCGAGCACTTCATCGGTACCCAATTCGGCCAAATCTTCTTGCGATTTCACGCCGTTAGCCGCCAATTTTTTCGCCATGTCCGGTTCCATCCCATCAAGATCCAATAAATCTTGCTCCGGTTCCGCTAAGGCTTGTTTCTCTTCCTCGGCAATTGCCATGGTCAACAAAGCATCTTTTGCACGTTGCTTTAACTCGGCAACGATGTCTTCGTCAAAACCATCAATATCCAGCATTTCTGCAGCAGGAACATAAGCAACTTCCTCCAGTGTTGAGAAGCCTTCTGCGACCAACACTTCAGCCATCTCTTCGTCAACATCCAGATTATTGGTAAACACGTTGACTTGATCTTTAGACTCGATTTCATGCTTTTCTGCCATCGATGTCTGCGTCATGACATTCAAAGTCCAGCCGGTTAATTCCGAAGCCAAACGAATGTTTTGACCGTTCTTACCGATCGCTTGTGATAAAGAGTCGTCTTCAACCGCTAAATCCATCGAATGTTTATCTTCATCGACCATGATCGACGTCACTTCCGCAGGAGCCATCGCATTAATAACGAATTGAGCATCGCTGCCATCCCACAAAATGATATCGATACGCTCACCATTCAACTCGTTCGTGACGGCTTGCACACGACCACCGCGCATCCCAACGCAAGCACCGATAGGGTCCAAACGAGGATCATTAGCACGCACCGCAATCTTGGCACGGAAGCCAACATCACGTGCCGCAGACATAATATCAATCAAATCATCAGCAATTTCTGGCACTTCGATTTTAAACAGCTCAATCAACATCTCATTACAGGCGCGCGACATAATCAATTGCGGTCCACGTGGGCGGAACTCAACTAACTGAAGATAGCCACGAACGCGATCGCCCATACGGAAGGTTTCACGTCCGACTAACTCGCTACGCGGAATCATGGCATCGACGTTATCGCCCATATCCAAAATGACATCGCCGCGATCAATTCGCTTAACCTGACCAGTTAGGATTTCACCAACGCGTTTTTGGTAAACTTCAACCACTTTCTTACGCTCAGCTTCACGCACTTTTTGAATAATGACTTGTTT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42 | Bodo_saltans_virus(11.11%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1652913 : 1676979
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_AP021889|1652913:1676979|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_AP021889|1652913:1676979|1666943_1667294_-|WP_173272483.1|DBSCAN-SWA MQTPDGQLINSFIVSEPASENTEQLLKMIIENVHYKIPNQGVVNVTGLVVWKKALSCLKEPSAISIIPSKVAWQHEDSNGWMSRISASYNGASKEKHWSVRQKSEPLYIENTPEIK >NZ_AP021889|1652913:1676979|1656785_1657307_-|WP_173274283.1|DBSCAN-SWA MAVTSKQEFLTFIIGREQFGVEIQRVQEIRGWERPNPLPNVPPFVKGVVDLRGNIVPIIDLRERFRLKAEYKPTTVVIVVHVLTSQGERTVGLVVDAVSDVKTFDINSLQPPPDTSTDIKAQFIIGLASIESTEQSRAADSAAKVKASRMVVLVNIDRLVNEGLIEEITSDLP >NZ_AP021889|1652913:1676979|1673154_1673484_-|WP_173272493.1|DBSCAN-SWA MIRIDHYWLATEPMDMRAGPDTALARVIAVFGEAKPHHAYLFANKRGNRMKLLVHDGLGIWLCARRLNQGKFHWAELWRGDSVTLSPEQCLALVQGLPWQRLETSLSLS >NZ_AP021889|1652913:1676979|1675968_1676265_-|WP_173272502.1|DBSCAN-SWA MTTKRRTADQWQVLVDQQHHSGLSARQFCQQQKVGYASFCNWRKRLSEKPDESDDSASSESSFLDLSSLISDSRASDSGWNIVLSLGNGVELRLSQNG >NZ_AP021889|1652913:1676979|1652913_1654362_-|WP_173272466.1|protease|DBSCAN-SWA 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24 | uncultured_Mediterranean_phage(25.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1683378 : 1692034
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_AP021889|1683378:1692034|DBSCAN-SWA ATTAGGCTTTTCCGCCTAATCGCTCACGCTGGTAAGATCCGTCTTGCACGTTTTTACACCACTCTTGATTATCCAAATACCATTGCACGGTTTTTTTGATACCACTCTCAAAGGTTTCTTGCGGTTTCCAGCCTAGCTCTCGCTCGATTTTGCTGGCATCAATTGCGTAGCGCATATCGTGTCCTGGGCGATCTTGCACGTACTTAATCAATGCGACATAGCTATCGGCATTACCCGGCTCGCAAGAGTAGGTGTCGATGTTGGGATTGTTTTCGCTAGGAGCAAGTTCTTCCAGAATCGTGCAGATGGTTTTGACCACGTCTAAATTCTGTTTTTCGTTGTGTCCGCCGATGTTGTAGGTTTCTCCTACCTTGCCTTGGGTAGCGACCACAACCAGCGCACGCGCATGATCTTCGACATACAACCAATCGCGGATTTGATTGCCCTTGCCGTACACCGGCAACGGCTTGCCTTCCAGCGCGTTAAGAATCATCAACGGAATGAGTTTTTCCGGGAAATGATACGGGCCGTAGTTATTTGAACAGTTGGTGACCAGTGTTGGCATACCGTATGTTCTTAGCCATGCTCTGACTAAGTGATCAGAACCTGCTTTCGACGCGCTATAAGGCGAGCTAGGCGCATAAGCCGTCGTTTCGGTAAACAGAGGTAATTCTGAATGTTTGTCGTTATGAGATTCCGGATCGAGTCCGGAATGACGGTCGTTAACTTCATCAGGGTGCGGCAGATCGCCGTAAACTTCGTCAGTGGAAATATGATGAAAACGGAAATTGGCTTTTTTATCGCCGTCTAATGCATTCCAGTAAGCGCGCGCTTGTTCCAGCAAGGTATAGGTACCGACGATATTGGTATGAATAAATTCGCCCGGCCCGTCAATCGAACGGTCAACATGGGACTCTGCGGCCAAGTGCATCACAATATCCGGCTGGTGTTGATTGAAAACTCGCTTTAAGCCTTCGGCATCGCAGATATCGACTTGTTCAAAAGCGTAATACACGTTATCGCTGACCGATTTAAGGGACTCAAGGTTTCCGGCATAAGTCAGTTTGTCGACATTGACAACCGAATGTTCAGTGTCATTAATTAGATGTCGTACGACAGCAGAACCGATAAAACCGGCACCGCCAGTGACTAGAATTTTAGAGGGAGTTATTGAATTTTCAGACATGATTCATTGTGTTCTTTTTTAATTCGTTTAGACAAGCTATAAGCGAGTCACGCCAGTAAGGAATCTCTAGCGCCATATCGTTTTTCATTTTGGCTTTATTCATCAGACTATAGTGTGGACGCGTAGCCGGTGTCGGGTAGTCTTTAGTTTCAATCGGTGAAACCTGACACTTTATATCGCTTAATGCAAATATGGCTTTGGCGAAGTCATACCAAGAGCAAACGCCTTCGTTGCTATAGTGGTAAATTGTCACATTGCTTTTACCTTTAAAAGATTGCTTCGCTTCGCTCGCAATGACTTGCAGAATAGCTTGAGCCAAACCCCCAGCATAGGTCGGACTTCCGACTTGATCAAAGATCACATTCAAACTATCCCGCTCTGCACCTAAGCGCAGCATGGTTTTAACAAAGTTATTGCCTAACTCGGAATAAACCCAGCTGGTACGGATAATCACACTTTTCGGGTTAATTGCTTGTATCGCCTGTTCACCTTTCAGCTTGGTAAGCCCATAAACACATTGCGGGTCAACCGAATCACTTTCGACATAAGGTTTATGGTTTTTGCCATTAAAAACATAGTCGGTACTGATATGAATCAGCGTCGAATCTTGTTTCTTGGCGATTTCAGCGAGTTGCTTTACCGCTAGGTGATTAATCTGATCAGCCAATTCCGGTTCGGACTCGGCTTTATCCACGGCCGTATAGGCCGCACAGTTAATGATGCAGTCAAAGTGCTTATCCTGAAAATACGCTTCGATTGAAGATGAATCGGCAAGATCGAGTTCATCACGCCCAACAAAGGTAAAACAATGTTGAATGTTTGATGTTGAATGTTGAGTGACCAGTTTATAGAGCGACTGGCCCAACTGACCGTTTTTTCCGGTGACCAGAATAGATTTTTGATTTTTAATGTTTGATGTTAGATTCATAATGTCTTTTGACTTTTTTTTACAATACTTGTTAACTATTTCTGGAGGCTATCTATTCAGTGAATATTGCCTGTGTTTTAACACTATTACGATCTATATACTCACTATCCGCTAACAAATTTAACCAATAGCCGATTTCTATTGCCTCTTTACTTGCAATTGACATTTTCGCAATGAAGTCTTTTTTACTAATTGCCGCTTGTGCTTCATTCAGGTTAGCACCAATTGAAGTACCCGAACGAAGAAGTTGTTTTGACAAAACATATTCTTTCTTTTCCGTTGTTAAATACTGATTCAATTTAACGACATGCAAAGCAAACTGATAGTTCAATACTAAAACCGCATTATCCGTTTGCAACTTCACGCTTACCCTCGGTACAAATTTTTCTGGTAATCAAACATCGAACATTCAATATCCAGCATCTCTAGCGCTGGTTGCTTTTGATCTTTTTCGGAGAGCTTAAGGAACTCTTTCGGCAGCTGCCAATCAATATTTAAACTCGGGTCGTCAAAGGCTAATCCGCGATCATTTTCCGGCGAATAATAATTATCGACTTTATAAGAAAAAATGGCGGTATCACTTAAGACCACAAAGCCGTGCGCAAAGCCTCTTGGCACAAACAACTGGTGTTTATTTTCGGCACTGAGTTCGGCGGTTACATATTGCCCAAACGTCGGACTGCCCTTGCGGATATCCACAGCAACATCCAGCACCTTGCCTTCGATGACGCGCACCAGTTTCGATTGCGCCGCCGGCGGCAGCTGAAAATGCAATCCGCGCAGCACGCCTTTGGTCGATTTCGACTCATTATCTTGGCAAAAATTGACTTTATAGCCGATGGCTTGCTCAAAGCCTTCACGATGAAAAGTTTCGACAAAATAACCGCGCTCGTCGCCATACACTTTGGATTTACACAAAAATACTTCCGAGATGTGCTGCTTTATATACTCCACGAAATTCCCTCTTACCTTTATTCTTTAAAACTGCCATAAACCTTTGGAGATTCTGACTTTTGTCAGAATGGCGGTGGCGTGAAGTTCTGTGCTTGTGCTTACTATTTAACACGCCCTTCTTCTGCACGCTTAAGCAAATATTGCCCGTATTGATTTGTCTTAAGCGGCTGCGCCAATTCAATCAATTGCGCTTTATTGATATACCCCATTTCAAAAGCGATCTCTTCCAAACAAGCCACTTTGAGTCCTTGACGTTTTTCGATGGTTTCGATAAAAGTCGAGGCTTCCAACAAACTCTCATGGGTGCCGGTATCCAACCACGCAAAGCCGCGTCCCATGGTTTCCAATTTTAAGCGCCCTTCGGCCAAATACATTTGATTAACGGTGGTGATTTCCAACTCGCCGCGGTCAGAAGGCTTTACCTCGGCGGCTTTTTGCAGCACATCGTTTGGATAGAAATACAGACCGGTAACGGCATAGTTCGATTTTGGTACCGCAGGCTTTTCTTCAAGCGAAACCACATTGCCTTGTACATCAAACTCGGCCACACCGTAACGCTTCGGGTCATGCACGTGATACCCAAACACAGTGGCTTTGCTTTCTTTACGCGCATTCTGCACCGCAGAGGCCAAAAGCTTACTCAAATCATGACCATAATAGATGTTATCTCCCAAAATCAGACAAGCGTCATCGTCGCCGACAAACTCTTTGCCCAGTATGAACGCTTGCGCTAATCCCTCCGGTGAAGGCTGCACCACATACTCGAAACGTATGCCCAATTCGGAACCATCTCCCAACAAACGCTGAAAACTGGACTGATCTTCTGGGGTGGTAATAATCAACACCTCTTTAATCCCAGCTAGCATCAACACCGATAATGGGTAATAGATCATCGGCTTGTCATAAAGCGGGACAAGCTGTTTTGAGATGCCACGTGTTAGTGGATAAAGACGTGTACCAGAACCGCCGGCGAGAATAATGCCTTTCATTGCAATCAAACCTTTTTAAAAAACGCGTATCAAACTACCTGATTACGCCTGTAAACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTCAACACTTAATCGTAAGCGTCCGGCAATCACCGGTTGCTAGGTTGCCAATTGTGCGGTAGGAGTTGGTCGATTTGACTGGCTTTATGGGTGGGTAAGCGTTCAAGCACGTCTTTGAGATAGGCGTAAGGATCCAGACCATTGTTTTTAGCTGATTGAATCAAGCTCATAATATTCGCCGCACGTTGACCACTGCGTAGACTGCCGGCAAACAGCCAGTTCTTGCGACCTAACGCCCAAGGTCGGATTTGATTTTCCACCCAGTTATTATCGATGGGCAGGCGGCCATCTCCGAGGTATCGGCTTAAGGCATCCCAACGTTTCAGGCTATAGTGAATCGCTTTTTCCGTTGCCCCACCTTTGGGCACTTTTTCTCGATGGACCTGCAGCCATTTGAGCAGCAAGTCCATGATCGGTTTGGATTTTTGCTGCCGGATTATCTGTCGTTCCTCTGGGGCTAAGGGTTGAATCTCTTTTTCAATGGCGTAAAGTTGCCCCATTAGTTCAATGGCTTGAATGGCAATCGTGCTTTTGCCGCTTTCATGCAGCTCAACGAACTTACGACGGGCATGCGCCATGCAACCGACTTCGATCACGCCTTGCTTAAAACTGGCTTTGTACCCTGAATAGTCATCGCACACCAACAATCC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_AP021889|1683378:1692034|1686546_1687434_-|WP_173272524.1|DBSCAN-SWA MKGIILAGGSGTRLYPLTRGISKQLVPLYDKPMIYYPLSVLMLAGIKEVLIITTPEDQSSFQRLLGDGSELGIRFEYVVQPSPEGLAQAFILGKEFVGDDDACLILGDNIYYGHDLSKLLASAVQNARKESKATVFGYHVHDPKRYGVAEFDVQGNVVSLEEKPAVPKSNYAVTGLYFYPNDVLQKAAEVKPSDRGELEITTVNQMYLAEGRLKLETMGRGFAWLDTGTHESLLEASTFIETIEKRQGLKVACLEEIAFEMGYINKAQLIELAQPLKTNQYGQYLLKRAEEGRVK >NZ_AP021889|1683378:1692034|1687756_1688443_-|WP_173269187.1|transposase|DBSCAN-SWA MYYHFSEGRNGKFAREVLQDWKGLLVCDDYSGYKASFKQGVIEVGCMAHARRKFVELHESGKSTIAIQAIELMGQLYAIEKEIQPLAPEERQIIRQQKSKPIMDLLLKWLQVHREKVPKGGATEKAIHYSLKRWDALSRYLGDGRLPIDNNWVENQIRPWALGRKNWLFAGSLRSGQRAANIMSLIQSAKNNGLDPYAYLKDVLERLPTHKASQIDQLLPHNWQPSNR >NZ_AP021889|1683378:1692034|1689600_1690557_-|WP_173269191.1|transposase|DBSCAN-SWA MNAYPPIKPVKSTNSYRTIGNLAIGDCRTLTDQRIAANAKAIQQKELKIDQLTYELAYLRRLKFSHKSKQISALQMTLLDEVTDADIAAIESELESLKDKTDTAQPKKQPKRQPLPENLPRLEIRHDPESTTCSCGCQLRHIGEDVSEKLDYLPGSSQVERHIRSKWACDACETLVQKPMPPQIIDKGLPTSGLLAHLLIAKYADHLPLYRQAQIFERAGVKLPSSTLAEWVGVCGVQLEPVAQALKDFLLTQPVLHADETPVPMLKPGNKKTHKAYLWAYTNPANAQHKAVCSGQAFLDTWFLQFSYSIGVKSPFAV >NZ_AP021889|1683378:1692034|1684555_1685491_-|WP_173272517.1|DBSCAN-SWA MNLTSNIKNQKSILVTGKNGQLGQSLYKLVTQHSTSNIQHCFTFVGRDELDLADSSSIEAYFQDKHFDCIINCAAYTAVDKAESEPELADQINHLAVKQLAEIAKKQDSTLIHISTDYVFNGKNHKPYVESDSVDPQCVYGLTKLKGEQAIQAINPKSVIIRTSWVYSELGNNFVKTMLRLGAERDSLNVIFDQVGSPTYAGGLAQAILQVIASEAKQSFKGKSNVTIYHYSNEGVCSWYDFAKAIFALSDIKCQVSPIETKDYPTPATRPHYSLMNKAKMKNDMALEIPYWRDSLIACLNELKKNTMNHV >NZ_AP021889|1683378:1692034|1683378_1684563_-|WP_173272515.1|DBSCAN-SWA MSENSITPSKILVTGGAGFIGSAVVRHLINDTEHSVVNVDKLTYAGNLESLKSVSDNVYYAFEQVDICDAEGLKRVFNQHQPDIVMHLAAESHVDRSIDGPGEFIHTNIVGTYTLLEQARAYWNALDGDKKANFRFHHISTDEVYGDLPHPDEVNDRHSGLDPESHNDKHSELPLFTETTAYAPSSPYSASKAGSDHLVRAWLRTYGMPTLVTNCSNNYGPYHFPEKLIPLMILNALEGKPLPVYGKGNQIRDWLYVEDHARALVVVATQGKVGETYNIGGHNEKQNLDVVKTICTILEELAPSENNPNIDTYSCEPGNADSYVALIKYVQDRPGHDMRYAIDASKIERELGWKPQETFESGIKKTVQWYLDNQEWCKNVQDGSYQRERLGGKA >NZ_AP021889|1683378:1692034|1685543_1685855_-|WP_173272519.1|DBSCAN-SWA MKLQTDNAVLVLNYQFALHVVKLNQYLTTEKKEYVLSKQLLRSGTSIGANLNEAQAAISKKDFIAKMSIASKEAIEIGYWLNLLADSEYIDRNSVKTQAIFTE >NZ_AP021889|1683378:1692034|1690480_1692034_-|WP_173269099.1|transposase|DBSCAN-SWA MKTMPNLHQLSADQLRTLAAQLLVQVEEKDQRIAADAKAIQQKELKIDQLTYELAYLRRLKFSHKSEQISALQMTLLDEVTDADIAAIESELDALRDKTDTAQPKKKPKRQPLPEHLPRLDIRHDPESTTCSCGCQLRHIGEDVSEKLDYLPGTFQVERHIRSKWACDTCETLIQKPMPPQIIDKGLPTSGLLAHLLIAKYADHLPLYRQAQIFERAGVKLPSSTLAEWVGVCGVQLEPVAQALKDFLLTQPVLHADETPVPMLKPGNKKTHKAYLWAYTNPANAQHKAVYYHFSEGRNGKFAREVLQDWKGLLVCDDYPGYKASFKQGVSEVGCMAHARRKFVELHESGKSTIAIQAIELMGQLYAIEKEIQPLAPEERQIIRQQKSKPIMDLLLKWLKVHREKVPKGGATEKAIHYSLKRWDALSRYLGDGRLPIDNNWVENQIRPWALGRKNWLFAGSLRSGQRAANIMSLIQSAKNNGLDPYAYLKDVLERLPTHKASQIDQLLPHNWQPSNR >NZ_AP021889|1683378:1692034|1688510_1689672_+|WP_173269189.1|transposase|DBSCAN-SWA MSQKRTYKTYTDEFKKEAVALVTDQGYSVAEAAESLGVRTNLIYKWKEKFEAQANGSALSQDERAELKQLRAENKRLKLEKEILKKASALLAPRHPITFSFMDELIQEGLPVKPVSQVLKLSRSGYYAWKKRPKKAIKTEQLELYRTAKQLFKESRDSLGSRELAKALRKAGFLVSREKARRLMKTLGLVVKQRRAYKITTKRNLTHRVADNLVKMKFNPSAMNQVWAGDITYLKTPEGWLYLSVVMDLYSRRIIGWAVSERMTVELVMQSLQQAYWLRGHPKGVIFHSDRGSQYTSKRFATLLAKQNMTASMGDVGACWDNAVVERFFGSLKHDWLFKAYHPTRESMKKDVADYMRYYNLKRLHTANGDLTPIEYENCKNQVSKKA >NZ_AP021889|1683378:1692034|1685857_1686445_-|WP_173272522.1|DBSCAN-SWA MEYIKQHISEVFLCKSKVYGDERGYFVETFHREGFEQAIGYKVNFCQDNESKSTKGVLRGLHFQLPPAAQSKLVRVIEGKVLDVAVDIRKGSPTFGQYVTAELSAENKHQLFVPRGFAHGFVVLSDTAIFSYKVDNYYSPENDRGLAFDDPSLNIDWQLPKEFLKLSEKDQKQPALEMLDIECSMFDYQKNLYRG |
9 | Enterobacteria_phage(37.5%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2131232 : 2184363
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_AP021889|2131232:2184363|DBSCAN-SWA 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43 | Pseudomonas_phage(18.18%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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