Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP042243 | Crassaminicella sp. SY095 chromosome, complete genome | 2 crisprs | WYL,cas6,cas8b2,cas7,cas5,cas3,cas4,cas2,csa3,cas14j,cas10,csm2gr11,csm3gr7,csm4gr5,csm5gr7,DinG,csx1,DEDDh,RT | 0 | 10 | 6 | 0 |
NZ_CP042244 | Crassaminicella sp. SY095 plasmid pCT01, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP042243_1 | 179464-180590 | Unclear |
I-A
Consensus repeat of NZ_CP042243_1
|
17 spacers
spacers of NZ_CP042243_1
>1.1|179492|35|NZ_CP042243|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAGGTTCGGTAAAAATTTTAAATGCAAATGAAAG >1.2|179555|38|NZ_CP042243|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAAAAAACTCAATGATTTCATCAAGGCTCTCTGACTC >1.3|179621|37|NZ_CP042243|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAAGCTTGGTAAAGGAGCTAGTATTCTCTTATCAGT >1.4|179686|36|NZ_CP042243|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAACTTTAAATTTTTCAGCAAAACTGTTCCTACCT >1.5|179750|36|NZ_CP042243|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATAGCTCCCTCAATTCTTTAAGTGTCAATTTATCC >1.6|179814|36|NZ_CP042243|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTATCAGCTACTTTTGTAACTGCTTCATTAGCAG >1.7|179878|36|NZ_CP042243|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTAATTATGAAGTTATTTTAAAACCTGTGAGTACT >1.8|179942|36|NZ_CP042243|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAAGGAAAATATACAAGATTTAAAAACTGCAAATG >1.9|180006|36|NZ_CP042243|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAAATCACCAAGCAGACTATCATCTGTACCGCTG >1.10|180070|36|NZ_CP042243|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTTAGGTTCAAATTCAATTGTAAATGGAAAATAT >1.11|180134|36|NZ_CP042243|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGAAATATAAACGCTATACCTACAAGAAATCCGAAT >1.12|180198|39|NZ_CP042243|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTTTTCGAAATGAAAAATTGATTCAACTATTGCATGGG >1.13|180265|37|NZ_CP042243|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGACAAACATTTCTTAGAGAAGCAGCATCCATCCCCG >1.14|180330|37|NZ_CP042243|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATAGAAAATATCTAATCCTATACCACTAAAAATAAG >1.15|180395|37|NZ_CP042243|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCATAGAGCTTAAGCGTATCTTCTAAATTCATGTTAG >1.16|180460|36|NZ_CP042243|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTGATAGTGTTGAACAATTAAATCATACTTTCTTG >1.17|180524|39|NZ_CP042243|CRISPRCasFinder,CRT TATTTTCCAGCTTCATATTGACCTAGTTTAACTCTTTCG |
cas2,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP042243_1
The CRISPR arrays of NZ_CP042243_1 >merge|NZ_CP042243|1|179464-180590|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAATATAGGTTCGGTAAAAATTTTAAATGCAAATGAAAGATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAATTTAAAAAACTCAATGATTTCATCAAGGCTCTCTGACTCATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAATTTAAGCTTGGTAAAGGAGCTAGTATTCTCTTATCAGTATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAATTAAACTTTAAATTTTTCAGCAAAACTGTTCCTACCTATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAATAATAGCTCCCTCAATTCTTTAAGTGTCAATTTATCCATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAATTTTTATCAGCTACTTTTGTAACTGCTTCATTAGCAGATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAATGGTAATTATGAAGTTATTTTAAAACCTGTGAGTACTATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAATTTAAGGAAAATATACAAGATTTAAAAACTGCAAATGATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAATAAAAAATCACCAAGCAGACTATCATCTGTACCGCTGATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAATATTTTAGGTTCAAATTCAATTGTAAATGGAAAATATATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAATTGAAATATAAACGCTATACCTACAAGAAATCCGAATATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAATACTTTTCGAAATGAAAAATTGATTCAACTATTGCATGGGATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAATAGACAAACATTTCTTAGAGAAGCAGCATCCATCCCCGATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAATAATAGAAAATATCTAATCCTATACCACTAAAAATAAGATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAATGCATAGAGCTTAAGCGTATCTTCTAAATTCATGTTAGATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAATTGTGATAGTGTTGAACAATTAAATCATACTTTCTTGATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAATTATTTTCCAGCTTCATATTGACCTAGTTTAACTCTTTCGATTTATCTTAACTATGTGGGAGTTTAAA >NZ_CP042243|1|1|179464-180523|PILER-CR ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT ATAGGTTCGGTAAAAATTTTAAATGCAAATGAAAG ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT TTAAAAAACTCAATGATTTCATCAAGGCTCTCTGACTC ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT TTAAGCTTGGTAAAGGAGCTAGTATTCTCTTATCAGT ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT TAAACTTTAAATTTTTCAGCAAAACTGTTCCTACCT ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT AATAGCTCCCTCAATTCTTTAAGTGTCAATTTATCC ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTTATCAGCTACTTTTGTAACTGCTTCATTAGCAG ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT GGTAATTATGAAGTTATTTTAAAACCTGTGAGTACT ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT TTAAGGAAAATATACAAGATTTAAAAACTGCAAATG ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT AAAAAATCACCAAGCAGACTATCATCTGTACCGCTG ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT ATTTTAGGTTCAAATTCAATTGTAAATGGAAAATAT ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT TGAAATATAAACGCTATACCTACAAGAAATCCGAAT ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT ACTTTTCGAAATGAAAAATTGATTCAACTATTGCATGGG ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT AGACAAACATTTCTTAGAGAAGCAGCATCCATCCCCG ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT AATAGAAAATATCTAATCCTATACCACTAAAAATAAG ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT GCATAGAGCTTAAGCGTATCTTCTAAATTCATGTTAG ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT TGTGATAGTGTTGAACAATTAAATCATACTTTCTTG ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT >NZ_CP042243|1|1|179464-180590|CRISPRCasFinder ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT ATAGGTTCGGTAAAAATTTTAAATGCAAATGAAAG ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT TTAAAAAACTCAATGATTTCATCAAGGCTCTCTGACTC ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT TTAAGCTTGGTAAAGGAGCTAGTATTCTCTTATCAGT ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT TAAACTTTAAATTTTTCAGCAAAACTGTTCCTACCT ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT AATAGCTCCCTCAATTCTTTAAGTGTCAATTTATCC ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTTATCAGCTACTTTTGTAACTGCTTCATTAGCAG ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT GGTAATTATGAAGTTATTTTAAAACCTGTGAGTACT ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT TTAAGGAAAATATACAAGATTTAAAAACTGCAAATG ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT AAAAAATCACCAAGCAGACTATCATCTGTACCGCTG ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT ATTTTAGGTTCAAATTCAATTGTAAATGGAAAATAT ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT TGAAATATAAACGCTATACCTACAAGAAATCCGAAT ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT ACTTTTCGAAATGAAAAATTGATTCAACTATTGCATGGG ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT AGACAAACATTTCTTAGAGAAGCAGCATCCATCCCCG ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT AATAGAAAATATCTAATCCTATACCACTAAAAATAAG ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT GCATAGAGCTTAAGCGTATCTTCTAAATTCATGTTAG ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT TGTGATAGTGTTGAACAATTAAATCATACTTTCTTG ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT TATTTTCCAGCTTCATATTGACCTAGTTTAACTCTTTCG ATTTATCTTAACTATGTGGGAGTTTAAA >NZ_CP042243|1|1|179464-180590|CRT ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT ATAGGTTCGGTAAAAATTTTAAATGCAAATGAAAG ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT TTAAAAAACTCAATGATTTCATCAAGGCTCTCTGACTC ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT TTAAGCTTGGTAAAGGAGCTAGTATTCTCTTATCAGT ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT TAAACTTTAAATTTTTCAGCAAAACTGTTCCTACCT ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT AATAGCTCCCTCAATTCTTTAAGTGTCAATTTATCC ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTTATCAGCTACTTTTGTAACTGCTTCATTAGCAG ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT GGTAATTATGAAGTTATTTTAAAACCTGTGAGTACT ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT TTAAGGAAAATATACAAGATTTAAAAACTGCAAATG ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT AAAAAATCACCAAGCAGACTATCATCTGTACCGCTG ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT ATTTTAGGTTCAAATTCAATTGTAAATGGAAAATAT ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT TGAAATATAAACGCTATACCTACAAGAAATCCGAAT ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT ACTTTTCGAAATGAAAAATTGATTCAACTATTGCATGGG ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT AGACAAACATTTCTTAGAGAAGCAGCATCCATCCCCG ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT AATAGAAAATATCTAATCCTATACCACTAAAAATAAG ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT GCATAGAGCTTAAGCGTATCTTCTAAATTCATGTTAG ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT TGTGATAGTGTTGAACAATTAAATCATACTTTCTTG ATTTATCTTAACTATGTGGTATGTAAAT TATTTTCCAGCTTCATATTGACCTAGTTTAACTCTTTCG ATTTATCTTAACTATGTGGGAGTTTAAA
>NZ_CP042243.1|WP_148808098.1|179012_179279_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVIVTYDIVEPRVINKVRKILKKYLIWTQNSVFEGKITQGKLHQCLSEIGKVVDKSEDSIYVYRVGNHRNVTKDVIGQEKSFDELFL >NZ_CP042243.1|WP_148808097.1|177515_178037_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MNFEFEKFKTQGVKVNYYYVCKRKLWLFSKGITMEDNSDRVLSGKLVHENSYPRQKNKEILIDNIFKIDIFDKEYVREVKISSKMSLSDKMQLMYYLYYLNQLGIQKKGVINYVKEKKQEIIELTEDMKKEIEKVLVDIKDIIENKTPLKAINLPYCKKCAYYEFCYVKEEEE >NZ_CP042243.1|WP_148808096.1|175204_177499_+|CRISPR-associated-helicase-Cas3' MKNPFLAKTENKETIIEHTEKLLERMEALKHIYSNIKNLDWNILELACLYHDLGKMNTKFQNKLIRKLRRVKEYTDEFPEDLQDEFTNMEEIPHGYLSPAFLPKDELKKKFSDDELRILYQSIYFHHSRKKLENHNELKRIVNEDLNKYIQDFKFDRIKSIEKLNESFIRYIKRRIPDQYDTPETIRQYIMTKGLLNKIDYAASGGIPIEVKNENLFEKTNTYLSSGGFKPNELQEYMIENQDKNNVIIASTGIGKTEASLFWIGNNKGFFTLPLKVSINAIYDRVVDKIKFGKENTGLLHSETSSEYLKRNNNELDIEYYDQTKQLSLPLTICTLDQLVDFIFKYEGYELKLATLSYSKLIIDEIQMYSPELVAFLIVALKYITELGGKFSIVTATLPPIFLDFMKEQNIVFNQPLPFYKKIDGKVQLRHKLKVFEEDINTDHIKKNYKNKKVLIIVNTVKKAQEIYKKLKLDLDNETEIKLFHSRFIKKDRSKKENMILDMGKLEIKRTGIWITTQVVEASLDIDFDVLYTELSDIAGLLQRMGRVYRNRDLKEGLVNIYVYVGKDKFPSGIGSGDQSIIDKDIFELSKQAILTYVGDEMNGKEIDEKVKMELVKQVYSKERLVESNYYKKIKETIKHVMDIKAYEFMKKEVNLRNIENQIVIPKNIYEENKEFIQNNLHTIQETSDYNKKLIAKNEIKEFTMSIPKYQYDEAKRNGYIQGDFIELDKYNKIPIISYPYSFEKGLTRPQKKLDEFDEDLQFI >NZ_CP042243.1|WP_148808095.1|174396_175155_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKAIRLRIYQNLVNYRKPTSFQLKETYPLPPYSTVSGMIHFVCGFEEYKEMDISVQGKYYSKVNDLYTRYEFAGTSYENGRHNIKIKSREINKKTGEEIDKYYGIIRGVATCELLVDVELLIHIKPKDEELVEVIYETLKNPKEYLSLGRREDIARIDEVKIVNVDEVEIEEDTTLEYDAYIPIKMFGIDDFNSNATVYNLNKKYEKVEVKKGTFIRQWEKVKVIHGVMNRNELAQEAVVYKDEDENLVFFA >NZ_CP042243.1|WP_148808094.1|173485_174388_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MDKKGLTASFIFEAESGNYGEGIGNVTSLKKVSRGTGESYTYISRQALRFNIIEQMGENNTPLDVDGSVIQFAPDATIKDYAEIDLFGYMKTKKPTKTRAAVVRLSNAVSLESFNADLDFLTNKGLFDRYNAQGNEIKDGGNIAQSEIHKSYYAYTITIDLDKVGIDENYQDESGNPLEIKSEEKAKRVRSLLDTIKFLYRDIKGRRENLSPIFAIGGVYDIKNPFFENKLKVKNNKLVIDAIKDVYGLDKAIKESTHVGLIKGIFSNDVKIIEELNAKGMGEFFNSLKGEVEKYYSENE >NZ_CP042243.1|WP_148808093.1|171792_173493_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MKTINKIRLELADWLYNAGIVGVANILDANDVAYKRGINYIEFEETALENFEEKYFKYFIDKYKKFTSWYNIVKYEDVILNFKEENVDEEYLENINKQIDYVKEKLKSASYKSAYVIIQNKEKDLLKEEKQLNKIKKNKKQKVEDVLPNIKEQLNRMQQIIEYLKTDEVAKIILAKNIIYDIIAKFWSDVSFLNKNNNKKNMYEEYRIYFVDGTLQYIEKIIEKAKYKCFVCDRKISKLSKPVSYDLTWINKMGVDMSRKTSHFWDLSGDTFICPICNFVYSCIPAGFTVIKGQGLFINQNSSINNLIAVNKHALERNTTFEELEDASYFSIVENINQNKVEQLDKEIENIQIIKLDSTNVVRPYTFNILSKDKLKVMNGNKKMLQSMIKVKVKVGTKEYLNLYKEVVTRLYEGKNQFDLINQLFHLRLDKKFNKLHFIDMIIKINNNFIGGREKKKMVHHKVINDCKGFGLDLRISYVNKKAENKLNGISYRLLNALKTKNTSKFMDTLLNAYMYLNKQVPTIFIEGLKDTDKFQTLGYAFLLGLQGEEMKENKKDDIKEDMING >NZ_CP042243.1|WP_148808092.1|171054_171789_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRLKCEYKTKEIPVGYNMLLVSLIKEALKKSDENYFNKLYKYDENIANKRSKNFTFAAYIKNYERAEEIFKVNDRVILNISSPDLEFMINLYNGLLKLSKFQYKTFELYKLKIDLIKEKKLATNEVIFKTLSPICIKNKNNYFMKIEDDKYIDELNYIANLVLKNYRGEGLRENLMFMPLDMKKVVVKEEIRGFKSKTNRKYLYVNSYSGTFKMKGNVKDLEDLYALGVGFKRNQGFGMIEVIG >NZ_CP042243.1|WP_148808091.1|170040_170991_+|WYL-domain-containing-protein MSKVGNELKMLMILQSRGKMKAKDLAREIEVSEREIRRYKDDLIQAGIYIESDAGKYGGYSIGNDSYLLCLNFTDQEYMALLMINEELKKSNHLVLKDYNTAIDKINIVHKKKMHNLSNSYNYMLKGAIANINFQKERKKLIDIHAAILTKNKVNIKYTSLTSGQTERVVWPYATFQYKGDMYFTGYCERRKATIYFKLCRVNKYSVLEEKFEMDKPFDLEEYMKNCFGIFKDQAIQVKLKIHYPMSQIVKEKIWVENQKIIENEEDKSIIFEAMMEGLEEIKSWILSMGGSVEVIEPKMLIEEIKKEIEKMKSIY >NZ_CP042243.1|WP_148808090.1|167841_169836_+|HAMP-domain-containing-protein MEKKTKNRKGIRFRLTVIFTLLIALSLFTLGATSFFKSVNVTESKLKDSSLQLVKELNVSITNYLDGIEKFVCVLANSQVKKIRSNPEAIDEIMNEFETFKNSHKDIKYIYIGTKDKKIYPKPSKSYDPTQRPWYKKAIQAKKLIWTKPYKDISTGEYVISAAIPVYDKNNELIGVLAADIALKTLEEMIDGTKIGKKGYPFVLDENGKVIFHKNKELIGKVLPVEKIIKSIETKKEDIVNYKWEEDGEVYEKFVVYSTLEKLNWKVMGNMYVNEIEEETSGILKNTLTVGAVSLLIVVLITYLFATSLTNPIKELVYDMERVKEGDLSVRCNVKNKDEIGQLSENFNIMVEELGKLVGKMKDVSIEVTSSAQNLAATTEVSSASAEEVAAAVEAIAKGAADQAVDAEKGANLTLKLSSKFDQLEGDFDHIRKSAEDVMATSEASVDVVNELKEKTELNNEGTEKIEEAIIDLDHRIQDIGNILETIDAIADQTNLLALNASIEAARAGEAGRGFTVVAEQIRKLSEESRISSDEIKQIITNVQKESEHTVEIMKELKERSLGQSESVEKVHGSFEQIETAVHSITEKIESISKFVNQINNEKELIVKAIENISAVSEETASSSEEVNASMQQQAMIVEEIATAADKLDDLAVKLNSEISRFKV >NZ_CP042243.1|WP_148808089.1|166746_167550_+|haloacid-dehalogenase MIFASDLDRTLIYSKKFVSNDEGIKLIETKGKEEISFMTKKAIKRLKKLSEEILFIPVTTRTIEQYRRISLFQEEIRPKYAIVSNGGNILINGEIDYEWNNIIQKKIKEECISFKEVESKFEEIESNQWVINRKVADNLFSYCIIHPEYVPEVLYSFIDWMEDNNWKVSLQGRKLYFVPCCVCKWEATQYIKMRENIDFVASAGDSLLDLPMLKMADYAVVPPHGEIYKKYERTYETIQNITFTEKEGIFAAEEILEKIYGLIKQPV >NZ_CP042243.1|WP_148808099.1|180658_181204_+|DUF2284-domain-containing-protein MDKIKVLKNYINTKNIDFMQEISPKELLVSQKVRDACIKNKCGQYNNNFMCPPYVGEIEDFLKKLEGYTKGFLIFVKDKIDDPSDLNQFYKSATILHEIMLDIEKKGKELGFHKAFALIGGNCRLCDVCNAKLGKDNCINPKMARPSLEAVGIDVIHTCSQKGITIEFRKDEVIWVGLLLV >NZ_CP042243.1|WP_148808100.1|181224_182001_-|3-deoxy-7-phosphoheptulonate-synthase MNKQILTGKEIVVSVGNLKIGGNNPPIFIAGPCSVESREQILETALALKKIGVHILRGGVFKPRTSPYDFQGLEIEGLKYLKEAGNQAEIPIITELMDEKNLDIVLEYADIIQIGSRNMYNYSLLKTLGNIDKPILLKRGMSATVREWMMAAEYIAAYGNTNIILCERGIRTFETYTRNTLDLSVVPIMKNETGLPVIVDPSHGTGIRELIKPMSKAALACGADGLMIEVHPNPEKALSDGHQSLTIEQYKELFEEIN >NZ_CP042243.1|WP_148808101.1|181993_182476_-|2-amino-4-hydroxy-6--hydroxymethyldihydropteridine-diphosphokinase MSRAYLGIGGNMGNKKENIQNTIKLLKNHPQIHVSAISSYYETAPVGYTDQDWFLNIVVEINTSLDPYALLAYCNDIEQKLKRERLIRWGPRTIDVDILLYEGFTSDDEKLTVPHPRMCERAFVMVPLYEIAKDLVINNKKIEDIIKNLKGEEVRKIKNE >NZ_CP042243.1|WP_148808102.1|182468_182834_-|dihydroneopterin-aldolase MDKIIMKNLSFYGYHGAMPEENIIGQKFFVDIDLYLDLKKAGNTDCVAHTVHYGEAYEVVKNIVENKKFNLIEALAENIAKEILEQFSLVKEIHITIRKPEAPVKGIFDYFGVEIRRKQNE >NZ_CP042243.1|WP_148808103.1|182821_183688_-|dihydropteroate-synthase MKNTKYDFSRKVTIKCGEYTLNLGSKTYIMGILNVTPDSFSDGGKFIHLDKAILHAKEMAAQGADIIDIGGESTRPGHQEISVEEEIKRVLPVVERLVKELNVPISVDTSKAAVAEAVLNAGAHMINDVWGLQKDMNMAKVVAKYNVPVCIMHNQNTTEYKKDIIQSIKEFLKKSIEIALSSGIKKENIILDPGIGFGKTPEQNIHVMSRLDEFNDMGFPILLGTSRKSMIGKILDLPPNERIEGTIATSVIGIMQGMDILRVHDITENLRAIMVADAIVRGTKPWIK >NZ_CP042243.1|WP_148808104.1|183710_184271_-|GTP-cyclohydrolase-I-FolE MDKARIEKAIREILEAIGEDPNREGLKDTPKRIAKMYEEIFSGLNEDPKKHLEIFFQEEKHEELVLVKDIPFYSMCEHHFVPFFGKAHVGYLPKNGRLTGLSKLARVVETVAKRPQLQERLTSSIAEALVEKLDPYGVIVVVEAEHMCMTMRGVKKPGSKTITSAVRGLFERDAKARSEAMALIKF >NZ_CP042243.1|WP_148808105.1|184296_185112_-|4-amino-4-deoxychorismate-lyase MCISFNGTLIKSKETCISPESEAFLYGYGIFETLKIHCGKIFFIDEHLERLKKGCKELNIKLDYDLKKIQKYCYNLINSNSMVFGALKILYAKNKDQYNLLLFTRENIYTEEKYKKGFHICFADTKKNPYSKLTYIKSNNYLENILEKQKAKENGYDEAIFLNVLNKISEGTYTNIFFIKNNILYTPATECGILPGIMRNKIIDLIYKLNLNLKIGTFNKADLFNADEIFLTNSLMDIMPVSQLENKVFDLSKNYVTKLLQKSFYNLYYHQ >NZ_CP042243.1|WP_148808106.1|185129_186500_-|aminodeoxychorismate-synthase-component-I MLIKKINTSLNSFELYTLFKNEPYSFFLDSGMDPNKLGKYSFIGSNPFLIFKSKNNKIDICENGKTTVLNGDPLEKLREILSSYKMDYKTDLPFIGGAVGYLGYDLCHHIEKLPRHAVDDVNIPDCYIGLYDGIIIIDHQKEEVFASALGIKSPEEETIQKIINTIKAGEEKGVNIKIPKNNKPINLKSNFKKEDYIKAINKIKSYIKAGDIYQANMTQRFECDLQITPFELYAKLREINPAPFASYIDFGEGQIVSSSPERFIQIKNRIIETRPIKGTRPRGKTPTEDIKNREELLSSEKDKAELLMIVDLERNDLGKVSKTGTVEVTELFHLEEYATVYHLVSTIIGKMKDDCDVIDCIKATFPGGSITGAPKIRSMEIIDELEPTQRNIYTGSIGYIGFNGDTDLNIVIRTILCKNQKAYFQVGGGIVWDSDAELEYEETLHKAKALIKALES >NZ_CP042243.1|WP_148808107.1|186489_187089_-|C26-family-cysteine-hydrolase-domain-containing-family MILMIDNYDSFTYNLVQYLECLSEDVLVYRNDCITLEKIEKLNPYMIVLSPGPCTPNEAGICKDVVTTFKGKIPILGICLGHQTIGQVFGGNIIKAKEPVHGKVHPIKHENKGVFKDLPNPLKVTRYHSLVVEKESLPDCFEITAKTFQGEIMGIKHKEYLIEGVQFHPEAILTEKGMEILENFLIEAKKWTSRCKNVD >NZ_CP042243.1|WP_148808108.1|187122_187602_-|HD-domain-containing-protein MERVNKILHNPKYIDYLNRNAQAEKNRIFCHHDLRHAIDVARVSYILALEENLSIKKEVIYAAALLHDIGRWKEYLQGIDHASASADLASEILKESGYIKEEKDLIYSAIRNHRKYNKQNPPLDKILYKSDKISRPCSECLVINQCKRFLNGGNPKIDY |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP042243_2 | 802001-802761 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP042243_2
|
11 spacers
spacers of NZ_CP042243_2
>2.1|802035|32|NZ_CP042243|PILER-CR CAAAAAATAAGCAGACGCTGAAGCAATGCTCT >2.2|802101|33|NZ_CP042243|PILER-CR TTTACTCTCAATAATTCAACAGAATTAATATTC >2.3|802032|35|NZ_CP042243|CRISPRCasFinder TGGCAAAAAATAAGCAGACGCTGAAGCAATGCTCT >2.4|802098|36|NZ_CP042243|CRISPRCasFinder TTTTTTACTCTCAATAATTCAACAGAATTAATATTC >2.5|802165|37|NZ_CP042243|CRISPRCasFinder TTTCTAGCACGATATGAGCATTGCCATTACTATCAAA >2.6|802233|36|NZ_CP042243|CRISPRCasFinder AGCTAATTTTTCACCTTCAAATTCTTCTACAATTTG >2.7|802300|35|NZ_CP042243|CRISPRCasFinder TACGAGAGATGAGTATTTAGAGTTATTGAAAAGAG >2.8|802366|35|NZ_CP042243|CRISPRCasFinder TTTATTTGATTTATCTATTGCCCCTATTGTTATTA >2.9|802432|34|NZ_CP042243|CRISPRCasFinder TTAATAGTTGAAGGTTCACATTTCATTAATTTTG >2.10|802497|35|NZ_CP042243|CRISPRCasFinder TAGGATTCGTTTTTCTAAGCTGATCAAATCTATGA >2.11|802563|34|NZ_CP042243|CRISPRCasFinder TATATTCTTAAAATTTTATATAACAACAACTATA >2.12|802628|36|NZ_CP042243|CRISPRCasFinder AAGGAATGACAAGGTCAATTTCTTCTGTGTACGGCT >2.13|802695|36|NZ_CP042243|CRISPRCasFinder TTACATTGGCTATATCTTTTGCTACACTCGGTTTTT >2.14|802031|37|NZ_CP042243|CRT ATGGCAAAAAATAAGCAGACGCTGAAGCAATGCTCTG >2.15|802097|38|NZ_CP042243|CRT ATTTTTTACTCTCAATAATTCAACAGAATTAATATTCG >2.16|802164|39|NZ_CP042243|CRT TTTTCTAGCACGATATGAGCATTGCCATTACTATCAAAG >2.17|802232|38|NZ_CP042243|CRT TAGCTAATTTTTCACCTTCAAATTCTTCTACAATTTGG >2.18|802299|37|NZ_CP042243|CRT TTACGAGAGATGAGTATTTAGAGTTATTGAAAAGAGA >2.19|802365|37|NZ_CP042243|CRT TTTTATTTGATTTATCTATTGCCCCTATTGTTATTAC >2.20|802431|36|NZ_CP042243|CRT ATTAATAGTTGAAGGTTCACATTTCATTAATTTTGC >2.21|802496|37|NZ_CP042243|CRT TTAGGATTCGTTTTTCTAAGCTGATCAAATCTATGAG >2.22|802562|36|NZ_CP042243|CRT TTATATTCTTAAAATTTTATATAACAACAACTATAT >2.23|802627|38|NZ_CP042243|CRT AAAGGAATGACAAGGTCAATTTCTTCTGTGTACGGCTC >2.24|802694|38|NZ_CP042243|CRT ATTACATTGGCTATATCTTTTGCTACACTCGGTTTTTC >2.25|802384|18|NZ_CP042243|PILER-CR TTGCCCCTATTGTTATTA >2.26|802450|35|NZ_CP042243|PILER-CR ATTAATAGTTGAAGGTTCACATTTCATTAATTTTG |
cas6,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,csm2gr11,cas10 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP042243_2
The CRISPR arrays of NZ_CP042243_2 >merge|NZ_CP042243|2|802001-802761|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATATGGCAAAAAATAAGCAGACGCTGAAGCAATGCTCTGGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATATTTTTTACTCTCAATAATTCAACAGAATTAATATTCGGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATTTTTCTAGCACGATATGAGCATTGCCATTACTATCAAAGGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATTAGCTAATTTTTCACCTTCAAATTCTTCTACAATTTGGGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATTTACGAGAGATGAGTATTTAGAGTTATTGAAAAGAGAGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATTTTTATTTGATTTATCTATTGCCCCTATTGTTATTACGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATATTAATAGTTGAAGGTTCACATTTCATTAATTTTGCGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAAATTAGGATTCGTTTTTCTAAGCTGATCAAATCTATGAGGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAAATTATATTCTTAAAATTTTATATAACAACAACTATATGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATAAAGGAATGACAAGGTCAATTTCTTCTGTGTACGGCTCGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATATTACATTGGCTATATCTTTTGCTACACTCGGTTTTTCGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGAGAAGTT >NZ_CP042243|2|2|802001-802167|PILER-CR GGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATATGG CAAAAAATAAGCAGACGCTGAAGCAATGCTCT GGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATATTT TTTACTCTCAATAATTCAACAGAATTAATATTC GGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATTTTTCTAGCACGATATGAGCATTGCCATTACTATCAAAGGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATTAGCTAATTTTTCACCTTCAAATTCTTCTACAATTTGGGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATTTACGAGAGATGAGTATTTAGAGTTATTGAAAAGAGAGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATTTTTATTTGATTTATCTAT TGCCCCTATTGTTATTAC GTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATATTAATAGTTGAAGGTTCA CATTTCATTAATTTTGCGTTTCATAGTTCCTATAA >NZ_CP042243|2|2|802001-802761|CRISPRCasFinder GGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATA TGGCAAAAAATAAGCAGACGCTGAAGCAATGCTCT GGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATA TTTTTTACTCTCAATAATTCAACAGAATTAATATTC GGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATT TTTCTAGCACGATATGAGCATTGCCATTACTATCAAA GGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATT AGCTAATTTTTCACCTTCAAATTCTTCTACAATTTG GGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATT TACGAGAGATGAGTATTTAGAGTTATTGAAAAGAG AGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATT TTTATTTGATTTATCTATTGCCCCTATTGTTATTA CGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATA TTAATAGTTGAAGGTTCACATTTCATTAATTTTG CGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAAAT TAGGATTCGTTTTTCTAAGCTGATCAAATCTATGA GGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAAAT TATATTCTTAAAATTTTATATAACAACAACTATA TGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATA AAGGAATGACAAGGTCAATTTCTTCTGTGTACGGCT CGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATA TTACATTGGCTATATCTTTTGCTACACTCGGTTTTT CGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGAGAAGTT >NZ_CP042243|2|2|802002-802760|CRT GTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAAT ATGGCAAAAAATAAGCAGACGCTGAAGCAATGCTCTG GTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAAT ATTTTTTACTCTCAATAATTCAACAGAATTAATATTCG GTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAAT TTTTCTAGCACGATATGAGCATTGCCATTACTATCAAAG GTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAAT TAGCTAATTTTTCACCTTCAAATTCTTCTACAATTTGG GTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAAT TTACGAGAGATGAGTATTTAGAGTTATTGAAAAGAGA GTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAAT TTTTATTTGATTTATCTATTGCCCCTATTGTTATTAC GTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAAT ATTAATAGTTGAAGGTTCACATTTCATTAATTTTGC GTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAAA TTAGGATTCGTTTTTCTAAGCTGATCAAATCTATGAG GTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAAA TTATATTCTTAAAATTTTATATAACAACAACTATAT GTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAAT AAAGGAATGACAAGGTCAATTTCTTCTGTGTACGGCTC GTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAAT ATTACATTGGCTATATCTTTTGCTACACTCGGTTTTTC GTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGAGAAGT >NZ_CP042243|2|3|802336-802513|PILER-CR CAAAAAATAAGCAGACGCTGAAGCAATGCTCT GGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATATTT TTTACTCTCAATAATTCAACAGAATTAATATTC GGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATTTTTCTAGCACGATATGAGCATTGCCATTACTATCAAAGGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATTAGCTAATTTTTCACCTTCAAATTCTTCTACAATTTGGGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATTTACGAGAGATGAGTATTTAGAGTTATTGAAAAGAGAGTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATTTTTATTTGATTTATCTAT TGCCCCTATTGTTATTAC GTTTCATAGTTCCTATAAGGAAGTGGAATATTAATAGTTGAAGGTTCA CATTTCATTAATTTTGCGTTTCATAGTTCCTATAA GGAAGTGGAAATTAGGATTCGTTTTTCTA
>NZ_CP042243.1|WP_148808693.1|801057_801816_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MKLKIILQAKEFFALPINYNHMLQNKILELLNKKNSNFLHNEGYKVKWKSFKLFNFSSLEVEKKKICKNKIFVYPGKVILGISSADENFIFDFIDGIITNKGIDFKEGKLDLVSIFSSKELNGNKLVVFAKTPIVVTKPYSEKAIDFFTPRDAEYLASIEKNLKDKYEAFYNKKYDKELEIEIMDESKVYKKIRKYKKWVYEGYIMGVILNGNNDILNLAYKTGLGSKNAQGFGFVETFSSLNSLKNYIKVV >NZ_CP042243.1|WP_148808692.1|799938_801018_+|hypothetical-protein MIWGKKYNVYLKPISHVCVGSGEEYQSYEYIRDTKEKKIYLLDDNKIMELIREGIIKVEDIDVGLKELLNIIKEKDILHRFKSAYIDNCNKLVIKKFYKTLSIVDDEKIEYIATIPASTIKGLIRSGYDSYIIKVKNKKIRYKYIRKVEKDQNNKSKMKYKLKGICNEKKLLDNNNAFENNLLEKNLDQLFSKIKVNDLFISEDKFLNIKKAHRYNRKKCKTVISSYYEAVDSEATFYGSIQLQDDESILMNAIKGLKELATSNIKVERKLLKEVVEKCFYEKLEEENRKEYQAVVKIGFGGLIGKTFVSYDEKSNERYDDEFLPYTILTTESSYKYGKFKKQKPMGWAVLTIKENKED >NZ_CP042243.1|WP_148808691.1|799090_799942_+|hypothetical-protein MIYKARFKMKNMAVKLISSVIFGNMARVLFELFSENDAKALIQDMVGKDCMLISDAVTEDIFKKSGKIASCVEDLINGKEYRGKELLKVREEYRKYKNLLKKEEDNTTEIPRIRVGIDRRTLKAEDKKLHYQNEYWSNKDVIYNIYIYTENEKVIKLLEIVFNILERTGIGTDTTIGCGAIAFIKEGKNIFKKDDTIKLAFKKEGGINIASTIVDQNYLVDIDIQNYVINRYDSKSPNIKKPPYYYIERGCIINKEEYVPPQLKEYKGIWVYNCVFPVERSNK >NZ_CP042243.1|WP_148808690.1|798424_799075_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 MSKLVKIKTLKTVMKVISGIRIVGNSTEINIGGIDNPIIKEPLEGYPYIPGSSLKGVMRSLAEKSKGLDSLCDCDNCKICTLFGSAKADSKSLRRLIVRDSYLTENSKKILDKFLPYGAEIKKENTINRTTGKATPRTLDRIPKGVSFNIYFTIKLYENDKEEDYISFLKSLLKMIEFSGIGGSISRGYGQVSFSELKIEDTYDIEEELNKYLNNN >NZ_CP042243.1|WP_148808689.1|796347_796815_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm2 MGSVFSEINTMIKKGFMENGKLKIEVIDKIDYLSDKINKLKISNSSIRKIYDNLKDIELKVNKQVLRNLSENEQIDFDEEEKKAFKEIKVDIKLMKSKINYILERKIENEKKNKYEYINLKNFLSNCLNKIETKEDFKGFLDLLECIIGYMKDQL >NZ_CP042243.1|WP_168198226.1|793935_796347_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 MNINEKLCVAIGGLFHDIGKVLRRSRLKSKGKSHSIQSEKYVKDYFSNIDFLKDEELELIEYIARYHHVSDENISKALKENSMMEEVLKYIKYVKKADGESAGERKIEGKNKRSIEDNPFTNMLSLMWQAFNDRKYNSNFNYFRPNIFSRLNMPKKYIEKEEISSYVNIMKNELGRDLDNLRQYNERFKEHEDEFVACLQYLMKEYTSYITSCGKEIVRDISMYNHSVTTAALALCRCIDEKDKQRINEYILLHGRIYDIQKYIYGDINKRIEKPLRRVLTRSNIISILNTIIPYEIIQELKLYTTNILFCGGGTFSLLLPKKYEDEAEKIIERIKKKVAEIFENKIYIEYVLKTINVRDKKKEYSYKTHKKYMKEFYEYKKDFQKANNELNQKKYNRSIYLIDFNKNCKEEYYKCSNCGINTKRRDKCSICQIEENWMDKDIYDVKIAYEKMRVENIEAYEKLEATKKGQTVILFDEKNIEKYKDKYPIGGIYPVGKYSIPKSNELCKKCSIKDICDEKSDGKILSLTCIEKLSKNERLVATAKIDLDDMAFLMYYIYPVSKKDKKSKNVEKYPFAISRLANLADLINVFFTQHLVSVVKNKYTEDIFILYSGGDDILLTGNWERVYDFVLEINKTFNRYIGQKSEKRNITLTSSIVLHKATRPFNMVLKEVNRNMSLAKETKNLVIINEVIQEQESRFRGICINYKNLKKAKKIISKYTEWIEEEKISRGLLYDLVTIMNMRKKGGIEALKGASILNYILEKNEVDIDISNEIKALIKEKEIDLSIFILKTAIRKSKKEEL >NZ_CP042243.1|WP_148808687.1|793289_793646_-|oxidoreductase MAINYYREGYNCAESIIQSVNEKKKINIPVCIGSPFGSGMSTGSVCGAATAAVVAIGYLKGRNHSTEQNKAARYSKDLIKKIREKFGSEICIDLKRKGVSCKEIIQFVDDYLKTLTQE >NZ_CP042243.1|WP_148808686.1|791905_793246_+|hypothetical-protein MKMNKKKLLNISLNIVMLVVLQVMSYYGKIYYEGYKDLKNNMYYNFEDFGEALETFNDELSKILVLGYDDFDKKKEFIDESIVRAFHRSNWDASDMGKGKAIYDYDFMYLNINKVIHNLLDDGNITLSEEKYIKSLYEYNEELIKEYNNILGDVRYNWNFGKIHALEKRIASIYNDYSQKADKLLETPKYKFLKEYEGEFKEVGFEHAKAYCEEVFSKLVKNQRLKYDNKDEANNDEYVFKNYKELDHNKELFTVKNDISDIDYKVTYNKKTKKVTVMAVSYIVPKKKYKEDELDNIVKNTIAKFNQNVVNYYKSKKYDSEGKLSYITYLYIEKNNDIYDEMKKIKINIKIHGLISKLEIIDHNDKPIILPNVSKKDILSKIDKEAEIIDAFIIRNMKGTAYVVHLKYGDTLYEAVFDGEDGKIIYYGRNIKKDYLNNLNKKNKND >NZ_CP042243.1|WP_148808685.1|790321_791671_+|FAD-dependent-oxidoreductase MKKTDLLIIGGSAGGLLTATAARKLYGDIKITLIRKNKKVMVPCGIPYIFGTLNDTSKNQIPDALLSNAGVELLIDEVVKIDRDKKMVITADNTEIEYDKLVIATGSLPIVPKFIKGYDLENVFPIVKDEEYLKDILEKVKNMSDIVVIGGGFIGVEFAEQMKMAGKNVTLVEVADKCLWQAFDEEFSSDAEEQLKNNGVIVKTKTKVEEIIGDTKVKEVKLSNGETIKADAVILGMGVSPNSVLAKDAGIKVNEKAAIIVDEYMRTNDSDIFAVGDCTEKKCFFTGKNTPILLASTAAMEAKIAACNLFQLKYVRKIKGTISAFSTKVFDKAFAAAGLTERKAKEEGFDIVIGRASTMDKHPGSLPNTGKIDIKLIFAKDTGIILGAQISGGDSIGEMVNILSMAVQNSMTANELNTYQVATHPLLTASPIAYPINAAALDALTKLNK >NZ_CP042243.1|WP_148808684.1|789791_790154_+|DUF134-domain-containing-protein MSRPRKWRRICNMPKIDVFGPCIRDININETIQMTLEEFETIRLIDYEGLSQEECGQIMGVARSTIQRIYNDARKKIADSIINGKYLKIKGGNYKLCDEIEGMNICKGCVRKRHRGGRNI >NZ_CP042243.1|WP_148808694.1|803207_803747_+|hypothetical-protein MTQSIIFALIGVFLITAFTNVLATLKTILISKKIMNPVYFLVFLDAMIFATIVAKMTSSKGIHFTIAYALGKTMGVFIGGKIEERLALGIFEVDVFFNNKNKMIQIAEKLREAGYTVNNFLARGNNGYKRYKVEVVIKRKEFNVLEDIMDACGVHNPTLKIKNVNKINGKITTTRIKAV >NZ_CP042243.1|WP_148808695.1|804046_805789_+|phosphoadenosine-phosphosulfate-reductase-family-protein MWCKICNKIVNDKKCPDCGNRTQEDIPIKVYWCDTCSIPIIKEVNDKTIHQCPLCEDEIKYIGKDLRPVFPEERLLIEVLKDKPLKYKDASVWSSANRYYINGSRYRISTKEMKEANPNKIRNQILKYQEKNKNTYNGFYEIIKKFIKANKERLNKLKNEAHSFIQKSREGYKDIQVIVSFSGGKDSTVVSDLVMKALSNPKIVHIFGNTTLEFPLTIEYKDRFRKNNPKTILREAKNTDQEFYTVCDEIGPPSRVMRWCCTMFKTGPINRVISSIFREKSVLTFYGIRKFESTSRSKYDRIYDSPKILKQKVAAPIFNWRDIDLWLYMLAENLDFNDAYRLGYDRVGCWCCPNNSERSHFLNEIYMPDQTKKWRNYLIDFAKKIGKPDPEVYVDSGNWKARQGGYGVDAAKDVKIVYTNCTTEVNAKIYSLNRPLSDEFYNLFIPFGKVSKELGRKLIGEVLVLHPKTNIPIISIQPFKTDEYETSVKIQTLNVKDYDKVQRMISYQVRKYNACKKCLGCETVCIYRAIKVGNDGYKIDENKCKRCMKCVTAKHLEYGCLMGKYLFTASSSEEDNWSEI >NZ_CP042243.1|WP_148808696.1|806701_810358_+|hypothetical-protein MNKHVQPISEFIHTAPGFQYSINLKYDLQSVEKIQNYIATSSAMDIIEDILLSVSLSSNDRARLLIGPYGKGKSHLVLIIIALLYYKDKELFINILDKIQKYNEDLYKLALKIIEDKEKILPVIISGNSLNLNQSFLAGLKNALLSEELVDIMPNTYFNAAIDMINVWKNRYQVTYEKFRQMINVSIEEFLKGLEGYNQDFYNKFIQIYPSLTSGGEFNPLQGIDVVEIYSDVASKIKDKGYKGIFVIYDEFSKFLEGSIDRNSAMEIKMLQDFAEKCNRSADKQIHIMLISHKNISNYVDRLPKEKVDAWKAVGDRYKTIEINNLSNQMYEIMSHVIIKERNSWERFISYNQDKFNSLILEMSRNAIFSELGQDLENTVVYGGYPLHPITTYILPKISEKVAQNERTIFTFLSTRQQNTLGHFLMNNKNDFPLMTPDYIYNYFETLFKKENYTSEIYKIWRDTTNALKKIGEKEKIEEKIIKCLGLIYIVGEFQKLPPTFEIIKLILSSTIEQGNLDTIIDSLLQRKILYHIKSKGYLKFIEATDVDVNALISDTIEKRKNLFSNKKVLNDNFYDNYIYATAYNDEHEIIRYFDFEFIEYRELAETSDWEKKIECKISDGIVYAVLIDNEENLVESKKIIRNIHHERIVFILPNQILQFKSLLQKYDAIEYLIGKNQYENQDKLLHEELNVHLDDVKEQILNYLDIFLKPELGAATYYYIGKEQKINRKSLLSRLISEICEKVYSHTPVIINELINKNEPTTVAINNRRKVLDGLLQNKVLPRLGLVGYGQDVTIMQSTLVVTGILREEADNEENKAYLCTKGLEPKIQNVIDTIRTFLIDTSKNGRMTFDKLYDKLTKPKWHIGLKKGIIPIYIAVLLHEFKKYAVISRNGYEMEITGRLLDDINDKPEEFEIYIENWDEQKEKYIQGLENIFKEYIVDGEKEYNTFEYIVRAIYRWFLQLPKYTKEYRKVYLGSSNFDNLDTHIIKLRNSLKGTRINSRDFLFDKLFKIFGYEDFNTNIILDIKQVKITLDNNKKYLIEHLALDIKKIFMKHYNEQVSLYSVMKDWYEGLDNYTKNNLFNLGEEKFLQEIKNITNDYISFIEKISKIITGLRVEDWNDQTIDKFINEVKKYKENIEKFNEELQQEGNEKVEQRSYKISFFTENGEEKTKTFEKVKLSDEAELMYNEIESIFDGYGESIDISEKRQILMKIFEKCC >NZ_CP042243.1|WP_148808697.1|810432_811593_+|aminotransferase-class-V-fold-PLP-dependent-enzyme MDNIIYFDNAATTYPKPEEVYTFMDKYYREFGVNVGRGQYTTASKANKIVEETRELIRELFKCSIDKKVIFTPSATEAINIILQGINWQGEENVYITHFEHNAVLRLLYQLKEKYNIKINFLHTEKKPLFYDIEKIKHQFQDIKPDVVIMTHASNVCGLITPIKEITELAKVYNAQVAIDCAQTAGLLDIDMKKIDADYLIFAGHKTLYGPFGIAGFLMDERSTLKPLLYGGTGIDSANPNLPNTIPEKFEVGSLNVYAIAGLNAALKWINKIGRENIYKKEKEMTTSLITCLESFDNIRVITASDAEKQIGVVSCVFEGYGSDIIGQVFDQYNIAVRTGLHCAPEAHRFLGTFPGGTVRLSLGYFNSKEDITKLHNILEYIYLDS >NZ_CP042243.1|WP_168198227.1|811676_813824_+|DUF262-domain-containing-protein MNLKEIFEKSDEDRLVLPDFQREFEWNKDAQKRLLSSFFVSIPIGSLLILEGKKDDFLSKKLCFAGETIEPTEECLYLLDGQQRVSSLRSTFYDFFQDKHNWLNIWEKMYSGLRNRWFLKIKPDNEEEDVFGWRMLNFKGLKYCEPSDLINCFEHRYIYKRKSTDWYHPGYKLYDKEGKELEGSRLKNKLAREAAKMGLVPLYSIYGSIKTTDKQLHTYVLEKIAKERVEELQAEVEDGKIDVFEIFQEIEPDIEEYIENNEIEKIRDAWSRLSAKWSESVNKFLVGLFEQEIPTIDLPSDQISRAIAIFENINKGGTPLDTFDLIVAKAARTKGERSLSQRISDYLEEEIDLSEALTNDLVDKVPDKWDSTLVMTIDENKITKTIKNQYLNLLSLFSHVPYGEVDKLKLEYIKRAKIFELTHEQINTNTNITLKALTRACAFLQIRCGLIDIKSLSYDLMILPIAYILKNDDVYEDKRALARIEYWYWSSLFSGAYRERQNEQCIKDIKNLFEWIKGGENKFKIRYENILNDIGYSDKTVLLRKDQEHNIPKAIHNGILQYILSKQPVDFLPNAQEKLRLNAWEIGGKKIIEIDGNKQTISVEDHHICPLGTVTKIGETSKKLRNDKKHILNSILNRTYISSIANAKISDKSPERYMKYVMDSAQWGHYLPIKMKEIFEEKGKSLEQKYEAILENRYNMLKRAIKEELDRLEDM >NZ_CP042243.1|WP_148808699.1|814183_816373_+|DEAD/DEAH-box-helicase-family-protein MSLQDIDIKDEYRSLIDNVVKDFYIPLLQKASEYKRAVGFFSSSALIEISKGIAGLAKNGGKILMVASPYLSDDDVEAIRKGYELRDKIIRRALVRELNEPKDLYEKDRLNLLANLVSDGILDIKIAFTEDKNKMGMYHEKMGIISDALGNKVAFSGSMNESATAMMINYETIDVFCSWKNQFENEKVNAKESTFTSIWTDCEPNIRIIDFPNLKQEIIDRYKKSTPNFNIDEQEFGERSVVLETKTKYRLGAVIPTNIKLYDYQIEAIDKWEKQDFKGIFDMATGTGKTFTGLGAVARLSEKLDDRLAVVIVCPYQHLVEQWVEDAKNFNIMPIIGYSNSPQKDWKKRLSTSVRNQKLKVRGRDFFTFICTNATFKSKIVQEQISKIKNNLLLVVDEAHNFGTEGIRNLLDDRFTYRLALSATLERHNDEEGTQKLYNYFGEKCIEYSLEQAIKEKKLTPYKYYPVVTTLTEDEREIYSKLSYEMSRNLIKGKNGKLKLSKYGEILALKRARIVAAAKEKIDVLREKIVPYKNDSYILVYCGIANVIDDNQDYSIVDECDLRQIDVVTNLLGNELNMKVSQFTSKEDIEERKILKEQFAKGEQLQALIAIKCLDEGVNIPKIKTAFILASTTNPKEYIQRRGRVLRRAEGKDFAEIYDFITLPRPLDEVSSLTIEEMKRDISLVQNEIVRMEEFGRISMNAMDSYSLIWEIRELYGLNDRDLEFIQDI >NZ_CP042243.1|WP_168198228.1|816384_816549_+|hypothetical-protein MANVNGIEIDEKKAQRLLKKLILMEKNNIRTKQNSDPDMVKKIKKMIEEEVGCY >NZ_CP042243.1|WP_148808700.1|816539_818522_+|AAA-family-ATPase MLLKSLKLSNFRQFRNEEVQFSTDSDKNVTIIIGENGTGKTTFSQAFFWCLYGDVDFKDKSMLNKIVASELTPDKSATVKVILSLIHAGTEYEIIREQVYKINYSGKLKGLNSTLNIQYKKNGQQEFLKPLEIEPRIKEILPKELSKYFFFDGERIEKMSKEIQSGRKSYEFAQAVRGLLGLSAFISALEHLKPTSKGVIGSYENSYDAKSNINIARYTDEIDKYKTQLEKIENRLKEIENEILKSEDRKKELEKIIQKYAEGEKLQNQKKNLINKRSSTLNSKRITIDKLLREFNDKASSYFARSMIKKSLEILGNGDFTNKDIPEMHAKTIDFLIKKGTCLCGTPLEVGSKEYNNILSLLQYLPPQSIGIAVGQFIKESQMRAKTSRDLFESYSSTLAVIEEQNDTIAAYDNEISLIEKNLVGIESVAPYQSELQICEKVIRDRTREKDELIEQRGSITTKKERANTERQALTLRDETNKKIEIYKAYAQYMYDEIKKVYKENENFTRKKLEDTINNIFKDIYQGGLSLTIDENYNIAVLVDDYEQFSNVETSTAQSIAVIFAFISGIIKMARESNTSNDERVKMLASEPYPLVMDAPLSAFDKRRIESVCKALPNIAEQVIIFIKDTDGDLAKEHMGEKIGKQYRFDKLNEFETVLN >NZ_CP042243.1|WP_148808701.1|818533_819058_+|hypothetical-protein MFDKEYSFKGSHAKKVNRLTGQFDEHSKSKIFSRNIDVYIVAPLIGFLYGRKSPLNNEDKESAKIMGDMIIKSAEDLKYNLRLILLLDEKYEPDEKERINRAFKFLGSEKTVKQDLELFESYVRGGVDVLYEKIMEPSNEYMNNLYDFLEEFDDRFNQTISDDSIVDLCKLARS >NZ_CP042243.1|WP_148808702.1|819066_820146_+|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MISDNKRSIILKNLQTLAKNKGYLTFDNILDISEKFDIKIDDVDRISESVLDSGIIIKDTDDEKEDKSNIDRSRIDYNEIYDKVLELDSTLKSYIKFIKKVPSPAVRELQHLIYQAKDGNKYAVSRIVYMYSKMVIKIALSFSEKLHLPIADTIQDGIVGLIYAIDKYDPSSEGGFATYAPWWIRQYIQREAKIINSLIYYPVYMKEKIFSIYDIVLEHICDKCLENGYCPRLLSQIQGKLECDLEQVVWFLNQLQEYYSIESLIGDNNEVFNDNNLFEDIMIENINRDILKDRISCTLLQFKERERKVIEKRFGFKNDIEMTLEEVGKEFGVTRERIRQIEYKVLKRLKHLSRRKRLK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP042243_2 | 2.11|802563|34|NZ_CP042243|CRISPRCasFinder | 802563-802596 | 34 | NZ_CP041069 | Bacillus megaterium strain KNU-01 plasmid pKNU_01_5, complete sequence | 47763-47796 | 5 | 0.853 |
NZ_CP042243_2 | 2.2|802101|33|NZ_CP042243|PILER-CR | 802101-802133 | 33 | AP013737 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C40-MedDCM-OCT-S36-C23, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 27054-27086 | 7 | 0.788 |
NZ_CP042243_2 | 2.2|802101|33|NZ_CP042243|PILER-CR | 802101-802133 | 33 | AP013445 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G17, isolate: uvMED-CGR-C40-MedDCM-OCT-S28-C16 | 35027-35059 | 7 | 0.788 |
NZ_CP042243_2 | 2.22|802562|36|NZ_CP042243|CRT | 802562-802597 | 36 | NZ_CP041069 | Bacillus megaterium strain KNU-01 plasmid pKNU_01_5, complete sequence | 47762-47797 | 7 | 0.806 |
NZ_CP042243_1 | 1.8|179942|36|NZ_CP042243|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 179942-179977 | 36 | NZ_CP012484 | Bacillus cereus strain NJ-W plasmid unnamed35-36, complete sequence | 8772-8807 | 8 | 0.778 |
NZ_CP042243_1 | 1.10|180070|36|NZ_CP042243|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 180070-180105 | 36 | NZ_CP017574 | Bacillus thuringiensis strain SCG04-02 plasmid PSCG364, complete sequence | 321716-321751 | 8 | 0.778 |
NZ_CP042243_2 | 2.4|802098|36|NZ_CP042243|CRISPRCasFinder | 802098-802133 | 36 | AP013737 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C40-MedDCM-OCT-S36-C23, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 27054-27089 | 8 | 0.778 |
NZ_CP042243_2 | 2.4|802098|36|NZ_CP042243|CRISPRCasFinder | 802098-802133 | 36 | AP013445 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G17, isolate: uvMED-CGR-C40-MedDCM-OCT-S28-C16 | 35027-35062 | 8 | 0.778 |
NZ_CP042243_1 | 1.1|179492|35|NZ_CP042243|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 179492-179526 | 35 | MN693548 | Marine virus AFVG_25M358, complete genome | 34739-34773 | 9 | 0.743 |
NZ_CP042243_2 | 2.11|802563|34|NZ_CP042243|CRISPRCasFinder | 802563-802596 | 34 | NZ_CP053838 | Aliiarcobacter faecis strain CCUG 66484 plasmid pAFAEC, complete sequence | 18644-18677 | 9 | 0.735 |
NZ_CP042243_2 | 2.15|802097|38|NZ_CP042243|CRT | 802097-802134 | 38 | AP013737 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C40-MedDCM-OCT-S36-C23, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 27053-27090 | 9 | 0.763 |
NZ_CP042243_2 | 2.15|802097|38|NZ_CP042243|CRT | 802097-802134 | 38 | AP013445 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G17, isolate: uvMED-CGR-C40-MedDCM-OCT-S28-C16 | 35026-35063 | 9 | 0.763 |
NZ_CP042243_2 | 2.8|802366|35|NZ_CP042243|CRISPRCasFinder | 802366-802400 | 35 | KY554777 | Lactococcus phage LW81, complete genome | 102342-102376 | 10 | 0.714 |
NZ_CP042243_2 | 2.11|802563|34|NZ_CP042243|CRISPRCasFinder | 802563-802596 | 34 | NZ_CP011156 | Bacillus cereus strain HN001 plasmid pRML01, complete sequence | 88850-88883 | 10 | 0.706 |
NZ_CP042243_2 | 2.22|802562|36|NZ_CP042243|CRT | 802562-802597 | 36 | NZ_CP053838 | Aliiarcobacter faecis strain CCUG 66484 plasmid pAFAEC, complete sequence | 18643-18678 | 10 | 0.722 |
NZ_CP042243_2 | 2.19|802365|37|NZ_CP042243|CRT | 802365-802401 | 37 | KY554777 | Lactococcus phage LW81, complete genome | 102341-102377 | 12 | 0.676 |
1. spacer 2.11|802563|34|NZ_CP042243|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP041069 (Bacillus megaterium strain KNU-01 plasmid pKNU_01_5, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.853
tatattcttaaaattttatataac-aacaactata CRISPR spacer tatatttttaaaattttacataacaaataattat- Protospacer ******.***********.***** **.**.***
2. spacer 2.2|802101|33|NZ_CP042243|PILER-CR matches to AP013737 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C40-MedDCM-OCT-S36-C23, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
tttactctcaataattcaacagaattaatattc CRISPR spacer gtatctctaaataattcaacagtattaatatct Protospacer * **** ************* ********..
3. spacer 2.2|802101|33|NZ_CP042243|PILER-CR matches to AP013445 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G17, isolate: uvMED-CGR-C40-MedDCM-OCT-S28-C16) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
tttactctcaataattcaacagaattaatattc CRISPR spacer gtatctctaaataattcaacagtattaatatct Protospacer * **** ************* ********..
4. spacer 2.22|802562|36|NZ_CP042243|CRT matches to NZ_CP041069 (Bacillus megaterium strain KNU-01 plasmid pKNU_01_5, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
ttatattcttaaaattttatataac-aacaactatat CRISPR spacer gtatatttttaaaattttacataacaaataattatg- Protospacer ******.***********.***** **.**.***.
5. spacer 1.8|179942|36|NZ_CP042243|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP012484 (Bacillus cereus strain NJ-W plasmid unnamed35-36, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
ttaaggaaaatatacaagatttaaaaactgcaaatg CRISPR spacer cgaaggaaaatatagaagaattaaaaacaataaaag Protospacer . ************ **** ******** ..*** *
6. spacer 1.10|180070|36|NZ_CP042243|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017574 (Bacillus thuringiensis strain SCG04-02 plasmid PSCG364, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
attttaggttcaaattcaattgtaaatggaaaatat CRISPR spacer tttttaggttcaaatacatttgtaaatactacatct Protospacer ************** ** ********. * ** *
7. spacer 2.4|802098|36|NZ_CP042243|CRISPRCasFinder matches to AP013737 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C40-MedDCM-OCT-S36-C23, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
ttttttactctcaataattcaacagaattaatattc CRISPR spacer ttagtatctctaaataattcaacagtattaatatct Protospacer ** * **** ************* ********..
8. spacer 2.4|802098|36|NZ_CP042243|CRISPRCasFinder matches to AP013445 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G17, isolate: uvMED-CGR-C40-MedDCM-OCT-S28-C16) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
ttttttactctcaataattcaacagaattaatattc CRISPR spacer ttagtatctctaaataattcaacagtattaatatct Protospacer ** * **** ************* ********..
9. spacer 1.1|179492|35|NZ_CP042243|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693548 (Marine virus AFVG_25M358, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ataggttcggtaaaaattttaaatgcaaatgaaag CRISPR spacer gtaacaacagtaaaaattttaaatgcaaacgtaac Protospacer .**. *.********************.* **
10. spacer 2.11|802563|34|NZ_CP042243|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053838 (Aliiarcobacter faecis strain CCUG 66484 plasmid pAFAEC, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tatattcttaaaattttatataacaacaactata CRISPR spacer caagaattaaaaattttaaagaacaacaactata Protospacer .* . .* ********* * *************
11. spacer 2.15|802097|38|NZ_CP042243|CRT matches to AP013737 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C40-MedDCM-OCT-S36-C23, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
attttttactctcaataattcaacagaattaatattcg CRISPR spacer attagtatctctaaataattcaacagtattaatatcta Protospacer *** * **** ************* ********...
12. spacer 2.15|802097|38|NZ_CP042243|CRT matches to AP013445 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G17, isolate: uvMED-CGR-C40-MedDCM-OCT-S28-C16) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
attttttactctcaataattcaacagaattaatattcg CRISPR spacer attagtatctctaaataattcaacagtattaatatcta Protospacer *** * **** ************* ********...
13. spacer 2.8|802366|35|NZ_CP042243|CRISPRCasFinder matches to KY554777 (Lactococcus phage LW81, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tttatttgatttatctattgcccctattgttatta CRISPR spacer cattgctgatgtatctattgcccctatttttagat Protospacer . * .**** ***************** ***
14. spacer 2.11|802563|34|NZ_CP042243|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011156 (Bacillus cereus strain HN001 plasmid pRML01, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
tatattcttaaaattttatataacaacaactata CRISPR spacer cctaaaacaaaaattttatataactacaaccatt Protospacer . ** . *************** *****.**
15. spacer 2.22|802562|36|NZ_CP042243|CRT matches to NZ_CP053838 (Aliiarcobacter faecis strain CCUG 66484 plasmid pAFAEC, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
ttatattcttaaaattttatataacaacaactatat CRISPR spacer ccaagaattaaaaattttaaagaacaacaactatat Protospacer ..* . .* ********* * **************
16. spacer 2.19|802365|37|NZ_CP042243|CRT matches to KY554777 (Lactococcus phage LW81, complete genome) position: , mismatch: 12, identity: 0.676
ttttatttgatttatctattgcccctattgttattac CRISPR spacer ccattgctgatgtatctattgcccctatttttagatt Protospacer .. * .**** ***************** *** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
963019 : 973378
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP042243|963019:973378|DBSCAN-SWA ATTAAGCAAATTTTGTATTTTTCACAACCCATTTTTTAATGGCAATATTAGCCCAAAATCCATAAATACCTAAAGTAATAAAACATAATAGTAAAATTTTAATCCATTGACCGAACAATCCCATTGCTGTTCCAGTAAATTTTAGTCTCCTACCTTCAATAACTGTGTGTTCTGCAATCCATCTTTCTTTTAGGCATACAGCCCATGGTAAACATATTCCAGCAGTGAATACAGTAATTAAAAAGCCTAATATACTTATTCCGACAAGACCAAGTAAACCACCATCAAAATATGATTCTGAAGCAGAAGATGATGTTTGTATATTTGTATTAATATTATTAATGTTTATATTCATATCTGCATTTGTCATCCTTTCGTCACCTCCTTTTCCAAAGCAAATTATATAATAATTATTATGTCAAAATCCTCAAAATATTGTCGAAAGCTAATGTTTTTTAATATTGTCGAAACATACAAGAAAAAGGCGAACGATAACGCTATAGTGGACATTTTTTTTGGTACAATAGTATATGCAGTAGGCCTACAAAAAATTTTTTGTGTTATTCATACGATTTTTAGAACAACACAAACATAGTATTTGCAATGGTTGTAGCGTTGTTGTATAATACAATTACAAATTTGGTATTGAATACCATAAGAGGTAGTAGTATAATTTAAACAGAACATGTGTTCGATATAAATACAAAAACGCCTCGCCATGTAGAATAAGGGGGAATATATAGTGAAAAATACAGAAACTAAAGAAATTAATATCGACGTACCTTATCTAAAGGATTTAAAGATAAAAAATAATATAATTATAAATTCTAAACATAAAAAATAACAACTGATCTTTTGATCTAGTTGTTATTTTTTTAGGTATGTTTTTTTAAAACATCAAGTATTTTTTTGATGTCTTCGGGTGGAATTTCTTTATCTTGCATTTCTTTTGCTAATGTTAAGTATTCAACCCCTATATTGCGAAGTTCTTTTGGAACTTGATCTCCTGTAACCCTTATTACATCAGGATCATCTACAATTCCTAATAAATAATCTGTAGAAACATTGAAATAATTAGCAAGAAACTTTATTGTATTTGTATCTGGGTCTCTTCTTCCTTGTTCATACATACCTATTGTACTTGGTGATACATTTAATAGCTCAGCTAATTCCTGCTGAGTTATTTTCTTTTTACTTCTTAAGTGTTTCAATCTACTACCAAACATAAATATCACCTCTAAAACATTTTAACACATAATGTGTTGATAAAAAATATTTCACACAAAAAGTATAAAAAAGCATTTGACATCACACAATAAGTGTAGTAATATTAAATTAACGAATCACACTTAAAGTGTAGAAAGAACATTACTAGTGAGGAGGTGTTTTAGTGCAATCTCAAGAACGATTAAAAAAGTTTAGAGAAAATAAAAATCTAAATAAAGAACAAATGGCAAGTTTACTAGATATTTCAACATCATTCTACGAGAAAATAGAAAAAGGAGAAAGAAATCCTAGTTATAATTTTATTAAAAAATTTAAACGTAAATTCCCAGAAGCAGATATAAACTATATTTTTTTTAACATACTACTACACGAAAAGTGTAAAAACAAAACTACTGCCTAACTATATTTTCTCACACTTAACAACACAAAAATAGCTGTAAATTTTGGCAAAGGAGGGAGAAAAGTGGATAAAACATCAAAAAATCTTTACGCAACTCTAAATATTGAAGTTAAAGAAAGTAATAAAGAAAAAGAAGCAGATTGCTCATTGATTGTTAAAGCAACCTGCAACAGCAAAACAGAAGTACTAGTAGAAATTAACAATCCTGAAAGGTGGTGAAAAAATGAAAACTTTAGAGCAAAGAGTAGAAGAGTTAGAAAAAAGAATAGCTGAACTGGAAGGGCGAGTTCCAGAACAGCCAAAGAAAATTAGCACTCTAAAATTCAAAGAAATAGAGAATATAACTTTCTCTGAGTTAGAAAAAGATAAATTTACTTGGTAAGATGAATCCTTTTGATATCTTCTAAGATTTTTTCGTTATTTTTTATTATAGCAGTTGCTATAACATCACGTATAGCATTAGAGTCTATAGTTTTTTCAGGAGATATAGCATTTTTTAATATAGCATCTATTTCTTCATGTGAAAGACCAATTTTATTCATAATTTCACCTCCTTCCTATTTCCATATTTCTACAGGAAGAGAGTGAAACCTTCATACAAATATCGACAAAAGGGGGCAATAGACAAAACAGGAGATGGAATCAGATGAAACTGTATATCAAAGAGATTAGAGAACGCAGAGGATTCAGCATAAGACAATTATCAGAGCTATCTGGTATATCTAAGACATATATAGCTGAGTTGGAAAGAGGCACTAAAAAGAATGCATCAATGAAAGTTCTTTGCAGATTAGCAAAAGCTTTAGACGTTCATGTATCAGTTTTATTTAATTGTGATGAATAGTACAAACTAGAAAATTCATAAAATTTAGCAAAAGAAAAGAAAGGGGAGTGACAATTGGCTAAACAAAAAATAAAAGTTGTTGTAAACATTCCAGATAAAGAATATGCATCAGAATTGAAAGCAAAAGCAATGGCTGACATTATAGCAGCTAGAATAAGTAAACTCCCTTATGAACAACAGATATTAGCATACGAAAAAATTGAAAGAACATATGAACAAAGGGGGAACGAAAGATGAAAGAATTGATTACAAAACCAGCTACATTAGATAGCAGAGAAGTAGCTGAGATGGTAGGGAAAAGACATAGTGATTTATTGAGAGATATAGAAACATATATCCAATATTTAGAAAACGCAAAATTGCGTTCTCAGGATTTTTTCTTAGAAAGCACATATAAAGCAGAAGGAAACAACAAGACATATAAGCGTTATAACGTAACCAAAAAGGGTTGTGAGTTTATAGCACATAAACTAACAGGACAAAAAGGAGCAATATTTACTGCAAGGTACATCAATAAATTCCATGAAATGGAGCAACAATTATCAGCACCTTTACAACAACTTAGTCCGCAGCTTCAATTACTTATTAATATGGAACTGGAACAGAAAAAGCTTAAAGCAGATATACAGGAGACCAAAAAAGAGCTACAAGACATGCGTGATGTAATCACATTAGATACTACAAGTTGGAGAACAGATGCAAGAAATATAATTGTCAAAATAGCGCAAAAACTAGGTGGTTTTGGATATATAAAAGAGGTTAATACAGAAATTTATACGCTATTAGATAAGCGTATGGGGACAAACTTAAAACAACGCTTGACTAATAAGAGAAGAAGAATGGCAGATGAAGGAGTTTGTAAATCCAGAAGGGACAAGCTTAACTATCTTGATGTAATTGCAGATGATAAAAAGCTTATTGAGGGTTATGTGGCTATAACGAAGGAAATGGCAATTAAATATGGAGTGGCATGAGGAGGACAAAAGATGAACGATTTACAAATTTTCAAAAACAGAGAATTTGGGCAGGTAAGAGTAGTTACAAAGGATAACGAGCCTTGGTTTGTGGGAAAAGATGTAGCAACAATTTTAGGGTATTCAAATGCATCTAAAGCAGTAATGGTACATGTTGATGATGATGACAAAATTAAAGAAATGATAGCACATTCCCAAAATGGGAACATGGTTAAAAGTCAAACTACATTAATCAACGAAAGTGGACTTTACAGTTTAATTCTAAGTTCTAAACTTCCGAATGCAAAGAAGTTTAAAAGATGGGTAACAAGTGAAGTTTTACCTAGCATTCGCAAGCATGGAGCATACATGACAGATGATACATTAGAGAAAGCACTAACAAGTCCAGATTTTCTAATTCAATTAGCAACAAAGCTAAAAGAAGAAAAACAGAAACGAATTGAAGCAGAGAGAAAAATTGAAAAGGACAAGCCTAAAGTCCTATTTGCAGACGCTGTAAGTGCTTCTAAAACTTCAATATTGGTTGGAGATTTAGCAAAGCTTTTGAAACAAAATGGTATTGATACAGGAGCAAAGAGACTATTTAAGTGGCTAAGAGATAACGGCTACTTAATAAGGAGAAAAGGTACAGATTATAATATGCCAACACAAAGAAGTATGGAGTTAGGATTATTTGAGGTTAAAGAAACATCTATAACGCATTCAGATGGGCATGTAACGGTAAATAAAACTCCAAAGGTAACTGGTAAAGGGCAACAGTATTTTATCAATAAATTTTTAGAAAAGAGTGCGTAAATGGAAAGGGAGAGATATAGGGATGAATCTAGATGATCTCAAAGATGTAATAAAACAAACTATTGAGAAATCTTTATTAAAGCAAAATAAAGTGACCTTAACAATAGAAGAATGTGCTAAATTCACTGGTATTGGAAGAGATAAACTTAGGGAATTAGCACATAGCAAAAATTCTGATTTTCCTTGTTTCAAAGTTGGAACTAAATTTTTAGTAAATAAAGAAATGCTGATGGTTTGGCTAGAAAAAATAACAAAAGAAGGAAGGGTATTATAAATTACCGATAGTTTTAGTAAGTGTTATCTAATTTAGGACAAGCCTAGAGAGGGGGTGGAAGGATGGGTACAGCAACTAGAAAAATAGATGAAATTGAACATGATCGAAATGAAGTTATAGCTACATTGAAGTGTGCTAGAAAAGTGATGCAAAATTTAGAAGAAAACAATATGAGTTTATTGGTTGATGTAACAAATCAAGTATATATCAAAAACAATAAAAATGGAATATTAGTATGTCTTAATGATATGCAAGATGCGTTTAATGTAAAAGTTTTAAAAGAAGATGAAAGCATGTAATAAGTTACTTTATTTTTACAACTTTATCGAGTTTGCGGTGTATGAAAGAAAGTGTAGTTAATAAGTCAATAGCATCATTTTTATCAATATACCATTTTACTTTAGCTTCATGAGCTAAGGGGGTTCGAAACATATTAAATATTCCATAAGAAAGGAGGTGTAATGGTGAACTACTGGGGGATATTCTTCATGACTGCAATAGTGTTCATTCCGTTGATTCTTAATTACATGTTGCGGCATGAACTAGAGGAAAAAGAAAAAAGCACTAAGGTTGCTGCAACAACCAAATAGTGCACTAAAAAAACAACGTTACGTGTATTATAGCAGATTTTAAGAAATTTATACAGGGGGACTAGAGATGAATAGCTTAAAAATCGAAAAGAAAAGGTTAGATTACTTAATTTCGAAATACGGCGATTTGCAACATCCATTGGTGCAAAAGCAATCTCAAATTGTGGACAAGCTCGTTGTTGAGCATATGAGAGGGGTGACAGCGTGAAATGTAAAGTGTGTGGAAATGAGTTATATACAGATAGTTGGAGTGAATATGATTTTGGAACTGTAGAAACTATCGAAAGATGTGATAGATGTGGATTTTTAGAACACTGGTCATATGGGAGATTACTATTAGCACTAGGTGGAAAATGTTTCTATGATGGTCCCGCACATGGGTACATTGGAGAAGAAGTGAAAAAAGAGTTAGAAGAAGCCTACGAGAAATTTGAGAGAGCAATAAAGAGGACCAGGAAGTATTATAAGAGGTCGGGTAAATTTAGGAGGAGCAAGCATGCCTAAGAAAATTAAGTTTCGAAACGTTGTAACAGGAACAGTAATAGAAGTTGGTACAGGTTTAGTTGATTATTATAGAGCGAATCCAAGTTTCAAAGAGATTAAGGAGGAAGAAAAATGAAATTATATGAATTAACTGAGAATTATACAAACCTTTTAGACTTATTGGAGAACCCTGAGACACCACAAGAAGTTATACAAGAATCTTTAGGAGAATTACAAGAAGAGTTTAACGTAAAGGCAGAGAACATATGCAAGCTGATTAAGAGCATTGATCTCGAAGCGAAAGCAGTTAAGGAAGAAGAAAAAAGATTAGCTGATAGAAGGAAAGTATTAGAGAATAGAGTTTTGTACCTAAAAGAGTATTTAGACAGCAATATGAAGGCTATAGGTGTGAAAAAAATTAAAGGCAATATATTTACCCTATCAATACAAAAAAATCCTGCTAACGTGAATATACACACTACAGATGCAATTCCTAAAGAGTATATAGTTGTAAAAGAAGAATTTGACAAAAAAGCTATTAAAGAAGCATTGAAGAGAGGAATAGAAGTTCCAGGAGCTGAGCTCAAACAAACAGAATCGTTGAGAATTAGGTAGGTGTAAGAATGAATACTTTAAATGTAAATTATGATATATATTGCAGAATTTGTTCACATCAAGACGTGGAGCCAGTGAGCAGAGAAGAATTTGAGCAAAAGAAAGAACTACTTAGGAGTGAGGGGAGATAGGCGAAAGATGAATAGTAAAGCGATTAAATCAGTATTAGCTAAAAAACATAAAGAGTTATGTAATTCAATTAAAGATGAGAATGTAAGGAAATTAGTTGAAAAGAACACTATTATCACAGGCGGTTGCATTGTATCGTTATTAAATAATGAGGATGTAAATGATTTTGATTTTTATTTTAGGGATAAGGAAACAACATTAGCAGTATCACGATATTATGTCGGGAGATTCAATCAAAGACAAAATAAAAGTGTCGCTTCTGTAGTTGTAGGTAATCACATCAATAGATTAGAAGATATGTTAGCTGAAAATGAAGAAGAAATAAAAGAACTTGAAGAAAAGATTGTTAAAAGGATTCCAGAGAATTCAAAAGTTTATGATCCTGACAGAATTAGAGTATGGGTTCAATCATCAGGGGTAGCTGGTGAAATGCAAGAAGAAGAAAGTCTAAATCAAGAGAGTTTTGATTTAGATAAAGAAGAAAAAGAATCTGTAACTATTGAAAAATATGAACCTGTTTGGTTATCATCAAATGCCATAACACTAAAAGGTAAGGTTCAGTTGATTGTCAGATTTTATGGAGAACCTAATAAGATTCATGAAAATTTTGATTTTGTGCATTGTACATGCTATTGGGATTCAAGAACAGGCAAATTAGAACTACCTTCCAAGGCACTAGAAGCCATTTTAACTAAGCAACTTATATATGTAGGGAGTAAATATCCATTGTGTAGCATTATAAGGACTAGAAAGTTCATTAAACGTGGGTACACAATCAATGCAGGACAGTATCTTAAAATGGCTATGCAATTAAATGAATTTAACTTAAAAGATATTGATGTCCTAGAAGATCAATTAATTGGTGTAGATAGTGCTTATTTTGCAGCATTGATTGAACAGATTAAAACAAGGCAATCAAATGATCCTGGATTCACGTGGAATTTAGGATATGTAACAAGCATAATCGATAAGATATTTTAAGGTAGTGTAAACATGAACAGAAAGATAGAAGGAGTGAAGGAAGATGAATGTATATGAAAAGCTAATGAATATTCAATCGAAGCTAAAAGCTCCTAAAAATCAATACAACTCTTTTGGAAATTACCATTATAGGAGCTGTGAAGATATCTTAGAAGGATTAAAACCGTTATTAAATGAGCATAAAGCAATATTAACACTAAATGATGAAGTTTTACAAATAGGCGATCGATTCTATATCAAATCAACTGCTACATTCACAGATATAGAGAAAGGTGAAAGTATAAAAGTAGATGCTCTTGCAAGAGAGGATTTAAATAAAAAAGGAATGGACTTAGCACAAATAACTGGTAGTGTATCGTCATACGCTAGGAAATACGCTTTAAACGGATTATTTTGTATAGATGATACAAAAGACAGTGATGCAACAAACAATCATGGTAAGGGTGATAAGGACAAGCAGTCAAAGAAATTAAGTGAAGCACAAGTTAAAAGACTATATGCAATAGGAGCTAAAAATGGATATGATGCTGAATGCGTGAAGAAAGCAGTATTGAAGAAATATAGTAAAACAAAAGCAGAAGATTTAACTAAACAAGAGTATGATGAACTAATCAAAAACATAGAAGCTAATCCTAAGAAATAGGAGGACAAGCCATGAAATATTTGAGATTAGAGCGGGGACATGTTCCCCGCAGGATTAAAAAACGTCAGAAAATCAACAAATGCATATTTATTCTAGCATTAGTATCAGCAATTACAGTAAAGATTATACATGCCTTAATCAAATAAGCAGGTGGTAAAGTTGCGAGGATGGATTAGTTTATATAGATGTTTATTAGAAAAACCAATATGGAAAAACTCAACACCTGAACAAAAAACTATATTGATAACTTTGTTGCTAATGGCTAACCATCAAGAAAGCGAGTGGGAATGGAAAGGTCAAAAATTCAAAGCGAAACCAGGTCAATTTATTACAAGTTTAGATAGTATTGTAAAAGCATGTGGCAAAGGAATCACAATACAAAATGTTAGAAGTGCATTAAAACGTTTTGAAAAATTGGGATTTCTAACAAACCAATCAACAAAGACAGGAAGGCTTATAACTATTGAAAATTGGGAGATATACCAAGAAAACAACAATCAATCTAACAAAGCTAATAACAAAGAGGTAACAAAGAGGCAACAAAGAGGTAACAAAGAGGTAACACCTAACAATAATGATAATAATGATATAAATAATACTATATCTAAAGATATAGTTAGTAGCACTAAAGTGCAACCAATAATTCAAAAATGGAACTCACTAGGGTTGCAAAAGATTATTTCGGTTAATCCAGGTACTAATAGATACAAGTTATTGAATGCAAGACTTAAAGAATATGGACTAGATAATCTATTAAAAGCTATAGATAACATAAAGCAATCATCTTTTTTAAAAGGTCAAAATCCAAAAGGATGGACAATTACTTTCGACTGGCTTATTAAGCCTAACAACTTTATCAAGGTACTTGAAGGAAATTACGTAGACAAGGAAACTGAGAACAATGCAAGCAATACTCAACCGCAGTTTAAAAAAAATGGATTCCACAACTTCGAGCAACGGACTAAAAAGTATACGAAAGAACAGTTAGAAGCTATGTTTAGAGAAAATAAAACAAGTTAAGGGGGAGAAACCATGCAAGATAAGTTTGCTGAGGAAATATCGAACGGAGTAGTACAACTTGCGCAGCAGGGGATTGGCTGGAATAAGTTACTTGCAGAAGCAAAAGAGATATATGAAAAGCATAGACAAGCTATTAAACAAGAGGTGATTGTGTGAGGTGCGGAGATAAGAAAATCGAATGGAATAGTGAAATTATTGATTACATGATAAAAAGATTCTCAGAAGGAGCTACATTTACACAGATCGGCAGAGAGATTGGGTGCAGTTGTTGGACTGTTGGAAGAAAATTGCAAGAAGTTGGATTTCTAAAAAAGAAGGTGGAGGAAGATTGATGGGACCAGAGGGACATATACAAACGATATTAACACCTAATGGGAAAATTGAGGATGAACTAAGAATAACAATACCAGATATTCCACCTAGCAATAATAAGTACATGGGTAGGGGTTCAACATACACTCAGGCTTTTCAGTATCAAGCAGAAAAGAAAAAATGGCAGTCGGTAATAGGTTGGCTAGTCCGAGAACAAAAATGGGCTCAGAATCCATTAAAAAAGGCCGTGGTAGAAATTACCTATTTCTTCAAAGACAAAAGACGAAGAGATCCAGATAATTATAGCGGGAAATTCATACTAGATAGCTTAGTTCGAGCAGGAGTGTTGCAAGATGATAGTTTTGGAAATATCGAATTAATCTTGAAAGGGAATTATGACAAGAAAAATCCTAGAACAGAGGTAAGGGTTAGGAAAAATGAATGAGTATGCTGAAATAGTTGGATACAGAGAACTAGAAAAAGGAACTAGATTATCTGTCATAATTCCTGAAAAACACCTGGGGGAATATCTCAAAAGATTTGCAAGAGATGGAAAAGTAAAATCAGAAATACGTCTTGATGACGGAAGAACAATTACAGCAGAGCAAAGAAAAAAGGTATATGCAACTATACGAGATATGGCTACATATACAGGATACATGCCAGAAGAAATGAAAGAACTTATGAAATATAGCTATATATCAGAAACGGGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP042243|963019:973378|965722_966463_+|WP_148808812.1|DBSCAN-SWA MKELITKPATLDSREVAEMVGKRHSDLLRDIETYIQYLENAKLRSQDFFLESTYKAEGNNKTYKRYNVTKKGCEFIAHKLTGQKGAIFTARYINKFHEMEQQLSAPLQQLSPQLQLLINMELEQKKLKADIQETKKELQDMRDVITLDTTSWRTDARNIIVKIAQKLGGFGYIKEVNTEIYTLLDKRMGTNLKQRLTNKRRRMADEGVCKSRRDKLNYLDVIADDKKLIEGYVAITKEMAIKYGVA >NZ_CP042243|963019:973378|966475_967258_+|WP_148808813.1|DBSCAN-SWA MNDLQIFKNREFGQVRVVTKDNEPWFVGKDVATILGYSNASKAVMVHVDDDDKIKEMIAHSQNGNMVKSQTTLINESGLYSLILSSKLPNAKKFKRWVTSEVLPSIRKHGAYMTDDTLEKALTSPDFLIQLATKLKEEKQKRIEAERKIEKDKPKVLFADAVSASKTSILVGDLAKLLKQNGIDTGAKRLFKWLRDNGYLIRRKGTDYNMPTQRSMELGLFEVKETSITHSDGHVTVNKTPKVTGKGQQYFINKFLEKSA >NZ_CP042243|963019:973378|967594_967831_+|WP_148808815.1|DBSCAN-SWA MGTATRKIDEIEHDRNEVIATLKCARKVMQNLEENNMSLLVDVTNQVYIKNNKNGILVCLNDMQDAFNVKVLKEDESM >NZ_CP042243|963019:973378|963893_964244_-|WP_148808808.1|DBSCAN-SWA MFGSRLKHLRSKKKITQQELAELLNVSPSTIGMYEQGRRDPDTNTIKFLANYFNVSTDYLLGIVDDPDVIRVTGDQVPKELRNIGVEYLTLAKEMQDKEIPPEDIKKILDVLKKHT >NZ_CP042243|963019:973378|968737_969220_+|WP_148808819.1|DBSCAN-SWA MKLYELTENYTNLLDLLENPETPQEVIQESLGELQEEFNVKAENICKLIKSIDLEAKAVKEEEKRLADRRKVLENRVLYLKEYLDSNMKAIGVKKIKGNIFTLSIQKNPANVNIHTTDAIPKEYIVVKEEFDKKAIKEALKRGIEVPGAELKQTESLRIR >NZ_CP042243|963019:973378|964868_965027_+|WP_168198236.1|DBSCAN-SWA MKTLEQRVEELEKRIAELEGRVPEQPKKISTLKFKEIENITFSELEKDKFTW >NZ_CP042243|963019:973378|965291_965489_+|WP_148808810.1|DBSCAN-SWA MKLYIKEIRERRGFSIRQLSELSGISKTYIAELERGTKKNASMKVLCRLAKALDVHVSVLFNCDE >NZ_CP042243|963019:973378|965016_965187_-|WP_168198237.1|DBSCAN-SWA MNKIGLSHEEIDAILKNAISPEKTIDSNAIRDVIATAIIKNNEKILEDIKRIHLTK >NZ_CP042243|963019:973378|967280_967532_+|WP_148808814.1|DBSCAN-SWA MNLDDLKDVIKQTIEKSLLKQNKVTLTIEECAKFTGIGRDKLRELAHSKNSDFPCFKVGTKFLVNKEMLMVWLEKITKEGRVL >NZ_CP042243|963019:973378|967835_967964_-|WP_148808816.1|DBSCAN-SWA MFRTPLAHEAKVKWYIDKNDAIDLLTTLSFIHRKLDKVVKIK >NZ_CP042243|963019:973378|972742_973378_+|WP_148808824.1|DBSCAN-SWA MNEYAEIVGYRELEKGTRLSVIIPEKHLGEYLKRFARDGKVKSEIRLDDGRTITAEQRKKVYATIRDMATYTGYMPEEMKELMKYSYISETGSDYFSLSNCSVTTARLFINYIIEFCFRWNIPLLDHGLNRTDDIGKYLWQCLKYKKCAICGKEAEIHHWDAIGRGIDRKKYDDSKHRKIALCRIHHTEAHTIGRDTFAEKYHVYGIIYKE >NZ_CP042243|963019:973378|970373_970973_+|WP_148808821.1|DBSCAN-SWA MNVYEKLMNIQSKLKAPKNQYNSFGNYHYRSCEDILEGLKPLLNEHKAILTLNDEVLQIGDRFYIKSTATFTDIEKGESIKVDALAREDLNKKGMDLAQITGSVSSYARKYALNGLFCIDDTKDSDATNNHGKGDKDKQSKKLSEAQVKRLYAIGAKNGYDAECVKKAVLKKYSKTKAEDLTKQEYDELIKNIEANPKK >NZ_CP042243|963019:973378|972324_972750_+|WP_148808823.1|DBSCAN-SWA MGPEGHIQTILTPNGKIEDELRITIPDIPPSNNKYMGRGSTYTQAFQYQAEKKKWQSVIGWLVREQKWAQNPLKKAVVEITYFFKDKRRRDPDNYSGKFILDSLVRAGVLQDDSFGNIELILKGNYDKKNPRTEVRVRKNE >NZ_CP042243|963019:973378|972145_972325_+|WP_148808822.1|DBSCAN-SWA MRCGDKKIEWNSEIIDYMIKRFSEGATFTQIGREIGCSCWTVGRKLQEVGFLKKKVEED >NZ_CP042243|963019:973378|964408_964645_+|WP_148808809.1|DBSCAN-SWA MQSQERLKKFRENKNLNKEQMASLLDISTSFYEKIEKGERNPSYNFIKKFKRKFPEADINYIFFNILLHEKCKNKTTA >NZ_CP042243|963019:973378|963019_963388_-|WP_148808807.1|DBSCAN-SWA MTNADMNININNINTNIQTSSSASESYFDGGLLGLVGISILGFLITVFTAGICLPWAVCLKERWIAEHTVIEGRRLKFTGTAMGLFGQWIKILLLCFITLGIYGFWANIAIKKWVVKNTKFA >NZ_CP042243|963019:973378|972005_972149_+|WP_168198238.1|DBSCAN-SWA MQDKFAEEISNGVVQLAQQGIGWNKLLAEAKEIYEKHRQAIKQEVIV >NZ_CP042243|963019:973378|965543_965726_+|WP_148808811.1|DBSCAN-SWA MAKQKIKVVVNIPDKEYASELKAKAMADIIAARISKLPYEQQILAYEKIERTYEQRGNER >NZ_CP042243|963019:973378|969358_970330_+|WP_148808820.1|DBSCAN-SWA MNSKAIKSVLAKKHKELCNSIKDENVRKLVEKNTIITGGCIVSLLNNEDVNDFDFYFRDKETTLAVSRYYVGRFNQRQNKSVASVVVGNHINRLEDMLAENEEEIKELEEKIVKRIPENSKVYDPDRIRVWVQSSGVAGEMQEEESLNQESFDLDKEEKESVTIEKYEPVWLSSNAITLKGKVQLIVRFYGEPNKIHENFDFVHCTCYWDSRTGKLELPSKALEAILTKQLIYVGSKYPLCSIIRTRKFIKRGYTINAGQYLKMAMQLNEFNLKDIDVLEDQLIGVDSAYFAALIEQIKTRQSNDPGFTWNLGYVTSIIDKIF >NZ_CP042243|963019:973378|968189_968330_+|WP_148808817.1|DBSCAN-SWA MNSLKIEKKRLDYLISKYGDLQHPLVQKQSQIVDKLVVEHMRGVTA >NZ_CP042243|963019:973378|964708_964864_+|WP_168198235.1|DBSCAN-SWA MDKTSKNLYATLNIEVKESNKEKEADCSLIVKATCNSKTEVLVEINNPERW >NZ_CP042243|963019:973378|968326_968626_+|WP_148808818.1|DBSCAN-SWA MKCKVCGNELYTDSWSEYDFGTVETIERCDRCGFLEHWSYGRLLLALGGKCFYDGPAHGYIGEEVKKELEEAYEKFERAIKRTRKYYKRSGKFRRSKHA |
22 | Lactobacillus_phage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
977717 : 1003962
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP042243|977717:1003962|DBSCAN-SWA AGTGGTGAAAATAAAAACCATGCAAGACTTAATTTCAAATTCAAAATATTTACCTCAATCAGTAGTTGAGGATATAAACAGAAGAATAACCGATTGGCTAGCAAGTGGAGGAAATATAGATGATGATTATATTCAACAACAATTTAGATATGCTGAAAAATTTGTCAATCAAGAATTAAAGAGGAGGTAATACTGATGAATAATATAGAAAGATTATATAAAAATATTAAGATTTTAGTTGATACAAATATGTTAGAAGAAGAATTCAAAGTGTTTGCGGAAGAAAATTCAGATGTAACAACCATAGAAGAACTAAACGATGTGATAGAAACGGAGATTTCTTATTGGGAAGAATAATTTTACAATAGAACAAAATCTAAGAGATATAAAGCAGATTGAAAATAGTATAAATCTAAAGTAAAATCCAACTGCTCCTGGGACATGCCTGGGAGCGAAAGGGGGAATGCAAAAATGAACAGTGTTAATCTTATAGGAAGATGGACAAGAGATCCAGAAATGCGATTTACTCAAAACGGAAAAGCATTAACAAAAGTAAGTATAGCTGTTAATAGAACTTTTGGAGAAGGAGCAGATTTCTTTGAAGTTGTGATATGGGGAAAGATTGCTGAGAATACAGCACAATATACGAAAAAAGGTAGCAAAGTAGGAATAGAGGGTAGGCTACAACAGGAAACATGGGAAAAAGACGGACAGAAAAGAAGCAAAGTTGTGATAGTAGCTGAGAGAGTAGAATTTCTTGATAATAAAAATAGCCAATCAAATAATGAAATAGATGGATTTCAAGCAATAGATGATGACGATGATATACCATTTTAAGCGTTAAGGGGGCAAAATCGATGGAGGATATTCAATATAGAAGAACAGAAGGAATATTATATAGGCATTTTAAGAAGATCAAGAGGATCGAAAGATTAAAGTACGATATAGAGAATACAAAGCAGACTATACATAAGATACAACAAGACCTGAGAAACGTGAACGTAGAGCTATCGGATTGTGTTAAAGCTATAGATTATAGCCAGGACAGAGTACAATCTAGCATTGTTACATCAAGTGCTGTAGAAAGAGAGTTGGAACGAATTACGAATAAACTTTTAAATGAACTTAAATATAAAATCCAAAGGAAATATAAGTTAAAAGCAAGATTGAGAAAAATAGAGGAAGATGTTAAAAGGATTGAAAAAATACTTAGTGATCTTACCGAAGAAGAAATGCAGATTGTAGAACTTAGGTATTCGGAACATAGAACAAATAGAGCTATAGAAAAGATACTATACATGGAAGGAAGGCCTAGTAGTTATGTAAGTATTTGGAGGAAGAAAAATAAAATAATAGAATATATTTATAGTCAATTGAAGTAGATTGAAACAAAAATGAAACAAGATAGAAACATTTAAAATTAAAAATCTATAATATAATTGTATTGTAGAAATAGTTACCCCCTGATATCTTCTAATGACTAAGGCAGTCGAGAAATCGGCTGTCTTTTTCATGTATAAAAATGAGGTGATCGCATGGAATTACACAGATGCAAAGTTAAATTTCATAAAGGCAAGATAGTATGCGCTAGTGAAATTCTATGTTCAGATTGCCCTGAAAAAGATAAATGCGAGGATATAGATATTTATGTAGATAGTAAGTACTGGGGAAGCAAGGAATGCATGAGCCACGATAGCTATGAAAGGAAAAATAAGAGGATCAGGCAGAAAGGGTGGGGGAAATGAGTATACCTGAGAAAATATGGGGTATTAAATAGAACTATTGCAAGATGTGTATCACGTGGTGTAAATGATTATCATAATAAAAAGAAACAAAAGATAATAATACAAAAAAACTAAAAGATGAAATAAGTGAAAAAAAGGAAGCTTATTAATAGAAATTGGAATATTTCTTGGCGTAGGATTTGTATTGTTTGGAAGAGGAGAATATTGGATGTATAATAATATTTATTAGTTTTGCTTTAGCTGGTTTGCTTAATCATGAAAATAAATAAGTAGTCAATAAGTTAAACGATTTGTGTCGAAATTTGCGAGTGGAATATAAAGGATACTGTTTTCTTGTAGAGAATTCTAATAATTAGGAAGGAGGAGGACGTATGGGAGATAATGATAAAAAAGTAGCTGACAATTCTTTTGAAGCATCTGAAAATCTGAAAGATCATGTGGCAGGTGCTATAGACAAAGCTTCGAAAGGAGATTTTGCAGGAGCAGCTAAAGATGCAATGGATGCTGTTGGGGATATGGCACAAGTTGCAGGACATGTAGTAGAAGGAAATTAAAAAGAGCCAACCGGCTCTTTTTTCATGCAAAAATTCAAGTAGCACAACAGGTTAAATCAAATTTAACGTGCTACAATTATTTGTTATTTTTGCATACTATCATATTTTGATAGTAATTTATCCAGTAATTGGCTTAATTCAATTACTTCTTGATCCAGTAAATTTTCTTCTTTATGCTTGATTAATTCGTTTAGTGCAAATCTAGTTTGTTCAATCTGATCTAAGAGAGATTTTAATTTATTGTTATATTTATCCATTTTCCATACTCCTTTTCATTCGTGTATTTAGATTTAACCTGTCGCACTATTGTAAATTCTAATGGAAAAATATAACAAAGAGTAAATCATTTCAAAATATATAGATAATTTAGACACTGTAAAAGGTGTCTTTTTTAATGCAAATTTTTAGGTTTGCAGGATAACAACCTGCCACCTCTTAGGAGTTACGCATGGTGGGGGTAAGTTCCTACCACTCCTAGTTATCAATAAAATTCTAGGAGGTAGTCGATATGAGAGTGGCAAAAATCAATGATGTAAAAGTAAAAGTATTTGAGAAAAAAGAATTAATTGAGAAGCTAGGATTTACAGAAGAAGATGCAAAATTAGTTATGAAGTACCAAAAGACATTTCCTGAGTTATTACAGGATGGTGTAGAAGGGTTTGTTATTGACGCTGAAACTTTATGGGAGCAATTAGGTAAGCCGAATGGGCAATTTAGTAAATGGGCTAATAAAAGAATAAAGGAAGTGTTTAAGAATGGCTTAGAATGGAGTTTTAGCCGGATTAGGATAAAAGATGGTAGACCAAAACAAGTAATAAAATTAACTTTGGAAACTGCTAAACATGTAGCAATGGCTACTGGTTTAGATGGCAATTCGAGTAAAAAAGTAAGAGAAAAGGGAAATCTCGTTAGAAACTATTTTATAAAAATGGAAAAAGCTTTAAGAGATTATGAGTATTGGATCATGGTTAGAGAACCACAGAAAGAAGGATATAAAAAACTAAGTGAAGTATTAGATACAAATTACCAATTAACCCATGAAGGAAAATCAGCACCTAATTATGTATTTTCTAATGAAGCAGATATGATCAATAGAGCTTTACTTGGTATGTCGGCTAAAAAGCTTCAGGCACTATTGGATACAAAAGATAAAGCAACAAGAGAGCATTTTACTGTGGAGATCAATAAGACTATTTCTGAATTACAGACAATGGATATGGGTTTAGTAATGGCAGGACTTGACTATGAAACAAGGAAAAAGACTATAACAAATATTTGTAGTACGAAATATAAATATATGCAGCTGATAGTAAAAGAATTAAAGAAAACTGCATAAATTGTAATTTTTCATTTATGAGGTGGTGGTATGGCAAGAGTAAGAAGCCCAGATAGTATAAAAGCAGAAGAAATGTATCTAAAAAGTAAAGGTGAAATAGAATTAGTTGAAATTGCAAAAGAATTGAATGTATCACCTGGTACAGTTAGATCATGGAAGAATAGATATAAGTGGGATGATAAATTAAATGGTAACATAAATGCAACGTTGCAAAAAGAGAAGAAAAAGAAACGCAACGTTGCGAAAAAAGAAAAGAAAAAGGAAATTAAGACGGATGAAAAAATATTAGAGCAATTAGAAGATGCTGAACTTACTGAAAAGCAGCGTCTTTTTTGTTTGTATTACATAAAGAATTTCAATGCAACAATGGCAGCAATCAAGGCAGGATATTCGAAAGATACAGCACACGTAATAGGGCATGAAAACCTTAGGAAACCTAAAATTGCAGCTGAGATAAGAAGGTTAAAAGGAGCAATAAGACAAGAAGTATTCATTGATGCTATGGATGTACTAAATAAATACATCAAAATAGCTTTTGCAGATATAACAGACTACGTAACCTTTGGTCAGAAGGAAGTGCCTGTAATGGGACCATTTGGACCAATAGAAGATGATGAAGGTAATCCAGTGACGAAAATAGTAAACTATGTTGATTTTAAGGAAAGCAATATGGTAGATGGAACAATAATCGCTGAAGCAAAACAAGGGAAAGATGGGATATCTATTAAGTTGGCTGATAAGATGAAAGCTCTCGATAAACTATCTATGTATTTTGATCTATTCCCTGATAAGTTTAAGCGCCAAGTAGAAGAAGAGAAGATTAAGATACAAAAAGAAAAATTAAATTTAGATGGTAAAGATAAAACAATGAAAGTAGTGATTGTTGATGATATAGAAGGTGTAGAAGATGATTAAAGTTAAACTATCAGAAAAAGTAATCCCAGCCTTTTATGACTTTTGGAAGAATTGTGATAAATACCTTTATAAAGTATTAAAAGGTGGACGTAATAGTTCTAAATCATCACATATAAGTATCAAAATCATTACTGAACTTATGAAAAAAACTATTAATGCACTTGTTGTTAGAAAAGTAGGCAATACGTTAGAAACAAGTGTATATGAACAGCTTATATGGGCTATAGAACACCTTGAGGTGTCAGATTATTGGCATATACAAAAAAGTCCATTAAAACTTATTTACAAGCCAACCGGCAATTATATTATCTTTCGTGGCGCTGATAAACCAGAAAAAATTAAATCTATTAAAACAAGTAAGTATCCAATAGCAATTTTATGGATAGAGGAACTTGCAGAGTTTAAAACAGAAGAAGAAATATCGACTATAGTCAACTCTGTTATAAGAGC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>NZ_CP042243|977717:1003962|1000540_1001536_+|WP_148808860.1|DBSCAN-SWA MKKQHNNLFEILNITGRKTFWSQGFFGQDVKVAIIDTGINTQHQEFKNVKIKCKNVINDNVEPGMHGTATAGCLVYVAPNVEILNLEINDEKNEAYNDNIAKAIRKAVDEDCDIINLSYSHKSNYGGIEEACQYAYDNDVLIVCSMSNEGKKLRKYPACFDTVLSVGAIDWNEKRCDFSNYGQWIDVVQVGKNIPVPHYKYNDEYLVLDGTSFSTPLVAGIAALIKCKYKTLGKYLSMQEFMNLLTVAFSKDLGELGFDKYYGFGLCSLQPLVDTKEFTIGSNMMKQNREVIKMEAVAKIESGRTLVPLRYVNNNACVLWIPEEKKVKIMY >NZ_CP042243|977717:1003962|993059_994841_+|WP_148808853.1|DBSCAN-SWA 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MADTIDVIHERMLSNISDEYDKTEGSFFYDTTKPVAIELESVYKEQESILDKGFVETATGEWLDKKVAEQGLTRKPATKATGYVTIEGSEGAIINAGDKVANDTVTYTILESKTIDSTLKASVQVECDEFGSVGNVPINAIKYFPVTLSGLTKVYNEEKIDNGYDGETDEELRQRYYDKVRTPATSGNKYHYRNWAKEVTGVGDARVFPLANGPGTVKVMIIDSNKTGAEQELIDAVYNHIEENRPIGATVTVVSATEVPININVTLTIDTDNYAEQEVITNIENNITAYLKEIAFVEDYVSYAKVGSIILDTIGVLDYSNLIVNGGTSNITIADNEVAVLGGVTNV |
38 | Clostridium_phage(46.15%) | holin,terminase,coat,tail,plate,capsid,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1202855 : 1208780
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP042243|1202855:1208780|DBSCAN-SWA TATGTTAAGAAAAGAATGGAAAGGATTCAAAGAAGGGAATTGGACAGTAGAAGTAGATGTAAGAGATTTTATACAAAAAAACTACACTCCTTATGAAGGTGACGATCAGTTTTTAGAGGGACCTACAAGAAAAACTGAAAGAGTATGGGATATTTGTAAGAACTTATGCATAGAAGAGTTGAAAAAAGGGATACTTGATATTGATACAAAGACTGCTTCGGGGATAGATAACTTTGAGGCGGGTTATATAGATAAAGAAAATGAGGTTATTGTAGGGCTGCAAACAGATGCTCCGTTAAAGAGGATGGTAAATCCTTTTGGTGGAATAAGAATGGTAAAATCAGCTTTACATGCATATGGTTATGAAATAGATGGTGAAATGGATAGGGTGTTTCAAAATTATCGTAAGACACATAATGATGGAGTATTTGATGTATATACAGAAGAAACAAAGGTAGCAAGAAGTGCAGGACTTTTAACAGGACTTCCAGATGCATATGGAAGGGGAAGAATTATAGGAGATTATAGAAGGATACCACTTTACGGAATAGATTTTTTAATAGAACAAAAAATAAAGGATAAAAGTAGCTTAAAGGGTTTCATGGATGAGGAGCTAATTAGAAAGAGAGAAGAATTAGCAGAGCAAATACGTGCATTGAAGAAGATAAAAAACATGGCTAGTTCTTATGGTATAGATATATCAAAGCCAGCAAAAGATGCTAAAGAAGCAGTTCAGTTTTTATATTTTGGATATTTGGCTGGGATAAAGGAAAACAATGGCGCAGCTATGTCACTTGGAAGAACAAGTACTTTTATTGATATATATATGGAGAGAGATTTAGAAAAAGGGATAATAACTGAAAAAGAAGCACAGGAGATAATTGATCAGTTTGTTATAAAACTAAGAATGGCAAGACATTTGAGAACTCCTGAATATAATGAATTGTTTGCAGGAGATCCAAATTGGATTACAGAGTCTATAGGAGGGATGGGGATTAATGGAAGGACACTTGTAACAAAAACTTCCTTTAGATTTTTGAATACCTTAACTAATTTAGGTCCTGCTCCGGAGCCAAATATGACAGTTTTATGGTCTGAAAAGCTTCCTGAAGCTTTCAAAAAATATTGTGGAAAGATGTCTATTATGACCGATTCAATTCAGTATGAGAATGATGATCTAATGAGGAATATTTATGGAGATGATTATGGAATTGCTTGTTGTGTTTCTGCAATGCAGATAGGAAAAGAGATGCAGTTTTTTGGAGCAAGATGTAATCTTGCAAAAGCGCTTCTTTATGCAATAAATGGAGGAATAGATGAAAAGAAAGAAACTCTTGTTATACCTGGAATAAAAAAAATAGAAGATAATGTGTTGGATTATAATAAGGTAAAAGAAAGCTATGATAAAGTTTTAGAATATGTGGCACAGCTTTATGTAAATACCATGAATATTATCCATTATATGCATGATAAATATGCATATGAGGCAGGTTTAATGGCGCTACATGATACAGAGGTTGGAAGATTTATGGCATTTGGAGTAGCAGGTTTATCAGTAGTTGTAGATTCTTTAAGTGCAATAAAATATGCAAAAGTAAAACCTATTAGAAGAAATGGTATAGCAGTAGATTTTGAAATAATAGGAGAGTTCCCTAAGTATGGAAATGATGATGATAGAGTAGATGAAATAGCAGTTGAAATACTTAAAAAGTTTATCAAAGAATTGAAAAAGCATAAAACATATAGAAATGCAGTGCATACTTTATCAGTGCTTACTATTACATCAAATGTAGTATATGGAAAAAAAACAGGTGCAACGCCAGACGGAAGAAAAATGGGAGAAGCTTTTGCTCCAGGAGCAAATCCAATGCATGGAAGAGATAAAAATGGTGCTTTAGCATCTTTAAATTCAGTAGCAAAAATTCCATATAGATTTGTTTGTGAGGATGGAGTTTCAAATACTTTTACTATAGTGCCTGAGGCTTTAGGAAAAGATGAAAATACTAGAATTATTAATTTGGTAAATGTTTTAGATGGGTATTTTTGTCAAGGAGCACATCATTTAAATGTAAATGTATTAGATAGAGAAACACTTATAGATGCTATGGAGCATCCAGAAAAATATCCTACATTAACAATTAGAGTTTCTGGTTATGCGGTTAATTTTAACAGGCTTACAAGAGAACAGCAATTAGAAGTTATAGGAAGAACTTTCCATGAAAATATGGTAGTTTAGAGGTGATAGTATGATAGGAAAAATCCATTCTTATGAAAGTATGGGATTAGTAGATGGCCCTGGAATAAGATTTGTGGTATTTTTTCAGGGGTGTAAGCTAAGATGTGCGTATTGCCATAATCCAGATACTTGGGATTTTAATAAAGGAGAAGAAGTAACTGAAAATGAATTAATAAAAAAAGTGTTAAGATTTAAGCCATATTTTCAAAAATCAGATGGAGGTGTCACATGTTCAGGAGGGGAACCACTTATGCAGCCTGAGTTTTTAATAGAGTTTCTTAAGCTATGTAAAAAAAATGGTATTCATACAGCTATTGATACTGCAGGATTTGGAAAAGGCTTATATGAAGAAATATTAAAGTATACAGATTTAGTGATTTTGGATGTAAAACATGTAAATGGTATTGGATATAAAAAGTTAACTGGAGGAAATATAAAAGAGTTTGAAACGTTTCAAAAAGCTCTGCTAAAAGCAAATGTTAAACTATGGATTAGACATGTAGTTGTTCCAGGGATTACAGATAGCAAAGAACATTTGTATAAGTTAAAAAAAGTAATAAAGGGTTTTAAAAATGTAGAAAAGATTGAGCTACTTCCATATCATAGTCTAGGAGTAAGTAAGTATAAAACTATGGGAATATCTTATAATTTAGATATGGTTAAGCCAATGAGTAAAGAAAGAGCAATGGAGCTTGAAGAATATCTAAAAATTGTTTAAAGTATATAGAATAATTTTTATATATTAAAGAAGGAGGATGTTCTCCTTCTTTTTAATGCTTATTTCAATTTATTTACTTAAATTTCATTTTATGATAGAATTAATTTTGTAATTTTGTTATGAAACATTAAGGAGTGATATTAAAATATGGGTAGACATGGAACCATAGCTAATAGAAAAGAAAAGCAAGATGCAAAAAGAGCACAAATGTTTACAAAATATGCAAGATTAATTACTGTTGCTGCAAGAGAAGGGGGAGCTGACCCAGAATATAATGCAGCACTAAAGAATGCAATAGATAAGGCAAAAGCTATAAACATGCCTAATGATAATATAAATAGAGCTATTAAAAAAGGTGCAGGTGGAACAGACGGAGATAATTTTGAAAGAATAACGTATGAAGGATATGGCCCAAATGGGATAGCTGTAATTGTGGAAGCATTAACAGACAATAGAAATAGAACGGGTAGCAATTTAAGATATTATTTTGATAAAAATGGTGGAAATCTAGGAACTACAGGCTGTGTTGGATATATGTTTGATAGAAAAGGTCAAATTCTTATTGAGAAAAAAGATGAATATCAAGAAGATGAACTAATGGAAGCGGCATTAGAAGCTGGAGCAGAGGATTTTGTGACAGACGATGAAGAGGTTTATGAAATATTTACAGCTCCACAAGATTTTTATGATGTAAAAAATGAATTACAAGAAAAAGGATATGAATTTATTGAAGCTGATATAGCCATGATTCCTCAAACGACAACTAAATTAGAAAATGAAGAACAAATTAAAGCAATGAATAAGCTTATTGACATGCTTGAAGATGATGATGATATTCAGCAGATTTATCACAACTGGGATATGCCAGAAAAATAGATTTTAAATATACATGATATATGTTTTAAATACACCTTAAATTTTGTTGTGTATAACACAATCAAAATAGAGGTGTATTTTTGTGTATTTATATAAATAATCGCAACTATTGTTCCGAGTAGTAATATATATGAATAAAATTATATTTCCAAACTATAAACCTTAAATTACCTTGTATGTAAAAGCAAATGCTACAAAAAATAAAAAATGAGGTGAATAAACTATGGGAAAAAGGAATAAAATTCCTGATTTTAAAGAACTATTAAGTCATACACAACAAGAACTAGGCAAGGAATTAGGTTTAAGTAATAATGAAATAGGAGAAAAAATAAATGATAAACCTGATTTAGCAACACGTATAGCTGGTGGATATGTTGGAGGACAGATGACAAAGAATATTGTTAGGAGATCAAAAAAAGAATAAATATAAAAACTGCCTAGTTATTGATATGCTCCCCTTGAAGTGGACAGTTAAAATAAAAAAACTGTTTATTGAAGGAGGAGCATTTTCTTATGGGCAGAAAAGGTAAAATAGATTACGAACTAAAAATTAAAGCAGTTGAAGAATATTTAAATAATGTAGGATCACAAACATCAATTGCATCTAAATATGGTGTAACTAGAAACTCATTTAGACAATGGATTGTAAACTATCAATCAATGGGTAAAGAAGCATTAATGAATAAGTCTCATAATAATTTCTATTCAAAAAGAATTTAAAAATTACTGTTATTAAAAGCATATCTTGAGGGTGACAGTTCGATATATGACATTGCAAAAAATTTAAGATTCCCTCACATACAACTGTTCTTAAGTGGATTATAAAGTATAATGGTCATGAAGAGTTAAAATCATCAGGAATAGGAGAAGATAAAGTCATGGCCAACGGACGTAAAAACTAATTTTAATGAAAAGAATAGAAATTGTTAAACACTGCATTGAACATCAGAACAGCTATAATAAAACTGCAGATAAATATAAAGTATCATATCATCAAGTCTATTCATGGACTAAAAAATATGAGGAATCTGGTGTTGAGGCATTAAAAGATAAACGTGGCAAACAGAAAAATGCAAATGAATTGTCAGAGATTGAAAAAGCTTAGAGCACTAAACAAACTTCTGGAAGCTCAAAAATAAAAAGGCAACAAATGGAGATTGATTTTTTAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP042243|1202855:1208780|1208534_1208780_+|WP_148809054.1|transposase|DBSCAN-SWA MDKSEMIQSMSRVGRCIDNGPMEAFWGMLKSEMYYLRKFYTYEELETAVTNYIEYYNNHRYQKRLGCMTPLEYRQYLCNVA >NZ_CP042243|1202855:1208780|1205103_1205808_+|WP_168198393.1|DBSCAN-SWA MGKIHSYESMGLVDGPGIRFVVFFQGCKLRCAYCHNPDTWDFNKGEEVTENELIKKVLRFKPYFQKSDGGVTCSGGEPLMQPEFLIEFLKLCKKNGIHTAIDTAGFGKGLYEEILKYTDLVILDVKHVNGIGYKKLTGGNIKEFETFQKALLKANVKLWIRHVVVPGITDSKEHLYKLKKVIKGFKNVEKIELLPYHSLGVSKYKTMGISYNLDMVKPMSKERAMELEEYLKIV >NZ_CP042243|1202855:1208780|1202855_1205090_+|WP_148809047.1|DBSCAN-SWA MLRKEWKGFKEGNWTVEVDVRDFIQKNYTPYEGDDQFLEGPTRKTERVWDICKNLCIEELKKGILDIDTKTASGIDNFEAGYIDKENEVIVGLQTDAPLKRMVNPFGGIRMVKSALHAYGYEIDGEMDRVFQNYRKTHNDGVFDVYTEETKVARSAGLLTGLPDAYGRGRIIGDYRRIPLYGIDFLIEQKIKDKSSLKGFMDEELIRKREELAEQIRALKKIKNMASSYGIDISKPAKDAKEAVQFLYFGYLAGIKENNGAAMSLGRTSTFIDIYMERDLEKGIITEKEAQEIIDQFVIKLRMARHLRTPEYNELFAGDPNWITESIGGMGINGRTLVTKTSFRFLNTLTNLGPAPEPNMTVLWSEKLPEAFKKYCGKMSIMTDSIQYENDDLMRNIYGDDYGIACCVSAMQIGKEMQFFGARCNLAKALLYAINGGIDEKKETLVIPGIKKIEDNVLDYNKVKESYDKVLEYVAQLYVNTMNIIHYMHDKYAYEAGLMALHDTEVGRFMAFGVAGLSVVVDSLSAIKYAKVKPIRRNGIAVDFEIIGEFPKYGNDDDRVDEIAVEILKKFIKELKKHKTYRNAVHTLSVLTITSNVVYGKKTGATPDGRKMGEAFAPGANPMHGRDKNGALASLNSVAKIPYRFVCEDGVSNTFTIVPEALGKDENTRIINLVNVLDGYFCQGAHHLNVNVLDRETLIDAMEHPEKYPTLTIRVSGYAVNFNRLTREQQLEVIGRTFHENMVV >NZ_CP042243|1202855:1208780|1207591_1207789_+|WP_148809052.1|DBSCAN-SWA MKRIEIVKHCIEHQNSYNKTADKYKVSYHQVYSWTKKYEESGVEALKDKRGKQKNANELSEIEKA >NZ_CP042243|1202855:1208780|1208012_1208369_+|WP_148810771.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKESKNENFNKKLIPLIQEAYEERDGILGYRQMTIKLNRENNFRVNHKRIYRLMTILGLKSVCRKKKKKYIKSTPEVIAENILNRNFKADKFGQKWVTDVTEFKYGNNQKSILKCNN >NZ_CP042243|1202855:1208780|1206907_1207108_+|WP_148809050.1|DBSCAN-SWA MGKRNKIPDFKELLSHTQQELGKELGLSNNEIGEKINDKPDLATRIAGGYVGGQMTKNIVRRSKKE >NZ_CP042243|1202855:1208780|1208310_1208553_+|WP_148809053.1|DBSCAN-SWA MLRNLNMAIIKKAYLSAIIDLSDKSVVSFVIGKSNNNPLVFKTFDLAHENYPDEKPIFHSDRGFQYTSKKYFERSWINQK >NZ_CP042243|1202855:1208780|1207197_1207404_+|WP_148809051.1|DBSCAN-SWA MGRKGKIDYELKIKAVEEYLNNVGSQTSIASKYGVTRNSFRQWIVNYQSMGKEALMNKSHNNFYSKRI >NZ_CP042243|1202855:1208780|1205955_1206684_+|WP_148809049.1|DBSCAN-SWA MGRHGTIANRKEKQDAKRAQMFTKYARLITVAAREGGADPEYNAALKNAIDKAKAINMPNDNINRAIKKGAGGTDGDNFERITYEGYGPNGIAVIVEALTDNRNRTGSNLRYYFDKNGGNLGTTGCVGYMFDRKGQILIEKKDEYQEDELMEAALEAGAEDFVTDDEEVYEIFTAPQDFYDVKNELQEKGYEFIEADIAMIPQTTTKLENEEQIKAMNKLIDMLEDDDDIQQIYHNWDMPEK |
9 | Paenibacillus_phage(66.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1925932 : 1960878
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP042243|1925932:1960878|DBSCAN-SWA ATTATTTTATTTTCTTTTTCATTCCCTCTAATCTTTCTATAACCTTATCCATCATAGATTGATAATTTGCTTGTTTATTTTTCTCTTCTTCAATAACTTTTGCTGGAGCTTTTTCTAAAAATCCTTTATTAGAAAGTTTTCCATTTACCCTTTTTAATTCTTTTTCTAATTTTTCTTTTTCTTTTTCTAATCTTTCTATTTCTTTTTCAAAATCAACTAATTCGTCTAATGGAAGGAAAATCTCAGCACCTGCTACAACTGCAGACATAGCATCTTCTGGAATATCCTTTTTCTCTTTTTGAAGTACTACCTCTGTAGCACTTGCAAGAGTTATAAAATAATCTTTCCCCATATCTATTGCATCATAAGCTTCATCGGATGCTACAATAATAACTTTTGCTTTTTTAGATGGAACTACATTCATTTCAGCACGAATATTTCTTACACTTCTGATTGCGTCCATAATTATTTCCATATTTTTCTCTTCTTGTACAAAGCTATATGAAGGATCATATTTAGGCCATGGTGCAATCATAACGCTATCCTCTTTTGTAGTAGGAAGATGTTTCCATATTTCTTCAGTGATAAATGGCATAAATGGATGTAATAGTTTTAACATATTCTCAAGAACATATGTCAACGTATATAATGCAGCATGTTTTGTATCTGTTTCCTCTCCATATAGTCTTGGTTTCACAAGCTCAATATACCAGTCGCAGTACTCACTCCAAATAAAGTCATAAACCTTTTGTACAGCCATTCCTAATTCAAACTTATCTAAGTTGTCAGTAACTTCCTTAGCAACCTGATTCATTCTAGATAATATCCATTTATCTGCAAGCGTAAAGTGTTTCTCACACTCTGCTTTATCAAATGTATCTTGATTTAAATTCATTAATACAAAACGAGTAGCATTCCACAATTTGTTTGCAAAATTTCTATTAGACTCTACTCTCTCAATATAAAAACGCATATCATTTCCAGGACTATTACCTGTAGCAAGAGTCATTCTTAAAGCATCTGCTCCATATTGATTGATAATATCAAGTGGATCAATACCATTTCCAAGAGATTTACTCATTTTTCTACCTTGTGAATCACGCACTAAACCATGTACAAACACATATTTAAAAGGAATATCTCCCATTTGCTCAATTCCTGAGAACATCATCCTTACTACCCAGAAGAAAATAATATCGTATCCAGTAACCAACACATCTGTAGGATAAAAATATTTTAGTTCTTTTGTTTCTTCTGGCCAACCAAGAGTTGAAAATGGCCATAATGCTGAACTAAACCAAGTATCTAATACATCCTCATCTTGTTTTAACTTACTACTATTACATTTGCTGCAAAGCTCTGGAGCTGTTCTTGATACAATAATTTCTCCACAATCTTCACAATAATAAGCAGGTATTCTATGTCCCCACCACAATTGTCTTGAAATACACCAGTCCTTTATGTTTTCTAACCAGTGGAAATAAATTTTATTAAAACGCTCTGGAATAAATTTTGTCTTACCTTTTTTTACAGCTTCAATAGCTGGTTTTGCAAGCTCTTCCATCTTTACAAACCACTGATCGCTTAATCTTGGTTCAACTACTGTACTACAGCGATAACAAACACCTACATTATGCTGATGCTCTTTCACTTTTACTAAATAACCAGCATCCTCTAAATCTTTTACAAGAGCTTTTCTACATTCGTAACGATCCATACCTTTATACTTTCCTGCATGTTCGTTCATTTTTGCTTCATCATCCATTACAGTTATTTGCTCTAAATTATGTCTTAAACCTACTTCAAAGTCGTTCGGATCATGAGCAGGAGTAATTTTTACAGCACCTGTACCAAACTCTTTATCTACATATTCATCTGCTATAATTGGAATCTCTCTTTCTACAATTGGCAATATTAATGTTTTACCAACTAAATGAGCATATCTTTCATCTTCAGGATGTACTGCTACAGCTGTATCTCCAAGCATTGTTTCAGGTCTTGTAGTAGCAATTTCTAAATATTCATCTGAATCCTTTACTGGATATTTTATATGCCAAAAATATCCACCCTTCTCTTCATGCTCAACTTCAGCATCAGAAAGAGAAGTTTTACAATCTGGACACCAGTTAATAAGACGATTTCCCCTATATATATATCCTTTTTCATAAAGTTTTACAAAAACTTCAGTTACAGCTTTATTACAACCTTCATCCATTGTAAATCTCTCTTTTGACCAATCACAAGAATTTCCTAATTTTTTCATTTGCTCTACGATTCTTCCGCCATACTCTTCTTTCCATGCCCAAGCTCTTTTTAGGAACTCATCTCTTCCAATTTCTTCTTTTGTCTTTCCTTCTTCTTCTAATATCTTTTCTACTACTTTTACTTCTGTTGCAATACTTGCATGATCTGTTCCTGGCAACCATAATGTTTCATAACCTTGCATTCTCTTATACCTAATTAATATATCCTGTAAGGTATGATCAAGGGCATGTCCCATATGAAGCTGTCCAGTAATATTAGGCGGAGGTAGTACAATAGTAAATGGTTCTTTATCAGGATTTACTTCTGCTTTAAAATATTCTTTTTCCATCCAATAATCATAAATTCTTTTCTCAAATTCTTGTGGATTATAGGTTTTATCCAAATTTTTTATTTCCATAATAACACTCCTTTTCCTTTAAAATATCTAATAAACTCTAGACTTTTTGGAAACTCACCATTAATGATCATAAAAATTCCTATTACTGCTATGAAAAGTCCTATAAACTTTATATTAATAGGATTCCACTTAAAAATTTTCATTAAATATTTCGTTCCATATACAAAAATTGAACCAAAAATTAACAATATAACTCCTACATAAAACATAATCTCACCCCAAAATAAAAACCCCTTCATCCAATAAGGACGAAAGGATTATTTTCGCGGTACCACCTTAATTCCAGAAAACACTGGCTCTCATAAATCAATAACGGGATTTCCCGGCTGAATCTACATGAATCTTTCTCAATTCAGCAACTCAGAAGCTACCTTCAATAATTCTTCCCTAAGAAACCTTTCAGCCTACGGATTTCTCTCTCTATAGGGGGTTAATTATTTACTCCTCTTCTTCAATGTTTGTCTCTATATATTCATTTTTCATTATTATATATTTTATCTAATAAAAAAGTCAATATTTCACGAAAATTTTTAGTAAAAATTCATTAAAAATTTGCTTAGTGTACAATTTTTAATGAATATCTTCTTTCTAAGTAATTAATTAATTGTTTTACCATGTCTATATGGTTACTGTTTAATACATCCCACTCCCTTTTATAGTTTGCATATATATATCTTCTTACACTACAAGTAGGTGCATAAGGATTTCCTCCATGTTCCACCACATCTTTATATACACATAATCTTGTAACTCTTCCTTGTCCACTTTGCAAGTTAATAGGATTTATACCATTTTCCATAGCATCCTTATGCACTAATGCATACCAATAAAAATTATCTACCCTTCCTCTTATATATCCATGTTTATATTTCCCCTCATCAATCTTTATATTGTAATCCATAATACCCCACCTTCTAATAATATCATGGTTCTTTTTATAGTTATATTCAATATTGTATCCATTTAATAATATTTTTTTTCATATATTCATATGATTGATGTAGTTAGTTTTTTTTGGGGGGACCATTCATGAGAAAAAATTTTAATCTATTCTTATATATCATACAGTATATATTAGGAATTTTATGCAGTTTCATTGGGCAAATCTTACTAAGATTGCCTGCAAGTACTTGGTATACTTTGTCAAATACCAATAAAAACTATAAAATATTTATTCAAAGTCTTGCAAATCATGCAATAGCAGGCATTATTCTAGCTTTTATAGGTTTTGCATTATTATTCTATCTTATCTTTATAACAGCAATTTTATTGCTTTCTCATTGGAATCACATTAAATGGATATTTCGAATTTTTATAATCCTATGGGTTATCCTCCTATGTTTATCTACTCTATATCATGCAGTTATTTTATATCAAATTTTAAGTTATCTTTTTATTCTTGCATTAGCCATATTCTCTTTATTATTAATCTTAAATTATTTCCATCACGAAAGGGGCTAGCTTATGAAATGTTTTTTAAAAACTCTTTTTTGTTCCTAGTACATTCAATATATATATCCTCTGAAATTTTTCCATTTAAAAGTAAATCATCACATAATTTAATAAAAGCTTCTACTAATTCTATAATTTTTCTTTCTTCCACCTTTTTTGCCTCCTTAATCAAAGTTTTTATCTATTTCCCATTATATTCATGTTTCAAAAAAATTATTCTATCATTTTCACTCTATTTATCTATTTTTCTACATATTTTCATAAACACTATCCATTTGTAACCATTATTTTTTTTTCACATATAATGAAAATATGGAAAAACTTTAAATGTTTTGGAGGGATTGTAGGTGAAAAATATGAAAAGAATTGCTTTACTTATTTCTCTTATAATGCTTTTATCTATAGCCTTAACAGGTTGTGGAGAAAAAGCATTAACAAAGGTTCGAGTAGCAGAAGTAACCCATTCAGTATTTTATGCCCCTCAATATGTAGCAATTACAGAAGGATTCTTTGAAGAAGAAGGACTACAAGTAGAGTTCATCAATGGTCAAGGTGCTGATAAAACCATGACTGCACTATTATCTGATCAAGTAGATATCGGTTTTATGGGACCTGAAGCATCTGTTTATGTTTTTAACAAAGGAAAAGAAGACTATGCAGTAAACTTTGCTCAATTAACACAAAGAGATGGTTCTTTCTTATTAGCAAGAAAACCTATGCCAAACTTTACATTTGATGATGTAAAAGGAAAAACCATAATAGGTGGAAGAAAAGGCGGCATGCCTGAAATGACATTAGAGTATGTGCTAAAAGAAAATGGTATATTTCCTGGGAAAGATGTAAATGTACGTACAGATATCCAATTTGCTGTTATGGCAGGAGCTTT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50 | Caldibacillus_phage(19.05%) | terminase,tail,protease,plate,tRNA,capsid,portal,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2022041 : 2066911
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP042243|2022041:2066911|DBSCAN-SWA 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57 | Clostridium_phage(23.08%) | protease,tail,transposase,plate,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2417255 : 2428024
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP042243|2417255:2428024|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP042243|2417255:2428024|2419419_2420460_-|WP_148810162.1|DBSCAN-SWA MEKQSLTYKDAGVDVSEGARAVTLMKEHVQKTFTKNVLCGLGGFGGLFELDLEGIKKPVLVSGTDGVGTKLKIAFLMNKHDTVGQDCVAMCVNDILCQGAKPLFFLDYVATGKLKSEKIADIVKGISDGCIKAQCALIGGETAEMPGFYEEGEYDMAGFAVGIVDKEKIIDGSDIEEGDVLIGLPSSGIHSNGYSLVRKLFFETLGYKIDRYIEELGCTLGEELIKPTRIYVDVCSKVMKKYKVKGMVHMTGGGFYENIPRILPEGLGVEIDLGSFDILAIFKLIQKLGNICTEEMFSTFNMGIGMIMIVSNKDSQEVIEYLNSLEEKAYVIGRVTSEHGVTLCQK >NZ_CP042243|2417255:2428024|2427055_2428024_-|WP_148810166.1|DBSCAN-SWA MTQSLVEVKNLKKYFPIRKGIFRKDKSFVRAVDGVSFTIQRGETLGIVGESGCGKSTTGRMVLNLIHPTEGEIWFDGKEISKLTEDQMRVMRKEMQMVFQDPYASLNPRMTVREIISEPLIVHKISEGKEREKRVCELLELVGLNSYHADRYAHEFSGGQRQRIGIARALAVNPKLIVADEPVSALDVSIQSQILNLMQDLQKEFKLTYLFIAHDLSVVEHISDRVGVMYLGRIVEIADKDQLYDNPYHPYTKALLSAVPIPNPRIKRERIILEGDIPSPSNPPTGCTFHTRCSKRMKICELNVPKLNEIKKGHSVACHLYR >NZ_CP042243|2417255:2428024|2420471_2421887_-|WP_148810163.1|DBSCAN-SWA MYNTINFDKLKEECGIIGIYAPGIDNISQLAYFGLHSLQHRGQESAGIAANKNGEIHYYKEMGLVQEVFSDQIIERLQGDIAIGHVRYSTTGESYVANAQPLVVHHKGGAIALAHNGNLVNANEIREALEDQGVIFQTSIDSEVIANMIARHHKLGIENAIKETMDQIRGSYALAITYKDKLIGVRDPHGLRPLCIGKIDGGYVLSSESCAFNVIGAEFVRDVEPGEIVIIENYKIKSIRYAENMKRALCSFEFVYFARPDSVLDGQSVYVSRRNAGKMLAKEHPVEADLVIAVPDSGTVAAIGYAQESKIPFGEGLIKNRYVGRTFIQPDQRMRERSVRLKLNVLKDNIKGKRLIMVDDSIVRGTTSKQIVDLLKSAGAKEVHVRVCSPPVKYSCYFGIDTPTRKNLVGAVHSVEEIRKMIGADSLGYLSIEGLIKSTSMEGCSLCTACFSGDYPMEVPKQGNKYLFEKR >NZ_CP042243|2417255:2428024|2426192_2426924_-|WP_148810847.1|DBSCAN-SWA MKPIIGITTFWENRPQKLYNLVSYHYIRSVHMAGGIPILIPLMDDKIAGYEYIKSIDGLILSGGEDISPIVYGENPIEQVKLICDERDGFEINLFLEALKNNLPILGICRGIQIMNVALGGTLYQDIHAQRENTLGHYPKDTPVHNLYHQVHVKNESKIYNVFRQNEIRVNSFHHQAIKEIGNELIETAWAADGIIEAVEHIHKKFVVGVQWHPEDLTVHHPIFLKLFKALIEASKKQKGNFF >NZ_CP042243|2417255:2428024|2422635_2423118_-|WP_148810165.1|DBSCAN-SWA MKVAIIMGSDSDYNVVEKGEKILKDFGIEVQVRVISAHRTPNRAMEFAKNAEENGFEVIIGAAGKAAHLPGVLASLTVLPVIGLPIKSSTMDGLDSLLSIVQMPKGIPVATVAINGAENAALLAIQILSVKYPELREKLKAFRELQEKEVIKKDEGFLNR >NZ_CP042243|2417255:2428024|2423283_2424618_-|WP_168198342.1|DBSCAN-SWA MKLEITNKKSKSGVLENLFKLSEKKTNVKTEIIAGITTFMTMAYILIVNPDILSATGMDKGAVFTATALSAAFATFLMAFMANLPFALAPGMGLNAFFAFSVCIGMGYSWQFALTAVLIEGLIFIVLTLTNVREAIINGMPMVIKNAVSVGIGLFIAFIGFQSAGIIVNNDAVLVGLGNVKDPGVLLALVGIIVTGILLVKNVKGALLIGMILTTVGGMVIGKTAIPATIVSVPPSIKPIFFKFVGMNEILSWNMVVVVFTFLFVDLFDTLGTLIGVATKADMIDDEGKLPKAKQALFADAIGTTVGSMMGTSTVTTYVESASGVAEGGRTGLTALTTGVLFLASVVFAPLFTAVPPQATSAVLILVGLFMISPILKINFEDFTEAIPAFLTIIMMPLTYSIAEGLVFGVISYVLLKVLAKRSDEVHPMMYVIAVLFILKHIAS >NZ_CP042243|2417255:2428024|2418808_2419423_-|WP_148810844.1|DBSCAN-SWA MNIAVFVSGGGTNLQAIIDNIKKGNIDGNIEVIISSKKDAYALERGKKHGIEGIYIGKNNYPNLAERTYKILEILEEKQIDLIILAGFMSILDKEIVQRYKNRIINIHPSLIPSFCGRGFYGKKVHEAVLNYGVKVTGATVHFVDEGTDTGPVILQKTVIVKDDDTVESLSKRVLEVEHEILPMAIKLFAEGKLKVEGRKVRIK >NZ_CP042243|2417255:2428024|2421910_2422615_-|WP_148810164.1|DBSCAN-SWA MKKLEMLYEGKAKKVYKTDDEKKYIVEYKDDATAFNGVKKGTIEDKGIVNNKMSAVLFKILEEKGVPTHFEELLSDRESLVKAVKILPIEVIVRNVAAGSLAKRLGVAEGTEMKTTVLEFCYKNDELGDPMINDYHIEAIELATKEQVEVVKKYAFKINEILKEYFLERGMKLIDFKLEFGVFDGKVILADEISPDTCRLWDVETNKKMDKDRFRRDLGDVEKTYQEVLERLEK >NZ_CP042243|2417255:2428024|2425063_2426092_-|WP_148810846.1|DBSCAN-SWA MKTGKRNSITDVEGIKVGHVTLDKDNIKTGVTAVLPHAGNLFKEKVFAAAHVINGFGKTTGLVQIEELGTIETPIILTNTLSVGIASDALIAYMLDKNDDIGLTTGTVNPVVCECNDGYLNDIRGRHIKKEHVLKALENADVEFEEGSVGAGTGMSCYKLKGGIGTASRIITLDGNEYTVGAFVLTNMGQKRDLIIDSRFVGRIIEKIDETKDLEEDKGSIIIILASDIPMTHRQLKRISKRSVVGLSRTGSYIGNGSGEIVISFTTANRFSHYKKEDIFEMKMIHENNMDLVFRAVAECTEEAILNSLITANTTIGRDGNIRKSLKEYMHILLEKKISAIL >NZ_CP042243|2417255:2428024|2417255_2418797_-|WP_148810161.1|DBSCAN-SWA MIKRALISVSDKRGIIDFAKKLQEMGVEIISTGGTAKVLVENGVKVIPISDVTGFPECLDGRVKTLHPKVHGGLLAMRDNPEHLKQLENLNIVPIDLVAINLYPFKETIAKENATLEEAIENIDIGGPTMLRSAAKNHKDVTVICNPDDYTSVLEELENNGEVSYDTKYKLALRVFEHTAHYDALIADYLRKQIDAPLPDVFTMTFEKVQDLRYGENPHQKAVFYKEVGKNEGSLVDAIKLHGKELSFNNINDANGAIELLKEYEEPTVVAVKHTNACGVGSGYDIYDAYLKAYKCDPVSIFGGIVAMNRTIDKRTAEEINKIFIEIVIAPDYDEDALEILKSKKNIRILKLANINKKQSKNALDMKKVNGGLLIQDVDNELFVEEELKVVTERIPTKREMEDLMFAWKVVKHIKSNGIVLAREGQTIGIGPGQVNRIWAVENAIKQSNIPVKGSVMASDAFFPFPDCVEEAAKSGVTAIIQPGGSIKDEASIEMANKYGIAMVFTGMRHFKH |
10 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
880 : 34780
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP042244|880:34780|DBSCAN-SWA GATGGCACTAAAGAAAACTTGTACATGCGGAAGAATAATAGACTATAATCAAAAGCATTGTGAAGAATGCGAGAAGAAATACAAGCAAGAAAGAAGAGAAAGCGCTAAGCAATATGATAGACATGTTAGATATAGCAAAGATAACATTAAGTACAGTAAATTCTATCATAGTGCTGAATGGGCAAAAGCAAGACAAGTTGCTATAGTTAGAGATCACGCTTTATGCCAGGACTGTTTAAAAGAGAATAGAATCACAGTATACGATACAGTACATCATATTATACCGATTAAACAAGATTGGGATAAAAGATTAGATATAGATAACTTAGTATGTTTATGTGAGAGTTGCCATCAAAAGAGACATAAGGAGTTGAAATAAAATGAATGATGTAAAAGAATTAATAAAAATGAGAAACACTTTTAGAGAAGCGGCTGATATTATAGATGAATTGCTAGATCTAAAAGAAAAAGAAAATAATGGACAAGATGTTAAGAAAGAATTAGAGAGTGTTATTGGAAGGTTTGCAATTAAGATGTTGGAACTTAATTCATTGCAGTAAAGGGGTAGGGGGTATCAAAAAAGTTTTTAGTGAATCTAGAAAGACCGCAGGGCCCTCTCTCGCTTTTTAAAAATTCCCTAAATGAAAAAAAATCAAGACAGGAGGTGAGGGAATGGCAAGACCTTCAAAAAGCATAAAAACTATGAGCAAGAATTTAACTAAAGAAGAAAGAGCAATCAGGCTAGAAACAGAAGAAAAATTACGAGGTGGAGCCGATAAAATTTCCCCACCTAAACATTTGAATGCAAGACAGAAAAAAATATTTAATTATATAGTCGAAGAACTTGAAGCGAGTGGAATACTTGGGAATCTAGATATTTACATCTTAGGGGCTTGTGCTATTGCTATTGATAGATTACAACAAATAGAAAAAATGATTAACAAAGATATAAAAATGTTAATGAATAAAGATCTCATGAGAGCTAAAGAAAAATATACAAAAGATTTCTTTAGATGTTGTAATGAACTAAGTTTAAGTCCACAGTCGAGAGCAAAATTAGGTAATATTAATTTACAAGCGAAACAACAGCAAGAAGATCCATTGCTTAGAGTATTAGCTGGTGGTAAAGAATGATACTTTTAGATAAAGCTATTAAATACGCTACTGATGTTGTAGAAGGTAAAGAAATAACAACTAAAGAAGTAATAATTCAATGCAAGTGGTTCTTGATAGATTATAATAAGAGACAACATAAAGATGATTTTGAATTTTATTTTGATACATCAGAAATGGAAAAGATAGAAGGTATATTGAAATTATTAAATTTTGCAACAGGTTTAAATATAGTTGGTAAAACAATATTAGATGGATTATGGGGCTTTCAAGCCTTTTTTTTATGCAATATATTTGGTTGGAGATTTAAAACAGATAAGCGAAAATTCAGATATAGAGATGTTACGTTATTTATCCCAAGAAAAAATGCTAAAACATTCATATGTGCATTAATACTAATAATACTTATGTTGACGGAAGACAAACACAGTGAATTTTATTCTATATGCTTAGATAGGGAACTTGCTGGAGAGGTTAAAAAAGCTATTACTCAAATAATACAAGCAAGTCCAGTAGTAGAAAAGTATTTCAAATTGTCAACTACTCTAAGCGGAAAGATAATTTGCAAACTTACAAATAGTTACTATCAAGCAAGAACTGCTGAAGCAAATAGAAATAACTCTATCAGACCGAGTGCTTTCATAGCCGACGAGATAGGAGCATTTAGAGATTATAAAAACATAACAGCCATGCAATCAGGACAATTAAGTGTTAGAAACCCTTTAAGGTTTAAACTGACAACTGCATATGCCGAAAGTGAATCTATAATGCTTGAAGAACTGGACTATATTAGAAAAGTATATGATGGCGTTATTGAAGATAAAAGAATGTTTGCTTTGCTTTATTATGCAGAAGATGAACATAAATGGGATGATATAGGCTTGCAACAAGCTAATCCACTACGAATTAAAGAAAATTATCAAGAAATAAAAGATAATCGTAAAAAAGCATTAGAAAAACCTTCTGAACGTACAGAATTTCTAACTAAACACATGAATATATTTGTTGATGATATAAAAGAAAATAAATATATAGATTTCACATATTGGAAAAAAGGTGAATTAGAGAAAATAGATTTAGAAGGCAAAGAGGTTGTGGTAGGGGTAGACTTATCGCTTACTACTGACCTTACAGCAGTAGATATTATGTACAAGAAAAATGGGCAGTATTTTCTTAAATCACATGCTTTTTTACCCGAAGATACTTTACCGTTAAGACGAGAAAAAATAGATTATAGGCAAATGGAGAAACTAGGATATTGCACTATTACAAAAGGCAATATAGTGGATTACTTAGTTGTTGAGGACTATATAAGAAATATTGAAGAAAGTAATTGCAAAATTAAATGTATAGTATCTGACCCATATAATGCATTACAGATGATGCAGAGTTTAGCAAATGATTACGAGGTTATAATGCTAAAACAAACTTATTCGCAGTTAAGTCCTAGTATAAAAAGTTTTAGAGATGATGTATATAAAGGCAATATATTCTATGAAAAAAATAAACTGTTAGACTGGTGTATGAGCAATGCAACAACAGTTAAAGGAAGAACAACAGATGATATATTACTTGCTAAAGAAAACAAAAACAAACATAGAATAGACTTAGTTGTTGCAGCAATATTTGCTTATAGTCAGCTTTATTTGATAGATGAAAGTATTAATATTCAGGAAGTTACAGAGGATTATTTGAACATGATGGGCTGGTAAGGAGGTGAGAAAATGAGCATATTTAGTTGGTTGAAAAGCAAATTTAAAAATGAGACTGTAGATACAAACAACCCAGCACTTTTGGAATGGCTAGGAATAGACCCTAATACAAATAAAAACAAGTTGTCTGATGCAACCTATTTTGCTTGTATAAAGAAGTTATCTGAAAGTGTAGGAAAACTAACCTTAAAAATGTATCAAAATACAGATAAAGGAATTATAAAAAGTAATAAAAGCGAGCTTTATAATGTATTAAAATTGCGACCTAATCCGTACATGGCAGCTACTACATTTTGGAGTACGGTCGAAATGAATAGAAATCACTATGGCAATGCTTACGTGTGGTGTAGATATATTGGCCCTAAATTGCAAGATTTATGGATCATGCCTAGTACAGATGTAACTGTTGTGGTAGATGATAAAGGGATATTAGGTGCAAAAGGACGCATTTGGTATAAATATAGAGACAGTAAAAGCAATAAGCTGTATACATTTAATTCTGACGAGGTAATGCATTTTAAGACTTCTACAACGTTTGATGGTATTATAGGTAAAAGTGTTAGAGAGATACTAAAGCAGACAGTAGAAGGAAGTTTAGAAAGCCAAAATTTTATGAATAACTTATATAAGAGCGGGCTAACAGGCAAAGCCGTATTAGAGTATACGGGTGAGTTAAATAAAGAAGCTAAAGAAAGATTAGTTAAAGGTTTCGAAGAATTTGCTAATGGTTCAAAGAATGCAGGAAAAATTATACCTGTCCCACTAGGCATGAAATTAACTCCTTTAAATATTAAATTGACTGATAGTCAGTTTTTTGAGCTAAAAAAATATACAGCATTACAGATTGCAGCTGCATTTGGAATTATGCCTAATCAGATAAATGACTTTGAAAAATCTAGTTATGCAAGTGCAGAAATGCAAAACTTAGCTTTTTATACAGATACACTTCTCTATATTTTAAAGCAATATGAAGAAGAAATAACATATAAAGTATTAAGTAGCCAAATGATTAATCAAGGCTACTTTTTTAAATTCAATGTAAATTCGATCTTAAGGGCAGATTTAGAAACACAGATGAAAAGTTTAGCAACAGCAGTGCAAAATGGCATTTATACGCCAAATGAAGCACGAGAATATTTAGACAAACCTACACATGAAGGCGGTGATATATTAATGGCTAATGGCAATTATATACCGCTTACAATGGTGGGTAACCAGTATAAGAAAGGAGGTAACAGCTAATGAAAATAGAAATTAAAGGTCCTATTATATCTAGTAGTGTGCAATGGATTTATGATTTATTTGAAATGGAAGCTACTAGCCCTAAGAAGGTAAAAGAACAACTTAAAAATGCAAAAGATAATGAGGATGTTGAAGTTGAGATAAACAGCGGTGGTGGTTCTGTATTTGCAGGATCAGAAATATATACTATGCTAAAAGATTATGGAGGAAATGTAACAGTAAAAATAGTTGGTTTAGCCGCTAGTGCTGCAAGTGTAATTGCAATGGCTGGGAACAAGGTTATGATGTCGCCTACTGGTCAAATAATGATACATAACGCTAGCATTAGTGGAGTGAATGGAGATAAAAATACACTTAACCATGAAGCGGGAGTTTTAGAAAGTATTGATAGCACAATAGCTTATGCGTATGAGTTAAAAACTGGCATGACAGAAAAAGAATTATTAGACATGATGAATAAAGAAACTTGGCTATCTCCTAAAAAAGCATTAGATTATGGCTTTATTGATGAAATTATGTTCACTGAAAATAATCAAAACAGCTTTGTAGCAAGTGTAAATTGTGAAATAATACCACAACAAGTTATTGATAAGCTAAGAAATGAATTGCTAGGAAAAGGTGGTATAAGCAATTTATTAAATAATACGGAAGAAACTGCAGAAAAGTCTACAAAAAAATCAAGCAACGAATTAGAATTAGCAAAAGCTAAATTAAAATTAAAAATAAATTTATAGGAGGAATGAAGATGTTAAAATCAGTTGAAATGAAACAAGAATTAGAGGTTTTGAAAAACGAAGCGAGAAAACTATTGGAAGATAAAGAAGCTAAATTAGAGGATATTGAAGCTAAAAATGCAGAAATAGAAACACTGCAAGCGAAAATCATTATGCAAGAGAAATTAGAGCAGGAGGAAAAAGAAGAAATGGAAAATGC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>NZ_CP042244|880:34780|33784_34447_+|WP_148810940.1|DBSCAN-SWA MLLMMIEKNMKIDEIIFCDTGMEFPDMYEHIRKVEKYIGRIITKLKSNDSFEYYMFIHEKKSGQIGYGWPDFRNRWCTQMLKKSVISKHLRSIEDEIIEYHGIALDEAHRAKKNKEKAIRYPLIEWGITETEALQYCYEKGFNWNGLYEKFDRVSCWCCPLKGLQELRNLYRYYPKYWKRLKRMDELAHNRFRLDYSFEEMEKRFSKEIYLEENQLTIWG |
57 | Clostridium_phage(56.67%) | head,tail,integrase,portal,protease,capsid,plate,terminase | attL 6461:6475|attR 30156:30170 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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