Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP047432 | Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-4, complete sequence | 1 crisprs | NA | 1 | 1 | 0 | 0 |
NZ_CP047434 | Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-6 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 3 | 0 |
NZ_CP047435 | Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-7 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP047430 | Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP047436 | Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-8 | 1 crisprs | NA | 0 | 1 | 0 | 0 |
NZ_CP047429 | Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP047428 | Spiroplasma citri strain BLH-13 chromosome, complete genome | 0 crisprs | cas4 | 0 | 0 | 20 | 0 |
NZ_CP047431 | Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP047433 | Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-5, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP047432_1 | 34421-34526 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047432_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP047432_1
>1.1|34447|54|NZ_CP047432|CRISPRCasFinder CATATTTATATTTTTTTAAAAAACCACTTGAAAATATGGGTTTTTTATATTATC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047432_1
The CRISPR arrays of NZ_CP047432_1 >merge|NZ_CP047432|1|34421-34526|CRISPRCasFinder ATATAAATATGATAAATAATATTTATCATATTTATATTTTTTTAAAAAACCACTTGAAAATATGGGTTTTTTATATTATCATATAAATATGATAAATAATATTTAT >NZ_CP047432|1|1|34421-34526|CRISPRCasFinder ATATAAATATGATAAATAATATTTAT CATATTTATATTTTTTTAAAAAACCACTTGAAAATATGGGTTTTTTATATTATC ATATAAATATGATAAATAATATTTAT
>NZ_CP047432.1|WP_147077823.1|33413_34148_-|hypothetical-protein MKKLLSLVSVLTISGTAIQTTIAASPYQKEQEKEYYQDTINYEFFLREPNKIFFTFSKKRWNEIKQLYHDIYIKNKKNIKYQKKTFNINFIDILNNGVWQDWRLNSNSYNAISEKIIDNFDLINNIIEKTKQDYYQLNTNDEKSYFSFFPSTKGVPYSYITEISNQINKVNNYLNWNNLNIVVKGGIIGAVICGSILIIFFSSAAAFFGLANNIRFMASGIVNNAKIGILIGYIFGSGIAWIIN >NZ_CP047432.1|WP_164058538.1|32217_32862_-|hypothetical-protein MKKLLSLVGTGILTTSGIAPLMAMTPGFINTIEENNIIKYYQSNGVFESNILEVDSEKQVFLMNFDLTNILGITTREELINNFDLINFKRNYSENGILMSFNIKSYNDFLLSNEYVLENINVNNFSNSNSISEERNLHLENAWGSANIRLYLEVNLNEEQINTTEGNSNNNHLNLQILIRAELENFEIRRTYGGLINRLQIMVDSSNKIWFYKK >NZ_CP047432.1|WP_147077827.1|30131_31148_-|hypothetical-protein MKKLLSILTISTLTASIPAPLLANTPATRTLTSNSNNDYLPIKEFKNINVSSLKMTIDSKDNIYIGTSNDVFVLKHGETTATKLDGIITNAIKYSVNSLGVDSKDNIYFSKFDGAYKLSAGATTATKIDGISNGICCTTIDSKDNIYIGTDNGAYKLSTGSNTPTKINGINERILSIEIDNNNNVYFGADTGVYKLSAGATTPTKINGINDHVKIIAADSKGNIYFGTLNCVFVLKQGETTATKIDGIDGYVATIGVDSENNIYIGTDNGVFVLKQGSDTPTKINGIQTFISMADFKFDKNNKIYFGTYNGAFVLKHGETTATKIDGTSYDIQSIYNR >NZ_CP047432.1|WP_164028557.1|28561_30160_-|adhesin MTYNLYIIDSNDNIYFGTIRGTTNILQTVLSWAKTQSQFALVDSTKTQTWTRGDLLSVDGELNIDIANPNIDKIIFDNVEQPQTSKQWHINVKPETTACDHNLQVTFTLDGKQYTSEITVSMQAKINPPTPSKQENLSELIKTTDLGNIVDNNDDTIFNAVNQKNSNVIDDFSQIEITKKDNNSATLTAKKYSKSYADSVDVTYNVVSATTVDLKIDVTSSASGIQIDSDYLAQLDSSKMTNKVDTFYYSNGKSTIKIKQPSTGNFITGIVYGCDEKWNKTSQSNNIDPTTGLEIDKGQYGSVDGRYLIELQHKDLPTHTKTIYLQISEKQKIEHYWDTPNGKKFEEWAEDNGEKNIRGYGASQLNNLFEISAIWKQSLKHLDLKLDNFVVDNIKNVSQDEIDTYKTKMLASVKEQVENYASGVVENTGYVININNLVAGDWTTSKDVKVQAVSGSTKLLSFDSKTIPVEQKEQVTPLTSTPDNKKDGDNKFWIIGVVFGVLAGLGLAYLLFKKFVFDKYILKRRSRKRSRK >NZ_CP047432.1|WP_155522161.1|28390_28543_-|hypothetical-protein MMTLLATSGVNDLLNKILLPIYHLPAKITFNAAQRTTAKQAYEELIKEIK >NZ_CP047432.1|WP_164058537.1|28085_28388_-|hypothetical-protein MKIDENICLISHCEETKLLVDRMTLFCVEHSKRFFAFWSRYEVDSELDNMLEIDEEFQKEFFTDMVYDFCYEDIEEWKKINTPPIKNKQKRKKKTKNESR >NZ_CP047432.1|WP_164028561.1|25135_27628_-|adhesin MKKLLSILTISTLTASIPAPLLAAVPLTNTLTSNSNSAYLPVKQINGVNDKVQSITVDIKNNVYFGTNNGAYKLSAGSDTPTKINGINNIVTAIDVDSKDNIYFGTNNGAYKLSAGETNVTSISPLPFFVQSITVDSKNNVYFGTNNGAYKLSAGSDTPTKINGIKGGFVSSSFDSENNIYFGKFDGLYKLSAGSDTPTKINGIDDSVYSISVDSKDNIYIGTDNGAYKLSAGSDTPTKINGINNIVTAIDVDSKDNIYFGKFDGLYKLSAGSETPTKINGISGQINSLVIDKTKYLFCGTNNGAYLIHSALTSLDWTNQQSQFNLVDSTKAMTWTRPDLLSVDGELNIDIANPNIDKVIFDNVEQPQTSKHWKINVKPETTARDHNLQVTFTLDGKQYTSEITVSMQAKINPAPPSKQENLSELIKTTDLGNIFDKNDDTIFSAVNQKNHNVIDDFSQIEITKKDNNSATLTAKKDSKSYAGSVDVKYNVVSATVVDLKIDVTPTSLTATVIKDYLFQIDTSNITNPVNTFYYASSESIITMDKPTPSSVITGIVYGCDEKWNKTSQSSNIDSTNGIKLDGSQLATINGKYVVELSDNLGHTNNIYLQIAQDKKITNYFDTDNGKQFEIWAKANGYDNIRGYSASQLNNLFADSKNWQQLASDSQLASAVADRVKTSGKLSSTAPLTKEQMVEQLKTQIPSDIKIDKVNTSNYEKDKVSFVLNQSEFKPNDKVNITVKYNNATSEQFTLQIKDSNTPDNKKDGDNKFWIIGVVVGVLAGLGLVYLLFKKFVFDKYFLPKINKRRHDKLVEKVRKEEAEKGDKNNKGGDE >NZ_CP047432.1|WP_147077835.1|24866_25136_-|hypothetical-protein MMTLLATSGVNDLLNKILGIALPILIAIAVVSAIIMIGVYAIGGKFNADSSNRKETIKKVMWVLICLLIVILASAIVLAFKDTIAPITN >NZ_CP047432.1|WP_164028562.1|23289_24849_-|hypothetical-protein MRKRKQDNLTVIKSKKPILKQGLEQFVAYYFKKIFTIFAIAMIPLLIIGCIVIAILSAILWFLPNTEPATNIQSFFSSTLNVEAVETIGGSNIMGDIIGWAINSFCAILYLIFIKPIVWLLGGMQDVVYFIGGGALSERLFSMNNISTIYWLLFGIAMAILIVIIGTKAIAWMYNNRRHEIKAAITNILIIIIAIPLIPTLFIMANTIMTMIVKLFLQNAPIDTNNIALAIFNSSFDNGVHHFSYIPVSWTFYDSGSFSYIICLVSECFMVYIMFTVCLFLFWRVIELFILLCYSPVVVVMSVTDQGQQFRNWKDMVLGRFISYAFMFITYNIFIMSIAVLGQVATFMPNSLSQPIFILLGIFAFGFAVAKSPQIITSLIGGNTAMSDSIGNLMSFGMATNLAKIGGKFAWKSGKFAARNAIGKPVGLTQGISSAMKGGTPFKDAAAGTLFGGFNPNTGGVASAFAGQAMKTKDKVMTNISDYQTFKEQRNQKNNKDSVLEQASTKTTKKDKGDKNNEK >NZ_CP047432.1|WP_164028565.1|20777_23300_-|hypothetical-protein MKNNPKIITKKASKVRFTVSNALGGIGWQELFIIFAAVVLITLSLTLLAKLSLLAGVITTVIVAILTIFLIAPNKNGEKLYYVIFVAIVFLFKNKNHKIENTNNIQIINNRVIFNKKQALIYKINAVDLTLSTQEERNTPIYDFSNYLRGLNFDFEIIKIDSKLNFDKNKNYLTQTLKQDSLKNSQKHQLNNFLSMSEYLENQDLKLEQNYYLIVFTNNNDKKLQLSLLSYNQHLSLTLPTSEEIKKIVDKKIIPTNTAISTLPKTIKETANYLKLDNNKFVSYFTVNQFPLTVNDMWLSNFSEIENVNISLRVRHLDNMTAFKLLDRAIRRAQDQETKKASEDIEFNLYLQNFNELLQLIQVGGETLKMVSIIFTCFADSKNGLDQVVSNLKNEMIRNRFTINDLTFRQFETYKCLLFNNNDKLKNIEQEMATITLASAWPFPSKPLNDPQGLIMGENEQIQPIIFDIKTKSSIRASHNAFIVGQMGFGKTFNVKKQLNWLYCNNTKIYIIDPQREYGSFANYHGGEIIEFGNNPKAKINPLEIFTDNFSEHISLLEQWFKNLYSDLTNIELAKLQEYIIQLYKNFKITADTNLSQLTRKDYPILTDLYNLITKKEQDTLLEKMLWKLTKGADGTLFNGVSTLEIKSDLIVFDIYNMAKSKTIANAQMYLLLALLDRVMKKNKEDNLNLSPEQQSWVCIAVDEAHLLINQDNLLALNYLFSLSKTCRKFNGILFILTQSIGDFTQHGEEVKRQARGIIEQCTYQFIHHLNSIGLQNYIELLTDNNMINAYEKNVILTPKKGLCLFSINDKRYILQVIATSEEIKAIGTQEDINNLGKET >NZ_CP047432.1|WP_011310471.1|34555_34798_+|hypothetical-protein MPIIPKKNINILDKTKNTVSFNKELNSSKQVKLNSMTCDIDLINKFNELATKRKWNKTTLMNEILRDYFDRLENNKNEND >NZ_CP047432.1|WP_164028589.1|34784_35558_+|AAA-family-ATPase MKMISFCNKKGGVGKTTLCKNVAYKFALENKKVLVIDLDTQATISFLMQNENIDMSKSLHKIIASDCGMNINKVIQPTKYKNIDIIVGGETLKKSLIVMRELYDNDNFYLIGIKIYQSNQETFDGYDYVLIDYPPTTDDLSLNWLIFSDLIVIPTNNGSGSYKGILDLENTLTFICKKEKRGIPTLKIIFNNVKDDENTNLILKWISDKKLNSKLLETFIQHSKSYVKSENELNSIWTNQHYWRQKQAYEELIKEIK >NZ_CP047432.1|WP_147077814.1|36686_37460_-|AAA-family-ATPase MKMISFCNKKGGVGKTTLCKNVAYKFALENKKVLVIDLDTQATISFLMQNENIDMSKSLHKIIASDCGMNINKVIQPTKYKNIDIIVGGETLKKSLIVMRELYDNDNFYLIGIKIYQSNQETFDGYDYVLIDYPPTTDDLSLNWLIFSDLIVIPTNNGSGSYKGILDLNNNLDLILNKLKMFKPQLKILFNDITETENKNKFEKWLKEINLYDNLLTIFIKHSENFTTSENDFNSIWENPYYWRQKQAYEELIKEIK >NZ_CP047432.1|WP_011310471.1|37446_37689_-|hypothetical-protein MPIIPKKNINILDKTKNTVSFNKELNSSKQVKLNSMTCDIDLINKFNELATKRKWNKTTLMNEILRDYFDRLENNKNEND >NZ_CP047432.1|WP_147077810.1|37953_38469_-|hypothetical-protein MGTLLSILGSLAFASSGAGTTVSATTNNVISEMITSMPVDIELSNEIWDFSIWEIIFHEGENIPFEIFSNVTFSEISWDWIPSTSELSSLSAIEDGVLAGSLGMAAETLGISLAIGAAIYGGYYTYQHWDSVKQSASETLKAAKHYISSATNYLKSWLSLLQSLNNLNLII |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP047432_1 | 1.1|34447|54|NZ_CP047432|CRISPRCasFinder | 34447-34500 | 54 | NZ_CP047432.1 | 37745-37798 | 0 | 1.0 |
1. spacer 1.1|34447|54|NZ_CP047432|CRISPRCasFinder matches to position: 37745-37798, mismatch: 0, identity: 1.0
catatttatatttttttaaaaaaccacttgaaaatatgggttttttatattatc CRISPR spacer catatttatatttttttaaaaaaccacttgaaaatatgggttttttatattatc Protospacer ******************************************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP047432_1 | 1.1|34447|54|NZ_CP047432|CRISPRCasFinder | 34447-34500 | 54 | NC_007391 | Spiroplasma citri pSci5 plasmid | 2943-2996 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047432_1 | 1.1|34447|54|NZ_CP047432|CRISPRCasFinder | 34447-34500 | 54 | NC_007391 | Spiroplasma citri pSci5 plasmid | 27458-27511 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047432_1 | 1.1|34447|54|NZ_CP047432|CRISPRCasFinder | 34447-34500 | 54 | NZ_CP047432 | Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-4, complete sequence | 37745-37798 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047432_1 | 1.1|34447|54|NZ_CP047432|CRISPRCasFinder | 34447-34500 | 54 | NZ_CP047432 | Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-4, complete sequence | 34447-34500 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047432_1 | 1.1|34447|54|NZ_CP047432|CRISPRCasFinder | 34447-34500 | 54 | NZ_CP046370 | Spiroplasma citri strain BR12 plasmid pScpBR12-2, complete sequence | 40109-40162 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047432_1 | 1.1|34447|54|NZ_CP047432|CRISPRCasFinder | 34447-34500 | 54 | NZ_CP046370 | Spiroplasma citri strain BR12 plasmid pScpBR12-2, complete sequence | 36855-36908 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047432_1 | 1.1|34447|54|NZ_CP047432|CRISPRCasFinder | 34447-34500 | 54 | NZ_CP047441 | Spiroplasma citri strain BLH-MB plasmid pSciBLHMB-4, complete sequence | 38288-38341 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047432_1 | 1.1|34447|54|NZ_CP047432|CRISPRCasFinder | 34447-34500 | 54 | NZ_CP047441 | Spiroplasma citri strain BLH-MB plasmid pSciBLHMB-4, complete sequence | 35034-35087 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047432_1 | 1.1|34447|54|NZ_CP047432|CRISPRCasFinder | 34447-34500 | 54 | NZ_CP053311 | Spiroplasma citri strain C5 plasmid pScpC5-7, complete sequence | 274-327 | 1 | 0.981 |
NZ_CP047432_1 | 1.1|34447|54|NZ_CP047432|CRISPRCasFinder | 34447-34500 | 54 | NZ_CP042473 | Spiroplasma citri strain CC-2 plasmid pScpCC2-1, complete sequence | 28255-28308 | 1 | 0.981 |
1. spacer 1.1|34447|54|NZ_CP047432|CRISPRCasFinder matches to NC_007391 (Spiroplasma citri pSci5 plasmid) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
catatttatatttttttaaaaaaccacttgaaaatatgggttttttatattatc CRISPR spacer catatttatatttttttaaaaaaccacttgaaaatatgggttttttatattatc Protospacer ******************************************************
2. spacer 1.1|34447|54|NZ_CP047432|CRISPRCasFinder matches to NC_007391 (Spiroplasma citri pSci5 plasmid) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
catatttatatttttttaaaaaaccacttgaaaatatgggttttttatattatc CRISPR spacer catatttatatttttttaaaaaaccacttgaaaatatgggttttttatattatc Protospacer ******************************************************
3. spacer 1.1|34447|54|NZ_CP047432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP047432 (Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
catatttatatttttttaaaaaaccacttgaaaatatgggttttttatattatc CRISPR spacer catatttatatttttttaaaaaaccacttgaaaatatgggttttttatattatc Protospacer ******************************************************
4. spacer 1.1|34447|54|NZ_CP047432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP047432 (Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
catatttatatttttttaaaaaaccacttgaaaatatgggttttttatattatc CRISPR spacer catatttatatttttttaaaaaaccacttgaaaatatgggttttttatattatc Protospacer ******************************************************
5. spacer 1.1|34447|54|NZ_CP047432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP046370 (Spiroplasma citri strain BR12 plasmid pScpBR12-2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
catatttatatttttttaaaaaaccacttgaaaatatgggttttttatattatc CRISPR spacer catatttatatttttttaaaaaaccacttgaaaatatgggttttttatattatc Protospacer ******************************************************
6. spacer 1.1|34447|54|NZ_CP047432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP046370 (Spiroplasma citri strain BR12 plasmid pScpBR12-2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
catatttatatttttttaaaaaaccacttgaaaatatgggttttttatattatc CRISPR spacer catatttatatttttttaaaaaaccacttgaaaatatgggttttttatattatc Protospacer ******************************************************
7. spacer 1.1|34447|54|NZ_CP047432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP047441 (Spiroplasma citri strain BLH-MB plasmid pSciBLHMB-4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
catatttatatttttttaaaaaaccacttgaaaatatgggttttttatattatc CRISPR spacer catatttatatttttttaaaaaaccacttgaaaatatgggttttttatattatc Protospacer ******************************************************
8. spacer 1.1|34447|54|NZ_CP047432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP047441 (Spiroplasma citri strain BLH-MB plasmid pSciBLHMB-4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
catatttatatttttttaaaaaaccacttgaaaatatgggttttttatattatc CRISPR spacer catatttatatttttttaaaaaaccacttgaaaatatgggttttttatattatc Protospacer ******************************************************
9. spacer 1.1|34447|54|NZ_CP047432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053311 (Spiroplasma citri strain C5 plasmid pScpC5-7, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.981
catatttatatttttttaaaaaaccacttgaaaatatgggttttttatattatc- CRISPR spacer catatttatatttttttaaaaaaccacttgaaaatatggg-tttttatattatca Protospacer **************************************** *************
10. spacer 1.1|34447|54|NZ_CP047432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP042473 (Spiroplasma citri strain CC-2 plasmid pScpCC2-1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.981
catatttatatttttttaaaaaaccacttgaaaatatgggttttttatattatc- CRISPR spacer catatttatatttttttaaaaaaccacttgaaaatatggg-tttttatattatca Protospacer **************************************** *************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation |
---|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
5395 : 44835
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP047429|5395:44835|DBSCAN-SWA 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45 | Clostridium_phage(18.18%) | head,portal,capsid,tail,terminase,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
105017 : 111130
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP047428|105017:111130|DBSCAN-SWA TATGCCAACTTGATTAACGACAATATTTAGTGTTGTTATTGTATTAGCAATTTTTCTTTATTTTGGTTTATTAATTTACCAAAAAATTAAACAAATTCGAGGAAAGAAAAAAGATAAAAAAGAAATTGAAAGAAAGGAGAGTAATAAATAATGTTAGGTATGTATTTAACAACAGCGTTTAATTTTTTAACAGCACCTACACCTAAAACTATGTCTGAGGGTATGACTGGTATTTGAACTGATTTATCTAGTGCATTATGAAAAGTTAAAGAAGGTATAACAAATATTTTACCTGAGATAATGGTTTTCTTAGGTGAAGCGTGAGTTATATTAATTCCATTTGCTATATTTTGTATTATTAAAATCTTAAACTTTTTCCGTGTTATGGTTAAAGGATTTTAATATTTATTATAATCTATTATATATCTTAGCTATGGCACACTAGCTTTTATGTGAATTAAATAAATAATTTTGTTGTTTATTTTTGCACTATACACTGTTTACAAATTTATTTTTTAATAAACTTTATTACTATCGTTAATATTGGGATAATAAATATCCCTATTATACATATAAATTTAACTATATTTTCTATAGTTGATAACTCTATATTGTTTATTATTCATAATATTGAGTCTGTTATGAAAAATATTTTTTTAGTAGGATTTAATAAAAATAAGAATATTTCTATTAAGGGTCATACTAGTAATAGATTTGGGAAATAAATTTTTATAATATTTTTTATAAATACACCTACTTTTTTTAAAAACTTGTAAACAGTATATAGTGTAAAAATATCAACTTAATTATATTTAAGGTATTATTATGGTTTTCTCTCTGTATAAAAATATTTATAAATTTGTTAATTTATTAAAAATTCAAATAATAAATTTAAAAGTTATTATTAAAATTATTATTAGTGAAATAATTGTTTTAATTGGTGATACCATTCATGATAATCAAAAAATAGATGGTATCACATTTGTAAAAAATGAATTTATTAAATAGAAAAATGAATTTATTATTTCTTCGATATTTTATTTCTTCTTTCTATTTAAAATAATTTATACAGAGAGAAAACCATAATAATATCAACTTAATTATAAACTTATGATTTTATATTTTAATAACTATTGTTAAAAATTAAATAGTATTTTTCAGTGTGCCAATTTTTATTATTTTTATATTTAACAATGTTTATTAACAGTGTTTATTAAACATTAAATAAACAATATATTAGCATTATGTATAACATTGTTAATAATCAGTGTTTATTACAATTAAAAAACATTATATAAACATTATTTATAACATTGTTTATTAAACAAATATTTAGTTAGGAGATTATCTTATGGATATAAAATTTAAAACAACTAAGGAATGTAAAAAATTAAAGAGAGATTTTATTATTAGGAATTTTGTTTTTGGTTTTGTTTATTTTCAATTTTTCATTGTTCTTATTGAAATTATTGTAGGTCTTGTTTTGTTTTCAAATAGAGAAATAATTGTTGGTATTTTACTTTTTTCTTTATTTTTATTTTTAATATTTATTCTTTTATTTTTTATAATTCAATGTCATATATGCGAAATTAAAGAATATAAAGTTATGTTGTTAAAGAAAAGAATGTTACCGTTAGAAAATATAATTGGAGGATTAGGAAAAGGCACAATGTTAAGACCAGTAAGACGAGGAGATGATAAAATTGAGTAATTTTGTTAAGAAAAATCATAATGTAGAAAATTATTTTATTAGTAAGGAATTTATCCCTTTTACAACAGAAAAAGCAAGTTTTATTAATTTACCTAATCATAATCGTCATATTGGTTTTTGATTGAGTAATAAGTTTATTTATCCGAGTGAAAAACATTTGGAACAAGTAGCAATCGGTTTGATTTATGATAATTCTTACCCTATTGTAAAATATGATGAAAATTTAAAGCGAAATATTTGAAAATATTTAACTGGAACAGAATTAATCAATTTATATAATCAATATAAACAAAATTATTTTACTAAAATGAAAAAAGCGTTATTTTCAAGTGAACCTAAAAAAGTAAAAGCAAATAATAACAATAATAATTTAACAAATTGAAGTGTTGAAAAAGAACAAGAATTAATTAATGATTTGAAAGACTTAAATTAAATGAGTTTATATGATTATTGAGTTCAATTTGTTAGTTATATTATTGGTGCAAATGCCCCCTGAGTTTTTATATGTTATATCTTTTGTGTTATTTGTTGTTTTATTTTTTGGAATGTTTTTTAAACTTATTCAAAAAATATGGAGTTTTTAAAAATGCAAAATGATTGAATTAAATTAAAAGAGTTTTTTATTCATATATTTTTGTTTATCGATAAAACGAATGTTGAAAGTATTACAATGTGGAATTTAACGCAAAATGAATATTTAACCTTGATGGTTGGTGTTTGAGTTGTGATTTTGTTTTTAACTTGGTTTTTCTTGTGAATGGTTTTTAAGATAGTTGGGTATTTTAAATAATGAAAAAATTTATATTTTTCTTTAAAAACTATTGTTATATTAGTGGTTCAATGCTTTTGTTTAGTTTAATTGATTTATTACTTTGGTTAATTTCTTTGTATTGTGTTGGTTTAGTATTTTGAATATTATTTGCTTTGCAATGTGTATATTTTGTGTGATGATTGTGAAAAAATATTTTTTATCAGTTAAATTCTTTTGGGTTAGTAAATTTTGTTTGAGATAATCCGTTATCGGTAATTATTGGTAAGTTAGGAACTGGTAAAACATTACTTTTAACTTATTTGTCGCAAACTATGAAATTATTGACAGATGAAATTTATAGTAATTATCCGTTAGAAGATGATAAGGTTAAAGTTTTAACATTTAAAAATTTAGATTTTACTGATAGAACAAAACCCGTTCCCCTAGATGATAGTGTTATTTTATTTGATGAAAGTTATTTATATATTGACGGAACTAGTCCTCACGATGAAAAAAAAGTTCATAGTGGTAAAATACCGTGAATTGTTTTAGCGAGACATTTTGGACATCGTGCGTTGTTTACTGCTCAGCGTGAGGGTATGATTTGAAATAATATTCGCCAGTTAGCAAGTGGAATTATTATTCCAATTTCATTGAAAAAACCAGTTATTAAGAAAGGGTTTAATTTTTTTAATCGTTTCTTTATTATGCGAATTGGTATTTTTCAAGATATAACGGATTATGAAATTTGAAAAACAAAATCAGTAGAACGAACAGCAGAAGGTAAAAGAGTAAAACATAAGTCGGATGTTGGGTTAGGAATTCGGTTTTTTAAAATAATTATTCCCCTTGAATTCGCTAATAAGTATGATAGTCAATGGTTAAAGTTTGTGCGTGATTTAAAGAATGATGAAATTGTTAATAAAAAAGAATATTATTGGTCGGAAATCACAAAATTAAGTGTTAAAGAACGATTGGAGTTATTTGATATTGATATTTTGAAAAAGAATTTAAAACCTAAAAAAGAGAAAGGAAATGGTAAAGATGATTAATTTATTAGTTGAAAATAATAATAGTAATTGAGACAAGATTTTTAGTTTTGTTTTTGATATATTTTTGTTTATTTTTGATGTAATTTGAAATACAAAATTACCGATGACAAATACGTCAATTGCTTATTTTTTAATCTTTTTTATGGTTATTAAGTTATCGATTTATGCAATTCACGGGACATCAACACAATATAATAATTTAGGTTCAACAGTTAATAATGGTGTTTCACAAGTATATTCTTCAACAGTTCGCGGTGTTTCTGATACTAAACAAGGTATGCAAAAACATATTAAAGAGCGTAAACAATTTAAAATTAATCGTAATAAAAAACAATTATCAAGTTTAGCAAAACAAGCAAAAACAAGAGAACAAGGATATAGGAGAGTGCATAAGTAATGATTAAATTAGTTTTATTGGTGGCGGCGATTGCGATATTTGGAACTGGTTTTATTACTGTTATTATTAATCAATTTACATCAGCAAAAAATATTATTATGGATTTATATAATTCTGATACTTGGTTGATTTGATTATTTGGTAGAATGGCAGTTTTGTTTAGTCATCCGTTAATGTTAACAATATCGAGTTTATATATTGTTGGGTTTATTGTTTCAAAAACATTGTATAGTTAGGAGTTGAGTTTATGAAAAAATCGTTATCTTTATTTGCCATATTTATTTTAACTTTTTTGGGTTTGGTTATTCCATTTATTACTTTAACGGCGTTTAGACCCTTAAATGAGGAGCAATATACGCTTAAACAAGAAAGTAGTACTGGTAAAGGTATTAATGAAACTGATTTTATTAATACAATGTTTTTACGCAGTAGTTTTTTTGAAAATTGGTCGGAAACAAATTATTTTATTAATCCAACTTTAAAAACATCAAAAAATTTATTGTTTAATGATAAATGGTATTTAGATTTTTTACAAGATAGTTATTCAACCGGAGTTGTTTATGATAAACCTGGTGAAATATTTTTGAATTATTATCGACAATGACATAGTTTAAAAAATAAGTATATGGTTGAAAAATTTTATGATGTTAAAAAAGAGAATTTTTTGAATGATTTAACTGATTTTATTTATGCCTTTGCTGTAAAATATAAGATGTTTAATGTATCGAAAGAAATTGTGGAAAATGTTGACCGTTATAAAGAAAATCATTATCCAAGAGTTAAGTTGAACCAAGATAATTGAAAATTAATTGAAAATAATTATAGTAATGAAATTAAAAATATAAATAATAAAAATTAACAATTTTATAATTTCCAAAATTAAAAATAACTGAATATCATTTATTATTTATATTTTTAATTTCATTACTATAATTATTTTCAATTAATTTTCAATTACTACCTTCTGGTGGTTTTTGTGGATTATATGATGGTTTTGGTGTCGGTTTATTTTCTTCATTATTATTTGGTTTTTTAGATTTTTCACAACTGATTAGTGTTGTTGTGCTTGTTGCGTTTAATCCAATTGCTCCTATTATGCTAAGTCATTTTTTCATATATATTGCTCCTTTTTATTGTTTTATATATAATTGTTTTTATCACATATCAATTATATATCAATTATTCGTATTAAATATTAATTTTATAAGTTAATGAAAGGTATATAAATGTTATGTATAGTCATTTAAGTTTTATGGATAAAGTTAAATTAGAACAATTATTATTATCAAAAATTTTTTTAAAAAAGAATGGTGAGCAGAATATTTCTGCAATTGCTAAATATTTGAATAGACATCGTAGTACTATTTTACGAGAAATTAAGCGTTTTAAAACTATTGATGAATATAGTACTTATAAGTCAGATAAAATGTATTATGAGAAAAGAAAAAAGAATAATAAAAGATTTAAGTTTACAGAAGAACAATTAAATTTTATTCATCTGAGATTTAATGTTTATCATGATTCACCATCAGAACTTATTTATCGTTATTTTTTAAAATTTAAAGTTAAATTTCCCGTTTGTGTTAAAACATTGTATAAATGAATTCGTTTAGGTTTTTATGGTTTTTTAAAACAGAATTTACGACACCATGGTAAAAAATACAAAAGAAAAGGAAAATCTGATAATCGTGGTAAATTAACTGATTTTAAGTCAATTTGAGATATTGATAATAAAGTTTCTAATGTTGGATGACTTGAAATGGATACAGTGGTTGGTAAAGACCATAAATCTGCTATTTTAGTTTTAGTAGAACAATTAAGTAAAAAATATTTTGCAATAAAATTAGAAAATTATACTGCTAGGGAAGTTGAGAAAAAGTTTAAAGATATTATTATAAAAAATAATTTAATTGGAAAAATAAAAGGAATAATAACAGATAGAGGGAAAGAATTTAGTAAATGAAGAGAAATGGAAATATTTGCTGAAACACAAGTATATTTTTGTGATGCTGGTTCACCACAACAAAAACCTTTAATTGAATATATGAATAGTGAATTAAGACATTGATTTCCTAAGGGAACTGATTTTAATAAAGTTAGTCAAAAACAAATAGATTGAGTAGTTAATGTTATAAATGATAAACTCCAACCGTGTTTAAATTGAATAAGTGCAAAAGAAGTATTTTTACAGAATATTAAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP047428|105017:111130|108926_109163_+|WP_015967964.1|DBSCAN-SWA MIKLVLLVAAIAIFGTGFITVIINQFTSAKNIIMDLYNSDTWLIWLFGRMAVLFSHPLMLTISSLYIVGFIVSKTLYS >NZ_CP047428|105017:111130|108522_108927_+|WP_015979226.1|DBSCAN-SWA MINLLVENNNSNWDKIFSFVFDIFLFIFDVIWNTKLPMTNTSIAYFLIFFMVIKLSIYAIHGTSTQYNNLGSTVNNGVSQVYSSTVRGVSDTKQGMQKHIKERKQFKINRNKKQLSSLAKQAKTREQGYRRVHK >NZ_CP047428|105017:111130|107516_108530_+|WP_071890544.1|DBSCAN-SWA MKKFIFFFKNYCYISGSMLLFSLIDLLLWLISLYCVGLVFWILFALQCVYFVWWLWKNIFYQLNSFGLVNFVWDNPLSVIIGKLGTGKTLLLTYLSQTMKLLTDEIYSNYPLEDDKVKVLTFKNLDFTDRTKPVPLDDSVILFDESYLYIDGTSPHDEKKVHSGKIPWIVLARHFGHRALFTAQREGMIWNNIRQLASGIIIPISLKKPVIKKGFNFFNRFFIMRIGIFQDITDYEIWKTKSVERTAEGKRVKHKSDVGLGIRFFKIIIPLEFANKYDSQWLKFVRDLKNDEIVNKKEYYWSEITKLSVKERLELFDIDILKKNLKPKKEKGNGKDD >NZ_CP047428|105017:111130|107313_107517_+|WP_071890543.1|DBSCAN-SWA MQNDWIKLKEFFIHIFLFIDKTNVESITMWNLTQNEYLTLMVGVWVVILFLTWFFLWMVFKIVGYFK >NZ_CP047428|105017:111130|105017_105167_+|WP_071890527.1|DBSCAN-SWA MPTWLTTIFSVVIVLAIFLYFGLLIYQKIKQIRGKKKDKKEIERKESNK >NZ_CP047428|105017:111130|109760_110042_-|WP_071890551.1|DBSCAN-SWA MKKWLSIIGAIGLNATSTTTLISCEKSKKPNNNEENKPTPKPSYNPQKPPEGSNWKLIENNYSNEIKNINNKWYSVIFNFGNYKIVNFYYLYF >NZ_CP047428|105017:111130|106367_106727_+|WP_071890535.1|DBSCAN-SWA MDIKFKTTKECKKLKRDFIIRNFVFGFVYFQFFIVLIEIIVGLVLFSNREIIVGILLFSLFLFLIFILLFFIIQCHICEIKEYKVMLLKKRMLPLENIIGGLGKGTMLRPVRRGDDKIE >NZ_CP047428|105017:111130|106710_107160_+|WP_071890537.1|DBSCAN-SWA MIKLSNFVKKNHNVENYFISKEFIPFTTEKASFINLPNHNRHIGFWLSNKFIYPSEKHLEQVAIGLIYDNSYPIVKYDENLKRNIWKYLTGTELINLYNQYKQNYFTKMKKALFSSEPKKVKANNNNNNLTNWSVEKEQELINDLKDLN >NZ_CP047428|105017:111130|109174_109786_+|WP_071890548.1|DBSCAN-SWA MKKSLSLFAIFILTFLGLVIPFITLTAFRPLNEEQYTLKQESSTGKGINETDFINTMFLRSSFFENWSETNYFINPTLKTSKNLLFNDKWYLDFLQDSYSTGVVYDKPGEIFLNYYRQWHSLKNKYMVEKFYDVKKENFLNDLTDFIYAFAVKYKMFNVSKEIVENVDRYKENHYPRVKLNQDNWKLIENNYSNEIKNINNKN >NZ_CP047428|105017:111130|110158_111130_+|WP_071890554.1|transposase|DBSCAN-SWA MYSHLSFMDKVKLEQLLLSKIFLKKNGEQNISAIAKYLNRHRSTILREIKRFKTIDEYSTYKSDKMYYEKRKKNNKRFKFTEEQLNFIHLRFNVYHDSPSELIYRYFLKFKVKFPVCVKTLYKWIRLGFYGFLKQNLRHHGKKYKRKGKSDNRGKLTDFKSIWDIDNKVSNVGWLEMDTVVGKDHKSAILVLVEQLSKKYFAIKLENYTAREVEKKFKDIIIKNNLIGKIKGIITDRGKEFSKWREMEIFAETQVYFCDAGSPQQKPLIEYMNSELRHWFPKGTDFNKVSQKQIDWVVNVINDKLQPCLNWISAKEVFLQNIK >NZ_CP047428|105017:111130|105166_105418_+|WP_071890530.1|DBSCAN-SWA MLGMYLTTAFNFLTAPTPKTMSEGMTGIWTDLSSALWKVKEGITNILPEIMVFLGEAWVILIPFAIFCIIKILNFFRVMVKGF |
11 | Spiroplasma_virus(88.89%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
474861 : 483008
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP047428|474861:483008|DBSCAN-SWA GATGGAACAATATCTCAAAATGGCTCGTTTTATTTTGGAACACGGTCAAGAAAAAGATGATCGAACAAATACCGGAACAATTTCTTATTTTGGTTATCAAATGCGTTTTAATTTAAGCGAAGGTTTTCCAATTTTAACAACAAAAAAAATTCATTTTAAATCAATAGTTTATGAATTATTATGATTTATTAAAGGCGATACTAATATTAAATATTTAGTGGATCATGATGTTCGAATTTGAAATGAATGACCATATAAGAACTATCAAGCATCATCAAAATATAATAATGAAACATTAGCTGAATTTGTTGAAAAAATTAAAACTGATGCAAATTTTGCTGCTGAATTTGGTGATTTAGGACCGGTATATGGGAAACAATGACGAAATTTTAATGGGGTGGATCAGTTAGCAAAATTATTAGAAAATTTAAAAAAGAATCCATATTCACGTCGCCATATTATTAGTGCTTGAAATCCAGCAGAAGTTGATGAGATGGCTTTGCCACCTTGTCATACTTTAATTCAGTTTTATGTTTCAAAAGATAATAAATTAAGTTGTCAATTATATCAACGTAGTGCGGATGTTTTTTTAGGAGTTCCTTTTAATATTGCAAGTTATGCTTTATTAACCCATTTAATTGCTCAGGTTGTTGGCTTAGATGCTGGGGATTTTGTCCATACTTTAGGCGACTGTCATATTTATAAAAATCATCTTAGTCAAATTAAAGAACAATTAAGACGTTCTCTAGGGAAATTACCAACCTTGAAGTTAAATCAAACTATTTCTTCGTTATTTGATTTTAAATTTGAGGATATTATGCTTGAAAATTATGATCCAGCCCCATTAATTAAGGGGACTGTCGCAGTATAATGATTAAGTTATTATGAGCAATGGATGAAAATAATTTAATTGGTCAAAATGACCAATTACCATGACATTTAAGAGAAGAATTACAGCATTTTAAAGAAACAACATTAGGGCAAACAATTTTATTTGGTCGGTTGACTTATGAAGGAATTGGACGACCATTACCAAAACGAAAAACATTAGTTTTAACAAGACATCTTGATTATCAAATTAAGCATCCAGATGTGGAAGTAGTAACTGATTTAACAGCAATTATTAATTTTTATCATCAAAATCCAACGGAAGATATTTATATTTGTGGGGGAAAAAAAATTTATGAGGCAACATTACCATATGCTGATGAATTAATTATTAGTCTTATTAAAGGAAAATACCAAGGCGATACTTATTTTCCTTCGTTTGATTTAAACCAATTTACTTTAATTAAATTAAACGAATATCAACAATTTGTAATAAAATATTATAAGAGAAAGGAACAAAGTTAAAATGTTAAATATTTGAAAAATTATTATGACATGACCACGATTTTTAGGAACAATTACTAAAGCAAGAAGTATTAGCAAAAAAATTAAAAGAGATCCAAATATTGTTTCAGAAGAATATCGTTATCATTGATTGCAAAAACGAACACGTTATATTTTATGAGTACACGATGTTAAAATAATTGTTCATGATTGTGATAATTGAATTGATAAAGGTTGTTTAATGATTGCCAATCATCAATCGAATGTTGACCCGGCAATATTATTTGCTTTAAATGATTTTAATAAAACTGCACCTTGTGCATTTATTGCTAAAAAAGAATTGCAAAATAACCGAACATTTCGGAATTTTTTAACATTAATTGATGTTTTATTTTTAGATCGTGAAAACCCTCGTCAGGCATTAGAAGTTATTAAAGAGGCAAATGATTTAATCCGTGTACCGCGAACAATGGTTGTTTTTCCAGAAGGAACTCGGAGTCGAAGTCAAGAAATGGGAGAATTTCATGCTGGAAGTTTTAAAATTGCCCAGAAAGCACATGTCTCAATTATTCCTGTTTCAATTGTTAACTCTTATCCAATTTTTAATAAAGAATTTAAAAAAAGAGGGAAAAAGTATGTTCATGTTGTGTTTCACAAGCCAATTAAGCCAGATACGTTTATGACCAAATCAACTGAGTTAATTGCAAATAATGTTAAACAAATTATTCAAAAAGGAATCGACCAATATCAAGATGTTGATCACAAAAAAGCTTATGAAGAATATAAAACTTCATTAAAGAAAAAATAACTTAAAAAAAAGAAGGTATCGAATAGTGAATATTTTAGAATTAATTGATAAAAAGAAAAATGGACAAGAGTTATCACGAGAAGAAATTAACTTTATTGTTAAAGGATATACAACGGGGATTATTACGGATTATCAAATGTCAGCTTTTTTAATGGCAATTTATTTTCAATCAATGTCAGTTACAGAAATTTCGTTTTTAACTGAAGCAATGGTTAATTCAGGGGAAGTATATGATTTAACGGGGATTCCTGGTTTTAAAGTTGATAAGCATTCTTCTGGTGGAGTTGGTGATAAGGTTAGTTTAATTTATGCGCCTTTAGTTGCTGCCTTTGGTTTAAAAGTAGCAAAAATGTCAGGGCGGGGGTTAGGCCAAACAGGAGGAACAATTGATAAGTTGGAAAGTATTCCTGGTTTTAAAGTTGAACTTTCTTTTCATGAATTTAAAGATGTTATTAATAAAACAAATTTATCAATTATGGCTCAATCTGATAATCTTGTTCCAGCTGATAAAAAGATTTATGCTTTACGCGATGTGACAGCAACAGTTGATTCATTACCATTAGTGGCGGCAAGTATTATGTGTAAAAAAATTGCAACTGGTAGTGATGGAATTGTGTTGGATGTTAAATGTGGTAATGGTGCTTTTATGAAAACAATATCTGATGCACGAAAATTAGCACAAATTATGGTTGAACTTGGGATTAAATTTAATAAAAAAATTGCTGCTGAAATTACTAATATGACGCAACCACTAGGTCGTACCATCGGCAATGCAATTGAAATTTATGAAGCGTTACAAACATTGCAAGGAAAAGGACCTGATGATTTGACTTACATTGTATGTGAAGCGGCAGCCTTAAGTTTATGTCAAGCAGGGCTTTTTAACGATTTAGCAACAGCAGTTAAAACTTGTGAAGAAAAATTACAAACTGAAGAGCCATTAAATTACTTCCGTGCTTTTGTTAAAAAGCAAGGTGGAGATTTAAGTTTTATTGATAATAATTTAACTTTAAAAGAGGTATTAAAAGTAAAAAATGTAATTGAAATTAAAGCAAACCAAGCTGGTTTTATGGAAATTATTGATACTAATGAGTTGGGATTATTAGCTGTTCGTTTAGGAGCTGGACGTAATACAAAAAATGAAGCAATTGATTATCATGCTGGTATTTATTTAAATAAAAAAACTGGTGAAAAAGTTGCAAAAGATGATGTTGTGATGACTTTATATACTAGTCGCTATGTTACTGCTCCAGTCTATGATTGAGCACAACGAACTTTTCGAATTGTTTCAACAAAACCACCACAAGAAGAATTAGTTTATGAAATAATTCAATAAAAGTGATGCATTAAGTTAATCACTTTTATTATTTTAATGTCTTTAATTTTTTTAAAATAGCGGTATTATTAACTAAGAAAATAAACATGGGAGAGAAAGAATGTTACATTTACCACGCTATGAAGTAAAACTTGATAATTTTTCAGGACCATTAGATTTGTTATTGCATTTAATTAAAGAAAAGGAAATGAATCTTTTTGAAATTAAGTTAACAGAAATTACTGATCAATTTTTAGCGTATATTAGGGAAATTGAACAATTGAATATTGAAATTGCATCGGAATATTTAACAATGGCAAGTTATTTAGTTGAGACAAAAACAAAGTTAGTGTTGCCAAAAGAACAGGTTGAAATTGATGATAATTATGAAAAAGATGCTCGCGATGAAATAATTAATCGTTTGCTAGAATATAAAAAAATTAAAGAAGTTAGTCAATATTTTAAAGATCAACATCAAGAGGGAATTCGTTATTTATCAAAACCACGAACAATTATTAAAGGAAATTCAATTAAAGAAGAAGATTTACCATTATCACCAAAAATTAATATTGATAAATTAACGAATAGTTTTTTAAAAATGTTAGAACGAATTAATGCGGCAAAACCATTAGAATCAAATGTTGTTATTACTGAAGTTTCTCCAGAAGAAATGGCTGAACGAATCATGATGTTATTAGCACAAGATGATAAAGAATGAACATTAGAAGAATTACTAGGTAATTTTACTTTATCATTACAAGCTTTTGTTGCTTGTTTTATTGCTTTGTTAGATTTATCTCGACACCAAAAAATTGAAATTGAGCAATACCAGCATTTAGAAGCAATTTACATTAGACCATATTTACAGAAAGAGGGGAATTAAATTTGATGAATTTAAATGAAAAAATGGCTGTTTTAGAAGGGCTATTATTTATTAGTGGCGATGAAGGAATTAATTTAAAAGAAATTGCTCATATTCTTGAAATTTCTGTTCCTGAGTGTGAAGAGGTTTTAACAAAATTAAAAGCAGAATATCAAACTAGTAATAATCGTGGATTAACAATAACATCTTTTGCTGATAAATATCGTTTAGCAACAAAGCAAGAATATTATCAATTTTATTTAAAATTAGCTAATAATAAAATAGAAGCACGGTTATCACAAGCAGCATTAGAAACATTAGCAATTATTGCATACCGTGGACCAATTAGTAAGCCAGAAATTGAAGAGTTACGAGGAGTTAATTCTGACAGTGTTATTAACAAATTACGAGCACGTGATTTGATTGATGAAGCAGGTAAAAGTGACTTGCCAGGAAAGCCAATGACATATCATATTACTGAGGAATTTTTAAAAGTTTTTAATTTAACTTCATTAGCAGATTTACCACAAATTAAAGAAACTGTTGTAGAAAAAGAGCAGGATTTATTTAAGTAATGGAACGCTTACAAAAAGTTATTGCAGCAAAAGGTTATTGCTCACGACGAAAAGCAGAAGAACTAATTATTCAAGGAAGAGTTAAAGTTAATAATGTTGTGGTAACAACATTGGGCACTAAAGTTGGCAAAAATGATCAAATAAATAATCAAATTCTTATGAATGAAAATTCAAATAAAATTTATTTAATGCTGAACAAACGACGGAATTGTGTTTCAACGATGTATGATCCGCAACATCGCAAAACAGTTTTAACTTATGTTAAAGGTATTTCAGAACGAATTTATCCGGTAGGTCGCTTAGACTATGATACTAGTGGTCTTTTACTATTGACTAATGATGGAGAATTTACTAATATTATTACACACCCAAGTCATATTATTAATAAGACATATCATGTTTTACTTTCTGGTTATCTTTCAAAACAACAATTACAACAATTAGCAACAGGAATTGAAATTGAGCCAGGAATTATAAGAAGCCAAGCACAAGCAAAATTAGTAAAATATGAAGAAGTAAAAAATGTTTTGATTCTTTTATTAACTATTCATGAAGTCAGAAAACATCAAGTTAAAAAAATGATACAATCATTAGGGCATGAAGTTATTAAATTAAAACGAATTGCAATTGGTTTTTTACAATTAGATGAAACATTAAAGCCTGGTGAATGACGTTATTTAAAGCCCAAAGAAATTAAACGTTTTTTTGGAATAGCATCACACTTAAAAACAAAATAAAGGAGAGAAAAAACAATGCGGATTACATTAGCAGGAGTTGTTGGAGTTGGAAAATCAACTGTTAGTAAGCTATTGGGAAAAAAGCATCATTATATGGTAATGGATGAGCCAGTTGAGGAGAATCCATATTTAGATCAGTATTATGCTGATCCAAAAGATATGGCTTTTAAAATGCAAGTATATATGGTAATGGCGCGTAGTAAACAATTAAAACAAGCAAAAATAACATCTAATATTATTTTTGACCGTAGTATTTTAGAAGACCCAATTTTTGTTGATGTTTTATATGAGTTAGGATATATGAATACAACAGATTATAAAGTTTATAAAGAATTTTATGATGTTGTTGTTTTACAAAGTTTATATTTAGATGAAAACATTAAACCAGAATTAGTTGTTTATTTACGAGTTGATCCAGAGATAGCAATGGAACGAATTACCAAAAGAGGCCGCGCTAGTGAACAAAATATTGGCAGCGCTTATTGAACATTATTAAACCGAAAATATGAGGAATGATATGAACGCTCAAAAGATAAGTTTAATTTTTTAGTTATTGATGCCAATCATAAAACACCAGAAGAAATTGTTGCCATAATTTCAGAAAAATTAATTGAAAAGAAATAATATAAAAAAACTAGTGTTAATGAACATCTAAAATAAAATTGACAGAAAAAAGAGACAAACATTTTCTATTATATAATTTTATTGAAAGGATGTTCTTTTCTTATGGCAAAACAATGAAACAAAAATGAAAAACTAGAAATTTTAACATTTGCTGAGTTAAATGGCATTAGACTAACAGTTCAAAAATATAACATAGCCAAATCTACTATCCATAGATGACGTGTAGACGCACAAAACAATTTTGATAACCTAGAATGAGGTCGTGGATCTCAAAGTAAACAAAAGACAAAAAGAAGAATTAGTATTTCAACAATTGACTCAAATGATGTCAAAAAAATGTCACGTTCTGAATTAGAAGATATTGCTAAATTACATTTTGCATTAAAAAAGTATGAGGCGAAGACTATTAAAGAAAAGTTCTTCGCCGTAAATAAATTATCAACAGACTATTCTGTTGATTTTTTATGTAGAAAATTAGGTATTACTAGACAAGGTTATTACTTATGGATTAAACAAGGAAAACCTATGTATAAAAACTATAATTTTGTTTTAGCAGAAATAATACTTGAAATATTTAATAAATTTAAAGGTATTTATGGGTACCCAATGATTACGATTTTGTTAGAAAAATATAAAAATATCAAAGTTAATAAATGAGTAGTCTATCGCTATATGAAAATATTAAAAATTAAGTCTATTCGGAAGAAAATAAAACCGAATTATTTTAAATCAGGTCCTCTAAGATTCCCAAATATCTTAAAACGAGATTTTGTTACATCTGAACCAAACAAAAAATGAGTGACAGATATTACATATTTACCTATTAAGAATGGAATGGTATATTTATCAATTGTTCGTGACTTACTCAATGGTGAAATAATAGATTGAAAATTATCAAATCATGCTGATGCTAATTTGAGTTTTAAGAATTTAGTATCAGCTTGAAATTATGCAGGACGTCCCAAAAAATTAATTATTCATTCAGATCAAGGCTATGCATATACATCCCCGCAATGAAAAGAATTGTGTGAAAAAATGGGAATTATTATTTCGATGTCTCGCCGTGGTAATTCACCAGATAATGGTGCTTGTGAAACTTGATTCAGTTTATTTAAAAATGAATGTTTTTTCTTATATAAACGAAACAGCCTTAATTTTAGTAATATTATGAACATTGTTTCAAATTATGTTGATTTCTATAATTTTGTCAGACCTAGAGTTAAACAAAGAAAAACTCTATTCGAACAACGAATGGAGTTTCAAAATAAAAATGTCTCTTTTTTCTGTCAATTTTAATTGGCATTGTCATTAACACTAGTTTTTTTATATGTTTAAATTTGCCCTAATCCTTTTTCTTTTCAAATTTTCATCACAGCATCTTTTCCTTTTGTTTCTAAAATATCTTTGTATTCTAAATAACGTTCTTGGCATTCTTTAATTTCTTTTAAAGCTTGGTCTAATCCACTTCAACCATTAATTTTAACTTCTTTTTTTTGTAATGTTTTATATTGTAAAAAGAAAGTTTCAATTTCATTTCGTATTGCTAATGGAACATCTTCTAAAGTTTGAATATGATTAAAACGAGGATCATCTCCCATAACAGCCATTAATTTTGTGTCAATTTCACCGTTATCAATCATATTAATTGTTCCTAAAATACGAACATTAATTTGACAGCCAGGAATTGTTGGATAAGTGCTTAATGAGATTACATCAAGGGGGTCGCCATCTCAATCTAATGTATTTTCAATAAAACCATATTCTCCTGGATAAAAATTAGCACCATATAAAACACGATCTAAAACGATTCGTCCTGTTTTAAGATCGTATTCATATTTATGACCAGACCCCTTAGGGATTTCAACGATAATTGGTAAAACATTATTTTTACTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP047428|474861:483008|478436_479198_+|WP_071937088.1|DBSCAN-SWA MLHLPRYEVKLDNFSGPLDLLLHLIKEKEMNLFEIKLTEITDQFLAYIREIEQLNIEIASEYLTMASYLVETKTKLVLPKEQVEIDDNYEKDARDEIINRLLEYKKIKEVSQYFKDQHQEGIRYLSKPRTIIKGNSIKEEDLPLSPKINIDKLTNSFLKMLERINAAKPLESNVVITEVSPEEMAERIMMLLAQDDKEWTLEELLGNFTLSLQAFVACFIALLDLSRHQKIEIEQYQHLEAIYIRPYLQKEGN >NZ_CP047428|474861:483008|475730_476213_+|WP_071937085.1|DBSCAN-SWA MIKLLWAMDENNLIGQNDQLPWHLREELQHFKETTLGQTILFGRLTYEGIGRPLPKRKTLVLTRHLDYQIKHPDVEVVTDLTAIINFYHQNPTEDIYICGGKKIYEATLPYADELIISLIKGKYQGDTYFPSFDLNQFTLIKLNEYQQFVIKYYKRKEQS >NZ_CP047428|474861:483008|474861_475731_+|WP_071937084.1|DBSCAN-SWA MEQYLKMARFILEHGQEKDDRTNTGTISYFGYQMRFNLSEGFPILTTKKIHFKSIVYELLWFIKGDTNIKYLVDHDVRIWNEWPYKNYQASSKYNNETLAEFVEKIKTDANFAAEFGDLGPVYGKQWRNFNGVDQLAKLLENLKKNPYSRRHIISAWNPAEVDEMALPPCHTLIQFYVSKDNKLSCQLYQRSADVFLGVPFNIASYALLTHLIAQVVGLDAGDFVHTLGDCHIYKNHLSQIKEQLRRSLGKLPTLKLNQTISSLFDFKFEDIMLENYDPAPLIKGTVAV >NZ_CP047428|474861:483008|479751_480489_+|WP_071937089.1|DBSCAN-SWA MERLQKVIAAKGYCSRRKAEELIIQGRVKVNNVVVTTLGTKVGKNDQINNQILMNENSNKIYLMLNKRRNCVSTMYDPQHRKTVLTYVKGISERIYPVGRLDYDTSGLLLLTNDGEFTNIITHPSHIINKTYHVLLSGYLSKQQLQQLATGIEIEPGIIRSQAQAKLVKYEEVKNVLILLLTIHEVRKHQVKKMIQSLGHEVIKLKRIAIGFLQLDETLKPGEWRYLKPKEIKRFFGIASHLKTK >NZ_CP047428|474861:483008|480504_481113_+|WP_004028620.1|DBSCAN-SWA MRITLAGVVGVGKSTVSKLLGKKHHYMVMDEPVEENPYLDQYYADPKDMAFKMQVYMVMARSKQLKQAKITSNIIFDRSILEDPIFVDVLYELGYMNTTDYKVYKEFYDVVVLQSLYLDENIKPELVVYLRVDPEIAMERITKRGRASEQNIGSAYWTLLNRKYEEWYERSKDKFNFLVIDANHKTPEEIVAIISEKLIEKK >NZ_CP047428|474861:483008|482444_483008_-|WP_071937091.1|DBSCAN-SWA MSKNNVLPIIVEIPKGSGHKYEYDLKTGRIVLDRVLYGANFYPGEYGFIENTLDWDGDPLDVISLSTYPTIPGCQINVRILGTINMIDNGEIDTKLMAVMGDDPRFNHIQTLEDVPLAIRNEIETFFLQYKTLQKKEVKINGWSGLDQALKEIKECQERYLEYKDILETKGKDAVMKIWKEKGLGQI >NZ_CP047428|474861:483008|481215_482409_+|WP_071937090.1|transposase|DBSCAN-SWA MAKQWNKNEKLEILTFAELNGIRLTVQKYNIAKSTIHRWRVDAQNNFDNLEWGRGSQSKQKTKRRISISTIDSNDVKKMSRSELEDIAKLHFALKKYEAKTIKEKFFAVNKLSTDYSVDFLCRKLGITRQGYYLWIKQGKPMYKNYNFVLAEIILEIFNKFKGIYGYPMITILLEKYKNIKVNKWVVYRYMKILKIKSIRKKIKPNYFKSGPLRFPNILKRDFVTSEPNKKWVTDITYLPIKNGMVYLSIVRDLLNGEIIDWKLSNHADANLSFKNLVSAWNYAGRPKKLIIHSDQGYAYTSPQWKELCEKMGIIISMSRRGNSPDNGACETWFSLFKNECFFLYKRNSLNFSNIMNIVSNYVDFYNFVRPRVKQRKTLFEQRMEFQNKNVSFFCQF >NZ_CP047428|474861:483008|477025_478336_+|WP_071937087.1|DBSCAN-SWA MNILELIDKKKNGQELSREEINFIVKGYTTGIITDYQMSAFLMAIYFQSMSVTEISFLTEAMVNSGEVYDLTGIPGFKVDKHSSGGVGDKVSLIYAPLVAAFGLKVAKMSGRGLGQTGGTIDKLESIPGFKVELSFHEFKDVINKTNLSIMAQSDNLVPADKKIYALRDVTATVDSLPLVAASIMCKKIATGSDGIVLDVKCGNGAFMKTISDARKLAQIMVELGIKFNKKIAAEITNMTQPLGRTIGNAIEIYEALQTLQGKGPDDLTYIVCEAAALSLCQAGLFNDLATAVKTCEEKLQTEEPLNYFRAFVKKQGGDLSFIDNNLTLKEVLKVKNVIEIKANQAGFMEIIDTNELGLLAVRLGAGRNTKNEAIDYHAGIYLNKKTGEKVAKDDVVMTLYTSRYVTAPVYDWAQRTFRIVSTKPPQEELVYEIIQ >NZ_CP047428|474861:483008|479203_479752_+|WP_004028618.1|DBSCAN-SWA MNLNEKMAVLEGLLFISGDEGINLKEIAHILEISVPECEEVLTKLKAEYQTSNNRGLTITSFADKYRLATKQEYYQFYLKLANNKIEARLSQAALETLAIIAYRGPISKPEIEELRGVNSDSVINKLRARDLIDEAGKSDLPGKPMTYHITEEFLKVFNLTSLADLPQIKETVVEKEQDLFK >NZ_CP047428|474861:483008|476214_477000_+|WP_071937086.1|DBSCAN-SWA MLNIWKIIMTWPRFLGTITKARSISKKIKRDPNIVSEEYRYHWLQKRTRYILWVHDVKIIVHDCDNWIDKGCLMIANHQSNVDPAILFALNDFNKTAPCAFIAKKELQNNRTFRNFLTLIDVLFLDRENPRQALEVIKEANDLIRVPRTMVVFPEGTRSRSQEMGEFHAGSFKIAQKAHVSIIPVSIVNSYPIFNKEFKKRGKKYVHVVFHKPIKPDTFMTKSTELIANNVKQIIQKGIDQYQDVDHKKAYEEYKTSLKKK |
10 | Staphylococcus_phage(28.57%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
574923 : 629089
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP047428|574923:629089|DBSCAN-SWA ATTATTTTTAGCAATCAAAGGAATTTTAACAAAAATAACTGTTGATACCGCCAAATATGCTGGTGAGCTTAAAAAAACATCAAAAGAAATCGGTATCACAGCAGAAAACTTACAAATATTTCGTTATATTGCAAAAAGAACTGGAATTACTAGCGAAGAATTAGAAAAGAGTTTTAAAAAATTACGACAAGGTATTAGTGCTATTTCTTATGGAATATCAAATGAAACAACAGAAGCTTTTAATAAATTAGAAATTAATATTAAAAATAATGAGGGATCTTTAAAAGATACAGGAACTATTTTTTTAGAATTAAAAAAATCATTAGAACAAATAAGTGATGAAACTGAAAAAAATAATTTAATAATGGATATTTTTGGTTCTAAGTTAGGAAAAAACCTTATTCCAATGCTTGCCTTATCAGATGAAGAAATTAAAAAAATGACAAACAACATTAAAGATTTAGGTATTGTTTCAAATGAAAATGTTGACAAAACAACACTATTAAATAAAAAATGAAATGAATTTAAACATGTTATTAATATTACAAAAATGAATTTAGCACCCGCCCTATTACCCGTGTTTGAGTCTTTGGTTTCTTTTTTAGAAGTCAGTTTAATACCAATTAATTATTAAAGGAATAACAAATTTTTTTAATATGTTTAATGATACAACCAAAAAAACTATTTTTATTATTTTAGGAATATCAGCAAGTTTGGGAGCTGTTGTTTACACAATTGGAAAAATAATAAATGTTATTAGTTCATTAAAAACACTTTTATTAGGAATGGCAAAGCACCCAATTCTTTATGGTGTTTTAGTTAGTTTGTCTGCCTTAGCTGCTGGTGGGGTATGATTATATAATAAATTTAATAAACCACCACAAAACATTAACCAAGAAAGCCAAACTAATAACTATAATAAAATTGAAAATAAAAATGAATTTAAACCAACAATTATTATTGAAGGAGAAAATGATAAAGAACGAGCTGAAAAAATACTCGAATATATAGGGCAATGAAATAATAGAGTATAGGGAGAAAAATATGTATAATTTACCATTTAGAACTTTTAAAATTAGTAATAATAAAGATAATTTAATTAATTTATGTGATTTAGATAATATCATTATTTTATCATTTAATGGATTAAATATTAATTTTGATAATAATTATTTAAACATCGATAATAATTTTATTTTAAATAATAGTAAGCATTCTTTAAATCAAATAAATTTTAAATTATTATTTATAAGTCCAAACCCCTATGGTAAATTTAATGATTTTATTAATAAATTAAATATTAATTTAGATAATAAATCTTACCCCTTTTTATTATTTTATAGTTTTTGAATAAATGAGAAAACAAAATTGGAATATTATTGTGAAGTAATTATTAAAAGTATTATTAAAACAGAATTGAATAATAATAATGATTTAGAGGTTGATTTTATTTTAGAACAATTAACTAACTGAAAAAAAGAAGAAGATAAATTATTTGAAATTAAACCAAATAAAACAAGCGGAAAAATATACAATGAGCATAATAACAAATATTATTTTAAGTTAAATCGCATTAAATATGCCAATCAATATAATGAAAAAACTAAAATTAGTAATAATAGTTATTTAGCATCAGATACTCTAATAACAATCAATGGCCCCACAAAAGAGCCGTATTTAAAATTAGAAAATATTAATGGTAAAGTAATAAGTGAACTTAAAATTAATGCTGAAATAAATGAAAATGAAAAAATAATAATAGATAGTAGATTAAAAACTCAAAGCATTATAAAAGTTGATTTAAAAACCGAAAAATCATACAACATATATCAATATCAAGATTTTAAATATACTAATTTTATTCAAATTCCACCAGGAAACTATCATATTTTATATTCTTCTAACCTTTCAAAAGACAAACAAGTTGGAAATATTAATATTAAAAAATTTGAAGAATATATTTTAATTTAGAAAAAGGAGAAATTAAATGGGTGTAGGAAGTTCAACAAAAAACCACTGAAATGACGAAATAATTGCAATTAGAGAAGATAAAAAAGAAATTATTAATAAGTTAAAAAACAATACTTTAAATTCAGAAATTTTAAAACAAATCCAAGAATTAAAAGAAGAAATATCAGAATTAACAAAAGAAATTAATGTTGAAAAAAATCCTTTTGATGAACTTGTGAAAAATTATCCTGAAGTTATTTCACAAATCTTACAAACGCCTGATTATAAATTAATGATTGATTATCTTGATGAATTATCTAATATTGTGCTTGAAATTAATAAAACACAACAAGAAGCAGAAGAAAAAGCAAGACAAAAAGCAAAAGAAGAATTATTAAAATTAGAAATTAAAAAAGATAAAAATATTTATCAAGGTAATAGAACTAAATTAATTATATTAGGAGTTGATTTTGAAAAAGGATCTTTATTTTATAAAGATAATTGTATTGTTGAAAATTATAAGATATTTTTAGATATTTATACCCCGCAACTATCAACTTTTAATGCTTATAATTATTATAATCTTAATGTTGAAATTGAAGACATTGTTTGTATTTTGAATAACGAAAATCAATTATATATTGGAATTATTACTCATATTGAAAAAAACAAAGATGAAAATTTATATACCTTTACTACTAAAAATATTGAATCTATTTTTGATTTTAAAATTTACAACATATATAAAAATAAAAGTTGATATACTTTTCTTACTTTAATAAAAATTATTTATAACAATCTTCCCTTTATTAAACTTAATAAAAAAATTAATGATGAAAATAATAATAATCCTAAATTTTTTGAAGAAAATGAAGAAAAAGAATTTAATTGTTATCAATTTATTAACAAAATATTTAAAATAACAAATATATTTTTAAAATTTAATATTGATTTAAAAAATTTTATTTTAAATTGTGACATTTGCAAAGAAGGACAAGAAGATATCAAATTAAATAATTATAAAGTAAAAGATAATATTAAATGTATTACAAATATAGAAATTGAAGAATTAAACCAAAAAAGTATCAACAGAATTGATTTTTACCAAAAAAATAACTCAAACAAATATAAAAGAGCAATTTTATTAAAAAATAATGAAATCTCTTTTGATGAAAAAAACAATAATTTACAAAATAATTTAATTAAAAATAAAATTTATGAATTATAAGAAAAAGACTTTACCTTAGAAAATATTATAACTATTAGCAATCAAGAATTTAAGTTAAGTGAATACTCACACCTCATAAAATTTGATATCACAAAAGATAACAATATTTTAAATTTAAACAATTTACAACTAAGAGATAAATTTACCCTATTATTTAACAATAAAGAATATAACAGCATTTTATCTGGGATAATTTTAGAAAGCAATAAAAACACAATTACCCTAATATTCGGCCAAGTAAGATTATGAAAGTAAGTTTTAACACTTATTAACTAATATGCCCCTTAAAACAAGTAATAAAGGTATTTACAAATAATTATATTTTTATATAATCAATATGTAATAAGTTATTTATTTAAGGAAATATAAAATTTAATAAAAAATATAGGTATTTAAATGTTTTATTATAAATGAGGTTTTATAAATAAAAATGATGTAAATTTATTTAAATTAGCATTTATAAAAAACTCCTAATTTAAATAATGAAAATAACAATTTTTGAGATATTAGCTATAATAATAATTAAATTAATTCATAAAACAAAAATTAAAGATTATAAAATTAATGTAATATGAAAAAAGATTATTTTAGATGATGAATTTGCTACTTATTTAATAAAAATAGTTTATAGGTCGCATGAAATAGCACAAAAAATTAAACAAGAAGGATTATATGGCGAAAAATGAAAGGGGTCAATCAATGAAACTGTTAATGCATTAGTGTATAAACATTCCTATAATGATAAGATAACAGCTAATTTATTGTTTTTATTTGAATGTAAACAAAAATTTAACAATGGAAATAAAAGAACTGCACTAATTTCGTGTATATTATTTTTAAAATCTTGTGGTTTATTTTTTAGATATACAAATACTGTTGAAAAAGAATATATGAATTTATGAGAACCACGTATGAAAGAAATAGTTAAAATTTATGAATCAAGAAAATATTTAGATGAAATAATAATTGAAAAAATAGAAAAAATCATTGAAGAAAATGTTACAATATCTTATACAAGGTATTAAAATTTAATACAAAAAGGGACTGAGTAAATATGTCAAAAATTATGGAAAAAAAAGATTATAAATTATTGGAATTTAAATTTAATGAATGAGAACAAGATATTTATAATCACAAAGAATTAATGGAAAGTTTAAAAGCATTAGCAGATACATAATAAAAATAATAAAAAAAGAGATATTAAATCCCTTTTTTATTTATAGTATCGCACAGACTATTGACTGGCAATGTTTCTTTTCTTTATTTAAAAACTTGCAAGTAGAACCTAGAATAACTCGCAACATCACTTGCTATTTAATTATAGCATGTTTTTAGGTTTTTATTATATAATTTAATTAATAAAGAAAAGGTGATTAAGATGAAAGAAACTATGTTATCAAAATATTTAAATGTATCTCCAATAGAAGCAAACAAAATAGAAATGGCAGTATTATATTTATTAATTAATTGCAAAAAAAAATTTATTTTTAAAATATATATATAAATTTATTGCATCTTTAGAAATAGAAGTAGCCAAAAAATATGCAAACCATTTCTTTGAAATGGATTTTGTAGCATGAGAAAAGGGCCCTGTTCCTATTAGTTTTTTAAATTATGTAGAAAAATATAAAGGAAAATTTTTATATTTTAAATATTTAATAGAAGATGAAACAAAAACTAAATTTTATTTAGAAGATAAAAAAAATAATTGTAAAGAATTTAGTTGAGATTATTTTTCAGAAGAAGAAACAAAAATATTAAAATATATAACTACTATTTTTAATGAATATTTAGGCTTTCAAAAAACCAATGATGTTATTGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP047428|574923:629089|597717_598953_-|WP_164028171.1|DBSCAN-SWA MLNELWDGVTLENYNNFNPMTGKITQVPVRYNKFFKNDVELWFKTFALRAQNMINSYLNYPFTKLKFETFKDPLLKKICINMVFITIEHWTFNRIPVEFFTSATMNIGDINYSSQNDPMATWQGLLPTYAKSLANLTTLKKMFRTFEEKGIDLTMIDLEAYYTQLEVDALIEEKTKIDNKAIIKNKNNELSVPFDNDTIYYENNVWKAKQGGDIPSDVIKDSDLNKDYIDKEDGKYIVKKAQSGSSITVNAPLHQKDDSSLELLLSNDFDIENNKLSLNKGLKDTIDQILKWVLEMNKKIIWEEVPISSFKPDANNYIDIPEFSEKYCYDVRISPTNFKEAEGFLWLRPPYFTKQANNTLIKQQSNCFAGDVGKIPYDLSLYSATGRVYLTDVSTGANTKINSVRIFRKEV >NZ_CP047428|574923:629089|597420_597696_-|WP_071890344.1|DBSCAN-SWA MDLKEYKSEILLLIRKVFIWGLGAILIISAIVLFFCKVFKVIEIDWPEYFYIGLSLLITGSFIYLIDKVFDFFKKEKKDSIEDAIKKEDTK >NZ_CP047428|574923:629089|615391_615766_-|WP_071937179.1|DBSCAN-SWA MNLDKLDKKIFFNFAYINKTKKINNDFLNEIKKICNYSLRNLIQGSRQSCGYSNIETNKSRLPPKIPLELVNYVKSHFNKDIEQDIKKYDYLRVGDKERIYGVLVNNIFFAIIFDPDKYYQNNN >NZ_CP047428|574923:629089|593407_593911_+|WP_147077276.1|DBSCAN-SWA 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60 | Staphylococcus_phage(14.29%) | terminase,head,tail,portal,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
774261 : 784439
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP047428|774261:784439|DBSCAN-SWA TTTAATTAATGATTGCTTGAAAATCATCTTCTAAAGTAAACTTAACATTTTCATCAATTCAATATTTTCGTTTTTTAGCATCATCTCCCATTAAGGTTACAATCCGTCTTTCAGCCATAACGGCATCATCAATTGTTACTAAAATTAATTGACGAGTTTGAGGATTCATTGTTGTTTCTCATAATTGTTCTGCATTCATTTCTCCTAACCCTTTATAACGTTGTAATTCAAATTTACCATGAAATTGACTTAATTTATTTTTTAATTCTGTTTCATCTCATGCATATTCAATATGTTTATTTTTGGTGCTAGTAATCTTAAATAAAGGTGGCAAAGCAAGATAAACACGATGATTTTCAATTAATGGTCGCATATAACGATAAAAAAATGTTAATAGTAAAGTTTGAATATGTGCTCCATCAGTATCTGCATCGGTCATAATAATTACTTTACCATAGTTGGCATCATTAATGTCAAAACCATTCCCCACTCCTGCACCAATGGCATTAATCATTACATTAATTTCTTCATTATTCATTAAATCTTGAAGTTTTGCTTTTTCAGCATTAATTACTTTCCCTCGTAATGGTAAAATTGCCTGAAAACGACGATCACGTCCTAATTTGGCACTTCCCCCAGCAGAATCTCCTTCAACTAAAAAAATCTCATTATTAAATTTATTTCGATTTTGAGCAGGGGTTAATTTTCCTGTTAATAAACGATCACTATTACCCCGTTTTTTGCTATTGCGCGCTGCTTCACGTGCTTTCCGAGCTTCTTCACGAACATTACGAGCTAATAATGCTTTTTCAATAATAGTGTAAGCATTTGTTTTATTTTCTGTTAATCAAAATCCAAATTGTTTTGATACAATCGTTTCAACTGCAACCCGAGCTTCATAAGTTCCTAATTTTCCTTTGGTTTGTCCTTCATATTGAATTAAATTTTCAGGAATTTTTACTGAAACAATAGTCGTTAGTCCTTCACGTGTATCAACTGAATCAAGATTTTTATCTTTTTCTTTTAACAATCCTTCTTTCCGAGCATAATCATTAATTACTTTTGTTAATCCTGTTCGGAATCCAACAACATGGCTACCACCTTCACTTGTTTTAACATTATTTGCAAAACTAAGTAAATTTTCATTAAATTCAGTTGAATATTGTAATGCTATTTCAACTTCGATTTGTTTTTCTACTCCTTTTAACATAATAATTGGAGTAATACTTTTTTTATCTTCATTCATATAAGTAATGAACTCTTCTAAACCATTATTAAATAAATATGATACTTTTTTATCAGTTCGTTGGTCAGTCAATGTTAACTTAACCCCGCTATTTAAAAATGCTGATTCACGAATTCGTTCTGAAATTGTTGAAAAAGAAAAATCAATTACTTTAAAAATCTTATGATCAGGTAAAAAAGTAACTGTTGTTCCCGTTTTCGTTGTTGTTCCAATTTTTGTTAATGGTTCTTTAACTTGACCACCATTTGCGAATTTAATACTTCAAACTTTGTGATCACGATAAATTGTGACATCAAAAGTGGCCGATAAAGCGTTAACAACTGAAGAACCAACACCATGTAGTCCGCCTGCTGTTTTATAACCATCACCACCAAATTTTCCACCAGCATGTAAAACTGAAAAAATTACTTCTGGGGTTGATTTTCCAGATGAATGAACTCCAGTTGGAACACCACGCCCATTATCTGCCACCATAATAGCATTATTCTTATAAATAATAATATCAATTTCATTACAATAACCAGCTAATGCCTCATCAATTGAATTATCAATAATTTCTCAAACTAAATGATGTAATCCACGAACATCAGTTGACCCAATATACATTCCTGGACGTTTTCGAACTGCATCTAGTCCTTCTAAAATCTGAATTGATGATTCATCATACTTTAATGTTTTATCTTCAATACTCATATCCTCTATCATTCCTTTTAAATATAATTTTCACTATTATTATTTTATATTATAATGCTTTTATTTACAATTATTTACTAAATTATTTCTAATTGCTATATAATAATAAAAGAGAGGTGACCGAATGACATTATATGGATATTTAGGAAAAGCTATTACAGCAATAATTGGATACTTAATTGGTTCTTTTAGTTGGTCAATTTTTATTAGTAAAAAAATTTATAAAATTGATGTGCGTGATTATCATTCTAAAAATGCCGGAGCCACAAATACTAGTCGTGTTTTAGGTAAAAAATGAGGTTTTGCCATCATGTTTTTAGATATGCTAAAAGTTACTATTACAATGTTTATTGCCTTTGGTATTAGTTGTATTAATATTAATGGTGTTAATTTTGGTTCAACTAGTTATTATATTCCAGCTTTTTTTGTTTTAATTGGTCATTCTTATCCAATTTATTATAAATTTAAAGGTGGAAAAACAGTTTCGTCTTTTTTAGGTTTATTATGAATGACTAATCCATATTATTTTTTAATTGCTACAGTTGTTTGATGAAGTACAATTTTTATTTGAAAACGAGTTTCTGTTTCTTCAATTTTAGCAGCACTATTTACAGGAGCATTATGTTGAATCCCACAATTAAGTGGCATTGATATTATCAATTTTAATGGTGATTTACTTCAAAATTCTCACCTTGTTTGAGTGAATTACTTACATTATGTTAATTATGATAATTACTGCGATAGTTTAGCTTTAATTAATATTATTATTACTTTAAGTGCTATTTTCTTAATCTTAAAACATCATCAAAATATTACTCGTTTATTAAAAGGAGCCGAAAAGCCTTATGATTTTAAAGGGAAATCTGATTTAGAAAATGGTAATCTTTCAAAACACAATAAAATAAAAAACACTAATAATTACCCATAGTTTTAAGTACTTAATAAGTTAAATGAAAAATGCTTTCATTCTAAAGAAATGAAAGCATTTTTCATTTTTAAAATTTTTGTTTATTAACAAAACTTAAGCTACCTTAAATTCAATTATCTGTAAAAAGTTATAATTACCATCATTAATATTGGTTTCACCCTTGTTTGGATTAAACATAAAACTATAAAAAAAGTTGCTATACGATAAGTAAACATTGTTTGAAATGAGTGAGTATGTCTTAGTATCATTATTTCATGAATAAAATAATTGAAAAGTTATAGATTTTTCATTTTCAATTCAATTAATTTTATTGTTAAATTTACTTATATTGTACTTGTACTCATAAGAAAACTTTGTATTTCAGTCTAATGACTTCCAATAAAAGCTAAAAAAATATTTCAAAAATGTGTTAAAGTTGTCTAATATTTGGTTCTGTTTATACTTCGTTCTAATTTTTTTAACAATTTCATCAAAGTTAACTTGATTCATATTAAAAACAAGACGATTATTTTCATTATATGTTTCTAATTGATAATAATGCCAAAAACCCATTATTGTTTTTGCAAATATGATTAAGTCATTATCAAATTTATTTTTTTTCTCTCAATATTGTTATTGGTGCTTTTAATTCAATATTGAAACTTAAAATTTTAAGTGGGAGATTCTCAATAATAAAGTTATTCAAGAAATTGAAAGATTTTAATGTTGCTTGTATATAACACTCATTATGAAGGCATCATGTAATCGAAGTGCAACAAATCAATTCTGAAAGGAGTTGATTTTTTATTGAAAAGAAACATTATTTTATTTTGCGGTCCTTAGTAACTAAGTATGGAAAAGATATTGTTATTAATACTGTAAATAAGATAGTAATTAATAATTTAAAAGAAAATGAATAAATTATCCGCGTAATTTATTAGCGGTAATTTATTCAATATTGTTTATTTTGAGCGTAGCGAACACGCGGAGCGTGACGCGATATTTTTTAGAAAGGAGATGTATTATGCCAACTTGATTAACGACAATATTTAGTGTTGTTATTATATTAAGTATTTTTACTTATATTGGTTTATCAATTTACCAAAAAATTAAACAAATTCGAGGAAAGAAAAAAGATAAAAAAGAAATTGAAAGAAAGGAGAGTAATAAATAATGTTAGGTATGTATTTAACAACAGCGTTTAATTTTTTAACAGCACCTACACCTAAAACTATGACTAAGGGTATGACTGGTATTTGAACTGGTTTATCTAGTGCATTATGAAAAGTTAAAGAAGGTATAACAAATATTTTACCTGAGATAATGGTTTTCTTAGGTGAAGCGTGAATTATATTAATTCCATTTTCTATATTTTGTATTATTAAAATTTTAAACTTTTTCCGTGTTATGGTTAAAGGATTTTAATATTTATTATAATCGATTATATATCTTAGTTAAGGCACACTAGCTTTTATGTGAATTAAATAAATAATTTTGTTGTTTATTTTTGCACTATACACTGTTTACAAATTTATTTTTTAATAAACTTTATTACTATCGTTAATATTGGGATAATAAATAAATATCCCTATTATACATATAAATTTAACTATATTTTCTATAGTTGATAACTCTATATTGTTTATTATTCATAATATTGAGTCTGTTATGAAAAATATTTTTTTAGTAGGATTTAATAAAAATAAGAATATTTCTATTAAGGGTCATACTAGTAATAGATTTGGGAAATAAATTTTTATAATATTTTTTATAAATACACCTACTTTTTTTAAAAAACTTGTAAACAGTATATAGTGTAAAAATATCAACTTAATTATATTTAAGGTATTATTATGGTTTTCTCTCTGTATAAAAATATTTATAAATTTGTTAATTTATTAAAAATTCAAATAATAAATTTAAAAGTTATTATTAAAATTATTATTAGTGAAATAATTGTTTTAATTGGTGATACCATTCATGATAATCAAAAAATAGATGGTATCACATTTGTAAAAAATGAATTTATTAAATAGAAAAATGAATTTATTATTTCTTCGATATTTTATTTCTTCTTTCTATTTAAAATAATTTATACAGAGAGAAAACCATAATAATATCAACTTAATTATAAACTTATGATTTTATATTTTA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP047428|774261:784439|780633_781647_+|WP_071937347.1|DBSCAN-SWA MKKFIFFFKNYCYISGSMLLFSLIDLLLWLISLYCVGLVFWILFALQCVYFVWWLWKNIFYQLNSFGLVNFVWDNPLSVIIGKLGTGKTLLLTYLSQTMKLLTDEIYSNYPLEDDKVKVLTFKNLDFTDRTKPVPLDDSVILFDESYLYIDGTSPHDEKKVHSGKIPWIVLARHFGHRALFTAQREGMIWNNIRQLASGIIIPISLKKPVAKKGFNFFNRFFIMRIGIFQDITDYEIWKTKSVERTVEGKRAKHKSDVGLGIRFFKIIIPLEFANKYDSEWLKFVRDLKNDEIVNEKFYYWSEITKLSVKERLELFDIDILKKNLKPKKEKGNSKDD >NZ_CP047428|774261:784439|778130_778280_+|WP_071937130.1|DBSCAN-SWA MPTWLTTIFSVVIILSIFTYIGLSIYQKIKQIRGKKKDKKEIERKESNK >NZ_CP047428|774261:784439|782264_784439_+|WP_071937456.1|DBSCAN-SWA MKKSLSLFAIFILTFLGLVIPFITLTAFRPLNEEQYTLKQESSTGKGINETDFINTMFLRSSFFENWSETNYFINRTLKTSKNLLFNDKWYLDFLQDSYSTGVVYDKPDEVFLGYYQQWHSLKNRYMVEKFYDVKRENFLDDLTDFIYAFAVKYKMFNVSKEIVENVDRYKENHYPRVKLKVDNWKLIDRDNFVKENNEKNNKWYILIAKQMQSDNFSIIKFNFSNELIWKVGEHRGHRINNRWYVYINSLYRWDGVGEPQLPTIDKNTGEITDWNSYQQTRVKEFIDLSLYSVLQENIRVQQGGSADYENPNKVGTKRIIFDFETVDELDVKNIKKTIYRMILTVDEANLIISGSLELNNINNDDLSFNFSFMRTGMGEVFNFNGSIYSSLNSKDLKYYQQFSGQFDLSKFLQSFFASALVPVFQNRSSFIENGYIDNLQYDTVLVNFFALKLQNFNNILLSENINDKLQFDKLLNSMFKISQKFYTNYLRTIFDLENNTYVQGYNKKYGLLVNNGFKIYPRYFYFSDKYKQLDIKLYSSFKNRFYTINNYGSVFNYDFSVANNYDIKSNSGYVFGGDLQNKYGLQYKKIEEQKIGYNVFELQAQKENDMYRYYDFNFGIYNWQEINNGGLFPDKQWWQVQYVTPEGWWDFGAHIKNAVIWIVNTIPGVKQVNELASGVGKVFETVYSFFSQIFEVWKFNPALYSTITNIFLLIIFMKFVRLI >NZ_CP047428|774261:784439|780278_780428_+|WP_164028235.1|DBSCAN-SWA MSLYDYWVQFVSYIIGANAPEFLYVISFVLFVVLFFGMFFKLIQKIWSF >NZ_CP047428|774261:784439|781639_782017_+|WP_071937327.1|DBSCAN-SWA MINLLVENNNSNWDKIFSFVFDIFLFIFDVIWNTKLPMTNTSIAYFLIFFMVIKLSIYAIHGTSTQYNNLGSTVNNGVSQVYSSTVRKGINVGKNVYQNSNKQQVKREIKRQNVRQQAKFKRGVK >NZ_CP047428|774261:784439|776323_777127_+|WP_071937452.1|DBSCAN-SWA MTLYGYLGKAITAIIGYLIGSFSWSIFISKKIYKIDVRDYHSKNAGATNTSRVLGKKWGFAIMFLDMLKVTITMFIAFGISCININGVNFGSTSYYIPAFFVLIGHSYPIYYKFKGGKTVSSFLGLLWMTNPYYFLIATVVWWSTIFIWKRVSVSSILAALFTGALCWIPQLSGIDIINFNGDLLQNSHLVWVNYLHYVNYDNYCDSLALINIIITLSAIFLILKHHQNITRLLKGAEKPYDFKGKSDLENGNLSKHNKIKNTNNYP >NZ_CP047428|774261:784439|779485_779845_+|WP_071890535.1|DBSCAN-SWA MDIKFKTTKECKKLKRDFIIRNFVFGFVYFQFFIVLIEIIVGLVLFSNREIIVGILLFSLFLFLIFILLFFIIQCHICEIKEYKVMLLKKRMLPLENIIGGLGKGTMLRPVRRGDDKIE >NZ_CP047428|774261:784439|779828_780278_+|WP_071937455.1|DBSCAN-SWA MIKLSNFVKKNHNVENYFISKEFIPFTTEKASFINLPNHNRHIGFWLSNKFIYPSEKHLEQIAIGLIYDNSYPIVKYDENLKRNIWKYLTETELINLYNQYKQNYFTKMKKALFSSEPKKVKANNNNNNLTNWSVEKEQELINDLKDLN >NZ_CP047428|774261:784439|778279_778531_+|WP_164028297.1|DBSCAN-SWA MLGMYLTTAFNFLTAPTPKTMTKGMTGIWTGLSSALWKVKEGITNILPEIMVFLGEAWIILIPFSIFCIIKILNFFRVMVKGF >NZ_CP047428|774261:784439|774261_776199_-|WP_084566885.1|DBSCAN-SWA MSIEDKTLKYDESSIQILEGLDAVRKRPGMYIGSTDVRGLHHLVWEIIDNSIDEALAGYCNEIDIIIYKNNAIMVADNGRGVPTGVHSSGKSTPEVIFSVLHAGGKFGGDGYKTAGGLHGVGSSVVNALSATFDVTIYRDHKVWSIKFANGGQVKEPLTKIGTTTKTGTTVTFLPDHKIFKVIDFSFSTISERIRESAFLNSGVKLTLTDQRTDKKVSYLFNNGLEEFITYMNEDKKSITPIIMLKGVEKQIEVEIALQYSTEFNENLLSFANNVKTSEGGSHVVGFRTGLTKVINDYARKEGLLKEKDKNLDSVDTREGLTTIVSVKIPENLIQYEGQTKGKLGTYEARVAVETIVSKQFGFWLTENKTNAYTIIEKALLARNVREEARKAREAARNSKKRGNSDRLLTGKLTPAQNRNKFNNEIFLVEGDSAGGSAKLGRDRRFQAILPLRGKVINAEKAKLQDLMNNEEINVMINAIGAGVGNGFDINDANYGKVIIMTDADTDGAHIQTLLLTFFYRYMRPLIENHRVYLALPPLFKITSTKNKHIEYAWDETELKNKLSQFHGKFELQRYKGLGEMNAEQLWETTMNPQTRQLILVTIDDAVMAERRIVTLMGDDAKKRKYWIDENVKFTLEDDFQAIIN >NZ_CP047428|774261:784439|780430_780634_+|WP_071890543.1|DBSCAN-SWA MQNDWIKLKEFFIHIFLFIDKTNVESITMWNLTQNEYLTLMVGVWVVILFLTWFFLWMVFKIVGYFK >NZ_CP047428|774261:784439|777876_778026_+|WP_155522119.1|DBSCAN-SWA MQQINSERSWFFIEKKHYFILRSLVTKYGKDIVINTVNKIVINNLKENE >NZ_CP047428|774261:784439|782016_782253_+|WP_015967964.1|DBSCAN-SWA MIKLVLLVAAIAIFGTGFITVIINQFTSAKNIIMDLYNSDTWLIWLFGRMAVLFSHPLMLTISSLYIVGFIVSKTLYS |
13 | Spiroplasma_virus(90.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
794009 : 801750
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP047428|794009:801750|DBSCAN-SWA CCTAACTATACAATGTTTTTGAAACAATAAACCCAGCAATATATAAACTCGATATTGTTAACATTAACGGATGACTAAACAAAAATGCCATTCTGCCAAATAATCAAATCAACCAAGTATCAGAATTATATAAATCCATAAATACATCGATTGCTTATTTTTTAGTCTTTTTATGGTTATTAAGTTATCTATTTATGTAATTCATGGCACATCAACACAATATAATATTTTAGGTTCAACAGTTAATAATGGTGTTTCGCAAGTATATTCGTCAACTGTACGAAAAGGTATTAATGTTGGTAAAAATGTTTATCAAAATAGTAATAAGCAGCAAGTTAAAAAAGAACTTAAACGACAAAATATTAGATATCAAGCAAAAAATATTAGAAGTATTAAATTTAAAGAAGATAAAAAATAATGATTAAATTAGCTTTATTGGTTGCGGCAATCGCGATATTTGGAACTGGTTTTATTACTGTTCTTATTAATCAATTTACATCGGCAAAAAATATTATTATGCATTTATATAATTCTGATACTTGGTTGATTTGATTATTTGGCAGAATGGCAGTTTTGTTTAGTCATCCGTTAATGTTAACAATATCGAGTTTATATATTGTTGGGTTTATTGTTTCAAAAACATTGTATAGTTAGGAGTTGAGTTTATGAAAATTAAAATTTTAAAGTTTTTAAAAGAAAAATGATGAGAAATATTAGTATATATTTTAGTTGTTGGTTTTGGTTTTTCTTTATTTATTGGATCAATTTACGATAAATGAGTTTGGTATTTTATTCTGATATATGTTAGTTGCAAATTTGTATTTTTGATTTGAGTTAGTTTGATGTATTTTATTTATAATTAATTTTAAAAAGAAGAAAGGTGGTAAAGAATAATGCGTAAGCCATTATCTTTATTTTTAATATTTATTTTAACTTTTTAAATATATTTATAAGATGTAATGCATGCTAATACAATATTTAATAACATCGCACAAATCATAATTAATGCTCCAGCTAAGACAATTTTTGGTAAACTATTTAAAAATAATCCTGAAATAACATCATTACTAGCAATAATGCCATTAATTCCAAATAATAAATTAAAAGCATTTCCTAATTTACCAACAACACCAACTAAAATCCCAGCTCCCCCACTAATAATTAAAAACCCAATGGTTGTTTTAATCGTTGCGGAAATTGTTTCGGTAAATTTCTTGCGTTGTAATAAACAACCAACAAGGGCAAATAAACCAATCAAGATTGCTGGTGTGCCAATAAATTCTTTAAAAAAATTTAGAACATAATGCCCAGTTGTTAAAGATAAAAAAATCAACATTTTTATCCCTCCTTACTAATTATTATCTTTGTAGTATTAAGATAACGAAGGCTCTTCTAACACCTTAAATCAACATAACATATGTAACATATGTCTATTCTGATTTTATTTTTTTCTTTCTTCTTTGCAATTTGTTTTCTTTCTTTTGATAATAACGGGTGGAATTGTAAATTTTTTGCAAATTTATGCAAAAGTATTCGTAATGGTAATAATTTGATAAAACAAAAACACATGTTAGATTATTAATCTAACATGTGTTTCATTATTGGCAAAAGATATTAAATACAGCCTTATTTTGCACGTTTCATTGAATTCATAACCTTTTTAATATCTGCTTCTGATGGTTTACGTCCCATTTGCATATACATTGCCCGAATTTGTTTTTCAGTAATTGGGGGATTATCACGTAATTGTTTTTGCACATTTTTTTTGGTAATTAAAAATCCTAAAACCCCACCAATAACTAAACAACCAATCCCAATAATAAGTCCTGCTCATCAAGGCATTCTTGTTGTCCTCCTTTTTTCAATATGTAATAAGTAATTATTAGCATAATTCCTATAGTATTTTAACATATTTTTTAAAATAAGTCTTATTTTCGTGGTTTTTAAAAATCTGCTTTTCTTCTATTACATTTAGTATCGATAGCAATGATATTATCATTTAAATTTGTTCCATCTTGTGGGCATCGTGTACGATGAAGCGGCAAAAAAACAACTCTTGTTAAAGGGTTGTTTGTAGAAACCACACACATTTTGTATTTTTGGTTTTTACAGTTTTGAACTAAAAATTTTTATAATATTTTTAATTAAGGAGTTGAAATTATGCAAACAAAGCAATATTTTATTTTGCAGCCGCTAGTGAAAAAGTATGGTAAAGATAATGTTATTAATACTGTTAATAAGATTGCAAAAGATATTGAAATTAAAAAGTAAAAGAATAAATTATTCCGTGTAATTTATTAGCGGATAATTTATTCAATAGTGTTTTTAATGGAGCAAAGCGAGTTTGCAAATTTCAATTTTTTAGTTTTTAGAAAGGAGATGTAATATGCCAACTTGATTAACGAAAATATTTAGTGTTGTTATTATATTAGGGATTTTTGCTTGAATTGGTTTATCAATTTATCAAAAAATTAAACAAATTCGAGGAAAGAAAAAAGAAAAAAAAGAAATTGAAAGAAAGGAGAGTAATAAATAATGTTAGGTATGTATTTAACAACAGCGTTTAATTTTTTAACAGCACCTACACCTAAAACTATGACTGAGGGTATGACTGGTATTTGAACGGGTTTGACTAGTACATTATGAAAAGTTAAAGAAGGTATAACAAATATTTTACCTGAGATAATGGTTTTTTTAGGTGAAGCGTGAATTATATTAATTCCATTTGCTATATTTTGTATTATTAAAATCTTAAACTTTTTCCGTGTTATGGTTAAAGGATTTTAGTATTTATATTTATTATTTATCATGTATTTTAACTGTGGCACACTAGTTTTTATATGTGATTTGATTAAATAATTTTTTTGTTTATTTTTGCACTATACACTGTCTACAAATTTATTTTTAAATAAATTTAATTATTTTGGTTATTATTGATAATGTTAACAAGATGAAAAAACTTGTAGGCAGTATATAGTGTAAAAATATCAATTTAATTATATTTAAGGTATTATTATGGTTTTCTCTCTGTATAAAAATATTTATAAATTTGTTAATTTATTAAAAATTCAAATAATAAATTTAAAAGTTATTATTAAAATTATTATTAGTGAAATAATTGTTTTAATTGGTGATACCATTCATGATAATCAAAAAATAGATGGTATCACATTTGTAAAAAATGAATTTATTAAATAGAAAAATGAATTTATTATTTCTTCGATATTTTATTTCTCCTTTCTATTTAAAATAATTTATACAGAGAGAAAACCATAATAATATCAACTTAATTATAAATTTATGATTTTATATTTTAATAACTATTGTTAAAAATTAAATAGTATTTTTCAGTGTGCCAATTTTTATTATTTTATATATTTAACAATGTTTATTAACAGTGTTTATTAAACATTAAATAAACAATATATTAGCATTATTTATAACATTGTTAATAATCAGTGTTTATTGCAATAAATAAACATTATATAAACATTATTTATAACATTTTTTATTAAACAAATATTTAGTTAGGAGACTATATTATGGATATGAAATTTAAAACAACTAAGGAATATAAAAAAATAAAGAGAGATTTTATTAAAGATATTTTTTTATTAAGTTTAATTGTTTTTTTGGTATATTGTTAGTTTTTGTTTTTTTAAGTTCTTTTATTTATTTTTCAATATTGAGTTGAAATGATAAAGATTTTCCACACTTTGTATTTGCAATTATTATGTCTGTATATGCTTTTATAGGTATTATTTTTGTGATTATTATGTATATAAAATATATTTTTGAAATTAAGGTAGAATTTGATGTTGAAAAAGAAAAATTAAATCAATATTGACAAATTGAAGGAGTTGATAAAATTGAGTAATTTTGTTAAGAAAAATCAGAATGTAGAAAATTATTTTATTAGTAAGGAATTTATCCCTTTTACAACAGATAAAGCAAGTTTTATTAATTTACCCAATCATAATCGTCATATTGGTTTTTGATTGAGTAATAAGTTTATTTATCCGAGTGAAAAACATTCGGAACAAGTAGCAATCGGTTTGATTTATGATAATTCTTACCCTATTGTAAAATATGATGAAAATTTAAAACGCCATATTTGAAAGTATTTAACTGGAACAGAATTAATCAATTTATATAATCAATATAAACAAAATTATTTTACTAAAATGAAAAAAGCGTTATTTTTAAGTGAGCCTAAAAAAGTAAAAGCAAGTAATAACAATAATAATTTAACAAATTGAAGTGTTGAAAAAGAACAAGAATTAATTAATGATTTGAAAGACTTAAATTAAATGATTTTATATGATTATTGAGTTCAATTTGTTAGTTATATTATTGGTGCAAATGCCCCTGAGTTTTTATATTTTATATCGTTTGTGTTATTTATTGTTTTGTTTTTTGGAATGTTTTTTAAACTTATTCAAAAAATGTGGAGTTTTTAAAAATGCAAAATGATTGAATTAAATTAAAAGAGTTTTTCATTCATGTCTTTTTGTTTATAGATAAAACGAATGTTGAAAGTATTACAATGTGGAATTTAACGCAAAATGAATATTTAACTTTAATGGTTGGTGTTTGAATTGTGATTTTGTTTTTAACTTGGTTTTTCTTGTGAATGGTTTTTAAAATAGTTGGGTATTTTAAATAATGAAAAAATTTATATTTTTCTTTAAAAACTATTGTTATATTAGTGGTTCAATGCTTTTGTTTAGTTTAATTGATTTATTACTTTGGATAATTTCTTTGTATTGTGTTGGTTTAGTATTTTGAATATTATTTGCTTTGCAATGTGTATATTTTGTGTGATGATTGTGAAAAATATTTTTTATCAGTTAAACGCTTTTCGGTTAGTAAATTTTGTTTGAGATAATCCGTTATCAGTTATTATTGGGAAGTTAGGGGCCGGTAAAGCATTACTTTTAACTTATTTATCGCAAACTATGAAATTATTAACAGATGAAATTTATAGTAATTATCCGTTA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP047428|794009:801750|796543_796795_+|WP_071937359.1|DBSCAN-SWA MLGMYLTTAFNFLTAPTPKTMTEGMTGIWTGLTSTLWKVKEGITNILPEIMVFLGEAWIILIPFAIFCIIKILNFFRVMVKGF >NZ_CP047428|794009:801750|799681_800086_+|WP_015979226.1|DBSCAN-SWA MINLLVENNNSNWDKIFSFVFDIFLFIFDVIWNTKLPMTNTSIAYFLIFFMVIKLSIYAIHGTSTQYNNLGSTVNNGVSQVYSSTVRGVSDTKQGMQKHIKERKQFKINRNKKQLSSLAKQAKTREQGYRRVHK >NZ_CP047428|794009:801750|795634_795850_-|WP_071937465.1|DBSCAN-SWA MPWWAGLIIGIGCLVIGGVLGFLITKKNVQKQLRDNPPITEKQIRAMYMQMGRKPSEADIKKVMNSMKRAK >NZ_CP047428|794009:801750|800383_800536_+|WP_162302564.1|DBSCAN-SWA MVIPFITLTAFRPLNEEHYMLKQEFIIYRKLLNLIMFILIILLMMKKLEF >NZ_CP047428|794009:801750|800085_800322_+|WP_071937470.1|DBSCAN-SWA MIKLVLLVAAIAIFGTGFITVIINQFTSAKNIIMDLYNFDTWLIWLFGRMAILFSHPLMLTISSLYIIGFIVSKTLYS >NZ_CP047428|794009:801750|796394_796544_+|WP_071937466.1|DBSCAN-SWA MPTWLTKIFSVVIILGIFAWIGLSIYQKIKQIRGKKKEKKEIERKESNK >NZ_CP047428|794009:801750|794009_794147_-|WP_155522121.1|DBSCAN-SWA MDLYNSDTWLIWLFGRMAFLFSHPLMLTISSLYIAGFIVSKTLYS >NZ_CP047428|794009:801750|794425_794662_+|WP_071937463.1|DBSCAN-SWA MIKLALLVAAIAIFGTGFITVLINQFTSAKNIIMHLYNSDTWLIWLFGRMAVLFSHPLMLTISSLYIVGFIVSKTLYS >NZ_CP047428|794009:801750|800616_801156_+|WP_147077290.1|DBSCAN-SWA MYMNGAKPEENNKKFSGLIPYFLLCRQFDNNIIFAGQRINQNWVEYRAITNMIIVPMQCIPPSIFFPYFKMKIGFFDDLDDYLVWKTETVKRTANGKRVRKKSNKDIGINFVKITIPLSIAMQYDNKYLKFVRDLKNDKVPSYTKQNWPSIVKKDITLNELREMGVEHLLKNLGELEND >NZ_CP047428|794009:801750|797877_798318_+|WP_084566886.1|DBSCAN-SWA MSNFVKKNQNVENYFISKEFIPFTTDKASFINLPNHNRHIGFWLSNKFIYPSEKHSEQVAIGLIYDNSYPIVKYDENLKRHIWKYLTGTELINLYNQYKQNYFTKMKKALFLSEPKKVKASNNNNNLTNWSVEKEQELINDLKDLN >NZ_CP047428|794009:801750|798470_798674_+|WP_071937469.1|DBSCAN-SWA MQNDWIKLKEFFIHVFLFIDKTNVESITMWNLTQNEYLTLMVGVWIVILFLTWFFLWMVFKIVGYFK >NZ_CP047428|794009:801750|798318_798468_+|WP_164023992.1|DBSCAN-SWA MILYDYWVQFVSYIIGANAPEFLYFISFVLFIVLFFGMFFKLIQKMWSF >NZ_CP047428|794009:801750|801510_801750_+|WP_071937472.1|DBSCAN-SWA MLKLIFFFVIGLTVGFGFIANIVVATDLGFSTVKHYWESANDFYKLVAQLFIIATHPIFQLYMAFAIIIMGIKKIIFIV >NZ_CP047428|794009:801750|794673_794871_+|WP_071937464.1|DBSCAN-SWA MKIKILKFLKEKWWEILVYILVVGFGFSLFIGSIYDKWVWYFILIYVSCKFVFLIWVSLMYFIYN |
14 | Spiroplasma_virus(81.82%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
811399 : 823901
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP047428|811399:823901|DBSCAN-SWA ATTATTTAATTAAACTTAAACTATTCAAAAAATTAAATGGTGTCTGAAAATTTAAAGACTTATGTACTCTTTCAAAATTATAAAAATAATAATCATTTAATTTATTCTGTAAACTAACTGCATTTAATATTTTTTCTTCAAATACAAATAATTTAGTATAATTTTGATGAAATCTTTCAATCTTACCGTTTGACTGTGGAGAGCGAACTGGTGTTGTTTGATGCAAAATATCTTTATCTGTTAAAAATTGAGTAAAATTAGTCTTTTTAACACTAATTTTTTGATTATTCCGATAATTATTAATAAATTCAGAACCGTTATCAGTTCTAATCCGTGTTATTATAATACCAAATATATTTTTAAAATCACTAATTGCTTTTTTAACAGCAGCAATAGCATTATCAGTACTTAATTTATCATAAACATATCCTAATGCTAATCTTGTTTTTTCATCAATAAAATCATAAACATAATACTTTTTATCAACTGGAAATTTACTTGGTACAAAATATTTAGCGTCCATCTGTAACAAACCCATTTCTTTAACTTCATATCTTGGATGTTGTTTTTTAATTTCTTTAATTTTATTTTTTATTTTTAATCATCTTTCATCTTTTTTAAGTCAACGAAAAAATGTTTTTAAATTTTTTGGTGCTTTATTTTTTAATTCTTCTCCATGAATTCCTTTTTTTAAATTATAAAACAAAGATAAAACACCACCAGCATGTTTATTACAATATTCAAAATATAAATCACAAATAATTTTGCGAATATCATCACTATATTGATAATTAATATTATTAGGAATTGTTGACTTTAATAATAATTCAGCAAAATCATTATTTTTATATGCAATTAAAATTTTATTCGCTCAATAATAAAAAGTTGAAAACTTATTTTTAAAATATTTTTTAATTAAATCTTTCAACAAAAAATTACCATTATAATAATCATTACACAAATTAATATATGAAAATATTTTTTGTTTTATTCTTTTATAATATTTATTTTTATAATTTTTACTTAAAAAATTCTTTAATTTTGCTTGTAAATCAAACAAATTAAAATTATTAATAATATATTTCATTAATTTACACCTACCATCAAAAATATATAAAATTAATATTTAATACGAATAATTGATATATAATTGATATGTGATAAAATCAATTATATATAAAAAATAAAAAGGAGCAATCTATATGAAAAAATGACTTAGCATAATAATAGTAACAATCGGATTAACCGCAACAAGCACAACAACATTAATCAGTTGTAAAAAAGAAAATAATAATAAAAACGGTGGAGGAGATAATAAACCAGAACCATCATATAATCCACAACAACCTAATACACAACAACCGCCCAAAGATAGTAATTGAAAATTAATTACTGATTACAATTCTTTTGAAAATAATGTTGATAATAAATATTATTTTGTTGAGTGAAAAAATACAAGTAATGAATGAAAAATTGGTAAGTTTAAACACGATACATCTGGTGTAAAGAAAATAGGAGAGGTAATTTATGTTCATAGTATAAAATATTATGCTAAAAATAATAACCTTAAAGGTCTTTATCTTTGAGATGGTGTGGGTGAGCCGCAAATTCCAACTATTAATCCTAATACTGGTGAAATTACTGACTGAAAAGAACAAAAAAGGAACTAAATAACAGTTCCTTTTTTATATTAATCGCACAAATTTCATAAAAATAATTAATAAAAAGATATTTGTTATTGTACTATACAATGCGGGATTAAATTTTCATACTTCAAATATTTGACTAAAAAAACTATATACTGTTTCAAAAACCTTACCAACACCACTCGCTAACTCATTAACTTGTTTAACACCAGGAATAGTATTGACAATTCAAATCACCGCACTTCTAATATGAGCACCAAAATCTCATCAACCCTCTGGCGTTACATATTGCACTTGTCATCATTGTTTATCGGGAAACAACCCAACATTATTAATCTCTTGTCAGTTATAAATTCCAAAATTAAAATCATAATATCGGTACATATCATTCTCTTTTTGTTCTTGCAATTCAAAAACATTATAACCGATTTTTTGTTCTTCAATTTTTTTATATTGCAAACCATATTTATTTTGTAAATCACCGCCAAAAACATAACCCGAATTTGACTTAATATTATAATTATTAGCAACCGAAAAATCATAATTAAAAACACTACCATAATTATTAATCGTATAAAAACTGTTTATATTTATCTGAAAAATAAAAATATCGTGGGTAAATTTTAAAACCATTATTTACTAATAAACCATATTTTTTATTATAACCTTGAACATAAGTATTATTCTCTAAATCAAAAATCGTACGTAAATAATTAGTATAAAATTTCTGTGAAATCTTAAACATACTATTTAATAATTTATCAAATTGTAATTTATCGTTAATATTTTCACTCAACAAAATATTATTAAAATTTTGTAATTTCAAAGCAAAAAAGTTAACTAAAACAGTATCATACTGTAAATTATTAATATATCCATTTTCAATAAACGAACTACGATTTTGAAACACTGGCACCAAAGCACTTGCAAAAAACGACTGTAAAAACTTAGATAAATCAAACTGACCGCTAAACTGTTGATAATATTTTAAATCTTTACTATTTAATGATGCATAAATTGAACCATTAAAATTAAAAACCTCACCCATTCCCATTCGCATAAAACTAAAATTAAAACTTAAATCATCATTATTAATATTATTTAACTCTAAACTACCAGAAATAATTAAATTTGCTTCATCAACAGTTAAAATCATCCGATAAATTGCTTTTTTAATATTTTTAACATCCAATTCATCAACCGTCTCAAAATCAAAAATTATCCGCTTTGTTCCAACCTTATTCGGATTTTCATAATCAGCACTTCCGCCTTGCTGAACCCTAGTATTTTCTAGCAAAACAGAATATAAAGATAAACTAATAAATTCTTTTACGCGAGTTTGTTGATAACTATTTCAATCAGTAATTTCACCAGTGTTTTTATCAATAGTAGGTATTTGTGGCTCACCATTACCATCTCAACGATAAAGACCTTTAAGGTTATTATTTTTAGCATAATATTTTATACTATGAACATAAATTACCTCTCCTATTTTCTTTACACCAGATGTATCGTGTTTAAACTTACCAATTTTTCATTCATTACTTGTATTTTTTCACTCAACAAAATAATATTTATTATCAACATTATTTTCAAAAGAATTGTAATCAGTAATTAATTTTCAATTATCTTGGTTTAACTTAACTCTTGGATAATGATTTTCTTTATAACGGTCAACATTTTCCACAATTTCTTTCGATACATCAAACATCTTATATTTTACAGCAAAAGAATAAATAAAATCAGTTAAATCATCCAAAAAATTCTCCTTTTTAACATCATAAAATTTTTCAACCATATACTGATTTTTTAAACTATGTCATTGTTGATAATAATTTAAAAATGTTTCACTAGGTTTATCATAAACAACTCCCGTAGAATAACTATCTTGTAAAAAATCCAAATACCATTTATCATTAAATGATAATTTTTTTGATGTTTTTAAAGTTGGATTAATAAAATAATTTGTCTCCGACCAATTTTCAAAAAAACTACTGCGTAAAAACATTGTATTAATAAAATCAGTTTCATTAATACCTTTACCAGTAATAATTCTTCTTGTTTAAGCGTATAATGCTCCTCATTTAAGGGTCTAAACGCCGTTAAAGTAATAAATGGAATAACCAAACCCAAAAAACTTAAAATAAATATGGCAAATAAAGATAACGATTTTTTCATAAACTTAACTCCTAACTATACAATGTTTTTGAAACAATAAACCCAACAATATATAAACTTGATATCGTTAACATTAACGGATGACTAAACAAAACTGCCATTCTACCAAATAATCAAATCAACCAATTATCAGAATTATATAAATCCATAATAATATTTTTTGCCGATGTAAATTGATTAATAATAACAGTAATAAAACCAGTTCCAAATATCGCAATCGCCGCCACCAATAAAACTAATTTAATCATTACTTAACACCTCTTTTAAATTTTGCTTGTTGTCTAACATTTTGACGCTTAATTTCTCGTTTAACTTGCTGCTTATTACTATTTTGATAAACATTTTTACCAACATTAATACCTTTTCGTACAGTTGACGAATATACTTGCGAAACACCATTATTAACTGTCGAACCTAAATTATTATATTGTGTTGATGTCCCGTGAATTGCATAAATCGATAACTTAATAACCATAAAAAAGATTAAAAAATAAGCAATTGACGTATTTGTCATCGGTAATTTTGTATTTCAAATTACATCAAAAATAAACAAAAATATATCAAAAACAAAACTAAAAATCTTGTCTCAATTACTATTATTATTTTCAACTAATAAATTAATCATCTTTACTATTTCCTTTCTCTTTTTTAGGTTTTAAATTCTTTTTCAAAATATCAATATCAAATAACTCCAATCGTTCTTTAACGCTTAATTTTGTGATTTCCGATCAATAATAAAATTTTTCATTAACAATTTCATCATTCTTTAAATCACGTACAAACTTTAACCATTCACTATCATACTTATTAGCAAATTCAAGGGGAATTATTATTTTAAAAAACCGAATTCCTAACTCAACATCCGACTTATGTTTTGCTCTTTTACCTTCTACTGTTCGTTCTACTGATTTTGTTTTTCAAATTTCATAATCCGTTATATCTTGGAAAATCCCAATTCGCATAATAAAGAAACGATTAAAAAAAATTAAATCCTTTTTTAGCAACGGGTTTTTTCAATGAAATTGGAATAATAATTCCACTTGCTAACTGGCGAATATTATTTCAAATCATACCCTCACGCTGAGCAGTAAACAACGCACGATGTCCAAAATGTCTCGCTAAAACAATTCACGGTATTTTACCACTATGAACTTTTTTCTCATCGTGAGGACTAGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP047428|811399:823901|817997_818333_-|WP_071937487.1|DBSCAN-SWA MSNFVKKNQNVENYFISKEFKTIKEYKKLKKWYILVNFVAWFLYIFLFISSVVLVYVFILNINNNNKEIFILALVLWFVSVILAIVPTILEHIDLNKGFKKQLKKEVDKIE >NZ_CP047428|811399:823901|820251_820428_-|WP_164058319.1|DBSCAN-SWA MRLNMKNNKYILCYRSEKGKRPCKTYFGEYITGIDVEDVNINSTWEWEYFKKIMGKII >NZ_CP047428|811399:823901|815233_815470_-|WP_071937484.1|DBSCAN-SWA MIKLVLLVAAIAIFGTGFITVIINQFTSAKNIIMDLYNSDNWLIWLFGRMAVLFSHPLMLTISSLYIVGFIVSKTLYS >NZ_CP047428|811399:823901|817591_818005_-|WP_084566887.1|DBSCAN-SWA MSNFVKKNHNVENYFISKEFIPFTTEKASFINLPNHNRHIGFWLSNKFIYPSEKHLEQVAIGLIYDNSYPIVKYDENLKRNIWKYLTGTELINLYNQYKQNYFTKMKKALFSSEPKKVKANNNNNNFTNLSVEKKNN >NZ_CP047428|811399:823901|817059_817209_-|WP_155522122.1|DBSCAN-SWA MSLYNYWVQFVSYIIGANAPEFLYVISFVLFVVLFFGMFFKLIQKIWSF >NZ_CP047428|811399:823901|822660_822819_-|WP_155522124.1|DBSCAN-SWA MNSYKIIIGYYNKEIPIIFTQAGLLKINENENQLLYNGHFKCIKNKYDKINL >NZ_CP047428|811399:823901|821904_822489_-|WP_071937495.1|DBSCAN-SWA MKKKIGLLSSFTLLTAGVTPLMAMMPSSSNNIYTCENININFNKKEFFIKQQILEDEILFNCELNLTEKLNINSLKELKENFNGFYFKNFNMSLSVFDKELNQDTYIVKALKPNEYYNYISLLDKNENNSNLKFYKYKPNRNYEVEIIYNLCFVKKNNNFYLNMLFRMEGFTNNNNKIKLFINPEETINFVKNI >NZ_CP047428|811399:823901|823307_823901_-|WP_071937497.1|DBSCAN-SWA MQIGYKGYIQLAIRTGKYLTINAIEVKQGELLNFDELEQEYNFKWITNENERTKKETIGYVAFFKLLNGYKKTLYWSKEKCENNFKTYSKNYQTYGKFTAGSYEGMALKTVLTQLLRKWGIMSVEMQEAYQHDQAIIINNSKEFSDNPNIKNKEDKNVIELNNKKDELNLNLEQEFSSNEINDDEEIAKAVNEMFSD >NZ_CP047428|811399:823901|818325_818685_-|WP_071937488.1|DBSCAN-SWA MDMKFKTTKECKKLKRDFIIRNFVFGFVYFQFFIVLIEIIVGLVLFSNREIIVGILLFSLFLFLIFILLFFIIQCHICEIKEYKVMLLKKRMLPLENIIGGLGKGTMLRPVRRGVDKIE >NZ_CP047428|811399:823901|819774_820068_-|WP_071937491.1|DBSCAN-SWA MNNKIELILNNSKVNNWINEKLTNQKEINLFRKNILTIYNNNPSLFDKEKINLMSVLSACVKAMLLDLPLDPNLGYAYIVPYNWKGQLQIGYKGYIL >NZ_CP047428|811399:823901|822949_823327_-|WP_164023995.1|DBSCAN-SWA MKCFLIKKMKNNWKDYDKNRPIRHKFYRNKKWVKIRNDYFNSKMGICERCYQKRYIVNGVIVHHKEYITDQDFINWNIDKLFAWKNLELLCMKCHNKEHKTEKGYRDNVIIDEKTGKVKIIDKEE >NZ_CP047428|811399:823901|811399_812485_-|WP_071937482.1|integrase,transposase|DBSCAN-SWA MKYIINNFNLFDLQAKLKNFLSKNYKNKYYKRIKQKIFSYINLCNDYYNGNFLLKDLIKKYFKNKFSTFYYWANKILIAYKNNDFAELLLKSTIPNNINYQYSDDIRKIICDLYFEYCNKHAGGVLSLFYNLKKGIHGEELKNKAPKNLKTFFRWLKKDERWLKIKNKIKEIKKQHPRYEVKEMGLLQMDAKYFVPSKFPVDKKYYVYDFIDEKTRLALGYVYDKLSTDNAIAAVKKAISDFKNIFGIIITRIRTDNGSEFINNYRNNQKISVKKTNFTQFLTDKDILHQTTPVRSPQSNGKIERFHQNYTKLFVFEEKILNAVSLQNKLNDYYFYNFERVHKSLNFQTPFNFLNSLSLIK >NZ_CP047428|811399:823901|820549_821149_-|WP_071937493.1|DBSCAN-SWA MQANNEKTNLELYYEWINKNSNKNKVGIKIKKIVSTLVKELKSNKDYYFNHKEANKTISFIEKSCFHTTGEYNKQNFKLELWQKAFLEALYGFYDKKTNLRRFKEALLIVGRGNGKTALASAIALKSLILDNEANAELYSIATKRDQAKRVYEEMRRMIFINPNLNKILKVKRDKIEFIHNNSFFQPLLVVNFYKLIII >NZ_CP047428|811399:823901|817195_817567_-|WP_071937485.1|DBSCAN-SWA MEVKSTKEEQRENRIKYEKNKGYKLCDNGYIIYNSNENYFKLFGCSNQFIKAQVYFRKFGGEYKVKFLCKKCYKKFKKSLSYEFCEILDEQFYKKPVKLSMFRFDYKNAYEYDKYGGFYYEFI >NZ_CP047428|811399:823901|816853_817057_-|WP_071890543.1|DBSCAN-SWA MQNDWIKLKEFFIHIFLFIDKTNVESITMWNLTQNEYLTLMVGVWVVILFLTWFFLWMVFKIVGYFK >NZ_CP047428|811399:823901|815469_815847_-|WP_071937327.1|DBSCAN-SWA MINLLVENNNSNWDKIFSFVFDIFLFIFDVIWNTKLPMTNTSIAYFLIFFMVIKLSIYAIHGTSTQYNNLGSTVNNGVSQVYSSTVRKGINVGKNVYQNSNKQQVKREIKRQNVRQQAKFKRGVK >NZ_CP047428|811399:823901|821151_821634_-|WP_071937494.1|DBSCAN-SWA MNELKNSKKQAKNNQNLTKNESILTKENNNLNQQKNLLNWQKDKEKLINKYKRFLKEKNVILDIIKLDFLEEFCTLKLTLNNINNEIQTLINDGKLFSETDNNRGKPKEVRHPALISYGQAYKDYKAGYEIIEQWIKIANQKDNSDTFNFNNLYDNSEEK >NZ_CP047428|811399:823901|819048_819240_-|WP_071938058.1|DBSCAN-SWA MSEGMTGIWTGLTSALWKVKEGITNILLEIMVFLGEAWIILIPFAIFCIIKILNFFRVMVKGF >NZ_CP047428|811399:823901|819312_819450_-|WP_071937489.1|DBSCAN-SWA MPTWLTTIFSVVIVLAIFLYFGLLIYQKIKQIRGKKKDKKEIERK |
19 | Spiroplasma_virus(66.67%) | transposase,integrase | attL 804245:804260|attR 821124:821139 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
862880 : 899522
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP047428|862880:899522|DBSCAN-SWA 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48 | Clostridium_phage(18.18%) | terminase,head,tail,protease,portal,tRNA,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
927027 : 934793
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP047428|927027:934793|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP047428|927027:934793|928649_929027_+|WP_164024015.1|DBSCAN-SWA MKCFLIKKMKNNWKDYDKNRPIRHKFYRNKKWVKIRNDYFNSKMGMCERCYQKGYIVNGVIVHHKEYITDQDFINWNIDKLFAWKNLELLCMKCHNKEHKTEKGYRDNVIIDEETGKVKIIDKEE >NZ_CP047428|927027:934793|929172_929352_+|WP_071937570.1|DBSCAN-SWA MNSYKIIIGYYNKICSVCNKEIPIIFTQAGLLKINENENQLLYNGHFKCIKNKYDKINL >NZ_CP047428|927027:934793|933551_934793_+|WP_071937592.1|DBSCAN-SWA MRRMIFINPNLNKILKVKRDKIEFIHNNSFFQPLSSETKTLDGLNPYFVVLDEVAMMEKRDIYDVMRTATAKRKDYLMLLITTNGSIRENIFDERYSYAEKVLENTIKDNKFLPWIYELDERNEWKNFNNLYKANPNLGISKYIDNFKAEWQEALITPTQQPNFLIKHCNLKSNLDSALFSRLDLETKNNKIINTDEYLIKNRICTIGIDLSKTNDLSAVVFLIPNLDTNEFILLSQFFMPEARIIEKTTEDKIPYKLYQEQGILALCKGEEINISEIVNYIINIMKKYNLICYGIGYDTFNSYLLKQHLDNAGFYLINNLIRFGVRTISPIIKALKLEFDDNKFVFNQNPLLKLHFNNVDVLIDEEKENMMPIKRSKNKRIDGFIALLFAYKIFRDNKDRIYIELYKIYSQK >NZ_CP047428|927027:934793|927452_927695_+|WP_071937587.1|DBSCAN-SWA MRLNMKTNKYILCYRSEKGKRPCKTYFGEYITGIDVEDVNINSTWEWEYFKKNYGENNLVICKDDKLDLILERKKYNEKM >NZ_CP047428|927027:934793|929720_932102_+|WP_071937590.1|DBSCAN-SWA MANERITENIVRDKLQRLNYYSNNDIVIDEQISSNEKIKDLLKFSSKQGIGNGKPEFIIWHKTKELVIIIECKSLSKFHISENLDSPKEYAVDGALHYARNLKDNYNVIALGVSGQSLDDIKISAYSWLKNDKRYIPRKFNDLVSFDEYLSIFEISKKPISENELIKYSRELHNAMRDEAKLKETEKPLLVSALLLALDNDGFRAQYKSILDGNILARTIIIFIEEALKNSNLDNTKISVLKREFEGVVNKQELLNGKIVLTDSSYNNLLFKFLSDLEEKVYPFMKEIRNIDLVGKFYSEFVRYTGGDGKGLGIVLTPKHITTLFAKLADVNYKSTVLDICVGTGGFLIAALEKMFNDKSKDLSVEEINSIYSKKLIGYESQDDIFALACSNMIIRGDGKTNLFCKNSLLENSKDINKKFNTNVGLINPPYSQKKEDEKELKFVLHMLDSLSKGGIGVAIVPVSTILSTNKKATNTLLKQKILENHKLEAVISMPEELFYPTATVTCILVFRAWEKNDKTILYSLKDDGFKKVKYIGRMDMGNWEKIEKTCLDAIKNKDVSNNFTTKLLELKYYDEWLPEAYIDSNYTKLSKKHFIRTIKEYATFLFNSEQIKVASADSLINEKYEINFDDWRFFNLGDENIFLINRAKGVKVNDYEEGNKIPFVTTTSSNNGIIKYVDEQEINDLNCKNVITIANNGSVGESFYQNSDFLATSDVTILKTIKYKMNPFLAMFLCTMIKWEKFRFNYGRKWGIDRMKQSYIFLPSIKVDDQYVPDFEYMELFIKSLIYSKHII >NZ_CP047428|927027:934793|933087_933480_+|WP_071937591.1|DBSCAN-SWA MQANNEKTNLELYYEWINKNSNKNKVGIKIKKIVSTLVKELKSNKDYYFNHKEANKTISFIEKSCFHTTGEYNKQNFKLELWQKAFLEALYGFYDKKTNLRRFKEALLIVGRGNEKTALASAIALKSLIL >NZ_CP047428|927027:934793|929010_929154_+|WP_155522132.1|DBSCAN-SWA MIKKNKDFAKASKVVSETQLYKQAGNSIVIDVLEKIFIKMFKTEKKN >NZ_CP047428|927027:934793|932581_933085_+|WP_164028310.1|DBSCAN-SWA MNELKNSKKQAKNSQNLTKNAPFLTKNESILTKENNSLNQQKNLLNWEKDKEKLINKYKRFLKEKNVILDIIKLDFLEEFCTLKLTLNNINNEIQTLINDGKLFSETDNNRGKPKEVRHPALISYGQAYKDYKAGYEIIEQWIKIANQKDNSDTFNFNNLYDNSEEK >NZ_CP047428|927027:934793|927814_928669_+|WP_164028307.1|DBSCAN-SWA MNNKIELILNNSKVNNWINEKLTNQKEINLFRKNILTIYNNNPSLFDKEKINLMSVLSACVKAMLLDLPLDPNLGYAYIVPYNGKGQLQIGYKGYIQLAIRTGKYLTINAIEVKQGELLNFDELEQEYNFKWITNENERTKKETIGYVAFFKLLNDYKKTLYWSKEKCENHFKTYSKNYQTYGKFTAGSYEGMALKTVLTQLLRKWGIMSVEMQEAYQHDQAIIINNSKEFSDNPNIKNKEDNNVIELNNKKDELNLNLEQEFSSNEINDDEEIAKTVDEMFSD >NZ_CP047428|927027:934793|927027_927462_+|WP_071937586.1|DBSCAN-SWA MNQFIAIGRTTKDIEIKRTQNGKEYAMFQLAVTRPHSTQKETDFIPCQVWNKQASVLQQYCQKGSQIAITGILQSFKDKENKTQWAVRVYSCQFLQTNNNLKNSTPPITPTKINQTQSATRNIRLEEIEANKSFENNDDAILWD |
10 | Staphylococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
952255 : 963092
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP047428|952255:963092|DBSCAN-SWA CCTAACTATACAATGTTTTTGAAACAATAAACCCAACAATATATAAACTTGATATCGTTAACATTAACAGATGACTAAACAAAACTGCCATTCTACCAAATAATCAAATCAATCAAGTATCAGAATTATATAAATCCATAATAATATTTTTTGCTGATGTAAATTGATTAATAATAACAGTAATAAAACCAGTTCCAAATATCGCAATCGCCGCAAACAATAAAACTAATTTAATCATTACTTTTTATCTCCTTTAAATTTAGTACTTCTAATATTTTTTGCTTGATATCTAATACTTTGTCGTTTAAGTTCTTTTTTAACTTGCTGCTTATTACTATTTTGATAAACATTTTTACCAACATTAATACCTTTTCGTACAGTTGGCGAATATACTTGCGAAACACCATTATTAACTGTCGAACCTAAATTATTATATTGTGTTGATGTGCCGTGAATTGCATAAATAGATAACTTAATAACCATAAAAAAGACTAAAAAATAAGCAATCGATGTATTTGTCATCGGTAACTTTGTATTTCAAATTACATCAAAAATAAACAAAAATATATCAAAAACAAAACTAAAAATCTTATCTCAATTACTATTATTATTTTCAACTAATAAATTAATCATCTTTACCATTTCCTTTCTCTTTTTTAGGTTTTAAATTCTTTTTCAAAATATCAATATCAAACAATTCTAATCGTTCTTTAACACTTAACTTTGTAATTTCTGACCAATAATATTCTTTTTTATCAACAACTTCGTCATTCTTTAAATCACGCACAAACTTTAACCATTGACTATCATACTTATTAGCGAATTCAAGGGGAATAATTATTTTAAAAAACCGAATTCCTAACCCAACATCTGACTTATGTTTTGCTCTTTTACCTTCTGCTGTTCGTTCTACTGATTTTGTTTTTCAAATTTCATAATCCGTTATATCTTGGAAAATCCCAATTCGCATAATAAAGAAACGATTAAAAAAATTAAATCCTTTTTTAGCAACGGGTTTTTTCAATGAAATTGGAATAATAATCCCACTTGCTAACTGGCGAATATTGTTTCAAATCATACCCTCACGCTGAGCAGTAAACAACGCACGATTACCAAAATGTCTCGCTAAAACAATTCACGGTATTTTACCACTATGAACTTTTTTCTCATCATGAGGACTAGTTCCATCAATATACAAATAACTTTCATAAAATAAAATAACACTATCATCTGGGGGGGCGGTTTTGTTCTATCGGTAAAATCTAAATTTTTAAATGTTAAAATTTTAACTTTATCATCTTCTAACGGATAATTACTATAAATTTCATCTGTCAATAATTTCATAGTTTGCGACAAATAAGTTAAAAGTAATGTTTTACCAGTTTCTAACTTACCAATAATTACCGATAACGGATTATCTCAAACAAAATTTACTAACCGAAAAGCGTTTAACTGATAAAAAATATTTTTTCACAATCATCACACAAAATAAATACACTGCAAAACAAATAATATTCAAAATACTAAACCAACACAATACAAAGAAATTATCCAAAGTAATAAATCAATTAAACTAAACAAAAGCATTGAACCACAAATATAACAATAGTTTTTAAAGAAAAATATAAATTTTTTCATTATTTAAAATACCCAACTATTTTAAAAACCATCCACAAGAAAAACCAAGTTAAAAACAAAATCACAATTCAAACACCAACCATCAAAGTTAAATATTTATTTTGCGTTAAATTCCACATTTTAATACTTTCAACATTCGTTTTATCTATAAACAAAAATATATAAATAAAAAACTCTTTTAATTTAATTCAATCATTTTGCATTTTTAAAAACTCCACATTTTTTGAATAAGTTTAAAAAACATTCCAAAAAATAAAACAACAAATAACACAAAGGATATAACATATAAAAACTCAGGGGCATTTGCACCAATAATATAACTAACAAATTGAACTCAATAATCATATAAACTCATTTAATTTAAACTTTCTAAATCATTAATTAATTCTTGTACTTTTTCAACACTTCAATTTGTTAAATTATTATTATTATTATTATTATTATTTGCTTTTACTTTTTTAGGTTCACTTGAAAATAACGCTTCTTTCATTTTAGTAAAGTAATTTTGTTTATATTGATTATATAAATTGATTAATTCTGTTCCAGTTAAATATTTCCAAATATGACGTTTTAAATTTTCATCATATTTTACAATAGGATAAGAATTATCATAAATTAAACCGATTGCTACTTGTTCCGAATGTTTTTCACTCGGATAAATAAACTTATTACTCAACCAAAAACCAATATGGCGATTATGATTAGGTAAATTAATAAAACTTGCTTTATCTGTTGTAAAAGGTATAAATCCCTTACTAATAAAATAATTTTCTACATTCTGATTTTTCTTAATAAAATTACTCAATTTTATCATCTCCTAACTAAATATTTGTTTAATAAACAATGTTATAAATAATGTTTATATAATGTTTATTTATTGCAATAAACCTGATTATTAACAATGTTATAAATAATGCTAATATATTGTTTATTTAATGCTTAATAAACACTGTTAATAAAAGTTAAATATATAAAATAATAAAAATTGGCACACTGAAAAATACTATTTAATTTTTAACAATAGTTATTAAAATATAAAATCATAAATTTATAATTAAGTTGATATTATTATGGTTTTCTCTCTGTATAAATTATTTTAAATAGAAAGGAAAAATAAAATATCGAAGAAATAATAAATTCATTTTTTACAAATGTGATATCATCTATTTTTTGATTATCATGAATGGTATCACCAATTAAAACAATTATTTCACTAATAATAATTTTAATAATAACTTTTAAATTTAGGAATCATGTAATCGAAGTGCAACAAATCAATTCTGAAAGGAGTTGATTTTTTATTGAAAAGAAACATTATTTTATTTTGCGGTCCTTAGTAACTAAGTATGGAAAAGATATTGTTATTAATACTGTAAATAAGATAGTAATTAATAATTTAAAAGAAAATGAATAAATTATCCGCGTAATTTATTAGCGGTAATTTATTCAATATTGTTTATTTTGAGCGTAGCGAACACGCGGAGCGTGACGCGATATTTTTTAGAAAGGAGATGTATTATGCCAACTTGATTAACGACAATATTTAGTGTTGTTATTGTATTAGCAATTTTTCTTTATTTTGGTTTATTAATTTACGAAAAAATTAAACAAATTCGAGGAAAGAAAAAAGATAAAAAAGAAATTGAAAGAAAGGAGAGTAATAAATAATGTTAGGTATGTATTTAACAACAGCGTTTAATTTTTTAACAGCACCTACACCTAAAACTATGTCTGAGGGTATGACTGGTATTTGAACTGGTTTATCTAGTGCATTATGAAAAGTTAAAGAAGGTATAACAAATATTTTACCTGAGATAATGGTTTTCTTAGGTGAAGCGTGAATTATATTAATTCCATTTGCTATATTTTGTATTATTAAAATCTTAAACTTTTTCCGTGTTATGGTTAAAGGATTTTAATATTTATTATAATCGATCATATATCTTAGTTAAGGCACACTAGCTTTTATGTGAATTAAATAAATAATTTTATTGTTTATTTTTACACTATACACTGTTTACAAATTTATTTTTTAATAAACTTTATTACTATCGTTAATATTGGGATAATAAAAACCCCTATTATACATATAAATTTAACTATATTTTCTATAGTTGATAAATCTATATTGTTTATTATTCATAATATTGAGTCTGTTATGAAAAATATTTTTTTAGTAGGATTTAATAAAAATAAGAATATTTCTATTAAGGGTCATACTAGTAATAGATTTGGGAAATAAATTTTTATAATATTTTTTATAAATACACCTACTTTCTTTTAAAACTTGTAAACAGTATATAGTGTAAAAATATTAATTTAATTATATTTAAGGTATTATTATGGTTTTCTCTCTGTATAAAAATATTTACAAATTTGTTAATTTATTAAAAATTTGAATAATAAATTTAAAAGAAATAATTGTTTTAATTGGTGATACCATTTATGATAATCAAAAAATAGATGGTATCACATTTGTAAAAAATGAATTTATTAAATAGAAAAATGAATTTATTATTTCTTCGATATTTTATTTCTTCTTTCTATTTAAAATAATTTATACAGAGAGAAAACCATAATAATATCAACTTAATTATAAATTTATGATTTTATATTTTAATAACTATTGTTAAAAATTAAATAGTATTTTTCAGTGTGCCAATTTTTATTATTTTTATATTTAACAATGTTTATTAACAGTGTTTATTAACATTGTTTATTAAACATTAAATAAACAATATATTAGCATTATGTATAACATTGTTAATAATCAGTTTTTATTACAATTAAAAAACATTATATAAACATTATTTATAACATTGTTTATTAAACAAATATTTAGTTAGGAGACTATATTATGGATATGAAATTTAAAACAACTAAGGAATATAAAAAATAAAGAAAAATTTTATTAAAGATATTTTTTATTAAGTTTTTTAATTTTTTTAATTTTAATTGTTGGTTTCTTTTTTTTAAGTTCTTTTATTTATTTTTCAATATTAAGTTGAAGTGTTAAAGATTTTCTATATTTTGTGCTTGTAATTATTATGTCTGTATGTGCTTTTATATTTATTATTTTTGCGATTATTATGTATATAAAATATATTCTTGAATGTAAGGCAGAATTTGATGTTTAAAAAGAAAAATTAAATCAATATTTAAAAACTGAAGGAGATGATAAAATTGAGTAATTTTGTTAAGAAAAATCAGAATGTAGAAAATTATTTTATTAGTAAGGAATTTATCCCTTTTGCAACAGAAAAAGCAAGTTTTATAAATTTACCTAATCATAATCGTCATATTGGTTTTTGATTGAGTAATAAGTTTATTTATCCTAGTGAAAAACATTCGGAACAAGTAGCAATCGGTTTGATTTATGATAATTCTTACCCTATTGTAAAATATGATGAAAATTTAAAGCGAAATATTTGAAAATATTTAACTGGAACAGAATTAATCAATTTATATAATCAATATAAACAAAATTATTTTACTAAAATGAAAAAAGCGTTATTTTTAAGTGAACCTAAAAAAGTAAAAGCAAATAATAACAATAATAATTTAACAAATTGAAGTGTTGAAAAAGAACAAGAATTAATTAATGATTTGAAAGACTTAAATTAAATGAGTTTATATGATTATTGAGTTCAATTTGTTAGTTATATTATTGGTGCAAATGCCCCTGAGTTTTTATATGTTATATCGTTTGTGTTATTTATTGTTTTGTTTTTTGGAATGTTTTTTAAACTTATTCAAAAAATGTGGAGTTTTTAAAAATGCAAAATGATTGAATTAAATTAAAAGAGTTTTTCATTCATGTCTTTTTGTTTATAGATAAAACGAATGTTGAAAGTATTACAATGTGGAATTTAACGCAAAATGAATATTTAACTTTAATGGTTGGTGTTTGAATTGTGATTTTGTTTTTAACTTGGTTTTTCTTGTGAATGGTTTTTAAAATAGTTGGGTATTTTAAATAATGAAAAAATTTATATTTTTCTTTAAAAACTATTGTTATATTAGTGGTTCAATGCTTTTGTTTAGTTTAATTGATTTATTACTTTGGTTAATTTCTTTGTATTGTGTTGGTTTAGTATTTTGAATATTATTTGCTTTGCAATGTGTATATTTTGTGTGATGATTGTGAAAAAATATTTTTTATCAGTTAAATGCTTTTCGGTTAGTGAATTTTGTTTGAGATAATCCCTTATCGGTAATTATTGGTAAGTTAGGAACTGGTAAAACATTACTTTTAACTTATTTGTCGCAAACTATGAAATTATTGACAGATGAAATTTATAGTAATTATCCGTTAGAAGATGATAAAGTTAAAGTTTTAACATTTAAAAATTTAGATTTTACCGATAGAACAAAACCCGTTCCCCTAGATGATAGTGTTATTTTATTTGATGAAAGTTATTTATATATTGATGGAACTAGTCCTCACGATGAAAAAAAAGTTCATAGTGGTAAAATACCGTGAATTGTTTTAGCGAGACATTTTGGACATCGTGCGTTGTTTACTGCTCAGCGTGAGGGTATGATTTGAAATAATATTCGCCAGTTAGCAAGTGGAATTATTATTCCAATTTCATTGAAAAAAACCCGTTGCTAAAAAAGGATTTAATTTTTTTAATCGTTTCTTTATTATGCGAATTGGGATTTTCCAAGATATAACGGATTATGAAATTTGAAAAACAAAATCAGTAGAACGAACAGCAGAAGGTAAAAGAGCAAAACATAAGTCGGATGCTGGGTTAGGAATTCGGTTTTTTAAAATAATTATTCCCCTTGAATTCGCTAATAAGTATGATAGTCAATGGTTAAAGTTTGTGCGTGATTTAAAGAATGATGAAATTGTTAATAAAAAAGAATATTATTGGTCGGAAATCACAAAATTAAGCGTTAAAGAACGATTGGAGTTATTTGATATTGATATTTTGAAAAAGAATTTAAAACCTAAAAAAAGAGAAAGGAAATAGTAAAGATGATTAATTTATTAGTTGAAAATAATAATAGTAATTGAGACAAGATTTTTAGTTTTGTTTTTGATATATTTTTGTTTATTTTTGATGTAATTTGAAATACAAAATTACCGATGACAAATACCTCAATTGCTTATTTTTTAATCTTTTTTATGGTTATTAAGTTATCGATTTATGCAATTCACGGCACATCAACACAATATAATAATTTAGGTTTGACAGTTAATAATGGTGTTTCGCAAGTATATTCGTCAACTGTACGAGAAGATATTAATACTGTTAAAAGAGAAATTAAGCGTCAAAATGTTAGACAACAAGCAAAAGTTAAAAGAGGTGTTAAGTAATGATTAAATTAGTTTTATTGGTGGCGGCGATTGCGATATTTGGAACTGGTTTTATTACTGTTATTATTAATCAATTTACATCAGCAAAAAATATTATTATGGATTTATATAATTCTGATACTTGGTTGATTTGATTATTTGGTAGAATGGCAGTTTTGTTTAGTCATCCGTTAATGTTAACGATATCAAGTTTATATATTGTTGGGTTTATTGTTTCAAAAACATTGTATAGTTAGGAGTTAAGTTTATGAAAAAATCGTTATCTTTATTTGCCATATTTATTTTAAGTTTTTTGGGTTTAGTTATTCCATTTATTACTTTAAAGGCGTTTAGGCCCTTAAATGAGGAGCAATATACGCTTAAACAAGAAAGTAGTACTGGTAAAGGTATTAATGAAACTGATTTTATTAATACAATGTTTTTACGCAGTAGTTTTTTTGAAAATTGGTCGGAAACAAATTACTTTATTAATCCAACTTTAAAAACATCAAAAATTTATTGTTTAATGATAAATGGTATTTAGATTTTTTACAAGATAGTTATTCAACCGGAGTTGTTTATGATAAACCTTGTGAAATATTTTTGAATTATTATCGACAATGACATAGTTTAAAAAATCGTTATATGGTTGAAAAATTTTATGATGTTAAAAAGGAGAATTTTTTGGATGATTTAACTGATTTTATTTATGCTTTTGCTGTAAAATATAAGATGTTTGATGTATCGAAAGAAATTGTGGAAAATGTTGACCGCTATAAAGAAAATCATTATCCAAGAGTTAAGTTAAAACAAGATAATTGAAAATTAATTACTAATAGATATATTCCACGAGATACTGGATGATATATTATAATTTATGAAAGTTTTAATTTATGACGAATAGAAAAAATTAATAGTTCTAAAAACTTCGGAAGTAATACTGGTTATCCAATGGATATTATATATAAATGAGAATTAAATAATGAACCTACGAATTTACAATTACCAACCATTGATAAAAACACTGGTGAAATTACTGATTGAAATAGTTATCAACAAAGTCGTGTAAAACAGTTTATTGATTTATCTTTATATTCTGTTTTGCAAGAAAATATTAGAGTTCAGCAAGGTGGTAGTGCGGATTATGAAAATCCGAATAAGGTTGGAACAAAGCGGATAATTTTTGATTTTGAGACGGTTGACGAGTTGGATGTTAAAAATATTAAAAAAGCAATTTATCGGATGATTTTGACTGTTGATGAAGCAAATTTAATTATTTCTGGTAGTTTAGAGTTAAATAATATTAATAATGATGATTTAAGTTTTAATTTTAGTTTTATGCGAACTGGAATGGGTGAGGTTTTTAATTTTAATGGTTCAATTTATTCATCATTAAATAGTAAAGACTTAAAGTATTATCAACAATTTAGCGGTCAGTTTGATTTATCTAAGTTTTTACAGTCGTTTTTTGCAAGTGCATTGGTGCCCGTGTTTCAAAATCGTAGTTCGTTTATTGAAAATGGATATATTGATAATTTACAATATGATACTGTTTTAGTTAACTTTTTTGCGTTGAAATTACAAAATTTTAATAATATTTTGTTGATTGAAAATATTAACGATAAATTACAATTTGATAAATTATTAAATAGTATGTTTAAGATTTCACAGAAATTTTATACTAATTATTTACGTACGATTTTTGATTTAGAAAATAATACTTATGTTCAAGGTTATAATAAAAATATGGTTTGTTAGTAAATAATGGTTTTAAAATTTACCCACGATATTTTTATTTTTCTGATAAATATAAGCAATTAGATATTAAATTATATTCAGCATTTAAAAATCGGTTTTATACGATTAATAATTATGGTAGTGTTTTTAATTATGATTTTTCGGTTGCTAATAATTATAATATTAAGTCAAATTCGGGTTATGTTTTTGGCGGTGATTTACAAAATAAATATGGTTTGCAATATAAAAAAATTGAAGAACAAAAAATCGGTTATAATGTTTTTGAATTGCAAGCACAAAAAGAGAATGATATGTACCGATATTATGATTTTAATTTTGGGATTTATAATTGACAAGAAATTAATAATGGTGGGTTGTTCCCCGATAAACAATGATGACAAGTGCAATATGTAACGCCAGAGGGTTGATGAGATTTTGGTGCTCATATTAAAAATGCGGTGATTTGAATTGTCAATACTATTCCCGGTGTTAAACAAGTTAATGAATTAGCGAGTGGTGTTGGTAAGGTTTTTGAAACAGTATATAGTTTTTTTAGTCAAATATTTGAAGTATGAAAATTTAATCCAGCATTGTATAGTACAATAACAAATATTTTTTTATTAATTATTTTTATGAAATTTGTGCGATTAATATAAAAAAGGAACTGTTATTAAGTTCCTTTTTGTTCTTTTCAGTCAGTAATTTTACCAGTATTTTTGTCAATAGTTGGTAATTGTAAATTCGTAGGTTCATTATTTAATTCTCATTTATATATAATATCCATTGGATAACCAGTATTACTTCCGAAGTTTTTAGAACTATTAATTTTTTCTATTCGTCATAAATTAAAACTTTCATAAATTATAATATATCATCCAGTATCTCGTGGAATATATCTATTAGTAATTAATTTTCAATTACTATTTTCTGGTGGTTGTTGTGCGTTATATGATGGTTTTGGTTTATTATCTTCTTCGTTTTTATTATTATTTTCTTTTTTACAACTGATTAATGTTGTTGTACTTGTTGCGGTTAATCCGATTGCTCCTATTATGCTAAGTCATTTTTTCATATATATTGCTCCTTTTTATTTTTTTATATAATTGATTTTATCACATATCAATTATATATCAATTATTCGTATTAAATATTAATTTTATAAGTTAATGAAAGGTATATAAATGTTATGTATAGTCATTTAAGTTTTATGGATAAAGTTAAATTAGAACAATTATTATTATCAAAAATTTTTTTAAAAAAGAATGGTGAGCAGAATATTTCTGCAATCGCTAAATATTTGAATAGACATCGTAGTAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP047428|952255:963092|955410_955560_+|WP_071937614.1|DBSCAN-SWA MPTWLTTIFSVVIVLAIFLYFGLLIYEKIKQIRGKKKDKKEIERKESNK >NZ_CP047428|952255:963092|957066_957516_+|WP_071937616.1|DBSCAN-SWA MIKLSNFVKKNQNVENYFISKEFIPFATEKASFINLPNHNRHIGFWLSNKFIYPSEKHSEQVAIGLIYDNSYPIVKYDENLKRNIWKYLTGTELINLYNQYKQNYFTKMKKALFLSEPKKVKANNNNNNLTNWSVEKEQELINDLKDLN >NZ_CP047428|952255:963092|954097_954247_-|WP_164024019.1|DBSCAN-SWA MSLYDYWVQFVSYIIGANAPEFLYVISFVLFVVLFFGMFFKLIQKMWSF >NZ_CP047428|952255:963092|958879_959221_+|WP_071937617.1|DBSCAN-SWA MINLLVENNNSNWDKIFSFVFDIFLFIFDVIWNTKLPMTNTSIAYFLIFFMVIKLSIYAIHGTSTQYNNLGLTVNNGVSQVYSSTVREDINTVKREIKRQNVRQQAKVKRGVK >NZ_CP047428|952255:963092|952255_952492_-|WP_071937609.1|DBSCAN-SWA MIKLVLLFAAIAIFGTGFITVIINQFTSAKNIIMDLYNSDTWLIWLFGRMAVLFSHLLMLTISSLYIVGFIVSKTLYS >NZ_CP047428|952255:963092|952491_952887_-|WP_071937610.1|DBSCAN-SWA MINLLVENNNSNWDKIFSFVFDIFLFIFDVIWNTKLPMTNTSIAYFLVFFMVIKLSIYAIHGTSTQYNNLGSTVNNGVSQVYSPTVRKGINVGKNVYQNSNKQQVKKELKRQSIRYQAKNIRSTKFKGDKK >NZ_CP047428|952255:963092|954247_954706_-|WP_164058330.1|DBSCAN-SWA MIKLSNFIKKNQNVENYFISKGFIPFTTDKASFINLPNHNRHIGFWLSNKFIYPSEKHSEQVAIGLIYDNSYPIVKYDENLKRHIWKYLTGTELINLYNQYKQNYFTKMKEALFSSEPKKVKANNNNNNNNNLTNWSVEKVQELINDLESLN >NZ_CP047428|952255:963092|955559_955811_+|WP_071937131.1|DBSCAN-SWA MLGMYLTTAFNFLTAPTPKTMSEGMTGIWTGLSSALWKVKEGITNILPEIMVFLGEAWIILIPFAIFCIIKILNFFRVMVKGF >NZ_CP047428|952255:963092|953891_954095_-|WP_071937611.1|DBSCAN-SWA MQNDWIKLKEFFIYIFLFIDKTNVESIKMWNLTQNKYLTLMVGVWIVILFLTWFFLWMVFKIVGYFK >NZ_CP047428|952255:963092|955156_955306_+|WP_155522119.1|DBSCAN-SWA MQQINSERSWFFIEKKHYFILRSLVTKYGKDIVINTVNKIVINNLKENE >NZ_CP047428|952255:963092|962123_963092_+|WP_015979228.1|transposase|DBSCAN-SWA MYSHLSFMDKVKLEQLLLSKIFLKKNGEQNISAIAKYLNRHRSTILREIKRFKTIDEYSAYKSDKMYYEKRKKNNKRFKFTEEQLNFIHLRFNVYHDSPSELIYRYFLKFKVKFPVCVKTLYKWIRLGFYGFLKQNLRHHGKKYKRKGKSDNRGKLTDFKSIWDIDNKVSNVGWLEMDTVVGKDHKSAILVLVEQLSKKYFAIKLENHTAREVEKKFKDIIIKNNLIGKIKGIITDRRKEFSKWREMEIFAETQVYFCDAGSPQQKPLIEYMNSELRHWFPKGTDFNKVSQKQIDWVVNVINDKLRPCLNWISSKEMFLQNI >NZ_CP047428|952255:963092|961607_962009_-|WP_071937619.1|DBSCAN-SWA MKKWLSIIGAIGLTATSTTTLISCKKENNNKNEEDNKPKPSYNAQQPPENSNWKLITNRYIPRDTGWYIIIYESFNLWRIEKINSSKNFGSNTGYPMDIIYKWELNNEPTNLQLPTIDKNTGKITDWKEQKGT >NZ_CP047428|952255:963092|959220_959457_+|WP_015967964.1|DBSCAN-SWA MIKLVLLVAAIAIFGTGFITVIINQFTSAKNIIMDLYNSDTWLIWLFGRMAVLFSHPLMLTISSLYIVGFIVSKTLYS >NZ_CP047428|952255:963092|957516_957666_+|WP_015967972.1|DBSCAN-SWA MSLYDYWVQFVSYIIGANAPEFLYVISFVLFIVLFFGMFFKLIQKMWSF >NZ_CP047428|952255:963092|957668_957872_+|WP_071937469.1|DBSCAN-SWA MQNDWIKLKEFFIHVFLFIDKTNVESITMWNLTQNEYLTLMVGVWIVILFLTWFFLWMVFKIVGYFK |
15 | Spiroplasma_virus(92.31%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1047295 : 1056832
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP047428|1047295:1056832|DBSCAN-SWA TATGCCAACTTGATTAACGACAATATTTAGTGTTGTTATTGTATTAGCAATTTTTCTTTATTTTGGTTTATTAATTTACCAAAAAATTAAACAAATTCGAGGAAAGAAAAAAGATAAAAAAGAAATTGAAAGAAAGGAGAGTAATAAATAATGTTAGGTATGTATTTAACAACAGCGTTTAATTTTTTAACAGCACCTACACCTAAAACTATGTCTGAGGGTATGACTGGTATTTGAACTGGTTTATCTAGTGCATTATGAAAAGTTAAAGAAGGTATAACAAATATTTTACCTGAGATAATGGTTTTCTTAGGTGAAGCGTGAATTATATTAATTCCATTTGCTATATTTTGTATTATTAAAATCTTAAACTTTTTCCGTGTTATGGTTAAAGGATTTTAATATTTATTATAATCGATCATATATCTTAGTTAAGGCACACTAGCTTTTATGTGAATTAAATAAATAATTTTATTGTTTATTTTTACACTATACACTGTTTACAAATTTATTTTTTAATAAACTTTATTACTATCGTTAATATTGGGATAATAAAAACCCCTATTATACATATAAATTTAACTATATTTTCTATAGTTGATAAATCTATATTGTTTATTATTCATAATATTGAGTCTGTTATGAAAAATATTTTTTTAGTAGGATTTAATAAAAATAAGAATATTTCTATTAAGGGTCATACTAGTAATAGATTTGGGAAATAAATTTTTATAATATTTTTTATAAATATACCTACTTTCTTTTAAAACTTGTGAACAGTGTATAGTGTAAAAATATCAATTTAATTATATTTAAGGTATTATTATGGTTTTCTCTCTGTATAAAAATATTTATAAATTTGTTAATTTATTAAAAATTTGAATAATAAATTTAAAAGTTATTATTAAAATTATTATTAGTGAAATAATTGTTTTAATTGGTAATACCATTCATGATAATCAAAAAATAGATGGTATTACATTTGTAAAAAATGAATTTATTATTTCTTCGATATTTTATTTCTTCTTTCTATTTAAAATAATTTATACAGAGAGAAAACCATAATAATATCAACTTAATTATAAACTTATTATTTTATATTTTAATAACTATTGTTAAAAATTAAATAGTATTTTTCAGTGTGCCAATTTTTATTATTTTTATATTTAATAATGTTTATTAACATTGTTTATTAACATTGTTTATTAACATTGTTTATTAACATTGTTTATTAACATTGTTTATTAACATTGTTTATTAACATTGTTTATTAACATTGTTTATTAACATTGTTTATTAAACATTAAATAAACAATATATTAGCATTATATATAACATTGTTAATAATCAGTGTTTATTACAATTAAAAAACATTATATAAACATTATTTATAACATTGTTTATTAAACAAATATTTAGTTAGGAGACTATATTATGGATATAAAATTTAAAACAACTAAGGAATGTAAAAAATTAAAGAGAGATTTTATTATTAGGAATTTTGTTTTTGGTTTTGTTTATTTTCAATTTTTCATTGTTCTTATTGAAATTATTGTAGGTCTTGTTTTGTTTTCAAATAGAGAAATAATTGTTGGTATTTTACTTTTTTCTTTATTTTTATTTTTAATATTTATTCTTTTATTTTTTATAATTCAATGTCATATATGCGAAATTAAAGAATATAAAGTTATGTTGTTAAAGAAAAGAATGTTACCGTTAGAAAATATAATTGGAGGATTAGGAAAAGGCACAATGTTAAGACCAGTAAGACGAGGAGTTGATAAAATTGAGTAATTTTGTTAAGAAAAATCATAATGTAGAAAATTATTTTATTAGTAAGGAATTTATCCCTTTTACAACAGAAAAAGCAAGTTTTATTAATTTACCTAATCATAATCGCCATATTGGTTTTTGACTGAGTAATAAGTTTATTTATCCGAGTGAAAAACATTCAAAACAAGTAGCTATTGGTTTGATTTATGATAATTCTTATCCTATTGTAAAGTATGATGAAAATTTAAAACGCCATATTTGAAAGTATTTAACTGGAACAGAATTAATCAATTTATATAATCAATATAAACAAAATTATTTTACTAAAATGAAAAAAGCTTTATTTTCAAGTGAACCTAAAAAAGTAAAAGCAAATAATAACAATAATAATTTAACAAATTGAAGTGTTGAAAAAGAACAAGAATTAATTAATGATTTGAAAGACTTAAATTAAATGAGTTTATATGATTATTGAGTTCAATTTGTTAGTTATATTATTGGTGCAAATGCCCCTGAGTTTTTATATGTTATATCGTTTGTGTTATTTATTGTTTTGTTTTTTGGAATGTTTTTTAAACTTATTCAAAAAATGTGGAGTTTTTAAAAATGCAAAATGATTGAATTAAATTAAAAGAGTTTTTTATTTATATATTTTTGTTTATAGATAAAACGAATGTTGAAAGTATTACAATGTGGAATTTAACGCAAAATGAATATTTAACTTTGATGGTTGGTGTTTGAATTGTGATTTTGTTTTTAACTTGGTTTTTATTATGAATGGTTTTTAAAATAGTTGGGTATTTTAAATAATGAAAAAATTTATATTTTTCTTTAAAAACTATTGTTATATTAGTGGTTCAATGCTTTTGTTTAGTTTAATTGATTTATTACTTTGGATAATTTCTTTGTATTGTGTTGGTTTAGTATTTTGAATATTATTTGTTTTGCAGTGTATTTATTTTGTGTGATGATTGTGAAAAAATATTTTTTATCAGTTAAATTCTTTTGGGTTAGTAAATTTTGTTTGAGATAATCCGTTATCGGTAATTATTGGTAAGTTAGGGACCGGTAAAACATTACTTTTAACTTATTTGTCGCAAACTATGAAATTATTAACAGATGAAATTTATAGTAATTATCCGTTAGAAGACGATAAAGTTAAAGTTTTAACATTTAAAAATTTAGATTTTACTGATAGAACAAAACCGGTTCCCCCAGATGATAGTGTTATTTTATTTGATGAAAGTTATTTGTATATTGATGGAACTAGTCCTCACGATGAAAAAAAAGTTCATAGTGGTAAAATACCGTGAATTGTTTTAGCGAGACATTTTGGACATCGTGCGTTGTTTACTGCTCAGCGTGAGGGTATGATTTGAAATAATATTCGCCAGTTAGCAAGTGGAATTATTATTCCAATTTCATTGAAAAAACCAGTTATTAAGAAAGGGTTTAATTTTTTTAATCGTTTCTTTATTATGCGAATTGGTATTTTTCAAGATATAACGGATTATGAAATTTGAAAAACAAAATCAGTAGAACGAACAGCAGAAGGTAAAAGAGTAAAACATAAGTCGGATGCTGGGTTAGGAATTCGGTTTTTTAAAATAATTATTCCCCTTGAATTCGCTAATAAGTATGATAGTCAATGGTTAAAGTTTGTGCGTGATTTAAAGAATGATGAAATTGTTAATAAAAAAGAATATTATTGGTCGGAAATCACAAAATTAAGCGTTAAAAACGATTGGAGTTATTTGATATTGATATTTTGAAAAAGAATTTAAAACCTAAAAAAGAGAAAGGAAATAGTAAAGATGATTAATTTATTAGTTGAAAATAATAATAGTAATTGAGACAAGATTTTTAGTTTTGTTTTTGATATATTTTTGTTTATTTTTGATGTAATTTGAAATACAAAATTACCGATGACAAATACATCGATTGCTTATTTTTTAGTCTTTTTTATGGTTATTAAATTATCTATTTATGCAATTCACGGTACATCAACACAATATAATAATTTAGGTTCGACAGTTAATAATGGTGTTTCGCAAGTATATTCGTTAACTGTACGAGAAGATATTAATACTGTTAAAAGAGAAATTAAGCGTCAAAATGTTAGACAACAAGCAAAAGTTAAAAGAGGTGTTAAGTAATGATTAAATTAGTTTTATTGGTGGCGGCGATTGCGATATTTGGTACTGGTTTTATTACTGTTATTGTTAATCAATTTACATCAGCAAAAAATATTATTATGGATTTATATAATTCTGATACTTGGTTGTTTTGATTATTTGGCAGAATGGCAGTTTTGTTTAGTCATCCGTTAATGTTAACGATATCAAGTTTATATATTGTTGGGTTTATTGTTTCAAAAACATTGTATAGTTAGGAGTTGAGTTTATGAAAAAATCGTTATCTTTATTTGCCATATTTATTTTAAGTTTTTTGGGTTTGGTTATTCCATTTATTACTTTAACGGCGTTTAGACCCTTAAATGAGGAGCAATATACGCTTAAACAAGAAAGTAGTACTGGTAAAGGTATAAATGAAACTGATTTTATTAATACAATGTTTTTACGCAGTAGTTTTTTTGAAAATTGGTCGGAAACAAATTATTTTATTAATCCAACTTTAAAAACATCAAAAAATTTATTGTTTAATGATAAATGGTATTTAGATTTTTTACAAGATAGTTATTCAACCGGAGTTGTTTATGATAAACCTGGTGAAATATTTTTGAATTATTATCGACAATGACATAGTTTAAAAAATAAGTATATGGTTGAAAAATTTTATGATGTTAAAAAAGAGAATTTTTTGAATGATTTAACTGATTTTATTTATGCCTTTGCTGTAAAATATAAGATGTTTAATGTATCGAAAGAAATTGTGGAAAATGTTGACCGTTATAAAGAAAATCATTATCCAAGAGTTAATTTGAAAGTAGATAATTGAAAATTAATTGATATTAATTGACAAAAAGATAAATATAAATTTGAAAATGAATTTAAAAAGTTAAATAATAAATGATACTTTTTTATTGAATCTGATACATATGGATTTAATAAATATTTAGCAAAAAATAATGGTAATAATATAAAACAAGTAAACGAATGAAATTGAATTCTTCTTTTAAATAATAGAAATTATGCTTATTTTGATGCTTCAAAAATAAAATTAATTTATCGTTGAGATGGTGATGGTGAACCACAAACACCTACTAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP047428|1047295:1056832|1047444_1047696_+|WP_071937131.1|DBSCAN-SWA MLGMYLTTAFNFLTAPTPKTMSEGMTGIWTGLSSALWKVKEGITNILPEIMVFLGEAWIILIPFAIFCIIKILNFFRVMVKGF >NZ_CP047428|1047295:1056832|1056062_1056257_-|WP_071937677.1|DBSCAN-SWA MPKMKTKKSLAKRVKVTGTGKWKIAHAYTSHLAQNKKTKQKRHLRKAGLMDQTDQSRLKQLLQG >NZ_CP047428|1047295:1056832|1056301_1056832_-|WP_004028189.1|DBSCAN-SWA MNQPTKNNKNIEQVNYDIRAREVLIILDDGNKVGPLGRNEAIRFAEEKGLDLLLVSAASNPPVAKLVDYGKYKYEQKKKEKENKKNQHITENKEMRLRTGIGEHDLEFKAKKVREFLTDGNRVKISLKFRGREVARPEYGKETLDKFFSYIEDLAKIEKEPQLNGLFLDMYVVPKK >NZ_CP047428|1047295:1056832|1055679_1056039_-|WP_071937676.1|DBSCAN-SWA MARVKGGSTTRKRRKKIIKEAKGYFGTKSTHYKKAKEQVMKSWSYAFRDRKQRKRDFRSLWIQRINAAVREHDMSYSQFMNGLNKTNIEVNRKILSELAIHNPNEFKVLVEKSKQALKN >NZ_CP047428|1047295:1056832|1050881_1051223_+|WP_071937672.1|DBSCAN-SWA MINLLVENNNSNWDKIFSFVFDIFLFIFDVIWNTKLPMTNTSIAYFLVFFMVIKLSIYAIHGTSTQYNNLGSTVNNGVSQVYSLTVREDINTVKREIKRQNVRQQAKVKRGVK >NZ_CP047428|1047295:1056832|1053701_1054169_-|WP_071937675.1|DBSCAN-SWA MKKWLSIIGAIGLTATSTTTLISCKKENNNENEENNKPEPQYNPQQPPKYSNWKLVDINWQKDKYKFENEFKKLNNKWYFFIESDTYGFNKYLAKNNGNNIKQVNEWNWILLLNNRNYAYFDASKIKLIYRWDGDGEPQTPTIDKNTGEITDWKE >NZ_CP047428|1047295:1056832|1051470_1053675_+|WP_071937674.1|DBSCAN-SWA MKKSLSLFAIFILSFLGLVIPFITLTAFRPLNEEQYTLKQESSTGKGINETDFINTMFLRSSFFENWSETNYFINPTLKTSKNLLFNDKWYLDFLQDSYSTGVVYDKPGEIFLNYYRQWHSLKNKYMVEKFYDVKKENFLNDLTDFIYAFAVKYKMFNVSKEIVENVDRYKENHYPRVNLKVDNWKLIDINWQKDKYKFENEFKKLNNKWYFFIESDTYGFNKYLAKNNGNNIKQVNEWNWILLLNNRNYAYFDASKIKLIYRWDGDGEPQTPTIDKNTGEITDWNSYQQTRVKEFISLSLYSVLQENIRVQQGGSADYENPNKVGTKRIIFDFETVDELDVKNIKKAIYRMILTVDEANLIISGSLELNNINNDDLSFNFSFMRTGLGEVFNFNGSIYSSLNSKDLKYYQQFSGQFDLSKFLQSFFASALVPVFQNRSSFIENGYIDNLQYDTVLVNFFALKLQNFNNILLSENINDKLQFDKLLNSMFKISQKFYTNYLRTIFDLENNTYVQGYNKKYGLLVNNGFKIYPRYFYFSDKYKQLDIKLYSAFKNRFYTINNYGSVFNYDFSVANNYNIKLNSGYVFGGDLQNKYGLQYKKIEEQKIGYNVFELQAQKENDMYRYYDFNFGIYNWQEINNGGLFPDKQWWQVQYVTPEGWWDFGAHIKNAVIWIVNTIPGVKQVNELASGVGKVFETVYSFFIQIFEVWKFNPALYSTITNIFLLIIFMKFVRLI >NZ_CP047428|1047295:1056832|1048119_1048359_+|WP_015979231.1|DBSCAN-SWA MVFSLYKNIYKFVNLLKIWIINLKVIIKIIISEIIVLIGNTIHDNQKIDGITFVKNEFIISSIFYFFFLFKIIYTERKP >NZ_CP047428|1047295:1056832|1049673_1049877_+|WP_015979235.1|DBSCAN-SWA MQNDWIKLKEFFIYIFLFIDKTNVESITMWNLTQNEYLTLMVGVWIVILFLTWFLLWMVFKIVGYFK >NZ_CP047428|1047295:1056832|1049521_1049671_+|WP_015967972.1|DBSCAN-SWA MSLYDYWVQFVSYIIGANAPEFLYVISFVLFIVLFFGMFFKLIQKMWSF >NZ_CP047428|1047295:1056832|1049080_1049521_+|WP_015979233.1|DBSCAN-SWA MSNFVKKNHNVENYFISKEFIPFTTEKASFINLPNHNRHIGFWLSNKFIYPSEKHSKQVAIGLIYDNSYPIVKYDENLKRHIWKYLTGTELINLYNQYKQNYFTKMKKALFSSEPKKVKANNNNNNLTNWSVEKEQELINDLKDLN >NZ_CP047428|1047295:1056832|1051222_1051459_+|WP_071937673.1|DBSCAN-SWA MIKLVLLVAAIAIFGTGFITVIVNQFTSAKNIIMDLYNSDTWLFWLFGRMAVLFSHPLMLTISSLYIVGFIVSKTLYS >NZ_CP047428|1047295:1056832|1047295_1047445_+|WP_071890527.1|DBSCAN-SWA MPTWLTTIFSVVIVLAIFLYFGLLIYQKIKQIRGKKKDKKEIERKESNK >NZ_CP047428|1047295:1056832|1048728_1049088_+|WP_071937671.1|DBSCAN-SWA MDIKFKTTKECKKLKRDFIIRNFVFGFVYFQFFIVLIEIIVGLVLFSNREIIVGILLFSLFLFLIFILLFFIIQCHICEIKEYKVMLLKKRMLPLENIIGGLGKGTMLRPVRRGVDKIE |
14 | Spiroplasma_virus(90.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1061243 : 1087704
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP047428|1061243:1087704|DBSCAN-SWA 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38 | Spiroplasma_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1113715 : 1126435
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP047428|1113715:1126435|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP047428|1113715:1126435|1122176_1123184_-|WP_164028351.1|DBSCAN-SWA MNVNINPYNRLTGEVLYRPYIDNSNFVNQKYYVKKVYYGPYIKTIVLPLECINKFGKGNSTGIKNTGENETKLLNSRVRSQANCIRKAIHNFSGCENMGFLTLTYAENVQDIKKANHHFRLFIRRLNYYFSKYKKNKYKDLKYLVAYEYQKKGRIHFHIIFSEYIPNKVVRKCWPYGYNKNLPVETGTNEFVSKYVAKYIVKAQSEEKSKNIYDLNTKAYRFSANCTDPVVKVGVIEMCEMELIASLKGTKHNFMFNNKDGYLMGVSIDSDWNKDYFWQMEEYVPYDKKIFRFFHKISDLDRYKIRKKYNKYLNLGKQRYIKKSTFHLESTPCVA >NZ_CP047428|1113715:1126435|1115460_1116360_-|WP_164058435.1|DBSCAN-SWA MNVNMNPYNRLTGEVLYRPYIDSSNFVNQKYYVKKLYYGPYIKTVVLPLECINKFGKGNPLGIKNIGENETKLLNSRVRSQANCIRKAIHNFIGCKNMGFTTLTYAENMQDIKKANYHFKLFIKKIKYHFSKYKKNKYENLKYLVAYEYQKRGAVHFHIIFSEYISNKIIRKYWPYGLNKNLPVRNGTNEFVSKYVAKYVVKAYSQEKSKNIYDLNIKAYRFSANCTDPIVKVGLIEMCEMELIASLKGTKHNFMFNNKDGYLMGLALIVIEIKIIFGKWKNMSRMIKKYFGFFIKYLI >NZ_CP047428|1113715:1126435|1120423_1120627_-|WP_147077521.1|DBSCAN-SWA MNVNLLAGDADVIKQIGDFAGILANWAIAFTNWFITFLGSHMLLIIPLVLMFVVLGIETIRKLIHGY >NZ_CP047428|1113715:1126435|1114634_1114958_-|WP_071937731.1|DBSCAN-SWA MFKVYLSDIKYNQVIKDKSNKENYYDVYTFLRVEGKKIVGKEYQDKWVRKDSEFQNSLPEMIEGSFYYVEIGFNGKISKILPYEENYNEQDFINKYSSNSVITESNN >NZ_CP047428|1113715:1126435|1114135_1114633_-|WP_071937732.1|DBSCAN-SWA MLNDKKLKNSCYRSQNKCISKAIYNFSECNNLTLITLTFKENITDFKIANYQFKLFIQKIKYHYQSDLKYLKVYEYQKRGAIHFQIIFDKYISSKIIRKCWNYGIIKSLSINNKYIDFIKYFVYRYITKPLIKEETQKVYDLNIKAYQFSRNCKNPKVKVGVNYE >NZ_CP047428|1113715:1126435|1119993_1120203_-|WP_071937699.1|DBSCAN-SWA MDWNIFLQRVYQGLLQIFYFIPKTEIDNFVGSSIDNITYSVIMIGVWLVVFFLIWLSLFILYKTIRLVV >NZ_CP047428|1113715:1126435|1123420_1124815_-|WP_164028354.1|DBSCAN-SWA MIYKTKIIIDFIDEFFENNKENNNSQNKELNNNLNIKGQWGSGKTTYIKKLETELKKKYQVKIFNIWEYEISNNIFISILCDILRFFNYKSEDKFDLIKLLKSILTISTEYAINFASNYFKIESPLKYIKKIINKSKCKEENLLQFDNYNEAIKEIIRQINLYTQYSKNIFIFDELDRCTIPKMIEFLSIIKNILFRLNNCFFIVSCDSDRINKMLNQNENNGINQNENYTDKIFYHTINIENLSNFDNTIICINNVMIKDHLLKDYGKIYKAINRTKNLILFLKINKNNINLELFEFITFWIYYKNINLLKSNKNLANKNLYSLTKKINNATNNIFFERRKDSPKNVLYEIINIDRYCYIRIYNEKNISIPFGLFIPFIKDIDNFDFENLCNVTDIEDPVKYLSNKENYLGYYLEYKNIYKYLDKEGQELFDKIFYYCDYRKWIYIELDINIKEYFEYMQNII >NZ_CP047428|1113715:1126435|1113715_1113943_-|WP_071937733.1|DBSCAN-SWA MKKQTKLYKQRLQYLVNVIHQCLPTKIPLFMLRKVIKLYLNHNVIDIGVMEEQHFKLLVEQVKNYMLNIESKGDN >NZ_CP047428|1113715:1126435|1118978_1119989_-|WP_147077519.1|DBSCAN-SWA MFKNYFNLFRKQKNIKVSYWYVNWFMANILFYFFIVCFNLQFIYFSSTSVIDIILFIFLVIFDIIFFWSFFSNLFQTRKLIKIVKSSPISIINGALGTGKTLLMTYLSQIAKFDNVYSNYFINDEKIGVLGLNHLDFKNKNYKIPSNDSLILFDEIFLYMNGAKPEENNKKFSGLIPYFLLCRQFDNNIVFAGQRINQNWVEYREITNMIIVPMQCIKPSIFFPYFKMKIGFFDDLDDYLVWKTETVKRTANGKRVRKKSNKDIGINFVKITIPLSIAMQYDSKYLKFVRDLKNDKVPSYIKQNWPSIVKKDITLNELREMGMEHLLKNLGELEND >NZ_CP047428|1113715:1126435|1118387_1118624_-|WP_105298387.1|DBSCAN-SWA MLKLIFFFVIGLTVGFGFIANIVVATDLGFSTVKHYLESANDFYKLVAQLFIIATHPIFQLYMAFGIIIMGIRIIFIV >NZ_CP047428|1113715:1126435|1121508_1121823_-|WP_147077525.1|DBSCAN-SWA MFKVYLSDIKYNQVIKDKSNKENYYDVYTFLRVEGKKIIGKEYQDKWVRKDSEFQNSLPEMIEGSFYNVEIGFNGKISKILPYETEQDFINKYSNNSAISESNS >NZ_CP047428|1113715:1126435|1116590_1116767_+|WP_157092876.1|DBSCAN-SWA MQLVHRPSGIKSIKNLGKIEEEKYGKIVSITTTNENIGNLQKTVVFVATDKGYILKIS >NZ_CP047428|1113715:1126435|1120962_1121178_-|WP_147077523.1|DBSCAN-SWA MKKQNKLYKQRLEYLVNVIHQCLPTKIPLFMLRKAIKLYLNHNFIDIGVMEEQHFKLLVEQVKKIYVKYRK >NZ_CP047428|1113715:1126435|1118728_1118986_-|WP_147077518.1|DBSCAN-SWA MINLLANDVWNDAINVVVDIFMKIMDWMWALKLPGTNIPLFVIWVIGGVINVIFLLVNSSRGLSSVSRASLEASSNIAKGVKGTV >NZ_CP047428|1113715:1126435|1116970_1118374_-|WP_164028349.1|DBSCAN-SWA MRKRLLDIFIIFYLIFGWIFLFCGVTAVNYISNVCKLETRNNDSFSDLTYAKANEYDFQSTLMLRQDYFMQGLDPSNYAFSFGVETPFIPNLSADKNDSNYWFNKIKNTVWNYLLSWNLADISKGFLGRLIIDYKTPNKLLDIFIYKNNIKYEFTFNWEIIQYLFMPIIANQSYKYFDMNYLVLNFNYKELINMDILKKSNSNYFVDDVKQNFYSLDNLFLILDYFYSNVLRVIFDISNFREFIYFTSNNGNLGFVFFVKNGFLLYPKSMVFNILRFPDTDIYYLKPQVQLYNAYTINSTNDYFSYYSNWDYKTDILPSNNDKYTQSIKLLDMTDRSKYQGFNLIRFNTTRLTEDRSISINGFNFSLYNATDWSGEFNDGKIWQLPYKKGAWYRLDIHIENAAIWIVNNLPGMKEIYKFVNGIVHVFSNVSELFNNIGNLFAFDITFKIMLSSILVLAMVNGLLRYF >NZ_CP047428|1113715:1126435|1125031_1126435_-|WP_157092892.1|DBSCAN-SWA MRKRLLDIFIIFYLIFGWIFLFCGVTAVNYISNVCKLETRNNDSFSDLTYAKANEYDFQSTLILRQDYFMQGLDPSNYAFSFGVETPFIPNLSADKNDSNYWFNKIKNTVWNYLLSWNLADISKGSLGRLIIDYKTPNKLLDIFIYKNNIKYEFTFNWEIIQYLFMPIIANQSYKYFDMNYLVLNFNYKELINMDILKKSNSNYFVDDVKQNFYSLDNLFLILDYFYSNVLRVIFDISNFREFIYFTSNNGNLGFVFFVKNGFLLYPKSMVFNILRFPDVDIYYLKPQVQLYNAYTINSTNDYFSYYSNWDYKTDILPSNNDKWTQSIKLLDMTDRTKYQGFNVIRFNTTRLTEDRSISINGFNFSLYNATDWNNEINSGDIWKIPYKSCSWYNIACHIQNAAIWIVNNLPGMKEIYKFVNGIVHVFSNVSELFNNIGNLFAFDITFKIMLSSILVLAMVNGLLRYF >NZ_CP047428|1113715:1126435|1120758_1120950_-|WP_071937701.1|DBSCAN-SWA MTVTTVFATIILVIAMLMLLVFLTVNTIFKFKNKYLICPHCSKKVEFKEWGKRKIKKADKSVE |
17 | Spiroplasma_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1135227 : 1141242
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP047428|1135227:1141242|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP047428|1135227:1141242|1137931_1138168_-|WP_071937697.1|DBSCAN-SWA MLKLIFFFVIGLTVGFGFVANIVVATDLGFSTVKHYLESANDFYKLVAQLFIIATHPIFQLYMAFGIIIMGIRIIFIV >NZ_CP047428|1135227:1141242|1140319_1140502_-|WP_071937717.1|DBSCAN-SWA MTVFATIILVIAMLMLLVFLTVNTIFKFKNKYLICPHCSKKVEFKEWGKRKIKKADKSVE >NZ_CP047428|1135227:1141242|1136514_1137918_-|WP_157092874.1|DBSCAN-SWA MRKRLLDIFIIFYLIFGWIFLFCSVTTINYISNVCKVETRNNDSFSDLTYAKANEYDFQSTLMLRQDYFMQGLDPSNYAFSFGVETPFIPNLSADKNDSNYWFNKIKNTVWNYLLSWNLADISKGSLGRLIIDYKTPNKLLDIFIYKNNIKYEFTFNWEIIQYLFMPIIANQSYKYFDMNYLVLNFNYKELINMDILKKSNSNYFVDDVKQNFYSLDNLFIILDYFYSNVLRVIFDISNFREFIYFTSNNGNLGFVFFVKNGFLLYPKSMVFNILRFPDTDIYYLKPQVQLYNAYTINSTNDYFSYYSNWDYKTDILPSNNDKYTQSIKLLDMTDRSKYQGFNLIRFNTTRLTEDRSISINGFNFSLYNATDWSGELNDGKIWQLPYKKGAWYRLDIHIENAAIWIVNNLPGMKEIYKFVNGIVHVFSNVSELFNNIGNLFAFDITFKIMLSSILVLAMVNGLLRYF >NZ_CP047428|1135227:1141242|1140501_1140729_-|WP_071937718.1|DBSCAN-SWA MKKQTKLYKQRLDYLVNVIHQCLPTKIPLFMLRKVIKLYLNHNVIDIGVMEEQHFKLLVEQVKNYMLNIESKGDN >NZ_CP047428|1135227:1141242|1140927_1141242_-|WP_071937719.1|DBSCAN-SWA MFKVYLSEIKYNQVIKDKSNKDNYYDVYTFLRVEGKKIVGKEYQDKWVRKDSDFQNSLPEMIEGSFYNVEIGFNGKISKILPYETEQDFINKYSNNSTITESNS >NZ_CP047428|1135227:1141242|1139537_1139747_-|WP_071937716.1|DBSCAN-SWA MDWNTFFQRVYQGLLQIFYFIPKTEIDNFVGSSIDNITYSVIMIGIWLVVFFLIWLSIFILYKTIRLVV >NZ_CP047428|1135227:1141242|1138522_1139533_-|WP_071937715.1|DBSCAN-SWA MFKNYFNLFRRQKNIKVSYWYVNWFMANILFYFFIVCFNLQFIYFSSTSVIDIILFIFLVIFDIIFFWSFFSNLFQTRKLIKIVKSSPISIINGALGTGKTLLMTYLSQIAKFDNVYSNYFINDEKIGVLGLNHLDFKNKNYKIPSNDSLILFDEIFLYMNGAKPEENNKKFSGLIPYFLLCRQFDNNIVFAGQRINQNWVEYREIANMIIVPMQCIKPSIFFPYFKMKIGFFDDLDDYLVWKTETVKRTANGKRVRKKSNKDIGINFVKIKIPLSIAMQYDSKYLKFVRDLKNDKVPSYTKQNWPSIVKKDITLNELREMGMEHLLKNLGELEND >NZ_CP047428|1135227:1141242|1135227_1136280_-|WP_071937713.1|DBSCAN-SWA MENNININAYNRLTKENLYRPYIDNSNFINKKYYVKKVYYGNYVKNIVLPLECVDSFGNGNPTGIKNNGKNETKLLNSRVRSQGNCIRKAIHNFSDCKELGFLTLTYAEKMQDLDKANYHFNLFIKKLKYHFSKYKKNTFINLKYLVVYEYQDRKGIPIIHFHIIFNRFISSNLIREYWPYGINKNLKVKKNTNVFVIKYLTKYFVKSLSNTERQKKELCKEFDIPYKKPKKVSEVKLRNIYNLNKKSYRFSANCTDPLVKVGIIEMCEMELIASLKGIKNKFMFVDKQGYIMGVSIDSYLENDYFWQIEEYVPFYRKQYQHWKEQKLFFENYKKRHKKSISLHNNLLIQ |
8 | Spiroplasma_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1144493 : 1151854
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP047428|1144493:1151854|DBSCAN-SWA AATGGACTGAAATATTTTTTTGCAACGAGTATATCAAGGTCTTTTACAAATTTTTTATTTTATTCCGAAAACTGAAATTGATAACTTTGTCGGTAGTTCTATTGATAATATTACTTATTCAGTAATTATGATAGGTGTTTGATTAGTTGTTTTTTTTCTAATTTGGTTATCAATATTTATTTTATATAAAACAATTAGATTGGTGGTGTAGATATATGTTTAAAAATTATTTTAAATTATTTAAAAGACAAAAAAATATTAAGTTTTCTTATTGATATGTAAATTGATTTATGGCAAATATTTTGTTTTATTTTTTTATTGTTTGTTTTAATTTACAGTTTATATATTTTAGTTCTACATCAGTTATAGATATTATCTTTTTTATTTTTTTAGTAATTTTTGATATTATTTTCTTTTGGTCTTTTTTTAGTGATCTTTTTCAAACACGGAAACTTGTTAAAATTGTTAAAAGTAGTCCAATATCAATTATTAACGGTGCTTTGGGTACTGGTAAAACTTTATTGATGACTTATTTATCGCAAATTGCTAAATTTGATAATGTTTATTCTAATTATTTTATTAATGATGAAAAAATTGGAGTTTTAGGTTTAAACCATTTAGATTTTAAAAATAAAAAATATAAAATACCGCCAGATGATAGTTTAATTTTATTTGATGAAATATTTTTATATATAAATGGTACAAACCCTAAGGAAAATGATAAAAAATTTAGTGGTTTAAAAGCATATTTTTTATTATGTCGTCAGTTTAATAATAATATTATTTTTGCCGGACAACGAATTAATCAAAATTGAGTCGAATATAGAGAAATTGCTAATATGATTATTGTTCCTATGCAATGTATTCCACCTAGTATATTTTTTCCTTATTTTAAAATGAAAATAGGTTTTTTTTGATGATTTAGATGATTATTTAATATGAAAAACGGAAACGGTTAAACGAACAGCAAACGGTAAAAGAGTTCGTAAAAAATCTAATAAAAATATTGGTATTAATTTTGTTAAGATAAAAATTCCTTTATCTATTGCAATGCAATATGATAGTAAATATTTAAAGTTTGTACGTGATTTAAAAAATGATAAAGTACCAAGTTATACTAAGCAAAATTGACCTAGTATTGTTAAAAAAGATATTACGCTTAATGAATTACGAGAGATGGGAATGGAACATTTATTAAAGAATTTAGGAGAGTTAGAAAATGATTAATTTACTTGCTAATGATGTATGAAATGATGCCATTAATGTTGTAGTTGATATTTTTATGAAAATAATGGATTGAATGTGAGCATTAAAATTACCAGGTACAAATATTCCTTTATTTGTAATTTGAGTAATTGGTGGTGTTATAAATGTTATCTTTTTGTTAGTTAATAGTTCTCGTGGTTTAAGTTCAGTTTCTCGTGCAAGTTTAGAAGCAAGTTCTAATATTGCCAAAGGTGTTAAGGGTACTGTTTCATTTTCATATAAATCTGGTAAAAAAGTTGGTAATTATGTTGGTACTCGTTCAGCAAATAAAAAGGCAAGAATGTCAGCAAAAATAAATAAGGAGAATGATAAATAATGTTAAAGTTAATATTTTTCTTTGTTATTGGTTTAACCGTTGGGTTTGGCTTTATTGCTAATATTGTTGTGGCAACAGATTTAGGTTTTTCTACTGTTAAAAATTATTTGGAGTCTGCTAATGATTTTTATAAATTAGTAGCACAGTTATTTATTATTGCGACACATCCTATTTTCCAGTTATATATGGCGTTTGGAATTATTATTATGGGTATTAGAATTATTTTTATTGTTTAGGGGGTCAAAACAATGCGAAAACGATTATTAGATATATTTATTATTTTTTATTTAATATTTGGTTGAATATTTCTTTTTTGTAGTGTTACAGCTGTAAATTTTATTAGTAATGTTTGTAAAATAGAAACAAGAAATAATGATAATTTTAGTGATTTAACTTATGCAAAAGCAAATGAGTATGATTTTCAGTCTACTTTAATGTTGCGACAAGATTATTTTATGCAAGGTTTAGACCCTAGTAATTATGCATTTAGTTTTGGTGTTGAAATTCCTTTTATTCCAAAAGTGAGTGTTGATAAAAATGATAGTAATTATTGATTTAATAAAATTAAAAATGCTGCTTGAAATTATTTATTAAGTTGAAACCCGAAAGATATTTCTAAGGGTTTTTGGGGTAAATTAATTATTAATTATGAAACCCCAAATAAATTGTTAGATATTTTTATTTATAAAAACAATATAAAATATGAATTTACTTTTAATTGAGAAATTATACAATATTTATTTATGCCAATTATTGCCAATCAGAGTTATAAACATTTTGATATGAATTATTTAGTTTTAAATTTTAATTATAAAGAATTGATTAATATGGATATTCTTAAAAAATCTAATAGTAATTATTTTGTTGATGATGTTAAACAAAATTTTTATTCGTTGGATAATTTATTTCTAATTTTAGATTATTTTTATTCTAATGTTTTAAGAGTTATATTTGATATTTCTAATTTTAGAGAATTTATTTATTTTACATCTAATAATGGTAATTTAGGTTTTGTGTTTTTTGTAAAAAATGGTTTTTTATTATATCCAAAATCAATGGTTTTTAATATTTTAAGATTTCCTGATACAGATATTTATTATTTAAAACCACAAGTGCAATTGTATAATGCTTATACGATAAATAGTACTAATGATTATTTTTCTTATTATTCAAATTGAGATTATAAGACTGATATTTTACCTTCTAATAATGATAAATATACTCAATCAATAAAATTATTAGATATGACAGATAGGTCAAAATATCAAGGTTTTAATTTAATTAGATTTAATACAACCAGATTAACAGAAGATAGGTCTATTTCAATTAATGGTTTTAATTTTAGTCTTTATAATGCTACTGATTGAAGTGGTGAACTTAATGATGGAAAAATTTGACAATTACCTTATAAAAAAGGTGCTTGATACCGTTTAGATATTCATATTGAAAATGCGGCAATTTGGATTGTAAATAATTTGCCTGGTATGAAAGAAATTTATAAATTTGTTAATGGAATAGTACATGTGTTTAGTAATGTTTCTGAATTGTTTAATAATATTGGTAATTTGTTTGCTTTTGATATTACATTTAAGATTATGTTAAGTTCTATTTTAGTTTTAGCAATGGTTAATGGACTTTTACGCTATTTTTAGTAGTAGTAAAATAATGTTGTTGGTAAAAAAGTAAGGTGGTGTGGTGGTTTATCCACGCACCACCTTACTTAAAGGGGTAAAAGTCGCGAAGCGATTTAGGGGCGGAGCCCCTTTACTTGATTAAGTAACACAACGGAAGAAACGAAAATTGACAATATAAAAATGATAAATATAATTAAATTATTGTATTTATTAAATACATATAAATAAAATGAAAGGAATATTATATATGAAAAAAATACTAAGTTTAATCGGAGCAACTACTATAACAACGAGTGGAGGAGCACCTTTAATGGCAATGATGCCAAATAATTCTTCTAATTCTACAATTTCTTTTGAAAGCATAAATACAAGTGGAGTAAATAAAATTTTAAAAGATGAATTAATGACTACTATTATTACTGAATTCCCTACACAAAATACTAGAAGAACTATAACTAGTTACAATTTTGAACCGTGAGTTCTTTATTTATCAGATAATTCTATGCAACAAATAAATCAAATTTATTTACATGAAGAAAATTTAAATAACAATATTATATATATAATTAATTTTATAATTTCTAAATTAGTAGAAAATAATGAAGAAACTAATGAGTTTATTTCTTTATTAAGAAGAAATAACGAACAATTTTATATATTATTTTTTCAATCACTTAACAGTTTACTTTTAAATGAATATGAATCTTTATTTATAAATAATAGAAGTGGTTTATTTTTTTTAATAGAAAATAATGGTAATATAAAGAGCGTTCATTCTCAAACATAATAAAATTTTTTTAGTTAAAGCAATAAAATTTTTTTGTTTTTTATTTTATAAATATTTTTAATATATAAAGTAAATTGACAATATTAAAATTAAAAATATAATAAAAATTAGAATAAAAAAAACATTTATTAAAATGTTTAATGTATTCAAACCAAAATAAATGGTTTCACTTCACGAAACTTTAAATATAAGTAAATGTTTTTTTATTTTTGTTTTAGAAAGGAAAACAAAAAATGAATGTAAATATAAATGCATATAATCGTTTAACAGGGGAAAATTTATATAAGCCCTATATAAACCCAGAATGTTATATTAATGAAAAATATTATGTTAAAAAAGTATATTATGGTCCTTATATTAAAACAGTTGTTTTACCGTTAAAGTGTATTAATAGTTTTGGCAAAGGTAATTCAACAGGAGTTAAAAATACGGGTGAAAATGAAACTAAATTATTAAATAGTCGTATTCGTTCTCAAAGAAATTGTATTCAAAAAGCAATTCATAACTTTAATGGTTGTCAAAATTTAGGTTTTACAACTTTAACTTATGCAGAAAATATGCAAGATATTAAAAAAGCAAATTATTAATTTAAATTGTTTATTCAAAAAATAAAGTATCATTTTTCTAAATATAAAAAGAATAAATATGAAAATTTAAAATATTTAGTTGCTTATGAGTATCAAAAACTGGGAGCAGTCCATTTTCACATTATATTTAGTGAATATATCCCTAATAAAATAATAAGAAAGTATTGACTTTATGGGTTAAATAAAAATTTACCGGTTAAAAGTGGTACAAATGAATTTGTTAGTAAATATGTTGCAAAATACATTGTAAAAGCATACAGTCAACAAAAATCAAAAAATATTTATGACTTAAATATCAAAGCATATCGTTTTAGTGCAAATTGTACCGACCCAATTGTTAAGGTTGGAGTTATTGAAATGACAAAAGAAGAGTTAAAAATGGCATTATGTGGTGTAAAACATTTTTATATGTTTGCTGATAAACAAAAAAAGCATATGTTAGGTATTAGTATTGATAGTGATTGACATAGTGATTATTTTTGACAAATGGAAGAATATGTTCCATATGATAAAAAAATATTCCGATTTTTTAATAAAATAACCGATATTGGCATATATAAAGCCCGAAAAAAAATAGATAAATACCTTAATTTAGGTAAACAAAGGTACATTAAAAAAAGTACCTTCTAAATGGAAAGTACTAGTGTGTAATATAAGCACTTCACAACTTATATCACATAATTAATTAAAACAAAAAAACAAAAAAAAGCAAGTTGAGGATATAAATTTATTTTTTGCGTTTAAATATGTAATAGTTGACATATTTATTTTGTTATGTAAAATTAAATTAGAATATTACATATAGCATTTAGTTATATTTAAGTATTCAAACCAAAATAAATGGTTTCACTTCACGAAACTTTAAATATAGGTAAATGTTTTTATTTTGCATTTATATTTATATTCATTTTTAATTATTATTTAAATTAGTTTTTATTTTTTAGCATTTATGATTATTTAAAGTTTTAAACTATATGAAACCTTTATTTACTTAATTAAGTGAAGAAAGGAGTGCTTTATATGTATAAAGTATTATTAGCTCAAATTGCTTTTAACCATCAAATGGATAGTAAAGAAAAAGATGGTGAAAAAAATGATAATAAAGGTTTATTTTTTGATATCTTTACCTTTATGCAACTTGATGAAGATGATATGCCAATTCCAGACGAATATATAATTTCGTGGGTTTGAAAAGAAAGTAAATTGGCTAATGAATTACCAGAAATGAAAAAAAGGTAATTATTATTTAATTGATATTAAATTTCCGGTTGTCACTGATAGAAAAACGGGAAGAAAATATAACAAAGTAAGTGTTGTTAAAGTTGTTCCTTATGATAGACAACAAGATTTTATTAACAAATATTCTAATAATTCAGCAATAACAGAAAGCAATAGTTAATATGCAACAACAGTTATGTATCGTTTGTATTAATGATACTGTTTGAGAAAATGGGTCTCGTTATTGTTGAAATTGTGTTAATAAAAATGTTGTTTTAATTAATCAATATTATTCTAGGTTAGATAATGACTAAGAAAAAATCAGATTGTTATTTATGTAATAGACAAGATATTATTTGTCCTAAACATAAAAAATAAAATGAAAAAGCAAACTAAGTTATATAAACAAAGATTACAATATTTGGTTAATGTTATTCATCAATGTTTACCTACTAAAATACCTTTATTTATGTTAAGAAAAGTAATTAAGTTATATCTTAATCATAATGTTATTGATATTGATGTTATGGAAGAACAACATTTTAAGTTATTAGTAGAACAAGTAAAAAATTATATGTTAAATATAGAAAGTAAAGGTGATAATTAATGACCGTTTTTGCAACAATTATTTTAGTAATTACAATGTTAATGTTATTAGTTTTTTTAACAATTAATACGATATTTAAATTTAAAAATAAGTATTTAATTTGTCCGCATTGTTCTAAAAAAGTAGAATTTAAAGAATGGGGAAAACGAAAAATTAAAAAAGCAGATAAGTCTGTTGAATAAGTTGATATCAATAAAATACCTTCGCAAGTATAAAAATTGATTTTAGTTTTTAGTGTTAATTATTAAAATCAAGGTTAGAGTATGCGAAGGTTTTATTATTAATAGAAAGTATTTTAAGTGAGGTGTTATTAATGAATTTAAATTTATTAACGGGCGACGCTGATGTTATTAAGCAAATAGCGGATTTTGCTGCTATTCTTGCTAATTGAGCGATTGCTTTTACTAACTGATTTATTGCTTTTTTAGGGTCACATATGTTATTAATTACTCCATTAGTTTTAATGTTTGTGGTTTTGGGAATTCAAACAATCAGAAAATTAATTCACGGATATTAATATTTAATAATAAACTCTAATCTTGATTTTAGTAATTAACATTTAGGAAAGGAATAAGAAAAATGCAAAGTGTATGAGATTTATATTATGAATTTATGACAATTATTTTTGGAGTTAATCATCCCGCTATTTTAGATATTGTTATATTTGTTGTATTTTTAATACTTGTTTTTGGGATGTTATTTTTAATTTTAAGTTGTATTTTTAGGTGGATAAAATAATGGACTCAAATATTTTTTTGCAACGAGTATATCAAGGTCTTTTACAAATTTTTTATTTTATTCCGAAAACTGAAATTGATAACTTTGTTGGTAGTTCTATTGATAATATTACTTATTCAGTAATTATGATAGGTGTTTGATTAGTTGTTTTTTTTCTAATTTGGTTATCAATATTTATTTTATATAAAACAATTAGATTGGTGGTGTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP047428|1144493:1151854|1146073_1146310_+|WP_071937724.1|DBSCAN-SWA MLKLIFFFVIGLTVGFGFIANIVVATDLGFSTVKNYLESANDFYKLVAQLFIIATHPIFQLYMAFGIIIMGIRIIFIV >NZ_CP047428|1144493:1151854|1150292_1150481_+|WP_071937756.1|DBSCAN-SWA MNYQKWKKGNYYLIDIKFPVVTDRKTGRKYNKVSVVKVVPYDRQQDFINKYSNNSAITESNS >NZ_CP047428|1144493:1151854|1150906_1151089_+|WP_071937758.1|DBSCAN-SWA MTVFATIILVITMLMLLVFLTINTIFKFKNKYLICPHCSKKVEFKEWGKRKIKKADKSVE >NZ_CP047428|1144493:1151854|1148728_1149082_+|WP_071937753.1|DBSCAN-SWA MNVNINAYNRLTGENLYKPYINPECYINEKYYVKKVYYGPYIKTVVLPLKCINSFGKGNSTGVKNTGENETKLLNSRIRSQRNCIQKAIHNFNGCQNLGFTTLTYAENMQDIKKANY >NZ_CP047428|1144493:1151854|1151220_1151424_+|WP_071937759.1|DBSCAN-SWA MNLNLLTGDADVIKQIADFAAILANWAIAFTNWFIAFLGSHMLLITPLVLMFVVLGIQTIRKLIHGY >NZ_CP047428|1144493:1151854|1150679_1150907_+|WP_071937757.1|DBSCAN-SWA MKKQTKLYKQRLQYLVNVIHQCLPTKIPLFMLRKVIKLYLNHNVIDIDVMEEQHFKLLVEQVKNYMLNIESKGDN >NZ_CP047428|1144493:1151854|1144493_1144703_+|WP_071937723.1|DBSCAN-SWA MDWNIFLQRVYQGLLQIFYFIPKTEIDNFVGSSIDNITYSVIMIGVWLVVFFLIWLSIFILYKTIRLVV >NZ_CP047428|1144493:1151854|1151644_1151854_+|WP_071937760.1|DBSCAN-SWA MDSNIFLQRVYQGLLQIFYFIPKTEIDNFVGSSIDNITYSVIMIGVWLVVFFLIWLSIFILYKTIRLVV >NZ_CP047428|1144493:1151854|1149088_1149712_+|WP_071937754.1|DBSCAN-SWA MFIQKIKYHFSKYKKNKYENLKYLVAYEYQKLGAVHFHIIFSEYIPNKIIRKYWLYGLNKNLPVKSGTNEFVSKYVAKYIVKAYSQQKSKNIYDLNIKAYRFSANCTDPIVKVGVIEMTKEELKMALCGVKHFYMFADKQKKHMLGISIDSDWHSDYFWQMEEYVPYDKKIFRFFNKITDIGIYKARKKIDKYLNLGKQRYIKKSTF >NZ_CP047428|1144493:1151854|1146322_1147726_+|WP_164028358.1|DBSCAN-SWA MRKRLLDIFIIFYLIFGWIFLFCSVTAVNFISNVCKIETRNNDNFSDLTYAKANEYDFQSTLMLRQDYFMQGLDPSNYAFSFGVEIPFIPKVSVDKNDSNYWFNKIKNAAWNYLLSWNPKDISKGFWGKLIINYETPNKLLDIFIYKNNIKYEFTFNWEIIQYLFMPIIANQSYKHFDMNYLVLNFNYKELINMDILKKSNSNYFVDDVKQNFYSLDNLFLILDYFYSNVLRVIFDISNFREFIYFTSNNGNLGFVFFVKNGFLLYPKSMVFNILRFPDTDIYYLKPQVQLYNAYTINSTNDYFSYYSNWDYKTDILPSNNDKYTQSIKLLDMTDRSKYQGFNLIRFNTTRLTEDRSISINGFNFSLYNATDWSGELNDGKIWQLPYKKGAWYRLDIHIENAAIWIVNNLPGMKEIYKFVNGIVHVFSNVSELFNNIGNLFAFDITFKIMLSSILVLAMVNGLLRYF >NZ_CP047428|1144493:1151854|1150102_1150321_+|WP_071937755.1|DBSCAN-SWA MYKVLLAQIAFNHQMDSKEKDGEKNDNKGLFFDIFTFMQLDEDDMPIPDEYIISWVWKESKLANELPEMKKR >NZ_CP047428|1144493:1151854|1147955_1148495_+|WP_071937752.1|DBSCAN-SWA MKKILSLIGATTITTSGGAPLMAMMPNNSSNSTISFESINTSGVNKILKDELMTTIITEFPTQNTRRTITSYNFEPWVLYLSDNSMQQINQIYLHEENLNNNIIYIINFIISKLVENNEETNEFISLLRRNNEQFYILFFQSLNSLLLNEYESLFINNRSGLFFLIENNGNIKSVHSQT |
12 | Spiroplasma_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1204330 : 1210829
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP047428|1204330:1210829|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP047428|1204330:1210829|1210188_1210593_+|WP_071937783.1|DBSCAN-SWA MINLLVENNNSNWDKIFSFVFDIFLFIFDVIWNTKLPMTNTSIAYFLIFFMVIKLSIYAIHGTSTQYNNLFSTVNNGVSQVYSSTVRGVSDTKQGMQKHIKERKQFKINRNKKQLSSLVKQAKTREQWYRRVHK >NZ_CP047428|1204330:1210829|1207825_1208188_+|WP_071937781.1|DBSCAN-SWA MDMKFKTTKEYKKIKRNFIFLNLCFGFCYFLIFICSGFCIDFIIFSLNVGDIIYILISFFCLIASVSFLSLLIIGHIIQVKEFRVTVLKKQLLPLEIINNGVLGKGTMLRPVRRGDDKIE >NZ_CP047428|1204330:1210829|1208783_1208987_+|WP_071937782.1|DBSCAN-SWA MQNDWIKLKEFFIHIFLFIDKTNVESITMWNLTQNEYLTLMVGVWVVILFLTWFFLWMVFKIVSYFK >NZ_CP047428|1204330:1210829|1204330_1204615_-|WP_004027657.1|DBSCAN-SWA MSKKELAAQIAEKFTDVLSKTHAEEITNFVFDHIKKALVAGKEVSIAGFGKFAVTERAARDGRNPSTGETIKIPASKSAKFKAGKQLKTDLNNN >NZ_CP047428|1204330:1210829|1210592_1210829_+|WP_071937784.1|DBSCAN-SWA MIKLVLLVAAIAIFGTGFITVIINQFTSAKNIIMDLYNSDTWLIWLFGSMAVLFSHPLMLTISSLYIVGFIVSKTLYS >NZ_CP047428|1204330:1210829|1207013_1207265_+|WP_071937632.1|DBSCAN-SWA MLGMYLTTAFNFLTAPTPKTMTEGMTGIWTGLTSALWKVKEGITNILPEIMVFLGEAWIILIPFAIFCIIKILNFFRVMVKGF >NZ_CP047428|1204330:1210829|1208631_1208781_+|WP_164024034.1|DBSCAN-SWA MSLYDYWVQFVSYIIGSNAPDFLYVISFVLFIVLFFGIFFKLIQKMWSF >NZ_CP047428|1204330:1210829|1206864_1207014_+|WP_071937780.1|DBSCAN-SWA MLTWLTTIFSVVIVLAIFLYFGLLIYQKIRQIRGKKKDKKEIERKESNK >NZ_CP047428|1204330:1210829|1206611_1206761_+|WP_155522142.1|DBSCAN-SWA MQQINFERSWFFIEKKHYFILRSLVVKYGKDIVINTVNKIVINNVKENE |
9 | Spiroplasma_virus(85.71%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
1282072 : 1285892
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_CP047428|1282072:1285892|DBSCAN-SWA CCTAACTATACAATGTTTTTGAAACAATAAACCCAACAATATATAAACTCGATATTGTTAACATTAACGGATGACTAAACAAAACTGCCATTCTACCAAATAATCAAATCAACCAAGTATCAGAATTATATAAATCCATAATAATATTTTTTGCTGATGTAAATTGATTAATAATAACAGTAATAAAACCAGTTCCAAATATCGCAATCGCCGCCACCAATAAAACTAATTTAATCATTACTTAACACCTCTTTTAAATTTTGCTTGTTGTCTAACATTTTGACGCTTAATTTCTCGTTTAACTTGCTGCTTATTACTATTTTGATAAACATTTTTACCAACATTAATACCTTTTCGTACAGTTGACGAATATACTTGCGAAACACCATTATTAACTGTCGAACCTAAATTATTATATTGTGTTGATGTCCCGTGAATTGCATAAATCGATAACTTAATAACCATAAAAAAGATTAAAAAATAAGCAATTGACGTATTTGTCATCGGTAATTTTGTATTTCAAATTACATCAAAAATAAACAAAAATATATCAAAAACAAAACTAAAAATCTTGTCTCAATTACTATTATTATTTTCAACTAATAAATTAATCATCTTTACTATTTCCTTTCTCTTTTTTAGGTTTTAAATTCTTTTTCAAAATATCAATATCAAATAACTCCAATCGTTCTTTAACGCTTAATTTTGTGATTTCCGATCAATAATAAAATTTTTCATTAACAATTTCATCATTCTTTAAATCACGTACAAACTTTAACCATTCACTATCATACTTATTAGCAAATTCAAGGGGAATTATTATTTTAAAAAACCGAATTCCTAACCCAACATCCGACTTATGTTTTGCTCTTTTACCTTCTGCTGTTCGTTCTACTGATTTTGTTTTTCAAATTTCATAATCCGTTATATCTTGGAAAATCCCAATTCGCATAATAAAGAAACGATTAAAAAAATTAAATCCTTTTTTAGCAACGGGTTTTTTCAATGAAATTGGAATAATAATTCCACTTGCTAACTGGCGAATATTATTTCAAATCATACCCTCACGCTGAGCAGTAAACAACGCACGATGTCCAAAATGTCTCGCTAAAACAATTCACGGTATTTTACCACTATGAACTTTTTTCTCATCGTGAGGACTAGTTCCGTCAATATATAAATAACTTTCATCAAATAAAATAACACTATCATCTAGGGGAACGGGTTTTGTTCTATCAGTAAAATCTAAATTTTTAAATGTTAAAACTTTAACTTTATCATCTTCTAAGGGATAATTACTATAAATTTCATCTGTCAATAATTTCATAGTTTGCGACAAATAAGTTAAAAGTAATGTTTTACCAGTTCCTAACTTACCAATAATTACCGATAACGGATTATCTCAAACAAAATTTACTAACCCAAAAGAATTTAACTGATAAAAAATATTTTTTCACAATCATCACACAAAATATACACATTGCAAAGCAAATAATATTCAAAATACTAAACCAACACAATACAAAGAAATTAACCAAAGTAATAAATCAATTAAACTAAACAAAAGCATTGAACCACTAATATAACAATAGTTTTTAAAGAAAAATATAAATTTTTTCATTATTTAAAATACCCAACTATCTTAAAAACCATTCACAAGAAAAACCAAGTTAAAAACAAAATCACAACTCAAACACCAACCATCAAGGTTAAATATTCATTTTGCGTTAAATTCCACATTGTAATACTTTCAACATTCGTTTTATCGATAAACAAAAATATATGAATAAAAAACTCTTTTAATTTAATTCAATCATTTTGCATTTTTAAAAACTCCATATTTTTTGAATAAGTTTAAAAAACATTCCAAAAAATAAAACAACAAATAACACAAAAGATATAACATATAAAAACTCAGGGGCATTTGCACCAATAATATAACTAACAAATTGAACTCAATAATCATATAAACTCATTTAATTTAAGTCTTTCAAATCATTAATTAATTCTTGTTCTTTTTCAACACTTAAATTTGTTAAATTATTTTTATTTGTTTTTACTTTTTTAGGTTCACTTGAAAATAACGCTTTTTTCATTTTAGTAGAGTAATTTTGTTTATATTGATTATATAAATTAATTAATTCCGTTCCAGTTAAACTCTTTCAAATATTACGCTTTAAATTTTCATCATATTTTACAATAGGATAATAATTATCATAAATCAAACAGATTGCTACTTGTTCCAAATGTTTTTCACTCGGATAAATAAACTTATTACTCAATCAAAAACCAATATGACGATTATGATTAGGTAAATTAATAAAACTTGCTTTTTCTGTTGTAAAAGGGATAAATTCCTTACTAATAAAATAATTTTCTACATTATGATTTTTCTTAACAAAATTACTCAATTTTATCATCTCCTCGTCTTACTGGTCTTAACATTGTGCCTTTTCCTAATCCTCCAATTATATTTTCTAACGGTAACATTCTTTTCTTTAACAACATAACTTTATATTCTTTAATTTCGCATATATGACATTGAATTATAAAAAATAAAAGAATAAATATTAAAAATAAAAATAAAGAAAAAAGTAAAATACCAACAATTATTTCTCTATTTGAAAACAAAACAAGACCTACAATAATTTCAATAAGAACAATGAAAAATGGAAAATAAACAAAACCAAAAACAAAATTCCTAATAATAAAATCTCTCTTTAATTTTTTACATTCCTTAGTTGTTTTAAATTTTATATCCATAAGATAATCTCCTAACTAAATATTTGTTTAATAAACAATGTTATAAATAATGTTTATATAATGTTTTTTAATTGTAATAAACACTGATTATTAACAATGTTATACATAATGCTAATATATTGTTTATTTAATGTTTAATAAACACTGTTAATAAACATTGTTAAATATAAAAATAATAAAAATTGGCACACTGAAAAATACTATTTAATTTTTAACAATAGTTATTAAAATATAAAATCATAAGTTTATAATTAAGTTGATATTTTTACACTATATACTGTTTACAAGTTTTTTAAAAAAAAGTAGGTGTATTTATAAAAAATATTATAAAAATTTATTTCCCAAATCTATTACTAGTATGACCCTTAATAGAAATATTCTTATTTTTATTAAATCCTACTAAAAAAATATTTTTCATAACAGACTCAATATTATGAATAATAAACAATATAGAGTTATCAACTATAGAAAATATAGTTAAATTTATATGTATAATAGGGATATTTATTATCCCAATATTAACGATAGTAATAAAGTTTATTAAAAAATAAATTTGTAAACAGTGTATAGTGCAAAAATAAACAACAAAATTATTTATTTAATTCACATAAAAGCTAGTGTGCCTTAACTAAGATATATAATCGATTATAATAAATATTAAAATCCTTTAACCATAACACGAAAAAAGTTTAAAATTTTAATAATACAAAATATAGCAAATGGAATTAATATAATTCACGCTTCACCTAAGAAAACCATTATCTCAGGTAAAATATTTGTTATACCTTCTTTAACTTTTCATAATGCACTAGTCAAACCCGTTCAAATACCAGTCATACCCTCAGACATAGTTTTAGGTGTAGGTGCTGTTAAAAAATTAAACGCTGTTGTTAAATACATACCTAACATTATTTATTACTCTCCTTTCTTTCAATTTCTTTTTTATATTTTTTCTTTCCTCGAATTTGTTTAATTTTTTGGTAAATTGATAAACCAATATAAGTAAAAATACTTAATATAATAACAACACTAAATATTGTCGTTAATCAAGTTGGCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_CP047428|1282072:1285892|1285491_1285743_-|WP_071937855.1|DBSCAN-SWA MLGMYLTTAFNFLTAPTPKTMSEGMTGIWTGLTSALWKVKEGITNILPEIMVFLGEAWIILIPFAIFCIIKILNFFRVMVKGF >NZ_CP047428|1282072:1285892|1282072_1282309_-|WP_015967964.1|DBSCAN-SWA MIKLVLLVAAIAIFGTGFITVIINQFTSAKNIIMDLYNSDTWLIWLFGRMAVLFSHPLMLTISSLYIVGFIVSKTLYS >NZ_CP047428|1282072:1285892|1283691_1283895_-|WP_071890543.1|DBSCAN-SWA MQNDWIKLKEFFIHIFLFIDKTNVESITMWNLTQNEYLTLMVGVWVVILFLTWFFLWMVFKIVGYFK >NZ_CP047428|1282072:1285892|1282678_1283692_-|WP_071937852.1|DBSCAN-SWA MKKFIFFFKNYCYISGSMLLFSLIDLLLWLISLYCVGLVFWILFALQCVYFVWWLWKNIFYQLNSFGLVNFVWDNPLSVIIGKLGTGKTLLLTYLSQTMKLLTDEIYSNYPLEDDKVKVLTFKNLDFTDRTKPVPLDDSVILFDESYLYIDGTSPHDEKKVHSGKIPWIVLARHFGHRALFTAQREGMIWNNIRQLASGIIIPISLKKPVAKKGFNFFNRFFIMRIGIFQDITDYEIWKTKSVERTAEGKRAKHKSDVGLGIRFFKIIIPLEFANKYDSEWLKFVRDLKNDEIVNEKFYYWSEITKLSVKERLELFDIDILKKNLKPKKEKGNSKDD >NZ_CP047428|1282072:1285892|1284474_1284834_-|WP_071937854.1|DBSCAN-SWA MDIKFKTTKECKKLKRDFIIRNFVFGFVYFPFFIVLIEIIVGLVLFSNREIIVGILLFSLFLFLIFILLFFIIQCHICEIKEYKVMLLKKRMLPLENIIGGLGKGTMLRPVRRGDDKIE >NZ_CP047428|1282072:1285892|1282308_1282686_-|WP_071937327.1|DBSCAN-SWA MINLLVENNNSNWDKIFSFVFDIFLFIFDVIWNTKLPMTNTSIAYFLIFFMVIKLSIYAIHGTSTQYNNLGSTVNNGVSQVYSSTVRKGINVGKNVYQNSNKQQVKREIKRQNVRQQAKFKRGVK >NZ_CP047428|1282072:1285892|1283897_1284047_-|WP_164028235.1|DBSCAN-SWA MSLYDYWVQFVSYIIGANAPEFLYVISFVLFVVLFFGMFFKLIQKIWSF >NZ_CP047428|1282072:1285892|1285742_1285892_-|WP_071937856.1|DBSCAN-SWA MPTWLTTIFSVVIILSIFTYIGLSIYQKIKQIRGKKKYKKEIERKESNK >NZ_CP047428|1282072:1285892|1284047_1284491_-|WP_071937853.1|DBSCAN-SWA MIKLSNFVKKNHNVENYFISKEFIPFTTEKASFINLPNHNRHIGFWLSNKFIYPSEKHLEQVAICLIYDNYYPIVKYDENLKRNIWKSLTGTELINLYNQYKQNYSTKMKKALFSSEPKKVKTNKNNLTNLSVEKEQELINDLKDLN |
9 | Spiroplasma_virus(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
1306297 : 1359614
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_CP047428|1306297:1359614|DBSCAN-SWA 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50 | Spiroplasma_virus(47.06%) | capsid,transposase,terminase,tail,portal,tRNA,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_18 |
1424852 : 1431099
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NZ_CP047428|1424852:1431099|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_18 >NZ_CP047428|1424852:1431099|1427471_1427708_-|WP_071937946.1|DBSCAN-SWA MIKLVLLVAAIAIFGTGFITVIINQFTSAKNIIMDLYNSDTWLIWLFGRMAVLFSHPLMLTISSLYIAGFIVSKTLYS >NZ_CP047428|1424852:1431099|1429444_1429885_-|WP_084566901.1|DBSCAN-SWA MSNFVKKNQNVENYFISKEFISFTTEKASFINLPNHNRHIGFWLSNKFIYPSEKHSEQVAICLIYDNSYPIIKYDENLKRNIWKYLTGTELINLYNQYKQNYFTKMKKALFLSEPKKVKANNNNNNLTNWSVEKEQELINDLESLN >NZ_CP047428|1424852:1431099|1427707_1428085_-|WP_071937947.1|DBSCAN-SWA MINLLVENNNSNWDKIFSFVFDIFLFIFDVIWNTKLPMTNTSIAYFLIFFMVIKLSIYAIHGTSTQYNNLFSTVNNGVSQVYSSTVRKGINVGKNVYQNSNKQQVKREIKRQNVRQQAKVKRGVK >NZ_CP047428|1424852:1431099|1430949_1431099_-|WP_015967969.1|DBSCAN-SWA MPTWLTTIFSVVIILGIFAWIGLSIYQKIKQIRGKKKDKKEIERKESNK >NZ_CP047428|1424852:1431099|1429088_1429292_-|WP_071937948.1|DBSCAN-SWA MQNDWIKLKEFFIHIFLFIDKTNVESITMWNLTQNEYLTLMVGVWIVILFLTWFLLWMVFKIVGYFK >NZ_CP047428|1424852:1431099|1430231_1430471_-|WP_071937951.1|DBSCAN-SWA MVFSLYKNIYKFVNLLKIQIINLKVIIKIIISEIIVLIGDTIHDNQKIDRITFVKNEFIISSIFYFSFLFKITYTERKP >NZ_CP047428|1424852:1431099|1424852_1425305_+|WP_071937945.1|DBSCAN-SWA MKKWLNIIGTIGLTATSTTTLMSCKKENNKDTKPIAPTTKAQQPPEGSNWKLIDKNNINNQFSIYDEKWYIIIAKNTTNQSIEIIKFKNNQNEKSISPIINNTFYIFPIYNNWYSIINLYCWDGDGEPQTPTIDKNTGEITNWKEQKGTE |
7 | Spiroplasma_virus(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_19 |
1462266 : 1470123
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_CP047428|1462266:1470123|DBSCAN-SWA CTTATCTAAAATTATCTATAAATACATCTTTTGCTGTTCTTCAATTCAGAACAGGCCTTAATTTTTCATTTATTACATCATTAACTACTCAATCTAATCGTTTCTGACTAACCTTATTAAAATCAGTTCCAGGAGGAAATCAATGTCTTAATTCACCATTTATTTTTTCAATTAAAGGTTTTTGACGAGGTTTACCAGCATCACAAAAATAAACTTGTGTTTCAGCAAATATTTCCATTTCTCGTCATTTACTAAATTCTTTACCTCTATCTGTTATTATTCCTTTCATTTTACCCATTAAATTATTATTTATAACCATCTCTTTAAATTTTACTAGAACTTCCATAGCAGTATGATTTTCAAATTTTATTGCAAAATATTTTCTACTTGATTGTTCTACTAAAACTAAACAACTAGATAAATGTTCTTTTCCAACAACAGTATCCATTTCAAATCACCCAACATTAGAAACTTTATTTTCAATATCTCAAATTGACTTAAAATCAGTTAATTTACCACGATTATCAGATTTTCCTTTTGTTTTATATTTTTTTCCACGATGTCGCAAATTCTGTTTTAAAAAACCATAAAAACCTAAACGAATTCATTTATACAATGTTTTAACACAAACCGGAAATTTAACACCAAATTTTAAAAAATAACGATAAATAAGTTCTGACGGTGAATCGTGATATTTATTAAATCTAATTTGAATAAAATTAATCTGTTCTTCCGTAAATTTACATCTTTTATTATTCTTTTTTCTTTTCTTATAATACATTTTATCTGACTTATAAGCACTATATTCATCAGTAGTTTTAAAACGCTTAATTTCTCGTAAAATAGTACTACGATGTCTATTCAAACATTTAGCGATTGCAGAAATATTCTGTTCACCATTATTTTTTAAAAACATTTTTGATAATAATAATTGTTCTAATTTAACTTTATCCATAAAACTTAAATGACTATACATAACATTTATATACCTTTCATTAACTTATAAAATTAATATTTAATACGAATAATTGATATATAATTGATATGTGATAAAATCAATTATATATAAAAAACAAAAAGGAGCAATATATATGAAAAAATGACTTAGTATCATAGGAGCAATAGGATTAACCATAACAAGCACAACAACACTAATCAGTTGTGAAAAATCTGAAAAACCAAATAATAATAATAATAATAATAATAATGAAGAAAATAAACCAACAATACCAGCATCACAACCACAACAACCACCAAAAAATAGTAATTGGAAAACTATAAATGGGACATTTAATAATGAATTTAAAACACGTAATAATAAATTTTATATAATATCAGCAAAAGAACAAAGAGAAGATAAGACTTGAAAAATTATTAAATTTAAAAACGATGATATTAATAATCTATTTGGTAATGTATGAAATAATGGAGTTAAAATTAAAGACATTTGATATATAGTAAATAGTTTATATCGTTGAGATGGTGATGGTGAACCTGAAACACCAACCATTGACAAAAATACTGGTGAAATTACTGACTGAAAAGAACAAAAAGGAACTAAATAACAGTTCCTTTTTATATTAATCGAACAAATTTCATAAAGATAATTAATAAAAAGATATTTGTTATTGTACTATACAATGCGGGATTAAATTTTCATACTTCGAATATTTGACTAAAAAAACTATATACTGTCTCAAAAACCTTACCAACACCACTCGCTAACTCGTTAACTTGTTTAACACCAGGAATAGTGTTGACAATTCAAATCACCGCATTTTTAATATGTGCACCAAAATCTCATCAACCTTCGGGCGTTACATATTGCACTTGTCATCATTGTTTATCAGGGAATAAACCACCACTATTTATCTCTTGTCAATTATAAATCCCAAAATTAAAATCATAATAACGGTACATATCATTTTCTCTTTGTGCTTGTAATTCAAAAACATTATAACCGATTCTTTGTTCTTCAATTTTCTTGTATCGCAAACCATATTTACTTTGTAAATAACCAGCAAAAACATAACCAGAATTCAAATTAATATCATAATTATTAGCAACCGAAAAATCATAATTAAAAACACTACCATAATTATTAATCGTATAAAACCGATTTTTAAACGCTGAATATAATTTAATATCTAATTGCTTATATTTATCCGAAAAATAAAAATATCGTGGGTAAATTTTAAAACCATTATTTACTAACAAGCCATATTTTTTATTATAACCTTGGACATAAGTATTATTTTCTAAATCAAAAATCGTACGTAAATAATTAGTATAAAATTTCTGTGAAATCTTAAACATACTATTTAATAATTTATCAAATTGTAATTTATCATTAATATTTTCACTCAATAAAATATTATTAAAATTTTGTAATTTCAACGCAAAAAAGTTAACTAAAACAGTATCATATTGCAAATTATCAATATATCCATTTTCTATAAATGAACTACGATTTTGAAATACTGGCACCAAAGCACTTGCAAAAAACGACTGTAAAAACTTAGATAAATCAAACTGACCGCTAAACTGCTGATAATACTTTAAATCTTTACTATTTAATGATGAATAAATTGAACCATTAAAACTAAAAACTTGACCAGTTCCCGTTCGCATAAAACTAAAATTAAAACTTAAATCATCGTTATTAACATTATTCAACTCTAAACTACCAGAAATAATAGTATTTACTTCATCAACAGTTAAAATCATCCGATAAATTGCTTTTTTAATATCTTGAACATCCAATTCATCAACCGTCTCAAAATCAAAAATTATCCGCTTTGTACCAACCTTATTCGGATTTTCATAATCCGCACTACCACCTTGTTGAACCCTAATATTTTCTCGCAAAACAGCAGTTAAAGATAAATTAATAAATTGTATTACACAACTTTGTTGATAACTATTTCAGTCAGTAATTTCACCAGTATTTTTGTCAATGGTTGGTGTTTCAGGTTCACCATCACCATCTCAACGATATAAACTATTTACTATATATCAAATGTCTTTAATTTTAACTCCATTATTTCATACATTACCAAATAGATTATTAATATCATCGTTTTTAAATTTAATAATTTTTCAAGTCTTATCTTCTCTTTGTTCTTTTGCTGATATTATATAAAATTTATTATTACGTGTTTTAAATTCATTATTAAATGTCCCATTTATAGTTTTCCAATTATCTTGTTTTAACTTAACTCTTGGAGAAAAATTTTCTTTATAACGCTCAACATTTTTAACAATTTGTAAAGATACATCATACATATTGTATTTATAAGCAAAAGCATAAATAAAATCAGTTAAATCATTCAAAAAATTCTCTTTTTTAACATCATAAAACTTATCAATTTTATACGTAAATTTAAAAGTATCTCACATTTGAAAAAATTCTAAAAATTTATCGTGTGGTTTATCATAAACAAGTCCAGTTGAATAACTATCTTGTAAAAAATCCAAATACCATTTATCATTAAACGATAATTTTTTTGACGTTTTTAAAGTTGGATTAATAAAATAATTGGTATCACTTCAATTTTCAAAAAAACTACTACGTAAAAACATTGTATTAATAAAATCAGTTTCATTAATACCTTTACCAGTACTACTTTCTTGTTTAAGCGTATATTGCTCCTCATTTAAGGGTCTAAACGCCGTTAAAGTAATAAATGGAATAACCAAACCCAAAAAAGTTAAAATAAATATGGCAAATAAAGATAACGATTTTTTCATAAACTCAACTCCTAACTATACAATGTTTTTGAAACAATAAACCCAACAATATATAAACTCGATATTGTTAACATTAACGGATGACTAAACAAAACTGCCATTCTACCAAATAATCAAATCAACCAAGTATCAGAATTATATAAATCCATAATAATATTTTTTGCTGATGTAAATTGATTAATAATAACAGTAATAAAACCAGTTCCAAATATCGCAATCGCCGCCACCAATAAAACTAATTTAATCATTACTTAACACCTCTTTTAAATTTTGCTTGTTGTCTAACATTTTGACGCTTAATTTCTCGTTTAACTTGCTGCTTATTACTATTTTGATAAACATTTTTACCAACATTAATACCTTTTCGTACAGTTGACGAATATACTTGCGAAACACCATTATTAACTGTCGAACCTAAATTATTATATTGTGTTGATGTCCCGTGAATTGCATAAATCGATAACTTAATAACCATAAAAAAGATTAAAAAATAAGCAATTGACGTATTTGTCATCGGTAATTTTGTATTTCAAATTACATCAAAAATAAACAAAAATATATCAAAAACAAAACTAAAAATCTTGTCTCAATTACTATTATTATTTTCAACTAATAAATTAATCATCTTTACTATTTCCTTTCTCTTTTTTAGGTTTTAAATTCTTTTTCAAAATATCAATATCAAATAACTCCAATCGTTCTTTAACGCTTAATTTTGTGATTTCCGATCAATAATAAAATTTTTCATTAACAATTTCGTCATTCTTTAAATCACGTACAAACTTTAACCATTCACTATCATACTTATTAGCAAATTCAAGGGGAATTATTATTTTAAAAAACCGAATTCCTAACCCAACATCCGACTTATGTTTTGCTCTTTTACCTTCTACTGTTCGTTCTACTGATTTTGTTTTTCAAATTTCATAATCCGTTATATCTTGGAAAATCCCAATTCGCATAATAAAGAAACGATTAAAAAAATTAAATCCTTTTTTAGCAACGGGTTTTTTCAATGAAATTGGAATAATAATTCCACTTGCTAACTGGCGAATATTATTTCAAATCATACCCTCACGCTGAGCAGTAAACAACGCACGATGTCCAAAATGTCTCGCTAAAACAATTCACGGTATTTTACCACTATGAACTTTTTTCTCATCGTGAGGACTAGTTCCGTCAATATATAAATAACTTTCATCAAATAAAATAACACTATCATCTAGGGGAACGGGTTTTGTTCTATCAGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_CP047428|1462266:1470123|1467645_1467849_-|WP_071890543.1|DBSCAN-SWA MQNDWIKLKEFFIHIFLFIDKTNVESITMWNLTQNEYLTLMVGVWVVILFLTWFFLWMVFKIVGYFK >NZ_CP047428|1462266:1470123|1469973_1470123_-|WP_015979229.1|DBSCAN-SWA MPTWLTTIFSVVIVLAIFLYFGLLIYQKIRQIRGKKKDKKEIERKESNK >NZ_CP047428|1462266:1470123|1463356_1463830_+|WP_164058452.1|DBSCAN-SWA MKKWLSIIGAIGLTITSTTTLISCEKSEKPNNNNNNNNNEENKPTIPASQPQQPPKNSNWKTINGTFNNEFKTRNNKFYIISAKEQREDKTWKIIKFKNDDINNLFGNVWNNGVKIKDIWYIVNSLYRWDGDGEPETPTIDKNTGEITDWKEQKGTK >NZ_CP047428|1462266:1470123|1466632_1467646_-|WP_071937347.1|DBSCAN-SWA MKKFIFFFKNYCYISGSMLLFSLIDLLLWLISLYCVGLVFWILFALQCVYFVWWLWKNIFYQLNSFGLVNFVWDNPLSVIIGKLGTGKTLLLTYLSQTMKLLTDEIYSNYPLEDDKVKVLTFKNLDFTDRTKPVPLDDSVILFDESYLYIDGTSPHDEKKVHSGKIPWIVLARHFGHRALFTAQREGMIWNNIRQLASGIIIPISLKKPVAKKGFNFFNRFFIMRIGIFQDITDYEIWKTKSVERTVEGKRAKHKSDVGLGIRFFKIIIPLEFANKYDSEWLKFVRDLKNDEIVNEKFYYWSEITKLSVKERLELFDIDILKKNLKPKKEKGNSKDD >NZ_CP047428|1462266:1470123|1468434_1468794_-|WP_071890535.1|DBSCAN-SWA MDIKFKTTKECKKLKRDFIIRNFVFGFVYFQFFIVLIEIIVGLVLFSNREIIVGILLFSLFLFLIFILLFFIIQCHICEIKEYKVMLLKKRMLPLENIIGGLGKGTMLRPVRRGDDKIE >NZ_CP047428|1462266:1470123|1466026_1466263_-|WP_015967964.1|DBSCAN-SWA MIKLVLLVAAIAIFGTGFITVIINQFTSAKNIIMDLYNSDTWLIWLFGRMAVLFSHPLMLTISSLYIVGFIVSKTLYS >NZ_CP047428|1462266:1470123|1462266_1463241_-|WP_071936912.1|transposase|DBSCAN-SWA MYSHLSFMDKVKLEQLLLSKMFLKNNGEQNISAIAKCLNRHRSTILREIKRFKTTDEYSAYKSDKMYYKKRKKNNKRCKFTEEQINFIQIRFNKYHDSPSELIYRYFLKFGVKFPVCVKTLYKWIRLGFYGFLKQNLRHRGKKYKTKGKSDNRGKLTDFKSIWDIENKVSNVGWFEMDTVVGKEHLSSCLVLVEQSSRKYFAIKFENHTAMEVLVKFKEMVINNNLMGKMKGIITDRGKEFSKWREMEIFAETQVYFCDAGKPRQKPLIEKINGELRHWFPPGTDFNKVSQKRLDWVVNDVINEKLRPVLNWRTAKDVFIDNFR >NZ_CP047428|1462266:1470123|1468001_1468451_-|WP_071937346.1|DBSCAN-SWA MIKLSNFVKKNHNVENYFISKEFIPFTTEKASFINLPNHNRHIGFWLSNKFIYPSEKHLEQIAIGLIYDNSYPIVKYDENLKRNIWKYLTGTELINLYNQYKQNYFTKMKKALFSSEPKKVKANNNNNNLTNWSVEKEQELINDLKDLN >NZ_CP047428|1462266:1470123|1463840_1466015_-|WP_071937973.1|DBSCAN-SWA MKKSLSLFAIFILTFLGLVIPFITLTAFRPLNEEQYTLKQESSTGKGINETDFINTMFLRSSFFENWSDTNYFINPTLKTSKKLSFNDKWYLDFLQDSYSTGLVYDKPHDKFLEFFQMWDTFKFTYKIDKFYDVKKENFLNDLTDFIYAFAYKYNMYDVSLQIVKNVERYKENFSPRVKLKQDNWKTINGTFNNEFKTRNNKFYIISAKEQREDKTWKIIKFKNDDINNLFGNVWNNGVKIKDIWYIVNSLYRWDGDGEPETPTIDKNTGEITDWNSYQQSCVIQFINLSLTAVLRENIRVQQGGSADYENPNKVGTKRIIFDFETVDELDVQDIKKAIYRMILTVDEVNTIISGSLELNNVNNDDLSFNFSFMRTGTGQVFSFNGSIYSSLNSKDLKYYQQFSGQFDLSKFLQSFFASALVPVFQNRSSFIENGYIDNLQYDTVLVNFFALKLQNFNNILLSENINDKLQFDKLLNSMFKISQKFYTNYLRTIFDLENNTYVQGYNKKYGLLVNNGFKIYPRYFYFSDKYKQLDIKLYSAFKNRFYTINNYGSVFNYDFSVANNYDINLNSGYVFAGYLQSKYGLRYKKIEEQRIGYNVFELQAQRENDMYRYYDFNFGIYNWQEINSGGLFPDKQWWQVQYVTPEGWWDFGAHIKNAVIWIVNTIPGVKQVNELASGVGKVFETVYSFFSQIFEVWKFNPALYSTITNIFLLIIFMKFVRLI >NZ_CP047428|1462266:1470123|1469059_1469299_-|WP_015979231.1|DBSCAN-SWA MVFSLYKNIYKFVNLLKIWIINLKVIIKIIISEIIVLIGNTIHDNQKIDGITFVKNEFIISSIFYFFFLFKIIYTERKP >NZ_CP047428|1462266:1470123|1467851_1468001_-|WP_164028235.1|DBSCAN-SWA MSLYDYWVQFVSYIIGANAPEFLYVISFVLFVVLFFGMFFKLIQKIWSF >NZ_CP047428|1462266:1470123|1469722_1469974_-|WP_015979230.1|DBSCAN-SWA MLGMYLTTAFNFLTASTPKTMSEGMTGIWTGLSSALWKVKEGITNILPEIMVFLGEAWIILIPFAIFCIIKILNFFRVMVKGF >NZ_CP047428|1462266:1470123|1466262_1466640_-|WP_071937327.1|DBSCAN-SWA MINLLVENNNSNWDKIFSFVFDIFLFIFDVIWNTKLPMTNTSIAYFLIFFMVIKLSIYAIHGTSTQYNNLGSTVNNGVSQVYSSTVRKGINVGKNVYQNSNKQQVKREIKRQNVRQQAKFKRGVK |
13 | Spiroplasma_virus(90.91%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_20 |
1529693 : 1540327
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >NZ_CP047428|1529693:1540327|DBSCAN-SWA CTTATCTAAAATTATCTATAAATACATCTTTTGCTGTTCTTCAATTCAGAACAGGCCTTAATTTTTCATTTATTACATCATTAACTACTCAATCTAATCGTTTCTGACTAACCTTATTAAAATCAGTTCCAGGAGGAAATCAATGTCTTAATTCACCATTTATTTTTTCAATTAAAGGTTTTTGACGAGGTTTACCAGCATCACAAAAATAAACTTGTGTTTCAGCAAATATTTCCATTTCTCGTCATTTACTAAATTCTTTACCTCTATCTGTTATTATTCCTTTCATTTTACCCATTAAATTATTATTTATAACCATCTCTTTAAATTTTACTAGAACTTCCATAGCAGTATGATTTTCAAATTTTATTGCAAAATATTTTCTACTTGATTGTTCTACTAAAACTAAACAACTAGATAAATGTTCTTTTCCAACAACAGTATCCATTTCAAATCATCCAACATTAGAAACTTTATTTTCAATATCTCAAATTGACTTAAAATCAGTTAATTTACCACGATTATCAGATTTTCCTTTTGTTTTATATTTTTTTCCACGATGTCGCAAATTCTGTTTTAAAAAACCATAAAAACCTAAACGAATTCATTTATACAATGTTTTAACACAAACCGGAAATTTAACACCAAATTTTAAAAAATAACGATAAATAAGTTCTGACGGTGAATCGTGATATTTATTAAATCTAATTTGAATAAAATTAATCTGTTCTTCCGTAAATTTACATCTTTTATTATTCTTTTTTCTTTTCTTATAATACATTTTATCTGACTTATAAGCACTATATTCATCAGTAGTTTTAAAACGCTTAATTTCTCGTAAAATAGTACTACGATGTCTATTCAAACATTTAGCGATTGCAGAAATATTCTGTTCACCATTATTTTTTAAAAACATTTTTGATAATAATAATTGTTCTAATTTAACTTTATCCATAAAACTTAAATGACTATACATAACATTTATATACCTTTCATTAACTTATAAAATTAATATTTAATACGAATAATTGATATATAATTGATATGTGATAAAAACAATTATATATAAAACAATAAAAAGGAGCAATATATATGAAAAAATGACTTAGCATAATAGGAGCAATTGGATTAACCGCAACAAGCACAACAACACTAATCAGTTGTGAAAAATCTAAAAAACCAAATAATAATGAAGAAAATAAACCGACACCAGAACCACAATATAATCCACAACAAGCACAAAAAGATAGTAATTGAAAATTAATTGATAAAAATAATTTTGATAATGAATTTAGTACAAAAAATAATAAATCATATTTATTTCTTAATTTATTTGATGTAGGTAAATATGGTATATATTTAGCAAAAAATAATGGTAATATATCACAAAAAAGAAATAATATTTGATATTTAGAAACATATAATCCAAAAGATTTCGTAATGTTTAACACTGCAAATATAAAATCACTTTATCGTTGAGATGGGGATAGTGAACCACAATTACCAACTATCGACAAAAACACCGGTGAAATTACTGACTGAAAAGAACAAAAAGGAACTGAATAACAGTTCCTTTTTTATATTAATCGCACAAATTTCATAAAAATAATTAATAAAAAGATATTTGTTATTGTACTATACAATGCTGGATTAAATTTTCATACCTCAAATATTTGACTAAAAAAAATATATACTGCTTCAAAAACCTTACCAACACCACTCGCTAATTCGTTAACTTGTTTAACTCCCGGAATAGTATTAACAATTCAAATCACCGCATTTTTAATATGAGTTTCTAAATCTCATCAACCTTTAGGAGTTATATATTGCACTTGAAATCATTGCTTATCGGGGAACAACCCACCATTATTAATTTCTTGTCAATTATAAATCCCAAAATTAAAATCATAATATCGGTACATATCATTTTCTTTTTGTGCTTGTAATTCAAAAACATTATAACCGATTTTTTGTTCTTCAATTTTTTTATATTGCAAACCATATTTATTTTGTAAATTACCTCCAAAAACATAACCGGAATTTAACTTAATATTATAATTATTAGCAACCGAAAAATCATAATTAAAAACACTACCATAATTATTAATGGTATAAAACCGATTTTTAAATGCTGAATATAATTTAATATCTAATTGCTTATATTTATCAGAAAAATAAAAATATCGTGGGTAAATTTTAAAACCATTATTTACTAACAAACCATATTTTTTATTATAACCTTGAACATAAGTATTATTTTCTAAATCAAAAATCGTACGTAAATAATTAGTATAAAATTTCTGTGAAATCTTAAACATACTATTTAATAATTTATCAAATTGTAATTTATCGTTAATATTTTCACTCAACAAAATATTATTAAAATTTTGTAATTTCAACGCAAAAAAGTTAACTAAAACAGTATCATATTGTAAATTATCAATATATCCATTTTCAATAAAAGAACTACGATTTTGAAACACTGGCACCAATGCACTTGCAAAAAACGACTGTAAAAACTTAGATAAATCAAACTGACCGCTAAACTGTTGATAATACTTTAAATCTTTACTATTTAATGATGAATAAATTGAACCATTAAAATTAAAAACCTCACCCATTCCCGTTCGCATAAAACTAAAATTAAAACTTAAATCATCATTATTAATATTATTTAACTCTAAACTACCAGAAATAATTAAATTTGCTTCATCAACAGTCAAAATCATCCGATAAATTGCTTTTTTAATATTTTTAACATCCAACTCATCAACCGTCTCAAAATCAAAAATTATCCGCTTTGTACCAACCTTATTCGGATTTTCATAATCAGCACTTCCGCCTTGCTGAACCCTAATATTTTCTTGCAAAACAGAATATAAAGACAAACCAATAAATTCTTTTACGCGAGTTTGTTGATAACTATTTCAGTCAGTAATTTCACCGGTGTTTTTGTCGATAGTTGGTAATTGTGGTTCACTATCCCCATCTCAACGATAAAGTGATTTTATATTTGCAGTGTTAAACATTACGAAATCTTTTGGATTATATGTTTCTAAATATCAAATATTATTTCTTTTTTGTGATATATTACCATTATTTTTTGCTAAATATATACCATATCTACCTACATCAAATAAATTAAGAAATAAATATGATTTATTATTTTTTGTACTAAATTCATTATCAAAATTATTTTTATCAATTAATTTTCAATTATCTTGGTTTAACTTAACTCTTGGATAATGATTTTCTTTATAACGGTCAACATTTTCCACAATTTCTTTCGATACATCAAACATCTTATATTTTACAGCAAAAGCATAAATAAAATCAGTTAAATCATTCAAAAAATTCTCTTTTTTAACATCATAAAATTTTTCAACCATATACTTATTTTTTAAACTATGTCATTGTCGATAATAATTCAAAAATATTTCACCAGGTTTATCATAAACAACTCCGGTTGAATAACTATCTTGTAAAAAATCTAAATACCATTTATCATTAAACAATAAATTTTTTGATGTTTTTAAAGTTGGATTAATAAAATAATTTGTTTCCGACCAATTTTCAAAAAAACTACTGCGTAAAAACATTGTATTAATAAAATCAGTTTCATTAATACCTTTACCAGTACTACTTTCTTGTTTAAGCGTATATTGCTCCTCATTTAAGGGTCTAAACGCCGTTAAAGTAATAAATGGAATAACCAAACCCAAAAAAGTTAAAATAAATATGGCAAATAAAGATAACGATTTTTTCATAAACTCAACTCCTAACTATACAATGTTTTTGAAACAATAAACCCAACAATATATAAACTCGATATTGTTAACATTAACGGATGACTAAACAAAACTGCCATTCTACCAAATAATCAAATCAACCAAGTATCAGAATTATATAAATCCATAATAATATTTTTTGCTGATGTAAATTGATTAATAATAACAGTAATAAAACCAGTTCCAAATATCGCAATCGCCGCCACCAATAAAACTAATTTAATCATTACTTATGCACTCTCCTATATCCTTGTTCTCTTGTTTTTGCTTGTTTTGCTAAACTTGATAATTGTTTTTTATTACGATTAATTTTAAATTGTTTACGCTCTTTAATATGTTTTTGCATACCTTGTTTAGTATCAGAAACACCGCGAACTGTTGAAGAATATACTTGTGAAACACCATTATTAACTGTTGAACCTAAATTATTATATTGTGTTGATGTCCCGTGAATTGCATAAATCGATAACTTAATAACCATAAAAAAGATTAAAAAATAAGCAATTGACGTATTTGTCATCGGTAATTTTGTATTTCAAATTACATCAAAAATAAACAAAAATATATCAAAAACAAAACTAAAAATCTTGTCTCAATTACTATTATTATTTTCAACTAATAAATTAATCATCTTTACCATTTCCTTTCTCTTTTTTAGGTTTTAAATTCTTTTTCAAAATATCAATATCAAATAACTCCAATCGTTCTTTAACACTTAATTTTGTGATTTCCGACCAATAATATTCTTTTTTATTAACAATTTCATCATTCTTTAAATCACGCACAAACTTTAACCATTGACTATCATACTTATTAGCGAATTCAAGGGGAATAATTATTTTAAAAAACCGAATTCCTAACCCAACATCCGACTTATGTTTTACTCTTTTACCTTCTGCTGTTCGTTCTACTGATTTTGTTTTTCAAATTTCATAATCCGTTATATCTTGAAAAATACCAATTCGCATAATAAAGAAACGATTAAAAAAATTAAACCCTTTCTTAATAACTGGTTTTTTCAATGAAATTGGAATAATAATTCCACTTGCTAACTGGCGAATATTATTTCAAATCATACCCTCACGCTGAGCAGTAAACAACGCACGATGTCCAAAATGTCTCGCTAAAACAATTCACGGTATTTTACCACTATGAACTTTTTTTTCATCGTGAGGACTAGTTCCGTCAATATATAAATAACTTTCATCAAATAAAATAACACTATCATCTAGGGGAACGGGTTTTGTTCTATCAGTAAAATCTAAATTTTTAAATGTTAAAACTTTAACTTTATCATCTTCTAAGGGATAATTACTATAAATTTCATCTGTCAATAATTTCATAGTTTGCGATAAATAAGTTAAAAGTAATGTTTTACCAGTTCCTAACTTACCAATAATTACCGATAACGGATTATCTCAAACAAAATTTACTAACCCAAAAGAATTTAACTGATAAAAAATATTTTTTCACAATCATCACACAAAATATACACATTGCAAAGCAAATAATATTCAAAATACTAAACCAACACAATACAAAGAAATTAACCAAAGTAATAAATCAATTAAACTAAACAAAAGCATTGAACCACTAATATAACAATAGTTTTTAAAGAAAAATATAAATTTTTTCATTATTTAAAATACCCAACTATCTTAAAAACCATTCACAAGAAAAACCAAGTTAAAAACAAAATCACAACTCAAACACCAACCATCAAGGTTAAATATTCATTTTGCGTTAAATTCCACATTGTAATACTTTCAACATTCGTTTTATCGATAAACAAAAATATATGAATAAAAAACTCTTTTAATTTAATTCAATCATTTTGCATTTTTAAAAACTCCATATTTTTTGAATAAGTTTAAAAAACATTCCAAAAAACAAAACAATAAATAACACAAACGATATAACATATAAAAACTCAGGGGCATTTGCACCAATAATATAACTAACAAATTGAACTCAATAATCATATAAACTCATTTAATTTAAGTCTTTCAAATCATTAATTAATTCTTGTTCTTTTTCAACACTTCAATTTGTTAAATTATTATTGTTATTATTTGCTTTTACTTTTTTAGGTTCACTTGAAAATAACGCTTTTTTCATTTTAGTAAAATAATTTTGTTTATATTGATTATATAAATTGATTAATTCTGTTCCAGTTAAATATTTTCAAATATTACGCTTTAAATTTTCATCATATTTTACAATAGAATAATAATTATCATAAATCAAACCGATTGCTACTTGTTCCAAATGTTTTTCACTCGGATAAATAAACTTATTACTCAATCAAAAACCAATATGACGATTATGATTAGGTAAATTAATAAAACTTGCTTTTTCTGTTGTAAAAGGGATAAATTCCTTACTAATAAAATAATTTTCTACATTATGATTTTTCTTAACAAAATTACTCAATTTTATCAACTCCTACTCTTAATCCTCTTAGCATTTTACCTTCTAACTCTTCTATTTGTTTCTTTAATACTGTAACTTTAAATCGCTTAATTTCTGATATATGCTCCATAATTAAATCAAATAAATTCCAAACTGATAAAATTAAAAGTAAAAAAGGAAATAAAATAACCAAAATTATTTCTACTTCAAAATTTATGGAAATAATAAAACAAACAATACACATAATAAAAGAAATTAAAAATAAAAAATAACAAAAACCAAAAGCAAAATTCCTAATAATAAAATCTCTCTTTATTTTTTTATATTCCTTAGTTGTTCAAAATTTCATATCCATAATATATAATCTCCTAACTAAATATTTAATAATATAAATATTTGTTTAATAAACAATGTTATAAATAATGTTTATATAATGTTTTTTAATTGTAATAAACACTGATTATTAACAATGTTATATATAATGCTAATATATTGTTTATTTAATGTTTAATAAACAATGTTAATAAACAATGTTAATAAACATTATTAAATATAAAAATAATAAAAATTGGCACACTGAAAAATACTATTTAATTTTTAACAATAGTTATTAAAATATAAAATAATAAGTTTATAATTAAGTTGATATTATTATGGTTTTCTCTCTGTATAAATTATTTTAAATAAAAAGAAGAAATAAAATATCGAAGAAATAATAAATTCATTTTTTACAAATGTAATACCATCTATTTTTTGATTATCATGAATGGTATTACCAATTAAAACAATTATTTCACTAATAATAATTTTAATAATAACTTTTAAATTTATTATTCAAATTTTTAATAAATTAACAAATTTATAAATATTTTTATACAGAGAGAAAACCATAATAATACCTTAAATATAATTAAATTGATATTTTTACACTATACACTGTTCACAAATTTTAAAAAAAAGTAGGTATATTTATAAAAAATATTATAAAAATTTATTTCCCAAATCTATTACTAGTATGACCCTTAATAGAAATATTCTTATTTTTATTAAATCCTACTAAAAAATATTTTTCATAACAGACTCAATATTATGAATAATAAACAATATAGATTTATCAACTATAGAAAATATAGTTAAATTTATAGTTAAATTTATATGTATAATAGAGATTTTTATTATCCCAATATTAACGATAGTAATAAAGTTTATTAAAAAATAAATTTGTAAACAGTATATAGTGTAAAAATAAACAATAAAATTATTTATTTAATTCACATAAAAGCTAGTGTGCCTTAACTAAGATATATGATCGATTATAATAAATATTAAAATCCTTTAACCATAACACGGAAAAAGTTTAAGATTTTAATAATACAAAATATAGCAAATGGAATTAATATAATTCACGCTTCACCTAAGAAAACCATTATCTCAGGTAAAATATTTGTTATACCTTCTTTAACTTTTCATAATGCACTAGATAAACCAGTTCAAATACCAGTCATACCCTCAGACATAGTTTTAGGTGTAGATGCTGTTAAAAAATTAAACGCTGTTGTTAAATACATACCTAACATTATTTATTACTCTCCTTTCTTTCAATTTCTTTTTTATCTTTTTTCTTTCCTCGAATTTGACGAATTTTTTGGTAAATTAATAAACCAAAATAAAGAAAAATTGCTAATACAATAACAACACTAAATATTGTCGTTAATCAAGTTGGCATAATATATCTCCTTTCAAAATTTTTAAATATCGCGTCACGCTCCGCGTGTTCGCTACGCTCAAAATAAACTATATTGAATAAATTACCGCTAATAAATTACGCGGATAATTTATTCATTTTCTTTTACATTATTAATTACTATCTTATTTACAGTATTAATAACAATATCTTTTCCATACTTAATTACTAAGGACCGCAAAATAAAATAATGTTTCTTTTCAATAAAAAATCAACTCCTTTCAGAATTGATTTGTTGCACTTCGATTACAGGATGCATTGCATTAAAAAAATAACGAATAGTAAAAATAAAGCTGATAATTGCAAGTTTAGTAAAATTGTTACTAAATATTTTTAATAGATTTTGTTTTTAAAAAACTAATGCGGATTAAAATACTAATAATGAAAAAATAAAAATTCAAATAAAAATTGATGAAAAGATATTATTTATAAAGTTAATAAATCTATTAAAAGTGATATTAGATAAAGAATTTATTAACATTTTTCCCTGCTCCTATATTTTTACACAGTAATATTTTACAAAAAAAAGCAAAGGTCTATTTTTGCTTTTTTTAAGAAAATTAAATTATTTAAGATCAACTGAAGCTCCAGATGATACTAATTGTCCTTTAATTTCTTCTGCTTCTTCTACTTTTACTTTTTCTTTAATTACTGCTGGTAATTTATCAACAATCGCTTTTGCTGCCATTAATTCTTTTCCAGTAATTTCTTTAACTAATTTAATAATTGCAACTTTACTTGGTCCTGTATCTGTTAACACAATATTAACCTCTGAAGGCCCCGCTGCTGCTGATCCTTCTACTGGAGCTGCAGCAACTGCTGCGGCAGCTACAACACCAAAATGATCTTCAATTGCTTTTACTAATTCATTTAAATCTGATAATTTCATTTCTTCTAATGCTTTAATAATATCATCTTTTGATAATGCCATAATATTTTCCTCCTCATTAAGATTTTTTTATAAAATGTTTGAATAAACTAACTAATTATCCACTTCTTGTTTTAGCAATTTCTTTAACTGCTATTGCAAACATACGTAATGGGTATAATAAACTTGCTCCAAACATTGATAGTAACTCGCCTTTTGTTGGTAACGCTGCAATTTCAACAATCGCTTTTGTGTCTAAGACTTTACCCTCATAAATTCCAGCTTTTAATTTTATTGCTGGATGTATTTTTGCAAATTTCGCTAAAGTTTTTGCGGCAGCCATCTGTTCACCTGTACCAAACGCAAAAGCATTAGGACCTGTTAAAAATTGGTCTAATTCAGCAAATCCTGCTTCTTTAGCAGCCAAACTTACTAAGTTATTTTTATATACTTTAATGTTTACATCTTGTTTTGTAAGCATTCTTCTTAGTTCTGTAAATTCAGCAACCGTTAATTTTTGATATTCGACAATAACCGCTGAATTAGCAGTTTTAAAGTTATTAACAATTTCATTAACAACTGCTTTTTTAATTTTCATTGCTGGCTTCATTTTTCGCCTCCCTATAATAATTTTAAAAGCAAAGGCAATTAATCCATTTGGCTAATTGCCTAAAACATTATTTAAATAATATAAAAACATGTCATTGTTCTATATCTCAATAATGCCTCGGCAACATAATTAAGATTTAATAAAATCCGTTGCTGTCTATGGTATTTTGATGACTATGGTACAATACCAATTAACATAGTATTATAATTTTTGTTAAAAGTCAAATAAAAAATTTATTTGCTCGAATATTATTTTAGGTACCAGTTTAACAATAATTTTAGACTATTTTTAAAAATAGTTAATCATTAAACCGCTTAATTTAAAAGTATCTTATTTACATATTTATTAAAACATACTTCTTGAAAAAAGGGAATACTAAAATGAGAATATTTTTAAAATATTCTTTTTTTTGTAAAATTAAGGACTTTTAAACTAGTATCTTACTGCTGTTATTTCTTTTAATTCTTTACTAATCCCAGTAGTATGATAATCCATTACAGGCATACTTCCTTTTTTAGGTTCATATAAAGAATTATTAGCGTTATGCATTTTGTAATTGAAGTGCAAAAAATAAACTTTGAAAGGAGTTGACTTTTTATTGAAAAAAACATTATTTTATTTTGTGGTCCCTAATAACTAAATATGGAAAAGATATTGTTATTAATACTGTAAATAAGATAGTAATTAATAATGTAAAAGAAAATGAATAAATTATCCGCGTAATTTATTAGCGGTAATTTATTCAATATAGTTTATTTTGAACGTAGCGAACACGCGAAGCGTGCCGCAATATTTTTAGAAAGGAGATGTAATATGCCAACTTGATTAACGACAATATTTAGTGTTGTTATTATATTAGGTATTTTTGCTTGAATTGGTTTATCAATTTATCAAAAAATTAAACAAATTCGAGGAAAGAAAAAAGAAAAAAAGAAATTGAAAGAAAGGAGAGTAATAAATAATGTTATGTATGTATTTAACAACAGCGTTTAATTTTTTAACAGCACCTACACCTAAAACTATGACTGGGGGTATGACTGTTATTTGAACGGGTTTGACTAGTGCATTATGAAAAGTTAAAGAAGGTATAACAAATATTTTACCTGAGGTAATGGTTTTCTTAGGTGAAGCGTGAATTATATTAATTCCATTTGCTATATTTTGTATTATTAAAATCTTAAACTTTTTCCGTGTTATGGTTAAAGGATTTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_20 >NZ_CP047428|1529693:1540327|1538201_1538567_-|WP_071938017.1|DBSCAN-SWA MALSKDDIIKALEEMKLSDLNELVKAIEDHFGVVAAAAVAAAPVEGSAAAGPSEVNIVLTDTGPSKVAIIKLVKEITGKELMAAKAIVDKLPAVIKEKVKVEEAEEIKGQLVSSGASVDLK >NZ_CP047428|1529693:1540327|1538622_1539114_-|WP_071938018.1|DBSCAN-SWA MKPAMKIKKAVVNEIVNNFKTANSAVIVEYQKLTVAEFTELRRMLTKQDVNIKVYKNNLVSLAAKEAGFAELDQFLTGPNAFAFGTGEQMAAAKTLAKFAKIHPAIKLKAGIYEGKVLDTKAIVEIAALPTKGELLSMFGASLLYPLRMFAIAVKEIAKTRSG >NZ_CP047428|1529693:1540327|1537468_1537618_-|WP_015979229.1|DBSCAN-SWA MPTWLTTIFSVVIVLAIFLYFGLLIYQKIRQIRGKKKDKKEIERKESNK >NZ_CP047428|1529693:1540327|1535116_1535320_-|WP_071890543.1|DBSCAN-SWA MQNDWIKLKEFFIHIFLFIDKTNVESITMWNLTQNEYLTLMVGVWVVILFLTWFFLWMVFKIVGYFK >NZ_CP047428|1529693:1540327|1535472_1535913_-|WP_084566904.1|DBSCAN-SWA MSNFVKKNHNVENYFISKEFIPFTTEKASFINLPNHNRHIGFWLSNKFIYPSEKHLEQVAIGLIYDNYYSIVKYDENLKRNIWKYLTGTELINLYNQYKQNYFTKMKKALFSSEPKKVKANNNNNNLTNWSVEKEQELINDLKDLN >NZ_CP047428|1529693:1540327|1533470_1533707_-|WP_015967964.1|DBSCAN-SWA MIKLVLLVAAIAIFGTGFITVIINQFTSAKNIIMDLYNSDTWLIWLFGRMAVLFSHPLMLTISSLYIVGFIVSKTLYS >NZ_CP047428|1529693:1540327|1537217_1537469_-|WP_015979230.1|DBSCAN-SWA MLGMYLTTAFNFLTASTPKTMSEGMTGIWTGLSSALWKVKEGITNILPEIMVFLGEAWIILIPFAIFCIIKILNFFRVMVKGF >NZ_CP047428|1529693:1540327|1537727_1537877_-|WP_155522075.1|DBSCAN-SWA MQQINSERSWFFIEKKHYFILRSLVIKYGKDIVINTVNKIVINNVKENE >NZ_CP047428|1529693:1540327|1533706_1534111_-|WP_015979226.1|DBSCAN-SWA MINLLVENNNSNWDKIFSFVFDIFLFIFDVIWNTKLPMTNTSIAYFLIFFMVIKLSIYAIHGTSTQYNNLGSTVNNGVSQVYSSTVRGVSDTKQGMQKHIKERKQFKINRNKKQLSSLAKQAKTREQGYRRVHK >NZ_CP047428|1529693:1540327|1535905_1536247_-|WP_015979232.1|DBSCAN-SWA MDMKFWTTKEYKKIKRDFIIRNFAFGFCYFLFLISFIMCIVCFIISINFEVEIILVILFPFLLLILSVWNLFDLIMEHISEIKRFKVTVLKKQIEELEGKMLRGLRVGVDKIE >NZ_CP047428|1529693:1540327|1539927_1540107_+|WP_147077704.1|DBSCAN-SWA MPTWLTTIFSVVIILGIFAWIGLSIYQKIKQIRGKKKEKKKLKERRVINNVMYVFNNSV >NZ_CP047428|1529693:1540327|1540075_1540327_+|WP_071938019.1|DBSCAN-SWA MLCMYLTTAFNFLTAPTPKTMTGGMTVIWTGLTSALWKVKEGITNILPEVMVFLGEAWIILIPFAIFCIIKILNFFRVMVKGF >NZ_CP047428|1529693:1540327|1535322_1535472_-|WP_164024074.1|DBSCAN-SWA MSLYDYWVQFVSYIIGANAPEFLYVISFVLFIVLFFGMFFKLIQKIWSF >NZ_CP047428|1529693:1540327|1529693_1530668_-|WP_071936912.1|transposase|DBSCAN-SWA MYSHLSFMDKVKLEQLLLSKMFLKNNGEQNISAIAKCLNRHRSTILREIKRFKTTDEYSAYKSDKMYYKKRKKNNKRCKFTEEQINFIQIRFNKYHDSPSELIYRYFLKFGVKFPVCVKTLYKWIRLGFYGFLKQNLRHRGKKYKTKGKSDNRGKLTDFKSIWDIENKVSNVGWFEMDTVVGKEHLSSCLVLVEQSSRKYFAIKFENHTAMEVLVKFKEMVINNNLMGKMKGIITDRGKEFSKWREMEIFAETQVYFCDAGKPRQKPLIEKINGELRHWFPPGTDFNKVSQKRLDWVVNDVINEKLRPVLNWRTAKDVFIDNFR >NZ_CP047428|1529693:1540327|1534103_1535117_-|WP_071890544.1|DBSCAN-SWA MKKFIFFFKNYCYISGSMLLFSLIDLLLWLISLYCVGLVFWILFALQCVYFVWWLWKNIFYQLNSFGLVNFVWDNPLSVIIGKLGTGKTLLLTYLSQTMKLLTDEIYSNYPLEDDKVKVLTFKNLDFTDRTKPVPLDDSVILFDESYLYIDGTSPHDEKKVHSGKIPWIVLARHFGHRALFTAQREGMIWNNIRQLASGIIIPISLKKPVIKKGFNFFNRFFIMRIGIFQDITDYEIWKTKSVERTAEGKRVKHKSDVGLGIRFFKIIIPLEFANKYDSQWLKFVRDLKNDEIVNKKEYYWSEITKLSVKERLELFDIDILKKNLKPKKEKGNGKDD >NZ_CP047428|1529693:1540327|1531269_1533459_-|WP_071892025.1|DBSCAN-SWA MKKSLSLFAIFILTFLGLVIPFITLTAFRPLNEEQYTLKQESSTGKGINETDFINTMFLRSSFFENWSETNYFINPTLKTSKNLLFNDKWYLDFLQDSYSTGVVYDKPGEIFLNYYRQWHSLKNKYMVEKFYDVKKENFLNDLTDFIYAFAVKYKMFDVSKEIVENVDRYKENHYPRVKLNQDNWKLIDKNNFDNEFSTKNNKSYLFLNLFDVGRYGIYLAKNNGNISQKRNNIWYLETYNPKDFVMFNTANIKSLYRWDGDSEPQLPTIDKNTGEITDWNSYQQTRVKEFIGLSLYSVLQENIRVQQGGSADYENPNKVGTKRIIFDFETVDELDVKNIKKAIYRMILTVDEANLIISGSLELNNINNDDLSFNFSFMRTGMGEVFNFNGSIYSSLNSKDLKYYQQFSGQFDLSKFLQSFFASALVPVFQNRSSFIENGYIDNLQYDTVLVNFFALKLQNFNNILLSENINDKLQFDKLLNSMFKISQKFYTNYLRTIFDLENNTYVQGYNKKYGLLVNNGFKIYPRYFYFSDKYKQLDIKLYSAFKNRFYTINNYGSVFNYDFSVANNYNIKLNSGYVFGGNLQNKYGLQYKKIEEQKIGYNVFELQAQKENDMYRYYDFNFGIYNWQEINNGGLFPDKQWFQVQYITPKGWWDLETHIKNAVIWIVNTIPGVKQVNELASGVGKVFEAVYIFFSQIFEVWKFNPALYSTITNIFLLIIFMKFVRLI >NZ_CP047428|1529693:1540327|1536543_1536783_-|WP_015979231.1|DBSCAN-SWA MVFSLYKNIYKFVNLLKIWIINLKVIIKIIISEIIVLIGNTIHDNQKIDGITFVKNEFIISSIFYFFFLFKIIYTERKP |
17 | Spiroplasma_virus(91.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP047436_1 | 1703-1817 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047436_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP047436_1
>1.1|1737|47|NZ_CP047436|CRISPRCasFinder AAGAAAATAAATTTTTTATAATTAATATTTTGCTTTGTTCTTGTTTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047436_1
The CRISPR arrays of NZ_CP047436_1 >merge|NZ_CP047436|1|1703-1817|CRISPRCasFinder GAATGCTATGAGAAGTAAAATATTTTTTTAATTTAAGAAAATAAATTTTTTATAATTAATATTTTGCTTTGTTCTTGTTTGGAATGCTATGAGAAGTAAAATATTTTTTTAATTT >NZ_CP047436|1|1|1703-1817|CRISPRCasFinder GAATGCTATGAGAAGTAAAATATTTTTTTAATTT AAGAAAATAAATTTTTTATAATTAATATTTTGCTTTGTTCTTGTTTG GAATGCTATGAGAAGTAAAATATTTTTTTAATTT
>NZ_CP047436.1|WP_164058678.1|784_1054_+|hypothetical-protein MAERKSIFSQAKITSVGESISETLLNNENENKLNDVNNFEIKNIKLKKNSIKKHINLTLKEDVIIKMKDVAKKNNMSVSALLEEVIEQL >NZ_CP047436.1|WP_164058677.1|11_782_+|AAA-family-ATPase MKIITVGALKGGVGKTNVTFNLSCFLSIEKKKRILLIDLDPQGNLTQCFKLDPPNPVAMDIFLEQDADIKNLIFKTGFEKINIIPTNIKMANLEIKLFNELQRESKLKNYIEKNISFLEKKYDYILIDTNPSLNVTNINAYSVANSIILISDNSIHSLRAIDVIGNMWETISKKLKIENNIKAIILNNFDSYSISKDFKFELEQLPSKKILIKQEIKKKQVFKASEITGIPVVKTLKKDENPYFNIVDELKQKGVI |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP047436_1 | 1.1|1737|47|NZ_CP047436|CRISPRCasFinder | 1737-1783 | 47 | NC_007386 | Spiroplasma citri plasmid pSciA strain GII3 | 3570-3616 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047436_1 | 1.1|1737|47|NZ_CP047436|CRISPRCasFinder | 1737-1783 | 47 | NZ_CP047436 | Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-8 | 1737-1783 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047436_1 | 1.1|1737|47|NZ_CP047436|CRISPRCasFinder | 1737-1783 | 47 | NZ_CP053305 | Spiroplasma citri strain C5 plasmid pScpC5-1, complete sequence | 2691-2737 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047436_1 | 1.1|1737|47|NZ_CP047436|CRISPRCasFinder | 1737-1783 | 47 | NZ_CP047443 | Spiroplasma citri strain BLH-MB plasmid pSciBLHMB-6, complete sequence | 4542-4588 | 2 | 0.957 |
NZ_CP047436_1 | 1.1|1737|47|NZ_CP047436|CRISPRCasFinder | 1737-1783 | 47 | NZ_CP047442 | Spiroplasma citri strain BLH-MB plasmid pSciBLHMB-5, complete sequence | 4528-4574 | 2 | 0.957 |
1. spacer 1.1|1737|47|NZ_CP047436|CRISPRCasFinder matches to NC_007386 (Spiroplasma citri plasmid pSciA strain GII3) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagaaaataaattttttataattaatattttgctttgttcttgtttg CRISPR spacer aagaaaataaattttttataattaatattttgctttgttcttgtttg Protospacer ***********************************************
2. spacer 1.1|1737|47|NZ_CP047436|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP047436 (Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-8) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagaaaataaattttttataattaatattttgctttgttcttgtttg CRISPR spacer aagaaaataaattttttataattaatattttgctttgttcttgtttg Protospacer ***********************************************
3. spacer 1.1|1737|47|NZ_CP047436|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053305 (Spiroplasma citri strain C5 plasmid pScpC5-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagaaaataaattttttataattaatattttgctttgttcttgtttg CRISPR spacer aagaaaataaattttttataattaatattttgctttgttcttgtttg Protospacer ***********************************************
4. spacer 1.1|1737|47|NZ_CP047436|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP047443 (Spiroplasma citri strain BLH-MB plasmid pSciBLHMB-6, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.957
-aagaaaataaattttttataattaatattttgctttgttcttgtttg CRISPR spacer taagaaaat-aattttttataattaatattttgctttgttcttgttgg Protospacer ******** ************************************ *
5. spacer 1.1|1737|47|NZ_CP047436|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP047442 (Spiroplasma citri strain BLH-MB plasmid pSciBLHMB-5, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.957
aagaaaataaattttttataattaatattttgc-tttgttcttgtttg CRISPR spacer aagaaaataaattttttataattaatattttgcttttgttcttgttg- Protospacer ********************************* ************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation |
---|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
63946 : 67542
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP047434|63946:67542|DBSCAN-SWA CCTAACTATACAATGTTTTTGAAACAATAAACCCAACAATATATAAACTTGATATCGTTAACATTAACGGATGACTAAACAAAACTGCCATTCTGCCAAATAATCAAATCAACCAAGTATCAGAATTATATAAATCCATAATAATATTTTTTGCTGATGTAAATTGATTAATAATAACAGTAATAAAACCAGTTCCAAATATCGCAATTGCCGCCACCAATAAAACTAATTTAATCATTACTTAACACCTCTTTTAAATTTTGCTTGTTGTCTAACATTTTGACGCTTAATTTCTCGTTTAACTTGCTGCTTATTACTATTTTGATAAACATTTTTACCAACATTAATACCTTTTCGTACAGTTGACGAATATACTTGCGAAACACCATTATTAACTGTCGAACCTAAATTATTATATTGTGTTGATGTGCCGTGAATTGCATAAATCGATAACTTAATAACCATAAAAAAGATTAAAAAATAAGCAATTGACGTATTTGTCATCGGTAATTTTGTATTTCAAATTACATCAAAAATAAACAAAAATATATCAAAAACAAAACTAAAAATCTTGTCTCAATTACTATTATTATTTTCAACTAATAAATTAATCATCTTTACTATTTCCTTTCTCTTTTTTAGGTTTTAAATTCTTTTTCAAAATATCAATATCAAATAACTCCAATCGTTCTTTAACGCTTAATTTTGTGATTTCTGACCAATAATATTCTTTTTTATTAACAATTTCATCATTCTTTAAATCACGCACAAACTTTAACCATTGACTATCATACTTATTAGCGAATTCAAGGGGAATTATTATTTTAAAAAACCGAATTCCTAACCCAATATCCGACTTATGTTTTACTCTTTTACCTTCTGCTGTTCGTTCTACTGATTTTGTTTTTCAAATTTCATAATCCGTTATATCTTGAAAAATACCAATTCGCATAATAAAGAAACGATTAAAAAAATTAAACCCTTTCTTAATAACTGGTTTTTTCAATGAAATTGGAATAATAATTCCACTTGCTAACTGGCGAATATTATTTCAAATCATACCCTCACGCTGAGCAGTAAACAACGCACGATGTCCAAAATGTCTCGCTAAAACAATTCACGGTATTTTACCACTATGAACTTTTTTTTCATCGTGAGGACTAGTTCCGTCAATATATAAATAACTTTCATCAAATAAAATAACACTATCATCTAGGGGAACGGGTTTTGTTCTATCAGTAAAATCTAAATTTTTAAATGTTAAAACTTTAACCTTATCATCTTTTAACGGATAATTACTATAAATTTCATCTGTCAATAATTTCATAGTTTGCGACAAATAAGTTAAAAGTAATGTTTTACCAGTTCCTAACTTACCAATAATTACCGATAACGGATTATCTCAAACAAAATTTACTAACCCAAAAGAATTTAACTGATAAAAAATATTTTTTCACAATCATCACACAAAATAAACACACTGCAAAGCAAATAATATTCAAAATACTAAACCAACACAATACAAAGAAATTATCCAAAGTAATAAATCAATTAAACTAAACAAAAGCATTGAACCACTAATATAACAATAGTTTTTAAAGAAAAATATAAATTTTTTCATTTTACCTCCAATAGTTATTTATAATTAAACTAGTATTATTATGGTTTTCTCTCCACACAAATCAAAAAGAAATATTTTTTACAACATTATTTATATTAATAAATACTGCATTCGTAATGAAAATATATATTATATTCAAAAAAAATTTTAAAATTTTGTGGGCAGAGAAAACCATAATAATAACAAAATTTAATTATTTAAAATAACTAACTATTTTAAAAACCATTCACAAGAAAAACCAAGTTAAAAACAAAATCACAACTCAAACACCAACCATCAAAGTTAAATATTCATTTTGCGTTAAATTCCACATTGTAATACTTTCAACATTCGTTTTATCGATAAACAAAAATATATGAATAAAAAACTCTTTTAATTTAATTAAATCATTTTGCATTTTTAAAAACTCCATATTTTTTGAATAAGTTTAAAAAACATTCCAAAAAATAAAACAACAAATAACACAAAAGATATAACATATAAAAACTCAGGGGCATTTGCACCAATAATATAACTAACAAATTGAACTCAATAATCATATAAACTCATTTAATTTAAGTCTTTCAAATCATTAATTAATTCTTGTTCTTTTTCAACACTTCAATTTGTTAAATTATTATTGTTATTATTTGTTTTTACTTTTTTAGGTTCACTTGAAAATAAAGCTTTTTTCATTTTAGTAAAATAATTTTGTTTATATTGATTATATAAATTGATTAATTCTGTTCCAGTTAAATATTTTCAAATATTTCGCTTTAAATTTTCATCATATTTTACAATAGGGTAAGAATTATCATAAATCAAACCGATTGCTACTTGTTCCAAATGTTTTTCACTCGGATAAATAAACTTATTACTCAATCAAAAACCAATATGACGATTATGATTAGGTAAATTAATAAAACTTGCTTTTTCTGTTGTAAAAGGGATAAATTCCTTACTAATAAAATAATTTTCTACATTCTGATTTTTCTTAACAAAATTACTCAATTTTATCATCTCCTCGTCTTACTGGTCTTAACATTGTGCCTTTTCCTAATCCTCCAATTTTATTTTCTAACGGTAACATTTTTTTCTTTAACAACATAACTTTATATTCTTTAATTTCGCATATATGACATTGAATTATAAAAAATAAAAGAATAAATATTAAAAATAAAAATAAAGAAAAAAGTAAAATACCAACAATTATTTCTCTATTTGAAAACAAAACAAGACCTACAATAATTTCAATAAGAACAATGAAAAATTGAAAATAAACAAAACCAAAAACAAAATTCCTAATAATAAAATCTCTCTTAAATTTTTTACATTCCTTAGTTGTTTTAAATTTTATATCCATAAGATAATCTCCTAACTAAATATTTGTTTAATAAACAATGTTATAAATAATGTTTATATAATGTTTTTTAATTGTAATAAACACTGATTATTAACAATGTTATACATAATGCTAATATATTGTTTATTTAATGTTTAATAAACAATGTTAATAAACAATGTTAAATATAAAAATAATAAAAATTGGCACACTGAAAATAACTATTAAGAACTTTAATAGTAAATATAATAAGTTCATTTTTCTATTTAATAAATTCATTTTTTACAAATGTGATAGCATCTATTTTTTGATTATCATGAATGGTATCACCAATTCAAAAAATTATTTCACTAAAAATTCCTAGTGTGCCTTAACTAAGATATATAATCGATTATAATAAATATTAAAATCCTTTAACCATAACACGGAAAAAGTTTAAAATTTTAATAATACAAAATATAGCAAATGGAATTAATATAATTCACGCTTCACCTAAGAAAATCATTATCTCAGGTAAAATATTTGTTATACATTCTTTAACTTTTCATAATGCACTAGTCAAACCCGTTCAAATACCAGTCATACCCTCAGACATAGTTTTAGGTGTAGGTGCTGTTAAAAAATTAAACGCTGTTGTTAAATACATACCTAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP047434|63946:67542|65759_65963_-|WP_071937329.1|DBSCAN-SWA MQNDLIKLKEFFIHIFLFIDKTNVESITMWNLTQNEYLTLMVGVWVVILFLTWFFLWMVFKIVSYFK >NZ_CP047434|63946:67542|66548_66908_-|WP_164028237.1|DBSCAN-SWA MDIKFKTTKECKKFKRDFIIRNFVFGFVYFQFFIVLIEIIVGLVLFSNREIIVGILLFSLFLFLIFILLFFIIQCHICEIKEYKVMLLKKKMLPLENKIGGLGKGTMLRPVRRGDDKIE >NZ_CP047434|63946:67542|64552_65566_-|WP_071937328.1|DBSCAN-SWA MKKFIFFFKNYCYISGSMLLFSLIDLLLWIISLYCVGLVFWILFALQCVYFVWWLWKNIFYQLNSFGLVNFVWDNPLSVIIGKLGTGKTLLLTYLSQTMKLLTDEIYSNYPLKDDKVKVLTFKNLDFTDRTKPVPLDDSVILFDESYLYIDGTSPHDEKKVHSGKIPWIVLARHFGHRALFTAQREGMIWNNIRQLASGIIIPISLKKPVIKKGFNFFNRFFIMRIGIFQDITDYEIWKTKSVERTAEGKRVKHKSDIGLGIRFFKIIIPLEFANKYDSQWLKFVRDLKNDEIVNKKEYYWSEITKLSVKERLELFDIDILKKNLKPKKEKGNSKDD >NZ_CP047434|63946:67542|64182_64560_-|WP_071937327.1|DBSCAN-SWA MINLLVENNNSNWDKIFSFVFDIFLFIFDVIWNTKLPMTNTSIAYFLIFFMVIKLSIYAIHGTSTQYNNLGSTVNNGVSQVYSSTVRKGINVGKNVYQNSNKQQVKREIKRQNVRQQAKFKRGVK >NZ_CP047434|63946:67542|67290_67542_-|WP_071937332.1|DBSCAN-SWA MLGMYLTTAFNFLTAPTPKTMSEGMTGIWTGLTSALWKVKECITNILPEIMIFLGEAWIILIPFAIFCIIKILNFFRVMVKGF >NZ_CP047434|63946:67542|63946_64183_-|WP_015967964.1|DBSCAN-SWA MIKLVLLVAAIAIFGTGFITVIINQFTSAKNIIMDLYNSDTWLIWLFGRMAVLFSHPLMLTISSLYIVGFIVSKTLYS >NZ_CP047434|63946:67542|65965_66115_-|WP_164028235.1|DBSCAN-SWA MSLYDYWVQFVSYIIGANAPEFLYVISFVLFVVLFFGMFFKLIQKIWSF >NZ_CP047434|63946:67542|66115_66565_-|WP_071937330.1|DBSCAN-SWA MIKLSNFVKKNQNVENYFISKEFIPFTTEKASFINLPNHNRHIGFWLSNKFIYPSEKHLEQVAIGLIYDNSYPIVKYDENLKRNIWKYLTGTELINLYNQYKQNYFTKMKKALFSSEPKKVKTNNNNNNLTNWSVEKEQELINDLKDLN |
8 | Spiroplasma_virus(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
79256 : 86386
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP047434|79256:86386|DBSCAN-SWA TATGCCAACTTGATTAACGACAATATTTAGTGTTGTTATTGTATTAGCAATTTTTCTTTATTTTGGTTTATCAATTTACCAAAAAATTAAACAAATTCGAGGAAAGAAAAAAGAAAAAAAAGAAATTGAAAGAAAGGAGAGTAGTAAATAATGTTAGGTATGTATTTAACAACAGCGTTTAATTTTTTAACAGCACCTACACCTAAAACTATGACTGAGGGTATGACTGGTATTTGAACTGGTTTATCTAGTGCATTATGAAAAGTTAAAGAATGTATAACAAATATTTTACTTGAGATAATGGTTTTTTTAGGTGAAGCGTGAATTATATTAATTCCATTTGCTATATTTTGTATTATTAAAATTTTAAACTTTTTCCGTGTTATGGTTAAAGGATTTTAATATTTATTATAATCGATTATATATCTTAGCTATGGCACACTAGTTTTTATGCGAATTGAATAAATAATTTTGTTGTTTATTTTTGCACTATACACTGTCTACAAATTTATTTTTAAATAAATTTAACTACTCATTTGGTTATTTTTAGTAGGATTTAATAGAAATAAGAATATTAATAACAGTTTTGAACCAAAAATTTTTATAATATTTTTTATAAATATATTTACTTTCTTTTAAAAACTTGTGGGCAGTATATAGTGTAAAAATATCAACTTAATTATATTTAAGGTATTATTATGGTTTTCTCTCTGTATAAAAATATTTATAAATTTGTTAATTTATTAAAAATTCAAATAATAAATTTAAAAGTTATTATTAAAATTATTATTAGTGAAATAATTGTTTTAATTGGGGATACCATTCATGATAATCAAAAAATAGATGGTATCACATTTGTAAAAAATGAATTTATTAAATAGAAAAATGAATTTATTATTTCTTCGATATTTTATTTCTTCTTTCTATTTAAAATAATTTATACAGACAGAAAACCATAATAATATCAACTTAATTATAAACTTATGATTTTACATTTTAAAAACTATTGTTAAAAATTAAATAGTATTTTTCAGTGTTCCAATTTTTATTATTTTTATATTTAACAATGTTTATTAACATTATTTATTAAACATTAAATAAACAATATATTAGCATTATGTATAACATTTTTAATAATCAGTGTTTATTACAATTAAAAAACATTATATAAACATTATTTATAACATTGTTTATTAAATAAATATTTAGTTAGGAGATTATCTTATGGATATGAAATTTAAAACAACTAAGGAATATAAAAAAATAAAGAAAAATTTTATTAAAGATATTTTTTTATTAAGTTTTTTAATTTTTTTAAATTTAATTGCTGATTTCTTTTTTTTTAAGTTCTTTTATTTATTTTTCAATATTGAGTTGAAATGATAAAGATTTTCCACACTTTGTATTTGCAATTATTATGTCTGTATGTGCTTTTATAGTTATTATTTTTGTGATTATTATGTATATAAAATATATTTTTGAAATTAAGGTAGAATTTGATGTTGAAAAAGAAAAATTAAATCAATATTGACAAATTGAAGGAGTTGATAAAATTGAGTAATTTTGTTAAGAAAAATCAGAATGTAGAAAATTATTTTATTAGTAAGGAATTTATATCTTTTACAACAGAAAAAGCAAGTTTTATTAATTTACCCAATCATAATCGTCATATTGGTTTTTGATTGAGTAATAAGTTTATTTATCCGAGTGAAAAACATTCGGAACAAGTAGCAATCGGTTTGATTTATGATAATTCTTACCCTATTGTAAAATATGATGAAAATTTGAAACGCTATATTTGAAAGTATTTAACTGGAACAGAATTAATCAATTTATATAATCAATATAAACAAAATTATTTTACTAAAATGAAAAAAGCGTTATTTTTAAGTTAACCTCAAAAAGTAAAAACAAATAATAATAATTTAACAAATTGAAGTTTTGAAAAAGAACAAGAATTAATTAATGATTTGAAAGACTTAAATTAAATGAGTTTATATGATTATTGAGTTCAATTTGTTAGTTATATTATTGGTGCAAATGCCCCTGAGTTTTTATATGTTATATTGTTTGTGTTATTTATTGTTTTGTTTTTTGGAATGTTTTTTAAATTTATTTAAAAAATGTGGAGTTTTTAAAAATGCAAAATGATTGAATTAAATTAAAAGAGTTTTTATTCATATATTTTTGTTTATAGATAAAACGAATGTTGAAAGTATTACAATGTGGAATTTAACGCAAAATGAATATTTAACTTTGATGGTTGGTGTTTGAGTTGTGATTTTGTTTTTAACTTGGTTTTTCTTGTGAATGGTTTTTAAAATAGTTAGTTATTTTAAATAATTAAATTTTGTTATTATTATGGTTTTCTCTCCACACAAAATTTTAAAATTTTTTTTGAATATAATATATATTTTCATTACGAATGCAGTAATTACTTAATATAAATAATGTTGTAAAAAATATTTCTTTTTGATTTGTGGGGGGAGAAAACCATAATAATACTAGTTTAATTATAAATAACTATTGGAGGTAAAATGAAAAAATTTATATTTTTTTTTAAAAACTATTGTTATATTAGTGGTTCAATGCTTTTGTTTAGTTTAATTGATTTATTACTTTGAATAATTTCTTTGTATTGTGTTGGTTTAGTATTTTGATTGTTGTTTGCTTTGCAATGTGTATATTTTGTGCGATGATTGTGAAAAAATATTTTTTATCAGTTAAACGCTTTTCGGTTAGTAAATTTTGTTTGAGATGCATCCTGTAATCGAAGTGCAACAAATCAATTCTGAAAGGAGTTGATTTTTTATTGAAAAGAAACATTATTTTATTTTGCGGTCCTTAGTAATTAAGTATGGAAAAGATATTGTTATTAATACTGTAAATAAGATAGTAATTAATAATGTAAAAGAAAATGAATAAATTATCCGCGTAATTTATTAGCGGTAATTTATTCAATATAGTTTATTTTGAGCGTAGCGAACACGCGGAGCGTGACGCGATATTTAAAAATTTTGAAAGGAGATATATTATGCCAACTTGATTAACGACAATATTTAGTGTTGTTATTGTATTAGCAATTTTTCTTTATTTTGGTTTATTAATTTACCAAAAAATTCGTCAAATTCGAGGAAAGAAAAAAGATAAAAAAGAAATTGAAAGAAAGGAGAGTAATAAATAATGTTAGGTATGTATTTAACAACAGCGTTTAATTTTTTAACAGCATCTACACCTAAAACTATGTCTGAGGGTATGACTGGTATTTGAACTGGTTTATCTAGTGCATTATGAAAAGTTAAAGAAGGTATAACAAATATTTTACCTGAGATAATGGTTTTCTTAGGTGAAGCGTGAATTATATTAATTCCATTTGCTATATTTTGTATTATTAAAATCTTAAACTTTTTCCGTGTTATGGTTAAAGGATTTTAATATTTATTATAATCGATCATATATCTTAGTTAAGGCACACTAGCTTTTATGTGAATTAAATAAATAATTTTATTGTTTATTTTTACACTATACACTGTTTACAAATTTATTTTTTAATAAACTTTATTACTATCGTTAATATTGGGATAATAAAAATCTCTATTATACATATAAATTTAACTATATTTTCTATAGTTGATAAATCTATATTGTTTATTATTCATAATATTGAGTCTGTTATGAAAAATATTTTTTTAGTAGGATTTAATAAAAATAAGAATATTTCTATTAAGGGTCATACTAGTAATAGATTTGGGAAATAAATTTTTATAATATTTTTTATAAATATACCTACTTTTTTTTAAAATTTGTGAACAGTGTATAGTGTAAAAATATCAATTTAATTATATTTAAGGTATTATTATGGTTTTCTCTCTGTATAAAAATATTTATAAATTTGTTAATTTATTAAAAATTTGAATAATAAATTTAAAAGTTATTATTAAAATTATTATTAGTGAAATAATTGTTTTAATTGGTAATACCATTCATGATAATCAAAAAATAGATGGTATTACATTTGTAAAAAATGAATTTATTATTTCTTCGATATTTTATTTCTTCTTTTTATTTAAAATAATTTATACAGAGAGAAAACCATAATAATATCAACTTAATTATAAACTTATGATTTTATATTTTAATAACTATTGTTAAAAATTAAATAGTATTTTTCAGTGTGCCAATTTTTATTATTTTTATATTTAACATTGTTTATTAACATTGTTTATTAAACATTAAATAAACAATATATTAGCATTATGTATAACATTGTTAATAATCAGTGTTTATTACAATTAAAAAACATTATATAAACATTATTTATAACATTGTTTATTAAACAAATATTTAGTTAGGAGATTATCTTATGGATATAAAATTTAAAACAACTAAGGAATGTAAAAAATTAAAGAGAGATTTTATTATTAGGAATTTTGTTTTTGGTTTTGTTTATTTTCAATTTTTCATTGTTCTTATTGAAATTATTGTAGGTCTTGTTTTGTTTTCAAATAGAGAAATAATTGTTGGTATTTTACTTTTTTCTTTATTTTTATTTTTAATATTTATTCTTTTATTTTTTATAATTCAATGTCATATATGCGAAATTAAAGAATATAAAGTTATGTTGTTAAAGAAAAGAATGTTACCGTTAGAAAATATAATTGGAGGATTAGGAAAAGGCACAATGTTAAGACCAGTAAGACGAGGAGATGATAAAATTGAGTAATTTTGTTAAGAAAAATCATAATGTAGAAAATTATTTTATTAGTAAGGAATTTATCCCTTTTACAACAGAAAAAGCAAGTTTTATTAATTTACCTAATCATAATCGTCATATTGGTTTTTGATTGAGTAATAAGTTTATTTATCCGAGTGAAAAACATTTGGAACAAATAGCAATCGGTTTGATTTATGATAATTCTTACCCTATTGTAAAATATGATGAAAATTTAAAGCGAAATATTTGAAAATATTTAACTGGAACAGAATTAATCAATTTATATAATCAATATAAACAAAATTATTTTACTAAAATGAAAAAAGCGTTATTTTCAAGTGAACCTAAAAAAGTAAAAGCAAATAATAACAATAATAATTTAACAAATTGAAGTGTTGAAAAAGAACAAGAATTAATTAATGATTTGAAAGACTTAAATTAAATGAGTTTATATGATTATTGAGTTCAATTTGTTAGTTATATTATTGGTGCAAATGCCCCTGAGTTTTTATATGTTATATCTTTTGTGTTATTTGTTGTTTTATTTTTTGGAATGTTTTTTAAACTTATTCAAAAAATATGGAGTTTTTAAAAATGCAAAATGATTGAATTAAATTAAAAGAGTTTTTTATTCATATATTTTTGTTTATCGATAAAACGAATGTTGAAAGTATTACAATGTGGAATTTAACGCAAAATGAATATTTAACCTTGATGGTTGGTGTTTGAGTTGTGATTTTGTTTTTAACTTGGTTTTTCTTGTGAATGGTTTTTAAGATAGTTGGGTATTTTAAATAATGAAAAAATTTATATTTTTCTTTAAAAACTATTGTTATATTAGTGGTTCAATGCTTTTGTTTAGTTTAATTGATTTATTACTTTGGTTAATTTCTTTGTATTGTGTTGGTTTAGTATTTTGAATATTATTTGCTTTGCAATGTGTATATTTTGTGTGATGATTGTGAAAAAATATTTTTTATCAGTTAAATTCTTTTGGGTTAGTAAATTTTGTTTGAGATAATCCGTTATCGGTAATTATTGGTAAGTTAGGAACTGGTAAAACATTACTTTTAACTTATTTATCGCAAACTATGAAATTATTGACAGATGAAATTTATAGTAATTATCCCTTAGAAGATGATAAAGTTAAAGTTTTAACATTTAAAAATTTAGATTTTACTGATAGAACAAAACCCGTTCCCCTAGATGATAGTGTTATTTTATTTGATGAAAGTTATTTATATATTGACGGAACTAGTCCTCACGATGAGAAAAAAGTTCATAGTGGTAAAATACCGTGAATTGTTTTAGCGAGACATTTTGGACATCGTGCGTTGTTTACTGCTCAGCGTGAGGGTATGATTTGAAATAATATTCGCCAGTTAGCAAGTGGAATTATTATTCCAATTTCATTGAAAAAACCCGTTGCTAAAAAAGGATTTAATTTTTTTAATCGTTTCTTTATTATGCGAATTGGGATTTTCCAAGATATAACGGATTATGAAATTTGAAAAACAAAATCAGTAGAACGAACAGTAGAAGGTAAAAGAGCAAAACATAAGTCGGATGTTGGGTTAGGAATTCGGTTTTTTAAAATAATAATTCCCCTTGAATTTGCTAATAAGTATGATAGTGAATGGTTAAAGTTTGTACGTGATTTAAAGAATGACGAAATTGTTAATGAAAAATTTTATTATTGATCGGAAATCACAAAATTAAGCGTTAAAGAACGATTGGAGTTATTTGATATTGATATTTTGAAAAAGAATTTAAAACCTAAAAAAGAGAAAGGAAATAGTAAAGATGATTAATTTATTAGTTGAAAATAATAATAGTAATTGAGACAAGATTTTTAGTTTTGTTTTTGATATATTTTTGTTTATTTTTGATGTAATTTGAAATACAAAATTACCGATGACAAATACGTCAATTGCTTATTTTTTAATCTTTTTTATGGTTATTAAGTTATCGATTTATGCAATTCACGGGACATCAACACAATATAATAATTTAGGTTCGACAGTTAATAATGGTGTTTCGCAAGTATATTCGTCAACTGTACGAAAAGGTATTAATGTTGGTAAAAATGTTTATCAAAATAGTAATAAGCAGCAAGTTAAACGAGAAATTAAGCGTCAAAATGTTAGACAACAAGCAAAATTTAAAAGAGGTGTTAAGTAATGATTAAATTAGTTTTATTGGTGGCGGCGATTGCGATATTTGGAACTGGTTTTATTACTGTTATTATTAATCAATTTACATCAGCAAAAAATATTATTATGGATTTATATAATTCTGATACTTGGTTGATTTGATTATTTGGTAGAATGGCAGTTTTGTTTAGTCATCCGTTAATGTTAACAATATCGAGTTTATATATTGTTGGGTTTATTGTTTCAAAAACATTGTATAGTTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP047434|79256:86386|82030_82180_+|WP_155522075.1|DBSCAN-SWA MQQINSERSWFFIEKKHYFILRSLVIKYGKDIVINTVNKIVINNVKENE >NZ_CP047434|79256:86386|79256_79406_+|WP_071937342.1|DBSCAN-SWA MPTWLTTIFSVVIVLAIFLYFGLSIYQKIKQIRGKKKEKKEIERKESSK >NZ_CP047434|79256:86386|83618_83978_+|WP_071890535.1|DBSCAN-SWA MDIKFKTTKECKKLKRDFIIRNFVFGFVYFQFFIVLIEIIVGLVLFSNREIIVGILLFSLFLFLIFILLFFIIQCHICEIKEYKVMLLKKRMLPLENIIGGLGKGTMLRPVRRGDDKIE >NZ_CP047434|79256:86386|85772_86150_+|WP_071937327.1|DBSCAN-SWA MINLLVENNNSNWDKIFSFVFDIFLFIFDVIWNTKLPMTNTSIAYFLIFFMVIKLSIYAIHGTSTQYNNLGSTVNNGVSQVYSSTVRKGINVGKNVYQNSNKQQVKREIKRQNVRQQAKFKRGVK >NZ_CP047434|79256:86386|82438_82690_+|WP_015979230.1|DBSCAN-SWA MLGMYLTTAFNFLTASTPKTMSEGMTGIWTGLSSALWKVKEGITNILPEIMVFLGEAWIILIPFAIFCIIKILNFFRVMVKGF >NZ_CP047434|79256:86386|84411_84561_+|WP_164028235.1|DBSCAN-SWA MSLYDYWVQFVSYIIGANAPEFLYVISFVLFVVLFFGMFFKLIQKIWSF >NZ_CP047434|79256:86386|82289_82439_+|WP_015979229.1|DBSCAN-SWA MPTWLTTIFSVVIVLAIFLYFGLLIYQKIRQIRGKKKDKKEIERKESNK >NZ_CP047434|79256:86386|84563_84767_+|WP_071890543.1|DBSCAN-SWA MQNDWIKLKEFFIHIFLFIDKTNVESITMWNLTQNEYLTLMVGVWVVILFLTWFFLWMVFKIVGYFK >NZ_CP047434|79256:86386|84766_85780_+|WP_071937347.1|DBSCAN-SWA MKKFIFFFKNYCYISGSMLLFSLIDLLLWLISLYCVGLVFWILFALQCVYFVWWLWKNIFYQLNSFGLVNFVWDNPLSVIIGKLGTGKTLLLTYLSQTMKLLTDEIYSNYPLEDDKVKVLTFKNLDFTDRTKPVPLDDSVILFDESYLYIDGTSPHDEKKVHSGKIPWIVLARHFGHRALFTAQREGMIWNNIRQLASGIIIPISLKKPVAKKGFNFFNRFFIMRIGIFQDITDYEIWKTKSVERTVEGKRAKHKSDVGLGIRFFKIIIPLEFANKYDSEWLKFVRDLKNDEIVNEKFYYWSEITKLSVKERLELFDIDILKKNLKPKKEKGNSKDD >NZ_CP047434|79256:86386|79405_79657_+|WP_071937343.1|DBSCAN-SWA MLGMYLTTAFNFLTAPTPKTMTEGMTGIWTGLSSALWKVKECITNILLEIMVFLGEAWIILIPFAIFCIIKILNFFRVMVKGF >NZ_CP047434|79256:86386|86149_86386_+|WP_015967964.1|DBSCAN-SWA MIKLVLLVAAIAIFGTGFITVIINQFTSAKNIIMDLYNSDTWLIWLFGRMAVLFSHPLMLTISSLYIVGFIVSKTLYS >NZ_CP047434|79256:86386|83961_84411_+|WP_071937346.1|DBSCAN-SWA MIKLSNFVKKNHNVENYFISKEFIPFTTEKASFINLPNHNRHIGFWLSNKFIYPSEKHLEQIAIGLIYDNSYPIVKYDENLKRNIWKYLTGTELINLYNQYKQNYFTKMKKALFSSEPKKVKANNNNNNLTNWSVEKEQELINDLKDLN >NZ_CP047434|79256:86386|83113_83353_+|WP_015979231.1|DBSCAN-SWA MVFSLYKNIYKFVNLLKIWIINLKVIIKIIISEIIVLIGNTIHDNQKIDGITFVKNEFIISSIFYFFFLFKIIYTERKP |
13 | Spiroplasma_virus(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
91225 : 125051
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP047434|91225:125051|DBSCAN-SWA GATGATTAATTTATTAGTTGAAAATAATAATAGTAATTGAGACAAGATTTTTAGTTTTGTTTTTGATATATTTTTGTTTATTTTTGATGTAATTTGAAATACAAAATTACCGATGCATCCTGTAATCGAAGTGCAACAAATCAATTCTGAAAGGAGTTGATTTTTTATTGAAAAGAAACATTATTTTATTTTGCGGTCCTTAGTAATTAAGTATGGAAAAGATATTGTTATTAATACTGTAAATAAGATAGTAATTAATAATGTAAAAGAAAATGAATAAATTATCCGCGTAATTTATTAGCGGTAATTTATTCAATATAGTTTATTTTGAGCGTAGCGAACACGCGGAGCGTGACGCGATATTTAAAAATTTTGAAAGGAGATATATTATGCCAACTTGATTAACGACAATATTTAGTGTTGTTATTGTATTAGCAATTTTTCTTTATTTTGGTTTATTAATTTACCAAAAAATTCGTCAAATTCGAGGAAAGAAAAAAGATAAAAAAGAAATTGAAAGAAAGGAGAGTAATAAATAATGTTAGGTATGTATTTAACAACAGCGTTTAATTTTTTAACAGCATCTACACCTAAAACTATGTCTGAGGGTATGACTGGTATTTGAACTGGTTTATCTAGTGCATTATGAAAAGTTAAAGAAGGTATAACAAATATTTTACCTGAGATAATGGTTTTCTTAGGTGAAGCGTGAATTATATTAATTCCATTTGCTATATTTTGTATTATTAAAATCTTAAACTTTTTCCGTGTTATGGTTAAAGGATTTTAATATTTATTATAATCGATCATATATCTTAGTTAAGGCACACTAGCTTTTATGTGAATTAAATAAATAATTTTATTGTTTATTTTTACACTATACACTGTTTACAAATTTATTTTTTAATAAACTTTATTACTATCGTTAATATTGGGATAATAAAAATCTCTATTATACATATAAATTTAACTATATTTTCTATAGTTGATAAATCTATATTGTTTATTATTCATAATATTGAGTCTGTTATGAAAAATATTTTTTTAGTAGGATTTAATAAAAATAAGAATATTTCTATTAAGGGTCATACTAGTAATAGATTTGGGAAATAAATTTTTATAATATTTTTTATAAATATACCTACTTTTTTTTAAAATTTGTGAACAGTGTATAGTGTAAAAATATCAATTTAATTATATTTAAGGTATTATTATGGTTTTCTCTCTGTATAAAAATATTTATAAATTTGTTAATTTATTAAAAATTTGAATAATAAATTTAAAAGTTATTATTAAAATTATTATTAGTGAAATAATTGTTTTAATTGGTAATACCATTCATGATAATCAAAAAATAGATGGTATTACATTTGTAAAAAATGAATTTATTATTTCTTCGATATTTTATTTCTTCTTTTTATTTAAAATAATTTATACAGAGAGAAAACCATAATAATATCAACTTAATTATAAACTTATTATTTTATATTTTAATAACTATTGTTAAAAATTAAATAGTATTTTTCAGTGTGCCAATTTTTATTATTTTTATATTTAATAATGTTTATTAACATTGTTTATTAAACATTAAATAAACAATATATTAGCATTATATATAACATTGTTAATAATCAGTGTTTATTACAATTAAAAAACATTATATAAACATTATTTATAACATTGTTTATTAAACAAATATTTATATTATTAAATATTTAGTTAGGAGATTATATATTATGGATATGAAATTTTGAACAACTAAGGAATATAAAAAAATAAAGAGAGATTTTATTATTAGGAATTTTGCTTTTGGTTTTTGTTATTTTTTATTTTTAATTTCTTTTATTATGTGTATTGTTTGTTTTATTATTTCCATAAATTTTGAAGTAGAAATAATTTTGGTTATTTTATTTCCTTTTTTACTTTTAATTTTATCAGTTTGGAATTTATTTGATTTAATTATGGAGCATATATCAGAAATTAAGCGATTTAAAGTTACAGTATTAAAGAAACAAATAGAAGAGTTAGAAGGTAAAATGCTAAGAGGATTAAGAGTAGGAGTTGATAAAATTGAGTAATTTTGTTAAGAAAAATCATAATGTAGAAAATTATTTTATTAGTAAGGAATTTATCCCTTTTACAACAGAAAAAGCAAGTTTTATTAATTTACCTAATCATAATCGCCATATTGGTTTTTGACTGAGTAATAAGTTTATTTATCCGAGTGAAAAACATTCAAAACAAGTAGCTATTGGTTTGATTTATGATAATTCTTATCCTATTGTAAAGTATGATGAAAATTTAAAACGTCATATTTGAAAGTATTTAACTGGAACAGAATTAATCAATTTATATAATCAATATAAACAAAATTATTTTACTAAAATGAAAAAAGCTTTATTTTCAAGTGAACCTAAAAAAGTAAAAGCAAATAATAACAATAATAATTTAACAAATTGAAGTGTTGAAAAAGAACAAGAATTAATTAATGATTTGAAAGACTTAAATTAAATGAGTTTATATGATTATTGAGTTCAATTTGTTAGTTATATTATTGGTGCAAATGCCCCTGAGTTTTTATATGTTATATCGTTTGTGTTATTTATTGTTTTGTTTTTTGGAATGTTTTTTAAACTTATTCAAAAAATGTGGAGTTTTTAAAAATGCAAAATGATTGAATTAAATTAAAAGAGTTTTTTATTTATATATTTTTGTTTATAGATAAAACGAATGTTGAAAGTATTACAATGTGGAATTTAACGCAAAATGAATATTTAACTTTGATGGTTGGTGTTTGAATTGTGATTTTGTTTTTAACTTGGTTTTTATTATGAATGGTTTTTAAAATAGTTGGGTATTTTAAATAATGAAAAAATTTATATTTTTCTTTAAAAACTATTGTTATATTAGTGGTTCAATGCTTTTGTTTAGTTTAATTGATTTATTACTTTGGATAATTTCTTTGTATTGTGTTGGTTTAGTATTTTGAATATTATTTGTTTTGCAGTGTATTTATTTTGTGTGATGATTGTGAAAAAATATTTTTTATCAGTTAAATTCTTTTGGGTTAGTAAATTTTGTTTGAGATAATCCGTTATCGGTAATTATTGGTAAGTTAGGGACCGGTAAAACATTACTTTTAACTTATTTGTCGCAAACTATGAAATTATTAACAGATGAAATTTATAGTAATTATCCGTTAGAAGATGATAAAGTTAAAGTTTTAACATTTAAAAATTTAGATTTTACAGATAGAACAAAACCAGTTCCGCCAGATGATAGTGTTATTTTATTTGATGAAAGTTATTTATATATTGATGGAACTAGTCCTCACGATGAGAAAAAAGTTCATAGTGGTAAAATTCCGTGAATTGTATTAGCAAGACATTTTGGTAATCGTGCGTTGTTTACTGCTCAGCGTGAGGGTATGATTTGAAATAATATTCGCCAGTTAGCAAGTGGAATTATTATTCCAATTTCATTGAAAAAACCAGTTATTAAGAAAGGGTTTAATTTTTTTAATCGTTTCTTTATTATGCAAATTGGTATTTTTCAAGATATAACGGATTATGAAATTTGAAAAACAAAATCAGTAGAACGAACAGCAGAAGGTAAAAGAGTAAAACATAAGTCGGATGTTGGGTTAGGAATTCGGTTTTTTAAAATAATTATTCCCCTTGAATTTGCTAATAAGTATGATAGTCAATGGTTAAAGTTTGTGCGTGATTTAAAGAATGATGAAATTGTTAATAAAAAAGAATATTATTGGTCGGAAATCACAAAATTAAGTGTTAAAGAACGATTGGAGTTATTTGATATTGATATTTTGAAAAAGAATTTAAAACCTAAAAAAGAGAAAGGAAATGGTAAAGATGATTAATTTATTAGTTGAAAATAATAATAGTAATTGAGACAAGATTTTTAGTTTTGTTTTTGATATATTTTTGTTTATTTTTGATGTAATTTGAAATACAAAATTACCGATGACAAATACGTCAATTGCTTATTTTTTAATCTTTTTTATGGTTATTAAGTTATCGATTTATGCAATTCACGGGACATCAACACAATATAATAATTTAGGTTCAACAGTTAATAATGGTGTTTCACAAGTATATTCTTCAACAGTTCGCGGTGTTTCTGATACTAAACAAGGTATGCAAAAACATATTAAAGAGCGTAAACAATTTAAAATTAATCGTAATAAAAAACAATTATCAAGTTTAGCAAAACAAGCAAAAACAAGAGAACAAGGATATAGGAGAGTGCATAAGTAATGATTAAATTAGTTTTATTGGTGGCGGCGATTGCGATATTTGGAACTGGTTTTATTACTGTTATTATTAATCAATTTACATCAGCAAAAAATATTATTATGTATTTATATAATTCTGATACTTGGTTGATTTGATTATTTGGTAGAATGGCAGTTTTGTTTAGTCATCCGTTAATGTTAACAATATCGAGTTTATATATTGTTGGGTTTATTGTTTCAAAAACATTGTATAGTTAGGAGTTGAGTTTATGAAAAAATCGTTATCTTTATTTGCCATATTTATTTTAACTTTTTTGGGTTTGGTTATTCCATTTATTACTTTAACGGCGTTTAGACCCTTAAATGAGGAGCAATATACGCTTAAACAAGAAAGTAGTACTGGTAAAGGTATTAATGAAACTGATTTTATTAATACAATGTTTTTACGTAGTAGTTTTTTTGAAAATTGAAGTGATACCAATTATTTTATTAATCCAACTTTAAAAACGTCAAAAAAATTATCGTTTAATGATAAATGGTATTTGGATTTTTTACAAGATAGTTATTCAACTGGACTTGTTTATGATAAACCACACGATAAATTTTTAGAATTTTTTCAAATGTGAGATACTTTTAAATTTACGTATAAAATTGATAAGTTTTATGATGTTAAAAAAGAGAATTTTTTGAATGATTTAACTGATTTTATTTATGCTTTTGCCGTAAAATATGAGTTGTTTGATGT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45 | Spiroplasma_virus(73.33%) | protease,portal,transposase,capsid,tail,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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