Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP018794 | Lachnospiraceae bacterium KM106-2 | 1 crisprs | cas3,DinG,WYL,RT,csa3,DEDDh,csx20 | 0 | 0 | 5 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_AP018794_1 | 2764358-2764507 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_AP018794_1
|
1 spacers
spacers of NZ_AP018794_1
>1.1|2764408|50|NZ_AP018794|CRISPRCasFinder TTGTCTCTCCAAATCCCCAAACACAACCCACAAACAAATTTCCACCCAGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP018794_1
The CRISPR arrays of NZ_AP018794_1 >merge|NZ_AP018794|1|2764358-2764507|CRISPRCasFinder GACTGACGCGCGCAGCAAGGCAGTTATGCGTCCGTCCGCATCACCCTCATTTGTCTCTCCAAATCCCCAAACACAACCCACAAACAAATTTCCACCCAGCGACTGACGCGCGCAGCAAGGCAGTTATGCGTCCGTCCGACATCACCCTCA >NZ_AP018794|1|1|2764358-2764507|CRISPRCasFinder GACTGACGCGCGCAGCAAGGCAGTTATGCGTCCGTCCGCATCACCCTCAT TTGTCTCTCCAAATCCCCAAACACAACCCACAAACAAATTTCCACCCAGC GACTGACGCGCGCAGCAAGGCAGTTATGCGTCCGTCCGACATCACCCTCA
>NZ_AP018794.1|WP_155881064.1|2762450_2764187_+|S8-family-serine-peptidase MNSAKLDNQLNLALQVSNTDREKTNSLDVGYDYTTNEWELIIRHSGNIDQIISDLNVKITKLLNNYAIVTLKEDAIDQLSEYPEIEFIEKPYSLTFATTTSKIASCIQEVQQGDSRLDGTGVLIAIIDSGIDYSHPDFINADNTSRILSLWDQTIPGNPPDGYSIGTLYSNADINAAIKVTNPIRRIENFPSIDTSGHGTHVAGIAAGNGRASNGRNKGVAPNSELLVVKLGFPKANSFPSTVELIQAINFCINTATTEKKPLVISLSFGNNYGSHDGLSLLEQYINDISAIWKTSIVIGTGNEGASARHTNGIVKTDQSALIEIAVPSTELSFSLQIWKNYYDNISIEIISPSGQRSGLIKELLGKQEFVLDKVKILLYYAKPKPINIAQEIYLEFIPQDTYLTVGLWNIRLAGNKVVTGEYDLWLPSGAKLISNTKFTKPTPDITLTTPSTAYRAISVGAYNAITNSYASFSGRGYTRMTQYIKPELCAPGVNILSTAVNGGYTQRTGTSMATPFVSGAAALLMQWGIVENNDPYLYGEKLKAYLIKGARPLPGYRNYPNNSVGWGALCVSNSLPL >NZ_AP018794.1|WP_155881063.1|2760734_2762144_-|S8-family-serine-peptidase MQNYRVEEYAYSYIPKIYTTLQEDIDFDTFSLNQAGIYAVQNPPISLTGRGVMVGFIDTGIDYTKEVFRNADGTTRILGLWDQIIGSGTKPEGILYGTEYKREQINQALKSDDPYSVVPSRDENGHGTFMASVVCGSNIEENFTYLGAAPDEYILVVKLKEAKQYLKEYYLIDEKIECYQETDILAAVRYLNAYAVSLRRPLVICMALGSNQAEHSGDSKLAEFLSRVAEKKSRTIVTAGGNEGIAGHHYAGKLSPQEPTEVVEINVGSGVSGFFAKFWGQTPFLFGVKVRSPEGELTPAASLKTKQSQSFQFILDRSIITFDALTIEQNTGRLLIAVSIKNPSPGVWQIVVSNLTGLVGGEFDIYLPMTEMMTGEVVFLRPEPRSTLVNPSFSAQSITVVAYDSSTKSVSPASGRGYSLSGAVKPDLAVPGVNIPTILGRRSGSSYAAALAAGIAQLLQWTVIERMIF >NZ_AP018794.1|WP_155881062.1|2759788_2760043_-|hypothetical-protein MQIIRGIMNDWGEAVMKSRDSMSLIIKWIILIVVSVGIGTFMDKNILENMNINIWVARCGGALTCAIVALVLYYLFLKRDGTES >NZ_AP018794.1|WP_155881061.1|2758911_2759652_-|Type-1-glutamine-amidotransferase-like-domain-containing-protein MKKFYLTSNIGGINYEEKLWKPCKLDNSNGFVDKLKTDWKGVKKGLILSSSPSDHMMNERFQMLYEKAFELSGVAFESLDLCDDRNAEALGETIYEYDVLILSGGHVPTENIFFRQIGLADLLENFEGIIIGISAGTMNCAEMVYAPPASEEEILSTDYSSYFEGLGVTKINVFPHFQEMDDCVVGGKRVIEDILIPDSKVRPFYSLIDGSYILIENQKETLYGETYLFDNGQIEKICEKDKWLEL >NZ_AP018794.1|WP_155881060.1|2756786_2758487_-|S8-family-serine-peptidase MTCEERIYSNDYIDIITEFEPTEDILGQFTDDYCYQPIDQFGFFSASREDIPIYNVSTYGYVNVPKVFVPLQNNIEFNTFNLNEAGIIVAQNAPLNLTGRGVVVGIIDAGIDYTNPVFRNQDGTTRILGLWDQTSREGVPPEGMLYGTEYKTEQINEALQSENPYSIVPSRDESGHGTAVASVICGSRLNEGETFFGAAPDTQIAVVKLKQAKQYLKEYYLVNDDVECYQETDILTALAYLDSFATALSRPLVICITLGSNLGGHTGDSILSLYLGLIGERKSRAIVVAGGNEGLAAHHYRGELTSSKTREVIEVNVDENVNGFMIEFWGDPPALFTMSVRSPLGELSPPASLRATQRQTFRFVFRDSVVTFDTLTIEQSTGKLLIELRITNPPAGVWQINVTGLGGSIGGTFNLYLPNSELLSGKVEFLKPDPLSTLTAPSYVSSAITVVSYDSITRSVSPESGRGYGLRGEIKPDVAVPGVNVPSIVGIRSGTSFSAAIAAGGIAQFFQWAVAEKNDILVDSNDIRSYLIRGAIRDIELMYPNENWGYGRYNLIGVFNYLATIE >NZ_AP018794.1|WP_155881059.1|2755692_2756475_-|methyltransferase-domain-containing-protein MNEIENWYDHEYEEWERLERHRIEFEITKRYLNEYITGKSANIIDIGGGPGRYSIFLAEQGHEVSLVDLSQHNVEVAGRKAKERGVCLKGCEKGDALNLQKYNDGEFDVVLLMGPLYHLTKELDRKAALSEALRVLKPGGVIFAAFISNYAPIQDCLSYLEFNDEVSEILHYLDDGRNEDGAGFTTAYFTSVKEAKELMREAGLDELAFVGVENVIGCKEREIAQLPEEEFAKWLEICYQLGQDPQVYGTSQHFLYIGRK >NZ_AP018794.1|WP_155881058.1|2755040_2755679_-|chloramphenicol-acetyltransferase MIGSYQIIDMKHWKRAMHCQAFRNSLQPMYCVTMELDITHFLEVIKKKGYSFTFAFVYAVSFCANEIEEFRYRFLDGEVVLFDQIQTSFTYLDQETELFKVVNVPITDTMQEYVIMAADILERQTAYFTGPMGLDIFQFSSIPWVSYTHISHTSSGKKEQATPLFDWGKYFGRENRILLPFSIEVHHSFVDGVHIGRLVDRLQSYLNELTLD >NZ_AP018794.1|WP_155881057.1|2754622_2755015_-|ester-cyclase MTNKELIKSFFYEGYGNKNYNFVLEHVAKDYVDHSPAGARSNEDAVGILKCVSNMFEGMNVEIMDIFEENGMVATRVKYDAIHAGECMGIQATGRHITFEALENFKIENGKIVESWGYWPNKEIEQLLQL >NZ_AP018794.1|WP_155881056.1|2753200_2754511_-|aminotransferase-class-I/II-fold-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MSKKNREARNFKFETLQLHVGQENADPVTDSRAVPIYQTSSYVFHNSEHAEARFGLSDAGNIYGRLTNPTEDVFEKRIAALEGGVAALAVASGAAAIAYTFQNLASQGDHIVASKNIYGGTYNLLAHTLPQYGITASFVDPTDYEEIRAAMKENTKALFVETLGNPNSDMVDLEELAKIAHENQIPLVVDNTFATPYLVRPIEYGADIVVHSATKFIGGHGTTIGGVIVDSGKFDWEASGKFPSITEPNPSYHGISFTKAAGPAAFVTKVRAILLRDLGATLSPFHAFLFLQGLETLSLRVERHVSNALKVVDYLEHHPFVERVNHPSVSQDPLQQKLYQKYFPNGGGSIFTFEIKGDDTTAKNFIDQLELFSLLANVADVKSLVIHPASTTHSQLSKEELLEQGIKPNTIRLSIGTENIDDIIEDLEEAFKAIEE >NZ_AP018794.1|WP_155882675.1|2752238_2753072_-|PRD-domain-containing-protein MKLIKVINNNIISSVNDEGQEVVVMGRGIGFQAKPGQEIDMERVEKIFCMQDKKSSEQLQLILKELPLEHVQVSNDIVSYAKKQLGVALNENIYITLTDHISFAITRIEHGTYYRNALIWEIKKFYPVEFSIGKYAVELIKERLGVELGEDEAGSIALHIVNAEFNTTMNKAVDITKLIQRVLNIVKYYFKINIDEDDVNVERFITHLKFFAQRIVSNTMLQDEDEEFQRAIEKKYPEYYRCAEMIRELIKDELHYEITREEMMYITIHIGRIVREK >NZ_AP018794.1|WP_155881065.1|2764998_2766831_-|hypothetical-protein MKRNVSKFILAASLTVGIAVGGQCLASDSALAQSVSFDGGNGTKSNPYQISSAKQLKLVSKNLKASYVLKRDINLKGTKWKSIGSVSMNDMKKGNTSKSFSGSFDGDGHTISNFACVEEKGEIAVGFFEHNSGIIKDVTFKNVTSKGSSNSMSVGAVTGIDAGTTKNVSLVGKNKITGTNCVGGIAGGSMGASISNCKVKGTTIQVTGSNSFLDGLIIQCDKAECGGLIAGGGFNGSVKNCKASGTVVANGKEAVGLGGIGGCLQCMKEIKGNEATVTIRTKNAHAVGGLCGYAGMGDDGTGKVQKPCKITDCKVNVKIETKKATHVGGLVGTGLYYYGMEDRFNISNCSVKGSINGAVTPGTVAGRATGSKIKSCKINVKIDGKKSKNKVGKTSQLYQSADQYEEGSKKAAAYLLKNVKGSYTALFEKLCLPKYDKEWSKNTALCVGNDKADAAAAMLKASVTGSLYGQQAIDAYSKDSASMAFACGFIQGVTKFKFNGNKISGTDSNGATVFSHTYDFIGYDKENGLYEFQTKDANAGEFKYFLLKSDTPDTTYHIEFRYGSDLHALTEYMQGAYAYWMAAGILDNANEQMIYNCIRLFCVENLSEQK >NZ_AP018794.1|WP_155881066.1|2767854_2769348_-|4-alpha-glucanotransferase MRNAGILMSISALPSNYGVGDFGKSSYEFVDMISEANMNIWQLLPLNPLGYGNSPYQPYSSYAGDELYISLDRLVEDGLLSKELLKTEEVRSYVAEMKRAKQVDYPRVREFKNHLLKEAFKNFKPTKDYDKFVANEWVHVYGVFIALKKQNDLVCWNEWPQEQKDWIKDKKYDISHLEEEIQYNMFLQYEFYKQWMELKHYANRKGIKIMGDMPFYVGIDSQDVWENQDSFLLDKEGRPTYIAGVPPDYFSETGQRWGNPIYDWDYLKKTNYDFWIKRLDYSNQLYDIIRIDHFRAFDTYWKIPSTCPTAIEGDWIEAPGYELFDTLYEKIPKIKIVVEDLGDLRDEVGELRDHYKFKGMKVLQFTFDPKETNNNFPDRANMIVYTGTHDNQTIRGWYRSQKVSLQRSIRRKLKEDGYTHKDVSWNFIEMAYNSVANMAIVPMQDFLNLDDSGRINVPGTLGSPNWEWKLDSFSKFKKKLPEITELIYSAKHKRASK >NZ_AP018794.1|WP_155881067.1|2769361_2771623_-|glycogen/starch/alpha-glucan-family-phosphorylase MKERIQEMLQRNLGKSIKEASDSEIYCALLEVTKELIKDKGVNEGKKKIYYISAEFLIGKLLSNNLINLGIYDDVASILSSNGKTITAIEEEELEPSLGNGGLGRLAACFLDSIATLGLPGDGIGLNYHYGLFKQVFENNKQMETKNPWITKESWLTKLDNTYEVKFKDFTLKSSLYEIAVTGYDSKAIKLKLFDVDTVDDSMVKSGIDFDQEDIKRNLTLFLYPDDSTVDGQLLRIYQQYFMVSNGAQLILEEAKAKGSDLHDLFDYAAIQINDTHPSMVIPELIRLLTAEGIEMDEAIEIVTKTCAYTNHTILAEALEKWPLSYLEKVVPHLIPIIEELDKRVKEKYDDESVAIIDKEDRVHMAHMDIHYGHSVNGVAALHTEILIKNELKQFYDIYPEKFNNKTNGITFRRWLMECNKPLSDYITTLIGEGWKKDAEELQKLGQFVSDDSVLDRIGEIKFNNKVALKEYLKRTNNFDLNENSVFDIQIKRLHEYKRQQMNALYIIHKYLEIKAGKKPSTPITMIFGAKAAPAYTIAKDTIHLILCLQELINNDPEVSPYLNVFMVENYNVTAAEKLIPACDISEQISLASKEASGTGNMKFMLNGAITLGTMDGANVEIHDLVGDDNIYIFGASSETVIEHYENHTYDAPKIYFEDDYIGNLVDFIISPELKAIGCRQNLVRLYKEIAGKDWFMTLLDIKDYIAKKEEAFKDYEDQKAWRKKALVNISKAGFFSSDRTIKQYNDDIWKLN >NZ_AP018794.1|WP_155881068.1|2771667_2773431_-|alpha-amylase-N-terminal-ig-like-domain-containing-protein MNFSAVYHRTTDNYCYPLNESELIVNLKTGYDVERVFICYGDPFSAGILGGNEQWVPQREEIPYKKKLKHQIWWTTTLKPEFKRCRYYFELQTANEKWFYFEDGFLTEKGLHLEGKMLQCFTFPWMNSADINRTPRWVNDTVWYQIFPERFCNGDDSLSPEWVKPWKKGKVRNEDFYGGDLVGITKKLDYLKDLGITGLYLTPINESESSHKYDTTDYRKIDPYFGDEKIFKHLVEESHDHGMKIMLDGVFNHCGRKFAPWMDVVEKGPESKYYDWFMIHEWPFRKDGKAAKSGQYYTFAFIDNMPKLNTNNPAVIEYFVSVCEEWVQKYDVDGIRLDVANEVSHEFCKELRKRLKAIKPDIYILGEIWHDSSNWLLGDQFDAVMNYPLAGTISDFWINQELTNHDFECGINRCYTMYMQQVNDVLFNLLDSHDTNRLIDKVKSLDVFYQQLAVLYTMPGSPCIYYGTEIALEGGFDPDCRRCMPWDEIDSGKYDDRLGVVKRLIELRKTNSLFRSRNFHFPNTINNQRVIEYIKIGEYGDSQMAVYLNCSNEDIELQGFIDPIFSLKYDKTKKVLKPYGILISKQV >NZ_AP018794.1|WP_155881069.1|2773444_2775031_-|alpha-amylase MKKSILKLVLLVLCITFLTACGNKKDSNEKLNIIDDNNRTYYEVFLYSFCDSNKDGIGDINGLISKLDYISDLGCNGIWLMPIMPSDSYHKYDVNDYYSVDPSYGTKKDFKKLVAECNKRGIKLIIDMVFNHTSNKQEWFVKATDYLKQLPAGKKPDEKECKYIKYYNFAKDMQDKSTYYQVKGTDWYYQGVFAENMPDLNLDDQNVKKEIQKVADYWLDLGIGGFRLDASKEYFSGNPEKNIEVLKWFSRYVQRKSNKIYVVAEVWDEFTTISDYYTSGIDSIFNYTLGGVDGIIPETVRMAGNGSAGKTFAENLKTIQSTFQESNKNYIDAPFISNHDNDRPVSYVSYDKDKVKFMGGINLMMNGSSFIYYGEEIGMSGNGKDENKRAPMRWTKEKTDETTDGPIGMEKQKNKFGSVEEQEKDDTSIWNYYKHAIRLRNENPEIARGTINVMNDITDGDIVAITKTYKKSKIGMLMNNSSKEKKLTLNKEKYGFSRIKGSLTVNDKEPELEEKKITLPPYSIVILK >NZ_AP018794.1|WP_155881070.1|2775088_2775928_-|ABC-transporter-permease-subunit MKRKRIVKDILSHALLIALSIVWLIPIVWVVAQSFNEEQGAYFPYFFPKKWSFCNYISLWTDNTQFMFGRWYLNTLIVAVFCCIISTFFVLSVSFVLSRMRFKARKPLMNVALVLGMFPGFMSMIAVYYILKGIGITQSLFALILVYSGSAGLSYYIAKGFFDTIPKAIDEAAYIDGATKFQVFTRITMPLSKPIVIYTVLTSFTAPWLDYIFASVIMGDKYERYTVSIGLWTMVQQEYVQTWFTRFTAGAVCVSIPIALLFIVTQKYYVEGLSGAVKG >NZ_AP018794.1|WP_155881071.1|2775927_2777322_-|ABC-transporter-permease-subunit MSKGKKDSTGVNPKPKGRLKRIGEMFVKGDIWTKLSFFVLGLSNIVRGQILKGLMFLSMEIGFIFYMVIVGVSGIAQCKTLGKIAQKQVWDESEGIYRVMTFDNSMIILLLGVVSVFLIACFIFVWQAGVKAAYNAQELKENGKKLPSALEDIKAHLDSKLHRTLLFLPSIGILLFNILPIIFMIMIAFTNFDKDHQPPGSLFHWVGISNFKTMLNSGSMLGKSFWPILIWTIVWAIFATFLNYIFGMLLAMLINRKTTRCKGLWRTIFVLTIAIPQFVSLLVINNMLQRTGIINVLLQNWGWIKEPLPFLTDTTWARVTVIIVNCWVGVPYTMLITTGILQNIPAEYYEAAKVDGANAFTIFVKITLPYMLFVTTPYLITQFIGNINNFNVIYFLTGGLPASLDYYQSGTTDLLVTWLYKLTTTSFDYSYASVIGILVFVISGTLSLITYRRTGSYKNEEGFQ >NZ_AP018794.1|WP_155881072.1|2777413_2778709_-|extracellular-solute-binding-protein MRKVKKATALLAVTAMVITSFAGCGKSNNDAASTKTKDTSNDKKTVENISLKVWSPQDDQKEVGSYSEGVLKELCKKFDEAHPEWNIKFTFGICAEGDALKNLKKDPAAGADVFMYTTDQLAGLVEAGITNPLAPTAEATMNKTMDEQAVSAVKSGDKLYGFPYTANSWFLYYNKSMFSADEVKSLDTMMAKKFDKGVYNFAIDVDNAWYNSAFFFANGDKLFGDDGTDAKKCTFNDAKGVEAGNYLLDLYKTKKVFDITNNNEKKLFQQGKIAATCSGTWDAVTYKKALGENYAAAKLPTVKMGGKDLQLSNFKSYKVVGVNSQTKAPKAALALAEYLASDEAQQVRLDAQSIAPTSKAISGKLAKADPAVKAINEQLQYSTLQPSISQMNNFWTPAQALGAGIIDGSVTKDNMQAKLDKMVDGILKGIK >NZ_AP018794.1|WP_155881073.1|2779142_2780138_+|substrate-binding-domain-containing-protein MVTIKDIAKQLGISISTVSKGLNGASDISEEMRQLVLDTALEMGYVTKNKRPTIRHKVAIIVENMEYENINQFGYEIMTGFRLAANEQQYEVSIIPVDLYFQAKQSYDNMMIQNGYSGAFILGFDLTDVYINQLQSTTIPTVLFDNYISNKHVGYIGTDNTAGIDALIQHLYDLGHRNIAFLNGAKHSFITGRRFDLMQKAMKSLDLEIPKNMVAYGEFDPSTAKKYVNDFINNGATAIVCGSDLIASGVINELHRIGKRVPEEISVTGFDDLPIAKYLAPPLTTVRQERFTLGKLAFMLLTNLIHNISITTLLLQSELIVRETTGPCNQK >NZ_AP018794.1|WP_162527779.1|2780311_2781925_-|DUF5011-domain-containing-protein MNQKKKLSKYIAGVFFAFVLVAGMLLTNGQKASAATKKPYLIKVNKIKNCITIYEQDKNGEYTKPIKAMACSTGAKTPTGTFRTMQKYEWKILLDDVWGQYCTRIVKDILFHSVYYYSKSPSDLAWRQYNNLGIMCSHGCIRLSVKDAKWIYDHCGLGTTVKIYNSSNPGPLGKPESIKLKAGTRWDPSDTGKSANPFNNKKPSIKGAKNRTYEYGEKINLLDGIKAYNTTGFNRTDLVKVRGKVNNKKAGKYKITYVMKDELGRTAKKKVTITIKQEPDPIVISGVTNREFPKTVSASEMKKTALKGVSAKSGSKKIAKSKIKVTYKKVASKNNYIEYKVTYKVTLGIKTKTATARFYLDRKAPVIKGNKDRIISSDEFNEAMANNTFVSKLALEGVTVSDNLTKLKKSNITVKAVNNNNGTYTINYTVSDKAGNKTSVSSVYTVLSDITVAPKNANNININTEAEMTSDLALQNVKITANGKDFTNQFVSKSMVTAKIQRAVENNQVVFHVTYEVKILNKTFASTTTANYYVAVQ |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
407112 : 460547
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_AP018794|407112:460547|DBSCAN-SWA 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57 | Bacillus_phage(14.29%) | coat,holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
670876 : 713361
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_AP018794|670876:713361|DBSCAN-SWA 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63 | Faecalibacterium_phage(37.5%) | tail,integrase,portal,protease,plate,head,capsid,terminase,holin | attL 673925:673950|attR 713870:713895 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2679961 : 2688792
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_AP018794|2679961:2688792|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_AP018794|2679961:2688792|2681915_2682455_-|WP_155881000.1|DBSCAN-SWA MKIGHKIKELRTQKGLTQEELADRSELSKGFISQLERDLTSPSIATLVDILQCLGTNLEEFFANTTSEQVVFKKQDYFEKEDQELHNTIEWIIPNAQKNMMEPILLTLGPDGSTYPDNPHEGEEFGYVLSGSITIYIGNHAYKAKKGESFYFIPNKKHYIKANVKSGATLLWVSTPPSF >NZ_AP018794|2679961:2688792|2685099_2686866_-|WP_155881002.1|DBSCAN-SWA MKFMKKHVRITAFLCALCLWVASVMQVSLDASAAAPIIQVTHPEQNTIKLSWNAVEGASGYNIYMSLASSTQMQYIASVNDTKFSFTGLKESSKYNFKIVPYTVSGVNKVEAAAENAGTITESSNKQGIDISKYQRNIDFAKLKQNTDIRFVIIRIGYTGSKTGKCTLDPYFKQNMKNAQANGFKVGVYYYSLATTQKKAQEEANFVIKNLQGYQIDYPVAMDVEDNVQKKVTKVKNSLSITTFCETVKAAGYSPMVYTGYYFMNTYLDYNAIKQYDIWLARYNSYLGYNNPVRMWQYSSKAELPGITATTVDVNYEYDKDDINGSVVYNTSKNSVSYRVASGDTLQMISDKTGMGVDQIVAQNTGITAASKLSKGKEIKLYDLTVNMTQVNNNVSTGVAQQTITVSKPTNVKAKRASASSIKVTWKKATNANQYEVYRATSKKGTYKKVKTTTATSFTNSKLTTGKTYYYKVYGVYKSGSTTKKSAASSITSAKTSLSKTTLKSAKAGKKQVKLSWSKVSSASGYRIFRATSKNGSYKKVRDVKGTSATIKGLKAKKTYYFKVKAYKNVSKKKVLSAYSNRKSTKTK >NZ_AP018794|2679961:2688792|2687040_2688792_-|WP_155881003.1|DBSCAN-SWA MKFFKKHIRLFSLVCACCLWFVSIMQGPLDVLAAAPVITTVSHPEQNTIKLSWNPVSGVSGYNIYMSLATDANMQYIASVNDTKFSFTGLSANSKYNFKIVPYIVSGGNKVEATPSDATSVTETANRQGIDVSHYQGNIDWAKLKANTDVRFVMIKLGEGSSLDSCFKKNIQNAKANGFKVGVYYYTHATTQEEAQQEANFVVENLKGYSIDYPVAMDIEAPEQKKLTKVQNTLNITTFCEAIKAAGYSPMVYTFYSYMNSYLDYNGIKQYDIWLARYNSYLGYDNPVRMWQYSSTTTLPGITANTVDTNYEYDKDDMNGSVIFDLSKSALYYRVASGDTLQTISDKVGMSVSEIIAQNTGLTETSQLTAGQDIGLHNITFTVSTAPVETPVASTTPAITLAKPKSVKAKRASATSIKVTWKKVTNANKYYVYRATAKKGKYKKIKTVKGTSFTNVKLTTGKTYYYKIYAVYQSGSTLKKSAASAIVSAKPYLSKPTLKAAKAGRKQVKVTWKKVSGASRYQVFMSTKSNKGYKKVKDVKGTSVTIKKLKAKKKYYFKVKAYKVVSKKKVMSSYSNRKSTKTK >NZ_AP018794|2679961:2688792|2679961_2680786_-|WP_155880998.1|DBSCAN-SWA MNNNRKRFLAFPYILWMSAFIVIPLFIIVYYGFTNADGAFTFANLEEIIDPVNLKALGLSLLLSLISTIVCLLLAYPLAMIIRNSKHRSSNFIIFIFILPMWMNSLLRTIAWQTLLEKNGVINTILQTIHLPKMNVMNTPTAVVIGMVYNFLPFMVLPIYNTLMKIDNNVINAARDLGANGVQTFCRIIFPLSMPGVVSGITMVYVPSLTTFVISDLLGGGKSLLIGNVIEQEFKFNYDWNVGSGLSLVLMVFIIISMAFIVKYDGDMEDTNVW >NZ_AP018794|2679961:2688792|2682822_2684811_-|WP_155881001.1|DBSCAN-SWA MKKRYARVLSLLCALCVWLSSILQVSAAAPVIKVTHPEHNTIKLSWNAVAGASGYNVYMSPTVNSQLQYIASINDTKMSFTGLSKSGKYNFKIVPYTVSGEVASDASSLTETANRQGIDISKWQGNIDFAKLKAQTDVRFIIIRLGYSSVSGSNITTNLDPYFKKNIEAAKANGFKVGVYYYSKATTKSHAMKEANYVLSKLKGYQIDYPVGFDIEDAVQKKVSKAVNNLNVVTFCEAVKAGGYTPMVYTGLNFMNNYLDYNAIKQYDIWMARYNSYLGYDNAVRMWQYSSSVVLPGITANTVDVNYEYDYKDTINGTIVYDLSKKGLFYRTKSGDSLQIISNKIGISINEIIAQNTGITSGMQLSAGHEIGLRGISMNVKPVSVAKPTSVKAKRASATSIKVTWKKANNANKYYVYRATSKKGTYKKVKTVSSTSFTDTKLITGKTYYYKIYSVYSVGSTVKKSSASSVVSAKPTLSKPVMKTAVPDKKQVKLTWNKLSGATGYRIYISSKKSRGYKKVADVKGTSYTVKKLKQNHNYYFKIKAYRTVNKTKVMSSASSVKNARTVHAKAPVKTTVKSVKAGKRKVTVSFKKVSKASGYRVYISTKKIGGYKKVKDIKKTSLTISNLKSKKTYYVKVKAYKTVKRQKLVSAESNIKSSKTK >NZ_AP018794|2679961:2688792|2680775_2681852_-|WP_155880999.1|DBSCAN-SWA MANKLIDLQNISKSYGENVILDNLNLYIKENEFLTLLGPSGCGKTTTLRIIGGFETPDQGRVMFRGADITKMPPNERQLNTVFQKYALFSNMTIAENIAFGLKIKKKSKQYINDKISYALKLVNLDGFENRRPDSLSGGQQQRIAIARAIVNEPKLLLLDEPLGALDLKLRQDMQYELIRLKNELGITFIYVTHDQEEALTMSDTIVVMNQGYVQQIGSPEDIYNEPQNAFVADFIGESNIIGATMIQDKVVEILGQKFECVDTGFGKNKPVDVVIRPEDIDLVKPSEGIISGRVTSLIFKGVHYEMGVMANGHEWLVHSTDLSPVGSEVGLRVDPFDIQIMNKPESEDEEAVVSDEQ |
6 | Bacillus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
3127395 : 3139893
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_AP018794|3127395:3139893|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_AP018794|3127395:3139893|3134440_3135319_-|WP_155881310.1|DBSCAN-SWA MKGIILAGGSGTRLYPLTMVTSKQLLPVYDKPMIYYPLSTLMLAGIKEILIISTPHDLPNFKKLLGDGSNFGIQLSYAEQPSPDGLAQAFIIGEEFINGDSCAMVLGDNIFYGNGLTKHLKEAANREVGATVFGYYVDDPERFGIVEFDENGKAVSIEEKPEQPKSNYCVTGLYFYDNRVVEMAKKVKPSPRGELEITDLNKMYLEEGNLNVVTLGRGYAWLDTGTMDALAEATEFVKVIENRQGIKVSAVEEIAYKNGWITKEKLLESAKKYGKSNYGKHLQQVADGKIKY >NZ_AP018794|3127395:3139893|3138930_3139893_-|WP_155881315.1|DBSCAN-SWA MLKLNVVIPCYNEQEVLYETSRRLHKKMRQLMSDSKISRDSKVVFVDDGSKDMTWSIIEQLHEENSLFGGVKLSRNRGHQNALLAGLASMADHGDAVISMDADLQDDIEAIDDFIEQYNNGCEVVYGVRKARQTDTFFKRFTAEQFYKMMHLLGAEVVYNHADYRLLSNRALKGLLEFKEVNLFLRGIVPMVGYKSGRVYYDRNERFAGESKYPLKKMLSFAFQGITSLSIKPIRFIINLGLTTFFISIIMMIYFLVQHFTGNTVSGWTSLIVSIWALGGLQLLAIGIIGEYIGKVYLETKERPRFIIEKKLYDVNKVEE >NZ_AP018794|3127395:3139893|3127395_3129684_-|WP_155881306.1|DBSCAN-SWA MGRVGELLDKSKETISNDGVAIFAKKSAAYVKRHITRDKSNENNDPEKLVADVLFINGCFLPHPSRYRVSHQREQLLATNIVSNEVFYENVTLEMVKNYRVFIFFRCPITDTIKEFIELAKQYNKKVLFDIDDLVIDKKYTDQIKYLKTLSKEEKDGYDDGVNRMQETLRMCDGAITSTERLAAELRNYVPEVYINRNTASDRMLELSEHAIYNRDKLPYINTDNLTHRSEKKQYKKSCEIIKGWKGKEVRLGYFSGSITHNDDFNMILPVIARIMKEYSNVVLHVVGELDIPKELEPFKERVVGMPFCDWQKLPELIASVDINLVPLEQSIFNEAKSENKWVEASLVKVVTIASNVGALKDMMVDSETGLLCDNNEDDWYNRLKQLIENEQLRSKLAETAYQYTKKHCTTVYNSYQFGKYIKSIMVPNIAFVVPSVQTSGGILVIFKHAAILQSYGYDVTLINDGFESKDILKDGSRIPVVSKQTQQIHTSFDKMVATLWSTLSTLALYPNIKDRYYFVQNFETDFYEAGNFFKVAANQSYNPCFDVNFITISKWCQNWLVDSYEKDASYLPNGIDLEHFTAKKRNFNNNGKIRILVEGNSNDYYKNVDESFRIIEQLDKDKYEIWFMSYLGKPKAWYHVDKFLHKVPYEKVPEVYQQCHILIKSSLLESFSYPPLEMMSTGGYVVVAPNEGNIEYLRDEENCLFYDRNKEGDAVRAIERICSDSNLRDKLYENGIETAKRRDWRELEKEVLSFYGFNRGE >NZ_AP018794|3127395:3139893|3136295_3137435_-|WP_155881312.1|DBSCAN-SWA MKKALLVTTISGFVPQFEMNNVRLLQEMGYEVHYACNYHTPVYTDNNERLDGTGIVRHQIDFVRSPFKLQNFKIYRQLLSLMRKEEFDLIHCHTPMGAVIARLAAHKAKVSPVVYTAHGFHFYKGAPKSNWMFFYPVEKFLAKWTDVLITINEEDYERAKKFKVRKRLVKIPGIGIKTDQFIADLENGKKVFQELGIQTDDFVIISVGELSKRKNQRAVIESMSYLKDHKDIKYIVCGSGAMETEYRKLAAELGVENQVRFAGYRTDVKDLLSLSDIFIFPSLQEGLPVALMEGMCAGLPVICSEIRGNSELVKEGWNGYLIKDGKARTYAKAIQMAYDHRNMLPEMGERSREHVKKYDLLIVSKIMKEVYTEIDNGRE >NZ_AP018794|3127395:3139893|3135403_3136309_-|WP_155881311.1|DBSCAN-SWA MVENKLQVLMSAYNGEKYIRVQLDSILNQTYQNIEILIRDDGSTDSTVSILKEYQEKYENVSFYSGENVGVIGSFFDLINHADKEATYYAFSDQDDYWLEQKLEAAVEQLQKEKEIPFLYCSNTTLVDDQLEVIPMEIKQSKVVPEFGNALVENKATGCTCVINHELLKLLQHVEPEYTVMHDWWIYLAASCFGKVYFDPVSYIYYRQHGGNQVGARNTYWKEFVARFKRFGSNKGKIIRQLRAFENAYEIESAKREKLHIVTDYKKSFKNRLKAILTKEVYRQRTVDNIVFKALFLIGEI >NZ_AP018794|3127395:3139893|3131917_3132763_-|WP_155881307.1|DBSCAN-SWA MKVLVTGVKGQLGYDVMKVLKERNIDCIGADREQFDITDAQKTSEFIKAYGPDVVVHCSAFTAVDRAEEMIDVCREVNVEGPRNIAKVCKELDAKLVYISTDYVFPGTGDQFYEVDDPTGPLGQYGMTKLDGELAVKELVEKLFVVRISWVFGKNGNNFIKTMLRLGKEHDELTVVADQIGSPTYTADLAILLCDMLETEKYGTYHATNEGICSWADFTEEIFKVAGYDTKVKRCTTEEYGAKAPRPKNSRMSKKSLDENGFDRLPDWKDALRRYIAEIEE >NZ_AP018794|3127395:3139893|3137453_3138314_-|WP_155881313.1|DBSCAN-SWA MKKILIVGKNSYIGNHLESYLEGFNQADQVEYEVVKVSASNGEWKAVDYADYDIVVLLSGLVHKKESVYGYEAYYKVNYEMAVEIARKAKESNVSQFIFTSTMAVFGDHATRITQETKEQPTTFYGKTKLMAEQTILEMEDDAFKVSVVRPPMVYGKGCKGNFPRLASLVKKLLLFPRVQNKRSMIHIDNLCEFLHLLIETKKTGVFHPQNKELVSTCELVSEISKQQNKKLYLVPGFSWVIKLGMKYVRSMHKVFGDCYYEQEMSQYVGMDYWIIDEIESVKKSV >NZ_AP018794|3127395:3139893|3129683_3130421_-|WP_155882686.1|DBSCAN-SWA MITVDNVSMQFRMANDKILSLKEFVIAHLKNQVQYNEFWAFKDISFDINKGEVVGIIGRNGAGKSTLLKVISGVLKPTSGKVIANGNIVPMLELGSGFDMELSGRENIFLNGAILGYSEEFLKEKYDEILEFSELHEFIETPIRNYSSGMLMRLAFSIATVVHPEILIVDEILAVGDEGFQQKSKSKMLELMSGGTTVLFVSHSIDQIEEMCNRVVWIDNKKVKMIGNAKEVCNEYRKFWNQGEQ >NZ_AP018794|3127395:3139893|3133863_3134427_-|WP_155881309.1|DBSCAN-SWA MNVIKTDVLDVYILEPQVFGDNRGWFMESWSQAKMEEAGLFYNFVQDNHSYSAHKGTLRGLHFQKGEASQAKLVRCGKGAVLDVAVDMREGSPTYKKWVAVELSADNKRQLLIPRGFLHGFVTLTDDVEFLYKADGYYNHPADRNIRWNDPEIGVEWGVEDPIVSEKDAKAPFLKDSDIDFVYKESK >NZ_AP018794|3127395:3139893|3130461_3131232_-|WP_155882687.1|DBSCAN-SWA MFVGTYIKYKFLIKQLVSRDFKTKYKRSVLGFFWSFLNPLFTMAIQYIVFSTIFRANIDNFPVYLLTGSILFTFFTESVGVGLTSIINNSSLITKVYMPKYIYPVSKVLSTAINLLISFAPLLLAVLVTGEKITKAYLLLPFVVICLLVFCLGMSFMLSAFMVFFRDTQFLWGIVSLLWMYATPLFYPESIIPSHFAFVLKVNPMYYFIKFARIVIMDGISPEPIQYVMCMLCSAVSLIIGMIVFKKSQDRFVLYL >NZ_AP018794|3127395:3139893|3138313_3138925_-|WP_155881314.1|DBSCAN-SWA MYQKIVKRFFDIILSFIGMVILIIPILIIAIWIKVTSKGPVFFKQKRIGIHKTTFPILKFRTMRIDTPKDKPTHLLENPDQYITSVGKFLRKTSLDEIPQIFNIFVGQMSIVGPRPALWNQYDLLEERDQYGANDIRPGLTGWAQVNGRDELPISVKAKLDGVYVEKCSFLFDLKCMFRTVFSVAKQEGVVEGGTGAMKKEQK >NZ_AP018794|3127395:3139893|3132843_3133863_-|WP_155881308.1|DBSCAN-SWA MKIIVTGGAGFIGGNFVHHMVNKYPNYEIICLDKLTYAGNMETLEPVMDKPNFKFVKGDIADRDFVYNLFETEKPDMVVNFAAESHVDRSIVDPGIFLQTNVMGTGVLLDACRIYGIKRYHQVSTDEVYGDLPLDRPDLFFTETTPLHTSSPYSASKASSDLLVQAYHRTFGLPVTISRCSNNYGPYHFPEKLIPLMIANALNDKDLPVYGTGENVRDWLYVEDHCIAIDMIIHDGKVGEVYNIGGHNERTNLQVVKTVLHELGKGEDKIKYVADRKGHDRRYAIDPTKIKNDLGWEPTTTFDEGIKRTIKWYLDNRKWWENIISGEYQNYYEKMYSNK |
12 | Enterobacteria_phage(37.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
4029536 : 4048382
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_AP018794|4029536:4048382|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_AP018794|4029536:4048382|4045766_4046708_+|WP_155882173.1|DBSCAN-SWA MSTVTERLGLQIQGEEEAYDIGIPNENFKKIDRVMGEIPRRNLLVNGDFQVWQRGTVFNNPPVWQYFADRWRVYHNGDVDLTVSQIDQNVGGMSIKWADGQNAGINIQYLALVDEKVKLLGRNLTLTVKIDGLLIERPITMVRGGAYIHIGMSAANAYSCQVENPLLEEESPFVIIFELEPKVAGGTRKIEFIKLEYGNYYSGFEPRPYYEELRDCSLYFQHHEIEWRQEYTTQNLYWTRPFIIPLLRNTATVTIKSFVDDSGTSLMPYVLGNVIQTSTSTATLRLWMHARSDAFLTQGKSYEIKLDIDASLC >NZ_AP018794|4029536:4048382|4039809_4041792_+|WP_155882166.1|DBSCAN-SWA 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25 | Clostridium_phage(70.59%) | tail,portal,plate,head,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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