CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP038965	Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed3, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP038964	Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed2, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP038963	Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence	1 crisprs	RT	0	3	2	5
NZ_CP038966	Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed4, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP038962	Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 chromosome, complete genome	3 crisprs	RT,DinG,DEDDh,cas3,csa3	1	2	31	32

1. NZ_CP038962

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP038962_1

• CRISPR_ID: NZ_CP038962_1
• CRISPR_location: 360407-360536
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038962_1

Consensus_repeat	Method
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP038962_1

>1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder
CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038962_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038962_1

>merge|NZ_CP038962|1|360407-360536|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

>NZ_CP038962|1|1|360407-360536|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038962.1|WP_036777801.1|352017_352236_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038962.1|WP_016211795.1|355110_355305_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038962.1|WP_155046940.1|363866_364250_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038962.1|WP_081007059.1|355987_357049_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224871
NZ_CP038962.1|WP_036794771.1|353986_354973_+|APC-family-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223605
NZ_CP038962.1|WP_016212008.1|361681_362380_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038962.1|WP_016212044.1|353009_353264_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|236153
NZ_CP038962.1|WP_075273619.1|364522_365098_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038962.1|WP_036777835.1|368556_369342_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038962.1|WP_016212010.1|362396_362693_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038962.1|WP_075273359.1|358664_359240_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP038962.1|WP_016211268.1|366104_367289_+|fatty-acid-desaturase	unknown	unknown	gnl|CDD|224316
NZ_CP038962.1|WP_032126227.1|361353_361644_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038962.1|WP_054300516.1|365155_365989_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	unknown	unknown	gnl|CDD|234899
NZ_CP038962.1|WP_155047051.1|349412_350282_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038962.1|WP_016211797.1|357210_358614_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|143424
NZ_CP038962.1|WP_016211271.1|367307_368252_-|L,D-transpeptidase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|182341
NZ_CP038962.1|WP_054300520.1|359185_359500_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038962.1|WP_155047052.1|350426_351155_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038962.1|WP_054300518.1|362816_363662_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038962.1|WP_016211271.1|367307_368252_-|L,D-transpeptidase-family-protein	gnl|CDD|182341	PRK10260, PRK10260, L,D-transpeptidase; Provisional.	3.41097e-37
NZ_CP038962.1|WP_075273359.1|358664_359240_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	6.00312e-45
NZ_CP038962.1|WP_016211268.1|366104_367289_+|fatty-acid-desaturase	gnl|CDD|224316	COG1398, OLE1, Fatty-acid desaturase [Lipid metabolism].	2.7962e-82
NZ_CP038962.1|WP_081007059.1|355987_357049_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	gnl|CDD|224871	COG1960, CaiA, Acyl-CoA dehydrogenases [Lipid metabolism].	5.06874e-09
NZ_CP038962.1|WP_036794771.1|353986_354973_+|APC-family-permease	gnl|CDD|223605	COG0531, PotE, Amino acid transporters [Amino acid transport and metabolism].	3.69328e-17
NZ_CP038962.1|WP_016211797.1|357210_358614_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	gnl|CDD|143424	cd07106, ALDH_AldA-AAD23400, Streptomyces aureofaciens putative aldehyde dehydrogenase AldA (AAD23400)-like. Putative aldehyde dehydrogenase, AldA, from Streptomyces aureofaciens (locus AAD23400) and other similar sequences are present in this CD.	0
NZ_CP038962.1|WP_016212044.1|353009_353264_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|236153	PRK08116, PRK08116, hypothetical protein; Validated.	0.00575708
NZ_CP038962.1|WP_054300516.1|365155_365989_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	gnl|CDD|234899	PRK01103, PRK01103, bifunctional DNA-formamidopyrimidine glycosylase/DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase.	2.70834e-151

Protein sequences

>NZ_CP038962.1|WP_054300520.1|359185_359500_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MKGYLITQISKLLKISRDTLHRWRNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
>NZ_CP038962.1|WP_075273359.1|358664_359240_-|IS630-family-transposase
MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEGAGCHLLFLPPYSPDLNSIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETVR
>NZ_CP038962.1|WP_016211797.1|357210_358614_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein
MSSYAMLINGQLHSGIDSFAVVNPATEAVIAECPIASVELLEQAVNAAKIALIDGTGTLEQRRELLRACADKIEAYQEELSQLLTKEQGKPISQAQNEVSWAIGLLRKQCELDIPKKVLRDDTQAQVTVTRKPLGVVAGITPWNFPFYIAVNKMAEAIYSGNSIIIKPSPYTPLTTLKLGELIQDVIPAGLVNIISGDNEIGALLVKHPKISAISFTGSVATGKHIATAAAADLKRVVLELGGNDAAIVLNDVDVKEVAEKIFWNAFSNCGQVCVAVKRLYVQRAIYHDVLDEMVRIAKTVKVGNGLDSEVTMGPLNNVMQYERIIELLNDAKAQGATVHCGGVAQEGLGYFFPPTIISGIEEGVRLIDEEQFGPLLPVLAFDDVNEVIQRVNNSSMGLSAYVWSKDNDLAVQIANRLEVGIVRVNTSTTEASLTPFGGMKQSGIGREGGVWGIEAMTDAQTLSVKY
>NZ_CP038962.1|WP_081007059.1|355987_357049_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase
MVLLEQLDTFLISRVDPYANQLDIDSMILKSRFSELGEKKLLAIKVASEFNGIAADRALNHDYFARLARSSYALAFLTAQHESCASLLQKGNNQELKADLLPEMVQGKFRAGVGIYHLRSHTRRAMIMAKKVAGGYRVSGRLDWISGFDIFDYIALGFIIDIGNSQENHEVVGLVPFKVQQYLSGEINIGPKQEVTAISSTNTVAIEFNDWFIRDKDIMIDQPGRAIEQRSILSITHATMLMGIFQAALNIIGNSKSILKKNTVVLSQFNQLNNQCLLLRNQLIHTNTQEEVQKMRAQIHKYTRDCIYLAAALSGGRSVLADHPVQRLNRELLQATIAGVNSLFIHNLCIDIN
>NZ_CP038962.1|WP_016211795.1|355110_355305_-|hypothetical-protein
MKLKTKKISNACKGNTFLCVNFAKSKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP038962.1|WP_036794771.1|353986_354973_+|APC-family-permease
MAMSGNQALQENVGFLGALVFAVSLVLGSGVLVLPGVIYHSIGELAIFTWLADALLMVPLVIIFASFGSKYPGSGGVAGFIEQAFPYLSGGSAYLLLGQCSICFAIVAITGILYSFALLLPNFHASHMLVAGISLALMFIVFFISFLGNHRVIWLQKLIIIPLLLFLLVLIFLSINHPDAATSSVTYWPKHFDTGLITQGMILAFFAFGGWESFASMTGEIKKPARTVPFVIFVGFLLTVGLYVGLSIAIQKIFFEKNMMTGSSFLLDLVQVNHLGQFSVAICFFIVFVVVISNLNGVIWSGSRTLVTLGQKGWAPAFAASHGVLSTG
>NZ_CP038962.1|WP_016212044.1|353009_353264_+|hypothetical-protein
MNHIISCPFCGVSTEHEMSYGLQSYVCEACHNLIAAGMDDCCLFFSHDLACLCQRENEKKMEREREEKEEEEALLCPSLRKWSS
>NZ_CP038962.1|WP_036777801.1|352017_352236_-|hypothetical-protein
MFKQLQNNRLYFQKERAYLSISKAKKFNGPGNNAQRIIIPLHGDTSGVLKSHLTIASLFDHRPKDKGKPFKP
>NZ_CP038962.1|WP_155047052.1|350426_351155_-|hypothetical-protein
MLCRPENSETLKNILISQKDTLISGAKHHKNILVLLIKTAIEFGNVRLLVTLDRLDLNPDRILFENTRQSFMQHLINHVYKYDDEEFAVWLFTVLYKQKIHFPHAKETFKIDFLDTSLRVNALQCLVYSGFFKLALCLSEAGIIDKASSTRYKGERRQVAACGFLITAIVKEGISQEKLDLLVALANGHDIATSQHLISIYRGLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP038962.1|WP_155047051.1|349412_350282_-|hypothetical-protein
MLSTPWLAAYVSAIQNQGGNELEKLIRLIDTLAKLSVINIYKQDSAAILPFYMHPALAYQGIIQEYQQQLSHTRTMRNPHAISQYRVGEALGWLTMLKLAIHCTICHKSVQAGDRARQTRQLLQALSNLKKRNLSLEPLRTSLMLVDGVSMCFQPLRVFHPTHIMEIFAHQLLQLSEKGNCDNFAQIIDLIQQQVLTALKGTEFEALQNAKKHVATIFSLIPPSQPIHANNLPQTPEISATQSTTDEIKPARKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP038962.1|WP_032126227.1|361353_361644_+|hypothetical-protein
MGRLFNKENPADLKSSGYFSTEPRGQSHHSVIVIVMAMISIFVMTRVICSIITWMIHSAPLTFIFTMLISFFAAPYVFIVIIIVAFFIGILVKTPS
>NZ_CP038962.1|WP_016212008.1|361681_362380_+|hypothetical-protein
MLKKNKSTSFVIGLALSLSFACYANALTEAEFKATKLPYSVMAYSNQYAHEYGLDASKAIDLPKGLEAIKLILYKEHIKGDEVLLPQDIYRCSAELYVDKSLSLYWPGNYPKVDKVGDRGLQKAQVSTVQLKRKGEYWVPGPYASMLYDSYDQTIKPNLAKINLGFFGCNYIPSRYTAVKDGLAIWLERKGGHNYAAIGQSEAEISSKDFYIFKLPQKLVNNYLPYARMAAN
>NZ_CP038962.1|WP_016212010.1|362396_362693_+|hypothetical-protein
MVQLTLSDFAFLANDVYLNPGLELALPRENSQRCQRLLNNTETVINSDPHGPKANGFFARVYKYKQGNKMSLIVAYRGTSNVEDYLIDAELASGQAIE
>NZ_CP038962.1|WP_054300518.1|362816_363662_+|hypothetical-protein
MLTVDYSQLFGIKPTAFRTVTFNPPGMQGVDPNGRAPHYAEIAHTISQHKIASGKLAAAMVSVAPEVSLVGATAGVEVVVKKIMELLNYQTAIKNRSIALRMGQGALIFLWDLLMPDRNGLSVDKEINNPYPHIYNISSRYDLVHCSGNPGGNLINYDIDPLGKITNGDDDRRAKFKYQFLENYFEARQHYLKHGVNSAKMKSKYEQLSKADNWALYFENPGKEGVHLPTAKDWENYFKDVRNIPEYQQSARKTDRVMQYYTGTLSRCEPWSAKHGVSRPR
>NZ_CP038962.1|WP_155046940.1|363866_364250_+|hypothetical-protein
MCKIPTEVATLTSNQAYDKPYDLFLTKAAKVFIKYLFIAEHSMANMLPSIQVNQNLAQVKISYSAHETILAMRKCSSLINLHTTERLKGPLVAAHDNVQKYQKKGIYPYNQTNYQALAASHGVLSTG
>NZ_CP038962.1|WP_075273619.1|364522_365098_+|hypothetical-protein
MANYSQAYCVAQGFNVNANIHRRFGYINYLRIGDLELSADIDVEVPVEGVKSKHVGVISDLFWQETAKVQPITIDFRLSVSNQQQLAHYIEQNNFNSDVLIEFASYDYDANAQAFYSSFNTDKETIEGDLEILAADSQLAIYVGKEQETDVQSPVNYFVSLSMVSTAKAQQLISATSARIKRVLPWGVTVA
>NZ_CP038962.1|WP_054300516.1|365155_365989_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase
MPELPEVETSCRGIAPHIQNQKIQRVTIRQQQLRYPVSVQITTKKLKQQQVTQVSRRGKYILLELDHSAWLMIHLGMSGNLRILEDTTPAGKHDHIEIQFANQKILRLNDPRRFGCFLWTNDLANHKLLKHLGIEPLTRQFNANYLYQAAQSRKIAIKTLLMDSQVVVGVGNIYANEALFQTGIHPSTYCHVLTTNQCAELTRIIKAILKQAIKAGGTSLKDFTNSDGKPGYFKQKLFVYGRSKEPCLTCQEDIQQFRQNQRSSFFCPCCQPEPKTM
>NZ_CP038962.1|WP_016211268.1|366104_367289_+|fatty-acid-desaturase
MLSFYGLLNLPWWGYIIAVLLLTHVTIVAVTVFLHRHQAHRALDLHPVVSHFFRLWLWLTTGMVTKEWVAVHRKHHAHCETAEDPHSPKTYGIKTVLWEGADLYRHAIQTQPEMMEKFGHATPNDTLERHLYSRFRYLGIIIMLILDIVLLGVPGIAVWAIQMMWIPFFAAGVINGIGHYVGYRNFEAADASTNVSPWGILIGGEELHNNHHAYASSAKFSVKPWEFDVGWMYIRLLEVCQLAHVKKRIPRGACVAGKSEVDNATLKAVIQNRLQLLSKYQKDVLQPTFKAERARQGESVLNSTASKLLKRDQRFFSHADHQALEQVLISSKALDLVYQFRAKLQAIWTQKASNQKDVLDALKQWCSQAEASGEQRLQEFVSYLRGYVLTTQSH
>NZ_CP038962.1|WP_016211271.1|367307_368252_-|L,D-transpeptidase-family-protein
MGIITQRHNTVAGIALFTSSIFCTSAATAFTLPISSHNTNDVVGWQVITYSKAGDTPLKIAQRHSISIQRLQALNSKVRHWQKQRIYLPYQVILPQLIQQQQSKITVNLAEKRLYYFNAKSQVLSVYPVSIGREHWRTPTPTKTTYIIHKKKHPTWNVPASIQRYYRAQGKSLPKQVPPGPENPLGTRALYLGITGILIHGTNQPASIGTASSSGCIRLYTNDIEHLYKQAGVNTPVKLIYQPYKVGFNENVLYIEAHPVISDYDKNNQQRQIIIEKLQNMTNNSKQLQVNWSLVDKAINEAAGIPVPIGKLFY
>NZ_CP038962.1|WP_036777835.1|368556_369342_+|hypothetical-protein
MAKKIFYSLIIVILLLVVGSYFLFSHMDSILRSAVEKIGSKTTGTTVTLGSLKTSLKEGQVSLSRLTMSNPAGFSQANAISFKDVMVNLDPSSATQQTIVLNKVIIKDPYLLYEMKEGSSRSNLQQIQKNIQSYFASKQAKNNESNQRNSGVTQQEPSQAKVAAKNQKKFIIKELEILAGQVKVISPLLKSKEKTLSLPNIRLTNIGTGGSGLTPDQVTEQIINVLVANSGQAVAQAGLDRVKTKLKEKASGLLNNLLGNP

Crispr_ID: NZ_CP038962_2

• CRISPR_ID: NZ_CP038962_2
• CRISPR_location: 1400825-1400931
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038962_2

Consensus_repeat	Method
GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP038962_2

>2.1|1400863|31|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder
CCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038962_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038962_2

>merge|NZ_CP038962|2|1400825-1400931|CRISPRCasFinder
GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGACCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAAGCGCTTAATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA

>NZ_CP038962|2|2|1400825-1400931|CRISPRCasFinder
GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA	CCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAA
GCGCTTAATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038962.1|WP_129556527.1|1406690_1406951_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038962.1|WP_016211836.1|1398773_1399262_+|protein-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|270916
NZ_CP038962.1|WP_016210801.1|1411228_1412200_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270361
NZ_CP038962.1|WP_016210751.1|1386386_1388192_-|DEAD/DEAH-box-helicase	unknown	unknown	gnl|CDD|236941
NZ_CP038962.1|WP_155047165.1|1402928_1404494_-|amino-acid-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223605
NZ_CP038962.1|WP_129556641.1|1385036_1386299_+|cation:dicarboxylase-symporter-family-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|224736
NZ_CP038962.1|WP_016210748.1|1390402_1392358_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|183236
NZ_CP038962.1|WP_075273540.1|1405894_1406506_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038962.1|WP_016212182.1|1393039_1393225_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038962.1|WP_155047164.1|1407943_1408366_+|response-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|381151
NZ_CP038962.1|WP_052104738.1|1409363_1410170_+|methyltransferase-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226472
NZ_CP038962.1|WP_036778182.1|1404700_1405528_-|thioredoxin-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239321
NZ_CP038962.1|WP_016210749.1|1389642_1390104_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038962.1|WP_051307365.1|1398493_1398754_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038962.1|WP_052047040.1|1401964_1402903_+|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|366234
NZ_CP038962.1|WP_036777256.1|1408788_1408989_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038962.1|WP_016211834.1|1397921_1398236_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038962.1|WP_016210795.1|1410275_1411247_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270361
NZ_CP038962.1|WP_016212185.1|1393558_1394548_+|rhodanese-related-sulfurtransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|223982
NZ_CP038962.1|WP_016210752.1|1388675_1389473_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|368573

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038962.1|WP_016210795.1|1410275_1411247_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|270361	cd13643, PBP2_BCP_2, Substrate-binding domain of osmoregulatory ABC-type glycine betaine/choline/L-proline transport system-like; the type 2 periplasmic-binding protein fold. This subfamily is part of a high affinity multicomponent binding-protein-dependent transport system specific to certain quaternary ammonium compounds for osmoregulation. The periplasmic substrate-binding domain, which is often fused to the permease component of the ATP-binding cassette transporter complex, is involved in uptake of osmoprotectants (also termed compatible solutes) such as glycine betaine, proline betaine, choline, and carnitine. Many microorganisms accumulate these compatible solutes in response to high osmolarity to offset the loss of cell water. This domain belongs to the type 2 periplasmic binding fold protein superfamily (PBP2). The PBP2 proteins are typically comprised of two globular subdomains connected by a flexible hinge and bind their ligand in the cleft between these domains in a manner resembling a Venus flytrap.	1.06046e-118
NZ_CP038962.1|WP_016211836.1|1398773_1399262_+|protein-kinase	gnl|CDD|270916	cd14014, STKc_PknB_like, Catalytic domain of bacterial Serine/Threonine kinases, PknB and similar proteins. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. This subfamily includes many bacterial eukaryotic-type STKs including Staphylococcus aureus PknB (also called PrkC or Stk1), Bacillus subtilis PrkC, and Mycobacterium tuberculosis Pkn proteins (PknB, PknD, PknE, PknF, PknL, and PknH), among others. S. aureus PknB is the only eukaryotic-type STK present in this species, although many microorganisms encode for several such proteins. It is important for the survival and pathogenesis of S. aureus as it is involved in the regulation of purine and pyrimidine biosynthesis, cell wall metabolism, autolysis, virulence, and antibiotic resistance. M. tuberculosis PknB is essential for growth and it acts on diverse substrates including proteins involved in peptidoglycan synthesis, cell division, transcription, stress responses, and metabolic regulation. B. subtilis PrkC is located at the inner membrane of endospores and functions to trigger spore germination. Bacterial STKs in this subfamily show varied domain architectures. The well-characterized members such as S. aureus and M. tuberculosis PknB, and B. subtilis PrkC, contain an N-terminal cytosolic kinase domain, a transmembrane (TM) segment, and mutliple C-terminal extracellular PASTA domains. The PknB subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	8.26648e-13
NZ_CP038962.1|WP_016210751.1|1386386_1388192_-|DEAD/DEAH-box-helicase	gnl|CDD|236941	PRK11634, PRK11634, ATP-dependent RNA helicase DeaD; Provisional.	0
NZ_CP038962.1|WP_155047165.1|1402928_1404494_-|amino-acid-permease	gnl|CDD|223605	COG0531, PotE, Amino acid transporters [Amino acid transport and metabolism].	1.71769e-34
NZ_CP038962.1|WP_129556641.1|1385036_1386299_+|cation:dicarboxylase-symporter-family-transporter	gnl|CDD|224736	COG1823, COG1823, Predicted Na+/dicarboxylate symporter [General function prediction only].	2.59319e-84
NZ_CP038962.1|WP_052104738.1|1409363_1410170_+|methyltransferase-domain-containing-protein	gnl|CDD|226472	COG3963, COG3963, Phospholipid N-methyltransferase [Lipid metabolism].	1.28417e-38
NZ_CP038962.1|WP_016210801.1|1411228_1412200_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|270361	cd13643, PBP2_BCP_2, Substrate-binding domain of osmoregulatory ABC-type glycine betaine/choline/L-proline transport system-like; the type 2 periplasmic-binding protein fold. This subfamily is part of a high affinity multicomponent binding-protein-dependent transport system specific to certain quaternary ammonium compounds for osmoregulation. The periplasmic substrate-binding domain, which is often fused to the permease component of the ATP-binding cassette transporter complex, is involved in uptake of osmoprotectants (also termed compatible solutes) such as glycine betaine, proline betaine, choline, and carnitine. Many microorganisms accumulate these compatible solutes in response to high osmolarity to offset the loss of cell water. This domain belongs to the type 2 periplasmic binding fold protein superfamily (PBP2). The PBP2 proteins are typically comprised of two globular subdomains connected by a flexible hinge and bind their ligand in the cleft between these domains in a manner resembling a Venus flytrap.	7.8235e-122
NZ_CP038962.1|WP_155047164.1|1407943_1408366_+|response-regulator	gnl|CDD|381151	cd19924, REC_CheV-like, phosphoacceptor receiver (REC) domain of chemotaxis protein CheV and similar proteins. This subfamily includes the REC domains of Bacillus subtilis chemotaxis protein CheV, Myxococcus xanthus gliding motility regulatory protein FrzE, and similar proteins. CheV is a hybrid protein with an N-terminal CheW-like domain and a C-terminal CheY-like REC domain. The CheV pathway is one of three systems employed by B. subtilis for sensory adaptation that contribute to chemotaxis. It is involved in the transmission of sensory signals from chemoreceptors to flagellar motors. Together with CheW, it is involved in the coupling of methyl-accepting chemoreceptors to the central two-component histidine kinase CheA. FrzE is a hybrid sensor histidine kinase/response regulator that is part of the Frz pathway that controls cell reversal frequency to support directional motility during swarming and fruiting body formation. REC domains function as phosphorylation-mediated switches within response regulators, but some also transfer phosphoryl groups in multistep phosphorelays.	6.94615e-31
NZ_CP038962.1|WP_052047040.1|1401964_1402903_+|IS3-family-transposase	gnl|CDD|366234	pfam00665, rve, Integrase core domain. Integrase mediates integration of a DNA copy of the viral genome into the host chromosome. Integrase is composed of three domains. The amino-terminal domain is a zinc binding domain pfam02022. This domain is the central catalytic domain. The carboxyl terminal domain that is a non-specific DNA binding domain pfam00552. The catalytic domain acts as an endonuclease when two nucleotides are removed from the 3' ends of the blunt-ended viral DNA made by reverse transcription. This domain also catalyzes the DNA strand transfer reaction of the 3' ends of the viral DNA to the 5' ends of the integration site.	7.86095e-24
NZ_CP038962.1|WP_016210748.1|1390402_1392358_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein	gnl|CDD|183236	PRK11619, PRK11619, lytic murein transglycosylase; Provisional.	1.01987e-91
NZ_CP038962.1|WP_036778182.1|1404700_1405528_-|thioredoxin-domain-containing-protein	gnl|CDD|239321	cd03023, DsbA_Com1_like, DsbA family, Com1-like subfamily; composed of proteins similar to Com1, a 27-kDa outer membrane-associated immunoreactive protein originally found in both acute and chronic disease strains of the pathogenic bacteria Coxiella burnetti. It contains a CXXC motif, assumed to be imbedded in a DsbA-like structure. Its homology to DsbA suggests that the protein is a protein disulfide oxidoreductase. The role of such a protein in pathogenesis is unknown.	1.37155e-43
NZ_CP038962.1|WP_016212185.1|1393558_1394548_+|rhodanese-related-sulfurtransferase	gnl|CDD|223982	COG1054, COG1054, Predicted sulfurtransferase [General function prediction only].	3.74089e-160
NZ_CP038962.1|WP_016210752.1|1388675_1389473_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|368573	pfam05708, Peptidase_C92, Permuted papain-like amidase enzyme, YaeF/YiiX, C92 family. Amidase_YiiX is a family of permuted papain-like amidases. It has amidase specificity for the amide bond between a lipid and an amino acid (or peptide). From the structure, a tetramer, each monomer is made up of a layered alpha-beta fold with a central, 6-stranded, antiparallel beta-sheet that is protected by helices on either side. The catalytic Cys154 in UniProtKB:Q74NK7, Structure 3kw0, is located on the N-terminus of helix alphaF. The two additional helices located above Cys154 contribute to the formation of the active site, where the lysine ligand is bound.	2.13986e-06

Protein sequences

>NZ_CP038962.1|WP_016211836.1|1398773_1399262_+|protein-kinase
MPFFPGDSFNAALTKDPDSVDEIILAVALELQRIHQSGVIHGDIRSDNIIIEEKNGIFNAKFIDFGWAYEYPSDDNVIVTKCSYFAPERAKIDLKAHPSQDIYSFGWMLGIAHDLVKEIPEKFYGFLIGANEEDPVLRPELRLLIKANLCPTLGEYYTQLVK
>NZ_CP038962.1|WP_051307365.1|1398493_1398754_+|hypothetical-protein
MPILEYQRPRSGSVIERRLESGVVESYQSIRDLGQGGNGSVRLFASKTALERYAVKRPLEVQRHSLDYLKLEERLSKRRSFIFSNF
>NZ_CP038962.1|WP_016211834.1|1397921_1398236_-|hypothetical-protein
MNQDTELSLSEEKEQKNFESLCDMLYECTIKTINQHTASFNEDELIFKQPIFMHINAAAQVLNAMINDAGDVLAEQHNEVTPELAVNELKKLTHSILFGDDHSH
>NZ_CP038962.1|WP_016212185.1|1393558_1394548_+|rhodanese-related-sulfurtransferase
MNQVVVAAMYKFARLPDYKDIQPKLLAFCKAQGIKGTLLLAQEGINGTVSGSRQAIDNLLNFLKSDSRLRALEHKESYLDAAEVPFYRMRVKLKKEIVTLGVDGIDPNEIVGHYVKAQNWNALISDPDVIVVDTRNDYEYDIGTFKRAENPNTETFREFPEYVEKNLDPKKHKKVAMFCTGGIRCEKSTAYMLKQGFEEVYHLEGGILKYLEEVPKEESLWEGECFVFDNRVSVNHDLEKGQYDQCHGCRYPITEQEKASSLYIEGVSCPYCYNNLSDEQKARFSERQRQMALAKHRGHQHIGDSIELAKQVKRQKRKAQVEACQTKQK
>NZ_CP038962.1|WP_016212182.1|1393039_1393225_+|hypothetical-protein
MKSMKKHSKLEAEIAIEPADVIEMTMTELSTRRAEAMEAIESGKFIQIVKHKKPIGMLVPF
>NZ_CP038962.1|WP_016210748.1|1390402_1392358_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein
MPYYTFIYLIALMVSLFITQSFYAANYLNHSLDKQRIFFHQAEQHLKKSRLQSFKKELKKLTHYPLYPYLRYQELIRQLQLGFLPNNKIKHFLNQYQNTIFHDRLHRQWMIHLYNKKWWKTLIKYYQPATKSTAMQCRYLWARYQLNYQQQSLHAFKKVWLQGRSLPKVCDRLISALRKHKQLTNSLAWQRITLAMQKRNYQLAGYLARFLSSQDKKALTLWRILRRHPEKMTKTSLIRAAGNKANYIANDTLLQLAKRKPEYAITIWPRLKSKFSLTKQQKIAITKSIALHLALKKSSKTSHWMEKVPDQDQSLTLTSWNIRTALYQQRWQHALTLINTLPPNEYDSHLWQYWKARALEQLGQITQAKKVYKRLAKHRDYYGFLASNKLQQPYQLNRKAVNISKHILSNVSKKPGIRRAYEFKKTGHPGLARSEWVYAINQFTETEKLAAAKLAHDWGWYNLSVLTTTKTKHRDDLKLRFPMAHYRAILRNAKRYEISPAWVFSVARQESIFHEHAYSPVGARGIMQLMPTTARYIAGKIQIRHYTSKLLDANHNIALGTAYLKRLLERYDNRLILALAAYNAGISRVNQWLPERNPIAADLWIETIPYKETRSYIKNILAYTVVYNARLGHTTKMAQQLVNVPTLKQIS
>NZ_CP038962.1|WP_016210749.1|1389642_1390104_+|hypothetical-protein
MSKIKSLKPFVHEITVDVHFSKKQAMHIRKLGQNLDLRVITPKAMVRLGEQLFTAKLISAIDLMSLLQPGFNQNYGEVAAQMGVQLKQPPALMNAIQFYYESWQKKIRQKGVNSQQRLLARREYHLMLALQKSLGLPVDGKMIQAKKTVIEDL
>NZ_CP038962.1|WP_016210752.1|1388675_1389473_-|hypothetical-protein
MQLLNRPLVKWLLKEEPPPSTPLCDYERICYEIRPCDVLLVEGRSRLSDVIQVITRSPWSHSALYIGRSQDIENLHIRQFIEDNYDGSPQDQLVIEGYLGQGTVINLLDDYKYSHIRICRPRGLSRKDVQQVIAYAASKVGSAYNVRQIFDLFRLLLPWTILPRSWRSSLFHHNLGDPTRTVCSTMIAEAFNVVDFPILPDLHTSEDGKMALHIRNPRLFTPRDFDYSPYFEIIKYPFISIDDHMPAYKNLPWQKGRPQDLPTEK
>NZ_CP038962.1|WP_016210751.1|1386386_1388192_-|DEAD/DEAH-box-helicase
MSSTIGFDKLGINDNILNSISELGYETPSPIQEQSIPVLLNQQDILAQAQTGTGKTAAFALPILTQLSLKHNQPQALVLAPTRELAIQIAEAFQRYAKYLPGFHVLPIYGGQEFRSQLRALKRGVHIVVGTPGRIMDHMRRETLPLESLKTVVLDEADEMLKMGFIDDVKWILQQIPTEHQTALFSATLPPSIKGIASQHLVEPVHIQIKSTTNTVSTIEQSYMITSKHHKLEALTRYLELEEFDAVIVFARTKIATTELAERLEARGYSAAAMNGDMNQASREQVIKRIKNGAIDIVIATDVAARGIDVNRITHVVNFDIPHDPESYVHRIGRTGRAGRDGKALLFVSPRERRLLKDLERVTRQPIKAITPPTANEITEKREESFKKQIINTINETTDLDYYRNLIESLLPLSEKSELDIAAALAYMAQKQKPLQMQKEDPKALSFESPHDRGGRHEPSQRERRTRQAIQTAEHGMSRCRLEVGHRHRIQPSDIVGVLANEGNITHKAIGRIHIFDDYSLVDLTSKVTNQVIELTHQCRVKGHPIKIKPATDKDNQEGQSNNHGRRSHSRDRDSGFKRRRSNSSHNGQSQSQSRTRKKIS
>NZ_CP038962.1|WP_129556641.1|1385036_1386299_+|cation:dicarboxylase-symporter-family-transporter
MKFNGLVLIALITGVGLGALARFSLVSDHFAMADLNSVFHLVGEGYIDLLKMLVIPLVFTSLVSALLSLSDKGAANFRLSAIRFVVMLLVLTGISAGIGMLMGMAFNLGTGLVIPGVDLQPGHHYTGVVDTILGMLPTNPIAAMASGNAAALALFSIFIGAAALVVKKSKIADIKPFEGFIQSTFEISKQLARFVVALTPYGVLALIANVASATGASSLLSVLSYLVAIYVAMALVFALHLVILAAQGISPTYYLKHAYKALLVAFTTRSSFGTLPVTEETLRQKFKIHPDLATFAPTIGSSIGFNACAGVFPAMLVVMAMTIMHEPVTWQIIVMVMFINAIASLGISGIPGTASIAAAVTLSTLGLPYAVIAIVQGVDPIVDMGRTATNVNGVMASALTVDKYLATEETQARSIKAEAL
>NZ_CP038962.1|WP_052047040.1|1401964_1402903_+|IS3-family-transposase
MPRATYYRQQKKGTLEKKPAFKPSNAIDNQEKDQIIELLHSERFIDSTPYQTFYTLLDEGHYYCSIRTMYRLLTEHSGTKDRRIQRNHRNAIKPELIATTPNQVWSWDITKLLSTKRLVYYHLYVILDIFSRYAVGWLIADRECQDLAYQLIEATALRQGVQKGSLTLHADNGPSMTSGTVGDLLENMGIIKSHNRPYTSNDNPFSESQFKTLKYCPQFPKRFDNIKEAELFSQDFFKWYNSMHYHSGRCFLTPESVHYGLSDGILDKRHDTLMSAYIENPSRFNNKPPVRKILKPAYINPPQTVIIQGVQK
>NZ_CP038962.1|WP_155047165.1|1402928_1404494_-|amino-acid-permease
MIGSGWLFSSYYAAKITGAAACLSWITTSVVILLLGLCLAEIATLYPKRGLMARLLTLSHNKEFAFICTISTWLGLTAVIATEAEGSVQYISSLSDSFGPMIFNNQIHQLTSLGLIIAIVMILSFGLINFWGIKILSKSNVALTTCKIAIPLVTGLSVMFAAFHHQNFHNDHAPLLNYGPSSVFIAMIGAGMIYSFNGFQNILSFSSEARQPTRDIPLAIIFSILITLAIYLVLQIAFIGALSPHILEQGWQSLNFTSPFVQLTALLNLNFITIILYADSVISPSGTGLIYTGSTTRLLTAMSQDGQMPRFFNKIGAYNFSRRSLIFTVGFSIIFLLLFRSWSALVSFLSLFYVISYMSIPLSLSKLHQQNLVGKFRAPLPKLLLPVIFAFLSLLFIFSKFPYTGDVALFTVIAYAAYLLSQFKLATDLNHFKKTVKHSSLMVIYIIILAALSSIGPKEYGGYNLLSKLQFFPSVIFVSFIMYRLSLAWIRDKATETQVIKISPTLQRNVSGEMRQNYRFS
>NZ_CP038962.1|WP_036778182.1|1404700_1405528_-|thioredoxin-domain-containing-protein
MKNYLFASLSLVTPFVLSNAFAANTTTFTAAQQEKIGEIAAQYIINHPEVLIQAGQKLQQQQMKAQEKQQITAVLHAKKQLLSDPKTPTVGPSNAKVAVVEFFDYQCVFCSKVAPAIEKIMKDNPKVKFVFKDFPIFGQRWPTSTYAAEVGLVAYKQGGAKMYMNYHNGIYATGKDEGKLTNKDVDMVAKKAGVDLTKDKTLLSAGKTPPPSIQANFQLAGEALGLRGTPALVIMPTSGANEKNVTVFAGYPANPQGGTAAAVTAIQQAIDKASQ
>NZ_CP038962.1|WP_075273540.1|1405894_1406506_+|hypothetical-protein
MSKVIAICPLLVGCTFLCSTSAESESDPSVSQDAQFITEVARSVMQDDISQSIVTECKSMNTESQSALIAEKNHYVPTKKAIQHMETAILEYGSNLADHYEREHPSTMLVTYRGWITSKQCINKLKETVMRAAQALICLGKEQNAVRDSAQLLLIDTVEAVAMKQDYGVSEDQEDQPCAIGWSSTMTYYGLKALDQALVTSKH
>NZ_CP038962.1|WP_129556527.1|1406690_1406951_+|hypothetical-protein
MSANSNSKIDVIALTVSGQVEKKIRVECNSLATDHVTDDLASKTNRDRAWQIYSSSYERCMAEALDMMRQDLLAVSIQPQLRPEIN
>NZ_CP038962.1|WP_155047164.1|1407943_1408366_+|response-regulator
MIEQAPHYTALVVDDSLIARKQVKKALDTIGVKSILMRNGREALDYLINVLPGAGGDITQKYLMVIADVEMPEIDGYAFIKACREHPGLKNLFIILNTSITGVFNENDIQQTGCNEFIGKVNPQKIIECARMQILNRASQ
>NZ_CP038962.1|WP_036777256.1|1408788_1408989_-|hypothetical-protein
MTGDEKKKAAKTSTRENQSSLIDSEASSLPPTLLFYTDSLSLIDQGQDIPIGSKKESSCPTCCLVM
>NZ_CP038962.1|WP_052104738.1|1409363_1410170_+|methyltransferase-domain-containing-protein
MKLGEGSLKEKMVFIERATDQSIPTPWQLFSRLIYRYWFLKYPWQMSKFLGRQSKRLWLWFWLSSCNRSSGLKKVDNSIKNTLEKYGLTLGFFKAAIANPRATGAVLPSSRFLVREMVTHVVQMPERYVVELGAGTGVITQELLSSGVSPGQLIAIEYDKNLARKLAARFPDILVICGNAVELERLLGEKNGCVSTVISGLPLRSLPNQAVVHILQQIPSVLVSGGSYIQFTYDFKKKEEYYPGDIELSLSKKIWLNIPPAKVDVFTK
>NZ_CP038962.1|WP_016210795.1|1410275_1411247_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein
MFKSKLIVLTLSIWATCFYGNVVAQTKTSTNNNTKIARVLVNDWTSQIVLSKITAHILASINYQVTFVQSTSNRQWYKLKSNLADIQVEVWQGTMADKYNQLIKSGDIVDAGNHVAKTREDWWYPEYVEKQCPGLPDWKALRKCYKIFATPKTAPKGMYLGGPWEKPDRARIRALNMNFKVIQVKNGDALWIELEKAVKQKRPIVLFNWTPNWIESKYKGKFIEFPHYSAECENNPKWGLNSKFPWDCGNPKDGWLKKIARSQFQKEQPCAFELLKNINFTNTMIANITAAVDADKMSYDEAAQDWLNQNKALWHSWIPSSCK
>NZ_CP038962.1|WP_016210801.1|1411228_1412200_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein
MKNTIKNTLVFPALLVFGSSFLQTSIAAKTKEPVRIIVNDWTSQIVLSKITGSILSDMGYQVKYINSKSNGQWFKLKNNQADIQVEVWQGTMAKKYNQLIKTGDIVDAGNHAAKTREDWWYPEYVEKQCPGLPDWKALEKCYKIFATSKTKPKGMYLGGPWEKPDRARIRALKMNFKVIQVKNGDALWVELEKAAKEERPIVLFNWTPNWVEAKYKGKFVEFPKYSPKCISDPKWGKNSKYPWDCGNPKDGWLKKIARTEFSKEQPCAFELLKNISFTNAMISNVAASVDADKMSYDQAAQQWLDSNKKLWHSWIPATCSKVN

Crispr_ID: NZ_CP038962_3

• CRISPR_ID: NZ_CP038962_3
• CRISPR_location: 2626920-2627040
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038962_3

Consensus_repeat	Method
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP038962_3

>3.1|2626957|47|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder
CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038962_3

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038962_3

>merge|NZ_CP038962|3|2626920-2627040|CRISPRCasFinder
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCTCGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGCTTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT

>NZ_CP038962|3|3|2626920-2627040|CRISPRCasFinder
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT	CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC
TTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038962.1|WP_054300282.1|2628417_2628882_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP038962.1|WP_016211759.1|2632611_2633799_+|S-methyl-5-thioribose-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|236561
NZ_CP038962.1|WP_036778484.1|2635604_2636216_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|236415
NZ_CP038962.1|WP_036778479.1|2631640_2632366_-|D-Ala-D-Ala-dipeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|350618
NZ_CP038962.1|WP_052047041.1|2624866_2625130_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038962.1|WP_016210944.1|2636262_2637282_-|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase	unknown	unknown	gnl|CDD|273112
NZ_CP038962.1|WP_032126312.1|2630667_2631462_-|M48-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|307807
NZ_CP038962.1|WP_016211905.1|2625398_2625809_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038962.1|WP_036778297.1|2618257_2618731_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038962.1|WP_036778294.1|2616866_2618249_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|130153
NZ_CP038962.1|WP_016210676.1|2620578_2622660_+|kinase-domain-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270918
NZ_CP038962.1|WP_129556590.1|2630275_2630671_+|nucleic-acid-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|380015
NZ_CP038962.1|WP_098082812.1|2624118_2624634_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038962.1|WP_155047228.1|2628938_2629421_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|279973
NZ_CP038962.1|WP_016210943.1|2634914_2635601_-|acireductone-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|319768
NZ_CP038962.1|WP_155046943.1|2626507_2626648_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038962.1|WP_054300492.1|2622963_2623974_+|protein-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|270916
NZ_CP038962.1|WP_016210671.1|2618863_2620123_+|6-phosphofructokinase	unknown	unknown	gnl|CDD|237600
NZ_CP038962.1|WP_075275117.1|2626052_2626475_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038962.1|WP_016210935.1|2634375_2634918_-|acireductone-dioxygenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224704

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038962.1|WP_054300282.1|2628417_2628882_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	3.57411e-45
NZ_CP038962.1|WP_016211759.1|2632611_2633799_+|S-methyl-5-thioribose-kinase	gnl|CDD|236561	PRK09550, mtnK, methylthioribose kinase; Reviewed.	0
NZ_CP038962.1|WP_036778484.1|2635604_2636216_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	gnl|CDD|236415	PRK09220, PRK09220, methylthioribulose 1-phosphate dehydratase.	2.90159e-95
NZ_CP038962.1|WP_036778479.1|2631640_2632366_-|D-Ala-D-Ala-dipeptidase	gnl|CDD|350618	cd14843, D-Ala-D-Ala_dipeptidase_like, D-Ala-D-Ala dipeptidase, includes uncharacterized enzymes. This subfamily of D-Ala-D-Ala dipeptidase (also known as D-alanyl-D-alanine dipeptidase vanX; VanX; EC 3.4.13.22) also includes several uncharacterized proteins. This is a Zn2+-dependent enzyme that mediates resistance to the antibiotic vancomycin in Enterococci and other bacteria (both Gram-positive and Gram-negative). It is part of a gene cluster that affects cell-wall biosynthesis. The operon triggers the termination of peptidoglycan precursors by D-Ala-(R)-lactate instead of D-Ala-D-Ala dipeptides. The enzyme is stereospecific, as L-Ala-L-Ala, D-Ala-L-Ala and L-Ala-D-Ala are not substrates. It belongs in the MEROPS peptidase family M15, subfamily D.	3.8045e-65
NZ_CP038962.1|WP_016210944.1|2636262_2637282_-|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase	gnl|CDD|273112	TIGR00512, methylthioribose-1-phosphate_isomerase_predicted, S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase. The delineation of this family was based in part on a discussion and neighbor-joining phylogenetic study, by Kyrpides and Woese, of archaeal and other proteins homologous to the alpha, beta, and delta subunits of eukaryotic initiation factor 2B (eIF-2B), a five-subunit molecule that catalyzes GTP recycling for eIF-2. This clade is now recognized to include the methionine salvage pathway enzyme MtnA. [Amino acid biosynthesis, Aspartate family].	1.29472e-143
NZ_CP038962.1|WP_032126312.1|2630667_2631462_-|M48-family-metallopeptidase	gnl|CDD|307807	pfam01863, DUF45, Protein of unknown function DUF45. This protein has no known function. Members are found in some archaebacteria, as well as Helicobacter pylori. The proteins are 190-240 amino acids long, with the C-terminus being the most conserved region, containing three conserved histidines. This motif is similar to that found in Zinc proteases, suggesting that this family may also be proteases.	1.59691e-55
NZ_CP038962.1|WP_016210676.1|2620578_2622660_+|kinase-domain-protein	gnl|CDD|270918	cd14016, STKc_CK1, Catalytic domain of the Serine/Threonine protein kinase, Casein Kinase 1. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. CK1 phosphorylates a variety of substrates including enzymes, transcription and splice factors, cytoskeletal proteins, viral oncogenes, receptors, and membrane-associated proteins. There are mutliple isoforms of CK1 and in mammals, seven isoforms (alpha, beta, gamma1-3, delta, and epsilon) have been characterized. These isoforms differ mainly in the length and structure of their C-terminal non-catalytic region. Some isoforms have several splice variants such as the long (L) and short (S) variants of CK1alpha. CK1 proteins are involved in the regulation of many cellular processes including membrane transport processes, circadian rhythm, cell division, apoptosis, and the development of cancer and neurodegenerative diseases. The CK1 subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	1.187e-09
NZ_CP038962.1|WP_036778294.1|2616866_2618249_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	gnl|CDD|130153	TIGR01081, mpl, UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate ligase. Alternate name: murein tripeptide ligase [Cell envelope, Biosynthesis and degradation of murein sacculus and peptidoglycan].	0
NZ_CP038962.1|WP_016210943.1|2634914_2635601_-|acireductone-synthase	gnl|CDD|319768	cd01629, HAD_EP, Enolase-phosphatase similar to human enolase-phosphatase E1 and and Xanthomonas oryzae pv. Oryzae enolase-phosphatase Xep. Enolase-phosphatase E1 (also called MASA) is a bifunctional enolase- phosphatase which promotes the conversion of 2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane to 1,2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene anion (an aci-reductone) in the methionine salvage pathway. The catalytic reaction is carried out continuously by enolization and dephosphorylation, and the enolase activity cannot be classified as typical enzymatic enolization. This family belongs to the haloacid dehalogenase-like (HAD) hydrolases, a large superfamily of diverse enzymes that catalyze carbon or phosphoryl group transfer reactions on a range of substrates, using an active site aspartate in nucleophilic catalysis. Members of this superfamily include 2-L-haloalkanoic acid dehalogenase, azetidine hydrolase, phosphonoacetaldehyde hydrolase, phosphoserine phosphatase, phosphomannomutase, P-type ATPases and many others. HAD hydrolases are found in all three kingdoms of life, and most genomes are predicted to contain multiple HAD-like proteins. Members possess a highly conserved alpha/beta core domain, and many also possess a small cap domain, the fold and function of which is variable. HAD hydrolases are sometimes referred to as belonging to the DDDD superfamily of phosphohydrolases.	1.88858e-105
NZ_CP038962.1|WP_129556590.1|2630275_2630671_+|nucleic-acid-binding-protein	gnl|CDD|380015	pfam17775, UPF0225, UPF0225 domain. This entry represents an NTF2-like domain found in bacterial proteins.	6.66662e-47
NZ_CP038962.1|WP_155047228.1|2628938_2629421_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	gnl|CDD|279973	pfam01710, HTH_Tnp_IS630, Transposase. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This family includes insertion sequences from Synechocystis PCC 6803 three of which are characterized as homologous to bacterial IS5- and IS4- and to several members of the IS630-Tc1-mariner superfamily.	4.80837e-07
NZ_CP038962.1|WP_054300492.1|2622963_2623974_+|protein-kinase	gnl|CDD|270916	cd14014, STKc_PknB_like, Catalytic domain of bacterial Serine/Threonine kinases, PknB and similar proteins. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. This subfamily includes many bacterial eukaryotic-type STKs including Staphylococcus aureus PknB (also called PrkC or Stk1), Bacillus subtilis PrkC, and Mycobacterium tuberculosis Pkn proteins (PknB, PknD, PknE, PknF, PknL, and PknH), among others. S. aureus PknB is the only eukaryotic-type STK present in this species, although many microorganisms encode for several such proteins. It is important for the survival and pathogenesis of S. aureus as it is involved in the regulation of purine and pyrimidine biosynthesis, cell wall metabolism, autolysis, virulence, and antibiotic resistance. M. tuberculosis PknB is essential for growth and it acts on diverse substrates including proteins involved in peptidoglycan synthesis, cell division, transcription, stress responses, and metabolic regulation. B. subtilis PrkC is located at the inner membrane of endospores and functions to trigger spore germination. Bacterial STKs in this subfamily show varied domain architectures. The well-characterized members such as S. aureus and M. tuberculosis PknB, and B. subtilis PrkC, contain an N-terminal cytosolic kinase domain, a transmembrane (TM) segment, and mutliple C-terminal extracellular PASTA domains. The PknB subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	6.53e-14
NZ_CP038962.1|WP_016210671.1|2618863_2620123_+|6-phosphofructokinase	gnl|CDD|237600	PRK14072, PRK14072, diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase.	0
NZ_CP038962.1|WP_016210935.1|2634375_2634918_-|acireductone-dioxygenase	gnl|CDD|224704	COG1791, COG1791, Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain [Function unknown].	2.05718e-61

Protein sequences

>NZ_CP038962.1|WP_155046943.1|2626507_2626648_+|hypothetical-protein
MIEDPPALRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP038962.1|WP_075275117.1|2626052_2626475_-|hypothetical-protein
MQLSYLELNSVEYIQKVLANITLLDQDACALNKLRVVYSKITQQIESGQLKVHGLGGGSAITFKGERTKVPEGISKIWYEITDMQGNFRWMDNVSAVLNKVKVEANNRSGYRGLTAIGLFFGSYRDAQTKDLYSKISQAL
>NZ_CP038962.1|WP_016211905.1|2625398_2625809_+|hypothetical-protein
MKLNTKETFTRFMGLFIAVDCLYYLIGLTIFSAIPSGNLIAFVNIFTSFCGLVTGILLFIKIYDKWYTPFVAIEFFTCIYWFFLTLGETVSNTQYASLSKVITSLNYDLFSCFMGVIACLLWLKFAFSFKANKLAN
>NZ_CP038962.1|WP_052047041.1|2624866_2625130_+|hypothetical-protein
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>NZ_CP038962.1|WP_098082812.1|2624118_2624634_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAALDLDLDTDDDIIKTKNLSALDVTCRLIISRYNLYQRENFFQVFNNPKCFYQSYQYLEILGLNQAASIQQLLDGPFEKYKDTWSTLSYLGLDCRENAQRILTNPQSFEQDFDGLIALRSAYESIVKEMEANQLKAHGLAGGNPIKFKGETVSVATSVGILHIQ
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MPKIVWESQENRTAAEQQAAEWRIAKKYLAGRAPGTQLNPKHGQHKISFKDPKTNEEVYLTHRYLLGNKGEIFVKSNGYLLGKTPRNLVTFGQTQDGQVWAIKESCEIGKDLKESEIACDLDAAKKMFKSNSKCYQVYRFLGLPLDQYLRQNRLTEEERLDLAIKVSQAVHHLHIGTQSRSHTCYAHLDLKPSNICIDHEGQVHLIDYGFSKSLAGRLTHRKGTSSYLSVDYASASKEALDIFALLRTLYLPKKFKTYTQKAKKSRDHHEYILNDDIISKNGLLYALLDTEDGKIKHTRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP038962.1|WP_016210676.1|2620578_2622660_+|kinase-domain-protein
MPKVIWLAQENRTAEQQQAAEWRIAKKHLTGKPPGTQLNPQSGKKVKAYEDPETGEKITLTHRYLIGHEGEIFVKFNGQALGQGICGEVTFGQTEDGHMWAIKESSEKPKNSQEGKIAVDLGKAKNYFKYQGKHYQVYYFLGTPLDKYLKEAKQSLTQAQQYDLAIKMARVIYHLHTGKYSKEKTSYAHLDLKPENFCIDDSGELHLIDYGLSEILPGKLDNEIKGSPAYLPFSVAEASKEELDIIALLRSLYLPLCFKGLGKVRNRGPAAQQLNTQWVFSSTILSQNSTLSQLLDTTKGEVVNLSALDIACQLILLKYGLHSSENLEKVTANPQQFEQDSQLLESLGLNQAAYLKCMLEQRDLVSVFKEYTDKFLILNQFDLNQPIYIKKVLANLEQFSQDYQYLESLGLNQAAYLKCLLEQRESIDLLKEHANKFLTLNQYELNQSIYIGKVLANPEQFNQDYQYLKSFGLNQAAYLKYTLDQHDQFAYNCQRLKDLKLNSRNYIEEIINNPERFEQNYQHLETLGLNQEIYIRPMLNNPQRFGEYCQQLKDLGLNQASDLARALDHPQRFQDDLPSLLKLRKIYDDLSNEIASDRLKVRGLFAGGITVNCQGQSKLVPRGIGSIWLEIIDKQGNFYWMKDVSAALTKSTDQARLRSSSQQQAEGQNSNLFFATYRDPKTQAVYDRISQLP
>NZ_CP038962.1|WP_016210671.1|2618863_2620123_+|6-phosphofructokinase
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>NZ_CP038962.1|WP_036778297.1|2618257_2618731_-|hypothetical-protein
MMQIIWRLCTFRAGPQDIVYSVFGLQLICVIHFILQWGWLSLRLPLLHSALVALFSAALLLALPYLVVNSAKYAGRFLQTALALQLVSCVLHILLLALFLLHSPLVLLNYYLIFSFIWGAALFSHIIKEAIVVKLWQAVLIVLIYFIVRTVSVIGLM
>NZ_CP038962.1|WP_036778294.1|2616866_2618249_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase
MHIHILGIAGTFMGGVAQLARAKGVTVTGADLNVYPPMSTQLAQAGIAVTAGYDDEFLKLTKRPDCVVIGNALSRGNPAVEATLNENMPYCSGPEWLAREVLHGRHVLAVAGTHGKTTTSSMLTWILEHAGLQPGFLIGGVPKNFGVSARLGQGEYFVVEADEYDSAFFDKRSKFVHYQPKTLVLNNLEYDHADIFDDLQAIMRQFHHLVRTVPSNGKIIVNSIDENLHTVLEMGCWSPRVSVGLQAGDITAEVIQADGSHFEVICHGMRYEVNWSLIGQHNVMNGLAAIGAALQVGVDLKHACEALTLFQGVERRLQVFGQSQGVTVYDDFAHHPTAIATTLEGLRHRVGTEGRVIAVFEPRSNTFKMGVHQDNLAAAFSCADRVYFYQPTGLSWQIADNLKKKEQFNYRVRHSIDELLQALTDDGLKDHDHVVVMSNGSFEQFHQRLLNQLELECENA
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Self-targeting detection

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MGE targeting detection<

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3. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039213 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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4. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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5. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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6. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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7. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038897 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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8. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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9. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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10. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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11. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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12. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033943 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013780 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050946 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050947 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048070 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039207 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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112. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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113. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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114. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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115. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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116. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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117. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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118. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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119. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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120. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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121. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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122. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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123. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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124. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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125. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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126. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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127. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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128. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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129. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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130. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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131. spacer 2.1|1400863|31|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774

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132. spacer 2.1|1400863|31|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016317 (Bacillus cereus strain M3 plasmid pBCM301, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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133. spacer 2.1|1400863|31|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to CP020755 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid pLDW-16, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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134. spacer 2.1|1400863|31|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021062 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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135. spacer 2.1|1400863|31|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NC_020385 (Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-328, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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136. spacer 2.1|1400863|31|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NC_018492 (Bacillus cereus FRI-35 plasmid p01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	45576 : 89169	43	Moraxella_phage(20.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	127259 : 181540	58	Staphylococcus_phage(42.86%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_3	200556 : 271553	58	Acinetobacter_phage(25.0%)	transposase,tail,protease,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_4	300567 : 360427	57	Bodo_saltans_virus(20.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_5	444659 : 546001	109	Escherichia_phage(45.45%)	transposase,integrase,tRNA	attL 511446:511505|attR 525657:525830
DBSCAN-SWA_6	553700 : 601653	51	Synechococcus_phage(33.33%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_7	623123 : 725719	108	Prochlorococcus_phage(17.65%)	transposase,protease,plate,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_8	761136 : 809061	37	Staphylococcus_phage(42.86%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_9	825742 : 934526	102	Staphylococcus_phage(26.67%)	transposase,integrase,protease	attL 888207:888266|attR 909401:910503
DBSCAN-SWA_10	955068 : 1000191	44	Escherichia_phage(16.67%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_11	1012699 : 1067588	56	Orpheovirus(16.67%)	transposase,protease,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_12	1082627 : 1211843	103	Staphylococcus_phage(21.43%)	transposase,protease,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_13	1252515 : 1428412	153	Staphylococcus_phage(17.65%)	transposase,integrase,tRNA	attL 1284769:1284828|attR 1360874:1361237
DBSCAN-SWA_14	1444027 : 1550294	102	Staphylococcus_phage(14.81%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_15	1568692 : 1612646	48	Staphylococcus_phage(45.45%)	transposase,integrase,protease	attL 1568597:1568656|attR 1595409:1595497
DBSCAN-SWA_16	1621534 : 1668938	43	Staphylococcus_phage(25.0%)	transposase,integrase,tRNA	attL 1611581:1611640|attR 1654406:1655507
DBSCAN-SWA_17	1694999 : 1739345	39	Staphylococcus_phage(22.22%)	transposase,protease,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_18	1760765 : 1816291	55	Staphylococcus_phage(15.38%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_19	1823056 : 1881973	58	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(33.33%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_20	1892764 : 1948197	47	uncultured_Mediterranean_phage(30.77%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_21	1952745 : 2066466	107	Staphylococcus_phage(17.65%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_22	2084219 : 2126854	44	Staphylococcus_phage(25.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_23	2148559 : 2201565	56	Leptospira_phage(16.67%)	transposase,protease,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_24	2205488 : 2250539	51	Staphylococcus_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_25	2320727 : 2383069	56	Planktothrix_phage(18.18%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_26	2472962 : 2555673	82	Escherichia_phage(37.93%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_27	2571014 : 2599201	26	Acinetobacter_phage(12.5%)	transposase,integrase,protease,tRNA	attL 2568403:2568462|attR 2586243:2586531
DBSCAN-SWA_28	2628417 : 2680869	56	Microbacterium_phage(12.5%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_29	2741748 : 2799781	57	Staphylococcus_phage(37.5%)	transposase,protease,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_30	2924641 : 2988770	53	Staphylococcus_phage(16.67%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_31	2996655 : 3110575	113	Staphylococcus_phage(33.33%)	transposase,tRNA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038962|45576:89169|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_036779326.1|47724_49251_+	2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase	NA	NA	NA	NA
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WP_032126790.1|54588_55494_+|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210700.1|66676_67840_-	radical SAM family heme chaperone HemW	NA	NA	NA	NA
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WP_036777711.1|72440_73250_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211100.1|73645_74596_+	TonB family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155047033.1|88572_89169_-|transposase	IS1595 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP038962|127259:181540|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

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MDAVLDDWFWDYKKGQIVLRNESGDISVETKVSIRREDWSWPYPVDSEEWSRVCVGCFRMHGKIANSTLQKWLHSEEGERLIRRLVAQQKFG
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>NZ_CP038962|127259:181540|161426_161849_-|WP_016210233.1|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016209611.1|128482_128674_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047035.1|128753_128933_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209580.1|129024_129549_+	ankyrin repeat family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209612.1|129932_130301_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209595.1|130338_130611_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300576.1|130701_131997_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211692.1|132632_133535_+	LysR family transcriptional regulator	Q6JIH3	Burkholderia_virus	1.6e-18	28.4
WP_051307362.1|133591_134443_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211694.1|135022_137032_+	DNA helicase Rep	A7KV33	Bacillus_phage	3.0e-110	37.8
WP_054300271.1|137069_138044_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016211637.1|138545_139958_-	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
WP_032126550.1|140450_141458_+	DNA polymerase IV	NA	NA	NA	NA
WP_016211636.1|141477_142998_+	AMP-binding protein	A0A2H4PQM9	Staphylococcus_phage	2.7e-31	27.1
WP_016211018.1|143948_145265_+	LbtU family siderophore porin	NA	NA	NA	NA
WP_016211015.1|145368_145752_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211019.1|145886_148952_-	MMPL family transporter	S5VTK5	Leptospira_phage	5.1e-53	20.6
WP_016211017.1|149020_150124_-	efflux RND transporter periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016211016.1|150147_150702_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273381.1|150816_151386_+	PadR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211020.1|151505_152261_+	DUF2076 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047036.1|152427_153327_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047037.1|153471_153777_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_098082829.1|154171_154567_+	HDOD domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|154588_154954_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046700.1|155010_155175_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007013.1|155164_155464_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300544.1|155554_156001_+	HDOD domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126725.1|156496_157063_-	DUF1415 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210241.1|157074_157860_-	phenylalanine 4-monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210235.1|158491_159415_+	two pore domain potassium channel family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210246.1|159466_160462_-	NAD(P)-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210237.1|160493_160988_-	protein-export chaperone SecB	NA	NA	NA	NA
WP_036778333.1|161079_161337_-	glutaredoxin 3	NA	NA	NA	NA
WP_016210233.1|161426_161849_-	rhodanese-like domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210236.1|162167_162884_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210247.1|162927_163179_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036778330.1|163183_164620_+	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016210231.1|164647_166090_+	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016210242.1|166177_166516_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210243.1|166600_167131_+	outer membrane family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210228.1|167191_169384_+	DNA helicase II	A7KV33	Bacillus_phage	1.3e-106	36.0
WP_098082837.1|169426_169918_-	proQ/FINO family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210226.1|170187_170619_+	DUF4402 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036778324.1|170636_171467_-	diaminopimelate epimerase	NA	NA	NA	NA
WP_080664837.1|171481_171625_-	lipoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_052104672.1|171655_172540_-	formyltetrahydrofolate deformylase	NA	NA	NA	NA
WP_016210244.1|172511_172733_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210225.1|172906_173185_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126790.1|174155_175061_+|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036780891.1|175117_176296_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|176292_176868_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155053570.1|176966_177179_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300541.1|177506_178286_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126848.1|178819_179620_+	carbonic anhydrase	NA	NA	NA	NA
WP_052104671.1|179838_180597_+	ion transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211859.1|180673_180961_+	pyridoxamine 5'-phosphate oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|180964_181540_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP038962|200556:271553|DBSCAN-SWA
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MQKYLLKHPLHSRGKKITCVNIRRAKVADLQEARYSENKLDNIIQLVSKLCNLPTPQVLELDQEDFSKITLLIIEHLCISHGGDSHFYQELWGPCIP
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MNDIPISILALVLVVLILISAFFSGSETASMSLNRFRLRHLARSGHGAAKRLQKLLSRPDRLLGVILLGNTFANILASAVATVIADRLFGDIGIAIGTVLLTVVVLIFAEVTPKTFAALRAEKFSFSVSHPLTLLLKLFYPAVWLINTTASIVLLPFGIREKTLKDTLSREELRSVVNEESLRMPSRHKHMLLSVLDLEKIDVDDVMEPRNEIIGIDLEDTLAHIKLELLQSKHNYLPLYRDDIDNIIGILPVRKSLSLLAQDQFSKDNLEQLAEPPYFIPEGSPLYSQLINFQQTKKHIGLVIDEYGDIIGLITLNHILDEIVGDFSKEALAKHKQVHHSKDNTNSYLVEGSMSVRELNKLLNIELPTDGPRTLSGLVVEYLEDIPSAPACVNIKGYPLEILSIQDNLIKSIKVYSPPKTLVSAY
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MDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVK
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MSQATLQLLFSSTLDTVYMVFVAGIIAIALGLPIAIALTLARPGSLYENKSLYRLLSLIVNIGRSVPFIILMVAIIPLTRFIVGTSIGTEAAMVPLSIAAIPYFARIAEGKLHELDHSLIELSEVVGANVWQIITKVMLPEAWPALVNGMTILFVSLIEYSAMAGTIGGSGLGNMAIQYGYYRFDLKVMFLAVAGLVILVLLVQWFGDFIVASSMKHRQRRNHGN
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MTLFLSILYFPIRVWRCLKSWQQVILALILGASCGLAFKTSAEFLKPLGDLFINGIHMIVMPLVFIAIISAITSVSDGNKMRRVGLRALVLYAITMIFAAMIGIGVAVLVQPGLGLAHAHSLQQVPELQHIKWQSFISNLIPANPLKAFVDGNILQVIVFAVLLGIALRQAGEKAAAVIHFFQSFTHVIFRLAGLVISFAPYGVFALSAWVFSQFGLSALWSLIKLIFVVYLACLLHMAVVYGGGLRLMGIKPLAFFKKIRYPLSIAYTTSSSAATLPVSIETTATELKVPREIAQFLLPLGANFNLNGLSIYVSAATVFAANFYGIHLHITDYITLVVTIVLTAMGAAGVPGSGVIVMGAVMSSLGLPLGAIPLVVGVDRLNDMMQTMTNVAGDVFATIVVTKQEQERTSDFVNVNSPGVSN
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MMNDYCQYTLTTMTFYSSGTECTLQHIKTAKELTIPLAQLAAQGQLLKQLSKDSLAAVLYQLEQETSDLQLKH
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MNVNSYLFYDIETTGINKCFDQVVQFAAIRTDLNLNEISRHEYVVKLRPDVIPAPKAAITHLISLDRLVQAESEYTVIKKIHELLNEPGTISLGYNTLGFDDEFLRFSFYRNLLNPYSHQYANGCSRMDLYPMVALYYLYCPTVLQWPQVNGQPSLRLENLSALNQLAEGQAHDAMVDVEATVALAKCLIQEKATWDYLCNYFIKREDQNRLLKLPRLFDDDSQSFLAMMIAGEMGTKVNYQAPALLLGEHYHYKNQTVWLRLDQEYLKQIIISDFSEKIWVKNKKYGEPPFVLPLTEKRLAKMSKEQLELYQENKNWLLNNKSLLQEIREYYLDYKYPEHENVDAMALLYQSGFYNYREKNWIECFHEYLLGQQLYDHAVPSERLGVLSDRLAGYENKILANDPRQQLFDSYVDECWQVEEQNARRDYKGECALTVEAALAEITQLEADKGLSSIQQTRLAELKAYILGKTEVKP
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MTKHIAAFFCGTGYTQESDASFQLLRSNCPAFVELHGYDGCDSQGKFLNLGGLNANGTGEPADDFVEKLREAMRASEGERLKVNLIAHSRGCLSALKAVQRIQADPELRDCVDIVLDLRELIPGNLELGAHLTH
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MDIKRIDHIVLTVKDIDVTLDFYTGVLGMEAATITRKNSVRDMQVLKFGNQRMNLHEYGNERQPNAAQALPGSQDLCFVVDVSIDNVIARLEKLNIKIEFGPVIIPGAVGQMESVFIRDPRCEPWSAKHGVSRPR
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MSPVALLFSSVSAILGSGWLFSAYFTSQLAGPAALIAWLIGGVTSIIIAFVFAELCTAFPVTGSSTRIPLLSHGTLVSFVFSWIIWLSYMALAPTEVQAVVQYLAFYFPSLTQSQGALTTTGYISATLLMLVISAINTYSLYWLIRANNALTYLKLIIPIIIAITILVHFHQPAHLIHQEAGGFSPFGMHGIFAAITSGGIVFAFTGFKQAAELAGEAKNPAKALPIAIIGSIVICLIIFLLLQAAFLTSMNTNNLAHGWHHLDLSGATSPLAATLQQDHLTTLLPLLYIGALAGPLASGLMYCSSSSRSLFGMSKNGYLPISLQRITAQGNPITAIMVNFAVGMLMFAPLPGWEKMVGFLSSLMSLTYAIAPIALLALRRQMPDIKRPFKLPFTPVWAWLAFYIATLMSYWSGWETISKISIALIAGLILFFGYRLFSPRGRSCKIDWKESTWLWPYLLGLTLISYLGNFGHSKHILPFGIDFIVIGIFCALIMMLALRFRLPNANTQHYVTTLTEVTG
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MEAAEKKYTNTPNLKAIIQTPEFYLRSSLFSVRNRSQKRKQYTSENLIATDHYTMKITGEQLDQHDMAVLFSALLTKDNNQGHNQELVVSLQQILRGLNTTDGSSQRRAINNSFQRFTEVTFDIVFGHKKFTTTQLNSFDYSAKTKAFTLIFSDEYANLCAADALTTLNIKERNSLPQGLTSWLYGYWSTFNQLPPLQIDELYKLCGSASSNMSTFKRSLTMALSTLENIGFIQPNWNISKPGFIFASKTLTTPSITPTPKTEEEVIA
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MIRLNSVSKYYSLAGGQVTALNDISLHIEQGSIVGIVGRSGAGKSTLIRMLNILETPSQGEVTIDGVCLNTLNRKELRAQRRQIGMVFQHFNLLASRTVFSNIAFPLEISHISHEQINKKVNELLKLVGLTDKATQWPSQLSGGQKQRVAIARALAVEPKVLLCDEATSALDPESTGSILKLLEKINDKLAVTIVLITHEMDVVKSICQRVAVLDHGCLVEENSVHGLFSEPKSTAGQELVNHSLNLNLPREIKAIICHDNRENYSPLVRLAFVGQQATYPVISVLAEKFALKVNILEAHLDMLAGSQVGIMLCQLDGDDAAVSASIDYLRTHQITVEVLGYVPSHTTAIV

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016209871.1|200556_202539_+|protease	ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH	G9E4U6	Ostreococcus_lucimarinus_virus	3.9e-115	40.9
WP_016209869.1|202748_204092_+	phosphoglucosamine mutase	NA	NA	NA	NA
WP_016209874.1|204358_207028_+	pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring), homodimeric type	NA	NA	NA	NA
WP_016209857.1|207051_208971_+	dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209860.1|209140_210562_+	dihydrolipoyl dehydrogenase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	3.1e-45	27.8
WP_016209866.1|210707_211682_+	phospholipase A	NA	NA	NA	NA
WP_054300537.1|211713_212121_+	glyoxalase	NA	NA	NA	NA
WP_016209859.1|212399_212621_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209875.1|212784_214446_-	chaperonin GroEL	A0A2I7SAK5	Vibrio_phage	5.3e-182	64.9
WP_016209850.1|214518_214809_-	co-chaperone GroES	A0A221S322	uncultured_virus	3.3e-15	42.6
WP_036776911.1|215034_215490_+	type II 3-dehydroquinate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016209852.1|215554_216019_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209862.1|216111_217458_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209870.1|217457_218363_+	50S ribosomal protein L11 methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209854.1|218424_219411_+|tRNA	tRNA dihydrouridine synthase DusB	NA	NA	NA	NA
WP_016209851.1|219403_219646_+	Fis family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016209858.1|219767_221312_+	bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase	Q58MG4	Prochlorococcus_phage	6.5e-65	47.8
WP_036776914.1|221358_222645_+	phosphoribosylamine--glycine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016209864.1|222687_224082_+	aminopeptidase P family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209867.1|224105_224285_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307322.1|224281_224461_-	DDE endonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_054300181.1|224464_224746_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|224802_225168_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210079.1|228173_228671_-	purine-binding chemotaxis protein CheW	NA	NA	NA	NA
WP_016210095.1|228841_229537_-	response regulator transcription factor	NA	NA	NA	NA
WP_080664831.1|229639_231202_-	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210093.1|231517_233311_+	aminopeptidase P family protein	A0A0P0I8D7	Acinetobacter_phage	2.6e-118	41.3
WP_016210081.1|233396_233669_+	DUF615 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210094.1|233674_234301_+	DUF938 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210077.1|234287_235718_+	exodeoxyribonuclease I	NA	NA	NA	NA
WP_016210086.1|236050_237106_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	4.3e-28	34.2
WP_032126605.1|237074_237752_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210084.1|237741_238578_+	D-methionine-binding lipoprotein metQ	NA	NA	NA	NA
WP_016210080.1|238737_239031_-|tail	phage tail assembly protein	NA	NA	NA	NA
WP_122940784.1|239137_239944_-	trfA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210083.1|240248_241103_-	Hsp33 family molecular chaperone HslO	NA	NA	NA	NA
WP_036776920.1|241257_242307_-	nitronate monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_036776924.1|242357_243014_-	DedA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210097.1|243031_244312_-	HlyC/CorC family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210096.1|244585_245947_+	signal recognition particle protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126863.1|246346_246898_+	paraquat-inducible protein A	NA	NA	NA	NA
WP_016211802.1|252329_253601_+	dicarboxylate/amino acid:cation symporter	NA	NA	NA	NA
WP_036778206.1|253657_254641_+	biotin--[acetyl-CoA-carboxylase] ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016211800.1|254637_255423_+	type III pantothenate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|256119_256485_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|256430_257006_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300535.1|257009_257729_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300534.1|257873_258074_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211358.1|258121_258583_-	DUF1499 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211357.1|259006_260488_+	MFS transporter	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	6.3e-49	28.3
WP_016211355.1|260550_261660_-	S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase	E3SJ82	Synechococcus_phage	2.9e-35	29.8
WP_016211354.1|261757_263719_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211359.1|264248_264653_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047045.1|264705_265401_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|265377_266352_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_098082809.1|266522_266873_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300162.1|267815_268898_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1
WP_129556499.1|270400_271553_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.5e-58	44.2

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP038962|300567:360427|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP038962|444659:546001|DBSCAN-SWA
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MNTFKKITDDLERGTRFLVVTVVLLYTCTLIVYVVQWGLSLFTDEINADLGSALITAYFLIILSVIIGAFFEKLRA

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_051307335.1|447320_448355_-	EF-P beta-lysylation protein EpmB	NA	NA	NA	NA
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WP_122940481.1|449108_450080_+	elongation factor P--(R)-beta-lysine ligase	A0A1V0SAC0	Catovirus	2.8e-21	25.3
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WP_054300512.1|453052_454162_-	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210649.1|455529_457518_+	excinuclease ABC subunit UvrB	NA	NA	NA	NA
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WP_032126128.1|460632_462039_+	capsule biosynthesis protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210501.1|462056_463043_+	UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase (inverting)	K7Y9E1	Megavirus	4.9e-42	34.2
WP_016210490.1|463045_464200_+	UDP-4-amino-4, 6-dideoxy-N-acetyl-beta-L-altrosamine transaminase	A0A2D2W2B8	Stenotrophomonas_phage	1.3e-14	28.6
WP_016210502.1|464196_464892_+	pseudaminic acid cytidylyltransferase	A0A1B1IVD3	uncultured_Mediterranean_phage	1.5e-08	35.5
WP_016210500.1|465026_466517_+	UDP-2,4-diacetamido-2,4, 6-trideoxy-beta-L-altropyranose hydrolase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210496.1|467653_469048_-	capsule polysaccharide biosynthesis family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036777444.1|469926_471858_+|tRNA	threonine--tRNA ligase	A0A2K9L297	Tupanvirus	1.0e-120	36.6
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WP_016210495.1|472664_473024_+	50S ribosomal protein L20	NA	NA	NA	NA
WP_016211706.1|473443_474439_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit alpha	A0A2K9L3A8	Tupanvirus	2.5e-33	37.4
WP_036777440.1|474451_476833_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016211707.1|476838_477126_+	integration host factor subunit alpha	A0A0H3UZA0	Geobacillus_virus	3.0e-08	33.7
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WP_016211714.1|505902_509247_-	autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211642.1|524377_524731_+	toxin-antitoxin system HicB family antitoxin	NA	NA	NA	NA
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525657:525830	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_017375910.1|530197_530926_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
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WP_052104773.1|536168_536612_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

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MIQSVLHGILGLLGFCLLAFIFSENKRAIKWKPVGYGLIAQVIIALILFYVPLFSLAFAKMNEVIIALQQSVIEATSTVFGYIGGGPSPFEVKPGGNTFILALQALPMVIVIGAIGAILTYWGIIPFIIRHISKALHRFAGIGGALGTVLSANIFLGFPEAQLTIRGYLKHLTRSEIFTMMTMGLAAVAGTVMGLYVIFLQPIFPNGVIGYVITSVVMGIPAVITISRIMVPETETVTTNQTDLTHESASSTMDALTQGIFEGGKTLMAIIIMMLAALALVSFINHGLALLPHIYGHTVSVQLLLSYLLVPFMWLMGIPWEHAQMAAELMATKLATNELIAYSQLATMHHLDPRVQIVMVFAMCGFANFGSIGSMLGSFTSLMPEKRKIIVNFGFKAMLAGTIVTCMNGTVVGALYSLGVPIIHN
>NZ_CP038962|553700:601653|565873_566128_+|WP_036779246.1|DBSCAN-SWA
MALKIFDECINCDVCEPECPNEAIYQGEDIYEIDPDKCTHCLGHFKTQQCVEVCPVDCIIIDPENPENEETLWARYHRLTENKW
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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
>NZ_CP038962|553700:601653|584504_585941_-|WP_032126195.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MEWETVIGLEVHIQLATQSKIFSGASTAYGALPNTQACAIDLGLPGVLPVLNQEAIKMAVKFALASDSKVNPRSIFSRKHYFYADLPKGYQISQYDQPIVHDGHLNVRLDNDEIKRIGITRAHLEEDAGKSLHEDFQGLSGIDLNRAGTPLLEIVSEPDMRSAEEAVAYLKTLHSLVRYLEICDGNMQEGSFRVDVNVSVRPKGQAEFGTRTETKNLNSFRFIDRAIHFEVERQIQVLESGGIINQETRLFDAMKGETRPLRSKEDAHDYRYFPDPDLLPVAIEANFIDEIQATMPELPEQKRLRFVEEYQLNDYDADVLTANRDMANFYEQAVNTAGGHAKLVANFIMGDFSAALNKELLDVTQSPISASGLGGLIARVGDNTISGKIAKEIFIAMWEGQGDADSIIDKKGLKQITDPTAIAAIVDDVIAANPTQLEQYRSGKDKLFGFFVGQAMKASKGKANPAELNKVLKHKLSS
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MGGLAVYYSAQRIVSDRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
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MRSYMHRTERYLSQCLIAFATILLALLLEMLVVSGGLVYFWPQWLLLVVCYWTVRAPDMLPLGGVLLLGLALDVIHTNVLGIHAVILLALVYLVRKFHKRFRLFPVLQQAFFIMLITLVYQVALLGFEYWLHAEKSSALFNPWYQMTIVSSFVSWPLLQFLLNSLSGRREHG
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MKIFINLMFVLALCGFNLNVSYSAERVIKLTMDDRPPFHYLQDGKLKGPVIQTLQCIFKHMQQAYDVEVVSWSRAQHYVKVGYADGFFAASHNKTRDQYATLSYPFVDQYWSWFTLKSKTISKKQLESKALKVSSWKKSNSQHWLEKNSYNFINYPPQEISHLVNILRAERVAAIFGSNIAIYQYLKRLRVFDQVKEIKVVHKPMGLYMSHRYLKEDPEFLRVFNEKSKKCL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211663.1|554522_555188_-	fumarylacetoacetate hydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211661.1|555252_556209_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	1.4e-33	31.9
WP_032126810.1|556467_557166_+	transporter substrate-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211662.1|557208_558321_-	C1 family peptidase	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|558925_559501_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|559446_559812_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212580.1|559899_560250_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|560985_562047_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016210908.1|563258_564074_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126716.1|564164_565148_+	transaldolase	V5UTB0	Synechococcus_phage	2.2e-13	32.9
WP_016210913.1|565318_565840_+	pantetheine-phosphate adenylyltransferase	A0A1B1IVQ3	uncultured_Mediterranean_phage	1.8e-27	43.8
WP_036779246.1|565873_566128_+	YfhL family 4Fe-4S dicluster ferredoxin	A0A1B1IWY9	uncultured_Mediterranean_phage	1.4e-20	58.8
WP_016210909.1|566130_567408_-	na+ dependent nucleoside transporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307343.1|568100_568628_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210906.1|568747_571060_-	RNA-binding transcriptional accessory protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126715.1|571188_572004_-	transporter substrate-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210915.1|572201_572666_+	DUF4402 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|572795_573857_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211491.1|574117_574414_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211493.1|574696_576160_+	4-hydroxy-3-polyprenylbenzoate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016211489.1|576162_577215_+	2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein	M4QRZ2	Synechococcus_phage	5.3e-10	41.1
WP_036779281.1|577204_577660_+	arginine repressor	NA	NA	NA	NA
WP_155047071.1|577684_578008_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126199.1|578355_578667_-	DOPA 4,5-dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_054300208.1|578796_579588_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036779278.1|580745_581699_-	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016212075.1|581812_582010_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126198.1|582255_582456_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_142396463.1|582566_582683_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212074.1|582769_582991_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|583017_583383_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046696.1|583439_583604_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047072.1|583593_583908_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046713.1|584045_584210_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126195.1|584504_585941_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatB	NA	NA	NA	NA
WP_016210532.1|585982_587434_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatA	NA	NA	NA	NA
WP_016210537.1|587545_587833_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatC	NA	NA	NA	NA
WP_016210526.1|588022_589066_+	rod shape-determining protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210536.1|589081_589981_+	rod shape-determining protein MreC	NA	NA	NA	NA
WP_016210528.1|589977_590496_+	rod shape-determining protein MreD	NA	NA	NA	NA
WP_016210527.1|590565_591183_+	septum formation inhibitor Maf	NA	NA	NA	NA
WP_036776217.1|591192_592680_+	ribonuclease G	NA	NA	NA	NA
WP_016210534.1|592689_596370_+	DUF3971 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036776215.1|596443_597256_+	3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210530.1|597252_597933_+	histidine phosphatase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047260.1|598773_598932_-	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_155047073.1|599124_599682_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556461.1|599731_600022_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300215.1|600825_601320_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007066.1|601314_601653_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP038962|623123:725719|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016209523.1|623123_624473_-|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssK	NA	NA	NA	NA
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WP_016209501.1|625222_626734_+	DUF2169 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036778935.1|626739_627966_+	pentapeptide repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209528.1|627959_628988_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209514.1|628965_629658_+	DUF3540 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155049805.1|629659_631132_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036778941.1|631124_631613_+	type VI secretion system contractile sheath small subunit	NA	NA	NA	NA
WP_051307310.1|631618_633091_+	type VI secretion system contractile sheath large subunit	NA	NA	NA	NA
WP_032126187.1|633090_633489_+|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssE	NA	NA	NA	NA
WP_016209524.1|633485_635174_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209506.1|635155_636112_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209515.1|636154_636670_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209526.1|636774_637707_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	1.2e-21	25.8
WP_016209534.1|637926_638313_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209530.1|638329_638974_-	2-polyprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016209504.1|639154_639994_+	carbon-nitrogen hydrolase family protein	M1I6H3	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	2.0e-15	28.8
WP_016209502.1|640069_640672_+	signal peptidase I	NA	NA	NA	NA
WP_016209512.1|640672_641527_-	RNase adapter RapZ	NA	NA	NA	NA
WP_016209537.1|641883_642195_-	ribosome-associated translation inhibitor RaiA	NA	NA	NA	NA
WP_016209519.1|642219_643611_-	RNA polymerase factor sigma-54	NA	NA	NA	NA
WP_016209538.1|643766_644498_-	LPS export ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	1.3e-20	30.7
WP_129556465.1|644494_645067_-	lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA	NA	NA	NA	NA
WP_016209499.1|645053_645611_-	LPS export ABC transporter periplasmic protein LptC	NA	NA	NA	NA
WP_016209498.1|645616_646597_-	KpsF/GutQ family sugar-phosphate isomerase	A0A2P0VNK5	Tetraselmis_virus	6.0e-32	30.4
WP_016209539.1|646736_647537_+	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.6e-25	32.7
WP_036780687.1|647540_648308_+	lipid asymmetry maintenance ABC transporter permease subunit MlaE	NA	NA	NA	NA
WP_016209535.1|648304_648769_+	outer membrane lipid asymmetry maintenance protein MlaD	NA	NA	NA	NA
WP_016209507.1|648791_649445_+	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209517.1|649448_649796_+	STAS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209505.1|649829_650081_+	BolA/IbaG family iron-sulfur metabolism protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209518.1|650157_651426_+	UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209527.1|651428_652187_+	Nif3-like dinuclear metal center hexameric protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209508.1|652248_653139_+	OmpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209511.1|653189_653873_+	uracil-DNA glycosylase	A0A0R5YU95	Harp_seal_herpesvirus	2.3e-46	49.5
WP_075273445.1|653958_654216_-	DUF4286 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047218.1|654488_656657_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210408.1|656648_657521_-	DNA replication terminus site-binding family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210409.1|657688_659518_+	class I poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210411.1|659680_660322_-	BON domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273448.1|660563_661094_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210404.1|661111_661285_+	50S ribosomal protein L32	NA	NA	NA	NA
WP_016210402.1|661343_662393_+	phosphate acyltransferase PlsX	NA	NA	NA	NA
WP_016210405.1|662399_663350_+	ketoacyl-ACP synthase III	NA	NA	NA	NA
WP_016210406.1|663403_664348_+	ACP S-malonyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210415.1|664375_665113_+	3-oxoacyl-ACP reductase FabG	NA	NA	NA	NA
WP_016210413.1|665201_665444_+	acyl carrier protein	A0A1P8VVJ5	Erythrobacter_phage	2.0e-05	39.7
WP_016210403.1|665518_666742_+	beta-ketoacyl-ACP synthase II	NA	NA	NA	NA
WP_016210400.1|666773_667622_+	aminodeoxychorismate lyase	NA	NA	NA	NA
WP_016210401.1|667618_668671_+	endolytic transglycosylase MltG	NA	NA	NA	NA
WP_032126181.1|668791_669412_+	dTMP kinase	A0A1L2BX49	Bacteriophage	4.2e-39	44.2
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WP_054300225.1|705722_706142_-|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046954.1|706248_706422_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126800.1|706648_707383_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300148.1|707507_708569_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_155047215.1|722673_723927_-	LbtU family siderophore porin	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP038962|761136:809061|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP038962|825742:934526|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9

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MPSFNDILNQYLLHFKKYFLDLDLSLNHRTSILSSQGTTPNFQEIAKLFSDGEIEKEFESLQNKLNRYPDTSHLELYIKFNDFFKSKTDHSLESERVIGFFKDRNESIAGKKLLEIVFLESISFAASADLQESFNAELKSAINITAEEDNDSFYELIKEQFKEASTYPLSRFNLSYHPKAFEQLDQLGLGDQSNCILELLGHPPQLINIEGISNQVKEIFENAKKSIPTEIESTQQNLIAACYEKYQANVIGLIFNFFIPKEKNQEDLELQLFIYENEFLSSSNFANHGTQFESFCPKILEIIKASNKEHIQESDSQLFFSQQKEKTTFDSSASARYNQ
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Homologous phage analysis in the prophage region

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888207:888266	attL	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|888298_889273_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NZ_CP038962|955068:1000191|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

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CTCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCGATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTAACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCACTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTAGCATTGCAATAACCTTCAACCATCATTGGTGCCATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCTATAAAGTTAATTCGTATTGATTTTTTACCGGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGACCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTCTCGACTTTTTCCAGGAAGGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATTTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGAGTTTTACCCGGATTCTGATCAATGAATTTTTGAAATTCTTCCATATCGCTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAATCTTGCTTTGACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGGGTATCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAACTTGTGTAATAAGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAACTCTTAAGTCATAACTGTAAGGAGAAGGCATCCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTGGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGCAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATAGTATGTCAGAAACTGTTGATCGAGCGCTATAAGTTTTAACAGGACCCTTTCGTTTATAGTTAGGTTATAAGCCTTTTTTTAGCATTTTTAACACTTGTGCTCGGCCTGATTTATATATGGATTTTGATTATTAGAAAGTTGTTTTTTGATATGAGTATCATTTTGACCTTTGATTAATTGTGTTTCCTGGGCCGGATAGTGTGGACATAGATGTTTTTTAGTGCTGGGATTGTTTTCTAAATAAATTAATGCCCCTCTAGTCCAAGAAATATTTGAGCCATCACGGTTAGTGTGGGTTGGAATAATAGTTGCGTTGCTAGGGAATTGATAACCACGTGAAAGCAGGCGGCTAAAATAAGCTGAATTGATGCAATATGTATATAGAAATGGATTATTCGGGTAAGTTTTTTGTAGTTGATCCCAAGATGTTGAACAAAACTGCTTGCCCTTTTGCTTAAGTAAATCGGCACTGAGTGATTGTAACTTGAAAAATTGCGCAGTATAGCTAAATCCTGATAAAGCATTGAAGGTTTTATTTGAGTCAATCAGGTTATTGATAGGTTGAACTTGATGTACTTTAGTAATTAATGGGTTAATACTTCTTTGACACGTTGCGTAATCAGCAAGTTGTGAGCGCTTGCCGTTGGGTAGTTTATAACCATTAGGAAAGCATGTGGTATGATTTAAAAATTGATTGCGTAATTGATCTTGCCCTAAGCCAAGATAGCTGGCTGAGTAAATAGAGATTGGCCTATGGCCTAGATTAATCCGGGTGATATTATTATTATGCACATTGGTTGTCGGGTGGAAAGTAATTTGTGTCGAAGCACCGCCCATCTCTAAAATACCATTTGTGTGTGCAGTTAAGCGAAATTTGGCATTATCCCAGTTATTATCTATCCAAGCAAAAATGCCTTCCCACCTGCCGGAAATTGTGCGTATGCCATGTGGGAATATATTAAATTTCTTGCTGTTTGGCTGTTGCTGTAGTGTTGTTCTTATCGCCTGATAAATCGCTTTTTGAGCATCTTGAGAAAGCAAACGCATTCCTGCGGTGCCGTAGAGTCCAAATTGAACTTTACTGGCATCGCTATAACAACTGTTAGGAATATTCACTTTTTTTAATAATTCACTGATGTAATCAGGTGCTTTATCTGCGCTGATTATCGATAAGCCTGGCGAGAGCTTAGCTGCTTTTCCAAACTCGGCTACTTTGCCAAAGTGGCTCTTATTGAGGTCATATTGATAAAGGTGCGCTCGTGAGCCTGAACTACCTGCGTCAATGATTAAAGCGCATTGTGTTGATGCCTGCGTGGTAGACAATGCACTTGTTGATAGAATGCAAGTGATAATGAGATATAATTTTTTATTTTTCATTGTGGACCTTGATAAATTAAGTTTATTTAAACTTTAAAATAATTTTTTTAATTATATTTAATGCTTAAATTTGAGCATGAATAAACTTATAGCACTTTTTTGTTTTAGAAGGTAGAAAATATTGATGGGTATGTGAGTGGATTGATCTTAACTCGAAAAAGTGGATTGTAGCCTATTGCATTTTTTTATGATGATTTAAGGCTTGGCAAGTGTAGGCGATTTTATTTGTGTTGCCAATAAATACAAGAGTACAGAGATTAAAAATAACAAGAGTAATAAGCTTTGCATGGCTATCTGATTGCCAATCCAGCCGGTAATAAAATAAGCACTCAGCCAGCATGCATGAGATAAAGAAAAGTAAGCGGTAAAGTAGTTGTTTTGTTTTTCTTGAGTAATATTTTCTGTAATAGTGAGGCCAATAAGTGTTTCTATTAAGCTTGCGCCGATGCCAAGAATAAACCAAATAATAAAGATGCCTGTTAAATTAGGTGTCAGTATGCCAATGGCAAAGCCGCCAATACAAAAAAGAGCACCACACTTCATTAGCTTATTAGAGGAAGCGTATTGAGAGAGTGCTGGAATGGAAATTGTCGTGATTAAAGAGGCGATACCGAAAACCGCCATGGTAAGCGCGGTTATACTTTCACTTAAATGGTAAGTACCTTGAATATAAACAACGGTATTAATAATTACCATGGCACCTGCTAATGCGGCAATAAAAATAAAGAGTAAGCCCTGTAGCAAAGGTTTAATTGTTAAATAGTCATAGAGGCAGCCAAATCCACGTGACTGGACTGTCTTATTTGATGACTTTAATGGTGTTGAATAAATTAATAGCGAAGATATTAAAAAGGTGAGTGCGTTTAGAGCAAAGAGTAGTTTAAAAGAAACAAAAAAAAGTAATAGTGCGGCAAGAAGTGGGCTTAATAGCGATTCTAAGTTATAGGCCATTCTGGAAAGCGATAGTGCTTTGGTATAGTCGGCTTTTTTTTGAAAGAGTGTTGGAATTAGGGCTTGGAATGTTGGGGTGAAGCCTGCTGAGCATAAATTAATAAGGATAATTAATAGATAGATTTGCCAGGTCGCTTGGACAAAAAACATACTGACAAGTAAGAGCATACGGATAAGATCCATTATGATCATAAATAACTTGCTTGGTATTTTTGCTGAAAGGTAGCTCATAAGTGGTGCACCGAAAATATAAGCGACCATCTTTAACACCAACGCAATGCCTAATATCTTACCCGCATGCCTATCTGATAAATGATAAGCCAGTTGCGCTAAAGCAATGCTGGATAAGCCGGTGCCGAAAGTAGCAAGAATTTGCGCACAAAAAAGTTTTCTAAAAAATGGATTGGCCAGTATAGATGGTAGAGACTTCATAATAATTAGCTGGTTAACCTGGTCTTTGCTTGTCTTAAATAGTACTGCTTTGAATTATGCCTTATACCTTATAGGGGTATAGTATGCGTTGAATGGAGAAGCGTCAAGCCTTCTGCGGCATTTAGGGTTTTAGTGAAACCAGCCAACGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGTGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAATCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGGTATGTTAGGCTAAATTTTGAAGGAGAATATTTAATGATGAAAGGATTGATTGGTATTTTATTACTGATAGGTTTTTTGGCTATTGTTATCACTTATTGGGTTGCCCGTCTTGAAGTGCCTGTACTTGTCAGTTATGAATTACAAAAAGTGTTGTCTTTAAAGATAAACTCAGAAATTTTTAATTTAAGTTATAAAAAAATAGATGCAGGGTTTACCTTTTTTTTAAATGGTAGTTTTCAATTGGATGACGTAACAGTGAAGTTAAAGCGCTTTCCCGAGGTGTTATTGATGTCCCCTAAAGTTGCCGTGACTGGATTTAAGTTGAGCAAGGTCAAAGGTATTCAGGTGGACTCATTTGTTATAACAGGTCATCAATGGCTAGGTGATGGTGTTAATCGCTGGTCGTTAGGTGTTCGCTATTATCAAGACTCTCAGAATAAAAAGAAAAACTTAGCATTGAATGTCTACAAGCAAGAGACTCTTATCGGTGAATTTTTTGCTGTTTTGCCGGTCGAAGAGTCTTTGTTTAAAGCGTTAAATAACTGGTCATTAGGGCGAAAAACTGCTGGATTGAAGATCAATTATACAGACCAT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>NZ_CP038962|1012699:1067588|1031144_1031390_-|WP_016211259.1|DBSCAN-SWA
MAKEENIEMEGTVLETLPNTMFRVELENGHVITAHISGRMRKNYIRILTGDKVKVEMTPYDLSKGRIIFRGNDRKSQSSPR
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MSERKHFNLLILGSGPAGYTAAVYAARANLKPVIITGMQQGGQLTTTTDVDNWPGDDQGVQGPELMERMQKHAERFGTDVIFDHIQSVDLKQRPLLLNGDFGQYSCDALIICTGASAKYLGLASEEAYKGRGVSACATCDGFFYRDQDVVVIGGGNTAVEEALYLSNIAKTVTLVHRRDSLRAEKILIDKLMAKTEGGNVTIEWNATLDEVLGNEQGVTGVRLKHMQDQSTKELATNGVFIAIGHTPNTAIFQDQLDMESGYITIKGGLSGNATATSTPGVFAAGDVADSIYRQAVTSAGTGCMAALDAERYLDEFKH
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MIDDDSAGILEEGQALSDYFDALLGVNSAQKEELELEKAKSFEVVTDNQSFVFQDDNKVADLAVVEPAIVMPLPKVQELDASIKEIDVDDVVASTVIEADLDVLPGTLSEVLEEIEVAVITTESELDAASIEFDSVVPTWARQEFQCVSFMVQGLQLIMPLSGLNQIYALQEHRVKAIFGQADWFIGMMKVMEKNIHVLDVMHWLLPEDAQPLGRVNQTDTDLQHEFVLALEGSSWGVVCNGLGFSEFLKSDDVNWHNKDPKRPWLAGVVVDKMCGLIDPEQLVKFLNAESRGLSIK
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MKQHSPTMDELYRHCCTLLKQIEKKQQQEDYTEVRLLGLALDAIAEEMDEKSSEYH
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MPRPGLTYDEITEAANRVLAAGEKPTINRVREALGGRGSSTTISRYLKDWKRQVQEAGGVVELDDNVDVPQIEEEAADASNAPLEKLKVDSDIDVESAETSATAASIAADEEYELPAITHEQFRSVEGGSELEVLKREHEALKIQFRRLNSAVNKERIRRQAFEMLAREAKEYVNVIKEQIGQRILDLRMASDQTINQLKAHAREAKQESERELKFYREELMRVQKEIGRNSSQSKPVMTNRGPRRQVTTTS
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MSKRLTKLLDVTLEKEDMEGDIATEVARPKLQVPPMYKVVLLNDDYTPMDFVVDVLKRYFTMDEDRATVIMLEIHTKGRATCGLYSRDVAETKVAQVNDYSKESGYPLLCIMEVDRQ
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MKRTCLRALLAAASVVLVGCSSLTHHDQQSTQSTSSVDKGHSVQSLQKGSAAATLGKGK
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MAIVITYWVARLEVPVLVSYELQKVLSLKINSEIFNLSYKKIDAGFTFFLNGSFQLDDVTVKLKRFPEVLLMSPKVAVTGFKLSKVKGIQVDSFVITGHQWLGDGVNRWSLGVRYYQDSQNKKKNLALNVYKQETLIGEFFAVLPVEESLFKALNNWSLGRKTAGLKINYTDHGLRGQLAGFKFHVAELGPVLDHVKAS
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MYKKMQQVIDKADLKSLGLIYRGLEKENMRIDSHGYIALTDHPRALGSALTNPWVTTDFSESLVEVVTPAVASLSQLKQDISTISQFCYARLNKDELFWPASMPSCLNESDIRLAYYGKNNSGKMKQVYRHGLAERYGKTMQMIAGIHYNISFSQALFESLWRYDGKSCSLAEYTNQRYMGLVRNFFRYGWLLPYLFGASPIASGRSVSESFDFLQAQGQDYIGPYATSLRLSRLGYQNKGKHLMHMSYNSVEEYASSILQATRTPYAPFSKLGICSKDKAGQRHYTQLNDALLQIENEYYSPMRPKQPAERCKRPVASLLEKGVCYIELRALDLNPFEPLGFEAGELEFVDLFLLFCLLEDSPVLSAAELADTELCLQQVAEYGRKPGLMLTIQGRQVSLQDAAERLFEALLPLAECLDAEQAQAGSYLIALNANYKKLTDISLIPSAKLLDEFLASGINYTEFMLKYACKHQDYWQQQAINPVDFQRFDDLAKQSLVEFENIEQAEQVPFEEYLARYFQQGDAKKVGQ
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MAANFFGQWLLERGLITPEALIDAVEYQKKHNISLGEVAIEKSWLTENQVASINAEQQRSDRKFGEIATDLKLINDEQVQELLNTQKARRIFFGEALLALGHIQQDVLDKEIQAHKKAQEEHEELLKANLDNIPEAITVKAMLDHTLKMFLRIAREMVKITEVSTEANAISTDQNHYTFAQEITGEKNFYYALTMPEALVINVAGKLLMDDNHNEITPLSLDAASEYVNIIIGHGCGKLGTLDCMVHANPPFAYKKSEEKNPDCKHQVTVELASAHGDLMVEFLFKK
>NZ_CP038962|1012699:1067588|1050870_1052121_+|WP_052047073.1|DBSCAN-SWA
MRKNNWEISVKHWKKVVVTGFGLLAVVLAGCSSYKDNTIAPAPLKIFKPKVAVLEHWQAQVGEGSGTAAKAVLSFGDEGYWQYQAAENWHLNVTQAGQSLYAVDYNGLVKSFNLAGQTNWHVNLKQLLTASPVAGPEYVYVVTAEGTVFALNKKTGQIQWQKPLGSLVIAAPAAAKGVVVIHTKPGAVIALRAVDGRQLWRYDLLLNPSMTMERSSVPVIAGQQVVIGSDNGQVVALDRQTGDLLWQYQVAVPSGASEVAQIVDVDVTPVVKDGTVYVSSVKNRTIAVSLQSGRMLWKHKVGSFSGLAVSQNKVIVTANNGALWALDRQTGKAVWVDSNLLGRGPTAPAIVGHYVVVGDYKGFVHWFSLKTGQLVGRMSVGARAIVGQPVVDGSIVYVMDASGRLVAVRGSKVEEL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_129556478.1|1012699_1013586_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211932.1|1013996_1015286_-	GDA1/CD39 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036777061.1|1015481_1016669_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211476.1|1016986_1017196_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211473.1|1017179_1017779_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211474.1|1017853_1019203_+	23S rRNA (uracil(1939)-C(5))-methyltransferase RlmD	E4ZFI6	Streptococcus_phage	5.7e-33	27.6
WP_032126518.1|1019285_1021487_+	GTP diphosphokinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211478.1|1021503_1022319_+	nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126519.1|1022298_1023018_-	TIGR00730 family Rossman fold protein	A0A1D8KUT5	Synechococcus_phage	1.9e-19	34.8
WP_075273327.1|1023185_1023761_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|1023706_1024072_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211265.1|1024246_1024909_+	adenylate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211263.1|1024939_1025308_+	thioredoxin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126514.1|1025318_1026635_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_051307354.1|1026917_1027493_+	DedA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126515.1|1027568_1027748_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211261.1|1027920_1028214_-	cold-shock protein	A0A2H4N7Y6	Lake_Baikal_phage	5.8e-15	61.5
WP_075273504.1|1028403_1028757_+|protease	ATP-dependent Clp protease adapter ClpS	A0A218MMY6	uncultured_virus	6.7e-10	40.0
WP_016211262.1|1028811_1031085_+|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA	A0A223W0B1	Agrobacterium_phage	1.0e-167	41.8
WP_016211259.1|1031144_1031390_-	translation initiation factor IF-1	NA	NA	NA	NA
WP_054300275.1|1031514_1032390_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211550.1|1032467_1033229_-|tRNA	leucyl/phenylalanyl-tRNA--protein transferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211548.1|1033212_1034169_-	thioredoxin-disulfide reductase	A0A2I2L5E1	Orpheovirus	1.6e-61	43.7
WP_016211549.1|1034431_1036936_+	DNA translocase FtsK	A0A218M9A2	Mycobacterium_phage	4.9e-86	43.1
WP_016211553.1|1036939_1037680_+	outer membrane lipocarrier LolA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|1038019_1038385_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046696.1|1038441_1038606_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007013.1|1038595_1038895_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155049809.1|1038898_1040194_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1040368_1041343_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016209411.1|1041548_1042343_-	inositol monophosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016209421.1|1042505_1043294_+|tRNA	tRNA (cytosine(32)/uridine(32)-2'-O)-methyltransferase TrmJ	NA	NA	NA	NA
WP_036776605.1|1043290_1044502_+	aminotransferase class V-fold PLP-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_032126508.1|1044491_1044851_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209444.1|1044945_1045374_+	nucleoside-diphosphate kinase	A0A167REB2	Powai_lake_megavirus	1.1e-17	39.4
WP_129556555.1|1045504_1046635_+	23S rRNA (adenine(2503)-C(2))-methyltransferase RlmN	NA	NA	NA	NA
WP_016209436.1|1046631_1047360_+	type IV pilus biogenesis/stability protein PilW	NA	NA	NA	NA
WP_016209412.1|1047417_1048305_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209433.1|1048389_1048764_+	rhodanese-like domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209424.1|1048863_1050141_+|tRNA	histidine--tRNA ligase	A0A2I2L577	Orpheovirus	6.6e-23	25.1
WP_080664816.1|1050152_1050884_+	tetratricopeptide repeat protein	NA	NA	NA	NA
WP_052047073.1|1050870_1052121_+	outer membrane protein assembly factor BamB	NA	NA	NA	NA
WP_016209427.1|1052214_1053618_+	ribosome biogenesis GTPase Der	NA	NA	NA	NA
WP_016209408.1|1053771_1053942_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209406.1|1054256_1055078_+	ParA family protein	Q8JL10	Natrialba_phage	5.0e-16	32.2
WP_016209405.1|1055074_1055968_+	cheW-like domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209443.1|1056013_1056535_+	chemotaxis protein CheW	NA	NA	NA	NA
WP_036776598.1|1056609_1057095_+	DUF2802 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047194.1|1057383_1058142_+	DNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209404.1|1058131_1058995_-	chemotaxis phosphatase CheX family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209435.1|1059021_1059393_-	response regulator	W8CYM9	Bacillus_phage	1.1e-05	29.4
WP_016209445.1|1059493_1060450_-	23S rRNA pseudouridine(955/2504/2580) synthase RluC	NA	NA	NA	NA
WP_054300277.1|1060932_1063614_+	Rne/Rng family ribonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_016209439.1|1063694_1064321_+	phosphatase PAP2 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556553.1|1064484_1066077_+	glutamate--cysteine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016209434.1|1066166_1067588_+|tRNA	glutamate--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

>NZ_CP038962|1082627:1211843|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12

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MMPDSGSDEVNEAKQELFAAKIADGTPGLYLALKNGCHQATESYIDGVFSASLGIALNE

Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>NZ_CP038962|1252515:1428412|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_13

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_129556540.1|1257479_1257875_-	ArsC family reductase	NA	NA	NA	NA
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WP_155047178.1|1263936_1264665_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	2.5e-43	41.4
WP_155047177.1|1264711_1264858_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300189.1|1264914_1265280_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036779232.1|1265574_1267134_-	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016211215.1|1267494_1269465_+	acetate--CoA ligase	A0A2H4PQU7	Staphylococcus_phage	1.5e-77	37.2
WP_016211211.1|1269656_1270736_+	FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_052104715.1|1270784_1270991_+	sulfur carrier protein ThiS	NA	NA	NA	NA
WP_016211210.1|1270997_1272479_+	thiamine phosphate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016211214.1|1272581_1273145_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211942.1|1274906_1276166_+	DUF4804 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211940.1|1276286_1276619_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556538.1|1276732_1277707_-	D-alanine--D-alanine ligase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

>NZ_CP038962|1444027:1550294|DBSCAN-SWA
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MLVIMLIAFTLVPITIVASEHATNRVNISAVAMQKVNEAQNSKLMSKDQEASIVNNTSISKQHKERPSGGFLALILLLIFIFVSTPILFIIWLSARRNK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_129556639.1|1464041_1464452_+	flagellar basal body-associated FliL family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209784.1|1472888_1473611_+	RNA polymerase sigma factor FliA	A0A1B1P7V3	Bacillus_phage	2.7e-05	24.1
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WP_016209791.1|1477394_1478117_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209771.1|1478281_1479004_-	sel1 repeat family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126436.1|1479710_1480166_+	SUF system Fe-S cluster assembly regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016209793.1|1480181_1481630_+	Fe-S cluster assembly protein SufB	NA	NA	NA	NA
WP_016209795.1|1481670_1482426_+	Fe-S cluster assembly ATPase SufC	A0A285PWH2	Cedratvirus	1.3e-10	24.6
WP_080664823.1|1482406_1483807_+	Fe-S cluster assembly protein SufD	NA	NA	NA	NA
WP_016209796.1|1483830_1485048_+	cysteine desulfurase	Q2XUY6	environmental_halophage	2.9e-92	42.0
WP_016209778.1|1485078_1485453_+	iron-sulfur cluster assembly accessory protein	A0A218MM00	uncultured_virus	1.7e-11	38.5
WP_016209772.1|1485471_1486023_+	putative Fe-S cluster assembly protein SufT	NA	NA	NA	NA
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WP_054300148.1|1488376_1489438_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1489992_1490967_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016212424.1|1491310_1491589_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036781387.1|1491581_1491854_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300162.1|1491971_1493054_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1
WP_054300346.1|1493200_1494076_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126678.1|1494086_1495097_-	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	1.2e-22	40.6
WP_016211554.1|1495423_1496050_+	uridine kinase	A0A1V0SAA3	Catovirus	1.6e-33	41.3
WP_016211557.1|1496095_1497325_+	na+ dependent nucleoside transporter family protein	B2YG43	Musca_hytrovirus	2.0e-08	22.0
WP_032126677.1|1497519_1498083_-	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211555.1|1498157_1499516_+	dNTP triphosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016211664.1|1500052_1500781_-	single-stranded DNA-binding protein	A0A2I7QWB5	Vibrio_phage	6.2e-42	65.6
WP_016211666.1|1501153_1503973_+	excinuclease ABC subunit UvrA	A0A1B1IVR3	uncultured_Mediterranean_phage	1.0e-311	55.2
WP_016211669.1|1504127_1504478_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1505302_1506277_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_129556522.1|1507587_1508820_+	MFS transporter	S4TR35	Salmonella_phage	9.0e-17	23.2
WP_016211405.1|1509026_1510799_+|tRNA	aspartate--tRNA ligase	A0A2K9L0E9	Tupanvirus	4.9e-08	41.9
WP_016211403.1|1510934_1511978_+	quinolinate synthase NadA	NA	NA	NA	NA
WP_036777261.1|1511991_1512735_+	YebC/PmpR family DNA-binding transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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WP_105962623.1|1534458_1535612_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
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WP_016210099.1|1547501_1548779_+	phosphopyruvate hydratase	A0A1X9I5Z8	Streptococcus_phage	2.5e-139	60.9
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WP_016210106.1|1549202_1550294_+|tRNA	tRNA pseudouridine(13) synthase TruD	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

>NZ_CP038962|1568692:1612646|DBSCAN-SWA
CATGCTTAATGAAGGCCAAGCGGGTGTTAAAGTTGAAGATATTTGTCGCCAGTATGGTATTGCTAAAAGCAGCTACTACAAACTCAGGTCCAAATATCAAGGCATGGGCGTTTCAGATCTACAGCGTTTAAAAGAGCTTGAAGACGAAAATCGGCGTTTGAAACAGATGTACGCAGACATTAGCCTAGAGCACAAAGTGCTCAAGGATATTGTTGAAAAAAAGCTATAACCGCAGCGAGTCGGCTTGACTTAGTTGATTATGCTGTCAAAACTCATGCATTGAGCGGGAATAAAGCATGCAAGATATGCAGTATTGGCCGATCAGTTTATCGGTATCAACCTAAAAAGCAGGTTACTGATACTAAAATTAAAAAGGTGCTGACAGATTTAGCTAAGGTACATCATCGCTGGGGTTTTGACAAAATGATGGCTAAAATCAAGCAAAACTACGCTTGGAACCATAAGCGTGTTTACCGTGTCTATTGTGAGCTCAAGCTTAATTTGAGGGTCAAGCCTAGAAAAAGACGTTCACCACGGCAAGCAAAAATGTTAGTTCAGCCTATTGTACCAAACTACTGTTGGTCACTTGATTTTATGAGTGACACGCTATCGAATAAGCGCAAGTTTAGAACCTTAAATGTGATCGATGATTATAATCGTGAGTATTTATTGATTGAGCCTGCTTTTCCCTTGCCATCAATGGTTGTCACTCGACTGCTTGATCAGGTTGCCGAGTCAAAAGGTTATCCTGAAGTGATTCGCAGTGACAATGGCCCAGAGTTTATTTCAAGTGATTTTACAAAATGGGCAGAGCAGCACAACATATTGCTCCATCATATTCAGCCTGGGAAGCCCGCACACGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAACGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAACTCTCTAGTTCGCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGGTTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGTGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGTCAAGCTTTTCGACAAATTTCAGAGGAGGCAAAAATGTTGATCCATCAACGGTTAAGCACCCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAGGAACTTATACGAGAGCATGATATCCAGGTGAGTGAAAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCAGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCGGGAAAACCTTATAAGAAAAAGGTGAATCGTGGTGATCAAATAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACACCGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGCGATCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACCTCTGACAATGGAACAGAGTTTGCGGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAGCACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACAGATTTTAATGAAATTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATTGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGTGATCAAGATGAAATAAATTTAGAGACAGCGCTTAGTCAAGTAATGAAGTCAATGTCAGAAACTATTCGTTGAGCTCTATAATAACAATTGCTGCGATTAAAATTTATTAATTCACATTGCCTTGTAACTGGAATATTTTTCGGCTCAGACTCAATAAGGCACTTTCTTGTTTCATAGTCCAAGCTCTTCAACTTTTTTGCAGCCCACTCCAACTCTGCTGTGCGTTTGCCCAGTTGACGGTGAAGTTCATTCACTTCTTTTTCTTTGGTTTTGATTTCATCCTTAAACTCCGCCACAGCGCTATCGATATTATAGCGCTGGATTAACAGTTTCTGACATAATATCAGTAGGTTAAAAAATACAATAAGGAAAAACGATGCCTTCTCCTTACAGTTATGACTTAAGAATTCGAGCACTAAAAATGATTGATGAAGGGATACCTATTACACAAATTTCCAAGCTCTTAAAAATCAGTCGAGACACTCTGCATCGTTGGAAAAATAGGCGTGATCATACAGGAGACGTCAAAGCAAGGTTTGGCTACCAAACGGGCTATAACCATAAAATCAGTGATATGAAAGAATTTCAAAAATTTATTGATCAGAATCCGGGTAAAACTCATCAACAACTCGCTGATCTTTACCCTGTAGAAATGAGTGCAAAAACCATGGGAGTGTGGATTAAAAAATTAGGCTATACCAGAAAAAAAAGAGCTTCAGATACCAAGAACGTGATGCATTAAAGCGGAAAGCTTTCCTGGAAAAAGTCGAGAAAATCGATAACGACAAAATTGTTTATATGGACGAAGCGGGTATGGATGATACTGAGCGTTACGCTTATGGCCACTCTGCTAAAGGTAAACGGTGCTATGCAGAGAAGCCAGGTAAAAAATCAATACGAATTAACTTTATAGGTGGTTTGCGCGGCAAGCAATTTATCGCACCAATGATGGTTGAAGGTTATTGCAATGCTAACGTTTGTCAGGCTTATATCGATCAGTGCTTAATTCCCTGTTTATCTCCTGGAGAGACTGTAATCATGGATAATGCCTCTTTTCACAAATCAAAAGGGGTTAAGGAAGCGATTGAAGATGCGGGTTGTCACTTATTATTTTTACCCCCTTATTCTCCTGATTTAAACCCGATAGAGCATGTATGGTCACCGCTTAAAAATAGGGTTCGCATGAAGCTTGATCAAGATGAAATAAATTTAGAGACAGCGCTTAGTCAAGTAATGAAGTCAATGTCAGAAACTATTCGTTGAGTGCTATAAAAGCCAGGCTTGCATTTGCTAAAAACACCTTTTTCCAGTTTTGAACAGTTTTAGGGACTAGCTCATATTTCGAGCATATTTGGTTGAGCGTCTGATCTCCTTCGATGACCTCTAAGACAACTTTAGTTTTAAATTCAGCGCTTGGCTTCTTTCTTTTTTGACTCATGTCATAGCTCCTAAAATGTTAAGCATCATTTTAACCTTTCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGTCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGCAGGAATAAATCGTTAAACTGTTCTGTCTGAAAACTCGGGAGCATTATAGCTTTCGCTGCACTTATTTTATTTAATTTTAAGAAACAATCTCTAGATCTAAAGGTGTTTTGTGTTTAGACTTTCTTGAGTGATTAATCATTGATTTTTGGGCGTTTGGTTTAAATTGTGGAATAAAGTCTTGTACATTAATCCGTGGGTGAATATTTTGAAAAACCTGCAAAAATTCTTGGGTGAGTTTATGACTTGGATACAGCTGGATTAATGGCTCTGCTTTTTTATGAGATTCTTTCATTTTTATAGAAGATGATAAGTAGGGCTCTATAACGTTGAGCTGGTCATCTAGCAACTCTTGAACCACTTGTTGGGGCAGCTTGCTGGTGGGCTGGTATTGATTAATGACAATGCCTTCTATGGCTAAATTTGGATTATGATCACTACTGATCTCATGAATATTGTGAGTTAGTGTGTATAAGCCTTGGCGGGAGAATTCATCGCAATCAAAAGGAATGAGGCAGTGTGAGGCGGCGATGAGGGCAGAGCGACTAAAAAAATTAAAGGCCGGGGGAGTGTCGATATACACGGCATCATAATCGAGCTGGTCAAGCGTTTCTTTGAGTTTATAAATTTTATGGCGTGATTCTAGTTTGCTGTGTAGGGTTTCTAATTCAAGATTTGAAGGGATGATGACTAGGTTTTGTATTGCTGTGGGTTGAATACACTCAGCCAGAGGGCTGCTTGAATAATTAAACGATAAAATATTACTAAAAAAGTCGGTAATAGTATGTTCACATTCGGTGTATTGTTGGCCTAATAAATAAAAGCTTGAATTCGCTTGTGGATCAAGATCAATAACTAGAGTTTTCAGGCCACAGAGTGCGCTGATCGCCGCAAGATTGCAAGTAATACTGGATTTGCCAACCCCACCTTTTTGATTAAAAACGACACGCTTCATGATGATACTTTCCTTGAGATCGATAGAGTGTATTTGCTAAGTCTAACGAAACATTGACTGAAGGTCGAGAAAGTTACGATTTTCCTTTTCCCCTCCGGGTGTTTTGCAAAATTTGTTTGATGCTGTGCTATGATGCTGCTGCACGACAGTGGAGAAGAGAACAGCATGCAGCAAATGATATTTGACCAATTAATGCAAGAATGTACGGTAAAAGAGGCGTGGCAGTTACGTAAAGCCT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_15

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MKYYTTSFINVKSCQCALMLALLALFVITMGSTDVVYANGRYSDPNNLFLFLAKTDKNTKDFEVSVHQQQSNPEILHVHWDIAPGLQLYKDKIQFSIQPKTHQIQLGRIDMPQGNYNNDTVIGNYQVYKNALDIQIPVKNSKNLPYSLTIDYQGCQPGRYCYPPQTQTFYFNQAQSTASKPSQEQEKTSLFTTANLTTIQHLFSEQNIPLILFSFFIFGLLLSLTPCVLPMLPILMGIVLGQKNNTAKQAFLLSLAYVLGIAISYAIAGIIAAKLGQSLQVFLQNPWVISVFSLIFIVLALSLFGAYNLQLPIKIQNSLHNINQKFRGGSYLSAAMMGMISSLVASPCLTAPLAGALVYLSSTGNQFIGGSALFSLGIGFGIPMLILGASGGKLILKAGNWMKHIKTLLGLILIAMAIWMQSRVLSDTIMPLIWGAFLVITPIALGILEPAKTLWQRIYKALGITILIVGTGLILKTLISPNINNNQTNSKQQTLNKNNNSHYFNTVYTMNQLQTALDKAKIKKQPVMVDYYASWCTTCKELDATTFKNNNVLVALKNFSIIRVDITKNDLHAKQIQQAFHVFGPPTIQFFNTHGKLIPHAEVVGYIAADNLVNKIHLVK
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MYEYELSTECCTSDDGGRYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCLWPVRKVSFRVSCSGIETTFPVITTTWFKTESSKHK
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MRPSHSHALSALIKLLIVMILVVLLFNPAVSWQAAIVFLIIIIFLIGFIIITYENFEHGIRKQLAKKEDDALLNIEDKTDSTTKKLTNADLASAEKTEEK
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MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDIISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA
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MTINKRDFFDAINYADTAVQIHEYLLNILEKQQKDFAENCNNDNDSEKSKALASISDVELRFAQLDMLSAIYRKILLNTLNEIEGCNDQELKTIKNGLLHMVATTLEACVNDFTIEAKITIDIKEEQ
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MERKHLTLRTRIKRLARKTICFSKSEKMHDVVIGLFINKLEFGKAT
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MDVQNTYRGSDAYDNTGGSEKYINYTINLVGAGHLIKSGTEYPILNGSSVSNHDDLEKANFNGNITYIDNNGNTVNQLPLIEFFSRPGSGVNNGSVVLVSKVKSTCDFIEGTARDGLENVCKGIDNLSDTYSSSDSNIAKRVLEKAPVLTSVPVNVNNVYINKVLAAKRSSDNKSLSTPFSGVSTGAKVDRGFSPWIDAYTAHETEDPADGYDGYTQSIKGVSFGIDYNTLDKFGLFFSYSENRFTTEMTNSTIKSNSYGITFFLEKSFKDLDYYSSFSYFFNDFNNERTDTSKSVNSFQSSFSNHSVLFNNRFLCGFYPENLNNYDLKLFFDVNYSQVMGYDYQEDYLNLGGQSVQVDTWHQLNFGIGLSIDKEIKTYSGIITPAASFKIQYSVLNDPSFMNVSSVDFPGSIQVQSVNSKKLEYDLGVALKYEYKDNVELILEYNSIWGNSRKEVVSMLAKYRF

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
1568597:1568656	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_054300354.1|1569066_1569585_+|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.3e-30	42.9
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WP_054300271.1|1569723_1570698_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_032126362.1|1571111_1571477_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|1571422_1571998_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300355.1|1571987_1572173_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211564.1|1572577_1573453_-	ParA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_052104693.1|1573618_1577485_+	ATP-dependent RNA helicase HrpA	A0A1V0SBU4	Catovirus	1.9e-49	26.2
WP_080728343.1|1577566_1577707_-	hypothetical protein	A0A0U2RK18	Escherichia_phage	1.6e-07	69.0
WP_081007034.1|1577688_1577973_-|transposase	IS1 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155064791.1|1578258_1579656_+	autotransporter domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211994.1|1581932_1582469_-	DUF2062 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155047150.1|1584993_1586220_+	DUF4131 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075273474.1|1586453_1587428_-|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	4.0e-28	31.9
WP_016212012.1|1587471_1588149_+	MBL fold metallo-hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016212013.1|1588164_1588548_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212011.1|1588769_1589891_-	calcium:proton antiporter	NA	NA	NA	NA
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WP_080664876.1|1595473_1597336_-	protein-disulfide reductase DsbD	NA	NA	NA	NA
1595409:1595497	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_155047148.1|1598491_1599529_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047147.1|1600058_1601033_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	6.2e-29	32.6
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WP_081377353.1|1601460_1602126_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1602165_1603140_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016211144.1|1603696_1604326_+	MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036779218.1|1604309_1604732_+	biopolymer transporter ExbD	NA	NA	NA	NA
WP_016211145.1|1604738_1606478_+	lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA	W8CYL7	Bacillus_phage	8.4e-53	30.8
WP_016211153.1|1606478_1607543_+	tetraacyldisaccharide 4'-kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211147.1|1607546_1607900_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211146.1|1608012_1608969_+	ferrochelatase	NA	NA	NA	NA
WP_016211151.1|1608978_1609290_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211143.1|1609305_1609875_+|protease	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit	A0A223W000	Agrobacterium_phage	7.3e-30	39.5
WP_016211148.1|1610138_1611467_+	sodium:alanine symporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1611671_1612646_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3

Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

>NZ_CP038962|1621534:1668938|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_036777656.1|1668158_1668938_-|tRNA	tRNA (guanosine(37)-N1)-methyltransferase TrmD	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_17

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17

>NZ_CP038962|1694999:1739345|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_17

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_18

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18

>NZ_CP038962|1760765:1816291|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016210515.1|1769750_1770653_+	carbon-nitrogen hydrolase	M1HCD5	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	2.7e-55	40.7
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WP_016211414.1|1809041_1809860_+	sulfite exporter TauE/SafE family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126139.1|1815361_1816291_-|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase MiaA	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_19

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19

>NZ_CP038962|1823056:1881973|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_19

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_155047127.1|1828846_1829662_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212251.1|1829823_1830360_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046960.1|1830521_1831175_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047126.1|1831294_1831786_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211219.1|1832589_1833867_-	FAD-dependent 5-carboxymethylaminomethyl-2-thiouridine(34) oxidoreductase MnmC	NA	NA	NA	NA
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WP_016211223.1|1834512_1836114_+	cytochrome d ubiquinol oxidase subunit 1	NA	NA	NA	NA
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WP_016211218.1|1837525_1838263_-	deoxyribose-phosphate aldolase	NA	NA	NA	NA
WP_016211224.1|1838287_1839559_-	phosphopentomutase	NA	NA	NA	NA
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WP_054300388.1|1843398_1845081_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209951.1|1847927_1848338_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209957.1|1848344_1848680_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556634.1|1848680_1849223_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209965.1|1853489_1854287_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209972.1|1857769_1858336_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036776381.1|1858335_1859379_-	type IVB secretion system coupling complex protein DotM/IcmP	NA	NA	NA	NA
WP_016209954.1|1859384_1859909_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209953.1|1859930_1862237_-	TraM recognition domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209962.1|1862283_1862523_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209958.1|1862524_1863652_-	type II/IV secretion system family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209964.1|1863651_1864404_-	dotC-like type IV secretion system protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307320.1|1864396_1864903_-	DotD/TraH family lipoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_016209959.1|1864927_1865335_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556635.1|1865362_1866370_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155064797.1|1866428_1867334_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209955.1|1867340_1868534_-	conjugal transfer protein TrbI	NA	NA	NA	NA
WP_155047125.1|1868530_1869457_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209960.1|1870074_1870227_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211310.1|1870431_1871145_-	phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase	A0A1D7SEW9	Cyanophage	2.2e-39	39.1
WP_016211308.1|1871220_1871499_-	lipoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_032126213.1|1871543_1872434_-	4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016211307.1|1872518_1872992_+	peroxiredoxin	NA	NA	NA	NA
WP_016211313.1|1873127_1873649_+	AAA family ATPase	NA	NA	NA	NA
WP_016211309.1|1873689_1874484_+	DUF2975 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211305.1|1874486_1874768_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_155047124.1|1874764_1875742_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211312.1|1876447_1877194_-	transporter substrate-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|1877315_1878377_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036780082.1|1878920_1879826_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212000.1|1879956_1880685_-	peptidoglycan editing factor PgeF	NA	NA	NA	NA
WP_016212002.1|1880804_1881083_+	DNA-J related family protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556478.1|1881086_1881973_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_20

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20

>NZ_CP038962|1892764:1948197|DBSCAN-SWA
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MVNIASYYAKELASAEDACVFLGCKTPELWLECALAHQEILLIDHAQCEKKAATTALSMINRYSDHTDMVMRMSKLAREELRHFEQVLVIMKKRGIQYSTLSASRYAEGLRQHIRAGRVECLVDTLIIGAFIEARSCERFAALVPLLDTELAKFYQGLLASEARHFLMYLHFAKKVADESIDKHVERFRKIECNLIETGDEQFRFHSGVPRSLRAMEC

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211770.1|1900225_1901359_+	patatin-like phospholipase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209939.1|1907104_1908379_-|tRNA	serine--tRNA ligase	A0A1B1IVT2	uncultured_Mediterranean_phage	1.7e-90	51.2
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WP_016209944.1|1909391_1910819_+	aminodeoxychorismate synthase component I	S4VNU7	Pandoravirus	4.2e-42	29.8
WP_016209938.1|1910793_1911432_+	transglycosylase SLT domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209935.1|1912153_1913098_-	protein translocase subunit SecF	A0A1B1IVP7	uncultured_Mediterranean_phage	3.2e-38	35.2
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WP_016209930.1|1915008_1915362_-	preprotein translocase subunit YajC	A0A1B1IVR5	uncultured_Mediterranean_phage	3.1e-07	45.7
WP_036777579.1|1915400_1916516_-|tRNA	tRNA guanosine(34) transglycosylase Tgt	A0A1B1IVQ4	uncultured_Mediterranean_phage	4.8e-94	48.9
WP_016209932.1|1916698_1917739_-|tRNA	tRNA preQ1(34) S-adenosylmethionine ribosyltransferase-isomerase QueA	NA	NA	NA	NA
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WP_016209926.1|1918772_1919834_-	LPS export ABC transporter permease LptF	NA	NA	NA	NA
WP_016209931.1|1919945_1921418_+	leucyl aminopeptidase	Q6GYZ8	Mycoplasma_phage	7.9e-44	30.4
WP_052104625.1|1921570_1922014_+	DNA polymerase III subunit chi	NA	NA	NA	NA
WP_016209940.1|1922089_1924861_+|tRNA	valine--tRNA ligase	A0A1V0SK04	Klosneuvirus	1.8e-150	39.3
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WP_016209947.1|1926273_1926936_-	carbonic anhydrase	NA	NA	NA	NA
WP_054300405.1|1927457_1927958_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_155047119.1|1932473_1933796_-	group II intron reverse transcriptase/maturase	A0A0N7AE80	Bacillus_phage	9.3e-12	24.3
WP_081007042.1|1934204_1935020_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300406.1|1937573_1940309_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|1940609_1941671_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126856.1|1941731_1942073_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556499.1|1942377_1943531_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.5e-58	44.2
WP_155049815.1|1943713_1943866_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|1944165_1944531_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|1944476_1945052_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212005.1|1945390_1947151_-	gamma-glutamyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210592.1|1947540_1948197_-|tRNA	tRNA-(ms[2]io[6]A)-hydroxylase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_21

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21

>NZ_CP038962|1952745:2066466|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126362.1|1971743_1972109_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274672.1|1972146_1972740_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_22

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22

>NZ_CP038962|2084219:2126854|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23

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MKRSKLTESQIVAMLNEGQAGVKVEDICRQYGIAKSSYYKLRSKYQGMGVSDLQRLKELEDENRRLKQMYADISLEHKVLKDIVEKKL
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MKQSIKNILNNVNSLGKDTKSALTKIQTALSHETKENKQMLETYAFYLAGKTTKEEMKHANEQFRQLLKTLGLGTFLVLPGRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
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MDTSLIGLFCIVDDFCQVFLPHWKASLLEHQDKQRNKPSRMSTSEIMTIMIYFHQSHYRNFKHYYQREVQGHLKKYFPKAVSYNRFVELMPTILLPLCFFIAAQRKTPTGIYFVDSIVLRVCHHKRSHQNRVFKGLAKKCGSTMGWFYGFKLHLIVNDMGELMAFKLSQATTDDRVVLPEIAQGLTGKIIGDKGYISQDLFNRLYEKGLQLINKIRKNMKNRLMPIIDKILLRKRGIIESVFDQLKNISQIEHSRHRSVNNFMVNILAGLAAYCLQEKKPSLNIQRNLLTN
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MLSTPWLAASVITLPLIIMLGKKFGIHLLPEFFHKQFPEIKPEDIDKYNQK
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MLQLNTTIYQHLAQYAKQMDLALFHLTLDGYILDISPSSSALFNNNHYYHLINKNIIDVLLYFGIENNLSIKKGKLKTAKKNLFLNLTLIHNSKNQSPYFILSVNIHAIFKSTLSIYTIIDSIPYPVYCKDENSQYIFANPALNSYAGKNIIGLTDFDSPWAATAKSLISNDQLVINNNKAIMVIEKLANYKGNKQITYSIKSPIYNKESNKVIGVFGISIFNCYQTMTNTNGEVSLSIGLDLSVREVECVNLLIQGFSSTEISKKLNISNRTAQDHIKNIKHKMNCPNLFKLGYILGKHFSHLLHY
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MSRAEDLDQLIIKTKKAQRVFADFTQQQVDEIFRAAALAVNRARISLAQDAVDETQMGLVEDKVIKNHFACEYIYHKYKDEKTCGILSEDSEFGIIRIAEPVGLIAAVIPTTNPTSTAIFKALIALKTRNGIIFSPHPRAKRCTSRATKIILDAAVKAGAPENIISWIDEPSVTLSDQLMHHRDINLILATGGPGMVKAAYSSGKPAIGVGAGNTPVVIDETADIKRAIASIIMSKSFDHGVVCASEQAVIVVDEVYDEVKTCFASHGGYILSIEEVEKIRDYIFKDGHLNTEIVGQSASKIAMMAGISIPDYTEVMIGECEVL
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MEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_036777115.1|2149259_2149460_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209891.1|2149601_2150300_-|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit type 1 TsaB	NA	NA	NA	NA
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WP_122940402.1|2151330_2151954_-	porin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126745.1|2152162_2152765_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_105962625.1|2152836_2153722_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_105962625.1|2153945_2154832_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075273603.1|2154911_2155088_+	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016212526.1|2155211_2155745_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047105.1|2155915_2156797_-|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	3.4e-50	41.1
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WP_032126686.1|2157364_2157949_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274681.1|2158499_2159375_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_026063519.1|2159423_2159840_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016210465.1|2160126_2160969_-	NADPH-dependent 7-cyano-7-deazaguanine reductase QueF	I6XGV6	Vibriophage	5.2e-32	35.3
WP_016210463.1|2161019_2161367_-	cupin domain-containing protein	A0A1V0SH58	Hokovirus	9.2e-20	42.1
WP_016210471.1|2161557_2162445_+	ROK family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210467.1|2162559_2163162_-	HAD family phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016210468.1|2163158_2163878_-	TIGR00266 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_052104601.1|2163946_2165659_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036777098.1|2165806_2167744_+	AsmA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126596.1|2167852_2168905_+	A/G-specific adenine glycosylase	NA	NA	NA	NA
WP_016210461.1|2168904_2169180_+	oxidative damage protection protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210458.1|2169260_2169809_+	DUF2147 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307322.1|2170082_2170262_-	DDE endonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_155047104.1|2170265_2170547_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2170603_2170969_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047103.1|2171084_2172206_-	iron-containing alcohol dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_155049817.1|2173000_2173887_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036780722.1|2173948_2174923_-	aldehyde dehydrogenase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210459.1|2175087_2175606_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047101.1|2175810_2176929_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211720.1|2177176_2178100_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211716.1|2178113_2179037_+	PAS and helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036778439.1|2178984_2179641_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211719.1|2179943_2180771_+	class II glutamine amidotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_155047100.1|2181211_2181571_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047099.1|2181715_2181871_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126590.1|2182063_2183596_+	nuclease	NA	NA	NA	NA
WP_032126591.1|2183658_2184996_-	N-succinylarginine dihydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210313.1|2185138_2186605_-	succinylglutamate-semialdehyde dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210314.1|2186601_2187651_-	arginine N-succinyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_036778435.1|2187774_2189889_-	ATP-dependent DNA helicase RecG	NA	NA	NA	NA
WP_016210305.1|2190053_2190458_+	acyl-CoA thioesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016210308.1|2190518_2191244_-	ribonuclease PH	NA	NA	NA	NA
WP_016210307.1|2191329_2192220_+	YicC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126592.1|2192260_2192881_+	guanylate kinase	A0A143DIC6	Abalone_herpesvirus	2.5e-20	36.3
WP_016210310.1|2192941_2193148_+	DNA-directed RNA polymerase subunit omega	NA	NA	NA	NA
WP_016210316.1|2193169_2195323_+	bifunctional (p)ppGpp synthetase/guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase	A0A2I2L310	Orpheovirus	1.1e-12	37.1
WP_054300439.1|2195329_2197312_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036780594.1|2197583_2198066_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|2198069_2198645_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2198590_2198956_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036780787.1|2199154_2200114_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300162.1|2200482_2201565_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1

Sequences of DBSCAN-SWA_24

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24

>NZ_CP038962|2205488:2250539|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_25

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25

>NZ_CP038962|2320727:2383069|DBSCAN-SWA
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MLSEHTKTIIKATAPVMKEYGLTITLRMYDIMFARYPKTKTLFNQTHQENKQQPRALANSIYAYAANIDNLDALSDTIELVAHKHASLNIRPEHYDIVAECLIQAVKDILKEAATTEIISAWTEAYTFLANVFINREEELYQYDRNKAGGWNGFRPFIITDKVKESTHVYSFYLRPQDNQPLIDFQPGQYIALRTHLNNTTITRNYSLSATDHSNHYRISVKREEQGQLSPLLHDQLNINDTVELTAPKGNFTLNNLEQTKQPIVFISGGIGITPLFAMLEKTLNTPASPQITFIHATENSKTHTFKNQLADYNSQHANLLKSYTCYHQPLAQDQCDLAGTINQDWLREKLPKSPADYYLCGSPLFMKHIFQQLISLGINEEAIHYEYFGPLEQMN
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MSACLYIVATPIGHLGDLTSRAIGVLKEVAVIAAEDTRHSKRLLQHFSIQTSMLTLHEHNEREQALALLARIKQGESMALISDAGTPLVSDPGYHFVRLAHELGVKVVPIPGASALIAALSVSGLASDEFRFVGFLPAKSSGRGQRLQSLSTDTATLIFYEAPHRICDCIVQMAEIFGAEREACIARELTKQYETIKKAPLAELITWLDSDSNQQRGEFVILVTGAEKKPEQALSVEDERIMGVLLEQLKVKAAAQLAAEITGKSKRDFYQYALSLKER
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MSNQNDRIVVLISGSGSNLQALIDTIHQNPEKVGHIVAVISNNADALGLQRAEQVGIETRVLSHQGFREREAYDTALLELIEYYQPKLIVLAGFMRILSAFFVAHFQGRLLNIHPSLLPKHKGLHTHKRALEAGDTEHGASVHFVSADLDGGPVIAQSYCQINPEDDEASLAQRVQDLEHVLYPQVVSWFIQDQLQWFNGSTLRLHGKELAQPLRI
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MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
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MQKPSLSYRDAGVNIDAGNRLVERIKHVAKATHRPGVMGSLGGFGALFELPTDRYKAPVLVSGTDGVGTKLKLALELGIHDTVGIDLVAMCVNDLIVIGAEPLFFLDYYATGELDVDVAASVIKGIGEGCLQAGAALVGGETAEMPGMYSAGDYDLAGFCVGVVEKERIVDASRVTAGDVLIALGSSGVHSNGYSLVRKILAVAGQGFETVLSESGKTLAELLLAPTRIYIKSLLPLFNQDKIHACAHITGGGLPENLPRVLPAGVSAKINTASWQWPEIFQWLQQQGGVETDEMYRTFNCGVGMVICVAREDVDDCLAQLTASGENAWVVGEMIDGQDQPVIFSE
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MNKELLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINHAINNQVKFDYTVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL
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MQGKSMRRFLYRLLFIALLLISQITLPVSFAIFLPNLFQADIPIEHNTQSERDLALGTALFGIITKITPSPLNSEQKKQLQQSPWRFVSSYTVKKATPLNTNTPTHAIEPLIFHVQINQQQLKAWLKEQNIAFWSNYRPLTLVWLSIDNDMQKLIVGDTDQLITQILNKTAKQYGIPLQFPKADVRDLEQVSANDIWNFNTTALKKASKRYRPDIILAGRIFPTTTGWEASWHLITNHHHQALTWRSASEHLSGVLKTATAKLAQTLAKLYQNSQEEHQLTLQVHGIDHLQQYRNLTTYLSQQHMISQVQTRSIAADRVTLSIISNVNPQQLLKTLALSRKLITIEDQASPASWLNFRWQG
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MAYINGEKNEHLESSGIFAQQITQRKSELKALTNRQLVSSIKHMDLASAMHHLQQHSNKSLSTNDQTPEPQAETQEKMPLNNSVASSFTAASHTSSPQQSCLFQQQQAEPTRDEAHQTKDKATKKCCTIM
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MPKYTFVPFEGENKSMPTLARRWRRGQYTIKEGARRSDWPKVRTYDKTSDQLSDIGPGDKLYIYAHGLIGTGQVRSTRHKVAESEYLTPEELADRLITSGLRRDSPQINLFMCESGRTYIGKGHPELEGTSIAGRFAARLSQQGFRNVTVIGYTQPLQPAIGPAVTLAGTTKLCSRYKEIRRTVDDSELVGPLRRAKEVQRRYTIDGDGHVMDSSTGEYSYRNNGPIRLPRHLFSRTFASSPASSSLYDSALRAVKTPLEEQIDKTPEPTTSSTLIFDHVAASDSGLYDSALRAVQTPLEEQIEM
>NZ_CP038962|2320727:2383069|2364787_2365081_-|WP_036794860.1|DBSCAN-SWA
MKKIALPDSLPKDTIGLDPIRGSDYTYPTRDDMELHTLTDNSTSEDKQVNILPLSFDFKYELAGKISEEAALLFLEEMTRSSIAPDACKETISFIPE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_129556571.1|2320727_2321438_+|tRNA	tRNA (guanosine(18)-2'-O)-methyltransferase TrmH	NA	NA	NA	NA
WP_017376619.1|2321466_2321871_+	RidA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036777168.1|2321895_2322855_-	response regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016209567.1|2322986_2323604_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_032126712.1|2324038_2324497_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209553.1|2325241_2326252_+	DUF475 domain-containing protein	A0A172Q0Y5	Acinetobacter_phage	2.9e-58	42.2
WP_016209566.1|2326736_2327648_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209545.1|2327973_2331468_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209551.1|2331505_2332345_-	16S rRNA (cytidine(1402)-2'-O)-methyltransferase	M1PLC5	Streptococcus_phage	1.8e-45	45.0
WP_036777155.1|2332531_2332747_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209547.1|2332795_2333371_-	ribonuclease HI	V9M0C8	Vibrio_phage	1.3e-29	46.6
WP_016209540.1|2333367_2333706_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209568.1|2333874_2334864_-	murein tripeptide/oligopeptide ABC transporter ATP binding protein OppF	G9BWD6	Planktothrix_phage	1.7e-18	32.7
WP_016209572.1|2334864_2335827_-	oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein OppD	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.7e-16	32.1
WP_054300271.1|2336782_2337757_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016212612.1|2337894_2338128_-	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_054300455.1|2338221_2338587_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556449.1|2338601_2339108_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212572.1|2339165_2339558_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|2339687_2340053_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300461.1|2340109_2340418_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|2340509_2341085_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2341030_2341396_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_080728364.1|2341548_2341821_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126774.1|2342429_2342765_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307356.1|2342924_2344457_-	apolipoprotein N-acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211407.1|2344489_2345329_-	CBS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211411.1|2345325_2345823_-	rRNA maturation RNase YbeY	NA	NA	NA	NA
WP_036779082.1|2345826_2346819_-	AAA family ATPase	A0A0S0MVD6	Pseudomonas_phage	9.3e-49	45.1
WP_155047091.1|2346933_2348280_-|tRNA	tRNA (N6-isopentenyl adenosine(37)-C2)-methylthiotransferase MiaB	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|2348503_2349565_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212287.1|2349643_2350789_+|tRNA	multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'-cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/2'phosphatase	A0A0F6YPT7	Sinorhizobium_phage	2.7e-60	41.7
WP_016211372.1|2356596_2357454_-	PIG-L family deacetylase	NA	NA	NA	NA
WP_016211371.1|2357440_2358364_-	badF/BadG/BcrA/BcrD ATPase	NA	NA	NA	NA
WP_036778204.1|2358560_2359952_+	sugar porter family MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211369.1|2359998_2361042_+	SIS domain-containing protein	F2Y1G4	Organic_Lake_phycodnavirus	5.2e-18	28.4
WP_016211370.1|2361084_2361528_-	Rrf2 family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211374.1|2361660_2362851_+	NO-inducible flavohemoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_016211373.1|2362905_2363052_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212140.1|2363602_2364520_-	EamA family transporter RarD	NA	NA	NA	NA
WP_036794860.1|2364787_2365081_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080664878.1|2365157_2365352_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300462.1|2366370_2367288_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210876.1|2367753_2368596_-	isopenicillin N synthase family oxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210873.1|2368663_2369314_-	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	4.1e-21	36.6
WP_016210874.1|2369328_2370369_-	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	Q58MH8	Prochlorococcus_phage	1.5e-68	44.0
WP_016210882.1|2370491_2371577_+	DUF2066 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210872.1|2371603_2372713_+	AI-2E family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210871.1|2372729_2373047_-	multidrug efflux SMR transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210879.1|2373043_2373403_-	multidrug efflux SMR transporter	NA	NA	NA	NA
WP_080664847.1|2376734_2377688_-	LD-carboxypeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|2377760_2378822_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212048.1|2379585_2380143_+	disulfide bond formation protein B	NA	NA	NA	NA
WP_032126664.1|2380336_2381020_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126663.1|2381738_2381981_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300237.1|2382007_2383069_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_26

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26

>NZ_CP038962|2472962:2555673|DBSCAN-SWA
ATTAAGCAGCTAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGATTTTGGGCACAGATATTCTGTTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATGCGCATCGCTTCCATTATGTCAATGGTAGGCCGTGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGGAAACGGGATTTGCGCTTTACCGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAGTTGTTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACACTGACTAGAAAAGACACCTTCATCTTTGGCTTTTTGGTGAGCGGGTGGAAATGAAGCGTGCTTGTCGACATTCACAACACGCGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCGATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCATCGCCGCTTTGGCATTTTGCTGTCGGCTGAGCATCCAGTCCAAAGTATGGCCATATTTATCAATGGCTCGATAAAGGTAATACCAACGACCTTTGATTTTCACCAACGTTTCATCTAACCGCCAAGAGGCACACGTTTGACGAAAGTGGGGCCTCAGCCGTTTGGCGATCTGCGAGCCATACTCGTGCACCCAGCGACAAATGGTTGAACGCTCAATCTCAAGACCTCTTTCAGCTGCTATTTCTTTGAGATCACGGTAAGATAAGGCATAGCGGCCATACCAACGCACCAGCCAAAGAATGATCTCACCGGAATAATGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTCTACCCACAGCAATTCACTCTTAACTTCCGTTGATTGCTACACCCTACTCAAATCTAAATTTTTTGCAACAGTGCCAAAATAATAGCATTATACAGATTAAGGCCTAAAATATACTTTGTTTGCTGTATTATAAAAAATATCTTCATGTGTTATTTGAGGTAGTTTATTCATTAATGTTTCTTGCCATAGTGTATAGTGATGGTGATTGTCGACAGGAAAATTAGAGCCATAGCATAATCTTTGGCTTGGTATATTAGATAAAATAGCGTCTAAGCAGCTATCTAGTGCTTTTTCTTGGCTATTTATCATATAAAATCCTGAGAGTTTTAAAATAATATTATTATATTGAGTGATTTCTTTGATTAAGTCATGCCAGGCTTGCATTTCTTGGCTAGATTGCGTGAGTGGCAAGGCCATATGCTCGATGACAGTGGTGACTTGAGAGTCGCTGATATTGTCTAGTATATTAAGTAGTTGGCTCGCGTACATTTGACATTCAAAAATATAGTGATGACCTTTTAATAAAGTGAGTTTTTGGGTCAAGTTTTTAGGGAGGTGATGATATTGGCAGGGTGAGTAGGTAGACTCCGTGTGGTAAGACATAATTTGCCGAATGCCGACAACTTTTGAATATTTTTTGAGCTGATTAAGCTGTAATAAAAAATGATTACTATCAACGTAAAAATCTCCACAACCAATATAGCGCATATGGTATTGGCTTAATTGATTTTCTAACCACTCTACTTCTTTAATGATATTAATTGCTGAATCATGGGCTTCGATATGAACGAATTGCTTGCATGGTAATGCTGTTGGGAGAAAATCTTGCTGTAATTCTTTTTTTTCGTTATATACCCATTGGTTAATATTGTTTTTTAAATCCCAAAAATGAATATGGCTATCGATGATAGTCTTCATATCTATGACTTACCTCCTAATTTTTATGTCAATTACAAATCAAGAGGTGAGTATAGCATTAAGTGAGTACAAGCGGATGAGAGGCTAATGGGCCGAGCATTATTTACTGTATTGTTCATGCCGATTGCCGATTTACAAAATCAGAGCTAGCTTGATTTACTTTGACCGGCGACGATTTTATCACACAGTCCTTTAGGCATCATAATCCATTCTTTTTTATCACCACTGGCTTTGGCTTGACCTGCGCAGGCATGGTGAGGGGTTGCGCAGTCATTTTTCCCTGCTTTGGCAACGCCATAGCATTTTTCAGACTTGGCAGCATGGGTACTGGTAATTGTGCTGGTTAAGCTTGCAGCAATTGCGGCGGCGATGGCCAGTGACAGTGCTTTTCTTGTTGCCATAATAATCATTACTCCATAACTAAAAATGAAAGCGGCGTGGCTTATTTGGAGTGTAGTTGATAGTTTAGGTTATTTTTAGTTGGTGTTGTTATGGTCTATTAAGTTGTCCAATAAAGCACAGGAATTGCAATGATTAAAAAAATAACCGTCATGACACTGCCAATTTTAATAAAATCACTGATGCGGTAGCCTCCAGGGCCAGTGATCAAGGTGTTGACCTGGTGGGAGGGTAATAAGAATGAATTGGATGCACAAACAGCAACAATTAAGGCGAATAAGCGCGGGTCAGCGCCAGTTTCTGTAGCTAGGTGAATGACGATGGGAACGAGTAAGAGTGTTGCTCCAACATTGGTCATTACCAGGGTGGCAAAGGTCGTAATAATACCGATTAAAAACGCGATTTCTAAGGTTGACCAGCCATGCAATAGGTCAATGATGCCTTGGGTTAGCCACTGTGCTGTTCCTGTTATCTGCAAGGCCGTGCCCAAGGGGATAAGCCCGGCAAGCAAGAAAACTGTACGCCAGCTGATCGACTGATAAGCGCTTTCTATCGGAATACAACCGGTGACAATCATAAGCACTGCGCCGGTCATCAGGCTTAAAGGTTCTGGTACTGCAGGTAAGATAACCAGGACGAGAGTAAATAGTGCAATGGCCAGTGCATACCAGCGTTTTTCTAGGTGTTGGTGTTCTTTTGGGTAGTCACTGGTGATGACGAGGTAGCTTTCATTTTTTTCAAGTCGGCTTAAATCTTGCCAGGGTGAAAATACCCCTAAGGTATCGCCAGCGCGTAAAGTCATTGCCTTCATTTCATCGCCTAAGCGTGAGGTTTTACCACGTAGTACCGCAAGTAGTTGTAAGCCATGCGTACGGCGCATTTTTAATTTTTTGACTTGTTGGCCAATAAGGTCGGAACTGGGTGGAATAACAACTTCACTGAGGCCTGTTCGTGCGGGGCTTAGTACCTCAGCAAATTTCTTTAAGCGCGGCTCGATTGCAAGATTAAACTCTTTGGCAAAATCGCTAATGCGCTTTTCATCAGCGAGGCAAGCGAGTTTAAAGTGGGCTTTTAAAATACTTTTGCGCAAAGGCGGGGAGGTGATTTCTTTTTCATTATAAAGGCCAATGATGGCAATATTATTATGAATTTTAGTTTCTAGCTCTTTTAAAGACATACCAATGAGTGGGCTGTTGGGGGTAATGGTGAGTTCAAAAAACTGCCCACCGATACCGTAGGTGTTGCGAAAGTAAGTTTTACGCACACCAAAACGTTTTTCTTTCGTAACAGGGAGCCAGTGGCGCGCGAAAAGAGCAAAAAATAAAACCGCTGCAATCAGTAGAGTAAGACCAACAGGGGCAACAGAGAAGAGGTGGTATTGCTCGCCGTGTCCAGCTGAGGCCATGAATTCGTTGAGAATAATGAGTGGCCCGGAACCGACCATGGTGACTGTGCCGCCAATAATGGCACAAAAGGCCACAGGCATCAGCAGTCTGGATTTTGAAGTTTGTGTGCGCATAGAAATACGACTGATCACTGGCATCAAGAGGGCAACTGCACCGACATTACGCAGAAAGCTTGCAAGTAGTCCAGCACTAAATGCGTGGGCGGCAATGAGACGGGATTCACTGCGCCCCCCTAATTTTAAAATCAGTTGTGCCAGGTAATTGGATAGGCCAACACGGTCGATTCCAGCGCCAATAATCATGACCGCAATGATGGAGATAATGGCGCTGCTGGAAAAGCCGGCAAAAGCTTGTTGCGGGCTTAATATGCCAGATAGGCCGAGTATGGTTAAAACTAGGAGGGCTGTGACATCGGTTCTGAGCCACTCGGTGATAAATAAAATAATGGTGCAAACGAGGACAGTCAGGACAAAAATCATTGAAAGTGTCATGCGCTTATTCCACCTTGAATATTATATTTTTTCTTGGTCTCTTGCGTTAATTTTATATTTTATTATCTAGTTTCGCTTACTTTTTGATTTTTTTAAATAGTAAGTCCCAGGTGCCATAACCTAAACGTTGGCCGCGTTGTTCGAATTTGGTCAATGGCCTATAATTTGGCCGTGGGGTGTACTGATCAATGCCCGCGGTATTTTCAAAGTGACTATGTGCTGATAGCACCTGCATCATATGTTCAGCATAGTTTTCCCAGTCAGTGGCTAAGTGAATCACTCCTCCCATCGTTAATTTTTTGGAGAGTAAATCAATGAATGTTGGTTGAATTAAGCGGCGCTTATGGTGACGTTTTTTATGCCAAGGGTCTGGAAAGAAAATCTGCACTTGGCTTAAGCTATAATCTGGAATGCATTGTTTGAGAACTTCAACGGCATCGTCCATATAGCTGCGAATATTCGTGATATTTTCTTGTTCCATCTGTAATAACAACGAACCGACACCGGGACGGTGAACTTCTATACCAATAAAGTTATGCTCAGGCATGGTCTTTGCCATGGTCACTAGGGAATTTCCCATGCCATAGCCAATTTCTAAGGTGATTGGCTGGTGATTTGTAAACTCTTGAAGCGCATTAAAGTGACCTTCGGCGATGGTTTTGCCATAGTGTGGCCAGTGTTTTGCTAATGCTTGCTCTTGGCCTTTGGTTAAGCGGCCTTCACGGCGAACAAAGCTCTTGATCTTGCGTTGTATTTTTACTGTTTGAATATGAGGCTGGATTGGCGATTGAGTCATGTGAATTACTGCTCTTGTTACTTTTTACTTTCTTGAATTTTAACTTTTATTTATATTTGCTAGATCATTTTAAATGAAATCATTTTAAATCTTCTGAGCTGGATTGAATAAAAAAATTTAAAGATAGATGCACAAAAAATCCGCTAAGTCTAAATTAAAGCTGAGTGAGAAGTAGGCAGAGCCTAGTTTTTAGGCCCTGGTTTTTTTGATTTTATAGCGATAGTATCTAACAGGGCTAGGCCCTCGTCATAATACTTCATAAACTTA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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_054300202.1|2489270_2489999_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
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WP_087910645.1|2552690_2553844_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	8.9e-59	44.2
WP_075274943.1|2554129_2554654_+	helix-turn-helix domain-containing protein	Q9MBM9	Staphylococcus_prophage	1.5e-05	33.1
WP_129556588.1|2554844_2555012_-	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_075274944.1|2554956_2555673_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	3.2e-43	44.8

Sequences of DBSCAN-SWA_27

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27

>NZ_CP038962|2571014:2599201|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_155047223.1|2586971_2587217_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155047224.1|2590943_2591420_-	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_036778088.1|2591404_2592487_-	alanine racemase	A0A0P0YM39	Yellowstone_lake_mimivirus	2.0e-20	27.5
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WP_016210066.1|2596275_2596944_+|protease	modulator of FtsH protease YccA	A0A2H4JFM9	uncultured_Caudovirales_phage	3.6e-28	44.1
WP_032126425.1|2597387_2597984_-	outer membrane beta-barrel protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210052.1|2598004_2599201_-|tRNA	tyrosine--tRNA ligase	A0A2I2L594	Orpheovirus	8.2e-07	24.4

Sequences of DBSCAN-SWA_28

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28

>NZ_CP038962|2628417:2680869|DBSCAN-SWA
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MTETDQSSQELEFNENEHIAQRKAKLAEMRSQGVAFPNDFRPEHHAAQLTAEFDEKTKDELEALAYPVKVAGRIMLRRLMGKASFLHIQDSTARLQVYLRRDDLPEGQYHAFKNWDLGDIVAIEGVMFKTNKGELSVKASNLRLLTKALRPLPDKHHGLAEVETRYRQRYLDLIVNDESRNAFIIRSKVVASIRRFLTERDYMEVETPMLQVIPGGASARPFITHHNSLGLDMYLRIAPELYLKRLVVGGFERVFEINRNFRNEGLSTRHNPEFTMLEFYQAHADYHDLMDLTEQMLRTVATEVLGQAQVPYQGEVYDFDQPFVRMSMIDSILHFNQDIHREDLVTLASAIAVAERTGVKLKGHEGRGKVITEIFEATVEEQLRQPTFITEYPAEVSPLARLNDNDPFITDRFEFFCGGREVANGFSELNDPEDQAERFKRQVAEKDAGDAEAMHYDADYITALEHGMPPTAGEGIGIDRLVMLFTDSSSIRDVILFPHMRPQQDLRIDNKI
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MVASSSEADKTSATDSSSSLTASSPSLVASSGSLASSGAGFDEVDKADSASHLGSKSSLAASNSSLASSVNFGEELEGVMNNPFQCKESATLSFMRSNEGTRYSQTVRLALRLMILDRVRRESHQAPFTSEMFDEMKDNLEKVKNINFPEVGKVEFAKKVGYLVTFSVGSAVFKYAALEDSKAKVKIGPVEMDPGSFFGTSSAVLGAMALDKAYELFHIMYPFWNISGQELERVVVEQMGDGPESEQKSGCLAKVACLTEVPYVELDIPEVELGTPVSGCSPCLFMAVKGQGASNDVAGNKDNSNGTREEREELQMVTSL
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MKQRTTKNVIITSLLIMLPLLNSANSIIGAVEHTKIPFIDESIRTRIDSGAKIGAISGFDLDIFNKSGKDYISFTFESPKGHIRHRFTLPIARYIHIKERRTQGSEQNKLAKRPVIVLPVCVGHTVKKVELSILDRRNFMYPILLGRDAIIKFNRLIDPAQRFITKPTCQESELTQ
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_036778479.1|2631640_2632366_-	D-Ala-D-Ala dipeptidase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210944.1|2636262_2637282_-	S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_29

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29

>NZ_CP038962|2741748:2799781|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_054300185.1|2745797_2746160_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_129556595.1|2747018_2747435_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016212036.1|2750494_2751343_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126284.1|2751787_2752498_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_036777788.1|2759215_2761051_-	penicillin-binding protein 2	NA	NA	NA	NA
WP_016210381.1|2761093_2761564_-	23S rRNA (pseudouridine(1915)-N(3))-methyltransferase RlmH	NA	NA	NA	NA
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WP_080664840.1|2761948_2762665_-	nicotinate (nicotinamide) nucleotide adenylyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210577.1|2768192_2768483_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036777784.1|2768548_2770147_-	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	1.5e-08	64.3
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WP_036777781.1|2770640_2772305_-	ubiquinone biosynthesis regulatory protein kinase UbiB	E5ERK4	Ostreococcus_lucimarinus_virus	5.4e-33	28.5
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WP_016210572.1|2777252_2779010_-|tRNA	arginine--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
WP_032126277.1|2779232_2779823_-	YihA family ribosome biogenesis GTP-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_155049840.1|2779911_2780331_-	DksA protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273416.1|2780471_2781086_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016212084.1|2784573_2785590_+|tRNA	tryptophan--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
WP_032126534.1|2785589_2786105_+	disulfide bond formation protein B	NA	NA	NA	NA
WP_016212085.1|2786146_2786620_-|tRNA	tRNA (uridine(34)/cytosine(34)/5- carboxymethylaminomethyluridine(34)-2'-O)- methyltransferase TrmL	NA	NA	NA	NA
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WP_032126362.1|2797624_2797990_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_105962623.1|2798628_2799781_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8

Sequences of DBSCAN-SWA_30

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30

>NZ_CP038962|2924641:2988770|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_30

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MPIIKPIKLDEGGVAHQNQDVVFATSGSYGDSLVSHAAIIARSNAGYGLFHTTGTSKESSVEARAALDQWLKELKEVLGSQITFTTMDPHNLSYLYQKGLEESCKKLGVSARFSSEGQVQISPRQPVGIDHSGIMVGGESLLRKIEQGPRQELFYEVEAAKPEGALEQGLRFIAEELVEQAEFSEPDPFAEQEPELPKEIKVDELEADLGQVLAIDNEVEIHQGPRLEGEEELYSSQKSSLVDAAALEEEKAGDLEDSLGQEVGLSEFHQGGDSAGLLGSAERLQKFAPEEEDDVFKSGWLAGDSFSLSLSSDELELQQTDGSELTEEFLESPESLQGDLATEWSGTFEPGRLDDNPFSLSSLSDEPEQCVTAEVSSECSEQLETLQEYVLEDVAVQEKSALVLMEDLLEEAILKEGAGLSAGEEPIIIKEGHFQPVSLELVEITDSCKLVSALSKLTQNTIAELEATVASASYFFSWNDPDSSKGSIKELKAFQMLLNAEGIDGSLNDKPIELIELAVGDYCANKVGCKDTQIISSFLKKVAKVLGNFRVAPCAGTSSVQDEDGGGWTRVGGISEVESAVDGWTNVDVVSSESEPAATGRAVMDEGDEFELVGQIPQSASLFQERHNAVDQQSSASNMSQSYPQ
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MKQKVKIKILSKKIGEDIALPAYGTVGSAGLDLRACLDEPVQLAPGQVSLIPTGLAIYLEDPNLAAMLLPRSGLGHKHGIVLGNLVGLIDSDYQGELKVSCWNRGSDHYTVEPGERIAQMIIVPVVQADFELVDDFAASVRGEGGFGHTGSH
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MEPLQQLLNTQDFITTTLEHIHSDFPPASTTLNNQTQVTLIDNGILAFEPLNNTKSQDKYDLILSSGIHGNETAPIELCNILVKELLSENLTAQTRTLFILGNPLAMQAEQRFVEHNLNRLFCGAYKNINDCYEKNRAQCLEKHVQNFYQNTHSLRLHYDLHTAIRPSHFEKFAIYPYLGTQQSYSKEQIAFLLDSDIHTLLLSHTPTTTFSFHTSNHFNAHGFTLELGKVRPFGQNDPNKLTRLKNNLTALISTGKLNQAASLDSLNAFTVHHALIKTSDDFKLHLGKDIENFSLLPSGATISSDKHDKYQVKNDDERIVFPNPNVPIGDWSGLILRPCELENKL

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211163.1|2927982_2928969_-	fumarylacetoacetate hydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211156.1|2930327_2931152_+	phenylalanine 4-monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016211160.1|2931468_2932473_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211155.1|2932681_2933647_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047242.1|2933785_2934661_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211698.1|2936277_2936706_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_033923654.1|2936919_2937411_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211702.1|2937466_2938717_-	malic enzyme, NAD-binding domain protein	NA	NA	NA	NA
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WP_036777591.1|2939495_2940350_+	SIS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210728.1|2940404_2940875_-	peptide-methionine (S)-S-oxide reductase MsrA	NA	NA	NA	NA
WP_016210732.1|2941259_2942639_-	phosphomannomutase/phosphoglucomutase	A0A127AWJ1	Bacillus_phage	5.1e-53	31.6
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WP_032126740.1|2943102_2944320_-	bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase CoaBC	Q9HH70	Methanothermobacter_phage	3.7e-39	34.2
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WP_016210731.1|2944997_2945960_+	alpha/beta fold hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210735.1|2946119_2947436_+	MATE family efflux transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210727.1|2947445_2948114_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210734.1|2948476_2950291_+	translational GTPase TypA	A0A1S5SF82	Streptococcus_phage	3.8e-24	45.1
WP_054300166.1|2950408_2951197_-	sulfite exporter TauE/SafE family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211544.1|2953539_2954340_+	ABC transporter ATP-binding protein	G3M9Y6	Bacillus_virus	5.8e-33	38.6
WP_016211545.1|2954442_2954931_-	dihydrofolate reductase	A0A1B2IDT7	Erwinia_phage	2.4e-29	43.7
WP_032126435.1|2955104_2955419_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375799.1|2956439_2956784_+	DMT family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210039.1|2963626_2964886_-	transcription termination factor Rho	NA	NA	NA	NA
WP_016210045.1|2965109_2965436_-	thioredoxin TrxA	A0A1J0GW78	Streptomyces_phage	1.5e-16	46.2
WP_052104566.1|2965630_2966581_+	Ppx/GppA family phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_032126434.1|2966638_2968705_-	polyphosphate kinase 1	NA	NA	NA	NA
WP_016210049.1|2968710_2969706_-	porphobilinogen synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210042.1|2970291_2971872_+	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210041.1|2972028_2973438_-	glutamate--ammonia ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016210047.1|2973497_2974631_-	cation transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210033.1|2974770_2975595_-	mechanosensitive ion channel	NA	NA	NA	NA
WP_016210034.1|2975822_2976452_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126431.1|2977902_2978751_+	pantoate--beta-alanine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016210037.1|2978878_2979919_+	succinylglutamate desuccinylase	NA	NA	NA	NA
WP_155047244.1|2979991_2981929_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300165.1|2982212_2982872_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|2983026_2984001_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_129556602.1|2985494_2985704_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_054300161.1|2987708_2988770_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_31

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31

>NZ_CP038962|2996655:3110575|DBSCAN-SWA
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Anti-CRISPR protein detection

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NZ_CP038962.1|WP_144019123.1|2740328_2741072_-|hypothetical-protein	2740328_2741072_-	247 aa aa	NA	NA	NA	No	NA
NZ_CP038962.1|WP_155047234.1|2741561_2741705_-|hypothetical-protein	2741561_2741705_-	47 aa aa	NA	NA	NA	No	NA
NZ_CP038962.1|WP_016212372.1|3054480_3054702_+|hypothetical-protein	3054480_3054702_+	73 aa aa	NA	NA	NA	2996655-3110575	yes
NZ_CP038962.1|WP_155047252.1|3054817_3055396_+|hypothetical-protein	3054817_3055396_+	192 aa aa	NA	NA	NA	2996655-3110575	yes
NZ_CP038962.1|WP_155047253.1|3055540_3055735_+|hypothetical-protein	3055540_3055735_+	64 aa aa	NA	NA	NA	2996655-3110575	yes
NZ_CP038962.1|WP_155046758.1|3088934_3089066_+|phosphatase	3088934_3089066_+	43 aa aa	NA	NA	NA	2996655-3110575	yes
NZ_CP038962.1|WP_155046759.1|3089210_3089366_+|hypothetical-protein	3089210_3089366_+	51 aa aa	NA	NA	NA	2996655-3110575	yes
NZ_CP038962.1|WP_155047254.1|3091403_3091541_-|hypothetical-protein	3091403_3091541_-	45 aa aa	NA	NA	NA	2996655-3110575	yes

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_054300283.1|1092599_1093241_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038962.1|WP_054300283.1|1092599_1093241_-|hypothetical-protein
MPQAYPTSNNEQQSNNFPPPSSTTSSSATASNLPLEQIKTQPASKTVKNLGDSITYDQLLHLIKQETQKSIFILAKKIKNAKLPFSTLFEDTSGRKTGIQVLEEFIKDILSHSNQGHPHQPLTQALGELVHERVKSFYEDDGKMKGRRKTETISMLFSEIKRMFQNITYANAAVSRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	1092385-1092422	0
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	1134336-1134373	0
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	1136897-1136860	1

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 1092385-1092422, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 1134336-1134373, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 1136897-1136860, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttgatccagcgct	Protospacer
***************************.**********

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_098082828.1|1141216_1141474_+|transposase

>NZ_CP038962.1|WP_098082828.1|1141216_1141474_+|transposase
MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	1092385-1092422	0
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	1134336-1134373	0
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	1136897-1136860	1

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 1092385-1092422, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 1134336-1134373, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 1136897-1136860, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttgatccagcgct	Protospacer
***************************.**********

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_098082828.1|1199974_1200232_-|transposase

>NZ_CP038962.1|WP_098082828.1|1199974_1200232_-|transposase
MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	1092385-1092422	0
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	1134336-1134373	0
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	1136897-1136860	1

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 1092385-1092422, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 1134336-1134373, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 1136897-1136860, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttgatccagcgct	Protospacer
***************************.**********

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_075273543.1|1443745_1443988_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038962.1|WP_075273543.1|1443745_1443988_-|hypothetical-protein
MYEYELSTECCTSDDGGRFPISLTLLLPALSFAFTMAPSRIITQNHYKMKKVSAESQSNNPLLREKQRIWFSNIKHPEES

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_155047156.1|1536252_1536876_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038962.1|WP_155047156.1|1536252_1536876_+|hypothetical-protein
MILTGPIGTAIGASLILITCGIQYWLNHYFLPKKEIQLATDPLELLHLKLDSHIDAQIAKFTKALDQLGEGSEKAQTELKLQTYMAAKAELESWQTMPDRNSHSDKLHQAMSLAMDASKICRRGNGAPSSYKALKAELKYFTVDWQDRYKQTQIKFNPLLKDFLSSSKIKPSAENDRMTSLIFQDSFIADGAVSGASGVFSAPASLV

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	1541318-1541281	0

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 1541318-1541281, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_155047155.1|1569530_1569680_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038962.1|WP_155047155.1|1569530_1569680_-|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGVSQLRSAKNPNLPRPTHPVLSTPWLAACAGFPG

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	1571086-1571049	0

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 1571086-1571049, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_032126537.1|1581710_1581896_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038962.1|WP_032126537.1|1581710_1581896_+|hypothetical-protein
MEKIERVYARDHGLSGNFKDIQFEKYCRDWLEPMRRKVNESTKLDDYVNPRVKSRLDGYLG

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	1571086-1571049	0

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 1571086-1571049, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_155047152.1|1582671_1583394_-|transposase

>NZ_CP038962.1|WP_155047152.1|1582671_1583394_-|transposase
MYEYELSTECCTSDDGGRYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCLWPVRKVSFRVSCSGIETTFPVITTTWFKTESSKHK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	1571086-1571049	0

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 1571086-1571049, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_016212013.1|1588164_1588548_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038962.1|WP_016212013.1|1588164_1588548_-|hypothetical-protein
MTINKRDFFDAINYADTAVQIHEYLLNILEKQQKDFAENCNNDNDSEKSKALASISDVELRFAQLDMLSAIYRKILLNTLNEIEGCNDQELKTIKNGLLHMVATTLEACVNDFTIEAKITIDIKEEQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	1571086-1571049	0

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 1571086-1571049, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_054300361.1|1601186_1601483_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038962.1|WP_054300361.1|1601186_1601483_+|hypothetical-protein
MTNNEIEGLTPQQEEVVLLKNLLLESLDKLINSCKKSSVVLDFLGLPDVRHDSRFKRIETLIDNLLEIDTGNIIDHPELTERYIEHSPYAQVINILIA

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	1571086-1571049	0

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 1571086-1571049, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_081377353.1|1601460_1602126_-|transposase

>NZ_CP038962.1|WP_081377353.1|1601460_1602126_-|transposase
MYEYELSTECCTSDDGGRFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGNGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	1571086-1571049	0

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 1571086-1571049, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_016211151.1|1608978_1609290_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038962.1|WP_016211151.1|1608978_1609290_+|hypothetical-protein
MKNYPHIDDIIDQVAKEFDCDRNRMAYEAFATDVKELIENEDFDCQTEEQARLELAKRGPHIINLYMEGLDGEDWLSQDYLPADINVTVVREFYKFVVNEEKK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	1571086-1571049	0

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 1571086-1571049, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_016210146.1|1694306_1694798_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038962.1|WP_016210146.1|1694306_1694798_-|hypothetical-protein
MHQKEQITELLECPQELTLVKIVLLAGLEKVIANCLDRQSVVKLKIAEFFRLEVEAITEGSDSDESLSAELASLKMDKLKDILKKAACAFHQKSGLFTAKSYQVAKPYFEVLRELFGISDVEWKGILAHEANLDCEELSLQFYNKYMANKDDMASPGHLPTRP

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_155046721.1|1696241_1696409_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038962.1|WP_155046721.1|1696241_1696409_+|hypothetical-protein
MKEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	1735035-1734998	0

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 1735035-1734998, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_036781272.1|1780809_1781028_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038962.1|WP_036781272.1|1780809_1781028_+|hypothetical-protein
MPMTTKERKRISNLLESWKTGKKKAAPNFDKLNLSEEGLTWAKAELEKLLSQQSKANTDLKQKLITHLTHRS

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	1802216-1802179	0

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 1802216-1802179, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_155047136.1|1781120_1781552_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038962.1|WP_155047136.1|1781120_1781552_+|hypothetical-protein
MHIFIDYFFLCYDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	1802216-1802179	0

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 1802216-1802179, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_016212421.1|1791885_1792068_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038962.1|WP_016212421.1|1791885_1792068_+|hypothetical-protein
MLLKDLRFSVLRLLSDLYNHEKSKDGSTNDLNFLTKCKREAEEANSKQEIADLLNTHLTH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	1802216-1802179	0

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 1802216-1802179, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_155047131.1|1794636_1795293_+|transposase

>NZ_CP038962.1|WP_155047131.1|1794636_1795293_+|transposase
MARSERKSNISKNEYFRNLINHAINNQVKFDYTVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDSEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	1802216-1802179	0

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 1802216-1802179, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_155049815.1|1943713_1943866_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038962.1|WP_155049815.1|1943713_1943866_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAAHENILLMLIKIKSINLCYKLNIINNKKRQYHTTFILLLFVK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	1944140-1944103	0
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	1932215-1932252	0

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 1944140-1944103, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 1932215-1932252, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_032126179.1|1980371_1980623_-|TSUP-family-transporter

>NZ_CP038962.1|WP_032126179.1|1980371_1980623_-|TSUP-family-transporter
MSTALAFPMGLFALTSLLVASAGMAGLPSGSVGYLYLPALIGLLIGSFLGSPLGVWMVKRVSEQTSVWLFRIVLLAVIMQMIH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	1982180-1982143	0
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	1972135-1972172	0
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	2048299-2048336	0
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	2062434-2062471	0

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 1982180-1982143, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 1972135-1972172, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 2048299-2048336, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 2062434-2062471, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_155047097.1|2202948_2203632_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038962.1|WP_155047097.1|2202948_2203632_-|hypothetical-protein
MGEIFVPKFNLLSVTGDQETVDNLLLSVKKRLYDKGTPLKNCYFNLQGQLLAEGWVYDSKTLIEVDLGGELKPEWYNEALSTAIEKIKKTEVSDKNYPAVNAHMLPFLKAYFFSYIEKALAKIDEEEGSLVQKLNAKLSFLSTLKSSFRAKFSGEWAHQFYFDHSSALNEVAGFDSEGECPQSYFALFNAFEAVGNKDRKAVTLALTLDKFSSTQVVCDNREIFSTE

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_129556569.1|2249453_2249663_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038962.1|WP_129556569.1|2249453_2249663_+|hypothetical-protein
MTNFVHASEFTFQQDDGLINDDWVRLVQPSLPLGTQINSLALTQAGDTLYINTQSVGSFLCQGDIALNE

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	2244648-2244611	0

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 2244648-2244611, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_016209540.1|2333367_2333706_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038962.1|WP_016209540.1|2333367_2333706_-|hypothetical-protein
MSYPALIQQIDKLSKKYGFERHKMRFISGITDAETLAAERKLSHADAEGLIQQHGINGIWLAWLTDDGLLIEDECFKYIDELLAMPSYAEEWFDLVNGHEEIQKKEAQGLDK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	2338196-2338159	0
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	2341422-2341459	0

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 2338196-2338159, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 2341422-2341459, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_016209990.1|2739891_2740296_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038962.1|WP_016209990.1|2739891_2740296_-|hypothetical-protein
MYILVCYGGYPYHAAYVVAIFTGGSFVTQEVYAGDIDSLRLKVKGDFRIYKDLESFFDRSIECMQNKKAQIIILKPAIESNFSNLLIFESVIRKTRQSTLLMYESMEVDEEAPLVAGAEAMLHYYSELLRCTKQ

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_144019123.1|2740328_2741072_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038962.1|WP_144019123.1|2740328_2741072_-|hypothetical-protein
MLKNLKELIKEYNIQTIDALEQLKSDLLRESDSREFCKKYGIDYSPIEFTFHQGFYFLFNAANELNDQYPNDRNLIAYFTYRLSSQQQKAFEPVTNMLEIAKLAEDKIEGDCQLLEQGGNQPKAIKTFKEKAIKAVYKYVESTLAGPEHSNKAREEYQQSIKNCSEECKAALDDSSCERLRKVLKVLVNFLTHISLVGIVANIYHKHTTGSWLLFERKKESYDIQENLHGIQKISESAMQVNLYLSA

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_155047234.1|2741561_2741705_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038962.1|WP_155047234.1|2741561_2741705_-|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGEAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_016212372.1|3054480_3054702_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038962.1|WP_016212372.1|3054480_3054702_+|hypothetical-protein
MAKYHALFLQQDKHMHNLLQATPLPLELDHEIVEFSIGQGPCQQLGKCSDLLYQHATNPEPESTTTTGCCAVL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	3000725-3000762	0
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	3011585-3011622	0

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 3000725-3000762, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 3011585-3011622, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_155047252.1|3054817_3055396_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038962.1|WP_155047252.1|3054817_3055396_+|hypothetical-protein
MNFIIDFFKGQHQDHQKVLLPLASIKEDVVNAVDREKLTISPKDQYEFSLIRTNELFLEKIRALNLFDNIEDYLSAYNNIVAWDPKATESFSPPYLVAIQGAFLECCHESFKKKINISKEHSTEILANKWLYTAIMTVQQQSTAIEENYTTIKQRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	3000725-3000762	0
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	3011585-3011622	0

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 3000725-3000762, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 3011585-3011622, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_155047253.1|3055540_3055735_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038962.1|WP_155047253.1|3055540_3055735_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAAIVANILRLRHLHSTQTAENQTIINDYSATVFRLFGEYCSKKIDNSALRHLKCNTQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	3000725-3000762	0
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	3011585-3011622	0

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 3000725-3000762, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 3011585-3011622, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_155046758.1|3088934_3089066_+|phosphatase

>NZ_CP038962.1|WP_155046758.1|3088934_3089066_+|phosphatase
MFYCMRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	3000725-3000762	0
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	3011585-3011622	0

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 3000725-3000762, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 3011585-3011622, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_155046759.1|3089210_3089366_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038962.1|WP_155046759.1|3089210_3089366_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAAPEKYSPPSKTCLINSTIKLFQRVKPHWDYNQKNVYTCKAATT

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	3000725-3000762	0
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	3011585-3011622	0

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 3000725-3000762, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 3011585-3011622, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038962.1|WP_155047254.1|3091403_3091541_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038962.1|WP_155047254.1|3091403_3091541_-|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGVSYSNLLMSDNFVISYKVYDDFIAVIIIL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	3000725-3000762	0
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	3011585-3011622	0

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 3000725-3000762, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038962 position: 3011585-3011622, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. NZ_CP038965

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	6445 : 19646	15	Erysipelothrix_phage(25.0%)	terminase,transposase,protease,head,tail,capsid,portal	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038965|6445:19646|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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>NZ_CP038965|6445:19646|8470_8866_-|WP_016211139.1|DBSCAN-SWA
MPKMSFSVEGLRELEQKLKTLEPKKIRNLNRRALRKAAEPVEAQMKANAPQKSGALAESIKRRSKKGKGRRTIVNVTVGPARKIQYAIEQEYGSSHQPARPFIRPALNDNAQTSIDIFKNALTLALKKQKL
>NZ_CP038965|6445:19646|18671_19646_-|WP_054300271.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300271.1|6445_7420_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7
WP_155047317.1|7554_8391_+|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.9e-42	36.7
WP_016211139.1|8470_8866_-	HK97 gp10 family phage protein	Q7Y404	Yersinia_phage	2.1e-07	40.7
WP_016211132.1|8858_9182_-|head	phage head closure protein	A0A1W6JP44	Morganella_phage	5.0e-12	39.8
WP_016211137.1|9178_9490_-|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	A0A2H4J711	uncultured_Caudovirales_phage	1.1e-08	34.7
WP_155047318.1|9680_11015_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211140.1|11135_12329_-|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	2.7e-66	40.1
WP_080664855.1|12386_13058_-|protease	Clp protease ClpP	Q8VNN5	Enterobacteria_phage	3.0e-43	44.8
WP_155047319.1|13005_13626_-|portal	phage portal protein	A0A2K5B287	Erysipelothrix_phage	5.5e-39	50.9
WP_052104629.1|13828_14854_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047320.1|14984_15707_-|portal	phage portal protein	A0A2K5B287	Erysipelothrix_phage	2.6e-40	40.8
WP_155047321.1|15703_17386_-|terminase	terminase large subunit	A0A1P8DTK0	Proteus_phage	6.9e-137	45.7
WP_016212234.1|17388_17868_-|terminase	P27 family phage terminase small subunit	NA	NA	NA	NA
WP_155047322.1|17944_18337_-	HNH endonuclease	A0A2D1GNP5	Pseudomonas_phage	4.4e-26	47.2
WP_054300271.1|18671_19646_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7

3. NZ_CP038964

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	2671 : 47766	57	Streptococcus_phage(13.64%)	transposase,portal,integrase,tail,capsid,protease,head	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038964|2671:47766|DBSCAN-SWA
GTTAGAACTTAATGAGCTGCATGGTCGCTAGGGCTTTGTGGTGCTTCATGATTACTGACAAGCGTTGCTTTGGACGCCCACCGGTTAAAAGCATTTTGCTACCACAAAGGATGCACTCAAACGGGTCAGTGTTGATAAAGCCTTTGAGGAGTGATGCATAAGTGATTTTTTTAACCGGCTCTACCGTCTGGTCCAGTAACTTATAAATTGTTGGCAGCAGCTTTCCGCGGGTGCGAAAGCTCAAGAAGCCGTAATAGCGGATCATCTTAAATGATTTAGTGGGGATGTGACGGATTAGACGCTCAATAAACTCAAATGTTGTACTGGTGTGCTTTTCCTGCTTACCCGTTTTGCGATCAATATAGCGAAAGATCACTTCTTTGCCATCATAGTGCAGTAAGCGTGAATTTGAGAGTGGCGGTCGCTTTAAGTATCGACCTAAATAATCAACGTTTTGGTGGTGTGAAGGCTGAGCTTTTGCAAAATGGACATGCCAGAGTTTATTGTATTCTGGGTTGATGAATCGATTAAATGATGTGAGGTCAGTAATGTGGTTTTGATATTGATGAGGAATCACGAGTTTCCCTGTTTTGTAAGCGGTGCGTAATAAATTAACAATCGAAAACCGCCACATTGGCATCGTTTTTTTCTTTGTGAAATAAACTTTCTTCCAGGTTGTCTTGCACTTAGATAAGCCACCACGTGTCACTGATAAGTGGACGTGCGTATTCCAATTTAAACTCTGGCCGAAAGTATGCAGAGCTGTGAATATACCGATCTTAATTTTTTTCTTCTTTGCAGTTTTGAGCAGAACATTTGCGGCGAGTCGTGATAGATGATTCAGTAGCTCACGATTAGCAAGGAAAAACGGGCAAAGTGCTTTTGGCATGGTGAATGTTATGTGCTGGTATTCGCACTTTGGGAGTAACTTATTCTGTGCAGCAATCCATTGCTCAGTGGCTTTTTTCCACATGAGGAGCATAGCCGTGATTTGCAGGTATAGGTGACGACTTTGGTGTGTTTGCATCCTGAGTTAGAGCAACTGTATTCATCATGACCTGCAAACTTAGTTCTACAGCTGAGCATTTTCACGACGACTTCAACCACAGAGCGAGGAATATTATCGCGATTGGCCACATAGTAGCGCCACCAAGCTCTGCCAGTTTGGAAAAGATGTTTAAGCGTGAATTGAATCAAACTAACTATCTCATTGTGTTGATTAACAAGCGATTAATCATACAGACAACGATAAATTATACAACGGCCCTCCTAAAGTCGCGAGCTGTACTCAGCGAGCCTATCCTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCTATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATGGCACTGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTAGGGTGTAGTAATCAACGGAAGTTAAGAGTGAATTACTGTGGCTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCACTACTCTGGTGAGATCATTCTTTGGTTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTGGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGCAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCCCATTTAGTTCTTTTGCTTGCTTTTGAGCTAAGTTCTTTAATTTAGTATTTTTTTGCACTTCAATTTTTTCTAATAATTTCGCACGCTCTTCTGAGCCTTTACGCGTGGCGTCTAAAATAATGCGTTTTTGCTTGTCATAGGAGTGTTTAATGGCTTCCTCTTCAGAAAGTAAGCGCTCTTTTAAGCTATCAAGTTGCTTTTGATTGTCCTGAGCGCGCAGCGAGGCGCCCATTAAGGCGGATTTTTCTGGCTGTGATGCTCTTATTTTTGCATCTAAGGCGGCGGCTTTTTCTGCAATGTCATCAAAATAAGCATCAACGCTTTCAGTGGGTCGTTTTGAAAATAGAGTTTGATAAAGCTGTGCGAGCTTTTGATTCACATTATTCGCACTTTCTTCTGCGATGTTTAATCCGGAGGTATCGAGGGTAAAACGTTCGGAGACACTGGCTTTCATGCGCGCTATGGATTGACTAAGGCGCTCAAATTTATTACCAACGATAGGTAATGTGGCTCCGGCTTCTGCTATTTTTTGATATTGAGAGAGAGCGAAATTAATCCCCTCGCCCATTTTTTGATAGAACCAACTTAGCCCCTGAGCAATTGCAGTTAGGGATTGAATGGCCATATTTTTCATTACTGCAAAGCCTGCGCTAATAATATCAAGGCCGAGGTTGATGTAATGCACGCCATCACCGATCACAGCAAAGGACTTAGCTACAACACGAAACCCACTGAGCACATTACTGCTAAAACTACTTGCTGCGGTGCCGGCGTTAGTAAAGCGCGTGGTTAAATCCTCAATAATCGGCGCAAAGGTAATGGCGAGCTGGTGACTGACCCCCACAAAGAGCTGACGCATTTTGTACGCTGCATCATTGGCGGCCTCAACTTTTGCCGCATCAATGCGATTAATCGCAATGCCGAGCCGTGCCGCTTCACTGGCGGCTTGATCCAACCCTTCAGCCCCTAAAGCTAAAGTATTAACGAGGCTCACCCCTTCCGAATCAAACAGCTTAAACGCTAAACGCACTTTATCCGACTGGCCTTCGACATTTTCCATCGCTCGCGCGACTTCTTTAAAGGCGGCATCTGGGGAGAGTTGATTTAAGTGCTCAGCATCTAGTCCTAATTCAACCAAGGCTTTGCGTGCTTCACCCGTGCCTGCCGCCGCTTCAGATAAGCGCCGCGTCATCCGTTGTAAGCCCATATCGAGTTTATTTTGTGATACACCCGTCAGCTCTGCGGCATGGCGTAATCTCGCCAGTGCTTCAGTGGTGACCCCGAGCTTGTCCGAGGTTTTGGCGAGTAAATCAATCGAGTCACTGGACTTACTAATCATCACCGCTACAGCCCCCGTTGCTGCGGTGGAAACGGCGGCAAAGGCCAGCGTTGTCTTTTTCAGATTACGCTGCACTTTTTTAGAAAAGTTCTTGCTGGCAAGTTCTGCTTTGGTTAAAGATTTAACGAGTTGAGCGGAATTTGCACTTAAATTAACAACGAGAGAACCGATTGTTGCCATCGCTTACTGCCTTTTTGCAATTGCGGATAAAATAGCGGCCATGTCTGTCGCGCTTTGTGTTTTTTTCTCATCACCAGCGCTATAGTTCGGCATAAAATCATTAGGGGTAAATAGTGTTTTATCTTTGCGCTGCAAGGGTCCATTCACAACCGCGCTCACCATTAAAGCGGTGCGATGGTCGTCTTTTTCCACGCCAAACGGTTCCAGTGAGTAATACGCCAGCCACTCATTAAATTCAGAAAGACTAAGTTCCTGTGAGAGCTGATTCACCGTTTTGCCTAGCGCTAAAGCTAAACGAAATAAAAACCGTCGCTCATGATCATAAGCTAGTTTTTTTTAAGATCGTGCGCTGCACTTTCATTAAAGCCATTCACTTCAACAATCGCATCGGTGATTTGTTTAATAACGCCGAGCGGTAATTCAGCCAGTTTTTTATATTCACTGACATCAAAGATTTTAACGCCTTGGTGGTCACACAAAGATAAGCAAATTAGTAATAAACTGGCTTCAGTTTCGCTTAAATCAGCATGCTGCTGTTGATAATATTGCTGCTCGGCAATAGAGAGTTCTTTGACCTGTAATTCTAATTCGCCCAAAGTCACCGGGGCAGTTTTAAAGGCAAGATTAAATAAAGCATTACGGAGAGCCATTTTATACCTCATCACTTTGCGTGATCACGCTGGTCGGCTGCAAACTCACGCTCATGCTAATCGCTTCAGTTAATGGGGCGATGATTTTGTGATTGGTAATTAAGGCAGTAAATTCATAAATCTGCCGTTTCGGTTGGGTGGCCAAAATAATTTTAAACTGGCGCTCTATGCCGGTATCATGATCACTAATTAAATTTTTCAGCTCACTATTATCTTGGGCGACATTCATATCGAGCTGAATTTCATCATGATCTTT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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_075274761.1|7090_7414_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075274763.1|8184_8580_-	HK97 gp10 family phage protein	Q7Y404	Yersinia_phage	6.0e-07	39.1
WP_075274764.1|8572_8896_-|head	phage head closure protein	K7PH08	Enterobacteria_phage	5.4e-14	41.7
WP_075274765.1|8892_9204_-|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	Q8SBH7	Shigella_phage	2.5e-08	31.7
WP_155064811.1|9541_10105_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047306.1|10140_11307_-|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	1.2e-66	38.7
WP_081007077.1|11362_12034_-|protease	Clp protease ClpP	Q8VNN5	Enterobacteria_phage	5.5e-45	45.8
WP_054300593.1|11981_13223_-|portal	phage portal protein	Q6DMU2	Streptococcus_phage	2.7e-85	43.6
WP_155047307.1|13219_13816_-	hypothetical protein	E4ZFM0	Streptococcus_phage	2.0e-38	45.3
WP_155047308.1|13859_14834_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	8.3e-26	31.5
WP_155047309.1|14853_15783_-	hypothetical protein	A0A1W6JP18	Morganella_phage	1.5e-85	52.0
WP_155047310.1|16011_16494_-	hypothetical protein	Q9B019	Phage_GMSE-1	1.1e-13	33.3
WP_032126915.1|16580_16964_-	HNH endonuclease	A0A2D1GNP5	Pseudomonas_phage	4.7e-25	45.5
WP_052047121.1|17142_17544_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126916.1|17688_18159_-	single-stranded DNA-binding protein	L7TJL2	Pseudomonas_virus	1.5e-33	48.8
WP_155047311.1|18146_18449_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_033923627.1|18445_18733_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210963.1|18828_19068_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047315.1|19064_19412_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047314.1|19404_19767_-	hypothetical protein	R9TNL4	Vibrio_phage	2.9e-24	53.8
WP_036780304.1|19735_20272_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211080.1|20312_21299_-	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A0S2MVA0	Bacillus_phage	4.3e-14	45.4
WP_036780299.1|21337_21640_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211079.1|21794_22100_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211067.1|22309_23053_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211077.1|23185_23971_+	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300594.1|24403_25429_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036780005.1|25576_26224_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211069.1|26207_26639_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047030.1|26663_26807_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211075.1|27021_28263_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211068.1|28266_29079_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_080664851.1|29075_29885_-	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|30087_31062_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7
WP_155047312.1|31097_31439_-	toxin-antitoxin system HicB family antitoxin	K7PJX6	Enterobacterial_phage	2.0e-11	34.7
WP_027242955.1|31431_31692_-	type II toxin-antitoxin system HicA family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_016211925.1|32191_32977_+	ParA family protein	A0A0K2FLP4	Brevibacillus_phage	9.7e-17	28.7
WP_016211928.1|32969_33410_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126138.1|33960_34224_+	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300276.1|35154_36129_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	2.4e-25	30.8
WP_016212188.1|37218_37959_+	class I SAM-dependent methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_155047301.1|38136_38409_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273298.1|39029_39605_+|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	6.0e-08	26.6
WP_032126136.1|39670_40216_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_052104629.1|41249_42275_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047302.1|42928_44008_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212274.1|44538_45003_-	type II toxin-antitoxin system HicB family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_032126154.1|45013_45208_-	addiction module toxin, HicA family	A0A1X9I5T5	Streptococcus_phage	2.8e-10	48.4
WP_032126152.1|45423_46014_+|integrase	site-specific integrase	K4K6A1	Caulobacter_phage	1.4e-20	33.8
WP_081007075.1|46077_46419_+	MBL fold metallo-hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_155047303.1|46764_47766_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.3e-29	33.2

4. NZ_CP038966

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	10315 : 26969	20	Indivirus(18.18%)	tail,transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038966|10315:26969|DBSCAN-SWA
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MKKMIHGAGGGGGKGGGSTHTPTEAPNTLSTNAVVTLVDLLGEGEIEGLVNGAQSVYFDDTPLQNADGSYNFEGVTLKSNNGTPSQDYLPGFAESASEEAFNVKVTHEQPVIRTVGRQETNELRVKIGLDALTEYANNGDINGSSVHIRMYLNNVLVVNHEITGKTTSKLEQTFIIKISPGYYIADIETSDVVLDNLDEYFSWKRAGAHAITNNYYKPTHFTYPYTLKVERVTEDSDSSRVQNTVYLTSITDVIDTKLSYPNSAVVGLEFSAAQFGNQLPKRSYLIRGLKIQVPSNYDPSTRVYSGIWDGSFKTEYSNNPAWVFYDLLTNQRYGAGNYLVESDVDKWELYSIAQYCDELVPDGRGGKQPRFCCNLAINNQNQALNMITQLTSIFRGMAYDAAGTIQFSQDRPREPSMLITQTDVVNGQFDYQTSSIKELHSVCVVAFRNPDLNYSIDQEVVEDASRLARLGERRLEITAVGCTSRSQAMRQGLWALQSEAQSDMISYKATQDHIHSLPSDIVKIFDPNMDQEEGAAGVITAVTDNVVTLDREVSLSSQNTLMIFSAEQGIEEYTVIGAPGSRRLEIDRTIIADVGTRWVLYHATPPKQWRITAITEEDDGTYTVNAIAHDPDKYQKIDEERALGVSKENTAIPSLKAPSNYRVEQSVSYHGGIAEAVLIVAFDGDPNAAYYEYQVRSNDGNYSDVKTTHLNHIEFSSTGATYTFRVRAMGWFGQRSHYSTYHCSASLEQQIPQNVSRFVSSYSDKIAVLEWAKNPELYVKHYEIRHGTAWENSILIAELDSTTLHLTHARPGFYLIKAVSQWGIKSAEASVLELTDLTPLNIIQEYNYAANDWPGEFDHTAVNNNNHIRLFSYYSWGGMAQPWDDYSDSWENTKSGTLATDISAGYYLSAVYDLGKTMRCRVYADMQISQSNDDLSWDNMQQAWEHYTLENNWSWLGSPEACGFEVQFSTSSDSESWSEFMPLTASFSHFRYAKFKVILTRFDAQYTPELQELSCTFDVPETVYNVDNFPVSAASSTYVFPEPMQQKVIVIATIQSGAAGDQVQVNKSLTQATVNIFDKDGTAKTGEVDLYIGGH
>NZ_CP038966|10315:26969|18268_18691_+|WP_016211141.1|DBSCAN-SWA
MSESIGALSEIYRDSDNAGNYVKLANITNIGEISSSRDKIDVTEYGSTQKKYKLGLKDHDEIQLDMNVAQDNSELKNLISDHDTGIERQFKIILATQPKRQIYEFTALITNHKIIAPLSEVISMSVSLQPTSVIVQSDEV
>NZ_CP038966|10315:26969|17603_17888_-|WP_155047336.1|transposase|DBSCAN-SWA
MKKSKLSESKIVELLKRVEAGADIETTARDYGISTSTYYILKERYGAMDISQLKRLKQLEKENQQLKRMYADSQIEIEALKDALRHLKCNTTLY
>NZ_CP038966|10315:26969|21751_22423_+|WP_016210666.1|tail|DBSCAN-SWA
MSLVESAKIYLFTLDLTPLQSSIKYHFCNSPDGNQAVRFGGVEYQPIPLKTDGFERTTIHQPTPSIVLGNVKPILLPLLKAHDNLRGALIRRVMTYVRHLDGHSDPDASATLPEQVYVIERKSQHNNLTITFELGSKLPSDLKLPRRTQLASCSKIYRQWDEEQQAWIAGSCPYAAAQYYNEFGQQTTDKTKDQCGKKLSDCMARFGNGHALPFEGFEGIKPF
>NZ_CP038966|10315:26969|19342_21421_+|WP_075275195.1|DBSCAN-SWA
MATIGSLVVNLSANSAQLVKSLTKAELASKNFSKKVQRNLKKTTLAFAAVSTAATGAVAVMISKSSDSIDLLAKTSDKLGVTTEALASLRHAAELTGVSQNKLDMGLQRMTRRLSEAAAGTGEARKALVELGLDAEHLNQLSPDAAFKEVARAMENVEGQSDKVRLAFKLFDSEGVSLVNTLALGAEGLDQAASEAARLGIAINRIDAAKVEAANDAAYKMRQLFVGVSHQLAITFAPIIEDLTTRFTNAGTAASSFSSNVLSGFRVVAKSFAIVGDGVHYINVGLDIISAGFAVMKNMAIQSLTAIAKGLSWLYQKMGEGINFVLSQYQKIAKAGAILPIVGNKFERLGQSIARMKSSVSERFTLDTSGLNIAEESANNVNQKLAQLYQTLFSKRPTESVDAYFDEIEQKAAALDEKIRAAQPEKSALMGASLRAQDNQKQLDSLKERLLSEEEAIKHSYDKQKRIILDATREGSEERIKLLEKIEVQKNTKLKDLAQKQAKELNGVGHQAKEFAGNMEGSFSNAFAGVVKGTATVSDAFSSMLNDMAAEALSMASRGIFKSILGGVIGSVGGSSFASWFSGGATAAGAKASGGSVAAGQLYRVNEHGAELFSSGGKDYLMTGKKAGFVTPNHQLGQTVISNQVQNNITIAPTINASGADGEQVSQEVVTTIKHIVNDQIFKLKKQKLLNA
>NZ_CP038966|10315:26969|19072_19339_+|WP_016211142.1|DBSCAN-SWA
MNQLSQELSLSEFNEWLAYYSLEPFGVEKDDHRTALMVSAVVNGPLQRKDKTLFTPNDFMPNYSAGDEKKTQSATDMAAILSAIAKRQ
>NZ_CP038966|10315:26969|21413_21755_+|WP_036776958.1|tail|DBSCAN-SWA
MLNFPSLLPTKIAMDKLKPRLRITPLGDGYVQREADGLNTLRHYFTVSFIGLSEIEKDSLINFVTERAGLEPFLWYHPGEKRYFQIICSEWQANLQHNYWTVVLRFEEDFNPV
>NZ_CP038966|10315:26969|14398_14839_-|WP_155047334.1|DBSCAN-SWA
MLEFLSHNCKEKASFFLIVFFNLLIVCQKLLIERYKGSSVLYGATKGAIATITKSLAIDFASSNIRVNSVCPGTIETPLYHNAVKSNSHKLNMTNDDLYNILKTSQPIQRVGLPEEVSNVIYFLNSGEASFVTGSLYSVDGGYTAQ
>NZ_CP038966|10315:26969|11130_12017_-|WP_129556478.1|transposase|DBSCAN-SWA
MPSPYSYDLRVRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
>NZ_CP038966|10315:26969|16632_17607_+|WP_054300271.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP038966|10315:26969|14799_15165_+|WP_054300249.1|DBSCAN-SWA
MPSPYSYDLRIRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
>NZ_CP038966|10315:26969|14089_14332_-|WP_032126346.1|DBSCAN-SWA
MPSTTHKILELLKSGEELTRPKAYKLGFGHCLPTFICQLRKEGYNIRSWKGEKGYYHYQLDTRKQVQSDLFEVKQLTFDF
>NZ_CP038966|10315:26969|18692_19016_+|WP_075275196.1|DBSCAN-SWA
MALRNALFNLAFKTAPVTLGELELQVKELSIAEQQRYQELHPSLSETEANLLLICLSLCDHQGVKILDVSEYKKLAELPLGVIKQITDAIVEVNGFNESAAHDLKKN
>NZ_CP038966|10315:26969|10315_10576_+|WP_036781073.1|DBSCAN-SWA
MSKNTIEWKLKALKQVKKFPLKSKEKIFSGVESLYDWPSCKDVKKLQNREGYRLRVGQYRVFFDVNQGKINIITIEEVKKRDSKTY

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_036781073.1|10315_10576_+	cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system	A0A1S5NR91	Burkholderia_phage	2.1e-13	48.8
WP_081007079.1|10646_10919_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_129556478.1|11130_12017_-|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	5.8e-10	22.4
WP_016212315.1|13555_13990_+	DUF29 domain-containing protein	A0JC30	Ralstonia_phage	9.1e-25	39.7
WP_032126346.1|14089_14332_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047334.1|14398_14839_-	SDR family oxidoreductase	F2NZ40	Diadromus_pulchellus_ascovirus	1.1e-06	37.6
WP_054300249.1|14799_15165_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047335.1|15179_15623_+|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	5.1e-07	25.5
WP_054300271.1|16632_17607_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7
WP_155047336.1|17603_17888_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047337.1|17906_18269_+	DUF3168 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211141.1|18268_18691_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275196.1|18692_19016_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211142.1|19072_19339_+	DUF4035 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275195.1|19342_21421_+	hypothetical protein	A0A1J0GWA6	Alteromonas_phage	2.5e-56	33.4
WP_036776958.1|21413_21755_+|tail	phage minor tail family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210666.1|21751_22423_+|tail	phage minor tail protein L	A0A2I6PHT9	Pseudomonas_phage	3.0e-27	32.7
WP_032126911.1|22391_23138_+	hypothetical protein	A0A0R6PHF9	Moraxella_phage	1.7e-42	42.9
WP_054300696.1|23127_23685_+|tail	tail assembly protein	K7PGY0	Enterobacteria_phage	1.3e-20	36.2
WP_075275194.1|23681_26969_+	host specificity protein J	A0A0R6PIC0	Moraxella_phage	5.2e-112	33.2

5. NZ_CP038963

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP038963_1

• CRISPR_ID: NZ_CP038963_1
• CRISPR_location: 128460-128683
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 3 spacers
• Cas_protein_info: RT

Consensus repeat of NZ_CP038963_1

Consensus_repeat	Method
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	CRT

spacers of NZ_CP038963_1

>1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT
ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
>1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT
TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
>1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT
ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038963_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038963_1

>merge|NZ_CP038963|1|128460-128683|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAGAAATGGAACACAAACGGAATACAAGTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATAAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACACAAACGGAACACAAA

>NZ_CP038963|1|1|128460-128683|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
AAATGGAACACAAACGGAATACAAG	TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038963.1|WP_080963647.1|137109_137280_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379554
NZ_CP038963.1|WP_155064810.1|133148_133916_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038963.1|WP_105962623.1|118595_119749_+|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|222853
NZ_CP038963.1|WP_155047013.1|124146_124293_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038963.1|WP_155047299.1|139862_141221_-|DEAD/DEAH-box-helicase	unknown	unknown	gnl|CDD|350771
NZ_CP038963.1|WP_155047284.1|120377_121406_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038963.1|WP_155064809.1|130103_131975_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|273167
NZ_CP038963.1|WP_016212014.1|117289_117703_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038963.1|WP_036780064.1|125683_126274_+|site-specific-integrase	unknown	unknown	gnl|CDD|271175
NZ_CP038963.1|WP_036774631.1|136306_136771_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038963.1|WP_155047285.1|134915_135173_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038963.1|WP_054300202.1|129171_129900_+|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP038963.1|WP_016211879.1|127228_128248_+|ParA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224113
NZ_CP038963.1|WP_036771347.1|132054_133032_+|IS5-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|290455
NZ_CP038963.1|WP_036771347.1|133919_134897_-|IS5-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|290455
NZ_CP038963.1|WP_054300202.1|117800_118529_-|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP038963.1|WP_075273826.1|122798_123926_-|hypothetical-protein	RT	pfam00078_RT_CAS-I:CAS-III	gnl|CDD|275209
NZ_CP038963.1|WP_081377350.1|124622_125438_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|377437
NZ_CP038963.1|WP_017375910.1|138950_139679_-|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP038963.1|WP_105962623.1|121685_122839_-|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|222853

HMMScan for Signature genes

Protein	Cas_name	Cas_description	E-value	Identity	Coverage
NZ_CP038963.1|WP_075273826.1|122798_123926_-|hypothetical-protein	RT	pfam00078_RT_CAS-I:CAS-III	2e-50	166.1	0.1

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038963.1|WP_105962623.1|118595_119749_+|IS3-family-transposase	gnl|CDD|222853	PHA02517, PHA02517, putative transposase OrfB; Reviewed.	2.3205e-84
NZ_CP038963.1|WP_155047299.1|139862_141221_-|DEAD/DEAH-box-helicase	gnl|CDD|350771	cd18013, DEXQc_bact_SNF2, DEXQ-box helicase domain of bacterial SNF2 family proteins. Proteins belonging to the SNF2 family of DNA dependent ATPases are important members of the chromatin remodeling complexes that are implicated in epigenetic control of gene expression. The Snf2 family comprise a large group of ATP-hydrolyzing proteins that are ubiquitous in eukaryotes, but also present in eubacteria and archaea. The bacterial SNF2 present in this family are members of the DEAD-like helicase superfamily, a diverse family of proteins involved in ATP-dependent RNA or DNA unwinding. This domain contains the ATP-binding region.	2.71429e-84
NZ_CP038963.1|WP_016211879.1|127228_128248_+|ParA-family-protein	gnl|CDD|224113	COG1192, Soj, ATPases involved in chromosome partitioning [Cell division and chromosome partitioning].	2.24633e-33
NZ_CP038963.1|WP_155064809.1|130103_131975_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|273167	TIGR00601, UV_excision_repair_protein_RAD23_homolog_A, UV excision repair protein Rad23. All proteins in this family for which functions are known are components of a multiprotein complex used for targeting nucleotide excision repair to specific parts of the genome. In humans, Rad23 complexes with the XPC protein. This family is based on the phylogenomic analysis of JA Eisen (1999, Ph.D. Thesis, Stanford University). [DNA metabolism, DNA replication, recombination, and repair].	0.00881306
NZ_CP038963.1|WP_036780064.1|125683_126274_+|site-specific-integrase	gnl|CDD|271175	cd00397, DNA_BRE_C, DNA breaking-rejoining enzymes, C-terminal catalytic domain. The DNA breaking-rejoining enzyme superfamily includes type IB topoisomerases and tyrosine based site-specific recombinases (integrases) that share the same fold in their catalytic domain containing conserved active site residues. The best-studied members of this diverse superfamily include Human topoisomerase I, the bacteriophage lambda integrase, the bacteriophage P1 Cre recombinase, the yeast Flp recombinase, and the bacterial XerD/C recombinases. Their overall reaction mechanism is essentially identical and involves cleavage of a single strand of a DNA duplex by nucleophilic attack of a conserved tyrosine to give a 3' phosphotyrosyl protein-DNA adduct. In the second rejoining step, a terminal 5' hydroxyl attacks the covalent adduct to release the enzyme and generate duplex DNA. The enzymes differ in that topoisomerases cleave and then rejoin the same 5' and 3' termini, whereas a site-specific recombinase transfers a 5' hydroxyl generated by recombinase cleavage to a new 3' phosphate partner located in a different duplex region. Many DNA breaking-rejoining enzymes also have N-terminal domains, which show little sequence or structure similarity.	2.06134e-23
NZ_CP038963.1|WP_054300202.1|129171_129900_+|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP038963.1|WP_036771347.1|132054_133032_+|IS5-family-transposase	gnl|CDD|290455	pfam13737, DDE_Tnp_1_5, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis.	3.06507e-32
NZ_CP038963.1|WP_080963647.1|137109_137280_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|379554	pfam14319, Zn_Tnp_IS91, Transposase zinc-binding domain. This domain is likely to be a zinc-binding domain. It is found at the N-terminus of transposases belonging to the IS91 family.	4.0743e-09
NZ_CP038963.1|WP_054300202.1|117800_118529_-|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP038963.1|WP_075273826.1|122798_123926_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|275209	TIGR04416, hypothetical_protein, group II intron reverse transcriptase/maturase. Members of this protein family are multifunctional proteins encoded in most examples of bacterial group II introns. These group II introns are mobile selfish genetic elements, often with multiple highly identical copies per genome. Member proteins have an N-terminal reverse transcriptase (RNA-directed DNA polymerase) domain (pfam00078) followed by an RNA-binding maturase domain (pfam08388). Some members of this family may have an additional C-terminal DNA endonuclease domain that this model does not cover. A region of the group II intron ribozyme structure should be detectable nearby on the genome by Rfam model RF00029. [Mobile and extrachromosomal element functions, Other].	4.35291e-98
NZ_CP038963.1|WP_036771347.1|133919_134897_-|IS5-family-transposase	gnl|CDD|290455	pfam13737, DDE_Tnp_1_5, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis.	3.06507e-32
NZ_CP038963.1|WP_017375910.1|138950_139679_-|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	2.26977e-51
NZ_CP038963.1|WP_105962623.1|121685_122839_-|IS3-family-transposase	gnl|CDD|222853	PHA02517, PHA02517, putative transposase OrfB; Reviewed.	2.3205e-84
NZ_CP038963.1|WP_081377350.1|124622_125438_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|377437	pfam04986, Y2_Tnp, Putative transposase. Transposases are needed for efficient transposition of the insertion sequence or transposon DNA. This family includes transposases IS1294 and IS801. This is a rolling-circle transposase.	2.93086e-44

Protein sequences

>NZ_CP038963.1|WP_016211879.1|127228_128248_+|ParA-family-protein
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MGE targeting detection<

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NZ_CP038963_1	1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT	128617-128658	42	NZ_CP039182	Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence	1389-1430	0	1.0
NZ_CP038963_1	1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT	128617-128658	42	NZ_CP039182	Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence	1467-1508	0	1.0
NZ_CP038963_1	1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT	128617-128658	42	NZ_CP039182	Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence	1677-1718	0	1.0
NZ_CP038963_1	1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT	128617-128658	42	NZ_CP039187	Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence	1389-1430	0	1.0
NZ_CP038963_1	1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT	128617-128658	42	NZ_CP039187	Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence	1467-1508	0	1.0
NZ_CP038963_1	1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT	128617-128658	42	NZ_CP039187	Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence	1677-1718	0	1.0
NZ_CP038963_1	1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT	128617-128658	42	NZ_CP038948	Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence	1389-1430	0	1.0
NZ_CP038963_1	1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT	128617-128658	42	NZ_CP038933	Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence	197195-197236	0	1.0
NZ_CP038963_1	1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT	128617-128658	42	NZ_CP038973	Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence	1389-1430	0	1.0
NZ_CP038963_1	1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT	128617-128658	42	NZ_CP039036	Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence	128617-128658	0	1.0
NZ_CP038963_1	1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT	128617-128658	42	NZ_CP039066	Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence	1389-1430	0	1.0
NZ_CP038963_1	1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT	128617-128658	42	NZ_CP039066	Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence	1467-1508	0	1.0
NZ_CP038963_1	1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT	128617-128658	42	NZ_CP039066	Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence	1677-1718	0	1.0
NZ_CP038963_1	1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT	128617-128658	42	NZ_CP038887	Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence	92334-92375	0	1.0
NZ_CP038963_1	1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT	128617-128658	42	NZ_CP039215	Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence	137266-137307	0	1.0
NZ_CP038963_1	1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT	128617-128658	42	NZ_CP038938	Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence	1389-1430	0	1.0
NZ_CP038963_1	1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT	128617-128658	42	NZ_CP038963	Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence	128617-128658	0	1.0
NZ_CP038963_1	1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT	128617-128658	42	NZ_CP038877	Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence	137267-137308	0	1.0
NZ_CP038963_1	1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT	128617-128658	42	NZ_CP038882	Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence	93293-93334	0	1.0

1. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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2. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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3. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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4. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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5. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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6. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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7. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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8. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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9. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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10. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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11. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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12. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|128485|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.2|128552|40|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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112. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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113. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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114. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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115. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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116. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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117. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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118. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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119. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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120. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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121. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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122. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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123. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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124. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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125. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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126. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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127. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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128. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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129. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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130. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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131. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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132. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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133. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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134. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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135. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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136. spacer 1.3|128617|42|NZ_CP038963|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	2012 : 48760	54	Acinetobacter_phage(21.43%)	integrase,transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	51856 : 169547	120	Streptococcus_phage(19.23%)	integrase,transposase,protease,head,tail,capsid	attL 46910:46969|attR 165207:166451

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038963|2012:48760|DBSCAN-SWA
GATGCCTTCTCCTTACAGTTATGACTTAAGAATTCGAGCACTAAAAATGATTGATGAAGGGATACTTATTACACAAGTTTCCAAGCTCTTAAAAATCAGTCGAGATACCCTGCATCGTTGGAAAAATAGGCGTGATCATACAGGAGACGTCAAAGCAAGGTTTGGCTACCAAACGGGCTATAACCATAAAATCAGCGATATGGAAGAATTTCAAAAATTCATTGATCAGAATCCGGGTAAAACTCATCAACAACTCGCTGATCTTTACCCTGTAGAAATGAGTGCAAAAACCATGGGAGTGTGGATTAAAAAATTAGGCTATACCAGAAAAAAAAGAGCTTCAGATACCAAGAACGTGATGCATTAAAGCGGAAAGCCTTCCTGGAAAAAGTCGAGAAAATCGATAACGACAAAATTGTTTATATGGACGAAGCGGGTATGGATGATACTGAGCGTTACGCTTATGGTCACTCTGCTAAAGGTAAACGGTGCTATGCAGAGAAGCCCGGTAAAAAATCAATACGAATTAACTTTATAGGTGGTTTGCGCGGCAAGCAATTTATGGCACCAATGATGGTTGAAGGTTATTGCAATGCTAACGTTTGTCAGGCTTATATCGATCAGTGCTTAATTCCCTGTTTATCTCCTGGAGAGACTGTAATCATGGATAATGCCTCTTTTCACAAATCAAAAGGGGTTAAGGAAGCGATTGAAGATGCGGGTTGTCACTTATTATTTTTACCCCCTTATTCTCCTGATTTAAACCCGATCGAGCATGTATGGTCACCGCTTAAAAATAGGGTTCGCATGAAGCTTGATCAAGATGAAATAAATTTAGAGACAGCGCTTAGTCAAGTAATGAAGTCAATGTCAGAAACTATTCGTTGAGCGCTATATTACCTTTATCGAGCGATTGATAAATATGGCCATACTTTGGATTGGATGCTCAGTCGTCAGCAAAATGCTAAAGCGGCCTTGCGCTTTTTCAAAAAGCAATGGCTCAACCTTACGTGAAACCACCACGTATTGTGAATGTCGATAAACACGCTTCATTTCCACCGGCTCATCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTGTCTTTTCTAGGCGATGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGATCTACCATTGATGTGATGGAAGCAATGCGTATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGGATATCTGTGCCCAAAACCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGGCAGCGAACATAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCCCTATAACTTTTCGCAACAGTGCCGTTTTTCACATTTGGCTTCTTCTTGCTAATCTCTTGCAAAGCTTCTTCGCCACTCTAAATTTTTCGCAACAGTGCCTCTTAGTCAGTCATATAATATAAGTAGCAGCCGGATTATCAAACAATTCAATTGGCCGGATATAACGATCTAGTGCAGCGGAACTGTGTTGACTCACCTGGCGTAACTTTTCCCCAGGCGCTCCATTGAGTTTTGCTTGCGTTAAAAAACCAGCTCTAAAACTATGAGGTGTATAACCTGATAAGCCTGAATGATTGAGATATTTATTAAGAATATGATCAACTGCACTACTCGACAGAGGTTTGTATTGCAACTGCTCCCCTTTTTTAATCTCTCTAAAAATGGAGCCTTCTTTAATGTTTGAGCGTTGAAACCAACACTGCATCAATGTTACCGGACAATATCGATAAGTTGGTTGTAATATGATAGGCACTTGCAGCAACTTTTCACCTGCCTGATTAATTTTATTACGCCCAAGATTAAATAGCACACCTTTGCCACTCACCCACTCAAAATCTTCAATATTAGCAGCCACCACTTCAGATTTTCTGAAGGCACCAAACCACAACCAAGATAACAGTGTTACATCACGTAATCCGGTTAATGTATTTTTATCAATCACCGCCAATAATCTCTCGAAGTCATTTTTAAGCAACGGCTTTGCTTGTTTTGGTCTGTAGTTATCATTGCGCTTGATTGCAAATAAGATGGCTTTGACCTGCATTGAGTCACTAAAACTCTTAAATCCCATCTTAATATGCTTGGAATTAATGGCTGCCAATGACTTTTGAATGGTTGTTCTTTTAAGATTTTTTTTCTTATACAGGTAGTGCAAAAAAAGTGCGACCGCTCCTTCATCCGCCGGTAAAGGGACTAAGCCTAATTTATAGCAGTAATTTTCAAAATCTTTCCAGGGCTTTGCATAGGCTGTTTCTGTGCTTTTTGCTGTTTGATTATCTTTAACAAATGCTTCAAGGTCTTTGAGTGATTGCAGTAACTCTGAAGAACTGTCTATTTTCATTAATTTATCCATACTGCAACCACAACCGATCTATACTATAGTTTATTTTTAGAGCCTTTCGATAGACCCACTTTTTTGGTGGTCGTTGTTTTTTTTTCCTTAGGCTTCTTTGCAACTACTTTTTTAGAAGAAGCTTTTTTAGTTGTTGTTTTACTCGTTACTGACTTTTTAGCTGGCTTATCATCATCTAAAATTTCACCCAACTTTTTCCAAGTGATTTTTTTATTGTTTAAGGTGATACCACTACTACTGACTGCTAACGTACCAAACTTTTTAGAACCATCTTTAATCTCAAAAGTCATTCCTTTTGCTTTAACGTCTAAATCGCCTAAGTTCAGTGTTACTTTCATAAAATAGCCTTTTATTTTTAAGTTATTCGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTACTCTATACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCAATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTGTTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAATTTCATTAAAATCTGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCCGCAAACTCTGTTCCATTGTCAGAGGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGATCGCGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGGTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTATTTGATCACCACGATTCACCTTTTTCTTATAAGGTTTTCCCGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTTTCACTCACCTGGATATCATGCTCTCGTATAAGTTCCTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGGGTGCTTAACCGTTGATGGATCAACATTTTTGCCTCCTCTGAAATTTGTCGAAAAGCTTGACCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCACAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAACCATCTCTACCCTCTAAGTCAAAAGGCGAACTAGAGAGTTTATCTGTATGAATATGAACTCTCTACTGAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCCATTAACCTTAACTCATGTTACGCGCTTAACCTTTAAGCCATACTTCTAAGCTCCTGAAGTGCAATTTGATTAGCCCTTAATATCAGCTTATATTTTATTGCAAAATGGTTTAAAGATTTTTTCAATTTTAATCTTTCCAATCTGCAAAACCCAAGAATACTGTAATAAATATGGTTCAACTGAGATGTGACAATCCGCGTAGGCGACTTTTCAAAGCTCGAATTTTGTTTTACTGACTTGTGAAATTCCTCAATACTCCAGCGTTTTTTATAGGTATCCAGGATGGGTTGGCCATCAATACTCAAGTCATTAGTTACTAGATATAAGACACGTTCCTTACCATTTTCGTTTTTGAATGTTTTTTTCATAACCTGTACTTTGAAAGCCATACCTTTTAAGTACACAGTCTGAGGAATGCCGTCTTCTAATGATATTTGCTTTAGTTGTTGATGCTTACCATTCTCTTTATTTTTTTCAGTCAGTGCGACACATCGATTACTTTTGATTCCCATGATAAATTTCTTTCCAGCATTGTGGATATAGCTCATATTTGATTGACTGCTAAACCAGCGATCTGCAAGCACATATGTAAACTTTAAGTCGTTACGAATAGCGACATTCAGAAGTTTTAGAAAAAGGTCATTTTTTGTAAAAGAAGACTTTCTTCGTTCTTTTTTGGTTTGAAGGTCACTATAACGAATCGTTTTCTCTATCACTTCATAAGCGATAGGCAAGCGTACGTCTCCGTAGCGCACCATCGCTGTCAAGATATTAATGCCCTTCACTGTTCGACCTTTACTATGGTCATAATGCCAGGCGATAATATCATTTTCATCGCTGTAGGGTTTTTCAGCAATCATATCATCCAAGGCTAAAACTCCATCATCAAGTCCCTCATACTCACGAACATCAGTCTTAATTTTTAACCAAAGGCCTTTTGATGTTTGTGGGGCTTTATTCAATAAGCGAGTTATCTGATCATGTGACAATTCGTCAGGCATTAAATCTGCTAATCCGGTAGCTGTTGCATGTTTGTTTTGAGCGATTAGATAGTCTGTGTATATGTCAGCAAGGTTTAAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211885.1|7121_8162_-	DNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556706.1|8175_8805_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_052104769.1|10617_11541_+	chemotaxis protein CheV	NA	NA	NA	NA
WP_105962623.1|12685_13838_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
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WP_075273822.1|14266_14767_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300162.1|15211_16294_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1
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Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_155046767.1|85411_85573_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_052047048.1|85572_86073_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_052104629.1|88356_89382_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047281.1|89608_89938_-|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	5.5e-06	36.8
WP_155047018.1|90005_90809_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.9e-55	45.2
WP_075274752.1|90844_91144_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|91140_91716_-|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	2.7e-08	26.6
WP_032126362.1|91661_92027_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212061.1|92931_94974_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274748.1|95743_95944_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047246.1|96084_97059_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.9e-25	30.0
WP_016212579.1|98555_98753_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|99352_100327_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7
99317:99955	attR	NA	NA	NA	NA
WP_016212456.1|100370_100658_+	type II toxin-antitoxin system HigB family toxin	A0A0P0ZE17	Stx2-converting_phage	2.9e-11	39.2
99317:99955	attR	NA	NA	NA	NA
WP_036779532.1|100654_101056_+	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A222YXG1	Escherichia_phage	3.9e-22	47.0
WP_075273881.1|101065_103252_-	ATP-dependent RecD-like DNA helicase	A0A0K2FLP8	Brevibacillus_phage	9.2e-73	30.2
WP_016212404.1|103372_103606_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273857.1|104382_105117_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	8.4e-39	43.6
WP_129556710.1|105270_105741_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556709.1|105821_105911_-	DUF1891 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_052047129.1|106122_107706_-	protein kinase	NA	NA	NA	NA
WP_075274745.1|107988_108717_-|transposase	IS6-like element ISPsa2 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.2e-37	42.2
WP_016212365.1|109429_109672_+	antidote-toxin recognition MazE family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036781349.1|109673_110000_+	potassium ABC transporter ATPase	A9D9Y1	Lactobacillus_prophage	1.1e-11	36.6
WP_054300202.1|110115_110844_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
WP_016212152.1|111313_111697_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212154.1|112003_112381_-|transposase	IS3 family transposase	Q716C2	Shigella_phage	1.2e-17	46.0
WP_155047283.1|112545_112878_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212156.1|112830_112983_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081377351.1|113066_113846_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047298.1|114375_114561_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212019.1|114947_115643_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	2.2e-41	42.9
WP_105962690.1|116111_116387_-	type II toxin-antitoxin system RelE/ParE family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_047927838.1|116383_116629_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047016.1|116658_116886_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212014.1|117289_117703_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|117800_118529_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
WP_105962623.1|118595_119748_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
WP_155047284.1|120377_121406_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_105962623.1|121685_122839_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
WP_075273826.1|122798_123926_-	hypothetical protein	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	1.9e-18	30.3
WP_155047013.1|124146_124293_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081377350.1|124622_125438_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036780064.1|125683_126274_+|integrase	site-specific integrase	K4K6A1	Caulobacter_phage	2.0e-22	38.3
WP_016211879.1|127228_128248_+	ParA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274742.1|128260_129142_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|129171_129900_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
WP_155064809.1|130103_131975_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771347.1|132054_133032_+|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9
WP_155064810.1|133148_133916_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771347.1|133919_134897_-|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9
WP_155047285.1|134915_135173_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036774631.1|136306_136771_+	hypothetical protein	H6WFS7	Cyanophage	2.9e-21	38.2
WP_080963647.1|137109_137280_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375910.1|138950_139679_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	42.6
WP_155047299.1|139862_141221_-	DEAD/DEAH box helicase	D2J050	Enterococcus_phage	2.6e-126	50.5
WP_155047286.1|141310_141877_-	helix-turn-helix domain-containing protein	I1ZBD6	Salisaeta_icosahedral_phage	1.4e-20	35.0
WP_017377658.1|141880_142567_-	Fic family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375910.1|142814_143543_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	42.6
WP_129556703.1|145924_146413_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211956.1|146470_147199_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211955.1|147655_148636_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275154.1|148772_149429_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	7.6e-31	40.7
WP_036771347.1|149791_150769_-|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9
WP_027242575.1|151398_151884_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242576.1|151917_153780_-	AAA family ATPase	A0A088C4M0	Shewanella_sp._phage	1.0e-56	30.9
WP_036771347.1|153972_154950_+|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9
WP_155047288.1|154964_155090_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047289.1|155022_155199_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075275025.1|155448_157464_+	DUF1561 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047291.1|159125_161156_+	DUF1561 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771347.1|161290_162268_+|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9
WP_155047292.1|162345_163263_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_105962623.1|164052_165206_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
WP_075273751.1|165555_167286_-	PLD-like domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047019.1|167298_167451_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047293.1|167940_168666_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|168818_169547_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
NZ_CP038963.1|WP_129556706.1|8175_8805_-|hypothetical-protein	8175_8805_-	209 aa aa	NA	NA	NA	2012-48760	yes
NZ_CP038963.1|WP_032126838.1|16647_16851_-|hypothetical-protein	16647_16851_-	67 aa aa	NA	NA	NA	2012-48760	yes
NZ_CP038963.1|WP_016212257.1|17187_17412_-|hypothetical-protein	17187_17412_-	74 aa aa	NA	NA	NA	2012-48760	yes
NZ_CP038963.1|WP_016212260.1|17431_17704_-|hypothetical-protein	17431_17704_-	90 aa aa	NA	NA	NA	2012-48760	yes
NZ_CP038963.1|WP_016212398.1|22141_22603_+|hypothetical-protein	22141_22603_+	153 aa aa	NA	NA	NA	2012-48760	yes

Protein sequences of NZ_CP038963.1|WP_129556706.1|8175_8805_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038963.1|WP_129556706.1|8175_8805_-|hypothetical-protein
MNREWVELSKDTSQIYLQVYALQSVQIHIIQMQQQGDSHSIVSTNDLLEERATSYELQCELGLPCGHMLIDLVFDLNDRVVSQRSLESFTKLVQPIQTLKLLDTHRLNVIEKQVINFIKILKLRQPQDIHFELKAIWPEYIQFHLEDEKTLDLKTKHLYLVEIVADGSGIKVAVNQKYQCCYLFDQDKNSLKKLLNDLHACDVPVSFKQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	23925-23888	0

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038963 position: 23925-23888, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038963.1|WP_032126838.1|16647_16851_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038963.1|WP_032126838.1|16647_16851_-|hypothetical-protein
MQKAVKCEAEEIQERMRFVKNNYKSLTVKRLKILWGVNSLNVYQFLRQYDLPWLPIDELTIKQRGRI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	23925-23888	0

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038963 position: 23925-23888, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038963.1|WP_016212257.1|17187_17412_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038963.1|WP_016212257.1|17187_17412_-|hypothetical-protein
MLGVAIDSTESLNDRCKQIVKAVDSFLKGYKLATNKKLSELGINIKDHHDLTKCLGLEPYTEISRNGVVLYGIK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	23925-23888	0

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038963 position: 23925-23888, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038963.1|WP_016212260.1|17431_17704_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038963.1|WP_016212260.1|17431_17704_-|hypothetical-protein
MIIPEKSKLTAWPSPVLYAAAKATAWGGCYGVSSHQSFKENYNRSIKKYLAGQKFEVPPEVCRSIEHKGPRNSEAALSQLEKMRRNLRVH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	23925-23888	0

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038963 position: 23925-23888, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038963.1|WP_016212398.1|22141_22603_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038963.1|WP_016212398.1|22141_22603_+|hypothetical-protein
MKNIKKTIGVIVLSVISSGWAVAWSPWIVCGGATHKVYPEGGGDPFDQTSYYSARCSDGQAPEGFTCAYHPARLVNVIYINNVGGKDNYYDVSQSQMNAIDKICQKIDKSAKAEDPAYLAHRQGDNGGGMYGHYYDFRVVSNNNFFSKEKIIF

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038962_1	Orphan	1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder	360453-360490	38	23925-23888	0

1. spacer 1.1|360453|38|NZ_CP038962|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038963 position: 23925-23888, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************