Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP039032 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 chromosome, complete genome | 3 crisprs | DEDDh,csa3,RT,DinG,cas3 | 1 | 2 | 30 | 38 |
NZ_CP039033 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence | 1 crisprs | RT | 0 | 3 | 1 | 13 |
NZ_CP039034 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 2 | 6 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP039032_1 | 363130-363259 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP039032_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP039032_1
>1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039032_1
The CRISPR arrays of NZ_CP039032_1 >merge|NZ_CP039032|1|363130-363259|CRISPRCasFinder ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA >NZ_CP039032|1|1|363130-363259|CRISPRCasFinder ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA
>NZ_CP039032.1|WP_054300520.1|361908_362223_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MKGYLITQISKLLKISRDTLHRWRNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH >NZ_CP039032.1|WP_075273359.1|361387_361963_-|IS630-family-transposase MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEGAGCHLLFLPPYSPDLNSIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETVR >NZ_CP039032.1|WP_016211797.1|359933_361337_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein MSSYAMLINGQLHSGIDSFAVVNPATEAVIAECPIASVELLEQAVNAAKIALIDGTGTLEQRRELLRACADKIEAYQEELSQLLTKEQGKPISQAQNEVSWAIGLLRKQCELDIPKKVLRDDTQAQVTVTRKPLGVVAGITPWNFPFYIAVNKMAEAIYSGNSIIIKPSPYTPLTTLKLGELIQDVIPAGLVNIISGDNEIGALLVKHPKISAISFTGSVATGKHIATAAAADLKRVVLELGGNDAAIVLNDVDVKEVAEKIFWNAFSNCGQVCVAVKRLYVQRAIYHDVLDEMVRIAKTVKVGNGLDSEVTMGPLNNVMQYERIIELLNDAKAQGATVHCGGVAQEGLGYFFPPTIISGIEEGVRLIDEEQFGPLLPVLAFDDVNEVIQRVNNSSMGLSAYVWSKDNDLAVQIANRLEVGIVRVNTSTTEASLTPFGGMKQSGIGREGGVWGIEAMTDAQTLSVKY >NZ_CP039032.1|WP_129556444.1|359349_359772_+|hypothetical-protein MNKDIMIDQPGRAIEQRSILSITHATMLMGIFQAALNIIGNSKSILKKNTVVLSQFNQLNNQCLLLRNQLIHTNTQEEVQKMRAQIHKYTRDCIYLAAALSGGRSVLADHPVQRLNRELLQATIAGVNSLFIHNLCIDIN >NZ_CP039032.1|WP_080664870.1|358709_359357_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase MVLLEQLDTFLISRVDPYANQLDIDSMILKSRFSELGEKKLLAIKVASEFNGIAADRALNHDYFARLARSSYALAFLTAQHESCASLLQKGNNQELKADLLPEMVQGKFRAGVGIYHLRSHTRRAMIMAKKVAGGYRVSGRLDWISGFDIFDYIALGFIIDIGNSQENHEVVGLVPFKAQQYLSGEINIGPKQEVTAISSTNTVAIEFNDWFIRE >NZ_CP039032.1|WP_016211795.1|357832_358027_-|hypothetical-protein MKLKTKKISNACKGNTFLCVNFAKSKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP039032.1|WP_036794771.1|356708_357695_+|APC-family-permease MAMSGNQALQENVGFLGALVFAVSLVLGSGVLVLPGVIYHSIGELAIFTWLADALLMVPLVIIFASFGSKYPGSGGVAGFIEQAFPYLSGGSAYLLLGQCSICFAIVAITGILYSFALLLPNFHASHMLVAGISLALMFIVFFISFLGNHRVIWLQKLIIIPLLLFLLVLIFLSINHPDAATSSVTYWPKHFDTGLITQGMILAFFAFGGWESFASMTGEIKKPARTVPFVIFVGFLLTVGLYVGLSIAIQKIFFEKNMMTGSSFLLDLVQVNHLGQFSVAICFFIVFVVVISNLNGVIWSGSRTLVTLGQKGWAPAFAASHGVLSTG >NZ_CP039032.1|WP_016212044.1|355731_355986_+|hypothetical-protein MNHIISCPFCGVSTEHEMSYGLQSYVCEACHNLIAAGMDDCCLFFSHDLACLCQRENEKKMEREREEKEEEEALLCPSLRKWSS >NZ_CP039032.1|WP_054300271.1|354218_355193_+|IS30-family-transposase MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039032.1|WP_016212359.1|353632_353851_-|hypothetical-protein MFKQLQNNRLYFQKERAYLSISKAKKFNGPGNNAQRIIIPLHGDTSGVLKSHLTIASLFDHRPQDKGKPFKP >NZ_CP039032.1|WP_032126227.1|363788_364079_+|hypothetical-protein MGRLFNKENPADLKSSGYFSTEPRGQSHHSVIVIVMAMISIFVMTRVICSIITWMIHSAPLTFIFTMLISFFAAPYVFIVIIIVAFFIGILVKTPS >NZ_CP039032.1|WP_016212008.1|364116_364815_+|hypothetical-protein MLKKNKSTSFVIGLALSLSFACYANALTEAEFKATKLPYSVMAYSNQYAHEYGLDASKAIDLPKGLEAIKLILYKEHIKGDEVLLPQDIYRCSAELYVDKSLSLYWPGNYPKVDKVGDRGLQKAQVSTVQLKRKGEYWVPGPYASMLYDSYDQTIKPNLAKINLGFFGCNYIPSRYTAVKDGLAIWLERKGGHNYAAIGQSEAEISSKDFYIFKLPQKLVNNYLPYARMAAN >NZ_CP039032.1|WP_016212010.1|364831_365128_+|hypothetical-protein MVQLTLSDFAFLANDVYLNPGLELALPRENSQRCQRLLNNTETVINSDPHGPKANGFFARVYKYKQGNKMSLIVAYRGTSNVEDYLIDAELASGQAIE >NZ_CP039032.1|WP_016212007.1|365251_366397_+|hypothetical-protein MLTVDYSQLFGIKPTAFRTVTFNPPGMQGVDPNGRAPHYAEIAHTISQHKIASGKLAAAMVSVAPEVSLVGATAGVEVVVKKIMELLNYQTAIKNRSIALRMGQGALIFLWDLLMPDRNGLSVDKEINNPYPHIYNISSRYDLVHCSGNPGGNLINYDIDPLGKITNGDDDRRAKFKYQFLENYFEARQHYLKHGVNSAKMKSKYEQLSKADNWALYFENPGKEGVHLPTAKDWENYFKDVRNIPEYQQSARKTDRVMQYYTGTLSSNQAYDKPYDLFLTKAAKVFIKYLFIAEHSMANMLPSIQVNQNLAQVKISYSAHETILAMRKCSSLINLHTTERLKGPLVAAHDNVQKYQKKGIYPYNQTNYQALAASHGVLSTG >NZ_CP039032.1|WP_075273619.1|366669_367245_+|hypothetical-protein MANYSQAYCVAQGFNVNANIHRRFGYINYLRIGDLELSADIDVEVPVEGVKSKHVGVISDLFWQETAKVQPITIDFRLSVSNQQQLAHYIEQNNFNSDVLIEFASYDYDANAQAFYSSFNTDKETIEGDLEILAADSQLAIYVGKEQETDVQSPVNYFVSLSMVSTAKAQQLISATSARIKRVLPWGVTVA >NZ_CP039032.1|WP_016211273.1|367302_368136_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase MPELPEVETSCRGIAPHIQNQKIQRVTIRQQQLRYPVSVQITTKKLKQQKVTQVSRRGKYILLELDHSAWLMIHLGMSGNLRILEDTTPAGKHDHIEIQFANQKILRLNDPRRFGCFLWTNDLANHKLLKHLGIEPLTRQFNANYLYQAAQSRKIAIKTLLMDSQVVVGVGNIYANEALFQTGIHPSTYCHVLTTNQCAELTRIIKAILKQAIKAGGTSLKDFTNSDGKPGYFKQKLFVYGRSKEPCLTCQEDIQQFRQNQRSSFFCPCCQPEPKTM >NZ_CP039032.1|WP_016211268.1|368251_369436_+|fatty-acid-desaturase MLSFYGLLNLPWWGYIIAVLLLTHVTIVAVTVFLHRHQAHRALDLHPVVSHFFRLWLWLTTGMVTKEWVAVHRKHHAHCETAEDPHSPKTYGIKTVLWEGADLYRHAIQTQPEMMEKFGHATPNDTLERHLYSRFRYLGIIIMLILDIVLLGVPGIAVWAIQMMWIPFFAAGVINGIGHYVGYRNFEAADASTNVSPWGILIGGEELHNNHHAYASSAKFSVKPWEFDVGWMYIRLLEVCQLAHVKKRIPRGACVAGKSEVDNATLKAVIQNRLQLLSKYQKDVLQPTFKAERARQGESVLNSTASKLLKRDQRFFSHADHQALEQVLISSKALDLVYQFRAKLQAIWTQKASNQKDVLDALKQWCSQAEASGEQRLQEFVSYLRGYVLTTQSH >NZ_CP039032.1|WP_016211271.1|369454_370399_-|L,D-transpeptidase-family-protein MGIITQRHNTVAGIALFTSSIFCTSAATAFTLPISSHNTNDVVGWQVITYSKAGDTPLKIAQRHSISIQRLQALNSKVRHWQKQRIYLPYQVILPQLIQQQQSKITVNLAEKRLYYFNAKSQVLSVYPVSIGREHWRTPTPTKTTYIIHKKKHPTWNVPASIQRYYRAQGKSLPKQVPPGPENPLGTRALYLGITGILIHGTNQPASIGTASSSGCIRLYTNDIEHLYKQAGVNTPVKLIYQPYKVGFNENVLYIEAHPVISDYDKNNQQRQIIIEKLQNMTNNSKQLQVNWSLVDKAINEAAGIPVPIGKLFY >NZ_CP039032.1|WP_016211269.1|370703_371489_+|hypothetical-protein MAKKIFYSLIIVILLLVVGSYFLFSHMDSILRSAVEKIGSKTTGTTVTLGSLKTSLKEGQVSLSRLTMSNPAGFSQANAISFKDIMVNLDPSSATQQTIVLNKVIIKDPYLLYEMKEGSSRSNLQQIQKNIQSYFASKQAKNNESNQRNSGVTQQEPSQAKVAAKNQKKFIIKELEILAGQVKVISPLLKSKEKTLSLPNIRLTNIGTGGSGLTPDQVTEQIINVLVANSGQAVAQAGLDRVKTKLKEKASGLLNNLLGNP >NZ_CP039032.1|WP_016211272.1|371606_371975_-|hypothetical-protein MKIHCLPTHFSVCRFKVGTPLPALKNLSFYSLSSDSEGLRLVLKEQDMPKRIRGVDHGWCALHFTDEDDNSEQCLNLLCSRLNSEQIESFVAPTYEMNFLFVQQHNLEAALDVIEDLEYQWA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP039032_2 | 685145-685265 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP039032_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP039032_2
>2.1|685182|47|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder GCAAAGTATGTCCAGCACGTACTTACTGACCCTAAACGATTTGAGCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039032_2
The CRISPR arrays of NZ_CP039032_2 >merge|NZ_CP039032|2|685145-685265|CRISPRCasFinder AGCTTATCAATGGTTAGTAGCCCTTGGACTTAATCAAGCAAAGTATGTCCAGCACGTACTTACTGACCCTAAACGATTTGAGCGAGCTTATCAATGGTTAGCAGCCCTTGGACTTAATCAA >NZ_CP039032|2|2|685145-685265|CRISPRCasFinder AGCTTATCAATGGTTAGTAGCCCTTGGACTTAATCAA GCAAAGTATGTCCAGCACGTACTTACTGACCCTAAACGATTTGAGCG AGCTTATCAATGGTTAGCAGCCCTTGGACTTAATCAA
>NZ_CP039032.1|WP_054300282.1|683302_683767_+|IS630-family-transposase MDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR >NZ_CP039032.1|WP_051307363.1|682185_682368_+|hypothetical-protein MYIKHCKLPENKQIELMKYFIADSTTRTAADLADIHRNTAIRFFHKLREKIALKQQNRSE >NZ_CP039032.1|WP_129556590.1|681513_681909_-|nucleic-acid-binding-protein MTELCPCCSQKPYSSCCQPFVSGQTLPATPEQLMRSRYTAYTQANIDYIIATMQGEALNGFNRNSATTWAKQSTWLNLQVLSAPAVKQDGQEGFVEFIASLQNQGKIECLHEKSRFIKNKDQWFYVDGQQH >NZ_CP039032.1|WP_032126312.1|680722_681517_+|M48-family-metallopeptidase MIVLIFALCTLEHLGYDGAMKIVKKLKQLKTYQLTVDNIDYRISHTGRTKTYGLSIRDGKVHMNVPKRMSKQRVCQAIDDNQAWVRENIRFSLASTKQHQSLSSGSLISYLGKQYSLKLTYVNQSVVFYDDAFLMGVPARVKSENHQAYIRDKLSAWFKEQALLRFEQRTFFIANRMQLKPTKVSVRSYKARWGSCSSSGCLSFDWKLLQAPEFIIDYVIVHELSHLKHFDHSPAFWQLVSLYYPEHKVARQWLKNNQTSLARL >NZ_CP039032.1|WP_016211756.1|679818_680544_+|M15-family-metallopeptidase MLPDLPICHNYKTVDKQALNELQQQAACVELKPSSRIMCLNEYYQQKLPGALSVMYTRQSVYLKLLAVLENLAPHFAFAIFDAYRSVACQKTLFEQIYRELYQRHPGRSKEWLEIEVRKYVSHPHEPSRFAVPPHNSGGAIDLTLMDLRTNTALDFGTEFDNTTTLSQTDYFERDYSANLGISSERWLLIRQNRRLLFNTMKQEGFTNFVSEWWHYDLGDCLWADAVGSSWFYDSMEAEVN >NZ_CP039032.1|WP_016211759.1|678385_679573_-|S-methyl-5-thioribose-kinase MNKYQKLNAEKAIEYVKQYNIFFTHYEHLRCEEIGDGNLNLVFRLINDNDNKSLIIKQALPYARCVGESWPLSLDRARIEAESTQIQANICPGYVPKIYHTDNTLALTIMEDLSDHVVLRNGLISGQSYPELPQQIGSFLAHTLFYTSNLYLDSHLKKQYLRQFINPDLCKITEDLVLTDPFFGSERNHYDQDIQTQVTELQNNQQLQLNVAALKLKFLSSTEALLHGDVHTGSIFVTKNSMKVFDSEFAYYGPMGFDIGLIIGNMVLSLCSHFIQNNLNSVNYCLNAIEIIWQTFESKFTTLAKEHTQDLAFKNDIYINHTIKNIFADTLGYTGCEVIRRIIGLAHVEDLDGMENKTLKNKAEILALTIGQQFILEQNQLHTIDNVIQKLQGHL >NZ_CP039032.1|WP_016210935.1|676030_676573_+|acireductone-dioxygenase MSQLTIFHANNSHQMIFQSSNQREISSQLAHVGIRFEQWQAHAKVSAEDSEEHILTMYAEDIHRLKKQGGYQAVDVISLDSSHPDKALLRQKFLSEHTHSEDEVRFFVKGKGLFCLHIDDKVYQVLCEQNDLISVPDHVAHWFDMGSEPEFTAIRLFNNTEGWVAELTGSNIAKRFPLLD >NZ_CP039032.1|WP_016210943.1|675347_676034_+|acireductone-synthase MIKAILTDIEGTITRISFVKDVLFPYAEKQLPEFIHCFCETPEVFAQLDAVKNEINNQQATIAQLIDTLLAWIREDKKITALKQLQGMIWEKGYQQGDFTGHLYSDAVEFIREQCKRNIPVYVYSSGSVKAQKLLFSYSDFGDILELFSGFYDTKIGGKKEMKSYQNIIEELNIQAENVLFLSDIAAELDAAKQAGLKTCQLVRDNQKPSKHHPWVNNFNKFIIQDYS >NZ_CP039032.1|WP_016210942.1|674732_675344_+|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase MQNNNDVVNQLITAGAWISEKGWVPATGGNFSARLANGVVVTASGYDKGCLTEASFCQFDLEGNQFTGTGKPSAETALHLAIYQLDDHAKAVLHTHSIAATTLSRYIAESQLAIHGYEMQKSLAGIQSHLETINIAIFDNDQDIDALVGKVNKAHAKKPLRHGILIRGHGLYAWGDSILEARRHLEGLEFLFMCELERFKLQG >NZ_CP039032.1|WP_016210944.1|673666_674686_+|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase MQDLLSTALRYEKNSLYILDQTLLPHKMQWLECCDVDTMTEIIQSLRVRGAPLIGIACSVLVAHLAAQGMEKRELISAIAVLKASRPTAVNLMNNLQQMTLALKVENYRQALIKTAEKLFFEDVLLCQKMAENGAKLLATQQNLLTHCNTGSLATVGMGTALGVIQQAHTNNDNIHIYVDETRPLLQGGRLTAWELSQLNISNTIICDNMAASLMAQGQIDAVLVGADRIAVNGDFANKIGTYNLAVLAHYHDIPFYVVAPYTTVDCDCLHGEDIPVELRDGDEVRGVKGAFGKIVWSPAESQVYNPAFDVTPAQLVTRWILDTGVFGLDDIKAGVLAK >NZ_CP039032.1|WP_075275117.1|685421_685844_+|hypothetical-protein MQLSYLELNSVEYIQKVLANITLLDQDACALNKLRVVYSKITQQIESGQLKVHGLGGGSAITFKGERTKVPEGISKIWYEITDMQGNFRWMDNVSAVLNKVKVEANNRSGYRGLTAIGLFFGSYRDAQTKDLYSKISQAL >NZ_CP039032.1|WP_016211905.1|686087_686498_-|hypothetical-protein MKLNTKETFTRFMGLFIAVDCLYYLIGLTIFSAIPSGNLIAFVNIFTSFCGLVTGILLFIKIYDKWYTPFVAIEFFTCIYWFFLTLGETVSNTQYASLSKVITSLNYDLFSCFMGVIACLLWLKFAFSFKANKLAN >NZ_CP039032.1|WP_052047041.1|686766_687030_-|hypothetical-protein MARSVRIVPQGVYHIWREMTDSEGKFKWPSDVCAAINRSKVQAEQRKDYRGLTAVSLFFGSYRDTHTKALYSQISQGFKTNTHQYKD >NZ_CP039032.1|WP_098082812.1|687262_687778_-|hypothetical-protein MLSTPWLAALDLDLDTDDDIIKTKNLSALDVTCRLIISRYNLYQRENFFQVFNNPKCFYQSYQYLEILGLNQAASIQQLLDGPFEKYKDTWSTLSYLGLDCRENAQRILTNPQSFEQDFDGLIALRSAYESIVKEMEANQLKAHGLAGGNPIKFKGETVSVATSVGILHIQ >NZ_CP039032.1|WP_016210678.1|687922_688933_-|protein-kinase MPKIVWESQENRTAAEQQAAEWRIAKKYLAGRAPGTQLNPKHGQHKISFKDPKTNEEVYLTHRYLLGNKGEIFVKSNGYLLGKTPRNLVTFGQTKDGQVWAIKESCEIGKDLKESEIACDLDAAKKMFKSNSKCYQVYRFLGLPLDQYLRQNRLTEEERLDLAIKVSQAVHHLHIGTQSRSHTCYAHLDLKPSNICIDHEGQVHLIDYGFSKSLAGRLTHRKGTSSYLSVDYASASKEALDIFALLRTLYLPKKFKTYTQKAKKSRDHHEYILNDDIISKNGLLYALLDTEDGKIKHTRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP >NZ_CP039032.1|WP_016210676.1|689236_691318_-|kinase-domain-protein MPKVIWLAQENRTAEQQQAAEWRIAKKHLTGKPPGTQLNPQSGKKVKAYEDPETGEKITLTHRYLIGHEGEIFVKFNGQALGQGICGEVTFGQTEDGHMWAIKESSEKPKNSQEGKIAVDLGKAKNYFKYQGKHYQVYYFLGTPLDKYLKEAKQSLTQAQQYDLAIKMARVIYHLHTGKYSKEKTSYAHLDLKPENFCIDDSGELHLIDYGLSEILPGKLDNEIKGSPAYLPFSVAEASKEELDIIALLRSLYLPLCFKGLGKVRNRGPAAQQLNTQWVFSSTILSQNSTLSQLLDTTKGEVVNLSALDIACQLILLKYGLHSSENLEKVTANPQQFEQDSQLLESLGLNQAAYLKCMLEQRDLVSVFKEYTDKFLILNQFDLNQPIYIKKVLANLEQFSQDYQYLESLGLNQAAYLKCLLEQRESIDLLKEHANKFLTLNQYELNQSIYIGKVLANPEQFNQDYQYLKSFGLNQAAYLKYTLDQHDQFAYNCQRLKDLKLNSRNYIEEIINNPERFEQNYQHLETLGLNQEIYIRPMLNNPQRFGEYCQQLKDLGLNQASDLARALDHPQRFQDDLPSLLKLRKIYDDLSNEIASDRLKVRGLFAGGITVNCQGQSKLVPRGIGSIWLEIIDKQGNFYWMKDVSAALTKSTDQARLRSSSQQQAEGQNSNLFFATYRDPKTQAVYDRISQLP >NZ_CP039032.1|WP_016210671.1|691773_693033_-|6-phosphofructokinase MNNSKNLFYAQSGGATAVINTTACGVIETARQKEEINNVFVGHDGIIGALAEELIDTSLESAETIRQLYHTPGSAFGSCRYKLPPIGQNDEVYQRLFSVFEAHDIHYFLYNGGGDSQDTTNKVSIMSKKLGYPLKCIGLPKTIDNDLMHTDNCPGFGSAAKYIATSIKEAALDVAGMARTSTKVFLMEIMGRNAGWLAAAAGLAAEQDGDAPHIILFPEIAFNEKRFLQRVKEVVQTHGACTIAISEGLRDEHGDLLIKSSSIDAFGHVQLGGIASKVAALIKHNLGYKYHWALPDYLQRAGRHLGSKADVEQAYAIGQAAVEAVIAEKDNIMLAIERTSNSPYQWQVGEVCLNDIANHEKFMPKEFISEDGYHITEACRDYMSPLIAGECIPPFKNGLPVYARLKKQTIPPKLSPFEI >NZ_CP039032.1|WP_016210673.1|693165_693639_+|hypothetical-protein MMQIIWRLCTFRAGPQDIVYSVFGLQLICVIHFISQWGWLSLRLPLLHSALVALFSAALLLALPYLVVNSAKYAGRFLQTALALQLVSCVLHILLLALFLLHSPLVLLNYYLIFSFIWGAALFSHIIKEAIVVKLWQAVLIVLIYFIVRTVSVIGLM >NZ_CP039032.1|WP_016210672.1|693647_695030_+|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase MHIHILGIAGTFMGGVAQLARAKGVTVTGADLNVYPPMSTQLAQAGIAVTAGYDDEFLKLTKRPDCVVIGNALSRGNPAVEATLNENMPYCSGPEWLAREVLHGRHVLAVAGTHGKTTTSSMLTWILEHAGLQPGFLIGGVPKNFGVSARLGQGEYFVVEADEYDSAFFDKRSKFVHYQPKTLVLNNLEYDHADIFDDLQAIMRQFHHLVRTVPSNGKIIVNSIDENLHTVLEMGCWSPRVSVGLQAGDITAEVIQADGSHFEVICHGMRYEVNWSLIGQHNVMNGLAAIGAALQVGVDLKHACEALTLFQGVERRLQVFGQSQGVTVYDDFAHHPTAIATTLEGLRHRVGTEGRVIAVFEPRSNTFKMGVHQDNLAAAFSCADRVYFYQPTGLSWQIADNLKKEEQFNYRVRHSIDELLQALTDDGLKDHDHVVVMSNGSFEQFHQRLLNQLELECENA >NZ_CP039032.1|WP_016210677.1|695022_695637_+|UbiX-family-flavin-prenyltransferase MLNFKKKIILAVTGASGAPYALRLLEHLVLSGVQVSFLISPAGALTIKEECDIHLPAKPEVLQQRLTELTGATAQQILCYGRNDWFAPMASGSAAFDAMIICPCTMRALAAVAMGLSDSLIERAADVMLKERRQLILVPREMPLSVIHLENMLKLARAGAEIIPPMPGFYYRPDSVDDLIDFVVARLLDRLGLAHSLGQRWGER |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP039032_3 | 1617428-1617534 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP039032_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP039032_3
>3.1|1617466|31|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder CCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039032_3
The CRISPR arrays of NZ_CP039032_3 >merge|NZ_CP039032|3|1617428-1617534|CRISPRCasFinder GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGACCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAAGCGCTTAATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA >NZ_CP039032|3|3|1617428-1617534|CRISPRCasFinder GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA CCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAA GCGCTTAATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA
>NZ_CP039032.1|WP_016211836.1|1615376_1615865_+|protein-kinase MPFFPGDSFNAALTKDPDSVDEIILAVALELQRIHQSGVIHGDIRSDNIIIEEKNGIFNAKFIDFGWAYEYPSDDNVIVTKCSYFAPERAKIDLKAHPSQDIYSFGWMLGIAHDLVKEIPEKFYGFLIGANEEDPVLRPELRLLIKANLCPTLGEYYTQLVK >NZ_CP039032.1|WP_051307365.1|1615096_1615357_+|hypothetical-protein MPILEYQRPRSGSVIERRLESGVVESYQSIRDLGQGGNGSVRLFASKTALERYAVKRPLEVQRHSLDYLKLEERLSKRRSFIFSNF >NZ_CP039032.1|WP_016211834.1|1614525_1614840_-|hypothetical-protein MNQDTELSLSEEKEQKNFESLCDMLYECTIKTINQHTASFNEDELIFKQPIFMHINAAAQVLNAMINDAGDVLAEQHNEVTPELAVNELKKLTHSILFGDDHSH >NZ_CP039032.1|WP_080664871.1|1612812_1614435_+|SulP-family-inorganic-anion-transporter MKSKFLNNVKGNVFGGITAAIIALPVALAFGLSSGMGPMAGLYSAVCVGLFAALFDGTPAQISGPTGPMTVVMAATLINLNDVDAEAGLAMGFTVVVLAGCFQILFGLAKLGRYITLVPYPVISGFMSGVGVIIIILQLPPLFGYPLLANLWQTVLNITDMLAAPNYTTFYIGLIVLVIAFFWQGRLNQFFPAYLLALIVGTVIYLIIFKNNADMISVIGNIPSGIPKLHWPTFDIPHLRVIITSALLLAVLGAVDSLFTSLVANNITHEHHHSDRELIGQGLGNMASGLIGGLPGAGATMRTVASIQAGGSTSLAGIVHSLILLAVVLGAGHYFSSIPHAVLAGILIKVGTDIIDWKFIVRLYRLPIFSSILMLIVLLLTVFVDLISAVFVGVFIANLVTIDRLSHIQLDGISLSDGIKNRHDLLSSEADKLRKKRGQIVLFRLVGAISFGVARQIKKQISDFKEHQMLVLDLSRVSLVGVTSIIMIDDIVQAELNKNNKVYIIMDEEGVDENLEKISILKKLKQEYFVKSLDEVLRKC >NZ_CP039032.1|WP_032126362.1|1612015_1612381_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH >NZ_CP039032.1|WP_075273327.1|1611494_1612070_-|IS630-family-transposase MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR >NZ_CP039032.1|WP_016212185.1|1610411_1611401_+|rhodanese-related-sulfurtransferase MNQVVVAAMYKFARLPDYKDIQPKLLAFCKAQGIKGTLLLAQEGINGTVSGSRQAIDNLLNFLKSDSRLRALEHKESYLDAAEVPFYRMRVKLKKEIVTLGVDGIDPNEIVGHYVKAQNWNALISDPDVIVVDTRNDYEYDIGTFKRAENPNTETFREFPEYVEKNLDPKKHKKVAMFCTGGIRCEKSTAYMLKQGFEEVYHLEGGILKYLEEVPKEESLWEGECFVFDNRVSVNHDLEKGQYDQCHGCRYPITEQEKASSLYIEGVSCPYCYNNLSDEQKARFSERQRQMALAKHRGHQHIGDSIELAKQVKRQKRKAQVEACQTKQK >NZ_CP039032.1|WP_016212182.1|1609892_1610078_+|hypothetical-protein MKSMKKHSKLEAEIAIEPADVIEMTMTELSTRRAEAMEAIESGKFIQIVKHKKPIGMLVPF >NZ_CP039032.1|WP_016210748.1|1607257_1609213_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein MPYYTFIYLIALMVSLFITQSFYAANYLNHSLDKQRIFFHQAEQHLKKSRLQSFKKELKKLTHYPLYPYLRYQELIRQLQLGFLPNNKIKHFLNQYQNTIFHDRLHRQWMIHLYNKKWWKTLIKYYQPATKSTAMQCRYLWARYQLNYQQQSLHAFKKVWLQGRSLPKVCDRLISALRKHKQLTNSLAWQRITLAMQKRNYQLAGYLARFLSSQDKKALTLWRILRRHPEKMTKTSLIRAAGNKANYIANDTLLQLAKRKPEYAITIWPRLKSKFSLTKQQKIAITKSIALHLALKKSSKTSHWMEKVPDQDQSLTLTSWNIRTALYQQRWQHALTLINTLPPNEYDSHLWQYWKARALEQLGQITQAKKVYKRLAKHRDYYGFLASNKLQQPYQLNRKAVNISKHILSNVSKKPGIRRAYEFKKTGHPGLARSEWVYAINQFTETEKLAAAKLAHDWGWYNLSVLTTTKTKHRDDLKLRFPMAHYRAILRNAKRYEISPAWVFSVARQESIFHEHAYSPVGARGIMQLMPTTARYIAGKIQIRHYTSKLLDANHNIALGTAYLKRLLERYDNRLILALAAYNAGISRVNQWLPERNPIAADLWIETIPYKETRSYIKNILAYTVVYNARLGHTTKMAQQLVNVPTLKQIS >NZ_CP039032.1|WP_016210749.1|1606497_1606959_+|hypothetical-protein MSKIKSLKPFVHEITVDVHFSKKQAMHIRKLGQNLDLRVITPKAMVRLGEQLFTAKLISAIDLMSLLQPGFNQNYGEVAAQMGVQLKQPPALMNAIQFYYESWQKKIRQKGVNSQQRLLARREYHLMLALQKSLGLPVDGKMIQAKKTVIEDL >NZ_CP039032.1|WP_098082828.1|1618238_1618496_+|transposase MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN >NZ_CP039032.1|WP_052047040.1|1618565_1619504_+|IS3-family-transposase MPRATYYRQQKKGTLEKKPAFKPSNAIDNQEKDQIIELLHSERFIDSTPYQTFYTLLDEGHYYCSIRTMYRLLTEHSGTKDRRIQRNHRNAIKPELIATTPNQVWSWDITKLLSTKRLVYYHLYVILDIFSRYAVGWLIADRECQDLAYQLIEATALRQGVQKGSLTLHADNGPSMTSGTVGDLLENMGIIKSHNRPYTSNDNPFSESQFKTLKYCPQFPKRFDNIKEAELFSQDFFKWYNSMHYHSGRCFLTPESVHYGLSDGILDKRHDTLMSAYIENPSRFNNKPPVRKILKPAYINPPQTVIIQGVQK >NZ_CP039032.1|WP_051307338.1|1619529_1621095_-|APC-family-permease MIGSGWLFSSYYAAKITGAAACLSWITTSVVILLLGLCLAEIATLYPKRGLMARLLTLSHNKEFAFICTISTWLGLTAVIATEAEGSVQYISSLSDSFGPMIFNNQIHQLTSLGLIIAIVMILSFGLINFWGIKILSKSNVALTTCKIAIPLVTGLSVMFAAFHHQNFHNDHAPLLNYGPSSVFIAMIGAGMIYSFNGFQNILSFSSEARQPTRDIPLAIIFSILITLAIYLVLQIAFIGALSPHILEQGWQSLNFTSPFVQLTALLNLNFITIILYADSVISPSGTGLIYTGSTTRLLTAMSQDGQMPRFFNKIGAYNFSRRSLIFTVGFSIIFLLLFRSWSALVSFLSLFYVISYMSIPLSLSKLHQQNLVGKFRAPLPKLLLPVIFAFLSLLFIFSKFPYTGDVALFTVIAYAAYLLSKFKLATDLNHFKKTVKHSSLMVIYIIILAALSSIGPKEYGGYNLLSKLQFFPSVIFVSFIMYRLSLAWIRDKATETQVIKISPTLQRNVSGEMRQNYRFS >NZ_CP039032.1|WP_016210800.1|1621304_1622132_-|DsbA-family-protein MKKYLFASLSLVTPFVLSNAFAANTTTFTAAQQEKIGEIAAQYIINHPEVLIQAGQKLQQQQMKAQEKQQITAVLHAKKQLLSDPKTPTVGPSNAKVAVVEFFDYQCVFCSKVAPAIEKIMKDNPKVKFVFKDFPIFGQRWPTSTYAAEVGLVAYKQGGAKMYMNYHNGIYATGKDEGKLTNKDVDMVAKKAGVDLTKDKTLLSAGKTPPPSIQANFQLAGEALGLRGTPALVIMPTSGANEKNVTVFAGYPANPQGGTAAAVTAIQQAIDKASQ >NZ_CP039032.1|WP_075273540.1|1622498_1623110_+|hypothetical-protein MSKVIAICPLLVGCTFLCSTSAESESDPSVSQDAQFITEVARSVMQDDISQSIVTECKSMNTESQSALIAEKNHYVPTKKAIQHMETAILEYGSNLADHYEREHPSTMLVTYRGWITSKQCINKLKETVMRAAQALICLGKEQNAVRDSAQLLLIDTVEAVAMKQDYGVSEDQEDQPCAIGWSSTMTYYGLKALDQALVTSKH >NZ_CP039032.1|WP_129556527.1|1623294_1623555_+|hypothetical-protein MSANSNSKIDVIALTVSGQVEKKIRVECNSLATDHVTDDLASKTNRDRAWQIYSSSYERCMAEALDMMRQDLLAVSIQPQLRPEIN >NZ_CP039032.1|WP_016210799.1|1624016_1624970_+|chemotaxis-protein-CheV MRANLLENIDSRTKLVGRNRFEALVFSIHGRQYAINVFKVREVLHLPELTVLPESHPAVLGVVHIRNQSLAVIDTCQAIFAKKTLDPLSGILIVTEYNHSVQGFLVHEIHHIINATWENVIAAPEATGKDKYITSVLKINEEGATSLIQVIDVEKVIYEIHPAQYDIKVSTNTLENVVIEQAPHYTALVVDDSLIARKQVKKALDTIGVKSILMRNGREALDYLINVLPGAGGDITQKYLMVIADVEMPEIDGYAFIKACREHPGLKNLFIILNTSITGVFNENDIQQTGCNEFIGKVNPQKIIECARMQILNRASQ >NZ_CP039032.1|WP_016210791.1|1625396_1625597_-|hypothetical-protein MPGDEKKKAAKTSTRENQSSLIDSEASSLPPTLLFYTDSLSLIDQGQDIPIGSKKESSCPTCCLVM >NZ_CP039032.1|WP_051307339.1|1625971_1626778_+|methyltransferase-domain-containing-protein MKLGEGSLKEKMVFIERATDQSIPTPWQLFSRLIYRYWFLKYPWQMSKFLGRQSKRLWLWFWLSSCNRSSGLKKVDNSIKNTLEKYGLTLGFFKAAIANPRATGAVLPSSRFLVREMVTHVVQMPERYVVELGAGTGVITQELLSSGVSPGQLIAIEYDKNLARKLAARFPDILVICGNAVELERLLGEKNGCVSTVISGLPLRSLPNQAVMHILQQIPSVLVSGGSYIQFTYDFKKKEEYYPGDIELSLSKKIWLNIPPAKVDVFTK >NZ_CP039032.1|WP_016210795.1|1626883_1627855_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MFKSKLIVLTLSIWATCFYGNVVAQTKTSTNNNTKIARVLVNDWTSQIVLSKITAHILASINYQVTFVQSTSNRQWYKLKSNLADIQVEVWQGTMADKYNQLIKSGDIVDAGNHVAKTREDWWYPEYVEKQCPGLPDWKALRKCYKIFATPKTAPKGMYLGGPWEKPDRARIRALNMNFKVIQVKNGDALWIELEKAVKQKRPIVLFNWTPNWIESKYKGKFIEFPHYSAECENNPKWGLNSKFPWDCGNPKDGWLKKIARSQFQKEQPCAFELLKNINFTNTMIANITAAVDADKMSYDEAAQDWLNQNKALWHSWIPSSCK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP039032_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039032.1 | 155058-155095 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039032_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039032.1 | 256554-256591 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039032_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039032.1 | 962081-962118 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039032_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039032.1 | 1051631-1051668 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039032_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039032.1 | 1060501-1060538 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039032_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039032.1 | 1092380-1092417 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039032_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039032.1 | 1174269-1174306 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039032_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039032.1 | 1183570-1183607 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039032_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039032.1 | 1482552-1482589 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039032_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039032.1 | 1482686-1482723 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039032_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039032.1 | 1753518-1753555 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039032_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039032.1 | 2312960-2312997 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039032_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039032.1 | 2416533-2416570 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039032_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039032.1 | 2453312-2453349 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039032_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039032.1 | 2642309-2642346 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039032_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039032.1 | 2761820-2761857 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039032_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039032.1 | 46479-46516 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP039032_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039032.1 | 225981-226018 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039032_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039032.1 | 461924-461961 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039032_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039032.1 | 603556-603593 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039032_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039032.1 | 965333-965370 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP039032_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039032.1 | 1363585-1363622 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039032_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039032.1 | 1521158-1521195 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039032_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039032.1 | 1565980-1566017 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039032_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039032.1 | 1598043-1598080 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP039032_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039032.1 | 1702970-1703007 | 0 | 1.0 |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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NZ_CP039032_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039210 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence | 166717-166754 | 0 | 1.0 |
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4. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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5. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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6. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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7. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038897 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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8. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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9. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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10. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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11. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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12. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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13. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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14. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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15. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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16. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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17. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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18. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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19. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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20. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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21. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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22. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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23. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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24. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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25. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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26. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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27. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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28. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
29. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
30. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
31. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
32. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
33. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
34. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033943 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
35. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
36. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
37. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
38. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
39. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
40. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
41. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
42. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
43. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
44. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
45. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013780 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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46. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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47. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050946 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
48. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050947 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
49. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
50. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
51. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
52. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
53. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
54. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
55. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
56. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
57. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
58. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
59. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
60. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
61. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
62. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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63. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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64. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
65. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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66. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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67. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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68. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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69. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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70. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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71. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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72. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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73. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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74. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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75. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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76. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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77. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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78. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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79. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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80. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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81. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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82. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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83. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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84. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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85. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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86. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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87. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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88. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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89. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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90. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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91. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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92. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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93. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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94. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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95. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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96. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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97. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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98. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048070 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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99. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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100. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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101. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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102. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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103. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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104. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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105. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039207 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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106. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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107. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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108. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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109. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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110. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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111. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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112. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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113. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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114. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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115. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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116. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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117. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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118. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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119. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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120. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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121. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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122. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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123. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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124. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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125. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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126. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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127. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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128. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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129. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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130. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** ***
131. spacer 3.1|1617466|31|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
cctaggattaagtcagaatcgtattgaaaaa CRISPR spacer tataggattaagttagaatcgaattcagtaa Protospacer . ***********.******* *** *. **
132. spacer 3.1|1617466|31|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016317 (Bacillus cereus strain M3 plasmid pBCM301, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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133. spacer 3.1|1617466|31|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to CP020755 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid pLDW-16, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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134. spacer 3.1|1617466|31|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021062 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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135. spacer 3.1|1617466|31|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NC_020385 (Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-328, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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136. spacer 3.1|1617466|31|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NC_018492 (Bacillus cereus FRI-35 plasmid p01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
45566 : 89679
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039032|45566:89679|DBSCAN-SWA CTCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCTATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTAACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCACTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTAGCATTGCAATAACCTTCAACCATCATTGGTGGGATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCTATAAAGTTAATTCGTATTGATTTTTTACCTGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGGCCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTCTCGACTTTTTCCAGGAAAGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATTTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGAGTTTTACCCGGATTCTGATCAATAAATTTTTGAAATTCTTTCATATCACTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAACCTTGCTTTGACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGAGTGTCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAATTTGTGTAATAGGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAATTCTTAAGTCATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAAAATATAATTTTTTGTGATGAAATATTTAATCATTGATAATGAGTGATCTCTTTTTTATTGAGTTGGTTAATAATTCTAGGCTGAGATAATTAGGTTTAGATAAAGTACATTTACTTTATCACTGCATCAATTTACTCATGATTGCTTGGTTTGGGCAATAGCCCTAAGCCAGGTAGGATCACTCCCCAAGGTTGCCAAGATAGGCCTAAAGTTAAGCCAAATAAATTAAGTTGCACCCCTTGCCGGTTTGATATAATTAAACCTAAAACTCCCCACAGTGAAAGACGATAGCCAGTTTTATCAGCAAGTCTGGTTATTATTATTTTTAGTGACACATAGTCTTTGCCTAGTGCATTGGCTGGCATGATTGCTCCAAATTCAGGCGTTTGATCTAATATATAGGCAATAAACGTATTGCTATTTGGTCCAGGCCATGCTTGATAAGTGTGTGCATATGGATAGCTTTTAGCTGCTTTAGCGATCTTTGTGATTAATATTTCTGCTTTTTTCCCTGTCAAGCTTTTCACAATGATGGGGGTGTGCCCAAACCATAGACGGTCAGGCGCCCCTGATGAAATATCAACAATAGGACGGTTGTGATACGCATTCCAGCCAATTACTTGATAGTTTGTATAGTGGGTTGCACCATAAGGTTTTACAGCGATCCAGGTATGCACGGCAAACAAGCCACGCCAATTAAATGCGCGAGCTTCATATAGCTGTACGACGGCTTCTTTAAATTGACCGGCCGTAGGGGCAATTCCAATAGAATGGCGGTCAGCGGTTTGCCAATTTTGACCGAACTGTACTTGACCTGTTACTGCGAGCCAGATTGGCCCGATTAAAAGGGTTATAAGAATGATTATAATTATAAAAAATGTTTTCAAAAGCATACACTATCTTTAATTTGTCTAGATTGCAGTTAGCTTATCAAGAAACTGAAAGGCACAGCAATATACTTGTCTTTTGCTAAACGCTTTTTGTTTTATTAACACTGAGTTTGATGTCATAGACCATGAAAAATCAAGCTTATTGTGTTACTTGGGGTTATTTAATAGAGATGTACTTAAATTTAGGGTTCTGTTAGCGTGAGAGCTGTATGTTAAAATTCAGTGCTTAAACTTTATAGATTTTATGAGTTTTTATGTATCATAACCTAACTGTATTTTAAAGTATTAAAAAGAGAGTGTTGTCGTGAAAAAAACTGTAGTTTTACTTGTACTTGATGGATGGGGCCATTCTACTGATACTAATAGCAATGCGATTTTGAATGCGAATACGCCTGTTTGGGACCACTTAACCGCTACGTATCCGATGACGCTAATCTCCGCATCTGGTACGGATGTAGGCTTACCGGCAGGTCAGATGGGTAATTCTGAAGTCGGTCATTTGAATTTAGGCGCGGGTCGTGTTGTTTATCAAGACTTATTGCGTATCGGCTGTGATATTGAAAGTGGTGCTTTTTTTGATAATAAAACACTGACAGAGGCCGTCGATACGGCGGTGAATCAAGATGCGGCTGTGCACATCATGGGATTGTTATCGCCCGGTGGTGTGCACTCTCATGAAGATCATATTGAGGCGATGATTGATTTAGCTGTGCAACGCGGTGCAGAAAATATTTATTTGCATGCCTTTTTAGATGGCCGTGATACGGCACCGAAGAGTGCTGAGAGCTCGCTTGCTCGCTTTGAAGAAAAATTCGTCAAGAGTGGCAAAGGCAGGATAGCCAGTATCATCGGCCGTTATTATGCCATGGACAGAGACCAGCGCTGGGAGCGTATAGAAGCGGCTTATCAGCTGATTACAGAGGGTAAAGCAGAGCATCAGGCTAAAAGTGCAGTTGACGCTTTGCAGGCCGCTTATGCACGAGGTGAGCGTGATGAGTTTGTGCAAGCGACATGTATCGGTAAGGCTGTGGCCTTAAATAGTAATGATACTTTGATCTTTATGAACTTTAGAGCCGATCGTGCCCGCCAACTCTCACAGGTGTTCAGTGACGAAAGCTTTGCTGGGTTTGCTCGTGTAGTTCATCCTCGTCTGTCGGCTTTTGTTAATTTAACTGAATATGCAACGAGTATTAATGCACAGGTAGCCTATCCATCATTGACACTCAACAATGTGTTAGGTGAAGTGTTGGCAAAAGCGGGTAAAAAGCAATTGCGTATTGCTGAAACAGAAAAATATGCGCATGTAACGTTCTTTTTTAATGGAGGTATCGAAGAGGTGTTTGCCGGTGAAGAGCGCGTGCTGATTGCCTCACCGAAGGTGGCAACCTATGATTTGCAGCCACAAATGAGCGCACAGGAGTTAACGGATAAGCTGGTCGCTGCAATTGCGAGTCAAGACTTTGATGCGATTATTTGTAATTATGCTAATGCGGATATGGTCGGTCACACGGGGGATTATGCGGCTGCGGTACAGGCGATTGAAGCGCTGGATCACTGCCTTAGTCAGGTTGTTGCAGCTGGGCAGCAAGTAGCTGCGGATATCTTGATTACTGCTGATCATGGTAATGCTGAGCTGATGGAAAATCTTCAAACTGGCCAGCCTCACACGGCCCACACCAGCAATTTAGTACCGCTTGTGTATATAGGCAAAGATGCTACCCTAACTAAAGAAGGTGGTACTTTATCTGATATTGCGCCGACACTATTACAGCTGTTAGATCTTACAGTTCCAGTTGAGATGACCGGCCAATCTTTGGTGTATTTGAAATAGCCAATAAAGTAAGTAAAGATAACGATATAAGATAAAGATGGGCCACTGAATACAGGTGGCCTATTGATATGCAGCGATCGATTCTAATTTTTTTTCTTATCATCTGCGTTTTTTTATTTTTTGTTAGTTTTATAAAGGTGATTAATGCAGCAGATAATCGTTTAGTAAAGCTACGCAAAAAAATTGCAGTACTTGACCAAAGCTTAAGTTTGGACAAAACAAAACGTGCAGATATAGAAAAAAGAATTTTCCTGATTGAGAATCATATTAAACAGGCTAATGTATTGATTATTAATAATCAAAATAATATCAATGATAAAAAGCTAAAATTAATTAATCTAAAAGAAAAACAGCAGCAGCTAAAGAAAAGTTTGTTTAAGCAGCGTCAGGAGATTAATCGATATATTAAAACCATTTTTTTGATGGGTCGAGAGCCTTATTTAAAGTTGATTTTTAGCCAGCAAGATCCGAAACTTTTTGGTAGAATGCAGCACTATTTTCAATATATTATGAAAGCAAATCTTGCGCGTTTAGATCAAGCTGAGCAAACAGAGCAGGCACTGAATGAGACAAAAGCGACCTTGCTTGTAGAAAAAAAACAGTTAGAGCGTTTAATAAAACAGCAAGAAATTGATTTAAAGAAACTTTCTAATGATAAGCAATTGAAAGATCAATTAGTTACTATTATTTCGACCTCTATTAATGAAAAAAGTAAGCGATTGGTTGATTTGTACAAAAATGAAAAGCGCTTATTAGCATTGATAGAGCAGTTAGATCAAGAGAGTTTAAAATTTGTCCAAAGCCAAGTAAAGTCATTTAGTCTTATGAAAAAGCAACTGCTTTGCCCTTTTAATTATATTAATTATGATCAAGCTATTAAAAATTTAGCGATGCTAAGAAAAAACAAGCCTGTATTTATTCCAATAAAGCAAGGCAGTCCAGTGCAGGCGGCATATTATGGCCAGGTTGTTTTTGCTAATCAGTTAAAAGGCTATGGCCAATTGGTTATTATTGATCATGCTGAAGGTTATATGAGTTTATATGGTTATAATCAGAAATTATTGGTGAGCAAGGGGCAATGGATTTCTGCTGGGGACCTGATTGCATTGTCTGGACAGGGCAGTGAGGGTATCGGTATGTATTTTGAATTACGTCATAATAATCAAGTTGTTAGTCTAAAAGATTGGTGCCAGAAAATAAACTTGGCATAAAAATAGCTTATATCCTTTTACGAAAATAAGGGGATATACATGAAGCGTTTATTAAAGTACTTGATGTGCTGCCTGATGCCATCATTATTAATGACATTATCTGTAAGTGCATC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46 | Moraxella_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
136473 : 178470
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP039032|136473:178470|DBSCAN-SWA 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46 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
182276 : 239530
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP039032|182276:239530|DBSCAN-SWA 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56 | Escherichia_phage(12.5%) | transposase,protease,tail,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
256927 : 301882
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP039032|256927:301882|DBSCAN-SWA 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49 | Acinetobacter_phage(40.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
329457 : 375012
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP039032|329457:375012|DBSCAN-SWA 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46 | Hokovirus(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
447624 : 545944
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP039032|447624:545944|DBSCAN-SWA 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93 | Escherichia_phage(32.14%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
590095 : 641240
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP039032|590095:641240|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP039032|590095:641240|619656_620772_-|WP_016210170.1|DBSCAN-SWA MTTIGQTKQHIDTPALVIDQQKLLANLHFMQKFANQHGKQLRPHAKTHKCSHLAKLQQQIGAIGICVTKIAEAEVLVKHGITGILITSPVVTPQKIQRLMILAKQDSSIMVVIDYAGNAEVLNQAAVQADITLKVLVDIDPGVQRTGTSYQQALILGQQLHELPGLELQGIQCYAGNLQHVHDFHVRQQASSQAMQRASEVFSQFKAANLPCTILTGTGTGTYDIDSQVSLVSEMQPGSYTVMDQEYANIQGQNLHRFDQFAPAMTLLTTVISANHDHHVTVDAGLKSLYIDQTPPRIISHPHLHYDWGGFGDEHGKVTSDGNGPLPKVGDVLELIVPHCDPTINLFDQFYITQANLITEIWPIDLRGKSQ >NZ_CP039032|590095:641240|604373_605651_-|WP_032126294.1|DBSCAN-SWA MSTNIQQQNYSKPLINRHYPALLISLCTLFLFYKYLLQISPSVMTSELMTSFHLEGAGLGNLAATFFYSYFIMQIFAGPMLDRFNVRYLASGAITMSAIGTIIFANAYSLGLAEIGRSLMGAGAAFATVTYLKVTADYFPPERFAFISGLLPTGVMIGAAIGGGPLAKLVESTGWRHSLLICSLIGLLIASCFFVFMRSNPKSATTSQRKPSKLTLKDYLSVLAQPSNWCLTLYSGFAFAPLAVFSGLWGQPFLQVAYHLSSAHAASLATLGFIGFGFGGPAFGYFADKIKRPILSMVLGGIVSLISLITVIYLAPTLLLLSIFIFIFGFGVGAFMLGFAFAKNLNSLLLVGTVTAMINTGDALCGALSEPLIGYLLDLGWKGQHFNGAPVFSTHDYKHAFLILPVYILLSLVFLWLAQRLEKSK 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52 | Staphylococcus_phage(37.5%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
649327 : 683767
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP039032|649327:683767|DBSCAN-SWA 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37 | Catovirus(20.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
712407 : 819880
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP039032|712407:819880|DBSCAN-SWA 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102 | Escherichia_phage(36.59%) | protease,tRNA,transposase,integrase | attL 729021:729080|attR 735249:735536 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
909092 : 961152
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP039032|909092:961152|DBSCAN-SWA 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44 | Agrobacterium_phage(12.5%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1023064 : 1104672
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP039032|1023064:1104672|DBSCAN-SWA 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83 | Staphylococcus_phage(35.29%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1125342 : 1252690
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP039032|1125342:1252690|DBSCAN-SWA 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119 | Staphylococcus_phage(17.65%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1295410 : 1478618
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP039032|1295410:1478618|DBSCAN-SWA 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175 | Leptospira_phage(12.5%) | transposase,tRNA,protease,integrase | attL 1361095:1361154|attR 1429634:1430863 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1483059 : 1527190
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP039032|1483059:1527190|DBSCAN-SWA 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46 | Escherichia_phage(16.67%) | transposase,integrase | attL 1498185:1498244|attR 1527957:1528247 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1556812 : 1612070
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP039032|1556812:1612070|DBSCAN-SWA 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47 | Bacillus_thuringiensis_phage(20.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
1618238 : 1674031
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_CP039032|1618238:1674031|DBSCAN-SWA 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56 | Staphylococcus_phage(42.86%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
1702057 : 1740899
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_CP039032|1702057:1740899|DBSCAN-SWA 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31 | Staphylococcus_phage(20.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_18 |
1751164 : 1851060
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NZ_CP039032|1751164:1851060|DBSCAN-SWA 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96 | Staphylococcus_phage(20.0%) | transposase,tRNA,protease,integrase | attL 1821576:1821635|attR 1856060:1856140 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_19 |
1877910 : 1937020
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_CP039032|1877910:1937020|DBSCAN-SWA 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55 | uncultured_Mediterranean_phage(30.77%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_20 |
1973834 : 2018957
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >NZ_CP039032|1973834:2018957|DBSCAN-SWA 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MAIDKQLVLNLQKVGIDYDDIWRDCKDNLELQALAATTVNSVESWQKAKQFIVVKSALESFNPAQSYQTPFSLITVNKRENLRDLRGLCSAVAASEEHSGLLVGELARLLNLPTNNALKLEICPEGNAVSMNDIDNYVSVRELLEGDRRAEGDLEAVGGELSMLMLEAHTKTSEAEQLNSMSLTH |
37 | Bacillus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_21 |
2025713 : 2069391
Sequences of DBSCAN-SWA_21
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21 >NZ_CP039032|2025713:2069391|DBSCAN-SWA 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47 | Staphylococcus_phage(14.29%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_22 |
2081917 : 2139791
Sequences of DBSCAN-SWA_22
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22 >NZ_CP039032|2081917:2139791|DBSCAN-SWA 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53 | Klosneuvirus(28.57%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_23 |
2176863 : 2213939
Sequences of DBSCAN-SWA_23
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23 >NZ_CP039032|2176863:2213939|DBSCAN-SWA 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28 | Vibrio_phage(14.29%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_24 |
2224007 : 2283898
Sequences of DBSCAN-SWA_24
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24 >NZ_CP039032|2224007:2283898|DBSCAN-SWA 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55 | Bacillus_phage(27.27%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_25 |
2300025 : 2399582
Sequences of DBSCAN-SWA_25
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25 >NZ_CP039032|2300025:2399582|DBSCAN-SWA 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99 | Armadillidium_vulgare_iridescent_virus(12.5%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_26 |
2415420 : 2457190
Sequences of DBSCAN-SWA_26
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26 >NZ_CP039032|2415420:2457190|DBSCAN-SWA 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42 | Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(20.0%) | transposase,integrase | attL 2425637:2425696|attR 2453819:2454922 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_27 |
2475982 : 2649049
Sequences of DBSCAN-SWA_27
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27 >NZ_CP039032|2475982:2649049|DBSCAN-SWA GTTACTGCTGGCCGGCACGTTGTTGTTGCTGATCGTTGTCATTACTCTCTTCATAGACAATTAAAGGTTCAGACTGACCTTCAATCACAGACTGGTCAACAACAATCGTTTTCGCCTCTTCCTGTGAAGGAATTTCATACATCGTATTTAATAGCACTTGTTCAAGCACAGAGCGTAGCCCACGAGCCCCCGCTTTGCGTTCAATCGACTTACGTGCGATTGCACGCAAGGCATCATCACGCAAATCAAGCTCCACGCCTTCCATCTCGAACAAACGTTTATACTGTTTTACTAGCGAGTTTTTCGGCTCTTTTAACACCCGAACCAAGGCATCTTCATCCAACTCACGCAAAACCGCGGTCACAGGCAGTCGGCCAATGAACTCTGGAATTAAACCAAACTTCATTAAATCTTCAGGTTCAACACTTTGCAAAACATCAGATGTATTTTTTGTCTCGTCCTTACCACGAACTTCTGCTGAAAAGCCAATGCCTCCTTTTTCAGAACGCTCACGAATTACTTTTTCCAGGCCATCAAAAGCCCCCCCACAGATAAAAAGGATATTTGCAGTATCAACCTGCAAAAATTCTTGCTGAGGGTGTTTTCTGCCTCCTTGTGGCGGAACAGAGGCGACCGTACCTTCTATCAATTTCAATAATGCCTGCTGCACCCCTTCCCCAGACACATCACGTGTAATCGACGGATTATCAGACTTGCGTGAGATCTTATCAATCTCATCGATGTAAACAATGCCTTTTTGCGCTTTTTCTACATCATAGTCACACTTTTGCAGCAATTTCTGGATAATATTCTCAACGTCCTCACCAACATAGCCAGCCTCTGTCAATGTCGTTGCATCAGCAATGGTAAAAGGCACATCCAACAAGCGAGCTAAAGTTTGTGCAAGTAAGGTCTTACCGCAACCGGTTGGTCCTACAAGCAAGATATTACTCTTACTCAGTTCGACATCATCCGCTTTTACTTCTCCGCCTCCTGGCATCAGACGCTTATAATGATTATACACGGCAACAGCCAACACTTTTTTAGCTTGCTTTTGGCCGATCACATACTCATCTAGCACCTGCTTAATTTCACGAGGGGTAGGTAACTGACTGGGCTCTTCAGAAGTTTCACCTTCTTTTAGCTCTTCACGGACGATATCACCACATAAAGACACACATTCATCACAAATATAAACAGAAGGGCCGGCAATTAATTTACGGACCTCATGCTGGCTTTTTCCACAAAAAGAACAATACAGGAGTTTGCTGCTCTCATCTCGTCCGTTTTTCTCATCACTCATGTACTAACCTCGTTTTAACAATCTTTGCTCTTATTTTTAAACATGGCGCCCTGACCATGCTTTTTCAAGAAACTAGAGCCTTTAGGCGGTAATACCCCGCTCAGCAACAACCTGATCAATTAGGCCATAAGATTTAGCATCATCAGCGCTCATAAAGTTATCACGCTCAGTATCTTTACAAACCTTACTATAATCTTGGCCAGTATGCTTGGCCATTAAACGATTCAGACGCTCTTTTGTCTCTAGAATATTATTTGCATGAATCTCAATATCTGTCGCCTGGCCCTGAATACCGCCTAAAGGCTGATGAATCATCACTGAGGAGTTCGGCAAACAAAAGCGCTTACCTTTCTCACCCGCAGTTAATAAAAATGCCCCCATACTACAGGCTTGACCAACACATAACGTACTAACGTTGGGCTTAATAAACTGCATCGTATCATAAATGGACATTCCCGCCGTCACAGATCCACCTGGCGAATTAATATACAAAGAAATATCTTTATCTGGATTCTCAGCTTCTAAAAATAATAATTGGGCAACGACTAAATTGGCCATATGGTCTTCAACCTGGCCCACTAAAAAAATAATACGCTCTTTTAATAAACGTGAGTAAATATCAAATGAACGCTCGCCACGTGAGGTCTGTTCGACAACCATTGGCACTAAATTTGCTGAAATTGACATTGTGTTTTTGCCCCTCTAGTTTTCCGCAAAAAGAAAAATCGCTGCAACCTTTTCTTAAGTATAAAAAAACATTGCAACGATTAACACATACAATGTGAGATTAGGCGTGAAATTAAGCCGCAGCTGTACTCATCACCTCAGCAAAAGTCACGTTTTTCTCTGTTACATGCGCATCTTCAAGTAAAGCATCGACCACTTGGTCTTCCATAACAATCGCTTCAACTTCAGCTAATTTTTCTTTGCTATTGTAATAATAATCAATGACTGATTGAGGCTGTTCATAGGCCGCTGCTAATTTTTCAACCATCGCTTTAACACGCTCTGCATCAGGTTTTAGCTCTTTTTTCTCAATCACTTCAGCCACCAACAAACCTAATAAGACACGGCGCGTGGCCTGTTCCTCAAACATTGAGGCAGGAAAATCTGGTGCTTTAGCGCCTTGCATTTGGCCATACTGTTTTTGCATTTGCTGCTGCAAACGGCCAACCTCAGCATCGATTAATGTTTTTGGCAAATCAACGCTATTTTTCTCAACTAATAAGTCAAGGATCTCAGTTTTATTTTTATTTTGCACAGAAAGATCAAGCTCACGCTGCATCGTTGTCCGCAATTCCTCACGCAAGGCCTCAACCGTTTCACCATTCACTTCTAAACGTTTAGCAAAATCGTCATTAATTTCTGGCAGTTCAGGCGCTTCGATACCATTCACTTTAACGGTAAATTCAGCAGGTTGCCCAGCAAGGTCAGAGACCTGGTAATTCTCAGGGAAAGCAACATTAATCACACGCTCTTCTGCTAATTTCATTCCCATGATGCCATCTTCAAAGCCTGGAATCATCATACCCGAGCCTAACACTAAGCTAAAGTTCTCAGAGGAGCCGCCCGCAAAAGTCTCACCGTCTTTACGACCTTCAAAATCAATCGCTAAGCGATCGCCATCTTGTGCTTCACGCTCAACACTTACCCAATTACAGTGCTGTTTACGTAACGTTTCTAGCATATTATCAACGTCTTTATCCTCAACCAGACCCACCGCTTTTTCTACTTCAGCGCCAACCAAGTCGATAAGCTCCACTTTAGGCATCACTTCAAAAATCGCCTGAAAAGAAAATTCTTCTTTCTCTGCTTCTTTAGCCAACTCAAAACGCGGATAACCGGCTGGATGTAATTCTTCTTGTTGAATCGCCTCATAAAAACTCGACTGCATCACTTCAGAAGCAACTTCTTGATACACACTCGCACCATAACGTGATTTTACCACTGCAAAGGGTACTTTACCTGGACGAAAGCCATCCATTTTTGCTGTAAGGCCTATTTTTTTTAATCGTTTATCCACTTCACCATTGATTCTGGTCGCAGGAACTGCAATATCCAATCGACGTTCTAACCCTTCACCTGCTTCTACCGCAACACGCATCTTCATCACCTCTATTTCAATAAATCTCTAATATTCTTGTAATAATGACCAAAGTCTAAACTCTCGCAGTCTACGGATTGTCCCAAGACTTGTCTAGCCCAACCTAATCCGGTTGCGTCAAATTTTAACTAAAAGTAAGGATTGCAGCAAAGTTTTTCAAGGGGGAGGTAGCAAATTTATCAGATCTGAAGAATACCGACCAATACAAATTAAATAACAATAATATCTAAAAGCATGTTAAAAAATAGAGCTGGTGCGAATGGAGAGACTCGAACTCTCACAGGGTTACCCCCACTGGCACCTGAAGCCAGCACGTCTACCAATTCCGCCACACTCGCAATGGCGCGCCTGGTAGGATTCGAACCCACTACCCTCGGCTTAGAAGGCCGATGCTCTATCCGTATGAGCTACAGGCGCATAAGATACTAACGTTAAGAAAACGCTAGACATTCTAGGCTAATAAGCCCATGTAGGTCAAGCACCTACTCACACAATTACCAATAAAGTTTTTTATTTAAAGGCTGACGTGATGCATACAATATGAGAAAATGCAGCCTCTTTCATAGCACCTGAACATCTTTAAACAGCATTGAGGTTTATATCATGGCCAAGATCATCGATGGCAAACAAATCGCCGAGGACGTCCGTACTACCCTTGCCAAGCGCATAAACCAACGACTCGGCCAAGGGCTACGTGCCCCAGGATTGGCCGTTATCCTCATTGGCAGTGACCCCGCCTCTGAAGTCTATGTCAACAACAAGAAAAAAGCCTGTGATGCCGTTGGCATACTCTCAAAAGAATATCGTTTGAGCACAAAAACCTCAGAGCAAGAGCTCACTACACTCATTCAACAGCTCAATACCGACCCCATGATCGACGGCATCTTAATCCAACTCCCCTTACCAAACCACATTAATTCAGATGCAATTTTAGAGTTAATCCATCCCGACAAAGATGTCGATGGCTTTCACCCTTACAACCTCGGCCGCCTAACCCAAAAACGCCCCCTATTGCGCCCTTGCACGCCCTATGGTGTGGTTACTTTACTGAAAAAAACCCTCGGTGAGTCCTTACATGGCCTACATGCCGTGGTTGTCGGTGCCTCTAACCTGGTGGGCCGTCCTATGAGTCTGGAGCTACTTCTTGCTGGCTGTACTGTCACCACCTGCCATCGTTTTACCAAAGACCTACAAACCCAAGTCGGTCGCGCCGACATACTCGTCGTCGCGGTTGGTAAACCTGAATTTATTCCTGGGCAATGGATTAAATCTGGAGCAACCGTCATTGATGTTGGGATCAACCGCCTAGAAGATGGCCGCCTAGTGGGTGATGTTGACTTTAACCGTGCTTTGGAACAAGCCGCTCATATTACCCCTGTACCCGGTGGTGTTGGGCCGATGACCGTGACGACCCTACTCGAAAATACCCTGTATGCGTGTGAAAATTTGCATAGTACAAACACATCAGTCCCAAAATAAACCAAGCCTAATAAGCCTAATCTAGATCAGATGTTATTTTGCTTTATTAATATAACCCCTGATCTAAAGCAACCGACTTTAATTAATTTTTATTTCAGCTTTTTGCCCTGAATA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152 | Staphylococcus_phage(11.11%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_28 |
2686128 : 2825112
Sequences of DBSCAN-SWA_28
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28 >NZ_CP039032|2686128:2825112|DBSCAN-SWA 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140 | Escherichia_phage(32.14%) | transposase,plate,integrase,tRNA | attL 2791068:2791127|attR 2804853:2805044 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_29 |
2937674 : 2981072
Sequences of DBSCAN-SWA_29
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29 >NZ_CP039032|2937674:2981072|DBSCAN-SWA 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41 | Acanthamoeba_polyphaga_lentillevirus(14.29%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_30 |
3012757 : 3130184
Sequences of DBSCAN-SWA_30
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30 >NZ_CP039032|3012757:3130184|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP039032|3012757:3130184|3068358_3069135_-|WP_016209710.1|DBSCAN-SWA MNFIDKMIAIKKEEITEIDAKDIFQRLENMSVVELSKKEFLPDQFNIIAEIKRSSPSKGHLAKINDPIALAHQYAQGGVQAISVLTEEKYFNGSLEDLKQVSDSLIDTNIAVLRKDFIIDELQIYQAAAFGASAVLLITSMVKGQLVHLIKVALEVGLQPFVETHSLDDIKCAEDAGAKILGINNRNLHTLGIDPEHCLRMIDHVTISTDIKVVAESGIHSIEQVQAMKKSGFTATLIGELLVKSNDPTALIQTMLKD >NZ_CP039032|3012757:3130184|3065722_3066481_-|WP_016209700.1|DBSCAN-SWA MSISTVFNNKQPFIAYITAGHISVEQTIESILSLERAGVDIVELGVPFSDPVADGPVIQQAMTRALKQQITFDDVIYIIEKVREHSAIPLVLFSYYNPILKHGECFYQRSQQAGVDAILVVDLPLEEMAEHIQLCQRYNLQIIPLITNTMALSRVKESAALDSPFLYYVSRKGVTGVQAQSNIVTTKVHLAKVKEVAQKPVAIGFGIGCKNSAKEALAVADGFVVGSYIVNLIEQALHPEQIETLVKNIDPR >NZ_CP039032|3012757:3130184|3046006_3046330_-|WP_016209707.1|DBSCAN-SWA MVLCKVVWRITLIISCLTLSGFNSVWASLSDPTDDSSATTTTQTTSTDQNQQKNNQERTKLTQKVIKALTKTDYKKWSSQQNFNGEVDQEEGKLFASDDYDSVGDNE >NZ_CP039032|3012757:3130184|3121251_3121596_+|WP_016211291.1|DBSCAN-SWA MSETIDRALYQNNIAGTLSFNHFDKANHNAKIGYWLAPCYQGQGLITTACQKFIEYGFNALNLKCVEIHCAINNIKSQNIPIRLGFTKTDDRQEEIKLADNQYADAIIYSLVKH >NZ_CP039032|3012757:3130184|3098330_3098834_-|WP_016210340.1|DBSCAN-SWA MALLNILQYPDPRLRLQAKPVTVFDDALAQTVQDMYETMYESSGIGLAATQVNIQQQILVMDLSENRSDPLCVINPEILETFDHAEHDEGCLSFPGVFAKVERAARIKIAAFDQRGEKFELEAEGLLAVCLQHEIDHLEGKVFIDYLSPLKRKRLEKKLLKQRRQVL >NZ_CP039032|3012757:3130184|3041847_3043245_-|WP_016209721.1|tRNA|DBSCAN-SWA MTMSVKAILAGAAKVGDRVTVKGWVRTKRDSKAGISFVAINDGSCFDSVQVIAANSLTNYESEIAKLTKDCAVIASGELVESPGQGQSFEVQATDIQVVGWVEKPESYPVSPKRHTVEYLREVAHLRPRTNLFAAVTRVRNCISQAIHRFLSQEGFAWVHTPLITASDCEGAGEMFRVSTLDMLNLPRTDKGAIDYSQDFFGQESFLTVSGQLNVEAYCLAMSKVYTFGPTFRAENSNTSRHLAEFWMIEPEIAFADLNDNAALAERMLKFVSTTLLEQCADDMAFFAARVDKQALTRLETISQSNFEIMDYTTAIEQLLKADKSFEFPVAWGVDLASEHERYLCEELVGKPVTVMNYPKDIKSFYMRLNEDGRTVAAMDVLAPGVGEIIGGSQREERLDVLKARMQEIGVSEQHLDWYLDLRRYGTVPHAGFGLGLERLVSYVTGVANVRDVIPFPRTPGNIPF >NZ_CP039032|3012757:3130184|3077433_3077973_+|WP_016211865.1|DBSCAN-SWA MISVGQKLPEFNVKATVSNTLNDNAFTEITEKSYAGKWKVLFFWPKDFTFVCPTEIAAFNDLYSDFDDRDTILLGGSTDSEFVHLAWRQNKEELYDLRFPMLADVKRELSAKLGILDSEEGVSQRATLIIDPENIIRFVMVTDLNVGRNPQEVIRVLDALQTDELCPCNWQAGDQTIKV >NZ_CP039032|3012757:3130184|3023111_3024110_-|WP_016211203.1|DBSCAN-SWA MAYAYQAKKSASFLRRLNNPFDSDSKGFKPYITPGWNKQLELIGHTVCYSDYVVAVYGPIGAGKSTFLELLKQRLDKRAQFSHLQGESKHSELTTLRAIAVALYLPPADHCTTIEHCFDYIYKYMAERRHTGVSYVLTVDHADHFGPKILSMLQLLAAKLRDQKGCMLHFLLFGEERLIRQLKEILGDKSWQEYLYCCKLKPFSDVEVQLYLDDKLRSLSEAFAFSERDIDLVLKGAVGLPGRINQISRQLVQQKEPKQTRAHRGYRNWAVVFSLLVLISVVVSYLSNQPSWHDSARYGEHSKQSVSHKTTAGLKPGEVSVPLILPGKASSG >NZ_CP039032|3012757:3130184|3020769_3022056_-|WP_080664857.1|DBSCAN-SWA MGNNIVYSQCLSNGCNRRRGDNLLYIQQRNKLNFILVIFGVIAAQAAVSLYLPSLPAIDHEWHLASGQAQLTLSAFFLTFGVSQLFYGALSDHFGRKPLLLMGLVILVLSSVWAIYATSFHSLLAARLVQGVGGGALSVLARAIIRDLFHGDELRKAISILAIAASFTPALAPSLGGWLEDHFDWRSSFVILTAYSIILLVTIFSLFTETNQYQRQPNESIDFSKVVASYYSVTKNKLFWCYGFAILIGYLSLVICLANAPFLLEKKFGLSAEITGYLMFVQPGFFLVGNLLQHKLTDKISGDLFLKFGMVILGVIGLSFLFQGVFHSATLINVLLTLALAGFATSLILVNALAGVLLPFTENAGAAAALSGVLQMVVASFITALISNLHWTSIIDLGWIYLALFVVLYISLLFLHRIRLYSPCYKSA >NZ_CP039032|3012757:3130184|3029092_3029458_-|WP_032126362.1|DBSCAN-SWA MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH >NZ_CP039032|3012757:3130184|3018991_3020308_-|WP_016211206.1|DBSCAN-SWA MKADSLGIAQYQQDNTQGQSRLAWLAIALCACFLFYKYVLQVSPSVMTNDLMESFHIHGAGLGNLAATFFYSYLIIQIFSGPLLDRFGARYIGSLALLVSALGTWLFAQADQLLWAEIGRALMGVGVAFATVTYLKVAATWFDARRFALLSGLVPTAVMIGAVFGQVPLAHVVASEGWRRSLELCAILGVIFAVLFLLFVRDKKNHSFAIDDTQQVNWQDIISVLKRPANWLLTLYSGLAFAPLAVFAGLWGNPFLVASYQLTTADAASLTSLVFIGLGVGGPIFGALADYFGKRTLWMFLGGFVTLASVLCLLYCPDLHSTLLSILMFLFGFGTSAFMLGFAMAKDMNSLLLAGTVVAMINTGDAILGAVTEPLVGYVLDLGWHGQELNHSPVFSMQDYMYAFSLLPVYLILSLLFLFWITKVMKKEDKKENLVISK >NZ_CP039032|3012757:3130184|3075932_3076994_-|WP_075274972.1|transposase|DBSCAN-SWA MNKELLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDEVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDSEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKVQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL >NZ_CP039032|3012757:3130184|3094555_3095935_-|WP_016210336.1|DBSCAN-SWA MKITILGAGQVGSTIAAQLSQEDDNEITIVDANSENLEALQEKLDIRTVTGLASYPHVLAQAGVEEADMLVAVTSSDEVNMIACQIAHSLFNAPMKIARIRSQSYTKHGNELFLNKVIPIDVIISPEQVITRQICRLIRYPGALQVLNFAGTKVRLVAIKVDRNSILAGHPASFLSNIDKHIDAKVVAIFRDNQGIIPGANTTLLPGDEIFFISANDDIKTLMSKIYEDRPRFNSIMIAGGGNIGTYVAKRLEADYDIKLIEIDPKHSERACHTLDRTIILLGDATDSDLLNQENIENIDIFCSLTNDDENNIMSAMQAKRLGAKYAISLINRPAYVDLVEGGDIDIAISPQHATIGALLAHIRRGDVEKVHSLRKGAAEAIEAVAHGSAETSKVVGRKVSALKLPEGAVVGAVVREDQVYIHCEDVMIQENDHVVLFMTNKRKIRDIESLFQVSSGFL >NZ_CP039032|3012757:3130184|3110120_3110303_-|WP_032126148.1|DBSCAN-SWA MTCDNITPLGYVFMPHHIALWRARGVEANYQGQLKMLRNIHAADSQHRNKQQCNQRKSNI |
113 | Staphylococcus_phage(33.33%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP039032.1|WP_129556569.1|1052569_1052779_-|hypothetical-protein |
1052569_1052779_-
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_129556569.1|1052569_1052779_-|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_129556569.1|1052569_1052779_-|hypothetical-protein MTNFVHASEFTFQQDDGLINDDWVRLVQPSLPLGTQINSLALTQAGDTLYINTQSVGSFLCQGDIALNE |
69 aa aa | NA |
HTH_ARSR
HTH_ARSR HTH domain information
|
NA | 1023064-1104672 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 1051668-1051631, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 1060538-1060501, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 1092417-1092380, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 1060404-1060367, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ********** *************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_016212450.1|1059505_1060408_+|hypothetical-protein |
1059505_1060408_+
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_016212450.1|1059505_1060408_+|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_016212450.1|1059505_1060408_+|hypothetical-protein MNMNSLLSVALQMTEGELIKDGQITFEQALEFTYDQQSVCESDAIRALIQQGILSFDLSLKLTGCQQRNLEAPVIAELLRSKDQRCRLTLEQALALDSVQRDNIKSKTVRALLQEGILPSIEKALSLTEEQRRSLVRPTVGKLLRSKDHFLHLTLEQALNIKSEQELTLASKDIRQLIQDRQITLEQALAFTSEQQRSCESGVIRALVQEGILSFDLSLKLTGCQQRNLEEPRVAELLRSKDEHCRLTLDQALRLMSWHKEFLQSKLTFKLIKDKKLTMEQALTLSYSAGLTVSDILSVG |
300 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 1023064-1104672 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 1051668-1051631, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 1060538-1060501, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 1092417-1092380, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 1060404-1060367, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ********** *************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_016211536.1|1099361_1099595_+|hypothetical-protein |
1099361_1099595_+
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_016211536.1|1099361_1099595_+|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_016211536.1|1099361_1099595_+|hypothetical-protein MGEIFVPKFNLLSVTGDQETVDNLLLSVKKRLYDKGTPLKNCYFNLQGQLLAEGWVYDSKTLIEVDLGGELKPEWYN |
77 aa aa | NA |
HTH_Tnp_IS1,HTH_38
HTH_Tnp_IS1,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 1023064-1104672 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 1051668-1051631, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 1060538-1060501, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 1092417-1092380, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 1060404-1060367, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ********** *************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_016212614.1|1103322_1103529_-|hypothetical-protein |
1103322_1103529_-
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_016212614.1|1103322_1103529_-|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_016212614.1|1103322_1103529_-|hypothetical-protein MRLKELRRQIFAFLQLNDLIQDAQTAQDVLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP |
68 aa aa | NA |
HTH_Tnp_IS1,HTH_38
HTH_Tnp_IS1,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 1023064-1104672 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 1051668-1051631, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 1060538-1060501, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 1092417-1092380, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 1060404-1060367, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ********** *************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_033923740.1|1124996_1125284_+|hypothetical-protein |
1124996_1125284_+
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_033923740.1|1124996_1125284_+|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_033923740.1|1124996_1125284_+|hypothetical-protein MPRYQLLEKMNGEKILDFDQESYILMNRKVRQHAKAHPGSLIAHIAGGMELISVVWHGACAAINIELLNFLADAEKGGIARVREFALRHLKCNTQ |
95 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | No | NA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_098082828.1|1367587_1367845_+|transposase |
1367587_1367845_+
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_098082828.1|1367587_1367845_+|transposase>NZ_CP039032.1|WP_098082828.1|1367587_1367845_+|transposase MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN |
85 aa aa | NA |
HTH_21
HTH_21 HTH domain information
|
NA | 1295410-1478618 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 1363585-1363622, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_098082828.1|1427746_1428004_-|transposase |
1427746_1428004_-
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_098082828.1|1427746_1428004_-|transposase>NZ_CP039032.1|WP_098082828.1|1427746_1428004_-|transposase MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN |
85 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 1295410-1478618 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 1363585-1363622, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_155049900.1|1788273_1788579_-|hypothetical-protein |
1788273_1788579_-
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_155049900.1|1788273_1788579_-|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_155049900.1|1788273_1788579_-|hypothetical-protein MFLANASLAFNIDSAVAEFKDEIKTKEKEVNELHRQLGKRTAELEWAAKKLKSLDYETRKCLIESEPKNIPVTRQCELINFNRSNCYYSAQRIVSDIDFIT |
101 aa aa | NA |
HTH_Tnp_1,HTH_38
HTH_Tnp_1,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 1751164-1851060 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 1753555-1753518, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_016211563.1|1788927_1789089_-|hypothetical-protein |
1788927_1789089_-
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_016211563.1|1788927_1789089_-|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_016211563.1|1788927_1789089_-|hypothetical-protein MLPSFQTEQFNDLFLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSTVRVTQRYVP |
53 aa aa | NA |
HTH_Tnp_1,HTH_38
HTH_Tnp_1,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 1751164-1851060 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 1753555-1753518, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_016212013.1|1807874_1808258_-|hypothetical-protein |
1807874_1808258_-
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_016212013.1|1807874_1808258_-|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_016212013.1|1807874_1808258_-|hypothetical-protein MTINKRDFFDAINYADTAVQIHEYLLNILEKQQKDFAENCNNDNDSEKSKALASISDVELRFAQLDMLSAIYRKILLNTLNEIEGCNDQELKTIKNGLLHMVATTLEACVNDFTIEAKITIDIKEEQ |
127 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 1751164-1851060 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 1753555-1753518, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_129556517.1|1803663_1803951_-|hypothetical-protein |
1803663_1803951_-
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_129556517.1|1803663_1803951_-|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_129556517.1|1803663_1803951_-|hypothetical-protein MLSTPWLAASDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVLSTPHK |
95 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 1751164-1851060 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 1753555-1753518, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_155046727.1|1821235_1821580_+|hypothetical-protein |
1821235_1821580_+
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_155046727.1|1821235_1821580_+|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_155046727.1|1821235_1821580_+|hypothetical-protein MRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLT |
114 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 1751164-1851060 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 1753555-1753518, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_129556515.1|1822405_1822765_-|hypothetical-protein |
1822405_1822765_-
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_129556515.1|1822405_1822765_-|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_129556515.1|1822405_1822765_-|hypothetical-protein MLTEDSSYELSHFKGGLPGHLYLITNDLETDGNGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL |
119 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 1751164-1851060 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 1753555-1753518, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_075274844.1|1823912_1824164_-|hypothetical-protein |
1823912_1824164_-
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_075274844.1|1823912_1824164_-|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_075274844.1|1823912_1824164_-|hypothetical-protein MNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGCQPPISETV |
83 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 1751164-1851060 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 1753555-1753518, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_081377858.1|2032471_2033182_+|transposase |
2032471_2033182_+
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_081377858.1|2032471_2033182_+|transposase>NZ_CP039032.1|WP_081377858.1|2032471_2033182_+|transposase MLKTRTYLGLLTPCLALHGSQRKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKFLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL |
236 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2025713-2069391 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2050189-2050226, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2053695-2053732, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_054300380.1|2050264_2050921_-|transposase |
2050264_2050921_-
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_054300380.1|2050264_2050921_-|transposase>NZ_CP039032.1|WP_054300380.1|2050264_2050921_-|transposase MARSERKSNISKNEYFRNLINHAINNQVKFDYTVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL |
218 aa aa | NA |
HTH_21
HTH_21 HTH domain information
|
NA | 2025713-2069391 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2050189-2050226, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2053695-2053732, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_016212421.1|2054160_2054343_-|hypothetical-protein |
2054160_2054343_-
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_016212421.1|2054160_2054343_-|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_016212421.1|2054160_2054343_-|hypothetical-protein MLLKDLRFSVLRLLSDLYNHEKSKDGSTNDLNFLTKCKREAEEANSKQEIADLLNTHLTH |
60 aa aa | NA |
HTH_21,HTH_38
HTH_21,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2025713-2069391 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2050189-2050226, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2053695-2053732, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_032127044.1|2066067_2066268_-|hypothetical-protein |
2066067_2066268_-
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_032127044.1|2066067_2066268_-|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_032127044.1|2066067_2066268_-|hypothetical-protein MARSVSNLLESWKTGKKKAAPNFDKLNLSEEGLTWAKAELEKLLSQQSKANTDLKQKLITHLTHRS |
66 aa aa | NA |
HTH_21
HTH_21 HTH domain information
|
NA | 2025713-2069391 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2050189-2050226, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2053695-2053732, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_016212482.1|2066482_2066626_+|hypothetical-protein |
2066482_2066626_+
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_016212482.1|2066482_2066626_+|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_016212482.1|2066482_2066626_+|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVLFLSFVVIGIFTFSYSFNLDSVLGLG |
47 aa aa | NA |
HTH_21
HTH_21 HTH domain information
|
NA | 2025713-2069391 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2050189-2050226, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2053695-2053732, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_016210918.1|2100717_2101467_+|hypothetical-protein |
2100717_2101467_+
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_016210918.1|2100717_2101467_+|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_016210918.1|2100717_2101467_+|hypothetical-protein MLSDKARIAALEEKLANIEHEIKAHNSHIKRNIVNHTETTKINNSVLAENIDNETLKKTIGSSSSTANINSNTSHVSYVTNTGYTQTAAQANYEIMGATVSGNTYGAIATTKIAATAKASLETGGLSNITDIAATKLTLEMIPNKTNMKLSTIEETVSTAVATEINNVRSEVALATTAAIASSTKTIASDVKIAMSRIDTVESQVDLVASKVTNVAQQTHRGLYATACALTEQKTHSMIITNAAMQVLS |
249 aa aa | NA |
WHTH_GntR
WHTH_GntR HTH domain information
|
NA | 2081917-2139791 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2088023-2088060, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2112171-2112208, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_032126179.1|2234115_2234367_-|TSUP-family-transporter |
2234115_2234367_-
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_032126179.1|2234115_2234367_-|TSUP-family-transporter>NZ_CP039032.1|WP_032126179.1|2234115_2234367_-|TSUP-family-transporter MSTALAFPMGLFALTSLLVASAGMAGLPSGSVGYLYLPALIGLLIGSFLGSPLGVWMVKRVSEQTSVWLFRIVLLAVIMQMIH |
83 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2224007-2283898 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2225745-2225782, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2235924-2235887, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttagtccagcgct Protospacer ****************************.********* 3. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2225879-2225916, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ********** *************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_016212461.1|2398628_2399003_+|hypothetical-protein |
2398628_2399003_+
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_016212461.1|2398628_2399003_+|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_016212461.1|2398628_2399003_+|hypothetical-protein MPKNIFVFNINKTLLWAEEHPRTINQVPTQSTWPFYGCDNIHIINQEKIAKIMQAILANGDQIVFLQERAKTTKNNTREEKEKEQTEKAEFLRLCTDKYGISLQPNNIYFHHGSDGKIARLLSI |
124 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2300025-2399582 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2312997-2312960, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2317293-2317330, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2343891-2343928, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2345008-2345045, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_016211512.1|2449707_2450514_+|hypothetical-protein |
2449707_2450514_+
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_016211512.1|2449707_2450514_+|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_016211512.1|2449707_2450514_+|hypothetical-protein MPTTSKLKAYLNEPNSTNKKHALEEMFPLLNEAYENVKKQRPNKPFGADEIWPEIQIIFSAHYGELSSQLSILQYFNLYTLFDDLTESSCDKIQHISHGEFCQPVVQVINLTTPYLSTKAIPQFIENSNQCIDEFTKWGVTHDNDEITRAAHVLATKLAGCRDEFIQRIIQNKETNQGYKITDDVPNYRRKIREIIESSTETKLLSSQQDWQGIIGNVLIGLTGIGLVALAVKAAHSQATTGQASLFFDTNAAQKAEQLGEDLLLMER |
268 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2415420-2457190 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2416570-2416533, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2453349-2453312, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2443546-2443583, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_051307360.1|2451605_2452535_+|hypothetical-protein |
2451605_2452535_+
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_051307360.1|2451605_2452535_+|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_051307360.1|2451605_2452535_+|hypothetical-protein MTLEQWWNSRTPAEKSIVAAIIAGFNLQIIEKNILAAQKAIFLDYLREQLANYNIEVPDLDEEEAEEAADKIQKLLEEEELNLQLEKKPKQSLPAEGFSFSDLEPKTLTAMSREEFHQLLLSPRQIGIIVTVGEILKKEDGFNIFDYQVNNGPKLDAQLTQIAPGTPTPDTPIKIQAQFHCPLRQSIPLEEQEEEKNKQATTLAQLVESVCTMNQAKRCPVRLNVQAEEHEVSPLAQAFICALQQRVLLKQLQHLSFNNQVFDYSHLLPNTTPFQTQQQGAEGYTSSEPELKQEPDQEPEQEQEQKLAL |
309 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2415420-2457190 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2416570-2416533, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2453349-2453312, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2443546-2443583, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_016209640.1|2488812_2489832_+|hypothetical-protein |
2488812_2489832_+
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_016209640.1|2488812_2489832_+|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_016209640.1|2488812_2489832_+|hypothetical-protein MPSFNDILNQYLLHFKKYFLDLDLSLNHRTSILSSQGTTPNFQEIAKLFSDGEIEKEFESLQNKLNRYPDTSHLELYIKFNDFFKSKTDHSLESERVIGFFKDRNESIAGKKLLEIVFLESISFAASADLQESFNAELKSAINITAEEDNDSFYELIKEQFKEASTYPLSRFNLSYHPKAFEQLDQLGLGDQSNCILELLGHPPQLINIEGISNQVKEIFENAKKSIPTEIESTQQNLIAACYEKYQANVIGLIFNFFIPKEKNQEDLELQLFIYENEFLSSSNFANHGTQFESFCPKILEIIKASNKEHIQESDSQLFFSQQKEKTTFDSSASARYNQ |
339 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2475982-2649049 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2642346-2642309, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2538974-2539011, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2541126-2541163, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2596778-2596815, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_129556474.1|2526712_2526934_-|hypothetical-protein |
2526712_2526934_-
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_129556474.1|2526712_2526934_-|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_129556474.1|2526712_2526934_-|hypothetical-protein MKSKSYEVAMPYLLECKKLLEISEQDWEVMLAIQYGFGKFHPEHEHQTFKFYEQYMDKHDGRLDGLNLTVQPQ |
73 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2475982-2649049 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2642346-2642309, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2538974-2539011, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2541126-2541163, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2596778-2596815, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_016212416.1|2541519_2542050_-|hypothetical-protein |
2541519_2542050_-
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_016212416.1|2541519_2542050_-|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_016212416.1|2541519_2542050_-|hypothetical-protein MSTEPSIDDKNKIESLTKDFCSALVISPNLIKGLTKGKYYKIVEALDVAVEELKVLAEQPLLDLYKSHYLKKHSVTSLDVKFAQIDSVFSSQVKWGLAIKKDSEQKRQAEKIGQELKALSTAIVRSFEENSTAFYRKYRWAEITKLKLSEKYIDKVVANPGQFRENYCRLEELGPH |
176 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2475982-2649049 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2642346-2642309, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2538974-2539011, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2541126-2541163, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2596778-2596815, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_075275039.1|2719256_2719751_-|hypothetical-protein |
2719256_2719751_-
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_075275039.1|2719256_2719751_-|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_075275039.1|2719256_2719751_-|hypothetical-protein MAINKIHHHRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKARLNYFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL |
164 aa aa | NA |
HTH_21
HTH_21 HTH domain information
|
NA | 2686128-2825112 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2761857-2761820, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2823347-2823384, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_032126150.1|2792368_2792602_+|hypothetical-protein |
2792368_2792602_+
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_032126150.1|2792368_2792602_+|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_032126150.1|2792368_2792602_+|hypothetical-protein MASKIKEGMGAKSLEKTIDKLLSNPEITNNKKEIFINNKKVFSINGGDIKISKSVYSQINMDELEKLIYSHISEKLT |
77 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2686128-2825112 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2761857-2761820, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2823347-2823384, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_016212022.1|2803212_2803431_+|hypothetical-protein |
2803212_2803431_+
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_016212022.1|2803212_2803431_+|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_016212022.1|2803212_2803431_+|hypothetical-protein MSPQQEKLFWKKFERELGFDSGEAALSHLSAGRPIYYGDDRYSDAVIKEYPDGTKQLVRFDDNDNEIIIEEL |
72 aa aa | NA |
HTH_21
HTH_21 HTH domain information
|
NA | 2686128-2825112 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2761857-2761820, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2823347-2823384, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_016212024.1|2804026_2804275_+|hypothetical-protein |
2804026_2804275_+
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_016212024.1|2804026_2804275_+|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_016212024.1|2804026_2804275_+|hypothetical-protein MSVEVEHSLACDGHERDRDFLTTPEIQQLLEGSKKGRYPIRDQARKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP |
82 aa aa | NA |
HTH_21
HTH_21 HTH domain information
|
NA | 2686128-2825112 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2761857-2761820, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 2823347-2823384, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_155047000.1|3014874_3015021_-|hypothetical-protein |
3014874_3015021_-
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_155047000.1|3014874_3015021_-|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_155047000.1|3014874_3015021_-|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVDLEQRIALESQVIYELVSRDNSPYALT |
48 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 3012757-3130184 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 3029484-3029521, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_155047001.1|3015225_3015411_-|hypothetical-protein |
3015225_3015411_-
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_155047001.1|3015225_3015411_-|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_155047001.1|3015225_3015411_-|hypothetical-protein MILNSEKICDLIITEKMTVDQTLQLKLEQRITLESQAIYELVSRGKITVDQTLQPLRAMEC |
61 aa aa | NA |
HTH_1,HTH_38
HTH_1,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 3012757-3130184 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 3029484-3029521, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_016211201.1|3018568_3018877_-|hypothetical-protein |
3018568_3018877_-
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_016211201.1|3018568_3018877_-|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_016211201.1|3018568_3018877_-|hypothetical-protein MQAIGAFQAGLAAINAGAGELREHANEIAHFSIPRGTVAEQEHRPAVVAVNELTQTERPAHFGQNMVRPMVGLLEASNQAQVGAKVLQIASDTLGSLIDIRA |
102 aa aa | NA |
HTH_1,HTH_38
HTH_1,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 3012757-3130184 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 3029484-3029521, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_155049899.1|3107594_3107738_-|hypothetical-protein |
3107594_3107738_-
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_155049899.1|3107594_3107738_-|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_155049899.1|3107594_3107738_-|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYGFSRQELRNFLPICELSFSHNTSTSGS |
47 aa aa | NA |
HTH_21,HTH_38
HTH_21,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 3012757-3130184 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 3029484-3029521, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_155046758.1|3108046_3108178_+|phosphatase |
3108046_3108178_+
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_155046758.1|3108046_3108178_+|phosphatase>NZ_CP039032.1|WP_155046758.1|3108046_3108178_+|phosphatase MFYCMRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP |
43 aa aa | NA |
HTH_21,HTH_38
HTH_21,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 3012757-3130184 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 3029484-3029521, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_155046759.1|3108322_3108478_+|hypothetical-protein |
3108322_3108478_+
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_155046759.1|3108322_3108478_+|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_155046759.1|3108322_3108478_+|hypothetical-protein MLSTPWLAAPEKYSPPSKTCLINSTIKLFQRVKPHWDYNQKNVYTCKAATT |
51 aa aa | NA |
HTH_21,HTH_38
HTH_21,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 3012757-3130184 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 3029484-3029521, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039032.1|WP_032126148.1|3110120_3110303_-|hypothetical-protein |
3110120_3110303_-
Protein sequences of NZ_CP039032.1|WP_032126148.1|3110120_3110303_-|hypothetical-protein>NZ_CP039032.1|WP_032126148.1|3110120_3110303_-|hypothetical-protein MTCDNITPLGYVFMPHHIALWRARGVEANYQGQLKMLRNIHAADSQHRNKQQCNQRKSNI |
60 aa aa | NA |
HTH_21,HTH_38
HTH_21,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 3012757-3130184 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039032 position: 3029484-3029521, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP039033_1 | 1232-1455 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP039033_1
|
3 spacers
spacers of NZ_CP039033_1
>1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG >1.2|1324|40|NZ_CP039033|CRT TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA >1.3|1389|42|NZ_CP039033|CRT ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039033_1
The CRISPR arrays of NZ_CP039033_1 >merge|NZ_CP039033|1|1232-1455|CRT AAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAGAAATGGAACACAAACGGAATACAAGTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATAAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACACAAACGGAACACAAA >NZ_CP039033|1|1|1232-1455|CRT AAACGGAACACAAACGGAACACAAA ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG AAATGGAACACAAACGGAATACAAG TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA AAACGGAACACAAACGGAACACAAA ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA AAACGGAACACAAACGGAACACAAA
>NZ_CP039033.1|WP_016211879.1|0_1020_+|ParA-family-protein MTKAWTPGQLISLYRTNKAKSSVLRDEQKGVIPPAKREKRGAISVRVWDEELIPLIGEQYGFLKKNFKKKRNPQSVISVYAPKGGVLKSTLAFNLARIFSINNISVLAIGLEVSQRTLTSNLELVHDHEVESLAEAQKLHSGGLWDVSEGSQSIQDVICKSSLPNLHYIPESTDLNLLEQRIKDSPRREYFLQKLLKPIMKNYEVIIFDNSPSWGSLLVQNSLTLATDVVAPFSCELESYRSVTTNIEMINDFKRDMELNWNSFSIVPTKVDQTKLSKEIETQYRVLFPEFVTASSIRFLRGVAEESGMEQLSVIENSNTSSLADDYYNLSKELWTKLS >NZ_CP039033.1|WP_155046770.1|2669_2837_-|hypothetical-protein MQQCHKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAAYFASETQ >NZ_CP039033.1|WP_054300202.1|2892_3621_+|IS6-family-transposase MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP039033.1|WP_016212168.1|3589_5278_-|hypothetical-protein MPELTFLKIEGNHSSPIQLARLVQEAAGNPAQKLGKHYFDLQGQALAEGQFEDKDGPRKVLVAVDLVERAAGESEEDKAEALARTKAKLDFFYQQLADTLPSPLLRDKLRANFDRLTCSNQRFSIIPIHKEMYFHVLRCVNAVTIDQDRARTAFKFAYNYVYQLINADIAAFLNDCEDIGVGEINRFIDQQRVKYATVAESMVMSHLLSPPAATPRENSRKWLKTHTAADMDYLATNQLTGVLTYVRGAEKQQSSHSKKDQPAAMMAIDRYALVRSDDAKERFDDAKPSQSQVKVPSLKEFKAQGRSITISQQIRDFMVGYNLQGSDAPPVVYNLLTSLPRGQDSCEQEASAKKIFKGAHHYNATRDNRPLFYVMNLPINQHTQFLHYDGSKTQKEALLLADLAMVHTVLKDLLTPGNSFVANIDSLYQNYLRNRSSDKESEGGYFSKSLEGKQAIKLLRALKEGINHGKVIDFSASDDATRDVLLEKALLKLYASKYPGNKVGDQKEYASLVQALFLAATNNHNFKGCKRALLRKIIVNFRKVIFLCSLLRIKQLIQIIYQ >NZ_CP039033.1|WP_075275149.1|5621_6596_+|IS30-family-transposase MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMLNKQAKAVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRSLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEDTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039033.1|WP_016211953.1|6830_7310_+|hypothetical-protein MPKPRYALVDNSKERSIKNGNCGYYAYALGLMSYLCKDHKINLAKEIWQRFDLGEKDKSSLNSIIEEKNAFMSLKNQRTITRLLRPVLREKNIENIINIFSDQDCKDSAYHSPLIWKIKKMIAGQLLRPQRWLLGEAFDPDGIFSGTELLRAPGIYDQC >NZ_CP039033.1|WP_016211956.1|7367_8096_+|hypothetical-protein MTQQFINSYQETAAEYTRLNLLIQEKQASEDGQKKASKYYAFTQRNLGIYNRLTHTRRRTISRDFEPEKVVWSRLKEEALVKVENLVNEAYEALVKSDEFQKWFRTQFTQDGVWAGDVELNGCLHPFVQGEHDIPFGYVAGNGKSTPYLLHDEGILLSRRSRFQRLKSGHTTSHHWMALIPKEQFLPESLQEGELDDFNKVYQALVAGQNKMFRTNKGKPVDVDKINEYILKYPASKSAWAL >NZ_CP039033.1|WP_016211955.1|8552_9533_+|hypothetical-protein MPNLIKASRAIRNLITDHMAEIGYVGFSIANIFADSNVKNHLFNFRSTITSQQASIIGSVWNHLDAVYSALAAATMIYNMANGNVNKHEMLYQKPQAAVLIASSVALAALTITGIPSWGFAIATYADLINESMNFYKAQKEYSDISYWTQSMVSKLQLIDKKLAETSSGNDKNVLQRQKTDILIDIAARYEFENKKQIPFSIRNKVDSAVKSSGLRLWQLEQRGKGVTHDLKKQRNEKTGQFLLKLGSAIGMTLLAIGSAVHPIGFAITLGIAAGYMGCKFYQAYQSKKEKGKKAKMLFFNYEVEVNKNEDQESYRYGGRHLEAPF >NZ_CP039033.1|WP_054300202.1|9678_10407_-|IS6-family-transposase MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP039033.1|WP_032126843.1|10710_10890_+|hypothetical-protein MKKSKPNKTNSKKNRKVAPNARKRKSSNAKLLSSQKKSLDISDEELQFPESKPPREAEE >NZ_CP039033.1|WP_032126844.1|11108_11405_+|hypothetical-protein MNGSNAPEWEHLRLWLEDHKNQPCVLGFGKAIEYEVNHNKSCLEITYKLSRLKIHFKYVPIHSNSFDIIKNHLISKSNQDNWFIYDGKKFKEINESQF |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP039210 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence | 125217-125258 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP048067 | Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence | 111946-111987 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP039033 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence | 1257-1298 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP038894 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence | 129443-129484 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP038924 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence | 1257-1298 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP038953 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence | 1257-1298 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP038958 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence | 1257-1298 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP039196 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence | 55594-55635 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP039196 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence | 55882-55923 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP038812 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence | 134135-134176 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP013769 | Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence | 106963-107004 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP033942 | Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence | 72670-72711 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP013761 | Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence | 110060-110101 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP013761 | Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence | 110348-110389 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP013774 | Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence | 45294-45335 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP038892 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence | 1257-1298 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP038914 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence | 1257-1298 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP038968 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence | 134137-134178 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP039202 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence | 1257-1298 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP039202 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence | 1545-1586 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP039205 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence | 1257-1298 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP039205 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence | 1467-1508 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP039042 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence | 128485-128526 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP039182 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence | 1257-1298 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP039182 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence | 1545-1586 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP039187 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence | 1257-1298 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP039187 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence | 1545-1586 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP038948 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence | 1257-1298 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP038933 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence | 197063-197104 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP038973 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence | 1257-1298 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP039036 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence | 128485-128526 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP039066 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence | 1257-1298 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP039066 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence | 1545-1586 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP038887 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence | 92202-92243 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP039215 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence | 137134-137175 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP038938 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence | 1257-1298 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP038963 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence | 128485-128526 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP038877 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence | 137135-137176 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP038882 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence | 93161-93202 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP013763 | Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence | 67864-67905 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP013763 | Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence | 68152-68193 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP013779 | Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence | 120144-120185 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP050945 | Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence | 99505-99546 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.2|1324|40|NZ_CP039033|CRT | 1324-1363 | 40 | NZ_CP013763 | Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence | 67799-67838 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.2|1324|40|NZ_CP039033|CRT | 1324-1363 | 40 | NZ_CP013763 | Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence | 68087-68126 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.2|1324|40|NZ_CP039033|CRT | 1324-1363 | 40 | NZ_CP013779 | Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence | 120079-120118 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.2|1324|40|NZ_CP039033|CRT | 1324-1363 | 40 | NZ_CP050945 | Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence | 99440-99479 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.2|1324|40|NZ_CP039033|CRT | 1324-1363 | 40 | NZ_CP039210 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence | 125284-125323 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.2|1324|40|NZ_CP039033|CRT | 1324-1363 | 40 | NZ_CP048067 | Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence | 112013-112052 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.2|1324|40|NZ_CP039033|CRT | 1324-1363 | 40 | NZ_CP039033 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence | 1324-1363 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP039033_1 | 1.3|1389|42|NZ_CP039033|CRT | 1389-1430 | 42 | NZ_CP039066 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence | 1467-1508 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.3|1389|42|NZ_CP039033|CRT | 1389-1430 | 42 | NZ_CP039066 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence | 1677-1718 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.3|1389|42|NZ_CP039033|CRT | 1389-1430 | 42 | NZ_CP038887 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence | 92334-92375 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.3|1389|42|NZ_CP039033|CRT | 1389-1430 | 42 | NZ_CP039215 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence | 137266-137307 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.3|1389|42|NZ_CP039033|CRT | 1389-1430 | 42 | NZ_CP038938 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence | 1389-1430 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.3|1389|42|NZ_CP039033|CRT | 1389-1430 | 42 | NZ_CP038963 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence | 128617-128658 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.3|1389|42|NZ_CP039033|CRT | 1389-1430 | 42 | NZ_CP038877 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence | 137267-137308 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039033_1 | 1.3|1389|42|NZ_CP039033|CRT | 1389-1430 | 42 | NZ_CP038882 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence | 93293-93334 | 0 | 1.0 |
1. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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3. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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4. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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5. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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6. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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7. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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8. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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9. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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10. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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11. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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12. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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13. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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14. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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15. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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16. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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17. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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18. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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19. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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20. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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21. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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22. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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23. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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24. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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25. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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26. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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27. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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28. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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29. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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30. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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31. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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32. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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33. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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34. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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35. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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36. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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37. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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38. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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39. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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40. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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41. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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42. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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43. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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44. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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45. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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46. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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47. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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48. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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50. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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56. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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57. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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58. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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59. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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60. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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61. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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84. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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85. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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86. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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88. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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101. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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106. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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107. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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108. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
130. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
131. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
132. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
133. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
134. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
135. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
136. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039033|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
2892 : 102211
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039033|2892:102211|DBSCAN-SWA TGTGGGTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATCATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGCTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATCAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCCATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTGTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGTTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCCTCTTACAGCCCTTAAAATTATGATTATTTGTCGCTGCTAAAAATAGTGCTTGAACTAAGCTTGCATATTCTTTTTGGTCACCAACTTTATTGCCGGGATATTTACTTGCATATAGTTTTAAAAGCGCCTTTTCCAGCAATACATCTCGAGTAGCATCATCACTAGCACTAAAATCAATCACCTTACCATGATTAATCCCTTCTTTGAGTGCTCGTAGTAATTTAATCGCCTGCTTGCCTTCAAGAGATTTAGAAAAATAGCCCCCTTCAGATTCTTTATCGCTAGATCTATTACGTAAATAGTTTTGATACAGGCTGTCAATGTTTGCAACAAATGAATTACCCGGGGTAAGAAGGTCTTTCAGCACCGTATGCACCATAGCTAAATCAGCCAGCAACAAAGCTTCTTTTTGTGTCTTACTGCCATCATAGTGTAAAAATTGTGTATGCTGATTAATAGGCAAGTTCATTACATAAAACAGCGGTCTATTGTCACGAGTTGCATTATAATGATGCGCGCCCTTAAATATTTTTTTAGCACTAGCCTCTTGTTCACACGAATCCTGCCCTCGAGGTAAAGAGGTCAATAAATTGTAAACCACGGGAGGGGCATCGCTACCCTGTAAATTATAGCCAACCATAAAGTCTCGAATTTGCTGGCTAATCGTAATACTGCGACCTTGGGCTTTAAACTCCTTTAAAGATGGCACTTTAACTTGAGACTGCGATGGCTTAGCATCATCAAACCTCTCTTTGGCATCATCAGATCGCACTAAAGCATAGCGGTCTATGGCCATCATCGCCGCAGGCTGGTCTTTCTTACTATGTGAGGACTGCTGTTTCTCGGCACCTCTGACATAAGTCAACACGCCTGTCAGCTGATTAGTTGCAAGGTAGTCCATATCCGCGGCCGTGTGTGTTTTTAACCACTTACGACTGTTTTCTCTCGGCGTTGCTGCAGGAGGCGATAATAAATGGCTCATCACCATACTTTCTGCAACCGTTGCATATTTAACGCGCTGCTGATCAATAAATCGATTGATCTCCCCTACACCAATATCCTCACAATCATTCAAAAAGGCTGCAATATCCGCATTGATCAACTGATAAACATAATTATAAGCAAACTTAAATGCAGTACGTGCTCTATCTTGATCTATCGTTACCGCATTAACACAGCGCAATACATGAAAATACATTTCTTTATGAATCGGAATAATACTAAAGCGCTGATTTGAACACGTAAGACGATCAAAGTTAGCTCTTAACTTATCTCTTAATAATGGTGATGGAAGCGTATCTGCTAACTGTTGATAAAAAAAATCCAACTTAGCCTTAGTTCTAGCTAAAGCCTCAGCTTTATCTTCTTCACTCTCTCCTGCTGCGCGCTCAACCAGATCAACGGCCACTAATACCTTTCTAGGTCCGTCTTTATCCTCAAACTGACCTTCTGCCAACGCTTGCCCTTGCAGATCAAAATAATGCTTGCCAAGCTTTTGAGCTGGATTACCTGCTGCTTCTTGCACCAAGCGAGCTAACTGAATAGGAGAGGAGTGATTGCCTTCTATTTTTAAGAATGTAAGCTCTGGCATAACAACTCTCCCGACCACAACAACAAAGTTATACTATTTATTAATTTAGCAAAGCTAATATCCAATCAACAGCCAGACAACATGATATTCATCTACTATGTCATCGATGCAGAAACTTAGCTCCATACTTAAAAAATAATCGAAAGTTGTTTTTAGTAATATTGAGAATATTTTCAAAAATAGAAAAAAATCGCTAGTAAAGTGTAAGTGTTAACTCATGTTACGCAGCAAGAGCTAATTGATACTATAATCGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAATTCTCTAGTTCGCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGGTTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGTGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGTCAAGCTTTTCGACAAATTTCAGAGGAGGCAAAAATGTTGATCCATCAACGGTTAAGCACCCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAGGAACTTATACGAGAGCATGATATCCAGGTGAGTGAAAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCAGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCGGGAAAACCTTATAAGAAAAAGGTGAATCGTGGTGATCAAATAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACACCGGCCTGCTATTGCGGATGAAAAGACAGAATTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGAGATCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCAAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCTTAACAAACAAGCCAAGGCGGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACCTCTGACAATGGAACAGAGTTTGCGGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAAGTCTAAATGAGCACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACAGATTTTAATGAAATTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGGATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATTGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGTTTTTCTCTTAAAATAATGCCCTATAGTAGCGATTACGTTGAATTTAGCAAGGCCTTCCTAAAGCTGCCGACGCAGGAGGCCTCTTTTAATTCATATTAACAAAATACGATAATTTTCAGAAAATCTGTAGATTATGTTATCTCGTTATTTGTGATTAATTAACACCATCAAAAACATTTTAAATGTGATTGCTAAATATGCCTAAACCGAGATATGCCTTAGTTGATAATAGTAAAGAAAGAAGTATTAAAAATGGTAATTGTGGTTATTATGCCTATGCTTTAGGCCTGATGAGTTACCTTTGTAAAGATCATAAGATTAATTTAGCAAAGGAAATATGGCAACGGTTCGATTTAGGTGAAAAGGATAAGTCATCCTTAAATAGCATTATTGAAGAAAAAAATGCCTTTATGTCGCTGAAAAATCAGCGAACAATTACGCGATTGTTAAGACCTGTTTTACGAGAAAAAAATATAGAAAATATTATAAATATATTTAGTGACCAAGACTGTAAAGATAGTGCGTATCATTCCCCATTAATTTGGAAAATAAAAAAAATGATTGCAGGTCAGCTGCTACGCCCACAAAGGTGGTTGCTCGGTGAAGCTTTTGACCCTGATGGTATTTTTTCTGGAACAGAGTTACTTAGGGCCCCAGGGATTTATGATCAGTGCTAAAAAATGCCAAGCTAAAGTAGCAAGGCTTGATAGGCAGCTATTAAGAAATAAAGCCATATGACTCAGCAATTTATCAACTCATATCAGGAAACAGCAGCAGAGTATACTCGTTTAAATTTATTAATACAGGAAAAACAGGCATCTGAGGATGGCCAGAAAAAAGCATCAAAGTATTATGCGTTTACTCAGCGAAATCTTGGCATTTATAATAGGTTAACTCACACTCGTAGAAGGACAATTTCTAGAGACTTTGAACCTGAAAAAGTCGTCTGGTCACGCTTAAAGGAAGAGGCTTTAGTTAAGGTAGAAAATTTAGTAAATGAAGCATATGAGGCTTTAGTTAAAAGTGATGAATTTCAGAAATGGTTTCGGACTCAGTTTACACAAGATGGTGTTTGGGCAGGTGATGTTGAGTTAAATGGATGTTTACATCCCTTTGTTCAAGGTGAACATGATATACCTTTTGGCTATGTTGCAGGCAATGGTAAGTCGACACCTTATTTGCTTCATGATGAAGGAATTCTTTTAAGCCGAAGATCAAGATTCCAGCGCTTGAAATCCGGCCATACGACAAGCCATCA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>NZ_CP039033|2892:102211|64788_65523_-|WP_032126360.1|DBSCAN-SWA MPSIQMKAKIDINLQHDQLSQSPVGSCRTYKICQGILNKYAIDKDHLKKPEIILMAYIQNNPDVQLAEAFDIAESIACMKMDKLNSLLSMYSAGNLMTAEIIQQFSSELDKKAAMNALRRQTYNPFEAHGFSLITCENKSKFLGELSQKVKSMGLQTLEDLREDLLEGQTNPKSPYRELWREKGLFKYKSDKPENHNSTTSTREALKMLDQEIQRKTPPLPFKNESIRASGPDQSTSHASNVSP >NZ_CP039033|2892:102211|38299_38755_-|WP_081007004.1|transposase|DBSCAN-SWA MRALRDIKKDKGINQALDRSCGGFSTKVHILTEGLGYPVDFVLTRGQAHDAPQAQGLLTSVAFDQIIADKAYDDIKIRELVVKKGAKCIIPSKSNRINKFDHDQHVYKERHLIECCIGKLKQFRRVFSRFEKRACRYLSFLKIASTILWLR >NZ_CP039033|2892:102211|45309_45510_-|WP_129556699.1|DBSCAN-SWA MRKNLSFGDSYELIERPDGILIRPAKPIRAGWLEAAQTLKAEGMTEEEKMWANDGNNNDLEDEWEW >NZ_CP039033|2892:102211|98357_99407_+|WP_033923686.1|transposase|DBSCAN-SWA MLNLADIYTDYLIAQNKHATATGLADLMPDELSHDQITRLLNKAPQTSKGLWLKIKTDVREYEGLDDGVLALDDMIAEKPYSDENDIIAWHYDHSKGRTVKGINILTAMVRYGDVRLPIAYEVIEKTIRYSDLQTKKERRKSSFTKNDLFLKLLNVAIRNDLKFTYVLADRWFSSQSNMSYIHNAGKKFIMGIKSNRCVALTEKNKENGKHQQLKQISLEDGIPQTVYLKGMAFKVQVMKKTFKNENGKERVLYLVTNDLSIDGQPILDTYKKRWSIEEFHKSVKQNSSFEKSPTRIVTSQLNHIYYSILGFCRLERLKLKKSLNHFAIKYKLILRANQIALQELRSMA >NZ_CP039033|2892:102211|32881_34035_-|WP_129556702.1|transposase|DBSCAN-SWA MGKRHVTKYTEEFKKSSAKLAVDSNQAISHTAQELGIHSSTLHGWVNKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREMLKKASALLCKRNTVKYAWIKENKCVFPVDRVCSILGVSRSGYYSWLKVQPSKRMIENQKLARRIKEIFIESRATYGTRRIRKQLATQEISVSRKRVGRLMKQNQLCCKIKRKFKVTTDSKHRLPIAKNVLDRNFSATGPNQKYVGDITYIRTQQGWLYLAVVIDLFSRKVVGWAMEDHMEASLVNDALLMALWKRKPKAGLIWHSDRGSQYASESHREILKDHQIKQSMSRKGDCWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS |
116 | Streptococcus_phage(27.27%) | protease,transposase,integrase | attL 84783:84842|attR 101094:101474 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP039033.1|WP_129556704.1|16697_17027_-|hypothetical-protein |
16697_17027_-
Protein sequences of NZ_CP039033.1|WP_129556704.1|16697_17027_-|hypothetical-protein>NZ_CP039033.1|WP_129556704.1|16697_17027_-|hypothetical-protein MFLANASLAFNIDSAVAEFKDEIKTKEKEVNELHRQLGKRTAELEWAAKKLKSLDYEKRKCLIESEPKNIPVTRQCELINFNRSNCYYKGTVAKNYSELQKGYFLVLSA |
109 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2892-102211 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 position: 66642-66679, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 position: 30986-30949, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
|||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039033.1|WP_032126844.1|11108_11405_+|hypothetical-protein |
11108_11405_+
Protein sequences of NZ_CP039033.1|WP_032126844.1|11108_11405_+|hypothetical-protein>NZ_CP039033.1|WP_032126844.1|11108_11405_+|hypothetical-protein MNGSNAPEWEHLRLWLEDHKNQPCVLGFGKAIEYEVNHNKSCLEITYKLSRLKIHFKYVPIHSNSFDIIKNHLISKSNQDNWFIYDGKKFKEINESQF |
98 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2892-102211 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 position: 66642-66679, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 position: 30986-30949, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
|||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039033.1|WP_016212118.1|11499_11961_+|hypothetical-protein |
11499_11961_+
Protein sequences of NZ_CP039033.1|WP_016212118.1|11499_11961_+|hypothetical-protein>NZ_CP039033.1|WP_016212118.1|11499_11961_+|hypothetical-protein MILTAEQLEIIEMVLKKQLQNDPDYLFNHINLTVSQNTAEELEVTIQQRRPVITNIAHPAIERIMGINNSDPMDAGRKEYDENFTKKPRENRSEVERCKETIIYTPAYTAKIFLQCRSTLLHQRGTTSLFSDHQANISPERTTSVDNESCSVL |
153 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2892-102211 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 position: 66642-66679, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 position: 30986-30949, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
|||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039033.1|WP_032126838.1|23708_23912_-|hypothetical-protein |
23708_23912_-
Protein sequences of NZ_CP039033.1|WP_032126838.1|23708_23912_-|hypothetical-protein>NZ_CP039033.1|WP_032126838.1|23708_23912_-|hypothetical-protein MQKAVKCEAEEIQERMRFVKNNYKSLTVKRLKILWGVNSLNVYQFLRQYDLPWLPIDELTIKQRGRI |
67 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2892-102211 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 position: 66642-66679, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 position: 30986-30949, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
|||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039033.1|WP_016212257.1|24248_24473_-|hypothetical-protein |
24248_24473_-
Protein sequences of NZ_CP039033.1|WP_016212257.1|24248_24473_-|hypothetical-protein>NZ_CP039033.1|WP_016212257.1|24248_24473_-|hypothetical-protein MLGVAIDSTESLNDRCKQIVKAVDSFLKGYKLATNKKLSELGINIKDHHDLTKCLGLEPYTEISRNGVVLYGIK |
74 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2892-102211 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 position: 66642-66679, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 position: 30986-30949, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
|||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039033.1|WP_016212260.1|24492_24765_-|hypothetical-protein |
24492_24765_-
Protein sequences of NZ_CP039033.1|WP_016212260.1|24492_24765_-|hypothetical-protein>NZ_CP039033.1|WP_016212260.1|24492_24765_-|hypothetical-protein MIIPEKSKLTAWPSPVLYAAAKATAWGGCYGVSSHQSFKENYNRSIKKYLAGQKFEVPPEVCRSIEHKGPRNSEAALSQLEKMRRNLRVH |
90 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2892-102211 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 position: 66642-66679, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 position: 30986-30949, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
|||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039033.1|WP_016212398.1|29202_29664_+|hypothetical-protein |
29202_29664_+
Protein sequences of NZ_CP039033.1|WP_016212398.1|29202_29664_+|hypothetical-protein>NZ_CP039033.1|WP_016212398.1|29202_29664_+|hypothetical-protein MKNIKKTIGVIVLSVISSGWAVAWSPWIVCGGATHKVYPEGGGDPFDQTSYYSARCSDGQAPEGFTCAYHPARLVNVIYINNVGGKDNYYDVSQSQMNAIDKICQKIDKSAKAEDPAYLAHRQGDNGGGMYGHYYDFRVVSNNNFFSKEKIIF |
153 aa aa | NA |
HTH_21,HTH_38
HTH_21,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2892-102211 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 position: 66642-66679, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 position: 30986-30949, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
|||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039033.1|WP_016212499.1|49064_49439_-|hypothetical-protein |
49064_49439_-
Protein sequences of NZ_CP039033.1|WP_016212499.1|49064_49439_-|hypothetical-protein>NZ_CP039033.1|WP_016212499.1|49064_49439_-|hypothetical-protein MSENEKSKKTLGSPAEQTTHPLGSPLISYSIDLIEFRGKLNLTNFTVRSIQSADVSGSASLEYARDAILFALEGSEEDTAIESHILSEIQTASNLVVYAWGCKSCGEWWYRKTVNGHTYCPRCR |
124 aa aa | NA |
HTH_21,HTH_38
HTH_21,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2892-102211 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 position: 66642-66679, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 position: 30986-30949, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
|||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039033.1|WP_016211913.1|52718_53840_+|hypothetical-protein |
52718_53840_+
Protein sequences of NZ_CP039033.1|WP_016211913.1|52718_53840_+|hypothetical-protein>NZ_CP039033.1|WP_016211913.1|52718_53840_+|hypothetical-protein MSFEQACAALERAGVDFQNRETELKENEKLQQVVCALAQVRLLNPETWGKIQIRNSEAQQIIIDIIDSLPLQSKDGPTGEDEQTPIEKTASAIAYRAINYFIACDWAKHISDDRYMGQAYRRFQNDKPFQQVATHLHKKIAGDFDSRTIADIQGFYQEELAALSAVWKPSFLSHHQEHERGFQAATELHQRDCLSLGDCERYQAIFSLGAGQILSQKTFDQVCSSDDPKVEAAKILILDAQSKVAEKAKDLDKGTREKISNHLQTRLKNNTDTPKKSLLSTVRMASRPLGRHFRPKRDLDNLPETYKVAEKSLKIAARLLDIPIVEITKAITGGKSEEFNTYGDLKKFMEKEQKHLRSQAVQETEMTSMTGPS |
373 aa aa | NA |
HTH_21,HTH_38
HTH_21,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2892-102211 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 position: 66642-66679, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 position: 30986-30949, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
|||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039033.1|WP_016212298.1|58637_58964_+|hypothetical-protein |
58637_58964_+
Protein sequences of NZ_CP039033.1|WP_016212298.1|58637_58964_+|hypothetical-protein>NZ_CP039033.1|WP_016212298.1|58637_58964_+|hypothetical-protein MKLITIEDYAKINEMRIQDAYELVNNEKLRKFNQPHIGMKRLTLVYVDSAPDFISYLDVNTVYFSQSEAARTMGVSLEKMRKKVVSGEVKSTRMKKFCFIPSEQFKDL |
108 aa aa | NA |
HTH_21
HTH_21 HTH domain information
|
NA | 2892-102211 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 position: 66642-66679, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 position: 30986-30949, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
|||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039033.1|WP_016212139.1|83405_83651_+|hypothetical-protein |
83405_83651_+
Protein sequences of NZ_CP039033.1|WP_016212139.1|83405_83651_+|hypothetical-protein>NZ_CP039033.1|WP_016212139.1|83405_83651_+|hypothetical-protein MQKERELVLNKYKQEHKQEKNEIFLKIKESFKSLDIPEHKKLVIGDCQTLRDLCSAVSCQETHNYDATGSQDRKFMQLIPE |
81 aa aa | NA |
HTH_21,HTH_38
HTH_21,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2892-102211 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 position: 66642-66679, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 position: 30986-30949, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
|||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039033.1|WP_016212137.1|83726_84788_+|hypothetical-protein |
83726_84788_+
Protein sequences of NZ_CP039033.1|WP_016212137.1|83726_84788_+|hypothetical-protein>NZ_CP039033.1|WP_016212137.1|83726_84788_+|hypothetical-protein MPKFIEINKTQLETKIKEFYNEVDPKNKEKYKYIRSNIDFTLEALKKTCDTSLTELFMEHYFNPESVSDPTLQVAQCKNTLLTQLNDMLKSKKSKDKGKAPAIVSYITLIMKDVIALNFTLALDEFNKLYSWDKVKKLNLSKEYFNKILCNPSCFKDAIKLDFNQEYIEKSLDHPGFLKAALEDLTSKNNIQTILDALTLEKNNICEDISFSEAKSFLQHHKGCIARKCKNHPDKIAFGHIDEKGLIQQHLIEFKVDSWILKSGPEAQLGTKLGVTLTDIARNEGSLLHSSDSVKHWQSKREQMANSPSTCFFFDTKDLSYDNFKSSDEPEFIYHKSLEKKNSSSGQSNSVKL |
353 aa aa | NA |
HTH_21,HTH_38
HTH_21,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2892-102211 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 position: 66642-66679, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 position: 30986-30949, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
|||||||||||||||||||||||||
NZ_CP039033.1|WP_155046765.1|91935_92130_+|hypothetical-protein |
91935_92130_+
Protein sequences of NZ_CP039033.1|WP_155046765.1|91935_92130_+|hypothetical-protein>NZ_CP039033.1|WP_155046765.1|91935_92130_+|hypothetical-protein MCRLISRLIVLGEKPSALAIDLSESPRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP |
64 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2892-102211 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 position: 66642-66679, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 position: 30986-30949, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
4824 : 28863
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039034|4824:28863|DBSCAN-SWA CTCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCTATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTAACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCACTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTAGCATTGCAATAACCTTCAACCATCATTGGTGCGATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCTATAAAGTTAATTCGTATTGATTTTTTACCTGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGGCCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTCTCGACTTTTTCCAGGAAAGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATTTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGAGTTTTACCCGGATTCTGATCAATAAATTTTTGAAATTCTTTCATATCACTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAACCTTGCTTTGACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGAGTGTCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAATTTGTGTAATAGGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAATTCTTAAGTCATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACATGAATCAAGCAGCCACTGGTGACATACGAATGTGCAGCAACAAAGGCACGTTGATTTAAGCTAAAGCTGCCGCTGCCGGCTTGTAAAGTGACTTTCAGCACGCGGCAATCATAACCGATGCGATTAATATCACTACCAACAAGTTTAAGTAGCTCATATGCTTGATATTCGTCGCTGTCTTCAGCGGCGGAAGGACTCGGGGCAATGCGTTCAAACTCAGCACTTAAAGCTGAGGAGTTGTAATACGTATAAAAATAGCGTGGCAGGGTTCGCTCATCATCCCAGTCACGAAACGTACTGTTTAAATATAAATTAGGCCCACCGGCATAAGATTGTGCATCCTCATCCGTTGCTAACTGGCTATCAATCGGCCCTTTATTGATCCACTCGGTATTATCAAGACTGCGCTGCCAGAGTATTGCATTTTGCGTATCCGCCCAAAACATACAGGCCACCGGGTTACTCGGTGGAGTATCGCCGGCAAAATTGCTTTGATTGGCTAAGATAGAATTGACAATTTTTTCACGACTGACCGCGGGGCTCGAGGTGCCAACCACTTCATTAATTTTAAACTCCTGCATTAATGCCCTCCTATATATAAATCGACTTCGCCTGTTTTTGCTGTGCCGTCTTTATCAAAAATATTGACGGTCGCTTGAGTTAAACTTTTATTGATCTGCACTTGATCCCCCGCCGCGCCGCTTTGAATGGTCGCAATCACAATGACTTTTTGCTGCATCGGTTCGGGGAAAACATAGGTAGAACCGGCTGCACTGACCGGAAAATTATCAACGTTATACACGGTTTCCGGCACATCAAAGGTGCATATTAATTCTTGCAATTCCGGGGTATATTGCGCATCAAAGCGTTTTAAAATGACTTTAAATCGAGCATAACGAAAATGCCTAAATGATCAGGCTACCCTATTCCGGACAAATAAATTACAATAATCCGAGCCGGAGGAATCACAATGGGAAAGCGTCACGTCACCAAGTACACCGAAGAATTTAAAAAATCATCTGCCAAGCTTGCAGTCGATTCAAATCAAGCAATCAGTCATACAGCACAGGAATTGGGTATTCACTCAAGTACACTGCATGGTTGGGTCAATAAATATCATCCAAACAGTCCAAATACTGTTAAAGATGAAGTTAGTGATATGGCTGCTGAAATAAAACAGTTAAAAAAAGAGTTGGCTAGAGTGACACAGGAACGTGAAATACTAAAAAAAGCGGCGGCGTACTTTGCAAGCGAAACACAGTAAAGTATGCCTGGATCAAAGAAAATAAATGTGTTTTTCCAGTAGATAGGGTGTGCTCAATCTTAGGTGTTAGCCGATCAGGTTATTACAGTTGGTTAAAGGTACAGCCTTCCAAGCGAATGATAGAGAACCAAAAATTAGCTAGGCGAATCAAGGAAATATTCATCGAAAGCCGTGCAACCTATGGTACTCGAAGAATTAGAAAACAGTTGGCAACACAGGAAATTTCTGTAAGCCGTAAGCGAGTTGGCCGTTTAATGAAGCAGAACCAGCTTTGCTGCAAGATAAAGCGTAAATTCAAAGTAACTACGGATTCTAAACATCGATTGCCAATTGCGAAAAACGTGTTGGACCGGAATTTTTCAGCAACAGGCCCTAACCAAAAATATGTTGGTGATATTACCTACATACGGACCCAACAAGGCTGGTTGTACTTGGCTGTTGTGATTGACTTATTCTCACGAAAAGTTGTTGGCTGGGCCATGGAGGATCATATGGAAGCATCACTCGTCAATGATGCTCTGTTGATGGCCTTATGGAAACGAAAGCCTAAAGCTGGGTTAATTTGGCATTCAGATCGCGGAAGCCAATATGCTTCAGAAAGTCATCGTGAGATTCTTAAAGATCATCAAATTAAGCAAAGTATGAGTCGTAAGGGAGACTGCTGGGATAACGCTGTTTCAGAGAGTTTCTTTCATACCTTAAAAACGGAGTTAGTTCATCACATGAATTTTAAAAATCGACAGGAGGCTAAATCAGCGATCTTTGAGTATATCGAAGTTTTTTATAACAGAAAACGCATTCACTCAGCTAATGATTATTTATCACCTGAGGAATACGAGCATAATCAAAAAATCAGTTAAAAATTTGTCTAGAAAAAGGTTGCCAGATCAAAAGGATGCGGTGAGCGGTATAAACTCCGTCCAGTTTTGATTATCCTCTGACGTTGAACATTGCACTTCAAAGCCACAGGCTTCCGGTGATCCTAACCACGACCAATTATTTTCTAGCGTGTAATGGCTCCACGCGTTCTGCATATTATCAAAGGATAAATCATCATTGCTTTGACTGATTTGCATATCCGCATAGACACGGCAGCGCATGATTTTACCTAGATCATAAACAGCACTCAGGTAGTATCCTTCACTAATGTCCGTCGCTAAGGTTCCGCTTTTGGTGTTTTCCCAACTGTCACTATAATCCTCCCAGGATTGAGTCATACCGCCCCAAGAGTAGTATAAAAATAAACGAATATGGTTATTATTATTAACCGCGGTGTGATGAAACTCACCCGGCCAATCATTAGCGGCATAATCATATTCTTGAATAATATTTAACGGCGTTAAATCAGTCAGTTCTAACACACTCGCTTCAGCTGATTTAATCCCCCATTGACTCACCGCTTTAATCAAATAAAAGCCAGGTCTGGCCTGTGTTAGATGCAGTGTAGTGCTATTAAGTTCTGCAATTAAAATGGAGTTTTCCCAAGCGGTGCCGTGCCTGATCTCGTAGTGTTTAACATACAACTCTGGATTTTTCGCCCATTCTAAAACGGCGATTTTATCGCTATACGAGGAGACAAAACGGCTGACATTCTGAGGAATCTGCTGCTCGAGTGATGCGCTACAGTGGTATGTTGAATAATGGCTACGTTGCCCAAACCAGCCCATCGCACGCACTCGAAACGTGTAGGTTGCACCTGTGCTACTGAACTCAATATGATTTAAATGGGTGGTTTTAACGTCGGAATAATTACCGTCATTGCTACGCACTTGATACTCGTAATACGCCGCATTTGGATCGCCATCAAAGGCAACAATCAAGACCGCTTCGGCGATGCCGCCGTGATAACTTACGCTTTGTTCAACGCGGTAATTACTCGGTGCTTTTAAGGGCACTGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTATGGTGTAGCAATCAACTGAAATTAAGAGTGAATTACTGTGGCTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCACTACTCTGGTGAGATCATTCTTTGGTTGGTGCGCTGGTATGGCCGCTATGCTTTGTCTTATCGTGACCTCAAAGAAATGACAGGTGAAAGAGGTCTTGAGCTTGAACGTTCAACAATCTGTCGTTGGGTTCATGAATATGGACCTGAAATCGCTAAACGGTTACGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGCTGGATGAAACGCTGGTTAAAATTAAAGGGCGCTGGTATTACCTTTATCGAGCGATTGATAAATATGGCCATACTTTGGATTGGATGCTCAGTCGTCAGCAAAATGCTAAAGCGGCCTTGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATAGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGATAAACACGCTTCATTTCCACCCGCTCATCAAAAAGCCAAAGATGAAGTTGTCTTTTCTAGGCGATGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAATAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGATAAAGCGCAAATCCCGTTTTCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGATCTACCATTGATGTGATGGAAGCAATGCGTATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAGCAGGATATCTGCGCCCAAAACCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGGTAGCTAACACAAGAAAATAACCTTTCTGAAACTCACGATAACTTTTCGCAACAGTGCCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCA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33 | Streptococcus_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
37206 : 57887
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP039034|37206:57887|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP039034|37206:57887|44346_45540_+|WP_016211140.1|capsid|DBSCAN-SWA MPDIYELAQQRAEVINKQRAMLDHAESESRGFTDEEDGQYNDLNTQQLNIKNRIAKAEEVEAQERELNTLTSEPLRSSVQSPTENKATSPLATEEYEKNFFAYMRGQNSGVDIRAGQVEGTDNKGGYLVPTKLQTTLIEALEEQTVMRQMCRIIQTSSTTDLPMADSYGAATWTGEAVAHTATDDTFKKKSIKAYKLSRMLKISDELLADSAINIGAHIAYSFGRSFGEAQEKAFLTGDGTGKPNGLLNVAPTGVTAAAPTSITLDNILDLRSSVKAAYRRKASYLMHDSTYGSLLKMKDGNGQYIIQPDFKSGEGDLLRGKRVNTSDFMDTLAAGKCAALFGDFSNFIIADRGGISLRRLNELYAETGEVGYLMWLRVDALLLETEAIKQLKTAVS >NZ_CP039034|37206:57887|48975_49299_+|WP_032126913.1|DBSCAN-SWA MALRNALFNLAFKTAPVTLGELELQVKELSIAEQQRYQELHPSLSETEANLLLICLSLCDHQGVKIFDVSEYKKLAELPLGVIKQITDAIVEVNGFNESAAHDLKKN >NZ_CP039034|37206:57887|51696_52038_+|WP_016210657.1|tail|DBSCAN-SWA MLNFPSLLPTKIAMDKLKPRLRITPLGDGYVQREADGLNTLRHYFTVSFVGLSEIEKDSIISFIADRAGLEPFLWYHPGEKRYFQIICSEWQANLQHNYWTVVLRFEEDFNPV >NZ_CP039034|37206:57887|49625_51704_+|WP_032126912.1|DBSCAN-SWA 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MTNPIHGAGGGGGKGGGSVHTPTEAPNTLSTNAVVTLVDLLGEGEIEGLAHGAQSVYFDDTPLQNADGSYNFEGVTLKSNNGTPSQDYLPGFAESASEEAFNVKVTHEQPVIRTVGRQETNELRVKIGLDALTEYATNGDINGSSVHIRMYLNNVLVVNHEITGKTTSKLEQTFIIKISPGYYIADIETSDVVLDNLDEYFSWKRAGAHAITNNYYKATSFTYPYTLKVERVTEDADSSRVQNTVYLTSITDVIDTKLNYPNSAVVGLEFSAAQFGNQLPKRSYLIRGLKIQVPSNYDPSTRIYSGIWDGSFKTEYSNNPAWVFYDLLTSERYGAGHYLVDADVDKWELYSIAQYCDELVPDGRGGKQPRFCCNLAINNQNQALNMITQLTSIFRGMAYDAAGTIQFSQDRPREPSMLITQTDVVNGQFDYQTSSIKELHSVCVVAFRNPDLNYAIDQEVVEDASRLARLGERRLEITAVGCTSRSQAMRQGLWALQSEAQSDMISYKATQDHIHSLPSDIIKIFDPNMDQEQGAAGVITAVNNNVVTLDREVSLSSQNTLMIFSAEQGIEEYTVIGAPGSRRLEVDRTIIADVGARWVLYHFTAPKQWRITAITEEDDGTYTVNAITHDPDKYQKIDEERALGVSKENTVIPSLKAPSNYRVEQSVSYHSGTAESLLIVAFDGDPNAAYYEYQLRSNEGNYSDVKTTHLNHIELSSTGATYTFRVRAMGWFGQRSHYSTYRCSASLEQQIPENVSRFVSSYSDKIAVLEWAKNPELYVKHYEIRHGTAWENSILIAELNSTTLHLTHARPGFYLIKAVSQWGIKSAEASVLELTDLTPLNIIQEYDYAANDWPGEFYHTAVNNNNYIRLFSYYSWGGMTQPWEDYSDSWENTKSGTLATDISEGYYLSAVYDLDKIMRCRVYADMQISQSNDDLSWDNMQQAWEHYTLEHNWSWLGSPESCGFEVQFSTSNDNQNWSEFMPLSASFSHFRYARFKVILKRFDAQYTPELQELTCTFDVPETIYNVDNFPVSAAGSTYIFPEPMQQKVIVIATIQSGAAGDQVQVNKSLTQATVNIFDKDGTAKTGEVDLYIGGH >NZ_CP039034|37206:57887|52034_52706_+|WP_016210666.1|tail|DBSCAN-SWA MSLVESAKIYLFTLDLTPLQSSIKYHFCNSPDGNQAVRFGGVEYQPIPLKTDGFERTTIHQPTPSIVLGNVKPILLPLLKAHDNLRGALIRRVMTYVRHLDGHSDPDASATLPEQVYVIERKSQHNNLTITFELGSKLPSDLKLPRRTQLASCSKIYRQWDEEQQAWIAGSCPYAAAQYYNEFGQQTTDKTKDQCGKKLSDCMARFGNGHALPFEGFEGIKPF >NZ_CP039034|37206:57887|47493_47817_+|WP_016211132.1|head|DBSCAN-SWA MRASLLRHRVTLQNNLIGANNYGEAVDYWQDITTVWARVSPSAGRELFSAQQFYHEITQTVTLRYRSDITPSLRLVFDGRYLEILSVINPDERNRELILACREWLHA >NZ_CP039034|37206:57887|40974_41331_+|WP_080743047.1|DBSCAN-SWA MTLEPWQLFIITTVFGWRREVDGMRRFRTVYEEVARKNGKSTKLSGTGLYLFCADEEPGAEVYAAATKRDQAKIVFDDAVKMVRASKALAGRIGIYKNNMHYPKDLPNNKFEPLSSDS >NZ_CP039034|37206:57887|37206_37887_+|WP_129556725.1|DBSCAN-SWA MKYGIPGKADQYLCREGYSVGYNYKTKQPRWVAYHLTSKSVSKRIKRHDDFRPDPAIPYQYQAQLSDYKRSGYDRGHLAPYAAMDFDKNSASQSFLLSNMSPQKAGLNRQGWAKLESNVRFWAKYKSEVYVYTGPIFQGKNIKTIGKNKVAVPTAFFKIIFAPQQKQALAFVMPNKRVAKNKVSEYRTNIAHIEKLTGLKFLSQLTSSEREKLVIKTDTMWRTRYN >NZ_CP039034|37206:57887|47185_47497_+|WP_016211137.1|head,tail|DBSCAN-SWA MIDLARLKSHLRIEDNNEDDYLAFILAAALQAAEDYLDRAIVNNTNDLETIENSVLINKSIEIAILMSAGHFYENRESTSTLTVKEVPMSTHFLLNPHRHLSA >NZ_CP039034|37206:57887|38065_38359_+|WP_016210977.1|DBSCAN-SWA MPPCRSCNTERSNEQARFCSNCGASLETRSTYEEIINKDISVLSLTKDRISSIKNNSKIRNIKDILHDLSHKELRSIPQVGEYWAKRIFNLAEEYIS >NZ_CP039034|37206:57887|54251_54506_-|WP_016210670.1|DBSCAN-SWA MKQLYAQQSVTITELRKSPTSVINEANGEPVVILNHNAPAAYMVPPELFEAMLDSYEDRQLEGIVKKRLNSPDCDFIDVDVDDL >NZ_CP039034|37206:57887|47809_48205_+|WP_016211139.1|DBSCAN-SWA MPKMSFSVEGLRELEQKLKTLEPKKIRNLNRRALRKAAEPVEAQMKANAPQKSGALAESIKRRSKKGKGRRTIVNVTVGPARKIQYAIEQEYGSSHQPARPFIRPALNDNAQTSIDIFKNALTLALKKQKL >NZ_CP039034|37206:57887|42428_43670_+|WP_016211136.1|portal|DBSCAN-SWA MTLFKRWFGAATELEPSTEYGGYELLDAAPISASGQSIHPDNAMRLATVYACIRVLAESIAALPLHVYRYETGGGKALATDHPLYSVLHDLPNGEVTSFDLRENLVGHLCLRGNAYCQIIRDGAGRVRELIQLPTDNTTVRRDERTKKLIYSTISNGQSYELRDDQVWRLNAMGSDGIIGSSPITLQRESLGLSAATQEHGAKLFGNGARPSGILTTDSHLKKEGRENLAESWKKAHGGKNSNGVAVLENGLRWQALTMSSEDSQFLETRKYQRNEICGIFRVPPHMIADLERATFSNIEHQDLAFVRHSLVPWLVKIEQSISRDLLLAHERKKYFIKFNIEGLLRGDTAARAAFYNRMFSIGVMSQNDIRELENMNPIEDGDRYYRPLNMTPIGEDEEQNNEQLVSDQSTSK >NZ_CP039034|37206:57887|39795_40179_+|WP_032126134.1|DBSCAN-SWA MPRRAKQICCYAGCHNTTYARYCEYHEQHGNRYHAPRKTTAQRGYGGRWQRERKIFLQDHPLCKQCLQDDKLIPATEVDHIKPHDGDHDLMWNQSNWQALCKSCHSRKTVNEDGGFGRKKSPQGRGI >NZ_CP039034|37206:57887|40749_40959_+|WP_016212231.1|DBSCAN-SWA MLKSDPVKTALNYCDDVLSGRVIACDYVKKACQRHLNDLKYARDRGFYFDKEAACKVVRFFSYCKHSKG >NZ_CP039034|37206:57887|45660_46995_+|WP_016211133.1|DBSCAN-SWA MNANQLLAIGAALVTAVRRNIKYSENLYLLTGNSFFDERYKKVYSIREGINATSGKIDEQAPSAYAKRALDHRVGFCSELSEVSTFLGSMLNKFEAPVYISVIKTPLHAFCLIHQSSSLHQQTKSNVYISDNIKELSEKTELENAIIVDTWIYKATKLSNYKSHINYAKEFGKQFDLEECFDGEIKTEGYSEAFGTTQPIKIAEKRLLRDFNLAYQEESRKLFTKETYSTQGRRRNSIDTNLICDSKRWGQLKDLKLFIERIASKSSDWYSSSSNRKGKSYQALIDSLDFAIQKYMDISNTDLQEIFNRALQLAPIVRGTSSFKNLWGYRNHITKTTEGLLSTDVVPEEYYKFETLPQMNLFEIRNIRSRPISQNEKCTALIQWIKKEGADPSFYSDAQKAAAYKAVDDFVSRSQGEASLLFYDRAEEAPPLAAEASAASFKSF >NZ_CP039034|37206:57887|43617_44289_+|WP_080664855.1|protease|DBSCAN-SWA MKSKIMNNWYQIKAQANKHADVYIYDYIGDYGVEAKRFVMELQALDVEQINLRINSPGGSVTDGFAIYNALHRHPAKIIAHIDSLAASMASIIALTGETVHMADNAFYMIHRPWAYAVGDAEELSKIIEILDKNEAKIVNIYHQKSNLADDKIKAMMYETSWLTAAEAKEYGFIDEITEAVNIAAYVKPNQYKNTPQTLIKHSENNTVNALQRHKLALKRSLL >NZ_CP039034|37206:57887|53410_53968_+|WP_016210665.1|tail|DBSCAN-SWA MKTKIYLHGRLGRICGSFFELNIHHAREALYALSTQLPEFKKIIQSGEWAIFRKRQSLTIEQLELNCAGGELHIVPKPKGAKNSGFAQILIGAALITAGYFSVGTALAPIAGGLSAAGTGLVISGALTMLSPQPSYDNDYSTTDPNASTLFSGVDNVATPGAPVPLIYGEHLVGSSVVSSQYKTL >NZ_CP039034|37206:57887|48201_48552_+|WP_016211129.1|DBSCAN-SWA MIEDVYFALLSTGWPVFPIMLPKNQILPAVTYQVIGGDRRYSLDAQAHLQKKTIQISCIAKTYQECKLMQDSITEILNGYHSEKIQLITFESELDQYEQDTKTYRTNLTFTLTGVV >NZ_CP039034|37206:57887|40266_40746_+|WP_016212234.1|terminase|DBSCAN-SWA MGVKGSGRKRKPTRLKKITGNAGKRKLNHYEPELIEGRAACPHYFKGEAAKAFRFAVDCLENMQIKTAAFQLMLESFAFSYGEWRALSELVDQHGRTFETITQAGDTMYRSRPEVAQRNEAWKQVKASLSELGLTPTAISRLNAQVSNTIESEIDQILD >NZ_CP039034|37206:57887|52674_53421_+|WP_032126911.1|DBSCAN-SWA MKASRALNHFKAYALEQYPREAVGLILPADHFMPCPNLSTTPEENFCIDPAQLIDTPSGTILMHSHPDGSVEPSLADMVSQRDTGLLWGIVALNQHAVTDAIVFGEQLFTQQLLERPFLHGVFDCYSLIRDFYAVEKKIFLPDFPRQRSWWEIEKYNLYERYFTEAGFIEVDKATSLCRGDVLLMRVGRTTCINHGAIYLGEDCRLKEDHNTVSLPGMILHHVCDNLSRREMLSEWQKRIAKVVRYEN >NZ_CP039034|37206:57887|48551_48974_+|WP_016211141.1|DBSCAN-SWA MSESIGALSEIYRDSDNAGNYVKLANITNIGEISSSRDKIDVTEYGSTQKKYKLGLKDHDEIQLDMNVAQDNSELKNLISDHDTGIERQFKIILATQPKRQIYEFTALITNHKIIAPLSEVISMSVSLQPTSVIVQSDEV >NZ_CP039034|37206:57887|38576_38759_-|WP_129556724.1|DBSCAN-SWA MPCTPWLAASEEMEKEIFSKDAFSKEVQLNHTVARLSVCFDHFFLEIGHIFITPAIISLI >NZ_CP039034|37206:57887|41349_42432_+|WP_081377926.1|terminase|DBSCAN-SWA MHSSIVDELHAHKTGDLWRVLETGTGSRRQPLLYAITTAGFDQTGICYSLRDYAVKVLENIIVDDTFFGIIYTLDKDDDWTDERNWIKANPNLGVSKKLDDMQRQCVKAQQMKGERNGFLCKHLNIWTNAETAWLDLERWKACAEYTFKRESLENRPCYIGLDLASTNDIAALVAAFLMPDDSVRLFCRFYLPKETVMTRAKQSPVPYQLWADEGYLTLTEGNVIDYNYIKDDIYQLNKEFDVKEITYDPWNATQLANDLLEEGANMVEFRQGFKSMTPALKELERLVISTKLHHNNNPVLNWMASNLVVVEDDAGNMKPSKRKSTEKIDGMVATAMAVGRLIAGEDHSSIYNERELFIL >NZ_CP039034|37206:57887|39177_39495_+|WP_129556723.1|DBSCAN-SWA MPTFKGQTKVDLGFAELQDAAAVCTSLVCTLNIELFEDISMRWLDKWEKTLEYKNSDKNKLFKKVWTLFYSNFDSNNGSITSPCSMVKVRNKIKSSRIKNRKHVS >NZ_CP039034|37206:57887|38903_39083_-|WP_155046773.1|DBSCAN-SWA MLSWLDSLTLKGIRVSSFFLIRKRRYLGRYFAHPMIQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP >NZ_CP039034|37206:57887|49355_49622_+|WP_016211142.1|DBSCAN-SWA MNQLSQELSLSEFNEWLAYYSLEPFGVEKDDHRTALMVSAVVNGPLQRKDKTLFTPNDFMPNYSAGDEKKTQSATDMAAILSAIAKRQ |
29 | Pseudomonas_phage(11.76%) | protease,portal,capsid,terminase,tail,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP039034.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein |
5761_6361_-
Protein sequences of NZ_CP039034.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein>NZ_CP039034.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein MQEFKINEVVGTSSPAVSREKIVNSILANQSNFAGDTPPSNPVACMFWADTQNAILWQRSLDNTEWINKGPIDSQLATDEDAQSYAGGPNLYLNSTFRDWDDERTLPRYFYTYYNSSALSAEFERIAPSPSAAEDSDEYQAYELLKLVGSDINRIGYDCRVLKVTLQAGSGSFSLNQRAFVAAHSYVTSGCLIHVIALD |
199 aa aa | NA |
HTH_21
HTH_21 HTH domain information
|
NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039034 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||
NZ_CP039034.1|WP_016212399.1|6360_6621_-|hypothetical-protein |
6360_6621_-
Protein sequences of NZ_CP039034.1|WP_016212399.1|6360_6621_-|hypothetical-protein>NZ_CP039034.1|WP_016212399.1|6360_6621_-|hypothetical-protein MQELICTFDVPETVYNVDNFPVSAAGSTYVFPEPMQQKVIVIATIQSGAAGDQVQINKSLTQATVNIFDKDGTAKTGEVDLYIGGH |
86 aa aa | NA |
HTH_21
HTH_21 HTH domain information
|
NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039034 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||
NZ_CP039034.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein |
9914_10262_+
Protein sequences of NZ_CP039034.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein>NZ_CP039034.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein MTEGDFINELMFGRGNVPLNTSPQSNWTNLSMTENDDKKVIIRQNSNDVTTYNKDNIVFFVDDDNMFRHAALKIKHDIYLSLFGNSGGLMFSNRQEMLKAFGATKSFIAKKPRRR |
115 aa aa | NA |
HTH_21,HTH_38
HTH_21,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039034 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||
NZ_CP039034.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein |
23884_24064_+
Protein sequences of NZ_CP039034.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein>NZ_CP039034.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein MNMNSLLSVALQMTEGENNSKGWQCAEFAAQILKRCGLRLPERENLTPIELITLIKQGA |
59 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039034 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||
NZ_CP039034.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein |
24063_24492_+
Protein sequences of NZ_CP039034.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein>NZ_CP039034.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein MYSVIKSFWVYGVGGVLVIVIIFVWRYEMRQSAQYELRHEIAQTNWKHNTKTFHLEQQRLKQIQQRYFTKVAATDEEHDDVDHALLESLHASKNWSATDIPNTIFIKLCQAELVDHAQSHRCKSAVQFTQSLQNNKNPRTNQ |
142 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039034 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||
NZ_CP039034.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein |
24659_25199_-
Protein sequences of NZ_CP039034.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein>NZ_CP039034.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein MPSKLSLEDRITNVLGKLTRMDNMMLGGNLTPEQKNEIEQVIDSIPHEPDSSSYNPKDSRISNLTVAHVWYGMGSQTGVTSPEWKVRFLKQYVEAVQSNNVDGKRDSALFRSIEKMFNKHEFIYATAEDVTRPLINKEDPKIAPEVATLVKDFVMSGAGDLSITSIDHEEDSSISCLLM |
179 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP039032|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039034 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |