Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP047584 | Lactobacillus fermentum strain AGR1485 chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas14j,cas3,DEDDh,csa3,WYL,DinG | 0 | 2 | 20 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP047584_1 | 1719019-1719491 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047584_1
|
7 spacers
spacers of NZ_CP047584_1
>1.1|1719051|31|NZ_CP047584|CRISPRCasFinder TGCGCTCATGAATTGGTTCGTCCATCGAACC >1.2|1719114|31|NZ_CP047584|CRISPRCasFinder GTTACTATAAAACTGATCAGTGTACCGGGCC >1.3|1719177|31|NZ_CP047584|CRISPRCasFinder GTTGCTGTAGAATTGGTTGGTGTACCGGGCC >1.4|1719240|31|NZ_CP047584|CRISPRCasFinder GTTACTGTAAAATCTATTGGTATAGCGGACA >1.5|1719303|31|NZ_CP047584|CRISPRCasFinder ATTGCTGTAGAACTGGTTCGTATAACGAACG >1.6|1719366|31|NZ_CP047584|CRISPRCasFinder ATTGTAGTAGAACTGATCGGTGTAGCGAGCG >1.7|1719429|31|NZ_CP047584|CRISPRCasFinder ATTGTAGTAGAACTGATCTTTGTATTCCTTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047584_1
The CRISPR arrays of NZ_CP047584_1 >merge|NZ_CP047584|1|1719019-1719491|CRISPRCasFinder CCGTCAGACCCAAAGTAATAGATGTTACCCCATGCGCTCATGAATTGGTTCGTCCATCGAACCCCGTCATCGCCAAAGTAGTACATCTTCCCCCAGTTACTATAAAACTGATCAGTGTACCGGGCCCCGTCAGAGCCGAAATAGTACCTATTTCCCCAGTTGCTGTAGAATTGGTTGGTGTACCGGGCCCCATCATCACCAAAGTAGTACATCTTCCCCCAGTTACTGTAAAATCTATTGGTATAGCGGACACCATCATCGCCAAAGTAGTACATCTTCCCCCAATTGCTGTAGAACTGGTTCGTATAACGAACGCCGTGATCACCAAAGTAATACATGTTCCCCCAATTGTAGTAGAACTGATCGGTGTAGCGAGCGCCATCATTACCAAAGTAGTACATGTTCCCCCAATTGTAGTAGAACTGATCTTTGTATTCCTTACCATCAGAGCCGAAGTAATACATCTTGCCGTT >NZ_CP047584|1|1|1719019-1719491|CRISPRCasFinder CCGTCAGACCCAAAGTAATAGATGTTACCCCA TGCGCTCATGAATTGGTTCGTCCATCGAACC CCGTCATCGCCAAAGTAGTACATCTTCCCCCA GTTACTATAAAACTGATCAGTGTACCGGGCC CCGTCAGAGCCGAAATAGTACCTATTTCCCCA GTTGCTGTAGAATTGGTTGGTGTACCGGGCC CCATCATCACCAAAGTAGTACATCTTCCCCCA GTTACTGTAAAATCTATTGGTATAGCGGACA CCATCATCGCCAAAGTAGTACATCTTCCCCCA ATTGCTGTAGAACTGGTTCGTATAACGAACG CCGTGATCACCAAAGTAATACATGTTCCCCCA ATTGTAGTAGAACTGATCGGTGTAGCGAGCG CCATCATTACCAAAGTAGTACATGTTCCCCCA ATTGTAGTAGAACTGATCTTTGTATTCCTTA CCATCAGAGCCGAAGTAATACATCTTGCCGTT
>NZ_CP047584.1|WP_102116105.1|1716765_1718241_-|hypothetical-protein MEVSKHFKMYKKGKNWCTMALATAAVALGTTVATTKPVNADVTSDVTTQSAVSASATSSASTSSVELSSANLTAVESTASVRSAAVTSSEAVSAVSATVSSVVTASSVSTSASVSSSTSVASTSASTENVAEVSLASDSASVATVSANSASDELSASANVASEASSSADATSAVRAVAAATSTKNGMVTENGATYYYVNGVKQTNHFVSQNGNMYYFGADGKEYKDQFYSNWGNMYYFGSDGARYTNQFYSNWGNMYYFGEGGVRYTNQFYSNWGNMYYFGEGGVRYTNQFYSNWGNMYYFGSDGARYTNQFYSNWGKMYYFGSDGARYTNREYDNWGNKYYFGSDGALATNTDVTLNGTVYTADSQGILTVKNDINAKVNKALGEIGVPYVWGGNSPSVGFDCSGLVQWAYGLSSSYRTTYQQQTLGTHVYSNVSSSPKGALLFFGSDSAPYHVAISLGDGSYVHAPTVGENVKIGYQKYFTPSYYIVLS >NZ_CP047584.1|WP_080558617.1|1716059_1716623_-|hypothetical-protein MKANKLLTSIVAGAMLLSLAACSSNKSASGSDTTDSVSASSKAASKKSSTTKKQQVKTVSDDSSSSSSKSSSSATAANSSTSSSSASRGAAAATASNSSSSNGSNSSSSASTATLTQTQALDLLKERLGANLNNAGTSGQSMPVQPSATDVDSFTATQTGTNSWQFTGTVNGKTYTYNVSPTSITEN >NZ_CP047584.1|WP_111523419.1|1715037_1715970_-|glycosyltransferase-family-2-protein MPKLSIVVPCYNEQEALPLFYPAVEEVVQRIDGLKTEYWLVDDGSADQTLAEMRKLHSIDPERVHYLTFSRNFGKESALYAGLEAATGDYVVVMDADLQDPPSFLLQMYSILQEGEYDCVGTRRTDRKGEAKIKSFLSDQFYKVINRVSQTNIVPGARDFRMMTRQMVDAILSMKEYSRFSKGIFSWVGFKTKYLEYKNVERVAGTTDWSTWKLFKYAMDGIADFSQAPLSLAVWLGTTSFIISIIGLVFVVIRRLIEPTSSAFGWASMVCIILLLGGLQLLCIGIVGKYIGRIYMQVKNRPIYIIKEKK >NZ_CP047584.1|WP_163586986.1|1713928_1715038_-|AI-2E-family-transporter MPKSYQKALFWSFELLIIASLIWVCIQINFVFTPLLVFVSVVITPLIISLFLYYMLNPLFRLLMKIKVYKWHMKRGIASLVVVIGLVLIVAGGISALIPSVLNELNQVIHWLPQATKEIQKMIQEISEHPWVRKLHLSTYYGQINDQVSKYVHQIVTGLTSSAGTIIGTITSTVIVAITVPVMLFYMFKDGNRLVPSVQKLFPESSQDEVGELLRKMSKTLSSYISGQAIECLFVAIATSIGYLIIGQPLAVVLGVVAGIANMIPYVGPYIGITPSLMVSIAVAPEKIIWVIVVVVIVQQIDGNIIYPNIIGKTLQIHPLTIIMLLLAAGNIAGIPGMILCIPCYAVVKTVVTYLISIYNLRKRGENNG >NZ_CP047584.1|WP_049183109.1|1712862_1713840_-|glycosyltransferase-family-2-protein MLKTLTIVVPCYNEEEVLPETVKEIGAIVEDLIAQAKISTKSKILFVNDGSKDRTWELISEYSEKYSYVSGIKFTRNYGHQNALLAGMTVAVKYSDMIITIDADLQDDVNAIYQMVDKYLEGIDVVYGVRNSRETDSFFKRRTALAYYGLMKRLGVNLVPDSADYRLLSKRATEALLQYKERNLFLRGMVPLVGYPSAKVYYPRKERFAGKSKYPLGKMLHFAFDGISSFSIAPIQLILILGILTTSISIIMMIYVLIEKMMGHVLTGWSSLMISIWLLGGIQLISVSVIGEYVGKIFTEVKHRPRFNIETEDYTEKMVKDKNGY >NZ_CP047584.1|WP_014562579.1|1711063_1712644_-|peptide-chain-release-factor-3 MATKQQLEDAVSKRRTFAIISHPDAGKTTITEQLLLFGGVVREAGTVKGRGSSNFAKSDWMEIEQKRGISVTSSVMQFDYDGKRINILDTPGHEDFSEDTYRTLMAVDSAVMVIDGAKGIEPQTRKLFQICKMRGIPIFTFINKYDRDAREPLDLMNEIEETLGIETYPMDWPIGMGRQFMGVYDRHNHRVALTHPADESKPYLPLDENGEVIGENPLAGEGEWEDALEGMELISEAGSEFSAEKVAAGDQTPVFFGSALTNFGVKTFLETYLKYAPAPSAHNTEEGKAIDPLSPEFSGFVFKIQANMNPKHRDRIAFVRVCSGEFDRGMDVTLERTKKPLRLSNVTEFMANTRENVEKAVAGDIIGLYDTGNFQIGDSIYTGKEDIKFEKLPQFTPELFVRVSAKNVMKQKSFHKGINQLVQEGAVQLYQNYNTNDYILGAVGQLQFEVFKFRMQNEYNSEVIMEPMGKKTARWINPDQLDPKMSSSRNILVKDMQGEPLFLFENQFAENWFKQKYPDVELTSKL >NZ_CP047584.1|WP_100184896.1|1709993_1711025_-|sugar-transferase MKDPSGNVGGPKANMDNIKFLKEQMGFKELWLDYGWKDGFWWHHNLWDWINTRIHKYQLSRSVLPKFFKEHPDIDNVVIQYPLYSNKLIKQITDSVHQNSHAKLYFIIHDAEMIRLYADEPKRAQGELDSFNLSDGIIGHNAKMNKFLKEQGVKVPLVDLGIFDYDNPQPLQEYKGYDKSVCYAGNLIDAEFLQDVHPTNRFDLFGPNPAESYNEGLNYKGQFSPTDLPAHMDENFGLVWHGTSVDTCDGVFGRYLKWNNPHKTSLYLSSGLPVIIWDQAALADFVLENGVGITISSLNDLNDKLDALTEEEYRQMHDNVQKVANQMRTGYYITHAMEKMINN >NZ_CP047584.1|WP_031274336.1|1709067_1709976_-|glycosyltransferase MNKICAIVVTYNRKILLKQSLQALLDQTVTDFDILVVDNASTDNTREYIDDLLQEERIDYVNTGANLGGSGGFNHGLKVACKRGYQYVWMMDDDTMPTPTALEKILEADKILGGNYGYLASEVLFTDGQPCKMNGQKVLKKWFDESQYLKNGILRTTRATFVSFFVRTAVVEKVGLSYKEFFIWGDDMEYSNRISKQFPCYMVAQSIVVHHTKNNDGSSIAKDDGSRLWQYKFAYRNECVIARDDGLYGRCYQFAKVNWNILKVIGSHKPLKLKKIWILISASIRGIFFRPKIEYIKLDSDK >NZ_CP047584.1|WP_049183103.1|1708006_1708972_-|glycosyltransferase-family-2-protein MADILTIVVPCYNEEEVLPETAKELGSILEDLVDQNKVSPKSKILFVNDGSKDKTWKLISRYSKEYPYVTGLKFARNYGHQNALLAGMKTAVRYSDMIITIDADLQDDVKAIYQMVEQYLDGVDVVYGVRNSRETDTFFKRRTALAYYGLMKKLGVHSVPDSADYRLLSKRATEALLQYQERNLFLRGMVPLVGYQSAKVYYPRKERFAGESKYPLGKMLHFALDGITSFSIAPIQLILALGILTTSISILMMIYVCIAKMLGHVITGWASLMISIWLLGGIQLISVSVIGEYVGKIFTEVKHRPRYNIEDENYSDKMEKD >NZ_CP047584.1|WP_049183101.1|1706274_1707972_-|hypothetical-protein MGIKLKNKGTIIYFLLMIALSFFFVMAGIKSHTIFWSDDMPYHINRIQELVNSLKHGNWYPYIYTKQFKEVPYPLGIFYPQVTLIPIAALCILFNNYIIGIYAGFALYTFLTMIIMYVISRKLNKSMTGSFIISIVYSFSAYRLLDAYGRFAMGEFLAMTFIPMAIYGLYAVMKNGNDWEYLGIGLSFTLLSHVLSSLLCVIFLVIEFVVMLFFCKNWKQTFKSLIKAVIVFLFSSAIFIGPFIEQEVYQRFLQPSPTDLSKTSSVLSDLIRNSLNNNIIGPTQITETRAGTIGIVLLIVMVWGMINFRKLDKLNKFILILGTLSFLMATRIFPWSIMMHTPLKVIQFPFRILVFTTLLLSFTAGEMFESFYGSTSTKKIWKSLFTFFCLVIIVCPWFASYKSLQRAELGNSNNFTEKVSFAKGTWPTFWYLDQYTPAKAMKKYQQMYDIKAQVNGKIVQLTKVTGKVNEMIYSDKTLMNQSKVVLPASMYKNIQIWQNGKRLKVNKTGLVTLTHTSGGPIKYRYVPSTMDNVSRYVSVITWLGMCLWGVVKMVGNLRRGAKSGN >NZ_CP047584.1|WP_127429449.1|1720534_1721692_+|IS256-family-transposase MNQFNKDIPLNEVLRRQIEVAANQFLQNELTAVLGYEPHTRIDRSKDDVNYRNGTYTRTIDTEYGEINLTIPRDRLNKFQNALFPPYVRRTDGLEEMVIKMYSKGVTTREIADMVERMYGHYYSPTTVSNITKRTEHLVEEFHERKFKYSQYVCVFLDATYIPLRRGTVEREAVNVAIGIRSDGGKEVLDYSIAPTENGAAWSELLQGLRARGIKDIQLFIADGLVGLQSAIEANYPQAKFQRCWVHAERNLLGYVRKNDRREIITDFKAIRQAENLQAAKERLAAFSAKWESSYKRRIKNLVQMEELFTFFSFPTAIRQTIYSTNLIESFNKSLKKMVRRKEQFPNEGALDRFIMTQVMEYNDKFENRAHRGFKDCHDTLDSMF >NZ_CP047584.1|WP_111523422.1|1722044_1723472_-|flippase MKVIRNYLYNAGYQILLMIAPLVTTPYVSRALGAHASGINTYTNGWVTVFYLVGQMGIGLYGNREVAYHRDDKRERSRIFWGIEALQLCTISISLVAYLVAVFLFSTTFREYYLLQTLWIVACGIDVSWYFMGMEDFKKTVVRNTIVKLIMIVLIFTLVKTEADLWKYILLIGVAQLSGNLTLWPYLKSNIQWVSPKEWHPLRHLYPSLLLFIPTITTQIYLVVNKLMLGKIGQPTALGQFDYADRLVKLVLAIVTATGTVMLPHIANKFAKGDLKGVRESLYNSFDFVTAMAVPMMFGLMAISEKFAPWFLGNGYQDAGKIIFFEAPAIVFIAWSNVTGDQYLMPIDQVKEYTVSVSIGAVVNVIANILLIPFYSANGAALATVIAEFSVMAVQMNFVRSTIRRRQLFRSSWRYFLGGLIMFLVVNRICDVMTMNIVNMAIQIFVGTVIYVVCLFILKAPVIEQAKVVLGKEAK >NZ_CP047584.1|WP_100184702.1|1723474_1724596_-|UDP-galactopyranose-mutase MEKYDYLVVGAGLFGATFAYEAAKRGNRVKVIEKRDHIAGNIYTKEVDGIQVHQYGAHIFHTSNKEIWDYVNQFATFNRYTNSPVANYKGTMYNLPFNMNTFNKMWGVRTPQEAMDKINEQRQEMAGKTPQNLEEQAISLIGRDIYEKLVKGYTEKQWGQKATELPAFIIRRLPVRLTYDNNYFNDDFQGIPVGGYTQIVEKMLASDLIDVETGVDFFAKREEYLANYPKVVFTGMIDEFFDYQLGELQYRSLRFETEELDVDNYQGNAVINYTDAETPYTRVIEHKHFEFGKGDKDKTIVTREYPADWHRGDEPYYPVNNQQNNDLYKQYAKLAQEKEANVIFGGRLGQYRYYDMDQVLHAALVCVEKEFNK >NZ_CP047584.1|WP_014562705.1|1724822_1726010_-|IS256-family-transposase MNQFNKDIIAALSSDKDITLNEVLRRQIEVAANQFLQNELTAVLGYEPHTRIDRSKDDVNYRNGTYTRTIDTEYGEINLTIPRDRLNKFQNALFPPYVRRTDGLEEMVIKMYSKGVTTREIADMVERMYGHYYSPTTVSNITKRTEHLVEEFHERKFKYSQYVCVFLDATYIPLRRGTVEREAVNVAIGIRSDGGKEVLDYSIAPTENGAAWSELLQGLRARGIKDIQLFIADGLVGLQSAIEANYPQAKFQRCWVHAERNLLGYVRKNDRREIITDFKAIRQAENLQAAKERLAAFSAKWESSYKRRIKNLVQMEELFTFFSFPTAIRQTIYSTNLIESFNKSLKKMVRRKEQFPNEGALDRFIMTQVMEYNDKFENRAHRGFKDCHDTLDSMF >NZ_CP047584.1|WP_080983522.1|1726170_1727322_-|acyltransferase MEVGMSVVSKRILWIDIVRAVGMLFIIWGHSLKEWQSYQAAFFLTVNVPIFFALSGYLYHPQKVMKQVYKLVFNLLLPYFFTAFVIIFVSFVSNHVPHGATIMSIGSDKDTFKAFIFGMGGTAPLIGTKIIMPQIGAIWFLVALFWDSIVFNMMMKKLDQKTGGFWLGGLITICMAIFGFWLTPFHSGIHVNGELPWSLNATMIGLFFMWFGQLMKRIPQIWKSKRLGWLLVLVSTVVYLLVCYHDRGYHFGMATAVANSWTITMIGSLSGCVVMLLSAYWIEQQLKETKWQRGLVAIAHYGQASLVVLCFHIMELNLINPGTFISSWTHFPPAIDTFTIVLYRIAVSLIAIWIVKHSSFLSKIFVNRQNPFKFQERIRFKND >NZ_CP047584.1|WP_004563039.1|1727380_1727998_-|LPS-biosynthesis-protein MAMKISLSNLTKVVWKNILVILIFAVLGGAAGGFYAHTKKHTTYTASRSLMVAHRYNNSTANEQVQADLSLTNTYKDMIESSDVAAAAQKELPKKLRKQYSTEDILSMIKVKTVMQSLVLTVSVEAGNAKEATQVVNAVVDAAKTELPKISPSTGTISTFAKAKVKDADSQTSPSTKKYLLAGVAVGLIVGMVLAFTVTTWRNLI >NZ_CP047584.1|WP_004563038.1|1727972_1729196_-|hypothetical-protein MKARIAEIWRAPIQGQHVYLLAFSLYFVPAFLIDSTYTTLLSWSELRLITYLAIPLLIFKIYVMDEWQVSGKLVITALLVASIISWRTAQYPELMVTMAFVLGARSVDFKQVARWYLYLSVTLLLVIAATSLVNIVPNLVYVSNLRPNRYGLGMAYTTFVASHLFFSALAYCYVRFGKLKWFDYIGIAVVATIAMVYTDTRLDFYAMLLMIPVMWVTQRAAEGKRFSRMIASFWWMAMPVLAVITITAAYFFDDSNHIYRKFNELLSGRLSLSRKAFRLYDPNLIGRFIHEKSFGGVKGKTFANQNQNGLSADYFYIDSSFVRMLLLWGLIIFVLFIVIMTFIAIVSTVQKEYALSAIVMLVAINSMVEPHAVQLIYNVFILASIPQLEWVLKNIRGKKYGNENIAE >NZ_CP047584.1|WP_163586988.1|1729206_1729968_-|DUF4422-domain-containing-protein MRVKVLVAAHKNYEMPTDPMYLPVFVGKDLHPDVNHTFQGDNTGDNISQKNPTYNELTAIYWGWKNLDVDAMGLVHYRRYLSLRHHKSLQTVLSEKETVALLEDYDIILPSKRKYYIETNESHYLHAHHHEPFEVMRQVIQEQYPEYAPAFELVMKRTWAYMFNMFIMKKKPLNEYCTWMYDVLAKVEAQTEISNYSTYEQRVYGFLSELLLDVWLEVHPEYKTKEVNYVFMEHTNWLKKGGKFIQRKITGHA >NZ_CP047584.1|WP_003684130.1|1729979_1730633_-|sugar-transferase MVENMIHIDAERLNRQYFYRGIKRLFDVVASAIGVVVISPVLLIIAICIKVDDPHGPVFYTQTRVGKDGHEFKIIKFRSMVSNADELLAKLQDQNEVDGAMFKMKDDPRITRVGRVIRKYSLDELPQLINVVTGSMSIVGPRPPLVSEVEQYTEYDKQRLLVTPGATGMWQVGGRNDVDFDEMVRLDLTYIQNRSVWLDLKIMLETVKVMIKPNGAY >NZ_CP047584.1|WP_004563035.1|1730802_1731621_-|recombination-regulator-RecX MEKESQIRQITAIVAQKRPGRFNVFLNGQYAFPVAESVLIKYRLYKGMEVDQELLQQISNDDQVAQAYNKILDYLSHQLRTEHEVEQKLVEIDTPPEFVPVVMAKLRENRLLDDREYAAAYVRTEMNTGLKGPGVIRQKLRQKRVGEFLIDDALTQFTTEQQVENAAKLVQKLAKRYLNQPARRRSEKIHQGVLTQGYGDEVYQLVKENEIPSQTEDRQAELLEREAEKAWHRYRRFEGYERKMKTKQALYRKGFDLDEIDQWLAKQENLNN |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP047584_1 | 1.3|1719177|31|NZ_CP047584|CRISPRCasFinder | 1719177-1719207 | 31 | NZ_CP021878 | Enterococcus wangshanyuanii strain MN05 plasmid unnamed5 | 5048-5078 | 8 | 0.742 |
NZ_CP047584_1 | 1.3|1719177|31|NZ_CP047584|CRISPRCasFinder | 1719177-1719207 | 31 | NZ_CP021878 | Enterococcus wangshanyuanii strain MN05 plasmid unnamed5 | 55561-55591 | 8 | 0.742 |
NZ_CP047584_1 | 1.3|1719177|31|NZ_CP047584|CRISPRCasFinder | 1719177-1719207 | 31 | NC_019730 | Oscillatoria nigro-viridis PCC 7112 plasmid pOSC7112.02, complete sequence | 240578-240608 | 9 | 0.71 |
NZ_CP047584_1 | 1.5|1719303|31|NZ_CP047584|CRISPRCasFinder | 1719303-1719333 | 31 | NZ_CP004882 | Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD-1 plasmid pBMBLin15, complete sequence | 13746-13776 | 10 | 0.677 |
NZ_CP047584_1 | 1.5|1719303|31|NZ_CP047584|CRISPRCasFinder | 1719303-1719333 | 31 | NZ_CP011355 | Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC10, complete sequence | 10642-10672 | 10 | 0.677 |
NZ_CP047584_1 | 1.5|1719303|31|NZ_CP047584|CRISPRCasFinder | 1719303-1719333 | 31 | NC_006945 | Bacillus phage GIL16c, complete genome | 13737-13767 | 10 | 0.677 |
NZ_CP047584_1 | 1.5|1719303|31|NZ_CP047584|CRISPRCasFinder | 1719303-1719333 | 31 | AY701338 | Bacillus thuringiensis phage GIL16c, complete genome | 13737-13767 | 10 | 0.677 |
1. spacer 1.3|1719177|31|NZ_CP047584|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021878 (Enterococcus wangshanyuanii strain MN05 plasmid unnamed5) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
gttgctgtagaattggttggtgtaccgggcc CRISPR spacer gttgctgtagaattgattggtgtcgtccgtg Protospacer ***************.******* . *.
2. spacer 1.3|1719177|31|NZ_CP047584|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021878 (Enterococcus wangshanyuanii strain MN05 plasmid unnamed5) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
gttgctgtagaattggttggtgtaccgggcc CRISPR spacer gttgctgtagaattgattggtgtcgtccgtg Protospacer ***************.******* . *.
3. spacer 1.3|1719177|31|NZ_CP047584|CRISPRCasFinder matches to NC_019730 (Oscillatoria nigro-viridis PCC 7112 plasmid pOSC7112.02, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
gttgctgtagaattggttggtgtaccgggcc CRISPR spacer cctactgtataattggttggagtaccgaaat Protospacer .*.***** ********** ******.. .
4. spacer 1.5|1719303|31|NZ_CP047584|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP004882 (Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD-1 plasmid pBMBLin15, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.677
attgctgtagaactggttcgtataacgaacg CRISPR spacer tagcctgtataactgtttcgtataacggggc Protospacer ***** ***** ***********..
5. spacer 1.5|1719303|31|NZ_CP047584|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011355 (Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC10, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.677
attgctgtagaactggttcgtataacgaacg CRISPR spacer tagcctgtataactgtttcgtataacggggc Protospacer ***** ***** ***********..
6. spacer 1.5|1719303|31|NZ_CP047584|CRISPRCasFinder matches to NC_006945 (Bacillus phage GIL16c, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.677
attgctgtagaactggttcgtataacgaacg CRISPR spacer tagcctgtataactgtttcgtataacggggc Protospacer ***** ***** ***********..
7. spacer 1.5|1719303|31|NZ_CP047584|CRISPRCasFinder matches to AY701338 (Bacillus thuringiensis phage GIL16c, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.677
attgctgtagaactggttcgtataacgaacg CRISPR spacer tagcctgtataactgtttcgtataacggggc Protospacer ***** ***** ***********..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
14359 : 24534
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP047584|14359:24534|DBSCAN-SWA AATGCAAACAGAAATTAAGTTTCGTTGGCTGTTGCTCGGTAGCTTTTTGGTTAACGTTGGGAACAGCTTTATTTGGCCGCTGACGACGGTCTACATCCACGATCAACTACACCAGTCACTGACGGTTTCTGGAATTGTGCTCCTCTTTTATTCCGGAACTAACGTGATCGGTTCCTACGTCGGTGGGCGGTTATTTGACAAGTACTCGCCCCAACGGCTAACCCTCGGGGGGATCGTGGCGGCGGTAATCTTCATGGGGGTGTTGGTCTTTAAAAACGACTGGCCGACCTACCCGATCATGCTCGCCCTGATTGGGATCGTCAACGGGTGGTTGATGACGATGCACAACTCCTACGGTGCCCGGATGCGCAGTCGGGATGGGCGCTTCGTTTTTAACATGCTCTACTTTGCCAATAACTTGGGGATGGTCTTTGGGACCACGATTGTCGGCCCGCTTTACCAGTATGCCCACGATAACGTGGGGCCGCTGTTCTTGGTGACCGTGGTCATTTACGCCGCCTTTTCCTTAGTGGTGATCAAGTTCTACCAAATTGCCGTCATCAAACGGCCCCAGCACGAAGAAAAACTGGTTAAGTTGCCCCGGGCCAATTCCCAGCTGATTTGGACAATGAGCGGCGCCCTGTTGGTGATCTGGATGATGTACTCGCAATGGTCATCCAACATGTCGGTTTACATTACCGGTCACGGGGTTTCCATGACTAGCTACTCGCTGTTGTGGACGATCAACGGGCTCTTGATCGTGGTCTTGCAGATGGCGATTAACTGGTTAAACCGGCGGATGAACAACGATCATCTTTACTTGTACTTTGGCGCCGCCATGTTAGGGCTGTCCTTTTTGATCCTGCCCTTTGCCAAGGGCTACGGGGCCTTCGTCTTCTCAATGGTCGTGCTAACCCTGGGGGAGGCAACGGCGATTCCAACGATCCCGGCCCTGGTCAACCAGCTGTGCCCAATGGAAGATAAGGGGCGCTACCAAGGGATCGTCAATTCTTTTGGTTCGGCCGGCAAGGCGCTGGGCCCCTTATTTGGTGGCCTGGTGATCGAACGGTTTAGCTATCAGCCCCTCTTTTACGTCTGTACGTTAGCAATCCTTGGTGCCGGCTTAGTTTCCTGGTTGATGATTGAAAAGAATCACCACCAGGCTGAATACTACTAGGGGGTGAGCGTTTGTTTTACCAAAATTACGATGAAGTTCATGGCGAGGACCGCTGGGGGATGGTCGGTAAGGTCGGCGACCCCTTTAGGGAGGATTGCCTACTAGCGGCACCCTGCTACAAGTGTCACCGCCAGCCACTGGTGATCGCCGAGCGCAACTGGGAGGCCACCAACAACGACGACTCGCAACAGTACCAGATTCTAGTGGCCTGTACCCACTGCGGGGCGGTCGATGAGTTTACCGTCAACCAGGGAAGAGAAGGGGTGCTCAGTCAGCTCAAGCACAGCCACCAACGGGTGAGTGTTAACGACGTCAAAGCTGAATCGCAAGAGGGTGGGAAGTAACCTTCGAAAAGATAACAAGGAGAGTGGGAAATAACCTTCTCGGCAGGTCGTATGACTAAGCTAGGACGAACGGTTAGTGCAGAATGCACTGTTCTTCGGCCTGCTTAGGCACTAGGCCTGCGGTTATTTACCACGTTTTCTGTCTAACATTCGGGAATACAACAAGGGGCTGGGAGAAAACACAGTTTTCTCCCAGCCCCTTGTTTTTAGGTGGCGAATTTACAATTGAAATGCAACACAAAGTAAAAAAATAAACCCATACCGGGTAGAATATGTTTAACAACCAAATCAAACAATTCGAGGTATCCGGTATGAGCTATAAACATCTTACTATAAAAGAACGTGAAATACTTATGTTTTTACGAGCTAAGGGGTTATCTATCCGGGCTGTTGCGTTACGGCTGGGGCGAAATCCAAGCACTATTTCACGGGAGTTAAAACGTTGTGCAGGTAATTATTCCCCAAGCAAAGCAGATAATGACTATCATCAAAAGCGGCAGAATTGTCACAAGAAGCGGCTATTAGACAGCCATCCACAATTACGCCGTCAAATTGTTCATTACATCTTAGATCTGCACTGGTCACCAGAGCAGATTACCGCTCGCTTTAATAAGGAACATCAATGGTGTGTTAGCTACAACACAATTTACCGTCATATCTATCAACACAATTTAGGTGAGAAGTACTCCTCACGTGGTGATACCGGTATTCAGCGCCATCTCAGACATAAACATCGGACTCGGCATTCAAAGAATACTAGACGACATCGAGAAGTACAGACCGACTATATCTCGATCCATGAGCGCCCTGGTTTTATCAACCAGCGTCAACGTATAGGTGACTGGGAAATTGATACTGTGATTGGTCGAACGGGTCACTCCATCCTTTTAACGGTTGTCGATCGGCTTAGTCGGCTTACGCTTATCAAAAAGGTTGTGCAAAAGGACTCGCAGGAGATAAATAAAGGCTTAGTTGAACTGTTAGGGGCCATTCCTAAAGAATTTGTTCATTCTATTACACCAGATCATGGGACCGAATTTCTTCATCTTGATGAAATCAGCGAAAGGTTAGGTGTTACTGTCTATTGGCCCGATCCATATTCGCCTGAACAGCGTGGAACAAATGAGAATACAAATGGATTAATCCGGGAATATTTTCCCAAGCGAACAGATATTGATAATTACACAGAACAGGACGTTGAACACTGCCAAAAGCAGTTAAATCAACGTCCTCGCAAAGTGTTAAACTATGAAACCCCATATGAAGTATTTTTTGACAAACCGTTGCACTTAGTTTGACAATTCGCCGTATAAAAAAACCGCCACCCAAGCGGTGACGGAATGAAATGGGCAGTCAGGGGATCGAACCCTGGACACCCGGATTAAGAGTCCGGTGCTCTGCCAGCTGAGCTAACTGCCCATGTCTTAACAACATAAAGTATGATACCAGTTGACCATCGTTTTGGCAAGCCCCTTTTTAAAAAAGATCGGGGACCAGGGAAAGTGGGCCCCACCGCCAATTGAGGATGGCCATTTTTATACAAAAAAACCGCCACCCAAGCGGTGACGGAACGAAATGGGCAGTCAGGGGATCGAACCCTGGACACCCGGATTAAGAGTCCGGTGCTCTGCCAGCTGAGCTAACTGCCCATGTCATGTCTAACACAACGTTATTAACTATATCAGATGTGGTCTAATTTGGCAAGACCTTTTTGTGAAAAAAGTTGGAGGGCCGGGATCCACCCACCCGGTGTGGTATAATTAAGTTTACGATCAATTAACGAAGAATGAAAAAAGATGGATGCGGAGGGACCGACATGGCCAAGAAAGTTTTGGTTGTTGACGATGAAAAACCGATTTCGGATATCATTAAGTTTAACCTAGAAAAGGAGGGCTATGAAGTCGTCGTGGCTTACGACGGGGAAGAGGCCCTGCAAAAGGTCGAAAGCGAGTCACCGGATCTGATCGTCTTAGACCTGATGCTGCCCAAAATTGACGGCCTGGAAGTGGCTAAGCAGGTGCGGGCTAAGCGTTCGACGCCAATCATCATGGTAACGGCTAAGGATTCGGAACTCGATAAGGTTTTGGGCCTTGAGTTGGGGGCCGACGATTACGTTACCAAGCCGTTTTCTAACCGTGAGCTAGTGGCCCGGGTTAAGGCTAACCTGCGCCGCCAAGACGCCACCGTTTCACCGGCGAACGACGACCGGACCGCCGATATCAAGGTGGGGGATTTGACCATCCACCCGGACGCCTACACGGTCACCAAGCGGGGCGAAAACATCAACCTGACCCACCGGGAGTTCGAGCTCTTGCACTACCTCGCCCAACACATTGGCCAGGTCATCAACCGGGAGCACCTCTTGCAAACGGTGTGGGGCTACGATTACTTTGGTGACGTCCGGACCGTTGACGTAACGGTGCGCCGGTTGCGTGAAAAAATCGAAGATAACCCGAGTCACCCCCAGTGGCTGATCACGCGGCGGGGGGTCGGTTACTACCTGGCCAACCCGAATCAGGATTAAGGGCCTGAATCGTGAACAGTAAAATCAAATTCTACCAGTCGATCCACTTTAAAATCGCCCTTGTCTTTGCGCTGATGCTGATGCTGACGCTCGAAGTGGTGGGGGCGGTTTTTGTGCGTCAACTGGAACACCAAGAACTCGCCAACTTCAAGCAACAAATTGAGTTGCCGTCTTACATCGACAATTCCTTGGCCACCCAACTGACCAGCACCGATACCAAAACGGCCAACAAGGAAATTAAAACGATCCTCGCCCGGGTCAACAACACCAGTATCACCGAGATCCGGGTGGTCGATGCCAAGGGGATCATTCGCGGGACCAGTAGTTCGGGCAACCAGGGGATCGTCGGGCAAAAGACCACCGACACGGTAATTAAAAACACCCTGGTCAACAACCGCTCCCACACCGAAAACCTCTACGACAGCGCCAACCACAACCGCTACTACGTCAGTGTCGTGCCGCTGTTAGCCAGTGGCAACGCCAATAACGTGGTCGGGGTCGTTTACATGCGGGCCAACCTCGAGGGGGTCTATTCGACGATCAACTCGATCTCCTTGATCTACCTGTCGGCGGCTTTGATCACGATTGTCCTGGGGCTGGGGTTAGCGGTCCTAATTTCCCGGGAAATTACCCGGCCGATTGAAGAAATGCGCAAGCAGACCCTACGGATTGCCCGTGGGGACTTCTCCGGGCAGGTTAAGGTGATGGGCAACGACGAACTAGGCCAACTGGCCGGGGCAGTCAACAACCTCTCGGTGCGGGTGGAGGAGTCCCAAGAGTCCTCGGATGCCGAACGGCGCCGGTTGGATTCAGTCCTCTCCCACATGTCTGACGGGGTGTTGGCTACCGACCGCCGGGGTAACCTGACGATCGTTAATAACACCGCCCTCCAGTTTTTAAACATCGCTGACGAAGAGCAGGTGCTCGGCAAGTCGATTTTGGACGTCTTAAAGAT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CCGATGCCGGTGACTTAAAGACGGTGCTCTACAAGTACAAGGTCGGCGACACGGTCACTTTGACCTACTACCGTGACGGAAGCAAGAAAACGGCCAAGGTAGAATTAAACAAGGAGGCTAGCTCGTCGACCACGACCAGCAGTTCTTCTAGTGATGACGCAACCAGCGCCGAGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP047584|14359:24534|16151_17177_+|WP_163586672.1|transposase|DBSCAN-SWA MFNNQIKQFEVSGMSYKHLTIKEREILMFLRAKGLSIRAVALRLGRNPSTISRELKRCAGNYSPSKADNDYHQKRQNCHKKRLLDSHPQLRRQIVHYILDLHWSPEQITARFNKEHQWCVSYNTIYRHIYQHNLGEKYSSRGDTGIQRHLRHKHRTRHSKNTRRHREVQTDYISIHERPGFINQRQRIGDWEIDTVIGRTGHSILLTVVDRLSRLTLIKKVVQKDSQEINKGLVELLGAIPKEFVHSITPDHGTEFLHLDEISERLGVTVYWPDPYSPEQRGTNENTNGLIREYFPKRTDIDNYTEQDVEHCQKQLNQRPRKVLNYETPYEVFFDKPLHLV >NZ_CP047584|14359:24534|22372_23188_+|WP_003682315.1|DBSCAN-SWA MVQATVADTIHYSILASGSGGNATYLETAGHRILIDAGLSGKQLEQRMEAIGRSLDQVEALFVTHEHSDHSHGVGVLARRYGMPVYANAGTWAAVEGKIGKIAPDQKQLLAPGKFLDLGDLQVEAFAVSHDAAQPQFYQIHHDDQSFVILTDTGYVSDRVVQTIKNADGYLIECNHDPEMLRMGPYSWPLKQRILGDTGHLSNEEGAGALMEVIGERTKRVFLGHRSQHNNMRSLAHLTVASILENHDFGVDHDFKLADAEPDQPSPLLSL >NZ_CP047584|14359:24534|20257_21556_+|WP_163586673.1|DBSCAN-SWA MIKQIKKSSLTIALVIVVALSAVLSASVWINPFHYERGSGDSTSTSARQDTVQSLSDIYKPTEVIRTYQDRSQKLLYDQAKNPVMVIEQQVRKWKLKHLTRVVNNDSAAYLRDLRTENSIMISYPDAVATTVFNQTFNQSVDTARLKRINHIVITLDKTPTVYLMADEKYQVYRLTTTSQSLAVIKKSLVGGSQLNVDHKIVNGIPLTTFPHQISMPTYRSTINHQNLDGMAQTLMASSSVSTVSSQTTSKLITYTAGNSRRMTYNKGTGQVQYDNYLGKDNSYGTQTLYTHLFDLLADTAVPLEQVQYDNVSLVGQTITYRSFVEGFPIFSDNDYGTVRIKANNDGVERYHLSPLSLGTPLPASGQKVTLPSTVTVLNALYQAGKGKDIKGLRLGYTWATDQNKSLVTLSPTYYVYYHGNWVKYQSLLKGD >NZ_CP047584|14359:24534|21557_22358_+|WP_003682314.1|DBSCAN-SWA MNFRRIQWIFLIAFIILDLVLVSTLLWGNENFSTSGKQQSQTQLTLKEMKSNSITYPKLSPNSQTGYYLAVTPGDLSTERGRLKNQTTRTDGNLLTANFVDAVDLSSSQSVPKQLKKLLKDSRLFLHGTSYQYSAALSTSHSIVFTQVIKGEPVLSHEGQIRLRLNAARTKVVGYTQGYLKEERVLRPQSGTISQVRAVTWLYRHNEIPNSTQIVRVTYGYSPLMTSNGKQIFVPIYQVQLRAKSATTTQNLRINAFSGTIIQENN >NZ_CP047584|14359:24534|14359_15535_+|WP_070955304.1|DBSCAN-SWA MQTEIKFRWLLLGSFLVNVGNSFIWPLTTVYIHDQLHQSLTVSGIVLLFYSGTNVIGSYVGGRLFDKYSPQRLTLGGIVAAVIFMGVLVFKNDWPTYPIMLALIGIVNGWLMTMHNSYGARMRSRDGRFVFNMLYFANNLGMVFGTTIVGPLYQYAHDNVGPLFLVTVVIYAAFSLVVIKFYQIAVIKRPQHEEKLVKLPRANSQLIWTMSGALLVIWMMYSQWSSNMSVYITGHGVSMTSYSLLWTINGLLIVVLQMAINWLNRRMNNDHLYLYFGAAMLGLSFLILPFAKGYGAFVFSMVVLTLGEATAIPTIPALVNQLCPMEDKGRYQGIVNSFGSAGKALGPLFGGLVIERFSYQPLFYVCTLAILGAGLVSWLMIEKNHHQAEYY >NZ_CP047584|14359:24534|23262_24534_+|WP_163586674.1|DBSCAN-SWA MKKHLAPQQRRFWGKVILVGVLAGLLGGGAALGINSAISTYRNYATTKVPAGSSKSGGTSVSKNKASLTNETTKAYNATKNAVVSVINKQSTSSSDFLYGNVTGGSTSSSSGSLETVSEGSGVIYKKSGNVAYVVTNNHVVSGSSEIQVILSNGKTVDAQIVGTDETTDLAVLKINAANVTTVATFSNSNDIAAGQDVIAIGSPMGFEYANTVTKGIISATKRTVKASDSSVATTVIQTDAAINSGNSGGPLVNMAGQVIGINSMKLVSSTDGTSVEGMGFSIPSNEVVRVINQLIENGRITRPTLGVSLLNLSDVSSSQQQSVLNLPTSVTKGVVVMKVESGYPAANTGLQQYDVITAINGKKVTDAGDLKTVLYKYKVGDTVTLTYYRDGSKKTAKVELNKEASSSTTTSSSSSDDATSAE >NZ_CP047584|14359:24534|18414_20274_+|WP_015638411.1|DBSCAN-SWA MNSKIKFYQSIHFKIALVFALMLMLTLEVVGAVFVRQLEHQELANFKQQIELPSYIDNSLATQLTSTDTKTANKEIKTILARVNNTSITEIRVVDAKGIIRGTSSSGNQGIVGQKTTDTVIKNTLVNNRSHTENLYDSANHNRYYVSVVPLLASGNANNVVGVVYMRANLEGVYSTINSISLIYLSAALITIVLGLGLAVLISREITRPIEEMRKQTLRIARGDFSGQVKVMGNDELGQLAGAVNNLSVRVEESQESSDAERRRLDSVLSHMSDGVLATDRRGNLTIVNNTALQFLNIADEEQVLGKSILDVLKIRRQFSIRHLVDEDQDQVILDDLNEDLILSAYFSPIKRESGFVSGLVCVLHDVTSQQKEERERKEFVSNVSHELRTPLTSVKSYVEALSDGAINDPELAPRFLGVVSDETERMIRMINDLLSLSRMDSGTAKLNLEYVNINELFNYILNRFDMIIKNEAADPSQKKYTIVRYFTKKDLWVEIDTDKFTQVVDNIMNNAVKYSPDGGVITARLLETHNHVILSISDQGLGIPRKDLGHIFDRFFRVDKARSRKQGGTGLGLAISKEVVNLLGGQIWVDSVEGKGSTFYISLPYVPYEEEEWDDQAD >NZ_CP047584|14359:24534|17695_18403_+|WP_003685635.1|DBSCAN-SWA MAKKVLVVDDEKPISDIIKFNLEKEGYEVVVAYDGEEALQKVESESPDLIVLDLMLPKIDGLEVAKQVRAKRSTPIIMVTAKDSELDKVLGLELGADDYVTKPFSNRELVARVKANLRRQDATVSPANDDRTADIKVGDLTIHPDAYTVTKRGENINLTHREFELLHYLAQHIGQVINREHLLQTVWGYDYFGDVRTVDVTVRRLREKIEDNPSHPQWLITRRGVGYYLANPNQD >NZ_CP047584|14359:24534|15546_15879_+|WP_003682310.1|DBSCAN-SWA MFYQNYDEVHGEDRWGMVGKVGDPFREDCLLAAPCYKCHRQPLVIAERNWEATNNDDSQQYQILVACTHCGAVDEFTVNQGREGVLSQLKHSHQRVSVNDVKAESQEGGK |
9 | Staphylococcus_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
37852 : 150524
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP047584|37852:150524|DBSCAN-SWA TATGGCACGAATTCCAATAGATCCATTTAACAACGACATGGACGACTTATTTAACCAACTCATGGGGGGAATGAACGGGGTCAACAGCGAAAACCGCCGTTACCTGATTAACGGGCGCGAAGTAACGCCTGAAGAGTACGCCGCCTTTCGCCAGACCGGGAAGCTCCCGGGTGTAACTGACCCAACCCAAGTAAAAACTAAGCAACCACAACCAGACAGCATGCTAGCTAAGCTCGGCCGCAACTTGACGCAAGAAGCCAAGGACGGCAAGCTCGACCCGGTGATCGGCCGTAACAAGGAGATTCAAGAAACCGCCGAGATTCTGTCACGGCGGACCAAGAACAACCCAGTGTTAGTCGGTGACGCCGGGGTCGGTAAGACGGCGGTGGTGGAGGGCCTAGCCCAAGCCATCGTGGCCGGCGACGTTCCCGCTGCCATCAAGAACAAGCAGATTATTTCGATTGACATTTCCAGCTTGGAGGCCGGGACCCAATACCGGGGCTCCTTTGAAGAGAACATGCAAAAGCTGATCGACGAGGTCAAAAAGGCCGGCAACGTGATCCTCTTCTTCGATGAAATTCACCAAATCATCGGGGCCGGAAACGCCGGCGACGCCTCGGGTTCCAAGGGAATGGCTGACATCTTAAAGCCGGCCCTTTCCCGCGGCGAAGTGACCTTAATCGGGGCCACCACCCAAGACGAGTACCGCAACACGATCTTAAAGGACGCCGCTTTATCCCGGCGGTTCAACCAAGTAACGGTTAACGCCCCGAGCAAGGAAGACACCTTCAAGATCCTGCAAGGTTTGCGTAAGCTGTACGAAAAGCACCACAACGTTTCCTTGCCTGACGACGTCTTAAAGGCCGCCATCGATTACTCGGTTCAATACATTCCGCAACGCTCCTTACCTGACAAGGCGATCGACCTGATTGACGTCACGGCCGCTCACCTAGCTTCCAAGCACCCGGTCAAGGACGCCAAGACGATTGAAGAGGAGATCAAAAAGGCCGAGGCCAAGCAACAAGAAGCGGTTGAAAAAGAGGATTACCAAGCCGCCCAAGAGGCCAAGGACCAGGTGGCCAAGTTGCAAGACCAACTCAAGGACCACTCCGAATCCGAACGGGTCGTGGCAACGCCGAGTGACGTGGCCGCCGCCGTTGAACGGATGACCGGGATCCCGGTGTCCAAGATGGGTGCTTCCGATATCGAACGCTTAAAGGGCTTAGCCACCCGTTTGGAAGGCAAGGTTATCGGCCAACAAGAGGCCGTCGAAGCCGTGAGCCGGGCGATCCGGCGTAACCGGGCCGGCTTTGATGAAGGTAACCGGCCAATTGGGAGCTTCCTTTTCGTCGGCCCAACCGGGGTCGGTAAGACCGAATTGGCTAAGCAACTAGCCCTCGATATGTTTGGTTCCACCAACGACATCATCCGGCTCGACATGTCCGAATATACCGACCGGACGGCGGTTTCCAAGTTGATCGGGACCACCGCTGGCTACGTGGGTTACGACGATAACTCCAACACCCTGACCGAAAAGGTACGGCGTCACCCGTACTCGATCGTCTTGCTCGACGAAATCGAAAAGGCCAACCCGCAAGTCATCACCTTGCTCTTGCAAGTCTTAGATGATGGGCGCCTAACCGATGGGCAAGGGAACACGGTGGACTTCAAGAACACCATCATCATCGCCACCTCTAACGCCGGCTTCAGTAGCGACGCCGTGGCGGGCGAGGACGCTAAGTTGATGGACAAGTTGCAACCGTACTTCCGGCCAGAATTCCTGAACCGGTTTGACGCAATCGTGGAATTCCACACCCTGACCAAGGACGACTTAAAGCAAATCGTCGACCTGATGTTAGCCGGGGTTAACGAAACCTTGGCCAAGAAGGGGATGGACGTCACGGTGACCGATGAAGTGAAGAACTACCTGATTGACAAGGGCTATGACAAGACGATGGGGGCCCGGCCACTGCGGCGGGTGGTGGAACAAGAGATCCGTGACAAGGTGACGGATTACTACCTCGACCACCTGGACGAAAAGCACCTCGTGGCCACCTTAAAGGACGGCCAAGTCGTGATTGAACAAGCAAAGTAAGTGCGGATCAACCTTCTCGACAGCCCGTTGGGCTAAGCTAGGACGGGGGTTGATACGGCACGTATCGTTCTCCGACCGTACTTAGCCACTAGGCCTGTGGTTGGGAGCACGTTAAAAGTAAGTGCGGACCAACCTTCTTGACAGGCCGTGGGGCTAAGCTAGGACGGGGGTTGATGCGGCACGCATCGTTCTCCGACCGTACTTAGCCACTAGGCCTGTGGTTGGGAGCACGTTAAAAGTAAGTGCGGACCAACCATTTGGCAGGCCGTGGGCTAAGGCTAGGCCTAACATTTGAATAGCTGTAAAAAGAGACTGGAAAAAGTTTTCCAGCCTCTTTTTTTGGTCAGTGAAGTGAATTTCTTGGTTCTCCGGGTCCACTACGTTAAAATAAAGATATTCATAACGTTTGGGGGTGTTGGTGATGGGTTTAACGTGGGACCTGATTAGGTGGGCGCTTTTGGTGATCGTGATCATCAACGAAGTGGCGGCCCTGGTGACCGTTTTCCGGGAAAAACGGGACATCGCCGCTACTTGGGCCTGGCTAATGGTGCTAATGATTCCGGTGATCGGCTTTATCATTTACGCCTTTTTGGGCCGGAAATTACCCCAAAAACGCCTGGAACGGATTAGTTCGCCAACCGCCCAACACCTATACGACGCCTTTGAAGAACAGCGGACCGCCTTTGTGGAGATGCCCCGCCCCGAGGACAGCCTGGTGCAAACCTACCGGCGAACGATCATGCTCTTTCAAAGCATTGATGAGTCCTTTTTGAGCGAGGACAACCAGGTGGAAATCTTCACCACCGGGATTACCTTTTTTAACCGGTTACTAACCGATATTGAGCAAGCCAAACAAAGCATCCACATTGAGTTTTACACCATCTACAACGACCAAATTGGCAACCGCCTGCGGACCCTCTTGGAACAAAAGGCGGCCGCGGGTGTAGAGGTGCGGGTGCTGTACGATTCTTGGGGCTCAATGGGGGTGAAGAAGAGCTTTTACGATAACCTACGTAAAAACGGCGGCTTTGCCAGTCCCTTTTTGATGACCCACTCTAATTTCTTAGACTTTCGGTTAAACTACCGCGACCACCGTAAGATCGTCGTCATTGATGGCCAGATTGGTTACGTGGGGGGCTTTAACGTCGGTGATCAGTACCTAGGCCGGCTAAAGAAATTCGGCCCGTGGCGCGACACCCACCTAAGGATTCAAGGGGGCGGGGTTTACAGCCTCCAGCAGTGCTTCTTGCGTGACTGGAACGCCTCGGTCAAGCCGGCCGAGCGCTTGACCCACTTTAAGGACTACTTTCCTTCGGCCGCCCTCAACAAGGGAAAAACGGCGATGCAGATTGTCTCGTCGGGGCCGGATGCCCCCCTGCAGGCCATCAAGCTCGGCTACTTGCGCCTAATCAACGCCGCCCAGGACCATATTTGGATCCAGACGCCCTACCTGATTCCCGATGATTCGGTGATCGACGCCCTGCGGATTGCCGCCCACTCCGGGGTGGACGTCCGGATCATGATCCCTTCGATGCCCGACCACGCCTTTGTTTACCGGGCCACCCAGTATTACGCCCGCGCCCTAGCCAACGAAGGGGTGACGATTTATTCTTACCAGTTGGGCTTCTTGCACGCCAAGACAATGACGATCGACGGCAAGATGGCGTCGGTGGGATCGGCCAACCTCGACTTCCGGTCCTTTCAGCTCAACTTTGAGATCAACGCCTTCTTGTACGACCGGCAGTTAGTTGATGAGCTAGAACAAATCTTCATTAACGACGTCCGTGACAGCCGGGTGATTACCCCGGAGATGTTTGATGCCCAACCACTGGGCCTACGTTTTAAGCAGACCTTCTCGAGGTTGTTGTCGCCGATTTTATAGGGAAGTGTGCCTCAACCATTAAAGCAGGCCGTGGGCTAAGGAAAGACCACAGGTTAGCGCGCCAGCGGTGTTCTGTGGTCAGACTTAGCCACTAGGTTGGATAACTAAAAATGCCTCCCTGTTTCGGGGAGGCATTTTTTAGGTAACCACGCGGTTTAGCACCTATGAGGAGCAAACTCATAATAGAAAGATTGAGAGATTTGAAAATTGACGCACTAAACCGCCGAGATGGATTTACTTAGCACTTAATAAGTTCACTAAGTAACAATTTCATTTAACCATGGTCTGTCTAAAAAAACAAGGAAAAAACTTGGTAAGTGAGCAACTTAAACGATATTAAGATGAAAAGATAGTACGAGGTGAATGTGATTGAATATAAATTCACAATCAGTCGTCCGCACAACAATGCGAACATTCATTCCCCTTTTTGGCACCCTAGCGTGGTATAATTAGGCAACGATCTGAATGGGGGAATGATAAAAATGGCGACCTTACAATTTGTTTTGGGGAGTGCGTCCTTTGACCACCAGCAAGTGATGCTCGATCGCTTGGCGGCTCAGTACCAGCAAGCACCCAATGATACCTACCTTTACTTAGTGCCCAACCACGTTAAGTTCACCACCGAAGTAGCCGTTTTAAAGGGGCTTAAAAAGCGGTTGAAGCAAACCGGTAATTACGCCCAGGCTAACGTGGCGGTCCTGTCCTTTTCGCGCTTGGGGTGGTTTTTGTGTAAGGACGACCCCGATTACCAAAAGCCCCGCCTTTCCAACGTGGGGATGGCGATGGTGGTCGCCAAGATCATTCGGGAACTCAAGGCAGAATCCCCCGACCTTTTGAAGATGTTTCGGGGCGAAAGCGAACGCCAGGGCTTTGCCACGGCGGTGACCAAGCAGCTGGTGGAACTACAAAACGCCAATATTCAACCGGCCGACCTGGCGCCCGATCAGGAAACCGGGATTATTAAGCGGGCCCTGGCTAGTCAGGCGGGGGGTGGCCGGGCCAGTCAATCGACGGTCTTTACCG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91 | Paenibacillus_phage(19.44%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
173352 : 234214
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP047584|173352:234214|DBSCAN-SWA 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53 | Streptococcus_phage(38.89%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
237664 : 310346
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP047584|237664:310346|DBSCAN-SWA 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58 | Lactobacillus_phage(15.0%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
316061 : 357729
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP047584|316061:357729|DBSCAN-SWA 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33 | Bacillus_virus(20.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
445503 : 512883
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP047584|445503:512883|DBSCAN-SWA 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60 | Streptococcus_phage(26.09%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
679671 : 799852
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP047584|679671:799852|DBSCAN-SWA 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114 | unidentified_phage(15.15%) | protease,transposase,integrase,tRNA | attL 739293:739352|attR 777291:777497 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
805129 : 871215
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP047584|805129:871215|DBSCAN-SWA 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55 | Paenibacillus_phage(14.29%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
878771 : 945756
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP047584|878771:945756|DBSCAN-SWA 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55 | Staphylococcus_phage(25.0%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
966471 : 1022513
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP047584|966471:1022513|DBSCAN-SWA 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57 | Paenibacillus_phage(13.33%) | transposase,integrase,tRNA | attL 992597:992612|attR 1009196:1009211 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1026374 : 1085751
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP047584|1026374:1085751|DBSCAN-SWA 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56 | Streptococcus_phage(27.78%) | transposase,integrase | attL 1054540:1054555|attR 1067629:1067644 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1184545 : 1204712
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP047584|1184545:1204712|DBSCAN-SWA 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16 | Paenibacillus_phage(37.5%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1225806 : 1253417
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP047584|1225806:1253417|DBSCAN-SWA 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30 | Lactobacillus_phage(28.57%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1313699 : 1473442
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP047584|1313699:1473442|DBSCAN-SWA 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156 | Lactobacillus_phage(50.85%) | plate,portal,tail,protease,head,integrase,tRNA,capsid,transposase,terminase | attL 1361889:1361906|attR 1408927:1408944 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1488328 : 1590914
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP047584|1488328:1590914|DBSCAN-SWA 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110 | Lactobacillus_phage(57.89%) | protease,tail,portal,tRNA,head,integrase,capsid,transposase,terminase | attL 1530440:1530458|attR 1566811:1566829 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
1632291 : 1700350
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_CP047584|1632291:1700350|DBSCAN-SWA 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58 | Streptococcus_phage(22.22%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
1720534 : 1806374
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_CP047584|1720534:1806374|DBSCAN-SWA 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81 | Paenibacillus_phage(26.09%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_18 |
1838046 : 1894094
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NZ_CP047584|1838046:1894094|DBSCAN-SWA 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50 | Lactobacillus_phage(21.43%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_19 |
1917072 : 1956609
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_CP047584|1917072:1956609|DBSCAN-SWA 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34 | Lactobacillus_virus(18.18%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_20 |
2081355 : 2203074
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >NZ_CP047584|2081355:2203074|DBSCAN-SWA 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105 | Paenibacillus_phage(21.21%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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