Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP046785 | Vibrio parahaemolyticus strain 2013V-1136 chromosome 1, complete sequence | 0 crisprs | cas3,DinG,csa3,DEDDh,PD-DExK | 0 | 0 | 5 | 0 |
NZ_CP046786 | Vibrio parahaemolyticus strain 2013V-1136 chromosome 2, complete sequence | 1 crisprs | csa3,DEDDh,cas3,WYL | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
304679 : 311381
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP046785|304679:311381|DBSCAN-SWA ATTAGGAATCAATTTCAGATAGTACATTAATCATTTCAAGTGCGCTTAGTGCAGCCTCTGCACCTTTATTACCAGCCTTGGTTCCTGCGCGTTCAATCGCTTGATCGATAGTATCAACAGTCAGCACACCGAATGCGACTGGAAGACTGTATTCCAGAGACACTTGTGCTAGGCCCTTGTTACATTCACTACAAACATAATCAAAGTGTGGTGTACCGCCACGGATTACTGTACCTAGAGATACGATCGCATCGTATTTACCAGTTTTAGCAACACGTTGAGCTACTAGAGGTAGTTCTACGGCACCTGGACAACGTACAACAGTGATGTTGTCTTCGCTTACTTGTCCGTGACGCTTTAGTGTATCGATCGCACCAGAAAGTAAGCTTTCGTTAATAAAACTGTTGAAGCGAGAAATAACGATAGCAATTTTTGCATTTGGCGCTGGGAAGCCACCCTCGATCACTTTCATAAGCTTTCCTTTAACTCTATTTATAAGTGAAATTTGTTCATCAAGTGAGAATCGCCGGATTCTAGCACAAATTTGTGAGCAATATCTAATGGAAATTGGCCGCGTGTCGCGAGTTCCTAGTCCACACCAAAATAGGTGTGCATGGGACTAGGTACTTATCGTTCACTTCTTATTCGCAAACGTATTCAACCACGTTCAGGCCGAAACCGCCCAATGCATGGTATTTTTTGTTGGTCGAAGACAGAAGACGCATATCGTGAACACCAAGGTCTGCGAGAATTTGCGACCCCACTCCCACGCGGCGAGACGTGCCCTGCTTTTTCGCTAAAGTAGGTGCTTCGCCTTTATCTTGCGCTTCGAACATCTTCACGCGATGGATGAGCAACTCGGTTGATTCTTCATTGCCAAGAACAACCAGAACACCACCTTCTTCACCGATACGCTTCATCGCTTTATCCAGTGTCCAGCTGCGCTCTGCATTGCGGTCACTGCGTAATACATCGGTGAATACGTCTTGTAGATGCACACGAACCAGCGGCGCCTCGCCAGCCAAATCACCTTTACACATCGCGTAATGCACTTGATTATCGATGGTGTCTTTGTAAGTCACCAAAGTGAACTCACCGTGTTCAGTTGGCAGTTTGCATTCTGCTACACGCTCAATGGTCGTTTCTGTGTTGTTGCGGTATTCGATAAGGTCCGCAATAGTGCCTAACTTCAAGCCGTGTTTTTCAGCAAAGATTTCAAGATCAGGGCGGCGAGCCATGGTGCCGTCGTCGTTTAGAATCTCAACAATCACAGAAGCAGGCTCAAGCCCCGCAAGGCGAGCTAAATCACAACCTGCTTCGGTGTGACCAGCGCGAGTCAATACACCACCATCTTGCGCAGCAAGAGGGAAAATATGACCCGGTTGAACCAAGTCCGCCGCTTTTGCGTTTGGCGCAACCGCAGCTTGAACGGTACGTGCACGGTCAGCCGCTGAAATACCCGTGGTGACGCCTTCAGCAGCTTCGATAGAAACGGTAAAGTTAGTGGTGTACTGCGCGTTGTTGTCTTGCACCATTGGCGGCAAGCCGAGATTTTCACAACGCGCTTTAGTCATGGTCAGACAGATCAAGCCACGACCGTAAGTCGCCATAAAGTTGATCGCTTCCGGCGTAATATGCTCGGCAGCCATGATCAAGTCACCTTCATTCTCACGGTCTTCATCATCCATTAAGATGACCATTTTGCCTGCGCGAATATCATCAATAATTTCTTGTGGTGTACTGATTGGCATATTCTGTTTCCCGTTATTCTAAAATTTACTTTCCGACAGCAATGCGTGAAATCTTATTGCAATGGTAATGACATCAACAGTTTGAGCCTTGCACAATGCAAGTCAATTGCCCTAACGATGTTCTGTGAATCCGGTCTGTTATGGCAATTATCGCAACGTGGCTGAGCGCTTACGCAAAGCCATTTTGTTGTAAGAAGTCCATGGTGATGCGAGATTTAGGCTGCTCTTCTTGCTGACCTTGCAGCAAGCGTTCCATATAACGCGCCAACACATCCACTTCTAAATTCACTTTGCGGCCCACTTGGAACTGGTCGATGGTGGTTTCTTCACAGGTGTGAGGCACAATCGTCAGTTTGAATGCGTTTTTACGCAAATCATTCACCGTTAAGCTGATGCCATCAACGGTGATAGAGCCTTTTTCTGCCACGTACTTGCTGATCTCAGCAGGCATCGCGACCCAAAACTCTATCGCACGACCAACTTGATTGCGCTCCACAATTTCACCAACGCCGTCCACGTGTCCAGATACAATGTGTCCGCCAAAACGTGTCGTCGGCAGCATAGCTTTTTCTAAGTTAACCTTTTCGCCTACTTGGTAGTTTGCAAAACCGGTTTTTTTCAAGGTCTCGAGAGACAAATCTGCGCAGTAGTAATTGCTGCCAAAGTCAATCACCGTTAAGCACACACCGTTAGTTGCGATGCTGTCGCCTAACTTCACGTCAGACATGTCTAACTTACCTACTTCTACCGTAACGGTAATGTCTTCGCCTTTTGGCGTAATCGCAGTTAATTTACCAACTGCTTCTACAATTCCTGTAAACATAGTGCTTCTTTTCTAAATTTCTTTACGTACAAGGGTGGCGGTAATACGGATATCTCTGCCCACCATTCGCACATCAGTAATATTTAAATCGATGACCTGCGCCATCTCCGTCAATCCCAGCGCGCCAATTAAACCACGTCCATCGCTTCCCATTAGTTTCGGAGCGAGATAGACAATCAGCTCATCTACAAGGTTAGCTTTGATTAGAGAACTCGCGAGCGTCGCGCCAGCTTCCACCCATAAATGGTTGATATTATGCTGAGTCGCGACCGCTTTTAGGGTCGCAGCTAAATCAATTTTTCCGCTTTGGTCTAGTTGTGGGCAAACATCGCCTTCGCTGCTGACAATAATTCGCTCACCTTCGGTACTGAACAGTTTAAGGTCATCACTCAGTTTCTGTTGACGGTCGAGTATTACCCTGGCTGGTTGGCGAACTTCCGTCAGCTCATAGTGCGCTTGAACACTCTGCGGCAAATCATCCCAACGAACGTTGAGAGAAGCGTTATCATCCATCACTGTTTTGCTTGTAGACAGAATGCCACCGCTTTGCGCTCGATAACGCTGCACGTCTTGGCGAGCCTGTGGGGAGGTGATCCATTGGCTCTTGCCATTACTTAGCGCACTCTGTCCATCTAAGCTTGCTGCCATTTTTAATTGGATAAATGGCATGCCTGTTTGCATGAATTTAATGAAGCCACGATTGAGCTCAATCGCATCGTTTTCTAACAGTCCAACCTGAACCTCAACTCCGGCTTCACGTAGCATTTGGATGCCACGTCCAGCCACTTTTGGATTCGGATCTTCCATCGCACACACTACCCGCGCCACTTTGGCTTTTATCAATCCTTCAGCGCAAGGTGGCGTGCGTCCGTAGTGGGAGCACGGTTCAAGGGTAACGTATGCCGTTGCACCTTCAGCTTTATCACCAGCCATGCGCATCGCGTGCACTTCAGCATGGGGCTCTCCAGCGCGATGATGATAACCTTCACCAATGATCACGCCATCACGAACAATTACGCAACCGACGTTCGGGTTTGGAGCCGTCGTATAAATGCCGCGTCGAGCTAACTTGAGCGCACGCGACATCATTGAAAAATCTTGAGGAGAAAATGGAGACGCAGAAGTGTGTTGAGGCATGATTTAATCAGTCTTCAAGGCGGGCAATTTCTTCGCCGAATTCACGAATATCTTCAAAGCTACGATAAACCGATGCAAAACGGATGTAAGCCACTTTGTCGAGCTCTTTAAGCTGATCCATAACCAAGTTACCAATCATTTGGCTCGGTACTTCACGCTCGCCAGTTGCGCGGAGCTGCGACTTAATCATACTGATTGCAAGCTCGATAGAGTCGGCACTTACCGGACGTTTCTCTAATGCGCGCTGAATGCCACCGACCATTTTATCTTCATCGAATGGTTCACGATTGCCATTTGACTTAATGACTTTAGGCATGACCAATTCTGCCGTTTCAAACGTAGTAAAACGTTCACTACAGGCTAAACACTGGCGGCGGCGACGGACTTGATGACCATCCGCAACCAATCGGGAATCAATTACTTTTGTATCGTTCTCTGAACAAAAAGGACAATGCATATCACCTCCAAATAACGTGCCTTTGGGGCCGTCCCAAAAGCCAGACTAGTGTAGCGGAATTGATATGTGAGAGAAAACAAAAAGGGGCACTAGTGCCCCTTTTTCAATCAATATCGAGTCGAATCTGTTAACTGCGTGCTAAGTAGTTCGCTTTGCCGACCCATTTGTAGCTTGTTAATTCTTCCAAGCCCATCGGGCCACGTGCATGCAGCTTTTGAGTTGAGACGGCCACTTCAGCCCCCAAGCCAAACTGAGCACCGTCAGTAAAGCGCGTTGCCGCATTCACATAAACTGCAGCCGAGCCCACCGAATTGATGAACAACTCTGAGTTAATCAAGCTGTTGGTCATGATTGCATCTGAGTGACTTGCATTGTGAACTCGCATGTGATCAATCGCCTCTTTCACGTCAGCGACAACTTTTACACCTAACGTGTAGCTTAGCCATTCGGTATCAAAATCACCTTCTACGGCATCGCGAATTTGCGTAGCTTGAGCCATTAGCGCTTTCGCTTTTGGTTCTGCTACAAACGTCACTTTGTCACTCATTCGCTCGACAATCATTGGCAAGAATTTCGCCGCCACTTTCTCGTGAACAAGCAGTGTGTCTAGCGAGTTACATGCCGAAGGACGTTGAACTTTCGAGTTTTCAACCACGTTTAGCGATTTCTCTAGGTCCGCGGATTCATCAACAAAAATGTGACTGATACCAAAACCGCCGATGATCACTGGAATTGTGCTGTTCTCTTTACACATTTTGTGCAGACCAGCTCCACCACGTGGGATGATCATATCAACGTAGTCATCCAGTTTAAGCAGTTGAGAAACCAGCTC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP046785|304679:311381|308396_308846_-|WP_005482986.1|DBSCAN-SWA MHCPFCSENDTKVIDSRLVADGHQVRRRRQCLACSERFTTFETAELVMPKVIKSNGNREPFDEDKMVGGIQRALEKRPVSADSIELAISMIKSQLRATGEREVPSQMIGNLVMDQLKELDKVAYIRFASVYRSFEDIREFGEEIARLED >NZ_CP046785|304679:311381|304679_305150_-|WP_005440184.1|DBSCAN-SWA MKVIEGGFPAPNAKIAIVISRFNSFINESLLSGAIDTLKRHGQVSEDNITVVRCPGAVELPLVAQRVAKTGKYDAIVSLGTVIRGGTPHFDYVCSECNKGLAQVSLEYSLPVAFGVLTVDTIDQAIERAGTKAGNKGAEAALSALEMINVLSEIDS >NZ_CP046785|304679:311381|308973_310224_-|WP_020840182.1|DBSCAN-SWA MDLTNMGKAAKDAAFELATASTAQKNQALAIIADELEANSAAILAANAKDIELGREAGLTDALLDRLLLNEERLTGIANDVRNVISLNDPVGSEIDSKVLENGMSLSRRRVPLGVVGVIYEARPNVTIDIAALCLKTGNASILRGGKETFFSNMELVKVIQSALAKANLPAASVQYIEKPDRELVSQLLKLDDYVDMIIPRGGAGLHKMCKENSTIPVIIGGFGISHIFVDESADLEKSLNVVENSKVQRPSACNSLDTLLVHEKVAAKFLPMIVERMSDKVTFVAEPKAKALMAQATQIRDAVEGDFDTEWLSYTLGVKVVADVKEAIDHMRVHNASHSDAIMTNSLINSELFINSVGSAAVYVNAATRFTDGAQFGLGAEVAVSTQKLHARGPMGLEELTSYKWVGKANYLARS >NZ_CP046785|304679:311381|310241_311381_-|WP_005483011.1|DBSCAN-SWA MTTNQQNAVVSQPQTVVVKLGTSVLTGGTLALDRAHMVELARQCAELKKQGHSVVMVSSGAIAAGREHLGYPALPNEMASKQLLAAVGQSRLIQTWESLFGIYGIKIGQMLLTRADLDDRERFLNARDTINALVANDIIPIVNENDAVATSEIKVGDNDNLSALVGILCGADKLLLLTDQKGLFTADPRKDPNAELIKEVKTIDDTLRKIAGGSGTTLGTGGMATKLQAADIARRAGIEVIIAAGSAPNVIFDSLSTEPQGTRFLPCSEALENRKRWILAGPAASGDIIIDDGAVNAVVGKGSSLLAKGVIKVSGDFARGEVARVTNSHGKLVARGISAYSSEDLAKITGKHSKDIISILGHDYGSEVIHRDDLVVIQE >NZ_CP046785|304679:311381|307264_308389_-|WP_025625922.1|DBSCAN-SWA MPQHTSASPFSPQDFSMMSRALKLARRGIYTTAPNPNVGCVIVRDGVIIGEGYHHRAGEPHAEVHAMRMAGDKAEGATAYVTLEPCSHYGRTPPCAEGLIKAKVARVVCAMEDPNPKVAGRGIQMLREAGVEVQVGLLENDAIELNRGFIKFMQTGMPFIQLKMAASLDGQSALSNGKSQWITSPQARQDVQRYRAQSGGILSTSKTVMDDNASLNVRWDDLPQSVQAHYELTEVRQPARVILDRQQKLSDDLKLFSTEGERIIVSSEGDVCPQLDQSGKIDLAATLKAVATQHNINHLWVEAGATLASSLIKANLVDELIVYLAPKLMGSDGRGLIGALGLTEMAQVIDLNITDVRMVGRDIRITATLVRKEI >NZ_CP046785|304679:311381|305319_306429_-|WP_005496254.1|DBSCAN-SWA MPISTPQEIIDDIRAGKMVILMDDEDRENEGDLIMAAEHITPEAINFMATYGRGLICLTMTKARCENLGLPPMVQDNNAQYTTNFTVSIEAAEGVTTGISAADRARTVQAAVAPNAKAADLVQPGHIFPLAAQDGGVLTRAGHTEAGCDLARLAGLEPASVIVEILNDDGTMARRPDLEIFAEKHGLKLGTIADLIEYRNNTETTIERVAECKLPTEHGEFTLVTYKDTIDNQVHYAMCKGDLAGEAPLVRVHLQDVFTDVLRSDRNAERSWTLDKAMKRIGEEGGVLVVLGNEESTELLIHRVKMFEAQDKGEAPTLAKKQGTSRRVGVGSQILADLGVHDMRLLSSTNKKYHALGGFGLNVVEYVCE >NZ_CP046785|304679:311381|306598_307252_-|WP_089203406.1|DBSCAN-SWA MFTGIVEAVGKLTAITPKGEDITVTVEVGKLDMSDVKLGDSIATNGVCLTVIDFGSNYYCADLSLETLKKTGFANYQVGEKVNLEKAMLPTTRFGGHIVSGHVDGVGEIVERNQVGRAIEFWVAMPAEISKYVAEKGSITVDGISLTVNDLRKNAFKLTIVPHTCEETTIDQFQVGRKVNLEVDVLARYMERLLQGQQEEQPKSRITMDFLQQNGFA |
7 | Staphylococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1567798 : 1581878
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP046785|1567798:1581878|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP046785|1567798:1581878|1572973_1574017_+|WP_089203083.1|tRNA|DBSCAN-SWA MSDILSSLAYLTGKPVASAKIKAQPEHFQVREDLGFAFTGEGEHLMVRIRKTGENTSFVANELAKACGVKSKDVSWAGLKDRHAVTEQWLSVHLPKGETPDFSTFLAQYPSIEILATDRHNKKLRPGDLIGNEFVVTLSEVTDMADVEQRLEKVKQVGVPNYFGSQRFGNDGNNLDEARRWGRENVRTRNQNKRSMYLSAARSWIFNRIVSARLENGVFDKFIDGDIAQTSQGLLAVDANNLADMQNKLALSEVEITAALAGDNALPTQADALALEQPFIDEEPDLMALIRGNRMRHDRREIALKPKDLAWNIEGNNITLTFSLDAGSFATSIVRELVNEVKVEREY >NZ_CP046785|1567798:1581878|1575433_1576357_+|WP_089203082.1|DBSCAN-SWA MSKLLRHIGISFVLAAGLVGCAAHSPAPVSSLKKDYSSVERGSYRGSYYEVKKGDTLYFIAYVTDKDVNDLVRYNELSQPYTIYPGQKLKLWAPKYVAPKYGQKVEPVVVPVVTTTPPPVAKPTTTTKPVTSSKNSSQKPTTTPTKVAQKEPPKKVEQTKAKEYVGSKDNQPTKPKPPTTTVQNDKVSKWLWPTKGRVIKNFSAGEQGNKGIDIAGQRGQPIVSTAAGTVVYSGNALRGYGNLIIVKHNDNYLSAYAHNDKLLVTEGQSVKSGQKIATMGSSGAKSVKLHFEIRYQGKSVNPKRYLP >NZ_CP046785|1567798:1581878|1580834_1581878_+|WP_005478550.1|DBSCAN-SWA MDENKQKALAAALGQIEKQFGKGSIMRLGDNRAMDVETISTGSLSLDIALGAGGLPMGRIVEIYGPESSGKTTLTLELIAAAQREGKTCAFIDAEHALDPVYAKKLGVDIDALLVSQPDTGEQALEICDALARSGAIDVMVVDSVAALTPKAEIEGEMGDSHMGLQARMLSQAMRKLTGNLKQSNCMCIFINQIRMKIGVMFGNPETTTGGNALKFYASVRLDIRRTGAIKEGDEVVGNETRIKVVKNKIAAPFKEANTQIMYGQGFNREGELIDLGVKHKLVEKAGAWYSYNGDKIGQGKANACNYLREHPEIAKTIDTKLREMLLSPAQPEAPAAGEKPEQEEEF >NZ_CP046785|1567798:1581878|1569517_1570819_+|WP_005455579.1|DBSCAN-SWA MSKIVKVLGREIIDSRGNPTVEAEVHLEGGFVGMAAAPSGASTGSREALELRDGDKARFLGKGVLKAIEAVNGPIAEALVGKDAKDQAAIDAVMIELDGTENKSKFGANAILAVSLANAKAAAAAKGMPLYEHIAELNGTAGQFSMPLPMMNIINGGEHADNNVDIQEFMIQPVGAATLKEAVRMGAEVFHNLAKVLKSKGYNTAVGDEGGFAPNLKSNAEALEVIAEAVAAAGYELGKDVTLAMDCAASEFFDKEAGIYNMKGEGKTFTSEEFNHYLAGLVEQFPIVSIEDGLDESDWDGFAHQTQLLGDKIQLVGDDLFVTNTKILAEGIEKGIANSILIKFNQIGSLTETLAAIKMAKDAGYTAVISHRSGETEDATIADLAVGTAAGQIKTGSMSRSDRVAKYNQLIRIEEALGERAPFNGLKEVKGQA >NZ_CP046785|1567798:1581878|1580151_1580634_+|WP_021450025.1|DBSCAN-SWA MEKTTKLSADLGVLLARHGHVLTTAESCTGGGVAAAITDIAGSSGWLDRAFVTYSNEAKMEMLGVQFQTLEAYGAVSEPVVIEMVQGALKHSNATIGVSISGIAGPGGGSEEKPVGTVCFAFADNQGWQLVETMHFSGNRAEVREQAVIHALSQLHQHLI >NZ_CP046785|1567798:1581878|1577505_1580067_-|WP_089203081.1|DBSCAN-SWA MKAEQKHTPMMQQYLKLKAENPEILLFYRMGDFYELFYDDAKRASQLLDISLTKRGSSAGEPIPMAGVPFHAVEGYLAKLVQLGESVAICEQIGDPATSKGPVERKVVRIVTPGTVTDEALLSERLDNLIAAIYHHNGKFGYATLDVTSGRFQLTEPETEEAMMAELQRTAPRELLFPEDFEPIHLMSNRNGNRRRPVWEFELDTAKQQLNQQFGTRDLVGFGVEHASLGLCAAGCLIQYVKDTQRTALPHIRSLTFDRQDHSVILDAATRRNLEITQNLAGGTDNTLAAVLDHCSTPMGSRMLKRWLHQPMRCIDTLNNRLDAIGEIKDQGLFTDLQPTLKQIGDIERILARLALRSARPRDMARLRHAMQQLPELESLTASLTHPYLVKLAQYAAPIDEVCELLERAIKENPPVVIRDGGVIAEGYNEELDEWRKLADGATEYLEKLEADERERHGIDTLKVGYNAVHGFFIQVSRGQSHLVPPHYVRRQTLKNAERYIIPELKEHEDKVLNSKSKALALEKKLWEELFDLLMPHLEQMQNLASAVSQMDVLQNLAERADSLDYCRPTLVKDAGIHIQAGRHPVVEQVTSDPFIANPIELSPSRKMLIITGPNMGGKSTYMRQTALIALMAHIGSYVPAESAQIGSLDRIFTRIGASDDLASGRSTFMVEMTETANILHNATKNSLVLMDEIGRGTSTYDGLSLAWASAEWLATQIGAMTLFATHYFELTELPNLLPNLANVHLDAVEHGDSIAFMHAVQEGAASKSYGLAVAGLAGVPKTVIKNARTKLSQLEQLGQASDSPRPSTVDVANQLSLIPEPSEIEQALSNIDPDDLTPRQALEELYRLKKML >NZ_CP046785|1567798:1581878|1574016_1574793_+|WP_005478553.1|DBSCAN-SWA MELDSLNTKPLRILISNDDGVHAQGIHALADELRSIAEVIIVAPDRNRSGASNSLTLEQPLRVSEIAPNTYSVQGTPTDCVHFALNELMKDDLPDLVLSGINHGANLGDDVLYSGTVAAAMEGHFLGVQAIAFSLVGKRHFESAAKIARQLVEQHLAAPIPTNRLLNVNVPDLPLESLGEIEVTRLGARHHAENMIKQKDPRGHDIYWLGPPGKEQDAGEGTDFYAIEHGRVSITPLQVDLTAHESLRAMDSWLKEEK >NZ_CP046785|1567798:1581878|1571445_1571727_+|WP_005455577.1|DBSCAN-SWA MRIFVIALTLLFGWLQYTLWFGKNGVSDYYTVKDEIEVQQQVNSKLQARNNEMFAEIDDLKQGLDAIEERARHELGLVKEGETFYRIVGEENP >NZ_CP046785|1567798:1581878|1567798_1569439_+|WP_005455581.1|DBSCAN-SWA MTTNYIFVTGGVVSSLGKGIAAASLAAILEARGLKVTMMKLDPYINVDPGTMSPTQHGEVFVTEDGAETDLDLGHYERFIRTKMTKRNNFTAGRVYADVLRKERRGDYLGATIQVIPHITNAIKDRVIAGSEGHDIAIVEVGGTVGDIESLPFMEAIRQLAVELGRERAMFMHLTLVPYLAAAGEVKTKPTQHSVKELLSIGIQPDILVCRSDRMIPANERKKIALFCNVPEKAVISMKDVDSIYKIPQLVKSQGLDDLVCTRFGIDAPEADLSEWEQVIYEEANPTGEVTIGMVGKYIELPDAYKSVNEALKHAGLKNRLNVTIKYVDSQDIETKGVELLEGLDAILVPGGFGDRGVEGKIRAAQYARENKVPYLGICLGMQVALIEYARNVAGMEGAHSTEFNKDTKYPVVGLITEWVDETGNVEERTESSDLGGTMRLGSQLCHLEKGTKARELYGSATIHERHRHRYEVNNVLRPQIEKAGLKVSGLSADKKLVEMIENPAHPWFVAAQFHPEFTSTPRDGHPLFAGFVKAAGQYSRGEFEK >NZ_CP046785|1567798:1581878|1571728_1572433_+|WP_005478544.1|DBSCAN-SWA MSENVSSHIAIVPAAGVGSRMKADRPKQYLLIDGKTVLEHTVEKLLAHPQIAKVVVAVTEGDPYYPELSIALHPDVIRVAGGKERADSVLSGLNYVSAQLPCEWVLVHDAARPCVTLNDIDRLIDVCCAHPTGGILASPVRDTMKRANKENNIDHTVDREALWHALTPQMFKTQQLTRALADALQQGVAITDEASALEWLGETPALVQGSANNIKITQPEDLALAEFYLSRERG >NZ_CP046785|1567798:1581878|1572450_1572927_+|WP_005455572.1|DBSCAN-SWA MIRIGHGFDVHKFGGEGPVIIGGVAIPYEQGLIAHSDGDVALHALTDALLGAIAAGDIGRHFPDTDDKWKGANSRELLKDVYRRVKEQGYRLGNADVTIMAQAPKMAPYIDAMCAAIAEDLETDISNINVKATTTERLGFTGRKEGIATEAVVLLFKQ >NZ_CP046785|1567798:1581878|1574792_1575419_+|WP_005455562.1|DBSCAN-SWA MSNPHADRLIAFLISSGIKDQRVLDAMHCLPRESFVSQAMMHQAYDNNALPIGQGQTISQPYIVARMTELLELQRASNVLEIGTGSGYQTAVLAQIVDHVYSVERIKSLQWEAKRRLKQLDIYNVSTKHGDGWLGWETKGPFDAIIVTAAAEVIPQALLSQLKDGGKMVIPVGDAEQQLLRIERKGDEYLSTVVEMVRFVPLVAGDLA |
12 | uncultured_Mediterranean_phage(22.22%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1898469 : 1959740
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP046785|1898469:1959740|DBSCAN-SWA 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56 | uncultured_virus(33.33%) | protease,transposase,integrase | attL 1944591:1944609|attR 1963460:1963478 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2723031 : 2732557
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP046785|2723031:2732557|DBSCAN-SWA 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GAACTGGAAACCCAAACCGCGAGGCGCAGACAGCGACAAACCAAGCACTTGATTGGTAAAGATGCGCAAGCAATCTTCTAAGTAATTGCGATAGCAGATATCAAACGCTTTGTTGTACGCATCAATCTCGTCGGAAGTCTGAGCGACCGTCGGATTAAACACAGGTGGAGCAGGGAACTTAGGTGCACGACAGTGACGCTGTAACAGTCCGGATTTGGCAAAGCCTTTGTATTCCTCATGCTTGTGCAATCGACGAACGGCATCGTGACAATGACGTAAGTCTTTCACGGCAAACGTAAAACACAGGTAGTCGATATGAACGCTTTGCTCATCGAAACTTTTAAGGATGTTAGTTGCGGTAGTCATCGAACACCCCCAAATTGATACGTTGTTCAACGGTCGTGTTGGTGATGGACACCAACTCATAAGAAGCGAACTGAGAGGAAGCCCAAGATTCAAGATGAGACATGGATTTAAGCAAATCCCATTCGTCGCAACCTTTGACCAACACAGACACAGTGTAGTCAGGCAGCAAGTCGTAATAGATGATTTGAGCTTCGTTCATGGATTAAGCCTCTGAACTAGGCTTAGTGACGCTGTCACAGTTTTGATTGTTTTGGTTTTCAATCTGTGAGTTAACGGCGTGAATCAATCGACGAGTCATTTCACAATCAGCCAGTGCACGGTGCGCCGTTAAGTCAGACACATCAACATTCTGTTGAGCGCAAGCGTTGGAAAGTGATTGCCACTTGTAATCTTCATGGTGTTCATTCCAAACACCAAAGAACTCTGCATACCAAAGCATTGCGCACTGAGGAACACAGAACTTGAAAAACAAATCGTGAACGGATTGGACGTAAGCAGCGTTACAGTGCTTATCCAAAGATTGGATAATTAAGCGCGTATCAAAATCTGAGTTGTAGATGATGATTGGGCGACCGTTAAGAAGCGGAAGAAAATGGTTTGAGAAGACTAAGTGAAAGTCGGGCGCATCCTTAACGTCTTCATCGGTGATGCCATGAATAGCAGTTGCTTCAGCAGGAATCGAACAAGTTGGTTTAACAAGTTCGTTCACGATAACTTTGCCAGTGTGAGCACAAATAGCTGTGAACTCGACAATTTCTGCTTGAGAACCTAAACCAGTAGTTTCCGTATCAAGAATGATCGCGTTCTGAGTAGAGAGTTTTTTCATAGCAACACCAAGCAAGTTAAGTGAGTATCCGAATTTGCATACAGTAAACATGCATATTTGCATACTGTAAATACCCGAATTTGCATGCTCATGAGCTAGAATGATCAAATAGAAAACTGTTAGGAAAACAGAAATGTACATAAATGAACTGTTAGACGCCTATAAAAAGGCAAAGAACTATGTGCAAGATAAACAGATTGCCCATGATTTGGGTATCAGCACACAGAAAATGTCGAACATTAGAAATGGAAGTCGCTATCTAACTGAAACAGAAGCTCTTTTTCTAGCTGAAGCTATTGGAGCGGACAAGGAAACTGTGCTTGTGTACTTAGCAGCTGATAAAGCGAAAACGTACGAAGCGCAACAAGCTTGGGCAAACATAGCAAAAAAGTATAGTGGGCTTGGAATCTCTGGATTTTCAATGGTTTGTGCCGGATTTGCTGTAGTGTTTACAAGCCCATTAGAACCACTACATCAGTGCGCATTATGTATAAGCTGGTAAATGAGGGGCTAGGCTGGAGCCCCTGCTTGTAAGGCATTGATTAAGCGGGGGTTTATAGACTTATCTTCGAGTAAACCGTATACCACATCTTGATCATCCAACCCTAATAAGTCGGCGATTTTAAAGGCAATTTCCCAATCAAGAACACTGCGACCATTGCGGTAATTGCTAATTCTACTTGTGCCAACGTCCAAAACCTTAGCTAACTGATAGTCAGAGGTAAGTTCCAACTGGTTTTTCAGTTTATCTAAAAGCACATTTGTGTAGTTAGTCATGTTCCCGCATCCTTTCGCAATGTTGTTAAATTTTAGTGGATAGTCTGGCTTCTTTCACTACCGCAAGCCACTTGCGTGCTTAAAAAGATTTCCTTAACGTTGTTTTTGAGACAGGAAATCAATAGCTTGCGGAGGCTACAACATGGAACGTATCGTTACCGACCCAATTCACTTACCTTGCCCAGATATGGCAGGGTGTATCAATCCAGACCCAGCTAAAACAGCAAACTCACTTCATAAGATTGCACAATTACGCGAAAAGTTCGCTGAGCAATTCCCTAAGAAGAAACAAACCTACATTCCTACACGTTTTCGTCAGGGGGTTGTAGCATGAATTTGAGTATCTGGAAAACGCGCCGCAATCAGCGCCAACTTGTTGCATCGCAATGCAATGGAACTCATATTTACTTCGACAGTTTTGAACTGGAAACCGTTGAAGCCTCCCTTTGGCTCTATCAAGGCATGACGCTTGTTGCTTGTGTAAAAGCGCAAAATGCCACGTTAGCCGATATTACTAACGCCGCTCATCGTATGGCGACACTTGGCGCTCAAAACAACGGCGAACCATTACACCAAATCCGCAAGCAAGATGAAGCGCCCCAAGTGGGCGCGGATTCTTCCATCGAGCTTTGTGACGGTTGTAAAAACACGTTCAAACAAGACCACGTTGTTTGCCCTGATTGTTCGCAGTTGGGGGATGTATGAAACATCTATACGACGTGCAATCGCCACGCGAATTTACCCAACTTTTAAGCCCGCACGATGTGGGCTTTATTACGGCGTTAGCGCAAGACGTTACCGTTACCGAGAAAAATATCGCCGCTATCGAAAGCGGTTTTTTTAGTGCTCCAAACCGTGATTGGATGGAAAGTGAACTGCAAAAGTTCAAGTCATTGGATCAAATCCACCATTTACGCACCTTAAAAAGTGCCGAACTTGGGCGCGAAGCGCTGGACGAAGTCCAGAAAAGACTAGGCTCGTCAAAGGGCGCAAAAGTCGGACACGGAAAACGTAAGCAGATAGACCGCTTAATTACCCGTTCTCGACGTCTGCCGCCGCGCCATAAAACGGAATCGTTTTGTGGCGACAACGTGACCGATGAATATCGAGCACGCGCACAAGCGCAAACAGGCTGGATTCGTAACGAACACAACCGCCTTGAATGGCAACCCATTGGCACTAGCCGAGCGTATTTAATGTCTCGCGGTTGGGCACAACAACTGAAAATGCAGGTGAAATACCACCCAAGCCCGTCCGATGCACCTGAACCACAAACGGGTGAGCGATTCACTGAGAAACTGACGCCTCGCGCTGTGAAGAAAATCTTTGAATCGGGCGCTTATGTCGCGGCGTGTCATGGTGGGTTTAGCACCTTTCTCACTCTAACTTTTACGCAAAAGCAACGCGAGCGCATTTTTGGTGGCGAAGCGGTCACCGATGAGGGGCTGCCATATTGCCCAATCCAAACCACGATTGGTGCCGAGGTATCCCGTTTTCTAAATGGCCTCAAGAAAATGTACCAACGCGGGTTTGAATATTCCGCAAGCGAGGCGGGGTCACTTGGGTTAGACGGTGACAAAGTCAAAGTAACTGGCCGAATTGGCCGCCCGCTTAAAGCCGCTTGGAAAGATGACGACGGTATCAAGCACGTTAAAGAAATTCATGGACCAACCGCCAACCCGTTTGATTTTCATTACATTTGGGTCGCGGAATCTCCGGCGAATGAAGATGGCGAGCCTAATCCCCATGTGCATGTGCTGCTGAACTGGCGAGTGGAACAGCACCACTTTGCAGGATGGGCGAACCGCATCGAGCAGCTTTGGGGCAATGGCATGGCGCATCTGGAGAAAATCAAATTCAGCGAAGCGGCGGCGGGCTATCTCATCAAAGCGGTGGGTTACGCAGCCAAGGGCGACAATGCCGACCAAGGACTGATAAAAGGCAACCGCTACAACATTGCACGCTGTAGCCGCGCACCCGATTGGGATGTGTTGGCATCGTTCGAAGTGGACAACATGACGGGCATCATTAAAGAGTGCGGTTACATGTTGGAGCAATGGCGCAAGCCAATGCAGCGAGAAATTCGACGTAAAGAAACCAAAAAGCAAGACGCGATTCGCGCTATCGACATTAACCGCAAACAAGGCAATCACGATGCGGTGCAAAAGCTTAACCATCTGATTAAGAAGCTTGACCACGAAGCCCGCCAGATTCGCAACCAAATCAAGAGCCGCGGCACGTTCGCCAGTAGCCTAAACCAATTTTCTATCGTGTTTGAGGGTGAAAAAGCCCAGCGCAAAGCGGGCGCGTTTCTCTATTGGGCACGCGGTGCGCGTGGTTGGTCGATGAAATGCACCGCCGAGCGCAAAGGCAATGACTTAGCACTGATTCGCGACGATGCCAGCGACATTTACGCCGAACAGTTTGAACGATTTCAACTGCGCCAAGCCAACTGGAAAAGCCAGCTGGCACAAGTGCAACCGCCAGAGCCGGACATCAACATAATTAAGAGCAATGACATGGCGATTTACCATGATTATTGCCACTCAGTTCATTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP046785|2723031:2732557|2726884_2727244_-|WP_005477647.1|DBSCAN-SWA MAKSVFVLGMDITWNSARGDSAQLNVSRPLREINSEKFKRRTIGESGDVNPQWDQPLMIDHEYALLLERTGALVPRREYQLRLEINPEDPLAGAIVTELIPVDQEIKKHFEASMKPVQG >NZ_CP046785|2723031:2732557|2730329_2730704_+|WP_031829287.1|DBSCAN-SWA MNLSIWKTRRNQRQLVASQCNGTHIYFDSFELETVEASLWLYQGMTLVACVKAQNATLADITNAAHRMATLGAQNNGEPLHQIRKQDEAPQVGADSSIELCDGCKNTFKQDHVVCPDCSQLGDV >NZ_CP046785|2723031:2732557|2730141_2730333_+|WP_021448542.1|DBSCAN-SWA MERIVTDPIHLPCPDMAGCINPDPAKTANSLHKIAQLREKFAEQFPKKKQTYIPTRFRQGVVA >NZ_CP046785|2723031:2732557|2729355_2729724_+|WP_047726170.1|DBSCAN-SWA MYINELLDAYKKAKNYVQDKQIAHDLGISTQKMSNIRNGSRYLTETEALFLAEAIGADKETVLVYLAADKAKTYEAQQAWANIAKKYSGLGISGFSMVCAGFAVVFTSPLEPLHQCALCISW >NZ_CP046785|2723031:2732557|2726650_2726881_-|WP_005477619.1|DBSCAN-SWA MSVCVTVVNQYGNLKATKTPVADCQEYVLISAVDYQEYKEPVLFNGDLFLYVSGVLLINMVVGHWVGRVVRLMSKR >NZ_CP046785|2723031:2732557|2726276_2726387_-|WP_079400744.1|DBSCAN-SWA MPPLSGNLLGDVLAIILGVAFAGAFLHGFVSGINTH >NZ_CP046785|2723031:2732557|2723031_2724417_-|WP_089202626.1|DBSCAN-SWA MATSFRYGHGGSYKSACAVWFDLLPALREGRICITNIHGMQPLEVIEQRLGEKFPDTARLIRISSRNPEGFELWKYFFCWAPIGAFILIDECQQIFSVNAGFKMANIHKRPFTDFEPHLPEGFSELFHSRWLTIDTSSLDNGEIDDCKRTRFDEQGRIIYPENFNNAFMEHRHYNWDIVLLTPDFAQIPKELKGVAELAKQHKGKDGIFFSNRKPRILEHDPTRTVTKPSKDDVVYNLKVPLDVHLLYASTVTGQITKSGLGKNIFLNPKFLAAMALVVLSFGYLVYALIGMVSDSETTTAEGTQLHQTSQQGGVSTSQVQARPGQSGSPGSVMGSSGSVCTGSGCGNESYHDVGTVPAWFPLANSESIYVSAVERWHKATSIHVNVHFEVVTPRGVTYLDDGFLNKLGVKMEYLDDCLVQLSHGASNFYVTCSPYEQYAQRQEQDIELKPVGGLFSGDET >NZ_CP046785|2723031:2732557|2728379_2728595_-|WP_012842282.1|DBSCAN-SWA MNEAQIIYYDLLPDYTVSVLVKGCDEWDLLKSMSHLESWASSQFASYELVSITNTTVEQRINLGVFDDYRN >NZ_CP046785|2723031:2732557|2729732_2729999_-|WP_021448543.1|DBSCAN-SWA MTNYTNVLLDKLKNQLELTSDYQLAKVLDVGTSRISNYRNGRSVLDWEIAFKIADLLGLDDQDVVYGLLEDKSINPRLINALQAGAPA >NZ_CP046785|2723031:2732557|2728598_2729222_-|WP_047726187.1|DBSCAN-SWA MKKLSTQNAIILDTETTGLGSQAEIVEFTAICAHTGKVIVNELVKPTCSIPAEATAIHGITDEDVKDAPDFHLVFSNHFLPLLNGRPIIIYNSDFDTRLIIQSLDKHCNAAYVQSVHDLFFKFCVPQCAMLWYAEFFGVWNEHHEDYKWQSLSNACAQQNVDVSDLTAHRALADCEMTRRLIHAVNSQIENQNNQNCDSVTKPSSEA >NZ_CP046785|2723031:2732557|2727247_2728456_-|WP_015975179.1|DBSCAN-SWA MSWCPSPTRPLNNVSIWGCSMTTATNILKSFDEQSVHIDYLCFTFAVKDLRHCHDAVRRLHKHEEYKGFAKSGLLQRHCRAPKFPAPPVFNPTVAQTSDEIDAYNKAFDICYRNYLEDCLRIFTNQVLGLSLSAPRGLGFQFYTESMKLTSPDGEDFCGFVGIGGNNDTVHFQINGTGCKHVFARRPTWSLHDWLTNVLGVQTLARVDLAYDDYDGIFDCEYAYKAWRDDCFRTAERGRGPVLHEDMTIASIGKDGKPIYTKEQYSIGSRTSRIYWRIYNKALEQKLANTGLVWYRSEVELKKWNVDVLLNPAGAYAALNDFAASISTAKKFNTKPVPTKRAALDLLASAHWMRRQYGKILNSLIEFHEGDIETVVGSLVRDGTKFTFPDTYGKLVTHILET >NZ_CP046785|2723031:2732557|2730700_2732557_+|WP_158116419.1|DBSCAN-SWA MKHLYDVQSPREFTQLLSPHDVGFITALAQDVTVTEKNIAAIESGFFSAPNRDWMESELQKFKSLDQIHHLRTLKSAELGREALDEVQKRLGSSKGAKVGHGKRKQIDRLITRSRRLPPRHKTESFCGDNVTDEYRARAQAQTGWIRNEHNRLEWQPIGTSRAYLMSRGWAQQLKMQVKYHPSPSDAPEPQTGERFTEKLTPRAVKKIFESGAYVAACHGGFSTFLTLTFTQKQRERIFGGEAVTDEGLPYCPIQTTIGAEVSRFLNGLKKMYQRGFEYSASEAGSLGLDGDKVKVTGRIGRPLKAAWKDDDGIKHVKEIHGPTANPFDFHYIWVAESPANEDGEPNPHVHVLLNWRVEQHHFAGWANRIEQLWGNGMAHLEKIKFSEAAAGYLIKAVGYAAKGDNADQGLIKGNRYNIARCSRAPDWDVLASFEVDNMTGIIKECGYMLEQWRKPMQREIRRKETKKQDAIRAIDINRKQGNHDAVQKLNHLIKKLDHEARQIRNQIKSRGTFASSLNQFSIVFEGEKAQRKAGAFLYWARGARGWSMKCTAERKGNDLALIRDDASDIYAEQFERFQLRQANWKSQLAQVQPPEPDINIIKSNDMAIYHDYCHSVH >NZ_CP046785|2723031:2732557|2726399_2726645_-|WP_005495000.1|DBSCAN-SWA MKKLELVVNNVKHAVVNKKTAAGAALMVASVSPAFAEVDITGAINSAVSGGQANVSLVVAGLIGMAALGFGVTMVVGFLRR >NZ_CP046785|2723031:2732557|2724767_2725874_-|WP_089202625.1|DBSCAN-SWA MDACQFKQSIGDTVKLHWHPAVYGELVTGACYGDYGATRCEMTKNESTIICTGVPDGQYTPDSQCSLRFAYTGRQCDGGTLFWGVNGPDEPIIPPDTPEDPTHDPDDPTDEIEDPTVLPDDSTNTVNPGVVDDKPDVEDPDTDESTDTAVLSAIKGLNVDVNKGIHDLNVDINQSHADITNAVIDVKGSLVDNTQAIQEQQINDNKIYNNTKALIQQANGDITTAVNNNTNATIGIRNDLKGLGDSMGELDSSLNAIEGLLTGSEFGTPTGTDITGEIFTAEDFANLQTTIDEKAESIQGYVDDIKGLITIGTNFNNGTLSDKSFNIKGATVESGLQRFDAVSGYVRPVVLFICALIALWVLFGNRSK >NZ_CP046785|2723031:2732557|2724421_2724766_-|WP_005477634.1|DBSCAN-SWA MEYIYSALEFIANIGQTFLDFFDVAIEWIKNAFEYGAMWLISVWLDIKIASIQIALKIAQLLLEEYGVYTLVEDRFNALPSDVRYILTEYGVTSGLRVIFDAFATSLVMRFFNW |
15 | Vibrio_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2986818 : 3000736
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP046785|2986818:3000736|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP046785|2986818:3000736|2989338_2989551_-|WP_005483265.1|DBSCAN-SWA MSNKSTGSVKWFNETKGFGFISPENGGEDLFVHFQSIVSTGFKTLSEGQKVSYVVEQGKKGLQAGEVTVM >NZ_CP046785|2986818:3000736|2990457_2990661_+|WP_005483162.1|DBSCAN-SWA MRKKRDKSPRKYKKSGYEVKFEQMVKEYHDAKETLESMKEGSEEYNKQKNLCESLFASAERFFKQNQ >NZ_CP046785|2986818:3000736|2994967_2995636_+|WP_024702645.1|DBSCAN-SWA MKTNWNELVKSRMKTSGITQSDLAELMGVAQGTIARYLNEKREPSLDTIAEMMKHVGLSQMTLLSDGSVTPDGFANVKSIDDQPETKGLFPLISSVQAGQWREACEPYNVKDAQMLATTEKASSSSFWLTVEGDSMTAPPGSPLSFPTGVRVLVDPEVEAVNKSLVVAKLDDVNEATFKQLIIDAGQKFLSPLNPSFPKLPINGNCKIVGVVVDAKINVKLT >NZ_CP046785|2986818:3000736|2999695_3000223_+|WP_021453095.1|DBSCAN-SWA MADKTESMNNINQQVFDLLELAKQEEWDEQTIADNLAGIECSIDDKLMAYRRYMDKLETAAKLADAEKKVYAEQAKPYGDRAKSLKDERSRMTYPLLNLFQMLNIEKMKGAYGTFYIKNNPAKLRYEEAHLPEKYLIREVRFVPDEDAIRKALDDGEELDFAWYESQPQQVVLRK >NZ_CP046785|2986818:3000736|2993937_2994156_-|WP_005495414.1|DBSCAN-SWA MKKGVIDKSLIPVSEIVTITAPVQVVIRDGEFTVKELVVAGKTVDCYQGLTNILLEKQREFDRHKSQTLNDW >NZ_CP046785|2986818:3000736|2996538_2999703_+|WP_029802384.1|DBSCAN-SWA MADKYFKLTCNKKVSHKAVKESGDLEPVIHYIKAATQELAKSEAVCKVEATHPLCTENENSGYSDFFKGVKAEKISEEDYNAAIIELEAKGVDEGEFIHSDEQQINVPDTPYPTLGQDGYYDTKDPQVEDSSFIYSSETDSMKAAKVFILRVGHSQYAYGFRFKFGDFDKHEKMNLDRTEEKRDDAIDKAVERLEKFLDYQDEFGPEDQKTFISATMKHDFYHAFLEPSELFITALSQHPDAKNALEAHSDYLEVVEGHFADIWPLDKSPNQAIEHVNSMVTIGVLYDLEAFTESLKPYLPAVLTEKTKESMKHIEDVIDKPAANEYIIEPNCWKAALPVTDELHVVIAIRDCGDEGWQYAVEGNQKAERAFGDANDFGCEFATTRKEAIKMAGQAIIDALYKYDSSLSLAKIFMKSPYIQEFEENCIEVMDSEDLPPNECSPIENAVRERLARRPTARMTEGEVKLAMDALQPHITAQTDIEELVETINGLERCGVLFNESEAEYLVARCTVTKNNIQHKPAHNLENEYECFIAEIFSRISDGSPYLTTEQYEEAGEKLAAVVDELTNWHNGEREHNGKYLTFVKDKTLENIRNIDFDDASEVSKSFLNIRTLRAVFRENIELIESMEPASNTLISEVEHPSLLLAIAERLAHENHAVTPERAYTHLLKIITKDTDINALADYIKQLKNPVIIWHSTESVNLVMKFTGQPKADGNNELSSGNNEQKEAQKLPEQGKKEPTDGNGKPKVTKNAPLPESANDEHLADSDNNISGTDVPQNIVEQEPANDPEIPDVDLDESNSNMGIWNQSFKTDLNFTKQDPSTGRLSINAQYRQMKATEIFGPRGKGWGVDVKREWIEDGLPIFANGTYTGVNESVHNMEVELWYIHPNSGERCTLTAFGETERFYWSHNYSRMIKNGECRKKSLTDATGKALSMLGICGDVYMGEYDDENIINRSQMTKTTDNALKQLEFDAKATQQALDKAKSYTDKFSTAPSLAEIKRLQKLAETALDAIPTHDKASKAKKDKALSRIAEQAESAIKDFNADIKDKDQANG >NZ_CP046785|2986818:3000736|2994636_2994858_-|WP_021486590.1|DBSCAN-SWA MNRIKDYRTNLGITQQQLADELGVYQATVNRYEKGRSPNLKTCWQIINALCSLGAKCKFQDVFPDNTAPKKTA >NZ_CP046785|2986818:3000736|2986818_2989044_-|WP_089202549.1|DBSCAN-SWA MKLNISAQSLNYTKYDNVIPSRDAILGLFDKVKSYLSYEQISHSSGLNDEPEKDALKKRLRAMERDGQLIFTRRKGYKRVDQSSLVTGKISIHADGFGFLTYDDNEKDLFLPKHQLSHVFDGDIILVLKGHTQHQGRSNHRFIKIVERKTTHIVGLLKRKGSKLYLLPENSKLTQTIYVTPNELIAKNVGKLVHCKINTYPDYRQPTTVEVDEVLGRPGEAGIEVKLALRRHGINDKWDKDVLDAASAFGSQVEEKDKTSRVDYRDLPFVTIDGDDAKDFDDAVYGYQMDNGQWKLFVAIADVSHYVKPNDHLDLEAQSRATSVYFPGCVVPMLPESLSNGLCSLNPNEDRLVMVCEMTFDDEGNMLDSEFSEGIIHSHARLTYDDANRIIMQSSAKTTYQSNNPKNNIAQYLVNLHRLYLNLSGQRKVRGAIDFDTQELAFKLNNKKKIASIVPVVRNDAHRMIEEFMLCANVATAKFLELNKIPSLYRVHSGPQMKKLTSLRMLLAEKGLTLAGGDKPTSHDYNALLDQVRDLDECDIIRTLLLRSQSQAEYSPKNLGHFGLAYDAYAHFTSPIRRYPDLLIHRAIRAKLREKTTGKLRSLLMKLKPIRQLAGISNSYPYDTKEIEQLSVHCSHQSRQADEVSREVESALKCHYMKPFIGRNFMGSVSGVTHFGVFVELEENRIEGLIPLSSFQNGDFEFDAIKQKISSQTTTFTLGTQVNITVKEIDSKQRKIIFNFA >NZ_CP046785|2986818:3000736|2992540_2992894_-|WP_089202547.1|DBSCAN-SWA MPVLKKWGIPSDLPFIEGKLQRLNMANQKVASEQYEDIYKHFHNCGEWRKARELANQMLNDIANDYGITLKDYEQMIAANDDDSENTQFRVDLMIEKAKKAQKLAKPRIHFKELKRA >NZ_CP046785|2986818:3000736|2996346_2996526_+|WP_127463331.1|DBSCAN-SWA MDRPSQESVEQFWLSVKKLPHDRKIMTDYCRKHGFRSPDSVEENFETASSLKIQGSLAV >NZ_CP046785|2986818:3000736|2994152_2994617_-|WP_005495415.1|DBSCAN-SWA MLVKFDSKKEVVKEIIKKTKGGRGALAGAIGMSETTFNNKLYERNGCRFFDDEDLEAMEIHAGTYFLAQYRAGQRGGLFVPMAEFELDAEELSEIQIKEMAALGEANVEICRALADDQMIDNKEAKAIKSAAIEAAARVIASKLAAIRVYGMDK >NZ_CP046785|2986818:3000736|2990883_2991291_-|WP_005495402.1|DBSCAN-SWA MKDQDLERTRVLLRGWGNWSHNNTGCHWYTQMCGLSNVLPVAPDLRYKLCDDDALVIDKLVACMMDEENPRPMTFFVLHYVHGLNKSEIARRATREDKKQCTEGKVRSLLLLMESMVCGMLIQREQMGFRLEYDK >NZ_CP046785|2986818:3000736|2991327_2991729_-|WP_005495404.1|DBSCAN-SWA MKIKKYGYRVQKAQEQFNRFIVLRDSGKPCASCGRYLPLCCGHFRSVGAAPELRFNEDNAHGQCYECNGNKSGNSKEYRRGLIERIGLSRLETLESYHSPQNWTVYDLYDIEKVYKAKADVMSTNFEYFYESA >NZ_CP046785|2986818:3000736|2992918_2993872_-|WP_021486513.1|DBSCAN-SWA MSRRATDWAWRQDIKATMKLILLSLADRADEYHRAYPSAERIELDTRLNIKTIRSNLKAMQELGIIRDSGKRKGSTNQVVVWELLGIEDDVKHQVPKSSRTTSPEEKVPENGHLPKVPKIGLERYPKTDLKGTQNWVTEPVIEPTIDPLKDLIPSNDELLETRKPESEFEFPTNRRGEIYSVYMEDIFEFRKLYPSVDIYQEFRNMLGWLKSNPTRRKTKSGIPRFINSWLAKEQNKGRCNKNLESPVQLDCTAQIENEIHLAESKVAGLQQNIMQHQQWNIPGGDKAIVSFQADIEKLKRFIQQQRQIRERLQGER >NZ_CP046785|2986818:3000736|3000547_3000736_+|WP_021453797.1|DBSCAN-SWA MSNSYKEELNERLINVVNTKCNILGCDNCDLKWDGGCSATNLEAKIIEIEIKEMNSDTSSND >NZ_CP046785|2986818:3000736|2991930_2992548_-|WP_089202548.1|DBSCAN-SWA MRSCSTVKAKKETTEIIGAIGTGGYIQYATPEMREKAATMRGRVVAIKPKSKAKARVLDHHRKFFALIHLGFEYWSPDVSLISEPEYYIAHETAKQFCQLAGREDMYETHGIEIANIVLSKIKKQRESHCDPEAYKCIENYRYQVMIEAGYFDLEMLPNGGTVKRPWSIAFENADQEQFEKIYKGCFNVIWNQSLFQVFNDEQEM |
16 | Vibrio_phage(40.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP046786_1 | 1405062-1405159 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP046786_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP046786_1
>1.1|1405087|48|NZ_CP046786|CRISPRCasFinder TTGATTGCGATCTTGTTTTTCCGGATTCTTTAATTGCGCGGTTTCAAA |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP046786_1
The CRISPR arrays of NZ_CP046786_1 >merge|NZ_CP046786|1|1405062-1405159|CRISPRCasFinder TTTTTGAAAAGGCGTTTTAAAAATATTGATTGCGATCTTGTTTTTCCGGATTCTTTAATTGCGCGGTTTCAAATTTTTGAAAAGGCATTTTAAAAATA >NZ_CP046786|1|1|1405062-1405159|CRISPRCasFinder TTTTTGAAAAGGCGTTTTAAAAATA TTGATTGCGATCTTGTTTTTCCGGATTCTTTAATTGCGCGGTTTCAAA TTTTTGAAAAGGCATTTTAAAAATA
>NZ_CP046786.1|WP_005482916.1|1404200_1404962_-|2-dehydro-3-deoxy-D-gluconate-5-dehydrogenase-KduD MILDSFNLEGKVAIVTGCDTGLGQGMALGLAKAGCDIVGVNISEPTETIEKVEAEGRKFVDIRANLMKLDDIPTIVDRAVTELGRIDILVNNAGIIRRNDAIEFSEQDWDDVMNINVKSVFFMSQAVAKQFIAQGEGGKIINIASMLSFQGGIRVPSYTASKSGVMGVTRLMANEWASHGINVNAIAPGYMATNNTAALRADEQRNKEIVDRIPAARWGTPEDLAGPCVFLASKAADYINGYTIAVDGGWLAR >NZ_CP046786.1|WP_025501296.1|1403657_1404182_-|YgjV-family-protein MVDTSILAQALGFISFGLGFSVFYQKNDRHLKILMLIFNLNHLLHFLLLGSMVSALSALLSALRTTTAIFVSSKRVAAVFIVISLVSGFWVAEQWRDLWPIIGTVIGTYSVFCLSGIRMRIGFLLGASCWLTNNILVGSIGGTLLEMTVIVMNLLTIYRLHRQQSESMINQSSY >NZ_CP046786.1|WP_089202668.1|1403329_1403650_-|cupin-domain-containing-protein MFVFNQDIPMEDLGEGISRKVLAHSDNMMSVEVHFEEGAIGAMHSHPHEQLTYVLSGEFEFTIGDEKKIIKTGDTMYKEPNIEHGCVCLKAGVLIDTFTPMRKDFV >NZ_CP046786.1|WP_005460779.1|1402653_1403289_-|RpiB/LacA/LacB-family-sugar-phosphate-isomerase MKIALMMENSQAAKNAMVAGELNSVAGGLGHDVFNVGMTDENDHHLTYIHLGIMASILLNSKAVDFVVTGCGTGQGALMSCNLHPGVVCGYCLEPSDAFLFNQINNGNAISLAFAKGFGWAGELNVRYIFEKAFTGKRGEGYPIERAAPQQANAAILNNVKSAVAKDVVEGLRAIDQELVKTAVGSTQFQECFFAHCQVPEIAEYVKSLLD >NZ_CP046786.1|WP_089202667.1|1401664_1402576_-|alpha/beta-hydrolase MHVAPITSLQIWFPEHLVLPLWSEPQIRSHLVQSYQERNPNELLPDRAVFDITHPEIVVFEPEQSNGIGILLMPGGGYQRVSVDKEGADSARVLNQAGFTVFVMTYRMPNEGHEFGAWTPLADAQRAMRLVRRLPLASHLSSIGVLGFSAGGHVAASLATSHALDIYPLQDEADRVSAKPDFCALMYPVISMNTDIAHMGSRAELLANLERESDLLRFSLEKQVTSDMPPCFLLHASDDTAVSVENSIVFWQALRQHEIATEMHLFEQGKHGFGIRDAQGLPVAAWPQLLSAWLQNLTEKARR >NZ_CP046786.1|WP_005482884.1|1400636_1401566_-|sugar-kinase MNPISRVAIIGECMVELKKHDGVLQQGFGGDTLNTAVYLSRLTKQHGVETSYVTGLGHDPFSREMLTAWREEGINTDMVYLSEDKLPGIYAIETAEDGERSFFYWRNDAAAKYWLRERALLSLVKDLCQHQMIYLSGISLAIISDDCRQMLIELLTMCRKEGVKIAFDNNFRPKLWPNIEQARDFYSKILSVTDMAFLTFDDEVMLWGDKHEDEAISRTKNFGVKEIIVKRGADDCFVVTQDQQHTVAALKVDAVVDTTAAGDSFSAGYLAKRILGGDVAESALAGHKVAGTVIQHRGAIIPSQAMPTI >NZ_CP046786.1|WP_005460834.1|1400001_1400625_-|bifunctional-4-hydroxy-2-oxoglutarate-aldolase/2-dehydro-3-deoxy-phosphogluconate-aldolase MKDLNQQLSEIKVVPVIAIKDAGKAVKLAQVLIENGLPCAEVTFRTEDAALAIKNMREAYPEMLIGAGTVLTSAQVDEAIDAGVDFIVSPGFNPTTVKYCQQRNVTIVPGVNNPSLVEQAMEMGLRTLKFFPAEPSGGVAMLKALSAVYPVKFMPTGGVSPSNVKDYLSISSVLACGGTWMVPGDLIDNEQWDELAKLVREVAGIIE >NZ_CP046786.1|WP_005482845.1|1397355_1398033_-|porin MKVRYLTSALLLAMTSGLAAAASVDIRHEYVPDRDGDEHRDRIYVSHRFDNQIGFSVEAKWNYKDGHMGNAGHETGVSYRWKATDNFSLTPGINIDASPSGASVFKYNLTGAYKINDEWDVAARIRHGYKNTDDSRYNQLNLYANRKFEWGKLGVEAEYKDIHGGEGGWKDKGHDQLIDFKGEYTKLESGVIPFFAIAAITHKGDGSEFKDEYVPRFRVGLKYNF >NZ_CP046786.1|WP_031417528.1|1395111_1397340_-|hypothetical-protein MKKHTLALCLAAILAPAAHAAEIKVEDLTWKAITFGQSTDMNFGSTILPEKVGVNQVTVNGEAVAAGKLASTFTIESRGGKLANSHEGLTFYYTELPTDVNFTLSADVVLEQLGPETGATPNRQEGAGLMVRDILGAERLVPQPEGHEEFPSASNMVMNLMRSHTRTNDGMTNINASFREGVYQPWGTPGNRLSRVDYVEGVPYGTAETYRMTLTRTNDGFKVSYRNGEKFVEQAVKGANANIVEMQNSDSQYVGFFASRNAKMTVSNVDLQLAAADTVDAPKYAAKQGELVFQIASSPRSATKEYPVQARANYSGEFEVLHNGKVVAKQTVTAGELFSQWLTLDSGANQMEVRFTAIDGPNKETQAHRYSVDVVSLPDPMTLYVAPNGSDKGNGSQAQPLDLATAVELLPAGGTIILKDGDYQGMEIPLTASGSVDKLKHLRAEGDNVRFVSELRHEANYWHYQGIEVAGAQFIVHGSHNTFEKMVTHGAPDTGFVITSPENIGRALWASYNQVIESESYNNMDPSQINADGFAAKMRIGDGNTFIRCLSHHNIDDGWDLFNKVEDGANGAVTILDSISFSNGRTLDVANKGGTIGNGFKLGGEGIPVPHVVKNSLSFNNNMDGFTDNFNPGALVLSDNVSIDNKRFNYLFRKSPYSGEIEQGTFTNNRSYRFHVSSKYDDVINSAKSTGNALVENGTTYTSDGKAVDSKTLAPLKQASVIDTQQAIPGKQEAMQLKQLIH >NZ_CP046786.1|WP_089202666.1|1393035_1394811_-|Na+:solute-symporter MEYDYLVIAGYFALMVAISLLFKKMASNSTSDYFRGGGKMLWWMVGATAFMTQFSAWTFTGAAGKAFNDGFAVLAVFVGNMVAYVFAYFYFARRFRQMRVDTPTEGVKRRFGNTNEQFFTWVIIPLSVINAGVWLNGLGVFASAVFNADIVTTIWVTGLAVLAISLLSGAWGVVASDFIQTLVVAVISIACAAVALYVVGGPGEIVENFPGGFIMGPDMNYPLLLVCTFIFFVVKQLQSINNMQESYRFLNAKDSKNASKAALMALVMMLFGAVIWFIPPWASAILYPDAATQYSSLGAKASDAVYLVFARETMPLGTVGLLMAGLFAATMSSMDSALNRNSGIFVRSFYSNIVRKGQASDKELLRAGQIACLVNGILVIMMAQFFNSLKHLSLFDLMMQVATLLQSPILVPLFLGIIIRRTPKWAPWATVVVGMFVSWSVVKIFTPEFVGSWFGMDELTRREAGEMRTMITIAAHLVFTAGFFCLSTLFYKEETDTHKETTAEFFKDVDTECVAEEGQDIVDRMQRAKLGTLVIYMAAGLTLMVLIPNPLWGRLLFLACAASVFAVGYGLKKSAKLDTQPSSKVAATTTQ >NZ_CP046786.1|WP_089202669.1|1405202_1406000_+|DNA-binding-transcriptional-regulator-KdgR MKGATMEKSTQPEAVSSVLKVFHILQALGEQKAIGVSELSQRLMMSKATTYRFLQTMKSLGYVSQEGEADKYSLTLKLFELGAKSLEYVDLIELADKEMRHISEQTNEALHLGALDENAIIYIHKIDSGYNLRMQSRIGRRNPLYSTAIGKVLLSERDESFVRDVLNDVEFIKHTEKTLENTDQVLEELAKVRDFHYAEDNEEQEPGLRCIAAPIYDRFGQIIAGLSISFPTIRFDEERMEYYVGLLHQAGKNISEQLGYHDYPA >NZ_CP046786.1|WP_089202670.1|1406083_1407952_+|CBS-domain-containing-protein MGTSVTPNIFDFLIKIDPFDKLPEPVVESIANSVKVKYLVRGETIGFSALCDQRYLYIIRTGAIEQRTPNGELRARLGQDDQFGFTFLDPLENAEDGYQAEAIEDSLLYLIPHSELKLVSEEHPEFADYFAAQANVRLSSAVKYVCRKEEKGLFFRTVGEIASENIAIVDVNDSIRSVAQTMCGKQRSSCAVVMKEGEIIGLVTDRDMTKSVVAQDMDTNQPIADVMTPNPVLIEDDAKVIQAISLMLQYNIRCLPVVHGKQVKGLLTTTHLVHNHRTQSLFLIEKIKYASSLNALAALKEERQTIFQALVESGVSAEIQGRVMSMIMDAFTRRIIQLNEELLGPPPCDYAWLVAGSHARNEVHMLSDQDSAIVLSDDATEEHKLYFTHLAMRVCNGLAACGYPLCDGKYMAASPKWCQPIRRWKEYYQKWVASPEYNKLLSISVFLEVRAIHGNREFVDQIQQHLHDCIQKSPSFIPALVRDAIDTQPPLGIFNNLVLEKGGENSNTLNIKKYALNLIIDLARIFSLAAVGSLTGTEERFRYAAQHGTLSKDSVENIIGAYRFITQVRFRHQLNAILAGTTPDNHIAPDDFSSFERKHLKDAFKIISELQDVAKLKFVKGA >NZ_CP046786.1|WP_089202671.1|1407954_1408665_+|DNA-polymerase-III-subunit-epsilon MIKRWFKRWETPLSPEQKRQAIHVIDDWPMVLKDYLQQPLVDDSTTLKDLSFVALDFETTGVDAQGDKILSIGVVDLTLDGIDIASSKEWYICHGQFIKPETAKINGLTPQDLAKGLPLDEGMNRLLKRITGKVVLAHGCCIEKAFIHAYFSSRYQVEDFPAYFVDTLQIEKQFSYAGKSGAHSSYQLDDLRRYYHLPGYLSHSAASDALACAELFLVQSKKLTALPDVTLRQLMR >NZ_CP046786.1|WP_046268948.1|1408665_1409535_-|LysR-family-transcriptional-regulator MANWEGVSEFVAVAETNSFTGAAAKLKTSVAQISRRVSALEERLAVKLLHRTTRKVSLSEAGQLYYQQCKHLVEGLELAELAVTQMQTEPRGLLRVTAPVTYGEMNLAPLLHQFLEKYPRVDLDLVLTNQKLDLIEQGVDVAIRLGRLQDSSMIAKRLSSRQTYVCASPMYLERFGEPHTLSELGRHQCLVGSVDYWHFKENKRDKSLRVSGRIKCNSGFALVDAAKRGLGLVQLPDYYVQEALDNGELVEVLTDYRDDREGIWALYPQSRNLSPKVRLLIDFLAQELT >NZ_CP046786.1|WP_089202672.1|1409615_1410422_-|arylamine-N-acetyltransferase MNKTDLNAYLTKLGLPSELPADLESLHKIHVAQHRCLPFENFDISLQRGISVEIEDIIQKTVYHSRGGYCFELNGLMLDVLKTLGFEARSLLGRVHVMGTPTGRSHQITLVTLDEQAWIVDVGFGSNTPRAPLPFILNQVIQTDLQTFRFVEDAQFGYYLQVLSTDGTDTWNNLYSFDLEFVFAGDIAYGNFFTSTSPHSRFTSARVAAKATESGLVTLLNYTLKYTSEGEQTELELEPGQAYLDALKEYFGIELDAQYGDLHPLPDA >NZ_CP046786.1|WP_069493225.1|1410715_1411864_+|S-(hydroxymethyl)glutathione-dehydrogenase/class-III-alcohol-dehydrogenase MTLEIKPGQTHIKSKAMVAWAAGEPLKMEEVDVQLPKAGEVLVRIVATGVCHTDAFTLSGDDPEGIFPSILGHEGGGIVEMVGEGVTSVEVGDHVIPLYTAECGECKFCKSGKTNLCQAVRETQGKGLMPDGTSRFSINGETIFHYMGCSTFSEYTVLPEISLAKVNKQAPLEEVCLLGCGVTTGMGAVLNTAKVEKGDTVAIFGLGGIGLSAIIGARMAGASRIIGIDINESKFDLAKQLGATDAINPQKFDKPIQEVIVEMTDGGVDYSFECIGNVNVMRQALECCHKGWGESVIIGVAGAGQEISTRPFQLVTGRVWRGSAFGGVKGRSELPEIVNRYMAGEFGLQEFITHTMGLEDVNKAFDLMHEGKSIRTVIHMDK >NZ_CP046786.1|WP_025621985.1|1411925_1412765_+|S-formylglutathione-hydrolase MTIENVSQTKVFGGWHKQYTHDSKALNCTMRFAIFLPPNATKSNPVPALYWLSGLTCTDENFMQKAGAFRMAAELGIAIIAPDTSPRGEGVADDASYDLGQGAGFYLNATQAPWSLHYHMYDYVTQELPAIIEANFPVSDVKSISGHSMGGHGALTIGLKNPTLYRSISAFSPISNPMQCPWGQKAFTAYLGTDIESWKQYDASELLKKEKSPLPILVDQGDADGFLSEQLKPEVLLAAAKQHGSELNLRMQSGYDHSYYFISSFIDNHLNFHAKYLFS >NZ_CP046786.1|WP_005482833.1|1413210_1413672_+|oxidoreductase MKKIVSLSLLLFAPFLSANSITFSSPQQPSVTLKLEELQSLPTTSYTTDLPWIQQSSEFLGVKLSTLLTHVYGSIPEQVDIGSLNNYHSTLSRKDIVRYQPILAYQQDHHYIKVRNKGPYWVIYPLSQYPELDHNEYHAQMVWQVNEMKIKQK >NZ_CP046786.1|WP_005464959.1|1413671_1414763_+|GGDEF-domain-containing-protein MKLSEAYPIKQKNYSTTSKMLLLVFATSLLLANVILLQQTRVLAQSFTDEQKQATWFLFQLSKELSELVSEARRLDENVLKIEGAELQYELAWSRFDLLINSKDVYTFFSRNHIQQYFLQLFNEFKELEPLLVEAKTGDSQAAAQFYRATQTLYLNLVEFVNQNFRLTSQVYETQKDESQRLMKAQYMLFATFVLSILSLTYFFYRESHFHRKLALSDPLTGLGNRNALFVTLRNNTRNRTAFSLCLLDLNGFKNVNDTYGHQAGDTVLCEIAKRLKDMNIDSFSTYRMGGDEFAVVIESSDVDAEEAKKHIHSVFDTPVLNANNVSSLSTSIGVAHYPSDSDNVDFLISIADKRMYKMKFQR >NZ_CP046786.1|WP_031809655.1|1414772_1415177_+|hypothetical-protein MMRKFMQILLLLAVIAAGVLAWVFIPSHETIGQKTLEQALNDNYSLVGHRIYSTDPDAGNRFGYFVLATGQSIEEQEPFLVTSDQFIRMEQTGDNTLSVTVNGRIYQYHNDLWVPKSDGKLQHFLVSATANYVR |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
500641 : 508955
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP046786|500641:508955|DBSCAN-SWA CTCAAAGTATCGTAGTTCTTATCGTTACTTTAAGCTCTTTATCTACCGTATTGGTTTTTTCTGACCGGAAAAGAGCACCAAGCAACGGCACATCCATCAAGACAGGCACACCGCTTATAGAGTCGCGCTGCTCTTGAGAAATCAACCCACCTAAAGAGATCGTTTGGCGGTCTTTGACCTTGACCACGGTTTGCAGTGTTCGCGTATTGGTGATGATGTCGGATGCGATAGAGGAATCCGTTACCGAGTCGGATTTTTGCATTATCTGCAACACAACATGATCACCAATCACATGCGGTACTACCTCAAGTGACACACCCACGTCCTTACGTTCGATTTGTTGAACTCGATTACCGCCGTCAGTTACCTCAGACGAAGTGAGGAACGGTACGTTCTGACCAACCGTGATGTAGCCGCGCTCTCTGTCCATAATGAACATGTTTGGGCGTGATAAGAGCTTGGTGTTCTGATTCTTTGATACAGCTTTGATAAGCGCGTTAAAATCGCCGCCCTCATAGAACAGCAGGTTATCAACAGCTTTCTTGATTGCGGTAGGCTGCGAAACAAAGCCAGCTTCACTCAGTGCTAAATCCATATTTACACCGACTTCCTGAGAATCACCGAGCTCAGTTTCGGTAATTACCGCCTCAATAAAGACTTGCTTTTGTGGTCTATCAATCCCTTTGATGAGCACATCAATGTGCTTCAATTGGTTTTCAGAGCCAGTCACGATAATGCTGTTTGTGGTCGGTAGCACTTCAACCTTGTAATTCTTAATCGCTTTATTGTTCAGTGTTTGATTTTGCGTTGCAGCAAGCATCGAGGAAATTAAGTCAACGACCTTGGTATTTCGAACATTCTCAAAGAAGTACAGCTTCACTTGAGAGGGTTCGAACGTTTCCACCTTGTTCGCGTCAGCAATGATGGTAAAAACGCCGTGGTCATGTGTAAGCTCGTAGCCGTGCGCACGAAGTACCGAAAGGAAAAAGGCTGGATAGTCCTCATCTTTCAAATCCGGCGCGGTAAAGCTGACCTCACCAGTGACACCATGACCGAGCACAACTGTGTTTCCAGTGTGAACCGAGAACCACGATGCAAAGTCTCCAATCGGTGTGTTTTTTGCCTCAAAGGGCGCAGAGGTGGCGGCAAAAGCAGGAGAGCCAAGCAGGATGCACGCGAGCAGAAAGGCGGTAATGCTGGATGTGGAAAAGTTGGAACAAGCCGTTGTTTGTTTCTCAACTTTACCACAACGCATGATAAGTAATGAGCGAGCAAACAGTGAGCCTCCGGCGCAATAAAATTCTCTTTGTATTTTTGAAAGAAAAGCTGTGAGTTTTGCGATTATCCATGACATAAAGCGCACCTTTTTCCCTAGCACATGACTTTGAATGATTGACCGTTGCCACTCACCGTAATGGAGCAAGAGCCGTTAGATTGAGCCGTAAAGCCTTTTGCGTATAGTTGCGACGACGACAGACGCACATCGTCCTTAACCAGCACAAAAGACGGGGCAACGTTTGGGGGATTCATTGAAGATTCGATTCGATAGCCATCGAGCAAGTCACTCAATGACTCGCGAGGCACCGCGGCTTGAGCCGTTTCGGGTTCCGTCGACATGTTCGGCGTGCCAACTAAGGTGAACACCGCAAACGAGACGGCGACACCTGCCGCAAACACACTGAATCGAGAGTATTTGCGTAGATAGATTTTCGTAATGCGCATGATATTTCTCAACGTATACGGGACAGTGTAACGTCCGTGGGTGTAGTAGGGCGGCAATACTGAATAAACGCCGTCCTCATAGTTGTTTCTAAACATCTGCTTAGTGTCGTAAGAGCTGTATAAGTCCGTGCCCCAAAGCATCCATTTGTCGACGGTGAGTGAGTTTGCGTTGTCACCATACTTCACAATGCCAACGTGCAGCTTAGGCATTTTCAACTTGAGTTGACCGAGTGTCATAACGGATACCGCAGTCGAGATGATAGGGACTTGAAGACGGTCTAAACGACGACAAAACACGGTGTGTTCAGCCAGCGCGAGACGCGCTTGTTTATCAACAATCGAAATGTCTTGAACGATGAAAATCACATCCCATCCAAGCTTTCGAATATGCAAAAGGTGATCAATTAACTTTTGTCGATTCTTGTCGTTCCATGTGCGCGAGTTAAACCACGTTCCGCACTCATCGAGCACAATCAAACCGTCTTTTTTGGTGTCATAGCTCTTGTTTGCTGAGCCAATCACCATCAAATCTTCTACCTGAGGCTTGTCCGGCAGACGATAAAGGCGAGTATTGCGCTTGTTGCGTCCAAGCATTTCTTTCAAGTTGATATCGAGGTTTGTCGCCACAGGCACACCGCGCATAAACGCCTCACGAATCTTACCGACCGCCGTTAGTGTTTTGCCTGAGCCGAGCTTACCCGTGACAAAGTAGACCGATGCCATTACGCCGCCCTCACAATCGCGTAGAACTTCCATTCCCACACCCAACGCAGCAGACGCGCCGAGTAAATCGCACTCACACAAGGCACGGCGTTATTAGGGATGAACATACCCGCTGCTTGTGACCACATTGGAGGCGCAACATAAGACAGACCCGTTGCAAGGGTGTAAATTGCCAAGGTGAGGGTGACGGTCAAACCGATTAGCAGCGTTAAAATGACCAAGTTAATCGTGACGTTTCGTGCTTTCGCAATGAAGAACCAACCAAATAACGTGGTCGCTATCTGGGAGATAAAGGCAACCAGAGCAGGGAGGCGCAGCGCCGTCCCAATGGTACTGACAATTGGTAATAGCTGAATCATTAGTAATATCTCCCCGAACCTGGCTTGTTACTTGGTACAGGCGTGACCTCAGTCAGCAGGATTTCAACAAGCGTCTTAATCGTGTAGATGTAAATCAGAATTGAGATGATCATTTTGAGTTTCTGCGAAAACTCACAAGAGATAGAAGCGCGACCACCGCCAAGCGTGGGCAAGGATAGATTCATGCAGGGCGTTGGCTTAGGTAACACACTCAAAAACGAATCTGATATAGCATTAATATGCCCCTCAGATTCCGCCGTCAGATTCTTCTCAATTAAGTCGTTTGCCGCATCGGTCACAGTCTTTTCGTAGGAATTCATCGCACCGGACACGGCTTTATCCGCTTGAGTCAGCACATCACCGACATAATCCGAACCTAAACCATGAGGGTTTTCACAATAGTTGTTTTCCTCGGTAGGCTCACAAGGCTTGAGGTCGTCGAGCTTATCCGATAGCTCTGCAAATCCATCAGCGTTAGTGGTTTGCAAATCATCGAGTCCCTTAACCACCTCACCAACAGAGTTGGTGTTTCGATTGACCGCCGTCGTGATGTCACCGTTAGCTTGCTGAATCAGCGCCTTAGTGTTTTCGTAAATCTTGTTGTCGTTGATTTGCTGCTTTTGAATCGCTTGGGTGTTAGTCACCATCGACGCATTGAGCGCAATGATTTGGTTTTGAATATCAGCGCTCGATTGATTGAGGTCGACGTTGAGTGCGTTAAGTGCCTTGTTCACATCCGAGTTAAGCCCTTTAATCGCGTTAACTACGCCCTTATCGGTCGATTCATCTGTGTCAGGGTCTTCAACATCTGGCACACCCCCCGTATCTGGAGGATTAACTGTATTGGTGGAGTCGTCAGGAAGTACGCTAGGGTCTTCGATGTCGCCCGTTGGGTCGTCAGGGTCGTGAATTGGATCATCGGGAATAATAGGGGTGTCAGGACCATCTTTACCCCAAAACAGCGTACCACCATCACACTGATTACCAGTGAATTGAAACTTACCGTGACATCGCGTGTTTTGAGTGAACTCACCGGAGTCGACATCGGTACAAAGCGTAGTGTCATTTGGAATACGCTCAAGCTCACAACGGGTTGCGCCAAAATCGCCATAACATGCCCCCGTCACTTGCTCACCATAAACATAAGCCGACCAGTGAAGTGATTGTTTGTCATCAATGGATTGCTTGAACTGACAGGCATCCATACAAGTGCCGTCAGGGTTTTCGCCAAACTCACATGCAGGAACGATAGGCTCACAGGTGTAACCATCACCATCTTCTATTCTTTCATGATCTGCTGGACACTTAGCGGTACGATGAAGAAACGTTGCAGCGTGATACCTCGGGTAACTGGGACTGGTTGTGTTACAAATAATCATCAAAGAGAATTTACTACTCTCTATAGAGCATGATGTCGTATAGAAGTCTTTGTAGTTAACAAACTTATTTTCATAACAAGAAACATACGAGTAAGGGTTAACTCTCTTACCCAAGGACAAGTTACAGTTAGGATAAGCGGCAACATCGCTAGCGCTGTAAGTAGGTTGAGCGGCGCTTACATTAAAAGCACTAAACAAAACACCCAGTAAAATAATCAGTGACGCTATGCTTTGTTTAATGTTCATTTGTAAATCTTCCTCGTGAAAAATAACGCCCCCATTCGGAGGCGTTGACCAATGGGTGTATAAAGCAACCGCTAGAATTACGTTGCTTTGTTTGCACCTTTCTTGAATAGCTTGATGCCGATAAAGCCGACCGTCATTGGCACGGCGATGCCCCATGTCGAGGTGAGCATTTCAGTGACGTAACTTGCCAGTGTGCTAAAGGCTTGTGTTGCCACTTCTGGCAGTGCTGCATTCGCAGAAGATGCCGCCATGAGAAGTGCACCACCAAATGCCGCACGTTTTGCTGTTACTACTGCGCCAGCCTTAGCCATTGCTGCGCGTACTTTGCTTTGCTTTTCCATAGTCTTATTTCCTATGTTATGGTTTATGAAGAAGTTGAAACCTCAGCCGCTTTCTTGAATCCGAGAATGTGGAAGCCAATCGAGAAGCCAAGGATAAAGGCTGTCGCGAAACAGCCGAGCATGAACTCTGATGACAGCATTTATCTTTGTCCTCCGACCATCCAACCGAGCGCAACTAGCAAGAAACAAATGCCTAAGAACACCATTAACTGAAAGTTATCGAGTCGAGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP046786|500641:508955|503084_503444_-|WP_024701224.1|coat|DBSCAN-SWA MIQLLPIVSTIGTALRLPALVAFISQIATTLFGWFFIAKARNVTINLVILTLLIGLTVTLTLAIYTLATGLSYVAPPMWSQAAGMFIPNNAVPCVSAIYSARLLRWVWEWKFYAIVRAA >NZ_CP046786|500641:508955|505680_505986_-|WP_005389159.1|DBSCAN-SWA MEGLILDVSDIVQETKTDRNGEQKQNGKLRLITTNPTDTIEVRVSPELWENGKAGELLKRCVGNRMMFDVEHKKFSFGNDEGKHVSIDGFHLYALPQLNEK >NZ_CP046786|500641:508955|506069_508100_-|WP_089203305.1|DBSCAN-SWA MRELVIDLASGKQEWIDFVPVHSWASCEHIPDNLFDHRFEYVDHRFTTPEDFIPSAVKSAMSTSIYSHDLSDFIERPTSNPCLDLPKSLHRNGEFARHMTRAYTDILKTRNALEAVRAVSEAHDRLTEHGYSYAMSDEQITNLAKRKSRDFSRVLSAIPLEESQARFDKACQLLDSLGLAFSPEQIQYAENNCELFALVNRALDEHWLVRQLRRKCAYEVECVARDLALVQRRKQVYCSDFSLSRQRDRNTSNRIALENTIAYDEADPSNYFTLSELSAKSVSNAEIRRAEMFVRLRGFEEIAQESNHDAVFFTVTAPSRFHSVSKGDINPKWLEAGKPDAKAAHAYLMGVWANLRKSIDKSKIKVYGMRIVEPHQDGTPHHHLLLFMEKSARKFVTSEFRRLAMADSPDEKGAKKARFKAEVIDWSQGSAVGYVAKYLSKNIDGQHIDSDKGSSLSGSDAAERVVTWARVNQIRQFQFIGGPSVTVWRELRRLRDEFKEDDALFTDLSQDEHFLLEKVRRSADEGDWKAFCYAMGGVFVKRKDQPVKAEYSVSTSIEKLIASGGEYSSTRYGDMAQARLNGLMFHKIFIATRFRTWKTENKQQFIRAQQGIMSNVVDYFDALEREKEYERMYDDLYEQYEKHLALYDEMEALLLTDPQEINASCWVGAAPPDMMH >NZ_CP046786|500641:508955|508586_508955_+|WP_089203326.1|DBSCAN-SWA MYTAELINAYKKAKNYVQDKQVAHDLNLDPPKISKIRKGVRQLTDEEAVFLAHGAGIDPEIALLGCHADRNENPAIKSMWESIAKKYNGLGLSSISMVCAGLALVIASPQEPLHQCALYVLC >NZ_CP046786|500641:508955|505146_505410_-|WP_021448020.1|coat|DBSCAN-SWA MEKQSKVRAAMAKAGAVVTAKRAAFGGALLMAASSANAALPEVATQAFSTLASYVTEMLTSTWGIAVPMTVGFIGIKLFKKGANKAT >NZ_CP046786|500641:508955|508099_508402_-|WP_025518896.1|DBSCAN-SWA MSEVSNTKKLEIYLNRAWSLFLVSVIAAGIYFFGSLIYDSFEIPYDDYETFSFYLDHEFCGDLARDYASDGRVTVYEYLVVSHCSGKDEKRKFYSELEAQ >NZ_CP046786|500641:508955|502011_503085_-|WP_054574157.1|DBSCAN-SWA MASVYFVTGKLGSGKTLTAVGKIREAFMRGVPVATNLDINLKEMLGRNKRNTRLYRLPDKPQVEDLMVIGSANKSYDTKKDGLIVLDECGTWFNSRTWNDKNRQKLIDHLLHIRKLGWDVIFIVQDISIVDKQARLALAEHTVFCRRLDRLQVPIISTAVSVMTLGQLKLKMPKLHVGIVKYGDNANSLTVDKWMLWGTDLYSSYDTKQMFRNNYEDGVYSVLPPYYTHGRYTVPYTLRNIMRITKIYLRKYSRFSVFAAGVAVSFAVFTLVGTPNMSTEPETAQAAVPRESLSDLLDGYRIESSMNPPNVAPSFVLVKDDVRLSSSQLYAKGFTAQSNGSCSITVSGNGQSFKVMC >NZ_CP046786|500641:508955|500641_501994_-|WP_089203306.1|DBSCAN-SWA MSWIIAKLTAFLSKIQREFYCAGGSLFARSLLIMRCGKVEKQTTACSNFSTSSITAFLLACILLGSPAFAATSAPFEAKNTPIGDFASWFSVHTGNTVVLGHGVTGEVSFTAPDLKDEDYPAFFLSVLRAHGYELTHDHGVFTIIADANKVETFEPSQVKLYFFENVRNTKVVDLISSMLAATQNQTLNNKAIKNYKVEVLPTTNSIIVTGSENQLKHIDVLIKGIDRPQKQVFIEAVITETELGDSQEVGVNMDLALSEAGFVSQPTAIKKAVDNLLFYEGGDFNALIKAVSKNQNTKLLSRPNMFIMDRERGYITVGQNVPFLTSSEVTDGGNRVQQIERKDVGVSLEVVPHVIGDHVVLQIMQKSDSVTDSSIASDIITNTRTLQTVVKVKDRQTISLGGLISQEQRDSISGVPVLMDVPLLGALFRSEKTNTVDKELKVTIRTTIL |
8 | Vibrio_phage(85.71%) | coat | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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