Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP041970 | Acinetobacter dispersus strain NCCP 16014 chromosome, complete genome | 2 crisprs | RT,DEDDh,csa3,cas3,WYL | 0 | 1 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP041970_1 | 1247752-1247849 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041970_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP041970_1
>1.1|1247775|52|NZ_CP041970|CRISPRCasFinder GCCTTGTTGGTTCTGCGTATTTTGTTGCTGTCCACCAAGTTGTCCTAAGACA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041970_1
The CRISPR arrays of NZ_CP041970_1 >merge|NZ_CP041970|1|1247752-1247849|CRISPRCasFinder GAACCTAAAATCCCACCTAAACCGCCTTGTTGGTTCTGCGTATTTTGTTGCTGTCCACCAAGTTGTCCTAAGACAGAACCTAAAATGCCACCTAAACC >NZ_CP041970|1|1|1247752-1247849|CRISPRCasFinder GAACCTAAAATCCCACCTAAACC GCCTTGTTGGTTCTGCGTATTTTGTTGCTGTCCACCAAGTTGTCCTAAGACA GAACCTAAAATGCCACCTAAACC
>NZ_CP041970.1|WP_159883848.1|1246148_1247246_+|porin MKKLLLAATVATLAMNAAQAAPTLYGKLNVTLDQIDNNGFKDESVTKVNSNASRIGVKGEEKLTDNLSAVYLIEWQFNADGDGDQSFSNRNRYVGIKSDGIGTLKVGQFDSYFKNAAGNNQDIFNDHNELDMTKVLVGEDRLKNVIGFETDKKLLGGLAFNIMFQQGEESSAVKNDAKGQKGSRDGFGDGVSTSLTYENKDWGLAAAVAGNFGVASKYNAYSDLSGDNSVYSDAIRVTGSLDLTPAGVNGLVFGALWQTAQPTDDTVVVGTTPAVSYKGLQEDAYGVTAAYTIPSTPVKLKAEYISSTTEVNGRDDRKQDLYGVGADYQINKQTRFYGVVGQQKRDWLVKDDKKTTIGLGMEYNF >NZ_CP041970.1|WP_159883846.1|1245482_1245896_+|HIT-domain-containing-protein MAYDDQNIFARILRGELPAIKIYEDDQVLAFMDIMPQADGHALVIPKTPAVTLLDLPAEAAAYTIQIVQKIAKAIETSLDAKGIVLMQLSGAAAGQTVPHVHFHLIPSSVHELGRHAAKMGDQEKIQALAEKIKAAL >NZ_CP041970.1|WP_005152820.1|1245117_1245387_+|YARHG-domain-containing-protein MNKLMVAVFAGLVTLTGFSVQAATPEQECKKLQDDYNLIYASKGFCFKDADAKAKFGNENCHTTKPKFSDKEQQRLDEIKARQKELNCK >NZ_CP041970.1|WP_159883844.1|1242272_1242857_-|glycoside-hydrolase-family-protein MKALFDCLRKIAVGRLIRIKKYANDELSNIATASDVVETLGVAVDSKMTISVDGTHLITNFEDLKLQSYDDGVGVWTIGFGTTVYPNGIRVKKGDCCTLEQAKSFFQHDLRRFQSTVNHAVIVPLSQNQFDALVSLTYNIGPTAFKNSTLLKKLNANDYVGAADQFLVWNKGGGKTLKGLVRRRELERDLFLKI >NZ_CP041970.1|WP_159883842.1|1240911_1242024_-|OmpW-family-protein MKKTATKIVIATTLLTLTHLTYAQEFKRFSVSVGWLHVMPQGKANPFNINTNVKNGTVAKVGSISTTSFLNSVDPNAMGTDLGGEKFNQKEFLDLALADPSMTALLTDGKGNILPEVAGDANIYGLENWQQNNAGLEVDDVDTLGLMFNYYLNDKVSLQLIGGIPPKVDIKGKGEISAPLTGLAVSPNDIVKILFPDGITLGQSVPITNLGNKSKAATVRAWTPAIEAQYQFGKSGVDKFRPYVGAGLMYAHFNQIKLNDGIRSDLISAGHMIQNVLDGKAGAALDRKVSSGDMAVKVDADDAIAPIVSVGFTYDFNDAWYGVGSVSYAKLNNKATINVVNNTTGNTLIHATTKIDIDPLITYVGVGYRF >NZ_CP041970.1|WP_005188669.1|1240096_1240414_+|multidrug-efflux-SMR-transporter MAWAYLILAGIFEIVWAYSMKMSDGFTKLTPSVITIVFMILSFGLLAVAMKSLPLGTAYTIWVGIGAVGAFLIGIFFLHEPMGFLRLLAAASIIFGVVLMKVTTH >NZ_CP041970.1|WP_032864497.1|1239453_1239897_+|BLUF-domain-containing-protein MKSVRLLYVSKIKNIDSNLKNDLIKILDEAVDFNYRNDIRGVLYYGHGYFVQCLEGQKHIVDDLFYNKIVKDERHINCEILYYTECENQFFSQWSMKFSPINQNISDFFLKYHLEEFNPYLLTAETVEKFVSVLAGEPEYDVQAYVS >NZ_CP041970.1|WP_155757459.1|1238392_1238974_-|LysE-family-transporter MFIGLIITILLTPGPTNTLLASSGIQAGIKRSLKLIPAEVIGYFIAITTWGFLLESVSHYVPWLPPLIKLLSATFIIYLAIKLWITSTKDLDLNQPLITSKALFVATLLNPKALLFASAIFPHTAWLNLHEYLVHMGMFLALITPIAFLWIAFGSILISNKVSWLNQRNLQRSAAFVLTFFAMPLAYSAISSF >NZ_CP041970.1|WP_005188660.1|1238134_1238344_-|hypothetical-protein MNTIKIKVKDQFEAEKIATAKVKAINDQEIPFFKRIEHIEVEGEILLPNMDLLFENPKDGSIYRYVGAA >NZ_CP041970.1|WP_159883840.1|1237090_1237972_-|DUF4882-family-protein MKKIFLGIFISVITIGNSFGECTYSLDASLQDIKNWQTSSNNRFPNYPRSFELIPNINQVEQKVSGPISFLSNTPVDHYATSKKLAVFKTQYPFTDKLPSNTSFIDKSVSPNGILVLESVIDIANLNVDMGTIKDSYEFGYSLMGASQQKLELGLDVVFGKYNNTTVYADGDYIHVTGGSFKPDGNGFTTLKEVERKTHKVTIPADGKVKVGIYVNQTTKQVGYIINGVNYGYLNINLQNAITSFGYSAGINQNNNANSLLIGKSVGLQLVTDHAKMQLTYPSGAKDICGTTL >NZ_CP041970.1|WP_151716737.1|1248074_1248536_-|hypothetical-protein MAEQNVITSMLDDLSQEQPIHTALCIGQQIDQNASIQWHYFSVTDFLSLPFTQRYDLGFVLFDTEEMQNLTETQKAQLLVKLRDLMAKRIVVVSKLDDEKLLRSLGFTQLIDKTQHDRDFALWQFNILTYKHVPDWFNSKFWANPENWNKFRW >NZ_CP041970.1|WP_004653389.1|1248573_1249443_+|DUF2797-domain-containing-protein MELQGICHKMHAALKTHSVTDQSTSKANVEYKFILDRSETDLPFVLGQEIEIEWTGNIFCTSCGAKTPKSYSQGHCFKCFKTKAECDLCIMKPETCHYHLGTCREDQFAHDVCFQPHIVYLANSSALKIGITRIVNMPTRWLDQGATQALPIMKVGSRRLSGHLETLIGTQIADKTDWRKLLKGEAEPLNLLEQRDQILEEFAPKIQSIREEFNQNLEFNESLEFLEDETPREFIYPVEHYPEKIKSLNLDKTPKIRGVLQGIKGQYLLFDIGVINIRKYTGYELILRA >NZ_CP041970.1|WP_167515357.1|1249485_1250664_-|lipid-A-disaccharide-synthase MLKQKLKIGIVVGEVSGDTLGVKLMRSFREQGIDAEFEGIGGPQMIAEGFHSYYPMEILSVMGIVEVLKDLKKLFAVRDGLVERWTEHPVDIFIGIDAPDFNLRLSKTIKEKQLPIKTVQYVSPSVWAWRQGRVHGIKRSVDLVLCLFPFEKTFYQNYEVAAAFVGHPLAKQLPLKNPITEAKHQLGLSAHKTHIALLPGSRRGEIERLLPLLTGAAEILHRKHPDLEFLIPAINDARKHQIEQGIQNLDTSLKSKIHVLENSDAESKIGRMVMNASDIVALASGTATLEAMLLHRPMVTFYKLNWLTYLIAKFMVKIPYYSLPNIIAGKKVIEELIQADAMPQHLATEIEKLMDHETAHIQMMQHLSMHKQLISGNTEDPVQAILNCLNAG >NZ_CP041970.1|WP_159883852.1|1250912_1251206_+|hypothetical-protein MAKSASIPLVYRLSIFYRFVLSFVLGYLCMMYLSISLTMLLTVVLDKAEAVYLAAFIATLFYLGFIIISFCANSLLKLTVISLILTGALFGLSVGLN >NZ_CP041970.1|WP_159883854.1|1251208_1252762_+|PepSY-domain-containing-protein MQNKGVRQSMAWLHAWTGLIFGWLVFAIFLMGTSSYYRHQINLWMQPQLAQYQVNQDIAIRTATDYLAKNATDAKSWYLNIANHEEPVNKMYWEKASGGYESRSLDANTGKELQLSATQGGDFFYNFHFQLYGVPIMVGRLIACLAAFIMLVALVSGIITHKKIFTDFFTLRTFKSQRSWLDFHNVSSVLALPFFLTITFTGLAIFFYLYLPWGMKKVYPDNPLQFFTEIRTVNQATTDTPPNKAEMLPINTLLEKVKQQWGEQALASIEVKNPNTDQAIITFKQLEDRSITLNQAQITFDGTGKILGNTRNNSAIATLHSGVYGLHMATFAQPILRFAFFCSGILGCLMIASGLLLWSLKRQIQNKSDQFHFGYYLVDRLNVAAFVGLPMAMLGYLFANRLAHITETTPNYEIYTFFSIWGLSFIIALLTKKQYLWKSQICIFGLIALALPVYNLVYLIQHQLITDLHSYWIFLRIDLFLLVCALFAVFIFRNIQPIQVKSAQKIKAKLAKNEVKA >NZ_CP041970.1|WP_159883856.1|1252758_1253037_+|DUF1634-domain-containing-protein MIILSLILTLIGMLLLYKCSSKQINKAKQQIFIHYQTHLKVLAYFCLLLAGSLLCLEYGNSIGFISWWIFATPVTFILVLSVNELRPTKKLK >NZ_CP041970.1|WP_151716742.1|1253093_1253285_-|hypothetical-protein MFNIKTLLLSTLLLATTVPAFAASDCCKEKEATTKKECCEKKMKCCDDKDKTASQEDHSHHGH >NZ_CP041970.1|WP_159883858.1|1253321_1253696_-|hypothetical-protein MSIFIRSLISLLIAMCFITNSYAMAVSMNEESQSAVAHVISNHAAMSDCGMPTMTKHDPMDSGKMDTSHCQKSLCCVAATFEHSHHSIERSIQLIKTVNSAYVDQLTLGIYQLPYRPPNHVLVL >NZ_CP041970.1|WP_151716744.1|1253912_1254800_+|TSUP-family-transporter MFGPIEFIMAGVLVGFCVGITGVGGGSLMTPILISLFKIEPHIAIGTDLLYASISKFCGSVVHAKKLNIVWPIVLWLSLGSIPASFATSWVLEHYLSQSTHYKAVLTMVLGFMLTLTGISIVFRAQIEKFFDKFRNREQADMESEQHALQHKRHYIVIMGVVLGIFVTLSSVGAGAFGIMALVLMFPNLPMIRIIGSDVVHAVLLTAVAGLSHMSSGNVDFTLLMWLLVGSIPAIIVGTLISSRMPERLIRKILGITLFALGVNFMVNPIKAKPKPVETHQAVVVQQTKHVTTIV >NZ_CP041970.1|WP_004653380.1|1254918_1256010_+|3-deoxy-7-phosphoheptulonate-synthase MNTLQSNPVSQPDIDDVNIKSIQTLITPAELKADLPLSDAASQTVLQGRATVRNILDGNDKRLFVVIGPCSIHDPKAAHEYADRLKVLSEKVKDTLYLVMRVYFEKPRTTVGWKGLINDPDMNDSFNIEKGLHIGRGLLIDLNEKGLPCATEALDPNSPQYYQDLISWSAIGARTTESQTHREMSSGLSSPVGFKNGTDGGLTVATNAMQSVKHGHSFLGLNENGQVAIINTKGNPYAHVVLRGGNGKPNYDATSVAEAEAALAKAKVSNKIMIDTSHANSNKDPYLQPLVLKNITEQILDGNKSIVGIMVESHLKGGRQDIPENLCDLEYGKSVTDGCIDWETTEKALLEMHEALKDVLPTR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP041970_2 | 2408573-2408746 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041970_2
|
3 spacers
spacers of NZ_CP041970_2
>2.1|2408597|30|NZ_CP041970|CRISPRCasFinder ACTTTAGCTTTCGTTGGTTGCTCTAAGAAA >2.2|2408651|18|NZ_CP041970|CRISPRCasFinder AACGCTGCTGCTTCTGAA >2.3|2408693|30|NZ_CP041970|CRISPRCasFinder ACTACTGCTGCTTCTGAAGCTACTACTGCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041970_2
The CRISPR arrays of NZ_CP041970_2 >merge|NZ_CP041970|2|2408573-2408746|CRISPRCasFinder GCTGTTGCTGCTGCTATTGCTACTACTTTAGCTTTCGTTGGTTGCTCTAAGAAAGAAGAAGCACCTGCTGCTGATGCTAACGCTGCTGCTTCTGAAGCTGTAGCTGCTGCTTCTGAAGCTACTACTGCTGCTTCTGAAGCTACTACTGCTGCTGTAGCTGCTGCTTCTGAAGTT >NZ_CP041970|2|2|2408573-2408746|CRISPRCasFinder GCTGTTGCTGCTGCTATTGCTACT ACTTTAGCTTTCGTTGGTTGCTCTAAGAAA GAAGAAGCACCTGCTGCTGATGCT AACGCTGCTGCTTCTGAA GCTGTAGCTGCTGCTTCTGAAGCT ACTACTGCTGCTTCTGAAGCTACTACTGCT GCTGTAGCTGCTGCTTCTGAAGTT
>NZ_CP041970.1|WP_005146524.1|2406889_2408158_+|transcription-termination-factor-Rho MNLTELKKKPIGELIKIAEFMGLEGMARNRKQDIIFAILKRHAMNGEEIFGDGVLEILSDGFGFLRSAAGSYLAGPDDIYVSPSQIRRFNLRTGDTITGTIRPPKEGERYFALLKVNQINYDTPENSRNKILFENLTPLFPTEQLVMELGNGTTEDLTSRVVDLVAPIGKGQRSIIVAPPKAGKTMLLQTIAQSIVRNNPEVFLIVLLIDERPEEVTEMERTVRGEVIASTFDEAPARHVQVAEMVIEKAKRLVEHKKDVVILLDSITRLARAYNTVIPSSGKVLTGGVDAHALERPKRFFGAARNIEEGGSLTIISTALIETGSKMDDVIYEEFKGTGNQEITLDRRIAEKRVFPAMNIKKSGTRREERLMDEDNLRKVWILRKLLHPMDELAAMEFLLDRMKETKTNDDFFDQMKRKAST >NZ_CP041970.1|WP_005184718.1|2406232_2406559_+|thioredoxin MSATIVNTTDSNFQADVLDAETPVLVDFWAGWCAPCKAIAPVLEDLSNEYAGKVKIVKVDVTACEDIAVKYNIRNIPALLMFKNGEVVAQQVGAAPRSKLAAFIDQNI >NZ_CP041970.1|WP_005184716.1|2404438_2405959_-|exopolyphosphatase MSDFLIDEELLAAIDMGSNSFHLAIARVDHGEVKKVASMSEKVQLAAGLDENKNLTEAAQQRGLACLARFVGRLSSVQANRLRIVATNALRQAKNGHEFIQKAAEILPKPIEIIAGREEARLIYLGVSHTMANGGRRLVVDIGGGSTEFIIGEEFEPLHTESLQMGCVAYSKTYFPDGEITSKAFDKAVVAARKEMSAIANTYKSVGWDTVVGSSGTIKACRQIAVNLGLSDEQENLTRDGLYKLKDRLLKFKHVTEIDFEGLREDRRAVLPAGLAILYAIFEVLDIDKLAYSDGALREGVMYDLLGRFKHEDIRDRSVQALMGRYNADPKQAERVVNTAQELFDGVANALNLTTEDSDLLRRAAYLHEIGLAISHGGYHRHGAYLLQHSDIPGFSQIDQNHLSHLVSHHRRKLRADAKNDVLKVGGSHLLYLCLLLRLAVLLNHSRSDQMLPAIELSVVNDQQWQLSVSGDAKQWPLLVADLHDEQVQFKHWDIELNIQSDKFVD >NZ_CP041970.1|WP_005146510.1|2403585_2404410_-|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-alpha MKNKATQSKAWATVQIARHPERPQFLDYVSEIFTEFDALHGDRLFGDDGAMIGGLARFDGQPVMVVGQHRGRSTREKLQHNFGMCNPEGYRKSQRLLDMAERFNLPVFTFVDTMGAYPGVGAEERGQAEAIATSLAQLSSLKVPVIATILGEGGSGGALGIGVADRVIMLSHSIYSVISPEGCASILWKTADKAAQASEALSLTADKLQALGIVEYVVDEGDGAHLQPEKVMHDLKDVLKQALDELQPMDAQERCDARYQRLMKFGSSNLGIAS >NZ_CP041970.1|WP_159885046.1|2402257_2403649_-|tRNA-lysidine(34)-synthetase-TilS MRRTLSTFNEVWQQQFRHRVLAQTQHFSEQTQFLIGCSGGMDSMLLLFLMSELFPTQTRAIYVDHQLQAMSAEWGRVVKQQSDVLNIPCIIQQVDVATGNLEQQARQARYQAYQQHLQSNEILVLAHHQQDQAETLLLRLFSGAGVHGLAAMQQIDIRQDMTIWRPFLDVSREQIEQWSQQLGFAYVTDPTNHDTHYDRAWCREELWDVLQKRFPKMQAAVARTSSLMQDAAEILDEVLQKDWQHCATDRVLDLIKLQQLSAARQRQLLSTWMKGADQYRPSYEMVQRLQHEVILAKPDAQATLHINQHYFVRYQKTLYRLTHDELYAEKLFSFPDTLSQQFDMGETINVAAGKFKIETQKIGLSSRLLGRELRLLKRQGGEKIHLYGRVGHWPLKKAIQELQILPWLRHTIQILVVDNVMLGVFSPKGFWLARSDYLEQGGWQPSLISDCNDVFQQSFSYDE >NZ_CP041970.1|WP_004804503.1|2401414_2402254_-|pyrroline-5-carboxylate-reductase MATTLNQNICFIGGGNMAQALIGGLLSRGLPTTRITVSDPVEQIRHILEEKNIQTTTDNVDAIKNADVVVLAVKPQVLATVLQPLKGLLSDKLVISIIAGAEIQTISDLIGGSQRIVRVMPNTPALVQTGAHGIYASEAVNAQDRELTSQILAATGLTIWVESEAQIDAVTAVSGSGPAYFFYLMESMIRAGKNLGLDEKVATALTLQTALGAAQMAITSSNSPAELRKNVTSPNGTTQAALEVFDRAQISQNIQAALAAAQKRSQELAQELSDKTKSV >NZ_CP041970.1|WP_005184711.1|2400828_2401398_-|YggT-family-protein MGASSALIFGVLINVAILLVFFRFLMQLAAVSPYNPVVLSTVKATKIVDVFSRIFPTIGKGRVNLAAVALLVVLYLLKMFGLMYLSGQMPHSAVYLVITTFVTMIQDLIRFCRYLIFATIILSWVVMFTQSRSPYIEVIQELAEPLLAPFRRLLPNMGMIDLSPILAFLALYVAEILMNEAAKVLLTGL >NZ_CP041970.1|WP_159885037.1|2399656_2400787_+|acyltransferase-family-protein MSFNQVQFKRFHSIDSLRCISIFLVLLHHFNIPYKLFDTSINFQIFGENITTLLARNGNYGVTMFFVISGYLITSHTIKRWGALHQINTRDFYISRFARIMPTLILLICLVNLFAALELKPFMTQAPNGIVVAQSTVNLAALTFWMNILIIENGWVNYALGVLWSLSVEEVFYLLFPLTALLFKKKPYFLFVCFTLIVFAPYFRYLHYGEESGAYLYHYFSSFDGIAFGCIAALIAPQLKLQAETWLGLKYLAIATMFIIYFSAPIKQNCIWGVSLFALATAIVIVANVANEHINTQTQRFKWLQEIGKNSYEIYLFHLIILGFFKLFYTPALTEGNIKLVLLLIYFVLAIGLGAFIARYFSNPLNRAIRQRLIKK >NZ_CP041970.1|WP_159885035.1|2396763_2399529_+|DNA-polymerase-I MPPFVLVDGSYFLFRAFHALPPLTTSTGLHTNAIRGAISAIQKLMRRTQPTHMAVIFDTPEPTFRHKLSPIYKGDRPSMPEELSQQIPYLHALIKAQGIPLYFLAGAEADDIIGTLTKRALAEGHHVLISTGDKDMAQLVNEHVKLEDSFKERVLDEAGVFEKFGVHPNQIIDYLTLMGDASDGIMGVPGVGAKTAAKLLNEYGTLNNIIANADQLKGKLSQNIKDNVDNIKVDHQLASIVCDLDLVLDWHDLKLANPNVDQLRELYTELEFRNQLQSLDHPNNPNSPAYQQTSQSIAKAEQKAEPVVAEDHANLSSQDDQLGNATYHTVLSQQDWDVLLQRMQQADHFAIDTETTNLDYRVAELVGFSVAFDAKDAYYVPVAHDYEGAPEQLNREQLLAQIKPILENEQVKKIGHHLKYDAHIFANHGITIQGWYFDTMLASYVLNAAATRHGMDDVARLYLSHLTTTFEQIAGKGAKQKTFNQIELEVAAHYAAEDAHVTYRLYEVLAAKLKAHPELVNILHNIEMPVARVLTGMEEDGIKLDHQFLDQLSVEFSETIQTLEAQAAELAGEAFNVASPKQVGEVLFEKLGLKGGKKTATGQYSTSESILEKIEHPLAEVILEHRGLAKLKNTYTDRLIEQSHDTTHRVHTSYHQALTATGRLSSTDPNLQNIPIRTPIGRQIRKAFIAPEGRVLLAADYSQIELRLMAHFSQDDALVHAFQQGQDVHRRTASEVLGIAIEDVTNDQRRQAKAVNFGLLYGMSEFGLTRQLGFSREESRSYIARYFQRYPGVLDYMERTRQIAREQGFVETILGRRLYTPDIMASNKMIKQAAERAAINAPLQGSAADIIKLAMIAVDKMLPKDQAKLLLQVHDELVFEADAAIADELSKQIAEVMQSVLEISVPFVVEVGQGPNWDAAH >NZ_CP041970.1|WP_159885033.1|2393713_2396575_-|DUF2339-domain-containing-protein MYKKDKQGIVIVLIALTVLLACAIAFKWQGTIVAAAIGLTVVIVHILSEIHQRLLQLEQAALNYSALGAGIGVQKIVIYAAALIALFAYANTWMWLAGGALLVLLLCLIQTISAFQTRLLHLEQVATQSLNPNISIQPQQQTSSIGQSAEWVETTASNSPIEQQPAWLQARPESVQSPILQNSSSAVHPSESKQAAWWQPALDWMIHGNPILRVAVAILMVGVILLLRFASEHWQLSLGVKLGFIAIAGVATTVAGYLLQKKNQLFAVALQGVGLAVVFLTLIFSHHFAVIASLSTASILFVILLLATVYLSLKQHALYLAMLALTMAYLAPLVIPQNHPDVIFLFGYYFVINLAVVALNFIQPWKILHQIAFFATMFIGGSTIGIYAKTAQFDTLDIILWLHIALFIWLSIRYSQLMLRAQNAQQQTDQRSERLQPILDVGLIFSVPVLGFSLHAYLMHNSTSALTSGAVALAIVYISLNIWIKRQHPQLSILAKSFFILAVVFVALIFPLAKGAHWTSTGWVIQGTALIVWGVTERYRLSRYVGVALVLLSSVALLFQVWSNDHFPILSTAIFALAQFISAFYLLHYQEVEKYFSARMLSGVFLALGLYSGAIAAVELMQWQHDGLSPYLAVAAILLALFSLAVHIKSRLQWANVQLILLGALLALLYGESFAQHVYVVWHWSSRLDQVMFAIASITITLILSSLSTHTSKATVMLWSALLWLSLASIGLAIFPIMPLVAFAIIPAIYSIWRFTSNKTELLHQLPIWCLTLFWLVLVSLDPYSAEQYYFIPLLNLTDILSLLMFFGLIWMIYHHDFSAERSIEWGFKVTTILIGLLVLSSVVVRAMHHYLGTPLWSAAIWSNGDVQLSLTLLWVILAFILMTFSSRRHIRQIWFVGAALLGIVVAKLLLLDLSQSGTLTRVISFIGSGAVMLVIAYLAPLPPALSETKKES >NZ_CP041970.1|WP_000126166.1|2408881_2409178_-|integration-host-factor-subunit-alpha MTALTKADMADHLSELTSLNRREAKQMVELFFDEISQALIAGEQVKLSGFGNFELRDKRERPGRNPKTGEEIPISARRVVTFRAGQKFRQRVGNEQID >NZ_CP041970.1|WP_159885048.1|2409174_2411556_-|phenylalanine--tRNA-ligase-subunit-beta MKISENWLRTWVNPAIDSEALSDQLTMLGLEVDELAPVAKPFTRVVVGEVLTVEQHPDADRLRVTTINIGSGEPLQIVCGAPNVRVGMKAPVATIGAVLPGDFKIKKGKLRGVESQGMLCGASEIDLEDKIDGLLELPADAPVGMNIREYLKLDDNVIDISITPNRGDCFSIRGIAREIAVINQLKMNEPEIQSVPATITDEKAVTISTEGTPRYLGRVIKNVNVKAATPEWMEQALARSGIRTHSILVDITNYVLLELGQPMHAFDLAKIEGSIQVRQAKAQEKLTLLNDQEVELQDDMMVIADDQKVLAIAGIMGGLDSSVTDDTQDIFLESAFFAPLAIAGRARRFGLHTDSSQRYERGVDFELPMIAMHRASDLIQAFAGGEFGPITVAEQVALLPKREAIELKQAQVDQLLGYQVAGDFIADALTRLGCVVETQAQGEWRVVPPSHRYDMAIYQDLIEEVARIDGYDNIQISLPKIDAKLEKYQDRFEISQLRQTVATLGYQEAISFSFADAKLEKQLNPNVQPLMLANPISSDLAAMRSTLLSSLIPCVQYNLNRQQQRVRFFELGLRFDYQNAQSIHDLKQIPTLALIAVGSRTPESWHAKPQVMDFFDFKGEVEEILAAGRISVEFVRTERAWLHPGQSAEILVNGQSIGYLGRLHPSLQNELDLDTTWVAELDQQAVLQSYVSNFTELSRFPSVRRDIALLISDNIEVRDIQRLIEQTGGELLDSTWLFDVYTGQGVEQGKRSLAFAVLWQHPTRTLEDAEIKSGMDNIIQVLEDTYQATLRAS >NZ_CP041970.1|WP_005146537.1|2411589_2412570_-|phenylalanine--tRNA-ligase-subunit-alpha 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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NZ_CP041970_2 | 2.3|2408693|30|NZ_CP041970|CRISPRCasFinder | 2408693-2408722 | 30 | AP014400 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C28-MedDCM-OCT-S24-C124, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***, 3 ordered pieces | 5630-5659 | 5 | 0.833 |
NZ_CP041970_2 | 2.3|2408693|30|NZ_CP041970|CRISPRCasFinder | 2408693-2408722 | 30 | AP013556 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGR-C28-MedDCM-OCT-S32-C64, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***, 6 ordered pieces | 6804-6833 | 5 | 0.833 |
NZ_CP041970_2 | 2.3|2408693|30|NZ_CP041970|CRISPRCasFinder | 2408693-2408722 | 30 | NC_031245 | Bacillus phage SP-15, complete genome | 38481-38510 | 5 | 0.833 |
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NZ_CP041970_2 | 2.3|2408693|30|NZ_CP041970|CRISPRCasFinder | 2408693-2408722 | 30 | MT774400 | CrAssphage cr4_1, complete genome | 357-386 | 6 | 0.8 |
NZ_CP041970_2 | 2.3|2408693|30|NZ_CP041970|CRISPRCasFinder | 2408693-2408722 | 30 | MT774407 | CrAssphage cr125_1, complete genome | 60382-60411 | 6 | 0.8 |
NZ_CP041970_2 | 2.3|2408693|30|NZ_CP041970|CRISPRCasFinder | 2408693-2408722 | 30 | MF360958 | Salicola phage SCTP-2, complete genome | 76361-76390 | 7 | 0.767 |
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1. spacer 2.3|2408693|30|NZ_CP041970|CRISPRCasFinder matches to AP013557 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGR-C28-MedDCM-OCT-S41-C64, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***, 3 ordered pieces) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
actactgctgcttctgaagctactactgct CRISPR spacer tgtgctgctgctactgaagctactgctgct Protospacer *.******** ***********.*****
2. spacer 2.3|2408693|30|NZ_CP041970|CRISPRCasFinder matches to AP014400 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C28-MedDCM-OCT-S24-C124, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***, 3 ordered pieces) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
actactgctgcttctgaagctactactgct CRISPR spacer tgtgctgctgctactgaagctactgctgct Protospacer *.******** ***********.*****
3. spacer 2.3|2408693|30|NZ_CP041970|CRISPRCasFinder matches to AP013556 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGR-C28-MedDCM-OCT-S32-C64, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***, 6 ordered pieces) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
actactgctgcttctgaagctactactgct CRISPR spacer tgtgctgctgctactgaagctactgctgct Protospacer *.******** ***********.*****
4. spacer 2.3|2408693|30|NZ_CP041970|CRISPRCasFinder matches to NC_031245 (Bacillus phage SP-15, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
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5. spacer 2.3|2408693|30|NZ_CP041970|CRISPRCasFinder matches to MT774404 (CrAssphage cr114_1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
actactgctgcttctgaagctactactgct CRISPR spacer attaaaactgctgctgaagctgctactgct Protospacer *.** .***** ********.********
6. spacer 2.3|2408693|30|NZ_CP041970|CRISPRCasFinder matches to MT774400 (CrAssphage cr4_1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
actactgctgcttctgaagctactactgct CRISPR spacer attaaaactgctgctgaagctgctactgct Protospacer *.** .***** ********.********
7. spacer 2.3|2408693|30|NZ_CP041970|CRISPRCasFinder matches to MT774407 (CrAssphage cr125_1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
actactgctgcttctgaagctactactgct CRISPR spacer attaaaactgctgctgaagctgctactgct Protospacer *.** .***** ********.********
8. spacer 2.3|2408693|30|NZ_CP041970|CRISPRCasFinder matches to MF360958 (Salicola phage SCTP-2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
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9. spacer 2.3|2408693|30|NZ_CP041970|CRISPRCasFinder matches to NC_010418 (Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
actactgctgcttctgaagctactactgct CRISPR spacer ttagctgctgctgctgaagctactaaagca Protospacer . .******** ************ **
10. spacer 2.3|2408693|30|NZ_CP041970|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP006909 (Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
actactgctgcttctgaagctactactgct CRISPR spacer ttagctgctgctgctgaagctactaaagca Protospacer . .******** ************ **
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
363528 : 374329
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP041970|363528:374329|DBSCAN-SWA CATGATTACAAAAATAACTTATCAGCCATGGTTACAAGCAATTTTAACCATTGCCAAGCATTATCGAATTGAACCCTCTGAGGAACGGATTCGCTTACAACTAGACTGGAACCAGAACCAAAATTTGGATGAAGTTTTGGTACTCATCAGTCGACAGATTGGTTTAAACCTAAGAAAGGTTGCTTTTACCAATGAGGTGATCAACCCTTGGAGATTACCAGTTCTTGTAGAATTGGCTGATGGACAAGTCGGCGTAATTGATAAGGCTGATGGAGCGGGTCATGTCAGTATCCAGCTCAGTGGCGATCAAGGCTTATCACAGAAATTTGCAGTCGGTGCGTTAAAACATATTATTAAAAATGTGTATGTACTACGTCCTGAACAGTCTGTGCCTGATGCACGTGTTGATGAATATATCAAACCCTTTGAGCAAAGCTGGTTCTGGTCGATTGTATTGCAAGATTGGAAACGCTATATCGATATCATGCTGGCGTCGATGATTGCGAATATTCTGGCATTAGCAACGATCATATTTTCCATGCAAGTCTATGACCGTGTGGTGCCATCACAATCAGTTCCTACGCTTTGGGTACTGGCAGGTGGTGTACTGATTGCGGCCATTTTTGAGTTTGTGTTAAGACTATCCCGTGTTTACATTTCCGACATTATTGGTAAACGTGCGGATCTACGCATTTCAGATCGTGTTTTTGGTCATGCACTAAGAATTAAAAACAGCGAACGCTCTAAATCAACCGGGACTTTTATTTCACAAATTCGTGAATTAGAGGGGGTGCGTGAGCTGGTTACCTCAACAACGATGGGTGCAATTGCAGATTTACCATTCTTCTTCTTATTCCTTGCAATTTTTGCGGTGATTGGCGGCAACTTATTCTGGGTGATGTTATTGGTTGTTCCTTTAATGATCTTACCTGCGATTTTGGCTCAAAAGAAATTAGCACAGTTGGCACAAGAAGGGATGCGCGAATCTTCGATTCGTAATGCAATCTTGGTTGAAGCGGTGCAAGGGATTGAAGATATTAAGTTATTGCGTGCGGAGTCTCGTTTCCAAAACCAATGGAATCACATGAATGAAGTATCTGCTGATATTAGTATGCAGCAGCGCAAGATTGTGGGTGTGCTCACTGCTTGGACACAAAAAATTCAAGGTTTAACGTATGCTGCTGTGATTCTGGTTGGTTGTTTTGCAGTCATGAAAGGAGATATGACGACTGGTGCATTGGTTGCTTGTTCGATTTTATCTTCTCGTATGTTGGCACCGATTTCACAAATCACAGGAATTTTAGGTCGTTTACAACAGGCAAAAGTAGCGAAAAAAGGCCTTGATGAGTTGATGAAGAAACCAGTCGATCAGGCCGATCAAGCACATCTGGTTCATAAAGAAGTATTGCATGGTGACTACGAACTGAAAAATGTTGCATTTCAATATACTGAAGATGATCCACGACCAAGCCTTGCGATTCCTCACCTTAAAATTCGTGCAGGTGAGCGTATTGCGGTCTTGGGGCGTAATGGTGCGGGTAAATCAACACTCTTGCAGATTTTATCTGCGATGCAATTTCCAAATGCAGGTTCAGTACATTTAGATGATTTGGATATTAGCTTGATTGACCCTGCTGATGTTCGTCGCGATATGGGCTTACTGAATCAGAACTCGCATTTATTTTATGGCACCATTCGTGAAAACTTGACCCTTGGTGCGCCTTTAGCACGTGATGAAGACATCTTAAAAGCCCTGAAAGTTACTGGAGCACTCAGCTTTGTACATGAGAAGAAAGAAGGGTTGGACCATTTGGTTTTAGAAGGGGGCGTAGGCTTTTCTGGAGGACAAAGACAAGCTTTATTATTAGCACGTCTATTAATTCGTCAACCGAACATCTTATTGTTGGATGAGCCGACAGCTGCGATTGATGATGTGGCTGAGAAACAACTGATTGATCATTTGAGAACTTGGTTAGGGTATCGAACTTTAGTCGTTGCAACACACCGACGTGCTGTCTTGGAATTGGTTGATCGAATTATTGTCATGAATGAAGGCAAAATTGTCATGGATGGACCAGTAGACCAAGTTTTACAACAATCATCTATAAAACAAAAAATAGTTTAATATTTAGAGGAAAATGTATGAGTGAACAACAACAAAACAGCAGTCGTCCAATGAATGTAACTTATAAGGAACCTAAGTTACCTCGTTCGACACTCGTTGTTTGGATGATTGGGATTGGCTTACTTTCTCTCTTAATCTGGGCGTGGTTATTTAATCTAGAAGAAGTTTCAACAGGTACTGGTAAGGTTATTCCATCTTCAAAAGAGCAAATTATTCAATCACTCGAAGGGGGAATTCTTACCAAGCTAGATGTGAATGAAGGAGATATCGTTGAAAAAGGGCAAGTCCTTGCACAGCTTGATCCTACTCGCCTTGCATCAAATGTTGGGGAATCTAAATCTTTATTAATCTCTGCGCAGGCAACCGCAGCGCGTTTACGTGCTGAAGTAAATGGCACACCTTTAAGCTTCCCTGAAGAAGTTCAAAAAAATCCTAAGCTTGTACAGGAAGAGACGGCACTCTATGTATCACGCCGTGCCAATTTAGACCAGTCCATTGAGGGGTATGAACAGGCTGCTAAACTGGTAAGACAAGAGCTTGCGATGACTGAGCCATTGGTTGCAAAAGGAGCAGCCAGTGAGGTTGAAGTATTGCGTTTAAAGCGAGAAGCTAACGATTTAAACAATAAAATCAATGACACACGAAATCAATATTATGTAAAGGCTCGCGAAGAATTATCTAAGGCCAATACGGATATACAAACTCAGCAACAAGTGGTGAACGGTCGTAATGACAGCTTGTCACGTGCAGTATTTAAAGCGCCTGTACGTGGTGTCGTGAAAGAAATTGATGTCACAACATTAGGAGGGGTTATTCCTCAAAATGGTAAGCTCATGACGATTGTCCCTTTAGAGGATAAGTTGCTGATTGAAGCGCGTATTTCACCACGAGATATTGCTTTTATCCATCCAGGGCAAGAAGCCTTAGTCAAAATCACAGCCTATGATTATTCTATTTATGGTGGTCTAAATGGTAAGGTTACTGTGATTTCACCAGATACCATTCGTGATGAGGTGAAGCAGGATCAATTCTATTATCGTGTCTATATTCGTACTGACTCAGACCGTTTATACAACAAAGCCGGTAAAACTTTCAGCATTACCCCAGGTATGGTGGCAACTGTTGATATTCGTACTGGACAAAAAACCATTATGGATTACTTGTTGAAACCGTTTAATAAAGCCAAAGAAGCTTTACGCGAACGCTAATTTACTGTTGATAAAAAACCTCGCATCATGCGAGGTTTTTTATTTGTGTTGTAAAAAGCTATAATCGTGTTTTAAATTTTTATTCATATTCTATGCCATTCACCCTTGCCAGTTCGGTAACTTTTGAAGAAGATATTAAAAAAAGTCGCTTCCAAGCGATTGCAGCAGTTGTTGAAAATGAACAACAAGTGAAAAGTTTTTTAGAACAAAACAAGGACTTGTCCACCACGCATCAATGCTGGGCATGGAAGATCGGCCATCATGTTCGTTTTAATGATGATGGCGAACCTTCAGGAACAGCAGGGCGGCCAATACTTGCCACCATTGAAGGTAATGATTTAACCAATGTGATTGTATTGGTGAATCGTTGGTATGGTGGAATTAAACTGGGTACAGGTGGTTTGGTTCGTGCCTACGGTGGTTGCGCAGGACAATGTTTGCTCTTGGCAGAAAAAATCGAATTGATTGAAAAGAAAGAAATTCGTTTTGCGTGTTTGTTCAATGAATGGGCGATTATGCAATATGAGCTGATGCAGCAACAGATCGAGTATCAAGAACAATATACCGAAACAGGTGTCGTGATTGAGGCACGAGTTCAAGTGCATCAAATTGAACCATTAAGGTTAAAACTGCAAGATGTGAGTAGAGGACGTGAGCAACTGAAAGTCCTAGAGGAACACGCACATGATGAATGATCCTTTATTAAAATACCGAGAGCAGCATAAGCAACGTTTGAACTATATGCCGTGGCTATATTGGACTTTAAAACCCAAACATCGCGAATGGGCTGAAGCATGGCAAGCCGAGTACCAAGCCTATTTGATGGATATGGAAACGGTTGAAATCGGTCAAAACTGCTTTATTTCACCCTTGGCCCATATCTTTGCTGAACGTGGTCGCAAGATCAGTATCGGAGATAATACCTTTATTGCTGCAGATTGTACTTTGCATGGTCCTTTAGAAATTGGCAATGAAGTGGCAATTAACCATCATTGTATTTTAGATGGCGGTCGTAGCGGGATTAAGTTACATGATCAAGTTCGAATCGCGGCTTATAGTCATTTATATGCATTTGATCATGGCATGGAAATGGATCGTCCGATCTATCAACAACCCGTTACATCTAAAGGCATTGAGATTGGTCGAGATGTCTGGCTAGGAGCGCACGTTGGAATTAAAGATGGAATCAAAATTGGCGATCATGCTGTAGTGGGAATGAACAGTATGGTGACCAAAAATGTTGAGGATTATGCAGTGGTTGCAGGGAACCCCGCAAAATTAATTCGTTACCGAAGCGAATAAAAAAGTGTATGAGATTCGATACATAAATTTAACCCACCATGCTTTTATCTATGTTAAGTTAAAAATAAGTAGAAGACCTAAGGTACATACCTAGAGAGAGGCGAAAATGAACCGTGTAATTGCATGTATTGATTCTTCACCCTGCATTGATGCTGTTGCGGAAGCAGCAGTATGGGTTGCGAAACAAACGCAAAGAGAGTTGGTACTGTTGCAAATCTTGGACTATTACCCAGCTAGTTATCATTTAGGTGAAATCAGTGGCGTGATTGGCTTTGAAAGCAATGCCATGCTGCTCAAAGAACTTGCAGAGCTAGAACAGAAACAAAGTGAGCTAGCGCTCGATTATAGTAATAATTTACTCAAAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP041970|363528:374329|371359_371536_-|WP_167515351.1|DBSCAN-SWA MSRGDKSAYTAKQKRQAKHIEESELEQGHSQEEAERIAWATVNKQDGGGLKKKHKSSH >NZ_CP041970|363528:374329|366952_367555_+|WP_159882718.1|DBSCAN-SWA MPFTLASSVTFEEDIKKSRFQAIAAVVENEQQVKSFLEQNKDLSTTHQCWAWKIGHHVRFNDDGEPSGTAGRPILATIEGNDLTNVIVLVNRWYGGIKLGTGGLVRAYGGCAGQCLLLAEKIELIEKKEIRFACLFNEWAIMQYELMQQQIEYQEQYTETGVVIEARVQVHQIEPLRLKLQDVSRGREQLKVLEEHAHDE >NZ_CP041970|363528:374329|367544_368162_+|WP_159882720.1|DBSCAN-SWA MMNDPLLKYREQHKQRLNYMPWLYWTLKPKHREWAEAWQAEYQAYLMDMETVEIGQNCFISPLAHIFAERGRKISIGDNTFIAADCTLHGPLEIGNEVAINHHCILDGGRSGIKLHDQVRIAAYSHLYAFDHGMEMDRPIYQQPVTSKGIEIGRDVWLGAHVGIKDGIKIGDHAVVGMNSMVTKNVEDYAVVAGNPAKLIRYRSE >NZ_CP041970|363528:374329|368268_369111_+|WP_005183477.1|DBSCAN-SWA MNRVIACIDSSPCIDAVAEAAVWVAKQTQRELVLLQILDYYPASYHLGEISGVIGFESNAMLLKELAELEQKQSELALDYSNNLLKHISELIEKQYGLTSTKIQEKGDFLEQSFNLLNENDVVIIGRVGERAAEKNKPIGSNVENFIRGANCTVITVGEHFQPPKRFIFAYEYSPTCQKMLQRIAQSDLLKTLQCHLLYVGDHPEMLAEPEKYLTDAGLEVVSVYRYGDVAQNILEYQREHDIQLIVLGAFSHSKIHQFFLGSITTTIFRNANVPLLVAK >NZ_CP041970|363528:374329|369230_369899_-|WP_005183472.1|DBSCAN-SWA MQQMWTEIDDYINSHLIPTDPRLQHALDNTDTQGFSNHLAVAPNQGMFLQMLIQMNQCKRVLELGTFGAYSTIWLAKALPEDGYLLTVEGRDTHVIIAQENIDYANMPTNIELKKGRGADIMNQLIAEGSEAFDLIFIDADKQSYREYFELSLKLSHPGTIIVLDNVIRAGAIIDENNKKPSIEGIREAFTALKDHPQLLSCTALQTVGSKGHDGFAIAIVK >NZ_CP041970|363528:374329|370033_370693_-|WP_167515383.1|DBSCAN-SWA MVGCTSSTTKVNQNQGKRIYIPQEQVTFTRPIPNKVEPASYRQWLNQGDNYARVREYEQFLNRNNVAHIVPSFELLRTARDWQKCGRSEYMVPNRELWGNALPTLRVFKYLVAAKVLTDFEVTSVYRDLPLNQCAGGAGSSKHLFNSAIDFRIGPEYPQPQDYAFIEQTKFKLCQFWAQHGQSLDLGIGLYSSGQIHIDSQGYRTWGPDLTRNSSMCNF >NZ_CP041970|363528:374329|365669_366860_+|WP_005183484.1|DBSCAN-SWA MSEQQQNSSRPMNVTYKEPKLPRSTLVVWMIGIGLLSLLIWAWLFNLEEVSTGTGKVIPSSKEQIIQSLEGGILTKLDVNEGDIVEKGQVLAQLDPTRLASNVGESKSLLISAQATAARLRAEVNGTPLSFPEEVQKNPKLVQEETALYVSRRANLDQSIEGYEQAAKLVRQELAMTEPLVAKGAASEVEVLRLKREANDLNNKINDTRNQYYVKAREELSKANTDIQTQQQVVNGRNDSLSRAVFKAPVRGVVKEIDVTTLGGVIPQNGKLMTIVPLEDKLLIEARISPRDIAFIHPGQEALVKITAYDYSIYGGLNGKVTVISPDTIRDEVKQDQFYYRVYIRTDSDRLYNKAGKTFSITPGMVATVDIRTGQKTIMDYLLKPFNKAKEALRER >NZ_CP041970|363528:374329|370870_371200_-|WP_005145598.1|DBSCAN-SWA MTFVVTENCIKCKYQDCVEVCPVDCFYEGPNFLVINPDECIDCALCEPECPANAIFSEDELPEGQEVFIELNAELSEKWAGNNITQIGEQPADREDWNGKPDKLQYLEK >NZ_CP041970|363528:374329|371671_374329_-|WP_159882724.1|DBSCAN-SWA MNSAEIMADLSSHTPMMQQYLKVKTDYQHALLFYRMGDFYELFFEDAHLAAKLLGITLTHRGKASGQPIPMAGVPYHAAEGYLARLVKAGRTVAICEQVGEVTGKGPVERKVVRILTPGTLTDDALLGSYQSSNLVALCIQQNQIGFALLDLSAGIFKVQQQDYKPEQLAIELARLMPSEILIDEDLIDKNIIEQIKKNLDCPITKRPNVDFNLNNAQKTLCDQLSVSTLSGFGLDPIPLARAAAAALIHYAKETQKTALPHIRSIQIEQSTDFIALDPITRRNLEIIEPLFDHGTSLFQLINDCQTAMGGRLLSRTLMQPIRDTAVLDARLDATEQLLKGYHESPLRLVLKEIGDIERVLSRVALGSARPRDLVQLRQACAQIPFLRHTLDPVLKTQQSKLLVQLDEELGDFKSLHQHLMAAIVESPPVLLRDGNVIAEGYDDELDELRKIRDHAGQFLIDLEIKERERTGINTLKIGYNRVSGYYIELTRAQAEQAPADYIRRQTLKNAERYITPELKGFEDKVLSSESRALAREKLLFESLLDELRQNIAHLQMMSAAIAYIDVLANFAHQARLNNWARPEYTPETSIKIQAGRHPVVEALNKAPFTPNDTFLDSQHRMAIITGPNMGGKSTFMRQTALISLLAYCGSFVPAKSAKLGSIDRIFTRIGSADDLSTGKSTFMVEMTETSQILHHATSQSLVLMDEVGRGTSTYDGLSLAWACVVDLTKRVKCLCLFATHYFELTELGSEAGIDNYHVTAQELNGNLILLHKVQHGPASQSHGLQVAKLAGIPANVIKEAQKRLKILEKQQHQHLQSSVQNDLFSAVEHEIETQVVEKVIEVEAKSPALELLQNIDVDDLTPRQALEQLYQLKALYKTTQTLES >NZ_CP041970|363528:374329|363528_365652_+|WP_151716273.1|DBSCAN-SWA MITKITYQPWLQAILTIAKHYRIEPSEERIRLQLDWNQNQNLDEVLVLISRQIGLNLRKVAFTNEVINPWRLPVLVELADGQVGVIDKADGAGHVSIQLSGDQGLSQKFAVGALKHIIKNVYVLRPEQSVPDARVDEYIKPFEQSWFWSIVLQDWKRYIDIMLASMIANILALATIIFSMQVYDRVVPSQSVPTLWVLAGGVLIAAIFEFVLRLSRVYISDIIGKRADLRISDRVFGHALRIKNSERSKSTGTFISQIRELEGVRELVTSTTMGAIADLPFFFLFLAIFAVIGGNLFWVMLLVVPLMILPAILAQKKLAQLAQEGMRESSIRNAILVEAVQGIEDIKLLRAESRFQNQWNHMNEVSADISMQQRKIVGVLTAWTQKIQGLTYAAVILVGCFAVMKGDMTTGALVACSILSSRMLAPISQITGILGRLQQAKVAKKGLDELMKKPVDQADQAHLVHKEVLHGDYELKNVAFQYTEDDPRPSLAIPHLKIRAGERIAVLGRNGAGKSTLLQILSAMQFPNAGSVHLDDLDISLIDPADVRRDMGLLNQNSHLFYGTIRENLTLGAPLARDEDILKALKVTGALSFVHEKKEGLDHLVLEGGVGFSGGQRQALLLARLLIRQPNILLLDEPTAAIDDVAEKQLIDHLRTWLGYRTLVVATHRRAVLELVDRIIVMNEGKIVMDGPVDQVLQQSSIKQKIV |
10 | Bacillus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
856018 : 888509
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP041970|856018:888509|DBSCAN-SWA 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47 | Pseudomonas_phage(34.48%) | integrase,head,tail,plate,transposase | attL 859033:859049|attR 883048:883064 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
3672584 : 3758618
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP041970|3672584:3758618|DBSCAN-SWA 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98 | uncultured_Caudovirales_phage(66.67%) | holin,capsid,protease,integrase,terminase,head,tail,tRNA,plate,portal | attL 3684996:3685013|attR 3702932:3702949 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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