CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP040863	Rodentibacter heylii strain G1 chromosome, complete genome	1 crisprs	DinG,DEDDh,cas3,WYL	0	1	9	0

1. NZ_CP040863

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP040863_1

• CRISPR_ID: NZ_CP040863_1
• CRISPR_location: 2536934-2537072
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers
• Cas_protein_info: DEDDh

Consensus repeat of NZ_CP040863_1

Consensus_repeat	Method
TTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP040863_1

>1.1|2536983|41|NZ_CP040863|CRISPRCasFinder
TGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCAGAGAGTACAAAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP040863_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP040863_1

>merge|NZ_CP040863|1|2536934-2537072|CRISPRCasFinder
TTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCAGAGAGTACAAAATTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCGACCTTGGCAAGGT

>NZ_CP040863|1|1|2536934-2537072|CRISPRCasFinder
TTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGT	TGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCAGAGAGTACAAAA
TTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCGACCTTGGCAAGGT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP040863.1|WP_135968826.1|2534778_2536287_-|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|236692
NZ_CP040863.1|WP_164028752.1|2532895_2534779_-|DNA-mismatch-repair-endonuclease-MutL	unknown	unknown	gnl|CDD|234630
NZ_CP040863.1|WP_164028758.1|2543056_2546101_+|beta-galactosidase	unknown	unknown	gnl|CDD|236673
NZ_CP040863.1|WP_059366745.1|2520491_2521775_-|glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase	unknown	unknown	gnl|CDD|234607
NZ_CP040863.1|WP_164028754.1|2537192_2537741_-|oligoribonuclease	DEDDh	cd06127_DEDDh_CAS-I	gnl|CDD|235429
NZ_CP040863.1|WP_059366751.1|2516979_2517786_+|type-I-methionyl-aminopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|235576
NZ_CP040863.1|WP_059365483.1|2539375_2541103_+|phosphoenolpyruvate-protein-phosphotransferase-PtsI	unknown	unknown	gnl|CDD|183017
NZ_CP040863.1|WP_059365479.1|2546166_2547441_-|citrate-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|180164
NZ_CP040863.1|WP_164028759.1|2547470_2550074_-|bifunctional-aconitate-hydratase-2/2-methylisocitrate-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|236424
NZ_CP040863.1|WP_059366753.1|2516512_2516857_-|iron-sulfur-cluster-insertion-protein-ErpA	unknown	unknown	gnl|CDD|184186
NZ_CP040863.1|WP_059366743.1|2521897_2522962_+|UDP-N-acetylglucosamine--undecaprenyl-phosphate-N-acetylglucosaminephosphotransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|131433
NZ_CP040863.1|WP_164028755.1|2537811_2538852_+|small-ribosomal-subunit-biogenesis-GTPase-RsgA	unknown	unknown	gnl|CDD|237039
NZ_CP040863.1|WP_164028756.1|2539013_2539271_+|phosphocarrier-protein-Hpr	unknown	unknown	gnl|CDD|182777
NZ_CP040863.1|WP_164028750.1|2529012_2531955_-|bifunctional-[glutamate--ammonia-ligase]-adenylyl-L-tyrosine-phosphorylase/[glutamate--ammonia-ligase]-adenylyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|236836
NZ_CP040863.1|WP_059365482.1|2541162_2541663_+|PTS-glucose-transporter-subunit-IIA	unknown	unknown	gnl|CDD|181859
NZ_CP040863.1|WP_059365477.1|2550172_2551423_-|NADP-dependent-isocitrate-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|180792
NZ_CP040863.1|WP_164028751.1|2531959_2532895_-|tRNA-(adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase-MiaA	unknown	unknown	gnl|CDD|234626
NZ_CP040863.1|WP_164028757.1|2541720_2542920_+|mannose-6-phosphate-isomerase,-class-I	unknown	unknown	gnl|CDD|380414
NZ_CP040863.1|WP_164028749.1|2517859_2520451_+|bifunctional-uridylyltransferase/uridylyl-removing-protein-GlnD	unknown	unknown	gnl|CDD|234980
NZ_CP040863.1|WP_164028753.1|2536305_2536776_-|tRNA-(adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase-complex-ATPase-subunit-type-1-TsaE	unknown	unknown	gnl|CDD|182615

HMMScan for Signature genes

Protein	Cas_name	Cas_description	E-value	Identity	Coverage
NZ_CP040863.1|WP_164028754.1|2537192_2537741_-|oligoribonuclease	DEDDh	cd06127_DEDDh_CAS-I	1.9e-12	42.3	0.0

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP040863.1|WP_135968826.1|2534778_2536287_-|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein	gnl|CDD|236692	PRK10431, PRK10431, N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase II; Provisional.	6.92426e-105
NZ_CP040863.1|WP_164028752.1|2532895_2534779_-|DNA-mismatch-repair-endonuclease-MutL	gnl|CDD|234630	PRK00095, mutL, DNA mismatch repair endonuclease MutL.	0
NZ_CP040863.1|WP_164028758.1|2543056_2546101_+|beta-galactosidase	gnl|CDD|236673	PRK10340, ebgA, cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha; Reviewed.	0
NZ_CP040863.1|WP_059366745.1|2520491_2521775_-|glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase	gnl|CDD|234607	PRK00062, PRK00062, glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase.	0
NZ_CP040863.1|WP_164028754.1|2537192_2537741_-|oligoribonuclease	gnl|CDD|235429	PRK05359, PRK05359, oligoribonuclease; Provisional.	1.24585e-131
NZ_CP040863.1|WP_059366751.1|2516979_2517786_+|type-I-methionyl-aminopeptidase	gnl|CDD|235576	PRK05716, PRK05716, methionine aminopeptidase; Validated.	2.30557e-160
NZ_CP040863.1|WP_059365483.1|2539375_2541103_+|phosphoenolpyruvate-protein-phosphotransferase-PtsI	gnl|CDD|183017	PRK11177, PRK11177, phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsI.	0
NZ_CP040863.1|WP_059365479.1|2546166_2547441_-|citrate-synthase	gnl|CDD|180164	PRK05614, gltA, citrate synthase.	0
NZ_CP040863.1|WP_164028759.1|2547470_2550074_-|bifunctional-aconitate-hydratase-2/2-methylisocitrate-dehydratase	gnl|CDD|236424	PRK09238, PRK09238, bifunctional aconitate hydratase 2/2-methylisocitrate dehydratase; Validated.	0
NZ_CP040863.1|WP_059366753.1|2516512_2516857_-|iron-sulfur-cluster-insertion-protein-ErpA	gnl|CDD|184186	PRK13623, PRK13623, iron-sulfur cluster insertion protein ErpA; Provisional.	4.12925e-81
NZ_CP040863.1|WP_059366743.1|2521897_2522962_+|UDP-N-acetylglucosamine--undecaprenyl-phosphate-N-acetylglucosaminephosphotransferase	gnl|CDD|131433	TIGR02380, ECA_wecA, undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase. Members of this family are the WecA enzyme of enterobacterial common antigen biosynthesis, undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase. This family represents one narrow clade, and closely related sequences outside this clade may represent enzymes that catalyze the same specific reaction, but in the context of different pathways. A His-rich motif in a cytosolic loop of this integral membrane protein, shown critical to enzymatic activity for WecA is variously present or absent in the clade that includes Bacillus subtilis TagO teichoic acid biosynthesis enzyme, which may catalyze the same reaction as WecA. [Cell envelope, Biosynthesis and degradation of surface polysaccharides and lipopolysaccharides].	0
NZ_CP040863.1|WP_164028755.1|2537811_2538852_+|small-ribosomal-subunit-biogenesis-GTPase-RsgA	gnl|CDD|237039	PRK12288, PRK12288, small ribosomal subunit biogenesis GTPase RsgA.	0
NZ_CP040863.1|WP_164028756.1|2539013_2539271_+|phosphocarrier-protein-Hpr	gnl|CDD|182777	PRK10850, PRK10850, phosphocarrier protein Hpr.	2.7026e-39
NZ_CP040863.1|WP_164028750.1|2529012_2531955_-|bifunctional-[glutamate--ammonia-ligase]-adenylyl-L-tyrosine-phosphorylase/[glutamate--ammonia-ligase]-adenylyltransferase	gnl|CDD|236836	PRK11072, PRK11072, bifunctional [glutamate--ammonia ligase]-adenylyl-L-tyrosine phosphorylase/[glutamate--ammonia-ligase] adenylyltransferase.	0
NZ_CP040863.1|WP_059365482.1|2541162_2541663_+|PTS-glucose-transporter-subunit-IIA	gnl|CDD|181859	PRK09439, PRK09439, PTS system glucose-specific transporter subunit; Provisional.	1.59227e-104
NZ_CP040863.1|WP_059365477.1|2550172_2551423_-|NADP-dependent-isocitrate-dehydrogenase	gnl|CDD|180792	PRK07006, PRK07006, isocitrate dehydrogenase; Reviewed.	0
NZ_CP040863.1|WP_164028751.1|2531959_2532895_-|tRNA-(adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase-MiaA	gnl|CDD|234626	PRK00091, miaA, tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase; Reviewed.	3.62368e-166
NZ_CP040863.1|WP_164028757.1|2541720_2542920_+|mannose-6-phosphate-isomerase,-class-I	gnl|CDD|380414	cd07011, cupin_PMI_type_I_N, type I phosphomannose isomerase in eukaryotes and bacteria, N-terminal cupin domain. This subfamily contains type I phosphomannose isomerase (PMI; E.C. 5.3.1.8; also known as mannose-6-phosphate isomerase) found in eukaryotes and some bacteria such as Salmonella enterica. PMI catalyzes the reversible isomerization of fructose-6-phosphate (F6P) and mannose-6-phosphate (M6P), the first committed step in the synthesis of mannosylated glycoproteins. The active site, located within the N-terminal jelly roll-like beta-barrel cupin fold, contains a single essential zinc atom and forms a deep, open cavity large enough to contain M6P or F6P. PMI type I also has a C-terminal beta-barrel fold which has diverged considerably from the N-terminal domain and is not included here. This subfamily contains an alpha helical domain that is found in eukaryotic and some prokaryotic PMIs but is not present in their archaeal counterparts. F6P is a substrate for glycolysis and gluconeogenesis, while M6P is a substrate for production of activated mannose donor guanosine 5'-diphosphate D-mannose, an important precursor of mannosylated biomolecules such as glycoproteins, bacterial exopolysaccharides and fungal cell wall components. PMI is also essential for survival, virulence and possibly pathogenicity of some bacteria and protozoan parasites, as well as for cell wall integrity of certain yeasts. Thus, PMI is a potential target against fungal infections causing serious illness or death.	3.84513e-85
NZ_CP040863.1|WP_164028749.1|2517859_2520451_+|bifunctional-uridylyltransferase/uridylyl-removing-protein-GlnD	gnl|CDD|234980	PRK01759, glnD, bifunctional uridylyltransferase/uridylyl-removing protein GlnD.	0
NZ_CP040863.1|WP_164028753.1|2536305_2536776_-|tRNA-(adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase-complex-ATPase-subunit-type-1-TsaE	gnl|CDD|182615	PRK10646, PRK10646, tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex ATPase subunit type 1 TsaE.	3.48539e-67

Protein sequences

>NZ_CP040863.1|WP_164028753.1|2536305_2536776_-|tRNA-(adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase-complex-ATPase-subunit-type-1-TsaE
MNELTQYIPDESTMLRFGKKLAETILKCHTERAVILYFNGDLGAGKTTLTRGMVQGLGFQGNVKSPTYTLVEEYNITGKMIYHFDLYRLADPEELEFMGIRDYFAKDSICLIEWAEKGEGILPPADLFVNIDYYDDARNVTLIAQNALGEQIIQQL
>NZ_CP040863.1|WP_135968826.1|2534778_2536287_-|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein
MNTKFSFFLGIIFSLFASTAFAAQWTIAIDPGHGGKDPGAIGRNLGIYEKNVTLSIARELKALLDKDPNFRAVLTRNGDYYISVPERSEIARKFKANYLVSIHADSSLNPNQRGASVWVLSNRRANDEMGQWLEDDEKRSELLGGAGKVLSHNNDKYLDQTVLDLQFGHSQRTGYEIGRHILRRFSKITTLSRSTPQHASLGVLRSPDIPSVLVETGFLSNAEEEQKLNSPTYRRRIAYMIYEGLVAYRNGNLKSLVAFENDDKENSGKTNRTLLTKDSLIRHKVKNGESLGSLANKYDVKIADIVALNNLKRKALWVGETIKIPDNGKHKKPEETDSVDKKTNDKNTEKTDRTSEVKDSGIRHKVKNGESIGSLANKYDVKVTDIIQLNKLKRKELWIGETIKIPNNGKNQKIVEAQKAEKTTIKPADKKDSPKTDTDEKKKSKTDGKKADIPLYHTIKKDQTIYAVSREYNIPVKQILKLNPTLKNGKVITGQKIKLREK
>NZ_CP040863.1|WP_164028752.1|2532895_2534779_-|DNA-mismatch-repair-endonuclease-MutL
MAIKILSPQLANQIAAGEVVERPASVVKELIENSLDAGANKIQVDIENGGATLIRIRDNGCGIAKEELSLALARHATSKIADLEDLESILSLGFRGEALASISSVSRLTLTSRTAEQTEAWQVYAQGRDMETTVKPASHPVGTTVEVANLFFNTPARRKFLRTDKTEFAHIDEVIRRIALAKFNIAFTLTHNGKIIRQYRPATDLTQQLKRVSAICGEGFVKNALRIDWKYDDLHLSGWIATPDFSRSQNDLNYCYINGRMVRDKVITHAIRQAYAEYLPHESHPAFVLFIDLNPHEVDVNVHPTKHEVRFHQQRLIHDFIYEGINHALNNQPSLQATLPQQSADKHLRENDIKEPAPTYGTSWANKPNRASAGQNMFTQNVSAEKPMQNPPHFSRDNRTSHQGSPDYRENYRSEKPSKTEQRLYGELLGSTKDNDNLVQPKTSEQVVEKNENPTHLRALSLIENRALLLQQNQHHFLLSLEKLQQLQWKLALQQPQIELQPLLIPIVFHLTEKQFSQWEKVAENFAQAGFEFIENKPQRRLTLNKVPRFLRTQNLQKCVMTILNHSENSAPFSTALCSQLESKTVTVFADAVNLLSDIERLLNNTNRAEFDQLLKPIHWQPLLDEL
>NZ_CP040863.1|WP_164028751.1|2531959_2532895_-|tRNA-(adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase-MiaA
MKPTAIFLMGPTASGKTDLAIQLRQHLPVEIISVDSALIYKGMDIGTAKPSKEELALAPHRLIDILDPAESYSAMNFRDDALREMADISAQGKIPLLVGGTMLYYKALLEGLSPLPSADDTIRAEIERKAAQQGWVALHHELAQIDPISAQRINPNDSQRINRALEVFYITGQSLTNLTAQKGEALPYHILQFAIAPEDRHILHTRIEQRFHKMIDLGFQEEVEKLYARGDLSVNLPSIRCVGYRQMWEYLQGDYDHKEMIFRGICATRQLAKRQITWLRGWKTPIQWLDSLQPTQAKEKVLQLVDQNIKS
>NZ_CP040863.1|WP_164028750.1|2529012_2531955_-|bifunctional-[glutamate--ammonia-ligase]-adenylyl-L-tyrosine-phosphorylase/[glutamate--ammonia-ligase]-adenylyltransferase
MTALLSLSKQKLTALGIILCQSFPEIDANGVTQTIQQHQEDKNHPIGRLGYAVAMSDFVEKVLQKQPHLLAQWWETSPTFSDCEQYQERLNSELSAISDEAEFYKTLRFFRNTEMAKLSFCQSLNLATVEEIFIRLSELAESLIIGARDWLYRQACAEMGTPVDEQGNPQPLYILGMGKLGGFELNFSSDIDLIFTYPSQGETRIEGSNARKSVDNAKFFTRLGQRLISALDDFTADGFVYRTDMRLRPFGESGALALSFAAMEQYYQDQGRDWERYAMIKGRILGEKSDDPNSLYLQKMLRPFVYRRYIDFSVIQSLREMKGKIEREVRRRGLKDNIKLGAGGIREVEFIAQVFQLIRGGREIALQQHSLLKILPEITKLGLISQTQHHALHESYLFLRRVENILQAINDQQTQTLPTNEIDQQRLITACRNFTSFNEQNIAIQRTYPMENWQDFYCTLQQMQEKVRSVFDHLIGEENDENNDKENQWQDFLEADFDEITQMLEESSIQSDYISEILDKLGQFKESLKRRIIGNRGQDVLAQLMPKIFSLIFKQESDRTLLSRMLHIIEKISSRTTYLELLLENPQALQQVVNLCAKSQLIADQLARHPILLDELLNTESLRNPIPFTQYPNELQQYLLRLPEEDEEQFIDALRQFKQAILLRVAAADILGVLPVMKVSDHLTYLAEAIIASVINLAWKQVSTRFGVPQHLQDGEKGFLVIGYGKLGGIELGYKSDLDLVFLYKAVESQTIGGKKIIDSNQFYLRLAQKIVSIFSLNTSAGVLYDVDMRLRPSGDAGLLGCSLEAFENYQLNEAWTWEKQALVRSRAVFGDEPLRQKFEQIRQKVLATPRDVIQLKMDIQEMREKMYQTLSKPKEGEFNIKTDRGGITDIEFIAQYLMLAHAPQNPRLTKWSDNVRIFDDMASVQVISVSDCEKLKQCYVDLRNKIHHLNLIGQPPIVSDSEFCKEREFIQSFWQNLFG
>NZ_CP040863.1|WP_059366743.1|2521897_2522962_+|UDP-N-acetylglucosamine--undecaprenyl-phosphate-N-acetylglucosaminephosphotransferase
MLSLIVTFLGAFLTLMVMRPIANKIGLVDKPNYRKRHQGAIPLIGGVSLFMGNLCYYLMEWDQLRLPYLYLFSIFVLLAIGILDDRFDISPFLRAGIQSLLAILMIDLGNVYLDHFGQILGPFQLTLGSIGLVITVFATIAIINAFNMIDGIDGLLGGLSCVSFAAIGILMFRDGQMDMAHWSFALIAAMLPYLMLNLGIPLGTKYKVFMGDAGSTLIGFTIIWILLLSTQGKGHPMNPVTALWIIAIPLIDMVSIIYRRLRKGKSPFRPDRLHVHHLMVRAGLNSRQAFLLITFFAAVCAAIGILGEVYYVNEWIMFIGFIILFFLYAYSITKAWKITRWIRRTKRRARRNKG
>NZ_CP040863.1|WP_059366745.1|2520491_2521775_-|glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase
MTNSTALFSRAQQIIPGGVNSPVRAFKGVGGTPIFIQKAQGAYIYDTDNKPYIDYVGSWGPMILGHNHPTILNAVLKAAENGLSFGAPTPSEIDLAELVCQLMPSIEMVRMVSSGTEATMTAIRLARGYTGRDKILKFEGCYHGHSDSLLVKAGSGALTLGQPSSPGVPEDFAKHTLTAEYNNLDSVKQLFEQFPDSIACVIIEPVAGNMNCIPPKAGFLQGLRELCDNYGALFIIDEVMTGFRVALAGAQSYYGVTPDLTTLGKVIGGGMPVGAVGGKKAVMEYLAPTGPVYQAGTLSGNPIAMAAGLACLNELKKAGNEQKLTEKTEKLCVGLKALAEKYNVPFVVNYVGGMFGIFFTDQKEVTSYAEVMKCDTEKFKIFFHKMLDLGVYLAPSAFEAGFMSLAHTDEDIAKTLEAADIAFRSLA
>NZ_CP040863.1|WP_164028749.1|2517859_2520451_+|bifunctional-uridylyltransferase/uridylyl-removing-protein-GlnD
MTLFPFEPHSLFTPSAVKIQRENLKEFEREHFSQYSIFELIKNRCDFYDALLRKLWDEMGLSGQPQLSLIAVGGYGRQETFPLSDLDFLILTERELNPNEKEKIAKFVQFLWDCGFEVGHSVRTLAQCDSDGKQDITIATNLLEARFLVGNLPHFEALCELVKRDEFWAKEAFFNAKVQEQSERYQRYHNTAYNLEPDIKYSPGGLRDLHLLYWVALRHTGALTLEAILQSGFIYPQEYLQLQESQAFLFKVRFALHLILKRYDNRLLFDRQIKVSELLGFQGEGNQGVEKMMKRFFQALHRISLISNILIQHYREHFLSPLYDVFIHQLDDDFDLINERLCLRKPDLFFHQPERILDLFFYLTQFEQATIHSETLRKLQLALEQLPNKLCEIPAAREKFLRLFNQKNAISRAFIPMHQYGVITAYLPQWQAIEGLMQFDLFHIYTVDEHTLRVMLKLESFSHKETESEHPICYQIVSRLSDRTLLYVAALFHDIAKGRGGDHAVLGAADVAEFARLHGFDRREINTLSWLVEAHLLMSITAQRRDIYDPEVVMNFAETVQNQVRLDYLTCLTVADICATNGSLWNSWKRSLFSSLYDSTKQQFSQGMVALLDYSEKLEENRRLAMAILQADFPTMSEEKIHQLWARCPDEYFLRNSAKQIAGHSALLVDFSGELLVKVTNRFSFGGTEVFIYCRDQAQLFNKVVSTIGVKKFSIHDAQIITAQDGYVFDSFIITELNGELVKFDRRRELENALIQVLHSDKYQQSRIFPNRQLQHFTVRTEVRFLHESKTEHTEMELVALDKPGLLAEISQIFNALHLTLFNAKITTVGEKVEDFFILRNRMNKALTLEERTHLREVIERRI
>NZ_CP040863.1|WP_059366751.1|2516979_2517786_+|type-I-methionyl-aminopeptidase
MTIPLRTEKEVIKLREACKLASDVLVMIEPYVKAGVTTGELDRICHEYMVNEQKVIPACLNYHGFPKATCISINEVVCHGIPSSDKILKNGDIVNIDVTVIKDGYFGDNSKMYIVGGETNIRSKKLVEAAQEALYVGLRTVKPGIRLNEIGKSVQKYTESQGFSVVREYCGHGIGTEFHCEPQVLHYYADDGGVILKPGMVFTIEPMINAGKKEVRVMADGWTVKTKDRSHSAQYEHQIVVTENGCEVMTIRDEEIAEGRIQRIMVNI
>NZ_CP040863.1|WP_059366753.1|2516512_2516857_-|iron-sulfur-cluster-insertion-protein-ErpA
MTDNIAVPLTFTDAAANKVKSLISEEENSALKLRVYITGGGCSGFQYGFTFDEKVNEGDLTIEKSGVQLVIDPMSLQYLIGGTVDYIEGLEGSRFVVDNPNATSTCGCGSSFSI
>NZ_CP040863.1|WP_164028754.1|2537192_2537741_-|oligoribonuclease
MQLDKQNLIWIDLEMTGLEPDKERIIEIATIVTDKDLNILAEGPVLAIHQSDDLLGKMSEWCVKTHTANGLVERVKASKLTERAAELQTLDFLKRWVPKGASPICGNSVAQDKRFLYRYMPDLADYFHYRHLDVSTLKELAARWKPEILEGFKKANTHLALDDIRESIKELAYYRDHFIKLD
>NZ_CP040863.1|WP_164028755.1|2537811_2538852_+|small-ribosomal-subunit-biogenesis-GTPase-RsgA
MAKRKLTQNQFRRIEFNNARTLHRHKKREIEWQDEMLGVSQDGLVVTRYSMHADVENAQGEIYRCNLRRTLSSLVVGDRVIWREGNEQLQGVSGVIEAIHPRVNEILRPDYYDGLKPIAANIDCIIIVSAVLPVFSLNIVDRYLVVCEISGIEPVIVVNKGDLLTDEEEKNIEQQLQIYRDIGYQTLIISASNGKNMEKLTALLSSGTSIFVGQSGVGKSSLINAIFPNVNAQVGEVSENSGLGQHTTTSSRLYHLPQGGNLIDSPGIREFGLWHLDADQITKGYREFQYILGTCKFRDCKHLNDPGCALREAVETGKISQIRYENYHKLIASLSETKSQRHFSTS
>NZ_CP040863.1|WP_164028756.1|2539013_2539271_+|phosphocarrier-protein-Hpr
MFSKDVEITAPNGLHTRPAAQFVKEAKGFASDITVTSAGKSASAKSLFKLQTLGLTQGTVMTISAEGEDEQQAVEHLVALIPTLE
>NZ_CP040863.1|WP_059365483.1|2539375_2541103_+|phosphoenolpyruvate-protein-phosphotransferase-PtsI
MISGIPASPGIVFGKALVLKEEKIVLDTKSISDDQIETEIARFYEGRNAAVEQLNSIKDRAFASLGEEKAAIFEGHLMILEDEELEEEIIDYLRSHKVNAGVAASKIIDQQVAMLSEIDDEYLKERAGDIRDIGNRLIKNILGMHIVDLGDINEESILVAYDLTPSETAQLNLEKVLGFITDIGGRTSHTSIMARSLELPAIVGTNNVTEKVNTGDFLILDAVNNKVYINPTEAQINELKSLEAKLAEEKAELAKLKDLPAVTLDGHKVEVVANIGTIRDCDGANRNGAEGVGLYRTEFLFMDRDQLPTEEEQFIAYKEVVEAMDGRLVVLRTMDIGGDKDLPYLDLPKEMNPFLGWRAIRIALDRREILHAQLRAVLRASAFGKLAVMFPMIISVEEIRELKSVIETLKVELRAEAKAFDENIQIGVMVETPSAAVNAKFLAKEVDFFSIGTNDLTQYTLAVDRGNELISHLYNPMQPSVLGLIKQVIDASHAEGKWTGMCGELAGDERATLLLLGMGLDEFSMSAISVPRIKKLIRSVNFQEVKELASKALEKPTASEIEQLIEEFLSEKALS
>NZ_CP040863.1|WP_059365482.1|2541162_2541663_+|PTS-glucose-transporter-subunit-IIA
MGLFDKLFGSKENKSVEVEIYAPLSGEIVNIEDVPDVVFSEKIVGDGIAIRPTGNKIVAPVDGVIGKIFETNHAFSMESKEGVELFVHFGIDTVELKGEGFTRVAQEGQTVKRGDTVIEFDLELLEAKAKSVLTPVVISNMDEISSIEKKAGEVIAGESVVLSLKK
>NZ_CP040863.1|WP_164028757.1|2541720_2542920_+|mannose-6-phosphate-isomerase,-class-I
MIYKLTGVLQHYIWGGQHYIPQLLNLSVEENQHYAEWWLGAHISAPSIIEVEGKHLPLTEFLQQNPPALGEKSREIFGEELPYLLKILDVAKPLSIQLHPTKQQAEIGFAKENAKGIDLKDSKRTYKDNNHKPEMMIALSDFWLLHGFKAKEKILSSLNERPSLAPLAEKLGNQDLHSFYADVMQADQSQLYQWLAPIVEQNREAYAQNELRLNNPDYWLLYSMEAMEISLEKLDAGLVCFYLFNIVHLKKGEGIYQEAGIPHAYLRGQNIELMACSDNVIRGGLTPKYVDIPELLKVVDCREIEPQIISAAPHDMRVFTYSTPAKDFALQNIQYECGETHRLKIQSAGILMVMKGQLNLRSETTALSLKKGESAFITSGSSYEIEGLSEGYAVIAKLP
>NZ_CP040863.1|WP_164028758.1|2543056_2546101_+|beta-galactosidase
MPLPNYFQDPQILHINTTPHHAYFIPFDSVESAVKNQREFSAFFTLLNGEWDFAYFDRYVDLPKDFLHFSFSEKIPVPANWQNHGYDHHHYTNVNYPFPFDPPYVPIENPCGLYHRTFTHSPKQNKRYLLNFEGVDSCLFVYVNHQFVGYSQISHCTSEFDVSDFLKNGENHLHVVVLKWCDGSYLEDQDKFRMSGIFRDVYLLERENHYLQDFFIRTELADDLKSAVISVEVSFMERGKPAHLREIAWQLNDPQGEILLSAVTESGFHFTLNEITLWNAENPQLYTLLFRYGSEVICQKIGLRKIEVKDGVMLFNGEAIKFKGVNRHDSDPKTGYVINHEQALQDLRLMKEHNFNAIRTAHYPNAPWFTELCDEYGFYLIAESDIESHGTNAVYVKSPETSILLGVKTEIDHQAIRQQIIDNYCYMARSPEFNAAILDRTYANVERDKNRCSVLVWSLGNESGYGENFEQAAAWVKRRDPNRLVHYENAVFQHSDHQNDLTNLDFHSEMYTATEELDAYFADPHNRKPYLFCEYLHAMGNSCGDAEDYFQAMECHRGAAGGFVWEWCNHSPYLPHSERMGYGGDFADVPNDGNFCADGLVTADRQIQSNLLELKNVQRPIRAFLDEGNVRLKNYMDFTDTEEVIAIHYQITENLRVISEGYFDGIKITPKATALLPLDLPETDNELWHITLTYYQKIDRGLVAKNHCLGFDQLCFSSQSRLPVHQIKKATQTISLNETPHHVLISVGKICYELDKHRGIITQIFCEGSAWLNAPLDFNIWRAPLDNDSLIKTHWLAAGYEQAVTRAYDFVIVEQESALEIRVKSGINAVSRERILTLDVIYRIDTQGNLSIKIHAKKQPHLPFLPRFGVRFFLKDGFQQAEYIGYGETESYLDKHQATQFNLYKTTPKSNHVLYLKPQENGSHFGCQRFTIKNDREGFSIYCDKAFSFNLSPYTQEELEAKKHNDELEESGSTILCVDYKMSGIGSNSCGPSLKEKYRLSETEWDWEMQFLPR
>NZ_CP040863.1|WP_059365479.1|2546166_2547441_-|citrate-synthase
MPNLHPTLTAELHLSDGRKIALPVYHGTLGYDAIGVEALQKQGLFTYDQGLTSTALCESSITYIDGDQGILLHRGYSIDELAFNKTYLHTAYLLLEGEMPTEEQLTEFKKEICSHYMVNDQFTRLFQGFRRDSHPMAVMCAASSALAAFYNNDFQTEKNIDRTAIRLLAKMPTLAAMCYKYSIGRPFMYPQYHLSYAGNFLYMMFATPCEPYIVNPVLERAMDRIFTLHADHEQNASTSSVRSVASSGSNPFACIAAGIASLWGPSHGGANEACVRMLEEIGTVDRIPEFIARAKDKKDPFRLMGFGHRVYKNYDPRAKVMRETCHEVLQELGITTPLLEVAMELEHIALSDPYFIERKLYPNVDFYSGIILKAIGIPVSMFTVIFALGRTVGWIANWKEMNEENLKIVRPRQIYTGHQERHLK
>NZ_CP040863.1|WP_164028759.1|2547470_2550074_-|bifunctional-aconitate-hydratase-2/2-methylisocitrate-dehydratase
MSFLTEYQTHVDQRAAQGVVPLPLNAQQTAELVELLKNPPPENQNLLVELFESRIPTGVDEAAYVKAAFLADLIKGNTQSPLISPQKAVQLLGTMQGGYNIEPLIDTLEIDKLAPLAVKALSHTLLMFDNFYDVAQKAKQGNTYALQILQSWADAEWFLSRPQLAEKLTYTVFKVSGETNTDDLSPAQDAWSRPDIPLHALAMLKNSREGIKPDEAGAIGPMRQIESLKQKGFPLVYVGDVVGTGSSRKSATNSVLWLMGEDMPYIPNKRTGGIVLGGKIAPIFFNTMEDAGALPIELDVSQLNMGDVIDIYPYAGKVCKHNTDEVLSTFKLKTDVLLDEVRAGGRIPLIIGRGLTHKARVELSLPESDVFAKPQVSNKNNKGFTLAQKIVGRACGVTGIRAGQYCEPRMTSVGSQDTTGPMTRDELKDLACLGFSADLVMQSFCHTAAYPKPVDVITHHSLPDFIMNRGGISLRPGDGVIHSWLNRMLLPDTIGTGGDSHTRFPIGISFPAGSGLVAFAAATGVMPLDMPESVLIRFTGEMQPGITLRDLVHSIPYYAIQQGLLTVEKAGKKNIFSGKILEIEGLEHLKVEQAFEISDASAERSAAACSIKLNKEPIIEYLNSNIVLLKWMIAEGYGDKTTLERRIKAMQDWLANPQLLEVDKDAEYAAVIEINLNDIKEPIVCAPNDPDDARLLSEVQGDKVDEVFIGSCMTNIGHFRAAGKLLNQHQGMIPTRLWIVPPTKMDAHLLSDEGYFSIYGKSGARIEVPGCSLCMGNQARVADGATVVSTSTRNFPNRMGKGAFVYLASAELSAVCALLGRIPTPEEYLQYVQSLDADKDDTYRYMNFDQIDYYSNKVNSLIFQKAV
>NZ_CP040863.1|WP_059365477.1|2550172_2551423_-|NADP-dependent-isocitrate-dehydrogenase
MQHKKVATANGQAITLNQDCTLNVPNNPIIPFIEGDGIGVDVTPAMRLVIDAAVSKAYGTERKIDWLEIYAGEKANQVYGENTWLPAETLNAIKQYHIAIKGPLMTPVGGGIRSLNVTMRQELDLYNCLRPVRYYDGTPSPVKHPEFIDMVIFRENSEDIYAGVEWQAGSIEADKVIAFLRNEMGVKKIRFTEQCGIGIKPVSKKGTQRLVRSALQYVIDNDRRSLTLVHKGNIMKFTEGAFKEWGYQVAQEFGAEMIDNGPWHKLKNPKTGREIIIKDCIADAFLQEVLLHPKDYDVIATLNLNGDYISDALAAQVGGIGISPGANIGVETAIFEATHGTAPKIAGQNKANPSSIILSGEMMLRHLGWTEAANLVVKAVAKTISNKTVTLDLAETLENAKLRSTMEFAQDIVSNM

MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
NZ_CP040863_1	1.1|2536983|41|NZ_CP040863|CRISPRCasFinder	2536983-2537023	41	CP022016	Salmonella enterica subsp. enterica serovar India str. SA20085604 plasmid unnamed1, complete sequence	202586-202626	8	0.805

1. spacer 1.1|2536983|41|NZ_CP040863|CRISPRCasFinder matches to CP022016 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar India str. SA20085604 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.805

tgtgctctaccaactgagctattcccgcagagagtacaaaa----	CRISPR spacer
cgtgctctaccaactgagctattcccgc----agtatcaagcaac	Protospacer
.***************************    ****. **.    

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	15745 : 24506	7	Erysipelothrix_phage(16.67%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_2	214435 : 236759	24	Escherichia_phage(25.0%)	capsid,terminase,integrase,tRNA	attL 209866:209884|attR 243984:244002
DBSCAN-SWA_3	310775 : 320380	16	Mannheimia_phage(55.56%)	integrase	attL 300251:300267|attR 312680:312696
DBSCAN-SWA_4	325917 : 396252	82	Mannheimia_phage(26.32%)	tRNA,tail,capsid,plate,lysis,terminase	NA
DBSCAN-SWA_5	438631 : 493102	51	Enterobacteria_phage(15.38%)	protease,tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_6	855529 : 916262	75	Mannheimia_phage(47.92%)	tRNA,tail,capsid,terminase,bacteriocin	NA
DBSCAN-SWA_7	920171 : 968033	55	uncultured_Caudovirales_phage(30.43%)	head,tRNA,portal,tail,capsid,integrase,terminase,protease	attL 926792:926813|attR 963384:963405
DBSCAN-SWA_8	1144525 : 1154649	12	Heterosigma_akashiwo_virus(14.29%)	tRNA	NA
DBSCAN-SWA_9	2062207 : 2105929	51	Morganella_phage(13.33%)	capsid,integrase,tRNA	attL 2056835:2056851|attR 2111431:2111447

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP040863|15745:24506|DBSCAN-SWA
AATGAGTAAAGAAATTAAAACCCAAGTCGTTGTACTTGGTGCCGGGCCGGCAGGCTACTCTGCTGCATTCCGTTGTGCAGATCTTGGCTTAGAAACAGTGCTTGTTGAACGTTATTCTACGCTTGGTGGTGTGTGTTTGAATGTAGGTTGTATTCCATCTAAAGCCTTATTACACGTTGCCAAAGTTATTGAAGAAGCAAAACATGCTGGAAAAAATGGTGTTTATTTTAGTGAGCCTAAAATTGATTTAGACCAAGTTCGTGCGGGTAAAGATGCGGTTGTTGCAAAATTAACCGGCGGTTTAGCGGGTATGGCGAAACAACGTAAAGTAACTGTAGTAGAGGGTTTAGCCGCTTTTACCGACCCGAATACCTTAGTTGCCCGTGATCGTGACGGTAACCCGACGACGGTAAAATTTGATAATGCGATTATTGCGGCAGGTTCACGTCCAATTGAGTTACCTTTCATTCCACACGAAGATCCGCGTATTTGGAATTCAACCGATGCACTTAAATTAAAAGAAGTACCGAAAAAATTACTCATCATGGGTGGCGGTATTATCGGTTTAGAGATGGGAACGGTTTATCACGCATTGGGTTCAGAGATTGAAGTAGTTGAAATGTTTGACCAAGTTATTCCTGCTGCGGATAAAGATGTTGTCGCTATTTATACCAAACAAATCGAGAAAAAATTTAAGCTAATGCTTGAAACCAAAGTCACCGCTGTTGAAGCTAAAGATGACGGTATTTATGTCTCAATGGAAGGTAAAGCTTGCAATGATACTAAACGTTATGATGCAGTTCTCGTGGCGATCGGTCGTGTGCCTAACGGCAAATTAATTGATGCGGGTAAAGCCGGTGTTGAAGTTGATGAGCGTGGTTTCATTCGAGTGGATAAACAAATGCGTACTAATGTACCGCATATTTTTGCGATCGGTGATATCGTAGGACAACCAATGTTAGCCCATAAAGGGGTTCACGAAGGTCATGTTGCCGCTGAAGTGATTGCGGGACAAAAACATTACTTTGATCCGAAAGTCATTCCATCAATTGCTTATACTGAACCGGAAGTTGCTTGGGTTGGTAAAACCGAAAAAGAATGTAAACAGGAAGGTTTAAATTACGAAGTCGCGAAATTCCCATGGGCAGCATCGGGTCGTGCGATTGCATCCGAATGTTCGGAAGGGATGACAAAACTTATCTTTGATAAAGATACACATCGCATTCTTGGCGGTGCGATCGTTGGTTCAAACGGTGGTGAATTGTTAGGTGAAATTGGTCTTGCTATTGAAATGGGATGTGATGCGGAAGATATCGCATTAACTATCCATGCTCACCCAACATTACACGAATCGGTTGGATTGGCTGCTGAAGTTTTTGAAGGGTCGATTACCGATCTTCCTAATGCAAAAGCAAAGAAAAAATAGTTAGTTTTTCATGATTAAAAGGCAATCTCTATGGATTGCCTTTATTTTTAGAAGCCATAGCATAAATTAGTGTAAAAATTCAATTTTAACTGTCTATTTTCCTTTATATCTGATAGTATCCCGAAAATCTTATTTTTATATCTTTTAATTATTTTCAATTTTTTTAGTATGTTAAAGCGATTTTTAATGCTTACCGGGATTGTTACCCTCGCCACCGCCTGTTCAAGCGGAAGCAATAATGCCTATCATAATAAAATTTCAGAGAGCGATGATGCACAACTCACCGGATTAATTAGTAAATTAGAAAAGGGTGATCGTAGTATTCGTCACACATTAAGAACAAACCGTCCTCATTCCGGTTTAATTGGTGATAAAGCGCTTGCCGGTGTTTATACAGAGTGGGCGGGAACACGCTATAGAATGGGCGGTACGAGTAAGCGTGGTATTGATTGTTCGGCATTTATGCAGACCACCTTTCTGAATGCTTACGGTATTAAACTCCCCCGTTCTACTGCGGAACTGCGTCATTTAGGGCATAAAATTAATAAACATGAATTACAAAAAGGCGATCTTGTTTTCTTCCGTGGTAATAACCATGTGGGGGTTTATATCGGCAATAATCAATTTATGCATGCCAGTTCGAGCCAAGGTGTTACCATTAGCTCTTTAGATGAAAACTATTGGACAAGAACTTATACCCAATCACGTCGCATTATGTAAAGTAAAGTGCGGTCGTTTTTAACCTATTTTTTAAGGCTAAATGAGATGGTAATTTCATTTAGCCTTTTCTTTTATGACGATTTTTATACCTCTTTCGGTCAGGAAATTTCCATTTTTTCCAGCGTTTTATGATAGAATTTGAACTCAAAAATATTGATATTATCTCACTTTATCATTGAGTCCTTTTATGAATAAACAACTTGAACTGATTAAATCTTCTATAAAATCTATTCCTAACTACCCAAAAGAGGGAATTATCTTTCGCGATATTACCTCATTGCTAGAAGTTCCGGAGGCCTTTAAAGCGAGTATTGATCTGATCGTTGAACAATACCGCAATAAAAATATTACTAAAGTACTAGGTACGGAATCTCGCGGTTTTATTTTTGGTGCACCGGTTGCGATTGCGTTGGCTTTACCTTTTGAATTAGTGCGTAAACCTAAAAAGTTACCCCGTGAAACAATTTCTCAATCTTATCAATTGGAATATGGACAAGACACCTTAGAAATACATGCTGATGCAATTTCTCCGGATGATAATGTATTAATTATTGATGATTTACTTGCAACAGGCGGAACCGTAGAAGCAACGGTTAAACTTGTCGAGCGTTTAGGCGGAAAGGTTAATCATGCGGCATTTGTGATTAATTTGCCTGAACTGGGCGGTGAGAAACGTTTAAATGATTTAGGCGTGGATTGCTATACTTTAGTTAATTTTGAAGGTCATTAACAATACAAACCAATGAGTTATCAAGTTTTAGCCCGAAAATGGCGTCCCCAAACCTTTGATGAGGTAGTCGGACAAGGGCATATTATTACCGCACTTTCTAATGGATTAAAAGAGCAGCGACTTCATCATGCCTACCTGTTTTCGGGTACGCGCGGCGTGGGAAAGACTTCTATTGCCCGCCTTTTCGCTAAAGGCTTAAATTGCATTAAAAACGGTATTACGGATCATCCGTGTGGCGAATGTGAAAATTGCAAAGCCATTGAGCAAGGCTCATTTATTGATCTTATTGAGATTGATGCGGCTTCACGGACAAAAGTGGAAGATACGCGCGAGTTACTGGATAACGTGCAATACAAACCGGTGGTTGGGCGTTTTAAAGTGTATTTAATTGATGAAGTGCATATGCTATCGCGTCATTCTTTTAATGCCCTGCTTAAAACCTTGGAAGAGCCGCCTGAGTATGTAAAATTTTTGCTTGCTACCACGGATCCGCAAAAACTGCCGGTAACAATTTTATCCCGTTGTATGCAATTTCATCTGAAAGCGCTGGATGAACAGCAAATTTCACAACATCTTGCATATATTCTCACCCAAGAAAATATTCCTTTTGAGCCATTGGCTTTAGATAAATTGGCGAAAGCGGCTCAGGGTGGAATTCGCGATAGTTTAAGCTTAACGGATCAAGCTATTGCAATGGGGGATCGCCATGTTACGGTAAACGTGGTGAATGCAATGTTAGGCTTACTTGATGATACTCAAGCCATTGATATTATTTATGCCCTGCATCAGGGAAACGGTGAACGTTTGATGAGAGTGCTTCAAACTGTTTCTGAAAAAGCCGGTGATTGGGATCAATTATTGGCGGAAGTGGCGGAAAAACTTCACCAAATTGCGTTAATGCAGCTATTGCCACAAAATACGGCGAGTGAAAACGAACACCTCACATTTCTTGCAAAATATATCTCACCGGAAGATGTTCAATTTTTCTATCAAGTGATTGTTTCCGGTAGAAAAGAACTGAGTGCTGCACCGAATTATCGTGTAGGCGTGGAAATGACATTATTGAGGGCATTGGCATTTCACCCAAAGTTTCTTACGGCAACACCTAAGGCGAATTTATCTGCCGAGGCGGCACTTTCTGTTGGAAAAGGTGCGGCTGAGAATTCGGGCAATTATATTGATATGCCGGTGTTGTCGCAAAATATTAAATCCAACTATAAGAAAACGAAATCCGTTCAACCTACTTCCTCGAAGCATAAAGAAACAAATTTTGTCGGACTGGCGGCATTAGAAGCCTTAAAACAACTTGATCAAATTGAAACGAGTGAACGACAAGCCCGTCAAAAAGAAATGGATGAGGCGGTGAATAAGGCAATACATCAGGTACAAACACTTGATGAACAAAAAATACAGCGAAAAATGACCGCACTTCCCGTGCGTGAAATGACACCTCCCAAAAAAGTAGTGCAGTCAGGTTCAAAAAACGTGTCGGAGATACCCAAAAATGTTCAAACTATGATGAACATAGTGGAAGATCATTCTGACTTGGAACAGGAAGAGCGGGAAATTATTGAGGCGGAAAATTATCGGTGGGAGTGGAGTAATCCCGAATTGGCAAAAGAGACGCTAACCATTGCACCTTCCGATATTAAACAAGCCATACTGAAAGATATTACTCCGGAGTTGAATTCCCGTATTATTGAAATGACACAAACCCAAGATGAATGGGCTAATATTGTGGAAAGTTCGGGAGTGAGCGGTTTTTCGAAAGAATTGGCATTAAACTGCTTTTTATTGGATAAAACCGAAGAAAAAATCTATCTGGGGCTTCATTCAACAAAAGCGCATTTACGCCAAGAACGTAGTATTCATTTATTGGCAGAAGCACTGAGCCAATTTTATGAAAAATTGATAACCATTGATATTCAATTGGATGATCGGGATAGTGCAACGCCAATGGTTTATCGTAAAAAAATTTATCAAGATTTACGGGAACAAGCCCGTGATGAACTTCAACAGGATAAAAAACTCCTTCTCCTACAAAAAGAATTTGATGCGAAATTAGATATTGAGAGTATTCGTCCTGTTTAGGTTTCATTTTAAAAGTAGCTGTAAAATAGTAAGAAAACAAACCGCACTTTATGGATTTAGGGAATACAAAAGTGAGGTTTTTTGTGGGGAAATTTATTAAATTGGTTTTTTTGATTAATTTAATAGATTTTAATAGTTGAAACCTTTCTATATAATGCGAAGGAAATTTACTTCAACTTAATAAAGAGGAGCATCTCATGACGTCAAAATGTCCATTTTCTCATTCAACACCTTTAACAATGGGAAACGGCGCACCTGTTGCCGATAACCAAAACAGCTTAACAGCCGGCCCTCGAGGACCATTACTTGCGCAAGATTTATGGCTTAATGAAAAATTAGCGGATTTCGTCCGTGAAGTTATTCCTGAGCGCCGTATGCACGCAAAAGGTTCTGGCGCCTTTGGTACATTCACCGTAACCCATGACATCACCAAATATACCCGTGCTAAAATCTTCAGCGAAGTGGGTAAAAAAACTGAAATGTTCGCACGTTTCACCACTGTGGCAGGTGAACGCGGTGCGGCAGATGCGGAACGTGATATTCGCGGTTTTGCATTAAAATTCTATACGGAAGAAGGTAACTGGGATATGGTGGGTAACAATACACCGGTATTCTTCTTACGTGATCCGCGTAAATTCCCTGATCTAAACAAAGCGGTAAAACGTGATCCTCGCACTAATATGCGTTCAGCGACCAATAACTGGGATTTCTGGACATTGTTACCTGAAGCGTTACACCAAGTAACTATTGTGATGAGTGATCGTGGTATTCCGGCAAGCTATCGTCATATGCACGGTTACGGCTCGCACACTTATAGCTTCTGGAACGAAGCGGGCGAACGTTTTTGGGTGAAATTCCATTTCCATACTCAACAAGGTATCAAAAACTTTACAAATGAAGAAGCGGCAGAGTTAATCGCAAATGATCGTGAAACCCATCAACGTGATTTATATGAAGCGATTGAACGTGGCGATTTCCCGAAATGGAAAATGTTTATCCAAGTTATGCCTGAAGCAGACGCGGAAAAAGTACCTTACCATCCGTTTGATTTAACCAAAGTATGGCCGAAAAAAGATTATCCGTTAATTGAAGTCGGTGAATTCGAACTTAATCGTAATCCTGAAAACTTCTTTGCCGATGTGGAACAATCCGCATTTGCACCGAGCAACTTAGTACCGGGAATCGGTGCAAGTCCGGATAGAATGTTACAAGCCCGTTTGTTCAACTATGCGGATGCACAACGTTATCGTTTAGGCGTGAACTACCGTCAAATTCCGGTTAACCGCCCTCGTTGCCCTGTTCACAGCAACCAACGTGATGGTCAAGGTCGTGTCGATGGTAATTATGGCGGCTTACCGCACTATGAGCCAAACAGCTTTAATCAATGGCAACAACAACCGGATTTCGCAGAGCCGCCACTTCGCATTAATGGTGACGCAGCATTCTGGGATTATCGCCAAGATGATAACGATTATTTCAGCCAACCGCGTGCATTGTTTAACTTAATGAAAGCAGAACAAAAACAAGCTTTATTTAACAATACGGCTGCTGCTATGGGCGATGCGCCTGATTTTATTAAATATCGTCATATCCGTAACTGCCACTGGTGTGATCCGGCATACGGTGAAGGTGTTGCGAAAGCATTAGGTTTAACGGTAGAAGATGCGTTGAAAGCTCGTGATACCGATCCTGCGTTAGGTCAAGGCGGTTTATTATAATAGCTTTGTAACCTTTTTAAGAAAAACAGTTGATGTCAAAACGGCATCAACTGTTTTTTTATTAACGTGCGGTTAGAAAATAAAATTTTTTCTGACCGCACTTTGGTTTTATTTATTGTGCGGATAACATTGGGTAGGCTTTAATAAAATCCGGCAATCGATAGGCTTTGCTAAAAATTAAGGTGTAATTATTACGATCATTGTTTACCGCAACCGTCTCGGGGATTGGCTCGTCCAAACCGAACCGCCAAGGTTGATTGCCTATACGTGTAATCAAATATTCATTGCTGATCTCAATAGGGCCTTCATAGGATTTCCCATCTATTGTGATTATTTTATATTCAATAGGCAGATTGACCGATCCGTAAACTGTTTTCCAAAAGAAATAAGGCGACGCGGTCGGGTTTAAAATAGAGCGATTTGTTCCTGCTTTTTGTGTTAGTTCAACCACTTTGCCGTCAGATAATGCTAAATGATGTTGCCCCGGTTCTAAGATGAGCTTTTGCGTTTGATGAGCAGCAAGAGTGATTTCTTTTTCATCTAGTTTAAACGTCACGCTATGATCGGTCGGATTATCTGCATAAACGATATTTTTATCGTACCATGCCGTTAAATCCTCCGCTTCAAATGGGAAATATTTTGCGATAATCGAAACCACAAAATTTCGTTTACCGTCATCGGCATTGTCAGCTGTTGCTGATGTTTGCACAAAAGCTACGCCGACCAAAGCGACGATAATACTGAGTAACATAATCAGTTTTTTCATAGAATTCTCCTAAAAATAACCGCACTTTATTGCTGATAAGTGCGGTTGAAATAAAGATTATTTTCTTGTGGTGTAATTTCCTTCACAGACCCATTTATAGGTAGTAAGTGCTTCTAATCCCATTGGACCGCGTGCATGGAGTTTCTGGGTGCTGACGGCGACTTCCGCCCCTAAGCCAAATTGTCCGCCATCCGTAAAGCGGGTACTCGCATTCACATAAACCGCAGCGGCATCCACTTGGCTTACAAATTTCTGCGCCACGGTTTGAGAGGCGGTTAAAATACTTTCGGAATGTTGCGTGCCGTATTCACGAATATGGGCAATTGCTGCCTGAATATCCTTTACTATCACCACATTTAAATCAAGAGAGCCCCATTCTTCACGTAATTGTTGCTCGGTGATTTCATCTACCGTTGCTCCGGTTTGTTTTAATATTTCAAGTGCGGTTGATTTTGCGTGATATTTTACGTTTTTCGCTGTAAGTTGAGCCACAAGTTTAGGTAAAAATTCAGCGGCGATAGAATCTTGCACGAGTAGGGTTTCTAGGGTGTTACAAGTGCTTGGACGTTGGGTTTTCGCATTGTCGATAACGAGAACAGCCTGATTTTGATCCGCACTTTCTTCCACAAAAGTATGACAAACGCCCACGCCGCCGATAATCACCGGAATGGTGGCGTGTTGTTTACAAAGCTCGTGTAAGTTTGCCCCACCACGCGGAATAATCATATCCACATAGCGATCAAGTTTTAATAATTGCATGACGAGATCACGATTAGGATCGGTAATCGCTTGCACGGCAAATTTAGGTAACCCAGCTTGCTCAAGGGCGTTTTGCACCACCTTCACTAAAATATTATTGGAAAATTGGGTTTCTTTTCCCCCTCGTAAAATGACGGCATTGCCCGTTTTTAAACAAAGGCTTGCCACATCAATAGTAACATTTGGACGTGCCTCATAAATAGTACCGATTACCCCAATCGGCGTGCGGATACGTTCGATTTTTAAACCGCTATCCAATGTTCCCCCATCAATAATTTTACCCACAGGATCGGCAAGCGAAATCACATGACGTACGTCATTGGCAATGCCTTGTAAGCGTTCCGGAGTGAGTTGAAGACGATCAATCAACGCTTCAGACAGTCCGTTTTGCTTTGCCAGTTCAATATCCTTTGCATTCTCGGTTAAAATACGATCTGCTTGCTGTTCTAATTGTTCGGCAATAATATTTAAGGCATTGTTTTTTTCTGCGGTACTTAATTGTGCTAACACAAAAGCCGCTTCTTTGGCTTGTTTTCCCATCTGTTCTAACAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP040863|15745:24506|18632_20711_+|WP_164027400.1|DBSCAN-SWA
MSYQVLARKWRPQTFDEVVGQGHIITALSNGLKEQRLHHAYLFSGTRGVGKTSIARLFAKGLNCIKNGITDHPCGECENCKAIEQGSFIDLIEIDAASRTKVEDTRELLDNVQYKPVVGRFKVYLIDEVHMLSRHSFNALLKTLEEPPEYVKFLLATTDPQKLPVTILSRCMQFHLKALDEQQISQHLAYILTQENIPFEPLALDKLAKAAQGGIRDSLSLTDQAIAMGDRHVTVNVVNAMLGLLDDTQAIDIIYALHQGNGERLMRVLQTVSEKAGDWDQLLAEVAEKLHQIALMQLLPQNTASENEHLTFLAKYISPEDVQFFYQVIVSGRKELSAAPNYRVGVEMTLLRALAFHPKFLTATPKANLSAEAALSVGKGAAENSGNYIDMPVLSQNIKSNYKKTKSVQPTSSKHKETNFVGLAALEALKQLDQIETSERQARQKEMDEAVNKAIHQVQTLDEQKIQRKMTALPVREMTPPKKVVQSGSKNVSEIPKNVQTMMNIVEDHSDLEQEEREIIEAENYRWEWSNPELAKETLTIAPSDIKQAILKDITPELNSRIIEMTQTQDEWANIVESSGVSGFSKELALNCFLLDKTEEKIYLGLHSTKAHLRQERSIHLLAEALSQFYEKLITIDIQLDDRDSATPMVYRKKIYQDLREQARDELQQDKKLLLLQKEFDAKLDIESIRPV
>NZ_CP040863|15745:24506|17338_17890_+|WP_059365418.1|DBSCAN-SWA
MLKRFLMLTGIVTLATACSSGSNNAYHNKISESDDAQLTGLISKLEKGDRSIRHTLRTNRPHSGLIGDKALAGVYTEWAGTRYRMGGTSKRGIDCSAFMQTTFLNAYGIKLPRSTAELRHLGHKINKHELQKGDLVFFRGNNHVGVYIGNNQFMHASSSQGVTISSLDENYWTRTYTQSRRIM
>NZ_CP040863|15745:24506|18077_18620_+|WP_077582336.1|DBSCAN-SWA
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MLEQMGKQAKEAAFVLAQLSTAEKNNALNIIAEQLEQQADRILTENAKDIELAKQNGLSEALIDRLQLTPERLQGIANDVRHVISLADPVGKIIDGGTLDSGLKIERIRTPIGVIGTIYEARPNVTIDVASLCLKTGNAVILRGGKETQFSNNILVKVVQNALEQAGLPKFAVQAITDPNRDLVMQLLKLDRYVDMIIPRGGANLHELCKQHATIPVIIGGVGVCHTFVEESADQNQAVLVIDNAKTQRPSTCNTLETLLVQDSIAAEFLPKLVAQLTAKNVKYHAKSTALEILKQTGATVDEITEQQLREEWGSLDLNVVIVKDIQAAIAHIREYGTQHSESILTASQTVAQKFVSQVDAAAVYVNASTRFTDGGQFGLGAEVAVSTQKLHARGPMGLEALTTYKWVCEGNYTTRK
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MSKEIKTQVVVLGAGPAGYSAAFRCADLGLETVLVERYSTLGGVCLNVGCIPSKALLHVAKVIEEAKHAGKNGVYFSEPKIDLDQVRAGKDAVVAKLTGGLAGMAKQRKVTVVEGLAAFTDPNTLVARDRDGNPTTVKFDNAIIAAGSRPIELPFIPHEDPRIWNSTDALKLKEVPKKLLIMGGGIIGLEMGTVYHALGSEIEVVEMFDQVIPAADKDVVAIYTKQIEKKFKLMLETKVTAVEAKDDGIYVSMEGKACNDTKRYDAVLVAIGRVPNGKLIDAGKAGVEVDERGFIRVDKQMRTNVPHIFAIGDIVGQPMLAHKGVHEGHVAAEVIAGQKHYFDPKVIPSIAYTEPEVAWVGKTEKECKQEGLNYEVAKFPWAASGRAIASECSEGMTKLIFDKDTHRILGGAIVGSNGGELLGEIGLAIEMGCDAEDIALTIHAHPTLHESVGLAAEVFEGSITDLPNAKAKKK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_059365419.1|15745_17170_+	dihydrolipoyl dehydrogenase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	1.7e-43	27.5
WP_059365418.1|17338_17890_+	endopeptidase	S5MM68	Bacillus_phage	1.7e-12	37.2
WP_077582336.1|18077_18620_+	adenine phosphoribosyltransferase	A0A1V0SKE5	Klosneuvirus	1.9e-24	43.2
WP_164027400.1|18632_20711_+	DNA polymerase III subunit gamma/tau	A0A1L2BWV7	Bacteriophage	7.0e-46	34.7
WP_059365415.1|20908_22429_+	catalase	A0A2K9L0T1	Tupanvirus	1.8e-99	47.7
WP_164027401.1|22541_23195_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059365413.1|23252_24506_-	glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase	A0A1X9I5D4	Streptococcus_phage	5.2e-89	45.0

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP040863|214435:236759|DBSCAN-SWA
AATGAAAATTGCCTTAGGAATTGAGTATAACGGCCAACATTATTTTGGTTGGCAGAGACAAGAAAAAGTACGTTCGGTACAGGAAACATTGGAAAATGCGCTGTCTTTTGTGGCAAATGAAAAAATTGACGTATTTTGTGCGGGAAGAACGGATTCCGGTGTGCATGGTACAGGGCAGGTTGTGCATTTTGAAACGGATGCGGTCCGTCCTGAAAAGGCTTGGGCGTTTGGTACAAATGCAAACCTGCCTGATGATATAGCGGTGAAATGGGCAAAAGTCGTGGATGATGAATTTCATGCCCGTTTTTCTGCTACTGCACGTCGTTATCGTTACCTTCTATATTGTAATAAATTACGCTCCGCTATTTTACCCGCCGGCATTACCCATTGCCATTTGGAATTAGATGCGGAAAAAATGCATCAAGCAGGGCAATTTTTATTAGGTGAACATGATTTTTCTTCTTTCCGTGCGGCACAATGCCAATCAAATACACCGTGGCGAAATGTGCATCATCTGAATGTTGTACAAAAAGGCGAATATATTATTGTTGATATTCAAGCCAATGCGTTTGTACACCACATGGTTAGAAACATTGTCGGGAGTTTAATTGAAGTCGGTGCAGGAAATCAGCCGGTTGAGTGGCTTAAATGGTTACTTGAACAGCGTGATCGCAAACTTGCCGCACCAACAGCAAAACCGGAAGGACTTTATTTAGTGAATGTGATGTATCCTGAAAAATTTGCGCTTCCACAACAAAAATTAGGCCCGCTTTTCCTTGAAGATGAATTGACTTAGTTTGATGCGCTTGTCTGACTAGCAAGGTTCGCCGAATTATGGTTTAATACGCTGGATTTTCTAGTGGATAAATAGGTAAAAAATAATGAGCTGGATTGACCGAATTTTTAATAAAAGCCCTTCTTCTTCAGCACGTAAGTCTAACGTGCCTGAAGGCGTTTGGACAAAATGTACCTCCTGTGAACAGGTACTTTATAGTGAAGAATTAAAACGTAACCTTTATGTATGCCCGAAGTGTGGTCATCATATGCGTATTGATGCGCGTGAACGTCTTTTACGTTTATTGGATGAAGATTCAAGCCAAGAAATTGCAGCGGACTTAGAGCCAAAAGATATTTTAAGATTTAAAGATTTAAAGAAATATAAAGATCGTATCAGTGCAGCTCAAAAAGAAACCGGTGAAAAAGATGCGCTCATTACCATGACAGGAACACTTTATAATATACCGATTGTCGTGGCTGCCTCAAACTTTGCTTTTATGGGCGGCTCAATGGGCTCTGTTGTAGGCGCTAAGTTTGTAAAAGCAGCTGAAAAAGCTATGGAATTAAACTGTCCGTTTGTGTGTTTTTCCGCCAGTGGTGGGGCTCGTATGCAAGAGGCATTATTCTCATTAATGCAAATGGCAAAAACCAGTGCGGTGCTCGCCAAAATGCGTGAAAAGGGTGTGCCTTTTATTTCGGTTTTAACCGATCCGACTTTAGGCGGCGTATCTGCCAGTTTCGCAATGTTAGGTGATCTAAACATTGCCGAACCGAAAGCCTTAATTGGTTTTGCCGGCCCAAGGGTGATAGAACAAACCGTTCGTGAAAAATTACCGGAAGGTTTTCAGCGTAGCGAGTTTTTATTAGAAAAAGGGGCGATTGATATGATTGTAAAACGTGGTGATATGCGTTATACCCTAGCCAGTGTATTAAGTAAATTAACAAATCGACCTTCACCCTTTGCCGAACCTGAATTAATTGAAGATAACATTGAAACACATGAAGAATAATATGAATTTAAAAGCCACTTCGCCACTCGCTGAGTGGCTTTCTTATTTAGAAAATAGCCATTTTAAAGCCATCGATCTTGGCTTAGAACGAATTAAATCTGTCGCAGAAAAACTGGATCTTTTACACCCTGCACCTTATGTGATCACCGTTGGGGGAACCAATGGCAAAGGAACAACCTGCCGTTTATTAGAAACTATTTTGCTTCGGCATGGTTTGCGTGTCGGCGTATATTCCTCTCCCCATTTATTACGTTATAACGAACGTGTACGTATTCAAAATCAAGATTTACCGGGTGAAGCGCATACCGCTTCCTTTGCTTTTATTGAAGAAAATAAAACGGAATCATTGACCTATTTTGAATTCAGCACCCTTTCTGCTTTGCATTTGTTTAAACAACACCAGCTTGATGTCGTAATTTTAGAAGTGGGTTTAGGCGGACGTTTAGACGCAACCAATATTGTGGATAGCAATTTAGCGGTGATTACCAGCATTGATATTGATCATACGGATTTTTTAGGGAACACAAGGGAAGCAATCGCGTTTGAAAAAGCCGGTATTTTCCGTCAAAACTGTTCGGCTGTGATTGGAGAGCCAAATGTACCCAATACAATGTTGGAACAAGCCGCCCATTTAGACTGTCAGGTATCACGCCGTGAACTGGATTGGTCATTTCAAATCAATTCAAAGAGTTGGCAATGGCAAAGCCGAAAAGTGCGGTTAGAAAATTTACCGTTTTGTCAAATCCCATTAATGAATGCCGCCACCGCCTTAGCGGTGGTTGAACAGTTACCGTTTGATATTCAGGAAAGCACGCTTCGAGAGGCATTGCAAAGCGTTGAATTAGTCGGACGTTTTCAAACCATCAAGGAAAAGCAGTGTGAAAAACTGGCAAATTTATTTGATCAAAAAGTCGATAATTTACCAACGGTGATCGTTGATGTTGGGCATAATCCTCATGCAGCGGCATATTTGAGTGAAAAATTGACCGCACTTAAAACGCAAAAACAAGGTAAATTAATTGCCGTATGCGGAATGTTAAAAGATAAAGATGCTCAAGGCGTTTTTACTCATCTTGTTCCCGTTGTAGATGAATGGCATTGTGCGACTTTAGGGGGCTATCGAGGGCAAACAGGGGAAGAGTTGCAGTTAAAACTCACCGAGTTTTTCCCTGATGTCAAAGCAAAATCACAAAATTCAGTGATGAATGCTGTACAGATTGCGTTAAAAAGTGCGGTTAAAAATGACATTATTTTAGTGTTTGGATCATTTCATACGGTAGCAGAATTTTGGCAGGAAGTAGAATAATGGCAGGGGGATTATCACTTTTATCTTTACAAATTTTTACAATAAAAATTTGTGTTTAAAGTGAGTAATTTTGCTAGAACGCTTGCGCGTCTTTAAGGATTAATCGCTACCCAGTCTGAACTGCTCATTGAACCGGTTTGATTTGACCTACTGCTAGATCAGGTTTCGACTGAACGATGAGAAATGACCGAAGTATAATCAGCATCTTTTACCATTTTGATCGTTGTCAAAATTTCTGTTAATGAATCGATCTGATTGAATGTGATTAAGATTGAGTTAGCGATACTTTTCTCGTTCCCTTCTGTTTAGGAGCTTCGTATTGGTTACGAATAAATCATCGCTTACTAATTAAACCTTGTCGCCCAATACGTTAAAAAATTTCCCTACCTTAAGCGAAATCGACGGGGTAAAGAATCTGCAACCGAATAAAAGACTAAAACACCATAAAAACCGACCGCACTTTTTGTTTAGGTGAAAGTGCGGTCGGTTTTTGGGTTATTTTTCAGTAAATTTGATTACCATTGGTAACGATAAACTGCCTGAACGGTAAATGGCTGAGCTAAATGCTTACCGTTGGTTGTTTTGGCTTCGATACCAAAACGGTGATTGCCTGTTGCCGCGTTAATTCCCAATGCGGTTTCTAATCGTCCTTTGGCATTTTCGATTTCAAATTTGTGCTGATTGACGTGAACATAACCGGCGCTGTTTTTGCCTGTTACGCCATTTATTTCGGCATAAGGTTGAATCGTCCAATTGTTTACAGTCATGGCTTTTCCTATGCGCAACCCGATACGCCCGTAAAGTGCGGTCAGATTTTCCACATTATTTTTGCCGGAAATTTTTGTCCACGCGGCTTGTAATTGCGGGGTAATCGTCCAGTCTGCCAAGCGGTAAATCCGCCCGATTTCGGTAGAAAGGGTATTGGCATGGTATTGCTGTTTGCCTGTGCTTACCGATTCGGTTTTTAAACGTTCATATTTGTAGAGATTATCCCAGTAAAAGCCGTTGTTTAACATTAATGTGCCATACAGACCGAATTGTTGGGAATGGATTTTGCCCGAACTGTATTCGCCATTAAAGTCAATATTAGAACGTGCAGAGCCGATAAATCCACCAAGGCGGAAGTTTTCGCTCAATGCCGTATCCGCTCCAATTTGCAGACTGTGGTAATCCTGTTTAAAGCCTGAGGAACGACTGGTATCCGAGACGTTTAATTCGCCTAATTTATTCCGTGTGTTTATATGTCGCACCCAAACATTGCCTGCTTTACCGTCTTTTAATTCGCCTAAACGTTGGTGAATGCCGGTTAAACTTTGTTCCACGTGTAATAACTGCGCTTGGCGGAGTGAAACAAAGGCGTTAGTACGCTCGCTGAGCATTCGCTGTGTCGGTGTTGTAACAGACGGATTAGGCGGTGTTGTTACCGTTTCCGTTGGGGTATTGGGTGTATTCGGTTCGATCGGTTTCGCCGTTTCCGTTGGGGTACTCGGTGTATTCGGTTCGATCGATTTCGCTGTTTCCGTCGGGGTATTCAGCGTATTCGGTTCGATTGGTTTTACCGTTTCCGTTGGGATATTCGGTGTATTCGGTTCGATCGGTTGAACAGGGGGAACGGGTTGGGTTGGCGTGGTGATACTTGGTTCCCCTTGTTTATTTGATAATACCCAATTTGTTCCCTCTTTTAATAAACGGTAACGATATGCGCCGGCATCTACATAATCACGATCTTGTAGTTTAAATTGTGCGTTACCGGTTTGCGTTTCAACTAAGGTTAGCCGCCCGTCCGGTGCGTTTGGTTCATTGCCGCTATCGGCAATTTTTAAGCCAAAGTTCCCGCTGTCGGAGCCTTTAACAATAATTTTATCGCCTTGTTGGTCGGCAATATTGGTGTTAAGGGAAAACGAACC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

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MKNLDEWLSITELLERKFEDLPKSDKGISKKAEREGWEKRQRTGVKGKTYEYYVGDMPESVQKALGFALSRPNSIEESAGEYKTNKNTIDKIMEAVNSLEKKVKELEEPRDNLPDTLDNAEKRLIRWFRLCNKDRQAMLLSSAEVFAEMTLNEQKGRLAPLTDHK
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MNNVILTQSTNHTTPKAQKPLAPCFRLHYIKSALAKSKVRASKLVLLEMANSTPNRAFFVRSVYAPIQYSLFSDSLFSMVAHNGKGSALCRSTFLTVFEPVMCYRPSLETLAVVPQNLEMETAEMIYKFLCVNRTYPHFNLCVQTIQANNETNARLSLSADFQCLSLIAKINPKFNRTFVQGGIYA
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MSWIDRIFNKSPSSSARKSNVPEGVWTKCTSCEQVLYSEELKRNLYVCPKCGHHMRIDARERLLRLLDEDSSQEIAADLEPKDILRFKDLKKYKDRISAAQKETGEKDALITMTGTLYNIPIVVAASNFAFMGGSMGSVVGAKFVKAAEKAMELNCPFVCFSASGGARMQEALFSLMQMAKTSAVLAKMREKGVPFISVLTDPTLGGVSASFAMLGDLNIAEPKALIGFAGPRVIEQTVREKLPEGFQRSEFLLEKGAIDMIVKRGDMRYTLASVLSKLTNRPSPFAEPELIEDNIETHEE
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MKIALGIEYNGQHYFGWQRQEKVRSVQETLENALSFVANEKIDVFCAGRTDSGVHGTGQVVHFETDAVRPEKAWAFGTNANLPDDIAVKWAKVVDDEFHARFSATARRYRYLLYCNKLRSAILPAGITHCHLELDAEKMHQAGQFLLGEHDFSSFRAAQCQSNTPWRNVHHLNVVQKGEYIIVDIQANAFVHHMVRNIVGSLIEVGAGNQPVEWLKWLLEQRDRKLAAPTAKPEGLYLVNVMYPEKFALPQQKLGPLFLEDELT
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MNTYSLHFPNGAELEFFASDSALFNEAFFGLEFPKNEQLNFYERRMNKIKNKRKAQRIARRKNRK
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MARTTKPLSNTQIEKAKSKDKDYLLSDGKGLYLLIKSTGAKLWRFNYYKPITKKRTEISLGAFPTVQLAEARTIREEYRALLAQGIDPQIHHQQKLQAKLDDFNNTYESIAWAWFEYRKTKKNFSLDYQKDVESLIKRNLLPHFGHLPISQITAPLALKAFKQYQDEGKLEKLKRTIQKHNEIMTYALHRDIISVNPTANISKEFDSPTVEHFKTIKPEDLSEFIYTLNHAQIHLQTRYLILWQLFTMTRPNEAATARYEDIDETTRLWTIYIQKGIKESDKGRIHKITLSRQTLALLREIKKLSGGKTYLFPSVKNPQTHVNTQTANAAIKRMGYAGKLVAHGLRSIASTYLNEQGYDSELIEVALSHMKLDRIKAAYDRGERLEQRFKLLQVWGDFIEECSQGALPKHHLQMVV
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MQHKIEQFTQHQAEFSAGLHQLETLDKEIDRQNKIILALDNEISELEEQGKATNGQALPDSDLFMKFYSKEREARDKRAGVRQFVKQLQHNRECLTLDLSETKRRLIHAHSDLVESAGEKIIDEITSQICQPLANALQAISLSEGFKADLRNRENILRKNIDPLDFILTLFMQKLEQKGVKLLNQKDRTILAYKLDFEQLDKIPDISPIKANQLRQALRQGE
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MATIIKRNKGWRAQVRRKGISKSEQFRTKAEAIAWAKALEEKIINGTYHTGIPYITFADVIDKYIKEVSRYKKSYREERLRLFRLMDMPLGRVYLVDLKEDDFRLWRDERLSKVSVASVLREWNTLSHIMTMACGEWKFLKENPLKNVRKPKTPHARTRRYSHEEIERLKFVSGFSPNRTPLTALSRAGAAMLFALETAMRAGEICNAKWKNYNRQTKILHIPTSKNGHPRNVPLSTKAVAILDTMERLSFGEEEPIFQLTAKNLDANFRKLKERAGLDDADLHFHDTRREALTRLAEKVDVMTLAKISGHRDIKILLNTYYSPKMENVVSLLG
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MRNETRNKFNAYRESVALANGLSVADTDKKFTVEPSLQQTLENKVQESSAFLQMINLVPVAEQQGERLGLGAASTLASTTDTTTKDRETQAITNIDSIKYHCQQINYDSHLTYGQLDQWAKFPDFAARIAAVKQQRIALDRILIGMNGTSRAATSNRASNPLLQDVGIGWLEKIRTEATKRNMKEVESGSGKIYIGKGQHYQNLDALVFSAVTDILEPWFHEDPELVAIMGRDLLADKYFSLINNNSDKATEQLANDLIISQKRVGGLPAVRVPSVPAGTILITRLDNLSIYYQESAMRRSIVENAKRDRVEDYLSSNDAFVVENYDCVALLENIEFKDK
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MISKERFLKFEEVIARTGLAKTTIYKRMAAGLFPQNINLGGRRVVWLESEINEWMQQQIERNRREEPNAA
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MAEVKFNWFEFDALVIEMNNLQELISVANLYIAEEHETAGQAVSAIQSLTKRIYLDLLAKQEQATQDRGGKNGN
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MTALTIDQLNKTVEQLSRRVALLENNKTKSQTGLDMNPQAIWTPKHIAKYSGFSYGYIRNHLINAADFPKPIQRNTGTARQRKLYLAGEIIQYFSRNNKN
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METNQIYFNAREIAEKLGVSRSGIYSLMRSSHFPAPIKIGRLSRWKVADVTQWLNERKTANG
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MAKQSKFFRVAKAGATTDGRKISPEWIEQMAKNYNPAVYQARISIEHIKGLHPNSDFRNMGDVLALKTEKKGKDFYLLAQIAPTDELVAYTKAKQKNFTSIEVNPSFADTGEAYLVGLAVTDNPASLGTDYLEFAAKNTTANIYAARKTDPQNIITEAVEFTAQWEEVADPPPKKNRLNLARYWQKSNNYARKMPPCVNQWKRLKPPLNAWKKPRHRAIKNARLSPVKCHVITTLVFNLKGSYYA
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MSKDKQPDFKKIFKQSKDNERFEYFINWYKKPLFKDELTDFLYFYNGKKWELLKDNDALSLVIKFFDEMNVNYNVSNAKTLLELIVLKMPKLDKPNLEFIPFSNGVINRKTGEFLPHSKHYFLRSFIDIEYTLENKPMPNFEKWINWASKNDHEKKCRILAAFYMILTNSYKWQLFLEITGEGGSGKSIFNEIAMMLVGEENSTSINLKDLEKISSRTKLLDKTLIFAPDQGKLVTDGAILKALTGGDVMSFEPKYKDPFDARIQSIFLMTNNEPIVFTEHNGGISRRRVLFHFADKVPDNMVDDNLARKIKQEMPSIINLLISTFKDDPLKAKKLLEAQRDSKEAIGIKMETDHIMHFASFFETREKTGGLRPGKIQDALAWHKGLFSLYGEYCKIAEIKYQLNKATFLKSFIRALKDHKNLYPYKESINDGYKLTNVYLKNDSIEELKKEWEN
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MPNYAEIEREVQRRINNPTPAEQVQDKIEAFHAQNINIMTEFYPDLVLALDEYYRSAEMKEAKRQGGMLCLHEIMKNHSQTVDEQYSRLLADIRAILAGGKDE
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MNLKATSPLAEWLSYLENSHFKAIDLGLERIKSVAEKLDLLHPAPYVITVGGTNGKGTTCRLLETILLRHGLRVGVYSSPHLLRYNERVRIQNQDLPGEAHTASFAFIEENKTESLTYFEFSTLSALHLFKQHQLDVVILEVGLGGRLDATNIVDSNLAVITSIDIDHTDFLGNTREAIAFEKAGIFRQNCSAVIGEPNVPNTMLEQAAHLDCQVSRRELDWSFQINSKSWQWQSRKVRLENLPFCQIPLMNAATALAVVEQLPFDIQESTLREALQSVELVGRFQTIKEKQCEKLANLFDQKVDNLPTVIVDVGHNPHAAAYLSEKLTALKTQKQGKLIAVCGMLKDKDAQGVFTHLVPVVDEWHCATLGGYRGQTGEELQLKLTEFFPDVKAKSQNSVMNAVQIALKSAVKNDIILVFGSFHTVAEFWQEVE
>NZ_CP040863|214435:236759|231450_232095_-|WP_164027492.1|terminase|DBSCAN-SWA
MRPTQAHVLKMTALAESATENEDFADLSGYEKMLRVLSRHKKDLKLIQSNERKAAFKKQILPDYMPWINGALEAGSGKQDNILMTWLVWAIDCEEYALALTLADYALFHSLALPDNFNRTLGTLLAEEFSDRAQFAQNEQAAYLLTYLLRIKQLTDGEDMPDQSRARLYKAIGLLDAETNPQRALEHLTRANQLNPNCGVKTLIKRLQKQTALS
>NZ_CP040863|214435:236759|218042_220562_-|WP_164027480.1|DBSCAN-SWA
MKKHSKIYTALVLSGAMFGANSAFSASCSHPTLSQSEDGSGNITIGYVSHDQILNCKLTAGFVNNIIIIDSNDVLMQDSKITTEGYTLLTVDQSQFTMLNSTLISSGDNETLAISYDSSTINIKDSELISKGNGLLAGIAISYSKLDMQDSRLTTHGNGDDSVNYYSPLRANVYALTITEVDATLGNVTLSALGENSILFATDGGSVIGNNVTASVKGKNSHLFLNEPPRTSSSTISLTDSTLSSDSYGFLGSEIHFGLSDFHPTLNLLLNNSSLTVEKDLIKLRESSRYIRDDERWGFTNSTSHFIFKLTNNSTLSGGNFTSSDQLISRFELADSTWKVTKPVTITDLTLSQGEVNLTKAYGFQTFTILGNLSGTGSFSLNTNIADQQGDKIIVKGSDSGNFGLKIADSGNEPNAPDGRLTLVETQTGNAQFKLQDRDYVDAGAYRYRLLKEGTNWVLSNKQGEPSITTPTQPVPPVQPIEPNTPNIPTETVKPIEPNTLNTPTETAKSIEPNTPSTPTETAKPIEPNTPNTPTETVTTPPNPSVTTPTQRMLSERTNAFVSLRQAQLLHVEQSLTGIHQRLGELKDGKAGNVWVRHINTRNKLGELNVSDTSRSSGFKQDYHSLQIGADTALSENFRLGGFIGSARSNIDFNGEYSSGKIHSQQFGLYGTLMLNNGFYWDNLYKYERLKTESVSTGKQQYHANTLSTEIGRIYRLADWTITPQLQAAWTKISGKNNVENLTALYGRIGLRIGKAMTVNNWTIQPYAEINGVTGKNSAGYVHVNQHKFEIENAKGRLETALGINAATGNHRFGIEAKTTNGKHLAQPFTVQAVYRYQW
>NZ_CP040863|214435:236759|229478_229781_-|WP_136126130.1|DBSCAN-SWA
MGKNKKPRMKRNHSGLITPPKAESMQDNFSNFPVIGKLLTQLNIGENMSTQGADEAGKDISDGFKFFLKAVGAGAFIALICWQAPNLADALIQLITAIKQ

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
209866:209884	attL	NA	NA	NA	NA
WP_135969225.1|214435_215230_+|tRNA	tRNA pseudouridine(38-40) synthase TruA	NA	NA	NA	NA
WP_059365265.1|215315_216221_+	acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_059365264.1|216222_217527_+	bifunctional tetrahydrofolate synthase/dihydrofolate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_164027480.1|218042_220562_-	autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_135969227.1|221128_221626_+	ci repressor-like protein	NA	NA	NA	NA
WP_135969256.1|221973_222732_-	Fic family protein	D7RWK9	Brochothrix_phage	2.1e-08	27.0
WP_164027481.1|222838_224089_-|integrase	integrase arm-type DNA-binding domain-containing protein	A0A1B5FPC6	Escherichia_phage	6.2e-82	39.7
WP_164027482.1|224947_226315_-	hypothetical protein	Q7M2A8	Enterobacteria_phage	1.8e-63	34.1
WP_164027483.1|226357_226660_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027484.1|226669_227674_-|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	Q19US1	Mannheimia_phage	5.1e-95	55.9
WP_164027485.1|227683_227881_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027486.1|227877_228192_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027487.1|228181_228406_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027488.1|228468_228780_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027489.1|228772_229333_-	host cell division inhibitor Icd-like protein	NA	NA	NA	NA
WP_136126130.1|229478_229781_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027490.1|229773_229962_-	AlpA family phage regulatory protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027491.1|230153_231338_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027492.1|231450_232095_-|terminase	terminase	Q19US0	Mannheimia_phage	6.5e-43	44.1
WP_164027493.1|232097_233120_-|capsid	phage major capsid protein, P2 family	A0A077KEQ8	Ralstonia_phage	4.2e-105	58.0
WP_164027494.1|233112_233850_-|capsid	GPO family capsid scaffolding protein	A4PE29	Ralstonia_virus	5.0e-47	62.5
WP_164027495.1|233914_234583_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027496.1|234572_234785_-	AlpA family phage regulatory protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027497.1|235565_236759_-|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	A0A1B5FPC6	Escherichia_phage	3.9e-49	32.3
243984:244002	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP040863|310775:320380|DBSCAN-SWA
ATCAATGGTTTACGGCTTTTTTATTTGTGCTTTTTTCGTTTATTTCGTCATTTTCTGCGGTGATTTTTGAAGTGTCGATCGCAGAGTTTGACGTAAATTTGACGTGGTTTGCGTATCTCAACAAATGGTCAGCGTTGAGATGTGCATAACGTTTTACCATTTCCAAGGTTTCCCAACCCCCCAAATCTTTTAGCACCATCAATGGGGTGCCATTTTGAACATGCCAGCTCGCCCAGGTGTGACGCAAATCATGGAAACGGAAATTCTCAATTTTGCACCGTTTGAGTGCGCGTTTGAAATCGTAGGCATCAATTTCGCTGATTCGTTTTCCTTTTCCACGGTGAAAGACATAAGGTGAAATACGCTCAAATGTTCGCCTTTTCAAAATAGCCATTGCTTCGCCGCCTAATAACAAAGATCTTGCTTTGCCTGATTTGGCAATATCGCTTGTTACAATGGCTACTTGTCTTTCTATGTCAATTTTATCCCATGTTAATGTGAGGATCTCACTCGCTCTTGCGCCGGTGGCGAGAGCAAATGCGCAGACATCTTTCATCCATTCCAGTTGTAATGCATTGATTAAGCTTTGCGCTTTTGTTTGGCTTATCCATCGTACTCTTATTTTAGGTTCTCTGTTGCGTGGAATGTGCGGTATGCTATCAATCCAACCTGCTTTTTGTGCAAGGGATAGTACACGCATAATAGAGGAGCGGTAACGATTTTGGGTGGAAGGAGAAATTGGCTCTTTTGTGCCTGTTTTGTGAGTGGGGAGGGCGTTTAGAATATCATCGGTTGTTAAAGAGCTAAGTAGCCGTCCTGATAATGCCTCACGCCAATATTCCACATGGCGGATTTTAGTGGTGAAATCCTTTTGCCCTTGTGAAATCTCGAGGAAACGAATTAACGCCTCTTCGATTGTTCTTTCCGGCTTTTTGTTGAGTTTTTCAACTTGCCAAAGTTCGTGTTTTAACTTGTCGTGATATTCTTGCGCGAGCCTTTTTTCAGTTGTTTTAGCAGAGCATCTAATTCTTTCTCCGCTCGGTGTGGCAATATCGATTTGCCATATCCCGTTTTTTGATTTTCTGATCGACATTTTCTTTTCTCCGAATCGCCGACCTGTATATCTCGGCATAAATTATTCTTCTTTTTCTTACTTTGTTCAAGAACTGATTTTTCTACAAGCCAAATCTTTGAAGATTTCATTTGAAAAAATCCCCATTCTTTTTTACGGGCAAAAACAGTAGAGTAGCTTAAATTCAGTAGTTTTGCCGCTTGCTTGACTGTTAATGTCTGCTCCATATTTTCTCCACTACTTCAAAATATCCGGCACCTCAACAACTTTTAGCTGTTCAGGTGTCTTGTCTTTGTACTTAAGATAATAGTTGACGATCTCGGTCGCTTGCTCTTCCGTTACAGTTCTATGAGTTTCTTGGACCACCGTCCAAATATGTCTATATTGGCATTCAAGCACGACGTATCGTGTTAATTATTTGGGCTGTTCCGGCAAAGGTTGCCAGTATGTTACGTTTGCATAAGAGTTACTTGGAAAGGTGAACCACTTATCATTAACTCTTTCTGCAACAAAAATACATAAATGATTGCAGCATAAAACTTGTTGAAAATTATCCGGCAATCTATCCTCAACACTGATCCAGCCGTTATTGTTTTCACTCATTTTTTAAGTCCTCTTTGTTTGTTAATTTCATTATTTGTTTTCCTAAAAAGCCTGTTCAATTCTATGTATAGGTGCCATTTTTCCGTCATAATCATTACCAAGTTCTAAGTGCCACGCCAAGCTGATAAATACCAACGCTATCAGTGTAATTTTTACCTTTCTAATGCTCATTTTCTGTTCCTTTTGCTGAATCTAAGGTGCAAGAAACCGCCACACGATTTTCACGGGGAAAAGTGCGGTCGGTTTTGGTTGGGTTTTATTGTTTAATCAGGTTGATTGCCCGTGTCCAATTCAGACGGTCCGATTGCTTAAACGGGGCAATCAAGCGTTGAATGGTTGGGAGCGTGGCTTTGTATTGCCGCTGATATTCGTGGTGATGACTAATGACTATGCCGGTATAGCGTGAACCAATGGCATCGAGGGGTTCTATCATATCACCTAATAGGACGTTCATTTGTTTATGTCCGCACCATAACCAGACAAGCTGTTCAAGTTCATATTCGGTAAATTCAAAAGTGAATTTCTTTTCGGGTTCGGGCAAGGCGAGCTGTTTTGGCTCTAACTGATATTTTCCTGTTTTGCGGATTTGGGGTAGCACTTCTTCAAATACCCAAGCTTCAAAGGGTTCTGCTTCGGGTTTTCTGCTTTTGATGATCAGGCGGTATAAATTGGGTTCGTTGATGAAGATCATCTCTTGCTCACCGCTTTGGGTAGGGGTATAGCGTTTTGCTATACCCCCTTGTTTACAATGTTTAGTTAAGGCATCAGGGGCATTTTTATAACCTAAAATATAGCAAACATCAGATCCGCAGAACCAAAATTCACCTGTTGGATCTGTAATGACACGAACCGCATTTGCATTAAAATTGAAAGATTGAAATTGAATTTGAGTTGTCATTTGGAATGTATCCTCTGTTAGATTTTATTTTGCCCCATTGTTCAGATAGGGCGATCGGGTGCTTGAACACTGCTAACAGACAGCCTTCCGTTTTTCCTTACGGTCTTGTATGTACGGAACGCCACCCGATCATAAAATCAGGATACAAAAAAACCGCATTTCTGCGGTGATATTCCGCTGTTAGTCAAGGTGTGTTCAGCACCGTTAGCGGAATGATATAACAAAAAAGCCTGTGTTGTAAACAGGCTTTATCAAATTCTTCAGTTTTCAACAATGGCGGTCGGGAGGCTGAAAAACCCCGTAATAGGAAAGGGCTGGACGTATTCCCCGAAGGTATTGTATTAGTCGCCCTCCCGACCATAGTCAGGATTACGGATATAAAAAAATCGCCTTGTGGCGATTAGTGAACTATCCGCCTATTACATTAAGGTTTTCAGACCTTAGGCGGATAGTAAAACAAAACCCCGTGGATTGCAACGGGGTTTTTGAAAATTTATTCATCTTCGTTTCGTCTTTGTTGTTCCAGTGTGGTTATTTTACCACGTCCGAAACCTGCGATATAACCAGCTAATAATGCACCACCAATTTTAAGCACCTCTAGAGCAAAAGCAGTATTATCTGTAAACATTGATACAAAAATAACGGCAACAACCGCAACAATAACAATACCGATAATAATATTGCGTTGTGTGTGCATTTTGGAAACTGCTTTTATTTATTCGTTCCTGTCGCCTTTTTGTGCGTCAATGCTTGCCAGTGCAATCTTTTCATTGGATTTTATACGCTCTTGTTCAACTGCTAATTCTTTTTCTTTCACGGCTTGATTAGCTTGTTGTACTTTGACTAAATCTCGCATTGTGGCGAGAAGTTGAACGTCTGTTTGTGGCTTTGGATTCATACTATCTCAACGGGCAAAGTTGTGGTGTTTTGTAAGTGATCTGGAATGAACCGTAACCACTTGAACCGATTGTAGGTGGTACAAAAGTAACAGATTGGACATTGTTATTTACACTCGCTTTTTTCGCTTCATTCAAGTACTGCTTGGCTGAAACATTGCGAGTTTTTCTAGGAACAAGCAATTTTGTTTTAGTCATAATAAATACCTTTGGTTGTGCGAAAATCCCTTGTGAAATAGGGTTTCTATGAAAAGAGCCACTTAATGCGACTTGCTGACATTCTGTTGAAAGTGGGTTTAGTTTAGTCTGAATTGGGGGCAGTGTCAAATTTTTCAAAAGCAAAACCACTTATTAAAATGTGAGATATGCCTCAAAATTAAAATGATTTTGTTGAAGATGAAAATCGCTGTGCTATTCTTTTGATCGCCTTTGCTAACCACGAGGTATCTTTTACTGGAATGTGAATTGATTGCGTAATTTCGCCTTCGTAGGTTGCTTGGGAAACTGCCTTTATTTTTTCTTTGGCTTGCTTTGGCGTATCGGCAAAGATATTGATAACCCAAGTTTGACCCTCAAAATGATAAGTAAAGGTATATTCTTTCATTTGGTGCATAAGGAGCTCCTATGTATTTTGAAATTTATAAAGATGCGAAAGGTGAATTTCGCTGGAGATTGAAAGCAGGTAATCACCAATCTATAGCGACAAGTGGTGAAGGCTATACAACAAAGCAAAGTTGCCAACACGCCATTGGCGTTATTAAAACTGTAAATGAACAAACAGAAGTTAAAGACTTGACTGTTGCTTAAAATTTAGCCCTGTAATAACAGGGCTTTTATAAAATGAAACTGTGCATAAGAGCGGTTCGGTTAATTGCGGTTTGTATCAACAACCGGCAACTCAACAAACGCATTGAGCGGTTGCGGTGATAACGATTCTTCCGGTATATCTAATCGTCCGCCTAGCGTTGCATAACCTGCAATATCACGCCAGTGATCGACTTCGTGCGGATTACCGTTTAATATTCTCGCCAACTTTGTCGCTATCATCGTGATTGCGTATTTGTGTGTGCTATCCAGCTTTGTTGATTTTTCAACGTGCTTTAAGATGTCATTAAAAATCACCGCACCTTCGTGAAAATTTCCGTGTGTTTCAGCGCGCTCTTGTAGCGTTTCATTTATGTTCATTTTTCTTATCCTTATCCTTATCCTTATCCTTGTCCTAAAATTCTGCTCTTCGCCACTTCGATCAATAGTTGATACTCGCGTTTGGTTTTCTCGTCATGTACTTTCGCCGATTTTGCTAAAAACTCATCGACTGTGCCGGTAAAACAACCTCTTGTAACGATTAAGTCATCCTTGCCATTAAACACTGTGAGTGTACCGTTCTCGGTACCGACATTACTCGCCCAGAAAATCATTTTTCGCTCGGAAACAATGGCGCAAGAACTAACCCAAGCGTTGCCATATACCCAAGCGTTGCCAAATACCCGAGCGTTGCCACATACCCAAGCGTTGCCAGATTGATCTAAAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP040863|325917:396252|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_164027551.1|326467_327502_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059366202.1|327593_328253_-	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A0M3LSL8	Mannheimia_phage	1.1e-69	61.8
WP_059366203.1|328384_328591_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A0M3LSY2	Mannheimia_phage	1.2e-19	69.1
WP_164027552.1|328639_329083_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157888085.1|329128_329296_+	hypothetical protein	A0A0M3LPV5	Mannheimia_phage	6.8e-05	51.1
WP_164028795.1|329288_330155_+	replication protein	A0A0M3LQL8	Mannheimia_phage	1.4e-77	55.7
WP_164027553.1|330154_331615_+	AAA family ATPase	Q7Y5V9	Haemophilus_phage	4.2e-191	68.1
WP_164027554.1|331614_331830_+	hypothetical protein	A0A0M3LR43	Mannheimia_phage	2.6e-25	70.6
WP_164028796.1|331837_332275_+	DUF1367 family protein	A0A0M3LR84	Mannheimia_phage	1.5e-59	73.8
WP_164027555.1|332285_332861_+	recombination protein NinG	Q7Y5V6	Haemophilus_phage	4.0e-84	80.1
WP_164027556.1|332844_333489_+	HNH endonuclease	A0A2H4JH74	uncultured_Caudovirales_phage	1.5e-39	43.2
WP_164028797.1|333566_333932_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_136126486.1|334051_335206_+	type I restriction endonuclease subunit R	A0A1S5SAB0	Streptococcus_phage	3.0e-38	32.8
WP_164028798.1|335875_336358_+	hypothetical protein	D0UIK6	Aggregatibacter_phage	5.5e-39	58.5
WP_164027557.1|336467_336626_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027558.1|336858_337218_+	hypothetical protein	E7C9U7	Salmonella_phage	1.2e-22	41.9
WP_164027559.1|337240_337429_-	hypothetical protein	B8K1I9	Salmonella_phage	9.4e-19	73.2
WP_164027560.1|337764_338154_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027561.1|338258_338507_+	hypothetical protein	A0A0M3LR95	Mannheimia_phage	2.0e-16	57.0
WP_164027562.1|338499_339048_+	glycoside hydrolase family protein	A0A0M3LQY4	Mannheimia_phage	3.6e-50	54.3
WP_164027563.1|339020_339359_+	DUF2570 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_167514390.1|339261_339546_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027565.1|339564_340095_+|terminase	terminase small subunit	A0A0M3LSU1	Mannheimia_phage	2.0e-53	65.5
WP_164027566.1|340075_341296_+|terminase	PBSX family phage terminase large subunit	A0A0M3LTA2	Mannheimia_phage	1.8e-179	75.2
WP_164027567.1|341301_342816_+	DUF1073 domain-containing protein	I7B6L5	Escherichia_phage	1.2e-116	49.3
WP_164027568.1|342808_343636_+|capsid	minor capsid protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027569.1|344404_345658_+	DUF2213 domain-containing protein	Q6IWU4	Burkholderia_phage	3.3e-43	45.4
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WP_164027571.1|346193_347318_+	DUF2184 domain-containing protein	A0A2H4P6S2	Pseudomonas_phage	1.2e-87	47.0
WP_164027572.1|347399_347780_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027573.1|347779_348199_+	DUF4054 domain-containing protein	I7ATP1	Escherichia_phage	6.7e-25	44.6
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WP_164027575.1|349065_349566_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027576.1|349573_351052_+	DUF3383 family protein	A0A1V0DZ75	Acinetobacter_phage	1.1e-98	40.9
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WP_164027578.1|351679_352198_+	hypothetical protein	A0A0M4REH5	Salmonella_phage	1.1e-32	48.1
WP_164027579.1|352271_352676_+	hypothetical protein	A0A068CGG2	Acinetobacter_phage	5.5e-16	38.8
WP_164027580.1|352870_353098_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027581.1|353030_355283_+	glycoside hydrolase family 19 protein	A0A190XCB3	Acinetobacter_phage	8.5e-74	39.2
WP_164027582.1|355303_355936_+	SHOCT domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_164027587.1|357930_358836_+	phage repressor protein/antirepressor Ant	D0UIK6	Aggregatibacter_phage	1.7e-52	45.3
WP_164027588.1|358967_359486_+	hypothetical protein	A0A1B1P9D9	Acinetobacter_phage	1.5e-26	39.1
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WP_164027590.1|360493_361387_+	hypothetical protein	E2GM20	Acinetobacter_phage	1.7e-49	37.7
WP_164027591.1|361386_362046_+|plate	phage baseplate protein	H9C0X6	Aeromonas_phage	2.9e-38	42.6
WP_164027592.1|362109_362817_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027593.1|362813_363164_+	hypothetical protein	A0A2R3UAP1	Myoviridae_environmental_samples	2.2e-13	39.5
WP_164027594.1|363160_364348_+	hypothetical protein	K4I3B4	Acinetobacter_phage	3.1e-51	33.9
WP_164027595.1|364344_364962_+	DUF2612 domain-containing protein	A0A220NQG4	Acinetobacter_phage	5.4e-39	41.1
WP_164027596.1|365009_366707_+	hypothetical protein	D0UIH3	Aggregatibacter_phage	5.9e-27	27.1
WP_164027597.1|366697_367300_+|tail	phage tail protein	Q7Y5S1	Haemophilus_phage	5.7e-25	54.0
WP_059366240.1|367284_367557_+	hypothetical protein	Q776W9	Haemophilus_phage	7.7e-30	74.4
WP_069029799.1|367549_367897_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027598.1|368312_370586_-	5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine S-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_164027599.1|370884_371775_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027600.1|371865_372225_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027601.1|372458_373334_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027602.1|373404_373734_-	TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027603.1|373735_374668_-|tRNA	tRNA 2-thiocytidine(32) synthetase TtcA	A0A0U2S5Z2	Escherichia_phage	1.6e-122	80.9
WP_059366247.1|374816_376151_+	chromosome partition protein MukF	NA	NA	NA	NA
WP_077494552.1|376220_376979_+	chromosome partition protein MukE	NA	NA	NA	NA
WP_164027604.1|376978_381496_+	chromosome partition protein MukB	NA	NA	NA	NA
WP_135968565.1|381590_382463_+	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_164027605.1|382477_383902_+	exodeoxyribonuclease I	NA	NA	NA	NA
WP_135968567.1|384758_385244_+	non-heme ferritin	NA	NA	NA	NA
WP_135968568.1|385261_385762_+	non-heme ferritin	NA	NA	NA	NA
WP_164027606.1|385803_386256_-	molybdopterin synthase catalytic subunit MoaE	NA	NA	NA	NA
WP_135968570.1|386260_386506_-	molybdopterin synthase sulfur carrier subunit	NA	NA	NA	NA
WP_135968571.1|386509_386989_-	cyclic pyranopterin monophosphate synthase MoaC	NA	NA	NA	NA
WP_164027607.1|387028_388042_-	GTP 3',8-cyclase MoaA	NA	NA	NA	NA
WP_164027608.1|388321_389257_+	uridine diphosphate-N-acetylglucosamine-binding protein YvcK	A1IMD5	Streptococcus_phage	1.5e-24	27.3
WP_164027609.1|389303_390755_-|tRNA	tRNA 4-thiouridine(8) synthase ThiI	NA	NA	NA	NA
WP_059366283.1|390924_391164_+	exodeoxyribonuclease VII small subunit	NA	NA	NA	NA
WP_059366284.1|391165_392056_+	(2E,6E)-farnesyl diphosphate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_164027610.1|392123_393977_+	1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_135968575.1|394202_395555_-	deoxyguanosinetriphosphate triphosphohydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_135968576.1|395559_396252_-|lysis	CidB/LrgB family autolysis modulator	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP040863|438631:493102|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5

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MGILAECDKNTNEKLCLIADAITYGFTAVGNDNVQNPLDFIDRTFINLYTTRRVG

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_059366325.1|441050_441935_+	methylenetetrahydrofolate reductase	NA	NA	NA	NA
WP_164027624.1|441975_442467_-	endopeptidase	S5MM68	Bacillus_phage	5.0e-11	34.6
WP_059366327.1|442517_442814_-	integration host factor subunit alpha	Q2A099	Sodalis_phage	5.1e-11	40.4
WP_164027625.1|442818_445206_-|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_164027626.1|445270_446260_-|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit alpha	A0A2H4UW22	Bodo_saltans_virus	6.1e-32	38.9
WP_164027627.1|446614_447475_-	OmpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027628.1|447668_448727_-|protease	protease SohB	NA	NA	NA	NA
WP_059366332.1|448865_450269_+|tRNA	asparagine--tRNA ligase	A0A167RLM0	Powai_lake_megavirus	9.7e-84	37.5
WP_059366333.1|450338_451022_+	carbonate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_135968600.1|451192_451459_-	YcgL domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027629.1|451528_452095_-	histone	NA	NA	NA	NA
WP_059366336.1|452340_452826_-	phosphohistidine phosphatase SixA	NA	NA	NA	NA
WP_164027630.1|452884_454219_-	phosphoglucosamine mutase	NA	NA	NA	NA
WP_164027631.1|454255_455083_-	dihydropteroate synthase	A0A0B5J4J5	Pandoravirus	9.0e-13	24.9
WP_059366339.1|455194_457096_-|protease	ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH	A0A0P0BXI2	Ostreococcus_lucimarinus_virus	1.2e-113	42.0
WP_077587352.1|457176_457815_-	23S rRNA (uridine(2552)-2'-O)-methyltransferase RlmE	NA	NA	NA	NA
WP_059366341.1|457968_458268_+	ribosome assembly RNA-binding protein YhbY	NA	NA	NA	NA
WP_059366342.1|458312_458789_-	transcription elongation factor GreA	NA	NA	NA	NA
WP_164027632.1|458953_460393_+	serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_164028799.1|460502_461837_-	esterase-like activity of phytase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_059366345.1|462053_462803_-	SDR family oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_164027633.1|462936_463320_-	DUF2255 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027634.1|463408_464305_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_157888084.1|464768_464936_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059366348.1|464963_465899_+	KpsF/GutQ family sugar isomerase	A0A2P0VNK5	Tetraselmis_virus	1.3e-39	34.4
WP_059366349.1|465908_466451_+	HAD family hydrolase	A0A140XBD6	Dickeya_phage	1.8e-22	43.0
WP_164028800.1|466546_466831_+	antibiotic biosynthesis monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_164027635.1|466944_467652_-	NAD-dependent deacylase	A0A097EY61	Escherichia_phage	2.5e-16	30.2
WP_164027636.1|467828_468857_-	adenosine deaminase	NA	NA	NA	NA
WP_164027637.1|468957_470070_-	iron-sulfur cluster carrier protein ApbC	NA	NA	NA	NA
WP_164027638.1|470224_472273_+|tRNA	methionine--tRNA ligase	A0A1V0S905	Catovirus	7.9e-26	23.5
WP_164027639.1|473474_474335_+	SAM-dependent methyltransferase TehB	NA	NA	NA	NA
WP_164027640.1|474409_475237_-	2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate N-succinyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_164027641.1|475603_476620_+	HTH-type transcriptional repressor PurR	C6ZCU4	Enterobacteria_phage	2.3e-34	32.6
WP_135968612.1|476793_479433_+	phosphoenolpyruvate carboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_059366361.1|481227_481698_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027642.1|481851_482235_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157888087.1|482327_482498_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_077664009.1|482529_483111_-	AAA family ATPase	NA	NA	NA	NA
WP_059366364.1|483353_483788_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059366365.1|483787_484822_-|transposase	IS1595 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_059366366.1|484928_485264_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_164027643.1|485299_485488_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059366367.1|485551_487171_+	site-specific DNA-methyltransferase	Q1MVP0	Enterobacteria_phage	3.9e-52	34.8
WP_135968614.1|487181_489797_+	DEAD/DEAH box helicase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_059366368.1|490780_491905_+|transposase	IS1595 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_059366369.1|492085_493102_-|transposase	IS1595 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP040863|855529:916262|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6

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MIEADRIISSQAKLDEDVIDRAIRPKLLADYVGQAQVCEQMDIFIKAAKLRKDALDHLLIFGPPGLGKTTLANIVANEMGVNIRTTSGPVLEKAGDLAAMLTNLEPYDVLFIDEIHRLSPAIEEVLYPAMEDYQLDIMIGEGPAARSIKLELPPFTLVGATTRAGSLTSPLRDRFGIVQRLEFYSVEDLTSIVARSAVCLNLELEQQAAFEVARRSRGTPRIANRLLRRVRDYADVRNGGVISLDIAKQALSMLDVDDAGFDYLDRKLLSAVIERFDGGPVGLDNLAAAIGEERDTIEDVLEPYLIQQGFLQRTPRGRIATAQTYRHFGLQKLAS

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_059365634.1|855529_856264_-|tRNA	tRNA (cytosine(32)/uridine(32)-2'-O)-methyltransferase TrmJ	NA	NA	NA	NA
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WP_164027779.1|857192_858476_-	Tol-Pal system protein TolB	NA	NA	NA	NA
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WP_059365640.1|860899_861310_-	tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase	NA	NA	NA	NA
WP_059365641.1|861399_861684_-	cyd operon protein YbgE	NA	NA	NA	NA
WP_135969329.1|861794_862931_-	cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II	NA	NA	NA	NA
WP_059365643.1|862945_864511_-	cytochrome d terminal oxidase subunit 1	NA	NA	NA	NA
WP_059365644.1|864921_865227_+	DUF5339 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_059365645.1|865292_866300_-	Holliday junction branch migration DNA helicase RuvB	A0A127AWE7	Bacillus_phage	2.4e-07	25.1
WP_059365646.1|866310_866925_-	Holliday junction branch migration protein RuvA	NA	NA	NA	NA
WP_059365647.1|866985_867558_-	crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC	G3MA90	Bacillus_virus	2.4e-09	33.3
WP_059365648.1|867621_868149_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059365649.1|868170_868911_-	YebC/PmpR family DNA-binding transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_059365650.1|868938_869409_-	dihydroneopterin triphosphate diphosphatase	H6X3M3	Enterobacteria_phage	2.3e-05	30.5
WP_059365651.1|869409_869970_-	TIGR00730 family Rossman fold protein	A0A1G5S9X4	Enterococcus_phage	1.4e-22	38.3
WP_135969325.1|869966_870290_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027783.1|870375_872142_-|tRNA	aspartate--tRNA ligase	A0A2K9L3L6	Tupanvirus	4.3e-12	28.4
WP_077550882.1|872285_873011_+	carboxy-S-adenosyl-L-methionine synthase CmoA	S5VMD2	Pseudomonas_phage	2.7e-21	29.3
WP_164027784.1|873078_874410_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_059365656.1|874681_875089_+	lactoylglutathione lyase	NA	NA	NA	NA
WP_164027785.1|875163_875814_+	ribonuclease T	L0N5X9	Acaryochloris_phage	6.8e-08	24.0
WP_059365658.1|876149_877502_+	Na+/H+ antiporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027786.1|877537_878119_+	primosomal replication protein N	NA	NA	NA	NA
WP_164027787.1|878439_879057_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027788.1|879182_879530_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_077582188.1|879569_879863_-	hypothetical protein	A0A0M3LS64	Mannheimia_phage	7.0e-37	78.4
WP_164027789.1|884368_885013_-|tail	tail assembly protein	A0A0M3LQC4	Mannheimia_phage	4.3e-55	58.5
WP_164028807.1|885070_885553_-	hypothetical protein	D0UIK6	Aggregatibacter_phage	3.0e-37	57.1
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WP_077582646.1|886838_887024_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_160193526.1|887166_887328_-	hypothetical protein	A0A0M3LPX2	Mannheimia_phage	5.2e-10	64.0
WP_164027791.1|887573_888311_-|tail	phage tail protein	A0A0M3LQI5	Mannheimia_phage	1.8e-89	66.2
WP_164027792.1|888316_889030_-|tail	phage minor tail protein L	A0A0M3LSQ5	Mannheimia_phage	1.2e-85	64.3
WP_167367158.1|889033_889186_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027793.1|889313_892631_-	tape measure protein	A0A0M3LS69	Mannheimia_phage	3.8e-78	55.3
WP_164027794.1|892646_892976_-|tail	phage tail protein	Q687F2	Enterobacteria_phage	4.1e-17	39.8
WP_164028808.1|893045_893408_-	hypothetical protein	A0A0M3LQT0	Mannheimia_phage	1.1e-26	57.3
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WP_164027797.1|894874_895267_-	hypothetical protein	A0A0M3LQB6	Mannheimia_phage	3.3e-34	50.8
WP_164027798.1|895266_895665_-	HK97 gp10 family phage protein	A0A0M3LPJ5	Mannheimia_phage	5.8e-34	56.2
WP_164027799.1|895664_896048_-	hypothetical protein	A0A0M3LT14	Mannheimia_phage	4.0e-24	44.0
WP_164027800.1|896049_896490_-	hypothetical protein	A0A0M3LSP7	Mannheimia_phage	6.6e-31	53.5
WP_164027801.1|896467_896824_-	hypothetical protein	A0A0M3LS62	Mannheimia_phage	1.0e-29	61.7
WP_164027802.1|896875_897823_-	hypothetical protein	A0A0M3LQL5	Mannheimia_phage	4.0e-142	78.4
WP_164027803.1|897856_898594_-	hypothetical protein	A0A0M3LQV7	Mannheimia_phage	2.1e-66	53.7
WP_164027804.1|898708_899131_-	HD domain-containing protein	D0UIJ3	Aggregatibacter_phage	2.0e-37	59.7
WP_136126539.1|899131_899350_-	hypothetical protein	A0A0M3LPI7	Mannheimia_phage	5.8e-28	76.4
WP_164027805.1|899349_901002_-|capsid	minor capsid protein	A0A0M3LQ07	Mannheimia_phage	9.3e-203	65.6
WP_164027806.1|900967_902353_-	DUF4055 domain-containing protein	A0A0M3LQA1	Mannheimia_phage	5.9e-150	59.6
WP_164027807.1|902362_903721_-|terminase	PBSX family phage terminase large subunit	A0A220NQL3	Acinetobacter_phage	5.6e-129	55.1
WP_164027808.1|903713_904217_-|terminase	terminase small subunit	A0A0M3LSU1	Mannheimia_phage	1.2e-41	61.5
WP_164027809.1|904234_905635_-	site-specific DNA-methyltransferase	Q1MVP0	Enterobacteria_phage	6.5e-88	40.2
WP_164027810.1|905837_906176_-	DUF2570 family protein	Q7Y5U9	Haemophilus_phage	1.6e-05	32.6
WP_164027811.1|906148_906697_-	glycoside hydrolase family protein	A0A0M3LPQ1	Mannheimia_phage	3.2e-51	58.5
WP_164027812.1|906689_906935_-	hypothetical protein	A0A0M3LR95	Mannheimia_phage	9.4e-19	60.5
WP_164027813.1|907040_907601_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_152634407.1|907654_907924_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027814.1|908287_908587_+	type II toxin-antitoxin system RelE/ParE family toxin	A0A141GEX6	Brucella_phage	4.7e-20	45.3
WP_077493439.1|908583_908877_+	putative addiction module antidote protein	A4JWV1	Burkholderia_virus	6.4e-14	46.6
WP_164027815.1|908916_909285_-	antitermination protein	Q7Y5V5	Haemophilus_phage	8.8e-37	62.6
WP_164027816.1|909274_909835_-	recombination protein NinG	D0UIK8	Aggregatibacter_phage	8.6e-68	67.4
WP_135968557.1|909921_910104_+	type II toxin-antitoxin system HicA family toxin	A0A0D4DC32	Acinetobacter_phage	2.0e-05	46.7
WP_135968556.1|910132_910588_+	CopG family transcriptional regulator	A0A0R6PJ17	Moraxella_phage	2.1e-16	35.5
WP_164027817.1|910869_911529_+|bacteriocin	bacteriocin	A0A0P0ZCS0	Stx2-converting_phage	4.0e-16	50.0
WP_164028809.1|911565_911973_-	recombination protein NinB	Q7Y5V7	Haemophilus_phage	1.1e-35	53.0
WP_164027818.1|911983_912526_-	adenine methyltransferase	A0A0M3LNW2	Mannheimia_phage	1.3e-68	64.4
WP_167514392.1|912522_913158_-	replication P	D0UIL4	Aggregatibacter_phage	2.8e-38	50.5
WP_164027819.1|914029_914698_-	hypothetical protein	D0UIL6	Aggregatibacter_phage	1.3e-57	54.7
WP_164027820.1|914748_915192_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_136125112.1|915240_915444_-	helix-turn-helix domain-containing protein	Q76H55	Enterobacteria_phage	1.9e-09	50.0
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Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP040863|920171:968033|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP040863|920171:968033|930969_931176_+|WP_164027832.1|DBSCAN-SWA
MFKQELQVINNKRYVVLECQYRHIWTVIQETHRTVTEEQAIEIVNYYLKYKDKAPEQLKVVEVPDILK
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MSKPSLSYKDAGVDINAGNELVERIKPHVKRTTRPEVIGGLGGFGALCAIPSKYKEPILVSGTDGVGTKLRLAIDLKKHDTIGVDLVAMCVNDLVVQGAEPLFFLDYYATGKLEVDVAADVVKGIAEGCVQSGCALVGGETAEMPGMYHEGDYDLAGFCVGVVEKSEIIDGRQVRSGDALIALGSSGPHSNGYSLIRKVIDVSGVNPATEQLAGKPLSEQVLAPTKIYVKSILSLIKQTDVHAIAHLTGGGFWENIPRVLPKNTKAVIDEKSWEWQPIFKWLQEQGNISTYEMYRTFNCGVGMVIALPQNQVETALAILKQAGENAWLIGHIEQAADDEAQVVIQ
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MTSKFDPQHPFACFVTHSETMKSAVENAQRFAMFDVPLLIQGETGTGKDLLAKACHYQSLRRDKKFIAVNCAGLPDEDAESEMFGRKRGNSETIGFFEYANEGTVLLDGIAELSLNLQAKLLRFLTDGSFRRVGEEQEHYANVRVICTSQVPLNLLVEQGKVRADLFHRLNVLVINIPPLRERIADIQPLAEGFLQEISDELKIKLPTFNQDFLVYLQQYDWQGNVRELYNTLYRACSLSKDNQLSVESLNLTLPQSAVISVDEFENQTLEDIIGQYEAKVLQAFYKEYPSTRKLAQRLGVSHTAIANKLKQYEIGK
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MKNVLSIQSHVVYGFAGNKSATFPMQLLGVDVWALNTVQFSNHTQYGKWTGMVIPQEQIREIVTGLDNIEKLQECDALLSGYLGSPEQVDQILYALEQIKKHNPNALYLCDPVMPNPEKICVVANGVREALIEKAIPVADIMTPNLNELRQLSDFPINSFDDVLKAVRGLLDKGVKKVLVKHLGKVGKINDPDTFEIIMATPEGIWHLSRPLYQFNFEPVGVGDLIAGTFLANLLNGKSDVEAFEAMNNEVAGVMKTTFELNSYELQTIAARFEILNPTSQYKAEKIA
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MNFPKIAEQVIEKLGGKSNIATAAHCATRLRIVLNDESKVDKEGIDNIEGVKGQFSVAGQYQIIFGSGTVNKVHTELTKQLGIGDVSKAEVAEVAAGNQSLLQRLVKGLADIFVPIIPAIVAGGLLMGIHSMLTSVGFFWEGHSVVSKYPKVSDLVDFINTIANAPFVFLPVLLGFSATRKFGGNPFLGAALGMLLVHPALADGWNYAKILMEDKIQYWNIFGLAIEKVGYQGTVIPTIISAWVLATLEKTLRKFVPSYLDNLVTPLCSLFIAGCLAFTVIGPIGREAGSLISTGLTWLYDTLGFVGGAIFGTFYAPIVITGMHQTFIAVETQLLAEVVRTGGTFIFPIAAMSNIAQGAACLGVALALKDPKVRGLAVPSGISALLGITEPAMFGVNLRYRQAFFAAMIGSGLASAFIAFFNVKAIALGAAGFLGVPSIKPDSLAMYSVGMAISFIVAFSLSFVMVKRANVKA
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MNIKFTFKLEADSNCQGEYVLEYEATKPWTIDGANEKAAEIIRLLELHRLEQKPMIKPIPLIKVEHRHHLD
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MTRKKIPKAPDYLDDIAKSQWKAHIKQLIERGDIQDADLIHLEMYCTNYSLYRAAVKDLSERGFSITNSQGTEARNPALTAKADAEKIMIKMSALLGFDPVSRRKTPIDTEEKDELDEL
>NZ_CP040863|920171:968033|924818_925376_+|WP_059367746.1|DBSCAN-SWA
MLITHNREKLLQVITFFSQNVEKLGKIKLFKLLYFLDFEHYKQVGRSVTGLDYSAWKMGPVPVDLHEEIKQPEADFLAKIKIEQIPIRKGRQEMLKFNALSEFDQTHFSKRELKILNTLAQQYKNAFADDMIEATHLERLPWHQIYEVEGKKKEIIPYELALPSQNRESMHKDSIERLALLEVLK
>NZ_CP040863|920171:968033|922558_922747_-|WP_059366190.1|DBSCAN-SWA
MEKECISYEKAVDLAVQLVPKEEIYRANGNWENGLTDIVSALFQIADDIYNRINQDDDDVQP

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_164027824.1|920171_920786_+	polymer-forming cytoskeletal protein	A0A0M3LPL3	Mannheimia_phage	5.6e-44	85.2
WP_164027548.1|920763_921051_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027547.1|921051_921234_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027825.1|921589_922255_+	hypothetical protein	Q7Y5X0	Haemophilus_phage	1.9e-58	56.5
WP_059366191.1|922374_922590_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059366190.1|922558_922747_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164028794.1|922939_923236_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059366188.1|923222_923432_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027826.1|923453_923750_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_136125908.1|923762_924743_+	recombinase	A0A0M3LNU3	Mannheimia_phage	2.8e-114	71.9
WP_059367746.1|924818_925376_+	SocA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_059366185.1|925375_925786_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027827.1|926138_926786_+	hypothetical protein	Q7Y5X0	Haemophilus_phage	5.7e-63	58.4
926792:926813	attL	NA	NA	NA	NA
WP_167514393.1|926991_927636_+	translocation protein TolB precursor	A0A0M3LP90	Mannheimia_phage	5.4e-90	75.1
WP_164027828.1|927693_928404_+	polymer-forming cytoskeletal protein	A0A0M3LPL3	Mannheimia_phage	1.3e-33	72.2
WP_164027829.1|928433_928751_+	hypothetical protein	Q6J1P1	Burkholderia_virus	2.7e-10	44.7
WP_164027830.1|929299_929434_+	DUF551 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027831.1|929482_930157_+	hypothetical protein	Q7Y5X4	Haemophilus_phage	1.7e-09	28.6
WP_164027832.1|930969_931176_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027833.1|931397_932489_+|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	G8C7S0	Escherichia_phage	4.2e-58	37.8
WP_164027834.1|932753_935546_-	ribonuclease E	NA	NA	NA	NA
WP_059365661.1|935948_936917_+	23S rRNA pseudouridine(955/2504/2580) synthase RluC	NA	NA	NA	NA
WP_059365662.1|937007_937286_+	RNA chaperone Hfq	NA	NA	NA	NA
WP_164027835.1|937294_938650_+	GTPase HflX	NA	NA	NA	NA
WP_059365663.1|938675_939629_-	sigma 54-interacting transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_135969319.1|939978_941424_-	murein DD-endopeptidase MepM	A0A2K9VGT1	Pontimonas_phage	1.0e-19	48.7
WP_059365665.1|941601_942405_+	zinc ABC transporter ATP-binding protein ZnuC	G3M9Y6	Bacillus_virus	2.1e-14	26.8
WP_164027836.1|942404_943190_+	zinc ABC transporter permease subunit ZnuB	NA	NA	NA	NA
WP_059365667.1|943280_944228_+	acetyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit alpha	NA	NA	NA	NA
WP_059368799.1|944411_945278_+	pyridoxal kinase	NA	NA	NA	NA
WP_135969318.1|945277_946567_+|tRNA	tRNA lysidine(34) synthetase TilS	NA	NA	NA	NA
WP_059365669.1|946651_947269_+	MarC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_059365670.1|947706_948384_-	DNA mismatch repair endonuclease MutH	NA	NA	NA	NA
WP_077664652.1|948380_948920_-	methylated-DNA--[protein]-cysteine S-methyltransferase	M1PFU9	Streptococcus_phage	4.3e-24	40.1
WP_059365672.1|950495_950783_+	YfcZ/YiiS family protein	NA	NA	NA	NA
WP_059365673.1|950912_951950_+	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	M4QRQ6	Synechococcus_phage	4.5e-70	42.4
WP_059365674.1|952008_952647_+	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	E3SNR5	Prochlorococcus_phage	7.6e-28	41.1
WP_164027837.1|952704_953388_-	outer membrane beta-barrel protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027838.1|953667_954414_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059365677.1|954414_954975_+	septation protein A	NA	NA	NA	NA
WP_059365678.1|954974_955457_+	acyl-CoA thioester hydrolase YciA	NA	NA	NA	NA
WP_164027839.1|955468_955765_+	YciI family protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027840.1|955897_958078_+	transglycosylase SLT domain-containing protein	K4NWI2	Pseudomonas_phage	2.7e-16	35.8
WP_164027841.1|958110_958416_+	trp operon repressor	NA	NA	NA	NA
WP_059365682.1|958402_959146_+	monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase	NA	NA	NA	NA
WP_059365683.1|959191_960613_-	PTS sucrose transporter subunit IIBC	NA	NA	NA	NA
WP_164027842.1|961220_961619_+|tail	phage tail protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027843.1|961632_962823_+|capsid	phage major capsid protein	A0A2H4JED2	uncultured_Caudovirales_phage	1.3e-129	62.1
WP_164027844.1|962869_963436_+|head,protease	HK97 family phage prohead protease	A0A2H4JB68	uncultured_Caudovirales_phage	1.8e-49	64.0
963384:963405	attR	NA	NA	NA	NA
WP_164027845.1|963437_964676_+|portal	phage portal protein	A0A2H4JFJ9	uncultured_Caudovirales_phage	3.8e-140	61.4
WP_059365688.1|964659_965016_+|head	phage head closure protein	A0A2H4JHA9	uncultured_Caudovirales_phage	3.4e-09	36.3
WP_059365689.1|965002_965311_+|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	A0A2D1GNK0	Pseudomonas_phage	5.9e-10	36.0
WP_135969308.1|965320_965683_+	HNH endonuclease	A0A2H4JAS8	uncultured_Caudovirales_phage	3.3e-28	53.6
WP_135969307.1|966009_966369_+|terminase	phage terminase small subunit P27 family	A0A2H4JHS3	uncultured_Caudovirales_phage	3.2e-39	69.0
WP_164027846.1|966365_968033_+|terminase	terminase large subunit	A0A2H4JB64	uncultured_Caudovirales_phage	2.9e-244	70.9

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP040863|1144525:1154649|DBSCAN-SWA
GTCATTTGATTTCCAATTCTTGTAAAATTTGTTCTGCCGCAGCCTGTTCTGCTTTACGGCGACTTGATCCTTTCGCCACAAAAGTGCGGTCAATTTTAGCCACATTTTTCACTTTGCATTCAACAGTGAAAGTCTGGCAATGGGGTTCACCTTGAATATTAATAACTTCATAACTTGGTAATGCCAACCCCTTACCTTGTAAATATTCCTGTAGGCGGGTTTTCGCGTCTTTTTGATTGTCACCCGGTTTGATTTCTGCCAACAGAGTCTGATACCAGGTTCGAATCACTTGTGTCGTGAGAATAATGCCTTGATCCAACGACATCGCGCCAATAATGGCCTCCATGCAGTCCGCAAGGATTGATTCACGGCGAAAACCGCCGCTCTTTAACTCCCCGGAACCAAGCGACATATATTCCCCCAGTTCAAACTGACGCGCTAACATTGCCAACGTTTTTTCCCTTACTAAGGTCGCACGCATACGGCTCAATTCCCCTTCATTACAACGGGGAAATTGATGATACAAGGCTTCTGCAATAGTGAAATTGAGGATGGAATCGCCCAGAAATTCTAGGCGTTCATTGTGTTTTGTGGCAGCACTTCGATGTGTTAGTGCCAATTTTAAGAGCGAACTATCCTTAAATTGGTAACCGATTTTTCGCTCTAATCTATCTAAATGATTCATCTTATTTAATTGCTGTAAAGAAACGTTCAAAACGCAAGCCTGTCGGCCATTCGTTTGGTTCTTTTTCCAGACTCATCCAAATATAAGTGGCTTTACCGACAATATTTTTTTCCGGTACAAATCCCCAAAAACGACTATCATCACTGTGATCGCGATTATCACCCATGACAAAATATTGCCCTTCCGGTACGACCCATTCTGCGATCGGATTCCCCTCTTGGGTAAAAAATTCCGGGCCGGCATAATAGCGATACGGGCTAATCAATACGTTGTGTACCACATCACCTTTTTCTGTCAATTCCAATTCATTCGGAAATGCCGGATTCGTTGGATTTTGACTATATTCAAACGCTTTACTTTCACAGTTTACTTCGCAAGGTTTACCTTCTTTACCATACACAATCTTCAATGTTTTTTGATCCATATCGAAAATGATACGGTCTCCGCCTTGCCCTACAATACGTTTAATATAATCCACACCGGACATATTATTTTTTGAGGTTAACGCTAAATTTTCCGCATAAGCCGCTCGGGTTGCCCCCAATCCGGTACGAAGTAAGGCTTGTTCCGGCGCTTTAAATACGATGACATCACCACGTTGTGGCTTATCACCTGCAATAATCGTATTTTGAAAAATAGGATCTTTGACGCCATAAGCATATTTATTCACCACCAAAAAATCGCCTACACGCAATGTTGACTCCATTGAGCCGGAAGGGATTTGGAAAGGTTCAAATAAAAACGAACGGACAAAGAACACCACAGCAAGCACAGGAAATAATGAAGACAAAAACTCCGAACCTTCTGAAATAGGTTCGATTTTTGCCTTTTCTTCATCTGTTAATGCCTGACCAGAACGCTGCTCGGCACGAGCTATTTTACGTTGGCGTTTCGGCATAACAACAAAGCGATGGTAACACCATAATACGCCTGAAACCGTGGTCAAAATCAACAATAAAATACCGAAGGTATTCGGCAACTGGAAATAATCCAAAGCTTTCCAAATACCGAAACCAACGGCCAGTAAAATGATAAAAAATAAATTCGACATAGCTTTCCTTATTTATCCTTACCTACGTGTAAAATTGCTAAAAACGCCTCTTGCGGTACTTCTACATTACCTAAGGATTTCATTCGTTTTTTACCTTCTTTTTGTTTCTGTAAAAGTTTTTTCTTACGGCTAACATCACCACCATAACATTTCGCTAACACGTTTTTGCGTAATTGTTTCACCGTTGAACGTGCAATAATGTGATTACCGATAGCGGCTTGAATAGCAATATCAAATTGTTGGCGAGGGATCAGCTCGCGCATTTTTTCCACTAATTCACGACCACGATATTGTGAATTATCTTTGTGGACAATTAACGCTAACGCATCCACACGCTCACCATTAATCATAATATCGACACGCACCATATCCGCCGCTTGGAAACGTTTAAAACCATAATCCAGCGAGGCATAACCGCGGGAGGTTGATTTTAGACGATCGAAGAAATCCAGCACCACTTCGCCCATTGGGATTTCATAAGTCAATGCAATTTGATTCCCGTGATAGACCATATTGGTTTGTACGCCACGCTTTTCCACACATAGTGTAATAACGTTTCCTAAGTATTCTTGCGGCACGAGCATATTACATTCTGCAATCGGTTCACGAATTTCGGAAATATTATTAAGCGGCGGTAATTTAGCCGGACTATCCACATACACCACTTCGCCACTGGTCATTTCAACTTCATAAATTACCGTTGGTGCTGTGGTGATTAAATCAAGATCATACTCCCGTTCTAAGCGTTCTTGGATGATCTCCATATGAAGAAGTCCCAAGAAGCCGCAACGGAAACCAAAGCCAAGTGCGGTTGAATTTTCCGGTTCATAGAATAATGAGGCATCATTGAGACTTAGTTTACCCAACGCATCACGAAACGCCTCATAATCATCCGAACTGACGGGGAACAAACCGGCGTAAACTTGAGGTTTGACTTTTTTAAAGCCGGGTAAAACACTACTTGCCGGGTTATGTTGATGAGTTAATGTATCCCCCACCGGTGCACCTAAAATATCTTTAATCGCACAAACGACCCAGCCGACTTCGCCACAATTTAATACCGTTGTGTCCACTTGCTTTGGTGTGAAAATACCAAGACGATCCACATTATAAGCCTGCCCTGTGGACATCACTTTAATTTTATCGCCTTTTCGTAATACGCCATTTTTTATCCGTACTAAGGAAACCACGCCAAGATAGTTATCAAACCAAGAATCAATAATCAGGGCTTGTAACGGCGCATTCGGATCGCCCTCAGGAGCAGGGATTTTCGCCACAATTTCTTCCAATACATCTTCAATGCCCTGTCCGGTTTTTGCAGAACAACGCACCGCTTCCATCGCGTCAATACCCACAATATCTTCAATTTCTTCGGCAACCCGTTCAGGATCTGCTGCCGGTAGATCAATTTTATTTAAAATCGGCACAACCTCCAGATTCATTTCAATGGCGGTATAACAGTTCGCTAGAGTTTGTGCTTCTACCCCTTGCCCGGCGTCCACCACTAACAATGCGCCTTCACAAGCGGCAAGAGAACGGGAAACCTCATAGGAAAAATCCACGTGTCCCGGTGTATCAATAAAGTTTAATTGATAGGTTTCCCCATCTTTGGCTTGGTAATTTAAAGTTACGCTTTGAGCTTTAATGGTGATACCGCGTTCACGTTCAAGATCCATTGAATCCAACACTTGTGCTTCCATTTCACGATCTGAAAGACCGCCACAGGTTTGAATCAAACGGTCGGAAAGGGTTGATTTACCATGGTCAATATGGGCAATAATAGAAAAGTTACGAATATTCTTCATAAAAGTTTTGGTTTTCTCAAAAAATCATCAAATTTAACTGGCGGATTGTACCTGAAAAGCACCAAAACCGCTAGGGAAGAAAGGAAAGTGCGGTGGATTTTTTCTGAGTTTTAGAAAAACAAAACCCCGACAAAATCGGGGTTTCTATTTAATCTTTCAATTACAGACTTTCAGTGAAAGTACGGGTAATAACATCACGTTGCTGTTCCGGAGTTAAAGAATTGAAACGCACTGCGTAACCGGAAACACGGATTGTTAATTGTGGATATTTATCCGGATTGTTTACCGCATCTTCTAATGTTTCGCGACGTAACACGTTCACATTTAAGTGTTGACCGCCTTCCACTTTTACGGTTGGCGCAACGTTTACCGGTAATTCACGGTATTCGATTTGACCAAGTTCGCTTACTGCAACAACTTGATCTTCCTTGAAATCCCCTTTTGCGCATAGGCAACGAGCCTCATTCGTCTCACTATCTAACAACCAGAATGAGTTGAGTAAATTGTCATTTGCTGCTTGGGTAATTTGAATACCTTTAATCATAATAGACTCCTAAGTTGGTATGGGTATAATCATAAAACTGTGCAAATTTTATCAAAAAATTTTAATACATCAAATTCTTTTGATTAAGAATAAGCAGCTTTTTGCAAATTTTTCGTGAGATCAAAAAATTTTCTTGTAGCCTAATCGAGTTACAAGACTTAAATTAACAGTTCATCAACAAATTATCTCGTTCCATAGGTTATAACTTAGTTTATAATGCGACAACTCAATTTAAAGAGGATTCAATAATGAAAACATGGACAGATGTGATCGGCAAAGAAAAAGAGCAACCTTATTTCCAGCACACATTAAAACAAGTTCACCTTGCTAGACAAAGTGGGAAAACCGTTTATCCTCCGCAAGATGAAGTGTTCAACGCGTTTAAATACACCGCATTTGAAGATGTTAAAGTGGTCATTTTAGGTCAAGATCCGTACCATGGTCCAAATCAAGCACACGGGCTTGCTTTTTCAGTTAAACCGGAGGTGGCAATCCCTCCGTCCCTCGTGAATATCTATAAAGAATTAAGCCAAGATATTGCCGGTTTTCAAATGCCCTCCCACGGTTATTTAGTGAAATGGTCGGAACAAGGGGTGTTATTGCTCAATACCGTATTAACCGTTGAGCGGGGACTTGCCCATTCACATGCCAATTTAAATTGGGAAACCTTTACCGATCGCGTTATTGAGGCACTTAATCACTATCGTAAAAATTTAGTTTTTTTGCTCTGGGGTAGCCATGCGCAGAAAAAAGGTAGAATGATTGATCGCTCTCGTCATCTGGTTCTTAGTGCGCCTCACCCGTCTCCCCTTTCAGCACATCGAGGTTTTTTAGGTTGCCGCCATTTTTCCCAAACCAATGCTTACCTGAGGGAAAACGGGATCAAAGAAATTAATTGGCAAGTTTAAAGTGCGG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AGGCTAATATAATGAATCACCAACAAAGAAATATCTTCCTTATCCAAACGTTCATCAAAATGGGGCGAAAGAATTCGTCGGCAATCAGTCAACCAACCTTGTTCAATACATTTCAGTTTTTTCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_8

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MNQREMLLTYAAEQYGTSPEYLWKKFPSYAVLRHNNLRAKWYALIANVPKMKLGLNEEGNVEIANFKCIPELVGALRQNKNIFPAYHMNKEHWITVILDNNVPDDELCRLMEESYRLTG
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MKTWTDVIGKEKEQPYFQHTLKQVHLARQSGKTVYPPQDEVFNAFKYTAFEDVKVVILGQDPYHGPNQAHGLAFSVKPEVAIPPSLVNIYKELSQDIAGFQMPSHGYLVKWSEQGVLLLNTVLTVERGLAHSHANLNWETFTDRVIEALNHYRKNLVFLLWGSHAQKKGRMIDRSRHLVLSAPHPSPLSAHRGFLGCRHFSQTNAYLRENGIKEINWQV
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MIKGIQITQAANDNLLNSFWLLDSETNEARCLCAKGDFKEDQVVAVSELGQIEYRELPVNVAPTVKVEGGQHLNVNVLRRETLEDAVNNPDKYPQLTIRVSGYAVRFNSLTPEQQRDVITRTFTESL
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MKQYLDLCRRIIDEGEWIANKRTGKRCLTVINADLEYDVANNQFPLITTRKSYWKAAIAEFLGYIRGYDNAADFRKLGTKTWDANANDNVAWLANPHRKGTDDMGRVYGVQGRSWRKPNGETVDQLRKIVNNLTQGIDDRGEIMTFFNPGEIDLGCLRPCMHTHTFSLVGDTLHLTSYQRSCDVPLGLNFNQIQVFTFLALMAQITGKKAGKAFHKIINAHIYEDQLELMRDVQLKREPFPLPKLEINPDIKTLEDLETWVTMDDFKVIGYQSHEPIKYPFSV
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MIDFDGYRPNVGIVICNRKGQVLWAKRYGQNSWQFPQGGINDNESAEQAMYRELYEEVGLQPKDVRILSVSKHWLRYKLPKRLLRYDSKPMCIGQKQRWFLLQLISDEKNINMQTTKSPEFDGWRWVSFWYPVRQVVSFKKEVYRRAMKEFATFLFSNEKEKSVDQSEREQKFTPSRKSHYSKYSKRPFNKRG
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MMNQYLLLPHFDPSIFTFGDSNIGLRWYGLMYLLGFVFARWLAVRRANQPNSGWTVEQVDTLLFNGFMGVFLGGRIGDVFFYNLDHFLRDPLYLFRVWEGGMSFHGGLIGVIVAMIWTSRSQKRQFWVTADFMAPLIPFGLGLGRIGNFINLELWGRETDVPWAMIFPNDPLLLPRHPSQLYEAFLEGLVLFTILNFFIKKPRPAGSVSGLFLIGYGVFRFVVEYVREPEVESFLGVMTRGQALCLPMIIGGGLIMLWAYTRKSAVKN
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MRLALDLADKAESLGEIPVGAVLVDSEGNVLGEGWNLSITENDPTAHAEIVALRHAAKKVQNYRLLDTTLYVTLEPCTMCAGAILHSRIRRLVFGASDYKTGAVGSRFHFFDDYQMNHTVEITGGILAEECGEKLSAFFRKRRAEKRSEKVNARL
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MNHLDRLERKIGYQFKDSSLLKLALTHRSAATKHNERLEFLGDSILNFTIAEALYHQFPRCNEGELSRMRATLVREKTLAMLARQFELGEYMSLGSGELKSGGFRRESILADCMEAIIGAMSLDQGIILTTQVIRTWYQTLLAEIKPGDNQKDAKTRLQEYLQGKGLALPSYEVINIQGEPHCQTFTVECKVKNVAKIDRTFVAKGSSRRKAEQAAAEQILQELEIK
>NZ_CP040863|1144525:1154649|1152189_1152987_-|WP_164027910.1|DBSCAN-SWA
MLAFIVICLLVGALVGFLAGLFGIGGGLVIVPVLVYLLPMMGVPEPLLMSTALGTSFATIVITGFSSAQRHHKLGNIVWEAVKILAPVIMITVFISGLFIGKLDRDIVAKLFACLVVYLAVKMVISIKPKATESTKTLTTKSSIIGGILIGMASSAAGIGGGGFIVPFLNSRGIDMKKAIGSSAFCGMLLGLSGMLSFMVSGWDNPAMPDYSLGYIYLPAVFGITATSFFTSKLGATATTKLPVSMLKKGFALLLIAIAIDMFLK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_135969032.1|1144525_1145209_-	ribonuclease III	A0A1C9C5A7	Heterosigma_akashiwo_virus	3.3e-21	36.1
WP_059365839.1|1145210_1146260_-	signal peptidase I	NA	NA	NA	NA
WP_077582579.1|1146268_1148065_-	elongation factor 4	A0A2K9L2P9	Tupanvirus	3.8e-24	42.6
WP_077582580.1|1148225_1148609_-	autonomous glycyl radical cofactor GrcA	A0A2K9VG12	Escherichia_phage	1.3e-30	70.0
WP_059365842.1|1148857_1149517_+	uracil-DNA glycosylase	A0A0A7D988	Equid_alphaherpesvirus	7.8e-52	46.5
WP_059365843.1|1149596_1149956_+	MmcQ/YjbR family DNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_059368808.1|1150012_1150480_-|tRNA	tRNA adenosine(34) deaminase TadA	S4VYZ2	Pandoravirus	6.6e-05	28.8
WP_059365844.1|1150516_1151368_-	thymidylate synthase	H9EB68	Vibrio_phage	1.2e-134	78.1
WP_059365845.1|1151377_1152184_-	prolipoprotein diacylglyceryl transferase	NA	NA	NA	NA
WP_164027910.1|1152189_1152987_-	TSUP family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_059365847.1|1152990_1153572_-	RNA pyrophosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_164027911.1|1154079_1154649_-	1,6-anhydro-N-acetylmuramyl-L-alanine amidase AmpD	A0A076YN96	Rhizobium_phage	2.9e-10	30.9

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP040863|2062207:2105929|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9

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>NZ_CP040863|2062207:2105929|2078745_2080815_+|WP_164028442.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MVIQTFLAEIGTEELPPKALKKLGTAFAENVEQALNQAGLAFDKVEWFASPRRLAVKVLALAMQQPSKEIEKRGPAISAAFDAEGKPTKAAEGWARGCGIGVAQAERLVTDKGEWLVHRAKIEGQPTKNLLSDIVANALAKLPIPKPMRWADKTVQFIRPVHTVTMLLGDELIEGEILGVASGRTIRGHRFLGEREFEIQHADQYPQLLREKGSVIADFNERKAEILAKSQEKATALGGVADIEEDLLDEVTSLVEYPNVLTAKFEERFLAVPAEALVYTMKGDQKYFPIYDKEGKLLPHFIFVSNINPDDPTAIIEGNEKVVRPRLTDAEFFFKTDLKQKLVDRLPRLETVLFQQQLGTLRDKTARIEQLAGEIAKQIGADEVKAKRAGLLSKCDLMTNMVFEFTDTQGVMGMHYARYDGEDEEVAVALNEQYMPRFSGDSLPKSLVASAVALADKFDTLTGIFGIGQAPKGSADPFALRRAALGALRIIVEKNLPLDLEDLVQKSTALFGDKLTNENVVADVVDFMLGRFRAWYQDEGIAVDVIQAVLARRPTKPADFDARVRAVSHFRTLDSAEALAAANKRVSNILAKVEGEISSQIDRTLLLEEEEKVLAEQVLALQSELSPLFEQGKYQAALDRLAGLREAVDNFFDKVMVNAEDPKLRQNRLAILNNLRNLFLQVADISLLQ
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MADTTNDRFLRIDEVIQMTELSRSTIYDYSRCGRFPEAVDLGGNKRAWIESEVKQWMNDRIKQRNNKAKAGN
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MAICGRNVLDGAFIHLEPKQLNAQNGVLLTAQNLIGGLRAINAPFFPANGILITTLSNLAIYLKQNTARLFFKQEVREDSLNVYFSVQLDYLFENYRHAVLIEGIEG
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MNNAMTPTQERKQHSVTLAGIEEMISRIEAFSSSAVTGKASIINPDGTKTPMKPNESFDLINEMANLALMDIQTLRQEFERLTTINKKRGELVYLPVVDVKGDLIQ
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MNTNQELLEAVFPKVFHKETVAMTDSLKVAQYFGKRHDNLLQSIKNLGCSEEFNALNFKAVKYTDDKGEKRPMYLMTHDGFTLLTMGFTGKKAMQFKEAYITQFNKMKDWITTKSKLSHDQHRMNEAIKFHLESTGKQDEHIYSRENNLVYVVALGSTRKKWLKDNGYSPNDEIRDHLTESQLKLIDDLLSENAVMIKLGMNYHERKAKLEQSALYSLRKWALAA
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MNTYSLHFPNGAELEFFASDSALFNEAFFGLEFPKNEQLNFYERRMNKIKNKRKAQRIARRKNRK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
2056835:2056851	attL	NA	NA	NA	NA
WP_164028429.1|2062207_2065033_+|tRNA	isoleucine--tRNA ligase	A0A1V0SJ93	Klosneuvirus	5.5e-78	26.4
WP_077581977.1|2065098_2065617_+	signal peptidase II	NA	NA	NA	NA
WP_077586782.1|2065613_2066558_+	4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase	NA	NA	NA	NA
WP_164028430.1|2066765_2067371_+	CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_164028432.1|2067455_2069201_+	alpha/beta fold hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_164028433.1|2070486_2070846_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164028434.1|2070854_2071508_+	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_059367974.1|2071507_2072443_+	phosphatidate cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_164028436.1|2072673_2074599_-	TonB-dependent receptor	NA	NA	NA	NA
WP_077466004.1|2074791_2075700_+|tRNA	glycine--tRNA ligase subunit alpha	NA	NA	NA	NA
WP_164028438.1|2075745_2076393_+	FABP family protein	NA	NA	NA	NA
WP_164028835.1|2076443_2077832_+	restriction endonuclease subunit M	A0A0N9PBJ7	Sulfolobales_virus	8.3e-19	31.6
WP_164028440.1|2077818_2078733_+	CfrBI family restriction endonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_164028442.1|2078745_2080815_+|tRNA	glycine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_164028444.1|2081175_2082405_+|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	A0A1V0E8G8	Vibrio_phage	6.5e-84	39.9
WP_164028446.1|2082603_2083398_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164028447.1|2083601_2083814_+	AlpA family phage regulatory protein	NA	NA	NA	NA
WP_077664860.1|2083823_2084075_+	transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_164028449.1|2084102_2084423_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164028451.1|2084419_2084650_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164028452.1|2085173_2085467_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164028454.1|2085456_2086134_+	hypothetical protein	A0A0H4IQ68	Shigella_phage	8.9e-27	37.9
WP_164028456.1|2086145_2086955_+	phage antirepressor Ant	A0A0P0ZCA2	Stx2-converting_phage	5.0e-16	38.2
WP_164028458.1|2087042_2087231_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164028460.1|2087759_2088119_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164028462.1|2088105_2088642_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164028464.1|2088634_2089012_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164028466.1|2088999_2091177_+	DUF927 domain-containing protein	A0A1W6JPG0	Morganella_phage	2.3e-124	40.4
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WP_077427175.1|2091998_2092211_+	antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_164028470.1|2092914_2094138_+|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	A0A1B5FPC6	Escherichia_phage	2.5e-67	36.8
WP_059367958.1|2094165_2094426_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164028472.1|2095010_2095229_+	AlpA family phage regulatory protein	Q7M299	Enterobacteria_phage	3.2e-10	51.6
WP_164028474.1|2095231_2095924_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164028475.1|2095934_2096507_+|capsid	P2 family phage major capsid protein	A0A1L5C2B0	Pseudoalteromonas_phage	2.1e-05	47.3
WP_164028836.1|2096543_2096867_+|capsid	P2 family phage major capsid protein	A0A2H4JCR7	uncultured_Caudovirales_phage	7.5e-08	38.8
WP_164028477.1|2096872_2097094_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_135969508.1|2097196_2097460_+	type II toxin-antitoxin system RelE/ParE family toxin	A0A1S5NR91	Burkholderia_phage	2.8e-13	45.3
WP_164028479.1|2097471_2097864_+	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A1S5NNJ5	Burkholderia_phage	3.5e-07	33.9
WP_164028481.1|2098516_2098786_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164028483.1|2098923_2099139_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_164027396.1|2099150_2099576_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164028485.1|2099670_2100219_+	ash family protein	NA	NA	NA	NA
WP_164028487.1|2100211_2100382_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164028488.1|2100381_2100708_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164028490.1|2100707_2101022_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_164028492.1|2101225_2102230_+|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	Q19US1	Mannheimia_phage	3.7e-93	55.3
WP_164028494.1|2102247_2102544_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_110890466.1|2105551_2105929_+|integrase	integrase arm-type DNA-binding domain-containing protein	A0A0R6PH06	Moraxella_phage	3.5e-12	49.4
2111431:2111447	attR	NA	NA	NA	NA