Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP044367 | Lactobacillus paracasei strain TD 062 plasmid unnamed6 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP044363 | Lactobacillus paracasei strain TD 062 plasmid unnamed2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP044366 | Lactobacillus paracasei strain TD 062 plasmid unnamed5, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 6 | 0 |
NZ_CP044361 | Lactobacillus paracasei strain TD 062 chromosome, complete genome | 1 crisprs | DinG,DEDDh,csa3,cas3,WYL | 0 | 0 | 12 | 0 |
NZ_CP044362 | Lactobacillus paracasei strain TD 062 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP044364 | Lactobacillus paracasei strain TD 062 plasmid unnamed3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP044365 | Lactobacillus paracasei strain TD 062 plasmid unnamed4, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP044361_1 | 1648904-1649005 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP044361_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP044361_1
>1.1|1648928|54|NZ_CP044361|CRISPRCasFinder ACCGCGCCTACTCACGCTCTAAACGCAATGGCCAAAGCCCTACCATCACGTTCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP044361_1
The CRISPR arrays of NZ_CP044361_1 >merge|NZ_CP044361|1|1648904-1649005|CRISPRCasFinder AGGCCGCTTATGCTCCGGTTTCTAACCGCGCCTACTCACGCTCTAAACGCAATGGCCAAAGCCCTACCATCACGTTCAGGTCCGCTTATGCTCCGGTTTCTA >NZ_CP044361|1|1|1648904-1649005|CRISPRCasFinder AGGCCGCTTATGCTCCGGTTTCTA ACCGCGCCTACTCACGCTCTAAACGCAATGGCCAAAGCCCTACCATCACGTTCA GGTCCGCTTATGCTCCGGTTTCTA
>NZ_CP044361.1|WP_003565122.1|1648102_1648747_-|HAD-family-phosphatase MTTTIIFDLDGTLVNTEALYLKSNVKAAAQLGLHRTEADFRPLVGAAGPSEAKVIADMIGAEHAAWFQKFSTADVLDQIQGGADFVLPNVQPTLAALTTAGYPLALATSSPRHYVDVVLAATGWQRQFHPILTGSDVQAHKPDPEMYEAMKVKLGNVPAVVVEDTHVGVEAAVGAGLPVVMIPGIAQKPDSKATAILSSISELPAWLKNQPAFA >NZ_CP044361.1|WP_159301207.1|1647372_1648041_-|DNA-repair-protein-RadC MADAAELPRERLLAHGPRALTDAELLQLVVRAGNQHYPVKQIVSEVLATYPKLQGLAEGDQGLLEHIRGLGAAKRASILAGVELGRRAMQRQTVRYGQIKNSEQLGKTMISRFAGVNQESMLILFLDVKNQIITEQIAAIGTVDSAMADPRIVFREALKLSATNLIMVHNHPSGDPSPSQADRDTTTRFQLAAALLGMHLIDHLIVGGERYYSFARDDPEFN >NZ_CP044361.1|WP_003565127.1|1646231_1647233_-|rod-shape-determining-protein MFGFGSKNIGIDLGTANTLVYVDGKGIVLNEPSVVAKNTQTEEVIAVGEEARDMIGRTPTNIVAIRPMKDGVIADYDTTAAMLKYFMQKALGNGSHPQVMICVPSGVTEVEKRAVIDAAKVAGARDAFVIEEPYAAAIGAGLPVMDPTGSMVVDIGGGTTDVATISLGGIVSSRSIRVAGDKFDEAIINHLRQNFNLLIGERTAEAMKIQIGSASVEKAKDIDGMTVRGRDLLSGLPKTIEISATDIASAIHENVLDIITAIKETLEETSPEIAADVIDHGIVLTGGGALLKHLPDVISDETKVPVFIAQDPLDCVAIGTGESLKNIDVLKKR >NZ_CP044361.1|WP_003565129.1|1645282_1646143_-|rod-shape-determining-protein-MreC MQKFFSNKKLIALMIALLVSLGLIAGSMYASNNRNTPPFIQRIANDVVGIGGRLVAIPGDFARNGLDDINNLLDTFQENQRLKSQLDNLAQTKVQVQTLKRENKQLKTQLKLNGTLTDYSQISAAVILRTPSDWRNMVVINQGSAAGVKKGMPVMAGSGLIGRVVEVNRTNAKVEMLSTANKSSDRIAAAVETKGDKEVNGIITGYDEKSGDLILGELNTDTDIKKGDDVVTSGLGGMTPKGLLIGKVASVKKDDYGLANSVYLTPAASLNDVTVVTVISRTIAGD >NZ_CP044361.1|WP_003574845.1|1644750_1645281_-|rod-shape-determining-protein-MreD MLNEKHFTGHWWVVLLLLLLMLIDGSLASVLAQWIMRPNFMGTPQLTLLGLIMITLFVPEEKYITWIAAIIGLLFDTFYTGILGVNALLFPLVIYTIRQIRPYIPRTPVFVGMVYIIGLLLYGIANYIMNRFIGFGTGNVVMLIANHLGPGLTVNLALFVIVYGPLHRLLDNLAEE >NZ_CP044361.1|WP_003565132.1|1644080_1644737_-|cell-division-inhibitor MDSVVLKGRNDGLALQLQDTADFEQIMRTLKTLLGKLYEETPTGDVSYRLETGNRLLTEEQLADIQKIFADFPRFSINGVVSAVIDKTVVNEMIAAKTTHRIGGVIRSGQTIDLMGDVLFLGDLHSGATLCASGNIFVMGQVGGVVQAGSQGDARAVVVGDLKGAGQIRIADVVEIVADHYDPDRPVAYLNELHTMTHAGLADLASIRPRLFKQMEAM >NZ_CP044361.1|WP_003565134.1|1643282_1644080_-|septum-site-determining-protein-MinD MGTALVVTSGKGGVGKTTSSANIGTALALQGKRVVLLDLDIGLRNLDVVMGLSNRIIYDIVDVATGRAKLHQALIKDKRFDDLLYLLPAAQNAEKDALEPEQVVEIVEQLRPDFDFIILDSPAGIEQGFRNATGAADGAIVVTTPEISAVSDADRVVGLLEQREMPIKPRLVINRIRQNMLADGRSMDIDEITSHLGLDLLGIIVDDDGVIASSNKGEAIVMNPDDLASKGYRNIARRLLGDSVPLMDIRIKKQGFWSKLFHRHD >NZ_CP044361.1|WP_159301206.1|1641960_1642617_-|ABC-transporter-permease-subunit MSYIFQILPALLSGVKMTLGIFAITLIGSIPLGLILSVGLIPKPKSILGKAGKGLLEGYVWVFRGTPLLLQLMFIFYGLPIIGLVFDRFSAALVAFILNYAAYFAEIFRGGFGAIDEGQFEASTVLNMTRWQALRYVVIPQLVKIVLPSIGNEVINLVKDSSLVYVIGLGDLLRAGNIASARDVTLVPLVLVGIIYLLLTLILTFLQKRIESAFSYYR >NZ_CP044361.1|WP_003565139.1|1641309_1641948_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MLELKQINKSFNGQPVLVDINVTIEDGKTLAIVGPSGAGKTTLLRIISGLETADSGTMIWNGQPTTAQALRKEGVIGVVFQNFELFPNLSVMRNITLAPTLQGVDQKKADETAKKLLDRLELVAQENAYPYSLSGGQKQRVAIARALALNPQILLYDEPTSALDPLLRENVAALVNQFKASGMTQVVVTHDMDFAESVADTTYHVGKGGDGQ >NZ_CP044361.1|WP_003565141.1|1640500_1641313_-|amino-acid-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKRRIVLALMLLVTLLGTVISGCARETVGNSWPRIERTKKVVIGLDDTFVPMGFRQKNGQLAGYDIDLAKAVFKRYGINVDFQTIDWSMKETELKNQTIDLIWNGYSVTPERKEKVAFSDNYLINHQILVTKTKSNIKTIKDMAGKTLGVQTGSSGAFDLDAQPKLLKNFIANKTPILYDTFNDAFIDLDAGRIQGILMDEVYARYYIAHKPDPSSYRIASDDFPPENFAVGMRKSDNVLRSKINAGLKALKADGTVAKLQKKWFGKVEE >NZ_CP044361.1|WP_003574843.1|1649016_1650294_-|bifunctional-folylpolyglutamate-synthase/dihydrofolate-synthase MDYTESVAYIHSFPRLAKTGDHQRILTLLHALGDPQKRGHYIHVTGTNGKGSAANAIAHILEASGLSVGLYTSPFIMRFNERMMIDHQPIPDAELVKAVAVGQQALTQLRQATPDFGVTEFEFITALAFWYFDQKQVDLAVIEVGIGGDTDSTNVITPVVSVLTEVALDHQKLLGDTITAIATHKAGIIKPHVPVVTGNLVPDADAVVAAKVAATASTWLRFDRDFSVPKARLHGWGQRLTYADKDGELTDIDIPLVGDYQQRNMAIAIQTAKVYASATNWPLKSQEIRKGLAASRWPARLEKLSDEPLIVIDGAHNPDGIKGLIAALHQLFKQPVTVIAGILADKDYHTMADALTKAFHTVYLVPVPGNARALPEAGYAALHEGQLKDSWQEAMAASLADDPDQPIILTGSLYLAADVRQTLRA >NZ_CP044361.1|WP_003605034.1|1650585_1653228_-|valine--tRNA-ligase MKEQALAPKYDHKAVEAGRYQEWLDEDVFKPSGDQKAKPYSIVIPPPNVTGKLHMGHAWDTTLQDIVIREKRMQGFDTLWLPGMDHAGIATQAKVEAKLRKEGISRYDLGRDKFVQKVWEWKDEFAKTIHSQWAKMGLSLDYSRERFTLDKGLNEAVRKVFVELYKQGLIYRGEYIVNWDPQARTALSDIEVIHEDDKGAFYHVKYPFADGSGYIEIATTRPETMMGDTAVAVHPGDKRYQDLVGKELILPLANRKIPIIEDAYVDPAFGTGAVKITPAHDPNDFQVGNRHDLKRINTMNEDGTMNENAGKYNGMDRFEARKAMVADLDKEGLLLKVEPIVHSVGHSERTGVQVEARLSTQWFVKMKPLAEAAIKAQQEADKKVTFVPDRFEHTYLQWMENIHDWVISRQLWWGHQIPAWYNKQTGETYVGMEAPKDIENWQQDPDVLDTWFSSALWPFSTMGWPDTDSPDYKRYYPTDTLVTGYDIIPFWVARMIFQGLHFTGERPFKYTLIHGLMRDEQGRKMSKSLGNGIDPMDVIEKYGADALRWFLITGNKPGQDTRFSYKQVEAAWNFINKIWNISRFVMMNLGDLEKPQQPDPSTFDLSDKWLFAQLNETIKQVTDLSERFEFGEMGRTLYNFTWNVFADWYVEMSKEVLYGDDEKAKAAKRVNLAYALDQILRLLHPVMPFVTEKLWLALPHAGQSIVTASYPVANDAFENSAAVDAMDSIIALIRGVRSIRKDAGAPLKTKVDIIVKLTDPALKPIFEDNFDFIDRFVNSKAFTVGTDVAEPKMAGSTVITGATIFVPLNELVDLDEERAKLTKDAKKLQQEIDRIDKKLNNQGFLAKAPEAVVEEQRTKRSNFADQLNSTQQRLAQLQQA >NZ_CP044361.1|WP_003570094.1|1653600_1654254_-|redox-sensing-transcriptional-repressor-Rex MVVSKQALSQATIKRIPVYYRTVKDLQQTGEKRVRSDRLSKLVHIAPATIRRDFSNFGDLGRSGYGYSVDLLAQVFGELLEVHSEEQMALVGCGNLGRALLTNNFRRNPDLSITMGFDTDPQLIGTTIAGVPIYDLAALSEKLRPSMHTAIVCVPSSAQAAVVRQLEAQNVTAILTFAPKPVPAKPTTTIRYIDLTSELQALLFVDHQKQVKRVSQG >NZ_CP044361.1|WP_080595807.1|1654390_1654543_-|hypothetical-protein MPIDDSGHGKQQAFLFNKGNISQKLRLLTVFIFWLSVVIKSEAQTKLPGR >NZ_CP044361.1|WP_159301208.1|1654559_1655777_-|tRNA-4-thiouridine(8)-synthase-ThiI MQYSEIMVRYGELSTKGKNRQAFIGRLNGNVTRALHEFPNLTIRPKRDRMHIELNGEPSEQVMARLSQVFGIQNFSPSIAVEKDMDKVHAVALQLMNETAPKGISYKVNTRRSDHDFALDTNAMNLDLGDYLTDKRPDLVVKMHQPDMILRVEVRREAIYLSTKTIQGAGGLPVGTAGKAALMLSGGIDSPVAGYYALKRGVDIEMVHFFSPPYTSQQALNKAKQLTAKLTPYVGRIYFIEVPFTEIQEEIKAKVPEGYLMTVQRRLMLRLTEAIAQQRGDLAIFNGESVGQVASQTLESMAAINDVTTMPIIRPVATMDKNEIIAEAEKIDTYDLSIMPFEDCCTIFAPPSPKTKPKTDRARYYESKIDVAGLMDRALAGVKIQEIKSSDQFMNQDQNVIAELL >NZ_CP044361.1|WP_159301209.1|1655793_1656951_-|aminotransferase-class-V-fold-PLP-dependent-enzyme MIYFDNSATTKISLEALATYNKVSTDFFGNPSSLHALGTRANEVLQSSRAQIAQLIGAKPNEIYFTSGGTESDNWVIKGTAMAKREFGRHLITTSIEHPAVINTMKQLEKLGFDVTYLPVDHRGFINIDDLKAAIRKDTILVSIMAVNNEIGSMQPIVEAARVLDAYPNIHFHVDAVQAVGKGLDAALQDPRIDFMSFSGHKFHAPRGTGFIYAKEGRMIAPLLTGGGQENDWRSGTENVPAIAAMAKSLRLLLANEADNVARQQAVRKRIYDHVSQKPKVTMFSQLTPDFAPHVLCFAIAGVRGETIVHAFEAQAIYISTTSACSSKKGTESSTLAAMHTDSRIATSAIRVSLDEANTLAEADAFNKAFDTIYAKFAKLDKATV >NZ_CP044361.1|WP_159301210.1|1657259_1658963_-|septation-ring-formation-regulator-EzrA MIWFFVIVVIIVVAAGGVWWLQHYFQTRIKNLDAQVEAIDVGALLSQIRSIEQLKLTGDSLATFSKWERAFDQLNDDDLADLQKILLDLEDQAKRFRFDHAQKIAKVLEAKIDTARQQYDLISQALQDIRHDEADNRSKMLQLRDDYQVSRKTILAKSFVFGDAQPALEQQLQQLAELFQKIDQINNDGDHQAAKSEIKQLSDEMAALRRQVKELPPLVNEQVNEFPAQINEIEHGYRQLTTAHYVFTDDIPGMVEDVNEKMADANTALKSLDVDATEAANSEIEAEIDKMYAIMEKEMQARKRVDAAAPDLRQFIDHALRQNRELQTELDHLNQSYTLNHNEIKIAKDLKTQLDSIDANYIKDTDAIEAGKAVYSDVIERFDATKDELTAIEKQQVQINQAVAGLKKGEIVANKQAENFELDMRNIKHEILRHHLPGLPQDYVSQVKHVTAEIEQLNHDLDQVKINMDAIAKFLIKIASDIDALKKATSALIDAAGLTEELMQYANRYKTTVKPVAEAVHQATESYMQFDYKQAADTLATALEQTEAGSYKKVEDAYLARKKASLY >NZ_CP044361.1|WP_003598495.1|1659139_1659622_+|GAF-domain-containing-protein MTTLDPIIVDQLDGLLTGETNPITVLANASALLNDLMTDLNWAGFYIYNDKTGQLDLGPFQGKVACMHIQPGNGVVGTSYAQNAVLRVPNVHEFAGHIACDSASNAEIVVPITVDNRVVAIMDIDSPTLDRFSENDEAILTKFGETLAAHLDTAALNTVY >NZ_CP044361.1|WP_003565106.1|1659797_1660409_+|30S-ribosomal-protein-S4 MSRYTGPRWKQSRRLGLSLSGTGKELARRPYAPGDHGANNRRKISEYGQQLREKQKLRWMYGLNERQFQNLFLRAGKIKEGTHGDNFMILLETRLDNLVFRLGLASSRPQARQLVNHGHITVDGKRVDIPSYEVEPGQVIALRERSQNLAIVNEAIENTVSRPAYVTFDDTKKTGSLVRLPERGELEPEVDESLVVEYYNQKL >NZ_CP044361.1|WP_159301211.1|1660592_1660844_+|transposase MPTRYDKEFKQNIINLYKQGESAAQLAREYGIGYSTVHKWIQSQAKTQSGRSPDEIKAMEKRLASLSEENEILKKALGFLAQK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
19105 : 58531
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP044361|19105:58531|DBSCAN-SWA GTTACCACCTAGAAAGAGGCTTGCTCACTGCTTGAACTGGGGTTTGCCAACGGAGACATTTTCTGGGTTTGTTATTGATAAGCGCTGTGGCTCGTTGAATATTGGCCTCTGAAACCTGATCAAACTGTGTTCCCTTCGGGAAATAGTAGCGAAGTTCTCGATTGAACCGTTCATTTGTGCCCCGTTCATTCGGGTGATAGGCGTGGCAAAAGTAAACCGGTATCCGATAGCGCTTTGTAAGCGCCTGATCGCAGGAAAACTCTCTACCGTGATCAACCGTCACTGATCGAACCGGACCCGGAAAGTCCACCATCAGTCTTGCAAAACCCTTGAGAACAGCATTTTGTGATAAGTTTTCAAGCTTAGTTGTCGCCATTAAACGTGTGACCCGATCGACAATGGTCAAAACAGCAGCCTTTGACCCGCGCCCACCGCGAACTGTATCCATCTCTAAATGTCCTTTTTCGGTTCGCCGATTAGCTGACTCACTGCGAATCTCAATTGAGGTGCCTACTGCTTGGTTATAGCGCGACCGAAGGTCTTGTCTTCTTTTATGACGTTTACCGTGATCAAAGAGTTGACTTGGCTGAAAATCGACTTGTCTTTGATAAATCCAGTGGTAAATCGTGTGTGGCGCACAGTGAACGGCATAACCGACCATTTCAGGGGACCAACCTAGGGTTAGCCTCTCAGTTACCATCCGCTTCAACTTAGGCGTTAAAATCGAGTGCCGACCACAACGATGCCGACAAGTATCGGCATGATCCTGAGCTATAATGGCGCAGTAATCACCTTCAGGGCAACGGTGAAGCTCATGCCTAATAGAAATACGAGAGCGGCCTAAGGTCGCAGCGATGTATTGAATCGTGTGGTGTTGCATCAGTTCTATCTGAGATCGTTCAATTAAGGTTATAATGGCCATGGGACCTGTCCTTCTCTCTAGATTGTATGTTATGCAAAAACCATTTTAGCAAGAACGGACAGGTCTTTTTTCACATTTTCTGGGTGGTAACTTTAATTATGCAATCTAGGATATAACCACCATTCAGAGACAAGGCGATCTTACCAGTTTGATTTTCCGAAGTGTGTTGAACCCATAGCAGCATGCCTAAAATAGAGAAACGTAAATACAGTTTAAAAGTAATTTTATCAATAAATAAATCACCCCGCTAAGAAAACGTTTTCTAAATGCAAGGATACATAGAAGGAAACGGCTTGTCAACGTGTTTTAAAATCAATTTATAACTATAAAAATATAATTAATATATAAACGAGACGATATTCATTGAATGTATTGCTTGTATCAATACATCTGACATTTAAAAAGCAAATCAAAAGTGAAGCAATTGTTCAGTGTGAGACCGTCATTTTATCGATGACTGCTTCTACGTTCATGTCTGCTGGCTCCCGCGATGGTTGCAAGCAGAAGCAGGACTGCCGCCGCCAAAGCAAACCAAGTCCAACCGGCAATGGGAACATGAGCATCTGCCAAATAGCCAAAGCCATACATGATAACAAGGTGGCTGCCAGCAAGGACTAGTGCAGTGAACGTCATGCTAAGGCGCTGCCAGATTGTGACGGCGTTGGTGAACCAAGCCGTGGCCATGACTAGTAGCTGTGCCAGCAGCAACAAAGCCATGAGTAGCTGTAAAATTGTGTTGAGATACACCATTTTATTGGGCTCCTTTAAACGTGCTGTAAAGGACGAATCAATTTTACATTGTTGTACACGTATCATACCAACAAAAATTCAGACTTGATAGTGTTGTGCTGCGTCTCAGTTACAGACAGCAGCAGAGATAAACAAGGTCGTTTGGTGAAAAGCCGATATCGATTCCGTGTTGGGTATCATAACTGGTGACAATTGCGATTCCTGTGATGTCGCGTTTGATTGCTACCGGGGGGCGTGTCTCGAACAAGCAAAATAGTTGCTGATAAACTTTTCTCAATGCAAAAAAAGAAGCCACAAGGAATGCGATCAAACATTCTTTGTGACTTCTTTTAGATAACTCGGTAGTTTTAGGTTGGGACCGTGATGTGATCCCAAGACGTGATTAAGGGTAGGTAAAAATTACCGGTGGATATAAACGTAGCTGCTTGCACCAGAGATGGTTTGGGTGTTCGGGCCGGTTGGTGAGCTGAAGCCCATGCCGCCTTGGCTAATTGTGACACTGTCACCGGAGACAGATTGGACATAAGCAACGTGACCATATGAACCATCGGCTGTCCATTGACCGCCAACGGATTGACCAGCGGCGAAGACGATGATTGAGCCGGCTGCTGGCGTGTGGTTAACAGTGAAGCCAGCTGCTGCGGCTGAACCGCCCCATTGCGCGCCGTTGCCCCAGCCATTACCAGCCCATGGTGCAACTGATTTGACGTACCAGGTGCACTGACCCCAAGGATAGGTGTTACCTGAACCACTGAAGTCAGCGTGGCTGCCACTGCCTGAAGCTGTGTTGTTGGTGATAACAGAAGAACTGTTGTTTGAAGAACTTGATGTGTTGTTGGCGATGGTGCTGGTTGAAGTTGCGCTGCTTGAACTGCTGGTAGTAGAAGAACTTGCGGTTGAAGCGGCAACGGTCTTCAAAGCGGCTTGGGTTGCAGCAGCTGCTTCAGACTGTTCTTGGGCAAATTGGCTTTGCAAAGCAACCAACTCATCTTTATGATCGGCAATTTGCTTATTCAAAGCATCTTGTTTATCGTTAGCATCTTTTTGTAGGGAAACCAACTGTGATTTCTGGGTTTCCAATGAAGCCTTAGTTGAAACCAGCGTCTGACGGGCATTTTCCTGTTCCGTCTTCAAGCCAGCTAATTTATCCTTGGCAACTGTCACGGCATCAAGCGCATCTTTGCTGGCTTGGCTAAGTTTGCCAACCGTCATGGTGCGGGCAATTAAGTCAGACAAGTTCTGGGAATTCAGAACAAAGTCGATATAGACATTGCCGCTGACAGAGTTGCCAGCCTTTTTCTGCAAGGAGATCAACTGATCTTTCAAGTTGTTCTTGCGTGCTGTGACATTCTTTTGAGCGGCAACAATTTCACCGCTGAGTGATGAAATCTTGGCATCAGTTGCGCTGATCTTAGCCGTTGCATCGCTGATTTGACCATTCTTGGTATCGATCTGCTTGTTCAAATTGATAACTTCTGTGTTCGCATCTTCAATTTGCTTCAACAGTGCATTGGTTTCGCTTTTGTTGGAAGCGATACTGTCGCTTGTATCAGCGAAAACTGGTGTTACGGCGCTAGCAGAACCTGCTAAGGTAACTGCAGCAACCAACGTGATCATGACTTTATTGAATTTCATTTTTGACCTCACCCTTAATTTGATTAACTAAAGGCTACTTTACTGTGTCAATGTTACGTCAGCGTTACAGGACTGTTAGGAGTTGGTCTCAATCTTCATTTGCGCTTCAAAATTGCGATCATAAACGTTTTTAATCCCAATTTTTGATGAATTTTGTATGAAAAAAGCAGCGCCGTGACGACGCTGCCTGACAAAATTGTAAGTTATTCGTTTGATTTCAGGGCTTCGACCATGTCCACCCGTTGGAGTCGACGATGCGTGAGCCAGGTGACGACGCCGGTGAAGGCCAACATGAGTAACGTGGCCGTGAGGTAGCCGACAATGCTGATCGTGAGTGGGAAAACCACGGCCTCGGTTTCGGCTTGATACAAAATGTAGGCTGTCAGCAAATTGCCGAGCAGATAGCCGAACACGATGCCGATCACTGTCAACACAATGCTCTCACGACTGATGTACATGGTGACCTCGCGATCGAAAAAGCCAAGCACCTTGATTGTGGATAGTTCCCGAATGCGTTCCGAAACGTTGATGTTATTCAGATTGTACAAGACCACGAATGACAAAACCGCACTGAGCAGAATAAAAATCAAAACAATAGGATCTAACATACCGCTCATATTGCTTAACGTTTTCTTTGCTGTCGTCGTGAAACTAATCCCGACAATCGCGTGATGATTGAGCAATTGCTTAGCGAGTCGATCATTTTGTTTGCTGCTTTGGGGCTGCAAGCGGACTAGCAAGGTGTTTGGTTTCGCACTATTACCAGCGAGCTGGTGATAAGCGGTGTTGGAGAGATAGCCAAAATGGCCAACGTAATTCTTAGCAATGCCTTTAATTGTGAATCGCTTGCTCTGACCATTAGTTGTGGCGACTTTAAGGGTATCGCCCGTTGTCACGTTGAGTGCCTTAGCCAGTTTGCTGGTGATCACGATACCGTGGCGCGGCAAGGTCAGTTTGCGATTTGACGCCGTTGAACGGAGACTGACATAAGGTTCAAGATCGTTGCCGTTTGCTGGGGCAAACAAATTAACATCGCTCAGGCTATGGCCTTTAGCACTGAGCTTAGCCACCGCGCCGCTAACCGTGCCCGCGCTGCGATAAGCTTTGCTTTTAGCCAGAATGTCGCGGGCCGCAGCTGGCTTTTTGCCATCAGCCAATCGCACAATGGCTTGATAATGGATGACATCACCATACTGTTGAACACCAGTAGCAGTGATTGAGTCTTTGATGCCAAACCCGGTGAGGATCAAGGCGGTGCCGCCAGCAATCCCAAGAATGGTCATCACCAGCCGTGATTTGTATCGGAAAAGATTACGATAGCTGACTTTTTGGTTAAAAGACAGACGCGACCAAAGCGGCGTGATCCGCTCCAGCAAAATGCGTTTGGCTGATTTCGGTGCTCGCGGACGCATCAAGGCAGCCGGCTTTTCGGTTAGTTCATTGCGGACCACAATGGCGGCGGCCCCTAATGTTGCGATCAGCGCCAATAACAATGACAAGGCGATCAACGGCCATTGCAAGGAGACGACTTGTTGGAGCGGAATGTAATTTTTATACAAGCTCAAAACAATGCGCGGAATGCTCAAGTTGCCAGCAAAAACCCCGATGATCCCACCTAATAAACCAGCTAAGGCAGCATAGGCGAGGTAATTTCGCGCAATCGCCCATTTGCCGTAACCAAGCGCCTTGAATG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37 | Acinetobacter_phage(37.5%) | transposase,protease,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
70502 : 202563
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP044361|70502:202563|DBSCAN-SWA 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114 | unidentified_phage(20.83%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
270360 : 311541
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP044361|270360:311541|DBSCAN-SWA 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35 | Faecalibacterium_phage(37.5%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
474520 : 590860
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP044361|474520:590860|DBSCAN-SWA 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97 | unidentified_phage(10.71%) | transposase,protease,bacteriocin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
801174 : 926251
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP044361|801174:926251|DBSCAN-SWA 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102 | unidentified_phage(13.33%) | tRNA,tail,transposase,protease,integrase | attL 801123:801182|attR 851356:853016 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
935482 : 1012820
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP044361|935482:1012820|DBSCAN-SWA 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85 | Lactobacillus_phage(71.93%) | head,terminase,tail,transposase,portal,protease,holin,capsid,integrase | attL 938115:938133|attR 979956:979974 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1133771 : 1144047
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP044361|1133771:1144047|DBSCAN-SWA GATGAAACCACAGGAACTAGCAAAAGAAGTCGCAAAACGCCGCACATTTGCGATTATTTCACATCCAGATGCTGGGAAAACAACGATTACGGAACAGCTTTTATTGTTTGGCGGCGTGATCCGCGAGGCTGGAACAGTTAAAGGCCGAAAATCCGGACATTTTGCGAAATCGGACTGGATGGAAATCGAAAAGAAACGTGGTATTTCGGTTACCAGCTCTGTGATGCAATTCAATTATCAGGGCAAACGCATTAATATTCTGGATACCCCTGGGCATGAAGATTTTTCTGAAGATACCTATCGGACCTTGATGGCGGTTGATGCCGCAGTCATGGTCATCGACTCGGCAAAGGGGATTGAAGCTCAGACCAAGAAACTGTTCAAAGTTGTCAAACAACGTGGTATCCCGATTTTTACATTCATGAATAAGTTGGATCGTGATGGTCGCGAACCATTGGATTTGATTGCTGAACTTGAAGACTTGCTGGGTATCGAAGGCTATGCGATGAATTGGCCGATTGGTATGGGTAAGGGACTCAAGGGTCTCTACGATCGAGTGAATCAGCGAATCGAGCTTTATCGGCGTGAAGGTGATGATCGATTTTTGCCGTTGAATGATCAAGGTCAGCTTGATCCAAGTCAACCATTGACGCAGGATTCGATTTATACGCAAACATTAGATGATATCGAATTATTGAATGACGCGGGTAACCAGTTTAATTTGAAAAAGATCATGGCTGGTGAGCAAACACCAGTGTTCTTCGGGTCGGCGTTGACTAACTTTGGCGTTGAGACATTTTTGAATAGCTTCGTTCAATATGCACCCGAACCGGGACCGAAGAAAACAGAACAAGGCGGGGAAGTGAATCCGACTAACCCAGAGTTTTCCGCATTTGTCTTTAAGATTCAGGCAAACATGAACCCTGCTCATCGCGATCGCATCGCTTTTGTCCGAATTGTTTCAGGTGAATTTGAACGGGGGATGGATGTCATCCTTCATCGAACCGGCAAAACGATGCGACTGAATAACTCAACCGAATTTATGGCTGACACCCGTGAAACGGTTTCAACTGCGGTTGCCGGTGATATTGTTGGGTTGTATGATACTGGTAATTTTCAAATTGGCGATACCATTTATCAAGGCAAGGAACCGATTCAATTTGAAAAATTACCGCAGTTCACCCCTGAATTATTTGTTCGCGTTACGCCGAAGAATGTGATGAAGCAAAAATCATTTCATAAGGGGATGCAGCAGCTTGTCCAGGAAGGGGCAGTCCAGCTTTACAAGACCTATAACACGAATGATTATATTCTAGGAGCAGTCGGGCAACTTCAATTTGAAGTTTTCCAATTCCGGATGCTGCATGAATATCATTCAGAAGTGATTATGACCCCGATTGGCTCGCGAACAGCTCGCTGGATCAATCCAGATCAATTGGATGAAAAGATGAGCAGTTCCCGGAACTTATTGGTTCAGGATATCCACGGCGACCCGTTGTTCCTATTTGAGAATCAATACGCTGAACGCTGGTTTGCAGACAAGTATCCTGACGTTAAATTAACTGCCAAAATGTAATAGGGTGTTTGGGTATGAGTATCGTGGCACACAAAAAGCGGCTGAGCGATGTCAGCCGCTTTTTGTGTGCGCTTATTAATCTAGCAATGTGCAAAAATCTCATTGGTATTGGCAATGGTACTATCCCCTGTCAAGTTGACACTTATAAAAACGAAAACACAATTTTTCTTATCCGACCAAATCGTGGTAATATTCCGCCACGGTTTGGTCATTTCTTTTAGCGGAAATGAACTGATTCGTGAAGTACATTATTCCAGCACGAACCTGTTCCTGTAACTCTGCTAGAGTTTGCGCCTTTGGACGATGCTCGAGCCAGATGCTTTTAAAATCTGCCCACCAGTGTTCCATTACGGCGTTAGCCGCTGGTGTCCCAGGCGCCGATAGGCTATGCCTTACCTTCTCCTGACGGAGAGCTTCGTTGTAATTGGTGGACGTATATGCCGCTCCACGATCCGTATGGATCATTTCTGGAGTGGTTCCACTAGCCTTAGCGGCTTGGTTAAAGACTTTGATTGCGGCTTCACTGGTCTCCGTTGGTGAGATTAACCATGCTGCTGGCCTTTGTCCATATAGATCTAAGATGGCGTGTAGACGGACTTTATTAGCCGTCCCGTAAGTCAGTTCTGTTGTATCTGTTACCCAAACCTGATTCGGCTTTTCTTGCTTAAATTGCCGATTTAGTAGGTTTTCATCTTGATAGGTTTGTTTTGCTCCCTGGCGGTCCTTTTTTGGCTGCCGGTAATCCGCCCGAATTCCATTAATTTTCATAATCCTGCTAACCCGCTTAATCCCCACTCTGTAACTTAATCGGCCCTCTTTATTCAATAGACGAACCATCTTATCGTATCCAACACTATCTTGATGCCGTTTTTCGATTCGCTTGATCTCCTCCAGTACTTCCCGTTCCTGCTGTTCGCGTAGCGATAATCTACGATTTAACCATTTGTAATACGCTTGCCGACTGATTCCCGCAGCTCGGGCCGTTTCACTAACTGTGTACTCGCCACTGCTGGTCATTTCTTGAACCGCTTGATATCGTTTGGCCGCTTCACCTCCCGGTTGCTTATTTCGATCAATTTTTTTGAGAAGGCAATCTGAACCTCTCTTTCACGTAATTTAGCTTTGAGGTCCCGAATCTCTTTGAGTAACTGTTCCTCACGGTCGGCTGGTTGCCTACCCCTGGTCTTGCCACGCCGGTCCTTTAGGGCCGTCCAATCGTTTGCTTGCTCGTATTTCTGCGTCCAGGCATACGCTCTGGAATAGGTAATATCAAACTTTTGCGCTGCTTGCTTGTAGTCATGATTATGCTTCAAGACCCATTTAACGATTTCGATTTTCTCGTCATACGAGACCTTTCGTCCCATCTTCCGCACCCGCTTTCTTACTGGTTCTTTACCATTATTGTAAAGGATGACCCAGTTACGAAGTTGGGATAATCCACGGATATCATACTTTAATAGGATTTCTTTGGTAGGAAGACGGTGATTTCGATAATCACGGACGGCACGAAGCTTAAGCTTCTTAGGGTACCGGCGATTGTGTACTGGGCGCTCTAAATTAGCCAATCCGCCAGTTAGATACTGCTGGATCCAACGCTTTAAACTCCCTGCACCTACATTGTGATAATCAGCGAAAACCTTGAGTGACTCGTTAACGTTTTGAAATTGACTTAATAAGCGAAGCTTAGTAGTCGTTGAATAGGTGATTTTCATAAAAATAGCCTCAAAAGTCATCACTTTTTATTTCTTAAAGTGACAACTTTTAAGGCTATTGTACGAATCAAGGCGCTATCCTTCTTCGGGTTACTCTGCTTGCCGCTCAAGCTTGGGAACAGTCACTTCTGCCAGATGATGACCCATAATTGGCGAAACATCGCCAATGTCCTTTTGCAAAAGCCGTTCGAGTGTGAAAGCAATTTCCGCACGCTGAATATTGCGGCGCTCATTGGTGAAAAGAAGTTCGATATGGGAAGGTGCCTCCGTATAAACAACTGTCGTTTGGCCAAGTGAGAAGACCTTGACCAGCCGGGCATCGGTACCACTCAATTGTTGGCTTACTAGATTTCTGAAACTGTTGGTCACGTTAATCAGTCGCATGCTCATGCCCTCCATTTCTCTCCCTACTGTTTTTATTATAAAACAGTTTAACGGAAAATAATAATATGTGAATTGAAAGCCCTCGAACGCAATGAAGTTCGAGGGCTTTCTTAAAACAAATTACTTTTTAGATTTTTGAGTGGTTTCAGCCTTGGCAGGTTCACCAACCGTAATCTCACCATTACTGATGCGGGCTTCAAGTTCCTTAGCCTTTGGATGGTCAAGGTAGAAGTCAGCAACGCGGTCTTCAATCTGTTCCTGAATGACTCGACGCAGCGGCCGAGCTCCCATGGCAGGATTGTAACCGAGATTAACCAGCTTTTCCTTAACCGGATCGGTAACATGAATCGTCAAGCCCTGATCCTTGATGTTATTGTTGGTATCTTGAATCATCAGTGACACAATCTTCAACAAGTCGTCTTTAGACAATGACTTGAATTCAACGATGTCATCAAAACGGTTCAGGAATTCGGGCTTGAAGTAATTACCAAGCTGATCCAGCACACTGTGCGTCTTACCGCTTAAAGCTGCGCCAAAACCAACGTTTGCTTCGGCATCGGTTGAGCCAGCATTGGATGTCATGATAATGATCGTGTCCTTGAAGGAAACGGTACGGCCTTGAGAATCAGTCAATCGGCCGTCATCCAAGATCTGCAAGAACATATTCATCACATCTGGATGGGCTTTTTCAATTTCATCTAACAAGATGAGGCTATAAGGATTTCGGCGAACTTTTTCAGTTAATTGACCGGCTTCCTCATACCCGACATAGCCTGGCGGTGACCCGATAAGCTTGGAGACACTGAATTTCTCCATGTACTCCGACATATCAAACCGGATCATGGCGTCTTCAGAACCAAACAGCTCTTTGGCAAGCTGTTTAGCCAGTTCAGTTTTGCCGACACCTGTTGGGCCGACGAATAGGAAGGACCCAATCGGCCGACCGGACTTGTTAAAGCCGATCCGGTTACGACGAATAGCACGAGCAACTTTATCAACTGCTTCATTCTGACCAATGACATGCTTTTCAAGGTCACCAGCCAGATTCTTCAGCTGTGCTTGCTCCTGCGCCTTCAGTTCACCAACTGGAATGTTGGTTTTTTCTTCAACAATCTGTTCCATATCTTTTTCGGTGACAGTCGGAATTTCATTTTCAGGCAGATTAGACTGTTTCTTAGCCATATCTTCTAACTTAGTAACTTGGTCACGATAGAAGGCAGCTTTTTCGTAATCCTCCTGCTTCAGAGCAGCTTGCTTTTGCTTCTCGGCGTCGTCAATCTTGGTCTTGATCGTTTCTGGATCGACAGTGGCAATGGTCAGATTCTTCC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP044361|1133771:1144047|1140342_1140609_+|WP_003566007.1|DBSCAN-SWA MEKREFNIIAETGIHARPATLLVQAASKFNSDINLEYKGKSVNLKSIMGVMSLGVGQGADVTISAEGADEADAIAAITDTMKKEGLAE >NZ_CP044361|1133771:1144047|1140007_1140199_+|WP_003566008.1|DBSCAN-SWA MTQDYVALIDELKTGQRDKITVTPETFMAFRAAWTNYPDREEIVGMAKRDGVIEYHYRSVDSR >NZ_CP044361|1133771:1144047|1137562_1139659_-|WP_003658650.1|protease|DBSCAN-SWA MRPTDATDPFGFGSLDDIFRAMNQGMDQPQQPNAQTPPTQAGRGGNGNNGRNGNRGKGLLGQFGVDLTEQARNGQIDPVIGRDKEISRVIEILNRRTKNNPVLIGEAGVGKTAVVEGLALKIANGDVPSKLQDRHVIRLDVVSLVQGTGIRGQFEQRMQQLIDELKKNKNIILFIDEIHEIVGAGNAEGGMDAGNVLKPALARGELQLVGATTSNEYRQIEKDSALARRLQPVLVEEPTVEETIKILKGLQPRYQDFHHVKYTDAAIEAAATLSNRYIQDRFLPDKAIDLLDESGSRKNLTIATVDPETIKTKIDDAEKQKQAALKQEDYEKAAFYRDQVTKLEDMAKKQSNLPENEIPTVTEKDMEQIVEEKTNIPVGELKAQEQAQLKNLAGDLEKHVIGQNEAVDKVARAIRRNRIGFNKSGRPIGSFLFVGPTGVGKTELAKQLAKELFGSEDAMIRFDMSEYMEKFSVSKLIGSPPGYVGYEEAGQLTEKVRRNPYSLILLDEIEKAHPDVMNMFLQILDDGRLTDSQGRTVSFKDTIIIMTSNAGSTDAEANVGFGAALSGKTHSVLDQLGNYFKPEFLNRFDDIVEFKSLSKDDLLKIVSLMIQDTNNNIKDQGLTIHVTDPVKEKLVNLGYNPAMGARPLRRVIQEQIEDRVADFYLDHPKAKELEARISNGEITVGEPAKAETTQKSKK >NZ_CP044361|1133771:1144047|1140608_1142336_+|WP_003602661.1|DBSCAN-SWA MAEHLKGIAASDGIATARAYLLVQPDLSFQKKTVDDPSKEIDRLKQSLDQSNDELKVIRAKAAESLGEEEAQVFDAHMMILADPDFTGQVETKIKDEKVNAEQALKEVSEFFIKTFEGMTDNPYMQERAADVRDVTKRIMAHLLGRNLPNPALIDEEVVVVAHDLTPSDTAQLNKKYVKAFVTDIGGRTAHSAIMARSLEIPAVVGTDDITKKANNGDLISVDGLTGEVVVDPTDDEVAKFKQDAEAFAKQKAEWALLKTAKSITADGKHFDVAANIGTPKDLDGVLANGAEGIGLYRTEFLYMDSAELPTEDDQFEAYKKVVETMSPKPVVVRTMDIGGDKHLPYLPLPEEQNPFLGYRAIRISLDRQDIFRTQLRALLRASAFGNLRIMFPMIATIAEFKQAKQIFTEEKDKLVKDGVKVSDDIQLGIMIEIPAAAVLADQFAKYVDFFSIGTNDLIQYSMAADRGNEHVSYLYQPYNPSILRLIKHVIDSAHKEGKWAGMCGEAAGDPIMVPLLLGMGLDEYSMSATSVLKVRSLMKKLSTADMAKMDEIALNQNITNDENADLVKKTTGQK >NZ_CP044361|1133771:1144047|1136359_1137058_-|WP_003597552.1|DBSCAN-SWA MKITYSTTTKLRLLSQFQNVNESLKVFADYHNVGAGSLKRWIQQYLTGGLANLERPVHNRRYPKKLKLRAVRDYRNHRLPTKEILLKYDIRGLSQLRNWVILYNNGKEPVRKRVRKMGRKVSYDEKIEIVKWVLKHNHDYKQAAQKFDITYSRAYAWTQKYEQANDWTALKDRRGKTRGRQPADREEQLLKEIRDLKAKLREREVQIAFSKKLIEISNREVKRPNDIKRFKK >NZ_CP044361|1133771:1144047|1133771_1135346_+|WP_003566014.1|DBSCAN-SWA MKPQELAKEVAKRRTFAIISHPDAGKTTITEQLLLFGGVIREAGTVKGRKSGHFAKSDWMEIEKKRGISVTSSVMQFNYQGKRINILDTPGHEDFSEDTYRTLMAVDAAVMVIDSAKGIEAQTKKLFKVVKQRGIPIFTFMNKLDRDGREPLDLIAELEDLLGIEGYAMNWPIGMGKGLKGLYDRVNQRIELYRREGDDRFLPLNDQGQLDPSQPLTQDSIYTQTLDDIELLNDAGNQFNLKKIMAGEQTPVFFGSALTNFGVETFLNSFVQYAPEPGPKKTEQGGEVNPTNPEFSAFVFKIQANMNPAHRDRIAFVRIVSGEFERGMDVILHRTGKTMRLNNSTEFMADTRETVSTAVAGDIVGLYDTGNFQIGDTIYQGKEPIQFEKLPQFTPELFVRVTPKNVMKQKSFHKGMQQLVQEGAVQLYKTYNTNDYILGAVGQLQFEVFQFRMLHEYHSEVIMTPIGSRTARWINPDQLDEKMSSSRNLLVQDIHGDPLFLFENQYAERWFADKYPDVKLTAKM >NZ_CP044361|1133771:1144047|1135514_1136423_-|WP_159301321.1|transposase|DBSCAN-SWA MDRNKQPGGEAAKRYQAVQEMTSSGEYTVSETARAAGISRQAYYKWLNRRLSLREQQEREVLEEIKRIEKRHQDSVGYDKMVRLLNKEGRLSYRVGIKRVSRIMKINGIRADYRQPKKDRQGAKQTYQDENLLNRQFKQEKPNQVWVTDTTELTYGTANKVRLHAILDLYGQRPAAWLISPTETSEAAIKVFNQAAKASGTTPEMIHTDRGAAYTSTNYNEALRQEKVRHSLSAPGTPAANAVMEHWWADFKSIWLEHRPKAQTLAELQEQVRAGIMYFTNQFISAKRNDQTVAEYYHDLVG >NZ_CP044361|1133771:1144047|1137148_1137442_-|WP_003570563.1|DBSCAN-SWA MRLINVTNSFRNLVSQQLSGTDARLVKVFSLGQTTVVYTEAPSHIELLFTNERRNIQRAEIAFTLERLLQKDIGDVSPIMGHHLAEVTVPKLERQAE >NZ_CP044361|1133771:1144047|1142634_1144047_+|WP_003602660.1|DBSCAN-SWA MYQSKTHNHRFTGHLASAKTRLRLVALISTMGGLLFGYDTGVINGALPFISSELKLAPGSQGWVTSSLTLGAAFGAILVGRLSDRYGRRRLITMLAGLFFLATVASSLSPSAGWLIGARLILGLAVGGVSVLVPSFLAEIAPTSHRGRLVTQNELMVVTGQLLAFVLNAFLGTTFGNVPGIWRWMIVLAVIPAIILGIGTYFVPESPRWLMMKGRPAAARSSLEVLRSAAEVPAEIDHLKQNLAEDAKHKQASVRALKTKWIRRLVLIGIGLGVIQQIAGINVMMYYGTSILQMTGFGRDSALIANIANGVTAVAATIVTLQLLKHVPRRPMLIVGLIGSTVAITGVTFASRLPAGSPFRAFATIGMMMLFLAFFQGAISPMTWLLMSEIFPEQVRGIGMGAATFCLWLANFGVGVLFPIGLAQIGMFWTFVCFIGTNLISLLFVLIFVPETAGRSFETLHREEKARLNY |
9 | Streptococcus_phage(16.67%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1747697 : 1840143
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP044361|1747697:1840143|DBSCAN-SWA 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85 | unidentified_phage(15.38%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1857525 : 1911814
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP044361|1857525:1911814|DBSCAN-SWA ACTATACGTTTTCCGTAAACAGTCCTCTTAACTGCTGGATCATGCTAACCACTGAATAAGGTGGCTCTTGGCTTGCTGTGGTAACTGCTCCACGATTCTGATACCAGAATTCGGTCAACATGGCCACGGCAATATCAAACTGCGAGTACGCTTGTAAGGCATCAATCGCCGCTGTGCTGTCAACGGCATTGTGAACATAGTCTTGCGCCGCTGTCAGGTAGTTGCTGATCAAACTATCATCAGTATTAGTTTGCACACGCAGGCTATTTTTAATGTCATTAGTAGTTACAGTCATGTGCTCATCTCCTTATAAAAATAGGGGCGTACCCTAAGGCACACCCCCCACTAAATTATGCTTTTGGCGTGGCTGCTACCGGTGTGATGTCAACAATTCGAGCAGCGTCTGGATCAACTACTTCGTAATCGTTGCGGATGACAACCGCCAAACCTTGGCTATAACTGTCGAACCGTTCCCATTGAGTGTTGACTTCGTTCTTTTGGGCTAAGAAGATTGCTTGAGCAAAGTCTCCAATGATGATCCGATAGGTGCCAGCCTTATCAGTAGGAAGCACCTTATTAGAAATGACGATCACTGGGGCACCAAACAGTTGCTTGCCTGATGGTGCAGTGATTGAAGGTTGTAACAAGTATCGGCCCTCGCTGTCTTTCAGTGTATCAAGGTAGTTGAAAGCATCCTGATTGACGATAACAGACAAGGACAGTGCTGGATCTAACTCAACATTGAAGGTTTGCTTGATGTCATCGAGACCAGTACCCGTGATGTGCTTGAAGTTATCGTTGGTGCCCGTCTTGCCAGTCAGAACACTGATAATGTTGCTATTGTCCGTGTTTTGTACCAGCTTCTTGAGTTGATTTTTAACCTCGGCAACAATATCAACTTCACTGTCTTCTACCAGTTCATTAGACAGATAAATCTTGCCAGCACGGGTAGCAACCTTGTAGTCAACACCTTTAAACATATTGACGTCAACATCGGCCACGTCTGCAAGTTCTGCCTTGGTGGCTAAAACGCCATTGTTGGTAAGGGCGATCGGATAGGTGCCGACAGGGGTACCTACTTGCTTCACAGTGACGTATTTAGCCAGGTCATAATCTGATTGCTTTAAGTCCCAAACATCATTGATGACTTCTTTAGGAACGACTGCACCAGCGGTGGTTGTCGTTAATCCGTCACGTTGTTCACCCATGCTGCGGATGTAGTCTTCGTAAGCGCGAGATTCGGTATGTTCTTTGTTGTCGATAATTGTTTTTTCAGTCATGGTTTTATCTCCTTTTTCTGGTTGTTCAGTATTAGTTTTAAGCCACTCAGTGTAGCTGCGTTTGTCCACTTGGACGTTGGTATCGTCATACGCTGGAATAGCTACCAGTGAGACGTCAAACAAGCTCTTTACTTGCTTGATGGTGCGGATCACTTGCTCACTGTCGTCCTTAGTGAACGTGTCACCGTCTGGCGCAGCATTGAAAGTAAAACTCATGGCTGAAAGATTACCAGCTTGGACGTTGTTATAAGCATCATTGGCTGTGGTCGTATCGGGTAAGGTTGCTTCAAACTGCAAGCCTTTATCATCCACGTTTAAGGTCAAGGTGCCAGCCTTGGTACTGGCTAAGACTTGGCTAAAATTATGGTCTGAAACCATATAGACGTCTGATAGATCCACATTGTCGAATGCGTGCGGATCAACGATCTCACGGAACCCCCCAAGATCCTTACTTGGGCTATTGAAAACTACTGCATAACCACTTAGTTTCTTTGGACTGCTAGTGGTGTCGTCTTGTTGCTGTGTGTCTGGATCGTCTTGGCCTTGGCTGTCGTCTGCTGCGGCAGTTATATCAGCGTCAGGATTCAGGCGCTTTTCTACGTCATCTTGGTTCATTAGACGCACTTCCTTTCTGTTTATCTTGATAAGTGACAAGGTTGCTTAGTGGCGTGTAGTTCAGACTGACCATAATCTCATCACCACCGGTAATTGGTGACAGGTTTAATCTTGCTCGTGCTTCATTAGTGGTCAGAACACCGCCTTGCAACCCCTTAACTGCTAGTTCTTGCATCGTTGCTGGGTCTGCACTGAACAGCTTGTCAGTGTTGAAACTGAATCGATTATCGCCAGTCGAAAGTTTAGCATCCATCTCACTTGTGAAGCAGGTAAAATACTGAATCAGTGTGTTTTGCAGATAAACCAAATTCGACTGTACGGCATTAGAGTGCTCGCTTTCGATACCCAGCCGATCCAATGGTAACCCGAACGCTTTAGCAATCTGTTTAGTTGTCCAATCGCTAGAATTGACTAGATTAAGCACGTCAGTATTAACTTCGAGTTGCTTATAGTCCATATCATTGTCGAGAATGATTGTCTTGAGGGCATTATCACCACTGTTGGCAGCTTCAAATTTATTACGGATGTTTTCTTTGGCCTTGGTGTCTAGCTGGGTCTTGTTGACCTTAAGAATGCCTGTCCCTTGGACACCGGAGTTAAAGAAACCCTTCAGCAACGCATGCCCAGACTTTTGTACCCCAACCTCATCACGGAGGCTATAAAGTGGTGATAGTCCTTTGTAACCGTCTTGTGTGAAGCACTTGAAGTGTAAGACCTCACTGGCATTTAAACGCTGTGAACGACCGCTGTCAGGCGTGTATTCGTAACTGATAATGCCGGTCGTATCATCTTGTTTAACCACCATTTGACTGTTGGGGACTAACTCGAAGCCAGTGACTTGTCCGCTAGGATTTTTAGTAACCCGTGCAAAGCTGTTACCATTCAGCAGCATGTTAGCAGCTAGGGCAAACTTGAACCCCCACGCGGTCATGTGGTCATTGGGTGCTTTGTTAAGGAGCACGCTGATGCGCTTGTCACTATATTCAATCGGATTAGTTGCAAGATCACTGGCAATCACGCGCACCGCTGTAAACACATCCGAATTACGTAAAGCACCAATCCCCACATATAAGCCGCTGTCATTGCTGGTCATGCTGACAAGCGCATCTAAGAACGGGTCGCCGTTGTCATCGCGTGGTTGTGTTGTGTCATTCGTGAAAAAGCTCATTGTTTCACCTCCCTTTGTTGAAGTTGATGATGACTGCGACGGAGATCAAGGCCATGCCGACTGCTAACATACCAACGCCAAACCCGAACAGCCACCAGATACCGACAACCATACAGATCAGCCCCAGCAGTAATAGCACGGTCTGCACATTAAAAACTAAAGTCATCGCTCGAATAAAAATCATTGGGTGCTACCTCGCTTTCCTTGCTTTGATCCATTGCAATTGTGTAAGCATTCATCAGTGCGGCTATGGGTGGATGTAAGCTGATTCCTGAGACAACTTTTAAGAGAGGGTATAATGAATAAATCGTCTCTCAAAAGGAAGGAATTTTTACATGCCAACTCGTTACGACAAAGAATTCAAACAAAACATTATCAACCTATATAAGCAAGGCGAATCAGCTGCCCAACTGGCCAGAGAATATGGCATTGGCTATTCAACAGTTCATAAGTGGATCCAGGGCCAGGCCAAAACTCAATCCGGTAAATCGCCAGACGAAATCAAAGCGATGGAAAAGCGACTGGCTTCGCTGTCTGAGGAGAACGAAATCCTAAAAAAAGCCCTGGGCTTCCTTGCGCAGAAGTAACCAATATCTTTGATTACATTCACCAAGAAAGCCATCACCACCAGGTAACCAAGATGTGCCGAATCCTCGGTGTTTCCAGAGCTCAGTATTATCGTTATCGATCCCCCAAACCTTCAAAACACCGGGCCGAAGATGCGGGCTTGAAACAACGGATTCTGCGGATCTTTGCGGAATTTAAGCAGCGATACGGTGTTATGAAGATCCACCATGAATTGAATCTGGAACTTCAACCACTGCAGCTTCGGTGCAGTCCACGACGGATTTCCCGGCTCATGAAGGAACTGGATATCCACTCCGTTACCGTCAATAAGTGGAAAGCGGCTTCGGCTTCCAAAACCAAGGTTGAACAGCGTCCCAACTTGCTTAAGCAGGATTTCTCGACCACTGGTTTAAATCAAAAATGGACCGCTGATATGACCTATATTCAAACGAAGCGTAATGGCTGGTGTTACTTATCAACCATCATGGACCTGCACTCACGACGGATTATCGGCTATTCGTTCTCAAAAAAGATGGCTACTGATTTAGTCTTAAAGACCCTTGAAAGCGCGGTTAAAAATCGAACCATTACTGGGGACCTGATTATCCATACGGATTTAGGATCACAGTATACCAGCGATGATTACAATCAACGTTTAACTGAGCTACATATCCGCCACTCATACAGCCGTAAGGGTTGTCCGTATGATAATGCGCCAATGGAATCCTTTCACGCTTCCCTCAAAAAGGAATGTGTTTATCCAGTGCCGGTCTTTGAAGATTATGAAACTGCCGCTGCCGTCCTTTTTGAATATGTGCATGCTTTCTACAATAGGAAGAGAATTCATAGTTCACTGGGCTACCAGACCCCCTTACAAGTTGAAATTGCAACACTTACGAGCCAAATGGCCGCCTGACTTAATGCTTTCCAGGGTTCAAATAAGTTATTAATCGCAATTAATGATTTATTTGAGCTGTGGAAGGTAAACGCGGTTCTGAATGTCTCTTAAAATCTGTCTCAAATATTGACTTCAATCCAAGAACTGGCCTTAGGGTTCCTTGCTTGGCTGCTAGATCAACATCAGCTTGCAAGCTAGGCCGCATTGTCTTCGCTCTTTCAGCATTAGCCAGTAGTGGATTGGACTTCTCCCAAGTCTCTGGCGCAAAGGCTTCGTCCCGGTTGTCAGTTTCGAAAATGGCAATGAAATACCGATCAGCTTGTTCGCGACCGGTTAAGATTTTGGAGACAAATTTATATTCTTTATACATAGGGCCATTCAGGTCTGGCCCCGTAGTTGAGATTAGGGCTAGTAGGCTATTGTCCGAATTGATCTGTCCTGACTTCAGTGTCCGTAAAATCTCATCAGTGCG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58 | Lactobacillus_phage(22.22%) | head,tail,terminase,transposase,portal,capsid,integrase | attL 1854345:1854361|attR 1902626:1902642 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2006443 : 2113203
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP044361|2006443:2113203|DBSCAN-SWA 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108 | Lactobacillus_phage(60.0%) | tRNA,tail,terminase,transposase,protease,holin,integrase | attL 1994165:1994224|attR 2110931:2112410 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2224284 : 2262290
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP044361|2224284:2262290|DBSCAN-SWA ACTATTCGGGCATGAATGTTGTTGAATCATACAACTCGTTGTTTAAAATCAGGTGGTGCATGAGCCGGTTAAACTGACTCATTGCGGCGATGGCAATTTTCTTAGTCCCGTGGGACTGAGCGGATTGCTTTTTTCGTTTGTAGTTTGCGCTGATCAGCGTCGGTTGATATTGCGAGACGCTGATAATGTTTAGGATTGCCCTGTACAAAATCTTTCGGGCATACGGGTTCCCACGTTTTCTAATGTGCATTTTTGCTTCGTATTGTCCTGACTCATAGCGAATCAAGTCAATTCCAATATAAGCATTAATCGCATTGGCACTGTGAAAACGTCGCACGTCTCCCAGTTCTGCGATCAAGCATAGTGCTGTTTTTATACCGATTCCTGGGATCGAAACAAGGAGCGGCACTTCGCTGAGGTTTTCTCCCAAAGTTGTCATTTCTACGATTATCTGGGCCTTTAACTGATTGATGCGTTCAACTTCTTTAGCCAAGGCTATAACAGCTCTGACAGCGTGTGACTGTGGCTCTTTTGCCGGCGCTGAGTTTTGAGCTAAGGCCAATAAACGGTTGGCCAGTTTCATAGCTCGCTTGAGGCCTATCTTTTTAGAGGTCTCGGTTAAGATGATTTCTGTCAGTTCATTCTCTTCGTGAGACAGTACGATCGCTGGGTGCGGAAATCTTTGAACGATGTGCCAGTAGAGAACACCGTCAGTCGAGCTCATAAAATGCTCGATTTCCGGAAAGGTTAGCTGGAGCGCTCTATGCAGACGATTCTTGTTGGTTACAATGTCTTTATTAAACTGCTGATACGTCCGCTCTAGATCGTGTAACTCTGTATAAACTGGGCTTTCCTGATAGGTTGGCCTGAAGTGATTTTTGATCATCGCTCTGGCTAAACCCACCGCATCCAGCGCATCAGTTTTTGTATGCCTGAATTCTTCCATCACTTTCTTTGCGGCTAATGGATTGAGTTCTGTATATTTCCAGCCGTCTCGCTGTAGAAAGGCACGCAAACGACGAGAGTACATCGCGGTCGCCTCGTATATGATTAGGGGTGCGTTGAAGCTATTGAGTTCATCACTTAATAGCGAAAATCCTAACCGATCTAACCCAATTTTAAATTGCTTGATAACGACGTTATCAACAAGTACCGCTACATTGGCGTTCTCTTTACTGACATCAATACCAAATACACATTCCATACAACAAACACCACCTTTGAAGTTGTTTCACCGATTCACTCATCCCAATTTTCAATACACGGCGTCTTGCGCCAACAGACTGCGAACGAGTTTCTTGGTGGATCAAGCGAAGTTGCCAGTTTGATTTACGACGTCAAAGCGCCAAAAAGACCTACGGCATGTCAACTTCAACACCACTTTATCAAAAAAGAAAAGTGACGAACCAAGATTCCGTCGAGTCTTGGTTCGTCACTCATGTTAGTCTGTTTGATTCTTTTAGTAGTGATGTATACTTGCACAAAAAGAGGGGCATTTGAAATGGATGATACTTTGTTTGTACTAGGGAATGGATTTGATATACATTCTTGTTTACCAACCCGTTTTTGCCAATTTCGAAAATTTGTTTGTGAGAGAGCGGACATTAATCCGGGAAGGGTTTATAACGACATGGATAAACTTTTTCCAGAAAGCATGAATTTCCAACAAGATCCTAAAGGTGGGCTAAATGGTCCCTATATGAAGATTTGGATATACTTGTTAGATAGCGCCTCTAAGGAATGTTCAGCTTATGATCCCGATAAATATTGGGCTGATTTTGAAGAAGACTTAGGTGGGTTGCCATACGAAGACGTGCTGGATCAGCCAGAAATCCAATTCGATAGCGAAGGGGATGAAGATCCTTTCCAAACTGGGGAGGCAAGTCAATCAATGGAGCAATACATATCCGTAAATATGTTGACCAAAGAGTTACGAGAATGGATTGAGAACGTTGAAGAAACTAGTCCTGAGATTGATAAAAATCTAGCTGAAAGATTTAAAGGCCATAATAATATGTTTCTTTCATTTAATTATACCCTAGATTGCATAATTAAAGTTACCACCCAGAAAATGTGAAAAAAGACCTGTCCGTTCTTGCTAAAATGGTGTTTGCATAACATACCATCTAGAGAGAAGGACAGGTCCCATGGCCATTATAACCTTAATTGAACGATCTCAGATAGAACTGATGCAACACCACACGATTCAATACATCGCCGCGACCTTAGGCCGCTCTCGTATTTCTATTAGGCATGAGCTTCACCGTTGCCCTGAAGGTGATTACTGCGCCATTATAGCTCAGGATCATGCCGATACTTGTCGGCATCGTTGTGGTCGGCACTCGATTTTAACGCCTAAGTTGAAGCGGATGGTAACTGAGAAGCTAAACCTAGGTTGGTCCCCTGAAATGGTCGGTTATGCCGTTCACTGTGCGCCACACACGATTTACCACTGGATTTATCAAAGACAAGTCGATTTTCAGCCAAGCCAACTCTTTGATCACGGTAAACGTCATAAAAGAAGACAAGACCTTCGGTCGCGCTATAACCAAGCAGTAGGCACCTCAATTGAGATTCGCAGTGAGTCAGCTAATCGGCGAACCGAAAAAGGACATTTAGAGATGGATACAGTTCGCGGTGGTCGCGGGTCAAAGGCTGCTGTTTTGACCATTGTCGATCGGGTGACACGTTTAATGGCGACAACTAAGCTTGAAAACTTATCACAAAATGCTGTTCTTAAGGGATTTGCAAGACTGATGGTGGACTTTCCGGGTCCGGTTCGATCAGTGACGGTTGATCACGGTAAAGAGTTTTCCTGCGATCAGGCGCTTACAAAGCGCTATCGGATACCGGTTTACTTTTGCCACGCCTATCACCCGAATGAACGGGGCACAAATGAACGGTTCAATCGAGAACTTCGCTACTATTTCCCGAAGGGAACACAGTTTGATCAGGTTTCAGAGACCGATATTCAACAAGCCACAGCGCTTATCAATAACAAACCTAGAAAATGTCTCCGTTGGCAAACCCCAGTTCAAGCAGTGAGCAAGCCTCTTTCTAGGTGGTAACTTTATTATTGCAATCTAGGATACTAACACATTAGAAAAATGGTATGGAATAGATTATACACAGGTTACGCATATCCATGGATTTGTTGACAATGAAACACAGGTTCCTGATACTATTATTTTTGGACATAAAGATAACGATAGTTATAATATGCCTGCTCCGAGTGAAGAGTATATGTCAGACATTGACCAAGAAACCTTGAAACCTGTTCTTGATATCATTAGTAAACACGAATATTTCTATAAAAATATCATGGCAAGCAATCTTAAGAGCCTGTTCTTTTATGGATTTAGTTTTTCAGAAGTAGATAGTCCTTATATTGAAAAAATACTTAAATCAATTACTACATCAAAACCAATTATATATATAAACAAAATGTCATTCGAAGCAGGAATATATTATTTAAAGCATGTGTGTGCTAAATTAGGATTAAATGCAGTGTTCTACAAAATTTCGGATCCCCAGTTTACAATTCAAGTGCAACACCCTGACGACTAGACCATAAAGGCCATGAAGACCTATTCTTGTTAGTGCTAGCTAAACAAGAAAGCAGGAATCTTCATGACCCACTCTCAGACTAACACCCACAAGCATTACCAACAACTCAGTTTTAGCGACCGTGCTACAATTCAGGCCCTTCACGCTGCTGGTGACACCGCGACCGTGATTGCACAGAAGCTTCATCGCAGTAAAGCGACAATCTCACGAGAAATCACGCGTGGATCTGTAACTCAGCTCGACTCGAAGCGTCACTCGCATCAAGTCTATCTTGCGGAAACTGCCCAAGCCATGCACGACCGTAAACGCGATAGAACCGGTCACTACGCCTTTCTTAAGACCGGCCGTGCGTTCTTCAAGGCTCTCTCCAGGGAGCTTACTCGTAAGCCGCGCGTACACAGCGTTGATAGCTTCGTACACTTCTATCGCGACCAGGGCAAGGCTTGCCCTTCAACGACAACTGTGTATCGCTACATCGACGCCGGGCTGCTTGAGCTAGACAACATGACACTTCCCAAGAAGCTCCGACGCCGCATCAAAGGCTATAAGAACGCCCACAAGCGCAAGAATAAGAAGATATACGGCGACTCAATCGAGTTGCGTCCTGCGGCCGTGAATGACCGCACAGGCGTGGGACATTGGGAAGGCGACTTGGTCAAGGGTATTCGCTTAGCTGATGAGCCAGCATTAATGACGCTCACAGAACGGTACAGCCGGACTGAGATCATCGTCAAGATTCCTGACTATCATGCGGGCACCTGCCTTAAAGCCTTGCAGGACACGATCGACGACTACGGGGCCAAGGAATTTGAGAGTATCACTTTTGACAATGGTTCCGAGTTTGCCAAGTTATCAGAGATTGTTGGAACCCAGATTTACTTCGCACATCCGTACTCGCCTTGGGAGCGTGGCACAAACGAGAACGCCAATGGACTGCTTAGGGAATTCTTCCCGAAAGGGAAGTCTCTCAGAGCAGTTACCCTGGTTGAAATTCAAGCAGTCCAATCCGCACTGAACCATCGTCCCAGACGTATTCTGAACTATCTTCGCCCATGCGATTACTACCGATGCATGGCGTAACAGCCTAGACCACTATCAAGAATTCGTTATCATCGTTGCACTTGACTTGAAAATTGAGGCATCGTCAATAAGTCTTCGACGGTCAGGTGCTGTTTTTCCTCGCCACGGACATCAACAGCAATTTCACCATGATCCAGCATGATTAAGCGATCACCATATTTCAGTGCACTGGCCATGTTGTGTGTGATCATCAAAGTTGTCGTATGTTGCGCGCGCACCATTTTATCAGTCAAAGCCATGACGGTAGCGCTTGTCTGCGGATCAAGCGCTGCTGTGTGTTCGTCAAGCAATAACAACGCCGGTTCTTTTAAAGTAGCCATCAGCAAAGTTACTGCCTGTCGTTGACCGCCAGA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39 | unidentified_phage(22.22%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
2465800 : 2536149
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP044361|2465800:2536149|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP044361|2465800:2536149|2487667_2488570_-|WP_003567840.1|DBSCAN-SWA MANFSYEVFSKVVERGTLAKAAAELNVTPSAVSHSVSQLETELGFPLLIRNRTGVALTEDGAQVLPIIQSIQNLEEQLTQVADNINGVNTGRIRIGAFSSVSTNWLPTIIRRFKKRYPHIEISVVQGTFNRIVEAVRLGTADIGFSSLPVGPGVVVEPLLKDPIYCITPKQFKPKNGRTVTQADVDKQNFILQQIDYDRDTKNALDRYHVSSNAINYSIDDQSILSMVESGLGMGILPKLAVQKLVGDVNMYPFSEPFERTLCLVINPTIKKSPSVQRMQQVIHSFLAETYGEAFLGHQG >NZ_CP044361|2465800:2536149|2488819_2490022_+|WP_003600064.1|DBSCAN-SWA MKFATRTQKTGHSGLEDLFAASGPNVISFAGGYPDRDLFPTKQLNQAFSQNFTSGDRELLQYASTEGYEPLRAKIAARLQTTGMQVDADDIMMTQGAQQGIDLVARLMLDPGDGLVVEAPTYLGALAAFNAYQPTYYEVPMQADGMDINALQRILMSRKVKFIYTVPDFQNPTGVVMSLAKRQAIIRFANQYDVMILEDNPYRDLRYTGKALPTIKSLDTEGRVIYLGSFSKILSPSLRMGWLVAAPNLLKELLALKGGSDLESSNLVMHGINTYMENNDLDAHIREIQDCYREKKNAMVAAMKRYLPEEAHFTNPDGGFFIWLTMPAGFDMGVFMKEHLLPEANISYVPSTNLYATAALSNGARLNFTGPSLAQIDTGMKALGAALKVALQHNLVAEQA >NZ_CP044361|2465800:2536149|2514324_2515266_-|WP_159301300.1|DBSCAN-SWA MQKLTIVIPAYNEQEVLKDTVPRLWSIEREVVTQNFLSEDSDILIVDDGSSDNTWSIIESFHKQHSKIRGLRFSRNFGHQAAVIAGLTEAIRTTNMTITIDADLQDDPEKIMEMVQAYSAGADIVYGVRTHRETDSWFKRTTAQGYYKLLRLLGVQMVPNHADFRLMSKRAVQTLLTYPERNMFIRGLIPKLGFQTVKVYYKRTPRLAGESKYPLKKMLAFAWDGITSLTIAPVRLILLLGTLAVMLAFGMSVYSIIVKVLGLTVHGWSSLMVSLWFLGGLQMMSLGVIGEYIGKMMTEVKGRPRYTIQTRLD |
60 | Bacillus_virus(21.43%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
0 : 6282
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP044366|0:6282|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP044366|0:6282|5400_6282_-|WP_003582592.1|DBSCAN-SWA MQSKLNLKRPLTITVANAKGGVGKTTITRYLPYDLAERGYKVLVIDADPQANLTKSMGITKQQHDPDNIFTIDKSMMAAVRDGSFKGAVLEIVPNLYELPSQIDFRGFETFLSKKYGVAEKGDPEYLSVESKKVSLLKGLIEPIKADYDFVFIDTPPTAGQYVRNATFASDYVIIAFQTQSDSLDGAIQFISDDLTELVETFGARTDVLGILPNQVSKSGAIDQVVIKDAIARFGQQNLFDHIIPFARRIQAAPRMGLSRQGYWNQKLFDDIVDPLTDDFLQRLKIVGEVTNG >NZ_CP044366|0:6282|5021_5408_-|WP_003582590.1|DBSCAN-SWA MADTKKNTIGFFNKEKKHSPDMAYKEDIPVKETYKGSGLKAFDPSAEKKTTPVTHKVKDARRTIRIPRQQYYELLALLELSPNKYVYELIAELVDRAVKEISTDRPDELRLYQQAIERIKATDERRSR >NZ_CP044366|0:6282|3927_4713_+|WP_159301374.1|transposase|DBSCAN-SWA MPDYPSNISRAQFALIQPDLENFRKHTRPRRYDLYDVFNAILYSLTTGCQWRELPHDFPEWHTVYRYYDMWRDKPDPTADSLLEGAFKKTVASYRFAQGRSARTSFVIVDAQSVKTTDLTKNSGYDGGKKISGIKRHMAVDINGLPQAILVTRANVSDRPGALAMFSLASQNLELVQHVMVDGGYTGNDFADQVKLILNAKTTVAKRNELHMFTVLPQRWIVERSWSWLDKCRRLWKNCERALNSSLQMVVLAFLKIVLKRY |
3 | Enterococcus_phage(100.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
17291 : 19744
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP044366|17291:19744|DBSCAN-SWA TTTGTCTAGTATAACCTATTCCGAACGAATTAAAATCGAAACCTTTTGTGAACTAGGGCTGTCCAATATCCAAATGGGCGTTCGGCTGAACCGATCACCGTCAACAATTTCTTATGAATTATCTCGATGTCAACCTTATCAGGCTGAATTAGCACAAACAGATGCCGAATACAAGCGATCACGATGTGGTCGGAAAACTAAGCTGAGCGATGAGTTAAAGCAAAAAATTCTCAACCATTTACGTCTAAGCTGGTCACCAGGAATGATTGCTCACGAATTTAAACTAGCTACTAAATCTATTTATAATTGGCTAAATCAGGGGAGAATTGGTTTCTCCTTGAATGATCTACCTGAACATGGCGTACGCCAACGGCGTAACGTTGACCAACGATCCAAATATAATCAATCTTTGGGGCGATCAATTGAACAGCGTCCCATGATGATTAATCAACGTAATCGCATCGGCGATTTTGAACTAGATACAGTCGTTGGTCCTCGTGGGCATAGTAAGGCAGTTTTATTAACTTTAATCGATCGAAAATCACGGTTCCTTTGGGCATGCCGGTTAAAAGATCGGACGACAGCGACTGTTAATGAAGCACTAACTAAGTTCCTAACCACTTTTAATGGTCCGGTGCACAGCTTTACTGTGGACCGTGGCACTGAGTTTAGTGGGCTAGTATCACTTGAATCACAATATGGTATTAAGGCCTATTACTGCCATGCTTATACGCCGGCTGAACGTGGTAGTAATGAACGCTTTAATCGGAATTTACGTTATTTTTATCCTAAAGGGACTCGTATTGAGCACATTAGTGCTCAAAATTTAACGACGACGTTACTCCAAATTAACCAGCGACCGCTTAAAATACTCGACTGGCAAACACCGTATCAGGTTATGCTGACAAATTTGTCCAAAAATTCGGATTAAATTTGCAATCTACCCTAACCATTAAATTCGAAACCTCTGTTCCAATAAATTTAATATGAACCTCATAATGTAAATTAAAAAAATATATCGCAATGTTCTTGCTTGCAGTATGTCTCGCTCTTATCTGAATAAGATGACATTCAATCTTATCAACAATATAACTAATATAACAAAAGCAAATTAAAACATTCACGAAACAGAATTTGAAAATAACACCAGAGAAAAAATATTTTCAAGCTACTAGAAATTTCAACTATTTATCATGACTTTTTTATTTTTTAGCTCAAAAATGATTGACAGATGTCTCGAAATTGTGTATATTAATCACAATAAAAATTTCGGAGGTGTCATGATGAGTCAATCAATGTTTAATGCGATTAATTGTTGCTGTCGAACAACGCGTTTTTGGCGATGTTCGGCCTGTTAGCATTGACGTTTTTTGGGAAATCATGACCTAAAAAGAGTTCAATGTCCACTTGGCTGGAGTTGAACTAAGGGCGCGAAAATTCTGGATTTCAGAATTTCGCGCCCTTTTTCTATCTATTGCAACCATTTCCCCTAGCATCCCGCCAGCTAAACACTGCTCCAAATGATTAGAAAGGATCTTATTTATGCTTATTCATTCCATTTCAGAACTGATCGGTCATACGCCACTGATTGATCTGCAAATCAACATTCCAAATCACAGTCACATTTACGCCAAACTGGAGATGTTTAATCCAGGAGGCAGCATCAAAGACCGCCTGGGCCAATACATGATTCAAGATGCGATTAATCGTGGTCAGGTAACTGAAGGTGTAACAACAATTATCGAACCTACTGCCGGCAATACCGGAATTGGGGTTGCCCTTGCCGCTCAACAACACCATTTGTCAACCATTCTGGTCGTACCGGAAAAGTTCAGTTTTGAAAAACAACAATTGATGAAAGCCTTAGGGGCAAAATTAATCAACACCCCCAGTGATCAGGGCATCAAGGGCGCCATTGAAAAAGCAGAAGCGCTTCATGATCAAACTCCTAACAGTTTCGTTCCAATGCAATTCAAAAATCCGGCCAACCCTGATACTTATTATCACACTCTGGCACCAGAGTTGCTTGACGACCTCAATGACCCAATTGACGCCTTTGTTGCCGGTGCGGGCAGTGGTGGGACATTTGCAGGCGTCGCTCGTTACTTAAAGGAGCAGAATCCGGCGACTCAAACCATCGTTGTGGAACCTGAAGGCTCAATTCTAAATGGTGGGCCTGCCCATCCCCATCGGACTGAAGGCATCGGTGTTGAATTTGTCCCACCATTTTTTAAAGATGTTCAAATCGACAAAACGTTAACAATTGCCGATGCCGACGCCTTTCATCAAGTTAAGGAGCTTGCCAAGAAGCAGGGATTATTCATTGGCAGTTCAAGCGGGGCTGCTTTGGCTGCCAGCTTAAAGGTTGCCAAGGCACTTCCCGAGAATAGTACCATTGTCACAATTTTTCCAGATAGCAGTGAACGTTACATGAGTGAAAATATTTATGATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP044366|17291:19744|18832_19744_+|WP_003603806.1|DBSCAN-SWA MLIHSISELIGHTPLIDLQINIPNHSHIYAKLEMFNPGGSIKDRLGQYMIQDAINRGQVTEGVTTIIEPTAGNTGIGVALAAQQHHLSTILVVPEKFSFEKQQLMKALGAKLINTPSDQGIKGAIEKAEALHDQTPNSFVPMQFKNPANPDTYYHTLAPELLDDLNDPIDAFVAGAGSGGTFAGVARYLKEQNPATQTIVVEPEGSILNGGPAHPHRTEGIGVEFVPPFFKDVQIDKTLTIADADAFHQVKELAKKQGLFIGSSSGAALAASLKVAKALPENSTIVTIFPDSSERYMSENIYD >NZ_CP044366|17291:19744|17291_18221_+|WP_159301377.1|transposase|DBSCAN-SWA MSSITYSERIKIETFCELGLSNIQMGVRLNRSPSTISYELSRCQPYQAELAQTDAEYKRSRCGRKTKLSDELKQKILNHLRLSWSPGMIAHEFKLATKSIYNWLNQGRIGFSLNDLPEHGVRQRRNVDQRSKYNQSLGRSIEQRPMMINQRNRIGDFELDTVVGPRGHSKAVLLTLIDRKSRFLWACRLKDRTTATVNEALTKFLTTFNGPVHSFTVDRGTEFSGLVSLESQYGIKAYYCHAYTPAERGSNERFNRNLRYFYPKGTRIEHISAQNLTTTLLQINQRPLKILDWQTPYQVMLTNLSKNSD |
2 | unidentified_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
24940 : 34476
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP044366|24940:34476|DBSCAN-SWA CATGCAAGCTAATCTTCAATGGTTAGATGACCCAGAAGTCTTCCGGGTCAACCAATTACCTGCACATAGTGATCACCATTATTATCACGACACAGCAGAATTCAAAACGGGTAGTCGCTTCATCAAGAGTCTCAATGGCGCTTGGCGTTTTAACTTCGCCAAGACACCGGCTGAACGCCCAGTTGATTTTTATCAACCCGATTTCGATGCAACCGACTTTGATACGATTCAAGTTCCCGGTCATATTGAACTAGCCGGCTATGGTCAAATTCAATACATTAACACGCTATACCCATGGGAAGGTAAAATTTACCGTCGCCCACCGTATACCCTCAATCAAGATCAATTAACACCAGGCCTATTCAGCGACGCTGCGGACAACACCGTCGGCTCGTACCTCAAAACCTTCGATCTCGACGATGCTTTTAAAGGGCAACGTATTATCATTCAGTTCCAAGGGGTAGAAGAAGCCCTGTACGTCTGGTTAAATGGCCATTTTATTGGCTACGCTGAAGATAGTTTCACCCCTTCAGAATTTGATTTGACGCCGTATATTCAGGACCAAGGTAACGTTTTAGCGGTTCGGGTCTACAAACGCAGTACTGCTGCCTTTATTGAAGACCAAGATATGTTCCGTTTCTCTGGTATTTTCCGTGACGTCAATATACTGGCGGAGCCTGCTAGCCATATTACTGATTTGGACATCCGACCAGTTCCAAATGCCAATCTCAAAAGTGGTGAGCTCAACATCACTACTAAAGTAACCGGCGAACCAGCCACTTTAGCGCTGACCGTTAAAGACCATGACGGGCGAGTACTGACGAGTCAAACGCAAACCGGTAGTGGCAGTGTAACCTTTGATACTATGTTATTCGACCAACTGCACTTGTGGTCACCACAAACGCCGTATCTCTATCAATTGACAATTGAAGTTTACGATGCTGATCACCAACTCTTGGAAGTCGTCCCATATCAGTTTGGGTTCCGGACGGTCGAGCTGCGCGATGACAAAGTCATTTACGTCAACAATAAACGGTTGGTGATCAACGGAGTTAACCGGCACGAATGGAACGCCCACACCGGTCGCGTTATCAGTATGGCTGATATGCGCGCTGATATCCAAACCATGTTAGCTAACAATATCAATGCCGATCGGACCTGCCATTATCCTGATCAATTACCTTGGTATCAATTATGTGACGAGGCCGGTATCTACCTAATGGCCGAAAACAACCTCGAATCGCACGGGTCATGGCAAAAGATGGGGGCTATCGAGCCTTCTTACAATGTTCCTGGCGATAATCCACACTGGTTAGCAGCGGTGATCGACCGGGCCCGTTCAAACTACGAATGGTTTAAAAACCACCCATCGATCATTTTTTGGTCACTTGGCAATGAATCGTATGCTGGCGAAGATATCGCGGCGATGCAGGCTTTTTATAAAGAACACGATGATTCACGACTCGTCCACTACGAAGGCGTTGTCTACACACCAGAATTAAAAGATCGCATTTCTGATGTTGAAAGTCGGATGTACGAAAAGCCCCAAAATATTGTAGCTTACTTGGAAGATAACCCAACCAAACCTTTCCTAGATTGTGAATATATGCATGACATGGGGAATTCTCTGGGCGGTATGCAATCATATAATGATTTGATCGACAAGTATCCAATGTATCAAGGTGGCTTTATTTGGGACTTTATTGATCAAGCACTCTTCGTTCATGACCCAATCACCGACCAAGACGTGCTCCGGTATGGCGGTGATTTCGACGACCGCCACTCCGATTATGAATTCTCCGGTGACGGCTTAATGTTTGCCGACCGGACACCAAAACCAGCAATGCAAGAGGTGAAATATTATTATGGCTTACACAAATAATCAACTACACGTTATTTACGGCGACGGGAGTTTAGGACTACAGGGGGCTAATTTCCACTACCTCTTTAGCTACGAACGTGGCGGACTTGAATCACTCGTCGTCAACGATAAAGAGTGGCTCTATCGTACACCCACGCCCATCTTTTGGCGGGCGACAACCGATAATGATCACGGTAGCGGCTTTTCAGTCAAATCCGCACAGTGGTACGCGGCCGATAAGTTCTCAACTTGTCAAGATATCGAATTGACGGTTGACGACCAACCAGTCACACCGTTACCAATCGCGCCACTCAATAACAAATACACGGATCACGAAATCGCCACGAAAGTCTCTCTGGCTTACCACTTCGTTACCACGACCGTTCCTAGTACCATCGTCACAGTGACTTATACGGTGACAGCAGACGGTCAGATCAATATCGCCACCCATTATAGCGGTCAGTCTGATTTGCCAGAGCTACCCGCATTTGGTCTGCGGTTTATCATGCCGACTACCGCGACCGGCTTCGACTATACCGGTTTGTCCGGTGAGACTTATCCTGACCGGCTGGCTGGCGCAACACACGGGCAATTCCACGTTGACAGTCTGCCAGTCACACCATACTTGGTCCCACAAGAATGCGGCATGCACATGCAAACTGAACAAGTGACAGTAACGCGATCAACAACACAAAATAACGCTGACCACGACAACACACCATTCAGTTTGACATTTAGCCAAGCCGATGCACCATTCGCCTTCAGCTGCCTTCCCTATACCGCTGCTGAACTAGAAAACGCAACACACATGGAAGAATTACCATTAGCACGGCGAACGGTCTTATCAATCTACGGTGCCGTTCGTGGGGTCGGTGGCATTGATAGTTGGGGAACGGACGTAGAAGCCCCATATCATATCCTCGCTGATCAAGACATTGACTTCAGCTTTAACATTCATTTCTAAAAATTAATTTTATTTCAAAAGAACGCTCCGGCAGGTTATTTGCCAGAGCGTTCTTTTAGATTAACGATGATTAAGTTTTAATATGTTTAATGGCTGAGCTTAGTCCTTATCCTTGAAGTAATGTACCTGCGCCGTATAGTCACTAGTTTGAACGGGAGTCGTGTAGAGTCCTAGTTGCATCAATTCATCGCCACCGTACATTTTGTTTGTGTCGGTCTCAACGTAGGTCTGCTGAGGGTCTAATCCCGCTAACTTCGTAATATGCGGTTCTGGTTGAACTGCACCTAAAATAACGAAGGTGAACAGCAAAGCTTCTTTCTGATCCGGACTAACAAACATCCACGCGACCGTATTAGAACCTGTCTAGTATCTGCTGAATCTGGTAGAATTGTGGAAAACCGACTGAGGAGTTTGTCATGCCAGATTATCCAAGCAATATTTCTCGAGCGCAATTTGCGTTAATACAACCTGATTTAGAAAACTTCCGCAAGCATACAAGACCGCGTCGTTATGATCTTTATGACGTATTCAATGCCATCCTTTACTCGCTTACTACAGGGTGTCAATGGCGTGAATTACCGCACGATTTCCCGGAATGGCACACTGTCTACCGCTATTACGATATGTGGCGAGATAAACCAGACCCGACAGCTGATTCGCTATTAGAAGGCTTTTAAAAAAACTGTTGCTTCCTATCGCTTTGCACAGGGCCGATCGGCCCGAACGTCGTTTGTGATTGTTGATGCTCAAAGTGTTAAAACCACTGATTTAACGAAAAATAGTGGCTACGATGGCGGCAAAAAGATTTCAGGGATTAAGCGTCATATGGCGGTTGATATTAACGGTTTACCACAAGCCATTCTCGTGACACGAGCTAATGTATCAGATCGTTCAGGTGCATTGCTATGTTTAGTTTGGCTAGCCAAAATTTAGAGCTGGTTCAGCATGTCATGGTTGATGGTGGCTACACTGGCAATGACTTTGCGGATCAGGTGAAGCTCATTTTGAATGCTAAGACGACGGTAGCTAAACGCAACGAGTTGCATACGTTCACGGTGTTACCGCAACGATGGATCATTGAACGTTCATGGAGTTGGCTAGACAAATGTCGGCGACTTTGGAAAAACTGTGAACGCGCCCTTAACGGCAGTCTTCAAATGGTTGTATTGGCCTTCCTGAAGATAGTTCTTAAAAGATACTAGACAGGTTCTAATGAAATCGTCATTGGTGGCGATGAGCCCGATAATGCTTTAAAATTGAAGACGTTATATCATGAATATGCGCATAGTCAGTTACATGGGTTAAAATCAGCCTTTAAAGATCGCCCGCGAGCCTATCAAGAAACGCAAGCCGAAGCGGTCGCATATGTTGCCATGCAAAATATTGGCGTTGATACCAGCAACTACTCACTCGGTTACGTGGCCACCTGGGCCAAAGATAAAGCCGTAATCCATAGCGCTTTAAGTGAGATCCAGCAAGTGAGCAACAAAGTGATTGAGCTTAGCGATGGCTTAACCAAACAATTAGGCTTACAAGAAGCCCCAAAAGAGCCTGAGCATAATCTAAAAAAGCTATCAGCCCATGATCTTAATAAGTCCTATCAAGGCTTGCAACAACAAGTTCAGCAAGCAACGAATCCACAACAAAAATCAGAACTACAAAATAAATTAAATGATGTACACCATGAAATCAGTAATCGAACGCAAAAACAACTGAAAGCATTTTCTGAACAAAACCCGGCAATTAAACAACCAGAACATAATGCAGCTAAAACATTGAAAAGATAGGGGGATTTAACACTATGAAAATTGTTCTTTTAGATGGATATGAACTAAACAAAGATTTAAATTGGAAAAGCTTGCAAGAATTAGGCGACTGCACTTTATATGATCGTACCCCAGTTAACGATAACGCTGAAATCATAAAACGAATTAAATATGCTGATATCGTCATTACACACAAAACACCGCTAGATCATGAAGTGATTAGCAAAACATCACGATTGAAGTATATCGGAATCATGGGAACCGGTTATGATGTCGTTGATATTGAGAGCGCACACCAGAACAAGGTTGTGGTGACTAACATTCCCACATATGCAAGTGACGCAGTGGCACAATTTACTTTCTCGTTATTATTAGAAGTGACTAGCCAAGTTGGATTGCATAATCAGCTTGTTCATGAAAACCGGTGGGCACAGGCTCCTGATTTTACTTTTTGGGAAAAACCGCTATTAGAATTAAAAGGGAAAACTTTAGGAATAATCGGTTATGGCCATATTGCGCAAAAAGTTGCTAAAATAGGACACGCTTTTTCTATGAAAGTTATTTTCTATAATCATCGTCCTAAAAAGGTTCCTGAATCATGGATTCAGCAGGTTTCATTTGATGAACTATTAAGGCAATCTGATGTGCTTAGTCTGCATGTGATCCAAACACCAGAAACAATTGATTTAATTAATAATGATACGATTGCCAAAATGAAAACTGGGGTTATTATATTGAATACGGCCCGAGGCAAATTGGCTAATGAAGCGGACATCAAGAATGCCTTGAATGAAGGCAAAATTTATGCCTACGCCACTGATGTTGTTAAAGGGGAGCCCATTGCTAGTGATAGCCCATTATTACAGGCCAAAAATTGTTATATTACCCCACATATTGCTTGGGCACCATATGAGACAAGAGAACGGTTGTTGCATATGACTGTTGATAATATAAAAGCATATTTATCAGGAGATCTGAAAAACGTTATCAATTAACGGCAATGGTCTGTGAATTCTTTTGCCTCCATTATGTCCGCCCACTAGTGAAGCCCGCTTGATAGCGGTGCCTCCCTTTAATAAACTGGTCGCGTAAACTAGTTTGGTGAACCCAAATTGCCGGTGAATTTCATCAATCATTTGGTTTAACCGGCTATGGCGAATTTGGTTGCGCGGGGTTTCAAATAAATTAAGTTGTTGGCCGGAGTTGGCACTTAGTTTACTGCTATAAACACCAATATTCCGGACTGCTTGACCGTCCCAGTTCTGACGGAATAACCACAATAATTGTTGCGTCAAAACTTGATTGTCATTAGTCGGTTTAATTTTTAAAGCTTGGTGAAAGCCACCGCGGCCATCTGCTTCGGCTGCGGCATAGGAAAACCCAATGCTTAGCGATAGACACCCCGCCAGTTTATGGTGGTGCCGAAGCCGCGCCGCCACCTGTTCCCCAACTTCTTTAATGACGGTTTCAATTTCGACTTGGTTAAAATAATCTCGTGGCAATACTTGCGAATTACCCAGGCTAGCTTCTAAGATCCCCAGGTTTTCACCAACGTCCCAGTGGTGTTTTGGCTCAAAGTCAAAGTCGCGGATCTTACCGACCTTGCGGAGTTCAACAGCACCCTCCTCGGTCAGGCTGACTGGCACTCCATCGTGCGGGATATTCGGCAAGTGGGCCATCTTGTCATGAAGCTGCTCGTCATTGGCCTCGATTTGCTGGTCGAGTTCCTTAATCTTATCACCAAGCTCCCGGGTCTCCTTGATGGCTGCATCAGCGGATTCACCATTGCGCTTAGCTTCACCAATCTTTTTAGAAGCGGCGTTGCGTTGAGCCTTCATGGTTTCGGTTTGTTGCAGGAGTTCCCGCCGCTTTTGGTCAAGAGTCAAGACCTCATCGATCTCTTCGCCCATGCGATTACTACCGATGCATGGCGTAACAGCCTAGACCACTATCAAGAATTCGTTATCATCGTTGCACTTGACTTGAAAATTGAGGGTTAAAATATAACTAATAAAAAGTAAGGAGGGCCATCATGATTCATAATTCTACCATTGATTACCAGCTCAACCATCGATTCATCCGGGCATTTAAGCCCCAAAACCTCAGTGATGACCAACTGACCACTCTGTATGAGGCCGCTCGTCATGCCTCAACCAGTATGTTTATGCAGCAATTCAGTATTCTGCACGTCACTGATCCCGCCAAGCGAGCCGCAATCCGACGCCTCGGCAGACAACCTTATATCGGTCAAAATGGCGACTTGTTAATTTTTCTAGTCGACCTCTACCGTAATCAGAAGATCCGCCAGGCCGCGGGTAAGGATGACGGTCGTCTGCACACTACAGACATCTTCCAACAAGCCGTTGAGGACACAGTTCAGGCTGTTCAGAATACTCTGCTCGCTGCCGAAAGCATGGATCTGGGCGGTGTAATCCTCGGTTCCATCAAAAATAACCCAATCGAGTTGATCAAAGTCCTTGACCTGCCGAAGATGACTTTCCCACTGCTGGGCCTTCAGGTCGGCATTCCCGACCAGGCGCCTCAGCTCAAGCCTCGGCTGCCGCTGGATACTCTAGTGATGGAAAATAACTATCATCGCGCTTTTAAGGCCAGTGACCTCAAAGACTATGACCAGGTCGTCAGCCAATATTATGATCTCCGTGACGCCAATCGCCGGATCGACTCCTTCACCAAGCAGATCGCCGGCGCCAAGCTCGACAACCACGAAACAACGCGGGACAAGCTCGCCGCTGCCCTTCAGCAACAGGGATTGGCCCTGGACTGGAAACAAACTCAAACACCTCACTACCGTTGGTTTGACATGCTAACGGTAGTGAGGTGTTTTTTAGTAATCGAGCTTAATCGCCCAACACGAGCCGACATCCTACTGATATAGCAAAAGGGTTCTGGTGCAAATTTTCCTCGCTGACTTGATTTTAGTATACTGGGTGCCAAGAAACGAGGGATTGCGCGCATGAATCACTTTAAGGGACGCCACTTTCAAAAGGACATCATCTTAGTAGCCGTTGGCTACTATTTCAGATTCAGTCTCAGCTATCGTGACATCGTTGAATTGCTTCGGGATCGGGGTATCACTGTTCATCACACCACGGTCATGCGTTGGGTTCATCACTATGGCCCCATGTTTAAGACTCTATGGCGTCGGCATCAAACAGCTCACGCTAAAAGTTGGCGAATCGATGAGACCTATATTCGAGTTAAAGGCCGTTGGGCCTATTTGTATCGCGCTATTGACAGTAACGGTTTGACCATGGATTTTGAGCTACGAAAACACCGCGATTATACCGCATCCTATCACTTTTTGAAGCGTCTCTTGAGGACCAATGGTCGGCCTGATCGATTAGTCACTGATCAATATCGGGCAACACTGAAAGCAGTGAAGCACCTGATAAAGCAAGACTATTTGAGCAAATCAACCCACCAATGTTCCAAATATCGAAATCATTTGATTGAACAGGACCACCGATTCATTAAACGTCATCGTGTCCGCTCAGCAAGCTTTCAAAGCATTCGAACCGCTAGTGCAACGTTGAGCGGTGTGGAAATTGTTCACGCAATACGCAAAAGAACCCGACGAGAGTTAAGTCTCATCGGGTTCTCAGTCGTGGACGAATTAGAAGCATTGTTAGCTGCATAACCTTCAACATAGGATCAATAGCTGGTTAGATGGTCATCTCTCACACTGTTTGCACCAGATCCGATGTAAGCTGATTCCTGAGACAACTTTTAAGAGAGGGTATAATGAATAAATCGTCTCTCAAAAGGAAGGAATTTTTACATGCCAACTCGTTACGACAAAGAATTCAAACAAAACATTATCAACCTATATAAGCAAGGCGAATCAGCTGCCCAACTGGCCAGAGAATATGGCATTGGCTATTCAACAGTTCATAAGTGGATCCAGGGCCAGGCCAAAACTCAATCCGGTAGATCGCCAGACGAAATCAAAGCGATGGAAAAGCGACTGGCTTCGCTGTCTGAGGAGAACGAAATCCTAAAAAAAGCCCTGGGCTTCCTTGCGCAGAAGTAACCAATATCTTTGATTACATTCACCAAGAAAGCCATCACCACCAGGTAACCAAGATGTGCCGAATCCTCGGTGTTTCCAGAGCTCAGTATTATCGTTATCGATCCCCAAACCTTCAAAACGCCGGGCCGAAGATGCGGGCTTGAAACAACGGATTCTGCGGATCTTTGCGGAATTTAAGCAGCGATACGGTGTTATGAAGATCCACCATGAATTGAATCTGGAACTTCAACCACTGCAGCTTCGGTGCAGTCCACGACGGATTTCCCGGCTCATGAAGGAACTGGATATCCACTCCGTTACCGTCAATAAGTGGAAAGCGGCTTCGTCTTCCAAAACCAAGGTTGAACAGCGTCCCAACTTGCTTAAGCAGGATTTCTCGACCACTGGTTTAAATCAAAAATGGACCGCTGATATGACCTATATTCAAACGAAGCGTAATGGCTGGTGTTACTTATCAACCATCATGGACCTGCACTCACGACGGATTATCGGCTATTCGTTCTCAAAAAAGATGGCTACTGATTTAGTCTTAAAGACCCTTGAAAGCGCGGTTAAAAATCGAACCATTACTGGGGACCTGATTATCCATACGGATTTAGGATCACAGTATACCAGCGATAATTACAATCAACGTTTAACTGAACTACATATCCGCCACTCATACAGCCGTAAGGGTTGTCCGTATGATAATGCGCCAATGGAATCCTTTCACGCTTCCCTCAAAAAGGAATGTGTTTATCCAGTGCCGGTCTTTGAAGATTATGAAACTGCCGCTGCCGTCCTTTTTGAATATGTGCATGCTTTCTACAATAGGAAGAGAATTCATAGTTCACTGGGCTACCAGACCCCCTTACAAGTTGAAATTGCAACACTTACGAGCCAAATGGCCGTTTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP044366|24940:34476|26804_27764_+|WP_004559688.1|DBSCAN-SWA MAYTNNQLHVIYGDGSLGLQGANFHYLFSYERGGLESLVVNDKEWLYRTPTPIFWRATTDNDHGSGFSVKSAQWYAADKFSTCQDIELTVDDQPVTPLPIAPLNNKYTDHEIATKVSLAYHFVTTTVPSTIVTVTYTVTADGQINIATHYSGQSDLPELPAFGLRFIMPTTATGFDYTGLSGETYPDRLAGATHGQFHVDSLPVTPYLVPQECGMHMQTEQVTVTRSTTQNNADHDNTPFSLTFSQADAPFAFSCLPYTAAELENATHMEELPLARRTVLSIYGAVRGVGGIDSWGTDVEAPYHILADQDIDFSFNIHF >NZ_CP044366|24940:34476|24940_26821_+|WP_004559687.1|DBSCAN-SWA MQANLQWLDDPEVFRVNQLPAHSDHHYYHDTAEFKTGSRFIKSLNGAWRFNFAKTPAERPVDFYQPDFDATDFDTIQVPGHIELAGYGQIQYINTLYPWEGKIYRRPPYTLNQDQLTPGLFSDAADNTVGSYLKTFDLDDAFKGQRIIIQFQGVEEALYVWLNGHFIGYAEDSFTPSEFDLTPYIQDQGNVLAVRVYKRSTAAFIEDQDMFRFSGIFRDVNILAEPASHITDLDIRPVPNANLKSGELNITTKVTGEPATLALTVKDHDGRVLTSQTQTGSGSVTFDTMLFDQLHLWSPQTPYLYQLTIEVYDADHQLLEVVPYQFGFRTVELRDDKVIYVNNKRLVINGVNRHEWNAHTGRVISMADMRADIQTMLANNINADRTCHYPDQLPWYQLCDEAGIYLMAENNLESHGSWQKMGAIEPSYNVPGDNPHWLAAVIDRARSNYEWFKNHPSIIFWSLGNESYAGEDIAAMQAFYKEHDDSRLVHYEGVVYTPELKDRISDVESRMYEKPQNIVAYLEDNPTKPFLDCEYMHDMGNSLGGMQSYNDLIDKYPMYQGGFIWDFIDQALFVHDPITDQDVLRYGGDFDDRHSDYEFSGDGLMFADRTPKPAMQEVKYYYGLHK >NZ_CP044366|24940:34476|33329_33581_+|WP_159301333.1|transposase|DBSCAN-SWA MPTRYDKEFKQNIINLYKQGESAAQLAREYGIGYSTVHKWIQGQAKTQSGRSPDEIKAMEKRLASLSEENEILKKALGFLAQK >NZ_CP044366|24940:34476|29020_29551_+|WP_003603751.1|DBSCAN-SWA MKTLYHEYAHSQLHGLKSAFKDRPRAYQETQAEAVAYVAMQNIGVDTSNYSLGYVATWAKDKAVIHSALSEIQQVSNKVIELSDGLTKQLGLQEAPKEPEHNLKKLSAHDLNKSYQGLQQQVQQATNPQQKSELQNKLNDVHHEISNRTQKQLKAFSEQNPAIKQPEHNAAKTLKR >NZ_CP044366|24940:34476|30495_31440_-|WP_159301379.1|DBSCAN-SWA MGEEIDEVLTLDQKRRELLQQTETMKAQRNAASKKIGEAKRNGESADAAIKETRELGDKIKELDQQIEANDEQLHDKMAHLPNIPHDGVPVSLTEEGAVELRKVGKIRDFDFEPKHHWDVGENLGILEASLGNSQVLPRDYFNQVEIETVIKEVGEQVAARLRHHHKLAGCLSLSIGFSYAAAEADGRGGFHQALKIKPTNDNQVLTQQLLWLFRQNWDGQAVRNIGVYSSKLSANSGQQLNLFETPRNQIRHSRLNQMIDEIHRQFGFTKLVYATSLLKGGTAIKRASLVGGHNGGKRIHRPLPLIDNVFQIS >NZ_CP044366|24940:34476|33732_34476_+|WP_159301390.1|transposase|DBSCAN-SWA MLRIFAEFKQRYGVMKIHHELNLELQPLQLRCSPRRISRLMKELDIHSVTVNKWKAASSSKTKVEQRPNLLKQDFSTTGLNQKWTADMTYIQTKRNGWCYLSTIMDLHSRRIIGYSFSKKMATDLVLKTLESAVKNRTITGDLIIHTDLGSQYTSDNYNQRLTELHIRHSYSRKGCPYDNAPMESFHASLKKECVYPVPVFEDYETAAAVLFEYVHAFYNRKRIHSSLGYQTPLQVEIATLTSQMAV >NZ_CP044366|24940:34476|32504_33188_+|WP_159301380.1|transposase|DBSCAN-SWA MNHFKGRHFQKDIILVAVGYYFRFSLSYRDIVELLRDRGITVHHTTVMRWVHHYGPMFKTLWRRHQTAHAKSWRIDETYIRVKGRWAYLYRAIDSNGLTMDFELRKHRDYTASYHFLKRLLRTNGRPDRLVTDQYRATLKAVKHLIKQDYLSKSTHQCSKYRNHLIEQDHRFIKRHRVRSASFQSIRTASATLSGVEIVHAIRKRTRRELSLIGFSVVDELEALLAA >NZ_CP044366|24940:34476|29565_30525_+|WP_003603753.1|DBSCAN-SWA MKIVLLDGYELNKDLNWKSLQELGDCTLYDRTPVNDNAEIIKRIKYADIVITHKTPLDHEVISKTSRLKYIGIMGTGYDVVDIESAHQNKVVVTNIPTYASDAVAQFTFSLLLEVTSQVGLHNQLVHENRWAQAPDFTFWEKPLLELKGKTLGIIGYGHIAQKVAKIGHAFSMKVIFYNHRPKKVPESWIQQVSFDELLRQSDVLSLHVIQTPETIDLINNDTIAKMKTGVIILNTARGKLANEADIKNALNEGKIYAYATDVVKGEPIASDSPLLQAKNCYITPHIAWAPYETRERLLHMTVDNIKAYLSGDLKNVIN |
8 | Lactobacillus_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
40181 : 41312
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP044366|40181:41312|DBSCAN-SWA TTTATACCTTGACAGTGCGGTCTGCATCAGCCCGAATAGCATCCGTCGACTCTTTATCAAAAAAATGCGCTTTGTTCAAATCAAATCCCATGTTGACGGTATCTCCTGGGCTGTGAAAATCTCGAGAATTCACGATGGCGACAAATTCGGTTTCATCAATTTTTTGATATAACTGACTGGTCGCACCGAGAAGTTCAGAAACCACCACTTGCGATGCGATCACCGCTTCCGGCCAGGTTTCCAAAAAGGCTTCTTCGCTGTGAATGTCTTCGGGACGAATGCCAAAAACCAGTTGCTTACCGTTATAGCCTTGATCCTCCAGAACTTTTGCGCGCCCTTCTGGTACACTGAGGCGAAGACCCTTGCCATCGCTGATGACACCATCACGATACGTCACATCAAAGAAATTCATCGCTGGCGAACCGATAAAACCAGCCACAAATTGGTTACGCGGATATTCATAGATTTCCGCGGGCGTCCCGATTTGCTGAATCTGGCCAACAGACATCACCACAACTCGATCGGCCATCGTCATCGCTTCAGTTTGATCATGGGTCACATAAATCGTGGTGGTTTCAAGGCGTTGATGCAACTTGGCAATTTCCGCACGCATGGAAACACGTAATTTAGCATCCAGATTGGAAAGCGGCTCATCCATTAGAAAAATCGGTGCATCTCTGACAATAGCTCGCCCCAATGCCACCCGTTGCCGCTGACCGCCAGACAAGTCTGCTGGTTTACGGGCCAGAAACTCTGTCAGACCAAGAATATCGGCCGCAGCTGCCACCCGTTCTTGGATTGCATCCTTGCTATACTTCCGCAGCTTTAAACCAAACGCCATGTTGTCGAAAACCGTCATATGCGGGTAAAGGGCATAGTTTTGGAAAACCATGGCGATGTTGCGATCTTTCGGTGCCACATCGTTCATTACCTGATGATCAATCATTAACGTCCCTTTGGAAATATCCTCAAGTCCCGCGACCATGCGAAGCGTTGTTGACTTGCCGCAGCCAGACGGCCCGACAAAGACAATGAACTCCTTATTCTTAATGTGCAGATCGAAATCTTTGACAGAATCTTGTGCGGCATTCGGGTACTTCTTATAAAGATGGTTCAAATCAATCTCAACCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP044366|40181:41312|40181_41312_-|WP_159301382.1|DBSCAN-SWA MVEIDLNHLYKKYPNAAQDSVKDFDLHIKNKEFIVFVGPSGCGKSTTLRMVAGLEDISKGTLMIDHQVMNDVAPKDRNIAMVFQNYALYPHMTVFDNMAFGLKLRKYSKDAIQERVAAAADILGLTEFLARKPADLSGGQRQRVALGRAIVRDAPIFLMDEPLSNLDAKLRVSMRAEIAKLHQRLETTTIYVTHDQTEAMTMADRVVVMSVGQIQQIGTPAEIYEYPRNQFVAGFIGSPAMNFFDVTYRDGVISDGKGLRLSVPEGRAKVLEDQGYNGKQLVFGIRPEDIHSEEAFLETWPEAVIASQVVVSELLGATSQLYQKIDETEFVAIVNSRDFHSPGDTVNMGFDLNKAHFFDKESTDAIRADADRTVKV |
1 | Mycoplasma_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
51310 : 53567
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP044366|51310:53567|DBSCAN-SWA CTTATGCAGCTGCTGACTTTCTTTTGCAAGCACCGCGACCGTTGGTCTCGCGATCATGATTGTAGAAGGTGTTGTAACGAGCAATGGATTCAGTGACGTCTAGAATTGATTCATAGTTGATCTGCTCCAGCCGGACCCATTCTCGTTTCAATAGCGAATGGTAGGCTTCGATCCGCCCGTTATCAGCCGGTTTGCCTTTGCGCGAATATGAGTGACGCAGGTGCGCATCTGTCAATGTTGTCTCAAATAAACGACTGGTATATTGACTACCCATATCGCTATGCACCATCTTAAAAGTATAACCTTGGTGAATTAACGCTTGAATCGGTGCGACCGCGAGGTCTTGTGTCATCTGTTGACCCACTTGCCAAGCTAAGACTTTTCTCGCTTTTGGATCATACGCTGTTGCAAGGTAAACCCAGTTTTGGTTGATCAGTTGAATATAGGTGATATCGGTGGTCACGACCTCAGACAAGTCAGCTAGGTGTCGCATTAAATTAGGTTTTTGTGGCATGTCAGTGGTTGTGGTAGGCTTTTTAGAGCGTTTACGATACATTGTCGATTGAATCCCCAATTCACGCATGACTTTCCAAATCGTGCGGTCACTTAAGCGGCATTTAAGTAATTTACGAATGCGTTTAGCAATCCGCACGTATCCGTAAAATTTTCGACGTTGCCAAAGAACCTGAACCAGCTCTTTAAGCTTAATTCGGCGGCGATTTCGTGACTTAGGATGCCACTTTAACCAGTCATAGTAGGTACTCGAAGGGATCCGTAACGCTCGGAGAATAACTGTGATGCGGTGCCCCCGGCTCAATTGATCTTGAATCATAAAAAGAGCGGCCTTTCGGCCGCTATGAATCAACGCTTTGCCAGCAACACCGCCGCTCGTTTTAAAATATCGAGTTCTTCCCTCAAACGGCGATTTTCTTTTTGAAGTTGCTTGAACTGTTCGTTGGTCACAGCAGTACCTTGATGATCAATGGCAATGACAGTGGCCGCCTGAACCCATTTGCGAATAGTGTCTAAGGAAGGACCGTATTCTTCATGTAGTTCTTTGAATGAGTGTCCTTTTTCATGAAGATCAATCAAGGTTTGCTTAAATTCGGGGGTGTAGCGAATAGCTGTATTGGTCATAAAATATTCCTCATCTGTCAATTATCGCACAAACTATTTTTGTCCGTAATTACAGCATAGGAGCCCAGGTTAGATATGACGAATTCCATCCCTAGATTGCATAATTAAAGTTACCACCCAGAAAATGTGAAAAAAGACCTGTCCGTTCTTGCTAAAATGGTGTTTGCATAACATACCATCTAGAGAGAAGGACAGGTCCCATGGCCATTATAACCTTAATTGAACGATCTCAGATAGAACTGATGCAACACCACACGATTCAATACATCTCCGCGACCTTAGGCCGCTCTCGTATTTCTATTAGGCATGAGCTTCACCGTTGCCCTGAAGGTGATTACTGCGCCATTATAGCTCAGGATCATGCCGATACTTGTCGGCATCGTTGTGGTCGGCACTCGATTTTAACGCCTAAGTTGAAGCGGATGGTAACTGAGAAGCTAAACCTAGGTTGGTCCCCTGAAATGGTCGGTTATGCCGTTCACTGTGCGCCACACACGATTTACCACTGGATTTATCAAAGACAAGTCGATTTTCAGCCAAGCCAACTCTTTGATCACGGTAAACGTCATAAAAGAAGACAAGACCTTCGGTCGCGCTATAACCAAGCAGTAGGCACCTCAATTGAGATTCGCAGTGAGTCAGCTAATCGGCGAACCGAAAAAGGACATTTAGAGATGGATACAGTTCGCGGTGGTCGCGGGTCAAAGGCTGCTGTTTTGACCATTGTCGATCGGGTGACACGTTTAATGGCGACAACTAAGCTTGAAAACTTATCACAAAATGCTGTTCTCAAGGGATTTGCAAGACTGATGGTGGACTTTCCGGGTCCGGTTCGATCAGTGACGGTTGATCACGGTAAAGAGTTTTCCTGCGATCAGGCGCTTACAAAGCGCTATCGGATACCGGTTTACTTTTGCCACGCCTATCACCCGAATGAACGGGGCACAAATGAACGGTTCAATCGAGAACTTCGCTACTATTTCCCGAAGGGAACACAGTTTGATCAGGTTTCAGAGACCGATATTCAACAAGCCACAGCGCTTATCAATAACAAACCTAGAAAATGTCTCCGTTGGCAAACCCCAGTTCAAGCAGTGAGCAAGCCTCTTTCTAGGTGGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP044366|51310:53567|52646_53567_+|WP_159301064.1|transposase|DBSCAN-SWA MAIITLIERSQIELMQHHTIQYISATLGRSRISIRHELHRCPEGDYCAIIAQDHADTCRHRCGRHSILTPKLKRMVTEKLNLGWSPEMVGYAVHCAPHTIYHWIYQRQVDFQPSQLFDHGKRHKRRQDLRSRYNQAVGTSIEIRSESANRRTEKGHLEMDTVRGGRGSKAAVLTIVDRVTRLMATTKLENLSQNAVLKGFARLMVDFPGPVRSVTVDHGKEFSCDQALTKRYRIPVYFCHAYHPNERGTNERFNRELRYYFPKGTQFDQVSETDIQQATALINNKPRKCLRWQTPVQAVSKPLSRW >NZ_CP044366|51310:53567|52170_52467_-|WP_079322958.1|transposase|DBSCAN-SWA MTDEEYFMTNTAIRYTPEFKQTLIDLHEKGHSFKELHEEYGPSLDTIRKWVQAATVIAIDHQGTAVTNEQFKQLQKENRRLREELDILKRAAVLLAKR >NZ_CP044366|51310:53567|51310_52174_-|WP_096836489.1|transposase|DBSCAN-SWA MIHSGRKAALFMIQDQLSRGHRITVILRALRIPSSTYYDWLKWHPKSRNRRRIKLKELVQVLWQRRKFYGYVRIAKRIRKLLKCRLSDRTIWKVMRELGIQSTMYRKRSKKPTTTTDMPQKPNLMRHLADLSEVVTTDITYIQLINQNWVYLATAYDPKARKVLAWQVGQQMTQDLAVAPIQALIHQGYTFKMVHSDMGSQYTSRLFETTLTDAHLRHSYSRKGKPADNGRIEAYHSLLKREWVRLEQINYESILDVTESIARYNTFYNHDRETNGRGACKRKSAAA |
3 | Lactobacillus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
56671 : 63948
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP044366|56671:63948|DBSCAN-SWA CATGAATCACTTTAAGGGACGCCACTTTCAAAAGGACATCATCTTAGTAGCCGTTGGCTACTATTTCAGATTCAGTCTCAGCTATCGTGACATCGTTGAATTGCTTCGGGATCGGGGTATCACTGTTCATCACACCACGGTCATGCGTTGGGTTCATCACTATGGCCCCATCTTTAAGGCTCTATGGCGTCGGCATCAAACAGCTCACGCTAAAAGTTGGCGAATCGATGAGACCTATATTCGAGTTAAAGGCCGTTGGGCCTATTTGTATCGCGCTATTGACAGTAACGGTTTGACCATGGATTTTGAGCTACGAAAACACCGCGATTATACCGCATCCTATCACTTTTTGAAGCGTCTCTTGACGACCAATGGTCGGCCTGATCGATTAGTCACTGATCAATATCGGGCAACACTGAAAGCAGTGAAGCACCTGATAAAGCAAGACTATTTGAGCAAATCAGCCCACCAATGTTCCAAATATCGAAATAATTTGATTGAACAGGACCACCGATTCATTAAGCGTCATCGTGTCCGCTCAGCAAGCTTTCAAAGCATTCGAACCGCTAGTGCAACGTTGAGCGGTGTGGAAGTTGTTCACGCAATACGCAAAAGAACCCGACGAGAGTTAAGTCTCATCGGGTTCTCAGTCGTGGACGAGTTAGAAGCATTGTTAGCTGCATAACCTTCAACATAGGATCAATAGCTGGTTAGATGGTCATCTCTCAGACTGTTTGCACCAGATCCGTTCAACTTAAATTTTACAATCTATCTTTAGTATTCGCCCCAATATTTAGACATTGTTTGTTTACCAACGCCAGGGTTGAAACTATTAGTTGGATCATTTTTCTTATAGTGCTTGATTAAGGCCGGTGCTGCCAAATATAGATGCCCAACATTGTGTTCGGCTGGATAAACAGCGTGACGCTCATCCAAAATTTTAAGCATTTCTTTTTTAAGTTCATGCGCATCGACGCCAGGTTTTAGAATATAATCCTGGTGCATAACGTGATCAAGTACGTGACCATAATAAATTTTGTGTTCTATTTTGTCTTCAATCTCTTTAGGCAAATGCTCGAACCACTTATAATCATTACTTGCCAACGCGATATCTAGTGGCAAAATGTCAATACTATCCTGTTTTAATTCTTGATATCGAATCGCAACCCCAGCTGTTACATAGCGGTGAGTTGCCGCTTTACTGGTCTCATTGGCATCGGCTTCAAAGTAGTCGCCACTGGCTTTGTCAAAATAAGATTTGAGATACTCTCGCGCTTCTTCAATACCATTACCAGCCATTTTCAATTGTAGGTAATGGTCGTACTTTTCGTAATAATCATCTAACCGCTTTGGCATTTGATTAGGAAATAAATTACTTAATGTTTGAAGCAAACGATCTGGGAAATAAGGTTTGAAAAACGGAATGTGCTTCAAAAAGCGTTCGCCCCATGCTTTTAGCGCAAACATTTGGGGCAAATGACCCGTACCAATTTTTTCAATCACAATTAGTGAGTCTTTACCATATTTCTTGGCCAATTTATATGCATTTTTATGCATATATTCACCAGAAACAGGCAATTCTTTGAATGTCGTCATAATATGGCGACGAATATCTTCCAACTCATCGGGATTATTCGTTCCAATGTAAAACATTTGTGTTTTTTTATCCATTGGGAATGTATCTAAGCGGACAGCCAATGCCGCAACGTGACCGGACGATCCAGATACTTCATACAATTCTTTAGGATTTGCATTGTATCGAATAGGCTTATCAGATTCAACGTCACGCACAACCTGTTCATGATGGAACATTGAAGCATGATGTTCAGTAGCTGGTACTTGATTCAAATCAAAATTGCGGTTCTGCAAATTAGTAATAATCTCTTCGGGCGTTTTGCCCAAATCAATGCCTAAATGGTTAACTAAGTGCATTTCGTCATGTTCATCAATCCAAACATACAATGATAGCTCTGTATAAGCTGGACCTCTTCTGATCAAAGCACCACCAGAATTGTTGTTAATACCACCAATGACCGATGCACCCAAATTAGATGAGCCAATGACTGAATGTGGTTCACGTTTAAGTGGTCGCAATTCATTTTCTAAGTGAAACAGGGTCGTACCGGGGAATGCTAGTACTTGTTCCCCATTATTGATTAACTGTAAATCTTTAATTTTCATGCCGTTCACAACAACTGCAGAACGGTCATAACCTGGGGCTGGTACGGATCCCTCAGTCAAACTAGTGTTGGCTGCTTGCATAATAATGATAATATTGTTATCATGCAAAACATTAAGCACACGCCACATTGCCATTAAAGTGGTTGGAAATACGACTGCAACTGCATCGCCCTTACCTGAGCGGTACCCTTTCCTAAAACGTAAAGATTTTGCTTTGTTAGTAATAACATTTTTTTTACCAACAACATTGACTAGTTCTTCGACTAAGTCCATATTAACTTCTCCCCTCTATAACGTTTGTAAAAAACGTTTTAATCATTACGCTTTCAATGATACGCTTTTTTTGATGCGTATCTGGATTGAAGTCAATATTTGAGACAGATTTTAAGAGACATTCAGAACCGCGTTTACCTTCCACAGCTCAAATAAATCATTAATTGCGATTAATAACTTATTTGAACCCTGGAAAGCATTAAGTCAGGCGGCCATTTGGCTCGTAAGTGTTGCAATTTCAACTTGTAAGGGGGTCTGGTAGCCCAGTGAACTATGAATTCTCTTCCTATTGTAGAAAGCATGCACATATTCAAAAAGGACGGCAGCGGCAGTTTCATAATCTTCAAAGACCGGCACTGGATAAACACATTCCTTTTTGAGGGAAGCGTGAAAGGATTCCATTGGCGCATTATCATACGGACAACCCTTACGGCTGTATGAGTGGCGGATATGTAGCTCAGTTAAACGTTGATTGTAATCATCGCTGGTATACTGTGATCCTAAATCCGTATGGATAATCAGGTCCCCAGTAATGGTTCGATTTTTAACCGCGCTTTCAAGGGTCTTTAAGACTAAATCAGTAGCCATCTTTTTTGAGAACGAATAGCCGATAATCCGTCGTGAGTGCAGGTCCATGATGGTTGATAAGTAACACCAGCCATTACGCTTCGTTTGAATATAGGTCATATCAGCGGTCCATTTTTGATTTAAACCAGTGGTCGAGAAATCCTGCTTAAGCAAGTTGGGACGCTGTTCAACCGTGGTTTTGGAAGCCGAAGTCGCTTTCCACTTATTGACGGTAACGGAGTGGATATCCAGTTCCTTCATGAGCCGGGAAATCCGTCGTGGACGGCACCGAAGCTGCAGTGGTTGAAGTTCCAGATTCAATTCATGGTGGATCTTCATAACACCGTATCGCTGCTTAAATTCCGCAAAGATCCGCAGAATCCGTTGTTTCAAGCCCGCATCTTCGGCCCGGCGTTTTGAAGGTTTGGGGATCGATAACGATAATACTGAGCTCTGGAAACACCGAGGATTCGGCACATCTTGGTTACCTGGTGGTGATGGCTTTCTTGGTGAATGTAATCAAAGATATTGGTTACTTCTGCGCAAGGAAGCCCAGGGCTTTTTTTTAGGATTTCGTTCTCCTCAGACAGCGAAGCCAGTCGCTTTTCCATCGCTTTGATTTCGTCTGGCGATTTACCGGATTGAGTTTTGGCCTGGCCCTGGATCCACTTATGAACTGTTGAATAGCCAATGCCATATTCTCTGGCCAGTTGGGCAGCTGATTCGCCTTGTTTATATAGGTTGATAATGTTTTGTTTGAATTCTTTGTCGTAACGAGTTGGCATGTAAAAATTCCTTCCTTTTGAGAGATGATTTATTCATTATACCCTCTCTTAAAAGTTGTCTCAGGAATCAGCTTACATCCAAAATAAACACTGTATGAGTTTGGACACTAAAAAGTTCTTCGACTTACTCGGTTGAATTTGTTTTAAAAACCCTAGGCGATTTGAATACCAGCCTCTAAGGTGTTATCCAATTTATAGATTCGTTCAACATCAATAACCACTACGCCAGCGCGTGGGAAACGTTCAAAAATGTTAGTTTTATCTAAAATCTGATTAGCAAAATCATCTGTTTCATGAATATGAGCCGTTCCCTCAAAGCGAAATCCCTGTTGAGCGCCTCTATCAGCAACCGCAACCGCCGCCAAATGGTTGTTCGAGAGATTATTATAGGCCTGCCTAAAGGTGTGCTCAAAGTAGATTAAATGTGAGTCATCTAAGACATGTAGTGAACCCTTGGGACCAACTTGAGGTTTGCCATCTTTTCCTGTTGTTGCTAGAAAGGGGAGCTGATTCTTTAACATATTTTTCATTTCTTCTGTAAGGTTTACCATTTGATTTTCTCCTATCAACGTAATACTGGCTATTTATTTACTTTTAGTAAATATATTGTTGAGATACTATTTTGTCAATCCTATGTCCCAAGATGAACATCGCAGACTAGGATCACGGAAGGTTTAAAAAGATTCCCTTGTTTTGTAAATTGGTTAAGCAAACATGTTTATATCGTTGGTCATGCTCAGGATAGATGGGTATTGTGAGTGCAACCGGATTGAGTTGTTTGTATGCTGGGCAATGTTGACCTCGATACAGAGGATCATACCATTTCTGATCTGGATGATAACCTCGTTTTTCCATTTCACGTAACACAATACAGTGAAATTGAAATAATTTATATGGGGAATGTGCAAATACGTAATTAACGGTAGCGTGTTTCCGTCCCCATCCATTACCGCGAAGCGCCGCAATTTCACGATGCTGTCCCAATAATTGTTGTCTTGGGAGTTGCTGAATTAAGTCTTGATGCCACAAACGCACGTTACGGCTTCCTTTCTTGAAAACTAGTCTTAATATTTATGCCATTTGGAGGATTACAGTACTGAACCATTTTATGACGAAGCGCCTTTTCTATAGGTTCATCGGCAGTATAAGCAATGGGATTTGCGCCTACTCGGATTGTCTGATCAATTTGTTCAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP044366|56671:63948|62191_62476_-|WP_016363781.1|DBSCAN-SWA MIDLRGKRILFTGRLRSFRRFQAQQLATILGAKPVNGIDKNVDILVVGIISKPYDQLLTTQKLTYARTYGIPKIDELAFISWCQWRLDQLKTTL >NZ_CP044366|56671:63948|60628_61027_-|WP_159301388.1|DBSCAN-SWA MVNLTEEMKNMLKNQLPFLATTGKDGKPQVGPKGSLHVLDDSHLIYFEHTFRQAYNNLSNNHLAAVAVADRGAQQGFRFEGTAHIHETDDFANQILDKTNIFERFPRAGVVVIDVERIYKLDNTLEAGIQIA >NZ_CP044366|56671:63948|57444_59124_-|WP_159301387.1|DBSCAN-SWA MDLVEELVNVVGKKNVITNKAKSLRFRKGYRSGKGDAVAVVFPTTLMAMWRVLNVLHDNNIIIIMQAANTSLTEGSVPAPGYDRSAVVVNGMKIKDLQLINNGEQVLAFPGTTLFHLENELRPLKREPHSVIGSSNLGASVIGGINNNSGGALIRRGPAYTELSLYVWIDEHDEMHLVNHLGIDLGKTPEEIITNLQNRNFDLNQVPATEHHASMFHHEQVVRDVESDKPIRYNANPKELYEVSGSSGHVAALAVRLDTFPMDKKTQMFYIGTNNPDELEDIRRHIMTTFKELPVSGEYMHKNAYKLAKKYGKDSLIVIEKIGTGHLPQMFALKAWGERFLKHIPFFKPYFPDRLLQTLSNLFPNQMPKRLDDYYEKYDHYLQLKMAGNGIEEAREYLKSYFDKASGDYFEADANETSKAATHRYVTAGVAIRYQELKQDSIDILPLDIALASNDYKWFEHLPKEIEDKIEHKIYYGHVLDHVMHQDYILKPGVDAHELKKEMLKILDERHAVYPAEHNVGHLYLAAPALIKHYKKNDPTNSFNPGVGKQTMSKYWGEY >NZ_CP044366|56671:63948|61139_61511_-|WP_003563277.1|DBSCAN-SWA MRLWHQDLIQQLPRQQLLGQHREIAALRGNGWGRKHATVNYVFAHSPYKLFQFHCIVLREMEKRGYHPDQKWYDPLYRGQHCPAYKQLNPVALTIPIYPEHDQRYKHVCLTNLQNKGIFLNLP >NZ_CP044366|56671:63948|59328_60072_-|WP_159301391.1|transposase|DBSCAN-SWA MLRIFAEFKQRYGVMKIHHELNLELQPLQLRCRPRRISRLMKELDIHSVTVNKWKATSASKTTVEQRPNLLKQDFSTTGLNQKWTADMTYIQTKRNGWCYLSTIMDLHSRRIIGYSFSKKMATDLVLKTLESAVKNRTITGDLIIHTDLGSQYTSDDYNQRLTELHIRHSYSRKGCPYDNAPMESFHASLKKECVYPVPVFEDYETAAAVLFEYVHAFYNRKRIHSSLGYQTPLQVEIATLTSQMAA >NZ_CP044366|56671:63948|56671_57355_+|WP_159301386.1|transposase|DBSCAN-SWA MNHFKGRHFQKDIILVAVGYYFRFSLSYRDIVELLRDRGITVHHTTVMRWVHHYGPIFKALWRRHQTAHAKSWRIDETYIRVKGRWAYLYRAIDSNGLTMDFELRKHRDYTASYHFLKRLLTTNGRPDRLVTDQYRATLKAVKHLIKQDYLSKSAHQCSKYRNNLIEQDHRFIKRHRVRSASFQSIRTASATLSGVEVVHAIRKRTRRELSLIGFSVVDELEALLAA >NZ_CP044366|56671:63948|63279_63948_-|WP_159301392.1|DBSCAN-SWA MFFGPSILFVFLAFKTSDNFAGYIITSAICAVFGLIYIHTSLFGKDKILQKVADSIQLKQNSKILDVGCGHGAFMIKFENRINDIRKIVGIDIWNKRDQANNTLEETEKTVTNSGVSSKAKIQRADMCDLPFQDNEFDLVISSFAIHNVKPATQRRKAIEEIFRVLKHNGEVVIIDIEFKDNEYRKILEELKFNNIETSDAGFNGWWGSPLGPTFILKAVKS >NZ_CP044366|56671:63948|62481_63132_-|WP_159301346.1|DBSCAN-SWA MAKIGYARVSTRDQNLARQIEQLHDAGVNKIFQEKLSGKNADRPQLKAMLDYIRDDDEVVVLSLDRLGRNSHDLTDIIETIRRRGAQLNVLNLPSFASIEDPNLRNLITTIIVELYKYIAQEERETIKIRQQQGIEIAKRQGKYKGKIREYGPHSPNRQKRYIYKEACRLLNRKKDGDETLTKRQIARMLGIAPVTLYRIEKYQAEDLANVPRSER >NZ_CP044366|56671:63948|60080_60476_-|WP_011674191.1|transposase|DBSCAN-SWA MPTRYDKEFKQNIINLYKQGESAAQLAREYGIGYSTVHKWIQGQAKTQSGKSPDEIKAMEKRLASLSEENEILKKSPGLPCAEVTNIFDYIHQESHHHQVTKMCRILGVSRAQYYRYRSPNLQNAGPKMRA |
9 | Lactobacillus_phage(40.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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