CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP038973	Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence	1 crisprs	RT	0	3	2	7
NZ_CP038972	Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 chromosome, complete genome	2 crisprs	RT,cas3,DEDDh,DinG,csa3	1	1	35	11
NZ_CP038974	Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed2, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	2	4

1. NZ_CP038973

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP038973_1

• CRISPR_ID: NZ_CP038973_1
• CRISPR_location: 1232-1455
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 3 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038973_1

Consensus_repeat	Method
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	CRT

spacers of NZ_CP038973_1

>1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT
ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
>1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT
TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
>1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT
ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038973_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038973_1

>merge|NZ_CP038973|1|1232-1455|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAGAAATGGAACACAAACGGAATACAAGTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATAAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACACAAACGGAACACAAA

>NZ_CP038973|1|1|1232-1455|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
AAATGGAACACAAACGGAATACAAG	TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038973.1|WP_155047020.1|7264_8188_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038973.1|WP_054300202.1|9214_9943_-|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP038973.1|WP_075275154.1|8428_9085_-|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP038973.1|WP_075273751.1|4489_6220_+|PLD-like-domain-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|197207
NZ_CP038973.1|WP_016211879.1|0_1020_+|ParA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224113
NZ_CP038973.1|WP_054300477.1|6379_7108_+|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP038973.1|WP_155049199.1|3589_3835_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379554
NZ_CP038973.1|WP_155047019.1|4324_4477_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038973.1|WP_054300202.1|2892_3621_+|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP038973.1|WP_155046770.1|2669_2837_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|235600
NZ_CP038973.1|WP_155049201.1|10187_10808_-|TSUP-family-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|376667

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038973.1|WP_054300202.1|9214_9943_-|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP038973.1|WP_075273751.1|4489_6220_+|PLD-like-domain-protein	gnl|CDD|197207	cd09108, PLDc_PMFPLD_like_1, Catalytic domain, repeat 1, of phospholipase D from Streptomyces Sp. Strain PMF and similar proteins. Catalytic domain, repeat 1, of phospholipases D (PLD, EC 3.1.4.4) from Streptomyces Sp. Strain PMF (PMFPLD) and similar proteins, which are generally extracellular and bear N-terminal signal sequences. PMFPLD hydrolyzes the terminal phosphodiester bond of phospholipids with the formation of phosphatidic acid and alcohols. Phosphatidic acid is an essential compound involved in signal transduction. It also catalyzes a transphosphatidylation of phospholipids to acceptor alcohols, by which various phospholipids can be synthesized. In contrast to eukaryotic PLDs, PMFPLD has a compact structure, which consists of two catalytic domains, but lacks the regulatory domains. Each catalytic domain contains one copy of the HKD motif (H-x-K-x(4)-D, where x represents any amino acid residue) that characterizes the PLD superfamily. Two HKD motifs from two domains form a single active site. Like other PLD enzymes, PMFPLD may utilize a common two-step ping-pong catalytic mechanism involving an enzyme-substrate intermediate to cleave phosphodiester bonds. The two histidine residues from the two HKD motifs play key roles in the catalysis. Upon substrate binding, a histidine residue from one HKD motif could function as the nucleophile, attacking the phosphodiester bond to create a covalent phosphohistidine intermediate, while the other histidine residue from the second HKD motif could serve as a general acid, stabilizing the leaving group. A calcium-dependent PLD from Streptomyce chromofuscus is excluded from this family, since it displays very little sequence homology with other Streptomyces PLDs. Moreover, it does not contain the conserved HKD motif and hydrolyzes the phospholipids via a different mechanism.	5.20027e-25
NZ_CP038973.1|WP_016211879.1|0_1020_+|ParA-family-protein	gnl|CDD|224113	COG1192, Soj, ATPases involved in chromosome partitioning [Cell division and chromosome partitioning].	2.24633e-33
NZ_CP038973.1|WP_054300477.1|6379_7108_+|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.12573e-50
NZ_CP038973.1|WP_054300202.1|2892_3621_+|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP038973.1|WP_155049199.1|3589_3835_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|379554	pfam14319, Zn_Tnp_IS91, Transposase zinc-binding domain. This domain is likely to be a zinc-binding domain. It is found at the N-terminus of transposases belonging to the IS91 family.	5.15472e-08
NZ_CP038973.1|WP_075275154.1|8428_9085_-|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	8.27093e-49
NZ_CP038973.1|WP_155046770.1|2669_2837_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|235600	PRK05771, PRK05771, V-type ATP synthase subunit I; Validated.	0.00878538
NZ_CP038973.1|WP_155049201.1|10187_10808_-|TSUP-family-transporter	gnl|CDD|376667	pfam01925, TauE, Sulfite exporter TauE/SafE. This is a family of integral membrane proteins where the alignment appears to contain two duplicated modules of three transmembrane helices. The proteins are involved in the transport of anions across the cytoplasmic membrane during taurine metabolism as an exporter of sulfoacetate. This family used to be known as DUF81.	5.6898e-18

Protein sequences

>NZ_CP038973.1|WP_016211879.1|0_1020_+|ParA-family-protein
MTKAWTPGQLISLYRTNKAKSSVLRDEQKGVIPPAKREKRGAISVRVWDEELIPLIGEQYGFLKKNFKKKRNPQSVISVYAPKGGVLKSTLAFNLARIFSINNISVLAIGLEVSQRTLTSNLELVHDHEVESLAEAQKLHSGGLWDVSEGSQSIQDVICKSSLPNLHYIPESTDLNLLEQRIKDSPRREYFLQKLLKPIMKNYEVIIFDNSPSWGSLLVQNSLTLATDVVAPFSCELESYRSVTTNIEMINDFKRDMELNWNSFSIVPTKVDQTKLSKEIETQYRVLFPEFVTASSIRFLRGVAEESGMEQLSVIENSNTSSLADDYYNLSKELWTKLS
>NZ_CP038973.1|WP_155046770.1|2669_2837_-|hypothetical-protein
MQQCHKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAAYFASETQ
>NZ_CP038973.1|WP_054300202.1|2892_3621_+|IS6-family-transposase
MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP038973.1|WP_155049199.1|3589_3835_-|hypothetical-protein
MDKHRDVVVENVIKVLACGTTIMGHSKYCCSNSECSHTKVVPYTCKSRFWALLRKIIVNFRKVIFLCSLLRIKQLIQIIYQ
>NZ_CP038973.1|WP_155047019.1|4324_4477_+|hypothetical-protein
MKKTRADVEKALQKSRESGNGVSLSGAKLTDVTVSTTELKYAIFSNNFHN
>NZ_CP038973.1|WP_075273751.1|4489_6220_+|PLD-like-domain-protein
MKIKVFIILSIIFYSKLIYASPLNEIYKDIILKTDPTRSQDGITYSFTEKNLLKDDFLIQFPGKGVWGKSAKDYPGFAFHVGLDHDFGLPHCQTDSQCITNSTCSNLFSFNNEEHHKHIKMCNGYTEKNLDRFYNIIIRAEKFVDITTLEPMPDLRFRSTLRNALTFLARTGKHITIRILSGSYQTMPSKGLSNEQHKNKSLLGGYPTWYFLNDLIRDIKNIPGSNLNLYVSSMRSCSGKCGSDFLMSLSWNHSKIIDVDGKYIISGGVNMYDSYYLGKHPVFDLMIELEGPAATQAIRFTNLLWRFVRNNIKLYLYYPFNVIEYSATKNNNYAIVSNDLLGHDLYAAPHTTSGNAEVLAIGRTGYGLYKDDSAKNNNNSDYALYRLLTSAKKRIYIAQQSLKAHFNTWPYDTTKEQHTNLISALAKLLMEAGHVYIVQSPYSDATMMESGYLSLATDEEVWSKIKSEAMAMYPALKEDTINLKLCNKLHISTIRFNEYDDLWTDNEKITGHYKFMMVDKGMFYVGSQNFYPSGLQNYGHIINSKKASNIIRNSFWRPLWKYSSRTEYIPDLCKQN
>NZ_CP038973.1|WP_054300477.1|6379_7108_+|IS6-family-transposase
MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVNRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP038973.1|WP_155047020.1|7264_8188_+|hypothetical-protein
MSELKNKENFEDRGYAHYIQTCYFEEQKCYVKLSYKKDSSTSLLLFEALNLLSLKILGFAIPSTIHLIQDHKSNKCIGYLTSEVILDKTLKFIDFAEDISRITLTRLILGDNAATEDGNILMTRSQLISIDVPCFRLAPELVPSKYQDHLELFSKVFSNKDLLSHVSENTINHFYNNIGLISYELSRLYLDNVIDKIEKDGYLKKLINNIASFYGLISILKEKEYPHEFLSDFEDKLYFANRLEYIQQLNAIVVEQGLAAEKDHVSENLFFDANEYLEDIDTSELLFFDAKDTLEDTVAKNLDLSRV
>NZ_CP038973.1|WP_075275154.1|8428_9085_-|IS6-family-transposase
MINFSGRHFKKDLIMMAIRWYVAYTLSYRDIEELMAERGIQVDHSTIHRWVVKDTSQLEEHFKKRYKRQPGTSWRLDETYIDKYGDTIDFTLSKYRDEEAVYTFLKKATGSSNVIPDKIVIDQSGANTAGIMMFNYLLFILGLWFLMIEIIQIKYLNNIIEQDHRPVKKKMKAALGFKSTQGAKATISGVEFYRMLKKKQMHCHQDKPAYEQFYLLAA
>NZ_CP038973.1|WP_054300202.1|9214_9943_-|IS6-family-transposase
MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP038973.1|WP_155049201.1|10187_10808_-|TSUP-family-transporter
MFRNSATFHHYRSNNLVIPLFKGIVIFTVIGAVIGGQLDKIIPVAFVKILFTVIIISVLVQSFFHRINQVGKLEYQPVYPGFLSRSIMGFSVGILASLVGIGGSAITNPYMQYHRYPMKKSAAMSTALAFPMGLFALASLLASSVGMVGLPYGSLGYLYLPAFTGLLIGSLLGSPLGVWLVKRASEQTSVWVFRIILLAVIIQMVR

MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039210	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence	125217-125258	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP048067	Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence	111946-111987	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039033	Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP038894	Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence	129443-129484	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP038924	Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP038953	Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP038958	Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039196	Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence	55594-55635	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039196	Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence	55882-55923	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP038812	Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence	134135-134176	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP013769	Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence	106963-107004	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP033942	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence	72670-72711	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP013761	Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence	110060-110101	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP013761	Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence	110348-110389	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP013774	Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence	45294-45335	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP038892	Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP038914	Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP038968	Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence	134137-134178	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039202	Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039202	Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence	1545-1586	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039205	Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039205	Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence	1467-1508	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039042	Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence	128485-128526	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039182	Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039182	Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence	1545-1586	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039187	Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039187	Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence	1545-1586	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP038948	Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP038933	Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence	197063-197104	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP038973	Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039036	Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence	128485-128526	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039066	Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039066	Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence	1545-1586	0	1.0
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NZ_CP038973_1	1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT	1389-1430	42	NZ_CP039042	Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence	128617-128658	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT	1389-1430	42	NZ_CP039182	Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence	1389-1430	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT	1389-1430	42	NZ_CP039182	Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence	1467-1508	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT	1389-1430	42	NZ_CP039182	Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence	1677-1718	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT	1389-1430	42	NZ_CP039187	Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence	1389-1430	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT	1389-1430	42	NZ_CP039187	Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence	1467-1508	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT	1389-1430	42	NZ_CP039187	Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence	1677-1718	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT	1389-1430	42	NZ_CP038948	Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence	1389-1430	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT	1389-1430	42	NZ_CP038933	Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence	197195-197236	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT	1389-1430	42	NZ_CP038973	Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence	1389-1430	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT	1389-1430	42	NZ_CP039036	Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence	128617-128658	0	1.0
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NZ_CP038973_1	1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT	1389-1430	42	NZ_CP039066	Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence	1467-1508	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT	1389-1430	42	NZ_CP039066	Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence	1677-1718	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT	1389-1430	42	NZ_CP038887	Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence	92334-92375	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT	1389-1430	42	NZ_CP039215	Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence	137266-137307	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT	1389-1430	42	NZ_CP038938	Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence	1389-1430	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT	1389-1430	42	NZ_CP038963	Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence	128617-128658	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT	1389-1430	42	NZ_CP038877	Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence	137267-137308	0	1.0
NZ_CP038973_1	1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT	1389-1430	42	NZ_CP038882	Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence	93293-93334	0	1.0

1. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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2. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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3. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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4. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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5. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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6. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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7. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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8. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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9. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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10. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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11. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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12. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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112. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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113. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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114. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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115. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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116. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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117. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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118. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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119. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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120. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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121. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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122. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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123. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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124. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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125. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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126. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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127. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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128. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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129. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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130. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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131. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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132. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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133. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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134. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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135. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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136. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038973|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	2892 : 100910	112	Streptococcus_phage(26.67%)	transposase,capsid,head,tail,integrase	NA
DBSCAN-SWA_2	105582 : 151886	60	Streptococcus_phage(18.18%)	transposase,protease,integrase	attL 114022:114081|attR 137793:138764

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038973|2892:100910|DBSCAN-SWA
TGTGGGTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATCATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGCTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATCAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCCATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTGTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGTTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCCAAAAACGTGACTTACAGGTATAAGGTACAACTTTGGTATGAGAGCATTCAGAGTTGCTACAACAATATTTTGAGTGACCCATAATGGTTGTGCCGCATGCAAGTACTTTAATCACGTTTTCCACAACGACATCACGGTGCTTATCCATGTTAGCTATGAAGTCACGCCACCAATTATCGGCAGTTTGAAGAAGATGTTTGACTGTGTTGAGCAATTATTTTTCTCTTAAAAACTATGCTCTATAGTAGCGATTACGTTGAGTTTAGCAAGGCCCTCCTAAAGCTGCCGACGCAGGAGGCCTCTTTCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGACCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTGGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGCAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTAATTGCAAAAAATAACTTTTTGTTATATAAGTATTTTTTAATCATGAAAAAAACTCGTGCAGATGTAGAGAAGGCGCTTCAAAAATCAAGAGAAAGTGGTAATGGGGTTAGTTTATCTGGTGCAAAATTAACTGATGTCACTGTAAGCACAACTGAGCTTAAATATGCGATATTTTCCAACAATTTTCATAATTAATGTGGTATAACCATGAAAATAAAAGTTTTTATTATTTTATCTATTATTTTTTACTCTAAGTTAATATATGCATCTCCTTTAAATGAAATATATAAAGATATTATATTAAAAACCGACCCAACCCGTAGTCAAGACGGCATTACCTATAGTTTCACGGAAAAAAATCTATTAAAAGACGATTTTCTAATTCAATTTCCTGGTAAAGGTGTTTGGGGTAAAAGCGCGAAAGATTACCCTGGATTTGCCTTTCATGTCGGTCTAGATCATGATTTTGGCTTACCTCATTGCCAGACTGATTCTCAGTGCATAACTAATAGCACTTGTTCAAATTTATTCTCATTTAATAATGAAGAGCACCATAAACATATTAAAATGTGCAATGGATATACTGAAAAAAATTTAGATCGTTTTTATAATATAATTATACGTGCCGAAAAATTTGTTGATATAACAACATTGGAACCGATGCCTGATTTAAGATTTAGATCAACTCTTCGCAATGCACTTACTTTTCTAGCAAGAACAGGAAAACATATCACGATTCGTATTTTATCTGGCTCATATCAAACTATGCCTAGTAAAGGACTTTCAAATGAACAACATAAAAATAAATCTCTCCTTGGTGGTTATCCAACTTGGTATTTTTTAAATGATTTAATCCGTGATATAAAAAACATCCCAGGATCTAATTTAAATTTATATGTTTCTTCTATGCGAAGTTGTTCTGGTAAGTGTGGCTCAGATTTTCTAATGTCTTTATCTTGGAACCATTCAAAAATAATTGATGTTGATGGTAAATATATTATTAGTGGTGGGGTAAACATGTATGACAGTTACTATTTGGGGAAACACCCAGTTTTTGATCTCATGATTGAGTTAGAAGGCCCAGCAGCAACTCAAGCAATTAGATTTACAAATTTGCTGTGGAGGTTTGTAAGGAATAATATTAAACTTTATCTTTACTATCCTTTTAATGTTATTGAGTATTCCGCAACAAAAAATAACAATTATGCTATTGTGAGTAATGATTTGCTAGGACATGATTTATATGCTGCACCTCATACTACTTCTGGAAATGCAGAAGTTCTTGCAATCGGTCGCACTGGTTATGGTTTATATAAGGATGATTCAGCTAAAAATAATAATAATTCAGACTATGCTTTGTATCGGTTATTAACTTCAGCAAAAAAAAGGATTTATATAGCACAACAGAGCCTTAAAGCACACTTTAATACTTGGCCTTATGATACTACAAAGGAACAACACACTAACCTTATTAGTGCCCTAGCTAAACTTCTCATGGAAGCAGGCCATGTATATATTGTCCAATCTCCTTACAGTGATGCAACTATGATGGAATCAGGTTATTTATCTTTAGCCACCGATGAAGAAGTATGGAGTAAAATAAAAAGTGAAGCGATGGCAATGTATCCAGCATTAAAAGAAGATACTATTAATTTAAAACTATGCAATAAATTGCATATTTCTACAATTAGGTTCAATGAATATGATGACTTATGGACTGATAATGAAAAAATAACAGGCCATTATAAATTTATGATGGTAGACAAAGGGATGTTTTATGTAGGATCACAAAACTTTTACCCATCAGGATTACAAAACTATGGTCATATCATTAATAGCAAGAAAGCATCTAACATTATTAGAAATAGTTTCTGGCGCCCTCTTTGGAAATATTCATCTAGAACAGAATATATACCTGATCTGTGCAAACAAAATTAATAACTTCTGAGGCATATAGTCTTCGCCCTCCGTCACATGAAGTGCAACACCGAGTAGAGAGTTCATATCCATACAGATAAACTCTCTAGTTGGCACTGTTGCAAAAAATTTAGATTTGAGTAGGGTGTAGCAATCAACGGAAGTTAAGAGTGAATTGCTGTGGGTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATCATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATCAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCCATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTGTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAATCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGTTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCCCTATCCTTGTATGACGTCTTGTGTTGCACTGCAAATTACGGAGGGCGAACATAATTAAAATAGAGGTCTGCGGTCATGAGAAGAGTTAACTTGTCAGAGCTTAAAAATAAAGAAAATTTTGAAGACCGTGGGTACGCACATTATATACAAACATGTTATTTTGAAGAACAGAAGTGTTATGTAAAGCTCTCTTATAAAAAAGACTCTTCAACCTCTTTACTATTGTTCGAAGCATTGAACCTACTTTCTTTGAAAATTTTAGGATTTGCTATACCCAGTACTATTCATCTCATCCAAGATCACAAAAGTAATAAGTGTATTGGGTACTTAACTTCTGAAGTTATCTTAGATAAGACTTTAAAGTTTATCGACTTTGCCGAAGATATTTCAAGAATAACCCTTACTCGACTAATTTTAGGTGATAACGCGGCTACAGAAGATGGAAATATATTAATGACTAGGAGTCAATTGATCTCTATTGATGTACCATGCTTTCGTCTTGCGCCTGAACTCGTACCCAGTAAATATCAAGATCACCTTGAGTTATTTTCCAAAGTATTTTCAAATAAAGATTTGCTTAGCCATGTATCTGAAAATACAATCAACCATTTTTATAATAATATAGGCTTAATAAGCTATGAGCTTTCTAGGCTATATCTTGATAATGTAATTGACAAAATAGAAAAAGATGGCTATCTAAAAAAATTAATAAACAAT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MFSKTKVPLIISIGSVLVYFTILIFQVYSPPSFAKSYNKNPVGCEKLGKQAEELCVERINTMEEV

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_075273327.1|88855_89431_-|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	2.7e-08	26.6
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WP_129556716.1|91491_91782_+|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	2.7e-12	42.7
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WP_016210667.1|93018_93342_+|head	phage head closure protein	A0A1W6JP44	Morganella_phage	1.0e-12	39.0
WP_016210658.1|93334_93730_+	hypothetical protein	Q7Y404	Yersinia_phage	1.6e-07	40.0
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WP_016211142.1|94880_95147_+	DUF4035 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075275128.1|98647_99013_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|98958_99534_+|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	2.7e-08	26.6
WP_032126790.1|100004_100910_+|transposase	IS481 family transposase	A8RHK4	Spiroplasma_virus	6.8e-14	26.0

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP038973|105582:151886|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_075273327.1|105582_106158_+|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	2.7e-08	26.6
WP_032126360.1|106364_107099_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211895.1|107221_108280_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211894.1|108788_109535_+	AAA family ATPase	A0A222YXS3	Escherichia_phage	4.9e-18	29.9
WP_016211897.1|109535_109940_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007042.1|110333_111149_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|111753_112482_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
WP_016212298.1|112923_113250_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307374.1|113490_113967_+|protease	Clp protease ClpP	Q8VNN5	Enterobacteria_phage	3.2e-15	39.2
114022:114081	attL	NA	NA	NA	NA
WP_075275158.1|114081_114375_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081377916.1|114491_115016_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	2.5e-29	46.4
WP_098082791.1|115220_115523_+|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	8.6e-14	44.6
WP_129556698.1|115531_116233_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.8e-38	43.1
WP_016211912.1|116322_116913_-|integrase	site-specific integrase	K4K6A1	Caulobacter_phage	2.1e-19	33.3
WP_032126795.1|117185_117446_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211910.1|117449_117722_+	Txe/YoeB family addiction module toxin	NA	NA	NA	NA
WP_016211913.1|118047_119169_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273786.1|119601_120000_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_081377915.1|120008_120566_-|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	2.9e-47	51.5
WP_081377914.1|120710_121040_-|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126637.1|121156_121450_-|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	8.3e-06	36.5
WP_016212499.1|122448_122823_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212410.1|123027_123201_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212408.1|123448_123898_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212412.1|123890_124055_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059372613.1|124355_124982_+	hypothetical protein	A0A222ZGQ4	Arthrobacter_phage	1.8e-21	33.7
WP_054300202.1|125087_125816_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
WP_054300590.1|125845_126070_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556699.1|126377_126578_+	AbrB/MazE/SpoVT family DNA-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211871.1|126571_126907_+	type II toxin-antitoxin system PemK/MazF family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_032126138.1|127472_127736_+	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211872.1|128290_129094_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307367.1|129214_129739_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273798.1|129847_130072_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126346.1|130163_130406_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_033923775.1|130472_131213_-	SDR family oxidoreductase	F2NZ40	Diadromus_pulchellus_ascovirus	4.6e-08	28.0
WP_016212413.1|131260_131689_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377694.1|132022_132751_+|transposase	IS6-like element ISPsa2 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	7.1e-38	42.2
WP_129556700.1|132927_133173_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081007004.1|133132_133588_+|transposase	IS5 family transposase	A0A0N9SJT9	Paenibacillus_phage	6.2e-16	36.7
WP_054300148.1|133693_134755_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_080728342.1|134794_135298_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_032126739.1|135612_135945_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556701.1|136191_136716_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275159.1|137124_137832_+	hypothetical protein	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	3.8e-12	32.0
WP_129556702.1|137852_139005_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
137793:138764	attR	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|139989_140565_-|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	2.7e-08	26.6
WP_032126362.1|140510_140876_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212398.1|142223_142685_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273816.1|142947_143784_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	5.9e-20	32.6
WP_129556717.1|144109_145336_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274955.1|145990_146965_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.4e-25	30.7
WP_016212260.1|147122_147395_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212257.1|147414_147639_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126838.1|147975_148179_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212255.1|148175_148346_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273820.1|148532_149615_-|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	1.2e-142	71.8
WP_075273822.1|149771_150272_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274741.1|150373_150631_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556718.1|150699_151886_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.7e-58	43.8

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
NZ_CP038973.1|WP_016212298.1|112923_113250_-|hypothetical-protein	112923_113250_-	108 aa aa	NA	NA	NA	105582-151886	yes
NZ_CP038973.1|WP_016211913.1|118047_119169_-|hypothetical-protein	118047_119169_-	373 aa aa	NA	NA	NA	105582-151886	yes
NZ_CP038973.1|WP_016212499.1|122448_122823_+|hypothetical-protein	122448_122823_+	124 aa aa	NA	NA	NA	105582-151886	yes
NZ_CP038973.1|WP_016212398.1|142223_142685_-|hypothetical-protein	142223_142685_-	153 aa aa	NA	NA	NA	105582-151886	yes
NZ_CP038973.1|WP_016212260.1|147122_147395_+|hypothetical-protein	147122_147395_+	90 aa aa	NA	NA	NA	105582-151886	yes
NZ_CP038973.1|WP_016212257.1|147414_147639_+|hypothetical-protein	147414_147639_+	74 aa aa	NA	NA	NA	105582-151886	yes
NZ_CP038973.1|WP_032126838.1|147975_148179_+|hypothetical-protein	147975_148179_+	67 aa aa	NA	NA	NA	105582-151886	yes

Protein sequences of NZ_CP038973.1|WP_016212298.1|112923_113250_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038973.1|WP_016212298.1|112923_113250_-|hypothetical-protein
MKLITIEDYAKINEMRIQDAYELVNNEKLRKFNQPHIGMKRLTLVYVDSAPDFISYLDVNTVYFSQSEAARTMGVSLEKMRKKVVSGEVKSTRMKKFCFIPSEQFKDL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	140902-140939	1

1. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 position: 140902-140939, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038973.1|WP_016211913.1|118047_119169_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038973.1|WP_016211913.1|118047_119169_-|hypothetical-protein
MSFEQACAALERAGVDFQNRETELKENEKLQQVVCALAQVRLLNPETWGKIQIRNSEAQQIIIDIIDSLPLQSKDGPTGEDEQTPIEKTASAIAYRAINYFIACDWAKHISDDRYMGQAYRRFQNDKPFQQVATHLHKKIAGDFDSRTIADIQGFYQEELAALSAVWKPSFLSHHQEHERGFQAATELHQRDCLSLGDCERYQAIFSLGAGQILSQKTFDQVCSSDDPKVEAAKILILDAQSKVAEKAKDLDKGTREKISNHLQTRLKNNTDTPKKSLLSTVRMASRPLGRHFRPKRDLDNLPETYKVAEKSLKIAARLLDIPIVEITKAITGGKSEEFNTYGDLKKFMEKEQKHLRSQAVQETEMTSMTGPS

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	140902-140939	1

1. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 position: 140902-140939, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038973.1|WP_016212499.1|122448_122823_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038973.1|WP_016212499.1|122448_122823_+|hypothetical-protein
MSENEKSKKTLGSPAEQTTHPLGSPLISYSIDLIEFRGKLNLTNFTVRSIQSADVSGSASLEYARDAILFALEGSEEDTAIESHILSEIQTASNLVVYAWGCKSCGEWWYRKTVNGHTYCPRCR

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	140902-140939	1

1. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 position: 140902-140939, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038973.1|WP_016212398.1|142223_142685_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038973.1|WP_016212398.1|142223_142685_-|hypothetical-protein
MKNIKKTIGVIVLSVISSGWAVAWSPWIVCGGATHKVYPEGGGDPFDQTSYYSARCSDGQAPEGFTCAYHPARLVNVIYINNVGGKDNYYDVSQSQMNAIDKICQKIDKSAKAEDPAYLAHRQGDNGGGMYGHYYDFRVVSNNNFFSKEKIIF

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	140902-140939	1

1. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 position: 140902-140939, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038973.1|WP_016212260.1|147122_147395_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038973.1|WP_016212260.1|147122_147395_+|hypothetical-protein
MIIPEKSKLTAWPSPVLYAAAKATAWGGCYGVSSHQSFKENYNRSIKKYLAGQKFEVPPEVCRSIEHKGPRNSEAALSQLEKMRRNLRVH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	140902-140939	1

1. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 position: 140902-140939, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038973.1|WP_016212257.1|147414_147639_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038973.1|WP_016212257.1|147414_147639_+|hypothetical-protein
MLGVAIDSTESLNDRCKQIVKAVDSFLKGYKLATNKKLSELGINIKDHHDLTKCLGLEPYTEISRNGVVLYGIK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	140902-140939	1

1. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 position: 140902-140939, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038973.1|WP_032126838.1|147975_148179_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038973.1|WP_032126838.1|147975_148179_+|hypothetical-protein
MQKAVKCEAEEIQERMRFVKNNYKSLTVKRLKILWGVNSLNVYQFLRQYDLPWLPIDELTIKQRGRI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	140902-140939	1

1. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 position: 140902-140939, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

2. NZ_CP038972

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP038972_1

• CRISPR_ID: NZ_CP038972_1
• CRISPR_location: 363215-363344
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038972_1

Consensus_repeat	Method
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP038972_1

>1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder
CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038972_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038972_1

>merge|NZ_CP038972|1|363215-363344|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

>NZ_CP038972|1|1|363215-363344|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038972.1|WP_016211273.1|367387_368221_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	unknown	unknown	gnl|CDD|234899
NZ_CP038972.1|WP_080664870.1|358794_359442_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224871
NZ_CP038972.1|WP_036794771.1|356793_357780_+|APC-family-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223605
NZ_CP038972.1|WP_054300520.1|361993_362308_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038972.1|WP_016212007.1|365336_366482_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038972.1|WP_016211268.1|368336_369521_+|fatty-acid-desaturase	unknown	unknown	gnl|CDD|224316
NZ_CP038972.1|WP_016212010.1|364916_365213_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038972.1|WP_054300271.1|354303_355278_+|IS30-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
NZ_CP038972.1|WP_016212044.1|355816_356071_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|236153
NZ_CP038972.1|WP_075273359.1|361472_362048_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP038972.1|WP_032126227.1|363873_364164_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038972.1|WP_129556444.1|359434_359857_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038972.1|WP_016211269.1|370788_371574_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|274640
NZ_CP038972.1|WP_016212359.1|353717_353936_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038972.1|WP_075273619.1|366754_367330_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038972.1|WP_016211271.1|369539_370484_-|L,D-transpeptidase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|182341
NZ_CP038972.1|WP_016211797.1|360018_361422_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|143424
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NZ_CP038972.1|WP_016211272.1|371691_372060_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226131
NZ_CP038972.1|WP_016211795.1|357917_358112_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038972.1|WP_080664870.1|358794_359442_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	gnl|CDD|224871	COG1960, CaiA, Acyl-CoA dehydrogenases [Lipid metabolism].	6.77127e-06
NZ_CP038972.1|WP_016211268.1|368336_369521_+|fatty-acid-desaturase	gnl|CDD|224316	COG1398, OLE1, Fatty-acid desaturase [Lipid metabolism].	2.7962e-82
NZ_CP038972.1|WP_036794771.1|356793_357780_+|APC-family-permease	gnl|CDD|223605	COG0531, PotE, Amino acid transporters [Amino acid transport and metabolism].	3.69328e-17
NZ_CP038972.1|WP_016211273.1|367387_368221_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	gnl|CDD|234899	PRK01103, PRK01103, bifunctional DNA-formamidopyrimidine glycosylase/DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase.	1.71098e-151
NZ_CP038972.1|WP_016211272.1|371691_372060_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|226131	COG3603, COG3603, Uncharacterized conserved protein [Function unknown].	2.57105e-07
NZ_CP038972.1|WP_016211271.1|369539_370484_-|L,D-transpeptidase-family-protein	gnl|CDD|182341	PRK10260, PRK10260, L,D-transpeptidase; Provisional.	3.41097e-37
NZ_CP038972.1|WP_016211269.1|370788_371574_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|274640	TIGR03545, TIGR03545, TIGR03545 family protein. This model represents a relatively rare but broadly distributed uncharacterized protein family, distributed in 1-2 percent of bacterial genomes, all of which have outer membranes. In many of these genomes, it is part of a two-gene pair.	0.0067305
NZ_CP038972.1|WP_016211797.1|360018_361422_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	gnl|CDD|143424	cd07106, ALDH_AldA-AAD23400, Streptomyces aureofaciens putative aldehyde dehydrogenase AldA (AAD23400)-like. Putative aldehyde dehydrogenase, AldA, from Streptomyces aureofaciens (locus AAD23400) and other similar sequences are present in this CD.	0
NZ_CP038972.1|WP_054300271.1|354303_355278_+|IS30-family-transposase	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	5.97286e-78
NZ_CP038972.1|WP_016212044.1|355816_356071_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|236153	PRK08116, PRK08116, hypothetical protein; Validated.	0.00575708
NZ_CP038972.1|WP_075273359.1|361472_362048_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	6.00312e-45

Protein sequences

>NZ_CP038972.1|WP_054300520.1|361993_362308_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MKGYLITQISKLLKISRDTLHRWRNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
>NZ_CP038972.1|WP_075273359.1|361472_362048_-|IS630-family-transposase
MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEGAGCHLLFLPPYSPDLNSIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETVR
>NZ_CP038972.1|WP_016211797.1|360018_361422_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein
MSSYAMLINGQLHSGIDSFAVVNPATEAVIAECPIASVELLEQAVNAAKIALIDGTGTLEQRRELLRACADKIEAYQEELSQLLTKEQGKPISQAQNEVSWAIGLLRKQCELDIPKKVLRDDTQAQVTVTRKPLGVVAGITPWNFPFYIAVNKMAEAIYSGNSIIIKPSPYTPLTTLKLGELIQDVIPAGLVNIISGDNEIGALLVKHPKISAISFTGSVATGKHIATAAAADLKRVVLELGGNDAAIVLNDVDVKEVAEKIFWNAFSNCGQVCVAVKRLYVQRAIYHDVLDEMVRIAKTVKVGNGLDSEVTMGPLNNVMQYERIIELLNDAKAQGATVHCGGVAQEGLGYFFPPTIISGIEEGVRLIDEEQFGPLLPVLAFDDVNEVIQRVNNSSMGLSAYVWSKDNDLAVQIANRLEVGIVRVNTSTTEASLTPFGGMKQSGIGREGGVWGIEAMTDAQTLSVKY
>NZ_CP038972.1|WP_129556444.1|359434_359857_+|hypothetical-protein
MNKDIMIDQPGRAIEQRSILSITHATMLMGIFQAALNIIGNSKSILKKNTVVLSQFNQLNNQCLLLRNQLIHTNTQEEVQKMRAQIHKYTRDCIYLAAALSGGRSVLADHPVQRLNRELLQATIAGVNSLFIHNLCIDIN
>NZ_CP038972.1|WP_080664870.1|358794_359442_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase
MVLLEQLDTFLISRVDPYANQLDIDSMILKSRFSELGEKKLLAIKVASEFNGIAADRALNHDYFARLARSSYALAFLTAQHESCASLLQKGNNQELKADLLPEMVQGKFRAGVGIYHLRSHTRRAMIMAKKVAGGYRVSGRLDWISGFDIFDYIALGFIIDIGNSQENHEVVGLVPFKAQQYLSGEINIGPKQEVTAISSTNTVAIEFNDWFIRE
>NZ_CP038972.1|WP_016211795.1|357917_358112_-|hypothetical-protein
MKLKTKKISNACKGNTFLCVNFAKSKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP038972.1|WP_036794771.1|356793_357780_+|APC-family-permease
MAMSGNQALQENVGFLGALVFAVSLVLGSGVLVLPGVIYHSIGELAIFTWLADALLMVPLVIIFASFGSKYPGSGGVAGFIEQAFPYLSGGSAYLLLGQCSICFAIVAITGILYSFALLLPNFHASHMLVAGISLALMFIVFFISFLGNHRVIWLQKLIIIPLLLFLLVLIFLSINHPDAATSSVTYWPKHFDTGLITQGMILAFFAFGGWESFASMTGEIKKPARTVPFVIFVGFLLTVGLYVGLSIAIQKIFFEKNMMTGSSFLLDLVQVNHLGQFSVAICFFIVFVVVISNLNGVIWSGSRTLVTLGQKGWAPAFAASHGVLSTG
>NZ_CP038972.1|WP_016212044.1|355816_356071_+|hypothetical-protein
MNHIISCPFCGVSTEHEMSYGLQSYVCEACHNLIAAGMDDCCLFFSHDLACLCQRENEKKMEREREEKEEEEALLCPSLRKWSS
>NZ_CP038972.1|WP_054300271.1|354303_355278_+|IS30-family-transposase
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP038972.1|WP_016212359.1|353717_353936_-|hypothetical-protein
MFKQLQNNRLYFQKERAYLSISKAKKFNGPGNNAQRIIIPLHGDTSGVLKSHLTIASLFDHRPQDKGKPFKP
>NZ_CP038972.1|WP_032126227.1|363873_364164_+|hypothetical-protein
MGRLFNKENPADLKSSGYFSTEPRGQSHHSVIVIVMAMISIFVMTRVICSIITWMIHSAPLTFIFTMLISFFAAPYVFIVIIIVAFFIGILVKTPS
>NZ_CP038972.1|WP_016212008.1|364201_364900_+|hypothetical-protein
MLKKNKSTSFVIGLALSLSFACYANALTEAEFKATKLPYSVMAYSNQYAHEYGLDASKAIDLPKGLEAIKLILYKEHIKGDEVLLPQDIYRCSAELYVDKSLSLYWPGNYPKVDKVGDRGLQKAQVSTVQLKRKGEYWVPGPYASMLYDSYDQTIKPNLAKINLGFFGCNYIPSRYTAVKDGLAIWLERKGGHNYAAIGQSEAEISSKDFYIFKLPQKLVNNYLPYARMAAN
>NZ_CP038972.1|WP_016212010.1|364916_365213_+|hypothetical-protein
MVQLTLSDFAFLANDVYLNPGLELALPRENSQRCQRLLNNTETVINSDPHGPKANGFFARVYKYKQGNKMSLIVAYRGTSNVEDYLIDAELASGQAIE
>NZ_CP038972.1|WP_016212007.1|365336_366482_+|hypothetical-protein
MLTVDYSQLFGIKPTAFRTVTFNPPGMQGVDPNGRAPHYAEIAHTISQHKIASGKLAAAMVSVAPEVSLVGATAGVEVVVKKIMELLNYQTAIKNRSIALRMGQGALIFLWDLLMPDRNGLSVDKEINNPYPHIYNISSRYDLVHCSGNPGGNLINYDIDPLGKITNGDDDRRAKFKYQFLENYFEARQHYLKHGVNSAKMKSKYEQLSKADNWALYFENPGKEGVHLPTAKDWENYFKDVRNIPEYQQSARKTDRVMQYYTGTLSSNQAYDKPYDLFLTKAAKVFIKYLFIAEHSMANMLPSIQVNQNLAQVKISYSAHETILAMRKCSSLINLHTTERLKGPLVAAHDNVQKYQKKGIYPYNQTNYQALAASHGVLSTG
>NZ_CP038972.1|WP_075273619.1|366754_367330_+|hypothetical-protein
MANYSQAYCVAQGFNVNANIHRRFGYINYLRIGDLELSADIDVEVPVEGVKSKHVGVISDLFWQETAKVQPITIDFRLSVSNQQQLAHYIEQNNFNSDVLIEFASYDYDANAQAFYSSFNTDKETIEGDLEILAADSQLAIYVGKEQETDVQSPVNYFVSLSMVSTAKAQQLISATSARIKRVLPWGVTVA
>NZ_CP038972.1|WP_016211273.1|367387_368221_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase
MPELPEVETSCRGIAPHIQNQKIQRVTIRQQQLRYPVSVQITTKKLKQQKVTQVSRRGKYILLELDHSAWLMIHLGMSGNLRILEDTTPAGKHDHIEIQFANQKILRLNDPRRFGCFLWTNDLANHKLLKHLGIEPLTRQFNANYLYQAAQSRKIAIKTLLMDSQVVVGVGNIYANEALFQTGIHPSTYCHVLTTNQCAELTRIIKAILKQAIKAGGTSLKDFTNSDGKPGYFKQKLFVYGRSKEPCLTCQEDIQQFRQNQRSSFFCPCCQPEPKTM
>NZ_CP038972.1|WP_016211268.1|368336_369521_+|fatty-acid-desaturase
MLSFYGLLNLPWWGYIIAVLLLTHVTIVAVTVFLHRHQAHRALDLHPVVSHFFRLWLWLTTGMVTKEWVAVHRKHHAHCETAEDPHSPKTYGIKTVLWEGADLYRHAIQTQPEMMEKFGHATPNDTLERHLYSRFRYLGIIIMLILDIVLLGVPGIAVWAIQMMWIPFFAAGVINGIGHYVGYRNFEAADASTNVSPWGILIGGEELHNNHHAYASSAKFSVKPWEFDVGWMYIRLLEVCQLAHVKKRIPRGACVAGKSEVDNATLKAVIQNRLQLLSKYQKDVLQPTFKAERARQGESVLNSTASKLLKRDQRFFSHADHQALEQVLISSKALDLVYQFRAKLQAIWTQKASNQKDVLDALKQWCSQAEASGEQRLQEFVSYLRGYVLTTQSH
>NZ_CP038972.1|WP_016211271.1|369539_370484_-|L,D-transpeptidase-family-protein
MGIITQRHNTVAGIALFTSSIFCTSAATAFTLPISSHNTNDVVGWQVITYSKAGDTPLKIAQRHSISIQRLQALNSKVRHWQKQRIYLPYQVILPQLIQQQQSKITVNLAEKRLYYFNAKSQVLSVYPVSIGREHWRTPTPTKTTYIIHKKKHPTWNVPASIQRYYRAQGKSLPKQVPPGPENPLGTRALYLGITGILIHGTNQPASIGTASSSGCIRLYTNDIEHLYKQAGVNTPVKLIYQPYKVGFNENVLYIEAHPVISDYDKNNQQRQIIIEKLQNMTNNSKQLQVNWSLVDKAINEAAGIPVPIGKLFY
>NZ_CP038972.1|WP_016211269.1|370788_371574_+|hypothetical-protein
MAKKIFYSLIIVILLLVVGSYFLFSHMDSILRSAVEKIGSKTTGTTVTLGSLKTSLKEGQVSLSRLTMSNPAGFSQANAISFKDIMVNLDPSSATQQTIVLNKVIIKDPYLLYEMKEGSSRSNLQQIQKNIQSYFASKQAKNNESNQRNSGVTQQEPSQAKVAAKNQKKFIIKELEILAGQVKVISPLLKSKEKTLSLPNIRLTNIGTGGSGLTPDQVTEQIINVLVANSGQAVAQAGLDRVKTKLKEKASGLLNNLLGNP
>NZ_CP038972.1|WP_016211272.1|371691_372060_-|hypothetical-protein
MKIHCLPTHFSVCRFKVGTPLPALKNLSFYSLSSDSEGLRLVLKEQDMPKRIRGVDHGWCALHFTDEDDNSEQCLNLLCSRLNSEQIESFVAPTYEMNFLFVQQHNLEAALDVIEDLEYQWA

Crispr_ID: NZ_CP038972_2

• CRISPR_ID: NZ_CP038972_2
• CRISPR_location: 2622578-2622698
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038972_2

Consensus_repeat	Method
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP038972_2

>2.1|2622615|47|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder
CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038972_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038972_2

>merge|NZ_CP038972|2|2622578-2622698|CRISPRCasFinder
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCTCGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGCTTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT

>NZ_CP038972|2|2|2622578-2622698|CRISPRCasFinder
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT	CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC
TTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038972.1|WP_016210935.1|2631269_2631812_-|acireductone-dioxygenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224704
NZ_CP038972.1|WP_016211759.1|2628269_2629457_+|S-methyl-5-thioribose-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|236561
NZ_CP038972.1|WP_016210943.1|2631808_2632495_-|acireductone-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|319768
NZ_CP038972.1|WP_016211756.1|2627298_2628024_-|M15-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|350618
NZ_CP038972.1|WP_016210671.1|2614809_2616069_+|6-phosphofructokinase	unknown	unknown	gnl|CDD|237600
NZ_CP038972.1|WP_052047041.1|2620812_2621076_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038972.1|WP_098082812.1|2620064_2620580_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038972.1|WP_016210673.1|2614203_2614677_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038972.1|WP_016210677.1|2612205_2612820_-|UbiX-family-flavin-prenyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|180312
NZ_CP038972.1|WP_032126312.1|2626325_2627120_-|M48-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|307807
NZ_CP038972.1|WP_129556590.1|2625933_2626329_+|nucleic-acid-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|380015
NZ_CP038972.1|WP_016210942.1|2632498_2633110_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|236415
NZ_CP038972.1|WP_016210678.1|2618909_2619920_+|protein-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|270622
NZ_CP038972.1|WP_016211905.1|2621344_2621755_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
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NZ_CP038972.1|WP_081377344.1|2629811_2630939_-|transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|379252
NZ_CP038972.1|WP_075275117.1|2621998_2622421_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038972.1|WP_081377880.1|2624596_2625076_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|279973
NZ_CP038972.1|WP_016210672.1|2612812_2614195_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|130153
NZ_CP038972.1|WP_016210676.1|2616524_2618606_+|kinase-domain-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270918

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038972.1|WP_016210678.1|2618909_2619920_+|protein-kinase	gnl|CDD|270622	cd00180, PKc, Catalytic domain of Protein Kinases. PKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine or tyrosine residues on protein substrates. PKs make up a large family of serine/threonine kinases (STKs), protein tyrosine kinases (PTKs), and dual-specificity PKs that phosphorylate both serine/threonine and tyrosine residues of target proteins. Majority of protein phosphorylation occurs on serine residues while only 1% occurs on tyrosine residues. Protein phosphorylation is a mechanism by which a wide variety of cellular proteins, such as enzymes and membrane channels, are reversibly regulated in response to certain stimuli. PKs often function as components of signal transduction pathways in which one kinase activates a second kinase, which in turn, may act on other kinases; this sequential action transmits a signal from the cell surface to target proteins, which results in cellular responses. The PK family is one of the largest known protein families with more than 100 homologous yeast enzymes and more than 500 human proteins. A fraction of PK family members are pseudokinases that lack crucial residues for catalytic activity. The mutiplicity of kinases allows for specific regulation according to substrate, tissue distribution, and cellular localization. PKs regulate many cellular processes including proliferation, division, differentiation, motility, survival, metabolism, cell-cycle progression, cytoskeletal rearrangement, immunity, and neuronal functions. Many kinases are implicated in the development of various human diseases including different types of cancer. The PK family is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, phosphoinositide 3-kinase (PI3K), and actin-fragmin kinase.	5.43866e-14
NZ_CP038972.1|WP_016210943.1|2631808_2632495_-|acireductone-synthase	gnl|CDD|319768	cd01629, HAD_EP, Enolase-phosphatase similar to human enolase-phosphatase E1 and and Xanthomonas oryzae pv. Oryzae enolase-phosphatase Xep. Enolase-phosphatase E1 (also called MASA) is a bifunctional enolase- phosphatase which promotes the conversion of 2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane to 1,2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene anion (an aci-reductone) in the methionine salvage pathway. The catalytic reaction is carried out continuously by enolization and dephosphorylation, and the enolase activity cannot be classified as typical enzymatic enolization. This family belongs to the haloacid dehalogenase-like (HAD) hydrolases, a large superfamily of diverse enzymes that catalyze carbon or phosphoryl group transfer reactions on a range of substrates, using an active site aspartate in nucleophilic catalysis. Members of this superfamily include 2-L-haloalkanoic acid dehalogenase, azetidine hydrolase, phosphonoacetaldehyde hydrolase, phosphoserine phosphatase, phosphomannomutase, P-type ATPases and many others. HAD hydrolases are found in all three kingdoms of life, and most genomes are predicted to contain multiple HAD-like proteins. Members possess a highly conserved alpha/beta core domain, and many also possess a small cap domain, the fold and function of which is variable. HAD hydrolases are sometimes referred to as belonging to the DDDD superfamily of phosphohydrolases.	1.88858e-105
NZ_CP038972.1|WP_016210671.1|2614809_2616069_+|6-phosphofructokinase	gnl|CDD|237600	PRK14072, PRK14072, diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase.	0
NZ_CP038972.1|WP_016211756.1|2627298_2628024_-|M15-family-metallopeptidase	gnl|CDD|350618	cd14843, D-Ala-D-Ala_dipeptidase_like, D-Ala-D-Ala dipeptidase, includes uncharacterized enzymes. This subfamily of D-Ala-D-Ala dipeptidase (also known as D-alanyl-D-alanine dipeptidase vanX; VanX; EC 3.4.13.22) also includes several uncharacterized proteins. This is a Zn2+-dependent enzyme that mediates resistance to the antibiotic vancomycin in Enterococci and other bacteria (both Gram-positive and Gram-negative). It is part of a gene cluster that affects cell-wall biosynthesis. The operon triggers the termination of peptidoglycan precursors by D-Ala-(R)-lactate instead of D-Ala-D-Ala dipeptides. The enzyme is stereospecific, as L-Ala-L-Ala, D-Ala-L-Ala and L-Ala-D-Ala are not substrates. It belongs in the MEROPS peptidase family M15, subfamily D.	1.11944e-66
NZ_CP038972.1|WP_054300282.1|2624075_2624540_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	3.57411e-45
NZ_CP038972.1|WP_016210677.1|2612205_2612820_-|UbiX-family-flavin-prenyltransferase	gnl|CDD|180312	PRK05920, PRK05920, aromatic acid decarboxylase; Validated.	1.18434e-110
NZ_CP038972.1|WP_081377880.1|2624596_2625076_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	gnl|CDD|279973	pfam01710, HTH_Tnp_IS630, Transposase. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This family includes insertion sequences from Synechocystis PCC 6803 three of which are characterized as homologous to bacterial IS5- and IS4- and to several members of the IS630-Tc1-mariner superfamily.	6.67359e-07
NZ_CP038972.1|WP_016211759.1|2628269_2629457_+|S-methyl-5-thioribose-kinase	gnl|CDD|236561	PRK09550, mtnK, methylthioribose kinase; Reviewed.	0
NZ_CP038972.1|WP_016210942.1|2632498_2633110_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	gnl|CDD|236415	PRK09220, PRK09220, methylthioribulose 1-phosphate dehydratase.	1.82603e-94
NZ_CP038972.1|WP_129556590.1|2625933_2626329_+|nucleic-acid-binding-protein	gnl|CDD|380015	pfam17775, UPF0225, UPF0225 domain. This entry represents an NTF2-like domain found in bacterial proteins.	6.66662e-47
NZ_CP038972.1|WP_016210935.1|2631269_2631812_-|acireductone-dioxygenase	gnl|CDD|224704	COG1791, COG1791, Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain [Function unknown].	2.05718e-61
NZ_CP038972.1|WP_081377344.1|2629811_2630939_-|transposase	gnl|CDD|379252	pfam13546, DDE_5, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	2.01965e-11
NZ_CP038972.1|WP_032126312.1|2626325_2627120_-|M48-family-metallopeptidase	gnl|CDD|307807	pfam01863, DUF45, Protein of unknown function DUF45. This protein has no known function. Members are found in some archaebacteria, as well as Helicobacter pylori. The proteins are 190-240 amino acids long, with the C-terminus being the most conserved region, containing three conserved histidines. This motif is similar to that found in Zinc proteases, suggesting that this family may also be proteases.	1.59691e-55
NZ_CP038972.1|WP_016210672.1|2612812_2614195_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	gnl|CDD|130153	TIGR01081, mpl, UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate ligase. Alternate name: murein tripeptide ligase [Cell envelope, Biosynthesis and degradation of murein sacculus and peptidoglycan].	0
NZ_CP038972.1|WP_016210676.1|2616524_2618606_+|kinase-domain-protein	gnl|CDD|270918	cd14016, STKc_CK1, Catalytic domain of the Serine/Threonine protein kinase, Casein Kinase 1. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. CK1 phosphorylates a variety of substrates including enzymes, transcription and splice factors, cytoskeletal proteins, viral oncogenes, receptors, and membrane-associated proteins. There are mutliple isoforms of CK1 and in mammals, seven isoforms (alpha, beta, gamma1-3, delta, and epsilon) have been characterized. These isoforms differ mainly in the length and structure of their C-terminal non-catalytic region. Some isoforms have several splice variants such as the long (L) and short (S) variants of CK1alpha. CK1 proteins are involved in the regulation of many cellular processes including membrane transport processes, circadian rhythm, cell division, apoptosis, and the development of cancer and neurodegenerative diseases. The CK1 subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	1.187e-09

Protein sequences

>NZ_CP038972.1|WP_075275117.1|2621998_2622421_-|hypothetical-protein
MQLSYLELNSVEYIQKVLANITLLDQDACALNKLRVVYSKITQQIESGQLKVHGLGGGSAITFKGERTKVPEGISKIWYEITDMQGNFRWMDNVSAVLNKVKVEANNRSGYRGLTAIGLFFGSYRDAQTKDLYSKISQAL
>NZ_CP038972.1|WP_016211905.1|2621344_2621755_+|hypothetical-protein
MKLNTKETFTRFMGLFIAVDCLYYLIGLTIFSAIPSGNLIAFVNIFTSFCGLVTGILLFIKIYDKWYTPFVAIEFFTCIYWFFLTLGETVSNTQYASLSKVITSLNYDLFSCFMGVIACLLWLKFAFSFKANKLAN
>NZ_CP038972.1|WP_052047041.1|2620812_2621076_+|hypothetical-protein
MARSVRIVPQGVYHIWREMTDSEGKFKWPSDVCAAINRSKVQAEQRKDYRGLTAVSLFFGSYRDTHTKALYSQISQGFKTNTHQYKD
>NZ_CP038972.1|WP_098082812.1|2620064_2620580_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAALDLDLDTDDDIIKTKNLSALDVTCRLIISRYNLYQRENFFQVFNNPKCFYQSYQYLEILGLNQAASIQQLLDGPFEKYKDTWSTLSYLGLDCRENAQRILTNPQSFEQDFDGLIALRSAYESIVKEMEANQLKAHGLAGGNPIKFKGETVSVATSVGILHIQ
>NZ_CP038972.1|WP_016210678.1|2618909_2619920_+|protein-kinase
MPKIVWESQENRTAAEQQAAEWRIAKKYLAGRAPGTQLNPKHGQHKISFKDPKTNEEVYLTHRYLLGNKGEIFVKSNGYLLGKTPRNLVTFGQTKDGQVWAIKESCEIGKDLKESEIACDLDAAKKMFKSNSKCYQVYRFLGLPLDQYLRQNRLTEEERLDLAIKVSQAVHHLHIGTQSRSHTCYAHLDLKPSNICIDHEGQVHLIDYGFSKSLAGRLTHRKGTSSYLSVDYASASKEALDIFALLRTLYLPKKFKTYTQKAKKSRDHHEYILNDDIISKNGLLYALLDTEDGKIKHTRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP038972.1|WP_016210676.1|2616524_2618606_+|kinase-domain-protein
MPKVIWLAQENRTAEQQQAAEWRIAKKHLTGKPPGTQLNPQSGKKVKAYEDPETGEKITLTHRYLIGHEGEIFVKFNGQALGQGICGEVTFGQTEDGHMWAIKESSEKPKNSQEGKIAVDLGKAKNYFKYQGKHYQVYYFLGTPLDKYLKEAKQSLTQAQQYDLAIKMARVIYHLHTGKYSKEKTSYAHLDLKPENFCIDDSGELHLIDYGLSEILPGKLDNEIKGSPAYLPFSVAEASKEELDIIALLRSLYLPLCFKGLGKVRNRGPAAQQLNTQWVFSSTILSQNSTLSQLLDTTKGEVVNLSALDIACQLILLKYGLHSSENLEKVTANPQQFEQDSQLLESLGLNQAAYLKCMLEQRDLVSVFKEYTDKFLILNQFDLNQPIYIKKVLANLEQFSQDYQYLESLGLNQAAYLKCLLEQRESIDLLKEHANKFLTLNQYELNQSIYIGKVLANPEQFNQDYQYLKSFGLNQAAYLKYTLDQHDQFAYNCQRLKDLKLNSRNYIEEIINNPERFEQNYQHLETLGLNQEIYIRPMLNNPQRFGEYCQQLKDLGLNQASDLARALDHPQRFQDDLPSLLKLRKIYDDLSNEIASDRLKVRGLFAGGITVNCQGQSKLVPRGIGSIWLEIIDKQGNFYWMKDVSAALTKSTDQARLRSSSQQQAEGQNSNLFFATYRDPKTQAVYDRISQLP
>NZ_CP038972.1|WP_016210671.1|2614809_2616069_+|6-phosphofructokinase
MNNSKNLFYAQSGGATAVINTTACGVIETARQKEEINNVFVGHDGIIGALAEELIDTSLESAETIRQLYHTPGSAFGSCRYKLPPIGQNDEVYQRLFSVFEAHDIHYFLYNGGGDSQDTTNKVSIMSKKLGYPLKCIGLPKTIDNDLMHTDNCPGFGSAAKYIATSIKEAALDVAGMARTSTKVFLMEIMGRNAGWLAAAAGLAAEQDGDAPHIILFPEIAFNEKRFLQRVKEVVQTHGACTIAISEGLRDEHGDLLIKSSSIDAFGHVQLGGIASKVAALIKHNLGYKYHWALPDYLQRAGRHLGSKADVEQAYAIGQAAVEAVIAEKDNIMLAIERTSNSPYQWQVGEVCLNDIANHEKFMPKEFISEDGYHITEACRDYMSPLIAGECIPPFKNGLPVYARLKKQTIPPKLSPFEI
>NZ_CP038972.1|WP_016210673.1|2614203_2614677_-|hypothetical-protein
MMQIIWRLCTFRAGPQDIVYSVFGLQLICVIHFISQWGWLSLRLPLLHSALVALFSAALLLALPYLVVNSAKYAGRFLQTALALQLVSCVLHILLLALFLLHSPLVLLNYYLIFSFIWGAALFSHIIKEAIVVKLWQAVLIVLIYFIVRTVSVIGLM
>NZ_CP038972.1|WP_016210672.1|2612812_2614195_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase
MHIHILGIAGTFMGGVAQLARAKGVTVTGADLNVYPPMSTQLAQAGIAVTAGYDDEFLKLTKRPDCVVIGNALSRGNPAVEATLNENMPYCSGPEWLAREVLHGRHVLAVAGTHGKTTTSSMLTWILEHAGLQPGFLIGGVPKNFGVSARLGQGEYFVVEADEYDSAFFDKRSKFVHYQPKTLVLNNLEYDHADIFDDLQAIMRQFHHLVRTVPSNGKIIVNSIDENLHTVLEMGCWSPRVSVGLQAGDITAEVIQADGSHFEVICHGMRYEVNWSLIGQHNVMNGLAAIGAALQVGVDLKHACEALTLFQGVERRLQVFGQSQGVTVYDDFAHHPTAIATTLEGLRHRVGTEGRVIAVFEPRSNTFKMGVHQDNLAAAFSCADRVYFYQPTGLSWQIADNLKKEEQFNYRVRHSIDELLQALTDDGLKDHDHVVVMSNGSFEQFHQRLLNQLELECENA
>NZ_CP038972.1|WP_016210677.1|2612205_2612820_-|UbiX-family-flavin-prenyltransferase
MLNFKKKIILAVTGASGAPYALRLLEHLVLSGVQVSFLISPAGALTIKEECDIHLPAKPEVLQQRLTELTGATAQQILCYGRNDWFAPMASGSAAFDAMIICPCTMRALAAVAMGLSDSLIERAADVMLKERRQLILVPREMPLSVIHLENMLKLARAGAEIIPPMPGFYYRPDSVDDLIDFVVARLLDRLGLAHSLGQRWGER
>NZ_CP038972.1|WP_054300282.1|2624075_2624540_-|IS630-family-transposase
MDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
>NZ_CP038972.1|WP_081377880.1|2624596_2625076_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MECADSRHATLCDADSRGFIVVAFCSAILHHWMCKIPTEVATLTYDLRIRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
>NZ_CP038972.1|WP_129556590.1|2625933_2626329_+|nucleic-acid-binding-protein
MTELCPCCSQKPYSSCCQPFVSGQTLPATPEQLMRSRYTAYTQANIDYIIATMQGEALNGFNRNSATTWAKQSTWLNLQVLSAPAVKQDGQEGFVEFIASLQNQGKIECLHEKSRFIKNKDQWFYVDGQQH
>NZ_CP038972.1|WP_032126312.1|2626325_2627120_-|M48-family-metallopeptidase
MIVLIFALCTLEHLGYDGAMKIVKKLKQLKTYQLTVDNIDYRISHTGRTKTYGLSIRDGKVHMNVPKRMSKQRVCQAIDDNQAWVRENIRFSLASTKQHQSLSSGSLISYLGKQYSLKLTYVNQSVVFYDDAFLMGVPARVKSENHQAYIRDKLSAWFKEQALLRFEQRTFFIANRMQLKPTKVSVRSYKARWGSCSSSGCLSFDWKLLQAPEFIIDYVIVHELSHLKHFDHSPAFWQLVSLYYPEHKVARQWLKNNQTSLARL
>NZ_CP038972.1|WP_016211756.1|2627298_2628024_-|M15-family-metallopeptidase
MLPDLPICHNYKTVDKQALNELQQQAACVELKPSSRIMCLNEYYQQKLPGALSVMYTRQSVYLKLLAVLENLAPHFAFAIFDAYRSVACQKTLFEQIYRELYQRHPGRSKEWLEIEVRKYVSHPHEPSRFAVPPHNSGGAIDLTLMDLRTNTALDFGTEFDNTTTLSQTDYFERDYSANLGISSERWLLIRQNRRLLFNTMKQEGFTNFVSEWWHYDLGDCLWADAVGSSWFYDSMEAEVN
>NZ_CP038972.1|WP_016211759.1|2628269_2629457_+|S-methyl-5-thioribose-kinase
MNKYQKLNAEKAIEYVKQYNIFFTHYEHLRCEEIGDGNLNLVFRLINDNDNKSLIIKQALPYARCVGESWPLSLDRARIEAESTQIQANICPGYVPKIYHTDNTLALTIMEDLSDHVVLRNGLISGQSYPELPQQIGSFLAHTLFYTSNLYLDSHLKKQYLRQFINPDLCKITEDLVLTDPFFGSERNHYDQDIQTQVTELQNNQQLQLNVAALKLKFLSSTEALLHGDVHTGSIFVTKNSMKVFDSEFAYYGPMGFDIGLIIGNMVLSLCSHFIQNNLNSVNYCLNAIEIIWQTFESKFTTLAKEHTQDLAFKNDIYINHTIKNIFADTLGYTGCEVIRRIIGLAHVEDLDGMENKTLKNKAEILALTIGQQFILEQNQLHTIDNVIQKLQGHL
>NZ_CP038972.1|WP_081377344.1|2629811_2630939_-|transposase
MECADSRHVTLCDADSRGFIVVAFCSAILHHWMCKIPTEVATLTLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINHAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHRCEPWSAKHGVSRPR
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MSQLTIFHANNSHQMIFQSSNQREISSQLAHVGIRFEQWQAHAKVSAEDSEEHILTMYAEDIHRLKKQGGYQAVDVISLDSSHPDKALLRQKFLSEHTHSEDEVRFFVKGKGLFCLHIDDKVYQVLCEQNDLISVPDHVAHWFDMGSEPEFTAIRLFNNTEGWVAELTGSNIAKRFPLLD
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MIKAILTDIEGTITRISFVKDVLFPYAEKQLPEFIHCFCETPEVFAQLDAVKNEINNQQATIAQLIDTLLAWIREDKKITALKQLQGMIWEKGYQQGDFTGHLYSDAVEFIREQCKRNIPVYVYSSGSVKAQKLLFSYSDFGDILELFSGFYDTKIGGKKEMKSYQNIIEELNIQAENVLFLSDIAAELDAAKQAGLKTCQLVRDNQKPSKHHPWVNNFNKFIIQDYS
>NZ_CP038972.1|WP_016210942.1|2632498_2633110_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase
MQNNNDVVNQLITAGAWISEKGWVPATGGNFSARLANGVVVTASGYDKGCLTEASFCQFDLEGNQFTGTGKPSAETALHLAIYQLDDHAKAVLHTHSIAATTLSRYIAESQLAIHGYEMQKSLAGIQSHLETINIAIFDNDQDIDALVGKVNKAHAKKPLRHGILIRGHGLYAWGDSILEARRHLEGLEFLFMCELERFKLQG

Self-targeting detection

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MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
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NZ_CP038972_1	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	NZ_CP039210	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence	166717-166754	0	1.0
NZ_CP038972_1	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	NZ_CP039213	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence	30310-30347	0	1.0
NZ_CP038972_1	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	NZ_CP048067	Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence	7350-7387	0	1.0
NZ_CP038972_1	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	NZ_CP048067	Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence	186740-186777	0	1.0
NZ_CP038972_1	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	NZ_CP038894	Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence	23887-23924	0	1.0
NZ_CP038972_1	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	NZ_CP038897	Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence	30307-30344	0	1.0
NZ_CP038972_1	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	NZ_CP038924	Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence	98297-98334	0	1.0
NZ_CP038972_1	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	NZ_CP038924	Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence	104921-104958	0	1.0
NZ_CP038972_1	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	NZ_CP038924	Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence	74736-74773	0	1.0
NZ_CP038972_1	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	NZ_CP038924	Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence	89480-89517	0	1.0
NZ_CP038972_1	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	NZ_CP038953	Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence	91559-91596	0	1.0
NZ_CP038972_1	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	NZ_CP038958	Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence	45769-45806	0	1.0
NZ_CP038972_1	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	NZ_CP039196	Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence	48741-48778	0	1.0
NZ_CP038972_1	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	NZ_CP039196	Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence	38038-38075	0	1.0
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NZ_CP038972_1	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	NZ_CP038812	Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence	69445-69482	0	1.0
NZ_CP038972_1	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	NZ_CP013769	Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence	100110-100147	0	1.0
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NZ_CP038972_1	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	NZ_CP033943	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence	75017-75054	0	1.0
NZ_CP038972_1	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	NZ_CP013763	Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence	85712-85749	0	1.0
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NZ_CP038972_1	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	NZ_CP038933	Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence	180456-180493	1	0.974
NZ_CP038972_1	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	NZ_CP038973	Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence	140902-140939	1	0.974
NZ_CP038972_1	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	NZ_CP039066	Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence	91919-91956	1	0.974
NZ_CP038972_1	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	NZ_CP038887	Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence	75595-75632	1	0.974
NZ_CP038972_1	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	NZ_CP039215	Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence	120527-120564	1	0.974
NZ_CP038972_1	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	NZ_CP038938	Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence	94958-94995	1	0.974
NZ_CP038972_1	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	NZ_CP038877	Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence	120528-120565	1	0.974
NZ_CP038972_1	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	NZ_CP038882	Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence	76554-76591	1	0.974
NZ_CP038972_1	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	NZ_CP039033	Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence	30949-30986	1	0.974
NZ_CP038972_1	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	NZ_CP038914	Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence	30949-30986	1	0.974

1. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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2. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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3. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039213 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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4. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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5. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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6. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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7. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038897 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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8. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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9. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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10. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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11. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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12. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033943 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013780 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050946 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050947 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048070 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039207 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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112. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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113. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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114. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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115. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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116. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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117. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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118. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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119. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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120. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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121. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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122. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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123. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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124. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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125. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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126. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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127. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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128. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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129. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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130. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	45566 : 89679	46	Moraxella_phage(16.67%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	136473 : 178470	46	Staphylococcus_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_3	182276 : 239530	56	Escherichia_phage(12.5%)	tail,tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_4	256927 : 301967	48	Acinetobacter_phage(40.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_5	329542 : 375097	46	Hokovirus(33.33%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_6	447709 : 550123	98	Escherichia_phage(42.86%)	tRNA,transposase,integrase	attL 507580:507639|attR 540759:541139
DBSCAN-SWA_7	555051 : 613815	60	Escherichia_phage(22.22%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_8	634979 : 735608	104	Prochlorococcus_phage(17.65%)	tRNA,transposase,protease,plate	NA
DBSCAN-SWA_9	771026 : 817712	39	Staphylococcus_phage(28.57%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_10	834399 : 888852	45	Staphylococcus_phage(15.38%)	transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_11	895102 : 958137	58	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(14.29%)	integrase,transposase	attL 887462:887521|attR 904746:905185
DBSCAN-SWA_12	962011 : 1065203	110	uncultured_Mediterranean_phage(11.11%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_13	1094660 : 1201176	95	uncultured_Mediterranean_phage(22.22%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_14	1237990 : 1270999	30	Bacillus_phage(16.67%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_15	1275367 : 1324413	49	Bacillus_phage(15.38%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_16	1345212 : 1383768	33	Klosneuvirus(28.57%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_17	1414557 : 1459748	45	Tupanvirus(28.57%)	integrase,tRNA,transposase	attL 1422353:1422412|attR 1470158:1470512
DBSCAN-SWA_18	1468874 : 1518360	52	Staphylococcus_phage(35.71%)	transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_19	1536763 : 1602976	57	Staphylococcus_phage(11.11%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_20	1631003 : 1662275	29	uncultured_virus(25.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_21	1665855 : 1731761	58	Staphylococcus_phage(16.67%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_22	1738545 : 1794831	49	Acinetobacter_phage(100.0%)	tRNA,transposase,integrase	attL 1738168:1738227|attR 1783094:1784055
DBSCAN-SWA_23	1814742 : 1992709	167	Leptospira_phage(15.79%)	integrase,transposase,protease,tRNA	attL 1874656:1874715|attR 1942507:1943392
DBSCAN-SWA_24	2025222 : 2077388	52	Orpheovirus(18.18%)	tRNA,protease,transposase	NA
DBSCAN-SWA_25	2085232 : 2129938	47	Staphylococcus_phage(22.22%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_26	2151137 : 2200885	48	Staphylococcus_phage(33.33%)	tRNA,protease,transposase	NA
DBSCAN-SWA_27	2207614 : 2253537	52	Staphylococcus_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_28	2322740 : 2382351	57	Planktothrix_phage(16.67%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_29	2420336 : 2483964	60	Staphylococcus_phage(37.5%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_30	2487599 : 2595435	102	Escherichia_phage(34.15%)	integrase,transposase,protease,tRNA	attL 2570294:2570353|attR 2578535:2578822
DBSCAN-SWA_31	2624075 : 2658529	38	Microbacterium_phage(20.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_32	2716226 : 2799833	81	unidentified_phage(21.43%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_33	2912395 : 2956741	43	Acanthamoeba_polyphaga_lentillevirus(14.29%)	transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_34	2989763 : 3052950	55	Acinetobacter_phage(50.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_35	3059805 : 3108620	51	Staphylococcus_phage(42.86%)	tRNA,transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038972|45566:89679|DBSCAN-SWA
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MSVRKVSYTTGFTIEEVEFEREDSYDDKRILNMTNFSQNQVDLTGQLNRYSVLNTPFLNTHHHNNEEESECCCIIQ

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211200.1|50491_51799_+	S41 family peptidase	A0A0R6PIZ1	Moraxella_phage	2.1e-24	28.6
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WP_016210702.1|61135_64198_-	efflux RND transporter permease subunit	S5VTK5	Leptospira_phage	1.2e-62	22.9
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WP_016210703.1|65614_66568_-	glutathione synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210700.1|66599_67763_-	radical SAM family heme chaperone HemW	NA	NA	NA	NA
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WP_016210697.1|68555_69056_+	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	1.0e-19	41.2
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WP_016211096.1|72651_73461_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126369.1|73639_73867_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211100.1|73867_74818_+	TonB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126371.1|74873_75425_+	YqgE/AlgH family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211105.1|75551_75974_+	Holliday junction resolvase RuvX	NA	NA	NA	NA
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WP_016211103.1|76755_77454_+	YggS family pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_032126370.1|77464_78289_+	pyrroline-5-carboxylate reductase	A0A1X9I6T5	Streptococcus_phage	5.4e-26	35.5
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WP_075274980.1|78981_80043_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126486.1|80092_80323_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211250.1|87370_87583_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075274981.1|89082_89679_-|transposase	IS1595 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP038972|136473:178470|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP038972|182276:239530|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

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MKIRPLHDRVVIRRLEEETTSAGGIILTGSAQEKPNRGEVVAVGRGKALDNGDYRPIDVAVGSTVLFGQYSGSTVKIDGEEYQVMREDEIFAVVED
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MQKYLLKHPLHSRGKKITCVNIRRAKVADLQEARYSENKLDNIIQLVSKLCNLPTPQVLELDQEDFSKITLLIIEHLCISHGGDSHFYQELWGPCIP
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MNVNSYLFYDIETTGINKCFDQVVQFAAIRTDLNLNEISRHEYVVKLRPDVIPAPKAAITHLISLDRLVQAESEYTVIKKIHELLNEPGTISLGYNTLGFDDEFLRFSFYRNLLNPYSHQYANGCSRMDLYPMVALYYLYCPTVLQWPQVNGQPSLRLENLSALNQLAEGQAHDAMVDVEATVALAKCLIQEKATWDYLCNYFIKREDQNRLLKLPRLFDDDSQSFLAMMIAGEMGTKVNYQAPALLLGEHYHYKNQTVWLRLDQEYLKQIIISDFSEKIWVKNKKYGEPPFVLPLTEKRLAKMSKEQLELYQENKNWLLNNKSLLQEIREYYLDYKYPEHENVDAMALLYQSGFYNYREKNWIECFHEYLLGQQLYDHAVPSERLGVLSDRLAGYENKILANDPRQQLFDSYVDECWQVEEQNARRDYKGECALTVEAALAEITQLEADKGLSSIQQTRLAELKAYILGKTEVKP
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MFSKAKAPLIISISCVIIYFAVLVIQIYSPATFEKNHTEVLIGCEKLGKQAKELCIERVDVMANQSKQATKIKD
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>NZ_CP038972|182276:239530|185006_185456_-|WP_059372761.1|DBSCAN-SWA
MPNQSSSPLIRWPLKKLISSVVSTYNKQLISLFNTATYQSIINVLPIGQTIDKVAQTPQFYHSVQNGLSCINQVATATNPQPDINNCNYNNNQTYFAWNNSHLTTIANQYVAYQIYYNMINSIHLKTIQSDAKEQETIKKSVSSILALR

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_075274985.1|182797_183163_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_080728339.1|183226_183499_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212441.1|183766_183991_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059372761.1|185006_185456_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|185519_186248_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
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WP_017377589.1|188074_188728_-	epoxyqueuosine reductase QueH	NA	NA	NA	NA
WP_016210784.1|188905_189877_+	alpha/beta fold hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210782.1|189899_190796_-	branched-chain amino acid transaminase	NA	NA	NA	NA
WP_016210786.1|190954_191401_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210787.1|191397_192039_-	uracil phosphoribosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210789.1|192148_192727_-	TMEM165/GDT1 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210776.1|193202_193640_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210785.1|195568_196963_+	protein kinase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274986.1|198411_199479_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016209863.1|199531_199954_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209853.1|200194_200638_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209873.1|200692_200950_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209868.1|200927_201554_+	23S rRNA (uridine(2552)-2'-O)-methyltransferase RlmE	NA	NA	NA	NA
WP_016209871.1|201631_203614_+|protease	ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH	G9E4U6	Ostreococcus_lucimarinus_virus	3.9e-115	40.9
WP_016209869.1|203823_205167_+	phosphoglucosamine mutase	NA	NA	NA	NA
WP_016209874.1|205433_208103_+	pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring), homodimeric type	NA	NA	NA	NA
WP_016209857.1|208126_210046_+	dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209860.1|210215_211637_+	dihydrolipoyl dehydrogenase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	3.1e-45	27.8
WP_016209866.1|211782_212757_+	phospholipase A	NA	NA	NA	NA
WP_016209855.1|212788_213184_+	VOC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209859.1|213186_213408_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209875.1|213571_215233_-	chaperonin GroEL	A0A2I7SAK5	Vibrio_phage	5.3e-182	64.9
WP_016209850.1|215305_215596_-	co-chaperone GroES	A0A221S322	uncultured_virus	3.3e-15	42.6
WP_016209861.1|215821_216277_+	type II 3-dehydroquinate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016209852.1|216341_216806_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209862.1|216898_218245_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209870.1|218244_219150_+	50S ribosomal protein L11 methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209854.1|219211_220198_+|tRNA	tRNA dihydrouridine synthase DusB	NA	NA	NA	NA
WP_016209851.1|220190_220433_+	Fis family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016209858.1|220554_222099_+	bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase	Q58MG4	Prochlorococcus_phage	6.5e-65	47.8
WP_032126611.1|222145_223432_+	phosphoribosylamine--glycine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016209864.1|223474_224869_+	aminopeptidase P family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209867.1|224892_225072_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|225068_225644_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|225589_225955_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274988.1|226016_228251_-	type VI secretion system tip protein VgrG	NA	NA	NA	NA
WP_016210079.1|228672_229170_-	purine-binding chemotaxis protein CheW	NA	NA	NA	NA
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WP_080664831.1|230138_231701_-	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210093.1|232016_233810_+	aminopeptidase P family protein	A0A0P0I8D7	Acinetobacter_phage	2.6e-118	41.3
WP_016210081.1|233895_234168_+	DUF615 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210094.1|234173_234800_+	DUF938 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210077.1|234786_236217_+	exodeoxyribonuclease I	NA	NA	NA	NA
WP_016210086.1|236549_237605_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	4.3e-28	34.2
WP_032126605.1|237573_238251_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210084.1|238240_239077_+	D-methionine-binding lipoprotein metQ	NA	NA	NA	NA
WP_016210080.1|239236_239530_-|tail	phage tail assembly protein	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP038972|256927:301967|DBSCAN-SWA
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MEKDSIDYKGCQVIYWTHEKDGFFIAEAIIHCNHLDDDKIPHISGKAFTNLGDAEKYILNEAKTWIDAKERSIAKRQ

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211358.1|259577_260039_-	DUF1499 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211357.1|260462_261944_+	MFS transporter	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	6.3e-49	28.3
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WP_016211354.1|263213_265175_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211359.1|265704_266109_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_105962623.1|270449_271602_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

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MKLKTKKISNACKGNTFLCVNFAKSKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016210128.1|331289_331553_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210132.1|331919_332738_-	kinase/pyrophosphorylase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210131.1|337357_338380_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126491.1|339131_339449_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP038972|447709:550123|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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540759:541139	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_033923779.1|549286_550123_+|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP038972|555051:613815|DBSCAN-SWA
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MGQLKSQSASELRSKFSWLSRVYWKENIVWSPGYFVSSIGVDEVTIKRYVEHQGEQDSGQLRMEL
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MTINYETLEQFRGELLEKLRLYNPKDLQKHTSITDIYYGNTDLAFQRILQEACFKRDLHWYSTRTGRTRTMSYIKEIISANPEKYHELQELLTPFGGCEPDYSKKAMRYFACRGSLAGFDSHNKSVNQAYENYFATNSSDNPYSTSSQFLDEQLGGHYRKCSEDDFDLDSGMGQH
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MRWRLLAWICIDLLLVFALLLGAGAFYIYIEFAHPKVWLERLAKRQGVTLRAVNVRTVENNIFSPAFEIKNLVMSNKSQGWSAEVKYYYVHFNLLKSIWHWRLSTDDIAMRGATIDFDIEQAHFNQQNKHSLLTVFPWLNAQEKVQLSDIRLNLQQGKIKDHLFLNALWQSSAESMSTLTLRARGERDEKLIVNAEVKKTKLGGFQSAHIDLRTQKLLLSWLNLAKVKVAKQDYRLDMDAKFSGSLDQSQFFSKFSLQGARVNVLQSLDGEFSAKAHDGKAQLSLPKLNINGQAYPQPIELNLNYNRLNRQLHASGLVLKPLVPLMYLLDTTSFGYPRELDRLSSLQGHLTEIHGYWQSAERWQLAMGLVDLGVKPTITEPGITGVSGELVVKPNQLRFDLDSPNLHWLWPDTDKRQTPVLNTQAKIQVKQLKPGIKLSVSHIKVNHPQAHLAGKVSVIFRQQAAPVVTSRLDYTLATPEFVKKFLPHQGVNPEFFTWLQKALLAGKTQGIAILNGALSDFPFTDGQGQFFVQFDVRDGQLDTNRGWPIIRQGDARVTFAGPQLTITANKVLMAGLWLHDIRLKMADIMPGVPTELNIQGQSEFNLKKGMALIAKSPLKALVEKIKVSSGQGKINLNLKIPFGYVDKNKLTTVNGMLNVKNTSVDFTGKKVALTKLAGTFNFDEQGLVFAKDAKALIYGEPVNFSVTSQLQKQEPITTINFNSWLSAAVIKGLADIDLGSFIKGRTPIIGTYRFGEHSGNLSVNSKLQGLSSSLPAPFNKAINSQALLSLQEKKANNEQAIALTYGDQVKLEGHLNQEKKSTPALFLQANLKTLNLNEWGKTIQRLFSRELKSTNKDIIGSLNLTLDKLIIDEKSLSDVSLKVDRQASGVSIDVTSSVLSGVVHYQQGVNIPELSLDFSKADLNIAQSIYHWYQTDFSGGNQSAGVLKRTKHLPKVTATLNNVNYKNYQFKSVNLTLTPVNYGYQLDSLQLTDPNYTVHATGELNLIQRQNPSFIKGNVHFSNVGKGLDALGINNLIGGGRGSLFFDLEWLGLLTDVKPETLLGRIKVNLVNGHITKVNPGLISLINVFNVDSFWQRIKFDSSGVLQKGLAFSELTGLLSIFHGNLFTNDMVVKGPDLQLSIGGRVGFANKDVDLLVGAVPQVSGSIPVIALAAGGLSFAPIAGALWLFEKALSSEVSNPFVFQYHVYGPWDDVQTKAVNSNNNEK
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MKKQRKQENERWIIRTRRLIETVIGQLSDGFHIEKTKARDLWHFTNRITRKVLAHTVGVAIIALDQQFLTYYQ

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_129556626.1|557141_558530_+	class II fumarate hydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016211238.1|558972_560466_+	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
WP_129556456.1|560667_561417_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556457.1|561460_562399_-	FtsX-like permease family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211244.1|562382_563078_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	W5SAS9	Pithovirus	2.7e-10	27.4
WP_036776715.1|563479_564208_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_016211663.1|564301_564967_-	fumarylacetoacetate hydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211661.1|565031_565988_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	1.4e-33	31.9
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WP_016211662.1|566987_568100_-	C1 family peptidase	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|568704_569280_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016212580.1|569678_570029_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|570764_571826_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556458.1|572201_572435_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210908.1|573326_574142_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126716.1|574232_575216_+	transaldolase	V5UTB0	Synechococcus_phage	2.2e-13	32.9
WP_016210913.1|575386_575908_+	pantetheine-phosphate adenylyltransferase	A0A1B1IVQ3	uncultured_Mediterranean_phage	1.8e-27	43.8
WP_016210914.1|575941_576193_+	YfhL family 4Fe-4S dicluster ferredoxin	A0A1B1IWY9	uncultured_Mediterranean_phage	1.8e-20	58.8
WP_016210909.1|576198_577476_-	na+ dependent nucleoside transporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307343.1|578168_578696_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210906.1|578815_581128_-	RNA-binding transcriptional accessory protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126715.1|581256_582072_-	transporter substrate-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210915.1|582269_582734_+	DUF4402 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275036.1|582863_583925_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211491.1|584185_584482_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211493.1|584764_586228_+	4-hydroxy-3-polyprenylbenzoate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016211489.1|586230_587283_+	2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein	M4QRZ2	Synechococcus_phage	5.3e-10	41.1
WP_016211494.1|587272_587728_+	arginine repressor	NA	NA	NA	NA
WP_016211487.1|587752_588076_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126199.1|588423_588735_-	DOPA 4,5-dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_032126201.1|588864_589611_+	lipoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_054300148.1|589632_590694_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|590804_591779_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_032126197.1|591919_592873_-	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016212075.1|592986_593184_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126198.1|593429_593630_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212072.1|593659_593857_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212074.1|593943_594165_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|594191_594557_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275038.1|594502_595093_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046713.1|595230_595395_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126195.1|595689_597126_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatB	NA	NA	NA	NA
WP_016210532.1|597167_598619_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatA	NA	NA	NA	NA
WP_016210537.1|598730_599018_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatC	NA	NA	NA	NA
WP_016210526.1|599207_600251_+	rod shape-determining protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210536.1|600266_601166_+	rod shape-determining protein MreC	NA	NA	NA	NA
WP_016210528.1|601162_601681_+	rod shape-determining protein MreD	NA	NA	NA	NA
WP_016210527.1|601750_602368_+	septum formation inhibitor Maf	NA	NA	NA	NA
WP_016210531.1|602377_603865_+	ribonuclease G	NA	NA	NA	NA
WP_016210534.1|603874_607555_+	DUF3971 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210535.1|607628_608441_+	3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210530.1|608437_609118_+	histidine phosphatase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007010.1|609958_610579_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556461.1|610628_610919_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275039.1|611722_612217_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007066.1|612211_612550_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_105962625.1|612929_613815_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP038972|634979:735608|DBSCAN-SWA
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MCKIPTEVATLTYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINHAINNQVKFDYTVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016209516.1|641518_642988_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126187.1|644946_645345_+|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssE	NA	NA	NA	NA
WP_016209524.1|645341_647030_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209506.1|647011_647968_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209515.1|648010_648526_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209526.1|648630_649563_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	1.2e-21	25.8
WP_016209534.1|649782_650169_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209530.1|650185_650830_-	2-polyprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016209504.1|651010_651850_+	carbon-nitrogen hydrolase family protein	M1I6H3	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	2.0e-15	28.8
WP_016209502.1|651925_652528_+	signal peptidase I	NA	NA	NA	NA
WP_016209512.1|652528_653383_-	RNase adapter RapZ	NA	NA	NA	NA
WP_016209537.1|653739_654051_-	ribosome-associated translation inhibitor RaiA	NA	NA	NA	NA
WP_016209519.1|654075_655467_-	RNA polymerase factor sigma-54	NA	NA	NA	NA
WP_016209538.1|655622_656354_-	LPS export ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	1.3e-20	30.7
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WP_016209499.1|656909_657467_-	LPS export ABC transporter periplasmic protein LptC	NA	NA	NA	NA
WP_016209498.1|657472_658453_-	KpsF/GutQ family sugar-phosphate isomerase	A0A2P0VNK5	Tetraselmis_virus	6.0e-32	30.4
WP_016209539.1|658592_659393_+	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.6e-25	32.7
WP_036780687.1|659396_660164_+	lipid asymmetry maintenance ABC transporter permease subunit MlaE	NA	NA	NA	NA
WP_016209535.1|660160_660625_+	outer membrane lipid asymmetry maintenance protein MlaD	NA	NA	NA	NA
WP_016209507.1|660647_661301_+	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209517.1|661304_661652_+	STAS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209505.1|661685_661937_+	BolA/IbaG family iron-sulfur metabolism protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209518.1|662011_663280_+	UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209527.1|663282_664041_+	Nif3-like dinuclear metal center hexameric protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209508.1|664102_664993_+	OmpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209511.1|665043_665727_+	uracil-DNA glycosylase	A0A0R5YU95	Harp_seal_herpesvirus	2.3e-46	49.5
WP_075273445.1|665812_666070_-	DUF4286 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275046.1|666342_668556_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210408.1|668547_669420_-	DNA replication terminus site-binding family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210409.1|669587_671417_+	class I poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210411.1|671580_672222_-	BON domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273448.1|672463_672994_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210404.1|673011_673185_+	50S ribosomal protein L32	NA	NA	NA	NA
WP_016210402.1|673243_674293_+	phosphate acyltransferase PlsX	NA	NA	NA	NA
WP_016210405.1|674299_675250_+	ketoacyl-ACP synthase III	NA	NA	NA	NA
WP_016210406.1|675303_676248_+	ACP S-malonyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210415.1|676275_677013_+	3-oxoacyl-ACP reductase FabG	NA	NA	NA	NA
WP_016210413.1|677101_677344_+	acyl carrier protein	A0A1P8VVJ5	Erythrobacter_phage	2.0e-05	39.7
WP_016210403.1|677418_678642_+	beta-ketoacyl-ACP synthase II	NA	NA	NA	NA
WP_016210400.1|678673_679522_+	aminodeoxychorismate lyase	NA	NA	NA	NA
WP_016210401.1|679518_680571_+	endolytic transglycosylase MltG	NA	NA	NA	NA
WP_032126181.1|680691_681312_+	dTMP kinase	A0A1L2BX49	Bacteriophage	4.2e-39	44.2
WP_036780649.1|681327_682314_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_129556469.1|682839_683148_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016212599.1|686321_686531_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075273327.1|688215_688791_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075275054.1|688736_689102_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126651.1|689222_689408_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209899.1|689511_690546_-	phosphate regulon sensor histidine kinase PhoR	W8CYF6	Bacillus_phage	1.3e-32	34.2
WP_016209908.1|690542_691253_-	response regulator	W8CYM9	Bacillus_phage	2.2e-31	34.8
WP_016209923.1|691727_692246_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209901.1|692363_692696_-	GIY-YIG nuclease family protein	D7F5V9	Apocheima_cinerarium_nucleopolyhedrovirus	8.0e-05	34.2
WP_016209920.1|692725_695680_-	FAD-binding oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_016209912.1|695725_696223_-|protease	protease inhibitor I42 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209922.1|696282_696699_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209915.1|696790_697651_+	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126652.1|697733_698300_+	chorismate lyase	NA	NA	NA	NA
WP_016209918.1|698332_699187_+	4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209914.1|699228_702135_+	bifunctional [glutamate--ammonia ligase]-adenylyl-L-tyrosine phosphorylase/[glutamate--ammonia-ligase] adenylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209904.1|702195_702393_+	zinc-finger domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209903.1|702399_703410_+	lipopolysaccharide heptosyltransferase II	NA	NA	NA	NA
WP_016209910.1|703406_704465_+	lipopolysaccharide heptosyltransferase I	NA	NA	NA	NA
WP_032126655.1|704458_705259_+	glycosyltransferase family 2 protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209913.1|705261_706080_+	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209907.1|706091_707039_+	ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase	R9S880	Prochlorococcus_phage	1.6e-37	37.9
WP_032126654.1|707046_708348_+	3-deoxy-D-manno-octulosonic acid transferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209919.1|708526_709630_+	glycine cleavage system aminomethyltransferase GcvT	NA	NA	NA	NA
WP_016209906.1|709626_710019_+	glycine cleavage system protein GcvH	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016209374.1|771026_772478_+|tRNA	tRNA lysidine(34) synthetase TilS	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NZ_CP038972|834399:888852|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211685.1|836205_838011_+	excinuclease ABC subunit UvrC	NA	NA	NA	NA
WP_016211684.1|838034_838610_+	CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_129556476.1|839154_840165_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273474.1|840260_841235_-|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	4.0e-28	31.9
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WP_016209649.1|843131_844097_+	aldo/keto reductase	A0A2H4PQR8	Staphylococcus_phage	7.9e-45	39.8
WP_016209646.1|844141_844717_-	VOC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209651.1|844747_846022_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_032126159.1|846648_847362_+	aldolase	NA	NA	NA	NA
WP_016209641.1|847441_848179_+	SDR family oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_016209658.1|848299_849655_+	aminotransferase class I/II-fold pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_075273478.1|849831_850503_+	M48 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016209661.1|850618_851494_-	bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase FolD	A0A249XZQ2	Enterococcus_phage	1.5e-34	39.7
WP_016209645.1|852097_853402_+	trigger factor	NA	NA	NA	NA
WP_016209647.1|853514_854120_+	ATP-dependent Clp endopeptidase proteolytic subunit ClpP	A0A223W000	Agrobacterium_phage	8.4e-61	59.8
WP_016209663.1|854201_855503_+|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpX	G3M9Z9	Bacillus_virus	1.5e-134	57.3
WP_032126161.1|855570_858003_+	endopeptidase La	A0A0R6PGP8	Moraxella_phage	9.5e-220	52.7
WP_016209655.1|858106_858379_+	HU family DNA-binding protein	A4JWM7	Burkholderia_virus	2.0e-22	62.9
WP_032126162.1|858482_860360_+	SurA domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209643.1|860391_861276_+	lipid A biosynthesis acyltransferase	A0A1W6JP29	Morganella_phage	2.4e-40	35.3
WP_016209657.1|861284_861680_-	CrcB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209662.1|862107_864255_+	EAL domain-containing protein	G3MA91	Bacillus_virus	1.8e-25	36.7
WP_016209652.1|864226_865576_-	HlyD family type I secretion periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209642.1|865572_867693_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	F2Y1V5	Organic_Lake_phycodnavirus	2.0e-16	28.1
WP_016209656.1|867689_869393_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	W8CYL7	Bacillus_phage	2.8e-21	24.8
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Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_129556482.1|922295_922901_-	NUDIX domain-containing protein	A0A1S6L1P8	Vibrio_phage	1.2e-17	30.9
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WP_016210542.1|929141_930848_+	thiol reductant ABC exporter subunit CydC	W8CYL7	Bacillus_phage	2.5e-25	26.9
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WP_129556484.1|935822_937283_-	sodium:proton antiporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211426.1|937626_939069_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_075273490.1|940051_941344_+	outer membrane transport family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300148.1|941584_942646_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556485.1|942798_945357_+	HAD-IC family P-type ATPase	M1HX51	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	6.3e-73	30.6
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WP_016210417.1|946903_947341_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210423.1|947337_948222_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210416.1|948311_948842_+	prokaryotic cytochrome b561 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210420.1|948912_950091_-	mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein	Q6A202	Oenococcus_phage	2.0e-50	32.1
WP_016210425.1|950239_954088_-	bifunctional proline dehydrogenase/L-glutamate gamma-semialdehyde dehydrogenase PutA	NA	NA	NA	NA
WP_016210422.1|954074_955577_-	sodium/proline symporter PutP	NA	NA	NA	NA
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WP_054300173.1|957075_958137_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

>NZ_CP038972|962011:1065203|DBSCAN-SWA
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MHTQHQQKKLLNRAKRIRGQVDGIIRLLENKDDCTKILHTITSCRGAINSLMAELMEGHINEHVINPTEASTDQQEAATDLIYIIKKYLT

Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>NZ_CP038972|1094660:1201176|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_13

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_033923779.1|1146838_1147675_+|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3
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WP_016209947.1|1150425_1151088_+	carbonic anhydrase	NA	NA	NA	NA
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WP_016209937.1|1155347_1155791_-	DNA polymerase III subunit chi	NA	NA	NA	NA
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WP_016209932.1|1159622_1160663_+|tRNA	tRNA preQ1(34) S-adenosylmethionine ribosyltransferase-isomerase QueA	NA	NA	NA	NA
WP_016209936.1|1160845_1161961_+|tRNA	tRNA guanosine(34) transglycosylase Tgt	A0A1B1IVQ4	uncultured_Mediterranean_phage	1.4e-93	48.6
WP_016209930.1|1161999_1162353_+	preprotein translocase subunit YajC	A0A1B1IVR5	uncultured_Mediterranean_phage	3.1e-07	45.7
WP_032126634.1|1162373_1164242_+	protein translocase subunit SecD	NA	NA	NA	NA
WP_016209935.1|1164263_1165208_+	protein translocase subunit SecF	A0A1B1IVP7	uncultured_Mediterranean_phage	3.2e-38	35.2
WP_016209925.1|1165441_1165720_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209938.1|1165929_1166568_-	transglycosylase SLT domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209944.1|1166542_1167970_-	aminodeoxychorismate synthase component I	S4VNU7	Pandoravirus	4.2e-42	29.8
WP_016209927.1|1168170_1168848_+	M15 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016209939.1|1168982_1170257_+|tRNA	serine--tRNA ligase	A0A1B1IVT2	uncultured_Mediterranean_phage	1.7e-90	51.2
WP_016209943.1|1170324_1171080_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209948.1|1171131_1172049_+	TIGR01777 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209929.1|1172157_1173051_+	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274822.1|1174509_1175484_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	8.9e-28	32.0
WP_016211771.1|1175776_1175965_+	Trm112 family protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_14

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211224.1|1239152_1240424_+	phosphopentomutase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211221.1|1241438_1242581_-	cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II	NA	NA	NA	NA
WP_016211223.1|1242597_1244199_-	cytochrome d ubiquinol oxidase subunit 1	NA	NA	NA	NA
WP_080664858.1|1244710_1244848_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211219.1|1244844_1246122_+	FAD-dependent 5-carboxymethylaminomethyl-2-thiouridine(34) oxidoreductase MnmC	NA	NA	NA	NA
WP_032126789.1|1246471_1246654_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126600.1|1246925_1247447_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212250.1|1247569_1248220_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212251.1|1248381_1248918_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300384.1|1249079_1249895_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075274828.1|1250303_1251626_+	group II intron reverse transcriptase/maturase	A0A0N7AE80	Bacillus_phage	1.2e-11	24.3
WP_052133287.1|1251727_1252126_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212039.1|1252314_1252872_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212040.1|1253048_1254398_+	DNA recombination protein RmuC	NA	NA	NA	NA
WP_054300162.1|1254601_1255684_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1
WP_016210803.1|1255758_1257057_-	PAS domain S-box protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	7.5e-14	52.3
WP_016210808.1|1257234_1258086_+	pyridoxal kinase PdxY	NA	NA	NA	NA
WP_016210805.1|1258094_1258766_+	pyrimidine 5'-nucleotidase	NA	NA	NA	NA
WP_032126141.1|1259175_1260450_+	sphingomyelin phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016210804.1|1260514_1262434_+	DNA mismatch repair endonuclease MutL	A0A1B2LRQ5	Wolbachia_phage	4.5e-84	34.0
WP_032126139.1|1262440_1263370_+|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase MiaA	NA	NA	NA	NA
WP_033923779.1|1266038_1266875_-|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3
WP_075274829.1|1266886_1267159_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1267182_1268157_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_054300382.1|1268557_1268980_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081377858.1|1269198_1269909_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|1270112_1270478_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556449.1|1270492_1270999_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

>NZ_CP038972|1275367:1324413|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_15

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211840.1|1279227_1279692_+	DNA starvation/stationary phase protection protein	A0A0A7RTZ1	Clostridium_phage	4.7e-19	32.9
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WP_016211471.1|1295280_1297266_-	sodium/hydrogen exchanger family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126343.1|1297396_1298209_+	undecaprenyl-diphosphate phosphatase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210507.1|1308144_1308693_-	transglycosylase SLT domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210509.1|1309608_1313106_-	transcription-repair coupling factor	NA	NA	NA	NA
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WP_016211831.1|1319438_1321166_+	penicillin-binding protein 2	NA	NA	NA	NA
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WP_052047133.1|1323387_1323834_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|1323837_1324413_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

>NZ_CP038972|1345212:1383768|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126362.1|1348506_1348872_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211651.1|1349105_1350641_-	glycerol-3-phosphate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211648.1|1352909_1353449_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075278621.1|1355047_1355389_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126641.1|1355424_1357995_-	DNA mismatch repair protein MutS	A0A1V0SJ67	Klosneuvirus	3.9e-30	22.9
WP_016209840.1|1358102_1358588_+	CinA family protein	B5TK85	Pseudomonas_phage	1.2e-36	56.2
WP_016209844.1|1358760_1359801_+	recombinase RecA	A0A0S2MVG1	Bacillus_phage	1.3e-117	66.3
WP_016209835.1|1359778_1360261_+	regulatory protein RecX	NA	NA	NA	NA
WP_016209848.1|1360257_1362852_+|tRNA	alanine--tRNA ligase	A0A1V0SK38	Klosneuvirus	8.3e-89	41.3
WP_016209832.1|1363158_1363422_+	carbon storage regulator CsrA	A0A2I7RT00	Vibrio_phage	4.1e-12	68.6
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WP_016209841.1|1364618_1364813_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209827.1|1364888_1366448_-	SH3 domain of the SH3b1 type family protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556633.1|1366766_1367663_-	sphingomyelin phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016209845.1|1367879_1369355_-	APC family permease	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_17

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016211285.1|1414557_1415337_+|tRNA	tRNA (guanosine(37)-N1)-methyltransferase TrmD	NA	NA	NA	NA
WP_016211286.1|1415354_1415702_+	50S ribosomal protein L19	NA	NA	NA	NA
WP_016211289.1|1415813_1416086_+	hypothetical protein	A0A1B0Z0G5	Vibrio_phage	3.2e-12	53.4
WP_016211767.1|1417414_1418224_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211764.1|1418774_1419596_-	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126803.1|1419796_1421029_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	7.5e-32	26.6
WP_081377862.1|1421515_1422352_-|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3
1422353:1422412	attL	NA	NA	NA	NA
WP_032126239.1|1422363_1422636_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211806.1|1423425_1424151_-	UDP-2,3-diacylglucosamine diphosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016211805.1|1424193_1425732_+|tRNA	glutamate--tRNA ligase	A0A2K9L594	Tupanvirus	7.5e-05	36.9
WP_016211804.1|1425738_1427124_+|tRNA	cysteine--tRNA ligase	A0A2K9L6B7	Tupanvirus	2.5e-47	32.1
WP_032126599.1|1427818_1429162_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212498.1|1429801_1430485_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210332.1|1431426_1432170_-	ribonuclease T2 family protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_18

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18

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ACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCAATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTGTTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAATTTCATTAAAATCTGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCCGCAAACTCTGTTCCATTGTCAGAGGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGATCGCGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGGTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTATTTGATCACCACGATTCACCTTTTTCTTATAAGGTTTTCCCGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTTTCACTCACCTGGATATCATGCTCTCGTATAAGTTCCTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGGGTGCTTAACCGTTGATGGATCAACATTTTTGCCTCCTCTGAAATTTGTCGAAAAGCTTGACCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCACAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAGTAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAACCATCTCTACCCTCTAAGGTAACCCTCCCTTAAAATGAGACAACTCATAACTGGAATCTTCTGTTAACATTTTCAAACAGGAGAGCATATGAAAAAGAGCAAATTAAGTGAATCAAAAATCGTAGAGTTGCTTAAGCGTGTTGAGGCTGGAGCAGATATAGAAACCACAGCAAGAGACTACGGAATCTCAACTAGCACGTATTACACCTTAAAAGAACGTTATGGGGCAATGGATATCTCTCAGCTAAAAAGGCTAAAACAATTAGAGAAAGAGAACCAGCAACTTAAGAGAATGTATGCTGATTCTCAAATAGAAATTGAGGCTTTGAAAGATGTTGTGGAAAAAAAGCTACCGATATAGAGGATAAACGAATGCTCGCTACTTACCTCAAAGATGAACATAAGCTAAGCCTCGTGGTTGCTTGTAATTTAGTCACTCTTCCAAGAGCAAGCTATTACCGAAAAAAACAGCATCAATCTGATAATGCTGAAATAATTTCAGAGCTAAAGACGTTAGCGAGCAAACACAAACGCTGGGGTTGCGACAAAATGGTCGCATATTTAAAAAACAAAGGTAAGCCTTGGAACCATAAGCGCATTCGTCGAGTCTATATTGAAATGGGCTTAAACATAAGCTGTAAACCAAAGCATCACTACGTCAAAAACGAGCCTGAATATTTATTTCAGCCTATCTACAAAAATGTTTGTTGGTCATTAGATTTTATGAGTGACGCCCTTCTGAGCGGTACGAAATTTAGAACGATGAACCTCATTGATGATTACAACCGTAAGGCTTTAGGCATCGCTATCGATTTTTCAATGCCTGCTGTTTTTGTCACATCCAAACTTGATGAGTGGTGCAAAGTGCATGGCTACCCTGAAATGCTGCGGACTGACAATGGGCCTGAATTCATTTCTTCCCATTTCCAAGAATGGGCTGAAGGGCATGGAATTCAACTGCGTCGGATACAACCAGGAAAACCTGCTCAAAATGGTTATATTGAACGATTTAACCGCACTTATCGTGGTGATATTTTAGATTGCAATCAATTTACTTCATTGCAGCAAGTTCAGAAACTTAGCGATGACTGGATCGTTGAATATAATACGATCAGACCACATCAATCTTTAAAGAATCTTTCACCAGACACATTTGCTGAGAAACGTGAAAAACAGTTAGAAAAAATTTCGACAAAAACAGAGGGATAATTCCAGTTTTAAACTGTCTCACTTATGGGGGGTTGACAGTTATATTGAACGATTTAACCGCACTTATCGTGGTGATATTTTAGATTGCAATCAATTTACTTCATTGCAGCAAGTTCAGAAACTTAGCGATGACTGGATCGTTGAATATAATACGATCAGACCACATCAATCTTTAAAGAATCTTTCACCAGACACATTTGCTGAGAAACGTGAAAAACAGTTAGAAAAAATTTCGACAAAAACAGAGGGATAATTCCAGTTTTAAACTGTCTCACTTATGGGGGGTTGACAAAAGTATAGTCAAATTTAATAGCGCTAAAATGAAATAACGAGACTATGAACCTTCATAATCCCTAGTCAACTTAACAACTATAGGTGCTAACAATATTAAAGCAATCAGATTAGGAATAGCCATCAACGCATTTAAAATATCTGCAACTAGCCACAATAAATTTAGATTAGCGACAGCACCTAAAACAATCACAATTACCCATAGAATACGATAGGGAATAATGATTTTAGTACCAAATAAATAGCTCGCACAGCGTTCCCCATAATAACTCCAACCAAGCAAAGTAGTGAAAGCAAAAATAACGAGTCCCACCGTAACAACCAAGCCACCGCCATTAAAAGCAACCTGAAAAGCATCTGAAGAAAGCGCAGCCCCTGTCTCGCCAGATGTCCATAACCCACTTAATAAGATAACAAAGGCAGTAATACTACAAAGAATCATTGTATCAAAAAAGGTCCCGGTCATTGCGATTAATCCCTGGCGAACTGGGCTATTTGTTTTTGCTGCTGCATGAGCAATCGGTGCTGTGCCTAAACCCGCCTCATTTGAAAAAACACCGCGCGCAACACCAAAGCGAATCGCAGCCATTATCGTTGCACCAGCAAACCCTCCTGCTGCTGCTGCGCCACTAAACGCACTATTAATAATCAACATAAATACACTGGATAGGTGGTGAATATTAAGCCCAATAACAACCAGGCCGCCGATAATATAAAAAACAGCCATAATAGGAACCAAATAGCTAGTCACACGCCCAATCCAACGAATTCCTCCGAACAGTACTAAGCCCACCAAAACAGCACTGACTCCACCGACTAACCAAGGTGAAATACCAAAGTGATTATTTAATACGTGCGCCATCGAGTTACTTTGAACACTGTTGCCTATACCAAACGCTGCAATCGTTCCAAAAATAGCAAAGGCAACCCCTAAGCCTCGCCAGCGAGAGCCTAACCCATTTTTAATGTAATACATTGGACCACCAACGAAATTACCATTCGCATCCGTTTCCCGATATTTTACGGCAAGAACGGCTTCAGCATACTTTGTCACCATACCAATTAGTGCGGTCATCCACATCCAAAAAACAGCACCTGGCCCTCCTAAGACAATTGCAGTTGCAACGCCTGCAATATTTCCTGTACCTACCGTTGCAGCCATTGCTGTAGTCAATGCTTTAAAGCCACTGATTTCTCCTTTTGCTTGTTTTGAGTCTTTTTTAACAATTAGTTTAAGTGCTACACCCAGTTTTCTAAGCTGCAATAACCGTAAGCGTATCGTTAAATAAAGACCACAACCTAAAAGCAAAATCAGCATAACCGGGCCCCAAACAAAGCCACTTAATGCATTTAAAAATGATGCTATTTCCATATTAAAACTCACTCCTTGATTTACCTCTTTACTAGTGTAACAAAAAAGGCATAAGTAAAAGCAAGAGAAAAAATATTTTGGCTCGATTAATTATTTTTATAAACCTTTTAATAAAGTTAGGTTTAAGCATAATAGCTAGTCATAGCTCTACATGATTATTTCAAATAAAGGCAACTATAATAAAATTAATTCTGTTTTTTAAAAGCAAGTCAGGCATTTATAACAATATATGCCTGACTATAAAACGGTTATGATGTAATCAATTAAAGCTCACTGGCTGAAGCGATCACTTTATTTACAATGCCATATTCTTTGGCTTCTTCTGCCGTCATCCAGTAATCACGCTCAGTATCTTCTTCGACCTTCTCAAGTACCTGACCCGTACGCTCAGCAATAATAACATTCAAGCGCTTTCTCATTTTAATAATTTCTTTGGCTTGAATTGCTAGGTCCGTTGCCTGGCCACGTGCACCACCACTAGGTTGGTGTAATAAAAAACGTGTATTTGGCAAACAATAACGATCTTCTTTTTCAGCGCCTAGGAAGATTAAACTTCCTGCACTAGCCACCCAGCCGGTGCCAATCACACGAACACGAGGCTTGATAAAACGCATGACATCATGAATTGAATCTCCCGACTCAACATGCCCTCCCGGTGAATTCACATACACAGTAATCTCATCATCGCTCACATGTGCTAAAGCAATAAGTTGAGAAGTTACTTTTTGAGCCAGTTTTTGGTTAATTTCACCAAAAATAAAGACACTGCGCGCTTCAAACAGTTTTTCATCAATTAATGCTGAACCTTGAAGCTGTTGTTCTTGATCACTCATAATTTTATTTCACCTTTATTTCTTTTCTTCATTAACGACAAATTTATAAAATTCGCGGACAACGGTTACATTAATATCCGCAGGTAAATAGTCTTGGCTCAGCCAATCTTCACCATCCAAGCCTTCCATATACAAATTAATAATATGAGGACCGCGTTTTGCCAATTCAAGACGTGCTTGCTCTTCAGTTTGGCAATCAAAGTCTTCATTCTCAATTAACTCTTTTACATCTGTTGCAAAAGCCTCATAGGCCATACGATTGCGATCACAGTCAAACTCTTTAGCAACCTGATCGATGATATCGTCAATGTGCGGGTAATTTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_18

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211994.1|1506021_1506558_+	DUF2062 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211561.1|1511005_1514872_-	ATP-dependent RNA helicase HrpA	A0A1V0SBU4	Catovirus	1.9e-49	26.2
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WP_052047138.1|1518126_1518360_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_19

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19

>NZ_CP038972|1536763:1602976|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016210105.1|1537874_1538195_-	cell division protein FtsB	NA	NA	NA	NA
WP_016210099.1|1538278_1539556_-	phosphopyruvate hydratase	A0A1X9I5Z8	Streptococcus_phage	2.5e-139	60.9
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WP_016210111.1|1540420_1542055_-	CTP synthase	A0A1J0FA14	Only_Syngen_Nebraska_virus	9.7e-144	49.9
WP_016210117.1|1542475_1542835_+	aspartate 1-decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016210103.1|1543116_1544475_+	replication-associated recombination protein A	G3MBE0	Bacillus_virus	7.7e-70	37.2
WP_081377868.1|1544550_1545207_-|transposase	IS1595 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211627.1|1545512_1545677_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211632.1|1545902_1546757_+	DUF481 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211631.1|1547869_1548676_+	DUF2807 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_105962625.1|1552983_1553870_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300349.1|1555021_1556746_-	protein kinase	M1I1A9	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	1.7e-05	25.6
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WP_075274856.1|1566969_1567995_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211733.1|1569750_1570575_+	DNA/RNA non-specific endonuclease	X2KR27	Campylobacter_phage	2.4e-05	28.3
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WP_016211398.1|1573746_1574034_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211399.1|1574180_1574924_-	YebC/PmpR family DNA-binding transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211403.1|1574937_1575981_-	quinolinate synthase NadA	NA	NA	NA	NA
WP_016211405.1|1576116_1577889_-|tRNA	aspartate--tRNA ligase	A0A2K9L0E9	Tupanvirus	4.9e-08	41.9
WP_129556522.1|1578095_1579328_-	MFS transporter	S4TR35	Salmonella_phage	9.0e-17	23.2
WP_016211669.1|1582436_1582787_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211666.1|1582941_1585761_-	excinuclease ABC subunit UvrA	A0A1B1IVR3	uncultured_Mediterranean_phage	1.0e-311	55.2
WP_016211664.1|1586133_1586862_+	single-stranded DNA-binding protein	A0A2I7QWB5	Vibrio_phage	6.2e-42	65.6
WP_016211555.1|1587398_1588757_-	dNTP triphosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126677.1|1588831_1589395_+	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211557.1|1589589_1590819_-	na+ dependent nucleoside transporter family protein	B2YG43	Musca_hytrovirus	2.0e-08	22.0
WP_016211554.1|1590864_1591491_-	uridine kinase	A0A1V0SAA3	Catovirus	1.6e-33	41.3
WP_032126678.1|1591817_1592828_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	1.2e-22	40.6
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WP_075274858.1|1595293_1596379_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|1596515_1596881_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_129556523.1|1602090_1602976_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_20

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20

>NZ_CP038972|1631003:1662275|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_21

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21

>NZ_CP038972|1665855:1731761|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_075274864.1|1730735_1731761_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_22

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22

>NZ_CP038972|1738545:1794831|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_23

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23

>NZ_CP038972|1814742:1992709|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016209486.1|1838524_1838776_-	succinate dehydrogenase assembly factor 2	NA	NA	NA	NA
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WP_032126239.1|1874382_1874655_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
1874656:1874715	attL	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_24

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24

>NZ_CP038972|2025222:2077388|DBSCAN-SWA
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MAIERTLSIIKPDAVAKNVIGEIYARFEKAGLKVVAVKMTHLTEEEAGEFYAVHKARPFFGALVEFMTSGPVMVQVLEGENAVLVHRDIMGATNPAEAVAGTIRADFAESIDENAVHGSDAIETAAQEINFFFDGKVCARTR
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MKHSSAFLTLVEQARSSVSEISIENVCDYINEHVDFQLIDVRESDEVSVGKIKGARVLSKGIIERDIERLIPDVNTHIVLYCGGGYRSALAAENLQRMGYLHVESMIGGFKAWQQAHYETESTG
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MKRSHNIFGYLIAFFAVIFLVACTNTPLKVANDNFRLAGASKAHIDSYGRVMKHISKRYEVDGYFKTTVAVRQIAQEMVDEEFIKKFKAALRFERLNPADGDRLQRAIERDPRISYTATVFVPKYPNDLEKRLAQAFNESPVLRHKMKNPDFRFISSFIVVSAHGQAKYRDFDIKPQFFFGGSQKEKLYNLSNDAPKSLLDGSVFAYQYKVICWRHGFIYDTVLDEIGVKRPACPPGSSALYPGRAEQWKS
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MRIILLGAPGVGKGTQAQRLATRYGIPQISTGDMLRGAIREGTPLGLEAKKIMDEGGLVSDEVIIGLVKERILAKDCEKGFLLDGVPRTLAQAEALKAAAVRIDAVIEIDVADEEIIKRLSGRRVHLPSGRTYHIEYQPPKREGVDDMTGEALVQRDDDTEETVRNRLNIYYKHTSPLIDYYQQWLKEGGAFAPHYVKVKGIGDVAEIEQRICDGINHQS
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MVSKSSWQTYLYALTKRRILTVFLLGFSSGLPFALIAGTLQAWFTTAGLDLKTIGAASLIGLPYTLKPFIAPIIDRYRLPLLGRRRGWLLLFQFALLIAILFMSTLKPTHSVLVLGQTVPLLMIIGVCVAFFSTCQDIVINAYQTEVLYENERGLGASLGVTGWRISFILSGSIALILASHLGWHLTYIVMSLCMLIGVFATLFGPNPDNEGQPPMTFVKAIYEPFVDFFSRQKLPTALLVILLILTYKIGDALALALNTTFLIKGVGFSLDAIGVINKNIGIIGSIAGGIIGGLLMLRLSLFRSLMLFGLVQAIANLGYMWLAIVGKNYSVFVITAFSEHFFSGMGTAAFVALLMSQCNLNYTATQYALFTSLSLFGRTWLGPIAASMVDHFGWAQFFFWSFIVSLPCLFFVWLLRHKLEKDHQDRINKQGQEVACS
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MIYLDYAATTPVDPEVIQAMQECLGLEGDFANPSSLHRLGWLAAEKIKHARGQIARLVGADSKAIIFTSGATEANNLAIKGVCEAYQKRGRHIITSKAEHKSVLDVFAVLEKQGFEVTYLTPNKQGLIDPEILQTAMHEQTILVSLMHVNNELGVAHDLVALGTIVKAHGAIFHVDAVQALGKLPIDLAELPVDLMSFSAHKCYGPKGVGTLFVRRRPKVRLHAQQHGGGHELGLRSGTLATHQIVGFGRACELAEEKLNEEPQRVMALRDRLWQGLSQYDQVYWNGQGALTQAPGILSVSFAGVDGESLLACLPELAVSQGSACNSTTVEISHVLAAIGMPAERAHSTLRFSLGRYSTLAEVDQVIEQVGRALTHLRKLSPTWQVQQAGADPALLPWGRYVE
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MPSPYSYDLRVRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
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MKRTCLRALLAAASVVLVGCSSLTHHDQQSTQSTSSVDKGHSVQSLQKGSAAATLGKGK
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MFKIKQLLIRSVLFLLCYAMAITVSIAANNTSNHGNADHNSDLSTAGSSYLVEFLKAAKTYQADFWQIGEASAGRLECAYGRLLLKQPGQLLWQVKNIDCQQVQALKAPTDQQWDQVILTKQQSVKIYQPLLEQVIERSLGSLDDAVPVKLLTGASLQALAGFDVREQSKSDDQSQLFILSPKNKQSLVSKIEIAFKNKELQQMTVLTPLGQSTKLQFFNIKTNQILPSSLFELKLPKGIDVIKQG
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MNKKRNQPHPDASPDSCFTGNNETWQIFQIIAEFVEGYERLSHISPSVSIFGSARTPSSDPQFKLAQQISGRLSDEGFSIVTGGGPGMMEAGNLGASEGKSLSIGLNIQLPFEECNNPYQDISLKFRHFFSRKTMFIKYASAYVCMPGGYGTLDELSEILVLIQTAKVRAIPIILVCSEFWQGLVSWFDDVLVKQKMISPEDMNLFEMADTPDEVIKIIKTHHAENDLASDQHSLSVRL
>NZ_CP038972|2025222:2077388|2068115_2069816_-|WP_016210560.1|DBSCAN-SWA
MINNRVDGTREIKANTGVKKQAKSWQTEAALRMLANNLDAAVAENPVELVVYGGIGRAARNWLCFDKIVETLKRLENNETLLIQSGKPVGVFKTHEYAPRVIIANSNLVPAWSSWETFNKLDQKGLMMYGQMTAGSWIYIGSQGIVQGTYETFVNAAKKHYQGKILGRWILTAGLGGMGGAQPLAATMAGASLLAIECDPGRIEKRLGSGYLDIKTENLNEALTLIERACKEKKALSVGLLGNAAEVLPELVKRGVQPDFVTDQTSAHDPLNGYLPMGWSLAQAQKMRVENPEQVVKAAKESMAVHVKAMLEFHKLGIPTFDYGNNLQQMALEAGVSDAFAFPGFVPAYIRPLFCEGIGPFRWVALSGDPEDIYKTDEKVKALLPDNTHLHQWLDMAREKIQFQGLPARICWVGLKERMRLGLAFNDMVKSGELSAPIVIGRDHLDAGSVASPNRETEGMQDGSDAVSDWPLLNALLNTASGATWVSLHHGGGVGMGFSQHAGMVVVADGSDRAYKSLSKVLWNDPATGVMRHADAGYQQALACARAQSLDLPMMNMNNKNYQGRD

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016209424.1|2025222_2026500_-|tRNA	histidine--tRNA ligase	A0A2I2L577	Orpheovirus	6.6e-23	25.1
WP_016209433.1|2026599_2026974_-	rhodanese-like domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209412.1|2027058_2027946_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209436.1|2028003_2028732_-	type IV pilus biogenesis/stability protein PilW	NA	NA	NA	NA
WP_129556555.1|2028728_2029859_-	23S rRNA (adenine(2503)-C(2))-methyltransferase RlmN	NA	NA	NA	NA
WP_016209444.1|2029989_2030418_-	nucleoside-diphosphate kinase	A0A167REB2	Powai_lake_megavirus	1.1e-17	39.4
WP_032126508.1|2030512_2030872_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209447.1|2030861_2032073_-	aminotransferase class V-fold PLP-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_016209421.1|2032069_2032858_-|tRNA	tRNA (cytosine(32)/uridine(32)-2'-O)-methyltransferase TrmJ	NA	NA	NA	NA
WP_016209411.1|2033020_2033815_+	inositol monophosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|2034020_2034995_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_155046761.1|2035421_2035595_+	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_075274901.1|2035739_2036753_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007013.1|2036756_2037056_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046696.1|2037045_2037210_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300550.1|2037266_2037632_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211553.1|2037971_2038712_-	outer membrane lipocarrier LolA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211549.1|2038715_2041220_-	DNA translocase FtsK	A0A218M9A2	Mycobacterium_phage	4.9e-86	43.1
WP_016211548.1|2041482_2042439_+	thioredoxin-disulfide reductase	A0A2I2L5E1	Orpheovirus	1.6e-61	43.7
WP_016211550.1|2042422_2043184_+|tRNA	leucyl/phenylalanyl-tRNA--protein transferase	NA	NA	NA	NA
WP_075274903.1|2043261_2044137_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211259.1|2044261_2044507_+	translation initiation factor IF-1	NA	NA	NA	NA
WP_016211262.1|2044566_2046840_-|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA	A0A223W0B1	Agrobacterium_phage	1.0e-167	41.8
WP_075273504.1|2046894_2047248_-|protease	ATP-dependent Clp protease adapter ClpS	A0A218MMY6	uncultured_virus	6.7e-10	40.0
WP_016211261.1|2047437_2047731_+	cold-shock protein	A0A2H4N7Y6	Lake_Baikal_phage	5.8e-15	61.5
WP_032126515.1|2047903_2048083_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307354.1|2048158_2048734_-	DedA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126514.1|2049016_2050333_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211263.1|2050343_2050712_-	thioredoxin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211265.1|2050742_2051405_-	adenylate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2051579_2051945_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556556.1|2051890_2052466_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126519.1|2052633_2053353_+	TIGR00730 family Rossman fold protein	A0A1D8KUT5	Synechococcus_phage	1.9e-19	34.8
WP_016211478.1|2053332_2054148_-	nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126518.1|2054164_2056366_-	GTP diphosphokinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211474.1|2056448_2057798_-	23S rRNA (uracil(1939)-C(5))-methyltransferase RlmD	E4ZFI6	Streptococcus_phage	5.7e-33	27.6
WP_016211473.1|2057872_2058472_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211476.1|2058455_2058665_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211931.1|2058982_2060170_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211932.1|2060365_2061655_+	GDA1/CD39 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300152.1|2062065_2062431_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210558.1|2064067_2064823_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210562.1|2064896_2066549_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300273.1|2066577_2068116_-	histidine ammonia-lyase	A0A1V0S940	Catovirus	5.1e-70	37.2
WP_016210560.1|2068115_2069816_-	urocanate hydratase	NA	NA	NA	NA
WP_081007068.1|2069904_2071080_-	imidazolonepropionase	NA	NA	NA	NA
WP_016210559.1|2071118_2072081_-	formimidoylglutamase	NA	NA	NA	NA
WP_016210566.1|2072441_2072864_-	universal stress protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210568.1|2073169_2073811_+	pyridoxamine 5'-phosphate oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_016210561.1|2073938_2075273_+	dihydroorotase	NA	NA	NA	NA
WP_032126397.1|2075387_2075978_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|2076326_2077388_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_25

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25

>NZ_CP038972|2085232:2129938|DBSCAN-SWA
CGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGGAAGTTGGAGGCGTTTTAAGTCTGGATGATACCGTGGAAGAAAAGCCTTATACAGATGAGAATGATGTGGTTTGTTGGCATTATTCACACAGCAAAAGCGCTCATGTAAAGGGAATTAATATTTTGACAAGTATGGTGACTTACAAGAAAACGTCCGTACCTATTGGTTATGAAACTGTATTAAAAGACATCAAGTTTACTGATTTAAAGGACCGAAAAGAAAAGAGAAAATCTAATATATCGAAGAATGAGTACTTTCGTAACCTTATAAATCGTGCAATTAATAACCAGGTTAAATTTGATTATGCTGTTGCAGATAACTGGTTCAGTTCAAAAGAAAACATGAATTATATTCATGCCAAGTTAAATAAGTTGTTTATTTTAGGAATAAAATCTAATCGAATAGTTGCTTGCAGTTTAGATGATAAAATCAATAGAAATTACCAGCCAGTCAAATCTCTTGATTTAAAAGATGGTGAGGCCATAGATGTATATCTTCAGGGAATTAATTTCCCAGTGCGATTAATGAAAAAGATCTTCACAAACGAAGACGGGTCAACAGGTCACCTCTATTTAATAACAAATGATTTAGAGACGGATGGTGATGGGCTTTACAAAATCTATCAAAAACGATGGAAAATTGAAGAATATCATAAGTCGATTAAACAAAATGCAAGTTTAGCAAAATCACCAACTAAAACTGTTCGGTCACAATGCAATCATATTTTTGCATCAATCGTGGCATTTTGTAAACTAGAAACATTGAGTATAAAAGCACAACTTAACCACTTTGCACTCAAATATAAATTACTTGTGCGGTCAAATCAAATAGCTTTTGAAGAGCTTAGGCGATTAAAATGTTTATGACCTGTGCGTAAGGTGAGATACTTACTCGTTTGACCAAATAAAGGAGATATTTTCACAAGCAGAGATTACCATCACTCCTGATGATTACTTTAATCAAAATGATATTACAAAATATGGCTCAAAAAGAAGTTTTGTTGATGAAATATTTGATAATAAAGCTGCCATGCTATTTAGTCATTCCCTTAGAGATGAGCCAAGAAAAAATGTCCTTTTTACGCAAACATTTTCACACCATGATTTCCCACAACTAATTCATCTTGACAAAAATACACTTTTTTTAATACAAGAAGCTGGAGTAAGCTATGACGATGCTTGGCTATCAATTGAAGAAAGTCTTAACATTCGAGAAAACCTTCCAACTATGTTCTTTAATACCCGGAACAATGACGCTCCCGAGCATGCAGCAAAAGAGCAAAAAGAACCAGACTGCAATTAGCTTCAGCAGCTCAAAGTCGATTTTTCCACACAATTAAATGATAAATACCCAAATCAAAAACTATAAAAAACTTTGCATGGCCGTTTATCATTAATAATCCCCTAATTAGGACTAAGATGCGTCAATTATGAAAAAAACCATAATTGAAACTGTTCTTAGTACAAAGCCAGATAAAAGCAAAAATAGCCTCACTGTACAGTCAAATGTATTCTGTAAATTCCATAGAGCTATAAACTATAAGAAAGATCCCGTGTTGCAAAACCTTTTATCTGCCCAGTATAATTTTTTGCCAAGCCCATCACTTTAAACATCTCCCCCATTTCTGTTGGTAATGTTAACTGCTTAACTTGCTGAGTTAGCTTTAATTGTTTCAATGAATCTTGCTCTTTTTGTAGCTTTTCTTCAATGCAATTTAATAAGCCTGCATTTAATAAAAAGTTAGCCTGGGTATTAAAGCCAACAAGACTAAACCCTGCCTGATCAGCTGCGTTAGCCACTTCAGTAAAATTGACATGGCTGGTAATATCTTGCAGCCCTGGATAAGCAAATACCTCTTGATGGACACGGTGGCGATAAAAAGCACGCAAGGTACCATCCATACGCTCTGGATGAAAAACCTCGCAAGCACTACCACCATAGTCAATCAATAGTACCACCCCTTCAGCCATCGCATGATATAGCCCAGAAAGCCAGGGCTTCAATGCCACATTTAACTCAGCCTTTGTGCCATCAACTAACTTATAATTCATAATGCATTGATCAAGCTCAGTTTGGACAACAGATTGTTCACGCCCCATTGCTTGCCAACAAAATTGGTTCTTATCTAAGCCAACCCCTAACTCAACCGCCTGCTGATTAATTACTTCAAATACATGGACCGGCATTGCATCCAGTACCTCATTGGCAATCACAACACCATTAAAATGCTCTGGCCAGGTACTTAACCATTCAACCCGCGATACAATAGTTTCACCTAATTGAGCAAAACATTCACGCTGGCGCTCTATTAAGTCAGGACTGAGCTCTAAAATAAGGTACTTTTCAGGCAATTGATTAAGCTCTGCAAGCTTACTTAACAATCCACAAGCAAGTGCACCACTGCCAGCACCAATTTCTAGTAAGGTACGCTCTTTTTGCTCAAATACACTTAAAATTTCCAGCGCTTGCAAAGCCAAGGTCTCAGAAAATAAAGAAGATAGTTCAGGTGCAGTAATAAAATCCCCCTCAGCACCAAACTTACGGCTTCCTGCCATGTAATAGCCCAAGTTAGGCGCATATAAAACATACTCCATAAAGCGCTTAAACGACAGAGTACGATCAGGCTGGAGATTAATTTCATGCTGCAATAATTGTACAAGCTTTTGACTGTGAGCCACCTGTTCTGCACTTGGCTTGGGTAATTCAGCCAATTCTTTTACTAGTTTTTCACCTGATTGCATACGCACCGCCTCTCACATTCATTCAATAATTACCCTAAACAACAATATAATTCACTATAACGATATAATTTACTACCTATAATACAATTTAATTCTGTAAATTCTTTAAATATCAAAACTTATAATCACTCAAACTCAAACTAAAATAGTAACTCGCTAAAAATAACTTAAGCTCTCATAAATTCCAGCGATTATTTTCCTTTATCTCTCACCCAGTAAACGCCAGCACAGTTATCAACAATATAAATCTTGAATAAAGACACCATCCACGCTAAGCTCCTAAATTATTCAGATTAAACTCGACCCTTAAAACAATACATTTAAATTTATTACAGGAATAATTAGTCACTATGTTTATTGGTATCGCCCTTGTTATTTTTGCCTACCTGCTCGGCTCAATTTCAACCGGCATTGTAACCTGCAAGCTCATGGGATTACCAGACCCAAGAACCGACGGCTCAGGCAACCCCGGTGCCACCAATGTACTGCGCGTTGGCGGTAAAAAGGCAGCGATAATTACATTGGTTGGCGATGCACTCAAAGGCATTATCCCCGTTGCACTCGCTCATGCTTTAAACCAACACACTCTGCTGGGGCACACCCTTCAACTCACAGAAGCAGGTCTTGGCATCATCGCTTTTGCAGCTTTTTTTGGTCATCTTTACCCCATCTTCTTTAAATTTCAAGGCGGCAAAGGGGTAGCAACGGGCTTTGGCGCAGTGATCGCCTTAAGCTGGCCTCTGGGCCTCACTCTATTAATCACCTGGTTAATCATGGCCTTTTTGTTTAGGATCTCCTCTCTCGCTGCCTTAACTGCTAGCGTTCTTGCACCTTTATACAGCTATTGGCTCGGTACCGAAGGCTATATTATGCCACTGATTATCATGGCCATATTTACCCTCTATCGCCATAAAGCCAACATTGTACGTTTAATTCACGGTGCTGAGCCAAAAATTGGTCAAAAAAACAGCGCTCCCTAAGCTAACCTGCCTTGCAATAGCTTACTTTAAAGTCAGCATGTGAGTAGATTATACCGCAACCAACTCTGTTAACGGCCAACGCGGGGTAACTTTTAAAGTACTTTCACCCAACTGGCCTGCTTTTAGACGCTGGCACCCTGCATAAGCAATCATCGCACCATTATCCGTGCATAGTTCATGACGTGGATAATAGACGTCAAAATTACTTTGCTCACTGGCTTTTTTAAGAGCGACTCGCAGCTGCTTATTAGCACTCACCCCACCGGCCATCACCAAACGTTGCAAGCCTGTTTGCCTTAACGCACGCTGACACTTAAATAACATCACATCAACAACCGCCTCTTGAAAGGCATGCGCCACATCAGCCTTGACCTGAGGATCGTTATGACCATACTTTTTCAGAGTATTCAAAGCAAAGGTTTTTAAACCGCTGAAACTAAAATCTAAGCCAGGTCGATCACACATCGGCCGTGGAAAGATAAAACGCCCTGGCGTGCCTTGCTCTGCCAATTGCGATAAAGCTGCTCCCCCTGGATAGCCTAATCCAAGTAGCTTCGCCGTTTTATCAAACGCTTCACCCACCGCATCATCAATCGACTCTCCCAATAGTTCATACTGGCCTATTGCCGTCACTTGCACCAAAAGACTATGTCCACCTGATACTAATAAAGCTAAAAATGGAAATTCAGGTTGTTTTTCTTCTAACATCGGTGCAAGTAAGTGCCCTTCCATATGATGAACTGCAATAGCCGGCTTATCCCAAGCCAATGCCAACGCTTGCGCTACAGAGGCACCGACCAACAGTGCACCCACCAAACCCGGCCCAGCAGTATAAGCAATACCATCAATACTTTCCTGATGATTATTAGACTCTATCAGCAACTGCTGAATCATTGGCGCCAGCTTACGTACATGATCCCGTGATGCGATTTCAGGTACGACGCCACCATACTCAGCATGCAATGCCACTTGGCTATAAACTTCATGAGCAATCAAGCCCTGATCACTATCATAAATAGCAACCCCTGTCTCATCACACGAGCTTTCGATACCTAGTACACGCATAAAAATAACACTCTCGTTAATATTGATTTCATTTTTCTACGACTAATGCTTATATTATTTCTTTAAATGCAGCTATAATACCCAATACTCACCAGAGTACTAGATTAAAGTTGTATATTAGTTGCATTTTTTCCCAACTTGGGTAAAATGTCGCATCTGAATATTAATGATATTAATGTATCTAC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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_032126170.1|2086289_2086562_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211040.1|2086789_2088001_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211037.1|2088351_2088981_+	glycerol-3-phosphate 1-O-acyltransferase PlsY	NA	NA	NA	NA
WP_016211042.1|2089029_2090046_-|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex transferase subunit TsaD	A0A0R6PI74	Moraxella_phage	5.3e-100	54.2
WP_016211035.1|2090292_2090508_+	30S ribosomal protein S21	NA	NA	NA	NA
WP_016211043.1|2090560_2091010_+	GatB/YqeY domain-containing protein	A0A292GL36	Xanthomonas_phage	4.1e-20	44.2
WP_016211039.1|2091089_2092835_+	DNA primase	A0A1S5RGL3	Helicobacter_phage	2.6e-46	37.1
WP_016211036.1|2092926_2094798_+	RNA polymerase sigma factor RpoD	A0A2I7SAT0	Vibrio_phage	2.7e-33	30.7
WP_054300271.1|2095145_2096120_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016211094.1|2096139_2096463_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211091.1|2097527_2100008_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211092.1|2100051_2101344_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_26

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016210316.1|2195532_2197686_+	bifunctional (p)ppGpp synthetase/guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase	A0A2I2L310	Orpheovirus	1.1e-12	37.1
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WP_036771330.1|2199910_2200885_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9

Sequences of DBSCAN-SWA_27

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27

>NZ_CP038972|2207614:2253537|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_28

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28

>NZ_CP038972|2322740:2382351|DBSCAN-SWA
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MLSEHTKTIIKATAPVMKEYGLTITLRMYDIMFARYPKTKTLFNQTHQENKQQPRALANSIYAYAANIDNLDALSDTIELVAHKHASLNIRPEHYDIVAECLIQAVKDILKEAATTEIISAWTEAYTFLANVFINREEELYQYDRNKAGGWNGFRPFIITDKVKESTHVYSFYLRPQDNQPLIDFQPGQYIALRTHLNNTTITRNYSLSATDHSNHYRISVKREEQGQLSPLLHDQLNINDTVELTAPKGNFTLNNLEQTKQPIVFISGGIGITPLFAMLEKTLNTPASPQITFIHATENSKTHTFKNQLADYNSQHANLLKSYTCYHQPLAQDQCDLAGTINQDWLREKLPKSPADYYLCGSPLFMKHIFQQLISLGINEEAIHYEYFGPLEQMN
>NZ_CP038972|2322740:2382351|2372857_2373898_-|WP_016210874.1|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211371.1|2360968_2361892_-	badF/BadG/BcrA/BcrD ATPase	NA	NA	NA	NA
WP_016211368.1|2362088_2363480_+	sugar porter family MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211369.1|2363526_2364570_+	SIS domain-containing protein	F2Y1G4	Organic_Lake_phycodnavirus	5.2e-18	28.4
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WP_016211374.1|2365188_2366379_+	NO-inducible flavohemoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_016211373.1|2366433_2366580_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_080664878.1|2368686_2368881_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212197.1|2369899_2370817_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210876.1|2371282_2372125_-	isopenicillin N synthase family oxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210873.1|2372192_2372843_-	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	4.1e-21	36.6
WP_016210874.1|2372857_2373898_-	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	Q58MH8	Prochlorococcus_phage	1.5e-68	44.0
WP_016210882.1|2374020_2375106_+	DUF2066 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210872.1|2375132_2376242_+	AI-2E family transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_075274927.1|2381289_2382351_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_29

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29

>NZ_CP038972|2420336:2483964|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_129556659.1|2452620_2453766_-	conjugal transfer protein TrbI	NA	NA	NA	NA
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WP_016209690.1|2455703_2458391_-	aconitate hydratase AcnA	NA	NA	NA	NA
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WP_129556660.1|2462634_2463387_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211688.1|2463572_2463791_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211600.1|2463939_2464458_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211601.1|2464793_2465216_-	Hsp20 family protein	A0A1B1IW69	uncultured_Mediterranean_phage	1.1e-22	37.3
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WP_016211595.1|2467249_2467717_+	CBS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211599.1|2467729_2468740_-	DUF481 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_080664865.1|2468935_2469412_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_033923779.1|2469408_2470245_-|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3
WP_032126239.1|2470256_2470529_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211743.1|2470595_2470958_-	ABC transporter membrane domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556577.1|2470944_2471973_-	ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	4.8e-16	27.7
WP_016211744.1|2471950_2472355_-	glycine-rich domain-containing protein-like	NA	NA	NA	NA
WP_016211742.1|2472585_2474565_+	TonB-dependent receptor	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|2474844_2475573_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_144019244.1|2475662_2476274_-	amidohydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210955.1|2476630_2476885_-	DUF2282 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210954.1|2476983_2478768_-	SLC13 family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210956.1|2478856_2479576_-|tRNA	tRNA (guanosine(46)-N7)-methyltransferase TrmB	NA	NA	NA	NA
WP_016210951.1|2479758_2479965_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075274931.1|2483235_2483964_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8

Sequences of DBSCAN-SWA_30

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30

>NZ_CP038972|2487599:2595435|DBSCAN-SWA
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MNTAAWTKLTAHQQEIKHTHLRDLFINDSQRFNHYFKQGPHLSIDFSKNHLTNHTLKLLIALAQEHSLGDKIHALMQGATLNITEKRAAFHSALRVPASKHHQLPKAVAKQITTVHAQMRTLCAKIHGQTPLYSQGQIITDIVNLGIGGSDLGPAMVTTALTPYHKKHLRCHFVSNVDGNQLHNTLKNLKPETTLFIIASKSFTTQETFANAQSARHWLETAQLSTAQINHHFICCTSKPEKAREFGILAEHILPMWDWVGGRYSLWSSIGLPIALATGFDHFEALLAGAHAMDNHFQTASFEDNLPVMLGLIGLWYINFWHTRSHALLPYEQMLTLFPSHFQQVDMESNGKHVQINGEPVNGQTAPVIWGQPGTNGQHAYHQMLFQGTEMIPMDFIVGLKTHSPYQQQHNMLVANCFAQTRGLMWGCDEKEVYQQMINQGVNQTEAQRLAPHKAIIGNQPSTTILYDKLTPESLGALIALYEHKVFVQGVIWNINSFDQYGVELGKVIGQNILAQLQGGSNIKNNNIDDYDASTQGLIHYFRNNQ
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MARRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEMTGERGLELERSTICRWVHEYGPEITKRLRPYFRQTCASWRLDETLVKIKGCWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQHAKAALRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSRRCKLRRVKYLNNCIENYHKAIKRKSRFRQWYQSLSTARSTIDVMEAMRMVQKGQLRYIKKQDICAQNQLIDKLFGLAA
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MPARKKTESNRQVKRKTSRNKLSVQATKEAVSSKKTRAAARGQSTLTKVAVNSGEKTKYLSFRVDMDFHQRATNAAAYAYQGKLSELLDEAVKEKLEEIEQAQEAVLKSRLHLSKKDLKVIADEVETPSAPTKAFVDFMNKDHLDHKKYNKNIASILSGIQNRKT
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MQTVNIHEAKTHLSRLIEKASSGEPFIIAKAGKPLVKVVPLSAPDETDVKRVGFLTGQIEVPDDFDTMGCDEIEKLFGDEE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_075274931.1|2487599_2488328_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
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WP_016211816.1|2489396_2489750_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211812.1|2489791_2491405_+	DEAD/DEAH box helicase	A0A2I7RG64	Vibrio_phage	9.2e-62	32.6
WP_075274932.1|2491626_2491848_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274933.1|2492156_2492885_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_016211951.1|2493501_2494599_+	glutamate 5-kinase	A0A1X9I5D0	Streptococcus_phage	3.9e-48	34.3
WP_016211949.1|2494632_2495883_+	glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase	A0A1X9I5D4	Streptococcus_phage	1.6e-93	46.3
WP_075274934.1|2496370_2497039_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	2.8e-41	44.0
WP_016212193.1|2497161_2497500_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212195.1|2497567_2497954_-	type II toxin-antitoxin system VapC family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_016212196.1|2497950_2498196_-	type II toxin-antitoxin system Phd/YefM family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|2498604_2499333_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_016211625.1|2499816_2500686_-	UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU	A0A127AW70	Bacillus_phage	1.2e-68	47.5
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WP_016211623.1|2502144_2503785_+	glucose-6-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016211987.1|2505606_2507343_-	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	1.3e-24	44.0
WP_054300202.1|2507846_2508575_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_098082825.1|2508638_2508947_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211657.1|2508939_2509272_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211654.1|2509275_2509845_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211655.1|2509973_2510387_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211652.1|2510646_2511852_+	glycine C-acetyltransferase	V5LQ39	Emiliania_huxleyi_virus	2.5e-35	26.6
WP_016211653.1|2511959_2512985_+	L-threonine 3-dehydrogenase	R9TPW0	Vibrio_phage	2.3e-18	78.8
WP_054300202.1|2513076_2513805_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_033923779.1|2514017_2514854_-|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3
WP_032126239.1|2514865_2515138_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155049161.1|2515188_2515698_-	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_036780855.1|2515672_2516170_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274931.1|2516935_2517664_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
WP_155049878.1|2517706_2518282_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211047.1|2518360_2519995_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211051.1|2520356_2520860_+	methylated-DNA--[protein]-cysteine S-methyltransferase	A0A167R6J9	Powai_lake_megavirus	1.1e-13	43.5
WP_016211050.1|2520822_2521530_-	dethiobiotin synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016211044.1|2521598_2522459_-	malonyl-ACP O-methyltransferase BioC	NA	NA	NA	NA
WP_016211045.1|2522439_2523213_-	alpha/beta fold hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016211052.1|2523243_2524497_-	8-amino-7-oxononanoate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016211049.1|2524496_2525459_-	biotin synthase BioB	NA	NA	NA	NA
WP_016211056.1|2525502_2526255_+	ComF family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210615.1|2528630_2529101_-	DNA starvation/stationary phase protection protein	A0A0A7RTZ1	Clostridium_phage	2.1e-19	35.7
WP_016210624.1|2529146_2529386_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274938.1|2529404_2529911_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210617.1|2530074_2531499_+	bifunctional D-glycero-beta-D-manno-heptose-7-phosphate kinase/D-glycero-beta-D-manno-heptose 1-phosphate adenylyltransferase HldE	M4QSA2	Synechococcus_phage	1.4e-16	42.3
WP_016210618.1|2531563_2532613_-	UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_051307334.1|2532879_2533659_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556587.1|2533702_2534605_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210625.1|2534663_2535410_-	SDR family oxidoreductase	Q06VL0	Trichoplusia_ni_ascovirus	1.3e-18	30.8
WP_016210616.1|2535658_2538469_+	phosphoenolpyruvate carboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_129556661.1|2538769_2539333_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300481.1|2539321_2540050_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	9.6e-43	41.4
WP_080664881.1|2540139_2540346_+|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212263.1|2540508_2541102_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212264.1|2541147_2541741_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	5.4e-28	44.6
WP_016212238.1|2542256_2543546_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274939.1|2543575_2544304_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	2.8e-42	41.4
WP_087910645.1|2544416_2545569_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	8.9e-59	44.2
WP_075274940.1|2545597_2546278_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	2.0e-42	44.3
WP_016211997.1|2546633_2547743_+	ParA family protein	A0A1X9I765	Streptococcus_phage	4.4e-07	24.5
WP_016211996.1|2547744_2548692_+	ParB/RepB/Spo0J family partition protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274941.1|2549075_2549804_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.2e-42	41.8
WP_075275114.1|2549833_2550196_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212339.1|2550348_2551095_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274942.1|2551113_2551842_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	2.7e-45	43.1
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Sequences of DBSCAN-SWA_31

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31

>NZ_CP038972|2624075:2658529|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_31

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MIKAILTDIEGTITRISFVKDVLFPYAEKQLPEFIHCFCETPEVFAQLDAVKNEINNQQATIAQLIDTLLAWIREDKKITALKQLQGMIWEKGYQQGDFTGHLYSDAVEFIREQCKRNIPVYVYSSGSVKAQKLLFSYSDFGDILELFSGFYDTKIGGKKEMKSYQNIIEELNIQAENVLFLSDIAAELDAAKQAGLKTCQLVRDNQKPSKHHPWVNNFNKFIIQDYS

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_081377880.1|2624596_2625076_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556590.1|2625933_2626329_+	nucleic acid-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126312.1|2626325_2627120_-	M48 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016211756.1|2627298_2628024_-	M15 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016211759.1|2628269_2629457_+	S-methyl-5-thioribose kinase	NA	NA	NA	NA
WP_081377344.1|2629811_2630939_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016210935.1|2631269_2631812_-	acireductone dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210943.1|2631808_2632495_-	acireductone synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210942.1|2632498_2633110_-	methylthioribulose 1-phosphate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016210944.1|2633156_2634176_-	S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016210936.1|2634277_2635072_-	thymidylate synthase	A0A2R4A1R4	Microbacterium_phage	5.3e-103	69.0
WP_016210931.1|2635109_2635916_-	prolipoprotein diacylglyceryl transferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210941.1|2635994_2637044_-	pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_032126310.1|2637241_2638501_+	inorganic phosphate transporter	E5ESL8	Bathycoccus_sp._RCC1105_virus	5.9e-24	34.7
WP_032126309.1|2638547_2639225_+	TIGR00153 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210937.1|2639310_2639592_-	RNA chaperone Hfq	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_32

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_32

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MSGTTEQLTQVINDVLEAGKAKDITVLDVKEMTSITDHMVVASATSSRHLKALANAVVSDVKERGFEVLGVEGEASAEWVLVDMADVILHVMLPDTREFYNLEKFWSMPAA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016209994.1|2724892_2725180_+	4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016209985.1|2725336_2725675_+	integration host factor subunit beta	NA	NA	NA	NA
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WP_016209996.1|2732513_2732738_+	TIGR02449 family protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_33

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_33

>NZ_CP038972|2912395:2956741|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_33

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_34

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_34

>NZ_CP038972|2989763:3052950|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016209697.1|3046094_3046673_-	aminodeoxychorismate/anthranilate synthase component II	A0A0P0IKJ1	Acinetobacter_phage	2.8e-45	45.0
WP_016209713.1|3046669_3048139_-	anthranilate synthase component I family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075274970.1|3049476_3049947_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075274971.1|3050303_3050756_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_35

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_35

>NZ_CP038972|3059805:3108620|DBSCAN-SWA
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MQITVMLLLWKKATEQWIAAQNELLPKCEYQHITLTMPEALWPFFLANRDLLNELSRLAADILLKTAKKKKVKIGIFTMLHTFGQDLKWNTHIHLSVTRGGLSECEAIWKKIYFTKRKTMRMWRYAIINLLRDAYKAGKLVIPHQYQNRIIDLTSFNRFINPEYNKLWHVHFSDVQPSHHQNVDYLGRYLKRPPLSNSRILYYDGEKVAFRYIDRETGKQDEYHCTASEFIDRLIPHIPEKSFKMVRYYGFLSFRTRGKLLPKIYEILDQTVEPIKKITYASLLKGFINTDPFECILCGSKMVLTGGRPKQRLSVIMKYHKALATMQIIKF
>NZ_CP038972|3059805:3108620|3080567_3081146_+|WP_129556610.1|DBSCAN-SWA
MYQAFTLLMTIASILLSGCISHYSYYTPRPNDQNQCGILADNESIYIGTAQDFYLESRYYANSGNQISQLLLETVNKYTTHIKRSKNHVTMQQGLIQARNQGYSIYIYPTIISWQRPMPTISWLIDHSEVRLSLYNVKSGKLLNDVIIRADQPIASQWFEENSERLEFAFNKVIAYWYACQKNQMNIIHPTD
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MSGHYEVATNEKKNLGKSLRNYALGFILSAVLFAVATLLVSKQALSSTGVTLVLLIILAVLLLVQLVCFFGLNTRTENARWDMLTFAFTILVTVVVIGGSLWIMYNLNYYMVH
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MKRFIPLFIIIVTIIIFFSLGLQKYLSFSTLQEHNQFLQQFTHNHLILAILMFCLLYIISVTLSIPGATLLTITAGLLFGSILGTVCVVISATIGASLLFLAVRTSFGELLHTKAGPRIKQLEAGFQKNNFNYLLTLRLIPIFPFWLLNIAPALLKMPLQPYILATLLGIIPGSFVYVSLGNGLEHLLSLGKTPNLSIIFQPKILIPLIGLAILALLPIFYREIKHRQNKS
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MLSTPWLAAPEKYSPPSKTCLINSTIKLFQRVKPHWDYNQKNVYTCKAATT
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MKVNVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
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MKALKLIKGALPKHTAIIYMVISAVCIASAGFFAKIAMQYTSVQITLLARFGVPLLLLILFFSFYQRWKQLKFTYAKTHFIRAFFLTLAQFLLFISIIHLSLAEATVLYSTGPIFIAIFSFFKNKKINLQSLIAVLLGAVGVALMMHIENGIINPYVIVGLLSGFCLSASQLLLHSATKKEKNSHVMLFVYLFSTLLSLIYFGLINIEEELKTLTPMLSFSIPIIGILILVGLASLGNQFFRGKAYQQVKDPASIAPLIYISILVAGLYDIFFYNHLPNIEVIIGAILIVTSALFSKK
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MSTICITGASNGIGEALAYSYARPDNHLILIARNAERLEQVKAQCEKYGSKTTIAIINVCNHQALHDFLIDIDNQDPIHLVIANAGPSLKQLTHETTNYFSAQRLMVDTHINGTFNSIYPLIQRMQQRRSGQIAIMSSMNAKIFLPGRSIYGAVKAALLHFGLALRQQLKSDNIQVSVICPGWVKTPRTDLNQFSMPFKISAKKAALTIQKGLIQNKAIIQFPWQLSLITGIYSYLPLKIKEWVSQKLYFTNSKDND
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MTCDNITPLGYVFMPHHIALWRARGVEANYQGQLKMLRNIHAADSQHRNKQQCNQRKSNI
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MMNIHIERQLLEYRRYKIMTYSTGAGQETLLILHGGPGVPSDYMRESHFEFYVKKGLRVVTWIS
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MPHIELKYSDDLIIDTNKIFEAIENTINEYDSSSGVCKSRAYATSLYKHSHILVSVFLLKKPHRDDNFSQGLTYSLEQVVKEFIQQECHFSLSLEYNSDFYITNQYSVEKNC
>NZ_CP038972|3059805:3108620|3102513_3103938_+|WP_016211292.1|DBSCAN-SWA
MTVELHTNDINSHYQPTDNIDSLSGKRQMKSTFSLASLFGLRMLGLFMILPIFALYANQLHGATTLWVGLTLGVYGATSCLFQLIFGWASDHFGRKKIIALGLLIFAIGSLIAGLSDSIYGVFIGRALQGAGAIGSATLALIADLTKDKHRTKAMATVGMTIGFSFVIAMVLGPLLVGHIGLSGLFYLTGALALIAIIVLYKVVPSPKRSITHEGNTARWSQFKTVMTSPQLLNLDLGIFTLHAVLTASFMFIPLDMLHQLSLDAHEQWMVYLPVFIVSVIFMVPFVIIAEKKRHMKGVLLGMIALMLISQIGVWLFDSNLPGIIISLMLFFTAFTVLEALLPSWISKVSPVAAKGTAMGIYSSSQYLGAFIGGSIAGLLLSWHNSTALMIIILVALAVWWILSFLQAKPPHYSSRLIHVGALNAQQAATLQATLAKRPGVVEVMVAKEEGTAYLKVIADLYQDNDNQAQATET
>NZ_CP038972|3059805:3108620|3094662_3094926_+|WP_016211791.1|DBSCAN-SWA
MKKQLMVNNKIQLTLPTINHAIELFSLIDQYRSELREFLPWVDQTLDINNTQDYIKYCLSQYNNHSALIYLLYYSTQRIVSDIDFIT

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211227.1|3060755_3062834_+|tRNA	glycine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016211228.1|3062981_3063497_+	acyl-CoA thioesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016211234.1|3063505_3064069_+	D-glycero-beta-D-manno-heptose 1,7-bisphosphate 7-phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016211229.1|3064049_3064796_+	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211230.1|3064935_3065388_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210351.1|3065811_3066648_+	sterol desaturase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210335.1|3066644_3067541_+	EamA family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210345.1|3067573_3068641_+	4-oxalomesaconate tautomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016210352.1|3068659_3069028_-	diacylglycerol kinase	NA	NA	NA	NA
WP_129556609.1|3069053_3070502_-	potassium transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210336.1|3070511_3071891_-	Trk system potassium transporter TrkA	NA	NA	NA	NA
WP_051307328.1|3071931_3073263_-	16S rRNA (cytosine(967)-C(5))-methyltransferase RsmB	NA	NA	NA	NA
WP_032126694.1|3073234_3074194_-|tRNA	methionyl-tRNA formyltransferase	E3SNR5	Prochlorococcus_phage	2.2e-10	35.9
WP_016210340.1|3074286_3074790_-	peptide deformylase	E3SLL2	Synechococcus_phage	1.4e-13	37.1
WP_016210346.1|3074924_3076076_+	DNA-protecting protein DprA	NA	NA	NA	NA
WP_016210342.1|3076072_3076552_+	DUF494 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126693.1|3076698_3079020_+	type I DNA topoisomerase	A0A1V0SCS0	Indivirus	2.3e-98	35.7
WP_080664839.1|3078964_3079591_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210344.1|3079595_3080495_+	oxygen-dependent coproporphyrinogen oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_129556610.1|3080567_3081146_+	DUF4823 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210347.1|3081446_3081704_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556611.1|3081712_3082866_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
WP_155046758.1|3084002_3084134_+	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_155046759.1|3084278_3084434_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212051.1|3084761_3085535_+	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_032126148.1|3086076_3086259_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|3086862_3087837_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016212335.1|3088931_3089270_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212337.1|3089286_3089997_-	proline iminopeptidase-family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016212336.1|3089984_3090179_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007013.1|3090337_3090637_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046696.1|3090626_3090791_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300550.1|3090847_3091213_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211790.1|3092517_3093213_+	TVP38/TMEM64 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211793.1|3093209_3094637_+	FAD-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211791.1|3094662_3094926_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|3095286_3096261_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_129556612.1|3096319_3097170_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211291.1|3097207_3097552_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211297.1|3097548_3098385_-	protoheme IX farnesyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211294.1|3098385_3098727_-	prokaryotic cytochrome C oxidase subunit IV family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211298.1|3098728_3099334_-	cytochrome c oxidase subunit III family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126720.1|3099330_3101325_-	cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I	NA	NA	NA	NA
WP_016211299.1|3101344_3102286_-	ubiquinol oxidase subunit II	NA	NA	NA	NA
WP_016211292.1|3102513_3103938_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|3104450_3105425_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_080743040.1|3105483_3106140_-|transposase	IS1595 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126480.1|3106186_3106870_-	methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_080664873.1|3107415_3107730_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556613.1|3107624_3108620_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
NZ_CP038972.1|WP_032126179.1|1097129_1097381_+|TSUP-family-transporter	1097129_1097381_+	83 aa aa	NA	NA	NA	1094660-1201176	yes
NZ_CP038972.1|WP_054300380.1|1286991_1287648_-|transposase	1286991_1287648_-	218 aa aa	NA	NA	NA	1275367-1324413	yes
NZ_CP038972.1|WP_016212421.1|1290887_1291070_-|hypothetical-protein	1290887_1291070_-	60 aa aa	NA	NA	NA	1275367-1324413	yes
NZ_CP038972.1|WP_032127044.1|1302794_1302995_-|hypothetical-protein	1302794_1302995_-	66 aa aa	NA	NA	NA	1275367-1324413	yes
NZ_CP038972.1|WP_016212482.1|1303209_1303353_+|hypothetical-protein	1303209_1303353_+	47 aa aa	NA	NA	NA	1275367-1324413	yes
NZ_CP038972.1|WP_098082828.1|1876000_1876258_+|transposase	1876000_1876258_+	85 aa aa	NA	NA	NA	1814742-1992709	yes
NZ_CP038972.1|WP_098082828.1|1936159_1936417_-|transposase	1936159_1936417_-	85 aa aa	NA	NA	NA	1814742-1992709	yes
NZ_CP038972.1|WP_016212450.1|2245133_2246036_-|hypothetical-protein	2245133_2246036_-	300 aa aa	NA	NA	NA	2207614-2253537	yes
NZ_CP038972.1|WP_129556569.1|2252762_2252972_+|hypothetical-protein	2252762_2252972_+	69 aa aa	NA	NA	NA	2207614-2253537	yes
NZ_CP038972.1|WP_016210580.1|2777534_2777795_+|methyltransferase	2777534_2777795_+	86 aa aa	NA	NA	NA	2716226-2799833	yes
NZ_CP038972.1|WP_016211201.1|2994524_2994833_-|hypothetical-protein	2994524_2994833_-	102 aa aa	NA	NA	NA	2989763-3052950	yes

Protein sequences of NZ_CP038972.1|WP_032126179.1|1097129_1097381_+|TSUP-family-transporter

>NZ_CP038972.1|WP_032126179.1|1097129_1097381_+|TSUP-family-transporter
MSTALAFPMGLFALTSLLVASAGMAGLPSGSVGYLYLPALIGLLIGSFLGSPLGVWMVKRVSEQTSVWLFRIVLLAVIMQMIH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	1105752-1105715	0
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	1105618-1105581	1
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	1095573-1095610	1

1. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038972 position: 1105752-1105715, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038972 position: 1105618-1105581, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

3. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038972 position: 1095573-1095610, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttagtccagcgct	Protospacer
****************************.*********

Protein sequences of NZ_CP038972.1|WP_054300380.1|1286991_1287648_-|transposase

>NZ_CP038972.1|WP_054300380.1|1286991_1287648_-|transposase
MARSERKSNISKNEYFRNLINHAINNQVKFDYTVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	1286916-1286953	0
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	1290422-1290459	0

1. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038972 position: 1286916-1286953, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038972 position: 1290422-1290459, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038972.1|WP_016212421.1|1290887_1291070_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038972.1|WP_016212421.1|1290887_1291070_-|hypothetical-protein
MLLKDLRFSVLRLLSDLYNHEKSKDGSTNDLNFLTKCKREAEEANSKQEIADLLNTHLTH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	1286916-1286953	0
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	1290422-1290459	0

1. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038972 position: 1286916-1286953, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038972 position: 1290422-1290459, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038972.1|WP_032127044.1|1302794_1302995_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038972.1|WP_032127044.1|1302794_1302995_-|hypothetical-protein
MARSVSNLLESWKTGKKKAAPNFDKLNLSEEGLTWAKAELEKLLSQQSKANTDLKQKLITHLTHRS

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	1286916-1286953	0
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	1290422-1290459	0

1. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038972 position: 1286916-1286953, mismatch: 0

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**************************************

2. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038972 position: 1290422-1290459, mismatch: 0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP038972.1|WP_016212482.1|1303209_1303353_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038972.1|WP_016212482.1|1303209_1303353_+|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVLFLSFVVIGIFTFSYSFNLDSVLGLG

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	1286916-1286953	0
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	1290422-1290459	0

1. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038972 position: 1286916-1286953, mismatch: 0

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**************************************

2. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038972 position: 1290422-1290459, mismatch: 0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP038972.1|WP_098082828.1|1876000_1876258_+|transposase

>NZ_CP038972.1|WP_098082828.1|1876000_1876258_+|transposase
MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	1940420-1940383	0
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	1821282-1821319	0
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	1821416-1821453	0

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**************************************

2. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038972 position: 1821282-1821319, mismatch: 0

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**************************************

3. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038972 position: 1821416-1821453, mismatch: 0

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Protein sequences of NZ_CP038972.1|WP_098082828.1|1936159_1936417_-|transposase

>NZ_CP038972.1|WP_098082828.1|1936159_1936417_-|transposase
MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	1940420-1940383	0
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	1821282-1821319	0
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	1821416-1821453	0

1. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038972 position: 1940420-1940383, mismatch: 0

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**************************************

2. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038972 position: 1821282-1821319, mismatch: 0

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**************************************

3. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038972 position: 1821416-1821453, mismatch: 0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP038972.1|WP_016212450.1|2245133_2246036_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038972.1|WP_016212450.1|2245133_2246036_-|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGELIKDGQITFEQALEFTYDQQSVCESDAIRALIQQGILSFDLSLKLTGCQQRNLEAPVIAELLRSKDQRCRLTLEQALALDSVQRDNIKSKTVRALLQEGILPSIEKALSLTEEQRRSLVRPTVGKLLRSKDHFLHLTLEQALNIKSEQELTLASKDIRQLIQDRQITLEQALAFTSEQQRSCESGVIRALVQEGILSFDLSLKLTGCQQRNLEEPRVAELLRSKDEHCRLTLDQALRLMSWHKEFLQSKLTFKLIKDKKLTMEQALTLSYSAGLTVSDILSVG

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	2211204-2211241	0
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	2213125-2213162	0
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	2245004-2245041	0
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	2245138-2245175	1

1. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038972 position: 2211204-2211241, mismatch: 0

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**************************************

2. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038972 position: 2213125-2213162, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038972 position: 2245004-2245041, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038972 position: 2245138-2245175, mismatch: 1

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********** ***************************

Protein sequences of NZ_CP038972.1|WP_129556569.1|2252762_2252972_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038972.1|WP_129556569.1|2252762_2252972_+|hypothetical-protein
MTNFVHASEFTFQQDDGLINDDWVRLVQPSLPLGTQINSLALTQAGDTLYINTQSVGSFLCQGDIALNE

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	2211204-2211241	0
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	2213125-2213162	0
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	2245004-2245041	0
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	2245138-2245175	1

1. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038972 position: 2211204-2211241, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038972 position: 2213125-2213162, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038972 position: 2245004-2245041, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038972 position: 2245138-2245175, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

Protein sequences of NZ_CP038972.1|WP_016210580.1|2777534_2777795_+|methyltransferase

>NZ_CP038972.1|WP_016210580.1|2777534_2777795_+|methyltransferase
MKMRNYHSHILKIHEKEQGWRKLKTPNMPLDIEIGCGVGMHPLLYASAYPERFLIAIEKTREKFGKFAKKNNTIGPYQNLLAPSVI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	2798068-2798105	0

1. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038972 position: 2798068-2798105, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038972.1|WP_016211201.1|2994524_2994833_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038972.1|WP_016211201.1|2994524_2994833_-|hypothetical-protein
MQAIGAFQAGLAAINAGAGELREHANEIAHFSIPRGTVAEQEHRPAVVAVNELTQTERPAHFGQNMVRPMVGLLEASNQAQVGAKVLQIASDTLGSLIDIRA

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	3005440-3005477	0

1. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038972 position: 3005440-3005477, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. NZ_CP038974

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	4083 : 42287	46	Streptococcus_phage(20.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	50630 : 71311	29	Pseudomonas_phage(11.76%)	tail,portal,terminase,capsid,protease,head	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038974|4083:42287|DBSCAN-SWA
ATTATCCATCTGTTTTTGTCGAAATTTTTTCTAACTGTTTTTCACGTTTCTCAGCAAATGTGTCTGGTGAAAGATTCTTTAAAGATTGATGTGGTCTGATCGTATTATATTCAACGATCCAGTCATCGCTAAGTTTCTGAACTTGCTGCAATGAAGTAAATTGATTGCAATCTAAAATATCACCACGATAAGTGCGGTTAAATCGTTCAATATAACCATTTTGAGCAGGTTTTCCTGGTTGTATCCGACGCAGTTGAATTCCATGCCCTTCAGCCCATTCTTGGAAATGGGAAGAAATGAATTCAGGCCCATTGTCAGTCCGCAGCATTTCAGGGTAGCCATGCACTTTGCACCACTCATCAAGTTTGGATGTGACAAAAACAGCAGGCATTGAAAAATCGATAGCGATGCCTAAAGCCTTACGGTTGTAATCATCAATGAGGTTCATCGTTCTAAATTTCGTACCGCTCAGAAGGGCGTCACTCATAAAATCTAATGACCAACAAACATTTTTGTAGATAGGCTGAAATAAATATTCAGGCTCGTTTTTGACGTAGTGATGCTTTGGTTTACAGCTTATGTTTAAGCCCATTTCAATATAGACTCGACGAATGCGCTTATGGTTCCAAGGCTTACCTTTGTTTTTTAAATATGCGACCATTTTGTCGCAACCCCAGCGTTTGTGTTTGCTCGCTAACGTCTTTAGCTCTGAAATTATTTCAGCATTATCAGATTGATGCTGTTTTTTCGGTAATAGCTTGCTCTTGGAAGAGTGACTAAATTACAAGCAACCACGAGGCTTAGCTTATGTTCATCTTTGAGGTAAGTAGCGAGCATTCGTTTATCCTCTATATCGGTAGCTTTTTTTCCACAACATCTTTCAAAGCCTCAATTTCTATTTGAGAATCAGCATACATTCTCTTAAGTTGCTGGTTCTCTTTCTCTAATTGTTTTAGCCTTTTTAGCTGAGAGATATCCATTGCCCCATAACGTTCTTTTAAGGTGTAATACGTGCTAGTTGAGATTCCGTAGTCTCTTGCTGTGGTTTCTATATCTGCTCCAGCCTCAACACGCTTAAGCAACTCTACGATTTTTGATTCACTTAATTTGCTCTTTTTCATATGCTCTCCTGTTTGAAAATGTTAACAGAAGATTCCAGTTATGAGTTGTCTCATTTTAAGGGAGGGTTACCGAAGGGCGTCACTCATAAAATCTAATGACCAACAAACATTTTTGTAGATAGGCTGAAATAAATATTCAGGCTCGTTTTTGACATAGTGATGCTTTGGTTTACAGCTTATGTTTAAGCCCATTTCAATATAGACTCGACGAATGCGCTTATGGTTCCAAGGCTTACCTTTGTTTTTTAAATATGCGACCATTTTGTCACAACCCCAGCGTTTGTGTTTGCTCGCTAACGTCTTTAGCTCTGAAATTATTTCAGCATCATCAGATTGATGCTGTTTTTTTCGGTAATAGCTTGCTCTTGGAAGAGTGACTAAATCACAAGGATAGGCAGCCGAGTACAGCTGCTACTTTCGGAGGGTCGTGCTAATTTGATAATAAATTCCTCTTAATTAAGTCATTTGACTTGCATTTTATCTGCGCCGCTTTATCCTAACTTACTATTTAAATTTAATTTGTTATCTCTCATGGTTATTAAGCGGGAAAAGGGCGTAACCTACCAGGTCCAATTCACATTAAAGCATGTACTGCAATATCAAAATGCATGGTGGCGTTATCGTGCTCAGAACTTGGATTCTATTCGTCCTGCTGTTGATGAAAACGTTTTAAAGGTATTAAATTGCCGCACAGAGCTTGCTGGTTGTGATATCTTCAGCTGTTCTAATCCAAACTGCAAACATACTAAGGTGGTCTGCTTCACCTGCAAATCACGCTTCTGCTCAACATGCGGAAAAAAAGCAACAGAAACCTGGATTGAAGAGCAAAATGCAACGTTGCCTCAGTGCAAATGGCAACACATCACATTTACGATGCCTAAGCGATACTGGGCTTTTTTTCTATTCAATCGTGAATTGCTCAACATTATATTCAGGACTGCCGCGAATACCCTTTTAGAGACTGCAAAAAAGAAAGGCCTTGTCATCGGTATCTTTGCCGCTTTGCATACCTTTGGTCGAGACCTGAAGTGGAACGTCCACATCCACATTTCAGTCACACGTGGTGGCTTCGATGAAAAACATGAATCTTGGCGTGATATTTATTTTAAGCTCAAAGTGATTATGCCAATGTGGCGCTATGCAGTTACTGATCTGCTAAGACAAACCTACAAAAAAGGTCAACTAATAATCCCAGATGAATACCAAGACGAAATAACTGACCTAACAACATTCAACACATTTTTGAACGCTGAATATCAAAAATATTGGAAGGTGCATTTTGCTCAGCCTAAAGACAATCACCTACATAATGTCGATTACTTAGGCCGGTATATTAAGCGGCCGGCACTCGCCAATGCTCGCCTAGAGCATTATGATGGCAATTGAGTTATTTTCCGATATTTGGACCATAAGACTAAACAACAAAAGCTAAAGAAAGAAGGCATCGGCGACTTTTTTGATCGGCTCACCCAACACATCCCTGATAAATTTTTTAAAATGATTAGATATTATGGATTTTTAAGTTATCGCATTCGGGCAGTTATGTTGCCAAAAATCTATGATTTGGTTGATCAAACTATTGAGGGCTACAAAGAAACTTCATTTGCTGCTCTAATGAAAAGTAATTTTGGCTATGACCCTCTTGAATGTGTTTTATGTGGCAGCCAACTGAGAAGAACAGGCACTCGATTTGGCTTAAACCTTCATGACAAATGGAAGTATTATGAGGCGTTAGCAACCAGTAGATTTATGGGCACTGTTGCAAAAAATTTAGATTTGAGTAGGGTGTAGCAATCAACGGAAGTTAAGAGTGAATTGCTGTGGGTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATCATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGCTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATCAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCCATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTGTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGTTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCGATTTATGGGTCTCTAGGCTATTTCAGTGGGATGAATCCGTCTAAAAACAGAATAAATGCCAATTTTTAGCCGAAATCTCTCTTTTTTGGAGCATGGCTCTAATTTTATGGAAGCGCAATAACATAATTTGGTACATTTGTATCGTTTTGTTTATGATGTTGTTTTTTGAAATTCCTAAAACTAAATTTTAAGCGAGCGGCAAAGCCGATAGCTCTCTGTTTGATTATTGTCCTTCATCTGCTCTTGGATCCATTTCATTTGTGACAGGTGTTATTTCTGTCGCTGGAACGAAACTATGCTTTTCTTCCATAGGAACAGAAGCAGAAATTTGTTTACGCCACAGCATAAATAAGCACAAAGGCAAGCTCATCACCATGATAAAGACTAAAATTTCCCCATCAACCATCACAATATTGAAGAGCGGAGCAATGATAGGCCCAAACGTTGCTCCAAGTCCATATGACAATAATAAAGTCTGTGAAGCTGAAACAATTTGATTATTGTTAACACGATCGCAGGTATGACTGATCCCTATTGGATATAAACAGAAGGTTGTACCTCCTAGCAGAAAAGACAATATCGAAATGATATAAACATTGTCTTTGCCAATCTCAATAATTGCAACGCAAAGCACGGATGACATTAATGCGAGGAATGCAATGACGTAGCGCCGACTTATTAAATCTGAAAGCCGTCCAAAAGGATACTGAAAAATCATACCTCCAAAGATAGTTAAGCCCATAATGATTGATATTTCTGCGGTGGGATAACCTGAATTTTGAATAAAAATAGGATATAAACCATAAATACTTCCTAAAATCATCCCAGAAACAAAACAAGTTGAAACGCCGGATGGACTCAACTTAATCATTTGCCCAATGCTCAATGTTTCAGGCTCTGAGAAAATAGGTGCAGTTGTTCGAGTCAGTGCAAGTGGTATCACTGATAATGACGCAAAGACAGCAGCAATACAATATAGGATCAAAGTATCTTGGTCACCAATATTTAATAGCCACTGCCCACCAGCTTGGGCAACATATAGCGCAATCATATAAAGCGCTAAAGAGCCTCCTCTATTTTTATTATCTGTTGCAGACAATATCCAGCTTTCTATGACGATATACAGACCTGCTGTTGCAATGCCCCCTAAAAAACGCAATAAAAGCCAAAAATACACATCCACATAAAAGCCATGTAGTATAGAAAAAACAGCCAACATTGAAGCGAAAGCAGAATACGCTCTGATATGGCCTACTCTCAAAAT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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_032126239.1|4930_5203_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_080664877.1|5269_5611_-|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	4.4e-06	31.4
WP_054300202.1|7023_7752_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
WP_016212288.1|8041_9292_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|9955_11017_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075275207.1|11064_11514_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126388.1|11640_12666_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211377.1|13426_14449_+	AAA family ATPase	A0A1V0DZZ0	Clostridioides_phage	3.2e-12	27.5
WP_016211383.1|14472_15342_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126138.1|15647_15911_+	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211378.1|16158_16587_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211376.1|16586_17024_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211382.1|17023_17677_-	DUF4376 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155046731.1|18250_19136_-|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	9.0e-11	23.1
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Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

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>NZ_CP038974|50630:71311|68023_71311_+|WP_016210653.1|DBSCAN-SWA
MTNPIHGAGGGGGKGGGSVHTPTEAPNTLSTNAVVTLVDLLGEGEIEGLAHGAQSVYFDDTPLQNADGSYNFEGVTLKSNNGTPSQDYLPGFAESASEEAFNVKVTHEQPVIRTVGRQETNELRVKIGLDALTEYATNGDINGSSVHIRMYLNNVLVVNHEITGKTTSKLEQTFIIKISPGYYIADIETSDVVLDNLDEYFSWKRAGAHAITNNYYKATSFTYPYTLKVERVTEDADSSRVQNTVYLTSITDVIDTKLNYPNSAVVGLEFSAAQFGNQLPKRSYLIRGLKIQVPSNYDPSTRIYSGIWDGSFKTEYSNNPAWVFYDLLTSERYGAGHYLVDADVDKWELYSIAQYCDELVPDGRGGKQPRFCCNLAINNQNQALNMITQLTSIFRGMAYDAAGTIQFSQDRPREPSMLITQTDVVNGQFDYQTSSIKELHSVCVVAFRNPDLNYAIDQEVVEDASRLARLGERRLEITAVGCTSRSQAMRQGLWALQSEAQSDMISYKATQDHIHSLPSDIIKIFDPNMDQEQGAAGVITAVNNNVVTLDREVSLSSQNTLMIFSAEQGIEEYTVIGAPGSRRLEVDRTIIADVGARWVLYHFTAPKQWRITAITEEDDGTYTVNAITHDPDKYQKIDEERALGVSKENTVIPSLKAPSNYRVEQSVSYHSGTAESLLIVAFDGDPNAAYYEYQLRSNEGNYSDVKTTHLNHIELSSTGATYTFRVRAMGWFGQRSHYSTYRCSASLEQQIPENVSRFVSSYSDKIAVLEWAKNPELYVKHYEIRHGTAWENSILIAELNSTTLHLTHARPGFYLIKAVSQWGIKSAEASVLELTDLTPLNIIQEYDYAANDWPGEFYHTAVNNNNYIRLFSYYSWGGMTQPWEDYSDSWENTKSGTLATDISEGYYLSAVYDLDKIMRCRVYADMQISQSNDDLSWDNMQQAWEHYTLEHNWSWLGSPESCGFEVQFSTSNDNQNWSEFMPLSASFSHFRYARFKVILKRFDAQYTPELQELTCTFDVPETIYNVDNFPVSAAGSTYIFPEPMQQKVIVIATIQSGAAGDQVQVNKSLTQATVNIFDKDGTAKTGEVDLYIGGH
>NZ_CP038974|50630:71311|53219_53603_+|WP_032126134.1|DBSCAN-SWA
MPRRAKQICCYAGCHNTTYARYCEYHEQHGNRYHAPRKTTAQRGYGGRWQRERKIFLQDHPLCKQCLQDDKLIPATEVDHIKPHDGDHDLMWNQSNWQALCKSCHSRKTVNEDGGFGRKKSPQGRGI
>NZ_CP038974|50630:71311|52601_52919_+|WP_129556723.1|DBSCAN-SWA
MPTFKGQTKVDLGFAELQDAAAVCTSLVCTLNIELFEDISMRWLDKWEKTLEYKNSDKNKLFKKVWTLFYSNFDSNNGSITSPCSMVKVRNKIKSSRIKNRKHVS
>NZ_CP038974|50630:71311|61625_61976_+|WP_016211129.1|DBSCAN-SWA
MIEDVYFALLSTGWPVFPIMLPKNQILPAVTYQVIGGDRRYSLDAQAHLQKKTIQISCIAKTYQECKLMQDSITEILNGYHSEKIQLITFESELDQYEQDTKTYRTNLTFTLTGVV
>NZ_CP038974|50630:71311|62399_62723_+|WP_032126913.1|DBSCAN-SWA
MALRNALFNLAFKTAPVTLGELELQVKELSIAEQQRYQELHPSLSETEANLLLICLSLCDHQGVKIFDVSEYKKLAELPLGVIKQITDAIVEVNGFNESAAHDLKKN
>NZ_CP038974|50630:71311|60609_60921_+|WP_016211137.1|head,tail|DBSCAN-SWA
MIDLARLKSHLRIEDNNEDDYLAFILAAALQAAEDYLDRAIVNNTNDLETIENSVLINKSIEIAILMSAGHFYENRESTSTLTVKEVPMSTHFLLNPHRHLSA
>NZ_CP038974|50630:71311|52327_52507_-|WP_155046773.1|DBSCAN-SWA
MLSWLDSLTLKGIRVSSFFLIRKRRYLGRYFAHPMIQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP038974|50630:71311|62779_63046_+|WP_016211142.1|DBSCAN-SWA
MNQLSQELSLSEFNEWLAYYSLEPFGVEKDDHRTALMVSAVVNGPLQRKDKTLFTPNDFMPNYSAGDEKKTQSATDMAAILSAIAKRQ
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MKYGIPGKADQYLCREGYSVGYNYKTKQPRWVAYHLTSKSVSKRIKRHDDFRPDPAIPYQYQAQLSDYKRSGYDRGHLAPYAAMDFDKNSASQSFLLSNMSPQKAGLNRQGWAKLESNVRFWAKYKSEVYVYTGPIFQGKNIKTIGKNKVAVPTAFFKIIFAPQQKQALAFVMPNKRVAKNKVSEYRTNIAHIEKLTGLKFLSQLTSSEREKLVIKTDTMWRTRYN
>NZ_CP038974|50630:71311|65458_66130_+|WP_016210666.1|tail|DBSCAN-SWA
MSLVESAKIYLFTLDLTPLQSSIKYHFCNSPDGNQAVRFGGVEYQPIPLKTDGFERTTIHQPTPSIVLGNVKPILLPLLKAHDNLRGALIRRVMTYVRHLDGHSDPDASATLPEQVYVIERKSQHNNLTITFELGSKLPSDLKLPRRTQLASCSKIYRQWDEEQQAWIAGSCPYAAAQYYNEFGQQTTDKTKDQCGKKLSDCMARFGNGHALPFEGFEGIKPF
>NZ_CP038974|50630:71311|54173_54383_+|WP_016212231.1|DBSCAN-SWA
MLKSDPVKTALNYCDDVLSGRVIACDYVKKACQRHLNDLKYARDRGFYFDKEAACKVVRFFSYCKHSKG
>NZ_CP038974|50630:71311|67398_67686_-|WP_016210662.1|DBSCAN-SWA
MTYKLQFHKEAYKEWKKLNPTTQQQFQKVLKKRLINPHIPSAVCGGDLKGCYKIKLRALGYRLIYTVKEDKVVVQVLAIGSRNRLEAYRLAASRL
>NZ_CP038974|50630:71311|53690_54170_+|WP_016212234.1|terminase|DBSCAN-SWA
MGVKGSGRKRKPTRLKKITGNAGKRKLNHYEPELIEGRAACPHYFKGEAAKAFRFAVDCLENMQIKTAAFQLMLESFAFSYGEWRALSELVDQHGRTFETITQAGDTMYRSRPEVAQRNEAWKQVKASLSELGLTPTAISRLNAQVSNTIESEIDQILD
>NZ_CP038974|50630:71311|60917_61241_+|WP_016211132.1|head|DBSCAN-SWA
MRASLLRHRVTLQNNLIGANNYGEAVDYWQDITTVWARVSPSAGRELFSAQQFYHEITQTVTLRYRSDITPSLRLVFDGRYLEILSVINPDERNRELILACREWLHA
>NZ_CP038974|50630:71311|61975_62398_+|WP_016211141.1|DBSCAN-SWA
MSESIGALSEIYRDSDNAGNYVKLANITNIGEISSSRDKIDVTEYGSTQKKYKLGLKDHDEIQLDMNVAQDNSELKNLISDHDTGIERQFKIILATQPKRQIYEFTALITNHKIIAPLSEVISMSVSLQPTSVIVQSDEV
>NZ_CP038974|50630:71311|51489_51783_+|WP_016210977.1|DBSCAN-SWA
MPPCRSCNTERSNEQARFCSNCGASLETRSTYEEIINKDISVLSLTKDRISSIKNNSKIRNIKDILHDLSHKELRSIPQVGEYWAKRIFNLAEEYIS
>NZ_CP038974|50630:71311|66098_66845_+|WP_032126911.1|DBSCAN-SWA
MKASRALNHFKAYALEQYPREAVGLILPADHFMPCPNLSTTPEENFCIDPAQLIDTPSGTILMHSHPDGSVEPSLADMVSQRDTGLLWGIVALNQHAVTDAIVFGEQLFTQQLLERPFLHGVFDCYSLIRDFYAVEKKIFLPDFPRQRSWWEIEKYNLYERYFTEAGFIEVDKATSLCRGDVLLMRVGRTTCINHGAIYLGEDCRLKEDHNTVSLPGMILHHVCDNLSRREMLSEWQKRIAKVVRYEN
>NZ_CP038974|50630:71311|61233_61629_+|WP_016211139.1|DBSCAN-SWA
MPKMSFSVEGLRELEQKLKTLEPKKIRNLNRRALRKAAEPVEAQMKANAPQKSGALAESIKRRSKKGKGRRTIVNVTVGPARKIQYAIEQEYGSSHQPARPFIRPALNDNAQTSIDIFKNALTLALKKQKL
>NZ_CP038974|50630:71311|57770_58964_+|WP_016211140.1|capsid|DBSCAN-SWA
MPDIYELAQQRAEVINKQRAMLDHAESESRGFTDEEDGQYNDLNTQQLNIKNRIAKAEEVEAQERELNTLTSEPLRSSVQSPTENKATSPLATEEYEKNFFAYMRGQNSGVDIRAGQVEGTDNKGGYLVPTKLQTTLIEALEEQTVMRQMCRIIQTSSTTDLPMADSYGAATWTGEAVAHTATDDTFKKKSIKAYKLSRMLKISDELLADSAINIGAHIAYSFGRSFGEAQEKAFLTGDGTGKPNGLLNVAPTGVTAAAPTSITLDNILDLRSSVKAAYRRKASYLMHDSTYGSLLKMKDGNGQYIIQPDFKSGEGDLLRGKRVNTSDFMDTLAAGKCAALFGDFSNFIIADRGGISLRRLNELYAETGEVGYLMWLRVDALLLETEAIKQLKTAVS
>NZ_CP038974|50630:71311|63049_65128_+|WP_032126912.1|DBSCAN-SWA
MATIGSLVVNLSANSAQLVKSLTKAELASKNFSKKVQRNLKNTTLAFAAVSTAATGAVAVMISKSSDSIDLLAKTSDKLGVTTEALASLRHAAELTGVSQNKLDMGLQRMTRRLSEAAAGTGEARKALVELGLDAEHLNQLSPDAAFKEVARAMENVEGQSDKVRLAFKLFDSEGVSLVNTLALGAEGLDQAASEAARLGIAINRIDAAKVEAANDAAYKMRQLFVGVSHQLAITFAPIIEDLTTRFTNAGTAASSFSSNVLSGFRVVAKSFAIVGDGVHYINVGLDIISAGFAVMKNMAIQSLTAIAQGLSWLYQKMGEGINFVLSQYQKIAKAGAILPIVGNKFERLGQSIARMKSSVYERFTLDTSGLNIAEESANNVNQKLAQLYQTLFSKRPTESVDAYFDEIEQKAAALDEKIRAAQPEKSALMGASLRAQDNQKQLDSLKERLLSEEEAIKHSYDKQKRIILDATREGSEERIKLLEKIEVQKNTKLKDLAQKQAKELNGVGHQAKEFAGNMEGSFSNAFAGVVKGTATVSDAFSSMLNDMAAEALSMASRGIFKSILGGVIGSVGGSSFASWFSGGATAAGAKASGGSVAAGQLYRVNEHGAELFSSGGKDYLMTGKKAGFVTPNHQLGQTVISNQVQNNITIAPTINASGADGEQVSQEVVTTIKHIVNDQIFKLKKQKLLNA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_129556725.1|50630_51311_+	DNA/RNA non-specific endonuclease	A0A2H4N7Z3	Lake_Baikal_phage	3.3e-37	39.3
WP_016210977.1|51489_51783_+	zinc ribbon domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556724.1|52000_52183_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046773.1|52327_52507_-	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_129556723.1|52601_52919_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126134.1|53219_53603_+	HNH endonuclease	A0A2D1GNP5	Pseudomonas_phage	5.6e-26	47.2
WP_016212234.1|53690_54170_+|terminase	P27 family phage terminase small subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016212231.1|54173_54383_+	hypothetical protein	A0A1J0GUY5	Halomonas_phage	1.3e-08	43.1
WP_080743047.1|54398_54755_+	hypothetical protein	A0A1J0GUY5	Halomonas_phage	5.4e-23	61.3
WP_081377926.1|54773_55856_+|terminase	terminase large subunit	A0A1W6JP18	Morganella_phage	1.2e-89	46.3
WP_016211136.1|55852_57094_+|portal	phage portal protein	A0A2K5B287	Erysipelothrix_phage	3.1e-86	46.0
WP_080664855.1|57041_57713_+|protease	Clp protease ClpP	Q8VNN5	Enterobacteria_phage	3.0e-43	44.8
WP_016211140.1|57770_58964_+|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	2.7e-66	40.1
WP_016211133.1|59084_60419_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211137.1|60609_60921_+|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	A0A2H4J711	uncultured_Caudovirales_phage	1.1e-08	34.7
WP_016211132.1|60917_61241_+|head	phage head closure protein	A0A1W6JP44	Morganella_phage	5.0e-12	39.8
WP_016211139.1|61233_61629_+	HK97 gp10 family phage protein	Q7Y404	Yersinia_phage	2.1e-07	40.7
WP_016211129.1|61625_61976_+	DUF3168 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211141.1|61975_62398_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126913.1|62399_62723_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211142.1|62779_63046_+	DUF4035 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126912.1|63049_65128_+	hypothetical protein	A0A1J0GWA6	Alteromonas_phage	2.5e-56	33.0
WP_016210657.1|65120_65462_+|tail	phage minor tail family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210666.1|65458_66130_+|tail	phage minor tail protein L	A0A2I6PHT9	Pseudomonas_phage	3.0e-27	32.7
WP_032126911.1|66098_66845_+	hypothetical protein	A0A0R6PHF9	Moraxella_phage	1.7e-42	42.9
WP_016210665.1|66834_67392_+|tail	tail assembly protein	K7PGY0	Enterobacteria_phage	1.3e-20	36.2
WP_016210662.1|67398_67686_-	type II toxin-antitoxin system RelE/ParE family toxin	A0A2H4JBF4	uncultured_Caudovirales_phage	2.5e-15	50.5
WP_016210670.1|67675_67930_-	type II toxin-antitoxin system prevent-host-death family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_016210653.1|68023_71311_+	host specificity protein J	A0A0R6PIC9	Moraxella_phage	5.2e-112	33.5

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
NZ_CP038974.1|WP_016211383.1|14472_15342_+|hypothetical-protein	14472_15342_+	289 aa aa	NA	NA	NA	4083-42287	yes
NZ_CP038974.1|WP_016212400.1|19186_19786_-|hypothetical-protein	19186_19786_-	199 aa aa	NA	NA	NA	4083-42287	yes
NZ_CP038974.1|WP_016212399.1|19785_20046_-|hypothetical-protein	19785_20046_-	86 aa aa	NA	NA	NA	4083-42287	yes
NZ_CP038974.1|WP_016212131.1|23339_23687_+|hypothetical-protein	23339_23687_+	115 aa aa	NA	NA	NA	4083-42287	yes

Protein sequences of NZ_CP038974.1|WP_016211383.1|14472_15342_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038974.1|WP_016211383.1|14472_15342_+|hypothetical-protein
MDLSALLKKTKNKAKKAPVSKRQRVNIAADDRPYDLDIEEKEIQSKLSQHALEVEVKSDLIDENRTQTVHKVNTNHAQEEVVRKTVLSENALEVEVKSNLIDENRTQTVHKVNTSRTQKEVVRKTALVEHASEVEVKADLIDENRTQTVHKVNTNHAQEEAVRKTVLAENALEVEVKSNLIDENRTQTAHKVNTNRTQEDIKVSAPDVNLLVGVQKDIFMFIYKQASYHKDRVTRPLTLVEISQKVGCKVGAVKTSVARLKEKNYVMRYEYKNGRGGWTRYKVLSEPRR

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	19162-19199	0

1. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 position: 19162-19199, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038974.1|WP_016212400.1|19186_19786_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038974.1|WP_016212400.1|19186_19786_-|hypothetical-protein
MQEFKINEVVGTSSPAVSREKIVNSILANQSNFAGDTPPSNPVACMFWADTQNAILWQRSLDNTEWINKGPIDSQLATDEDAQSYAGGPNLYLNSTFRDWDDERTLPRYFYTYYNSSALSAEFERIAPSPSAAEDSDEYQAYELLKLVGSDINRIGYDCRVLKVTLQAGSGSFSLNQRAFVAAHSYVTSGCLIHVIALD

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	19162-19199	0

1. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 position: 19162-19199, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038974.1|WP_016212399.1|19785_20046_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038974.1|WP_016212399.1|19785_20046_-|hypothetical-protein
MQELICTFDVPETVYNVDNFPVSAAGSTYVFPEPMQQKVIVIATIQSGAAGDQVQINKSLTQATVNIFDKDGTAKTGEVDLYIGGH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	19162-19199	0

1. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 position: 19162-19199, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038974.1|WP_016212131.1|23339_23687_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038974.1|WP_016212131.1|23339_23687_+|hypothetical-protein
MTEGDFINELMFGRGNVPLNTSPQSNWTNLSMTENDDKKVIIRQNSNDVTTYNKDNIVFFVDDDNMFRHAALKIKHDIYLSLFGNSGGLMFSNRQEMLKAFGATKSFIAKKPRRR

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038972_1	Orphan	1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder	363261-363298	38	19162-19199	0

1. spacer 1.1|363261|38|NZ_CP038972|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 position: 19162-19199, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************