Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP049088 | Glaesserella parasuis strain sHPS7 chromosome, complete genome | 1 crisprs | DEDDh,PD-DExK,DinG,cas3,cas2 | 0 | 0 | 9 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP049088_1 | 1946826-1946938 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP049088_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP049088_1
>1.1|1946853|59|NZ_CP049088|CRISPRCasFinder TAACTTTGCGGTATTTTATAAATAATTGTCGGGCATAAATGCCTAACTTTGTGGTATTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP049088_1
The CRISPR arrays of NZ_CP049088_1 >merge|NZ_CP049088|1|1946826-1946938|CRISPRCasFinder TATAAATAATTGTCGGGCAAAAATGCCTAACTTTGCGGTATTTTATAAATAATTGTCGGGCATAAATGCCTAACTTTGTGGTATTTTATAAATAATTGTCGGGCATAAATGCC >NZ_CP049088|1|1|1946826-1946938|CRISPRCasFinder TATAAATAATTGTCGGGCAAAAATGCC TAACTTTGCGGTATTTTATAAATAATTGTCGGGCATAAATGCCTAACTTTGTGGTATTT TATAAATAATTGTCGGGCATAAATGCC
>NZ_CP049088.1|WP_021113356.1|1946068_1946776_-|hydroxyacylglutathione-hydrolase MLQITPIPALSDNYIWILQKERQAIIVDPAEAQAVLAFLAKHQLNPTAILLTHNHHDHTDGVAGLVAQFPDMLIYGSEEVSQFANQIVYPEQQFELLGLKVRVIESAGHTAQHISYLIENEYLFCGDALFSGGCGRVFTGDYQAQFDALQRFKALPDFVQVYAGHEYTQSNLKFAEVVMATNCVLMEYQERADILRSQYKPTLPSTIGIEKQINPFMQAVTLDEFISLRKQKDNF >NZ_CP049088.1|WP_021118496.1|1945246_1945960_-|di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase MDIEPQLMPQHVAIIMDGNGRWAKQQGKLRIFGHQNGVKAVRSAINFAAKHGIKVLTLYAFSSENWSRPKAEVSALMTVFMKALDYEVKKLHKNNIRLKIIGDKSALSESLQNRIAQSEALTANNTGLMLNIAGNYGGYWDITQATKQIALQVKNGELSVDEITPDYFQRHLVTEDQPQVDLLIRTSGEQRISNFLLWQIAYAELVFSPVLWPDFDEKAFTDAIIAYQQRDRRFGGC >NZ_CP049088.1|WP_021113345.1|1944359_1945229_-|phosphatidate-cytidylyltransferase MLKERILSAIVMIILAVVALFWLSPLAFTIGLSAIVVLGMWEWAQFAGFKRPIARAIVAFVVTCLLIFPIMAGTSYIQATRFLTDETTPLLFIGGFWWLVASALVVSYPKSADVWAKSVVAKFIFGFCTLIPFLIGTLALRFYQYNLDQYQGTYLLLYVFLLVWGADSGAYFAGRAFGKHKLAPKVSPSKSWEGAIGGVITSAVIATIFLSVVPANVFGRELNTSAFVVLSVITVAISILGDLSESMFKRQVGIKDSSNLIPGHGGILDRIDSLTAAVPIFAIGFFFFL >NZ_CP049088.1|WP_021113266.1|1943030_1944350_-|RIP-metalloprotease-RseP MTSMLAFFILICVLVFVHEYGHFWAARKCGVKVLRFSIGFGKVLWRKKDKQGTEFAFSLIPLGGYVQMHNGEAEHQLPDSQSLHTKSVLQRAFIVLAGPVANFLFAILAYWAVFNVGIPTVKPVIGSVIPDSIAAYAKLETELEIKTVDNRSVQDWEDVTLALLGKIGEAEVVIEGNHIDENISRQFTLDLRNWNVDGNKENPLTTLGIRPKSATVEPIIKNVVENSVSARSGILAGDKIISVNQQPFEWRYLLEQVQTGNIIDLTIERNNQQLAFQLQPEYSKEDERYLIGLVPTYQPLESKYRSELKYDILSAFGKSLEKVVSLSYTILQFIGNLITGELSLSNMGGPISMAKGAGATAEIGFVYYLGFMALISVNLAVMNLFPILPLDGGQLVLLTGEAVRRKPVPEAFQLRFQQIGGMFVVGLMLFALFNDLIHF >NZ_CP049088.1|WP_021118497.1|1940562_1942980_-|outer-membrane-protein-assembly-factor-BamA MKKLLLSTLLVANGVAFASPFVIKDIRIDGIQTSVSQTMIPTLPVKVGQLATDNDIANVIRHLFVQNRFQNISATREGDILIIKVVENPVINNVDIEGNSAIPKEPLEQNLKANLITKGELFNSTKLDAFKSALIEHYHSIGRYNATIDTVITNSDNGGVNIKLDIKEGDVAYVKAINFEGNQAFTSKVLMKQLDIQPDVSWFNIFQSSKFEQTAYNQDLENLRNFYMNQGYAKFNVEAEQPVFSDDKKEVSLTYKINEGIPYTVSEIRIIGNTAKLDNELNEQLKYYKTGELFSKNELSKIEDNIKQVFGNNGFASAKIELHPTFDDTNKTIRLTFVVDAGQRVYVRQIRFEGNDVTADSTLRREMRQQEGAWLSTSLAALGKARLERTGFYDSVEMSYPNVPNTADQVDIVYKIKERNTGSINFGVGYGTESGLSYQAGIKQDNFLGMGSTISLNGTRNDYGTSINLGYTEPYFTKDGVSLGGNIFYEDYDNSKNNSVASYKRQTYGVNSTLGFPVNEYNSYFLGLGYTQDLIKNAQREFNRELYVQSMKFPINNDLNVYKKIEANDFDFSFGWNYNSLNRGFLPTEGTLTSISGRITTPGSDNKYYKVSIDFKNYLPVNREHKWVISTKANIAYANGFSGKELPFYQTYTAGGIGSLRGFAYGAIGPKAIYLGKDNNGNIRFNSVNGDIVGGNAMASATLELITPTPFVSEKYQHNVRTSLFVDAATVLNTKWKTNPVVNDIQYNYSSLENFKDYKRFRASTGIAFQWNSPIGPLVFSYAKPIKKYQGDEIEQFQFSIGGSF >NZ_CP049088.1|WP_021113351.1|1939684_1940488_-|outer-membrane-family-protein MKNLFKLAAVASALAFSANTVNANEKIGFVDPNFLIQNHPLTIEANDKFTKFMKDTESKFAPREKQLAAENKALSDEEKALLDERKKIEEDAQKLQKEQVTLEAAMKKKVAQLEKDAPRLKAKEIQARQDKINAEAKPFQNKVSALQQREVEFGKKAEEFQKRADEFQKKVAAFQEEIAKVQKESGVITPEQVQQKVVEDINAKIKQVAESKGYTLVLPPSVALYAKDGNAADITEEILVAMGGKMPEAPKTQAPAAEVTKPEEVKK >NZ_CP049088.1|WP_005711021.1|1938659_1939685_-|UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)glucosamine-N-acyltransferase MAEFRLIELAEQIGGTLKGNADLAILSIAPLDKATSNQITFISNAKYRPQLAQCQAGAIIVSEADVEFCAEGQNLIVVGNPYVAYAILAQYMDTTPNPAENIAESAVISPDAKLGHNVSVGANAVIESGVEIGDDAVIGAGCFVGKNSKIGARTKLWANVSVYHNVQIGSDCLIQSSAVIGSDGFGYANEKGQWIKIPQTGGVIIGNRVEIGACTCIDRGALDPTVIEDNVIIDNLCQIAHNVHIGYGTAIAGGVVMAGSLKVGRFCQIGGASVINGHMEICDGAIITGMGMVMRPITEKGIYSSGIPLQTNKEWRKTAALVMNIDEMNKRLKALEKRLAE >NZ_CP049088.1|WP_021113251.1|1938173_1938641_-|3-hydroxyacyl-ACP-dehydratase-FabZ MTTKLQTENREPRIIEVTEIMEMLPHRYPFLLVDRVVDFEEGKWLRAVKNVSVNEPCFTGHFPNQPVFPGVLILEAMAQATGVLAIKSYGKLKENELYYFAAVDNARFKRPVVPGDQMIIEVTFVKERRGITAFTGKVYVDDTLVCEADLMCARK >NZ_CP049088.1|WP_021113366.1|1937351_1938146_-|acyl-ACP--UDP-N-acetylglucosamine-O-acyltransferase MQLIDASAKIHPTALIEEGAKIGANVEIGAFCVIGKDVRIGAGTKIHSHVVIQGDTEIGEDNQIFQFASIGEINQDLKYQGEPTKTIIGHRNRIRESVTIHRGTVQGGGVTRVGNDNLFMINCHIAHDCSIGNRCIIANNGTLAGHVTLDDFVIVGGMSAIHQFVVVGSHVMLGGGSMVSQDVPPYVMAQGNHAQPFGVNLEGLKRRGFEKATMHAIRNVYKLIYRSGKTLEEAIPEIEQYAKTEAAVSLFLDFFKRSRRGIIR >NZ_CP049088.1|WP_021118499.1|1934517_1936962_-|bifunctional-aspartate-kinase/homoserine-dehydrogenase-I MRVLKFGGTSLANPERFLQAADIIEKAHLADQAAGVLSAPAKITNHLVAVVDKAQTGESYESHLTEATDIFNNIINGLYAVNNNFDREGLSAFIKAELDDICNIAAEAAKNKFCPDNIGATVHSRGEKLSIAMMKAWFEAKGYEVTRVDPVEKLLANGSYLESSVDIAESTKRIEALSIPKKNVVLMAGFTAGNEQGELVLLGRNGSDYSAACLAACLKADVCEIWTDVDGVYTCDPRLVPDAICLESMSYQEAMELSYFGAKVIHPRTIGPLVPLNIPCLIKNTHNPEAAGTIINGNVVNDNLKVKGITNLDNVAMFNVSGSGMQGMVGMAARVFTAMSQAGISVNLITQSSSEYSISFCVPVKAVEKALTALNSTFAQELKEGLLDPVEVIKDLSIVSVVGDGMRTAKGIAARFFSALAQANISIVAIAQGSSERSISAVVPLNKAIEAVKATHKALFNNKKVVDVFLVGVGGVGGELIEQITTQKEYLAKKDIEIRVCALANSNKMLLNENGLSLDNWRADLESATQPSDFDVLLSFIKLHHVVNPVFVDCTTAQSVANLYSRALKEGFHVITPNKKANTSSYAYYQEMRENARQSQHKFLYETNVGAGLPVIENLQNLLAAGDEVEKFEGILSGSLSFIFGKLEEGATLSEATNIAKEKGFTEPDPRDDLSGQDVARKLLILARECGYPLELEDIEVEGVLPKGFSEGKTAAEFLAMLPELDAEFAKRVENATACGNVLRYVGSIENGKCRVAIKEVNGDDPLYKVKNGENALAFYTRYYSPIPLLLRGYGAGNDVTAAGIFADILRTLK >NZ_CP049088.1|WP_005711013.1|1946946_1947861_-|N-acetylglucosamine-kinase MVYYGLDIGGTKIELAAFNEKLEKLHSERVPTPQTSYEDWLRTVETLVRNADAKFGEQGTVGLGVPGFVNHKTGLAEIANIAVVHGNKIIQDLEARLGREVRVENDANCLALSEAWDESNLQYSTVLGLIIGTGFGGGIVLNGKAHSGQIGMAGEVGHIQLNYHALKLLGWDKAPIYKCGCGNMACLDSYISGRGFEMLYNDLVGEKVDAKNIIQRFYDKDEKTVEFVEKYIELMAISVANYITVLDPDMIVFGGGLSNFDYIYEALPKALPKYLLRNAEVPVIKKAIHGDSSGVRGAAALFLK >NZ_CP049088.1|WP_021118495.1|1947863_1948586_-|phosphatase-PAP2-family-protein MVKKLSFLTLLMLFIPATAWLIGWQWNLQTNLGVNVFDWALFILTETGSTPYALITCVLFMLWLMWLARTRYSWFLVGFICATSVVGTQAIKEGAKAVFKEPRPFVTQMFQADTEAFYALPKAEQETAVLKFVQPENQFVVEHQADELGYSFPSGHTIFGVSWLLMFAGLLFGIREQAVIFAQFFVILWAGLMLISRLRLGMHYPIDLFVSTLIAWVFHLIIFLWVIPLLEKWILFKKRG >NZ_CP049088.1|WP_021118494.1|1948876_1950151_-|isochorismate-synthase MSVFSQLKQQLYQQLQQKPVAQGLVQLQAEIAIDLENQQLLAWLKAQPLFPHYYWQNRDTEQTIVAVGAVQTFEHLDDIEQFSKQSDLMVVGGIEFEGQCHFVLPRLLLVKNEKNITAWLNLDGRYFESEQKECIALLAQFEQTAELHPIENSLLSTKVACDFSRWQHNIELAIEQIQQQQMNKVVLANATTKTFTHHISPYVLLFASQQKNLGCYHFLWSEKQGEAFIGSTPERLYLRQQRQFFTEALAGTVAVTDDPVQTEQNALWLLNDQKNIYENWLVVDDICSHLADCATDIQVSDAEIKRLHNVQHLRRKIQTQLTEQVSDADCLARIHPTAAVAGLPRPKAKQFIQQQECFERGWYAGALGYFTPEQAEFCVMLRSALIQANQITFYAGAGIVEKSDPQSEWQEIDRKARAMAGLME >NZ_CP049088.1|WP_005711010.1|1950297_1951515_+|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase MERFAKTDKLAHVRYDIRGPIHKEATRLEEEGHKILKLNIGNPAPFGFEAPAEILVDVIRNLPTAQGYCDSKGLYSARKAIVQYYQLKGMRDLDVGDVYIGNGVSELITMSMQALLNDGDEILIPMPDYPLWTAAATLAGGKAVHYLCDEENEWFPDIEDIKSKITPRTKAILVINPNNPTGAVYSRQLLLDIVAIAREHNLIIFSDEIYEKIVYDGAVHHHLAPLAPDLLTVTYNGLSKAYRVAGFRQGWMVLNGPKNQAKGFIEGLDMLASMRLCANTPMQHAIQTALGGYQSINEFILPGGRLLEQRNKAHELLTKIPGISCVKPKGAMYMFPKIDTEMYGIKDDQKFVYDLLQQEKVLLVQGSGFNWHKPDHFRVVTLPYVDQLEEAIGRLAKFLQSYRQD >NZ_CP049088.1|WP_021116217.1|1951681_1952563_+|EamA-family-transporter-RarD MIKGITFSVTASILFGVLYYLSTHLKPLSGEEIYGFRMWVSLPFVISALFIFKKNDEFNRYLKRLKQHPHLILVLLTTTAVTGSQMWLFLYAPNNGYAIDVSIGYLLMPIAMVAVGRFLFNETLSLLKIISIISASVGVFITLMTAGSLSWATSMVLIGYPVYFSLRKHFDMSHLSSFVCEIILMLPIATYFMLNTDMQFVTENNPNFYFWLVLLGIVSGTALIGYIMASSLVPINVLGLLSYIEPLAMLIVAFIIGEVLDQSSYILMACLMLSICLLVLDGIIAIRKQRRGE >NZ_CP049088.1|WP_005711008.1|1952562_1953429_+|EamA-family-transporter-RarD MLKGILFSLSANILFGAGYYFAVLLRPLESDSIFGFRIVVLMPFILLAIFLFHQQKAFKDLYYRVKQTPYLIFILLLLALNTAIQLWLFLWAPNNNQAIEVSIGYLLLPIVAVALGKLVFKEHFTLLKWLALFFATLGVTINIVLTASISWATFVAGFGYPIYIVLRRYFHINNLATFFVELLLLLPFAIYYIAQVDQASILMQNEYLYFYLALLGLVNGMAFILYIASSNLLPINVLGLLGYAEPLVMLFISFAIGEVLEAKSYILMACLAVSIILLSVDSFRKVKP >NZ_CP049088.1|WP_164681771.1|1953428_1955642_+|primosomal-protein-N' MNLIRIALPVPLARYFDYLLPTHFENVVKGARVVVPFGRQRKIGIVVDFPTTSDIPTEKLKPIEQLLDEQALFDTEMWQLLQWASRYYHAPFGEVLQSALPVKLRQGESSERTAPDYFVVTENGRKALANSVVQKAKKQQELLSKLAEFANFFEKPTACSPAVWKALFEKGYLEKLEIPFNVQSWQEKLGEQPICNTQNRLTLNKQQTLVVSRLHYQQGFGAFLLNGVTGSGKTEVYLQVIEEVLKRGEQVLVLVPEIGLTPQTIQRFQARFNVEIDALHSHLNDTQRLNAWLRAKNGESAIVIGTRSALFTQFQQLGLIIIDEEHDGSFKQQDGWRYHARDLAVLRAKNNNIPIILGSATPSFESLQNVQNGKFIELQLTARAGNAHFSKQTLIDLKKQRIYSGLSEKLLAMMQAHLEKGNQVMLFLNRRGFAPVLLCHECGWIADCPSCDKPFTYHQKQRVLRCHHCASQKAIPRQCGHCGSVNLITTGIGTEQLEQVLAQRFPQYSITRIDRDSTARKGSLEQHLAEIQAGKSQILIGTQMLAKGHHFPNVTLVAIVNVDSSLFSTDYRAEERLAQLYVQVSGRAGRAEKQGEVVLQTHYPDHPLLTSLLNDGYLAFASQALAMRKIMSLPPFSSQVLIRATGRDSGKVANFLQDLTACLQQIIGENDWQGFQLLGPFNAPMAKKAGYYRWQLLIQHSARSAIQQLLDRFDEQKEQFLRNDIRLTVDIDPQELG >NZ_CP049088.1|WP_021111382.1|1955681_1956665_-|thiamine-ABC-transporter-substrate-binding-subunit MKFKFFTLSALTLTTATVYAEQPTLTVYTYDSFASKWGPAAELEPLFEKQCQCNLKFMPFEDGVTMFNRIRLEKNKTKADVMLGIDHFLMPEAEKSNLFVEHNLQNNANNLPLEWQSKIFLPYDFGEYAFIYNKEKVSNPPKSLKELVERQDLKVIYQDPRTSTVGRGLLFWVNQVYGKQAESAWQNLAKHTVTVGKGWSETYGAFLKNEADLVLSYTTSPLYHQWHEQTDKYVAADFAEGHLVQVEVAAITKSSRQLKLAQQFLGFLQQPESQRIISYYNVMKPVVNTKADPLFNTLPTYQTISFTLPDNSEIKRWINTWLNIVNQ >NZ_CP049088.1|WP_021113044.1|1958001_1958232_-|zinc-ribbon-domain-containing-protein MALHRCPECRKKISESAVTCPHCGFSFNEADLEIYKQKLEQRRLHNQEINRKSVKLHLIWLAIFVLVIGLASLLSV >NZ_CP049088.1|WP_035493925.1|1958240_1959008_-|2-succinyl-6-hydroxy-2,-4-cyclohexadiene-1-carboxylate-synthase MLATTWHSHSGTPVVFLHGFLGSQQDWQPVLSLLQNTIAIRPLTLDLAGHGQSQAISYHSFQQAREQLHFTLQQHLAEQPFYLVGYSLGGRLALDYALTTQNPYLKGILLEGANIGLISDEDKKARWQNDCHWADRLSNEPLANVLEDWYRQPVFANLSESKRTDFIKKRLNNHGQALAQMLKATSLATQPYFSPEQRRQFHGKMLFIIGEKDSKFRQMAEQHQLPYHQIANAGHNTHCENPSAFVKHLIQFISK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
561 : 50055
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP049088|561:50055|DBSCAN-SWA 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56 | Haemophilus_phage(38.71%) | integrase,plate,tail,protease,transposase | attL 17579:17602|attR 33563:33586 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
112564 : 122328
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP049088|112564:122328|DBSCAN-SWA ATTAATAGAAAATTGCATTCAAAATATAGAAAATTAAAATTGAGAAGAATGCACCAGCAGGTAAGGTTACAACCCAAGATGCAACGATATTACGAATAACTGTTAAGTTTAACGCTGCAATACCACGAGCAAAACCTACGCCTAATACCGCACCTACTAAGGTTTGTGTTGTTGAAATAGGTAAACCTGTACCAGAGGCAACAACAACGGTCATTGCTGTTGCAAATTCTGCTGAGAAACCACGGCTTGGGGTTAGGTCAGTAATACCAGTTCCGATCGTTCCCATTACTTTGTAACCCATTACCGCTAAACCAGCAACGATACCCGTTGCACCTAATGGTAAAATCCAAGGGGCGAGAATTGATTTCGCTTCAATCACACCGCCGTTCTCAACGATAGATACTACGGCAGATAAAGGCCCAATCGCATTAGCTACGTCGTTTGAACCGTGAGCAAATGCCATTGAACAAGCGGTGAGTAACATTAAAATGCTGAACACTTTTTCTACACCACCAAATGCACCGCCTTGTACACGGTTAGCAAAAGATTGGCTACGGAAGTAGAAGAAACAAGTGATGATAGACGTAATTGAGATTGCACTTGAAATCACTAAGGTTTCAGTCATTGTAAGCTGTAAACCAACGTGTTTTAAGCCTTTTGTCATTGTAACAATACTCAAAATGAATGTGGTTAAACCCATATAGAATGGACCATATTTTTGAGCATTTTTCATCGGATTATCAGAATCAAAAATCAGTTTTTGTGTGCTAGTAAAAATAGCATAAGCAATGATCCCCGATACAACAGGTGTAACAAACCAGCTACCTACGATACCAGACAAATCACCCCAATGAACCGCTTCCGCACCAACGGTGACTAACGCAAAACCGATAATTGCACCGATAATAGAGTGAGTAGTGGATACTGGCCAGCCCATTTTAGAGGCAAGTAATAACCAAGTACCTGCAGCAAAAAGTGCCGACATCATACCTAGTACAAGGGTGTCTGGTCTGCCAGAGAATTGGTGAATATCAATGATGCCACTTTTGATGGTTTCAGTTACTTCACCGCCTGCTAAATAAGCACCAGCAAATTCAAAAACCATTGCAACTAAAATTGCCTGTTTTGCAGTGATAGTGCCTGAACCTACAGAGGTTCCCATTGCATTTGAAACATCGTTTGCACCGATACCAAATGCCATAAAGAAGCCAAACACTGCGGTGATGAGGACAATCATCGAGCCATATTCTTGAATCAGTTCCATTATTTAAGTCCTCTTTCGATTATGAACGAGCTAACATTAACTCAATGCGTGAACCGATACGTTGTGCTTGATCTGCAAGAACTCCGACCCATTCGATAATTTTGTATAAGAACATAATGTCAATTGGATTGTATTGTTGTTCAATCGCTAACATTGCTCGGCGTAGTACGATTTGAAGTTGATCCGTATCGTCTTCGATAACATCTAACTCTAAAATCATATTGTTCACAAAATTTAATTCGCGACCACGGAAGCCTGTTTCAAGTAGGTGATCCATTTCATTAATTACTTTATCAACGTGAACTGTTGCATCAAGGCTACGGGTTAAGAATTGTTGGAAAATAGGTTGGATTTCTTCAGGAATGTTTAATTGACGACCGATTGCACGACCAGAAATATCTTTAGCATAGTTTGCTAATTTATCTAACTGTGTAACGAGTTCAAGTAAGTCAGTACGTTCAACAGGCATAAATAAACCACGCGGTGATTTTAAACGAATTTCACGTTTAAGGGTATCTGCGCGGTTTTCTAAATCAATGACTTGACGACGGATATCTTCCGCTACTTCCCAATTTTTTTGAAAACTCGCTTCAAAAAATGGGATTAGTAATCCACAACATTCAGTCACTTTTTTTGAGTGCTTTTGTAATGGCTTGAGTGGCGACTGTGCGAATAATCCTAAAATATTATTCTTTGCCATAGGTATATCTCCAATAAAATTTAACAGCGTTGATTTGCACTTTTGCAAATCGGTGTAAATTTTACCGTATGTTTTCAAGAAGATCACGGATTAATGTTTAACAAGCGGTAATATTTGGTGTTTTTTTAGCAAAAATGGTAAAATAATCACAGTGTTTATCTTTGATAGCTGTTACAAATCAAAATGTTACCCCCACAAAATCCACACTTTTAAATTTACAATATCGCTTAGAAGTATTATTATTCAAGGCGTTTTGCCTATGAATGAGGCATTCAGTTTATTTATGTTGAAATTGATTAGAGGGTAGGTATGCAAAACCTAGAAAATATCGTTGCTGAAGCGTTGCAAGCGGTTGAAAAAGCCAGTGATGTTGCAAGTCTTGAAGCATTGCGTGTTGAATATTTTGGTAAGAAAGGTCATTTTACCTTGTTAATGCAAGGCTTGCGTGATGTGCCAGCAGATGAACGTCCTGCGGTGGGTGCAAAAATTAATGAAGCAAAACAGAAAGCACAAGATGCGTTAAATGGGAAAAAAGAGCAGTTAGAAACAGAAGAGCTCAATGCTAAATTAGCCAGTGAGAGTATTGATGTGAGCTTACCTGGTCGTAAAACAGAGTTAGGTGGTTTGCACCCTGTGTCGATTACAATTGAACGTGTGGTGAAATTCTTCTCAGAACTTGGCTTTAGTGTAGAGAAAGGTCCTGAAATTGAAACGGATTATTATAACTTTGATGCGTTAAATATCCCTGCACATCACCCTGCTCGTGCAGATCACGATACTTTCTGGTTTGATGCAGAGCGTTTGTTGCGTACACAAACATCAGGCGTTCAAATTCGTACGATGGAAAAAATGCAACCGCCTATTCGCATTATGGCGCCAGGGCGCGTTTATCGTAACGACTACGATCAAACTCATACGCCGATGTTCCATCAAATTGAATTGCTTTATGTAGATAAAAAAGCGAACTTTACTGAGTTAAAAGGCTTATTGCACGATTTCTTAAGAGCTTTCTTTGAAGAAGATCTGCAAGTGCGTTTCCGTCCGTCTTATTTCCCATTTACAGAGCCGTCGGCAGAGGTGGACGTAATGGGTAAAAACGGTAAATGGCTTGAAGTGTTAGGTTGCGGAATGGTTCACCCGAATGTACTTCGCAATGTGGGCATTGATCCTGATGAATACACTGGTTTTGCGGTTGGAATGGGCGTTGAGCGTTTGACGATGTTGCGTTATAACGTGACCGATTTACGTTCATTCTTTGAAAATGATCTGCGTTTCTTAAAGCAGTTTAAGTAATCTAATCATTTTGCGGATATATGCAGTTTGCGGACACACGCAGTGTGTCCCTACTATATTAATGGCTTATTTTCTCTTGTAGGGACACACTGCGTGTGTCTATCATAACAAGTGGTAAAATTTGTAGAAAACGTTACAAATATAGGATAGAAATAATGAAATTCAGCGAAAGTTGGTTGCGTGAGTGGGTTAATCCAGCGATTACCACCGAACAGCTATGTGACCAAATTACTATGTTAGGTTTAGAAGTTGATGCCGTTGAAGCGGTTGCAGGTGAATTTAACGGTGTTGTGATCGGCGAAGTGGTTGAGTGCGCTCAGCACCCTGATGCCGATAAATTGCGTGTCACCAAAGTGAATGTGGGTGGCGAACGTTTATTAGATATCGTTTGTGGCGCACCAAACTGCCGTCAAGGTTTGAAAGTGGCTTGTGCAACAGATGGGGCGGTGTTACCAGGTGATTTTAAAATTAAGAAAACTAAATTGCGTGGTCAGCCGTCAGAGGGAATGCTTTGCTCATTCTCAGAATTAGGGATTAAAGAAGATCATAGCGGTATTATTGAGTTGCCAGCAGATGCTCCAGTCGGTATTGATTTCCGTGACTATCTCAAATTAAATGACAGAGCCATTGAAATTAGTTTAACGCCTAACCGTGCGGACTGTTTAAGCATTGCAGGAATTGCGCGTGAAGTTGGGGTTGTTAATCAATTAGCGGTGAATGCACCTGAAATTCAAGCTGTGCCTGCAACTATTGCAGATAAAGTGACGATTGAACTTCAAGCCCCTGAAGCTTGCCCACTCTATTTAGGTCGTGTGGTAAAAAATGTGAATGTCAAAGCACAGTCACCATTATGGTTGCAAGAAAAATTACGCCGTTGTGGTATCCGTTCTATCGATCCGATTGTGGATATTACCAATCTGAGCTTACTGGAACTTGGTCAGCCAATGCACGCTTTTGATGCAGCAAAAATCAATGGTGCAATTCAAGTGCGTATGGCAAAAGAGGGTGAAGAACTCGTATTGCTTGATGGCACGACAGCAAAACTTCAGCCAAATACTTTGCTAATTGCAGACCAAAACGGACCGCTTGCAATGGCTGGTATTTTTGGTGGTGAAGCGAGTGGCGTAAGTGCCGAAACCAAAGATGTGGTGTTAGAAGCTGCATTCTTCGCACCGCTTGCAATTACAGGTCGTGCAAGACAATATGGCTTACACACAGACGCATCTCATCGTTTTGAACGTGGCGTTGATCCAGAATTAACGCGTAAAGCAATGGAAAGAGCGACAGCGTTACTGCTTGAAATTTGTGGCGGTGAAGCTGGTGAAATCGTAGAAGCGGTAAGTTCAGCCCATTTACCAACGTCAAAACAAGTGGTTTTACGTCGTAGTAAATTAGATAGCTTACTCGGTCATCATATTGAAACAGAAGCCGTAACTGATATTTTAGCTCGCTTAGGCTTAAACCCAAGCTATGCAGACGAGAGCTGGACAGTTCAATCACCAAGCTGGCGTTTTGATATTGAGATCGAAGAAGATCTTGTGGAAGAAGTGGCTCGTATTTACGGCTATAACAGCATTCCAAATAACGCACCGCTTGCTCATTTACAGATGAAAGGCTTCCCAGAGAAGATTTTAGAAGCTATTCGTGTGAGAACGGCTTTGGTCGATAGCGATTATCAAGAAGTGATTACTTATAGCTTTGTTGATCCAAAAGTGCAAGAGCTGTTACATCCAAGCCAAGAAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP049088|112564:122328|118728_119241_+|WP_005710634.1|DBSCAN-SWA MFYQLIKKHFSLCTMLLCAFLLSACVSKTSTVQDKSGNKHKGQLSDSIFVISSLSEHQREWKGTRYRLGGITKSGIDCSGFVQLTFRELFGIDLPRITVDQAKAGIQISKSELRTGDLVFFKTGRGPNGRHVGIYVKNGQFLHASTKGGVIYSDINSPYWSRSFWQARRL >NZ_CP049088|112564:122328|120098_120683_+|WP_005710639.1|DBSCAN-SWA MRLCDKDIERYLDEGIISLTPRPSNEKISGATIDVRLGNSFRVFREHSTPYIDLSGPREEMTAQLNRVMSDEILIADDEAFFLHPGELALATTLESVKLPANIVGWLDGRSSLARLGLMVHVTAHRIDPGWEGKIVLEFFNAGKLPLALRPNMAIGALSFEILSGYAEHPYNARKDAKYKNQQSAVFSRIDKDE >NZ_CP049088|112564:122328|115975_118363_+|WP_021118347.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKFSESWLREWVNPAITTEQLCDQITMLGLEVDAVEAVAGEFNGVVIGEVVECAQHPDADKLRVTKVNVGGERLLDIVCGAPNCRQGLKVACATDGAVLPGDFKIKKTKLRGQPSEGMLCSFSELGIKEDHSGIIELPADAPVGIDFRDYLKLNDRAIEISLTPNRADCLSIAGIAREVGVVNQLAVNAPEIQAVPATIADKVTIELQAPEACPLYLGRVVKNVNVKAQSPLWLQEKLRRCGIRSIDPIVDITNLSLLELGQPMHAFDAAKINGAIQVRMAKEGEELVLLDGTTAKLQPNTLLIADQNGPLAMAGIFGGEASGVSAETKDVVLEAAFFAPLAITGRARQYGLHTDASHRFERGVDPELTRKAMERATALLLEICGGEAGEIVEAVSSAHLPTSKQVVLRRSKLDSLLGHHIETEAVTDILARLGLNPSYADESWTVQSPSWRFDIEIEEDLVEEVARIYGYNSIPNNAPLAHLQMKGFPEKILEAIRVRTALVDSDYQEVITYSFVDPKVQELLHPSQEALILPNPISSEMSAMRVSLLTGLLETVAYNQNRQQNRVRIFESGLRFIPDANAENGVRQEFVLGAVIVGDKRPAHWEHKAENVDFFDLKGDLERVLSLTNAGNRLRFVAKSYPAFHPGQSAAILLDDQEIGYIGTIHPKVVQKLGLSGKPVAFELLWSAIAERSVPNAKEISRFPANKRDIAVVVDSNVPAGDLLDVARQAGGAKLVAVNLFDVYQGTNLPEGKKSLAISLTIQDTEKTLEEEEINAVLQAVLETLAQRFNAYLRD >NZ_CP049088|112564:122328|119428_120082_+|WP_010786629.1|DBSCAN-SWA MSNTTQKESCIVIAIAGASASGKSLIASTIYKELQAELGQDDIGIISEDAYYRDQSHLAMEERVKTNYDHPNSMDHELLVTHLKSLKQGQAVDIPEYDYAEHNRKETVTHFTPKKIIILEGILLLTDEKIRDEINVSIFVDAPLDICFIRRLQRDMEERGRTMESIVNQYRKTVRPMFLQFVEPSKQYADIIIPKGGKNRIAINILKAQIKQLLGHS >NZ_CP049088|112564:122328|114836_115820_+|WP_012621869.1|tRNA|DBSCAN-SWA MQNLENIVAEALQAVEKASDVASLEALRVEYFGKKGHFTLLMQGLRDVPADERPAVGAKINEAKQKAQDALNGKKEQLETEELNAKLASESIDVSLPGRKTELGGLHPVSITIERVVKFFSELGFSVEKGPEIETDYYNFDALNIPAHHPARADHDTFWFDAERLLRTQTSGVQIRTMEKMQPPIRIMAPGRVYRNDYDQTHTPMFHQIELLYVDKKANFTELKGLLHDFLRAFFEEDLQVRFRPSYFPFTEPSAEVDVMGKNGKWLEVLGCGMVHPNVLRNVGIDPDEYTGFAVGMGVERLTMLRYNVTDLRSFFENDLRFLKQFK >NZ_CP049088|112564:122328|118379_118676_+|WP_005710633.1|DBSCAN-SWA MALTKIEIAENLVERCGLDKRIAKQFVEDFFEEIRRSLESGEEVKLSGFGNFTVRDKKARPGRNPKTGEDVAVSARRVVVFKAGQKLRERVENAKVKA >NZ_CP049088|112564:122328|113846_114527_-|WP_005714552.1|DBSCAN-SWA MAKNNILGLFAQSPLKPLQKHSKKVTECCGLLIPFFEASFQKNWEVAEDIRRQVIDLENRADTLKREIRLKSPRGLFMPVERTDLLELVTQLDKLANYAKDISGRAIGRQLNIPEEIQPIFQQFLTRSLDATVHVDKVINEMDHLLETGFRGRELNFVNNMILELDVIEDDTDQLQIVLRRAMLAIEQQYNPIDIMFLYKIIEWVGVLADQAQRIGSRIELMLARS >NZ_CP049088|112564:122328|120813_122328_-|WP_021118348.1|DBSCAN-SWA MCGIVGIIGQTPVNQALYDGLTLLQHRGQDAAGIVTIDDENRFRLRKANGLVSDVFRQEHMLRLQGNVGIGHVRYPTAGCSSVSEAQPFYVNSPYGLTLVHNGNLTNNAELKRLLFNLAKRHVNTNSDSESLLNIFAYYLDQYPHEPLTPENIFESVRKTNQVIRGAYACLAMIIGHGMVAFRDPLGIRPLVLGKREIDGKTEYMFASESVALDVVGFEYVRDIQAGEAIYITFDGQFYSAICADNPKLNPCIFEYVYFARPDSVIDGVSVYSARVHMGKFLGEKIAKEWTDILADIDVVIPIPETSTDIALQIATVLKKTYRQGFVKNRYVARTFIMPGQAQRKNSVRRKLNAIASEFKGKNVLLVDDSIVRGTTSEQIVEMARQAGANKVYFASAAPEVRYPNVYGIDMPTCEELVAYNRSVEQVAEMIGVDRLIFQDLSALFKSVQLENPDIHNFDASVFTGEYITGDVSCEYLNAIAQARNDKAKTAQAKQAGNLEIHNE >NZ_CP049088|112564:122328|112564_113827_-|WP_021118346.1|DBSCAN-SWA MELIQEYGSMIVLITAVFGFFMAFGIGANDVSNAMGTSVGSGTITAKQAILVAMVFEFAGAYLAGGEVTETIKSGIIDIHQFSGRPDTLVLGMMSALFAAGTWLLLASKMGWPVSTTHSIIGAIIGFALVTVGAEAVHWGDLSGIVGSWFVTPVVSGIIAYAIFTSTQKLIFDSDNPMKNAQKYGPFYMGLTTFILSIVTMTKGLKHVGLQLTMTETLVISSAISITSIITCFFYFRSQSFANRVQGGAFGGVEKVFSILMLLTACSMAFAHGSNDVANAIGPLSAVVSIVENGGVIEAKSILAPWILPLGATGIVAGLAVMGYKVMGTIGTGITDLTPSRGFSAEFATAMTVVVASGTGLPISTTQTLVGAVLGVGFARGIAALNLTVIRNIVASWVVTLPAGAFFSILIFYILNAIFY |
9 | Ostreococcus_lucimarinus_virus(12.5%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
364342 : 459512
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP049088|364342:459512|DBSCAN-SWA TTTAAATTAGGCTGTGTCCGATATGAACCACTTGCCCGATGATTTGTAGGTTTTGGGCTTCATCTGCTGATATTCTGATTGGGCGGTATTCTTCTTTATTGTCGCTGATTAGCTCTACACCGTCCCATTCTATTTTTACACGTTTAACCCATACGCTGTCGCCGTTCTGGACTAAATAAATACGGTTACCTTTTACTTCTTTTTTACTTAAATCCACAAGCATTTGGTCGCCGTTTTCTATGGTTGGGCTCATAGAGTTGCCATTTGCCCAAAATACTGCGCAATGGTGGGCTTTTACGCCTAAACGTGCCAAGAGTTCATCTGAATAAGGCTCTTCCCCATCAGGCTCGGTTGTGCCTTCGTTAAAACTGCCAAAGCCTGCTGATACATTAATGCCTTCATAGCTGATAATCATTGAAATGTTATCTTTTAGCTTTTCCTGTATGGTGTTACTTGCAGGCGTTTCTTCACTTGTTTCATCTCTCTGCCCTTGCCCTGTGGCAAGCCACAAAAGATTTACATTCGATACTTCAGCTATTTTCACTAAATTTGAGCGAGAAGGATCCGCTTCACCTTTTACCCAACGAGCTAATGATGCCTGAGCAACTCCAACAGCTCTAGAAAATTCACTGTAATTACTCTTAAAACATTTTTCAGCAATCATTTTCATTCTTTCTGAAAACTTTTCATCGTAAATGTTTGGTTTACTCATCTTTTACGTTTCCGATATTTAAGTTTTACTCGTAAAACATATAGCTAAACCATTGATTTATAAATAAAATATGAATAAAGCAAAAATATTTTAAAAAATATTATGTTTTACGGTTGATTTATTTAAAGTTTTACGGTTAAATACACACATCAGATAGATAAAAAGGAGTGTATCAAATGAGTGTATTTAGCGACGTTAAAAAAACCGCTCAGAGTGATTGGCATCGAGCCGATATTCTGGCGGGACTTCGCAAAAACGGTTGGACACTTCGTTCTTTAGCAACAGAAGGGAACGTGAGTTACAACACCCTTAAATCTGCACTAGATAAGCCTTATCCCAAAATGGAACGCCTAATCGCAAATGCGATTGGTGTTGCCCCTGAAGTGATATGGGCTGGTCGCAATGCAGAACGCATAGAACGTAATAAACGACCGATTTTAACTAATAAGTTTTAATCATAAATGATCTTTAACGTAAAAGATAGATTAAAGGAACGTTTATGAGTGAATTAAGTTTAAAAACGCACTATTCAGTCGCAGAGCTATTAAGTTTTAAGTTATCTAGTCTGCCAAGTGCTCATAAAAACGTTTTAGAAAAAGCTAAAAGGGAAAACTGGATAGCACAAAAACGTAAAAGTAAAGGTGGTGGCTTAGAGTACGAGCTCATTTCAATGCCCGAAGCCGTCCAAACCGAAATCCGCTCACGTTTTGCGGTGGCGGTGGTGGAAAGTAAGCCGAAAAAATTACCTGCGGTGAAAGCCGAGGTGGATTTGGCGAACTTGACAACCAAACAGCGTGAGATTGCTGACGCTCGCATAGGGCTGATCCAGTATGTGTTGGATTTAGAGCAATCAATGAGCCGAATTAAAGCGGTCACTTATGTTTGCGAACTTGCAAAAAGTGGCAGATTGCCTCCGCATCTTGCGGTGTTGGTTGAAACGGCTAACGCTAAAAAATCGAAAAAACGGACAGTAAGCGTTCGTACTTTAAATGGCTGGGTGGTGGATTACTGCAAGGTGACAACCATTGAGCAACGGTTAAAACTTTTTGCCCCGCTCGTAAGGCAGGAAGTTAAGGCAGAAGAAATTTGGTGGCTTTCTTGGTTGTTGGGGATTTACCGCCAGAAGAATGCGTTAAGCGTACAAGAAAGTTACCGCTACTTTGAAGCGGAGTGGGTTGAACGGTATGCCGACAATCCGATGATGTTAGAGGCAATGCCTAATATCAGCAAAGTAAGACGAGCAATGGCGAAGTTGCCGATCCATATCTTAGAGAAAGGTCGCTTAAGTGGCTCGAAATATAAGCAGTTATTGCCTTATGTGATGCGTGATTGGTCGCCATTTGTGGCAAATGATATCTGGATTGGTGATGGTCACTCGCTGAAATTAAAAGTTGCCCACCCTGTACACGGCAGACCGTTTACCCCTGAGTTGACAATGATTGTTGATGGGGCAAGTCGAAAAATCGTGGGTTGGTCGCTGTCGTTGAGTGAAAACGCTTTTGCGGTGCTAGATGCGTTACGACACGGTATTGCGACACACGGTGTGCCAGCGATTTATTACTCTGATAACGGTGGCGGTGAGAAAAATAAAATACTTGATGCAGAAGTCACAGGGATTTTACCACGTTTCTCTATCCACCACGCAACAGGGATTGCAGGTAATCCGCAGGGGCGTGGGATTATTGAGCGGTTAAATAAGACGGTAGGTTTACGAATTGCAGAGCGATTTGAAACTTACTACGGCAAAAATGCCGATCCTGAAGCCACTCGTAAGATGTTGGCTAGACAGTTGGCGTATGCGAATGCAAAAAATGGCAAGGAACTGACCGCTTTGCAGAAGAAAGCTCGCAGAGAGTTGCCAAGTTGGGAAGAGTTGAAGGCAGTTATTCAAGAAGTGATTGATTGGTACAACAATGAACACGTTCACAGTGAAATTCGCTGTACGCCAGCGGTGAAATACCAACGAGTGACCGACATTGAAAAAGTGGTGTGGTTGAGCGATGTGGAATTAAGGGATATTCAACGTCCTGAATTTATCCGCACAACGAATAGAGGCTTGATTGAGTGGAACAATCATAAGTATTTCAGCTTGAATTTGTTGGATTACCAAGGGGAAGAAGTTGTTATCGGGGTGGATATTCACGATCCGATGTGGGTGCAGGTGCGAACCAAAGACGGACGGTTTATCTGCAATGCAGAGTTTGAAGGGAATAAACGAGATGCGTTTCCGCAGTCCTTTGTTGAGCAGAAGCGTGAGGAGCGAGCTAAAGGCAGACTTAAACGGAAAGAGCAACAGGTGGCAGAAATTATGGCAGAGCGTAATCCTGTTATTACGATTGAACACCAGCAAAGCGAGTTAATAACCACAAGTTATCAACCAAAACGAGAAAAAGTGTCTGTTCGTCCTATTTTTACCAGTGTGGTAGAGAGGGAGGAGTGGGAGAAGAAACAAGCATTAATTGAAGCCGTAGGCTAAGGGGAAATAATGAAGAAAAGTGAATTATTAAAACAGTTTCAACGTGAAGAACAGTTAAACGTTGAGCGTAAAAAGGTGCGTGAGGCAAGACGTGCGGAGTTAAATGCACCTTTAAATAATAGGGCGACCTGTTTAGTTGAGTTTAATGGAGTGGCTTTTGAGCTTTTTCTTGAAGTTCGCAAACTTGCTCCATTAAAGGCAAATACAGATCGTCCGCTACTTGAGAAAGTGTATCAAGCGTTTGCGAATCCACACCTTCCGCCTCAAGTAGATCCAGTTGCATATCAACAACATTTGAAAAATCACTTAGGGCTTGCTCTGCAATCTCTGGTGATAGGGTTGCTAATTGGCGAAATAGAGAATGAACAAGCTCAGACTGAATACCTTGTATCCCAGTTAGCAAAACGAGGAGTGAATGTAGCTCTGATTTAGTGAGTTTATTAAGGTCAGGTGGAGTTTTAAGCATAACGAAGCCTGTTGATGAAAAAAGAGACTTTGATTATAGGAAATAAGCGATGAAAAACCAACTATTAAAAGATTATATGGAACGCACCAAAATTGGGCAAAAAGAGGTTGCAAATAAATTAGGGGTGTCGATTGCTACGGTGAGTTTGTATTTGAGGGGTGAGTATGACGGCAATGTTGAAGAGTTGAATATTAAGGTGGAGCAGTTTTTGGCTCGCCAAAAAGATAAGGTGCTTGAGTATAAGGTGAGTGCAGAGTTTGTGCCGACTTTTACTGCTCGTCAGATTATGGCAACTATTCAAGAGGCTCACGTTGAAGGTGATATGTGTGCAGTGTATGGCGCATCAGGTTTGGGTAAAACGCAAGCGGTGTTGCAGTATGCGAAAGAGAATACAGGGGTAATTTTAATTGAGACCAATATGAGCTACACCGCAAAAGTGCTGTTGCAGAAAATCAGTGAAAAACTGAATTTAAACAACCGAGGTACGCTTGATCAGCTGTTTGATGGGATTGTGGCAAGGTTAAAGGGTAGTGAACGGGTCATTATCATTGATGAGGCGGAGAATTTACCTACTCGCTCGTTGGAGTTTATTCGCCGTATCCACGATGCAACTAAAGTGGGTGTTGCATTGGTTGGGACTGAGCGTTTGTTAATTAACTTAAAAGGCAGACATAACGATTTGGCTCAGGTGTATAACCGCATTTGGCGAACGAGTTCTCTCGGTAATGCGTTACCTGAAAAGGATTTGCATTTATTGACAGAAAGAGCGTTGAACACAGGGGAATATAACGAGTTATTTTTTAAGCATAGTCAAGGTAATGCGAGACGTTTGAACAAGTTGATTCGTGGTGTGGTGCGGTTAAGTCATATCAATGAATGTCAAATTGATGAACGGTTGATTAAAGAGTATACCAAGATGTTGATTGGTTAGGTGGCAAATGAGGTACCGTCAGATCTATGCGGCGTATCGTGGCGAAGAGAATGTGGCTGACGGTACAGCCGAAGAGTTAGCAATCAAGTTAGGGGTGACAGCAAAGACGGTGCGGAAATGGTCAACGCCGAGCTATCACCGAAGAAATAAAGGGCAACGGGTGATCGTTGTGAAGTTGGGAAAAGAAAAGGTGGTGTGAGATGGCACACACAATTAATAGAGCAAATCAGATGGCGGTGAAGTATTTGCGCCAAACACAAAAGGCGATTGGGCATATCAATGCGTTAGGTTTTACGGTGTTGATGATTGATTTTACGAAGATTAAACCACGAATCAAAGTGGATATTTCAGGTAATGAGGGGGTGGCAAGAGCGTTAATTGAGTCAAGAAAAGCAAACTGGTATGCCCAAGGGCA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96 | Haemophilus_phage(70.15%) | portal,integrase,tRNA,terminase,tail,plate,transposase,capsid,head | attL 357222:357237|attR 463727:463742 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
540106 : 556639
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP049088|540106:556639|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP049088|540106:556639|545764_545941_+|WP_021113607.1|DBSCAN-SWA MKQSEFLRWLIAQGVVKEEGSKHIKLYYNGNQSTMPRQPSKEIKNGTMRAIKKQLGLN >NZ_CP049088|540106:556639|551124_551460_-|WP_021118482.1|DBSCAN-SWA MLAYAKKEFELDKKPKDSDCTLREHLLAIQEQTGSVPEELENIEISPAISYLLGFFYELSLSRQSGMGLSPITYAEIEAWNRLLQIELAIWEIKVIKQLDVIFLNVQNTEI >NZ_CP049088|540106:556639|554521_554872_-|WP_021118475.1|DBSCAN-SWA MKILYFTHDFSSENVKFAKENGLTLRNLGAYHATDFIEQCDAVCGDIPERYQHLPKHTLPESSSQQKTLDKMTVPELTTALKALSVDIPQGAKKDELIALLKQAEGGDNDPERTNG >NZ_CP049088|540106:556639|554085_554547_-|WP_021118476.1|DBSCAN-SWA MTLNVPTDSYVSLEEANGYHQLRASFDVWNELDDEQKARRLVSASDFLDHNYRFVGEKADPTQIRQFPRQESSQESSEIPLQVKYAVCELALQSDLNQNTEQKMASVKVGPVSVNYENQAVISGSSNRFEYVKTLLSRFLNSSSTNNVSLLRG >NZ_CP049088|540106:556639|553702_554083_-|WP_021118477.1|DBSCAN-SWA MYGKLKQISKQLIQKFGSPCVIKTQISGQYDPATGKMQTEISKQSAYCLFDNLAYDFPSFQSGGTSRGEAVAIEQGDVVIYLTEKAEVGSAVEVNGEVWSIIAVQPIKPANVAMLYQCQGRKQLNE >NZ_CP049088|540106:556639|551888_552893_-|WP_021118480.1|DBSCAN-SWA MAQEVKRTLVISKESVFGTKPAKTGAKIIPRIETSLNANFESFQSEEIRSDLQRSASIVGFEKVEGDIKGELSAGQWSQFFAAVLRGAFTAEAKAPIIKKTSNGTGEKNGKILIVPETNHTTDSFTIEEIFQDINVNRVYTGCRVSKMSIDAQPNGISSVTVSFLGQKSEELQATYFTNPTPIAQSGKLAGVKGKLLLNKAEVGFVTGFKIDIDLGASSEPVLGATYAPDVFIGSIKVSGSFSTYLKDKAMWQAVRNGTSLSLALRMDAESETNSDYVTLILPGVKLTSSEVNSGDNLIQTLNYDAFPAVFDAESTIDDSLKKATTMIVQDTLA >NZ_CP049088|540106:556639|554925_555876_-|WP_021118474.1|DBSCAN-SWA MAFDLQVFNKQTQTALTEMVDQDIQKFNEASAGTIVLQNVPTEGDFDIRSSFKAISGLVRRRNAYGSGSVDSKRLQQMLNVAVKVAAGTPPLEYEPQQYHWILKNPELAAITIGEQLAKARMADMLNTAVLAGVAAIGGNTKTVLDDKTNAPTFRTLNKGAALFGDRSSAIKGWALHSTTMHSLFDNALTNTEKLFTYDNINVIRDPFGRLFIVTDSPALVDTQNTAYNTLGLVENAIIVSGNNDFNSVIVPKTGGENISATYQAEWTYNVGIHGYTWDMQAGGKSPNDSALGTPTNWVKSATFDKDTAGVLIKTR >NZ_CP049088|540106:556639|550796_551123_-|WP_021118483.1|tail|DBSCAN-SWA METFNFNPDWGMQLTKKPEVMKLKFGNGYEQVAPKGLNHNLRIYDISFSGTESRIKQIEAFLNNQGGVKAFLWTPHGSTQGKFRCDEWKTNQQQGFWTLSAQFREVVA 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18 | Mannheimia_phage(94.12%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
559841 : 573063
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP049088|559841:573063|DBSCAN-SWA 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24 | Mannheimia_phage(68.42%) | terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
578848 : 590366
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP049088|578848:590366|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP049088|578848:590366|582411_583050_+|WP_021118260.1|DBSCAN-SWA MTQPIFTYNQEQAVKAGNSAFISETGAYNCKIISAEYVQSQGGALSLEFSVETQEGLKGNYLSVYYQGKDGQPLQGGQNMIQAIMGCTGVQVLTQQFKDGRAYAPELSGKYVGLMLQKVLRTKQNGSDTYGFSILCPYFIKTKKTLSEHIENKPAERIQWLVEHTKDKDERDKQQKQQQGYQAQHQFYGQQATPPNSPQQPQVDNFDDDIPF >NZ_CP049088|578848:590366|580444_580765_+|WP_021118256.1|DBSCAN-SWA MNTLIKKFNLKYLLCALLIAFVIGGSLTGCEEPEPVSTLPVESNFQTEKIWTEDDFKRAEIAPEEVNYNALALHLPPPDNVTENDVEMIKQHNQNQLNKLIAGVKR >NZ_CP049088|578848:590366|583697_584270_+|WP_164681609.1|DBSCAN-SWA MTEQTQKKYELLKDDTVNHNGRTLYRIKALITFGTVVAGELGGYIETEKNLDHSGNAWVFEDAWVCGNARVYGNAEVYGNAEVYGDAEVYGDAEVYGDARVYGDTLVYGDALVRSFAVISERKMIFCASNVGPKNRTLTVFNGKYGLIVTRGCFTGTVDEFLSKSKEVHDDKTHHEYKLLIEVAQSRILN >NZ_CP049088|578848:590366|585703_585967_+|WP_164681611.1|DBSCAN-SWA MKTLNPFKLRKQLNYYVTLCSRQALALIRANEHVSELIAQNFKQQQELEQIKAKAESLAKALEFEQFQVRRFEEIEKVVTHGQGFNI >NZ_CP049088|578848:590366|589367_590366_-|WP_005712908.1|integrase|DBSCAN-SWA MATIIKRGDKWRVQINKKGIRKNATFSTKVEASRWAISVESQIEAGEYSSIPKMTFAELIDKYVAEVTVNKGGAREESLRLNRIAKTPLGRVELEDLNKEHFEKWQNKRLTEVSVLSVLRERVSLSAVVSQAIKWEFLKSNPLSLVDKPKEPPPRTRRYSQDEIDRLLFVSGFDFDKQPETMISRVGASILFAIETAMRVGEICNLKWEDVDFNKSTAFLPKTKNGFARTVPLSSTAIKILRHLEKVKSECNQTVFQVKSSSHDAIFRKMKELAGLADQDLHFHDTRREALSRLAKKVDVMTLAKISGHRDIKILLNTYYAPDMSDVAGILG >NZ_CP049088|578848:590366|581255_581732_+|WP_021110753.1|DBSCAN-SWA MKLYELSEGYQNLLDLLDQEEYQDNEDIINAIEKIQEEFGKKADSVVRLIKTAEAEANAIDPELKRLTARKRARENLAKRLKAYLLDNMTDLKIKTELFTISVAKTQSVDVQIPVEHLPLEYQKISIEPMKTELKKAIKSGVIIEGVTLVDSPYLAIR >NZ_CP049088|578848:590366|583162_583351_-|WP_021118261.1|DBSCAN-SWA MAMSRTEIVRRSEEKHGIKLKAFKLPLVVIAEIEQLSTQLNIPQNQLIIQAVELFKQSQKGE >NZ_CP049088|578848:590366|587479_588343_+|WP_021118921.1|DBSCAN-SWA MKKMCRLSALAILVASISACSPFSVDEGELGLVTKYGEIVEQKGAGLHWRSWLEDDVVFSTREVKARIGQFDDNGDVISGVSAYTRDTQTVTTALTISYKLTDPIAVYKNFRTTENMASQLIEPRSRQALEVVFSNYTAQKALENRAQLSTDITAQIRKAVEGYPIEIVSVQSVIQFSKEYEKRVEESVQKNVAIQTAERELIIQQKQAEIVKVNAQAKADAEVIQAKADAEKVRLAGEAEAAAIRAKGEALKENRQLVELTAAEKWNGVLPTTMTPNGTLPFVKVQ >NZ_CP049088|578848:590366|580761_580983_+|WP_021118257.1|DBSCAN-SWA MNKQPTAKVNVIPDKNGLYRGYIYADGKQLERTSGYFSKTNCITYLNQRVDYWNERKNLNIPKYVQEQQNAST >NZ_CP049088|578848:590366|580969_581176_+|WP_021118258.1|DBSCAN-SWA MRVPDPMRYETKDDYYNALEKFEAYQQAKYNDEVVPDEWDEFCEEVLICNPRERDYQDQTWLFGRKDV >NZ_CP049088|578848:590366|589080_589371_+|WP_005712911.1|DBSCAN-SWA METQNIVTNEQVFEKLCAIEELLLSPQIEKGLWSIKDVANYMDLSYRHVYENIVTDPRFPAPVDIPGKDGAKPKKLYIKTEVISYFERHKQKKNRI >NZ_CP049088|578848:590366|588755_589049_+|WP_021118174.1|DBSCAN-SWA MTETISVNHRTFQTLAIQSLRYCMGRRTFAVIDCVEFIREHWQDLTKHAKAVIIRDLDEALQSHEDDLRDNRDYCYLGDQCDYQKWKNLREWINEQA >NZ_CP049088|578848:590366|588561_588759_+|WP_164681614.1|DBSCAN-SWA MQLEAEKFVKILSHLQGICTTLGYEDIKFLCWLEKEDGNMEFVLEDGKSNQRLSFILPFKKEATK >NZ_CP049088|578848:590366|585090_585735_+|WP_078208345.1|DBSCAN-SWA MNELLSIIQTMGRKHDNLRVFQDFVEICACAISKPFQDRDERYFSIKSRYTDDEMYQFHQLGQILLNLLEEEPQDVLGQCYMKLQIANKQRGQCFTPISTGQVMANILIAPNEISEKGYFTLNEPTCGSGALIISFCETLKSQGYNPQQQLLVIAQDIDLKSVQMCYVQLSLLGISAIIQHANPIANNVIDTYYTPLYLLQRNRYENTQSFQTA >NZ_CP049088|578848:590366|586973_587423_+|WP_164681613.1|DBSCAN-SWA MIIESNWIDIDSTNKQKIPLLTPLYIKTRNYGIYVGFLGTFPAKDNFDYIDEDGNKFIYKWDVPEISSTLPFNEVESYSLVPIISDVNQEFNWISVDEALPESQGYYLVFCPYWENKVCSVQFDLDLGGFLDFSDEITHWQPLPPPPTK >NZ_CP049088|578848:590366|581753_582410_+|WP_021118259.1|DBSCAN-SWA MSVAILILGESGTGKSTSLRNLDPTKTLLIQSIGKPLPFRAKEWQLITKDNPTGSIFICDNAETICRAIAKTDREIIIIDDYQYIMANEFMRRAKEKGYDKFTDIGERAWAVFNQALNLPMNKRVYILAHTETDPFGKTKIKTIGKMLDEKITLEGMVTICLRTHVNDGQYQFSTQNNGSDTVKSPMGLFETQFIDNDLKLVDDKICDYYGIHTTQEQ >NZ_CP049088|578848:590366|585980_586667_+|WP_164681612.1|DBSCAN-SWA MISEQDKQAILNGAYGVSRKGHKCKFVGLINGTHSYRHMFVYFNEKGLIFNTEHLYEDFRYHTEFESPEDVVGLWEDKPEPFDVDRALNGEPVMLRNGLKAYVKYVMPKEYKGSHSMKGYVIDDKWSDGAYTLSWHLNGKAIEENCNHHLDIIGMYKEPKPQTNTVTLTLPCPLKEPRDEMWFISPWEEVSKSSYDRNMSERDFKERPYFASKADAQAWVDTLKNIGI >NZ_CP049088|578848:590366|584306_585089_+|WP_164681610.1|DBSCAN-SWA MTENIEPYLQPQKRQIIADKDKEKQLLKMAKEHYRSYADVAKFADALNLRAGIVYLTLKYHGFIKQTETTQYRVLDSYYQHNGDLKEITKDVGLTVWIVAKTLEQLNLSPNWASYKDRAETGLKGDWAENEFKRLVPSAIDMNMQYQMNNPRFDFVVNNKEIDVKYSSVRKVRGSKQYALRYDPDNLPDFFCLFASDDEVEKSDDPPSGYRILLLPREILPKNKTQVNINSDPDNKRASSTMYWDFAVEPAALSALLENI >NZ_CP049088|578848:590366|578848_579037_-|WP_005714998.1|DBSCAN-SWA MALSRTEINARSEAKRGIVTKSFKIHQSVSEQIDRLAVELGISKGKVLEQAIELFEQSQKGA >NZ_CP049088|578848:590366|579563_580364_+|WP_021118255.1|DBSCAN-SWA MSNLQILSTSIRQLDNLFNLKDLHIVAGNEKKHEPYLFVRLDTTKELIEEIQKEDPTTQPLKTLRGTQGGTYACEELALAYAMWISPKFHLVVLRAFLAMHKGELQNSAQIAPLTITPEQQRAIQEAVQQAHYRTGLHWQEIYSRLKSTFNVAKYDQLPQTMFEHVINFLNTLGNQYRPIDRSKKDITIAGLDAEQIAKYLVRARAFAKEVEVFHRKLYEDLGISRYVKNDIAGKAYDIAHEFNVWLDPFIEQVLPQLNQQRLARF |
20 | Mannheimia_phage(54.55%) | integrase | attL 587838:587851|attR 590448:590461 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1186133 : 1230232
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP049088|1186133:1230232|DBSCAN-SWA TATGTCGTGGAACGAATCAGGCAATCAGCAAGATCCTTGGGGTAAACCAGGGCAAAAAAAGCCTGAACAAAAACAACCATCGGGTCAAGAAAAAGAGCCGAATAAGCAATCAAATGAACAGCAACCACCTGATTTAGAGGAAGTTTTTAATAGCTTATTGAGAAAAATGGGTGGCGGTAAAGGCAATGGTTCAAACCAAAATAACCGTCCAGCTGTTTCTGCAGGAAAATTTTTACCTGTATTACTCGGCTTAGGCTTAGTTGTATGGGGAGCTTCAGGGTTTTATACCGTCCAAGAGGCAGAACGTGGCGTAGTTACTCGTTTCGGTAAATTACACGAAATTGTTTTACCTGGTCTAAACTGGAAACCAACTTTTATTGATAATGTAACGCCAGTGAATATTGAACGTGTGTTAGAACTGAGAACTAACGGCTCTATGCTTACCCAAGATGAAAATATGGTGTTGGTAGAAATGACCGTTCAATACCGTATTGAAGATCCAGCGAAATATCTCTTTAGCGTGACCAAACCTGATGATAGCTTGAAACAAGCGACTGACAGTGCATTGCGTTATGTGATCGGACATATGACAATGGACGATATTTTAACCACAGGGCGTGCGATTGTGCGTGAAAAAACGTGGAATGCCTTGCGTGATATTATCAAAAATTATGATATGGGATTATTGATCACCGATGTGAACTTCCAATATGCTCGTCCGCCTGAAGAAGTGAAAGCGGCATTTGATGATGCCATTAAAGCACAAGAAGATGAGCAGCGTTTAATTCGTGAAGCCGAAGCCTACGCAAGAGGGCAAGAGCCAATTGCTCGTGGTCAAGCACAACGTATTTTAGAGCAAGCAAATGCCTACAAAGAGCAAGTTGTGTTAAATGCTCGAGGTGAAGTACAACGCTTTACTCAATTATTGCCTGAATATAAAGCCGCACCAGAAGTCACTCGTGACCGCTTGTATATTCAAACAATGGAAAAAGTGATGAAAAATACACCGAAGTTAATGGTAGATAGCTCAAACGGCAATAATCTAACGGTGTTACCTATTGATAGATTGATGGCTAAATCAACGACAAATGAAGCGGTAAAAACACCATCATCACAACCTGTTATTCAACAACAGCCGCAACTTGCTCAACCTGTTAGCCCTGCTCAATTACCTGCAGTGGAACAGAATGAGCCTGTGCGTAAAGGGAGATTTTAAGAATGCGTAAGTTACTTTTACCTGTTTTAGCTGTTGTGACATTTATCCTTTTCCAATCGGTTATCGTAGTAAAAGAAGGTCAGCGTGGCATTATGTTACGTTTTAACAAAGTACATCGTGATGCCGATAATAAAGTGATTGTTTATAAACCAGGTTTACACTTTAAAGTGCCTGTTATCGATCAGCTAAAAACCTTAGATGCTCGTATTCAAACCCTTGATGGACAAGAGGATCGCTTTGTCACAGTCGAGAAAAAAGACTTGCTAGTGGACTCTTATGTGAAATGGAAAATCAGCGATTTTGGTCAATTTTATACTTCAACTGGTGGCGATACACAAAAAGCTTCAACCTTATTACAACGTAAAGTCAATGACCGTTTACGTTCTGAAATCGGTTCTCGTACCATTAAAGACATCGTTTCAGGTTCTCGTGGTGAACTGATGGCAGGAGCGCAAAAAGCCTTGAATGATGGCGAAGATGGTGCAGAACGATTAGGGATTGAAGTAGTTGATGTGCGTGTAAAACAGATCAACTTACCAAATGAAGTATCAGCCTCTATTTATCAACGTATGCAAGCTGAACGTGCCGCCGTTGCTCGTGAACACCGTTCACAAGGTGAAGAAAAAGCAGAATTTATTCGTGCTGATGTTGATAAAAAAGTGGTACTCATCTTAGCCAATGCAAATAAAACCGCTGAAGAACTAAAAGGTCAAGGTGATGCAGAAGCTGCTAAAATCTATGCTGAAGCATTTAAACAAGAACCTGAATTTTACAGTTTTGTGCGTAGTTTAAAGGCTTACGAAGAAAGTTTTGCTGCAGGCTCAAACAATATGATGTTGCTTAAACCAGACAGCGAATTTTTCCGCTTTATGAAAGCACCTACAAAATAGTTATATCCAAAGACCCGATAAAGCGGGTCTTTTTTATCTTTAAAATAGAAAGCTACAACGAGGTTGTAAAATTTTAGGTTGTTATATAACAGTTTATATTAACCAAAATGTAGGGACACACTGAGTGTGTCCCTACAGTATGCCTGAAAGATTGAGGTTTAGCGTAACTGTAACAACCAAAAAAATCTAACCGCTTGTATGCTTTTGACATTCACTAAACCTAACTAAAAGAGGCAATTTATTATGGGTAAAAGTGTTGCAATCCTTGGAGCTCAATGGGGCGATGAAGGTAAAGGCAAAATCGTAGATTTATTAACGGATCGTGTGAAATATGTGGTTCGTTACCAAGGTGGACATAATGCAGGTCACACCTTAATTATCAACGGCGAAAAAACCGTACTTCGCCTTATTCCATCAGGTATTTTGCGTGAAAACGTGACCTGCTTAATCGGCAACGGTGTAGTCCTTTCTCCTGCGGCATTAATGCAAGAAATGGGCGAATTAGAGTCCCGTGGTATTAATGTGCGTGACCGTTTAAAAATCTCTGAGGCTTGCCCATTAATTCTGCCATATCACGTTGCAATGGATCACGCTCGTGAAGCGGCGTTAGGTAAAAACAAAATCGGCACAACAGGTCGTGGTATCGGTCCAGCTTACGAAGATAAAGTCTCTCGTCGTGGTCTGCGTGTCAGCGATCTATTCAACCGTGAAGCCTTTGCAGAAAAATTAAAAACTATTTTGGAATATTACAACTTCCAACTAGTTCACTACTACAAAGTTGAGCCTGTAGATTACCAAAAAACCTTAGATGACCTTTTTGCGGTGGCAGACATCATCACAGGTATGGTTGCAGATATTACAACCCTATTACACAAAGCACGAGCCAATGGCGACAATATCCTGTTTGAAGGTGCGCAAGGCACAATGTTAGACATTGACCACGGTACTTATCCATTTGTAACCAGTTCAAATACGACTGCTGGTGGTGTTGCAACGGGTTCTGGCTTCGGACCTCGCAATTTAGATTATGTATTAGGCATCATCAAAGCCTACTGTACTCGTGTGGGTTCAGGTCCGTTCACTACTGAACTTTTTGATGAAGTCGGTGCAGAAATTGCTCGTAAAGGTAACGAATTTGGTGCAGTCACAGGTCGCCCACGTCGTTGCGGTTGGTTCGATGCCGTTGCCGTTCGCCGTGCAATTCAAATTAACTCAATCTCGGGCTTCTGTATGACCAAATTAGACGTACTTGATGGCTTTGAGGAATTAAAAATCTGTGTCGCATACAAATTACCAAATGGCGAAATCGTAGAATACTCACCGCTTGCGGCGGCAGACTGGGAAGGGGTTGAACCGATTTATGAAACCTTACCAGGTTGGAAAGAGAATACTTTCCGTGTAACTAAATTAGAAGATTTACCGCAAAATGCGATCAACTACATCAAACGCATTGAAGAAGTGTTAGGTGTACCAGTCGATATTCTTTCAACAGGCCCAGACCGTGTTGAAACAATGATTTTGCGTGATCCGTTTGCAGAGTAATTAGATTTTAACGATAACAATCTCCTAGTTTGTAGAAATTAGGGGATTTTTTGTATAAAACAGCTCGGATCTGACCGCTAGTTTACATTTATGTTGCGAACTTAGTGACAAAGTAGTGTAAAATAGCCAAGTTTTCGTGATTTATTATTCATAGAGGAAAAAGAATGAAAAGAGTCGTCATCACAGGTATCGGCATTATTTCGAGTATCGGTAATAACAAAGAAGAAGTATTAGCTTCATTAAAAGAAGGTAAATCAGGCATTGAATTTGTACCTAAATTTGCTGAAGTGGGTATGCGTAGCCAAGTTGCTGGAACAATTAAATTAAACCCTGCGGAATTAATTGACCGTAAAATTTATCGCTTTATGGGCGATGCAGCTGCTTATGCTTACCTTTCAATGAAAGAAGCAATTGAAGATGCTGGTTTAACCGAAGAGCAGGTATCTAATGATCGTACAGGTTTAATTATCGGTGCTGGTACAGGCTCTGCACATAGTCAATTAGTGGCTTGTGATGCAGTGCGTAGTCCTCGTGGTGTAAAAGCAATTGGCCCTTATGCCGTAACTAAAACAATGGCTTCAAGTGTATCTGCTTGCTTAGCAACCCCTTATAAAATTCGTGGTGTAAGCTACTCTATCAGCTCTGCTTGTGCAACCTCAGCACACTGTATCGGTCACGCAATGGAGTTAATCCAATTAGGCAAACAAGACGTGGTTTTCGCTGGCGGTGCAGAAGAGTTATCTTGGGAATGTGCAACGGAATTTGATGCAATGGGTGCAGTTTCAACCAAATACAACGAAACCCCAACTAAAGCTTCTCGTGCTTACGATGCCAACCGTGACGGCTTCGTCATCGCAGGTGGTGGTGCTGTTGTTGTGGTTGAAGAGCTTGAACACGCCCTTGCTCGTGGTGCAAAAATTTATGCGGAAATCGTAGGCTATGGTGCAACATCAGACGGTTACGATATGGTTGCCCCAAGTGGTGAAGGTGCGGAACGTTGTATGAAACAAGCGATGGCAACAGTTAAAGGCGAAATCGAATACATCAACGTACACGGTACATCAACACCAGTGGGTGATGTGAAAGAATTAGGCGCAATCAAAAATGTCTTTGGCGATAAAACCCCAGCGATTTCATCAACTAAATCAATGACCGGTCACTCATTAGGTGCAGCAGGTGCTCACGAAGCGATCTACTCGCTATTAATGTTAGATAACGATTTCATTGCACCAAGTATCAACATTGAAGAACCTGATGAACAAGCACAAGGTGTGAATATCGTAACAGAATGCCAAGACAAAGCGTTAACAACCGTAATGTCTAACAGTTTCGGCTTCGGCGGTACAAACGCT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40 | Bacillus_phage(27.27%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1238649 : 1282792
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP049088|1238649:1282792|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP049088|1238649:1282792|1245280_1245757_-|WP_035522942.1|DBSCAN-SWA MKVKCSACGAIHSLDALVANEAASQALNAALLINGELGRALIGYLGLFRPTESSLTFKRVTTLLNELTPMITAQTIKRDRDTFPAPPEAWIYAINQMLANRQTLKLPLKSHGYLLEIIASYKPVSTAVVVSDYGKSHTHSTSSKMNAVKGALEWATNG >NZ_CP049088|1238649:1282792|1280871_1281339_+|WP_021118215.1|DBSCAN-SWA MDKIYLALYKGNTKNWRERLEDWLIRKATKGQYSHCEIAIHKSRIFDHYHQEEWFECYSSSLRDGGVRCKIINVSDRSKWDLVELPNVTEAQIRFYFEITKGKKYDLWGALGVVLGFKQRGERFFCSEWCFNAIFNSEQGWRFSPNQLAEIVRRV >NZ_CP049088|1238649:1282792|1245806_1246220_-|WP_035522945.1|DBSCAN-SWA MKKYRAKFHVSVQPKEDNLGIKTGIKSARLPPQITELISDLMVKIPILIKTGWFTIIDKYPDAENGFDVVLSFDFEKDEDNDWTASCHVDDVGKVDCLILGMIKMIIQEDPIIDELIEMGLDELDLPDSIQHFTPTC >NZ_CP049088|1238649:1282792|1275261_1275630_+|WP_021115058.1|DBSCAN-SWA MNTHTLQHTHWQIAPEGVESIQGEGDLHQCIINILSTRKGSDVLRPDFGSNHFEYIDQPFDIAVPNMVREIFVAIDKWEKRVVVQEVQISGEAPHFFFNVKWCVAEDIERQIYATEFDYGNK >NZ_CP049088|1238649:1282792|1255298_1255532_+|WP_012621973.1|DBSCAN-SWA 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59 | Haemophilus_phage(22.86%) | transposase,tail,plate,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2262148 : 2274717
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP049088|2262148:2274717|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP049088|2262148:2274717|2264295_2267559_-|WP_021118485.1|DBSCAN-SWA MTDLATLAIKVTTNGAEKSTRDLNNVERAAKRTETATEQLNKCFGRLQALLALSGIGGGISHILALADKMQSLRNQVQFVTSSMTEMNQVQKELFEIAQRTRGSLEATTSLYTRSARALKDYGYAQKDILQFTETMNKAMAVGGVSAEAQASALFQLSQALGSGQLQGDEFKTIAESAPIILDVLAEYMGKSRAEVKKLASEGQLTSKLIFDAFNGSTEKINQKFEQMPISFGGAMQQMENAFMKFVDEQNRTLGITENLAAGVSFLAQNFEYLAGVLLAIAAGNGAKFISTLVLARVETHRQAQASLIAAKATQTQAAAELAAAQAKMNLLNSEMQLVRTKKARAAIEAKMAQQAQVITGLINAEAAAMNNLAAASQRASIASSAAAGAKNLLSGALGLIGGPMGAATIAAGALFYFSQKAQEAKEAALDTESANNRLKESYDGLSESALTLKIFEQIQAMENYGEQISKVQAEISQIQTSAWQFGLELSESSKQDLEKLNAELEKIRENKNIDLSVLTNQLTALGGVFLSNGKSIDDFRTKMKNLGVDANTADSVIAGLSNTIKQQKEAAQGGVKNNLDLDEAFKKLKERALTVAQNLEVAKLKQQGQAESAFVLAGLYELLGDKGAEYNQVLINIANGTITAANAADKGIDLSIETLNKLIEGRKVLQGMFKDQTQTEGINQGLNSGSGGGENARDSWLQFYDEVRKHSRSTLEEIDAEQQRMFQRLEEHNKKGVVSHEEYESAKLAISQRFANERAKLAEQFAPELQYARELKEHLQDIQQLNAAGLLTHDQAKKATENATWDAGNKQAQLAGQNAVSEYDRWKAEFDPMQAMKNEQATKLAENQSRYDQMLISHEDFLKRKNQLEEQYRSKTILEDLSNYSAGLQNLGGAFGQMADLAAQSMGKQSGVYKTMFAMSKAFAVADSMVRLQQAIVQAMGDGTAMTPAQKFANMAAVASAGMSVISQLTSISLSGMAHSGIDSIPKEGTWLLDRGERVVDSRTNQDLKAFLANQGNRNQASGKSSVNVQIINNSNAVDAKVSQEETPDGTHITVELLKTMRGIARDESQKAITNNFARAGGQFRR >NZ_CP049088|2262148:2274717|2271672_2272023_-|WP_021118475.1|DBSCAN-SWA MKILYFTHDFSSENVKFAKENGLTLRNLGAYHATDFIEQCDAVCGDIPERYQHLPKHTLPESSSQQKTLDKMTVPELTTALKALSVDIPQGAKKDELIALLKQAEGGDNDPERTNG >NZ_CP049088|2262148:2274717|2268275_2268611_-|WP_021118482.1|DBSCAN-SWA MLAYAKKEFELDKKPKDSDCTLREHLLAIQEQTGSVPEELENIEISPAISYLLGFFYELSLSRQSGMGLSPITYAEIEAWNRLLQIELAIWEIKVIKQLDVIFLNVQNTEI >NZ_CP049088|2262148:2274717|2269039_2270044_-|WP_021118480.1|DBSCAN-SWA MAQEVKRTLVISKESVFGTKPAKTGAKIIPRIETSLNANFESFQSEEIRSDLQRSASIVGFEKVEGDIKGELSAGQWSQFFAAVLRGAFTAEAKAPIIKKTSNGTGEKNGKILIVPETNHTTDSFTIEEIFQDINVNRVYTGCRVSKMSIDAQPNGISSVTVSFLGQKSEELQATYFTNPTPIAQSGKLAGVKGKLLLNKAEVGFVTGFKIDIDLGASSEPVLGATYAPDVFIGSIKVSGSFSTYLKDKAMWQAVRNGTSLSLALRMDAESETNSDYVTLILPGVKLTSSEVNSGDNLIQTLNYDAFPAVFDAESTIDDSLKKATTMIVQDTLA >NZ_CP049088|2262148:2274717|2263548_2264286_-|WP_021118486.1|tail|DBSCAN-SWA MPKALPQKMANELPKLEQNALIELWEIDLRHISSNSDPAQKGELLRFHNGLNQGQQNVWWQGNEYQAYPINADGFEISGQGPSNRPTLTISNLYGIVTALAADFGQGIGAKVTRRLVYAQFLDARNFPNGRNPQADPTQESVSLFIIEQLKSLNDEVATFELALPAETDNARIPLLMITSDTCIWQYRSAECGYTGGPVADEKDNPTTDPKKDACSHCLRGCKLRFGANAILPFGGFPSTTQYGA >NZ_CP049088|2262148:2274717|2268619_2269024_-|WP_021118481.1|DBSCAN-SWA MNLKDLAKDSISEKYRFELTHPVTGEGLGVFIHVVSAKSDQAQKFFAKQLRKEQKRELENARTRHPKFKELDEIKEDSVELALNRIVDWENVEFGDKKELLFTEENARMLLTECDWMIEQILEHSNDLGKFLKS >NZ_CP049088|2262148:2274717|2270447_2270861_-|WP_021118478.1|DBSCAN-SWA MSSFIAQIRQQIEQIEQRKNLVIRKVALDAFAKVQAKSPVDTGALRRSWTVSVSALPTNFNGSNEHIAKAKFGDVIYIATNLPYAPALEYGLYPNPPKNPSGKTKNGYSIQAPQGMVRITVKELKAYLARNPTLGLW >NZ_CP049088|2262148:2274717|2263276_2263552_+|WP_021115320.1|DBSCAN-SWA MFNPPHPGLLLKEYLDNADTSITQIAKQLGVTRVCLSRIINEKSAITPEMALRLSQLLPNTTPKLWLGMQADFDLWQLEQRATFHIEPLFA >NZ_CP049088|2262148:2274717|2270046_2270448_-|WP_021118479.1|DBSCAN-SWA MKKIIRSILQTQLTELGKFSTAWEGVNNKVSLPYQAVFLSVTTSDTASISDKPLSVETGFLQVTLFYPNGNGTHAIEERAELIRNHFYGQSIIEENVQVVISQPPTIGGIFLNDDKLALPITIHYTAYELNKE >NZ_CP049088|2262148:2274717|2262148_2262910_-|WP_021118487.1|DBSCAN-SWA MQNISFTEQILYHAKRSEPHESCGFVVSKGGELRYFPCENVAVDLINHFEISPDDWIRAESVGEIVAVVHSHPDLDTEKGLPYLSTADRECQVRLNLPFWLVCDGKLQKFRPIAPLVGRPFENNKQDCRNILLDAYMLSGLDLPDDVEYEFEWFKSGNLYEENLLRFGFERLDFEEQPQLGDIVLLQIGSDVANHAGIYLDNQMMLHHSEGRLSARVPYDGAWLQQTHSIWRYPKWSELNFTAILNDLSLTNR >NZ_CP049088|2262148:2274717|2274003_2274717_-|WP_041603221.1|DBSCAN-SWA MKQMRSNWSDDFPDTVIDRKLGDATSHPLYELAKRGDIDAAYHLAKDLVSDEAIEKLRKIIAGRNVIIVPVHAEEAVGRNMIPVATATVLAKKLNVKVDLSIVQATKVSRTAGDGWHRLIYSPAFDGEYPKGQLAIILDDTQTQGGTLASLKGYIEQQNGKVVGAYALTGKQYSVQLRLSKETLNQLREKYGSIEHWWTEEFGYDFSKLTEWEARFILNSRKTADEVRNTIIARKQA >NZ_CP049088|2262148:2274717|2262980_2263259_+|WP_016527932.1|DBSCAN-SWA MILSFKHKGLKLFFETGSTAGIQANHASKLRLQLATLENAETVSAMNFPGWDLHPLQGNLVGHWSVKVNKNWRLTFKFENGHAEIVDYQDYH >NZ_CP049088|2262148:2274717|2270853_2271234_-|WP_021118477.1|DBSCAN-SWA MYGKLKQISKQLIQKFGSPCVIKTQISGQYDPATGKMQTEISKQSAYCLFDNLAYDFPSFQSGGTSRGEAVAIEQGDVVIYLTEKAEVGSAVEVNGEVWSIIAVQPIKPANVAMLYQCQGRKQLNE >NZ_CP049088|2262148:2274717|2271236_2271698_-|WP_021118476.1|DBSCAN-SWA MTLNVPTDSYVSLEEANGYHQLRASFDVWNELDDEQKARRLVSASDFLDHNYRFVGEKADPTQIRQFPRQESSQESSEIPLQVKYAVCELALQSDLNQNTEQKMASVKVGPVSVNYENQAVISGSSNRFEYVKTLLSRFLNSSSTNNVSLLRG >NZ_CP049088|2262148:2274717|2267947_2268274_-|WP_021118483.1|tail|DBSCAN-SWA METFNFNPDWGMQLTKKPEVMKLKFGNGYEQVAPKGLNHNLRIYDISFSGTESRIKQIEAFLNNQGGVKAFLWTPHGSTQGKFRCDEWKTNQQQGFWTLSAQFREVVA >NZ_CP049088|2262148:2274717|2267633_2267894_-|WP_021118484.1|DBSCAN-SWA MFLFSCVKAVFIGWLMSWVIFFVLGAFAQDITLFHATIFGLSVTLIGSVAIGLYKNKIYLDRLKKELDAQQQKDAEKNQVKYVIIK |
16 | Mannheimia_phage(86.67%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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