Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038879 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP038880 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed4, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP038877 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence | 1 crisprs | RT | 0 | 3 | 1 | 0 |
NZ_CP038876 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 chromosome, complete genome | 2 crisprs | RT,cas3,DEDDh,DinG,csa3 | 1 | 1 | 33 | 26 |
NZ_CP038878 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 2 | 6 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
11559 : 19100
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038879|11559:19100|DBSCAN-SWA GATGGTTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGTGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGTCAAGCTTTTCGACAAATTTCAGAGGAGGCAAAAATGTTGATCCATCAACGGTTAAGCACCCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAGGAACTTATACGAGAGCATGATATCCAGGTGAGTGAAAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCAGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCGGGAAAACCTTATAAGAAAAAGGTGAATCGTGGTGATCAAATAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACACCGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGCGATCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTAAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACCTCTGACAATGGAACAGAGTTTGCGGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAGCACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACAGATTTTAATGAAATTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATTGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGGATTCCAGGGCGTTTTTCCTAGAAGGAATAAAAGATTTAAGCACTCGCTAAGTCAATAGAATCTTCATCATCAAACCTTAAGATAATTTCAACTCTAGCGCCCATTGCTTCTGCTGCACGCTCAAAGCGTTTTAAAGTCAAATTTTCACCTTTTTCAATTTGCTGATAATTTTGATATGGTACATTTAGCCTTCTAGCAACTTGAGCCAATGAGTATTCTCTTAATTCCCTTAATTTATGAAGAAGAATGGGCGCTGCTACTTGAGGACTCACAGGAATTAGTATCTCACTTTTACGTATATCAGAAGGTTCAGTAATTGTGTGTTTATCAGCTATCATTTCAGTCAGCAATAAATTCAAAACATCGCGTGCATTATACATCGCCTCTTCGATTGTCTCTCCATCAGTGAAGATATTTGGAAGATCACGGAAGCTGACAACATAACCACCCACTTCGTTATCTTCTTCAAATTTAGCTGGATACGATAACTTCAATTCCATGCTTTTATCCTCACTCAAACGTTACACCTGTTGCTTTTTCAATCTTCTTTAAAATGCCTCTTCCCAAATCTCTATTCGCATGTACTGGTACTGAGATTGGAGGAAGCCCTTGTTTCTTCATGATATGGTGTGAGCCACTAGTTCGTGTATGCTTCCAACCATATTTCTCAAGCTGTCTTATTACGCTCTTTCCACTAATAGGCATAAGCTCAGTCACAATATTTATATTGTAGTCCAATTTATCAGACAACAATAAAAACCACAAGTTTTATTTTGTGTTAGCTTAGAGTAAATTAGCTTGTTATATATGATAGAAACTATAACAACTTTAATAGTATCAAGGCTTTCAGCCTGTACACCTCTACTCACTCGTTATATTATCATTATATAGATCAATAATATAACGAGTTTAAGGTCAAAATGGGCTTAAGCAAGCAGGCACGAATTTTATCTGAAAGACAGGAGCGGATCATCATAACGCACCTCAAAAGCACTATCGCGCCGCAACGAAACCTCGTTTTATTTTTGCTGTCAATAAAAGCCGGACTCCGTGCGAAAGAAATTGCACACATCCAGTGGAAAATGGTTTTTAACTCAGACGGTCAAATCGGAGATTGCATCCACTTGACCAACGATGTGAGTAAAGGTGATCAAGGTGGCCGCATCATCCCTCTTAATCAGCAACTCAAAAAAGCATTGATAACATTATTTCAGTCTAATCCACCGCATCATGAAAATGTCCCTATCATCATTTCACAGCGCAAAGCTGCATTTACTCCACAAACGATCGTTAATTGGTTTAGTCGTTTATATGCTGATTTGGAGTTTAATGGACATTCTAGTCATTCAGGCCGTCGCACCTTTGTCACTCGTGCCGCAAAAAATGTAATCCGTGCTGGTGGGAGTCTACGTGATGTGCAACAATTAGTGGGTCACTCCTCGCTACAAACAACACAGCATTATATTGAAGGTGACAGCGAGGCTAAAAAAAAGCTAGTCGAGCTAATTTAAAGGGGTCTATACACCCCTTTTGACATAAATGGATCATCTAAAACAATCAACAGGGTAGTGATTATGATTTTTAGACAGCTATTTGATAACCAAACATCCACCTATACCTATTTGATTGCCTCAGATTACGGAAAAGAAAGCATTATTATTGACCCAGTTGATAGTAAGATAGATAGTTATATTCAGCTTTTAAGTGAATTATCTTTGAAGCTTGTCTATTCAATTGATACGCATGTTCATGCAGACCATGTGACCGGTTCTGGCTTGCTCATGCAACAGACCAATTGCAAGATTATTATGGGAAAACAAAGTAAAGCTGAAAATATATCATTAAAAGCCAATGAAAATGAGCCAATAAAAATAGATAATCTTACAATTCAACCGGCACTCGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTGCGTGCCTTGAATCGGCACACTCCACCACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGTCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTATGGTGTAGCAATCAACTGAAATTAAGAGTGAATTACTGTGGCTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCACTACCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGACCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTGGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCGATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTGTTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAACTTCATTAAAATCCGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCGGCAAACTCTGTTCCGTTGTCAGAAGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTCTTTAACCGCTGATGAATTAACATTTTTGCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCCTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCATCTCTACCCTCATAAGTCAAAAAGGCAAACTAGAGAGTTTATCTGTATGGATATGAACTCTCTACTCGGTGTTGTACTTCAGATGACGGAGGGCGATTTTAGTTTTCAAAATTTTAGTAAATTAAGATTTTTAGGAAGATAGATTAAGATGAATTTGATATTTATACCAATTTTATTGATGATTTTAATTATGTCACCAGCAATTTCATCAAAAACTGAAAACAAGTTATTTTCTTGGAAACCAGAGCAACTTATGAATATTAAACAAATTTCCGAGCTGGACTTGTCTTCAAGTGCGCCTACTCTTGCTTATGTTGTAGATTTTTACAAAAAGGACAATAAAAATATTTGGACTGAGAAGAGTTCAATCAAAATATTGTCATTAACAACAAAAGAAACCCATAAGGTTGATTATAAAGATGAAGATAGTTGGATGCCAAAATGGTCACCAAATGGTCATTATTTGGCTTTCTTATCTAAGAAGGTCAGTGAAAAATCAAATGATAATGCATTATCATTAATAAAGATATGGTCTAAAAAAACAAATAAAATCTATTTATTAACAGAAACAAAAAATAACATAAAAACACTTTCTTGGTCAAGAAATGGAAATTTTATTGCTTATGTTACTGAAAATAAAAAAGATTTTTATATAGATAAAAATAAATTAAAGATATTTTCATCTTCAGTGCGTAACGATGAAATGCACATTATAGAGATAGATTATAAAAATATCAAAAAAAATAAAGACAAAATAATAATAAGTAAATATATTCAAGGAAACAAATTTTCATATATTGGTAATTTAAGTTGGTCAAAAGATGATAAAGATATTGCATTTAGCCATGATATAGGTGATAGAAATGACCTATGGAATCTCGGTATTATATCAACAATAAACCTAATGACCAATAAAATAAATACAATAAATATCTTTAAACAACGAATGATAATGCAGCAACCTCATTATTCACCTGATGGTCAATATTTACTATTTACTGCAAGCCCTGAACAAGTATGGTCACCTCGATTTTGTATTTATATGCAAAAAATAATAACAAAGAGTGTCACTAAATTAGCCTGTAGCTTCGATCAAGATCCAAAACTTGTTGGTTGGAGTAAAAGTGGTAAAAATATTATTTTTACAGAAAATTTTCATACTTGGCGCAATATTTATAGTCTTTCTACTGACAGAGAAGATATTACTACTAAGGTAGTGAAAATAAATAAGTCAAATTCCCTGATTGATACTGTAAGTATCAATTCTAAAGGCGAAATAGCAATAGTACAGCAAAACAGCAAAAAAGCTGAAGAAATTTACCTAACAAACTTAATCCGCTATCAGCCACAAATCATTACTAATATTAATACGCGCTATACTAAATTTTCAGAGACTTTAGGAAAAACTGAGAAAATCAATTGGAAAAGCAAAGATGGACTAACAATATCAGGCCTACTTACTTATCCTGAAAATTACAATAAATCAAAAAAATATCCGCTGATTATTGAGCTACACGGCGGCCCTGCAGATGTTTTTCAAAACAGATTTATAGGAAGACGCTCTGTTTTTCCTATAGCAACTTTTTCAAAAGAAGGCTATTTTTATTTGAGACCTAATGTAAGAGGCTCATCTGCTTATGGTGTTTACTTTAAAGAATTAAATCATGGTGACTGGGGAGGTAAAGATTACCAAGATATAATGGATGGAATACAATATCTAAATGATAAAAATATCATTGATAGTAAAAAAATCTCTATCATTGGTTGGAGTTATGGAGGCTATTTAACTGCACAAGCGATTACACACAGTCCGCTATTTAAGGCTGCAATTATTGGTGGAGGAATTACAGATTTGGCAAGCTACAGCGTGACGAATGATTTACCAAACTACCTAAAACTTAATTTAGGTGGATACCTTTGGGATAAACCAAAGTTTTATCAAAAACGTTCGCCAATTTATGCTGCTAATCATGTAACAACTCCCACTTTACTAATGTATGGAGAAAACGATATACGAGTTCCTTTATCTCAAGGAGTTGAATTTTTCAATATTTTGAAATTAAGAAACATCCCAAGTATGATGTTGATTTATCCAAAACAGTATCACTCATTATCAGATCCAAACTATATTATCGATGCAGGAATAAGAAATGTATCATGGATTAATAAATATAGCCGAGCAGGCACTGTTGCAAAAAATTTAGATTTGAGTGGGGTGTAGCAATCAACGGAAGTTAAGAGTGAATTGCTGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGCCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038879|11559:19100|18371_19100_+|WP_129556739.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKPIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP038879|11559:19100|12252_12534_+|WP_052133268.1|transposase|DBSCAN-SWA MTSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP038879|11559:19100|16269_18342_+|WP_016211990.1|DBSCAN-SWA MNLIFIPILLMILIMSPAISSKTENKLFSWKPEQLMNIKQISELDLSSSAPTLAYVVDFYKKDNKNIWTEKSSIKILSLTTKETHKVDYKDEDSWMPKWSPNGHYLAFLSKKVSEKSNDNALSLIKIWSKKTNKIYLLTETKNNIKTLSWSRNGNFIAYVTENKKDFYIDKNKLKIFSSSVRNDEMHIIEIDYKNIKKNKDKIIISKYIQGNKFSYIGNLSWSKDDKDIAFSHDIGDRNDLWNLGIISTINLMTNKINTINIFKQRMIMQQPHYSPDGQYLLFTASPEQVWSPRFCIYMQKIITKSVTKLACSFDQDPKLVGWSKSGKNIIFTENFHTWRNIYSLSTDREDITTKVVKINKSNSLIDTVSINSKGEIAIVQQNSKKAEEIYLTNLIRYQPQIITNINTRYTKFSETLGKTEKINWKSKDGLTISGLLTYPENYNKSKKYPLIIELHGGPADVFQNRFIGRRSVFPIATFSKEGYFYLRPNVRGSSAYGVYFKELNHGDWGGKDYQDIMDGIQYLNDKNIIDSKKISIIGWSYGGYLTAQAITHSPLFKAAIIGGGITDLASYSVTNDLPNYLKLNLGGYLWDKPKFYQKRSPIYAANHVTTPTLLMYGENDIRVPLSQGVEFFNILKLRNIPSMMLIYPKQYHSLSDPNYIIDAGIRNVSWINKYSRAGTVAKNLDLSGV >NZ_CP038879|11559:19100|14145_14514_+|WP_129556740.1|DBSCAN-SWA MIFRQLFDNQTSTYTYLIASDYGKESIIIDPVDSKIDSYIQLLSELSLKLVYSIDTHVHADHVTGSGLLMQQTNCKIIMGKQSKAENISLKANENEPIKIDNLTIQPALVSVATSVGILHIQ >NZ_CP038879|11559:19100|12606_13071_-|WP_016212274.1|DBSCAN-SWA MELKLSYPAKFEEDNEVGGYVVSFRDLPNIFTDGETIEEAMYNARDVLNLLLTEMIADKHTITEPSDIRKSEILIPVSPQVAAPILLHKLRELREYSLAQVARRLNVPYQNYQQIEKGENLTLKRFERAAEAMGARVEIILRFDDEDSIDLASA >NZ_CP038879|11559:19100|11559_12231_+|WP_129556741.1|transposase|DBSCAN-SWA MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVG >NZ_CP038879|11559:19100|13491_14082_+|WP_032126152.1|integrase|DBSCAN-SWA MGLSKQARILSERQERIIITHLKSTIAPQRNLVLFLLSIKAGLRAKEIAHIQWKMVFNSDGQIGDCIHLTNDVSKGDQGGRIIPLNQQLKKALITLFQSNPPHHENVPIIISQRKAAFTPQTIVNWFSRLYADLEFNGHSSHSGRRTFVTRAAKNVIRAGGSLRDVQQLVGHSSLQTTQHYIEGDSEAKKKLVELI >NZ_CP038879|11559:19100|13081_13276_-|WP_032126154.1|DBSCAN-SWA MPISGKSVIRQLEKYGWKHTRTSGSHHIMKKQGLPPISVPVHANRDLGRGILKKIEKATGVTFE >NZ_CP038879|11559:19100|14725_14902_-|WP_155046774.1|DBSCAN-SWA MLSTPWLAAVVLPFKGLILLKSFTSSHSNSLLISVDCYTILKSKFFATAASHGVLSTG >NZ_CP038879|11559:19100|15120_16122_-|WP_054300579.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRAKAKQGQAFQQISEEAKMLIHQRLKTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYVSVATSVGILHIQ |
10 | unidentified_phage(33.33%) | transposase,integrase | attL 5164:5223|attR 18422:18613 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP038877_1 | 137110-137333 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038877_1
|
3 spacers
spacers of NZ_CP038877_1
>1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG >1.2|137202|40|NZ_CP038877|CRT TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA >1.3|137267|42|NZ_CP038877|CRT ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038877_1
The CRISPR arrays of NZ_CP038877_1 >merge|NZ_CP038877|1|137110-137333|CRT AAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAGAAATGGAACACAAACGGAATACAAGTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATAAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACACAAACGGAACACAAA >NZ_CP038877|1|1|137110-137333|CRT AAACGGAACACAAACGGAACACAAA ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG AAATGGAACACAAACGGAATACAAG TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA AAACGGAACACAAACGGAACACAAA ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA AAACGGAACACAAACGGAACACAAA
>NZ_CP038877.1|WP_016211879.1|135878_136898_+|ParA-family-protein MTKAWTPGQLISLYRTNKAKSSVLRDEQKGVIPPAKREKRGAISVRVWDEELIPLIGEQYGFLKKNFKKKRNPQSVISVYAPKGGVLKSTLAFNLARIFSINNISVLAIGLEVSQRTLTSNLELVHDHEVESLAEAQKLHSGGLWDVSEGSQSIQDVICKSSLPNLHYIPESTDLNLLEQRIKDSPRREYFLQKLLKPIMKNYEVIIFDNSPSWGSLLVQNSLTLATDVVAPFSCELESYRSVTTNIEMINDFKRDMELNWNSFSIVPTKVDQTKLSKEIETQYRVLFPEFVTASSIRFLRGVAEESGMEQLSVIENSNTSSLADDYYNLSKELWTKLS >NZ_CP038877.1|WP_059372616.1|134322_134913_+|site-specific-integrase MGLNKQAKILSERQEKAVLSSLQSTTYPTRNTVMFLLSIKAGLRAKEIAALTWNMLLTPEGQLCEAIHLRNTASKGKQGGRVIPLNKQLKQALSQLLDESKPKHGQRPVILSRRNSHFPTQTVVNWFAELYKNLGFEGCSSHSGRRTFVTRAAKNIIKAGGSLRDVQQLAGHTTLQTTQRYIEGDSEAKKRIVDLI >NZ_CP038877.1|WP_081377350.1|133261_134077_+|hypothetical-protein MLSCIFRAELSSASAEVYPQALLAPRGARNVHVHISVTRGGYDEANDSWSEIYFTRKVIMPMWRYAVTNLLRQTYKAKELTIPDEYQGEISGLTTFNRFLNREYQKFWKVHFAQPKENHQHNVDYLGRYIKRPALANARMEHYDGNVVIFRYLDHKTKQQKMKKQSIDDFIDRLTQHIPDKFFKMIRYYGFLSYRTRTIILPKIYDLVGQTIETYQQVTFTSLMKSNFNYNPLKCILCGNQLRRVSTQFGLTLREKYNYYEELATSRFRGF >NZ_CP038877.1|WP_155046769.1|132761_132932_+|hypothetical-protein MPCSKTPEMSNISSLNVLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP >NZ_CP038877.1|WP_129556718.1|130325_131512_-|IS3-family-transposase MNYNNPSRRNHNGKRHVTKYTEEFKKSSAKLAVDSNQAISHTAQELGIHSSTLHGWVNKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAALLCKRNTVKYAWIKENKCVFPVDRVCSILGVSRSGYYSWLKVQPSKRMIENQKLARRIKEIFIESRATYGTRRIRKQLATQEISVSRKRVGRLMKQNQLCCKIKRKFKVTTDSKHRLPIAKNVLDRNFSATGPNQKYVGDITYIRTQQGWLYLAVVIDLFSRKVVGWAMEDHMEASLVNDALLMALWKRKPKAGLIWHSDRGSQYASESHREILKDHQIKQSMSRKGDCWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS >NZ_CP038877.1|WP_075274741.1|129999_130257_-|hypothetical-protein MKKNRNKYPLRKLWEILCSKLKGHVQYYGVSFNADGVGLFLYKARRIFYKWVNRRSQRKSFNWGKFSLFVKRFPMPKAKVCHKFF >NZ_CP038877.1|WP_075273822.1|129397_129898_+|hypothetical-protein MVIQRQKGETYQIQFTLKHVLQYRSAWWNYRAKHADSIRPAVDENVLKVLGCRTKLMGCDVYGCSNPNCEHTKVVCFTCKSRFCSTCGKKATEQWIEEQNATLPQCKWQHITFTMPRKFWAFFLFNRELLNIIFRTAANTLLETAKKKGLVIGIFAALHTFGRDLK >NZ_CP038877.1|WP_075273820.1|128158_129241_-|IS481-family-transposase MTSLSEKIIKPKLGVLELAKQLGNVSKACEVMGYSRDSFYRFKKLYETGGEEALQEISKKRPNVKNRVPEHIEQAVIDLAIENPALGQLRASNELLQRGVIVSSSGVRSVWLRNGLETFKKRLKALEAKSAQDGILLTEEQLQALEKAKQEKEAHGEIETEHPGYLGSQDTYYVGTMKGVGRIYQQTFVDTYSRVAFACLYTEKNAVTAAHALNESVIPWFEERDTPLLRILTDRRTEYCGKIEHHAYQLYLAIEDVDHTRTKARSPQTNGICERFHRTMKQEFYDIAFRKKVYNSLEELQVDVDEWLIKYNQHRPHSGKYCYGKTPMQTFQDSKHLAQEKIINKNVQSDSLINQTNVVR >NZ_CP038877.1|WP_016212255.1|127801_127972_+|hypothetical-protein MKKRIKATGAIERAARAAKMGRSRPAWSENFLNEFSEECKSRNSKKPDKYQEVRSK >NZ_CP038877.1|WP_032126838.1|127601_127805_+|hypothetical-protein MQKAVKCEAEEIQERMRFVKNNYKSLTVKRLKILWGVNSLNVYQFLRQYDLPWLPIDELTIKQRGRI >NZ_CP038877.1|WP_155046770.1|138547_138715_-|hypothetical-protein MQQCHKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAAYFASETQ >NZ_CP038877.1|WP_054300202.1|138770_139499_+|IS6-family-transposase MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP038877.1|WP_016212168.1|139467_141156_-|hypothetical-protein 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NZ_CP038877_1 | 1.3|137267|42|NZ_CP038877|CRT | 137267-137308 | 42 | NZ_CP038887 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence | 92334-92375 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038877_1 | 1.3|137267|42|NZ_CP038877|CRT | 137267-137308 | 42 | NZ_CP038938 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence | 1389-1430 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038877_1 | 1.3|137267|42|NZ_CP038877|CRT | 137267-137308 | 42 | NZ_CP038963 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence | 128617-128658 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038877_1 | 1.3|137267|42|NZ_CP038877|CRT | 137267-137308 | 42 | NZ_CP038882 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence | 93293-93334 | 0 | 1.0 |
1. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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3. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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4. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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5. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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6. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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7. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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8. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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9. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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10. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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11. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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12. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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13. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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14. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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15. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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16. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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17. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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18. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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19. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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20. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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21. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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22. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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23. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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24. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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25. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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26. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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27. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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28. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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29. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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30. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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31. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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32. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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33. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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34. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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35. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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36. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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37. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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38. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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39. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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40. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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41. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggctttaactccgaaaataaacagacgataaaaaatag CRISPR spacer attaggctttaactccgaaaataaacagacgataaaaaatag Protospacer ******************************************
42. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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43. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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44. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata CRISPR spacer ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata Protospacer ****************************************
45. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata CRISPR spacer ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata Protospacer ****************************************
46. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata CRISPR spacer ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata Protospacer ****************************************
47. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata CRISPR spacer ttaaataaagaaaaagtaattaaatcaaattctaaagata Protospacer ****************************************
48. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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49. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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50. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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51. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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52. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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53. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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54. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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55. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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56. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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57. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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58. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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59. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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75. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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76. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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78. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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79. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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80. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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81. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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82. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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83. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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84. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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85. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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86. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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88. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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89. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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106. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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120. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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121. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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122. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
123. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
124. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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125. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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126. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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127. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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128. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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129. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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130. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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131. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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132. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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133. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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134. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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135. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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136. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038877|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
2323 : 101076
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038877|2323:101076|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP038877|2323:101076|2882_3857_+|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP038877|2323:101076|95157_95859_-|WP_129556698.1|transposase|DBSCAN-SWA MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNIDLATFF >NZ_CP038877|2323:101076|78584_79160_+|WP_075273327.1|transposase|DBSCAN-SWA MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR |
116 | Streptococcus_phage(21.28%) | protease,head,transposase,integrase,tail,capsid | attL 91315:91374|attR 104649:105511 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP038876_1 | 363130-363259 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038876_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP038876_1
>1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038876_1
The CRISPR arrays of NZ_CP038876_1 >merge|NZ_CP038876|1|363130-363259|CRISPRCasFinder ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA >NZ_CP038876|1|1|363130-363259|CRISPRCasFinder ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA
>NZ_CP038876.1|WP_054300520.1|361908_362223_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MKGYLITQISKLLKISRDTLHRWRNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH >NZ_CP038876.1|WP_075273359.1|361387_361963_-|IS630-family-transposase MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEGAGCHLLFLPPYSPDLNSIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETVR >NZ_CP038876.1|WP_016211797.1|359933_361337_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein MSSYAMLINGQLHSGIDSFAVVNPATEAVIAECPIASVELLEQAVNAAKIALIDGTGTLEQRRELLRACADKIEAYQEELSQLLTKEQGKPISQAQNEVSWAIGLLRKQCELDIPKKVLRDDTQAQVTVTRKPLGVVAGITPWNFPFYIAVNKMAEAIYSGNSIIIKPSPYTPLTTLKLGELIQDVIPAGLVNIISGDNEIGALLVKHPKISAISFTGSVATGKHIATAAAADLKRVVLELGGNDAAIVLNDVDVKEVAEKIFWNAFSNCGQVCVAVKRLYVQRAIYHDVLDEMVRIAKTVKVGNGLDSEVTMGPLNNVMQYERIIELLNDAKAQGATVHCGGVAQEGLGYFFPPTIISGIEEGVRLIDEEQFGPLLPVLAFDDVNEVIQRVNNSSMGLSAYVWSKDNDLAVQIANRLEVGIVRVNTSTTEASLTPFGGMKQSGIGREGGVWGIEAMTDAQTLSVKY >NZ_CP038876.1|WP_129556444.1|359349_359772_+|hypothetical-protein MNKDIMIDQPGRAIEQRSILSITHATMLMGIFQAALNIIGNSKSILKKNTVVLSQFNQLNNQCLLLRNQLIHTNTQEEVQKMRAQIHKYTRDCIYLAAALSGGRSVLADHPVQRLNRELLQATIAGVNSLFIHNLCIDIN >NZ_CP038876.1|WP_080664870.1|358709_359357_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase MVLLEQLDTFLISRVDPYANQLDIDSMILKSRFSELGEKKLLAIKVASEFNGIAADRALNHDYFARLARSSYALAFLTAQHESCASLLQKGNNQELKADLLPEMVQGKFRAGVGIYHLRSHTRRAMIMAKKVAGGYRVSGRLDWISGFDIFDYIALGFIIDIGNSQENHEVVGLVPFKAQQYLSGEINIGPKQEVTAISSTNTVAIEFNDWFIRE >NZ_CP038876.1|WP_016211795.1|357832_358027_-|hypothetical-protein MKLKTKKISNACKGNTFLCVNFAKSKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP038876.1|WP_036794771.1|356708_357695_+|APC-family-permease MAMSGNQALQENVGFLGALVFAVSLVLGSGVLVLPGVIYHSIGELAIFTWLADALLMVPLVIIFASFGSKYPGSGGVAGFIEQAFPYLSGGSAYLLLGQCSICFAIVAITGILYSFALLLPNFHASHMLVAGISLALMFIVFFISFLGNHRVIWLQKLIIIPLLLFLLVLIFLSINHPDAATSSVTYWPKHFDTGLITQGMILAFFAFGGWESFASMTGEIKKPARTVPFVIFVGFLLTVGLYVGLSIAIQKIFFEKNMMTGSSFLLDLVQVNHLGQFSVAICFFIVFVVVISNLNGVIWSGSRTLVTLGQKGWAPAFAASHGVLSTG >NZ_CP038876.1|WP_016212044.1|355731_355986_+|hypothetical-protein MNHIISCPFCGVSTEHEMSYGLQSYVCEACHNLIAAGMDDCCLFFSHDLACLCQRENEKKMEREREEKEEEEALLCPSLRKWSS >NZ_CP038876.1|WP_054300271.1|354218_355193_+|IS30-family-transposase MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP038876.1|WP_016212359.1|353632_353851_-|hypothetical-protein MFKQLQNNRLYFQKERAYLSISKAKKFNGPGNNAQRIIIPLHGDTSGVLKSHLTIASLFDHRPQDKGKPFKP >NZ_CP038876.1|WP_032126227.1|363788_364079_+|hypothetical-protein MGRLFNKENPADLKSSGYFSTEPRGQSHHSVIVIVMAMISIFVMTRVICSIITWMIHSAPLTFIFTMLISFFAAPYVFIVIIIVAFFIGILVKTPS >NZ_CP038876.1|WP_016212008.1|364116_364815_+|hypothetical-protein MLKKNKSTSFVIGLALSLSFACYANALTEAEFKATKLPYSVMAYSNQYAHEYGLDASKAIDLPKGLEAIKLILYKEHIKGDEVLLPQDIYRCSAELYVDKSLSLYWPGNYPKVDKVGDRGLQKAQVSTVQLKRKGEYWVPGPYASMLYDSYDQTIKPNLAKINLGFFGCNYIPSRYTAVKDGLAIWLERKGGHNYAAIGQSEAEISSKDFYIFKLPQKLVNNYLPYARMAAN >NZ_CP038876.1|WP_016212010.1|364831_365128_+|hypothetical-protein MVQLTLSDFAFLANDVYLNPGLELALPRENSQRCQRLLNNTETVINSDPHGPKANGFFARVYKYKQGNKMSLIVAYRGTSNVEDYLIDAELASGQAIE >NZ_CP038876.1|WP_016212007.1|365251_366397_+|hypothetical-protein MLTVDYSQLFGIKPTAFRTVTFNPPGMQGVDPNGRAPHYAEIAHTISQHKIASGKLAAAMVSVAPEVSLVGATAGVEVVVKKIMELLNYQTAIKNRSIALRMGQGALIFLWDLLMPDRNGLSVDKEINNPYPHIYNISSRYDLVHCSGNPGGNLINYDIDPLGKITNGDDDRRAKFKYQFLENYFEARQHYLKHGVNSAKMKSKYEQLSKADNWALYFENPGKEGVHLPTAKDWENYFKDVRNIPEYQQSARKTDRVMQYYTGTLSSNQAYDKPYDLFLTKAAKVFIKYLFIAEHSMANMLPSIQVNQNLAQVKISYSAHETILAMRKCSSLINLHTTERLKGPLVAAHDNVQKYQKKGIYPYNQTNYQALAASHGVLSTG >NZ_CP038876.1|WP_075273619.1|366669_367245_+|hypothetical-protein MANYSQAYCVAQGFNVNANIHRRFGYINYLRIGDLELSADIDVEVPVEGVKSKHVGVISDLFWQETAKVQPITIDFRLSVSNQQQLAHYIEQNNFNSDVLIEFASYDYDANAQAFYSSFNTDKETIEGDLEILAADSQLAIYVGKEQETDVQSPVNYFVSLSMVSTAKAQQLISATSARIKRVLPWGVTVA >NZ_CP038876.1|WP_016211273.1|367302_368136_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase MPELPEVETSCRGIAPHIQNQKIQRVTIRQQQLRYPVSVQITTKKLKQQKVTQVSRRGKYILLELDHSAWLMIHLGMSGNLRILEDTTPAGKHDHIEIQFANQKILRLNDPRRFGCFLWTNDLANHKLLKHLGIEPLTRQFNANYLYQAAQSRKIAIKTLLMDSQVVVGVGNIYANEALFQTGIHPSTYCHVLTTNQCAELTRIIKAILKQAIKAGGTSLKDFTNSDGKPGYFKQKLFVYGRSKEPCLTCQEDIQQFRQNQRSSFFCPCCQPEPKTM >NZ_CP038876.1|WP_016211268.1|368251_369436_+|fatty-acid-desaturase MLSFYGLLNLPWWGYIIAVLLLTHVTIVAVTVFLHRHQAHRALDLHPVVSHFFRLWLWLTTGMVTKEWVAVHRKHHAHCETAEDPHSPKTYGIKTVLWEGADLYRHAIQTQPEMMEKFGHATPNDTLERHLYSRFRYLGIIIMLILDIVLLGVPGIAVWAIQMMWIPFFAAGVINGIGHYVGYRNFEAADASTNVSPWGILIGGEELHNNHHAYASSAKFSVKPWEFDVGWMYIRLLEVCQLAHVKKRIPRGACVAGKSEVDNATLKAVIQNRLQLLSKYQKDVLQPTFKAERARQGESVLNSTASKLLKRDQRFFSHADHQALEQVLISSKALDLVYQFRAKLQAIWTQKASNQKDVLDALKQWCSQAEASGEQRLQEFVSYLRGYVLTTQSH >NZ_CP038876.1|WP_016211271.1|369454_370399_-|L,D-transpeptidase-family-protein MGIITQRHNTVAGIALFTSSIFCTSAATAFTLPISSHNTNDVVGWQVITYSKAGDTPLKIAQRHSISIQRLQALNSKVRHWQKQRIYLPYQVILPQLIQQQQSKITVNLAEKRLYYFNAKSQVLSVYPVSIGREHWRTPTPTKTTYIIHKKKHPTWNVPASIQRYYRAQGKSLPKQVPPGPENPLGTRALYLGITGILIHGTNQPASIGTASSSGCIRLYTNDIEHLYKQAGVNTPVKLIYQPYKVGFNENVLYIEAHPVISDYDKNNQQRQIIIEKLQNMTNNSKQLQVNWSLVDKAINEAAGIPVPIGKLFY >NZ_CP038876.1|WP_016211269.1|370703_371489_+|hypothetical-protein MAKKIFYSLIIVILLLVVGSYFLFSHMDSILRSAVEKIGSKTTGTTVTLGSLKTSLKEGQVSLSRLTMSNPAGFSQANAISFKDIMVNLDPSSATQQTIVLNKVIIKDPYLLYEMKEGSSRSNLQQIQKNIQSYFASKQAKNNESNQRNSGVTQQEPSQAKVAAKNQKKFIIKELEILAGQVKVISPLLKSKEKTLSLPNIRLTNIGTGGSGLTPDQVTEQIINVLVANSGQAVAQAGLDRVKTKLKEKASGLLNNLLGNP >NZ_CP038876.1|WP_016211272.1|371606_371975_-|hypothetical-protein MKIHCLPTHFSVCRFKVGTPLPALKNLSFYSLSSDSEGLRLVLKEQDMPKRIRGVDHGWCALHFTDEDDNSEQCLNLLCSRLNSEQIESFVAPTYEMNFLFVQQHNLEAALDVIEDLEYQWA |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038876_2 | 2626122-2626242 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038876_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP038876_2
>2.1|2626159|47|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038876_2
The CRISPR arrays of NZ_CP038876_2 >merge|NZ_CP038876|2|2626122-2626242|CRISPRCasFinder TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCTCGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGCTTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT >NZ_CP038876|2|2|2626122-2626242|CRISPRCasFinder TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC TTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT
>NZ_CP038876.1|WP_075275117.1|2625542_2625965_-|hypothetical-protein MQLSYLELNSVEYIQKVLANITLLDQDACALNKLRVVYSKITQQIESGQLKVHGLGGGSAITFKGERTKVPEGISKIWYEITDMQGNFRWMDNVSAVLNKVKVEANNRSGYRGLTAIGLFFGSYRDAQTKDLYSKISQAL >NZ_CP038876.1|WP_016211905.1|2624888_2625299_+|hypothetical-protein MKLNTKETFTRFMGLFIAVDCLYYLIGLTIFSAIPSGNLIAFVNIFTSFCGLVTGILLFIKIYDKWYTPFVAIEFFTCIYWFFLTLGETVSNTQYASLSKVITSLNYDLFSCFMGVIACLLWLKFAFSFKANKLAN >NZ_CP038876.1|WP_052047041.1|2624356_2624620_+|hypothetical-protein MARSVRIVPQGVYHIWREMTDSEGKFKWPSDVCAAINRSKVQAEQRKDYRGLTAVSLFFGSYRDTHTKALYSQISQGFKTNTHQYKD >NZ_CP038876.1|WP_098082812.1|2623608_2624124_+|hypothetical-protein MLSTPWLAALDLDLDTDDDIIKTKNLSALDVTCRLIISRYNLYQRENFFQVFNNPKCFYQSYQYLEILGLNQAASIQQLLDGPFEKYKDTWSTLSYLGLDCRENAQRILTNPQSFEQDFDGLIALRSAYESIVKEMEANQLKAHGLAGGNPIKFKGETVSVATSVGILHIQ >NZ_CP038876.1|WP_016210678.1|2622453_2623464_+|protein-kinase MPKIVWESQENRTAAEQQAAEWRIAKKYLAGRAPGTQLNPKHGQHKISFKDPKTNEEVYLTHRYLLGNKGEIFVKSNGYLLGKTPRNLVTFGQTKDGQVWAIKESCEIGKDLKESEIACDLDAAKKMFKSNSKCYQVYRFLGLPLDQYLRQNRLTEEERLDLAIKVSQAVHHLHIGTQSRSHTCYAHLDLKPSNICIDHEGQVHLIDYGFSKSLAGRLTHRKGTSSYLSVDYASASKEALDIFALLRTLYLPKKFKTYTQKAKKSRDHHEYILNDDIISKNGLLYALLDTEDGKIKHTRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP >NZ_CP038876.1|WP_016210676.1|2620068_2622150_+|kinase-domain-protein MPKVIWLAQENRTAEQQQAAEWRIAKKHLTGKPPGTQLNPQSGKKVKAYEDPETGEKITLTHRYLIGHEGEIFVKFNGQALGQGICGEVTFGQTEDGHMWAIKESSEKPKNSQEGKIAVDLGKAKNYFKYQGKHYQVYYFLGTPLDKYLKEAKQSLTQAQQYDLAIKMARVIYHLHTGKYSKEKTSYAHLDLKPENFCIDDSGELHLIDYGLSEILPGKLDNEIKGSPAYLPFSVAEASKEELDIIALLRSLYLPLCFKGLGKVRNRGPAAQQLNTQWVFSSTILSQNSTLSQLLDTTKGEVVNLSALDIACQLILLKYGLHSSENLEKVTANPQQFEQDSQLLESLGLNQAAYLKCMLEQRDLVSVFKEYTDKFLILNQFDLNQPIYIKKVLANLEQFSQDYQYLESLGLNQAAYLKCLLEQRESIDLLKEHANKFLTLNQYELNQSIYIGKVLANPEQFNQDYQYLKSFGLNQAAYLKYTLDQHDQFAYNCQRLKDLKLNSRNYIEEIINNPERFEQNYQHLETLGLNQEIYIRPMLNNPQRFGEYCQQLKDLGLNQASDLARALDHPQRFQDDLPSLLKLRKIYDDLSNEIASDRLKVRGLFAGGITVNCQGQSKLVPRGIGSIWLEIIDKQGNFYWMKDVSAALTKSTDQARLRSSSQQQAEGQNSNLFFATYRDPKTQAVYDRISQLP >NZ_CP038876.1|WP_016210671.1|2618353_2619613_+|6-phosphofructokinase MNNSKNLFYAQSGGATAVINTTACGVIETARQKEEINNVFVGHDGIIGALAEELIDTSLESAETIRQLYHTPGSAFGSCRYKLPPIGQNDEVYQRLFSVFEAHDIHYFLYNGGGDSQDTTNKVSIMSKKLGYPLKCIGLPKTIDNDLMHTDNCPGFGSAAKYIATSIKEAALDVAGMARTSTKVFLMEIMGRNAGWLAAAAGLAAEQDGDAPHIILFPEIAFNEKRFLQRVKEVVQTHGACTIAISEGLRDEHGDLLIKSSSIDAFGHVQLGGIASKVAALIKHNLGYKYHWALPDYLQRAGRHLGSKADVEQAYAIGQAAVEAVIAEKDNIMLAIERTSNSPYQWQVGEVCLNDIANHEKFMPKEFISEDGYHITEACRDYMSPLIAGECIPPFKNGLPVYARLKKQTIPPKLSPFEI >NZ_CP038876.1|WP_016210673.1|2617747_2618221_-|hypothetical-protein MMQIIWRLCTFRAGPQDIVYSVFGLQLICVIHFISQWGWLSLRLPLLHSALVALFSAALLLALPYLVVNSAKYAGRFLQTALALQLVSCVLHILLLALFLLHSPLVLLNYYLIFSFIWGAALFSHIIKEAIVVKLWQAVLIVLIYFIVRTVSVIGLM >NZ_CP038876.1|WP_016210672.1|2616356_2617739_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase MHIHILGIAGTFMGGVAQLARAKGVTVTGADLNVYPPMSTQLAQAGIAVTAGYDDEFLKLTKRPDCVVIGNALSRGNPAVEATLNENMPYCSGPEWLAREVLHGRHVLAVAGTHGKTTTSSMLTWILEHAGLQPGFLIGGVPKNFGVSARLGQGEYFVVEADEYDSAFFDKRSKFVHYQPKTLVLNNLEYDHADIFDDLQAIMRQFHHLVRTVPSNGKIIVNSIDENLHTVLEMGCWSPRVSVGLQAGDITAEVIQADGSHFEVICHGMRYEVNWSLIGQHNVMNGLAAIGAALQVGVDLKHACEALTLFQGVERRLQVFGQSQGVTVYDDFAHHPTAIATTLEGLRHRVGTEGRVIAVFEPRSNTFKMGVHQDNLAAAFSCADRVYFYQPTGLSWQIADNLKKEEQFNYRVRHSIDELLQALTDDGLKDHDHVVVMSNGSFEQFHQRLLNQLELECENA >NZ_CP038876.1|WP_016210677.1|2615749_2616364_-|UbiX-family-flavin-prenyltransferase MLNFKKKIILAVTGASGAPYALRLLEHLVLSGVQVSFLISPAGALTIKEECDIHLPAKPEVLQQRLTELTGATAQQILCYGRNDWFAPMASGSAAFDAMIICPCTMRALAAVAMGLSDSLIERAADVMLKERRQLILVPREMPLSVIHLENMLKLARAGAEIIPPMPGFYYRPDSVDDLIDFVVARLLDRLGLAHSLGQRWGER >NZ_CP038876.1|WP_054300282.1|2627619_2628084_-|IS630-family-transposase MDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR >NZ_CP038876.1|WP_081377880.1|2628140_2628620_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MECADSRHATLCDADSRGFIVVAFCSAILHHWMCKIPTEVATLTYDLRIRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH >NZ_CP038876.1|WP_129556590.1|2629477_2629873_+|nucleic-acid-binding-protein MTELCPCCSQKPYSSCCQPFVSGQTLPATPEQLMRSRYTAYTQANIDYIIATMQGEALNGFNRNSATTWAKQSTWLNLQVLSAPAVKQDGQEGFVEFIASLQNQGKIECLHEKSRFIKNKDQWFYVDGQQH >NZ_CP038876.1|WP_032126312.1|2629869_2630664_-|M48-family-metallopeptidase MIVLIFALCTLEHLGYDGAMKIVKKLKQLKTYQLTVDNIDYRISHTGRTKTYGLSIRDGKVHMNVPKRMSKQRVCQAIDDNQAWVRENIRFSLASTKQHQSLSSGSLISYLGKQYSLKLTYVNQSVVFYDDAFLMGVPARVKSENHQAYIRDKLSAWFKEQALLRFEQRTFFIANRMQLKPTKVSVRSYKARWGSCSSSGCLSFDWKLLQAPEFIIDYVIVHELSHLKHFDHSPAFWQLVSLYYPEHKVARQWLKNNQTSLARL >NZ_CP038876.1|WP_016211756.1|2630842_2631568_-|M15-family-metallopeptidase MLPDLPICHNYKTVDKQALNELQQQAACVELKPSSRIMCLNEYYQQKLPGALSVMYTRQSVYLKLLAVLENLAPHFAFAIFDAYRSVACQKTLFEQIYRELYQRHPGRSKEWLEIEVRKYVSHPHEPSRFAVPPHNSGGAIDLTLMDLRTNTALDFGTEFDNTTTLSQTDYFERDYSANLGISSERWLLIRQNRRLLFNTMKQEGFTNFVSEWWHYDLGDCLWADAVGSSWFYDSMEAEVN >NZ_CP038876.1|WP_016211759.1|2631813_2633001_+|S-methyl-5-thioribose-kinase MNKYQKLNAEKAIEYVKQYNIFFTHYEHLRCEEIGDGNLNLVFRLINDNDNKSLIIKQALPYARCVGESWPLSLDRARIEAESTQIQANICPGYVPKIYHTDNTLALTIMEDLSDHVVLRNGLISGQSYPELPQQIGSFLAHTLFYTSNLYLDSHLKKQYLRQFINPDLCKITEDLVLTDPFFGSERNHYDQDIQTQVTELQNNQQLQLNVAALKLKFLSSTEALLHGDVHTGSIFVTKNSMKVFDSEFAYYGPMGFDIGLIIGNMVLSLCSHFIQNNLNSVNYCLNAIEIIWQTFESKFTTLAKEHTQDLAFKNDIYINHTIKNIFADTLGYTGCEVIRRIIGLAHVEDLDGMENKTLKNKAEILALTIGQQFILEQNQLHTIDNVIQKLQGHL >NZ_CP038876.1|WP_081377344.1|2633355_2634483_-|transposase MECADSRHVTLCDADSRGFIVVAFCSAILHHWMCKIPTEVATLTLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINHAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHRCEPWSAKHGVSRPR >NZ_CP038876.1|WP_016210935.1|2634813_2635356_-|acireductone-dioxygenase MSQLTIFHANNSHQMIFQSSNQREISSQLAHVGIRFEQWQAHAKVSAEDSEEHILTMYAEDIHRLKKQGGYQAVDVISLDSSHPDKALLRQKFLSEHTHSEDEVRFFVKGKGLFCLHIDDKVYQVLCEQNDLISVPDHVAHWFDMGSEPEFTAIRLFNNTEGWVAELTGSNIAKRFPLLD >NZ_CP038876.1|WP_016210943.1|2635352_2636039_-|acireductone-synthase MIKAILTDIEGTITRISFVKDVLFPYAEKQLPEFIHCFCETPEVFAQLDAVKNEINNQQATIAQLIDTLLAWIREDKKITALKQLQGMIWEKGYQQGDFTGHLYSDAVEFIREQCKRNIPVYVYSSGSVKAQKLLFSYSDFGDILELFSGFYDTKIGGKKEMKSYQNIIEELNIQAENVLFLSDIAAELDAAKQAGLKTCQLVRDNQKPSKHHPWVNNFNKFIIQDYS >NZ_CP038876.1|WP_016210942.1|2636042_2636654_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase MQNNNDVVNQLITAGAWISEKGWVPATGGNFSARLANGVVVTASGYDKGCLTEASFCQFDLEGNQFTGTGKPSAETALHLAIYQLDDHAKAVLHTHSIAATTLSRYIAESQLAIHGYEMQKSLAGIQSHLETINIAIFDNDQDIDALVGKVNKAHAKKPLRHGILIRGHGLYAWGDSILEARRHLEGLEFLFMCELERFKLQG |
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---|---|---|---|---|---|---|---|
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NZ_CP038876_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039213 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence | 30310-30347 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038876_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP048067 | Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence | 7350-7387 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038876_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP048067 | Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence | 186740-186777 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038876_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP038894 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence | 23887-23924 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038876_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP038897 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence | 30307-30344 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038876_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP038924 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence | 98297-98334 | 0 | 1.0 |
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17. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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18. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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19. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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20. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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21. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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22. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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23. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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24. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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25. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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28. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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29. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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30. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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31. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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32. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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33. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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34. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033943 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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35. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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36. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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37. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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38. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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39. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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40. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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41. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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42. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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43. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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44. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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45. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013780 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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46. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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47. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050946 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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48. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050947 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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49. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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50. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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51. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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52. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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53. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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54. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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55. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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56. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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57. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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58. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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59. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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60. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
61. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
62. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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63. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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64. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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65. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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66. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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67. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
68. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
69. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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70. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
71. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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72. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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73. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
74. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
75. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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76. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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77. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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78. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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79. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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80. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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81. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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82. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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83. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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84. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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85. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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86. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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87. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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88. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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89. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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90. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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91. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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92. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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93. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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94. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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95. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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96. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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97. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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98. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048070 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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99. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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100. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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101. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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102. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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103. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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104. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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105. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039207 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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106. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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107. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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108. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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109. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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110. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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111. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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112. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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113. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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114. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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115. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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116. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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117. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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118. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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119. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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120. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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121. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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122. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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123. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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124. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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125. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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126. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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127. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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128. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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129. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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130. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
45566 : 89679
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038876|45566:89679|DBSCAN-SWA 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45 | Moraxella_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
136473 : 178470
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP038876|136473:178470|DBSCAN-SWA 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46 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
182276 : 239530
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP038876|182276:239530|DBSCAN-SWA 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56 | Escherichia_phage(12.5%) | tail,tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
256927 : 301882
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP038876|256927:301882|DBSCAN-SWA 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48 | Acinetobacter_phage(40.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
329457 : 375012
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP038876|329457:375012|DBSCAN-SWA AATTAGGCTATACCAGAAAAAAAAGAGCTTCAGATACCAAGAACGTGATGCATTAAAGCGGAAAGCCTTCCTGGAAAAAGTCGAGAAAATCGATAACGACAAAATTGTTTATATGGACGAAGCGGGCATGGATGATACTGAGCGTTACGCTTATGGTCACTCTGCTAAAGGTAAACGGTGCTATGCAGAGAAGCCCGGTAAAAAATCAATACGAATTAACTTTATAGGTGGTTTGCGCGGCAAGCAATTTATGGCACCAATGATGGTTGAAGGTTATTGCAATGCTAACGTTTGTCAGGCTTATATCGATCAGTGCTTAATTCCCTGTTTATCTCCTGGAGAGACTGTAATCATGGATAATGCCTCTTTTCACAAATCAAAAGGGGTTAAGGAAGCGATTGAAGATGCGGGTTGTCACTTATTATTTTTACCCCCTTATTCTCCTGATTTAAACCCGATAGAGCATGTATGGTCACCGCTTAAAAATAGGGTTCGCATGAAGCTTGATCAAGATGAAATAAATTTAGAGACAGCGCTTAGTCAAGTAATGAAGTCAATGTCAGAAACTATTCGTTGAGCGCTATACAATAGTCAAGTCATATGTAAGTTAAGCCGTTATGTATATTTTATTATTGAATTTGTGAGGCTGCGGCTGCCCCTTCAAGATCCCATGATTGAACTTGAGCCAAGGCAGTCGTACGCCGATCAAAAAGCAGGCACGCTGCTGCTTCTGAAGTTTCGTTTTCGTCTGTTGCCAGTTGCGAGCGGAATTGTTTCAGTAGCTCAGATTGCAAATTAACCCCTTGCAAATCATAAAAACGCTTGATACCGTCTAGCATGTCGGACAATACGAACTCAATATCTTCTTTGGCTTGCTCTTGCTTAAACAATTTTCTAAAACCGCTATAGCTGTCTAGTTGTTTGGCAAAGCTTTTCAGCTCATTAAGCATGTGTTGAATATAGTGTTCGGTTTGGTTTGGCTGATCCAGAATAGTCTTGGTATCTATTAATAAAAGATTATTGATAAGTATTGCAATTTTTTTAAATCGATGGGCTCTACTATTAGTAACTGAAATTTCGAAAAACTCTAGTGTTGTATTATAAAGATCTTTATAAGCATCAAGCCATTTATCTAACGATTGGATTAAAATGTTTTTTAGTAAGAGAACTTCCTCTTGTTGAGGGGTTAAGCCATCGATCTCATTACTGCTTACACGACTAAAATCAGTTAAATATTTCTCTTTAAATTTTCGAGATGGAAGTGAAGTAACGTAGTCATCATAATTATGAAAAGAAACTTTGTTATCGAGTAAACTTTTTACTTTTTTATTTCTCGACCGATCATCACTTTCACTTCTGATATTCACTATTTCAAATTTGTTTTTTCCCTCTTTTATTGCGCCGACTTTATAAATTGCTTCTTTATAATAGATTACAGATGTTTTTTTAAATCCTTTTTTATCTAATTCTTTCATCAAATTTTCTGCAAAATTTTCTGCATAAGATGCTATTAATTTTATCTGTATATTATTTTTAGCATGGTCAGGGAGGCTCTGGCTGAGTAGTTGAGCAATGTCTTGGTAGCTAATATCCAGAGAGGCATTTATTTTCGAATTATAGAAATGATCTCCTGGGTGGAAAATAATCTGTTGCAAATGCTCATCAGTGAAGGCATTGCCTGAGTCAATGTAAATTCGAGTAAATGGCCCAGCTTCATTTAAAGCCTCTTTTACTATATTATCAGCAATTTACTTGTTTGTTTTATCTGGATTGACTTGCCATTCAGCCGGTGCGTTTTCTGTGTAGGGGAAGTTTAGCCGTATAAAAGGAATTTGGTCCTTAAGTAAAGATTTCCTTTTATGCTGGATATACATATCAATGGTATATTTACGACTTAAATCTTTATCTTTTTGTGAAAAAAAAGATTTTTTGAATGAAGTACAGGCAAATAAGGGAGTTTGGATGTTACTGGCAAGAAAAGATAGATAGATCGATTGATGAAACTTAGGCATAGTATTTAAACCTTGATTGAAAATAAAACAAAATAAAATAAATCAATTTAGCTTTTAAAATTAAGATAACGAGTATTTTATTCTTATTTAAAAGTTATAGTAATCTACTAGAAAAGGGTTTAATATAAAACATTTATAACTGTTATTATAGTCTTTTGTTTAACTTTTTTAATTATTTGAGCGTATTATTAATTTTGCTGCAGAATAGAATAAGTACAAGTTACAAGCGAGTATTATTTTAACGAGTAAAGTTATGATGAATAAGACTGGACTGTTGCCAGTCTAGCCTTAAACAAGGTGATTAATAGGGCTTAATTTTGCCGGTAAAATTTTCGCCGGTAATCTTATAGTGTAAAATTCCAGCTTTTAATCATTATTTTGCTTAAAGCCTTTCAGGGAAATAATGCGTGCTGATAACTCTTCTATAGAGCGATGTGTGGTGTCTAAGGATGGGATATTATAGCGTTGAAAAAGTTGATTAGCATAGCGCACCTCTTGACGGCATAAAGCAGGATCGGCATAAGCACGAGTGGAACGGCGCTCTTTGCGGATGGCGTGTAAGCGGCCGGGGTCAATAGTTAAACCGATTAATTTATCTTGATAATCTTTTAATGCATGAGGCAATGAAGTATCGAGAAAATCTTCGGCAACCAGGGGGTAGTTGGCCGCGCGGATACCATATTGCAGAGCAAGATATAAGCAGGTTGGCGTTTTGCCTGAGCGTGAGACACCGACTAGGATAACATCGGCTTTTTTATAATGCTTAAGGTTCGTGCCATCATCACTGAGCATAGAAAAGTCAACAGCTGCAATCCGTTGATTATAGCTCTCTTCAGCCATAGGCTTACGTGCCAAGCCGATGGCATGGGTCGATGTTTGGTGAAAAAATTGCTCAAGTTCAGTCAAATAATGTTCAAATAAATCAAGAACTAAGGCGTCAGCTTGCCGAATAATTTGGCACAGTTCAGGTTGAACCATGCTGGAGAAAATCAGTGCTTTCTGGCCATATTGCTCTGATTTTTGATTGATCAGCTCATAAGTTTGTTGAGCTTTTAAAGGCGTATCAATAAAGGGTAGGGTATACTTATTAAATTCTAAGCCGGGGAACTGGGCGAGTAAGCTTAAGCCCAGGGTTTCTGTTGTGATTGCGGTAGAATCTGAAATAAAAAAGACAGGGTACTTCATTTTTACACCAATTTCGGGTAGTTTTCCCTATGTAACCAATTTCCACGCACAAAAGCAAGGAGACCCCTTAAAATGATGCAGTGCAATTTCGTTGTTCCACTTTCTAAGGTTAACCGTGAAGATGTGGCCCATGTTGGCGGTAAAAATGCCTCACTTGGAGAAATGCTTCAACATCTCACCGGGTTGGGTGTAGAGGTTCCTTCAGGAGTGGCAACGACTGCCGCTGCGTTTCAATACTTTCTCGCTGAAAATGATCTAGCTGAGAAAATTAGTGAAGCGCTCATGGGCTTAAATGTTGATGATGTTGATGAATTAACGCGTGTCGGCAAACAGATTCGTGAGCTGATTTTAGCTGCGCCATTTCCAGCAGCTTTAGAGGAAGAAATATTATCGTCGCTAAAAGTATTTATTGATAGTGAAACGATGCCGGTCGCTGTGCGTTCTTCAGCGACGGCAGAAGATTTGCCGACCGCTTCGTTTGCCGGTCAGCAGGAGACATTTTTAAATGTGCGAGGTTATCAAGAGATTCTCGCGAAAACGAAAGAAGTTTATGCTTCTTTATATAATGACCGAGCGATCGCTTACCGCGTGCATCAAGGTTTTGCTCATGAAGAGGTTTCTATTTCTGTCGGTATTCAACGAATGGTGGAAAGTGAAGTTAGCGGCGTGATGTTTACGCTGGATACTGAAACTGGCTTTGATGATGTGGTCTTGATCAATGGTGCCTATGGTCTGGGGGAAAGCGTGGTACAGGGCAGTGTGAGTCCTGATGAGTTTTATGTTTATAAGAAAAATATTCACGAAGGTCGTCCGGCAGTATTACGGCGGACCTTAGGCAGTAAAGCATTGCAGCTGACCTATAAAGACGGTGGTGGCATCATCGAGTCTGAGGTTGAGCTGGCGCAAAGCCAAGTTTTTTGTTTAACAGATCAAGAAGCCGAAGAGCTCGCGCGTTTTGCTCTGTGCATAGAAAAGCACTATGGTTGCCCGATGGATATCGAATGGGGTAAAGACCAAAACGATGGTAGGTTATATATTTTGCAAGCACGTCCTGAAACGGTGCAAAGCCAGGCGCAAGTGATTGAGCGTTATCAGCTAAAAGAGCAGGGCAACATATTATCTTCTGGGCGCAGTGTGGGTAAAAAGATTGCCTCCGGTCGTGTGCGTTTATTAAAAAGCTTGCAGGATATGAAGAACTTTCAAGCCGGCGATATTCTAGTGACGGATATGACAGATCCTGACTGGGAGCCGATTATGAAGCGCGCAGCGGCAATTGTGACCAATCGTGGTGGGCGCACTTGTCATGCGGCAATTATTGCTCGTGAACTTGGTGTACCGGCAGTGGTTGGTTGTGGTGATGCAACGGCTGAGTTAGTAGAAGGTCAGATTGTCACGGTGAGTTGTGCAGAAGGCGATACCGGTTATATTTATGAGGGGGCTTTAGGCTTTGATGTACAGGAGATTAACTGTGAGGCAATGCCAAAAATCCCTGTCAAGATTATGATGAATGTAGCGCACCCTGAGCGTGCTTTTGCCTTATCACGTCTGCCACATGAAGGGGTGGGTCTGGCACGCTTAGAGTTCGTTATTGGGCGGACTATTGGCATTCACCCACAGGCTTTATTAGAGTACGATCAGCAGCCTGAGGCGGTTAAAGCAGAGATTGATGAGCGTACAGCGGCCTATGGCTCGCCAGTTGACTTTTACGTTGAAAAGATTGTTGAAAGTATTGCAACACTTGCCGCAGCGTTTGCACCGAAGCGAGTGATTGTGCGCTTATCTGACTTTAAATCGAATGAATAT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46 | Hokovirus(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
447625 : 555265
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP038876|447625:555265|DBSCAN-SWA 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MKYILDTHVLLWAAGNSSRLSVEAKFLLSEKDNELFFSAASLWEIAIKNSLGRKDFKVEPHLLRRGLLDNGYSELPITSEHAVGVSGLPAIHKDPFDRILIAQAISEGFTLLTALLRKVIVSFRKVIFLC >NZ_CP038876|447625:555265|508171_508900_+|WP_054300501.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEMTGERGLELERSTICRWVHEYGPEIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAALRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSRRCKLRRVKYLNNCIENDHKAIKRKSRFRQWYQSLSTARSTIDVMEAMRMVQKGQLRYIKKQDICAQNQLIDKLFGLAA |
103 | Escherichia_phage(45.95%) | integrase,tRNA,transposase | attL 535384:535443|attR 560125:560988 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
560193 : 604160
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP038876|560193:604160|DBSCAN-SWA TGTGGGTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATCATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGCTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATCAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCCATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTGTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGTTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCGCTTCATGATTAGTTCGGCCTGATTGAGGTTTGATAAGCGTACCAAACTCGAGTTGCTCTATTTCTAAGGTAATTGGAGCAATAATGTGGGCAGAAGTGTTTAGAGAAATGTTAGTATTTGCAAAAGTAAAAGCTGGGCTGAATGTAAATAGCAATAGGCTGGATAGGATGCTTGATTTTTTCATGATAACTTTCCTTTTATCATAACTATCATTGATCTTATTGCATGCAGGCTCTATGCCTATTTTTCTATAATATTTGCTTAGACTAATAATAAACACTGAAATTATTTGGCTTTTTTTTGAAAAATTGTTTGGAATTGATTAAAACTGAGATAATTGCGCCATAGCTTAAGAGGTAAGCTATGGCGCGGCTTAGTCATTGTCATTTAGATTAAATATAATCTTGAGTGGTTAGAATCGATCATGCTTATAAGTAGCTTGCCGTTACCACGGTTGAGCCAACATAACGTCCCTTAGCCGTTGTACTTGCCACAGTGACAGAACCGCCAATTGCTTTAGTCATTGCACCACTGGCAGGTAGTCGGCTGGTACCAGCGCCACTTAAACGGACAGTGAGTCGATTAGGACCATTGGCGATGATTGCCGCTGGTGCATGGCTGATGCGGACATTGGCATTGCCTTCACCGGTGACTCTAAAGAGTGCAGCTGATCGTTTTGTTGCTGTGCCTGAAGCGGGTTTATAGATGTAACCAAAGTTCATCGCACGGGTTTGGACAATATTCAATGGCGTGATAACAATTGCACTCATAGTTAAGTTAGTACGGTCAGCAGCAATGGCGGGTGTTAATGTCGCTGCGGTTGTGATTGCAAGAATAGACGATAGGGCTAGTGCTAGTTTTCTCATTTAGAGGTCTCCATACCAATAATTTTTTAAGGAACCTTGTGTTTATTTTTCTTAAGGTTCACTTAAGGAATAGCTGTGGTTTTACAGAAATAAAAAAGAGAATTGATCTGTGTTGTGTGTGAGATCTCTGTTTTTTTGTCATCTATAACAAAAAAATGCGCTTTATAACTATTTGGAATTAAAGAAATAAACTTGTGGGAGAGGGGCTTGGCGGTAAAAGTCCTCCCCATATTGAGGGGAGGTAAAATCTCTACCTGCATGATAGAGCTGCCGTTGAACAGTTGCAATATTAATATAAATGATAATCATTATCAAGTTATTTGTGATAATTATTTTTTGCTGAACTGTGTTGGGTTGAATTTATAGGCGGTGCGCTTTACTCTAGGCAGAGTTTATATAAATCAACGCTGAAAAAAGGTGATAAAAATGATAAAAGCAGTGCGTATAGAAACCGATAGCATGGGTGAGATTGAGGTTGCAAGCGATAAGTATTGGGGGGCTCAGACCGAGCGCTCGTTACATCACTTTGCCATTGGTCACGATATTATGCCACGGGCGATGATTCGTGCGCTTGGCGTATTAAAAAAAGCGGCGGCGCTGACGAATGAATCCTTAGATAAATTGCCAGCAGAAAAAGCCAAGTTAATTGTCCAAGCCGCAGATGAGGTGATCAGTGGCCAGCTTGACGCTCATTTTCCTCTACGCGTATGGCAAACCGGTAGTGGCACACAGACCAATATGAACAGTAATGAAGTAATTGCTAATCGAGCGATAGAAATCGCGGGTGGAGAAAAGGGCAGTAAAGATCCGGTTCACCCCAATGATCATGTCAATATGTCTCAATCATCGAATGATACCTTTCCAACAGCGATGTATATTGCGACAGTAGAGACCATTGTTCATCACCTGCTTCCTGAAATAAAAGCGCTGCGTGATGCGATTGCTGATAAGCAAACAGAATATCAACATATTATTAAAATTGGCCGTACCCACTTGCAAGATGCTGTGCCGTTAACCTTAGGTCAAGAGTTTTCAGGTTATGTAACGCAGCTTAATCAGGCGATTGGTTATATTGAAAATAACTTAACTCATTTATATGAGCTTGCATTGGGGGGCACTGCTGTTGGCACGGGCTTAAATACTCACCCTAAATTTGCAAAGAAAGCCGCTAAGTTTATTGCTAAAGAAACCGGTTTAAAATTTAGTTCAGCTGAGAATAAGTTTGCTGTGCTTGCCGCGCATGATGCAATGGTACAAATCAGTGGTTCTTTGAAGACATTGGCCGCTGCATTGATGAAAATTGCCAATGATGTACGTTGGTTAGGTTCTGGCCCGCGCTGTGGTTTGGGTGAGTTAATTTTGCCTGAAAATGAGCCTGGTTCATCGATTATGCCTGGTAAAGTCAATCCGACTCAATGTGAGGCGATGACCATGGTGTGTGTGCAGGTGATGGGCAATGATGCGGCAGTTGGCTTTGCGGGTAGCCAAGGTAATTTTGAGTTAAATGTCTTTAAACCGGTGATGGTCCATAATGTACTTCATTCAATTCAGTTGCTGGCCGATGCATCACGCAGCTTCAAAGAGTTCTGTATCGAAGGGCTTCAGGCAAATAATGAACGGATTGACTACTTCTTGAAGCACTCTTTAATGCTTGTGACGGCACTGAATCAGGTGATCGGTTATGACAAGGCGGCTATGATTGCTAAAACAGCACATAAAGAAGGCAGTAGCTTAAAAGAAGCTTGTTTGAAACTGGGTTATTTAAATGCAGATGAATTTGACCAGGCGGTTAATCCTGCCAACATGATTGCGCCTTAGGGCTCAATCACCTCTTGCACCCATGAAGCCTTTTCGCTAGTATGAGGAGCTGTATAGCGTTTTTATTAATAATACTAATACATAGAGCAAGACTTAAGAAAAGGCTTTAACAATGAGAAGCAGAGACCCTCAAAACACCAGTATCACTCCCATCTTAGCTGTTGTTCCTTCTCATCATCATTATCTTCATCCTTATCCTTCCCTGTCTTTGCATCGACATCACTCTCATTATCATTGCGACTAAATCGCTTATCTTTTTATCGACTAGCTTTTAAAGACCGAAAACCCGAGAGCCATAATAAGGGTGAAGGATTAAATACTTTTTTAGTTGATATCTGATTTTATCCATTGTTTTTAGTTTAGTTATTATTACAGCGATTATTTTTACTAAATTTACTTTTTTGTTTTGCATTTTTCATTTTTTTATTGAATAGGGTATTGCATGGAAACGAATCAAACATTGCAACGAAACTTAAAGCCTCGCCACTTAATTATGTTGGCACTGGGGGGAACGATAGGAACGGGGTTATTATTGGCGAGCGGGGGGGCGGTTCATAGTGGTGGCCCGGGAGGCGCTATATTGGGTTATTTGCTGGTTGCTGTCATTGTATTATTTGTCATGACCAGCTTGGGTGAGCTAACCGCATTTTCACCAACGACAGGGTCATTTTGCGATGATGCTGCCAGATATGTAGACCCTTCGTTTGGCTTTGCTATGAGTTGGAACTATTGGCTTAACTGGGTGTTTGTGGTGGCCTCAGAAGTGATTGCTGCCGGTTTGGTCATGCAGTTTTGGTTTCCGCATGTTGATGTATGGATTTGGAGTGCGCTATTTTTCTTGCTGATTTTGGCGATTAACCTTGTGGCAGTGAAGCTATATGGTGAAGTTGAATACTGGATTGCTTTTATTAAAGTGGCTGCGGTGATTATTTTTATTACTGTGGGGACGTTAATGATTTTTGGTTTAGTTGGCTCACAGGGGAGCGTAGGCTTTGATAATATTACCTTAGGTGATGCGCCGTTTCATCATGGTCTGTTTGGCTTTTTCAGTGTCTTTTTAATTGCAGGATATTCGTTTCAAGGGGTTGAGCTGATGGGGGTTGCTGCAGGAGAAGCCGATGAGCCGAAGAAAACCATTCCCAAAGCGGTAAAAACCGTGTTTTGGCGTATCGTTTTATTTTATATTCTTGCGATTGCAGTGATTAGCTTTTTGATTCCTTATACGGATAGCAATCTAGTGAATGCTCACTCTAGTGTTGCAAGTAGTCCGTTTACAATTGTATTTGAAAATGCAGGAATTAAGTTTGCCGCATCGTTAATGAATCTTGTGGTGATTACAGCGATTTTATCTGCAGCCAATGCCAGTATGTATACAGCGTCACGGATGTTATGGCATATGGGTAAAGCGAAGGAAGCTTCAGGGTCTTTTCAGCGGGTGAATAAATATGGTGTGCCGGTTATCGGTGTGATTGTAACCGCTTTAATTAGTGTGGTGTTGATTTTAGCGTCAACTTATCATG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47 | Escherichia_phage(22.22%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
640121 : 740750
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP038876|640121:740750|DBSCAN-SWA 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104 | Prochlorococcus_phage(17.65%) | tRNA,plate,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
776180 : 822866
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP038876|776180:822866|DBSCAN-SWA 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39 | Staphylococcus_phage(28.57%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
839553 : 894006
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP038876|839553:894006|DBSCAN-SWA 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45 | Staphylococcus_phage(15.38%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
900256 : 963093
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP038876|900256:963093|DBSCAN-SWA 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58 | Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(14.29%) | integrase,transposase | attL 892616:892675|attR 909900:910339 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
967165 : 1070345
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP038876|967165:1070345|DBSCAN-SWA 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110 | uncultured_Mediterranean_phage(11.11%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1099802 : 1142862
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP038876|1099802:1142862|DBSCAN-SWA 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41 | Tupanvirus(28.57%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1196847 : 1249528
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP038876|1196847:1249528|DBSCAN-SWA 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48 | Klosneuvirus(28.57%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1254064 : 1431299
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP038876|1254064:1431299|DBSCAN-SWA 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169 | Bacillus_phage(11.76%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
1458149 : 1494669
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_CP038876|1458149:1494669|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP038876|1458149:1494669|1485305_1486142_-|WP_033923779.1|transposase|DBSCAN-SWA MLATYLKDEHKLSLVVACNLVTLPRASYYRKKQHQSDNAEIISELKTLASKHKRWGCDKMVAYLKNKGKPWNHKRIRRVYIEMGLNISCKPKHHYVKNEPEYLFQPIYKNVCWSLDFMSDALLSGTKFRTMNLIDDYNRKALGIAIDFSMPAVFVTSKLDEWCKVHGYPEMLRTDNGPEFISSHFQEWAEGHGIQLRRIQPGKPAQNGYIERFNRTYRGDILDCNQFTSLQQVQKLSDDWIVEYNTIRPHQSLKNLSPDTFAEKREKQLEKISTKTEG |
41 | Leptospira_phage(33.33%) | integrase,protease,transposase | attL 1450687:1450746|attR 1504997:1505254 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
1498499 : 1558045
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_CP038876|1498499:1558045|DBSCAN-SWA 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52 | Staphylococcus_phage(18.75%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_18 |
1568310 : 1624447
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NZ_CP038876|1568310:1624447|DBSCAN-SWA 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48 | Staphylococcus_phage(13.33%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_19 |
1636412 : 1692207
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_CP038876|1636412:1692207|DBSCAN-SWA 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57 | Staphylococcus_phage(42.86%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_20 |
1698375 : 1753625
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >NZ_CP038876|1698375:1753625|DBSCAN-SWA 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45 | Pseudomonas_phage(25.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_21 |
1783247 : 1827378
Sequences of DBSCAN-SWA_21
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21 >NZ_CP038876|1783247:1827378|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_21 >NZ_CP038876|1783247:1827378|1809498_1809831_+|WP_016211940.1|DBSCAN-SWA MKKITYSSLSTSITLSLGLGLSLSSTNTHASVFNHMEAKIERSAAYKIHRQCYLFAQDRAKTSHQTNGTTEKNPKKISYHQIYQSTYDQCVSSAVKLLGKDLQNLESKIP >NZ_CP038876|1783247:1827378|1812973_1813537_+|WP_016211214.1|DBSCAN-SWA MTFFDLKEKVSQYLLAIYLKLAGDQEKDAAAAFFSEFITKTARSQSAASLLHFLKQLINHESLDSNLHTSRYISFYSTLDDYLSKCELIVLDDIATGIFEQLKGPGFNLGYFKSNYSITDSDGKPHQVPERISRIMNIIRNENMTPNQRLEKIKEIKIAAPSYGSSYLFFNATDSSTNEFISNLQCD >NZ_CP038876|1783247:1827378|1784426_1785312_+|WP_129556535.1|transposase|DBSCAN-SWA MPSPYSYDLRVRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNMRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR >NZ_CP038876|1783247:1827378|1799021_1799369_+|WP_032126998.1|DBSCAN-SWA 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46 | Acinetobacter_phage(16.67%) | integrase,transposase | attL 1782191:1782250|attR 1811963:1812253 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_22 |
1831819 : 1951357
Sequences of DBSCAN-SWA_22
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22 >NZ_CP038876|1831819:1951357|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP038876|1831819:1951357|1908923_1909265_-|WP_016210390.1|DBSCAN-SWA MSIREDLAELKIIMKNMLLKAEEGEWESLIDMDMQRSKCISKLVAYSDSHLDSNFDPSLDGGLEENLTEEIELLMELDQQIMKICLNRKEDITKNLCDANKVMKGMNEYLKNS |
119 | Leptospira_phage(20.0%) | integrase,transposase | attL 1880815:1880874|attR 1949214:1950373 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_23 |
2031079 : 2082957
Sequences of DBSCAN-SWA_23
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23 >NZ_CP038876|2031079:2082957|DBSCAN-SWA 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51 | Orpheovirus(20.0%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_24 |
2090801 : 2135507
Sequences of DBSCAN-SWA_24
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24 >NZ_CP038876|2090801:2135507|DBSCAN-SWA 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47 | Staphylococcus_phage(22.22%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_25 |
2156706 : 2206453
Sequences of DBSCAN-SWA_25
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25 >NZ_CP038876|2156706:2206453|DBSCAN-SWA 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47 | Staphylococcus_phage(33.33%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_26 |
2212645 : 2258146
Sequences of DBSCAN-SWA_26
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26 >NZ_CP038876|2212645:2258146|DBSCAN-SWA 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52 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_27 |
2327349 : 2386960
Sequences of DBSCAN-SWA_27
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27 >NZ_CP038876|2327349:2386960|DBSCAN-SWA 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56 | Planktothrix_phage(16.67%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_28 |
2424944 : 2598979
Sequences of DBSCAN-SWA_28
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28 >NZ_CP038876|2424944:2598979|DBSCAN-SWA 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165 | Escherichia_phage(32.65%) | integrase,protease,tRNA,transposase | attL 2572603:2572662|attR 2580844:2581131 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_29 |
2627619 : 2662059
Sequences of DBSCAN-SWA_29
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29 >NZ_CP038876|2627619:2662059|DBSCAN-SWA 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38 | Microbacterium_phage(20.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_30 |
2670145 : 2721291
Sequences of DBSCAN-SWA_30
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30 >NZ_CP038876|2670145:2721291|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP038876|2670145:2721291|2709916_2710426_-|WP_032126291.1|DBSCAN-SWA MPSARPSKGRGQLCYLWLSVLALGLDFATKWWAQAALHYAMPKPVLPFLNWTLLYNPGAAFSFLSNQGGWQRWLFSAIALIIAIIIVRLLAKIPRQQHMAAIGLSLILAGALGNVIDRLRFGYVIDFIDVHVAGYHWPAFNIADSVICIGAVLLIWQQLRKSDKSSDKK >NZ_CP038876|2670145:2721291|2682965_2684420_-|WP_032126295.1|DBSCAN-SWA MKQIRRTKIVTTLGPATETPEVLERVLKAGANVVRLNFSHGEAEDHMHRAELVRSIAKKLDLNIAILGDLQGPKIRIARFKAGKVVLEKGADFILDAALDSHVGDDRQVGIDYKELPDDVGPGDVLLLDDGRLVFKVKDVTGTRVLCEVVVGGELSNNKGINRQGGGMSAAALTDKDRADIITAAKIGVDFVAVSFPRSAEDMQEARRLLDAQRCGAALVAKIERAEAVSDQAVLDEIISASDAVMVARGDLGVEIGDAELIGVQKKIIQRARTLDRVVITATQMMESMIYNAMPTRAEVFDVANAVLDGTDAVMLSAETATGDYPEEVVAAMSRVCLGAERERKAQVSRHRVECEFLRIDEAVAMATMYAANHLKGVKAIICLTESGATPLWMSRIHSGLPIFALSRNGETRRRLALVRGVEALEFDPTYIEPKHEVNQIAVNELQKQGLLADGDIVILTKGDHQGIHGGTNAIKILRVGQIA >NZ_CP038876|2670145:2721291|2685687_2686695_-|WP_016210176.1|DBSCAN-SWA 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51 | Staphylococcus_phage(37.5%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_31 |
2744257 : 2804034
Sequences of DBSCAN-SWA_31
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31 >NZ_CP038876|2744257:2804034|DBSCAN-SWA 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57 | unidentified_phage(33.33%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_32 |
2917831 : 2961229
Sequences of DBSCAN-SWA_32
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_32 >NZ_CP038876|2917831:2961229|DBSCAN-SWA 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41 | Acanthamoeba_polyphaga_lentillevirus(14.29%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_33 |
2992914 : 3110341
Sequences of DBSCAN-SWA_33
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_33 >NZ_CP038876|2992914:3110341|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP038876|2992914:3110341|3083796_3084696_+|WP_016210344.1|DBSCAN-SWA MQITPVKGFLMQLQDDICSQITELDGKPFAEDHWQHDSGGGGRTRILQGNIIEKGGVNFSHVQGTTLPDAILKRLPELIDYHFEAMGVSIVMHPDNPYIPTSHFNVRFFNASSPGKKDIWWFGGGFDLTPYYGFDEDCKHWHQVAARACAPYGAEVYARFKQECDDYFYLKHRNEARGIGGLFFDELNAWGFDQCFAFLQDIGRAYTQAYLPIVARRQHTPYTAAEKQFQKYRRGRYVEFNLVYDRGTLFGLQTGGRTESILMSLPPEVFWDYNWNPQPGSKEAELYSHYLKPRDWLAE >NZ_CP038876|2992914:3110341|3034520_3037628_+|WP_016209727.1|DBSCAN-SWA MKLPELCIKRPVLAVVISLIFILLGILGYLQLTLRDQPKVFKPGIAIRVTAPGSSPQYIEQNIIIPLENNLQAVSYLSYTHSESDQDYAQIDLNFKDITPAQFLTAQSQVQQAVNATDLPDNANTPVIDLRGSNTEQALLISLSDPNMKQHALVDYVANHVVKCLQQVPGVGQVQQMSAIDALRINLSPNNMALLGVSVEEVIAALKNNNSAIQAGQVTNSDQTISINLDARLTSIDQFKTIIVKHQGNHFIYLKDVATLSIDNVSYTGAYTFYNGMQGVAVRVRAADGANPIALGKHLHTALKHLQNQLPPGMQLHILWNQSKLIQHAVSEVFYTLLESMILVALVTLLFLGNWRFAIIPIVTIPVCMIASFAIMWLFGFSINLMTLLALVLAIGLVIDDAIIVLENSHRYVERGDQPMTATLKSMQQIVFPVIGMTLSIIAVYIPTAFLSGKTAVYFQQFAFTLAGATLISGVIALTLIPMMCARLLKANTKGSYTDKLEHAFLTLTHYYKQSLSWVISHRWLPISLFITLLIAGAIIFKSLPSTMIPKEYAGYVFIGIQAPDSASVAYTERAAKPIIAKIANMPEVAAIMSFGGGTGSSGNFGFNFAKLKPAYTRSVENAKVATKITTMFKHLKNVTVFSSPINIMSHNNDNSPGEINFYITGYANYNQIVTASQSFEKALKELPMFEKVNNNSRYSNQQYNIKVKRQLANELGISIDTINTAIGTYLGGYKFSHGYQFDGVEYPLYLQLAKNGLHDLNVLKHIFLTNNQGSPIALSRLVTIDYTTSLPQYIHIDSMRAGAMSVVPKSNYTNGQVINQLEAVAKQILPKDMSLQYDQHTREMLSGNHTIILIFSLGLIFIYLVLAALFESFIDPLIILLTVPLCIIGALAALKLIGGSLNIYTSIGLITLIGLIAKHGVLITHFANELYKQQNKQQDTSITTAIITAASMRLRPILMTTATMILGAVPLIFSNGVGANSRIQLGTVIIAGLAIGTIFSLFIVPIAYILFASLKIKINQNRKKATQTTVISDP >NZ_CP038876|2992914:3110341|3012330_3014346_+|WP_129556603.1|DBSCAN-SWA MDVMTKDTIAHMLENASQAFNRKNFIDSKNTLDQLIQQHPQVAEAWYRLALVLYKQNKLTSAIDHLQHALQLDPKNYIYHYQLGLCYKASEKPLDASFSLLQAVSLHPQDQTVLNALITELNTLKTNHPKHTLKMVRKLSQIFKHDTGLQLAKAKLLKGLPLIELITEDASLLDDIYQILELRTINARPLAPQVQILALSTNNLNEHLNDLLDHKSIKTLPQEKVQAIICHPLLLRTLTSFPISHAHIEQPLVKLRKSFLYHATHKTLNITQEVLTFLNCLCQQTWLNEYIYSTDSDESTWLKQLHKAIHTTELTPIQFIYSTLLWYCYHSVSEDEQTLHKSLQYLNAPLLQPIFNQYRSLQREKSLQKHLNKITSINDKVSKKVRNQYEESPYPRWTAVDIEPIKRNLSTLIQEHLPHFSPSKSLLKPARILIAGCGSGYQAINLASCCDAKEIIAIDLSATSLSYAKRMAEEFNITNIQFQQADILELTNSIDQPFDYILASGVLHHLNDPLAGWQVLTNLLKPKGIMLIGLYSKTGRKTVTQARKYIKEQKLAATPEDIRKLRADILQAPSHPLKPLSKWRDFFTLSECRDLIFHVKEHQFTLNQIKQALAKLSLQFTGFQSHDLALGKHKEKITARENYQNLDLWAEYEKNNPDLFYCMYNFFCQKK >NZ_CP038876|2992914:3110341|3029440_3031930_-|WP_016209720.1|DBSCAN-SWA MFNIAEYRKKPDRITDLLPWAALIAPGVVLNKDGSYQRTLRFRGPDLESSTDAELVATTARLNNALKRLGSGWALYIEARRSQAQRYSEESRFEDPVSWLVDLERHELFKRGGENFESHYYLTLQFMPPSEAVGKLSEAMIKRESDGQTVKNKKLSQKKQVKQKAAQAEKLDSYQSQLSFFNVSCERLFDIIKDFMFDAEFLDDDQTLTYLHQCISEKEHPVKKPQIPVYLDAILADTPLLAGLEPQLGQSHLRTVSILGFPSTSAPALLDQLNHLPIEYRWVTRFLPLDKTEAEKELKAYRKRWFAKRKGLGTMLMEMMTKSESAMVDQASVNKSRDADQAIQELEDDHVAFGYYTATITVWDKDPQVVTQKIREVERVVNGLGFTTILETLNAVEAWLSSLPGHANANIRAPLMHTLNLAHLIPFSAIWAGPERNQHLNGPPLLHARTRGNTPFRLVNHIGDVGHQMVLGPTGAGKSVLLNLMALQFRRYQDAQVFIFDKGGSFLASTLGVGGHYYEVGQPENKDLVFQPLAHVDKEAERIWATEWLLGLLQHEKIEVTPHVKDMLWQAMTGLAAVPENQRTLTGLKALLQDHQLRQALDHYTLGGPYGDILDADHELFTTGAWQCFDLEALMETPAIIPPVLDYIFHVLQQRFTGVPSLLILDEAWLFLDHPIFAAKIREWLKTLRKLNVSVIFTTQSVDDILESEITNSLLESCPSRIFLPNNRALEPSVYSAYEQLGLNTRQIQMLSSAMPKRQYYYESTQGNCMFDLSLGPIALAFAGVSRPEDKQKIHALYRRYEYREFIEHYLRECHLDWAISLLEQWSPL >NZ_CP038876|2992914:3110341|3084768_3085347_+|WP_129556610.1|DBSCAN-SWA MYQAFTLLMTIASILLSGCISHYSYYTPRPNDQNQCGILADNESIYIGTAQDFYLESRYYANSGNQISQLLLETVNKYTTHIKRSKNHVTMQQGLIQARNQGYSIYIYPTIISWQRPMPTISWLIDHSEVRLSLYNVKSGKLLNDVIIRADQPIASQWFEENSERLEFAFNKVIAYWYACQKNQMNIIHPTD >NZ_CP038876|2992914:3110341|3039162_3039444_-|WP_016209714.1|DBSCAN-SWA MFDPKLFDDMAKKIAEAMPSGLKSVQEDLERNMKTVLQSSFQKMDLVTREEFDIQSAVLAKTRLMVEALEQRVDELEAQLPTDQQQKELKNSE >NZ_CP038876|2992914:3110341|3073254_3074703_-|WP_129556609.1|DBSCAN-SWA MQEKAILKIIGILLMLFSFSMLPPVYVSWLYQDYDATPFLISFCLAFFSGFLVWLPARDYKVDLKARDGFIIVFLFWLVLGVYSALPFMLSYHPHMVLSEAVFEAVSGFTTTGGTVLSHIENLPPSILYYRQQLQFLGGMGIIVLAIAVLPMMGVGGMQLYRAEVTGPVKDKLTPRITETAKTLWYIYVGLTVICIMTFWLFGMDLFNAICYGFGTISTGGYAPHDASAAFYSSSLIQYAMIFFMLIGGTNFSLHFIMLRKGDIRTYWREPEFRMYISLFFIASIAIMAWLCLSGTEVSISKAIRDSMFQVSSFMTTAGFGSVNLGSWPQLIQLGLLFLGAIGGCAGSTSGGVKIIRLILLGKQSQREIQRLVHPNGVFHIKLGGFPVPVNVINATWGFLAAYVMSFIILMLLLMATGLDQVTAFSTLLACISNTGPALGEAINNYGNLNNSALWLLSFAMLLGRLEVFTVLVLFSRTFWRV |
111 | Staphylococcus_phage(33.33%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038876.1|WP_032126179.1|1102271_1102523_+|TSUP-family-transporter |
1102271_1102523_+
Protein sequences of NZ_CP038876.1|WP_032126179.1|1102271_1102523_+|TSUP-family-transporter>NZ_CP038876.1|WP_032126179.1|1102271_1102523_+|TSUP-family-transporter MSTALAFPMGLFALTSLLVASAGMAGLPSGSVGYLYLPALIGLLIGSFLGSPLGVWMVKRVSEQTSVWLFRIVLLAVIMQMIH |
83 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 1099802-1142862 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 1110894-1110857, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 1110760-1110723, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ********** *************************** 3. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 1100715-1100752, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttagtccagcgct Protospacer ****************************.********* |
||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038876.1|WP_155049815.1|1139317_1139470_-|hypothetical-protein |
1139317_1139470_-
Protein sequences of NZ_CP038876.1|WP_155049815.1|1139317_1139470_-|hypothetical-protein>NZ_CP038876.1|WP_155049815.1|1139317_1139470_-|hypothetical-protein MLSTPWLAAHENILLMLIKIKSINLCYKLNIINNKKRQYHTTFILLLFVK |
50 aa aa | NA |
HTH_21
HTH_21 HTH domain information
|
NA | 1099802-1142862 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 1110894-1110857, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 1110760-1110723, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ********** *************************** 3. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 1100715-1100752, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttagtccagcgct Protospacer ****************************.********* |
||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038876.1|WP_016210918.1|1235171_1235921_-|hypothetical-protein |
1235171_1235921_-
Protein sequences of NZ_CP038876.1|WP_016210918.1|1235171_1235921_-|hypothetical-protein>NZ_CP038876.1|WP_016210918.1|1235171_1235921_-|hypothetical-protein MLSDKARIAALEEKLANIEHEIKAHNSHIKRNIVNHTETTKINNSVLAENIDNETLKKTIGSSSSTANINSNTSHVSYVTNTGYTQTAAQANYEIMGATVSGNTYGAIATTKIAATAKASLETGGLSNITDIAATKLTLEMIPNKTNMKLSTIEETVSTAVATEINNVRSEVALATTAAIASSTKTIASDVKIAMSRIDTVESQVDLVASKVTNVAQQTHRGLYATACALTEQKTHSMIITNAAMQVLS |
249 aa aa | NA |
WHTH_GntR
WHTH_GntR HTH domain information
|
NA | 1196847-1249528 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 1224468-1224431, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 1248616-1248579, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038876.1|WP_032127044.1|1270370_1270571_+|hypothetical-protein |
1270370_1270571_+
Protein sequences of NZ_CP038876.1|WP_032127044.1|1270370_1270571_+|hypothetical-protein>NZ_CP038876.1|WP_032127044.1|1270370_1270571_+|hypothetical-protein MARSVSNLLESWKTGKKKAAPNFDKLNLSEEGLTWAKAELEKLLSQQSKANTDLKQKLITHLTHRS |
66 aa aa | NA |
HTH_21
HTH_21 HTH domain information
|
NA | 1254064-1431299 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 1282944-1282907, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 1286450-1286413, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038876.1|WP_016212421.1|1282295_1282478_+|hypothetical-protein |
1282295_1282478_+
Protein sequences of NZ_CP038876.1|WP_016212421.1|1282295_1282478_+|hypothetical-protein>NZ_CP038876.1|WP_016212421.1|1282295_1282478_+|hypothetical-protein MLLKDLRFSVLRLLSDLYNHEKSKDGSTNDLNFLTKCKREAEEANSKQEIADLLNTHLTH |
60 aa aa | NA |
HTH_21,HTH_38
HTH_21,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 1254064-1431299 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 1282944-1282907, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 1286450-1286413, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038876.1|WP_054300380.1|1285717_1286374_+|transposase |
1285717_1286374_+
Protein sequences of NZ_CP038876.1|WP_054300380.1|1285717_1286374_+|transposase>NZ_CP038876.1|WP_054300380.1|1285717_1286374_+|transposase MARSERKSNISKNEYFRNLINHAINNQVKFDYTVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL |
218 aa aa | NA |
HTH_21
HTH_21 HTH domain information
|
NA | 1254064-1431299 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 1282944-1282907, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 1286450-1286413, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038876.1|WP_081377858.1|1303456_1304167_-|transposase |
1303456_1304167_-
Protein sequences of NZ_CP038876.1|WP_081377858.1|1303456_1304167_-|transposase>NZ_CP038876.1|WP_081377858.1|1303456_1304167_-|transposase MLKTRTYLGLLTPCLALHGSQRKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKFLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL |
236 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 1254064-1431299 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 1282944-1282907, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 1286450-1286413, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038876.1|WP_155046725.1|1305024_1305165_-|hypothetical-protein |
1305024_1305165_-
Protein sequences of NZ_CP038876.1|WP_155046725.1|1305024_1305165_-|hypothetical-protein>NZ_CP038876.1|WP_155046725.1|1305024_1305165_-|hypothetical-protein MNMNSLLSVALQMTEGEFALFHMLSCLKMLTEDSSYELSHFKGGLP |
46 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 1254064-1431299 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 1282944-1282907, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 1286450-1286413, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038876.1|WP_129556517.1|1505258_1505546_+|hypothetical-protein |
1505258_1505546_+
Protein sequences of NZ_CP038876.1|WP_129556517.1|1505258_1505546_+|hypothetical-protein>NZ_CP038876.1|WP_129556517.1|1505258_1505546_+|hypothetical-protein MLSTPWLAASDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVLSTPHK |
95 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 1498499-1558045 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 1555655-1555692, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038876.1|WP_016212013.1|1500951_1501335_+|hypothetical-protein |
1500951_1501335_+
Protein sequences of NZ_CP038876.1|WP_016212013.1|1500951_1501335_+|hypothetical-protein>NZ_CP038876.1|WP_016212013.1|1500951_1501335_+|hypothetical-protein MTINKRDFFDAINYADTAVQIHEYLLNILEKQQKDFAENCNNDNDSEKSKALASISDVELRFAQLDMLSAIYRKILLNTLNEIEGCNDQELKTIKNGLLHMVATTLEACVNDFTIEAKITIDIKEEQ |
127 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 1498499-1558045 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 1555655-1555692, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038876.1|WP_016211563.1|1520120_1520282_+|hypothetical-protein |
1520120_1520282_+
Protein sequences of NZ_CP038876.1|WP_016211563.1|1520120_1520282_+|hypothetical-protein>NZ_CP038876.1|WP_016211563.1|1520120_1520282_+|hypothetical-protein MLPSFQTEQFNDLFLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSTVRVTQRYVP |
53 aa aa | NA |
HTH_Tnp_1,HTH_38
HTH_Tnp_1,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 1498499-1558045 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 1555655-1555692, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038876.1|WP_098082828.1|1882433_1882691_+|transposase |
1882433_1882691_+
Protein sequences of NZ_CP038876.1|WP_098082828.1|1882433_1882691_+|transposase>NZ_CP038876.1|WP_098082828.1|1882433_1882691_+|transposase MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN |
85 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 1831819-1951357 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 1946853-1946816, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038876.1|WP_098082828.1|1942592_1942850_-|transposase |
1942592_1942850_-
Protein sequences of NZ_CP038876.1|WP_098082828.1|1942592_1942850_-|transposase>NZ_CP038876.1|WP_098082828.1|1942592_1942850_-|transposase MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN |
85 aa aa | NA |
HTH_21
HTH_21 HTH domain information
|
NA | 1831819-1951357 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 1946853-1946816, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038876.1|WP_016211536.1|2210555_2210789_-|hypothetical-protein |
2210555_2210789_-
Protein sequences of NZ_CP038876.1|WP_016211536.1|2210555_2210789_-|hypothetical-protein>NZ_CP038876.1|WP_016211536.1|2210555_2210789_-|hypothetical-protein MGEIFVPKFNLLSVTGDQETVDNLLLSVKKRLYDKGTPLKNCYFNLQGQLLAEGWVYDSKTLIEVDLGGELKPEWYN |
77 aa aa | NA |
HTH_Tnp_IS1,HTH_38
HTH_Tnp_IS1,HTH_38 HTH domain information
|
NA | No | NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038876.1|WP_016212450.1|2249742_2250645_-|hypothetical-protein |
2249742_2250645_-
Protein sequences of NZ_CP038876.1|WP_016212450.1|2249742_2250645_-|hypothetical-protein>NZ_CP038876.1|WP_016212450.1|2249742_2250645_-|hypothetical-protein MNMNSLLSVALQMTEGELIKDGQITFEQALEFTYDQQSVCESDAIRALIQQGILSFDLSLKLTGCQQRNLEAPVIAELLRSKDQRCRLTLEQALALDSVQRDNIKSKTVRALLQEGILPSIEKALSLTEEQRRSLVRPTVGKLLRSKDHFLHLTLEQALNIKSEQELTLASKDIRQLIQDRQITLEQALAFTSEQQRSCESGVIRALVQEGILSFDLSLKLTGCQQRNLEEPRVAELLRSKDEHCRLTLDQALRLMSWHKEFLQSKLTFKLIKDKKLTMEQALTLSYSAGLTVSDILSVG |
300 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2212645-2258146 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 2217734-2217771, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 2249613-2249650, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 2249747-2249784, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ********** *************************** |
||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038876.1|WP_129556569.1|2257371_2257581_+|hypothetical-protein |
2257371_2257581_+
Protein sequences of NZ_CP038876.1|WP_129556569.1|2257371_2257581_+|hypothetical-protein>NZ_CP038876.1|WP_129556569.1|2257371_2257581_+|hypothetical-protein MTNFVHASEFTFQQDDGLINDDWVRLVQPSLPLGTQINSLALTQAGDTLYINTQSVGSFLCQGDIALNE |
69 aa aa | NA |
HTH_ARSR
HTH_ARSR HTH domain information
|
NA | 2212645-2258146 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 2217734-2217771, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 2249613-2249650, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 2249747-2249784, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ********** *************************** |
||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038876.1|WP_016211963.1|2674900_2675560_+|hypothetical-protein |
2674900_2675560_+
Protein sequences of NZ_CP038876.1|WP_016211963.1|2674900_2675560_+|hypothetical-protein>NZ_CP038876.1|WP_016211963.1|2674900_2675560_+|hypothetical-protein MLLSLITAITLIISLLFFAYAIKCLLHKRLTATFLYIFLGSTTTLITTCSALLLLNNLTLDHVTKNIPIAMLSLNQLPPLASKHYQATLSLPSGQIKTFKLIGDDWQLSAQIIVWQDWLHALGLTNRYRFDRIQSRYDNINAEQHAIHSIYPLNPPNTANSFWQWAKHHLIQRYFIKTIYGNAIFMPMRDGASFTIALTNNGLIATPINLAAKQSIGLA |
219 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2670145-2721291 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 2707831-2707794, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038876.1|WP_016211964.1|2676424_2676745_+|hypothetical-protein |
2676424_2676745_+
Protein sequences of NZ_CP038876.1|WP_016211964.1|2676424_2676745_+|hypothetical-protein>NZ_CP038876.1|WP_016211964.1|2676424_2676745_+|hypothetical-protein MHALSIFFMFFMISHTSHSLTMLYNERPPYLKTESKQQVLGLTGTFITQVFKTAKTPLHWKKTPAKRHLLLIKKNAEPLCAAGWFKNPQREKYAQYALRHLKCNTQ |
106 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2670145-2721291 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 2707831-2707794, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038876.1|WP_016210177.1|2698455_2698821_-|hypothetical-protein |
2698455_2698821_-
Protein sequences of NZ_CP038876.1|WP_016210177.1|2698455_2698821_-|hypothetical-protein>NZ_CP038876.1|WP_016210177.1|2698455_2698821_-|hypothetical-protein MDMSNSKTKKLKTGVIIAGAAAALMLAGCVGPGTKPASQSGPVKCSGINSCKGTSECATAKSACKGQNKCKGTGWVFAKSADLCKKKGGVVLSAGASNSSLAAVDASENLASLDDNKAYRR |
121 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2670145-2721291 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 2707831-2707794, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038876.1|WP_016210175.1|2699206_2699536_-|hypothetical-protein |
2699206_2699536_-
Protein sequences of NZ_CP038876.1|WP_016210175.1|2699206_2699536_-|hypothetical-protein>NZ_CP038876.1|WP_016210175.1|2699206_2699536_-|hypothetical-protein MFTDVFEKTLAESKEAQNWLAEATKEVFSLQQAMMADWAEWTRVSSVRSSSVKTVEEWVDLNLSSISELTQRSSKAMLDSVTMVSTFAAKNPFYQVKGREEKISKKKTS |
109 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2670145-2721291 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 2707831-2707794, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038876.1|WP_016210580.1|2781735_2781996_+|methyltransferase |
2781735_2781996_+
Protein sequences of NZ_CP038876.1|WP_016210580.1|2781735_2781996_+|methyltransferase>NZ_CP038876.1|WP_016210580.1|2781735_2781996_+|methyltransferase MKMRNYHSHILKIHEKEQGWRKLKTPNMPLDIEIGCGVGMHPLLYASAYPERFLIAIEKTREKFGKFAKKNNTIGPYQNLLAPSVI |
86 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2744257-2804034 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 2802269-2802306, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038876.1|WP_129556602.1|2995382_2995592_-|hypothetical-protein |
2995382_2995592_-
Protein sequences of NZ_CP038876.1|WP_129556602.1|2995382_2995592_-|hypothetical-protein>NZ_CP038876.1|WP_129556602.1|2995382_2995592_-|hypothetical-protein MAFAAKQRMILNSEKICDLIITEKMTVDQTLQLKLEQRITLESQAIYELVSRGKITVDQTLQPLRAMEC |
69 aa aa | NA |
HTH_1,HTH_38
HTH_1,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2992914-3110341 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 3009641-3009678, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038876.1|WP_016211201.1|2998725_2999034_-|hypothetical-protein |
2998725_2999034_-
Protein sequences of NZ_CP038876.1|WP_016211201.1|2998725_2999034_-|hypothetical-protein>NZ_CP038876.1|WP_016211201.1|2998725_2999034_-|hypothetical-protein MQAIGAFQAGLAAINAGAGELREHANEIAHFSIPRGTVAEQEHRPAVVAVNELTQTERPAHFGQNMVRPMVGLLEASNQAQVGAKVLQIASDTLGSLIDIRA |
102 aa aa | NA |
HTH_1,HTH_38
HTH_1,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2992914-3110341 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 3009641-3009678, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038876.1|WP_155046758.1|3088203_3088335_+|phosphatase |
3088203_3088335_+
Protein sequences of NZ_CP038876.1|WP_155046758.1|3088203_3088335_+|phosphatase>NZ_CP038876.1|WP_155046758.1|3088203_3088335_+|phosphatase MFYCMRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP |
43 aa aa | NA |
HTH_21,HTH_38
HTH_21,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2992914-3110341 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 3009641-3009678, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038876.1|WP_155046759.1|3088479_3088635_+|hypothetical-protein |
3088479_3088635_+
Protein sequences of NZ_CP038876.1|WP_155046759.1|3088479_3088635_+|hypothetical-protein>NZ_CP038876.1|WP_155046759.1|3088479_3088635_+|hypothetical-protein MLSTPWLAAPEKYSPPSKTCLINSTIKLFQRVKPHWDYNQKNVYTCKAATT |
51 aa aa | NA |
HTH_21,HTH_38
HTH_21,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2992914-3110341 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 3009641-3009678, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038876.1|WP_032126148.1|3090277_3090460_-|hypothetical-protein |
3090277_3090460_-
Protein sequences of NZ_CP038876.1|WP_032126148.1|3090277_3090460_-|hypothetical-protein>NZ_CP038876.1|WP_032126148.1|3090277_3090460_-|hypothetical-protein MTCDNITPLGYVFMPHHIALWRARGVEANYQGQLKMLRNIHAADSQHRNKQQCNQRKSNI |
60 aa aa | NA |
HTH_21,HTH_38
HTH_21,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2992914-3110341 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038876 position: 3009641-3009678, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
4824 : 28863
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038878|4824:28863|DBSCAN-SWA 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33 | Streptococcus_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
37206 : 57887
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP038878|37206:57887|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP038878|37206:57887|44346_45540_+|WP_016211140.1|capsid|DBSCAN-SWA MPDIYELAQQRAEVINKQRAMLDHAESESRGFTDEEDGQYNDLNTQQLNIKNRIAKAEEVEAQERELNTLTSEPLRSSVQSPTENKATSPLATEEYEKNFFAYMRGQNSGVDIRAGQVEGTDNKGGYLVPTKLQTTLIEALEEQTVMRQMCRIIQTSSTTDLPMADSYGAATWTGEAVAHTATDDTFKKKSIKAYKLSRMLKISDELLADSAINIGAHIAYSFGRSFGEAQEKAFLTGDGTGKPNGLLNVAPTGVTAAAPTSITLDNILDLRSSVKAAYRRKASYLMHDSTYGSLLKMKDGNGQYIIQPDFKSGEGDLLRGKRVNTSDFMDTLAAGKCAALFGDFSNFIIADRGGISLRRLNELYAETGEVGYLMWLRVDALLLETEAIKQLKTAVS >NZ_CP038878|37206:57887|48975_49299_+|WP_032126913.1|DBSCAN-SWA MALRNALFNLAFKTAPVTLGELELQVKELSIAEQQRYQELHPSLSETEANLLLICLSLCDHQGVKIFDVSEYKKLAELPLGVIKQITDAIVEVNGFNESAAHDLKKN >NZ_CP038878|37206:57887|51696_52038_+|WP_016210657.1|tail|DBSCAN-SWA MLNFPSLLPTKIAMDKLKPRLRITPLGDGYVQREADGLNTLRHYFTVSFVGLSEIEKDSIISFIADRAGLEPFLWYHPGEKRYFQIICSEWQANLQHNYWTVVLRFEEDFNPV >NZ_CP038878|37206:57887|49625_51704_+|WP_032126912.1|DBSCAN-SWA 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MTNPIHGAGGGGGKGGGSVHTPTEAPNTLSTNAVVTLVDLLGEGEIEGLAHGAQSVYFDDTPLQNADGSYNFEGVTLKSNNGTPSQDYLPGFAESASEEAFNVKVTHEQPVIRTVGRQETNELRVKIGLDALTEYATNGDINGSSVHIRMYLNNVLVVNHEITGKTTSKLEQTFIIKISPGYYIADIETSDVVLDNLDEYFSWKRAGAHAITNNYYKATSFTYPYTLKVERVTEDADSSRVQNTVYLTSITDVIDTKLNYPNSAVVGLEFSAAQFGNQLPKRSYLIRGLKIQVPSNYDPSTRIYSGIWDGSFKTEYSNNPAWVFYDLLTSERYGAGHYLVDADVDKWELYSIAQYCDELVPDGRGGKQPRFCCNLAINNQNQALNMITQLTSIFRGMAYDAAGTIQFSQDRPREPSMLITQTDVVNGQFDYQTSSIKELHSVCVVAFRNPDLNYAIDQEVVEDASRLARLGERRLEITAVGCTSRSQAMRQGLWALQSEAQSDMISYKATQDHIHSLPSDIIKIFDPNMDQEQGAAGVITAVNNNVVTLDREVSLSSQNTLMIFSAEQGIEEYTVIGAPGSRRLEVDRTIIADVGARWVLYHFTAPKQWRITAITEEDDGTYTVNAITHDPDKYQKIDEERALGVSKENTVIPSLKAPSNYRVEQSVSYHSGTAESLLIVAFDGDPNAAYYEYQLRSNEGNYSDVKTTHLNHIELSSTGATYTFRVRAMGWFGQRSHYSTYRCSASLEQQIPENVSRFVSSYSDKIAVLEWAKNPELYVKHYEIRHGTAWENSILIAELNSTTLHLTHARPGFYLIKAVSQWGIKSAEASVLELTDLTPLNIIQEYDYAANDWPGEFYHTAVNNNNYIRLFSYYSWGGMTQPWEDYSDSWENTKSGTLATDISEGYYLSAVYDLDKIMRCRVYADMQISQSNDDLSWDNMQQAWEHYTLEHNWSWLGSPESCGFEVQFSTSNDNQNWSEFMPLSASFSHFRYARFKVILKRFDAQYTPELQELTCTFDVPETIYNVDNFPVSAAGSTYIFPEPMQQKVIVIATIQSGAAGDQVQVNKSLTQATVNIFDKDGTAKTGEVDLYIGGH >NZ_CP038878|37206:57887|52034_52706_+|WP_016210666.1|tail|DBSCAN-SWA MSLVESAKIYLFTLDLTPLQSSIKYHFCNSPDGNQAVRFGGVEYQPIPLKTDGFERTTIHQPTPSIVLGNVKPILLPLLKAHDNLRGALIRRVMTYVRHLDGHSDPDASATLPEQVYVIERKSQHNNLTITFELGSKLPSDLKLPRRTQLASCSKIYRQWDEEQQAWIAGSCPYAAAQYYNEFGQQTTDKTKDQCGKKLSDCMARFGNGHALPFEGFEGIKPF >NZ_CP038878|37206:57887|47493_47817_+|WP_016211132.1|head|DBSCAN-SWA MRASLLRHRVTLQNNLIGANNYGEAVDYWQDITTVWARVSPSAGRELFSAQQFYHEITQTVTLRYRSDITPSLRLVFDGRYLEILSVINPDERNRELILACREWLHA >NZ_CP038878|37206:57887|40974_41331_+|WP_080743047.1|DBSCAN-SWA MTLEPWQLFIITTVFGWRREVDGMRRFRTVYEEVARKNGKSTKLSGTGLYLFCADEEPGAEVYAAATKRDQAKIVFDDAVKMVRASKALAGRIGIYKNNMHYPKDLPNNKFEPLSSDS >NZ_CP038878|37206:57887|37206_37887_+|WP_129556725.1|DBSCAN-SWA MKYGIPGKADQYLCREGYSVGYNYKTKQPRWVAYHLTSKSVSKRIKRHDDFRPDPAIPYQYQAQLSDYKRSGYDRGHLAPYAAMDFDKNSASQSFLLSNMSPQKAGLNRQGWAKLESNVRFWAKYKSEVYVYTGPIFQGKNIKTIGKNKVAVPTAFFKIIFAPQQKQALAFVMPNKRVAKNKVSEYRTNIAHIEKLTGLKFLSQLTSSEREKLVIKTDTMWRTRYN >NZ_CP038878|37206:57887|47185_47497_+|WP_016211137.1|head,tail|DBSCAN-SWA MIDLARLKSHLRIEDNNEDDYLAFILAAALQAAEDYLDRAIVNNTNDLETIENSVLINKSIEIAILMSAGHFYENRESTSTLTVKEVPMSTHFLLNPHRHLSA >NZ_CP038878|37206:57887|39129_39495_+|WP_016212235.1|DBSCAN-SWA MHSAGLLAAKNSANLELPTFKGQTKVDLGFAELQDAAAVCTSLVCTLNIELFEDISMRWLDKWEKTLEYKNSDKNKLFKKVWTLFYSNFDSNNGSITSPCSMVKVRNKIKSSRIKNRKHVS >NZ_CP038878|37206:57887|54251_54506_-|WP_016210670.1|DBSCAN-SWA MKQLYAQQSVTITELRKSPTSVINEANGEPVVILNHNAPAAYMVPPELFEAMLDSYEDRQLEGIVKKRLNSPDCDFIDVDVDDL >NZ_CP038878|37206:57887|47809_48205_+|WP_016211139.1|DBSCAN-SWA MPKMSFSVEGLRELEQKLKTLEPKKIRNLNRRALRKAAEPVEAQMKANAPQKSGALAESIKRRSKKGKGRRTIVNVTVGPARKIQYAIEQEYGSSHQPARPFIRPALNDNAQTSIDIFKNALTLALKKQKL >NZ_CP038878|37206:57887|42428_43670_+|WP_016211136.1|portal|DBSCAN-SWA MTLFKRWFGAATELEPSTEYGGYELLDAAPISASGQSIHPDNAMRLATVYACIRVLAESIAALPLHVYRYETGGGKALATDHPLYSVLHDLPNGEVTSFDLRENLVGHLCLRGNAYCQIIRDGAGRVRELIQLPTDNTTVRRDERTKKLIYSTISNGQSYELRDDQVWRLNAMGSDGIIGSSPITLQRESLGLSAATQEHGAKLFGNGARPSGILTTDSHLKKEGRENLAESWKKAHGGKNSNGVAVLENGLRWQALTMSSEDSQFLETRKYQRNEICGIFRVPPHMIADLERATFSNIEHQDLAFVRHSLVPWLVKIEQSISRDLLLAHERKKYFIKFNIEGLLRGDTAARAAFYNRMFSIGVMSQNDIRELENMNPIEDGDRYYRPLNMTPIGEDEEQNNEQLVSDQSTSK >NZ_CP038878|37206:57887|39795_40179_+|WP_032126134.1|DBSCAN-SWA MPRRAKQICCYAGCHNTTYARYCEYHEQHGNRYHAPRKTTAQRGYGGRWQRERKIFLQDHPLCKQCLQDDKLIPATEVDHIKPHDGDHDLMWNQSNWQALCKSCHSRKTVNEDGGFGRKKSPQGRGI >NZ_CP038878|37206:57887|40749_40959_+|WP_016212231.1|DBSCAN-SWA MLKSDPVKTALNYCDDVLSGRVIACDYVKKACQRHLNDLKYARDRGFYFDKEAACKVVRFFSYCKHSKG >NZ_CP038878|37206:57887|45660_46995_+|WP_016211133.1|DBSCAN-SWA MNANQLLAIGAALVTAVRRNIKYSENLYLLTGNSFFDERYKKVYSIREGINATSGKIDEQAPSAYAKRALDHRVGFCSELSEVSTFLGSMLNKFEAPVYISVIKTPLHAFCLIHQSSSLHQQTKSNVYISDNIKELSEKTELENAIIVDTWIYKATKLSNYKSHINYAKEFGKQFDLEECFDGEIKTEGYSEAFGTTQPIKIAEKRLLRDFNLAYQEESRKLFTKETYSTQGRRRNSIDTNLICDSKRWGQLKDLKLFIERIASKSSDWYSSSSNRKGKSYQALIDSLDFAIQKYMDISNTDLQEIFNRALQLAPIVRGTSSFKNLWGYRNHITKTTEGLLSTDVVPEEYYKFETLPQMNLFEIRNIRSRPISQNEKCTALIQWIKKEGADPSFYSDAQKAAAYKAVDDFVSRSQGEASLLFYDRAEEAPPLAAEASAASFKSF >NZ_CP038878|37206:57887|43617_44289_+|WP_080664855.1|protease|DBSCAN-SWA MKSKIMNNWYQIKAQANKHADVYIYDYIGDYGVEAKRFVMELQALDVEQINLRINSPGGSVTDGFAIYNALHRHPAKIIAHIDSLAASMASIIALTGETVHMADNAFYMIHRPWAYAVGDAEELSKIIEILDKNEAKIVNIYHQKSNLADDKIKAMMYETSWLTAAEAKEYGFIDEITEAVNIAAYVKPNQYKNTPQTLIKHSENNTVNALQRHKLALKRSLL >NZ_CP038878|37206:57887|53410_53968_+|WP_016210665.1|tail|DBSCAN-SWA MKTKIYLHGRLGRICGSFFELNIHHAREALYALSTQLPEFKKIIQSGEWAIFRKRQSLTIEQLELNCAGGELHIVPKPKGAKNSGFAQILIGAALITAGYFSVGTALAPIAGGLSAAGTGLVISGALTMLSPQPSYDNDYSTTDPNASTLFSGVDNVATPGAPVPLIYGEHLVGSSVVSSQYKTL >NZ_CP038878|37206:57887|38065_38359_+|WP_016210977.1|DBSCAN-SWA MPPCRSCNTERSNEQARFCSNCGASLETRSTYEEIINKDISVLSLTKDRISSIKNNSKIRNIKDILHDLSHKELRSIPQVGEYWAKRIFNLAEEYIS >NZ_CP038878|37206:57887|48201_48552_+|WP_016211129.1|DBSCAN-SWA MIEDVYFALLSTGWPVFPIMLPKNQILPAVTYQVIGGDRRYSLDAQAHLQKKTIQISCIAKTYQECKLMQDSITEILNGYHSEKIQLITFESELDQYEQDTKTYRTNLTFTLTGVV >NZ_CP038878|37206:57887|40266_40746_+|WP_016212234.1|terminase|DBSCAN-SWA MGVKGSGRKRKPTRLKKITGNAGKRKLNHYEPELIEGRAACPHYFKGEAAKAFRFAVDCLENMQIKTAAFQLMLESFAFSYGEWRALSELVDQHGRTFETITQAGDTMYRSRPEVAQRNEAWKQVKASLSELGLTPTAISRLNAQVSNTIESEIDQILD >NZ_CP038878|37206:57887|52674_53421_+|WP_032126911.1|DBSCAN-SWA MKASRALNHFKAYALEQYPREAVGLILPADHFMPCPNLSTTPEENFCIDPAQLIDTPSGTILMHSHPDGSVEPSLADMVSQRDTGLLWGIVALNQHAVTDAIVFGEQLFTQQLLERPFLHGVFDCYSLIRDFYAVEKKIFLPDFPRQRSWWEIEKYNLYERYFTEAGFIEVDKATSLCRGDVLLMRVGRTTCINHGAIYLGEDCRLKEDHNTVSLPGMILHHVCDNLSRREMLSEWQKRIAKVVRYEN >NZ_CP038878|37206:57887|48551_48974_+|WP_016211141.1|DBSCAN-SWA MSESIGALSEIYRDSDNAGNYVKLANITNIGEISSSRDKIDVTEYGSTQKKYKLGLKDHDEIQLDMNVAQDNSELKNLISDHDTGIERQFKIILATQPKRQIYEFTALITNHKIIAPLSEVISMSVSLQPTSVIVQSDEV >NZ_CP038878|37206:57887|38576_38759_-|WP_129556724.1|DBSCAN-SWA MPCTPWLAASEEMEKEIFSKDAFSKEVQLNHTVARLSVCFDHFFLEIGHIFITPAIISLI >NZ_CP038878|37206:57887|41349_42432_+|WP_081377926.1|terminase|DBSCAN-SWA MHSSIVDELHAHKTGDLWRVLETGTGSRRQPLLYAITTAGFDQTGICYSLRDYAVKVLENIIVDDTFFGIIYTLDKDDDWTDERNWIKANPNLGVSKKLDDMQRQCVKAQQMKGERNGFLCKHLNIWTNAETAWLDLERWKACAEYTFKRESLENRPCYIGLDLASTNDIAALVAAFLMPDDSVRLFCRFYLPKETVMTRAKQSPVPYQLWADEGYLTLTEGNVIDYNYIKDDIYQLNKEFDVKEITYDPWNATQLANDLLEEGANMVEFRQGFKSMTPALKELERLVISTKLHHNNNPVLNWMASNLVVVEDDAGNMKPSKRKSTEKIDGMVATAMAVGRLIAGEDHSSIYNERELFIL >NZ_CP038878|37206:57887|38903_39083_-|WP_155046773.1|DBSCAN-SWA MLSWLDSLTLKGIRVSSFFLIRKRRYLGRYFAHPMIQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP >NZ_CP038878|37206:57887|49355_49622_+|WP_016211142.1|DBSCAN-SWA MNQLSQELSLSEFNEWLAYYSLEPFGVEKDDHRTALMVSAVVNGPLQRKDKTLFTPNDFMPNYSAGDEKKTQSATDMAAILSAIAKRQ |
29 | Pseudomonas_phage(11.76%) | terminase,protease,head,capsid,portal,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038878.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein |
5761_6361_-
Protein sequences of NZ_CP038878.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein>NZ_CP038878.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein MQEFKINEVVGTSSPAVSREKIVNSILANQSNFAGDTPPSNPVACMFWADTQNAILWQRSLDNTEWINKGPIDSQLATDEDAQSYAGGPNLYLNSTFRDWDDERTLPRYFYTYYNSSALSAEFERIAPSPSAAEDSDEYQAYELLKLVGSDINRIGYDCRVLKVTLQAGSGSFSLNQRAFVAAHSYVTSGCLIHVIALD |
199 aa aa | NA |
HTH_21
HTH_21 HTH domain information
|
NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||
NZ_CP038878.1|WP_155046771.1|6360_6594_-|hypothetical-protein |
6360_6594_-
Protein sequences of NZ_CP038878.1|WP_155046771.1|6360_6594_-|hypothetical-protein>NZ_CP038878.1|WP_155046771.1|6360_6594_-|hypothetical-protein MPETVYNVDNFPVSAAGSTYVFPEPMQQKVIVIATIQSGAAGDQVQINKSLTQATVNIFDKDGTAKTGEVDLYIGGH |
77 aa aa | NA |
HTH_21
HTH_21 HTH domain information
|
NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||
NZ_CP038878.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein |
9914_10262_+
Protein sequences of NZ_CP038878.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein>NZ_CP038878.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein MTEGDFINELMFGRGNVPLNTSPQSNWTNLSMTENDDKKVIIRQNSNDVTTYNKDNIVFFVDDDNMFRHAALKIKHDIYLSLFGNSGGLMFSNRQEMLKAFGATKSFIAKKPRRR |
115 aa aa | NA |
HTH_21,HTH_38
HTH_21,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||
NZ_CP038878.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein |
23884_24064_+
Protein sequences of NZ_CP038878.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein>NZ_CP038878.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein MNMNSLLSVALQMTEGENNSKGWQCAEFAAQILKRCGLRLPERENLTPIELITLIKQGA |
59 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||
NZ_CP038878.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein |
24063_24492_+
Protein sequences of NZ_CP038878.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein>NZ_CP038878.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein MYSVIKSFWVYGVGGVLVIVIIFVWRYEMRQSAQYELRHEIAQTNWKHNTKTFHLEQQRLKQIQQRYFTKVAATDEEHDDVDHALLESLHASKNWSATDIPNTIFIKLCQAELVDHAQSHRCKSAVQFTQSLQNNKNPRTNQ |
142 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||
NZ_CP038878.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein |
24659_25199_-
Protein sequences of NZ_CP038878.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein>NZ_CP038878.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein MPSKLSLEDRITNVLGKLTRMDNMMLGGNLTPEQKNEIEQVIDSIPHEPDSSSYNPKDSRISNLTVAHVWYGMGSQTGVTSPEWKVRFLKQYVEAVQSNNVDGKRDSALFRSIEKMFNKHEFIYATAEDVTRPLINKEDPKIAPEVATLVKDFVMSGAGDLSITSIDHEEDSSISCLLM |
179 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038876|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |