| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP047602 | Thermoanaerobacterium aotearoense strain SCUT27 chromosome, complete genome | 4 crisprs | cas7,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2,csa3,DEDDh,DinG,RT,cas6 | 0 | 6 | 7 | 0 |
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP047602_1 | 150846-154532 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047602_1
|
55 spacers
spacers of NZ_CP047602_1
>1.1|150876|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCCAACCCTTTGGCTTTGGCATTTATTTCACCTCAA >1.2|150943|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACAATTAAATGACTTTTACGAATTTAAAATATTCGA >1.3|151010|35|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATTTTCAAGATACAAAGCCATGCATAATACAGA >1.4|151075|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTATATATTTTGAAACTTTTTTATTATTTGCATC >1.5|151141|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCCTCTTTTACAATTTCTTTATCTGCATCTGCAAT >1.6|151207|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTGGACCTCTGTATAATGCCAAAGGAGCTAAAATACC >1.7|151274|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTTTTTATCGATGTTTGTACATTATCTGCCAATAT >1.8|151340|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACATATCTTGTAAAATATAATAAATTGGATGGAAC >1.9|151406|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAGAAAGGTATTCTTGAGCAAGCTTCCATGTTTTT >1.10|151472|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACCTAATAAAGCTCGGCTTTGCGCCGAGCCTACTAT >1.11|151538|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGCTTACAATCTTTCGCTAATAAATCCTAATTTTGC >1.12|151605|38|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAAATGTTTTTGAAAGTGATTCTTTTAATATTTCTTC >1.13|151673|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATATTGGTAGTGAATTTCCTGCTGTTGTTCAGTTAGC >1.14|151740|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAATACTTTATAGGAAAATTAGCAATAACATATCTA >1.15|151806|40|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGAATCATAGACACTTACAATTTTTTGAGCATAATTTGG >1.16|151876|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTACAAATGCTATATATTCTCCAAATTCCTCATTGT >1.17|151943|35|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGAAATATCAAGTACCCGGAGTAAGCGAAGTATTC >1.18|152008|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATATATTAAAGTGGAGGAGAATATGAATTGTTGGAAT >1.19|152075|35|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGACTGGAATTCTCAGTTTGCAGGGATACAGACG >1.20|152140|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGAAAATGTCCCAGATGTAGAAGGTATAATTTACCA >1.21|152207|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACATTATCAAGGTCAATGGCAATTTCTTTAAAAGCAT >1.22|152274|35|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTCTCCTACTTCGTTTGTAGTTTCAACTAGTCTT >1.23|152339|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAATATAAATTTAATGAATTGTATGACAATTTAGA >1.24|152405|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAAGTTCTATTCTTGTATTAAATTCATCATTTGTA >1.25|152471|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACATTATTTGACCTGTGCTATTTTTTATAATAAAGG >1.26|152537|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTATGAGGAACTGTAACAACTGCGTCTGCTGCCTGA >1.27|152604|38|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGGACTTTGCGTATTGTCTACATTAAACTTCTTGTCT >1.28|152672|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTGCAAAAAGCAGTTCAAGGCCTTGCAACAGATAT >1.29|152738|38|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTAATTTCTTTGCTAATTTATCACGTTTTTGAAGTTT >1.30|152806|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTTAAAACAAAACAAGGAGTGACACAACAACAACT >1.31|152872|35|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTGTAGACAGTGCGGAAATTTAGTTCCAGAGAA >1.32|152937|35|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGCTTAATTATCCTGATATAACACAAGTGACGACG >1.33|153002|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGGGATGCTATCGCTAACCAATATCGGAAATTGAGA >1.34|153069|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTATTTTTGCTTTGCCTCGCTTAAGCAGTTTCCTTG >1.35|153135|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAATGCAATTAAAACAATTAAGTTAAATTAAAATTA >1.36|153201|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGAAATAAATAAGCAAAAGTATAAAAAAAGAAAAA >1.37|153268|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAGATATTTGGGAAAGTCAAAAATTTATAAGGTTA >1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAATAAACAAAAAAATAAAGCAGGCTTAACCTG >1.39|153398|38|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAACTCCTTTCCTTAACTCTATATATATAATAACATA >1.40|153466|38|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGACTGAGAAGTTTCCTTTTAGTTTGCCTTGGGATGT >1.41|153534|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATGTACTATCTGCTTTATCCCAACTATTCATTGGGT >1.42|153601|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGACTATGGATGAGAAAGCAAATATAATTCTTGAACA >1.43|153668|38|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGTAAAGTTACAGCAATAAATGGTTCAAATATTACTC >1.44|153736|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTGTATTTTGTAATTTCACAAAGTACATATCATATT >1.45|153803|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTACAAAATTTATTGAATTTGCAATACTTGGACCA >1.46|153869|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTAATCAAGCTATTCCATATATCCTCTGCACCTTGG >1.47|153936|38|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTTTTATCTATGCTGCCTTTTGCCTTTACTAATTTT >1.48|154004|35|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGGTTTGCCTAATATGTTTATCCATTCTCTTAAA >1.49|154069|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGGATAAATTGCTATGAAAGGTTTATTGACATCAT >1.50|154136|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAATATGACATTATTCGTAGCACAAAACAATACGG >1.51|154202|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGAAACTTAGCCAATATTCCATCTTAAGCACCTCCA >1.52|154269|35|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTATAAACAAATTCGGTTATAAAGTGTATGGCAA >1.53|154334|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCATAATAATGTTAATATTGGTAGTGAATTTTCTGC >1.54|154401|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTATTTCACCTCCATATTCTTGAGTTTTTCTAA >1.55|154467|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGATTAGAAATCTTAATAAAGAAGGTAAATCTGCT |
cas3,cas5,cas7,cas8b1,cas4,cas1,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047602_1
The CRISPR arrays of NZ_CP047602_1 >merge|NZ_CP047602|1|150846-154532|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCTCCAACCCTTTGGCTTTGGCATTTATTTCACCTCAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAACAATTAAATGACTTTTACGAATTTAAAATATTCGAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTATTTTCAAGATACAAAGCCATGCATAATACAGAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTTTATATATTTTGAAACTTTTTTATTATTTGCATCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATCCTCTTTTACAATTTCTTTATCTGCATCTGCAATGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGTGGACCTCTGTATAATGCCAAAGGAGCTAAAATACCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGCTTTTTATCGATGTTTGTACATTATCTGCCAATATGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTACATATCTTGTAAAATATAATAAATTGGATGGAACGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTAGAAAGGTATTCTTGAGCAAGCTTCCATGTTTTTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACACCTAATAAAGCTCGGCTTTGCGCCGAGCCTACTATGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAAGCTTACAATCTTTCGCTAATAAATCCTAATTTTGCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATAAATGTTTTTGAAAGTGATTCTTTTAATATTTCTTCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATATTGGTAGTGAATTTCCTGCTGTTGTTCAGTTAGCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGAATACTTTATAGGAAAATTAGCAATAACATATCTAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTGGAATCATAGACACTTACAATTTTTTGAGCATAATTTGGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACACTACAAATGCTATATATTCTCCAAATTCCTCATTGTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCGAAATATCAAGTACCCGGAGTAAGCGAAGTATTCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATATATTAAAGTGGAGGAGAATATGAATTGTTGGAATGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTAGACTGGAATTCTCAGTTTGCAGGGATACAGACGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATGAAAATGTCCCAGATGTAGAAGGTATAATTTACCAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACACATTATCAAGGTCAATGGCAATTTCTTTAAAAGCATGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTTCTCCTACTTCGTTTGTAGTTTCAACTAGTCTTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAAAATATAAATTTAATGAATTGTATGACAATTTAGAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACACAAGTTCTATTCTTGTATTAAATTCATCATTTGTAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACACATTATTTGACCTGTGCTATTTTTTATAATAAAGGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTTATGAGGAACTGTAACAACTGCGTCTGCTGCCTGAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAAGGACTTTGCGTATTGTCTACATTAAACTTCTTGTCTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAGTGCAAAAAGCAGTTCAAGGCCTTGCAACAGATATGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTTAATTTCTTTGCTAATTTATCACGTTTTTGAAGTTTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGCTTAAAACAAAACAAGGAGTGACACAACAACAACTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATTTGTAGACAGTGCGGAAATTTAGTTCCAGAGAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCGCTTAATTATCCTGATATAACACAAGTGACGACGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTGGGATGCTATCGCTAACCAATATCGGAAATTGAGAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCTATTTTTGCTTTGCCTCGCTTAAGCAGTTTCCTTGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTAATGCAATTAAAACAATTAAGTTAAATTAAAATTAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAAAGAAATAAATAAGCAAAAGTATAAAAAAAGAAAAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTAGATATTTGGGAAAGTCAAAAATTTATAAGGTTAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAAAATAAACAAAAAAATAAAGCAGGCTTAACCTGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATAACTCCTTTCCTTAACTCTATATATATAATAACATAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTGACTGAGAAGTTTCCTTTTAGTTTGCCTTGGGATGTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAATGTACTATCTGCTTTATCCCAACTATTCATTGGGTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTGACTATGGATGAGAAAGCAAATATAATTCTTGAACAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTGGTAAAGTTACAGCAATAAATGGTTCAAATATTACTCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCTTGTATTTTGTAATTTCACAAAGTACATATCATATTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATTACAAAATTTATTGAATTTGCAATACTTGGACCAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGTTAATCAAGCTATTCCATATATCCTCTGCACCTTGGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTGTTTTATCTATGCTGCCTTTTGCCTTTACTAATTTTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATGGTTTGCCTAATATGTTTATCCATTCTCTTAAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTTGGATAAATTGCTATGAAAGGTTTATTGACATCATGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCAAATATGACATTATTCGTAGCACAAAACAATACGGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTGAAACTTAGCCAATATTCCATCTTAAGCACCTCCAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCTTATAAACAAATTCGGTTATAAAGTGTATGGCAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTCATAATAATGTTAATATTGGTAGTGAATTTTCTGCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTTTTATTTCACCTCCATATTCTTGAGTTTTTCTAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTGGATTAGAAATCTTAATAAAGAAGGTAAATCTGCTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC >NZ_CP047602|1|1|150846-154532|PILER-CR GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CTCCAACCCTTTGGCTTTGGCATTTATTTCACCTCAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AACAATTAAATGACTTTTACGAATTTAAAATATTCGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTATTTTCAAGATACAAAGCCATGCATAATACAGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTTATATATTTTGAAACTTTTTTATTATTTGCATC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATCCTCTTTTACAATTTCTTTATCTGCATCTGCAAT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GTGGACCTCTGTATAATGCCAAAGGAGCTAAAATACC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GCTTTTTATCGATGTTTGTACATTATCTGCCAATAT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TACATATCTTGTAAAATATAATAAATTGGATGGAAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTAGAAAGGTATTCTTGAGCAAGCTTCCATGTTTTT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ACCTAATAAAGCTCGGCTTTGCGCCGAGCCTACTAT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAGCTTACAATCTTTCGCTAATAAATCCTAATTTTGC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATAAATGTTTTTGAAAGTGATTCTTTTAATATTTCTTC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATATTGGTAGTGAATTTCCTGCTGTTGTTCAGTTAGC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GAATACTTTATAGGAAAATTAGCAATAACATATCTA 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ATTTGTAGACAGTGCGGAAATTTAGTTCCAGAGAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CGCTTAATTATCCTGATATAACACAAGTGACGACG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTGGGATGCTATCGCTAACCAATATCGGAAATTGAGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CTATTTTTGCTTTGCCTCGCTTAAGCAGTTTCCTTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAATGCAATTAAAACAATTAAGTTAAATTAAAATTA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAAGAAATAAATAAGCAAAAGTATAAAAAAAGAAAAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTAGATATTTGGGAAAGTCAAAAATTTATAAGGTTA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAAATAAACAAAAAAATAAAGCAGGCTTAACCTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATAACTCCTTTCCTTAACTCTATATATATAATAACATA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTGACTGAGAAGTTTCCTTTTAGTTTGCCTTGGGATGT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AATGTACTATCTGCTTTATCCCAACTATTCATTGGGT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGACTATGGATGAGAAAGCAAATATAATTCTTGAACA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGGTAAAGTTACAGCAATAAATGGTTCAAATATTACTC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CTTGTATTTTGTAATTTCACAAAGTACATATCATATT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATTACAAAATTTATTGAATTTGCAATACTTGGACCA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GTTAATCAAGCTATTCCATATATCCTCTGCACCTTGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTGTTTTATCTATGCTGCCTTTTGCCTTTACTAATTTT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGGTTTGCCTAATATGTTTATCCATTCTCTTAAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTGGATAAATTGCTATGAAAGGTTTATTGACATCAT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CAAATATGACATTATTCGTAGCACAAAACAATACGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTGAAACTTAGCCAATATTCCATCTTAAGCACCTCCA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CTTATAAACAAATTCGGTTATAAAGTGTATGGCAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTCATAATAATGTTAATATTGGTAGTGAATTTTCTGC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTTTATTTCACCTCCATATTCTTGAGTTTTTCTAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGGATTAGAAATCTTAATAAAGAAGGTAAATCTGCT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC >NZ_CP047602|1|1|150846-154532|CRT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CTCCAACCCTTTGGCTTTGGCATTTATTTCACCTCAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AACAATTAAATGACTTTTACGAATTTAAAATATTCGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTATTTTCAAGATACAAAGCCATGCATAATACAGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC 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GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGGTTTGCCTAATATGTTTATCCATTCTCTTAAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTGGATAAATTGCTATGAAAGGTTTATTGACATCAT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CAAATATGACATTATTCGTAGCACAAAACAATACGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTGAAACTTAGCCAATATTCCATCTTAAGCACCTCCA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CTTATAAACAAATTCGGTTATAAAGTGTATGGCAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTCATAATAATGTTAATATTGGTAGTGAATTTTCTGC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTTTATTTCACCTCCATATTCTTGAGTTTTTCTAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGGATTAGAAATCTTAATAAAGAAGGTAAATCTGCT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
>NZ_CP047602.1|WP_014757341.1|148318_150682_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MKTSCFSELYSHPDKYLEEHLARCADLAEKFLDEAKSNLMDEELLSKLVRIVALCHDLGKSTGFFQEYLSSQDDNKKKELKSKKETHHSLISAVVAYFAVKQEVSGLDIDDDIKILLPFISYIAVKKHHGNLNDAATEASLEDRDIEIMKSQLQSIDESKFKILSDNLKKAGLNIDLNKTTVANNIENIKNEMRSIRLYLRKIKQREDLTYYILINYVFSLLIDADKSEVVVGEISPAYVELMPDAVDKYKSQISYKDNRINLLRENAYREVNENEINVDERILSINLPTGLGKTLTSISFALKLKRKLYDVYNKNFRIIYSLPFLSIIEQNYQEFEKILKTNDINVNTSVLLKHHHLSEVKYNDNETELDTEKSKIMIEGWNSEIIVTTFIQLFHTLLSNRNSALRKFHRIANSIIILDEIQSIPFYYWKLVKEILKAVAYKLNSYIIFVTATQPMIFEGDEIRQLTDKRKYFSQMERVVIKPVLQKEMHLDELIDMFDLKDGRSYLFILNTISSARDFYRLLKEKLSDEEIVYMSTHVIPYERLERINLLKKNNIKYAVTTQLVEAGVDIDFDVVVRDLAPLDSINQSAGRCNRNWERKGEVYVVSLIDENNRKYASRIYNKVMLNITERILSQHESISEKDFLDIIDQYYKEVSQNLSSKEAIDILDAVFKLKYDSDDDTPSVSNFKLIDDEYYKVDVFIEYNEEAINLWQRYIDLKKIKNLYKRRSTFDEFKADFYKYVISIPEKTENMPAEVEGFKYVNADSLKDYYDAETGFKPSGVLSIW >NZ_CP047602.1|WP_014757342.1|147627_148341_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKLLIFDVYGDFGHFKKYYTTSSPLTFSFPPPPTVKGLIGAIEGIGKEDYLKVLSSDKCKLAVRILKPVKKIRMGLNLINTKDNFWIPFKKKNHEARTQVKMELLKDPMYRIYFHHTDEDLFDDIVEKVKGHKNVYTVSLGLSEMIADYRFVGVKDAFEVENKEVFVSSVLPYKYILEDKIVFEDGKKYFKEKIPADMDEERIVLDYADVVYEANGKSIRSYVSKSWVIDDENIVLF >NZ_CP047602.1|WP_014757343.1|146652_147564_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csh2 MSNVIKNRSEILFLYDVSFANPNGDPVDENKPRIDEETGINIVTDVRLKRTIRDYLSGYKGMDVFILETRDESGKLRTKDDRISDFGSNDDIVNKCIDVRLFGATTAVKDKTMTLTGPVQFGFGRSLHKVNMTYIKGTTVMPSQSGNAQGTFTEKYILPYSLISFYGIVNENAAKNQNIPLTDGDVDLMLEAMWNGTKNLMSNSKMGHMPRFLLQVVMKEENYQIGELNKRIKFTHDVEDEELRDIQDGKIEIKELIESLNANKGKIEKLRYAADERAVFAVDGVVCNFGDVVKDFTVEKLSF >NZ_CP047602.1|WP_014757344.1|144895_146653_+|TIGR02556-family-CRISPR-associated-protein MLDAVKDIGEMSINAGRKSLLDVLIEDPNQNGSYKNIIAINFTVDSGDVKYKDVTIEETDSQKISRYLYSSAGGNGPGYMPAAKITEPDKTFNGKILSWFKILTKKGLNIDEDERRFLENLNSAIHENKDEILGEIVKFRGEFPKKDGLLLMLKFVEGSTYKYIGDIPLFRKLLIDTDNEKYNKLSANDKVCSICGEKKDLVFGKVDTYAFYTIDKTGYIVGGFDEKKSWRNFPVCPDCRLKLEEGKKYIENNLTFKFYGLKYQLIPKFLIGERFVKEEILDIFKETSKLVSLKESTKKRVITDEDDIMYFLKDADDSISLNYLFIEKQNSAERILLLIEDVFPSHIREIFKAKDTVDDIFNENFTFRNIRNFLSKSDMKKRDSDLDGYFLDLTDRIFRGRKIDINLILKFIMKRVRDEFIQDKYYQSAIKDGMMAIKFLQNLGLVEMEVKAMEERPLSDFFKKYDENFETPIKRGLVLLGALTELLLRKQYKDRGAKPFMKNLKSLKMDENDIRGLLPKVQNKLEEYDSFDKGKRLLAKEVSNYLLLAGNNWHMPVDEINFYFACGLNLADEIASIIYSKGEEQ >NZ_CP047602.1|WP_014757346.1|143621_144035_+|SUF-system-NifU-family-Fe-S-cluster-assembly-protein MSDLNQLYSEIIMEHYENSPNKREMDNPTIKERGHNPLCGDDITLELKMNGDVIEDASFVGHGCAISQASTSMMCDLIKGKDKKEALKLVEKFIDMIHKKDVDIDELGDAQVLQGVSDFPARVKCALLAWKTLEKII >NZ_CP047602.1|WP_014757347.1|142398_143625_+|cysteine-desulfurase MLDVLKIKEDFPVLKTTPHGKKLIYFDNAATTQKPTYVIDAVSKYYKEYNANVYRSPHYLSALSTEAYEEARDAVRKFINARSSESIVFTRNATESINLVAYTWGLKHIGEGDVIVLTIAEHHSNILPWQMVAEKKGAKLRYVHLDEDLRLDLDEFKDILKEGNVKLVALQHSSNVLGIINPVYDIVNLSHENGAKVLIDGAQSIPNMKIDVEKLGCDFYAFSGHKMMAPMGIGVLYIKEDLLSDIPPFLSGGEMIDEVFEDHSTFAPSPLKFEAGTPNVEGAYGLMKAIEYIEKIGLENILEHEQELTEYALEKLTKIDYVKLYGPKGAKDRTGIISFNVENVHPHDVATILDQDGIAVRSGHHCCQPLMRYLGVPATVRASFYVYNDKSEVDAFVDGLKDVRKWFR >NZ_CP047602.1|WP_014757348.1|141232_142399_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MIKSLDYNTIQDIIKEGGSGEKELRVKGYEVFSKVPMPMWKRVKLDDVHIPYYKEYKSATIGNDVQEGLVMNPLTKALMDDDLNTIKSALAHNFGVDEKFKNMVLAFYNTGFSIRALPNSNVKLPVTVNYSVVDDDDTIIDLNLIVAERLSNLTVVFDYVSDKKGFHNGLTAVIAKDGASVNIVKIQRFSDDSSNFDNNIIITGNDATVKWTQIDLGGKVDAYDVTAELEGVGSSAYFNSIFLGAYEQSHDMSYRVNHIGMRTGSSVDVKGALKDKSKAVFRGNLDMKRGAKKAKGNESEVVLLLDKTVRSDAIPALWCSEDDVQANHSASAGQIDENKLFYMMSRGLSMEEAKLLMVEASFNPVIDTLPNDVLKEAVKSYIGRRISG >NZ_CP047602.1|WP_014757349.1|139815_141219_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufB MKKTIVNDIDFSRYNIKNEVRYSYKTEKGLSKKIVEEISERKNEPKWMRDFRLKSLEIYESKPMPTWGVDLSQLDINSIVAYLSPDTKMKNSWDEVPEDIRNTFEKLGIPEAEKKALSGVGAQYDSEVVYHSIKDNLAKQGVIFEDMDTALKKYPDVIKEYFMTRNVTPNDHKFAALHGAIWSGGTFVYVPENVKVEVPLQAYFRMNAPGTGQFEHTLIIADRGSEVRFIEGCSAPQYAVSNLHAGCVELFVKEGARLIYSTIENWSKNTYNLNTKRALVDKDGVIEWISGSFGSHKTMLYPASVLRGKGAKSEYTGVTFAAKGQHLDTGSKMIHLAPYTSSKVLAKSISKDGGITNYRGLLRIGPNAEGAKASVQCEGLMIDEISRSDTMPIIEVLNDNVDIGHEAKVGRISDEQIFYLMTRGLSEDEARSMIVRGFVEPVAKSLPLEYAVELNRLIKLELEGTIG >NZ_CP047602.1|WP_014757350.1|139049_139802_+|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC MKDNLLEIKDVKAEVDGKEILKGLNLTIKRGEIHAIMGPNGSGKSTLCNVIMGNPHYKVTDGEILFEGENIVNLKVNERAKKGIFLSFQSPEEIPGITVDNFIRTSLNAVTNKNMPMLQFAKSMKEKMDMLDMKPEYRTRYLNVGFSGGEKKKSEILQMAMLNPKLVMLDEIDSGLDIDALRVVAETVRKLKVEDMSILIITHYNRILDYLEPDVISVLAHGRIVKEGDKNLAKELEKTGYESILDEVLS >NZ_CP047602.1|WP_014757351.1|138511_138808_+|hypothetical-protein MAYVWFFMALVMLIQLIRKVIKKEIDMIGGDFITMLAFVSMGILHLFNLSKDKLNSLEIHIFISYIILIVLFFIYWIHRYNKMNNIKLATKKLSNDKK >NZ_CP047602.1|WP_014757340.1|154544_155291_+|copper-amine-oxidase-N-terminal-domain-containing-protein MFRNKYKLMVSISIIVLFLFVNVYAVPYIKLVINGQQVNTDVPPQIVNGTTLVPIRVISESLGAKVDWDGNTQTVSVTMPRETLEAHTVDTFWEACESDTVTEPIIDDSVTPEFKAVLQKALALLKEKDNTTYKFVCVYIPRIAVQQYKDNIVGSWVDYTTHNVYFNSTNINRITSGGTWGIEYVAITLAHEAYHESTFCSGSSISIYSDVNEDEIQAYAFEYAVAKHLGVSSDLQNWVKQQITSLIN >NZ_CP047602.1|WP_014757339.1|155652_156150_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MYEEVTGSLMQSYNICKRQVWLMAHQIIPDQEHPYIEMGRLIDDMSYDRDRKKINFENVVIDLVRNDNGNLLVGEVKKSSKAIGSARLQLLFYLYKLKQNGIEAKGQLFFPEERKKIDVRLTSESEAEVVSAINEINDIINMDKAPAFEKIPYCKNCGYKEFCLS >NZ_CP047602.1|WP_014757338.1|156146_157139_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKPVYIFSDGELHRKDNTLYFEGESGRKFIPVENTSEIMIFGEVSLNKRFLEFISQSEIILHFFNHYGYYVGSFYPREHLNSGYMILKQAENYIDEKKRLYIAQKFVEGAYRNIRQVLKYYQNRGKNLDDIIYAIERLGDLIAGTSNVNELMAIEGNIREYYYKSFDEILGNCDFEFDARSRRPPKNSLNVLISFGNSLMYTTVLSEIYKTHLDPRIGYLHSTNFRRFTLNLDVSEIFKPIIVDRVIFTVVGKNIIKKDDFDEDAEGLLLKDKGKMAFIEEYENKLKTTINHRSLGNSVSYRRLIRLELYKLEKHLMGEEEYNPFVAQW >NZ_CP047602.1|WP_014757337.1|157148_157412_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFIILVYDVNEKRVNKVLKTCRKYLNWVQNSVLEGEISDANFKKLKSEISRIINKDEDSVIIYILRTTKYSDREIIGLEKGGESLFV >NZ_CP047602.1|WP_084214895.1|158010_158517_+|MarR-family-transcriptional-regulator MLKEGEEFLKEYNERIDVLKTLKSIMNMIHRNMESEFKDLKITGPQGMIIGILMHHGEMKISDLSDKMGLSSSTVSGIVDRLEKQGMVKRIRSSDDRRVVYVKVDEDFKKRSKESFKNIYERFETIMSKATDEEIADIVKGLNTLKKLIESSSGQSSDNFKKGGFDGC >NZ_CP047602.1|WP_014757334.1|158510_160736_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLKLRKYFKPYIFITIVAILFIFVQAMSDLSLPDYMSNIVNQGIQQGGIVNAVPDAVRKSTMDKLTLFMNDSDKNNVLNDYALVDKNSSDYDKYVKTYPDLKKEPIYVLKNIDKTEIDKINLPMGKAFLAVSGVEKMKSSAKGGFITFNNMKIPANADLFALFAKLPESERQKITDSMNEKFTSLGDNMVIQAATQSLKSEYKALGVNTDKIQTNYILSTGLIMLLITLLSAACSIMVGFLGSRVAAGFSRDIRKKLFTRVESFSNEEFDKFSTASLITRTTNDITQIQMLIVFMIRMIFYAPMIGIGGVIRAVGKSSSMSWIIALAVIVLLGLVSTVFSIALPKFKSVQKLVDRLNLVARENLAGMMVIRAFNTQEFEENRFDKANRDITNTMLFINRVMITMFPVMMLIMNGITLLIVWVGAHDIANSSMQVGDMMAFMQYAIQIIFAFLMMSMMFIMIPRASVSASRIAEVLETEPTVVDPKESKKFDDTQKGVVEFRNVSYKYHGAEEYAISNISFKAEPGKTTAIIGSTGAGKSTLINLIPRFYDATEGQVLVDGVDVRDVKQHDLREKIGYVPQKISLFKGTVMSNIKFGNENATDEEVKRAAEVAQAAEFIEKLPNGYDSEISQDATNISGGQKQRLSIARALVKKPEIYIFDDSFSALDFKTDRALRKALKEYTGNSTVIIVAQRISTIMNADQIIVLDDGKIAGIGTHEELMKTCETYREIAYSQLSKEELA >NZ_CP047602.1|WP_014757333.1|160735_162607_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MDGRNANTPRRPVMRRHGPMGGHGPMVGGEKANDFKGTMKKLMKYLGEYKLSIFLVVLFAAGSAALSIAGPKILSKAITKLYEGVMAKIAGTGNIDFDYIGRIILLLIGLYLLSSGLGYIQGWIMTNVAMKVTYKFRRDIMEKINRMPLKYFDGTNHGEILSRITNDVDTISQTLNQSITQIITSVTSVIGALIMMLTISVEMTGVTFLMIPVSMGIIALIVRFSQKYFREQQDYLGHVNGHVEEMYGGHVVMKAFNYEERSVKKFDEYNNELYNVAWKSQFLTGLMMPIMNSVSNLGYVGVVVLGSYLVINGTIQVGDIQAFIQYVRSFTQPLAQIANISNILQQTAACAERVFEFLDEEEEVPETEHPVKLENVEGHVQFDHVHFGYRPDKIIINDFSADIKPGQKVAIVGPTGAGKTTMVKLLMRFYDVNAGRILIDGYDIREFTRSDLRSLFGMVLQDTWLYNGTIMDNIRYGKLDATDEEVIKAAKAAHVDHFVHTLPDGYNMVLNEEASNVSQGQKQLITIARAILKDPKILILDEATSSVDTRTEILIQKAMDNLMKNRTSFIIAHRLSTIRDADLILVMDHGDIVEQGTHKELLAKGGFYAKLYNSQFEDQEVAS >NZ_CP047602.1|WP_014757332.1|162643_163492_-|2-oxoacid:ferredoxin-oxidoreductase-subunit-beta MNTAFETYETAWCPGCGNFGILNALKDALTELGLKPHQVVIASGIGQAAKMPHYINVNGFNGLHGRALPPATAINIANKDLKVIIDSGDGDTYGEGGNHFIHAIRRNANIAHFVHDNQIYGLTKGQASPTTAKGQKTSLQFDGVILDPVKPIKLALTMGAGFVARSFSGNHEHLKKMMKEAIMYDGYALLDIFQPCVTFNKVNTFKWYNDRVYELPDDYDYTDLDNAFKVADEWGDRIPIGIIYKVEKPTYIDNVSFLKDGPPLVDAKLDPMMAEKYLDDFR >NZ_CP047602.1|WP_014757331.1|163512_165201_-|2-oxoacid:acceptor-oxidoreductase-subunit-alpha MDYNVLIGGAAGQGIDTLSYIIEKTLKRCGLYVFSTKDYMSRVRGGHNFIQVRFGDKPIYSHDEKFNAIIALDEDTVNLHAKSLKTSGKLILDKSISDDSAYLSFDFKAVAKECGNPRVAGTAAVGVLLKLFGIPLDVSHTVLDDEFKGDVLNANIKAIDTGYNMAKQIFNVPLGKKDDNIYISGNEAIALGAIAAGVKFYSGYPMTPSTSVMTYIAKKSHDAGIVVEQVEDEISAINMALGASYAGVRAMTGSSGGGFALMVEGISLAGITEIPIVITEVQRPGPATGFPTRTEQGDLRFIIHSGHGEFPKMVISLRSPEDAFYQTARAFNIADKYQIPVILVSDQYLADSGVTVKPFDFTKVTIERHISGHEALENGVYKRYKLTESGISPRIIPGKVEGATVLIDSDEHDEFGHITESQDVRVKMVNKRMKKFKLLKEEIQEPLFIGAENPDILITCWGSTYGPVKEAVDMLLKDGMSIGALSFGDIWPFPTKLIKKYGKFAKMIIDVEQNATAQLDSLMRENALIKADEHILKYDGRMMSSRYIYERVREMTKASSLY >NZ_CP047602.1|WP_014757330.1|165561_166374_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MEGGSPAFGYFMRFCSLRSGSSGNAAYIGYKDVHILVDAGLSGSTIEKSLLNIDVDPHDISAILITHEHNDHIKGAGILSRRYDIPIYANEATWVSMEGLIGEIEPHNKRFFKTGEDFTLGDVKIRPFKKSHDASEPVGFSFFCGQNKATIATDLGYISRGVAANIMDSDVVLLESNHDVDMLINGTYPWPLKKRILSPHGHLSNKDAAEAIKKFIKLKAVGKIYLGHLSQNNNKPEIAYKTVVDALREEGIDYEINMALRYEESDIVEI |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP047602_2 | 804017-804227 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047602_2
|
2 spacers
spacers of NZ_CP047602_2
>2.1|804054|53|NZ_CP047602|PILER-CR GAGGTCGAGGGTTCGAGCCCCTTTTGGGTCGCCATAAAATTTAAAAAGCCTCG >2.2|804144|64|NZ_CP047602|PILER-CR GGGACTGAAAATCCCTGTGTCAGTGGTTCGATTCCACTTCGAGGCACCATTAAGTTAAGCGGAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047602_2
The CRISPR arrays of NZ_CP047602_2 >merge|NZ_CP047602|2|804017-804227|PILER-CR ATAGCTCAGTTGGTTAGAGCGCCAGCCTGTCACGCTGGAGGTCGAGGGTTCGAGCCCCTTTTGGGTCGCCATAAAATTTAAAAAGCCTCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAGGGACTGAAAATCCCTGTGTCAGTGGTTCGATTCCACTTCGAGGCACCATTAAGTTAAGCGGACATAGCTCAGTTGGTAGAGCATCACCTTGCCAAGGTG >NZ_CP047602|2|2|804017-804227|PILER-CR ATAGCTCAGTTGGTTAGAGCGCCAGCCTGTCACGCTG GAGGTCGAGGGTTCGAGCCCCTTTTGGGTCGCCATAAAATTTAAAAAGCCTCG ATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAGGGACTGAAAATCCCT GTGTCAGTGGTTCGATTCCACTTCGAGGCACCATTAAGTTAAGCGGACATAGCTCAGTTGGTAG AGCATCACCTTGCCAAGGTG
>NZ_CP047602.1|WP_013298441.1|803586_803790_+|cold-shock-protein MVRGKVKWFNAEKGYGFIEREGGSDVFVHYSAIEQDGFKTLEEGQEVEFDIVEAEKGPQAANVKKVS >NZ_CP047602.1|WP_014759291.1|802754_803504_+|NAD-dependent-protein-deacylase MAQEDVYEKVARLMENSKKTVILTGAGISTESGIPDFRSPGTGLWEKMDPMEALSTKVLYNDPKKFYKSGFKILLSMKDAKPNKAHYILAQLEQDGFISCVITQNIDNLHQKAGSKKVYEVHGQTRTGSCTNCGEVVSIDLLEAKVSKGEIPPKCDKCNGVLRPDVVMFGDQMPEDFEKAWHEAEDSDLMIVIGSSLTVSPVNFLPGLSKHLVIINKSETPEDRRADAVIRESAGEALSKIVRYLKTVQ >NZ_CP047602.1|WP_014759292.1|802565_802712_+|small,-acid-soluble-spore-protein,-alpha/beta-type MDEKLKIEAAKELGLLDKVHKVGWSNLTAQETGKIGAIVKKKKYKSAM >NZ_CP047602.1|WP_014759293.1|801054_802554_+|hypothetical-protein MIKKFFLLTLTLIMVFSLNVFSYAFPNDIQNQDYLKLLKDKMPFTSDMSVDQIRKNSDGSIEINMKSDGDIYKTLDVVLNDGQIKSADYYVDQMKYLFDKSGKSKIGKDDAEIIGKKLLENVFGEKFEYVSEVNDSTYIDDALERPIIYKFRYKNLVDDVPVYNLDAYVYIDSESGDILKLKGQSIDESSYNKDIKTIGSVDALKAFNSKLNPTLVYLKNNDDDFPKYRLYYALSIDYNLVGVDALNGDLVDFSGDKLYDDVATIKGCTNELKNSGNMVSYDEALKIAMNEMNNFRINDIKVLDSKTIERYFLTEKAAYTFNMNHTDKSLIVNANIAVDKESGIIMSENVDISDDDGLFDTYGNLDRIIDFAKKILRGKDCKLNLLKKPVVGNDDYTYMFYRVYNDAIVLDNYVRIKTDKNGKIINVSLNWDEADKPSTRDILNESIARNILIDEKPSLCYLYTSKYGLKPIYRLPTMDLIVDALTKQKISINEFEKGY >NZ_CP047602.1|WP_013787627.1|800721_800943_+|NifU-family-protein MRERVEEVLKLLRPSLQADGGDVELVDVTDDGVVQVRLTGACGGCPFAVMTLKEGIERAIKEEIPEVKEVVAL >NZ_CP047602.1|WP_014759294.1|799528_800551_-|NADPH-dehydrogenase-NamA MLFTPIKIKDITIKNRIMMSPMCQYSAGKDGLANNWHFVHYVSRAVGGVGLIMIEATAVESRGRITDRDLGIWNDQQVESLKKIVEECKKYGATMGIQLAHAGRKSEVTDETPVAPSSINWSDDYKLPHELTKEEINTIVEKFKDAAARALAAGFDVVEVHAAHGYLLHEFLSPLSNKRSDEYGGDVINRVRVLKEVIEAIKKVWPENKPLFVRVSSDDYIEGGIDIDEMIRILSHIKPLGVDVIDASSGGLLNAKIDLYPGYQVKYSEKIKSQLGFKTAAVGLITKAEMAEQILKDEKADIIALGRELLRNPYWPLYAAHDLKEDVEWPKQYERGKFRV >NZ_CP047602.1|WP_014759295.1|798728_799532_+|hypothetical-protein MLKYAKTLFLLILFSILIFGQIFAATIPSKPSQYDYVYDYANIMNQSDIDTIRSIGKEIESLTGAQIIVVTVDDIGDYQISDYALNLFRSWGIGQKDKNNGVLLLVDKKRLLEGLSGKVFISVGYGLEGAIPDSVAGRILDDYVLPKWNDKDYSGGIVEGYKAIAALVAKEYNVDLKNVDQSQYAQQNDNGSNKAEGIISVIAMIILLIIFSNIRGWWWRGPGGFGPGGFGGFGGFGTGGGGFGGGFGSGGGGSFGGGSTGGGGAGR >NZ_CP047602.1|WP_013787624.1|798146_798716_+|LemA-family-protein MKRSSVVLISVAAVVLLIVVYFFSSYNGLVSQQENVNSKWSQIENQLQRRADLIPNLVETVKGYAAHEQSVFDSVNKAREKLLAANTVQEKANANDELGTALGRLLAISENYPNLKADQNFRQLSDELAGTENRIAVARMDYNNAVQQYNTSIRQFPNVIIARMFGFTEKQYFKAQASASEVPKVDFSK >NZ_CP047602.1|WP_014759296.1|797642_798131_+|GAF-domain-containing-protein MEKKELFKELLSMIEKSSSEIDNLNDFYNEVVKILDSNLPYYNWTGFYFMEDGMLKLGPYIGRPTEHVKIKVGQGICGRAVAENATIVVDDVTKEDNYLACSIETKSEIVVPIRVDDEIIGEIDIDSDEKAAFDDDDRAFLEGVAEIVGKKIKKRTYNIKEN >NZ_CP047602.1|WP_013787622.1|796813_797590_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MYIPSISPYAFKIGPIAVHWYGIFMALSIAAGAYYLYVRSKELNYDEDFLLNLLMIVVISGIVGARLMFVLANDIDWFYKDPIQILKIYQGGLSWHGAVLGGFLAGLYYCHKKNVKINPLEDYAVIGLAIGNMLVRIGNIFNQEVLGRQTDFAFGRWPAQLVGVAMGLILLIRYFYIERKHMPYGYQFWSFIFYYQLMRGLIEETVRDNPLFWPVYLNKHLGIGFFTLTQIATPFILILAYWMMRRVLNDPENKKVNY >NZ_CP047602.1|WP_014759290.1|804437_805568_-|site-specific-integrase MRGHIRKHGDGWQYVVYIGKDPITGKKKYKSKTFKRQSDCEKAMNKLIRELETGQFVDSRTMTLADYLDYWLETYAKVNVTSSTYKRYAEFTTNIKNHIGIAKLQDLKPAHIQQYYSKLVDEGTLSNSTILKIHRMLHLALKHAVGWQMIYNNPSDSVTPPKVAKIEMKVWDEDTAKNFLDFIKDEKIYLPVKIALETGMREGEISALKWENVDLINGIIYVTSNMQYLYGTLTLKEPKTKKSKRKIVLFKTTIEALKAQRKKQIENKLLLGELYNDNNFVCTHENGDPLIPQYISKRFQLYEKAYNKENNKAPIEIIRFHDLRHTHATWLLKKGINPKIVSERLGHANVSITLDTYSHVLPDIQKQAIESIEIMQ >NZ_CP047602.1|WP_014759289.1|805710_806052_-|hypothetical-protein MAIDFLDKPLVKALLNQEIPFYELMTAYDIQVSIANIDTCIYGFTYVSRQGNYYLILNGNTDYETQCKVFIHELKHILEDCPKQSYYIGLDMQYKYIEIEADKVAEDIVKYCR >NZ_CP047602.1|WP_014759288.1|806075_808073_-|hypothetical-protein MGDIKITNSGIKRILNKYTYLKSIAEYIWNGFDAKANCVEINLHKNILKEIDEISIIDNGYGIDRTKLSEKFTPFFDSEKVINPDEKRKVSLMHGKNGVGRLTFFCFASNAKWETIYKDKSTNRNIKYEIYIDDQNLTTYIDKNIQETFENTGTKVTFTNLHNSINENEIIDFIKKEFCWFLELNKERNFNIKVNDKKVDYSDIILDEEKEELIYEKTKINFKIKFVQWRYPLTNEYSRFYFIDSNDIEKYKETTTLNKKADQFYHSIYIKSSLFNNFSFDSDDSQTCLFNSKSSDEYKFLMNSIEKLLKEKRKSFLRKSSEKLIDNLEKANAYPKFDKDNFIDQYKKSQLDDLISALYQAQPKIFTSLNDIQKKTFVHFLNLIMDSDEKEQLFEILNEIIELEEEDKTELLKLLKYSKLTNIIKTIKLIKDRFKAIEELKCLVFNKDLNANEIPHLQAFIESHYWIFGEQYHLVTAAEPNFEEALRRYCYILTGETEKKKIEHENKYKQMDIFAVRQDIQNDIINNIVVELKHPNIKLGTKQFYQVQEYMDVILKQHQFNAPNMFWEFYLVGNDYDNYISGLLKNAQPHGERSLAYKVDNYKIYIKKWSEIIAEFEIKHKFLNEKLELERKKLIDKNYISADEIIDNISNNTAVQPKEIVMPSY >NZ_CP047602.1|WP_014759287.1|808190_808580_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MSFAKRLSELRNEFKLTQKELADKLGVSRGTIGMYEIGQRDPDTDTLLKLSELFNVSVDYLLGNTDIRNPVDEITDAVSDDPELAEFWNELKQREDLKLLFKQTRNLSPKAIKQVMRIIKAIEDEESGE >NZ_CP047602.1|WP_038069695.1|808732_808978_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKNKLKEIRNSKNISGYELARKVNVTHSLIYMIENGTRNPSIKLAKKIAKVLNTSIDEIFFEEQSHETLHHNTIPDQSESA >NZ_CP047602.1|WP_014759285.1|808993_809239_+|hypothetical-protein MEEIKQRKELLDIHLKEVSKWMEDSNIDPTSEFGQEFLKQTKELIEQFYEIKELKGRVTALEKQIQEFPEQLMRLNNKCFD >NZ_CP047602.1|WP_014759284.1|809215_809572_-|hypothetical-protein MDNLEVFKYRKDALFELIKEAFIEATKAHELLFKEPNGKQNEIIAALYLNKAISLMSAARSLYLSNYEILMRQEIENIFHTFNVFESEFLSNISTGHSHQWTDLEFLKFKESVETFIV >NZ_CP047602.1|WP_014759283.1|809642_809933_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MALVYTTKEAAQLLKVDIKTIYKLKDEHKLQAVKVGSKILITEQSINSYLGIIPAKTENEIRLEEENKRLKEKLRQYERHLSQIKDEILKIDIKAV >NZ_CP047602.1|WP_014759282.1|809946_810159_+|hypothetical-protein MLTWHEQLTLLMVLDEKLNRLKERRQYYIVKLNTQEKLSQTQEDIFKDLQEQIKELESIYHKINSLEIKD >NZ_CP047602.1|WP_014759281.1|810172_810373_+|hypothetical-protein MLIDELDRELATLEMQIEFRYRRIKELQELKRQAEKADMIIKKLRDEIADYNEEYHEKLRLYYSQM |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP047602_3 | 1071150-1071248 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047602_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP047602_3
>3.1|1071182|35|NZ_CP047602|CRISPRCasFinder ATGATTGCGCGTTTGCCGTCAGACCTGGATGTGTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047602_3
The CRISPR arrays of NZ_CP047602_3 >merge|NZ_CP047602|3|1071150-1071248|CRISPRCasFinder GTTGAAAAGTATTGATTTTATGGTGAAAAGGGATGATTGCGCGTTTGCCGTCAGACCTGGATGTGTCGTTGAAAAGTATTGATTTTATGGTGAAAAGGG >NZ_CP047602|3|2|1071150-1071248|CRISPRCasFinder GTTGAAAAGTATTGATTTTATGGTGAAAAGGG ATGATTGCGCGTTTGCCGTCAGACCTGGATGTGTC GTTGAAAAGTATTGATTTTATGGTGAAAAGGG
>NZ_CP047602.1|WP_038069516.1|1068874_1070116_+|MFS-transporter MTAKNREVYKYLNYNIKMNLLNGITFSIGYNMIMPFVGIFAIKLGANNYEVSLINSLPALMALIGILPATIFINKAKNVFKFAYILEYITRSFYLLVALVPFMSKFRPEAVVLFVGLLNLPAIVAGMCWQSFMSDLIPEEFRGKVFADRNIWTGVLGTAAVFITGILLDRIKFPYGYQIMFFIAFLFGILDAYYYSKFHYVSHKKEASASILDSLKTMMQSKKFIYFSLASFIFTFTWMMAWPIFTIYKVDDLHANNMWMSISTIVGSVGSILTYKWWANLADRKGNGIALSISTLLIAIIPALWAKVTSLFVGAVIDFFGGMATAGYTMLSLNWLLELLPDHKEKMNYIAIYTIVTQFAAFLSPIAGTWFYEVVGYEAFMYITTVLRVLSSLLLFAVALYKTEKSVLNKGGV >NZ_CP047602.1|WP_014759045.1|1066868_1068773_+|threonine--tRNA-ligase MKIILKDGTEREYENGMSVYEIAKSLSQKLAKEALGGRLNGRIVELYTPINEDGKLEILTFDDEDGKKIYWHTSSHIMAQAIKRLYKNVKLTIGPAIENGFYYDFDIDEPFKVDDFSKIEDEMNKIIKEDLKLERFVLPREEAIKFMEEKGEPYKVELIKDLPQDATISFYRQGEFTDLCAGPHLPSTGMVKSIKLLSVAGAYWRGDEHNKMLQRIYGISFPKKSMLDEYLNMLEEAKKRDHRKLGKELDLFSIHNEGPGFPFFHPKGMVLRNILEDFWRKEHAKRGYQEIKTPIILNEELWHRSGHWDHYKENMYFTKIDDEDYAIKPMNCPGALLVYNSTMHSYRDLPLRLCELGLVHRHELSGALHGLMRVRSFTQDDAHLFMTPDQVESEILGVIKLIDYFYKIFGFEYFVELSTRPENSIGSDEDWELATNALIKAMEHIGLNYKVNEGDGAFYGPKIDFHLKDSIGRTWQCGTIQLDFQMPERFNCEYVGDDGEKHRPVMLHRVVFGSIERFIAILTENFAGAFPTWLAPVQVKILPISDKHLAYAQNIYERLLENDIRVELDDRNEKIGYKIREAQMQKIPYMLILGDKEVEAGNVSVRSRKEGDLGSKSLQEFLSSILEEIKQKSL >NZ_CP047602.1|WP_014759046.1|1065990_1066590_+|DUF445-family-protein MHFFLQMMFLGVVGAAIGWITNYIAVIMLFKPIKPVKIFGISIQGLIPRRRDEIAASIGKVVEDELVSMDDILDKLLNEDNRNYIIKRILDDVDIAVEKNIPSFIPKTLKSMIVNYVVGIVSKEAEKFLDESAATMLNDMSDKIGIAEIVEEKIKLFELEKLEKIILDVSNKELKMIVVLGGVLGFVIGILQAFVVRML >NZ_CP047602.1|WP_014759047.1|1065037_1065913_+|putative-sporulation-protein-YtxC MQLLSIGIPNALLSGSVFNNELEYMKNEGLDFTVNLDNRGNITFFNIDVEDRVSSKNIVKIKELVSDVISDVIVNQIDKKLIKRIIDKYYYYFDSDEKKKIENIAKSILDNDANKETFKLVKKERIFEEIEDFLKDNETIDIEGFVNFRLRDFIGEISEVVDRAVDEYMMQKEYDEFIGLLKYFVELQDSKVDVLNILIDKSGKFLFFDKEKKPITGKFLSDITIEFTGGELTDDDMLISTLIAMAPSKIYIHSLENIKSKDILDTVEKIFSNKVFICNGCSLCKVNEARK >NZ_CP047602.1|WP_014759048.1|1064242_1064983_+|hypothetical-protein MSLKNPYVPDKKVSHVIIDGRHYDVAESLRKMEIDVIMTKRHGSLYEAISYHPDMIVHNAGDGQIVLAPDVDENFVEEIKKLNLEVIFGKTVLSRNYPDNIAYNVARLGDYAFHNLKYTDPVLRKVLEKKGVKFIHVNQGYTKCNMAIVDNASFITSDAGVYKTASKEGFDCLLIEQGGIKLNGFDYGFIGGASGLIDKDVFCIAGDLRYHGEYKKIIDFMKYKNKEIIFLTSGEVKDIGSIIPLY >NZ_CP047602.1|WP_014759049.1|1063268_1064201_+|response-regulator MNEKSILIVDDDKLSRTILKNILGSAGYKIYESQDGDEALKLYRRILPDMVILDVVMPGLSGFDLLRILRDEEENQLVPVILLTSSDNYEEKLHGLELGADAYITKPFNEKELLAQVKNLFQRIEHNRMANPLTGLRGNIDIKYEIRRRIKNGSLYAVLYIDLDNFKSFNDYYGFSRGDKIIRQTARILKEALFKCGNANDFLGHIGGDDFIIITTPDKIDDVCNYIISTFDEDIKRYYDDEDLANGYIEVINRRGEIQRFPFVSISIAVVTNENRNFDNELQISAVAAEIKRKLKSMEGSKYLKDRRKC >NZ_CP047602.1|WP_014759050.1|1061720_1063055_+|beta-glucosidase MLDFSKDFLFGVATASYQVEGAYNEDGRTMSIWDTFSRQDGKVYKSHNGDVACDHYHLYKDDVKMMKDLGIEAYRFSIAWPRIFPAKGQYNPKGMDFYKRLTDELLKNDIKPFATIYHWDLPQWADDLGGWLNREIVEWYGEYAEKLFSELGGYIKNWITLNEPWCSSFLSYFIGEHAPGHKDLGEALLVSHNLLLSHGKAVEIFRGLNLDDSKIGITLNLNEVFPASDSDDDKVAAQIADGFQNRWFLDPLFKGKYPQDMVEYFGKYAKVDFINDEDLKLISQKLDFLGVNYYTRAVVQKGNDGLLDAVQIDPGNERTEMGWEIYPESLYNILMRLKREYTYDMPLYITENGAAFNDVVEDDGRVHDEKRVEFLKQHFKEAKRFLNDGGNLKGYFVWSLMDNFEWAHGYSKRFGIVYVDYETEKRILKDSALWYKDLISTRTI >NZ_CP047602.1|WP_013787791.1|1061399_1061603_+|4Fe-4S-ferredoxin MRYAYVDQEICDRSPFCPASHSCKFGAFKLSRKGLFQVEINVDKEKCTGCGVCTRYCPHGAIKLVNA >NZ_CP047602.1|WP_038069519.1|1059444_1061286_+|asparagine-synthase-(glutamine-hydrolyzing) MCGIAGWVSFDEEVINRKNIVVAMGKRLRNRGPDSWGTWFSTHCGFAQTRLIVIDPEGGEQPMIKELGERKCVIIYNGELYNTEEIRDELRSLGYKFNGHSDTEVLLTAYIEWGSDCVHKLNGIYAFAVWDDYENELFLSRDRIGVKPLFYTYKNGSLIFGSEIKAILAHPYAQAEVDEEGLAEIFVMGPTRTPGIGIFRDIYELKPGHSLTFNKGGIKIERYWSLVSKNHEDDLKTTMEKIRFLLDDASKRQLVSDVPLCSLLSGGLDSTAVSAFANEKLKRLGSKLITYSVDYIGNDKYFKPNQFQPNSDSDLVEAVSKEIDTDHNYVYVDNEELADALLPALYARDLPGMADVDSSLYLFLREVKKDVKVALSGEGADEVFGGYPWFRNKDAVESGTFPWIRMVEKRMNLLSQDVVKKIRPTEYLNDRYNEALREVPKLSGEDKTSSRMREIFYLNQTRFLSMLLDRMDRMSMASGLEVRVPFLDHRIVEYVWNIPWDMKNLHNREKGLLREALKGYIPDIVVERKKSPYPKTHNPVFKEKVKSWLQRIIDDPSSPILQLINKKEVQNLIDTDAKDYDPAWFSQLMGGPQLYAYLIQVNEWLLKYKIRIL >NZ_CP047602.1|WP_014759052.1|1057665_1059147_-|methyl-accepting-chemotaxis-protein MVFKDKQLLKLLNIINANNLLDENKDYINFKGIIKDISVSITRLKKKLVKYIFETQVASSRIFSVSEELSITMEENNAFAQQLYAESQEIFSNNSLCYENVENTITEIKKLVEKLENIKNTSGEMYNTGIQSRKLVNESFKEIRLVLDKISNISITTEETLNRINELTKISIQISQILKSIEKIAKETHLLSLNASIESAKAEKYGNGFGVIADGIRKLTLNTNKAVTDIVSLIEKVNNEIENVKKSASENYINVKDSVSSTMNIEKSLSMIEEYNNTVMNMISKIVNVSEDEYKYVKNINEKIESVQNLLKEVSNNFDIMNNSIYHQKENAEKIVFLSDKLKEASNDLKLLSESDEIKNVIRMNFENIKNTAINVIKSIKKEIISDEFLLMNRNFHKEALDAFLKNHKEIEALWTNDIKGRFIYSNPPAGIANANVREWFQKSIKGKEYVSEVYISAITKAPCLTVSIPLIDKNGSCIGVIGADLNIKISDL >NZ_CP047602.1|WP_013787800.1|1071421_1071934_+|translation-initiation-factor-IF-3 MNKELQVNEEIRDKEVRLIDQDGNQLGIMSAKEAYKIALERHIDLVKIAPQANPPVCKLMDFGKYRYEQSKKEKESKKKQKVINIKEIRMTPAIEEHDFGVKVKSAMKFLKDGDKVKVTIRFRGREASHTNLAEELLNRFAKSLEEYGNVEKAPNMEGRNLMMILAPKNV >NZ_CP047602.1|WP_014759041.1|1071951_1072149_+|50S-ribosomal-protein-L35 MPKMKTHSGAAKRFALTKNGKVKRSKAFKRHILTKKTRKTKRNLRKIAYLSSVDAKNIKRLIPYA >NZ_CP047602.1|WP_013787802.1|1072168_1072528_+|50S-ribosomal-protein-L20 MSRVKSGKVTRKRHKKILKLAKGYYGAKSKLFRVANQAVMKSLNYAYIGRKLRKRDFRKLWIARINAAARANGISYSRFINGLKKANIEINRKMLSEMAIHDNKAFAELVNIAKQQLNA >NZ_CP047602.1|WP_014759040.1|1072583_1073354_+|RNA-methyltransferase MVITSEKNEFIKNIKKLSDKKYRYEKKLFFVEGKNSVFEALKSGFEIVHLLLAEDFNVDFQIERDKIVFVDEKVFKKISDTVAPQMIMAVIKMPKWEVNDIVKEGGFYVILDEVQDPGNVGTIIRSADAFNVDGIFTINNTVDIYNPKVLRSTMGSIFHLPVVNDVEPSKLFDVLKRNGIRILSTSLKAEKYIYDFDISKNAALIFGNESRGVNKYLDGFIDDSFKIPMDGMAESLNVSVAASICLYESERQRLIK >NZ_CP047602.1|WP_014759039.1|1073648_1074668_+|phenylalanine--tRNA-ligase-subunit-alpha MEETLRNLLEEAKKELSSAENLKTLEEIRVKYLGKKGELTKILRGMGNLSPEERPIIGKISNDVREEIEKDLTQKREEVLRQEKEKKIKSEYIDITLPGKVHEIGHKHPMTKVLDEIKDIFLGLGFSIAEGPEIELDYYNFEALNTPPDHPARDLQDTFYITKNILLRTQTSPVQVRTMEKSKPPIKVISPGRVYRSDEIDATHSPVFNQIEGLAVDEGITMGDLKGVLNLFAKRLFGSDTKTKFRPHYFPFTEPSAEMDVSCFACGGKGCRVCGYSGWIEILGSGMVHPNVLRMSGIDPEKYSGFAFGMGLDRITMLKYGIDDLRLLYENDLRFIKQF >NZ_CP047602.1|WP_014759038.1|1074680_1077062_+|phenylalanine--tRNA-ligase-subunit-beta MLISYSWLKDYVDLSVDAKKLADDLTMSGSKVETVKSYGQEIKNVVIGKIVSLEKHPDALKLQIGIVDVGKEKLQIVTGAQNIKVGDYIPVALHGSTLPGGVKIKRGKLRGVESNGMMCSAKELGLDESLLPEYQRNGIFILPELPLGDDVRDALELDDVIEFEITPNRPDCLSVVGIAREAAATYRKSYRMPEIKISEVDDKNPATVTIEADDLCFRYVARVIRNAKIGPSPMWMQMRLLKAGIRPINNIVDVTNYVMMELGQPLHAFDLDKVKNRHIVVRKAKEGERLITLDDKERILDKDMLVIADEEKAIGLAGVMGGQNTEITDDTVNILIESANFKGSNIRYTSRKLGLRSEASSRFEKGLDPEITVLACNRAAQLMAELSGGEILEGLVDVYPKPVTEKVLSVRYERINKLLGTNLSCQEMKEILSFLDFGAICDGKNLIVKVPAFRSDIDSEADIAEEIGRMYGYNNIEDTLLKGTQITAGVKTREQKLEDTVKDVFLSCGLNEVITTSFMGMKDLDKINLPDDSYLRNAVKIMNPLGEDQGYMRTTLLPFMLNVVYTNYSRKVSEFKAFEISKVFVPKSLPLEELPYEIKSGIIAMYGYDADFLTIKGVIEELLDVLNIKNVKYVRSQNPAYHPGRSADVMVGDEKICVFGELNPDVAENYDINKRVYIAEVNLELLFKYANDEKVYKPLPRYPAVERDIAVLVDKNTFVADIENVIRKAGGQLVDDVKLFDVYEGENIPEDKKSVAFSIWYRSYDKTLTDEEVSKVHDKIVNRLSEELGAQLR >NZ_CP047602.1|WP_014759037.1|1077158_1077533_+|cell-division-protein-ZapA MEIRKITVNINGNEYILKTDYPEDYILRLTEHLNGVISGISGSYNRLSNQMVLVLSALNIADELFISREENNALKKEIVSLKSRLSADDERIEELTEEVEKLKEELKAAREELEEYINTFDDVG >NZ_CP047602.1|WP_014759036.1|1077587_1079933_+|U32-family-peptidase MKKIELLAPAGNLKTLKFALDYGADAVYIGGKFFGARAYAANFEEDELKEAVEYAHLRDRKVYVTVNTIVFNKEVELLLKYIDYLYQLNVDAIIVQDFGVVKLLKDFYPELDIHASTQMTLSNLESIKAAYEMGIKRVVMPRELSLKEIKKIKSATGIEVEAFVHGALCVSYSGQCLFSSVIGGRSGNRGRCAGPCRLKYDLLDDRMNTIASNMHLLSMADLCTIDYIKDMIESGIDSFKIEGRMKEKEYVASVVMSYRKAIDAYLSGEKINTDMYKEMMSGIFTRGFSNGYLYEKKPQYMSYTNPKNKGVPLGKVISIDGKKIKVSLLRSLSLGDGISTETGEYGYKVDDIMVEGKKVDEAYKGQVVELKKIPVNCGDALYKTYDAKLNKLFSVSNELKSPVDVFVNMREDKPLNIMIRNNDIFVSKDSKIASVKAMKKAIDKDTLIEKVSSINDTPFYVNDIEVDMDEGLFMPLSEVKETRRKAVEDLIAKKLKYREPKNIHINFHKSINDKIGDLKLSLYTEREEHVKIAYELGVDRVYFNYRLNYDAIKDVICYRDKCEVVPAFPQIMRDELDDFQREMENIKEMGFKKVLVTNLGMYDAAIKLGLDVCVDFNLNVSNNLAADFFDKADTITLSPELNIHQIEDISSRSNAKFEAIAYGRLPLLTMEYCPIKNLKGCDKKGCEEGKYFLKDRKGNLMKIVSDGFCRIKVLNSSVLYMADKMNDSRKIGLSYIRINDTVESDEEIKDAIKEYKNSLKFGTCDLHVKNYTRGHFYRGVL >NZ_CP047602.1|WP_014759035.1|1079932_1082293_+|endonuclease-MutS2 MDERYFKNLEFDKIINRISDLCDSEPGKEAALDIKPYENVEEALKEIEKVNEAVSFIVSYGNMSFSFKKIDDILAKAKIGSSLNPGQLLSLSRFLSLAGKVKAYLRNEKEEGIFPYLREYNMRLTNIRELYDKIDRTVISEDELADDASPALKEIRRQKAHINNKIRDTLNSIIASSSKELQDPIITIRNGRYVVPVKQEYRGTFKGLVHDQSSSGATLFIEPMAVVELNNDLRQLEIKEQHEIERILAELTDEVGEHADEIYENMVALKELDVIFAKAKYSINTDSTKPILNTKGYINIKNARHPLIAKDAVVPISVHLGQSFNTLVITGPNTGGKTVTLKTVGLLTLMSMSGLNIPADDGSDVAFFDNVFVDIGDEQSIEQSLSTFSAHMTNIVKILNNVNSNSLVLLDELGAGTDPTEGAALAMSILDFLHRMNCRTIATTHYSELKQYALKNEGVENASVEFDVETLKPTYRLTIGIPGKSNAFEISKRLGLNDDIIENAKNYITSEELRFEDILRDLENKRTEAENAKQKIEELKRHVESLKDEYEKKVKEAEREREKIIEKAREKAKKILEGTKSTADEIIAKLKEAEKSDRKNKLIEEARLKLKENINEIEENLKRSEIPEYKKIPKNVMPGQTFYIVPLDQTGTALSEPDKDGNVKIQAGILKMNVHISNLREAESSEEKEMEKGFAKYINEKSSNISTSIDLRGKTLEEASIEVDKYLDDAYLAGLKQVTVIHGKGTGILRSGITRLLKMNKHVKSFRLGRYGEGEDGVTIVELKEK >NZ_CP047602.1|WP_014759034.1|1082344_1083055_+|sporulation-protein-YunB MRRKKWGRRRIKIRGINKNFVYILASLLILSLLYMFVTYRLTPALIKASETVAQEVAVKSINKSINEKVLKGIQYSDLINVRTDNSGKVSMLQANTIEMNILSAKITQAVQDNLNSIGSVYVKLPLGSLISKDIFANTGPRIKVGLLPIGSVNVDFESSFEPAGINQTRHIIYLYIKTNIQIIAPLASKQIQVSTHMPIADSIIVGDVPQSFVDVNGNKYTVPVPSGDSKINVESN |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP047602_4 | 2635195-2635553 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047602_4
|
5 spacers
spacers of NZ_CP047602_4
>4.1|2635226|35|NZ_CP047602|PILER-CR CACCAGTAGAGCCGAAACCGGAGAAACCGAAAAAG >4.2|2635292|36|NZ_CP047602|PILER-CR TAGTAAGGCGTGAAAACAATATAGATTTAGGCTCAA >4.3|2635359|35|NZ_CP047602|PILER-CR AATGTTTGAGCGTCACTCTCGCCTTCTACAAGTAT >4.4|2635425|33|NZ_CP047602|PILER-CR AAGTATTCGCTGGAGGATTTGAACTCGTCCCCG >4.5|2635221|40|NZ_CP047602|CRISPRCasFinder AAACTCACCAGTAGAGCCGAAACCGGAGAAACCGAAAAAG >4.6|2635287|41|NZ_CP047602|CRISPRCasFinder AAACTTAGTAAGGCGTGAAAACAATATAGATTTAGGCTCAA >4.7|2635354|40|NZ_CP047602|CRISPRCasFinder AAACTAATGTTTGAGCGTCACTCTCGCCTTCTACAAGTAT >4.8|2635420|38|NZ_CP047602|CRISPRCasFinder AAACGAAGTATTCGCTGGAGGATTTGAACTCGTCCCCG >4.9|2635484|40|NZ_CP047602|CRISPRCasFinder AAACTTGAAATAAACACTCATAGATTTTCACCGCCTTTAA >4.10|2635225|36|NZ_CP047602|CRT TCACCAGTAGAGCCGAAACCGGAGAAACCGAAAAAG >4.11|2635291|37|NZ_CP047602|CRT TTAGTAAGGCGTGAAAACAATATAGATTTAGGCTCAA >4.12|2635358|36|NZ_CP047602|CRT TAATGTTTGAGCGTCACTCTCGCCTTCTACAAGTAT >4.13|2635424|34|NZ_CP047602|CRT GAAGTATTCGCTGGAGGATTTGAACTCGTCCCCG >4.14|2635488|36|NZ_CP047602|CRT TTGAAATAAACACTCATAGATTTTCACCGCCTTTAA |
cas3,cas7,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047602_4
The CRISPR arrays of NZ_CP047602_4 >merge|NZ_CP047602|4|2635195-2635553|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTATAAACTCACCAGTAGAGCCGAAACCGGAGAAACCGAAAAAGGTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTATAAACTTAGTAAGGCGTGAAAACAATATAGATTTAGGCTCAAGTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTATAAACTAATGTTTGAGCGTCACTCTCGCCTTCTACAAGTATGTTTAGGTAGAACCATTGTGGATTATAAACGAAGTATTCGCTGGAGGATTTGAACTCGTCCCCGGTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTATAAACTTGAAATAAACACTCATAGATTTTCACCGCCTTTAAGTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTATTATA >NZ_CP047602|4|3|2635195-2635488|PILER-CR GTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTATAAACT CACCAGTAGAGCCGAAACCGGAGAAACCGAAAAAG GTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTATAAACT TAGTAAGGCGTGAAAACAATATAGATTTAGGCTCAA GTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTATAAACT AATGTTTGAGCGTCACTCTCGCCTTCTACAAGTAT GTTTAGGTAGAACCATTGTGGATTATAAACG AAGTATTCGCTGGAGGATTTGAACTCGTCCCCG GTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTATAAACT >NZ_CP047602|4|3|2635195-2635549|CRISPRCasFinder GTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTAT AAACTCACCAGTAGAGCCGAAACCGGAGAAACCGAAAAAG GTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTAT AAACTTAGTAAGGCGTGAAAACAATATAGATTTAGGCTCAA GTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTAT AAACTAATGTTTGAGCGTCACTCTCGCCTTCTACAAGTAT GTTTAGGTAGAACCATTGTGGATTAT AAACGAAGTATTCGCTGGAGGATTTGAACTCGTCCCCG GTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTAT AAACTTGAAATAAACACTCATAGATTTTCACCGCCTTTAA GTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTAT >NZ_CP047602|4|2|2635195-2635553|CRT GTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTATAAAC TCACCAGTAGAGCCGAAACCGGAGAAACCGAAAAAG GTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTATAAAC TTAGTAAGGCGTGAAAACAATATAGATTTAGGCTCAA GTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTATAAAC TAATGTTTGAGCGTCACTCTCGCCTTCTACAAGTAT GTTTAGGTAGAACCATTGTGGATTATAAAC GAAGTATTCGCTGGAGGATTTGAACTCGTCCCCG GTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTATAAAC TTGAAATAAACACTCATAGATTTTCACCGCCTTTAA GTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTATTATA
>NZ_CP047602.1|WP_014757523.1|2632713_2635059_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MCISIPRSSSTLANYSCLNDVLAKDDGETLIEHTKKVVKVLIELKNLFENAGSYFGDDLLFEKVYIAGLLHDLGKIMPSFQIAVQNKSHWDLRHEVASLFLIGDIYINGKKLDENEIIDIYTIIVTHHKSLKDLKEKWIGYIEKSFIEVTKGKIEEGIVELAKLLEADRLSARRIYHDIFLEYVDYVKKTYNGLTGNILDLDIIKNYSESRFFQRFDRIYDIVQDSKRKQKLIFMIGLMKSADHLASSGQTEIVKIKIDFKIFEKGIRLYSTQEKASKIKDDVLLIAPTGSGKTEAALSWAKNNMKDSDNDRIFYLLPNIASINKMVERLQNIFGKDKVVPVHSKTAFKIYENFIEEKTFEELSEEEKRKINKNVSQQKSLIKKIHFPVKVATIYQLLKNAYYIGDYEINFAELYNARVIVDEIHAYEKEAVCKLIIFLKFLKENFNTKIMIMSATIPTSLQEFIIKKLGIENVLKMKDEELESFNRHIVFRLPGTLMDYVNEIACKVRNGKKILVVANTVETAQNLYKILKDKLSDNCIKEEGIKLLHSHFTLKDRDKIEEKVGDYKLLVATQIVEVSLNISYDELYTEPAPLDALLQRFGRINRFREKRELAPVFIVEKDINEKGYPYRDREVVEKTLELFKESPVKLEEKAIQKMLDEVYSSYDYEVFLDPRLHNYLNELLTEKYDNKDLRKQFYEEFDGITVYPFAFKDKVIESIDSRDFYELELYKISLNLGTVLGLMKKRLIEQEKINGIPINFVKCYYDSEIGLDKNRPLEIKK >NZ_CP047602.1|WP_014757524.1|2632097_2632754_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKVEKAVKIKITGWTATFTNIFFKTGKILAYEMPPLSSLIGLLSAAKGEVIKDVDFKIGYEFTYRAKSWDAETYYKATKRKDAKGESSVWFKNFLYDVELNLYLTDLSFTDYFKKPRYTILLGQSHDLATVEEIKEVDLIKTGKGTINNTAVSVSTKGVSGVPIIMPVKIDLDTREILNQKPFIIIKRPVSIENDNIYMVKGENKDVYLYSPEFINAC >NZ_CP047602.1|WP_014757525.1|2630985_2632029_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MNFAQGIFMFNVDAGALNNLKNDKKGDGTTITRTKKIVTYDANGHRKTYVLVSAQSYNHFIQATHMDKFKAKYSIKTKEGKKVNYEVDPVKYVDQDLRGYMETDQGLSRIAPFKFSHLISVNGVEILESFNTTSTEGDNMIYQYEIYKTHFKGKFNIDLDTVGRFEARNKSGYQNINDDLIKKYDEEEEYKEIIHKVDKENKVVVLTAKERAKRISEYLKSLNYIQGGAKLTNNFENIAPQFIILVIVESGNNILANVIHESGEYGSGFKVNFEVLKKMLSAYKDDLKSKVYIGRNEGYLDSLQTEIDRFIKEMSEEKIEVVNDIVKNVIDKFEEEICAFYCHADSN >NZ_CP047602.1|WP_014757526.1|2629445_2630879_+|hypothetical-protein MSIDYSGVYLVDVGIAYFKSWLKAQNGGTITTITGNDVRTFANQIRGHYINNPDDWKTLQKELLFIITRNPIRYKSAENLFKIKNRDLIIDLSEEYAKLLDGNASEESNGTKCSLCGQHEGAYPLDRTFMPYYVSGTNWNAKFFHKKEFLGCTRCTFFLTVMPFGLFKTVMDENNKTTGYAAFHTDDEEIYESIIDIVYTENNNLIKFKNENDLYKVVYKALSEYSQNNQSNRYRTSVDIYIFNNDNRDVGNDLKIIRLPDRNIGFILEVARDIKFKKDISKINTLEYGYFPAYRIFLSDINFLLGKKTLKTFGVWLFKNFSLDFIKLYFKEVLGMPENIIDYGFKLAERLTEFYKKSNANFRKIKYLENADSRHEFAREIVDIYRRTVTEGWKLTKNHGPGEVEKILAELKKPFDSAKEFFDVIMNESYDWRMLKLIVIARIYELLTNEKFVSNIDDLDGEIDNDLEYESADDSVF >NZ_CP047602.1|WP_014757527.1|2628644_2629445_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MQIGDKKSLRITGTAKKEQNILLDEINYSLTKFIYETLASNSPEFSRELHEVGFKKSKKSFKGVCFSRPYFSDFTLKENGIISVGKFVTIKVRSLVKGFLDNFILGLYKNEKIKIGEAEFNFEEVKILPELRFKTEEMFYLDTPLVLSVKDHSTGKAKYLRYLDDREKFKEALKQNLKEKYSAFYGNEIDLNDFDFSFDESYMATAAKHSKLITYCDQRIYGELAPFTIKAPIEVIEMVYYSGIGEKNMMGFGFISKKLKIKGGRV >NZ_CP047602.1|WP_014757528.1|2626818_2628201_-|ATP-binding-protein MFIGREYELNTLNKLYNEDKFHFIVMYGRRRVGKTTLLTEFCKDKPSIFFVAEEYNDKIALESFSDKILSYFGLNEMVSRFESWEKAFLFLGQKAKNERLVLVIDEFPYIVNSNKSIPSILQNLIDHYLKDTKLFLIICGSSMSFIEKEVLSYKSPLYGRRTSQLIVEPFDFFDSRKFFPNYSFEEQVIAYGVLGGIPQYLSIFDDKYNVYENIKTKILDKSSYLYEEPKLLLRQEVREPALYNSIIEAIATGSSKLNEISTKVSVDTDKCSKYISTLIDLKILERITPVELKAKSRKSIYKIKDNFFRFWYRFIFNNKAFIEQGLLDEVIESKIKPSMNDFLGLVYEEICTDYLKILNKNKKLPFIFEEIGKWWGNNPYKKREEEIDIVAINNDNIIFGECKWQNQKIDMAVLNDLIEKSALFDYPNKYYILFSKSGFTSEVANFASYSNNIILIESFD >NZ_CP047602.1|WP_014757529.1|2625989_2626343_-|transposase MFEYLGKLNSKGNYVRKMRIKLQYWAKQKIHEKVCDIAHSYGIRVSWINPKNSSALAFVGIGKVIRSNKKDICEFTTGKKYHADLNALYNIGARYFIREILNPLSEKERSQYQAKDR >NZ_CP047602.1|WP_014757530.1|2624537_2625488_-|DUF4351-domain-containing-protein MNDWHSDFVTAIREELKDEKVEIKQEEYLSKEPLRIDVIIIKKEKDGKINKRVGQIFKRYNILEYKSPDDYISIDDYFKGLGYVYLYKSIMNAYDKSRKEVDDIKIDELTLTFVCSNLPKKLISFLAEHKIKLDNFDNGIYYIDNEWIPVQIIVLSELDNVEENYPLMVLSNNMYFRNAIEKVFSSINEAKEYDNKIRLIEAAFRIDPGIVSEVIKMYADRLSEEQRRYVINNLKEANFKIYTEEELKKSMEEGMEKGIEKGIENLVIRLLKKKFNDIPEKYLRLIENADEKTLLQLADNIFEINKIEDIEKYIVN >NZ_CP047602.1|WP_014757531.1|2623621_2624512_-|DUF4351-domain-containing-protein MKDNNLDISYQNNDIILKSMAWEFKDKSLKFYGINVPKIVTVIPANLPSIEVKEDRLDFIFLLEDDSLLHMEFQTTNKKADIKRFLQYDTRLYSKYEKTIRTVVIYSGKIEEAISRLDIGSIIYNVEQVFLAKYDGDKIYEELNEKIDKKLRLTDIDKLNLIFLPLMGSKKSSDEMAIDAVELAKKIEDEDEKTYIIGALIGISDKFLTEEYKNKLKGAIKMTKIAEMLIQEGKAEGKAEGKAELIIKQLKKRFNKIPEFYVKRMYELNVDKLEKIGENIFDINKIEDLDKYFNDN >NZ_CP047602.1|WP_014757532.1|2622249_2623509_-|O-antigen-polymerase MNKLVNILYFLWVFLMLQADLKVTVNPYIDWFFTFVLFVPVIMFNIKKLKISFKKYYIILLPSNLLIISMLLSSFNSSIQINNIFQSIKLILLFFVIFPILNLDDNYEKISFDAFILSSIVNFGLIIVGKLFLKSVAWEAAYLRYGTIFNMPGSLYKPGIFILPYVLYIILNKFSVNYLILLITACGLIFFDGSRSGFIGLIFATLYIIMIYLSENVKFRSINIKKLNYYIILNTIFIILLIAIINENLIPGLDRIDMFLNKIYNYGLISGTIHSDPVRYQMIQKAINHITSSPIIGNGFGVTNVKGTVIHNTYLQSWADMGILGFISLILLYFSWLLILPKVINKIRYIKDFRYRGLIYNSIFSLFLYDLLGLFHPMSVEPSEWITFFVPYTIFINYYWKEIYDKSSKSINICDSSSI >NZ_CP047602.1|WP_014757522.1|2635847_2636336_-|hypothetical-protein MNRREFEDYLGEKVNSEVSEELSARFGKNNQAQQQAQQQAQQQAQQQAQQFQQQLQSMGINVTPQQFQQLLNQVKAQAQQQQQQTDMQVQQALQQAMAALQQAQQSIQANQVFAQMSKILDSSNQQLQQLTPQLQAQQAQQAQANFLNQQANQQNTTQTGMQ >NZ_CP047602.1|WP_014757521.1|2636412_2636994_-|hypothetical-protein MEILQSELKIENLIKETEHIFEKLMSFNEILLNDATKIEAKLEKSEKEIKEYIESQFEENNDRKYLISYLRKADNRSDSLKEVENMICSNVDELRNDVKTLKDNLDGMKKTLYKLKDLERDISSMKAVIEKDVLLNIELNKESAPEKVEYVYDLPPQLVNNLNTALNNLYIAKDGMNRIKIYEDIVNNLENFQ >NZ_CP047602.1|WP_014757520.1|2637081_2639814_-|UPF0182-family-protein MVICLKRGNLAIIILLISIFLIAALFASLANLIVDIQWFNSLNYLGVFFKKFLTQLTIGVPSFVVIFILSYFYLNRMVKDYAKFAQDIEIKSVRKRFRGVVIGLSIFVSFLISVFISANWWNDFLFYINSANFGVKDPIFNKDISLYMFRLPFLLDVYDLLIVIIPILIVATIIVYGLMYLSDKTRFYEISDRGGFFRAIYNKEILMIAFRQIAVLGFVFFAVLSLGYYLKAYGILYSKSGVVFGAGYTDVHVRLLFYRILMLASIISGVLFMIGAFRQKLKYIIASPVIIVAIMILSTVSQMVVQNFIVAPNELDKEKTYLKYNIDFTQKAFDLNNVEERNYDLSGDIDKKVLDENQDTINNIRINDYRPVSQIYNQLQSIRLYYKFNDIDIDRYMINGNYRQVFISAREMNLDNLASQAKNWINMHLKYTHGYGVVMSTVNDVTATGQPDMVIKNIPPVSSTNIKITRPEIYFGELTNTYAIVNTKTGEFDYPAGDTNKENFYSGKSGIPMTFLNKLLYTIYTGNIKILLSTDITADSRMLLFRNIKDRVQRIAPFLIYDDDPYIVVDNGKLYWMIDAYTYSGNYPYSEPYGDTGINYIRNSVKVVVDAYTGDVKYYISDKNDPIIKVYSRIFPGLFKNIDEMPQGLKAHIRYPQYMFDIQASVYKNYHMSDPQVFYNKEDSWDIAKEKFTGKIEPEESQYVIMKLPGEKTAEYVLMIPYTPATKDNMVAWMAARMDGNNYGKLVVYKFPKSTVVYGPMQIENMIDQDPNISKEMSLWDQKGSSIIRGNLLTLPIDDSMLYVEPIYIQSSNENAIPEVKRVILAYKDKIVMEDTLANALNKLFNLQTPAQPQVPQVQTNETQQELIKKANDIYNNAMNASKNGDWTDFGKNLDELGSVLNDLNNSIKK >NZ_CP047602.1|WP_014757519.1|2639951_2641178_+|LCP-family-protein MKRALKISLLVILGIALSIGTGVFMFYRNLNVVNTEENPVTTNAQVKTSKQSSSSQNKKNILFVGDADGLSDTIFVASFDANKKEIDMLSIPRDTYYPRPGYNAPTEKKINAAYSEQKIDGLKDAVENLLGIKIDNYVILTYDGFKDIIDTIGGVEVNIPFDMKYDDNVANPPLHINLKKGLQVLDGEEALQFVRYRHGYVDGDIGRINAQQEFLKSFIKKVTSPTIITKIPSLAITLSKNLKTDLTAKDITTYALDFVKNKPQNINTSILPGEGGYMGDYSYYFVDQQKAMEVASEMFGNGLSNDSVSTVSQITYSPLNSTISVAVYNGTKVQGLAAKYAEELKSLGFNVIKIANADAKNYDESCVYADTSIDKANKVAGALSIKNVLNGENSSSADVTVIIGNDKK >NZ_CP047602.1|WP_014757518.1|2641526_2642798_-|serine--tRNA-ligase MLDIKRIRNNPDEVKKAIELKKENSNIDEFLEIDEKRREILKELESLKNTRNKESENIAKLKKEGKDAEELIKEMKEISDKIKAMEGEVKQYDEKLEELLWTIPNIPHESVPVGDSDADNVEIRRWGEVREFDFEVKPHWDIGVELGLLDFEAASRVTGSRFTFYKGLGCRLERALINFMMDLHTEKHGYTEVFPPFMVHRRSMFGTGQLPKFEEDAFKVAGTDYFLIPTAEVPVTNMYRETIIDGEKLPIYNCAYSACFRQEAGSAGRDTRGLIRQHQFNKVELVKITEPEKSYEELEKMVSDAEDVLKTLGIPYRVVSICTGDLGFTAAKKYDLEVWMPSYGRYVEISSCSNCEDFQARRANIKYRPKDGGKAQYVHTLNGSGVAVGRTFAAILENYQQKDGSVVVPEALRPYMRCDVIRK >NZ_CP047602.1|WP_013786854.1|2643063_2643600_-|signal-peptidase-I MKSNTKKEIVSWILTIGLAFIIAMFIRTYVFELVDVPTGSMLNTIQLNDKFIELKFIYRFEPIKRGDIVVFKYPDDPSVSFVKRVIGIGGDTIEIKNGILYRNGKPVKEPYLKEPMNKNETFGPYKVPPNHYFMLGDNRNQSLDSRYWKNKYVSKDAIMGKIVFRIWPLSRFGSMIGK >NZ_CP047602.1|WP_014757517.1|2643999_2645064_+|sporulation-integral-membrane-protein-YtvI MKDFLSRYQSTIRNSIAILAIILSFYLFVFKLIPFLMPFAVALFLAILIDPAVEFSEKKLKIPRGLSSAFFILLLIAIIGLLISLLVTQLVFELNTLAEHAPSYTKNFDVVISDLIDRIRRYYVSLPTNISTFLESNLQSILNNISVYAKNFAGWILGLATKLPNFFFMSIITIVSTFFLSKDKWLILNFIKRQFPSNWAFHAENIKGDLFQTLIGFIRAEITIMFITFLEVSIGLTIIGFDYAFLLGLLVSFIDILPVLGSGSVLVPWALYNIFTKNYLIGIYLLIIYAIVTVVRQMIEPKIVGQSIGLHPLVTLLSMFIGARLFGGLGLIMGPVFVVVFKTFQKSGIIPSWK >NZ_CP047602.1|WP_014757516.1|2645107_2645578_-|6,7-dimethyl-8-ribityllumazine-synthase MKKYEGKLIGDGLKVGLVVSRFNEFITNKLLDGALDALRRHGIDDESIDIAWTPGAFEIPLISKKMATSKKYDAIIALGAVIRGDTPHFDYVANEVSKGVAKISVDYDVPVIFGVLTTDTVEQAIMRAGTKSGNKGFEAAVTAIEMANLIKEIESL >NZ_CP047602.1|WP_014757515.1|2645601_2646792_-|bifunctional-3,4-dihydroxy-2-butanone-4-phosphate-synthase/GTP-cyclohydrolase-II MFDTIESAIEDIKNGKMVIVVDDEDRENEGDLVMAAEKVTSDHVNFMIKYGRGLVCVPMMGERLKKLNIGKMVFDNTDKKETAFTVSVDHKNCKTGISAYERALTIKMLIDDESMPDDFTKPGHVFPLEAKEGGVLVRAGHTEAACDLARLAGLKSAGVICEIIKDDGKMARLPELIEFSKKFNLKIISIADLIEYRRKNEKLVKRVAEAYLPTKYGDFTIIGYEEILTGKDHVALVKGDLSDSPTLVRVHSECLTGDIMGSLRCDCGDQLHTAMEKIGKEGGVLLYLRQEGRGIGLLNKIKAYHLQDEGLDTVDANIRLGFPADMREYGIGAQILKDLGLKKLRIMTNNPKKLVGISGYGLEIVERVPIEVSINRHNERYLKTKKEKFDHIFTSF >NZ_CP047602.1|WP_014757514.1|2646806_2647427_-|riboflavin-synthase MFTGIIEEVGKVKMIQRGNITKMAVECKKALDGVKIGDSIAVNGVCLTVTNIGKDLFTSDIMYETLKTSNLGSLKIGSIVNLERALSISGRLNGHIVTGHVDTVGAIIEKNKINGTTTFKIKIDERYSKYVADKGSVAVDGISLTVVESSASYFTVSIIPHTEINTTLNIKRIGDTVNIEVDILSKYAERLLTKKNVDEFLIENYL |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP047602_1 | 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153334-153367 | 34 | NZ_CP021429 | Acinetobacter pittii strain HUMV-6483 plasmid p11, complete sequence | 89427-89460 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP047602_1 | 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153334-153367 | 34 | NZ_CP039041 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence | 61884-61917 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP047602_1 | 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153334-153367 | 34 | NZ_MG954377 | Acinetobacter baumannii strain SGH9601 plasmid pS21-2, complete sequence | 88661-88694 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP047602_1 | 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153334-153367 | 34 | NC_009425 | Enterobacter sp. 638 plasmid pENTE01, complete sequence | 6404-6437 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP047602_1 | 1.12|151605|38|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 151605-151642 | 38 | KU878088 | Bacillus phage AR9, complete genome | 211283-211320 | 9 | 0.763 |
| NZ_CP047602_1 | 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153334-153367 | 34 | NC_031107 | Erwinia phage vB_EamM_Asesino, complete genome | 190888-190921 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP047602_1 | 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153334-153367 | 34 | AP013405 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G15, isolate: uvMED-CGR-U-MedDCM-OCT-S42-C63 | 17407-17440 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP047602_1 | 1.39|153398|38|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153398-153435 | 38 | KX171213 | Staphylococcus phage vB_SscM-2, complete genome | 4870-4907 | 9 | 0.763 |
| NZ_CP047602_1 | 1.39|153398|38|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153398-153435 | 38 | NC_047767 | Staphylococcus phage vB_SscM-1, complete genome | 4870-4907 | 9 | 0.763 |
| NZ_CP047602_1 | 1.14|151740|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 151740-151775 | 36 | KT997873 | Uncultured Mediterranean phage uvDeep-CGR2-KM21-C368, complete genome | 9652-9687 | 10 | 0.722 |
| NZ_CP047602_1 | 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153334-153367 | 34 | MN694478 | Marine virus AFVG_250M504, complete genome | 10675-10708 | 10 | 0.706 |
| NZ_CP047602_1 | 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153334-153367 | 34 | MN694270 | Marine virus AFVG_250M505, complete genome | 10793-10826 | 10 | 0.706 |
| NZ_CP047602_1 | 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153334-153367 | 34 | MN694656 | Marine virus AFVG_250M501, complete genome | 10405-10438 | 10 | 0.706 |
| NZ_CP047602_1 | 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153334-153367 | 34 | MN693919 | Marine virus AFVG_250M503, complete genome | 25482-25515 | 10 | 0.706 |
| NZ_CP047602_1 | 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153334-153367 | 34 | MN694712 | Marine virus AFVG_250M502, complete genome | 25481-25514 | 10 | 0.706 |
| NZ_CP047602_1 | 1.36|153201|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153201-153237 | 37 | NC_048677 | Lactobacillus phage LpeD, complete genome | 79938-79974 | 11 | 0.703 |
| NZ_CP047602_1 | 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153334-153367 | 34 | NZ_AP018263 | Calothrix sp. NIES-4071 plasmid plasmid8 DNA, complete genome | 3046-3079 | 11 | 0.676 |
| NZ_CP047602_1 | 1.43|153668|38|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153668-153705 | 38 | MN693779 | Marine virus AFVG_250M346, complete genome | 53552-53589 | 11 | 0.711 |
1. spacer 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021429 (Acinetobacter pittii strain HUMV-6483 plasmid p11, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
aaaataaacaaaaaaataaagcaggcttaacctg CRISPR spacer taagtaagcaaaaaaataaagcaggaccaacttc Protospacer **.***.***************** ..***.*
2. spacer 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
aaaataaacaaaaaaataaagcag-gcttaacctg CRISPR spacer aaaataaagaaaataataaagcagcgagtaataa- Protospacer ******** **** ********** * ***.
3. spacer 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG954377 (Acinetobacter baumannii strain SGH9601 plasmid pS21-2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
aaaataaacaaaaaaataaagcaggcttaacctg CRISPR spacer taagtaagcaaaaaaataaagcaggaccaacttc Protospacer **.***.***************** ..***.*
4. spacer 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009425 (Enterobacter sp. 638 plasmid pENTE01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
aaaataaacaaaaaaataaagcaggc--ttaacctg CRISPR spacer aaaatatacaataaaataaagcagataagtgacc-- Protospacer ****** **** ************.. *.***
5. spacer 1.12|151605|38|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU878088 (Bacillus phage AR9, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
ataaatgtttttgaaagtgattcttttaatatttcttc CRISPR spacer aatgaagtttttgaaggtgatacttttaatatttatgg Protospacer * .* *********.***** ************ *
6. spacer 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_031107 (Erwinia phage vB_EamM_Asesino, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
aaaataaacaaaaaaataaagcaggcttaacctg CRISPR spacer aaaataaacaaaaaaagaaagcagtacccactcc Protospacer **************** ******* .. **..
7. spacer 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP013405 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G15, isolate: uvMED-CGR-U-MedDCM-OCT-S42-C63) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
aaaataaacaaaaaaataaagcaggcttaacctg CRISPR spacer taaataaacataataataaagcaggcagatacgt Protospacer ********* ** ************ * *
8. spacer 1.39|153398|38|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX171213 (Staphylococcus phage vB_SscM-2, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
ataactcctttccttaactctatatatataataacata CRISPR spacer ttgtggctgttccttaactctatatatagaataacatg Protospacer *. *. ******************* ********.
9. spacer 1.39|153398|38|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_047767 (Staphylococcus phage vB_SscM-1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
ataactcctttccttaactctatatatataataacata CRISPR spacer ttgtggctgttccttaactctatatatagaataacatg Protospacer *. *. ******************* ********.
10. spacer 1.14|151740|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KT997873 (Uncultured Mediterranean phage uvDeep-CGR2-KM21-C368, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
gaatactttataggaaaattagcaataacatatcta CRISPR spacer aaatactttatagaaaaatttgcaatagatgattct Protospacer .************.****** ******. **..
11. spacer 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694478 (Marine virus AFVG_250M504, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
aaaataaacaaaaaaataaagcaggcttaacctg CRISPR spacer aaaataaacaaaaaactaaagaagaaaaaatgaa Protospacer *************** ***** **. **. .
12. spacer 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694270 (Marine virus AFVG_250M505, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
aaaataaacaaaaaaataaagcaggcttaacctg CRISPR spacer aaaataaacaaaaaactaaagaagaaaaaatgaa Protospacer *************** ***** **. **. .
13. spacer 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694656 (Marine virus AFVG_250M501, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
aaaataaacaaaaaaataaagcaggcttaacctg CRISPR spacer aaaataaacaaaaaactaaagaagaaaaaatgaa Protospacer *************** ***** **. **. .
14. spacer 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693919 (Marine virus AFVG_250M503, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
aaaataaacaaaaaaataaagcaggcttaacctg CRISPR spacer aaaataaacaaaaaactaaagaagaaaaaatgaa Protospacer *************** ***** **. **. .
15. spacer 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694712 (Marine virus AFVG_250M502, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
aaaataaacaaaaaaataaagcaggcttaacctg CRISPR spacer aaaataaacaaaaaactaaagaagaaaaaatgaa Protospacer *************** ***** **. **. .
16. spacer 1.36|153201|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048677 (Lactobacillus phage LpeD, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
aaagaaataaataagcaaaagtataaaaaaagaaaaa CRISPR spacer tatcaattaaataagcaaaaggataaaaaattatccg Protospacer * ** ************** ******** * .
17. spacer 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP018263 (Calothrix sp. NIES-4071 plasmid plasmid8 DNA, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
aaaataaacaaaaaaataaagcaggcttaacctg CRISPR spacer aaaataaccaaaaaattaaagcagttggaggtac Protospacer ******* ******* ******** . *. .
18. spacer 1.43|153668|38|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693779 (Marine virus AFVG_250M346, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.711
tggtaaagttacagcaataaatggttcaaatattactc CRISPR spacer aggtaaagttactgcaacaaatggttcaacatctgtaa Protospacer *********** ****.*********** .*..
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
3906 : 65251
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP047602|3906:65251|DBSCAN-SWA CGTGATAGAAGATACTATTGCTGCGATTTCGACTCCAATAGGTGAAGGTGGTATATCCATCATAAGGATAAGTGGCAGTGATGCGATAAAAATTGTTTCTGGTATCTTTAAATCCAAGCGAAACGTGGATTTGAGGAATGTTAAGAGTCATACGGTTCATTACGGTTTTATTTACGATGCGGAAAATGATGAGATATACGATGAAGTTTTGGTAAATGTCATGAAAAGCCCTCATACTTACACAAAGGAAGATGTGGTAGAGATAAATTGCCACGGCGGCTATATTCCTTCTAAAAGAATTTTGGAGCTTGTACTTAAAAATGGTGCAAGGCTTGCTGAGCCTGGCGAATTTACAAAAAGGGCTTTTTTAAATGGAAGATTAGATATATCTCAGGCGGAAGCTGTCATAGACATAATAAGGTCTAAGACAGATCTGTCTAATAAATACGCTTTGATGCAGCTTAACGGAAGCGTCAAAGAAAAGATCACAAAGATAAAGAATGACCTTGTGGCACTTATTGCTCATATATTTGCCCTTATGGATTTTCCTGAGGAAGATGTGGAGTTACTTAATGATGGTGAGCTTATAGACGGCATTAACAATTCTATCAGAGAAATTGATGAGATACTTAAAACATCTGAAAAGGGAAGGATTGTAAGAGAAGGGCTTAACACAGCAATAATTGGGAAGCCTAATGTAGGCAAATCTTCACTTTTAAATGCACTGTTAAATGAAAATAGAGCCATTGTGACAGATGTGCCTGGCACAACGCGGGACATCATTGAAGAACATTTAAGCATAAAAGGCATACCTATAAATCTCATAGATACAGCAGGCATAAGGCAGACTGATGAGATCGTGGAGAAAATTGGAGTCGAAAGAAGCAGAGAAGCTATAGACAAAGCTGATTTGATAATATTCGTCTTTGATAATTCACGGCCTATAGAAAAAGATGATTATGAGATACTTAAATTGATTGAAAATAAGAAAGTTTTGTATATTTTGAATAAGATCGATCTGCCTTCTGCGATTGACATGGATGAAGTTTATAAGTTATCGGGTGGAAGGTATGTAAGATTGTCGTCTGTCACAAAAGAGGGGTTAGAAACATTAGAAAATACTGTATACAATATGGTCTTGTCTGATGGTTTGTCACGCGACGAATTTCTTCTGACAAACATGCGACACAAGGATGCACTGATTAAAGCTAAAGACAGTTTGATGTCATGCCTTAAGACGATAGAAGGCGGTTTGACGGAAGATTTTGTATCTATCGATTTAAACTCTGCGATAGATCATTTAGGCTTGATAACCGGTGAAACTGCAAATGAAGATTTAATCAATGAAATATTTGAAAGATTTTGTGTTGGAAAGTAGGTGGTTGAATGATATACAATGCTGGTGTATATGACGTAGCTGTAATAGGTTTAGGACATGCTGGATGTGAAGCGGCTTTAGCCACTGCACGGCTTGGATTAAAGACAGTCGCTTTTGCCATAAATTTAGATTCTATCGCTTTGATGCCATGTAATCCTGCCATAGGCGGACCGGCTAAGACTAACCTTGTTAGAGAGATTGATGCACTTGGTGGACAGATGGCTATAAACACGGATTTGACATTAATACAGGAGAGGACTTTAAATACCAGTAAAGGTCCTGCAGTAAGAGCTTTGAGGGCTCAGTCGGACAAAAAAAGGTATCAATTCAACATGAAGTATACGCTGGAAAAGCAAGAAAATTTAGACATCAAGCAGGCAGAAGTCGTCGATATAGAGGTTGAAGATGGACAAGTCAAAAGTGTCATTACAAAGACAGGTGCAAGGTATCTTTGCAAATCTTGCATTGTTACGACTGGTACTTATTTAAGAGGTAGGATAATCATAGGTGATGTAAGCTACAGCGGTGGACCAAACGGATTATTTCCAGCCAATGAGCTTTCTAAGTGCTTTGAGAGGCTTAACATCAGATTGATGAGGTTTAAGACGGGTACGCCAGCGAGAGTTGATAAAAAGTCTATAAATTTTGATGCGATGGAGATACAGCCTGGCGATGACAAGATAACGCCTTTTTCATACATGCACGACGAGATAAATGTTGAACAGATTCCTTGCTGGCTTACATATACAAACGAGAAAACCCATGAAGTGATAATGAGAAATATAGATAGATCTCCTCTTTACAGTGGTGAAATTAAAGGTGTTGGACCAAGGTATTGTCCATCTATTGAAGATAAGGTGGTCAAGTTTCCTGATAAGTTGAGGCATCAGCTTTTTATAGAGCCAGAGGGAAGGGACACAAATGAAATGTACGTGCAAGGCATGTCATCAAGCATGCCTGAAGATGTCCAGATAGAATTTTTAAGAACAATTAAGGGGTTAGAGAATGTCAAAGTGATGAGGCCGGGATATGCTATTGAGTACGACTGCATAGATCCTACTCAACTAAAACAGTCTTTAGAGTTAAAGACAATCTCAGGGCTATTTTTTGCAGGTCAAGTAAACGGCACGTCTGGATATGAGGAAGCTGCTGCACAAGGGCTTATGGCAGGCATAAATGCTGCTATGAAGCATTACAACAGGGAGCCGTTTATTTTGGATAGATCTGAAGCGTATATAGGTGTATTGATCGATGATCTTGTAACAAAAGGAACAAATGAGCCATACAGGATGTTGACGTCAAGAGCGGAGTACAGGCTTATTTTACGGCAGGACAATGCTGATTTTCGATTAACCGAAAAAGGAAGGCAGATAGGATTAGTCGATGATGAAAGATACAATAGATTTTTAATGAAAAAAGCGCAGTACGAGAAAGAGATGGAAAGATTGAAAAACACCATGATAACGCCAAGCCACGATGTCAATGAATATTTAAAGTCAAAGGGAAGTTCACCTATCGTCACAGGAATAACCATGTACGATTTGCTTAAAAGGCCTGAGATAGATTATGTTTCATCGAAGGTGATTGATTCAGGCAGGCCGGATGACATTAGAGATGATGTGGCTTTTCAGATCGATATAAATATAAAGTATGAAGGTTATATAAAGAAGCAAATGGAGCAAGTAGAAAAGTTTAAAGCGTTGGAGAATAAGAAGATTCCATCTTGGATAAATTACGATGATATAAAAGGGATAAGCATTGAAGCAAGACAAAAATTGAAAAGCATCATGCCTACATCTGTCGGTCAGGCATCAAGGATCTCCGGCGTTTCACCAGCAGACATTTCTGTTATATTAATTTATTTGCAGTCGAGGAGATAGGCATATGAACAGAGAATACATTGATATACTTATAAGCGGTGCTAATGATTTAGGGATAGAACTCAATATGTTCCATGTGGAACAATTTTTAAAGTACAATGATCTCCTTTTAAAGTGGAATGAGAAAATGAATTTAACGGCCATTACAGAAGAAAGGGAGATCATCATTAAGCACTTTTTAGACAGTTTAACTGCATTAAAATGCAATGTAATAAAAGGCACTGAAAGGATAATTGACGTAGGCGCAGGTGCTGGCTTTCCATCGGTGCCTCTTAAGATTTTATTTCCATCATTGAAGCTTACTATAGTCGATTCTTTAAAGAAAAGGACTGTGTTTTTAAACGAATTGGCTAGCCATCTTAATTTAAATGATGTTGAAATCATACATGGAAGAGCGGAAGACTTAGGTAAAGATATTGATTTCCGCGAAAAATACGACATCTCATTATCGAGGGCTGTTGCACAGCTAAATGTGCTAATAGAGTATTGCATACCTTTTACAAAGGTTGATGGATATTTGATAGCGTATAAGGGGTCTAATGCAGATGAAGAAATAAATGCATCGCAAAATGCTTTGAATGTTTTAAGGTGTCAGATAGAAAATGTCATTGACGTTACATTACCTTACACTGATATTCATCACAAACTTGTCTTAATAAAGAAGTTGAGTGTTACTGACGATAAATACCCGAGAAAGCCAAAATTAATTGAAAAGTCACCACTTTAACGAAAGGATAATGATTTATGAGGGATTTTAGGGCTTGTCTATTGGTTTCAAGAGGCGTTATCATTAATGACGGCAAAGTTCTTCTCGTAAAGCACCAGACGGAAGATGAGGTAGGCTGGGTCTTTCCAGGAGGTCGCGTTGAAGAAAATGAATCGCTTGTAGAGGCATTGGTGAGGGAATGCAAAGAAGAAACAGGGTACGATGTCGTGGCTGATAGCGTCTGTTATCTGGAGGAATACCTTATTTATTACGCTACATATTTTAAATGCAGAATTGTAGGTGGTGATTTGAAATTAGGTTCTGATCCTGATATGCCTAAAGATCAGCAGGTGATTAAAGACGTAAAGTGGGTTGACATATCGCAGTTTGATTGTTTGGACATATATCCAGAAGGGCTCAAAAAGATGATCATGGATGGAAGCATTAAGCATCAGAATTTAAAACTGCCCCAAATATACAGATAAAAAATTTTTGATAAAATATTAGGATAATAATGGAATTATAGGAGGAATTTTGATATTATTGTAGAATATATATAATATAATCTATTGTTTTACGAAGAGGTGTTTTTTATGGTGTCAATAAAACAGCAGGAAATCAAATACTTGCCGATAGACCTTATTAGGCCAAATCCATATCAGCCTCGCAAAATCTTTGACACAGCTAATCTTCAAGAGCTTTGCGATTCTATAAAAGCTTATGGCGTTATACAGCCAATAAGCGTGAGAGTCGTAAATGGCAATTCGTATGAGCTTATATCTGGAGAAAGACGTCTAAGAGCATCAAAGTTGGCGGGCCTTACGACAATTCCTGCTATAGTGTTTGAGGCGTACGATGAAGATTCTGCGGTTATTGCTTTAATAGAAAATTTACAGAGAAAGGATCTTAACTTTTTAGAGGAAGCTGAAGGGTATTACAACCTAATAAACGACCACAATCTTACTCAAGAAAAACTGGCTGTTATGCTGGGGAAAAGCCAATCTACAATAGCTAATAAGTTGAGGCTTTTAAAGCT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58 | Bacillus_phage(27.78%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
77386 : 108741
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP047602|77386:108741|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP047602|77386:108741|101151_101847_+|WP_014757393.1|DBSCAN-SWA MSRILIVDDEKPIVEILKYNLEKNGYSTIEAYDGEEGLKMAQEKNPDLILLDVMLPKMDGFTVLRILRQTMTTPILMLTAKEEEVDKVLGLELGADDYVTKPFSMRELIARVKANLRRSGISNGETMSNVLSVNNLNIDLSKYRVEKNGKPIELTSREFDLLKFLVANRGLIFSREMLLEKVWGYEYFGDVRTVDVTIRRLREKIEDDPANPRYIHTKRGVGYYFSEESEL >NZ_CP047602|77386:108741|95392_96835_+|WP_014757398.1|DBSCAN-SWA MKSKKYIWLVILVAAIGLLIYFAPIKNSNRTVYNMDLKYNDKDKTIIGTEAVDFINTDDVNLSEVYMHLYPNAFKDKSKVPFTKEEMGLAYPNGFKPGYIEINDVTFGKNEKATYSIDQKTGEILKILLPKKLGKGDRISFTIDFKVQIPPSCGRFGYGNNTIQVTNFYPILSVYDQNGWNNDPYYALGDPFYSDVSNYRVKLAVPKGMEVATTGVVTSKIRQGDMNVLTIDAPNVRDFAVVMSSKFKVAEGDVDGIRVKSYYFDEDSGLKALKYAQDAIRFYNSYIGKYPYKEYSVVESDFYMGGMEYPNLVFISKDLYSKDNLFNLEYVIAHETAHQWWYGVVGNNEVREAWLDEGLTEYTTIMYIERYYGKATADAVFKSIISGEFYKFSKTNKDDAMVKTLGQFKDWNDYTNIVYNKGAMVFNELRSLIGDEKFKEVLDKYYSEYKYKNATTQNLIDVVDSVTGKDTGGFFEEWLD >NZ_CP047602|77386:108741|96831_97812_-|WP_014757397.1|DBSCAN-SWA 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27 | Bacillus_phage(44.44%) | transposase,integrase,protease | attL 81139:81157|attR 84421:84439 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
667613 : 679018
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP047602|667613:679018|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP047602|667613:679018|671714_673163_+|WP_014759410.1|DBSCAN-SWA MVKNNEKRGFLDNFFKLKENGTTVKTEVIAGITTFITMAYIIFVNPSILMQAGMNAKGLLGTQAVKAGLSIANDPVIGAVFVATILSSVAATLVMGLFANVPFALSAGMGMNAFFTFYVVLTLHYSWQAALSLALISGIINIIITATKLRILIIKAIPQSLRSAIGAGIGLFIAIIGMENGGIVTKSSDTLITLGNFKDPGVILTVIGIAIIAILMSRGVKGAILIGIIATTIIGIPMGITNVSNLKTIVQMPPSLAPTFMKLDFAGLLKPGTDGNIISILTGLITVILAFSLADMFDAIGTLIGTGTKTGIFKEDDFEKSNGGFKTKFERALFADAIGTTLGSFLGTSTITTYVESASGISEGGKTGLTSTVVAILFLVSLFFAPIIGIVPSQATAPALIIVGALMIGSVTKVNFEDFSEAFPAFMTIAFMPFTYSISNGIAAGFIFYPITKIVVGKAKEVHPLMYIIGLLFLLRFAFFMG >NZ_CP047602|667613:679018|670692_670980_+|WP_014759412.1|DBSCAN-SWA MPYIRPVSDLRNNFADISRVVHETGEPVFLTKNGYGDMVVMSMEAYERKLFESEIYFKLKEAELEAQITKKRYSHKEIFDELKAKISDRMKSDNA >NZ_CP047602|667613:679018|675864_676875_+|WP_014759406.1|DBSCAN-SWA MDYKDAGVNIDEGNRFVEMIKPIAKATIKGGVLNGIGGFGALYQLTDYKNPVLVSGTDGVGTKLKIAFMMKKYDTIGVDLVAMCVNDIIVSGAKPLFFLDYFATGKLQSDVGIEVIKGIAAGCSEAECALIGGETAELPGMYNEGEFDLAGFAVGAVEKDEIIDGRNIEVGDVIIGLASSGIHSNGYSLVRKVLFDVGKMSTDDYIEEYGLSLGEVILKPTRIYVKAFKSLKGINIKGMAHITGGGFVDNIPRTLKDGVSARIDKKSWDVPHIFSLIKDIGNIDDIEMYRTFNMGIGMIIIVPNHQCDDAVSRLKAAGEKPFIIGEIVNGEKEVLL >NZ_CP047602|667613:679018|669080_670619_+|WP_014759413.1|DBSCAN-SWA MGINREVILILDFGGQYTQLIARRIREANVFCEIVPYNIKPEEIDKRQPKGLVLSGGPASVYTENAPMCDEGIFKLKYPILGICYGAQLMTMIQGGKVAEAPVREYGKTDVVINNNIPLFKGIEKETSCWMSHTDQIELPPKNFKVVASTANCPIAAIANVEGKQYAVQFHPEVVHTPRGTEIIRNFLFEVCDCSADWTMDSLIEQTVKEIRQKVGNDKVVCALSGGVDSSVAAVLVNRAIHDQLICIFVDNGLLRKNEAEKVVDTFKNNFDMEIIKVDAKDRFLEKLKGVKDPEEKRKIIGNEFIEVFKEEAKKIGDVKYLVQGTLYPDVIESGSPVASTIKSHHNVGGLPEDVGFELIEPLRMLFKDEVRQVGRELGMPDEILNRQPFPGPGLAVRILGEVTEEKLNILREADSIVLREMKKYGWYNNVWQSFAVLPDIKSVGIMGDDRTYAYPIILRIVESNDGMTADWVKMPYDILEDISTSIVNEVYGVNRVLYDITSKPPATIEWE >NZ_CP047602|667613:679018|670969_671278_+|WP_084214979.1|DBSCAN-SWA MMHDIRYLPLASRDLSNIVSYIVDELKAPNAAMDLINELDTSISRLAQFPYSCKVYQPEKPLKNEYRVLPVKNYLVFYVVREDVVEIHRIIYAKMDLAKLIK >NZ_CP047602|667613:679018|673242_673734_+|WP_014759409.1|DBSCAN-SWA MAKVAVVMGSDSDFPLMKKALDVFKQFGIDYDVRVISAHRTPDVAHDFAKNAAYRGYEVIIAAAGKAAHLAGVMASMTPLPVIGVPVKSSTLDGLDSLLSTVQMPQGIPVATVAIDGAYNAALLAVEILGVKYPEIMEKVVEYKNNLAEEVIEKDKKLQGEIL >NZ_CP047602|667613:679018|667613_669068_+|WP_014759414.1|DBSCAN-SWA MADKFVKEGLTFDDVLLIPAKSDVLPKEVDTKTRLTNSIMLNIPLISAGMDTVTESSLAIAIAREGGIGIIHKNMPIERQALEVDRVKRSEHGVITNPFYLSPEHKIQDAVELMERYRISGVPITVDNKLVGIITNRDIRFESNLDRPIKEVMTKENLVTAPVGTTIDEAREILKKHKIEKLPLVDDDNNLKGLITIKDIEKAVEYPNSAKDSRGRLLVGAAVGVSADVMERVQALVDANVDVVVVDTAHGHSVGVLNTVEKIKNRFPDLQIIAGNVATAEATRDLIERGADCVKVGIGPGSICTTRVVAGIGVPQITAIYDCAEEADKYGIPVIADGGIKYSGDIVKAIAAGASTVMIGSLFAGTEESPGEVEIYQGRSYKVYRGMGSISAMKSGSSDRYFQEGMKKLVPEGVEGRVPYKGPLKDTVYQMIGGLRAGMGYCGVHNIEELRTKTKFIKITNAGLTESHPHDIIITKEAPNYSIK >NZ_CP047602|667613:679018|676871_677480_+|WP_014759405.1|DBSCAN-SWA MRLLVMASGNGTDFQSIIDGIKSGYINAEIVALISDKEGAYALKRAEMNNIPAYCIPKKKLKDKFYNELANVINEINPDGIILAGFITILNEEIVNKYHNRIINIHPSLIPSFCGKGYYGINVHKAVVDYGVKYTGCTVHFVDSGADTGPIIMQDVVKVEDDDTPETVASKVLKLEHRLLPYAVKLFTEGRLKVEGRKVYIK >NZ_CP047602|667613:679018|677491_679018_+|WP_014759404.1|DBSCAN-SWA MSKRALISVSKKDGIVDFAKKLDEMGYEILSTGGTYRLLKDMGINAVKVSDVTGFPEILDGRVKTLHPKIHGGLLAIRDDENHRRQLEENGIKPIDIVAVNLYPFKETILKDDVTLEDAIENIDIGGPSMIRAAAKNYRYVTVLVDPDDYDKVVEEIKEYGNTKEETRFYLAMKAFGHTASYDSLIYNYLLDKNGVEFPDTITFSFEKSQDMRYGENPHQKAAFYKNSLKSFGISECVKLHGKELSFNNINDANAAIELLKEFDEPAAVAVKHTNPCGVAVADNIYDAFKKAYECDPVSIFGGIVAFNRKLDANTALELSKIFLEIIIAPDFEEEALAILEKKKNVRILKLSDGYVKEYDLKKVEGGILVQEKDEVDLYDDKLTVVTKNAPSERELKDLRFAWKVVKHVKSNAIVLAKDGMTVGIGAGQVNRIWPTEQSIRQAGEKARGSVLASDAFFPFPDVVEEASKAGITSIIQPGGSINDDASIDAADKAGISMIFTGIRHFKH >NZ_CP047602|667613:679018|673733_674441_+|WP_014759408.1|DBSCAN-SWA MEKLSMLYEGKAKKVYKTTDEDYYIIEYKDDATAFNGIKKGTIQNKGVLNNEISAILFELLEKEGIPTHFVKKLSDREMLVKSVEIYPIEVLIRNYAAGSISKRLGIEEGTKLKRTVLEFCYKNDELGDPFINEYHIEAMELATKEEVDTIKEYSFKINDILSKFFTSKNIILVDFKLEFGKSKDGIVLADEISPDTCRFWDSVTKEKLDKDRFRRDLGNVEGAYVEVLNRLEKQ >NZ_CP047602|667613:679018|674450_675848_+|WP_014759407.1|DBSCAN-SWA MIETVKLKEECGVFGAFSLNNPIHHHIYYGLQALQHRGQESAGIAVLKGSYVNCIKGMGLLLEVFSKENIDDLEGNVGIGHVRYSTTGNSDACNAQPFVANFSSGYMALAHNGNLINALELRKELEEEGRILQTTSDSEIILHLIAKYYRNGLVESLVKTIEKIKGSYALVILMEDKLIGIRDKNGIRPLCIGVKDGNYYLSSESCALDVIGAELIRDVEPGEIVIIDKNGLNSVKVDTFEKKMPCVFEYIYFSRPDSVLEGVSVYKARYEMGKRLAIESSVDADLVVPVPDSGVPASRGYSFQSGIPIGEGLIKNKYIGRTFICPKQKDREIGVRVKLNVLKELVKDKRIVLIDDSIVRGTTMKRLVSLLKKGGAKEVHVRISSPPVKYSCYFGIDTPTKKELVGSYMEVKDIRDYIGADSLSFLSLEGLKESVGLESICAACFDGKYPMEVPKEGSKYLFEKK |
11 | Synechococcus_phage(22.22%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
790248 : 829086
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP047602|790248:829086|DBSCAN-SWA 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MDTQEMKIIHLYDRQDPEIQIKLEKNSKGYNWEITFKGENANTVLTKIREVNKKLNEEYGGER >NZ_CP047602|790248:829086|825571_825868_+|WP_014759252.1|DBSCAN-SWA MEITLNNKTYIAPATKARVVRKAIEITEKINFNEIKTKDLDNLIDYVVELFGRQFTIDDVYDGLEANKLIPTIMDCIKGVVGEVGAKLEQFPNAQTGK |
57 | Bacillus_phage(22.22%) | portal,capsid,tail,integrase,terminase,protease,tRNA,head | attL 804293:804352|attR 838757:838849 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1383400 : 1393139
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP047602|1383400:1393139|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP047602|1383400:1393139|1385234_1386185_+|WP_014758726.1|tRNA|DBSCAN-SWA MAIPLLIIVGPTASGKSKLSVEIAKFYNGEIISADSMQIYKYMDIGTAKITNEEKQGIPHYMIDIVEPNVKFSVAEYEKMAKSLIDDIFKRGKLPIVVGGTGLYVNSLIYIMNFSEYIGNDDFRSALKNIASVLGNEYLFERLKMVDPKTYSKLHPNDLRRVIRALEVYQFTGIPISVYQELSNKRVNPDYNAVMVGLNYRNRETLYKKIDDRVDTMIKNNLIDEVVNLLKIGYNKYGTSMQALGYKEIIEYLEGKVSLEEAIADLKMKTRRYAKRQITWFKSYETINWFYVDDYSSFEDLEKNIISFLAGKLKFK >NZ_CP047602|1383400:1393139|1390876_1391767_-|WP_014758720.1|DBSCAN-SWA MSIWSVNFENYKIDKKAKSDDNKNIERDKSLEIEALKELNSLIGLNKVKQIINELYALEQVQIKRKNAGLVTDPIVLHMVFKGNPGTGKTTVARILGKLLKGIGVLNKGHVVEVERADLVGEYIGHTAHRVQENVKKALGGILFVDEAYSLARGGEKDFGKEAIDTLVKAMEDYKDQFVLILAGYRDEMEYFLNTNPGLRSRFPIQIDFPDYTIDELLRIAELMTKNRQYVLTDSAKRKIMKVLINDNTTREIGNARLVRNIIERAIRKQAVRIINKKTITKDDLMIIDSIDIRED >NZ_CP047602|1383400:1393139|1386227_1386482_+|WP_013788022.1|DBSCAN-SWA MNQKTAINLQDIFLNQVRKEHIAVTVYLINGFQLKGMVKGFDNFTVVLETDNKQQQLIYKHAVSTITPLKPVIFTTTEKDEKQQ >NZ_CP047602|1383400:1393139|1386549_1387347_+|WP_014758725.1|DBSCAN-SWA MKIGFIGTGNMGTALINGLINSDFVTANDIYAYDVSYDKLLKLKDELSINISKSNVDVTNECDVIILAVKPNLYDSVLEEIKNDVDENKIIIIIAPGISIDHVKSILKKGKIVRTIPNTPALIGEGITAISYPEDMSSRDKEIVEKIFKSCGEIVEIKENLIDAAMAISSCSPAYVYMFVEALSDAGVSLGLPRDVAYKLSSKAVSGSGSMVLKTGFHPGYLKDMVTSPAGTTIQGVRTLEKYGLRSAVFEAVISSFEKVKGNKQ >NZ_CP047602|1383400:1393139|1387343_1387805_+|WP_038068767.1|DBSCAN-SWA MMSIPEVIIYTDGACSGNPGPGGWGAILIYKDTVKEISGYEENTTNNRMELTAAIEALKMLKRPCKVNLYSDSSYLINAFNQKWIDNWLKKGWIKSDKTPVENKDLWLKLLDLSSIHHIKWIKVKGHADNEYNNRCDKLATDEIKKHQISIAK >NZ_CP047602|1383400:1393139|1387896_1388880_+|WP_014758723.1|DBSCAN-SWA MFISTKDNLELPPILEEFLNYFSTIKARSPNTVKAYLYDLILFFRFIKVRKNLCSDSDFDNIDISDVDISLIESIDLNDLYAFLSFVTHERSNTPPARARKVASLRSFYNYLYAKRKVITKNPALELESPKLGIRQPVYLTLDESVKLLNSIDGEFKERDYAIITLFLNCGLRLSELANINISDIKDDKLTVIGKGNKQRTVYLNDACINAINDYLKVRPHDGVKDKKALFLSKRLQRISIKTIQYIVKKHLKDANLDGKKYSTHKLRHTAATLMYRYGKVDIRTLQRLLGHSNVSTTQIYTHVDDSQLRDAVSKNPLSELNIDNKN >NZ_CP047602|1383400:1393139|1383400_1385224_+|WP_014758727.1|DBSCAN-SWA MNKINLLDDELINKISAGEVVERPMSIVKELVENSIDADSKNITIEIIDGGIPYIKVLDDGCGMNEIDAVLAFGRHATSKIKSTDDLFNIGTLGFRGEALASIAAISKVLLKTKEENSLYGTLINVEGGKILKKAKCGCEKGCSVEVKDVFYNTPARRKFLKRPSTEAMYITDMVAKIALSRPDISFKYIKDKRMEFMTSGNNSVNEVILRLYGDELYSNLIETEYNDEYMNIKIFLCKPSYTRGNRNMQILFVNGRFVKNKIYTTAVEEAYKTLIPVNRYPVVITYLNIDPKNIDVNVHPTKLEVKFSDEKEIFDSIYKSIKNALNRSNLIPAIRHDMFTYTDIPENKVEEKSNPKQLNIIEEESTNKIIEVYPNNKSFISNVKESSEKAYFDYNDVNALKTENTHIENFNTLPDDHDDYKIVGVIFSTYIVVEKNDMIYLVDQHAAHERILYEKFMNMYNNVQGKQTTIPILINIEPGDDVIINENIELFNKLGYKFESFGNNSIILREVPVVLGQPESRQLFIDIIDKLKRDDFNKDINLKEETIIMMACKKAVKAMDSLSKEEISSLFNDLKVTENPYTCPHGRPVIVSIKKYELEKMFKRIM >NZ_CP047602|1383400:1393139|1388938_1389562_+|WP_014758722.1|DBSCAN-SWA MKDASKISIKQQEIIDFIKSEIKRKGYPPSVREIGKAVGLRSTSTVHGHLSRLEKKGYIRRDPTKPRAIEVLSNDEKYISDVVKLPVIGKVTAGTPILAIQNIEEYYSVPRDLITGYESESFILKVRGESMINAGILDGDYIIIRKQSYADNGDIVVALIEDEATVKRFYKENNHIRLQPENPSMNPIIVDDVMILGKVVGVIRKLK >NZ_CP047602|1383400:1393139|1389585_1390872_-|WP_014758721.1|DBSCAN-SWA MSGNILEEKFNISKDVIFLLEKAENDVKDEFKKVDKIVEKNQYKVLYAMQKNHLSDIHFNGTTGYGYGDIGRDTIEKIYSDIFNAQDALVRPQIVSGTHAISLCLYGVLRPNDELISACGTPYDTLIDIIGKGSNSNNGSLTDLGIIYKEVPLLKNGKIDVEKLIGEVTSKTKMVMIQRSKGYDFRYSLSINDIEFVIKKLKDKKRDIIVFVDNCYGEFTEDLEPTDVGADLIAGSLIKNPGGGLSPTGGYVAGKKELVEKAAYRLFAPGIGKKVGPTLNTNRLTLEGLFFSPLVVGNALKGAIILAKIMEMLGYEVLPKFNELRTDIVQAIRFKTKEELITFIQSIQKGSPVDSHVVPEPWDMPGYDDQVIMAAGGFIQGSSIELSADAPIRKPYTAYVQGGLSYYQVKLSLMIAINNMIEKGFIKI >NZ_CP047602|1383400:1393139|1391843_1393139_-|WP_014758719.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNLIKINEMKDHVGEEVTINGWLYNKRSSGKIKFLIIRDGSGFVQGIVVKNEVDENVFELCDKLTQESSISVSGIVRKDERSPFGFELTIKNVDLVQMAFNDYPISLKEHGIDFLLDNRHLWIRTPRQQAILSVRHEVIRAIQEFLNNNDFVRIDSPIITPSTCEGTSDLFQIDYFGENAYLSQTGQLYQEAAAMAFGKVYSFGPTFRAEKSKTRRHLNEFWMVEPEMAFVDHYGNMEVQEKLVEYIVQSVLENCSRELKELGRDLSKLEKIKTPFPRLTYDEAIELLNKNGYEIQWGNDLGSPDETFLSNQFDKPVFITEYPAECKAFYMQPKEDRPEVVLCADLLAPEGYGEIIGGSQRIHDYDLLLKRLKEENLPIDMYNWYLDLRKYGTVPHSGFGLGIERTVAWITNTEHVRECIPFPRTLSRIRP |
10 | Wolbachia_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
2468326 : 2478448
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP047602|2468326:2478448|DBSCAN-SWA 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CATCGCCTTAAAAACTCTTTCTTTCGTCTCTTTGCTTATCCTTGGATTATCCGCAATAACCCTTGATACAGTCGAAGGCGCAACATGTGCTCTTTGTGCAACATCTTTTATAGTTACATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP047602|2468326:2478448|2469920_2471342_-|WP_014757666.1|DBSCAN-SWA MSRNRLFRRLLFTNIAIILLTMSILSVLFYIMFENYYFRDKEKIMVEEGKQINTVLNDYLIGDIDIDRLNQDLNVIDRLINASIWVVSTDGRIYIQSKNFEKNWTGVTLSKDDIKSILKGETIVRRGYFGGRFTQPVLTVGFPLVLAGKIQGAIFMHAPIVEMQKTLMDIFFIMLLAIAISIIIAFILISYTSKRISNPLKEMSIATEKMAKGDFSTKINVVDDDEIGDLAKSFNIMSSELGRMDNARKEFVANVSHELRSPLSTIQGYIDGVVDGTIPAEKSKFYLEIAQKETRRMSRLISELLDITKMESGAFPLNISEFDINELIRLTIIKMEARISDKDLMVKVDFESDKEIVEADKDKIEQVLTNLIDNAIKFSNPGGYIHISTEKVKEKVHVKVQNKGKTIPPDEIDHIWDRFYKVDKARSGSPGVGLGLYIVRSIINLHNEDIWATSSDADGTTFTFTLRAKKVKQ >NZ_CP047602|2468326:2478448|2472116_2473067_-|WP_013786968.1|DBSCAN-SWA MVRHGGAIKIFSGNSNPELAREIAENLGLTLGDSEVGTFSDGEISVRIKESIRGANVFVVQSTCSPVNDNLMELLIMIDAFKRASAGEITAVIPYYGYARQDRKSKPRDPITAKLVADLITVAGADRVLTMDLHAAQIQGYFNIPVDHLLGGPILAKYFMEKDLGGDVVVVSPDHGSVVRARNFAEKLNAPIAIIDKRRPKANVAEIMNLIGDVRGKIAILVDDLIDTAGTLQQGAQALIDNGAKEVYACATHGVLSGPAIERLMDSPIKELVITDTIPLPEEKKISKIKVRTVAPLLAEAIMRIYEGMSVSKLFV >NZ_CP047602|2468326:2478448|2475035_2475854_-|WP_014757663.1|DBSCAN-SWA MNSYKRYERISVILKILTENPNKLYNLNYFMDLFNVAKSTASEDMDILQGILEKFGLGKIKTVAGAGGGIKYIPINNIDNYREFMIDICNKLQDPKRIIPGGFLYTADIIYSPQYANKIGEILSYPFQDKDVDAVVTVETKGIPIAIMCAKALNVPLVIIRQDNRVTEGSSVSINYVSGSQKQIKAMSLSRRSLERNSKVVLIDDFMKAGGTIKGMIELMNEFDAEVIGAGVMISTKEPENKVVKNYFSVFTLVDMNEEKETVKMEISDWLK >NZ_CP047602|2468326:2478448|2474552_2474834_-|WP_013786966.1|DBSCAN-SWA MEITDVRVRKINEEGKMRAVVSVTFDNEFVVHDIKVIEGQNGLFIAMPSRKTPEGEFKDIAHPINSETRAKIQSAILSEYEKAKEQDKPQGQE >NZ_CP047602|2468326:2478448|2476011_2477409_+|WP_014757662.1|DBSCAN-SWA MTIDIENFKRVHFIGIGGISMSGLAHIMLNSGHIVTGSDIKDSHIIKKLRNEGAIINIPHSASNVDGADLVVYTAAVKEDNPEMIRSRQLNIPTIDRATLLGEIMKKYKYGVGVAGSHGKTTTTSLISVLLEEMNYDPTVLVGGEVDIIGGNVRVGNSEYFITEACEYTDSFLKFYPYIAVILNVDSDHLDYFKNIDNIKQSFTQFANLVPNDGFVVACGDDPNTMSVLKDVNRNIITFGIDSNCTWNAKNIKFDEKGFPSFDVYYNGTFVERFELSIVGKHNILNALATLSVCHLLGVDIKKCPDVIKKFKGTHRRFEFKGTIDGAIVIDDYAHHPTEIKATLSSALNYPHNRIICVFQPHTYTRTYSLLNDFAASFDDADITIITDIYAAREKDTGIVRAEDLVNLIKNRGNEVYYIKDFTDIVDYLKNTIKSGDLVITIGAGDVYKVGNMLLSFNKKAAIGA >NZ_CP047602|2468326:2478448|2471343_2472027_-|WP_014757665.1|DBSCAN-SWA MGENKKIYIVDDDRNICEIISLYLEKEGFATVKISDGLTALNKIKEELPLLIILDLMLPGIDGMTLCKEVRKFTNVPIIMLTAKGDTFDKVLGLEIGADDYIVKPFDGKELVARVKAVLRRYEHEENDGDSVTYPDLSISLSEYKVKYKGENVDLTPKELELFYFLCTHPNKVFTRDQLLENVWGYEYMGDSRTVDVHIKRLREKIGDGPNWKLTTVWGVGYKFEVK >NZ_CP047602|2468326:2478448|2468326_2469682_-|WP_014757667.1|DBSCAN-SWA MDFENEQNKNIGENEIDNFRTDDALGSDDIKGENIDDTQEIKATYGAEESGTYTNPRVEFRSNKKSLGKMVKRFRRRMLVSFVAVALIAALIGGGTVAGIMKYTNLGQQTQVINRYLPLSSSDNNNYSLIANIAKIVSPSVVGIDTSVSYSNGFGSALVPEGSGSGIIIDSQGYIVTNNHVVDGASKITVNLSDGRKFPAQLIGKDSKTDLAVLKINATNLIPAKLGDSSKLEVGDLAVAIGNPLGESFAGTVTAGIISGLNRNLQSDYGPVNLIQTDAAINPGNSGGPLVNSNGEVVGITSVKLTSTGGSDTQDPFGMFQSQSTPVEGMGFAIPINEAKPIIDDLIKHGYVERPMMGVSVQEVTQQDAAQYNIPVGLYIAQVQQGSGADEAGLQAGDVITAVDGTKVQTFDALQSIISKHKVGDTITVTFWRNGRTMSTKVKLMSSSNAQ >NZ_CP047602|2468326:2478448|2473069_2474443_-|WP_014757664.1|DBSCAN-SWA MDNFVTLILAAGLGKRMKSKHPKVIHKVCGRPMVEWVVKSAKEAGSQDVVVVLGHGANEVKNVLGDSVKYAYQEKQLGTGHAVMVSKDLLPDTGNIMILTGDTPLITSETLKKFYDFHLKEQNSITILSSFFDIPDGYGRIVRDSNGNVLKIVEDKDANDVEKGIHEINSGMYIFNSDYLRKSLQHIGNNNAQGEYYLTDAVEIVIRLGGKVGAYQASNEEIMGVNTRVQLKDAEKVMRKRINERLMLDGVTIIDPDSTYIGPDVMIGMDTIIYPGTMIEGKTTIGEDCEIGPNSYIIDSEIGNGCKIVFSMITESKLHNNIKLGPFAQIRPESVIHDNAKLGNFIEIKKSVIGEGTKVPHLTYIGDAEVGKRVNMGCGSIVVNYDGKNKHKTIIGDDVFVGCNVNLVSPLKVNDNAFIAAGSTITDEVPEGALAIARCRQTNKEGWVEERRKKGGL >NZ_CP047602|2468326:2478448|2477434_2478448_-|WP_013786963.1|DBSCAN-SWA MNVTIKDVAQRAHVAPSTVSRVIADNPRISKETKERVFKAMEELGYYPNAIARSLASKMTYTIGLIMPRSAEDAFSNPFFPEVMRGISVVAHNEKYDLLISTSGNEEEEKQAVIDMVKGRRVDGIVLLCSRTTDELIPWLREEKFPFTVIGKPLDSKGVCWVDNDNIGASRLATNYLIKHGHREIAFISGSLEFVVSLDRLDGYKLALEENNIPFDKELVAQDEFSEDGGYNAMMRILKQKKPTAVVVTDDIMSFGVIRAAIDYGLKVPQDVSLIGFNNIPLSAYANPPLTTIDISTFDLGVKSAELLLKNIKNKDFVADHIIVPVKLIERKSCIKR |
9 | Hokovirus(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
2641526 : 2650395
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP047602|2641526:2650395|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP047602|2641526:2650395|2643063_2643600_-|WP_013786854.1|DBSCAN-SWA MKSNTKKEIVSWILTIGLAFIIAMFIRTYVFELVDVPTGSMLNTIQLNDKFIELKFIYRFEPIKRGDIVVFKYPDDPSVSFVKRVIGIGGDTIEIKNGILYRNGKPVKEPYLKEPMNKNETFGPYKVPPNHYFMLGDNRNQSLDSRYWKNKYVSKDAIMGKIVFRIWPLSRFGSMIGK >NZ_CP047602|2641526:2650395|2648739_2650395_-|WP_014757512.1|DBSCAN-SWA MLIKGSQVVIEVLKEQGVEVVFGIPGGAVIPLYDALYDSDLRHILATHEQMAAHMADGYARVTGKVGVCFATSGPGATNLVTGIANAYMDSVPIVAITGQVATSLIGKDSFQEVDIAGITMPITKHNFIVKSPDKLADTLREAFFIAKDGRPGPVLVDIPKDIQTADINFVKRKDFYVEVKKHQALESDLEKAAQLISSSKRPVIFAGGGVIWSEASKNLYDFAKKHMIPVATSLMGLGCFPEDDELSLGLIGMHGSRYANTAVYKSDLVIAVGARFSDRVAGKAGGLAPNAKVIHIDIDPAEIGKNIDVDVPLVGDIKEVLSLLNGMIKERENREWINELISIKDKTSFKYKDDGKLKPQWIVEKVQELGGDSLVVATEVGQNQMWTAQYYRFKEPRTFVTSGGLGTMGFGLPASIGAQVGRDDKRVVNIAGDGSIRMNIHALETMSVYNIPVITIILNNQTLGMVRQWQNLLYDKRFSQTDLNPNLNFSKVAEAFGVTGRRIYTKEEFTEAFSDALSNNKPYVLECIIDKDEMVLPFIPAGGTIEEMID >NZ_CP047602|2641526:2650395|2645601_2646792_-|WP_014757515.1|DBSCAN-SWA MFDTIESAIEDIKNGKMVIVVDDEDRENEGDLVMAAEKVTSDHVNFMIKYGRGLVCVPMMGERLKKLNIGKMVFDNTDKKETAFTVSVDHKNCKTGISAYERALTIKMLIDDESMPDDFTKPGHVFPLEAKEGGVLVRAGHTEAACDLARLAGLKSAGVICEIIKDDGKMARLPELIEFSKKFNLKIISIADLIEYRRKNEKLVKRVAEAYLPTKYGDFTIIGYEEILTGKDHVALVKGDLSDSPTLVRVHSECLTGDIMGSLRCDCGDQLHTAMEKIGKEGGVLLYLRQEGRGIGLLNKIKAYHLQDEGLDTVDANIRLGFPADMREYGIGAQILKDLGLKKLRIMTNNPKKLVGISGYGLEIVERVPIEVSINRHNERYLKTKKEKFDHIFTSF >NZ_CP047602|2641526:2650395|2641526_2642798_-|WP_014757518.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLDIKRIRNNPDEVKKAIELKKENSNIDEFLEIDEKRREILKELESLKNTRNKESENIAKLKKEGKDAEELIKEMKEISDKIKAMEGEVKQYDEKLEELLWTIPNIPHESVPVGDSDADNVEIRRWGEVREFDFEVKPHWDIGVELGLLDFEAASRVTGSRFTFYKGLGCRLERALINFMMDLHTEKHGYTEVFPPFMVHRRSMFGTGQLPKFEEDAFKVAGTDYFLIPTAEVPVTNMYRETIIDGEKLPIYNCAYSACFRQEAGSAGRDTRGLIRQHQFNKVELVKITEPEKSYEELEKMVSDAEDVLKTLGIPYRVVSICTGDLGFTAAKKYDLEVWMPSYGRYVEISSCSNCEDFQARRANIKYRPKDGGKAQYVHTLNGSGVAVGRTFAAILENYQQKDGSVVVPEALRPYMRCDVIRK >NZ_CP047602|2641526:2650395|2647435_2648506_-|WP_160175256.1|DBSCAN-SWA MKRALQLAKLGVGHTNPNPLVGAVIVKDGRIIGEGYHEYYGGPHAEVNALKNAKEDVSGATLYVTLEPCCHHGKTPPCVDAVIKSGIKNVFIAMEDPNELVAGKGIKKLKEAGLNVYTGLLKDEAEKLNEVFIKYITSREPYVILKSAMTIDGKISTFTGDSKWITNEKSREHVHKVRGSVMAIMAGINTVIKDNPHLTVRLQGYKNPLRVIVDSHGRIPLDANVIIDKSAKTLIATTDMMPHDKVKALKDLGVDVVTIEKKNNKVHLKKLIHTLGKKGIDSILIEGGGTLNYSALKEGIVDKVMFYIALKIIGGSNSLTPVEGDGIALIKDAIMVEKIDIKKFDDDILIEGYIKK >NZ_CP047602|2641526:2650395|2645107_2645578_-|WP_014757516.1|DBSCAN-SWA MKKYEGKLIGDGLKVGLVVSRFNEFITNKLLDGALDALRRHGIDDESIDIAWTPGAFEIPLISKKMATSKKYDAIIALGAVIRGDTPHFDYVANEVSKGVAKISVDYDVPVIFGVLTTDTVEQAIMRAGTKSGNKGFEAAVTAIEMANLIKEIESL >NZ_CP047602|2641526:2650395|2646806_2647427_-|WP_014757514.1|DBSCAN-SWA MFTGIIEEVGKVKMIQRGNITKMAVECKKALDGVKIGDSIAVNGVCLTVTNIGKDLFTSDIMYETLKTSNLGSLKIGSIVNLERALSISGRLNGHIVTGHVDTVGAIIEKNKINGTTTFKIKIDERYSKYVADKGSVAVDGISLTVVESSASYFTVSIIPHTEINTTLNIKRIGDTVNIEVDILSKYAERLLTKKNVDEFLIENYL >NZ_CP047602|2641526:2650395|2643999_2645064_+|WP_014757517.1|DBSCAN-SWA MKDFLSRYQSTIRNSIAILAIILSFYLFVFKLIPFLMPFAVALFLAILIDPAVEFSEKKLKIPRGLSSAFFILLLIAIIGLLISLLVTQLVFELNTLAEHAPSYTKNFDVVISDLIDRIRRYYVSLPTNISTFLESNLQSILNNISVYAKNFAGWILGLATKLPNFFFMSIITIVSTFFLSKDKWLILNFIKRQFPSNWAFHAENIKGDLFQTLIGFIRAEITIMFITFLEVSIGLTIIGFDYAFLLGLLVSFIDILPVLGSGSVLVPWALYNIFTKNYLIGIYLLIIYAIVTVVRQMIEPKIVGQSIGLHPLVTLLSMFIGARLFGGLGLIMGPVFVVVFKTFQKSGIIPSWK |
8 | Staphylococcus_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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