Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP041724 | Staphylococcus lugdunensis strain SL55 chromosome, complete genome | 4 crisprs | csa3,WYL,DEDDh,cas3,DinG | 2 | 2 | 7 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP041724_1 | 921370-921453 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041724_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP041724_1
>1.1|921397|30|NZ_CP041724|CRISPRCasFinder GCCCCCAACACAAAGAAATGCAACAAGCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041724_1
The CRISPR arrays of NZ_CP041724_1 >merge|NZ_CP041724|1|921370-921453|CRISPRCasFinder TTCCACGAACAACGCAAGTTGGGGTGGGCCCCCAACACAAAGAAATGCAACAAGCATTTCCACGAACAACGCAAGTTGGGGTGG >NZ_CP041724|1|1|921370-921453|CRISPRCasFinder TTCCACGAACAACGCAAGTTGGGGTGG GCCCCCAACACAAAGAAATGCAACAAGCAT TTCCACGAACAACGCAAGTTGGGGTGG
>NZ_CP041724.1|WP_002478773.1|919373_921338_+|DHA2-family-efflux-MFS-transporter-permease-subunit MTTTFIIGYIVVALIFIGLINFFVVKSRKKNKNKGQFKEQRNLQDSKSQQSKFKISDLDKEEMSKNGFNQSKSNDIEDDKRKHQFNDTTEHIATTETGDTSDKLQHADETSHGVNQGDDAHDAINPNSVEGRVNEQIKNQNEDFVFGKNVTRAQIIAAMLFGMFIAILNQTLLNVALPRINTEFNISASTGQWLMTGFMLVNGILIPISAFLFNKYSYRKLFIIALTLFTLGSLVCAISTNFPIMMTGRVLQAIGAGILMPLGSNVIVTIFPPERRGVAMGTMGIAMILAPAIGPTLSGYIVQNYHWNVMFYGMFILGLIAIIIGFIWFRLYQRTTNPKADYQGVVYSTIGFGALLYGFSEAGNKGWGSTEIIVMFILGAVFITLFVIRELTMKAPMLNLEVLKSSTYTLTTIINMVVMMSLFGGMILLPIYLQNLRGFSALDSGLLMLPGALVMGALGPVAGKLLDTVGLKPLALFGIAVMTYGTYELTKLNLDTPYMHIMSIYIIRSFGMAFVMMPLMTAAINALPPRLISHGNAFLNTMRQLAGSIGTAILVTVMTTQTTQHFNAFSTELDKTNPVVQDHMRELATQYGGEQGAMKVLSMFVQKISSVDGINDAFWIATALSILAFILSLFLKSKKKADAEHDKMMSKEHI >NZ_CP041724.1|WP_002460169.1|918713_919361_+|HlyD-family-secretion-protein MKKLILINVITIVVLAVIGIIGFHFYNNATSYVTTDNAKVDGKQIKIASPTSGQIKSFDAKEGDKLSKGDKVATVVGKSESGDTQSMDIKMPQNGTIVKTDGAEGSMAQAGNPIAYAYNLDELYITANVDEKDVSSIEKGNDVDVTIDAQGTTVSGKVEHVGQATANSFSLMPSSNSDGNYTKVSQVVPVKISLDSTPSKDVVPGMNAEVKIHKN >NZ_CP041724.1|WP_002478772.1|918029_918581_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MKNRAKYRIIFNFVHLLEQYPFEAITTKLICAHSNVNRSTFYANFKDKYDLYDIIQNYHKKKYINLLDTLYNDFEDVKSNNMKIHKFFVIVLKYIQRKKAFFHAVFITHPNREIAIEYFQLTKVKYEKILTDYNTTIENKSAFVTYTLGGQTAILLSWLKDGCQESPHKIADILLANTIKLQR >NZ_CP041724.1|WP_037545156.1|916382_917588_+|multidrug-effflux-MFS-transporter MSSQQRDKQSLIFIIILGALTAIGPLSIDMFLPGLPEIKHDFNTSTAISQLTLSLFMIGLALGNLFVGPISDAIGRKMPLVVSMFIFTLASFSIIFVSNIWVMIVLRFVQGLTGGASAVISRAIASDLYSGKALTKFLALLMLVNGIAPIIAPTLGGIILSVSIWRTVFIVLTVFGILMLLGSALKVTESLHIEQRETSGIKVIFKNFGKLLATPKYVLPMLIQGVTFIMLFSYISASPFLIQKIYGQSPFAFSLIFASIGVTLIISSQLTGKLVDYVDRQQLLRILTVIQIVGVIIVGFVLTNHWSFWILIIGLIVLVAPVTGVATLGFAIAMDERTTGSGSASSLLGLLQSLLGGLVTPLVNLKGEYNSTPYLIIISIAALALMMLQIVNYFVFKKSTE >NZ_CP041724.1|WP_012990757.1|914907_916281_+|zinc-ribbon-domain-containing-protein MTTCPKCGEEIKNEQTNHCPNCGATINDNGENSSNQASNEATIRLKKIVPWAIGGFIIILLIIVFVLLKNFNSPDAQAKILINAIDNDDSQKVATMLTTRDNKVDETEAQTYIKYIKKEVGMTKFIFDIRETVEKLNKSETRVAAYLQTRAGENVLRVSKNGRRYLIFNNMSFTPPTKEVTVKPKEDTKYEFKDDGRNKKVVAEADKETTIGKFIPGNYAIDAKKITDNGVFTGYLKFDFKYANSNTVDVNEDFNEAKVHVKIKNGEQLSRSSLKVKINDRTWDYGNAKVYGPYPKNKDITVSATGKVKGKTFETETKSIKADKLTDNTDVTVSFDDDDISDYIEKKEKEDNSLKNKLGSFFSSYSLSLNQAIAQSDFSLVHSFLKKGSSSYDKVRKNIASNTSARLVSPIILSVDQTGDTIKAKVQGFGLNGLPVVKNYVLEESKDDLGYKLVKVD >NZ_CP041724.1|WP_002460176.1|913220_914174_-|YdcF-family-protein MLSISIAFLTFICIVPTLFNSQTFVSLRLYFISVILAFSFVLINLWQQSFVLCYFSLFIVLVTVLFVKHFYLIKQQQGRQLLQELMKYIYRLLLFSCACAYISLIHVPVFNGLFIWFSLIAISTLTTFALYLCFSSAFGRMTNHCTFDGIIVLGAGIFTEAVTPLLASRLNRALSIYNQQSHCTIIVSGGQGKDEPISEALAMKRYLLSHGVPEQSIIMEAHSTNTAENFLYSKSIIDAMTPKPNKLLVVTSQFHILRALRFAQKFGLPVQGIGSSTPCHLLARSLIRDFLGLMHQYKLLLTLYFALLFISAILLNL >NZ_CP041724.1|WP_037545159.1|912461_913130_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MTLKVANLRKTFGQGEAKTQVLKGIDFEIADGEFVILNGASGSGKTTLLTMLGGLLTPTEGTIEVNDKPLFSTQSHNSALRLTDIGFIFQAAYLIPYLSVIEQLTLVGKEAGQSHNDAQQHARTLLSDIGLAHRLDAYPHMLSGGEKQRVAIMRAFMNQPKIILADEPTASLDAKRAVQVVDMIKTQIKSNHMMGIMITHDERLFAYADRVIQLYDGQIVPG >NZ_CP041724.1|WP_080606525.1|911403_912465_+|ABC-transporter-permease MMKLAWREITFYKFRYILITLIIILLASMVLFITGLAQGLARENISFFEQQHAQHYVMQKMSQPQLEKSNISAQDTSKVRTILQQQPTRLKPQVLTVNQDSLDVMTVTTDKTFKPQLQAGTYPKKAHDIAINNKLTAKGIQIGDKVHFKGHSTHYHVTGILENTMYAHSSMLWMTQEGFEQLNKQAAIVFPVKDLNEKQRSQLADDSKLELVKPDTLQANIASYQAEQAPLNLMVMSLFVITAIVLSAFFYVMTIQKISQIGILKAIGIKTRHLLIALIGQIMLITLFGVSIAVGLIWSLTFVMPVTMPFYIHLTNILVILGGFVFVALIGALLSMIKVLKVDPIEAIGGNAS >NZ_CP041724.1|WP_002460180.1|910601_911276_-|response-regulator-transcription-factor MVNCLIVDDDQTILDYVASHLNNEGYHTYTKPSGTAALQFLEQQTVDIAIVDIMMAGMDGFELCQQIKLDFDLPVIMLTARDALTDKERAFLSGTDDYVTKPFEIKELIFRIKAVLRRYQINAEHIIQLGNLTLNDNYMEVQVDHKTMTLPKKEFQLLYMLTSHPKQVFLRDTLIEKVWGFDYEGDERTLDVHIKRLRQRLSKLAANVTITTVRGQGYKVEAHV >NZ_CP041724.1|WP_002492213.1|909238_910609_-|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MFKSLYSRIAIYTITVILLSAILSFFISNVYYHFNLKPKNDQKIMTTLKDARQFDAAQQHQVSTSFFKHLADMNYQIMTVDNYGHKHFYGADFRKDTLSATNIQRVLQGHDYHGIAKQPFQLLVTGFFDNETDNTVGVRFKSSEGYVAVFMRPDIGQTFSEFRIFLALLIILLLIISISLIIASTYAIIKPIQSLKYATERLMHGDFDTPIKQTRTDEIGILQYRFDTMRQSLKQVDAMRQHFVQNVSHEMKTPLTHIHHALTQLQASDDKATQQTIINDLFTITSRLSDLTRELLILSELDNASHIQLNSTIQLDLLLQDLIRHEQYLIERKNIIVYAELLPSSLLGNERLMHQAFENLLRNAIKYTNNEGAINIKLQHRNNHVHFTIQNDGQPMTKEAQLHIFDRFYKVNSNDTSNGLGLSITQAIVQLHHGHIEVESNNLIGTQFTVILPFKP >NZ_CP041724.1|WP_002460164.1|921616_922324_-|hypothetical-protein MEQSRSQHPTYQRTQYQPDYQLQTTKKRSWVSIIIHFIVLVLTAISGYSMYKQPLFIFGLKDTEVGYTQLKNFKQSLSNLTELSINSDQVTKLNGLGLSDIAKQLEALSIKPEHIEQLKSVIEQINMLFNIFFGLCILSLILTILTLLFNRTLLKLLNFLSIASMLAIVVYFMIAIDYLAQRIAKLLNNAYVQITPDQVIIEADATHNAIILLICCLALIFLSLFFRSKRQIKRL >NZ_CP041724.1|WP_070648164.1|922532_923441_+|alpha/beta-hydrolase MRTYMMNRVVNKYLLHNRSIQFKDEGQFNQFMEKRRNANRLKHKQPSTLNVKSNLDKLMLDDMQVFRFNFRHETGKKILYLHGGYNTLQPSPFHWRLMDKLTLATLYEVVLPIYPKAPEFHIDDTFKAIQAVYVQLVDEVGAENIVVMGDGTGGALALSFVQSLIKQQLPMPRKLYLLSPLLDATLSNPEITEKLQQQDQFVNRQGVHDILSVWAAGKPLNNAEISPINGNLEGLPPIIMFGAGKEIYYPDMERLDFYLSEHRQPIEFFRYPKMIHDFSLFPIHESHKVVKQIAQTIDNDLR >NZ_CP041724.1|WP_070648165.1|923473_923863_-|hypothetical-protein MTKSSIEKIKSYLLDLHDDLKLNLIDMNQTKDMFMNGPSTELLRRALNMSYYQGQKQALDWLQYNVESQDSHTLMTLIEDKLHLLTEQDSKVKNLAIIAKELPEQLSQEAHRDGQRSILKHIKTRIDVF >NZ_CP041724.1|WP_070648166.1|923868_924336_-|thioesterase MIFTVQGMVQQSQIDHNAHMHDADYNYIFSDAINQFNYTHGLSLAERQALHYTIFTVEEHTTYLAEMSLGEHYTIQLFIYNYDDKRIHFFLKLIKENGTLAATNEVMMLGIDSTTRKAAAFPEPYFTEMTSYYKTQDISQWSKQLGHQIGIPNKG >NZ_CP041724.1|WP_002478778.1|924454_925402_+|magnesium/cobalt-transporter-CorA MSITIRYQTPHTSLTTVPDIADVPKDATIVWYDFEDATAKENDFLRENFDFNYLEIDDTITGVPRVKYKAYDDYQYIVFHSINSDDYSPRALNVFLKNNVLVTYHHKHFSSLMKVAKWNAYHHDGELDCADIVIHILDMMVDKYFDFVYDIEEKVYNFEDKHVDDALSKKVMDNVFKLRSDLIKIKRVMFPMQELVETIKSEGNLIVDSKHSMYIQHIDDHLIKQSNIIRTSQEMTNEIRENYESYSSFRMNSIMQILTLVSVIFSPLTFIAGVYGMNFDNMPELRWHYSYYICLVVMLVIAIALIIFFRKKRWF >NZ_CP041724.1|WP_070648167.1|925447_926500_+|type-2-isopentenyl-diphosphate-Delta-isomerase MSNFQREQRKNEHVEIAMAQQDAPASDFDRVRFVHHSIPHIDVAQVNLSTHTSNFKLDYPLYINAMTGGSEWTKQINEKLATVARETGLAMAVGSTHAALRNPDMIESFRIARQVNPEGVIFSNVGADVPVERAVEAVELMEAQALQIHVNAPQELVMPEGNRTFASWMDNIAKMINHVSVPVIIKEVGFGFSKETFKALKDIGVTYVDVSGRGGTNFVSIENERRSNKDMNYLANWGQSTVESLLESQAYQSSLNIFASGGIRTPLDAIKSLALGAKAVGMSRPFLNHVENEGVEQTITFVAQFTTQMQQIMTMLNAPDIEALKQSQLIFDQQLLSWMEQRHIDIDRGL >NZ_CP041724.1|WP_002492246.1|926624_927233_-|DNA-3-methyladenine-glycosylase MDFIVPSTIDTAKALLGVKVIYNDDGQIYSGYIVETEAYLGFDDRAAHGFGGKQTPKVTSLYQRGGTIYGHIMHTHLLINFVTQQAGVPEGVLIRAIEPVDGIEAMKINRGKHGYELTNGPGKWTKAFHIPRAIDGTLLNVGRLSIDTKNRKYPREIEASARIGIPNKGIWTSKPLRYTVKGNPYVSRIPKKNMRAAIDTWK >NZ_CP041724.1|WP_002460156.1|927470_927686_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKEVVTRLNKVKVYRGYSKISQLELARAVGVSRQTINMIENGKYNPSLKLCVNIAKTLGTTLDTLFWENDT >NZ_CP041724.1|WP_062077973.1|928240_929251_+|galactose-mutarotase MIVEVEKQRHGIDLIKIDNNETSIVFSNYGARIVAWKFHDNNIVLGNRVEADEFYLNNPLKFGATIGRYSGRIEAGAFKLNQDRYQLEQNDGLNHIHGGSNGCDQVLFDYDIVEGISDVKVIFRAKLNASDDGYPGDLALKVIHHYDIEHRWTITYEAETTATTIFNPTNHVYFNLNRDNNVIDNHQIHAKDLKMYLLNRQHFLLNDTPINLTSQFGSDHITFQEIFQAYQDDIKQQMERYQGLDHPFELSEQTLSVENGEFKLQIDTDMPYVVIYTMNHPETWESQLNIYKPHSGFTLETQFLPNDINYFGQQAPSILRAGQQFSSTTSYQISEQ >NZ_CP041724.1|WP_002478781.1|929326_929980_-|MOSC-domain-containing-protein MIPVVAISTGKIQHLPYSTKKPMISALDKIPFTGRMWLSIDGFSEDEQAYKDHGGPHKAVCCFSQSNYDMYKEDLAQLPTYAMFGENVTVKHLDERDVYFGNQYRLGEAILEVSEMREPCWKIQAKYQIPDLVKRMTASGKTGFYFRVIQEGYVSQEDNLELLTQANKASRLSVYELNDIYYNDRKNISRISYALNNPYLSPSRREKLSRLYHRACK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP041724_2 | 1210125-1210209 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041724_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP041724_2
>2.1|1210153|29|NZ_CP041724|CRISPRCasFinder CAAAGACTTTCCAAAAGAAAGTCCACGAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041724_2
The CRISPR arrays of NZ_CP041724_2 >merge|NZ_CP041724|2|1210125-1210209|CRISPRCasFinder CAACGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACACAAAGACTTTCCAAAAGAAAGTCCACGAACAACGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACAG >NZ_CP041724|2|2|1210125-1210209|CRISPRCasFinder CAACGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACA CAAAGACTTTCCAAAAGAAAGTCCACGAA CAACGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACAG
>NZ_CP041724.1|WP_080606543.1|1208448_1209957_+|hypothetical-protein MTRKKTKIKYLSASFAIAVSTQVISPHITHAQDNTLYNKVTNEKSTAHSDNLSQDNSNQKDSDNTNQPSNSSNSANNEGKDNRPNKPSDGTDNGGKDNRPNKPSDGTDNEGKDNKPNKPSDGTDNGGKDNKPNKPSDGTDNEGKDNKPNKPSDGTDHGGKDNKPNKPSDGTDHGGKDNRPNKPSDGTDNVGKDNKPNKPSDGTDHGGKDNKPNKPSDGTDHGGKDNKPSDGKDNGRTSSHPQTPTQNGGHGHKPTNQPNNKDNNNGQNNGNGNQGWNTSNGQQSPQNGEKTDHNISDDFINQINGRGHNSGRNSSSYFPRNHYDEGPVANNQRQSIMKRFKSLAIGSFKYNPFIIEQVNKLGESGNQVSDQDLYALFRKQNFSGNSYLNSLQRGSNYFRFEYFNPTNSSKYYKNLDEQVLALITGEIGSMPDLKKPVDKKGEDNHTQRSEDKIISAEGEDHKQGMTDVKFNRLNVTLIGSMCMIFVAVMIYWFINRQKEKEQ >NZ_CP041724.1|WP_062077860.1|1207631_1208255_-|nitroreductase-family-protein MGLFSKNSEKSFLNAIEERRTVYNLKESISISDEELEQIMTQAIKHVPSAFNSQSTRIVLLLNDKNKQFWDNTKAVLKEKMGADRDFTATEQKIDNFKHSYGTILYFEDQSVVKGLQEQMPSYAENFAIWSTQANAMHQFAIWTALSTKGIGASLQHYNPLVDAVTHQDFDIPETWELMAQMPFGDVREEPNEKEIQPVDARFLVRK >NZ_CP041724.1|WP_002477923.1|1206711_1207497_-|carbon-nitrogen-family-hydrolase MKLQLLQFNVAYADVNANEHKIKTWFSNSLQQDTDVVILPEMWNNGYALEQLEEKADFDLERSTDFIKNLALQYQVDIIAGSVSNKHHDHIFNTAFAIDKTGKVINQYDKMHLVPMLDEPAFLTAGKNVPETFKLSNGVKVTQMICYDLRFPELLRYPARSGATIAFYVAQWPSARLNHWQVLLKARAIENNMYVIGCNGCGYDGKTQYAGHSVVINPNGEIIQELSTTEKELTVTIDIDAVEQQRKAIPVFDSLVPHLYK >NZ_CP041724.1|WP_080606542.1|1205517_1206165_-|accessory-gene-regulator-AgrB MRIKQLGINDQMNCVKLYNDTKERDANLKAIDKKIERFARYLQRQNNLDHIQFLKIRLGIQVALGNFFKTIVTYGVALLFHTFLYTLITHLTYFFVRRFAHGAHARSSLLCHIQNLVLFVALPWSIVHFQVSWTFMILLAFIAFIIIICYAPAATKKQPILPHLRKKKKRNAILISICFLVLMLFVSEPYMQLIALGMCIEAITLLPIFFSKEET >NZ_CP041724.1|WP_150868048.1|1205371_1205515_-|cyclic-lactone-autoinducer-peptide MNLLSGLFTKGISAIFEFIGNFSAQDICNAYFDEPVVPQELIDLQRK >NZ_CP041724.1|WP_070648269.1|1204060_1205350_-|GHKL-domain-containing-protein MDLLNSIPLSIFQSLMLLFVAKIVADIKFQMRDYFAIFGIIIPSTILFGVIGRQSLIFLIIGCLIFFYLKIGLYSVLAIFGSALIMYVSNYISVILSVIADYFSLSYIVQIIIILVSFTLISIICAYFIRFLINKLKKTYLYFNKIYISVISIFLILSLIMLYLYTQIFKQEYQDLKIFAIIFVGILFFLAIFIIVITFSVHREMQYKRNLKEIETYYEYTLQIESINNEMRKFRHDYVNILSTMSEFIREDDMPGLREYFNDNIVSMKDNLQMNSIKINGTDKLKVRAIKGLVTTKILQAQEKNIPISIEVPELIEHIEMNTVDLSRVIGIIIDNAIEASESLEDALIRIAFIKNEDSVLFIVMNKCSDTTPKIHELFQENFSTKGKNRGLGLSNLKEITDATPNTLLDTTIDNGYFIQKVEILNNIP >NZ_CP041724.1|WP_002461418.1|1203331_1204048_-|response-regulator-transcription-factor MKIYICEDDVKQRENMVEIINNYIMIEEKPMEIALATDNPYEILKMSKENEDVGCYFLDIQLEADINGIKLGSEIRKYDPIGNIIFVTSHSELTYLTFVYKVSAMDFIFKDDPAELKTRIIDCLETAHTRLKLLSKERTVETIELKRGSNSVYVQYDEVMFFESSTNSHRLIAHLDNRQIEFYGNLKQISQIDDRFFRCHNSFVVNRHNISSINSKERVVYFKNGEHCYASVRNVKKI >NZ_CP041724.1|WP_070648268.1|1202265_1203240_+|carbohydrate-kinase MRTLYAIGEALIDFIPNVVNSELKDVTGFTRQVGGAPANVANTVARLGGQAHMITQLGQDAFGDIIVETLQQIGVGTSHIKRTDIANTALAFVSLKEDGQRDFSFYRKPSADMLYHPDNVEEIDVSSEDIMHFCSVDLIDSDMKQAHYKLIEKFEAQRGTIIFDPNVRLPLWKNAADCKKAINEFIPKANIVKVSDEELEFITGESSLEAGIQALFKGHVEAVIYTAGSNGASIYLKNGKHIYHEGFTVKAIDTTGAGDAFIGAVISRLLLAEDTPVTQQLEQDGAEILEFSNCVASTVTTKYGAIESIPTLEEVKQQLNKKTS >NZ_CP041724.1|WP_070648267.1|1200780_1202265_+|sucrose-6-phosphate-hydrolase MSEWTREQRYQGIDDVPQSQLIELKQKVDASHYRQTYHIQPETGLLNDPNGLIFYNGTYYVSHQWFPLGAVHGLKYWFNYTSKDLVSFTPHGPILEPDTAYDSHGVYSGSAFEYNGQLYYMYTGNHRDSEWNRHSSQMLAKVDEYGDAVKFEKPVIPAPPTGYTQHFRDPNVFQKDGQYFMIIAAQNEQENACLLLYKMEEQVNEWAFVGEIATQLSNFGYMWECPDFFNLNQTDVLLFCPQGISPEGERFNNIYQSGYLLGTLDIQKPAFEHQDFKELDYGFDFYAPQTFLDKQGNRILIGWMGMPDTHYPTDDEGWAHCLTLPRVLTVEHGKLIQRPLPALQKLRHNEETAEGYANKFTTKLHPYEGLHYELIIDILENEASEVYFELRTSKQHSTLITYNKQSQRLTLDRSDSGALPEPVKGTTRSTILDTPLSQLQIFVDTSSIEIFCNNGERVLTSRIFPDEQATGIKTSTESGQVYLKFTKYELKDEK >NZ_CP041724.1|WP_002461422.1|1199730_1200681_+|LacI-family-transcriptional-regulator MKNIADIARLAGVSKSTVSRYLNNGSVSTKTKEKLSKIIKEQDYQPNQFAQSLRARHTKMIGAIIPRMNSHAVDETIKGVAHVCKELEYQLLLNYTGLDLSEEIIALETLSRSKVDGIILMATRITPQHLDVINKINVPVILVGQEHSGVNSIIHDDYLAGSYVGRQIVEANYKQVYFFGVTEEDKAVGQQRKNGVLDILALNHIDVQVFKTSFQFMEAKNDVKLHLQSVHTADAIIGATDTIALAIHSYCSQPHHKLIPHKIYGFGGDPITQIVTPQINTVMYHYFKAGQQALSQLHRLINHHDAQLLTVIPVEL >NZ_CP041724.1|WP_150868049.1|1210498_1211239_-|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MSKIWISFLTIVIYALAQYLPVFIIKLTSFQIKSPTQLLHVAIYIQVILFIIAAIIIILLQKVIKNPTKLESDYKEPKRYLVQYALLGFIVVMIYQMFAGLINTWIFGELKASPNTERLMDIARQAPIFIILISIVGPILEEYVFRKVIFGEILDRLKGNIVMRFLIASVVSSLLFALAHNDITFIIVYFGMGMIFSLAYVLTKRIAVSIMIHMMQNGFVVIMQVCFGDVLKHLQTQANAIFHLFF >NZ_CP041724.1|WP_002461410.1|1211419_1211704_+|co-chaperone-GroES MLKPIGNRVVIEKKEQEQTTKSGIVLTDSAKEKSNEGVVIAVGLGRQLENGQRITPDVNEGDRVVFQEYAGTEIKQGNDTYLILNADDILAIIE >NZ_CP041724.1|WP_002461409.1|1211763_1213386_+|chaperonin-GroEL MAKDLKFSEDARQAMLRGVDKLANAVKVTIGPKGRNVVLDKEYAAPLITNDGVTIAKEIELEDPYENMGAKLVQEVANKTNEIAGDGTTTATVLAQAMIQEGLKNVTSGANPVGLRQGIDKAVKVAIEALHDISQKVENKNEIAQVGAISAADEEIGQYISEAMDKVGNDGVITIEESSGFNTELEVVEGMQFDRGYQSPYMVTDSDKMTAELERPYILVTDKKISSFQDILPLLEQVVQSSRPILIVADEVEGDALTNIVLNRMRGTFTAVAVKAPGFGDRRKAMLEDLAILTGAQVITDDLGLELKDATMDMLGSANKVEVTKDNTTIVDGDGDNNNIDARVSQIKAQIEETDSDFDKEKLQERLAKLAGGVAVIKVGAASETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTALVNIYKKVSDIQAEGDVETGINIVLKALTAPVRQIAENAGLEGSIIVERLKHADSGVGFNAATNEWVNMLEAGIVDPTKVTRSALQHAASVAAMFLTTEAVVANIPEPESNNQPPMGGGMPGMM >NZ_CP041724.1|WP_070648272.1|1213929_1215216_-|aminotransferase-class-I/II-fold-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MNPLAQNLNNELYQYNPEVLSMLSQLGKEMFYPKGILSQSADAKSTKYNATIGMATDKDGKMYANELYGVFNHLSPDEIFPYAPPQGIEGLRTLWQEKMLKENPDLKSHMISKPIVTNALTHGLSLIGDLFVDTNDTILLPSHNWGNYKLIFNTRHQANINTYDIFDNNGHYTTDALVSTLEHYTSDKVIMILNYPNNPTGYTPTKQEVKTIVEAIEALANKGTKVIAVVDDAYYGLFYEDVYTQSIFTALTTLNHKNILPVRLDGATKEFFAWGLRVGFMTFGIHNDTAQQVLEAKVKGLIRSNISSGPMPSQNAIKYVLEHHEQFNKEIQANINTLQERYAVTKEVVYDKQYQRHWQAYDFNSGYFMALKVNGVDPEELRVHLINKYSIGIIALNDTDIRVAFSCVEKDDIPHVFNSIAQAIEDLK >NZ_CP041724.1|WP_002461405.1|1215689_1215869_+|hypothetical-protein MKHLTKIFAILAIILFVLGYYLQATNHESSGIKILTAAILFIICAFISRNNDRRKQNRK >NZ_CP041724.1|WP_002461404.1|1216094_1216475_+|GntR-family-transcriptional-regulator MKILIKNTSNQPIYEQIKQQIKENILTGQIDAGSHLPSMRELAKDLQVSLITTKRAYEDLEKDGFVTTIRGKGTFVKEQDQSILKEKQFIVIEQLAHSLCKEAKTIGMPLAEIKEIISLIYEEDEV >NZ_CP041724.1|WP_002461402.1|1216471_1217359_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNVVELNNVNYKNPSIELKNISFNIPRGFVTGFIGANGSGKTTIIRLIMGLLEASSGTIQLFNRTMDDAPQYIKDKIGFVYSDIYANPDWTIDKLEYYTAPFYNQWDTKCFNDYLRQFHLNKQQKIKMLSSGMKMKLSLALALSHHAELFVFDEPTSGLDPVARNEVLTLIQHELLDEQKTVLMSTHIMSDLEKIADYLVYLKHGEILLTGECDALLAKYDIVKGDAAQLDSELDDLLDYKEIRHTGYLGLTSHGNTFKELFGHDVEVYSPTIEELMIYLDKGQKNNLSVREDSQ >NZ_CP041724.1|WP_002477928.1|1217355_1218021_+|membrane-protein MKSLLMRNFKLRQWTLYIYLGLLVFFPIYIIITVNTDFGFIIFIPIGIILMIISIFDAGHMFRVHKRLGGQQAYIYFASLPVSKKDMLRANYLTCLLLTLFGALVIGLYDSQTIDNELMNRLHISTAYSFLIVNFLSIPIAFPKYTEYKRKGVSYVGYLIFMLIVIPVMYSFFFTVLNHAMFNNQLSKNEVAYFLNNGLLVIAILIFIINYFIQLKYIKRL >NZ_CP041724.1|WP_002461399.1|1218039_1218912_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MQLKKITKTYKDNVVLDQIDFDFKESQIVGLIGKNGVGKTTLMKVMNNNIINYQGEVAVNREDNIGYLIEHPKLYDNKSGLDNLKLFAQVLGNGFDKSYSDKIIDAFGMRSYINKKVKKYSMGMKQKLAIAVSLMNKPKYLILDEPTNGMDPDGSIDVLETIKSLVEELQMKILISSHKLEDIELICDRAIFLRNGKFVQDVDMTKGSIDDATIIKVKVEQFDEAKEVLENHFNVLESHAELGELHIKIQQDYSQLLKLLAQRHVYPTFIESRKNSLRDTYFNINQRGDK >NZ_CP041724.1|WP_002477929.1|1218911_1219640_+|ABC-transporter-permease MRSLQLVKYDLISIIKSYLTYVAIALVGGLFGLVSYLFMKNTHKVHYESLIPMINWALLFVGTLFVIKTITRDYSQGTIQLYMNRVSSRIGYVMAKVISIILIALIFAGVAYISMLLIQAFTKGDKLDGDIFLKNIWFYVIFLLFYGLVLFLLTLIVQKPAVIFTIGIFLIFIVPFIDPFLGLIPEWGEHIQDAMKYIPFSYLTKKELNSNIEFTNWQWFISIASIVVLFVTTLFYATKRDI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP041724_3 | 1866457-1866542 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041724_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP041724_3
>3.1|1866486|28|NZ_CP041724|CRISPRCasFinder GGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCGAAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041724_3
The CRISPR arrays of NZ_CP041724_3 >merge|NZ_CP041724|3|1866457-1866542|CRISPRCasFinder GAAATTCGACAAACAAAGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCGAAATGAAATTCGACAAACAAAGCAAGTTGGGGT >NZ_CP041724|3|3|1866457-1866542|CRISPRCasFinder GAAATTCGACAAACAAAGCAAGTTGGGGT GGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCGAAAT GAAATTCGACAAACAAAGCAAGTTGGGGT
>NZ_CP041724.1|WP_141750749.1|1865180_1866053_-|DNA-protecting-protein-DprA MDDIVLLKLRYSGIQAPQFQRLIHGYPNFLSFSEDDLLNLLSKTEIKKWFGDIAAQYKRISEDYILTSLYDASVKFITINSQCYSTLLKEIYDFPPILFYRGDISLLNSNTTLAVVGSRKATSYSYKALDFLFSQFNRRFTIVSGLAKGADSMAHELAIQHHHATIAVLGFGHLTHYPKETYILRQKIEAHHLSISEYLPFEPVTKYHFPQRNRLISGISKGVLITEAEKRSGSQITIAHALDQNRNVYVLPGDLFNPLTQGNLYRAREGACIVTGAEDILMDYDINKVF >NZ_CP041724.1|WP_070481494.1|1862939_1865009_-|type-I-DNA-topoisomerase MADNLVIVESPAKAKTIEKYLGKKYKVIASMGHVRDLPRSQMGVDVDDNFEPKYITIRGKGPVVKELKKHAKKAKKVFLASDPDREGEAIAWHLSNILELEDSKENRVVFNEITKDAVKESFKHPRDIEMDLVDAQQARRILDRLVGYNISPVLWKKVKKGLSAGRVQSVALRLVIDRENEIRNFKPEEYWTIEGEFRYQKSKFTAKFLHYKNKPFKLQNKDDVNKVTAKLDGDQFEITNVNKKEKTRNPAQPFTTSTLQQEAARKLNFKARKTMMIAQQLYEGIDLKRQGTVGLITYMRTDSTRISDAAKNEAKSYITENYGSNYVSKRQAKGKQGDQDAHEAIRPTSAMRTPNEMKSYLSRDQHRLYKLIWERFVASQMAPAILDTVALDVTQNDIKFRANGQTIKFKGFMTLYVEAKDDKENDKENKLPNLKEGDKVTATQIEPAQHFTQPPPRYTEARLVKTLEELKIGRPSTYAPTIDTIQKRNYVKLDSKRFVPTELGEIVYEQVKEYFPEIIDVEFTVNMETLLDKIAEGDMKWRKVIDDFYNSFKLDVARAEKEMEKIEIKDEPAGEDCEVCGSPMVIKMGRYGKFMACSNFPDCRNTKAIVKTIGVTCPTCKKGDVVERKSKKNRIFYGCSNYPECDFISWDKPIGRDCPKCEHYLVEKKKGRSSQVVCSNCDYQEEAQK >NZ_CP041724.1|WP_002459294.1|1861580_1862888_-|FADH(2)-oxidizing-methylenetetrahydrofolate--tRNA-(uracil(54)-C(5))--methyltransferase-TrmFO MTQTVNVIGAGLAGSEAAYQLAQRGINVNLIEMRPVKQTPAHHTDKFAELVCSNSLRGNALTNAVGVLKEEMRRLDSLIIKAADQAKVPAGGALAVDRHDFAGYVTDALRSHPNVTVLNEEITQIPDGHSIIATGPLTTSSLAQEIVNITGKDQLYFYDAAAPIIEKDSIDMDKVYLKSRYDKGEAAYLNCPMTEEEFNRFYDAVLAAEVAPVNEFEKEKYFEGCMPFEVMAERGRKTLLFGPMKPVGLEDPKTGKRPFAVVQLRQDDAAGTLYNIVGFQTHLKWGAQKEVIQLIPGLENVEIVRYGVMHRNTFINSPDVLNEKYELIGNEHIQFAGQMTGVEGYVESAASGLVAGVNLAHKLLAKGEVIFPRETMIGSMAYYISHAKNDKNFQPMNANFGLLPVLEKRIKDKKERYETLANRALEYLEKYKKTL >NZ_CP041724.1|WP_002459293.1|1860555_1861449_-|tyrosine-recombinase-XerC MNEIQKAFLYMLKVERNFSDHTIKSYHDDLMQFNEFLAQEMLTLSTFEYKDARNYLSYLYNKNLKRTTVSRKISTLRSFYEYWMTQDETVINPFVQLVHPKKEQYLPQFFYEAEMDALFETVLHDAKKGLRDRVILELLYSTGMRVSELVHIKKMDIDLTLPGVKVLGKGSKERFLPFGEFCKQSIEQYLLEFGPVKQNDHPFLLVNMNGQPITERGVRYVLNDIVKRTAGVTDIHPHKLRHTFATHLLNQGADLRTVQSLLGHVNLSTTGRYTHVSKDQLRKVYLNAHPRAKKERN >NZ_CP041724.1|WP_002459292.1|1860012_1860555_-|ATP-dependent-protease-subunit-HslV MSTSIHATTIYAVRHNGEAAMAGDGQVTLGQQVIMKQTARKVRRLYDDKVLAGFAGSVADAFTLFEKFETKLQQFSGNLERAAVELAQEWRGDKQLRQLEAMLIVMDKSGILVVSGTGEVIAPDDDIIAIGSGGNYALSAGRALKRHAAHLSAKEMAYESLKVASDICVFTNDNIIVETL >NZ_CP041724.1|WP_002478282.1|1858562_1859966_-|ATP-dependent-protease-ATPase-subunit-HslU MDTNGIKLTPKDIVSQLNEYIVGQDDAKRKVAIALRNRYRRSLLDEETKQEIAPKNILMIGPTGVGKTEIARRMAKIVGAPFIKVEATKFTEVGYVGRDVESMVRDLVDVAVRLVKNQKKAMVKDEAVAKANDKLVKLLVPSMKKKAAQGNNPLENLFGGAIPNFGNNQEDEEEPPTEEIKTKRSEIRQQLLAGKLEDEKVRIKVEQDPGALGMLGTNQNQQMQDMMNQLMPKKKVEREVPVKTARNILADDFADELIDQETANQEAIELAEQMGIIFIDEIDKVATNNQSSGQDVSRQGVQRDILPILEGSMIQTKYGTVNTEHMLFIGAGAFHVSKPSDLIPELQGRFPIRVELESLTVNDFYRILTEPKLSLVKQYEALLKTEEVTVNFTDGAITKLAEIAYQVNQDTDNIGARRLHTILEKMLEDLSFEAPNMPNAVVDITPQYVDEKLKSISTNKDLSAFIL >NZ_CP041724.1|WP_002459290.1|1857767_1858541_-|GTP-sensing-pleiotropic-transcriptional-regulator-CodY MSLLSKTRELNTLLQKHKGIAVDFKDVAQTISNVTVTNVFIVSRRGKILGSSLNELLKSERINQMLESKHIPEEYTEQLMEVKQTQSNIDIDNVLTVFPPEDRETFINSRTTVFPILGGGERFGTLVLGRVKDDFNENDLVLGEYAATVIGMEILREKHNEVEKEARDKAAINMAINSLSYSEKEAIEHIFEELGGNEGLLIASKVADRVGITRSVIVNALRKLESAGVIESRSLGMKGTFIKVKKEKFLDELERNK >NZ_CP041724.1|WP_002459289.1|1856760_1857549_-|30S-ribosomal-protein-S2 MAVISMKQLLEAGVHFGHQTRRWNPKMKKYIFTERNGIYIIDLQKTVKKVEEAYNFIKQVSEDGGKVLFVGTKKQAQESVKAEAERAGQFYVNQRWLGGILTNYKTISKRIKRISEIEKMEEDGLFDVLPKKEVVELKKEYDRLIKFLGGIRDMKSMPQALFVVDPRKERNAIAEARKLNIPIVGIVDTNCDPDEIDYVIPANDDAIRAVKLLTGKMADAVLEGQQGVSNEEVAAEQNIDLDEKEEAKDAETTEENTSVESN >NZ_CP041724.1|WP_070648622.1|1855698_1856577_-|elongation-factor-Ts MAISAKLVKQLRERTGAGMMDCKKALTETDGDIDKAIDYLREKGIAKAAKKADRIAAEGLVHVEVKGNEAAIVEINSETDFVARNEGFQELVKEIANQILDTKPESVDALMETKLPNGHSVDEKMKEAISTIGEKLSIRRFAVKSKSDNDAFGAYLHMGGRIGVLSVVEGSTDEEAAKDVAMHIAAINPKYVSSEQVSEDEINHEREVLKQQALNEGKPANIVEKMVEGRLRKYLQEICAVDQNFVKDPDQTVEAFLKSKGGKLVDFVRYEVGEGMEKREENFADEVKGQMK >NZ_CP041724.1|WP_002459287.1|1854839_1855562_-|UMP-kinase MTQTSKYKRVVLKLSGEALAGEKGFGINPIIIKSVAEQVAEVAKMDCEIAVIVGGGNIWRGKTGSDLGMDRGTADYMGMLATVMNALALQDSLEQLDCDTRVLTSIEMKQVAEPYIRRRAIRHLEKKRVVIFAAGIGNPYFSTDTTAALRAAEVEADVILMGKNNVDGVYSADPKVDPNAVKYEHLTHIQMLQEGLQVMDSTASSFCMDNNIPLNVFSIMEEGNIKRAVMGEKIGTLITK >NZ_CP041724.1|WP_037545870.1|1866711_1867947_-|aminoacyltransferase MNFTTLTCEEFNTYVSKHFSHYTQSIQLYEYRKQQHKGVHLVGVKNIYGEVIAACLLTEARVLKIFKYFYSHRGPVMDYNDLSLVKFFFKHLTRYLKKQRGLFVLIDPYILENIRNAEGEIIHTYNNEKLIDTMHRLGYEHQGFSVGYSDMSQIRWHSVLNLQQKSEDQLLKEMSYQTRRNINKTFEMGVEVITLPIEETDRFYRLFKMAEEKHGFNFREESYFEEMQKIYHDNGCIKLAYINLTDYLTRLEKQRQKLIVLLNDVKETLEINPNSKKSKTKYQQLTQQLASIDKNIAKTQDLQQEDGNILDLAAALYVYNNHEMYYLSSGSNPKYNQYMGAYRLQWDMICFAKSHHIHRYNFYGITGDFSSQAEDYGVQQFKKGFNAFVEEYIGDFIKPLRPWLYKFYSRK >NZ_CP041724.1|WP_150868074.1|1867960_1869109_-|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MERQQLYCKKVINPKVLITSLIFFASFLMIGELNHAWAAEETVNSQKNINVNNTINLVEKNSLKSVDDKASYKETINNKISVFNNENKKGNLIGNKTKKRNIIVNYSDSKHNQKTTKNNKFKLSNDYLNRKDRNNTNIKITKSKDSKEKPQKQLLNKTFSNSGLVGFRSAENYNERTQNYVVKKGDYLGAIAKKFNTTVSKIQKLHNIKNPNFILIGQVLKVPFISSNNSSTNTNRRNNSSSTLNYLNSLAYKGWDFDGAYGNQCFDLVNVYWNYLYGHGLRGYGAKDIPFANNFRGEATVYRNTPTFKAELGDVAVFSGRYGGGFGHTAIVLNGNYDGKLMKFQSLDQNWYGGDSRRADIAHKVVHNYDYDMYFIRPYKKA >NZ_CP041724.1|WP_002478289.1|1869304_1870213_-|succinate--CoA-ligase-subunit-alpha MSVFIDKNTKVMVQGITGSTALFHTKQMLDYGTQIVAGVTPGKGGQVVEGVPVYNTVAEAKQETGANVSVVYVPAPFAADSILEAADADLDMVICITEHIPVVDMVKVKRYLEGRKTRLVGPNCPGVITADECKIGIMPGYIHKKGHVGVVSRSGTLTYEAVHQLTEEGIGQTTAVGIGGDPVNGTNFIDVLKAFNDDEETKAVVMIGEIGGTAEEEAAEWIKANMTKPVVGFVGGQTAPPGKRMGHAGAIISGGKGTAAEKIKTLNSCGVKTADTPSEIGTTLIAAAKEAGIYEQLLTIDK >NZ_CP041724.1|WP_070648626.1|1870234_1871401_-|ADP-forming-succinate--CoA-ligase-subunit-beta MNIHEYQGKEIFRSMGVAVPEGRVAFTAKEAVEKAKELNSDVYVVKAQIHAGGRGKAGGVKIAKSLSEVETYANELLGKQLVTHQTGPEGKEVKRLYIEQGCDIQKEYYVGFVIDRATDRITLMASEEGGTEIEEVAATTPEKIFKETIDPVVGLSPYQARRIAFNINIPKESINKAAKFLISLYNVFVEKDCSIVEINPLVTTGDGEVLALDAKINFDDNALFRHKDIQELRDLEEENPKEIEASKYDLSYIALDGDIGCMVNGAGLAMATMDTINHFGGNPANFLDVGGGATKEKVTEAFKIILGDDNVKGIFVNIFGGIMKCDVIAEGIVAAVKEVELTLPLVVRLEGTNVERGKEILNDSGLAIEPAATMAEGAQKIVKLVKEA >NZ_CP041724.1|WP_002478291.1|1871511_1872279_-|ribonuclease-HII MKITIKEAKAQLNKVTTLEALSNHALHLDERKGVKQAIRVRQRQLEKELKLEQDYQRMMKYEQEILQQQPDAIICGIDEVGRGPLAGPVVACAVILNANHHYLGLNDSKKVSAVNRAQLNQDLMANVRGYAYGIASAAEIDQLNIYRATQVAMQRAINQLQVRPTHLLIDAMSIDSTISQTAIIKGDAKSVSIAAASIMAKEYRDHLMRDYAQVYPYYGFDKNVGYGTKAHLAGLKQYGVTPIHRRTFEPVKSML >NZ_CP041724.1|WP_002493074.1|1872262_1873147_-|ribosome-biogenesis-GTPase-YlqF MAIQWYPGHMAKAKREVTEQLKKVDVVFELVDARIPYSSRNPMIDDVIKQKPRVVILNKKDMTNLKEMSKWEHYFVEQGFYPVAVDAKHGKNLKGVEAAAIEATKDKFAKEQAKGLKPRAIRAMIVGIPNVGKSTLINKLARKNIAQTGNKPGVTKQQQWIKVGKVLQLLDTPGILWPKFEDELVGKKLSLTGAIKDSIVHLDDVAIFGLNFLIQHDIETLRQHYHISVEEDAAILEWFDAIGRRRGLLQKGNEVDYEAVIELLINDLRNAKMGTYCFDLYSEMKRDIAHENND >NZ_CP041724.1|WP_070648628.1|1873403_1875995_+|YfhO-family-protein MTKKLLMIMLFLTLAIIGHTYILYRFIHDGILFTGPNDGIEQMIPMQMYLYDKWSQGQFFYATDFGLGGDFFSDLSYYFSTNLLFIINAIIIYITNLIVSLPTGNVTFWTINAIVISIVKATIAMLVTYLFSMRIVKHRVNSSLIAFLFVMSPLYYRFTVYWPFFSDVFIGLPLLLYAIEHMLQQKKIGLLILAITIIMINNFYFAYYFLLIGAGYLLIRITFAHKDDRMKRITALWLSVLCAFLGLANALFMFYYSAQSYINNRRIPYKDHVPVFESLNINNNIFIDNYLIILLFITIQALLTFKLYKHYYFRLFAFLTCITILFNFMPIVDQIFNGFSAPQKRWHFLLAFNSAMVIGLFIKYFSTIRIKTYIWTNIVAQLAVFISVIVYHQYVPWLVLVPIVSLIGLFTLIIKDATSRLIIKQIYVFSIISLSILVSAVFIKNQIYFKDHEQRANNMYIHSSLYNSELQRQLLSYMTHTKEPWERIDWRVNEQDNTPMYQKFKGLSLYSSIFHHNILDLYYDNLKINLAEESLSRYQSTNGRQNIASLFSVRYMMLKDYQNNLPAYFQKIKSSGQYAIYENKLNLPAVKVTNHLYNDQSIKTSIDREHAMLDGVIVHNGGNNYHKHSKNLLNKVSQSSQHIQCLSNKHIKVNSQQGGTIKLHLPKSIRQHYTDFYLTMYIKRGQPDSNYSVAINGYVNHRLYNQSTYRTGVNTQLYRTQPDENGNISIQLTPSGTFDMKLISLHGENYHKLVQTHRQANFDHRYQDIHDGVRITLAPHSQGMAVVNIPYRKGMMAYVDGKRINPIRVNTMMTGIPVKKSTTSIIIKYLPPHWIVMLLLSSISILCSIMITRIFTKKRKDEE >NZ_CP041724.1|WP_080606678.1|1875999_1878606_+|YfhO-family-protein MQKRTVQAMKTFVMITLISFIATLIIYFPFIKDWISKGYVFSGVGDGFRQMMPFQMYLYEHYTQLKGFYDHSFGLGGDYVKSLAYYYSLSPTMWCNFIMIWLGERLLHWNPHVIGFWPFNQLIVALGRSLLTFICAFYYFRYLKLKQAPLMIATILYGASTVGLYYNFTWSFYGDLLIFLPLSLWGMERFFQRGKIGVFIVAIAITLFSNFYFSYYQAIVLGIYFLLRIIFEYRYDIVTRWQKFYLLMFGTILALFSSIIGFYTGVSSFLNNDRQQNSDFKISLFTDLTQDNYYIFSNGFYITISIIALVALLSFKLYKHYYYKLFAIITWFLLIGSLTQYFDSAFNGFSLPQRRWVYFLVLSTSALMALHIQHISELSIKQYCFAAIPVFIFGLCRYLFAEHFVNWMLISLILIIILALLVWRKKWLYHPLVLLGIVVIFFVQQVVMTIESSKRTIGPYSTTMSTITDPSYYNTKLAKVIQQINHKNNNPLHRIDYMSFYALNSPFIYHYNGISLYSSIFDGSILNYYDHLMQINMPVDKNSTYRYLSNRANLEALWNVQDRFRHPNDLNIPYGFKKIDTIKNGNDTLIHSKNTINYPATHVTNKVFNASDLKSPLDREQAMLQGIVPSDGSIKANTAFKANQNLIDEAKRSTHNATWLNHSRLKVDKNNGGVTYTLPKNVAKKYKDLYVEMDVELLTPDKNHEVGVNEYVQDRNELTYKYRRFVTPVTMRIKAADKLNIHLSQGTYRLSVKGIYGEDYSSLQQSAKDLKAVSVKENKNGYTISKSKSTSGYVVLPMVYADGMKATVNGRNEDVKKVNGIMTAIPVNKGDTNIRLTYTPPHWHLLFIMSILGIFLSIAFRFWVKRKV >NZ_CP041724.1|WP_002459304.1|1878807_1879158_-|50S-ribosomal-protein-L19 MSNHKLIEAVTKSQLRTDLPSFRTGDTLRVHVRIIEGSRERIQVFEGVVIKRRGGGISETFTVRKISSGVGVERTFPLHTPKIEKIEVKRRGKVRRAKLYYLRNLRGKAARIQEIR >NZ_CP041724.1|WP_002459305.1|1879263_1880001_-|tRNA-(guanosine(37)-N1)-methyltransferase-TrmD MKIDYLTLFPEMFEGVLNHSILKRAQDKGIINVNTINFRDYAVNKHNQVDDYPFGGGQGMVLKPEPVFNAMKDIQHNDETRVILMCPQGRPFTQKIAQELSSTEHIVFICGHYEGYDERIREHLVTDEISMGDYVLTGGELPAMTMTDAIVRLIPGVLGNQQSHQDDSFSDGLLEFPQYTRPREFQGMTVPDVLLSGNHAHIEKWRHKQKLIRTYLKRPDLLMAYPLSEQDKEIIESFKKQLKKG |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP041724_4 | 2375803-2375891 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041724_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP041724_4
>4.1|2375834|27|NZ_CP041724|CRISPRCasFinder TGCAACGCAAGCTGGGGTGGGGCCCTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041724_4
The CRISPR arrays of NZ_CP041724_4 >merge|NZ_CP041724|4|2375803-2375891|CRISPRCasFinder AGCACAAAGAAATGCACCAAGCATTTCTACGTGCAACGCAAGCTGGGGTGGGGCCCTAAGCACAGAGAAATGCACCAAGCATTTCTACG >NZ_CP041724|4|4|2375803-2375891|CRISPRCasFinder AGCACAAAGAAATGCACCAAGCATTTCTACG TGCAACGCAAGCTGGGGTGGGGCCCTA AGCACAGAGAAATGCACCAAGCATTTCTACG
>NZ_CP041724.1|WP_002479384.1|2375105_2375795_+|hypothetical-protein MKSTSQLMRENNVKSLRLNNTDREIFENYMTYVRAELSVNPYDSELMLNRILKQLLKAEDNGTLALEFFNHDPKAHAKQEIRALPNETINNIFNYIYQNFMFLIGIFCFCKGFIGFFIGGNNNRIYLYTFPIIVIIGLFIIFLFIWMIFKTVQLQCFNNKNLVWILTYIVIGLLISALVYVFFIPQSFLAIGPYITISNWHFIIASLIITPIAFYTKHRHTNKNANTRL >NZ_CP041724.1|WP_002459791.1|2374442_2374895_-|hypothetical-protein MKKGLVLLLAAIFLLTACGKGNDEKQSLEQDIQKLEKEKKDLEKQEEKLKSDKEKYKSQRETLEKEVEEMQSTSSDDDKDNKEKTSDKSKEKSSQHQTTHHQNKDQQNQHQNSNNTDNTQTDKDKTHKQQSSQSTKNDTQKQSKQPKQQQ >NZ_CP041724.1|WP_002459790.1|2374020_2374317_-|hypothetical-protein MHEQDFRILEGQDITLPELGRELETLTGRTIVDSTGEINRVVAHLPNFDSDFDTFVATYKLNHQNDFIDAIFTAPKAQRNRLKEIPVHIELISYISKA >NZ_CP041724.1|WP_002492957.1|2373364_2373907_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MTVYIETERLKLRDWEENDLLPFQKLNANPQVRRYFPSLLSYRRSALDMKQMQKNITATGIGLFAVELKETNEWIGFIGLNYIPKDSQYPFNNLPFYEIGWRLIPEVWGNGIATEGAEAVLKYAQKKGVYDIYSLTAETNLSSRKVMEKIGMKVFDRFEFPELNKYHPLKMQVRYYKNLK >NZ_CP041724.1|WP_002479382.1|2372766_2373333_+|TIGR00730-family-Rossman-fold-protein MKKIAVFCGASKGSNPTYVNEAYNLGKYMAQKGYELIFGAGSVGIMGAIQNGVLDHNGTVIGVMPKELDTKEITSQRVSELILVDSLHQRKEKMAELADAFILAPGGAGSLEEFFEIYSWTQIGIYQKPIGIYNLNGFFEPLHQLIIHMIQEGFIDEKYKALAPLYHTKEDLLHGLQNAKPLGERSYD >NZ_CP041724.1|WP_070647837.1|2372304_2372751_+|YaiI/YqxD-family-protein MTSIIIDGDACPVIQSVIELTSGTGIFVIIVRSFSHYTTQTYPEHVNTIYVDDGPDAVDYKIVQLAQSKDIVITQDYGLASLLLNKVKTVLHHKGYIYNSTNIDMLIQQRYNHAQLRKQSGRHKGPTPFSNKDQQHFEHIFRRVLSQI >NZ_CP041724.1|WP_111703912.1|2371714_2371930_-|DUF1736-domain-containing-protein MLSASLRFFFANFSPFFSIYSGSFSFAIFFNSRLLSCSCFLSITNSLTSVALLATVLDARDVAAVTFLTSE >NZ_CP041724.1|WP_150868091.1|2370409_2371282_+|undecaprenyl-diphosphate-phosphatase MFLLELIKGIILGIVEGLTEFAPVSSTGHMILMDDMWLKSTDFLGSESAFTFKVVIQLGSVFAAAWVFRERFFELLHIGKQHQAPISEEFRSKPRRLNLLHVLVGMIPAGILGLMFDDLIEKYLFSVPTVMIGLFLGAIYMIIADKYSEKVKHPQNVNQINYFQAFVIGISQAIAMWPGFSRSGSTISTGVLMKMNHKAASDFTFIMSVPIMLAASGLSLIKHYEYIHLAHIPFYLLGFLAAFIVGLIAIKTFLHLINKIKLVPFAIYRIILVVIIAILYFGFGIGKGIY >NZ_CP041724.1|WP_002459784.1|2369587_2370028_+|MarR-family-transcriptional-regulator MSEHHNLKEQLCFSLYNAQRQVNRYYSNKVFKKYNLTYPQFLVLSILWDESPVNVKKVVTELALDTGTVSPLLKRMEHVDLIKRERSEVDQREVFIHLTEKSEGIKPDLKDASSKVATASSLSADEAQELNRLLGKVINAFTENKE >NZ_CP041724.1|WP_070647839.1|2368430_2369363_-|GTP-binding-protein MKKHNCRNTYISIVSGFLGSGKTTFLQEYMQYLLKTDEKITIIMNEFGTFDVDSLTFNNEVAINALVNGCVCCDLKADLVAQLKNIIADGQTTHIIIEATGIAHPLEIMMACQDPEVIHLISEVKMIGILDASRFLHRHRYSLTTVELMEEQLAYSSTIIINKMDLINDQEQKKLSAELTQINPQATTCYTTFGQLDITTFNNIKHVDNMKSLAKHAHHHGIKSMQYTFSGPIDRQLFYQFILKLPQNVFRLKGFVRFRDRANVIYEFQYAHGLPSYGEVDKEVPLTIVIIGEHIDVERLRNNLDMLQFT >NZ_CP041724.1|WP_002479385.1|2376244_2376730_-|DUF456-domain-containing-protein MTVLLWLLIIFAFILAFVGLIKPVIPSVLMLWVGFLIYQFAFNNGELSWIFYVSMIVLTVLMFISDFAMNKYFVNKYGGSKISEYVALIGVLVGCFVFPPFGIIIIPFVAVFAVELMQDFDVNKAFKASLGSIVAFLTSNIAKAIIMFIMIVWFFIDVFVI >NZ_CP041724.1|WP_002459795.1|2376731_2377949_-|MFS-transporter MFKALLHIKNYKLFVVNMMLLGMGIAITVPYFVLFATNELGMTTNQFGILLALAAVSQFTINSIVARFSDTHNINRKFLIITALFMGAVSFSIYFYIHDIWLFIITYAIFQGLFAPAMPQLYASARESINISSSRKNAKFANTVLRSMFSFGFLFGPLIGSRLIHFNGYAGLFGGTVAIILFTLLLQVFFYQDLKLTGEQQVGGTAHIETTAPNMLKDVTLFLPFVAFILLHIGQWMYTMNMPLFVTKQLHISEDYVGTLASLCAGLEVPFMVILGMLATKLQTRTLLIVGALSGGAFYFSIGIFNNIYMMMLGQVFLAFFLAILLGLGISYFQDILPDFPGYASTLFANAMVIGQLCGNLLGGAMSQWVGLENVFFVSASSIFIGMVLIFFTKDQKFTEEKVIS >NZ_CP041724.1|WP_002459796.1|2378034_2378889_-|LysR-family-transcriptional-regulator MKIEDYRLLITLDETKTLRKAAELLYISQPAVTQRLKAIENNFGVDIFIRTKKQLITTTEGAMIIEHARDMLKRERLFYDKMQAHIGEVNGTISIGCSSLIGQTLLPDVLSLYNTQFPNVEIQVQVGSTEHIKAHHRDYHVMITRGNKVMNLTNTHLFNDEHYFIYPKDKRAEVDKLPFIEFQADPIYINQIKEWYNDNLGQDFHATITVDQVGTCKEMLLSGVGVTILPEVMMKYIDKNQFECEKVLIEGQPLIRSTFMSYEANMLQLPQVDSFVNLMYNFIR >NZ_CP041724.1|WP_002459797.1|2379339_2379960_-|DUF402-domain-containing-protein MAVKVKYIDKRHWRRLIEREYIEVKVNNKRFKGIIGLVTMNKVREPLEVTVVGKHMVVADDHYQWLQILPEKKRYSITAMFDDKGQPLEYYFDINIKNITQKGNARTLDLFLDVLVLPTGKYELVDEDDLMNALVNEQITKRQYHEAYMIAHQLMIEINDNFDELERRIMHCYRKMNQKKHKAKRHHHQAPQPQQRHKRKKRFTED >NZ_CP041724.1|WP_002459798.1|2380337_2380805_-|cupin-domain-containing-protein MISAEEWINRLELMPHPEGGYYKETLRPDDKKRASYSSIYFLLKDADVSHFHRIDADEVWYHHSGETLLIHMITTEGKYYVEQLGQNVADGDVLQCVVPKGTIFASSLKHSKGYGIVGCMCQPAFEFEHFELLAQAILLEKYPQHQEIIKAYAVE >NZ_CP041724.1|WP_002459799.1|2380804_2381521_-|YebC/PmpR-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MGRKWNNIKEKKAQKDKNTSRIYAKFGKEIYVAAKSGEPDPNSNQALRLVLERAKTYSVPNHIIDKAIDKAKGAGEENFDHLRYEGFGPSGSMIIVDALTNNVNRTASDVRAAFGKNGGNMGVSGSVAYMFDDTATFAIEGKSADDVLEALMEQDVDVRDVIDEDGLTVVYAEPDQFAQVQEALRAIGVEEFKVAEFEMLPQTDIELSAEDQETFEKLVDALEELEDVQNVFHNVDLK >NZ_CP041724.1|WP_002459800.1|2381754_2382114_-|MarR-family-transcriptional-regulator MSKDKLNQLLNLYKKHKLLSEYIDKKYKLTLNDLAVLKLAKDYTSEEKVLMQSFLKLAIEELDLSRTKLLVSIRRLIDKEKLSKQRSEEDERKIFIYMNDDNIESFNDLFKDVEELLEI >NZ_CP041724.1|WP_070647836.1|2382257_2384402_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTNTFFRILTKEEYQPTRCIDGIIVILPIQGDLTIQHFANSTTISDEIYIINNKDIFTIKQNHKSLMLYITSDWFKNHDYVFFDYKYSVNLIKSINKLKQLMLKIAINYINQMPITSNENYIKQMVEVIATEGSVDLETAENQYKFLFYGELSQILEYINKHSHEKLTLNALSQNLFTSKSNISAQFHQNLNMGFKQYVDSLKIAESIEYLLTENSTISHISDKLEFSNSASYTKMFKSYIGITPNDYRSLNIKDKYLLMNYEVLSEDNEQHLKTVLRQQINYYQENIERKIFIDNNKVKTNQNFELVTQINTVEEFKELFFIKIKGKANINTENLIIYVNFGIGTLINNLSDAEIGDMFKKIAANNLHIAFKIQSLEIMDYIERIYVQVVERLNYKKSLANGDRGIIMLVFDMEVIELKEIYRLILKIQNKQFGLRFGLDISCLLNETVMFKTLESQIKRIGFDYLFIDNAHLEQPYLLEDSQHLLLKNILEYQNIEKILTQIDLSYSKVIFLNIENHQFLNNENDLSNSAPLIIETFLKTAELFDGMGVNLYFSRNSFNAIHIFDENGFKTVLGIIIGQIKWMMNQSRTIKDNYIVVENEAQYTLFLYDWRVFESEASITYFGDTEVLIHFEEVAEQSIRLIKSEKVDEKNGNINHIINRHIREKYNWTQELLKEIEDHLHTTMRIIEHDFRKDYFKVNLGYDSLRIIKIFK >NZ_CP041724.1|WP_002459802.1|2384710_2385364_-|membrane-protein MNDFSKKQRHMTDHSQSKSWAYSQVWLYFMYYWLIFGIGCYFGQYLPDEWRMPLSIGLLVLIFSTLIFKRARKYGLIISHIYAIIVGLLSYAMFTTYLQNLGADVFYKNIVLAIGAFVIFGVIGFFFIKDASSIGRYLFVTLLALIVASLIGLFIHNPVFYTVITVVSLFLFLLYTLYDFNRMKRGQFSPREMGFNLFINLLNIILDILSLANRFRN >NZ_CP041724.1|WP_150868092.1|2385731_2386535_+|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MKKLAFAITAASGAAAALTHQHAEAATQHTVKSGESLWSIAQQHNTTVNDIKQSNNLSNNFVFPGQVLSVGGNNTNSSQYSGQNSSATSHTVQAGESLNLIANQYGVSVNDLMRANNLNGYLIMPNQTLNIPSGSDNGAGSGGTTVTPSNTNTTPTFNHSNLYTSGQCTWYVFDRRSQAGKPISTYWSDAKYWAGNAANDGYRVDNSPEVGAIMQSTPGPYGHVAYVERVNGDGSILISEMNYTYGPYNTNTRTIPASEVSSYAFIH |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP041724_1 | 1.1|921397|30|NZ_CP041724|CRISPRCasFinder | 921397-921426 | 30 | NZ_CP041724.1 | 1967534-1967563 | 1 | 0.967 |
NZ_CP041724_3 | 3.1|1866486|28|NZ_CP041724|CRISPRCasFinder | 1866486-1866513 | 28 | NZ_CP041724.1 | 1986290-1986317 | 2 | 0.929 |
1. spacer 1.1|921397|30|NZ_CP041724|CRISPRCasFinder matches to position: 1967534-1967563, mismatch: 1, identity: 0.967
gcccccaacacaaagaaatgcaacaagcat CRISPR spacer gcccccaacacaaagaaatgcatcaagcat Protospacer ********************** *******
2. spacer 3.1|1866486|28|NZ_CP041724|CRISPRCasFinder matches to position: 1986290-1986317, mismatch: 2, identity: 0.929
ggggccccaacaaagagaatttcgaaat CRISPR spacer ggggccccaacaaagaggctttcgaaat Protospacer *****************. *********
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP041724_2 | 2.1|1210153|29|NZ_CP041724|CRISPRCasFinder | 1210153-1210181 | 29 | NC_018265 | Melissococcus plutonius DAT561 plasmid 1, complete sequence | 120055-120083 | 6 | 0.793 |
NZ_CP041724_1 | 1.1|921397|30|NZ_CP041724|CRISPRCasFinder | 921397-921426 | 30 | NC_007058 | Staphylococcus phage ROSA, complete genome | 41575-41604 | 7 | 0.767 |
NZ_CP041724_1 | 1.1|921397|30|NZ_CP041724|CRISPRCasFinder | 921397-921426 | 30 | KT186243 | Staphylococcus phage vB_SauS_phi2, complete genome | 37496-37525 | 7 | 0.767 |
NZ_CP041724_1 | 1.1|921397|30|NZ_CP041724|CRISPRCasFinder | 921397-921426 | 30 | AY954955 | Bacteriophage 42e, complete genome | 41356-41385 | 7 | 0.767 |
NZ_CP041724_1 | 1.1|921397|30|NZ_CP041724|CRISPRCasFinder | 921397-921426 | 30 | AY954961 | Bacteriophage ROSA, complete genome | 41575-41604 | 7 | 0.767 |
NZ_CP041724_1 | 1.1|921397|30|NZ_CP041724|CRISPRCasFinder | 921397-921426 | 30 | NC_007052 | Staphylococcus phage 42e, complete genome | 41356-41385 | 7 | 0.767 |
NZ_CP041724_1 | 1.1|921397|30|NZ_CP041724|CRISPRCasFinder | 921397-921426 | 30 | AP013478 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G18, isolate: uvMED-CGR-U-MedDCM-OCT-S26-C62 | 18066-18095 | 9 | 0.7 |
NZ_CP041724_2 | 2.1|1210153|29|NZ_CP041724|CRISPRCasFinder | 1210153-1210181 | 29 | MT774376 | CrAssphage cr55_1, complete genome | 42412-42440 | 9 | 0.69 |
NZ_CP041724_2 | 2.1|1210153|29|NZ_CP041724|CRISPRCasFinder | 1210153-1210181 | 29 | MT774380 | CrAssphage cr1_1, complete genome | 46180-46208 | 9 | 0.69 |
1. spacer 2.1|1210153|29|NZ_CP041724|CRISPRCasFinder matches to NC_018265 (Melissococcus plutonius DAT561 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
caaagactttccaaaagaaagtccacgaa CRISPR spacer aaaagactttccataagaaagtctaaata Protospacer ************ *********.* . *
2. spacer 1.1|921397|30|NZ_CP041724|CRISPRCasFinder matches to NC_007058 (Staphylococcus phage ROSA, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gcccccaacacaaagaaatgcaacaagcat CRISPR spacer gttaccaacacaaagaaacgcaccaaggaa Protospacer *.. **************.*** **** *
3. spacer 1.1|921397|30|NZ_CP041724|CRISPRCasFinder matches to KT186243 (Staphylococcus phage vB_SauS_phi2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gcccccaacacaaagaaatgcaacaagcat CRISPR spacer gttaccaacacaaagaaacgcaccaaggaa Protospacer *.. **************.*** **** *
4. spacer 1.1|921397|30|NZ_CP041724|CRISPRCasFinder matches to AY954955 (Bacteriophage 42e, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gcccccaacacaaagaaatgcaacaagcat CRISPR spacer gttaccaacacaaagaaacgcaccaaggaa Protospacer *.. **************.*** **** *
5. spacer 1.1|921397|30|NZ_CP041724|CRISPRCasFinder matches to AY954961 (Bacteriophage ROSA, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gcccccaacacaaagaaatgcaacaagcat CRISPR spacer gttaccaacacaaagaaacgcaccaaggaa Protospacer *.. **************.*** **** *
6. spacer 1.1|921397|30|NZ_CP041724|CRISPRCasFinder matches to NC_007052 (Staphylococcus phage 42e, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gcccccaacacaaagaaatgcaacaagcat CRISPR spacer gttaccaacacaaagaaacgcaccaaggaa Protospacer *.. **************.*** **** *
7. spacer 1.1|921397|30|NZ_CP041724|CRISPRCasFinder matches to AP013478 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G18, isolate: uvMED-CGR-U-MedDCM-OCT-S26-C62) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
gcccccaacacaaagaaatgcaacaagcat CRISPR spacer atgagttacataaagaaatgcaaaaagcat Protospacer .. . ***.************ ******
8. spacer 2.1|1210153|29|NZ_CP041724|CRISPRCasFinder matches to MT774376 (CrAssphage cr55_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.69
caaagactttccaaaagaaagtccacgaa CRISPR spacer taaagactttcctaaagaaagtatttatc Protospacer .*********** ********* . ..
9. spacer 2.1|1210153|29|NZ_CP041724|CRISPRCasFinder matches to MT774380 (CrAssphage cr1_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.69
caaagactttccaaaagaaagtccacgaa CRISPR spacer taaagactttcctaaagaaagtatttatc Protospacer .*********** ********* . ..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1331435 : 1361688
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP041724|1331435:1361688|DBSCAN-SWA 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31 | Staphylococcus_phage(96.15%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1478404 : 1487423
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP041724|1478404:1487423|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP041724|1478404:1487423|1479411_1480437_+|WP_002478079.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEDFDYHLPESLIAQTPLKNRDQSRLLVLNKETGDMKHQHFKDVINYLNPGDTLVLNDTRVMPARLFGVKEETGAKVEMLMLTQIENNDWEVLLKPAKRIKVGNQLSFGEGKIIAECIKELDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKARLDDPDRYQTVYAKENGSAAAPTAGLHFTDNLLKDIKAKGVNIAFITLHVGLGTFRPVSVENINEHEMHSEYYQMTENTAKLLNNTKLQGHRIIAVGTTSTRTLETIRRDHSQFIATSGWTDIFIYPGFEFKAIDALITNFHLPKSTLVMLVSAFSSRQFILTAYRKAVELEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP041724|1478404:1487423|1481613_1481874_+|WP_002458927.1|DBSCAN-SWA MNLTAILIPVLFLLVFYFLIIRPQQKRAKEHREMVNRVEAGQKITTIGGLKGTVKAVDETTVVITVNGHGTEMTFEKPAIKQVDPS >NZ_CP041724|1478404:1487423|1482059_1484348_+|WP_070648431.1|DBSCAN-SWA MKKGSRIVAFILLIVLLFAGMGLTYKNVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVKPLQKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPRIQVEDPDRIRVQLAGVKNQNQARDVLSSQANLTIRDANDNVKLTGKDIVQGSAKQEFKQQTNEPTVTFKLKDRDKFKKVTEEISKKKENMMVVWLDYEKGDSYHKELQKKNENDRKYVSAASVNQPINSDSVEISGGFHGQEGVKKAKQISELLNAGSLPVKLDELTSTSVGAQFGQDALDKTIFASFIGIAVIYLFMVGFYRLPGFVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTLKQAYTKANRSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRGLLSLLVSSNYFKKKFWLFGVKKKQCHDINEGKDVHDLKTSFERWNFVKLAKPLIGLSILILIVGIVILSIFKLNLGIDFSSGSRVDVESNHSLSQAKVEKTMKDVGLKADEIQINGDGKKQATIMFKHDLAKKDIAKLNDKFKNEFGHSPSVNTVSPVIGQELAKNALKALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDAFMIVAVFSLFRIEVDITFIAAVLTIIGYSINDTIVTFDRVRENLHKLKVITSPEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILLFGAPSIFNFSLALLVGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSDKGKLVVYKEKKSNDEKILV >NZ_CP041724|1478404:1487423|1484608_1486885_+|WP_150868060.1|DBSCAN-SWA MIKSKYTWNHNEPTQYIDEQIAKKYKLSPIIKKVLESKHIVNEKDIEGLLNGQQQLHEPWLLSDMTKAIERINLAIDKHERILIYGDYDADGVTSTTIMVKTLQSLGAEVGWYIPNRFSEGYGPNELAFKNAYDEGVSLIITVDNGIQGHREIEMIQELGVDVIVTDHHEMGSTLPDAFAIVHPMHPEFDYPCPNLCGAGVAYKVSQTLLKNNVPPYYIALASIGTIADLVSLTDENRTIVKTGLSILNDYQPIQIAALLNEANYNDPIDEETIGFIIGPRLNAVGRLEDASLAAELLMTEDAEEAAFLAEQVNHFNNERKDIVSKITEEALLLAKEEVAKGRQFLLLAKENWHEGVLGIVASRIVETYGLPTLILNIDDEQHYAKGSARSIEQVSMFEILSDHQNLISKFGGHHMAAGMTMPIENISELREDLNAWMANLAQTTSFDQKKQIDVKITEDEITVNNIYDIERLKPFGIDFNKPLFELDDVNVNSLKAIGKDKNHLKMTIGNSNLATLYWNSGSLVDELELNQPINMIGQLQINEWNGNQSPQFIIQDIAINQQQILDYRSKRKQLSIDFHDEQLAILIHPQKEKLDHNYYHYGETIDEHVNRVVLRDLPLSLAHLSESMNGHQFSQIYVVLQHQHSIYFEGMPDKKTFKACFKILMSKQKVNLVNDGMALSKFLGIQPNTLKFMLKVFLELGFIIDSNGIISVNQNPNKQDIEASQVYQTRKARIEVEKLMLYDDFQHLKHWIIEQMG >NZ_CP041724|1478404:1487423|1486904_1487423_+|WP_002458930.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKAGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDQIVTYAKEREVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEALGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >NZ_CP041724|1478404:1487423|1478404_1479409_+|WP_002478078.1|DBSCAN-SWA MDDRMVDQSFHQEDSAFEYSLRPTYLKQYIGQTTIKSNLEVFIQAAKLREEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLIGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNEHELKEIIIRTADVLGTSIDDESAVELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNGDDQIYIETTKKALKLLQVDEQGLDYIDHKMMNCIINQYQGGPVGLDTIAVSIGEERVTIEDVYEPFLIQKGFIERTPRGRKATAFAYEHFMKSKEKRE >NZ_CP041724|1478404:1487423|1480455_1481595_+|WP_002478080.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELTDIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKQAGGLHKFMNWNGPILTDSGGFQVFSLSNLRKISEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMEIQNDLGSDIMMAFDECPPMPSEYKYVKDSIERTSRWAERCLKAHKRPDDQALFGIIQGGEYKDLREQSAKELVALDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYNMVKHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSIGRLVIKNAQFANDFRPLDENCDCYTCKNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEAFFEQYGLNVENPKNF |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1613090 : 1621786
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP041724|1613090:1621786|DBSCAN-SWA AATGTATGAAGTAAAATTAGACGCTTTTAGCGGTCCACTCGATTTATTGCTCCATTTAATTCAGAAATATGAAATAGATGTTTATGACATTCCAATGAAAACATTAACTGAGCAATATATGCAATATGTACATACGATGAAGCGTCTAGAAATTAATATTGCTAGTGAATATCTCGTTATGGCTTCTGAACTCTTAATGATTAAAAGTAAATTACTTCTACCTCAATCAGATGATCATGTAGAATTTGAAGAAGATCCACGTGAAGATTTAGTAGGTAGACTAATTGAATATCAAAACTATAAAGAATATACAGAAATACTTGATAGTATGAAAGCAGAACGAGATCTCTACTTTACAAAACATCCGACAGATTTATCTCATTTAGAAACTAATGAAAGTTGGGATAAATCAAACACCATTGATTTGACAGAACTGATTGTTGCTTATCAAAGAGTGAAAAATCGCGTTGAGTATCACACACCAAAAACTGTAGAAATCAGTAAAGAAACATTCACTATTGAAGAAGCAACAGAAATTGTAACGACAAGATTACGTACACAAACAGCGTTTAATTTTTTCAGCTTATTTACTTTTCATGAACCAATTGAACAAGTCGTTACGCATTTTCTTGCTATTTTAGAAATGTCTAAGGCTGGCATAATAAACATAAGTCAAAAGCAAAATTTTGATGATATTGATATTGTAAGGGGAGTGAATTATCAAGTTGGATAAACAAGCAATCTTAGAGGCATTATTATATACAGCTGGCGATGAAGGTATTGACACAAAACAATTACTAGAGATACTGGACATTACTAAACCACAATTGATTGAATTAATCGATAATTATTCATCTCAAGGACTAGAAATTCATCACTACGGTCAAACTTATGTATTAACTACAAAAAAAGATGCTGCTAATTATATTGAAAAACTCGTTCAACAAAAGTCAAATATGAAATTATCACAAGCTGCAATGGAAACGTTATCAATCGTTGCTTATAATCAACCTATTACACGTAGTGATATTGAATTAATACGAGGTATTAATTCAGATGGTGCTGTTAGAACATTAGTTGCTCGTGGTATGATTGAAGCTAAAGATGTTGAACATTCAAGAAGCCATCACTTGTATACAACTGAATTATTTTTAAATGTATTTGGATTAGAAACAATAGAAGATTTACCAACTACCGAAGAAGATGATGAAGAAATAGAAGATTTCTTTAGTCAATTAGTTAATCAAAAGGGAGAATGATTATGAGCAAAGAACTAGAGCGATTGCAAAAAAGAATTGCTAATAGTGGTTATACGTCTAGAAGAAAAGCTGAAACATTGATTACTGAAGGTAAAGTCAAAGTGAATGGAGAAGTTGTCACTGAACTTGGCACAAAAGTAAAACCATCAGATCAAGTTGAAGTAGAAGGAATCAAAATGGAACAAGAAGATAAAATATATATTCTGTTTCATAAACCAGCGCAAGTCATTACTAGTGTATCAGATGACCGTGGAAGAACAGTTGTGACTGACTATTTTAAAGACTTAGATACTAGAATATATCCTGTTGGTCGTTTAGATTACGATACATCCGGAGTATTACTACTAACAAATGATGGTGAGTTCACTAATCTTATGACCCATCCACGGTACCATATACCAAAAACATATGTTGCCAAACTCAAAGGTTACCTTATGCGCGAAGAAGTAAAAGCACTTGAAGCAGGAATAGAACTTGAAGATGGTTTAACTCAACCCGCTACTGTTAAAATTAAACGCCAAGATAAAGACAAAAATACAACGTTAGTTGAGATTACCATTAGTGAAGGACGAAATCGACAAGTACGTCGTATGTTTGAGCATTTTGGCCATAGCGTTAATAAATTAACACGTATACAATTCGGTTCACTAAATTTAAAAGGTCTTAACGCTGGAGAAGGACGCGTATTAACACCTCATGAAGTAAAAGTATTACGTCATCAAGCAGAAAACGGCAATTGGTAAGCGGTTACATGTAGTTTGCTGAAGTTAATTTTATGGTTATAAAATCATGCTAATTTTTTCACAATCAAATTTGAAATTAGAGATTTAACAATTACCATATGCTATAATAAACAAGAAAATAGCATGTGTAGGAGGTATATGAATTAATGAGTAAGGAAATACTTATCGTAGATGATGAAGACAGAATTAGAAGATTACTCAAATTATACTTAGAGAGAGAATCTTTTAACATTCATGAGGCTAGTGACGGCAAAGAAGCCTATGAATTAGCCATGGACCACAATTATGCATGCATACTTTTAGACTTAATGCTTCCTGAAATGGATGGAATCGAGGTCGCATCAAAACTACGGGAGCATAAAGATACACCTATCATTATGCTTACTGCTAAAGGCGAAGAAACTAACCGAGTTGAAGGATTCGAATCAGGTGCTGATGATTATATTGTTAAACCATTCTCTCCACGTGAAGTGGTCTTAAGAGTGAAAGCGCTATTAAGACGTACACAATCAACAAGCGCCGAACAAAGCGAGCCTCATGCGAGAGATATCATAGAATTTAATCATTTACTTATTGATAATGATGCGCATCGTGTATTAGCTGATAATCAACAAGTTAACTTAACACCCAAAGAATATGAACTACTAATATATTTAGCTAAAACACCAAACAAAGTATTTGATAGAGAACAATTACTTAAAGAAGTTTGGCATTATGAATTTTATGGTGACTTAAGAACTGTTGATACCCATGTTAAACGCTTAAGAGAAAAACTTAATCGTGTTTCAGAAGATGCAGCACAAATGATTCAAACAGTATGGGGTGTTGGCTACAAATTTGAAGTTAGAGCTAGCGATGAGCCGACTAAATAGTGTTGTAATAAAACTGTGGTTAACTATTATCTTTATAGTAACGACAGTTTTAATTTTATTAAGTGCTGCATTAATAACTTTTATTCAATACTATTATACTGAGCAAACAGAAAAATCAATTCGTGATGATGCCAAAAGAATCAGTCATGTTGTTGAAACATCTAAAAATAAAAAGTTAGCTATTGAACATAGCCAAAAACTGATTAGTGGTTCTGGTGGCGTTATTATTATGAAAGACAAGTCAACACATCATAATGCTAAAGAGTCACAATTAAATAATCAAATGTTGGCTGAGATTAATCAAAATGAACACTTTTCTCCAGTGTTTAATAAAGGTCAATCTGCAACTCAAAATGTAACATTAAAACATAATGACCATTCTCGTTCTTATATCTTACTGGGTTATCCTATGAAAGCTCAAAAGGGAAGTCACAGTCATTATAGTGGCGTCTTTATTTATCAGGATTTAAAATCCATAGAAGATACCAATAACGCTATTACGATTATTATTCTGATAACTGCAATTATTTTCCTAGGTATTTCAACTGTCTTCGCCTTTTTCCTATCTAATAGAATTACTAAACCACTTAGAAAGCTTAGAAATCAGGCTAAAAGTGTTTCTAAAGGGGATTATTCTCAAATTTCATCTGTAACAACTAAAGATGAAATTGGTGAACTATCTCGCGCATTAAACGACATGAGTTTCGAAATTCAGGAAAATGTTCAAGCACTATCAACCTCAAAAAATATTCGTGATAGTTTAATTAATTCAATGGCTGAAGGTGTTGTAGGTATCAATGATCATCGCGACATTATATTATCAAATAAAATGGCAGATGAAATTTTACCAACTATTGATCAATCTATGTATGAACGAATTGAAGACCAAATCGAAGATACTTTTACAAGTAAAGGCACAGAATTTCGAGAATACGATTTTGACACACGCTATTATGTCTTCATTATGAGTTACATTCCTCAGATTCAAGAAGATGGTCGCAGTGGAATTGTCGTTATTATTCGTGATATGACTAATGAGTATAACTTAGATCAAATGAAAAAAGATTTCATTGCTAATGTTTCTCATGAATTGCGTACACCTATTTCATTATTACAAGGATATACAGAATCAATTGTTGACGGTATCGTTACAGAACCAGAAGAAATTAAAGAGTCATTATCAATTGTCTTAGATGAAACAAATAGGCTCAATCGTTTAGTTAATGAATTACTCAATGTTGCAAGAATGAATGCTGAAGGGTTATCTGTTAATAAAGAGATACAACCTATTGCACCATTATTAAACAAAATACAAACAAAGTATAGACAACAAGCTAGTGATTTATCATTAAATATGTACTTAACTCCAGAAACTAATGACGCATTGTGGTACTACGATTCTGATCGAATCGATCAAGTGCTCACAAATCTTATTGATAATGCTACAAGATATACTCAACCTGGTGATACAATTTCTATTACTAGCGAAGATACTGATAAGTACAATGTGCTTCACATAAATGATACAGGCAGTGGTATTGCTCCTGAACATTTAAATCTTGTTTTTGATCGCTTTTACAAGGTTGAAGCATCCAGAACACGTGGCAAACAAGGAACCGGCTTAGGATTATTCATTTGTAAAATGATTATAGAAGAACATGGAGGTACGATTACTGTATCAAGTGTCGTTGGAGAGGGAACAACATTTACAATCAAGTTACCGAAGCCTTAATCTTCAGGCTTATTTATAAAATTTATCAAAGATAATATCACTGAATTCAGACAGGGACATAAACCCGCAAATAATAGCACAAAGATGATTTAAAATTAAAAATCGTCTTTGTGCTTTTTTATATTCAATACTTTGTATGATCGACTCGCATGCTTAGGAGACTACTTCAGCTTGCTTTGTTAGAAAAAACTGGTTTAGTCAGTTTTTTCTGTGCTGGACTTTGACTTAATATAAAAATAAGGACGAAGGCTATTTAAGCAGAGACGTTTATGAGCCGACCTGACCTTATATATAGTTAATATCAGTTAAAACATATTGAGATTAACTATGCACGATATATTGGCAGTAGTTGACTGAATTGAAAATATCCTTATACCAAGCTTTTTCCATCCTA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP041724|1613090:1621786|1619101_1619350_-|WP_002449743.1|DBSCAN-SWA MAKYTIVDMDTCIACGACGAAAPDIYDYDDEGIAFVILDDNQGTAEVPEELYEDMEDALEGCPTDSIKIEEEPFDGDALKFE >NZ_CP041724|1613090:1621786|1620406_1621786_+|WP_002459069.1|DBSCAN-SWA MLEDKLKSWFGFDNFKAGQKEIIKSVLDSNHTLGILPTGSGKSLCYQMATYELQQSTLIISPLISLMDDQVAQLKMSGEQSVAYIHSGMDDNEKNWNMKRLAKSRFIFLSPEFILQPQNFKLISTIDFGLIVLDEAHCISEWGYDFRPHYALISKITNYYKNATILALTATAPPHLEQDLNQLLNVSFHVIKTHMNRPNISFQHINFRNDQEKMNWLMHYIEQSGPTIIYVSSKKMCVELAKTIYKHGYLTGIYHGDLSYQERQTVQQQFINNDIPVIVATSAFGMGVNKKDIRTVIHFHLSTSPSSYLQEIGRAGRDQQPSQAISLFQPDDRYLLETILFADMILPYDIDCYELGANIEPLKQDILEILHSHFTYAQLKQIFQIAQERKQLALNRMLSYSQLDQCRRKYLLEFFGEVPDIPSICCDHDTDIKPLKIYNRKKVKRQMSYEDKLKNLFLS >NZ_CP041724|1613090:1621786|1614350_1615091_+|WP_070648510.1|DBSCAN-SWA MSKELERLQKRIANSGYTSRRKAETLITEGKVKVNGEVVTELGTKVKPSDQVEVEGIKMEQEDKIYILFHKPAQVITSVSDDRGRTVVTDYFKDLDTRIYPVGRLDYDTSGVLLLTNDGEFTNLMTHPRYHIPKTYVAKLKGYLMREEVKALEAGIELEDGLTQPATVKIKRQDKDKNTTLVEITISEGRNRQVRRMFEHFGHSVNKLTRIQFGSLNLKGLNAGEGRVLTPHEVKVLRHQAENGNW >NZ_CP041724|1613090:1621786|1613814_1614348_+|WP_070648508.1|DBSCAN-SWA MDKQAILEALLYTAGDEGIDTKQLLEILDITKPQLIELIDNYSSQGLEIHHYGQTYVLTTKKDAANYIEKLVQQKSNMKLSQAAMETLSIVAYNQPITRSDIELIRGINSDGAVRTLVARGMIEAKDVEHSRSHHLYTTELFLNVFGLETIEDLPTTEEDDEEIEDFFSQLVNQKGE >NZ_CP041724|1613090:1621786|1615237_1615963_+|WP_002459064.1|DBSCAN-SWA MSKEILIVDDEDRIRRLLKLYLERESFNIHEASDGKEAYELAMDHNYACILLDLMLPEMDGIEVASKLREHKDTPIIMLTAKGEETNRVEGFESGADDYIVKPFSPREVVLRVKALLRRTQSTSAEQSEPHARDIIEFNHLLIDNDAHRVLADNQQVNLTPKEYELLIYLAKTPNKVFDREQLLKEVWHYEFYGDLRTVDTHVKRLREKLNRVSEDAAQMIQTVWGVGYKFEVRASDEPTK >NZ_CP041724|1613090:1621786|1619460_1620420_+|WP_037544342.1|DBSCAN-SWA MKDIILYSKQHSFTYKTNKSIFNLLTGKKTHQTFFDACSQQLLSLYHSLPNLKYPSFERFMAQNVNNGMTIKVHPRYTYDSLVHTFNCIQLLIQTLSNTQQNVYSFIPISQHGLIQRKVKQIYYYIKKEDKDSAFITELNQLFKALYTNNNNYCCLHYYLQGYEEPMYTRQQISLIESIPEQHLFNLEMNELVTLMYELEIEYRYPILSQCIIKPSLLHKTHITQQQLKQRFSMTQIAQKQHVKLNTIEDHILELFIKGYITHYFDFISEDGFHQFNEFYNKHRGERLKAYKQAFPNLSYFEIKLMIVGIERGELIARG >NZ_CP041724|1613090:1621786|1615946_1617695_+|WP_150868066.1|DBSCAN-SWA MSRLNSVVIKLWLTIIFIVTTVLILLSAALITFIQYYYTEQTEKSIRDDAKRISHVVETSKNKKLAIEHSQKLISGSGGVIIMKDKSTHHNAKESQLNNQMLAEINQNEHFSPVFNKGQSATQNVTLKHNDHSRSYILLGYPMKAQKGSHSHYSGVFIYQDLKSIEDTNNAITIIILITAIIFLGISTVFAFFLSNRITKPLRKLRNQAKSVSKGDYSQISSVTTKDEIGELSRALNDMSFEIQENVQALSTSKNIRDSLINSMAEGVVGINDHRDIILSNKMADEILPTIDQSMYERIEDQIEDTFTSKGTEFREYDFDTRYYVFIMSYIPQIQEDGRSGIVVIIRDMTNEYNLDQMKKDFIANVSHELRTPISLLQGYTESIVDGIVTEPEEIKESLSIVLDETNRLNRLVNELLNVARMNAEGLSVNKEIQPIAPLLNKIQTKYRQQASDLSLNMYLTPETNDALWYYDSDRIDQVLTNLIDNATRYTQPGDTISITSEDTDKYNVLHINDTGSGIAPEHLNLVFDRFYKVEASRTRGKQGTGLGLFICKMIIEEHGGTITVSSVVGEGTTFTIKLPKP >NZ_CP041724|1613090:1621786|1613090_1613822_+|WP_002459061.1|DBSCAN-SWA MYEVKLDAFSGPLDLLLHLIQKYEIDVYDIPMKTLTEQYMQYVHTMKRLEINIASEYLVMASELLMIKSKLLLPQSDDHVEFEEDPREDLVGRLIEYQNYKEYTEILDSMKAERDLYFTKHPTDLSHLETNESWDKSNTIDLTELIVAYQRVKNRVEYHTPKTVEISKETFTIEEATEIVTTRLRTQTAFNFFSLFTFHEPIEQVVTHFLAILEMSKAGIINISQKQNFDDIDIVRGVNYQVG |
8 | uncultured_Mediterranean_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2026191 : 2034661
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP041724|2026191:2034661|DBSCAN-SWA CTTATTTAATAACCTTAGCTATAACACTAGGATAAAGTTCATATTCTAATTGTTTGACACGTTCTTCCAAATTTTCTTTGGTATCATCCGGTTTGATCTCGCATTGTTTTTGTTCAATAATTTCTCCCGTATCCATGCCACTATCGACATAATGAACTGTTGATCCTGTAACATTATCACCACTATTAAAAGCCTGACCAATAGCATCTTTCCCCTTATATTTTGGCAATAATGATGGATGAATATTTAAAATCTTACCTTCGTATGCGTCTAACAAATCAGGACCAATTAGCCTCATATAACCTGCGAGAATAATCCATTCAACTTCTTCACGCTCTAGTATACGAATCAAATGGTGTTCATAGGCAGATTTTGAGTCAAAATCTTTTGGTTCGTTGATATTAACTGCTACCTTTAACTGTTTTGCGCGTTCAATACAATACGCATCGTGATGATCAGTATAAAGTGAAGTAATTTCTATATTGTTGAGTTCTCCTTTATCCACTTTTAAAACAATATTTTCGAAATTACTGCCCGATCCAGAGGCAAAAATAGCTACCTTAGTCACTATTCTACCCCCTTGAGATAAATAGGCACATGTGCATCTTCTATAACATTGCCTATGTGATAAGCAGGGACATCGTGTTTTTTTAGGACATCTAGTGCTTTAGCAATGTCATCTTGACTAACGATGACCGTATACCCTATTCCCATATTAAAAATGTTATACATTTCATCCGTAGAAATTTGTCCTTGTTGTTGTAACCAGTCAAAAATAGGAGGTGTTGGGAATGTATTCACATCAATTTGCGCAGCTAAACCATCAGGTAACACTCTAGGAATATTTTCATAAAATCCACCACCAGTGATATGATTCATCCCCATGATTGTTACTTTATCTTTTAAATCAAGTATCGGTTTCACATAGAGTCGCGTAGGTGTTAAGAATGTATCTAAATATGTTTGACCATTGAAGTCATCGTATAAATCAATGTCAGTCTGTTTAATTAATTTACGTACTAAGCTATAACCATTTGAATGTATCCCACTAGAAGCTAAACCAATAATTGCATGACCTGCTTTTATATTTGAGCCATCAATGTATTCTGCTTTTTCAACAGCACCGACAGCAAAGCCAGCTAAGTCATACTCACCTTCATGATACATTTCTCCCATCTCCGCGGTTTCACCACCAATCAGTGCGGTATTTGTTTGTTGACATCCTTCGCTGACTCCTTTTACAATCTGCTCAATAACTTCTGGAACAACTTTATTTGCCGCAATATAATCTAAAAAATATAATGGTTCTGCTCCAGTTGTAAGAATGTCATTCACACACATGGCTACGGCATCAATTCCAATGGTGTCATGTCTGTCATAATCGATAGCTAACTTTAACTTTGTTCCTACACCGTCTGTACCTGACACAAGCATAGGCGCTGTCATCTGCAATTGTGATAAGTCAAATGTCGCACCAAAACCACCTAAGCCACCTAAGACTTCTTTTCGTAGTGTTCGCTTTACATGTGCTGACATTCTTTCTACTGCTTCATATCCTGCTTCTATATCTACTCCAGATTGTTCATAAGCTTTAGACATTTTTATTTCCCTCTCGATCATAATAGTGTTGGTGATTCTCGATATATGCTTTTTGTCGTGGGCTCAAGTGCTTAAAATAATTTTCTTCATAATCATACAAACCAGCTGGATAATCACCTGTAAAACTTTCTAAACATAGACCACTATATGGCGCATCATAGTCTAAGCCAATAGCTTCTATTAAACCATCAACGCTTAAATAGGCTAATGAGTCGGCACCTATATGGTCACAAATTTCTTCAGGTGATTTACTCGCTGAAATCAACTCAGCAGTAGTTGAAACATCAATACCATAAAAGCTTGGAAACATAAATTCTGGTGATGCGATCCTTACATGTACTTCTTTAGCACCGGAATCTTTGAGCATTTTGACTATACGTTTAATAGTTGTGCCACGTACAATTGAGTCATCGACTAAAATAATTTTTTTACCTTCTACAATGTCTTTGACAGCTGATAGTTTGACACGTACCCCTTGTTCTCTCAATTCTTGAGTTGGTTGGATGAACGTTCTAGCGACATATTGATTTTTAACTAATCCCATTTCATAAGGCAGCTGGCTTTCTTCAGCATAGCCACTAGCTGCTGATAATGATGAATTAGGTACACCAATAACCATATCTGCTTCTACAGGATTTTCTTGAGCTAATTTCTTTCCAGAAGCTTTACGAACTGCATGCACATTCTTACCAGCTATTGTAGAGTCTGGACGCGCAAAATAAATATATTCCATTGCTGAAATCGCAGTACTTGTGTGTTTTGTATATGATTTTATTTTTATACCTTCGTCATTGATAACGACATATTCTCCTGCGTGAACATCTTGGATAAATTCTCCACCTAAAACATCAATAGCGCATGTTTCACTTGCTAATATATAAGTTCCATCTTGCATTTTACCGACCGCTAATGGTCTAATGGCATTAGGATCAACTGCACCATATAAAGCATCCTTCGTCAAAATCGTAAAGGTAAAACCACCTTTAATTTGGCGTAGACTTTCTTTTAGTGCTTCTTCAAATGTTGGTGCTTTACTTCTACGAATTAAATGCATAATCACTTCAGTATCTGAAGACGAATGAAATATTGCCCCATGCTTTTCTAAGTATTGTCGTAATGATTGTGCGTTGATCAAATTTCCGTTATGACATACTGCAACGCTCATATCATAAAAATGATAGAGAAATGGTTGAATATTCTCGATACCTTTATTGCCTGATGTTGCATAACGTACATGACCTATAGCGTTACGACCTGTTTTTAATTGTTCCATTTGCACTTCTTTGATTGCTTCAGTTAACAGCCCTACACCACGTTCACCTTTTAATGTGTTACCATCTGTGACAACAATTCCAGCGCCTTCTTGACCGCGATGTTGTAAACTATGCAATCCCATATATGTCAATTGAGCTGCCTCTGCATGGTTCCAAATTCCAAATACGCCACACTCTTCGTTTAATCCACTGTAGTTAAACATTGCGCAATAGCTCCTTCCCATTGTGCTTTTATATCAGAAGCTCTCTTAGAAATTGATGTATGAGCAGCTGCAACATTAAATTCATCCGTATCTGTAAGTTGACCTATTTCAATTGCATGCTCAATATTTAATTCTTGTCCTGCTTTAACAGCAATCACATAACGTCCTTGCGTTTCACTGAATAACTGTGCATCTGAAAGATTTACTTTAGCTTTTAATCCAAGACTATAATGCGCACTGATTCTAGCGAGAGTAATTAACAATCCACCTTTGCCAACAGTCTGTACGTGTGAAGCCACACCATTTCTAATTGCCTTTTTAACGGCTTCACCCTTTGTCACTTCATCGCTTAAATCAATCGCTTCAAATTCATGATTCACTTTGCCGTATAACAATTTTTCAATTTGACTGCCACCGAAATCATCCCTAGTATCTCCAACTAAGTACAATTTATGTCCTGCTTGAGGATGGAAATCATTTAAATATTCGATATTTTCAATTAGCCCTACCATACCAACAACTGGTGTTGGAAAAATAGATGTACCACGTGTTTCGTTATAAAGCGAAACATTACCAGATACTACTGGTGTTTTTAAAATTTCACATGCTTCTGACATCCCTTTTGTTGAATCTATTAATTGTTGATAGATTTCTTTTTTCTCAGGAGAACCATAATTTAAGCAATCTGTCATTGCAAGTGGCGTGGCACCAACAGCAATTAAATTGCGATAGGCTTCTGCCACTACCATTTTTCCACCTTCATATGGTTGATTAAAGACATAACGTGCTTCGCCATCAATGGTAGAAGCAATCGCTTTTTGGGTACCTTCAACACGAACAACTGAAGCCTGTAAACCTGGTTTAATGATTGTATTGGCACCCACTTGTTGATCATATTGTTCATATAAATAATGTTTTGATGCAATTGTTGGATGTGTGAGTAACTGGTCAAATACCTCTTGAACATTGATAGAATTATAATCATTTTTAGAAGTATTATATGCCTTTTCTTCGCCTTCAAGCACATAAACAGGTGCTTCATCAGCTAGTGATTGCACTGGAATATCTGCAAATACTTCATCCTCATATTTAAGTATAAAACGGTCTGTATTTGTTACTTCACCAATAACAGCACTATCTAATTCATGTTTATCAAATAAATCTAAGAATTTTTGTTCCGTACCCTTTTCAACAACAAGTAACATTCTTTCTTGTGTTTCAGAAAGCATCATTTCATAAGGAGATATGCCAGGTTCTCTAGTCGGCACTTGGTCTAAATTTAATATTAAGCCACTGCCACCTTTAGCTGCCATTTCAGACGATGACGATGTTAATCCGGCTGCTCCCATATCTTGAATACCTACGAGCTCTTTGTATGTAATTGCTTCTAGGGTAGCTTCCATTAATTTCTTACCTACAAAAGGGTCGCCAATTTGAACTGAAGGACGTTTACTTTCACTTTCTTCCGTCAATTCTTCAGACGCAAACGTTGCACCATGAATACCATCACGACCTGTTTTCAAACCAACATATATAACTGAATTTCCTTCGCCTTTAGCCGTCCCTTTTTGAATCATATCATGGTCAATAATACCTACACACATCGCATTAACTAATGGATTGCCATCATAACGATCATCAAATTCAATTTCACCTGCAGTAGTAGGAATACCGATACAGTTACCATAGCCACCTATACCGCGAACGACCCCTTTTAGTAGTCGTTGATTTTGTTTCACTGATAATTCACCAAAACGCAAACTGTTTAATAAATTAATAGGTCGTGCACCTATTGACACAATGTCACGAATAATCCCACCTACGCCAGTTGCTGCACCTTGATATGGTTCAATTGCTGAAGGGTGATTATGTGATTCAACTTTAAAAACGACCGCTTGGTTATCACCAATATCAACTACACCAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP041724|2026191:2034661|2031426_2032098_-|WP_150868082.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMYNAAIKTGAEAEYVDYRETSLEGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPVIDEVKRLASEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNETLKIVNNQTPFTNLYENNDLVVYPVAHGEGHYYCTDDIYEELVTNNQIILTYQDNPNGSYKDIAGIVNKEGNVCGMMPHPERALETILGTDSGVKLFEAMVSSWREQHV >NZ_CP041724|2026191:2034661|2032099_2032360_-|WP_002459451.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQALNRAVHDLGYTQVNDIRVGKVLYMSVDEATDEAVDNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKIVDEKENA >NZ_CP041724|2026191:2034661|2026757_2027789_-|WP_070647954.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVDIEAGYEAVERMSAHVKRTLRKEVLGGLGGFGATFDLSQLQMTAPMLVSGTDGVGTKLKLAIDYDRHDTIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIAANKVVPEVIEQIVKGVSEGCQQTNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDLAGFAVGAVEKAEYIDGSNIKAGHAIIGLASSGIHSNGYSLVRKLIKQTDIDLYDDFNGQTYLDTFLTPTRLYVKPILDLKDKVTIMGMNHITGGGFYENIPRVLPDGLAAQIDVNTFPTPPIFDWLQQQGQISTDEMYNIFNMGIGYTVIVSQDDIAKALDVLKKHDVPAYHIGNVIEDAHVPIYLKGVE >NZ_CP041724|2026191:2034661|2032359_2033064_-|WP_002478381.1|DBSCAN-SWA MALLYEGKAKRVFSTEVENQLRVEYKDEVTAGNGAKKDTMKGKGRLNNQITSIIFDYLSHKGIESHFIKQLSETEQLVKEVKIIPLEVVVRNVAAGSITKRLGLDKGYQFNEPLVEFFYKNDDLNDPLITDDHVKLLNIANDEEIQTLKQMAKDINHVLIQLMDEMDLQLVDFKIEFGKTQDGKILLADEISPDTCRIWDKDSGTNFDKDVYRNETGSLIDTYQTFLNKLEEVK >NZ_CP041724|2026191:2034661|2033064_2034192_-|WP_002478382.1|DBSCAN-SWA MSFNKLKFGDTIGIIGGGQLGKMMTQSAQKMGFKVICLDPNTDCPCHHIANEFITAAYDDTQALQELGEKSDVITYEFENISAQQLKTLSEQFNIPQGYQAIELLQDRLTEKQTLERAGAHIVPFLSINNIDDLYNAIEELGYPFIIKTRFGGYDGKGQILVKDHTAIEEAKQLIAQQECVAEQYLDIEREVSLTVTIGNQKQTTYFPLQENEHRNQILFKTIVPARSDKEQLARIEVNKIIDTVHFVGTFTVEFFIDKQNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAITGQTLPQTIELLKPAVMMNLLGRDLDLLEDDFGQHPEWHVHIYGKAERKPDRKMGHMTILTDDVNATEATMLKQFEGREL >NZ_CP041724|2026191:2034661|2026191_2026758_-|WP_037545988.1|DBSCAN-SWA MTKVAIFASGSGSNFENIVLKVDKGELNNIEITSLYTDHHDAYCIERAKQLKVAVNINEPKDFDSKSAYEHHLIRILEREEVEWIILAGYMRLIGPDLLDAYEGKILNIHPSLLPKYKGKDAIGQAFNSGDNVTGSTVHYVDSGMDTGEIIEQKQCEIKPDDTKENLEERVKQLEYELYPSVIAKVIK >NZ_CP041724|2026191:2034661|2034178_2034661_-|WP_002478383.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCAMLEEFGIPFDKKVVSAHRTPKLMYDFANQARANDYDIIIAGAGGAAHLPGMVASMTTLPVIGVPIESKSLKGLDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGKSGAKNAGILAARILSISHKSVLEKLENYEKTLVKKVGDMQHELQ >NZ_CP041724|2026191:2034661|2027781_2029266_-|WP_002459448.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHAEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVTDGNTLKGERGVGLLTEAIKEVQMEQLKTGRNAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVAVCHNGNLINAQSLRQYLEKHGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRQIKGGFTFTILTKDALYGAVDPNAIRPLAVGKMQDGTYILASETCAIDVLGGEFIQDVHAGEYVVINDEGIKIKSYTKHTSTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQENPVEADMVIGVPNSSLSAASGYAEESQLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVEGKKIILVDDSIVRGTTIKRIVKMLKDSGAKEVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEICDHIGADSLAYLSVDGLIEAIGLDYDAPYSGLCLESFTGDYPAGLYDYEENYFKHLSPRQKAYIENHQHYYDREGNKNV >NZ_CP041724|2026191:2034661|2029244_2031434_-|WP_070647953.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSIEEIKVEKLYQDMGLSDAEYTKVCDVLGREPNFTEVGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTTGERILMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELSVKQNQRLLKGVVRGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDDRYDGNPLVNAMCVGIIDHDMIQKGTAKGEGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITYKELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLILNLDQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTNTDRFILKYEDEVFADIPVQSLADEAPVYVLEGEEKAYNTSKNDYNSINVQEVFDQLLTHPTIASKHYLYEQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTQKAIASTIDGEARYVFNQPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMSEACEILKTPVVSGNVSLYNETRGTSIFPTPVVGMVGLIENIEYLNDFHPQAGHKLYLVGDTRDDFGGSQIEKLLYGKVNHEFEAIDLSDEVTKGEAVKKAIRNGVASHVQTVGKGGLLITLARISAHYSLGLKAKVNLSDAQLFSETQGRYVIAVKAGQELNIEHAIEIGQLTDTDEFNVAAAHTSISKRASDIKAQWEGAIAQCLTTVD |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2313975 : 2331772
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP041724|2313975:2331772|DBSCAN-SWA 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15 | uncultured_Caudovirales_phage(58.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2346294 : 2352915
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP041724|2346294:2352915|DBSCAN-SWA TTTATAGCATCTCCAAAATTTTAGCTTTATCACGAAATTCTTGCACTTCATTTTCAGGATCAGAATCAATAGTAATACCCGCGCCGACACCGTATATCGCTTTATTATCACGATATTCAATTGTGCGAATAGGCACATTAAAAATCATCTTGTCATCTGGCATCAATATGCCAAGCGTACCACAGTAAATATAACGCGGTTGGTCTTCTAATTTGTGAATATATGACATCGTGTTTAATTTAGGTGCACCTGTTATGGAACCACAAGGAAATAGCGCATGAAATAACGTTGCTAATGGTAATGTTGCATTTGAGAGTTGACCTGCAACCATACTTGTCATTTGATATACAGTGGCATAAGTTTCAATAAAAAACGGACGATACACATGTACCGTACCTTTTCGTGCAATTCTAGCAATATCATTTCTCAATAAATCAACAATCATGACATTTTCTGCTCTATCCTTTAATGATTGTTGTAAATATTTATAATTATATTGATCTTGCTGTTTGACATCTGACCTTGGCATGGTGCCTTTCATAGGCTTACTCACAACTACATTATCTTGACCATCAAATGGCCCTTTCTGAAAGAATAATTCGGGTGAAATAGAAGCGACTTGTACGTCTTCAGTATCCATTAACATGGTGTAATTGCCATTTTTAGTTTGCGTTAATTTATCATACAGGTCTTTAATTGGCATTTGTACTGGCGAACTCACTCTTGTTGTATAGTTTACCTGGTAAGTTTCGCCATCAATAATTGCTGCTTGTACTGCTTTGATATGTTGAATCATAGTTGCCTCTTTTACTTGAAAGGCAAACTGGTGTTGTGGCTTATTATTATAATGCTTTATTGACGTCTCTTGTTGTATGGGCTGTGCCGATTGATAACTATAAGCTGCTGCTAATATTGCATCGTCTGCAGTTGGATGCACAGCCATGTCAGGATTAAAGTATTGTGCCGCTTCATACGTCATATAAAGCGCCACATATTTCCCTTCTTTCTGCTGTTGTTCTGCAAAATTGATAACGTCTCCCACATCTTTCATCTCATATGCTAGATATTGCCCTAACCTTTCTGTGAGTTTAAGTTGGTGCGTTTCGTAGCGTGAATCGTCTAAATAATATCTATAATTAAATTGTATTGTCACACTGATTCACCCCCAAAGTTTTAATAAACAGCTCAATTTGTGCATGACCATGTTCACTGAGAATTGATTCAGGATGATATTGCACCGCATAAATAGGCCATTGTCGATGCTGAACTGCCATAATAATACCTTCATCATTTTCAGCACTAATTTCAAGTTGTGCCGGCAGTGATTGACGCTCTGCAATCAAAGAATGGTAACGCATCACTTCAAAATGTTGTGGCAGTTGAGCAAAAATCCCTTTATTATTATGATTAAGCTTTGTTGTGTGGCCGTGTACAGGTCGTTTACCATGAATAATACGGCCCCCAAAATAATCGTAAATGCATTGAAATCCTAAGCAAACACCTAATATGGGAATACGCTTTTTAAATGCTGCAATAATCTGTGCGATTATCGGATAATCACTAGGCTTACCCGGGCCTGGGGAAATAACTAGCGCTGACGGATTAAGCTGTTGTAATGATTGTATTGTGACTTGATTGATACGATAAACAATGATTTCTATATCAGTAACTGTTTTAAAATAATCTATCAAGTTATATGTAAATGAGTCGTTATTATCTATGACTAATATCATTTTATGCTTACCTTCTTTAGTTTCATTCGTAAAAATTACCACTTTATTATAATATATATGTAAGGGGTTACGTTTCTATTATCCCAAAATATTTCTTGATTTTACATAGTTTCTGTATTATTCTAGCTAGCGTATTCAAAATAAATAATCAGAGGTTCCTAGCCGAAACCCTCTATAAAAAACTAGACACCGAATGTTTCAATCAATATTTAAAGTAACTTATCATCATATGCATTTACTTATTCTGTGGTCTATCTTTTTTATAGAGATAGCTTTTTTTATGTCTAAAAATAGGTTGCATTACCCTCAACGCACTTAAATTGGAGAGATGGACAATGACTGAAACAACTTTAAACAATAACAAAGCCATAGTCGTATTTAGCGGTGGTCAAGATAGTACTACATGCTTATTTTATGCTAAAAAGCACTTTGACGAAGTCGAACTTGTTACGTTCAATTATGGACAGCGTCATAATACTGAAATTGAAGTAGCCAAAAGCATAGCGCATGAACAAGGACTAGCACATCACATTCTTGATATGTCGCTATTATCACAATTAACGCCAAACGCATTAACGCAACACGATATGAAAATCGAAACCAACGATGACGGTATGCCTAATACATTCGTACCTGCACGTAATCTATTGTTTTTATCATTTGCAGGTGCCCTTGCTTACCAACTCAACGCCAAACATATTATCACTGGTGTATGTGAAACAGATTTCTCTGGCTACCCAGATTGCAGAGATAACTTTATTAAATCAATGAATGTGACACTAAGTTTAGCTATGGATAAAGATTTTGTTATTCATACACCTCTCATGTGGCTAAACAAAGCTCAAACATGGGCGCTAAGTGATGAACTTGGTGTCTTAGACTATATCCGTCATCAAACATTAACATGCTATAACGGCATCATTGGTGATGGCTGCGGAGAATGTCCAGCTTGTCACTTAAGAGCACGTGGTTTACAACAATATCTTAATTCTAAAGGAGCGAAATAATATGTTACAACAAATTTACCCGTCTGTCTCACATCCTTACCAATTCGAACTCAATAAAGACTTTAATTTTTCTGCAGCACATTTTATACCATGTAAAGATGCTGGAAAATGCGTACGCACTCATGGACATACGTATTTCGTAAATTTAACAATTGCGGGTGACACGCTTGATCATAATGGTTTCCTTATCAATTTCCAAGAGTTAAAAGCATTGATTCACGATCAATTTGATCATTATTTATTGAATGATTTGCCACACTTTAAAGATCAAAGTCCCTCTACTGAAATTGTGGCACAGACAATATATAACATGATTGAAAATCATCTGATGCAATATACAAATCGTCCACATTGTGTTCAAGTCTACTTAAGAGAAACACCAACAAGTTATGTTGTTTATCGTCCGAAGGTGCAACATTAATGGCTGCTAAAATACCTGTATTAGAAATTTTTGGCCCCACAATTCAAGGTGAAGGCCGTGTCATTGGACGTAAAACGATGTTTGTTCGAACTGCTGGATGTGATTATCGCTGTAGTTGGTGCGATTCCGCATTTACCTGGGATGGCAGTGCAAAAGATCAAATTCAATTAATGAGCGCAACAGAAATTTATGAAAAATTAATTGAAATTGGTGGCGATTGTTTTGATCATGTAACGATATCAGGAGGTAATCCTGCATTAATTAAAGGTATACAAGATCTTGTCGATTTATTTGAAACTGAGCATATCGCAACTGCTTTAGAAACACAAGGTAGTAAATTCCAACCTTGGATGACACAGATTAATGATTTGACGATAAGTCCTAAACCACCTAGCTCTTCAATGACACCTAATTTAGAAGTTTTAGATCAAGTCATTGCACAATGTGTGCCACAATCCTTAAATTTGAAAGTGGTTGTTTTTGATGATGAAGATTATGCTTTTGCCAAAATGATTCATCATCGTTATCCAGACATACCTTTCTATTTGCAAGTAGGCAACCCATACTTAGCAGATGACGTAGCAAATCACACTGAAAAACTATTGTCACGATATGAACAATTGGTTGAAAAAGTAATGCATAGCAATGATATGAATCGCGCTTATGTCTTACCACAACTTCATACATTATTATGGAGCAACAAAAAAGGTGTTTAAATTTATCGCTATAAAATGTTTTGTAAGTGTTATGAAATGATTAAGTTGTGTTAAATTGCTATAATATGGCAATGAAGTATTTGCGATAGGAGTTCATCATGATTATATACGTACTATTAAACATTGCTGTAGTTTTGGCTATCGTTGGGTTTGATTTATATAGGCAGCAATATAAACAACTTAAATTTAGTTCTCTACTATTAGCGATTGTCATTAACACAACAATAAATATGTTTATTATTCAAAAGTATAATTTTATTTCAACTTATACCACTGCATTACTAATCATATGGTTATTACTGCAACTGTATGTTAATTATAAGGTACATCCTTTTGTAATTAATAACCAAAAATTTCTTGCCAGCATATTTGCGATTATTTTAAGCTTATCAGCATTTATTATGGATATTTCGAGCGACCAATCTGTCTATATGTCCATTCCTTATCTGTCACCAGCTATTTTTCTAATTGGGGCAATCATTTTATTTACGGGTACATTTAAATCAACCGAACGCAATCGCTTGCCATTATTCAAACGAATACAAGCCCCTATCATGATAGGAACAATTATTATTGCATTATCATTTGTTGTTATGATGATGTTAACACCATTCTGGTACATATTTTTAGGAATCTATGTATTATTTATAGCATTTATTATTTGGCAAAAAGTATTTCAACATTATTAAAATAACCGGAACACACTTGTCGGCGTGTTTCGGTTATTTATTATATATGCTCTTTTTCTTTATCTTTCACGGTATGCTCATGGTTTATATTACATTGATATGCATTGGGACTATGACCATTTTCATAGGTTAAATTCGAAGCTTGTACAATGTACTTAGGTCTTTGCTTCACTTCATAATAAATCCGTCCGATATATTCTCCGACAACACCTATAGAGATAAGCTGAATACCACCAAGTAACAAAATAGCAGCTATCGTCGTGAAATAACCTGGATTACTAATGCCATTTACGATAATGCCTATAGACAAATAAATAATATAGATAAGGCTAATTGCAAAAATAAATAATCCAAAATAAATCATTGTCCGTAATGGCTTACTATTAAATGAAATTAAACCATCAATACCATAATTAAATAACTTTCTAAAATTCCACTTTGATTGTCCCGCTTCACGTTCTACATTTTTATATGAAAAGACTTTTGTATTATAACCAATCCAAGCAAATAATCCTTTTGAAAAACGATTGTTCTCTTGCAACTTAGCAATTGCACACACAGCTCGTTGACTCAACAATCTAAAATCTCCTACCCCATCGACAAACTGGACATCTTCAACAAATGCATTAATCAATTTATAATACATCTTTGTCACTATTTTACGTGATAGCTGTTCGCCTTCTCTATCACGTTGGGCAATGACTTGATCATAACCCTCTAGATAACCATCAATCATATTGGGTATAAATTCAGGAGGATGCTGTAAATCACCATCTATCATAATGACAGCGTCTACATCAACACTATGGTGAAAACCTGCAATCATCGCTGATTCTTTACCAAAATTCCTACTAAATGAAATAAACTTTACGTGTTTATCTTCTAACGACAATTGCTGTATGTGTTGAATCGTACTATCTTTGCTACCATCATCAATAAATAATAAATCATAGTCATAATTTTTTTCGTTACTGTCTTTCAACATAATTTCAGTCAATCGCTCATATGTTTTTAATACGACTTCTCCTTCGTTATAACAGGGGACAATGACTCTGATTTTCATCCGATTACTTCCTTTACTTATTTCTTAATACTATTTTATCAATTTATTCATAAAACGCGCTAGTATCGTTCTTTAATTTTACAAAAAATTAATAAAGTTGCAAGCGAACTAGTTTTTAAAGCTATTTTATTTTTTTAAGTAGGCTTATCATTTGTACTATTTTAAATCGCCAATGCTAACATCATCAGGATCTTTCCCTTGTCTTGCATTGCGATTCAAACTATCAATTTCTGCAATTTCAGCTAATTCCAAATTAAAATTAAATAAATCGAAATTTTCTTTAATTCGTGAAGGTGTCTGAGACTTAGGTATAATGATACGATTATGTGCTAAGTGCCAACGCAACACGATTTGAGCCGGTGTCTTGTCGTGTTGTTGGGCAATATGTTGAATTGTTGAATCATCTAATAATCCGCGATTGCGCATTAATGGCATCCATGCCGTTACAGTAATATCGTGTTTATCGCAAAAGTCTTGAACATCCTGTTGATTAAAGTAAGGATGCAATTCAATTTGGTTAATTTGTGGAACGATATTGGTTTCTTGCATTAATTTTTCCAAGTGATGAATTTTAAAATTACATACGCCAATCGCTTTTACTTTACCTTCATGATATAAATCCTCTAGTGCTTTATATGTTTCAATATATCGTCCATTCTGTTCACATGGCCAATGAATCAAGAATAAATCAAAATAATCAAGACCCATGTTATCTAAAGAACGTTGGAAATAGGCTTTCGTCTGTTCATAACCTTGATGATCATTCCATACCTTAGACGTGATAAACAATTCTTCACGTGGCACACCACTGTTCTTTAAAGCCTGTCCTAATGATGCCTCATTGCCATAAAAATATGCAGTATCAAATGCACGATAGCCGGTTTCTATAGCTTGTTGAATGACTTTCGGCATATCTTCATCAGTGATTTTATAAACACCAAAACCTACTTTGGGCATAGGATAGCCATTATTTAATAATTGCGTATCATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP041724|2346294:2352915|2348361_2349033_+|WP_002459764.1|DBSCAN-SWA MTETTLNNNKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFDEVELVTFNYGQRHNTEIEVAKSIAHEQGLAHHILDMSLLSQLTPNALTQHDMKIETNDDGMPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQLNAKHIITGVCETDFSGYPDCRDNFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAQTWALSDELGVLDYIRHQTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRARGLQQYLNSKGAK >NZ_CP041724|2346294:2352915|2352078_2352915_-|WP_002479368.1|DBSCAN-SWA MNDTQLLNNGYPMPKVGFGVYKITDEDMPKVIQQAIETGYRAFDTAYFYGNEASLGQALKNSGVPREELFITSKVWNDHQGYEQTKAYFQRSLDNMGLDYFDLFLIHWPCEQNGRYIETYKALEDLYHEGKVKAIGVCNFKIHHLEKLMQETNIVPQINQIELHPYFNQQDVQDFCDKHDITVTAWMPLMRNRGLLDDSTIQHIAQQHDKTPAQIVLRWHLAHNRIIIPKSQTPSRIKENFDLFNFNLELAEIAEIDSLNRNARQGKDPDDVSIGDLK >NZ_CP041724|2346294:2352915|2349034_2349454_+|WP_002459765.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSVSHPYQFELNKDFNFSAAHFIPCKDAGKCVRTHGHTYFVNLTIAGDTLDHNGFLINFQELKALIHDQFDHYLLNDLPHFKDQSPSTEIVAQTIYNMIENHLMQYTNRPHCVQVYLRETPTSYVVYRPKVQH >NZ_CP041724|2346294:2352915|2347429_2348026_-|WP_002479366.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYFKTVTDIEIIVYRINQVTIQSLQQLNPSALVISPGPGKPSDYPIIAQIIAAFKKRIPILGVCLGFQCIYDYFGGRIIHGKRPVHGHTTKLNHNNKGIFAQLPQHFEVMRYHSLIAERQSLPAQLEISAENDEGIIMAVQHRQWPIYAVQYHPESILSEHGHAQIELFIKTLGVNQCDNTI >NZ_CP041724|2346294:2352915|2349453_2350170_+|WP_002459766.1|DBSCAN-SWA MAAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKDQIQLMSATEIYEKLIEIGGDCFDHVTISGGNPALIKGIQDLVDLFETEHIATALETQGSKFQPWMTQINDLTISPKPPSSSMTPNLEVLDQVIAQCVPQSLNLKVVVFDDEDYAFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLADDVANHTEKLLSRYEQLVEKVMHSNDMNRAYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_CP041724|2346294:2352915|2350899_2351922_-|WP_070647844.1|DBSCAN-SWA MKIRVIVPCYNEGEVVLKTYERLTEIMLKDSNEKNYDYDLLFIDDGSKDSTIQHIQQLSLEDKHVKFISFSRNFGKESAMIAGFHHSVDVDAVIMIDGDLQHPPEFIPNMIDGYLEGYDQVIAQRDREGEQLSRKIVTKMYYKLINAFVEDVQFVDGVGDFRLLSQRAVCAIAKLQENNRFSKGLFAWIGYNTKVFSYKNVEREAGQSKWNFRKLFNYGIDGLISFNSKPLRTMIYFGLFIFAISLIYIIYLSIGIIVNGISNPGYFTTIAAILLLGGIQLISIGVVGEYIGRIYYEVKQRPKYIVQASNLTYENGHSPNAYQCNINHEHTVKDKEKEHI >NZ_CP041724|2346294:2352915|2346294_2347446_-|WP_002459762.1|DBSCAN-SWA MTIQFNYRYYLDDSRYETHQLKLTERLGQYLAYEMKDVGDVINFAEQQQKEGKYVALYMTYEAAQYFNPDMAVHPTADDAILAAAYSYQSAQPIQQETSIKHYNNKPQHQFAFQVKEATMIQHIKAVQAAIIDGETYQVNYTTRVSSPVQMPIKDLYDKLTQTKNGNYTMLMDTEDVQVASISPELFFQKGPFDGQDNVVVSKPMKGTMPRSDVKQQDQYNYKYLQQSLKDRAENVMIVDLLRNDIARIARKGTVHVYRPFFIETYATVYQMTSMVAGQLSNATLPLATLFHALFPCGSITGAPKLNTMSYIHKLEDQPRYIYCGTLGILMPDDKMIFNVPIRTIEYRDNKAIYGVGAGITIDSDPENEVQEFRDKAKILEML >NZ_CP041724|2346294:2352915|2350268_2350859_+|WP_002459767.1|DBSCAN-SWA MIIYVLLNIAVVLAIVGFDLYRQQYKQLKFSSLLLAIVINTTINMFIIQKYNFISTYTTALLIIWLLLQLYVNYKVHPFVINNQKFLASIFAIILSLSAFIMDISSDQSVYMSIPYLSPAIFLIGAIILFTGTFKSTERNRLPLFKRIQAPIMIGTIIIALSFVVMMMLTPFWYIFLGIYVLFIAFIIWQKVFQHY |
8 | Pandoravirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2447163 : 2537995
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP041724|2447163:2537995|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP041724|2447163:2537995|2481969_2482389_-|WP_150868101.1|DBSCAN-SWA MIVIQKHDIKKLEDYIKNIEEYRKEFLMRGYELMENHEPENVGAGKSNLPGNPIERETVKKLSDNRYVMLRNVVKGVDKLIFEADEEDTKDLIRLRYWECPIGCYEWEDIANYFGISKTSVLRRRDAMISRLAEFIGYV |
93 | Staphylococcus_phage(57.14%) | holin,terminase,tRNA,head,tail,portal,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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