Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP026655 | Arcobacter cryaerophilus strain G13RTA chromosome, complete genome | 0 crisprs | DEDDh,cas3,cas4,csa3 | 0 | 0 | 4 | 0 |
1. NZ_CP026655
Click the left colored region to show detailed information
0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
38664 : 46028
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP026655|38664:46028|DBSCAN-SWA TATGAAATATGCAAATAATGTAACAGAATTAGTAGGAAACACTCCATTAGTAAAACTACAAGATGCAAGTAATGTAAGTGGAGCTACAGTTTTAGGTAAATGTGAATTTATGAATCCAAGCTCAAGTGTAAAAGATAGAATTGGAACAAATATGATAAAAGTTGCTCTTAAAGATGGTCTTATAAATAAAGAATCAACTTTAATAGAACCAACAAGTGGAAATACTGGAATTGCACTTGCAAGTGTTAGTGCAGCTTTAGGATTAAAACTTGTACTTGTAATGCCAGCTTCAATGAGTATTGAAAGAAGAAGACTTCTTCAAGCTTTAGGTGCAAAATTAGTTCTTACTCCTGCTGAAAAAGGGATGAAAGGCGCTATTGAAAAAGCTAATGAGATAAAAAATGAAACTCCAAATTCAATTATCTTACAACAGTTTCAAAATGCTTCTAATCCAGCAATACATAGAGAGACAACAGCGCAAGAGATTTTAAAAGATACAGATGGAAAAATTGATATTTTTATAGCTGGTGTTGGAACAGGTGGAACTTTAACAGGTGTTGGTGAAGTTTTAAAAGCACATAACCCAAATATAAAAATAATTGCAGTTGAGCCAGAAGCATCTCCTGTATTAAGTGGAGGTAACCCAGGACCACATAAGATTCAAGGAATTGGGGCTGGATTTGTACCTGACGTTTTAAATACAAAAATTTATGATGAGGTAATAAAAATAGCAAATGATGATGCAATTGAAAGCTCAAGAGAGTTAGCAAGAACAGAAGGACTTTTAGTAGGAGTATCTTCAGGATCAAATGCCCTTGCAGCAAAAATAGTTGCTTCAAGACCAGAAAACAAAGGTAAAATAATAGTAACGATTCTTTGTGATACAGGTGAGAGATATTTAAGCTCTGGTTTATATGACTATATAGAAGAATAATTCTTCTATATGGCTTGAATTTAGGAAATTTATGCACGAAAAACCATATAGGTCGGTTGTTAAAACAATATCTTGGCGAACAGTTGGAACATTAGATACTATAATAGTATCTTACTTTGTAACTGGAAATTTAGTTATGGCAGCTTCAATTGGATCAATTGAAGTTATTACAAAAATGATTTTATACTATTTTCATGAAAGAGCTTGGAATAGATTAAAATTTGGAACTGTAAAACAAGTAGAAAACGATTATCAAATTTAAGGTATTTTATGAGTATAGAAATAGTAAAAAATATTGAAGAAAAAATTTTATCTTTAAATACAACTGATTTAATCAAATATATATTAGAAAATTACAAAAATGTAGCATTTAGTTCAAGTTTAGGTGCTGAAGATCAAGTTTTAACAGATATGATATTTAAAGTAAATAAAAATAGTAGAGTATTTACTCTTGATACTGGAAGATTACATAGCGAAACTTACAGAGTTTTAGATGAGACAAATTTAAAATATGGTGTAAAAATAGAAGTTTTTTTCCCAAAATTTGAAGAAGTAGAAAACTTATATAAAACTCAAGGTGTAAATGGTCACTTTGAAAGTATTGATAATAGAAAAAATTGTTGCAATATTAGAAAAATAGAGCCTTTAAAAAGAGCTTTGAGAAATGTTGATATTTGGATTACAGGGCTTAGAGCATCTCAAAGTATTACAAGAGAAACTATGCCAATAATTGAGTGGGATGAAAATTTTAAAGTTATAAAACTAAATCCACTTATAAACTGGAGCGAAGATGATGTTTGGAATTATATAAAAGAGAATAAAGTTCCATACAATAAACTACACGATAATGGCTTTCCAAGTATTGGTTGTGAACCTTGTACAAGAACTATTAAAGATGGTGAGGATATAAGAGCTGGAAGATGGTGGTGGGAAGACCCTAGTCATAAAGAGTGTGGTCTTCATAAGAAATAGTAGAAGTTTTTCCAAAAAGGTATTTTATATACTCATTTGGAAAATCAAAATATATTGCCGTAAGGCAATTCCACTGCTTTAGCACGGGACACTTTGTTTTTTTAGGAAAAAGATTTTTTATATAAATTTCGTTAAGAAAATGAAACTGTTTGAAGAAAACTTTAGTTTGCAAGTTTTTCATTTTTAGAAATTTATTGAAAAAATCCCTAAAAAGGCAACCGTGTTCCGATTTTGCATACTTTTTTAAAAAGTATGAGAAGAAAAAAAAGAGCTGAGGCTAAAGCCTCGGTTCCAAAGTACACAAATTAAAGAGGAGAAAATAGATGTTAGATACAAAACAACTAACACATTTAAAACAACTAGAAGCTGAATCAATTCATATAATTAGAGAGGTTGTTGCAGAGTTTGACAATCCTGTTATGATGTACTCTGTTGGAAAAGATTCAGCTGTAATGCTTCATTTAGCACTAAAAGCATTTGCTCCTGCAAAATTACCATTTCCACTTTTACATGTGGATACTTTATGGAAATTTAAAGAGATGATTGCTTTTAGAGATAAAAGAGCAAAAGAGGAAGGATTTGAACTTTTGGTTCACACAAATCCTGAAGGTATTGAGATGAATATTAGCCCTTTTACTCACGGTTCAGCTGTTCATACAGATATTATGAAGACTCAAGGACTAAAACAAGCGCTAAATAAATATAAATTTGATGCTGTTTTTGGAGGAGCTAGAAGGGATGAAGAAAAATCTCGTGCAAAAGAGAGAATCTACTCTTTTAGAGATAAAAATCACAGATGGGATCCAAAAAACCAAAGACCAGAACTTTGGAATATCTACAATGCAAGAGTTCATAAAGATGAAAGTATTAGAGTTTTCCCACTTTCAAATTGGACAGAACTTGATATTTGGCAATATATCTATTTAGAGCAAATTCCAATAGTTCCTCTATATTTTGCAGCTAAAAGACCAGTTGTTGAAAAAGATGGTGTAAAAATCATGGTTGATGATGAAAGAATGCCAATAGGTCCAGATGATGTTATAAAAGAAGAAATGGTTAGATTCAGAACTTTAGGATGTTATCCTTTAACGGGTGCTGTAAATTCAACTGCAACAACTCTTGAAGAGATAATAAAAGAGATGCTTCTAAGCCGTACAAGTGAGAGACAAGGAAGAGTTATAGACAATGATAGTGCTGGGTCTATGGAGAAGAAAAAAATAGAAGGGTATTTTTAAAATGGAAAAAATTGATGATATAAAAGCTTATTTAAAAGAGCATGAGAATAAACAACTTCTTAGATTTATAACTTGTGGAAATGTTGATGATGGAAAATCTACTTTAATTGGAAGATTACTTCATGATAGCAAAGGGATTTTTGAAGATCAGCTTGAAAATATAAAAAAAGATAGTAAAAAAAATAATAGTACAGACAATGAGTTTGATTTATCACTTTTAGTGGATGGGTTACAAAGTGAGAGAGAGCAAGGTATCACTATAGATGTTGCATATAGATACTTTACAACTCCAAAAAGAAAGTTTATTATTGCTGATACTCCAGGTCATGAACAATATACTAGAAATATGGCAACGGGAGCTAGTACAGCAAACTTAGCAATTATTTTAATAGATGCTAGATATGGAGTTCAAACTCAAACGAAAAGACACTCTTTTATAAATAAGTTATTAGGAATTAAACATATAGTTGTAGCTGTTAATAAAATGGATTTAATGGATTTTAGAGAAGATGTTTTTAATAAAATTAAAGAGGATTATCTTAAATTTGCAAAAGAGTTAGGTCTTTCTAGTAATATAACTTTAATTCCATTATCTGCTTTAAATGGAGATAATGTTGTTGAAAGAAGCTCGAAATCTCCTTGGTATAATGGTGAAACATTAATAGAACATTTAGAAAATGTACAAATTGATAGCGATAGAGATTTAACACACTTTAGATTCCCAGTTCAATATGTAAATAGAGCTAACCTTGATTTTAGAGGATTTTGTGGAACAGTTGCTAGTGGAGTTATAAAAGTTGGTGATGAAATTACAGTTTTACCATCTAAAAAAAGCTCAAAAGTAAGAGAGATTGTAACTTATGATGGAAATTTGCCTTATGCATACGCACAACAAGCAATTACTTTAACTTTAGAAGATGAAATAGATATTAGTCGTGGAGATGTGATTGTAAAAAGTGATGAACAAGCTGATGAGGCAAACAATTTTGATGTAGATATTGTATGGTTAAGTGAAGATCCACTAATAAAAGGAAAACAATATTTTATTAAAAGAGCAACAACTACAACAGTTGGAACTATTAGTCAATTTTATTATAAAACAGATGTAAACACATTGGAAAGAAGTGCAACAAATACTCTAAACTTAAATGAGATAGCAAGAGCAAAACTTGATTTAGAGCAAATAATTGCGTACGATACTTATGATAAAATAAAAACAATGGGAAGCTTTATAATAATAGATAGAGTTACAAACAACACTGTTGGTGCTGGTATGATTAGATCAAAATCAAGTGATCAAAGTAAAAAAGATAGCTCTTATAGTGCTTTTGAGATTGAGTTTAATGCTCTTGTGCGAAAACATTTTCCACACTGGGAGTGCAAAGAGATTTTTTAATGGAGTTGAAATGTCAATAAATATAAATATTGAAAAATTAAAAAAAGATATAACTAGTGAAGATATTTTGGCTTCACTATTTTATTATGCTGTTTTTGGAGAAAAAATATCACAAAATGATTTAGAGAGATTTAAGTGGCATGGAATTTATGCAAAAGATGAAAAACAAACAAGTTTTTCTCTTAAAATTCCTCTAAATTTAGGAGAGCTAAATTTAGAACAGCTAGAGTCAATATTAGATATTTTAGAGACTTTTTCACTATTAAAAATATCTTTTAAAGATGGTCAAAAAATAGAGTTTGATAGTTTAAATTTAAGAGATATTCCAGAGATTTTTAATATATTAAATAAAGTAGGGCTATCAAGTTTTTTTGAGTCAAGTCATAGTATAAAAAAAGTTTTGACATGTCCTGTAAATGGACTAGATACTACACAAATCTTTGATGTAGAAGATTTAGCAAAAAAATTAAATGAGAGTTTTGTTGAAAATAAAAATTTCTTTAATCTTCCAAATAAATTGCAATTTGCAATAAGTGGTTATCGTGAAGGTTGTGATGCTGGATTTACACCAGATGTTAGTTTTAATGCTTTTAAAAATAACAAAGATAAAATAGTTTTTGATTTAAAAATTTTGGATAAGGTTGTAGCTCAAATAAGTAGTTCTCAGATAATAAAAACAGCAAGAGTAATAGCTAGCGTATATAGAGATTTTGGGAATAGAGAAAAAAATAGCAATTTTAAAGAGTTTATAGAAGAGTTTACAATTGATAGTTTTTGTGATATCTTAAGTTCAAATTTGGATATCAAAATAGATAATAATCAAGAGATAAAAATATTAAAAGAACCAAAGAAACCTAGAATGGGAATAAATAAAAGTTCAAAAGATGGTTACTCTTTTATAGGACTAAAAAGCATAAAAAAAGAGTTCACTAAAGATGATTTAAAAAATATAATAGAAAATATGAAAAAATATAGTACAACAAAGTTAAAAATTACTCATAAATCGAATATTATAATCTTAGATGTACCAAGTCAAAATAGTGATAATCTAGTAAACTCTCTTAAAAATAGCGGATTAGTTTTAGAATAATATAAATAGTTGAAGATATAAACTATTTATAACTTCTAATAATCAAAAAGCTGATAATTGATAAAAAAGTGATACTAAAAGCTATCACAAAAAATCCATTATTATCAAAATTTAGAGCAATAGATGATATTAAAGCACCCAATCCAAACTGTAAAACTCCAATAACACCACTAGCAACTCCAGCATTTTTTGAAAAATGCTCAATTGCTAAAGACATACAATTTCCAAAAATGAATGCCATCATACTCATATATGAAGCTATTATAATAACTGTTAAAATCAAGTTCATATCTTTATGAATTAATAAAAATATAATACCAACACAAAATTGAATTAATGTTGCATATTTTGCAATAATTTTAGCTTCATAAGTTTTTAGAAGTTTAACATTTACATTTATCATAGCTATTAAGATAATAAAATTTATACCAAAGAATAGTGGAAAATAGTCTGTTTTAATACCAAAATATTCAATATAAATATATGATGTTTTTGCAATAATAATAAAAAAAGCACCAAAACTAATAGCAAGTACCAACATAGCTTTCATGGCTTTTTTATGAGTTAAAACAAGCTTGTATGATTCAATAATATTTTGTTTTGTATATGTAAAACTCTCTGGTAAATCTTTATAAATAAAAAATGCAACAATTAGTGCATAAATTGTTAAAAAGACAAAAATACCTTCCCATGGAAAAAAGTGAATTATAGCAGCACCAAATACAGGAGCTAAAAGAGGAGCTAAACTTCTAACCATTCCAATAAGTGAAAAAACTTTTGCTGCTTCTTGTCCGCTAAATCTATCTCTAACAGCAGCAGTTGCATTAACAACTGTAATTCCACCAAAAAATGCTTCTAAAAATCTATAAATCCATAATTCATAAATAGATGAACTAAAAATGATTAAGAAACTAAAAAGGGCATATCCTAAAAGTCCAACAATAGAGCCAACTCTTCTTCCATATCTATCAGAAATTGGACCACCAAAAATTTGTCCAATAGAAAATCCTATTAAAAATATAGATAAAGATAGCTCTACTTTGTGGATATTTACATCAAAATATTTTGCAATTTCTGGGATTGATGGTAAATATGTATCAACTCCCATTGGAGCTACTGAAGATAAAATAGATATAAGAATAATTAAATATAGATGATTAATAGATTTTCGCATAAAAACTCATTTGTAAAATATTATAAATTTTTTTGATTTTAAAGATTAGAAATTAAAAAATTGATAGTAAAATTTTAGTTAAAAGAGGATAAAAATCCTCTTTTATAGATTTTATAGGATATAGACCTATTTTTGCATACTGTTTAGCATCCATAAATCTTTTTCAAGTTTTGCAACTTTTTCATCTGCAAATGCTTCAGTTCCTTTGTCATCTTCTTCACTAGCAGCAGCACTTAATTTTTTGAAAGATTTTAAAAGGTATTCAAAATCAGCAGTTATTTTTTCTACTATCTCTCTTGATTTAAAGCTATCACCTTTTTCAGTCTCTATTTTTGTAGCTTTACTTAACTCTTCAATAGTTAAATATGGTTTATCACCTAAGATAATTGTTCTTTCTGCCATATCATCAAAAAGAACTGACATCTCATTATAAAGTCCTTCTGTATAAGCATGAACTGGGTGAAAATCCATACCTTTTACATTCCAATGATAATTATGAACTTTTATATACAAAGCATGCGCATCTGCTTGAATTTGTTTTAACTGTTTAATTACTTTTGACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP026655|38664:46028|39867_40569_+|WP_164468906.1|DBSCAN-SWA MSIEIVKNIEEKILSLNTTDLIKYILENYKNVAFSSSLGAEDQVLTDMIFKVNKNSRVFTLDTGRLHSETYRVLDETNLKYGVKIEVFFPKFEEVENLYKTQGVNGHFESIDNRKNCCNIRKIEPLKRALRNVDIWITGLRASQSITRETMPIIEWDENFKVIKLNPLINWSEDDVWNYIKENKVPYNKLHDNGFPSIGCEPCTRTIKDGEDIRAGRWWWEDPSHKECGLHKK >NZ_CP026655|38664:46028|41805_43200_+|WP_164468907.1|DBSCAN-SWA MEKIDDIKAYLKEHENKQLLRFITCGNVDDGKSTLIGRLLHDSKGIFEDQLENIKKDSKKNNSTDNEFDLSLLVDGLQSEREQGITIDVAYRYFTTPKRKFIIADTPGHEQYTRNMATGASTANLAIILIDARYGVQTQTKRHSFINKLLGIKHIVVAVNKMDLMDFREDVFNKIKEDYLKFAKELGLSSNITLIPLSALNGDNVVERSSKSPWYNGETLIEHLENVQIDSDRDLTHFRFPVQYVNRANLDFRGFCGTVASGVIKVGDEITVLPSKKSSKVREIVTYDGNLPYAYAQQAITLTLEDEIDISRGDVIVKSDEQADEANNFDVDIVWLSEDPLIKGKQYFIKRATTTTVGTISQFYYKTDVNTLERSATNTLNLNEIARAKLDLEQIIAYDTYDKIKTMGSFIIIDRVTNNTVGAGMIRSKSSDQSKKDSSYSAFEIEFNALVRKHFPHWECKEIF >NZ_CP026655|38664:46028|43210_44290_+|WP_164468908.1|DBSCAN-SWA MSININIEKLKKDITSEDILASLFYYAVFGEKISQNDLERFKWHGIYAKDEKQTSFSLKIPLNLGELNLEQLESILDILETFSLLKISFKDGQKIEFDSLNLRDIPEIFNILNKVGLSSFFESSHSIKKVLTCPVNGLDTTQIFDVEDLAKKLNESFVENKNFFNLPNKLQFAISGYREGCDAGFTPDVSFNAFKNNKDKIVFDLKILDKVVAQISSSQIIKTARVIASVYRDFGNREKNSNFKEFIEEFTIDSFCDILSSNLDIKIDNNQEIKILKEPKKPRMGINKSSKDGYSFIGLKSIKKEFTKDDLKNIIENMKKYSTTKLKITHKSNIIILDVPSQNSDNLVNSLKNSGLVLE >NZ_CP026655|38664:46028|38664_39597_+|WP_164468905.1|DBSCAN-SWA MKYANNVTELVGNTPLVKLQDASNVSGATVLGKCEFMNPSSSVKDRIGTNMIKVALKDGLINKESTLIEPTSGNTGIALASVSAALGLKLVLVMPASMSIERRRLLQALGAKLVLTPAEKGMKGAIEKANEIKNETPNSIILQQFQNASNPAIHRETTAQEILKDTDGKIDIFIAGVGTGGTLTGVGEVLKAHNPNIKIIAVEPEASPVLSGGNPGPHKIQGIGAGFVPDVLNTKIYDEVIKIANDDAIESSRELARTEGLLVGVSSGSNALAAKIVASRPENKGKIIVTILCDTGERYLSSGLYDYIEE >NZ_CP026655|38664:46028|40892_41804_+|WP_066345995.1|DBSCAN-SWA MLDTKQLTHLKQLEAESIHIIREVVAEFDNPVMMYSVGKDSAVMLHLALKAFAPAKLPFPLLHVDTLWKFKEMIAFRDKRAKEEGFELLVHTNPEGIEMNISPFTHGSAVHTDIMKTQGLKQALNKYKFDAVFGGARRDEEKSRAKERIYSFRDKNHRWDPKNQRPELWNIYNARVHKDESIRVFPLSNWTELDIWQYIYLEQIPIVPLYFAAKRPVVEKDGVKIMVDDERMPIGPDDVIKEEMVRFRTLGCYPLTGAVNSTATTLEEIIKEMLLSRTSERQGRVIDNDSAGSMEKKKIEGYF >NZ_CP026655|38664:46028|39628_39859_+|WP_024775753.1|DBSCAN-SWA MHEKPYRSVVKTISWRTVGTLDTIIVSYFVTGNLVMAASIGSIEVITKMILYYFHERAWNRLKFGTVKQVENDYQI >NZ_CP026655|38664:46028|45590_46028_-|WP_066152977.1|DBSCAN-SWA MSKVIKQLKQIQADAHALYIKVHNYHWNVKGMDFHPVHAYTEGLYNEMSVLFDDMAERTIILGDKPYLTIEELSKATKIETEKGDSFKSREIVEKITADFEYLLKSFKKLSAAASEEDDKGTEAFADEKVAKLEKDLWMLNSMQK >NZ_CP026655|38664:46028|44312_45464_-|WP_164468909.1|DBSCAN-SWA MRKSINHLYLIILISILSSVAPMGVDTYLPSIPEIAKYFDVNIHKVELSLSIFLIGFSIGQIFGGPISDRYGRRVGSIVGLLGYALFSFLIIFSSSIYELWIYRFLEAFFGGITVVNATAAVRDRFSGQEAAKVFSLIGMVRSLAPLLAPVFGAAIIHFFPWEGIFVFLTIYALIVAFFIYKDLPESFTYTKQNIIESYKLVLTHKKAMKAMLVLAISFGAFFIIIAKTSYIYIEYFGIKTDYFPLFFGINFIILIAMINVNVKLLKTYEAKIIAKYATLIQFCVGIIFLLIHKDMNLILTVIIIASYMSMMAFIFGNCMSLAIEHFSKNAGVASGVIGVLQFGLGALISSIALNFDNNGFFVIAFSITFLSIISFLIIRSYK |
8 | Streptococcus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DBSCAN-SWA_2 |
199819 : 206753
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP026655|199819:206753|DBSCAN-SWA ATCATTTAAATTGTCCTAATAGTCTTGTATCACTCTCAAATAGAGATCTTAAATCCCCAATACTATGAATTAGCATAGCAAATCTTTCTATTCCTAAACCAAATGCATAACCTGATTTATCTTTATATCCAACAGCATCAAAAACATTTTGATCTACAACTCCACATCCTAAAACTTCTAGCCATCCTGTTTGTGAACATACACGGCAACCACTTCCTTTGCAAAAAACACATGAAATATCAACTTCAGCAGAAGGTTCTGTAAATGGGAAGTATGAAGGTCTAAATCTAACTTCAACTTCTCCAAACATGTGTTGTAAAAATTCAACTAAAACATGTTTTAAATTTGCAAATGAGATTTTATCTGCTTCATCTACAACTAAAGCTTCAATTTGATGAAACATTGGAGTGTGAGTGATATCAAAATCTCTTCTAAAAACAGTTCCTGGAGCAATCATTCTTATAGGAGCTTTTTGACTTAGCATTGTTCTTATTTGAACAGGAGAAGTATGTGTTCTTAAAAGTGTATAATCTTTGTTGTAAAAAGTATCTGCCATATCTCGTGCTGGATGATATTCAGGTAGGTTTAGTGCTTGAAAATTATGAAAATCATCTTCTACTAGTGGACCTTCTTCAACCGTAAAATTAAGGTTTAAAAAGTAGTTAATAATTCTATTCATAGTCTCTGCAACTGGGTGAGAAGCACCACAACTAAGTTCGTTATTAAACTTTGTAACATCAATTTTTTCAAATTTTAATTTTTTATCTAAAGCAATTGCTTCTAGTTCTACTTTTTTGCTATCTAAAGCTCTTGTTATTTCATCTTTTTGTCTATTTAGATTTTCTGCAAATGACTTTTTATCAACAGCTGGAATATCCTTCATTTTTGCAAATTCTATAGTCAAAACTCCCTTCTTACCAAGGGTATCAACTCTTAAACTCTCCAGTTCTTCAAGTGTTGAAGCAGATTCAATTTTCTTTATCCAAAGTTCCAATTTTTATTCCTAATCTCTAATTTATTTTTTACAAAATATTTATTTATAATCTCTCAAAGTTGCGATTATACCTAATTTTTTATTAGAGTTTGGTTATAATTTATTATACAAAAATCAAGGAGAAAATATGTGCATTTTTTGCAAAATTGTAAATAAAGAGATACCTAGCAATATTGTATTAGAAGATGATAATTTTTTAGCTTTTCATGATATAAATCCTACAAGAAAGATTCATGTTTTAGTAATTCCAAAGTCACATTATGATTCATTTGAAGATACTCCATCTGATATTATGTCTGATTTAAGTAGTTTTATAAAAAAAGTTACAAAAGAGTTAAAAATAGATAAAAGTGGATATAGAATGATTACAAATATTGGTAATGACGGTGGGCAAGAGGTACCACACTTACATTTTCATTTAATCGGTGGTGAAAAAGTTGGAAGATTAGTTAGGGACAAAAACGATTTATAAGATAAACTAAAAAGTTTATCTTATTTATTACTCAGAGAAAGACCCCAAATTCATAATTTTTTGATACTTTTTCTCTTGTCTCTCTTGCGGAGTTAGTTTTTTAAGCTCTTCAACCGAGTTTAAAAAATACTCTTTTAAAGCCATATAAGCTTCATCTTTATTTCTATGAGCACCAATTAGAGGCTCATTTATAACATCATCTATTAGATTTTGTTGCTTTAGATTTTCAGCTGTAATTTTAAGTGCTTGTGCTGCTGTTTCAACTTTTGATGGGTCATTCCATAAAATAGCACTACAACCTTCAGGTGATATAACAGCATATACAGAATATCTCATCATGGCAAGCTTATCAGCAATAGATATAGCTAAAGCTCCACCACTACCACCTTCTCCAATTACAACTGAAACTGTTGGAGTTGTAAGATTTGCAAATTCATAAAGATTTTTTGCAATTGCTTCACTTTGATTTCTCTCTTCAGCTCCAAGCCCTGGATATGCACCTGGAGTGTCAACTAACATAAGAATCGGAATTTGAAATTTTTCTGCTATTTGTGCAGCTCTTAAAGCTTTTCTATAACCTTCAGGACTAGGCATTCCAAAGTTTCTTTTTAGTTTCTCTTTTGTTCCTCGACCCTTTTGCTCACCAATTACTAAAGTTTTTTGATTTCCAATAAAACCTAAATAACAAACAATTGCATTATCATCTACAAAGTGTCTATCTCCATGAATTTCGTAAGCATTTGATAAAATAGCATTTATATAATCAAGTGCATAAGGTCGATCTGGATGACGTGCAAGTTGAAGTTTTTGATAATCATTTAAATTTTTAAAAGTTTTTTCAACTTCTTTTTCAAGTTTTTTATTTAATATTTCAACAGCAGCTTCATCCGATTTTGTTTTTGCAATTATTATATCTTCTTCAATTTTCTTTATTTTTTCTTCAAATTCTAAGTAAGTAGCCAATATTTTTCCTTAATAAAAAGGGTAGCAATACCCTTTAAGGTTTAGATTTATTTTGTAAATTTTTTAAAAATTACTGAACCGTTTGTTCCACCAAAACCAAAGTTATTTGACATAACAGTTGTTAAATCAACTTTTCTAGCAACATTTGGAACAACATCCAAATCACATTCTGGATCTTGGTTTTCAACATTTATTGTAGGAGGAATAACACCTTCATTTAAAGCTTTAATAGCCATAATAGCTTCAATAGCTCCAGCAGCACCTAAACAGTGACCAATTTGACCCTTTGTAGATGATACAGGAGGGCAGTTATCTTTTCCATTAAAAAGTTCTTTAATAGCAGCTGTCTCATTTTTATCTCCAACTGGAGTTGAAGTTCCATGAGTATTTATATAGTCAATTTTTGGATACTCTCCAGTTAACTCTTTTGCCATTTCAAATGCAGCTCTCATAGCTCTTAAAGGACCATCTATTACAGGTGAAGTGATATGATTTGCATCACCACTCTCTCCAAAACCAATAATCTCACAATATATTTTTGCATTTCTAGCTATTGCACTACCAAGAGTTTCAAGAACTAAAGCGCCAGCTCCTTCACCCATTACAAATCCATCTCTATCTATATCAAAAGGTCTTGAAGATTTTTTAGGGTCATCATTTCTAGTAGATAGCGCTTTCATAGCGGCGAAACCACCAACACCAGCTCCACAAATAGCACTTTCAGCCCCAACAACTAAAATTCTATCAGCTCCACCTAAAACAATTGTTTTCATAGCATCATTTAATGCATGAGTTGAAGCAGCACAAGCAGTAACATGGCTTAAAGATGGACCTTTTAAATTATGTTCAATAGAGATAAACCCACTTAGCATATTTGCTAAAGATGATGGTATAAAAAATGGAGATATTTTTCTTGAACCTTTTGTGTCACAAATTGTAGAATTTTTTTGAATTGTACTTAATCCACCAATTCCAGAACCTGAAATTATTCCAAATCTATTTGCTATTGAATCATCTACTTTTTTATTTTCACTTGTAACAAAACCACTATCAATCATAGCTTCCAAAGCGGCTTTTATACCTAATTGAATAAATCTATCAGCTTTTTTAACTTCTTTTTTATCCATTACAGTTTCAGGATCAAAATTTTTTACTTCACCTGCAATTTGAACTGAAAAATCAGTTGTATCAAACAGTGTAATTTTATCAATTCCGCAAACACCGTTTACAACGGCATCAAAAGATTCGTTTACACTATGTCCAGTAGAATTTATAGTACCTAATCCTGTAATAACAACTCTTTTCATCTAATAATGCTCCAATATTTTATTTAAACTATTCAATTTTTAAATTAAAAAACTCAATAATAAAAACTATAGATAAAAGAGTAACTCTTTTATCTAAAAAAAGAAAAAACTATTTGTTGTTTTCAATGTATGATATTGCATCACCAACAGTTAATATTTTTTCAGCTTCTTCATCAGGGATTTCGATATCAAATTTCTCTTCTAAAGCCATTACAAGCTCCACAACATCTAGTGAATCTGCTCCTAAGTCTTCAATGAACTTTGAATCTTCTTTTACTTCAGCTGGATCGCAATCTAATTGATCAACAACAACAGCTTTTACATCATCTAATAATGCCATTTTAATTCCTTTAATAAAATTGTCCCAAAATTATAGCAAAAAAGTTTTAAAAACTTTTTAATTTAAATAAATTATAGTTTAAAGATAAACTTTAAACGTATAATCCACCATTCACTTTTAGAATTTCACCTGTGATATATGATGAGTGATCGCTTAGTAAAAATGCTACTGCATCTGCAATTTCACTTGGATTTCCAAATCTTGAAAGAGGGATATTTTTTTCATAATCAGCTTTTACTTCAGCTTTTAATAAATCTGTCATATCTGTTTGAATAAACCCTGGAGTTATTGCATTGTATCTAATATTTCTACTAGCGGCTTCTTTTGCAAATGATTTTGTCATAGCATTTAATCCACCTTTTGAAGCTGAATAGTTTGCTTGACCAGGATTTCCCATCTCTCCAACAATTGAAGATATATTTACAACAGCTCCAAAACCTTTTTTACCTCTTTGTTTGAAAAACTCTCTACAACCTATAAATGCTGAAGTAAGATTCGCATCAATTACAGATGTAAAATCTTCAACACTCATTTTAAGAGCTAGTTTATCTTTTGTTATTCCAGCATTATTTACCAAATATGCCAACTCTCCATCACTTTCAACAATTGTTTTAATAGCAGCTACGAACTGTTCTTCTATTGATACATCAGCTTTTATAATTGCTGCTGTTCCCCCAGCTTTTTCAATTTGTTCTTTTATAGCTTCTGCTTCTTCAATTTTACTTCTATAATTTATCCAAACTTTTAAACCATAGCTTGCTAAATTCTTTGCAATTTCTGCACCTATACCTTTGCTAGCTCCTGTTATTAAAACATTTTTTCCACTAAATTTCATATTTTTATCCTTTTATTTTTTTGCATAAAGATTTATTATATCAATATTTTGATTATATTAAACTCCTCTTTTATTATTCCAAATTCTAATATGTAATCTATCAGAGTATTTAAATCCATATTTAATTGCTAGATTTACAACTTTTTCAGAGTTTATATCAATAGTTTCAGAACTATCACCAAGTGGCATTAAATAAACCTCACATTGTGGAATATTTTTTAATATATCTTCAATTTCAACTATTGCATTTTCTAAAAAATCATTACCAATTACAAATTTAAGATAAGACTCTTTTGTGTTTTCCAAAATTTTTGTTAATGTTGATTTATTAACTCTTTTTTTTAAAGGTTCTAAAGAGTTGCTTAATTTTACACTCATTGAAAATAGAATATTTTTTTGATACTCCTCTTGAAAATCTATATTTAAAGAGGCATTTGTTTCGATTGTTAGCTTATGATTTTTATTAATATAATGTTTTATTAAATTTTGAAACTCTTGATTATTCCAATATAAAAGTGGTTCCCCGCCTGTTATTACAATATCAACTCTGTTTTTATAATTACAATTTTTAAGAAGTTTATCAACTTCATTTACTATATCAAGATAATTTTCATAGCTTTTCCAACTATTTTTAAACTCCATATCAACAGCGTAGTATGAGTCACAAGCACACTTTTTAACTCCACTTGGGGTTTCATATTCTACATTAAATCCAATACATTTAAAATTACATTTACCAAATCGAATGAAAATTGAGAGGTTTCCTACTAATTTCCCTTCGCCTTGAATTGTTGGTCCAAAAATTTCATTAACTTCTAGCATAAAAAGTGCTTTTGCTTTTTGGAGTCTCTAAAAATTCAACTTTTGATACTTTTATATTTAATTTATCCATTTTATTCTGAACAATTTTTAACAACCAAGCTGAAATATTCTCACTTGTTGGAACAAAATCTACAATAATATAACTTTCATAAAGTTCTAATAACTCATCTTTAAAATTTTTTAAATTAACAATTTTATAATCTTCATCAAAATTTATCAAATCGCTTTTATTTATATTTGGTAGTAAAGTTGAAAATAGTGGATCATTTATATCTATTATAAACTTATGATCAATAACATCATCTAAAAATTTTTTAAACCAATTTAAATGTTTAAAATCTGTAACCATTCCACTTTTCAGACTATCAGACTTTAGATATACAATTACCTTACCTTGGTGTCCATGAAGATGTCTACACATAAGACAGCTATCAAGTGAGAACTCAACATTTAATGATTGTGACCAAACTCTATGTCCATAACAAAAATCAAACTCTTTGGAAATTTCCCACATTTTAACTCTCCTTATAAGGTATTAAATCTTTTTGATTTGCCTCTTTAAATCCATTTAATCTAAGTCTACAAGAGTCACAAACTCCACAAGCTTTTTCCTCTTCTTTGTAGCAAGACCAAGTTAGTTCTAGCGGAACATTTAATTTTATAGCTTCTTCTACTATTTGAGCTTTACTTAAATGAACAAGAGGAGTTATTATCTCTATTTTTGTATCATCTTTTGTACCTTCATTTATAGCATTTTGAATTTTTCGTATAAAGTTATCACTACAATCTGGATAACCTGAACTATCCTCTTCTACTACGCCAATATAGATTGCACTTGCATTCTCTTTTTCAGCAATAGCACTTGCGATACTTAAAAATATTCCATTTCTAAATGGAACATAAGTAATTGGAACAACACCTTTTTCAACCCCATTTACTGGAACATCTATATTTTTATCAGTTAAAGCACTTGCTCCAATTTGAGAAAAAAATGGAATATCAATTTCATATTTATTTAAAACATTTAACTCTTTACAAATATCTCTAAATGCCTTTAATTCTCTATCTTGAGTTCTTTGACCATAGTTAAAGTGAATAGCTATTAATTCATAACCACTATTTTTTGCAATATAAGAGCTTAAAGTGGAATCCATTCCACCACTTAATATTACAACTGCTTTTTTATTAAAATTTTGATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP026655|199819:206753|203985_204729_-|WP_164468999.1|DBSCAN-SWA MKFSGKNVLITGASKGIGAEIAKNLASYGLKVWINYRSKIEEAEAIKEQIEKAGGTAAIIKADVSIEEQFVAAIKTIVESDGELAYLVNNAGITKDKLALKMSVEDFTSVIDANLTSAFIGCREFFKQRGKKGFGAVVNISSIVGEMGNPGQANYSASKGGLNAMTKSFAKEAASRNIRYNAITPGFIQTDMTDLLKAEVKADYEKNIPLSRFGNPSEIADAVAFLLSDHSSYITGEILKVNGGLYV >NZ_CP026655|199819:206753|200939_201284_+|WP_066156455.1|DBSCAN-SWA MCIFCKIVNKEIPSNIVLEDDNFLAFHDINPTRKIHVLVIPKSHYDSFEDTPSDIMSDLSSFIKKVTKELKIDKSGYRMITNIGNDGGQEVPHLHFHLIGGEKVGRLVRDKNDL >NZ_CP026655|199819:206753|203663_203894_-|WP_066156446.1|DBSCAN-SWA MALLDDVKAVVVDQLDCDPAEVKEDSKFIEDLGADSLDVVELVMALEEKFDIEIPDEEAEKILTVGDAISYIENNK >NZ_CP026655|199819:206753|199819_200812_-|WP_066156458.1|tRNA|DBSCAN-SWA MELWIKKIESASTLEELESLRVDTLGKKGVLTIEFAKMKDIPAVDKKSFAENLNRQKDEITRALDSKKVELEAIALDKKLKFEKIDVTKFNNELSCGASHPVAETMNRIINYFLNLNFTVEEGPLVEDDFHNFQALNLPEYHPARDMADTFYNKDYTLLRTHTSPVQIRTMLSQKAPIRMIAPGTVFRRDFDITHTPMFHQIEALVVDEADKISFANLKHVLVEFLQHMFGEVEVRFRPSYFPFTEPSAEVDISCVFCKGSGCRVCSQTGWLEVLGCGVVDQNVFDAVGYKDKSGYAFGLGIERFAMLIHSIGDLRSLFESDTRLLGQFK >NZ_CP026655|199819:206753|206066_206753_-|WP_164469001.1|DBSCAN-SWA MNQNFNKKAVVILSGGMDSTLSSYIAKNSGYELIAIHFNYGQRTQDRELKAFRDICKELNVLNKYEIDIPFFSQIGASALTDKNIDVPVNGVEKGVVPITYVPFRNGIFLSIASAIAEKENASAIYIGVVEEDSSGYPDCSDNFIRKIQNAINEGTKDDTKIEIITPLVHLSKAQIVEEAIKLNVPLELTWSCYKEEEKACGVCDSCRLRLNGFKEANQKDLIPYKES >NZ_CP026655|199819:206753|201311_202247_-|WP_066347840.1|DBSCAN-SWA MATYLEFEEKIKKIEEDIIIAKTKSDEAAVEILNKKLEKEVEKTFKNLNDYQKLQLARHPDRPYALDYINAILSNAYEIHGDRHFVDDNAIVCYLGFIGNQKTLVIGEQKGRGTKEKLKRNFGMPSPEGYRKALRAAQIAEKFQIPILMLVDTPGAYPGLGAEERNQSEAIAKNLYEFANLTTPTVSVVIGEGGSGGALAISIADKLAMMRYSVYAVISPEGCSAILWNDPSKVETAAQALKITAENLKQQNLIDDVINEPLIGAHRNKDEAYMALKEYFLNSVEELKKLTPQERQEKKYQKIMNLGSFSE >NZ_CP026655|199819:206753|204786_205551_-|WP_164469000.1|DBSCAN-SWA MLEVNEIFGPTIQGEGKLVGNLSIFIRFGKCNFKCIGFNVEYETPSGVKKCACDSYYAVDMEFKNSWKSYENYLDIVNEVDKLLKNCNYKNRVDIVITGGEPLLYWNNQEFQNLIKHYINKNHKLTIETNASLNIDFQEEYQKNILFSMSVKLSNSLEPLKKRVNKSTLTKILENTKESYLKFVIGNDFLENAIVEIEDILKNIPQCEVYLMPLGDSSETIDINSEKVVNLAIKYGFKYSDRLHIRIWNNKRGV >NZ_CP026655|199819:206753|202294_203554_-|WP_164468998.1|DBSCAN-SWA MKRVVITGLGTINSTGHSVNESFDAVVNGVCGIDKITLFDTTDFSVQIAGEVKNFDPETVMDKKEVKKADRFIQLGIKAALEAMIDSGFVTSENKKVDDSIANRFGIISGSGIGGLSTIQKNSTICDTKGSRKISPFFIPSSLANMLSGFISIEHNLKGPSLSHVTACAASTHALNDAMKTIVLGGADRILVVGAESAICGAGVGGFAAMKALSTRNDDPKKSSRPFDIDRDGFVMGEGAGALVLETLGSAIARNAKIYCEIIGFGESGDANHITSPVIDGPLRAMRAAFEMAKELTGEYPKIDYINTHGTSTPVGDKNETAAIKELFNGKDNCPPVSSTKGQIGHCLGAAGAIEAIMAIKALNEGVIPPTINVENQDPECDLDVVPNVARKVDLTTVMSNNFGFGGTNGSVIFKKFTK >NZ_CP026655|199819:206753|205537_206065_-|WP_066156437.1|DBSCAN-SWA MWEISKEFDFCYGHRVWSQSLNVEFSLDSCLMCRHLHGHQGKVIVYLKSDSLKSGMVTDFKHLNWFKKFLDDVIDHKFIIDINDPLFSTLLPNINKSDLINFDEDYKIVNLKNFKDELLELYESYIIVDFVPTSENISAWLLKIVQNKMDKLNIKVSKVEFLETPKSKSTFYARS |
9 | Campylobacter_virus(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_3 |
719042 : 728415
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP026655|719042:728415|DBSCAN-SWA GATGAATCCAATTAGTGTAACTACTTTAAATACACAAATAAAATCTCTTTTAGAGACAACTTTTATGCAAGTTTTTGTTTCTGGAGAGATTTCAAATCTAGTTATTCATAACTCTGGACACATATATTTTTCTATTAAAGATGATAATTCAACCATATCTTGCGTAATGTTTAAAGGTAATACAAAATACCTGAAATTTGATTTAGAAAATGGACAAAAAGTACAAATTACTGCAAATATAACTGTTTTTGTTCCAAGAGGAAATTATCAACTTCTTTGTACTAAAATTGAGCCAGATGGAATAGGAAGTTTGGCTTTAGCATATGAGCAACTTAAAACAAAACTTCAAGTAAAAGGTTATTTTGAACAAAGTATAAAAAAGCCTCTTCCAAAATATCCAAAAAAAATTGCAATTGTAACAAGTGCTACAGGTGCTGCTATAGAAGATATTAAAAAAGTTGCAAGTTCTAGATGGAATTTAGTTGAGTTAATACTTATTCCAACTCTTGTTCAAGGAAATGGAAGTATTGAAGATATTGCAAAAAATATAAAATTTGCTGATAGTTTAAATTGTGATATTATGATTGTTGGAAGAGGTGGTGGAAGTATTGAAGATTTATGGTCTTTTAATAGTGAACTTGTAGCAGATGCAATTTTTAGCTCTATTACACCAATAATTTCTGCTGTAGGACATGAAATAGATTATTTAATAAGTGATTTTGTAGCAGATCTTAGAGCTGCAACTCCATCAAATGCTATGGAAATAGCACTTCCTAGTCAAAGTGAACATCTTTTATATATAGATAGTTTAATTGAAAATTTTCAAAAAGTTTTAAAAACAACTTTTGAAAAAAAAGAGCAAGAGCTTAAAAACTTAAAAGCAAGTTTTGAGCAAAATTCAATAAATTCTAAATTATTTTTTGTAGAGTCACAAATAAAACTTTTAAAAGAGCAGTTTTTTCAAACTTTAAATCAAAAGTTTCAAATTGCTTCTAATATTTTGGAGAGTTTAAAATCAAATTATCTTTTAAATAATCCAGAAAATAGACAAAAAGATGGTTTAGTTGAATTGAGTAAAAATAAGAAACTTATAAATTTGGATTTAGTAAAAGTAGATGATATTGTAGAGCTACAATCCATTGATATAATTGCAGAGTGTAAAATAATTAGTTTAAGTAAACAAAAGGTAAAATAACAGCAATTTTGCTTACGAAAATATTGAAATAAGGGGATTAAAATGGAACATAATCATGAAAAAAGCGCTACTCCAAATATAACTGAGTTTATGACATTCGAATTGGGGAAAATGAAATATGCTATTGAGTTACCAAAAATAAAAGAGATATTGACTTATCCAGATAATATTACTATTTTGCCAAATACTTCTGATTGGGTAAAAGGTTTAATTAATTCAAGAGGAGAAGTTGTTCCTATTTTAGATATTAGAATTAAGTTTAATACAGGTCCAGCTCTTTATGATGTTAATACTTCTATTATTATAGTAATTACAGAAGATAAAAGAATGGTTGGAATTGTAGTTGATTTAGTTGATGATACACAAAAAATAGATACTTCAATGTTAGCTTCAGTTTCTGAGATGGGTTCTGGAATTCCTGCTAGGTATTTAAAAGGTTATGTAAGAGTAGAAGATAATAAAATGCTAGTTATTATGGATATCGAAAAAGTTGTTTGTAAAGAAGAGCTAGAGGATTAATTTTATAATCCTCTATTTTTATTTTTTACTCTTCTATTGTAATTTTATTTATTTTAACATCTTCTAAAGGTTTATCACCACCACTTCTTCCATTTGTTTTTACATTTTCAATCTCTTTTACAACATCTTTACCACTAATTACATATCCAAAAATTGTATGCATTCCATTTAACCAGTATGTTGGAGCTGTTGTTATGAAAAATTGACTTCCATTTGTATTTTTACCTCTATTTGCCATAGCTAAAATAAATGGTTTATCAAAAACTGCATTTGGTGCAAACTCATCTTCAAAACTTTTGTTCCAAATAGACTCTCCTCCAGCACCAGTTCCAGTAGGATCACCACCTTGAATCATAAATCCTTTTATAACTCTGTGAAAGATTTGTCCATCATAGTAGCCTTTTTTTGCTAAACCAATAAAATTTTCAACAGCTTTTGGAGCTATTTTTGGTTTTAATTCTATTTTTACAATACCTTTAGATGTATCAAAAATAGCAATAGGATCTTTTTTTGTATCTTCATTTGAAAATAAAAAAAGTGTAAAAGATAAAAAGAGAAATATAATCTTTTTCATAGTTCTTTCCTTTAATTTAGTTTTATAATAAATTAGTATAGTATAATAGCTTTGAAAAAATAATAAAGGATTTTCTAAATGACTTTTGAAATGTTATACAGCAAAATTCATAGAGCAACTGTTAGCGATGCAAATTTAAATTATGTTGGTTCAATTACTATTGATGAAGAGTTGATGAAAGCTAGTAATCTTAGAGTTGGGCAAAAAGTTGATATTGTAAATATAAACAATGGTGAGAGATTTCAAACTTATGTAATAAAAGGTGAGTTTGGTAAAAAAGATATGTGTCTAAATGGTGCAGCTGCTAGAAAAGTATCTGTTGGAGATAAGATAATTGTAATAGCTTATGCAACATATAATGAAGAAGAGTTAAAAAATTATAAACCAACTGTTGTGTTAGTAGATGATAAAAACAATATTGAACTTATTACAAATGATTTAGTAGGTGGTAACTATGTTTGATGGTATTGATTTAAAAAACTTAAATCTTGGAGATATGATAAATAAATTTCAGGATATGGCAAAAGAGCAAGAAGCAAAAAATGCACAAAATCTATTTACTGCAAAAGCTGGTGGTGGAATGGTTGAAATTTCAATCAATGGTAATTCTGAAGTTGTTGATTTAAAAATTGATGACTCACTTCTTGAAGATAAAGACTCATTACAAATACTTTTAATCTCTTGCATGAATGATATTATAAAACAAAGTGAAGAGAATAAAAAAAGAATGGCTATGAATTTGATGGGTAATTTAGGTGGATTAGGGAATTTGGGTCAAAAATAGATGAAAGAACTTTTAGAAAAATTTGAGGATTATTTACTTAATAATCTACCAAAAATAGATACTTTTCACCCACATTTTGAAAATGCTATGCAAGATATGTTAAAAGCTGGTGGAAAAAGATTTAGACCGATGTTACTTTTGAGTGTTGTAAAATCAAAGAAACCTTTGCTTATTGAAAATGCTTTAAAAGTGGCACTTGCAGTTGAATTTTTGCATACTTATTCTTTAATTCATGATGATTTACCATCTATGGATAATTCTGACTTAAGAAGAGGTTTTACTACTTTACATAAAAAATATGATGAAGTAACGGCTATTTTGGTAGGAGATGCTCTAAATAGTGAAAGCTTTAATCTAATAGCAAATGCATCACTTCATAATGATGTAAAAATAGAACTTATTAAACTTTTGGGCGAAAATGGTGGATTAAATGGTATGATAATTGGTCAAGCAATAGATTGCCAATTTGAAAAGCAAAAATTGGAACTTAAAAAATTAGAGTTTTTACATATTCATAAAACAGCAAAATTGATAGCAGCAAGTTTAAAAATGGGTGCTATTATTTCAAATTATGATGAAAATATACAAGAAGATTTATATAGCTTTGGCTTAGATTTAGGTCTTCTTTTCCAAATTCAAGATGATATTATAGATGAACTTGAAAGCAGTGAAATTGCTGGAAAAACTACAAAAAATGATAGTTTTAAAAACTCTTTTGTAAATTTATTAGGACTTGAAGATGCTTTAAAAAGTGCAGATAAGTTGGCTAAAAAGTGTTTAGAAACTATGAATAGTTTTGATAAAAATTTAAAAGATTCACTTTTTGAACTTCTAATAAATTATATAAATAGACATAAAAAATACAACTCTTAGTAGATTTGACTAAAGGTTTATTGACAAAAAAGAAAAAATTGTATAGAATTTGGCACTTAGAATTTGTAAGTGCTAAATTCTAAGCTACAAAAGAAAAATAATTACAACAAATAAAGGAAAGAAAATGAATTTTAAACCACTAGGTGAGAGAGTTCTTGTTGAAAGAACTGAGGTTGAGAACAAAACTGCAAGTGGAATTATAATTCCAGATAATGCTAAAGAGAAACCTCAAACTGCTAAAGTTATTGCAGTTGGAAGTAAAGTTGAAGATGTAAAAGTTGGAGATACAATTGTATTTGAACAATATAGAGGAACTGAAATAAAACTTGAAGGAAAAGATTATTTAGTTTTAAATGTTGAAAATATAATTGGTGTTATGTAATTACAATTTACATAAATAAGTGTAGAGATTTGATAAATTAAGATTTATATAAAATAAAAAGGAAAATATTATGGCAAAAGAGATTATATTTAGTGATAATGCAAGAAATAGACTGTTTGCTGGAGTTGAAAAACTTTGCGATGCTGTTAAAGTTACTATGGGTCCAAGAGGAAGAAATGTTTTATTACAAAAATCTTTTGGTGCGCCTACAATTACAAAAGATGGAGTAAGTGTTGCAAAAGAGATTGAACTTGCTGATACTTTAGAAAACATGGGAGCTCAACTTGTAAAAGAGGTTGCTAGTAAAACTGCTGATGAAGCTGGAGATGGAACAACAACAGCAACTGTTTTAGCTCACTCAATTTTTAAAGAGGGATTAAGAAATGTAACAGCAGGAGCAAATCCAATATCTCTAAAAAGAGGAATGGATAAGGCTTGTGAAGCTATTTTATCAGAGCTTAAAAAATCTTCAAAAGTTGTTGCAAATAAAACAGAAATAGAACAAGTTGCAACAATTTCAGCAAACTCAGATAGTGCAATTGGAAAAATGATTGCTGAAGCTATGGAAAAAGTTGGAAAAGATGGTGTTATTACTGTTGAAGAGGCAAAAGGAATTTCGGATGAACTAGATGTTGTAGAAGGAATGCAGTTTGATAGAGGATATTTAAGTCCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP026655|719042:728415|721783_722113_+|WP_066164576.1|DBSCAN-SWA MFDGIDLKNLNLGDMINKFQDMAKEQEAKNAQNLFTAKAGGGMVEISINGNSEVVDLKIDDSLLEDKDSLQILLISCMNDIIKQSEENKKRMAMNLMGNLGGLGNLGQK >NZ_CP026655|719042:728415|725349_726114_+|WP_164469309.1|DBSCAN-SWA MRRFYYFIVLFFIFNIYLFAQSDRSFVVIDSNTNKVLIEEKSNKKHKIASLTKIWTALIVLENSNLDDEVVVSKRATLQQGSSIYLKENQICTIKDLLHGMLLRSGNDASVALAEHIAGSEEKFVKLMNKRAKEFGIKNTKFVDVTGLGNNISTAKDVAIMFELALKNSKFKDISGQSSYKNSLDGQIWKNKHKLVVENSKAFAGKTGYTKQSGRTLATAFYDEKSSKSFIVVTLNEKDDWKVHKFLAQKVFMK >NZ_CP026655|719042:728415|719042_720236_+|WP_164469305.1|DBSCAN-SWA MNPISVTTLNTQIKSLLETTFMQVFVSGEISNLVIHNSGHIYFSIKDDNSTISCVMFKGNTKYLKFDLENGQKVQITANITVFVPRGNYQLLCTKIEPDGIGSLALAYEQLKTKLQVKGYFEQSIKKPLPKYPKKIAIVTSATGAAIEDIKKVASSRWNLVELILIPTLVQGNGSIEDIAKNIKFADSLNCDIMIVGRGGGSIEDLWSFNSELVADAIFSSITPIISAVGHEIDYLISDFVADLRAATPSNAMEIALPSQSEHLLYIDSLIENFQKVLKTTFEKKEQELKNLKASFEQNSINSKLFFVESQIKLLKEQFFQTLNQKFQIASNILESLKSNYLLNNPENRQKDGLVELSKNKKLINLDLVKVDDIVELQSIDIIAECKIISLSKQKVK >NZ_CP026655|719042:728415|726153_728415_+|WP_164469310.1|DBSCAN-SWA MKLFLLFLLSTFLYSSSLEKVSIQFNWKYQFEVAGFIAAKEKGFYENVGLDVELKEYNPEVDILFDVLNNKVTYGISSSNIVLENKKIASIVLLATYLQKSPLVFITKPDIKTPSQFLGKTIMGNKDELKNSSLALFLSHFNINFSNTKFIPHNFKIDDFINGKVEIMSAFRSNQLYELDKKKIDYNIIDPADYGFVMSAVNLYTSKEEAFKNKDRTQKFIEATNRGWEYALKNKEEIIDILIKKYGVDKSKEALLYETDVVNQVMMRDFYPIGKVSPELTQRLVKQLSYSGMIEPNQKINHIFFENILDKIPSDFSLTKSEKEYLNSKHSLKICIDPFWYPIEFIKDGKISGITSDLKRYFEEKIQINIDVVPTNNWNESLDFIKDKKCDIISSISPSYDRMSYLNFTKPILTLPIVVTTQKDKPFLRDISLLKNEKIAILKGHFIAEYIKDYFPYLKIVEVASMNEGLYLVEQGEVYGYIDNALVLSSTIQKEFSNSLKIGFRFDILDELSIGTRNDEPILNDIFSRLVDDLDETKKQEFLNNWTIITEQVGWFSSKEIIFLVIFTTTIFGGLIFYQRKLKILNKKLKKLYLTDKLTGLYNRFKIDKELSSQKDNIDRNESYSCGLILIDIDYFKSINDTLGHLVGDCILKDISKLLKNNLRKTDIIGRWGGEEFLIILPFTSKDIAKKVAENLRVLIEENNFSYKMNRKITISIGVTEFSKSKSVEDTLLLVDNLLYKAKENGRNRVEES >NZ_CP026655|719042:728415|723110_723368_+|WP_066219304.1|DBSCAN-SWA MNFKPLGERVLVERTEVENKTASGIIIPDNAKEKPQTAKVIAVGSKVEDVKVGDTIVFEQYRGTEIKLEGKDYLVLNVENIIGVM >NZ_CP026655|719042:728415|721407_721791_+|WP_066156182.1|DBSCAN-SWA MTFEMLYSKIHRATVSDANLNYVGSITIDEELMKASNLRVGQKVDIVNINNGERFQTYVIKGEFGKKDMCLNGAAARKVSVGDKIIVIAYATYNEEELKNYKPTVVLVDDKNNIELITNDLVGGNYV >NZ_CP026655|719042:728415|720278_720755_+|WP_066156187.1|DBSCAN-SWA MEHNHEKSATPNITEFMTFELGKMKYAIELPKIKEILTYPDNITILPNTSDWVKGLINSRGEVVPILDIRIKFNTGPALYDVNTSIIIVITEDKRMVGIVVDLVDDTQKIDTSMLASVSEMGSGIPARYLKGYVRVEDNKMLVIMDIEKVVCKEELED >NZ_CP026655|719042:728415|720780_721329_-|WP_164469306.1|DBSCAN-SWA MKKIIFLFLSFTLFLFSNEDTKKDPIAIFDTSKGIVKIELKPKIAPKAVENFIGLAKKGYYDGQIFHRVIKGFMIQGGDPTGTGAGGESIWNKSFEDEFAPNAVFDKPFILAMANRGKNTNGSQFFITTAPTYWLNGMHTIFGYVISGKDVVKEIENVKTNGRSGGDKPLEDVKINKITIEE >NZ_CP026655|719042:728415|723438_725076_+|WP_164469308.1|DBSCAN-SWA MAKEIIFSDNARNRLFAGVEKLCDAVKVTMGPRGRNVLLQKSFGAPTITKDGVSVAKEIELADTLENMGAQLVKEVASKTADEAGDGTTTATVLAHSIFKEGLRNVTAGANPISLKRGMDKACEAILSELKKSSKVVANKTEIEQVATISANSDSAIGKMIAEAMEKVGKDGVITVEEAKGISDELDVVEGMQFDRGYLSPYFVTNPEKMTTEFNNPFILLYDKKISSLKEMLPILEGVNKSGRPLLIIAEDVDGEALATLVVNRLRGALQIAAVKAPGFGDRRKAMLEDIAVLTGGTVVSEEMGMKLETTDLSALGTASKVVIDKDNTTIVDGSGSKDTVLARVNQIKAEIANTTSDYDREKLQERLAKLSGGVAVIKVGAATETEMKEKKDRVDDALSATRAAVEEGIVIGGGAALIRAAAKVKLDLCGDEQIGAAIVLRAIKAPLKQIALNAGYDAGVVANEVEKSSNENLGFNAATGEYVDMFEAGIVDPAKVERVAMQNAVSVASLLLTTEATVTDIKEDRPSMPDMSGMGGMGGMPGMM >NZ_CP026655|719042:728415|722113_722986_+|WP_164469307.1|DBSCAN-SWA MKELLEKFEDYLLNNLPKIDTFHPHFENAMQDMLKAGGKRFRPMLLLSVVKSKKPLLIENALKVALAVEFLHTYSLIHDDLPSMDNSDLRRGFTTLHKKYDEVTAILVGDALNSESFNLIANASLHNDVKIELIKLLGENGGLNGMIIGQAIDCQFEKQKLELKKLEFLHIHKTAKLIAASLKMGAIISNYDENIQEDLYSFGLDLGLLFQIQDDIIDELESSEIAGKTTKNDSFKNSFVNLLGLEDALKSADKLAKKCLETMNSFDKNLKDSLFELLINYINRHKKYNS |
10 | Indivirus(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1780939 : 1791352
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP026655|1780939:1791352|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP026655|1780939:1791352|1786335_1787109_-|WP_066157890.1|DBSCAN-SWA MIKIGILGSSGRVGSLLIDDLKNDKEAKLACVHVFDKIEKILPEDTVVTNDINILFDESDVIIDFSSPVATEELLTAVIEGGKRKALVIATTGLSKHQQNLLLEASKLVPILYATNMSLGVAVLNKLVALASKTLRDFDIEIVEQHHKHKVDAPSGTALTLAEHAASARDLDLDEVRISGRDGQIGARTKDEIAVMALRGGDIVGRHTVGLYNDGEFLELNHTATARNTFSKGALKVAKWLVKKDANLYSINDALGL >NZ_CP026655|1780939:1791352|1783108_1784005_+|WP_066157879.1|DBSCAN-SWA MLNDFAKLETFLTVVREKSFSKASAKLGISQPAVTQQMKFIEDYLDVQIVDRKKNGIKLTKEGQILHGIALKIEKCVNSAEKELLKIMNKNTTFVFGASFIIGNYILPRFLNNLKENIHNDVSINVSVSHEAIEDLLDKKIDIALVENYIANDEIIYREWMEDEIVIFSNQKLPARAKPEDLLSYKWICRNPESNTGSIFKECLEKANYPDCDTFEVTSEVTSATTIVQTVLHSDKNATPAVSIVSRNAIESLLKSGALYESRIGNQKMLRKLYIAYRKDRKHDAFIENVVDYLLKIK >NZ_CP026655|1780939:1791352|1784009_1784975_-|WP_164469918.1|DBSCAN-SWA MSKNLKEVLTIGRYFKNKFGEKVYKIPISISGFTCPNIDGTKAKGGCSFCENDSFSPNLQEKKTKFKLNPNIEHNPFLENQLKQLEMQFIATKKRLENKFKAKKFIVYFQSFTNTYAPLSTLKSLYEKALSFDDVIGLSIGTRTDCVTDEILDFLYEKSKQKEIWIEYGIQSFFQTTLDKINRADDVENMRYWIRITKEKGLNVCGHLIYGLPDENQEMMLETFKQTIDLKVDSIKFHPLYVVKNTLLTNEFKKGRFTPISEELYIDTVVKSIINLPQNVSVQRVTAGIDDDTLLSPFWCKNKHQQMKKIRFALEEKGFIY >NZ_CP026655|1780939:1791352|1788769_1791352_+|WP_164470185.1|tRNA|DBSCAN-SWA MDIRKEYLEFFKSKGHEVISSMPLVPDDPTLMFTNAGMVQFKDIFTGSIPVPQNPRATSCQLCVRAGGKHNDLENVGYTARHHTLFEMLGNFSFGDYFKEEAIAYAWEFITKNIALPKEKLWVTVHERDDEAFEIWTKHIDSSRILRFGDKDNFWSMGDTGACGPCSEIFYDQGEEHFSSSEDKMGGDGDRFLEIWNLVFMQYERTKEGELIPLPKPSIDTGMGLERVIAIKEGVFNNFDSSNFKPIIETLEKIANKKATKENIGSYRVIADHLRATSFMLSQGILFGNEGRPYVLRRILRRAIRHGYLIGLRKPFMAQLVDTLVDIMGGHYVELKENTNYIKEQLTLEEERFFKTISAGITLFNDELVNTKDIFSGEVAFKLYDTYGFPLDLTEDMLKDKGLKVDLDKFEELMTNQKTMAKAAWKGSGDSSNEGDFKTLLEKYGLNEFVGYTNITYNSKILALLDENFKEVQFLENQIGWVLLDKTPFYATSGGQNGDIGAIEKNGSNIIVIETSKFHNLNLSKIDVKNVKISQNEIVEAVVVNRYEIAKHHSATHLLQSALKMVLGDSVSQAGSFNDANKLRFDFTYPKAMTNEQINEVEDLVNSMINRALAGVVEELPLEEAKKKGAIAMFGEKYGEVVRVISFGDVSVEFCGGTHVKNTADIGSFYIIKESGVSAGIRRIEAVVGASAFKYTKEQINKLNELQAEIKSNDLIAGVKKLKSEIKELKNQIQNSQNQTQAPINEEIIGDTKVVVCVIENGDLKKIVDDMKNANEKLAILLLQAKDDKVLIVAGSKNTNIKAGDWIKNIAPIVGGGGGGRPDFATAGGKDITKIEEAKIAALTYAKDNLHMKNIKTLKD >NZ_CP026655|1780939:1791352|1784974_1786321_-|WP_066157887.1|DBSCAN-SWA MCAIVGIYGNDNAARLASIALFAMQHRGQEATGISSSCDGKIYTKKDRGLVSEVFNEEALTYLKGNMAIGHNRYATAGSDSVLDAQPVYAKYKLGQISIVHNGNLINKDEVRNDLIDKGAIFQTGMDTENLIHLIAKNTKDHLKDRIIEALNRTIGAYCFIVQSRSKQFVIRDRYGIRPLSLGKLKSGGYIVASETCAFDLVGAEFIRDVRPGEMLIFSEEDDIESVQLFEPEFRPCAFEYVYFARPDSVIDGKNVYTTRENMGKALAKNDANSKIKYDMVVPVPDSGVPAALGYAAQSGIPFKYGIIRNHYIGRTFIEPTQEMRNLKVKMKLSPMSSIIAGKSLLVIDDSIVRGTTSKRIVKMLKEAGAKEVHFRVASPEIKFPCFYGIDTPTKEELISTQMTKDEVCKYIEADSLEYLSIDDLVNAIGNDRHYALESFDGDYFVKA >NZ_CP026655|1780939:1791352|1787113_1788043_-|WP_164469919.1|DBSCAN-SWA MLDLAIIGGGPAGLTAGLYATRGGLANVVMFEMGMPGGQITGSSEIENYPGQGAVMTGMDLMASWPEQCQKFGLKHEMAQVETITKNGDTFKILTNDNREFEAKAVLMATGSVPRRAGFKGEDEFFGRGVSTCATCDGFFYRGKEVAVIGGGDSALEEAYYLSKMCKKVYLVHRRDTYRAAPSTIAHIKNSENIEEVTNVSVEEVYGDNSGVLGLKVKCNKTGEIRDLPTPGVFVFVGRNVLNAPLKQADGSFLCDVIESGEVVVDLKMRTTTKGLWAAGDIRIDAAKQVVCAAADGATAAVDIIEYLG >NZ_CP026655|1780939:1791352|1788255_1788573_-|WP_066157896.1|DBSCAN-SWA MGKYIELTSANFDATTKEGVSLVDFWAPWCGPCRMIAPVIDELAGDFEGKANICKVNTDEEQDLAVKYGIRSIPTIIFMKNGEVVDQLIGATSKQALTDKINSLL >NZ_CP026655|1780939:1791352|1780939_1782994_-|WP_066157873.1|DBSCAN-SWA MSENLLISLNNSQKSAAQHIDGPLLILAGAGSGKTKTITTRLAYLISIGIDPKTILTLTFTNKAANEMRDRAFSLLDTSILNTPPLLCTFHKFGLLFLKFYISELNRKNNFIIIDSDDKRRVLKSINKEIPTALLVSEVSKYKNSIMTPIEVKSQAQGKLYSEIADIYEKYEEHLLKNNLVDFDDLLLLPYKILKNNQKLAESTSQKYQYIMVDEYQDTNELQYRLLRLLCSNHDNLCVVGDDDQSIYGWRGATIKNILNFNEHFKRATIVKLEENYRSTDTILHHANALIEHNRDRLGKKLVGTKDKGSSIKVYESHDENEETRKIVDDIKKLLQSDEKAKDIAILFRVNALSRSLEEGFNKAGLNYKLVGGMKFYERTEIKDLIAYFRILTNLSDNFSIKRVINKPKRGIGATTIDKLEEKANELNSSIFDMIQNLNADELSAIVGKKNARTIKVFEASILDLRELMNQSKMRLLDSFEETFDYRASYDNLPDGFERQANIDEFYGYIRDFFLQNPHLDLKDFLNEIALENQNDEYSNDAISMMSIHSSKGLEFKHLFIIGLEEGFFPIIGDGTDLEEERRLGYVAFTRAMDNLTLSFVHSRFYKGKRTQLNKSRFLVESGLVKGSLVIEKTSGFKKGDMVSHKIFGQGRVEKAVNAGKDYKLTINFGGQKRDILSSFVEKN |
8 | Bacillus_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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