Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP046243 | Campylobacter lari strain SCHS02 chromosome, complete genome | 1 crisprs | DEDDh,WYL | 0 | 0 | 2 | 0 |
1. NZ_CP046243
Click the left colored region to show detailed information
0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP046243_1 | 1364091-1364351 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP046243_1
|
2 spacers
spacers of NZ_CP046243_1
>1.1|1364148|72|NZ_CP046243|PILER-CR ATCAATTTCAACTGCAGCCATTCCTTGAAAAAAGTCTTTGGTTTTATTGTATTTAGTGTCTATAGCAATTTC >1.2|1364277|48|NZ_CP046243|PILER-CR TCCATTAAGCTCAACCCTAGCTAAACCTTCGTTAAAATCATAAGCATT |
WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP046243_1
The CRISPR arrays of NZ_CP046243_1 >merge|NZ_CP046243|1|1364091-1364351|PILER-CR ATCATACTTTGCTTCTATGACTAAATTCCCTTTTTTATCTATAAAACCCCATTTATTATCAATTTCAACTGCAGCCATTCCTTGAAAAAAGTCTTTGGTTTTATTGTATTTAGTGTCTATAGCAATTTCCCCTTTTTTATCTATAAAACCACATTTTCCATTAAGCTCAACCCTAGCTAAACCTTCGTTAAAATCATAAGCATTATCATACTTTGCATCTATGATTAAATTCCCTTTTTTATCTATAAAACCCCATTTATT >NZ_CP046243|1|1|1364091-1364351|PILER-CR ATCATACTTTGCTTCTATGACTAAATTCCCTTTTTTATCTATAAAACCCCATTTATT ATCAATTTCAACTGCAGCCATTCCTTGAAAAAAGTCTTTGGTTTTATTGTATTTAGTGTCTATAGCAATTTC CCCTTTTTTATCTATAAAACCACATTTTCCATTAAGCTCAACCCTAGCTAAACCTTC GTTAAAATCATAAGCATTATCATACTTTGCATCTATGATTAAATTCCC TTTTTTATCTATAAAACCCCATTTATT
>NZ_CP046243.1|WP_070256867.1|1363444_1363636_+|hypothetical-protein MLDLQFENVSDLGNGIYELSKNGHKFYLEYNGKITLNPFSQRQIECISKDIGWRILRLLELKV >NZ_CP046243.1|WP_070256866.1|1363229_1363472_+|WG-repeat-containing-protein MKEVKIIIDDEFDYIRDFKNGFSAVKKAGKYSFINKNGELICDFLYDDILDFSQNLAAVMKNGVLLIQMENLCLICSLKM >NZ_CP046243.1|WP_070256864.1|1362959_1363148_-|hypothetical-protein MKKKKLPSQVLFSFEDSPFESKEEYLEFIKNMPKIATLDKALIKKSREENLANKSLAKFTKR >NZ_CP046243.1|WP_070256860.1|1361909_1362737_+|NAD-dependent-deacetylase MQIKTHIKEALDKAEIIIITAGAGMGVDSGLPDFRGKDGFWRAYPHLQKLGIDFERMANPTNFYTNAQLAWAFYGHRFKLYKDTKPHKGYEILLKLAKSKQDYYVVTTNVDGHFKKAGFDENKIYEFHGNINYLQCFNYACGDLIWQMQEELDIDMENFKALSLPKCPRCQGLARPNILMFNDGSFNDGRYFLQKQNYKNWLKPLEDKNILLIELGAGKAIPSMRIFGEDFCKKSKTRTLLRINPNECDFPKFFRNGIGLKMKALEALEMIDSLI >NZ_CP046243.1|WP_070256857.1|1361471_1361900_+|hypothetical-protein MALALESIQDYTIQKGKKSFWMCFNTPNNDFHVNKTKHSDLFDKNKTDYKARDEFLAFMKENFPKTKLTMVFDTASVGYLSYPYLGSLAVDCEENDEVYKAINKKYEDEDCMPKSMNAVFWEMSLEVAKELHEARKFDYENF >NZ_CP046243.1|WP_080750177.1|1357470_1357641_-|hypothetical-protein MQNEFKDAQISTIEKGGGHFIVEVDGKIIYSKKDLFNCEVDRFPHEGEITKLMKQM >NZ_CP046243.1|WP_070256853.1|1356880_1357447_+|DJ-1-family-protein MKKVLVPLAKGFEEAEFIGIADVLKRAGEASGNLEVIIASLDEELLVQGANGICIKADVSLASIDQENLDAIALAGGFEGMMNLKNNPTIIKIIQDLHAKQKIVAAICASPIVLAKAGVIKGEFSCYPGCEVGIEGTRINKAVVVNENVITAAGPATAILFGLELVKHLCSEEIYQKLYEGMLVPLTK >NZ_CP046243.1|WP_070256851.1|1355996_1356869_+|N-carbamoylputrescine-amidohydrolase MKLALIQQEFKQNKEKTIEKTCELIKQAAKEKAELVCLQELHQTQYFCQSENTDFFDLANDYEEDINFWSNVAKENKVVLVTSLFEKRSAGLYHNTSVVFEKDGSIAGKYRKMHIPDDPCFYEKFYFTPGDLGFEPIQTSVGKLGVLICWDQWYPEAARLMALKGAQILIYPTAIGWFDKDSKEEKQRQLEAWIGVQRGHAIANGLPVVAINRVGFEKDESGVEEGIRFWGNSFVFGAQGEELFRADDKQELCKIIEIDMQRCENVRRWWPFLRDRRIEYFHELNKRFID >NZ_CP046243.1|WP_070256849.1|1355113_1356028_+|cation-transporter MNLQKSATIIASVCAIFLAIVKFIVGLASGSVAVLSSAIDSLLDCVISGLNFLALKKSSQGSSKEYNFGLSKIEALMGLFEGLVISGVGVYIFYESVLKIHNQESVEKLDLGIFVMAFAMAVTLCLVIFLNYVAKKTKSLIIKADSLHYKIDFLTNALTLLALVIIAFTNYHFIDGLFGIAISLYTIFSAFKIIKESSKILLDVAIDKEQVEVIKQIISANKEVKSFHHLKTRTSPDILYVSVHLVFEPTISLLKAHKIGDEIEDSIREHFKDDFWNIHIHLDPYDDSEEERSKNEISTHTARI >NZ_CP046243.1|WP_070256847.1|1354139_1355117_+|peptidyl-arginine-deiminase MRKSIAEWQKQELLLLSLPHENSDWKPYLEEILQSYEEFVKAVANFQKVLFIAPSEKDFQRFKHIKNVDFFKCDTNDTWIRDFGAIDVCEDDKLIGLDFTFNAWGDKFQSTLDNAVNSKLFSQKLSGKLEKIDFILEGGSIDFNGQGVMLTTSACLLNENRNSHLNKEQIEAKLKEIFGLKEIIWLENGFIKGDDTDSHVDTLARFINEKTIAYCVCKDENDEHYAPLKAMEEELKKTGFDLLELPLPKPLYFEGKRLGATYANFVFVNGGLIVPTYNDENDALVLENLQKACKDRKVVGVDARVFLRENGSLHCSCQNRYEGQR >NZ_CP046243.1|WP_070256869.1|1366506_1367151_-|hypothetical-protein MKKLFLILSILMCICFTFTNAEVNYTTAQQDITIEKTIDNNTSTKIAQEDYTNTIIITIAILIYIIIAAVLVYYGLKGKVVIYRNTIDLSLCVGLFAVLPLAFIIFMTLFLMRIERDTALIIMGVIAFIWACVVLYIAYTTLRDNRNNPLLMILILPLKITLGLWYGLSIFAVLRKSNLKTVAQRREEKQNALARFAFSSGLIYALMRDKPLKK >NZ_CP046243.1|WP_070256870.1|1367346_1369224_+|AAA-domain-containing-protein MSDLKTSLNAIKDKNFGYFFDKDGKCYIYHTKFGKERNSEISGNDNIESKFRDLIDDIYKENDDKFNSLKEAFENYLYIYNDKSTIHIKFDKDGEFLQTKSEIVNKFSETFGKKIDEIDFNQGNFNDETFKQWWDKSINSARMQGNATNLLKDKGKLIENLKKIKEAAKSETLTKLFEALSKVEGMSATARELAYFLQFNLESNDKFPLANDAMINMAKYIFEMLNEDSKKKLEDIKKETTKTRNEEIYFNFVLDELKINENSYNLPKYYILDQFLNLIDKIKKSDLALIAKEKLAENDLDQSAYYKLYKAAYDFANLCGKADIKSNDLEGFKKLLKTHKNIIFHGIPGTGKTYTIVNNVKNIIKNENQMLITQFHPSFSYEDFIEGIKPAGIENGQLKLELKNGIFREFCDKAKEEEKGFLEKLEKGNFNEALSDHGYFFIADEINRAELSRVFGELLYALEYRGEKGKIKTQYASMRNDEDFYVPENVFFLGTMNDLDKSIDSFDLALRRRFIWQEMECDYNVIRDEIYANNIEEYAQACKKLNDKISKNIGEKYQLGHSYFLKIEFKNDEIKDSDMKKLFSNRFEALLKEYLRSEYSEKDIQTSLDKLKKLFVIEKNDDKNK >NZ_CP046243.1|WP_070256871.1|1369204_1370545_+|hypothetical-protein MMIKINDNSFIEINQKSSRIQDFDLYFEDFIKNGNFFSFFNDDEKILSKNAKNPIISLRTIEENKRQITSGNYIGKISYNGLEIEINSRFGKKFLERMLNYANDVFVDDVSIYQDVKKESNISEFILFYIFVQKLEKSFLIGLPKNYQSKKYNDLRFKGNIDMVEFIKHNIPLKAKVATKTREQIEDVHIINVLYKALEVIEKKNSGFLKNVKHIKTYLVQNKSEHCFIKESLNKAFSSKALRNQNYQNYKELLKYAKMIIESQNFTSKNKNDQKSYGFIVNIAELFEIYISKLLRNNFEEYMVDSPKLEIYKNSFYKRYIIPDIVLSKDDTYIVFDTKYKRMKMEGRSQNGMGDLDRNDLFQIHTYMGYYQKIGKVLLGGLLYPMQEFEKAKCHSENSILSDEYKFIVDGIFLEDSQDKEITHEYITQKETQFIERIKELLKQSF >NZ_CP046243.1|WP_070256872.1|1370536_1371229_-|hypothetical-protein MNITLQGTLHKSFVFGFNDIKAKDYIKALFKSKNDELNFQAQIQNAEDVQLLSQSYHLENGCFLDINTQSRLLSFENFLSQNYADFKHFCVVDFIKHNAKIHYKLKETNTKSKLYHLASAYAFAENGWVDKKLLNINNISPYQNILIEGLFYTKEQELLEILKQNENLIRNNFYLKDYDFSKGLKKLLDVSLDILFANISTKNFKPYKLEINSITHEDIERKISFTKLLK >NZ_CP046243.1|WP_070256873.1|1371242_1373165_-|AAA-family-ATPase MQTNTSTLTHIVDLDYYTHNIRVISLHAQMFSHNKQIKKDFYSEFEDILNKDSKIPSFIYKQYSKFILPDFLKKNLNYLKKYLNFSQAECDVFVFFYYANKGRFALHQGYSAALGKKIIEKIFNLTPKDINKALSNDSMLFKLDALCYYDSDAFGIDIKNFENIFTQDISKTTLMSEFSYFLPKTRLNLSDFDYIQEEFNTITTFLKKSQKGNIFIYGKAGVGKNELSALIAKELGKEALCVKDCEDVKKSNRISNFYALKKIINPKKQMIIFDECEDSLCYDSLKEKIRINKILDEENGICVFLSNSNEMDEAYLRRFDMILELECMPKEKKIQNIKKLFAKKRLKIDEAIIESIASHPELSQGVILKCANNAKIFKNKSQEVFVRLINENLKARSLRTISMPKKDKKYNLNLIECDLNLQELINNINENSNLRILSYGIAGSGKSEFGKELANVLNKTLHSYKLSDILDPFVGNNEKNIANIFKKASKDNAILQLDEIDALIYSRDEANKSWEKSLVNEMLMQMENFEGIFIASTNYLQSLDKASIRRFDLKIEFQALKQEKLLKAFEFFAKELNLSFDKKQITKRLLRLQNICLGDFALILRQNKIFKIKNIDEFLEKLEKESKLKSDDEKTNMGFL >NZ_CP046243.1|WP_159427734.1|1373231_1373387_-|hypothetical-protein MCKKIFSQNPTLSKESIIHTLKQSLNLKHIIFLPKLAYDRYTHNDDINDFS >NZ_CP046243.1|WP_141080128.1|1373379_1373520_-|agmatine-deiminase-family-protein MIAISTLLSSKHKRIYQNLVQNFAKLNITFKEIPSNDIWLRDFMYV >NZ_CP046243.1|WP_070256875.1|1373516_1374065_-|hypothetical-protein MLQTMKHILTHTDETLLAKKFGYNNVEKFIKTKTLFLECESIQEWLLKGHYDMVNSSLEFIQKFDFILDKEILNSTLEQSILLKDKHIKLQEAKAIIKTNFKRKSEPLHVLMFLSHLRVLKFPISNDLLYLNKTQIMQKFKELTIKHYKNSQGKLKLWGDILQYDIIYDDDLLVLSMLKSDE >NZ_CP046243.1|WP_070256878.1|1374170_1375565_+|PD-(D/E)XK-nuclease-family-protein MKVFIEELLRVNNKFEENTKKGMSDINIFEALNVQESENYHSKFIAYLIDPHDDHYQELFANEFLKKLGRYTKAKKFKNLTAYDIERVETEARAKDNRRIDILISLKDKRYIIIENKLNARDQPNQLKDYVKYIKEKVENMDDFHENILTIYLHKNEDTEPSKYSLGTRNGFKINDDLIYNNSNKKMSYYLKMDYKWIKEWVNACIGVCENKVKNNEIDKKFKNDMQNVIFTLNQYKTILTWYVAIDDYVVKDYVLEFLKSSKENLNNSIKLKDESDSKDIKYKKAKEIVEEKWDEICEELVSDFFNELEKEFEKERTICGIKWFGYKLNEKRFNCDWFDFYPKIYEDDGNDVWPSVGVYFGKSDYSNFGLTFKINHNKKNDKYKEFFQNSNIRNDNIRRSGNHYYYNEFDNFNFKEKYAFVYWLINNHGNWMVEFSKILEEFLNKETIKNTLKKINNKLKPNK >NZ_CP046243.1|WP_070256880.1|1375569_1376490_-|transcriptional-regulator MKDLKKYIANSKLTRLEVLYEKLVKSENGITIKELAQELNVSAKTIKRDMQGVFEPMGLIKNGRKWRIDTSKDTQEQDDEKIILEVLDTMAKSAGNSFYAKAHPLLSKLSQNISNPIHTSLDAEKLEEKDLNNFQILEQAINTKTQIVFKYENKLFQAKPLKLAFFSGFWYLLAFDMKKRDIFKKFYLKNIQNITLTQEHFQTDESLEIKLQRVNSIWFSLDKPFTVRLLVEEPIRKYFERKPLNSQIITGKDKDGSIEIELEITHEMEILPLVYYYIPYVKVLEPDFIANKVKEVVKQYLDHISK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
Click the colored protein region to show detailed information
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
398304 : 407007
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP046243|398304:407007|DBSCAN-SWA TTCATAATATTAACCTTTCATATTCTTGTGGTGTTCCACAAAATATTATATCATTTATATCTATTTCATGATATCTTATATCTTTATTCTGATTAATCAAATAATTGTACATAGGTGCTATATAAAATTCATTTTTTACCAATAAATTATTAATTTTTATATAATGAAAAACATCTTTAAAATCTTTACTTTTTTTAAAATAATATAATCCACTACTACATAAATTTGAAATTTTATCTTTTTCTGTAGTTTTTAAAACTTTTTTATTTTCTCCTGGTAAAACAAAAGACCATTGGTCTCCATCAGCTTGAAACACTTCCAAATATCCATCTAGCTTCTCATAGTTAAAATTAGGTAAAATATAATTATATCTAAAAGTATCTATATTAAAAATTAATATATTTTCATTATCATCAATATGAGATTTTTCCAAGCCAAGCATAACTGTGTGAGCTTGTCCTTGAGTTTCATTATCAAGTTTTACAAGAAATTTATTCTTAATTTTAAGTTTTTTACACTCTTCTATAATAAATTTTTCAGTATTATAAATATCTCTATAAATAAATAAAAAATTGCAATCTTCAAAATAACATTTAAAGCTTAAAACTGCATTATAAAATACAGTTTGATTTTGTATCTCAAGCATATATTTTGGTATTTTATAACCCGCATTTGAAAATCGTGAACTAAGTCCAGCCATAGGAAAAACAATAGTCATAGCAAACCTTTATCTTTAAAATAAAAATACAATCTAAAAATGTTAACAAATAAAGCCTTTTGCCTATCATCATCGTCAGCATGCAAAGGAAGCATAGAGGCAAATAAGTGTATTGCAATCGAACAAACTTGTTTATCAATTTCAAACATTGCAAAAAATTCCTCTTGAATTTTAACTATTTCATCACTTATATCTATAGATAAAAATATTTTATCTTTTTGGATTTCACATCTTGAAAAACCAGAAATAATAAAATCGTACAAACCTAGTACAGAATGTACTAATTTTGCATAGTCATAACGTATATCTCCATAGACTGTTATATTTTCATCAAAATCCATTCCTCTAGGATCAAATGTTTTTATATTTTTTGATCTAAAATCATACATAATATTACTAAAACAAAAATCTCCATGAATCAACACTATATCTTGCTTTTGTGATATGTTTTCGTTTAACAAATCTAAAATTTCACACACTGATATGCTTTCATAGTTGTTAAAAGAGTATTTTTTGGTAAAACTAATTTCTGGATGATTAACTTGCTTTAGTCTTTTTAGTGTTTTGGTTTTATAATCAAAAACAATCTCTTTGTCACTTTTAAATTTATGAATAGCATTCAAAAACACCTTTACAGACTCAAAAATACTACGCCAAATATAATGTGGTAATTTTCCAAAAACAAATAATTCTAGTAAAGTATTATGATACAAATACTCTAACTGATAAGAATCTGTATTTTCACAGTAAAATCTTGGTAAATATATGCTGTACTCTTGTGGAAAATTTCTAAACCAATTAATCTCAGCTCCTATTTTACTGCGCCAGCTTGAAGACTTTATTACAAAATTTTCATCAATCAATAAATGATTAAAAGCTCTTTGCGTACTAAAGTTTTTTTTGGAATGAAAATAATTTGTTATCAAACCAAAATCTAGCCATGAATCATCTTGGACTACACTAAAAGTATAGGTTTTCGAATATTCTCTTAACCCATCAACAAAAGAATAATTATTATCTAAAAGACATTTAACCAAAAAATATGGATATTCAATGTTCATAAAACCAGACAAAACCAATTCATGGTCTTCTGCAATATCGTTTTTTATATTATATTTTAACACTTCTTTCTCGAACAAGTAGGCCCATTTATAATTCTCTTTTACTTTTGAAACTACTAGATAATTTTTTAAAGATTGTATAGAACTAAAGTATGTATCACCGTGCAATATATAAATTGAATCATTGATTGGCGAAATCATATTAATAGTATAAATCAAAGCTTCTGCTAATTTCATATTATCAGGAATATATAAAATTTCAACACTTAATGATTTTAATTTTAAAAAGTCATATTTACTAATTTGAAAACTTCGAGGAAGAGTTAATATTATTGACTCGTTTAAACCACGAAAAAGTCCAATCTGGTATTCATATAATCTTTTATTACCCAAAGGTAAAAAAGAAGGAGGAATTTTTCCAAATTCTAACTCAAAATCAGTAGAACAATAAGCTGATGACATTATGATTATCATTTATTACCTCCATCTTTATATGGATTTTCTCTTTGAAGAAGCTCAATAATTTCATTATAAGAGTATTTTATAAATTCGGAAGGTCTTATAGCTTTATCATCCACATAAAAACCATCAAAACCACACCATGGTTTCCCTATAACAATATCATCATAAGGAACTTTATGCTTATCAAGCCACTCTATGATTATAGGTAAAGTATTTTGTCTAATATTTCTAACATCACCCTGATATGTTCTCATATTTCTACTAGTAAATATAGTTATCTTAAAACCCAAATCTTTATAATAACAAAGTTGCTCTAAAACATCTGTATTTATTGGTTTATCTTTATAAGAGCTATCAACATCTAATGTCAAAGTTCCATCTAAATCGATAACAAGTTGCTTCATTGTTTACTTCTATATCCTATAAATCTTTTATAATCTTCAGGTATCCCAATATCAATAAAATAATCATCAAAAATTTGGGTTTGTATTTTTAATGCGTTACAGTTTGACTGCAAAAATTCTTCAAAAGAAAATTTTTTTCCTAAATCAAATTCATCAAAAATATCTTTTTTTAGTAAGTATATACCACCATTGATTAAACCTTGCTTTTTAAATACTTTTTCTTCAAAAGAAATTACAATACCTTGATCATCAACATTTACAGTGCCATATCTATCAAAATTTTGCATTTGTTTTAGTGCGATGCAAATTTTACTATCATTTAAAACAAGTTTTTTTAGATCAATATCAAAAATAGTATCTCCATTTAAAACATAAGCTTGATTTTGTATAAATTTCAAAGCATCTTTTATAGCTCCACCCGTACCTAAAAGCTCTTTTTCAATGTTATAGCGTATTTTCATACCATCAAATTCATCTTTAAAACACTCTTGAATGAGTTCGTATTTATACGAAACACTTAAAATAACTTCAGTAATTCCTTGTTTTTTTAAATACTCTAAAACAAAGGCTAAAAATGGCTTTCCATTAATAGGCGCCATAGGCTTTGGAAGATCTTGCACTACGCTTTTTAACCTTGTGCCAAGACCTCCTGCTAAAACTATAGCTTGCAATCAAACCCCTTGCCAAAAAGCTCTTCTTCTACTATAGCACAGATGATATGACCTATTAAAATATGTGCTTCTTGAACTCTTGGTGTACAAGATGATGGCACTTTGATACAATAATCACAAAGCTCATTCATAGCACCGCCACTAGCCCCGGTTAAACCTATGCTTAAAATTCCTTTTTCTTTACAAATTTCCAAAGCTTTTAGGATATTTTTACTATTTCCACTTGTAGAAATTCCTATAAATACATCCCCATTCACACCTTGGGCTTGCACTTGTCTTGCAAATAAATTTTCATAGCCATAGTCATTGCCAATAGCTGTTAAAATACTCGTATCAGTACTTAAAGCAATACTTGCAATACCAGGTCTATCAAAGTAAAATCTACTCACAAATTCCCCAGCTATATGCTGTGCATCGGCTGCACTTCCTCCATTGCCTGCTAGTAAAGTTTTATTACCATTTTTATAAGCATTGATCACTTTTAAAGATGCTTCTTTAATTAAACCGATCATATCATTATCATTTAAAATCTTAGTTTTAATATCAATTGAATCACTAAAATGAGATTTTATATATAAATTTAAATTTTCCATGATTTTGCTCCTTCTTTAGTGAAGTAGAACTCTTGCACATATCCTTGTTGTTCATTTAGAATTTTTTTAAGTTTATATTTTTTTATAGGATCAACCATAAAAAACATAAATCCTCCAGCGCCAGCTCCACTTGTTTTACCACTATAGGCACCATTTTCCATAGCTAAATGATAAATTCTCTCAAGTTCATCATTACTAACTATATCAGAAATGATTTTCTTTGACTGCCATGATTTACCTAAAATTTGAGCTATTTTATCAAAATCAGCTCTAAATAATGCTTCTTTCATATTTAGCGCATCTTGTTTTATCGCGTGCATAGCTTTAAGAGAATTTTCATCTCCTAGTTTTCCTTTTTTATGCTCTTCTATATCCTTAGCTTCTCTAGTAATATTTGTAAAATAAAGTAAAATTCTAGCTTCAAATTCACTCGCTATCCAATTTTTAATGCGCAAAGGATTGACTATAACTTTTTTATTTTCATAAAATTCCATAAAGTTAAATCCACCAAAAGTTGCAGCGTATTGATCTTGTGCACCGCCTACTATAGCCATATCTTCTCTTTCTATCTCATAAGCAAGCTTTGCTATATCGTATTCTCCAAGTGGTAAATTAAGCCATTCTACGAAAGCTTTTATAATACCTACAACCAAAGTAGAACTTCCTCCTAAACCACTACCACTTGGCACATCTGAGTAAGTATGCAAAGAAAAGCTTAAAGGTTTTTTAACATAATCTTTTACCAAACGATTATAAATTGCTTTATAAAGATCTAGCTTGCCATCATTTTCCAAAAAATCTTTGCTTTTATACTCTACTTTTATATTTGTATCTGATGAATCAAAGATGATTTTCCCATCTTCTCTTTCTACTAAAGTACAATGCACATATAAAGATATCGTCGCATTTAACACATAACCTGTATATTGATCACAATATAAATTTATATCAGTACCCCCGCCAGCTAAACCCAAACGCAATGGGGTTTGAGAACGAACTATCATGATTGTTACCTATTAAGTGGGATTCTACCCATGGAAATTTCTTTCCTCCAGTGGTTTAGCAAATCTTCAAACATCTGTCTAGCTGGAATTTCTGGCTTCCAGTTAATATAGCTTTTGATTTTAGTATTATCAAACATTTGATAGTCTGCATCAATAGGACGCAATCTTTCTTCATCTTGCTCTACTTTGATATCTTTTCTTGTAGAAAAACTCAAAAGTATCTCAATAACTTCAGGAAGTTTAAAAGCTTCTTCACCTGCTATATTAAAAGCTTCACCACAAGGAACTTTTCCTTTTTCACTTTCTAATGAAAGCAAATAATAAGCCCTTATCGCATCTCTAGCATCTTGAAAAGTTCTTACACTTGATAAATTTCCTACTTTAATAATTGGTTCTTGATAACCCGCTTCAATTAATGCGATTTGTTTTGCAACAGTGCTTTCAAAAAAAACATCACTTCTTCTTGGACCACTATGAGTTCCCATCCTAGTGACATAAGTTTTTATATCATAAGCCTCACCATAAAATCTTCCCAAATAATCAGTACCAATTTTACTTATACTATAAGGACTTGCACCATGAAAAGTTGTATCTTCATTTAACTTAATACCAACTTTTGCTCTACCATAGACTTCACTAGAAGAACACACATGCACTACAGGATCATAACCATCTTTAGCTTTTAATAATCTAATATTTTCTAAAATATTTGCTGTGCCTATGATATTGGTTTGCAAAGTTTCTATAGGTATATCAAAAGAAGTTTTTGGGTAAGACTGCGCAGCTAAATGAAAGATCACATCAGGTCTTTTGCTCTCAAAAAGCTTTTGAATACTTGAATAATCATTCAAATCAGCATAAAAAATGCTAATTCTATCTTTTTTGTTAATCCTATCACTTAGGTGATAGATATTATCCATAGGTTCTTGCCAACGCATCATACCTATAACATCATAGTTGGTATTTTCTAGTAAAAAGTCCACCATTTGCGAGCCAACTTGGCCCGTAAAACCTGTAATTAATGCTGTTTTTTTCATTTTATAACCTTTTTTATAAAATTATAACAGCATAAACTTAATTTCTGATATTTTCTTGTTTTAAATACCATTCATACATCAATTTTACACCATCTTTAAGTTCTATTTTGTGTTTCCAACCTAAAGAATGAATTTTATCACAGCTACCAAGTTTTTGAAAAGTACCTTCAGGTTTCGCACTATTGTAAAATACATTTCCTGTAAAACCGATAATTTCATTCACCAAGGAAACTAAATCTTTTATCGCTATATCTTTACCAGAACCTATGTTGATATGCGTATTCCTTATTTCGTCACATTGGGGATTATATAAATCATTAAAGTTGATATTTTGCATGACATAAATACAAGCATCTGCCATATCATCAGCATGTAAAAATTCTCTTCTTGCGTTTCCAGTTCCCCAAATTTCAACCTCATTTTCAGTGATGCCAAATTTTTGAAGATATTCTTTAGCTCTGCTAATATCATCCATTTGTACATCTTTTAACACAAGATCATATCTTTTTTCATTAAGTAATTTTGCTAAATAGAATTTTCTAATCAATGCTGGTAATACATGTGATTTTTCTAAATTAAAATTATCATTTAAACCATACAAAGAGCAAGGCATAACAGAAATAAAGTTTGTGTTATATTGCAAATTATAAGATTCGCACATTTTAAGACCCGCTATTTTAGCTATTGCATAAGGCTCATTTGTATATTCTAAAATACTTGTTAAAAGATACTCCTCTTTCATAGGTTGAGAGCAATTTTTAGGATATATACAAGCTGTCCCTAAAAACAAAAGCTTTTTTACATTATTTAAATATGCACTATGTATAACATTATTCTGAATTTGTAAATTTTGATATATAAAATCTGCCCTATAAGTATTATTAGCTAATATCCCACCCACTTTCGCAGCACATAAAAATACATACTCGGGCTTTTCTTTTTCAAAAAAATATTCTACAGCTTGTTGATTTGTTAAATCTAACTCTTTATGGGATTTTAATATAAAATTTTTATAACCTTTTTCTTGTAATTTCGTTAAAATAGCTGACCCAGTTAAACCATTATGTCCCGCTATATAAATTTTAGAATCTTTGTTCATGCTACCTCCTTAAGCATTCTACTGCAAGGAGAGTAATTATAATTTATTTTTTTGTATATCCCCCCCCCGTAATTATTTAAATACCAATCATACATCATTCTTATTCCTTCTTCTAGTTCTATTTTATGCTTCCAACCCAAAGAATGAATTTTAGAGCAATCCATTAAACGATCCATTGTACTATCTGGTCTATTGGCATTAAAAATCAATTTTCCTTTAAATCCAACAATTTGCTTAACCATTTGAGCAACTTCTGCTATACTATAATCAATACCTGTTCCAATATTAATATGCGTATTTTTTATTTTTTCATCTTTTTTATATAAATCAGAAAAATTTACATTTTCCATAACATAAATAGCAGCATCAGCCAAATCATCACTATGTATAAATTCTCTTCTAACTTTCCCTGTCCCCCAAATTTCCACACAGTCTTTTGAAATACCAAAATCAGTTAAATATTTCTTCGCTTCAATAAATGATTTCATTTTTAAATCTTTTAAAATTTCATCCTCTCTTTCCCCCTCTAATAGTTTAGCTAGATGAAATTTCCTAAGTAGTGCTGGCAACACTCTAGACTTTCCAAAGTCAAAATTTGCTCTTGTTCCATATAAATTATTTAAAGCTAAAGTTATAAAATTAGTTCCATATTGAATGTTATATGATTCACACATCAATGTACCTGATATTTTTGCAACACCAAACGAGGTTGCATTATATTCTAATATATCAGTCAACATACTTTCTTCTTTAATAGGATTAAGAGTTTTTTCAGGATACATATAACCTGAACCAAAAAAAATTAATTTTTTTACTCCAAATTTGAAAGATTGATGGATAATATTATTTTGTATAGTTGTATTTTCGTATATAAAATCTGCTCTTTGGGATACATTAGCAGCACCACATGGCAAAACTGCTGCTAAAAAAACATATTCTGGTTGCTCGTTTTTAAAAAATTCAATCACAGCTTGTTGATTTAACAAATCAAGTTCTTGTCGTGTTTTAAGAATTAGATTTTCATATCCTCTTTTTTTTAAGTTTTCTACCAAAGCAACACCAGCTGTACCTTTGTGTCCTGCTATGTAAATTTTAGAATCTTTATTCATTTACTTTCCTTTTTTTGGAGCCAAAATATCTCTTTCTGAAAGAATCGGTGAATTGGTTGGCCAATCAATTTCTATTCTCTCATCGTTCCAAGCATAAGTAAACTGATCAGGAGCATCTAAATATTCACCTTCATACGCAAGTTTATAATAATAAACTGCATCTTTCGAACTAACATAGTGCGAATTACCCATATTTGGTGGAAGTAAAATTAACTGTTGGTTACTTTGATTAATAATAAATTTTTCCCACTTTAAGTATGTAGGTGAATCTTTTCTACAATCAACTACTACTTGATGCACCTCGCCATAAACACAAGTAACAAGTTTCCAAGTTTTAACATCACCGTGAATACCCCTCAATACATTAAAATGTGAATTTATAAATTTATCATGCTTAAATCTTAAATCTTTAGGTATGATATTTCCTAAATTTTCTTCAGTAAAAGCTGTCCAAATTTCACCTCTTAAATCTCTAAATTTATTTGGGGTAATAATATAAACACCTTTTAGAATTTTTGACTCTTGTATATCAAATTCTATGTCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP046243|398304:407007|406461_407007_-|WP_057032372.1|DBSCAN-SWA MDIEFDIQESKILKGVYIITPNKFRDLRGEIWTAFTEENLGNIIPKDLRFKHDKFINSHFNVLRGIHGDVKTWKLVTCVYGEVHQVVVDCRKDSPTYLKWEKFIINQSNQQLILLPPNMGNSHYVSSKDAVYYYKLAYEGEYLDAPDQFTYAWNDERIEIDWPTNSPILSERDILAPKKGK >NZ_CP046243|398304:407007|404290_405352_-|WP_057032370.1|DBSCAN-SWA MNKDSKIYIAGHNGLTGSAILTKLQEKGYKNFILKSHKELDLTNQQAVEYFFEKEKPEYVFLCAAKVGGILANNTYRADFIYQNLQIQNNVIHSAYLNNVKKLLFLGTACIYPKNCSQPMKEEYLLTSILEYTNEPYAIAKIAGLKMCESYNLQYNTNFISVMPCSLYGLNDNFNLEKSHVLPALIRKFYLAKLLNEKRYDLVLKDVQMDDISRAKEYLQKFGITENEVEIWGTGNARREFLHADDMADACIYVMQNINFNDLYNPQCDEIRNTHINIGSGKDIAIKDLVSLVNEIIGFTGNVFYNSAKPEGTFQKLGSCDKIHSLGWKHKIELKDGVKLMYEWYLKQENIRN >NZ_CP046243|398304:407007|400944_401619_-|WP_057032366.1|DBSCAN-SWA MQAIVLAGGLGTRLKSVVQDLPKPMAPINGKPFLAFVLEYLKKQGITEVILSVSYKYELIQECFKDEFDGMKIRYNIEKELLGTGGAIKDALKFIQNQAYVLNGDTIFDIDLKKLVLNDSKICIALKQMQNFDRYGTVNVDDQGIVISFEEKVFKKQGLINGGIYLLKKDIFDEFDLGKKFSFEEFLQSNCNALKIQTQIFDDYFIDIGIPEDYKRFIGYRSKQ >NZ_CP046243|398304:407007|400552_400948_-|WP_057032365.1|DBSCAN-SWA MKQLVIDLDGTLTLDVDSSYKDKPINTDVLEQLCYYKDLGFKITIFTSRNMRTYQGDVRNIRQNTLPIIIEWLDKHKVPYDDIVIGKPWCGFDGFYVDDKAIRPSEFIKYSYNEIIELLQRENPYKDGGNK >NZ_CP046243|398304:407007|403221_404253_-|WP_057032369.1|DBSCAN-SWA MKKTALITGFTGQVGSQMVDFLLENTNYDVIGMMRWQEPMDNIYHLSDRINKKDRISIFYADLNDYSSIQKLFESKRPDVIFHLAAQSYPKTSFDIPIETLQTNIIGTANILENIRLLKAKDGYDPVVHVCSSSEVYGRAKVGIKLNEDTTFHGASPYSISKIGTDYLGRFYGEAYDIKTYVTRMGTHSGPRRSDVFFESTVAKQIALIEAGYQEPIIKVGNLSSVRTFQDARDAIRAYYLLSLESEKGKVPCGEAFNIAGEEAFKLPEVIEILLSFSTRKDIKVEQDEERLRPIDADYQMFDNTKIKSYINWKPEIPARQMFEDLLNHWRKEISMGRIPLNR >NZ_CP046243|398304:407007|399017_400556_-|WP_057032364.1|DBSCAN-SWA MIIIMSSAYCSTDFELEFGKIPPSFLPLGNKRLYEYQIGLFRGLNESIILTLPRSFQISKYDFLKLKSLSVEILYIPDNMKLAEALIYTINMISPINDSIYILHGDTYFSSIQSLKNYLVVSKVKENYKWAYLFEKEVLKYNIKNDIAEDHELVLSGFMNIEYPYFLVKCLLDNNYSFVDGLREYSKTYTFSVVQDDSWLDFGLITNYFHSKKNFSTQRAFNHLLIDENFVIKSSSWRSKIGAEINWFRNFPQEYSIYLPRFYCENTDSYQLEYLYHNTLLELFVFGKLPHYIWRSIFESVKVFLNAIHKFKSDKEIVFDYKTKTLKRLKQVNHPEISFTKKYSFNNYESISVCEILDLLNENISQKQDIVLIHGDFCFSNIMYDFRSKNIKTFDPRGMDFDENITVYGDIRYDYAKLVHSVLGLYDFIISGFSRCEIQKDKIFLSIDISDEIVKIQEEFFAMFEIDKQVCSIAIHLFASMLPLHADDDDRQKALFVNIFRLYFYFKDKGLL >NZ_CP046243|398304:407007|401606_402212_-|WP_057032367.1|DBSCAN-SWA MENLNLYIKSHFSDSIDIKTKILNDNDMIGLIKEASLKVINAYKNGNKTLLAGNGGSAADAQHIAGEFVSRFYFDRPGIASIALSTDTSILTAIGNDYGYENLFARQVQAQGVNGDVFIGISTSGNSKNILKALEICKEKGILSIGLTGASGGAMNELCDYCIKVPSSCTPRVQEAHILIGHIICAIVEEELFGKGFDCKL >NZ_CP046243|398304:407007|405348_406461_-|WP_070255863.1|DBSCAN-SWA MNKDSKIYIAGHKGTAGVALVENLKKRGYENLILKTRQELDLLNQQAVIEFFKNEQPEYVFLAAVLPCGAANVSQRADFIYENTTIQNNIIHQSFKFGVKKLIFFGSGYMYPEKTLNPIKEESMLTDILEYNATSFGVAKISGTLMCESYNIQYGTNFITLALNNLYGTRANFDFGKSRVLPALLRKFHLAKLLEGEREDEILKDLKMKSFIEAKKYLTDFGISKDCVEIWGTGKVRREFIHSDDLADAAIYVMENVNFSDLYKKDEKIKNTHINIGTGIDYSIAEVAQMVKQIVGFKGKLIFNANRPDSTMDRLMDCSKIHSLGWKHKIELEEGIRMMYDWYLNNYGGGIYKKINYNYSPCSRMLKEVA >NZ_CP046243|398304:407007|398304_399021_-|WP_057032363.1|DBSCAN-SWA MTIVFPMAGLSSRFSNAGYKIPKYMLEIQNQTVFYNAVLSFKCYFEDCNFLFIYRDIYNTEKFIIEECKKLKIKNKFLVKLDNETQGQAHTVMLGLEKSHIDDNENILIFNIDTFRYNYILPNFNYEKLDGYLEVFQADGDQWSFVLPGENKKVLKTTEKDKISNLCSSGLYYFKKSKDFKDVFHYIKINNLLVKNEFYIAPMYNYLINQNKDIRYHEIDINDIIFCGTPQEYERLIL >NZ_CP046243|398304:407007|402199_403219_-|WP_148120126.1|DBSCAN-SWA MMIVRSQTPLRLGLAGGGTDINLYCDQYTGYVLNATISLYVHCTLVEREDGKIIFDSSDTNIKVEYKSKDFLENDGKLDLYKAIYNRLVKDYVKKPLSFSLHTYSDVPSGSGLGGSSTLVVGIIKAFVEWLNLPLGEYDIAKLAYEIEREDMAIVGGAQDQYAATFGGFNFMEFYENKKVIVNPLRIKNWIASEFEARILLYFTNITREAKDIEEHKKGKLGDENSLKAMHAIKQDALNMKEALFRADFDKIAQILGKSWQSKKIISDIVSNDELERIYHLAMENGAYSGKTSGAGAGGFMFFMVDPIKKYKLKKILNEQQGYVQEFYFTKEGAKSWKI |
10 | Synechococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DBSCAN-SWA_2 |
1285438 : 1294668
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP046243|1285438:1294668|DBSCAN-SWA AATGCATTTTGAAGAAAAGATTGCTTTAAATAAAGCATTGTTTTCTTCTTTATATGATAAAGAAATTCAGTGCTTTAAATCGCCTTTAAAAGCTTATAGAACAAGGGCAGAATTTTGCATATATCATCATGAAAATGGAGAAATTTCTTATGCAATGTATGAAAATAAGAAAAAAATTCCTATAAAAAATTTTGAAATAGCAGATGAAAAAATTCAAGAATATATGCCTATTTTATTAGACAATTTAAATGAAAATTTAAAACATAAACTTTTCGGAGTAGAATTTTTAGCTACAAAAATAGATTTAAGCATAACTTTACTTTATCATAAAAATATAGAATCAATCACGCAAGATTTACAAGAATTATCCAAAAAGTTAAATCTTAAACTCATTGCAAGAAGTAGGGGTAAAAAACTTGTATTTAATGGAGAAAATTTAAAGCAAATTTTAAATATTAAAAATAAAGAAATTTTTTATGAGTTTAATAATGATTGTTTTATACAACCCAATACAACCATAAATGAAAAAATGATTGAATGGGTGATTGATTTATTAGAAAAAGAAGAAAGAAAAGATTTATTAGAGCTTTATTGTGGTTATGGAAATTTTACCATAGCGCTAGCAAAGTATTTTAATAAAATTTTAGCGACTGAAATTTCTAAAAAAAACATTGAATTTGCTTTGAAAAATTGTGATTTAAATTCCATAAAAAACATAAGCTTTACAAGACTTTCTAGTGAAGAGCTAAGTCAAGCTTTAAAAAAAGAAAGAGAATTTAATCGCTTAAAAGGTATAGATTTAGATGGTTTTAATATATCTCATGTTTTGGTAGATCCGCCAAGAGCAGGGCTTGATGTAAGCGTGATTGAGCTTATTAAAAAATATGAAAATATTATTTATATTTCTTGCAATCCTATCACTTTGAGAGAAAATCTTGAAATTTTATCTCAAAGCCATGAAATTTTAAATTTGGCATTTTTTGATCAATTTGCTAATACTCCCCATCTTGAATGTGGGGTGTATTTAAGATTAAAAGCTTAGTATAAGTTAGAATTTATACAAGCTTTGCTATTATAAAAATAGTTGATTTAATCAATTAATTTTTATAAAGGATTTCTTATTTTATTTCAAAAAATTACCTATACAAACAGAAAAATACTCTATAAAGTCAATGAAATTTTAAAACCCTTTGGATTAAAATCAAGTGATTGGAGGGTTTTTGTATATTTAAATCAGCATGGTTGTAGTACTTTAGCTCCAATATGTGAGTTTTATCAGATGGATAAAGCTATACTTTCTAGAGTTGTTTCTAAATTAGCAAAACTTGAATATATAGAGTTTTTAAAAGCAGATGATAAAAGAGAAAAAATCATTACTTTAAGCGCTAAAGGTAAAGAAATTTTTTTAGATGCAAATGCTTATATAAGAAAATATGAAAGAAATATTTTAGATATCTTAGATGTAAAAGATCAAGAAAGACTTTTAAAATTACTTGATTATATCAATGAGAAAATTTAAAAGGTTTTTTCATGGGATTAAGTAAAAAATATAATTTATTTAATGTGAATTTTTTCTGTATTTTCGGGATAAATTTTGCTATTTGTCTTGTTTTTTATATGAGTACTATTTCTAGTACAGATTATGTTTTAGGTGTTTTAAACCTTCAAACTAGCACCGCAGGTCTTATCATGGGAGCTTTTGTTATAGGCGCTTTGCTATCTAGACTTTATTTTGGTTCTATAATCGATGATGTTAATATAAAAAAGGTTATAGTGTTTTCGCTTTTGTTTTATCTTTTTATTAATTTAATGTATTTGAAATTTTATAATGTATATTTTTTGATTTTAATACGCTTTTTAGCAGGGATTTGCTATGGAATTTGTTCTTGTGCTTGCGGGGCAGCTATTGCTAGAATAATACCTAGCAATAAAAGAGGAGTTGGTATAGGATATTATGCTACAAGCGTTGTTTTAACTTCAGCTTTAGGTCCTTTTTTGGCCATAAAACTTGACTCCATCAATCAATTTTGGATTAGTTTTTTAATAGCATGCTTGAGTATTGTTTTTGCATTAATCTTATCTATTTTTTTAAAAGTAAGAAGATTTAAAAAACATCATCATACAAAAAGAAAATTTAGTATTTATAATTACTTTGAAAAATCAGTTTTAAATTTAGCCTTGGTAACCTTTTTACTTGCATGTCCTTTTGGCGCTATTATAGCCTATATGAGTGCTTATACCCAAAGTTTAAATTTAGCTTTCGCTGGGTCTATGTTTTTTGTGATATATGCTGGATTTTCTATGATTTTTAGACCACTTGCTGGTAAAGTGTTTGATAAATATGGTGCTGATATTGTGATGATTTTTTCTTTTTTGAGTTTTATAGTATGTTTGCTTTTACTTGCTTTTGCATTAAATTTTTATATGATTATTTTAGCTGGAGTTTTTTGTGCGTTAGGTTATGCTAATGCTACTTCAAGTGCTCAAGCTTTAGCTATAAAACTTGCACCTAAAGAAAAAATGGGCTTGGCTAATTCTACCTTTTTTATAGCCTTAGATTTTGGTATAGGAGTAAGTCCTTATTTGCTAGGAATTATAGAGCCAAGTATAGGTTTTGCTAATGTTTATGCCTTTTGTGCTTTATTAGTTGTAATGGCTTTGATTTTGTATTGTTTATTGGTTGTAAAAAAAGCTTCTTATTAATTTGATTTTAGATACAATGCTTTAAAAAGGAAAAGCATTGTGTGATAGCTATAAAATACTAAGTACTATGAAAAATATAGCCATTATAGGACTTAGTCCTAATCAAGATAAACCTTCTCATTTTGTAAGTAAATATTTACAAGATTTAGGTTATAAAATTTATCCCATCTATCCTAAAGAAGATTTTATTTTAAATGAAAGAGTTTATAGAAACTTAAAAGAAATTCCTTTTGAAGTTGATACGGTTGTAATGTTTAGAAAAGCAAGTTTTGCAAATGAAATTTTTGAGGATCTTTTGAGCAAAAAGATTAAAAATTTTTGGATGCAACTTGGCATTATCAATGAAGAAATAATGCAAAAATGTAAAAAATATGGTATAAATTGCGTTCAAGATCGTTGCATTAAAATAGAACTACAAAAAGGATAATCATGGTTGAATTAAATAAAATTTATCAAGCAAAACAAAAAATCGCAGATTTTGTATTAAAAACCCCTTTTGTACACTCTTCTTTTTTGAGCGAGTTTTTAGAAACTGATGTTTTTTTAAAATGTGAAAATTTGCAAAAAACAGGTGCTTATAAAATCAGAGGAGCTTATAATACAATAGCTAATTTAACTAAAGAACAAAAACAAGCAGGCGTAATAGCTGCAAGTGCAGGAAATCACGCACAAGGAGTTGCAATTAGTGCTAAAAAATTTGACATAGAAGCTGTGATTGTTATGCCTGAAGCCACGCCTTTGTTAAAAGTAAGTGCGACTAAAAATTTAGGTGCAAAAGTGATTTTAAAAGGAGATAATTTTGATGAGGCTTATGCTTATGCACTAAATTATGCCAAAGAACATCATTTAAATTTCATTCATCCTTTTGAAAATGAAAGTATTATAGCAGGGCAGGGTACTTTAATGCTTGAAATGCTTGATGAAATAAGTGATTTAGATATGATTTTAGCTCCAGTTGGTGGAGGAGGTTTGATTAGTGGAGTGGCAAGTGCTGCTAAGCAAATTAATCCTGCTATAAAAGTCATCGGAGTGAGTGCTAAAGGAGCTCCTGCGATGTATGAGAGTTTTAAAAGTAAAAAAATGATTAACTCAAAAGCTGTTAGAACTATAGCTGATGGTATAGCAGTGCGTGATGTGAATAAAATTAATTTTGATATTATTCTTGAATGTGTTGATGATTTTATTCAAGTTGATGATGAGGAAATAGCTAATGCGGTATTGTATTTACTTGAAAAACATAAAATCACAGTTGAGGGAGCAGGTGCATCAGCAGTAGCTGCGCTTTTGCATAAAAAAATAGATTTAAAAAATCATAAAAAAATTGGCGTGATTTTAAGTGGTGGAAATATCGATGTGCAAATGTTAAATATCATCATAGAAAAAGGTTTATTCAAAGCTTTTAGAAAAATGCATATTAATGTTACTTTGATTGATAAACCAGGGGCTTTGAGTGCTTTGAGTGATGCGATCAAAGAAGCGCAGGCTAATATAGTTAAAATTGATTATGATAGATTTTCAACTAAACTCGAATATGGCGATGCAATGATTTCAATTACCTTAGAAACTAAAGGAAAAGAACACCAAGAACTAGTTAGAAAAATACTTTATGATAAAGGCTTTAATTTTAACGAAATTTTATGATATATTAAATATAATATTTTTTAAATGAAATTTAAAAAAGGGTAAAAATGTCACAAGAAAAAATTTTAGAACCAAATACTCTCATCACTTCTAAGACAGATTTAAAGGGTAATATTATCTATGCTAATGATGATTTTTTAAAATATGCTGGTTATAAAATGAATGAAATTTTGTATAAACCACACAATATTGTGCGTCATCCTGATATGCCAAAAACGGTTTTTAAATGTTTGTGGGATTACATACAAGATGGAAAAGAAATTTTTGCTTTTGTAAAAAATAAAACTAAACAAAATGATTATTATTGGGTTTTTACTAATGTTACAGCTTCGTTTGATAATCAAGGAAATATTATAAATTATTATTCCGTAAGAAGAAAGCCTAAAAGAGAAGCTATACCGGTTATAGAACAAGTTTATAAGATTTTGTTGGAAACTGAAAAAACTGGAGGTATAAAAGCTGGAGTGAGTGAACTTATGAAGATAGTTAATTCTTATGGTATGAGTTATAATCAGCTAATTTTAGAGCTTCAAAAATAATTTTTCAAAAATATTTAAAAAATATTTTATAAAAAAAGGTATAATTAGTCTGATTAATTTAAATTTAAGGAATTTGTCTATGTCTTTGGAAAAAGTTCTAACTTCAGATGTTTTAATAACATCAAAAACTAATTTAAAAGGTGAAATTATTTATGCTAACGAGGATTTTTTAAAATACTCTGATTATAAAATTGATGAAATTTTATATAAACCTCATAGCATCATGCGTCATCCTGATATGCCAAGAACTGTTTTTAAATATTTATGGGATAACATTCAAAGGAAAAGAGAGGTTTTTGCTTTTGTAAAAAATAAAACAAAATTTAATGATTATTATTGGGTTTTTGCAAATATAACTGCTTCTTGTGATGTCAATGAAAATATTTTAAATTATTACTCAGTAAGAAGAAAACCAAAAGCAGAAGCTGTTAAAACAATAGAGGAAATTTATAAAGTTCTTACAAGAAAAGAAAAGGAAGGTGGTGTAAAAGCAGGACTTGAAGAGTTGAATGCTGTGGTAAAATCCTATGGGATGAGCTACAATGAATTAATAATGCAAATTCAAAAATAAAGGAATGTTGATGAAAAATATTGTATTAATTGGTATAGGTCTGGGTATTTTATCTTGTGCAAATTCTATATATTTTATGGATTTTATTTCTTTTGGATTTTCTTTGGCTTTGCTTTTGTTATTTGCTTTTGCTTTTGCTGTGTTAAAAAAAGAAGATCAATTTAGTGATAAAATCTTAGATCTTAGCAGAGAATTAAAAAATGGTAATTTTGATTCAAGGATTGTATATATTAAGTGTAGTAACAAAAAACTTAAAGAAATTGCAGATAATCTTAATAATACCATAGACGGCTTAGAAGCTTATTTGAGGGAAATTAACACTTCTATTGCTTGTTCTCAAAAGGGAGAGTATTTTAGAAGAGCTATTCCTGAAGGTTTAAAAGGAATTTTTGTTCAAAATATTAAATTTATTAATAAAGCTTTAGATGATATAGAAAAAACAGGAAAATCTGTTTTTAAAAATGCCTTATCAAGAGAATTGATGGATTTAAGTTTAAATAGTCAAAACAAAAATTTAAATGATTTATCTTCTGCTTTAAATGGAATTATTAAGTTAATGAGAGAGGTTTTTGGTGATATCAAGATTATCTCAGATACTGCTCAAAAAAACGGTCTAGAAGTGGGTAATTTACAAGATTCAGTTTCTTCTATGATGCAAGTAGCTGATGAGAGTAAAAATGCTGTTGATACCTTTGCATCAAATGCTCAAAGTATTAATGCAATTGTAGAAGTTATAAGAGATATAGCAGATCAAACCAATCTTCTTGCACTAAATGCAGCCATTGAAGCTGCTCGTGCGGGTGAACATGGTAGAGGCTTTGCTGTAGTTGCAGATGAGGTAAGACAACTTGCTGAAAAAACCCAAAAAGCAACAGGAGAAATTACCTTGGCAATTCAAGTAATGAATCAAGAAATTGGTTCAATACAAGAAAATAGTGAAAAAGTATTCGATATTGCAAATTCTTCTAATAGTAAAATTGCTGATTTTAGTGAAGCATTTAGAGAATTAGAGGATAAAAGCTCTCATTTGGGAAGAGAATTTATTAATTTTGCTTCTGATTTGACTTTATCGGCTATGAAAATAGATCATATTTTATATAAATCAGATGTTTATCTAACTCTTAATGGCTCTCAGCAAAAGCTACAAAATCTTGAACCAATCTCTAGTCTATGTAAAGATGAAGATGCAAAAAGTATTTTCTGTCCTTTAATCTCTCAAAATGAAATGGATTCTAAGAGTGAAAAAATTCAACATTCTGCAAATAAAGCTATAGAAATAGCTAAAAAAGAAAATATCTCAAAAGAAGATTATGATACAATTATTAGTGACATAAGAGAGTTGGAAAAAGATAGTAAATTAATTATGGACAAACTAGAAGCTTCATAAGCTTCTAGTTCTTAAGCAAGAGCTATTTTTAAAACTTCTTGTAAATTTTTCACCCCAATTATTTTCAAATTTTTTACTACTTCCTCTGGGATATCTTTTAAGTCTCTTTCGTAATTTTTATGTGGGATAATGGCTGTTTTAATATCGGCTTTATAAGCAGCAATTAATTTTTCTTTTAAGCCACCTATTGGTAAAACATTACCCATTAGGTCAATCTCTCCTGTCATTGCAACATCAGACCTTACTTTTTTGCCACTAAAAATAGAGGCGATAGCTGTGGTGATTGTTATGCCTGCACTTGGTCCATCTTTTGGTGTTGCACCATCTGGAACATGAATATGAAGATTGTATTGATTGTAAATACTTTCATCTTTTTTATAAAAAAGATTTTTTGGTGTTTTGATTTGCTCTTCATCAATTAAATTTTTAATAAGACTTTGGGCAATTTTTGCTGATTCTTTCATCACATCACCCAAACTTCCTGTAAGAGTTAGTTCGCCTTTACCTTTGATTTTGATAGCTTCAATTTTTAATACATCTCCACCTACTGCAGTCCATGCAAGTCCATTTACTTGACCGATTTTGTTTTCTTTTTCATGTTTTTCTATTTCAAAGACTTTTTTATTTAAAAAATCTTTTAAATTTTTAGCATTAATTTGAATATTTTTAATATTTTCTTCTAAAAGAAGTTTTTTAACACATTTTCTACAAATTTCAGCAATCTTTCTTCTTAAATTTCTTACACCCGATTCTCTAGTATATTCATTGACTATTAATTCTATAGCTTCATCATCAAAGTTAATTTCTTTTTCTTTGAGTCCATGTTTTTTTATTTCATCAGGTATGAGATAGTTTTTTGCTATTTGGAATTTTTCTTGAGGAGTGTAAGAGCTAAGCTCTATAAATTCCATTCTATCTTTTAGCGCAGGTGGAATTAAACTAGCATCATTTGCAGTAGCTATGAAAATAATTTTACTTAAATCAATATTGAAATTTAGGTAATAATCCCTAAATTTAGTATTTTGTTCAGGATCTAAGATTTCAAGTAAAACTGCACTTGGATCTCCTCTATGGTTGCGACTTAGTTTATCAATCTCATCAAGTACTACCACAGGATTGCTTTGTTTTGCTTCTATAAGTCCTTGTATAATGCGACCTGGCATAGCTCCTATATAGGTTCTTCTATGCCCTCTTAATTCATTTACATCTTCTAAACCACCTAAAGCTATGCGTACTAATTCTCTTTTTAATGCTTTTGCGACTGAATTTGCTAAAGAAGTCTTACCAACACCTGGAGGTCCAACCAAACACAGGATAACTTTAGCACCATCTCTATCTTTAATTTTGCGTTTTTCTAAAAGTTCTTTAACTGCAAAATATTCTTCAATACGTTCTTTTGGTTTTTCTAATGCATAATGATCACTGTTAAGCTGTAAAGATACATCTTTTAGATTAAGCTTTTTCTTTGAAGAGTATTCAAAAGGTATGTCTAAAACTGTTTCTATGTATGTTTGTACCATAGAGGCTTCTGAATTGTCTTGATGAATTCTTTCATATTTTTGAATTTGTTTTTTGATTTCTTTATAAGCTTCTTCATACATAAAAGCTTTTTTCTTTTCTAATTTTTTATTATATTCTTCTACTTCACTTTCTTTTTGTATATCACTTCCAAGCTCTCTTTGAATTTGCTTGAGTTGTTCTTTTAAGAAATATTCTTTATTGACTTTATCTATTTTAGAGTGAACTTTATTTTTGATTTCTTTTTGAATTTTATTTGCTTCAATTTCTTTAGCTAAATAATCAATTAAATTTAAAAGCTTAGTTTCTAAATTAGTTTCGATGAAAAATTCATACGCTTGCTGTTTTTTGATTTTAATGGAATTTAGTATTAAATCACAAATTCTACTAGGCTCAACATCTTCTTCTATAGTTCGTAAAAGATCAGGTGGAAAATAATGACTCACGGTAGATAAAGCTTTAGCTTTTTCTCTTACTACTTCAATGATTGCTTCTTTTTTTGTACTACATAATGGCTCTTGATGGATTAAATCAACTAGAGCAAGTAAGGGGTCATCTGAGATTTTTTCAACTATCTTAGCTTTGGCATAACCTTGAAATAAAATTTTAATTCTACCATCAGGTAATGGAACTTTTCTCATAATAGTTCCAATAACCCCACAATCATAAATTTCATCAAAACCACGTCCACCTTCAATCTTAGATGGTGCTACAAAAATCATACTTTCATTTTGTAAAGCGATATCCAAGGCTTTGATATTTTGCATATCATTTAAAAAAATCGGTGTTATCATAAAAGGGTATAAAAAAAGCTCATCTTCCACAAGAACAGGAAGTTTTGTTGGATAGTTTTGAGTATTTTCTAATTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP046243|1285438:1294668|1286967_1288140_+|WP_070256768.1|DBSCAN-SWA MGLSKKYNLFNVNFFCIFGINFAICLVFYMSTISSTDYVLGVLNLQTSTAGLIMGAFVIGALLSRLYFGSIIDDVNIKKVIVFSLLFYLFINLMYLKFYNVYFLILIRFLAGICYGICSCACGAAIARIIPSNKRGVGIGYYATSVVLTSALGPFLAIKLDSINQFWISFLIACLSIVFALILSIFLKVRRFKKHHHTKRKFSIYNYFEKSVLNLALVTFLLACPFGAIIAYMSAYTQSLNLAFAGSMFFVIYAGFSMIFRPLAGKVFDKYGADIVMIFSFLSFIVCLLLLAFALNFYMIILAGVFCALGYANATSSAQALAIKLAPKEKMGLANSTFFIALDFGIGVSPYLLGIIEPSIGFANVYAFCALLVVMALILYCLLVVKKASY >NZ_CP046243|1285438:1294668|1285438_1286479_+|WP_070256767.1|tRNA|DBSCAN-SWA MHFEEKIALNKALFSSLYDKEIQCFKSPLKAYRTRAEFCIYHHENGEISYAMYENKKKIPIKNFEIADEKIQEYMPILLDNLNENLKHKLFGVEFLATKIDLSITLLYHKNIESITQDLQELSKKLNLKLIARSRGKKLVFNGENLKQILNIKNKEIFYEFNNDCFIQPNTTINEKMIEWVIDLLEKEERKDLLELYCGYGNFTIALAKYFNKILATEISKKNIEFALKNCDLNSIKNISFTRLSSEELSQALKKEREFNRLKGIDLDGFNISHVLVDPPRAGLDVSVIELIKKYENIIYISCNPITLRENLEILSQSHEILNLAFFDQFANTPHLECGVYLRLKA >NZ_CP046243|1285438:1294668|1289828_1290320_+|WP_070256775.1|DBSCAN-SWA MSQEKILEPNTLITSKTDLKGNIIYANDDFLKYAGYKMNEILYKPHNIVRHPDMPKTVFKCLWDYIQDGKEIFAFVKNKTKQNDYYWVFTNVTASFDNQGNIINYYSVRRKPKREAIPVIEQVYKILLETEKTGGIKAGVSELMKIVNSYGMSYNQLILELQK >NZ_CP046243|1285438:1294668|1290901_1292278_+|WP_081336345.1|DBSCAN-SWA MKNIVLIGIGLGILSCANSIYFMDFISFGFSLALLLLFAFAFAVLKKEDQFSDKILDLSRELKNGNFDSRIVYIKCSNKKLKEIADNLNNTIDGLEAYLREINTSIACSQKGEYFRRAIPEGLKGIFVQNIKFINKALDDIEKTGKSVFKNALSRELMDLSLNSQNKNLNDLSSALNGIIKLMREVFGDIKIISDTAQKNGLEVGNLQDSVSSMMQVADESKNAVDTFASNAQSINAIVEVIRDIADQTNLLALNAAIEAARAGEHGRGFAVVADEVRQLAEKTQKATGEITLAIQVMNQEIGSIQENSEKVFDIANSSNSKIADFSEAFRELEDKSSHLGREFINFASDLTLSAMKIDHILYKSDVYLTLNGSQQKLQNLEPISSLCKDEDAKSIFCPLISQNEMDSKSEKIQHSANKAIEIAKKENISKEDYDTIISDIRELEKDSKLIMDKLEAS >NZ_CP046243|1285438:1294668|1292289_1294668_-|WP_070256782.1|DBSCAN-SWA MKLENTQNYPTKLPVLVEDELFLYPFMITPIFLNDMQNIKALDIALQNESMIFVAPSKIEGGRGFDEIYDCGVIGTIMRKVPLPDGRIKILFQGYAKAKIVEKISDDPLLALVDLIHQEPLCSTKKEAIIEVVREKAKALSTVSHYFPPDLLRTIEEDVEPSRICDLILNSIKIKKQQAYEFFIETNLETKLLNLIDYLAKEIEANKIQKEIKNKVHSKIDKVNKEYFLKEQLKQIQRELGSDIQKESEVEEYNKKLEKKKAFMYEEAYKEIKKQIQKYERIHQDNSEASMVQTYIETVLDIPFEYSSKKKLNLKDVSLQLNSDHYALEKPKERIEEYFAVKELLEKRKIKDRDGAKVILCLVGPPGVGKTSLANSVAKALKRELVRIALGGLEDVNELRGHRRTYIGAMPGRIIQGLIEAKQSNPVVVLDEIDKLSRNHRGDPSAVLLEILDPEQNTKFRDYYLNFNIDLSKIIFIATANDASLIPPALKDRMEFIELSSYTPQEKFQIAKNYLIPDEIKKHGLKEKEINFDDEAIELIVNEYTRESGVRNLRRKIAEICRKCVKKLLLEENIKNIQINAKNLKDFLNKKVFEIEKHEKENKIGQVNGLAWTAVGGDVLKIEAIKIKGKGELTLTGSLGDVMKESAKIAQSLIKNLIDEEQIKTPKNLFYKKDESIYNQYNLHIHVPDGATPKDGPSAGITITTAIASIFSGKKVRSDVAMTGEIDLMGNVLPIGGLKEKLIAAYKADIKTAIIPHKNYERDLKDIPEEVVKNLKIIGVKNLQEVLKIALA >NZ_CP046243|1285438:1294668|1290399_1290891_+|WP_070256777.1|DBSCAN-SWA MSLEKVLTSDVLITSKTNLKGEIIYANEDFLKYSDYKIDEILYKPHSIMRHPDMPRTVFKYLWDNIQRKREVFAFVKNKTKFNDYYWVFANITASCDVNENILNYYSVRRKPKAEAVKTIEEIYKVLTRKEKEGGVKAGLEELNAVVKSYGMSYNELIMQIQK >NZ_CP046243|1285438:1294668|1288569_1289781_+|WP_070256772.1|DBSCAN-SWA MVELNKIYQAKQKIADFVLKTPFVHSSFLSEFLETDVFLKCENLQKTGAYKIRGAYNTIANLTKEQKQAGVIAASAGNHAQGVAISAKKFDIEAVIVMPEATPLLKVSATKNLGAKVILKGDNFDEAYAYALNYAKEHHLNFIHPFENESIIAGQGTLMLEMLDEISDLDMILAPVGGGGLISGVASAAKQINPAIKVIGVSAKGAPAMYESFKSKKMINSKAVRTIADGIAVRDVNKINFDIILECVDDFIQVDDEEIANAVLYLLEKHKITVEGAGASAVAALLHKKIDLKNHKKIGVILSGGNIDVQMLNIIIEKGLFKAFRKMHINVTLIDKPGALSALSDAIKEAQANIVKIDYDRFSTKLEYGDAMISITLETKGKEHQELVRKILYDKGFNFNEIL >NZ_CP046243|1285438:1294668|1286533_1286956_+|WP_081336344.1|DBSCAN-SWA MNFYKGFLILFQKITYTNRKILYKVNEILKPFGLKSSDWRVFVYLNQHGCSTLAPICEFYQMDKAILSRVVSKLAKLEYIEFLKADDKREKIITLSAKGKEIFLDANAYIRKYERNILDILDVKDQERLLKLLDYINEKI >NZ_CP046243|1285438:1294668|1288207_1288567_+|WP_052243414.1|DBSCAN-SWA MKNIAIIGLSPNQDKPSHFVSKYLQDLGYKIYPIYPKEDFILNERVYRNLKEIPFEVDTVVMFRKASFANEIFEDLLSKKIKNFWMQLGIINEEIMQKCKKYGINCVQDRCIKIELQKG |
9 | Salmonella_phage(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
|---|