CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP039217	Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed3, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP039214	Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a chromosome, complete genome	2 crisprs	RT,cas3,DEDDh,DinG,csa3	1	1	34	25
NZ_CP039216	Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed2, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	2	7
NZ_CP039218	Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed4, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP039215	Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence	1 crisprs	RT	0	3	1	0

1. NZ_CP039215

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP039215_1

• CRISPR_ID: NZ_CP039215_1
• CRISPR_location: 137109-137332
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 3 spacers

Consensus repeat of NZ_CP039215_1

Consensus_repeat	Method
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	CRT

spacers of NZ_CP039215_1

>1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT
ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
>1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT
TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
>1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT
ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039215_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP039215_1

>merge|NZ_CP039215|1|137109-137332|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAGAAATGGAACACAAACGGAATACAAGTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATAAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACACAAACGGAACACAAA

>NZ_CP039215|1|1|137109-137332|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
AAATGGAACACAAACGGAATACAAG	TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP039215.1|WP_075273822.1|129396_129897_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379554
NZ_CP039215.1|WP_075275149.1|141498_142473_+|IS30-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
NZ_CP039215.1|WP_075274741.1|129998_130256_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039215.1|WP_155047013.1|132784_132931_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039215.1|WP_032126838.1|127600_127804_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039215.1|WP_054300202.1|138769_139498_+|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP039215.1|WP_032126844.1|146985_147282_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039215.1|WP_081377350.1|133260_134076_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|377437
NZ_CP039215.1|WP_059372616.1|134321_134912_+|site-specific-integrase	unknown	unknown	gnl|CDD|271175
NZ_CP039215.1|WP_054300202.1|145555_146284_-|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP039215.1|WP_075273820.1|128157_129240_-|IS481-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|366234
NZ_CP039215.1|WP_129556703.1|142698_143187_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039215.1|WP_032126843.1|146587_146767_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039215.1|WP_016211879.1|135877_136897_+|ParA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224113
NZ_CP039215.1|WP_016212255.1|127800_127971_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039215.1|WP_016212168.1|139466_141155_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039215.1|WP_016211956.1|143244_143973_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039215.1|WP_016211955.1|144429_145410_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039215.1|WP_155046770.1|138546_138714_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|235600
NZ_CP039215.1|WP_129556718.1|130324_131511_-|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|222853

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP039215.1|WP_075273822.1|129396_129897_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|379554	pfam14319, Zn_Tnp_IS91, Transposase zinc-binding domain. This domain is likely to be a zinc-binding domain. It is found at the N-terminus of transposases belonging to the IS91 family.	3.05671e-28
NZ_CP039215.1|WP_075275149.1|141498_142473_+|IS30-family-transposase	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	3.60259e-75
NZ_CP039215.1|WP_054300202.1|138769_139498_+|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP039215.1|WP_016211879.1|135877_136897_+|ParA-family-protein	gnl|CDD|224113	COG1192, Soj, ATPases involved in chromosome partitioning [Cell division and chromosome partitioning].	2.24633e-33
NZ_CP039215.1|WP_075273820.1|128157_129240_-|IS481-family-transposase	gnl|CDD|366234	pfam00665, rve, Integrase core domain. Integrase mediates integration of a DNA copy of the viral genome into the host chromosome. Integrase is composed of three domains. The amino-terminal domain is a zinc binding domain pfam02022. This domain is the central catalytic domain. The carboxyl terminal domain that is a non-specific DNA binding domain pfam00552. The catalytic domain acts as an endonuclease when two nucleotides are removed from the 3' ends of the blunt-ended viral DNA made by reverse transcription. This domain also catalyzes the DNA strand transfer reaction of the 3' ends of the viral DNA to the 5' ends of the integration site.	4.76533e-23
NZ_CP039215.1|WP_081377350.1|133260_134076_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|377437	pfam04986, Y2_Tnp, Putative transposase. Transposases are needed for efficient transposition of the insertion sequence or transposon DNA. This family includes transposases IS1294 and IS801. This is a rolling-circle transposase.	2.93086e-44
NZ_CP039215.1|WP_059372616.1|134321_134912_+|site-specific-integrase	gnl|CDD|271175	cd00397, DNA_BRE_C, DNA breaking-rejoining enzymes, C-terminal catalytic domain. The DNA breaking-rejoining enzyme superfamily includes type IB topoisomerases and tyrosine based site-specific recombinases (integrases) that share the same fold in their catalytic domain containing conserved active site residues. The best-studied members of this diverse superfamily include Human topoisomerase I, the bacteriophage lambda integrase, the bacteriophage P1 Cre recombinase, the yeast Flp recombinase, and the bacterial XerD/C recombinases. Their overall reaction mechanism is essentially identical and involves cleavage of a single strand of a DNA duplex by nucleophilic attack of a conserved tyrosine to give a 3' phosphotyrosyl protein-DNA adduct. In the second rejoining step, a terminal 5' hydroxyl attacks the covalent adduct to release the enzyme and generate duplex DNA. The enzymes differ in that topoisomerases cleave and then rejoin the same 5' and 3' termini, whereas a site-specific recombinase transfers a 5' hydroxyl generated by recombinase cleavage to a new 3' phosphate partner located in a different duplex region. Many DNA breaking-rejoining enzymes also have N-terminal domains, which show little sequence or structure similarity.	6.85681e-23
NZ_CP039215.1|WP_155046770.1|138546_138714_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|235600	PRK05771, PRK05771, V-type ATP synthase subunit I; Validated.	0.00878538
NZ_CP039215.1|WP_054300202.1|145555_146284_-|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP039215.1|WP_129556718.1|130324_131511_-|IS3-family-transposase	gnl|CDD|222853	PHA02517, PHA02517, putative transposase OrfB; Reviewed.	5.96251e-84

Protein sequences

>NZ_CP039215.1|WP_016211879.1|135877_136897_+|ParA-family-protein
MTKAWTPGQLISLYRTNKAKSSVLRDEQKGVIPPAKREKRGAISVRVWDEELIPLIGEQYGFLKKNFKKKRNPQSVISVYAPKGGVLKSTLAFNLARIFSINNISVLAIGLEVSQRTLTSNLELVHDHEVESLAEAQKLHSGGLWDVSEGSQSIQDVICKSSLPNLHYIPESTDLNLLEQRIKDSPRREYFLQKLLKPIMKNYEVIIFDNSPSWGSLLVQNSLTLATDVVAPFSCELESYRSVTTNIEMINDFKRDMELNWNSFSIVPTKVDQTKLSKEIETQYRVLFPEFVTASSIRFLRGVAEESGMEQLSVIENSNTSSLADDYYNLSKELWTKLS
>NZ_CP039215.1|WP_059372616.1|134321_134912_+|site-specific-integrase
MGLNKQAKILSERQEKAVLSSLQSTTYPTRNTVMFLLSIKAGLRAKEIAALTWNMLLTPEGQLCEAIHLRNTASKGKQGGRVIPLNKQLKQALSQLLDESKPKHGQRPVILSRRNSHFPTQTVVNWFAELYKNLGFEGCSSHSGRRTFVTRAAKNIIKAGGSLRDVQQLAGHTTLQTTQRYIEGDSEAKKRIVDLI
>NZ_CP039215.1|WP_081377350.1|133260_134076_+|hypothetical-protein
MLSCIFRAELSSASAEVYPQALLAPRGARNVHVHISVTRGGYDEANDSWSEIYFTRKVIMPMWRYAVTNLLRQTYKAKELTIPDEYQGEISGLTTFNRFLNREYQKFWKVHFAQPKENHQHNVDYLGRYIKRPALANARMEHYDGNVVIFRYLDHKTKQQKMKKQSIDDFIDRLTQHIPDKFFKMIRYYGFLSYRTRTIILPKIYDLVGQTIETYQQVTFTSLMKSNFNYNPLKCILCGNQLRRVSTQFGLTLREKYNYYEELATSRFRGF
>NZ_CP039215.1|WP_155047013.1|132784_132931_+|hypothetical-protein
MSNISSLNVLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP039215.1|WP_129556718.1|130324_131511_-|IS3-family-transposase
MNYNNPSRRNHNGKRHVTKYTEEFKKSSAKLAVDSNQAISHTAQELGIHSSTLHGWVNKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAALLCKRNTVKYAWIKENKCVFPVDRVCSILGVSRSGYYSWLKVQPSKRMIENQKLARRIKEIFIESRATYGTRRIRKQLATQEISVSRKRVGRLMKQNQLCCKIKRKFKVTTDSKHRLPIAKNVLDRNFSATGPNQKYVGDITYIRTQQGWLYLAVVIDLFSRKVVGWAMEDHMEASLVNDALLMALWKRKPKAGLIWHSDRGSQYASESHREILKDHQIKQSMSRKGDCWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS
>NZ_CP039215.1|WP_075274741.1|129998_130256_-|hypothetical-protein
MKKNRNKYPLRKLWEILCSKLKGHVQYYGVSFNADGVGLFLYKARRIFYKWVNRRSQRKSFNWGKFSLFVKRFPMPKAKVCHKFF
>NZ_CP039215.1|WP_075273822.1|129396_129897_+|hypothetical-protein
MVIQRQKGETYQIQFTLKHVLQYRSAWWNYRAKHADSIRPAVDENVLKVLGCRTKLMGCDVYGCSNPNCEHTKVVCFTCKSRFCSTCGKKATEQWIEEQNATLPQCKWQHITFTMPRKFWAFFLFNRELLNIIFRTAANTLLETAKKKGLVIGIFAALHTFGRDLK
>NZ_CP039215.1|WP_075273820.1|128157_129240_-|IS481-family-transposase
MTSLSEKIIKPKLGVLELAKQLGNVSKACEVMGYSRDSFYRFKKLYETGGEEALQEISKKRPNVKNRVPEHIEQAVIDLAIENPALGQLRASNELLQRGVIVSSSGVRSVWLRNGLETFKKRLKALEAKSAQDGILLTEEQLQALEKAKQEKEAHGEIETEHPGYLGSQDTYYVGTMKGVGRIYQQTFVDTYSRVAFACLYTEKNAVTAAHALNESVIPWFEERDTPLLRILTDRRTEYCGKIEHHAYQLYLAIEDVDHTRTKARSPQTNGICERFHRTMKQEFYDIAFRKKVYNSLEELQVDVDEWLIKYNQHRPHSGKYCYGKTPMQTFQDSKHLAQEKIINKNVQSDSLINQTNVVR
>NZ_CP039215.1|WP_016212255.1|127800_127971_+|hypothetical-protein
MKKRIKATGAIERAARAAKMGRSRPAWSENFLNEFSEECKSRNSKKPDKYQEVRSK
>NZ_CP039215.1|WP_032126838.1|127600_127804_+|hypothetical-protein
MQKAVKCEAEEIQERMRFVKNNYKSLTVKRLKILWGVNSLNVYQFLRQYDLPWLPIDELTIKQRGRI
>NZ_CP039215.1|WP_155046770.1|138546_138714_-|hypothetical-protein
MQQCHKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAAYFASETQ
>NZ_CP039215.1|WP_054300202.1|138769_139498_+|IS6-family-transposase
MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP039215.1|WP_016212168.1|139466_141155_-|hypothetical-protein
MPELTFLKIEGNHSSPIQLARLVQEAAGNPAQKLGKHYFDLQGQALAEGQFEDKDGPRKVLVAVDLVERAAGESEEDKAEALARTKAKLDFFYQQLADTLPSPLLRDKLRANFDRLTCSNQRFSIIPIHKEMYFHVLRCVNAVTIDQDRARTAFKFAYNYVYQLINADIAAFLNDCEDIGVGEINRFIDQQRVKYATVAESMVMSHLLSPPAATPRENSRKWLKTHTAADMDYLATNQLTGVLTYVRGAEKQQSSHSKKDQPAAMMAIDRYALVRSDDAKERFDDAKPSQSQVKVPSLKEFKAQGRSITISQQIRDFMVGYNLQGSDAPPVVYNLLTSLPRGQDSCEQEASAKKIFKGAHHYNATRDNRPLFYVMNLPINQHTQFLHYDGSKTQKEALLLADLAMVHTVLKDLLTPGNSFVANIDSLYQNYLRNRSSDKESEGGYFSKSLEGKQAIKLLRALKEGINHGKVIDFSASDDATRDVLLEKALLKLYASKYPGNKVGDQKEYASLVQALFLAATNNHNFKGCKRALLRKIIVNFRKVIFLCSLLRIKQLIQIIYQ
>NZ_CP039215.1|WP_075275149.1|141498_142473_+|IS30-family-transposase
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMLNKQAKAVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRSLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEDTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP039215.1|WP_129556703.1|142698_143187_+|hypothetical-protein
MLNMPKPRYALVDNSKERSIKNGNCGYYAYALGLMSYLCKDHKINLAKEIWQRFDLGEKDKSSLNSIIEEKNAFMSLKNQRTITRLLRPVLREKNIENIINIFSDQDCKDSAYHSPLIWKIKKMIAGQLLRPQRWLLGEAFDPDGIFSGTELLRAPGIYDQC
>NZ_CP039215.1|WP_016211956.1|143244_143973_+|hypothetical-protein
MTQQFINSYQETAAEYTRLNLLIQEKQASEDGQKKASKYYAFTQRNLGIYNRLTHTRRRTISRDFEPEKVVWSRLKEEALVKVENLVNEAYEALVKSDEFQKWFRTQFTQDGVWAGDVELNGCLHPFVQGEHDIPFGYVAGNGKSTPYLLHDEGILLSRRSRFQRLKSGHTTSHHWMALIPKEQFLPESLQEGELDDFNKVYQALVAGQNKMFRTNKGKPVDVDKINEYILKYPASKSAWAL
>NZ_CP039215.1|WP_016211955.1|144429_145410_+|hypothetical-protein
MPNLIKASRAIRNLITDHMAEIGYVGFSIANIFADSNVKNHLFNFRSTITSQQASIIGSVWNHLDAVYSALAAATMIYNMANGNVNKHEMLYQKPQAAVLIASSVALAALTITGIPSWGFAIATYADLINESMNFYKAQKEYSDISYWTQSMVSKLQLIDKKLAETSSGNDKNVLQRQKTDILIDIAARYEFENKKQIPFSIRNKVDSAVKSSGLRLWQLEQRGKGVTHDLKKQRNEKTGQFLLKLGSAIGMTLLAIGSAVHPIGFAITLGIAAGYMGCKFYQAYQSKKEKGKKAKMLFFNYEVEVNKNEDQESYRYGGRHLEAPF
>NZ_CP039215.1|WP_054300202.1|145555_146284_-|IS6-family-transposase
MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP039215.1|WP_032126843.1|146587_146767_+|hypothetical-protein
MKKSKPNKTNSKKNRKVAPNARKRKSSNAKLLSSQKKSLDISDEELQFPESKPPREAEE
>NZ_CP039215.1|WP_032126844.1|146985_147282_+|hypothetical-protein
MNGSNAPEWEHLRLWLEDHKNQPCVLGFGKAIEYEVNHNKSCLEITYKLSRLKIHFKYVPIHSNSFDIIKNHLISKSNQDNWFIYDGKKFKEINESQF

MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
NZ_CP039215_1	1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT	137134-137175	42	NZ_CP039210	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence	125217-125258	0	1.0
NZ_CP039215_1	1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT	137134-137175	42	NZ_CP048067	Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence	111946-111987	0	1.0
NZ_CP039215_1	1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT	137134-137175	42	NZ_CP039033	Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP039215_1	1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT	137134-137175	42	NZ_CP038894	Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence	129443-129484	0	1.0
NZ_CP039215_1	1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT	137134-137175	42	NZ_CP038924	Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP039215_1	1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT	137134-137175	42	NZ_CP038953	Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP039215_1	1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT	137134-137175	42	NZ_CP038958	Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP039215_1	1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT	137134-137175	42	NZ_CP039196	Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence	55594-55635	0	1.0
NZ_CP039215_1	1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT	137134-137175	42	NZ_CP039196	Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence	55882-55923	0	1.0
NZ_CP039215_1	1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT	137134-137175	42	NZ_CP038812	Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence	134135-134176	0	1.0
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NZ_CP039215_1	1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT	137266-137307	42	NZ_CP039066	Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence	1677-1718	0	1.0
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NZ_CP039215_1	1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT	137266-137307	42	NZ_CP038877	Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence	137267-137308	0	1.0
NZ_CP039215_1	1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT	137266-137307	42	NZ_CP038882	Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence	93293-93334	0	1.0

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3. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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9. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|137134|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.2|137201|40|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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112. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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113. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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114. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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115. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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116. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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117. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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118. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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119. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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120. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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121. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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122. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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123. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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124. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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125. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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126. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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127. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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128. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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129. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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130. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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131. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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132. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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133. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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134. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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135. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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136. spacer 1.3|137266|42|NZ_CP039215|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	2323 : 101075	115	Streptococcus_phage(19.57%)	tail,transposase,head,capsid,integrase,protease	attL 91314:91373|attR 104648:105510

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP039215|2323:101075|DBSCAN-SWA
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MLGDFASLDVQNTYRGSDAYEDHQIKQSMSRKGDCWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYKHNQKIS

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016212150.1|6802_7117_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016212456.1|49796_50084_-	type II toxin-antitoxin system HigB family toxin	A0A0P0ZE17	Stx2-converting_phage	2.9e-11	39.2
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WP_075273327.1|68480_69056_-|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	2.7e-08	26.6
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WP_075273327.1|85207_85783_+|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	2.7e-08	26.6
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WP_081007042.1|89958_90774_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
91314:91373	attL	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|91378_92107_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
WP_016212298.1|92548_92875_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307374.1|93115_93592_+|protease	Clp protease ClpP	Q8VNN5	Enterobacteria_phage	3.2e-15	39.2
WP_075275158.1|93706_94000_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081377916.1|94116_94641_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	2.5e-29	46.4
WP_098082791.1|94845_95148_+|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	8.6e-14	44.6
WP_129556698.1|95156_95858_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.8e-38	43.1
WP_016211912.1|95947_96538_-|integrase	site-specific integrase	K4K6A1	Caulobacter_phage	2.1e-19	33.3
WP_032126795.1|96810_97071_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211910.1|97074_97347_+	Txe/YoeB family addiction module toxin	NA	NA	NA	NA
WP_016211913.1|97672_98794_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273786.1|99226_99625_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_081377915.1|99633_100191_-|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	2.9e-47	51.5
WP_081377914.1|100335_100665_-|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126637.1|100781_101075_-|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	8.3e-06	36.5
104648:105510	attR	NA	NA	NA	NA

2. NZ_CP039214

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP039214_1

• CRISPR_ID: NZ_CP039214_1
• CRISPR_location: 363106-363235
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP039214_1

Consensus_repeat	Method
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP039214_1

>1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder
CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039214_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP039214_1

>merge|NZ_CP039214|1|363106-363235|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

>NZ_CP039214|1|1|363106-363235|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP039214.1|WP_075273619.1|366645_367221_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039214.1|WP_032126227.1|363764_364055_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039214.1|WP_080664870.1|358685_359333_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224871
NZ_CP039214.1|WP_054300520.1|361884_362199_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039214.1|WP_016212044.1|355707_355962_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|236153
NZ_CP039214.1|WP_036794771.1|356684_357671_+|APC-family-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223605
NZ_CP039214.1|WP_129556446.1|365221_366373_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039214.1|WP_075273359.1|361363_361939_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP039214.1|WP_016211272.1|371582_371951_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226131
NZ_CP039214.1|WP_129556444.1|359325_359748_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039214.1|WP_016211795.1|357808_358003_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039214.1|WP_016212010.1|364807_365104_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039214.1|WP_016212008.1|364092_364791_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039214.1|WP_054300271.1|354194_355169_+|IS30-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
NZ_CP039214.1|WP_016212359.1|353608_353827_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039214.1|WP_016211273.1|367278_368112_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	unknown	unknown	gnl|CDD|234899
NZ_CP039214.1|WP_016211268.1|368227_369412_+|fatty-acid-desaturase	unknown	unknown	gnl|CDD|224316
NZ_CP039214.1|WP_016211271.1|369430_370375_-|L,D-transpeptidase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|182341
NZ_CP039214.1|WP_016211269.1|370679_371465_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|274640
NZ_CP039214.1|WP_016211797.1|359909_361313_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|143424

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP039214.1|WP_016211269.1|370679_371465_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|274640	TIGR03545, TIGR03545, TIGR03545 family protein. This model represents a relatively rare but broadly distributed uncharacterized protein family, distributed in 1-2 percent of bacterial genomes, all of which have outer membranes. In many of these genomes, it is part of a two-gene pair.	0.0067305
NZ_CP039214.1|WP_016211271.1|369430_370375_-|L,D-transpeptidase-family-protein	gnl|CDD|182341	PRK10260, PRK10260, L,D-transpeptidase; Provisional.	3.41097e-37
NZ_CP039214.1|WP_016211272.1|371582_371951_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|226131	COG3603, COG3603, Uncharacterized conserved protein [Function unknown].	2.57105e-07
NZ_CP039214.1|WP_080664870.1|358685_359333_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	gnl|CDD|224871	COG1960, CaiA, Acyl-CoA dehydrogenases [Lipid metabolism].	6.77127e-06
NZ_CP039214.1|WP_016211273.1|367278_368112_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	gnl|CDD|234899	PRK01103, PRK01103, bifunctional DNA-formamidopyrimidine glycosylase/DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase.	1.71098e-151
NZ_CP039214.1|WP_016212044.1|355707_355962_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|236153	PRK08116, PRK08116, hypothetical protein; Validated.	0.00575708
NZ_CP039214.1|WP_036794771.1|356684_357671_+|APC-family-permease	gnl|CDD|223605	COG0531, PotE, Amino acid transporters [Amino acid transport and metabolism].	3.69328e-17
NZ_CP039214.1|WP_016211268.1|368227_369412_+|fatty-acid-desaturase	gnl|CDD|224316	COG1398, OLE1, Fatty-acid desaturase [Lipid metabolism].	2.7962e-82
NZ_CP039214.1|WP_075273359.1|361363_361939_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	6.00312e-45
NZ_CP039214.1|WP_016211797.1|359909_361313_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	gnl|CDD|143424	cd07106, ALDH_AldA-AAD23400, Streptomyces aureofaciens putative aldehyde dehydrogenase AldA (AAD23400)-like. Putative aldehyde dehydrogenase, AldA, from Streptomyces aureofaciens (locus AAD23400) and other similar sequences are present in this CD.	0
NZ_CP039214.1|WP_054300271.1|354194_355169_+|IS30-family-transposase	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	5.97286e-78

Protein sequences

>NZ_CP039214.1|WP_054300520.1|361884_362199_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MKGYLITQISKLLKISRDTLHRWRNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
>NZ_CP039214.1|WP_075273359.1|361363_361939_-|IS630-family-transposase
MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEGAGCHLLFLPPYSPDLNSIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETVR
>NZ_CP039214.1|WP_016211797.1|359909_361313_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein
MSSYAMLINGQLHSGIDSFAVVNPATEAVIAECPIASVELLEQAVNAAKIALIDGTGTLEQRRELLRACADKIEAYQEELSQLLTKEQGKPISQAQNEVSWAIGLLRKQCELDIPKKVLRDDTQAQVTVTRKPLGVVAGITPWNFPFYIAVNKMAEAIYSGNSIIIKPSPYTPLTTLKLGELIQDVIPAGLVNIISGDNEIGALLVKHPKISAISFTGSVATGKHIATAAAADLKRVVLELGGNDAAIVLNDVDVKEVAEKIFWNAFSNCGQVCVAVKRLYVQRAIYHDVLDEMVRIAKTVKVGNGLDSEVTMGPLNNVMQYERIIELLNDAKAQGATVHCGGVAQEGLGYFFPPTIISGIEEGVRLIDEEQFGPLLPVLAFDDVNEVIQRVNNSSMGLSAYVWSKDNDLAVQIANRLEVGIVRVNTSTTEASLTPFGGMKQSGIGREGGVWGIEAMTDAQTLSVKY
>NZ_CP039214.1|WP_129556444.1|359325_359748_+|hypothetical-protein
MNKDIMIDQPGRAIEQRSILSITHATMLMGIFQAALNIIGNSKSILKKNTVVLSQFNQLNNQCLLLRNQLIHTNTQEEVQKMRAQIHKYTRDCIYLAAALSGGRSVLADHPVQRLNRELLQATIAGVNSLFIHNLCIDIN
>NZ_CP039214.1|WP_080664870.1|358685_359333_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase
MVLLEQLDTFLISRVDPYANQLDIDSMILKSRFSELGEKKLLAIKVASEFNGIAADRALNHDYFARLARSSYALAFLTAQHESCASLLQKGNNQELKADLLPEMVQGKFRAGVGIYHLRSHTRRAMIMAKKVAGGYRVSGRLDWISGFDIFDYIALGFIIDIGNSQENHEVVGLVPFKAQQYLSGEINIGPKQEVTAISSTNTVAIEFNDWFIRE
>NZ_CP039214.1|WP_016211795.1|357808_358003_-|hypothetical-protein
MKLKTKKISNACKGNTFLCVNFAKSKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP039214.1|WP_036794771.1|356684_357671_+|APC-family-permease
MAMSGNQALQENVGFLGALVFAVSLVLGSGVLVLPGVIYHSIGELAIFTWLADALLMVPLVIIFASFGSKYPGSGGVAGFIEQAFPYLSGGSAYLLLGQCSICFAIVAITGILYSFALLLPNFHASHMLVAGISLALMFIVFFISFLGNHRVIWLQKLIIIPLLLFLLVLIFLSINHPDAATSSVTYWPKHFDTGLITQGMILAFFAFGGWESFASMTGEIKKPARTVPFVIFVGFLLTVGLYVGLSIAIQKIFFEKNMMTGSSFLLDLVQVNHLGQFSVAICFFIVFVVVISNLNGVIWSGSRTLVTLGQKGWAPAFAASHGVLSTG
>NZ_CP039214.1|WP_016212044.1|355707_355962_+|hypothetical-protein
MNHIISCPFCGVSTEHEMSYGLQSYVCEACHNLIAAGMDDCCLFFSHDLACLCQRENEKKMEREREEKEEEEALLCPSLRKWSS
>NZ_CP039214.1|WP_054300271.1|354194_355169_+|IS30-family-transposase
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP039214.1|WP_016212359.1|353608_353827_-|hypothetical-protein
MFKQLQNNRLYFQKERAYLSISKAKKFNGPGNNAQRIIIPLHGDTSGVLKSHLTIASLFDHRPQDKGKPFKP
>NZ_CP039214.1|WP_032126227.1|363764_364055_+|hypothetical-protein
MGRLFNKENPADLKSSGYFSTEPRGQSHHSVIVIVMAMISIFVMTRVICSIITWMIHSAPLTFIFTMLISFFAAPYVFIVIIIVAFFIGILVKTPS
>NZ_CP039214.1|WP_016212008.1|364092_364791_+|hypothetical-protein
MLKKNKSTSFVIGLALSLSFACYANALTEAEFKATKLPYSVMAYSNQYAHEYGLDASKAIDLPKGLEAIKLILYKEHIKGDEVLLPQDIYRCSAELYVDKSLSLYWPGNYPKVDKVGDRGLQKAQVSTVQLKRKGEYWVPGPYASMLYDSYDQTIKPNLAKINLGFFGCNYIPSRYTAVKDGLAIWLERKGGHNYAAIGQSEAEISSKDFYIFKLPQKLVNNYLPYARMAAN
>NZ_CP039214.1|WP_016212010.1|364807_365104_+|hypothetical-protein
MVQLTLSDFAFLANDVYLNPGLELALPRENSQRCQRLLNNTETVINSDPHGPKANGFFARVYKYKQGNKMSLIVAYRGTSNVEDYLIDAELASGQAIE
>NZ_CP039214.1|WP_129556446.1|365221_366373_+|hypothetical-protein
MSMLTVDYSQLFGIKPTAFRTVTFNPPGMQGVDPNGRAPHYAEIAHTISQHKIASGKLAAAMVSVAPEVSLVGATAGVEVVVKKIMELLNYQTAIKNRSIALRMGQGALIFLWDLLMPDRNGLSVDKEINNPYPHIYNISSRYDLVHCSGNPGGNLINYDIDPLGKITNGDDDRRAKFKYQFLENYFEARQHYLKHGVNSAKMKSKYEQLSKADNWALYFENPGKEGVHLPTAKDWENYFKDVRNIPEYQQSARKTDRVMQYYTGTLSSNQAYDKPYDLFLTKAAKVFIKYLFIAEHSMANMLPSIQVNQNLAQVKISYSAHETILAMRKCSSLINLHTTERLKGPLVAAHDNVQKYQKKGIYPYNQTNYQALAASHGVLSTG
>NZ_CP039214.1|WP_075273619.1|366645_367221_+|hypothetical-protein
MANYSQAYCVAQGFNVNANIHRRFGYINYLRIGDLELSADIDVEVPVEGVKSKHVGVISDLFWQETAKVQPITIDFRLSVSNQQQLAHYIEQNNFNSDVLIEFASYDYDANAQAFYSSFNTDKETIEGDLEILAADSQLAIYVGKEQETDVQSPVNYFVSLSMVSTAKAQQLISATSARIKRVLPWGVTVA
>NZ_CP039214.1|WP_016211273.1|367278_368112_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase
MPELPEVETSCRGIAPHIQNQKIQRVTIRQQQLRYPVSVQITTKKLKQQKVTQVSRRGKYILLELDHSAWLMIHLGMSGNLRILEDTTPAGKHDHIEIQFANQKILRLNDPRRFGCFLWTNDLANHKLLKHLGIEPLTRQFNANYLYQAAQSRKIAIKTLLMDSQVVVGVGNIYANEALFQTGIHPSTYCHVLTTNQCAELTRIIKAILKQAIKAGGTSLKDFTNSDGKPGYFKQKLFVYGRSKEPCLTCQEDIQQFRQNQRSSFFCPCCQPEPKTM
>NZ_CP039214.1|WP_016211268.1|368227_369412_+|fatty-acid-desaturase
MLSFYGLLNLPWWGYIIAVLLLTHVTIVAVTVFLHRHQAHRALDLHPVVSHFFRLWLWLTTGMVTKEWVAVHRKHHAHCETAEDPHSPKTYGIKTVLWEGADLYRHAIQTQPEMMEKFGHATPNDTLERHLYSRFRYLGIIIMLILDIVLLGVPGIAVWAIQMMWIPFFAAGVINGIGHYVGYRNFEAADASTNVSPWGILIGGEELHNNHHAYASSAKFSVKPWEFDVGWMYIRLLEVCQLAHVKKRIPRGACVAGKSEVDNATLKAVIQNRLQLLSKYQKDVLQPTFKAERARQGESVLNSTASKLLKRDQRFFSHADHQALEQVLISSKALDLVYQFRAKLQAIWTQKASNQKDVLDALKQWCSQAEASGEQRLQEFVSYLRGYVLTTQSH
>NZ_CP039214.1|WP_016211271.1|369430_370375_-|L,D-transpeptidase-family-protein
MGIITQRHNTVAGIALFTSSIFCTSAATAFTLPISSHNTNDVVGWQVITYSKAGDTPLKIAQRHSISIQRLQALNSKVRHWQKQRIYLPYQVILPQLIQQQQSKITVNLAEKRLYYFNAKSQVLSVYPVSIGREHWRTPTPTKTTYIIHKKKHPTWNVPASIQRYYRAQGKSLPKQVPPGPENPLGTRALYLGITGILIHGTNQPASIGTASSSGCIRLYTNDIEHLYKQAGVNTPVKLIYQPYKVGFNENVLYIEAHPVISDYDKNNQQRQIIIEKLQNMTNNSKQLQVNWSLVDKAINEAAGIPVPIGKLFY
>NZ_CP039214.1|WP_016211269.1|370679_371465_+|hypothetical-protein
MAKKIFYSLIIVILLLVVGSYFLFSHMDSILRSAVEKIGSKTTGTTVTLGSLKTSLKEGQVSLSRLTMSNPAGFSQANAISFKDIMVNLDPSSATQQTIVLNKVIIKDPYLLYEMKEGSSRSNLQQIQKNIQSYFASKQAKNNESNQRNSGVTQQEPSQAKVAAKNQKKFIIKELEILAGQVKVISPLLKSKEKTLSLPNIRLTNIGTGGSGLTPDQVTEQIINVLVANSGQAVAQAGLDRVKTKLKEKASGLLNNLLGNP
>NZ_CP039214.1|WP_016211272.1|371582_371951_-|hypothetical-protein
MKIHCLPTHFSVCRFKVGTPLPALKNLSFYSLSSDSEGLRLVLKEQDMPKRIRGVDHGWCALHFTDEDDNSEQCLNLLCSRLNSEQIESFVAPTYEMNFLFVQQHNLEAALDVIEDLEYQWA

Crispr_ID: NZ_CP039214_2

• CRISPR_ID: NZ_CP039214_2
• CRISPR_location: 2626397-2626517
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP039214_2

Consensus_repeat	Method
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP039214_2

>2.1|2626434|47|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder
CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039214_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP039214_2

>merge|NZ_CP039214|2|2626397-2626517|CRISPRCasFinder
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCTCGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGCTTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT

>NZ_CP039214|2|2|2626397-2626517|CRISPRCasFinder
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT	CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC
TTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP039214.1|WP_016211905.1|2625163_2625574_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039214.1|WP_098082812.1|2623883_2624399_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039214.1|WP_016210942.1|2636317_2636929_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|236415
NZ_CP039214.1|WP_016211756.1|2631117_2631843_-|M15-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|350618
NZ_CP039214.1|WP_054300282.1|2627894_2628359_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP039214.1|WP_016210678.1|2622728_2623739_+|protein-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|270622
NZ_CP039214.1|WP_016211759.1|2632088_2633276_+|S-methyl-5-thioribose-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|236561
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NZ_CP039214.1|WP_016210672.1|2616631_2618014_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|130153
NZ_CP039214.1|WP_032126312.1|2630144_2630939_-|M48-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|307807

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP039214.1|WP_081377880.1|2628415_2628895_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	gnl|CDD|279973	pfam01710, HTH_Tnp_IS630, Transposase. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This family includes insertion sequences from Synechocystis PCC 6803 three of which are characterized as homologous to bacterial IS5- and IS4- and to several members of the IS630-Tc1-mariner superfamily.	6.67359e-07
NZ_CP039214.1|WP_016210942.1|2636317_2636929_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	gnl|CDD|236415	PRK09220, PRK09220, methylthioribulose 1-phosphate dehydratase.	1.82603e-94
NZ_CP039214.1|WP_054300282.1|2627894_2628359_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	3.57411e-45
NZ_CP039214.1|WP_016210678.1|2622728_2623739_+|protein-kinase	gnl|CDD|270622	cd00180, PKc, Catalytic domain of Protein Kinases. PKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine or tyrosine residues on protein substrates. PKs make up a large family of serine/threonine kinases (STKs), protein tyrosine kinases (PTKs), and dual-specificity PKs that phosphorylate both serine/threonine and tyrosine residues of target proteins. Majority of protein phosphorylation occurs on serine residues while only 1% occurs on tyrosine residues. Protein phosphorylation is a mechanism by which a wide variety of cellular proteins, such as enzymes and membrane channels, are reversibly regulated in response to certain stimuli. PKs often function as components of signal transduction pathways in which one kinase activates a second kinase, which in turn, may act on other kinases; this sequential action transmits a signal from the cell surface to target proteins, which results in cellular responses. The PK family is one of the largest known protein families with more than 100 homologous yeast enzymes and more than 500 human proteins. A fraction of PK family members are pseudokinases that lack crucial residues for catalytic activity. The mutiplicity of kinases allows for specific regulation according to substrate, tissue distribution, and cellular localization. PKs regulate many cellular processes including proliferation, division, differentiation, motility, survival, metabolism, cell-cycle progression, cytoskeletal rearrangement, immunity, and neuronal functions. Many kinases are implicated in the development of various human diseases including different types of cancer. The PK family is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, phosphoinositide 3-kinase (PI3K), and actin-fragmin kinase.	5.43866e-14
NZ_CP039214.1|WP_016211759.1|2632088_2633276_+|S-methyl-5-thioribose-kinase	gnl|CDD|236561	PRK09550, mtnK, methylthioribose kinase; Reviewed.	0
NZ_CP039214.1|WP_016210935.1|2635088_2635631_-|acireductone-dioxygenase	gnl|CDD|224704	COG1791, COG1791, Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain [Function unknown].	2.05718e-61
NZ_CP039214.1|WP_129556590.1|2629752_2630148_+|nucleic-acid-binding-protein	gnl|CDD|380015	pfam17775, UPF0225, UPF0225 domain. This entry represents an NTF2-like domain found in bacterial proteins.	6.66662e-47
NZ_CP039214.1|WP_016210677.1|2616024_2616639_-|UbiX-family-flavin-prenyltransferase	gnl|CDD|180312	PRK05920, PRK05920, aromatic acid decarboxylase; Validated.	1.18434e-110
NZ_CP039214.1|WP_032126312.1|2630144_2630939_-|M48-family-metallopeptidase	gnl|CDD|307807	pfam01863, DUF45, Protein of unknown function DUF45. This protein has no known function. Members are found in some archaebacteria, as well as Helicobacter pylori. The proteins are 190-240 amino acids long, with the C-terminus being the most conserved region, containing three conserved histidines. This motif is similar to that found in Zinc proteases, suggesting that this family may also be proteases.	1.59691e-55
NZ_CP039214.1|WP_016210671.1|2618628_2619888_+|6-phosphofructokinase	gnl|CDD|237600	PRK14072, PRK14072, diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase.	0
NZ_CP039214.1|WP_016211756.1|2631117_2631843_-|M15-family-metallopeptidase	gnl|CDD|350618	cd14843, D-Ala-D-Ala_dipeptidase_like, D-Ala-D-Ala dipeptidase, includes uncharacterized enzymes. This subfamily of D-Ala-D-Ala dipeptidase (also known as D-alanyl-D-alanine dipeptidase vanX; VanX; EC 3.4.13.22) also includes several uncharacterized proteins. This is a Zn2+-dependent enzyme that mediates resistance to the antibiotic vancomycin in Enterococci and other bacteria (both Gram-positive and Gram-negative). It is part of a gene cluster that affects cell-wall biosynthesis. The operon triggers the termination of peptidoglycan precursors by D-Ala-(R)-lactate instead of D-Ala-D-Ala dipeptides. The enzyme is stereospecific, as L-Ala-L-Ala, D-Ala-L-Ala and L-Ala-D-Ala are not substrates. It belongs in the MEROPS peptidase family M15, subfamily D.	1.11944e-66
NZ_CP039214.1|WP_016210676.1|2620343_2622425_+|kinase-domain-protein	gnl|CDD|270918	cd14016, STKc_CK1, Catalytic domain of the Serine/Threonine protein kinase, Casein Kinase 1. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. CK1 phosphorylates a variety of substrates including enzymes, transcription and splice factors, cytoskeletal proteins, viral oncogenes, receptors, and membrane-associated proteins. There are mutliple isoforms of CK1 and in mammals, seven isoforms (alpha, beta, gamma1-3, delta, and epsilon) have been characterized. These isoforms differ mainly in the length and structure of their C-terminal non-catalytic region. Some isoforms have several splice variants such as the long (L) and short (S) variants of CK1alpha. CK1 proteins are involved in the regulation of many cellular processes including membrane transport processes, circadian rhythm, cell division, apoptosis, and the development of cancer and neurodegenerative diseases. The CK1 subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	1.187e-09
NZ_CP039214.1|WP_016210943.1|2635627_2636314_-|acireductone-synthase	gnl|CDD|319768	cd01629, HAD_EP, Enolase-phosphatase similar to human enolase-phosphatase E1 and and Xanthomonas oryzae pv. Oryzae enolase-phosphatase Xep. Enolase-phosphatase E1 (also called MASA) is a bifunctional enolase- phosphatase which promotes the conversion of 2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane to 1,2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene anion (an aci-reductone) in the methionine salvage pathway. The catalytic reaction is carried out continuously by enolization and dephosphorylation, and the enolase activity cannot be classified as typical enzymatic enolization. This family belongs to the haloacid dehalogenase-like (HAD) hydrolases, a large superfamily of diverse enzymes that catalyze carbon or phosphoryl group transfer reactions on a range of substrates, using an active site aspartate in nucleophilic catalysis. Members of this superfamily include 2-L-haloalkanoic acid dehalogenase, azetidine hydrolase, phosphonoacetaldehyde hydrolase, phosphoserine phosphatase, phosphomannomutase, P-type ATPases and many others. HAD hydrolases are found in all three kingdoms of life, and most genomes are predicted to contain multiple HAD-like proteins. Members possess a highly conserved alpha/beta core domain, and many also possess a small cap domain, the fold and function of which is variable. HAD hydrolases are sometimes referred to as belonging to the DDDD superfamily of phosphohydrolases.	1.88858e-105
NZ_CP039214.1|WP_016210672.1|2616631_2618014_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	gnl|CDD|130153	TIGR01081, mpl, UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate ligase. Alternate name: murein tripeptide ligase [Cell envelope, Biosynthesis and degradation of murein sacculus and peptidoglycan].	0
NZ_CP039214.1|WP_081377344.1|2633630_2634758_-|transposase	gnl|CDD|379252	pfam13546, DDE_5, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	2.01965e-11

Protein sequences

>NZ_CP039214.1|WP_075275117.1|2625817_2626240_-|hypothetical-protein
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MKLNTKETFTRFMGLFIAVDCLYYLIGLTIFSAIPSGNLIAFVNIFTSFCGLVTGILLFIKIYDKWYTPFVAIEFFTCIYWFFLTLGETVSNTQYASLSKVITSLNYDLFSCFMGVIACLLWLKFAFSFKANKLAN
>NZ_CP039214.1|WP_052047041.1|2624631_2624895_+|hypothetical-protein
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>NZ_CP039214.1|WP_016210676.1|2620343_2622425_+|kinase-domain-protein
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>NZ_CP039214.1|WP_016210671.1|2618628_2619888_+|6-phosphofructokinase
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MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP039210	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence	23888-23925	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP039210	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence	166717-166754	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP039213	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence	30310-30347	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP048067	Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence	7350-7387	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP048067	Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence	186740-186777	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP038894	Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence	23887-23924	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP038897	Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence	30307-30344	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP038924	Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence	98297-98334	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP038924	Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence	104921-104958	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP038924	Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence	74736-74773	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP038924	Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence	89480-89517	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP038953	Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence	91559-91596	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP038958	Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence	45769-45806	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP039196	Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence	48741-48778	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP039196	Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence	38038-38075	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP038812	Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence	78262-78299	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP038812	Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence	84886-84923	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP038812	Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence	55526-55563	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP038812	Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence	69445-69482	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP013769	Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence	100110-100147	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP013769	Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence	89408-89445	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP033938	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence	7974-8011	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP033938	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence	11226-11263	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP033940	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence	1087-1124	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP033940	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence	3391-3428	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP033940	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence	24828-24865	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP033940	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence	29210-29247	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP033942	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence	13746-13783	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP033942	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence	20370-20407	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP033942	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence	167516-167553	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP033942	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence	4929-4966	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP033942	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence	144791-144828	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP033942	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence	158710-158747	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP033943	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence	75017-75054	0	1.0
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP013763	Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence	85712-85749	0	1.0
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NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP038877	Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence	120528-120565	1	0.974
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP038882	Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence	76554-76591	1	0.974
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP039033	Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence	30949-30986	1	0.974
NZ_CP039214_1	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	NZ_CP038914	Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence	30949-30986	1	0.974

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039213 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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4. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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5. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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6. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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7. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038897 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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8. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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9. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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10. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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11. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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12. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033943 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013780 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050946 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048070 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039207 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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112. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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113. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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114. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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115. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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116. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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117. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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118. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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119. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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120. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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121. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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122. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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123. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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124. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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125. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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126. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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127. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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128. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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129. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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130. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	45566 : 89679	46	Moraxella_phage(16.67%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	136473 : 178470	46	Staphylococcus_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_3	182276 : 239530	56	Escherichia_phage(12.5%)	protease,transposase,tRNA,tail	NA
DBSCAN-SWA_4	256927 : 301858	48	Acinetobacter_phage(40.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_5	329433 : 374988	45	Hokovirus(33.33%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_6	447601 : 555242	103	Escherichia_phage(45.95%)	transposase,integrase,tRNA	attL 512755:512814|attR 545878:546258
DBSCAN-SWA_7	560170 : 604137	47	Escherichia_phage(22.22%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_8	640386 : 741015	104	Prochlorococcus_phage(17.65%)	protease,transposase,tRNA,plate	NA
DBSCAN-SWA_9	776445 : 823131	39	Staphylococcus_phage(28.57%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_10	839818 : 894271	45	Staphylococcus_phage(15.38%)	protease,transposase	NA
DBSCAN-SWA_11	900521 : 963358	59	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(14.29%)	transposase,integrase	attL 892881:892940|attR 910165:910604
DBSCAN-SWA_12	967430 : 1070611	110	uncultured_Mediterranean_phage(11.11%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_13	1100068 : 1143128	41	Tupanvirus(28.57%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_14	1197113 : 1249794	48	Klosneuvirus(28.57%)	protease,tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_15	1254330 : 1431565	168	Bacillus_phage(11.76%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_16	1458415 : 1494935	41	Leptospira_phage(33.33%)	protease,transposase,integrase	attL 1450953:1451012|attR 1505263:1505520
DBSCAN-SWA_17	1498765 : 1558311	51	Staphylococcus_phage(18.75%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_18	1568576 : 1624713	48	Staphylococcus_phage(13.33%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_19	1636678 : 1692472	57	Staphylococcus_phage(42.86%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_20	1698640 : 1753898	45	Pseudomonas_phage(25.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_21	1783520 : 1832968	51	Acinetobacter_phage(16.67%)	transposase,integrase	attL 1782464:1782523|attR 1812236:1812526
DBSCAN-SWA_22	1875658 : 1892025	15	Leptospira_phage(40.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_23	1936820 : 1951630	22	Acinetobacter_phage(50.0%)	transposase,integrase	attL 1941876:1941935|attR 1945578:1945816
DBSCAN-SWA_24	2031352 : 2083230	51	Orpheovirus(20.0%)	protease,transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_25	2091074 : 2135780	47	Staphylococcus_phage(22.22%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_26	2156979 : 2206727	48	Staphylococcus_phage(33.33%)	protease,tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_27	2212919 : 2258420	52	Staphylococcus_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_28	2327623 : 2387235	58	Planktothrix_phage(16.67%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_29	2425220 : 2599254	165	Escherichia_phage(32.65%)	protease,transposase,integrase,tRNA	attL 2572878:2572937|attR 2581119:2581406
DBSCAN-SWA_30	2627894 : 2662334	38	Microbacterium_phage(20.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_31	2670420 : 2721566	51	Staphylococcus_phage(37.5%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_32	2744532 : 2804309	57	unidentified_phage(33.33%)	protease,transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_33	2918106 : 2961504	41	Acanthamoeba_polyphaga_lentillevirus(14.29%)	protease,transposase	NA
DBSCAN-SWA_34	2993189 : 3109901	110	Staphylococcus_phage(33.33%)	transposase,tRNA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP039214|45566:89679|DBSCAN-SWA
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MSVRKVSYTTGFTIEEVEFEREDSYDDKRILNMTNFSQNQVDLTGQLNRYSVLNTPFLNTHHHNNEEESECCCIIQ

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_129556617.1|49612_50452_+	peptidoglycan DD-metalloendopeptidase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211200.1|50491_51799_+	S41 family peptidase	A0A0R6PIZ1	Moraxella_phage	2.1e-24	28.6
WP_016211199.1|51773_52943_+	glycoside hydrolase family 3 protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211196.1|52997_53723_+	16S rRNA (uracil(1498)-N(3))-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211194.1|54001_54391_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210702.1|61135_64198_-	efflux RND transporter permease subunit	S5VTK5	Leptospira_phage	1.2e-62	22.9
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WP_016210703.1|65614_66568_-	glutathione synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210700.1|66599_67763_-	radical SAM family heme chaperone HemW	NA	NA	NA	NA
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WP_016210697.1|68555_69056_+	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	1.0e-19	41.2
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WP_016211096.1|72651_73461_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126369.1|73639_73867_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211100.1|73867_74818_+	TonB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126371.1|74873_75425_+	YqgE/AlgH family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211105.1|75551_75974_+	Holliday junction resolvase RuvX	NA	NA	NA	NA
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WP_016211103.1|76755_77454_+	YggS family pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_032126370.1|77464_78289_+	pyrroline-5-carboxylate reductase	A0A1X9I6T5	Streptococcus_phage	5.4e-26	35.5
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WP_032126486.1|80092_80323_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211250.1|87370_87583_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075274981.1|89082_89679_-|transposase	IS1595 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP039214|136473:178470|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP039214|182276:239530|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

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MKIRPLHDRVVIRRLEEETTSAGGIILTGSAQEKPNRGEVVAVGRGKALDNGDYRPIDVAVGSTVLFGQYSGSTVKIDGEEYQVMREDEIFAVVED
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MTETTLTQTATHYSTTSDKQVELLIFTLKNQQDYAVDIFKTREIITLQKLNCFPGMHESIIGVTTIRNHTLPIIDLGYILSGQATQETAAATLIITISNNHQQALLVHQVKHITCISHDAIHPAEKSLGSERYITATAQIEGKLVQLIDIEKILNTIKPSNNSNN
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MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
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MQKYLLKHPLHSRGKKITCVNIRRAKVADLQEARYSENKLDNIIQLVSKLCNLPTPQVLELDQEDFSKITLLIIEHLCISHGGDSHFYQELWGPCIP
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MSQLQADVVVLGSGPGGYTAAFRAADLGKKVILIEKYAEIGGVCLNVGCIPSKALLHTVKVVDEAKHMSAHGVKFGKISFDIDKIRDYKAGVVTRLTKGLKALASARKVQIVQGYGKFASDKEIIVEHAGKTQSVSFNHCIIAAGSRPVKLPFLPEDERIMDSTGALELKDVPKELLVIGGGIIGLEMAQVYSTLGAKVTIVELADQLMNGADKDVVKPFQNFVKDRYEIMLQTSVTAVDAKKDGLHVAFEGKHAAEGTRRFDRILSAVGRVPNGKLIDAEQAGVKVSERGFVTVDDQMRTNVPHIFAIGDIVDNGPMLAHVAVPQGKVAAEVISGEKHFFNPLCIPSVAYTDPEVAWVGKTEEECKKAGIKYGKGVFPWAASGRSLGIGRDEGQTKVLFDEETHRILGAAMVGPNAGELVAEAGLAIEMGADAEDIALTIHAHPTLSETFALATEMYEGSITDLIAPKKKKK
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MNVNSYLFYDIETTGINKCFDQVVQFAAIRTDLNLNEISRHEYVVKLRPDVIPAPKAAITHLISLDRLVQAESEYTVIKKIHELLNEPGTISLGYNTLGFDDEFLRFSFYRNLLNPYSHQYANGCSRMDLYPMVALYYLYCPTVLQWPQVNGQPSLRLENLSALNQLAEGQAHDAMVDVEATVALAKCLIQEKATWDYLCNYFIKREDQNRLLKLPRLFDDDSQSFLAMMIAGEMGTKVNYQAPALLLGEHYHYKNQTVWLRLDQEYLKQIIISDFSEKIWVKNKKYGEPPFVLPLTEKRLAKMSKEQLELYQENKNWLLNNKSLLQEIREYYLDYKYPEHENVDAMALLYQSGFYNYREKNWIECFHEYLLGQQLYDHAVPSERLGVLSDRLAGYENKILANDPRQQLFDSYVDECWQVEEQNARRDYKGECALTVEAALAEITQLEADKGLSSIQQTRLAELKAYILGKTEVKP
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MFSKAKAPLIISISCVIIYFAVLVIQIYSPATFEKNHTEVLIGCEKLGKQAKELCIERVDVMANQSKQATKIKD
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MHSFLISTLTVSTAELGDKTQLLTLLFAARFQKPLPIILAIFIATLLNHGITTWLGVFFSSFFSPIILHSLLMLSFIITAVWALIPDTLDESEPKKTKNKNIFWVVLITFFIAELGDKTQLITLTLSIQYQTIFWVTLGTTLGMMIANIPAVFLGKIWCKKLPLQQIRIASALLFIILASYEAYQLVQLFNS
>NZ_CP039214|182276:239530|185006_185456_-|WP_059372761.1|DBSCAN-SWA
MPNQSSSPLIRWPLKKLISSVVSTYNKQLISLFNTATYQSIINVLPIGQTIDKVAQTPQFYHSVQNGLSCINQVATATNPQPDINNCNYNNNQTYFAWNNSHLTTIANQYVAYQIYYNMINSIHLKTIQSDAKEQETIKKSVSSILALR

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_032126362.1|182797_183163_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_080728339.1|183226_183499_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212441.1|183766_183991_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059372761.1|185006_185456_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|185519_186248_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
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WP_017377589.1|188074_188728_-	epoxyqueuosine reductase QueH	NA	NA	NA	NA
WP_016210784.1|188905_189877_+	alpha/beta fold hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210782.1|189899_190796_-	branched-chain amino acid transaminase	NA	NA	NA	NA
WP_016210786.1|190954_191401_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210787.1|191397_192039_-	uracil phosphoribosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210789.1|192148_192727_-	TMEM165/GDT1 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210776.1|193202_193640_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210785.1|195568_196963_+	protein kinase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274986.1|198411_199479_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016209863.1|199531_199954_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209853.1|200194_200638_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209873.1|200692_200950_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209868.1|200927_201554_+	23S rRNA (uridine(2552)-2'-O)-methyltransferase RlmE	NA	NA	NA	NA
WP_016209871.1|201631_203614_+|protease	ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH	G9E4U6	Ostreococcus_lucimarinus_virus	3.9e-115	40.9
WP_016209869.1|203823_205167_+	phosphoglucosamine mutase	NA	NA	NA	NA
WP_016209874.1|205433_208103_+	pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring), homodimeric type	NA	NA	NA	NA
WP_016209857.1|208126_210046_+	dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209860.1|210215_211637_+	dihydrolipoyl dehydrogenase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	3.1e-45	27.8
WP_016209866.1|211782_212757_+	phospholipase A	NA	NA	NA	NA
WP_016209855.1|212788_213184_+	VOC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209859.1|213186_213408_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209875.1|213571_215233_-	chaperonin GroEL	A0A2I7SAK5	Vibrio_phage	5.3e-182	64.9
WP_016209850.1|215305_215596_-	co-chaperone GroES	A0A221S322	uncultured_virus	3.3e-15	42.6
WP_016209861.1|215821_216277_+	type II 3-dehydroquinate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016209852.1|216341_216806_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209862.1|216898_218245_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209870.1|218244_219150_+	50S ribosomal protein L11 methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209854.1|219211_220198_+|tRNA	tRNA dihydrouridine synthase DusB	NA	NA	NA	NA
WP_016209851.1|220190_220433_+	Fis family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016209858.1|220554_222099_+	bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase	Q58MG4	Prochlorococcus_phage	6.5e-65	47.8
WP_032126611.1|222145_223432_+	phosphoribosylamine--glycine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016209864.1|223474_224869_+	aminopeptidase P family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209867.1|224892_225072_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|225068_225644_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|225589_225955_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274988.1|226016_228251_-	type VI secretion system tip protein VgrG	NA	NA	NA	NA
WP_016210079.1|228672_229170_-	purine-binding chemotaxis protein CheW	NA	NA	NA	NA
WP_016210095.1|229340_230036_-	response regulator transcription factor	NA	NA	NA	NA
WP_080664831.1|230138_231701_-	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210093.1|232016_233810_+	aminopeptidase P family protein	A0A0P0I8D7	Acinetobacter_phage	2.6e-118	41.3
WP_016210081.1|233895_234168_+	DUF615 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210094.1|234173_234800_+	DUF938 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210077.1|234786_236217_+	exodeoxyribonuclease I	NA	NA	NA	NA
WP_016210086.1|236549_237605_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	4.3e-28	34.2
WP_032126605.1|237573_238251_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210084.1|238240_239077_+	D-methionine-binding lipoprotein metQ	NA	NA	NA	NA
WP_016210080.1|239236_239530_-|tail	phage tail assembly protein	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP039214|256927:301858|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_105962623.1|270449_271602_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
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WP_155046703.1|274490_274628_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_105962625.1|274631_275518_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212538.1|275689_276130_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016210131.1|337248_338271_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210121.1|341789_343562_+	single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

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MYSAGNLMTVEIIQQFSSELDRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
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MKVVIRTDSSFLIGSGHVMRCLVLADLLNIAGHTVSFICRDLPGNFNKYIVERGYAIAILPLSDKEKKKYLKIELVDDYELWRGVALKTDSQETRNALVDKTVGLLVVDHYGIDCVWHKQLRDCVDKIMVVDDLANRQHDCDVLLDHNFYIGLEKRYDNLVPKKCKKLLGPSYALINPKLKAVLEHRKHSGKLDKNNTIKNILVFLGGVDGEDYTDRILTQVLVIKRFESCVFNVVLGSNNPNKSALKKKYCEYDNVVFHVQPDYYHALMEKADLAVGAGGVSQLERSYIKIPSFVQAVAENQKKIVKEMRLYGYIQSIEGLSELGDKNLNFNELECHILSISELFNDNKNTELSSRLVNEKDMKDIYEWRIHPSVVSVSASKQAFSFSEHRAWFLEKLQSDDSYFLMFECLGFKVGVIRFDIKGRKFAVVNIFLNPLCINQGYGKKILKYGLSEFFKNTTITEVRADILEENIKSKRIFIRCGFNKYKASYCLHK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_129556623.1|448681_450241_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	3.0e-09	24.9
WP_051307335.1|450262_451297_-	EF-P beta-lysylation protein EpmB	NA	NA	NA	NA
WP_016210643.1|451345_451915_+	elongation factor P	NA	NA	NA	NA
WP_122940481.1|452050_453022_+	elongation factor P--(R)-beta-lysine ligase	A0A1V0SAC0	Catovirus	2.8e-21	25.3
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WP_129556624.1|454676_455663_+	glycosyltransferase family 4 protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210646.1|455994_457104_-	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210650.1|457209_458394_-	pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210649.1|458471_460460_+	excinuclease ABC subunit UvrB	NA	NA	NA	NA
WP_016210644.1|460668_460824_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300511.1|461081_461381_-	DDE endonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_075275005.1|461539_461875_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126128.1|462791_464198_+	capsule biosynthesis protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210501.1|464215_465202_+	UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase (inverting)	K7Y9E1	Megavirus	4.9e-42	34.2
WP_016210490.1|465204_466359_+	UDP-4-amino-4, 6-dideoxy-N-acetyl-beta-L-altrosamine transaminase	A0A2D2W2B8	Stenotrophomonas_phage	1.3e-14	28.6
WP_016210502.1|466355_467051_+	pseudaminic acid cytidylyltransferase	A0A1B1IVD3	uncultured_Mediterranean_phage	1.5e-08	35.5
WP_016210500.1|467185_468676_+	UDP-2,4-diacetamido-2,4, 6-trideoxy-beta-L-altropyranose hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210494.1|468696_469746_+	pseudaminic acid synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210496.1|469812_471207_-	capsule polysaccharide biosynthesis family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210489.1|472085_474017_+|tRNA	threonine--tRNA ligase	A0A2K9L297	Tupanvirus	2.3e-120	36.5
WP_075273353.1|474021_474552_+	translation initiation factor IF-3	A0A2L0UZ54	Agrobacterium_phage	4.7e-15	33.9
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WP_016210495.1|474823_475183_+	50S ribosomal protein L20	NA	NA	NA	NA
WP_016211706.1|475602_476598_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit alpha	A0A2K9L3A8	Tupanvirus	2.5e-33	37.4
WP_032126132.1|476610_478992_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016211707.1|478997_479285_+	integration host factor subunit alpha	A0A0H3UZA0	Geobacillus_virus	3.0e-08	33.7
WP_052133265.1|479556_480033_-	YbhB/YbcL family Raf kinase inhibitor-like protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210477.1|482957_484247_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126626.1|484483_485176_+	acid phosphatase AphA	NA	NA	NA	NA
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WP_016210484.1|488853_490611_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210486.1|491159_491918_-	oxidoreductase NAD-binding domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126625.1|492125_492698_+	DNA-3-methyladenine glycosylase I	NA	NA	NA	NA
WP_016210475.1|492801_493350_+	DUF2058 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210487.1|493651_493897_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210488.1|493925_494222_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_122941726.1|494489_495413_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556451.1|495891_496149_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075275009.1|497644_498352_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.3e-44	45.8
WP_075275011.1|498395_499124_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.2e-42	41.4
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WP_129556452.1|501248_501596_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212146.1|501598_503338_-	PLD-like domain protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016212066.1|504931_505708_+	N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase	NA	NA	NA	NA
WP_016212069.1|505919_506087_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212070.1|506061_506661_+	DUF1353 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300500.1|507070_507799_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	2.7e-45	42.7
WP_054300501.1|508147_508876_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	7.8e-45	42.7
WP_032126794.1|508887_509280_-	type II toxin-antitoxin system VapC family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_016212477.1|509276_509522_-	type II toxin-antitoxin system Phd/YefM family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_054300307.1|510625_511354_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.9e-43	41.4
WP_054300307.1|511960_512689_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.9e-43	41.4
512755:512814	attL	NA	NA	NA	NA
WP_016212268.1|513333_513918_-	recombinase family protein	W6CWV1	Ralstonia_phage	5.9e-27	38.0
WP_016212269.1|513921_514605_-	Fic family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375910.1|514887_515616_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
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WP_016212159.1|517121_517319_-	antirestriction family protein	A0A222Z017	Rhodococcus_phage	4.1e-09	55.7
WP_016212158.1|517586_518501_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275019.1|518610_519315_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	9.2e-43	44.3
WP_105962625.1|519278_520165_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211714.1|520539_523884_+	autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126478.1|527130_527469_+	hypothetical protein	R9TNL4	Vibrio_phage	2.7e-24	53.8
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Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP039214|640386:741015|DBSCAN-SWA
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MKNILIVGPSWVGDMMMSQSLLKVLKQQHAEVNIDVLAPNWTFALLARMPQVREAISAPFAHGQFAFKERMRLGQSLQEKHYDQVIVLPNSWKSAVVPWAAKIPQRTGWLGEFRYGLLNDGRKLDKVKYPLMVQRMVALAYPKGKEILPSMCPNPELIADENNVKQALEKFNLNMQSGSILALSPGAEFGPSKKWSPDYFAHVALEKIQAGWQVWLFGSKKDEAVAQEVLAKAPGCIDLVGKTNLEEAVDLLSATDQVVSNDSGLMHIAASLGKPTVAIYGSTDPGFTPPLGKKVRVLEKELDCRPCFKRECPLEHHHCMDSIKPDEVLHALDQLP

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_032126188.1|644002_645229_+	pentapeptide repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209528.1|645222_646251_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209514.1|646228_646921_+	DUF3540 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209516.1|646925_648395_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_051307310.1|648881_650354_+	type VI secretion system contractile sheath large subunit	NA	NA	NA	NA
WP_032126187.1|650353_650752_+|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssE	NA	NA	NA	NA
WP_016209524.1|650748_652437_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209506.1|652418_653375_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209515.1|653417_653933_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209526.1|654037_654970_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	1.2e-21	25.8
WP_016209534.1|655189_655576_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209530.1|655592_656237_-	2-polyprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016209504.1|656417_657257_+	carbon-nitrogen hydrolase family protein	M1I6H3	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	2.0e-15	28.8
WP_016209502.1|657332_657935_+	signal peptidase I	NA	NA	NA	NA
WP_016209512.1|657935_658790_-	RNase adapter RapZ	NA	NA	NA	NA
WP_016209537.1|659146_659458_-	ribosome-associated translation inhibitor RaiA	NA	NA	NA	NA
WP_016209519.1|659482_660874_-	RNA polymerase factor sigma-54	NA	NA	NA	NA
WP_016209538.1|661029_661761_-	LPS export ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	1.3e-20	30.7
WP_129556465.1|661757_662330_-	lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA	NA	NA	NA	NA
WP_016209499.1|662316_662874_-	LPS export ABC transporter periplasmic protein LptC	NA	NA	NA	NA
WP_016209498.1|662879_663860_-	KpsF/GutQ family sugar-phosphate isomerase	A0A2P0VNK5	Tetraselmis_virus	6.0e-32	30.4
WP_016209539.1|663999_664800_+	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.6e-25	32.7
WP_129556466.1|664803_665571_+	lipid asymmetry maintenance ABC transporter permease subunit MlaE	NA	NA	NA	NA
WP_016209535.1|665567_666032_+	outer membrane lipid asymmetry maintenance protein MlaD	NA	NA	NA	NA
WP_016209507.1|666054_666708_+	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209517.1|666711_667059_+	STAS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209505.1|667092_667344_+	BolA/IbaG family iron-sulfur metabolism protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209518.1|667418_668687_+	UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209527.1|668689_669448_+	Nif3-like dinuclear metal center hexameric protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209508.1|669509_670400_+	OmpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209511.1|670450_671134_+	uracil-DNA glycosylase	A0A0R5YU95	Harp_seal_herpesvirus	2.3e-46	49.5
WP_075273445.1|671219_671477_-	DUF4286 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275046.1|671749_673963_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210408.1|673954_674827_-	DNA replication terminus site-binding family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210409.1|674994_676824_+	class I poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210411.1|676987_677629_-	BON domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273448.1|677870_678401_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210404.1|678418_678592_+	50S ribosomal protein L32	NA	NA	NA	NA
WP_016210402.1|678650_679700_+	phosphate acyltransferase PlsX	NA	NA	NA	NA
WP_016210405.1|679706_680657_+	ketoacyl-ACP synthase III	NA	NA	NA	NA
WP_016210406.1|680710_681655_+	ACP S-malonyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210415.1|681682_682420_+	3-oxoacyl-ACP reductase FabG	NA	NA	NA	NA
WP_016210413.1|682508_682751_+	acyl carrier protein	A0A1P8VVJ5	Erythrobacter_phage	2.0e-05	39.7
WP_016210403.1|682825_684049_+	beta-ketoacyl-ACP synthase II	NA	NA	NA	NA
WP_016210400.1|684080_684929_+	aminodeoxychorismate lyase	NA	NA	NA	NA
WP_016210401.1|684925_685978_+	endolytic transglycosylase MltG	NA	NA	NA	NA
WP_032126181.1|686098_686719_+	dTMP kinase	A0A1L2BX49	Bacteriophage	4.2e-39	44.2
WP_016210407.1|686734_687721_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080743011.1|687831_688287_-|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556469.1|688246_688555_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_075275052.1|691169_691679_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212599.1|691728_691938_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212369.1|693172_693619_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|693622_694198_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075275054.1|694143_694509_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126651.1|694629_694815_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209899.1|694918_695953_-	phosphate regulon sensor histidine kinase PhoR	W8CYF6	Bacillus_phage	1.3e-32	34.2
WP_016209908.1|695949_696660_-	response regulator	W8CYM9	Bacillus_phage	2.2e-31	34.8
WP_016209923.1|697134_697653_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209901.1|697770_698103_-	GIY-YIG nuclease family protein	D7F5V9	Apocheima_cinerarium_nucleopolyhedrovirus	8.0e-05	34.2
WP_016209920.1|698132_701087_-	FAD-binding oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_016209912.1|701132_701630_-|protease	protease inhibitor I42 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209922.1|701689_702106_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209915.1|702197_703058_+	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126652.1|703140_703707_+	chorismate lyase	NA	NA	NA	NA
WP_016209918.1|703739_704594_+	4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209914.1|704635_707542_+	bifunctional [glutamate--ammonia ligase]-adenylyl-L-tyrosine phosphorylase/[glutamate--ammonia-ligase] adenylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209904.1|707602_707800_+	zinc-finger domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209903.1|707806_708817_+	lipopolysaccharide heptosyltransferase II	NA	NA	NA	NA
WP_016209910.1|708813_709872_+	lipopolysaccharide heptosyltransferase I	NA	NA	NA	NA
WP_032126655.1|709865_710666_+	glycosyltransferase family 2 protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209913.1|710668_711487_+	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209907.1|711498_712446_+	ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase	R9S880	Prochlorococcus_phage	1.6e-37	37.9
WP_032126654.1|712453_713755_+	3-deoxy-D-manno-octulosonic acid transferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209919.1|713933_715037_+	glycine cleavage system aminomethyltransferase GcvT	NA	NA	NA	NA
WP_016209906.1|715033_715426_+	glycine cleavage system protein GcvH	NA	NA	NA	NA
WP_016209924.1|715437_716814_+	aminomethyl-transferring glycine dehydrogenase subunit GcvPA	E3SN07	Prochlorococcus_phage	4.2e-47	34.6
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Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NZ_CP039214|839818:894271|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016209658.1|853718_855074_+	aminotransferase class I/II-fold pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_075273478.1|855250_855922_+	M48 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016209661.1|856037_856913_-	bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase FolD	A0A249XZQ2	Enterococcus_phage	1.5e-34	39.7
WP_016209645.1|857516_858821_+	trigger factor	NA	NA	NA	NA
WP_016209647.1|858933_859539_+	ATP-dependent Clp endopeptidase proteolytic subunit ClpP	A0A223W000	Agrobacterium_phage	8.4e-61	59.8
WP_016209663.1|859620_860922_+|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpX	G3M9Z9	Bacillus_virus	1.5e-134	57.3
WP_032126161.1|860989_863422_+	endopeptidase La	A0A0R6PGP8	Moraxella_phage	9.5e-220	52.7
WP_016209655.1|863525_863798_+	HU family DNA-binding protein	A4JWM7	Burkholderia_virus	2.0e-22	62.9
WP_032126162.1|863901_865779_+	SurA domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209643.1|865810_866695_+	lipid A biosynthesis acyltransferase	A0A1W6JP29	Morganella_phage	2.4e-40	35.3
WP_016209657.1|866703_867099_-	CrcB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209662.1|867526_869674_+	EAL domain-containing protein	G3MA91	Bacillus_virus	1.8e-25	36.7
WP_016209652.1|869645_870995_-	HlyD family type I secretion periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209642.1|870991_873112_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	F2Y1V5	Organic_Lake_phycodnavirus	2.0e-16	28.1
WP_016209656.1|873108_874812_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	W8CYL7	Bacillus_phage	2.8e-21	24.8
WP_016209654.1|874930_876073_-	galactokinase	NA	NA	NA	NA
WP_016209659.1|876137_877166_-	UDP-glucose--hexose-1-phosphate uridylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_129556477.1|877325_878807_+	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_059372266.1|878896_879382_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275067.1|879714_880782_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_129556482.1|927714_928320_-	NUDIX domain-containing protein	A0A1S6L1P8	Vibrio_phage	1.2e-17	30.9
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WP_016210542.1|934560_936267_+	thiol reductant ABC exporter subunit CydC	W8CYL7	Bacillus_phage	2.5e-25	26.9
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WP_016211426.1|943045_944488_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_016210416.1|953730_954261_+	prokaryotic cytochrome b561 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210420.1|954331_955510_-	mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein	Q6A202	Oenococcus_phage	2.0e-50	32.1
WP_016210425.1|955658_959507_-	bifunctional proline dehydrogenase/L-glutamate gamma-semialdehyde dehydrogenase PutA	NA	NA	NA	NA
WP_016210422.1|959493_960996_-	sodium/proline symporter PutP	NA	NA	NA	NA
WP_016210418.1|961546_962182_+	peroxiredoxin C	NA	NA	NA	NA
WP_081377899.1|962494_963358_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

>NZ_CP039214|967430:1070611|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>NZ_CP039214|1100068:1143128|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016212005.1|1137257_1139018_+	gamma-glutamyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_032126856.1|1141376_1141718_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081377901.1|1141778_1142489_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075275102.1|1142669_1143128_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

>NZ_CP039214|1197113:1249794|DBSCAN-SWA
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MTQQQMNKINQACKKVDEKVAAEYAERGLKFISDRQGDLGGGHFSNVYPLKVKAGTNKEIFGSTHYSP
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MIEIIITLILMTFIVGFFNPRMIVWSIAGAILLVIWSYLGISSVLIKTFIWVAFLAIAVIYTFRPIRRRFISSAILKIFKKSLPTVSQTEEEALNAGDSWFEADIFRGQPNWQKLQTLTISKMSTEEQAFFDNETEQLCQMIDDWQATHEDKDLSPKVWQFMKDQGFFGLVIDKKYGGKGFSAYAHSSIVMKVASKSSSAGVTVMVPNSLGPGELLYHYGTDEQKNKFLPELAQGRQIPCFALTAPEAGSDAASIPDKGIVCMGHYQGEETLGIRLTFNKRYITLAPVATLVGLAFHLYDPERLLDGEEAIGITCALMPHDHPGVNIGNRGIPLDMCFMNGTVRGEDVFIPIDWIIGGRARAGQGWKMLVECLSIGRSISLPACATATGALSFVMTGAYALVREQFNTSIGHFEGVEEALARIGGLTYLLDACRRLTVTAVDQGIKPSVASAIAKYHMTEMSRQVINDAMDIHGGRGILLGPRNYLGRAYQSVPIGITVEGANILTRNLILFGQGAMCTHPYLRKEFYAARDGKLAEFDQELFSHGGYLFKNFCRSLWHGLTAGKLIAVPESRLAGYYQQISRMSATFALTADVALLYLGGSLKRKERLSARLGDVMSYLYMASSALKRYTDEGEPQQECIYVEWAVQHCLYQVQVAFDEFYQNFPQRFLASVLRRLTFFWGKPYKMPQDYLDHKIAQDMLKNTEVRRRFAALVYVPEHMPDDAVGRVECAFQLRLEAAAILAKVKQAVKAGEIAKGALKGQIEQLSQRGALSAQELALLKRYEHARWEVIQVDEFSKESLQNNKTRPS
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MLILTRRIGETLMIGDDVTVTVLGIRGNQVRIGVNAPKEVSVHREEIYLRIQEEKDGGQSQAGHSSGSEMNGNRVPFPGSDDIDGNR

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016209836.1|1198006_1199221_-|protease	FtsH protease activity modulator HflK	NA	NA	NA	NA
WP_032126639.1|1199240_1200527_-	GTPase HflX	NA	NA	NA	NA
WP_016209846.1|1200542_1200797_-	RNA chaperone Hfq	NA	NA	NA	NA
WP_016209830.1|1201032_1202400_-	glycerol-3-phosphate transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209826.1|1202730_1203753_+	glycerophosphoryl diester phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
WP_032126640.1|1204275_1205751_+	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_129556633.1|1205967_1206864_+	sphingomyelin phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016209827.1|1207182_1208742_+	SH3 domain of the SH3b1 type family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209841.1|1208817_1209012_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209831.1|1209231_1209930_+	DUF3865 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209832.1|1210208_1210472_-	carbon storage regulator CsrA	A0A2I7RT00	Vibrio_phage	4.1e-12	68.6
WP_016209848.1|1210778_1213373_-|tRNA	alanine--tRNA ligase	A0A1V0SK38	Klosneuvirus	8.3e-89	41.3
WP_016209835.1|1213369_1213852_-	regulatory protein RecX	NA	NA	NA	NA
WP_016209844.1|1213829_1214870_-	recombinase RecA	A0A0S2MVG1	Bacillus_phage	1.3e-117	66.3
WP_016209840.1|1215042_1215528_-	CinA family protein	B5TK85	Pseudomonas_phage	1.2e-36	56.2
WP_032126641.1|1215635_1218206_+	DNA mismatch repair protein MutS	A0A1V0SJ67	Klosneuvirus	3.9e-30	22.9
WP_032126642.1|1218241_1218703_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126643.1|1218772_1218979_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211648.1|1220182_1220722_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211650.1|1221381_1222866_-	glycerol kinase GlpK	NA	NA	NA	NA
WP_016211651.1|1222990_1224526_+	glycerol-3-phosphate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|1224759_1225125_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556501.1|1225070_1225646_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_059372539.1|1225678_1226542_+|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_080728346.1|1226559_1226892_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300375.1|1227698_1227899_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210928.1|1228113_1228419_+|transposase	ISAs1 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016210929.1|1228453_1228810_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046724.1|1228806_1228974_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210921.1|1229198_1229783_-	superoxide dismutase	NA	NA	NA	NA
WP_016210925.1|1229874_1230561_-	7-cyano-7-deazaguanine synthase QueC	A0A2H4J8Q7	uncultured_Caudovirales_phage	9.7e-29	36.5
WP_032126561.1|1230684_1231869_-	NAD(P)/FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_016210917.1|1232082_1233525_-	PLP-dependent aminotransferase family protein	A0A1X9I5H2	Streptococcus_phage	5.4e-21	24.5
WP_016210927.1|1233649_1234600_+	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210930.1|1234660_1235434_+	enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210918.1|1235437_1236187_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210926.1|1236271_1237741_-	type VI secretion system tip protein VgrG	NA	NA	NA	NA
WP_129556502.1|1238000_1238564_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273571.1|1238672_1239350_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211012.1|1239499_1240072_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211008.1|1240180_1241683_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211011.1|1244483_1245680_-	acetyl-CoA C-acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211013.1|1245740_1248107_-	3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126565.1|1248424_1248697_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|1248907_1249273_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|1249218_1249794_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

>NZ_CP039214|1254330:1431565|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016210515.1|1258203_1259106_+	carbon-nitrogen hydrolase	M1HCD5	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	2.7e-55	40.7
WP_016210514.1|1259214_1260468_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075273576.1|1264082_1264811_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210507.1|1264938_1265487_+	transglycosylase SLT domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211471.1|1276365_1278351_+	sodium/hydrogen exchanger family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211418.1|1301029_1301491_+	YaiI/YqxD family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211221.1|1331050_1332193_+	cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II	NA	NA	NA	NA
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WP_032126210.1|1353255_1354299_-	type IVB secretion system coupling complex protein DotM/IcmP	NA	NA	NA	NA
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WP_016211806.1|1427866_1428592_-	UDP-2,3-diacylglucosamine diphosphatase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

>NZ_CP039214|1458415:1494935|DBSCAN-SWA
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MNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGCQPPISETV

Homologous phage analysis in the prophage region

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1450953:1451012	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_054300363.1|1461726_1462074_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_129556637.1|1463409_1464189_-|integrase	site-specific integrase	NA	NA	NA	NA
WP_016210843.1|1464803_1465034_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210844.1|1465120_1466248_+	Fic family protein	D7RWK9	Brochothrix_phage	5.7e-10	23.2
WP_122941824.1|1466432_1468169_+	sodium:proton exchanger	NA	NA	NA	NA
WP_032126340.1|1468249_1469011_-	DUF4402 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556514.1|1469290_1471747_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210839.1|1471898_1472672_+	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210841.1|1472730_1473102_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1473315_1474290_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_033923779.1|1474658_1475495_+|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3
WP_081377864.1|1475508_1475748_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211148.1|1475829_1477158_-	sodium:alanine symporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211143.1|1477421_1477991_-|protease	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit	A0A223W000	Agrobacterium_phage	7.3e-30	39.5
WP_016211151.1|1478006_1478318_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211146.1|1478327_1479284_-	ferrochelatase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_17

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17

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MIIYHLRNTSIIKKSVKNLSRKRLPDHRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_054300271.1|1504152_1505127_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_016212348.1|1507814_1509044_-	ComEC/Rec2 family competence protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211994.1|1510462_1510999_+	DUF2062 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126537.1|1511035_1511221_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211991.1|1511461_1512367_-	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_032126538.1|1513275_1514694_-	autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007034.1|1514958_1515243_+|transposase	IS1 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_080728343.1|1515224_1515365_+	hypothetical protein	A0A0U2RK18	Escherichia_phage	1.6e-07	69.0
WP_016211561.1|1515446_1519313_-	ATP-dependent RNA helicase HrpA	A0A1V0SBU4	Catovirus	1.9e-49	26.2
WP_016211564.1|1519478_1520354_+	ParA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211563.1|1520386_1520548_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274852.1|1520758_1521202_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1521330_1522305_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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Sequences of DBSCAN-SWA_18

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18

>NZ_CP039214|1568576:1624713|DBSCAN-SWA
AATGATGCCAAAATTATTAGAACAAAAGCAGTGGGACAAAATCTACTTATTCTTAAAAGACTTTTCAGGGATTTACTGTGGCTCAGAAAGGAAATGTCGTTTATTTATCGAAGCCGTTATATGGATTCTCCGTACAGGCTCCCAATGGCGTTACCTACCGGAAGATTATGGATATTGGAATAGTGTTTATAAACGGTTTAGTCGTTGGGATAACCGAGGCGTTTGGGATGCTCTTTTTACATCTGTGCAAACACCTGAACTAGACTCAGGTATGGTTGATTCAACAGTGATTCGAGCTCATGCGTGCTCTGCGGGATATAAAAAAAGACAAAGGGATTAACCAAGCCTTAGATCGTAGCTGTGGAGGCTTTAGTACAAAAGTCCATATTTTAACAGAGGGGTTGGGTTATCCTGTAGATTTTGTACTGACACGAGGGCAAGCACATGATGCTCCTCAGGCTCAGGGGTTACTCACTTCAGTGGCGTTTGATCAAATTATTGCCGATAAAGCTTATGATGACATAAAGATAAGAGAGTTAGTTGTCAAAAAGGGGGCTAAGTGTATTATTCCTTCTAAATCAAATAGGATTAATAAATTTGACCACGATCAGCATGTTTACAAGGAAAGGCATTTGATAGAGTGCTGCATTGGCAAGTTAAAACAATTTAGAAGAGTTTTTTCACGTTTTGAAAAAAGGGCTTGCAGATATTTATCCTTTTTGAAAATTGCAAGCACTATCTTATGGTTAAGGTGAAATGTCAACGGAGCCTAATCATTAACATAAAATAATTAGCTTGCTATTGGAATCGCTTATTTACACAACATAGCATCAAACCAGGTTAAAACTTCTCAAGCGCCTTACTTTAGAGCACTCAAAATTAGGTTAGGTTAGATTAATAAATCACAATAGACCAATCACTTTATCCAGGCATTTTAATAATTTCTCGTGCTACCGTCATATCAAATTTCAACTTCATCTCTAGATAATCCATAAACACCTCACGAGCCAGCTCTCTTTGGACATCCGCTGCTGGGCCCTCTAATCTCATTAGAAACTCTTCGTAAATATAATTCCTAAACTCAATGGGTGCGTATTTTTTTAGGTTGTGAATATTATGACCCGCATCATATAGCAAATCGATACATTGACTAATTTCTTGATCACATACGGAAAAGACAAGCTCGCACACAGGCTCACGGTGAAAAGCCTCTACAGCTTCAACTGTTCCAGCAGACTCTGCTGCAAATTTTGCTAATGATTTTTTCTGTCTGGTGAACATAACTGACTCTCCTTGTTCTTTTAATAGATGTAGACCATTTTACTGCAAATAACCACCATCATTATAAACAAAAACAGACGGTACTGAGTTTCCTGAGCAAAGCCACTCTTACAAAAACAGCCACCTCACCCTAAAACATGTTAGAATAAGCTTCAGTCTTAACAAAAAACTCTATTTATACAGAATATTTTATATACCATCAATTCATTTAATAACCTAGATTTTATGTCTTTATTCCTTGAAAACTCGGAATTAAAAATAAAGATAAGGAGTAGAAATAATGACCTTTGGCATTTGGCTATCTTTATTTGCTGTATGTATATTAGGTGCGATGTCTCCAGGGCCTAGCCTTGCCATTGTTACCAAGCATAGCTTAGCCAATGGCCGCTGGCACGGCATTGCCACTTCATGGTCTCACGCACTAGGTGTTGGTTTATACGCAACACTCACCTTATTAGGCTTAGCTGTATTACTGAAAAAATCGCCCATATTGTTTACCATCATCAGCTATGCTGGCGCTGGCTATTTAGTCTATCTAGGAATAAATGCATTACGCTCTAAAGGCGGTATTGACTCTAAGCTTAACCTTGGCCAACCGGCACCACTTAAAGACAGCTGCCGAGAAGGCTTCATGATCTCATTGTTCAATCCAAAACTTGCACTATTTTTCCTCGCGCTGTTTAGTCAGTTTATCTCTGTAGGGCACCAATTATCGAGCCAAGTCATTATCGTTGCAACTCCGACACTGGTTGATGGGCTTTGGTATACCTTAATCGCCTTTATTCTATCCAATCCCAAGGTACTCAGTATTCTAAAAAATAAAGCTCAGCTAATTGACCGTTTATCAGGTATCGTGTTGCTGCTTTTAGCCAGTGTTTTTATTATATCAACGATTAGCCATTCTATATTCAATATAGTGGTTCAATGAGGATGGCGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTGCGTGCCTTGAATCGGCACACTCCACCACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGTCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGGTAGATAGGTGCAATATTTCGTTATTTGGTAAAATAATTAAGGTTGCGAAGCAGTCAATATTACAAAAATATTTCAACCTTTTTATAAAAAAAGAAAACATTTTATCTTCATAAACTTCATTCATAATAATGTTTGCTTTTTTTCGTATATTGATCATTTGATAAATTTAAGCTGTCTTTGTATTGAGGGATGTCATTTCTGTTAAATACTCAACTCTTACCTTGAATAAACCAAAGTTAGATGAGTTTTTTATATTAAAGAGCTCACCTTACGCACTGACATGATAAACAATGTATAATGAAATCTGATAGATACAGGGATTTCATCAGGAATGAATAAAGAGCTACTGGATATTTATAGCGACTATTTAATTAGCCAGAACCATTATGCAACGGCAACAGGACTTTCAGATTTACTGGAAGGAAGTATCAGCCATGATAAAGTCACACGCTTTTTAAATAAAAACCACTTTGGATCAAAAGAGCTCTGGAGCTATGTTAAAAAGCATGTTCGTCAGTATGAAGAAGAAGTTGGAGGCGTTTTAAGTCTGGATGATACCGTGGAAGAAAAGCCTTATACAGATGAGAATGATGTGGTTTGTTGGCATTATTCACACAGCAAAAGCGCTCATGTAAAGGGAATTAATATTTTGACAAGTATGGTGACTTACAAGAAAACGTCCGTACCTATTGGTTATGAAACTGTATTAAAAGACATCAAGTTTACTGATTTAAAGGACCGAAAAGAAAAGAGAAAATCTAATATATCGAAGAATGAGTACTTTCGTAACCTTATAAATCGTGCAATTAATAACCAGGTTAAATTTGATTATGCTGTTGCAGATAACTGGTTCAGTTCAAAAGAAAACATGAATTATATTCATGCTAAGTTAAATAAGTTGTTTATTTTAGGAATAAAATCTAATCGAATAGTTGCTTGCAGTTTAGATGATAAAATCAATAGAAATTACCAGCCAGTCAAATCTCTTGATTTAAAAGATGGTGAGGCCATAGATGTATATCTTCAGGGAATTAATTTCCCAGTGCGATTAATGAAAAAGATCTTCACAAACGAAGACGGGTCAACAGGTCACCTCTATTTAATAACAAATGATTTAGAGACGGATGGTGATGGGCTTTACAAAATCTATCAAAAACGATGGAAAATTGAAGAATATCATAAGTCGATTAAACAAAATGCAAGTTTAGCAAAATCACCAACTAAAACTGTTCGGTCACAATGCAATCATATTTTTGCATCAATCGTGGCATTTTGTAAACTAGAAACATTGAGTGTAAAAGCACAACTTAACCACTTCGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTACTCTATACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCAATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTGTTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAATTTCATTAAAATCTGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCCGCAAACTCTGTTCCATTGTCAGAGGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGATCGCGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGGTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTATTTGATCACCACGATTCACCTTTTTCTTATAAGGTTTTCCCGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTTTCACTCACCTGGATATCATGCTCTCGTATAAGTTCCTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGGGTGCTTAACCGTTGATGGATCAACATTTTTGCCTCCTCTGAAATTTGTCGAAAAGCTTGACCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCACAGGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAACCATCTCTACCCTCTAAGTCAAAAGGCGAACTAGAGAGTTTATCTGTATGAATATGAACTCTCTACTGAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGCTTTGCACTCAAATATAAATTACTTGTGCGGTCAAATCAAATAGCTTTTGAAGAGCTTAGGCGATTAAAATGTTTAT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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211666.1|1587382_1590202_-	excinuclease ABC subunit UvrA	A0A1B1IVR3	uncultured_Mediterranean_phage	1.0e-311	55.2
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WP_032126677.1|1593272_1593836_+	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211557.1|1594030_1595260_-	na+ dependent nucleoside transporter family protein	B2YG43	Musca_hytrovirus	2.0e-08	22.0
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WP_032126678.1|1596258_1597269_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	1.2e-22	40.6
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WP_075274858.1|1599734_1600820_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|1600956_1601322_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|1601267_1601843_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_075274822.1|1605221_1606196_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	8.9e-28	32.0
WP_129556523.1|1606531_1607417_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016209772.1|1608436_1608988_-	putative Fe-S cluster assembly protein SufT	NA	NA	NA	NA
WP_016209778.1|1609006_1609381_-	iron-sulfur cluster assembly accessory protein	A0A218MM00	uncultured_virus	1.7e-11	38.5
WP_016209796.1|1609411_1610629_-	cysteine desulfurase	Q2XUY6	environmental_halophage	2.9e-92	42.0
WP_080664823.1|1610652_1612053_-	Fe-S cluster assembly protein SufD	NA	NA	NA	NA
WP_016209795.1|1612033_1612789_-	Fe-S cluster assembly ATPase SufC	A0A285PWH2	Cedratvirus	1.3e-10	24.6
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WP_032126436.1|1614293_1614749_-	SUF system Fe-S cluster assembly regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016209771.1|1615455_1616178_+	sel1 repeat family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209791.1|1616342_1617065_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307317.1|1617201_1617495_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209798.1|1617556_1619581_-	chemotaxis protein CheA	NA	NA	NA	NA
WP_016209769.1|1619593_1620337_-	protein phosphatase CheZ	NA	NA	NA	NA
WP_017377132.1|1620378_1620762_-	response regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016209784.1|1620848_1621571_-	RNA polymerase sigma factor FliA	A0A1B1P7V3	Bacillus_phage	2.7e-05	24.1
WP_129556524.1|1621567_1622455_-	MinD/ParA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126239.1|1623592_1623865_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_033923779.1|1623876_1624713_+|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3

Sequences of DBSCAN-SWA_19

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19

>NZ_CP039214|1636678:1692472|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_20

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20

>NZ_CP039214|1698640:1753898|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_21

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21

>NZ_CP039214|1783520:1832968|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_21

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211940.1|1809771_1810104_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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1812236:1812526	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_016211947.1|1830544_1831690_+	succinyl-diaminopimelate desuccinylase	NA	NA	NA	NA
WP_075274878.1|1832092_1832968_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_22

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22

>NZ_CP039214|1875658:1892025|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016212247.1|1884337_1885093_+	ZIP zinc transporter family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016212246.1|1888220_1888877_-	AT hook motif family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274882.1|1889812_1890409_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556544.1|1890523_1890880_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300162.1|1890942_1892025_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1

Sequences of DBSCAN-SWA_23

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23

>NZ_CP039214|1936820:1951630|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_24

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24

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MIYLDYAATTPVDPEVIQAMQECLGLEGDFANPSSLHRLGWLAAEKIKHARGQIARLVGADSKAIIFTSGATEANNLAIKGVCEAYQKRGRHIITSKAEHKSVLDVFAVLEKQGFEVTYLTPNKQGLIDPEILQTAMHEQTILVSLMHVNNELGVAHDLVALGTIVKAHGAIFHVDAVQALGKLPIDLAELPVDLMSFSAHKCYGPKGVGTLFVRRRPKVRLHAQQHGGGHELGLRSGTLATHQIVGFGRACELAEEKLNEEPQRVMALRDRLWQGLSQYDQVYWNGQGALTQAPGILSVSFAGVDGESLLACLPELAVSQGSACNSTTVEISHVLAAIGMPAERAHSTLRFSLGRYSTLAEVDQVIEQVGRALTHLRKLSPTWQVQQAGADPALLPWGRYVE
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MDTSLIGLFCIVDDFCQVFLPHWKASLLEHQDKQRNKPSRMSTSEIMTIMIYFHQSHYRNFKHYYQREVQGHLKKYFPKAVSYNRFVELMPTILLPLCFFIAAQRKTPTGIYFVDSIVLRVCHHKRSHQNRVFKGLAKKCGSTMGWFYGFKLHLIVNDMGELMAFKLSQATTDDRVVLPEIAQGLTGKIIGDKGYISQDLFNRLYEKGLQLINKIRKNMKNKLMPIIDKILLRKRGIIESVFDQLKNISQIEHSRHRSVNNFMVNILAGLAAYCLQEKKPSLNIQRNLLTS
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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
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MAKEENIEMEGTVLETLPNTMFRVELENGHVITAHISGRMRKNYIRILTGDKVKVEMTPYDLSKGRIIFRGNDRKSQSSPR
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MSILPKIRIVLVETSHSGNIGAVARAMKNMGLGRLYLVAPNDFPSDQAYALSSHAEDVLDHAVISASLAEAIADCQLVFGTSARERKVPWPLEAPRQMAQRVMSEHSQHEIAVVFGRERTGLTNQELQCCHYHVHIPTNEEYSSLNLAQAVQVIAYELRLAALDHNQNVNNNALNNDNNIGLKTIEQPEKLLASSAQMEGFYLHLEKLLRKIHFLDEAQEGMLMLKLRRLYQRSRVEEAEMHILRGILSKMERRLDEKGKSK
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MQATAVTMQKVNLLNLDRVGLQQFFQSIGEKPFRARQVLQWIHQRGVVNFDEMTDLSKALRGRLHESAEIVAPKVVFDKVSVDGTRKWLIQLPEGNCIETVFIPEGKRGTLCVSSQVGCALNCTFCSTATQGFNRNLSVNEIIGQVWVAKHALEKDIDVQKSPDQRVLTNVVMMGMGEPLLNFDAVMSAMSLMMDDYAYGLSKRRVTLSTSGVVPALYEMKKHSDAALAVSLHAPNDELRNQIVPINKKYPIAELLKACENYIHGRPHAKVTIEYVMLQEVNDSLEHAKELAEVLKTLPCKINLIPFNPFPGTCYQRSSRNRIVRFQNYLLEKEFIVTVRKTRGDDIDAACGQLAGDFTDKTRRRERLQVKQQEAV
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MATGFVKWFNNAKGYGFIRPAEGGADLFAHFSSIDMDGYRTLKTGQPVSYETNQGTKGLYATNIYVDRGLDDQMFSHNFSTETSIRPSANTPKGSSS
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MKRTCLRALLAAASVVLVGCSSLTHHDQQSTQSTSSVDKGHSVQSLQKGSAAATLGKGK
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MKNKKLYLIITCILSTSALSTTQASTQCALIIDAGSSGSRAHLYQYDLNKSHFGKVAEFGKAAKLSPGLSIISADKAPDYISELLKKVNIPNSCYSDASKVQFGLYGTAGMRLLSQDAQKAIYQAIRTTLQQQPNSKKFNIFPHGIRTISGRWEGIFAWIDNNWDNAKFRLTAHTNGILEMGGASTQITFHPTTNVHNNNITRINLGHRPISIYSASYLGLGQDQLRNQFLNHTTCFPNGYKLPNGKRSQLADYATCQRSINPLITKVHQVQPINNLIDSNKTFNALSGFSYTAQFFKLQSLSADLLKQKGKQFCSTSWDQLQKTYPNNPFLYTYCINSAYFSRLLSRGYQFPSNATIIPTHTNRDGSNISWTRGALIYLENNPSTKKHLCPHYPAQETQLIKGQNDTHIKKQLSNNQNPYINQAEHKC

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016209424.1|2031352_2032630_-|tRNA	histidine--tRNA ligase	A0A2I2L577	Orpheovirus	6.6e-23	25.1
WP_016209433.1|2032729_2033104_-	rhodanese-like domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209412.1|2033188_2034076_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209436.1|2034133_2034862_-	type IV pilus biogenesis/stability protein PilW	NA	NA	NA	NA
WP_129556555.1|2034858_2035989_-	23S rRNA (adenine(2503)-C(2))-methyltransferase RlmN	NA	NA	NA	NA
WP_016209444.1|2036119_2036548_-	nucleoside-diphosphate kinase	A0A167REB2	Powai_lake_megavirus	1.1e-17	39.4
WP_032126508.1|2036642_2037002_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209447.1|2036991_2038203_-	aminotransferase class V-fold PLP-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_016209421.1|2038199_2038988_-|tRNA	tRNA (cytosine(32)/uridine(32)-2'-O)-methyltransferase TrmJ	NA	NA	NA	NA
WP_016209411.1|2039150_2039945_+	inositol monophosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|2040150_2041125_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_155049809.1|2041299_2042595_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007013.1|2042598_2042898_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046696.1|2042887_2043052_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300550.1|2043108_2043474_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211553.1|2043813_2044554_-	outer membrane lipocarrier LolA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211549.1|2044557_2047062_-	DNA translocase FtsK	A0A218M9A2	Mycobacterium_phage	4.9e-86	43.1
WP_016211548.1|2047324_2048281_+	thioredoxin-disulfide reductase	A0A2I2L5E1	Orpheovirus	1.6e-61	43.7
WP_016211550.1|2048264_2049026_+|tRNA	leucyl/phenylalanyl-tRNA--protein transferase	NA	NA	NA	NA
WP_075274903.1|2049103_2049979_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211259.1|2050103_2050349_+	translation initiation factor IF-1	NA	NA	NA	NA
WP_016211262.1|2050408_2052682_-|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA	A0A223W0B1	Agrobacterium_phage	1.0e-167	41.8
WP_075273504.1|2052736_2053090_-|protease	ATP-dependent Clp protease adapter ClpS	A0A218MMY6	uncultured_virus	6.7e-10	40.0
WP_016211261.1|2053279_2053573_+	cold-shock protein	A0A2H4N7Y6	Lake_Baikal_phage	5.8e-15	61.5
WP_032126515.1|2053745_2053925_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307354.1|2054000_2054576_-	DedA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126514.1|2054858_2056175_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211263.1|2056185_2056554_-	thioredoxin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211265.1|2056584_2057247_-	adenylate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2057421_2057787_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556556.1|2057732_2058308_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126519.1|2058475_2059195_+	TIGR00730 family Rossman fold protein	A0A1D8KUT5	Synechococcus_phage	1.9e-19	34.8
WP_016211478.1|2059174_2059990_-	nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126518.1|2060006_2062208_-	GTP diphosphokinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211474.1|2062290_2063640_-	23S rRNA (uracil(1939)-C(5))-methyltransferase RlmD	E4ZFI6	Streptococcus_phage	5.7e-33	27.6
WP_016211473.1|2063714_2064314_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211476.1|2064297_2064507_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211931.1|2064824_2066012_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211932.1|2066207_2067497_+	GDA1/CD39 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300152.1|2067907_2068273_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210558.1|2069909_2070665_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210562.1|2070738_2072391_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210560.1|2073958_2075659_-	urocanate hydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016210557.1|2075747_2076500_-	amidohydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210564.1|2076502_2076964_-	amidohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210559.1|2076960_2077923_-	formimidoylglutamase	NA	NA	NA	NA
WP_016210566.1|2078283_2078706_-	universal stress protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210568.1|2079011_2079653_+	pyridoxamine 5'-phosphate oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_016210561.1|2079780_2081115_+	dihydroorotase	NA	NA	NA	NA
WP_032126397.1|2081229_2081820_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|2082168_2083230_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_25

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25

>NZ_CP039214|2091074:2135780|DBSCAN-SWA
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MLSTPWLAAFDQIIADKAYDDIKIRELVVKKGAKCIIPSKSNRINKFDHDQHVYKERHLIA

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211037.1|2094193_2094823_+	glycerol-3-phosphate 1-O-acyltransferase PlsY	NA	NA	NA	NA
WP_016211042.1|2094871_2095888_-|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex transferase subunit TsaD	A0A0R6PI74	Moraxella_phage	5.3e-100	54.2
WP_016211035.1|2096134_2096350_+	30S ribosomal protein S21	NA	NA	NA	NA
WP_016211043.1|2096402_2096852_+	GatB/YqeY domain-containing protein	A0A292GL36	Xanthomonas_phage	4.1e-20	44.2
WP_016211039.1|2096931_2098677_+	DNA primase	A0A1S5RGL3	Helicobacter_phage	2.6e-46	37.1
WP_016211036.1|2098768_2100640_+	RNA polymerase sigma factor RpoD	A0A2I7SAT0	Vibrio_phage	2.7e-33	30.7
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Sequences of DBSCAN-SWA_26

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26

>NZ_CP039214|2156979:2206727|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP039214|2156979:2206727|2157679_2157880_-|WP_036777115.1|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_27

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27

>NZ_CP039214|2212919:2258420|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_28

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28

>NZ_CP039214|2327623:2387235|DBSCAN-SWA
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MQKPSLSYRDAGVNIDAGNRLVERIKHVAKATHRPGVMGSLGGFGALFELPTDRYKAPVLVSGTDGVGTKLKLALELGIHDTVGIDLVAMCVNDLIVIGAEPLFFLDYYATGELDVDVAASVIKGIGEGCLQAGAALVGGETAEMPGMYSAGDYDLAGFCVGVVEKERIVDASRVTAGDVLIALGSSGVHSNGYSLVRKILAVAGQGFETVLSESGKTLAELLLAPTRIYIKSLLPLFNQDKIHACAHITGGGLPENLPRVLPAGVSAKINTASWQWPEIFQWLQQQGGVETDEMYRTFNCGVGMVICVAREDVDDCLAQLTASGENAWVVGEMIDGQDQPVIFSE
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MAQVRIVDCQLETAAQDFALSLRETGFAVVKNHGIPFELVRSVYNEWLAFFKTEAKYQYLFDRDKQDGYFPPEVSETAKGHTEKDIKEYYHIYSWGRYPAGLSNQAHELCEKSTELAVMLLNWLEAETPAEIREKLSESFASMITASDNILQRILHYPPMTGDEEPGAIRAAAHGDINLLTVLPSSNEPGLQVKPLGSDWIDVPCEPETIVINAGDMLEEATAGYYPSTLHRVINPTGAGSANSRLTAPLFLHPRSDVVLSERHTAKSYLDERLKELGVK
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MKRRNISSGSDWEKQIGFSQAVCVGPFIQISALTPVDAEGKVIGIRDAYEQTKQILTNLQATLEHAGAEMADVVRTRIYVKDLRLWQEIGRAHGEAFQDIKPATSMLEVSRMTGPDFLVSIEADAIIDESAERV
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MANLKYFYGSLLVTIAGLIAAFFVGHEHPLTAVYITAVLALLEISLSFDNAVINARVLADMPMFWRKLFIYIGLPIAVFGMRLIFPILLVDMTTQLSFIDVFHLATSDPHAYHEALLQGMPMISAFGGAFLLKVFLGFFFDKEKDVHWVPFLEANRAIKAASNLPGVSLLLSLLAGMLLIYYTKDWHVAFAYLSGIILHELLSVMGLLFNQPASSGQTLVRNGLISFIYLEFLDASFSFDGVIGAFAISTNIFIIMIGLGIGAMFVRSLTIFLVEKKTLSSFPYLEHGAHYAIGFLACVMFIKMFHHVPEAITGTVGIGLIIIACLHSYIERRIKS
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MLKAMDKMMAPYFGLSRDIYIIALTEFVLALGRFVFPFLSLLLTQKLGLTIAQAGVWIAVTGLNSLLGSLIGGKLSDHCRRRSIIIVGQACSVMVMFVGGFCTTGLAILPLIFIASFTMGVAMPAVRALLTDLSTPDNRDAVAASHGVLSTG

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017376619.1|2328362_2328767_+	RidA family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126712.1|2330934_2331393_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209553.1|2332137_2333148_+	DUF475 domain-containing protein	A0A172Q0Y5	Acinetobacter_phage	2.9e-58	42.2
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WP_016209545.1|2334869_2338364_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209551.1|2338401_2339241_-	16S rRNA (cytidine(1402)-2'-O)-methyltransferase	M1PLC5	Streptococcus_phage	1.8e-45	45.0
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WP_016209547.1|2339691_2340267_-	ribonuclease HI	V9M0C8	Vibrio_phage	1.3e-29	46.6
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WP_016209568.1|2340770_2341760_-	murein tripeptide/oligopeptide ABC transporter ATP binding protein OppF	G9BWD6	Planktothrix_phage	1.7e-18	32.7
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WP_016211371.1|2365851_2366775_-	badF/BadG/BcrA/BcrD ATPase	NA	NA	NA	NA
WP_016211368.1|2366971_2368363_+	sugar porter family MFS transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_016211374.1|2370071_2371262_+	NO-inducible flavohemoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_016211373.1|2371316_2371463_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016212197.1|2374782_2375700_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210873.1|2377075_2377726_-	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	4.1e-21	36.6
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Sequences of DBSCAN-SWA_29

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29

>NZ_CP039214|2425220:2599254|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_29

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MARSVCMNMNSLLSVALQMTEGVMLPFKGLILLKSFTSSHSNSLLTSVDYYTLLKSKFFATVPPN
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MRTYSQLLYIKKVYNKIVKSAAATKATHFLFPYHCVFCQAHTENHDICPYCLDDLPWIQAACARCAHPLPAHQDYCGNCISTPPPFHYSHSLLEFNWQAQFLIYQLKYQKNPAYAKLLAQLFIYRIKITHLPDALLAVPLHQGRLKQRGFNQSQLITNQLAKHYQIPIIQPIKRIKNTQSQTGLNKKQRENNLKNAFQITQTISKNLSHLAIIDDVLTTGATISELSQLLIHHTGIEKISVWTLARTCKS
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MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEAKMLIHQRLKTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIGTVAKNYSELQKGYFIVLSA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_075274928.1|2430790_2431765_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	5.2e-28	32.0
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WP_016209671.1|2436809_2437037_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556575.1|2437104_2438073_-	phosphatase PAP2 family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209693.1|2453710_2454457_-	type IV secretion system protein DotC	NA	NA	NA	NA
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WP_016209681.1|2456518_2457499_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556659.1|2457504_2458650_-	conjugal transfer protein TrbI	NA	NA	NA	NA
WP_016209676.1|2458706_2459546_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209690.1|2460587_2463275_-	aconitate hydratase AcnA	NA	NA	NA	NA
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WP_016211688.1|2468456_2468675_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211600.1|2468823_2469342_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211601.1|2469677_2470100_-	Hsp20 family protein	A0A1B1IW69	uncultured_Mediterranean_phage	1.1e-22	37.3
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WP_016211595.1|2472133_2472601_+	CBS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211599.1|2472613_2473624_-	DUF481 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_033923779.1|2474292_2475129_-|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3
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WP_129556577.1|2475828_2476857_-	ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	4.8e-16	27.7
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WP_016210956.1|2484610_2485330_-|tRNA	tRNA (guanosine(46)-N7)-methyltransferase TrmB	NA	NA	NA	NA
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WP_016211812.1|2493609_2495223_+	DEAD/DEAH box helicase	A0A2I7RG64	Vibrio_phage	9.2e-62	32.6
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WP_075274931.1|2519519_2520248_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
WP_016211053.1|2520290_2520857_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211047.1|2520944_2522579_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211051.1|2522940_2523444_+	methylated-DNA--[protein]-cysteine S-methyltransferase	A0A167R6J9	Powai_lake_megavirus	1.1e-13	43.5
WP_016211050.1|2523406_2524114_-	dethiobiotin synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016211044.1|2524182_2525043_-	malonyl-ACP O-methyltransferase BioC	NA	NA	NA	NA
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WP_016211049.1|2527080_2528043_-	biotin synthase BioB	NA	NA	NA	NA
WP_016211056.1|2528086_2528839_+	ComF family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210615.1|2531214_2531685_-	DNA starvation/stationary phase protection protein	A0A0A7RTZ1	Clostridium_phage	2.1e-19	35.7
WP_016210624.1|2531730_2531970_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274938.1|2531988_2532495_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210617.1|2532658_2534083_+	bifunctional D-glycero-beta-D-manno-heptose-7-phosphate kinase/D-glycero-beta-D-manno-heptose 1-phosphate adenylyltransferase HldE	M4QSA2	Synechococcus_phage	1.4e-16	42.3
WP_016210618.1|2534147_2535197_-	UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_051307334.1|2535463_2536243_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556587.1|2536286_2537189_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210625.1|2537247_2537994_-	SDR family oxidoreductase	Q06VL0	Trichoplusia_ni_ascovirus	1.3e-18	30.8
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Sequences of DBSCAN-SWA_30

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30

>NZ_CP039214|2627894:2662334|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_30

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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
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MIHSSLIKGIALTLFSALSYASLAAVIKHHPEVPLSLLVFAQSLVCLVLILPIIIQQNKKTAGALKNKKSLFKTNYLHFHIIRAFFSLGISYCLFFALKTIPLVNGVLLANTSALFTPFLALLFFRQKINHKLWPAILIGFVGVAIILNPSHDGFLRGGALFALASALCVSSSMLFIRRTTDQDSGLTSAFYYFLLSSIISGVFLAINQPHLSTSFIRIILVTGLLFFCTQFALTLALQFIDAHIVSTLYYSNIVFAVLISVILLHAPTSLLMLGGIVLVCFSGIGCVYIQNKQKKHNIHHTQHGVTQTYATD
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MPKLKYQRERRGSIIERQLEDDVVTLYQPIEELGVGKYGSVRAFASATNSVKFAVKRPLHPNKDTIHKLKVEKTFFEKAYPDTEVLFEEVDTLDCRLVMPLFPGKDFHNTQDLRIDNKIQLCTYKKLVFSVRFFHNLHEVLS

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_081377880.1|2628415_2628895_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556590.1|2629752_2630148_+	nucleic acid-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126312.1|2630144_2630939_-	M48 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016211756.1|2631117_2631843_-	M15 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016211759.1|2632088_2633276_+	S-methyl-5-thioribose kinase	NA	NA	NA	NA
WP_081377344.1|2633630_2634758_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016210935.1|2635088_2635631_-	acireductone dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210943.1|2635627_2636314_-	acireductone synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210942.1|2636317_2636929_-	methylthioribulose 1-phosphate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016210944.1|2636975_2637995_-	S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016210936.1|2638096_2638891_-	thymidylate synthase	A0A2R4A1R4	Microbacterium_phage	5.3e-103	69.0
WP_016210931.1|2638928_2639735_-	prolipoprotein diacylglyceryl transferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210941.1|2639813_2640863_-	pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_032126310.1|2641060_2642320_+	inorganic phosphate transporter	E5ESL8	Bathycoccus_sp._RCC1105_virus	5.9e-24	34.7
WP_032126309.1|2642366_2643044_+	TIGR00153 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210937.1|2643129_2643411_-	RNA chaperone Hfq	NA	NA	NA	NA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_32

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_32

>NZ_CP039214|2744532:2804309|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_33

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_33

>NZ_CP039214|2918106:2961504|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211187.1|2925337_2926258_-	SPFH/Band 7/PHB domain protein	J3IZE5	Acanthamoeba_polyphaga_lentillevirus	2.2e-20	27.5
WP_016211186.1|2926384_2927167_-	exodeoxyribonuclease III	E3T4M6	Cafeteria_roenbergensis_virus	8.2e-32	33.3
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Sequences of DBSCAN-SWA_34

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_34

>NZ_CP039214|2993189:3109901|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_129556603.1|3012605_3014621_+	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075274968.1|3018736_3019837_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556605.1|3020231_3021341_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209721.1|3022279_3023677_-|tRNA	asparagine--tRNA ligase	A0A167RLM0	Powai_lake_megavirus	1.3e-77	34.4
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WP_016209698.1|3025242_3026442_-	trbL/VirB6 plasmid conjugal transfer family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209707.1|3026438_3026762_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209703.1|3026763_3027993_-	conjugal transfer protein TrbI	NA	NA	NA	NA
WP_016209722.1|3027992_3029036_-	TrbG/VirB9 family P-type conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556606.1|3029035_3029719_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209720.1|3029715_3032205_-	cagE, TrbE, VirB, component of type IV transporter system family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377396.1|3032221_3032476_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209715.1|3032476_3032833_-	trbC/VIRB2 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_080664821.1|3033612_3034776_+	HlyD family efflux transporter periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209727.1|3034795_3037903_+	efflux RND transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209723.1|3037904_3039410_-	YifB family Mg chelatase-like AAA ATPase	NA	NA	NA	NA
WP_016209714.1|3039437_3039719_-	accessory factor UbiK family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209709.1|3039867_3040209_+	P-II family nitrogen regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016209712.1|3040328_3042209_+	biosynthetic arginine decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_059372650.1|3042293_3043892_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307314.1|3043909_3045025_-	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209706.1|3045152_3046151_-	3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016209700.1|3046154_3046913_-	tryptophan synthase subunit alpha	NA	NA	NA	NA
WP_016209702.1|3046914_3048114_-	tryptophan synthase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016209711.1|3048097_3048769_-	phosphoribosylanthranilate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016209710.1|3048790_3049567_-	indole-3-glycerol-phosphate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016209717.1|3049570_3050569_-	anthranilate phosphoribosyltransferase	A0A0N7IRD9	Acinetobacter_phage	5.2e-39	32.7
WP_016209697.1|3050570_3051149_-	aminodeoxychorismate/anthranilate synthase component II	A0A0P0IKJ1	Acinetobacter_phage	2.8e-45	45.0
WP_016209713.1|3051145_3052615_-	anthranilate synthase component I family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209719.1|3052658_3052946_-	trp operon repressor	NA	NA	NA	NA
WP_016209699.1|3053146_3053743_+	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_075274970.1|3053952_3054423_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046757.1|3054479_3054635_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274971.1|3054779_3055232_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212372.1|3055417_3055639_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212371.1|3055754_3056387_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274972.1|3056364_3057426_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211865.1|3057865_3058405_+	peroxiredoxin	NA	NA	NA	NA
WP_032126699.1|3058489_3059026_+	alkyl hydroperoxide reductase	NA	NA	NA	NA
WP_016211866.1|3059677_3059980_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126698.1|3060429_3060738_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274973.1|3061328_3061796_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556608.1|3062078_3062789_+	VUT family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211232.1|3063015_3063414_-	DUF3135 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211231.1|3064281_3065232_+|tRNA	glycine--tRNA ligase subunit alpha	NA	NA	NA	NA
WP_016211227.1|3065231_3067310_+|tRNA	glycine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016211228.1|3067457_3067973_+	acyl-CoA thioesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016211234.1|3067981_3068545_+	D-glycero-beta-D-manno-heptose 1,7-bisphosphate 7-phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016211229.1|3068525_3069272_+	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211230.1|3069411_3069864_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210351.1|3070287_3071124_+	sterol desaturase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210335.1|3071120_3072017_+	EamA family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210345.1|3072049_3073117_+	4-oxalomesaconate tautomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016210352.1|3073135_3073504_-	diacylglycerol kinase	NA	NA	NA	NA
WP_129556609.1|3073529_3074978_-	potassium transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210336.1|3074987_3076367_-	Trk system potassium transporter TrkA	NA	NA	NA	NA
WP_051307328.1|3076407_3077739_-	16S rRNA (cytosine(967)-C(5))-methyltransferase RsmB	NA	NA	NA	NA
WP_032126694.1|3077710_3078670_-|tRNA	methionyl-tRNA formyltransferase	E3SNR5	Prochlorococcus_phage	2.2e-10	35.9
WP_016210340.1|3078762_3079266_-	peptide deformylase	E3SLL2	Synechococcus_phage	1.4e-13	37.1
WP_016210346.1|3079400_3080552_+	DNA-protecting protein DprA	NA	NA	NA	NA
WP_016210342.1|3080548_3081028_+	DUF494 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126693.1|3081174_3083496_+	type I DNA topoisomerase	A0A1V0SCS0	Indivirus	2.3e-98	35.7
WP_080664839.1|3083440_3084067_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210344.1|3084071_3084971_+	oxygen-dependent coproporphyrinogen oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_129556610.1|3085043_3085622_+	DUF4823 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210347.1|3085922_3086180_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556611.1|3086188_3087342_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
WP_155046758.1|3088478_3088610_+	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_155046759.1|3088754_3088910_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212051.1|3089237_3090011_+	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_032126148.1|3090552_3090735_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|3091338_3092313_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016212335.1|3093407_3093746_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212337.1|3093762_3094473_-	proline iminopeptidase-family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_051307375.1|3094460_3094652_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007013.1|3094813_3095113_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046696.1|3095102_3095267_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300550.1|3095323_3095689_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211790.1|3096993_3097689_+	TVP38/TMEM64 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211793.1|3097685_3099113_+	FAD-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211791.1|3099138_3099402_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|3099762_3100737_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_129556612.1|3100795_3101646_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211291.1|3101683_3102028_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211297.1|3102024_3102861_-	protoheme IX farnesyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211294.1|3102861_3103203_-	prokaryotic cytochrome C oxidase subunit IV family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211298.1|3103204_3103810_-	cytochrome c oxidase subunit III family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126720.1|3103806_3105801_-	cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I	NA	NA	NA	NA
WP_016211299.1|3105820_3106762_-	ubiquinol oxidase subunit II	NA	NA	NA	NA
WP_016211292.1|3106989_3108414_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|3108926_3109901_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
NZ_CP039214.1|WP_032126179.1|1102537_1102789_+|TSUP-family-transporter	1102537_1102789_+	83 aa aa	NA	HTH_38	NA	1100068-1143128	yes
NZ_CP039214.1|WP_155049815.1|1139583_1139736_-|hypothetical-protein	1139583_1139736_-	50 aa aa	NA	HTH_21	NA	1100068-1143128	yes
NZ_CP039214.1|WP_016210918.1|1235437_1236187_-|hypothetical-protein	1235437_1236187_-	249 aa aa	NA	WHTH_GntR	NA	1197113-1249794	yes
NZ_CP039214.1|WP_032127044.1|1270636_1270837_+|hypothetical-protein	1270636_1270837_+	66 aa aa	NA	HTH_21	NA	1254330-1431565	yes
NZ_CP039214.1|WP_016212421.1|1282561_1282744_+|hypothetical-protein	1282561_1282744_+	60 aa aa	NA	HTH_21,HTH_38	NA	1254330-1431565	yes
NZ_CP039214.1|WP_054300380.1|1285983_1286640_+|transposase	1285983_1286640_+	218 aa aa	NA	HTH_21	NA	1254330-1431565	yes
NZ_CP039214.1|WP_081377858.1|1303722_1304433_-|transposase	1303722_1304433_-	236 aa aa	NA	HTH_38	NA	1254330-1431565	yes
NZ_CP039214.1|WP_155046725.1|1305290_1305431_-|hypothetical-protein	1305290_1305431_-	46 aa aa	NA	HTH_38	NA	1254330-1431565	yes
NZ_CP039214.1|WP_129556517.1|1505524_1505812_+|hypothetical-protein	1505524_1505812_+	95 aa aa	NA	HTH_38	NA	1498765-1558311	yes
NZ_CP039214.1|WP_016212013.1|1501217_1501601_+|hypothetical-protein	1501217_1501601_+	127 aa aa	NA	HTH_38	NA	1498765-1558311	yes
NZ_CP039214.1|WP_016211563.1|1520386_1520548_+|hypothetical-protein	1520386_1520548_+	53 aa aa	NA	HTH_Tnp_1,HTH_38	NA	1498765-1558311	yes
NZ_CP039214.1|WP_098082828.1|1942865_1943123_-|transposase	1942865_1943123_-	85 aa aa	NA	HTH_21	NA	1936820-1951630	yes
NZ_CP039214.1|WP_016211536.1|2210829_2211063_-|hypothetical-protein	2210829_2211063_-	77 aa aa	NA	HTH_Tnp_IS1,HTH_38	NA	No	NA
NZ_CP039214.1|WP_016212450.1|2250016_2250919_-|hypothetical-protein	2250016_2250919_-	300 aa aa	NA	HTH_38	NA	2212919-2258420	yes
NZ_CP039214.1|WP_129556569.1|2257645_2257855_+|hypothetical-protein	2257645_2257855_+	69 aa aa	NA	HTH_ARSR	NA	2212919-2258420	yes
NZ_CP039214.1|WP_016211963.1|2675175_2675835_+|hypothetical-protein	2675175_2675835_+	219 aa aa	NA	HTH_38	NA	2670420-2721566	yes
NZ_CP039214.1|WP_016211964.1|2676699_2677020_+|hypothetical-protein	2676699_2677020_+	106 aa aa	NA	HTH_38	NA	2670420-2721566	yes
NZ_CP039214.1|WP_016210177.1|2698730_2699096_-|hypothetical-protein	2698730_2699096_-	121 aa aa	NA	HTH_38	NA	2670420-2721566	yes
NZ_CP039214.1|WP_016210175.1|2699481_2699811_-|hypothetical-protein	2699481_2699811_-	109 aa aa	NA	HTH_38	NA	2670420-2721566	yes
NZ_CP039214.1|WP_016210580.1|2782010_2782271_+|methyltransferase	2782010_2782271_+	86 aa aa	NA	HTH_38	NA	2744532-2804309	yes
NZ_CP039214.1|WP_129556602.1|2995657_2995867_-|hypothetical-protein	2995657_2995867_-	69 aa aa	NA	HTH_1,HTH_38	NA	2993189-3109901	yes
NZ_CP039214.1|WP_016211201.1|2999000_2999309_-|hypothetical-protein	2999000_2999309_-	102 aa aa	NA	HTH_1,HTH_38	NA	2993189-3109901	yes
NZ_CP039214.1|WP_155046758.1|3088478_3088610_+|phosphatase	3088478_3088610_+	43 aa aa	NA	HTH_21,HTH_38	NA	2993189-3109901	yes
NZ_CP039214.1|WP_155046759.1|3088754_3088910_+|hypothetical-protein	3088754_3088910_+	51 aa aa	NA	HTH_21,HTH_38	NA	2993189-3109901	yes
NZ_CP039214.1|WP_032126148.1|3090552_3090735_-|hypothetical-protein	3090552_3090735_-	60 aa aa	NA	HTH_21,HTH_38	NA	2993189-3109901	yes

Protein sequences of NZ_CP039214.1|WP_032126179.1|1102537_1102789_+|TSUP-family-transporter

>NZ_CP039214.1|WP_032126179.1|1102537_1102789_+|TSUP-family-transporter
MSTALAFPMGLFALTSLLVASAGMAGLPSGSVGYLYLPALIGLLIGSFLGSPLGVWMVKRVSEQTSVWLFRIVLLAVIMQMIH

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1111160-1111123	0
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1111026-1110989	1
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1100981-1101018	1

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 1111160-1111123, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 1111026-1110989, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 1100981-1101018, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttagtccagcgct	Protospacer
****************************.*********

Protein sequences of NZ_CP039214.1|WP_155049815.1|1139583_1139736_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039214.1|WP_155049815.1|1139583_1139736_-|hypothetical-protein
MLSTPWLAAHENILLMLIKIKSINLCYKLNIINNKKRQYHTTFILLLFVK

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1111160-1111123	0
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1111026-1110989	1
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1100981-1101018	1

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 1111160-1111123, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 1111026-1110989, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 1100981-1101018, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttagtccagcgct	Protospacer
****************************.*********

Protein sequences of NZ_CP039214.1|WP_016210918.1|1235437_1236187_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039214.1|WP_016210918.1|1235437_1236187_-|hypothetical-protein
MLSDKARIAALEEKLANIEHEIKAHNSHIKRNIVNHTETTKINNSVLAENIDNETLKKTIGSSSSTANINSNTSHVSYVTNTGYTQTAAQANYEIMGATVSGNTYGAIATTKIAATAKASLETGGLSNITDIAATKLTLEMIPNKTNMKLSTIEETVSTAVATEINNVRSEVALATTAAIASSTKTIASDVKIAMSRIDTVESQVDLVASKVTNVAQQTHRGLYATACALTEQKTHSMIITNAAMQVLS

WHTH_GntR HTH domain information

• Identity: 0.47692307692307695
• Hit_domain_coverage: 0.9848484848484849

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1224734-1224697	0
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1248882-1248845	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 1224734-1224697, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 1248882-1248845, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039214.1|WP_032127044.1|1270636_1270837_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039214.1|WP_032127044.1|1270636_1270837_+|hypothetical-protein
MARSVSNLLESWKTGKKKAAPNFDKLNLSEEGLTWAKAELEKLLSQQSKANTDLKQKLITHLTHRS

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1283210-1283173	0
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1286716-1286679	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 1283210-1283173, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 1286716-1286679, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039214.1|WP_016212421.1|1282561_1282744_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039214.1|WP_016212421.1|1282561_1282744_+|hypothetical-protein
MLLKDLRFSVLRLLSDLYNHEKSKDGSTNDLNFLTKCKREAEEANSKQEIADLLNTHLTH

HTH_21,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1283210-1283173	0
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1286716-1286679	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 1283210-1283173, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 1286716-1286679, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039214.1|WP_054300380.1|1285983_1286640_+|transposase

>NZ_CP039214.1|WP_054300380.1|1285983_1286640_+|transposase
MARSERKSNISKNEYFRNLINHAINNQVKFDYTVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1283210-1283173	0
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1286716-1286679	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 1283210-1283173, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 1286716-1286679, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039214.1|WP_081377858.1|1303722_1304433_-|transposase

>NZ_CP039214.1|WP_081377858.1|1303722_1304433_-|transposase
MLKTRTYLGLLTPCLALHGSQRKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKFLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1283210-1283173	0
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1286716-1286679	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 1283210-1283173, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 1286716-1286679, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039214.1|WP_155046725.1|1305290_1305431_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039214.1|WP_155046725.1|1305290_1305431_-|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGEFALFHMLSCLKMLTEDSSYELSHFKGGLP

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1283210-1283173	0
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1286716-1286679	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 1283210-1283173, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 1286716-1286679, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039214.1|WP_129556517.1|1505524_1505812_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039214.1|WP_129556517.1|1505524_1505812_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAASDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVLSTPHK

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1555921-1555958	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 1555921-1555958, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039214.1|WP_016212013.1|1501217_1501601_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039214.1|WP_016212013.1|1501217_1501601_+|hypothetical-protein
MTINKRDFFDAINYADTAVQIHEYLLNILEKQQKDFAENCNNDNDSEKSKALASISDVELRFAQLDMLSAIYRKILLNTLNEIEGCNDQELKTIKNGLLHMVATTLEACVNDFTIEAKITIDIKEEQ

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1555921-1555958	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 1555921-1555958, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039214.1|WP_016211563.1|1520386_1520548_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039214.1|WP_016211563.1|1520386_1520548_+|hypothetical-protein
MLPSFQTEQFNDLFLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSTVRVTQRYVP

HTH_Tnp_1,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1555921-1555958	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 1555921-1555958, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039214.1|WP_098082828.1|1942865_1943123_-|transposase

>NZ_CP039214.1|WP_098082828.1|1942865_1943123_-|transposase
MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1947126-1947089	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 1947126-1947089, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039214.1|WP_016211536.1|2210829_2211063_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039214.1|WP_016211536.1|2210829_2211063_-|hypothetical-protein
MGEIFVPKFNLLSVTGDQETVDNLLLSVKKRLYDKGTPLKNCYFNLQGQLLAEGWVYDSKTLIEVDLGGELKPEWYN

HTH_Tnp_IS1,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.5555555555555556
• Hit_domain_coverage: 0.9782608695652174

Protein sequences of NZ_CP039214.1|WP_016212450.1|2250016_2250919_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039214.1|WP_016212450.1|2250016_2250919_-|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGELIKDGQITFEQALEFTYDQQSVCESDAIRALIQQGILSFDLSLKLTGCQQRNLEAPVIAELLRSKDQRCRLTLEQALALDSVQRDNIKSKTVRALLQEGILPSIEKALSLTEEQRRSLVRPTVGKLLRSKDHFLHLTLEQALNIKSEQELTLASKDIRQLIQDRQITLEQALAFTSEQQRSCESGVIRALVQEGILSFDLSLKLTGCQQRNLEEPRVAELLRSKDEHCRLTLDQALRLMSWHKEFLQSKLTFKLIKDKKLTMEQALTLSYSAGLTVSDILSVG

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2218008-2218045	0
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2249887-2249924	0
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2250021-2250058	1

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 2218008-2218045, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 2249887-2249924, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 2250021-2250058, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

Protein sequences of NZ_CP039214.1|WP_129556569.1|2257645_2257855_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039214.1|WP_129556569.1|2257645_2257855_+|hypothetical-protein
MTNFVHASEFTFQQDDGLINDDWVRLVQPSLPLGTQINSLALTQAGDTLYINTQSVGSFLCQGDIALNE

HTH_ARSR HTH domain information

• Identity: 0.46774193548387094
• Hit_domain_coverage: 0.7948717948717948

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2218008-2218045	0
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2249887-2249924	0
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2250021-2250058	1

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 2218008-2218045, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 2249887-2249924, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 2250021-2250058, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

Protein sequences of NZ_CP039214.1|WP_016211963.1|2675175_2675835_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039214.1|WP_016211963.1|2675175_2675835_+|hypothetical-protein
MLLSLITAITLIISLLFFAYAIKCLLHKRLTATFLYIFLGSTTTLITTCSALLLLNNLTLDHVTKNIPIAMLSLNQLPPLASKHYQATLSLPSGQIKTFKLIGDDWQLSAQIIVWQDWLHALGLTNRYRFDRIQSRYDNINAEQHAIHSIYPLNPPNTANSFWQWAKHHLIQRYFIKTIYGNAIFMPMRDGASFTIALTNNGLIATPINLAAKQSIGLA

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2708106-2708069	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 2708106-2708069, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039214.1|WP_016211964.1|2676699_2677020_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039214.1|WP_016211964.1|2676699_2677020_+|hypothetical-protein
MHALSIFFMFFMISHTSHSLTMLYNERPPYLKTESKQQVLGLTGTFITQVFKTAKTPLHWKKTPAKRHLLLIKKNAEPLCAAGWFKNPQREKYAQYALRHLKCNTQ

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2708106-2708069	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 2708106-2708069, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039214.1|WP_016210177.1|2698730_2699096_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039214.1|WP_016210177.1|2698730_2699096_-|hypothetical-protein
MDMSNSKTKKLKTGVIIAGAAAALMLAGCVGPGTKPASQSGPVKCSGINSCKGTSECATAKSACKGQNKCKGTGWVFAKSADLCKKKGGVVLSAGASNSSLAAVDASENLASLDDNKAYRR

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2708106-2708069	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 2708106-2708069, mismatch: 0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP039214.1|WP_016210175.1|2699481_2699811_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039214.1|WP_016210175.1|2699481_2699811_-|hypothetical-protein
MFTDVFEKTLAESKEAQNWLAEATKEVFSLQQAMMADWAEWTRVSSVRSSSVKTVEEWVDLNLSSISELTQRSSKAMLDSVTMVSTFAAKNPFYQVKGREEKISKKKTS

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2708106-2708069	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 2708106-2708069, mismatch: 0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP039214.1|WP_016210580.1|2782010_2782271_+|methyltransferase

>NZ_CP039214.1|WP_016210580.1|2782010_2782271_+|methyltransferase
MKMRNYHSHILKIHEKEQGWRKLKTPNMPLDIEIGCGVGMHPLLYASAYPERFLIAIEKTREKFGKFAKKNNTIGPYQNLLAPSVI

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.5813953488372093
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2802544-2802581	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 2802544-2802581, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039214.1|WP_129556602.1|2995657_2995867_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039214.1|WP_129556602.1|2995657_2995867_-|hypothetical-protein
MAFAAKQRMILNSEKICDLIITEKMTVDQTLQLKLEQRITLESQAIYELVSRGKITVDQTLQPLRAMEC

HTH_1,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	3009916-3009953	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 3009916-3009953, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039214.1|WP_016211201.1|2999000_2999309_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039214.1|WP_016211201.1|2999000_2999309_-|hypothetical-protein
MQAIGAFQAGLAAINAGAGELREHANEIAHFSIPRGTVAEQEHRPAVVAVNELTQTERPAHFGQNMVRPMVGLLEASNQAQVGAKVLQIASDTLGSLIDIRA

HTH_1,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.5178571428571429
• Hit_domain_coverage: 0.9333333333333333

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	3009916-3009953	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 3009916-3009953, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039214.1|WP_155046758.1|3088478_3088610_+|phosphatase

>NZ_CP039214.1|WP_155046758.1|3088478_3088610_+|phosphatase
MFYCMRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

HTH_21,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	3009916-3009953	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 3009916-3009953, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039214.1|WP_155046759.1|3088754_3088910_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039214.1|WP_155046759.1|3088754_3088910_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAAPEKYSPPSKTCLINSTIKLFQRVKPHWDYNQKNVYTCKAATT

HTH_21,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	3009916-3009953	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 3009916-3009953, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039214.1|WP_032126148.1|3090552_3090735_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039214.1|WP_032126148.1|3090552_3090735_-|hypothetical-protein
MTCDNITPLGYVFMPHHIALWRARGVEANYQGQLKMLRNIHAADSQHRNKQQCNQRKSNI

HTH_21,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	3009916-3009953	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039214 position: 3009916-3009953, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. NZ_CP039217

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	10622 : 20331	13	unidentified_phage(28.57%)	integrase,transposase	attL 5164:5223|attR 19653:19844

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP039217|10622:20331|DBSCAN-SWA
AATGGTCGCATATTTAAAAAACAAAGGTAAGCCTTGGAACCATAAGCGCATTCGTCGAGTCTATATTGAAATGGGCTTAAACATAAGCTGTAAACCAAAGCATCACTACGTCAAAAACGAGCCTGAATATTTATTTCAGCCTATCTACAAAAATGTTTGTTGGTCATTAGATTTTATGAGTGACGCCCTTCTGAGCGGTACGAAATTTAGAACGATGAACCTCATTGATGATTACAACCGTAAGGCTTTAGGCATCGCTATCGATTTTTCAATGCCTGCTGTTTTTGTCACATCCAAACTTGATGAGTGGTGCAAAGTGCATGGCTACCCTGAAATGCTGCGGACTGACAATGGGCCTGAATTCATTTCTTCCATTTCCAAGAATGGGCTGAAGGGCATGGAATTCAACTGCGTCGGATACAACCAGGAAAACCTGCTCAAAATGGTTATATTGAACGATTTAACCGCACTTATCGTGGTGATATTTTAGATTGCAATCAATTTACTTCATTGCAGCAAGTTCAGAAACTTAGCGATGACTGGATCGTTGAATATAATACGATCAGACCACATCAATCTTTAAAGAATCTTTCACCAGACACATTTGCTGAGAAACGTGAAAAACAGTTAGAAAAAATTTCGACAAAAACAGAGGGATAATTCCAGTTTTAAACTGTCTCACTTATGGGGGGTTGACATAACCATTGTTTAAATGTTATTTTTTTATTATCTTCATTTTCTTTAAAGGTTTGCCAGGATTCATAATTATAAATTATTTCTTGAATTTTTTTTACATTGTCACTCTCCATTAATAATTTACATGGATTTCTTTTTCCTTCAAATAAATCACTGCTATATTTTCTAATTTCAAAGGTAACACTACTGACAGGAGCTTGCGCTGTTGCTTCCATATTATCGGATTCAGGTTGCTTTAAAGGTGGAATAGCAGCCTCAATTTTAGAAGGCTTACTAGAAAGAAACATATATGGATCTTGACTATAAGACTGAGAACGTCTGTGAGAACGGCCGCGAGATTTAGGAGTAACTTTATCTGAGTTAAAAAAATAATTTTCGATATTGCTCTGTGGTTTAACTAAAGACTTTTCTTGAGGTAAAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATCTAATTTGAGATGAAGAACGAGATAGCCACCCAGATCCTTTTGAATTCCTTACTGATGAACTTCTTTTATTTAAAATTGCTGATCTTTTTTTTTCAATTGTAAGTGGGTTTTTTTGTATACTTACAGAGGGTTTTTCAAAGGCATTATAAGCTGTCTCACAAAAATCTTTTACGCTATTATATTTTTTATATACAGACTGAAAAGATAAACTATGATGTTCAAAAAAGTGAACATCACTTTTTTCGAAAAATGGTTGACTTGAAGAGGCAATTATTTTTCTATTTTCAAAGAAACAATTTATTTCTTCCTCGAGACTATCTTTTAATGCATTAAGCTTTAAATTATTACTGGCCGCATCTTTAGTAGCATTGCGTAGTTGTGTTTCATTATATTTAAGCGAAAATTGATCCAAAATATTTGGCATTGATAAAAAACCTATCTCTTAATACTTATTGTTCTTTATATTATTTTTATACTTCCCTAATCAATATATAAATCATTGATTTACATTAATTTTATTTAAAATTAACTAAACGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGGGATCTGTTTAAGGTTGTCGACCGCCTTAAATTAAACCACGGCTTTAGATAGATATGTTTTTGCCGCTTTACATGATTTTGCTAGATGTCATGCGGGATCGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAACTCTCTAGTTCGCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGGTTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGTGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGTCAAGCTTTTCGACAAATTTCAGAGGAGGCAAAAATGTTGATCCATCAACGGTTAAGCACCCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAGGAACTTATACGAGAGCATGATATCCAGGTGAGTGAAAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCAGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCGGGAAAACCTTATAAGAAAAAGGTGAATCGTGGTGATCAAATAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACACCGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGCGATCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTAAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACCTCTGACAATGGAACAGAGTTTGCGGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAGCACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACAGATTTTAATGAAATTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATTGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGGATTCCAGGGCGTTTTTCCTAGAAGGAATAAAAGATTTAAGCACTCGCTAAGTCAATAGAATCTTCATCATCAAACCTTAAGATAATTTCAACTCTAGCGCCCATTGCTTCTGCTGCACGCTCAAAGCGTTTTAAAGTCAAATTTTCACCTTTTTCAATTTGCTGATAATTTTGATATGGTACATTTAGCCTTCTAGCAACTTGAGCCAATGAGTATTCTCTTAATTCCCTTAATTTATGAAGAAGAATGGGCGCTGCTACTTGAGGACTCACAGGAATTAGTATCTCACTTTTACGTATATCAGAAGGTTCAGTAATTGTGTGTTTATCAGCTATCATTTCAGTCAGCAATAAATTCAAAACATCGCGTGCATTATACATCGCCTCTTCGATTGTCTCTCCATCAGTGAAGATATTTGGAAGATCACGGAAGCTGACAACATAACCACCCACTTCGTTATCTTCTTCAAATTTAGCTGGATACGATAACTTCAATTCCATGCTTTTATCCTCACTCAAACGTTACACCTGTTGCTTTTTCAATCTTCTTTAAAATGCCTCTTCCCAAATCTCTATTCGCATGTACTGGTACTGAGATTGGAGGAAGCCCTTGTTTCTTCATGATATGGTGTGAGCCACTAGTTCGTGTATGCTTCCAACCATATTTCTCAAGCTGTCTTATTACGCTCTTTCCACTAATAGGCATAAGCTCAGTCACAATATTTATATTGTAGTCCAATTTATCAGACAACAATAAAAACCACAAGTTTTATTTTGTGTTAGCTTAGAGTAAATTAGCTTGTTATATATGATAGAAACTATAACAACTTTAATAGTATCAAGGCTTTCAGCCTGTACACCTCTACTCACTCGTTATATTATCATTATATAGATCAATAATATAACGAGTTTAAGGTCAAAATGGGCTTAAGCAAGCAGGCACGAATTTTATCTGAAAGACAGGAGCGGATCATCATAACGCACCTCAAAAGCACTATCGCGCCGCAACGAAACCTCGTTTTATTTTTGCTGTCAATAAAAGCCGGACTCCGTGCGAAAGAAATTGCACACATCCAGTGGAAAATGGTTTTTAACTCAGACGGTCAAATCGGAGATTGCATCCACTTGACCAACGATGTGAGTAAAGGTGATCAAGGTGGCCGCATCATCCCTCTTAATCAGCAACTCAAAAAAGCATTGATAACATTATTTCAGTCTAATCCACCGCATCATGAAAATGTCCCTATCATCATTTCACAGCGCAAAGCTGCATTTACTCCACAAACGATCGTTAATTGGTTTAGTCGTTTATATGCTGATTTGGAGTTTAATGGACATTCTAGTCATTCAGGCCGTCGCACCTTTGTCACTCGTGCCGCAAAAAATGTAATCCGTGCTGGTGGGAGTCTACGTGATGTGCAACAATTAGTGGGTCACTCCTCGCTACAAACAACACAGCATTATATTGAAGGTGACAGCGAGGCTAAAAAAAAGCTAGTCGAGCTAATTTAAAGGGGTCTATACACCCCTTTTGACATAAATGGATCATCTAAAACAATCAACAGGGTAGTGATTATGATTTTTAGACAGCTATTTGATAACCAAACATCCACCTATACCTATTTGATTGCCTCAGATTACGGAAAAGAAAGCATTATTATTGACCCAGTTGATAGTAAGATAGATAGTTATATTCAGCTTTTAAGTGAATTATCTTTGAAGCTTGTCTATTCAATTGATACGCATGTTCATGCAGACCATGTGACCGGTTCTGGCTTGCTCATGCAACAGACCAATTGCAAGATTATTATGGGAAAACAAAGTAAAGCTGAAAATATATCATTAAAAGCCAATGAAAATGAGCCAATAAAAATAGATAATCTTACAATTCAACCGGCACTCGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTGCGTGCCTTGAATCGGCACACTCCACCACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGTCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTATGGTGTAGCAATCAACTGAAATTAAGAGTGAATTACTGTGGCTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCACTACCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGACCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTGGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCGATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTGTTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAACTTCATTAAAATCCGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCGGCAAACTCTGTTCCGTTGTCAGAAGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTCTTTAACCGCTGATGAATTAACATTTTTGCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCCTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCATCTCTACCCTCATAAGTCAAAAAGGCAAACTAGAGAGTTTATCTGTATGGATATGAACTCTCTACTCGGTGTTGTACTTCAGATGACGGAGGGCGATTTTAGTTTTCAAAATTTTAGTAAATTAAGATTTTTAGGAAGATAGATTAAGATGAATTTGATATTTATACCAATTTTATTGATGATTTTAATTATGTCACCAGCAATTTCATCAAAAACTGAAAACAAGTTATTTTCTTGGAAACCAGAGCAACTTATGAATATTAAACAAATTTCCGAGCTGGACTTGTCTTCAAGTGCGCCTACTCTTGCTTATGTTGTAGATTTTTACAAAAAGGACAATAAAAATATTTGGACTGAGAAGAGTTCAATCAAAATATTGTCATTAACAACAAAAGAAACCCATAAGGTTGATTATAAAGATGAAGATAGTTGGATGCCAAAATGGTCACCAAATGGTCATTATTTGGCTTTCTTATCTAAGAAGGTCAGTGAAAAATCAAATGATAATGCATTATCATTAATAAAGATATGGTCTAAAAAAACAAATAAAATCTATTTATTAACAGAAACAAAAAATAACATAAAAACACTTTCTTGGTCAAGAAATGGAAATTTTATTGCTTATGTTACTGAAAATAAAAAAGATTTTTATATAGATAAAAATAAATTAAAGATATTTTCATCTTCAGTGCGTAACGATGAAATGCACATTATAGAGATAGATTATAAAAATATCAAAAAAAATAAAGACAAAATAATAATAAGTAAATATATTCAAGGAAACAAATTTTCATATATTGGTAATTTAAGTTGGTCAAAAGATGATAAAGATATTGCATTTAGCCATGATATAGGTGATAGAAATGACCTATGGAATCTCGGTATTATATCAACAATAAACCTAATGACCAATAAAATAAATACAATAAATATCTTTAAACAACGAATGATAATGCAGCAACCTCATTATTCACCTGATGGTCAATATTTACTATTTACTGCAAGCCCTGAACAAGTATGGTCACCTCGATTTTGTATTTATATGCAAAAAATAATAACAAAGAGTGTCACTAAATTAGCCTGTAGCTTCGATCAAGATCCAAAACTTGTTGGTTGGAGTAAAAGTGGTAAAAATATTATTTTTACAGAAAATTTTCATACTTGGCGCAATATTTATAGTCTTTCTACTGACAGAGAAGATATTACTACTAAGGTAGTGAAAATAAATAAGTCAAATTCCCTGATTGATACTGTAAGTATCAATTCTAAAGGCGAAATAGCAATAGTACAGCAAAACAGCAAAAAAGCTGAAGAAATTTACCTAACAAACTTAATCCGCTATCAGCCACAAATCATTACTAATATTAATACGCGCTATACTAAATTTTCAGAGACTTTAGGAAAAACTGAGAAAATCAATTGGAAAAGCAAAGATGGACTAACAATATCAGGCCTACTTACTTATCCTGAAAATTACAATAAATCAAAAAAATATCCGCTGATTATTGAGCTACACGGCGGCCCTGCAGATGTTTTTCAAAACAGATTTATAGGAAGACGCTCTGTTTTTCCTATAGCAACTTTTTCAAAAGAAGGCTATTTTTATTTGAGACCTAATGTAAGAGGCTCATCTGCTTATGGTGTTTACTTTAAAGAATTAAATCATGGTGACTGGGGAGGTAAAGATTACCAAGATATAATGGATGGAATACAATATCTAAATGATAAAAATATCATTGATAGTAAAAAAATCTCTATCATTGGTTGGAGTTATGGAGGCTATTTAACTGCACAAGCGATTACACACAGTCCGCTATTTAAGGCTGCAATTATTGGTGGAGGAATTACAGATTTGGCAAGCTACAGCGTGACGAATGATTTACCAAACTACCTAAAACTTAATTTAGGTGGATACCTTTGGGATAAACCAAAGTTTTATCAAAAACGTTCGCCAATTTATGCTGCTAATCATGTAACAACTCCCACTTTACTAATGTATGGAGAAAACGATATACGAGTTCCTTTATCTCAAGGAGTTGAATTTTTCAATATTTTGAAATTAAGAAACATCCCAAGTATGATGTTGATTTATCCAAAACAGTATCACTCATTATCAGATCCAAACTATATTATCGATGCAGGAATAAGAAATGTATCATGGATTAATAAATATAGCCGAGCAGGCACTGTTGCAAAAAATTTAGATTTGAGTGGGGTGTAGCAATCAACGGAAGTTAAGAGTGAATTGCTGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGCCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP039217|10622:20331|16351_17353_-|WP_054300579.1|transposase|DBSCAN-SWA
MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRAKAKQGQAFQQISEEAKMLIHQRLKTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYVSVATSVGILHIQ
>NZ_CP039217|10622:20331|12790_13462_+|WP_129556741.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVG
>NZ_CP039217|10622:20331|13483_13765_+|WP_052133268.1|transposase|DBSCAN-SWA
MTSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP039217|10622:20331|10622_11111_+|WP_155066192.1|integrase,transposase|DBSCAN-SWA
MVAYLKNKGKPWNHKRIRRVYIEMGLNISCKPKHHYVKNEPEYLFQPIYKNVCWSLDFMSDALLSGTKFRTMNLIDDYNRKALGIAIDFSMPAVFVTSKLDEWCKVHGYPEMLRTDNGPEFISSISKNGLKGMEFNCVGYNQENLLKMVILNDLTALIVVIF
>NZ_CP039217|10622:20331|17500_19573_+|WP_016211990.1|DBSCAN-SWA
MNLIFIPILLMILIMSPAISSKTENKLFSWKPEQLMNIKQISELDLSSSAPTLAYVVDFYKKDNKNIWTEKSSIKILSLTTKETHKVDYKDEDSWMPKWSPNGHYLAFLSKKVSEKSNDNALSLIKIWSKKTNKIYLLTETKNNIKTLSWSRNGNFIAYVTENKKDFYIDKNKLKIFSSSVRNDEMHIIEIDYKNIKKNKDKIIISKYIQGNKFSYIGNLSWSKDDKDIAFSHDIGDRNDLWNLGIISTINLMTNKINTINIFKQRMIMQQPHYSPDGQYLLFTASPEQVWSPRFCIYMQKIITKSVTKLACSFDQDPKLVGWSKSGKNIIFTENFHTWRNIYSLSTDREDITTKVVKINKSNSLIDTVSINSKGEIAIVQQNSKKAEEIYLTNLIRYQPQIITNINTRYTKFSETLGKTEKINWKSKDGLTISGLLTYPENYNKSKKYPLIIELHGGPADVFQNRFIGRRSVFPIATFSKEGYFYLRPNVRGSSAYGVYFKELNHGDWGGKDYQDIMDGIQYLNDKNIIDSKKISIIGWSYGGYLTAQAITHSPLFKAAIIGGGITDLASYSVTNDLPNYLKLNLGGYLWDKPKFYQKRSPIYAANHVTTPTLLMYGENDIRVPLSQGVEFFNILKLRNIPSMMLIYPKQYHSLSDPNYIIDAGIRNVSWINKYSRAGTVAKNLDLSGV
>NZ_CP039217|10622:20331|15376_15745_+|WP_129556740.1|DBSCAN-SWA
MIFRQLFDNQTSTYTYLIASDYGKESIIIDPVDSKIDSYIQLLSELSLKLVYSIDTHVHADHVTGSGLLMQQTNCKIIMGKQSKAENISLKANENEPIKIDNLTIQPALVSVATSVGILHIQ
>NZ_CP039217|10622:20331|10981_11281_+|WP_155066193.1|transposase|DBSCAN-SWA
MHFFHFQEWAEGHGIQLRRIQPGKPAQNGYIERFNRTYRGDILDCNQFTSLQQVQKLSDDWIVEYNTIRPHQSLKNLSPDTFAEKREKQLEKISTKTEG
>NZ_CP039217|10622:20331|11289_12201_-|WP_155066191.1|DBSCAN-SWA
MPNILDQFSLKYNETQLRNATKDAASNNLKLNALKDSLEEEINCFFENRKIIASSSQPFFEKSDVHFFEHHSLSFQSVYKKYNSVKDFCETAYNAFEKPSVSIQKNPLTIEKKRSAILNKRSSSVRNSKGSGWLSRSSSQIRSPSPSPSPSPSPSLPQEKSLVKPQSNIENYFFNSDKVTPKSRGRSHRRSQSYSQDPYMFLSSKPSKIEAAIPPLKQPESDNMEATAQAPVSSVTFEIRKYSSDLFEGKRNPCKLLMESDNVKKIQEIIYNYESWQTFKENEDNKKITFKQWLCQPPISETV
>NZ_CP039217|10622:20331|15956_16133_-|WP_155046774.1|DBSCAN-SWA
MLSTPWLAAVVLPFKGLILLKSFTSSHSNSLLISVDCYTILKSKFFATAASHGVLSTG
>NZ_CP039217|10622:20331|14722_15313_+|WP_032126152.1|integrase|DBSCAN-SWA
MGLSKQARILSERQERIIITHLKSTIAPQRNLVLFLLSIKAGLRAKEIAHIQWKMVFNSDGQIGDCIHLTNDVSKGDQGGRIIPLNQQLKKALITLFQSNPPHHENVPIIISQRKAAFTPQTIVNWFSRLYADLEFNGHSSHSGRRTFVTRAAKNVIRAGGSLRDVQQLVGHSSLQTTQHYIEGDSEAKKKLVELI
>NZ_CP039217|10622:20331|19602_20331_+|WP_129556739.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKPIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP039217|10622:20331|13837_14302_-|WP_016212274.1|DBSCAN-SWA
MELKLSYPAKFEEDNEVGGYVVSFRDLPNIFTDGETIEEAMYNARDVLNLLLTEMIADKHTITEPSDIRKSEILIPVSPQVAAPILLHKLRELREYSLAQVARRLNVPYQNYQQIEKGENLTLKRFERAAEAMGARVEIILRFDDEDSIDLASA
>NZ_CP039217|10622:20331|14312_14507_-|WP_032126154.1|DBSCAN-SWA
MPISGKSVIRQLEKYGWKHTRTSGSHHIMKKQGLPPISVPVHANRDLGRGILKKIEKATGVTFE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
5164:5223	attL	NA	NA	NA	NA
WP_155066192.1|10622_11111_+|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	S5WIU1	Leptospira_phage	5.5e-18	42.3
WP_155066193.1|10981_11281_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155066191.1|11289_12201_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556741.1|12790_13462_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.4e-10	30.4
WP_052133268.1|13483_13765_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	8.3e-11	38.7
WP_016212274.1|13837_14302_-	type II toxin-antitoxin system HicB family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_032126154.1|14312_14507_-	addiction module toxin, HicA family	A0A1X9I5T5	Streptococcus_phage	2.8e-10	48.4
WP_032126152.1|14722_15313_+|integrase	site-specific integrase	K4K6A1	Caulobacter_phage	1.4e-20	33.8
WP_129556740.1|15376_15745_+	MBL fold metallo-hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_155046774.1|15956_16133_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300579.1|16351_17353_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.3e-26	31.0
WP_016211990.1|17500_19573_+	S9 family peptidase	NA	NA	NA	NA
WP_129556739.1|19602_20331_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	42.6
19653:19844	attR	NA	NA	NA	NA

4. NZ_CP039216

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	3311 : 43500	51	Streptococcus_phage(17.65%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	51843 : 72524	29	Pseudomonas_phage(11.76%)	terminase,tail,protease,capsid,portal,head	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP039216|3311:43500|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_080664877.1|6480_6822_-|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	4.4e-06	31.4
WP_054300202.1|8234_8963_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
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WP_054300173.1|11166_12228_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_032126388.1|12851_13877_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211377.1|14637_15660_+	AAA family ATPase	A0A1V0DZZ0	Clostridioides_phage	3.2e-12	27.5
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WP_016211376.1|17797_18235_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211382.1|18234_18888_-	DUF4376 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211381.1|18899_19391_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|19461_20037_-|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	2.7e-08	26.6
WP_032126362.1|19982_20348_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212400.1|20398_20998_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046771.1|20997_21231_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_105962623.1|21387_22540_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
WP_016212392.1|22568_23576_-	hypothetical protein	W6E8G0	Rhizobium_phage	1.2e-06	26.4
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Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

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>NZ_CP039216|51843:72524|64262_66341_+|WP_032126912.1|DBSCAN-SWA
MATIGSLVVNLSANSAQLVKSLTKAELASKNFSKKVQRNLKNTTLAFAAVSTAATGAVAVMISKSSDSIDLLAKTSDKLGVTTEALASLRHAAELTGVSQNKLDMGLQRMTRRLSEAAAGTGEARKALVELGLDAEHLNQLSPDAAFKEVARAMENVEGQSDKVRLAFKLFDSEGVSLVNTLALGAEGLDQAASEAARLGIAINRIDAAKVEAANDAAYKMRQLFVGVSHQLAITFAPIIEDLTTRFTNAGTAASSFSSNVLSGFRVVAKSFAIVGDGVHYINVGLDIISAGFAVMKNMAIQSLTAIAQGLSWLYQKMGEGINFVLSQYQKIAKAGAILPIVGNKFERLGQSIARMKSSVYERFTLDTSGLNIAEESANNVNQKLAQLYQTLFSKRPTESVDAYFDEIEQKAAALDEKIRAAQPEKSALMGASLRAQDNQKQLDSLKERLLSEEEAIKHSYDKQKRIILDATREGSEERIKLLEKIEVQKNTKLKDLAQKQAKELNGVGHQAKEFAGNMEGSFSNAFAGVVKGTATVSDAFSSMLNDMAAEALSMASRGIFKSILGGVIGSVGGSSFASWFSGGATAAGAKASGGSVAAGQLYRVNEHGAELFSSGGKDYLMTGKKAGFVTPNHQLGQTVISNQVQNNITIAPTINASGADGEQVSQEVVTTIKHIVNDQIFKLKKQKLLNA
>NZ_CP039216|51843:72524|62446_62842_+|WP_016211139.1|DBSCAN-SWA
MPKMSFSVEGLRELEQKLKTLEPKKIRNLNRRALRKAAEPVEAQMKANAPQKSGALAESIKRRSKKGKGRRTIVNVTVGPARKIQYAIEQEYGSSHQPARPFIRPALNDNAQTSIDIFKNALTLALKKQKL
>NZ_CP039216|51843:72524|61822_62134_+|WP_016211137.1|head,tail|DBSCAN-SWA
MIDLARLKSHLRIEDNNEDDYLAFILAAALQAAEDYLDRAIVNNTNDLETIENSVLINKSIEIAILMSAGHFYENRESTSTLTVKEVPMSTHFLLNPHRHLSA
>NZ_CP039216|51843:72524|52702_52996_+|WP_016210977.1|DBSCAN-SWA
MPPCRSCNTERSNEQARFCSNCGASLETRSTYEEIINKDISVLSLTKDRISSIKNNSKIRNIKDILHDLSHKELRSIPQVGEYWAKRIFNLAEEYIS
>NZ_CP039216|51843:72524|69236_72524_+|WP_016210653.1|DBSCAN-SWA
MTNPIHGAGGGGGKGGGSVHTPTEAPNTLSTNAVVTLVDLLGEGEIEGLAHGAQSVYFDDTPLQNADGSYNFEGVTLKSNNGTPSQDYLPGFAESASEEAFNVKVTHEQPVIRTVGRQETNELRVKIGLDALTEYATNGDINGSSVHIRMYLNNVLVVNHEITGKTTSKLEQTFIIKISPGYYIADIETSDVVLDNLDEYFSWKRAGAHAITNNYYKATSFTYPYTLKVERVTEDADSSRVQNTVYLTSITDVIDTKLNYPNSAVVGLEFSAAQFGNQLPKRSYLIRGLKIQVPSNYDPSTRIYSGIWDGSFKTEYSNNPAWVFYDLLTSERYGAGHYLVDADVDKWELYSIAQYCDELVPDGRGGKQPRFCCNLAINNQNQALNMITQLTSIFRGMAYDAAGTIQFSQDRPREPSMLITQTDVVNGQFDYQTSSIKELHSVCVVAFRNPDLNYAIDQEVVEDASRLARLGERRLEITAVGCTSRSQAMRQGLWALQSEAQSDMISYKATQDHIHSLPSDIIKIFDPNMDQEQGAAGVITAVNNNVVTLDREVSLSSQNTLMIFSAEQGIEEYTVIGAPGSRRLEVDRTIIADVGARWVLYHFTAPKQWRITAITEEDDGTYTVNAITHDPDKYQKIDEERALGVSKENTVIPSLKAPSNYRVEQSVSYHSGTAESLLIVAFDGDPNAAYYEYQLRSNEGNYSDVKTTHLNHIELSSTGATYTFRVRAMGWFGQRSHYSTYRCSASLEQQIPENVSRFVSSYSDKIAVLEWAKNPELYVKHYEIRHGTAWENSILIAELNSTTLHLTHARPGFYLIKAVSQWGIKSAEASVLELTDLTPLNIIQEYDYAANDWPGEFYHTAVNNNNYIRLFSYYSWGGMTQPWEDYSDSWENTKSGTLATDISEGYYLSAVYDLDKIMRCRVYADMQISQSNDDLSWDNMQQAWEHYTLEHNWSWLGSPESCGFEVQFSTSNDNQNWSEFMPLSASFSHFRYARFKVILKRFDAQYTPELQELTCTFDVPETIYNVDNFPVSAAGSTYIFPEPMQQKVIVIATIQSGAAGDQVQVNKSLTQATVNIFDKDGTAKTGEVDLYIGGH
>NZ_CP039216|51843:72524|66333_66675_+|WP_016210657.1|tail|DBSCAN-SWA
MLNFPSLLPTKIAMDKLKPRLRITPLGDGYVQREADGLNTLRHYFTVSFVGLSEIEKDSIISFIADRAGLEPFLWYHPGEKRYFQIICSEWQANLQHNYWTVVLRFEEDFNPV
>NZ_CP039216|51843:72524|63612_63936_+|WP_032126913.1|DBSCAN-SWA
MALRNALFNLAFKTAPVTLGELELQVKELSIAEQQRYQELHPSLSETEANLLLICLSLCDHQGVKIFDVSEYKKLAELPLGVIKQITDAIVEVNGFNESAAHDLKKN
>NZ_CP039216|51843:72524|53766_54132_+|WP_016212235.1|DBSCAN-SWA
MHSAGLLAAKNSANLELPTFKGQTKVDLGFAELQDAAAVCTSLVCTLNIELFEDISMRWLDKWEKTLEYKNSDKNKLFKKVWTLFYSNFDSNNGSITSPCSMVKVRNKIKSSRIKNRKHVS
>NZ_CP039216|51843:72524|67311_68058_+|WP_032126911.1|DBSCAN-SWA
MKASRALNHFKAYALEQYPREAVGLILPADHFMPCPNLSTTPEENFCIDPAQLIDTPSGTILMHSHPDGSVEPSLADMVSQRDTGLLWGIVALNQHAVTDAIVFGEQLFTQQLLERPFLHGVFDCYSLIRDFYAVEKKIFLPDFPRQRSWWEIEKYNLYERYFTEAGFIEVDKATSLCRGDVLLMRVGRTTCINHGAIYLGEDCRLKEDHNTVSLPGMILHHVCDNLSRREMLSEWQKRIAKVVRYEN
>NZ_CP039216|51843:72524|60297_61632_+|WP_016211133.1|DBSCAN-SWA
MNANQLLAIGAALVTAVRRNIKYSENLYLLTGNSFFDERYKKVYSIREGINATSGKIDEQAPSAYAKRALDHRVGFCSELSEVSTFLGSMLNKFEAPVYISVIKTPLHAFCLIHQSSSLHQQTKSNVYISDNIKELSEKTELENAIIVDTWIYKATKLSNYKSHINYAKEFGKQFDLEECFDGEIKTEGYSEAFGTTQPIKIAEKRLLRDFNLAYQEESRKLFTKETYSTQGRRRNSIDTNLICDSKRWGQLKDLKLFIERIASKSSDWYSSSSNRKGKSYQALIDSLDFAIQKYMDISNTDLQEIFNRALQLAPIVRGTSSFKNLWGYRNHITKTTEGLLSTDVVPEEYYKFETLPQMNLFEIRNIRSRPISQNEKCTALIQWIKKEGADPSFYSDAQKAAAYKAVDDFVSRSQGEASLLFYDRAEEAPPLAAEASAASFKSF
>NZ_CP039216|51843:72524|63188_63611_+|WP_016211141.1|DBSCAN-SWA
MSESIGALSEIYRDSDNAGNYVKLANITNIGEISSSRDKIDVTEYGSTQKKYKLGLKDHDEIQLDMNVAQDNSELKNLISDHDTGIERQFKIILATQPKRQIYEFTALITNHKIIAPLSEVISMSVSLQPTSVIVQSDEV
>NZ_CP039216|51843:72524|55986_57069_+|WP_081377926.1|terminase|DBSCAN-SWA
MHSSIVDELHAHKTGDLWRVLETGTGSRRQPLLYAITTAGFDQTGICYSLRDYAVKVLENIIVDDTFFGIIYTLDKDDDWTDERNWIKANPNLGVSKKLDDMQRQCVKAQQMKGERNGFLCKHLNIWTNAETAWLDLERWKACAEYTFKRESLENRPCYIGLDLASTNDIAALVAAFLMPDDSVRLFCRFYLPKETVMTRAKQSPVPYQLWADEGYLTLTEGNVIDYNYIKDDIYQLNKEFDVKEITYDPWNATQLANDLLEEGANMVEFRQGFKSMTPALKELERLVISTKLHHNNNPVLNWMASNLVVVEDDAGNMKPSKRKSTEKIDGMVATAMAVGRLIAGEDHSSIYNERELFIL
>NZ_CP039216|51843:72524|62130_62454_+|WP_016211132.1|head|DBSCAN-SWA
MRASLLRHRVTLQNNLIGANNYGEAVDYWQDITTVWARVSPSAGRELFSAQQFYHEITQTVTLRYRSDITPSLRLVFDGRYLEILSVINPDERNRELILACREWLHA
>NZ_CP039216|51843:72524|55386_55596_+|WP_016212231.1|DBSCAN-SWA
MLKSDPVKTALNYCDDVLSGRVIACDYVKKACQRHLNDLKYARDRGFYFDKEAACKVVRFFSYCKHSKG
>NZ_CP039216|51843:72524|57065_58307_+|WP_016211136.1|portal|DBSCAN-SWA
MTLFKRWFGAATELEPSTEYGGYELLDAAPISASGQSIHPDNAMRLATVYACIRVLAESIAALPLHVYRYETGGGKALATDHPLYSVLHDLPNGEVTSFDLRENLVGHLCLRGNAYCQIIRDGAGRVRELIQLPTDNTTVRRDERTKKLIYSTISNGQSYELRDDQVWRLNAMGSDGIIGSSPITLQRESLGLSAATQEHGAKLFGNGARPSGILTTDSHLKKEGRENLAESWKKAHGGKNSNGVAVLENGLRWQALTMSSEDSQFLETRKYQRNEICGIFRVPPHMIADLERATFSNIEHQDLAFVRHSLVPWLVKIEQSISRDLLLAHERKKYFIKFNIEGLLRGDTAARAAFYNRMFSIGVMSQNDIRELENMNPIEDGDRYYRPLNMTPIGEDEEQNNEQLVSDQSTSK
>NZ_CP039216|51843:72524|58254_58926_+|WP_080664855.1|protease|DBSCAN-SWA
MKSKIMNNWYQIKAQANKHADVYIYDYIGDYGVEAKRFVMELQALDVEQINLRINSPGGSVTDGFAIYNALHRHPAKIIAHIDSLAASMASIIALTGETVHMADNAFYMIHRPWAYAVGDAEELSKIIEILDKNEAKIVNIYHQKSNLADDKIKAMMYETSWLTAAEAKEYGFIDEITEAVNIAAYVKPNQYKNTPQTLIKHSENNTVNALQRHKLALKRSLL
>NZ_CP039216|51843:72524|68611_68899_-|WP_016210662.1|DBSCAN-SWA
MTYKLQFHKEAYKEWKKLNPTTQQQFQKVLKKRLINPHIPSAVCGGDLKGCYKIKLRALGYRLIYTVKEDKVVVQVLAIGSRNRLEAYRLAASRL
>NZ_CP039216|51843:72524|63992_64259_+|WP_016211142.1|DBSCAN-SWA
MNQLSQELSLSEFNEWLAYYSLEPFGVEKDDHRTALMVSAVVNGPLQRKDKTLFTPNDFMPNYSAGDEKKTQSATDMAAILSAIAKRQ

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_129556725.1|51843_52524_+	DNA/RNA non-specific endonuclease	A0A2H4N7Z3	Lake_Baikal_phage	3.3e-37	39.3
WP_016210977.1|52702_52996_+	zinc ribbon domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556724.1|53213_53396_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046773.1|53540_53720_-	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016212235.1|53766_54132_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126134.1|54432_54816_+	HNH endonuclease	A0A2D1GNP5	Pseudomonas_phage	5.6e-26	47.2
WP_016212234.1|54903_55383_+|terminase	P27 family phage terminase small subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016212231.1|55386_55596_+	hypothetical protein	A0A1J0GUY5	Halomonas_phage	1.3e-08	43.1
WP_080743047.1|55611_55968_+	hypothetical protein	A0A1J0GUY5	Halomonas_phage	5.4e-23	61.3
WP_081377926.1|55986_57069_+|terminase	terminase large subunit	A0A1W6JP18	Morganella_phage	1.2e-89	46.3
WP_016211136.1|57065_58307_+|portal	phage portal protein	A0A2K5B287	Erysipelothrix_phage	3.1e-86	46.0
WP_080664855.1|58254_58926_+|protease	Clp protease ClpP	Q8VNN5	Enterobacteria_phage	3.0e-43	44.8
WP_016211140.1|58983_60177_+|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	2.7e-66	40.1
WP_016211133.1|60297_61632_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211137.1|61822_62134_+|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	A0A2H4J711	uncultured_Caudovirales_phage	1.1e-08	34.7
WP_016211132.1|62130_62454_+|head	phage head closure protein	A0A1W6JP44	Morganella_phage	5.0e-12	39.8
WP_016211139.1|62446_62842_+	HK97 gp10 family phage protein	Q7Y404	Yersinia_phage	2.1e-07	40.7
WP_016211129.1|62838_63189_+	DUF3168 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211141.1|63188_63611_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126913.1|63612_63936_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211142.1|63992_64259_+	DUF4035 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126912.1|64262_66341_+	hypothetical protein	A0A1J0GWA6	Alteromonas_phage	2.5e-56	33.0
WP_016210657.1|66333_66675_+|tail	phage minor tail family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210666.1|66671_67343_+|tail	phage minor tail protein L	A0A2I6PHT9	Pseudomonas_phage	3.0e-27	32.7
WP_032126911.1|67311_68058_+	hypothetical protein	A0A0R6PHF9	Moraxella_phage	1.7e-42	42.9
WP_016210665.1|68047_68605_+|tail	tail assembly protein	K7PGY0	Enterobacteria_phage	1.3e-20	36.2
WP_016210662.1|68611_68899_-	type II toxin-antitoxin system RelE/ParE family toxin	A0A2H4JBF4	uncultured_Caudovirales_phage	2.5e-15	50.5
WP_016210670.1|68888_69143_-	type II toxin-antitoxin system prevent-host-death family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_016210653.1|69236_72524_+	host specificity protein J	A0A0R6PIC9	Moraxella_phage	5.2e-112	33.5

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
NZ_CP039216.1|WP_016211383.1|15683_16553_+|hypothetical-protein	15683_16553_+	289 aa aa	NA	HTH_38	NA	3311-43500	yes
NZ_CP039216.1|WP_016212400.1|20398_20998_-|hypothetical-protein	20398_20998_-	199 aa aa	NA	HTH_21	NA	3311-43500	yes
NZ_CP039216.1|WP_155046771.1|20997_21231_-|hypothetical-protein	20997_21231_-	77 aa aa	NA	HTH_21	NA	3311-43500	yes
NZ_CP039216.1|WP_016212131.1|24551_24899_+|hypothetical-protein	24551_24899_+	115 aa aa	NA	HTH_21,HTH_38	NA	3311-43500	yes
NZ_CP039216.1|WP_016212090.1|38521_38701_+|hypothetical-protein	38521_38701_+	59 aa aa	NA	HTH_38	NA	3311-43500	yes
NZ_CP039216.1|WP_016212087.1|38700_39129_+|hypothetical-protein	38700_39129_+	142 aa aa	NA	HTH_38	NA	3311-43500	yes
NZ_CP039216.1|WP_032126714.1|39296_39836_-|hypothetical-protein	39296_39836_-	179 aa aa	NA	HTH_38	NA	3311-43500	yes

Protein sequences of NZ_CP039216.1|WP_016211383.1|15683_16553_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039216.1|WP_016211383.1|15683_16553_+|hypothetical-protein
MDLSALLKKTKNKAKKAPVSKRQRVNIAADDRPYDLDIEEKEIQSKLSQHALEVEVKSDLIDENRTQTVHKVNTNHAQEEVVRKTVLSENALEVEVKSNLIDENRTQTVHKVNTSRTQKEVVRKTALVEHASEVEVKADLIDENRTQTVHKVNTNHAQEEAVRKTVLAENALEVEVKSNLIDENRTQTAHKVNTNRTQEDIKVSAPDVNLLVGVQKDIFMFIYKQASYHKDRVTRPLTLVEISQKVGCKVGAVKTSVARLKEKNYVMRYEYKNGRGGWTRYKVLSEPRR

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	20374-20411	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 position: 20374-20411, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039216.1|WP_016212400.1|20398_20998_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039216.1|WP_016212400.1|20398_20998_-|hypothetical-protein
MQEFKINEVVGTSSPAVSREKIVNSILANQSNFAGDTPPSNPVACMFWADTQNAILWQRSLDNTEWINKGPIDSQLATDEDAQSYAGGPNLYLNSTFRDWDDERTLPRYFYTYYNSSALSAEFERIAPSPSAAEDSDEYQAYELLKLVGSDINRIGYDCRVLKVTLQAGSGSFSLNQRAFVAAHSYVTSGCLIHVIALD

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	20374-20411	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 position: 20374-20411, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039216.1|WP_155046771.1|20997_21231_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039216.1|WP_155046771.1|20997_21231_-|hypothetical-protein
MPETVYNVDNFPVSAAGSTYVFPEPMQQKVIVIATIQSGAAGDQVQINKSLTQATVNIFDKDGTAKTGEVDLYIGGH

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	20374-20411	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 position: 20374-20411, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039216.1|WP_016212131.1|24551_24899_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039216.1|WP_016212131.1|24551_24899_+|hypothetical-protein
MTEGDFINELMFGRGNVPLNTSPQSNWTNLSMTENDDKKVIIRQNSNDVTTYNKDNIVFFVDDDNMFRHAALKIKHDIYLSLFGNSGGLMFSNRQEMLKAFGATKSFIAKKPRRR

HTH_21,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	20374-20411	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 position: 20374-20411, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039216.1|WP_016212090.1|38521_38701_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039216.1|WP_016212090.1|38521_38701_+|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGENNSKGWQCAEFAAQILKRCGLRLPERENLTPIELITLIKQGA

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	20374-20411	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 position: 20374-20411, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039216.1|WP_016212087.1|38700_39129_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039216.1|WP_016212087.1|38700_39129_+|hypothetical-protein
MYSVIKSFWVYGVGGVLVIVIIFVWRYEMRQSAQYELRHEIAQTNWKHNTKTFHLEQQRLKQIQQRYFTKVAATDEEHDDVDHALLESLHASKNWSATDIPNTIFIKLCQAELVDHAQSHRCKSAVQFTQSLQNNKNPRTNQ

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	20374-20411	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 position: 20374-20411, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039216.1|WP_032126714.1|39296_39836_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039216.1|WP_032126714.1|39296_39836_-|hypothetical-protein
MPSKLSLEDRITNVLGKLTRMDNMMLGGNLTPEQKNEIEQVIDSIPHEPDSSSYNPKDSRISNLTVAHVWYGMGSQTGVTSPEWKVRFLKQYVEAVQSNNVDGKRDSALFRSIEKMFNKHEFIYATAEDVTRPLINKEDPKIAPEVATLVKDFVMSGAGDLSITSIDHEEDSSISCLLM

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039214_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP039214|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	20374-20411	0

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**************************************