Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NZ_CP039245 | Piscirickettsia salmonis strain MR5 plasmid unnamed5, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP039240 | Piscirickettsia salmonis strain MR5 chromosome, complete genome | 3 crisprs | DEDDh,cas3,DinG,csa3 | 0 | 2 | 43 | 0 |
NZ_CP039244 | Piscirickettsia salmonis strain MR5 plasmid unnamed4, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP039241 | Piscirickettsia salmonis strain MR5 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 2 | 0 |
NZ_CP039243 | Piscirickettsia salmonis strain MR5 plasmid unnamed3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP039246 | Piscirickettsia salmonis strain MR5 plasmid unnamed6, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP039242 | Piscirickettsia salmonis strain MR5 plasmid unnamed2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
6661 : 41300
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039245|6661:41300|DBSCAN-SWA 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46 | unidentified_phage(23.81%) | head,tail,capsid,transposase,protease,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP039240_1 | 685934-686033 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP039240_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP039240_1
>1.1|685957|54|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder AAATTAATATTTTTTAATAATTTATAAAAATTAATTGATAAATAGTAGTTATAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039240_1
The CRISPR arrays of NZ_CP039240_1 >merge|NZ_CP039240|1|685934-686033|CRISPRCasFinder AATAAATATTAATTTTTTAAATTAAATTAATATTTTTTAATAATTTATAAAAATTAATTGATAAATAGTAGTTATAAAATAAATATTAAATTTTTAAATT >NZ_CP039240|1|1|685934-686033|CRISPRCasFinder AATAAATATTAATTTTTTAAATT AAATTAATATTTTTTAATAATTTATAAAAATTAATTGATAAATAGTAGTTATAA AATAAATATTAAATTTTTAAATT
>NZ_CP039240.1|WP_155079478.1|684659_685217_+|IS630-family-transposase MKKEPKYKQRRDAERSEFIEKLTGIDLSQLVYLDEVGVDDNIVVEYGWSAAGVRSYAEQAGFKRKRLSLVAGLKYSDKSLVAPFEFSGAMNKDLFLGWFEQELCPKLNPGQVIIMDNASFHKSPELYDMVEAVDCELLYLPAYSPDLNPIEKFWANFKRNIRKVIKKHEHLCNAITDALIKTLPG >NZ_CP039240.1|WP_155079476.1|684289_684676_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MILLLFLHEKYSRILELQAYSQDLRERVIEAYKDGLSRREISTLFKVHYDTACEWIRRYLSTGDYSSKQGVGCGAQIRFNDKQTILDFIKKNPDANGIAIRDGIAPDLPMSTFYDALKRLKVTYKKRA >NZ_CP039240.1|WP_155079963.1|683903_684293_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MAYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSMRSIARALGFAPSTVSRETKRHTPSDFNGLYCHRLASRCAQEKRSNAKQGQDFQKISEKAKVLIHERLSTHTSPDVISKELIQEHNIQVSESTIYRYIADTVELTF >NZ_CP039240.1|WP_155079962.1|682566_683625_-|hypothetical-protein MKEIQDKYLILLAEACSTVDECARNRQSIYKPINEPTNKKCKEYVSHKAVEHFFLEESDNEIENAYKELKEKLESSNEKEALYDKFNDFFYKKTAHKIDTARIVGFSKERKFFSKSLYDNLLLNAIEFTASSKLRDSFDLAFKEANILSTHDDGIAFRALTKNLTHVTVMPLEKLDISCHLELFQQLIELGLGNQPSHILDMLDFPQQFKDFNHILQETYNQIKAHVSAQISYSQAQSHPLLSCFFSKKNNVSACFQQYQTNVTRAAFNFLFSKERDLAVLESQLTQHDANFLSSSGLKSSYPNFQGAYPKLLKQIKQPNKAEAISAQLFSQQQTATGASILANMTSDIAPI >NZ_CP039240.1|WP_155079961.1|681130_681784_-|hypothetical-protein MLNLADIYTDYLIAQNKHATATGLADLMPDELSHDQITRLLNKTPQTSKDLWLKIKADVREYEGLDDGVLALDDMIAEKPYSDENDIIAWHYDHSKGRTVKGINILTAMVRYGDVRLPIAYEVIEKTIRYSDLQTKKERRKSSFTKNDLFLKLLNVAIRNDLKFAYVLADRWFSSQSNMSYIHNVGKKFIMGIKSNRCVALTEKDKENGKYQRKRST >NZ_CP039240.1|WP_155079960.1|679369_680767_+|IS66-family-transposase METAVYPENIEDCYKVIDHVSTERDHYKALYEQLQRYRYGQRSEKLSQDQLDLFAEFLDENAEKESQQEAITVPAHQRQRPKRKPLPEHLPRERIEHDLTEGDKVCACGCAMQRIGEEITEKLEVIPAQFKVIQHVRFKYGCKACETGIKIPSLPPMLIPKSIITPSLLAMIVSDKFESHLPLHRQQQRFEALGIDLPRNTMANWVIVTAMLCESLLELMKQDLLQAKLIHADESPLRVLSEGKQKSYLWYYYGRIAEKQICCIDFQASRHSIHPAKFLKGYTGYMMTDAYSGYGEVIKNEKITSTYCWSHARRKFEAIPQPKKDSKKITLAMEMLNLIKELYRIEKEIKGKSPDIIYQHRQEKSKPILDEIKQWLEHYQPSIPPKVPLGQAMSYLHKNWNEFIRYIDEPFLSIDNNVLERQIRPLAVGRHNWLFSASEAGAQATAAFYSLVATCAASHGVLSTG >NZ_CP039240.1|WP_155079959.1|678976_679327_+|IS66-family-insertion-sequence-element-accessory-protein-TnpB MNFPSSIKVHLATTHCDMRKSIDGLAWEVQSRFDMDVLDGAVFVFYNRNKDKLKYIYYDGTGFCLFYKRLAKGRFKIPPLKNDCYQMSEAQLRLLLEGVEWSKIKPNRKQKYSQMF >NZ_CP039240.1|WP_155079958.1|678671_678980_+|hypothetical-protein MIDQTKLPNNREDWLEMVKLWKESGLTKEAFCREMSIKSSQFSYYCKIYREQNKSRLNFAEIKTAPSTTLSLKLCGQHELTIPPDFDEPTLLRLLSIANKVQ >NZ_CP039240.1|WP_155079957.1|678243_678396_-|phosphatase MARSGRSPFVEKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKSSAVRVTQRYVP >NZ_CP039240.1|WP_155079956.1|677465_677954_-|hypothetical-protein MAFKVQVMKKTFKNENGKESVLYLVTNDLSNKFAQNSIYLSSQQATRYFGKLPLRVVMRFVFFRSKLWGIRPLAIDGQPILDTYKKRWSIEEFHKSVKQNSSFEKSPTRIVTSQLNHIYYSILGFCRLERLKLKKSLNHFAIKYKLILRANQIALQELRSMV >NZ_CP039240.1|WP_155079964.1|686436_687228_-|methyltransferase-domain-containing-protein MAVTFKEHAKEYEERAISQRLAAKTLIKMMDIKKGDQILDVGCGGGGVTSLLADQHNVFIDAIDSCKEIFDEAVKNFGHRKNIQFSNLSANKINYENKYNWIFSNSSAYYLGDLIDIFSKFKKALKPNGKLAIQAQYKTAPQIKRCFDLILSDPLIGAIFKKHKFPVNKLNGKQFAEVLLLASFATPEFKQITHRTMHSVDEIMTIFYSGWHVPWLLNGYSGPINTEYKVNFKNLLYQGLLKQADINNKLWLEVPRVYVIANI >NZ_CP039240.1|WP_155079965.1|687768_688335_+|hypothetical-protein MTVYLSFFKAAVRKQGEFKRFYQDIGQFEKLKEFSDNLLQSLNAVEYKLRQGQAPRLSHLGLWISALDRGDLNLIDYLCSQNKKLDNLLKNTEFHPCIIAWRLKFYGLGQKKVTDLIFASHISLRKSVANIIKTGNITLNDWYRIQGNPLLQKAVNSFAALGKFSRDDWRTVRDNRLLQKAMIAPSVI >NZ_CP039240.1|WP_155079445.1|689003_689978_-|IS30-family-transposase MAYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSMRSIARALGFAPSTVSRETKRHTPSDFNGLYCHRLASRCAQEKRSNAKQGQDFQKISEKAKVLIHERLSTHTSPDVISKELIQEHNIQVSESTIYRYIHEDREKGGELYKSLPHSGKPYKKKVKSGDKTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTIVGRDHKSYLLTLVDKANKMCCIRKMANKCAETVVETFRSIVASTFFDFKTITSDNGTEFAGHEDISKITDADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDAKIAKIEHTLNARRRASLDYRAPNHVFLENLMAA >NZ_CP039240.1|WP_155079966.1|690037_690436_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSFRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEAAKMLIHQRLRTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYALRHMKCNTQ >NZ_CP039240.1|WP_155079967.1|690481_691111_+|hypothetical-protein MDMNSLLSVALHVTEGVALHKTGVNFKNDWQQLKENAQLQKTVLILNQTGVNFKKQWLKIKGNKQLQETVIENNKKLQKSYYPNLKQYECHLEKNKADYHSKWKDVKKFFKISRKCARNYLMGLKNSFAPLLDTKSNMKAIYQHRRSLKSRVGLTFITSIFSAGLALMFEAGRAAVRKYQGKSFECLFLGATTSQNLAKSVKSAGLALG >NZ_CP039240.1|WP_155079968.1|691477_693118_-|glucose-6-phosphate-isomerase MNTAAWTKLTAHQQEIKHTHLRDLFINDSQRFNHYFKQGPHLSIDFSKNHLTNHTLKLLIALAQEHLLGDKIHALMQGATLNITEKRAAFHSALRVPASKHHQLPKEIAKQITTVHAQMRTLCAKIHSQTPLYSQGQIITDIVNLGIGGSDLGPAMVTTALTPYHKKYLRCHFVSNVDGNQLHNTLKNLKPETTLFIIASKSFTTQETFANAQSARHWLETAQLSTAQINHHFICCTSKPEKAREFGILAEHILPMWDWVGGRYSLWSSIGLPIALATGFDHFEALLTGAHAMDNHFQTASFEDNLPVMLGLIGLWYINFWHTRSHALLPYEQMLALFPNHFQQVDMESNGKHVQINGEPVHWQTAPVIWGQPGTNGQHAYHQMLFQGTEMIPMDFIVGLKTHSPYQQQHNMLVANCFAQTRGLMWGCDEQEVYQQMINQGINQAEAQRLAPHKAIIGNQPSTTILYDKLTPESLGALIALYEHKVFVQGVIWNINSFDQYGVELGKVIGQNVLAQLQGGSNIKNNNIDDYDASTQGLIHYFRNNQ >NZ_CP039240.1|WP_155068160.1|693230_694580_+|nucleotide-sugar-dehydrogenase MRVTVFGAGYVGLVTAACFADLGNQVICVDVDEKKLAQLAEGKSPIYEPGLDELLLRGQESGHLEFTADIQSAVEQGEFIFIAVGTPSEESGSADLQYVLAVAKSIGEYMNGYKLVIDKSTVPLGTADKVRQVISNELGARGVNYEFDVSSNPEFLKEGAAIEDFMYPDRVVIGIDNLRAEKRLKTLYTPLTKKNNCLVVMDARSAELTKYAANAMLATKISFMNEMSQLAERVGADIEMVRQGIGSDSRIGYHFIYPGCGYGGSCFPKDVRALVHTAAEHGFDTKILAAVQEVNEKQKELLLEKVLREFQGDIQGKTFALWGLAFKPKTDDIREAPSRVLMEGLWQHGAKVQAYDPAAMDNIQAVYGARDDLYLATSASSALTGADALIVVTEWTEFRSPDFNVIKKTLNQPLVIDGRNIYDAEHLESLGITYRCIGRGEWLMKDVCR >NZ_CP039240.1|WP_155068159.1|694576_695446_+|UTP--glucose-1-phosphate-uridylyltransferase-GalU MSIIKKAVFPVAGMGTRFLPATKATPKEMLPVVDKPLIQYAVEEAIEAGIKELIFVTSSNKRAIEDHFDRHYELEKRLEEAGKAQFLSIVRDILPQGVSCSYVRQAEPLGLGHAVLCAESLVGAEPFAVILADDLIANDGPLCLSQMVEKYNDKDADCVLAVQEVPEGDTHKYGIVATESSDRVIHMVEKPKPENAPSRQAVVGRYILSPEIFTALKNTSQGAGGEIQLTDAIASVLQNQRVLAYPFTGKRYDCGSKLGFLEATLDYALDHPELGLACQEYLQKRFQSN >NZ_CP039240.1|WP_155079969.1|696192_696507_+|transposase MGYPVEFRRKVFKLKEKKGLTYEEVSELFGVSMRTLFRWNTRIEIKKKAPKPRVINLEELKNDVKNHPDSYQWERAQRFGVSQHCIQHWLNFLAIVKPPFLCQV >NZ_CP039240.1|WP_155079970.1|696503_697211_-|IS3-family-transposase MTKIKKVLTDLAKVHHRWGFDKMMAKIKQNYAWNHKRVYRVYCELKLNLRIKPRKRVSPREAKMLVQPIVSNHCWSLDFMSDTLSNKRKFRTLNVINDYNRECLLIEPAFSLPSMVVTRLLDQVAESKGYPEVIRSDNGPEFISSDFTKWAEQHNILLHHIQPGKPAQNGFIERFNRTYRQDILDAHWFYNLEEVREITEPWVDQYNNERPHESLANLSPINFKKMRDKTTEIPL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP039240_2 | 1073605-1073716 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP039240_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP039240_2
>2.1|1073636|50|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder GGGTGTTATCCTTCACTTGCTGCCAATTATCTTTAAGGCTGATCTCTGCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039240_2
The CRISPR arrays of NZ_CP039240_2 >merge|NZ_CP039240|2|1073605-1073716|CRISPRCasFinder TCATGAAGTATTAATAATGCTTTTGTTAGGTGGGTGTTATCCTTCACTTGCTGCCAATTATCTTTAAGGCTGATCTCTGCATCATGAAGTATTAATAATGCTTTTGCTAGGT >NZ_CP039240|2|2|1073605-1073716|CRISPRCasFinder TCATGAAGTATTAATAATGCTTTTGTTAGGT GGGTGTTATCCTTCACTTGCTGCCAATTATCTTTAAGGCTGATCTCTGCA TCATGAAGTATTAATAATGCTTTTGCTAGGT
>NZ_CP039240.1|WP_155066848.1|1072506_1073046_-|superoxide-dismutase MKHLLLPLKIASLMLFSVTAYHTYANANAHTHKHSAEKVTLYTVAKGTPSHNIGYVLLKDSPNGLLILPHLSHVPAGFHGFHIHVNPSCKDHGMAAGGHYDPTKTGKHLGPYGRGHLGDLPVLYANKKGDINGPVIAPHLTLKQIHGRSLMLHAGGDNYADKPESLGGGGARFACGIIH >NZ_CP039240.1|WP_155080161.1|1071938_1072154_+|hypothetical-protein MDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGSKSIRINFMGGLRGKQFIAPMVVEGYCNNNVCQAYIDQSLRV >NZ_CP039240.1|WP_155079974.1|1071516_1071882_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MPSPYSYDLRVRALKMIDEGIPITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNSGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKRLGYTRKKRASDTKNVMH >NZ_CP039240.1|WP_155079445.1|1070329_1071304_+|IS30-family-transposase MAYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSMRSIARALGFAPSTVSRETKRHTPSDFNGLYCHRLASRCAQEKRSNAKQGQDFQKISEKAKVLIHERLSTHTSPDVISKELIQEHNIQVSESTIYRYIHEDREKGGELYKSLPHSGKPYKKKVKSGDKTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTIVGRDHKSYLLTLVDKANKMCCIRKMANKCAETVVETFRSIVASTFFDFKTITSDNGTEFAGHEDISKITDADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDAKIAKIEHTLNARRRASLDYRAPNHVFLENLMAA >NZ_CP039240.1|WP_155080160.1|1068905_1070132_+|MFS-transporter MNLSLSRRTTAVFLLTFSSSLPLILVGSTLSAWYTVAGVSLLGIGALSMVQQPYIFKFLWTPLMDRFSLFGWCRRRSWILLTQVLLVIGLVLMAYTGPKQYPFGLAMIALILAFFSASQDIAIDAYRIDILHANELGMGAAITSLAGRIAMLFGGAVALVFAAEIGWQNTYLIMAAVMALEILATLAAPALRNEEATPRSLQESIVGPLKDFVRREHALSILIFILTYKMCDALALALNTPFLIRGVGFSLLEMGTIYKTMSLVASLLGTVVGGFFYKRLGLYRTLMCYGILQALSNLAYMGLALASKSYFLMATAVFVEYFCGALSTVAFVAYLMSLCKQRFSATQYAILSAIIAIPRVYFGPLAAIMIDYFGWAQFYLITCLIGFPPLILLFRMKKYLLNYWLDTE >NZ_CP039240.1|WP_155080159.1|1066676_1068317_-|hypothetical-protein MSTIDDLLRDLSASRQRELLEELTAVYNSSSSRQHLNTESREKYRQLLRDFGYMNRLQQFDKTEGEYSSLNHGLGPWPGVQFFPDWNYTRLLLLRFRRQAQAIADAFHSNVFNQNLGHREVGIGFSILGVVWYLPRLLRHTVLSLKHLLTNEKSSSDYFKKHWFQFFNDLIWAATGAITLGIGTGWYLGPWAAALGPGGIILTVALYAFDVVNMVAKAYTKIRKMNRIIAHTNEQIQGVCGELGLLFSTSIDIESLYTYVKEQIQQGATEDELEKLNKLKDLLDIRERMLLRKSYVKYDQFSKVGITVGLLAGMVLMLTGPIGAAVGAGVVLVTCGIQYWLNHYFLPKKEVQLASDPLELLHLKLNSHVDKQIIKLTEELQYLKNGPEKEQTNHKLLMYMRARGALNRWRDRPERNNDSTMLLQAAALTMDASKIRRKGTGAPASYKDLKSALKHFSTPWRDAFNDAQKQFSLLLKNFSASSKVKSSTESPLSRSSTDSQGSSNDENFDKGIFEKAAAQAAAGSDYQPLQSESGITTASSASPALG >NZ_CP039240.1|WP_155079724.1|1065345_1066527_-|transposase MLNLADIYTDYLIAQNKHATATGLADLMPDELSHDQITRLLNKTPQTSKDLWLKIKADVREYEGLDDGVLALDDMIAEKPYSDENDIIAWHYDHSKGRTVKGINILTAMVRYGDVRLPIAYEVIEKTIRYSDLQTKKERRKSSFTKNDLFLKLLNVAIRNDLKFAYVLADRWFSSQSNMSYIHNVGKKFIMGIKSNRCVALTEKDKENGKYQQLKQISLEDGIPQTVYLKGMAFKVQVMKKTFKNENGKESVLYLVTNDLSNKFAQNSIYLSSQQATRYFGKLPLRVVMRFVFFRSKLRGIRPLAIDGQPILDTYKKRWSIEEFHKSVKQNSSFEKSPTRIVTSQLNHIYYSILGFCRLERLKLKKSLNHFAIKYKLILRANQIALQELRSMA >NZ_CP039240.1|WP_155080158.1|1063451_1064615_+|MFS-transporter MEAIRLVRKSAIFRVVLALSFLESFALMMDFTVLYTVIVYLWKLPLYKVILFSFTVSIPSIIISPFAGRLVDAKGSIICIQYSSILCFFLTIGLIFTNSYFILFTLVFIRSSLKAVFSPALSRIIKLTVDKKQLLSVNSLIQFNANGLLIIAPIIGMVVFSTLGKKWCFLITSILFFLTFSLSFFLKGVSDKRSQVDMGLLLQSDLDIKKLLVPFLGMMIAAFAIYLGDSLFPLLLKSTGLDFKDFALIGSFFGIGGMAASIFCQCYKNSNEVTLIKLGAILVIISMFTYGMFSSMLSQCVFFVFAMLNAGGITLISISSATLLQKNTPAHMMGKVSSINNMIFGLASIIVPAFGLTFSQLVSVKLPFLLLSIITLSLLLTLRAMEC >NZ_CP039240.1|WP_155080157.1|1060514_1063205_+|DUF4135-domain-containing-protein MNKNEAFLDIYRSIIGQFISSKDVQNILDSFPQGKISETILTKSFLKLYSSLLDVTLYRVLEVDSQIYFKENKSNDYNQYLTGFDLNTCLSKYHSTDSFDLQCHFLKDALLQFYLRLAADIREIESHILAGEKIEVITEVSPVGDFHGALECGFCIGFKSQLKESGEFYYKPRLSHLFEKYNNFITWLNEVEHSAMLDNIALKNINKQDYSWIQSVHAILTATADHQRLSPALQGQNDHLAFERFGALLCLAYVFSSCDLHYENIVFNGDYPVIVDIETIFSGKWHKYQEVGHLYDTLMLPRSILNREEEASPLTYDTNRKNAFETHIDDLIVGFEKTYDLIIKIKPDFIIKVNELFSDIDYRVILRGTKTYFNIIKNINHPVTLIKQSQALEINKMYEVDLPTALYQYEAEQLKSASIPIFYAKFDSKKLCSYDGKVLFTKMEKSAKDLFDIKIKLLSNKDKENQINNILVAKKAFVARRDGITLTEISPDINTLKRKDFFDAGVSHIEIIQSTWQRLVNKLCYISSTVHMPTIILENNTWNGLASLDLYNGTPGILLVWHQLHTALKIKKTKHYKAIRNDIKHYFCRERISYEPSLYQGLVGCLYVYIITSENLLEELPVIQVALQKIAYGVAALEVKSVLDLDVIKGLSGIVLGLLTIKSQLQSYHAISKSLGCICQSTVLKIVNALDQHLNDKTLLGFAHGTAGIIAALSAYMNHYGRNIQYIKVINMLMKRERSFFDPSINHWRRPDNGQFDESWCHGSIGIVLSKLYARRYINIDFDKEINTVLTHIELSKSANLNLCHGLAGYLEFLNTILTLSQLDIKEDTRLRCEAVKDNLIKKIDLIYLNYSVLVDNYYHEDELPGLLSGTAGFLLTLLSCYKKNIVDNILSIGVH >NZ_CP039240.1|WP_155080156.1|1059374_1060223_+|hypothetical-protein MEVEMSFSPLRSKIRQWLIELRQVVMDKSGNIYNPAFSIKDYDPLLTIRKTLSAVTTAQSGGDLLDALNYLERDYLKRNSKLSKYLLNIRGSQLIAELYTQLNEYRESCKIYIESGLVTSAEQKQAIAKEEKAVAKEKKFVELRQTLQNFDTSASKQEALGQCQTLQDLCFAASIRQKSGLLHLGNTTATANELVRLLNLPTNGLLRQEICSDGEKVRMRDVRHYARFGVKSSSQRYFLSAEDRENERFFSHLKNEKQSQPMLMFDRYKVAQNQTLEVCLDA >NZ_CP039240.1|WP_155079476.1|1075012_1075399_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MILLLFLHEKYSRILELQAYSQDLRERVIEAYKDGLSRREISTLFKVHYDTACEWIRRYLSTGDYSSKQGVGCGAQIRFNDKQTILDFIKKNPDANGIAIRDGIAPDLPMSTFYDALKRLKVTYKKRA >NZ_CP039240.1|WP_155079478.1|1075382_1075940_+|IS630-family-transposase MKKEPKYKQRRDAERSEFIEKLTGIDLSQLVYLDEVGVDDNIVVEYGWSAAGVRSYAEQAGFKRKRLSLVAGLKYSDKSLVAPFEFSGAMNKDLFLGWFEQELCPKLNPGQVIIMDNASFHKSPELYDMVEAVDCELLYLPAYSPDLNPIEKFWANFKRNIRKVIKKHEHLCNAITDALIKTLPG >NZ_CP039240.1|WP_155080163.1|1076731_1077241_-|hypothetical-protein MNVTVPARIIFLKFLNLQHNVDYLGRYIKRPALANARMEHYDGNVVIFRYLDHKTKQQKMKKQSIDDFIDRLTQHIPDKFFKMIRYYGFLSYRTRTIILPKIYDLVGQTIEAYNQVTFVSLMKSNFNYNPLKCILCGSQLRRISTQFGLTLREKYSYYEELATSRFRGF >NZ_CP039240.1|WP_155079445.1|1077917_1078892_-|IS30-family-transposase MAYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSMRSIARALGFAPSTVSRETKRHTPSDFNGLYCHRLASRCAQEKRSNAKQGQDFQKISEKAKVLIHERLSTHTSPDVISKELIQEHNIQVSESTIYRYIHEDREKGGELYKSLPHSGKPYKKKVKSGDKTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTIVGRDHKSYLLTLVDKANKMCCIRKMANKCAETVVETFRSIVASTFFDFKTITSDNGTEFAGHEDISKITDADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDAKIAKIEHTLNARRRASLDYRAPNHVFLENLMAA >NZ_CP039240.1|WP_155066852.1|1080156_1080570_+|hypothetical-protein MTDISTTAAASLVEVSVRKIQRMIKLGEISAIRNSKGSWRIDLSELGRVFGLTIDELSERLSAIEIRKNTSGSDKINTENLENLAVLSQEVELLKSHIFSKDEQITLLTKEKEELMQLLEQLKKQRKKKGFFAKLFS >NZ_CP039240.1|WP_155080164.1|1081187_1082162_+|IS30-family-transposase MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLRTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQQPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHPSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKETAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039240.1|WP_155080165.1|1082348_1082816_+|hypothetical-protein MPKVAWKNKEQEAAEWRVVKRYLGEYAGTQLGSNHNDKTTFIDPLTKKQVYLTHRYLRGADGEIFVKSNGKALGAGTFGKVTFGQTENGQMWAIKKSPTMVILPEKGKVNLLPSLLKESDIAVDLGKARRSFQGKDGSKYYQIYQFLGTPLDKHL >NZ_CP039240.1|WP_155079826.1|1082877_1083764_+|IS630-family-transposase MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNSGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVAKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGSKSIRINFMGGLRGKQFIAPMVVEGYCNNNVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLEAALSQVMKSMSETVR >NZ_CP039240.1|WP_155080166.1|1083760_1085071_+|hypothetical-protein MSAISENALGEEQRFDLAIKIAQAVYHLHVGSYARSKALYAHLDLKPANICVDDQGQVHLIDYGFSESLTGTLSRLKGTLIFLPQQPVGISKEALDVFALLRILYLPELFRTPKDWVSRADSHKEGVVSLFNYDFVEKNNLTLLLDTSDGRANDKSIVFILCKLILLRWNLATDANLKKVLERPQQFNENYECLVALGLNSAEYVQQVMTNPDSIEGFKQEQSNLLKLNQLGLDQAVYINALLASPNLIDQFEQNQGQFLRLNQLGLNQVVYIQQVLEDPGQFDKDYCYLKSFGLDRPETVKKMLDCLESQSALVEILLEAALDKAIEDCRQRGSQKKLTIAKFLKSKISIDPVNLILRNTVNILSHRSGLLKSKSYGVAMPYLLECKRLLEISEQDWNAMLATGYGFAGLHSGHEGTVAKNYSELQKGYFLVLSA >NZ_CP039240.1|WP_155080167.1|1085073_1085802_-|IS6-family-transposase MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLELERSTICRWVHEYGPEIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRHQNAKAALRFFKKAMAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSRRCKLRRVKYLNNYIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKKNICAQNQLIDKLFGLAA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP039240_3 | 1444308-1444540 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP039240_3
|
4 spacers
spacers of NZ_CP039240_3
>3.1|1444334|31|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder AAGCTTATAGATTCTTTACCTGGGACTGATA >3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder ATTCTTGAGGATTCTGCTTCTCAAGGTTCTATTT >3.3|1444451|19|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder GCTTTTGAAGATTCTGCTT >3.4|1444496|19|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder GCTGCTCAGGATTCTGCTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039240_3
The CRISPR arrays of NZ_CP039240_3 >merge|NZ_CP039240|3|1444308-1444540|CRISPRCasFinder TTGAAGAGCCAGGTCTTGAAGGTTCTAAGCTTATAGATTCTTTACCTGGGACTGATACTGCAATTTCTACTTCTCAAGGTTCTATTCTTGAGGATTCTGCTTCTCAAGGTTCTATTTTTGAGGGTTCTGCTTCTCAGGGTTCTGCTTTTGAAGATTCTGCTTCTCAAGGTTCTGCTTCTCAAGATTCTGCTGCTCAGGATTCTGCTGCTCAAGGTTCTGCTTCTCAGGATTCT >NZ_CP039240|3|3|1444308-1444540|CRISPRCasFinder TTGAAGAGCCAGGTCTTGAAGGTTCT AAGCTTATAGATTCTTTACCTGGGACTGATA CTGCAATTTCTACTTCTCAAGGTTCT ATTCTTGAGGATTCTGCTTCTCAAGGTTCTATTT TTGAGGGTTCTGCTTCTCAGGGTTCT GCTTTTGAAGATTCTGCTT CTCAAGGTTCTGCTTCTCAAGATTCT GCTGCTCAGGATTCTGCTG CTCAAGGTTCTGCTTCTCAGGATTCT
>NZ_CP039240.1|WP_155080364.1|1442292_1444032_+|hypothetical-protein MKFIELKQKFILVLQLVDGLSGSGATKHQGTAHSTEDKKDLISAVEEILSVRFLEGLSAVLTDSGRPKQAEILTRTQENIVFLLEDPDVKDSLGLLTTAKIAKFEIVYKYLLGEEGEELDALVQALFAQKSTDSQEINVCRYEAIEGFSSYFDLKANIPPREELFGEFHNEMRKINNEIKSAENTILELESKKITADSLARRKINLVTNQSNALTSIAALYIQGDRKLGLKSHSASYFNKIFGPYFEFNGGSPVIAPGYSLVDGKSDFEQILAGIVDNCQRKRTFWARVWGKLQAGKISALLLEAVDKGCSKTALKIHSGNVRTGEAFSSSWIGKKPSECEAEAKALSDEFNKEKYLLELSSTTIEAGEAKKQKLLNDFTQKVTDYGKELKRVFNAIRSFRLLVQKAEKKGAAAGGLDSQVKGAEGGEKLQQETFLPKELRLTGERKVDGAIIVKHIEGITGNEQLLSLYNELREKEYLIKGNLLRIFSHFRTTMSGEAVKCSETWHTIEAAFTNRVRSNHQAMGGSEQDWTQLVTDYPFLRNHMQAQTGVALEALVFGSVLQQSTEVSPEELNCVAHL >NZ_CP039240.1|WP_122942954.1|1441505_1441739_+|hypothetical-protein MKKSFVIILVIIALFSCFMVSFIAGGANGFLKIFSSLLSLLEWGILGFIIFVTGLFVIFGSIVVCAAVWDELFKKQK >NZ_CP039240.1|WP_155081510.1|1440684_1441305_-|hypothetical-protein MIYLTYVGTLIMIKIKKLPCILTLMPPLLSSLSSCSIYPVDLGTDATYKSPVTASALPFPIQVAPIKLTKAGLYKHYRFYSTEHFPAALRLTVQSMLTQANLGSPLNNNTHLKKVSTLKIKLYPIAINDSSKNTVIGTFSFSTTLENNQQTLWSKKLSATITGSSLDHLFNQAAQEIAYAINYTLTQECRFNINTVQCKGERFKIR >NZ_CP039240.1|WP_155067605.1|1439752_1440718_+|PAP2-family-protein MEVTGDKAATCKRNNVLITFISYLNKNFSYLDKATILLSTILILLSFLFSYINCKYTHYLSSVTPPLFIGSILIILAIMLTLLALPLRQALPKISLVFKLIGLYLIAWVAMLLAYNMQFTPFDPLDDYLYHIDLALGFDLGLWMQWLHQHPYIQQSLLYIYDSLEYQAFILPIIACFLVNQQDIELFLAKFAFLNLIGCLIYYFWPTASPASMVNSPYFTQGQLDIALQFKQLHEGIQPSVIGAGLISFPSFHVIWSALFTCLFKKKPYLFWPLLTLNIILWFSTVLLGWHYILDVIVGLILVLFAIAIFDYLILKRSPLH >NZ_CP039240.1|WP_155067606.1|1439351_1439762_+|hypothetical-protein MFKKIVSSFKSAASYSFLKESFSFIFSTSKKILTVSPDNKNGEKTQINELEISNYEIKKAKSVFRFLMWVYFLFFIIIFTYTLVNIVNHSLMTAIIGIAASLACLSLAFKYHFWLTQIKVGQLGITLKEWYESLWK >NZ_CP039240.1|WP_155067607.1|1439009_1439345_+|hypothetical-protein MDYNSTLAKVMRLYMGHRFFWKGDEISHEDVLSLSGNIIETLLRKVNLTYSFLFDSKISYSRKRLEGQSQESIHINSDKETAFILLLIVIDIMEEAVIKSGDDVYLDNYIK >NZ_CP039240.1|WP_155080363.1|1438388_1439009_+|hypothetical-protein MADSALTQVKLRNDFYRDNFRRVSLILLISILINVALLAAFIVSLSSRPEPKYFATTSNGQLIKLHSLSFPVMNDSAVISWLSDIVPNINSLDFLNYRTQIREKRKYFTSYGWEQYLKAFQPIVEKIRDNKYVARAVVSDVPVVIQKGNIDGVYSWRLQVPIIITYQQGASRDTQNVIWTVLIQRSNEHADSLFGIAQIIQKGDET >NZ_CP039240.1|WP_155080362.1|1437319_1438153_+|hypothetical-protein MPSPGNLDDNPNPLDQPAAGPEPASDQPIAQPAAGPEPAYEMAGGQPIAQSAAPAEGQEECDPDAEEQSVQDQAEAAADQERSTAASATEKEKKEKKKRLTEMRDALGKSHEDMGKQPERGRSISKQHRDKGNELTQRMEKLSNTDPKNVTDEEKNQFMDELKALGREANQLAMSDKEKVLLRGGFLGTLVSLFQKFITWDREYKVDFQLEAIKDQAEALKQKFDSELSEYNTAGADGPKPGGTGPKCADDEEDADNQRDEEKKKKQKEEMMKEFAM >NZ_CP039240.1|WP_155080361.1|1434169_1437283_+|DotA/TraY-family-protein MLSLVPGPGNDQSVYFLWQIFGNIIYWVSGQETSESDLTIIHYVISAFNSGLLSLLLVIYALVIFIGTLNTAHQGEFLGRNWSSLWMPIRAIFGPLCVVPVKYGFCLAQVVLLYGVLVGVQLANYVWNSLETDLDGTAIPSVPVSLLNSVKENVGRAVLYRSVQKVSDSLGLKTTDLPSTRLKSSYACDEVQGANQFYNIGNTPTFCANSQSLIPTSLLSKLTSYTSQLCQPNKFDNFIAAMRWFYQDPYNDNGMTIKPAGVPGLSSGTLAQQCVDAVDSLLTGGSSSMEKVYNYNFSVAGKNQVIALKANLGDAYLHDNNENKERYVNAVGHIAFNFENQNYSSGKASDYSKSADEFTRTIVNDLYKNDVKQAHSSLNDYLNELNKNLLNVAGDATNRLVKNTNVPTDVSVRQGTDIVTHSVNCNNYLINGNLSLRYLECLQLKDSGQTFSMYDVSNKDYPFENYIKSWWIGGGSYLAVDKIMNYNLEMVKNKLDQEISYPGMNIVSTVHYEIPLSVNYYPLINGHPPRYQNSEGNTEYASDVKTTIVSANAGVTSVTNTIPDGLSMVSSSWASNVYHAVPACIENSGSQACKDIITLQTQLLNLPSEWRPPFIYLFNLIKSGSKLAMKSISDSPKDVTFLNNVFYFLKQNGIYQSTTTTAVPVYAVIGRIFDQVGGNGLSSDMTAVMNEFYNLGMPSSNLFSKIMQAQQVGADVVQAVIDSFTNIFENYQEQFKDIQSTAESMIADWSWGAGIAGALGGLFGAGSIGTAAAILGQTAVQLYMATQIGNLSMSLAWLPIALVVLGSLFTAAISFVVMMPLIPYFLFWAGTIVWALSILEGLVAAPLVALALVYPEGHEILGHGSPAIKIALNIIFRPVLMVIGVVAAMALTYVLITYSAQGFHLVAPLILNNFSASGMVNGIVSCFLIFIYASFMMMAFSKCFSVIYLIPDKVFDWIGASAGHRAGAEEVQQLQGKTEGMGSQAGQSMGSGVQQGIQAKQTETQSSVQAQSQDIQVAEKAGEAAGSEARSAAEMAT >NZ_CP039240.1|WP_155067611.1|1433345_1434140_+|hypothetical-protein MNIIKKTLIVFAVISSVSLNSIQVVHADAVSLAVLLKELNAIESHQKVGNKELEKANSALNSGFPPDALKSFENLSPEPSLSKFSEYMQDIAHSGSKSKENNSVKAQIKNLPDNKYLMSLVQGQYYDKEVKENLLSAGASPQAVVLATAVLSQVNLNEKTNGQLLKAVQAQLSKNWQDGLRVSTRDQLLRMISLQLSVSNLSQYQQLRTQELMALLQLAGLMDHGVLLGKLTEINNKSIRIDKKLSEVNRQLDIINRHFKKSSN >NZ_CP039240.1|WP_155067602.1|1447302_1448574_+|phosphopentomutase MLKGRVIILLMDSFGVGASEDAEQFGDAGADTFGHIVEHAAHGLADSPERQGALKLPYLASLGLEQAAKQSRGRPIAKTITGDLELPIQGVYGYAIEQSCAKDTTSGHWEITGVPVEFEWDYFHKAAECKTPGQYSSCFPADFMRRFLVETGLTQGVLDAGHASGTEVINRLGDEHCLTGKPIVYTSADSVFQIACHEKSFGLERLYGLCQTARELFDEMGLNIGRVIARPFVGNKAGEYQRTGNRHDYSVPPPQPTLLEYVVKSGGEVISVGKIADIFADRGISHKVKATGITELFDQSLAAFKRSKAGSLVFTNFVDFDSQYGHRRDVAGYAKALEYFDSRLPELMDSMEPGDLMILTADHGCDPTWPGSDHTREHIPVLAWGPGLQSKNIGQRHSFADIGQSIADFMGLAPLAHGQSFLS >NZ_CP039240.1|WP_155080366.1|1448598_1449336_+|deoxyribose-phosphate-aldolase MDKTKKIVMALIDLTSLNLNDNDQMIMDVCAKASNRLGKVAAVCIDPKFVSLAKRLLKNQHIAVASVVNFPLGNDPIETVLADINQVLIDGADEVDLVIPYQDYLQKGGSEWALHLVKASKALCNDKLLKVILETGELKSHALIFKAACDAINAGADFIKTSTGKTAVGATVSAVKAMLDAIQVNLHYHPHVGLKVSGGIKTLAEASQYIHLAKEVYGKEKIQVSSMNLRFGASRLVDDLLSNDS >NZ_CP039240.1|WP_155067596.1|1449588_1450731_-|cytochrome-d-ubiquinol-oxidase-subunit-II MIDLPTLQVIGWVIVGATLLAFALTSGFDSGIGILLPFIGRNDTERRLTLNVIGPTWDGNQVWLIAAGGAVFAIWPLVYSTAFSGYYVAMLLILWSLFLRPVGFEYRSKLPNQTWRNNWDVGIFIASFIPILIMGIAFGNLLLGSPFSYDPVFLRMQYTGSFIDLLSPFALLSGVIAIFMVTCHGAAYLNLRTKGIIKTRAQKALRLFAWCYLIAFALAGLLITYKIPGYLLGSQAGSIHDPLINHVNRHVGAWLNNYHTHHWMVLAPVIGFLGAFLAIISTHANRAIWSFIGTSFIQIGTLLTAAFSLFPFIMPSSSDPAHSLTVWNASTSQHTLTIIAIVAVIMVPIIFCYTSFVYIKMWRDGPIHEKDIEKNQHILY >NZ_CP039240.1|WP_155080367.1|1450747_1452349_-|cytochrome-bd-I-ubiquinol-oxidase-subunit-CydA MLPIEHVVELSRWQFGITALYHFIFVPLTLGMTWILFGMECLYVKTGKQVYKDMVRFWGKLFGINFAMGVVTGITMEFEFGVNWAYYSQYVGDIFGAPLAIEGLVAFMLESTFFGIFFFGWDKLSKKQHLFATFCLAIGSMFSALFILIANGWMQHPVGSQFNIDSMRMELTSFYDVLLNPTAQAEFAHTITAGLVTAAMFVTGISSYYLLKGRDIVFAKRSFIYGSFFGLIVLLGVAFFGDHAGLDVDETQPMKMAAIEGLWETPEAPAPWTILALPSNNQLKNLAAIKIPYALSIIATHSLDGTVKGMQEIIADNVVRMTQGRKAYLALIELRTEKNIDGKTLSAEQLTTAKHTLERYKDDLGYGLLLKSYISDIQHASEAQIQHVAKQAIPEVWAVFYSFRLMIGCFGIMLLIVLAAGFFNLRGKLWEQRWLFRTALYAIPLPFLACLFGWFVAEHGRQPWVVQNTLPTAMGTSSVSTGQLTFSLTGFALFYTLLFIIEIYLMFKYARLGPSALHTGCYHFEQPAHVNKS >NZ_CP039240.1|WP_017378241.1|1452819_1452996_+|hypothetical-protein MIDSIDTAMAQLTHNSGSFATFTSAGVVRRALTQAGFVVKKIPGFAGKREMMRGWETI >NZ_CP039240.1|WP_155080368.1|1452992_1454270_+|FAD-dependent-5-carboxymethylaminomethyl-2-thiouridine(34)-oxidoreductase-MnmC MTMLVEGNYAPWNRLAASVTSPNVIVVGAGIAGASTSWALSTQGFNVTLVEKAAEAAQEASGNLAGLMMPALATDQSSFAEYFIQAYLYSIQHAKTLAQSHQFNFSQTGIIQLAFNDRQQKRQKNWLELEHVADLLEWVSQEQVMALSGLDFSCSGVYFKEAAWLSPYLYVKSHIHACKTSINCLFNCYVNQLHYEQGLWKLYDQHQHLIAEAPTLILANASDATRLLGQFSSVLPLSLRTVRGQVSALENHARISQLKLPVCYDGYITPVINGKNYLGATFIDDYQAKCLHQDRVQNIQQLKQVLPGLNIDKREYKDISQDRAALRCITTDYLPVIGPVPDVAFYRQHYSRLIQDRRESRYPSAQYLPGLFMNIGHGSRGMVSAPFATKLLVSELMGKNLKLSKRLREHLHPGRFLIRQLKKGK >NZ_CP039240.1|WP_155080369.1|1454625_1455039_+|hypothetical-protein MPINIKQSLKRFQAQDALQASGSFLKKGLPEGTNQADFIKAVNREIQIVIDGMQSIVRNNQPSASSYRGEDSVSGLLELQFLLSQLIAEPKQAISKAFLTLIASIIYQYYKQTEIYSKKMENEGWLYLRKKYQKKRF >NZ_CP039240.1|WP_155080370.1|1456403_1457084_+|hypothetical-protein MGIISIVRKNPSEPESNEFIFVAATTATASSGQEDHGLLHSSRNFKQENNFSYSGLKGVSSATTQTNSKNLIHIINQKIQSTIDEISEKKVNLCFKTAIRKKSVKELKNLQNVLEIIFTEPEEKLTKEFVQLIQEKISQAYEEKITYKNKRLVCCLFDELKQDLSALHCSIDSLSAGLSVANVSDKSQVQQCESVQSPMLFHQQHEQNLQPVDRDRSCYVMYETSV >NZ_CP039240.1|WP_155080371.1|1457326_1458208_+|hypothetical-protein MDLDENAFSYHKKNKRMDQEVDVGCFHILNVKKMNYHKSSGIFFVDKIAFLEVKKFLDNGHDLQVVTAGAYPPEMISKVFNELGIDIKLQHGENYFNRFDFGVGGSGALNKQEFIDKHLNNNKAMLIDDQFCNQPKAKEGVLFTLTLPSRPFPTLVAIDKQLVLNLQKVGIDYDEIWKHAKDNLELQALAATTVSSVEGWQKAKQFIVVKSALESFNPAQSYQTPFSLITVNKRENLRDLRGLCSAVAASEEHSGLLVGELARLLNLPSNNALKLEICPEGNAVSMNDIVKTL >NZ_CP039240.1|WP_155067991.1|1458202_1458619_-|transposase MPRKRGYSQKGTRCYGVHNWHEKGRINVIGALLGKLLLTVSLFTGSINSDVFYAWLVKDLLPKLPAHSVIVMDNARFHKRSDMIEAIEEQGHTLEYLPSYSPDLNPIERKWAEAKAIRRKYHCSIEDLFLEHLHYVNL |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP039240_3 | 3.1|1444334|31|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder | 1444334-1444364 | 31 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 85746-85776 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039240_3 | 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder | 1444391-1444424 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83226-83259 | 3 | 0.912 |
NZ_CP039240_3 | 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder | 1444391-1444424 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 84366-84399 | 3 | 0.912 |
NZ_CP039240_3 | 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder | 1444391-1444424 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83076-83109 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039240_3 | 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder | 1444391-1444424 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83106-83139 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039240_3 | 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder | 1444391-1444424 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83136-83169 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039240_3 | 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder | 1444391-1444424 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83166-83199 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039240_3 | 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder | 1444391-1444424 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83196-83229 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039240_3 | 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder | 1444391-1444424 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83256-83289 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039240_3 | 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder | 1444391-1444424 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83286-83319 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039240_3 | 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder | 1444391-1444424 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83316-83349 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039240_3 | 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder | 1444391-1444424 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83346-83379 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039240_3 | 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder | 1444391-1444424 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83376-83409 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039240_3 | 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder | 1444391-1444424 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83406-83439 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039240_3 | 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder | 1444391-1444424 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83436-83469 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039240_3 | 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder | 1444391-1444424 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83466-83499 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039240_3 | 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder | 1444391-1444424 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83496-83529 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039240_3 | 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder | 1444391-1444424 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83526-83559 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039240_3 | 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder | 1444391-1444424 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83556-83589 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039240_3 | 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder | 1444391-1444424 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83586-83619 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039240_3 | 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder | 1444391-1444424 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83616-83649 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039240_3 | 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder | 1444391-1444424 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83646-83679 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039240_3 | 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder | 1444391-1444424 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83676-83709 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039240_3 | 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder | 1444391-1444424 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83706-83739 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039240_3 | 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder | 1444391-1444424 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83736-83769 | 4 | 0.882 |
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NZ_CP039240_3 | 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder | 1444391-1444424 | 34 | HQ634177 | Synechococcus phage S-CAM1 genomic sequence | 17036-17069 | 9 | 0.735 |
1. spacer 3.1|1444334|31|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039048 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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4. spacer 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039048 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.882
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25. spacer 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039048 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.882
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26. spacer 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039048 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.882
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90. spacer 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder matches to KU686195 (Synechococcus phage S-CAM1 isolate 0810SB17, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
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94. spacer 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder matches to KU686192 (Synechococcus phage S-CAM1 isolate 0309SB33, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
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95. spacer 3.2|1444391|34|NZ_CP039240|CRISPRCasFinder matches to HQ634177 (Synechococcus phage S-CAM1 genomic sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
8320 : 67215
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039240|8320:67215|DBSCAN-SWA 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54 | unidentified_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
75064 : 126950
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP039240|75064:126950|DBSCAN-SWA AATGTTAAACCTTGCTGACATATACACAGACTATCTAATCGCTCAAAACAAACATGCAACAGCTACCGGATTAGCAGATTTAATGCCTGACGAATTGTCACATGATCAGATAACTCGCTTATTGAATAAAACCCCACAAACATCAAAAGACCTTTGGTTAAAAATTAAGGCTGATGTTCGTGAGTATGAGGGACTTGATGATGGAGTTTTAGCCTTAGATGATATGATTGCTGAAAAACCCTACAGCGATGAAAATGATATTATCGCCTGGCATTATGACCATAGTAAAGGTCGAACAGTGAAGGGCATTAATATCTTGACAGCGATGGTGCGCTACGGAGACGTACGCTTGCCTATCGCTTATGAAGTGATAGAGAAAACCATTCGTTATAGTGACCTTCAAACCAAAAAAGAACGAAGAAAGTCTTCTTTTACAAAAAATGACCTTTTTCTAAAACTTCTGAATGTCGCTATTCGTAACGACTTAAAGTTTGCATATGTGCTTGCAGATCGCTGGTTTAGCAGTCAATCAAATATGAGCTATATCCACAATGTTGGAAAGAAATTTATCATGGGAATCAAAAGTAATCGATGTGTCGCACTGACTGAAAAAGATAAAGAGAATGGTAAGTATCAACAACTAAAGCAAATATCATTAGAAGACGGCATTCCTCAGACTGTGTACTTAAAAGGTATGGCTTTCAAAGTACAGGTTATGAAAAAAACATTCAAAAACGAAAATGGTAAGGAAAGTGTCTTATATCTAGTAACTAATGACTTGAGTATTGATGGCCAACCCATCCTGGATACCTATAAAAAACGCTGGAGTATTGAGGAATTTCACAAGTCAGTAAAACAAAATTCGAGCTTTGAAAAGTCACCTACGCGGATTGTCACATCTCAGTTGAACCATATTTATTACAGTATTCTTGGGTTTTGCAGATTGGAAAGATTAAAATTGAAAAAATCTTTAAACCATTTTGCAATAAAATATAAGCTGATATTAAGGGCTAATCAAATTGCACTTCAGGAGCTTAGAAGTATGGTTTAAAGGTTAAGCGCGTAACATGAGTAAGTTAAAAGAAAAGAAAGGGCTAACTTATGAGGAAGTTTCAGAGCTCTTTGGCGTTTCAATGAGGACGCTGTTTCGATGGAATACAAGAATAGAAACGCCCTCCGTCACATGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATCCATACAGATAAACTCTCTAGTTTGTCTTTTTGACTTATGAGGGTAGAGATGGTTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAAGGAGACTCGTTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGCGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGACAGGCTTTTCAACAAATTTCAGAAGCGGCAAAAATGTTGATTCATCAGCGGTTAAGGACTCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAAGAACTTATACGTGAGCATAATATTCAGGTGAGTGAGAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCAGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCAGGAAAACCTTATAAGAAGAAGGTGAGTCGTGGTGATCAAACAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACAACGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGTGACCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCAAAGACGGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGACTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACCTCTGACAACGGAACAGAGTTTGCGGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCATTGAAGCAGGCTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAGCACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACGGATTTTAATGAAATTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATCGCTCACCTAATCATATTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGAAATAAAAAAGAAGGCACCAAAACCTCGAGTGATTAACTTAGAAGAGCTAAAGAATGATGTAAAAAATTATCCGGATAGTTATCAATGGGAACGTGCGCAACGTTTTGGTGTAAGTCAACACTGTATTCAGCATTGGTTGAATTTCCTTGCAATCAGCTGTAAAAAAAACACTAAAACACCCAAAAGCCAACGAAAATACACGTACAAGCTTCCAGAATAAAATCAAGCGCTACGCCGGCTATGGTCGACCCATTGTTTATTTAGATGAAAGTGGTTTTGCAACAGATATGCCAAGAAAGCGAGGCTACTCCCAGAAAGGAACGCGCTGTTATGGTGTTCATAACTGGCATGAAAAGGGTCGTATTAATGTCATTGGTGCCCTCTTAGGGAAGTTATTATTAACAGTCTCTTTATTTACTGGGTCAATTAATTCTGATGTGTTTTATGCATGGCTAGTTAAAGATTTATTGCCTAAATTGCCAGCACATTCAGTAATTGTTATGGATAATGCGCGCTTTCACAAACGCTCTGACATGATTGAAGCGATTGAAGAGCAAGGGCATACACTTGAGTATTTACCATCTTATAGCCCTGACCTTAACCCGATTGAGAGAAAATGGGCAGAAGCTAAAGCCATTCGAAGAAAGTATCACTGTAGTATCGAAGATCTTTTTTTAGAACATCTACATTATGTCAATTTATAAGGTTTTAACTATAGTTAGCGTTTACTTGCACAGTGCCATTTTTTTTAGCTTGGTGAGCAAAGTGATAAATGAAAATTTTGTTTTTGTTTTTATATTTTAAATACATATGAAAATATATCTGATATAAATTAATTTATATTTAAATAAATTTTATTTAATCGTTAATTAATGTTATTAATAAGTAAATTAAATGACTGGCTAATGAATAACCAGTCTATTAAAATAGGTTAAAAGTATAGTCTTTATTTAGTTAATTTTTAACTTTTATTTCAATAACATCAAAAAGTGTGGCTAAAATATTATCACTATACTGTGCATCAAGTTGGCGTACACAGGTGGGGCTGGTCACATTAATTTCCGTTAAATAATCACCGATAATATCTAAACCGGCAAATAACACACCTTTTTCTTTGAGCATGGGGCCAATTGTTTGGGCGATTTCTAAATCGCGTTCGCTTAATGCTTGGCCGATACCCGTGCCGCCGGCGGCAAGATTAGCGCGGCTTTTATCATCTTTTGGAATGCGTGCTAGGGCATAAGGGTAAGAGCTGCCATTAATGATTAAAATGCGTTTATCGCCGTATATTACCTCAGGAATAAACTTTTGTACCATTAATGTTGTACTGTGATTTTTGCTAAGGGTGTCTAAAATAACCTCAAGATTAGGATCGCCTTTTTTTACTCTAAAAATAGATTCTCCACCCATTAAATTAAGAGGCTTAATTACTATTTCATCATGTTGATTTGAAAATTTAATAATTTGAAGTTTGTTTTTTGTAATTAATGTTGGTGTGCAGAATTTGGCATAACGGCTGATAGTGAATTTTTCATTCAAATCACGCAGACTTTGTGGTTTATTGACGATCAATACACCTTGAGTTTCTAATTGCTCAAGCATATAGGTGGTATAGATATATTCTAGGTCAAATGGTGGATCTTTACGCATGAGTATAACGTTGAGTGTACTTAAATCCAGTGTTTGCTCTGATTCTATATGATAAAAATCATGAGGCTGATCTTGCACGGTGACTTGCTGACAATGGGCATAGACTTTACCATTAGTACTATAAAGTGCATGTTGTTGAATATAGAAAATATCATACCCTCGTCGTGAGGCTTCTAACATCATGGCAAAACCGGTGTCTTTTTCAGGAATCACCTGATTAATATCATCCATGATAATGCCAAGCTTAATGTTACTCATGAGGGTCTCCTTTTGAAAATGACTGTAGTTTTTATTGCTGTTATTTAAATAAATTTTTCAAGCAGGCTATTTAAAAACTGCCTGCCCTTAAAGCTTGTGCAGATTGTATCTGGATTTGCACTTAATAAACCTTGTGTTTGTAATTGAGTTAATTTGGGTTGAATGGTGCTGAATGCTAATCCTGTACGTGTAGAAAAATAGCGTGTTGGTACACCCGTAGTTAAACGCAGTGCATTCATCATAAATTCAAAAGGTAAATCTTCAGGTTTTATTGTTTGTGATCCTGCCAGTAAATTTTGCTTTGAATCTAGATAGGCTTTGGGGTGTTTTAGTTTCCAGCGTCGTGTAATGTTATTTTGCTTAATTGATGTAATTTTACCATGGGCACCGGCACCGATGCCAAGATAGTCACCAAATTGCCAATAATTAGTATTATGTTTGGCTTGATGTTGATCTTGACTATAAGCAGAGATTTCGTATTGGTGTAACCCTTGCTTTTTTAATAACTCTTGACCTGTTAATTGCATCTGCCAAATGGACTCATCATCAGGTAATTTAGGGGGCCGTGCATGAAATAGCGTATTGGGTTCAAGAGTAAGTTGATACCAAGATAAGTGAAGAGGTTTTAAAGCAATCGCTTGTTTTAAATCAGTTAAGGCTTGATTGTGAGTTTGGTTAGGTAGGCCATACATAATATCGATATTAAAGCTGTTAAAGCCGGATTGATGAGCAATATCGATGGCTGCAAAAGCGTCTTTGCTGTCATGTACTCGCCCTAAATTTTTTAATTGACTATTGTTAAAGCTTTGAATGCCG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52 | Hokovirus(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
197092 : 242060
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP039240|197092:242060|DBSCAN-SWA 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54 | unidentified_phage(80.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
282538 : 314841
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP039240|282538:314841|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP039240|282538:314841|304683_305142_+|WP_155068444.1|DBSCAN-SWA MEQLLNQLQYWHWLSFGIVLIVLEVLGAGGILLWSGVAALIVGIILWAVPIAWEIQLLLFAVLSIAAVIIWRMYWKKHPEKVERPHLNQRAQRLIGHEFILPALLSPGESIQVKIAGTQWKVVSEVKITVGRKVRVAQVLANEVHVQAVDES >NZ_CP039240|282538:314841|307939_308914_-|WP_155079726.1|transposase|DBSCAN-SWA MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSFRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEAAKMLIHQRLRTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039240|282538:314841|289809_290196_-|WP_155079708.1|DBSCAN-SWA MILLLFLHEKYSRILELQAYSQDLRERVIEAYKDGLSRREISTLFKVHYDTACEWIRRYLSTGDYSSKQGVGCGAQIRFNDKQTILDFIKKNPDTNGIAIRDGIAPDLPMSTFYDALKRLKVTYKKRA >NZ_CP039240|282538:314841|311529_312579_+|WP_155079733.1|transposase|DBSCAN-SWA 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29 | Faustovirus(25.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
426369 : 435829
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP039240|426369:435829|DBSCAN-SWA TATAAAAAAAGAGCCTAAGTATAAGCAAAGACGTGACGCCGAAAGATCTGAATTTATAGAAAAGCTAACAGGAATTGATTTGAGCCAATTAGTTTATCTTGATGAGGTTGGCGTTGATGATAATATCGTTGTTGAATATGGCTGGTCAGCTGCCGGAGTGCGAAGTTATGCTGAACAAGCAGGCTTCAAGAGGAAAAGGTTAAGCCTTGTTGCTGGCTTGAAGTATAGTGATAAAAGTTTGGTTGCTCCTTTCGAATTTTCAGGTGCAATGAATAAGGATTTGTTTTTAGGCTGGTTTGAACAGGAATTATGTCCGAAGCTAAATCCTGGGCAAGTAATTATCATGGATAATGCAAGCTTCCATAAAAGCCCTGAACTTTATGATATGGTTGAAGCTGTTGATTGTGAACTATTATACTTGCCAGCCTACTCACCAGACTTAAATCCAATTGAAAAATTCTGGGCTAATTTTAAACGAAATATAAGAAAGGTGATTAAAAAACATGAGCATCTTTGCAACGCAATTACTGACGCATTAATTAAGACTCTTCCGGGTTAGCTATATGAACACCATAACAGCGCGTTCCTTTCTGGGAGTAGCCTCGCTTTCTTGGCATATCTGTTGCAAAACCACTTTCATCTAAATAAACAATGGGTCGACCATAGCCGGCGTAGCGCTTGATTTTATTCTGGAAGCTTGTACGTGTATTCTCGTTGGCTTTTGGGTGTTTTAGTGTTTTTTTTACAGCTGATTGCAAGGAAATTCAACCAATGCTGAATACAGTGTTGACTTACACCAAAACGTTGCGCACGTTCCCATTGATAACTATCCGGATAATTTTTTACATCCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTGGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGCAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGATTCTTTAGCTCTTCTAAGTTAATCACTCGAGGTTTTGGTGCCTTCTTTTTTATTTCTATTCTTGTATTCCATCGAAACAGCGTCCTCATTGAAACGCCAAAGAGCTCTGAAACTTCCTCATAAGTTAGCCCTTTCTTTTCTTTTAACTTAAAGACCTTCCGTCTGAATTCAACTGGATATCCCATGACACACTCCTTGTTTAATTCTACAATTATTCAATCGCTAAGGGTCTGATTCCCCGCAGCTTGCTGCGAAAAAAAACAAAGCGCATTACGACCCGAAGGGGTAATTTTCCGAAATACCTCGTAGCTTGCTGCGAGGATAGGTAAATTGAGTTTTGCGCAAATTTATTAAGTTATTATGCCATATATTTAGGATTTAGCTATATTAACTCTATGTTGACATAAACATAAAAATTATTGAAGTTTTCCTGGTTATAAAATATACATTTTTATTTCAAAATATTAACATAAATATTAAATGCTGAATATTTTAAGCTTTTGGGGTTTAAAAATAGTAGCATGATTTTTTTTATGCCTATTGTTGTTAATAAAAGAGGAAATTAAATAAAAAATTAAGTAATAATATTGTCATGTATTTTATATGTAGAGTAAAAATAGAATAAATCAAACTTAATCTTGCTGCTATTAGTGTGTAATGTCCAAATTATATTAGTAAGTATTTTAAGTATGTTAATAAAAATAATATTGGAGATTATGTAATGCCTAGAGCTAGAACATCAAGAAGGAGAGCGTCGTTATTTTCTTTGTTAGGTCCGCGTAGATCACGAACAACCTACCAAGCAGGAAGTTCAACTGCCAATAAATTTTATTCTCTTTTAAAAGAGAATGGAGAGGAAATTTTCAGAGAAAATGACCTTTATCTATCAATCTCTGAACCAAAAGCATTTTCCAGCGAAACGAACAATGCTCAATATATTTCTATTGATTTGCTTAATGAAACTTTAGGAGTATCGGATTTTCATTTAACTGTATCTTCTTTTTTTAAGAAAAGATCTGATCAGGGTGCTGCAGAGCTGAAGCCACTGGAAGGTCATATACATTGTTCTTTAAAATATTGTGATCAAGAGGGTGATATTCATGATATAAAGTTATATTACAGGCATCAGCCAGGAGAAATTCCTAAAATTGGCTTGGTGGCCAATAAAAGTGGCAAACCATTGGATCCGGAAATAAAAAGGCAAATAAAAGCACAAGCTATTGCAGCGATGATGCCATTAATTATTAAATTGGATCAATTTTTACAGGATTTTGAGCATAGAAAAGTTGATTTAGAAAGTAGAATAACAGAGGCAAATACTCAATTAGCCACTGTCACAGGATTATCTGAAAAACTGCACTTTGCTCGAGAAGCTCGCGCTTTATATCAACAATGGTTTCAGCTTATAGGTGAAGAAGATTATAAATATGTAAAAAACCTTAGAAATAATGCTTTACCACGGACCGATGCTGATGGTTATACCATGCAATCGACTAACAGTCGTTTAACTAAAGATAAGCTTGATGAAATATTGAGAGCGACTTTTAGGCAATGGTTGAGTAGTCTTCACAGTATTATTAAACAGCTGGAAGCTGAACATGCACAATCATCAAGGGGTCATAAATCTTCTACTAGTGCAGTGGCAAGGCGGTATAAAAAGCCTAGAGGAAGAGGAAAGAGAAAGGCGGCTAAAAAGACAGCACCAAGACAAGAAGAAACATTGGAAGATTATTTAGAAAAGGCAGGTAACTGGGTTGCTGCTTATCTGCAGCTACAAGGGGCATTAAATCGTGGAGATTTTCCTATATTTAACCAGCTTTTGCAAGGAAGAATGTTTAAAAATAAATGTATATTATTTTATCTTGATTCAGAATCTTTAGGAATACGCCCTCCGTCATATGAAGTGCAACACCACTCTACACTAAGCCGCCATTAAATTCTCTAAAAAAACATGATTAGGTGCGCGATAATCTAAACTCGCCCTTCTTCTCGCATTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTTAGCATCACTTATTTCATTAAAGTCTGTTCCTTTAGGAAGAAAACGCCTAATCAAACCATTCGTGTGCTCATTTAGGCCTCTGTCGCAAGAGCGATAAGGTCTAGCAAAGTAGAAATCAGCATCAGTAATCTTTGAAATATCCTCATGACCAGCGAATTCTGTCCCGTTATCTGAGGTAATCGTTTTAAAGTCAAAGAAAGTTGAGGCGACTATACTTCTGAAGGTCTCAACAACGGTTTCTGCACATTTGTTAGCCATTTTCCTTATACAACACATCTTATTGGCTTTATCAACAAGGGTTATAGCTGACACGGTTGAGTTAACCTTTTGATTTTGCTATTATTCTTACATGAAAAATATAGCAGGATTTTAGAATTGCAAGCTTATAGTCAGGATTTGCGAGAGCGCGTTATTGAAGCTTATAAAGATGGGCTTAGCCGAAGAGAAATATCCACTCTTTTCAAGGTGCATTATGATACAGCTTGTGAATGGATTCGACGTTATTTATCAACAGGTGACTACTCTTCAAAACAAGGAGTTGGCTGTGGCGCACAAATAAGGTTTAATGACAAACAAACTATTCTAGATTTCATAAAGAAAAATCCAGATGCAAATGGGATTGCCATTCGTGATGGCATTGCTCCTGACCTCCCTATGTCAACCTTTTATGACGCATTGAAACGATTAAAAGTCACATATAAAAAAAGAGCCTAAGTATAAGCAAAGACGTGACGCCGAAAGATCTGAATTTATAGAAAAGCTAACAGGAATTGATTTGAGCCAATTAGTTTATCTTGATGAGGTTGGCGTTGATGATAATATCGTTGTTGAATATGGCTGGTCAGCTGCCGGAGTGCGAAGTTATGCTGAACAAGCAGGCTTCAAGAGGAAAAGGTTAAGCCTTGTTGCTGGCTTGAAGTATAGTGATAAAAGTTTGGTTGCTCCTTTCGAATTTTCAGGTGCAATGAATAAGGATTTGTTTTTAGGCTGGTTTGAACAGGAATTATGTCCGAAGCTAAATCCTGGGCAAGTAATTATCATGGATAATGCAAGCTTCCATAAAAGCCCTGAACTTTATGATATGGTTGAAGCTGTTGATTGTGAACTATTATACTTGCCAGCCTACTCACCAGACTTAAATCCAATTGAAAAATTCTGGGCTAATTTTAAACGAAATATAAGAAAGGTGATTAAAAAACATGAGCATCTTTGCAACGCAATTACTGACGCATTAATTAAGACTCTTCCGGGTTAGCTATAACAAGTAAGATTTGTGATCTCGACCTACTATGGTATCAATTTCAAAATGTCCAAATTCAGTCTTTTCGTCAGCAATAGCGGGCCTTTGTTCAATACCAACGCGGTTCGGTATTTTAGTTTTATCACCACTTTTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCAGAGTGGGGCAGGCTTTTGTAAAGCTCTCCTCCTTTCTCTCGATCCTCATGAATATAACGGTAGATGGTGCTCTCACTCACTTGGATATTATGCTCCTGTATAAGCTCTTTACTAATAACATCGGGTGACGTATGGGTGCTTAACCGCTCATGAATTAATACTTTTGCTTTCTCTGAAATTTTCTGAAAATCCTGCCCTTGCTTAGCATTAGACCGTTTTTCTTGCGCACAACGCGAGGCCAAGCGATGGCAATAAAGACCGTTAAAATCGCTTGGGGTATGCCGTTTAGTCTCACGACTGACTGTGCTAGGAGCAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTCATGGAGTCCCCTTCTGATAAACGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAGCCATTTGTACCC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP039240|426369:435829|431663_432749_+|WP_155079806.1|DBSCAN-SWA MMYHLIDVAYKENKDKFYAWFFVNLHGQGVSCLDNEQIVKLDFGKRMFWLEPLKRAACMGLSSLTRAFIKAGVKDRLTSVRYVLKKDEGKDEKGRCDVTACDFIVEDIVCGERLEDEELEAERLVEQSELLLALCNSHGPKEMGHAVATGAQIFRQLMQSEGGNKEEKTALLVDCLAKIFMVNRIFKIFKEEKKHTAPDSALVGAVYRNVGNVAKKLQGGRTQRNPRLAVARKLEEIRAWMALLKFAIHDAVCRYSRPGEKAGLIGHVVKQIDDFKQRYQPGMTLRADLDKGSQGQDQTVEFNPVHIVEIMVGKLLKLFPVDSVSVDKIVECIKAQVLFAFEDVEFNVLTHVTRLTFKPYF >NZ_CP039240|426369:435829|427388_427691_-|WP_155066524.1|DBSCAN-SWA MGYPVEFRRKVFKLKEKKGLTYEEVSELFGVSMRTLFRWNTRIEIKKKAPKPRVINLEELKNRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP >NZ_CP039240|426369:435829|430226_430784_+|WP_155079478.1|transposase|DBSCAN-SWA MKKEPKYKQRRDAERSEFIEKLTGIDLSQLVYLDEVGVDDNIVVEYGWSAAGVRSYAEQAGFKRKRLSLVAGLKYSDKSLVAPFEFSGAMNKDLFLGWFEQELCPKLNPGQVIIMDNASFHKSPELYDMVEAVDCELLYLPAYSPDLNPIEKFWANFKRNIRKVIKKHEHLCNAITDALIKTLPG >NZ_CP039240|426369:435829|430784_431360_-|WP_155079805.1|transposase|DBSCAN-SWA MAYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSMRSIARALGFAPSTVSRETKRHTPSDFNGLYCHRLASRCAQEKRSNAKQGQDFQKISEKAKVLIHERLSTHTSPDVISKELIQEHNIQVSESTIYRYIHEDREKGGELYKSLPHSGKPYKKKVKSGDKTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTIVGRDHKSYLL >NZ_CP039240|426369:435829|428272_429442_+|WP_155079804.1|DBSCAN-SWA MLGPRRSRTTYQAGSSTANKFYSLLKENGEEIFRENDLYLSISEPKAFSSETNNAQYISIDLLNETLGVSDFHLTVSSFFKKRSDQGAAELKPLEGHIHCSLKYCDQEGDIHDIKLYYRHQPGEIPKIGLVANKSGKPLDPEIKRQIKAQAIAAMMPLIIKLDQFLQDFEHRKVDLESRITEANTQLATVTGLSEKLHFAREARALYQQWFQLIGEEDYKYVKNLRNNALPRTDADGYTMQSTNSRLTKDKLDEILRATFRQWLSSLHSIIKQLEAEHAQSSRGHKSSTSAVARRYKKPRGRGKRKAAKKTAPRQEETLEDYLEKAGNWVAAYLQLQGALNRGDFPIFNQLLQGRMFKNKCILFYLDSESLGIRPPSYEVQHHSTLSRH >NZ_CP039240|426369:435829|434023_434998_+|WP_155079809.1|transposase|DBSCAN-SWA MAYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSMRSIARALGFAPSTVSRETKRHTPSDFNGLYCHRLASRCAQEKRSNAKQGQDFQKISEKAKVLIHERLSTHTSPDVISKELIQEHNIQVSESTIYRYIHEDREKGGELYKSLPHSGKPYKKKVKSGDKTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTIVGRDHKSYLLTLVDKANEMCCIRKMANKCAETVVETFRSIVASTFFDFKTITSDNGTEFAGHEDISKITDADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDAKIAKIEHTLNARRRASLDYRAPNHVFLENLMAA >NZ_CP039240|426369:435829|429856_430243_+|WP_155079476.1|DBSCAN-SWA MILLLFLHEKYSRILELQAYSQDLRERVIEAYKDGLSRREISTLFKVHYDTACEWIRRYLSTGDYSSKQGVGCGAQIRFNDKQTILDFIKKNPDANGIAIRDGIAPDLPMSTFYDALKRLKVTYKKRA >NZ_CP039240|426369:435829|435037_435829_+|WP_155079810.1|transposase|DBSCAN-SWA MIAWHYDHSKGRTVKGINILTAMVRYGDVRLPIAYEVIEKTIRYSDLQTKKERRKSSFTKNDLFLKLLNVAIRNDLKFAYVLADRWFSSQSNMSYIHNVGKKFIMGIKSNRCVALTEKDKENGKYQQLKQISLEDGIPQTVYLKGMAFKVQVMKKTFKNENGKESVLYLVTNDLSIDGQPILDTYKKRWSIEEFHKSVKQNSSFEKSPTRIVTSQLNHIYYSILGFCRLERLKLKKSLNHFAIKYKLILRANQIALQELRSMA >NZ_CP039240|426369:435829|426907_427126_-|WP_155079803.1|DBSCAN-SWA MQSAVKKTLKHPKANENTRTSFQNKIKRYAGYGRPIVYLDESGFATDMPRKRGYSQKGTRCYGVHIANPEES >NZ_CP039240|426369:435829|433672_433981_+|WP_155079808.1|DBSCAN-SWA MLNLADIYTDYLIAQNKHATATGLADLMPDELSHDQITRLLNKTPQTSKDLWLKIKADVREYEGLDDGVLALDDMIAEKPYSDENDRPPSYEVQHPVESSLP >NZ_CP039240|426369:435829|432732_433599_-|WP_155079807.1|transposase|DBSCAN-SWA MTAMVRYGDVRLPIAYEVIEKTIRYSDLQTKKERRKSSFTKNDLFLKLLNVAIRNDLKFAYVLADRWFSSQSNMSYIHNVGKKFIMGIKSNRCVALTEKDKENGKHQQLKQISLEDSIPQTVYLKGMAFKVQVMKKTFKNENGKESVLYLVTNDLSNKFAQNSIYLSSQQATRYFGKLPLRVVMRFVFFRSKLRGIRPLAIDGQPILDTYKKRWSIEEFHKSVKQNSSFEKPPTRIVTSQLNHIYYSILGFCRLERLKLKKSLNHFAIKYKLILRANQIALQELRSMA >NZ_CP039240|426369:435829|426369_426927_+|WP_155079478.1|transposase|DBSCAN-SWA MKKEPKYKQRRDAERSEFIEKLTGIDLSQLVYLDEVGVDDNIVVEYGWSAAGVRSYAEQAGFKRKRLSLVAGLKYSDKSLVAPFEFSGAMNKDLFLGWFEQELCPKLNPGQVIIMDNASFHKSPELYDMVEAVDCELLYLPAYSPDLNPIEKFWANFKRNIRKVIKKHEHLCNAITDALIKTLPG |
12 | unidentified_phage(100.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
439107 : 486785
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP039240|439107:486785|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP039240|439107:486785|460636_463117_+|WP_155079828.1|tRNA|DBSCAN-SWA MQEYQYDAKSVEASVQRFWQSSQSFLATEDQNKEKFYCLCMFPYPSGKLHMGHVRNYTLGDVVSRYQRMQGKNVMQPMGWDAFGLPAENAAMKHDVPPARWTYENINYMRDQLKSLGFGYDWSREIATCDPSYYRWEQWLFLQMYKQGLVYKKNAVVNWDPVDKTVLANEQVVDGRGWRSGALVERREIPQWFIKITDYADELLNDLDQLTDWPEQVRTMQSNWIGRSEGVEIDFKLEHKPDSVLTVFTTRPDTVMGVSFISVAAGHPLAQQAVESNPQLAHFLQECNTASVAEADIATMEKKGMASGFFAIHPLSGEKVPVWVANFVLMGYGTGAVMAVPAHDQRDYEFAHKYGLDIKQVIDAEGDLSKAAITEKGQLMNSAPFADGLDFQAAFKAISEHLETGQTGRVVVNYRLRDWGISRQRYWGAPIPMINCPSCGVVPVPESDLPVRLPEDVVVTGDGSPLKRLPEFVNTTCPECQGPAERETDTFDTFMESSWYYARFASFNSDQAMLDERASYWAPVDQYIGGVEHAILHLLYARFFHKVMRDQGLVSSDEPFKALLTQGMVLKDGAKMSKSKGNTVDPQALIERYGADTVRLFTMFAAPPEQSLEWSDTGVEGAYRFIRRIWTFACDYKERFIAHNQLGCNNFNKQSADYSGASDALLELRRDAHDVLKQALYDFERYQFNTVVAAGMKLANLWQRLPEEDGLSDTFAHELMGIILRLLSPIIPHVTQELWSTLAFGENISTVPWPQVDEAALVTHSIELIVQVNGKLRDRIQVATAANRAEIEGVALASEKVQSFIESKTVRKVIVVPNRLVNIVAN 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53 | unidentified_phage(28.57%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
508421 : 592013
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP039240|508421:592013|DBSCAN-SWA AATGTTAAACCTTGCTGACATATACACAGACTATCTAATCGCTCAAAACAAACATGCAACAGCTACCGGATTAGCAGATTTAATGCCTGACGAATTGTCACATGATCAGATAACTCGCTTATTGAATAAAACCCCGCAAACATCAAAAGACCTTTGGTTAAAAATTAAGGCTGATGTTCGTGAGTATGAGGGACTTGATGATGGAGTTTTAGCCTTAGATGATATGATTGCTGAAAAACCCTACAGCGATGAAAATGATATTATCGCCTGGCATTATGACCATAGTAAAGGTCGAACAGTGAAGGGCATTAATATCTTGACAGCGATGGTGCGCTACGGAGACGTACGCTTGCCTATCGCTTATGAAGTGATAGAGAAAACCATTCGTTATAGTGACCTTCAAACCAAAAAAGAACGAAGAAAGTCTTCTTTTACAAAAAATGACCTTTTTCTAAAACTTCTGAATGTCGCTATTCGTAACGACTTAAAGTTTGCATATGTGCTTGCAGATCGCTGGTTTAGCAGTCAATCAAATATGAGCTATATCCACAATGTTGGAAAGAAATTTATCATGGGAATCAAAAGTAATCGATGTGTCGCACTGACTGAAAAAGATAAAGAGAATGGTAAGTATCAACAACTAAAGCAAATATCATTAGAAGACGGCATTCCTCAGACTGTGTACTTAAAAGGTATGGCTTTCAAAGTACAGGTTATGAAAAAAACATTCAAAAACGAAAATGGTAAGGAAAGTGTCTTATATCTAGTAACTAATGACTTGAGTATTGATGGCCAACCCATCCTGGATACCTATAAAAAACGCTGGAGTATTGAGGAATTTCACAAGTCAGTAAAACAAAATTCGAGCTTTGAAAAGTCGCCTACGCGGATTGTCACATCTCAGTTGAACCATATTTATTACAGTATTCTTGGGTTTTGCAGATTGGAAAGATTAAAATTGAAAAAATCTTTAAACCATTTTGCAATAAAATATAAGCTGATATTAAGGGCTAATCAAATTGCACTTCAGGAGCTTAGAAGTATGGCTTAAAGGTTAAGCGCGTAACATGAGTTATTCATTAGAATTGCTTGCATAAGCTCGGCGATTTTATCTCGATTAATCGTATAGCTTGGATAGTTAGAGCCATAGACAGAGTAATGTGATCGAGTATTTGGTACTTTATTAATTAAAGAGTGGCTCTTAGGGCACGTTAGGAGTGTTTCATCAATATCATATACAAAAATCTTTTTTGGCATGGCTTTAACCTTCTTTCTTTTATTTCATTTAAAAGAGATATTCTATTGTTATATGGCAATAGTAGATTTTATGGTTCGCAATGTAGTAAAGGCTTTAAGCCTTGGATCTAAATTGGATGCGCCCTCCGTCATATGAAGTGCAACACCACTCTACACTAAGCCGCCATTAAATTCTCTAAAAAAACATGATTAGGTGCGCGATAATCTAAACTCGCCCTTCTTCTCGCATTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTTAGCATCACTTATTTCATTAAAGTCTGTTCCTTTAGGAAGAAAACGCCTAATCAAACCATTCGTGTGCTCATTTAGGCCTCTGTCGCAAGAGCGATAAGGTCTAGCAAAGTAGAAATCAGCATCAGTAATCTTTGAAATATCCTCATGACCAGCGAATTCTGTTCCGTTATCTGAGGTAATCGTTTTAAAGTCAAAGAAAGTTGAGGCGACTATACTTCTGAAGGTCTCAACAACGGTTTCTGCACATTTGTTAGCCATTTTCCTTATACAACACATCTTATTGGCTTTATCAACAAGGGTTAACAAGTAAGATTTGTGATCTCGACCTACTATGGTATCAATTTCAAAATGTCCAAATTCAGTCTTTTCGTCAGCAATAGCGGGCCTTTGTTCAATACCAACGCGGTTCGGTATTTTAGTTTTATCACCACTTTTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCAGAGTGGGGCAGGCTTTTGTAAAGCTCTCCTCCTTTCTCTCGATCCTCATGAATATAACGGTAGATGGTGCTCTCACTCACTTGGATATTATGCTCCTGTATAAGCTCTTTACTAATAACATCGGGTGACGTATGGGTGCTTAACCGCTCATGAATTAATACTTTTGCTTTCTCTGAAATTTTCTGAAAATCCTGCCCTTGCTTAGCATTAGACCGTTTTTCTTGCGCACAACGCGAGGCCAAGCGATGGCAATAAAGACCGTTAAAATCGCTTGGGGTATGCCGTTTAGTCTCACGACTGACTGTGCTAGGAGCAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTCATGGAGTCCCCTTCTGATAAACGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAGCCATTTGTACCCTCTAAGTCAAAAAGGCGAACTAGAGAGTTTATCTTTATGGGAGTGAACTCTCTACTGGGTGTTGCACTTCATATGACGGAGGGCGATGCTATTGTTTAGTTCTGTGGACTTTTAAATTTTTGCTTTGTTATTTAGCTAAAATAATTTTATATAAAATGAAAATATTTTGCAAATATTCATTTTTTAATTTTATTGTTATTTATGTACTGGCCTTTAAAGCTTATGGCACAAAGGTGGACGTGTGCTGCCATATTCACCACCCCAATCATCAGTCATTTGATTGCGAATATCCCAAAGTTCGGGGAAAAAGCGCATTTTCAGTCCTTTTTCTAATAAATCGGCCGAATGGCCTTTGAGTGACTTTGAGCTAAGGCCGAGTATACGTTGAACCAGTTGAATATGGCGATAGCGAAAATGCTGAAAAAGTTCATCAAATTCGGCTAATTGTTCAGCAAGAAGGTAAAGTTCATCATGTTGATAGTGGTCATCATAAATGTCACGCAAAGAAAGATTAGCAGGTATTAAATAATGTGTTTGAAAGCTCTGCCAGAGGGGCTTTGCCATTTGAATAATGACATGAAAACCTGGTGATTCTTGGCCGCTGCCATTGCCCAAGTTTAAACGGATACTTTGGTAGTCTTTAGGTGACATGGTTTCTAATAGTGCTAAATGATCGACCATGCTCTGTTGAATACGGTGAGTGCGGTTAAACAGAGTGAGTACCTTTAGGCTGTGTTTTGCAGCGAGCTGCTCATCAATCTCTAATAGAGTATAAGCGATGAGTTTCATCCATAATTCTTGAACTTGGTGAGTAATTTGAAATTGTAACTCATCATGATTGCATAGTTGGTCATAGGGTGTTTGGCATTGCAAAAGATCATGCCTGTTTAAATATTGCTCATAATCTGAGGCGTTATCACCTGCTATCAGAGCGTAAAAACTATGGCGGTCCATGCCATCTCCTTAGTATAACCGGATCTGTTTTTATTAGTTTATAAAAATAATTCTTTATTTGCCAATTAGTTACTTTGATAAATACAGCTAAATTGAGTTACCTTTAGCGAATAAAATATTGCACGGTTGCAACAACACGCACCTTTTTCATAATTTCATTATCACCGTATGAGCCATCAGCAGAGCGGATGGAAAACAATCCTTGAGAGGCATGGCGGATGCCTTTGAGGGTGCTGCGTGAGTTTTTAGCAAATGTTTGGGCGGCTTGTTCAGCGTTCTCAGTCGCTAGAGTGAGCATGCTGGGTTTGACCTGATTAAGGTCAGTATAGTTATAGCGTGTATTCGAGCTGGTGATAACCACACCTTGCTGGACTAACTCGCCTGTCGTTTGAGAGGCTTGACTGACACGTTGGACTTGTGTGGTTAGTAAGTTGACACCCGCTGTAGCACCATAGCGTGATTCAGGCTTGCGGCTGCCGTATTGATTGGCATTGTTATCTGTTACTGAAACGGTATCAAAATGAATGCTTTCTGCCTTAAAGTCCTTGTGTTTAAGAAAAGAGCTGATGTCTGCTTGTGCTTTGGCAATCTGTTGATACAGGCCGGGCAGTGAGTTGCTGCTGGTGGAAAAACGCAGTTGCCATGTGGCTTGATTAGCCGCAACGGTTTTTTCAGCTAAGCCTTTGACTGTGACATAGCGGTTATCATTGTGAAACAAGGTGAGACCAATGGCAACTAAAGCACCAGCGCCGATCATACCACCGGCAAGAATAAAGCTAGATAGAGTACGCATGATATTAGACTCAAAAGTTAATAAAATAGCCTTGATCATAAAATTAAATTGAATAAATTAGCAATCATATTACTGGTTTATTTTTTTATAGATGATGCCTATTAATCGATGTTATACCTTGTCTTTAGAGTTTATAGTGAAAATTATAAGGATGCGCCTAACTTTTTGAACTCTGCTTTTAAGTCTTTTTCGCTGCTAGTTTGCATGCTCACCAGTGTGGCAAGTTTGTCTAAACTATGTCGATTCGTATTTGTTTTTGCAATTTCTGCGAGCTCTTCAAGCTTAATTTCTGGACTTTCTATAATTAAGTCAAAAAAACGCTTTAATTTGATTTGGTCTAAATTATCTGGCTCCGGCTGTGGAATGTCTTTCCCTTGGTATTTTTTTTGAATTAATAACGCCCTCCGTCATATGAAGTGCAACACCACTCTACACTAAGCCGCCATTAAATTCTCTAAAAAAACATGATTAGGTGCGCGATAATCTAAACTCGCCCTTCTTCTCGCATTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTTAGCATCACTTATTTCATTAAAGTCTGTTCCTTTAGGAAGAAAACGCCTAATCAAACCATTCGTGTGCTCATTTAGGCCTCTGTCGCAAGAGCGATAAGGTCTAGCAAAGTAGAAATCAGCATCAGTAATCTTTGAAATATCCTCATGACCAGCGAATTCTGTCCCGTTATCTGAGGTAATCGTTTTAAAGTCAAAGAAAGTTGAGGCGACTATACTTCTGAAGGTCTCAACAACGGTTTCTGCACATTTGTTAGCCATTTTCCTTATACAACACATCTTATTGGCTTTATCAACAAGGGTTAACAAGTAAGATTTGTGATCT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95 | Acinetobacter_phage(28.57%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
599953 : 650272
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP039240|599953:650272|DBSCAN-SWA 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56 | unidentified_phage(20.0%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
656424 : 707051
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP039240|656424:707051|DBSCAN-SWA 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59 | Vibrio_phage(21.43%) | transposase,integrase | attL 656391:656450|attR 699428:700741 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
714944 : 747593
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP039240|714944:747593|DBSCAN-SWA 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42 | unidentified_phage(40.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
767767 : 803442
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP039240|767767:803442|DBSCAN-SWA GATGCCTTCTCCTTACAGTTATGACTTAAGAATTCGAGCACTAAAAATGATTGATGAAGGGATACCTATTACACAAGTTTCCAAGCTCTTAAAAATCAGTCGAGACACCCTGCATCGTTGGAAAAATAGGCGTGATCATACAGGAGACGTTAAAGCAAGATTTGGCTACCAAACGGGCTATAACCATAAAATCAGCGATATGGAGGAATTTCAAAAATTTATTGATCAGAATTCGGGTAAAACTCATCAACAACTCGCTGATCTTTACCCTGTAGAAATGAGTGCAAAAACCATGGGAGTGTGGATTAAAAAATTAGGCTATACCAGAAAAAAAAGAGCTTCAGATACCAAGAACGTGATGCATTAAAGCGGAAAGCCTTCCTGGAGAAAGTCGCAAAAATCGATAACGACAAAATTGTTTATATGGACGAAGCGGGTATGGATGATACTGAGCGTTACGCTTATGGCCACTCTGCTAAAGGTAAACGGTGCTATGCAGAGAAGCCAGGCAGCAAATCGATACGAATTAACTTTATGGGTGGTTTGCGCGGCAAGCAATTTATCGCACCGATGGTGGTTGAAGGTTATTGCAATAATAACGTTTGTCAGGCTTATATCGATCAATGCTTAATTCCCTGTTTATCTCCTGGAGAGACTGTAATCATGGATAATGCCTCTTTTCACAAATCAAAAGAGGTGAAGGAAGCGATTGAAGATGCGGGTTGTCACTTATTATTTTTACCCCCTTATTCTCCTGATTTAAACCCGATCGAGCATGTATGGTCACCGCTTAAAAATAGGGTTCGCATGAAGCTCGATCAAGATGAAATAAATTTAGAGGCAGCACTTAGTCAAGTAATGAAGTCAATGTCAGAAACTATTCGTTGAGCGCTATAGCCATATGCTGCAGTTAATGCTTTTTGTAAGTGTGGATTTGCTTTAAGGTTTTGCCAATTTTCACTGAGGTTGATGCCGGCATAATGGAGAGCTGTGAGTGCTTTTTCTAGGTCAGGGCTCTGGTCAAGCTCTTGGAAGTAGGTGCTAATATCTATATGCGGGCCTGTTAAGGTTTGTAATAGTTGATAATGGGCAGCACAAGGCTTTCCTGGCGCTTGAGAGTGCATGTATTTATCTGGAATAAAGGATTGCCAATGTACGTTGTGTACATTGTTTAATATGATACCTTACTTGATTAATTTCGCCATAAAATGGTTTGCCATTAATCAACGCCTGCAGAGAAATATCTTCTTCAGTAACCGCTCTGTGTAGAGCCATGATCTCATCCCATGAAGCGAACTTTCTATCTGCGGCAAAAACCTTTAAAACATTTTTTATGGTAGGTAAAAAACACTCTATATAAATTTTATTAATTAGCTTGTTGATTTCTTCAGGGCTTTCAGTTCCTGTTAGTTTGGCAGCATATGGAGTCGATTCTTCAAGTAAGAAATTTTTTAAGCCTCGTGTTTTTAATACTTCGGCTTTACTAAATATGCCATCAACATCTTCTTGTTGTAATTGGTTTGCAAGCTGTTGTTGCTGATTTGGCGTTAGCTGCTGATGTAAAACTTGTCGAACCTGCCAAGCAATAGGAGGGTAGTTGGGGCTATCAAGGGGAGAGTTTTTAAATTCGGATGAGGTTTGTTCTACAGCTTTAGCGCGTAGCTTGGCCCCTAGTATCTGCTGAATGAGGTCTCTGTTAACTTTTAGCTTAAAGTTTTCAGGTTTGAAGCATTCTTTTAAGATGAGCCTATCGGGTTGTACTAATTGTAATTTATCAAAGAACGACTCAGTGCTTTCTGGGTGTAGGCCTAAATATGCTGCAATTGAAAGCCCATAAGACAGGCGCTGCGAGCCATGGAGTGCAAGGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTGGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGCAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTAGCCACAATTGCCTTCGCCGAAATTTTCGACCAACTGATGGTTAGGCATAGTTTAATCTCTCATTTCTAGTCTTTACTTGGATGCTTGAAAAGCGAGAGTCTCACTTTATAAATACATGGAAAATAAAAAACAAACAATTAAAAAAATAATTTACTTTTAATTATCATTGATATAGTTAATTTAAGTTAATATTTATTATTTTTAAGATGCTATAGTTAAAACCTTATAAATTGACATAATGTAGATGTTCTAAAAAAAGATCTTCGATACTACAGTGATACTTTCTTCGAATGGCTTTAGCTTCTGCCCATTTTCTCTCAATCGGGTTAAGGTCAGGGCTATAAGATGGTAAATACTCAAGTGTATGCCCTTGCTCTTCAATCGCTTCAATCATGTCAGAGCGTTTGTGAAAGCGCGCATTATCCATAACAATTACTGAATGTGCTGGCAATTTAGGCAATAAATCTTTAACTAGCCATGCATAAAACACATCAGAATTAATTGACCCAGTAAATAAAGAGGCTGTTAATAATAACTTCCCTAAGAGGGCGCCAATGACATTAATACGACCCTTTTCATGCCAGTTATGAACACCATAACAGCGCGTTCCTTTCTGGGAGTGGCCTCGCTTTCTTGGCATATCTGTTGCAAAACCACTTTCATCTAAATAAACAATGGGTCGACCATAGCCGGCGTAGCGCTTGATTTTATTCTGGAAGCTTGTACGTGTATTTTCGTTGGCTTTTGGATGTTTTAGTGTTTTTTTTACAGCTGATTGCAAGGAAATTCAACCAATGCTGAATACAGTGTTGACTTACACCAAAACGTTGCGCACGTTCCCATTGATAACTATCCGGATGATTTTTTACATCATTCTTTAGCTCTTCTAAGTTAATCACTCGAGGTTTTGGTGCCTTCTTTTTTATTTCTATTCTTGTATTCCATCGAAACAGCGTCCTCATTGAAACGCCAAAGAGCTCTGAAACTTCCTCATAAGTTAGCCCTTTCTTTTCTTTTAACTTAAAGACCTTCCGTCTGAATTCAACTGGATATCCCATGACACATTCTTTGTTTAATTCTACAATTATTCAATAAGTTATTATGCCATATATTTAGGATTTAGCTATAGTTAAAAGTTGTTGTTTTATTTTAATTGAACATTATTAAATTTTCTATTTAAATAGTGCTAGGTATCAACACTCAAATTAATTATTGCGCCCTCCGTCATATGAAGTGCAACACCACTCTACACTAAGCCGCCATTAAATTCTCTAAAAAAACATGATTAGGTACGCGATAATCTAAACTCGCCCTTCTTCTCGCATTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTTAGCATCACTTATTTCATTAAAGTCTGTTCCTTTAGGAAGAAAACGCCTAATCAAACCATTCGTGTGCTCATTTAGGCCTCTGTCGCAAGAGCGATAAGGTCTAGCAAAGTAGAAATCAGCATCAGTAATCTTTGAAATATCCTCATGACCAGCGAATTCTGTCCCGTTATCTGAGGTAATCGTTTTAAAGTCAAAGAAAGTTGAGGCGACTATACTTCTGAAGGTCTCAACAACGGTTTCTGCACATTTGTTAGCCATTTTCCTTATACAACACATCTTATTGGCTTTATCAACAAGGGTTAACAAGTAAGATTTGTGATCTCGACCTACTATGGTATCAATTTCAAAATGTCCAAATTCAGTCTTTTCGTCAGCAATAGCGGGCCTTTGTTCAATACCAACGCGGTTCGGTATTTTAGTTTTATCACCACTTTTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCAGAGTGGGGCAGGCTTTTGTAAAGCTCTCCTCCTTTCTCTCGATCCTCATGAATATAACGGTAGATGGTGCTCTCACTCACTTGGATATTATGCTCCTGTATAAGCTCTTTACTAATAACATCGGGTGACGTATGGGTGCTTAACCGCTCATGAATTAATACTTTTGCTTTCTCTGAAATTTTCTGAAAATCCTGCCCTTGCTTAGCATTAGACCGTTTTTCTTGCGCACAACGCGAGGCCAAGCGATGGCAATAAAGACCGTTAAAATCGCTTGGGGTATGCCGTTTAGTCTCACGACTGACTGTGCTAGGAGCAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTCATGGAGTCCCCTTCTGATAAACGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAGCCATTTGTACCCTCTAAGTCAAAAAGGCGAACTAGAGAGTTTATCTTTATGGGAGTGAACTCTCTACTGGGTGTTGCACTTCATATGACGGAGGGCGTTGCTTTATAGCGCTTTGATATTTGATATATTTTATTTATAGCGCTCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGTGCTGCCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCGAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCGATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTCACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCATTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTATTATTGCAATAACCTTCAACCACCATCGGTGCGATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCCATAAAGTTAATTCGTATCGATTTGCTGCCTGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGGCCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAACTCATGTTACGCGCTTAACCTTTAAACCAT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41 | unidentified_phage(33.33%) | transposase,integrase,tRNA | attL 773018:773077|attR 803795:803933 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
878771 : 913349
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP039240|878771:913349|DBSCAN-SWA 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39 | unidentified_phage(37.5%) | transposase,integrase | attL 888014:888073|attR 897937:898676 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
933290 : 979282
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP039240|933290:979282|DBSCAN-SWA 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50 | Staphylococcus_phage(14.29%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
993379 : 1066527
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP039240|993379:1066527|DBSCAN-SWA 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57 | Pseudomonas_phage(18.18%) | transposase,integrase,tRNA | attL 978307:978366|attR 1070329:1071340 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1070329 : 1116043
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP039240|1070329:1116043|DBSCAN-SWA 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50 | unidentified_phage(57.14%) | transposase,integrase | attL 1074986:1075045|attR 1104336:1105295 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA') |
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DBSCAN-SWA_16 |
1129852 : 1229904
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_CP039240|1129852:1229904|DBSCAN-SWA 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114 | Leptospira_phage(21.43%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
1235503 : 1269410
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_CP039240|1235503:1269410|DBSCAN-SWA 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41 | Leptospira_phage(42.86%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_18 |
1289925 : 1359915
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NZ_CP039240|1289925:1359915|DBSCAN-SWA 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58 | Leptospira_phage(20.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_19 |
1364260 : 1411949
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_CP039240|1364260:1411949|DBSCAN-SWA 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43 | uncultured_Mediterranean_phage(36.36%) | transposase,integrase,tRNA | attL 1386957:1387016|attR 1392277:1392374 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_20 |
1458202 : 1697731
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >NZ_CP039240|1458202:1697731|DBSCAN-SWA 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250 | unidentified_phage(28.89%) | protease,transposase,integrase,tRNA | attL 1623427:1623486|attR 1658561:1659675 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_21 |
1723664 : 1766051
Sequences of DBSCAN-SWA_21
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21 >NZ_CP039240|1723664:1766051|DBSCAN-SWA ACTAAGCCGCCATTAAATTCTCTAAAAAAACATGATTAGGTGCGCGATAATCTAAACTCGCCCTTCTTCTCGCATTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTTAGCATCACTTATTTCATTAAAGTCTGTTCCTTTAGGAAGAAAACGCCTAATCAAACCATTCGTGTGCTCATTTAGGCCTCTGTCGCAAGAGCGATAAGGTCTAGCAAAGTAGAAATCAGCATCAGTAATCTTTGAAATATCCTCATGACCAGCGAATTCTGTCCCGTTATCTGAGGTAATCGTTTTAAAGTCAAAGAAAGTTGAGGCGACTATACTTCTGAAGGTCTCAACAACGGTTTCTGCACATTTGTTAGCCATTTTCCTTATACAACACATCTTATTGGCTTTATCAACAAGGGTTAACAAGTAAGATTTGTGATCTCGACCTACTATGGTATCAATTTCAAAATGTCCAAATTCAGTCTTTTCGTCAGCAATAGCGGGCCTTTGTTCAATACCAACGCGGTTCGGTATTTTAGTTTTATCACCACTTTTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCAGAGTGGGGCAGGCTTTTGTAAAGCTCTCCTCCTTTCTCTCGATCCTCATGAATATAACGGTAGATGGTGCTCTCACTCACTTGGATATTATGCTCCTGTATAAGCTCTTTACTAATAACATCGGGTGACGTATGGGTGCTTAACCGCTCATGAATTAATACTTTTGCTTTCTCTGAAATTTTCTGAAAATCCTGCCCTTGCTTAGCATTAGACCGTTTTTCTTGCGCACAACGCGAGGCCAAGCGATGGCAATAAAGACCGTTAAAATCGCTTGGGGTATGCCGTTTAGTCTCACGACTGACTGTGCTAGGAGCAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTCATGGAGTCCCCTTCTGATAAACGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAGCCATTTGTACCCTCTAAGTCAAAAAGGCGAACTAGAGAGTTTATCTTTATGGGAGTGAACTCTCTACTGGGTGTTGCACTTCATATGACGGAGGGCGCGATCTTTCTTTTCCCAACACCCTCAGCTAGAATACTATTAAATTCATTGATAATCATTAGCTATTAACTCGATCATAAATTAAAATATAAAGCAGTTCACATACATGAAAAACACGTTTTATCCTTCTGCTACAATTGCAATGCTAGCACTTACTCTTGCGGCCTGCACTACAACATCAACGATTCAAAAAAATAATGCACTCCAACATAATCAGGCACACCTAGCTTCAAAATCAACAGCAGCTTATGCAGTGACCCCTATTTCTAATTCTATTGCTAGCCTTACACCAATCACCCCAATAGAAAATTTAGCTGCCGGGCCGATCACCGAAGACCCAGATGTTGAACTATGGCAGCGTATTCGCCAACATTTTTCATTGAATCATTATAATAATATACCGCGAGTTCAATATTATATTCATTGGTACTTAAAGCATGCGAAAGATTTCAATACAAGTATAGAACGAGCAACACCTTTTCTTTATTATATCGTTGAACAAGTTGAAGAACGCCACATGCCCATGGAAATCGCTTTGCTTCCCTTGGTTGAAAGCGGCTTTCGCCCGAGTGTCTCGTCCAGCGCAGGAGCCTCTGGGTTATGGCAGTTAATGCCAATTACTGCCTCGCGCTTTGGTGTCAAACAAAATTGGTGGTATGACGGACGCTTTGATATTGGCAAATCTACCCGCTCAGCACTTAATTATTTACTCTATCTACATAATTTTTTCGATGGCAACTGGCTGCTTGCCTTAGCAGCCTATAACTCTGGAGAAGGAACAGTACAACAAGCTATTACTAAAAATATGCGCGCCCATAAACCAACCGCATATTGGAATTTAGCCTTACCACGAGAAACTCGCGACTATGTCCCTAAACTACTTGCCGCAGCCGCCATTATTGCTAATCCAGAAACCTATCATATTAATATCCCCCAAATAGAAAATAAGCCACAAATTATGCCCATTGATATGGGTGGACAAGTTAACCTTGCTCAAGTAGCAAAATATGCGGGTATCAGTGTCGATGAGGTGAATCGTTTAAACCCTGGATATACCCGCTTAATTACCTCACCCAAAGGCCCCCATATTCTTTGGCTACCCATTGCTGCGGCAAAACGCCTTGAAAGTCATATGAATCAACATCCGAAAAAACAACTGTTATCTTGGCACCGTTATCGTGTTCAGCCCGGTGATACCATCAGTGCTATTGCAAACAAGTTAGATATTCCTACCCGTATGTTAAGCGAAGTGAATCAATTAAATGGTCACTTAATTTATCCAGGACAATTCTTACTCTACCCCGCCCCCAAAGCAACCCACCATGTTAAAAATAATAATAACTCGCCAAAACCACATGTAGCTACTGTAAGCAGTGCCACGACAACACCCCCTAAACTCTATACAGTCCGCTCTGGTGATAGCCTCTGGGTGATCAGCAAACGCTATCGCATTCACCTTGCAGACCTAAAAAAATGGAATCCAACAATTCAAGAACAAAACTTAAATATTGGCCAAACATTGCATTTACAACCAACAGTCTCAACAAAAATAAAACATCAACTTGTAACTCATAAATCATCCGATGCCCCTTATTTTGTCCAAGCAGGCGACTCCATTTCAACAATTGCACAAAAGTTTAATATTAGCACCGATCAATTAAAAACCTGGAACAACTTAAAATCTAGCCATATTTATCCGAAACAAAAACTGCTCGTTAAAGCACCCAAAGCCACAATGCTCACTTATAAAGTCAAATCAGGAGATACTTTATACCGTATTTCTCAACTTTTTGATGTCAATGTCAGTGATATTATGTACTGGAATCATTTAAGCAATAATAATATTCATCCAGGTCAACAACTGAAGATTGCTCAAAATCAAGAGAATCATATTAGCAAGGTCGCCTATAAAGTCCGTAATGGCGATACCCTGTACTCCATTAGCCGCCACTATGATACTACAGTTGCTAATTTACAACACTGGAACAAGTTAAGCAACAACAGCATTAAAATTGGTCAAGCACTTACTATTTATACTGACACAGCTTAAAGTTTCACATTTATAAGGCCAAACCTCTGGCCTTATACCTAAGCATTAAGCATCAAAACTAGCAGACAATTCACTCGCATCTCTAGACAATTGCTCCTCTGCAGTAAGACGATTATGCGAATAACTCCCGACCAATGACTGCTGCCTTAAAACCACACATGCCGTCCCATAAGTAGCTGCAATCAGCGCTGACATTGGCAATACCGTTCCACGAGTTAGAGGAAAACAATCGGAGAAATCACTAAGATCAGGGCAATCTTGAAATTCGCGTGCAATAATTGGCGCGGCTGTTAAAGTCAAGCTCAGCCCAACTCGAATAAGAGCAGATAACGATTTTTTTAAAGCTTCCATAGAACTATATGTAGCGATACCATTTTCAGCGCCCGTACCCTCTGCATACTGCTGAACCGCTTCACTTGCTTCAACCTGACTTTTTTCACGCAAGTCCTTAACTAACCTAGTTAATAGCCTGACCTTACGGATATCTTTCTCTTGTTCAGGAGCACCATGTGCAGTCCACTCCGCTTGCAAACGCCTTGAGAGATTTCTAACATCACTTACAAATGAATGTCTAAGGCCATCTGCACCTTTACCTTCAAAATCCAGCTGCCTAGCTTCACCTAATAATACCTCTAGCTCACGGCTAAATTCTGCATTTAAATTTGGCATATAAATTTCCTTTTAATTTAAAGTCCGCAGCAAAGTATACAACTAAAGATGAGCTATTTAATGGCAACATCGACGGCTATATTTAAGTTTTATGTAAATTAATATTCTAAAAAAGTGATATAGCGCTCAACGAACAGTTTCTGACAATAAATTTGCGCAAAACTCAATTTACCTATCCTCGCAGCAAGCTACGAGGTATTTCGGAAAATTACCCCTTCGGGTCGTAATGCGCTTTGTTTTTTTTCGCAGCAAGCTGCGGGGAATCAGACCCTTAGCGATTGACTTCATTACTTGACTAAGTGCTGCCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCGAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCGATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTCACCTCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCATTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTATTATTGCAATAACCTTCAACCACCATCGGTGCGATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCCATAAAGTTAATTCGTATCGATTTGCTGCCTGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTAGCCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAATAATTTTGTCGTTATCGATTTTTGCGACTTTCTCCAGGAAGGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATCTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGAGTTTTACCCGAATTCTGATCAATCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAGCCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTAC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46 | unidentified_phage(28.57%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_22 |
1774293 : 1891448
Sequences of DBSCAN-SWA_22
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22 >NZ_CP039240|1774293:1891448|DBSCAN-SWA 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117 | unidentified_phage(23.53%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_23 |
1898840 : 1947780
Sequences of DBSCAN-SWA_23
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23 >NZ_CP039240|1898840:1947780|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_23 >NZ_CP039240|1898840:1947780|1938467_1939619_-|WP_155080623.1|transposase|DBSCAN-SWA MLSTPWLAATEKLEVIPAQFKVIQHVRFKYGCKACETGIKIPSLPPMLIPKSIITPSLLAMIVSDKFESHLPLHRQQQRFEALGIDLPRNTMANWVIVTAMLCESLLELMKQDLLQAKLIHADESPLRVLSEGKQKSYLWYYYGRIAEKQICCIDFQASRHSIHPAKFLKGYTGYMMTDAYSGYGEVIKNEKITSTYCWSHARRKFEAIPQPKKDSKKITLAMEMLNLIKELYRIEKEIKGKSPDIIYQHRQEKSKPILDEIKQWLEHYQPSIPPKVPLGQAMSYLHKNWNEFIRYIDEPFLSIDNNVLERQIRPLAVGRHNWLFSASEAGAQATAAFYSLVATCKLNAHKPYHYLKYLFENIRAAKTDDELRALLPYNFDSS >NZ_CP039240|1898840:1947780|1922655_1923399_-|WP_155080612.1|DBSCAN-SWA MAGHSKWHNIQHRKNAQDAKRGKLFTKLIREIVVAAKMGGGDPENNPRLRAAIDKGLSNNMKRDVVDRAIKRGAGGDDADNYDEIRYEGYGSGGIAVMVDCLTDNHKRTVAEVRHAFSKCGGNLGTDGSVSYMFNQRGSISFGQGLNEDSLMEAALEAGAEDVVMDNDGSAEVITAPSDFLEVKEALVAAGFKAIEADVTMVADNTTELDLDAAQKVMRLVDMLEDLDDVQKVYTNADIPESVLVEL >NZ_CP039240|1898840:1947780|1937188_1937803_-|WP_155080621.1|DBSCAN-SWA 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50 | unidentified_phage(16.67%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_24 |
1958605 : 2003516
Sequences of DBSCAN-SWA_24
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24 >NZ_CP039240|1958605:2003516|DBSCAN-SWA 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58 | Acinetobacter_phage(50.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA') |
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DBSCAN-SWA_25 |
2014374 : 2068585
Sequences of DBSCAN-SWA_25
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25 >NZ_CP039240|2014374:2068585|DBSCAN-SWA 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51 | Streptococcus_phage(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_26 |
2192740 : 2260631
Sequences of DBSCAN-SWA_26
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26 >NZ_CP039240|2192740:2260631|DBSCAN-SWA AATGGTTATCCAGCGGCAGAAAGATGAAACCTATCAAATTCAATTCACACTGAAGCACGTACTTCAATATCGAAGTGCTTGGTGGAACTATCGCGCTAAACACGCTGATTCCATTCGACCTGCCGTTGATGAAAATGTTCTCAAAGTGCTCGGTTGTCGCACCAAGTTAATGGGGTGTGATGTTTACGGTTGTTCCAATCCAAACTGCGAACATACCAAGGTCGTTTGTTTCACATGCAAGTCCCGCTTTTGCTCAACCTGTGGAAAAAAAGCAACAGAGCAATGGATCGAAGAGCAAAACGCCACTCTCCCACAGTGCAAATGGCAACACATCACATTTACTATGCCTAGAAAATTCTGGGCATTTTTCTTATTCAATCGTGAATTACTCAATATAATCTTTAGGACTGCAGCCAATACGTTACTAGAAACCGCAAAGAAGAAAGGCCTTATCATTGGCATTTTCGCCGCTTTACATACATTTGGTCGAGATCTGAAATGGAATGTACATGTTCATATCTCCGTCACACGTGGAGGTTATGATGAAGCTAATGATTCTTGGTGTGAGATTTATTTTACTCGCAAAGTTATTATGCCAATGTGGCGCTATGCCGTCACCAACCTGCTTAGGCAAACCTACAAAGCTGGGGAGTTGACTATTCCTGATGAATACCAGAGTGAAATCAGTGACCTTACAACCTTCAATCGATTTTTAAATCGTGAATACCAGAAATTTTGGAAAGTCCACTTTGCTCAACCCAAAGAAAATCACCAGCACAATGTCGATTACCTCGGCCGCTACATTAAACGCCCGGCTCTCGCCAACGCCAGAATGGAGCACTATGATGGTAATGTTGTGATCTTTCGTTACCTGGATCACAAAACCAAACAGCAGAAAATGAAAAAGCAGAGTATCGACGATTTTATTGATCGCCTTACCCAACACATCCCGGACAAGTTCTTTAAAATGATCCGCTACTATGGATTTCTAAGCTATCGCACTCGGACAATAATACTACCAAAAATTTATGATTTAGTCGGGCAAACTATTGAGGCATATAACCAGGTCACGTTTGTTTCACTGATGAAAAGTAATTTCAACTACAACCCTCTTAAATGCATCTTGTGCGGCAGTCAGTTAAGAAGGATAAGCACCCAATTTGGTCTGACTCTTAGGGAAAAGTACAGTTACTATGAAGAGCTAGCAACCAGCCGATTTAGAGGCTTTTAGTAGGATAACTCCGCCAGAAATTAGAGAATTCGCCTATTTTCACCTAAAAAACCGCCTGCAGGCATTATATTCGGTAATGGCCACAGCAATACTGACCAGAATTTAACATCCTCCTAAACATTGCCGCCAGGATCATTTTTTTGAAATTCCTGAATCTTGAATTTAGGATTTCCTCTACATAGACTTTGACCGCATCCGTATACCCATTCCCCATCAAAAGATGAAAAACAGAACGCACACCTGCATACTCTGACAGTAAAAGCCGCATTACCTCAGCGCCTGTTAGCCCAGCACTAAGCACTTTTCTAATATAAGCAGCGACAGCCAAAGCGTGGCCCTTTTCCGCGGCAACAATTAAGCCAGAAATATTATATTTATTTTTAGCCGCTAACAGCTCACATAGATCAGCACGACTTAAATTTACTCGCAGTAATGCATCAATATAGACTTCAATAGCAAAGTTACTGCCATTTTCCAGCGCAAGATATAGCGCTGGTGTGCCATCCGCTGTTTTAAGAGCCAACAGCTCTTTCTTCGTCTCGTTCCTCTCAATGATTGCTCTGACTATTTGCTGATGGTTTCCCTGTAGCGCAAACGTAAAAATAAACGCGCCCGGACTATCTTGCGTTTTTAAAAAGTCTAATTGCTTTAGGGCATCTCGAACAATGTGAAAGTGCTCTTCAGCGATTACATCTCCCTGGCCAATCAATATCTCTAGCAGAGAAAAAGCATCCTCCCTATATATATTAAGCAACTTCAGTATTATATTCTGCGGCAAGCCCCGCAGTGATAGCCGCCATGCTTTTAGATTTTCATAACAGCCTTTGATTAACTGATATAGCTGACACGGTTGAGTTAACCTTTTGATTTTGCTATTATTCTTACATGAAAAATATAGCAGGATTTTAGAATTGCAAGCTTATAGTCAGGATTTGCGAGAGCGCGTTATTGAAGCTTATAAAGATGGGCTTAGCCGAAGAGAAATATCCACTCTTTTCAAGGTGCATTATGATACAGCTTGTGAATGGATTCGACGTTATTTATCAACAGGTGACTACTCTTCAAAACAAGGAGTTGGCTGTGGCGCACAAATAAGGTTTAATGACAAACAAACTATTCTAGATTTCATAAAGAAAAATCCAGATGCAAATGGGATTGCCATTCGTGATGGCATTGCTCCTGACCTCCCTATGTCAACCTTTTATGACGCATTGAAACGATTAAAAGTCACATATAAAAAAAGAGCCTAAGTATAAGCAAAGACGTGACGCCGAAAGATCTGAATTTATAGAAAAGCTAACAGGAATTGATTTGAGCCAATTAGTTTATCTTGATGAGGTTGGCGTTGATGATAATATCGTTGTTGAATATGGCTGGTCAGCTGCCGGAGTGCGAAGTTATGCTGAACAAGCAGGCTTCAAGAGGAAAAGGTTAAGCCTTGTTGCTGGCTTGAAGTATAGTGATAAAAGTTTGGTTGCTCCTTTCGAATTTTCAGGTGCAATGAATAAGGATTTGTTTTTAGGCTGGTTTGAACAGGAATTATGTCCGAAGCTAAATCCTGGGCAAGTAATTATCATGGATAATGCAAGCTTCCATAAAAGCCCTGAACTTTATGATATGGTTGAAGCTGTTGATTGTGAACTATTATACTTGCCAGCCTACTCACCAGACTTAAATCCAATTGAAAAATTCTGGGCTAATTTTAAACGAAATATAAGAAAGGTGATTAAAAAACATGAGCATCTTTGCAACGCAATTACTGACGCATTAATTAAGACTCTTCCGGGTTAGCTATAGTCTTTCTCACTATCTTTACAAATACGCACGACATACCTTTCAATACCAAGGGCTTCATCCTCAATAAATTCTTGAATAAAAATGTCATCATCGGTTTGATAAAACGTGACCTTACTCGCTGCACTGGCAGGGATTTCTTTCACAAAGCCTTCAGCAAATCCAAGTTCCTGCAAAGATAGTTTCAGTAATAACAGCCCTGTGCGCTCCACATCATGTGCCTGGCCTGCAGAATCATATAAGGCTAATATCCAGTCCTCACGCATGCGTTCTGGAAGGATTTCAGCCATAAATTGAGAGTTATACTCCTCAGGGATAACGAGTTGATTTCGCAAAAGATTCACTAGGACTTGAGGGGTAGTTTTATCTCTTAGATACTGAGTGAAGTAATTAAAGCCACCCTCTGTAAAATTTTGAGCATCAGCATAAGAATCGGTAATAGGCTGCATATTGTAGCTAGCTGCTACATGGTTATAGAAACCATTCACCGAGTGAATATTAGGGAAAGCAGCACCTGTTTCTAACATAAAGTTAAACGCTTGCTGCTGTATCAACTCCCTTTTTGCTGATAATAAATAATTAGTTAAGCCATCACCAGCAATAATTCGATCAATTAACATAACCGCATTAGAATATGCACCTTGGTAACACCGCCCTAAGGTCAAATCACTAAATTGCTCTGCCCGCAAGTGTTTTAACAAATGTTGGTTATAACAATATAAAGACTCAAAGCGCTTTTTTAAGTCAATAAGAAGTGGCTCTTTCTCCACATCTTCACAATTTATTGTTAATTTATCAACATTCTTTTTTAAAACGTTTAGTTGCACTAAGGCAGGTTCATTCTCAGCGGTTATTTTACCCAGCAGAAAAATTAGCTGTTTTTTAGCTTTATGAAACGATTCCTCATTGCCTCTTGAGTAATAGACAGGGGGTTCGCCATAAACTGCCTGGTCTTCTCCAGAAAGTTCCTGAACAATTTTTTCTTTTAACTCATGTTACGCAGCAAGAGCTAATTGATACTATAATGTTTTGTTCAACAACTTGATTTTTTTGGTAATAATGTTAAACCTTGCTGACATATACACAGACTATCTAATCGCTCAAAACAAACATGCAACAGCTACCGGATTAGCAGATTTAATGCCTGACGAATTGTCACATGATCAGATAACTCGCTTATTGAATAAAACCCCACAAACATCAAAAGACCTTTGGTTAAAAATTAAGGCTGATGTTCGTGAGTATGAGGGACTTGATGATGGAGTTTTAGCCTTAGATGATATGATTGCTGAAAAACCCTACAGCGATGAAAATGATATTATCGCCTGGCATTATGACCATAGTAAAGGTCGAACAGTGAAGGGCATTAATATCTTGACAGCGATGGTGCGCTACGGAGACGTACGCTTGCCTATCGCTTATGAAGTGATAGAGAAAACCATTCGTTATAGTGACCTTCAAACCAAAAAAGAACGAAGAAAGTCTTCTTTTACAAAAAATGACCTTTTTCTAAAACTTCTGAATGTCGCTATTCGTAACGACTTAAAGTTTGCATATGTGCTTGCAGATCGCTGGTTTAGCAGTCAATCAAATATGAGCTATATCCACAATGTTGGAAAGAAATTTATCATGGGAATCAAAAGTAATCGATGTGTCGCACTGACTGAAAAAGATAAAGAGAATGGTAAGTATCAACAACTAAAGCAAATATCATTAGAAGACGGCATTCCTCAGACTGTGTACTTAAAAGGTATGGCTTTCAAAGTACAGGTTATGAAAAAAACATTCAAAAACGAAAATGGTAAGGAAAGTGTCTTATATCTAGTAACTAATGACTTGAGTAATAAATTTGCGCAAAACTCAATTTACCTATCCTCGCAGCAAGCTACGAGGTATTTCGGAAAATTACCCCTTCGGGTCGTAATGCGCTTTGTTTTTTTTCGCAGCAAGCTGCGGGGAATCAGACCCTTAGCGA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55 | Acinetobacter_phage(42.86%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_27 |
2280367 : 2328925
Sequences of DBSCAN-SWA_27
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27 >NZ_CP039240|2280367:2328925|DBSCAN-SWA 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41 | unidentified_phage(50.0%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA') |
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DBSCAN-SWA_28 |
2343463 : 2396131
Sequences of DBSCAN-SWA_28
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28 >NZ_CP039240|2343463:2396131|DBSCAN-SWA 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52 | unidentified_phage(21.43%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_29 |
2410864 : 2451496
Sequences of DBSCAN-SWA_29
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29 >NZ_CP039240|2410864:2451496|DBSCAN-SWA 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MLNLADIYTDYLIAQNKHATATGLADLMPDELSHDQITRLLNKTPQTSKDLWLKIKADVREYEGLDDGVLALDDMIAEKPYSDENDIIAWHYDHSKGRTVKGINILTAMVRYGDVRLPIAYEVIEKTIRYSDLQTKKERRKSSFTKNDLFLKLLNVAIRNDLKFAYVLADRWFSSQSNMSYIHNVGKKFIMGIKSNRCVALTEKDKENGKYQQLKQISLEDGIPQTVYLKGMAFKVQVMKKTFKNENGKESVLYLVTNDLSIDGQPILDTYKKRSSIEEFHKSVKQNSSFEKSPTRIVTSQLNHIYYSILGFCRLERLKLKKSLNHFAIKYKLILRANQIALQELRSMV |
44 | Acinetobacter_phage(28.57%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_30 |
2460115 : 2511785
Sequences of DBSCAN-SWA_30
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30 >NZ_CP039240|2460115:2511785|DBSCAN-SWA 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54 | Acinetobacter_phage(25.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_31 |
2525471 : 2578780
Sequences of DBSCAN-SWA_31
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31 >NZ_CP039240|2525471:2578780|DBSCAN-SWA 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48 | Bacillus_phage(15.38%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_32 |
2605554 : 2633340
Sequences of DBSCAN-SWA_32
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_32 >NZ_CP039240|2605554:2633340|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_32 >NZ_CP039240|2605554:2633340|2619452_2621411_-|WP_155081556.1|DBSCAN-SWA MLDFKKDFFKDQFEKYPELLAFLSSNADVTADYYLGPRTAWMDELYAVAAEYLPVAQALELPLPIQELLKKATVNRRSLELEHAMLSLMSAHSIVFGNYLFFASSSVVSGKEVSQDQLKKLSELYNYAEYKFVVDLALVISDLGKIRPLRQYVREKEGIKVEDPGQFITALLQKGQAVCAKYLPSLANLSPEVFSELTKINTGFQFGHFAHAESTERELAKLKQVIDEHGVDYLSLSMLVQCLDVAGAAAHNDGKILLNQAMTESYLDFLLPILMLLKDQTPETVYEIYLKERMEQCQLGVARLAPLTMDDRVLGRLLCMLRMTEAAPAQKLKQAFIQLKNTPEFIDDLETLTLYEADPRLQTPAYMSSLLVALTESAEFAELARNQGKSPQEMALSIGLRIIACCLKEHYARVQAGKVRQEIPIRFNDLTRFIKEDASVLKHLIEPNKPNSGALNCDGVQFIGGQTFEMLRHSIKSTLGDMHEHQQELLQSTGDKFTLYKSRINQAPSAQECIEKLKDLGNMCELPACTSSLGSVVVRLKLEGCIQNCKEYMLNAIGTAIINRAQGRGFDLGIGGSRHRITLPDGQEKQVPERVSLVMQVLKNTNFSVDEKLELIKDLKMSAVENHRSSTCFFFGRTQTSTNTFLANLECG >NZ_CP039240|2605554:2633340|2627393_2627963_-|WP_155068734.1|DBSCAN-SWA 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30 | Burkholderia_phage(20.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_33 |
2642669 : 2692427
Sequences of DBSCAN-SWA_33
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_33 >NZ_CP039240|2642669:2692427|DBSCAN-SWA 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45 | unidentified_phage(16.67%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_34 |
2704004 : 2753977
Sequences of DBSCAN-SWA_34
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_34 >NZ_CP039240|2704004:2753977|DBSCAN-SWA ACTAAGCCGCCATTAAATTCTCTAAAAAAACATGATTAGGTGCGCGATAATCTAAACTCGCCCTTCTTCTCGCATTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTTAGCATCACTTATTTCATTAAAGTCTGTTCCTTTAGGAAGAAAACGCCTAATCAAACCATTCGTGTGCTCATTTAGGCCTCTGTCGCAAGAGCGATAAGGTCTAGCAAAGTAGAAATCAGCATCAGTAATCTTTGAAATATCCTCATGACCAGCGAATTCTGTCCCGTTATCTGAGGTAATCGTTTTAAAGTCAAAGAAAGTTGAGGCGACTATACTTCTGAAGGTCTCAACAACGGTTTCTGCACATTTGTTAGCCATTTTCCTTATACAACACATCTTATTGGCTTTATCAACAAGGGTTAACAAGTAAGATTTGTGATCTCGACCTACTATGGTATCAATTTCAAAATGTCCAAATTCAGTCTTTTCGTCAGCAATAGCGGGCCTTTGTTCAATACCAACGCGGTTCGGTATTTTAGTTTTATCACCACTTTTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCAGAGTGGGGCAGGCTTTTGTAAAGCTCTCCTCCTTTCTCTCGATCCTCATGAATATAACGGTAGATGGTGCTCTCACTCACTTGGATATTATGCTCCTGTATAAGCTCTTTACTAATAACATCGGGTGACGTATGGGTGCTTAACCGCTCATGAATTAATACTTTTGCTTTCTCTGAAATTTTCTGAAAATCCTGCCCTTGCTTAGCATTAGACCGTTTTTCTTGCGCACAACGCGAGGCCAAGCGATGGCAATAAAGACCGTTAAAATCGCTTGGGGTATGCCGTTTAGTCTCACGACTGACTGTGCTAGGAGCAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTCATGGAGTCCCCTTCTGATAAACGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAGCCATTTGTACCCTCTAAGTCAAAAAGGCGAACTAGAGAGTTTATCTTTATGGGAGTGAACTCTCTACTGGGTGTTGCACTTCATATGACGGAGGGCGTAGTGATAAAAGTTTGGTTGCTCCTTTCGAATTTTCAGGTGCAATGAATAAGGATTTGTTTTTAGGCTGGTTTGAACAGGAATTATGTCCGAAGCTAAATCCTGGGCAAGTAATTATCATGGATAATGCAAGCTTCCATAAAAGCCCTGAACTTTATGATATGGTTGAAGCTGTTGATTGTGAACTATTATACTTGCCAGCCTACTCACCAGACTTAAATCCAATTGAAAAATTCTGGGCTAATTTTAAACGAAATATAAGAAAGGTGATTAAAAAACATGAGCATCTTTGCAACGCAATTACTGACGCATTAATTAAGACTCTTCCGGGTTAGCTATACACTGTGCACACGACCAAAAGCCTTAAAAAAACAAATAGCAATCTCACTTTTATTCTGCTCAGTTACTAACTGTGCAATCAGTCCACCTTTTCTTAAAGCCTGACTAGAACTCACTTGACCAAAGATGACAATAAACTCACCCGGAATCATATCTGCAGCAGAAGTTAGACGTGTATGATCTTCATAACGAAAAGGTAGGTGTAATAACAAATCAGTGAGTGAGTAGATGCCAAGTTGCTCAAGTTTCCCTAATAATTTATAGCTGACACGGTTGAGTTAACCTTTTGATTTTGCTATTATTCTTACATGAAAAATATAGCAGGATTTTAGAATTGCAAGCTTATAGTCAGGATTTGCGAGAGCGCGTTATTGAAGCTTATAAAGATGGGCTTAGCCGAAGAGAAATATCCACTCTTTTCAAGGTGCATTATGATACAGCTTGTGAATGGATTCGACGTTATTTATCAACAGGTGACTACTCTTCAAAACAAGGAGTTGGCTGTGGCGCACAAATAAGGTTTAATGACAAACAAACTATTCTAGATTTCATAAAGAAAAATCCAGATGCAAATGGGATTGCCATTCGTGATGGCATTGCTCCTGACCTCCCTATGTCAACCTTTTATGACGCATTGAAACGATTAAAAGTCACATATAAAAAAAGAGCCTAAGTATAAGCAAAGACGTGACGCCGAAAGATCTGAATTTATAGAAAAGCTAACAGGAATTGATTTGAGCCAATTAGTTTATCTTGATGAGGTTGGCGTTGATGATAATATCGTTGTTGAATATGGCTGGTCAGCTGCCGGAGTGCGAAGTTATGCTGAACAAGCAGGCTTCAAGAGGAAAAGGTTAAGCCTTGTTGCTGGCTTGAAGTATAGTGATAAAAGTTTGGTTGCTCCTTTCGAATTTTCAGGTGCAATGAATAAGGATTTGTTTTTAGGCTGGTTTGAACAGGAATTATGTCCGAAGCTAAATCCTGGGCAAGTAATTATCATGGATAATGCAAGCTTCCATAAAAGCCCTGAACTTTATGATATGGTTGAAGCTGTTGATTGTGAACTATTATACTTGCCAGCCTACTCACCAGACTTAAATCCAATTGAAAAATTCTGGGCTAATTTTAAACGAAATATAAGAAAGGTGATTAAAAAACATGAGCATCTTTGCAACGCAATTACTGACGCATTAATTAAGACTCTTCCGGGTTAGCTATAGGCCCCACTCCGTTTAAACCCGCTAAAGGCAATTCGTGAATAAATTTGCGCAAAACTCAATTTACCTATCCTCGCAGCAAGCTACGAGGTATTTCGGAAAATTACCCCTTCGGGTCGTAATGCGCTTTGTTTTTTTTCGCAGCAAGCTGCGGGGAATCAGACCCTTAGCGATTGATCAAAAAACACCTACCTCTGTATCCTATACTCTCTAATGTATTCCCAATATATTTCTAATAGTTATATCTCTATATTATGTCTTTCTTTTAGACACTAACCCCTCCATAATAACACTAAAATAAACCTAGACTTTATAAAAAATAACCAAACTTCAGGAGCTGATCATGGTTGAAACAAGCTTAGTTAAATCTCAAGGTGCACTCGTTATGCGCACCATCGCCATGCCTGCAGATACGAATGCAAATGGCGATATTTTTGGCGGCTGGATTCTCTCACAAATGGACTTAGGCGGTGGTATTATTGCTAAAAAAACAGCCAACACACGCACAACAACCATCGCGATTGACTCACTGACCTTTTTAAACCCGGTTCATGTCGGTGACACCGTCTCTTGCTATGCACAGGTCGCACATATTGGTCGCACATCCATGAAAATCAATGTCGAAGTCTGGGTCTATCGTCATTTAAGCGATGAAGATTTATTGGTGACTAAAGGTGTTTTTACTTATGTATCTATTGGTGAAAACGGGCGCCCCACACCAGTGAAACGCACACAAAATGAAAGTTAATAGTTAACAATATATCTGGCACATTAAGTATCGTAAGTACCGCGTTGCATTGAATTAAGCTTAAGAAATAGCTAAATCTAAGGCTTTTTTCTGCATACCAATTAACTGCTCAATGCCATGCTGACCTAATTTAAGCATGGACTGCAATTCATCAGCACTAAAGGCAACACCTTCTGCTGTCCCTTGTACTTCAATAAAATGATTCTCATCATTCATAATGATATTCATATCCGTTTCAGCATTAGAGTCCTCAGCATAGTCCAGATCTAATACTGGCTCCCCCTTATAAATACCGACAGAGACAGAAGCGACAAGATTTTTTAATGGATTTGATTTTAAACGATTGCGCTCATACAAATGACGGATGGCATCGGCCATAGCGACACAGGCCCCTGTAATCGATGCAGTACGCGTGCCACCATCCGCTTGAATTACATCGCAATCAATATGAATGGTATTCTCACCCAGCGCTTTCATATCCACTGCTGCGCGTAATGAGCGACCAATTAAACGCTGGATTTCCTGTGTCCGACCCGTTTGTTTACCACGCGCCGCTTCACGATCGGTACGCTGAGTTGTCGCACGCGGGAGCATGCCATATTCTGCTGTCACCCAACCTTGGCCCTGACCTTTCAAAAAGCGTGGCACACCATTCACGGCACTGGCATTACATAACACTTTCGTCTCACCATACTCAACCAACACTGACCCTTCAGCATGCTTGGTATAATTACGGGTAATGCGGATTTCCCGCAATTCATCTTGCTTTCGACCACTCGGACGCATAACTACCTTTCCTAAAAAAAATGAAAGAGGTATTATAACCCATTTAACGCCAGGGTAAGAAGGGCAAGAGAGGATTAATAGAATAATGACTAAAATTTATAGCATGACCGCCTTTGCACGTTATGAACACAAAGCAACCCCCTGCCAACTGACCTGGGAAATCCGTGCCGTCAATCACCGCTATTTGGAAATCCAGCCCAAACTTCCCGATGCTTTTCGTGACCTTGAGCCAGCTTTACGCGACATGGTTAAAAAGCAGGTGACGCGCGGCAAACTTGAAGTGAGTTTGCGTTATCAGTTGGATAGCCCATCAAATAATGAGGCATTTACCATCAATCAAGCGCTCACTACTTCTTTACTCTCAGCCCTCAACCAACTCAAGGCAATAACCGACGTTAAGCGAGAGCAAACGGCATTCGCCCCTGCCAATCCACTCGAATTGCTCGCTTGGCCAGGTGTACTTGAACAGCAACAAAATGATCTTAACCAAGTCAAGCCCGCTGCACTTAATGCATTAGCAAGTGCCTTAACAGAATTTAATGCCTGTCGTGAACGCGAAGGCGCTGAATTAAAAACATTCTTACTCTACCACTTAGACTCTATGGCGCCATTCATTAACCAAGTGACAGAAGCAGCGCCCGAAAACCTGATCCACCTGCGCACAAAAATGACCGAACGTTTAGCGGAAATTAATCAAACAGCAAATTCAGAACGCTTAGAGCAAGAGCTCCTCTTCTGGGCGCAAAAACTTGATATCAGCGAAGAAATTGAACGCCTACACACACACATAAAAGAAACACGACGCGTATTAAATCAAGGTGGCACCACCGGTCGACGCTTGG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58 | unidentified_phage(25.0%) | transposase,integrase | attL 2703969:2704028|attR 2741176:2742281 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_35 |
2759165 : 2807639
Sequences of DBSCAN-SWA_35
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_35 >NZ_CP039240|2759165:2807639|DBSCAN-SWA 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52 | Halovirus(16.67%) | transposase,integrase,tRNA | attL 2804501:2804560|attR 2809013:2809301 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_36 |
2827079 : 2861405
Sequences of DBSCAN-SWA_36
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_36 >NZ_CP039240|2827079:2861405|DBSCAN-SWA CTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGTCCGCGTAGGTGACTTTTCAAAGCTCGAATTTTGTTTTACTGACTTGTGAAATTCCTCAATACTCCAGCGTTTTTTATAGGTATCCAGGATGGGTTGGCCATCAATACTCAAGTCATTAGTTACTAGATATAAGACACTTTCCTTACCATTTTCGTTTTTGAATGTTTTTTTCATAACCTGTACTTTGAAAGCCATACCTTTTAAGTACACAGTCTGAGGAATGCCGTCTTCTAATGATATTTGCTTTAGTTGTTGATACTTACCATTCTCTTTATCTTTTTCAGTCAGTGCGACACATCGATTACTTTTGATTCCCATGATAAATTTCTTTCCAACATTGTGGATATAGCTCATATTTGATTGACTGCTAAACCAGCGATCTGCAAGCACATATGCAAACTTTAAGTCGTTACGAATAGCGACATTCAGAAGTTTTAGAAAAAGGTCATTTTTTGTAAAAGAAGACTTTCTTCGTTCTTTTTTGGTTTGAAGGTCACTATAACGAATGGTTTTCTCTATCACTTCATAAGCGATAGGCAAGCGTACGTCTCCGTAGCGCACCATCGCTGTCAAGATATTAATGCCCTTCACTGTTCGACCTTTACTATGGTCATAATGCCAGGCGATAATATCATTTTCATCGCTGTAGGGTTTTTCAGCAATCATATCATCTAAGGCTAAAACTCCATCATCAAGTCGCCCTCCCTCATACTCACGAACATCAGCCTTAATTTTTAACCAAAGGTCTTTTGATGTTTGTGGGGTTTTATTCAATAAGCGAGTTATCTGATCATGTGACAATTCGTCAGGCATTAAATCTGCTAATCCGGTAGCTGTTGCATGTTTGTTTTGAGCGATTAGATAGTCTGTGTATATGTCAGCAAGGTTTAACATTATTACCAAAAAAATCAAGTTGTTGAACAAAACATTATAGTATCAATTAGCTCTTGCTGCGTAACATGAGTGATTACCTAATTAATTCAATGCGTTCATACTTCAAACTTAAAACAAAACCACAAAACCTGCTCTTAAGCAGAAAAACACAAACAACACAATCAAGATATGTTTTTGATTTATTTATTGTTAGCATAATTATAATTCGCTATGCTAGGCAACAAAGCATTAAAGCATTTAATGATCGTTTTACGATATACAACGCTACAACGCATATTTCTATAGCTTTTTATAGAATCGTAACAAATCAAGTAGCTTCATAAAGAGGGAGTATAATCAGGAGCATGACTAAACTAGAATTTACCCAAAGCAATACCCATACACTTGCAGAGCGCTTAAACCGTCTAATGCGAGAGCACGGCGTGACTACAGCACAACTTGCAAAAAGCACAGGTATTGCCGTCGGCACCATTAACCGCATGTCTAATGACAAAACATGCAACCCAACGATCTCTTCATTAAAACCAGTTTGTGACTTTTTTTCTATCACCGTCAGCCAAATGATCGGTGAAGACGAACTACGTAACTTTCAAAAAGTCGCAACGAAATGGCTAAATGTTCCCATCATTCATTGGAAGGAACTAAACTGCCACTTAAACACTGACAATACCAATACCACTCTTATTTCTGATAACTCTGAAAAAGAAACAGAAGAAAAAGAAAAAGAGCAAATTAAAATCAACAGCGAGTTTAGCTCCAGCAGCTTTGCAACACGAATGCCTGACGATTCAATGACACCTTTCTTTCCAAAAGAAAGCGTATTAATTTTCGACCCAGAGCAAACCATCAATGACCGGAGCTACGTCTTAGTTTATCTACATCGCCATAATAGCTATGTCTTTAAGCAACTCATCATCGATAAACCTTATCAATATTTAAAGTCAGCCCACTCAGAACTCGGGTCTTACTTACAATTACAAAAAAGTGATAAGATTATCGCCCCACTCGTGCAATCAAAAATAAACTTCTAGTCTAAAATAATAAAACACAAAGCAAATTTGAGCTGAAAAATAAATCGTTTCAGCTCAATATTATTCACATCGATGGCAATACACCATAAAACATTCCCAACACCGTCCCAGACATAGACGTGCACAATACCGCAGCAATTAATGCTTTAAACGATAACTTCACATATTCAGCACGACGCCCTGGGATCAATGCATTATACGTCCCAATTAAAATGCCAATACTTGAGAAATTGGAAAAACCACACATCGCATAAACCAATATCAACTCTGTTCTTGGATCTAAACTATGGCGCACAACACCTAACTTTTCAAAAGCAACCAACTCATTAATCACCACCTTTGATGCCATCAGATTCGCCGCGATATGCATTTGATTTCCTGGCACTCCCATCAACCACACCAGAGGTTCCATCACCCATGTCATGATTCCCGTCATACTCAGATGCAAGTCACCGAAATGAACTAACGCTAATCCTTTATCTATAAATTTAACCAATGCAACCACACCAATCATCATTACAATAATACCCAGTAAAATTTTACCTCCCTCAAAAGCCCCCAAGGTTAATGCTTCCACACTATTACTCGCCTCATGCTGATGGGCCAACCGTCCCTCTGTCATCTCATCCACTTCTGGAACAATAATTCGCGCAATCGTAATAACAGCAGGAATCGTCACCAATACTGCAGAAATCACATGCATCATGCCCATTTTACCCAAAACACCCGATAAAATGGCAACATACAACCCCATCACGGTCCCAGCCGTTCCAGCTAACCCCACAGTCATTAACGTAAATAATTCACTGCGTGTTAACTGTTTTAAATAAGGCCGAATCATCAGCGGTGCTTCTGATACACCCAAAAAAATATTAGAAGAAACACCAACACCTAAAGCGCCCCCAACACCAAAAATACGCTTTAATAACCAACCCATTCCTTGAACAACTTTACTGAGCACGCCCCAATATGTTAACAATGACGCCAATGCTGCGATCGTAATTACCAACGGCAGGGCCTGCAATGCTAAAATCATTAAACTCGACTGTCCTGTCGGTGTAACCGCAAAGGGTAAACCGCCACCACCGATATAACCAAAGACAACCCCTGTTGCATCCAGCGTTGCCCTCATAAGTGATTGAACTACAGCATTAATTGCCATAAAAACATCAGCAAACCAGGGAATCAAAAATAACATTAATAAAATGACAATTTGTGCAATTAGGCCGGCAAATACTTGACGCCAACGAATCGCTCGACGATTTTCACTAATTAAAAACGCAATAAAACAAAAACCCGCGAGACCAACAATGCCGTGCACAACGGGAAATAAATAATGACCAAGCTGCATCACTACACTCTAAAAATATCAAACAATAATACTAAAAAATGCGATTATACCGATAAATAAGCAGAAAGTAAGGAAAATCAGCAATATATAGCTAAATCCTAAATATATGGCATAATAACTTATTGAATAATTGTAGAATTAAACAAGGAGTGTGTCATGGGATATCCAGTTGAATTCAGACGGAAGGTCTTTAAGTTAAAAGAAAAGAAAGGGCTAACTTATGAGGAAGTTTCAGAGCTCTTTGGCGTTTCAATGAGGACGCTGTTTCGATGGAATACAAGAATAGAAATAAAAAAGAAGGCACCAAAACCTCGAGTGATTAACTTAGAAGAGCTAAAGAATGATGTAAAAAATTATCCGGATAGTTATCAATGGGAACGTGCGCAACGTTTTGGTGTAAGTCAACACTGTATTCAGCATTGGTTGAATTTCCTTGCAATCAGCTGTAAAAAAAACACTAAAACACCCAAAAGCCAACGAGAATACACGTACAAGCTTCCAGAATAAAATCAAGCGCTACGCCGGCTATGGTCGACCCATTGTTTATTTAGATGAAAGTGGTTTTGCAACAGATATGCCAAGAAAGCGAGGCTACTCCCAGAAAGGAACGCGCTGTTATGGTGTTCATAACTGGCATGAAAAGGGTCGTATTAATGTCATTGGTGCCCTCTTAGGGAAGTTATTATTAACAGTCTCTTTATTTACTGGGTCAATTAATTCTGATGTGTTTTATGCATGGCTAGTTAAAGATTTATTGCCTAAATTGCCAGCACATTCAGTAATTGTTATGGATAATGCGCGCTTTCACAAACGCTCTGACATGATTGAAGCGATTGAAGAGCAAGGGCATACACTTGAGTATTTACCATCTTATAGCCCTGACCTTAACCCGATTGAGAGAAAATGGGCAGAAGCTAAAGCCATTCGAAGAAAGTATCACTGTAGTATCGAAGATCTTTTTTTAGAACATCTACATTATGTCAATTTATAAGGTTTTAACTATATTCTAAACATACCCCTGACTATCAGAGCCATAATTTATCATAACAACATCAGCCAGGGCCGTCATAAAAGTAAAAAAACACTATTAAAATAGCTTTATAGATTAAGGCAAAGACATAAAGATAAAGATGAAAATAAAGGCAAACAGAACAATCAAGTAATAATTAAAGAGAAGCTAAGCACCAATTGCAGTGCCTAGCTTTAGAGATCAATACTTAGTAATTAGTAATGATTACGTGGCTGACGCTTTTCTTGCGGCTTAGCCATGCTAACTTTCATAGGACGACCACCATTATCCTGACCATCCAATTTCAATGCAGCTTCAGCAGCATCCTTCTCATCAAACTCAACGAATGCAAATCCTTTAGAACGGCCAGTTTCACGATCTTGGATCACTTTAACGCTGGTAATAGCACCGAATTGAGAAAAAAGTTCTTCAAGTGATGCATCATCTGCGCTATATGGCAGGTTTCCTACGTACAGTTTTTTCATGTAAATTCTCATTAAATAACAGTTTAACTTAAGTCGCGTATTTACTTAACCTTTTAGGCTAAGAAAGTACGCTGGGTAGAGTATACACTATATCCTAAAAAACGTATACTTCCGATCCAATTATTTTCTCATCGAACAAACTGCTATGTAAAGCACCCATATAAAGCCGTTATTTTTTAATATATTAGTCCGCATACCAACAGGC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33 | Planktothrix_phage(28.57%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_37 |
2876828 : 2933251
Sequences of DBSCAN-SWA_37
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_37 >NZ_CP039240|2876828:2933251|DBSCAN-SWA 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52 | Bacillus_virus(14.29%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_38 |
2938921 : 3048991
Sequences of DBSCAN-SWA_38
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_38 >NZ_CP039240|2938921:3048991|DBSCAN-SWA 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116 | unidentified_phage(35.71%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA') |
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DBSCAN-SWA_39 |
3063849 : 3115879
Sequences of DBSCAN-SWA_39
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_39 >NZ_CP039240|3063849:3115879|DBSCAN-SWA 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64 | Acinetobacter_phage(28.57%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_40 |
3190953 : 3281069
Sequences of DBSCAN-SWA_40
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_40 >NZ_CP039240|3190953:3281069|DBSCAN-SWA 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93 | unidentified_phage(46.15%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_41 |
3297708 : 3331001
Sequences of DBSCAN-SWA_41
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_41 >NZ_CP039240|3297708:3331001|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_41 >NZ_CP039240|3297708:3331001|3321754_3321967_-|WP_155081347.1|DBSCAN-SWA MSEDRTLISAYTEAVRFIANPSKYKVLDPRTLFALEHTWGNKRSLNQANISSFTLFSHFYLVAQGLDALT >NZ_CP039240|3297708:3331001|3311564_3312566_+|WP_155081342.1|transposase|DBSCAN-SWA MSRHKCTKEIYKAFLQASSVRYSGLALSEVSPEPFSHDSVSRWLQSQQYRPRDIWHIVKDLINTEEPCLLVVDDTVLDKHRSKQIDLVHHQYSGNAHDVIAGIGLVNLVWYGLERQHSIPIDYRVYDKDTDGKTKNDHFREMLKLGKNRGMTPSAVVFDAWYSSLNNLKAARDLHWNWVAGLKKNRKVNRNETLEMLDFPDEGLKLHLRGYGWITVFRFVAKNGRTDYIGTNIEEPSRDQVEVIVKALWSIEVIVKALWSIEVYHRELKQTCGIERCQARTGRAQRNHISLSIAAWVDKYKRKLNEKISLYQQDWDVIKVGISCSIQKILAAT >NZ_CP039240|3297708:3331001|3300946_3301723_+|WP_155081592.1|DBSCAN-SWA MYGGSILLWFKKKKNRHLCTSAGASHCGHVRDHNEDAYLIQDDVGVFVVADGMGGGAFGERASAVLASPFTHLDAAMSLADKVAEVSKQLHQRHREIYLFSQEINKSVGSTVVVCITAAHENKVAFLWTGDSRAYVLDHKDFKQVTQDHRYVLQLLEAGVISAKEVDNHPYANRLTHAVGVSAHLQLDQCEFSVTGPLRILLCTDGLSGELSITDLKQIIAVHKATAEQCCQRLVEQTLKTRARDNLTAVIVDLNLHN 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37 | unidentified_phage(33.33%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_42 |
3341802 : 3399908
Sequences of DBSCAN-SWA_42
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_42 >NZ_CP039240|3341802:3399908|DBSCAN-SWA 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54 | Acinetobacter_phage(28.57%) | tail,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_43 |
3410353 : 3518231
Sequences of DBSCAN-SWA_43
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_43 >NZ_CP039240|3410353:3518231|DBSCAN-SWA 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115 | Acinetobacter_phage(36.36%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
28336 : 40779
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039244|28336:40779|DBSCAN-SWA 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CGGCTTAGTGTAGAGTGGTGTTGCACTTCATATGACGGAGGGCGGAATAGTTTCTGTTCTTCAGGTCAAATCTCTCAAATTTTGCTTCACTAAAAAATGATCCATTGACCCGGCTGAAACTTTCAAATTCTTCAATATTAAACCATAACTGACTGACTCTAAGTCAAAAAGACGGCCCCTGTGCAAGCAACTTTATTGTTGCACTAAGGAGGGCTTATATCTTGGCTTTCGCCTAAGTCAGGATTCTTTGCTTGTACCGACAGCTCGCCATCGTGGAATAAAAGCCTAGGCTTCCTTTCCAGCTTCCCCTTATATTCAGCAACAAGCCCCCCAATCTGCTCTTGTAATTCAGGACTATAACCATTTACCAAGACAGTCTTTGTTGTAACAGGAATCCTCGTCATAGGGCTCCTTTCATCGCGTCTCAAACTTTTTAATAATTCTTTTGCTTCATAAGGGTACACCTCACCATCAATAGTAACCGGTTCTTCTACTGGATGTTGACTGATTGGTCCTGTAATAAGTTTGTTAAATTTTTGCTCAAACTCTCGATATACATCAGCAGGTAAATTCTGAGCAAGCTCTGAAGGAATAGGAAAAGACTTAGGTCCGAAACTAGAAAAACGCCTTAAAACTTCATCAGTTGCAGACGTTATTTGAGGAAGATCAACAGGAAGGTCAACAAAAGCTCCTCCTCCTCCTATTTCTAAATCGTCAAGATCAATATTTAGTCGTGATAACTCTGGGTTACTTGCTACAAAAGCTTCAAGAAAACGCAACCTTTCTTCTGTCGTTTGTTCAGGAAAGTCAGAAAAACTATTTCGTCGACTTACCCCTAAATCTCTAGTGAGTGTAGAGTCTTGCTCCGAAGTTAAACCCATTAGGAAGTCATCTTCTGACTCCGAACCTAGATCCATTGGAAGGTCAACGCCTGGTTCTGCCTCTTGATATGTTAAATGACTAGAAAAAGCACCTGCCCCACTTAACTCTAGATTTTCAGCAGATGCAGGTTCTGGTTCCACACCTAAAACTTCTGGATGGTGACCCCTGTTTTGTTTACGTTCTCTTGGCATTTTTTTATCCTAATGCAATTTCATTATATGAATGTCCTATTTTCGACATAAAAGTGTATAAAACATATCGAAAGATATATGTAAAAATATATGAATTGCCTTCATTTTTCATACATCTGATAATTTATGCTTAAGAAGGCACTGTTGCAAAAAATTTAGATTTGAGTAGGGTGTAGCAATCAACGGAAGTTAAGAGTGAATTGCTGTGGTAAAATGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATCATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGCTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGTTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTATAGCGATCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGTGCTGCCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCGAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCGATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTCACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCATTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTATTATTGCAATAACCTTCAACCACCATCGGTGCGATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCCATAAAGTTAATTCGTATCGATTTGCTGCCTGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGGCCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTTGCGACTTTCTCCAGGAAGGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039244|28336:40779|28336_29722_+|WP_155081897.1|DBSCAN-SWA MPKLSWESEEHKKKEWEIAEKHLRNGKVGEETVLPKSKPWWNPKLYTDQEGIKHKINHDFIVVDGQIFALAGTGNYLGKGSCGTVKLAEDKKGNIYAVKTGSLKYIPESELQALTDVNSPTGRKLIKGHMTKGHKRYVLLHFFGISLDKVNFKGYRHKLDACFQAVHLVKLLNRGALSESGTEYYHSDIKPENFVMDKEGNVELIDFGSISSRTNPSTIDTPMTIRYQAPEIERRFHPHSPTNKNTETYSLGKTLKDILPKGSRLRHTASLMSSPYPSCRPNKIFIEIDILVERYQDSDQELTEALDQYHIPFSCSEAKAISALLQASTPEHNLTIRENIQLIKNCPNIKSALIMAHNYLQTPMDASKFGITKDHGYRGRKETKKLITSLLRVPNDSRDRVASLVKDWVKTSGLCNGSRIAYVHQSDLFNKGPVLFSKMLDNEREDFKKSVLTFSNTQPTP >NZ_CP039244|28336:40779|35968_36319_-|WP_155066936.1|transposase|DBSCAN-SWA MGYPVEFRRKVFKLKEKKGLTYEEVSELFGVSMRTLFRWNTRIEIKKKAPKPRVINLEELKNDVKNYPDSYQWERAQRFGVSQHCIQHWLNFLAISCKKNTKTPKSQRKYTYKLPE >NZ_CP039244|28336:40779|36388_36805_+|WP_155067991.1|transposase|DBSCAN-SWA MPRKRGYSQKGTRCYGVHNWHEKGRINVIGALLGKLLLTVSLFTGSINSDVFYAWLVKDLLPKLPAHSVIVMDNARFHKRSDMIEAIEEQGHTLEYLPSYSPDLNPIERKWAEAKAIRRKYHCSIEDLFLEHLHYVNL >NZ_CP039244|28336:40779|35331_35490_+|WP_155081901.1|DBSCAN-SWA MQSAVKKTLKHPKANENTRTSFQNKIKRYAGYGRPIVYLDESGFATDIVKTL >NZ_CP039244|28336:40779|35484_35937_-|WP_155081465.1|transposase|DBSCAN-SWA MVYLDESGFATDMPRKRGYSQKGTRCYGVHNWHEKGRINVIGALLGKLLLTVSLFTGSINSDVFYAWLVKDLLPKLPAHSVIVMDNARFHKRSDMIEAIEGQGHTLEYLPSYSPDLNPIERKWAEAKAIRRKYHCSIEDLFLEHLHYVNL >NZ_CP039244|28336:40779|33883_34858_+|WP_155081900.1|transposase|DBSCAN-SWA MAYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSMRSIARALGFAPSTVSRETKRHTPSDFNGLYCHRLASCCAQEKRSNAKQGQDFQKISEKAKVLIHERLSTHTSPDVISKELIQEHNIQVSESTIYRYIHEDREKGGELYKSLPHSGKPYKKKVKSGDKTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDIIVGRDHKSYLLTLVDKANKMCCIRKMANKCAETVVETFRSIVASTFFDFKTITSDNGTEFAGHEDISKITDADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDAKIAKIEHTLNARRRASLDYRAPNHVFLENLMAA >NZ_CP039244|28336:40779|31048_31363_+|WP_155068889.1|DBSCAN-SWA MVSLIQFTLKHLFQTGRAWWRYYVANRENIPRSVVETVVKMLSCKTKFTGHDEYSCSNPDCKHTKTVAYTCKSRLCSSCGKKPQSNGLLHKMSYYQSANINTSH >NZ_CP039244|28336:40779|29711_29897_-|WP_155081911.1|DBSCAN-SWA MGYLYTFDLIYPEKTLCVEFEVMHSNILKAEEAVEAEFDQWVGEQEGGATGYDYSYKTIRG >NZ_CP039244|28336:40779|36791_37379_+|WP_155081902.1|transposase|DBSCAN-SWA MSIYKVLTIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSMRSIARELGFAPSTVSRETKRHTPSDFNGLYCHRLASHCAQEKRSNAKQGQDFQKISEKAKVLIHERLSTHTSPDVISKELVQEHDIQVSESTIYRYIHEDREKGGELYKSLPHSGKPYKKKVKSGDKTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFENDTPRSKLRGI >NZ_CP039244|28336:40779|31768_32761_-|WP_155081899.1|transposase|DBSCAN-SWA MCKIPTEVATLTNEKDRFYIEQRLSEGDSMRSIARALGFAPSTVSRETKRHTPSDFNGLYCHRLASRCAQEKRSNAKQGQDFQKISEKAKVLIHERLSTHTSPDVISKELIQEHNIQVSESTIYRYIHEDREKGGELYKSLPHSGKPYKKKVKSGDKTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTIVGRDHKSYLLTLVDKANKMCCIRKMANKCAETVVETFRSIVASTFFDFKTITSDNGTEFAGHEDISKITDADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDAKIAKIEHTLNARRRASLDYRAPNHVFLENLMAA >NZ_CP039244|28336:40779|38538_39408_-|WP_155081903.1|DBSCAN-SWA MPRERKQNRGHHPEVLGVEPEPASAENLELSGAGAFSSHLTYQEAEPGVDLPMDLGSESEDDFLMGLTSEQDSTLTRDLGVSRRNSFSDFPEQTTEERLRFLEAFVASNPELSRLNIDLDDLEIGGGGAFVDLPVDLPQITSATDEVLRRFSSFGPKSFPIPSELAQNLPADVYREFEQKFNKLITGPISQHPVEEPVTIDGEVYPYEAKELLKSLRRDERSPMTRIPVTTKTVLVNGYSPELQEQIGGLVAEYKGKLERKPRLLFHDGELSVQAKNPDLGESQDISPP >NZ_CP039244|28336:40779|40203_40779_-|WP_155066610.1|transposase|DBSCAN-SWA MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVAKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGSKSIRINFMGGLRGKQFIAPMVVEGYCNNNVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLEAALSQVMKSMSETIR >NZ_CP039244|28336:40779|35054_35405_+|WP_155066936.1|transposase|DBSCAN-SWA MGYPVEFRRKVFKLKEKKGLTYEEVSELFGVSMRTLFRWNTRIEIKKKAPKPRVINLEELKNDVKNYPDSYQWERAQRFGVSQHCIQHWLNFLAISCKKNTKTPKSQRKYTYKLPE >NZ_CP039244|28336:40779|29924_30647_-|WP_155081898.1|transposase|DBSCAN-SWA MDVQNTYRGSDAYADLAKVHHRWGFDKMMAKIKENYAWNHKRVYRVYCELKLNLRIKPRKRFSPREAKMLVQPIVSNHCWSLDFMSDTLSNKRKFRTLNVIDDYNRECLLIEPAFSLPSMVVTRLLDQVAESKGYPEVIRSDNGPEFISSDFTKWAEQHNILLHHIQPGKPAQNGFIERFNRTYRQDILDAHWFYNLEEVREITEPWVDQYNNERPHESLANLSPINFKKMRDKTTEIPL >NZ_CP039244|28336:40779|37394_37847_-|WP_155080102.1|transposase|DBSCAN-SWA MSESSFIHKSHNVSVLIYHVVCPSKYRRVVFDKEVDSYLKNVCLEIEKRYEINFLEIGLDGDHAHFLVQSVPMYSVKKVVQTIKSITARELLQQYPWLKAKLWGAESWSKGYFASTVGKHGDEKMLKNYVRNQGVAKDYQPLHQSQLRLL |
15 | unidentified_phage(22.22%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1087 : 165478
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039241|1087:165478|DBSCAN-SWA AATGGTTATCCAGCGGCAGAAAGATGAAACCTATCAAATTCAATTCACACTGAAGCACGTACTTCAATATCGAAGTGCTTGGTGGAACTATCGCGCTAAACACGCTGATTCCATTCGACCTGCCGTTGATGAAAATGTTCTCAAAGTGCTCGGTTGTCGCACCAAGTTAATGGGGTGTGATGTTTACGGTTGTTCCAATCCAAACTGCGAACATACCAAGGTCGTTTGTTTCACATGCAAGTCCCGCTTTTGCTCAACCTGTGGAAAAAAAGCAACAGAGCAATGGATCGAAGAGCAAAACGCCACTCTCCCACAGTGCAAATGGCAACACATCACATTTACTATGCCTAGAAAATTCTGGGCATTTTTCTTATTCAATCGTGAATTACTCAATATAATCTTTAGGACTGCAGCCAATACGTTACTAGAAACCGCAAAGAAGAAAGGCCTTATCATTGGCATTTTCGCCGCTTTACATACATTTGGTCGAGATCTGAAATGGAATGTACATGTTCATATCTCCGTCACACGTGGAGGTTATGACGAAGCTAATGATTCTTGGTGTGAGATTTATTTTACTCGCAAAGTTATTATGCCAATGTGGCGCTATGCCGTCACCAACCTGCTTAGGCAAACCTACAAAGCTGGGGAGTTGACTATTCCTGATGAATACCAGAGTGAAATCAGTGACCTTACAACCTTCAATCGATTTTTAAATCGTGAATACCAGAAATTTTGGAAAGTCCACTTTGCTCAACCCAAAGAAAATCACCAGCACAATGTCGATTACCTCGGCCGCTACATTAAACGCCCGGCTCTCGCCAACGCCAGAATGGAGCACTATGATGGTAATGTTGTGATCTTTCGTTACCTGGATCACAAAACCAAACAGCAGAAAATGAAAAAGCAGAGTATCGACGATTTTATTGATCGCCTTACCCAACACATCCCGGACAAGTTCTTTAAAATGATCCGCTACTATGGATTTCGCCCTCCGTCATATGAAGTGCAACACCCAGTAGAGAGTTCACTCCCATAAAGATAAACTCTCTAGTTCGCCTTTTTGACTTAGAGGGTACAAATGGCTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGTTTATCAGAAGGGGACTCCATGAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTGCTCCTAGCACAGTCAGTCGTGAGACTAAACGGCATACCCCAAGCGATTTTAACGGTCTTTATTGCCATCGCTTGGCCTCGCGTTGTGCGCAAGAAAAACGGTCTAATGCTAAGCAAGGGCAGGATTTTCAGAAAATTTCAGAGAAAGCAAAAGTATTAATTCATGAGCGGTTAAGCACCCATACGTCACCCGATGTTATTAGTAAAGAGCTTATACAGGAGCATAATATCCAAGTGAGTGAGAGCACCATCTACCGTTATATTCATGAGGATCGAGAGAAAGGAGGAGAGCTTTACAAAAGCCTGCCCCACTCTGGAAAACCTTATAAGAAGAAGGTGAAAAGTGGTGATAAAACTAAAATACCGAACCGCGTTGGTATTGAACAAAGGCCCGCTATTGCTGACGAAAAGACTGAATTTGGACATTTTGAAATTGATACCATAGTAGGTCGAGATCACAAATCTTACTTGTTAACCCTTGTTGATAAAGCCAATAAGATGTGTTGTATAAGGAAAATGGCTAACAAATGTGCAGAAACCGTTGTTGAGACCTTCAGAAGTATAGTCGCCTCAACTTTCTTTGACTTTAAAACGATTACCTCAGATAACGGGACAGAATTCGCTGGTCATGAGGATATTTCAAAGATTACTGATGCTGATTTCTACTTTGCTAGACCTTATCGCTCTTGCGACAGAGGCCTAAATGAGCACACGAATGGTTTGATTAGGCGTTTTCTTCCTAAAGGAACAGACTTTAATGAAATAAGTGATGCTAAAATAGCAAAAATAGAGCATATAGCGCTCAACGAACAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGTGCTGCCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCGAGCTTCACGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTGCGTGCCTTGAATCGGCACACTCCACCACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGCCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGTGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCGATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTCACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCATTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTATTATTGCAATAACCTTCAACCACCATCGGTGCGATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCCATAAAGTTAATTCGTATCGATTTGCTGCCTGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGGCCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTTGCGACTTTCTCCAGGAAGGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATCTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGAGTTTTACCCGAATTCTGATCAATAAATTTTTGAAATTCCTCCATATCGCTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAATCTTGCTTTAACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGGGTGTCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAACTTGTGTAATAGGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAATTCTTAAGTCATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTCCTAATATTATGTCAGAAACTGTTGACCGAGCGCTATACATTGAATGCGAGAAGAAGGGCGAGTTTAGATTATCGCGCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGAATTTAATGGCGGCTTAGTGTAGAGTGGTGTTGCACTTCATATGACGGAGGGCGTTCTAAGCTATCGCACTCGGACAATAATACTACCAAAAATTTATGATTTAGTCGGGCAAACTATTGAGGCATATAACCAGGTCACGTTTGTTTCACTGATGAAAAGTAATTTCAACTACAACCCTCTTAAATGCATCTTGTGCGGCAGTCAGTTAAGAAGGATAAGCACCCAATTTGGTCTGACTCTTAGGGAAAAGTACAGTTACTATGAAGAGCTAGCAACCAGCCGATTTAGAGGCTTTTAGTAGGATAACTCCGCCAGAAATTAGAGAATTCGCCTATTTTCACCTAAAAAACCGCCTGCAGGCATTATATTCGGTAATGGCCACAGCAATACTGACCAGAATTTAACATCCTCCTAAACATTGCCGCCAAGATCATTTTTTTGAAATTCCTGAATCTTCAACTACTCAGTTTAATATTGCTAGTCTTTATTCTATAGCTAACCCGGAAGAGTCTTAATTAATGCGTCAGTAATTGCGTTGCAAAGATGCTCATGTTTTTTAATCACCTTTCTTATATTTCGTTTAAAATTAGCCCAGAATTTTTCAATTGGATTTAAGTCTGGTGAGTAGGCTGGCAAGTATAATAGTTCACAATCAACAGCTTCAACCATATCATAAAGTTCAGGGCTTTTATGGAAGCTTGCATTATCCATGATAATTACTTGCCCAGGATTTAGCTTCGGACATAATTCCTGTTCAAACCAGCCTAAAAACAAATCCTTATTCATTGCACCTGAAAATTCGAAAGGAGCAACCAAACTTTTATCACTATACTTCAAGCCAGCAACAAGGCTTAACCTTTTCCTCTTGAAGCCTGCTTGTTCAGCATAACTTCGCACTCCGGCAGCTGACCAGCCATATTCAACAACGATATTATCATCAACGCCAACCTCATCAAGATAAACTAATTGGCTCAAATCAATTCCTGTTAGCTTTTCTATAAATTCAGATCTTTCGGCGTCACGTCTTTGCTTATACTTAGGCTCTTTTTTTATATGTGACTTTTAATCGTTTCAATGCGTCATAAAAGGTTGACATAGGGAGGTCAGGAGCAATGCCATCACGAATGGCAATCCCATTTGCATCTGGATTTTTCTTTATGAAATCTAGAATAGTTTGTTTGTCATTAAACCTTATTTGTGCGCCACAGCCAACTCCTTGTTTTGAAGAGTAGTCACCTGTTGATAAATAACGTCGAATCCATTCACAAGCTGTATCATAATGCACCTTGAAAAGAGTGGATATTTCTCTTCGGCTAAGCCCATCTTTATAAGCTTCAATAACGCGCTCTCGCAAATCCTGACTATAAGCTTGCAATTCTAAAATCCTGCTATATTTTTCATGTAAGAATAATAGCAAAATCAAAAGGTTAACTCAACCGTGTCAGCTATATACAGAAACAAAAAACTGTTAGACTACTGCAATACTCGGTGAAATATCAAATGCAATGGTGAAATATCAAATGCAAAATGGTGAAATATCAAATGCAAAATGGTGAAATATCAAATGCAAAATGGTGAAATATCAAATGCAAAATGGTGAAATATCAAATGCAATGGTGAAATATCAAATGCAAAATGGTGAAATATCAAATGCAAAATGGTGAAATATCAAATGCAAAATGGTGAAATATCAAATGCAATGGTGAAATATCAA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189 | unidentified_phage(20.55%) | head,integrase,transposase,tail | attL 55752:55811|attR 142474:143579 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
168552 : 177080
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP039241|168552:177080|DBSCAN-SWA AATGAAGCCGACCGAAGAACAACAGAAGATAATTAACGCTGTAAAATCAGGAAATAACCTACATGTTGCAGCCTTTGCAGGAACAGGAAAAACAACCACATTAGAATTAATCGGTCGTCAATACTCAACTAAACAAGGTCTCTATCTAGCCTATAATCGAGCTATCTTAGATGACTCTAAAGGAAAATTTCCTAAAAATATCACCTGCAAAACCACCCATAGCTTAGCCTACGCCACGTATGGTCGTGACTATAGGGAAAAGCTAAATAATCGCATTACCTCTATGAAAGTGGCCGATCATTTAGAAATTAGCTTATTACGCCATCACATCAATGGTAAAATCGTTCAAGCCACATCACGCAACATTGCAGCCTGTGCCACTCGGATCGTTGCTCATTATTGCAATAGTGCGGATACTGAGATTGGTGTTCAGCACTTATCGATGTTTCACATTAAGATGTTGCAAAACCGTTATAAAAAAGAAGAAATTGAGCTAGAACTCGACAAAAGTCGCATCAACAAACCAAAAACATTTTTAGAATGCTATGCCAGAATCTGTCTACAAGAAGCAGAACAACTGTGGCAATGCATGATTGATCTTAAAAACCACACAATTGGCATCACGCATGACGGTTATTTAAAGCTTTATCAGCTCTCAAAGCCGATCTTGAATCAATATGACTTTATCATGCTCGATGAGGCACAGGATGCCAATCCTGCTATTTTAGATATTTTTGAACGTCAAACCGCCCAACGCATTTATGTGGGTGATCAGCATCAACAAATTTACTCCTGGCGTGGCTCTATCAATGCAATGGAACAAATGAGTGGTGAAAAACATTACCTTACTCAATCGTTTCGGTTTGGCCAGCCCATTGCCGACTTTGCCAATGAAATCCTAAAAAAATTAGGAGAATCACAACAAATTCAAGCGAACCCTAATGTCGCTAGCAAACTTGATGTAATTGACCCAAGCCAACCCTTTACAACGTTATGTCGAACAAACGCAGGTCTACTGACCTGTTGCTTGCAGCATATCGAGCTTGGTCGTCGTGTTGCCTGTGTAGGAGGCATTAAAGAGGCTCTATCTGATTTTACAGCTGCCTATTACCTTTGGCGTAACGAATTAGATAAAGTCATCTCAAACAAAATTAAACTCTATCAAACTTGGCAAAATCTTGTTGATGAAGCAAGCTTAACAGGAGATAGAGAGCTTAAAGGCATCATAAAATTTATTCTAGAGCATGATGAGTATAGCCTGGAAGTCATAGGAAAGATTAAAGAAGCTGTGGAGATGGATGAGAGTAAAGCGGATGTTATTCTCTCTACAGCTCATAAAGCAAAGGGCCGTCAGTGGTCACAAGTATTAATTCATATTGATTTTGAAGACTATAAAAGCTGTGGCGGTGAAGAATTGAACCTCTGGTACGTTGCAGTCACACGAGCCATGCATACACTCGATCTCAGTGAAATTTCAAAACAAGAAGATCTTGAGAAACCAAAGAGCCAACCTAAACAAGTAGCAGTTGCAACAGAACAAAAGCTCGAAGAGTTTGTCGATTTAGCCGAAGAATCTAAAGCCGCTAGCATTATTCAAAACAATCCTAATAAAAGCAGTCAGTGGCTAAAACTTAAAATGCATCAAAAAGGTATTGCGACCAATATTGCAGCTAAGTTACTACCAGACTGTGCCAGTCACGACCGTGAAGTCGCTCTCTGCTTGGCTCATAAAAAATGGCCAAAAATCAAAGCTAAAGATACCAGGCAACGTATTTCTAAGCTAGCAGGTTTCTTAGGCAGACAAGGCTTTAGTGCTGATTTATGTTGGGAGGTTGCAAGCTTACAAGAAAAGCTTAACGTCCCTTGAATCTGTGTAAGAAGTGTATTTTGAAGATAAACACAATCATCTTATTTATAAAAGGACGGTGATCAGTCTCAACTTAAAAAACAGCCACCATCGTTACTTCTAAAACTCAATTAATGGATTGTTTAGCCTAAACAGTTAAATCAACGGACTCGCCGTTTTTTTGTTGCTTTTTCTGAGGCTGATTAAATTTCTCAAACAGCTGCATCATCTCCTGTTGTTGCTGCTTCATGTATTGCATCATATTTTTTTGCATCTTCTCAAAATCACTCCAAGAATTACGCCCTCCGTCATATGAAGTGCAACACCCAGTAGAGAGTTCACTCCCATAAAGATAAACTCTCTAGTTCGCCTTTTTGACTTAGAGGGTACAAATGGCTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGTTTATCAGAAGGGGACTCCATGAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTGCTCCTAGCACAGTCAGTCGTGAGACTAAACGGCATACCCCAAGCGATTTTAACGGTCTTTATTGCCATCGCTTGGCCTCGCGTTGTGCGCAAGAAAAACGGTCTAATGCTAAGCAAGGGCAGGATTTTCAGAAAATTTCAGAGAAAGCAAAAGTATTAATTCATGAGCGGTTAAGCACCCATACGTCACCCGATGTTATTAGTAAAGAGCTTATACAGGAGCATAATATCCAAGTGAGTGAGAGCACCATCTACCGTTATATTCATGAGGATCGAGAGAAAGGAGGAGAGCTTTACAAAAGCCTGCCCCACTCTGGAAAACCTTATAAGAAGAAGGTGAAAAGTGGTGATAAAACTAAAATACCGAACCGCGTTGGTATTGAACAAAGGCCCGCTATTGCTGACGAAAAGACTGAATTTGGACATTTTGAAATTGATACCATAGTAGGTCGAGATCACAAATCTTACTTGTTAACCCTTGTTGATAAAGCCAATAAGATGTGTTGTATAAGGAAAATGGCTAACAAATGTGCAGAAACCGTTGTTGAGACCTTCAGAAGTATAGTCGCCTCAACTTTCTTTGACTTTAAAACGATTACCTCAGATAACGGGACAGAATTCGCTGGTCATGAGGATATTTCAAAGATTACTGATGCTGATTTCTACTTTGCTAGACCTTATCGCTCTTGCGACAGAGGCCTAAATGAGCACACGAATGGTTTGATTAGGCGTTTTCTTCCTAAAGGAACAGACTTTAATGAAATAAGTGGGACTGTTGCAAAAAATCAGAATAAGTTTCAGAAAGGTTGTTTACTTGCATTCCCTTCTTCAAATTAAGCAGCTAATCCAAATAACTTATTGATTAGCTGATTTTGGGCACAGATATTCTGTTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATACGCATTGCTTCCATCACATCAATGGTAGATCGTGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGAAAACGGGATTTGCGCTTTACCGCTTTGTGATCATTTTCAATCCCGTTATTTAAGTACTTCATTCGCCTGAGTTTACACTGACTAGAAAAGACACCTTCATCTTTGGCTTTTTGATGAGCCGGTGGAAATGAAGCGTGTTTATCGACGTTCACAACACGTGGCGGTTTCACGTAAGGTTGAGCCATTGCTTTTTTGAAAAAGCGCAAGGCCGCTTTAGCATTTTGCTGACGACTGAGCATCCAATCTAAAGTGTGGCCATATTTATCAATCGCTCGATAAAGGTAATACCAGCGCCCTTTAATTTTAACCAGCGTTTCATCCAGCCGCCAAGAGGCGCACGTTTGGCGGAAGTGGGGCCGTAACCGTTTAGCGATTTCAGGTCCATATTCATGAACCCAACGACAGATTGTTGAACGCTCAAGTTCAAGACCTCTTTCAGCTGCTATTTCTTTGAGATCACGGTAAGATAAGGCATAACAGCCATACCAACGCACCAACCAAAGAATGATATCACCAGAATAATGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATTGTTTACGTCTAGCCACAGTAATTAACTCTTAACTTCAGTTGATTACTACACCATACCTAAATCTAAATTTTTCGCAACAGTGCCCCTAAATGAGCACACGAATGGTTTGATTAGGCGTTTTCTTCCTAAAGGAACAGACTTTAATGAAATAAGTGATGCTAAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAATGCGAGAAGAAGGGCGAGTTTAGATTATCGCGCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGAATTTAATGGCGGCTTAGTGTAGAGTGGTGTTGCACTTCATATGACGGAGGGCGAAACCGTTGTTCTATGTATGCTATCAGTATATTACGATTCAGTGTAGTTACCACAAAACTATCTGACCATGACTGCTTATGTTAATATGCACCATCTATGTTTGGTTTGATGAAATTCAAGCTTCAATATGGAGCTGGGCCTTAGAGTCCATTTATAGCCGGGTGTGAACACGGCAACTTAAGAATGATTTAGTGAGACTGATTTTTTATGAAGAAATTATATGTAGGGAATTTGACATATTCTGTTGAAGACCGCGACCTAGTAGAGATGTTTTCAAAGTACGGTGAAGTGATTAGCGCAAGAGTGATTACTGATCGTGATACGGGTCGCTCAAAAGGATTTGCATTTGTTGAGTTTCAAACTCAGGAACAAGCGCAAGCAGCTCTTGAGCTTGATGGGAAAGACTCTGGTGGCCGTAACTTAAAAGTCAATATGGCTAAGCCACAAGAAAAAAGACAAAGTAGCTGGTAGACCAGTTGTTTTGCTGAGCCTCGTCTTGTGAGGCTCCACTTCTCCTCTAAGTATAAAAACATTCTTTGGCAAACTTTTTTTCCTAGACCTTTAACTCTTTTTTAAGTTTTCTTGACCTATCCAACAATTTTCACCGTTTATAAACTTTAGCTATTCCAGTGGTTCGCCCTCCGTCATATGAAGTGCAACACCACTCTACACTAAGCCGCCATTAAATTCTCTAAAAAAACATGATTAGGTGCGCGATAATCTAAACTCGCCCTTCTTCTCGCATTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTTAGCATCACTTATTTCATTAAAGTCTGTTCCTTTAGGAAGAAAACGCCTAATCAAACCATTCGTGTGCTCATTTAGGCCTCTGTCGCAAGAGCGATAAGGTCTAGCAAAGTAGAAATCAGCATCAGTAATCTTTGAAATATCCTCATGACCAGCGAATTCTGTCCCGTTATCTGAGGTAATCGTTTTAAAGTCAAAGAAAGTTGAGGCGACTATACTTCTGAAGGTCTCAACAACGGTTTCTGCACATTTGTTAGCCATTTTCCTTATACAACACATCTTATTGGCTTTATCAACAAGGGTTAACAAGTAAGATTTGTGATCTCGACCTACTATGGTATCAATTTCAAAATGTCCAAATTCAGTCTTTTCGTCAGCAATAGCGGGCCTTTGTTCAATACCAACGCGGTTCGGTATTTTAGTTTTATCACCACTTTTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCAGAGTGGGGCAGGCTTTTGTAAAGCTCTCCTCCTTTCTCTCGATCCTCATGAATATAACGGTAGATGGTGCTCTCACTCACTTGGATATTATGCTCCTGTATAAGCTCTTTACTAATAACATCGGGTGACGTATGGGTGCTTAACCGCTCATGAATTAATACTTTTGCTTTCTCTGAAATTTTCTGAAAATCCTGCCCTTGCTTAGCATTAGACCGTTTTTCTTGCGCACAACGCGAGGCCAAGCGATGGCAATAAAGACCGTTAAAATCGCTTGGGGTATGCCGTTTAGTCTCACGACTGACTGTGCTAGGAGCAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTCATGGAGTCCCCTTCTGATAAACGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAGCCATTTGTACCCTCTAAGTCAAAAAGGCGAACTAGAGAGTTTATCTTTATGGGAGTGAACTCTCTACTGGGTGTTGCACTTCATATGACGGAGGGCGGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCTGGTGATATCATTCTTTGGTTGGTGCGTTGGTATGGCTGTTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAACTTGAGCGTTCAACAATCTGTCGTTGGGTTCATGAATATGGACCTGAAATCGCTAAACGGTTACGGCCCCACTTCCGCCAAACGTGCGCCTCTTGGCGGCTGGATGAAACGCTGGTTAAAATTAAAGGGCGCTGGTATTACCTTTATCGAGCGATTGATAAATATGGCCACACTTTAGATTGGATGCTCAGTCGTCAGCAAAATGCTAAAGCGGCCTTGCGCTTTTTCAAAAAAGCAATGGCTCAACCTTACGTGAAACCGCCACGTGTTGTGAACGTCGATAAACACGCTTCATTTCCACCGGCTCATCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTGTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAATGAAGTACTTAAATAACGGGATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTTCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGATCTACCATTGATGTGATGGAAGCAATGCGTATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTAATCAATAAGTTATTTGGATTAGCTGCTTAATTTGAAGAAGGGAATGCAAGTAAACAACCTTTCTGAAACTTATTCTGATTTTTTGCAACAGTCCCCGGTAGAGTTCAACACCTGCGCCCTCCGTCATATGAAGTGCAACACCCAGTAGAGAGTTCACTCCCATAAAGATAAACTCTCTAGTTCGCCTTTTTGACTTAGAGGGTACAAATGGCTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGTTTATCAGAAGGGGACTCCATGAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTGCTCCTAGCACAGTCAGTCGTGAGACTAAACGGCATACCCCAAGCGATTTTAACGGTCTTTATTGCCATCGCTTGGCCTCGCGTTGTGCGCAAGAAAAACGGTCTAATGCTAAGCAAGGGCAGGATTTTCAGAAAATTTCAGAGAAAGCAAAAGTATTAATTCATGAGCGGTTAAGCACCCATACGTCACCCGATGTTATTAGTAAAGAGCTTATACAGGAGCATAATATCCAAGTGAGTGAGAGCACCATCTACCGTTATATTCATGAGGATCGAGAGAAAGGAGGAGAGCTTTACAAAAGCCTGCCCCACTCTGGAAAACCTTATAAGAAGAAGGTGAAAAGTGGTGATAAAACTAAAATACCGAACCGCGTTGGTATTGAACAAAGGCCCGCTATTGCTGACGAAAAGACTGAATTTGGACATTTTGAAATTGATACCATAGTAGGTCGAGATCACAAATCTTACTTGTTAACCCTTGTTGATAAAGCCAATAAGATGTGTTGTATAAGGAAAATGGCTAACAAATGTGCAGAAACCGTTGTTGAGACCTTCAGAAGTATAGTCGCCTCAACTTTCTTTGACTTTAAAACGATTACCTCAGATAACGGGACAGAATTCGCTGGTCATGAGGATATTTCAAAGATTACTGATGCTGATTTCTACTTTGCTAGACCTTATCGCTCTTGCGACAGAGGCCTAAATGAGCACACGAATGGTTTGATTAGGCGTTTTCTTCCTAAAGGAACAGACTTTAATGAAATAAGTGATGCTAAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAATGCGAGAAGAAGGGCGAGTTTAGATTATCGCGCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGAATTTAATGGCGGCTTAGTGTAGAGTGGTGTTGCACTTCATATGACGGAGGGCGACATCCAGCCTTCATTTGTTCTCAAATAGGTCACATCACCCGCCCAAGCCACATTTGGAGTCGTTGGGTTAAACTGCTGATTAAGTAAATTATCAGCGATTTCGTGGTGATGTTTACGCTTTGTTGTCACTTTATAAGCAATACGCTGCCTAACTTTCAGCCCAAGCTTTCGCATCAAGCTTCTCGCTCGATAGCGCCCAACAGTAACGCCTTCTTCTTGAAGTTTTTTAGCCATCATACGAGATCCCAAGCTTTCACGACTCTGTTTAAATAGCTCTTTGCATCGCCTGTATAGTTGCAGCTCCTCTACTGAGATTACTTTGGCAGGGCGCTCTTGCCAACTATAGAAGGCTGATGTGCTCACCTTCATAATTTTACACATCAAATTAACAGGGCATAAGTCTTTGTTATCTCTAATAAAGTTAAACTTTACTTCATTTCTTTCGCGAAGAAGGCACTGGCCTTTTTTAAAATTTCTTTCTCCATACGGAGCTGCTTCACTTCTTTACGTAAGGCTTTTAGCTCTTCTTTTTCATCTGGACTCATTGTAGACTTCGCCTGTTTTTCTTGCTGATCTTTCCAGCGATAGAGCAAGTTGGCTCTAATTCCTAAAGAATCTGCCGCTTTTTGAACGCTGTAGCCTTGTTCTGTCACTAAAGCAACAGCTTCTTCCTTGAATTCTTTAGGGTAACTTTTGCTTTGTTTCTTCTGCTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP039241|168552:177080|168552_170418_+|WP_155081712.1|DBSCAN-SWA MKPTEEQQKIINAVKSGNNLHVAAFAGTGKTTTLELIGRQYSTKQGLYLAYNRAILDDSKGKFPKNITCKTTHSLAYATYGRDYREKLNNRITSMKVADHLEISLLRHHINGKIVQATSRNIAACATRIVAHYCNSADTEIGVQHLSMFHIKMLQNRYKKEEIELELDKSRINKPKTFLECYARICLQEAEQLWQCMIDLKNHTIGITHDGYLKLYQLSKPILNQYDFIMLDEAQDANPAILDIFERQTAQRIYVGDQHQQIYSWRGSINAMEQMSGEKHYLTQSFRFGQPIADFANEILKKLGESQQIQANPNVASKLDVIDPSQPFTTLCRTNAGLLTCCLQHIELGRRVACVGGIKEALSDFTAAYYLWRNELDKVISNKIKLYQTWQNLVDEASLTGDRELKGIIKFILEHDEYSLEVIGKIKEAVEMDESKADVILSTAHKAKGRQWSQVLIHIDFEDYKSCGGEELNLWYVAVTRAMHTLDLSEISKQEDLEKPKSQPKQVAVATEQKLEEFVDLAEESKAASIIQNNPNKSSQWLKLKMHQKGIATNIAAKLLPDCASHDREVALCLAHKKWPKIKAKDTRQRISKLAGFLGRQGFSADLCWEVASLQEKLNVP >NZ_CP039241|168552:177080|176346_176745_-|WP_155081715.1|transposase|DBSCAN-SWA MCKIMKVSTSAFYSWQERPAKVISVEELQLYRRCKELFKQSRESLGSRMMAKKLQEEGVTVGRYRARSLMRKLGLKVRQRIAYKVTTKRKHHHEIADNLLNQQFNPTTPNVAWAGDVTYLRTNEGWMSPSVI >NZ_CP039241|168552:177080|175352_176327_+|WP_155079445.1|transposase|DBSCAN-SWA MAYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSMRSIARALGFAPSTVSRETKRHTPSDFNGLYCHRLASRCAQEKRSNAKQGQDFQKISEKAKVLIHERLSTHTSPDVISKELIQEHNIQVSESTIYRYIHEDREKGGELYKSLPHSGKPYKKKVKSGDKTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTIVGRDHKSYLLTLVDKANKMCCIRKMANKCAETVVETFRSIVASTFFDFKTITSDNGTEFAGHEDISKITDADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDAKIAKIEHTLNARRRASLDYRAPNHVFLENLMAA >NZ_CP039241|168552:177080|174509_175175_+|WP_155081714.1|transposase|DBSCAN-SWA MILWLVRWYGCYALSYRDLKEIAAERGLELERSTICRWVHEYGPEIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAALRFFKKAMAQPYVKPPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRMKYLNNGIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARSTIDVMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLINKLFGLAA >NZ_CP039241|168552:177080|171721_172450_-|WP_155081713.1|transposase|DBSCAN-SWA MARRKQFKKNQPFKWKHYSGDIILWLVRWYGCYALSYRDLKEIAAERGLELERSTICRWVHEYGPEIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAALRFFKKAMAQPYVKPPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRMKYLNNGIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARSTIDVMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLINKLFGLAA >NZ_CP039241|168552:177080|173404_174379_-|WP_155079445.1|transposase|DBSCAN-SWA MAYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSMRSIARALGFAPSTVSRETKRHTPSDFNGLYCHRLASRCAQEKRSNAKQGQDFQKISEKAKVLIHERLSTHTSPDVISKELIQEHNIQVSESTIYRYIHEDREKGGELYKSLPHSGKPYKKKVKSGDKTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTIVGRDHKSYLLTLVDKANKMCCIRKMANKCAETVVETFRSIVASTFFDFKTITSDNGTEFAGHEDISKITDADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDAKIAKIEHTLNARRRASLDYRAPNHVFLENLMAA >NZ_CP039241|168552:177080|176792_177080_-|WP_155080338.1|transposase|DBSCAN-SWA MKQKKQSKSYPKEFKEEAVALVTEQGYSVQKAADSLGIRANLLYRWKDQQEKQAKSTMSPDEKEELKALRKEVKQLRMEKEILKKASAFFAKEMK >NZ_CP039241|168552:177080|172940_173204_+|WP_032126138.1|DBSCAN-SWA MKKLYVGNLTYSVEDRDLVEMFSKYGEVISARVITDRDTGRSKGFAFVEFQTQEQAQAALELDGKDSGGRNLKVNMAKPQEKRQSSW |
8 | unidentified_phage(28.57%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
3613 : 48333
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039243|3613:48333|DBSCAN-SWA ACTAAAAGCCTCTAAATCGGCTGGTTGCTAGCTCTTCATAGTAACTGTACTTTTCCCTAAGAGTCAGACCAAATTGGGTGCTTATCCTTCTTAACTGACTGCCGCACAAGATGCATTTAAGAGGGTTGTAGTTGAAATTACTTTTCATCAGTGAAACAAACGTGACCTGGTTATATGCCTCAATAGTTTGCCCGACTAAATCATAAATTTTTGGTAGTATTATTGTCCGAGTGCGATAGCTTAGAAATCCATAGTAGCGGATCATTTTAAAGAACTTGTCCGGGATGTGTTGGGTAAGGCGATCAATAAAATCGTCGATACTCTGCTTTTTCATTTTCTGCTGTTTGGTTTTGTGATCCAGGTAACGAAAGATCACAACATTACCATCATAGTGCTCCATTCTGGCGTTGGCGAGAGCCGGGCGTTTAATGTAGCGGCCGAGGTAATCGACATTGTGCTGGTGATTTTCTTTGGGTTGAGCAAAGTGGACTTTCCAAAATTTCTGGTATTCACGATTTAAAAATCGATTGAAGGTTGTAAGGTCACTGATTTCACTCTGGTATTCATCAGGAATAGTCAACTCCCCAGCTTTGTAGGTTTGCCTAAGCAGGTTGGTGACGGCATAGCGCCACATTGGCATAATAACTTTGCGAGTAAAATAAATCTCACACCAAGAATCATTAGCTTCGTCATAACCTCCACGTGTGACGGAGATATGAACATGTACATTCCATTTCAGATCTCGACCAAATGTATGTAAAGCGGCGAAAATGCCAATGATAAGGCCTTTCTTCTTTGCGGTTTCTAGTAACGTATTGGCTGCAGTCCTAAAGATTATATTGAGTAATTCACGATTGAATAAGAAAAATGCCCAGAATTTTCTAGGCATAGTAAATGTGATGTGTTGCCATTTGCACTGTGGGAGAGTGGCGTTTTGCTCTTCGATCCATTGCTCTGTTGCTTTTTTTCCACAGGTTGAGCAAAAGCGGGACTTGCATGTGAAACAAACGACCTTGGTATGTTCGCAGTTTGGATTGGAACAACCGTAAACATCATACCCCATTAACTTGGTGCGACAACCGAGCACTTTGAGAACATTTTCATCAACGGCAGGTCGAATGGAATCAGCGTGTTTAGCGCGATAGTTCCACCAAGCACTTCGATATTGAAGTACGTGCTTCAGTGTGAATTGAATTTGATAGGTTTCATCTTTCTGCCGCTGGATCACCATTGAGAACAAATTACCATATTAAACAACGAATCAGGATAACAAGGTTAGATCAGATCTAACAAGACTAATGTGAGTTAATAAGCGGTAAAGTGACGGGTGTTAGCAGGGACATCCGAAAGTCGCGAGCTGTGCGAGCCTATTCTTGGAGAACATTTTCATCAACGGCAGGTCGAATGGAATCAGCGTGTTTAGCGCGATAGTTCCACCAAGCACTTCGATATTGAAGTACGTGCTTCAGTGTGAATTGAATTTGATAGGTTTCATCTTTCTGCCGCTGGATAACCATTGAGAACAAATTACCATATTAAACAACGAATCAGGATAACAAGGTTAGATCAGATCTAACAAGACTAATGTGAGTTAATAAGCGGTAAAGTGACGGGTGTTAGCAGGGACATCCGAAAGTCGCGAGCTGTGCGAGCCTATTCTTGTAACAGAAAACGCATTCACTCAGCTAATGATTATTTATCACCTGAGGAATACGAGCATAATCAAAAAATCAGTTAAAAATTTGTCTAGAAAAAGGTTGCCAGATCACTGATGCAGTTTACCATTTCTTTTGCGGGCTTTGAAAGTTCGCGTTTTTTATGATAAATACAGACGAGATCAGCATAAAAACGTTTTTTTACAAAGGATATTTCACGTAAGTTTTGATCAATTAAGTGTTTAGGAAAAATGCTCCAGCCAATTTCAGCCTCAACCATTTTTTTTATCGTCTCCAGCATATTAATATTTGATATTATTTTTGACTCTATTCCGTAATCATTGCGAATATCATTGAGTATATCATAGTAGATATTTACTTTTTCAGGTGCAATCAATGGAATTTGAGACAATCTAGTAATTTCTTTACCTTTTTGTCTGAAAAATGGATGAGTGGGGCTTAATACGACACGCATATCATTTTTCCAAAATTTTTTTACAATGATATCACTTAGAGTTTCTCTAGGCAGAGAGATAAAACCAATGTCTATATTATAATTAATAATAAGATCAATAATTTCACTTGATGTACGAAAAATAAAATTATAATCAACCTCTGGAAATTTATTTTTATAGTTTTTAATAAGTCCAGGGAGTTGATGGGTTGCAATATGGTTGTTGCAGCCAATCGTTAAGGTTCCACAGACTGTTTGGCTAAAGTTGGCAATCTGATGAAGACCATTTTGCCACTCAGTGTAGATAGTACGAGCGCGAGGTAAAAAGGCTTGACCTGCTTCTGTCAATACAATACGGTGGCCAATGCGTTCAAATAGCTTAATTTTAAATTGGCTTTCTAAATTGGCAATGCGTTTAGTGACTGCAGGTTGAGTTAAATGTATGTATTCACTGGCTTTGGTAAACGACTTTGTGTCAGCTACGGCCAGAAAAGCGGTAATATTCTTCATTACAATCCATATATTCCAAAAAGCTATCATTTTTATAAAAATAATTCATTTGAGCCATCATTGTCAATACTTTAAAGTTACATAACTTTAATAACCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGAGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCAGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTGGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGCAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTTTAATTTTACAAGGGTTGTTCAATGATATTAGTACCTTATATTGTTGCTGGTGTTTTTACAGGAATTCTTTCAGGGTGGGTAGGCGCTGGTGGCGGCATTGTTATTGTCCCCGTGATGTTATGGCTGGCAGCACAACAAGGAATAAATACGACATTGGCTATGCATCTTGCAGTAACAACATCACTTGGTTTTATCATGGTTAATTCATTGTATACAACTTTTCATCACTATCGAAGTAATAACTTAGTGATTCCTTTATTTAAGGGTATTGTTATTTTTACAGTTATTGGCGCTTTAATCGGTGGGCAGCTTGATAAAATTATTCCTGTTGCTTTTGTGAAAATATTATTTACTGTAATTATTATCAGTGTGTTAGTTCAAAGTTTTTTTAATCGTATCAACCAGGTCGGGAGGTTTGAATGTCAGCCGGTGTATCCAGGATTTTTATCACGGTCAATAATGGGATTCTCTGTTGGTATTCTTGCTTCTTTAGTTGGTATTGGTGGATCAGCGATTACTAATCCGTATATGCAATACCATCGTTATCCAATGAAAAAAAGCGCGGCGATGTCAACAGCGCTGGCTTTTCCTATGGGTTTATTTGCACTTGCCAGTTTATTGGCTTCAAGTGTAGGTATGGTTGGTCTACCTTATGGCAGTGTAGGCTATTTGTATCTCCCGGCTTTTACTGGTTTATTGATCGGGTCACTCTTAGGCTCACCTCTTGGAGTGTGGCTGGTTAAGCGCGCTTCCGAACAAATTTCCGTTTGGGTATTTCGTATTATATTATTAGCAGTGGTTATTCAGATGGTTCGCTGATATGGCACTGTTGCGACAAAATCAGAAAATTACCTTAGAACCGTGGCAGCTGTTTATTATGGTTCTGTCTCAATTTGAGCTGATGGTATAATGCTGGTTTTTGTTTAAGGTGGAGTCATGATCAATTTCAGCGGCCGTCATTTTAAGAAAGACCTGATCATGATGGCCATTCGGTGGTACATCGCTTATACGTTGAGCTATCGTGACATCGAAGAACTTATGGCTGAGCGTGGTATTCCAGTTGATCATTCAACGATTCATCGTTGGGTTGTTGAGTATACTCCACAGCTAGAGGGACGATTTAAGAAGCGCTATAAGCGCCAACCTGGGGCTAGTTGGCGTCTGGGATGAGACTTACATTAAGATCAAAGGCTGAAATGATCCCCAAAATTTAATGTCTAAGTTAAGGCATACTTTTGGAGATTTTTACATGAGCAGACAGCAGTATTCAGGCAGCAAAAAGTTCCAGATTACACTTGAAGCAATAAAGGGCAAAGAGACCATTGCAGCTCTCAGCACCAAGCACGGCATTGCACCCACATTAATTTCAAAGTGGAAGAAAGACTTGCTTGAACGAGGCTGTGAACTTTTTGAAAAAGGCTATAAAACCGCCGATGTTCGTTTAGAGCATGAACGCGACCAGCTGTTTAAAAAAGTTGGCGAGCTGAGCCTAGAGGTGGATTACTTAAAAAAGGGCTTCGCGAGCATTTAACCTCTAAAGAACGTCGATTGCTCGTGAATCCAGAGTTGAAAATTACGGTCGCCCGCCAGTGTGAGTTGCTTAGTGTTGAGCGCAGTGGGCTTTATTATAAGCCGGTGCCAAAAGTTGATGATACGGTGATGATGAATCGTATTTATGACATTTGGTACCAAAGTCCTTGTTTTGGTTATCGTCGCGTGACAAAAGTTCTGCGCCGTGAAGGCATGCGAGTGAATCGTAAGAAAGTGAAGCGCCTGATGAATTTAATGGGGTTAAAAGCCATTTTCCCAGGGCCAAAGACCTCATTAAAAGGAGAAAATCATAAAATTTATGATTATTTACTGGACGGACTTCACATCGTGCGACCCAATCAAGTTTGGCAGGTGGATATTACCTATATTCGCACACGTAAAGGCTTTGCTTATCTTACGGCCTTAATCGATGTCTACAGTCGTTATATTGTAGGCTGGGCGCTGT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56 | unidentified_phage(27.78%) | transposase,integrase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
915 : 57804
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039242|915:57804|DBSCAN-SWA AATGAGGATTTTTGTTTTAAGGTTCGCCATGCTTTCACGCCCACCCAAAGGTCATCGTTTTCCTGCCCAGGTTATCAGTTATGTTATCTGGCTCTATCATCGTTTTAGTTTGAGCTATCGTGATATTGAAGAAATGATGGCAGAACGAGGATTGAGAGTGAGCTATGAAAGCGTTAGGCGTTGGTGTAAAAAATTTGCTCGGCCCCTGACTCAACGATTGCGCAAGAAAGAAGCGAAGCGATCTGATAAATGGCATTTAGATGAGATGACCATAAAAATTAATGGTGACAAGTATGTGTTGTGGCGTGCGGTAGATAGTGAAGGCTATGAGCTGGATATCTTCATTCAAAAGCGCAAAAATAAAAAGTCGGCGATGCGTTTTTTGAAACGACTATTGGGTTCAAATCCCGCACCACGTGTGATTGTGACGGATAAATTACGCAGCTATAATCAGCCGATTAAAAAGTGCTGCCCTAATGCTGATCATCGCAAACATAAAGGCCTCAATAACCGCGTTGAGAATGCGCATCAACCAACACGCCGCCGTGAGAAATCACTGATCAAAATGAAGTCGACAAACTCGGCTCAAAAAATGCTGAAGCTGATGGGGGTCACTCGTAATTTTTTTGCTGTTGATGTCGGTCGTTATCGTAACCCTGCATCAGTCAGGAGACAAAAACTAAGCCAGGCTTTTCAATGTTGGAATGATGTCACCGCACAGGTGCTTTGTGCCTAAAATAAGGTAATATCCATATAATTTTGGATTCTGAAAATAACGTGACGGTGCCATTGATAAATATGGCCATACTTTGGATTGGATGCTCAGTCGTCAGCAAAATGCTAAAGCGGCCTTGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGATAAACACGCTTCATTTCCACCCGCTCATCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTGTCTTTTCTAGGCGATGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAATAACGGCACTGTTGCGAAAAGTTATCGTGAGTTTCAGAAAGGTTATTTTCTTGTGTTAGCTACCTTAGAATTAAGCAGCTAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGGTTTTGGGCGCAGATATCCTGCTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATACGCATTGCTTCCATCACATCAATGGTAGATCGTGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGAAAACGGGATTTGCGCTTTATCGCTTTGTGATCATTTTCAATCGCTAAGGGTCTGATTCCCCGCAGCTTGCTGCGAAAAAAAACAAAGCGCATTACGACCCGAAGGGGTAATTTTCCGAAATACCTCGTAGCTTGCTGCGAGGATAGGTAAATTGAGTTTTGCGCAAATTTATTGCAGTTATTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACATCGCCTAGAAAAGACACCTTCATCCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGATTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTTTGGCTTTTTGATGAGCGGGTGGAAATGAAGCGTGTTTATCGACATTCACAACACGCGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCGATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCAAGGCCGCTTTAGCATTTTGCTGACGACTGAGCATCCAATCCAAAGTATGGCCATATTTATCAATCGCTCGATAAAGGTAATACCAGCGCCCTTTAATTTTAACCAGCGTTTCATCCAGCCGCCAAGAGGCACACGTTTGGCGAAAATGGGGCCGTAACCGTTTAGCGATTTCAGGTCCATATTCATGAACCCAACGACAGATTGTTGAACGTTCAAGCTCAAGACCTCTTTCACCTGTCATTTCTTTGAGGTCACGATAAGACAAAGCATAGCGGCCATACCAGCACACCAACCAAAGAATGATCTCACCAGAATAATGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTCTAGCCACAGTAATTCACTCTTAATTTCAGTTGATTGCTACACCCTACTCAAATCTAAATTTTTCGCAACAGTGCCCTCCAAAGCACTCGTACTTTAAATAGATTGGCGTTATTGCTAGCTTTTAAGGCTCGTACTTTAAATAGGTTTGGAGGCTCCAAAGTACTCGTACTTTAAATAGATTGGCGCTATTGCTAGCTTTTAAGGCTCGTACTTTAAATAGATTGGCGCTATTGCTAGCTTTTAAGGCTCGTACTTTAAATAGATTGGCGTTATTGCTAGCTTTTAAGACTCGTACTTTAAATAGGTTTGGAGCTTCTGAAAGCATAGAGCCCTACGCAAACAACCTTGTTAAGCGCCCTCCCATTCTTTAATGGCGTTATACTCTAAAAAGCCAAGAGAGACTTATACTCTCACTTCAATCTCCATCGTCGCCCGACAGTCAGGGTATCCACTACAGCCCCAAAATTTACTAGTTTTCTGACCTTCACCTTTAGCATGTCTTAACTTCATAGGCTTTGTACATTCAGGGCACGCAGGCCCATCTTCTTGTATGATCAGGACAGGCTTGTTTCGGTTATCCTTGAATGTTTTCTTGCATGTCATGTTTTGACATCCCCAAAAAAAACCATATTTTCCTTTGATTCTCTTAAGCGCACCGTTGCAAGTAAGGCAAGCATGTTCACTTTTTTCTGCCCCACCTTGATTCGCAGCTTGCACTTGCACTCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGATTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTGAATCGTTTTAGCTCTCTCTTTATAGCTAACCCGGAAGAGTCTTAATTAATGCGTCAGTAATTGCGTTGCAAAGATGCTCATGTTTTTTAATCACCTTTCTTATATTTCGTTTAAAATTAGCCCAGAATTTTTCAATTGGATTTAAGTCTGGTGAGTAGGCTGGCAAGTATAATAGTTCACAATCAACAGCTTCAACCATATCATAAAGTTCAGGGCTTTTATGGAAGCTTGCATTATCCATGATAATTACTTGCCCAGGATTTAGCTTCGGACATAATTCCTGTTCAAACCAGCCTAAAAACAAATCCTTATTCATTGCACCTGAAAATTCGAAAGGAGCAACCAAACTTTTATCACTATACTTCAAGCCAGCAACAAGGCTTAACCTTTTCCTCTTGAAGCCTGCTTGTTCAGCATAACTTCGCACTCCGGCAGCTGACCAGCCATATTCAACAACGATATTATCATCAACGCCAACCTCATCAAGATAAACTAATTGGCTCAAATCAATTCCTGTTAGCTTTTCTATAAATTCAGATCTTTCGGCGTCACGTCTTTGCTTATACTTAGGCTCTTTTTTTATATGTGACTTTTAATCGTTTCAATGCGTCATAAAAGGTTGACATAGGGAGGTCAGGAGCAATGCCATCACGAATGGCAATCCCATTTGCATCTGGATTTTTCTTTATGAAATCTAGAATAGTTTGTTTGTCATTAAACCTTATTTGTGCGCCACAGCCAACTCCTTGTTTTGAAGAGTAGTCACCTGTTGATAAATAACGTCGAATCCATTCACAAGCTGTATCATAATGCACCTTGAAAAGAGTGGATATTTCTCTTCGGCTAAGCCCATCTTTATAAGCTTCAATAACGCGCTCTCGCAAATCCTGACTATAAGCTTGCAATTCTAAAATCCTGCTATATTTTTCATGTAAGAATAATAGCAAAATCAAAAGGTTAACTCAACCGTGTCAGCTATAACTCTAGTGACCAACGCTGCGAGCCAAGGAGTGCAAGGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTGGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGCAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTTTATTTAGCCACCCTGAAATATCGTTCAGAAATTTATCTAACTCAACTTCACCTGTAGCGACTTTCTCTAACTCCTGCTCCCATGCTGCGGTTAACTCAGGCGACTTGATTGACTTGGGAATTAACTTTAACAACATATAGGCTTTATCAGTCGCTTTCATCGACTTTTTCTCGCGTATTAAATACCCGCGATCAACCGCACCTTGAATAATTCCTGCACGTGTTGCTGGTGTGCCTATACCTGACGTTTCCTTGAGGATTTTCTTAAATCGATCATCCTCAGCCAACTTTGCAATATTTTCCATTGAAGAAAGAAGGCTCGCTTCAGTATGATGCGCCGGAGGCTTTGTCATTTTATTTTGCAACAGCACATCAATTATATTTGCATCATCACCCGCCTGCACTTGCGGTAGATTAGATTGCTCTTGCTCATCTTCATTGTCGTTTTTTTCTTTCTTCGGCAATTCAATAACACGCTTCCA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56 | Streptococcus_phage(39.13%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
61342 : 106498
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP039242|61342:106498|DBSCAN-SWA 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57 | Streptococcus_phage(36.84%) | integrase,transposase | attL 67152:67211|attR 100919:101880 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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