CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP039060	Piscirickettsia salmonis strain Psal-099 chromosome, complete genome	2 crisprs	DinG,cas3,DEDDh	0	0	38	0
NZ_CP039062	Piscirickettsia salmonis strain Psal-099 plasmid unnamed2, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP039064	Piscirickettsia salmonis strain Psal-099 plasmid unnamed4, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP039061	Piscirickettsia salmonis strain Psal-099 plasmid unnamed1, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	5	0
NZ_CP039063	Piscirickettsia salmonis strain Psal-099 plasmid unnamed3, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0

1. NZ_CP039060

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP039060_1

• CRISPR_ID: NZ_CP039060_1
• CRISPR_location: 1538744-1538854
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP039060_1

Consensus_repeat	Method
AGGATGATTGGGAGCAACTTAAAGATA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP039060_1

>1.1|1538771|57|NZ_CP039060|CRISPRCasFinder
GCTCTATCCTTCAAACAGCCATTATCGCCCTTTATCGTTCCGATATCAAATTAGCTC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039060_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP039060_1

>merge|NZ_CP039060|1|1538744-1538854|CRISPRCasFinder
AGGATGATTGGGAGCAACTTAAAGATAGCTCTATCCTTCAAACAGCCATTATCGCCCTTTATCGTTCCGATATCAAATTAGCTCGAGGAGATTGGGAGCAACTTAAAGATA

>NZ_CP039060|1|1|1538744-1538854|CRISPRCasFinder
AGGATGATTGGGAGCAACTTAAAGATA	GCTCTATCCTTCAAACAGCCATTATCGCCCTTTATCGTTCCGATATCAAATTAGCTC
GAGGAGATTGGGAGCAACTTAAAGATA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP039060.1|WP_027242578.1|1540821_1541358_-|DUF2062-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378263
NZ_CP039060.1|WP_144420680.1|1545413_1546334_+|DNA-internalization-related-competence-protein-ComEC/Rec2	unknown	unknown	gnl|CDD|225212
NZ_CP039060.1|WP_017375696.1|1546349_1546733_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039060.1|WP_027243099.1|1534712_1536026_+|DEAD/DEAH-box-helicase	unknown	unknown	gnl|CDD|236722
NZ_CP039060.1|WP_048876008.1|1542673_1543648_-|IS30-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
NZ_CP039060.1|WP_027243095.1|1529305_1531591_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039060.1|WP_155046589.1|1543727_1543877_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039060.1|WP_144420682.1|1537885_1538047_-|phosphatase	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039060.1|WP_144420683.1|1531579_1532236_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039060.1|WP_155046588.1|1537141_1537351_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039060.1|WP_027243096.1|1532412_1533045_+|MarC-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225006
NZ_CP039060.1|WP_155046590.1|1544056_1544221_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039060.1|WP_027243098.1|1533331_1534477_-|carboxypeptidase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|349453
NZ_CP039060.1|WP_027243097.1|1533080_1533266_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039060.1|WP_017376797.1|1528672_1529032_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039060.1|WP_017376798.1|1527755_1528391_-|LysE-family-translocator	unknown	unknown	gnl|CDD|224199
NZ_CP039060.1|WP_017376784.1|1540599_1540785_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039060.1|WP_017376785.1|1539453_1540359_+|LysR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|182768
NZ_CP039060.1|WP_036774017.1|1544222_1545098_-|IS982-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|372648
NZ_CP039060.1|WP_027242577.1|1541375_1542677_+|ComEC/Rec2-family-competence-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|273036

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP039060.1|WP_144420680.1|1545413_1546334_+|DNA-internalization-related-competence-protein-ComEC/Rec2	gnl|CDD|225212	COG2333, ComEC, Predicted hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily) [General function prediction only].	1.00534e-72
NZ_CP039060.1|WP_027243096.1|1532412_1533045_+|MarC-family-protein	gnl|CDD|225006	COG2095, MarC, Multiple antibiotic transporter [Intracellular trafficking and secretion].	1.76545e-45
NZ_CP039060.1|WP_027243098.1|1533331_1534477_-|carboxypeptidase-family-protein	gnl|CDD|349453	cd06234, M14_PaCCP-like, Peptidase M14-like domain of ATP/GTP binding proteins and cytosolic carboxypeptidases similar to Pseudomonas aerugnosa CCP (PaCCP). A bacterial subgroup of the Peptidase M14-like domain of Nna-1 (Nervous system Nuclear protein induced by Axotomy), also known as ATP/GTP binding protein (AGTPBP-1) and cytosolic carboxypeptidase (CCP)-like proteins. This subgroup includes PaCCP from Pseudomonas aeruginosa, a carboxypeptidase homologous to M14D subfamily of human CCPs. Structural complexes with well-known inhibitors of metallocarboxypeptidases indicate that PaCCP might only possess C-terminal hydrolase activity against cellular substrates of particular specificity. The Peptidase M14 family of metallocarboxypeptidases are zinc-binding carboxypeptidases (CPs) which hydrolyze single, C-terminal amino acids from polypeptide chains, and have a recognition site for the free C-terminal carboxyl group, which is a key determinant of specificity. Nna1-like proteins are active metallopeptidases that are thought to act on cytosolic proteins (such as alpha-tubulin in eukaryotes) to remove a C-terminal tyrosine. Nna1-like proteins from the different phyla are highly diverse, but they all contain a unique N-terminal conserved domain right before the CP domain. It has been suggested that this N-terminal domain might act as a folding domain.	9.10914e-164
NZ_CP039060.1|WP_027242577.1|1541375_1542677_+|ComEC/Rec2-family-competence-protein	gnl|CDD|273036	TIGR00361, Recombination_protein_2, DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2. Apparant orthologs are found in 5 species so far (Haemophilus influenzae, Escherichia coli, Bacillus subtilis, Neisseria gonorrhoeae, Streptococcus pneumoniae), of which all but E. coli are model systems for the study of competence for natural transformation. This protein is a predicted multiple membrane-spanning protein likely to be involved in DNA internalization. In a large number of bacterial species not known to exhibit competence, this protein is replaced by a half-length N-terminal homolog of unknown function, modelled by the related model ComEC_N-term. The role for this protein in species that are not naturally transformable is unknown. [Cellular processes, DNA transformation].	2.99327e-41
NZ_CP039060.1|WP_017376798.1|1527755_1528391_-|LysE-family-translocator	gnl|CDD|224199	COG1280, RhtB, Putative threonine efflux protein [Amino acid transport and metabolism].	2.53606e-35
NZ_CP039060.1|WP_036774017.1|1544222_1545098_-|IS982-family-transposase	gnl|CDD|372648	pfam13612, DDE_Tnp_1_3, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contains three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	3.54754e-84
NZ_CP039060.1|WP_017376785.1|1539453_1540359_+|LysR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|182768	PRK10837, PRK10837, putative DNA-binding transcriptional regulator; Provisional.	3.43302e-86
NZ_CP039060.1|WP_048876008.1|1542673_1543648_-|IS30-family-transposase	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	1.65717e-79
NZ_CP039060.1|WP_027243099.1|1534712_1536026_+|DEAD/DEAH-box-helicase	gnl|CDD|236722	PRK10590, PRK10590, ATP-dependent RNA helicase RhlE; Provisional.	0
NZ_CP039060.1|WP_027242578.1|1540821_1541358_-|DUF2062-domain-containing-protein	gnl|CDD|378263	pfam09835, DUF2062, Uncharacterized protein conserved in bacteria (DUF2062). This domain, found in various prokaryotic proteins, has no known function.	2.12897e-42

Protein sequences

>NZ_CP039060.1|WP_144420682.1|1537885_1538047_-|phosphatase
MYHFQIDNQINQFLNRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP039060.1|WP_155046588.1|1537141_1537351_+|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYEINNILILFSYLFGAILKLTFPSYYNFLAKLRSHTICQELYGIQKSKEP
>NZ_CP039060.1|WP_027243099.1|1534712_1536026_+|DEAD/DEAH-box-helicase
MSFSSLGLSAPLLDAITEQNYKEPSAIQAQAIPAVLSGRDVMAAAQTGTGKTASFTLPLLERLSKGEQVRANQARALVLTPTRELAIQVAESVAVYGKNMPLRSTAVFGGVKINPQMMRLRRGVDILVATPGRLLDLYSQNAIKFKQLEVLVLDEADRMLDMGFIHDLRKIMALLPKQRQNLLFSATFSKEIRALAKTFVHQPLEISVTPRNTTAKTVKQWICPVDKKQKSALLMHLISHHQWQQALVFSKTKHGANRLARYLDDQGVTAAAIHGNKSQGARTKALADFKQGEVRILVATDIAARGLDIDQLPQVVNFDLPNVPEDYVHRIGRTGRAGACGQAVSLVSADEIKQLSDIEHLIGQLLARKLVDGFEPVHDVPVSSLDRRSKAPKKPEIEHQGGQRLGGSMQGKRREDHRNSQQQPGRKRRRPQLCRSK
>NZ_CP039060.1|WP_027243098.1|1533331_1534477_-|carboxypeptidase-family-protein
MRISSQFDAGNIEVISAEAVNNIQLKIRKDNQSDFLQWFHFRLHGAKNQACTLKILNASACSYPQGWQNYNIVASYDKEHWFRIPSHYDGKTLIVEHTPEANSIYYAYFTPYSYERHQELIGHAQQHSQCEVSLLGQTVDGRDLDLLTLGQLDQSNSDHHHKKKIWLIARQHPGETMAEWFIEGFLGALLDESNALARVLLSKAVFYVVPNMNPDGSVRGNLRTNAAGANLNREWQTPSMTKSPEVYYVKEKMQNTGVDLFLDIHGDEALPYNFVVGTEGNPLYSARIHSLEKQFKDAFKQTNPDFQDQYGYDKDQPGQANLTVACNNIGQTFDCLAFTIEMPFKDNADLPCKEFGWSAERSEQLGASVLQPIYNVIDQLR
>NZ_CP039060.1|WP_027243097.1|1533080_1533266_-|hypothetical-protein
MFDMSELSRPENKWDIFKNSKGQWQWSCSDPNGRFLGASTETFDNEESCVANAREQGYSSE
>NZ_CP039060.1|WP_027243096.1|1532412_1533045_+|MarC-family-protein
MHELITFFITLLALTNPFGNLAIFIGLVEGRDVKEQRGIAFKAGIAVAIILMIVTLFGQNILDFFGISIGAFEVAGGLVILLLGLSMLNMKTEHQPHTKSEHTLAEEKPAIAVVPLAMPIIAGPGALAAVIIHTQSHVADRLFAKLPYVGVDIVIAVVVTAVLLFAPFFHKLLGVAGLKIVERIMGLILMAMAVTMMASGVHSLFPVPAA
>NZ_CP039060.1|WP_144420683.1|1531579_1532236_-|hypothetical-protein
MLKACSVPTMQLHADYDTETKKSHYSPLGDLRIQRFFDGRPNIQKTALKRYFKKKLPSGIFSGKTQPELSTYLQTTMRTIGQENGSNAPHSTQHYVITGIIQSIQVSKKPGVAKELMNPNAQYTPYIGASHYHAQVKFKAELRQAGLIILTVPVSINLFEITASHLTVQQDSDKMAYLLKKAINQAIKTMYKKLHQQLPQQSTMTSIKKLSQINRLHP
>NZ_CP039060.1|WP_027243095.1|1529305_1531591_+|hypothetical-protein
MPYTVELEEIYQGKRFESERKRYQECFNAADALADSVYLSESMLGYFEDVSGDELDFNNDATYSSSLSLFVLLGIFGVFKARAHFDKNENIDKYYKKLRTALSGLKNGRHALVNISSLVSILSHHAVASSVVSPVGALGFAIGILLAANNLYKLKLEEKRNSNLKAIEQYFLNFDRPEFDQDFKRIVPPNVKSNRKLIYTNIIDGFTDGLYLVGNAFMLLGLCGATSMVPTVAIGLCVAYGVYTLGSIINKYFKEKEEQLKEEFIYLKFLENLENQGKLVEYHDQFKSDPNYKKYIGDLSESDGAEEIRNKLGVALKIKEKELNAKKETLQSNTFYKVYKMISKSFSTVRSYVNTIKNSLATVTGIDILASQHPLAQAAVSLGCIITGCAVAVPFLVYKTYCSFRPTYQLRCRQGLDYPDLLYFFNEYAKSGFLKKHNHKGLIDRLTDDYQDYRENYLHILCTVNEYIADHYRNMNQKGELFLRYQAAKDYILCKHKYFSSMIKQLYKEYHYYSSLNINSDSDDIFIKNTRCLLKLYPATTKKEVVESLAIFSWDRQIAIITALPEFIDDHQVIMDLKGFLSAIKKPLREKNNFWLDKAHKKAQQDFFNAMLQNYLDNGVVNRSECAALVMNINKLLNSELLYPMPVKTINFYLHKAAVNYLAASASKILKNENLSIQQKIALYQSQHDELLRLLPNMMKSYAQRDSHDSLKVDESQFEEFLARAKNHRSNSNSCFTNMMFYHGQVDTMEPASSHRLVLGV
>NZ_CP039060.1|WP_017376797.1|1528672_1529032_+|hypothetical-protein
MFTRQKKSLAKFAAESAGTVEAVEAFHREPVCELVFSVCDQEISQCIDLLYDAGHNIHNLKKYAPIEFRNYIYEEFLMRLESPAADVQRELAREVFMDYLETRLKFDMDIAREIIKMPG
>NZ_CP039060.1|WP_017376798.1|1527755_1528391_-|LysE-family-translocator
MTFGIWLSLFAVCILGAMSPGPSLAIVTKHSLTNGRWHGIATSWSHALGVGLYATLTLLGLAVLLKRSPILFAIISYAGAGYLIYLGINALRSKGGIDSKLNLGQPAPLKDSCREGFMISLLNPKLALFFLALFSQFISVGHQLSSQVIIVATPTLVDGLWYTLIAFILSNPKVLSILKNKAQLIDRLSGIVLLLLASVFIISTISHSIFN
>NZ_CP039060.1|WP_017376785.1|1539453_1540359_+|LysR-family-transcriptional-regulator
MSVKITLRQLEIFVAISQHGHVTQAANSLYLSQSAVSMALAELERQLGKTLFDRAHKNLQLTNEGRLLLDKAVSLMQQAREVEQLFESDVQGELVVGASSTVGNYMLAGLMSEYLQKYPQLRLRLEISNTRRSQEKLLDYQFDCAFVEGEVTHADIKRQLWCMDEMLLIVAPTHPLAYKGLVEASDLSKAVWVLREQGSGTREFFNRRVLPELTYAQVCLELSDSTAIVQSVETGVGVSCLSRHVVECALREKRLAKLPYERKLERAFYLLIHKKKHIPALVHHFIDFCYQYIGKNNNYSL
>NZ_CP039060.1|WP_017376784.1|1540599_1540785_+|hypothetical-protein
MEKIERVYARDHGISGNFKDIQFEKYCRDWLEPMRRKVNESTKLDDYVNPRVKSRLGGYLG
>NZ_CP039060.1|WP_027242578.1|1540821_1541358_-|DUF2062-domain-containing-protein
MFNWFKKKIPTRESLQDHKILAKLYHLLHYHYLWHFNRHSVSKAIAIGSFFAFIPVPFQMIPAALCALVFRANVGISIATVWISNPITIPPMIYAAYKLGSWMIGHPGFIISLEQPHDIIHLLSQSWPPFLLGCITLSITFSLVNYIIARLFYRLWIIHKWHKNREKHKQANTTKKER
>NZ_CP039060.1|WP_027242577.1|1541375_1542677_+|ComEC/Rec2-family-competence-protein
MLGFIFVIGFLTLFFLGWQGAVLLSLSIGGLCYFIKSKHKAKLLCCLGLGGLWAIIIIFWQDYLHLDDFVLNQVVVITGNVVSIPEHDTRKVCFLFLIESINHQPLWPARQVRLNWYRFKQKKQQVLKAGESWQFQVKLRAPFGLENFIGFNYRRWLYQHSIQATGLVIDRYGKKGINRKLSSSHVFNLQQYRQKIAWFLERIDLHNTALIKALVLGERAEVKRSVRNLLQQTGTAHLLAVSGLHIGLIVTFTFFLIRGVLLWAPGMSRKYKSSGYALFIAAIVSLLVALCYSALAGFSVATLRACLMTVCVLLAFLCRRVVPIWALYQYALVGVVILFPLSVLSIGFWLSFLSVGVLIFVCAGRLTQTKLQKYLKPQWALLIALAPLSLAYFFNMPLIGLLANLVAIPWVGFLVLPLLLFALRHLKCNTTLY
>NZ_CP039060.1|WP_048876008.1|1542673_1543648_-|IS30-family-transposase
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKSITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP039060.1|WP_155046589.1|1543727_1543877_+|hypothetical-protein
MTEGVLGLIFIPLSNELSWVLFHCADLQITWLINRCEPWSAKHGVSRPR
>NZ_CP039060.1|WP_155046590.1|1544056_1544221_+|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYGITLFRPLAALYTTLLWCANINFIGFFFFNVSSI
>NZ_CP039060.1|WP_036774017.1|1544222_1545098_-|IS982-family-transposase
MDLTLISLFCVIDDFCQELLPQWNAILLEDTNKKRNKPSQMSTSEIMTIMIYFHKSNYRNFKMYYLHVIKGSMVKYFPNSVSYNRFVELMPSILLPLCFFIAAQGKTATGIYFVDSTILRVCHEKRASQNRAFKGLAKKSKSTMRWYYGFKLHIIVNDMGELMAFKMSKATTDDRVVLPKMAENLTGKIIGDKGYISQKLFDQLYEKGLQLITKIRKNMKNKLVLMIDKILLRKRGIIESVFDQLKNISQIEHSRHRSADNFMVNIVAGLAAYCLQEKKPSLGIKYNLLNG
>NZ_CP039060.1|WP_144420680.1|1545413_1546334_+|DNA-internalization-related-competence-protein-ComEC/Rec2
MCKIPTEVATLTYFLCRTHVFLGTLILLMPRGFPGRLFGLVTMLVPWVYALRPVTPDHAFVRVLDVGQGLAVIVKTHHHNLVYDVGNKTKSGFDLGQMVVVPNLYALGIQHIDKLVISHIDSDHSAGLASVLAAYPKTPIVSSSPLLPYTKIQACVAGDRWLWDGVTFEFLSPAYPFPYGRNNQSCVLKVSINEEGSSMLLTGDIEKRQEKKLLLQAPLSLKSDILFAPHHGSNSSSTSPFIKAVSPHTVIISAGRYNAYRLPHVKVLHRYQSQHIAILNTGQVGAIDFQLSGNKEPLFTFAGAGV
>NZ_CP039060.1|WP_017375696.1|1546349_1546733_-|hypothetical-protein
MTINKRDFFDAINYADTAVKIHEYLLNTLEKQQKDFAESCNNDNSSEKSKALASISDVELRFAQLDMLSAIYRKVLLNTLNEIEGCNDQELKTIKNGLLHMVATTLEACVNDFTIEAKITIDIKEEQ

Crispr_ID: NZ_CP039060_2

• CRISPR_ID: NZ_CP039060_2
• CRISPR_location: 2097998-2098093
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP039060_2

Consensus_repeat	Method
CTCAAGGGGCTTCAGGGCACTCTG	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP039060_2

>2.1|2098022|48|NZ_CP039060|CRISPRCasFinder
GACAAGAAGAAGAAATTTTTGGTACTGTAGGTGGTTTTCAATCCCAAT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039060_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP039060_2

>merge|NZ_CP039060|2|2097998-2098093|CRISPRCasFinder
CTCAAGGGGCTTCAGGGCACTCTGGACAAGAAGAAGAAATTTTTGGTACTGTAGGTGGTTTTCAATCCCAATCTCAAGGGGCTTCAGGACACTCTG

>NZ_CP039060|2|2|2097998-2098093|CRISPRCasFinder
CTCAAGGGGCTTCAGGGCACTCTG	GACAAGAAGAAGAAATTTTTGGTACTGTAGGTGGTTTTCAATCCCAAT
CTCAAGGGGCTTCAGGACACTCTG

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP039060.1|WP_017378003.1|2087189_2088020_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|367907
NZ_CP039060.1|WP_017378009.1|2098752_2100498_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223021
NZ_CP039060.1|WP_036773793.1|2105788_2106166_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039060.1|WP_036771696.1|2100912_2102373_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223021
NZ_CP039060.1|WP_017377998.1|2083551_2084082_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|284031
NZ_CP039060.1|WP_048875961.1|2093446_2094850_+|IS4-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|376573
NZ_CP039060.1|WP_144420647.1|2103292_2103490_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039060.1|WP_017378007.1|2094995_2096939_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226654
NZ_CP039060.1|WP_027242834.1|2106625_2107933_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039060.1|WP_017378005.1|2091739_2092459_+|sulfate-transporter-CysZ	unknown	unknown	gnl|CDD|179898
NZ_CP039060.1|WP_146619530.1|2108681_2108939_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039060.1|WP_048875964.1|2103898_2104678_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|376573
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NZ_CP039060.1|WP_027243145.1|2084092_2085148_-|protease-SohB	unknown	unknown	gnl|CDD|236978
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NZ_CP039060.1|WP_036773465.1|2085163_2087203_-|NAD-dependent-DNA-ligase-LigA	unknown	unknown	gnl|CDD|236137
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NZ_CP039060.1|WP_017376708.1|2105242_2105644_+|transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|376573
NZ_CP039060.1|WP_017378006.1|2092697_2093327_+|response-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|381113

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP039060.1|WP_017378003.1|2087189_2088020_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|367907	pfam04354, ZipA_C, ZipA, C-terminal FtsZ-binding domain. This family represents the ZipA C-terminal domain. ZipA is involved in septum formation in bacterial cell division. Its C-terminal domain binds FtsZ, a major component of the bacterial septal ring. The structure of this domain is an alpha-beta fold with three alpha helices and a beta sheet of six antiparallel beta strands. The major loops protruding from the beta sheet surface are thought to form a binding site for FtsZ.	1.17377e-13
NZ_CP039060.1|WP_017378009.1|2098752_2100498_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|223021	PHA03247, PHA03247, large tegument protein UL36; Provisional.	0.000214736
NZ_CP039060.1|WP_036771696.1|2100912_2102373_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|223021	PHA03247, PHA03247, large tegument protein UL36; Provisional.	8.47893e-06
NZ_CP039060.1|WP_017377998.1|2083551_2084082_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|284031	pfam06508, QueC, Queuosine biosynthesis protein QueC. This family of proteins participate in the biosynthesis of 7-carboxy-7-deazaguanine. They catalyze the conversion of 7-deaza-7-carboxyguanine to preQ0.	1.95217e-24
NZ_CP039060.1|WP_048875961.1|2093446_2094850_+|IS4-family-transposase	gnl|CDD|376573	pfam01609, DDE_Tnp_1, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction. This family contains transposases for IS4, IS421, IS5377, IS427, IS402, IS1355, IS5, which was original isolated in bacteriophage lambda.	1.76184e-13
NZ_CP039060.1|WP_017378007.1|2094995_2096939_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|226654	COG4191, COG4191, Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system [Signal transduction mechanisms].	6.24409e-47
NZ_CP039060.1|WP_017378005.1|2091739_2092459_+|sulfate-transporter-CysZ	gnl|CDD|179898	PRK04949, PRK04949, putative sulfate transport protein CysZ; Validated.	2.22151e-69
NZ_CP039060.1|WP_048875964.1|2103898_2104678_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|376573	pfam01609, DDE_Tnp_1, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction. This family contains transposases for IS4, IS421, IS5377, IS427, IS402, IS1355, IS5, which was original isolated in bacteriophage lambda.	0.00345182
NZ_CP039060.1|WP_053093668.1|2102555_2103155_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|379252	pfam13546, DDE_5, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	0.000376208
NZ_CP039060.1|WP_017378004.1|2088086_2091626_-|chromosome-segregation-protein-SMC	gnl|CDD|274008	TIGR02168, Chromosome_partition_protein_Smc, chromosome segregation protein SMC, common bacterial type. SMC (structural maintenance of chromosomes) proteins bind DNA and act in organizing and segregating chromosomes for partition. SMC proteins are found in bacteria, archaea, and eukaryotes. This family represents the SMC protein of most bacteria. The smc gene is often associated with scpB (TIGR00281) and scpA genes, where scp stands for segregation and condensation protein. SMC was shown (in Caulobacter crescentus) to be induced early in S phase but present and bound to DNA throughout the cell cycle. [Cellular processes, Cell division, DNA metabolism, Chromosome-associated proteins].	0
NZ_CP039060.1|WP_027243145.1|2084092_2085148_-|protease-SohB	gnl|CDD|236978	PRK11778, PRK11778, putative inner membrane peptidase; Provisional.	0
NZ_CP039060.1|WP_036773465.1|2085163_2087203_-|NAD-dependent-DNA-ligase-LigA	gnl|CDD|236137	PRK07956, ligA, NAD-dependent DNA ligase LigA; Validated.	0
NZ_CP039060.1|WP_017376708.1|2105242_2105644_+|transposase	gnl|CDD|376573	pfam01609, DDE_Tnp_1, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction. This family contains transposases for IS4, IS421, IS5377, IS427, IS402, IS1355, IS5, which was original isolated in bacteriophage lambda.	0.00109659
NZ_CP039060.1|WP_017378006.1|2092697_2093327_+|response-regulator	gnl|CDD|381113	cd17569, REC_HupR-like, phosphoacceptor receiver (REC) domain of hydrogen uptake protein regulator (HupR) and similar domains. This family is composed of mostly uncharacterized response regulators with similarity to the REC domains of response regulator components of two-component systems that regulates hydrogenase activity, including HupR and HoxA. HupR is part of the HupT/HupR system that controls the synthesis of the membrane-bound [NiFe]hydrogenase, HupSL, of the photosynthetic bacterium Rhodobacter capsulatus. It contains an N-terminal REC domain, a central sigma-54 interaction domain that lacks ATPase activity, and a C-terminal DNA-binding domain. Members of this family contain a REC domain and various output domains including the cyclase homology domain (CHD) and the c-di-GMP phosphodiesterase domains, HD-GYP and EAL. REC domains function as phosphorylation-mediated switches within response regulators, but some also transfer phosphoryl groups in multistep phosphorelays.	1.63665e-55

Protein sequences

>NZ_CP039060.1|WP_017378007.1|2094995_2096939_+|hypothetical-protein
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>NZ_CP039060.1|WP_048875961.1|2093446_2094850_+|IS4-family-transposase
MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFKSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSQRKYDFRKGRKLGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP
>NZ_CP039060.1|WP_017378006.1|2092697_2093327_+|response-regulator
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>NZ_CP039060.1|WP_017378005.1|2091739_2092459_+|sulfate-transporter-CysZ
MSGFHYFLNGLNFILTPKMRRYLYLPILLNIILLLVLSYLGVHGIEVITNHVSTSLPHGLHFLRPIATIILSLALITLLVFSFTTLASIIGAPFYSLLCEAVLQKKDHQLPQDNITALIKDMPRLIGRELIKLRYFIIRVMILMILLFIPGINLIVSLLWFIFNCWMQAIQYIDYPMDVLKHPFKQTLKATRQTPLTAMSFGLVCFVCTLIPLLNLIAIPAAVAGGTLLWSERIQPLLK
>NZ_CP039060.1|WP_017378004.1|2088086_2091626_-|chromosome-segregation-protein-SMC
MRLKKIKLAGFKSFVDPMTVELPSQLAAIVGPNGCGKSNIIDAVRWVMGESSAKNLRGESITDVIFSGSSARKPVSQATIELIFDNSQGKLVGPYVSYSEISIKRIVNREAQSSYFLNGTKCRKRDIADVFLGTGLGPRSYSIIEQGMISRVIEAKPEELRVHLEEAAGISKYKERRKETERRIRHTRENLERLGDIREELGKQLSRLHQQAQAAEKYQNFKKEEREVKGQLYIQRWKSLQTQHGQEQKKIQEHEVIVEKQRAGQQHIDASLEKERLALSEASEKLHACQADYYQAGNEVSRLEQQIEHATTRIRETGQEMARLNTSLEKARSELAADEQQKVLLSAQEEALEPETELLQNAVDEAALSAEEAEVSYRQLEKERESLLQQVALCRQEAEVEQTRIRHMEEQGQRLQQRLERLRAETHNSDLISLEVGLEDVQGQQRELEEKEQELQLGAEEQQQRLIQQRQLIEQQRKGLEQQRGELHPLKGRLASLEALQQAALFDVNADSASSVKTWLETQGLIASKQLAQSLRVQEGWETAVETVLGDNLQALYTPGYQVNACVAELEMSLICIDQPLALNVNTQVAQGHENQAGILKLTDVIEPGESLPSQLQHVYLAEDLLAALRIRSELKSYESVVTVDGLWLGVNWLKVTKRDDSQSGVIAREKELMTLRQQELALEESICLHEEQLSQSQEVLMQVEAQVKSVQQQAQALQRELAEVKARVSGRLAHIEQVRARLAVVEHELSEALELFNEEQEEIKIARQRLEIAVEKMAELELQRQALESGRVEASRTTQEARQQLESLKSQYQQKQMQLQRVQSEQAGIKAALQRLEELLGRDKVRLVELEQSRIGLEEPLEEQRMLLDEQLERQLSFEDRLKTVKDQAQAHENQVRTFEKQLHEQMNQVAHAREALEQGRMQAQELFIRRQSVEEQLVEAGFQLRGLLEIYQEGCDVKELETALEDIGRRIQRLGVINLAAIDEYAGQSERKVYLDAQHDDLTEALDMLEAAIRKIDKETRTRFKETFDEVNGHFKLLFPKLFGGGSATLELIGEDLLEAGVALMAHPPGKRNSTIHLLSGGEKALTAAALVFAIFQLNPAPFCMLDEVDAPLDDANVGRFCRLVEEMSESVQFIFISHNKIAMEMADQLVGVTMREPGVSRLVAVDIEKALEMAEE
>NZ_CP039060.1|WP_017378003.1|2087189_2088020_-|hypothetical-protein
METFLKVLVLLVGILLVWVFIWEGLRRLKVWRIRKWGVKRPLQMRSGDPLAEDDIVDDVTDRQNTEDNQQNQSQHDRQADTVSARAPEPNHIILNIYIESKSTGFLAYALFSLLKRSGLIFNDELQVFEAKNEQGEVDFYITSAVAPGVFDIKNAMVSIPAVSVFARPDLQTNPRMSFFKLLESTHTIASELDGRVLNMRREILSEASVSADYLSVVNTYAVAESTAAALSASNSTSIVVDESMQDDNHVYQENESHVIADTRVDADSNKDQHVAG
>NZ_CP039060.1|WP_036773465.1|2085163_2087203_-|NAD-dependent-DNA-ligase-LigA
MSPAKLKRELVSDARVDELVKQLNLYSEAYYSEDDPLVPDSEYDRLFNELQQLEADYPELKQVDSPTLRVGGTILAEFTEVQHQSPMLSLSNGFNDQDIYDFIKRLKVDEDACFFCEPKLDGLAISLHYQRGRLVLAATRGDGTTGEDVTENVKTIRSIPLRLHSNNPPEFLEVRGEVFMMKSGFNKLNDQLRETNQKTFANPRNAAAGSLRQLNSKVAASRPLSFYAYSLTHMVGIELAQSHHERLALLASWGIPVNGDARCAAGTKGCLVFYQSILKVRDQLNYDIDGVVYKLDDIAAQEKLGFTARAPRWALAHKLPAEEEITIVKAIEFQVGRTGALTPVARLEPVHVGGVVVSNATLHNMDEVERKDVRIGDSVIVRRAGDVIPEIVKTIIENDTQSKAHAARPKLVMPDKCPVCDSAVERLAGEAVSRCMGGWRCKAQRKEALKHFISRKALNVDGLGEKLIEQLVDLELVQDAADLYQLTLEQLAGLERMAEKSANNVLEALEKSKVTTFGRLLYALGIRNVGQATAQVLAQRFGNLAALLAANTEELHAVDDVGPVTSQFILQFFSQQENQQLIERLQALGVCWPEQDKPLLAVRALQGEVIVLTGTLHGFSRDEVKEKLEQLGAKVTSSVSKKTTLLIAGENAGSKLDKAQALGVPVKNENDLKVLLGSN
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>NZ_CP039060.1|WP_017377998.1|2083551_2084082_-|hypothetical-protein
MQRKAIVLLSGGGYSSLCLYLARSQGYLPYALSLDIPKRHFQLDSAQQFARDVGVAEHQVIAMNENSLSDSKALTYYSSLLSFAVNWAQELSAQDIFIGLHPSAEHTLEYMVEWLQSYQELINLSSTTAIRIQTPLLFMSDKKREQTAEQFNLKLPEPVSKLKSKKKKFIQRIFSE
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MLSTPWLAALDFDGCLYNVNIDNVRRAFHSPGKPKEELTLAHLITINQKLIDHLNNQAEKFSSSTVFLGSDRQDYKKERDNSAGPNREGQYCYPLISDFAKKIGAEFDPLLMADIYNNLPLGESFRQALQDYHTPEKHDQDPHTQPDSSKLTLLYAQMHKAATENPDDIVTYEFYDDRKDILLSLQEIFESDPHMIPKNITLYLNHYDGVNLQNLLIIQGQGNPDSQYQHTLKNPAYRKASANPAEAQTDYSISELIKEKFPKISKSFLEIKQKLQQLNLPKLKKSLIREATSVSVATSVGILHIQ
>NZ_CP039060.1|WP_017378009.1|2098752_2100498_+|hypothetical-protein
MPITKQTKATTIQISIRALLSSTMEPCGQTIISSIDSSHQEIIRWLEFVKELPQIKESGGGVSFILESNTPLPEGFQQDLKDQCERLIANSKIFFNISSIAAKHHAAEKNSIEISEEIYEEIDSKHYATSPRQSVTEHSLSNHTDDDKDSSTHAHPIANTTQNNDFPPPPPNAADSSATASNLPFEQIQTQPASETVKNLGGSITYDQLLNLLKQEIQKAVAIIDKKIKNAKLPFSISTPFEDTKGRKKSILVLEEFIKDILTYPDQGNPDQPLTQELGMLVHTRLKDFYEDDGKMKGRRKTKTISMLFSEIKLMFQNITYANTAVSDDNGSPFPPPPPPLLEQDLLSLELTQFNDSELPLPPPPPPSPILLEDQQQLELNAAQPDLSADSHKAHMAVLGAKLRERQLSLGNETQSNSNSQPAPPPLPPKPVFSVGDLAPPNSGNTKPPLPPKPPLVVDDLTSSESTHAQCASDLTADKTVTFLEEIQQRKQQGLRSIKHSHPLQGPAPLDLNAQILKRRQNMQQTGTSDGKPINLAAALLFQCSQMNTQHSQSNNSNATNDNNDNWSDDWSDSASSPPSP
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MIKVIKENEGAIVTKGQETILLTGSIYDGSNLGKSPAIIALSELGSGLFCAKATLQSENSCLSWLQELKETLGNEITFHLTGKQSKEDLAELQILCQQAEIEAQFPIPEKQPLLYSLATGVNANGIIEKEDLYEKTGGFSFSLTLTKEIEQAISELEKKIKDSWFTINTKGRTDSIILLKELKQNLEQLGESYIGPVNSESDLKFPKSLKEAIKDYSGSEAKNGRQQTTTVGGLLKTLDFHFTRYTVLTTKFTQVPVLTATWHTSEPSADTDSASATPMPDINESKSTPPPPPPAELKAGAKARREEEAAVTVLTNAMEFADDNAEDLPPPPPPSNPDLQQPLPDFNDSDFPPPPPPPPPSDEEQMPLADFDDIELPPPPPMDFETGPETQVSPIEEVNSGATPTDGTGPDTTEKKDSANITAEMQSIMARRGAIGGPDSETEAGEDDSWSDQEDNSGPNQSPSTLFQRQQSQSQEADNSNPLQYN
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MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFKSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSHVSVATSVGILHIQ
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>NZ_CP039060.1|WP_146619530.1|2108681_2108939_-|hypothetical-protein
MFRQKCSHSYRYYAVAMPKINMLTDFTDGDFERIHKAHWNIERFHRATKQLCSIEKFQVRTTECIKNHIFRCEPWSAKHGVSRPR

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	31805 : 91608	52	Staphylococcus_phage(28.57%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_2	123090 : 241158	105	Staphylococcus_phage(12.5%)	protease,transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_3	314961 : 357320	54	Chrysochromulina_ericina_virus(20.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_4	375338 : 425021	54	Staphylococcus_phage(25.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_5	451093 : 499232	42	Staphylococcus_phage(100.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_6	504036 : 558719	52	Streptococcus_phage(22.22%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_7	590510 : 723904	110	Staphylococcus_phage(13.64%)	transposase,tRNA,plate	NA
DBSCAN-SWA_8	732546 : 778861	52	Staphylococcus_phage(21.43%)	transposase,plate	NA
DBSCAN-SWA_9	787021 : 841332	49	Prochlorococcus_phage(33.33%)	protease,transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_10	885012 : 947553	53	Staphylococcus_phage(28.57%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_11	951455 : 1018418	56	Bacillus_phage(20.0%)	protease,transposase,tRNA	NA
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DBSCAN-SWA_13	1095258 : 1144826	39	Acinetobacter_phage(22.22%)	transposase	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP039060|31805:91608|DBSCAN-SWA
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MGQATESFLFEIGTEELPPKSLENLAISLKNSFETALKNAKLNYGDIELFAAPRRIGLLIQQLDAIQPDQIIERRGPAVHAAFNQDGKPTPAALGFARSCNVSLEQIERLETAKGQWLFYKLLEKGAKATDLLPSIAEQAVKKLPIAKAMRWGTNKTQFVRPVHWITMLYGTDVITAKILELSADRITYGHRFHSTGAISLAHANDYAKTLKTTSYVIASFHERRNLIKNQLENIGTKVNGQVHINNDLLNEVTALVEWPMALLANFDKEFLNVPQEALISSMQMHQKCFAVLEPQTSKMLPHFVTISNIDSKNPATVISGNEKVMRARLADAAFFYQTDKKHTLESHLERLKTVTFQAKLGSVYERAERLASISGFIATHLAADIHLAKRAGLLAKTDLMSEMVMEFPELQGIMGRYYAHHDGEANDVALALEEQYLPRFAGDKLPQSMIGAAIALADKIDTLVGIFGIGQKPSGDKDPFALRRAALGLLRIIIENKLALNLTDLIQHSITLYSNKLNNKNTEQDVLQFINERLPAYYAEQSISPDTLEAVTGLQLSYPLDIDQRIQAVHRFRQLEVATALAAANKRVKNILDKQQPATSTISAGLLIEKAEKELYQAICAKHAEVQPLLTEHAYDQALESLASLRHPVDHFFDHVMVMAEDAGLQANRLALLAELRQLFLKVADISYLQN
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MVQEKAILKIIGILLMLFSFSMLPPVYVSWLYQDYDATPFLISFCLAFFSGFLVWLPARDYKVDLKARDGFIIVFLFWLVLGVYSALPFMLSYHPHMVLSEAVFEAVSGFTTTGGTVLSHIENLPPSILYYRQQLQFLGGMGIIVLAIAVLPMMGVGGMQLYRAEVTGPVKDKLTPRITETAKTLWYIYVGLTVICIMTFWLFGMDLFNAICYGFGTISTGGYAPHDASAAFYSSSLIQYAMIFFMLIGGTNFSLHFIMLRKGDIRTYWREPEFRMYISLFFIASIAIMAWLYLSGTEVSISKAIRDSMFQVSSFMTTAGFGSVNLGLWPQLIQLGLLFLGAIGGCAGSTSGGVKIIRLILLGKQSQREIQRLVHPNGVFHIKLGGFPVPVNVINATWGFLAAYVMSFIILMLLLMATGLDQVTAFSTLLACISNTGPALGEAINNYGNLNNSALWLLSFAMLLGRLEVFTVLVLFSRTFWRV
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MARSEGIWSLYWHGLAGSIIAYISELLLFSWLYNRLFNKSFWLSSIASICTTLAIHNAICDYQMFAGSPDRLDLILSNYGVNLIVIITYTTFISVLRKKFNSSASNQLS
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MFAKAKAPLIISIGCVATYFIILLFQVYTPTAHEKSRKQGLVGCDKLGKQARQLCIERINSLGTHAEKTIVIKE
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MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEESLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFRSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRFVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
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MPRDSIGFSQTSLKRLVLTELKELEKQLSLSLNKLLASQQSLELAVKLDQSTFVVSNPDKLSLTNEKLNNLRAKQEKTKVGLTQRLKAVRLEILIKGFDKELECEPTEIADKERDHLQTEMIPKI

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_017378443.1|34486_34993_-	GrpB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378442.1|34989_35358_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378441.1|36760_38545_+	peptidase M4 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378440.1|39025_40153_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378439.1|40225_40981_-	enoyl-ACP reductase FabI	NA	NA	NA	NA
WP_027242743.1|41017_43711_-	DNA polymerase I	A0A2H4J6W7	uncultured_Caudovirales_phage	9.9e-69	30.7
WP_036771562.1|43742_44294_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_026063736.1|44401_45415_+	aminotransferase class V-fold PLP-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_017378435.1|45535_45760_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_144420740.1|47019_47814_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_048875841.1|47958_48711_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378433.1|49022_50549_+	2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase	NA	NA	NA	NA
WP_065653750.1|50687_51761_+	peptidoglycan DD-metalloendopeptidase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242742.1|51800_53108_+	S41 family peptidase	A0A0R6PIZ1	Moraxella_phage	1.2e-24	28.4
WP_017378429.1|53082_54252_+	glycoside hydrolase family 3 protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242741.1|54306_55032_+	16S rRNA (uracil(1498)-N(3))-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_027242740.1|55497_57603_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378426.1|57817_58282_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420739.1|58301_58811_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420738.1|59195_60137_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_053856772.1|60418_61870_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036773655.1|62336_62741_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_036771330.1|65977_66952_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_036773242.1|66991_67546_-	DUF4823 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378416.1|67740_68640_-	oxygen-dependent coproporphyrinogen oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_080963576.1|68644_69271_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242705.1|69215_71537_-	type I DNA topoisomerase	A0A1V0SCS0	Indivirus	7.9e-99	35.9
WP_016210342.1|71683_72163_-	DUF494 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378414.1|72159_73311_-	DNA-protecting protein DprA	NA	NA	NA	NA
WP_017378413.1|73445_73949_+	peptide deformylase	E3SLL2	Synechococcus_phage	5.4e-13	37.1
WP_026063734.1|74042_75017_+|tRNA	methionyl-tRNA formyltransferase	E3SNR5	Prochlorococcus_phage	1.3e-10	35.9
WP_036773239.1|75006_76320_+	16S rRNA (cytosine(967)-C(5))-methyltransferase RsmB	NA	NA	NA	NA
WP_017378410.1|76360_77740_+	Trk system potassium transporter TrkA	NA	NA	NA	NA
WP_080963575.1|77746_79198_+	potassium transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210352.1|79223_79592_+	diacylglycerol kinase	NA	NA	NA	NA
WP_017378407.1|79610_80678_-	4-oxalomesaconate tautomerase	NA	NA	NA	NA
WP_027242707.1|80710_81607_-	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_047927132.1|81603_82440_-	sterol desaturase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378404.1|82575_83028_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378403.1|83166_83913_-	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_017378402.1|83893_84457_-	D-glycero-beta-D-manno-heptose 1,7-bisphosphate 7-phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_017378401.1|84465_84981_-	acyl-CoA thioesterase	NA	NA	NA	NA
WP_017378400.1|85122_87201_-|tRNA	glycine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
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WP_017378398.1|89018_89417_+	DUF3135 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275373.1|89642_89972_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875844.1|90588_91608_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP039060|123090:241158|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017377401.1|129182_130412_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017377403.1|130739_131939_+	type IV secretion system protein	NA	NA	NA	NA
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WP_048875847.1|136195_141418_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_036773453.1|147398_147794_+	PilN domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242719.1|147790_148324_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017377563.1|149446_150403_+	type IV pilus secretin PilQ	G4WZN6	Enterobacteria_phage	1.0e-12	24.5
WP_017377562.1|150912_151437_+	shikimate kinase AroK	NA	NA	NA	NA
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WP_017377550.1|158589_158880_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377545.1|161418_162459_-	succinylglutamate desuccinylase	NA	NA	NA	NA
WP_048875849.1|162561_163533_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017377543.1|163655_164504_-	pantoate--beta-alanine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_017377542.1|164655_164943_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210044.1|165253_165625_+	isochorismatase	NA	NA	NA	NA
WP_017377540.1|166676_166910_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046561.1|167047_167185_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377539.1|167198_167411_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377537.1|167934_168759_+	mechanosensitive ion channel	NA	NA	NA	NA
WP_017377536.1|168897_170031_+	cation transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210041.1|170090_171500_+	glutamate--ammonia ligase	NA	NA	NA	NA
WP_027242724.1|171647_173228_-	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_017377534.1|173985_174981_+	porphobilinogen synthase	NA	NA	NA	NA
WP_027242725.1|174986_177053_+	polyphosphate kinase 1	NA	NA	NA	NA
WP_048875850.1|177110_178061_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210045.1|178255_178582_+	thioredoxin TrxA	A0A1J0GW78	Streptomyces_phage	1.5e-16	46.2
WP_026063646.1|178804_180064_+	transcription termination factor Rho	NA	NA	NA	NA
WP_036772663.1|180323_181199_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017377528.1|181237_182200_+	hypothetical protein	M1HUT5	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	7.0e-17	28.1
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WP_047927156.1|188335_189259_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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WP_017378141.1|226348_227401_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP039060|314961:357320|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP039060|375338:425021|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_048875864.1|423995_425021_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP039060|451093:499232|DBSCAN-SWA
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MKKSFIIISIITLVLSVLFLIYSKSIPIALSFIFYKLIQIIKWGGLAIAITFVGIFIIVGTIIMVATLWSELFES
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_155046566.1|459380_459974_-	DedA family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_144420726.1|469868_470108_+	type IV secretion protein IcmT	NA	NA	NA	NA
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WP_027242649.1|473088_474165_+	type IVB secretion system coupling complex protein DotM/IcmP	NA	NA	NA	NA
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WP_027242647.1|475279_478279_+	ATPase AAA	NA	NA	NA	NA
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WP_027242644.1|485434_488761_+	DotA/TraY family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_048876253.1|491576_492233_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.3e-10	35.7
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WP_032126138.1|493645_493909_+	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771639.1|494336_495311_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	5.6e-30	33.2
WP_087910671.1|495698_496163_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_087910670.1|496256_496442_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875857.1|498257_499232_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	2.8e-29	33.2

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP039060|504036:558719|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP039060|590510:723904|DBSCAN-SWA
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MLNPFRQHLIDANESYFSHMRFALRQCGRLFTAACCLMLHALLPFILTHTASYLIDKINHDLEEKRSRKPQ

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017377070.1|603620_605441_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_027242612.1|611311_611554_+	sulfurtransferase TusA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242611.1|611856_612948_+	AI-2E family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_017377060.1|612928_613882_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	2.9e-31	27.9
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WP_026063546.1|662178_662853_-|tRNA	tRNA (guanosine(18)-2'-O)-methyltransferase TrmH	NA	NA	NA	NA
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WP_026063550.1|665041_666196_+	DegT/DnrJ/EryC1/StrS family aminotransferase	A0A2K9L0G1	Tupanvirus	3.9e-38	33.0
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WP_017376623.1|667209_668226_+	bifunctional UDP-4-keto-pentose/UDP-xylose synthase	D5GW02	Campylobacter_virus	1.9e-12	28.7
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WP_017376625.1|669633_670026_-	RidA family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_144420813.1|677872_678844_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	3.0e-15	29.3
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WP_075275355.1|688153_689128_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	4.3e-30	33.2
WP_027242570.1|689341_690481_-	hypothetical protein	A0A0F6YPT7	Sinorhizobium_phage	9.3e-61	41.7
WP_017376020.1|690689_692060_+|tRNA	tRNA (N6-isopentenyl adenosine(37)-C2)-methylthiotransferase MiaB	NA	NA	NA	NA
WP_017376019.1|692438_693431_+	PhoH family protein	A0A0S0MVD6	Pseudomonas_phage	9.3e-49	45.1
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WP_027242569.1|694818_696369_+	apolipoprotein N-acyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_017376011.1|698068_698230_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_048875960.1|700709_701684_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_036774104.1|701742_702171_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376321.1|702358_703165_-	symmetrical bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_017376322.1|703239_703632_-	Co2+/Mg2+ efflux protein ApaG	NA	NA	NA	NA
WP_017376323.1|703676_704498_-	16S rRNA (adenine(1518)-N(6)/adenine(1519)-N(6))- dimethyltransferase RsmA	NA	NA	NA	NA
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WP_027242862.1|713405_714077_+	ribulose-phosphate 3-epimerase	NA	NA	NA	NA
WP_017376334.1|714159_714735_+	aminodeoxychorismate/anthranilate synthase component II	A0A0P0IKJ1	Acinetobacter_phage	3.2e-57	50.0
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WP_017376336.1|715775_716633_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242861.1|717495_718632_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_027242858.1|722596_723904_-|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssK	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP039060|732546:778861|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017377691.1|775567_775909_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377690.1|776012_777047_-	phosphate regulon sensor histidine kinase PhoR	W8CYF6	Bacillus_phage	1.3e-32	34.2
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Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP039060|787021:841332|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_048876070.1|790596_793503_+	bifunctional [glutamate--ammonia ligase]-adenylyl-L-tyrosine phosphorylase/[glutamate--ammonia-ligase] adenylyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_017377935.1|793767_794778_+	lipopolysaccharide heptosyltransferase II	NA	NA	NA	NA
WP_017377934.1|794774_795833_+	lipopolysaccharide heptosyltransferase I	NA	NA	NA	NA
WP_087910662.1|795847_796627_+	glycosyltransferase family 2 protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017377930.1|800982_801375_+	glycine cleavage system protein GcvH	NA	NA	NA	NA
WP_027243054.1|801387_802764_+	aminomethyl-transferring glycine dehydrogenase subunit GcvPA	E3SN07	Prochlorococcus_phage	4.2e-47	34.6
WP_017377929.1|802757_804227_+	glycine dehydrogenase subunit 2	M4QFZ1	Prochlorococcus_phage	2.7e-84	41.7
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WP_027243053.1|806361_807387_+	hypothetical protein	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	4.5e-30	30.5
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WP_155046574.1|811022_811817_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_017377906.1|825441_826527_+	peptide chain release factor 1	W8EDB3	Pseudomonas_phage	4.3e-07	41.2
WP_017377905.1|826519_827401_+	peptide chain release factor N(5)-glutamine methyltransferase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NZ_CP039060|885012:947553|DBSCAN-SWA
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MNYLEHAEHTENKVAKKLLTLMAEKQTNLSLSADVTSAAQLIQLADSIGPEICLLKTHIDIIEDFTPELTKTLKELANQHQFLIFEDRKFADIGNTVHKQFTAGIYKISSWADIINAHMLPGPGIIDGLKKDIDLEKTGLLLLAQMSSAGNLLHSDYTQATVNIAKTHNNFVMGFISREKLSDDPGMIHMTPGVQLQEGQDALGQCYLTPEHVIDHLGNDIIIVGRGIYNDNQPLKMAQSYRQAGWQAYLKRL
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>NZ_CP039060|885012:947553|939418_939880_+|WP_017376525.1|DBSCAN-SWA
MQCPFCQHKDTKVIDSRWVSESNQVRRRRECIQCAERFTTYEGVELAMPRVIKRNGDRESFNEDKLRKGLTHALEKRPVSAKDIDALIQKVSSQMRAMGEREVDSGLLGEWVMKELKSLDQVAYVRFASIYRSFQDVDAFRQEIERLLQGEST

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_017376743.1|886642_887275_-	endonuclease III	NA	NA	NA	NA
WP_017376742.1|887290_887938_-	RnfABCDGE type electron transport complex subunit B	NA	NA	NA	NA
WP_027242971.1|887940_890004_-|tRNA	methionine--tRNA ligase	A0A1V0S905	Catovirus	5.5e-35	26.2
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WP_027242973.1|892011_894222_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_027242975.1|897280_898156_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420805.1|898414_899026_+	DUF1669 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242976.1|899453_902042_+	ATP-dependent chaperone ClpB	K4FB40	Cronobacter_phage	4.3e-122	37.1
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WP_027242978.1|904521_907707_-	carbamoyl-phosphate synthase (glutamine-hydrolyzing) large subunit	NA	NA	NA	NA
WP_017375707.1|907710_908766_-	glutamine-hydrolyzing carbamoyl-phosphate synthase small subunit	R4TGJ8	Halovirus	1.5e-49	34.7
WP_027242979.1|908995_909598_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375705.1|909641_910304_+	PAS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375704.1|910338_910686_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046576.1|911154_912099_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876031.1|912648_914052_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_027242980.1|915170_915515_+	winged helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_027242981.1|915606_916062_+	glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_144420715.1|916310_916445_-	VOC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377756.1|916437_917079_-	HAD-IA family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_017377755.1|917075_917792_-	bifunctional 2-polyprenyl-6-hydroxyphenol methylase/3-demethylubiquinol 3-O-methyltransferase UbiG	NA	NA	NA	NA
WP_017377754.1|917795_919115_-	TRZ/ATZ family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_155046577.1|919796_919958_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036773644.1|920919_923556_+	DNA gyrase subunit A	G3M9Z5	Bacillus_virus	1.5e-98	32.6
WP_036773645.1|923597_924683_+	3-phosphoserine/phosphohydroxythreonine transaminase	M1Q1P2	Streptococcus_phage	9.8e-76	43.3
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WP_017377747.1|927240_927495_+	LapA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377746.1|927573_927891_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377745.1|928043_928442_+	VOC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242983.1|928523_929162_+	SGNH/GDSL hydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|929318_930293_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_144420804.1|930665_930941_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017375618.1|931490_931775_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036772261.1|933591_934185_+	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243172.1|935293_936175_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376527.1|936286_937966_-	energy-dependent translational throttle protein EttA	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	3.0e-39	26.6
WP_017376526.1|938092_939343_+	serine hydroxymethyltransferase	A0A219Y950	Aeromonas_phage	2.4e-102	54.4
WP_017376525.1|939418_939880_+	transcriptional regulator NrdR	NA	NA	NA	NA
WP_017376524.1|939876_941025_+	bifunctional diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase RibD	A0A1V0SE20	Indivirus	4.7e-44	34.8
WP_017376523.1|941030_941705_+	riboflavin synthase	A0A2H4PQS5	Staphylococcus_phage	6.0e-31	37.7
WP_017376522.1|941701_942358_+	3,4-dihydroxy-2-butanone-4-phosphate synthase	A0A2H4PQS2	Staphylococcus_phage	6.8e-40	44.2
WP_017376521.1|942483_942957_+	6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase	A0A2H4PQS3	Staphylococcus_phage	2.4e-26	43.4
WP_017376520.1|942958_943381_+	transcription antitermination factor NusB	NA	NA	NA	NA
WP_047927196.1|943367_944387_+	thiamine-phosphate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_155046578.1|944546_944726_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243174.1|944944_945226_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875904.1|946677_947553_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>NZ_CP039060|951455:1018418|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017377787.1|981844_982072_+|transposase	transposase	A4JX31	Burkholderia_virus	8.1e-09	47.0
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WP_017376996.1|989761_990649_-	ROK family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210463.1|990839_991187_+	cupin domain-containing protein	A0A1V0SH58	Hokovirus	9.2e-20	42.1
WP_017376997.1|991237_992077_+	NADPH-dependent 7-cyano-7-deazaguanine reductase QueF	I6XGV6	Vibriophage	1.0e-32	35.3
WP_017376998.1|992172_992919_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_026063589.1|993115_993742_+	porin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377000.1|994057_994627_+	outer membrane beta-barrel protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377001.1|994770_995469_+|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit type 1 TsaB	NA	NA	NA	NA
WP_017377003.1|996175_996799_-|protease	site-2 protease family protein	NA	NA	NA	NA
WP_052106204.1|996908_997802_+	thiol:disulfide interchange protein DsbG	NA	NA	NA	NA
WP_017377006.1|997908_999519_-	SpoVR family protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242880.1|999515_1000811_-	YeaH/YhbH family protein	A0A219UQP6	Bacillus_phage	1.2e-06	32.8
WP_027242879.1|1000832_1002755_-	PrkA family serine protein kinase	NA	NA	NA	NA
WP_017377007.1|1002865_1003168_+	DUF2835 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377008.1|1003262_1008149_+	NAD-glutamate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_047927528.1|1008196_1009519_-	Na+/H+ antiporter NhaA	A0A2H4J5W3	uncultured_Caudovirales_phage	7.3e-65	39.9
WP_036771855.1|1009643_1010738_+	fusaric acid resistance family protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242877.1|1010789_1011728_+	signal peptide peptidase SppA	A0A2I6UGK8	Salinibacter_virus	4.9e-15	30.1
WP_026063591.1|1011808_1012393_-	septum formation inhibitor Maf	NA	NA	NA	NA
WP_027242876.1|1012777_1013668_-	Rossmann-like and DUF2520 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377014.1|1013870_1014362_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242875.1|1014501_1014993_-	Spy/CpxP family protein refolding chaperone	NA	NA	NA	NA
WP_016209885.1|1015161_1015875_+	response regulator transcription factor	NA	NA	NA	NA
WP_065653747.1|1015937_1017278_+	HAMP domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875904.1|1017542_1018418_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

>NZ_CP039060|1024031:1086558|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>NZ_CP039060|1095258:1144826|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

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MLLDSKRLRWACRRGMLELDLVLQPYVEKAYDGSSDRHKELFCKLLAEADQDLFIWFTQRETPKDSELADIVKVVLEYTQL
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MKNISQIEHSRHRSADNFMVNIVAGLAAYCLQEKKPSLGIKYNLLNG
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MNQTTCIAIASLLQELEKTLREQRLWEAEAPCKSALLSQEPFCVDTLHFSQWVQWIFLPRMKVIIAAGEDLPLAPGIAPMAEAGLKAQGVRGQEIIRIFKQFDQLLA

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017375975.1|1170921_1171245_+	YqcC family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017375977.1|1173374_1174328_-	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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WP_048876036.1|1176394_1177033_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	2.1e-09	35.7
WP_036771312.1|1177330_1178326_-	glycosyl hydrolase family 17	NA	NA	NA	NA
WP_036774189.1|1179086_1180094_-|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_098082828.1|1180093_1180351_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_017375766.1|1182176_1184207_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_027242770.1|1188643_1189054_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_080963649.1|1189683_1190721_-	folate-binding protein YgfZ	NA	NA	NA	NA
WP_027242767.1|1190762_1191008_+	succinate dehydrogenase assembly factor 2	NA	NA	NA	NA
WP_129556541.1|1191132_1191447_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242765.1|1191454_1193029_-	L-aspartate oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_027242764.1|1193183_1193753_+	RNA polymerase sigma factor RpoE	NA	NA	NA	NA
WP_027242763.1|1194062_1195865_+	elongation factor 4	E4ZFJ7	Streptococcus_phage	5.1e-21	25.1
WP_087910649.1|1195861_1196803_+	signal peptidase I	NA	NA	NA	NA
WP_036771308.1|1196830_1197052_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242761.1|1197214_1197889_+	ribonuclease III	E5EQH1	Micromonas_sp._RCC1109_virus	2.2e-25	33.2
WP_144420798.1|1197894_1198794_+	GTPase Era	NA	NA	NA	NA
WP_027242759.1|1198807_1199551_+	DNA repair protein RecO	NA	NA	NA	NA
WP_027242758.1|1199553_1200285_+	pyridoxine 5'-phosphate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_027242757.1|1200281_1200665_+	holo-ACP synthase	NA	NA	NA	NA
WP_027242756.1|1200802_1202050_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242755.1|1202460_1203606_-	succinyl-diaminopimelate desuccinylase	NA	NA	NA	NA
WP_027242754.1|1203598_1203952_-	ArsC family reductase	NA	NA	NA	NA
WP_027242753.1|1204232_1204775_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_047927692.1|1205419_1205608_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|1205627_1206602_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_144420702.1|1206645_1207521_+|transposase	IS3 family transposase	Q6H9S3	Enterobacteria_phage	1.4e-19	33.3
WP_036815628.1|1207874_1208702_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_080963648.1|1208801_1208963_+|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017375762.1|1209613_1210954_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377787.1|1212005_1212233_+|transposase	transposase	A4JX31	Burkholderia_virus	8.1e-09	47.0
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WP_027243001.1|1218204_1220175_+	acetate--CoA ligase	A0A2H4PQU7	Staphylococcus_phage	7.2e-77	36.9
WP_017375893.1|1220372_1221443_+	FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_017375892.1|1221500_1221707_+	sulfur carrier protein ThiS	NA	NA	NA	NA
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WP_017375890.1|1223324_1223888_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876031.1|1224057_1225461_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_027242999.1|1226427_1227522_+|tRNA	tRNA 2-thiouridine(34) synthase MnmA	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

>NZ_CP039060|1243764:1291489|DBSCAN-SWA
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MKKFGMVKVFRQKCSHSYRYYAVAMPKINMLTDFTDGDFERIHKAHWNIERFHRATKQLCSIEKFQVRTTECIKNHIFCSFISFIKLE

Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

>NZ_CP039060|1315308:1356518|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_087910645.1|1316502_1317655_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	8.9e-59	44.2
WP_048876022.1|1318068_1318920_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_144420700.1|1319057_1319207_-	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_017377952.1|1319831_1322198_+	3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377953.1|1322245_1323442_+	acetyl-CoA C-acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_027242965.1|1324010_1326443_+	acyl-CoA dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_036773041.1|1326764_1328264_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242964.1|1328372_1328945_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242963.1|1329259_1330729_+	type VI secretion system tip protein VgrG	NA	NA	NA	NA
WP_017377960.1|1330801_1331551_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876021.1|1331554_1332328_-	enoyl-CoA hydratase	NA	NA	NA	NA
WP_027242961.1|1332426_1333377_-	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_017377963.1|1333516_1334959_+	PLP-dependent aminotransferase family protein	A0A1X9I5H2	Streptococcus_phage	3.5e-20	24.2
WP_027242960.1|1335174_1336359_+	NAD(P)/FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_017377966.1|1336482_1337169_+	7-cyano-7-deazaguanine synthase QueC	A0A2H4J8Q7	uncultured_Caudovirales_phage	2.8e-28	36.0
WP_026063694.1|1337304_1337889_+	superoxide dismutase	NA	NA	NA	NA
WP_144420699.1|1337978_1338308_-	ribosome-associated translation inhibitor RaiA	NA	NA	NA	NA
WP_017377969.1|1338643_1338883_+	membrane protein insertion efficiency factor YidD	NA	NA	NA	NA
WP_155046686.1|1338976_1339123_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275334.1|1339897_1340191_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420698.1|1340339_1340501_-	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_017378162.1|1341015_1341555_-	porin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378161.1|1341893_1342538_-	porin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378160.1|1342871_1343522_-	porin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378159.1|1344045_1345098_+	efflux RND transporter periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_017378158.1|1345115_1348196_+	efflux RND transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_027242571.1|1348361_1348610_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036772663.1|1348675_1349551_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036772025.1|1350473_1350980_+	type VI secretion system contractile sheath small subunit	NA	NA	NA	NA
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WP_144420794.1|1351213_1351357_+	type VI secretion system contractile sheath large subunit	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_17

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17

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MDLTLISLFCVIDDFCQELLPQWNAILLEDTNKKRNKPSQMSTSEIMTIMIYFHKSNYRNFKMYYLHVIKGSRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
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MGKTHLFSLIQAYFRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
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MYKAFLQASSVRYSGLALSEVSPKPFSHDSVSRWLQSQQYRPRDIWHIVKDLINTEEPCLLVVDDTVLDKHRSKQIDLVHHQYSGNAHDVIAGIGLVNLVWYGLERQHSIPIDYRVYDKDTDGKTKNDHFRDMLKLGKNRGMTPSAVVFDAWYSSLNNLKAARDLHWNWVAGLKKNRKVNRNDTLEMLDFPDEGLKLHLRGYGWITVFRFVAKNGRTDYIGTNIEEPSRDQVEVIVKARWSIEVYHRELKQTCGIERCQARTGRAQRNHISLSIAAWVDKYKRKLNEKISLYQQDWDVIKVGISCSIQKILAAT
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MTTSPTSTLSFFERYHTIIDDVDAFLNTLATPLPLCLWSNDLRINSNDFAALLDGEHIHYQRIPWTSNGFRILNSTDNGAALELYRGSLPYSRGSLHAACIYPQASSARSHT
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MVELYRTHVILADVPCSCEGTSRKNPNVVQQLTIKKLHAQAKQQQAILRRAIQLCKPGGSILYSTCTYAPEENEAVLNAMLQEFNQDNHSHLRILPIHIPFLKTTPALTHWQGQEYHPEISSAVRIWPHHNNTGGFFIALMQKQVQTQARLKPPAKPITKVATTTSHLIQPQDQDQFLQALNLRFGISSQPLKQYHWWQYNQHIRLNSSAHSTDFNPIINAGLPLIHTHGHHPKVTSAGALFLGPFAQKNKVSLTTEQRELYLKRQAICLDQDQIKQLLPGAVFVGYKNHTIGLGHYRRLQSNNKEANNTQERHQLESLLPKRWSKTSALDQP
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MKINNSVTKLLNIEHPIISAPMGIIAGSMLANEVTQAGGLGMIGGGYCNKKSIGRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_027242912.1|1388715_1392018_-	DUF490 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376668.1|1392014_1393838_-	BamA/TamA family outer membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376669.1|1393877_1394276_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242911.1|1394384_1395401_-|tRNA	tRNA dihydrouridine(20/20a) synthase DusA	NA	NA	NA	NA
WP_027242910.1|1395835_1397290_+	efflux RND transporter periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_017376672.1|1397371_1400428_+	efflux RND transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_144420694.1|1400721_1400958_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081329473.1|1401818_1402238_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017376676.1|1402610_1403075_-	copper chaperone PCu(A)C	NA	NA	NA	NA
WP_075275332.1|1403147_1404149_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771585.1|1407041_1407374_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420693.1|1407735_1407879_-	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_048876152.1|1407866_1408811_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_080963606.1|1408814_1409201_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275328.1|1409022_1409361_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376273.1|1409735_1410335_-	NAD(P)H:quinone oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_017376274.1|1410334_1410682_-	arsenate reductase (glutaredoxin)	NA	NA	NA	NA
WP_026063520.1|1410832_1411816_+	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	1.3e-34	32.7
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WP_144420691.1|1413188_1413347_-	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_144420690.1|1413318_1414248_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	2.2e-60	44.9
WP_026063521.1|1415162_1415579_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051929528.1|1416707_1417424_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017376099.1|1418172_1418331_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420689.1|1418379_1418955_-	nitronate monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_075275424.1|1419099_1419378_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376100.1|1419442_1420318_-	ParA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876018.1|1420483_1424350_+	ATP-dependent RNA helicase HrpA	A0A1V0SBU4	Catovirus	1.6e-51	26.5
WP_017376104.1|1425363_1426185_-	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_017376105.1|1426384_1427617_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	8.9e-33	27.2
WP_017376106.1|1427787_1428513_-	UDP-2,3-diacylglucosamine diphosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_017376107.1|1428555_1430094_+|tRNA	glutamate--tRNA ligase	A0A2K9L594	Tupanvirus	2.6e-05	22.4
WP_017376108.1|1430100_1431486_+|tRNA	cysteine--tRNA ligase	A0A2K9L6B7	Tupanvirus	3.4e-49	29.7
WP_048876011.1|1431799_1432849_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_051929549.1|1433408_1433786_-|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_144420688.1|1433977_1434853_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017377787.1|1435834_1436062_+|transposase	transposase	A4JX31	Burkholderia_virus	8.1e-09	47.0
WP_048876149.1|1436114_1436633_-|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_146619432.1|1436888_1437080_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420793.1|1437488_1438262_+	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_048875984.1|1440931_1441468_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_18

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18

>NZ_CP039060|1460403:1509822|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_18

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MSANSNSKIDVIALTVSGQVEKKIRVECNSLATDHVTDDLASKTNQDRAWQIYSSSYERCMAEALDMMRQDLLAVSIQPELN

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_027243049.1|1473702_1474281_+	nucleoside deaminase	A0A0B5J096	Pandoravirus	2.3e-15	37.7
WP_065653751.1|1474308_1474773_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377206.1|1474809_1476267_-	hypothetical protein	A0A1C3NFI8	Phage_NCTB	4.3e-10	24.8
WP_027243048.1|1476328_1477816_-	type VI secretion system-associated FHA domain protein TagH	NA	NA	NA	NA
WP_017377202.1|1478585_1479188_-	short chain dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_017377201.1|1479749_1480220_+	DUF1289 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036772316.1|1481867_1482611_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275422.1|1482762_1483194_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243044.1|1485831_1487178_+	cation:dicarboxylase symporter family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_036772310.1|1487265_1489071_-	DEAD/DEAH box helicase	Q5GF26	Diachasmimorpha_longicaudata_entomopoxvirus	5.8e-57	34.9
WP_017378301.1|1489536_1490334_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378302.1|1490718_1491180_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|1491402_1492377_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_080963614.1|1492419_1492542_+|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017376833.1|1492613_1494569_-	transglycosylase SLT domain-containing protein	K4NWI2	Pseudomonas_phage	9.2e-16	39.7
WP_016212182.1|1494958_1495144_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376832.1|1495465_1496455_+	rhodanese-related sulfurtransferase	NA	NA	NA	NA
WP_027243043.1|1496867_1498493_+	SulP family inorganic anion transporter	A0A2H4J153	uncultured_Caudovirales_phage	3.9e-28	25.3
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WP_048876010.1|1499211_1500597_+	protein kinase family protein	A0A1M7XTW9	Cedratvirus	1.4e-05	27.7
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WP_017376828.1|1501129_1501588_-	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
WP_144420685.1|1501788_1501974_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376827.1|1502042_1502870_-	DsbA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420792.1|1503324_1503849_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420684.1|1504031_1504280_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243041.1|1504449_1505403_+	chemotaxis protein CheV	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|1505597_1506572_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
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Sequences of DBSCAN-SWA_19

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19

>NZ_CP039060|1518543:1578114|DBSCAN-SWA
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MKKKLLLLTLLPALLQGCHAFTEQKSIIKEKQEVTLVHSNLCLLNTCPTGYSPKDQIINHKIIILANNPKSKFADWVAYIIRPDYINGPSRKREWQQDPDLPENTTLPPSAYRGANALFNVDRGHQAPLGSFRGAENYYVTNYLSNITPQQSQLNQGPWNHLENAVRAYAKQYGPVYVITGPYYEKGQKPVKAFPNYSGTLMIPKGYFKVITTIKNNRIYASTFIMPQTATSKINYCDTTSSLEEVYKLTQGLTVLAKKPVGNLNKLLGCSQQN
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MTEGELKAGVTEYIEFYNNKRFHQTLDYKKPMDVYCNLQPQLLLEAA
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MHRRELNQAFDRSFALLIEEENCQHITDLLEQLCCDHHDLLIETKYDDVEVCFKYQAQENYIEMVVYQDKVLLEDYHIAIEKVCEKQKIEELHHMCHLIRKTLNDLPLHKNKPCLPD
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MQFRPNSNKHKDIILDLAPLIDVVLLVLIFLMVTATFIKVGGVQVNLPSTESASLNGPLQETLVISVDFKGDYYVNSDRVRGGRAALKQSLLKQAKYNKNRLVRIKGDTNAPLQIIVDIMELVQNAGFVKVQILTQVKRS
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MLGDFASLDVQNTYRGSDAYDLFQTGHAWWRYYSANKENIPRPCSRRCSAAKKKSPVTIISTPTLTPTVYMQRSSLPSPTNHAGVTHAEKGH
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MFTRQKKSLAKFAAESAGTVEAVEAFHREPVCELVFSVCDQEISQCIDLLYDAGHNIHNLKKYAPIEFRNYIYEEFLMRLESPAADVQRELAREVFMDYLETRLKFDMDIAREIIKMPG
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MYHFQIDNQINQFLNRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
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MCKIPTEVATLTYFLCRTHVFLGTLILLMPRGFPGRLFGLVTMLVPWVYALRPVTPDHAFVRVLDVGQGLAVIVKTHHHNLVYDVGNKTKSGFDLGQMVVVPNLYALGIQHIDKLVISHIDSDHSAGLASVLAAYPKTPIVSSSPLLPYTKIQACVAGDRWLWDGVTFEFLSPAYPFPYGRNNQSCVLKVSINEEGSSMLLTGDIEKRQEKKLLLQAPLSLKSDILFAPHHGSNSSSTSPFIKAVSPHTVIISAGRYNAYRLPHVKVLHRYQSQHIAILNTGQVGAIDFQLSGNKEPLFTFAGAGV
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MTQEQKIIIESTSQFDKVYKKLKANQVADFEEALEALIENPEIGEEKKGDLLGVRVYKFKMVKQQTLLAYYWEGKKLVLTLMKLGPHENFYRDLKKTTG

Homologous phage analysis in the prophage region

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1507394:1507453	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_017376807.1|1521508_1522252_+	YebC/PmpR family DNA-binding transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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WP_146619422.1|1522743_1522923_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243094.1|1522985_1523693_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420791.1|1524476_1525688_+	protein kinase	NA	NA	NA	NA
WP_017376801.1|1525743_1526568_-	hypothetical protein	X2KR27	Campylobacter_phage	6.2e-06	28.3
WP_017376798.1|1527755_1528391_-	LysE family translocator	NA	NA	NA	NA
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WP_027243095.1|1529305_1531591_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_027243099.1|1534712_1536026_+	DEAD/DEAH box helicase	Q5GF26	Diachasmimorpha_longicaudata_entomopoxvirus	7.7e-51	32.0
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WP_017376785.1|1539453_1540359_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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WP_027242578.1|1540821_1541358_-	DUF2062 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242577.1|1541375_1542677_+	ComEC/Rec2 family competence protein	NA	NA	NA	NA
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WP_144420680.1|1545413_1546334_+	DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2	NA	NA	NA	NA
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WP_048876007.1|1550800_1551775_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	2.1e-29	32.9
WP_047927346.1|1551922_1553794_-	protein-disulfide reductase DsbD	NA	NA	NA	NA
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WP_017378517.1|1554773_1555196_+	biopolymer transporter ExbD	NA	NA	NA	NA
WP_017378516.1|1555202_1556942_+	lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA	W8CYL7	Bacillus_phage	5.8e-54	31.2
WP_017378515.1|1556942_1558007_+	tetraacyldisaccharide 4'-kinase	NA	NA	NA	NA
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WP_017378514.1|1558476_1559445_+	ferrochelatase	NA	NA	NA	NA
WP_017378513.1|1559454_1559766_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211143.1|1559781_1560351_+|protease	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit	A0A223W000	Agrobacterium_phage	7.3e-30	39.5
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WP_036771639.1|1561983_1562958_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	5.6e-30	33.2
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WP_146619459.1|1564465_1566922_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036773893.1|1567124_1567976_+	DUF4402 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_047927336.1|1572536_1572782_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_065653736.1|1573145_1574174_+|integrase	site-specific integrase	NA	NA	NA	NA
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WP_144420676.1|1574792_1575749_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.8e-49	39.5
WP_047927838.1|1576041_1576287_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212018.1|1576283_1576583_+	type II toxin-antitoxin system RelE/ParE family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_036774927.1|1576805_1577276_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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1577819:1578429	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_20

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20

>NZ_CP039060|1583566:1626497|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017375995.1|1589540_1589954_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_21

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_22

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22

>NZ_CP039060|1785846:1836331|DBSCAN-SWA
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MVNIASYYAKELASAEDACVFLGCKTPELWLECALAHQETLLIDHAQCEKKAAATALSMINRYSDHTDMVMRMSKLAREELRHFEQVLVIMKKRGIQYSTLSASRYAEGLRQHIRTGRVECLVDTLIIGAFIEARSCERFAALVPLLDTELAKFYQGLLASEARHFLMYLHFAKKIAGESIDKHVERFREIECNLIGTGDEQFRFHSGVPRFFTKAGSLQQ

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_017376461.1|1787094_1787358_-	carbon storage regulator CsrA	A0A2I7RT00	Vibrio_phage	4.1e-12	68.6
WP_017376460.1|1787664_1790259_-|tRNA	alanine--tRNA ligase	A0A1V0SK38	Klosneuvirus	2.4e-88	41.3
WP_017376459.1|1790255_1790738_-	regulatory protein RecX	NA	NA	NA	NA
WP_017376458.1|1790715_1791756_-	recombinase RecA	A0A0S2MVG1	Bacillus_phage	5.8e-118	66.3
WP_017376457.1|1791930_1792416_-	CinA family protein	B5TK85	Pseudomonas_phage	8.0e-38	56.9
WP_017376456.1|1792523_1795094_+	DNA mismatch repair protein MutS	A0A1V0SJ67	Klosneuvirus	3.5e-31	23.0
WP_017376455.1|1795127_1795589_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036773947.1|1795925_1796801_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_017376451.1|1798932_1799598_-|tRNA	tRNA-(ms[2]io[6]A)-hydroxylase	NA	NA	NA	NA
WP_017376450.1|1799610_1801116_-	amidophosphoribosyltransferase	A0A0M3SGR2	Mollivirus	7.7e-87	40.4
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WP_017376447.1|1803190_1804063_-	acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_026063532.1|1804164_1804953_-|tRNA	tRNA pseudouridine(38-40) synthase TruA	NA	NA	NA	NA
WP_017376445.1|1805045_1806371_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376444.1|1806724_1807900_-	formate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_017376443.1|1808068_1808722_-	glutaredoxin 2	NA	NA	NA	NA
WP_017376442.1|1808877_1810818_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	1.8e-72	33.0
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WP_036773116.1|1811602_1812577_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.6e-29	32.9
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WP_053856767.1|1813465_1814869_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_087910640.1|1814936_1815353_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875986.1|1815760_1816258_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771639.1|1816254_1817229_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	5.6e-30	33.2
WP_155046598.1|1817308_1817878_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875984.1|1818022_1818559_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017375549.1|1818563_1818860_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875983.1|1818868_1819474_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	6.3e-48	49.5
WP_017378212.1|1819659_1820058_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420662.1|1820248_1820452_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046599.1|1820596_1820752_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378213.1|1820876_1821329_-	CBS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378214.1|1821445_1822918_-	catalase	A0A2K9L572	Tupanvirus	3.3e-98	46.5
WP_016211840.1|1823356_1823821_-	DNA starvation/stationary phase protection protein	A0A0A7RTZ1	Clostridium_phage	4.7e-19	32.9
WP_144420785.1|1824509_1825760_-	AMIN domain-containing protein	A0A067ZJB6	Vibrio_phage	1.7e-15	27.4
WP_017378219.1|1825869_1826340_-|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex ATPase subunit type 1 TsaE	NA	NA	NA	NA
WP_047927040.1|1826362_1826956_-	oligoribonuclease	A0A1B3B0T8	Gordonia_phage	1.2e-14	29.6
WP_027242798.1|1827093_1828143_+	small ribosomal subunit biogenesis GTPase RsgA	NA	NA	NA	NA
WP_017378221.1|1828166_1829090_+	phosphatidylserine decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016211418.1|1829106_1829568_+	YaiI/YqxD family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378223.1|1829675_1830494_+	sulfite exporter TauE/SafE family protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046600.1|1831103_1831247_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378228.1|1835410_1836331_-|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase MiaA	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_23

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23

>NZ_CP039060|1898564:1913880|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_24

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24

>NZ_CP039060|1942553:1991425|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_24

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MKFSLTQTAAHTIKSDCLVVAIFEGKELSETATAIDQATDGLISRFIARGDINGKSGQSLLIPEVSAITAERILLIGAGKKDKLTDLHFKTLHTKAMTKLKELTLNQVTFSTLELAICNNNAADKLSLAMQAIDASYYRVDGLKSQPKEQHIPDEFSFIGHASEADLSNANALLAGIHLTKDLANAPGNICTPSHFAKTAQELAQQYTRITTQIIDEEEGRDIGLNSFLAVGQGSEEPSKFIIMQYQGADNKDEAPIGFIGKGISFDSGGISIKPGEGMEGMKYDMCGAASVFGVFKAAAQMNLKKNLVGIIVAAENMPDGKALKPGDILTSYSGQTIEVINTDAEGRLALCDGLSYIEKFKPHAVIDIATLTGACVVALGEHNTGLMSNDDTFAKTLLQAGKEAADKAWQLPLDEEYQEQIDSPFADMANIGGRAAGTITAACFLSRFAKNYTWAHLDIAGSAGGVFDKKKGATARPVPLLMRYLSALT
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MKKLFAILALLAVSSASFAADAPAAGATSSLMSFLPLVVIVIIFYFLLIRPQSKRAKEHRKLLSELAKGDEVSTSGGVLGKVTKVDESVVTIEIASDVEIQVQKSAVSAVLPKGTIK
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MDSTTLYKIRRVSFVIQCLCWLIIITLPIPYIIYWLYNGTWAEQPASALSVSTIIELGYPLRSLIFATSFLPVTTYIFACYQLIRIFRNYAVGQIFVLDNVRHYRHLGLAALIWAILTPLSKSLLSILTTYMNPPGYRFFNLQFNDGTIIALFIGLILIVISWVMREACQLKQQQELTI
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MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
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MHIDAFDFELPEHLIAQYPQTERRASRLLHVNRQGQCLHRGFSEIIDLLNPSDVLVLNNTEVIAARLYGKKLTGGKIEILVERLISEYEVLAHVKASKAPQAGTQIILSEVGAEVMVLGRDESLFRLKFNQAVLPLLARIGHMPLPPYMVRPDEETDRTRYQTVYARHPGAVAAPTAGLHFDDELLAEIKGKGVEIAFVTLHVGAGTFQPVRVENIQDHVMHAEWLQVSDDVVAKVNQAQRSGGRVIAVGSTSLRSLETAAAQAEEELKAFEGESRLFITPGFNFKVVDCMITNFHLPKSTLMMLVSAFAGYDEIMTAYYLAIEEKYRFFSYGDAMFLEKKEPMKV
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MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVTHGQVTLPTLELLKAGCILRSLLIYTLEK
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MILRRYLAKQCLSMTLLILFALVALDFFFGLIGNLDGNSFIQALVFMLWRLPEDMNQLIPISGLLGSLLALGQMSRNSELVVMRVAGFSMLKIARAVAGAGFLLAIVLFFNMTLIAPWANQQLRSLNHTGKSNQATLTQVWLRSDHGLVNIQAFWPNGVLTGVSRYEFKEGKLDRIELAQKVRYQNNQWHAGDIKTVDISDKKVTYNSTQSALWQSLMAPKLLTLVATPADELNVVGLWRNIIYRVQNSLNSNQYEFVLWQSIFTPVSAILMMLLAVPFIFGAGRNSSLGFKMMLGILVGFGFFIVNQFVGSLSSLIQLSPLLAASFPSILCILLFVYGVQRLG
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MTTAQVNYFDEVVYLFQGGGAMGAFQVGVYEALMEEMYSPDWIVGISIGAINASLIAGNPPGEGIAKLEEFWSRITRRHYPLPVTDYFGIRKLYNYWSAQTTLLFGQPNFFEPHWLSPLLLTPKTPDLISFYSTLPLKQTLIDLIDFDYLNRAYMRLSIGAVDLETGEQVFFDNTKHTLTPEHIMASCALPPGFPAIKIDGHYYWDGGLYSNTPILAVTNEPEHKNRLCFLVNLFNPKGVPPHSLDGVQERAKDIEYASHLRTIIEQYDSKQYLQGIIAQLAEHIPEEIKHKENLQELLKYGDSHKLHVAQINYKSKQGTELHSKDYEFSELSADDHRSQGYKNALALVKNPDWFYEQHIESKTVVHKLDDQDHPHQ

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_144420657.1|1942553_1943615_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_144420656.1|1944326_1944488_+	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_017376418.1|1945404_1945944_+	DUF2975 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376419.1|1946326_1946743_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376420.1|1946838_1947654_+	exodeoxyribonuclease III	NA	NA	NA	NA
WP_017376421.1|1947786_1949280_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420655.1|1949465_1949891_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376423.1|1949887_1951948_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376424.1|1952231_1953047_+	septum site-determining protein MinC	NA	NA	NA	NA
WP_017376425.1|1953147_1953966_+	septum site-determining protein MinD	NA	NA	NA	NA
WP_027242802.1|1953962_1954331_+	cell division topological specificity factor MinE	NA	NA	NA	NA
WP_075275409.1|1954512_1955340_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017375910.1|1955403_1956132_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
WP_017375910.1|1956534_1957263_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
WP_017376428.1|1957652_1958378_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875975.1|1958412_1962285_-	tandem-95 repeat protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376430.1|1962485_1963619_+	patatin-like phospholipase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_026063530.1|1963632_1963821_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376433.1|1964044_1965403_+	MFS transporter	Q6JIH2	Burkholderia_virus	3.9e-37	26.0
WP_036773947.1|1967009_1967885_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_048875973.1|1968396_1969032_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_080999981.1|1969044_1969518_-|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	2.9e-32	48.0
WP_155046603.1|1969445_1969598_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051929627.1|1969791_1970142_-|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017376231.1|1970201_1970489_-|transposase	IS3 family transposase	A9YX41	Burkholderia_phage	2.2e-06	37.2
WP_144420654.1|1970541_1971321_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017376415.1|1971745_1972663_-	TIGR01777 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376414.1|1972714_1973470_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242801.1|1973537_1974812_-|tRNA	serine--tRNA ligase	A0A1B1IVT2	uncultured_Mediterranean_phage	1.7e-90	50.9
WP_017376412.1|1974932_1975610_-	M15 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_017376411.1|1975810_1977235_+	aminodeoxychorismate synthase component I	A0A0B5J984	Pandoravirus	3.9e-40	33.4
WP_016209938.1|1977209_1977848_+	transglycosylase SLT domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376410.1|1978210_1978489_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376409.1|1978722_1979667_-	protein translocase subunit SecF	A0A1B1IVP7	uncultured_Mediterranean_phage	2.4e-38	35.2
WP_017376408.1|1979688_1981557_-	protein translocase subunit SecD	NA	NA	NA	NA
WP_017376407.1|1981577_1981931_-	preprotein translocase subunit YajC	A0A1B1IVR5	uncultured_Mediterranean_phage	1.1e-07	46.5
WP_026063528.1|1981969_1983085_-|tRNA	tRNA guanosine(34) transglycosylase Tgt	A0A1B1IVQ4	uncultured_Mediterranean_phage	2.2e-94	49.2
WP_017376405.1|1983269_1984310_-|tRNA	tRNA preQ1(34) S-adenosylmethionine ribosyltransferase-isomerase QueA	NA	NA	NA	NA
WP_027242800.1|1984312_1985347_-	LPS export ABC transporter permease LptG	NA	NA	NA	NA
WP_017376402.1|1985343_1986405_-	LPS export ABC transporter permease LptF	NA	NA	NA	NA
WP_017376401.1|1986516_1987989_+	leucyl aminopeptidase	Q6GYZ8	Mycoplasma_phage	1.8e-43	30.2
WP_017376400.1|1988141_1988585_+	DNA polymerase III subunit chi	NA	NA	NA	NA
WP_017376399.1|1988653_1991425_+|tRNA	valine--tRNA ligase	A0A1V0SK04	Klosneuvirus	6.9e-150	39.4

Sequences of DBSCAN-SWA_25

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25

>NZ_CP039060|1995856:2044723|DBSCAN-SWA
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MKYFIKAPEYYQSIFSSLWIDEDLYLVIADDGIQDVLCQVNELIKLKEYRLAYENIESKLSIIINNKLTDFEKSVYYYYHSICLFLIDSYDKANQAIREAIKFHNEISYYYHNAAILTFKIKKYDEVILLLEKSRSSAIPFYLSSAYLAVIYSFEKLWSKSMICAQEAKQHHIESKNLVELCLITSSFKHCNKVQGDIDFNSFYHSDVDIENLYRKFPVVNFYDNMSDSNNSICIFFACDAVYFLNYCIYSIFSINDQKVSTNVHVHLFNVDCKADDRISELINIIKKLSYIRCSYSFERVNYSDYQIDCPLYTSSMRFCRAYQYMMAYKRPVLIVDCDSLFKAPLDTIICDIHTFIAVLGDEYAPEWEKLAAGVVYLEYNLVAENYLKQVSYFIMNNILLGKGIWFLDQLALKFAYEITLKDKKSNYQRLDSALFCDLAYTDSSYIWMVTTKKEEQVLFNRFKDSLKKKYFNTLDV
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MQLATVVSHSDLFIIGGGINGTGIAADAAGRGLTVTLCEQADLASATSSASSKLIHGGLRYLEHYEFSLVRKALAEREILLRKAPHIIRPLQFILPHQKHLRPAWLIRIGLFLYDHLAKRKFLPRSRAYNLNTTLFGKNLKSKLKRGFSYYDCHVDDSRLVVLNALSAKEQGATILTRSKCIFAKRHNNMLWYVKVQDQQTQIIKEYTAKALINASGPWASTILPNLTHAPTQYHLSLVKGSHIVIPKLYEGEHAYILQNTDNRIVFTIPYEQNFTLIGTTDLNYEDDPAQVKINNEEIDYLINLVNNYFEPGMQKADILWNYSGVRPLLNDESDTPSAITRDYKIIVDDQHGLPLVNIFGGKITTYRTLAEQTLEKLQPYFPAMTAPWTANDYLPGGDLGTKTFDKFYQRLQDQYPWLPKQLTLRLARSYGARIHCILRKCTSTTDLGQHFGNTLYEKEVKYLIEHEWAKTADDILWRRSKLGLHLTAEQQKQLSAWLSHYLNQQENNLK

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_036771332.1|2000968_2001943_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	7.3e-30	33.2
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WP_017377436.1|2004137_2004656_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242883.1|2005623_2007108_-	glycerol kinase GlpK	NA	NA	NA	NA
WP_017377433.1|2007232_2008768_+	glycerol-3-phosphate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_017377432.1|2008790_2009120_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080963636.1|2009016_2009232_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_087910639.1|2011215_2012415_+	PLD-like domain protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017377427.1|2013600_2014179_-	cysteine hydrolase	NA	NA	NA	NA
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WP_017377424.1|2015229_2016213_-	UDP-glucose 4-epimerase GalE	A0A2K9L5H6	Tupanvirus	6.2e-53	38.4
WP_080963565.1|2016606_2017104_+	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_026063633.1|2017248_2017524_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377423.1|2017675_2019358_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	2.1e-24	32.0
WP_017377422.1|2019365_2020388_-	YHYH protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377421.1|2020556_2021558_+	D-alanine--D-alanine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_017377420.1|2021671_2022010_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377419.1|2022485_2023745_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375625.1|2023953_2024181_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420653.1|2024209_2024428_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_036772810.1|2024998_2025241_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242887.1|2025255_2025591_-	flagellar protein FliT	NA	NA	NA	NA
WP_017377418.1|2025595_2026033_-	flagellar export chaperone FliS	NA	NA	NA	NA
WP_036772812.1|2026058_2027444_-	flagellar filament capping protein FliD	NA	NA	NA	NA
WP_036772815.1|2027554_2027986_-	flaG family protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420782.1|2028091_2029603_-	B-type flagellin	NA	NA	NA	NA
WP_017377414.1|2029893_2031486_-	flagellin	NA	NA	NA	NA
WP_027242888.1|2031686_2033882_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036772819.1|2033975_2035409_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_047927084.1|2035451_2035967_-	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_036772822.1|2035966_2036914_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242892.1|2036897_2037563_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242893.1|2037559_2038288_-	class I SAM-dependent methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_047927085.1|2038277_2039024_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080963566.1|2039007_2040072_-	DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377789.1|2040276_2041464_+	multidrug effflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_017377788.1|2041520_2042639_-	hypothetical protein	A0A1V0SIK8	Klosneuvirus	1.0e-11	29.3
WP_047927086.1|2043086_2043344_-|transposase	transposase	A4JX31	Burkholderia_virus	4.1e-09	47.8
WP_144420652.1|2043623_2044301_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	2.6e-34	38.8
WP_017375591.1|2044519_2044723_-|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_26

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26

>NZ_CP039060|2064423:2113958|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_26

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MSSVGACVDNAVVERFFGSLKHEWLLNVIHLTRDTMKEDVEAYIRYYNHDRLHTANGNLSPINFEKSQLKVSNMT

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017378005.1|2091739_2092459_+	sulfate transporter CysZ	NA	NA	NA	NA
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WP_017377869.1|2110634_2112344_+|tRNA	proline--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
WP_017377870.1|2112513_2112876_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875960.1|2112983_2113958_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9

Sequences of DBSCAN-SWA_27

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27

>NZ_CP039060|2128527:2188080|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_27

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_28

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_29

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29

>NZ_CP039060|2268214:2329182|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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2326488:2327248	attR	NA	NA	NA	NA
WP_048875933.1|2328237_2329182_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_30

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30

>NZ_CP039060|2350024:2377677|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017377304.1|2352125_2353430_-	trigger factor	NA	NA	NA	NA
WP_017377303.1|2354030_2354906_+	bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase FolD	A0A249XZQ2	Enterococcus_phage	9.8e-34	39.7
WP_075275279.1|2355021_2355693_-	M48 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_017377301.1|2355872_2357228_-	O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase/cysteine synthase	NA	NA	NA	NA
WP_017377300.1|2357348_2358086_-	SDR family oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_144420629.1|2358164_2358881_-	aldolase	NA	NA	NA	NA
WP_036771756.1|2359529_2360804_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209646.1|2360834_2361410_+	VOC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377295.1|2361454_2362420_-	aldo/keto reductase	A0A2H4PQR8	Staphylococcus_phage	1.8e-44	38.1
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WP_080999973.1|2367627_2368593_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	2.0e-48	38.6
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Sequences of DBSCAN-SWA_31

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31

>NZ_CP039060|2416724:2488664|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_036773116.1|2485624_2486599_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.6e-29	32.9
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WP_036773116.1|2487689_2488664_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.6e-29	32.9

Sequences of DBSCAN-SWA_32

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_32

>NZ_CP039060|2499396:2544188|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP039060|2499396:2544188|2541263_2541491_-|WP_017377787.1|transposase|DBSCAN-SWA
MSSVGACVDNAVVERFFGSLKHEWLLNVIHLTRDTMKEDVEAYIRYYNHDRLHTANGNLSPINFEKSQLKVSNMT

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_017376308.1|2499804_2501265_+|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatA	NA	NA	NA	NA
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WP_036771325.1|2502905_2503880_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
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WP_017377787.1|2507989_2508217_-|transposase	transposase	A4JX31	Burkholderia_virus	8.1e-09	47.0
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WP_048875919.1|2509400_2509718_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_027242901.1|2509744_2510434_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377709.1|2510774_2510978_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420768.1|2511109_2512045_+	EamA family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_047927332.1|2512057_2512840_-	lipoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_017377712.1|2512969_2513281_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242900.1|2513624_2513951_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377714.1|2513975_2514431_-	arginine repressor	NA	NA	NA	NA
WP_017377715.1|2514420_2515473_-	2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein	M4QRZ2	Synechococcus_phage	3.1e-10	41.1
WP_017377716.1|2515475_2516939_-	4-hydroxy-3-polyprenylbenzoate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_017377787.1|2517073_2517301_-|transposase	transposase	A4JX31	Burkholderia_virus	8.1e-09	47.0
WP_017377718.1|2518717_2519182_-	DUF4402 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036773913.1|2519438_2520254_+	transporter substrate-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377721.1|2520382_2522695_+	RNA-binding transcriptional accessory protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377722.1|2522811_2523339_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377723.1|2524030_2525308_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377724.1|2525318_2525570_-	YfhL family 4Fe-4S dicluster ferredoxin	A0A1B1IWY9	uncultured_Mediterranean_phage	3.9e-20	57.6
WP_017377725.1|2525603_2526125_-	pantetheine-phosphate adenylyltransferase	A0A1B1IVQ3	uncultured_Mediterranean_phage	1.8e-27	43.8
WP_017377726.1|2526294_2527281_-	transaldolase	V5UTB0	Synechococcus_phage	1.3e-13	33.5
WP_017377727.1|2527371_2528187_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036773915.1|2528615_2529011_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377787.1|2528983_2529211_-|transposase	transposase	A4JX31	Burkholderia_virus	8.1e-09	47.0
WP_047927746.1|2530179_2530767_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046614.1|2531369_2532041_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875918.1|2532185_2532767_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_027243185.1|2533765_2534722_+	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	6.3e-34	31.6
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Sequences of DBSCAN-SWA_33

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_33

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MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFRSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSQRKYDFRKGRKLGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP
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MNQQQGELELLLHSQVTDYASEWMSGYDAAQNEQLEADNPNDPDQETTAFNAWTEGWWAGFYNEPPLYQKNAPVDNVAAARSQAANENSLQSNKSNNDNNSEEHQEKGFEKVLLGVGVAFACVVCYELVVTMVA

Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_34

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_34

>NZ_CP039060|2614617:2733078|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017377818.1|2630798_2631443_-	porin family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017377815.1|2635794_2637333_-|tRNA	lysine--tRNA ligase	A0A1V0SAC0	Catovirus	3.5e-87	36.5
WP_144420614.1|2637485_2638584_-	peptide chain release factor 2	A0A0S4KWG0	Pseudomonas_phage	1.1e-05	43.1
WP_036773165.1|2638822_2640022_+	Bcr/CflA family efflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_027243005.1|2640052_2640679_+	ribonuclease T	NA	NA	NA	NA
WP_017377811.1|2640707_2641592_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017377799.1|2652148_2652808_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377798.1|2652908_2653559_+	isoprenoid biosynthesis glyoxalase ElbB	NA	NA	NA	NA
WP_075275388.1|2653706_2654396_+	transporter substrate-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377795.1|2654418_2655582_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377794.1|2655786_2656038_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_146619442.1|2656561_2657224_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771639.1|2657357_2658332_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	5.6e-30	33.2
WP_017376009.1|2659686_2659977_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376008.1|2660299_2661337_-	fructose-bisphosphate aldolase class II	NA	NA	NA	NA
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WP_017376003.1|2667620_2668781_+	methionine adenosyltransferase	A0A2H4PQS6	Staphylococcus_phage	2.8e-121	58.7
WP_017376001.1|2669017_2670133_+	DSD1 family PLP-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_017376000.1|2670295_2670820_+	inorganic diphosphatase	A0A2H4J8U1	uncultured_Caudovirales_phage	1.5e-50	58.4
WP_017375999.1|2670819_2671350_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875904.1|2673009_2673885_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_144420759.1|2674005_2674506_-	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_017376501.1|2674502_2674769_-	DUF1778 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_35

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_35

>NZ_CP039060|2770856:2823885|DBSCAN-SWA
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MKFKVYRYNPDVDKAPYMQEYNLDIPKGSDMMVLDALECLKEEDQTIAIRRSCREGVCGSDGMNINGKNRLACVTHLSELKGPIVIRPLPGLPVIRDLVVDMTPFYKQYERVKPYLTPAGEVPAKERLQSPKEREKLDGLYECILCACCSTSCPSFWWNPDKFVGPAGLLQAYRFLIDSREGHVDERLAGLEDQFSLFRCRGIMNCVDVCPKGLNPTKAIGHIRSMMLKKAV
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MMSESDNKLDIEKFLALTEGVTSAVIAEMKQHGLVSMTEDPNMIATLMASSLGMLIGSTTQHTKGSRDQILNSVDRLINEAINTADTIYKED
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MISNLFKNIKIISFVRARGLRLQFYLALVFALTAVLFVFGVLNFNSYKAALHQQLEEEVVATAERLSKSIAGPMWNADELQVLSLLKAEMLSKHIAGVVIYPTHHPMIGFYKQHGQVQSMPKQIKMLESFAVRNIMYKDHKKDYTLGKLYIYIDEQLVLDELDDYLLSNIMQIIILNAILLLCIAFLLNHIIIDPLEKIKSAIGTLSDGEGDLSQRVNVQGFSPEIAALGDDFNRFAYKVGQMIKTVASDADKMTEETGQIAKANFNIDAQVDSQASSLQLVSHAISDIEDLNQAIEDIVSYAAQCSTESSIAAGRGGEIVRRNMVNMNSISLAVHHSAASLEKLAALGDSITDIIEVIGSITRQTDLLALNAAIEAARAGPKGRGFAVVAEEVRKLAIETEEATREVAPVLEAINNEVQQTTCAMHEGVGWVLQGVEEVAEAGEILDLIIDSAYEVNAATQQVFDATVLQNDKTIAVSQSMLSSLSGVESLKKNTNQASESAVVLKVKSAQLIKAISAFKISN
>NZ_CP039060|2770856:2823885|2774134_2775010_-|WP_017378341.1|DBSCAN-SWA
MSVLLNKNTKVICQGFTGKQGTFHSEQAIEYGTNMVGGVTPGKGGETHLGLPVFNTVAEAVEKTGAEASVIYVPAPFCKDAILEAADAGIQLIVCITEGIPVLDMLDAKEYIEKNTSARLIGPNCPGVITPGESKIGIMPGHIHLPGKVGIVSRSGTLTYEAVKQTTDLGFGQSTCVGIGGDPIPGSTFIDILEMFEKDPQTEAIIMVGEIGGTAEEEAAEFIKHHVTKPVVSYIAGVTAPAGKRMGHAGAIISGGKGTAAEKFAALEAAGVRTVKAPTQLGQAIKEVTGW

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_017378343.1|2771987_2773562_-	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	9.4e-11	21.3
WP_017378342.1|2773786_2774065_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378341.1|2774134_2775010_-	succinate--CoA ligase subunit alpha	NA	NA	NA	NA
WP_016210208.1|2775019_2776180_-	ADP-forming succinate--CoA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_017378340.1|2776294_2777443_-	dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_017378339.1|2777453_2780255_-	2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component	NA	NA	NA	NA
WP_017378338.1|2780361_2781060_-	succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit	NA	NA	NA	NA
WP_017378337.1|2781072_2782836_-	succinate dehydrogenase flavoprotein subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016210223.1|2782839_2783187_-	succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378336.1|2783180_2783555_-	succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit	NA	NA	NA	NA
WP_017378335.1|2784502_2785786_+	citrate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_017378334.1|2786195_2787491_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_017378333.1|2787846_2788392_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046622.1|2788985_2789501_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420607.1|2789512_2790892_-	flagellar hook-length control protein FliK	NA	NA	NA	NA
WP_017378329.1|2791127_2791562_-	flagellar export protein FliJ	NA	NA	NA	NA
WP_017378328.1|2791558_2792911_-	flagellar protein export ATPase FliI	NA	NA	NA	NA
WP_027242734.1|2792910_2794026_-	flagellar assembly protein FliH	NA	NA	NA	NA
WP_017378326.1|2794026_2795043_-	flagellar motor switch protein FliG	NA	NA	NA	NA
WP_017378325.1|2795032_2796703_-	flagellar basal body M-ring protein FliF	NA	NA	NA	NA
WP_017378324.1|2796722_2797058_-	flagellar hook-basal body complex protein FliE	NA	NA	NA	NA
WP_036772382.1|2797085_2798525_-	sigma-54-dependent Fis family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_047927447.1|2798521_2799568_-	PAS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378320.1|2799710_2801207_-	sigma-54-dependent Fis family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_017378319.1|2801502_2802504_+	glucokinase	NA	NA	NA	NA
WP_080963617.1|2802609_2803221_-	penicillin-binding protein activator LpoB	NA	NA	NA	NA
WP_144420755.1|2803341_2803719_-	DUF1425 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242736.1|2803769_2805176_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378315.1|2805169_2806237_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378314.1|2806343_2807945_-	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_027242737.1|2808193_2809111_+	transporter substrate-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242738.1|2809179_2810874_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	5.3e-20	29.3
WP_017378310.1|2811108_2812038_+	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_048876031.1|2812068_2813472_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017378308.1|2813702_2814407_+	CoA transferase subunit A	NA	NA	NA	NA
WP_017378307.1|2814473_2815130_+	CoA transferase subunit B	NA	NA	NA	NA
WP_036774478.1|2815140_2816022_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242739.1|2816192_2818862_+	aminopeptidase N	A0A0P0IY26	Acinetobacter_phage	5.5e-19	24.5
WP_036771639.1|2819222_2820197_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	5.6e-30	33.2
WP_036771744.1|2820276_2821248_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|2821301_2822276_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_036772729.1|2822395_2822617_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420754.1|2822680_2822989_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036772743.1|2822913_2823885_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_36

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_36

>NZ_CP039060|2838451:2892712|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_36

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MLSTPWLAANVAKLENLPLEKIKESTPQVNSITQSIKQSLLSIIYQKTKPPKEMYKLMALP
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MVIYQVNLNIDANIFNEYKAWLIPHMQEMLSFPGFLQADLCDDIETDININNEIALRHLKCNTQ
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MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRAKAKQGQAFQQISEEAKMLIHQRLKTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA
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MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEESLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFRSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDQYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSQRKYDFRKGRKLGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP
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MSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_053856767.1|2864078_2865482_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_017375939.1|2866092_2867520_-	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
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WP_027243188.1|2872420_2872966_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017376551.1|2875962_2876454_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243039.1|2877126_2878014_-	N-acetylneuraminate lyase	NA	NA	NA	NA
WP_027243038.1|2878103_2879594_-	sodium:solute symporter	A0A219Y9P9	Aeromonas_phage	8.0e-20	23.8
WP_017376549.1|2879617_2880499_-	ROK family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376548.1|2880495_2881218_-	putative N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase	NA	NA	NA	NA
WP_017376547.1|2881917_2882709_-	3-hydroxybutyrate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210862.1|2882895_2883141_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420598.1|2883292_2883523_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376543.1|2883552_2884332_-	TatD family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_047927468.1|2884357_2884663_-	pilus assembly protein PilZ	NA	NA	NA	NA
WP_144420752.1|2884659_2885553_-	DNA polymerase III subunit delta'	S5WKH4	Pseudomonas_phage	2.3e-14	33.8
WP_027243035.1|2885908_2887207_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_080999962.1|2891284_2892712_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_37

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_37

>NZ_CP039060|2900298:2949879|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_37

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_38

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_38

>NZ_CP039060|3077561:3143098|DBSCAN-SWA
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MKLIAILLFVFIGVTESYSQVRLDISVVSSYLNESLPENTTVRFTQVHGGAGIDFSQLVEVTNFVNIGYKVGYTFYGKLNIEGVDHVDNVFNDYLSSQAMHFIAIVHYRLNKNIRVEFGGGVAYQWNKITVSQPIIINSQSVTFPDQAGNYSSFRPITEIGGYYRFKKGLSAGLSYRHIFGDKIAGPGFTGGSVGIDSVAVTLRYRF
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MIYPVILSGGSGSRLWPLSRALYPKQLLPIATERTMLQDTVSRLTEKTLFASPTIICNHEHRFIVAEQLREQHITNSKVILEPCGRNTAPAAVIAALSVLETDPEGDVLLLPSDHLIKKQEHFIQAIQAAQQAAEDEQLVTFGIKPSHPETGYGYIQAGHALNQSQHAFKANRFVEKPDIKTAEKYLASGDYSWNSGIFFFKAKTLINIAKDLIPHTLTQCELALINSTKDLDFYRLNEKEFAQCEDVSIDYAIMEKATNTVVIPVDLGWSDVGSWSALWQVSKKDSQGNYIQGDIINQGSKNCYLRSDGPLIASVGINNLIVVATEDAVLIADKDDTQNVKKIVEQLKQDKRYEHRHHTKIYRPWGWVQSLDQGLGFEIKRLSIKPGQTLSKQRHMHRSEHWVVLAGTARITKGTEEAILLEPNQSAYIPIGEIHQLENPGKIDLEIIEVRSGSYLNEDDIERFY
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MKQLLVTGGAGFIGCNFVRYMLKTYNHVNIINVDKLTYAGSLNNLKNLPDESRHIFVQGDICDRLFIDQLLREHNIDTIVHFAAESHVDNSIKNPKLFIETNINGTFTLLEAARQFWLEEKQWLNKGDCRFHHVSTDEVYGTLSKGAPAFTETTAYAPNSPYSASKAGSDHLVRAYFHTYGLPVTISNCSNNYGPYQHREKLIPTVIHLCLAEKKIPIYGNGSNIRDWLYVEDHCSVIDKILHNGRLGEVYNIGANNEVDNLTLVKQVCQILDKKQPRKNGSSYQELITFVTDRAGHDWRYAIDNRKIKNELNWQPVYSLQGALDLLINEKIQDI
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MGFAMLLQERIGHIKSEILWIKNVDNVLMEVQDYKDWLLNQGYEIIGTEPLQARLNREGRSYVEVIVRKVK
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MKNTLGSILIIAGTAIGGGMLALPLASAGPGFSASITLLAMIWLGLLASAFVLLEAVLAFPKGTNFSTIARLTLGLPGQIAMWISMLMLLYALDAAYISGGSSLIVAALSQAFNLPISAHLSACLFLLILGSIVWYSTRAVDRVNSILFSLKGVAFILLLSLFAPHVNLTQLLDSGNSHYLLYAIPIFFTSFGFHPVIPTIASYNDLDPKRCRRIILIGGSLPIIIYLVWEISTLGIIPRTGDNSFHSILNQQGSVGEMMIAFHHILNNKLITLTANAFSDIAVTTSFLGVSLALFDFIADATKRPNTIKGRSQTAFMAFLPPLAFALFYPNGFILALSNAAIVFAITLAVPVLSAWRLRITGKTGAYKVAGGYILFTSLLIYYLVICIIQICSDCGMLAQFGH
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MTQTTLLTNSNKALMLTPGSNLDTFIHNVNQVPMLSPEEELALAQEYHEHQNIEAARRLVMAHLRFVVKIARGYAGYGLAQADLIQEGNIGLMKAVKRFDPSVGVRLVSFAVHWIKAEIHEFIIRNWRIVKVATTKAQRKLFFSLRSQKKRLGWFNQAEVESVAADLGVPAKTVVEMEARLSAHDAVIAPTSPEEGESTGAAQPSYLEDTNAMNNPALALEHDNWQSNQENKLLQAISILDERSRDILQQRWLNEENKATLHELAAKYQVSAERVRQLEKSALKKLRKSMTE
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MIKNILYMLISNFVKLASTAVIFFILARVWGVEAFGQFTYCFAMIAIVQVILDYGFNLQVVKDISEDKKKAIDIIQKSLTVKHIITFTVYIFSWLMLVFYNKSSSFNFLYLLLLISVTLNSYANYFLYPSQAEEEFKVVSLVMLAYNISFVVIIGLALLFGYRTLTDIAAVFALARLVPFLICVCLIKKHYPAVQLLALRTKGSWQYFKKSLSYGILVFFGMAYFQMDTLFINHFLGAREVGLYQAGVRILVASAFIVDVFNSVYLPKTISLKNNINKLIEYQSKTTHYFSLISLAVVSVCVLFPKIITMILYGKEYIELANYLPLFSLLITLRYIGSSYGLLVTVFDAQRLRCLLVGGALLVNVLLSIILIPRCFLYGGLLAALMTLIFLNFGYFMFSLYRVKSIYLKADTLLVLTALMASVFAFYFGLGGWLVALSLFLGWVAAIRKKDILFISRRLSLI
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MTSFKLLLKSLLFCLIMILLIIVSYFYIDRNLAIWINQHVLANVFFNLSIKIPIIFYLFSGVSLITLAFLSMIRPLKAWEKTLIVAAVSQYCAMGLKVGMKYFFGRYTPGVYFSEHLYGFNFFHDGMKYYSFPSGHTTAIVSYLAVIWMRHNRMLKGLVAVLSCCVGISLIALNMHYLSDVLAAIMLGIMMAIFSNQLFFNQTKYFC
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MTCDNITPLGYVFMPHHIALWRARGVEANYQGQLKMLRNIPATDSQHRNKQQCNQRKSNI
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MILVDHFLVAMPHVEDPNFSQSVIYICEHSEKGAMGIMINKPIGLTLGELLNYVDISCKSPKDSQLEVVAGGPIQQESGFILHPTEEVWQTTLHINEHVAVTSSRDILEAIALGQGPQHILPALGYCSWGAGELEQGIFDNLWLCVPAVTQLIFDSPFQERWQAAASLIGVNLYQISSDVGRA
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MEDYQCLIFDLDDTLYNFSYAQSIALEKLYARYFGDVCRYDDFKERYQAINRSYWQQVEAGVIRAGQLSVLRFTELKECFKTTALVKDLVEFYHHESCTLPAWCQGAEQALPLLTKQFSCALLSNGTRRDQLAKLQALGLMDDFYPVIFSDELGVSKPNSDIFQPILNTLNVQPKDCLLIGDSLTSDYQAALNIGMDFCWFNEKKVKYSGELSPKIEINSLMELVRYLRMAQATVDDERLQSK
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MDAIMARESEYEPVDWLGIETFSRKGGRSKASVADCLKSVELHAQQGQILLGELSLLPLLEHYIEDAKDRLGRKLSQSALVLLRGKVIYPSQSIDTQHFDVNAWSEQTLNFLQHEYQESLRLVLLVGEALYFYGFPDCDEQRSFSLADCHRGLRAQELVDRSLTDYRKQQRHLMRVAMAELNQEYVKAVLSSYSIMQEGNLDASHGLVYSRQSLIEQVSQIEGRLQKLNDEQRRLTSALAVICVDVKRYQHTLLAYEHLLEQKKKIEGEVQIVSNRVKSITKEDRSFWGTLSYFLAVLAGNSHTIKEERSLLAELFRELNAVDETLHNSEEQLKKVLHDQHQAIIWAKTQQELDKDPALEGVYNRFRQLQYYQAKLKRDERQCQQRANQLQRALQVLSQQMNKQNESNGLGEVG
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MADGFVKWFNNETGFGYITPQDGGDDIFVHRSGFDPQAQIQALTTHQKVSYSIHKDTSGTPYAADVILIEDNNDTS

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_017376170.1|3077561_3078662_-|protease	trypsin-like serine protease	A0A1B1IT49	uncultured_Mediterranean_phage	1.4e-21	28.3
WP_017376171.1|3079019_3079994_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_036771588.1|3080130_3081009_+	RNA polymerase sigma factor RpoH	A0A248SJA5	Salicola_phage	2.0e-39	40.9
WP_016209597.1|3081016_3081247_+	cold-shock protein	A0A2H4N7Y6	Lake_Baikal_phage	1.0e-06	40.7
WP_036771607.1|3081300_3082305_-	OmpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771589.1|3082811_3083639_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420747.1|3083720_3085109_-	undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_017376176.1|3085396_3086797_+	mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase	A0A1V0SH58	Hokovirus	4.0e-53	31.1
WP_017376177.1|3086891_3087818_-	NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein	A0A2K9L4U8	Tupanvirus	3.0e-57	44.2
WP_027242699.1|3087814_3088951_-	glycosyltransferase family 4 protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242700.1|3088947_3089955_-	glycosyltransferase family 4 protein	B6EFC4	Stygiolobus_rod-shaped_virus	3.4e-06	35.1
WP_027242701.1|3089951_3091115_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376183.1|3091124_3091976_-	glycosyltransferase family 2 protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242702.1|3092007_3093180_-	glycerophosphotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_065653741.1|3093176_3094565_-	oligosaccharide flippase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376186.1|3094593_3095001_-	adenylyltransferase/cytidyltransferase family protein	A0A1V0SGE7	Hokovirus	1.3e-28	50.4
WP_017376187.1|3095020_3096028_-	dTDP-glucose 4,6-dehydratase	A0A1D7XFE8	Escherichia_phage	3.0e-79	49.7
WP_017376188.1|3096024_3096897_-	glucose-1-phosphate thymidylyltransferase RfbA	A0A291LA53	Escherichia_phage	1.6e-92	58.7
WP_036771610.1|3096893_3097754_-	UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU	A0A127AW70	Bacillus_phage	1.3e-67	51.1
WP_065653742.1|3097755_3100026_-	polysaccharide biosynthesis tyrosine autokinase	NA	NA	NA	NA
WP_017376192.1|3100027_3101173_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376193.1|3101219_3101705_-	low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_027242703.1|3101744_3102368_-	phosphatase PAP2 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376237.1|3108047_3108800_+	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_155046626.1|3109402_3109570_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243062.1|3110131_3110755_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243063.1|3110859_3111648_-	hydroxyacylglutathione hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_027243064.1|3111647_3112379_-	HAD-IA family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_017376241.1|3112412_3114140_-	NAD-dependent malic enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_017376242.1|3114153_3115215_-	uroporphyrinogen decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_017376243.1|3115529_3116744_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376244.1|3116876_3117401_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_026063518.1|3118018_3118867_-	pyrroline-5-carboxylate reductase	A0A1X9I6T5	Streptococcus_phage	4.3e-26	35.5
WP_017376247.1|3118853_3119552_-	YggS family pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_017376248.1|3119606_3120368_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376249.1|3120360_3120783_-	Holliday junction resolvase RuvX	NA	NA	NA	NA
WP_017376250.1|3120912_3121464_-	YqgE/AlgH family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376251.1|3121519_3122482_-	TonB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420746.1|3122482_3122698_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376253.1|3122884_3123694_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376254.1|3123673_3124516_-	shikimate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_017376255.1|3124512_3125757_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376256.1|3125895_3126984_-	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase	NA	NA	NA	NA
WP_017376257.1|3127001_3127502_-	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	1.2e-20	42.5
WP_017376258.1|3127689_3128289_+	RdgB/HAM1 family non-canonical purine NTP pyrophosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_017376259.1|3128294_3129458_+	radical SAM family heme chaperone HemW	NA	NA	NA	NA
WP_017376260.1|3129490_3130444_+	glutathione synthase	NA	NA	NA	NA
WP_017376261.1|3130807_3131872_+	efflux RND transporter periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_027243065.1|3131868_3134931_+	efflux RND transporter permease subunit	S5VTK5	Leptospira_phage	1.0e-61	22.3
WP_144420745.1|3135083_3135536_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_027243066.1|3135567_3135924_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036772645.1|3136342_3137116_+	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_027243067.1|3137675_3137858_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376269.1|3139739_3140030_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036772663.1|3140254_3141130_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_048876179.1|3141126_3141684_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_048876031.1|3141694_3143098_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA

2. NZ_CP039064

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	3344 : 19366	21	unidentified_phage(35.71%)	terminase,integrase,transposase,tail,capsid,head	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP039064|3344:19366|DBSCAN-SWA
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MLADWGDYIQRGAEHGSSNSIFGMIQKYGGVVIQNNNSGNDPYIANSDALEVDRIVNELLHSDCKSDQTMARILVIHYGITGSAAKKQAIYHISSPTYDSYLGKGVSYVRGCLNALMCKPA
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MNNKHRKTLRDIFHNPIKASIVWADIEKLLLALGAEVIERDGSRVAVILNQVKTTFHRPHPEKTTDKGAVKSIRLFLKNAGVDKNA
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MPRRAKQICCYAGCHNTTYARYCEYHEQHGNRYHAPRKTTAQRGYGGRWQRERKIFLQDHPLCKQCLKDDKLIPAIEVDHIKPHDGDYELMWNQHNWQALCKPCHSRKTVNEDGGFGRKKSPQGRGV
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MIKSDPVKTALTYCDNVLSGRVIACDYVKKACQRHLNDLKYARDRGFYFDKEAACKAPSVI
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MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA
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MTEGESHLRIDDNNEDEYLEFILAAALQAAEDYRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
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MKTKIYLHGRLGRICGPFFELNIHHAREALYALSTQLPEFKKIIQAGEWAIFRKRQSLNLEQLELNCAGGELHIVPKPKGAKNSGFVQVLIGAALITAGYFSVGTALAPIAGGLSAAGTGLVISGALTMLSPQPSYDNDYSTTDPNASTLFSGVDNVAAPGAPVPLIYGEHLVGSSVVSSQYKTL
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MPTQKHMEKITNLIDDLQKRITKLDGQIEAEAKSSFISSGLLEREKSKGSRPVEYYHNVREFSRKLLPKIASWARKALLLCECKNFLEEMTKDDSKALEHATHLNETYLRHSNLAVFEARFRSMTKSLCSKTYKILKSIAKENQQSAVAATNWGGGAYAVADIVNRHQSSGLTSVEEGLQVVELPQTQPAMQG
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MLDLRSSVKAAYRRKASYLMHDSTYGSLLKMKDGNGQYIIQPDFKSGEGDLLRGKRVNTSDFMDTLAAGKCAALFGDFSNFIIADRGGISLRRLNELYAATGEVGYLMWLRVDALLLETDAIKQLKTAAA
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MSRAKGQGRKPKPTKIKKITGNPGCRKLNEHEPKPQDRVAICPDYFDEIAKGAFESAVSDLEYMHIKTASFQKQLEIYASAYSDWRQLSTVIEQKGRTFETTTQAGDTMYRSRPEVAQRNEAWKQVKTSLSELGLTPTAISRLNAQVSNTIESEIDKILD
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MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP039064|3344:19366|8713_9070_+|WP_080963620.1|DBSCAN-SWA
MAYMLRYKGYAAVVNFDDHDKILHGEILNIRDMVTFECEDLQGIELAFHNAVDDYVAMCKEKGRTPNKPYSGTTNLRLGTVLHEMCALAAAENDQSLNDWIIQQLNNSLHENNNASKN
>NZ_CP039064|3344:19366|13006_13981_-|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA
MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_036771330.1|3344_4319_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.7e-26	31.8
WP_016212329.1|4854_5445_-|integrase	site-specific integrase	K4K6A1	Caulobacter_phage	3.2e-20	35.3
WP_027242955.1|5675_5936_+	type II toxin-antitoxin system HicA family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_016211078.1|5928_6282_+	type II toxin-antitoxin system HicB family antitoxin	K7PJX6	Enterobacterial_phage	6.5e-13	34.8
WP_069971681.1|6458_7433_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.7e-26	31.2
WP_027242954.1|7965_8331_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242953.1|8475_8730_+	addiction module toxin, HicA family	NA	NA	NA	NA
WP_080963620.1|8713_9070_+	type II toxin-antitoxin system HicB family antitoxin	K7PJX6	Enterobacterial_phage	1.7e-16	36.4
WP_036771330.1|9167_10142_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.7e-26	31.8
WP_027242951.1|10767_11634_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242950.1|11846_12230_+	HNH endonuclease	A0A2D1GNP5	Pseudomonas_phage	4.3e-26	46.3
WP_027242949.1|12316_12799_+|terminase	P27 family phage terminase small subunit	Q9B019	Phage_GMSE-1	3.6e-14	34.0
WP_027242948.1|12801_12987_+	hypothetical protein	A0A1J0GUY5	Halomonas_phage	9.0e-06	47.3
WP_036771330.1|13006_13981_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.7e-26	31.8
WP_075275490.1|14077_14470_+|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	7.0e-24	45.0
WP_027242946.1|14505_15087_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|15467_16442_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.7e-26	31.8
WP_144420855.1|16515_16731_+|head,tail	phage head-tail connector protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242945.1|17534_18050_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242944.1|18395_18953_+|tail	tail assembly protein	K7PGY0	Enterobacteria_phage	7.9e-21	36.2
WP_027242943.1|18949_19366_+	hypothetical protein	A0A2R3UA88	Siphoviridae_environmental_samples	2.2e-20	41.7

3. NZ_CP039061

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	0 : 131711	126	Streptococcus_phage(41.82%)	transposase,portal,terminase,integrase	attL 8795:8854|attR 98041:99157
DBSCAN-SWA_2	139110 : 139839	1	Streptococcus_phage(100.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_3	145496 : 149457	3	Staphylococcus_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_4	153425 : 160556	7	Streptococcus_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_5	166920 : 172823	9	Staphylococcus_phage(28.57%)	transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP039061|0:131711|DBSCAN-SWA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP039061|0:131711|113698_114229_+|WP_155046635.1|DBSCAN-SWA
MECADSRHVTLCDADSRGFIVVAFCSAILHHWMCKIPTEVATLTYIKDDIYQLNKEFDVKEITYDPWNATQLANDLLEEGANMVEFRQDFKSMTPALKELERLVISTKLHHNNNPVLNWMASNLVVVEDDAGNMKPSKRKSTEKIDGMVAIAMAVGRLIAGEDHNSIYNERELLIL
>NZ_CP039061|0:131711|22483_22882_+|WP_036816769.1|DBSCAN-SWA
MKIIIDTNVLASAVFWGGQPLIILEAWFNEEFELLVTEDIFNEYSRVLEILSKKYKKDVSAILRLITVKSQWIVPVKMKTQVCQDIDDDKFIACALAAQGKVIVSGDKLLLECSGYQHIDIIKPKIFIDNYL
>NZ_CP039061|0:131711|18183_19161_-|WP_036771347.1|transposase|DBSCAN-SWA
MPYKYPKGKGWDIPKQKYGVTNWAKYTDSLRNRGRIDVWISEKAIEGWYKKDRVYDGTGTPFLYSDLAIITCHEIRKVFKQPLRQTQGLIDSFFESQGLPIKCPDYTVLSKRLAELDIKVPRYRKTDKPDDDIAGIAIDSTGLKRFGRDEWHQEKYKISAKRSWRKLHVAVDDDHYIQAALITDRYEADEEVVDELLEQIDEPFDRFTADGAYDSHDVYDSVLNHSPNADVVIPPPKNAVFDENNHAIRNINFNEIKDHGRMHWQKTRQYGKRNYSELAIQRYKRILGNTMQSREISRQKNEGLIGAGILNKMTSLGMPDSFRRS
>NZ_CP039061|0:131711|96956_98105_+|WP_048876196.1|DBSCAN-SWA
MPNIVDQFSLKYNETQLRNATKDAASNILKLNGLKDSLEKEINCFFENRKIIGSSSQPFFEKSDVHFFEHHSLSFQSVYKKYNSVKYFCETAYNAFEKPAVSIQKNPLTIEKKRLAILNKRSSSVRNSKGSGWLSRSSSQIRSPSPSPSPSPSPSPSPSPSLPPSLPQEKSLVKPQSNTENYFFNSDKITPKSRGRSHRRSQSYSQDPYMFLSSKPSQVEAAIPPLKQPESDNMGATAQVLVSSVTFEIRKYRGDLFEGKRNPCKLLMESDNVKKIKEIIYKYESWQTFKESKDNKNITFKQWLDIEEKDKMKVKLENQAIIQKDLQFCKKVDLPLKSESELLSSTLFLDTKKTESNPDMVGLCCIAQKVINSGGLPTLLLH
>NZ_CP039061|0:131711|85172_85400_+|WP_082300723.1|transposase|DBSCAN-SWA
MSSVGACVDNAVVERFFGSLKHEWLLNVIHLTRDTMKEDVEAYIRYYNHDRLHTANANLSPINFEKSQLKVSNMT
>NZ_CP039061|0:131711|17327_18056_+|WP_036771359.1|transposase|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP039061|0:131711|27845_28574_+|WP_017375910.1|transposase|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP039061|0:131711|126025_127003_-|WP_036771347.1|transposase|DBSCAN-SWA
MPYKYPKGKGWDIPKQKYGVTNWAKYTDSLRNRGRIDVWISEKAIEGWYKKDRVYDGTGTPFLYSDLAIITCHEIRKVFKQPLRQTQGLIDSFFESQGLPIKCPDYTVLSKRLAELDIKVPRYRKTDKPDDDIAGIAIDSTGLKRFGRDEWHQEKYKISAKRSWRKLHVAVDDDHYIQAALITDRYEADEEVVDELLEQIDEPFDRFTADGAYDSHDVYDSVLNHSPNADVVIPPPKNAVFDENNHAIRNINFNEIKDHGRMHWQKTRQYGKRNYSELAIQRYKRILGNTMQSREISRQKNEGLIGAGILNKMTSLGMPDSFRRS
>NZ_CP039061|0:131711|49605_49941_-|WP_017375632.1|transposase|DBSCAN-SWA
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MAKSRIFKSGNSQAVRLPKEMRLDGEEVVIHRFGNSLLIQPVYETWMDVYNHMPDVSDDFMEDRQDIQAQERDWF
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MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA
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MQQCPNLSYANLSKANLSSMGWGSAIVAGAAYGGFVAAISKNIAGMSVGTSVLTGATVAAMVTFTKKLEGANVKVTNLFGANLSGANLTHTNCTGAYFIDTDLTNAKVSKTDLKYAMFSKISLEGTGLNFKDLVGDATPKSEGLMELPSVIYIPKVTGSYQYYERNHGYLSAHLPQEESTLNTPRLFEGSQQQECQEQSSSVNLTH
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MAGQFDHLKKKNKIELTPDSFINEAAGGAVATLDRENVDTSVAQEKAVDSPEEAKKKGRPRKDMASELLITTKGRHTRKKSEAFNLYLPKELDKEIAEKTAGNKQLVLNYLVKTAWDSIKRKGKMIVVDADEVA
>NZ_CP039061|0:131711|64627_65356_-|WP_036815648.1|transposase|DBSCAN-SWA
MARRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEMTGERGLELERSTICRWVHEYGPEIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAALRFFKKAIAQPYVKSPRIVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSRRCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARSTIDVMEAMRMVQKGQLRYIKKQDICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP039061|0:131711|130019_131015_+|WP_036817204.1|DBSCAN-SWA
MSEVSAICTTMASLKKERAELVEKTSDLPSLRLKEKELIEKQRDFQKQNDVISVNQESINKVQHELSIISVNSQNLSTIKQYFERRVTELSLFLNGEQLPLLKGENSNEMNRIIRQGIADDDGYIQSVITNDQQVLQSINLEAERLCANRSLLEERARKNRAEVENFTEGAGIVLGELGRVRESIAQFVNLEQIGAEKSSQLNEQYALCQKALVSLAELRQKIFLSRNSVVTQLNQSLSPSIRTELTHQTDLQSYMENLESSFRGSSLKYKGLVPEMVQKVNPQWLLYYTSHLKYDDFSAALGIPIDRATRVLGYLSDIDLGSVLTSEIEA
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MSRMRGQGRKPKPTKIKKITGNPGCRKLNEHEPKPQDGVAICPGYFDEIAKGAFDSAVSDLEYMHIKTASFQKQLEIYASAYSDWRQLSAVIEQKGRTFETTTQAGDTMYRSRPEVAQRNEAWKQVKASLSELGLTPTAISRLNAQVSSAIESEIDKILD
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MPYKYPKGKGWDIPKQKYGVTNWAKYTDSLRNRGRIDVWISEKAIEGWYKKDRVYDGTGTPFLYSDLAIITCHEIRKVFKQPLRQTQGLIDSFFESQGLPIKCPDYTVLSKRLAELDIKVPRYRKTDKPDDDIAGIAIDSTGLKRFGRDEWHQEKYKISAKRSWRKLHVAVDDDHYIQAALITDRYEADEEVVDELLEQIDEPFDRFTADGAYDSHDVYDSVLNHSPNADVVIPPPKNAVFDENNHAIRNINFNEIKDHGRMHWQKTRQYGKRNYSELAIQRYKRILGNTMQSREISRQKNEGLIGAGILNKMTSLGMPDSFRRS
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MMRLSEFSFLVALGLLLASQCYGLAFFLIRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_036815609.1|23125_23581_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_146619477.1|25445_25739_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377667.1|25883_26054_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016212398.1|38975_39437_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_051929623.1|66983_70325_-	DEAD/DEAH box helicase	C3VNU0	Bombyx_mandarina_nucleopolyhedrovirus	2.6e-50	28.7
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98041:99157	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_036771347.1|104061_105039_+|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9
WP_027243212.1|105533_105821_-	type II toxin-antitoxin system RelE/ParE family toxin	A0A2H4JBF4	uncultured_Caudovirales_phage	9.6e-15	50.5
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WP_027242932.1|108543_108771_+	AbrB/MazE/SpoVT family DNA-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242931.1|108779_109187_+	DUF4411 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242930.1|109332_110715_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375952.1|110904_111108_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242929.1|111303_111687_+	HNH endonuclease	A0A2D1GNP5	Pseudomonas_phage	9.5e-26	45.5
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WP_155046635.1|113698_114229_+	hypothetical protein	E4ZFM0	Streptococcus_phage	1.6e-26	45.8
WP_087910668.1|114315_114702_+|portal	phage portal protein	Q6DMU2	Streptococcus_phage	2.1e-25	50.0
WP_036771649.1|114739_115474_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	42.6
WP_048876202.1|115520_116234_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.2e-11	31.2
WP_144420848.1|117612_117798_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243190.1|117801_121146_+	autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377509.1|121326_122055_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	3.2e-38	42.2
WP_075275482.1|122148_123123_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.9
WP_027242596.1|123436_123799_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242595.1|123838_124348_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420849.1|124579_125560_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771347.1|126025_127003_-|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9
WP_155050394.1|127021_127303_-	winged helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_146619517.1|127332_127485_+	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_017375959.1|127622_127856_-	hypothetical protein	A0A0M3LQB1	Mannheimia_phage	5.1e-06	45.2
WP_017375960.1|128157_129201_+	NAD(P)-dependent alcohol dehydrogenase	A0A2K9L339	Tupanvirus	2.2e-77	44.0
WP_036817201.1|129308_129716_+	AAA family ATPase	NA	NA	NA	NA
WP_036817204.1|130019_131015_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375964.1|131285_131711_+	hypothetical protein	A0A1B1IUG5	uncultured_Mediterranean_phage	5.1e-12	43.9

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP039061|139110:139839|DBSCAN-SWA
ATTAAGCAGCTAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGGTTTTGGGCGCAGATATCCTGCTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATCCGCATTGCTTCCATCACATCAATGGTAGATCGGGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGGAAACGGGATTTGCGCTTTACTGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAATTGTTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACATCGCCTAGAAAAGACACCTTCATCTTTGGCTTTTTGATGAGCCGGTGGAAATGAAGCATGTTTATCGACATTCACAATACGTGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCTATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCAAGGCCGCTTTAGCATTTTGCTGACGACTGAGCATCCAGTCCAAAGTATTGCCATATTTATCAATGGCTCGATAAAGGTAATACCAGCGCCCTTTAATTTTCACCAACGTTTCATCTAACCGCCAAGAGGCACACGTTTGGCGAAAGTGGGGCCGTAACCGTTTAGCGATTTCAGGTCCATATTCATGAACCCAACGACAGATTGTTGAACGTTCAAGCTCAAGACCTCTTTCACCTGTCATTTCTTTGAGGTCACGATAAGACAAAGCATAGCGGCCATACCAGCGCACCAACCAAAGAATGATCTCACCAGAGTAGTGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTCTAGCCAC

Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP039061|139110:139839|139110_139839_-|WP_036771279.1|transposase|DBSCAN-SWA
MARRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEMTGERGLELERSTICRWVHEYGPEIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAALRFFKKAIAQPYVKSPRIVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSRRCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARSTIDVMEAMRMVQKGQLRYIKKQDICAQNQLIDKLFGLAA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_036771279.1|139110_139839_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	7.1e-38	42.2

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP039061|145496:149457|DBSCAN-SWA
ACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCGGCAAACTCTGTTCCGTTGTCAGAAGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCCGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTGCTTAACCGCTGATGAATCAACATTTTTTCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCATCTCTACCCTCTAAGTCAAAAGGAGAACTAGAGAGTTTATCTGTATGAATATGAACTCTCTACTGAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGTTTTCTATGCATGCTGGACACTATTCACAAAGGTTTATCCTCGTTATGACACGGCTTATTATTTGGCTGAGGTTGAGAAGATGCTTAATTGCGGCACTGATCTGGGCGGCTTTGCTTTGTTTTGTTGCTGCCGTTGCGGCAAGGGCCGTCACAAGGATAGGCTCGCTGAGTACAGCTCACGACTTTAGGAAGGCCGTTGTATAATTTATCGTTGTCTGTATGATTAATCGCTTGTTAATCAACACAATGAGATAGTTAGTCTGATTCAATTCACGCTCAAACACCTTTTCCAAACCGACAGAGCCTGGTGGCGCTACTATGTGGCCAATCGAGAGAATATTCCTCGCTCAGTGGTTGAAACAGTCGTGAAGATGCTCAGCTGCAAAACCAAGTTTACCGGCCATGACGAATACAGCTGTTCTAACCCAGACTGCAAGCACACTAAGACCGTTCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGGCCTATACTTGCAAATCACGGTTATGCTCCTCTTGTGGAAAAAAGCCACAGAGCAATGGATTGCTGCACAAAATGAGTTATTACCAAAGTGCGAATATCAACACATCACACTGACAATGCCAGAAGCTCTCTGGCCATTTTTTCTGGCGAATCGTGACCTGCTCAACGAGTTATCACGTCTGGCCGCTGACATCCTGCTCAAAACTGCAAAGAAGAAAAAAGTTAAGATTGGTATCTTTACCATGCTCCACACCTTTGGCCAGGATTTAAAGTGGAACACACACATCCACTTATCCGTGACACGTGGTGGCTTATCTGAATGCGAAGCGATGTGGAAAAAGATTTACTTTACTAAGAGAAAAACCATGCGGATGTGGAGGTATGCAATCATTAATTTATTACGCGATGCCTACAAAGCAGGAAAACTCGTGATTCCTCATCAATATCAAAACCGCATTATTGACCTCACATCATTTAATCGATTTATTAATCCAGAATACAACAAACTCTGGCATGTGTATTTTTCTGACGTTCAGCCTTCACACCATCAAAATGTTGATTACTTGGGGCGCTATCTTAAACGACCACCGCTTTCTAACTCACGTATCCTCTATTACGATGGTGAGAAAGTCGCCTTTCGTTACATCGACCGAGAAACAGGAAAGCAGGACGAGTATCACTGCACGGCCTCAGAGTTCATTGATCGTTTAATCCCTCACATCCCAGAAAAGTCATTTAAGATGGTTCGTTACTATGGTTTCTTGAGCTTCCGTAGGCGTGGAAAATTACTGCCAAAGATTTACGAAATATTGGACCAGACGGTAGAGCCAGTCAAAAAAATTACCTATGCATCACTCCTCAAAGGCTTTATCAACACTGATCCGTTTGAATGCATCCTCTGCGGTAGCAAAATGGTTTTAACGGGTGGTCGCCCAAAACAGCGCTTATCAGTCATTATGAAGTATCACAAAGCTCTAGCAACCATGCAGATAATTAAATTCTAACAGGAGTAGTCCGTCTAGGGTCAGGCTTTAAGCCTGATTTTTGCTATTTCATCACTTAATTAGCATCTATGCTTTCGGTGCTGGAAGTAATTTTTAGTCGAATTATTTCAATTTCATGATATGGCTGATTTTCAGAGTATTGTAATTCCTAAGCGCTAAAAATGATTTGTGATATTTTTCTGTTTCTGTGAAGTGTTTTAGCTCACTCATAAACTCAGTAAAGGTTTTTTTTAGGTTGATTTCTTTTGCATACATGATATTATTTCTCCGTTACGTATTATTTTTAATAACCTGACTGTTACCGCACTCAGGTTATTTTTTTGCTCTGCCCTTCCCCCCCCCATCACAACCGACCCGGAGAGGGAAGGAACAAGAGAAAAGAGAGCATACCGATCAGGGTAAAAATCAACTTCGCATGCGCAGGTTTGGCAAAAACATTTCAAAGAAATGTTTCTTGATAAAGCGAGAACGGAGTTTATTTTTAACCAAGGTATGCTTGAGTGGGCACTGTTGCGAAAAGTTATCGTGAGCTTCAGAAAGGTTATTTTCTTGTGCTCTCTGCTTAGAATTAAGCAGCTAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGATTTTGGGCACAGATATTCTGTTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATGCGCATCGCTTCCATTATGTCAATGGTAGGCCGTGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGGAAACGGGATTTGCGCTTTACCGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAGTTGTTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACACTGACTAGAAAAGAGACCTTCATCTTTGGCTTTTTGGTGAGCGGGTGGAAATGAAGCGTGCTTGTCGACATTCACAACACGCGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCGATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCATCGCCGCTTTGGCATTTTGCTGTCGGCTGAGCATCCAGTCCAAAGTATTGCCATATTTATCAATGGCTCGATAAAGGTAATACCAACGACCTTTAATTTTCACCAACGTTTCATCTAACCGCCAAGAGGCACACGTTTGACGAAAGTGGGGCCTCAGCCGTTTGGCGATCTGCGAGCCATACTCGTGCACCCAACGACAAATGGTTGAACGCTCAATCTCAAGACCTCTTTCAGCTGCTATTTCTTTGAGATCACGGTAAGATAAGGCATAGCGGCCATACCAACGCACCAGCCAAAGAATAATCTCACCGGAATAATGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTTTTACCAC

Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP039061|145496:149457|147188_148160_+|WP_048876229.1|transposase|DBSCAN-SWA
MWKKATEQWIAAQNELLPKCEYQHITLTMPEALWPFFLANRDLLNELSRLAADILLKTAKKKKVKIGIFTMLHTFGQDLKWNTHIHLSVTRGGLSECEAMWKKIYFTKRKTMRMWRYAIINLLRDAYKAGKLVIPHQYQNRIIDLTSFNRFINPEYNKLWHVYFSDVQPSHHQNVDYLGRYLKRPPLSNSRILYYDGEKVAFRYIDRETGKQDEYHCTASEFIDRLIPHIPEKSFKMVRYYGFLSFRRRGKLLPKIYEILDQTVEPVKKITYASLLKGFINTDPFECILCGSKMVLTGGRPKQRLSVIMKYHKALATMQIIKF
>NZ_CP039061|145496:149457|145496_146324_-|WP_048876208.1|transposase|DBSCAN-SWA
MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNGHCCEKL
>NZ_CP039061|145496:149457|148728_149457_-|WP_017375910.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_048876208.1|145496_146324_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.2e-17	32.1
WP_048876229.1|147188_148160_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017375910.1|148728_149457_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	42.6

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP039061|153425:160556|DBSCAN-SWA
AGTGCCATATAAATATCCAAAAGGAAAAGGGTGGGATATCCCTAAACAAAAATATGGCGTTACAAACTGGGCAAAGTACACCGATAGCCTGCGTAATCGTGGCCGTATTGATGTTTGGATTTCAGAGAAAGCCATTGAAGGTTGGTACAAAAAAGACCGAGTTTATGATGGTACAGGCACGCCGTTTCTATACTCAGACCTGGCGATCATCACCTGTCATGAAATTCGTAAAGTGTTTAAACAGCCATTACGCCAGACTCAGGGCCTAATTGATTCCTTCTTTGAATCCCAAGGACTGCCGATCAAATGCCCTGACTATACGGTGTTATCAAAAAGGTTAGCGGAGCTCGATATTAAGGTCCCACGCTATCGCAAAACAGATAAGCCAGATGATGATATTGCGGGAATAGCCATTGATTCTACAGGCCTTAAGCGTTTTGGCCGTGACGAGTGGCACCAAGAAAAATACAAGATATCAGCAAAGCGCAGCTGGCGTAAACTTCATGTGGCCGTTGATGATGATCACTATATTCAAGCCGCACTCATCACCGATCGCTATGAAGCAGATGAGGAGGTTGTGGATGAGCTACTGGAGCAAATTGATGAGCCGTTTGATCGCTTCACTGCAGACGGAGCCTACGATAGCCATGATGTTTACGATTCCGTTTTAAACCACTCACCTAATGCTGATGTTGTTATCCCTCCTCCTAAAAATGCCGTATTTGATGAAAATAACCACGCGATTAGAAACATAAATTTTAATGAGATTAAAGATCATGGTAGAATGCACTGGCAAAAGACACGACAATACGGCAAGCGTAATTATTCTGAGTTGGCGATTCAGCGTTACAAACGCATTTTGGGCAACACGATGCAGTCCAGAGAGATATCGCGTCAGAAAAATGAAGGACTAATTGGCGCGGGTATTTTAAATAAGATGACCAGTCTCGGCATGCCGGATAGTTTTAGACGCAGCTGAATTGTGCCTGGAATATGGGACCAGAGGTTACGCAACAACGCCACTTAGTGATTCCTTTATTTAAGGGTACTGTTATTTTTACAGTTATTGGCGCTTTAATCGGTGGGCAGCTTGATAAAATTATTCCTGTTGCTTTTGTGAAAATATTATTTACTGTAATTATTATCAGTGTGTTAGTTCAAAGTTTTTTTAATCGTATCAACCAGGTCGGGAGGTTTGAATGTCAGCCGATGTATCCAGGATTTTTATCACGGTCAATAATGGGATTCTCTGTTGGTATTCTTGCTTCTTTAGTTGGTATTGGTGGATCAGCGATTACTAATCCGTATATGCAATACCATCGTTATCCAATGAAAAAAAGCGCGGCGATGTCAACAGCGCTGGCTTTTCCTATGGGTTTATTTGCACTTGCCAGTTTATTGGCTTCAAGTGTAGGTATGGTTGGTCTACCTTATGGCAGTGTAGGCTATTTGTATCTCCCGGCTTTTACTGGTTTATTGATCGGGTCACTCTTAGGCTCACCTCTTGGAGTGTGGCTGGTTAAGCGCGCTTCCGAACAAATTTCCGTTTGGGTATTTCGTATTATATTATTAGCAGTGGTTATTCAGATGGTTCGCTGATATGGCACTGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTAGGGTGTAGCAATCCGCCCTCCGTCAAGTATGATGAATTTAAGCCCCTTACGTTACCATTGAAGTCTGGGCGAGGGTAAGGAGAGCGATAGCGTCAAAGCTTTCGAGGCTGTTCAGATGAATGCTCCCTTACCTGTTTTAGTCCATTAACTTCGAATAGAAGGGTGTGCCAAGAGCACGAATACTTGACTGAAGCGGAGGACGAAAAATGGGGCACTGTTGCGAAAAATTATAGTGAGCTTCAGAAAGGTTATTTTCTTGTGCTCTCTGCTTAGAATTAAGCAGCTAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGATTTTGGGCACTGTTGCAAAAAATTTAGATTTGAGTAGGGTGTAGCAATCAACCGAAGTTAAGAGTGAATTGCTGTGGCTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAACGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAACTCTCTAGTTCGCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGATTTATCAGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGAACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGCGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGACAAGCTTTTCGACAAATTTCAGAAGAGGCAAAAATGTTGATTCATCAGCGGTTAAAGACTCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAAGAACTTATACGTGAGCATAATATTCAGGTGAGTGAGAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCGGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCAGGAAAACCTTATAAGAAGAAGGTGAGTCGTGGTGATCAAACAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACAACGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGTGACCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACTTCTGACAACGGAACAGAGTTTGCCGGTCATGAGGTCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAGCACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACGGATTTTAATGAAGTTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATATATTGAATACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATCGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGGTCATTCTTTGGTTGGTGCGCTGGTATGGTCGTTATGGCACTGTTGCGAAAAATTATAGTGAACTTCAGAAAGGTTATTTTCTTGTGCTCTCTGCTTAGAATGAAGCAGCTAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGATTTTGGGCACAGATATTCTGTTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATGCGCATCGCTTCCATTATGTCAATGGTAGGCCGTGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGGAAACGGGATTTGCGCTTTACCGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAGTTGTTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACACTGACTAGAAAAGAGACCTTCATCTTTGGCTTTTTGATGAGCCGGTGGAAATGAAGCGTGTTTATCGACATTCACAACGCTCGGTGATTTCACATAAGGTTGAGCCATTGCTTTTTTGAAAAAGCGCAAGGCCGCTTTGGCATTTTGATGACGACTGAGGGCACTGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTATGGTGTAGCAATCAACTGAAATTAAGAGTGAATTACTGTGGCTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCACTACTCTGGTGAGATCATTCTGGCACTGTTGCGAAAAATTATAGTGAGCTTCAGAAAGGTTATTTTCTTGTGCTCTCTGCTTAGAATTAAGCAGCTAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGATTTTGGGCACAGATATTCTGTTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATGCGCATCGCTTCCATTATGTCAATGGTAGGCCGTGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGGAAACGGGATTTGCGCTTTACCGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAGTTGTTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACACTGACTAGAAAAGAGACCTTCATCTTTGGCTTTTTGGTGAGCGGGTGGAAATGAAGCGTGCTTGTCGACATTCACAACACGCGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCGATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCAAGGCCGCTTTAGCATTTTGCTGACGACTGAGCATCCAGTCCAAAGTATTGCCATATTTATCAATGGCTCGATAAAGGTAATACCAACGACCTTTAATTTTCACCAACGTTTCATCTAACCGCCAAGAGGCACACGTTTGACGAAAGTGGGGCCTCAGCCGTTTGGCGATCTGCGAGCCATACTCGTGCACCCAACGACAAATGGTTGAACGCTCAATCTCAAGACCTCTTTCAGCTGCTATTTCTTTGAGATCACGGTAAGATAAGGCATAGCGGCCATACCAACGCACCAGCCAAAGAATAATCTCACCGGAATAATGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTTTTACCACAGCAATTCACTCTTAACTTCCGTTGATTGCTACACCCTACTCAAATCTAAATTTTTTGCAACAGTGCCCAATTTTCCAGCACCAACGCTAGCAAAAATCAAGCAGGGCTCTTCATTTTCTCTAAACCAATTCGCTACGGCTGTAACGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCGGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTCGCTTCTTTTTGGTAAGTCCTTAGTGCGAACATCTTAAATATCTCTTAACTTGCTACCGTGTTAAAAACACTTGTTATGATTGAGAAATACGAATGAATTGCGGAGTATTTTCCTCTGGTTGATGTTTTTCAAACTCTGAAAGTGCAGGTAGGTCGCTCATACCATTTTTCTCGGCAAGAGGTAAAAATCGTGTGTATGACTCTTGATCAAAAGCGTATGCAGCACCTCGGCTAATGCCTTGCATGATTTCTTCAAAACGTGTTTTCTTAACAATGCCACTGGTTTCTCGATCAGGCAGCATAGCATCAATGTACCCATGCAAACTTTCTGAAGAACCTGAAATAACGCAGGCATCCTTATCACAAAAGACATCCCCTTCTTCACTGTACGAAAAATATCCAATAACTTTATGTGAATCTTTATACATTGCATATCCTCACTAACAATTAAACGAGCCGACGTTGAAAAATGTAAAACAAACTTTCTTAGATAGTCCAAATCTCTCATCGATGCGGCTCGTAACAACGGGCCCAGTTCGGACTTCAGAGTCATCAATGACGCCTAACATTTCGTTAATTAACTCTTTAGTATTATAAAAATTAAGATAGCTCTTAGCATTGATACACATAATACAACAGCCTTTTTTCATTGTGATAAGTAATGTGCTCTACAGAGCTACTGATTAAGGACTGATCTTTTCATCTGTTTTCAGGATCAAAGAATAATCGATCGCTCTTGTATAATGTTGAAATCGACTTACTTTAAACACAGAAAATAACCTTTGCTTGATGTTAAATATAAGGCGCTATTATAACGCTTTAAAAGAAAGCTTACTATGCCGGCCGAATGAAAATTAGATCAGTATTAGATTATGGGTGAGCTAGTTAATGAAATGATCCCCAAAATTTAATGTCTAAATTCGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTACGTGCCTTGAAGCGGCACACTCCACTACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGCCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGAAGGCATACTTTTGGAGATTTTTACATGAGCAGACAGCAGTATTCAAGCAGCAAAAAGTTCCAGATTGCGCTTGAAGCGGCACTGTTGCAAAAAATTTAGATTTGAGTAGGGTGTAGCAATCAACGGAAGTTAAGAGTGAATTGCTGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCTTTGTCTTATCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP039061|153425:160556|157309_158038_-|WP_048876214.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAALRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP039061|153425:160556|158546_158900_-|WP_017377521.1|DBSCAN-SWA
MYKDSHKVIGYFSYSEEGDVFCDKDACVISGSSESLHGYIDAMLPDRETSGIVKKTRFEEIMQGISRGAAYAFDQESYTRFLPLAEKNGMSDLPALSEFEKHQPEENTPQFIRISQS
>NZ_CP039061|153425:160556|159827_160556_+|WP_017375910.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP039061|153425:160556|154417_155023_+|WP_155050395.1|DBSCAN-SWA
MGPEVTQQRHLVIPLFKGTVIFTVIGALIGGQLDKIIPVAFVKILFTVIIISVLVQSFFNRINQVGRFECQPMYPGFLSRSIMGFSVGILASLVGIGGSAITNPYMQYHRYPMKKSAAMSTALAFPMGLFALASLLASSVGMVGLPYGSVGYLYLPAFTGLLIGSLLGSPLGVWLVKRASEQISVWVFRIILLAVVIQMVR
>NZ_CP039061|153425:160556|155563_156538_+|WP_075275471.1|transposase|DBSCAN-SWA
MIYQHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPRTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLKTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEVISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHILNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP039061|153425:160556|153425_154403_+|WP_036771347.1|transposase|DBSCAN-SWA
MPYKYPKGKGWDIPKQKYGVTNWAKYTDSLRNRGRIDVWISEKAIEGWYKKDRVYDGTGTPFLYSDLAIITCHEIRKVFKQPLRQTQGLIDSFFESQGLPIKCPDYTVLSKRLAELDIKVPRYRKTDKPDDDIAGIAIDSTGLKRFGRDEWHQEKYKISAKRSWRKLHVAVDDDHYIQAALITDRYEADEEVVDELLEQIDEPFDRFTADGAYDSHDVYDSVLNHSPNADVVIPPPKNAVFDENNHAIRNINFNEIKDHGRMHWQKTRQYGKRNYSELAIQRYKRILGNTMQSREISRQKNEGLIGAGILNKMTSLGMPDSFRRS
>NZ_CP039061|153425:160556|157173_157341_+|WP_155046640.1|DBSCAN-SWA
MARRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILALLRKIIVSFRKVIFLCSLLRIKQLIQIIYQ

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_036771347.1|153425_154403_+|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9
WP_155050395.1|154417_155023_+	TSUP family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_075275471.1|155563_156538_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.3e-26	31.2
WP_155046640.1|157173_157341_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876214.1|157309_158038_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.1e-38	42.6
WP_017377521.1|158546_158900_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375910.1|159827_160556_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	42.6

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP039061|166920:172823|DBSCAN-SWA
TATGTTAGTTTTAACACGTAAAAGCGGACAAGAAATTTTTGTCGGTAAAGATATTACTATTAAGGTTTTATCTGTAGTAAATGGTCAAGTAAGAATAGGCATTGATGCGCCTCAAGAGGTACAAATACAGAGGGATGACGTTAAGAAAAGACCGGAGTTGATTAAAGCTGTTGTGTGATTAAGGGCTTCGGCCCTTTTTTCTTAAGAGTGAATAAGAAATATTTTTAATTTGGTTTAATTTTTTTCTGAGAATGAGTGATACTATTAGTAGAAATTTTAATGCTGGGGAAATAAATGCCAATTGTTCAAATAGCAAATTCTAAGGGTGGAGTTGGAAAGAGCACAATAGCGTGTAATTTAGCAACAGCACTTGTTCATGCTGGTTTTTCGGTTGTTATAGCTGATTGTGATCCCCAGTTTTCTTCTTCAAGTTGGGCAGATGAAAGGCAAGACAATGGTAAGTTGCTTAATGTTGATATAGTGCAAAAAACAGGCAAGATTATCCCAGCACTACGGCAGTTAACAAAAAAATATGATTTTGTAGTTGTAGATACAGCAGGGCATGATTCTGTAGAAATGCGTGCGGCTTTAACTGTTTCTGATTTAACTATTGTCCCTTTTAAGCCAAGCCAGCTTGATATTGATGTGCTAGGGGCTATGCAAGAGTTAATAGAAAATGCACAAGATGCTGGAAATGATAAAATGCAGGTTGCTTGGATTATTAATATGGCGGCACCCAATCCACGGAGTAAGAAGCTAAAAGAAACTCAAGATGCTTTGAATGATGCAGAGGGCTTTAACCTTCTTAAGTCTGTCTTACATAATAGGGATGCTTATGTAGAGTCTATGTCTGAAGGTTGTGGTGTAGTCGAATTGAAAGATAAAAAAGCTAAAACTGAGATAGAAGCTTTAGTTAAAGAAGTGTTGAAATTAACGGGCAAGAAGGCAGTGCGTCATGGCATTAAAGCTAAAAAAACAGTCAAAGCAAAAAAATCAGCGTAAAGCAAACAAGAACGATTTTATATACGCTTTCAAAGGAAGTGAGCACCTAAAAGAAAAGTTCGACAGTGGTGATAAGTGGGTAGATACAGAGCAGTGTTACATTGCCGAGATTAAAATAGACCGTAAAACTAAAGATCAGGACTACCTTAATGAACTTGCTGCATCCATGAGCGGCAAGAAACAAATTAATGCGGCGATAGTTCGTAAAGCAAAGGATGGTCGTTATGAATTGATTAACGGTGAGTGTCGTTATGATGCTGCAAAAATCAATAATGAGCCTTTGCTTGTTCGGGTTGTTGATTATGATGATGATGAAGCAATCGGTGCCATCATTGCTGAAAATGACAAGCGTAAAGATTTGTGTGACTACGATAAAGCCTTAGCATATCTTGAGTATAAAAGTGATTTGAGTATTCGTGCATTTGCGGAAAAATATAATCTTAACAGAAACTATGTTAATCGACTTTTTAAAGTTGATAAGATACCTGAGTCAGTTGTATTGGCCCTACCTATGATTGAATTGAGTGCATCTCAATTTGAAGAAATTGCTATAAGAATCAAGGATAATCAGCTTTATACCGACGTATTTATAGAGCTTGCTCCACTACTGTCTCAAATTGAGACACCTGTTACATGGAAAGACTTCTTAAGCCGCATAGACCGCAAGGTTAATCCACCAGAGAAGCAGCCTCAAAAGAAAATCGAGCGCTATGTTTTCAGCTCTGAAAAAGCTAATCTGAGATACACAGATAGTGGCTTTATAGTGAAGTCCGAAAAGCTCACACGAAAGCAAAAAGAGCAAATACAAGAAGCGTTAGACTCGATTTTATAATGTAGGCCCAGAGGGGCCTTTTTTTAGTTCTTATGCTGTTCGCTCCCAGACAATCACACCAGAACGGGCAGGGTCGAGGTCGTGAGAGTGCGGTTTTCCGCCGCCAGTATTGAATGTGTAGTCATTGCTTTTATTTGTTGTTGTTGGCGTAACTACTCCAACATCTGCGCCACCTCTTTGAATTGCTGACTCGTTCGGAATTCCGTGATTGTGCTCGGGCATTTCATCAATAGAAAGAGTGTGATCATTTGTTCTTGTAGAGCCTGCTTTTGCTCCGGCATCTATTGTAAAGTTACTTGAGCCTGCGACTGTAAGTAAGCGGCCGGCATGGTCTGCATCGATGTCAGTGATTTTTTTCCAAGTTGCCCCTTTTCCTTGAAATGGTGGGATATAGTTTTCGTCAAAAGTTAGTTCTATCTTTCCGACCGGGTAGAGTTGATCTATGAGTAGTTCGATTTGCAAAGAGCCGTCAGCGTTTTGTTTCCGGCTTAGTGTTTCACTTTGAATCGAGTCGGGTGTGTTATCTATGCGATTCCACGATGTCCAGCCAGAGCTTTCTGTATAGATACGCACAAAAGTAGGGGATGTGCCGTCTACGGCTAAGCCTGTGATGGTCTGTGTTAAGTCAGGCGAATTAGGAACACGAACAACGTTAGCCGTCCACCAATGATCTTTTGTAGTTTCTAAGCTGGGTGAGTTTTTGGCACTGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTAGGGTGTAGCAATCAACGGAAGTTAACGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACCGAGTAGAGAGTTCATATCCATACAGATAAACTCTCTAGTTTGCCTTATGAGGGTAGAGATGATTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGCGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGACAAGCTTTTCAACAAATTTCAGAAGAGGAAAAAATGTTGATTCATCAGCGGTTAAGCACTCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAAGAACTTATACGTGAGCATAATATTCAGGTGAGTGAGAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCGGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCAGGAAAACCTTATAAGAAGAAGGTGAGTCGTGGTGATCAAACAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACAACGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGTGACCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACGGCACTGTTGCGAAAAGTTATCGTGAGTTTCAGAAAGGTTATTTTCTTGTGTTAGCTACCTTAGAATTAAGCAGCTAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGGTTTTGGGCGCAGATATCCTGCTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAATCATACGCATTGCTTCCATCACATCAATGGTAGATCGTGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGAAAACGGGATTTGCGCTTTATCGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAGTTATTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACATCGCCTAGAAAAGACACCTTCATCTTTGGCTTTTTGATGAGCGGGTGGAAATGAAGCGTGTTTATCGACATTCACAACACGCGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCTATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCAAGGCCGCTTTAGCATTTTGCTGACGACTGAGCATCCAATCCAAAGTATGGCCATATTTATCAATCGCTCGATAAAGGTAATACCAGCGCCCTTTAATTTTAACCAGCGTTTCATCCAGCCGCCAAGAGGCACACGTTTGGCGAAAGTGGGGCCGTAACCGTTTAGCGATTTCAGGTCCATATTCATGAACCCAACGACAGATTGTTGAACGTTCAAGCTCAAGACCTCTTTCACCTGTCATTTCTTTGAGGTCACGATAAGACAAAGCATAGCGGCCATACCAGCGCACCAACCAAAGAATGATCTCACCAGAGTAGTGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTTTTAAATCGTTTACGTCTAGCCACAGTAATTCACTCTTAATTTCAGTTGATTGCTACACCATACTCAAATCTAAATTTTTCGCAACAGTGCCCTTACGACCAAACTTTATACCTTTTTCTCTGGCTATTCTGATTCCATCAGCTTGGCGTTCCTTGCGTATATTATTTTCAAATTCAGCAAAAACGCCCAATAATTGATACATCATTTTACCTAGTGCGCTGCGTGTATCTATTTTTTGGTCTAAAACAATCAGATTTACATCAGCAGCCATCAAACCTTCGACGATTTGGTTTAAATGAGTATTTGAGCGTGCAAGGCGATCAAGTTTAGTCACAACCAAAGTATCTTCGTCACGTAAATAATCTAAGCAATTTTTTAGCTCTTTACGGTTTTGGTGGCACTGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTATGGTGTAGCAATCAACTGAAATTAAGAGTGAATTACTGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCCGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTGCTTAACCGCTGATGAATCAACATTTTTTCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP039061|166920:172823|171483_172212_+|WP_017375910.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP039061|166920:172823|169597_170302_+|WP_048876211.1|transposase|DBSCAN-SWA
MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTALLRKVIVSFRKVIFLC
>NZ_CP039061|166920:172823|170313_171042_-|WP_036772541.1|transposase|DBSCAN-SWA
MARRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEMTGERGLELERSTICRWVHEYGPEIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAALRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSRRCKLRRVKYLNNCIENDHKAIKRKSRFRQWYQSLSTARSTIDVMEAMRMIQKGQLRYIKKQDICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP039061|166920:172823|168783_169326_-|WP_027243193.1|DBSCAN-SWA
MRIYTESSGWTSWNRIDNTPDSIQSETLSRKQNADGSLQIELLIDQLYPVGKIELTFDENYIPPFQGKGATWKKITDIDADHAGRLLTVAGSSNFTIDAGAKAGSTRTNDHTLSIDEMPEHNHGIPNESAIQRGGADVGVVTPTTTNKSNDYTFNTGGGKPHSHDLDPARSGVIVWERTA
>NZ_CP039061|166920:172823|167213_167921_+|WP_027243191.1|DBSCAN-SWA
MPIVQIANSKGGVGKSTIACNLATALVHAGFSVVIADCDPQFSSSSWADERQDNGKLLNVDIVQKTGKIIPALRQLTKKYDFVVVDTAGHDSVEMRAALTVSDLTIVPFKPSQLDIDVLGAMQELIENAQDAGNDKMQVAWIINMAAPNPRSKKLKETQDALNDAEGFNLLKSVLHNRDAYVESMSEGCGVVELKDKKAKTEIEALVKEVLKLTGKKAVRHGIKAKKTVKAKKSA
>NZ_CP039061|166920:172823|172214_172823_-|WP_036815979.1|transposase|DBSCAN-SWA
MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGTVAKNYSELQKGYFLVLSA
>NZ_CP039061|166920:172823|167874_168753_+|WP_048876212.1|DBSCAN-SWA
MALKLKKQSKQKNQRKANKNDFIYAFKGSEHLKEKFDSGDKWVDTEQCYIAEIKIDRKTKDQDYLNELAASMSGKKQINAAIVRKAKDGRYELINGECRYDAAKINNEPLLVRVVDYDDDEAIGAIIAENDKRKDLCDYDKALAYLEYKSDLSIRAFAEKYNLNRNYVNRLFKVDKIPESVVLALPMIELSASQFEEIAIRIKDNQLYTDVFIELAPLLSQIETPVTWKDFLSRIDRKVNPPEKQPQKKIERYVFSSEKANLRYTDSGFIVKSEKLTRKQKEQIQEALDSIL
>NZ_CP039061|166920:172823|166920_167097_+|WP_075275473.1|DBSCAN-SWA
MLVLTRKSGQEIFVGKDITIKVLSVVNGQVRIGIDAPQEVQIQRDDVKKRPELIKAVV
>NZ_CP039061|166920:172823|171071_171461_-|WP_051929563.1|DBSCAN-SWA
MIATPYSNLNFSQQCHQNRKELKNCLDYLRDEDTLVVTKLDRLARSNTHLNQIVEGLMAADVNLIVLDQKIDTRSALGKMMYQLLGVFAEFENNIRKERQADGIRIAREKGIKFGRKGTVAKNLDLSMV

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_075275473.1|166920_167097_+	carbon storage regulator	A0A2I7RT00	Vibrio_phage	1.7e-06	46.0
WP_027243191.1|167213_167921_+	AAA family ATPase	A0A222YXS3	Escherichia_phage	1.2e-34	40.0
WP_048876212.1|167874_168753_+	ParB/RepB/Spo0J family partition protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243193.1|168783_169326_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876211.1|169597_170302_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	7.9e-10	31.7
WP_036772541.1|170313_171042_-|transposase	IS6-like element ISPsa2 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	5.4e-38	42.2
WP_051929563.1|171071_171461_-	recombinase family protein	A0A219Y912	Aeromonas_phage	1.1e-10	40.0
WP_017375910.1|171483_172212_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	42.6
WP_036815979.1|172214_172823_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	8.9e-10	34.6

4. NZ_CP039063

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	2917 : 16713	18	Moraxella_phage(18.18%)	tail,capsid,transposase,head	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_036771347.1|2917_3895_+|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9
WP_017375652.1|3922_4351_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_027242568.1|4409_7100_-	host specificity protein J	A0A0R6PIC9	Moraxella_phage	6.1e-111	32.9
WP_017375789.1|7096_7654_-|tail	tail assembly protein	K7PM97	Enterobacterial_phage	2.7e-21	35.6
WP_144420832.1|7643_8429_-	hypothetical protein	A0A0R6PHF9	Moraxella_phage	5.1e-42	41.1
WP_017375787.1|8358_9030_-|tail	phage minor tail protein L	W6EC15	Rhizobium_phage	1.4e-27	33.6
WP_017375786.1|9026_9368_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771950.1|9360_11439_-|tail	phage tail tape measure protein	A0A1J0GWA6	Alteromonas_phage	1.6e-50	31.2
WP_017375784.1|11442_11709_-	DUF4035 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375783.1|11765_12089_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375782.1|12090_12513_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375781.1|12512_12863_-	DUF3168 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375780.1|12859_13255_-	HK97 gp10 family phage protein	Q6UAX1	Klebsiella_phage	4.3e-05	39.6
WP_017375779.1|13433_13859_-|head	phage head closure protein	A0A1W6JP44	Morganella_phage	3.9e-12	37.9
WP_017375778.1|13855_14167_-|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	Q8SBH7	Shigella_phage	5.6e-08	30.8
WP_027242598.1|14551_15136_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275454.1|15149_15689_-|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	9.3e-35	44.2
WP_036771639.1|15738_16713_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	4.9e-26	30.9