Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP043908 | Thermodesulfobacterium sp. TA1 chromosome, complete genome | 4 crisprs | cas3,Cas9_archaeal,csa3,cas2,cas1,cas4,cas8b10,cas11b,cas7,cas5,cas6,DEDDh,cas10,csm2gr11,csm3gr7,csm4gr5,csm5gr7,csx1 | 0 | 18 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP043908_1 | 104249-106035 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP043908_1
|
23 spacers
spacers of NZ_CP043908_1
>1.1|104284|42|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT ACAAGTAAATCATAAATTACTGCAGCTGGATTACTTCCATAA >1.2|104361|44|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT CTTTCGTGACCGCGTAAATTTAATTTTTTTTCAAAAGTCAAAAA >1.3|104440|40|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAATAAATTGTTTTTAATTATGATATACCATGCTTTCATT >1.4|104515|40|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGCCTTCTGTATCTCTTAACAATTTTGCGATTTCTTTAG >1.5|104590|39|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGTAAATGTACGGATTATTTATACTTCGAATTACTTCG >1.6|104664|41|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCCTTTCAATGGGAGAAATCTTTCAAAACTTATAAATAATG >1.7|104740|40|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTTTCTCGTTCGGTTCGTAGTTTTTCTTCGATTTCTTT >1.8|104815|39|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT TGCAGCGGGTGACCGCAATAACTACCACCTGGTACATCA >1.9|104889|46|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACTTGCTAAATAAAAACTCTCTTTTGATATTAAAGTCTTCATATAA >1.10|104970|41|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTCTCAATCAACTCCCCACGGTTGTCGTCTAACTTAGTCCA >1.11|105046|39|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTCGAAAACGGTGTTTGTAAGTGTTAAGGCATCTTTTTT >1.12|105120|42|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAGAAAATCTTTCATTTTTTGTGATTTTTCGGTACCTCTTAA >1.13|105197|43|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAATACACCTCCCCGCAAATTTCTACTTCGAAAAATAAACCTT >1.14|105275|41|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAATTATTTCTTTGATTACGATCCATCCTTCTTTCTCATCT >1.15|105351|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAGGGGCATCCCCTTCTTTGCACCACCCCATTCTGAAT >1.16|105424|42|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTCTTTTAAAAGCTCTTTTAAAACCATACCTCTACCCCCT >1.17|105501|41|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTTCTATGATATAATTCAAAGTTGTTAGTCCTGTTTTTT >1.18|105577|39|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGTATTTTTGCGACCTCCTGCTGGTTCAACTTTTTTGT >1.19|105651|39|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CATTAAAAATATTTCTATGATTATAAACGTATTCTTTAG >1.20|105725|39|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTACCTTGCAAAAGACTATTATTACTTTATCACTAAGA >1.21|105799|41|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATATTTCTTCTGAAATTTCTATTTCATTTACTTTTATTTT >1.22|105875|42|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTCTTTTAAAAGCTCTTTTAAAACCATACCTCTACCCCCT >1.23|105952|49|NZ_CP043908|CRT GGTGGCTCCGCCTGATCTTCCAAAATTTAAGCACGTTTTAATGGGGTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP043908_1
The CRISPR arrays of NZ_CP043908_1 >merge|NZ_CP043908|1|104249-106035|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR,PILER-CR GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACACAAGTAAATCATAAATTACTGCAGCTGGATTACTTCCATAAGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACCTTTCGTGACCGCGTAAATTTAATTTTTTTTCAAAAGTCAAAAAGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACAAATAAATTGTTTTTAATTATGATATACCATGCTTTCATTGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACTTGCCTTCTGTATCTCTTAACAATTTTGCGATTTCTTTAGGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACTTGTAAATGTACGGATTATTTATACTTCGAATTACTTCGGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACTCCTTTCAATGGGAGAAATCTTTCAAAACTTATAAATAATGGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACATTTTTCTCGTTCGGTTCGTAGTTTTTCTTCGATTTCTTTGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACTGCAGCGGGTGACCGCAATAACTACCACCTGGTACATCAGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACACTTGCTAAATAAAAACTCTCTTTTGATATTAAAGTCTTCATATAAGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACCTCTCAATCAACTCCCCACGGTTGTCGTCTAACTTAGTCCAGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACTTCGAAAACGGTGTTTGTAAGTGTTAAGGCATCTTTTTTGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACGAGAAAATCTTTCATTTTTTGTGATTTTTCGGTACCTCTTAAGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACAAATACACCTCCCCGCAAATTTCTACTTCGAAAAATAAACCTTGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACAAATTATTTCTTTGATTACGATCCATCCTTCTTTCTCATCTGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACCAGGGGCATCCCCTTCTTTGCACCACCCCATTCTGAATGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACATTTCTTTTAAAAGCTCTTTTAAAACCATACCTCTACCCCCTGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACTTTTTCTATGATATAATTCAAAGTTGTTAGTCCTGTTTTTTGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACAAGTATTTTTGCGACCTCCTGCTGGTTCAACTTTTTTGTGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACCATTAAAAATATTTCTATGATTATAAACGTATTCTTTAGGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACTCTACCTTGCAAAAGACTATTATTACTTTATCACTAAGAGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACAATATTTCTTCTGAAATTTCTATTTCATTTACTTTTATTTTGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACATTTCTTTTAAAAGCTCTTTTAAAACCATACCTCTACCCCCTGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACGGTGGCTCCGCCTGATCTTCCAAAATTTAAGCACGTTTTAATGGGGTTTCTTGAAACCTTTTAAAAGTAGTTTTAGTTTATTCT >NZ_CP043908|1|1|104249-105951|CRISPRCasFinder GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC ACAAGTAAATCATAAATTACTGCAGCTGGATTACTTCCATAA GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC CTTTCGTGACCGCGTAAATTTAATTTTTTTTCAAAAGTCAAAAA GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC AAATAAATTGTTTTTAATTATGATATACCATGCTTTCATT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC TTGCCTTCTGTATCTCTTAACAATTTTGCGATTTCTTTAG GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC TTGTAAATGTACGGATTATTTATACTTCGAATTACTTCG GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC TCCTTTCAATGGGAGAAATCTTTCAAAACTTATAAATAATG GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC ATTTTTCTCGTTCGGTTCGTAGTTTTTCTTCGATTTCTTT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC TGCAGCGGGTGACCGCAATAACTACCACCTGGTACATCA GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC ACTTGCTAAATAAAAACTCTCTTTTGATATTAAAGTCTTCATATAA GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC CTCTCAATCAACTCCCCACGGTTGTCGTCTAACTTAGTCCA GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC TTCGAAAACGGTGTTTGTAAGTGTTAAGGCATCTTTTTT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC GAGAAAATCTTTCATTTTTTGTGATTTTTCGGTACCTCTTAA GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC AAATACACCTCCCCGCAAATTTCTACTTCGAAAAATAAACCTT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC AAATTATTTCTTTGATTACGATCCATCCTTCTTTCTCATCT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC CAGGGGCATCCCCTTCTTTGCACCACCCCATTCTGAAT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC ATTTCTTTTAAAAGCTCTTTTAAAACCATACCTCTACCCCCT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC TTTTTCTATGATATAATTCAAAGTTGTTAGTCCTGTTTTTT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC AAGTATTTTTGCGACCTCCTGCTGGTTCAACTTTTTTGT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC CATTAAAAATATTTCTATGATTATAAACGTATTCTTTAG GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC TCTACCTTGCAAAAGACTATTATTACTTTATCACTAAGA GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC AATATTTCTTCTGAAATTTCTATTTCATTTACTTTTATTTT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC ATTTCTTTTAAAAGCTCTTTTAAAACCATACCTCTACCCCCT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC >NZ_CP043908|1|1|104249-106035|CRT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC ACAAGTAAATCATAAATTACTGCAGCTGGATTACTTCCATAA GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC 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GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC CAGGGGCATCCCCTTCTTTGCACCACCCCATTCTGAAT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC ATTTCTTTTAAAAGCTCTTTTAAAACCATACCTCTACCCCCT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC TTTTTCTATGATATAATTCAAAGTTGTTAGTCCTGTTTTTT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC AAGTATTTTTGCGACCTCCTGCTGGTTCAACTTTTTTGT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC CATTAAAAATATTTCTATGATTATAAACGTATTCTTTAG GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC TCTACCTTGCAAAAGACTATTATTACTTTATCACTAAGA GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC AATATTTCTTCTGAAATTTCTATTTCATTTACTTTTATTTT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC ATTTCTTTTAAAAGCTCTTTTAAAACCATACCTCTACCCCCT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC GGTGGCTCCGCCTGATCTTCCAAAATTTAAGCACGTTTTAATGGGGTTT CTTGAAACCTTTTAAAAGTAGTTTTAGTTTATTCT >NZ_CP043908|1|1|104405-104814|PILER-CR GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC AAATAAATTGTTTTTAATTATGATATACCATGCTTTCATT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC TTGCCTTCTGTATCTCTTAACAATTTTGCGATTTCTTTAG GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC 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GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC AAGTATTTTTGCGACCTCCTGCTGGTTCAACTTTTTTGT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC CATTAAAAATATTTCTATGATTATAAACGTATTCTTTAG GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC TCTACCTTGCAAAAGACTATTATTACTTTATCACTAAGA GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC AATATTTCTTCTGAAATTTCTATTTCATTTACTTTTATTTT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC ATTTCTTTTAAAAGCTCTTTTAAAACCATACCTCTACCCCCT >NZ_CP043908|1|2|104854-105951|PILER-CR AAATAAATTGTTTTTAATTATGATATACCATGCTTTCATT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC TTGCCTTCTGTATCTCTTAACAATTTTGCGATTTCTTTAG GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC TTGTAAATGTACGGATTATTTATACTTCGAATTACTTCG GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC TCCTTTCAATGGGAGAAATCTTTCAAAACTTATAAATAATG GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC ATTTTTCTCGTTCGGTTCGTAGTTTTTCTTCGATTTCTTT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACTGCAGCGGGTGACCGCAATAACTACCACCTGGTACATCAGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC ACTTGCTAAATAAAAACTCTCTTTTGATATTAAAGTCTTCATATAA GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC CTCTCAATCAACTCCCCACGGTTGTCGTCTAACTTAGTCCA GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC TTCGAAAACGGTGTTTGTAAGTGTTAAGGCATCTTTTTT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC GAGAAAATCTTTCATTTTTTGTGATTTTTCGGTACCTCTTAA GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC AAATACACCTCCCCGCAAATTTCTACTTCGAAAAATAAACCTT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC AAATTATTTCTTTGATTACGATCCATCCTTCTTTCTCATCT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC CAGGGGCATCCCCTTCTTTGCACCACCCCATTCTGAAT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC ATTTCTTTTAAAAGCTCTTTTAAAACCATACCTCTACCCCCT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC TTTTTCTATGATATAATTCAAAGTTGTTAGTCCTGTTTTTT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC AAGTATTTTTGCGACCTCCTGCTGGTTCAACTTTTTTGT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC CATTAAAAATATTTCTATGATTATAAACGTATTCTTTAG GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC TCTACCTTGCAAAAGACTATTATTACTTTATCACTAAGA GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC AATATTTCTTCTGAAATTTCTATTTCATTTACTTTTATTTT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC ATTTCTTTTAAAAGCTCTTTTAAAACCATACCTCTACCCCCT GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC
>NZ_CP043908.1|WP_150071160.1|102969_103410_-|hypothetical-protein MKKMWVFLCLVLTFFLTTNSKNLFAQEVIDVSKEINITGANKDLVYFPVPFIPVLKDLSYQGEQSALLKTGKVITGMLVFKGNYKANSLLEFYKVQMKNNGWEEVGSFTSKITFIAYKRPEGQAFISVSERYFSTELRIVVILNQN >NZ_CP043908.1|WP_168194222.1|101729_102941_-|bifunctional-phosphopantothenoylcysteine-decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine-ligase-CoaBC MFANGFKGKNVLVGLTGGIAIYKVCELIRKFKNSGANVKVILSKGAEKFVTPLLFASLSGQKAYTEEDFFKPTGEILHIELANFPDVVVIAPATASFIAKLASGQADELLLSTLLATKAPVYIFPAMNTNMWEHPATQRNIEILKTWGYRIYEPASGILACDTTGKGRLPEVEEIFETLQAHFVKKTLLNHKVLITGGPTKEYIDEVRCITNDSSGKMAFLLAKEAYYRGAEVYLIWGGKDLPGVFPRINEFLGIPYPKVFPVSTTKEMLEVAKRIFPKCRLAIFAAAPCDFRPKTAFKGKLKKQEVLTLDLELTEDIAKTLSSQKKPDQITIGFALENPENLEKYALTKKQEKNFDLIVANPISTLSAEISDFIVFTPKDKLYFNQVSKDYLAKVLFDLVGV >NZ_CP043908.1|WP_150071158.1|100698_101769_+|heme-b-synthase MKKEFKPRLIAWELTRSCNLDCVHCRAAASQGPYSNELTTEEVFRILEEIKEVAEPIIILTGGEPLLREDLFLIAKKAIDLGFKPVLATNGTLITEEIAQKIKETGISRVSISLDGSTPESHDGFRKVPGAFEGAIKGIENLKKFGVPFQINTTITPWNLEELSKVHELAKTLGAVAHHIFLLVPVGRGKDLAIDTISPEKYEELLGWFYEQRDKCNLQLKATCAPTYYRILRQKAKKEGKEVTVENFGLDAMTRGCLAGTGFCFISHVGIVQTCGYLEVPCGNLREQTFKEVWENSEVFNNLRDFSKYKGKCGRCEYIRVCGGCRARAYEATGDYLEEEPLCPYTPTKSNKTLAK >NZ_CP043908.1|WP_150071157.1|99515_100685_+|metallophosphoesterase MFWFLLFFFCFFGLIHLYIYFTKVKPIVKKANLRKFSFLVFVWLVVSPVFIRWADRFLEPIFSKWIAFVVLIWIGFVFYLFFFCVVFDLIRLIFRWKSLTSKKVLLGALALALGFSVYSYYETLGLEVIRLQVKTDKLPSHIEQVKIMQVSDLHLGPLLGKEKIELVKKVWEREKPDLILETGDLVDGNMRKKDYLAEELAKITAPLGKYAIMGNHEYYRGWREASEFIERSGFKLLKDQVEVVGGFLVIAGLDDKDCRYAKACTTDFDEIAFLSKLPRDKFVLVLKHQPLVKKETLGYFDLMLSGHTHGGLYRPIGSFLVRFLYETDRGLKYLGKGSYLFVSKGVGTGGPPMRFLTPPDVVIIELINLKKEKQPKSTAVMLREIYQIL >NZ_CP043908.1|WP_150071156.1|98472_99498_+|phosphate-ABC-transporter-substrate-binding-protein-PstS MKLKTLVLILILVLGLFGCKGGNEKASKFINGAGASFPYILYANWANEYYKLTGIKVNYQSIGSGGGIKQIIEKTVDFGATDKPLTPKEVEDNKLLQFPTVIGGVVPVVNLPELKDKSLVLDGKTLCYIFLGKIKKFNDQEIKKLNPDINLPDKEILVVYRADGSGTTAIFTYYLSQVCAEWKKEVGTGTSVSWKTGVGAKGNEGVSNYVKKTPYTIGYIEYAYAVQNKLSMVSLKNAQGVVVSPSEESFKEAARAADLDPKKHFYVWLTNTPGEKAWPITGVTYILLSKEKGEVNKEVVKFFEWAFKQGDEIAKKLTYVPLPEEVKTKIYKYWEENGVKP >NZ_CP043908.1|WP_168194221.1|97508_98468_+|orotate-phosphoribosyltransferase MEKRSFTRIPIPVDVEFLVGTESYPAKIKDISYGGVFLESKFCPEPNQEVVLVLFLSPEVKIFIKGIVVRKEEGKGFGIKFTYISPESFEHLKNLIYYNFPSEERAFKELRRFLGKANPLVQTVSEICRQAKRETLLNFILERAFLYSPEKPFVLASGKESPYYLDCRKVTLYSKSFELVGCVFWQEIRFLGVDGVAGMSIGADPIVCAILSKAQEEDYPLEGLLIRKEPKKYGTSKQIEGNFYPGMEVVLVEDVITTGGSLLKAIEVLEKEKIKIIKVMAFVDREEGGRERIEERGYEFTSIFTFSEIIKAYQKGAGR >NZ_CP043908.1|WP_150071154.1|97221_97509_+|ferrous-iron-transport-protein-A MLLIDAKCGDKVKIEDFLGEDAIIKKIEAMGLRKGDVFEVLRVWGRNFLLKNETSKVVISFDVAKNIMVELLGKVVNPECECKPCKKKKHRWGWF >NZ_CP043908.1|WP_150071153.1|96772_97207_+|transcriptional-repressor MLEEIRKFRSFIKSKGLKYTPEREKIFQEILEYTKHFDVEDVYLSLKNKGHKISKASVYRTIPLLIEGGYIQEVYRQNGRSFYEVTLKKKLHLHFICIKCKQVEEMIDERLEILLQKDMKRKGFLPLTYHLEIFGICQRCRQTG >NZ_CP043908.1|WP_150071152.1|95258_96491_-|molybdopterin-molybdotransferase-MoeA MLDKQYLTLKNALDLLLAKIPFKSLPSEEIPIEEAYFRIAAEDVFSPENLPGFKRSTVDGFAVRAQDTFGAKDTMPAYLTVKGEILMGAVPSFELNPGEAAYIPTGGMLPKGADAVVMVEHVNVVSSDLIEILKPVGPLENVILEDEDIKKGELVISAGTKLKPHHIGGLAGLGITKIKVTAKPKVGIILTGDEIIPHHEKVSPGKVRDINSFTLAGMILEEGGIPVKFGIVKDDYQAIKELVTKAYHQTDMVLITGGTSAGTKDVTAQVIDELGPPGVLFHGVSIKPGKPIIGGLCGNKPIFGLPGHPVAVYVCFSFLVKPVLQKMMGLASKNYTPFIKAKMAKSIQSQAGRTDFIRVYLEEKDGKLYAVPLISKSGLIMSLVKADGIVIISEDLLGIEKDEEVAVFLC >NZ_CP043908.1|WP_150071151.1|93770_95162_-|alginate-export-family-protein MRKNWVVFFLFFCFLVLSPVISLAVEHEFGGSLRFRYELWDNIVSLGYQEEIKNSNKDRNFFRLRAQVWDKITFNNSTSFYVRLATEPKYHMGPNYLILKDAQEKRHFDQDEIFIDNLYLDLKKPLGLPVNLRIGRQDFLGKDMYGEGFLILEGTPNDGSRSFYFNALKATLLFNPNHTVDIVLVSNPQRDVYLPVIHPSYDDGKDISYIQHKKRLTGSNERGFWVYGRHKLSEKLNVEPYYIYKKEEKSQVISHASYIHTIGMRAVYKLGAYTLRGEIAKQWGEYSNEVDRSGLGGYAFLTRKFEKCPVKPEVEIGYVYLSGDDPKTQKNEGFNPLFSRAPIWNELIFYTYIYETSSKGGPIPGYWTNLKAPMITLKFYPYKNTEFKISYQKLMADEKATSSPSGMFGNGKNRGDLLAFLLQHRFNQKLSGFLQYEILNPGDFYFDKSKSANFFRAQLFYQF >NZ_CP043908.1|WP_150071161.1|106251_106992_+|TSUP-family-transporter MESIIIIIGIFILAFVSGMIGLGVAFSAIPFLGLFMDDLVHQVQPLSLLLNGVTALLSALGFAKSGFIEWKKAIYLSIITTLSAPVGAVLAHYISQDIIWVIYFFSVLYLAYRLFKPIKAVKEDKTNFKLAAILAVPISVLSGLLGVGPGFLLMPTLIICGFDPKRAAGINAFAVCPPSFSALLPHISTAHWNFTLTIALITVGAVASYLGARATSLYVPSKRIKQIFATLIVIVTAYKITTLFFK >NZ_CP043908.1|WP_168194223.1|107662_107809_+|hypothetical-protein MKQQKLNLPFHSLEEILNLFHQEVNMLLKNFWKTLCLREEELVWDGVK >NZ_CP043908.1|WP_150072736.1|107851_107953_+|hypothetical-protein MILFERRRADLDLTEVVVNLYAVGVSTRKISQF >NZ_CP043908.1|WP_150072737.1|107958_108108_+|hypothetical-protein MYGSYYSSQSISRLIKVAEEEVKAWRGRPFSEKYFAIFLDGSYLFDEME >NZ_CP043908.1|WP_150071162.1|108310_108466_-|hypothetical-protein MFFEFPFEIKRFIYTTNQLEKLFEEVKRGLRVMEFLSDEENVEKILFLIFF >NZ_CP043908.1|WP_150071163.1|108711_110718_-|glycosyltransferase MSNISKIKVDERHLKFEAVWHDLEPGYYLIRGIFKSDKALCEGKIIIKSSKKELCWVLPIPRSGRINHIVNAGSSKIESLSIQIPITKNTVIHEKISIRKLNFLEKFAHFYRRILGIYFSKSPATKELRKVVKTSLLRALLNPEKAYYRISELRHRRICGAKSYEDWLKAYREDELLFWKKKRKLPKSPSILLVVIQNETEQLKKRTIESIKNQICKPEKVVFCTSENIEKILKKVKEDYVIFLEEGDVLSPSAIRTFKHFAFYKDYPDVIYADNDYFDENGNPRDPQFKPDWGPEYFFEYDYIQSPVAFKREILTDVKEFGSNYEIILQALKKKNLKIKHIPALLLTKTKTIENRYVQKLNKLKEYFGKKAEVLSSKGSNTFRILYKISEYPKVSIIIPTKNKPELIKNCIRSLLEKTIYPDFEIVVVDNGSTDKEVIDFYSELKNERRIKILSYDMPFNFSALVNFGLSKAEGDVVCLLNNDVEVVNDNWLDEMMRHATRKEVGIVGAKLLYPDGTIQHGGVIMGIWNGADHAFKGESDGIGYMYRLCTVQNYLAVTGACMMFRKNVFYEVGGFDEEFRVDFNDVDFCLKVYEKGYKVIWTPYAVLIHYESQSKAKVKDKKIAEKEIRLLKKRWKKYIERDPFYNPNLTIYNTNFDLSYLPQFLAL >NZ_CP043908.1|WP_150071164.1|110909_111179_+|AbrB/MazE/SpoVT-family-DNA-binding-domain-containing-protein MTKNLASSSVLTKKFQITLPKKIRQILEVKSGERIGFIVEGNEVKIVPLKSKLEENFGKVKALRKPENFKEIRNFVEKEMAKNVIEELK >NZ_CP043908.1|WP_150071165.1|111175_111580_+|PIN-domain-containing-protein MRKFLDTNIFPRYLTKDDEEKAYKVLDLLKKIEKGEEKVITSPLVIFELIFTLQKYYKLPKEEIKNLVLPLINLRGLKLPYKAVFEKTLEVFPNTNVSFADLFNYFFMLEHEVKEIYSYDEDFDELPEVKRLVP >NZ_CP043908.1|WP_150071166.1|111637_111988_+|hypothetical-protein MVASPMHNNQNYQKGGEATVKEKTKTLTKQPIERILNFFQQEVNNLIKNLLENLMLEERRIYLEEQEAYANGFYTRDLLFVSSYFLKEGGLKSISRLIKVTEDEVKELICLFGEMR >NZ_CP043908.1|WP_168194224.1|112045_112270_+|hypothetical-protein MDFGYLGLKGRGLAKEIKRRIKVIEVFPDEGSVERLLYLILKELNERLNSRKLRGFNEIELGNYHAFPGKFFTQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP043908_2 | 744408-744497 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP043908_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP043908_2
>2.1|744435|36|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder GGAAGCTCAAAAGAGGACTGAGGAGAGAGTAAATGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP043908_2
The CRISPR arrays of NZ_CP043908_2 >merge|NZ_CP043908|2|744408-744497|CRISPRCasFinder ATTAGCAGAAAAAGTAAATGAGTTAGCGGAAGCTCAAAAGAGGACTGAGGAGAGAGTAAATGGATTAGCAGAAAAAGTAAATGAGTTAGC >NZ_CP043908|2|2|744408-744497|CRISPRCasFinder ATTAGCAGAAAAAGTAAATGAGTTAGC GGAAGCTCAAAAGAGGACTGAGGAGAGAGTAAATGG ATTAGCAGAAAAAGTAAATGAGTTAGC
>NZ_CP043908.1|WP_150071787.1|742383_743520_+|chromate-efflux-transporter MKPIRIRDLFFSFLKLGLTAFGGPAMVAYIQDLAVDKKKWLDEKTFQEGVALAQAIPGATAMQVVAYVGFKTRGNIGGLVSFISFGLPAFLLMLFLSYVYTKTYNLPEVISIFAGLQAIVVAIVANAFLSFAKPVIKSVGKIIVAIFSFLLFLFKISPFLIIIACFLLSQIIFKDTPDHKFQNSKKFNFVGIFILILFIGLIFLYFLDKFLFKLSLIMMKIDLFAFGGGYASVPLMLHEIVDRLHWLDSKTFMDGIALGQITPGPIVITATFVGYLIRGFLGAIVATISVFIPSFIIMAFASEISEKIRNSKIFLRAKKGLLASFSGLLLFATFKFIILVEWNFLKLTIALGSFLALYKKINIFYVVLIGAIISSIIF >NZ_CP043908.1|WP_150071786.1|739542_742059_+|HAD-IC-family-P-type-ATPase MHQLTVDEALQRLSASVGGLSQDEVKRRLQFYGPNELKEEKENKLKVFIRQFTSPFILILICAGFLAFFLGDLKDAIVIFGLVLANGLIGFYQELKALASVEALRKLAQAKVRVLRDGREVEVDVRELVPGDVVLLGEGDVVPADLRLISATGLMVDEALLTGESIPAEKIAQVVLKEDTPIHARKNLVFKGTTVVKGKAIALVYATGENTEVGKIAKKMQEKSPESPLIKALGALGKRWVIILVFLLSVLVLIGIHQGREAKTIVFFAIAQLVSAVPEGFPIVVTITLVIGAIRLSRENVLAKYLPSVETLGSATFICSDKTGTITTGKLKVADYVTIDEEKFILACALCNDAELVDGEGKGDPLEVSLLEWLKDKEVDYRVLREEYPRVWEEPFDTKKRFMATAVIAKEGGIDFYIKGSFESLSKMCEGECPTEFFAIHDSLAKKGLRVLAFGYARLKDVPKNVDEIRFQILGLMGFLDPPKEGVKEAILQAKKAGIKVIMITGDNLLTARAVAEMVSLHSKNDLTIEGKDLAKYNDDELYEVLKRVSVVARAVPDDKYRIVKVLQSKKEIVVVTGDGVNDVPALKVADLGIAMGSGSQAAKDAAKMIITDNNLAIIVNAIKRGRLIAKNISKVIRYLFSTSVFEVLYNSLAIIMGLPLPLYATQILWINLVTDGAQDKAYPFTKYEGEPMKEKPKKPEKVFLGKEQMFKIVYNGLFMAFSHFFLFKYLVNIYPYEVALTISFTSAAVTQWAVGIQEIGEKPFFKNPVQYMQLNPYIYLGVLIGGLLQLMAIYAIPHYFHAVILGIRELLYVMFIPVLTFIAIEIRKWFFLRHDLK >NZ_CP043908.1|WP_150071785.1|737308_739267_+|hypothetical-protein MKKSLLFLSCLIFLGLVVQPLRVQSFQTLQKQTLQKVSQPVQLQWIAPKKAVLGHTDPIPSEAVKISKLNLELKPGETLEFYVPLQKGGTEVSVKFVPEKLTIQKPLLKKVPISDPKKVEEVLQTLVYEQNKETKTKDLSFILLLKNNLGVQKVFYPVEGLSSRYKFWLKVGSEFSGFTQAKGILKNESSHILKGTVYVSSTDHAKKMAYQLQKQQTEIEEAIENAKNPEMLWIVSQLLKRHIKGYPGGKSEFEESLAKNLSGLKVPQSLVVNVSETLTKYEHKLERRIVNREVLKIGETQPVKRETINKFLRLEKIDKKSSLEGLEGKVDRIPTDGPRIHIIYPNGDDTWEEGKTYNIRWESANYQQQVKLILKWQGGQYVIGNIPNTGSYLLTLPKLSNQKELPIWVGVFSIDEKIGDWSDKSLVVKKFGANEKYKIRLLGIMSHRCADDEGWERGCDGEEPYVLWTAFGPNYETYGRTDEGKGVEKGDSWLFSQDVNVYGGGSNKTQAIEVNSPLIFVYMVLEKDSGSPSRDEIVNATVGALSLAKAIYDKKWDEAIKNVGAVWDTIVIFQKIAAKSDDLYPPYLSYFDHQTLLQITTGNGNPPPLDRALVSSIGNYDHLSIRKADIYNDPINQRGLQWSVIYMVIREE >NZ_CP043908.1|WP_168194258.1|736858_737305_+|DUF3617-family-protein MKKLFLFFILFLGLWGTACSKKEVSKSSGIDLKEGKWEITVSMESSSYPGKLPNQVYTQCITKDEAIPIQGQAMSSSNQNCVYKQKEVKGNSISWIMECKEEGETIVNQGSMVYKGDQFDGRVIVKSKDTEFVQTMQGKWVGKCEDRR >NZ_CP043908.1|WP_150071783.1|734197_735997_-|aldehyde-ferredoxin-oxidoreductase-family-protein MYGYAGKILRIDLTNQEIKVEDLNTEWAKKYVGGRGLASKYLFEEIDPKVDPFSPENKLIVATGPLTGTSVPTGGRYMVITKSPLTGAIACSNSGGFFGAELKMAGYDMIILEGKAPKPVYIAIEDDKVEIKDASHLWGKLVYETTDFLKQEYGDKAKVLAIGPAGEKLVKIAAVMNDYDRAAGRSGVGAVMGSKNVKAIVAKGTKGVSVADEQKVKDVVASKIKIIRENPVTGEGLPAYGTAILVNIINEHGIFPVANFQKAYTPEADNISGETMAKTILTKKHACFRCPIACGRIVRLKDGKEVGGPEYETVWSYGADCEVYDLNAIAEANYWCNQYGLDTISTGATIAAAMELYQKGYIKDEEIAKDGLSLKFGDPEAIVGWTIKIGKREGLGDKLAEGSYRLCEAYGVAELSMSVKKLELPAYDPRGVQGHGLVYATANRGGCHVRGYLISAEILGIPQKLDRFSLENKAEWAKLFQDLTAVIDSLGMCLFTSFALGLKDYVDLINAVCGTDYTEETLLTAGERINNLERLFNLKAGIDPSQDTLPKRLLEEPIPEGPSKGAVHKLSELLPKYYEVRGWDEKGYPKEETLKRLEI >NZ_CP043908.1|WP_150071782.1|733074_734112_-|tungsten-cofactor-oxidoreductase-radical-SAM-maturase MSFEKLYLELTSKCNLTCKICYRQGWQETLQDLDFSLLEKIYQETKGLNLKEIVLGGIGEPLFYPYIKETLNLFSRFNLTLTTNGTLLKNELLEMVATKISKVVVSIDGSFKTYEKIRGYPLNEVLNNLKALNNIKQKLKSELPFLSVEFVLSKENQKELLKMVEICAEIKADQLIISQLVPQTEVNKNKILYKKYNNQKLKSLLEKVKLYALKKGLKLVIPKVELKTERFCPFIEEKALVVGADGKVYPCYRFSHSMVEYIFGRKKEVFKHSFGDLREKSLIEIFNTSSYQDFRYRIYANRYPSCIDCDLIDGCELVKTSECDCYALMPSCGDCLWSRGFAICP >NZ_CP043908.1|WP_150071781.1|732832_733054_-|MoaD/ThiS-family-protein MIKVKLFATLREGRKNEIDFEFFEGINGRYILNALNIPEKQVSIFLVNGRDKSLDEPLSDGDVIAIFPPVGGG >NZ_CP043908.1|WP_150072756.1|732142_732796_-|HesA/MoeB/ThiF-family-protein MLSLEEQKKLKDTKVLVAGCGGLGGYVVEMLARLGIGFITVVDDEVFEETNLNRQLFSDVNTIGKKKALVAKERILAVNPEVSVNPVLTKIEENNAKEILAGHEMVVDALDSIPHKILLERTCEDLKIPLIHGAIAGWYGQVTTVLPGDKTLSIIYKNRSNGIEKELGTPSFSPAVIAGIQVSEVVKISLKRGEILSKKLLYVDLLNQEYHKIELHF >NZ_CP043908.1|WP_150071780.1|731667_732117_-|transcriptional-repressor MRYGRWCWKKHGFKECGVRKTQAREALIELLSQTEGHLTAEEIFWKLKEVLPGIGLATVYRTLELLTQLGLVKKLDFQEGKARFEFIKPEERDHHHLICKNCGKIFNYTPSEEYQTLKELTEKIKKEFGFMVDTLEIQAYGLCKDCQKV >NZ_CP043908.1|WP_150071779.1|729432_731391_-|chemotaxis-protein MGMFSNLNKNLRLRWKLTIPLVLVLFIGITATVFVTSYSLYYINLYHAKTKSLPHYAKAVKESLVKDMVNPNYKDLRNYYLSSLGNVKVLRGPKVESQFGADKNVSLELSSVEKEAVLGGKEVFRKENHTLQGIYPIKAENRCLGCHKVNEGEVLGALVISLPYNEIFSLITKTQIVYGVFGFLGIIGGFLAVYFAYIISHKPLDQLALILQKMAEGDLTVKVPYSDFKDITGRVARSIQKLLNSFIELNEKSLSYSHRLAEATDKNFQYVDKTFESSKELTSQASQIAAAIEEMTATIGDIAKNANSVSDLASKNIEIAFEGQNISEEAGRVVLKANQETLALKQVINSLNQRAGEIGYIVQLIKDIADQTNLLALNATIEAARAGEHGKGFAVVADEIRKLADRTLKATQEIAEKISNIQQETHQAFTNMESTAKEVETALSSLEKVKQVLTQIVTSSQQVKDAISQIAAATEQQSVASEEISQNVEKVAKIASEVDHFVEQLGQSIYQLILISSDLRHTATSVVTQKLKEALFDIFIGDHERMFLRVKAHLKGWDKLNPELIANYQDCGIGKWYYGEEGAKFRNLPVFKEFEEIHKKCHLLSKETVLAYESGQFEKVKTLEKELEQNSQKIREFLNKMEEIYLSELKKG >NZ_CP043908.1|WP_150071788.1|745128_745962_+|zinc-ABC-transporter-solute-binding-protein MKVLKILCVLLIFIFLGNNKVLALNLVVSNSALEKIVKEIVSTKHQVITLQSENKDFHSFEPTPSQWNFIRRADLVIIVGTEHWAMKTYQIRANKPLLTLAQGQTRFKDPHLWFDLSRVKALVSNLVNFLETRDPFNRDFYHERLQLFLHNLVKLEEKAKSLRNCRYKEVYILGHPVFGYLLEPYGIKEKTLIKGHHKEGEPSVKLLTEILQNVEKRHPKVVFLTDPEFERYVSWFKNKGVEVIKLWSGGTYRFQGSFIELLDYNLSWFSYALGCGK >NZ_CP043908.1|WP_150071789.1|745980_748563_+|protein-translocase-subunit-SecD MSLKLKLKILFLLFLIGFAGLLLLPTFVPNLPPWFKKYVYRGELKLGLDLKGGVHLVLQPDMDKAMQNQFENYIQDIKAQLNKLVSSTYDVSIDRLSAVFKFKDQKDVVAFKEEVLKGFKEITIAKEYQEGSVFLVEVTLSKTQIDYIKENLLTQVLEVIRNRVDQFGVSEAVITKQGKDKIVVQLPGLRDPERAINIIGQTAQLEFRLVDEETMQRLDLEVLVRSLVESGKISLDAPIEEWRKVLSSYIPQDSQFYFVVEKDRETGKVIKKPIVLKKEVMLTGTYLKTAQVRINPQNNEPYVWIQFDSRGAKIFELITAENVGRRLAIVLDEVVRSAPVIKEKISGGEAQITGSFSMQEASDLALVLRAGALPAPVKILQNITIGPSLGADSIKKGIIAGLIGATAVIVFTSIYYKISGVIAVIALVLNVYFLLALLSAFQATLTLPGIAGIILSIGMGVDSNVLIFERIREELRTGRTEFSAIFQGYSRTFVTIFDAHVTVLITSLILFIFGTGPIRGFAVTLSISILVNLFTAIFVTKIFYEYLYEKGKEFKVKFFELIKNPNFNFMKFKKPFAILSLILSLIGCLGMVQAFLGKANLGIDFTGGTIIYLSSEKTPNLELLRKTLEENGIKDFMLQDIKKENMVLLKVKSSKESLTDEVNYILSVLNKNLPDYKFSVVAKEEIGSTISKELKHKAALAILGSLLGIIVYLAFRFNVYFGIAAGLATLHDVLVTFALFYLLGKEINLLFITALLTLAGYSLTDTVVIFDRIRENLQKYSFANFDQLINKSINDVFSRTIITVLTTLFGSLSLLLFGGVVIRDFALALTIGFIVGTYSSIFLASPLLQVLHKGKLPQFK >NZ_CP043908.1|WP_150071790.1|748555_749488_-|methionyl-tRNA-formyltransferase MRYRIVYFGSPEFAIHPLEGLYEKEKVLAVVTQPDKPQGRGLKTLPCAVKSWALGKGLYVLDPPKIKGNEEFLKALKDLSPELIVVCAYGKILPKEVLEVPKFGCWNIHASLLPKYRGASPINWAILEGEKETGITIMLMDEGLDTGPILLQKKIPINPEDNALTLSQKLSQLGKEAILEAIELHKKGLLKPTPQPDEGVSYAPLLKKEDGFFTFEDPAWLIERKVKAFIPWPTAYTYIQGKIFKVYQAKAQPSEKEIPGKILRINQEGLLVATSEGAILLIEVQPEGKKKMSGFEFACGRRFKPGDLLI >NZ_CP043908.1|WP_150071791.1|749651_750422_+|undecaprenyl-diphosphate-phosphatase MDLIHAAILGIVEGLTEFLPVSSTGHLILTAHILGIPHTNFTKTFEIAIQLGSILAILFLYFERFLKDFETWKRIILAFIPTGVLGFLLYKIIKKFFIGNDLLVVINLILGGVVLLFVDRLFQKGKKMEDVKEVSLKKAPLIGIFQALAMVPGVSRSAATIIGGMLVGLNRKAAAEFSFMLAFPTMFAATSYDLFKSYSEISFQDWQTLLVGFIFAFITALITVKTFLRFIAKHSFFVFGVYRILVGLIYFLVFLR >NZ_CP043908.1|WP_168194260.1|750464_751358_+|TIGR01777-family-protein MKKILVVGGTGFVGGYLVSELLNRGFKPTLLVRDLEKVKTRFSGCDFIVGDPVKEGSWQAEVPKFEVVINLTGQNIFGKWTEEYKRLILESRIKSTENIVNSLKEGSFLVNASAIGYYGDRGDVLVDETAPPGDDFLAKVCVEWEKKANAAKEKGCKVAITRFGIVLGKGGMIKKVLPVFKWGLGGTLGNGKQWFSWIHIQDLVAGLLFLIEIDLEGVFNFTSPQPVTNKEFTRALAEVLRKPAFFRVPKFMLKLVLGELAESILASIKAYPERLIKEGFTFNYPEIKNALKHIIQN >NZ_CP043908.1|WP_150071793.1|752650_753514_-|hypothetical-protein MFKFFKQENKKIDSSSFSSPYPKNVKKIAQKLWKFSYIKSLSNYVSNALIKALQLSQESGKYISYLVERFNFAINTLSEKILPIKNETDNLVKKSEESKKKINVMIEEVKVIESSLKSFVETSQKMQTSFQEIKNSLTEIHNIAEQTTILSLNASIEAARVGLAGKGFTVLAEEIRKLANKTNQFAKHINESILSVEKNINFFTNSIFTLKENLDKNIKTLNELYTFVESNYKMAENVEHLINDMFLAIEDQAKITEEITQNMLNLSKNLEITEKQLKSIVIQFKKI >NZ_CP043908.1|WP_168194323.1|753529_754285_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MIKGIVLYEDSDHKFIWLGWEEEEEEGLVQTNQYLIVNKGRGILLDPGGVYVFPRVLAAVANYIDIENIDYIFFSHQDPDVSSGIITWLENTNAKVYISKLWIRFIPHFGYNSLKRTIPLEDKGGELTLPSGDKLLFIPAHFLHSKGNFTVFDTRSKILFSGDIGAAVFPKGERYLFVENFENHVKLMEGFHKRYMGSNKVCKKWVNLVRPLNPTMITPQHGAIFKGDNVKKFLNWFETLTCGLDIIDQIY >NZ_CP043908.1|WP_150071795.1|754356_756072_-|HAMP-domain-containing-protein MKKFENLSIKGKLLILILFSLIGYVIFFLLQSFYLKEAILREKKLDLMNKGEIALSVVKNYYNLYQAGNLTEEEAKEKAKLTLKSLRYEEGINYFWINDGTLPYPIMIMHPTVPQLEGKPLSDSKFNVAYMRQTDLSAKEEKVNNQNLFTLLVETASKTGHAFVWYKWPKPLKQGGVTQEFYPKLSYVVKFEPWNWYIGTGIYIDDVDKAFTQAIKRNIIKTVVIIFGILFIVVLLAFLSVRSISNPISELEEKIRLFGQGNLNIQFKTQRKDEIGKIANSLDEAVNNLKAIIFSVKDVSENLSQLAVGLTNASNQFKDNLDLQTEKASQIASAAEEMSITVVDIAKNTTNILEESKKTAEIAKEGENYTLKTASEVKIIEKTTNKLKEVMYTLEERTKAIENVIEFIKDVAEQTNLLALNATIEAARAGEHGKSFAVVAGEIRKLAERTNKSTDEIANTIREIKGVVSEVKQEVEDIGKKVENGTKLSEDAAAILAKIADAAERLQEMIQSIASATEEMSVTSEAVAKDVGSVAEGVQELKKNISILLDTTEDIKKIEEELREKTSVFTL >NZ_CP043908.1|WP_150071796.1|756281_756653_+|NADPH-dependent-7-cyano-7-deazaguanine-reductase-QueF MEEKRYGELAIEQAKLEPWPNPYPDRDYTITITFPEFTCLCPRSGYPDFAVIKIEYVPNEKIIELRSLKLWLNKFRNRYISHEAATNEIFDALWKVLEPKKLKVVGDFHPRGNVHTVITVEKP >NZ_CP043908.1|WP_150071797.1|756716_758378_-|hypothetical-protein MRSTFKLLTLFFIILLVYKPGFGSLSPEIYEQIKKDFSPVLGLLIGIEDRELIIDKGLAQGVKNKDIFTVYKRGKKIVHPETQKTLGYLKEPVAKIEVVRVDEHFATAKVIYQKEPLTVPMPITRYADLKVLILAEHPNPTENLFLILKNNLPDCTIIFDPNLRFNQITPEYLLAEKFDLLFVEEENNIKVYNSKLDLIRYYGGLSYQRVSASTYSKPASPTKAESKPLGVLQPALIGKTKGEVVQAEFADMDNDGTPEMVYFNSQGLFIIKIKGGLLAQYKPSSGKIVNFSVGPAGWIALNVYDERVGMKSEVLQYTNQGLNPVITNINLILNFVDYTARGIKDTLLGQTFDPENFFGKEVFILKRENNQLIYATKLNLYEEYQNIGTVFVDFDLDGQPEILTYLADGRLGIYKNNQLQWTSPYAVVQHFYEVRLTKGKKGQEIVKKIVLPFVAPVVQNVGNKTTVFFASTSFPLETVKKDLKYLPLDSAVSQVFVLGFEGNFYYKNLTSEQRGFITGLGVYDNFIYFTVVKGKYPIDTETELYSAIVGNNP |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP043908_3 | 1434207-1441572 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NZ_CP043908_3
|
111 spacers
spacers of NZ_CP043908_3
>3.1|1434237|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTCTTTTTGCAGTTTATAAAACTTATACATTCCCT >3.2|1434303|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGGACGAAATTGTTATTTACGACGAAACTTTAAAC >3.3|1434369|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTCAGACGTCTTGTGCAGATATATCTTAATTTTCT >3.4|1434435|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGCCTCCCGCAAAATCGCCGCTAAAAATTCCTTTAA >3.5|1434501|35|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTACTTTTAAACACTTAAAAGCAAACATATTTCG >3.6|1434566|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTTGTGCTACTTTTTCTAAAGCTGGTCCCTTTC >3.7|1434632|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCAAGCATTGCTCTTGCAAGAACACTTCCCATTTTGC >3.8|1434699|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAGGACATAGCGGATGTAGAAGTTTATAGTCCAGA >3.9|1434765|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGACTTCAAGCTCTACAAGCTCGTCTCCTAAGAACT >3.10|1434831|35|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTAGAAAAGGCTGTAGAGGATTTCATTGCTTGGA >3.11|1434896|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGAAAATATTTTTCGTAAGTGTCCTCTTTGTGGA >3.12|1434962|35|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAAGGTTATTAATCAATCTTCAGACCTACGCAAG >3.13|1435027|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATCCTCCCCCGCATTGACGAAATAGAAGACGAGAA >3.14|1435093|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATGTATTGAATAGCCTTGTCAATTCTTTTCAGCAT >3.15|1435160|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACGAGTTTTCTGTCTTCTGTGCAAACTTTGCTTGT >3.16|1435226|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGGGATCTTTCATAGGGCTTGGTATTCACGCAAACT >3.17|1435292|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATAAGGTTTCAGCGGTATATGTCGCTGGATTTGAA >3.18|1435358|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAGAAATAGCTGGTGCGTCAATTCCTGAAAGAAGA >3.19|1435424|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCGGGATGGGATGGGATTTACGGACTTTGGAGAAGA >3.20|1435490|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGTAATAGAAATAGAAATTAGAAGAAATGAATAAA >3.21|1435556|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGTAGGTGAGGAATGGGAAGTATCCATTATTGATAA >3.22|1435623|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCGTATTTGTCAATGACTTTATAAACTTTTTCCTCA >3.23|1435690|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATAGACAGGCTCAGGGACATACTCAGATTTTTTCG >3.24|1435756|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAAATGTCTCACCAATAACCGCATCTGTTAAATCT >3.25|1435822|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTTTTGGTGAGCCGTTTGGGGTGGATGGCAGTTAT >3.26|1435889|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACCTGATAGTGATATAGAATTTTTTGATTTCTTAGC >3.27|1435956|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCCTTATATTAGTTATATTTCTACCCATTGAAGCTTC >3.28|1436023|35|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CACTAAGACATAATCTTCGTTGATTTCTCTTTCAA >3.29|1436088|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTGGTAATCTTTGCTTTAAAGCAAAGTGAATACCT >3.30|1436154|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTTTTTCTGCTCTTTTTATCTCTTCTTCGTTAAC >3.31|1436220|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTAGTTCTAATTGATTATTTTCAATAAATAGAGCT >3.32|1436286|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATCGATGCGGGGTATTTTTGAAGAGAAGAAGCTT >3.33|1436352|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAGGGCGGCGAGGTTTTAGATCGTCAACTATATGAA >3.34|1436418|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGGAGTAATTCCCGAGCTTCATCAACAGTAATTCT >3.35|1436484|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATACTTTCAAATAAACACCTCATATCATCATTATA >3.36|1436550|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTATTTGTCGAAGTCTTTGGCAAGCATGATGACCCCA >3.37|1436617|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTTTGGTTGTTTTGATATTAAATGTGTAAAATGTT >3.38|1436683|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGGTGTCCCAGGTGGCAGCTTTTGCTGCCACCCA >3.39|1436749|35|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAGAAAAAAGGAACTTATTTTCTGACAGGATAAG >3.40|1436814|35|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTCCTAACATACCGAAATTCAAGTGTCCGTTATG >3.41|1436879|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGGGGCTTTTTGCATATTGGCTTGTTTATTTATTA >3.42|1436945|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCCGTGTAAAGCCCCTTTATGAATTGTTTAGTAATT >3.43|1437011|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTTATAACCAAATACATTGATAGACTGCTAAATC >3.44|1437077|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGGTTGGCAGAGGGGCTATGAGCTTTGGAGAAAAT >3.45|1437143|35|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGTCGTTTTTGCAACAGATAATGAGACACATAG >3.46|1437208|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACGTCGATAATGGTATTTTTGATGATAACAAAAAT >3.47|1437274|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAAAATGAGGGGACACTTTCAGGAGAGAATGTCTC >3.48|1437340|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAGCCGGCGAAGGGATCTAAAATTATGTCATTAAGC >3.49|1437406|35|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGGTAGGTTTTCTTGCTCTTCTTTTTCTCTGAAGG >3.50|1437471|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACCCCGCAATGGAACGAGAAAATATTTATTATTCCG >3.51|1437538|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGATCTTTATAAATGTCTTTATAGTGCTTTTTAAG >3.52|1437604|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCTCTTTCATCTCATCATATATCTTTTTCGCAATTA >3.53|1437671|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTCTACATACAACTTCCTCAACATCTCTTTCTCT >3.54|1437737|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGAAGCTTCATTTCTTGAATTAATGCACTAATCGTA >3.55|1437803|35|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTGGATTTCTTTTCCACGGTAATGATTTAACGA >3.56|1437868|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTGTCTTTCGGTTTTACAGTTACATCAAACAAATCC >3.57|1437935|35|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTGATAAAGGAAGGTTTTTTATCGCAAAGCCTA >3.58|1438000|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAAAAACAAAACACTAAGAACCTAAAGCAAACTC >3.59|1438066|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTACAATAAAAACAAATGGATTTGAGTTCGACGTT >3.60|1438132|35|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAAGAAAAATTACATACCAAGCCCTGTCTACGA >3.61|1438197|35|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATAAGATCCATCGTTAAATTGCTCAAGGTCTTT >3.62|1438262|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGTTGTTTGTACTCATAACACACCTCCTTTGCTA >3.63|1438328|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTGCATGCCCTCATTTGGGGAGCATGGGGGACAGGG >3.64|1438394|35|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCCTCTCTGTTTAGCTAACTTTGCTATCTCTTCAT >3.65|1438459|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGGTTGAAAGATAGTAATTTTCTAATATTATACTA >3.66|1438525|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTTGAAGTTTAATCGTAAAAAAGCCATAGACTTTTC >3.67|1438592|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCGCTATATCCTCTTCATTCAGAAGTTTTCTCTTC >3.68|1438658|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATAATGATTTGGAGTTTTTTGATTTCTTAGCTCAAT >3.69|1438725|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAATGAAACAAAAGTAGATATATTATCAGTTGCACGG >3.70|1438792|38|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTGGTGTGGATGTGGATGTTTTATTAGTCTTAACAAGG >3.71|1438860|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGCATACACCACCAACAGAGATATGGCATCCATGTG >3.72|1438927|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACGACTACTATTTTATCCTTGTTTTCTACTACCTCA >3.73|1438993|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GACCAAATCTCTCTTGCAAGAAGGATGAAGTAGTTT >3.74|1439059|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCTCTTCTTCTTTATGTTGGTATTGTATTTGCCTT >3.75|1439125|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTCTAATTTCAGCCATTTGCGCGTAATCAAACTCA >3.76|1439191|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CACAATTTGGGTCGTCACAGAAGTGATATATATTTT >3.77|1439257|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTACATCAAGTTTGTTTTGACCATCCGCTCTGAACG >3.78|1439324|34|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATAAAGATGAACCTCCGTTCTTTTTACCAAGA >3.79|1439388|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACATGTACCTAATGAGGACTACTTTGAATACTTCCCG >3.80|1439455|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCTGTGAAAAATTCGTCATTACGAATCAATTCTTC >3.81|1439521|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACATGTCCTACATCCTTTTTTCACTTTTCAGTGAAA >3.82|1439587|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAAGGGTTTAGAAAAAGAAGAAAAACGGCTTTTG >3.83|1439653|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGCATTTTCCCTATTTGGCTTTTTAACAAAAACACT >3.84|1439719|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTATAACAACTAATACACCATTTAAAAATTTACAA >3.85|1439786|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAACGTTCGCAATCTTCATTCGGAATATAAACAGGC >3.86|1439852|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTGTTTGTCCTAAATATGAACCTCTTCCGTTTGAA >3.87|1439918|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGCCTGCTCCTTTTCGTTTTGCACGAAAACGCTGC >3.88|1439984|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGATTCATGATTATGAATTGTTTGAATTTTTCTTCAA >3.89|1440051|35|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GACCCGCGGGGGGCTACGTCGATTGTAGTAAACGA >3.90|1440116|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCGAGGATCTCTCGCGGTTTCTTAAGCGATTGCTCAA >3.91|1440183|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGGAAAAGCCCCCGTTGGACGACGAGGGGCAGTTAG >3.92|1440250|35|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGAGAACTTCAGCCGGTTTTTTAGTTGACTGCTGT >3.93|1440315|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGAGAAGGCAAGTTAAGGCAAAAAGCTTTTTCGTA >3.94|1440381|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGAAAGCTTAGCTGGAGCTTCTTTTTTACGTGAG >3.95|1440447|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTAACGGTAAGGTTCCAGTAAAGGGTTTTCGGCTTG >3.96|1440514|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAAAAAATCAAAAAAAATGTTTACCGTCAGCCTG >3.97|1440580|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTAACGCTGATAACTAATCCACAGCTTTGGGGATG >3.98|1440647|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTCAGAAACTGAGCAAGATTTGTCGCTTTTACAC >3.99|1440713|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGCTAACGTCTTTTTTTCTGCAATAATTAAATAAT >3.100|1440779|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTATGAAGCAGATAAATTATGTAAAAGATTTGATGG >3.101|1440846|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTTACTGTCTCTCTGTATATAGTTTCTTTTTATA >3.102|1440913|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTCAGGTAGGAAGTGTAAAGGTGAGGTTTCCGAGGG >3.103|1440980|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACAAGTTTAAAGTAGAACTGACTTCTACAGATAGA >3.104|1441046|35|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAGAAATAATAAGTAGAGTTTATGATTATTTGAT >3.105|1441111|35|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGAGGAGGGTAAGAAAGTGCCGGGTGTTGTGCGGT >3.106|1441176|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGATGCGAAAAATCAAGTGTTAAACTAGTTTTATATA >3.107|1441243|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTATGGAGCGTTTATTTATAATGATACTTTAGCTG >3.108|1441310|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGCTTTTAGCTTGTTAAACATTTTACCTTTGATAG >3.109|1441376|42|NZ_CP043908|PILER-CR TTTGCTAATTCTTCATCGTATAAATCTATTAACTCCGTTGCG >3.110|1441448|41|NZ_CP043908|PILER-CR ACTTTCTAAAAACTTTCTCAATTTTTCAACTAAGTGTTGCG >3.111|1441519|36|NZ_CP043908|PILER-CR TTCGATATATTTTTAGAAAATAAAGAAATAGTGGAT >3.112|1441376|36|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT TTTGCTAATTCTTCATCGTATAAATCTATTAACTCC >3.113|1441442|35|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT ACTTTCTAAAAACTTTCTCAATTTTTCAACTAAGT >3.114|1441507|36|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT TTCGATATATTTTTAGAAAATAAAGAAATAGTGGAT |
cas3,cas5,cas7,cas11b,cas8b10,cas4,cas1,cas2,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP043908_3
The CRISPR arrays of NZ_CP043908_3 >merge|NZ_CP043908|3|1434207-1441572|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT 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>NZ_CP043908.1|WP_150072407.1|1431132_1433826_+|CRISPR-associated-helicase-Cas3' MKLIDLLRAKSEGQESLLFKEHIIEALQRAKQLKNFIDANKESIKCQQLKDIEFFEALATAIILHDLGKVNYEFQKMVYDKASEEWEKVKEFLKVLRNVNLKDHEVLSSIWASILLDNSEWNAKIRTAVLLHHYNGYFVNEKDLMGIVEDYRENIMLYLKFLIEKKDEIDDFLNDLLNEINEKFEEDFIKSAVSKIQKINVFERAKDLLEKIENREDDISEFADFYNINNENPDYDFMLFLGCLRRCDYSASGGVDLELEKINNMEDVYTTLKERIKTKVKSDSLWQENILEKIDPLKPIVLVAPTGSGKTEFALLWAEKNNRKLIYTLPLRVALNDLFFRFREADHAYFEKEFVDVLHSTAFIEYLGREKVYESGDIEKKLTAAKLLSSPILLTTPDQVFLTSLNYYGSDKVLAVYPLSSIVIDEVQTYDEEMASIIVKTLQIVQKLGGVVIVMTATLPPYFEPFLKGEVDFTDLQFDFIDLQDIKENVKNYNIKRHKIKVVDKALVKYVDNDKKDKELKKGKKDIDISDELELWLDEFKDKNMFIVVNNVSKAIAIYEWLKNKDYPNIFLLHSRLIEKEKSRRIKLIKELIKPNKNEEEISKLKQEGEKINPDKPAIVVATQIIEASVDLDFDAMITEISTIDSQIQRWGRVYRNKDQDYNKEEPNIVIFAGEQEEGKTKIDKGTKAIYDKKVIEKTIEVLKEFEGKVLNYDDERAMVNEVFNREVEVEGYQGTLKDFYIKKIRENLDFLKYFTVEKKSQAQRVFRRIAGIQVVIPEIMKHYGDELTEKFAEIVENLDLNKITWEEIVDELNKKLSNGLNKIETKWMLKKILYEYSINIPVFYWEGGKLSNLRTHEFKGFQVLKLSREQAEEVYWYGIDKILKKEEEEVYFDNII 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>NZ_CP043908.1|WP_150072401.1|1425196_1426162_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MRSFYLFSSGKLERRENTLCLSTSEGKRFIPVTQVEQIYLFGENTLNTKLVNFLSQNGILLHFFNYYGYYTGSFYPRETNISGTVIVKQVEHYLNPSQRLYLAKEIIASAIHNIHRILEKREYEKEILGLRKCEEEVMQAKSINEIMLIEAKARRIYYSTFERITNWEFGERSFRPPENPLNALISFGNSMLYTTILKEIYHTQLNPAVSFLHEPFERRFSLALDISEIFKPLIVDKLIFRLINEGLIKPSDFLKEVEFAYLTEKGRKTFVYHFDKLLESTIYHRKLKRKVKYKTLIKLELYKLIKHLLGEKKYKGLRVWW >NZ_CP043908.1|WP_150072400.1|1424908_1425193_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MKVILIYDIETIEPSDQKRLNKVRKIARKYLYHVQKSVFEGDLTEGQLYKLEKAILEVVDKDKDSVIIYKLPDTVKWERIILARKNFDFDSNVI >NZ_CP043908.1|WP_150072399.1|1424482_1424833_-|hypothetical-protein MVASPMHNNQNYQKGGEATVKEKTKTLTKQPIEEILNFFQQEVNNLIKNLLEKLMLEERRIYLEEQEDYANGFYTRDLLFVPSYFLKEGGLKSISRLIKVTEDEVKELIYLFGEMR >NZ_CP043908.1|WP_150072782.1|1424366_1424501_-|hypothetical-protein MRRNEVAKEPVYLALGIKPDGRREILGFWIFGSEGESAKNWENL >NZ_CP043908.1|WP_150072408.1|1441596_1442331_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRLAITFVSEKEAVLPIHYNEVLQGLIYHLLDRALAEKLHNEGFVYQKRRFKFFTFSRIFGKLEKERDKFKISSPFKFFISSPYTEMLLSLTSNFLYNKEIQLDVNRVWLESIKVLPSPEIRKEILIRMLSPLTVYSTLYGADGKKKTYYYHPNEKNFSMLVKENIIKKYKAFYKKMPPSEEFFIEPIKLEKGNEKIIIYKGFVIKGWMGNFVLRGDPELLRLAYDAGLGAKNSQGFGMFEVIK >NZ_CP043908.1|WP_150072409.1|1442623_1443436_+|YkgJ-family-cysteine-cluster-protein MEALQNLRGLDKILVPIRLTGKSKFVFQCHPGVPCFKLCCSDLFLPLTPYDIIRIRDKLGLTTDEFLLQYTEPFILPKSGLPIARLKMSENEEKTCPFLGDGGCNIYEVRPLACRYYPLGFGLFRNKDKRKNEEIYYLVKEGFCQGLDSGEEMTVDEYRKSQGIPGLEDPILEWAEIIMKKESLGPISVPEKSLQLFFMVSTNPERFRSFVFESKFLDMFEVDEKTLEEIKKDDLKLLQFGFKWLKTVLFGENLVKRRKESPAVKKVKPF >NZ_CP043908.1|WP_150072410.1|1443438_1444539_+|flavodoxin-dependent-(E)-4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl-diphosphate-synthase MYPKIKRRVTRKVWVGKISVGGDSPIRVQSMTNTPTADLNATLSQIQKLFEAGCEIVRVAVPDEKSAKALKDLVKESPIPVIADLHFATLLGEKAVKAGCAGIRINPGTFKNKANLERLLKICKDYNCCVRIGINAGSLEPEILKKYKVPSYKAMVESALRWVEYVVETVDYHNLKVSLKSSNWWETIKAYQAFSKKSDFPLHVGVTEAGGLIPGTIKNTMAISYLLLKGIGDTLRVSLTADPVEEVYVAYEILKNLGLRTLYPEVIACPTCGRCEIDLFSLYQKVEAWTKRIKANLKLAVMGCVVNGPGEAKMADIGIAGGKGVGVIFREGKIIKKVPETQLLEEFFKEVETFLKEHPERLINPQ >NZ_CP043908.1|WP_150072411.1|1444525_1445365_-|16S-rRNA-(cytidine(1402)-2'-O)-methyltransferase MEKTKGTLYVVGVPIGNLGDITLRALEVLKSVEIIVSEDTRSVKKLLTHYGCGPKKLISLYKEVEVEKTYKVLKLLEEAKDVVFTSEAGCPLISDPGAYLVKEAHKRGVKVVPVPGVSSLTCALSVSGVELTKGFIFLGFLPRKKTEQKKVLENLPENLPIVIFESPHRMGKTVKNLLEILGNRECFLARELTKLHEELLWTDLETLAQRENFLGEITLIILPRTDKEESVLLKKGLSGLKKRIRELKKEGLKPKEIAKILAEEYNIPAKEVYQLITEG >NZ_CP043908.1|WP_150072412.1|1445521_1447402_-|TonB-dependent-receptor MGKNLLNQLSFFLMAGILASPGFCTEKPKPEEFKELPEVVVSADRVEEPIKETTAKVTVITKEELKKKNFVLVTDVLRTLPQVYVRANGGPGQTAGAILSRGAKSYHTLVLIDGFKVNDPSLGMFDFGSLTVDDIERIEIVEGPQSTLYGSEAVAGVINIITKKGKGKPKVGISLDAGSYGTYKPSFEVAGEFKGFDFRLNAFHYYTDGFSASRYGSEKDGFKNSFVSTKMGVNFHPKARFEVLGRYSYGRTEYDGYDFRYNLIDKDYVRREHHYLIGAKLDLSLLHNYKQTFSVYKNRFQRKFYEPDGWFPYNRYTPSAEGFSWENFLSLGKAYSLVFGVDFKREKVEMLSESSLGLTSYDEKREHVGIFVNNKFSFLEERLIFNVGLRHDDYKNFGEKTTYRLGFRYIIPQIEVVLKANYGTSFRAPTFDDLFYPNYSNPNLNPEESKGWDLSLERVFFKERLLLGISAFYQKYKDLIQFDQTTWKPENIGKAVIKGAEAYLNLRLTQNLSFKANYTYLDAEDRDKGKYLVYKPSHKAGATLEYSWKNLTLLADYVYTGERFHDKDNTKSLKPYSLVNLSANYSFNPKLKFYFRIENLFNANYEEVKDYGTPDRSIYGGIKFDY >NZ_CP043908.1|WP_150072413.1|1447746_1448307_-|DUF996-domain-containing-protein MKDNLSMSTPKLIGGIGSILLILTMTPYFGIAAGLVGIVLLLISFNMFSKIFNDPQIFKNALLSFIFTIIGGFFVIFTVGLTFFSLFTMMGSHFHSFHMFPHVGIGTIFVWIILYILLVISAYYLKTSLYLLSSYTGVNLYKTGGFLYFIGNILMIIVIGVLINLVAWILIAVAFFTTPEEIKSEA >NZ_CP043908.1|WP_150072414.1|1448376_1449414_-|hypothetical-protein MELFLIFSIVLNSAFGLAIVFFIKNIKRAKNQIEELKQTKSFWEETLYQLEIPVFLVDNKEETQWQNKASLSFFGDLRGKTFQIDLQKFYPKKWEVKTLSLQKGQKVYLLIDKSEEEIFKKSYTIALSYLSHEIKTPFTILRGYAEKLEAEILSSSQYPQLHTYFITFKNALDKIERLTSKLFTSLEYLVKDLPLKKERFDLRIALEEVIFWIKPLCEDKNISLEVELPENLWIEGDKDWMMQALINPIENAVKFTPKNGKITIKSYVREDQKINILIRDQGPGVNPQDLPFLGMPFFKSSAEKGLGFGLFITKKVIEAHQGKLKFSLPPQGGLEVLIELPLCNQ >NZ_CP043908.1|WP_150072415.1|1449417_1450092_-|response-regulator MKKILIVEDDQDIANLISETLLAQGFKPYVVNSLAQAYSFLLQSSVDLVVLDLILPDGDGIELLKYLKFTSKFSKTPVVIVSARGAELDRVLGLELGADDYVVKPFSLRELTLRIKKLLKNEGFSSSQVKVGPLLLDKEKKTISLEEKPLILTPTEYKILELLIENPEKVFSREELSSHLWALEKDYYSRVVDAYICRLRDKLGDYGYLIETVRGFGYKLKKNS >NZ_CP043908.1|WP_150072416.1|1450319_1451354_+|phosphate-ABC-transporter-substrate-binding-protein-PstS MQKGANKKGWFKKLVSLALGIGFFTTASAQAAEITGAGATFPQPVFQAWAYEYHKATGIKVNYQGIGSGGGIKQAQSKTVDFGASDKPLTSEELKQYNLAQFPAIIGAVVLTYNLPGLKEVSLNLDEKAVCDIYLGKITKWNDPYLQKLNPNIKLPDAPITVVRRSDGSGTTWLFTTYLSKACPEWKNKVGAGTSVDWPVGIGAKGNPGVTNYIKQNNWSIGYVEYTYAKENKLPVARLLNRDKTYYLAPSVETIQAAASHAKWSMDKDFYEDLTYQPGKNSYPIVGASFVLLVKDSPRVKEATKFFRWSFEKGDGIAQQLYYIPLPKNVKSMIYKYWEKHKVN >NZ_CP043908.1|WP_150072417.1|1451472_1452414_+|phosphate-ABC-transporter-permease-subunit-PstC MEKRLAYITEILTRYFLGFWAIFTGFLFPFVIFLILLYESKLAIKNFGFLHFLTSTEWDPVRESFGALPMVVGTLISTFIAILFAAPISMGIAIFITELAPSWLKGIFATAIELLAAIPSIIYGMWGFLVFAKYMREDIEPFLQKIFSPFPVLSQLFSGNPTGIDVLTTSVVLSIMIIPFMSSVVKDAFNLVPSVMKESAYGLGATKWEVVKDVVIPYTASGIAGGLILSTGRALGETMAVTFLAGNVPQIPKSLLEPFTTITVALANQFTEADTPLYLSSLFYLSLFLFVISFGVLILAKLMILRIEKRWKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP043908_4 | 1637618-1641408 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP043908_4
|
50 spacers
spacers of NZ_CP043908_4
>4.1|1637653|39|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT TTCATTTCTTACCTCCTCCTCCTTAAATTTTTTTGTTTT >4.2|1637727|44|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT TAGAAATTCTTATCTTAAATCTAAAGTTCCTGTTCTTGTTTATT >4.3|1637806|40|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCGACTTTGTATTTCATTTTTATTGTATTTAGTATTTCTG >4.4|1637881|37|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACCTACTGGGGGCTTTAATTTTTTAAACCCCTAAAAT >4.5|1637953|39|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAAAGATTATTGATATTTGATATTTTAGAATTTTTGAT >4.6|1638027|36|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAGCAATAGTGCTTAGTGTTTGATTGGGTACAAAA >4.7|1638098|40|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACATAATAACCTTTCATTTTACACCTCCTCCTTTTTTTAG >4.8|1638173|40|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACATAATAACCTTTCATTTTACACCTCCTCCTTTTTTTAG >4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATATTTTTTATTTTTTTTTAATTTTTTTCAAGTCATT >4.10|1638321|37|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCAATATTTCATTTATTGGTATTTCTATCTCTTTTAT >4.11|1638393|37|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGAGTATTTCTTTTATTTTAAATAAATATGGATTATT >4.12|1638465|39|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATGGTATACTATACTTTTCTTTTTTTATTAGCTTAAAG >4.13|1638539|43|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGCTTTTTTGATGTAAGACTTCATCTTTTGGGACTTTTCAGT >4.14|1638617|40|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGTCTATATCTTTTAATATTACAAAATTATATTTTAATA >4.15|1638692|44|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAGATCTCTTCTATATACCATATACCAACCTAAACCATATATAT >4.16|1638771|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTATATTTTTTATTCTTTTTATTTTTTATTTTTTAAAA >4.17|1638844|41|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTAAACTTTTGATAAATTGATCATCTATTTCTATTTCAG >4.18|1638920|39|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTATAAACAATAAAGCTTATCAAAAAGTTATCTAATTT >4.19|1638994|36|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACTTTTTCTCAAAAGTTACGAAAAGAGAGTCTTTTA >4.20|1639065|36|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTAAAGAAAGCTTTTCATTTTATTGGCTTTCTCAAA >4.21|1639136|37|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAAAACTATCAAGATATAACCATAACGGAGTAGCTA >4.22|1639208|39|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAAAATCCTCTCATAACTTACCTCCTTTTTTTTTGATTT >4.23|1639282|37|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTCAGAAATCTTTTTAACTCAAAGCTATTTAACCG >4.24|1639354|43|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATTTTTCTTTTTCTATTAGCATTTTTCAATCTCTATATTATT >4.25|1639432|39|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATCGAGGTTCAAAGTTCGATAAAGAAAGTCTTTCATCT >4.26|1639506|34|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAAGGTTATTCAAGGTTTCAGGTTTAGTAAAAA >4.27|1639575|41|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT ATTAAAAAAAGATTAAGAGGCAAGCTTAATGGCTTGCCTCT >4.28|1639651|47|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATGTCTACACCTCCTCTTATTTTAATTTTTTTTATTTTTCTATTTGG >4.29|1639733|39|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGGTATAGACTTAATACAAGATTTTTTTAATATAGAAAT >4.30|1639807|43|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCATGTTATTTGCGGTATATATTAGTTTTAGATCTCTTCTATA >4.31|1639885|39|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTCAAAACTAAAATATCTGTTATCTATTATCCTGTACA >4.32|1639959|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATTAGAGATACATTATTTGTAAACTTTGAGAAAAGA >4.33|1640032|47|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGGCTTTTTTCGCTACCTTTTAATGATAGCCTTTTTTCAAAGCTTAT >4.34|1640114|39|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATAAAATCCTTTCATTTTAAACCTCCTTTTTTTAGTTT >4.35|1640188|40|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTATGAATAAACTACCATTAATTAAAATGTAAAATCCTTT >4.36|1640263|42|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAAAAAATAATTTTTCTTTTTCTATAATCATTTTTTATACCT >4.37|1640340|44|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAATAGTTTTTTTGCTATTTCAAAAAATATGTCGTTATTATCGG >4.38|1640419|43|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGACATTCTTGCATTAATTTAGAATAGTGACTAGCAGTAAGA >4.39|1640497|44|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGTTGTTTAGTGGTAATATCTTTGTAAAGCATTATCATTTTTA >4.40|1640576|39|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAATAGTATCCTTTAATGTCAGAGAAATCATATCCACAT >4.41|1640650|42|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCGGCTAGCTTCTTAGAGATAGAACATGCGAGAGACTATAAA >4.42|1640727|44|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGTTGTTTAGTGGTAATATCTTTGTAAAGCATTATCATTTTTA >4.43|1640806|39|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAATAGTATCCTTTAATGTCAGAGAAATCATATCCACAT >4.44|1640880|37|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTTCCTGTAAAGTCTTCCTTACTCTTAAATTTTCTT >4.45|1640952|42|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAACCTTCCTTCCCTCTTCTTCCAGTCCTTCCATGATACGT >4.46|1641029|43|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCCCCTTTTTTATCTTTTTTAGCAGCTTTTCTAGATTTTTTAA >4.47|1641107|39|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCGAGAAAACATATCTTAAAAAAATTTGCTTTTCTTCTG >4.48|1641181|39|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAAAGGAGATATTATCATCTTAAAAATAATCCCAAACAT >4.49|1641255|40|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTAAGATTAAAGCTTTTCCTTCTTTGCTATAAGAATAAT >4.50|1641330|44|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGTCTCTTTAGCCTTTTTTTCTAAATCCTGAATAATTTGTACA |
cas2,cas1,csx1,cas6,csm5gr7 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP043908_4
The CRISPR arrays of NZ_CP043908_4 >merge|NZ_CP043908|4|1637618-1641408|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR,PILER-CR GTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACTTCATTTCTTACCTCCTCCTCCTTAAATTTTTTTGTTTTGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACTAGAAATTCTTATCTTAAATCTAAAGTTCCTGTTCTTGTTTATTGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACTCGACTTTGTATTTCATTTTTATTGTATTTAGTATTTCTGGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACACCTACTGGGGGCTTTAATTTTTTAAACCCCTAAAATGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACAAAAAGATTATTGATATTTGATATTTTAGAATTTTTGATGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACTTAGCAATAGTGCTTAGTGTTTGATTGGGTACAAAAGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACACATAATAACCTTTCATTTTACACCTCCTCCTTTTTTTAGGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACACATAATAACCTTTCATTTTACACCTCCTCCTTTTTTTAGGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACTATATTTTTTATTTTTTTTTAATTTTTTTCAAGTCATTGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACTCAATATTTCATTTATTGGTATTTCTATCTCTTTTATGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACCGAGTATTTCTTTTATTTTAAATAAATATGGATTATTGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACAATGGTATACTATACTTTTCTTTTTTTATTAGCTTAAAGGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACAAGCTTTTTTGATGTAAGACTTCATCTTTTGGGACTTTTCAGTGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACAAGTCTATATCTTTTAATATTACAAAATTATATTTTAATAGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACTAGATCTCTTCTATATACCATATACCAACCTAAACCATATATATGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACTTATATTTTTTATTCTTTTTATTTTTTATTTTTTAAAAGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACATTTAAACTTTTGATAAATTGATCATCTATTTCTATTTCAGGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACATTATAAACAATAAAGCTTATCAAAAAGTTATCTAATTTGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACACTTTTTCTCAAAAGTTACGAAAAGAGAGTCTTTTAGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACGTAAAGAAAGCTTTTCATTTTATTGGCTTTCTCAAAGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACAAAAAACTATCAAGATATAACCATAACGGAGTAGCTAGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACTAAAATCCTCTCATAACTTACCTCCTTTTTTTTTGATTTGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACTTTTCAGAAATCTTTTTAACTCAAAGCTATTTAACCGGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACAATTTTTCTTTTTCTATTAGCATTTTTCAATCTCTATATTATTGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACTATCGAGGTTCAAAGTTCGATAAAGAAAGTCTTTCATCTGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACTTAAGGTTATTCAAGGTTTCAGGTTTAGTAAAAAGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACATTAAAAAAAGATTAAGAGGCAAGCTTAATGGCTTGCCTCTGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACATGTCTACACCTCCTCTTATTTTAATTTTTTTTATTTTTCTATTTGGGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACTGGTATAGACTTAATACAAGATTTTTTTAATATAGAAATGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACCCATGTTATTTGCGGTATATATTAGTTTTAGATCTCTTCTATAGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACATTCAAAACTAAAATATCTGTTATCTATTATCCTGTACAGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACTAATTAGAGATACATTATTTGTAAACTTTGAGAAAAGAGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACTGGCTTTTTTCGCTACCTTTTAATGATAGCCTTTTTTCAAAGCTTATGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACAATAAAATCCTTTCATTTTAAACCTCCTTTTTTTAGTTTGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACTTATGAATAAACTACCATTAATTAAAATGTAAAATCCTTTGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACTAAAAAATAATTTTTCTTTTTCTATAATCATTTTTTATACCTGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACAAATAGTTTTTTTGCTATTTCAAAAAATATGTCGTTATTATCGGGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACAAGACATTCTTGCATTAATTTAGAATAGTGACTAGCAGTAAGAGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACAAGTTGTTTAGTGGTAATATCTTTGTAAAGCATTATCATTTTTAGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACAAATAGTATCCTTTAATGTCAGAGAAATCATATCCACATGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACGCGGCTAGCTTCTTAGAGATAGAACATGCGAGAGACTATAAAGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACAAGTTGTTTAGTGGTAATATCTTTGTAAAGCATTATCATTTTTAGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACAAATAGTATCCTTTAATGTCAGAGAAATCATATCCACATGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACTCTTCCTGTAAAGTCTTCCTTACTCTTAAATTTTCTTGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACAAAACCTTCCTTCCCTCTTCTTCCAGTCCTTCCATGATACGTGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACCCCCCTTTTTTATCTTTTTTAGCAGCTTTTCTAGATTTTTTAAGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACGCGAGAAAACATATCTTAAAAAAATTTGCTTTTCTTCTGGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACTAAAGGAGATATTATCATCTTAAAAATAATCCCAAACATGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACCTTAAGATTAAAGCTTTTCCTTCTTTGCTATAAGAATAATGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGACAAGTCTCTTTAGCCTTTTTTTCTAAATCCTGAATAATTTGTACAGTTGAAACCTGCCCTACTTAAAAAGGGATTGCGAC 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>NZ_CP043908.1|WP_168194307.1|1636958_1637204_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MRVILYDYETEKVRNKVRKNLKKVGVHVQWSVFESLEHFEKLIKILQEEEEKNFRISVFRINSKGKILKIGTDWEKMRFVF >NZ_CP043908.1|WP_150072576.1|1636060_1636936_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKQTVIIYNHYVELSRKAERLFIKTAHTESSIPLSNIDGILIFGKVKLTSDAISLCMKKQIPILLLTIYGQIKAQILPPIGSETTKRRLKQVGLYFLKRLDIAKYLIKRKCLEIEYTFDINLEHFKVKVEKVSDYAVLLGLEGQVSKLMFQKFEEMIRPTSFTFRERNYHPPKDEVNALLSFIYTLGYNLSTALILLKGFDPYISFLHSKRGSHAAFSSDLMEIIRPKLTHFCGEILLNKLITSDDFMKKDDCIMLKKSSIAKVLTEFSNIKENLLELLKEFLIEFEGVEF >NZ_CP043908.1|WP_150072575.1|1635790_1636051_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MGYLIVYDISEHKKRLKVARILQKFGYRIQYSAFYLPEADENLIGFLYEEISKLVDKTTDRVFFYPVDPPEVFKGYPLEPWKIFVF >NZ_CP043908.1|WP_150072574.1|1635125_1635806_+|hypothetical-protein MKGKVIVYYGQKVEFSHEVISIISFTKDIVNVGKRQIIVINKEEKYFRYYLNFKRSPEIENSLMAKYLKNREKIREEIRTISILGLKYREHKLYGKTFNEFIPFKALIKEVSLLIEAYYKYYSIACAILTTLFFTKIGIPSSLPKIIDYIYGQDFLDDFFFAPAFIFTIFESTTDLLLGERLVDEACIARSFLSFLLWKHAKPLLKIPYFNLIQTGVSRDLIWVIL >NZ_CP043908.1|WP_150072573.1|1634125_1634716_+|DUF996-domain-containing-protein MEKRLSNAKILGVISSILLALTAFLPEVEIILWIVGSVLLLISLNIMSDIFNDKRLFKNILKSFVIILAGITLALLVLLIAGVITGTSLSSLFTELMEISLEEKPTINNIPIIFIIVLYLSYLYSSYYFKKAMDLLYEYTKIKLFRYGGLLYFISAILFVVVFLSTLADLIAFVLIAIGFFTIPEDITSKSLSEKT >NZ_CP043908.1|WP_150072572.1|1633253_1634081_+|hypothetical-protein MKKQVFIAFMFSFFLFFVSFSKSFAWFFKSENKEEISLEDCTAAVGGTADLILKNIDKPFKYLSEEDKNLYYTLYKKVENCRNKYLEANKIVFRKKDWYEGKIFRIYPKTPLEKANPNKFTLLFLDGNVKEVAVLKRIYGDGLGFLMFHEMYVYQSGKSNRDKIIKILDREEKQPFCYVEGFTGYMKIVCPPYHLEKNFSSLIIKDYKENTSKEEIVSSLENMTGFLNEELNQKVAIDYRVLLYENIRNLIIWIEKEFGPKGRNLIPSVLEKKPN >NZ_CP043908.1|WP_150072571.1|1632442_1633195_+|hypothetical-protein MRNRGFSKFISLLLILFFIFQLTGCATIPEAIEYRNLYTNYKMSDTIFLDVTKKLQYRNVFVDVRNTSQLQEVDTNVLKEAIAQNLASKGYNVVNDPAQADYILQTNVLYFDYYRKTAAKDGATSGALAGAVAGGLAGGRDVDALILAAIGAGVGYVGGALIGSAIKIETFAGVVDIQIMERTDKPVVGKVVTNASQGTSTVITTEQEYKKNYQIYRTKLAVTATQTNLKRDEAAREVTRMLALQIAGIF >NZ_CP043908.1|WP_150072570.1|1631061_1632432_+|TIGR01897-family-CRISPR-associated-protein MKLIYQIGRLDAKSFENINFFYKDKEYSAQLSSFVLKEHFEENKEKSKVILIYPVSLLINKSFLNNTQFPEVLKNTINNILTNPENYFVNPRKYFMEHPHSKIADDFIIIHSIGQYEGINFFATLEDLILEIFIDLVSRYQKEPFSELYLDISSGHNIYVSALLEAGRLFFTFYKLQNFHSKNDDLQVYITFSDPILPPYDRKFMIREKFPLKVKAFFHYPETPHNNSLNDGYGAFAKLLTGEAKELRKKKNLLNELFSYGYFFYSAIKNNTPLVLYTWEYHPEEKIEEGISVISTLVKDRLTANYQTTPNLDFNLFSSAFLMLSLYKGIVRVLQTYNIFKKEEVSLTEIKSKFLGNDSLYRCFGLIQNIPYLSHEINNTFEKEPERGGINHLITEDYKLLREFIKGESDKINDRNFLAHCGFERNCVYVRKNEETLFIKYNKTELQKIEEILIKN >NZ_CP043908.1|WP_150072569.1|1630145_1631060_+|CRISPR-system-precrRNA-processing-endoribonuclease-RAMP-protein-Cas6 MIVEIPYKILNLDCEPEDELYLPSFKGSSFRGVIGRTLRKALCVLKTYKDCRQCPLYLNCYYAYIFETIPNPEKPLPFNLHKYPSIPHPFVIKPPEEKKTLYKKGETFSIKIVLIGKATAYEPHFILAMRLAGEHGIGKGNRKFFITNYSSTGIFKQSITFDLNSNHPSISELTLQLLTPLRLIYGKKLVKNLEFHHIIRALLRRITILYYFHVSENIPEIPVKGLINLAEKIKTVQSNLKWFDWERYSYRQNRRMVLGGLIGDITFAGELSPFYTLLKAGEIFHAGKNTSFGLGKYKILTSGE >NZ_CP043908.1|WP_150072568.1|1629003_1630149_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm5 MEKYKITIEVLSPIHIGCDEVFSPLEFVIDSQKQILIKFNLFDLLEKLSPEERTELNKISNKKDVSALVDLYKFYAYRIKDRVKRLSNIKQYAIPSELAKRYEEVLKLPQKDIIQNFNNFEIPRTYFNPYTDQPIIPGSSLKGTLRTGYLEALLRQKIEEKSIKDLAQKISQINVNTRPKEINGLFNELEKNLLKYNNPSEDPFGSLKISDLNLKNPIDTKILYKVNVSKEKGEPKGRLTLPIEVIPPGAYFEGTMEITQATNRDKINFDELKNSIHKHFISILEKEYKLHKNLNFKMFVLNPFHKTQIKEKKAVFIKLGKHSGAEAMTIEGIRKILIKKAGGRKEYSTSPTTIWLASERKQDISNAMPFGWAILYFEKIV >NZ_CP043908.1|WP_150071130.1|1641450_1641708_-|hypothetical-protein MEVIFRNVNTDVMGHDATSFLRFLSLTPSSRVAGALVAQPTYRVLRDRGTYSLRGSKAYQKWSPCPSLTYKLLFYYTKQNVLNKP >NZ_CP043908.1|WP_150071129.1|1641663_1642863_+|IS110-family-transposase MTHYIGVDISKDNFHFCILNHEAKTLSSGKLSMSLQGFSDFFNLLKTLSDPIVVMESSGRFHIPLYCFLVEKDIQTFILNPKIVHRFFEFISANNPSKYDTKDAKILALFALNNPEFLKSYPENSELRSASRLIQKLKHELAEAKTQIKYALTVLFPEAEKHFNIYSHSFLNILLKFPSAKTLKKAKPNEISEIIKSSVPKGKTPSFSPDEVINLAKNSIGVDNPYLSQTLIIYIEKLFFLEPRIKKLEEMLVEKMDEDQQEQIKLISSIKGISSKLASLFLAEIRDVKRFSNAKKLIKFAGTDPVTKQSGKYKAKMSISKQGSSFLRNVLFQMAVGVVKWNFYFRSYFIRKKKNFGSYKKAMIAVVNKLIRVIYAICRKKTFFNPAFSKFPVLEVSHV >NZ_CP043908.1|WP_150072578.1|1643106_1643310_+|hypothetical-protein MNHNKIVNLENKTKSLEDLKLSPLDEITLKTTKEIVIKFIEMGRCSPATFEEVFSQVFSVIKKTLTK >NZ_CP043908.1|WP_150072579.1|1643316_1643955_+|flavodoxin-family-protein MYLLAVHASPRKQGNSEILLNSFLSGLNPPKINAEKIRLAELKFMPCIECGGCEKDGTCILEDALTEVYSKVLKTNFLVIATPIFFYTYPSFLQAFFERFQAFWVSKYLLKNPAPSQKPKGILLALGATKGKKIFECLVRSFKYVLDTIDGEYIGGIFIRGIDKKGEILNHPEFLEKAKVLGQKVCLLEKKDLAKPKDELARFLGLNLDPVP >NZ_CP043908.1|WP_150072580.1|1643951_1644578_-|thiamine-phosphate-synthase MDIRGFYAITDEVLTPYQDGKVFLMVEKALRGGAKFIQLRDKTTPLENLIYLALELKKLCHKFNAYFIVNDRVELGARVSADGVHIGKDDASLAEVKKFFKGPIIGVSCYGDIKRAVEAEKQGATYVAFGSFYPSPTKPNAKIVDKNIIPMAKKILKIPVCAIGGITLEQAYELVKLGADMIAVISDLWKSEDIEEKARAYAKLFNYV >NZ_CP043908.1|WP_150072581.1|1644582_1645275_-|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase-activating-protein MIKGFIGTSLVDYPGRISSVVFTYGCNFRCPFCYNIDLVLPERYKKLKNLPESWVIEEIKRRKGFIKGVVITGGEPTLWGKKLIRFVEEIRIETGLPVKLDTNGSQPELVKSLVEDRLIDFWAVDFKTSPARYFELEGDFRLVEETFKVLKEVADQVEIRITLYPPLLTEEDLEEMVPYLSWFKRIALQKFVPEHTLKQEALGPVNPSFYHKVAEFLRERLPEVSLIKRF >NZ_CP043908.1|WP_150072582.1|1645450_1646203_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MVEVIFLGTAGGRYVVAKQLRASAGTVIRIDNSYLLLDPGPGTLVYLAKKRIPIEKIQTIVVSHQHLDHSADLNIVVDAVVEGGLKKRGSVFLTESTLNEGILLSYLKPYLKRLEILRPHTVYEDPPFRLKTTCLLRHNAENHGLIFYLPEGKTIGFLTDTAYFEGLAEEFSEANILVINTVRYTPKEGVLHLSIPDVKRLLTQIRPEEVILTHFGMTMLRANPFKVAQQLSQELGLPIKACYDGMSLKI >NZ_CP043908.1|WP_150072583.1|1646199_1647288_-|DUF763-domain-containing-protein MVSRSVVDLPLHGGKCPPWLFERMIRLSRAFLLLVYQEFGPKELIKRLTDPFWFQALGCLLGFDWHSSGLTTTVGGAVKEALKPYFRDLGVYVCGGKAKRALNTPQEIIFWGEKEGLPQEASKLVTLSRLTARIDNNAIQDGFQLYFHLFIFSKEGDWGVIQQGMDEKTSYARRYQWYSQKIIDLCENPHAGIVSQIKKQDVLNLVAKESKPVQSCLVNLVKEDFSLVMKELTPKVHLIFKKEHALTPQDLSFKSLRKIWEKVYENPPADFKDLILSQGMGAKALRALTLASELIYEVKASREDPVVYSYAHGGKDGHPYRLNKKLYDNTIQELEEILRKAKLGETEKLEMFRRLPKLFNLV >NZ_CP043908.1|WP_150072584.1|1647301_1648213_-|cation-diffusion-facilitator-family-transporter MHPHHHHSDHSEISGKNLFYVVVFNLVITLVEFVGGLVSGSMSLLSDAFHNLSDAMSITITYFAYKFSLKGPDEKKTFGYKRITILASLFNSVTLLVICIFLVKEAVERLINTHPIEIKTVFIIGGIGLLGNLLSLLFLKGAAKKDLNVKSAYLHILGDALSSIAVIIGALFIYFWGMVRIDPLISILIAVYIAKESLEVLLKSVNIIMQSTPTHVEPTKVVEELMKIQEIKDVHHVHLWSLDDKNHFFEGHVNLKSDLTVTQTMQVYQKIKDKLQKLGINHVTVQFEYNGCPGCEVVPKKAL >NZ_CP043908.1|WP_150072585.1|1648428_1649703_+|GHKL-domain-containing-protein MGKNDKLRRYLKTSVLSWVFLGVSLIAGFLFFIAGVYNYKNIEKTLENALKLQAIGVEITLKSLIKNFNLDLIKKERNFFVELLLGNEWEGVAYVAIYDKNGTALLHSNPELIGQKIEQFVPIRPPFPRSFYQTSLTEEKLFLYENLIRLKNEQAVLRVALHVYPVEERLSYARRHIYLEFLLGLVFIGIGGIGFWFFRKTERLIRQVEDLERWRFISQVLAHEMKNPLASIKGFTQLILKKNPEEKTQKALNFIFKETLRMENLLRTLNSYTHPLLINPSNFNLKELLTEVVETFKLLYPEADLRLNLRGENFLVFTDQDKLKEILINLLENAWQASQENGSLRVDLGLNSEKNFYIIYIKDYGKGIPKELLLKVWEPFFTTKAKGMGLGLTIVKKLCEELNLSIELKSQPAYGTEVWLKIPR |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP043908_3 | 3.30|1436154|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1436154-1436189 | 36 | NZ_CP007063 | Fusobacterium nucleatum subsp. animalis 7_1 plasmid unnamed, complete sequence | 1901-1936 | 7 | 0.806 |
NZ_CP043908_3 | 3.104|1441046|35|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1441046-1441080 | 35 | NZ_LR214986 | Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13 | 346125-346159 | 7 | 0.8 |
NZ_CP043908_3 | 3.113|1441442|35|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT | 1441442-1441476 | 35 | NC_015386 | Treponema succinifaciens DSM 2489 plasmid pTRESU01, complete sequence | 87137-87171 | 7 | 0.8 |
NZ_CP043908_3 | 3.113|1441442|35|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT | 1441442-1441476 | 35 | NC_015386 | Treponema succinifaciens DSM 2489 plasmid pTRESU01, complete sequence | 135410-135444 | 7 | 0.8 |
NZ_CP043908_4 | 4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1638248-1638285 | 38 | MF360958 | Salicola phage SCTP-2, complete genome | 383411-383448 | 7 | 0.816 |
NZ_CP043908_4 | 4.16|1638771|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1638771-1638808 | 38 | MN693518 | Marine virus AFVG_25M99, complete genome | 57453-57490 | 7 | 0.816 |
NZ_CP043908_3 | 3.29|1436088|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1436088-1436123 | 36 | AM087122 | Acidianus filamentous virus 7, partial viral genome | 6272-6307 | 8 | 0.778 |
NZ_CP043908_3 | 3.82|1439587|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1439587-1439622 | 36 | NZ_CP053930 | Bacillus cereus strain FDAARGOS_797 plasmid unnamed1, complete sequence | 98973-99008 | 8 | 0.778 |
NZ_CP043908_3 | 3.82|1439587|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1439587-1439622 | 36 | NZ_CP033789 | Bacillus sp. FDAARGOS_527 plasmid unnamed2, complete sequence | 218302-218337 | 8 | 0.778 |
NZ_CP043908_3 | 3.82|1439587|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1439587-1439622 | 36 | NZ_CP009299 | Bacillus cereus D17 plasmid unnamed, complete sequence | 78420-78455 | 8 | 0.778 |
NZ_CP043908_4 | 4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1638248-1638285 | 38 | MG945598 | UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 4354-180177, complete genome | 1359-1396 | 8 | 0.789 |
NZ_CP043908_4 | 4.16|1638771|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1638771-1638808 | 38 | NC_011261 | Borrelia duttonii Ly plasmid pl26, complete sequence | 852-889 | 8 | 0.789 |
NZ_CP043908_3 | 3.1|1434237|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1434237-1434272 | 36 | NC_020292 | Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT) plasmid Csp_135p, complete sequence | 28052-28087 | 9 | 0.75 |
NZ_CP043908_3 | 3.15|1435160|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1435160-1435195 | 36 | AP013453 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G17, isolate: uvMED-CGR-U-MedDCM-OCT-S28-C28 | 23643-23678 | 9 | 0.75 |
NZ_CP043908_3 | 3.105|1441111|35|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1441111-1441145 | 35 | NZ_AP017309 | Leptolyngbya sp. NIES-3755 plasmid plasmid1 DNA, complete genome | 106322-106356 | 9 | 0.743 |
NZ_CP043908_3 | 3.111|1441519|36|NZ_CP043908|PILER-CR | 1441519-1441554 | 36 | NZ_KT897275 | Clostridium botulinum strain IFR 12/29 plasmid p12/29, complete sequence | 63307-63342 | 9 | 0.75 |
NZ_CP043908_3 | 3.114|1441507|36|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT | 1441507-1441542 | 36 | NZ_KT897275 | Clostridium botulinum strain IFR 12/29 plasmid p12/29, complete sequence | 63307-63342 | 9 | 0.75 |
NZ_CP043908_4 | 4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1638248-1638285 | 38 | MG592414 | Vibrio phage 1.030.O._10N.222.55.F9, partial genome | 14048-14085 | 9 | 0.763 |
NZ_CP043908_4 | 4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1638248-1638285 | 38 | MT774392 | CrAssphage cr128_1, complete genome | 4278-4315 | 9 | 0.763 |
NZ_CP043908_4 | 4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1638248-1638285 | 38 | NC_049978 | IAS virus, complete genome | 1941-1978 | 9 | 0.763 |
NZ_CP043908_4 | 4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1638248-1638285 | 38 | MK496734 | Capybara microvirus Cap1_SP_161, complete genome | 2362-2399 | 9 | 0.763 |
NZ_CP043908_4 | 4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1638248-1638285 | 38 | NZ_CP026741 | Bacillus megaterium strain YC4-R4 plasmid unnamed5 | 335-372 | 9 | 0.763 |
NZ_CP043908_4 | 4.16|1638771|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1638771-1638808 | 38 | NZ_CP053847 | Campylobacter sp. CCUG 57310 plasmid pCORI-2, complete sequence | 1877-1914 | 9 | 0.763 |
NZ_CP043908_4 | 4.16|1638771|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1638771-1638808 | 38 | CP046512 | Bacillus cereus strain JHU plasmid p1, complete sequence | 453115-453152 | 9 | 0.763 |
NZ_CP043908_3 | 3.30|1436154|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1436154-1436189 | 36 | NZ_CP032914 | Alteromonas sp. RKMC-009 plasmid unnamed, complete sequence | 67678-67713 | 10 | 0.722 |
NZ_CP043908_3 | 3.49|1437406|35|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1437406-1437440 | 35 | MK813940 | Aeromonas phage 4_L372X, complete genome | 27483-27517 | 10 | 0.714 |
NZ_CP043908_3 | 3.52|1437604|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1437604-1437640 | 37 | KY653116 | Staphylococcus phage IME1318_01, complete genome | 15231-15267 | 10 | 0.73 |
NZ_CP043908_3 | 3.54|1437737|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1437737-1437772 | 36 | NZ_CP028934 | Campylobacter jejuni strain FORC_083 plasmid pFORC_083_2, complete sequence | 17485-17520 | 10 | 0.722 |
NZ_CP043908_3 | 3.100|1440779|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1440779-1440815 | 37 | NZ_CP021514 | Acetobacter pasteurianus subsp. pasteurianus strain SRCM101342 plasmid pAP1342-5, complete sequence | 6033-6069 | 10 | 0.73 |
NZ_CP043908_3 | 3.106|1441176|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1441176-1441212 | 37 | NZ_CP017773 | Paenibacillus crassostreae strain LPB0068 plasmid pPC03, complete sequence | 81697-81733 | 10 | 0.73 |
NZ_CP043908_4 | 4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1638248-1638285 | 38 | NC_014633 | Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence | 875992-876029 | 10 | 0.737 |
NZ_CP043908_4 | 4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1638248-1638285 | 38 | NZ_AP017631 | Clostridium perfringens strain CBA7123 plasmid pCBA7123-01, complete sequence | 23382-23419 | 10 | 0.737 |
NZ_CP043908_4 | 4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1638248-1638285 | 38 | MT774410 | CrAssphage cr272_1, complete genome | 9143-9180 | 10 | 0.737 |
NZ_CP043908_4 | 4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1638248-1638285 | 38 | NZ_CP010312 | Geoalkalibacter subterraneus strain Red1 plasmid pGSUB1, complete sequence | 235511-235548 | 10 | 0.737 |
NZ_CP043908_4 | 4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1638248-1638285 | 38 | MK496797 | Capybara microvirus Cap3_SP_450, complete genome | 1620-1657 | 10 | 0.737 |
NZ_CP043908_4 | 4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1638248-1638285 | 38 | NC_041831 | Campylobacter phage vB_CcoM-IBB_35 clone Contig3, complete sequence | 10122-10159 | 10 | 0.737 |
NZ_CP043908_4 | 4.11|1638393|37|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1638393-1638429 | 37 | NZ_CP011146 | Bacillus cereus strain FORC_013 plasmid pFORC13, complete sequence | 103787-103823 | 10 | 0.73 |
NZ_CP043908_4 | 4.16|1638771|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1638771-1638808 | 38 | MH972263 | Staphylococcus phage JBug18, complete genome | 18513-18547 | 10 | 0.737 |
NZ_CP043908_4 | 4.16|1638771|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1638771-1638808 | 38 | MK496707 | Capybara microvirus Cap1_SP_107, complete genome | 3143-3180 | 10 | 0.737 |
NZ_CP043908_4 | 4.16|1638771|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1638771-1638808 | 38 | MT773554 | Myoviridae sp. isolate BML_2 genomic sequence | 181405-181442 | 10 | 0.737 |
NZ_CP043908_4 | 4.16|1638771|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1638771-1638808 | 38 | MF448557 | Lactococcus phage 37201, complete genome | 27988-28025 | 10 | 0.737 |
NZ_CP043908_4 | 4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1638248-1638285 | 38 | MT774411 | CrAssphage cr273_1, complete genome | 28369-28406 | 11 | 0.711 |
NZ_CP043908_4 | 4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1638248-1638285 | 38 | NZ_CP040083 | Acinetobacter baumannii strain SP304 plasmid unnamed3, complete sequence | 8678-8715 | 11 | 0.711 |
NZ_CP043908_4 | 4.16|1638771|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1638771-1638808 | 38 | MN180250 | UNVERIFIED: Wolbachia phage WO isolate Seq1wOMel_KL1 genomic sequence | 11280-11317 | 12 | 0.684 |
1. spacer 3.30|1436154|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP007063 (Fusobacterium nucleatum subsp. animalis 7_1 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
ctttttttctgctctttttatctcttcttcgttaac-- CRISPR spacer ttctttttcttctctttttatatcttctt--ttagctg Protospacer .*.******* ********** ******* ***.*
2. spacer 3.104|1441046|35|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR214986 (Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
gaagaaataataagtagagtttatgattatttgat CRISPR spacer gacaaaataataaatagagtttatgaatataaaat Protospacer ** .*********.************ *** .**
3. spacer 3.113|1441442|35|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_015386 (Treponema succinifaciens DSM 2489 plasmid pTRESU01, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
actttctaaaaactttctcaatttttcaactaagt-- CRISPR spacer actttataaaaactttctcgatttt--atctgcgttc Protospacer ***** *************.***** * **. **
4. spacer 3.113|1441442|35|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_015386 (Treponema succinifaciens DSM 2489 plasmid pTRESU01, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
actttctaaaaactttctcaatttttcaactaagt-- CRISPR spacer actttataaaaactttctcgatttt--atctgcgttc Protospacer ***** *************.***** * **. **
5. spacer 4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF360958 (Salicola phage SCTP-2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.816
tatattttttatttttttttaatt----tttttcaagtcatt CRISPR spacer tatattttttatttttttgtaattcttgtttttctaat---- Protospacer ****************** ***** ****** *.*
6. spacer 4.16|1638771|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693518 (Marine virus AFVG_25M99, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.816
ttatatttttt-----attctttttattttttattttttaaaa CRISPR spacer -----ttttttataaaattatttttattttttattttttcaaa Protospacer ****** *** ******************* ***
7. spacer 3.29|1436088|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AM087122 (Acidianus filamentous virus 7, partial viral genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
tctggtaatctttgctttaaagcaaagtgaatacct CRISPR spacer tctggtaacctttgctttaaagaaaatgctataatt Protospacer ********.************* *** *** .*
8. spacer 3.82|1439587|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053930 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_797 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
aaaaagggtttagaaaaagaagaaaaacggcttttg CRISPR spacer aaaaaggttttagaaaaagatgaaaaacaactcaaa Protospacer ******* ************ *******..**. .
9. spacer 3.82|1439587|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP033789 (Bacillus sp. FDAARGOS_527 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
aaaaagggtttagaaaaagaagaaaaacggcttttg CRISPR spacer aaaaaggttttagaaaaagatgaaaaacaactcaaa Protospacer ******* ************ *******..**. .
10. spacer 3.82|1439587|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009299 (Bacillus cereus D17 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
aaaaagggtttagaaaaagaagaaaaacggcttttg CRISPR spacer aaaaaggttttagaaaaagatgaaaaacaactcaaa Protospacer ******* ************ *******..**. .
11. spacer 4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG945598 (UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 4354-180177, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.789
tatattttttatttttttttaatttttttcaagtcatt CRISPR spacer tatattttttatttttctttaatattttggaggtaaaa Protospacer ****************.****** **** *.** *
12. spacer 4.16|1638771|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_011261 (Borrelia duttonii Ly plasmid pl26, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.789
ttatattttttattctttttattttttattttttaaaa CRISPR spacer tcttcttttttattttttttattatttatttttttatt Protospacer *. * *********.******** ********** *
13. spacer 3.1|1434237|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_020292 (Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT) plasmid Csp_135p, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
-----tttctttttgcagtttataaaacttatacattccct CRISPR spacer aaagatatgt-----cagtttataaaagttatacattgcct Protospacer * * * ************ ********* ***
14. spacer 3.15|1435160|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP013453 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G17, isolate: uvMED-CGR-U-MedDCM-OCT-S28-C28) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tacgagttttctgtcttctgtgcaaactttgcttgt CRISPR spacer cccaacttttctctcttctgtgcaaagtttgcatca Protospacer . *.* ****** ************* ***** *
15. spacer 3.105|1441111|35|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP017309 (Leptolyngbya sp. NIES-3755 plasmid plasmid1 DNA, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tgaggagggtaagaaagtgccgggtgttgtgcggt CRISPR spacer acaggagggtaagaaaattccgggtgttgtaatta Protospacer **************.* ***********.
16. spacer 3.111|1441519|36|NZ_CP043908|PILER-CR matches to NZ_KT897275 (Clostridium botulinum strain IFR 12/29 plasmid p12/29, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ttcgatatatttttagaaaataaagaaatagtggat-- CRISPR spacer aaatatataaatttagaaaataaagaaata--agatca Protospacer ***** ******************* .***
17. spacer 3.114|1441507|36|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KT897275 (Clostridium botulinum strain IFR 12/29 plasmid p12/29, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ttcgatatatttttagaaaataaagaaatagtggat-- CRISPR spacer aaatatataaatttagaaaataaagaaata--agatca Protospacer ***** ******************* .***
18. spacer 4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG592414 (Vibrio phage 1.030.O._10N.222.55.F9, partial genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
tatattttttatttttttttaatttttttcaagtcatt CRISPR spacer ttttttttttttttttttttaatttttttcattttccc Protospacer * * ****** ******************** *. ..
19. spacer 4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT774392 (CrAssphage cr128_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
tatattttttatttttttttaatttttttcaagtcatt CRISPR spacer tttattttttattttttttttatttttttttcttagct Protospacer * ****************** ********. * ..*
20. spacer 4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_049978 (IAS virus, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
tatattttttatttttttttaatttttttcaagtcatt CRISPR spacer aattttttttatttttttttaattttgtttctataagt Protospacer ** ********************** **. .* * *
21. spacer 4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK496734 (Capybara microvirus Cap1_SP_161, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
tatattttttatttttttttaatttttttcaagtcatt CRISPR spacer ttaaatttttaattttttttaattttttacaaaaaata Protospacer * * ****** **************** ***. **
22. spacer 4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP026741 (Bacillus megaterium strain YC4-R4 plasmid unnamed5) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
tatattttttatttttttttaatttttttcaagtcatt CRISPR spacer tttattttttattttttttttttttttttttttttttt Protospacer * ****************** *******. *. **
23. spacer 4.16|1638771|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP053847 (Campylobacter sp. CCUG 57310 plasmid pCORI-2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
ttatattttttattctttttattttttattttttaaaa CRISPR spacer atccattttttatcctttttattttttattatttgttt Protospacer * .*********.**************** ***.
24. spacer 4.16|1638771|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP046512 (Bacillus cereus strain JHU plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
ttatattttttattctttttattttttattttttaaaa CRISPR spacer tgatatttttcattcttttttttttttatatacccaat Protospacer * ********.********* ******** * .. **
25. spacer 3.30|1436154|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032914 (Alteromonas sp. RKMC-009 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
ctttttttctgctctttttatctcttcttcgttaac CRISPR spacer gttttcttctgctttttttatctcttcataaagcgc Protospacer ****.*******.************* * . .*
26. spacer 3.49|1437406|35|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK813940 (Aeromonas phage 4_L372X, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
aggtaggttttcttgctcttctttttctctgaagg CRISPR spacer gcataggttttcttgcaattctttttctgcgtaat Protospacer . .************* ********** .* *.
27. spacer 3.52|1437604|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KY653116 (Staphylococcus phage IME1318_01, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
ctctctttcatctcatcatatatctttttcgcaatta CRISPR spacer ccattgttcatctcctcatatatctctttcgcttctt Protospacer *. *. ******** **********.****** .*
28. spacer 3.54|1437737|36|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP028934 (Campylobacter jejuni strain FORC_083 plasmid pFORC_083_2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
tgaagcttcatttcttgaattaatgcactaatcgta CRISPR spacer tgaagtttcatttcctgaattaatgcctggagtttg Protospacer *****.********.*********** . .* . *.
29. spacer 3.100|1440779|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021514 (Acetobacter pasteurianus subsp. pasteurianus strain SRCM101342 plasmid pAP1342-5, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tctatgaagcagataaattatgtaaaagatttgatgg CRISPR spacer gttttgaagcagataaattatggaaaaaataaaagga Protospacer .* ****************** ****.** .* *.
30. spacer 3.106|1441176|37|NZ_CP043908|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017773 (Paenibacillus crassostreae strain LPB0068 plasmid pPC03, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
-ggatgcgaaaaatcaagtgttaaactagttttatata CRISPR spacer taaacac-aaaaatctagtgttagactagttttaattt Protospacer ..*..* ******* *******.********** *
31. spacer 4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_014633 (Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.737
tatattttttatttttttttaatttttttcaagtcatt CRISPR spacer aacattttttatgtttttttaattttttttaaaagcga Protospacer *.********* ****************.**.
32. spacer 4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_AP017631 (Clostridium perfringens strain CBA7123 plasmid pCBA7123-01, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.737
tatattttttatttttttttaatttttttcaagtcatt- CRISPR spacer -atttgtttttttttttttttattttttttcaatatttt Protospacer ** * **** ********* ********. *.* **
33. spacer 4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT774410 (CrAssphage cr272_1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.737
tatattttttatttttttttaatttttttcaagtcatt CRISPR spacer agctttttttattttttttttattttttttaaatgtgt Protospacer .. **************** ********.**.* *
34. spacer 4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP010312 (Geoalkalibacter subterraneus strain Red1 plasmid pGSUB1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.737
tatattttttatttttttttaatttttttcaagtcatt CRISPR spacer tttattttttatttttttttatttcttttttttgtaat Protospacer * ******************* **.****. .* *
35. spacer 4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK496797 (Capybara microvirus Cap3_SP_450, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.737
tatattttttatttttttttaatttttttcaagtcatt- CRISPR spacer ctccctttttattttttttaaattttttttaa-tgatga Protospacer . . .************** *********.** * **
36. spacer 4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_041831 (Campylobacter phage vB_CcoM-IBB_35 clone Contig3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.737
tatattttttatttttttttaatttttttcaagtcatt CRISPR spacer attattttttattttttttttttttttttttttttttt Protospacer ****************** *******. *. **
37. spacer 4.11|1638393|37|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP011146 (Bacillus cereus strain FORC_013 plasmid pFORC13, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
cgagtatttcttttattttaaataaatatggattatt CRISPR spacer gcagcatttcttttatttcaaataaataatcatctat Protospacer **.*************.********* **. *
38. spacer 4.16|1638771|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH972263 (Staphylococcus phage JBug18, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.737
ttatattttttattctttttattttttattttttaaaa CRISPR spacer ---ttttttttattttttttattttttttttttttttt Protospacer * *********.************ ******
39. spacer 4.16|1638771|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK496707 (Capybara microvirus Cap1_SP_107, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.737
ttatattttttattctttttattttttattttttaaaa CRISPR spacer aaattttttttattttttttattttttatttagtgctt Protospacer ** *********.**************** *.
40. spacer 4.16|1638771|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT773554 (Myoviridae sp. isolate BML_2 genomic sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.737
ttatattttttattctttttattttttattttttaaaa CRISPR spacer caattaaatttattctttttgtttcttattttttaatt Protospacer . ** ************.***.***********
41. spacer 4.16|1638771|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF448557 (Lactococcus phage 37201, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.737
ttatattttttattctttttattttttattttttaaaa CRISPR spacer atttcgcttttattctttttatttttttttctttcatc Protospacer * * .******************** **.*** *
42. spacer 4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT774411 (CrAssphage cr273_1, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.711
tatattttttatttttttttaatttttttcaagtcatt CRISPR spacer agctttttttatttttttttattttttttaaatgtgtg Protospacer .. ***************** ******* ** ..*
43. spacer 4.9|1638248|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP040083 (Acinetobacter baumannii strain SP304 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.711
tatattttttatttttttttaattttt---ttcaagtcatt CRISPR spacer tatattttttatatttttttaaattttaagcctagacc--- Protospacer ************ ********* **** ...*...*
44. spacer 4.16|1638771|38|NZ_CP043908|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN180250 (UNVERIFIED: Wolbachia phage WO isolate Seq1wOMel_KL1 genomic sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.684
ttatattttttattctttttattttttattttttaaaa CRISPR spacer aggagttttttattctttctattttttgttttatgttc Protospacer . .*************.********.**** *.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation |
---|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|