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NZ_CP038909 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence | 1 crisprs | RT | 1 | 1 | 2 | 0 |
NZ_CP038912 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 3 | 0 |
NZ_CP038908 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 chromosome, complete genome | 4 crisprs | RT,DinG,DEDDh,cas3,csa3 | 1 | 5 | 33 | 39 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
6445 : 19646
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038911|6445:19646|DBSCAN-SWA 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15 | Erysipelothrix_phage(25.0%) | protease,terminase,capsid,portal,head,tail,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
2671 : 47766
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038910|2671:47766|DBSCAN-SWA 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57 | Streptococcus_phage(13.64%) | protease,portal,transposase,integrase,tail,head,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP038908_1 | 364295-364518 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038908_1
|
3 spacers
spacers of NZ_CP038908_1
>1.1|364320|42|NZ_CP038908|CRT ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG >1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA >1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA |
RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038908_1
The CRISPR arrays of NZ_CP038908_1 >merge|NZ_CP038908|1|364295-364518|CRT AAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAGAAATGGAACACAAACGGAATACAAGTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATAAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACACAAACGGAACACAAA >NZ_CP038908|1|1|364295-364518|CRT AAACGGAACACAAACGGAACACAAA ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG AAATGGAACACAAACGGAATACAAG TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA AAACGGAACACAAACGGAACACAAA ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA AAACGGAACACAAACGGAACACAAA
>NZ_CP038908.1|WP_016211879.1|363063_364083_+|ParA-family-protein MTKAWTPGQLISLYRTNKAKSSVLRDEQKGVIPPAKREKRGAISVRVWDEELIPLIGEQYGFLKKNFKKKRNPQSVISVYAPKGGVLKSTLAFNLARIFSINNISVLAIGLEVSQRTLTSNLELVHDHEVESLAEAQKLHSGGLWDVSEGSQSIQDVICKSSLPNLHYIPESTDLNLLEQRIKDSPRREYFLQKLLKPIMKNYEVIIFDNSPSWGSLLVQNSLTLATDVVAPFSCELESYRSVTTNIEMINDFKRDMELNWNSFSIVPTKVDQTKLSKEIETQYRVLFPEFVTASSIRFLRGVAEESGMEQLSVIENSNTSSLADDYYNLSKELWTKLS >NZ_CP038908.1|WP_036780064.1|361518_362109_+|site-specific-integrase MGLNKQAKILSERQEKAVLSSLQSTTYPTRNTVMFLLSIKAGLRAKEIAALTWDMLLTPEGQLCEAIHLRNTASKGKQGGRVIPLNKQLKQALSQLLDESKPKHGQRPVILSRRNSHFPTQTVVNWFAELYKNLGFEGCSSHSGRRTFVTRAAKNIIKAGGSLRDVQQLAGHTTLQTTQRYIEGDSEAKKRIVDLI >NZ_CP038908.1|WP_081377350.1|360457_361273_+|hypothetical-protein MLSCIFRAELSSASAEVYPQALLAPRGARNVHVHISVTRGGYDEANDSWSEIYFTRKVIMPMWRYAVTNLLRQTYKAKELTIPDEYQGEISGLTTFNRFLNREYQKFWKVHFAQPKENHQHNVDYLGRYIKRPALANARMEHYDGNVVIFRYLDHKTKQQKMKKQSIDDFIDRLTQHIPDKFFKMIRYYGFLSYRTRTIILPKIYDLVGQTIETYQQVTFTSLMKSNFNYNPLKCILCGNQLRRVSTQFGLTLREKYNYYEELATSRFRGF >NZ_CP038908.1|WP_155047013.1|359981_360128_+|hypothetical-protein MSNISSLNVLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP >NZ_CP038908.1|WP_075273826.1|358633_359761_-|hypothetical-protein MEPTETSSSTETKLERIAWLSAVDPGKVFNQVMHHFNLDSLLQCFYELNGKKAPGVDGVTKEQYEENLISNLLDLLDRMKRMAYIPGAVRLVPIPKEGRPGAMRPLGISNFEDKIIQKMTQKVLESIYDPIFLGNSYGFRPGKSCHNAIRALDYYLFSNRIESIIDVDLENYFGTIDHNLLIDMLETKIKDQRFIRYIIRMFKAGVLSKGELTMSDEGVPQGSVCSPIISNIFAHYVIDDWFEKVVKKHCQGKVEMFRYADDMVICCQFRNDAGRIKKALAKRLSKFRLKMNEDKTREIAFSKQDAARGIRQGAFDFLGFAFYLGVSVSGRAIIPKLKSSGKLIRLPYSGQINYNNPSRRNHNGKASRHQVHRRI >NZ_CP038908.1|WP_105962623.1|357520_358674_-|IS3-family-transposase MGKRHVTKYTEEFKKSSAKLAVDSNQAISHTAQELGIHSSTLHGWVNKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAALLCKRNTVKYAWIKENKCVFPVDRVCSILGVSRSGYYSWLKVQPSKRMIENQKLARRIKEIFIESRATYGTRRIRKQLATQEISVSRKRVGRLMKQNQLCCKIKRKFKVTTDSKHRLPIAKNVLDRNFSATGPNQKYVGDITYIRTQQGWLYLAVVIDLFSRKVVGWAMEDHMEASLVNDALLMALWKRKPKAGLIWHSDRGSQYASESHREILKDHQIKQSMSRKGDCWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS >NZ_CP038908.1|WP_155047284.1|356212_357241_+|hypothetical-protein MLSTPWLAAGVRYMSFFFDKMTIKSIIENNIFSPILELLCMSIMYPGLHISLDTENARFKGNPLYSLSGQSYFFCQEQGMEVDSHYISQQSSYEEIDWDKRYKFSFSEYRALTSTDKLQLTRLHAMRWNYGLLLLENYLPEMSPSNSRLLTEKKFVESPSENELLQKLYAGWFIYQVESQCAGISEATERLFKIEMDLAPNCELSKEKEIARKISLFRKSLNLLKARPENSNPRTIAAINNHELAILTSFIKYQLGQINQGDFEREIQTVEEQCAELLKDAPSKQFLKIAINILITCLTLGVANLVNKALTGEFLFFKNSEAKQLAVSVATSAASHGVLSTG >NZ_CP038908.1|WP_105962623.1|354430_355584_+|IS3-family-transposase MGKRHVTKYTEEFKKSSAKLAVDSNQAISHTAQELGIHSSTLHGWVNKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAALLCKRNTVKYAWIKENKCVFPVDRVCSILGVSRSGYYSWLKVQPSKRMIENQKLARRIKEIFIESRATYGTRRIRKQLATQEISVSRKRVGRLMKQNQLCCKIKRKFKVTTDSKHRLPIAKNVLDRNFSATGPNQKYVGDITYIRTQQGWLYLAVVIDLFSRKVVGWAMEDHMEASLVNDALLMALWKRKPKAGLIWHSDRGSQYASESHREILKDHQIKQSMSRKGDCWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS >NZ_CP038908.1|WP_054300202.1|353635_354364_-|IS6-family-transposase MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP038908.1|WP_016212014.1|353124_353538_-|hypothetical-protein MILIPNGYLIPALPQPSPNLFGIAAADLSGSQNAAVSITKDGFTVTAAGKACDGILQNTPKKSEDCEIICSGAVKATAAGAITAGDYVKVASNGQLIQAAAGDTATGAALETAKAAGDLIGIHLIPNGYLILAAPSK >NZ_CP038908.1|WP_054300202.1|365006_365735_+|IS6-family-transposase MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP038908.1|WP_016211890.1|365938_368515_+|hypothetical-protein MPVRFNPIKKVSLNGKVFNVPKEVPNKALVKLGQQQPDVVEILADFFRTNPKQEFFSKLFLGDRYQISAMYVSLRNIGLNQRIYIQKVFDDPEGFSDIIQRLSNIELCQSVYVQAAFENPDLIAVFEKHKDKFTSLNQFELNQWVYVKAVLGDPDRFDDILQRLRDIALCEPVYVQAALKSPQRVVEFAKHTHRLVTLNALEPNQFVYVQKVLDDPEGFDAILQQLSDIELCQLPYIQAALDYPDRVDVFKAHQDKFALFNHLKLSQLTNIEAVLGNLEGFDEGYRSLKAVGLDQPKNIQAMLDNIEKFNENLQNLREVGLDQPKNIQAMLDNIEKFNENLQNLRKVESDQSDNIQLMLDNIEEFNENFQILRQFGLSQQLYIESILKSPNVIVNISDCSDELLMLEELGLGQTVYLQKVLDHPDRSKANLYRLIRMGLDQPVYVQSALKDLDRFDDVCQRLNDIELCESAYVQAVLDDPNRIAVFERHKDKFTSLNQFGLNQWIYVKAVLDDPKGFDDILQRLRDIALCAPVYVQAALQDPQRVAEFAKHTHRLVTLNALEPNQFVYVQKVLDNPEGFDAILQQLSDIELCQSVYVQAVLDDPNIITKLKEHQKKLVKLNQLGLSQPKYIQAVFDHPEDFERNLQTLEILGLNKTEYVQAIFDDPTRIDKLHKYHHLFFRLHMLGLSQPICVDAVFNNTEKYAQICSCLEEVKDRIETVEDTIQQSSLGQSREQGFKSHYPVYKSKVIQSSFDFLISERKDPAEMKAHLFEHEREFLCNSNIKSDRSSFGAICRSAMRALTNTIFIIVAPVVGYKRNWHKKNMSITEKCLPFYNHTESTNKVMDLTCDIQHTLVADF >NZ_CP038908.1|WP_036771347.1|368631_369609_-|IS5-family-transposase MPYKYPKGKGWDIPKQKYGVTNWAKYTDSLRNRGRIDVWISEKAIEGWYKKDRVYDGTGTPFLYSDLAIITCHEIRKVFKQPLRQTQGLIDSFFESQGLPIKCPDYTVLSKRLAELDIKVPRYRKTDKPDDDIAGIAIDSTGLKRFGRDEWHQEKYKISAKRSWRKLHVAVDDDHYIQAALITDRYEADEEVVDELLEQIDEPFDRFTADGAYDSHDVYDSVLNHSPNADVVIPPPKNAVFDENNHAIRNINFNEIKDHGRMHWQKTRQYGKRNYSELAIQRYKRILGNTMQSREISRQKNEGLIGAGILNKMTSLGMPDSFRRS >NZ_CP038908.1|WP_155047285.1|369627_369885_-|hypothetical-protein MNMNSLLSVALQMTEGDWLIYYEKTFPTPNLDFCFTGCWFSNEPNHKIQRGNVVSGFAKITALLHSSKSDQFWRFAYPAATLTSN >NZ_CP038908.1|WP_036774631.1|371018_371483_+|hypothetical-protein MNIFYLDHNIKKCAQYHCDTHVVKMILESTQILCTVLAKTGVDTPYRPTHKNHPCTLWAEESLDNWLWLLDLTMALNSEYMYRFNRKTPHKSAIVAQSLVFPEITPIGLTERPQAMPEKYRIPDDPVCAYRQYYLAEKNHLFKYTKRNKPIWQL >NZ_CP038908.1|WP_080963647.1|371821_371992_+|hypothetical-protein MKTQSAKLVPYTCKSCFCSACGKKATEIWIEKQNAVLPQCEYQHISSQKNLVTKSL >NZ_CP038908.1|WP_017375910.1|373662_374391_-|IS6-family-transposase MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP038908.1|WP_155047299.1|374574_375933_-|DEAD/DEAH-box-helicase MLHEYQHDAVNFIIENPSCALFLECGLGKTITTLTALSSLVNQYEIIKTLVVAPKRVVATVWAQEAQKWTHTDYLTFSSVIGSPAQRERALEKKADVYLINYENLVWLIEHKTIDFDFDALIFDEFSKMKAFNSKRFKAVKKVLPCVNRVIGLTGTPAPNSLLDLWSLSYILDRGKRLGKAYTGFRERYFQSDYMGYNWKPHAGSATEIHSLLEDICLTLTADEYLKLPRRIDNIIEVELPSAARHEYDELESDCLIKFEGQSLAVQNPAILTNKLLQFSNGAVYTDDEGTYKIVHDAKLEALDDIIQEAVGNPVLVAYNYKSDLSRLRERFPKAEHINDAPDTIERWNKGEIDILLAHPASAGHGLNLQDGGNTIVWFGLNWSLELYLQFNARLYRQRQTKPVFIHHIVTKDSVDQSVIESLQNKDQTQQALLDALKWGMSQRMKRKKVVT >NZ_CP038908.1|WP_155047286.1|376022_376589_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MALVGYARVSSYGQNLESQTKKLQEYGCKKIYKEKISGVDQNRKELKNCLDYLRDEDTLVVTKLDRLARSNTHLNQIVEGLMAADVNLIVLDQKIDTRSALGKMMYQLLGVFAEFENNIRKERQADGIRIAREKGIKFGRKRKYSDTEVDSMIKDRESGMTIKLITEKYDISKASFYRLCSSRMENSI >NZ_CP038908.1|WP_017377658.1|376592_377279_-|Fic-family-protein MIALSKLTTIERNDLFSRLRTSFTHHSNAIEGISLTFGETKRLLESGMTAGDKPLHEQLVVMGFADAFDFVIREANNTSSELDDDFIKDIHAILFAKAMKICPERLEKPIGAWRTDERYIKGVDIKLSQPRMIDQDTNNLLYQVKDKALSLTDIADFHITFERIHPFADGNGRVGRLLIAYQAIKSDCIPPLILNDHREEYLQSLSETSKLTEFLIKAIDNSYALVKG |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP038908_2 | 551725-551854 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038908_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP038908_2
>2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038908_2
The CRISPR arrays of NZ_CP038908_2 >merge|NZ_CP038908|2|551725-551854|CRISPRCasFinder ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA >NZ_CP038908|2|1|551725-551854|CRISPRCasFinder ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA
>NZ_CP038908.1|WP_054300520.1|550503_550818_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MKGYLITQISKLLKISRDTLHRWRNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH >NZ_CP038908.1|WP_075273359.1|549982_550558_-|IS630-family-transposase MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEGAGCHLLFLPPYSPDLNSIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETVR >NZ_CP038908.1|WP_016211797.1|548528_549932_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein MSSYAMLINGQLHSGIDSFAVVNPATEAVIAECPIASVELLEQAVNAAKIALIDGTGTLEQRRELLRACADKIEAYQEELSQLLTKEQGKPISQAQNEVSWAIGLLRKQCELDIPKKVLRDDTQAQVTVTRKPLGVVAGITPWNFPFYIAVNKMAEAIYSGNSIIIKPSPYTPLTTLKLGELIQDVIPAGLVNIISGDNEIGALLVKHPKISAISFTGSVATGKHIATAAAADLKRVVLELGGNDAAIVLNDVDVKEVAEKIFWNAFSNCGQVCVAVKRLYVQRAIYHDVLDEMVRIAKTVKVGNGLDSEVTMGPLNNVMQYERIIELLNDAKAQGATVHCGGVAQEGLGYFFPPTIISGIEEGVRLIDEEQFGPLLPVLAFDDVNEVIQRVNNSSMGLSAYVWSKDNDLAVQIANRLEVGIVRVNTSTTEASLTPFGGMKQSGIGREGGVWGIEAMTDAQTLSVKY >NZ_CP038908.1|WP_081007059.1|547305_548367_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase MVLLEQLDTFLISRVDPYANQLDIDSMILKSRFSELGEKKLLAIKVASEFNGIAADRALNHDYFARLARSSYALAFLTAQHESCASLLQKGNNQELKADLLPEMVQGKFRAGVGIYHLRSHTRRAMIMAKKVAGGYRVSGRLDWISGFDIFDYIALGFIIDIGNSQENHEVVGLVPFKVQQYLSGEINIGPKQEVTAISSTNTVAIEFNDWFIRDKDIMIDQPGRAIEQRSILSITHATMLMGIFQAALNIIGNSKSILKKNTVVLSQFNQLNNQCLLLRNQLIHTNTQEEVQKMRAQIHKYTRDCIYLAAALSGGRSVLADHPVQRLNRELLQATIAGVNSLFIHNLCIDIN >NZ_CP038908.1|WP_016211795.1|546428_546623_-|hypothetical-protein MKLKTKKISNACKGNTFLCVNFAKSKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP038908.1|WP_036794771.1|545304_546291_+|APC-family-permease MAMSGNQALQENVGFLGALVFAVSLVLGSGVLVLPGVIYHSIGELAIFTWLADALLMVPLVIIFASFGSKYPGSGGVAGFIEQAFPYLSGGSAYLLLGQCSICFAIVAITGILYSFALLLPNFHASHMLVAGISLALMFIVFFISFLGNHRVIWLQKLIIIPLLLFLLVLIFLSINHPDAATSSVTYWPKHFDTGLITQGMILAFFAFGGWESFASMTGEIKKPARTVPFVIFVGFLLTVGLYVGLSIAIQKIFFEKNMMTGSSFLLDLVQVNHLGQFSVAICFFIVFVVVISNLNGVIWSGSRTLVTLGQKGWAPAFAASHGVLSTG >NZ_CP038908.1|WP_016212044.1|544327_544582_+|hypothetical-protein MNHIISCPFCGVSTEHEMSYGLQSYVCEACHNLIAAGMDDCCLFFSHDLACLCQRENEKKMEREREEKEEEEALLCPSLRKWSS >NZ_CP038908.1|WP_036777801.1|543335_543554_-|hypothetical-protein MFKQLQNNRLYFQKERAYLSISKAKKFNGPGNNAQRIIIPLHGDTSGVLKSHLTIASLFDHRPKDKGKPFKP >NZ_CP038908.1|WP_155047052.1|541744_542473_-|hypothetical-protein MLCRPENSETLKNILISQKDTLISGAKHHKNILVLLIKTAIEFGNVRLLVTLDRLDLNPDRILFENTRQSFMQHLINHVYKYDDEEFAVWLFTVLYKQKIHFPHAKETFKIDFLDTSLRVNALQCLVYSGFFKLALCLSEAGIIDKASSTRYKGERRQVAACGFLITAIVKEGISQEKLDLLVALANGHDIATSQHLISIYRGLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP038908.1|WP_155047051.1|540730_541600_-|hypothetical-protein MLSTPWLAAYVSAIQNQGGNELEKLIRLIDTLAKLSVINIYKQDSAAILPFYMHPALAYQGIIQEYQQQLSHTRTMRNPHAISQYRVGEALGWLTMLKLAIHCTICHKSVQAGDRARQTRQLLQALSNLKKRNLSLEPLRTSLMLVDGVSMCFQPLRVFHPTHIMEIFAHQLLQLSEKGNCDNFAQIIDLIQQQVLTALKGTEFEALQNAKKHVATIFSLIPPSQPIHANNLPQTPEISATQSTTDEIKPARKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP >NZ_CP038908.1|WP_032126227.1|552671_552962_+|hypothetical-protein MGRLFNKENPADLKSSGYFSTEPRGQSHHSVIVIVMAMISIFVMTRVICSIITWMIHSAPLTFIFTMLISFFAAPYVFIVIIIVAFFIGILVKTPS >NZ_CP038908.1|WP_016212008.1|552999_553698_+|hypothetical-protein MLKKNKSTSFVIGLALSLSFACYANALTEAEFKATKLPYSVMAYSNQYAHEYGLDASKAIDLPKGLEAIKLILYKEHIKGDEVLLPQDIYRCSAELYVDKSLSLYWPGNYPKVDKVGDRGLQKAQVSTVQLKRKGEYWVPGPYASMLYDSYDQTIKPNLAKINLGFFGCNYIPSRYTAVKDGLAIWLERKGGHNYAAIGQSEAEISSKDFYIFKLPQKLVNNYLPYARMAAN >NZ_CP038908.1|WP_016212010.1|553714_554011_+|hypothetical-protein MVQLTLSDFAFLANDVYLNPGLELALPRENSQRCQRLLNNTETVINSDPHGPKANGFFARVYKYKQGNKMSLIVAYRGTSNVEDYLIDAELASGQAIE >NZ_CP038908.1|WP_155066233.1|554128_554980_+|hypothetical-protein MSMLTVDYSQLFGIKPTAFRTVTFNPPGMQGVDPNGRAPHYAEIAHTISQHKIASGKLAAAMVSVAPEVSLVGATAGVEVVVKKIMELLNYQTAIKNRSIALRMGQGALIFLWDLLMPDRNGLSVDKEINNPYPHIYNISSRYDLVHCSGNPGGNLINYDIDPLGKITNGDDDRRAKFKYQFLENYFEARQHYLKHGVNSAKMKSKYEQLSKADNWALYFENPGKEGVHLPTAKDWENYFKDVRNIPEYQQSARKTDRVMQYYTGTLSRCEPWSAKHGVSRPR >NZ_CP038908.1|WP_155046940.1|555184_555568_+|hypothetical-protein MCKIPTEVATLTSNQAYDKPYDLFLTKAAKVFIKYLFIAEHSMANMLPSIQVNQNLAQVKISYSAHETILAMRKCSSLINLHTTERLKGPLVAAHDNVQKYQKKGIYPYNQTNYQALAASHGVLSTG >NZ_CP038908.1|WP_075273619.1|555840_556416_+|hypothetical-protein MANYSQAYCVAQGFNVNANIHRRFGYINYLRIGDLELSADIDVEVPVEGVKSKHVGVISDLFWQETAKVQPITIDFRLSVSNQQQLAHYIEQNNFNSDVLIEFASYDYDANAQAFYSSFNTDKETIEGDLEILAADSQLAIYVGKEQETDVQSPVNYFVSLSMVSTAKAQQLISATSARIKRVLPWGVTVA >NZ_CP038908.1|WP_054300516.1|556473_557307_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase MPELPEVETSCRGIAPHIQNQKIQRVTIRQQQLRYPVSVQITTKKLKQQQVTQVSRRGKYILLELDHSAWLMIHLGMSGNLRILEDTTPAGKHDHIEIQFANQKILRLNDPRRFGCFLWTNDLANHKLLKHLGIEPLTRQFNANYLYQAAQSRKIAIKTLLMDSQVVVGVGNIYANEALFQTGIHPSTYCHVLTTNQCAELTRIIKAILKQAIKAGGTSLKDFTNSDGKPGYFKQKLFVYGRSKEPCLTCQEDIQQFRQNQRSSFFCPCCQPEPKTM >NZ_CP038908.1|WP_016211268.1|557422_558607_+|fatty-acid-desaturase MLSFYGLLNLPWWGYIIAVLLLTHVTIVAVTVFLHRHQAHRALDLHPVVSHFFRLWLWLTTGMVTKEWVAVHRKHHAHCETAEDPHSPKTYGIKTVLWEGADLYRHAIQTQPEMMEKFGHATPNDTLERHLYSRFRYLGIIIMLILDIVLLGVPGIAVWAIQMMWIPFFAAGVINGIGHYVGYRNFEAADASTNVSPWGILIGGEELHNNHHAYASSAKFSVKPWEFDVGWMYIRLLEVCQLAHVKKRIPRGACVAGKSEVDNATLKAVIQNRLQLLSKYQKDVLQPTFKAERARQGESVLNSTASKLLKRDQRFFSHADHQALEQVLISSKALDLVYQFRAKLQAIWTQKASNQKDVLDALKQWCSQAEASGEQRLQEFVSYLRGYVLTTQSH >NZ_CP038908.1|WP_016211271.1|558625_559570_-|L,D-transpeptidase-family-protein MGIITQRHNTVAGIALFTSSIFCTSAATAFTLPISSHNTNDVVGWQVITYSKAGDTPLKIAQRHSISIQRLQALNSKVRHWQKQRIYLPYQVILPQLIQQQQSKITVNLAEKRLYYFNAKSQVLSVYPVSIGREHWRTPTPTKTTYIIHKKKHPTWNVPASIQRYYRAQGKSLPKQVPPGPENPLGTRALYLGITGILIHGTNQPASIGTASSSGCIRLYTNDIEHLYKQAGVNTPVKLIYQPYKVGFNENVLYIEAHPVISDYDKNNQQRQIIIEKLQNMTNNSKQLQVNWSLVDKAINEAAGIPVPIGKLFY >NZ_CP038908.1|WP_036777835.1|559874_560660_+|hypothetical-protein MAKKIFYSLIIVILLLVVGSYFLFSHMDSILRSAVEKIGSKTTGTTVTLGSLKTSLKEGQVSLSRLTMSNPAGFSQANAISFKDVMVNLDPSSATQQTIVLNKVIIKDPYLLYEMKEGSSRSNLQQIQKNIQSYFASKQAKNNESNQRNSGVTQQEPSQAKVAAKNQKKFIIKELEILAGQVKVISPLLKSKEKTLSLPNIRLTNIGTGGSGLTPDQVTEQIINVLVANSGQAVAQAGLDRVKTKLKEKASGLLNNLLGNP |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP038908_3 | 1595895-1596001 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038908_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP038908_3
>3.1|1595933|31|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder CCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038908_3
The CRISPR arrays of NZ_CP038908_3 >merge|NZ_CP038908|3|1595895-1596001|CRISPRCasFinder GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGACCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAAGCGCTTAATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA >NZ_CP038908|3|2|1595895-1596001|CRISPRCasFinder GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA CCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAA GCGCTTAATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA
>NZ_CP038908.1|WP_016211836.1|1593843_1594332_+|protein-kinase MPFFPGDSFNAALTKDPDSVDEIILAVALELQRIHQSGVIHGDIRSDNIIIEEKNGIFNAKFIDFGWAYEYPSDDNVIVTKCSYFAPERAKIDLKAHPSQDIYSFGWMLGIAHDLVKEIPEKFYGFLIGANEEDPVLRPELRLLIKANLCPTLGEYYTQLVK >NZ_CP038908.1|WP_051307365.1|1593563_1593824_+|hypothetical-protein MPILEYQRPRSGSVIERRLESGVVESYQSIRDLGQGGNGSVRLFASKTALERYAVKRPLEVQRHSLDYLKLEERLSKRRSFIFSNF >NZ_CP038908.1|WP_016211834.1|1592991_1593306_-|hypothetical-protein MNQDTELSLSEEKEQKNFESLCDMLYECTIKTINQHTASFNEDELIFKQPIFMHINAAAQVLNAMINDAGDVLAEQHNEVTPELAVNELKKLTHSILFGDDHSH >NZ_CP038908.1|WP_016212185.1|1588628_1589618_+|rhodanese-related-sulfurtransferase MNQVVVAAMYKFARLPDYKDIQPKLLAFCKAQGIKGTLLLAQEGINGTVSGSRQAIDNLLNFLKSDSRLRALEHKESYLDAAEVPFYRMRVKLKKEIVTLGVDGIDPNEIVGHYVKAQNWNALISDPDVIVVDTRNDYEYDIGTFKRAENPNTETFREFPEYVEKNLDPKKHKKVAMFCTGGIRCEKSTAYMLKQGFEEVYHLEGGILKYLEEVPKEESLWEGECFVFDNRVSVNHDLEKGQYDQCHGCRYPITEQEKASSLYIEGVSCPYCYNNLSDEQKARFSERQRQMALAKHRGHQHIGDSIELAKQVKRQKRKAQVEACQTKQK >NZ_CP038908.1|WP_016212182.1|1588109_1588295_+|hypothetical-protein MKSMKKHSKLEAEIAIEPADVIEMTMTELSTRRAEAMEAIESGKFIQIVKHKKPIGMLVPF >NZ_CP038908.1|WP_016210748.1|1585472_1587428_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein MPYYTFIYLIALMVSLFITQSFYAANYLNHSLDKQRIFFHQAEQHLKKSRLQSFKKELKKLTHYPLYPYLRYQELIRQLQLGFLPNNKIKHFLNQYQNTIFHDRLHRQWMIHLYNKKWWKTLIKYYQPATKSTAMQCRYLWARYQLNYQQQSLHAFKKVWLQGRSLPKVCDRLISALRKHKQLTNSLAWQRITLAMQKRNYQLAGYLARFLSSQDKKALTLWRILRRHPEKMTKTSLIRAAGNKANYIANDTLLQLAKRKPEYAITIWPRLKSKFSLTKQQKIAITKSIALHLALKKSSKTSHWMEKVPDQDQSLTLTSWNIRTALYQQRWQHALTLINTLPPNEYDSHLWQYWKARALEQLGQITQAKKVYKRLAKHRDYYGFLASNKLQQPYQLNRKAVNISKHILSNVSKKPGIRRAYEFKKTGHPGLARSEWVYAINQFTETEKLAAAKLAHDWGWYNLSVLTTTKTKHRDDLKLRFPMAHYRAILRNAKRYEISPAWVFSVARQESIFHEHAYSPVGARGIMQLMPTTARYIAGKIQIRHYTSKLLDANHNIALGTAYLKRLLERYDNRLILALAAYNAGISRVNQWLPERNPIAADLWIETIPYKETRSYIKNILAYTVVYNARLGHTTKMAQQLVNVPTLKQIS >NZ_CP038908.1|WP_016210749.1|1584712_1585174_+|hypothetical-protein MSKIKSLKPFVHEITVDVHFSKKQAMHIRKLGQNLDLRVITPKAMVRLGEQLFTAKLISAIDLMSLLQPGFNQNYGEVAAQMGVQLKQPPALMNAIQFYYESWQKKIRQKGVNSQQRLLARREYHLMLALQKSLGLPVDGKMIQAKKTVIEDL >NZ_CP038908.1|WP_016210752.1|1583745_1584543_-|hypothetical-protein MQLLNRPLVKWLLKEEPPPSTPLCDYERICYEIRPCDVLLVEGRSRLSDVIQVITRSPWSHSALYIGRSQDIENLHIRQFIEDNYDGSPQDQLVIEGYLGQGTVINLLDDYKYSHIRICRPRGLSRKDVQQVIAYAASKVGSAYNVRQIFDLFRLLLPWTILPRSWRSSLFHHNLGDPTRTVCSTMIAEAFNVVDFPILPDLHTSEDGKMALHIRNPRLFTPRDFDYSPYFEIIKYPFISIDDHMPAYKNLPWQKGRPQDLPTEK >NZ_CP038908.1|WP_016210751.1|1581456_1583262_-|DEAD/DEAH-box-helicase MSSTIGFDKLGINDNILNSISELGYETPSPIQEQSIPVLLNQQDILAQAQTGTGKTAAFALPILTQLSLKHNQPQALVLAPTRELAIQIAEAFQRYAKYLPGFHVLPIYGGQEFRSQLRALKRGVHIVVGTPGRIMDHMRRETLPLESLKTVVLDEADEMLKMGFIDDVKWILQQIPTEHQTALFSATLPPSIKGIASQHLVEPVHIQIKSTTNTVSTIEQSYMITSKHHKLEALTRYLELEEFDAVIVFARTKIATTELAERLEARGYSAAAMNGDMNQASREQVIKRIKNGAIDIVIATDVAARGIDVNRITHVVNFDIPHDPESYVHRIGRTGRAGRDGKALLFVSPRERRLLKDLERVTRQPIKAITPPTANEITEKREESFKKQIINTINETTDLDYYRNLIESLLPLSEKSELDIAAALAYMAQKQKPLQMQKEDPKALSFESPHDRGGRHEPSQRERRTRQAIQTAEHGMSRCRLEVGHRHRIQPSDIVGVLANEGNITHKAIGRIHIFDDYSLVDLTSKVTNQVIELTHQCRVKGHPIKIKPATDKDNQEGQSNNHGRRSHSRDRDSGFKRRRSNSSHNGQSQSQSRTRKKIS >NZ_CP038908.1|WP_129556641.1|1580106_1581369_+|cation:dicarboxylase-symporter-family-transporter MKFNGLVLIALITGVGLGALARFSLVSDHFAMADLNSVFHLVGEGYIDLLKMLVIPLVFTSLVSALLSLSDKGAANFRLSAIRFVVMLLVLTGISAGIGMLMGMAFNLGTGLVIPGVDLQPGHHYTGVVDTILGMLPTNPIAAMASGNAAALALFSIFIGAAALVVKKSKIADIKPFEGFIQSTFEISKQLARFVVALTPYGVLALIANVASATGASSLLSVLSYLVAIYVAMALVFALHLVILAAQGISPTYYLKHAYKALLVAFTTRSSFGTLPVTEETLRQKFKIHPDLATFAPTIGSSIGFNACAGVFPAMLVVMAMTIMHEPVTWQIIVMVMFINAIASLGISGIPGTASIAAAVTLSTLGLPYAVIAIVQGVDPIVDMGRTATNVNGVMASALTVDKYLATEETQARSIKAEAL >NZ_CP038908.1|WP_052047040.1|1597034_1597973_+|IS3-family-transposase MPRATYYRQQKKGTLEKKPAFKPSNAIDNQEKDQIIELLHSERFIDSTPYQTFYTLLDEGHYYCSIRTMYRLLTEHSGTKDRRIQRNHRNAIKPELIATTPNQVWSWDITKLLSTKRLVYYHLYVILDIFSRYAVGWLIADRECQDLAYQLIEATALRQGVQKGSLTLHADNGPSMTSGTVGDLLENMGIIKSHNRPYTSNDNPFSESQFKTLKYCPQFPKRFDNIKEAELFSQDFFKWYNSMHYHSGRCFLTPESVHYGLSDGILDKRHDTLMSAYIENPSRFNNKPPVRKILKPAYINPPQTVIIQGVQK >NZ_CP038908.1|WP_155047165.1|1597998_1599564_-|amino-acid-permease MIGSGWLFSSYYAAKITGAAACLSWITTSVVILLLGLCLAEIATLYPKRGLMARLLTLSHNKEFAFICTISTWLGLTAVIATEAEGSVQYISSLSDSFGPMIFNNQIHQLTSLGLIIAIVMILSFGLINFWGIKILSKSNVALTTCKIAIPLVTGLSVMFAAFHHQNFHNDHAPLLNYGPSSVFIAMIGAGMIYSFNGFQNILSFSSEARQPTRDIPLAIIFSILITLAIYLVLQIAFIGALSPHILEQGWQSLNFTSPFVQLTALLNLNFITIILYADSVISPSGTGLIYTGSTTRLLTAMSQDGQMPRFFNKIGAYNFSRRSLIFTVGFSIIFLLLFRSWSALVSFLSLFYVISYMSIPLSLSKLHQQNLVGKFRAPLPKLLLPVIFAFLSLLFIFSKFPYTGDVALFTVIAYAAYLLSQFKLATDLNHFKKTVKHSSLMVIYIIILAALSSIGPKEYGGYNLLSKLQFFPSVIFVSFIMYRLSLAWIRDKATETQVIKISPTLQRNVSGEMRQNYRFS >NZ_CP038908.1|WP_036778182.1|1599770_1600598_-|thioredoxin-domain-containing-protein MKNYLFASLSLVTPFVLSNAFAANTTTFTAAQQEKIGEIAAQYIINHPEVLIQAGQKLQQQQMKAQEKQQITAVLHAKKQLLSDPKTPTVGPSNAKVAVVEFFDYQCVFCSKVAPAIEKIMKDNPKVKFVFKDFPIFGQRWPTSTYAAEVGLVAYKQGGAKMYMNYHNGIYATGKDEGKLTNKDVDMVAKKAGVDLTKDKTLLSAGKTPPPSIQANFQLAGEALGLRGTPALVIMPTSGANEKNVTVFAGYPANPQGGTAAAVTAIQQAIDKASQ >NZ_CP038908.1|WP_075273540.1|1600964_1601576_+|hypothetical-protein MSKVIAICPLLVGCTFLCSTSAESESDPSVSQDAQFITEVARSVMQDDISQSIVTECKSMNTESQSALIAEKNHYVPTKKAIQHMETAILEYGSNLADHYEREHPSTMLVTYRGWITSKQCINKLKETVMRAAQALICLGKEQNAVRDSAQLLLIDTVEAVAMKQDYGVSEDQEDQPCAIGWSSTMTYYGLKALDQALVTSKH >NZ_CP038908.1|WP_129556527.1|1601760_1602021_+|hypothetical-protein MSANSNSKIDVIALTVSGQVEKKIRVECNSLATDHVTDDLASKTNRDRAWQIYSSSYERCMAEALDMMRQDLLAVSIQPQLRPEIN >NZ_CP038908.1|WP_155047164.1|1603013_1603436_+|response-regulator MIEQAPHYTALVVDDSLIARKQVKKALDTIGVKSILMRNGREALDYLINVLPGAGGDITQKYLMVIADVEMPEIDGYAFIKACREHPGLKNLFIILNTSITGVFNENDIQQTGCNEFIGKVNPQKIIECARMQILNRASQ >NZ_CP038908.1|WP_036777256.1|1603858_1604059_-|hypothetical-protein MTGDEKKKAAKTSTRENQSSLIDSEASSLPPTLLFYTDSLSLIDQGQDIPIGSKKESSCPTCCLVM >NZ_CP038908.1|WP_052104738.1|1604433_1605240_+|methyltransferase-domain-containing-protein MKLGEGSLKEKMVFIERATDQSIPTPWQLFSRLIYRYWFLKYPWQMSKFLGRQSKRLWLWFWLSSCNRSSGLKKVDNSIKNTLEKYGLTLGFFKAAIANPRATGAVLPSSRFLVREMVTHVVQMPERYVVELGAGTGVITQELLSSGVSPGQLIAIEYDKNLARKLAARFPDILVICGNAVELERLLGEKNGCVSTVISGLPLRSLPNQAVVHILQQIPSVLVSGGSYIQFTYDFKKKEEYYPGDIELSLSKKIWLNIPPAKVDVFTK >NZ_CP038908.1|WP_016210795.1|1605345_1606317_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MFKSKLIVLTLSIWATCFYGNVVAQTKTSTNNNTKIARVLVNDWTSQIVLSKITAHILASINYQVTFVQSTSNRQWYKLKSNLADIQVEVWQGTMADKYNQLIKSGDIVDAGNHVAKTREDWWYPEYVEKQCPGLPDWKALRKCYKIFATPKTAPKGMYLGGPWEKPDRARIRALNMNFKVIQVKNGDALWIELEKAVKQKRPIVLFNWTPNWIESKYKGKFIEFPHYSAECENNPKWGLNSKFPWDCGNPKDGWLKKIARSQFQKEQPCAFELLKNINFTNTMIANITAAVDADKMSYDEAAQDWLNQNKALWHSWIPSSCK >NZ_CP038908.1|WP_016210801.1|1606298_1607270_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKNTIKNTLVFPALLVFGSSFLQTSIAAKTKEPVRIIVNDWTSQIVLSKITGSILSDMGYQVKYINSKSNGQWFKLKNNQADIQVEVWQGTMAKKYNQLIKTGDIVDAGNHAAKTREDWWYPEYVEKQCPGLPDWKALEKCYKIFATSKTKPKGMYLGGPWEKPDRARIRALKMNFKVIQVKNGDALWVELEKAAKEERPIVLFNWTPNWVEAKYKGKFVEFPKYSPKCISDPKWGKNSKYPWDCGNPKDGWLKKIARTEFSKEQPCAFELLKNISFTNAMISNVAASVDADKMSYDQAAQQWLDSNKKLWHSWIPATCSKVN |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038908_4 | 2821991-2822111 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038908_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP038908_4
>4.1|2822028|47|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038908_4
The CRISPR arrays of NZ_CP038908_4 >merge|NZ_CP038908|4|2821991-2822111|CRISPRCasFinder TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCTCGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGCTTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT >NZ_CP038908|4|3|2821991-2822111|CRISPRCasFinder TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC TTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT
>NZ_CP038908.1|WP_155046943.1|2821578_2821719_+|hypothetical-protein MIEDPPALRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP >NZ_CP038908.1|WP_075275117.1|2821123_2821546_-|hypothetical-protein MQLSYLELNSVEYIQKVLANITLLDQDACALNKLRVVYSKITQQIESGQLKVHGLGGGSAITFKGERTKVPEGISKIWYEITDMQGNFRWMDNVSAVLNKVKVEANNRSGYRGLTAIGLFFGSYRDAQTKDLYSKISQAL >NZ_CP038908.1|WP_016211905.1|2820469_2820880_+|hypothetical-protein MKLNTKETFTRFMGLFIAVDCLYYLIGLTIFSAIPSGNLIAFVNIFTSFCGLVTGILLFIKIYDKWYTPFVAIEFFTCIYWFFLTLGETVSNTQYASLSKVITSLNYDLFSCFMGVIACLLWLKFAFSFKANKLAN >NZ_CP038908.1|WP_052047041.1|2819937_2820201_+|hypothetical-protein MARSVRIVPQGVYHIWREMTDSEGKFKWPSDVCAAINRSKVQAEQRKDYRGLTAVSLFFGSYRDTHTKALYSQISQGFKTNTHQYKD >NZ_CP038908.1|WP_098082812.1|2819189_2819705_+|hypothetical-protein MLSTPWLAALDLDLDTDDDIIKTKNLSALDVTCRLIISRYNLYQRENFFQVFNNPKCFYQSYQYLEILGLNQAASIQQLLDGPFEKYKDTWSTLSYLGLDCRENAQRILTNPQSFEQDFDGLIALRSAYESIVKEMEANQLKAHGLAGGNPIKFKGETVSVATSVGILHIQ >NZ_CP038908.1|WP_054300492.1|2818034_2819045_+|protein-kinase MPKIVWESQENRTAAEQQAAEWRIAKKYLAGRAPGTQLNPKHGQHKISFKDPKTNEEVYLTHRYLLGNKGEIFVKSNGYLLGKTPRNLVTFGQTQDGQVWAIKESCEIGKDLKESEIACDLDAAKKMFKSNSKCYQVYRFLGLPLDQYLRQNRLTEEERLDLAIKVSQAVHHLHIGTQSRSHTCYAHLDLKPSNICIDHEGQVHLIDYGFSKSLAGRLTHRKGTSSYLSVDYASASKEALDIFALLRTLYLPKKFKTYTQKAKKSRDHHEYILNDDIISKNGLLYALLDTEDGKIKHTRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP >NZ_CP038908.1|WP_016210676.1|2815649_2817731_+|kinase-domain-protein MPKVIWLAQENRTAEQQQAAEWRIAKKHLTGKPPGTQLNPQSGKKVKAYEDPETGEKITLTHRYLIGHEGEIFVKFNGQALGQGICGEVTFGQTEDGHMWAIKESSEKPKNSQEGKIAVDLGKAKNYFKYQGKHYQVYYFLGTPLDKYLKEAKQSLTQAQQYDLAIKMARVIYHLHTGKYSKEKTSYAHLDLKPENFCIDDSGELHLIDYGLSEILPGKLDNEIKGSPAYLPFSVAEASKEELDIIALLRSLYLPLCFKGLGKVRNRGPAAQQLNTQWVFSSTILSQNSTLSQLLDTTKGEVVNLSALDIACQLILLKYGLHSSENLEKVTANPQQFEQDSQLLESLGLNQAAYLKCMLEQRDLVSVFKEYTDKFLILNQFDLNQPIYIKKVLANLEQFSQDYQYLESLGLNQAAYLKCLLEQRESIDLLKEHANKFLTLNQYELNQSIYIGKVLANPEQFNQDYQYLKSFGLNQAAYLKYTLDQHDQFAYNCQRLKDLKLNSRNYIEEIINNPERFEQNYQHLETLGLNQEIYIRPMLNNPQRFGEYCQQLKDLGLNQASDLARALDHPQRFQDDLPSLLKLRKIYDDLSNEIASDRLKVRGLFAGGITVNCQGQSKLVPRGIGSIWLEIIDKQGNFYWMKDVSAALTKSTDQARLRSSSQQQAEGQNSNLFFATYRDPKTQAVYDRISQLP >NZ_CP038908.1|WP_016210671.1|2813934_2815194_+|6-phosphofructokinase MNNSKNLFYAQSGGATAVINTTACGVIETARQKEEINNVFVGHDGIIGALAEELIDTSLESAETIRQLYHTPGSAFGSCRYKLPPIGQNDEVYQRLFSVFEAHDIHYFLYNGGGDSQDTTNKVSIMSKKLGYPLKCIGLPKTIDNDLMHTDNCPGFGSAAKYIATSIKEAALDVAGMARTSTKVFLMEIMGRNAGWLAAAAGLAAEQDGDAPHIILFPEIAFNEKRFLQRVKEVVQTHGACTIAISEGLRDEHGDLLIKSSSIDAFGHVQLGGIASKVAALIKHNLGYKYHWALPDYLQRAGRHLGSKADVEQAYAIGQAAVEAVIAEKDNIMLAIERTSNSPYQWQVGEVCLNDIANHEKFMPKEFISEDGYHITEACRDYMSPLIAGECIPPFKNGLPVYARLKKQTIPPKLSPFEI >NZ_CP038908.1|WP_036778297.1|2813328_2813802_-|hypothetical-protein MMQIIWRLCTFRAGPQDIVYSVFGLQLICVIHFILQWGWLSLRLPLLHSALVALFSAALLLALPYLVVNSAKYAGRFLQTALALQLVSCVLHILLLALFLLHSPLVLLNYYLIFSFIWGAALFSHIIKEAIVVKLWQAVLIVLIYFIVRTVSVIGLM >NZ_CP038908.1|WP_036778294.1|2811937_2813320_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase MHIHILGIAGTFMGGVAQLARAKGVTVTGADLNVYPPMSTQLAQAGIAVTAGYDDEFLKLTKRPDCVVIGNALSRGNPAVEATLNENMPYCSGPEWLAREVLHGRHVLAVAGTHGKTTTSSMLTWILEHAGLQPGFLIGGVPKNFGVSARLGQGEYFVVEADEYDSAFFDKRSKFVHYQPKTLVLNNLEYDHADIFDDLQAIMRQFHHLVRTVPSNGKIIVNSIDENLHTVLEMGCWSPRVSVGLQAGDITAEVIQADGSHFEVICHGMRYEVNWSLIGQHNVMNGLAAIGAALQVGVDLKHACEALTLFQGVERRLQVFGQSQGVTVYDDFAHHPTAIATTLEGLRHRVGTEGRVIAVFEPRSNTFKMGVHQDNLAAAFSCADRVYFYQPTGLSWQIADNLKKKEQFNYRVRHSIDELLQALTDDGLKDHDHVVVMSNGSFEQFHQRLLNQLELECENA >NZ_CP038908.1|WP_054300282.1|2823488_2823953_-|IS630-family-transposase MDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR >NZ_CP038908.1|WP_155047228.1|2824009_2824492_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MVECADSRHATLCDADSRGFIIVAFCSAILHHWMCKIPTEVATLTYDLRIRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH >NZ_CP038908.1|WP_129556590.1|2825346_2825742_+|nucleic-acid-binding-protein MTELCPCCSQKPYSSCCQPFVSGQTLPATPEQLMRSRYTAYTQANIDYIIATMQGEALNGFNRNSATTWAKQSTWLNLQVLSAPAVKQDGQEGFVEFIASLQNQGKIECLHEKSRFIKNKDQWFYVDGQQH >NZ_CP038908.1|WP_032126312.1|2825738_2826533_-|M48-family-metallopeptidase MIVLIFALCTLEHLGYDGAMKIVKKLKQLKTYQLTVDNIDYRISHTGRTKTYGLSIRDGKVHMNVPKRMSKQRVCQAIDDNQAWVRENIRFSLASTKQHQSLSSGSLISYLGKQYSLKLTYVNQSVVFYDDAFLMGVPARVKSENHQAYIRDKLSAWFKEQALLRFEQRTFFIANRMQLKPTKVSVRSYKARWGSCSSSGCLSFDWKLLQAPEFIIDYVIVHELSHLKHFDHSPAFWQLVSLYYPEHKVARQWLKNNQTSLARL >NZ_CP038908.1|WP_036778479.1|2826711_2827437_-|D-Ala-D-Ala-dipeptidase MLPDLPICHNYKTVDKQALNELQQQAACVELKPSSRIMCLNEYYQQKLPGALSVMYTRQSVYLKLLAVLENLAPHFAFAIFDAYRSVACQKTLFEQIYRELYQRHPGRSKEWLEIEVRKYVSHPHEPSRFAVPPHNSGGAIDLTLMDLRTNTALDFGTEFDNTTTLSQTDYFERDYSANLGISSERWLLIRQNRRLLFNTMKQEGFTDFVSEWWHYDLGDCLWADAVGSSWFYDSMEAEVN >NZ_CP038908.1|WP_016211759.1|2827682_2828870_+|S-methyl-5-thioribose-kinase MNKYQKLNAEKAIEYVKQYNIFFTHYEHLRCEEIGDGNLNLVFRLINDNDNKSLIIKQALPYARCVGESWPLSLDRARIEAESTQIQANICPGYVPKIYHTDNTLALTIMEDLSDHVVLRNGLISGQSYPELPQQIGSFLAHTLFYTSNLYLDSHLKKQYLRQFINPDLCKITEDLVLTDPFFGSERNHYDQDIQTQVTELQNNQQLQLNVAALKLKFLSSTEALLHGDVHTGSIFVTKNSMKVFDSEFAYYGPMGFDIGLIIGNMVLSLCSHFIQNNLNSVNYCLNAIEIIWQTFESKFTTLAKEHTQDLAFKNDIYINHTIKNIFADTLGYTGCEVIRRIIGLAHVEDLDGMENKTLKNKAEILALTIGQQFILEQNQLHTIDNVIQKLQGHL >NZ_CP038908.1|WP_016210935.1|2829446_2829989_-|acireductone-dioxygenase MSQLTIFHANNSHQMIFQSSNQREISSQLAHVGIRFEQWQAHAKVSAEDSEEHILTMYAEDIHRLKKQGGYQAVDVISLDSSHPDKALLRQKFLSEHTHSEDEVRFFVKGKGLFCLHIDDKVYQVLCEQNDLISVPDHVAHWFDMGSEPEFTAIRLFNNTEGWVAELTGSNIAKRFPLLD >NZ_CP038908.1|WP_016210943.1|2829985_2830672_-|acireductone-synthase MIKAILTDIEGTITRISFVKDVLFPYAEKQLPEFIHCFCETPEVFAQLDAVKNEINNQQATIAQLIDTLLAWIREDKKITALKQLQGMIWEKGYQQGDFTGHLYSDAVEFIREQCKRNIPVYVYSSGSVKAQKLLFSYSDFGDILELFSGFYDTKIGGKKEMKSYQNIIEELNIQAENVLFLSDIAAELDAAKQAGLKTCQLVRDNQKPSKHHPWVNNFNKFIIQDYS >NZ_CP038908.1|WP_036778484.1|2830675_2831287_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase MQNNNDVVNQLITAGAWISEKGWVPATGGNFSARLADGVVVTASGYDKGCLTEASFCQFDLEGNQFTGTGKPSAETALHLAIYQLDDHAKAVLHTHSIAATTLSRYIAESQLAIHGYEMQKSLAGIQSHLETINIAIFDNDQDIDALVGKVNKAHAKKPLRHGILIRGHGLYAWGDSILEARRHLEGLEFLFMCELERFKLQG >NZ_CP038908.1|WP_016210944.1|2831333_2832353_-|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase MQDLLSTALRYEKNSLYILDQTLLPHKMQWLECCDVDTMTEIIQSLRVRGAPLIGIACSVLVAHLAAQGMEKRELISAIAVLKASRPTAVNLMNNLQQMTLALKVENYRQALIKTAEKLFFEDVLLCQKMAENGAKLLATQQNLLTHCNTGSLATVGMGTALGVIQQAHTNNDNIHIYVDETRPLLQGGRLTAWELSQLNISNTIICDNMAASLMAQGQIDAVLVGADRIAVNGDFANKIGTYNLAVLAHYHDIPFYVVAPYTTVDCDCLHGEDIPVELRDGDEVRGVKGAFGKIVWSPAESQVYNPAFDVTPAQLVTRWILDTGVFGLDDIKAGVLAK |
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1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to position: 30174-30211, mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to position: 53421-53458, mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
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29. spacer 1.1|364320|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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32. spacer 1.1|364320|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggctttaactccgaaaataaacagacgataaaaaatag CRISPR spacer attaggctttaactccgaaaataaacagacgataaaaaatag Protospacer ******************************************
33. spacer 1.1|364320|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggctttaactccgaaaataaacagacgataaaaaatag CRISPR spacer attaggctttaactccgaaaataaacagacgataaaaaatag Protospacer ******************************************
34. spacer 1.1|364320|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggctttaactccgaaaataaacagacgataaaaaatag CRISPR spacer attaggctttaactccgaaaataaacagacgataaaaaatag Protospacer ******************************************
35. spacer 1.1|364320|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggctttaactccgaaaataaacagacgataaaaaatag CRISPR spacer attaggctttaactccgaaaataaacagacgataaaaaatag Protospacer ******************************************
36. spacer 1.1|364320|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggctttaactccgaaaataaacagacgataaaaaatag CRISPR spacer attaggctttaactccgaaaataaacagacgataaaaaatag Protospacer ******************************************
37. spacer 1.1|364320|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggctttaactccgaaaataaacagacgataaaaaatag CRISPR spacer attaggctttaactccgaaaataaacagacgataaaaaatag Protospacer ******************************************
38. spacer 1.1|364320|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggctttaactccgaaaataaacagacgataaaaaatag CRISPR spacer attaggctttaactccgaaaataaacagacgataaaaaatag Protospacer ******************************************
39. spacer 1.1|364320|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggctttaactccgaaaataaacagacgataaaaaatag CRISPR spacer attaggctttaactccgaaaataaacagacgataaaaaatag Protospacer ******************************************
40. spacer 1.1|364320|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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41. spacer 1.1|364320|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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42. spacer 1.1|364320|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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43. spacer 1.1|364320|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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44. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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45. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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46. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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47. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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48. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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49. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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50. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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51. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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52. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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53. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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54. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata CRISPR spacer ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata Protospacer ****************************************
55. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata CRISPR spacer ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata Protospacer ****************************************
56. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata CRISPR spacer ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata Protospacer ****************************************
57. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata CRISPR spacer ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata Protospacer ****************************************
58. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata CRISPR spacer ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata Protospacer ****************************************
59. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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60. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata CRISPR spacer ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata Protospacer ****************************************
61. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata CRISPR spacer ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata Protospacer ****************************************
62. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata CRISPR spacer ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata Protospacer ****************************************
63. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata CRISPR spacer ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata Protospacer ****************************************
64. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata CRISPR spacer ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata Protospacer ****************************************
65. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata CRISPR spacer ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata Protospacer ****************************************
66. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata CRISPR spacer ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata Protospacer ****************************************
67. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata CRISPR spacer ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata Protospacer ****************************************
68. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata CRISPR spacer ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata Protospacer ****************************************
69. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata CRISPR spacer ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata Protospacer ****************************************
70. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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71. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata CRISPR spacer ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata Protospacer ****************************************
72. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata CRISPR spacer ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata Protospacer ****************************************
73. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata CRISPR spacer ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata Protospacer ****************************************
74. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata CRISPR spacer ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata Protospacer ****************************************
75. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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76. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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77. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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78. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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79. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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80. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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81. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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82. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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83. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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84. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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85. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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86. spacer 1.2|364387|40|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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87. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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88. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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89. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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90. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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91. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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92. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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93. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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94. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
95. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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96. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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97. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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98. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
99. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
100. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
101. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
102. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
103. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
104. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
105. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
106. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
107. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
108. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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109. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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110. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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111. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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112. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
113. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
114. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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115. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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116. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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117. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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118. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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119. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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120. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
121. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
122. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
123. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
124. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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125. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
126. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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127. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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128. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
129. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
130. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
131. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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132. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
133. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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134. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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135. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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136. spacer 1.3|364452|42|NZ_CP038908|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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137. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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138. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
139. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039213 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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140. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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141. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
142. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
143. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038897 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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144. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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145. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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146. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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147. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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148. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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149. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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150. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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151. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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152. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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153. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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154. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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155. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
156. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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157. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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158. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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159. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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160. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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162. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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163. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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164. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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165. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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166. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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167. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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168. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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169. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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170. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033943 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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172. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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173. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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175. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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176. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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179. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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180. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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181. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013780 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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182. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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183. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050946 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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184. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050947 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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185. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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186. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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187. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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188. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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189. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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190. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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191. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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192. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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194. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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195. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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196. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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197. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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198. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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199. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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200. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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201. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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202. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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203. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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204. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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205. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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206. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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207. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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208. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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209. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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210. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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211. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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212. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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213. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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214. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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215. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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216. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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217. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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218. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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219. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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220. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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221. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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222. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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223. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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224. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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225. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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226. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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227. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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228. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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229. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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230. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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231. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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232. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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233. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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234. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048070 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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235. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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236. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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237. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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238. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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239. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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240. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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241. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039207 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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242. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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243. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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244. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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245. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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246. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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247. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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248. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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249. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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250. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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251. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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252. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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253. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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254. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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255. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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256. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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257. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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258. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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259. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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260. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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261. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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262. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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263. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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264. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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265. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** ***
266. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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267. spacer 3.1|1595933|31|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
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268. spacer 3.1|1595933|31|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016317 (Bacillus cereus strain M3 plasmid pBCM301, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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269. spacer 3.1|1595933|31|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to CP020755 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid pLDW-16, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
cctaggattaagtcagaatcgtattgaaaaa CRISPR spacer atataaattaagtcagaatcgcaatgaaaaa Protospacer . ..***************.* *******
270. spacer 3.1|1595933|31|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021062 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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271. spacer 3.1|1595933|31|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NC_020385 (Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-328, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
cctaggattaagtcagaatcgtattgaaaaa CRISPR spacer atataaattaagtcagaatcgcaatgaaaaa Protospacer . ..***************.* *******
272. spacer 3.1|1595933|31|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NC_018492 (Bacillus cereus FRI-35 plasmid p01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
45576 : 89168
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038908|45576:89168|DBSCAN-SWA CTCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCTATCGGTTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTAACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCACTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTAGCATTGCAATAACCTTCAACCATCATTGGTGCGATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCTATAAAGTTAATTCGTATTGATTTTTTACCTGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGGCCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTCTCGACTTTTTCCAGGAAAGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATTTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGAGTTTTACCCGGATTCTGATCAATAAATTTTTGAAATTCTTTCATATCACTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAACCTTGCTTTGACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGAGTGTCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAATTTGTGTAATAGGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAATTCTTAAGTCATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAAAATATAATTTTTTGTGATGAAATATTTAATCATTGATAATGAGTGATCTCTTTTTTATTGAGTTGGTTAATAATTCTAGGCTGAGATAATTAGGTTTAGATAAAGTACATTTACTTTATCACTGCATCAATTTACTCATGATTGCTTGGTTTGGGCAATAGCCCTAAGCCAGGTAGGATCACTCCCCAAGGTTGCCAAGATAGGCCTAAAGTTAAGCCAAATAAATTAAGTTGCACCCCTTGCCGGTTTGATATAATTAAACCTAAAACTCCCCACAGTGAAAGACGATAGCCAGTTTTATCAGCAAGTCTGGTTATTATTATTTTTAGTGACACATAGTCTTTGCCTAGTGCATTGGCTGGCATGATTGCTCCAAATTCAGGCGTTTGATCTAATATATAGGCAATAAACGTATTGCTATTTGGTCCAGGCCATGCTTGATAAGTGTGTGCATATGGATAGCTTTTAGCTGCTTTAGCGATCTTTGTGATTAATATTTCTGCTTTTTTCCCTGTCAAGCTTTTCACAATGATGGGGGTGTGCCCAAACCATAGACGGTCAGGCGCCCCTGATGAAATATCAACAATAGGACGGTTGTGATACGCATTCCAGCCAGTTACTTGATAGTTTGTATAGTGGGTTGCACCATAAGGTTTTACAGCGATCCAGGTATGCACGGCAAACAAGCCACGCCAATTAAATGCGCGAGCTTCATATAGCTGTACGACGGCTTCTTTAAATTGACCGGCCGTAGGGGCAATTCCAATAGAATGGCGGTCAGCGGTTTGCCAATTTTGACCGAACTGTACTTGACCTGTTACTGCGAGCCAGATTGGCCCGATTAAAAGGGTTATAAGAATGATTATAATTATAAAAAATGTTTTCAAAAGCATACACTATCTTTAATTTGTCTAGATTGCAGTTAGCTTATCAAGAAACTGAAAGGCACAGCAATATACTTGTCTTTTGCTAAACGCTTTTTGTTTTATTAACACTGAGTTTGATGTCATAGACCATGAAAAATCAAGCTTATTGTGTTACTTGGGGTTATTTAATAGAGATGTACTTAAATTTAGGGTTCTGTTAGCGTGAGAGCTGTATGTTAAAATTCAGTGCTTAAACTTTATAGATTTTATGAGTTTTTATGTATCATAACCTAACTGTATTTTAAAGTATTAAAAAGAGAGTGTTGTCGTGAAAAAAACTGTAGTTTTACTTGTACTTGATGGATGGGGCCATTCTACTGATACTAATAGCAATGCGATTTTGAATGCGAATACGCCTGTTTGGGACCACTTAACCGCTACGTATCCGATGACGCTAATCTCCGCATCTGGTACGGATGTAGGCTTACCGGCAGGTCAGATGGGTAATTCTGAAGTCGGTCATTTGAATTTAGGCGCGGGTCGTGTTGTTTATCAAGACTTATTGCGTATCGGCTGTGATATTGAAAGTGGTGCTTTTTTTGATAATAAAACACTGACAGAGGCCGTCGATACGGCGGTGAATCAAGATGCGGCTGTGCACATCATGGGATTGTTATCGCCCGGTGGTGTGCACTCTCATGAAGATCATATTGAGGCGATGATTGATTTAGCTGTGCAACGCGGTGCAGAAAAGATTTATTTGCATGCCTTTTTAGATGGCCGTGATACGGCACCGAAGAGTGCTGAGAGCTCGCTTGCTCGCTTTGAAGAAAAATTCGTCAAGAGTGGCAAAGGCAGGATAGCCAGTATCATCGGCCGTTATTATGCCATGGACAGAGACCAGCGCTGGGAGCGTATAGAAGCGGCTTATCAGCTGATTACAGAGGGTAAAGCAGAGCATCAGGCTAAAAGTGCAGTTGACGCTTTGCAGGCCGCTTATGCACGAGGTGAGCGTGATGAGTTTGTGCAAGCGACATGTATCGGTAAGGCTGTGGCCTTAAATAGTAATGATACTTTGATCTTTATGAACTTTAGAGCCGATCGTGCCCGCCAACTCTCACAGGTGTTCAGTGACGAAAGCTTTGCTGGGTTTGCTCGTGTAGTTCATCCTCGTCTGTCGGCTTTTGTTAATTTAACTGAATATGCAACGAGTATTAATGCACAGGTAGCCTATCCATCATTGACACTCAACAATGTGTTAGGTGAAGTGTTGGCAAAAGCGGGTAAAAAGCAATTGCGTATTGCTGAAACAGAAAAATATGCGCATGTAACGTTCTTTTTTAATGGAGGTATCGAAGAGGTGTTTGCCGGTGAAGAGCGCGTGCTGATTGCCTCACCGAAGGTGGCAACCTATGATTTGCAGCCACAAATGAGCGCACAGGAGTTAACGGATAAGCTGGTCGCTGCAATTGCGAGTCAAGACTTTGATGCGATTATTTGTAATTATGCTAATGCGGATATGGTCGGTCACACGGGGGATTATGCGGCTGCGGTACAGGCGATTGAAGCGCTGGATCACTGCCTTAGTCAGGTTGTTGCAGCTGGGCAGCAAGTAGCTGCGGATATCTTGATTACTGCTGATCATGGTAATGCTGAGCTGATGGAAAATCTTCAAACTGGCCAGCCTCACACGGCCCACACCAGCAATTTAGTACCGCTTGTGTATATAGGCAAAGATGCTACCCTAACTAAAGAAGGTGGTACTTTATCTGATATTGCGCCGACACTATTACAGCTGTTAGATCTTACAGTTCCAGTTGAGATGACCGGCCAATCTTTGGTGTATTTGAAATAGCCAATAAAGTAAGTAAAGATAACGATATAAGATAAAGATGGGCCACTGAATACAGGTGGCCTATTGATATGCAGCGATCGATTCTAATTTTTTTTCTTATCATCTGCGTTTTTTTATTTTTTGTTAGTTTTATAAAGGTGATTAATGCAGCAGATAATCGTTTAGTAAAGCTACGCAAAAAAATTGCAGTACTTGACCAAAGCTTAAGTTTGGACAAAACAAAACGTGCAGATATAGAAAAAAGAATTTTCCTGATTGAGAATCATATTAAACAGGCTAATGTATTGATTATTAATAATCAAAATAATATCAATGATAAAAAGCTAAAATTAATTAATCTAAAAGAAAAACAGCAGCAGCTAAAGAAAAGTTTGTTTAAGCAGCGTCAGGAGATTAATCGATATATTAAAACCATTTTTTTGATGGGTCGAGAGCCTTATTTAAAGTTGATTTTTAGCCAGCAAGATCCGAAACTTTTTGGTAGAATGCAGCACTATTTTCAATATATTATGAAAGCAAATCTTGCGCGTTTAGATCAAGCTGAGCAAACAGAGCAGGCACTGAATGAGACAAAAGCGACCTTGCTTGTAGAAAAAAAACAGTTAGAGCGTTTAATAAAACAGCAAGAAATTGATTTAAAGAAACTTTCTAATGATAAGCAATTGAAAGATCAATTAGTTACTATTATTTCGACCTCTATTAATGAAAAAAGTAAGCGATTGGTTGATTTGTACAAAAATGAAAAGCGCTTATTAGCATTGATAGAGCAGTTAGATCAAGAGAGTTTAAAATTTGTCCAAAGCCAAGTAAAGTCATTTAGTCTTATGAAAAAGCAACTGCTTTGCCCTTTTAATTATATTAATTATGATCAAGCTATTAAAAATTTAGCGATGCTAAGAAAAAACAAGCCTGTATTTATTCCAATAAAGCAAGGCAGTCCAGTGCAGGCGGCATATTATGGCCAGGTTGTTTTTGCTAATCAGTTAAAAGGCTATGGCCAATTGGTTATTATTGATCATGCTGAAGGTTATATGAGTTTATATGGTTATAATCAGAAATTATTGGTGAGCAAGGGGCAATGGATTTCTGCTGGGGACCTGATTGCATTGTCTGGACAGGGCAGTGAGGGTATCGGTATGTATTTTGAATTACGTCATAATAATCAAGTTGTTAGTCTAAAAGATTGGTGCCAGAAAATAAACTTGGCATAAAAATAGCTTATATCCTTTTACGAAAATAAGGGGATATACATGAAGCGTTTATTAAAGTACTTGATGTGCTGCCTGATGCCATCATTATTAATGACATTATCTGTAAGTGCATC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42 | Moraxella_phage(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
127258 : 181533
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP038908|127258:181533|DBSCAN-SWA 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58 | Staphylococcus_phage(42.86%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
200549 : 271546
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP038908|200549:271546|DBSCAN-SWA 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58 | Acinetobacter_phage(25.0%) | tail,transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
274887 : 327551
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP038908|274887:327551|DBSCAN-SWA 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57 | Acinetobacter_phage(33.33%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
331919 : 385446
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP038908|331919:385446|DBSCAN-SWA 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56 | Escherichia_phage(37.04%) | integrase,transposase | attL 345882:345941|attR 364938:365801 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
394072 : 551745
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP038908|394072:551745|DBSCAN-SWA 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166 | Escherichia_phage(24.32%) | integrase,transposase,head,protease,tail,capsid | attL 409323:409382|attR 481493:482668 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
635977 : 736449
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP038908|635977:736449|DBSCAN-SWA 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108 | Escherichia_phage(43.75%) | integrase,transposase,tRNA | attL 702764:702823|attR 716975:717148 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
744148 : 792101
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP038908|744148:792101|DBSCAN-SWA 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51 | Synechococcus_phage(33.33%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
813571 : 916167
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP038908|813571:916167|DBSCAN-SWA ATTATTCCTCTTTCATTGCCCATAAATACAATTTCATATCAGGGATAAAATCACTGATATGCATAGCAATGCTGCGAGAGTGAATGAGTGATTCCCATTTATCATGAAAGTGATTAATTTCAAAATATGATGTATTTTCATAAAAAGGGATGTTATAAGGAAGGCGGATAATCGTATCAATAGGAATGCCAGGTAATTGCAAACGAATTAAGTCATTGATTTCATCAGGTGAGGCGATTTTAATTAAATAGGGGAGCTGATTCCGAATAATATCTTTATTAATTTTACCTGAAACAGCAAGAATAATACGATGGTTTGGCGTAACTTTTTCTAATGAACCAAGGAACACACTGTTATCCATATAGTTAATGGGTATTTCAATGATATTATCTTCAATGACATAATTCAATACTTGGTGTAGAGCCTGATTGAGTTTATAAAAGCTGTTATATAGATGAATGTGGTCATAGGTGATTTTTTCATAATAACGAGGTTTTGTTGTGAACGTTGCAACTTCATTAATGAGTTGTAACAAGTATTCAAAGATTTTTATAGGGGGAATATGATTGTGATCAAGTGCATGCTCTAGAAGTGGTAAGTAGCGATTGATTGATTGTAGTATTAATAAACCGACCATACCTCGATCTATACTGCTATTATCAGCAAAGCGTGTTGCTAGACTATGGCGACGTTGCTGCAGAATCTGTACAGAGTCTTCAAGTAAGCTTTGAATGGCAGGGTTACCTTGGCTATAAAGTAAGGGCGGGGAGAAGTCTGTACGAAACGTTGGAGTATTATCACTTTTATATTTAGAAAATTGTAGAATAGGGATATACTCAAAATCAGCATTATTATCTGTTGTTAAAAAAATATTAAGTTTACTGACAATAAGATCTTCATATTCATTTAGGCTATCTGTTGTATTTTTAACTTTTTTACGGATTGCGTTATATCTTGTTTTTGATGGTGTGCTTTCAAGGTCAACTTCAAGACCAACTTCATTTGATTTGGTGATGGCTAGATAAATAATCGTATTTGCTTCAATACTATCCAAGGTTAAGCTTGAAATATCACCCTGACCTGCATTGATGAAAGTGCCATCTGGAAAAATTGCTGAACATTGCTGAATGGTAAGCTTGCCTTGTTGTAAATCTATGGAACTAATGGTAATAGATTTGATACCCCAGGCATATTTATGCAAGGAAAGTTGGTATTGCGTGAGTAAGGTTTCAAAATAACGGTCTTGTTGTTGAAAGTGGTGAGGCTTTAAAAATAAGCCTTCAGACCAAACAACCTTACCTGTATCCATTATATTATCCTTCTTTATCTTGCCATAATTTAATCTTGCCATAATTTAAACTTAATAATTATATTAACTGGTTTATAGCAGTTTCTAATTATTTATCGGTTGATATGCATTGTATTGCTATCAAGTTTAATCGTAAGAGTGACAGAGCTTGGATGAGTGCTAATATCAATGACTTTTTTCCAGTTATCACTTGGAAGCTTTCGATAGGCCGTAAAAATGCCAATATAATTTTCTGTTTTTGTAAGTGGCAATGATAAGGCTTTGGCTTGTCCAGGGTAGATTTCGAAAATATATGATTTGACTAGGGAGTCATCCAATGTTTTTGATGGACTTGTTAGGCTTTTAAAATTGGCGAGGTCAAATAGCTCACGCTGTTTCATTGTATATAGATACATAACAACAGGGGATGGATGATGGTTAATATCTGGATTGAGATGATCTGTCGCGCTCACATTTAGATGCAAGCCGGGGTGGCAACCTGTGAGAATAATAGATAAAGTAAATAATAAAATGAGAAGAATATTTTTCATTTTATGGAAAGTTTTCCTTTTATTCTTATTAGGTCTGAAAATAATATACCATGAAAATTTGTGATCACAAGGATTTTAACATGTTGATATTAACAAACTATTAATATTATGTTTTTTTCTATAGAAAAATTTCATAGTTTTTATTTGATTGGAAATGTTTAACAAAACTTTAACTTTTCTTGGTGCTGTCTCTGTTGATATCATTTTTACAGATAGTATAATGGCTGCGTATCCACTCAAAATTGTGCTGGAAAATAGCCAATGAAAATATATAAAGGCACAGAACATGCAGCTTTGACTCGTTGCTATGGTTTTGATAACAGGCTTTATTTGACCGTCTCTATTATGGTGCCATTTGAAATTAGCCACAGACAATTACTTCATGAAAAAATAATATGGAAAGATTGTCTGGAGCAGCTACGTGATTTTGAGCATTTGGATCCATATGGTATTGCCAAGAAAAATACAGATATACTGGTGCAAGGAGCCGCTTATGCACAAGAGTCTACAGAACAGACAACAGTAAAATTGCATTTTGAATCGATAGAAAAAACTCTTTTAGTTTCTGGGGATCGTTATTGGCAGGAGTCGACTATTGGCTCTCAGGCAAGTGAAGCACAAAAGTTTCAGCGCTTAGAAGTAAATTATCGTAATGCGTTTGGTGGTGAAAAATTTAGTCTTAATCCGTTAGGAAAGGGGGTAGCTCCTCAAAAAGAGTTATGGCATTTGCCAAATATTGAATATCTACATGATCGTCAGCTTCAGCCAAGTCAGTCGGTAAGTCCTGCTTCCTTTGGCCCTATTGGCGCTTTATGGCAGCCACGATTAGATTATGCAGGAACCTATAACCAAGAATGGTTAGAACTACATTGGCCTTATTTTCCGGCGGATATTAACTGGCAGTATTTTAATATTGCACCGGTAGACCAGCAACTTCCCTTTATGTTGATAGGAAATGAGCATTTTTACTTGCAAAATATGAATGCAAAGTATCCTCGTCTTGAAGGACAATTACCGGGAATGCGTGTGCGTTGTTTTGTTGAATCTTTGGAAAATAAAGATAAAACTTATGCAGAAACACCCATGCAACTTGATACATGTTGGCTATTTCCAGACTTATTAACGGGAGTCATGGTTTTTCATGGCCAAGTTGCGGTTATTGATGAAGATGCATCTAATATAAGTTTTTTGCAAATAGAGAGTGAATTTTTAAATAACCCTCTTGATATTCAAGATTATAAAAAGAAGTCAACTGATCGAGTTAAAAATCCTGAAAAATATTTGCCTAAATCTGCACATGATGATTTTGATGACTTTAAAGAACTTGAAAGTGAGTTGGAAAGCTTATTTACAAAAAACCGTAAGAAAATGGATTTAGCGAAGCAAGAATATGATAAAACAATGGTTGATGCTAAGAAAAAAGTAGTAAAAATGCATCAGGAGATAGTTGATCATCAGGATCTTGATTATATTAAAAAAATGCATGTGTTGAATCAACCTAAGGCAACAGGAATGGATATGCCTATGTTTAAAGGCGATATGCCTACACCTAAGGGTATGGAGCAGTGGCGAGGTATGCAACTTGATGATTTTAGTCAGCATATGCATGAATCTACAGCTAAAATGTACGAGATGATGGGAAAAATGAATCAGAGTGTGAAGTCGTTAGATGTGAATGACCCTACATCCTATGATCAATATAAACAGCTGATGGAGCAATATCAGGAGAATATGCAGGTTTTATTAAAGTCAATGCAGAAAGTGCCAGGTTAATAACCATGCTTACAAAAACTAGATTTATGCGAAAAATGAGAAAAGGTGAGTTGCTTGAAGGCCAATCAATTAGCTGTATGACTTTTTCTAAAAGTGAGCTAAATCAGTTTAATATGCAAGGGTTAAGGTTTAATTTCTGCCAGTTTATTGATTGTGAGATTGAGCAGGCAAATTTTAATCATGCTACTTTTGAGCACTGTAAGTTTCATTTATCAAAATTTAATAGAATCCAATTAAATAATGCTATGTTTATTAATTGTACTATTGAAAATGTTGACTTTGCTAACATAGCTGCAAATAGTATGAAATTAAGTGAAAGTAATGTGCTTAATGTTACTTTTGATTCGTCTGAATGTGATGAATTTAGCGTAAATGAAAGCAGAATCCACTGTTTACACGCTAAGAGCACTAATTTTTCTGGTTTAAATGTAATGAAAGCTGTGATAGAGCACAGCATATTCGATTACTGTAATTTAGTTTTTGCTAACTTTTATGAGATTACAAGCCGGTCGATTAATTTTTTATCATCAAAAATGACAGGTTGCTCTTTTTCAAAAAGTACATTGATTAAATCTAAATTTTTTGAGTCAAAATGTATTAATTTATCATTATCAATGTGTCAATTGACGCATAGTGTTGTTGTAAAGTGTGATTTTACGTTAGCTGATTTTACAAAGTCTACGCTTTTTTCAGTAAAATTTGATCAGACTAATTTAAAAAAAGCATCAATGTCTTTGGTAAATGCTGAAGATGTTACGATGATTTCTTGTGATTTATTTAAGTTTGGTGCACATAAAGCTTCTTTTTTACGATTAAACATTGCTAAATGTCATTTAAAAGAGAGTAGTTGGTGTAACACTAAAATTGATGAATCTGATTTTTCAGAAGTTCAGGGTTTAAAATTATCATTTTTTAATAGTGAAATTAAGCGTTCTAATTTTTATCGGGCTAGATTAGTTGAATCTGGGCTGTCTGGAGCATTTATTTATCAATGTAATTTTACATCAGCAAATTTATTAAATTCTGAACTATCTAAGGCAAGTTGTATTTTTACTAGTTTTTTAGGTGCTAATTTATTTAATTGTGGTTTTTATAATGCACGGTTTGTTGAAGTTAATATTAAAGATGCTTTGACTAATAAATATTTAGAAAGAGTGATTGATAAAAGTTTGGCGCAAGAAAATCATCAACCTGCTCTGGTTGCTCGAGCAGATCAAGGTGCTATATGTTAAAAGACTATTATTATCAAGAGATAATTTGTGATATTGACTTTTCTGGTCAAGATTTGTCTGGTCTTTCATTTAATGAGTGCCAAATTAATAAATGTAAATTTAATGGGGCTCTATTAACAGGGGCTTCATTCAATCGCTGTATGATTGATCAATCAA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108 | Prochlorococcus_phage(17.65%) | transposase,plate,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
951584 : 999509
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP038908|951584:999509|DBSCAN-SWA 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37 | Staphylococcus_phage(42.86%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1016190 : 1129604
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP038908|1016190:1129604|DBSCAN-SWA 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107 | Staphylococcus_phage(30.3%) | integrase,transposase,protease | attL 1078655:1078714|attR 1099849:1100951 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1150146 : 1195269
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP038908|1150146:1195269|DBSCAN-SWA 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44 | Escherichia_phage(16.67%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1207777 : 1245219
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP038908|1207777:1245219|DBSCAN-SWA 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40 | Orpheovirus(20.0%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1277705 : 1406921
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP038908|1277705:1406921|DBSCAN-SWA 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104 | Staphylococcus_phage(21.43%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1447593 : 1623482
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP038908|1447593:1623482|DBSCAN-SWA 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153 | Staphylococcus_phage(17.65%) | integrase,transposase,tRNA | attL 1480354:1480413|attR 1553248:1553537 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
1639097 : 1745364
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_CP038908|1639097:1745364|DBSCAN-SWA 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102 | Staphylococcus_phage(14.81%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
1763762 : 1807716
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_CP038908|1763762:1807716|DBSCAN-SWA 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48 | Staphylococcus_phage(45.45%) | integrase,transposase,protease | attL 1763667:1763726|attR 1790479:1790567 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_18 |
1816604 : 1864008
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NZ_CP038908|1816604:1864008|DBSCAN-SWA 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44 | Staphylococcus_phage(25.0%) | integrase,transposase,tRNA | attL 1806651:1806710|attR 1849476:1850577 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_19 |
1890069 : 1934415
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_CP038908|1890069:1934415|DBSCAN-SWA 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39 | Staphylococcus_phage(22.22%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_20 |
1955835 : 2011361
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >NZ_CP038908|1955835:2011361|DBSCAN-SWA 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55 | Staphylococcus_phage(15.38%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_21 |
2018126 : 2077043
Sequences of DBSCAN-SWA_21
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21 >NZ_CP038908|2018126:2077043|DBSCAN-SWA 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58 | Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_22 |
2087834 : 2143267
Sequences of DBSCAN-SWA_22
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22 >NZ_CP038908|2087834:2143267|DBSCAN-SWA 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46 | uncultured_Mediterranean_phage(30.77%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_23 |
2147815 : 2261536
Sequences of DBSCAN-SWA_23
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23 >NZ_CP038908|2147815:2261536|DBSCAN-SWA 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107 | Staphylococcus_phage(17.65%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_24 |
2279289 : 2321923
Sequences of DBSCAN-SWA_24
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24 >NZ_CP038908|2279289:2321923|DBSCAN-SWA 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44 | Staphylococcus_phage(25.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_25 |
2343628 : 2396634
Sequences of DBSCAN-SWA_25
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25 >NZ_CP038908|2343628:2396634|DBSCAN-SWA 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56 | Leptospira_phage(16.67%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_26 |
2400557 : 2445608
Sequences of DBSCAN-SWA_26
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26 >NZ_CP038908|2400557:2445608|DBSCAN-SWA 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51 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_27 |
2515796 : 2578139
Sequences of DBSCAN-SWA_27
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27 >NZ_CP038908|2515796:2578139|DBSCAN-SWA 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57 | Planktothrix_phage(18.18%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_28 |
2668032 : 2750743
Sequences of DBSCAN-SWA_28
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28 >NZ_CP038908|2668032:2750743|DBSCAN-SWA 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82 | Escherichia_phage(37.93%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_29 |
2766085 : 2794272
Sequences of DBSCAN-SWA_29
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29 >NZ_CP038908|2766085:2794272|DBSCAN-SWA 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27 | Acinetobacter_phage(12.5%) | integrase,transposase,protease,tRNA | attL 2763474:2763533|attR 2781314:2781602 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_30 |
2823488 : 2875948
Sequences of DBSCAN-SWA_30
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30 >NZ_CP038908|2823488:2875948|DBSCAN-SWA 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57 | Microbacterium_phage(12.5%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_31 |
2936827 : 2994860
Sequences of DBSCAN-SWA_31
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31 >NZ_CP038908|2936827:2994860|DBSCAN-SWA 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MNKELLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP |
57 | Staphylococcus_phage(37.5%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_32 |
3119728 : 3183859
Sequences of DBSCAN-SWA_32
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_32 >NZ_CP038908|3119728:3183859|DBSCAN-SWA 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53 | Staphylococcus_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_33 |
3191744 : 3305664
Sequences of DBSCAN-SWA_33
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_33 >NZ_CP038908|3191744:3305664|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP038908|3191744:3305664|3219688_3220732_-|WP_016209722.1|DBSCAN-SWA MKLKVLKVISPIVLLPLALASCASMGSDQETETSNNNAPVHFQPAVDQNLVKTKVVTQYVAVPVPGQLKYLKDQGKNLKNVANKTFKNKEDAIQYANKAALRYPNSRDFVNSIMNYQFMDGASYAVYASPGQMTDIEFQSGEKLISQAAGDTLRWQIGKTVSGSGAYQREHLLIKPNQTGLKTTMVVMTDQRVYHIQLISTPDAYMQAVKWQYPNENVVTYQSEDNSVTGDTRLSTAGASGLDVNIASMYSHYTTQSLQGDTRNFTPVLVFDDGVKTYIKFNKTTLNRQMPLVEVDTGDKTYVSSVNYHVKGQYIIIEGVYHKIRLQLGTKLADNLALIQINRKEKA >NZ_CP038908|3191744:3305664|3253699_3254239_+|WP_036776841.1|DBSCAN-SWA MISVGQKLPEFNVKATVSNTLNDNAFTEITEKSYAGKWKVLFFWPKDFTFVCPTEIAAFNDLYSDFDDRDTVLLGGSTDSEFVHLAWRQNKEELYDLRFPMLADVKRELSAKLGILDSEEGVSQRATLIIDPENIIRFVMVTDLNVGRNPQEVIRVLDALQTDELCPCNWQAGDQTIKV >NZ_CP038908|3191744:3305664|3204838_3205027_-|WP_155047245.1|DBSCAN-SWA MTEGDFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVK >NZ_CP038908|3191744:3305664|3264359_3265106_+|WP_016211229.1|DBSCAN-SWA MQIQQPSFFLKATSLIRSIVYYLIVGIVTLFISITSIITLLLPFKVRYRYIMAFCPIALFCARWICGIRYEIQGQKHLANEKVAVIISNHQSAWETFLFPAMFPPLAIIIKQSLLKIPFWGWSFASLEPIAINRHDGKKALLQILRQSKAAVAKGRWIVIYPEGTRSEPGQLATFKKGSGVLAASLHQPIFPIAHDAGKCWPKNSFIKYPGTIHVRIGKKIDTADKTHEQINTECYSWIKEQLQRFKN |
113 | Staphylococcus_phage(33.33%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038908.1|WP_155046989.1|1023335_1024400_-|hypothetical-protein |
1023335_1024400_-
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_155046989.1|1023335_1024400_-|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_155046989.1|1023335_1024400_-|hypothetical-protein MPLSTLNEVQNQYALYFKQACLNTSQSFITRGSIKNGGASVGIENIEGHFTDQEIESKFKVLKESLRGCSPSERSDLLNNFSLFINNKTNHDVDTVRVLAFFKDKDITDLTFLEILYLEAINFEASAALQIAFYKTNQTKTDTEEGVLATQAQKSLFTSVADLFLSQLNLSYHPNIFANLDKIGLGNQPEYIQGALKCSQQLNDEDYQLLKEMSEDLKEMYQAIKNHVALSSEPSSNNNSDSFLSSLFSCFATQKLDLEARFKQYQSRTIETFFDFFTPDNKNQSQEALKAQLSQLKADFLSSSDSSFQSSLSSPLNRAETQNNQPSPSSPLLFSQQQAAAAHSTAPTPEPSPY |
354 aa aa | NA | NA | NA | 1016190-1129604 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1075117-1075080, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1124325-1124288, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1107674-1107711, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1075080-1075117, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 5. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1124288-1124325, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 6. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1107711-1107674, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_155046989.1|1025699_1026764_-|hypothetical-protein |
1025699_1026764_-
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_155046989.1|1025699_1026764_-|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_155046989.1|1025699_1026764_-|hypothetical-protein MPLSTLNEVQNQYALYFKQACLNTSQSFITRGSIKNGGASVGIENIEGHFTDQEIESKFKVLKESLRGCSPSERSDLLNNFSLFINNKTNHDVDTVRVLAFFKDKDITDLTFLEILYLEAINFEASAALQIAFYKTNQTKTDTEEGVLATQAQKSLFTSVADLFLSQLNLSYHPNIFANLDKIGLGNQPEYIQGALKCSQQLNDEDYQLLKEMSEDLKEMYQAIKNHVALSSEPSSNNNSDSFLSSLFSCFATQKLDLEARFKQYQSRTIETFFDFFTPDNKNQSQEALKAQLSQLKADFLSSSDSSFQSSLSSPLNRAETQNNQPSPSSPLLFSQQQAAAAHSTAPTPEPSPY |
354 aa aa | NA | NA | NA | 1016190-1129604 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1075117-1075080, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1124325-1124288, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1107674-1107711, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1075080-1075117, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 5. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1124288-1124325, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 6. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1107711-1107674, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_016209640.1|1030314_1031334_-|hypothetical-protein |
1030314_1031334_-
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_016209640.1|1030314_1031334_-|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_016209640.1|1030314_1031334_-|hypothetical-protein MPSFNDILNQYLLHFKKYFLDLDLSLNHRTSILSSQGTTPNFQEIAKLFSDGEIEKEFESLQNKLNRYPDTSHLELYIKFNDFFKSKTDHSLESERVIGFFKDRNESIAGKKLLEIVFLESISFAASADLQESFNAELKSAINITAEEDNDSFYELIKEQFKEASTYPLSRFNLSYHPKAFEQLDQLGLGDQSNCILELLGHPPQLINIEGISNQVKEIFENAKKSIPTEIESTQQNLIAACYEKYQANVIGLIFNFFIPKEKNQEDLELQLFIYENEFLSSSNFANHGTQFESFCPKILEIIKASNKEHIQESDSQLFFSQQKEKTTFDSSASARYNQ |
339 aa aa | NA | NA | NA | 1016190-1129604 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1075117-1075080, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1124325-1124288, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1107674-1107711, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1075080-1075117, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 5. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1124288-1124325, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 6. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1107711-1107674, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_016211528.1|1077881_1078187_+|hypothetical-protein |
1077881_1078187_+
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_016211528.1|1077881_1078187_+|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_016211528.1|1077881_1078187_+|hypothetical-protein MSQNQSKFPAPAKKVKREKISSKATKKELEITSKGDDSYIERNELDPNAPPTKGYTVPLNEYELTLLLKISEKHDRSQRKQIRRFVIDALEQEAKTLGIGI |
101 aa aa | NA | NA | NA | 1016190-1129604 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1075117-1075080, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1124325-1124288, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1107674-1107711, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1075080-1075117, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 5. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1124288-1124325, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 6. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1107711-1107674, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** |
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NZ_CP038908.1|WP_016211583.1|1098827_1099736_-|hypothetical-protein |
1098827_1099736_-
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_016211583.1|1098827_1099736_-|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_016211583.1|1098827_1099736_-|hypothetical-protein MLKFNVRENNDRSSYVSILRNKPGWKKGEGSPYESIANLKFSSSVSEYPEKLGEKDKKNLSPDEVTSLENWYSCVLFSAKNFGSSIVDLESLIYRLDPKFNDALNELAAAARKHDIDFTPQQIMLDALLEAAKKTEHAIEKKTRKKADILSKVDIDSRPAGLLYRLDEKNRGIFEALFGLPCGQAKMIKEFNATAQRYGRRGDTTLNTLEKMAYPKKGEHPLTVKKWMFSAAIDLLYENQLNPINVISADSVAQYFALQRKQEGISVEECVFIFEKRFDPNKTQLKLAVKAIEKQYGETVNV |
302 aa aa | NA | NA | NA | 1016190-1129604 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1075117-1075080, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1124325-1124288, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1107674-1107711, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1075080-1075117, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 5. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1124288-1124325, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 6. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1107711-1107674, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** |
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NZ_CP038908.1|WP_155047201.1|1103733_1104495_+|hypothetical-protein |
1103733_1104495_+
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_155047201.1|1103733_1104495_+|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_155047201.1|1103733_1104495_+|hypothetical-protein MTIKQIQLSEENRGNPKRGRKANLLSNMWQDIEASEVERLIDLNRDRHQENKDTEATITLSKYIPHKSYSAKELLHYPELTMLLRKEKQYLVKDYLLTGPLFELRTPLFMIEAGKQLLQIENDFRESLASEQKRLNNLMFLAKNKVKNIRVTGGKPSCQWSAGTIELNGVSWRVNKDSPAYLGPTGGIEALSFSYCEEIGQMDSFKIETAHIGTSIVELKVRNKGHNKGRRAFLNIEKLGLVPTAEAKAPSVI |
253 aa aa | NA | NA | NA | 1016190-1129604 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1075117-1075080, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1124325-1124288, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1107674-1107711, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1075080-1075117, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 5. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1124288-1124325, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 6. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1107711-1107674, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** |
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NZ_CP038908.1|WP_016212461.1|1125240_1125615_-|hypothetical-protein |
1125240_1125615_-
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_016212461.1|1125240_1125615_-|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_016212461.1|1125240_1125615_-|hypothetical-protein MPKNIFVFNINKTLLWAEEHPRTINQVPTQSTWPFYGCDNIHIINQEKIAKIMQAILANGDQIVFLQERAKTTKNNTREEKEKEQTEKAEFLRLCTDKYGISLQPNNIYFHHGSDGKIARLLSI |
124 aa aa | NA | NA | NA | 1016190-1129604 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1075117-1075080, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1124325-1124288, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1107674-1107711, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1075080-1075117, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 5. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1124288-1124325, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 6. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1107711-1107674, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** |
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NZ_CP038908.1|WP_054300283.1|1287677_1288319_-|hypothetical-protein |
1287677_1288319_-
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_054300283.1|1287677_1288319_-|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_054300283.1|1287677_1288319_-|hypothetical-protein MPQAYPTSNNEQQSNNFPPPSSTTSSSATASNLPLEQIKTQPASKTVKNLGDSITYDQLLHLIKQETQKSIFILAKKIKNAKLPFSTLFEDTSGRKTGIQVLEEFIKDILSHSNQGHPHQPLTQALGELVHERVKSFYEDDGKMKGRRKTETISMLFSEIKRMFQNITYANAAVSRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP |
213 aa aa | NA | NA | NA | 1277705-1406921 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1287463-1287500, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1329414-1329451, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1331975-1331938, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttgatccagcgct Protospacer ***************************.********** 4. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1287500-1287463, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 5. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1329451-1329414, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 6. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1331938-1331975, mismatch: 1 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggatcaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer **********.*************************** |
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NZ_CP038908.1|WP_054300290.1|1335298_1335556_+|hypothetical-protein |
1335298_1335556_+
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_054300290.1|1335298_1335556_+|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_054300290.1|1335298_1335556_+|hypothetical-protein MKKKRNKYPLRKLWEIFCSKLKGHVQYYGVSFNADGVGLFLYKARRIFYKWVNRRSQRKSFNWGKFSLFVKRFPMPKAKVCHKFF |
85 aa aa | NA | NA | NA | 1277705-1406921 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1287463-1287500, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1329414-1329451, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1331975-1331938, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttgatccagcgct Protospacer ***************************.********** 4. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1287500-1287463, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 5. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1329451-1329414, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 6. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1331938-1331975, mismatch: 1 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggatcaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer **********.*************************** |
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NZ_CP038908.1|WP_098082828.1|1336294_1336552_+|transposase |
1336294_1336552_+
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_098082828.1|1336294_1336552_+|transposase>NZ_CP038908.1|WP_098082828.1|1336294_1336552_+|transposase MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN |
85 aa aa | NA | NA | NA | 1277705-1406921 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1287463-1287500, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1329414-1329451, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1331975-1331938, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttgatccagcgct Protospacer ***************************.********** 4. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1287500-1287463, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 5. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1329451-1329414, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 6. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1331938-1331975, mismatch: 1 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggatcaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer **********.*************************** |
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NZ_CP038908.1|WP_098082828.1|1395052_1395310_-|transposase |
1395052_1395310_-
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_098082828.1|1395052_1395310_-|transposase>NZ_CP038908.1|WP_098082828.1|1395052_1395310_-|transposase MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN |
85 aa aa | NA | NA | NA | 1277705-1406921 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1287463-1287500, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1329414-1329451, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1331975-1331938, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttgatccagcgct Protospacer ***************************.********** 4. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1287500-1287463, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 5. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1329451-1329414, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 6. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1331938-1331975, mismatch: 1 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggatcaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer **********.*************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_075273543.1|1638815_1639058_-|hypothetical-protein |
1638815_1639058_-
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_075273543.1|1638815_1639058_-|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_075273543.1|1638815_1639058_-|hypothetical-protein MYEYELSTECCTSDDGGRFPISLTLLLPALSFAFTMAPSRIITQNHYKMKKVSAESQSNNPLLREKQRIWFSNIKHPEES |
80 aa aa | NA | NA | NA | No | NA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_155047156.1|1731322_1731946_+|hypothetical-protein |
1731322_1731946_+
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_155047156.1|1731322_1731946_+|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_155047156.1|1731322_1731946_+|hypothetical-protein MILTGPIGTAIGASLILITCGIQYWLNHYFLPKKEIQLATDPLELLHLKLDSHIDAQIAKFTKALDQLGEGSEKAQTELKLQTYMAAKAELESWQTMPDRNSHSDKLHQAMSLAMDASKICRRGNGAPSSYKALKAELKYFTVDWQDRYKQTQIKFNPLLKDFLSSSKIKPSAENDRMTSLIFQDSFIADGAVSGASGVFSAPASLV |
207 aa aa | NA | NA | NA | 1639097-1745364 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1736388-1736351, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1736351-1736388, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_155047155.1|1764600_1764750_-|hypothetical-protein |
1764600_1764750_-
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_155047155.1|1764600_1764750_-|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_155047155.1|1764600_1764750_-|hypothetical-protein MNMNSLLSVALQMTEGVSQLRSAKNPNLPRPTHPVLSTPWLAACAGFPG |
49 aa aa | NA | NA | NA | 1763762-1807716 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1766156-1766119, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1766119-1766156, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_032126537.1|1776780_1776966_+|hypothetical-protein |
1776780_1776966_+
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_032126537.1|1776780_1776966_+|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_032126537.1|1776780_1776966_+|hypothetical-protein MEKIERVYARDHGLSGNFKDIQFEKYCRDWLEPMRRKVNESTKLDDYVNPRVKSRLDGYLG |
61 aa aa | NA | NA | NA | 1763762-1807716 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1766156-1766119, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1766119-1766156, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_155047152.1|1777741_1778464_-|transposase |
1777741_1778464_-
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_155047152.1|1777741_1778464_-|transposase>NZ_CP038908.1|WP_155047152.1|1777741_1778464_-|transposase MYEYELSTECCTSDDGGRYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCLWPVRKVSFRVSCSGIETTFPVITTTWFKTESSKHK |
240 aa aa | NA | NA | NA | 1763762-1807716 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1766156-1766119, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1766119-1766156, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_016212013.1|1783234_1783618_-|hypothetical-protein |
1783234_1783618_-
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_016212013.1|1783234_1783618_-|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_016212013.1|1783234_1783618_-|hypothetical-protein MTINKRDFFDAINYADTAVQIHEYLLNILEKQQKDFAENCNNDNDSEKSKALASISDVELRFAQLDMLSAIYRKILLNTLNEIEGCNDQELKTIKNGLLHMVATTLEACVNDFTIEAKITIDIKEEQ |
127 aa aa | NA | NA | NA | 1763762-1807716 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1766156-1766119, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1766119-1766156, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_054300361.1|1796256_1796553_+|hypothetical-protein |
1796256_1796553_+
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_054300361.1|1796256_1796553_+|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_054300361.1|1796256_1796553_+|hypothetical-protein MTNNEIEGLTPQQEEVVLLKNLLLESLDKLINSCKKSSVVLDFLGLPDVRHDSRFKRIETLIDNLLEIDTGNIIDHPELTERYIEHSPYAQVINILIA |
98 aa aa | NA | NA | NA | 1763762-1807716 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1766156-1766119, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1766119-1766156, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_081377353.1|1796530_1797196_-|transposase |
1796530_1797196_-
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_081377353.1|1796530_1797196_-|transposase>NZ_CP038908.1|WP_081377353.1|1796530_1797196_-|transposase MYEYELSTECCTSDDGGRFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGNGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL |
221 aa aa | NA | NA | NA | 1763762-1807716 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1766156-1766119, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1766119-1766156, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_016211151.1|1804048_1804360_+|hypothetical-protein |
1804048_1804360_+
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_016211151.1|1804048_1804360_+|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_016211151.1|1804048_1804360_+|hypothetical-protein MKNYPHIDDIIDQVAKEFDCDRNRMAYEAFATDVKELIENEDFDCQTEEQARLELAKRGPHIINLYMEGLDGEDWLSQDYLPADINVTVVREFYKFVVNEEKK |
103 aa aa | NA | NA | NA | 1763762-1807716 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1766156-1766119, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1766119-1766156, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_016210146.1|1889376_1889868_-|hypothetical-protein |
1889376_1889868_-
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_016210146.1|1889376_1889868_-|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_016210146.1|1889376_1889868_-|hypothetical-protein MHQKEQITELLECPQELTLVKIVLLAGLEKVIANCLDRQSVVKLKIAEFFRLEVEAITEGSDSDESLSAELASLKMDKLKDILKKAACAFHQKSGLFTAKSYQVAKPYFEVLRELFGISDVEWKGILAHEANLDCEELSLQFYNKYMANKDDMASPGHLPTRP |
163 aa aa | NA | NA | NA | No | NA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_155046721.1|1891311_1891479_+|hypothetical-protein |
1891311_1891479_+
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_155046721.1|1891311_1891479_+|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_155046721.1|1891311_1891479_+|hypothetical-protein MKEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH |
55 aa aa | NA | NA | NA | 1890069-1934415 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1930105-1930068, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1930068-1930105, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_036781272.1|1975879_1976098_+|hypothetical-protein |
1975879_1976098_+
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_036781272.1|1975879_1976098_+|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_036781272.1|1975879_1976098_+|hypothetical-protein MPMTTKERKRISNLLESWKTGKKKAAPNFDKLNLSEEGLTWAKAELEKLLSQQSKANTDLKQKLITHLTHRS |
72 aa aa | NA | NA | NA | 1955835-2011361 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1997286-1997249, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1997249-1997286, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_155047136.1|1976190_1976622_+|hypothetical-protein |
1976190_1976622_+
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_155047136.1|1976190_1976622_+|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_155047136.1|1976190_1976622_+|hypothetical-protein MHIFIDYFFLCYDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL |
143 aa aa | NA | NA | NA | 1955835-2011361 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1997286-1997249, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1997249-1997286, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_016212421.1|1986955_1987138_+|hypothetical-protein |
1986955_1987138_+
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_016212421.1|1986955_1987138_+|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_016212421.1|1986955_1987138_+|hypothetical-protein MLLKDLRFSVLRLLSDLYNHEKSKDGSTNDLNFLTKCKREAEEANSKQEIADLLNTHLTH |
60 aa aa | NA | NA | NA | 1955835-2011361 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1997286-1997249, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1997249-1997286, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_155047131.1|1989706_1990363_+|transposase |
1989706_1990363_+
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_155047131.1|1989706_1990363_+|transposase>NZ_CP038908.1|WP_155047131.1|1989706_1990363_+|transposase MARSERKSNISKNEYFRNLINHAINNQVKFDYTVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDSEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL |
218 aa aa | NA | NA | NA | 1955835-2011361 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1997286-1997249, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 1997249-1997286, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_032126179.1|2175441_2175693_-|TSUP-family-transporter |
2175441_2175693_-
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_032126179.1|2175441_2175693_-|TSUP-family-transporter>NZ_CP038908.1|WP_032126179.1|2175441_2175693_-|TSUP-family-transporter MSTALAFPMGLFALTSLLVASAGMAGLPSGSVGYLYLPALIGLLIGSFLGSPLGVWMVKRVSEQTSVWLFRIVLLAVIMQMIH |
83 aa aa | NA | NA | NA | 2147815-2261536 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 2177250-2177213, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 2167205-2167242, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 2243369-2243406, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 4. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 2257504-2257541, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 5. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 2177213-2177250, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 6. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 2167242-2167205, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 7. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 2243406-2243369, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 8. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 2257541-2257504, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_155047097.1|2398017_2398701_-|hypothetical-protein |
2398017_2398701_-
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_155047097.1|2398017_2398701_-|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_155047097.1|2398017_2398701_-|hypothetical-protein MGEIFVPKFNLLSVTGDQETVDNLLLSVKKRLYDKGTPLKNCYFNLQGQLLAEGWVYDSKTLIEVDLGGELKPEWYNEALSTAIEKIKKTEVSDKNYPAVNAHMLPFLKAYFFSYIEKALAKIDEEEGSLVQKLNAKLSFLSTLKSSFRAKFSGEWAHQFYFDHSSALNEVAGFDSEGECPQSYFALFNAFEAVGNKDRKAVTLALTLDKFSSTQVVCDNREIFSTE |
227 aa aa | NA | NA | NA | No | NA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_129556569.1|2444522_2444732_+|hypothetical-protein |
2444522_2444732_+
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_129556569.1|2444522_2444732_+|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_129556569.1|2444522_2444732_+|hypothetical-protein MTNFVHASEFTFQQDDGLINDDWVRLVQPSLPLGTQINSLALTQAGDTLYINTQSVGSFLCQGDIALNE |
69 aa aa | NA | NA | NA | 2400557-2445608 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 2439717-2439680, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 2439680-2439717, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_016209540.1|2528436_2528775_-|hypothetical-protein |
2528436_2528775_-
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_016209540.1|2528436_2528775_-|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_016209540.1|2528436_2528775_-|hypothetical-protein MSYPALIQQIDKLSKKYGFERHKMRFISGITDAETLAAERKLSHADAEGLIQQHGINGIWLAWLTDDGLLIEDECFKYIDELLAMPSYAEEWFDLVNGHEEIQKKEAQGLDK |
112 aa aa | NA | NA | NA | 2515796-2578139 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 2533265-2533228, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 2536491-2536528, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 2533228-2533265, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 2536528-2536491, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_016209990.1|2934970_2935375_-|hypothetical-protein |
2934970_2935375_-
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_016209990.1|2934970_2935375_-|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_016209990.1|2934970_2935375_-|hypothetical-protein MYILVCYGGYPYHAAYVVAIFTGGSFVTQEVYAGDIDSLRLKVKGDFRIYKDLESFFDRSIECMQNKKAQIIILKPAIESNFSNLLIFESVIRKTRQSTLLMYESMEVDEEAPLVAGAEAMLHYYSELLRCTKQ |
134 aa aa | NA | NA | NA | No | NA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_144019123.1|2935407_2936151_-|hypothetical-protein |
2935407_2936151_-
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_144019123.1|2935407_2936151_-|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_144019123.1|2935407_2936151_-|hypothetical-protein MLKNLKELIKEYNIQTIDALEQLKSDLLRESDSREFCKKYGIDYSPIEFTFHQGFYFLFNAANELNDQYPNDRNLIAYFTYRLSSQQQKAFEPVTNMLEIAKLAEDKIEGDCQLLEQGGNQPKAIKTFKEKAIKAVYKYVESTLAGPEHSNKAREEYQQSIKNCSEECKAALDDSSCERLRKVLKVLVNFLTHISLVGIVANIYHKHTTGSWLLFERKKESYDIQENLHGIQKISESAMQVNLYLSA |
247 aa aa | NA | NA | NA | No | NA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_155047234.1|2936640_2936784_-|hypothetical-protein |
2936640_2936784_-
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_155047234.1|2936640_2936784_-|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_155047234.1|2936640_2936784_-|hypothetical-protein MNMNSLLSVALQMTEGEAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL |
47 aa aa | NA | NA | NA | No | NA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_016212372.1|3249569_3249791_+|hypothetical-protein |
3249569_3249791_+
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_016212372.1|3249569_3249791_+|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_016212372.1|3249569_3249791_+|hypothetical-protein MAKYHALFLQQDKHMHNLLQATPLPLELDHEIVEFSIGQGPCQQLGKCSDLLYQHATNPEPESTTTTGCCAVL |
73 aa aa | NA | NA | NA | 3191744-3305664 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 3195814-3195851, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 3206674-3206711, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 3195851-3195814, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 3206711-3206674, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_155047252.1|3249906_3250485_+|hypothetical-protein |
3249906_3250485_+
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_155047252.1|3249906_3250485_+|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_155047252.1|3249906_3250485_+|hypothetical-protein MNFIIDFFKGQHQDHQKVLLPLASIKEDVVNAVDREKLTISPKDQYEFSLIRTNELFLEKIRALNLFDNIEDYLSAYNNIVAWDPKATESFSPPYLVAIQGAFLECCHESFKKKINISKEHSTEILANKWLYTAIMTVQQQSTAIEENYTTIKQRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP |
192 aa aa | NA | NA | NA | 3191744-3305664 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 3195814-3195851, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 3206674-3206711, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 3195851-3195814, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 3206711-3206674, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_155047253.1|3250629_3250824_+|hypothetical-protein |
3250629_3250824_+
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_155047253.1|3250629_3250824_+|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_155047253.1|3250629_3250824_+|hypothetical-protein MLSTPWLAAIVANILRLRHLHSTQTAENQTIINDYSATVFRLFGEYCSKKIDNSALRHLKCNTQ |
64 aa aa | NA | NA | NA | 3191744-3305664 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 3195814-3195851, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 3206674-3206711, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 3195851-3195814, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 3206711-3206674, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_155046758.1|3284023_3284155_+|phosphatase |
3284023_3284155_+
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_155046758.1|3284023_3284155_+|phosphatase>NZ_CP038908.1|WP_155046758.1|3284023_3284155_+|phosphatase MFYCMRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP |
43 aa aa | NA | NA | NA | 3191744-3305664 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 3195814-3195851, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 3206674-3206711, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 3195851-3195814, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 3206711-3206674, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_155046759.1|3284299_3284455_+|hypothetical-protein |
3284299_3284455_+
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_155046759.1|3284299_3284455_+|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_155046759.1|3284299_3284455_+|hypothetical-protein MLSTPWLAAPEKYSPPSKTCLINSTIKLFQRVKPHWDYNQKNVYTCKAATT |
51 aa aa | NA | NA | NA | 3191744-3305664 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 3195814-3195851, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 3206674-3206711, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 3195851-3195814, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 3206711-3206674, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038908.1|WP_155047254.1|3286492_3286630_-|hypothetical-protein |
3286492_3286630_-
Protein sequences of NZ_CP038908.1|WP_155047254.1|3286492_3286630_-|hypothetical-protein>NZ_CP038908.1|WP_155047254.1|3286492_3286630_-|hypothetical-protein MNMNSLLSVALQMTEGVSYSNLLMSDNFVISYKVYDDFIAVIIIL |
45 aa aa | NA | NA | NA | 3191744-3305664 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 3195814-3195851, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 2.1|551771|38|NZ_CP038908|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 3206674-3206711, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 3195851-3195814, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038908 position: 3206711-3206674, mismatch: 0 agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer ************************************** |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038909_1 | 30320-30449 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038909_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP038909_1
>1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder AGCGCTGGATTAACAGTTTCTGACATAATATCAGTAGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038909_1
The CRISPR arrays of NZ_CP038909_1 >merge|NZ_CP038909|1|30320-30449|CRISPRCasFinder TTAAAAAATACAATAAAGAAAAACGATGCCTTCTCCTTACAGTTATAGCGCTGGATTAACAGTTTCTGACATAATATCAGTAGGTTAAAAAATACAATAAGGAAAAACGATGCCTTCTCCTTACAGTTAT >NZ_CP038909|1|1|30320-30449|CRISPRCasFinder TTAAAAAATACAATAAAGAAAAACGATGCCTTCTCCTTACAGTTAT AGCGCTGGATTAACAGTTTCTGACATAATATCAGTAGG TTAAAAAATACAATAAGGAAAAACGATGCCTTCTCCTTACAGTTAT
>NZ_CP038909.1|WP_032126227.1|29211_29502_-|hypothetical-protein MGRLFNKENPADLKSSGYFSTEPRGQSHHSVIVIVMAMISIFVMTRVICSIITWMIHSAPLTFIFTMLISFFAAPYVFIVIIIVAFFIGILVKTPS >NZ_CP038909.1|WP_016212008.1|28475_29174_-|hypothetical-protein MLKKNKSTSFVIGLALSLSFACYANALTEAEFKATKLPYSVMAYSNQYAHEYGLDASKAIDLPKGLEAIKLILYKEHIKGDEVLLPQDIYRCSAELYVDKSLSLYWPGNYPKVDKVGDRGLQKAQVSTVQLKRKGEYWVPGPYASMLYDSYDQTIKPNLAKINLGFFGCNYIPSRYTAVKDGLAIWLERKGGHNYAAIGQSEAEISSKDFYIFKLPQKLVNNYLPYARMAAN >NZ_CP038909.1|WP_016212010.1|28162_28459_-|hypothetical-protein MVQLTLSDFAFLANDVYLNPGLELALPRENSQRCQRLLNNTETVINSDPHGPKANGFFARVYKYKQGNKMSLIVAYRGTSNVEDYLIDAELASGQAIE >NZ_CP038909.1|WP_155066233.1|27193_28045_-|hypothetical-protein MSMLTVDYSQLFGIKPTAFRTVTFNPPGMQGVDPNGRAPHYAEIAHTISQHKIASGKLAAAMVSVAPEVSLVGATAGVEVVVKKIMELLNYQTAIKNRSIALRMGQGALIFLWDLLMPDRNGLSVDKEINNPYPHIYNISSRYDLVHCSGNPGGNLINYDIDPLGKITNGDDDRRAKFKYQFLENYFEARQHYLKHGVNSAKMKSKYEQLSKADNWALYFENPGKEGVHLPTAKDWENYFKDVRNIPEYQQSARKTDRVMQYYTGTLSRCEPWSAKHGVSRPR >NZ_CP038909.1|WP_155046940.1|26605_26989_-|hypothetical-protein MCKIPTEVATLTSNQAYDKPYDLFLTKAAKVFIKYLFIAEHSMANMLPSIQVNQNLAQVKISYSAHETILAMRKCSSLINLHTTERLKGPLVAAHDNVQKYQKKGIYPYNQTNYQALAASHGVLSTG >NZ_CP038909.1|WP_155047297.1|26321_26468_+|phosphatase MKTLGVGAKTRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP038909.1|WP_032126138.1|24849_25113_+|RNA-binding-protein MKKLYVGNLTYSVEDRDLVEMFSKYGEVISARVITDRDTGRSKGFAFVEFQTQEQAQAALELDGKDSGGRNLKVNMAKPQEKRQSSW >NZ_CP038909.1|WP_016211871.1|23948_24284_+|type-II-toxin-antitoxin-system-PemK/MazF-family-toxin MVDKPINRFEVWSIRLNPTEGSEQRGVSRPCVVISPQELIDNLSIVTVLPLTSQSRKTPFRISCTFKGREGLVLLEQIRTVTKDRFLGKMGHIGDKVAIEISDTLQEFFAY >NZ_CP038909.1|WP_129556699.1|23754_23955_+|AbrB/MazE/SpoVT-family-DNA-binding-domain-containing-protein MRKNLSFGDSYELIERPDGILIRPAKPIRAGWLEAAQTLKAEGMTEEEKMWANDGNNNDLEDEWEW >NZ_CP038909.1|WP_054300590.1|23222_23447_-|hypothetical-protein MVIQRQKGETYQIQFTLKHVLQYRSAWWNYRAKHADSIRPAVDENVLKVLGCRTKLMGCDVYGTVAKNLDLSRV >NZ_CP038909.1|WP_054300520.1|31355_31670_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MKGYLITQISKLLKISRDTLHRWRNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH >NZ_CP038909.1|WP_075273359.1|31615_32191_+|IS630-family-transposase MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEGAGCHLLFLPPYSPDLNSIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETVR >NZ_CP038909.1|WP_016211797.1|32241_33645_-|aldehyde-dehydrogenase-family-protein MSSYAMLINGQLHSGIDSFAVVNPATEAVIAECPIASVELLEQAVNAAKIALIDGTGTLEQRRELLRACADKIEAYQEELSQLLTKEQGKPISQAQNEVSWAIGLLRKQCELDIPKKVLRDDTQAQVTVTRKPLGVVAGITPWNFPFYIAVNKMAEAIYSGNSIIIKPSPYTPLTTLKLGELIQDVIPAGLVNIISGDNEIGALLVKHPKISAISFTGSVATGKHIATAAAADLKRVVLELGGNDAAIVLNDVDVKEVAEKIFWNAFSNCGQVCVAVKRLYVQRAIYHDVLDEMVRIAKTVKVGNGLDSEVTMGPLNNVMQYERIIELLNDAKAQGATVHCGGVAQEGLGYFFPPTIISGIEEGVRLIDEEQFGPLLPVLAFDDVNEVIQRVNNSSMGLSAYVWSKDNDLAVQIANRLEVGIVRVNTSTTEASLTPFGGMKQSGIGREGGVWGIEAMTDAQTLSVKY >NZ_CP038909.1|WP_081007059.1|33806_34868_-|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase MVLLEQLDTFLISRVDPYANQLDIDSMILKSRFSELGEKKLLAIKVASEFNGIAADRALNHDYFARLARSSYALAFLTAQHESCASLLQKGNNQELKADLLPEMVQGKFRAGVGIYHLRSHTRRAMIMAKKVAGGYRVSGRLDWISGFDIFDYIALGFIIDIGNSQENHEVVGLVPFKVQQYLSGEINIGPKQEVTAISSTNTVAIEFNDWFIRDKDIMIDQPGRAIEQRSILSITHATMLMGIFQAALNIIGNSKSILKKNTVVLSQFNQLNNQCLLLRNQLIHTNTQEEVQKMRAQIHKYTRDCIYLAAALSGGRSVLADHPVQRLNRELLQATIAGVNSLFIHNLCIDIN >NZ_CP038909.1|WP_016211795.1|35550_35745_+|hypothetical-protein MKLKTKKISNACKGNTFLCVNFAKSKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP038909.1|WP_036794771.1|35882_36869_-|APC-family-permease MAMSGNQALQENVGFLGALVFAVSLVLGSGVLVLPGVIYHSIGELAIFTWLADALLMVPLVIIFASFGSKYPGSGGVAGFIEQAFPYLSGGSAYLLLGQCSICFAIVAITGILYSFALLLPNFHASHMLVAGISLALMFIVFFISFLGNHRVIWLQKLIIIPLLLFLLVLIFLSINHPDAATSSVTYWPKHFDTGLITQGMILAFFAFGGWESFASMTGEIKKPARTVPFVIFVGFLLTVGLYVGLSIAIQKIFFEKNMMTGSSFLLDLVQVNHLGQFSVAICFFIVFVVVISNLNGVIWSGSRTLVTLGQKGWAPAFAASHGVLSTG >NZ_CP038909.1|WP_016212044.1|37591_37846_-|hypothetical-protein MNHIISCPFCGVSTEHEMSYGLQSYVCEACHNLIAAGMDDCCLFFSHDLACLCQRENEKKMEREREEKEEEEALLCPSLRKWSS >NZ_CP038909.1|WP_036777801.1|38619_38838_+|hypothetical-protein MFKQLQNNRLYFQKERAYLSISKAKKFNGPGNNAQRIIIPLHGDTSGVLKSHLTIASLFDHRPKDKGKPFKP >NZ_CP038909.1|WP_155047052.1|39700_40429_+|hypothetical-protein MLCRPENSETLKNILISQKDTLISGAKHHKNILVLLIKTAIEFGNVRLLVTLDRLDLNPDRILFENTRQSFMQHLINHVYKYDDEEFAVWLFTVLYKQKIHFPHAKETFKIDFLDTSLRVNALQCLVYSGFFKLALCLSEAGIIDKASSTRYKGERRQVAACGFLITAIVKEGISQEKLDLLVALANGHDIATSQHLISIYRGLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP038909.1|WP_155047051.1|40573_41443_+|hypothetical-protein MLSTPWLAAYVSAIQNQGGNELEKLIRLIDTLAKLSVINIYKQDSAAILPFYMHPALAYQGIIQEYQQQLSHTRTMRNPHAISQYRVGEALGWLTMLKLAIHCTICHKSVQAGDRARQTRQLLQALSNLKKRNLSLEPLRTSLMLVDGVSMCFQPLRVFHPTHIMEIFAHQLLQLSEKGNCDNFAQIIDLIQQQVLTALKGTEFEALQNAKKHVATIFSLIPPSQPIHANNLPQTPEISATQSTTDEIKPARKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038912.1 | 30174-30211 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038909.1 | 53421-53458 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038908.1 | 256050-256087 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038908.1 | 451137-451174 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038908.1 | 528716-528753 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038908.1 | 649733-649770 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038908.1 | 891237-891274 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038908.1 | 915218-915255 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038908.1 | 973030-973067 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038908.1 | 1075080-1075117 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038908.1 | 1124288-1124325 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038908.1 | 1554988-1555025 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038908.1 | 1577075-1577112 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038908.1 | 1611153-1611190 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038908.1 | 1736351-1736388 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038908.1 | 1766119-1766156 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038908.1 | 702726-702763 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038908.1 | 750286-750323 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038908.1 | 3206674-3206711 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038908.1 | 1331938-1331975 | 1 | 0.974 |
1. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to position: 30174-30211, mismatch: 0, identity: 1.0
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer **************************************
2. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to position: 53421-53458, mismatch: 0, identity: 1.0
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer **************************************
3. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to position: 256050-256087, mismatch: 0, identity: 1.0
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer **************************************
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50. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to position: 1331938-1331975, mismatch: 1, identity: 0.974
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP039210 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence | 166717-166754 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP039213 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence | 30310-30347 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP048067 | Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence | 7350-7387 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP048067 | Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence | 186740-186777 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038894 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence | 23887-23924 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038897 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence | 30307-30344 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038924 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence | 98297-98334 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038924 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence | 104921-104958 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038924 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence | 74736-74773 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038953 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence | 91559-91596 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038958 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence | 45769-45806 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP039196 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence | 48741-48778 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038812 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence | 84886-84923 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038812 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence | 55526-55563 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038812 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence | 69445-69482 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP013769 | Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence | 100110-100147 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP013769 | Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence | 89408-89445 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP033938 | Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence | 7974-8011 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP033938 | Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence | 11226-11263 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP033940 | Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence | 1087-1124 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP033940 | Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence | 3391-3428 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP033940 | Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence | 24828-24865 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038909_1 | 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder | 30366-30403 | 38 | NZ_CP038914 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence | 30949-30986 | 1 | 0.974 |
1. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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3. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039213 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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4. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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5. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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6. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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7. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038897 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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8. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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9. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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10. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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11. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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12. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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13. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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14. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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15. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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16. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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17. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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18. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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19. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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20. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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21. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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22. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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23. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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24. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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25. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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26. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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27. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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28. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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29. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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30. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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31. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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32. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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33. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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34. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033943 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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35. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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36. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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37. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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38. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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39. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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40. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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41. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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42. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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43. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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44. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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45. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013780 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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46. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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47. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050946 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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48. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050947 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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49. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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50. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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51. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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52. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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53. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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54. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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55. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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56. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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57. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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58. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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59. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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60. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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61. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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62. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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63. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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64. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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65. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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66. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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67. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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68. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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69. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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70. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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71. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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72. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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73. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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74. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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75. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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76. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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77. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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78. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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79. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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80. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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81. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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82. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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83. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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84. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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85. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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86. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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87. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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88. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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89. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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90. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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91. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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92. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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93. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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94. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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95. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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96. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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97. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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98. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048070 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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99. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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100. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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101. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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102. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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103. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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104. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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105. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039207 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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106. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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107. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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108. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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109. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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110. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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111. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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112. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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113. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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114. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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115. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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116. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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117. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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118. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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119. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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120. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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121. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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122. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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123. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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124. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agctctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer *** **********************************
125. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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126. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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127. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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128. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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129. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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130. spacer 1.1|30366|38|NZ_CP038909|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
agcgctggattaacagtttctgacataatatcagtagg CRISPR spacer agctctggattaacagtttctgacataatatcagtagg Protospacer *** **********************************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
2991 : 53084
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038909|2991:53084|DBSCAN-SWA 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MSSYAMLINGQLHSGIDSFAVVNPATEAVIAECPIASVELLEQAVNAAKIALIDGTGTLEQRRELLRACADKIEAYQEELSQLLTKEQGKPISQAQNEVSWAIGLLRKQCELDIPKKVLRDDTQAQVTVTRKPLGVVAGITPWNFPFYIAVNKMAEAIYSGNSIIIKPSPYTPLTTLKLGELIQDVIPAGLVNIISGDNEIGALLVKHPKISAISFTGSVATGKHIATAAAADLKRVVLELGGNDAAIVLNDVDVKEVAEKIFWNAFSNCGQVCVAVKRLYVQRAIYHDVLDEMVRIAKTVKVGNGLDSEVTMGPLNNVMQYERIIELLNDAKAQGATVHCGGVAQEGLGYFFPPTIISGIEEGVRLIDEEQFGPLLPVLAFDDVNEVIQRVNNSSMGLSAYVWSKDNDLAVQIANRLEVGIVRVNTSTTEASLTPFGGMKQSGIGREGGVWGIEAMTDAQTLSVKY >NZ_CP038909|2991:53084|47865_48213_+|WP_016210136.1|DBSCAN-SWA MVIYQVNLTIDANIFNEYKAWLIPHMQEMLSFPGFLQADLCDDIETDININNETPTQNLTALYLLDSEQSLQYYFDHYAKPMRDDGIKKFGNHFRATRNILKISQSFTPESLNIR >NZ_CP038909|2991:53084|38619_38838_+|WP_036777801.1|DBSCAN-SWA MFKQLQNNRLYFQKERAYLSISKAKKFNGPGNNAQRIIIPLHGDTSGVLKSHLTIASLFDHRPKDKGKPFKP >NZ_CP038909|2991:53084|29211_29502_-|WP_032126227.1|DBSCAN-SWA MGRLFNKENPADLKSSGYFSTEPRGQSHHSVIVIVMAMISIFVMTRVICSIITWMIHSAPLTFIFTMLISFFAAPYVFIVIIIVAFFIGILVKTPS >NZ_CP038909|2991:53084|27193_28045_-|WP_155066233.1|DBSCAN-SWA MSMLTVDYSQLFGIKPTAFRTVTFNPPGMQGVDPNGRAPHYAEIAHTISQHKIASGKLAAAMVSVAPEVSLVGATAGVEVVVKKIMELLNYQTAIKNRSIALRMGQGALIFLWDLLMPDRNGLSVDKEINNPYPHIYNISSRYDLVHCSGNPGGNLINYDIDPLGKITNGDDDRRAKFKYQFLENYFEARQHYLKHGVNSAKMKSKYEQLSKADNWALYFENPGKEGVHLPTAKDWENYFKDVRNIPEYQQSARKTDRVMQYYTGTLSRCEPWSAKHGVSRPR |
56 | Indivirus(33.33%) | protease,transposase,integrase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_2 |
75899 : 83186
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP038909|75899:83186|DBSCAN-SWA TTTAACTGATTTTTTGATTATGCTCGTATTCCTCAGGTGATAAATAATCATTAGCTGAGTGAATGCGTTTTCTGTTATAAAAAACTTCGATATACTCAAAGATCGCTGATTTAGCCTCCTGTCGATTTTTAAAATTCATGTGATGAACTAACTCCGTTTTTAAGGTATGAAAGAAACTCTCTGAAACAGCGTTATCCCAGCAGTCTCCCTTACGACTCATACTTTGCTTAATTTGATGATCTTTAAGAATCTCACGATGACTTTCTGAAGCATATTGGCTTCCGCGATCTGAATGCCAAATTAACCCAGCTTTAGGCTTTCGTTTCCATAAGGCCATCAACAGAGCATCATTGACGAGTGATGCTTCCATATGATCCTCCATGGCCCAGCCAACAACTTTTCGTGAGAATAAGTCAATCACAACAGCCAAGTACAACCAGCCTTGTTGGGTCCGTATGTAGGTAATATCACCAACATATTTTTGGTTAGGGCCTGTTGCTGAAAAATTCCGGTCCAACACGTTTTTTGCAATTGGCAATCGATGTTTAGAATCCGTAGTTACTTTGAATTTACGCTTTATCTTGCAGCAAAGCTGGTTCTGCTTCATTAAACGGCCAACTCGCTTACGGCTTACAGAAATTTCCTGTGTTGCCAACTGTTTTCTAATTCTTCGAGTACCATAGGTTGCACGGCTTTCGATGAATATTTCCTTGATTCGCCTAGCTAATTTTTGGTTCTCTATCATTCGCTTGGAAGGCTGTACCTTTAACCAACTGTAATAACCTGATCGGCTAACACCTAAGATTGAGCACACCCTATCTACTGGAAAAACACATTTATTTTCTTTGATCCAGGCATACTTTACTGTGTTTCGCTTGCAAAGTACGCCGCCGCTTTTTTTAGTATTTCACGTTCCTGTGTCACTCTAGCCAACTCTTTTTTTAACTGTTTTATTTCAGCAGCCATATCACTAACTTCATCTTTAACAGTATTTGGACTGTTTGGATGATATTTATTGACCCAACCATGCAGTGTACTTGAGTGAATACCCAATTCCTGTGCTGTATGACTGATTGCTTGATTTGAATCGACTGCAAGCTTGGCAGATGATTTTTTAAATTCTTCGGTGTACTTGGTGACGTGACGCTTCCCATTGTGATTCCTCCGGCTCGGATTATTGTAATTTATTTGTCCGGAATAGGGTAGCCTGATCAAAGTGATGCACCACTTTAATCTGGATTCGCTGCTGCAATGCTTCCATGAGCTGAATGGAAAGAAGGCTCTAGGAGTTGATGGAGTCACGAAAGAGCAATACGAGGAGAATTTAATTCCGAATTTACTCGACTTGCTGGACCGCATGAAACGAATGGCCTACATTCCAGGAGCGGTACGCTTAGTACTGATTCCCAAAGAAGGAAGGCCAGGAGCAATGCGTCCACTGGGTATTAGTAATTTCGAAGATAAAATTATCCAGAAGATGACACAGAAAGTGCTAGAAAGCATTTATGATCCTATTTTTCTAGGAAACTCTTATGGCTTTAGGCCTGGAAAAAGCTGTCATAATGCTATCAGAGCACTGGATTACTATCTGTTTTCAAATCGAATCGAAAGTATTATTGATGTAGATTTAGAAAACTACTTTGGCACAATTGATCACAATCTGTTGATAGATATGTTAGAAACTAAGATTAAAGACCAGCGCTTTATCCGATATATTATTCGGATGTTCAAAGCTGGGGTTTTATCAAAAGGTGAGTTGACAATGAGCGATGAGGGAGTTCCCCAAGGCTCAGTGTGTAGCCCGATAATTTCAAATATATTTGCACACTATGTGATAGATGACTGGTTTGAAAAGGTGGTGAAGAAGCACTGTCAAGGTAAAGTAGAAATGTTTCGATATGCAGATGACATGGTTATCTGCTGTCAGTTCAGAAATGATGCTGGCCGAATAAAGAAAGCGTTAGCCAAGAGATTATCAAAGTTCAGGTTAAAATGAATGAGGATAAGACCCGAGAAATTGCATTTTCAAAGCAAGATGCAGCTCGAGGGATACGACAGGGCGCGTTTGATTTTCTCGGCTTTACCTTTTATCTAGGGGTTTCAGTTAGTGGGAGAGCTATTATTCCCAAGCTGAAGTCGAGTGGAAAACGCCTAAGATCCAAACTGAAGAAAATATCAGAATGGATGAAGAAGAACCGCAATAAATATCCGCTACGGAAACTTTGGGAAATATTTTGCTCAAAGCTTAAGGGGCACGTCCAGTACTATGGAGTATCTTTTAATGCAGATGGAGTAGGTCTATTTCTTTATAAAGCAAGGCGAATATTTTATAAGTGGGTAAACCGACGCAGCCAGAGGAAGTCTTTTAATTGGGGCAAGTTTAGCCTATTTGTAAAACGATTTCCGATGCCAAAGGCTAAAGTATGTCACAAGTTTTTTTTTAATTCATATAGACAAGTGAAAGTAATTATCTTGAGCCTATTGCCTTAATTGGGCACGATGGGTTCTAACGAGGGGTTGATCTTGTGAAAGATCAGCCTACTCTCTATTTGAGGTCGCGGCCAAAAGTATGTATGGCTGCAAAAATGCCAATTGTAATTCCTTTATCTTTTGCAGTTTTAAGCAGAGTTTCAGCCGTTTTCTTGACAAATTCATTTAACAGCCAACGGTTATAGAGGAAGAAAATACGAAATTCTTTGGGAATGGTAAAAGTGATGTGTTGATACTCACACTGAGGAAGAACGGCATTTTGTTCCTCAATCCAAATCTCTGTTGCTTTTTTGCCACATGCACTGCAAAAACGTGACTTACAGGTATAAGGTACAACTTTGGTATGAGAGCATTCAGAGCTGCTACAACAGTATTTTGAGTGACCCATCACGGTTGTGCCGCATGCAAGTACTTTAATCACGTTTTCCACAACGACATCACGGTGCTTGTCCATGTTAGCTATGAAGTCACGCCACCAATTGTCGGCAGTTTGAAGAAGATGTTTGACTGTGTTGAGCAATTATTTTTCTCTTAAAATAATGTCCTATAGTAGTGATTACGTTGAATTTAGCAAGGCCTTCCTAAAGCTGCCGACGTTTTATATCCAACCTGATTTTAAAAGCGGTGAGGGTGATTTATTACGCGGTAAACGTGTGAATACCTCAGATTTTATGGATACCCTCGCCGCTGGAAAATGCGCCGCCTTATTTGGTGATTTTTCTAATTTTATTATTGCTGACCGGGGCGGTATCTCGCTGCGCCGATTAAATGAGCTCTATGCTGAAACCGGTGAAGTTGGTTATTTAATGTGGTTGCGTGTTGATGCGCTATTGCTTGAGACAGACGCCATTAAACAACTTAAAACCGCCGCAACTTAAAAAATAAATAAGATCAAGACTGCCCTGGAGCATTAGCTTCAGGACTCGGCTCAGAAGAAGTAACTTGAAAACTTTGAAGTGTATTAAGCACAGGAGAAGCAGTACGCCATTGACCTGCTGATTGCGCCGCTTCTGCTTCTACGCTTACTCTTTCTTTTAGCAATTTACGAGTTTCGGAACATAATCTTTTAGTTGCGCTAAATGCCCCCCAGGCAGCATTTTCAAACGCTGCAGCATAGTGGTATGTCGTTCCATCAAAACGAGAGATGCCAAAAAGCGAGTTTAAAAAATCTGAACCTCTTTTAGCCGCACCTATGTCATGTATGGACTCTTGTAAAAAGCTTTTGCATTTAAGTAACACAACTAACTTGCGGGACTGTGATACTACGATAGGATCGGCAACCCTGTTATTGTTTGTTTTAGCGAATTGTTTTAAATTTTCGTATTGTTGATAAAGTGGTAAATCTTGTGTTCTTTGTCTTTGCAAACATCGACGCAAGTTAGGATCTATATTCGCGTAAAGGTCTGCTTTTTTTTGTAAACTTGCAATTTTTGCATCAAGTTTATCAATGAGCTTTCTTGTTTTTTTTAAATTTTCTTGTGTAGGCATTATACTTTGACTCTTAGTTTATACCGAACTGGTGTTAATTTCAGAATGTAAAATACCAGATAAAAAAATAAAACATCATAAGCGTAATTATATAAAATCAAAAACTAATGTTGTTTTTATGTAAATCACTTTAACTCACATTTAAATCAAATCTAAAAGGTTTTTTATGAAAGTTAAAATCTTAGTGCCTCGGGCCGGGATAAATATTTCTTATAATATCGGCGATATTGTTGATTTACCCGATAAAACCGCAAAAGCTATGATTAAGTACGGCGATGCTGAGTCAGTTAACGTTAAAACGTTCAAGAAAAAATCAAAATGATCGATTTAACACGCTTAAAAAGCCACCTGCGGATCGACAATCATAGCGAAGATGACTATTTAGAGTTTATTCTCGCCGCCGCCCTGCAAGCCGCTGAGGATTATCTTGACCGTGTAATTGTAAACAATACGGATGATTTAGAAGCGATTGAAAACAGTGTGTTAATTAATAAATCGATAGAAATTGCCATTTTAATGTCTGCCGGTCACTTCTACGAAAACCGTGAATCAACGAGTAGTTTAACGGTGAAAGAGGTGCCAATGAGTACCCATTTTTTACTTAATCCGCATCGGTATTTAAGCGCATGAGAGCGGGCTTGTTACGCCATCGCGTGACTTTACAAAATAATTTAATCGGTGCAAATAATTATGGTGAAGCGGTGGATTATTGGCAGGATATCACCACCGTCTGGGCACGGGTCAGCCCCAGTGCAGGCCGGGAACTTTTTAGCGCCCAGCAGTTTTATCATGAAATCAGTCAAACCGTCACCCTGCGTTATCGATCTGACGTCACTCCGTCGTTGCGCCTTGTTTTTGAGGGCCGTTATTTGGAGATTTTAAGTGTGATTAATCCAGATGAGCGTAATCGTGAGCTCATTTTAGCCTGTCGGGAGTGGGTACATGCCTAAAATAAGTTTCTCTGTTGACGGGTTGCGTGATTTAGAAAAACAATTAAAACAGTTAGCACCGAAAAAAATTAAAACCTTAAACCGCCGCGCCCTGCGTAAAGCCGCAGAACCGGTTGAAACACAAATGAAAGCGAATGCACCGCAAAAGTCAGGTGCTTTAGTTGAATCGATTAAACGCCGTTCTAAAAAAGGCAAAGGCCGGCGAACCATTGTTAATGTGACGGTGGGGCCAACACGTAAAATAGACTATGCCATCGAGCAAGAATATGGCAGCAGCCACCAACCGGCACGGCCATTTATTCGCCCCGCGCTGAATGATAACGCGCAAACATCCATCGATAGTTTTAAAAATGCATTAACCCTCGCGCTGAAAAAGCAAAAGTTATGATTGAAGATGTCTATTTTGCGCTACTGAATACCGGCTGGCCGGTGTTCCCTATCCTGCTACCTAAAAATCAAATACTGCCCGCAGTAACCTATCAGGTCATTGGTGGCGATCGGCGCTATGGGCTGGATGCTCAGGCGCATTTACAGAAAAAAACCATACAAATTAGCTGCATCGCCAAAACATACCAAGAATGCAAACTCATGCAAGACAATATCACCGAGCAATTAAACGGCTATCACAGTGAAAATATCCAGCTCATTACGTTTGAATCAGAACTTGATCAATATGAACAGGACACAAAAACCTACCGCACCAATTTAACCTTTACTTTAACAGGAGTTGTATGATGAGTGAGTCCATCGGCGCCCTTTCAGAGATTTACCGTGACAGTGATAATGCAGGCAATTACGTCAAACTGGCCAATATTACTAACATCGGTGAAATCTCATCGAGCCGCGATAAAATTGATGTGACCGAATACGGCAGTACACAGAAAAAATATAAGCTCGGCCTGAAAGATCATGATGAAATTCAGCTCGATATGAATGTCGCCCAAGACAATAGTGAGCTGAAAAATTTAATTAGTGATCATGATGCCGGCATAGAGCGCCAATTTAAAATTATTTTAGCGACGCAACCGAAGCGGCAAATTTATGAATTTACTGCCTTAATTACCAATCACAAAATCATCGCCCCATTAACTGAAGCGATTAGCATGAGCGTGAGTTTGCAGCCGACCAGCGTGATCACGCAAAGTGATGAGGTATAAAATGGTTCTCCGTAATGCTTTATTTAATCTTGCCTTTAAAACTGCCCCGGTGACTTTGGGCGAATTAGAATTACAGGTCAAAGAACTCTCTATTGCCGAGCAGCAATATTATCAACAGCAGCATGCTGATTTAAGCGAAACCGAAGCCAGTTTATTGCTAATTTGCTTATCCTTATGTGACCACCAAGGCGTTAAAATCTTTGATGCAACTGAATATAAAAAGCTGGCTGAGTTACTGTGAAAGTCTGAACCTAGCTTGACAGTTGGAGTCTACTAACTGTTTGGAGGTAAAGATTAATGAATTTAAAAGCGAAACGCGATATTTCACGAAAATTGAAAGTACTTAACCATGCTTTAGAAAGTAAAAATGTTTCAAGGACTTGCCGTTATTTTGGTGTTTCTAGAGAATCTTTCTATACATGGCGCAGAGCTTATGAGCAAGACGGTGAAGAGGGCTTAATTAATAATAAGCCCTGCCCTGAAAACCCAAACTTAAGAATTGACAAGGCCATTGAAGAAAAAATTGTTTATCTGCGAACAACCTATCATTTTGGCCCTTTAAAAATATCATGGTATCTGGAGCGGTTTCATGACATCAAAGTTTCTCGGTCTGGTTGTTACTATATTTTACTAAGAAATAGGCTTAATCGTCTTCCTGAGAACATTAGAAAACGATCTATGCCTCAGTTTAAACGTTATGAGAAAAAAGTTCCTGGGCATCATGTACAAGTTGATGTTAAATTCCTATTTTTTAATGATGAAGATGGTAAAAGAATTAAACGTTATCAATATACAGCAATCGATGATGCGACACGTATTCGTGCTTTAAAAATTTACTCAAAACACACCCAAGCTAACGCAATTGATTTTATTAATTATGTGGTTGATAAATTCCCATTTCGAATTAAAGTAATTCGTACCGATAATGGCAGTGAGTTTCAAGCAAAATTTAATTGGCATGTACAAGACCTTGGTATGGATCATGTTTATATTAAACCAGGAACGCCAAGGCTCAATGGCAAGGTAGAACGCTCACATCGCACTGACAAACAAGAGTTCTATCAATTAATCGATTATAATGGTGATGTTGATTTACATGACAAGCTTGCAGAGTGGGAGGCTTTTTATAACTTTCAGAGGCCCCACTCTGCTCATTCTGGAAAAACCCCTTACGAAATGTTAAAAACTAAGTTAGGATTGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP038909|75899:83186|78443_78842_-|WP_052047108.1|transposase|DBSCAN-SWA MDKHRDVVVENVIKVLACGTTVMGHSKYCCSSSECSHTKVVPYTCKSRFCSACGKKATEIWIEEQNAVLPQCEYQHITFTIPKEFRIFFLYNRWLLNEFVKKTAETLLKTAKDKGITIGIFAAIHTFGRDLK >NZ_CP038909|75899:83186|79279_79876_-|WP_016210655.1|DBSCAN-SWA MPTQENLKKTRKLIDKLDAKIASLQKKADLYANIDPNLRRCLQRQRTQDLPLYQQYENLKQFAKTNNNRVADPIVVSQSRKLVVLLKCKSFLQESIHDIGAAKRGSDFLNSLFGISRFDGTTYHYAAAFENAAWGAFSATKRLCSETRKLLKERVSVEAEAAQSAGQWRTASPVLNTLQSFQVTSSEPSPEANAPGQS >NZ_CP038909|75899:83186|80818_81214_+|WP_016210658.1|DBSCAN-SWA MPKISFSVDGLRDLEKQLKQLAPKKIKTLNRRALRKAAEPVETQMKANAPQKSGALVESIKRRSKKGKGRRTIVNVTVGPTRKIDYAIEQEYGSSHQPARPFIRPALNDNAQTSIDSFKNALTLALKKQKL >NZ_CP038909|75899:83186|80502_80826_+|WP_016210667.1|head|DBSCAN-SWA MRAGLLRHRVTLQNNLIGANNYGEAVDYWQDITTVWARVSPSAGRELFSAQQFYHEISQTVTLRYRSDVTPSLRLVFEGRYLEILSVINPDERNRELILACREWVHA >NZ_CP038909|75899:83186|81560_81983_+|WP_016210664.1|DBSCAN-SWA MSESIGALSEIYRDSDNAGNYVKLANITNIGEISSSRDKIDVTEYGSTQKKYKLGLKDHDEIQLDMNVAQDNSELKNLISDHDAGIERQFKIILATQPKRQIYEFTALITNHKIIAPLTEAISMSVSLQPTSVITQSDEV >NZ_CP038909|75899:83186|75899_77086_-|WP_129556718.1|transposase|DBSCAN-SWA MNYNNPSRRNHNGKRHVTKYTEEFKKSSAKLAVDSNQAISHTAQELGIHSSTLHGWVNKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAALLCKRNTVKYAWIKENKCVFPVDRVCSILGVSRSGYYSWLKVQPSKRMIENQKLARRIKEIFIESRATYGTRRIRKQLATQEISVSRKRVGRLMKQNQLCCKIKRKFKVTTDSKHRLPIAKNVLDRNFSATGPNQKYVGDITYIRTQQGWLYLAVVIDLFSRKVVGWAMEDHMEASLVNDALLMALWKRKPKAGLIWHSDRGSQYASESHREILKDHQIKQSMSRKGDCWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS >NZ_CP038909|75899:83186|78975_79266_+|WP_129556716.1|capsid|DBSCAN-SWA MPTFYIQPDFKSGEGDLLRGKRVNTSDFMDTLAAGKCAALFGDFSNFIIADRGGISLRRLNELYAETGEVGYLMWLRVDALLLETDAIKQLKTAAT >NZ_CP038909|75899:83186|77114_77894_+|WP_155047276.1|DBSCAN-SWA MMHHFNLDSLLQCFHELNGKKALGVDGVTKEQYEENLIPNLLDLLDRMKRMAYIPGAVRLVLIPKEGRPGAMRPLGISNFEDKIIQKMTQKVLESIYDPIFLGNSYGFRPGKSCHNAIRALDYYLFSNRIESIIDVDLENYFGTIDHNLLIDMLETKIKDQRFIRYIIRMFKAGVLSKGELTMSDEGVPQGSVCSPIISNIFAHYVIDDWFEKVVKKHCQGKVEMFRYADDMVICCQFRNDAGRIKKALAKRLSKFRLK >NZ_CP038909|75899:83186|81210_81561_+|WP_016210651.1|DBSCAN-SWA MIEDVYFALLNTGWPVFPILLPKNQILPAVTYQVIGGDRRYGLDAQAHLQKKTIQISCIAKTYQECKLMQDNITEQLNGYHSENIQLITFESELDQYEQDTKTYRTNLTFTLTGVV >NZ_CP038909|75899:83186|82280_83186_+|WP_032126790.1|transposase|DBSCAN-SWA MNLKAKRDISRKLKVLNHALESKNVSRTCRYFGVSRESFYTWRRAYEQDGEEGLINNKPCPENPNLRIDKAIEEKIVYLRTTYHFGPLKISWYLERFHDIKVSRSGCYYILLRNRLNRLPENIRKRSMPQFKRYEKKVPGHHVQVDVKFLFFNDEDGKRIKRYQYTAIDDATRIRALKIYSKHTQANAIDFINYVVDKFPFRIKVIRTDNGSEFQAKFNWHVQDLGMDHVYIKPGTPRLNGKVERSHRTDKQEFYQLIDYNGDVDLHDKLAEWEAFYNFQRPHSAHSGKTPYEMLKTKLGL >NZ_CP038909|75899:83186|77890_78388_+|WP_155047275.1|DBSCAN-SWA MNEDKTREIAFSKQDAARGIRQGAFDFLGFTFYLGVSVSGRAIIPKLKSSGKRLRSKLKKISEWMKKNRNKYPLRKLWEIFCSKLKGHVQYYGVSFNADGVGLFLYKARRIFYKWVNRRSQRKSFNWGKFSLFVKRFPMPKAKVCHKFFFNSYRQVKVIILSLLP >NZ_CP038909|75899:83186|80194_80506_+|WP_016210663.1|head,tail|DBSCAN-SWA MIDLTRLKSHLRIDNHSEDDYLEFILAAALQAAEDYLDRVIVNNTDDLEAIENSVLINKSIEIAILMSAGHFYENRESTSSLTVKEVPMSTHFLLNPHRYLSA |
12 | Acinetobacter_phage(14.29%) | transposase,capsid,tail,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
0 : 3739
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038912|0:3739|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038912|0:3739|2764_3739_+|WP_054300271.1|transposase|DBSCAN-SWA MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP038912|0:3739|876_2289_+|WP_155047332.1|DBSCAN-SWA MATAEELLKKAENRKKKDKKKFQPTKRRAWDYVNDEESSSEEQYGNEYRNNQEHISEQYGNEYRNNQEHISEQYGNEYRNNQEHISEQYGNEYRNNQEHISEQYGNEYRNNQEHISEQYGNEYGNEYRGANKNTNRNNNSSKASKISKRDNNDIKSFSHEDIDTNILKNLRKTIGHQRTIMILITSHIKSMKNDNNLINIPISILATKINTDKETVRTSIKRLQKKAILLKAQGERGRHGSTQVIVPNFVKKECLKLYNCHPQPIDETNQNGNEYSNEYSNKNRNEKSLYSSSSNINTITINKDSGLPENWLNINFTPLEEIGFTSTQLKQLHSRSLNTPEIIQDSIYHFAFALKFKKTVQKYSEPLNVLMGVLRKGEAWTEQNYRSAQEIAQEEFIERKKAEKERLNKLKEEAYKLAFDEWSKSLTLEAIDKIAPRKKINGDITPQQVKLNNHFKENVWEKIKEEYLLS |
2 | unidentified_phage(100.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
10182 : 26836
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP038912|10182:26836|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP038912|10182:26836|17773_18136_+|WP_155047337.1|DBSCAN-SWA MLTEDSSYELSHFKGGLPPVFPIMLPKNQILPAVTYQVIGGDRRYSLDAQAHLQKKTIQISCIAKTYQECKLMQDSITEILNGYHSEKIQLITFESELDQYEQDTKTYRTNLTFTLTGVV >NZ_CP038912|10182:26836|21280_21622_+|WP_036776958.1|tail|DBSCAN-SWA MLNFPSLLPTKIAMDKLKPRLRITPLGDGYVQREADGLNTLRHYFTVSFIGLSEIEKDSLINFVTERAGLEPFLWYHPGEKRYFQIICSEWQANLQHNYWTVVLRFEEDFNPV >NZ_CP038912|10182:26836|17470_17755_-|WP_155047336.1|transposase|DBSCAN-SWA MKKSKLSESKIVELLKRVEAGADIETTARDYGISTSTYYILKERYGAMDISQLKRLKQLEKENQQLKRMYADSQIEIEALKDALRHLKCNTTLY >NZ_CP038912|10182:26836|14666_15032_+|WP_054300249.1|DBSCAN-SWA MPSPYSYDLRIRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH >NZ_CP038912|10182:26836|14265_14706_-|WP_155047334.1|DBSCAN-SWA MLEFLSHNCKEKASFFLIVFFNLLIVCQKLLIERYKGSSVLYGATKGAIATITKSLAIDFASSNIRVNSVCPGTIETPLYHNAVKSNSHKLNMTNDDLYNILKTSQPIQRVGLPEEVSNVIYFLNSGEASFVTGSLYSVDGGYTAQ 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19 | Indivirus(18.18%) | transposase,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
30547 : 32866
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP038912|30547:32866|DBSCAN-SWA AATTAGGCTATACCAGAAAAAAAAGAGCTTCAGATACCAAGAACGTGATGCATTAAAGCGGAAAGCTTTCCTGGAAAAAGTCGAGAAAATCGATAACGACAAAATTGTTTATATGGACGAAGCGGGTATGGATGATACTGAGCGTTACGCTTATGGCCACTCTGCTAAAGGTAAACGGTGCTATGCAGAGAAGCCAGGTAAAAAATCAATACGAATTAACTTTATAGGTGGTTTGCGCGGCAAGCAATTTATCGCACCAATGATGGTTGAAGGTTATTGCAATGCTAACGTTTGTCAGGCTTATATCGATCAGTGCTTAATTCCCTGTTTATCTCCTGGAGAGACTGTAATCATGGATAATGCCTCTTTTCACAAATCAAAAGGGGTTAAGGAAGCGATTGAAGATGCGGGTTGTCACTTATTATTTTTACCCCCTTATTCTCCTGATTTAAACCCGATAGAGCATGTATGGTCACCGCTTAAAAATAGGGTTCGCATGAAGCTTGATCAAGATGAAATAAATTTAGAGACAGCGCTTAGTCAAGTAATGAAGTCAATGTCAGAAACTATTCGTTGAGTGCTATAACTACACTGAACCGTAATATGCTGATGGCATACATAACATAGAACGAGTTACCCTCTAGTCGTTTTATAGCTGTAATCGTAGCTCGTCGCACCATCCTCTTGCTCTCCCACCCACTCATCAAATGCCTCCCCAACCGCTTCTTTAGCTTTTAAGATATTTGAGTGCATCTCTTCAAATTCAACACAAAGTGTCTTTTCTGGGTAGATTAAATCAAATGTATGCAAGTAACCTGTCGTTTTACCTTATTTTTTCCTGTGTGTTGTTTTTTTAATTCCCTAAATCACTCTAATATTACAAAGGTCACTATGTTTGCAGAATCAGCGTAAATAAACAAATTTACTTTAAGCTACCCCTCAAAAACTAACCATCCCATTTGGTCGGGTACGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTACGTGCCTTGAAGCGGCACACTCCACTACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGCCTTTCGCAATTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGAATGTTGGCGCTATCGCACTTAAAATGCCTATTACTTTATCATAAAGTATACGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTACTCTATACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCAATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTGTTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAATTTCATTAAAATCTGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCCGCAAACTCTGTTCCATTGTCAGAGGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGATCGCGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGGTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTATTTGATCACCACGATTCACCTTTTTCTTATAAGGTTTTCCCGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTTTCACTCACCTGGATATCATGCTCTCGTATAAGTTCCTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGGGTGCTTAACCGTTGATGGATCAACATTTTTGCCTCCTCTGAAATTTGTCGAAAAGCTTGACCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCACAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCAATAAACCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP038912|30547:32866|31891_32866_-|WP_054300276.1|transposase|DBSCAN-SWA MVYWHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP038912|30547:32866|30547_31123_+|WP_075273327.1|transposase|DBSCAN-SWA MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR |
2 | Indivirus(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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