Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048617 | Caloranaerobacter azorensis strain T3-1 chromosome, complete genome | 11 crisprs | cas14k,RT,DEDDh,csa3,cas3,cas2,cas1,cas5,cas7,cas8b2,cas6,WYL,csx20,cmr6gr7,cmr5gr11,cmr4gr7,csm6,cmr3gr5,cas10,cmr1gr7,cas4,casR,Cas9_archaeal | 4 | 22 | 10 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP048617_1 | 742241-745416 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of NZ_CP048617_1
|
48 spacers
spacers of NZ_CP048617_1
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048617_1
The CRISPR arrays of NZ_CP048617_1 >merge|NZ_CP048617|1|742241-745416|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR 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ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC TGTTTAACAATAGTAAGAGTTTCAAGACCTCAATAT ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC TTACCCCCTCATTCTTCATAAATAACCCCATACACA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC GAGATAAACCAACTTCAAGAGCAGACAAGTAGTAATGC ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC TGCACTTTAAATCAAGACCACTGTATAGAAATTTCA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC TGATACAGAACCAATAAATCAAAAACCAAAACAGC ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC TATGCTTGGGGTTGTATTGTAACAATTAAAAATAC ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC AGATTTTGTTTTTACTAAAAAAGATATGAAAAATGTA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC CTATTCTTTTAATCTTTTCTTCATTCTGCTTTAATGC ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC CTATATCATTCATTTCTATTCCTGCGACATCCGCTA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC GGGAACAGTTTTTTATTGAGGCAGAATATCTTAAAA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC TCAATTATTCTACTAATAATAGTCCAGAAAAGCCATTG ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC CTTTTGCTACAACAACACCTCTGCTTTGCTCTTTTAA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC CTTATACTGTTCTGCAGTAGTTTTGCTTTTTACATA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC GTACCAGTTAGCTCTCATCTATATCCCCTAACTAAAA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC CTGAACAGTATCCTATGTATACTCTGTTAGAAGAAAT ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC
>NZ_CP048617.1|WP_163234593.1|741265_742027_+|ATP-binding-protein MRNGLLNEIKEYIKELKIPGINQSLKTRIEEAYRLDISYEEFLRDLFRDAYDVRKENGKKNRIKNANFPYKKYLEDLKTEYLPEEARKRLKELKTLKFIEEGKNIIFVGNPGTGKTHISIGLGIEACNAGYKVFFTTVPLLINELKESRSEKRLRSFEKKFEKYDLIIADELGYISFDKEGSELLFTFLSLRAERKSTIITTNLSFDRWKEVFKDPVLTAALIDRLTHKSYVINMNGDSYRMKETIEWLGKSN >NZ_CP048617.1|WP_163234592.1|739694_741269_+|IS21-family-transposase MISLKQKAEILLKYFREGESQREISRTLGISRKTVRKYIKGFEEKLQKLGSESDEKKILLLIEEMVSKPKYDTSKRKKVKLTDEVIEIIDKCLEENEKKKLSGKSKQIMKKIDIHEYLIEKGYDISYTTVCNYIREKGEIKEAFIRQEYMLGETLEFDWGEVKLNIDGKDTVLNIGLFTTAKGSYHYARLYRNKKMENFLDIHVKAFENIGGIHKEIVYDNMKQAVKKFVGPNEKEATEDLIKLSLYYGFRYRFCNARSGNEKGHVERGIEYVRRKVFSKKEVFDSIEEANKYLQERLNIINSKPRSHFEGKSPKEILEEEKLYLLALKPRYDVSRREEVRVNKYSTVNIDQNKYSVPDYLVGKFVIAKIYPETINIYYKDFLIASHKRCYSVHQWIIDINHFIHTLKKKPGALHSSAGRHQMCPELQQIYQDYYINNPKDFIVLLELIKQKGLKPVLEAVKKLSQIKRSVVNTDNIKSIILNRPPSNEDYPSSKDSEIEKVSVNLIKKINDIFNMNSEGGLLN >NZ_CP048617.1|WP_163234591.1|738506_738806_-|hypothetical-protein MEMTDLDRLIELYGMDVTDDLEVSPFEYVETFLIRSEIENNYEKLNEFQKKKLEEYDKILLKRAKEFVCYLKEPFPGWNNKEPKEHWWWHLDKVLNDDN >NZ_CP048617.1|WP_035161363.1|737446_738181_-|hypothetical-protein MSTAPKKLWDIYEGLKNQFLFYNDINSIYILLSLYDLEENISNIRPKYTCTKSIKRRIKYILKNRTNRELIARNISILIHEDINRLELCFYLEGYKYGYNNKKWVDRLENKAIELYGIEGLYDNSYLFHYDFSKPEIIDLRKALRREIDSKEKKDRQIEGLVYTFCNKIIKKKIENLDKYVDKQLKIDFNPYNYSIKEEDYKLKEEEQDKIYHSIVNVIIKNVKDIYKDACWYAINDKVLKRYI >NZ_CP048617.1|WP_073196120.1|736777_737380_-|hypothetical-protein MKRVSKVTFVTFALLLLLISFIYGYNVGDKKAIEKPQKELTIKDAENNVIGYKNDNNVGVEKENVIGPNTVIEYINYYKKCNDTLTQIAEPEETIINFNEEDYRKYLETNHPNWQLLSFSSERIIVKRELDRYCPNHYIIGVKDNKIAIFKFNDMGEKVLIEMINKSVSTLKEIDQEKLKKGIVVDSKEEIGDILENFIS >NZ_CP048617.1|WP_163234590.1|736101_736596_-|crossover-junction-endodeoxyribonuclease-RuvC MIIVGIDPGIAIVGYGIIEKKGNKLKAIKYGAITTEPDISLPYRLKTVYDELTKILIEYKPDAFAIEELFFNKNVKTAITIGQARGVEILAAVNCGIDIYEYTPLQVKQGVVGYGRAQKKQVQEMVKLLLNLKEIPKPDDVADALAVAICHAHSGRFKELFKIR >NZ_CP048617.1|WP_035161359.1|735495_736080_-|Holliday-junction-branch-migration-protein-RuvA MFSYIIGDVSEIGEDYIVIDNHGIGYFINTSKNTICNLKDNIKGVKIHTHFHVREDGISIYGFISKEELEMFKLLLLVSKIGPKVALGILSSLTPESIKQAILNEDIKLLSTAQGIGLKTGKRIILELKDKIKDGIFTETNVFKSDSSIDEAVGALISLGYSRTEINNVLSKIDTSDLKTEDIIKIALKKLSTK >NZ_CP048617.1|WP_163234589.1|734462_735482_-|Holliday-junction-branch-migration-DNA-helicase-RuvB MSSIAEENRIITSNLKYEDYEIENTLRPKRIDDYIGQNKVKEKLKIFIEAAKRRNESLDHVLLYGPPGLGKTTLANIIANEMGVNIKITSGPAIERQGDLAAILTNLEENDVLFIDEIHRLNRNVEEILYPAMEDYVLDIVIGKGPSAKSIRLDLSKFTLIGATTRAGLLTSPLRDRFGVICKLDFYDVENLKKIIIRSAYILGVKIDEDGANEIAKRSRGTPRIANRLLKRVRDYAQVVEDGVITKSVAQKALELLEVDEMGLDNVDKRLLYTIIYKFNGGPVGLDTLAASTGEESNTIEDVYEPYLLQLGFINRTPRGRVVTKKCLDYFNIKLDELG >NZ_CP048617.1|WP_073196115.1|734242_734458_-|DUF2905-domain-containing-protein MESLGRFLVLTGFIFIILGGFLMLLQRLGLGKLPGDIVYQKGNFTFVFPIVTCIVLSIILSIILNIFSRLK >NZ_CP048617.1|WP_163234588.1|732599_734219_-|SpoIID/LytB-domain-containing-protein MNVKRILTIILAVVLIQFISLNVLGDKSDVKYIRVGLKNPMVYQDQAVISTNNGFVIGTMDNGFNEILKTDAKSLFIRLDDFYKIEDSIKLVNEDEQLDYGPYHLEIKGEYKEYDDVEAEIINLKDASIKAYPYYNGKFRIWLGFYKTYEEALTESELFSEKLGKKINVIDNSNMRIVIEDNKGNVLLVLDPDAKLYIKSNVAEGYESIIAVNGSNYRDYLTLNRIDKELIIINYLPLEHYLYGVVPREMSANWPLEALKAQAVAARNYALISLKRHDDLGYDLCDTQHCQVYAGYDWENIKSNKAVDETYGKVLKYNGKLVNAYFHSTSGGHTENSENVWEYEIPYLRGVKDDFSIGSPNYSWQLVLNNKEIKERLEANDISIGDICSVEPLVRSEYGRVLELKIEGTDGVEILKKEKSRKVFGYASLKSTWFDVKSDADVYVVSGVNFKPVKTTLNKVYIVSANGMVTNTRNVYSQVKITNGDKTNIMPVIPNMYVFEGRGWGHGVGMSQWGAKKMAELGYNYKQILEYYYTGAKVE >NZ_CP048617.1|WP_073197684.1|746049_746790_-|YebC/PmpR-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MAGHSKWANIKHRKGKQDAKRAKIFTKLTRAIIVAAREGGADPEYNAALKTAIEKAKAANMPNDNIERAIKKGAGELDGVNYEEITYEGYGPGGIAVLVEVLTDNRNRTASDIRHYFSKFGGNLGSTGCVSFMFDRKGVLIIEKEEGIDEEELMMQAIEAGAEDFITEEEYFEITTSPEDFATVRDSLKQAGYTFTTAEISFIPQNTTRLTDEDDIKNMTKLIDALEDNDDVQNVYHNWEMPEDLE >NZ_CP048617.1|WP_163236141.1|746802_747519_-|NAD(+)-synthase MEKVCDNLVSWLIDKVQEAGCKGLVVGLSGGIDSAVVAALAKRAFPESSLGVIMPCHSNSKDEEHAKLVAETIGLKIVKVDLSKTFDSLLDELKDDGTNLLAVSNIKPRLRMTTLYYFAQKNKYLVAGTGNKSELTIGYFTKYGDSGVDLLPIADFVKFEVKELAKFLGIPEIIINKPPSAGLWENQTDEGEMGFSYKELDTFILTGGATPDVKEKIIRMNKLSEHKRRMPLMFIREK >NZ_CP048617.1|WP_163234594.1|747703_748159_+|zinc-ribbon-domain-containing-protein MSNKISTKRKITYYIGLLLTIIGFLMFFSAFFIGFTAINEPSFGGASSAFVRVPIGMGLIIAGAILQIIGRKGAAGSGIILDPEKAREDLKPFNTTKGKMINDVVENVDILKNFTEKSSSPIKEVVKIKCRNCGKLNDENAKFCNECGREL >NZ_CP048617.1|WP_035164817.1|749697_750384_-|response-regulator-transcription-factor MKEKILIADDEEDIVSFIKDFLEEDYEILCAYNGEEAIEKAKCNPDLILLDVMMPNLNGYEVCNIIRDIVSCPIIFLTAKHEEQDIIRGLTIGGDDYIAKPFSLRELKVRIEAHLRREKRSYNNKRARLYFGDLSIDLKGNKVYFKNEIIHMTKKEYKIVEFLAINCGQVFSKEQIYEKIWGYDAEGDASVVAEHVKKIRQKISEYDSKRDYIKTVWGVGYRWEKWSM >NZ_CP048617.1|WP_163234595.1|750491_751289_-|ABC-transporter-permease MKALILSELERIWGRKRTGILFILNIVLIFMICAFVNFYKVGFYGPNAYIKLNSLNFSPFVLREGHIILTCIICPIIFIDCLNYEKTSGRFRLYMIRAYDKFEYIVSKWIALSITLFIFVISIFIVSNVFGFTLMPKTEYTELVNVQGEYGLISALLYNIKFYMIEYMILLCILGIASLVSVLVPNAVLAVIATIAVIVGSIYVWDGFSFLLFSTDEIFNALGGINTAQFFISLIGIILITVLSSGLYGKRKGIIFSGKHDKILV >NZ_CP048617.1|WP_163234596.1|751304_752129_-|ABC-transporter-permease-subunit MVDLIKSEWERLWLKKSTWLCFLAIPFMVYATILYYAKKNMMILQTSPEYTNFLNFPVAALQEQLISAINVFLILFIVLSITEEYRSGQMRMVMIRRYNIREILFAKYIVIILVMFLFLSYYFIFSFIEGYIFLPKDKTTRFFFREDIFLAKNAVIYCLKYYFLAFVTIIAVASMCVFISLISKSTTVAAGANIAIVLFLAMGTEIVKIFAQILGYAPPTKVMFSSIVHIQYKGIYYLLSNNELNSWIIFIILAYIIVFSVFSYLYLRKKDSFI >NZ_CP048617.1|WP_163234597.1|752175_752880_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MKEKKIEVINVTKKIGKKTILENISFTVLKGEISALIGPNGAGKTTLIRMLTGLIDLTDGEIFICGNSIIKDRKNALKKLGAIVEAPIFFPYMTGRKLLQNLVRLHNDMLRKEQLDKVEEVLELVGLRDRGDDKVKTYSLGMKQRLGIAQALLGNPDVIILDEPSNGLDPLGMKQLRELIKKLRDEKGVTFLISSHLLDELQLFCDKFIIINNGKVIWEGTKEELITLTSGGIE >NZ_CP048617.1|WP_163234598.1|753096_754011_-|cysteine-synthase-A MIYSSIIETIGNTPIVKLNNIVDKNSADVYVKLEYFNPGSSVKDRIALNMIKQAEKEGKLNKDSVIIEPTSGNTGIGLAMIGAAKGYKVVLVMPDTMSLERRNLLKAYGAELVLTPGIKGMKGAVEKAKELLEKNENYFMPQQFENPSNPEIHRKTTAREIIEQMDSKFDAFVAGVGTGGTLTGVAQVLKQEMKNVEIIAVEPEKSPVLSGGQPGPHGLQGIGAGFIPKVLDKDLIDSIERVSEEDAINTIKEVAKKEGILLGISSGAAIYAALNKAKKLGKGKKVVVIAPDNGERYLSTGIFE >NZ_CP048617.1|WP_073197671.1|754147_754513_+|sulfite-exporter-TauE/SafE-family-protein MILNKKIYKSLLVGFITGIINGLFGSGGGTIIVPSLVFLLGIEEHKAHATAIFIILPITFISTFIYLKQGMLVYKIAIPVIIGAVLGSIIGSKLLNKIPTNILRKIFGIFMIIAAIRMVIK >NZ_CP048617.1|WP_163234599.1|754509_754860_+|sulfite-exporter-TauE/SafE-family-protein MILFIIGFFSGIISGLGIGGGTILIPGLIFFTTLSQHKAQGINLLVFIPTAITALFIHFYNRNILLKIAFPIIITGLIGALIGSMIAVNINSEMLKKIFAIFLFFMGIYEFYYKKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048617_2 | 1340038-1340727 | TypeI-A,TypeV |
I-A
Consensus repeat of NZ_CP048617_2
|
10 spacers
spacers of NZ_CP048617_2
>2.1|1340067|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT TTGTTTTAAACCACTCTATTACCTGCCGTGCAGGACC >2.2|1340133|36|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGTTTTATAAAAGTTCTTTAAATGATGATGAACTAA >2.3|1340198|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTCTGAATGGTAAATCTTCTTGAATAGCCTTTAACTT >2.4|1340264|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTGAAGAATTAGATTATATTAGAAAAGTATATGA >2.5|1340328|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGGAAGAGTTGGATTTTCTGATAGATATTTTTGTGCA >2.6|1340394|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGGATTTAATTTATATAGATGGTAGGGGTGATTTAAA >2.7|1340460|38|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTGAAGTTATTAAAAGATATAAAAGCAGAGTTTGACGA >2.8|1340527|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGGCTAACTTTTTACGATTTAAAAGATTTTGTAGAAA >2.9|1340593|36|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATCTCATCAAGAAGTCCAATCATCATACATTTATT >2.10|1340658|40|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT TTCTTTTATGTCTTGGTATTCCTTTCCTACTCTATTTCTA |
cas2,cas1,cas5,cas7,cas8b2,cas14k |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048617_2
The CRISPR arrays of NZ_CP048617_2 >merge|NZ_CP048617|2|1340038-1340727|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACTTCACATTCATATAGTTAATATAAAACTTGTTTTAAACCACTCTATTACCTGCCGTGCAGGACCATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAACAGTTTTATAAAAGTTCTTTAAATGATGATGAACTAAATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAACCTCTGAATGGTAAATCTTCTTGAATAGCCTTTAACTTATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAACCTTGAAGAATTAGATTATATTAGAAAAGTATATGAATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAACTGGAAGAGTTGGATTTTCTGATAGATATTTTTGTGCAATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAACAGGATTTAATTTATATAGATGGTAGGGGTGATTTAAATTTTACATTCCACATAGTTAATATAAAACGTGAAGTTATTAAAAGATATAAAAGCAGAGTTTGACGAATTTACATTCCACATAGTTAATATAGAACTGGCTAACTTTTTACGATTTAAAAGATTTTGTAGAAAATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAACTATCTCATCAAGAAGTCCAATCATCATACATTTATTATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAACTTCTTTTATGTCTTGGTATTCCTTTCCTACTCTATTTCTAATTTACATTCCACATAGTTAATATCTTTTT >NZ_CP048617|2|2|1340038-1340727|CRISPRCasFinder ACTTCACATTCATATAGTTAATATAAAAC TTGTTTTAAACCACTCTATTACCTGCCGTGCAGGACC ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC AGTTTTATAAAAGTTCTTTAAATGATGATGAACTAA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC CTCTGAATGGTAAATCTTCTTGAATAGCCTTTAACTT ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC CTTGAAGAATTAGATTATATTAGAAAAGTATATGA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC TGGAAGAGTTGGATTTTCTGATAGATATTTTTGTGCA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC AGGATTTAATTTATATAGATGGTAGGGGTGATTTAAA TTTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC GTGAAGTTATTAAAAGATATAAAAGCAGAGTTTGACGA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAGAAC TGGCTAACTTTTTACGATTTAAAAGATTTTGTAGAAA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC TATCTCATCAAGAAGTCCAATCATCATACATTTATT ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC TTCTTTTATGTCTTGGTATTCCTTTCCTACTCTATTTCTA ATTTACATTCCACATAGTTAATATCTTTTT >NZ_CP048617|2|2|1340038-1340726|CRT ACTTCACATTCATATAGTTAATATAAAAC TTGTTTTAAACCACTCTATTACCTGCCGTGCAGGACC ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC AGTTTTATAAAAGTTCTTTAAATGATGATGAACTAA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC CTCTGAATGGTAAATCTTCTTGAATAGCCTTTAACTT ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC CTTGAAGAATTAGATTATATTAGAAAAGTATATGA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC TGGAAGAGTTGGATTTTCTGATAGATATTTTTGTGCA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC AGGATTTAATTTATATAGATGGTAGGGGTGATTTAAA TTTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC GTGAAGTTATTAAAAGATATAAAAGCAGAGTTTGACGA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAGAAC TGGCTAACTTTTTACGATTTAAAAGATTTTGTAGAAA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC TATCTCATCAAGAAGTCCAATCATCATACATTTATT ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC TTCTTTTATGTCTTGGTATTCCTTTCCTACTCTATTTCTA ATTTACATTCCACATAGTTAATATCTTTT >NZ_CP048617|2|2|1340104-1340657|PILER-CR ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC AGTTTTATAAAAGTTCTTTAAATGATGATGAACTAA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC CTCTGAATGGTAAATCTTCTTGAATAGCCTTTAACTT ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC CTTGAAGAATTAGATTATATTAGAAAAGTATATGA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC TGGAAGAGTTGGATTTTCTGATAGATATTTTTGTGCA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC AGGATTTAATTTATATAGATGGTAGGGGTGATTTAAA TTTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC GTGAAGTTATTAAAAGATATAAAAGCAGAGTTTGACGA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAGAAC TGGCTAACTTTTTACGATTTAAAAGATTTTGTAGAAA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC TATCTCATCAAGAAGTCCAATCATCATACATTTATT ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC
>NZ_CP048617.1|WP_073198185.1|1339145_1339244_-|hypothetical-protein MITFYNKVIDIYIDESGNEFKTSNFKIHYSKR >NZ_CP048617.1|WP_163235002.1|1339012_1339192_-|hypothetical-protein MNLRRAILKSITVKGESLEDILNIEYQEVIKDNRKAKIYRDGNGIFPILSSEIEKVELL >NZ_CP048617.1|WP_163235001.1|1338836_1338980_-|hypothetical-protein MNSKFENYTKNKSPNLYTIWIAKKAEVVFIDGELMVVNVIDWNEDSY >NZ_CP048617.1|WP_163235000.1|1338463_1338709_-|hypothetical-protein MNYGKFNSLQDLKDSIEMGLDIECYIYGQRYYIGWGDNGRVIAKCPDGDGVYFNSLDEMLNFKIQDKKIKDIWKDIQIISM >NZ_CP048617.1|WP_163234999.1|1337965_1338268_-|hypothetical-protein MIANILYYLIKIFLWGLALFLSIIPGMIAGYIGETLLGGIGYWIGFVIGILIFLVYMKPLLAFDDDKPLEKEYYQQSYGTSLFSFLVGIWLGRKFFGKDD >NZ_CP048617.1|WP_163234998.1|1337579_1337744_-|hypothetical-protein MIKCPITNSDIDIAECVVIVDVSEGCAKETILSDNIKKVENWREICKHCKKHNS >NZ_CP048617.1|WP_163234997.1|1337334_1337529_-|hypothetical-protein MKLWEYLGKKIKVTCIEGEVIQGKCNGYIQALDNEPEIASISIDAGEIDYEIYENEIEKIELVD >NZ_CP048617.1|WP_159430380.1|1337127_1337304_-|hypothetical-protein MDDEYNCPLVNRKINESYCLEYCEAVDGMLKMDIINGFKGTREEAQRICYNCLNHKDD >NZ_CP048617.1|WP_163234996.1|1335633_1336851_+|IS256-family-transposase MSKLSKEVLRQMISDGGLKTADDLYEYLKDMFKDALQEMLEAELEVELGYAKGDIKNKQTDNRRNGYSEKTFKTKYGKLDIEVPRDRNGEFEPIVVPKNKRDISGIEEKVISLYARGMTTRDMHEQIKDIYGIQISSEMVSKITDKLLPQIQEWQNRPLEPIYPFVFMDAIHYKVREDGQIKNKAAYVVLGINLEGFKDILGIWIGESESSKFWLGILNELKNRGVKDILIFSVDGLTGLKEAIGASFPKSEIQRCIIHQFRNSFKYVPYKDLKEFTTDFKQVYTAVNEETAYSKLQEIEEKWGEKYPFAIKSWYANWKVLSPFFKFPAEIRRIMYTTNIIESLHRQFRKVTKTKTIFPSDKALYKILYLASQNVMKKWTVRYKNWDIVINQLMIFFEGRIESYL >NZ_CP048617.1|WP_163234995.1|1335226_1335490_+|hypothetical-protein MTNIEEFLNKNNIIFEEKRIKIFLKDGSIIVGNASDYLEERLGETPEDILNIENPKIIKNNGKAEIYKEKEGVSPVFIKDIKEIELI >NZ_CP048617.1|WP_163235003.1|1340792_1341110_+|transposase MPKKQLTEEFRVKVVKEALETGEQGIVARRHDIHPVTSSRWINNYKKYGKTTVSKQTSKTTNKDVKSQILEKENEQLKKLLGEKELEIQILRDLLKKTNQDLKID >NZ_CP048617.1|WP_163236228.1|1341112_1342039_+|IS3-family-transposase MAEKWISKGYKVSLVLKIIGINRSTWYYHQNKTNRNTHNHSGKGRPIPGYSYNTSGQKINDLKIMKYIKELIKGEAYCYGYLKITYLLRKKYNLIINKKKVYRLCKQLNILKPQREIKPKYPRKIAINRTITGSNQLWEADVKYGYIASSKKFFYILSIIDVFDRSIIDYHIGLSCTAKDAKATLINALIKRNLLSSKTKPIIRTDNGSQFVSNIFKYTCEKLNMHHEQIPVKTPNKNAHIESFHNLLQNECLRYFSFTSFKEAYKEVVKYIDYYNNTRIHSAIGYMTPMEFYRENSSNIKKKLVVRV >NZ_CP048617.1|WP_163234593.1|1342720_1343482_-|ATP-binding-protein MRNGLLNEIKEYIKELKIPGINQSLKTRIEEAYRLDISYEEFLRDLFRDAYDVRKENGKKNRIKNANFPYKKYLEDLKTEYLPEEARKRLKELKTLKFIEEGKNIIFVGNPGTGKTHISIGLGIEACNAGYKVFFTTVPLLINELKESRSEKRLRSFEKKFEKYDLIIADELGYISFDKEGSELLFTFLSLRAERKSTIITTNLSFDRWKEVFKDPVLTAALIDRLTHKSYVINMNGDSYRMKETIEWLGKSN >NZ_CP048617.1|WP_163234592.1|1343478_1345053_-|IS21-family-transposase MISLKQKAEILLKYFREGESQREISRTLGISRKTVRKYIKGFEEKLQKLGSESDEKKILLLIEEMVSKPKYDTSKRKKVKLTDEVIEIIDKCLEENEKKKLSGKSKQIMKKIDIHEYLIEKGYDISYTTVCNYIREKGEIKEAFIRQEYMLGETLEFDWGEVKLNIDGKDTVLNIGLFTTAKGSYHYARLYRNKKMENFLDIHVKAFENIGGIHKEIVYDNMKQAVKKFVGPNEKEATEDLIKLSLYYGFRYRFCNARSGNEKGHVERGIEYVRRKVFSKKEVFDSIEEANKYLQERLNIINSKPRSHFEGKSPKEILEEEKLYLLALKPRYDVSRREEVRVNKYSTVNIDQNKYSVPDYLVGKFVIAKIYPETINIYYKDFLIASHKRCYSVHQWIIDINHFIHTLKKKPGALHSSAGRHQMCPELQQIYQDYYINNPKDFIVLLELIKQKGLKPVLEAVKKLSQIKRSVVNTDNIKSIILNRPPSNEDYPSSKDSEIEKVSVNLIKKINDIFNMNSEGGLLN >NZ_CP048617.1|WP_163235004.1|1348413_1348683_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVILTYDVGEKRVNKVRKKLKEYLIWTQNSVFEGEITEGKLKKCLYEVNKILNKQEDSLYIYEIKTSSHIKKKVIGIDKSFDDIFYNS >NZ_CP048617.1|WP_163235005.1|1348684_1349668_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MARDFYIFNNGRLKRKDNTIYFIDCLENKRALPIQQINSIHLFGEIDLNSKLINYLSQYGIMLNFYNYYGHYSGTYYPRKKNVSGFTLVNQAAHYTDYEKRLCIAKSFVDSAVHHILKNMRRHKEGIEDLIERIQIERNNIEKAQRIDELMGIEGRIRKSYYKSFSKILKSDFNIQKREKRPPTDPVNAMISFGNSLMYMTVLSEIYKTQLDPTISFLHEPSVKRFSLSLDISEIFKPLVVDTVIFYLVNNRIITFDDFNIDEGICYLNEKGRKKFISEYERKLDTTIKHRKLKRKVSYRTFIKLECYKLIKHFIGDEEYKPLKAWW >NZ_CP048617.1|WP_035164508.1|1352547_1353309_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MRAIRLKLYQNLVNYKKPTSFQLKETYPLPPYSTVIGMIHYVCGFEEYKDMSISIQGKYHSKVNDLWTRYEFSCAAYEKGRHNIKVSSREINKKTGEEIEKTYGIIKGVSTAELLVDVELLIHIKPQDEKLLDLIYENFTKPKEYISLGRREDIVRVDEVKIVEISNEELEDCSVKLNYDAYIPVDMFSKSDFPSNATIYNLNKVYNKIKIKKNTTIRQWEKVKVIHGVMNRNEITEGTEIYKDEDNNLVFFA >NZ_CP048617.1|WP_035164510.1|1353317_1354202_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MDKKGLTASFIFEAESANYGEGVGNVASLKKISRGSGDSYTYISRQAIRYNIITQMGEDRTPLELDGSVIQFAPDATIKDYPEIDLFGYMKTKKPAKTRSAVVRLSNAVSLESFNADLDFLTNKGLLDRYNKQNGEIKDGGNIAQSEIHKSYYAYTITIDLDKVGIDENDDIEIPNEEKARRINKLLDTIKFLYRDIKGRRENLSPIFAIGGVYDIKNPFFENKLKVRNNKILIDTIEDVYKLDDNIKENTICGLIKGIFKNDSDIEERLKPLNMGDFFNELKKRVDEYYKAVK >NZ_CP048617.1|WP_163235006.1|1354194_1355898_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MREISRIRLELSDWLYNAGIVGIANILEHSGKKFEKKSNYIEFDEELLENFEEMYFKYFIDKYLKFTSWYKIVSFEDYIINFNEGEITEKDIEKINNHIEYTKKKLTSSSYKSGYSIIKSSKIDLLKEEKKLKKIKKNKKQTIKDIIPNIKEQLDVISDIIDFLKADEVKRVILAKNIIYDVIAKFIKDVSFLHKNANKNDMYEEYKNYFINSIIEYINNEDNSNSNYNCFNCNRKISKLSKPASYDLTWINKIGVDMSRKTSHFWNFYGDAFVCPICNLVYSCIPAGFTVVRDRGLFINQNSDVKTLISINNIVIDHNTRFEELEEKSYYAVSENLKQSVVENMEKEIDNIQIVKLDSNNDRRPYTFNVLSKNKLKIIYENKKLLRYLVNSYVKTDTGDYINVYSEVIKRLYDNKNQFDLINKLLYLNINDNFSKISNIKIIIKINNDYLGGIMKGKMISYNTIDKLQQFGFELKKAYEAKNSKNKISGISYRLLNALKTKNTDKFMDTLINAYMYLNKEIPSEFIEGLKDEDRFQTLGYSFLLGLQGESGKKELDKENEGDEING >NZ_CP048617.1|WP_163235007.1|1355993_1357046_-|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB MSKSIAGNKNIRTYKMRIKDKKFKSKVIDYIYKYRHFENMYIILLNQDYKQNIGDFRLLTNYEIMRALFRGTAPRKLEEKLTYIRNKYKNHQIMNDLINLSKELKIHNIVEIIKRVKSQYKGFSLKRKNQLGINLNNNRFIAKLNREIMTTKDKNRKRHLEKYRTYLYEKRNRYFYDQFHKISKRVLEYLEKHDVTEIILSDNLNNLKNNGKCKLNKAIKQNFIQIPFGKLLRYIEYKAEGYGIEVKFVDESYTSKVSSLTEDIKIMKKLLQYNLDLTNALNGKRVKRGLFKDKVINKIINADLNGARNICILGSKKAQQKYKAGGENRWLNLKLCNPIKVESDVKFVGL |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048617_3 | 1342099-1342654 | TypeI-A,TypeV |
I-A
Consensus repeat of NZ_CP048617_3
|
8 spacers
spacers of NZ_CP048617_3
>3.1|1342128|36|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGGGCTAAAGAGGTAACAGGTGTCGGTGATGCAA >3.2|1342193|36|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAGTCATATTTTATTAGCTTTAATTCCATATAAC >3.3|1342258|36|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTAAAGCAGATTAAAACAATTAATAGGTAAAAAA >3.4|1342323|36|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTCATTATATTTAATTATTGTATATCCATAACTTTG >3.5|1342388|38|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATATATCATGACATTCTTTATATTCATCTCGGCTGTA >3.6|1342455|36|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT ATCTACTTCTTCAATTTTGCAATCATATCGTACGAC >3.7|1342520|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT TTCCACATAGTTAATATAAAACAAGTGTGAAGTGTGC >3.8|1342586|40|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT TACTAATTGCCCTACTAGGCTTCTTCATATTGACAATCAT |
cas2,cas1,cas5,cas7,cas8b2,cas14k,cas6,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048617_3
The CRISPR arrays of NZ_CP048617_3 >merge|NZ_CP048617|3|1342099-1342654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAACATTGGGCTAAAGAGGTAACAGGTGTCGGTGATGCAAATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAACAAAAGTCATATTTTATTAGCTTTAATTCCATATAACATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAACTTTTAAAGCAGATTAAAACAATTAATAGGTAAAAAAATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAACGTCATTATATTTAATTATTGTATATCCATAACTTTGATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAACGATATATCATGACATTCTTTATATTCATCTCGGCTGTAATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAACATCTACTTCTTCAATTTTGCAATCATATCGTACGACATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAACTTCCACATAGTTAATATAAAACAAGTGTGAAGTGTGCATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAACTACTAATTGCCCTACTAGGCTTCTTCATATTGACAATCATATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC >NZ_CP048617|3|3|1342099-1342454|PILER-CR ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC ATTGGGCTAAAGAGGTAACAGGTGTCGGTGATGCAA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC AAAAGTCATATTTTATTAGCTTTAATTCCATATAAC ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC TTTTAAAGCAGATTAAAACAATTAATAGGTAAAAAA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC GTCATTATATTTAATTATTGTATATCCATAACTTTG ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC GATATATCATGACATTCTTTATATTCATCTCGGCTGTA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC >NZ_CP048617|3|3|1342099-1342654|CRISPRCasFinder ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC ATTGGGCTAAAGAGGTAACAGGTGTCGGTGATGCAA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC AAAAGTCATATTTTATTAGCTTTAATTCCATATAAC ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC TTTTAAAGCAGATTAAAACAATTAATAGGTAAAAAA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC GTCATTATATTTAATTATTGTATATCCATAACTTTG ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC GATATATCATGACATTCTTTATATTCATCTCGGCTGTA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC ATCTACTTCTTCAATTTTGCAATCATATCGTACGAC ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC TTCCACATAGTTAATATAAAACAAGTGTGAAGTGTGC ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC TACTAATTGCCCTACTAGGCTTCTTCATATTGACAATCAT ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC >NZ_CP048617|3|3|1342099-1342654|CRT ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC ATTGGGCTAAAGAGGTAACAGGTGTCGGTGATGCAA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC AAAAGTCATATTTTATTAGCTTTAATTCCATATAAC ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC TTTTAAAGCAGATTAAAACAATTAATAGGTAAAAAA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC GTCATTATATTTAATTATTGTATATCCATAACTTTG ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC GATATATCATGACATTCTTTATATTCATCTCGGCTGTA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC ATCTACTTCTTCAATTTTGCAATCATATCGTACGAC ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC TTCCACATAGTTAATATAAAACAAGTGTGAAGTGTGC ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC TACTAATTGCCCTACTAGGCTTCTTCATATTGACAATCAT ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC
>NZ_CP048617.1|WP_163236228.1|1341112_1342039_+|IS3-family-transposase MAEKWISKGYKVSLVLKIIGINRSTWYYHQNKTNRNTHNHSGKGRPIPGYSYNTSGQKINDLKIMKYIKELIKGEAYCYGYLKITYLLRKKYNLIINKKKVYRLCKQLNILKPQREIKPKYPRKIAINRTITGSNQLWEADVKYGYIASSKKFFYILSIIDVFDRSIIDYHIGLSCTAKDAKATLINALIKRNLLSSKTKPIIRTDNGSQFVSNIFKYTCEKLNMHHEQIPVKTPNKNAHIESFHNLLQNECLRYFSFTSFKEAYKEVVKYIDYYNNTRIHSAIGYMTPMEFYRENSSNIKKKLVVRV >NZ_CP048617.1|WP_163235003.1|1340792_1341110_+|transposase MPKKQLTEEFRVKVVKEALETGEQGIVARRHDIHPVTSSRWINNYKKYGKTTVSKQTSKTTNKDVKSQILEKENEQLKKLLGEKELEIQILRDLLKKTNQDLKID >NZ_CP048617.1|WP_073198185.1|1339145_1339244_-|hypothetical-protein MITFYNKVIDIYIDESGNEFKTSNFKIHYSKR >NZ_CP048617.1|WP_163235002.1|1339012_1339192_-|hypothetical-protein MNLRRAILKSITVKGESLEDILNIEYQEVIKDNRKAKIYRDGNGIFPILSSEIEKVELL >NZ_CP048617.1|WP_163235001.1|1338836_1338980_-|hypothetical-protein MNSKFENYTKNKSPNLYTIWIAKKAEVVFIDGELMVVNVIDWNEDSY >NZ_CP048617.1|WP_163235000.1|1338463_1338709_-|hypothetical-protein MNYGKFNSLQDLKDSIEMGLDIECYIYGQRYYIGWGDNGRVIAKCPDGDGVYFNSLDEMLNFKIQDKKIKDIWKDIQIISM >NZ_CP048617.1|WP_163234999.1|1337965_1338268_-|hypothetical-protein MIANILYYLIKIFLWGLALFLSIIPGMIAGYIGETLLGGIGYWIGFVIGILIFLVYMKPLLAFDDDKPLEKEYYQQSYGTSLFSFLVGIWLGRKFFGKDD >NZ_CP048617.1|WP_163234998.1|1337579_1337744_-|hypothetical-protein MIKCPITNSDIDIAECVVIVDVSEGCAKETILSDNIKKVENWREICKHCKKHNS >NZ_CP048617.1|WP_163234997.1|1337334_1337529_-|hypothetical-protein MKLWEYLGKKIKVTCIEGEVIQGKCNGYIQALDNEPEIASISIDAGEIDYEIYENEIEKIELVD >NZ_CP048617.1|WP_159430380.1|1337127_1337304_-|hypothetical-protein MDDEYNCPLVNRKINESYCLEYCEAVDGMLKMDIINGFKGTREEAQRICYNCLNHKDD >NZ_CP048617.1|WP_163234593.1|1342720_1343482_-|ATP-binding-protein MRNGLLNEIKEYIKELKIPGINQSLKTRIEEAYRLDISYEEFLRDLFRDAYDVRKENGKKNRIKNANFPYKKYLEDLKTEYLPEEARKRLKELKTLKFIEEGKNIIFVGNPGTGKTHISIGLGIEACNAGYKVFFTTVPLLINELKESRSEKRLRSFEKKFEKYDLIIADELGYISFDKEGSELLFTFLSLRAERKSTIITTNLSFDRWKEVFKDPVLTAALIDRLTHKSYVINMNGDSYRMKETIEWLGKSN >NZ_CP048617.1|WP_163234592.1|1343478_1345053_-|IS21-family-transposase MISLKQKAEILLKYFREGESQREISRTLGISRKTVRKYIKGFEEKLQKLGSESDEKKILLLIEEMVSKPKYDTSKRKKVKLTDEVIEIIDKCLEENEKKKLSGKSKQIMKKIDIHEYLIEKGYDISYTTVCNYIREKGEIKEAFIRQEYMLGETLEFDWGEVKLNIDGKDTVLNIGLFTTAKGSYHYARLYRNKKMENFLDIHVKAFENIGGIHKEIVYDNMKQAVKKFVGPNEKEATEDLIKLSLYYGFRYRFCNARSGNEKGHVERGIEYVRRKVFSKKEVFDSIEEANKYLQERLNIINSKPRSHFEGKSPKEILEEEKLYLLALKPRYDVSRREEVRVNKYSTVNIDQNKYSVPDYLVGKFVIAKIYPETINIYYKDFLIASHKRCYSVHQWIIDINHFIHTLKKKPGALHSSAGRHQMCPELQQIYQDYYINNPKDFIVLLELIKQKGLKPVLEAVKKLSQIKRSVVNTDNIKSIILNRPPSNEDYPSSKDSEIEKVSVNLIKKINDIFNMNSEGGLLN >NZ_CP048617.1|WP_163235004.1|1348413_1348683_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVILTYDVGEKRVNKVRKKLKEYLIWTQNSVFEGEITEGKLKKCLYEVNKILNKQEDSLYIYEIKTSSHIKKKVIGIDKSFDDIFYNS >NZ_CP048617.1|WP_163235005.1|1348684_1349668_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MARDFYIFNNGRLKRKDNTIYFIDCLENKRALPIQQINSIHLFGEIDLNSKLINYLSQYGIMLNFYNYYGHYSGTYYPRKKNVSGFTLVNQAAHYTDYEKRLCIAKSFVDSAVHHILKNMRRHKEGIEDLIERIQIERNNIEKAQRIDELMGIEGRIRKSYYKSFSKILKSDFNIQKREKRPPTDPVNAMISFGNSLMYMTVLSEIYKTQLDPTISFLHEPSVKRFSLSLDISEIFKPLVVDTVIFYLVNNRIITFDDFNIDEGICYLNEKGRKKFISEYERKLDTTIKHRKLKRKVSYRTFIKLECYKLIKHFIGDEEYKPLKAWW >NZ_CP048617.1|WP_035164508.1|1352547_1353309_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MRAIRLKLYQNLVNYKKPTSFQLKETYPLPPYSTVIGMIHYVCGFEEYKDMSISIQGKYHSKVNDLWTRYEFSCAAYEKGRHNIKVSSREINKKTGEEIEKTYGIIKGVSTAELLVDVELLIHIKPQDEKLLDLIYENFTKPKEYISLGRREDIVRVDEVKIVEISNEELEDCSVKLNYDAYIPVDMFSKSDFPSNATIYNLNKVYNKIKIKKNTTIRQWEKVKVIHGVMNRNEITEGTEIYKDEDNNLVFFA >NZ_CP048617.1|WP_035164510.1|1353317_1354202_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MDKKGLTASFIFEAESANYGEGVGNVASLKKISRGSGDSYTYISRQAIRYNIITQMGEDRTPLELDGSVIQFAPDATIKDYPEIDLFGYMKTKKPAKTRSAVVRLSNAVSLESFNADLDFLTNKGLLDRYNKQNGEIKDGGNIAQSEIHKSYYAYTITIDLDKVGIDENDDIEIPNEEKARRINKLLDTIKFLYRDIKGRRENLSPIFAIGGVYDIKNPFFENKLKVRNNKILIDTIEDVYKLDDNIKENTICGLIKGIFKNDSDIEERLKPLNMGDFFNELKKRVDEYYKAVK >NZ_CP048617.1|WP_163235006.1|1354194_1355898_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MREISRIRLELSDWLYNAGIVGIANILEHSGKKFEKKSNYIEFDEELLENFEEMYFKYFIDKYLKFTSWYKIVSFEDYIINFNEGEITEKDIEKINNHIEYTKKKLTSSSYKSGYSIIKSSKIDLLKEEKKLKKIKKNKKQTIKDIIPNIKEQLDVISDIIDFLKADEVKRVILAKNIIYDVIAKFIKDVSFLHKNANKNDMYEEYKNYFINSIIEYINNEDNSNSNYNCFNCNRKISKLSKPASYDLTWINKIGVDMSRKTSHFWNFYGDAFVCPICNLVYSCIPAGFTVVRDRGLFINQNSDVKTLISINNIVIDHNTRFEELEEKSYYAVSENLKQSVVENMEKEIDNIQIVKLDSNNDRRPYTFNVLSKNKLKIIYENKKLLRYLVNSYVKTDTGDYINVYSEVIKRLYDNKNQFDLINKLLYLNINDNFSKISNIKIIIKINNDYLGGIMKGKMISYNTIDKLQQFGFELKKAYEAKNSKNKISGISYRLLNALKTKNTDKFMDTLINAYMYLNKEIPSEFIEGLKDEDRFQTLGYSFLLGLQGESGKKELDKENEGDEING >NZ_CP048617.1|WP_163235007.1|1355993_1357046_-|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB MSKSIAGNKNIRTYKMRIKDKKFKSKVIDYIYKYRHFENMYIILLNQDYKQNIGDFRLLTNYEIMRALFRGTAPRKLEEKLTYIRNKYKNHQIMNDLINLSKELKIHNIVEIIKRVKSQYKGFSLKRKNQLGINLNNNRFIAKLNREIMTTKDKNRKRHLEKYRTYLYEKRNRYFYDQFHKISKRVLEYLEKHDVTEIILSDNLNNLKNNGKCKLNKAIKQNFIQIPFGKLLRYIEYKAEGYGIEVKFVDESYTSKVSSLTEDIKIMKKLLQYNLDLTNALNGKRVKRGLFKDKVINKIINADLNGARNICILGSKKAQQKYKAGGENRWLNLKLCNPIKVESDVKFVGL >NZ_CP048617.1|WP_163235008.1|1357153_1357885_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRLSCCYECDILPLSYRMMFVSLIKKSLEKSNKEYFNNLYYYKDKSNKKSKNFCFSVYLNDFSRENENFRVNGKIILNISSPDHEFMINLYNGLLKNTDFEYKSYRLKKERVRLIREKKILKDRAIFKTLSPIYIKDKMGNSLSPEDEKYEENLNYILDLTLKNFRGYGLKREVKFNPINLTKVVVKEKIRGYIEKNDNDYLYLNSYRGSFYLEGDVEDLNDIYMLGIGFRRNQGFGMVEVLE >NZ_CP048617.1|WP_163235009.1|1357994_1358948_-|transcriptional-regulator MSKVSNCLRMLILLKSRGKMKIKELAERLEVSERMIREYKNELEKAEIYLMSEPGKNGGYYLDENSFIFNLNLEEAEISSFLMAKEFLEKEDNFMFLKEYESGLDKIKAAVKGRYDDGKNQHIVKVSRPNIDLEDEKKKYLDISSSIISRNKLEINYFSINSGLVKRVIRPYALFMYKGFWYCIGYCELRGEIRDFKLSRIRSYKLLEDTFDKPIDFKLSDYLGHNSIFKDKLYNIKLKINPPMSIIISERIWSENQKIIFNQEDNSILFEATMSGLPEIKSWILSMGSCVEILEPEELKEEIREEVKKLKNLYKIY |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP048617_4 | 1345174-1347956 | TypeI-A,TypeV |
I-A
Consensus repeat of NZ_CP048617_4
|
42 spacers
spacers of NZ_CP048617_4
>4.1|1345203|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTTTATCTCTTTCTCTTTTTTCTTTTAACCATTC >4.2|1345269|36|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAGAATCTTTTAATGCAGTTACATTTTTCTTTTTG >4.3|1345334|36|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGCTACAGCTACTTTCTTAAATGTACAAGCATTTA >4.4|1345399|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTATATAGAATCTAGTAGTAATTTAAAATATCCCAA >4.5|1345465|36|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCTTCGTTTGCCATGCACTCACCACCTTTACAAAA >4.6|1345530|36|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTGTGTTATAGAATGTAGTACGCTTTTTAATAGA >4.7|1345595|36|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTAGTTTTATAATCTTTAACATTATTTGTTAAAATG >4.8|1345660|38|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGTTCTTTCCGAACTTGCAATAACAATCCTATCAAAT >4.9|1345727|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGGGTTAGTATTAGAAAAGCATGTAAAAAAATCTGA >4.10|1345793|35|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCAGAGTTTAAGATTAATCTTCCTCGTGAGTATGG >4.11|1345857|36|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACCTTTGTGATAAAACTTCACAACAGTCGTACTGCC >4.12|1345922|36|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GACCAGGTGAAAGAAATTAAAGATTACAAAATCAAA >4.13|1345987|40|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAACTATAACAGTCATATAAAGCTGTGCCATTGCATTTGT >4.14|1346056|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATAAGCTAGAAGATTATGTGATTAAGAATTAAGGCT >4.15|1346122|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGCACCAGTTATATCACCATTCGTACCACCAGTAAG >4.16|1346188|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAATTATGAGAGAAATACTGCTCAAATATAAAAACAA >4.17|1346254|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCAATCCATCACCACCTTCAATATTGGGTGCGGGGG >4.18|1346320|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGATTAGAAATTGATTAAAATAAGAAAGCCCCTAAC >4.19|1346386|36|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATGCATTAATATTTGATTACTTACCTAAAATCCCA >4.20|1346451|35|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGGGCGCAAGCTATAGCCTATAAATTGCAAAATT >4.21|1346515|36|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTATCATATTTAAAACTCTCCCAAAAGCGAACGGA >4.22|1346580|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGCTCTTCATTATCCCAATACTCCGGCTTTGAAATA >4.23|1346646|35|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAGACACTTAATGCTACAGAAGCGTATAAAAGAGC >4.24|1346710|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTCTATTAATATATAGTCTATCAACTCATTTAAAGT >4.25|1346776|38|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCCCAGTCATCTAGTTTATCAGCGTTTAGTCCACTTCC >4.26|1346843|38|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATAAAACATATATAAATTCTTCTTTAGAGCAAAAGCA >4.27|1346910|36|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAAAATTTACTTTAACCTCAAGTAGTCGGAAGAAA >4.28|1346975|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CACAACTATGTGCACAAAAAAACTAATAAAAAAATAA >4.29|1347041|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATAAACAAAGAAACAGGCGAAGTTTTAGACATAGA >4.30|1347107|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGTGGTTGAATGAGATAAAGGATTTATTAAATTTAA >4.31|1347173|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTCAACTGTTCTTTCAATTCTTTATTTTCGGTTTTC >4.32|1347239|36|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTAGATGTTAGTCCAGTTAATTTTAAAGTATATAG >4.33|1347304|36|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAGCACACATTACACCCCCTGAATTTTAAGTAAA >4.34|1347369|38|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGAAGGCACTTTCAAAAAACAGGTCCCCCTGCTACGC >4.35|1347436|35|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTAATGATTATTGCGAGTGCTTTCTTTTTTTGGC >4.36|1347500|36|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCCTAAAACTACTTTATCTGCTGCTAAATCACATA >4.37|1347565|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CACTCTGTAGAGAGCATCATACAGAAGCACACAAGAT >4.38|1347631|35|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCTGTTAATGTTATTTTCTTGTTAATAGTTTCAAA >4.39|1347695|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGCCAAATATTTAGCATATTCACGTGTTTGAATAAA >4.40|1347761|36|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTACACGTAAACAAAAGTCTACATGTTCATCTAC >4.41|1347826|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTACATCTAAAGCCGCATCAATTTTCTCTTTCCATTC >4.42|1347892|36|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGGCTTTTTTCGCTTCCTTTTTTATCTCATTTATT |
cas2,cas1,cas5,cas7,cas8b2,cas14k,cas6,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048617_4
The CRISPR arrays of NZ_CP048617_4 >merge|NZ_CP048617|4|1345174-1347956|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT 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TAGTGGTTGAATGAGATAAAGGATTTATTAAATTTAA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC CTTCAACTGTTCTTTCAATTCTTTATTTTCGGTTTTC ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC GGTAGATGTTAGTCCAGTTAATTTTAAAGTATATAG ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC AAAAGCACACATTACACCCCCTGAATTTTAAGTAAA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC CTGAAGGCACTTTCAAAAAACAGGTCCCCCTGCTACGC ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC CTTAATGATTATTGCGAGTGCTTTCTTTTTTTGGC ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC CTCCTAAAACTACTTTATCTGCTGCTAAATCACATA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC CACTCTGTAGAGAGCATCATACAGAAGCACACAAGAT ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC CCTGTTAATGTTATTTTCTTGTTAATAGTTTCAAA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC CTGCCAAATATTTAGCATATTCACGTGTTTGAATAAA ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC TTTTACACGTAAACAAAAGTCTACATGTTCATCTAC ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC CTACATCTAAAGCCGCATCAATTTTCTCTTTCCATTC ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC TCGGCTTTTTTCGCTTCCTTTTTTATCTCATTTATT ATTTACATTCCACATAGTTAATATAAAAC
>NZ_CP048617.1|WP_163234592.1|1343478_1345053_-|IS21-family-transposase MISLKQKAEILLKYFREGESQREISRTLGISRKTVRKYIKGFEEKLQKLGSESDEKKILLLIEEMVSKPKYDTSKRKKVKLTDEVIEIIDKCLEENEKKKLSGKSKQIMKKIDIHEYLIEKGYDISYTTVCNYIREKGEIKEAFIRQEYMLGETLEFDWGEVKLNIDGKDTVLNIGLFTTAKGSYHYARLYRNKKMENFLDIHVKAFENIGGIHKEIVYDNMKQAVKKFVGPNEKEATEDLIKLSLYYGFRYRFCNARSGNEKGHVERGIEYVRRKVFSKKEVFDSIEEANKYLQERLNIINSKPRSHFEGKSPKEILEEEKLYLLALKPRYDVSRREEVRVNKYSTVNIDQNKYSVPDYLVGKFVIAKIYPETINIYYKDFLIASHKRCYSVHQWIIDINHFIHTLKKKPGALHSSAGRHQMCPELQQIYQDYYINNPKDFIVLLELIKQKGLKPVLEAVKKLSQIKRSVVNTDNIKSIILNRPPSNEDYPSSKDSEIEKVSVNLIKKINDIFNMNSEGGLLN >NZ_CP048617.1|WP_163234593.1|1342720_1343482_-|ATP-binding-protein MRNGLLNEIKEYIKELKIPGINQSLKTRIEEAYRLDISYEEFLRDLFRDAYDVRKENGKKNRIKNANFPYKKYLEDLKTEYLPEEARKRLKELKTLKFIEEGKNIIFVGNPGTGKTHISIGLGIEACNAGYKVFFTTVPLLINELKESRSEKRLRSFEKKFEKYDLIIADELGYISFDKEGSELLFTFLSLRAERKSTIITTNLSFDRWKEVFKDPVLTAALIDRLTHKSYVINMNGDSYRMKETIEWLGKSN >NZ_CP048617.1|WP_163236228.1|1341112_1342039_+|IS3-family-transposase MAEKWISKGYKVSLVLKIIGINRSTWYYHQNKTNRNTHNHSGKGRPIPGYSYNTSGQKINDLKIMKYIKELIKGEAYCYGYLKITYLLRKKYNLIINKKKVYRLCKQLNILKPQREIKPKYPRKIAINRTITGSNQLWEADVKYGYIASSKKFFYILSIIDVFDRSIIDYHIGLSCTAKDAKATLINALIKRNLLSSKTKPIIRTDNGSQFVSNIFKYTCEKLNMHHEQIPVKTPNKNAHIESFHNLLQNECLRYFSFTSFKEAYKEVVKYIDYYNNTRIHSAIGYMTPMEFYRENSSNIKKKLVVRV >NZ_CP048617.1|WP_163235003.1|1340792_1341110_+|transposase MPKKQLTEEFRVKVVKEALETGEQGIVARRHDIHPVTSSRWINNYKKYGKTTVSKQTSKTTNKDVKSQILEKENEQLKKLLGEKELEIQILRDLLKKTNQDLKID >NZ_CP048617.1|WP_073198185.1|1339145_1339244_-|hypothetical-protein MITFYNKVIDIYIDESGNEFKTSNFKIHYSKR >NZ_CP048617.1|WP_163235002.1|1339012_1339192_-|hypothetical-protein MNLRRAILKSITVKGESLEDILNIEYQEVIKDNRKAKIYRDGNGIFPILSSEIEKVELL >NZ_CP048617.1|WP_163235001.1|1338836_1338980_-|hypothetical-protein MNSKFENYTKNKSPNLYTIWIAKKAEVVFIDGELMVVNVIDWNEDSY >NZ_CP048617.1|WP_163235000.1|1338463_1338709_-|hypothetical-protein MNYGKFNSLQDLKDSIEMGLDIECYIYGQRYYIGWGDNGRVIAKCPDGDGVYFNSLDEMLNFKIQDKKIKDIWKDIQIISM >NZ_CP048617.1|WP_163234999.1|1337965_1338268_-|hypothetical-protein MIANILYYLIKIFLWGLALFLSIIPGMIAGYIGETLLGGIGYWIGFVIGILIFLVYMKPLLAFDDDKPLEKEYYQQSYGTSLFSFLVGIWLGRKFFGKDD >NZ_CP048617.1|WP_163234998.1|1337579_1337744_-|hypothetical-protein MIKCPITNSDIDIAECVVIVDVSEGCAKETILSDNIKKVENWREICKHCKKHNS >NZ_CP048617.1|WP_163235004.1|1348413_1348683_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVILTYDVGEKRVNKVRKKLKEYLIWTQNSVFEGEITEGKLKKCLYEVNKILNKQEDSLYIYEIKTSSHIKKKVIGIDKSFDDIFYNS >NZ_CP048617.1|WP_163235005.1|1348684_1349668_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MARDFYIFNNGRLKRKDNTIYFIDCLENKRALPIQQINSIHLFGEIDLNSKLINYLSQYGIMLNFYNYYGHYSGTYYPRKKNVSGFTLVNQAAHYTDYEKRLCIAKSFVDSAVHHILKNMRRHKEGIEDLIERIQIERNNIEKAQRIDELMGIEGRIRKSYYKSFSKILKSDFNIQKREKRPPTDPVNAMISFGNSLMYMTVLSEIYKTQLDPTISFLHEPSVKRFSLSLDISEIFKPLVVDTVIFYLVNNRIITFDDFNIDEGICYLNEKGRKKFISEYERKLDTTIKHRKLKRKVSYRTFIKLECYKLIKHFIGDEEYKPLKAWW >NZ_CP048617.1|WP_035164508.1|1352547_1353309_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MRAIRLKLYQNLVNYKKPTSFQLKETYPLPPYSTVIGMIHYVCGFEEYKDMSISIQGKYHSKVNDLWTRYEFSCAAYEKGRHNIKVSSREINKKTGEEIEKTYGIIKGVSTAELLVDVELLIHIKPQDEKLLDLIYENFTKPKEYISLGRREDIVRVDEVKIVEISNEELEDCSVKLNYDAYIPVDMFSKSDFPSNATIYNLNKVYNKIKIKKNTTIRQWEKVKVIHGVMNRNEITEGTEIYKDEDNNLVFFA >NZ_CP048617.1|WP_035164510.1|1353317_1354202_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MDKKGLTASFIFEAESANYGEGVGNVASLKKISRGSGDSYTYISRQAIRYNIITQMGEDRTPLELDGSVIQFAPDATIKDYPEIDLFGYMKTKKPAKTRSAVVRLSNAVSLESFNADLDFLTNKGLLDRYNKQNGEIKDGGNIAQSEIHKSYYAYTITIDLDKVGIDENDDIEIPNEEKARRINKLLDTIKFLYRDIKGRRENLSPIFAIGGVYDIKNPFFENKLKVRNNKILIDTIEDVYKLDDNIKENTICGLIKGIFKNDSDIEERLKPLNMGDFFNELKKRVDEYYKAVK >NZ_CP048617.1|WP_163235006.1|1354194_1355898_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MREISRIRLELSDWLYNAGIVGIANILEHSGKKFEKKSNYIEFDEELLENFEEMYFKYFIDKYLKFTSWYKIVSFEDYIINFNEGEITEKDIEKINNHIEYTKKKLTSSSYKSGYSIIKSSKIDLLKEEKKLKKIKKNKKQTIKDIIPNIKEQLDVISDIIDFLKADEVKRVILAKNIIYDVIAKFIKDVSFLHKNANKNDMYEEYKNYFINSIIEYINNEDNSNSNYNCFNCNRKISKLSKPASYDLTWINKIGVDMSRKTSHFWNFYGDAFVCPICNLVYSCIPAGFTVVRDRGLFINQNSDVKTLISINNIVIDHNTRFEELEEKSYYAVSENLKQSVVENMEKEIDNIQIVKLDSNNDRRPYTFNVLSKNKLKIIYENKKLLRYLVNSYVKTDTGDYINVYSEVIKRLYDNKNQFDLINKLLYLNINDNFSKISNIKIIIKINNDYLGGIMKGKMISYNTIDKLQQFGFELKKAYEAKNSKNKISGISYRLLNALKTKNTDKFMDTLINAYMYLNKEIPSEFIEGLKDEDRFQTLGYSFLLGLQGESGKKELDKENEGDEING >NZ_CP048617.1|WP_163235007.1|1355993_1357046_-|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB MSKSIAGNKNIRTYKMRIKDKKFKSKVIDYIYKYRHFENMYIILLNQDYKQNIGDFRLLTNYEIMRALFRGTAPRKLEEKLTYIRNKYKNHQIMNDLINLSKELKIHNIVEIIKRVKSQYKGFSLKRKNQLGINLNNNRFIAKLNREIMTTKDKNRKRHLEKYRTYLYEKRNRYFYDQFHKISKRVLEYLEKHDVTEIILSDNLNNLKNNGKCKLNKAIKQNFIQIPFGKLLRYIEYKAEGYGIEVKFVDESYTSKVSSLTEDIKIMKKLLQYNLDLTNALNGKRVKRGLFKDKVINKIINADLNGARNICILGSKKAQQKYKAGGENRWLNLKLCNPIKVESDVKFVGL >NZ_CP048617.1|WP_163235008.1|1357153_1357885_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRLSCCYECDILPLSYRMMFVSLIKKSLEKSNKEYFNNLYYYKDKSNKKSKNFCFSVYLNDFSRENENFRVNGKIILNISSPDHEFMINLYNGLLKNTDFEYKSYRLKKERVRLIREKKILKDRAIFKTLSPIYIKDKMGNSLSPEDEKYEENLNYILDLTLKNFRGYGLKREVKFNPINLTKVVVKEKIRGYIEKNDNDYLYLNSYRGSFYLEGDVEDLNDIYMLGIGFRRNQGFGMVEVLE >NZ_CP048617.1|WP_163235009.1|1357994_1358948_-|transcriptional-regulator MSKVSNCLRMLILLKSRGKMKIKELAERLEVSERMIREYKNELEKAEIYLMSEPGKNGGYYLDENSFIFNLNLEEAEISSFLMAKEFLEKEDNFMFLKEYESGLDKIKAAVKGRYDDGKNQHIVKVSRPNIDLEDEKKKYLDISSSIISRNKLEINYFSINSGLVKRVIRPYALFMYKGFWYCIGYCELRGEIRDFKLSRIRSYKLLEDTFDKPIDFKLSDYLGHNSIFKDKLYNIKLKINPPMSIIISERIWSENQKIIFNQEDNSILFEATMSGLPEIKSWILSMGSCVEILEPEELKEEIREEVKKLKNLYKIY >NZ_CP048617.1|WP_163235010.1|1359170_1359410_+|ferrous-iron-transport-protein-A MIHEIPLNKLPVGKKARIKVLSKNTLPRRRLLDLGLIPNTIVKTERISPSGNPIAYNIRGAVIALRKEEIENVIVEIID >NZ_CP048617.1|WP_163235011.1|1359422_1360178_+|iron-transporter-FeoB MGLTSKSTGLSILKNRYDIVKEDKDMIIIALAGNPNTGKSTLFNTLTGLNQHTGNWPGKTVSNAKGTFKYKDKKFLLVDLPGTYSLLANSVEEEIARDFICFGNPDITIVITDATCLERNLNLVLQVMEITDRVIVCLNLMDEAKRKGISIDIEKLENRLGVPVIPTVARDNKGIDKLLETIYQMINGNIKTNPYRLKYSDEIESIIKEIEPILIETLGTKYNTRWLALRLIDGDKAISNSIDNILKKYSI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048617_5 | 1466368-1466599 | TypeV |
NA
Consensus repeat of NZ_CP048617_5
|
3 spacers
spacers of NZ_CP048617_5
>5.1|1466399|38|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder CCAGCATTAGCTTTATATGAAGATGAATTTACAGAAGA >5.2|1466468|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder TGACGGACATGCAATAGTTCATAGAGAACTTATTA >5.3|1466534|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder TATATTTAATCTTTCAAGCTCATCTCTAAAGACTT |
cas14k |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048617_5
The CRISPR arrays of NZ_CP048617_5 >merge|NZ_CP048617|5|1466368-1466599|CRISPRCasFinder TTTTCTAATTCCTCATAGGTAAGCTATAAACCCAGCATTAGCTTTATATGAAGATGAATTTACAGAAGAGGTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTATAAACTGACGGACATGCAATAGTTCATAGAGAACTTATTATGTTTCAATTCCTCATAGGTACACTATAAACTATATTTAATCTTTCAAGCTCATCTCTAAAGACTTTGTTTCAATTCCTCATAGGTACACTATAAAC >NZ_CP048617|5|5|1466368-1466599|CRISPRCasFinder TTTTCTAATTCCTCATAGGTAAGCTATAAAC CCAGCATTAGCTTTATATGAAGATGAATTTACAGAAGA GGTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTATAAAC TGACGGACATGCAATAGTTCATAGAGAACTTATTA TGTTTCAATTCCTCATAGGTACACTATAAAC TATATTTAATCTTTCAAGCTCATCTCTAAAGACTT TGTTTCAATTCCTCATAGGTACACTATAAAC
>NZ_CP048617.1|WP_163235067.1|1465891_1466269_-|hypothetical-protein MKYINALTSIFGGNMKYIIILISIFIAALLLYLGFHLSFFVVSLCSGKEVVRIPFTHHYIAKIKPSEWEGSEAVNHKYFFNKFIEEQNKKGWKYNPEKRLGRLIIFEKDGKVKGMSYPRFIGIKW >NZ_CP048617.1|WP_163235066.1|1465029_1465674_-|lytic-transglycosylase-domain-containing-protein MRKKLVLSTILVVTLIFGSTVYAIMLNSDDYNVLDLSVVNNDKVIENTEIKKYIKDYALIEYIKNKTNLTEVESAFLLKQCNEKDLNIFIVLGLMKVESNFNPKCVGALGERGLGQLMENTARQIAFNINKEFKPELLFNPKYNIELFTTQLKYLNVIFNDDIHKVLTAYNRGEYGLRRYMASRSWTSNPAKSTYSEKVLKYAAMFQKEYQNWK >NZ_CP048617.1|WP_156099444.1|1463891_1464944_-|hypothetical-protein MEDRIKYFINNAVYGDSLRYFASKSDTINQKKIKGQWSYIVELFIITVKSLIPSMNVEGTIVEYTRFEEEIKLWINYRHGSNKPLISSVNKFDDRTYWVENDDSIYARIFPIVAANTQWDIILSEIIKNVLFTTGNIFVLQECIMLSKILYLILNSQKDYDKIIINLKEEIIQLSQKELISKYNKYYRADIATFPGNFVIDFEKTRIELLNLFNGKTINNNFYILGKVLDILRGDIEEFNQIPYNFFLYGMLGLIVQNNSKTMEYKDKNFIQSLSDYLIKLRKSRINPESLYIKSYYMPDVFKYDVQEEFNHSLLNRCKVINKEETEKLFITYIKTKSGVYRFFKFKNPV >NZ_CP048617.1|WP_163235065.1|1463681_1463876_+|hypothetical-protein MQEFDKISIAEISKKDMLMIIEALEYTGKNTNIDSFLKLRNNIIKELIELADSTEDEFIQYLKK >NZ_CP048617.1|WP_035165092.1|1463088_1463574_+|hypothetical-protein MSYMTIRQIRHEMCLNKLRELGCQVASIQGVMFYVKYTLDELKIEYMYHINPDNTYYLERIKPYVVSAGILESEDEVVNAIIIDIEQFKNAKHSKNFKAFIEVDTELSKAVRAFEDLYLYYNISREDTELIKKEINNVMELLIEVKNRSDRVFFKKEPESF >NZ_CP048617.1|WP_163235064.1|1461552_1462992_+|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB MSKSIAGNKNIRTYKMRIKDKKFKSKVIDYIYKYRHFENMYIILLNQDYKQNIGDFRLLTNYEIMRTLFRGTTPKKLEEKLTYIRNKYENHQIMNDLINLSKELKIHNIVEIIKRVKSQYKGFFTRVKNGDYKAKPPKPKKLSKLTNYTIPLDSYKGFSLKRKNQLGINLNNKMIRTYINHKELEKVVGNLKNIKAVHLNFSNNELYLLFIYVKEEKEIKEKPYKSAGIDIGINNLLSIYVDDKDAPSLIIDGKKFKTYNDNFNRFIAKLNREIMTTKDKNRKRYLEKYRTYLYEKRNRYFYDQFHKISKRVLEYLEKHDVTEIILSDNLNNIKNNGKCKLNKAIKQNFIQIPFGKLIRYIEYKAKEYGIEVKFVDESYTSKISSLTEDIKIMQKLLQYNLDLTNALNGKRVKRGLFKDKVINKIINADLNGARNICILGSKKAQQRYKVGGENRWLNLKLCNPIKIESDFELCRLIAS >NZ_CP048617.1|WP_163235063.1|1459998_1461345_-|MATE-family-efflux-transporter MILENNSRLKIIWNLAWPVMVSQILQTLLDIIDMYFVSNIGVNEAAAVGIGASIIGVIIVITQLIATGAIALISRKTGENDDKAVLEITGQALILSIAIGILISILGFSLSTSIIKLFGVEIEVAKNSINYLKIVSLSMPFVFFNLTGRAILQARGDTKTPMLIFGLMNLVNIILDPILIYGLFCFPRLMFMGAPLATAISNVFASVLMFKIILRKIFNDEIKKCLQVLSIKINLICKILKIGSYSAVQAISRPITGLVMYKIANYSGTKAVAAFTIGGRIFNLVFIFLAGLNLSISVLVGQNLGKKDIESAESIVKDGIKLALINMLIFSLPYFMFAKYLMFIFTKDFEVINIGANYLRIVYIGVIFIIYPIVYGGAFVGAGDTAPPMIASLVANLCFKLPMAYILSKVFNMGANGVWIAISLSVLLEAAIMIYNFRLGKWKNKNVF >NZ_CP048617.1|WP_163235062.1|1459212_1459953_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MGIVHCVSNVEMIKHLLDYDKIATINVLGRMRFTKDWKIIVDNINRPKGFILKSDEWNIVYSPEDGVAKNMLENMNLKGQDFAGVLKKYYDLIKSREEIDWEEQCYLYYMDKKDLDLTRIKHEVKELRVKDALVVNEYYTYKSEDSLEYIIDCIKNRPSSAIFDENGVPISWAIVREDGSMGIMYTKEEYRGKGLAVSVSIDLAKKVFDIGWIPYVHILVDNIPSIKLAESIGFKKYGEIVWFGVK >NZ_CP048617.1|WP_163235061.1|1457358_1459137_-|B12-binding-domain-containing-radical-SAM-protein MNIVISTLNSKYIHSSLSIRYLRSYCINSFDNIKLMEFTINQNTEYITGEIFKQAPDVLAFSCYIWNIEKTLEICERLKIVRPQTKIILGGPEVSFDGDELLRKYDFIDFIIYGEGEETFKELLHYLYEGIKDYENIKGLIFRKDKVIVINNPRPLISNLDIIPSPYEGDLNEFKDKIVYFESSRGCPFNCQFCLSSTIKGVRYFSLDRVKEDLLKLIKAGVKQVKFVDRTFNAKKDYALEIMRFIMTQNVKNINFHFEVTAHLLDDEMLDFLKFVPEGLFQFEIGVQSTNDKTLEAISRKTDFDKLSKVVRKIKSYNNIHQHLDLIAGLPYEDYNSFKKSFNDVYNLQPDMLQLGFLKLLKGSGLRRDREKYGFKFLDKPPYEVLENDYINYGEMLKLKSIEDLLEKYSNNSRSFENSLKYVIKNYYQTPFDFFEDFSSYWEKHKLDSISHSKVSLYRIFYDYYFDRINKNIEIFRELLKYDFLLNNKTSNLPEFMKSDKKIDDRNIIHKFLQNELYVNKYLKEFVNIPAKRIINKVHFEIFTFDILDFMKNNFEIDKVLYKESIVLFKYNEDKKVFNKVTVYNVTEDIEK >NZ_CP048617.1|WP_163235060.1|1456188_1457328_-|tetratricopeptide-repeat-protein MRGIEKFFKGKTENLTFIELKSSANTKFNKFKLDSNIPLPILVDELITEIKERRAQDEIKISSIIRGMIYTVGVDPNFPYIEKYRDILYSFDEKIEDFILYNGVKFIKRGLLDDGLIYLRALVVLNDKNVDGLYNYGVALEERAKKYLELRDEKRANMFINEATRQFENILEIDDEYPLAYYKLGYHYRLNKQFIKCKIIWEKFLTLSKDEELKEEIKLNLLEMQDDIVYEEGYNEIFTGDPVKGLEKLLPLKEKYTDWWNLLFIIGLGYRQIGDFAKAKEEFESVLSIVPGQVDALNELGLCLANLGQYEEAIEKFTEAYKKRPKDYEILCNRGMTYLQMGILDKAKEDIQKAYDENPLDEITIACMKEIERIEGMTR >NZ_CP048617.1|WP_163235068.1|1467039_1467363_+|hypothetical-protein MDKFLSIILSVLLVLGLIFSTKNVFNNKDTSQYEIEKLFHEKYEVLTFLSPSCKTLSNCNDYTRNNINNTNAKYKYGDYIRENAMGKESEPKLLPNFSGPIHIMLLQ >NZ_CP048617.1|WP_163235069.1|1467363_1467564_-|hypothetical-protein MKRILSIALTLVLMLGLSIRIYAEKAKNIDELLAPYQEVVDKLNAELGSTIYIPAYCSIFKSLFKE >NZ_CP048617.1|WP_163235070.1|1470981_1471581_-|GerMN-domain-containing-protein MKKLITILLTLTLITTLFVGCSKKDKVKEEQGNLKDNAVTEVKEESKSEDVEEDKVEEVNYVLYLKQKSIPFIFAEKYTIKADDPKLKDKSIEWIALEHLINFKGFQDFISPIPEGTKLLGLNKENGIVYVDLSKEFIDNMPKDKQSTKLVIDSIVNTLTFFDGNESVMFKIEGQAVKKINGVDLSKQFYFSSDFIPDK >NZ_CP048617.1|WP_163235071.1|1471607_1472051_-|DUF523-domain-containing-protein MIIISACLVGVNCKYNGGNNFNKKIYELFRSRKAILVCPEQLGGLPTPRVPSEIVIKDDEIRVLNKEGIDVTENFLKGGYETLKIAKAVGANLAILKSKSPSCGVGYIYDGTFSGEITEGNGITAQMLIKNGIRVCTENDFLDYISE >NZ_CP048617.1|WP_163235072.1|1474465_1476946_-|U32-family-peptidase MVHVKEKVELLAPVGSIESLYAAVENGADAVYLGGKMFNARQYASNFDREELKKAVEYAHIKDVKVYVTVNILLSDSEFKEALEYISFLYNIDVDAIIIQDLGLASLVKKLLPDFEIHGSTQMTIINQYGAKFLEELGFTRVVLGRELSLKEIKYIKDETNIELEGFIHGALCISYSGQCLMSSIIGGRSGNRGRCAQPCRMPYTLVNAETGQIVSQKLDKKFLLSTRDLNTIEDLNMIIKSGIISLKIEGRMKRPEYVAVIVSKYRKALDNLYNRIDRVISKEDKKELLQIFNRKFTRGYILGDFGRDLVAIDRPDNRGVYIGRVIDIDKKYIYILLEDSLHVGDGIEITDNKGNKDGIVVNSIFSKGKQVKSCREGEIAKIKRIGNIKKDSKVYKTSDVLLLENAKKSFTERDKLKKIDIYMEVEIKIGHPIKMFLWDDRGNYVTIVSEERVQEGENIYLTEEKVIKQLSKLGGTHYVLKDINVKLENNSMIPVSVLNKLRREAIEELNRKRAIINKRIEINEKDILNKMQDIIEKSKPYVKTNNRLISVSIQSFKQFAKIDLNKLDRVYISYYEGVNESIKEIKKYGKEVYLQTERILTSLDFKTLNRQIRDIGIENIDGISVSNLGTLKYIKDNFDTNIHCDIGINAYNSFTMKFLEEYGVKSVTLSPELKLSQIKNICLNTNLICETIGYGYLPVMISKYCPFSIIKGCLSDRECDRCKFRYGYGLKDRLGKVFRIVRKGKVTTIYNSQPLVVIENLKEIYNSKVDMIRLDFTFEDDIKEIQTMYYEFANDNIDEKNVVEFINKIKKSRGLTKGHYYRGVL >NZ_CP048617.1|WP_163235073.1|1476997_1477624_-|DUF421-domain-containing-protein MYSSISGYFIYVLRTILGYFLALIIVRFMGKRSIGELSAFDIVLITGVGHIMSSVALDKKLPFIEGVIILFTIAVLEIVLSFISIKNRKISSIINGKPTYLIKDGKLLKENMKKEKFNIYDLRQELRKKGIGNENDVEKAVIEACGKFSVIKKYAEEPLRRKDLGIFKDGDSPQYLEQKFAELKSELNRLNMSLDNIIIEINKLKSKE >NZ_CP048617.1|WP_163235074.1|1477691_1478261_-|cell-division-protein-ZapA MIKKYNISHGLEERILMGEKKKVTIRIRGQEYTVIGEESEEYIKELGNYVDNKIKDILEKNSKLNQTMAATLAAFTIADELYKIRKLVDSLNKIINEKDNEIEEKLNIIKGKETEIEDIKAQYEELNNKINDYQKKIKKYEHALDLKEKELQNTQKIITELQNKLYEKQIELVQAKKELEEFIKTFDTK >NZ_CP048617.1|WP_163235075.1|1478655_1481055_-|phenylalanine--tRNA-ligase-subunit-beta 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP048617_6 | 1517977-1519079 | Orphan |
I-A,II-B,III-A
Consensus repeat of NZ_CP048617_6
|
16 spacers
spacers of NZ_CP048617_6
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048617_6
The CRISPR arrays of NZ_CP048617_6 >merge|NZ_CP048617|6|1517977-1519079|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR ATCTTAATTCCATCACTGGTACGATTAAAACTATTAGCAGCAATCAAGGAACTCCGAAAAAAAGATTGTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAACTAAACGGAGTAAAAGATACTTCGTATGAAACTGTCCAGTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAACTAATTCGCTATTTATATCATTGTATACTTCTACTTGTGAGTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAACCTCCACCAAAAACTTCTATGTAGCATTTATGATCTTCATTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAACGTTGGTCGTGATGATGATTCTTATAAAACTTTGATTGTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAACTTTCTATATTCTACTTTAATGTACTTAATACCATGATTGTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAACGAATTATATCTATTTCTATCTCAGGCTTGTCTATGCTGTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAACCTAGTTCCTTTGAAAATAATAAACTTTTCTGTAGACGTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAACAAAGAATGAAGAACAAAGGAGGAATTAGAAGGGAAATGTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAACCATATGACAAAACAACAACTTTTTCAATTTCGGGTATGTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAACTTTAAATTTTAATGCTTCCATGACACGTTGATAAATGTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAACCTTTTTGCTATTCCCTCTCCAATAGTACCTATTAATCTGTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAACCTTTTTGCTATTCCCTCTCCAATAGTACCTATTAATCTGTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAACAAATTAAACTTAAGGACGGTGATTCCCTAATGACCATGTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAACTTTCATTAATTCACCTCCTATCTTTGTGTTGACTATGTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAACGCTAACATCTTCTTTACTTAAATATTTCCAATTCAACGTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC >NZ_CP048617|6|5|1517977-1519079|CRT ATCTTAATTCCATCACTGGTACGATTAAAA CTATTAGCAGCAATCAAGGAACTCCGAAAAAAAGATT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC TAAACGGAGTAAAAGATACTTCGTATGAAACTGTCCA GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC TAATTCGCTATTTATATCATTGTATACTTCTACTTGTGA GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC CTCCACCAAAAACTTCTATGTAGCATTTATGATCTTC ATTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC GTTGGTCGTGATGATGATTCTTATAAAACTTTGATT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC TTTCTATATTCTACTTTAATGTACTTAATACCATGATT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC GAATTATATCTATTTCTATCTCAGGCTTGTCTATGCT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC CTAGTTCCTTTGAAAATAATAAACTTTTCTGTAGAC GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC AAAGAATGAAGAACAAAGGAGGAATTAGAAGGGAAAT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC CATATGACAAAACAACAACTTTTTCAATTTCGGGTAT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC TTTAAATTTTAATGCTTCCATGACACGTTGATAAAT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC CTTTTTGCTATTCCCTCTCCAATAGTACCTATTAATCT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC CTTTTTGCTATTCCCTCTCCAATAGTACCTATTAATCT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC AAATTAAACTTAAGGACGGTGATTCCCTAATGACCAT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC TTTCATTAATTCACCTCCTATCTTTGTGTTGACTAT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC GCTAACATCTTCTTTACTTAAATATTTCCAATTCAAC GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC >NZ_CP048617|6|6|1517978-1519079|CRISPRCasFinder TCTTAATTCCATCACTGGTACGATTAAAAC TATTAGCAGCAATCAAGGAACTCCGAAAAAAAGATT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC TAAACGGAGTAAAAGATACTTCGTATGAAACTGTCCA GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC TAATTCGCTATTTATATCATTGTATACTTCTACTTGTGA GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC CTCCACCAAAAACTTCTATGTAGCATTTATGATCTTC ATTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC GTTGGTCGTGATGATGATTCTTATAAAACTTTGATT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC TTTCTATATTCTACTTTAATGTACTTAATACCATGATT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC GAATTATATCTATTTCTATCTCAGGCTTGTCTATGCT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC CTAGTTCCTTTGAAAATAATAAACTTTTCTGTAGAC GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC AAAGAATGAAGAACAAAGGAGGAATTAGAAGGGAAAT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC CATATGACAAAACAACAACTTTTTCAATTTCGGGTAT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC TTTAAATTTTAATGCTTCCATGACACGTTGATAAAT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC CTTTTTGCTATTCCCTCTCCAATAGTACCTATTAATCT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC CTTTTTGCTATTCCCTCTCCAATAGTACCTATTAATCT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC AAATTAAACTTAAGGACGGTGATTCCCTAATGACCAT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC TTTCATTAATTCACCTCCTATCTTTGTGTTGACTAT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC GCTAACATCTTCTTTACTTAAATATTTCCAATTCAAC GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC >NZ_CP048617|6|5|1518044-1519079|PILER-CR GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC TAAACGGAGTAAAAGATACTTCGTATGAAACTGTCCA GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC TAATTCGCTATTTATATCATTGTATACTTCTACTTGTGA GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC CTCCACCAAAAACTTCTATGTAGCATTTATGATCTTC ATTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC GTTGGTCGTGATGATGATTCTTATAAAACTTTGATT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC TTTCTATATTCTACTTTAATGTACTTAATACCATGATT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC GAATTATATCTATTTCTATCTCAGGCTTGTCTATGCT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC CTAGTTCCTTTGAAAATAATAAACTTTTCTGTAGAC GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC AAAGAATGAAGAACAAAGGAGGAATTAGAAGGGAAAT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC CATATGACAAAACAACAACTTTTTCAATTTCGGGTAT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC TTTAAATTTTAATGCTTCCATGACACGTTGATAAAT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC CTTTTTGCTATTCCCTCTCCAATAGTACCTATTAATCT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC CTTTTTGCTATTCCCTCTCCAATAGTACCTATTAATCT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC AAATTAAACTTAAGGACGGTGATTCCCTAATGACCAT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC TTTCATTAATTCACCTCCTATCTTTGTGTTGACTAT GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC GCTAACATCTTCTTTACTTAAATATTTCCAATTCAAC GTTTCAATTCCATACTGGTACGATTAAAAC
>NZ_CP048617.1|WP_163235097.1|1517320_1517704_-|hypothetical-protein MFNRSKKIISLLLVTIMMFGMFLGIIPNTSAEASSNDNIIIDGKFDDAWNSVPIIGESPHSGFEGYSIDNLRLYNDSDYLFFWVDAVNVPSWGEKGMFIDIALNVNDEDSGISSNPWGPSLILMVQM >NZ_CP048617.1|WP_163235096.1|1509050_1517303_-|type-I-pullulanase 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MNFEKIIDSYKDDIIKSTQELIRIKSVEGEPKPGMPFGEGPNEALEYALRLAESMGFETLNVDGYAGHADLGEGEEVVGVLVHLDVVPEGDGWTYPPYVAEIHDGKIYGRGAIDDKGPTIASLYAMKAIKESGVKLNKKIRIIFGTNEESGWGGINYYLKKVKAPNLAFTPDADFPVIHGEMGILIFNIEKKFERKCNCAVKINYIKGGNRPNMVPDYCEALLEVADEKKEFVKEKLDKFVEKTGYKLSLDDRGKHVIIKSYGISAHGSTPQAGKNAISQLIAFLGEVVECDCDASEFVKLYNRKIGMEYNGQSIGCGFEDSVSGKLVFNVGVIDMNEEEVKVSVNIRYPIKYKREDIYNGMEEELKGTGVRIVHIEHLPPIYIPSEDTLVQKLMSVYREFTGDYDSKPITIGGGTYARAMKNAVAFGPLFPGQEELAHQKDEYIAVDDLIKITKLYAKALYELAR >NZ_CP048617.1|WP_163235089.1|1499657_1501364_+|phosphoenolpyruvate--protein-phosphotransferase MKIGTGASPGIAFGKALVIKNEELVIEKKSVENIEEEKNRFEKAIEESKAQLLNIKEKAAKELDEGKSAIFDAHIMILEDPELISSTLNKIESKGVNAEYAFKEIIEQFIAIFEAMDNEYMRERASDLRDVSGRVFRNLMGIKVIDLSVLDEEVILVADDLTPSEAVTMDKEKVLGFLTNIGGRTSHTAIMARTLEIPAVVGLKDITEVLKEGDIVAFNGETGEVIINPSEEEINHYKELKNKYDKEKKELQNLKGQESITLDGITVELVGNIGTPNDIEGLIKNDAEGVGLYRTEFIYMDRDSLPTEDEQFESYKKVLQAMNPKPVVIRTLDIGGDKEVSYLNIDKEMNPFLGYRAIRLCLDKVEIFKVQLRALLRASIYGNLKIMFPMISSLEELREAKKILQEVKRDLDNERVEYASNIEVGMMIEVPSAAIISDILAKEVDFFSIGTNDLIQYTTAVDRMNQKIRHLYNPFNPAVIRLIKMVIDNGHKEGIWVGMCGEMAGDKRMIPILLGLGLDEFSMSPISILPARKLIRSLNSKEMKKLADEILKMNTAEEIEKFIENYFK >NZ_CP048617.1|WP_163236063.1|1519427_1520795_+|DDE-type-integrase/transposase/recombinase MKPKTNKPISKPYRKIEVDTELPIVETIEVPNYKELLKQYEHKHGKPLKPINRRKKINFPKGTKCPYCGSPKEYIYTNNGSKGQCLCKVCNNTFMLGSNLNKKTISKCPYCGHTLEKTKDRNSFIIYKCKNDNCKYYQNKLNSLTKEEKEIYKSNPGKLKLRYIYREFKFSLASLNPNTPNRPKIDLAKAHNPLNVVGLIMTFYVNFGLSSRTVSRIMDEVFSIKVSHQTVLNYAQATAYYLSSFTKDHIKDLSSKLCGDETYIKVKGKWRYIFFILDPVKKILISSLVSKKRDTLAACTAIKQVIDCFKEIPEDLTFIFDGNPIYLLAKMFFAKNNIQFDLKTVIGLTNDDPISAEFRPYKQFIERLNRTFKDNYRHTNGFGSFDGAISYVTLFTAWFNFLRPHSALNGKVPIPINELNKYETMPAKWAKLIELAQIHTIENQKHKSNVLKEAA >NZ_CP048617.1|WP_163235098.1|1521097_1521556_-|winged-helix-turn-helix-transcriptional-regulator MMDFKKYILDKKYLILFYIILMLFISLVVYLDITVKVSIGNILYINFVSFMKVESEVIEYNNVFLNIKDSCVLYEGKQVELTKNEFKIMYILMKNAGSIVSRDKIMRSLWEDESFVDDNTLTVNINRLRKKLEEIGIKDFIKTKKGQGYIIL >NZ_CP048617.1|WP_163235099.1|1521878_1522139_+|hypothetical-protein MKKAKNNNLQSPKPVELKNIAEIKKQMGTLYTDITPEGYTNNANGKNTMPYTHTSSTINGEFYMNYPELFNFNYEIPTVHLFEYKR >NZ_CP048617.1|WP_163235100.1|1522224_1523595_-|aldehyde-dehydrogenase MNEIKELIDRQRKYFERGITLDINFRINMLKVLKSAIIENEKLILKALKEDLNKSDFEGYETEIGIVLDEIGYIIKNLRYWTKPKRVKTPITQFISKSYIYSEPYGVTLIIAPWNYPFQLVMAPLIGSISAGNCSIIKPSEYSPNTSKIISKIISDNFEEEFIAVVEGGIEVNKALLEEKFDYIFFTGSVNVGKIVMEAASKHLTPITLELGGKSPCIVDEDADVELAAKRIVWGKFLNAGQTCVAPDYLYLHKNIKDDFIKNAIKFIKEFFGENPLKSEDYPRIVNIKHFNRLKNLLKDGDVLYGGDFNEEKLYIAPTIIDNITWEDSIMQEEIFGPILPILMFEKLDEVIKIVNIRPKPLALYYFSNNKEKQERVIREISFGGGCINDTIVHLATPYLPFGGVGNSGMGNYHGKASFDTFSHKKSVLKKSNLIDISLRYPPYKNKINLLKKILK >NZ_CP048617.1|WP_163235101.1|1523762_1525733_+|methyl-accepting-chemotaxis-protein MKNIKLKTKLILIITALVFLSSTVSGLISYSNQKEAILNELEDTSSNLAKILSNQIETFLNGKIKLLESISNLDGITSLDKDSQTKILKSIKTKQPDFSLLFVTNLKGYQIARSDGKTFYSDLSNRQYIKDVKEKKKTVISDILISKTTGRPSLAIVTPIFDSGNKMIGILGAFVDLSTIENFRKEIAIGKTGFAFVVDSEGKVLAHPDKNIIQERVSYSNIEPVKEVLKKKIGTTIYEINGTKYYASYRPVSILNGGVIVQQSYKEAFSALNKVRLFTAMITIIIILVASAIGYIFSLSITKPISKLVFFANGLSEGDLTQKINIKNKDEIGKLASAFEKMNNNLKNLLNNINIASEKVNKAALNLSESSSQVSEISEQISVAIDELASGNSAQAASIENTSNSVNEIVKSIETISNKSIESARISNESKLLADRGIEIINNQNNKLKQSAEAIKNVSNSIENLNKKSEEINQITNLISSIAEQTNLLALNASIEAARAGEAGRGFSVVADEIRKLAEQSQESVEQINNILIDMVNDIKDVVLITRDTLEIFKEQESLSQNTTDAFYKISDSINKVLHQTNDIAEAIEKVKSETDNMVDEIQSISAVSEESAASAEEVAASTQEQSASIQRISVAAQELAELSINLENEVRKFKF >NZ_CP048617.1|WP_163235102.1|1525761_1526448_-|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase-activating-protein MNFKGLQKSSFIDYPDKICTVLFTGGCNFRCPFCHNSLLVKNEGEIILERDVLEFLESRKTMIEAVCISGGEPTLQKELVSFIKKVKDIGYLVKLDTNGTNPDVIKRLLDLRLVDYIAMDIKAPFSKYSSVAGVMVDINSIRESIKLIKNSDIDYEFRTTVCKELLSQNDILELSKEISGAKRYIIQNFKDRETVLAGQGRFTPYLREELLEIEKEIKDLFGEIKIRF >NZ_CP048617.1|WP_163235103.1|1526470_1528609_-|ribonucleoside-triphosphate-reductase MVARVQKRNGNIVDFDIQKIENAIFAAAKAVGGDDRKEARRLAEITANILEEAFGVGIPTVEDIQDIVEKVLIEEGHAKTAKAYILYRKKHEELRDVKNLFMDAEKMIEEYVSLEDWRINENANMGFSLQGLNNHIVESITKKYWLNKIYRKELRDAHINGDLHIHDLGLLAPYCCGWDLEALLIHGFKGASGKIESKPAKHFQSFLGQIVNWLYTLQGEAAGAQAISSLDTYVAPFIYYDGLDYDQVKKIVQSFVFNLNIPTRVGFQTPFTNITLDITPHPMLKNMPVIIGGKRMEKTYGEFQKEMDMFNKALCEVMMEGDGAGRSFSFPIPTINITKDFPWDSEVVNLIMEMTRKFGTPYFANFINSDMSPEDVRSMCCRLRLDNRELRRRGGGLFGANPLTGSINVVTLNMARIGYLSKNKEEFKRRVRELMELAKEICETKRKVLEGYMEAGLYPYSKFYLQSIKDAEGEYFKNHFSTIGLNGMNEACINLLGKDITTEEGNEFAIEIMEFMNKVIQIFQEETGSLWNLEASPAESASYRFARMDKKLYPKIFTQGDKEPYYTNSTQLPVGHTKDIFEAISLQDKLQSLYTGGTVFHGFIGEAIESVEVVKTLIKKVFEDSKIPYFTITPTYSICPEHGYISGEHFNCPECGREAEVWTRVVGFHRPVQSWNKGKKEEFKDRLEFDAKYSILNNVSKEEERLIAVGEV >NZ_CP048617.1|WP_163235104.1|1528898_1529921_-|flippase-like-domain-containing-protein MKRQILNYIFVVVLIVITMSLILGENRIAEIPLLLLRINKTYLLIGMLCMALYWIFDGSIIYYLTKMINSKSSLLKSIKFTMIGQYYNNITPFSSGGQPAQIYVMANESIPIGISTSILLVKFIIFQIVVTLFSVFMFIIKFGFIYRNLKMILPFFAIGIIIRLSGTIVLITLFFNQNITKKLINIILCLLHRVKIIKNLEKVVLTFEKHLDEYMVGIDKIKENGKISLKISFLTLIQITVYFSITYFIYLSMGFNKASLLDIISIQSLLDVTVSYMPTPGRVGASEGGFYLFFKGFFSAGMLPYAIFLWRMITYYLNLVISGLVTLVDYLSRKRTKFST >NZ_CP048617.1|WP_163235105.1|1530065_1530233_-|hypothetical-protein MVLNEKGGGILKIKKLLIVLTIIFTLTIGIGASLGYCDSPDDPEPWSTEPGTLQN >NZ_CP048617.1|WP_163235106.1|1530237_1531542_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MYILEDTILPTNEKIRAIRKFLKINQKELAGDNIDRSLISYIENGKVKLSNETAKILANNLSRILKEKNLNYQVDADYLLADEKKQASYRLNTIIEILKNMMKDSTDEFLTKFYMAEELLRKWDIPSKKAVIYDLVGDYFFNKLNYYRSEFYYMMALGNYFRLNDYRNLVNVCTKIVRCLIKRGEYEEAISLNDYAMSIIEDFKILDSDFKERILFNNSLALFKIELYEESLNCLDKLISEFDISEESKQMDILLLKANNYNLIGRLEESLEIYKQLLELAKQSGNLERMAIAYNNIGEIYYKLNNIEKSIEFLEKSLIIREEINSIYLISTIKLFIDKLFEDSKYDEAMLYLFRLLDIAKKRNDLVLLLDTYCRLLDIFIVNSMNMEENLIDEMVKFVKKNMEMKGIGELIARLCKYFANKDIYKIRDLFDRG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048617_7 | 1580794-1581028 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP048617_7
|
3 spacers
spacers of NZ_CP048617_7
>7.1|1580824|40|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder GAAAAAAAATAAATATGATAGTAGATAGGATGATTGAAGG >7.2|1580894|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder TAATCTTCTATTTGTGAGTATTTATTAAGTGGATAGA >7.3|1580961|38|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder ATGGTATCAAACATTTGTAATGCCACCAATGAAGAAAA >7.4|1580894|32|NZ_CP048617|PILER-CR TAATCTTCTATTTGTGAGTATTTATTAAGTGG >7.5|1580961|33|NZ_CP048617|PILER-CR ATGGTATCAAACATTTGTAATGCCACCAATGAA |
csx20,cmr6gr7,cmr5gr11,cmr4gr7,csm6,cmr3gr5,cas10,cmr1gr7 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048617_7
The CRISPR arrays of NZ_CP048617_7 >merge|NZ_CP048617|7|1580794-1581028|CRISPRCasFinder,PILER-CR ATTGTAATTCCTGATAGGTAGGCTGTGAACGAAAAAAAATAAATATGATAGTAGATAGGATGATTGAAGGGTTTCAATTCCTCATAGGTAGTCTATAAACTAATCTTCTATTTGTGAGTATTTATTAAGTGGATAGAGTTTCAATTCCTCATAGGTAGTCTATAAACATGGTATCAAACATTTGTAATGCCACCAATGAAGAAAAGTTTCAATTCCTCATAGGTAGTCTATAAAC >NZ_CP048617|7|7|1580794-1581028|CRISPRCasFinder ATTGTAATTCCTGATAGGTAGGCTGTGAAC GAAAAAAAATAAATATGATAGTAGATAGGATGATTGAAGG GTTTCAATTCCTCATAGGTAGTCTATAAAC TAATCTTCTATTTGTGAGTATTTATTAAGTGGATAGA GTTTCAATTCCTCATAGGTAGTCTATAAAC ATGGTATCAAACATTTGTAATGCCACCAATGAAGAAAA GTTTCAATTCCTCATAGGTAGTCTATAAAC >NZ_CP048617|7|6|1580859-1581028|PILER-CR GAAGGGTTTCAATTCCTCATAGGTAGTCTATAAAC TAATCTTCTATTTGTGAGTATTTATTAAGTGG ATAGAGTTTCAATTCCTCATAGGTAGTCTATAAAC ATGGTATCAAACATTTGTAATGCCACCAATGAA GAAAAGTTTCAATTCCTCATAGGTAGTCTATAAAC
>NZ_CP048617.1|WP_163235140.1|1578901_1580710_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MRFRDVYKNNLFMLKFVWKYYKIYIITSILISFSSILTPLADVLGPKYIIDFISQKKPFTWIVTVVILIFSIEILKSIYYSWYYKFITPRAHNKIKGGINNLLMQKAASLDLECYENADFYDKYTRALKEADIRALSVVSSTRDFLLSLVYALTLFGVIVTLDPILLLISVVSMLLSSLFGLISGKCQFKYERLLTPFEKHLNYIKRVFYEVQYSKEIRIFPISKLLFKKYDNNIDKIDSVLKTRGKKLTLLNILGDTVEFIMTIGVTMLYLAWKIYNGVLTLGDFMALYIASRQFSSRLQVFFNSFTQFYEHSLYITNLKEVLDYESKIENSSDSLEILEEKITDISVDNVSFSYSEREVLHNITIKASKGEKIAIVGHNGAGKTTLIKLIIRLYDINKGKILINNKDIKKLSVKHLRSKIGLVFQDYQLYSASIAENILLREVKTPEDEDKVWFALKQVGLYEKVKELPNGIHTLITKEFSNEGIFLSGGEAQKLALARIYIKDYDVVILDEPSSSLDPLAEKQMYENMMDITKNKIAIFITHRLSTTVMADRIYLIDNGRVIEQGTHKELMELNGKYRRMFDAQAQFYREQAEDSLVVS >NZ_CP048617.1|WP_035164954.1|1578278_1578485_-|hypothetical-protein MLYKGILFILIGAFLIIYEKYDIKKIIKDRIFLIKEDFVYDSYYEIKLFLGIFSIIVGIFSIINYIVY >NZ_CP048617.1|WP_163235139.1|1577049_1578267_-|hypothetical-protein MNTKKILITVLLLLIFISFFSKLVLAERIKLIMIILDELDFDLTEKITQNTKNSVGIMNTKTGYFYSPKNEESYFLTIATGRRVKISSKSYKGIIKNRDGSLYIIGFEDIIRELKKKYLTFSREISTFGDFFNKRSIKIGYIGNNSSSLIAANINGYIEYGENKVVYEEKWLNDKSREILKKADILILSYELNNKEERIELLKKYIEKMKCNMIIFPKTISGDVNIKWNTTLVPVVYITPDNKEGLLISSTTRREGVITSLDIFPDAANLFGISTDRFIGSSIKIMPENRPILKCKNYLKEFLNLNIIKYIFHGIIIALQLSVIFSKNLEKQACKFLMYTILSIIFFSLLFGFFKIYKSIIIYCIIVLMSSFLLSFLLIKKEKAVKYLSIFTNILILYGIFLTII >NZ_CP048617.1|WP_163235138.1|1576348_1576978_-|hypothetical-protein MGVLLATSIIVYFSIREKIKDKIVLSLFLIIYFPLIILALSGKYGVNFGGYITSILLFFILIYEMFYHSEINKSIVLLIFGSIFILLNFIIQFNGYSLNHIGKLLLRIETVGFIELFDVIINKLKQLIIMVLAPPWSIISLGQLYYVYGLYRDENICMRDFKDLNIGKCIYIIFIGSIISTFINDTGIISFVYMNTYLIAILVSLHNIK >NZ_CP048617.1|WP_163235137.1|1573827_1576128_-|UvrD-helicase-domain-containing-protein MLANKHPDYEKESKYLKTTCDCISDEIVYLEKEIEKMDESINKLKKSTKGNYSDEMVVKATIQEANKRKYRQLVKAQYKPYFGRIDFRELGKDELETFYIGKTSVVRRGDEKRLVVDWRAPIASLYYSGELGDVMYTAPDGLIIGELELKRQYEIENKRLINIFDKGLTPMDEFLQQALWQKKDNRLKDIVTTIQSEQNDIIRADKDITLIVQGVAGSGKTTIVLHRIAYLMYTYQDVFTPENILIIVPNNLFLDYISDVLPDLGVEEINQYTYEDLVMKLLNKRYKLKSVEDKLVKLIENSSINEEYYENIKYTSWFKGSMMFKKILDKYIRDMIKDFVPKENLKVLDYEIYSYEEVKEMFDKDFNYLPVIPRVERIKKYIKANIKERIEKITESIDEDYKKLVDKVKKSDLDDGEIKKELIKIYDERDKKINEIEKAVPNSINKYFSIWPKIDIDELYKSVITDFDVMSKYSNGEIEDRKIEFITNYCRGIFENDEIEREDLPAILYLKMKLLGLEMQGKFSHIIIDEAQDYSQLQMYVLKKLNIGNSFTIVGDLSQGIHSYKGIGSWRDLIKEVFDEDSTRYLTIRKCYRSTMEIMNFANEVIKNWEKEDITLAEPVLRSGDKPYIIGKNSEDEIIEDIAKRVEGLKDKGYKSIAVICKTNKESKEVYESLKKYKITDLHLITDEDITYESGVVVIPTYLAKGLEFDAVFVHDCSEKSYPNNELHIKLLYVSITRPLHELYIYYKDKPSVLIENISEEFCNKE >NZ_CP048617.1|WP_035164948.1|1572459_1573623_+|MFS-transporter MNLYLTLLVVFFIQFVISLEASFISPIIPYLADYFNIRESSVIYLNLGFSTIGLFSPLFGMAADKYGKKNIITFAILTFLSGTIITGWAPSPVIFGLGRMLIGVGNITLTTTLLSYISDFISYENRGKGNGILRIAFAIAILLSPIYSTNMVKYFNIHYLYWSVSILSVIILFLSIKLPKDHNVHISHSSELNLKEVISITKEPITIKFLIIQFLLILAPILMFNYLSIWLKHNFNLTQSHIGYVFTLTALGTVIGVTIAAILSDKIGKIKYCILSFILMTLFLAPLPYIKSIRLVIPLTFFYALGLDGGWSAFQTICSEIYPNRRTVFMTLLYFVISVCSLLLTIIGPSLFELGGYKLVIGIGTISNILSVILLIDVSKDKSFNIK >NZ_CP048617.1|WP_163235136.1|1572054_1572225_-|hypothetical-protein MKKETWLKVRDTIILLLIALPFLILFIVKEIPLYNFSQVTTTILLGYYVFKKMNEK >NZ_CP048617.1|WP_163235135.1|1570144_1571884_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKKFISYYRPHMKLFILDMVCAFFIAVLDLVFPMMTREIVNNVIPSGNIRMLYIFTIVLVVLYVFRAIFNYIVDYWGHVVGTRIEHDMRRDLFAHLQTLDISYFDNTKTGYIMSRIVNDLNEISELAHHGPEDLFLSIIMLIGSFAMLMSINWKLTLIIFTFVIAMIWFAIKKRKKMAESFRNVRKKIANVNAQLENSISGIRVAKSFTNEEYEMEKFSIGNREFKESREFAFKSMAEFFTGIRFLSNMLNVVVVSVGGLFLYKNVINTGDLFAYLLYVNFFMQPIRRLTQFTQQYQSGMAGFERFIEILNIKPSIVDKENAIDLKDVKGKIEFKNVSFSYNSKSNRVLSNINLTIEAGKTLALVGPSGAGKTTLCHLIPRFYEVDSGEILLDGINIKDISIKSLRKNIGLVQQNVFLFTGAIKENILYGRPDASFEEVVEAAKNANIHDFIMSLPDGYDTYIGEKGIKLSGGQKQRISIARVFLKNPPILILDEATSALDNETEIIIQNALERLSKDRTTLVIAHRLSTIKNADEIVVLTDKGIQERGKHEELIEKNGLYASLYNAQFKGFIPDDVN >NZ_CP048617.1|WP_163235134.1|1569623_1570040_-|hemerythrin-family-protein MFKWKEEFSTKVDIFDEEHKKLFEIGNRLYDLIKLDDEIDRYDEIMGVISEMADYAKYHFKHEEELMHKYGYPPREFFKHVSEHKAFFMEVEKMMSEDIDVEQREVSMHLVTFLVDWISNHILKTDMKYADFFADKDI >NZ_CP048617.1|WP_163235133.1|1568327_1569488_-|sensor-histidine-kinase MSDKNFKVFMLIKILVLLPIFYTAIYFENTFGKRFYTIILIFIVYMILGVIRRKLCNKYSTLFMSFFIDILLIFLLEYNSRFLINYFLHSFYIVIILEASLTLKRDRSLIVGIVAVLISLIKSIMLIYYKSNLANISEMAFFALINILTLIVTNFAQYNKEEKEKKELLYKELLKAHKKLKEYSDRVERLTIIEERNRIARDIHDTLGHKMTALIMQLEMSSYMIDENPEKAKQLIEEAKKQAREGLLSIRKVVETLRINDDISQGIDFIKQMADEFSKKTGTDIKFKIKGNQIKIPSNINTVLYRIIQESLTNAVRHGKATKINIEIVFKENSVNFCIRDNGIGVDNIKEGYGLKGIRERVEHFNGKVKFESRGGFEVKGYLPIS >NZ_CP048617.1|WP_052045321.1|1581224_1581617_-|hypothetical-protein MNLLVVMSHELLDFQVEEAKFKLGVDTIKTLPDNLKQIWSNLNPKGELPVGELNLVRDWILKESYEGEYVLVQGEFGATFYIVDFCFKYNRIPIYATTARKVEETKVDNKVITKRVFVHENFRKYLRYKI >NZ_CP048617.1|WP_163235141.1|1581687_1582602_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr6 MNRKRMKRNNSKKNNNKMNNDEKISLKLPRDTRQLLNDNIENIGLKLNKYIKFVEKKGKEEVQKRTNNGMFRLSSAQRKLLDQITIRNRKMIIELQQAGYEIKTALFKPLWRMTIGLGIPSVRETSMLFHHIYGIPYIPASMIKGVVRNFIITEKFRGGDRKAEEAALQDEGFCDIFGCPKNSVYKESRQGKIVFFDAFPIDPVNIEWDIMNVHYQKYYNGNEYPADSQNPNPVFFLTIKDTQFYFVIGIKGENEEIKSGVFAGEKILDLTFDYFKKTLKNYGLGAKTAVGYGFMKEENLENFL >NZ_CP048617.1|WP_163235142.1|1582573_1582861_-|type-III-B-CRISPR-module-associated-protein-Cmr5 MLIKVNGLGATLAFMKSKGNTYDIIYAQIGEWLKADEKNLIEIENELVESVISLDSPDYRMVTNEVLAFLNWLRRFAEGLIEEDVDSEQEENEKE >NZ_CP048617.1|WP_163235143.1|1582854_1583070_-|hypothetical-protein MRGRDKTTIKSIEEGRADFAYKCVKQVINLNSFEFKGRDIYPSYLKKLSKNDNSHMKTMKEYRAYTKKFLC >NZ_CP048617.1|WP_163235144.1|1583053_1584040_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr4 MYKKAVPFFMITRTPLHAGSGQDLGFVDLPIQREKHTDFPKIEASGIKGSLREAFENSNKTIKIAGKNIDAKEHKEVVKFIFGPEDGDLHAGLLGFTNARVLLFPVKSIKGVFAWITCPMVLERFKEELEMRIIDDLNKQKELFEIPTERSIVKGSNLIIEDKNGKEKIVLEEYTFGDVVETEECKEFAEWIAERIFPNNDYWKEKMKKDIVVLSNDDFRDFVKFSTEIVTRTKIDNEKGTVEEGALFTEEYLPSETILYSFALISSLSPGTDIDKKYFSSDKNKKEDLIMQYFKDGIPEIMQIGGNATIGKGIVKIQIWEDKYERER >NZ_CP048617.1|WP_163235145.1|1584032_1585175_-|putative-CRISPR-associated-protein MKKVITTVGTSIISNYVENGGKRLNSYKNYLKESFENWEEDYSISMKKTLKDWMKKVKEEDISAEIKSLLKIKKEEDCCLEVYLITTDTVASNLCAQLIADYFEEKKDDCIEVKYNPKTSNIKGLQIENRKKFVQEGLPNLINRIRKIANDYYDNVIFNITGGYKGVIPYLTIMAAVNGSSIKYIFEESNELITIPSLPLKIDEKIFFDYYSELTKLEKGIEDYSKVKNEKFAAFSELEKKGLVEWDDEYAFLSPIGQIFFNRYRDRYFTFYCTKGIWEQIHKEEDILRIIKTKFYSEENRESKTEDKGNGHKKVYDDGNNCNRIFYFIQNSNIYIYKVFSRDHDKYDQYIRTVKFEDEKQKTLKNAKSYKIEKEREKNV >NZ_CP048617.1|WP_163235146.1|1585188_1586271_-|type-III-B-CRISPR-module-associated-protein-Cmr3 MIIEIIPLDPLFFRDGRSFTAGEDTWASSLILPYPSVIYGALRTAYFSNHPEELKYANTEEDPTKELKIKNILYKSGSEVYYPIPLDCLKEKYSKEKDAFTMKLVDNEIISNLRTEKRLEKPDEGIFYERINDGLLNYLNFKNYIYNTEKSFIYSTIADFVLREPKIGIARDKTTRSSKEGRLYRINMMRWQNTSEEKLGILVDFEGIEIPEEGIIKLGGEGRAARYKKPEESEVKKINVPNIEEDIFKMYFATPTFFKNGWLASWIDIESYEGYLPNTKVRVKLVAAAIGQFMNIGGFSIKGKNGKPYPKYMHRMLPPGSVYFLRILDGDKEELKNVHLSSVSDVRSNEGFGICYIGKI >NZ_CP048617.1|WP_163235147.1|1586267_1588046_-|type-III-B-CRISPR-associated-protein-Cas10/Cmr2 MKEYLLLFAINPAQRYISQARKVQDLKMGSFILSYITNKTIEELYKSVSETNVQILFPHKSIQKKPNRFVAKVKVDNPKELGKELEQFAKSKFKEIASYVLKEVTNNCIVKKSNPDTLEKQINTYFYVNWVFHELDNDYYSTYCEIEKLVSSVKVLNMFKPLSEVGRKCKLCGERNIVFYRRTDSEESKGTDYIPKKLYIEELSILDSNSPQRYRFEKGEGLCAVCTVKRFGELYFQKESCFEKENLSTAAIAVMNWLDKISIKEQEEYKSLFDNFDEQLYYEENLSEKYAEKYEYIKSENKDNLEKARNMLRNCYKKHGRPPKYYALLVSDGDDMGHWLSGDFLIDKSQLKAFHENMSQELGRYADDIEKIINKPKGKVIYAGGDDVLAFVNLDYLLDTMPSLRTEFPQFDKLVQVKDDIKSSVSCGVVIAHYKEPLEEVLNWARRMEKEAKQQDGKAAFSIVVLRRSGEIQKITMKWEEDDIKPIEILKELVKELKNDKEGFSDTFIRRLEEEGRKFNQIEEYILKSELTRLLNRSCFETCKSKKRGKVEKWAKNLTNVFRYFANYNKDGFEGFISFLKIANFLAKKVTM >NZ_CP048617.1|WP_163235148.1|1588042_1589128_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr1 MKKVTLKCEVVTPMFIAGANSCVPEIRGPSLKGVMRFWWRALNGNLSFKDLNLLKTEEAKIFGSSEKYGKSSFGIRIDKSFQRNEIETNLFNNINILNTLDDKNKSAIKYIYYFMYIRGKERHCIRPGVEFSIDLLFSKDDKRIYEEVFKAFALLTLFGALGARSRRGAGCFTVNSVEGDSFCDCKYSEFFEKYNRISSTKDLKLFIEEEIKKWISNDDYSDEYTTLKGSKIYIFGQEDNWEKALSKIAKPYYEFRTKNESRITETPNFGFPIRHKNGTTMIAGKKRKKDKIIRRASPLIFKVIKTGKNNYFPIIIWLNGRLLPNGYEIMDFNGGNRATEDDSIIEEFINSIDCKKEETSL >NZ_CP048617.1|WP_163235149.1|1590075_1591887_+|hypothetical-protein 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NZ_CP048617_8 | 1593577-1598490 | TypeIII |
I-A,II-B,III-A
Consensus repeat of NZ_CP048617_8
|
73 spacers
spacers of NZ_CP048617_8
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048617_8
The CRISPR arrays of NZ_CP048617_8 >merge|NZ_CP048617|8|1593577-1598490|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR 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MIIEIIPLDPLFFRDGRSFTAGEDTWASSLILPYPSVIYGALRTAYFSNHPEELKYANTEEDPTKELKIKNILYKSGSEVYYPIPLDCLKEKYSKEKDAFTMKLVDNEIISNLRTEKRLEKPDEGIFYERINDGLLNYLNFKNYIYNTEKSFIYSTIADFVLREPKIGIARDKTTRSSKEGRLYRINMMRWQNTSEEKLGILVDFEGIEIPEEGIIKLGGEGRAARYKKPEESEVKKINVPNIEEDIFKMYFATPTFFKNGWLASWIDIESYEGYLPNTKVRVKLVAAAIGQFMNIGGFSIKGKNGKPYPKYMHRMLPPGSVYFLRILDGDKEELKNVHLSSVSDVRSNEGFGICYIGKI >NZ_CP048617.1|WP_163235145.1|1584032_1585175_-|putative-CRISPR-associated-protein MKKVITTVGTSIISNYVENGGKRLNSYKNYLKESFENWEEDYSISMKKTLKDWMKKVKEEDISAEIKSLLKIKKEEDCCLEVYLITTDTVASNLCAQLIADYFEEKKDDCIEVKYNPKTSNIKGLQIENRKKFVQEGLPNLINRIRKIANDYYDNVIFNITGGYKGVIPYLTIMAAVNGSSIKYIFEESNELITIPSLPLKIDEKIFFDYYSELTKLEKGIEDYSKVKNEKFAAFSELEKKGLVEWDDEYAFLSPIGQIFFNRYRDRYFTFYCTKGIWEQIHKEEDILRIIKTKFYSEENRESKTEDKGNGHKKVYDDGNNCNRIFYFIQNSNIYIYKVFSRDHDKYDQYIRTVKFEDEKQKTLKNAKSYKIEKEREKNV >NZ_CP048617.1|WP_163235144.1|1583053_1584040_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr4 MYKKAVPFFMITRTPLHAGSGQDLGFVDLPIQREKHTDFPKIEASGIKGSLREAFENSNKTIKIAGKNIDAKEHKEVVKFIFGPEDGDLHAGLLGFTNARVLLFPVKSIKGVFAWITCPMVLERFKEELEMRIIDDLNKQKELFEIPTERSIVKGSNLIIEDKNGKEKIVLEEYTFGDVVETEECKEFAEWIAERIFPNNDYWKEKMKKDIVVLSNDDFRDFVKFSTEIVTRTKIDNEKGTVEEGALFTEEYLPSETILYSFALISSLSPGTDIDKKYFSSDKNKKEDLIMQYFKDGIPEIMQIGGNATIGKGIVKIQIWEDKYERER >NZ_CP048617.1|WP_163235143.1|1582854_1583070_-|hypothetical-protein MRGRDKTTIKSIEEGRADFAYKCVKQVINLNSFEFKGRDIYPSYLKKLSKNDNSHMKTMKEYRAYTKKFLC >NZ_CP048617.1|WP_163235142.1|1582573_1582861_-|type-III-B-CRISPR-module-associated-protein-Cmr5 MLIKVNGLGATLAFMKSKGNTYDIIYAQIGEWLKADEKNLIEIENELVESVISLDSPDYRMVTNEVLAFLNWLRRFAEGLIEEDVDSEQEENEKE >NZ_CP048617.1|WP_163235141.1|1581687_1582602_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr6 MNRKRMKRNNSKKNNNKMNNDEKISLKLPRDTRQLLNDNIENIGLKLNKYIKFVEKKGKEEVQKRTNNGMFRLSSAQRKLLDQITIRNRKMIIELQQAGYEIKTALFKPLWRMTIGLGIPSVRETSMLFHHIYGIPYIPASMIKGVVRNFIITEKFRGGDRKAEEAALQDEGFCDIFGCPKNSVYKESRQGKIVFFDAFPIDPVNIEWDIMNVHYQKYYNGNEYPADSQNPNPVFFLTIKDTQFYFVIGIKGENEEIKSGVFAGEKILDLTFDYFKKTLKNYGLGAKTAVGYGFMKEENLENFL >NZ_CP048617.1|WP_163235151.1|1598632_1599388_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRLEIEFIINKTKKINFNYNYYITSAIYNLISEHNKDFSEMLHNEGYKIGNKRFKLFVYSRLMPQKFTIDGSNMIIEKGITRLYVNSPIKEFISGLGNSLIKRGSMRIGEEEFQVNNIYLKDNVKFNYETKFITLSPIVVTTGEERNGEIKPRTVHITEDKFIENIRNNLIKKYFLVYGKLPDNMSIDIKFDEEYIKKHKRGHLVNFKGVSVKGYIAPFVMRCSDDIKKVAVDCGIGENNSIGMGYIMEKK >NZ_CP048617.1|WP_163235152.1|1599410_1599674_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYVLIVYDVGEKRVQKVLKFLRKYLNWIQNSVFEGHVTDAQLLKIKNGLKSLTDQEEDSIIFFIARSDKWIKKEIMGVEKNSTDNFI >NZ_CP048617.1|WP_163235153.1|1599675_1600668_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKRAYYILNNGRLKRKDNTVCVESNGVRKYIPINDVESIYVFGELDFNTKALNFLAHNNVTVHLFNYYGFYTSSLYPREYLPSGFSLVNQVKKYVDKEERLKIAKEIISTASYNILKNLKYYNPRRNNKLEDLILHIEKEREKIPTITDIQDLMGTEGRIRDLYYSAFNIITKGKFKIKKRVKRPPDNPMNTLISFGNSLLYATVLTEIYHTQLNPTISFLHEPGERRFSLSLDISEVFKPIIVDRVIFKLINEGMIDESHFTEELNFCHLNEKGRKVFLKQFEEKLNTTIKHKDLGREISYKRLIRLECYKLIKHINDIKEYNGLKMWW >NZ_CP048617.1|WP_163236238.1|1600681_1601173_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MMKATGVEINYYFVCKRKLWFFTHGINMEHNSTRVEIGKEVHEQSFSRNKKEIMIDNLICLDFIDKKLVINETKLTKSMQKATKYQILYYIYYLEKKGIEGVTGVIHYPKSKRKDTILLTDQDRKVLDKTIKSIYAIKYQTTPPPIENDKKCKKCSYYELCYC >NZ_CP048617.1|WP_163235154.1|1601201_1603424_-|CRISPR-associated-helicase-Cas3' MDWKSKILAKEDESLYQHTENTLKVLKSLINSYQEVIEITKEEKFFEHLFYALFLHDIGKVAEGFQEELEGNKPWYRHEILSASFVSALELEEIYKKAICLAIVTHHKDIKELIYKYATYDIKSPAYTRYIENINSLGKNYWYVDKMFQNIDVLSEKYLGYKLKKLKLPRLDELIDPFRYCIKDYEDEFLDAEEKIYHGVYGIILKGLVNACDHLASAGKYEIKNAIIDMKSIYNFKNYKSTQRKAMRTKGNALLIAPTGSGKTEASLLWSDINQNKVKGRRVYYLLPYTASINAMYNRLNKDFSKQEDNLVGILHGKAQYFIYKSLSDDDSYTEKKEIAKNIQNITKKLYRPYKIMTPFQILKAFFRVKGFEVQLAEMSNGLFILDEIHAYDPHTTSLLLNILEILKKKYKANFFIMSATFPSFLKLLFKERLNIKDENEIYMSDSELGEIIRHKVNIFKGDIFQHIDKIKKDLIEGKKVLVVCNTVKRSQEVFKKLKKVTKNSQLLHSNLILKHREIVESKLKDSRLLVGTQAVEVSLNIDYDVLYTEPAPIDALLQRFGRVNRKGIKGICPVYIFEEGSEFDSIIYNEGRIQRTLDILKNYDILSEKHIQKIVDKVYEQGYTDKELKEFKRVDKYFKSLLNDLIPFVNNENIKEDFYGLFKSREVIPNRYRDDYIRCIEEKRYFDAMGYTLNISDKKYFILQKNNKIDKTKDGMPVVLCDYNDKLGLLIDKETDNFL >NZ_CP048617.1|WP_163235155.1|1603407_1604043_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MRCLRVIISGWTASFRYPIFISGFQPTISVPPLSTLYGLLSAAKGELVTPKDTNIGYVFTSESKFVDLETIYELDKNLKAKSNIMKREILFKPKLYLYLSNLEMKEYFKKPRYQLLLGRSSDICIVEDISEIELIDNRENIKIGNTILPFPMEGINGVIQALPTYFTDTIPRKAQGTRMFCIVENMYEHKGNKFLYDEDFDWGVYMHGLEE >NZ_CP048617.1|WP_163235156.1|1604053_1605055_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MKNIIGLLLIDTPHSALNNAGNDIGARTENTIAVKKITKKGKQGYEVYPYISAQAFRYWWRHTLSERYGWNLSPIERDKKIAFTKANPFKYEDDDVFGYMRAQSKDTVTRISPLKCSPLVSVIPTSIVDDYGVMARHEGDPVPYEHQFYSTIMEGVFSLDVDLVGRFSMINKTGYKNITDKMKEEWEKVGAIVKENVVELPKSIREKRIKDTILAIPYMYGGAKQTLHLTDVTPKFIILAEINGGNHLFMNIVQSEKGILKINFEALKEVLYDYKEDILTNVYIGKRKGFEDEIESDINIFIKQVKEERVFEKEIIFNSINTVISQFVEEIVL >NZ_CP048617.1|WP_163235157.1|1605051_1606383_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MSYFEFTGNPFVDAGIWGIMAWLNKKSPMDIEIEELKDEFEDITNLYTTDQWKKLMHYLFPNNPIVNPSYKGKHKKKYIEYLNKLTNQIKLVGNNGTCISCGKRGIVSQAKRNNVPLTGSGKLRNYFSYAQEGADYCPVCILSIQFLPLVLYICGGRVILISSDSKKVMRRWANKCIEMVRRQILLKEFERGINENYMLPHNSLFHIVGDLILEKNAEEFKGNKVSIRVYYFTNYGQSPDIEIFDLPSKVFSFLVYLKQTNEYKKWFEVVNRGFLKEIDDEEEKYKKYRNIVYEKLLNNESIIHYFMDNERNTYGTWNILNLYLKEVREMDDRKIELIKNLGDKIAIYIKNSDKLKRLTDLERAQKYYEFTNILRLISKDRIKQNAKEPLFSLDDYVEIVYRENYPEWKEVRDLILFRIYENLHDWLISKEEYKKEVEREEIS >NZ_CP048617.1|WP_163235158.1|1606387_1607140_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRLSIEFSFKDKLVLPIHYNHILQGFIYNNISDNAFRNFLHDEGYKYEKRSFKLFTFSRIFGQFKMDKQSNTITFSSPIKLTVSSILDDFVNDFASTLIKKDDLILGKTQIRLEKIEVFSHPEVEEEEVVIKMLSPTVTYSTVDVHGKKKTIYHKPGDGVFSELAYKNLQKKYKSFYGKDMPECEFSIKPVNDEKIKMISANYRGFIIKGWIGEFIMKGSKELIKLAYDTGLGSKNAQGFGCFEIVGVRR >NZ_CP048617.1|WP_163235159.1|1607354_1608149_+|chemotaxis-protein MKIAIVGAGNGGTAILKSLSKIEGINIEIIVDTNLNAPGILLAKELGIKYSDSIDDINCNNLDMIIEATGVEEVSKLLNEKSNGKCKIIDSEGAFLIMTLVERETKTLEKLNSQMSVIADTSSVVQNQLDEITSSIKSIHNVSENLLNTAEVSNKYIEKSDKIVSYVNKIAQQIKILGLNANIEAARAGEHGKGFSVVANEIQKLANNSESFAKEINQMLVKLANEIRKINGEIDNLKKLSQVQLNASETVSSALERLKSKTTI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048617_9 | 1659657-1659748 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP048617_9
|
1 spacers
spacers of NZ_CP048617_9
>9.1|1659681|44|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder TCATGTATGTTAAACATAGAAAACATATTATTTTTTTAATACTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048617_9
The CRISPR arrays of NZ_CP048617_9 >merge|NZ_CP048617|9|1659657-1659748|CRISPRCasFinder TATTGTTAATTTTTTAACTATATTTCATGTATGTTAAACATAGAAAACATATTATTTTTTTAATACTCTATTGTTAATTTTTTAACTATAAT >NZ_CP048617|9|9|1659657-1659748|CRISPRCasFinder TATTGTTAATTTTTTAACTATATT TCATGTATGTTAAACATAGAAAACATATTATTTTTTTAATACTC TATTGTTAATTTTTTAACTATAAT
>NZ_CP048617.1|WP_163235198.1|1656503_1659200_-|AAA-family-ATPase MTPICVKLFDIPTVIKDGKKITFPLRKAEALFYYLVVNKKATRDELAFLLWGELSERKAKKNLRNTMYKIRKSFEMDIIISPQKHIVMLNPDIDLNIDLDIFLSDSDNDIEAYSGEFLKGFLVKDAQKFDEWLINTRENFKEIYISKLYKRINESQLKQEYDLVEKYAKLLIEADEFDEKAHRILIKLYSSKGAYNKAIDIYNKLLKRLASELGITPELETKRLYENILLMRDSKKKEDLSNKEFFYGRNEELQFLEKNYKEFVYGKSSKSVLIIGEAGIGKTRLKDKFLSMVDKKDVYIIEANCYQVEEDYLLKPWNTILDKLINIIKIENIDVPVLWKNIISCIFPVFADESVQLNINPVEKIDSLKYQVVEDVILSIFKKVSRKKKILLIFEDLHWMDDMSLSLLSKLILHDENNNINLLGTLRNVCSYKIERFIALLIKYNKLEKIFLSRFTKSEVEDFLSKALPGHRFTEELKNRIYEETEGNTFFLVEFLNTVKEKGNINFMTSKIQDILKSRLLGISDDGRKIINIISLFFDEASLDIIKEVSGKSEFEIIEIIEELKNKYIIKEIVQEDKISYKFTHQKLREFVYFEQSQTMRRLLHNRIGSILERNLKNNNSDMLLYPKIIYHFSNGGNKLATLKYSIKNVDRYLDFSHELFPELTNVPIKDKGYLYITKDKAIKYLNDIEKLLDEVKKKEGLTEDIIKLEIAFFHMKGRYLIREGEYDRGIDYIKRVINKSIEVGEYRYALKGYRQMIYYSIQTHNSDTMKKYLDLGLKLARQLEYKKDIAILLRLKGVNKIMSGEYKKAEEFLKESIRMFTILNQDEDRYSLNIAAAYNYIGEIRRHNMSFSTALTFYDKAIKICEDKKVIRGLTIFTTNAGQAAYDMGIIIELDSI >NZ_CP048617.1|WP_163235197.1|1656150_1656507_-|hypothetical-protein MRKALDVYNHIDTLWGRSTAEGYMALLYIQEGKYKEALESLKRADYFSKKLKSPYELGLIYRVKAEIRSKMGKNQFLNDIFKDYLNKDLKYYCDCGIELLKKVRESYEVDILKALRKE >NZ_CP048617.1|WP_163236240.1|1655261_1656122_-|branched-chain-amino-acid-aminotransferase MKKCEVLDMVNELYLDFYIVNGKVCSVKEVNTDLINSPSIYEVIRVIDGVPLYVEEHLMRMRKSARLLGFKIKKSDDEILYEIKRLIAANNFPNLNIKLVFSDLDKNNQMFLAYFIKSYYPEKEVYENGIHTILFNIVRENPNAKVVNIKFKEKIKKELEDKNAFEALLVNEDGYITEGSRSNIFFVIDDKVYTAPEGDVLQGITREKVLKVSKELGIEIIEKNIHIDELKNLDGAFMTGTSVNVLPIKTIDEIKLNSVNNKIIKEIGLRYIKDMENYIESKKNLF >NZ_CP048617.1|WP_163235196.1|1654746_1655247_-|HAD-family-hydrolase MKAIFLDRDGVINDNSKHVNRPEDLIIYESAKRGLKKLYDAGFTLFIVTNQGGVELGYITEEDLNKIHKKLIEELKPYCQIKEIKFCPDFYRKSECRKPKPGMILELAEKYNIDLSQSWMIGDMDTDIIAGLKAGCKTAKIGDAYEKAHINGRDLDDVAEKILSRV >NZ_CP048617.1|WP_163235195.1|1652735_1654520_+|M3-family-oligoendopeptidase MDLKWSLDELYTSFESEDFINDMKKLDSSIKKINDWSEINLNTKDNAIQKIEEYINIQIELNTLFEKLMSFAELTSSVDAKNEKALMIIDKLQTKITELTKPTVKFQRWLNSIENLDKIISSSNILKEHEFYLKEIYNKAKYLLSDEEEILIAKMSNTGSNAWTKLQNILTSTLLVDININGQEKQLPLPIVRNMAYDKDPKIRKTAYEAELKSYKKIEESSAACLNGIKGEVLTVCEMKGYNSPLDMTLIDSRMDRDTLNAMLSAIKESLPTFRKYYKRKAELLGYNNGLPFYELFAPMGEIDMNFTYNEAKDYIVKNFRSFSEKLAEFANNAFENRWIDAKPREGKRGGAFCANLHPIKQSRILSNFTGSFSDVITLAHELGHGYHGDCLKDESILNSDYPMPLAETASIFCETIVKNAALKEATSKEAFWILEQSISDAGQVIVDIYSRFLFESNLFEKRKDHALSVRELKELMLDAQKEAYGDGLDENYLHPYMWICKPHYYEAAYNFYNFPYAFGLLFAIGLYAEYLKKGKAFIEEYDRLLAATGKNNAVDVAKLMDIDIRSVDFWRSSLKLIEKDIEKFIELSNSNTN >NZ_CP048617.1|WP_163235194.1|1651077_1652232_-|methyl-accepting-chemotaxis-protein MYFVNNMVYAVLISLALSILISIILVKRISKQLMILKSEVERLSKGDLTVKLQVTSKDEFAEIGKFINKVVEDLRTKIGEVKDNADELEKNIEMINSSIQETNASMEEVAASISEIASGAESQTIQLENTSNNIEKIAERIKDLANNSQKIAELAQKSDEDAESGSKEIIGVIDRIQELKVTIDKSVESVLNLKENADKIDKIVEVISNISSQTNMLALNAAIEAARAGESGKGFTIVAEEVRKLAENTKDATEEIAHIIKVVQTNVEETTALIEHIKNEVNLAQERSRIGEKELQNIIKSIDLIGQQVEEMAKGLEHIASSSDEIVESTYRVASVAQNTTAGTQEVSSSTEEITAVMNEITAKTDTLTDMVTKMRDSIEEFTL >NZ_CP048617.1|WP_163235193.1|1650585_1651050_-|purine-binding-chemotaxis-protein-CheW MSEKQYVIFKLNDEEYGVEISNVKEITSYEEGVKVPDAPDFVDGIINLRGDIVPIINLKKRFKLDTDGIDENSRVIISDINEKLVGFAVDDASRVLTMKDDDVESPPEVILSNNKRFIAGIGKFNDEIIIILDFREILSEEEKQQIQKMQTSLE >NZ_CP048617.1|WP_163235192.1|1648627_1650409_-|methyl-accepting-chemotaxis-protein MNNKGERRIVLKTGNIFSSVRSKLLSIFMAVIIIPLSLLGYFTYRKSFKILESNFRIVTQQNVNEVNKYLNENLTRMEKLVSILADNVSFKNIDMMYEENLNNEKLVLELLKNIKGNNYEVLHTYFGTESGDMYICPEGKLPDNYEFKSRLWYKKALINKGKIVWTSYKDAITGEVVITVSKAVVNNGKAVGVVGIDVDLKALSRKLSGIAVGKRGYVFITDKNGTLIAYPDLKLIGNSEMIPKLEFWSTAKKDNRGFLRYVFKGKNKFLSFTTNEKTGWKLMASMEENELIEDTDIISHFVLYGILIGIILAVIVSLIVSGRIAKKLNKIKVAIEKASTGDLTSKVKLNAKDEFGQIANSFNNMIDNISNLIKEVQKASSTVHEASESLAATTQQATIASEEIAKTIEEVAKSTIEQAKDTEKGSFNANELANAIDIVLNATEEMNNISKEASELSNNGLEHVKVLTEKTRENSEAATRVNEIVQKVDKSSEEIGVITDTISQIAEQTNLLALNAAIEAARAGEQGRGFAVVAEEIRELAEQSSKEAEEIKALIEGIQNQSKIAVDAMADAKVIVEKQNLAVLETEKYLIKY >NZ_CP048617.1|WP_163235191.1|1648367_1648631_-|methyl-accepting-chemotaxis-protein MISIRALVDKVSEIEEHNYDMVKKKNTILDIMSNISAVAQQTSAATQQVSASTEEQSASMETISSHTQELKALADKLHGIINEFKVN >NZ_CP048617.1|WP_163235190.1|1647114_1648344_+|peptidase-T MSKVVERFLKYVKYDTRSNEESNTVPTTNGQTVFAKELAKELENIGLKDISVDENGYVMATLPANVEKNVPTIGFIAHMDTSPEMPGKNVNPQIVRNYDGKDIVLNKEKNIILSPKDYPELKNYIGKDIITTDGNTLLGADDKAGIAEIITAMEYLINHPEIPHGTIRIAFTPDEEVGRGADLFDVKKFNADFAYTIDGGAIGELEYENFNAASARVYINGINIHPGSAKNKMKNSMLIANEFISMLPETETPAHTEGYEGFYHLISIKGSVEKTELYYIIRDFDRNNFENRKKLVEKIANELNNKYGSNTVEIKIRDQYYNMKEKIEEVKHIVDTAIEAMKAAKVTPVVVPIRGGTDGARLSFMGLPTPNIFTGGHNFHGRYEYIPTFAMEKAVEVILKIVEIYATKN >NZ_CP048617.1|WP_163235199.1|1659782_1662374_+|bifunctional-acetaldehyde-CoA/alcohol-dehydrogenase MSVKNVEDLMKKLKEIRKAQKKYATYTQEQVDEIFRQAAIAATNARIELAKMAVEETGMGIVEDKVIKNHFSSEYIYNKYKDEKTCGIIERDNSFGIVKIAEPIGVIAAIVPTTNPTSTTIFKALIALKTRNGIIFSPHPRAKKSTIAAAKIILEAAVKAGAPEGIIGWIDEPSIELSQCAMRESDLILATGGPGMVKAAYSSGKPAIGVGAGNTPAIIDETAHIKMAVNSILLSKSFDNGVICASEQSVIVIEDVYDEVKKEFSERGAYLLKKNEIDKLRKIILVNGSINPNIVGQSAYKIAEMAGIKVPENTKVLIGEVESVEASEPFAHEKLSPILALYKVKSFSEALDKAEKLVELGGFGHTSVLYTDQVKSKDRIAKFSEVMKTGRTIINMPSSQGAIGDIYNFKLAPSLTLGCGSWGGNSVSENVGVKHLLNIKNVAERRENMLWFRVPEKIYFKYGCLAMALKELKDMNKKKAFIVTDKVLYNLGFVDKITKVLEEIQIDFKVFFDVEPDPTLAIAKKGAEEMRSFEPDTIIALGGGSPMDAAKIMWVMYEHPEVRFEDLAMRFMDIRKRVFRFPKMGEKAMMVAIPTSAGTGSEVTPFAVITDERTQIKYPLADYELTPDMAIVDAELMMNMPKGLTAASGIDALTHAIEAYVSVCASEYTNGMALEAIRLIFKYLPQAYNDGPNNIKAREKMAHASTMAGMAFANAFLGVCHSMAHKLGSMHHIPHGIANALLINEVIRYNAVDNPRKQATFPQYKYPNAKWRYARIADYLQLGGNTDDEKVELLIKAIDDLKAKLNIPKTIREAGVSKQKFFATLDEMSEKAFDDQCTVSNPRYPLISEIKQMYINAFGEIKK >NZ_CP048617.1|WP_163235200.1|1662437_1663622_-|YibE/F-family-protein MSIYDSRRLFFIVVLLTVFILIFNTASVFADGNDGNFENEMQDISQEELKPVHGKVVEILSDEIEETEGYDQNYEMRHQRVKVKITSGKHKGETIIVDNYIDERIVYNIIVNKGDNVLLFLEEDENGNISVGYIGEIARDKYLLYLVIVFILLLILVGGFKGFKTVITLALTILAVVKILLPLILKGYSPVLVSIIVSIGVIIITLLIISGINKKTLCAIIGTAGGVLIAGLIALGIGTMAKLTGLGNEEAQMLMFIPQNISFNFKGLLFAGIILGALGAVMDVSMSISSAMYEMQSVNPEISTKDLIKSGMNMGRDIMGTMSNTLILAYAGGAIHLMLLFLAYNFSFVEIINRDMIASEVVRALAGSIGLILTIPLTVLVSGTIGRDKNYKSI >NZ_CP048617.1|WP_163235201.1|1664252_1664669_-|hypothetical-protein MRLVNRKYFRIMNSFLLLILILTLVLTGCNKRGNNFTNNAIRDKNVNSENRLPKKIDEDKKDELENIKTEWKEINKKIDKVKKEITNKKGNLREDAINNENIKNLIEQYEKEAKTMEEISDKLNKEIEKNLSIQLYKK >NZ_CP048617.1|WP_052045216.1|1664808_1665141_-|SdpI-family-protein MFFYYLNIIISFIYALAGLLLIRTIANKSPNLWFGIRNKYTLSNKEIWRKTNRSGGIILIISGLILLIPNLFIGPSNEKFYLWFTLISPIAVIVILGIATWIISKRLSEE >NZ_CP048617.1|WP_163235202.1|1665142_1666834_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MMNVFMTKFLKKYKLRIFVEIVLSLFFFIMSLIPAFLIKILIDFIVNGDKNSIQTTLFLFLCLFYIVNSILNYFANEYFVLTRQYLLYDIRISLLDSVSKIDYLQYQKIKIGELLYSITSDVANIGLYIDFLISLIVNILKIIALIVILSFISVKLILFYLLIVPIYILLVYYFKKKIILFNYQVKQMEAKMTEEFHDYFEKNIIYRVFSVIRIKLLKISEFLHSIIIFNKKAIMVERSASIVTGSITGLWSIILLWISSILILNKQITLGEMVLYFNLSNYLYTPIDALVNLFYSFQSMNVSYKRIANIMLLSTEDYSENKIEISDVCDVEFDDVSLIVDGKVILKDINFKISSKKIFIIGSSGSGKTTLINMLIKLIKPTKGNIKVNGIPIEKIKDYTKFIGVCFDKEYIINDTVYNNIKFYRNISSGFLIDELINLLELNDFSDIFKQQDIESVISKNFSKGQRQRIALARALYSKPKILVLDEALSGVEYSMEKRILDKIDQYLPNSLKIISTHRINLINDDDIVIYLENGRLIYYGKFSEIKKVDMSISYKNRRGGED >NZ_CP048617.1|WP_163235203.1|1666881_1668300_-|methyltransferase MIKIQDKYVNNLREILELIDYNFIISNVRGIYNFIDPWFADVKTGERVLKCIPSYLRNIFEFMLLGKSMNVKELEEIIGEKRVTLLLESGLAYSFEDQIRLNDYTVIVYQQLYFLVDLNCKYETCQDKYPNTYIGYDSYRLGENILFKRNTKVLDLCSGSGIQGILAARSASEVYCVELNPVAANMAIFNVKLNELEDKVRIIEGDLFSEVKGQKFDIIYSNPPFIPMIKGVNYPICGDGGEDGLFIVRKIIGGLQEHLNENGEFIMFCQMLGDEENIFYLEELKNNFYDRKWKVEVISTDRMYLGFQNRSVTELTKMINPDIDKNIVISRLEKIYRSMNAKYLYTTLIKIKQNNKLNNIDINLFKLFNDVHYEDRMIVKNNLAIEQNKEQFIVCSNGKILAQIDRETKDLLMLSDEFKGKKSIEELVDILIEKKNLLVSNEKIDLSREKIIMDTLSVCKILQESNVIEILK >NZ_CP048617.1|WP_163235204.1|1668408_1669200_-|PqqD-family-protein MILQKNKNDFLHVRNEKKGYVSIFNHNTRTTTFLNETAYEILKLVNEGKNYEEIVSIYNSKYGMGENLEEEVLNTLYSLKYRKLIEFEMENNNISENDIRVAGEKDYSEISKLIKNNFIKPNKYIYMAADNEVYYNEETIRIRQFNNYEYNIVAVENARIEAVLTIAPPRSQFFGTSLITGIFFSPDMSEDKCKLLFTKLLEKGKEYLLGDINKIRIHIPDTENLRNKKELIYLLLENGFINEATLKNEICKKYDLIFYTLFI >NZ_CP048617.1|WP_163235205.1|1669196_1670261_-|radical-SAM-protein MEQNVVSDSITGFKYAPNLKDDYEGLRQVNGPMMVSLDVTSRCNLSCIHCLNDSSNRGNSVYEEMNDRDILMVVDQIIELNPHTVCICGGEPLLRKNLFDIIDKFSQKGIFVSMVSNGFLIDSECVNKLKKCGLKFIQISLDGVNKKQHDYFRGVQGSFDRAVSAIKLLVKAGFNVAVSFVPNKLNHKDFYEYVDFVNKLGVISVRVMPFLPLGRGNKFGKLLMLNEEEYFYFQRKIFRCAEIYRGKMDVEWGDPLDHYIRMKNNYKAGLKTYCVEIRANGDIFFSTYMPIKIGNCLKKSLKEYWLNGLDNVWGNPTVIQWVNKVKNIYDFEKLDPQPYFDTPIEIKLDNGGRI >NZ_CP048617.1|WP_163235206.1|1670433_1670649_-|hypothetical-protein MKASKGHVTPKVTGTGDVVAPEGLFLGLVNVAVAFNAIWAANVYTHANANVGANANAAANANAIYNVNTMG >NZ_CP048617.1|WP_073195057.1|1671127_1671745_-|cyclodeaminase/cyclohydrolase-family-protein MLQDLNLKEFLEKTASKSPVPGGGSVAALSASLSASLIEMVGNLTIGKKGYEDVEDEMKEIVSICSKYREKFVNDIDRDSDAFNKVMAAFKLPKDTEEEKAARKEAIQESFKTAALVPLEVAEDAFKLLEFAAKVVEKGNKNAVTDGAVAAMMARTAVLSALYNVKINLGSIKDEEFVSKVSKQVESLESQVNNIEKEILSKVKL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048617_10 | 2278384-2278615 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP048617_10
|
3 spacers
spacers of NZ_CP048617_10
>10.1|2278414|39|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCGATACATTTCTATATCTTGCATAAGTTGATTTAAAT >10.2|2278483|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATCATCGACTCGCGAAGATTTTTGTTAAATTGACA >10.3|2278550|36|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT GATTCCATATCTGCTAATACCCAACCTGCAATACTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048617_10
The CRISPR arrays of NZ_CP048617_10 >merge|NZ_CP048617|10|2278384-2278615|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTATTAGAGTACCTATAAGGAATTGAAACTTCGATACATTTCTATATCTTGCATAAGTTGATTTAAATGTTATTAGAGTACCTATAAGGAATTGAAACAAATCATCGACTCGCGAAGATTTTTGTTAAATTGACAGTTATTAGAGTACCTATAAGGAATTGAAACGATTCCATATCTGCTAATACCCAACCTGCAATACTAGTTATTAGAGTACCTATGAGGAGAATATTA >NZ_CP048617|10|8|2278384-2278549|PILER-CR GTTATTAGAGTACCTATAAGGAATTGAAAC TTCGATACATTTCTATATCTTGCATAAGTTGATTTAAAT GTTATTAGAGTACCTATAAGGAATTGAAAC AAATCATCGACTCGCGAAGATTTTTGTTAAATTGACA GTTATTAGAGTACCTATAAGGAATTGAAAC >NZ_CP048617|10|10|2278384-2278615|CRISPRCasFinder GTTATTAGAGTACCTATAAGGAATTGAAAC TTCGATACATTTCTATATCTTGCATAAGTTGATTTAAAT GTTATTAGAGTACCTATAAGGAATTGAAAC AAATCATCGACTCGCGAAGATTTTTGTTAAATTGACA GTTATTAGAGTACCTATAAGGAATTGAAAC GATTCCATATCTGCTAATACCCAACCTGCAATACTA GTTATTAGAGTACCTATGAGGAGAATATTA >NZ_CP048617|10|7|2278384-2278615|CRT GTTATTAGAGTACCTATAAGGAATTGAAAC TTCGATACATTTCTATATCTTGCATAAGTTGATTTAAAT GTTATTAGAGTACCTATAAGGAATTGAAAC AAATCATCGACTCGCGAAGATTTTTGTTAAATTGACA GTTATTAGAGTACCTATAAGGAATTGAAAC GATTCCATATCTGCTAATACCCAACCTGCAATACTA GTTATTAGAGTACCTATGAGGAGAATATTA
>NZ_CP048617.1|WP_163235712.1|2276368_2278156_+|2Fe-2S-iron-sulfur-cluster-binding-domain-containing-protein MKKVTITIDNQVIQVPENYTVLEAARSIGIDIPTLCYLKEINEVAACRMCLVEVEGARNLQTSCVLPVREGMVVRTNTKKVREARKATLELLLSNHNRECLTCTRNGNCELQTLADELGVKDIPFEGEKTVAPVDTSSPSIVRDPQKCILCGRCVSVCQNVQTVGVLDFTNRGFKTVVGPAFDKGIGDVPCINCGQCIAVCPVGALREKESIDYVWEAIDDPNKHVVVQTAPAVRAALGEEFGLPMGTRVTGKMVAALRRLGFDKVFDTDFGADLTIMEEGYELLHRLKNGGKLPMITSCSPGWVKFCEHYYPEFLDNLSTCKSPHEMLGAIIKSYYAEKNNIDPKDIVVVSIMPCTAKKYESQREELSYAGYQDVDYVLTTRELAKMIKESRIDFVNLPNEDFDEVLGESTGAGVIFGATGGVMEAALRTVAEVVTGKELENIDFEQVRGTEGIKEAEVKLGDLAVKVAVAHGTGNARKLLEQIKSGEKEYHFIEIMACPGGCVTGGGQPHVSAKDRMTKDIMKERAKALYDEDKAKEIRKSHENPMIKKIYKEFLGEPNSHKAHELLHTHYVERKNYPVDEENKYKEYFCDCK >NZ_CP048617.1|WP_163235710.1|2274544_2276338_+|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-NuoF MNIYRAHVLICGGTGCTSSSSDKIQNEFELKIKEKGLDKEVKVVRTGCFGLCEAGPIVIVYPEGAFYSHVKVEDVEEIVEEHLLKGRIVKRLLYKDAVEEDTIKSINEVGFYKKQKRIALRNCGVINPEDINEYIAFDGYMALGKVLTEMTPEEVIQVVKDSGLRGRGGGGFPTGLKWEFTAKAQGDQKYVLCNADEGDPGAFMDRSILEGDPHSVLEAMAIAGYAIGANQGYIYVRVEYPIAVQRLEIAIKQAREKGLLGKNIFGTGFDFDIEVRLGAGAFVCGEETALIASIEGQRGMPRNKPPYPANKGLWGKPTLINNVETYANIPQIILKGAEWFRSIGTEKSPGTKVFALGGKINNTGLVEIPMGTTLREVIYEIGGGIPNGKKFKAVQTGGPSGGCIPADLIDTTIEFDTLTELGSMMGSGGMIVMDEDTCMVDIARFFLDFTVEESCGKCPPCRIGTKRMLEILEKITSGKGEPGDIEKLEKLANTIKSASLCGLGQTAPNPVLSTLKYFRHEYEAHVNEKRCPAGSCKSLLSYHIQEDLCKGCTVCAKVCPVGAISGERKSPHVIDQDKCIKCGACLEKCPFNAIVKK >NZ_CP048617.1|WP_035164872.1|2274127_2274496_+|(2Fe-2S)-ferredoxin-domain-containing-protein MKSLEELKKIKEETLKKVDLRKQKEGTRIVVGMATCGISAGARPVLMALLEEVKNRNLSDVIVTQTGCIGVCRLEPIVEVYRPGEEKVTYVEMTPEKAKRIIAEHIVNGKVVTEYTIGAYEK >NZ_CP048617.1|WP_035164874.1|2273470_2273959_+|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-NuoE MEFKFNWEENKDKIEELKKVIEENKGKKGALMPVLHEAQRIFGYLPIEVQRMISEGLNIPLAEIYGVATFYSQFSLIPKGKYQIGVCLGTACYVKGAQAIIDKIKEELKLEVGGTTKDRKFSLQATRCIGACGLAPVMTINEDVYGRLKADEIPAILKKYME >NZ_CP048617.1|WP_163235708.1|2271244_2272117_+|ParB/RepB/Spo0J-family-partition-protein MTKKKRGLGKGLAALIPDEPLHNIENDSENRVINIDVSLIQPSKEQPRRKFTLDSLNELAESIKVHGLIQPIIVRKIDDRYEVVAGERRLRAAKIAGFEQIPCIVKDFENRESAEVALVENIQRKDLNPIEEAIAYKRLMENYNLTQDEISIVVGKSRPYITNTLRLLNLSQQVIDFILENKLTSGHGRALLQINDSNIQIKIAKEIIEKKLSVRETEKLIKELKKDGKRKKKDKNETEKDIFILDVEEQLRKILGTKVQIVKGKKKGKIEIEYYNQDDLDRILDIILNS >NZ_CP048617.1|WP_163235706.1|2270471_2271245_+|ParA-family-protein MAKVIAVFNQKGGVGKTTTNVNLTACLAKKGKKILVIDIDPQGNTTSGFGINKNDVENSIYDSIINGLDIKKVIVNTDIENLYLVPSNVELAGAEIELTKKQDRELTLRNVIKDIRNDYDYIFIDCPPSLGLLTINSLVAVDSVLIPIQCEYYALEGVSQLMDTIRLVKKSLNPDLEIEGVVLSMFDGRTNLSIQVVDEVKKYFKGKVYTTIIPRNVRLAEAPSYGLPVIDYDPKSRGAEAYMELAEEFLEYVEDVI >NZ_CP048617.1|WP_163235704.1|2269447_2270245_+|nucleoid-occlusion-protein MSNLKEEIMYIPINCIKPNPYQPRKTFSKRSLEELGQSIKAYGIIQPISVRKINDNSYELVAGERRLRAAELVNLEKVPVVVLDMNDQDSAVLALIENLQREDLNFLEEAEGYYNLINDHGFTQQELAEKVGKNQSTIANKLRILRLPDEVKKMLIENGLTERHARALLKLPDKELQIEVLNKVIKNDLTVKKTEKLIKDILEEITKEKEPESKQNIKSIINFKIYLNTLKNAYNAIKESGIDAKYEQRDKGDFIEVVVKIPKKK >NZ_CP048617.1|WP_163235703.1|2268544_2269261_+|16S-rRNA-(guanine(527)-N(7))-methyltransferase-RsmG MSNIDTLIEGSRELGISLKAEEIEKFYKFKELLKEWNKKINLTAIEDDKEIDIKHFLDSLTLLKTDYIKDGYKIIDIGTGGGFPGIPLKIVREDIELVLMDSLQKRIKFLDLVINELELDNIKAIHGRAEDFGRDKEYREKFDIAVSRAVASLNILSEYCLPFVKVGGLFIAMKGPDVDAELKESERAIRLLGGKVLDVIKIKLPLSDITHTLIIIEKINETLTKYPRKAGKPKKNPL >NZ_CP048617.1|WP_163235701.1|2266653_2268552_+|tRNA-uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34)-synthesis-enzyme-MnmG MKYQAGEYDIIVIGAGHAGCEAALAAARMGMKTLLLTINLDSIALMPCNPAIGGTGKGHLVREIDALGGEMGKNIDKTFIQSRMLNTSKGPAVHSLRAQADKKRYQSSMKQVIEEQKNLDLKQAEVIEILVEDKKVTGVVTKTGGVYSGRAVILATGTYLKGRIFIGEVNFEGGPNGLFPANHLSESLKKIGVKLRRFKTGTPARIHRDSIDFSKMEVQPGDEEIVPFSFLNDKIEKDQVPCWLTYTNEETHKVILDNLNRSPLYAGEIEGVGPRYCPSIEDKIIRFSDKKKHQIFIEPEGLDTCEMYVQGMSTSLPEEVQIKMLRTVPGLENVEIMRPAYAIEYDCIDPTQLKRTLEYKEIENLYFAGQINGTSGYEEAAAQGIIAGINAVLKLRGKEPFILDRSEAYIGVLIDDLVTKGTNEPYRMMTSRAEYRLILRQDNADLRLTEKSYKIGLADEERYKKVVYKRQKIEEEIKRLKNIKITPTKEIQEFLTSKNSTPLKAPTTLYDLIKRPELSYEILAEIDKDRPKLPREIRMQVEIQIKYQGYINKQLKQIEQFKKLENKKLPKDIDYSKIEGLRLEARQKLNDIRPDSIGQASRISGVSPADISVLLIYLEQQKRLKTRSENDE >NZ_CP048617.1|WP_163235699.1|2265241_2266624_+|tRNA-uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34)-synthesis-GTPase-MnmE MYFDTIAAVATAPGEAGIGIVRISGEKALEIVDKIFRTKKERKLSDFQERRLTYGYIVEPDTGKKIDEVLAVYMKAPYTYTKEDIVEINCHGGMIPVRRILEIVLENGARLAEPGEFTKRAFLNGRIDLSQAEAVIDLIRAKTDSSFDVSFNQLEGGLSKEINEIREILLRMLANIEASIDFPEEDIETMTYKELVDEGNNVLKRIEKLLDTVYTGKILREGLKTVILGKPNVGKSSLMNAILRENRAIVTDIPGTTRDIIEEYVNIKGIPLKIIDTAGIRETEDVVERIGVERAKSLLEEADLVIVLFDVSKELTEEDMEIARLVKNKKVIVLTNKIDLPPVVSREEIEKILPGKKIIETSIIKGEGLEVLEDSLKEMFFAGEIKIKDNTIVTNARHKSLLLKAKKNIEEAIESIEMGMPIDCIEVDVKDCWENLGQITGDTVTEDIIDKIFEEFCIGK >NZ_CP048617.1|WP_073197450.1|2278941_2279766_+|formate/nitrite-transporter-family-protein MQKRMLTPSEIAQATINAGIKKANLSALQMILLGIFAGIFIGFGAQADITVMQTLKNVDIGLMKFMGAAVFPVGLMLVVMAGAELFTGNNLMTLALMDKKITLNQMLKNWFFVYLGNFIGSILLAAVVVKSGLYKIDTPATQLATKIAAGKIGLAFNQAFLRAILCNIIVVLAVWLATGAQDVISKIFACWFPIMMFVLSGYEHSVANMYFISLGKFLGLETTWGQIWVKNLIPVTLGNIVGGAVIVPIVYYLVYIVPAKENIDLERNIKSNLF >NZ_CP048617.1|WP_163235714.1|2279827_2280970_+|aminotransferase-class-V-fold-PLP-dependent-enzyme MIYLDNAATTYPKPEEVYQAMIESMKEFGANPGRSGHRLALKAGRAIYETRELLSKLFNIENPMNIIFTSNATEGLNLGIKGILKSGDHVITTSMEHNSVLRPLKALESIGVETTIIQCDKTGMINIDDIEKNIKQNTKMIITTHASNVTGTLFPIDEISKIAHENGLLYMVDAAQTAGVYDIDVKSMNIDILAFPGHKSLLGPQGTGGVYIRDGIDVVEMKEGGTGSKSESLIQPEMLPDKFESGTPNTPGIVGLGAGVKFILKTGIENIRKHEEELTEHFIRELEKIDKVKIYGPCDVSKQAPVVSINLGEEDSSEVSYILDKVFNIAVRPGLHCAPLAHKTIGTFEQGVVRFSIGYFNTHEDIENAVKAVREIAKEI >NZ_CP048617.1|WP_073197447.1|2281039_2281555_+|DUF4446-family-protein MEEMIAQYSNQIIIFLTVGVIILLILNIISQIRISSITKKYNRLVEGVDKDSLEDLIFEYIEEVKDMKKEAEVIKDMYEKLNNKLKFAVQRVGFVRYNAFNDVGSDLSFSIALLDDNLNGFVISSLFGRNECNTYAKPIFNGESKYALSDEEIQAIKMAKEYGVSSKLGNI >NZ_CP048617.1|WP_035165126.1|2281623_2281908_+|hypothetical-protein MVKKIAIQNGLDDLKYSLKSRGYEVYDINENKEVEAVIYMADGYNVPYIDKFINMNTGVEMSGGNEVLLINATGKTLQEIEYIINNRLYSPLFK >NZ_CP048617.1|WP_035165124.1|2281915_2282515_-|spore-protease-YyaC MFFQINHNKNSINSFSPYAVSEFSKIILEYLNKYYNKKNYKELIIVCIGTDRSTGDSLGPLVGYKLYPFFKKNNKVHLFGTLDNPVHAKNLKENINFIKSTFDNPFVVAIDACLGNIDRIGYVKVEKGPLKPGAGVNKNLPEIGDIHITGIVNISGFMEYIVLQNTRLSIVMKMADVISKSFYLSYIQFYKNNIQTIHK >NZ_CP048617.1|WP_163235716.1|2288345_2289323_+|hypothetical-protein MQDIISISQNKCKQCYSCVRNCSAKAVQIESGQAKIIHSRCINCGKCIKSCPQEAKIVLDSKGKTLNILKENDTVIACIAPSFVVSFHKYNYKKIIGALKEVGFSEVWEVAVGAEYVIEAISQYIKNKENNLFLSSPCPAFISLIEKHYPEMIKYLLPFVSPMIATGKIIREMHKGKDVKIVFIGPCVAKKCEALEPQFNGIIDSVLTFDELKDIFKIKGVNIEKAKEMDFDSIYCNEGKLFPLSGGLLRNLKSLYNLNESEYVVIDNDKDCIELINAIKDGKFKGKFVDVLMCRGCIDGPKIDSSLNYYERINKIYEYKNSTKK >NZ_CP048617.1|WP_163235718.1|2289427_2290990_+|PAS-domain-S-box-protein MTNKFTKEDELNCGACGYNTCREKAIAVLQGIAEVDMCLPYLISKKSKLVEQLSETLKETKNLKDELEAVIESSYDGLVVTDGNGRILKTNSAWRKMVGYKNKKEESVKDMENKNIIFPSATLLVLKEKRRISFIQYAHNDKEYLATATPIFDNDSSVKMVVTNIRDIDELNRLREQIEETRKLQKYHKETKRIKYKDYYNENIVVNSIEFGEVLGLASSVAKVDSTVLILGESGVGKEIVANFIHNLSIRKDKPFIKINCGAIPENLIESELFGYETGAFTGAKKKGKPGLIELADEGTLFLDEIGELPLNLQVKLLRVIQERKIMRIGGIKEKYVDVRIIAATNRDLYKMVQRGEFRADLYYRLNVVPIEIPPLRKRKTDILPLCYHFLDIFNSKYRCNKRLSKSVEKILEDYNWPGNVRELENLIERVVVTTPGDIIDVKDLPMFLLENTNDGSKKIDIEGIMPLREAVELVEKKLIKRAYKQCKSTYEMAKVLGVNQSTVVRKIQKYIKSNALKHD >NZ_CP048617.1|WP_035164031.1|2291138_2291498_+|(2Fe-2S)-ferredoxin-domain-containing-protein MILNDFYQQLRESAEEAIKSKRESGKIRAVLGYSICSVSVGANEVLRAMQEVLVEADIHNVILETTGCIGLCYKEPLLDIYMPNGMKYTYELVTPSKARAIIVSHSLYGEPMEEWLLKM >NZ_CP048617.1|WP_052045268.1|2291510_2291984_+|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase-subunit-E MNLQQIVSDAIDKKGNTKDKLIEILLEIQSRTEGNYVPTESLKMVSESLDIPLSKVYGVATFYSMLSVKKRGKYAIQICNSAPCYISGSSDIVKIFEEVLGIKMGEVTQDGMFSLEYTSCIGACNLAPAVKINDKVYGNLDRNKIIEIIASLRKGGE >NZ_CP048617.1|WP_163235720.1|2291983_2293276_+|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-NuoF MVSLISRLCGKLDPLSIYDYREKGGFKSLEKVLFKMKPIDVIDEIKKSNLKGRGGAAFPTGLKWQFVSMEESDEKYVICNADEGEPGTFKDKILLDGCPFQIIEGMLIAGYAVGAKKGFIYIRGEYPKSKELLIEAVDILKKEGYLGDNILSSDFSFDIEIRSGAGAYVCGEETALIESIEGEPGRSRFKPPYPPNKGLWGKPTLVNNVETLANIPVILEIGAENYKKYGTESSSGTKLISVSGSVVNKGVYEVEFGITLREIIYDICGGLIEDRKLKFLQIGGSSGVCIPVDMLDLRLDFDEFRKHDIGLGSGAILVVDENTCVVDFIKVTSEFFEHESCGKCTPCREGNYHIVRILKRIAEGKGRRRDLDLLKSISDVMQQCSLCGLGQAAPTALITTMKYFKEEYEEHLKGYCRAGKCTFKGGVLDE |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048617_11 | 2343074-2343300 | TypeII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP048617_11
|
3 spacers
spacers of NZ_CP048617_11
>11.1|2343097|46|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder ACTGGTTTGACGGACAAAAAAGTGGACAAGGCAAATACATATGGGC >11.2|2343166|46|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder ATTGGCATGAAGGAAGGATATATGGTAAAGGGAAATATACATTTGC >11.3|2343235|43|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder AATTTGCAGATGGAGAAATGATTAAAGGAGTTGTAACAAAAGC |
Cas9_archaeal |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP048617_11
The CRISPR arrays of NZ_CP048617_11 >merge|NZ_CP048617|11|2343074-2343300|CRISPRCasFinder TAATGGAGATATATATGAAGGAAACTGGTTTGACGGACAAAAAAGTGGACAAGGCAAATACATATGGGCTAATGGAGATATATATGAAGGTAATTGGCATGAAGGAAGGATATATGGTAAAGGGAAATATACATTTGCCAATGGAGATATTTACGAAGGAGAATTTGCAGATGGAGAAATGATTAAAGGAGTTGTAACAAAAGCTAATGGAGAAAAATATGAAATAG >NZ_CP048617|11|11|2343074-2343300|CRISPRCasFinder TAATGGAGATATATATGAAGGAA ACTGGTTTGACGGACAAAAAAGTGGACAAGGCAAATACATATGGGC TAATGGAGATATATATGAAGGTA ATTGGCATGAAGGAAGGATATATGGTAAAGGGAAATATACATTTGC CAATGGAGATATTTACGAAGGAG AATTTGCAGATGGAGAAATGATTAAAGGAGTTGTAACAAAAGC TAATGGAGAAAAATATGAAATAG
>NZ_CP048617.1|WP_163235799.1|2342069_2342459_+|zinc-ribbon-domain-containing-protein MFCNKCGNEIPDDSKYCLKCGNQIETEETAEDKEVEKGQAVAIKVNKQNTVQKSVCLVCKGRGKKIKKRYAAISIIITIFVLTPMLFIFGTMEGSTGLLGFILLASSVLGWGFKKRKCPVCDGKGSINL >NZ_CP048617.1|WP_163235797.1|2341752_2341953_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MDIGEKIREERIKKGLKQRQLANKAGISNTYLSDIEVGRTTPSIKTLMKIAQALDVDCTVFLKSDN >NZ_CP048617.1|WP_163235795.1|2341182_2341536_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MVGKRIKMLRKERGLSLKELSKKTDISISFLSDIENGRSNPSLERLKDIARGLNTTVSYLLGETDDIEINSEIKKLLSNPEFLKVLDELKDFNSWSDEDKSEFLAYIKAKRMIRNSK >NZ_CP048617.1|WP_163235793.1|2340629_2340998_+|hypothetical-protein MIKIGYEREVKNIKDLPKEVLEVVRGIVATLDTYYGENRDLDSEDGGYVLIIQSEEDIEKLEEFDIYIDEEIYPEYVDRIKVEEGEDWINALILCNNEFGISLIIPISIAPEILLDEISEDA >NZ_CP048617.1|WP_163235791.1|2340070_2340613_+|DUF1643-domain-containing-protein MPITQKTTIKTEAHFSKDGKHRYLLKKEWNKNKKKAMVMMINPSSADGMVIDHTTMYVINNLSKLDFGSVDIVNMFSKIDIRLSSRQNIKELVDKENDDYIEKSAAKADYIIIAWGSIGENNKKIKERQKEIFNLLKKYKDKLYIICDSRGKGGYHPLAPQIRHSWKLEKINLEDDLKIK >NZ_CP048617.1|WP_163235789.1|2338920_2339883_+|hypothetical-protein MLDRIIDEIKEKSVVIYTIILLSFTCFLLVKFWNLVVLTREALFKSVIILALHWESILFIIVLFITVRYLFKLSNEKSQEEIDRYHKPLEVESKCRRYISAKLIERYGKLNNVYGKILEIVIRNESHSDINYVKGYISLYKDFTRISKIDFEIDNFRKLFSERVFYDFIDHKKLFWDGFDIYVYQIRIGDKIDNNFTIEGNHFIRTHYLELNLEKFYDFRIFGVKTKYNLAWLKKKVREKILYGIQFFYSERRIHFYQKSFLLKLIDIDIISRYLRFLLVIFVLFIILLAIVFLLTDIGKVLLALYEVWKYYFQQIANFI >NZ_CP048617.1|WP_163236300.1|2338566_2338881_+|nucleotidyltransferase-domain-containing-protein MKNEISRIINQIQSVVLTSKIYLFGSFVYGTPNDDSDLDLCIVINERNIRKRDLIKTIIKVISKVATMPVDILVYYKDEFDERATLESTLEYKIVHEGVSLYEQ >NZ_CP048617.1|WP_163235787.1|2337988_2338468_+|23S-rRNA-(pseudouridine(1915)-N(3))-methyltransferase-RlmH MHIAIISVGKIKEKYLNEGIKEFSKRLSKYCKLKLVEVNDEKAPENLSEAEMEIVKKKEGERILGKLNENSYIITLCIDGESLSSEEFSKKLDSLALSGNSNITFIIGGSLGLSQDVINKSHFKLSFSKMTFPHQLMKLILLEQIYRAFRISRGEPYHK >NZ_CP048617.1|WP_163235785.1|2337566_2338004_+|hypothetical-protein MKLGNKDKLYIYQRDLKRCFYCGKKLKFHQITLDHYFPVSKGGTNDVFNLVTCCKKCNKLKADFLPQDYEAVILKLFLTAVIDDKIIGKGLNIDNKKLKKELLNVNRIECITDRFIFQSNSMRFYIKDNYVTKVVYLGGCECILR >NZ_CP048617.1|WP_073197358.1|2337316_2337484_+|CxxH/CxxC-protein MYVVCNEHLDIAIEEFIDVYEQPPDIYELDKVSFTDWTSPHTCDFCDKKPKYLIV >NZ_CP048617.1|WP_163235803.1|2343853_2344072_+|hypothetical-protein MPLPEIMMGLCMITLAVAFFKFQWGKGILYLFLMATVGSAVFQSSETIGSIVMIIISIVFLKWMNRKPKLFE >NZ_CP048617.1|WP_163235805.1|2344325_2345624_+|copper-amine-oxidase-N-terminal-domain-containing-protein MKKISIFLVIILLMNVVGPLKVLADEQSIKVSINGKLVEFDVPPTIINGRTLVPVRAILEQFGLKVDWDNETRTVIGKKDGLEIKLPVDNKKAQKNGEEIKIDVPATIINGRTLVPIRFIAESIGAKVDWDDKTKTVIITSSAKMNPFSLEKLKQLVENTPVDKEILEFRKKPNKRRNGLKKIEGKYFDLYYPDDDKAKAVAEFLKPYMDTAYIYLVELYGQQAPVEVHLIHEKDAENLKEGDIRRKENVTFVWIEPNNDDGGNNIAELVHEMHHNFFKHVNNNWSWADDKWSSFVDESLAKLLPSLYVKNVYDGKTDMWDIESDYTRTLIGIKKSVGNDFVTLDEAVDKYLGKPRSWGRAEGRHRIAQNTALAFWMYVYNEYGIEKIKEVLRTIGKGNYKPKLEKIFNKSTEELSDELINVMKESYDTYSY >NZ_CP048617.1|WP_163235807.1|2345760_2346246_+|JAB-domain-containing-protein MSRNQRKRVDIVTIRISKLELVKESSFFYKSGEERRKIISPRNAFDLVENMFKGLDREMVVAAYLNTKQEPLAISKISIGSLNSSIVHPREILKAAILSNAASFILYHNHPSGDYRTPSKEDISITKRIKEAGELIGIQLLDHLIVYEDKFMSMKEHNYLF >NZ_CP048617.1|WP_163234360.1|2346368_2347544_-|IS110-family-transposase MIIVGIDIGKFNHEATIIDIQGNIIGKSIRFSNSHQGTNKLLKYIRENNPYNEEIIFGLEATGHYWLALYSRLLSEGFKINVINPIQSDSFRNLYIRKTKNDTKDSFIIAEVIRFGRFTSTKLSDEKILALRQLCRYRTYMVDQISDLKRKVISVLDQIFPEYSKLFSDVFGKTSKELLLNHTTPEKIANLDTNYLAELLSKLSKGRLGFEKATQIKEAAANSFGIKLATDAFTFQIKQLLEQIKFMEAQLKELEENIANNFQTFNSPLTSIPGIGPVLGAIILSEIGDFSRFSNAAKLVAYAGIDPSVKQSGQFNATHNRMSKRGSPYLRRAIWMAATVAAFKDPVLNNYYNKKRSEGKHHLTAIGAVARKLTYIIYAVMRDNKEYTPMA >NZ_CP048617.1|WP_163235809.1|2347893_2348217_+|DUF960-domain-containing-protein MFEGKRYMTIGVKEMVGLDIQIIIWSMIDDISKKNDFNIDYLQVFELETIEINGLEFQKITHKQEVEPYSVTKIFKVEKPVNCKIFIISNKEEEGKEYSVMMLSHEY >NZ_CP048617.1|WP_163235811.1|2348431_2348848_-|hypothetical-protein MGIIRRDAIKKISKNKEAKIAYFKNELFLCRKKIKELKSISVDNLSDFKKIQLERDLQIEMHKREVLKKRLLGLGISEKRGRPKKNDSEKYSTTHKKFTAMLKPENLEYLKKLKSDKKIKNISCFLDELIEKYRFDNE >NZ_CP048617.1|WP_163235813.1|2349033_2349564_-|hypothetical-protein MMQEKQKAENYFDKSIHAMFIRNRLSHAVLEEKKRLEREGYFVPNTTLYVQGDTRQKFEPEKHFTKSFKNKIDEIKKEFGLTLTEMGIIYTLSYYINYEDNLLCHPNGNPLCKKDLQEILDLAHNAVDKYMNLLVKKGVLAKVKVKRSVNYYMNPYIFYKGNRIDNTLLNMFNKAK >NZ_CP048617.1|WP_163235815.1|2349660_2350689_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MSKLERMIFKAMKIVNKLNEELEFLESKKEKSISDIKRIRKIKVLLELIDGKTVLQCSTKWDLPISTVYRWNKEIKEGKISINTGGRNHRLNREQREEISKLILEKPKAYGYGLDFWTGKVLKDFIKKRFNIDIKERTAQKILYDNYVFPNEYTFEQFNKLINEYEKSSEVNLWYFISFLVWRKSEPKVEEGEICIGRRNILYYFMALNKKENKILVYEVVDEAKVTYDDFTVFVKDWINDYMDDRKNIIVMAKTSQNMRMAVDIALKKIDGMKLNRNIEILFIPMKERPTNNCIWKLNPLYLLKEDILNIIKENKKDSWTRVRSNVDKKITDMIEKQYALY >NZ_CP048617.1|WP_163235817.1|2351084_2351630_+|hypothetical-protein MIKKRPEKQQKSENIKEVVQQSQIETVFNQEKIIANCEQNLNNVTNKTASILDKFENCKSIGKSRDIGKGAAALSLVNSKNGMRVTLGAEVYRRINSPDKIQIAFSADEIAVFKSLPENKNYFRPRITGKVKKAIIYSADLVREITNKYGLEFNNRVSYSFYDVRYITENGITIALVKVKK >NZ_CP048617.1|WP_163235819.1|2351754_2352144_+|hypothetical-protein MLKVKPVTIFNEDNFEEYYTRIKIFTNKRANVRTVQKMTRTLDRISEIENIELRNKKYISITCKLNEWTPNYYRKIQKNFRDRVKNMVIKLMERTKLDSYSLSIYRYALGSNEITDEFQIDVSKEQKIY |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048617_4 | 4.42|1347892|36|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1347892-1347927 | 36 | NZ_CP048617.1 | 363104-363139 | 0 | 1.0 |
NZ_CP048617_8 | 8.12|1594337|38|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1594337-1594374 | 38 | NZ_CP048617.1 | 260824-260861 | 0 | 1.0 |
NZ_CP048617_8 | 8.19|1594804|38|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1594804-1594841 | 38 | NZ_CP048617.1 | 260824-260861 | 0 | 1.0 |
NZ_CP048617_8 | 8.26|1595274|38|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1595274-1595311 | 38 | NZ_CP048617.1 | 260824-260861 | 0 | 1.0 |
1. spacer 4.42|1347892|36|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 363104-363139, mismatch: 0, identity: 1.0
tcggcttttttcgcttccttttttatctcatttatt CRISPR spacer tcggcttttttcgcttccttttttatctcatttatt Protospacer ************************************
2. spacer 8.12|1594337|38|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to position: 260824-260861, mismatch: 0, identity: 1.0
gattctttccaccttataagagtttcaatgcatgtgct CRISPR spacer gattctttccaccttataagagtttcaatgcatgtgct Protospacer **************************************
3. spacer 8.19|1594804|38|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to position: 260824-260861, mismatch: 0, identity: 1.0
gattctttccaccttataagagtttcaatgcatgtgct CRISPR spacer gattctttccaccttataagagtttcaatgcatgtgct Protospacer **************************************
4. spacer 8.26|1595274|38|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to position: 260824-260861, mismatch: 0, identity: 1.0
gattctttccaccttataagagtttcaatgcatgtgct CRISPR spacer gattctttccaccttataagagtttcaatgcatgtgct Protospacer **************************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_LR214939 | Mycoplasma salivarium strain NCTC10113 plasmid 2 | 552765-552799 | 6 | 0.829 |
NZ_CP048617_8 | 8.60|1597560|36|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1597560-1597595 | 36 | NZ_KT901798 | Clostridium botulinum strain GA0702E1CS plasmid pGA0702E1CS, complete sequence | 7422-7457 | 6 | 0.833 |
NZ_CP048617_1 | 1.7|742663|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 742663-742699 | 37 | NZ_KT901798 | Clostridium botulinum strain GA0702E1CS plasmid pGA0702E1CS, complete sequence | 7421-7457 | 7 | 0.811 |
NZ_CP048617_1 | 1.7|742663|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 742663-742699 | 37 | MK250029 | Prevotella phage Lak-C1, complete genome | 485465-485501 | 7 | 0.811 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NC_011736 | Borreliella burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp32-4, complete sequence | 23220-23254 | 7 | 0.8 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_AP010873 | Candidatus Ishikawaella capsulata Mpkobe plasmid pAst, complete sequence | 7005-7039 | 7 | 0.8 |
NZ_CP048617_4 | 4.35|1347436|35|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1347436-1347470 | 35 | CP035920 | Vibrio cidicii strain 2423-01 plasmid unnamed1, complete sequence | 71038-71072 | 7 | 0.8 |
NZ_CP048617_8 | 8.60|1597560|36|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1597560-1597595 | 36 | MK250029 | Prevotella phage Lak-C1, complete genome | 485466-485501 | 7 | 0.806 |
NZ_CP048617_1 | 1.7|742663|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 742663-742699 | 37 | NZ_CP039286 | Leptospira interrogans strain FMAS_AW1 plasmid pLiSL3, complete sequence | 61772-61808 | 8 | 0.784 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_CP028882 | Borreliella bavariensis PBi plasmid lp28-3, complete sequence | 19768-19802 | 8 | 0.771 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | HG796796 | Uncultured bacterium plasmid pRGF00045 | 2004-2038 | 8 | 0.771 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_CP019926 | Borreliella burgdorferi strain PAbe plasmid p_lp56, complete sequence | 26834-26868 | 8 | 0.771 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NC_017424 | Borreliella burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-10, complete sequence | 23223-23257 | 8 | 0.771 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NC_000956 | Borreliella burgdorferi B31 plasmid lp56, complete sequence | 26834-26868 | 8 | 0.771 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_CP019855 | Borreliella burgdorferi plasmid lp56, complete sequence | 26834-26868 | 8 | 0.771 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_CP019766 | Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 plasmid p_lp56, complete sequence | 26814-26848 | 8 | 0.771 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_CP017203 | Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_cp32_1, complete sequence | 23329-23363 | 8 | 0.771 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_CP017204 | Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_cp32_10, complete sequence | 23218-23252 | 8 | 0.771 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NC_018689 | Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC429, complete sequence | 207721-207755 | 8 | 0.771 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NC_019308 | Lactococcus lactis subsp. lactis plasmid pIL6, complete sequence | 8220-8254 | 8 | 0.771 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | MK250019 | Prevotella phage Lak-A2, complete genome | 30871-30905 | 8 | 0.771 |
NZ_CP048617_1 | 1.34|744435|36|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 744435-744470 | 36 | MN693026 | Marine virus AFVG_117M72, complete genome | 85917-85952 | 8 | 0.778 |
NZ_CP048617_4 | 4.1|1345203|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1345203-1345239 | 37 | NC_018982 | Borrelia burgdorferi 297 plasmid 297_cp32-9, complete sequence | 19171-19207 | 8 | 0.784 |
NZ_CP048617_4 | 4.1|1345203|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1345203-1345239 | 37 | NC_017397 | Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-9, complete sequence | 27246-27282 | 8 | 0.784 |
NZ_CP048617_4 | 4.1|1345203|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1345203-1345239 | 37 | NC_004971 | Borrelia burgdorferi 297 plasmid cp18-2, complete sequence | 19153-19189 | 8 | 0.784 |
NZ_CP048617_5 | 5.3|1466534|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder | 1466534-1466568 | 35 | MK064563 | Sulfolobales Beppu filamentous virus 2 clone B, partial genome | 10354-10388 | 8 | 0.771 |
NZ_CP048617_7 | 7.5|1580961|33|NZ_CP048617|PILER-CR | 1580961-1580993 | 33 | MN693990 | Marine virus AFVG_250M702, complete genome | 90-122 | 8 | 0.758 |
NZ_CP048617_7 | 7.5|1580961|33|NZ_CP048617|PILER-CR | 1580961-1580993 | 33 | MN693990 | Marine virus AFVG_250M702, complete genome | 38473-38505 | 8 | 0.758 |
NZ_CP048617_8 | 8.6|1593944|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1593944-1593978 | 35 | MG945224 | UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 1409-1801, partial genome | 3119-3153 | 8 | 0.771 |
NZ_CP048617_8 | 8.60|1597560|36|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1597560-1597595 | 36 | NZ_CP039286 | Leptospira interrogans strain FMAS_AW1 plasmid pLiSL3, complete sequence | 61773-61808 | 8 | 0.778 |
NZ_CP048617_8 | 8.60|1597560|36|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1597560-1597595 | 36 | NZ_CP031735 | Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain Klebsiella pneumoniae plasmid pKPM501, complete sequence | 178308-178343 | 8 | 0.778 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_LR214986 | Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13 | 747802-747836 | 9 | 0.743 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_CP019918 | Borreliella burgdorferi strain PAbe plasmid p_cp32-5-1, complete sequence | 42733-42767 | 9 | 0.743 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_CP019918 | Borreliella burgdorferi strain PAbe plasmid p_cp32-5-1, complete sequence | 47096-47130 | 9 | 0.743 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NC_019004 | Borrelia burgdorferi 297 plasmid 297_cp32-11, complete sequence | 23198-23232 | 9 | 0.743 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NC_017424 | Borreliella burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-10, complete sequence | 18953-18987 | 9 | 0.743 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NC_017400 | Borreliella burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-4, complete sequence | 8848-8882 | 9 | 0.743 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NC_017393 | Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-11, complete sequence | 19075-19109 | 9 | 0.743 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NC_017393 | Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-11, complete sequence | 23344-23378 | 9 | 0.743 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NC_017425 | Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-6, complete sequence | 23268-23302 | 9 | 0.743 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NC_017426 | Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-8, complete sequence | 23499-23533 | 9 | 0.743 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NC_015909 | Borreliella bissettii DN127 plasmid cp32-5, complete sequence | 18611-18645 | 9 | 0.743 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_CP031407 | Borreliella burgdorferi strain MM1 plasmid plsm_cp32-7, complete sequence | 3835-3869 | 9 | 0.743 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NC_000948 | Borreliella burgdorferi B31 plasmid cp32-1, complete sequence | 18781-18815 | 9 | 0.743 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NC_000948 | Borreliella burgdorferi B31 plasmid cp32-1, complete sequence | 23144-23178 | 9 | 0.743 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_CP015800 | Borrelia mayonii strain MN14-1539 plasmid cp32-3, complete sequence | 22847-22881 | 9 | 0.743 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_CP015801 | Borrelia mayonii strain MN14-1539 plasmid cp32-4, complete sequence | 22858-22892 | 9 | 0.743 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_CP019846 | Borreliella burgdorferi plasmid cp32-1, complete sequence | 18757-18791 | 9 | 0.743 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_CP019846 | Borreliella burgdorferi plasmid cp32-1, complete sequence | 23120-23154 | 9 | 0.743 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_CP019756 | Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 plasmid p_cp32-1_1, complete sequence | 49449-49483 | 9 | 0.743 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_CP019756 | Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 plasmid p_cp32-1_1, complete sequence | 53812-53846 | 9 | 0.743 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_CP017203 | Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_cp32_1, complete sequence | 18985-19019 | 9 | 0.743 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_CP017206 | Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_cp32_4, complete sequence | 19273-19307 | 9 | 0.743 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_CP015784 | Borrelia mayonii strain MN14-1420 plasmid cp32-3, complete sequence | 22814-22848 | 9 | 0.743 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | CP031026 | Lactobacillus phage ViSo-2018a, partial genome | 33949-33983 | 9 | 0.743 |
NZ_CP048617_1 | 1.27|743978|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743978-744012 | 35 | LN681534 | Clostridium phage phiCD24-1, complete genome | 11019-11053 | 9 | 0.743 |
NZ_CP048617_2 | 2.4|1340264|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1340264-1340298 | 35 | MN698242 | Pelagibacter phage HTVC103P, complete genome | 7796-7830 | 9 | 0.743 |
NZ_CP048617_4 | 4.1|1345203|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1345203-1345239 | 37 | MN855996 | Bacteriophage sp. isolate 400, complete genome | 6034-6070 | 9 | 0.757 |
NZ_CP048617_4 | 4.1|1345203|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1345203-1345239 | 37 | NZ_CP019123 | Vibrio vulnificus strain FORC_054 plasmid pFORC54, complete sequence | 5248-5284 | 9 | 0.757 |
NZ_CP048617_6 | 6.16|1519013|37|NZ_CP048617|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1519013-1519049 | 37 | MN935200 | UNVERIFIED: Staphylococcus phage VTCCBPA116 genomic sequence | 57576-57612 | 9 | 0.757 |
NZ_CP048617_6 | 6.16|1519013|37|NZ_CP048617|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1519013-1519049 | 37 | KX011028 | Staphylococcus phage pSco-10, complete genome | 64536-64572 | 9 | 0.757 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_LR214999 | Mycoplasma conjunctivae strain NCTC10147 plasmid 3 | 2839-2873 | 10 | 0.714 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_LR215005 | Mycoplasma conjunctivae strain NCTC10147 plasmid 9 | 6929-6963 | 10 | 0.714 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_LR215007 | Mycoplasma conjunctivae strain NCTC10147 plasmid 11 | 14814-14848 | 10 | 0.714 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | LR214969 | Mycoplasma fermentans strain NCTC10117 genome assembly, plasmid: 15 | 16007-16041 | 10 | 0.714 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | MK408758 | Campylobacter phage CP20, complete genome | 170043-170077 | 10 | 0.714 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | FN667789 | Campylobacter phage CPt10, complete genome | 171019-171053 | 10 | 0.714 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_CP031408 | Borreliella burgdorferi strain MM1 plasmid plsm_cp32-1, complete sequence | 8206-8240 | 10 | 0.714 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | KT725776 | Bacillus phage vB_BceS-MY192, partial genome | 3317-3351 | 10 | 0.714 |
NZ_CP048617_1 | 1.40|744825|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 744825-744861 | 37 | NZ_CP028373 | Campylobacter jejuni subsp. jejuni strain huA17 plasmid unnamed1, complete sequence | 55508-55544 | 10 | 0.73 |
NZ_CP048617_1 | 1.40|744825|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 744825-744861 | 37 | NZ_CP018901 | Campylobacter coli strain YH502 plasmid pCOS502, complete sequence | 23506-23542 | 10 | 0.73 |
NZ_CP048617_1 | 1.40|744825|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 744825-744861 | 37 | NZ_CP040614 | Campylobacter sp. CFSAN093246 plasmid unnamed, complete sequence | 34869-34905 | 10 | 0.73 |
NZ_CP048617_1 | 1.40|744825|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 744825-744861 | 37 | NZ_CP014745 | Campylobacter jejuni strain OD267 plasmid pCJDM67 L, complete sequence | 97751-97787 | 10 | 0.73 |
NZ_CP048617_1 | 1.40|744825|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 744825-744861 | 37 | NZ_CP017026 | Campylobacter coli plasmid pCC14983A-1, complete sequence | 25018-25054 | 10 | 0.73 |
NZ_CP048617_1 | 1.40|744825|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 744825-744861 | 37 | NZ_CP014345 | Campylobacter jejuni strain RM3194 plasmid unnamed, complete sequence | 38542-38578 | 10 | 0.73 |
NZ_CP048617_1 | 1.40|744825|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 744825-744861 | 37 | NZ_CP014743 | Campylobacter jejuni strain WP2202 plasmid pCJDM202, complete sequence | 100412-100448 | 10 | 0.73 |
NZ_CP048617_1 | 1.40|744825|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 744825-744861 | 37 | NZ_CP044166 | Campylobacter coli strain AR-0416 plasmid pAR-0416 | 23002-23038 | 10 | 0.73 |
NZ_CP048617_1 | 1.40|744825|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 744825-744861 | 37 | NZ_CP044176 | Campylobacter coli strain AR-0411 plasmid pAR-0411, complete sequence | 14275-14311 | 10 | 0.73 |
NZ_CP048617_1 | 1.40|744825|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 744825-744861 | 37 | NZ_CP017417 | Campylobacter jejuni strain MTVDSCj13 plasmid pMTVDSCj13-2, complete sequence | 12324-12360 | 10 | 0.73 |
NZ_CP048617_1 | 1.40|744825|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 744825-744861 | 37 | NZ_CP025282 | Campylobacter coli strain YH503 plasmid pCOS503, complete sequence | 13125-13161 | 10 | 0.73 |
NZ_CP048617_1 | 1.40|744825|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 744825-744861 | 37 | NZ_CP048772 | Campylobacter jejuni strain ZS007 plasmid pCJ145K, complete sequence | 9782-9818 | 10 | 0.73 |
NZ_CP048617_1 | 1.40|744825|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 744825-744861 | 37 | NZ_CP048772 | Campylobacter jejuni strain ZS007 plasmid pCJ145K, complete sequence | 48300-48336 | 10 | 0.73 |
NZ_CP048617_1 | 1.40|744825|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 744825-744861 | 37 | NZ_CP048772 | Campylobacter jejuni strain ZS007 plasmid pCJ145K, complete sequence | 62829-62865 | 10 | 0.73 |
NZ_CP048617_1 | 1.40|744825|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 744825-744861 | 37 | NZ_CP044174 | Campylobacter jejuni strain AR-0412 plasmid pAR-0412, complete sequence | 77067-77103 | 10 | 0.73 |
NZ_CP048617_4 | 4.31|1347173|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1347173-1347209 | 37 | NZ_CP039925 | Agrobacterium tumefaciens strain CFBP7129 plasmid pAtCFBP7129b, complete sequence | 366414-366450 | 10 | 0.73 |
NZ_CP048617_4 | 4.38|1347631|35|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1347631-1347665 | 35 | NZ_CP029537 | Lactobacillus paracasei strain LC355 plasmid unnamed1, complete sequence | 40744-40778 | 10 | 0.714 |
NZ_CP048617_6 | 6.10|1518611|37|NZ_CP048617|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1518611-1518647 | 37 | MK774614 | Aeromonas phage CF8, complete genome | 37978-38014 | 10 | 0.73 |
NZ_CP048617_6 | 6.16|1519013|37|NZ_CP048617|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1519013-1519049 | 37 | KY779849 | Staphylococcus phage qdsa002, complete genome | 76227-76263 | 10 | 0.73 |
NZ_CP048617_6 | 6.16|1519013|37|NZ_CP048617|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1519013-1519049 | 37 | KY794641 | Staphylococcus phage vB_Sau_CG, complete genome | 32115-32151 | 10 | 0.73 |
NZ_CP048617_6 | 6.16|1519013|37|NZ_CP048617|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1519013-1519049 | 37 | NC_019448 | Staphylococcus phage GH15, complete genome | 72864-72900 | 10 | 0.73 |
NZ_CP048617_7 | 7.4|1580894|32|NZ_CP048617|PILER-CR | 1580894-1580925 | 32 | NZ_CP029155 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence | 50475-50506 | 10 | 0.688 |
NZ_CP048617_7 | 7.4|1580894|32|NZ_CP048617|PILER-CR | 1580894-1580925 | 32 | MF547662 | Clostridioides phage LIBA6276, complete genome | 131811-131842 | 10 | 0.688 |
NZ_CP048617_8 | 8.60|1597560|36|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1597560-1597595 | 36 | NC_007581 | Clostridium phage c-st, complete genome | 60677-60712 | 10 | 0.722 |
NZ_CP048617_8 | 8.60|1597560|36|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1597560-1597595 | 36 | AP008983 | Clostridium phage c-st genomic DNA, complete genome | 60677-60712 | 10 | 0.722 |
NZ_CP048617_8 | 8.66|1597958|36|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1597958-1597993 | 36 | NC_014389 | Butyrivibrio proteoclasticus B316 plasmid pCY360, complete sequence | 293866-293901 | 10 | 0.722 |
NZ_CP048617_8 | 8.71|1598291|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1598291-1598327 | 37 | NZ_CP016179 | Vibrio breoganii strain FF50 plasmid unnamed1, complete sequence | 155179-155215 | 10 | 0.73 |
NZ_CP048617_1 | 1.7|742663|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 742663-742699 | 37 | NC_007581 | Clostridium phage c-st, complete genome | 60676-60712 | 11 | 0.703 |
NZ_CP048617_1 | 1.7|742663|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 742663-742699 | 37 | AP008983 | Clostridium phage c-st genomic DNA, complete genome | 60676-60712 | 11 | 0.703 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_CP021873 | Borrelia miyamotoi strain CA17-2241 plasmid lp72, complete sequence | 9370-9404 | 11 | 0.686 |
NZ_CP048617_2 | 2.2|1340133|36|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1340133-1340168 | 36 | NZ_LR214985 | Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 12 | 3498-3533 | 11 | 0.694 |
NZ_CP048617_2 | 2.2|1340133|36|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1340133-1340168 | 36 | NZ_LR214985 | Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 12 | 43-78 | 11 | 0.694 |
NZ_CP048617_2 | 2.2|1340133|36|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1340133-1340168 | 36 | NZ_LR214986 | Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13 | 859636-859671 | 11 | 0.694 |
NZ_CP048617_2 | 2.4|1340264|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1340264-1340298 | 35 | CP029293 | Lactococcus lactis subsp. lactis KLDS 4.0325 plasmid unnamed6 | 78680-78714 | 11 | 0.686 |
NZ_CP048617_4 | 4.9|1345727|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1345727-1345763 | 37 | NZ_LR134420 | Legionella adelaidensis strain NCTC12735 genome assembly, plasmid: 11 | 17668-17704 | 11 | 0.703 |
NZ_CP048617_4 | 4.42|1347892|36|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1347892-1347927 | 36 | NZ_AP019564 | Rickettsia asiatica strain Maytaro1284 plasmid pRA1, complete sequence | 42738-42773 | 11 | 0.694 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NC_017428 | Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-10, complete sequence | 23031-23065 | 14 | 0.6 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_CP019918 | Borreliella burgdorferi strain PAbe plasmid p_cp32-5-1, complete sequence | 16354-16388 | 15 | 0.571 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_CP019921 | Borreliella burgdorferi strain PAbe plasmid p_cp32-9-4, complete sequence | 53405-53439 | 15 | 0.571 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NC_017422 | Borreliella burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-7, complete sequence | 10816-10850 | 15 | 0.571 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NC_017394 | Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-1+5, complete sequence | 53763-53797 | 15 | 0.571 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NC_000952 | Borreliella burgdorferi B31 plasmid cp32-7, complete sequence | 23049-23083 | 15 | 0.571 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_CP019848 | Borreliella burgdorferi plasmid cp32-4, complete sequence | 22747-22781 | 15 | 0.571 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_CP019849 | Borreliella burgdorferi plasmid cp32-5, complete sequence | 23069-23103 | 15 | 0.571 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_CP019756 | Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 plasmid p_cp32-1_1, complete sequence | 23070-23104 | 15 | 0.571 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_CP019759 | Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 plasmid p_cp32-4, complete sequence | 22748-22782 | 15 | 0.571 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_CP017206 | Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_cp32_4, complete sequence | 23513-23547 | 15 | 0.571 |
NZ_CP048617_1 | 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743648-743682 | 35 | NZ_CP017209 | Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_cp32_7, complete sequence | 23061-23095 | 15 | 0.571 |
1. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_LR214939 (Mycoplasma salivarium strain NCTC10113 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.829
tcgaacgatttt-ttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer -agaattattttgttaaaaaaaatttatcaaaaaaa Protospacer ***. ***** ************* *******.*
2. spacer 8.60|1597560|36|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KT901798 (Clostridium botulinum strain GA0702E1CS plasmid pGA0702E1CS, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
taaaactaaaataaaaaagataaaatataaataaaa CRISPR spacer tatattaaaaataaaaaagataaaaaataattaaaa Protospacer ** * . ****************** **** *****
3. spacer 1.7|742663|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KT901798 (Clostridium botulinum strain GA0702E1CS plasmid pGA0702E1CS, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
ataaaactaaaataaaaaagataaaatataaataaaa CRISPR spacer ttatattaaaaataaaaaagataaaaaataattaaaa Protospacer ** * . ****************** **** *****
4. spacer 1.7|742663|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK250029 (Prevotella phage Lak-C1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
ataaaacta-aaataaaaaagataaaatataaataaaa CRISPR spacer -taaaattgtttataaaaaatctaaaatataaataaaa Protospacer *****.*. ******** ****************
5. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_011736 (Borreliella burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp32-4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
--tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer tgtcagac--ttttttacaaaaaattttacaaaaaaa Protospacer **..** ******* ********** ******.*
6. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_AP010873 (Candidatus Ishikawaella capsulata Mpkobe plasmid pAst, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
--tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer aatgcaatga--ttttaaaaaaaatttttcacaatga Protospacer * **.** ******************* ** **
7. spacer 4.35|1347436|35|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP035920 (Vibrio cidicii strain 2423-01 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
-cttaatgattattgcgagtgctttctttttttggc CRISPR spacer aacttatga-tatttcgaatgctttctttttttggt Protospacer .* **** **** ***.****************.
8. spacer 8.60|1597560|36|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK250029 (Prevotella phage Lak-C1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
taaaacta-aaataaaaaagataaaatataaataaaa CRISPR spacer -aaaattgtttataaaaaatctaaaatataaataaaa Protospacer ****.*. ******** ****************
9. spacer 1.7|742663|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP039286 (Leptospira interrogans strain FMAS_AW1 plasmid pLiSL3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
ataaaactaaaataaaaaagataaaatataaataaaa CRISPR spacer agaaaactaaaaaaaaaacgataaaatataatattac Protospacer * ********** ***** ************ *
10. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP028882 (Borreliella bavariensis PBi plasmid lp28-3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer actttagattttttacaaaaaatttttcaaaaaag Protospacer * ********* *****************..
11. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to HG796796 (Uncultured bacterium plasmid pRGF00045) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer gaaatctattttttcaaaaaaatttttgaaaaata Protospacer .* * ******* ************ ***** *
12. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP019926 (Borreliella burgdorferi strain PAbe plasmid p_lp56, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer tgtcaggcttttttacaaaaaattttacaaaaaaa Protospacer * * * ******* ********** ******.*
13. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_017424 (Borreliella burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-10, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer tgtcaggcttttttacaaaaaattttacaaaaaaa Protospacer * * * ******* ********** ******.*
14. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_000956 (Borreliella burgdorferi B31 plasmid lp56, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer tgtcaggcttttttacaaaaaattttacaaaaaaa Protospacer * * * ******* ********** ******.*
15. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP019855 (Borreliella burgdorferi plasmid lp56, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer tgtcaggcttttttacaaaaaattttacaaaaaaa Protospacer * * * ******* ********** ******.*
16. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP019766 (Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 plasmid p_lp56, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer tgtcaggcttttttacaaaaaattttacaaaaaaa Protospacer * * * ******* ********** ******.*
17. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP017203 (Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_cp32_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer tgtcaggcttttttacaaaaaattttacaaaaaaa Protospacer * * * ******* ********** ******.*
18. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP017204 (Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_cp32_10, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer tgtcaggcttttttacaaaaaattttacaaaaaaa Protospacer * * * ******* ********** ******.*
19. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_018689 (Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC429, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer ttcaaataatttttaaaaaaaatatttaaaaaagt Protospacer *. ** * ************** *** ******
20. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019308 (Lactococcus lactis subsp. lactis plasmid pIL6, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer tgcattgatttttttaaaaaaatttttaaaatata Protospacer * * .******** ************ *** * *
21. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK250019 (Prevotella phage Lak-A2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
--tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer aatttaa--attttttgaaaaaaagttttcaaaatta Protospacer *. ** *******.******* ********* *
22. spacer 1.34|744435|36|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693026 (Marine virus AFVG_117M72, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
tgtttaacaatagtaagagtttcaagacctcaatat CRISPR spacer taactaacaatagtaagagtttctagaactcaacgg Protospacer *. .******************* *** *****..
23. spacer 4.1|1345203|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018982 (Borrelia burgdorferi 297 plasmid 297_cp32-9, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
tttttttatctctttctcttttttcttttaaccattc CRISPR spacer ttttttgttctctttctcttttttctttttgtgcttt Protospacer ****** ********************* .. **.
24. spacer 4.1|1345203|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_017397 (Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-9, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
tttttttatctctttctcttttttcttttaaccattc CRISPR spacer ttttttgttctctttctcttttttctttttgtgcttt Protospacer ****** ********************* .. **.
25. spacer 4.1|1345203|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004971 (Borrelia burgdorferi 297 plasmid cp18-2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
tttttttatctctttctcttttttcttttaaccattc CRISPR spacer ttttttgttctctttctcttttttctttttgtgcttt Protospacer ****** ********************* .. **.
26. spacer 5.3|1466534|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder matches to MK064563 (Sulfolobales Beppu filamentous virus 2 clone B, partial genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tatatttaatctttcaagctcatctctaaagactt CRISPR spacer actatttaatttttcaagctcatctataacgctta Protospacer ********.************** *** * .*
27. spacer 7.5|1580961|33|NZ_CP048617|PILER-CR matches to MN693990 (Marine virus AFVG_250M702, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
atggtatcaaacatttgtaatgccaccaatgaa CRISPR spacer atggtatcaaactgttgtaatgccctgaatatc Protospacer ************ ********** . ***.
28. spacer 7.5|1580961|33|NZ_CP048617|PILER-CR matches to MN693990 (Marine virus AFVG_250M702, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
atggtatcaaacatttgtaatgccaccaatgaa CRISPR spacer atggtatcaaactgttgtaatgccctgaatatc Protospacer ************ ********** . ***.
29. spacer 8.6|1593944|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG945224 (UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 1409-1801, partial genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
ttagtcatcatttgaaaacctcctttagtttttat CRISPR spacer tttttactcatttgaaaaactcctttaattttttg Protospacer ** * *********** ********.*****
30. spacer 8.60|1597560|36|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP039286 (Leptospira interrogans strain FMAS_AW1 plasmid pLiSL3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
taaaactaaaataaaaaagataaaatataaataaaa CRISPR spacer gaaaactaaaaaaaaaacgataaaatataatattac Protospacer ********** ***** ************ *
31. spacer 8.60|1597560|36|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP031735 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain Klebsiella pneumoniae plasmid pKPM501, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
taaaactaaaataaaaaagataaaatataaataaaa CRISPR spacer ttaaactaaaatataaaatataaaatataaaagcgg Protospacer * *********** **** ************ . ..
32. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_LR214986 (Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer atttatgattttataaaaaaaatatttcaaaataa Protospacer . *.****** ********** ******** .*
33. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP019918 (Borreliella burgdorferi strain PAbe plasmid p_cp32-5-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer ttgccaacttttttacaaaaaattttacaaaaaaa Protospacer *.* . ******* ********** ******.*
34. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP019918 (Borreliella burgdorferi strain PAbe plasmid p_cp32-5-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer ttgccaacttttttacaaaaaattttacaaaaaaa Protospacer *.* . ******* ********** ******.*
35. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019004 (Borrelia burgdorferi 297 plasmid 297_cp32-11, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer ttgccaacttttttacaaaaaattttacaaaaaaa Protospacer *.* . ******* ********** ******.*
36. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_017424 (Borreliella burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-10, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer ttgccaacttttttacaaaaaattttacaaaaaaa Protospacer *.* . ******* ********** ******.*
37. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_017400 (Borreliella burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer ttgccaacttttttacaaaaaattttacaaaaaaa Protospacer *.* . ******* ********** ******.*
38. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_017393 (Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-11, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer ttgccaacttttttacaaaaaattttacaaaaaaa Protospacer *.* . ******* ********** ******.*
39. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_017393 (Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-11, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer ttgccaacttttttacaaaaaattttacaaaaaaa Protospacer *.* . ******* ********** ******.*
40. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_017425 (Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-6, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer ttgccaacttttttacaaaaaattttacaaaaaaa Protospacer *.* . ******* ********** ******.*
41. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_017426 (Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-8, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer ttgccaacttttttacaaaaaattttacaaaaaaa Protospacer *.* . ******* ********** ******.*
42. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_015909 (Borreliella bissettii DN127 plasmid cp32-5, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer ttgccaacttttttacaaaaaattttacaaaaaaa Protospacer *.* . ******* ********** ******.*
43. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP031407 (Borreliella burgdorferi strain MM1 plasmid plsm_cp32-7, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer ttgccaacttttttacaaaaaattttacaaaaaaa Protospacer *.* . ******* ********** ******.*
44. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_000948 (Borreliella burgdorferi B31 plasmid cp32-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer ttgccaacttttttacaaaaaattttacaaaaaaa Protospacer *.* . ******* ********** ******.*
45. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_000948 (Borreliella burgdorferi B31 plasmid cp32-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer ttgccaacttttttacaaaaaattttacaaaaaaa Protospacer *.* . ******* ********** ******.*
46. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP015800 (Borrelia mayonii strain MN14-1539 plasmid cp32-3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer ttgccaacttttttacaaaaaattttacaaaaaaa Protospacer *.* . ******* ********** ******.*
47. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP015801 (Borrelia mayonii strain MN14-1539 plasmid cp32-4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer ttgccaacttttttacaaaaaattttacaaaaaaa Protospacer *.* . ******* ********** ******.*
48. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP019846 (Borreliella burgdorferi plasmid cp32-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer ttgccaacttttttacaaaaaattttacaaaaaaa Protospacer *.* . ******* ********** ******.*
49. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP019846 (Borreliella burgdorferi plasmid cp32-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer ttgccaacttttttacaaaaaattttacaaaaaaa Protospacer *.* . ******* ********** ******.*
50. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP019756 (Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 plasmid p_cp32-1_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer ttgccaacttttttacaaaaaattttacaaaaaaa Protospacer *.* . ******* ********** ******.*
51. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP019756 (Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 plasmid p_cp32-1_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer ttgccaacttttttacaaaaaattttacaaaaaaa Protospacer *.* . ******* ********** ******.*
52. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP017203 (Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_cp32_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer ttgccaacttttttacaaaaaattttacaaaaaaa Protospacer *.* . ******* ********** ******.*
53. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP017206 (Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_cp32_4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer ttgccaacttttttacaaaaaattttacaaaaaaa Protospacer *.* . ******* ********** ******.*
54. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP015784 (Borrelia mayonii strain MN14-1420 plasmid cp32-3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer ttgccaacttttttacaaaaaattttacaaaaaaa Protospacer *.* . ******* ********** ******.*
55. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP031026 (Lactobacillus phage ViSo-2018a, partial genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer gctacagattttttaaaaaaagttcttcaaatatg Protospacer * * ***************.**.****** * .
56. spacer 1.27|743978|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LN681534 (Clostridium phage phiCD24-1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ccacatagttaatataaaacaagtgtgtgtgcgcc--- CRISPR spacer ccacttagttaatataatacaagtg---gtatacttgg Protospacer **** ************ ******* **...*.
57. spacer 2.4|1340264|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN698242 (Pelagibacter phage HTVC103P, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
cttgaagaattagattatattagaaaagtatatga CRISPR spacer gttgaagaattacattatattaaaaatgaactcgg Protospacer *********** *********.*** * *. .*.
58. spacer 4.1|1345203|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN855996 (Bacteriophage sp. isolate 400, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
tttttttatctctttctcttttttcttttaaccattc CRISPR spacer ccttttgatctctttctgttttttctttttttctatc Protospacer ..**** ********** *********** .* **
59. spacer 4.1|1345203|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP019123 (Vibrio vulnificus strain FORC_054 plasmid pFORC54, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
tttttttatctctttctcttttttcttt--taaccattc CRISPR spacer caatttcatctctttctctattttcttttctaagcgt-- Protospacer . ***.************ ******** *** *.*
60. spacer 6.16|1519013|37|NZ_CP048617|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN935200 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage VTCCBPA116 genomic sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
gctaacatcttctttacttaaatatttccaattcaac-- CRISPR spacer tctaacatcttcttcagttaaatattttaga--gaactt Protospacer *************.* **********. .* ***
61. spacer 6.16|1519013|37|NZ_CP048617|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KX011028 (Staphylococcus phage pSco-10, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
gctaacatcttctttacttaaatatttccaattcaac-- CRISPR spacer tctaacatcttcttcagttaaatattttaga--gaactt Protospacer *************.* **********. .* ***
62. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_LR214999 (Mycoplasma conjunctivae strain NCTC10147 plasmid 3) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer ctaatatgatttttaaaaaaaatatttcaaaaagt Protospacer ...* . ************** **********
63. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_LR215005 (Mycoplasma conjunctivae strain NCTC10147 plasmid 9) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer ctaatatgatttttaaaaaaaatatttcaaaaagt Protospacer ...* . ************** **********
64. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_LR215007 (Mycoplasma conjunctivae strain NCTC10147 plasmid 11) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer ctaatatgatttttaaaaaaaatatttcaaaaagt Protospacer ...* . ************** **********
65. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LR214969 (Mycoplasma fermentans strain NCTC10117 genome assembly, plasmid: 15) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer ctaatatgatttttaaaaaaaatatttcaaaaagt Protospacer ...* . ************** **********
66. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK408758 (Campylobacter phage CP20, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer atataaagctttttaaaaaaaatttttaaaaaagt Protospacer .. * ...****************** ******
67. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to FN667789 (Campylobacter phage CPt10, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer atataaagctttttaaaaaaaatttttaaaaaagt Protospacer .. * ...****************** ******
68. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP031408 (Borreliella burgdorferi strain MM1 plasmid plsm_cp32-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer ttgccaatttttttacaaaaaattttacaaaaaag Protospacer *.* . ******* ********** ******..
69. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KT725776 (Bacillus phage vB_BceS-MY192, partial genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga CRISPR spacer aaggggaaaatttttaaaataatttttcaaaaaga Protospacer *.. .* **** **** ***************
70. spacer 1.40|744825|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP028373 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni strain huA17 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
agattttgtttttactaaaaaagatatgaaaaatgta CRISPR spacer taatcaattttttattaaaaaagatataaaaaataaa Protospacer .**. ******.************.******. *
71. spacer 1.40|744825|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP018901 (Campylobacter coli strain YH502 plasmid pCOS502, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
agattttgtttttactaaaaaagatatgaaaaatgta CRISPR spacer taatcaattttttattaaaaaagatataaaaaataaa Protospacer .**. ******.************.******. *
72. spacer 1.40|744825|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP040614 (Campylobacter sp. CFSAN093246 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
agattttgtttttactaaaaaagatatgaaaaatgta CRISPR spacer taatcaattttttattaaaaaagatataaaaaataaa Protospacer .**. ******.************.******. *
73. spacer 1.40|744825|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP014745 (Campylobacter jejuni strain OD267 plasmid pCJDM67 L, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
agattttgtttttactaaaaaagatatgaaaaatgta CRISPR spacer taatcaattttttattaaaaaagatataaaaaataaa Protospacer .**. ******.************.******. *
74. spacer 1.40|744825|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP017026 (Campylobacter coli plasmid pCC14983A-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
agattttgtttttactaaaaaagatatgaaaaatgta CRISPR spacer taatcaattttttattaaaaaagatataaaaaataaa Protospacer .**. ******.************.******. *
75. spacer 1.40|744825|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP014345 (Campylobacter jejuni strain RM3194 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
agattttgtttttactaaaaaagatatgaaaaatgta CRISPR spacer taatcaattttttattaaaaaagatataaaaaataaa Protospacer .**. ******.************.******. *
76. spacer 1.40|744825|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP014743 (Campylobacter jejuni strain WP2202 plasmid pCJDM202, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
agattttgtttttactaaaaaagatatgaaaaatgta CRISPR spacer taatcaattttttattaaaaaagatataaaaaataaa Protospacer .**. ******.************.******. *
77. spacer 1.40|744825|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP044166 (Campylobacter coli strain AR-0416 plasmid pAR-0416) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
agattttgtttttactaaaaaagatatgaaaaatgta CRISPR spacer taatcaattttttattaaaaaagatataaaaaataaa Protospacer .**. ******.************.******. *
78. spacer 1.40|744825|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP044176 (Campylobacter coli strain AR-0411 plasmid pAR-0411, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
agattttgtttttactaaaaaagatatgaaaaatgta CRISPR spacer taatcaattttttattaaaaaagatataaaaaataaa Protospacer .**. ******.************.******. *
79. spacer 1.40|744825|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP017417 (Campylobacter jejuni strain MTVDSCj13 plasmid pMTVDSCj13-2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
agattttgtttttactaaaaaagatatgaaaaatgta CRISPR spacer taatcaattttttattaaaaaagatataaaaaataaa Protospacer .**. ******.************.******. *
80. spacer 1.40|744825|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP025282 (Campylobacter coli strain YH503 plasmid pCOS503, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
agattttgtttttactaaaaaagatatgaaaaatgta CRISPR spacer taatcaattttttattaaaaaagatataaaaaataaa Protospacer .**. ******.************.******. *
81. spacer 1.40|744825|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP048772 (Campylobacter jejuni strain ZS007 plasmid pCJ145K, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
agattttgtttttactaaaaaagatatgaaaaatgta CRISPR spacer taatcaattttttattaaaaaagatataaaaaataaa Protospacer .**. ******.************.******. *
82. spacer 1.40|744825|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP048772 (Campylobacter jejuni strain ZS007 plasmid pCJ145K, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
agattttgtttttactaaaaaagatatgaaaaatgta CRISPR spacer taatcaattttttattaaaaaagatataaaaaataaa Protospacer .**. ******.************.******. *
83. spacer 1.40|744825|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP048772 (Campylobacter jejuni strain ZS007 plasmid pCJ145K, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
agattttgtttttactaaaaaagatatgaaaaatgta CRISPR spacer taatcaattttttattaaaaaagatataaaaaataaa Protospacer .**. ******.************.******. *
84. spacer 1.40|744825|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP044174 (Campylobacter jejuni strain AR-0412 plasmid pAR-0412, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
agattttgtttttactaaaaaagatatgaaaaatgta CRISPR spacer taatcaattttttattaaaaaagatataaaaaataaa Protospacer .**. ******.************.******. *
85. spacer 4.31|1347173|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP039925 (Agrobacterium tumefaciens strain CFBP7129 plasmid pAtCFBP7129b, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
cttcaactgttctttcaattctttattttcggttttc CRISPR spacer ggcaaactgttctttcaactcttcattttcgataagc Protospacer . **************.****.*******.* *
86. spacer 4.38|1347631|35|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029537 (Lactobacillus paracasei strain LC355 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
cctgttaatgttattttcttgttaatagtttcaaa CRISPR spacer tctgtttattttattttcttgttaatccttatgcg Protospacer .***** ** **************** ** .. .
87. spacer 6.10|1518611|37|NZ_CP048617|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MK774614 (Aeromonas phage CF8, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
catatgacaaaacaacaactttttcaatttcgggtat CRISPR spacer ttgattgcaaagcaactactttttcaatttcgggcgg Protospacer . ** .****.**** *****************..
88. spacer 6.16|1519013|37|NZ_CP048617|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KY779849 (Staphylococcus phage qdsa002, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
gctaacatcttctttacttaaatatttccaattcaac CRISPR spacer actaacatcttcttcagttaaatattttaaagagctc Protospacer .*************.* **********. ** *
89. spacer 6.16|1519013|37|NZ_CP048617|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KY794641 (Staphylococcus phage vB_Sau_CG, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
gctaacatcttctttacttaaatatttccaattcaac CRISPR spacer actaacatcttcttcagttaaatattttaaagagctc Protospacer .*************.* **********. ** *
90. spacer 6.16|1519013|37|NZ_CP048617|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_019448 (Staphylococcus phage GH15, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
gctaacatcttctttacttaaatatttccaattcaac CRISPR spacer actaacatcttcttcagttaaatattttaaagagctc Protospacer .*************.* **********. ** *
91. spacer 7.4|1580894|32|NZ_CP048617|PILER-CR matches to NZ_CP029155 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
taatcttctatttgtgagtatttattaagtgg CRISPR spacer aaatcttctatttgttggtatttacttgaaac Protospacer ************** .*******.* .. .
92. spacer 7.4|1580894|32|NZ_CP048617|PILER-CR matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
taatcttctatttgtgagtatttattaagtgg CRISPR spacer aaatcttctatttgttggtatttacttgaaac Protospacer ************** .*******.* .. .
93. spacer 8.60|1597560|36|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_007581 (Clostridium phage c-st, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
taaaactaaaataaaaaagataaaatataaataaaa CRISPR spacer acattttaaaataaaaatgataatatataaatgtac Protospacer * .*********** ***** ********. *
94. spacer 8.60|1597560|36|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AP008983 (Clostridium phage c-st genomic DNA, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
taaaactaaaataaaaaagataaaatataaataaaa CRISPR spacer acattttaaaataaaaatgataatatataaatgtac Protospacer * .*********** ***** ********. *
95. spacer 8.66|1597958|36|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_014389 (Butyrivibrio proteoclasticus B316 plasmid pCY360, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
atttgatgcatatgtaaatgttaagattgatggtgg CRISPR spacer caccagttcatatgtaaatattgagattgatggtag Protospacer ....* ***********.**.***********.*
96. spacer 8.71|1598291|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP016179 (Vibrio breoganii strain FF50 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
atttaatccctgtcgttttagaggtatttaaggttag CRISPR spacer agccgttacctgtcgtttttgaggtatttatggttgt Protospacer * ... * *********** ********** ****.
97. spacer 1.7|742663|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_007581 (Clostridium phage c-st, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
ataaaactaaaataaaaaagataaaatataaataaaa CRISPR spacer gacattttaaaataaaaatgataatatataaatgtac Protospacer . * .*********** ***** ********. *
98. spacer 1.7|742663|37|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AP008983 (Clostridium phage c-st genomic DNA, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
ataaaactaaaataaaaaagataaaatataaataaaa CRISPR spacer gacattttaaaataaaaatgataatatataaatgtac Protospacer . * .*********** ***** ********. *
99. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP021873 (Borrelia miyamotoi strain CA17-2241 plasmid lp72, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga- CRISPR spacer -aataaaatttttttaaaaaaaaattttaaaaaaat Protospacer . * .******* ******* ***.*****.*
100. spacer 2.2|1340133|36|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_LR214985 (Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 12) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
agttttataaaagttctttaaatgatgatgaactaa CRISPR spacer cttttgaaaaaagttctttaaatgatgaaatttttt Protospacer *** * ******************** . .*
101. spacer 2.2|1340133|36|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_LR214985 (Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 12) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
agttttataaaagttctttaaatgatgatgaactaa CRISPR spacer cttttgaaaaaagttctttaaatgatgaaatttttt Protospacer *** * ******************** . .*
102. spacer 2.2|1340133|36|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_LR214986 (Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
agttttataaaagttctttaaatgatgatgaactaa CRISPR spacer cttttgaaaaaagttctttaaatgatgaaatttttt Protospacer *** * ******************** . .*
103. spacer 2.4|1340264|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP029293 (Lactococcus lactis subsp. lactis KLDS 4.0325 plasmid unnamed6) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
cttgaagaattagattatattagaaaagtatatga CRISPR spacer agattagaattagattataatagcaaagtaattcc Protospacer ************** *** ****** *
104. spacer 4.9|1345727|37|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR134420 (Legionella adelaidensis strain NCTC12735 genome assembly, plasmid: 11) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
aagggttagtattagaaaagcatgtaaaaaaatctga CRISPR spacer gtacgagaaatttagaagagcatgtaaaaaaagctga Protospacer . . * *. ******.************** ****
105. spacer 4.42|1347892|36|NZ_CP048617|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP019564 (Rickettsia asiatica strain Maytaro1284 plasmid pRA1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
tcggcttttttcgcttccttttttatctcatttatt CRISPR spacer ccaatttttatcgcttccttttttctctcatcataa Protospacer .*...**** ************** ******.
106. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_017428 (Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-10, complete sequence) position: , mismatch: 14, identity: 0.6
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga------- CRISPR spacer -------attttttgtaaaattttttgtaaaaaaattggcaa Protospacer *******. **** **** .*****.*
107. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP019918 (Borreliella burgdorferi strain PAbe plasmid p_cp32-5-1, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.571
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga------- CRISPR spacer -------attttttgtaaaattttttgtaaaaaagttggcaa Protospacer *******. **** **** .*****..
108. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP019921 (Borreliella burgdorferi strain PAbe plasmid p_cp32-9-4, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.571
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga------- CRISPR spacer -------attttttgtaaaattttttgtaaaaaagttggcaa Protospacer *******. **** **** .*****..
109. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_017422 (Borreliella burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-7, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.571
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga------- CRISPR spacer -------attttttgtaaaattttttgtaaaaaagttggcaa Protospacer *******. **** **** .*****..
110. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_017394 (Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-1+5, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.571
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111. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_000952 (Borreliella burgdorferi B31 plasmid cp32-7, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.571
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga------- CRISPR spacer -------attttttgtaaaattttttgtaaaaaagttggcaa Protospacer *******. **** **** .*****..
112. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP019848 (Borreliella burgdorferi plasmid cp32-4, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.571
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga------- CRISPR spacer -------attttttgtaaaattttttgtaaaaaagttggcaa Protospacer *******. **** **** .*****..
113. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP019849 (Borreliella burgdorferi plasmid cp32-5, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.571
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga------- CRISPR spacer -------attttttgtaaaattttttgtaaaaaagttggcaa Protospacer *******. **** **** .*****..
114. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP019756 (Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 plasmid p_cp32-1_1, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.571
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115. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP019759 (Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 plasmid p_cp32-4, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.571
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116. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP017206 (Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_cp32_4, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.571
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117. spacer 1.22|743648|35|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP017209 (Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_cp32_7, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.571
tcgaacgattttttaaaaaaaatttttcaaaaaga------- CRISPR spacer -------attttttgtaaaattttttgtaaaaaagttggcaa Protospacer *******. **** **** .*****..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
14282 : 65152
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP048617|14282:65152|DBSCAN-SWA ATTATTGAACTCCTTTCCCATAGAAATGTTTTGAGGCTACAAAAACTTCACCTTTTTCAATTATTTCTAAAGCAATAGAATAAAATTTAACTATTTTATCAAATTCTTCTGATTTTTCAGTTAAACCCATTCTTAGAGCATTATCTCTATGGATAGTTTCGCTTTCAATTGTGTCTTTAACAGCCTGTAAATGTCTTGGATATATCTTTTTCTTAACACAGGTCTTACAAGCCATATGAGGACAAGAAGGCATTTTATATGGATGTTCACAGCACCCATCGCCAAGTTCAAAAACTCCTATAATTTTATTTTTAACCCATTTGTTATCGTATAATTGCACTTGTTCTTGAAGATCATTTTTTATATCAGTAGCGTCAGACTTACTCAACTTTTCCTTAAATTCCTTCTTTAATCTTTGTTGATATACTTTAATATATTTCTCTGTCATGGCAATTGAAGAATGTCCTAAAAACTCTTTAATAGCATATATATCTACTCCTGCATCAATCATTTCAGTTGCCACTGTATGTCTAAATTGATGTGTAGATATTTGATATATGCTACTGTCAATATTTTTTAGTGGTATTTCATTACAGATTTTAGGTAACACAATATTGGTGTTAAAAGTACTATATGAAATACTATCAACAATAGGATTATTCTCTCTATCTAAAATAACTTTTCCTTCACCTAAACCTCTATTATCCATCTTTATTTCTCTAAATAGATATTTATATCCATCAGGGGCAGGAGGAAGATTTTTAACTCTGTCTATTTGTCTTAATATTGCTCTTTCAACCATATTATTACCCTTAGAATCCTTCAAATGTGTCAAAGGTATTCTCAAATCCTTTGGAATTTTAGCAATACGGTGGTCTAAATAAAGCATGGGATCTCCATCTAAATCATACTGTAAGCACTCCTTACTCTTATCTTCATGTTCAGCAATCAAATGGCATATATCTTCAAATCTCCTTCCAGTATTCCTAATAATAATAAGTAAATCCCAATATTGTGACTCTACTATTGGAGTAGGTTTACCATCTTCTAATAATGGAATTACAGTTTTTTCAATATAATCATCCAGTTGAATCTTTATATTTGGTGGTATAGGTCTTGGTAAGGTTTCTTCAACTTTCGGGCTATCATATTTATTTAATAATCCAAGAGAAGGTGCATCATCCCATTTGTTATAGTACATATACTCAAACATAGATTTTATATGTGATAATGTCTTTTTCTTTTGCTTTTGCGAACACTTCATATTAAGTAGTATTGGCTCTATATGCTGTTCTCTTTGTAATTGACTAAATGAATTTATATTCGGAAACAATTCATACATTGAATTTAAAAAATATCCAAACGAAAGAAGTCTAATTTTAAAAGTTCGTGCTGACCAATTAGATAGCATATTTGTGTAATATCTTTTAACTATCTTTCTGATTTGCATATTAGAAATTTTATCTAAATATATAATAAAATGGCAAGGATTGAGGTGTCGTGGATATTCTTGATATAGCCTTCTCATATCCCAAACATCATTTTTAAGATATTCTTCTCTTTCTTCGGGATTTTTTATATATTCAACTTCATTATGAGAAGGGTAATGGTTATTTCTTATTTTTACTTGAACTCCCATTTTTTCGAGTAAGTTAGCAAACTTTTTATCTTTAATGGCTTTATACCAAGGTCCAAAACTCTTATATCCTGCTAACTTACAAATGTCACCATACTTTTTATCTCTATTTTTCTCAATCTTCAAGACCTCAAATAATTTTTTTTGAGCCTTTGTCATCCATGAAGTATCAATTCTTTCAATTGGAAAGGTTGTGATATTGCTACTACTTTCATAGTTCTGTTTAGAACCATTTACAACAATGGTTTTTGCACTTACTTTTAATTCAGACAAAACATAATCCTCCTTTAATAGTCACTATTACAAAACGATAAACTTGATCCTTTAATATTATCTTACTTCAATTTATTGCCTAATCTTTTACTTTCTTTATATGACTGCATCCTCTGATATTCTTTCTTATAATCTTCTGGCTTTAAATGTGCATATATCTCCATTGTAGTTGTTACATTTGCATGTCCAATTCTTTTAGATATATATTCCCAATTTATTTGTTTTCCTTTACTGATATATTCTCTTGCAAATTCAGTTACATGTGTATGTCTTAACATATGTGGAGTTATTTTTATCCCTGTTTTCTTGCTATAATATTTAAACATAGAATCAAGAGTTGATTTAGTCATTGCTTTTCCATTATTAGAAGGTGTATTACTATTTACTACTACGAATAAAAAATCATTATCAGCATTACTTTCTAACCATTCAGAACTTATGTATCTATCTATTAGAGACATTAAATCAGCAGGTAAATGGACAAATCTATCTCTACCATAACCAGCCTTTGCCCTTGAGCCATTTGAGTTATCTGCCCTAAATCTAACCCATAAACCTTGTTCTGCAAAATCTATATCTTCTAAATGAATTCCAAGCAACTCATTTGACCTAAAGCCACCTTCTTTTAAGCAGAGAAGTATTATTTTATCTCTCAAAAGATTCACACTATCTAAAAACTTCTTAAAATCCTTTTGCTCTACTGTTTTAGGCACAACTTTTGGTACTTTTGATTTTAAAGTATTTACTTGTATCATTCTGTTATGCCTTGTATGTGCTAACATATCTTTATCTCTCATTGATTGAGTAACCATAACACTTCTGTATACAACTGGATTTTCCTTAATCCGATTACTTGCTTTAAGCCATAAATATAAAGAACTAACTCTGCTGATTATTGCATTTATAGTAGTTGCTTTTAATGAATCTTCAACATAATCAAATTCAATATCATAATTTAACACTTTTATATTTTCATAGAATCTGTATGGATTTTTAAGCCATAATTTAAACTGTGCTAATACATCAGGTTTTCCATCAAGGTCAAGTATTTTTAAACCTTTAATTTTCAAAAACACAACAAAATACCACAATAGGTAGCAATAAGTTTTAACTGTATTAGGGGATACCTCTCTTTCTGCTCTTGCCTGTATCATGTTCAAATATTCTTTTATCAATGGTATAAAGTCATAGTTATCATCAACTAAATAATACATCTTACCTAAATCTGTTTGTGCCTTTACTATTCTAATCTTCTCATACCATTTTTCTTTAGGACTTCTCTCTTTAGTTCCTTCCATACGCTATTCACTCCTATATTTAATTCTATTATCTATTATACAATAATTACTTAACCTAATCTTTACTTACTATATATTATTTATAAATAAATATGGATATAAAAATAGAGTAAGGCATATCTTATATGACTTACCTTACTCTTATTATTTATATACTATTAAAATTAAGGAGTCTTTTTTTTAGCTTATTTTAATGTTTATTTATAAAATTATTTGCCCATAATAATAGTTGGATAGGAGGTGCTTTATGTCTTATAAAATTGGTATACCGCGGGCATTACTCTATTATGAGTATTATCCTTTATGGAAAGAGTTTTTTACAGAATTAGGTGCAGAAATAGTTTTATCTTCAAATACGAATAAATCTATATTAAATGCTGGAGTTTCTAGTTGTGTTGATGAAGCATGTCTGCCTGTGAAGGTATTTCATGGCCATGTAGAAGAGCTTAAAAATAAAGTAGATTATTTATTTATACCTAAATTTATTAGTGTTTATAAAAAAGAATATTTATGTCCTAAATTATTAGGATTACCTGAAATGGTAATAAATTCCATTGACAATTTACCGCCAGTTATAGATGTGGAAATTAACCTATTAAAATCTGATGATAACTTACATAAATCGGTAATAGAAATTGGTAAAATTTTTACATCTGACAATAAGAAAATAAAATCGGCTTTTGATAAAGCTATTAGCAGATTTAATGAATACAGAAAGTTGTTAGCTAATGGGGTAATTCCTATTGAAGCAATTAAAGTTTATAACAAATATGTTAATAGTATTACAACTTTGAAAAATAGCAAATACAAAATTCTCGTTTTAGGACATTCATACAATTTATATGATGAATTTTTAAGTATGAAACTCATTGAAAAATTACAGAAAGAGAATATGAAAGTAATAACTCCAGATATTGTAGACATAGGTAAAATAAATCATTATATATCCAAATTGCCTAAAAGGATGTTTTGGAGTTTTGGAAGAAAAATTGTTGGTGCTTCTTTTTATTTAATTGAGGAAAAAGCAGTCGATGGGATAATTTATATATCTTCATTTGGCTGTGGTTTAGATTCTGTTTTAATCGATTTGGTATCCAGAAAGGCAAAAAAATATAAGGTTCCATTTACATTAGTAACTATTGATGAACATTCAGGAGAAGCAGGAGTTAATACGAGACTAGAGGCATTTATAGATATGATTATATGGAGGGACAGAAATGAAGATTACATTTCCACACATGGGTAATACTTATATTGCAGTAAAAGCAATGTTTGAAGATTTTGGATTAGAAGTGGTTGTACCGCCAAAATGCAGTAAGCGTACGCTTGAATTAGGTACTAAATATTCGCCAGAATCAATTTGTCTGCCTCTGAAAATTAATATAGGTAATTACATTGAAAGTATAGAAAAAGGAGCAGATACGATATTGATAACTGGTAGTTGTGGCCCTTGTAGATTTGGTTTTTATCCGGTGATAGAGAGAGAGATTTTGAAGGATTTAGGATATGATGTTGATATTATAGTGTTTGATCCTCCAGATGGTAATTATAAAGAACTAATAAATAATATAACAAGAGCAGTAAATACAAAGAACCCAATTAAGATGCTAAAGAGTTTTAATAGAGGAAGAATTATATTAAAAGAAGTAGATAGGTTATTTGAATTTTCAAATAAAATACGAGCGTATGCTGTGAATAGTTATGAAGTAGATGAAATTATGCAAAGGTTCAGTGAAGATGTTTTGAAAGTTAAAGGCGTTATAGAAACTAGAAAGCTAATAAGAAGAACTTTT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42 | Streptococcus_phage(27.27%) | tRNA,integrase,transposase | attL 29449:29508|attR 65321:65548 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
229249 : 239760
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP048617|229249:239760|DBSCAN-SWA CTTATATATCTTTATCTCTATATATAAATTTGTGAGTAAGTCCGTTCTTAAAACATATAGAGGATACCTTTCCATCATCAACTATAACTTTATCAATAACTGTATTGATAAAATCTTTAATTAGTTTTTTATCAATAGTCATAACCATATTTTTATAATCTATTGTTTTTTTATTTAAAAGTTCATTACTAATCATAAAATGACTAGCTTTCTGAAGAAAAGATATATCGTTATATGCTACTTGATTGCTATGCTCCTCATGCAGTTCATGGAGCTTTTTATTTATATCATCTATTTTATTTTTTAGTTTATGTTTTTGAAGCAGGAAATCTTTCTCGGACATAGACTCTTCTGAGAATAAATATAGGTTTTGAAGTCTGTCAATTGCTCTTTCATACTTTTCTTTCTCTTTTTTTAATATTTCCATTTCAGAAATATTTTCTTTTTTTACATCTTTATTTTTCGGCATATCGATAAGAACATTATCTAAATTAGAATAAAGTATTGAAATATAAATACTTTCAAGTCCTTTAGTTTCTATTCCAGCTATATTTTTAAAAGTTTTTCCGGATAAAAGTATTTTCTCTAAGTCTTTAAGGTTATGTTTTTTAGTTAGCTTTTGTTGAGCTTTTGATAAGTTCGCAAGGTAATTTATCACAAATGGTCCAAGTGTAATCTCACTTACCATTTTAGCATCACAACCTAAAGCTCTAGATTTACCCTGACAGCGATAAATCGAAGGTCTATATCCGTCACTGCGTGGCTGGTCTAGAGCAGCATTAAATCCTCGACCGCATTTTTTGCACTTTACAAGGCCACTAAATATATGAGTATGGGTATTTTTTCTAAGCAGAGCAGTATTTCTAGAAGCATTAAAGTCCATTATCTTGTTGCATCTTTCCCATTGTTCCTTTGAGATAATAGCCTCATGATTATCATCTACAATTATCCATTCTGATTTATCTTTCTTTTTCCCCCTAGCACTTTCCCTATAGTTATATCTATATGTACCTTTATAAAAAGGATTTCTTATGATATCAACTACAGTCTTGCTTGTCCATGTCCCGCCGCGTTTAGTTTTTATGTTATTTGTATTCAAGATTTTCATGACCTGAAAAGCCGAACGAAGCTCTTCGTACTTATCATATATAAACTGGACCACCTTAGCTTCTTCTTCATCCGGAACAGGGAATTTCTTTTCATCATCCCATTTATAACCTAGTGGACACTGTGCTCCGTTCCAAAGACCTTTCTCTGCTCGTGATAGCATTATTGATGAAACTCTTTCTGCAGTAAGTTTTCTCTCAAGTTCTGCAAATACCAAGATAATTTTAAGCATAGCCTCTCCCATAGCGGAGCTAGTATCAAACTGTTCATTTTTAGAAATGAAAGTTACACCATACTTTTTGATTTCTTCATACATTTCAGTGAAGTCTTTAAGATTACGGGATATACGATCTATTTTCCACACAAGAAGATGAGTAAATTCTCCCTGTCTAATCCTTGCCATCATATCCTGGAATGCTGGTCTGTCCATATTTTTTCCAGAGTATCCGGCATCTTCGAAAATTTCATAGTCATCAATGCCTAAAAGGTACTTTGAATAGTTTATAAGCTCTTGGCGTTGAAACGGAAGAGAGTCTCTGTCGATTTGATGGTGTGTACTAACCCTTATATATAATGCAGCTTTTTTTATAATGATCACCTTCCTTGCACTTTACAAATTAAAAACAATGATAATAAAATTAACTGATATTATACTTCAACAAAATAATAAAGAAACTCGAAGAAGAAATCATTGCTGAAAACTCTACTCATTGTGATTATTAGTTTCTTCGTGATAAATATCTAAAGTATATCTTTTTATTTTATTGCTTCTCAATTCTTTTATTATGCTTCTTTCTCTAAAGCTGATGATTGTTCTTCTTTGGTTTTTTCAACCTGTTCTTTGATTTTTAAGAGCTGTATATATTTTTCTAGCTCTTTTTTGCTTTCCTCTGATAATGTTTCAATTTCTTTAAGTATTTCGTTTTGTTCTTTTGGTTCATTTTGCATCTTTCCATCGTTAATTAAATAATCTACCGTAACATTAAAAAAAATCGCTAATTTTTTTAATGTTTTAACATCTGGTTCGCTTTTTCCTGTTTCATATTGGGTGTAAGTTGTTCTTCCGACTCCTAAAAATTTTGCTACTTCAGATTGGGTTAAACCTTTTTCGTTTCTTAATTTTCTTAAAATTTTCATACTTTAATTCCCTCCCTTTATTAGTCTTCCCTAATATAATTATAGTTTGTCAATTAGGTTGACAACAACAAAAGTCAAAAAAATTGACTTATCAAAATAAATTTAATAAAAAAGGTATTGACATGTCAAGAATTTTGACATAAAATATAATCAAAGTCAAGGAAGATGACACAAAGGAGTGTATGATTAATGTTTGAATGGCTTAGAGAAAAAAGGTTGTCAAGAAATATGACGCAAGAACAATTAGCAAAAGAAGTTGGTATATCTAGAACAATGATAACTGAACTTGAAAATGGAAATGCAAAACCTTCAGTTAAAACAGCTAAAGCCATAGCAAAAGTTTTAGATTTTTCGTGGACTTTATTTTTTGATAAAGAAGAATAATTGGCGAGGTGAACAAATTGAAGTTTTTAGAGAAGAAAAAACTCCTTAAACAGCTTAAAAGAAAGGAGGAGCTTTAAGCAATGAATGACATTCAAGACAGAATAAAAAGAATGTGGAAATATCTGAATGAAAATGGAATATACACAGAAGAAGATTTAGATAAAGCACTAGAAAAAATGCCTAAGCTCAATATAGGAATATTTGTATCACCATTGAAAGGGGGTGAAAAATGTGTCACAGAGTCTAGATAGAGTGGATATTAAAATATCAGTAAATACAAAACTAGACGGTGAATTTGATGAGCTATTATTCAGTGTTGATACTTGTAACTACAAAGAAGTAAAAAATGGAGAAGTGATTTTCTATATAGATTTTAGAAGTGATGTAGCTGATGCAAAAAAGGACATAGAGAAGGTTCTAGACAAAGCTAAAGAAATACAGAAGGTTTATAAAAATGTAAAGTATCCATATGAAGCTATTGAGATACTACTTAAGAAAAGAAAGGGGGCATAGTAATGCAAAATTTACATGCAATAGCTTATGCTGTACTGACATATAGAAGATTAGAGGGACAAGAGTATGACGAAGAATGTTTTGCGAATGTAATGGAAGCTTTGATGAATAACTATACAGAAGATGAAGTTGTAAAAATTGTATATGGAGAGGAGGGGAAACAGTGTTGCTGAACATGGTACAAAAGCAAATAGGATATGTTTCAGAAGAACATTTCAGACTTGCATTGGATATGGCAACAGACGACATCAAAGCAAACCGAATCGCATTTGGTAAAAGGACAAGCCTTGAGGAAGCTTTAGAAATCATTATAGCTTGCATTAAAGTAGTTCAAAAAATAGAAAAAGGCAGCTCAACAGAGCCACCAACCCAAAACAATTATAACAGAAATGAACTACTTTGTGCAAGTATAACAGCTTAAAAGCAAGTATAACAGCTTAAAAGAGGGTGGGAATTTATGAGATTAAAACAAAGAGTAGAAGAAATTTTGAAATTTCAAATATCAAATAAAGATTATGAAGAAGCATATAGATATGCAAAGCATAAGCTCGAATGGCAAAACAAACATTTTGGAACTAATCATGGTGAATATTATTTAATACTGCTTATCGCTGATACATACAGGGAGCAGCAGTTTTCTAAATATACATGGGAGTTGTGCAAGGAAAGAATGAAAAAAGCGGAAGGAGTGGTTTTATGTTAATAAATATCAAAAATTTAAAACTCAAAAACTTCAAAGGCATAAAAGATATGAGCATAGACTTCGGGAGAGTAACTAATATTTATGGTGAAAACGCTACTGGAAAAACAACAATATTTGACGCTTTTACGTGGCTTTTGTTCGATAAAGATTCAACAGATAAAAAAGATTTCAATATCAAAACTATAGATGAAAATGGTGACGTAATTCATGGGCTAGAACATGAAGTTGAGGGAGTTTTAGAAGTAGACGGGAAAGAAATAACGCTTAGAAAAATCTATAAAGAAAAATGGACTCAAAAAAGAGGAGAGGAGCAAAGACTTCTTACTGGACATACTACAGAGCATTTTATAAATGATGTTCCGGTTAAAAAATCAGAATACACAAAAAGAATAAATGAATTGATAAATGAAAATATATTCAAACTTGTTACTAATCCGCTATACTTCAACACAAATCTTAATTGGAAAGATAGGAGAAAAATTCTTTTAGAAATAGTAGGGAATGTATCAGATCAAGATGTAATAGCTACAAATGATAAGTTAAAAAAACTTGAAACTCTACTTGAAGATAAGAACTTGGAAGAATTTAAAAAGATAATAGCTTTCAAAAAGAAAAAACTTAACGAAGAGCTAAAATCAATACCTTACAGGATAGACGAGCTTAATAACTCAATTGAGGATATAGACCCGGAAGTATTAGATTTTAGAAAAAGAGGTATAGTAGCTGCAATTAATCAGATTGAAGAAAGCCTCATGGATAATTCCAAGATGTACGAAGGTCTTATGAAGGAAAGGGACAAGCTATATCAGCTTAAATCAAAACTAAGAGAAATAGAATTTAATGCAAAGTTAGAAGCTGAAAAGCCTTTAAGGCACCTGCAAAAAGAGTTAAAGATGGCTGAGAATGAAAAATCACAACTAGATATGGAGCTATATAGACTAAATAATTTAATAGAAACCAAAGAGGATTTAATAAAATCCATAGAAAAAGAACTGGCAGAGCTAAGGGAGAAGTGGAATCAGATAAATCAAGAAGAGCTCCACATACCGGAAGATAGTTTTATATGTCCAACATGCAAAAGACCATTTGAAGAACATGATATAGAGCTTAAGAAAAATGAAATGATAGAAAACTTTAATCAAAATAAATCTAAAAGATTAAGCGATATAACTTCTACTGGAAAGCGTAAAAAAGAAAATTTAGAAAAGATTAAAGGCGAAATCGAAAGTCTCATAGCAAATAGAAATACTATTTTATCAAAATTAGAAAGTATAAACAAAGCTATAGAGAAAAAGAAAACTGAAATTGAAAACTACAATCCAATAGTAAATTTAGAAGACAATAAAGAATATATAGATATTTTAAAAGAAGTTAAGGAGTTAGAGTTAAAACTTTCTTCACCGGTAGAAGTTGAACAAGAAATTAGAGAATATAAAGCTAAAAAAAATGAGCTTGAAAAAGAACTCGAGGAAATAAATAATAGTCTAGCTTATCACGAACACAATCAAAAAGCAAAGAAAAGAATCGAAGAACTAATGAAGAGAGAAAAAGAACTAGCAAACATGATAGCAGAATTAGAAGGTCAAGAGTATTTATGTGAAGAGTTTATAAGAACTAAAGTTGACCTTTTAGAAAACAGAATAAATAGTAAGTTCAAAAATGTAAGATTTAAATTATTTAATACTCTTGTGAACGGAGCTCTTGAAGAATGCTGCGAAACTCTAATAAATGGAGTACCATTTCAGGATGCAAATAATGCGGCTAAAATCAATGCAGGAATAGACATTATAAATACTTTATCAGAACACTATCAAATAACAGCACCAATATTTATAGATAATAGGGAATCTATAAATCAAATATTAGAAAGTAACTCACAAATTATAAATTTAATAGTGAGTAAAGATAAAAAATTGAGAATAGAGGTGGCGTAAATGCTTAATTTGAAAATGACAATAGAAAGTATTTCAAAAGAAACAGGAAGACAACACATGACGTTAGGACTTGATGAGTTTATAAAGTTGAATAAGGTTTTAAATAAACTTGCTGATGAATTAAATCAGCAAGTTTCACAAACAAATCTTATAAGAAGCATAGAGCAAGGTCTTTTGGTTAATGAGCTTTGCAAAAGACCAGGAGTTCAATCCTTTATTATTAAGAACGGAATAGAATATGCAGTCGTACTTGAAGGTGAATACGAAAAAGTGGACTTTGGTCCTGCAAATATAATAATAATTTCTAATTTAGAAGGAGGAGAAAAATAATGGCAAATGATTTAATGACAAAAGAATGTAGTTTTGTAGTTAATGGTGAAGAGGTAAAACTTACAGGCAATACTGTAAAAAACTATCTTACAAGAGGAAATGCAGATGTTACAGATCAAGAAGTTGTAATGTTTATCAACCTTTGTAAATATCAAAAACTAAATCCTTTTTTAAATGAAGCGTATTTAGTGAAGTTTAAAGGAGCTCCAGCTCAAATAATAACTTCAAAAGAAGCCTATATGAAAAAAGCTGAAATGAATCCGCAATATGATGGTATGAGAGCTGGGCTTATAGTTCAAAGGGGGACAATATTATCGAAGTAGAAGGGAGTTTCACTTTAAAAGGCGATATTCTATTAGGAGCATGGGCCGAGGTTTATAGAAAAGATAGAAAGTATCCTTATATAGCAAAAGTGAGCTTTGATGAATATAACAAAGGTCAATCAACTTGGAAATCAATGCCTAAAACTATGATAAGAAAAGTTGCAATAGTACAAGCCTTGAGAGAAGCTTTCCCTGTTGATTTAGGAGCTTTGTATGTTGAAGAAGAAGCTCAAGCGGTAACTGGTGTTGAACATGAAGTAAAAGAGGAAATTAAAAATAAAGCTAACACGAAGACAATAGGGTTCTCAAAGGAAAATGTACAAGATGTTGCTTACAAAGAAGTAGAACCTGAACCAGTTGAAAAAACTAAAGAAAAATTAACTCAACAACAAATAAGTATTGAAGGACCAGGATTCTAATGAAACTGAAAATATTAGGTAGTAGCTCTTCGGGGAACTGCTACCTACTGCAGAATAAAACTGAAACTTTAGTATTAGAATGTGGGGTAAAGTGGAATGAGGTAAAAAAAGCTTTAAATTTTAATATGACTAATATATGCGGGTGTCTTATTACACATGAGCATAAAGACCACTGCAAATATATCAAAGATGTACTTAAAGCTGGTATTGATATATATAGCACTAAAGGAACTCTAAAAGCATTAAAAATTGATAGCCATAGGAGCCACGTAATTGAATATTTAAAGCCGTTTAAGGTAGGTGGATATAGTATACTGCCTTTTCAAACAAAACACGATTGTGAGGAACCTGTTGGCTTTCTAATACAACATGAAGACATGGGAACTTTATTATTCGCTACGGACACATACTATCTTGAATATAAATTTGAAAATCTTAATCATATTTTAGTTGAGTGTAACTATAGTTTAGATATTCTAAACAAAAACATTGAGGCGGGAAAAATTCATCCAGCTTTTAAGAATAGGGTGCTTCAATCACATTTTGAGTTTGACAATGTTAAAAACTTTTTAAAAGCAAATAATTTGGCGCAGGTAGCAAACATTGTATTACTTCACTTATCAAATGATAATAGCGATTCAGCAAGATTTAAAACTGAAATAGAAAAACTCACTGGAAAGCTGGTACACATAGCAGATAAAGGATTAGAAATTGATATTGGATTATATCCATTCTAATTAGACAGAAGGAAGGAGGGGAGGTGTATTGTGGCAAATCCACAGTTAGAAAATGGTTTCACAAGAATAGCAAATGAAATTTTAGAAGCACTAGCAAAGACTAAACTTAATGGAACGCAATTCAGAATTATAATGACAATATTTAGATATACTTATGGTTTTCATAGAAAAGAACATGAAATGTCTGAAACATTTATTGCTGAAGCTGTTGGGATTACTAAAAGACAAGTAAGAAGAGAATTAAAAACTTTAGTAGATAATAAAATAATCATTATAACCAAAGAATCTACTTATACAAAAGCTAGAAAGTTGAAATTTAATAAAAATTACAAAGAGTGGGGACTATTTAATCTACAGAGGACAAAAAAGACCACAGAGGATAAATCAGACCTCCCCCCAGAGGATAAATTAGTCCCCACACCAAAAGAGGAAAATAATAAAGAAAATTGCTCTAATCCTTGTAATAGTCAAGAGTTAGGAGAGGTGGGGCTAATCAGTCCCCAGAGGATAAATTAGTCCCCCAAAAAAGAAATAATATTAAAGATATATATAAAGAAATAGCTACTACTAATAATGATACAGAGGATAAATTAGTCCCCTCTTCAATACAAGAAGACGAATTAAGCAAATTTGCAGATTTAATATGCGATCATTATTCGGTATTAACAAGAAGAGTAATCAGTCCAGGAGATGATATGGTTATATTTCAATTTGCTCAATCGTTATCTGAATCTGATAGAGATATAAATCTTATAAAAAATGCTATGAATCGAGCGAAACAAAACTGGAAACCTAAATATCAAGGCGACCAAATCAGGAGCTTTAAATATTTTATACCAGCAATACAAGAAGCTCTTGCAGCGAAGGAGGCGAAGTTAAATGCAATCAATCAGCCAGATAATAGCAGATACACAAAAAATCATAGAATACCATGGCAACGGGAAGGAAAAGAAGAAAACACAGAATATGAACCAAAACCAAACAGTGGCTTCAGAAAGTTTAAAGTTTATAATAACAAGTCTTGAAGCCAGAAAACATGGATATTTACCAAAAGAACCTATACCTAAACCTTTAAAATGTCAATTTTGTCAAAAAACACTTTATCATAGAGGATTAATCAATCCTAAAAGTAGAGTTGTTTGGAAATGGTTACCCCCTGAAAGGTGTAATTGCAAAAAAGCTCAAGAATACTGGAAAAAGTATGACGAGGAACAGGAAAGGCTCATGCTTGAAAGAGCTAAGGAAGAAGAAAGAGAGAGGTTTAAGAGAAGAATTAAAAAGCTACTTGGCGAATCAGGAATAAAAAAGCGATTTTTAAATAGAACTTTTGATAATTTTGAAGTCGATGATTTGAATTTGGAAGCTTACGAAATAGCGAAAACATATGCTAGAGACTTTGAAAACTATAAGGAAAACGGAGAGGGTTTATACTTTGTAGGGAGCTTTGGAACTGGAAAAACACATTTAGCTGTGGCTATAGCACTTTATTTGATAAACAAAGGCGTACCGGTTATTTGTAAAACTTTGATAGACCTGTTGACAGACATAAAAAAGACTTTTGACAGTAGTCAGATAAGCGAGCATGAAGTTTTAAATATATACAAGACAGTTGACCTTTTAGTAATAGATGATCTAGGAAAAGAACCACCAACGGATTGGGCTATGGCGACTTTTTATTCAATTCTTAATGACAGATATGAAAACTGTCTACCGACTATAATCACAACAAACTATAACGATAAAGAGCTTATCGAAAGACTAAGCAGAAAAAGTGATACCAAAACTGCAGGAGCTATCGTTGATAGATTGCATGGGACATGTTCCCTAGTAGAAATGAACTGGAAGAGTTGGAGAACAATTTATTAAGTAAGGGGAGGTTAAATCATGGGAAAAAAGAGAAAATGCAGAATGACTGAAGAAGAAAGGACCATACATGATAAAGCTGTAAAAATAAGAAAAATGACTGACAGACAAATTATTGAGTATATCGATGATATTTATAAAACTGGCTATAGAGCAGGCATGAAAACAAGTAATATATCTCCGGATAAAATCATAGATGAGATTAAGAAAATCAAAGGCATAGGACCAATAACCCTTTCAAAAATAAAACAAGTGCTGGAGGGAGTAAAGTAATGGCATGGGCTAGTACTTATAGTAATCGAGGGAAGCTCCTAGAGCAGATAATAGAAGTTGCAAATAGGCAGTATAGAAATAAAGGCATTGCAGAAATTCAGAAAATAGCAACTCCTGTAAAAGTACTTCGAACAGACAAGAATGGAAAGATTTATGGATTTTGGGAAAAGAAAAGCACTGTTGATTTTATAGGGGTTTGTAATGGCATACCCATTGCTTTTGATGCCAAAGAAACTACAGGTAAAAGCCTGAAATTTGACAATATTCATAAGCACCAGATTGAATTTATGACAAACTGGCAACAACGTGGTGGACAGGCATTCTTGGTTGTATATTTCTCGGAGCTTAACAGGTACTTTAGATTAAGCATTTTAGAGCTTTTGCAGTACATGAAGAATCCTTTAAAAAGCAATAAAAAAAGTATACCAATTAAGTATTTTGAGGAATACGCTATAGAACTCAAAACAGGCCAAGTGTTTGTTTTAGATTATTTGAAAGGTTTAAGGAAGTGAGTTCATGAGTGAAAATCAAATATTATCACTGGCTATAAGAGTATTTGGTCAGCAAAAACAAAGAATTGTGGCCATAGAAGAATTGAGTGAGTTGCAGAAAGCTTTATGCAAATTTGAAAGAAACCAAACTAATGAAAATATAAACTCTATAGCCGAAGAAATAGCGGATGTTGAAATCATGTTGGAACAAATGAAATTACTCTACGATATAGAAGAATTAGTTCGAAACAATAAGCAACATAAATTAGAAAGATTGGATGAAATACTAGAAGAATAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP048617|229249:239760|232552_232810_+|WP_163234247.1|DBSCAN-SWA MLLNMVQKQIGYVSEEHFRLALDMATDDIKANRIAFGKRTSLEEALEIIIACIKVVQKIEKGSSTEPPTQNNYNRNELLCASITA >NZ_CP048617|229249:239760|236097_236835_+|WP_163234251.1|DBSCAN-SWA MKLKILGSSSSGNCYLLQNKTETLVLECGVKWNEVKKALNFNMTNICGCLITHEHKDHCKYIKDVLKAGIDIYSTKGTLKALKIDSHRSHVIEYLKPFKVGGYSILPFQTKHDCEEPVGFLIQHEDMGTLLFATDTYYLEYKFENLNHILVECNYSLDILNKNIEAGKIHPAFKNRVLQSHFEFDNVKNFLKANNLAQVANIVLLHLSNDNSDSARFKTEIEKLTGKLVHIADKGLEIDIGLYPF >NZ_CP048617|229249:239760|237801_238701_+|WP_163234254.1|DBSCAN-SWA MNQNQTVASESLKFIITSLEARKHGYLPKEPIPKPLKCQFCQKTLYHRGLINPKSRVVWKWLPPERCNCKKAQEYWKKYDEEQERLMLERAKEEERERFKRRIKKLLGESGIKKRFLNRTFDNFEVDDLNLEAYEIAKTYARDFENYKENGEGLYFVGSFGTGKTHLAVAIALYLINKGVPVICKTLIDLLTDIKKTFDSSQISEHEVLNIYKTVDLLVIDDLGKEPPTDWAMATFYSILNDRYENCLPTIITTNYNDKELIERLSRKSDTKTAGAIVDRLHGTCSLVEMNWKSWRTIY >NZ_CP048617|229249:239760|239487_239760_+|WP_163234257.1|DBSCAN-SWA MSENQILSLAIRVFGQQKQRIVAIEELSELQKALCKFERNQTNENINSIAEEIADVEIMLEQMKLLYDIEELVRNNKQHKLERLDEILEE >NZ_CP048617|229249:239760|231956_232127_+|WP_163234244.1|DBSCAN-SWA MNDIQDRIKRMWKYLNENGIYTEEDLDKALEKMPKLNIGIFVSPLKGGEKCVTESR >NZ_CP048617|229249:239760|233085_235026_+|WP_163234249.1|DBSCAN-SWA MLINIKNLKLKNFKGIKDMSIDFGRVTNIYGENATGKTTIFDAFTWLLFDKDSTDKKDFNIKTIDENGDVIHGLEHEVEGVLEVDGKEITLRKIYKEKWTQKRGEEQRLLTGHTTEHFINDVPVKKSEYTKRINELINENIFKLVTNPLYFNTNLNWKDRRKILLEIVGNVSDQDVIATNDKLKKLETLLEDKNLEEFKKIIAFKKKKLNEELKSIPYRIDELNNSIEDIDPEVLDFRKRGIVAAINQIEESLMDNSKMYEGLMKERDKLYQLKSKLREIEFNAKLEAEKPLRHLQKELKMAENEKSQLDMELYRLNNLIETKEDLIKSIEKELAELREKWNQINQEELHIPEDSFICPTCKRPFEEHDIELKKNEMIENFNQNKSKRLSDITSTGKRKKENLEKIKGEIESLIANRNTILSKLESINKAIEKKKTEIENYNPIVNLEDNKEYIDILKEVKELELKLSSPVEVEQEIREYKAKKNELEKELEEINNSLAYHEHNQKAKKRIEELMKREKELANMIAELEGQEYLCEEFIRTKVDLLENRINSKFKNVRFKLFNTLVNGALEECCETLINGVPFQDANNAAKINAGIDIINTLSEHYQITAPIFIDNRESINQILESNSQIINLIVSKDKKLRIEVA >NZ_CP048617|229249:239760|238719_238971_+|WP_163234255.1|DBSCAN-SWA MGKKRKCRMTEEERTIHDKAVKIRKMTDRQIIEYIDDIYKTGYRAGMKTSNISPDKIIDEIKKIKGIGPITLSKIKQVLEGVK >NZ_CP048617|229249:239760|229249_230944_-|WP_163236098.1|DBSCAN-SWA MKKAALYIRVSTHHQIDRDSLPFQRQELINYSKYLLGIDDYEIFEDAGYSGKNMDRPAFQDMMARIRQGEFTHLLVWKIDRISRNLKDFTEMYEEIKKYGVTFISKNEQFDTSSAMGEAMLKIILVFAELERKLTAERVSSIMLSRAEKGLWNGAQCPLGYKWDDEKKFPVPDEEEAKVVQFIYDKYEELRSAFQVMKILNTNNIKTKRGGTWTSKTVVDIIRNPFYKGTYRYNYRESARGKKKDKSEWIIVDDNHEAIISKEQWERCNKIMDFNASRNTALLRKNTHTHIFSGLVKCKKCGRGFNAALDQPRSDGYRPSIYRCQGKSRALGCDAKMVSEITLGPFVINYLANLSKAQQKLTKKHNLKDLEKILLSGKTFKNIAGIETKGLESIYISILYSNLDNVLIDMPKNKDVKKENISEMEILKKEKEKYERAIDRLQNLYLFSEESMSEKDFLLQKHKLKNKIDDINKKLHELHEEHSNQVAYNDISFLQKASHFMISNELLNKKTIDYKNMVMTIDKKLIKDFINTVIDKVIVDDGKVSSICFKNGLTHKFIYRDKDI >NZ_CP048617|229249:239760|231138_231492_-|WP_163234242.1|DBSCAN-SWA MKILRKLRNEKGLTQSEVAKFLGVGRTTYTQYETGKSEPDVKTLKKLAIFFNVTVDYLINDGKMQNEPKEQNEILKEIETLSEESKKELEKYIQLLKIKEQVEKTKEEQSSALEKEA >NZ_CP048617|229249:239760|231681_231876_+|WP_163234243.1|DBSCAN-SWA MFEWLREKRLSRNMTQEQLAKEVGISRTMITELENGNAKPSVKTAKAIAKVLDFSWTLFFDKEE >NZ_CP048617|229249:239760|235026_235356_+|WP_163234250.1|DBSCAN-SWA MLNLKMTIESISKETGRQHMTLGLDEFIKLNKVLNKLADELNQQVSQTNLIRSIEQGLLVNELCKRPGVQSFIIKNGIEYAVVLEGEYEKVDFGPANIIIISNLEGGEK >NZ_CP048617|229249:239760|236865_237351_+|WP_163234252.1|DBSCAN-SWA MANPQLENGFTRIANEILEALAKTKLNGTQFRIIMTIFRYTYGFHRKEHEMSETFIAEAVGITKRQVRRELKTLVDNKIIIITKESTYTKARKLKFNKNYKEWGLFNLQRTKKTTEDKSDLPPEDKLVPTPKEENNKENCSNPCNSQELGEVGLISPQRIN >NZ_CP048617|229249:239760|232846_233092_+|WP_163234248.1|DBSCAN-SWA MRLKQRVEEILKFQISNKDYEEAYRYAKHKLEWQNKHFGTNHGEYYLILLIADTYREQQFSKYTWELCKERMKKAEGVVLC >NZ_CP048617|229249:239760|232391_232562_+|WP_163234246.1|DBSCAN-SWA MQNLHAIAYAVLTYRRLEGQEYDEECFANVMEALMNNYTEDEVVKIVYGEEGKQCC >NZ_CP048617|229249:239760|238970_239483_+|WP_163234256.1|DBSCAN-SWA MAWASTYSNRGKLLEQIIEVANRQYRNKGIAEIQKIATPVKVLRTDKNGKIYGFWEKKSTVDFIGVCNGIPIAFDAKETTGKSLKFDNIHKHQIEFMTNWQQRGGQAFLVVYFSELNRYFRLSILELLQYMKNPLKSNKKSIPIKYFEEYAIELKTGQVFVLDYLKGLRK >NZ_CP048617|229249:239760|232107_232389_+|WP_163234245.1|DBSCAN-SWA MSQSLDRVDIKISVNTKLDGEFDELLFSVDTCNYKEVKNGEVIFYIDFRSDVADAKKDIEKVLDKAKEIQKVYKNVKYPYEAIEILLKKRKGA >NZ_CP048617|229249:239760|237530_237860_+|WP_163234253.1|DBSCAN-SWA MVIFQFAQSLSESDRDINLIKNAMNRAKQNWKPKYQGDQIRSFKYFIPAIQEALAAKEAKLNAINQPDNSRYTKNHRIPWQREGKEENTEYEPKPNSGFRKFKVYNNKS |
17 | Clostridium_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
243483 : 270768
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP048617|243483:270768|DBSCAN-SWA TATGAAATATAATGAAAATATAAGCGTAAAAAAAGCAATAGAAATTGGCATAGAGGCGGGGCTAAAGAAAGCTCTCGAAGAAATAGAAAAAGAAAAAATTAAAAAGAAAAAACAAAGATATGACAGAAGATTACGCAACACTGATTTGTTACTTAAAAACTATAATAATTTTGTTGCTCATTGCGAAAATGCTATATATACAAGAAAGCAACTTCTCGAGAACAATGCTATAGATATTCTTGATGAATGTGAAGATTTAGACTATGAAACTTACGTGAAAGCTATAATGAGAACAAAAGAAAGAACTGCAATTATAGTAAATCATATAAAAAACGTTTTGGAGTTTTATAAGTTTCAGGCGGAGAAGAGTAGAGAGCCTGAAAGAATTAGAAGGGTAAAAGTTATAAAAGCTATATACTTTGACAAAAAGAAGTATGAAGAGATAGCAGAAGAAATGTCACTTTCCGTAAGAACAGTGAAAAGGGATAAAAAGACTGCAATCGCTGAAATTTCAACGCTTGTATTCGGTATAGATGGACTCAAATTCGATATTTAGACATGTCCAAAATATGTCCTTTACATGTCCCTTTTAATAAAATATAATGATAGTATGAAAATCGTGTACATGATAAAAGCACTTGGAGAAATTTCCGGGTGCTTTTTGCTTTTTGAAGGAGGTTTGCTGTTTTGGAGAAACTTAAAATAGAAATGCTCCCTGTTGATGAACTTATTCCTTATGCTAATAATCCTCGAAACAATAAAAAGGCAGTAGATAAGGTTGTTGCAAGTATTAAAGAGTTTGGGTTTAAAGTTCCAATACTAATAGACCAGGATAATGAAATTATAGCGGGTCATACTAGACTATTAGCTGCTAAGAAATTAGAATACAAGAAGGTTCCGGTTATAAAAGTTACTGACTTAACGCCAGAGCAGATAAAAGCATTTAGAATAGCAGATAACAAAACAGCAGAGTATAGTGAGTGGGATTTTGAACTTTTAGCTAAAGAGCTAGAAGAGCTAAGATTAGAAGATTATAATATCGAATTTACCGGTTTTGATATTGGAGAGGCAGAAAGATTGATGAGCGAGTTTCTAGAAGAAACAGAGGAGTTTGAAGACGAAGTTCCTGAAGCTCCTGAAGAACCAGTTATAAAAACAGGGGATATTATTCTCCTTGGCAAGCATAGAGTTATCTGTGGAGATTCAACAAAGAGAGAAGATATAGAAAAGCTTATGAATGGATCTAGGGCAAAGCTCATTGTTATTGACGCTCCTTATGGCGTGGCTTATGTCGGTAAAACAGAGGATGCACTTACTATACAAAATGATGATTTAGAAGATGATGAATTTTACGAGTTTCTTTTAAAGGCACATAAAAATTTATATTTTATAGCAGATGATGGTTGTACTATTTACTCATTTCATGCAGATACTAAAGGCCATTTATTTAGACTTGCACTAATTAATGCAGGTTTTAAATTGTCCCAATGCTGTATATGGGTAAAAGATAATTTCGTTATGGGAAGGCAAAATTATCATTGGCAACATGAACCCTGCCTGGTGGGAGTTAAACCTACAGGTAAGCAATATTGGAACGGAGACAGAAAACAAAGCACAGTTTGGAACTTTGATAAACCTAAAAAGAATGCAGAGCACCCAACGATGAAACCTATTCCTCTTATTGAGTATATTATTAAAAACTCTAGTAAATATGGAGATCTGGTGGTTGATACATTTTTGGGAAGCGGTTCAACTTTAATTGCTGCAGATAGGACTAATAGAATATGCCATGGCTCCGAAATAGACCCTAAATATTGCGAGGTAATAATTAAAAGATGGATAAACTACAAAGATGGAGCTAATGGAGACAATGTGATTATAATCAGGGATAGAGAAAAGTATTCATACAATGATTTAGTTGACTTATTTATCAGCGAGAGCTGATATCAAAGAACTAACACTAAAGTTACAAAGTAGGTGGTGATGTTGAATGACATAAAAAAAGCTGAAAAAGATTATTTAAAAGGTATGAAGTATAAAGATATAGCTAAAAAGTATAATGTATCTTTAAATACAGTTAAATCATGGGTTCGAAGATATAATTGGGCTGAAAAGAAAAAGGGTGCACACAAAGAGGATGTGTGCACACCTAAAAAGAGAGGAGCACCAAAGGGCAACAAGAACGCTATAGGAAACAGCGGGGGTGGAGCTCCTAAAGGAAATAAAAATGCAGTTACTACAGGCGAGTTTGAACGCCTGTTTTTTTCTGATTTAACAAATGAAGAAAAAGAATTGATTAACAGTATAGAATATGATAAAAAAATACTTCTTCAACATGAAATAGCTTTATTAACTGTAAGAGAGAAAAGAATATTACAGAGAATAGAAGAAGCTAAAAATAAGACAGGTGGATTAAGCATAAAAGATGTAACTACTAGAAAGACAGAGATAACCGGAAATCTTTTATCTGGGAAACAAAAACAAAATGAAACTATTACACATGCTTTAAGCACATTTGAACTTATAAGCAGGCTCGAAGAAGCTCTTACAAGAATACAATCTAAAAAAATTAAATGTATTGATAGCCTTAATAAAATCGAAATTGATGAAAAGAGGTTACAGCTTGAAGAAAGAAAACTTACTGGAGAAACTGAACAAGATAAACTTGTTGATGAATGGATTGACAGTGTATTAGGTGATAAAGATGAATGATTTAAAACGTAAAAAGGTCTTTAAGAAAAGAATACCTGTTTATAGAGAAAATCCAGTATTGTTTTGTAAAGAAGTTTTAAAGTTTGAGCCTGACGATTGGCAAGAGCAGGTTTTAAGAGATTTGCCTCATCATTCAAAGTTTAGTATAAGGTCAGGTCAAGGGGTAGGGAAAACAGGTTTGGAGGCCTGTGTTCTTTTGTGGTTTTTAGCATGCTTTCCATTCCCTCGAGTAGTTGCTACTGCTCCTACAAGACAGCAACTTCACGATGTATTGTGGGCTGAAATTGCTAAATGGATGTCGAATAGTCCTTTGCTTAACAGGATACTGAGATGGACAAAAACTAGAATATACATGGTTGGCTATGAAAAAAGATGGTTTGCAGTAGCAAGAACAGCTACTAAACCAGAGAATATGCAAGGTTTTCACGAAGACAATATGCTTTTTATTATTGATGAAGCTTCTGGTGTGGCTGACCCAATAATTGAGGCTATTCTCGGTACACTATCCGGTGTAAACAATAAGCTCCTTATGTGTGGTAACCCTACGAAAACAACTGGCATATTCTACGATAGTCATCATGAAGATAGAGCGATATATAAAACTTATAAGGTATCCAGTGCAGATAGCAAGAGGACAAATAAAGAAAATATAGAGGCTCTTATTCGCAAGTATGGGAAAGATAGTAACGTTGTAAGAGTTAGGGTATACGGAGAATTCCCTAAAGCTGAAGATGATGTATTTATTCCTTTGTCATACATTGAAAATTCAATCATGACTGAATATGATCATAAAAAAGAAGTGGAGCAAATTCATATCGCATGTGACGTTGCACGTTATGGAAATGATAAGACAGTTATAGGTTATAAGATTAATGAAAAGGTTGAATTCCATAGAAAAATTAGAGGCCAGGATACAATGAGAACTGCTTCTGAAATAGTAATACTTGGAGAAATGCTTCGAGATAAGTATAAATTCAAAGGCAAAATACCTATTAAGGTTGACGATGGTGGTGTTGGTGGTGGTGTTGTAGATAGACTAAAACAGATAAAAAACAGCAACCCTAATAAATACGGGTGGATGGAAGTATTTCCTGTTAAATTTGGAGTTAGAATTAAACATAAATATTACTACGATAGTACTACTTATATGATGTCAATTGTTAAAAAGCTTTTAGAAAATATTGATGAAGATGGAAAGCCAAAGCCGGTAGAACTTATCTTACCTAACGATAGCGACTTAGTTGGTCAACTTTCTGTTAGAAAATATCAAGTAACTGAGAACAGTAAAATTAAAGTAGAAAGCAAAGACGATATGAAAAAACGTGGACTTGCTTCTCCGGATGAAGCGGATTGTGTTTTATTATTGTGTTTGCCTGTGAGTATTAAAAAATAAGGTGGTGAGAAAATGCCTAAATCAATGCAAGTTAAAATTATAAAAGCAATTAACAACATTACCGAAAACTTAATACAAAAAGCTGAATCTAAGCAAAATTTAAACAATCAAGAGACTAATGAAAATTTTATATATCCGCCTTATTCACTTAGAGCGTTAAAAGATTTTGTAAATCATTCAACTATACTTCCTCAATGTATCAGATCTTATAAAAATAATATAGCTGGTTTTGGACTCGAAGTGAAATATAAAGATGATTATAACGAAGAAACTCCTGAAATGATTAGAGAATTTGAAAAAGCAGAAGAAATCAGAGATCTTCTTAATATAGATATGGATACAAAAGAAGTCTTTGAAAAACTAATAGAAAGTAGAGAAACTTATGGAATTGGATATTTAGAAATAATACGAAGTCTTGATGGCCAAGTTATCCAAATTGATTTTATAGAAGACACAGAAACTATCTTTAAAACGCCTGCATTAGATCCAGCGCAAGATTATACTTATTTTTATAAAGGCAAAGAAATCAAACATAAAAAGAAATTTAGAAAATACAAGCAGGTCAAGGCAGGAAAAACTATATATTTTAAAGAATTTGGCGATCCAAGAATAATGGACAAACGAACAGGAGAATATTTAAAAGAAGGACAAACTTTAGAACTTCAATATCAAGCTAATGAAATTATGGAGTTTAAAGTAGGAACTGGCGAATATGGTACAGTGCGTTGGATAGGCCAACTACTAAATATAGATGGTAGCAGGAGAGCTGAAAACTTAAACAACAACTATTTCTTAAATGGAAGACATACCCCTTTGATGATTGTCATAAAAGGAGGAACTCTTTCTGATGAAAGCTGGGAAAAACTACAGAATTATATGAATGATATTAAAGGAG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37 | Clostridium_phage(35.71%) | plate,portal,tail,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
357921 : 400732
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP048617|357921:400732|DBSCAN-SWA 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42 | Bacillus_phage(23.08%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1035023 : 1083316
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP048617|1035023:1083316|DBSCAN-SWA 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39 | Bacillus_virus(30.0%) | head,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1160103 : 1212445
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP048617|1160103:1212445|DBSCAN-SWA 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48 | Bacillus_phage(33.33%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1301910 : 1341110
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP048617|1301910:1341110|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP048617|1301910:1341110|1324377_1324929_-|WP_163234990.1|DBSCAN-SWA MNAMTASNLRSAYGGESQAHMRYKVWAAKAEDEGFNNVARLFRAVSFAEEIHATSHFKALKDEKGDFSVTAGAGFGLGSTSENLQGAIAGENFEVEQMYPAFIEIAKMQGEKKATISMKYAYEAEKTHAALFTKAKESVDSGKDVEFGDLHVCEICGYTVEGETPEKCPICGAKSEKFRTFSK >NZ_CP048617|1301910:1341110|1338836_1338980_-|WP_163235001.1|DBSCAN-SWA MNSKFENYTKNKSPNLYTIWIAKKAEVVFIDGELMVVNVIDWNEDSY >NZ_CP048617|1301910:1341110|1340792_1341110_+|WP_163235003.1|transposase|DBSCAN-SWA MPKKQLTEEFRVKVVKEALETGEQGIVARRHDIHPVTSSRWINNYKKYGKTTVSKQTSKTTNKDVKSQILEKENEQLKKLLGEKELEIQILRDLLKKTNQDLKID >NZ_CP048617|1301910:1341110|1320662_1321397_-|WP_035163888.1|protease|DBSCAN-SWA MKDLLVRLFIIAITPAISIAYAVYLSDRYDREPISLLLKTFIFGALSVIPTIIVERFLASFNFFTGIPSAIYTAFLVAGFTEEFFKREVVLRFVYNSKYFDEKLDGIVYSIFSALGFATVENVMYVVFRFSYNSYVGLYRGILSVPAHAIFAVTMGYYLSISKFTSSLTEKELNLKKSLFIPIITHGIFDFMLMSRILILAVLFIPYLIYIWKNSQIKLNKYIIESGERFSKINKKNNLINKRE 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38 | uncultured_Caudovirales_phage(25.0%) | protease,coat,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1747836 : 1760278
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP048617|1747836:1760278|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP048617|1747836:1760278|1753900_1754149_-|WP_035163972.1|DBSCAN-SWA MMKAVVYVTLKKGISDPQGNAVKEALDSLGYREVNKVRIGKIIELELEDMDKEEAEIKIKEMCEKLLANTVMEKYSFEILEG >NZ_CP048617|1747836:1760278|1758823_1760278_-|WP_163235264.1|DBSCAN-SWA MEKFLKEGLTFDDVLLIPAKSEVLPKEVNVETYLTRKIKLNIPIMSAGMDTVTEARLAIAIAREGGIGIIHKNMPIERQAMEVDKVKRSEHGVITNPFYLSPEHNVSDALELMERYRISGVPITDANKKLVGIITNRDIRFETDTSKKIKEVMTKDNLVTAKRGITMDEAQELMKKHKIEKLPLVDDEGKLVGLITIKDIEKSIEYPNSAKDSKGRLLVGAAVGVTRDMLDRVEALVDAQVDVVVIDTAHGHSKGVLEAVSKIKEKFPELQLIAGNVATAEATLDLIKAGADAVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCAQAAKKYDVPIIGDGGIKYSGDIVKAIAAGADVVMMGSLFAGTEESPGETVLYQGRRFKVYRGMGSIGAMAAGSRDRYFQEDSKKLVPEGVEGRVPYKGPLKDVIFQLVGGLKAGMGYCGTPTIKDLQERGQFVRITQAGLIESHPHDIQITKEAPNYSGR >NZ_CP048617|1747836:1760278|1754145_1754853_-|WP_035163970.1|DBSCAN-SWA MKREFVYEGKAKRVYKTDDEKVYLIEYKDDATAFNGEKKGTIENKGAINNKISAMLFELLENAGIETHFVKLIDERRMLVKAVEIIPIEVIVRNVAAGSLAKRLGFEEGTQLETTVLEFCYKNDELGDPLINDYHIQALKLAGKEEVEVIKQKALKINEILVDFFGKIGLKLIDFKLEFGRYDGRIILADEISPDTCRLWDKETNQKMDKDRFRRDLGKVEDAYKEVLRRVEEVL >NZ_CP048617|1747836:1760278|1753193_1753898_-|WP_163235260.1|DBSCAN-SWA MKFGVVVFPGSNCDIDCYKVLSNVLKKDVDYVWHDTENIEKYDVIILPGGFSYGDYLRCGAIARFSKIMDSVVKHANKGKLVIGICNGFQILTEVGLLPGALIRNNNLKFICKTVPIRVENNTIPFTLNYEKGQVINIPIAHGEGNYFIDEEGLAQLEKNNQIVFRYCNEEGLIDEKSNPNGSVKNIAGICNKSGNVLGMMPHPERASELLLGNEDGLILFKSIIDYLERGHFE >NZ_CP048617|1747836:1760278|1754864_1755350_-|WP_163235261.1|DBSCAN-SWA MKVAVVMGSDSDFPIVSKTLEILDKFEIEREVRVLSAHRTPYKALEFAKNAENNGFDLIIAAAGKAAHLPGVLAAVTILPVIGLPIKSSTLDGMDSLLSIVQMPKGIPVATVAINGAENAGLLAVEILSLKYTELKDKLREYREEMKRVVEEKDRQIKEKN >NZ_CP048617|1747836:1760278|1755460_1756786_-|WP_163235262.1|DBSCAN-SWA MEKFFKLSENNTTIKTEITAGITTFMTMAYILIVNPSTLSATGMDSKALFTATALSAIIATLVMALYANYPFALAPGMGLNAYFAYTVVLKMGYSWQVALTAVFLEGIIFIILTFLNVREAIINCIPLNIKHAVSVGIGLFIAFIGLVNSGIVKTGMSYVGDGKLDGIIVKLGDITSKSPLLALIGLVVIGILLARNVKGALLIGIIITTIIGIPMGVTQIPEGMKIISLPPSLSPIMFKFDFSSIFTLDMLVVLFTFLFVDMFDTVGTLVGVASKADMLDKEGKLPKAKQALFADAIGTTVGAILGTSTVTTYVESASGVAEGGRTGLTSLTTAGMFAIALLFSPLFTMVPSAATAPALILVGLFMMSPIKKINLEDFTEAIPAFLTIIMMPLTYSIADGIVFGIISYILLKLLTGKGKQVSPIMYVLGILFILKFIIPS >NZ_CP048617|1747836:1760278|1750992_1753194_-|WP_163236246.1|DBSCAN-SWA MNNKLWESVGLTREEYDKILEILGREPNNLELNMYGVMWSEHCSYKNSRALFKHFPTSNERVLQGPGENAGIIDIGDNKAIAMKIESHNHPSAVEPYQGAATGVGGIIRDIFAMGARPIALLNSLRFGEIEDDAHMRYLFSGVVSGIGGYGNCIGIPTVGGEVYFNKCYKGNPLVNAMCIGVIEHDKIHRGTAAGVGNLVMYVGASTGRDGIGGASFASVELTEETAEQRSAVQVGDPFMEKLLLEACLELLDTDYVVGIQDLGAAGLTSACSEMASRGNSGMVIDVSLVPRREEGMLPVEVMISESQERMLLVIKKGAEEKVKKIFDKWGLHSAVIGKVTDDGMLTIMENGKIVGRVPAKSLADEAPKYYREYEKPEYIDKKRALSIDKLKEVNDLNEVLFKMISSTNLCSREWVYNQYDYQVRTNTVITPGSDAAVIRIDGTNKAIAATTDCNSRYCYLNPRRGAQIAVAEAARNIVVTGGKPLAITDGLNFGNPEKPDRFWQFRESILGISEACRKFNTPVVSGNVSFYNETPENAIYPTPIIGMIGLIDDLDKVMTMEFKDEGDIIVLLGSTKEEIGASEYLKVIHGLELGEVPEIDLDLEKRLQDLCLELIDKKLIKSAHDLSEGGLALALSECLAKGNLGAEISVDTDLREDIYLFSESQSRILVSLDSNNVDKLKKLCNRYEIPFTVLGRTIKDKLSIKINGDLVIDVKVEDITDKLRSVLPCIMG >NZ_CP048617|1747836:1760278|1748450_1749494_-|WP_163235258.1|DBSCAN-SWA MSTKGITYKDAGVDIKAGYEAVNLIKEHVKKTYTKGVMSSIGGFSGLFKIDTDKYKEPILVSGTDGVGTKLKVAYMMDKHDTIGEDCVAMCVNDILCQGAKPLFFLDYIGTYNIEPTVISKIVEGVANGCVKAGCALIGGETAEMPGVYSKGEYDLVGFAVGIVDKDKIIDGLSISEGDVLIGLKSSGLHSNGFSLVRKLFFEIEKFSVNQYVDELGTTLGEELLKPTRIYADVIEKILDKYAVKGMSHITGGGFYENIPRMLPEGFVADIDVRYIDTPAIFKLIEKLGRIDKKEMYSTFNMGIGMVIAVDKEDGDKVLDYLNSIGERAYLIGEIKKGEGGIRICHQ >NZ_CP048617|1747836:1760278|1747836_1748463_-|WP_163235257.1|DBSCAN-SWA MSSVNIGVLISGSGTNLQALIDSIDKGYINGKIKVVISNRKDAYGLVRARKNLIEALYINRKEFNSDIEFDLKILDELEKRQVELVVLAGYLKVLSKEFVNRYKNRIINIHPSLIPSFCGKGYYGEKVHRAVLDYGVKITGATVHFVDEGADTGPIILQEAVFVDDNDTVDTLKERVLEIEHKLLPMAVKLFCENKLEVIGRKVIIKY >NZ_CP048617|1747836:1760278|1749619_1751008_-|WP_163235259.1|DBSCAN-SWA MYNGLVCSDKLNEECGIVGIYSNDIQDISKLTYFGLYSLQHRGQESCGIAVNNKGKIKYCKGMGLVSEVFDDDVLKNLDGNISIGHVRYSTTGESKASNAQPLVVKYKNGDIALAHNGNLVNARTIREILEEEGVVLQTTIDTEVIVNLIARYHKFGIESAIKKVMELIRGSYALVLTMGDMLIGVRDPYGIRPLCIGKLKKGFVIASESCALDTVGADFIRDVEPGEIIIIDAKGMKSIPYDKWCKKSLCIFELIYFARPDSIMDGISVYLARKEAGRILARESKVDADIVISVPDSGTAAAIGFSEESGIPFSEGLIKNRYVGRTFIKPSQELREQGVRLKLNVLKENIKGKRVVLVDDSIVRGTTIRRIVDILKSAGAKEVHVRISSPPVKYPCFFGIDTPERKQLIGAKNTTEEIRKLINADSLSYLSIEGLIKTTGKNGGFCLACFNGDYPMEVPLE >NZ_CP048617|1747836:1760278|1757195_1758728_-|WP_163235263.1|DBSCAN-SWA MKNELILILDFGGQYSQLIARRVREANVYCEIVPYDYDIEKIKAKSPKGIIFSGGPASVYAEDSPKCNQGVFDLDVPILGICYGGQLIAQFFGGEVSRADAREYGKTKLEIIDNTDLFKGLEESIVCWMSHTDFIEKLPEGFEVIAKTDSCPVAAMKNEEKNIFAVQFHPEVEHTQRGRDIIKNFIYDICKCEPNWTMEDFIEQSVREIKEKIGNRKAICALSGGVDSSVAAVLVHKAIGHNLTCIFVDHGLLRKNEGDQVEKIFRDKFNMNLIRVNAKDRFLSKLKGVTDPEKKRKIIGEEFIRVFEEEKNKLGKVDYLVQGTIYPDVIESGTDKASVIKSHHNVGGLPEDVDFEIIEPLRLLFKDEVREVGRKLNIPDEIVDRQPFPGPGLAIRVLGEITEEKLEIVREADWIFRQEIKRNGLDKEIWQYFAVLPDVKSVGVMGDERTYSHLVVLRAVTSTDGMTADWAKIPFDILEEISNKIVNNVENVNRVVYDITSKPPGTIEWE |
11 | Synechococcus_phage(22.22%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1764948 : 1827089
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP048617|1764948:1827089|DBSCAN-SWA 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58 | uncultured_virus(14.29%) | tRNA,coat,bacteriocin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2130587 : 2138848
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP048617|2130587:2138848|DBSCAN-SWA TTTAAAACTCCATAACTTCAATTTGTTTTTGAATAATAATTTTTTCACCTGGCATTATATTTTCAGGATTTATAATATCATTTGTATTTATCAATTCATCAACGGTAGTGTTAAATCTCTTAGCTATGTCCCATAATGTATCGCCTTTTTGAACTATATAAATGGTTATACTAGGCCTATTGCTTAAGTCGACTACTTTATCATCTTCCTCAATCTCTGTTATAATATCAATCTTCTTGATTCTGTCAACTTTAACGTCGTTTTTTACAATACCCTCTATTTCAATATCGCGTGAATTAACTCTATTAAATTTTAAACTATCCATTACAAGCTCAATATCAATGTCCATATCTTCTTTAATTCCATCTATATCTACATAAGATTTAAATGGTATTTCTTCTTTAAAACCCATTATTTCTCCTGTAGATTCTCCAACATATAATATATCTGCCTCAAGTAAGCCTTCAATTATTAATTTATTTTCCACAACTCTATAATCTGCTAATACGGGCTTTGCCATTAAATCGCATATACTCTCAATGCCTTCATAATTCTGCGGTAAGTTAACTACTCCCTTTACAACTTCTTTAGATATGCTCTCTGCTATATTTTCTAATACATCTACTTCTTTTTTAACTAATTTAAACTTTCTCTTTGTAGAATATGAATCTAAAATTACTTCTTTTTCTCTTTGTTCAAATACTTTAGCACTTATTTTTACAAATGCCTCTATGTCTATTACTCTCTTTTCCCCACTTATATCTTCTCTTATGTCATATTCAACATTAGAAATTTCTATATTCACTCTATTATCCATATCTTTAACTGCACCCGGTAAATCAACAAAATGTGTAAATGGGATTTCATATTTCACATGATTTATTCTGCTCTCCTCATCATCACTATAATATATTATTGCACATTCAACTACTCCTGATACTATTACCTTATCTTCAACTACCCTAACTTCTCTTTCATACCCTTTCACATTTAACTTGAGTATATGTTCTATACTTGGCATATCTTCAGATAATTCAAATGCTTCTTTTACCAAAGTATCCGATGTATTACTTCCTACGATATCGTTATACCTTATACAATCTTTTAAAGTCTGTATACCTTCTACTCCCTGAATATCTTTTACTATTTCTATAGTACTGCATGATTGAACTTTTGTATTAAAGTGTAATACGGTCTTAATAGACATTTTTCTGCTGTCTATCAAATTACAGTCTATATGTTCTATGTTTGTTTTAATATCAACATTCATTTCTTCTTCTGCACCATTAATTAAAATTTCTTCTTGAAAATTAGTCGAGTCTTCTATTCTCTCAATAGTTAAATTTTCGTCATCTGCAGCATATAGTATATTGTATTTAATTATTCCATTTATTAATATTTTATCTTTAACAGCTCTAGTTTCTAAAGTCTCTATCTCCCCGTCAATATTAAGTATCTTCTTTATATCGGGTTTAACTTCCGATAATGACATTTCATCCTCAATCAATGCATCAATTTCTTCTTTGCCTATCGTCTCCTCTATTTTGAGTAAATCTTTGATTAGTTCAACTGCCATCTTTATCCCCCTTTCAATTATTTATAATCCATTTGTTCCAATCCCTAATTCAAAGCCTATTATATTATTATTTCTCTATGAAAAATTTTATGTTAAAATGTCCCAAAAAATTACTACAAAAAATTTAACCCACGAATAAATCGTGGGTTTGGCCTCTATTTAAATACCTTTATTTAATTTATTATTTTTCGCTATTTTATCAATTATTAAAGCTATAGCCCCATCTCCTGTAACATTTGTAGCTGTACCAAAACTATCCTGTGAAAAATGAATAGCTATCATTAATCCCTGTTGAGCAGCCGTAAAACCTAACATATTTTCTAATAAACCTAATGCGGCATATACTCCACCGCCCGGTATTCCAGGTGCAGCTACCATTGTTACACCTAACATTAATATAAATGGGAACATCATTTCAAATGTAGGAATAGTTCCTGATATCATCATAAGCCCCATAGATGCAAGCACTAATGTAATAGTATCTCCAGCTAGATGAATAGTAGCTCCTAAAGGTATTACAAAGTCTATGACATCTTCGGATATTCCATTTTTTCTGGCACATTGAATAGTTACAGGTATAGTAGCAGCCGAAGATTGTGTACCAAGTGCTGTGAAATATGCCGGCAGCATATTTTTAATGGATTTAAATGGCCCTTTACCGCTCACTAGCCATGCTACTAAATATTGAATAATTATATAACTTATTTGAAGAATTATTATCAATATGAAGACAGCCGAAAAAGCCTTAATTGTTTTGAACATTTCATTTGTAGCCGCCAATTTCGCAGATATTCCGGAAATATGAATAGGTATAAATGGAATTAATATTCTTCTTACAACACCTTCAATTATATTTTGAAAGTCTTTTAATGTTTCAAATAATGTTTTCCCCCTTATATTTGCCATTCCCAATCCCAATATAAAAGCAAAGATTAGAGCCGTCATTACCCCCATTATAGGCGGCATTTCAATCGTAAAATAAGGTTCTATTTTTACTGCGGATTTTTGAGCCATTTCACCTGCTTTAATTATATTTGGAAGTATGGTAGAACCTAAAAAGAAAGCAGCTGTTCCCGCTATTATCGTAGAAATATATGCTATACCGGCCGTTATTCCTAATAATTTGCCTGCTCCTTTGCCCAAATCTGCTATACCTGGTGCGACAAATCCTATAATTATTAAAGGAATGATAAATTTCAGAAAATTGCCAAAAATACTCGTAAATGTACTTAATACTCTTACTAAAAAGTATACTTGAATAGATCTTGAAATTAATCCTATAATAATTCCTAAAATGATTCCAGCAATCAATCTGGGTAGTAGTCCTACTTTTCTTTTCGCCACACTTATCACCACTCTTTCTGTATTTTTTGTATTTTCAAAATTTTATTTTTAATATTTTATAATAATTATTAACAAAATGCAACAATTTATTGGTGATATCCATAGTATGGTGGCGAACAAAAATCTAAACAATATACTTTTCATTTACTTTTAGGTTTTCTAAAGACAAATAAGTATTCATGTGCAATTAGAAGAAAATTATATTCTATACTCCTTTTATACCAAAATCCTGTTGCTTTACAATTATGCTGCTCTTTTATAATAATCTCTTTTAATATGAATCCTGCATCTAGAAATACCTGCATAACCTTAAATCCTAAAGGTATCATATGTTTATTTTTTCTAGTGTCTCCTATTAATATTGCACAATATTTATTTTCTTTTAACACTCTGAATGCTTCTTTTGCTACTTTCTTCATTTCATTAATAAACTCATCTATATTACATAATGATAAATCTCCTTCTATATCATTACTATATTTGATGATATTTGCATATGGAGGATGTGTGCAAATCAAATCGATACTATTATCAGGTATAAAATCTAAATTTCTAGCATCTCCTTTGTAAATTTTAGGTTCATATTCTTTATTTTTATTAAACCTCAAATTTGCTCTTGCTACTTTAATAGCATCTAAATTAATATCTACCCCTATTCCTCTTCTTTCTAATAATTTTGTTTCAACTAATGTAGTACCACTACCTAAAAATTGATCAAGTACAATATCTCCTTTTTTTGTATATCTGAGAATTATGTTTCTTGGTATATATGGCGACCAATTCCCTCTGTATTTTCCATTATGAGTAGCCCATTTACCTCTATCGGGAAAACTCCAAACAGTTGTAGCCTCTAAAGCAAAATCTTTAGGTTCCCAAGATTGTATTCTTAAAGGTTTTTTAACTCTATATAGTTCTTTGTCTTCTTTCAAATTTTCTAGCTTTTCTAACAATAACTTTTCTGGTATATATGTATACTCTTCAATTTCTTTTACTGAATACCCTTCATTATTCAACTCAACTATGTACTCTATTAATTCTTGATATTGATTTGTATGCTCAATCTCTAAATGCTCTAAATATTCTTTTTTATAAAACCTTTTATCACAAAAAACGCATTTAATTTTTCTTGCCATAGTTCTGACCCCTATGATTTAATTATTTCTTCTAAAACACCGTCAACTATCATTCTAGTATTTATTAAGTAATCATTATTTTCAAAAGTTTCTTTTAAAGGTTTATGTGCTGTTTGCCAACCAATACCATCTGTAATCCAAATGAACTTATCAATAATAACATCCTTTTCTAACAAAAAGTTATTTAAAGATTTAAACTCTCCTGCTACTGATTTTAATTTAGAGCCACCGCCTGAATAAAAATTAGTTTCTATCAATATTAACTTTCCCTTATTATTAACAGCAAAATCATACTGTCTTGATGACTTATCTACAGGCAAATCTACATTCCATGCATTTTTAATTTTTTCTTTTGTTGCTTGTGATATATACTCTAAATCTAATTTATCACATATTCCTTTTACATACCACTCAATGATATTCTCCATAATTTTGCCACCTCTGTTTTTACGTCCATTAGTTCCAATGCCTACTTCTATACCAATACAATAATCTACTATATTTTTAATTTTTTTATTAGAAAATAACTCTAATAAACCAACTCTTTCACAAAACTCTACAATATCATTAATTTCTTCATCAGAATATTTCTTTTTCTTTTTAAAAGAATAATTTTTATATACCCAATCATCTCCCTTAAAATCTATAAGAACCTCAAGGCTTTTGTCTCTTACAGCTATTAAAACAGGTACAGTTGAGACAACTGATGGATATTTTTTTATTAGTTTTTTAAATTCTTCATGTATATTTTCTCTACCAATTAAATAATTCAATATATTTAACTCAACTTCAATATTATCAACATTTTGGAAGACTTTACTCCAATCAATAAAGAACTCAAAAGTTCTATTAGTATGTTTTAGAGTTTTCATAAAGTACTCAAAAACTTCTTCTTTATTTTTTAACCCTAGTCTCATTCTCCAATATCCCCCTTAATAATTTGTAATTAATAGCTCCTTTATCTTCCCTCTTCCATTACCTTTAGAATTTATATTTCTTTTTGCATCTACCCTAAAAATATTAAAATCTCTATATAAATCATCAAAAAAATTATCGTTTTCATTTACATTTTTAGGGTCAGAATTGCTTAACATCAACTTAGCTCCTTTTTCATGCAATCTATGATATAGTTTTGCTAATCTTATCTGTTCATCATCATTAAAACTACATTTTTGATAAGAAGTGAAACTCGAAGTAGCATTTAAAGGTCTATAAGGTGGGTCAAAATATATAAACGTACTCTCATCTACATATTTTTCAATATTTTCAAAGTCTCCATTGAGTATTTGAATACTCTGCAATACCTTTGACACATTTAATAGATTTTCTTCATCTAATATCAGAGGATTCTTATATTTCCCATGCGGTACATTAAACTCTCCTTTTTTATTTACTCTATATAGCCCATTATAACAAGTCCTGTTTAAAAAAATAAAATATGCCGCTTTCTTTAACTCATCTAATAAATTACTATTAAATTTCTTTCTTACTTCATAGTAATACTCTTTCCTATCATCATCATTTAAAGACAAATATTCATCAGATATTTTCCTAAGTTCATTTATTAAAAATTCAACATCATTTCTTATAATCCTGTAAACATTGATTAAATCCTCATTTACATCATTTATTATAATCTTATCAAAAGTATAGTTTTCTAATAAATAAAATAAAACAGCTCCTCCTCCTACAAAAGGTTCGATATATTTTTTTATTTTATTTTGTTTTAATTCGATTGGTAATTTATTACTAATAACAGGGATTAATTGCCCTTTCCCTCCTGCCCATTTAACAAATGGTTTTGCAGCTGCTTTTTCTATTATCAATGTCATCACCTACAAAGTTATATTTTAAATTTATTACAGATAGCAAATTTTCAATTTAGTACAAAATATCAACTACGTTTTATTTTATCATTAACAAATATATAAAAAAAGTACATACTTTTATAATCTATTTGTAGTAATTTTAAAGCGGCCAATGGCCGCTTTAGTTTTTACTGATTGCAAGAACTAATTCTCTAAGTATTTTACATGCAACAGCAGTTGAAACTCCACTATTATCATAATGTGGAGATAGCTCCACAATATCAGCTCCCACAATATCTAAATTCTTTAAAATACCAATAATATTCATCATGTCATTAAATAGTATTCCTCCAGGTTCTGGTGTACCAGTTCCAGGAAAAACTGATGGATCTAAAATATCTAAATCGATAGTAACATAAACTTTTTTCTCTTTTAGCTTATTTACTACGTCTTCAAGACCTTTATATGTGAATTTAGTCAGATTTGTATGTCTTTTAGCCCATTCAAATTCTTCTCTTTCACCAGACCTAATCCCAAATTGGTATATCCTATCATCCCCAAGTAATTCCCATACTCTTCTTATAACTGTAGCATGAGATAACTTTTCGCCCATATAATCTTCTCTTAAGTCTGTATGAGCATCAAAATGTAAAACATAAATATCTTTATACTTTTCATGAACTGCCTTAACAGATGGCAAAGTTACTAAATGTTCACCACCTATCATAACAGGTATCTTACCGTCATTTAAAACATTTTTCGCAAACTCTTCTATCATGTCTAATACTTTTTTCGTATTACCAAATGGAAATTCCAAATCACCAGCATCATAAACTTTTATATCGGTTAAATCCTTATCAAGATACGGACTATATGTTTCCAATCCATATGATTCATTTCTCATTACAGCAGGAGCAAATCTCGTTCCCGGCCTAAATGAAGTTGTTCCATCAAAGGGGGCTCCAAAAACTACTATTTGCGAATCTTCATATTCACTGTCAAATCCTATAAATGTATGAATATTTTTATTTAGTACCAGCTTCGATCATCTCCTTAACATAAGTTGGCAAAGCAAATGCTCCTACATGTATTTCTGTATTATAGTATTTAGTTTTTAGGTTGAATTTCTTCCACTCTTCTGGTTTAAAATCTTTAATTGGATGTAATGATTTTGATGCAAATCCAAATAGCCAATGTCCTGATGGATAAGTAGGCATATGGAACTGGTATACTTCTACTATAGGGAAAATTTTCTTTAATTTTCCTGTTGCTCTTAACATAGCTTTAGCATCTCTTTCATAGTAAGGACTTTCATTTTGATTAACAAGTATACCTTTATCACTTAACGCTTTATAGCAATTCTTATAAAATTCTGTAGTAAACAATCCTTCTCCTGGTCCTATCGGATCCGTTGAATCTACAATCATTAAATCATATTCATTTTCCTTATCTTCCACAAACTTTATTCCATCTTCAAAATATAAAGTTACTCTCTCATCATCTAGTTTAGATGAAGTTAATGGTAAGAATTCCCTTGAAGCCTTAACAACTAATTCATCTATTTCAACCATGTCAATCTTTTCTATTGTATTATATCTAGTTAACTCTCTTACTGTACCGCCATCTCCACCACCTATAACTAGAACCCTTTTAATTTCAGGATTCGTAGCCATAGCAACATGAGTTATCATATCATGATATATAAATTCATCCTTTTCTGTTACCATAACAAGCCCGTCTAATAAAAGTACCTTGCCAAATTCATATGTATCTATAAAATCTACCTGTTGAAAAGGGCTCTTTTCTGAATAAAGATGTTTTTTCACTTTAAAAGAGAATTTAGCATAATCAGTATGTTCTTCAGTAAACCATAATTCCATTTCAAAATTCCTCCTTATGTTAGTTATTTATTATCTTATGACTTATAAAGCCGAGATCACCCTCGGCTTTATTTTTTTTCGTAAATTAAAAATTATGCATTTACAACTTCCGGCTTATGTTTAACTTTTATATCATCTAATTGCCCATTTGAAAATCTTTTTATTTTCTCTACTATTCCTCTTGGAACTTCTTGTGTTTCTGTTTTTTCAGCTTTTAACTTTTCTTTTAGGTAGTCAAAAGCAATCCATGGATCTACTTCATCTCCACATGTAAATAAATCTACCGCTGCATATCCGTATTCTGGCCAAGTATGAATTGTAAGATGAGATTCTTGTATTACCACAACTCCGCTTACTCCCCATGGATTGAACAAATGGAATACACTCTTTACTATTGTTGCCTTTGCTTCAATAGCTGCTTCATTCATATATTTCTCTATTAATGCATGGTCATTTAGTATATCTCTATCGCAGTTATAAAACTCTGCTAAAATATGTCTTCCTAATTGTTCTATCTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP048617|2130587:2138848|2138419_2138848_-|WP_163235549.1|DBSCAN-SWA MKIEQLGRHILAEFYNCDRDILNDHALIEKYMNEAAIEAKATIVKSVFHLFNPWGVSGVVVIQESHLTIHTWPEYGYAAVDLFTCGDEVDPWIAFDYLKEKLKAEKTETQEVPRGIVEKIKRFSNGQLDDIKVKHKPEVVNA >NZ_CP048617|2130587:2138848|2133646_2134639_-|WP_163235542.1|DBSCAN-SWA MARKIKCVFCDKRFYKKEYLEHLEIEHTNQYQELIEYIVELNNEGYSVKEIEEYTYIPEKLLLEKLENLKEDKELYRVKKPLRIQSWEPKDFALEATTVWSFPDRGKWATHNGKYRGNWSPYIPRNIILRYTKKGDIVLDQFLGSGTTLVETKLLERRGIGVDINLDAIKVARANLRFNKNKEYEPKIYKGDARNLDFIPDNSIDLICTHPPYANIIKYSNDIEGDLSLCNIDEFINEMKKVAKEAFRVLKENKYCAILIGDTRKNKHMIPLGFKVMQVFLDAGFILKEIIIKEQHNCKATGFWYKRSIEYNFLLIAHEYLFVFRKPKSK >NZ_CP048617|2130587:2138848|2134650_2135556_-|WP_163235544.1|DBSCAN-SWA MRLGLKNKEEVFEYFMKTLKHTNRTFEFFIDWSKVFQNVDNIEVELNILNYLIGRENIHEEFKKLIKKYPSVVSTVPVLIAVRDKSLEVLIDFKGDDWVYKNYSFKKKKKYSDEEINDIVEFCERVGLLELFSNKKIKNIVDYCIGIEVGIGTNGRKNRGGKIMENIIEWYVKGICDKLDLEYISQATKEKIKNAWNVDLPVDKSSRQYDFAVNNKGKLILIETNFYSGGGSKLKSVAGEFKSLNNFLLEKDVIIDKFIWITDGIGWQTAHKPLKETFENNDYLINTRMIVDGVLEEIIKS >NZ_CP048617|2130587:2138848|2135571_2136471_-|WP_163235545.1|DBSCAN-SWA MTLIIEKAAAKPFVKWAGGKGQLIPVISNKLPIELKQNKIKKYIEPFVGGGAVLFYLLENYTFDKIIINDVNEDLINVYRIIRNDVEFLINELRKISDEYLSLNDDDRKEYYYEVRKKFNSNLLDELKKAAYFIFLNRTCYNGLYRVNKKGEFNVPHGKYKNPLILDEENLLNVSKVLQSIQILNGDFENIEKYVDESTFIYFDPPYRPLNATSSFTSYQKCSFNDDEQIRLAKLYHRLHEKGAKLMLSNSDPKNVNENDNFFDDLYRDFNIFRVDAKRNINSKGNGRGKIKELLITNY >NZ_CP048617|2130587:2138848|2137472_2138327_-|WP_163235547.1|DBSCAN-SWA MELWFTEEHTDYAKFSFKVKKHLYSEKSPFQQVDFIDTYEFGKVLLLDGLVMVTEKDEFIYHDMITHVAMATNPEIKRVLVIGGGDGGTVRELTRYNTIEKIDMVEIDELVVKASREFLPLTSSKLDDERVTLYFEDGIKFVEDKENEYDLMIVDSTDPIGPGEGLFTTEFYKNCYKALSDKGILVNQNESPYYERDAKAMLRATGKLKKIFPIVEVYQFHMPTYPSGHWLFGFASKSLHPIKDFKPEEWKKFNLKTKYYNTEIHVGAFALPTYVKEMIEAGTK >NZ_CP048617|2130587:2138848|2130587_2132162_-|WP_163235539.1|DBSCAN-SWA MAVELIKDLLKIEETIGKEEIDALIEDEMSLSEVKPDIKKILNIDGEIETLETRAVKDKILINGIIKYNILYAADDENLTIERIEDSTNFQEEILINGAEEEMNVDIKTNIEHIDCNLIDSRKMSIKTVLHFNTKVQSCSTIEIVKDIQGVEGIQTLKDCIRYNDIVGSNTSDTLVKEAFELSEDMPSIEHILKLNVKGYEREVRVVEDKVIVSGVVECAIIYYSDDEESRINHVKYEIPFTHFVDLPGAVKDMDNRVNIEISNVEYDIREDISGEKRVIDIEAFVKISAKVFEQREKEVILDSYSTKRKFKLVKKEVDVLENIAESISKEVVKGVVNLPQNYEGIESICDLMAKPVLADYRVVENKLIIEGLLEADILYVGESTGEIMGFKEEIPFKSYVDIDGIKEDMDIDIELVMDSLKFNRVNSRDIEIEGIVKNDVKVDRIKKIDIITEIEEDDKVVDLSNRPSITIYIVQKGDTLWDIAKRFNTTVDELINTNDIINPENIMPGEKIIIQKQIEVMEF >NZ_CP048617|2130587:2138848|2132321_2133506_-|WP_163235540.1|DBSCAN-SWA MAKRKVGLLPRLIAGIILGIIIGLISRSIQVYFLVRVLSTFTSIFGNFLKFIIPLIIIGFVAPGIADLGKGAGKLLGITAGIAYISTIIAGTAAFFLGSTILPNIIKAGEMAQKSAVKIEPYFTIEMPPIMGVMTALIFAFILGLGMANIRGKTLFETLKDFQNIIEGVVRRILIPFIPIHISGISAKLAATNEMFKTIKAFSAVFILIIILQISYIIIQYLVAWLVSGKGPFKSIKNMLPAYFTALGTQSSAATIPVTIQCARKNGISEDVIDFVIPLGATIHLAGDTITLVLASMGLMMISGTIPTFEMMFPFILMLGVTMVAAPGIPGGGVYAALGLLENMLGFTAAQQGLMIAIHFSQDSFGTATNVTGDGAIALIIDKIAKNNKLNKGI >NZ_CP048617|2130587:2138848|2136628_2137486_-|WP_035164121.1|DBSCAN-SWA MVLNKNIHTFIGFDSEYEDSQIVVFGAPFDGTTSFRPGTRFAPAVMRNESYGLETYSPYLDKDLTDIKVYDAGDLEFPFGNTKKVLDMIEEFAKNVLNDGKIPVMIGGEHLVTLPSVKAVHEKYKDIYVLHFDAHTDLREDYMGEKLSHATVIRRVWELLGDDRIYQFGIRSGEREEFEWAKRHTNLTKFTYKGLEDVVNKLKEKKVYVTIDLDILDPSVFPGTGTPEPGGILFNDMMNIIGILKNLDIVGADIVELSPHYDNSGVSTAVACKILRELVLAISKN |
8 | Thermus_phage(14.29%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP048617.1|WP_163234269.1|248948_249134_+|hypothetical-protein |
248948_249134_+
Protein sequences of NZ_CP048617.1|WP_163234269.1|248948_249134_+|hypothetical-protein>NZ_CP048617.1|WP_163234269.1|248948_249134_+|hypothetical-protein MSEDYEQEWANTPIAIQRVLNKTQNQIQQQIQKAEQQDDVEIVAVLKEIKKALKQLEKKVA |
61 aa aa | NA | NA | NA | 243483-270768 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 8.12|1594337|38|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP048617 position: 260861-260824, mismatch: 0 gattctttccaccttataagagtttcaatgcatgtgct CRISPR spacer gattctttccaccttataagagtttcaatgcatgtgct Protospacer ************************************** 2. spacer 8.19|1594804|38|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP048617 position: 260861-260824, mismatch: 0 gattctttccaccttataagagtttcaatgcatgtgct CRISPR spacer gattctttccaccttataagagtttcaatgcatgtgct Protospacer ************************************** 3. spacer 8.26|1595274|38|NZ_CP048617|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP048617 position: 260861-260824, mismatch: 0 gattctttccaccttataagagtttcaatgcatgtgct CRISPR spacer gattctttccaccttataagagtttcaatgcatgtgct Protospacer ************************************** |