Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP042966 | Sulfurospirillum multivorans strain N chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas3,csa3,DEDDh,cas6,cas8b1,cas7b,cas5,cas4,cas1,cas2,WYL,RT | 2 | 21 | 9 | 0 |
1. NZ_CP042966
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP042966_1 | 1127588-1137173 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NZ_CP042966_1
|
146 spacers
spacers of NZ_CP042966_1
>1.1|1127618|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCAATCCATTCAGACAAATCGCCGTCAAAGTTATTT >1.2|1127684|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTCGTAGAATACACCGAAGAAGATTATAAAGTAGA >1.3|1127750|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTGTATATTCGCCTCCGTCAGGGTGCGACATTTTG >1.4|1127816|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACATATAAGATACCGCCTACCTTACGTCCACGTGC >1.5|1127882|34|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCAACTAATAGAATACGTGCCAATAACTCACCGT >1.6|1127946|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCAAAGATGCAATAACAAAAATAATAAAAGATATA >1.7|1128012|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACATATAAGATACCGCCTACCTTACGTCCACGTGC >1.8|1128078|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTAGTAATATTTGCCTAAAACTATGTACATGACCG >1.9|1128144|35|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTGGTGCAGTTATTGACGGCAATCCATTAAGAGC >1.10|1128209|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGTGTTAACAGAACGTGACTTCTTAGAACAATACAA >1.11|1128275|35|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAATTAGAAGCCTCTTTTACATTGCTTTCGATTG >1.12|1128340|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAAGATATTGTTTGCAATCACTTTCTCTCATCTTA >1.13|1128406|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTGCAGTGTGCAGAGAGTGCCACGATTACTGTCA >1.14|1128472|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGCTTTCCATTCTCCATATCCTCGTTCTCTGAACG >1.15|1128538|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGTAAACTCCTTGAATAATCGTATTTTTTTGGGA >1.16|1128604|35|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGCTTCCCGTTTTGTTGTAAAGAATTTCGCTACT >1.17|1128669|37|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAAGATAATGCGATGAGCATTATCGGAATGATTAG >1.18|1128736|35|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGAGGCACGCACATGTCATCAGTAACGCAAAAGG >1.19|1128801|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGTAACTTCTTAACCCACGTTTCAGTCTCGGTAATA >1.20|1128867|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATTCCACCTCTGTTAAACTGTTTAGAGGCATCTTG >1.21|1128933|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTATGATGATTACCCAGATTTTGAACTTATTAAT >1.22|1128999|38|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCGTAAATGCTTCTTACCTGCGCTAAGCTCTCATAAAA >1.23|1129067|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGACTTTAAAAATAATACTCTTAAATGTTTAATCGG >1.24|1129133|38|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACGCCACGCAAACCAACAGATTAACGTTAATACGCAAA >1.25|1129201|35|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTGTTTTAATGCCCCCTTGGTTATAGGCATACA >1.26|1129266|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTCTTCTCTTTTGGTAATGAAAGGAGCACGGATAA >1.27|1129332|37|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGCAATTACGCCAGTTTATAAACCAACGTATAACACA >1.28|1129399|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATATAAAACCTTTCATTTCCCTACTCCCTTCCCTT >1.29|1129465|35|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAATGTAAGGCAGTCATGTTTTTCGCACTCGTTTT >1.30|1129530|37|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGGTAGAAGGTATTGAATTTTATCTTAAAAATTTAA >1.31|1129597|35|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGAACTTAAGCACGTCCAAAAGTTTATCTGTGTA >1.32|1129662|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTATACAAAAGAACAAGTGGTGGACGGGTTTGA >1.33|1129728|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAATGATGGAGTAGTAGAACGTGCGGGAGCTTCTA >1.34|1129794|35|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGCTTTACAATTTAGATAGTTTTGATGCGTTTAA >1.35|1129859|34|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGTCAAGCATGATCGTATTACATTCTTCCAAAA >1.36|1129923|35|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGCTTAACGCTTGTTTACGTACGCTTAATTTTGC >1.37|1129988|35|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATAAACTACAATAAAAAGTTTTTGGCATTGCGTC >1.38|1130053|37|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCTAGGCTCGTTTAACTTCCACGTTGACTCTAAATT >1.39|1130120|37|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAATTAAAGAAGCTTACGAGAACAAATGCATTTCTG >1.40|1130187|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GACACGTATGCCTTTGCAAGTGCTTTTTTTGGCACT >1.41|1130253|34|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGATAGCTTAACTGGTGATATTCCTTTAGCTTC >1.42|1130317|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTAGGGGCGTTTAGACTGCTTTTTTATGTCTAG >1.43|1130383|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGTAAAATCTCCATAAAGTCGGCGTGCTCTCGTTC >1.44|1130449|34|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGGGATTTAATCCGCATTTAAATTTGATTACTT >1.45|1130513|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGCTCACGGTTTCCGCTTGGCTTTCGCTTGGCTCG >1.46|1130579|37|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGGGGCAACCGCCCCTGATTGGCTCGAATATGTCGC >1.47|1130646|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGGGGCAACCGCCCCTGATTGGCTCGAATATGTCGC >1.48|1130712|33|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGAACGGTTTGTTTTTTTGCGTTCTTGCTAAG >1.49|1130775|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GACTGACGGTGAAGAAGAATGGCAAGTAGGTACATG >1.50|1130841|34|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTATTTTCCTTATTGATAAATTATACCATTCGC >1.51|1130905|34|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACGGTAGGCATATTCCCTAAAACCTTAACTTTCA >1.52|1130969|35|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGAGTGCCAATATTAGAGACGGTGCTGATTTCTG >1.53|1131034|34|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTCTGTGTAGGTTGTGGTATTTAATAGTCCCATC >1.54|1131098|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTCGTAGCTTGTCCCGCTTGTGAGCGGGATTTCGT >1.55|1131164|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTCGTAGCTTGTCCCGCTTGTGAGCGGGATTTCGT >1.56|1131230|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTAGGGGCGTTTAGACTGCTTTTTTATGTCTAG >1.57|1131296|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTGTCTTTCCTCTCATCGCAAAGCGGGCGACCAT >1.58|1131362|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTGTTCCCGCTTGAATTTGAGCCACGAGCATAGCT >1.59|1131428|34|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTATTGCCTGCTTAAAATCAATCTTCTTTTTTT >1.60|1131492|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTCGTCATCATTGTGGCTTTCGATAAATTGGGTCA >1.61|1131558|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTGTCTTTCCTCTCATCGCAAAGCGGGCGACCAT >1.62|1131624|35|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAAAGAAGATATTTTGCTAATGCAGAACTTCGCC >1.63|1131689|35|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAGCGGGACAAGCTACGACATGACGAACGCCTCC >1.64|1131754|34|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATGAAGCGATGACAATGCGGGCATTTTTTACGA >1.65|1131818|35|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGAGCACATCGCCCGCTTTTAGCGAGCCGATGAGG >1.66|1131883|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT AAGGAATTGTACTAAGAACAAAACCACGCAAATAT >1.67|1131948|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT TGTCGTAGCTTGTCCCGCTTGTGAGCGGGATTTCG >1.68|1132013|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT TGTCGTAGCTTGTCCCGCTTGTGAGCGGGATTTCGT >1.69|1132079|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTAGTTCGATGGCGTTCGATGATATGGAAACTGAAG >1.70|1132145|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAACAGCAAGTACATGAGAAAGATTGACACTTTAG >1.71|1132210|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTCTAAATAACATTAGATGTCTCCTTCTTTCCAA >1.72|1132275|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTATAATTCTCCTAATGACACCCCTAGCGCATTTG >1.73|1132341|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTGGTGGTCGCACAGTCGATAAAGATTTTGGCAT >1.74|1132405|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAAATCCACTTACTCTGCTTTTTTCTTTTGCCC >1.75|1132469|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGCTTCTAAAACTGACGGTAACACTAGGGGTGCTGG >1.76|1132535|32|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAGTCGTTCATTATTGCACACGCTCTCTTTT >1.77|1132597|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAAATAAAAGGAGAATAGTTCATTTCAGTTCTTAG >1.78|1132662|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCGTGTACGGAGTAACGACAGTAACAGACGTTAAAG >1.79|1132728|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATTTACAAATGTTGGAGCTCAAACTGCACGAATTA >1.80|1132794|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGCTTAGCTGTGAGGTGGTACGACTAGGTAAATATA >1.81|1132860|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TACAGTTATCTATATAGATACTCTCGAGAATCTT >1.82|1132924|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAAGATAGCACCACAAGATTGGAAGAGTAAGTTAG >1.83|1132990|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCTCGTGGACATGAGGACGAACTCGCAGAAATGACA >1.84|1133056|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTGGCGGTTGTCGAACATGGGAGATGCGGAAGCG >1.85|1133121|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAAAGCGTAGGAGAGATTAGCGTATCTTATGCGCAA >1.86|1133187|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTATTGAGTATAAAAGCAAAGATTTTAAAATTAT >1.87|1133253|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAAGCTATCTTTCCGCCCTCTGTGTACTCTATTGGA >1.88|1133319|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTGTAGAAAGTACACCCTGCTCGTCTGTCATTAC >1.89|1133384|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTATTACAAGTGATACAACTGGCGCAACTTCTGCAC >1.90|1133450|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCACTAAGCCTACAAGCACAAAGAACAATCAAGACG >1.91|1133516|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTCAAAAAGAGGGAACAGCCGCACAAGCAGACAACC >1.92|1133582|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAAAATTTTGAAAAGTCGTGCCAATCATCACATACC >1.93|1133648|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GATGCACTTGGTTCTTTTACAAGTAAAACGGTAAA >1.94|1133713|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GATACTAATACTCTGCATTGTGCATTATCCTCATCA >1.95|1133779|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGCAGGTACACTTCGAGGCTCTCAAAAGGACAGATT >1.96|1133845|37|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGGTTACTAAGAGATAGAAAAGGAGCCTTAGCAGTAA >1.97|1133912|37|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAAGTCGACTATGATTAAGTTCTTAGACTTTGGTACA >1.98|1133979|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATGCAATGGAGAACAAAGATTTATTATTGAGAAAT >1.99|1134045|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCGTTTACATACACGCATTTAGGGGTAAGCGAGCT >1.100|1134110|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAGTTTGAAAATGCATATAAACAAACAATGCTAA >1.101|1134174|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGTATGGCGATCTTAACAACGATAAACAATCCTTT >1.102|1134239|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGTATGTTAAGAAACTCATGCCGGTTTAAGTTTA >1.103|1134303|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCCAATTTTAAAAGATTTGGAACAAAAAAGAAAATA >1.104|1134369|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGTATGTTAAGAAACTCATGCCGGTTTAAGTTTAA >1.105|1134434|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GATAAATTAAAAGTTTCATCTGGCTTAAATTCAG >1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAATAAGCAGAGAACAATCCAAACTTACTTATAA >1.107|1134562|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGATTGGTGTCATAAAAATAAAGCGTTGAGCCAGG >1.108|1134627|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACTAAATAAAACATACCACCTATTAATGCGCCTAC >1.109|1134692|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTGGTTAGTCATTTTCCACTCCTTGATTTTTTC >1.110|1134756|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAAATTACACCATGCTCCTGTGGACCGAGATGACCT >1.111|1134822|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GACAAATACCTTAACCCCTGGGTCTCCTGCAAGCG >1.112|1134887|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCCCTGCGGATGAGTGGGTAAATATGCCTGCTACA >1.113|1134952|37|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAGGCAAAATACAATACTTCGCCGCATAGGTTTTAAC >1.114|1135019|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATACTTGCGTAAGATAAACACGCCTTTTCACTTT >1.115|1135083|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTATGGTAAAAAATACTATGGCATCGCTAGATAAAC >1.116|1135149|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGCTCTTATAGAGAAGTTTAATGATGAAAGTATAGG >1.117|1135215|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCGCTTGCAATAGGCTTTACCTTGTCGCCTAGTT >1.118|1135279|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCTATGTAATAATTTATTACCCAGTACAAATATAAG >1.119|1135345|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAAACCACTGCACGATCACGAACCACTGCATCAT >1.120|1135409|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACGCTTAAGCGTAGTTCACTCAAATACCAATAAC >1.121|1135473|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGGCGTACAGTTTGGGGTGATCCTGAAATACAAA >1.122|1135537|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTGACTACTGCAAACTTAGGAAATGGTATAGTAG >1.123|1135601|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGAAGTAGATAGCGTTAACGTTCTTAACCAAGATTA >1.124|1135667|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTGTCCCAAAATTCTCCTTTAAAAAAGACATA >1.125|1135731|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CATAAGCAAAGAATTATAAACAGTAAGCCTTTACAC >1.126|1135797|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCTATCTCTGTTTGTGTTAATTTAAACAGTTTCC >1.127|1135861|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTACTAAAAAGGATAAACATGTCTAGAGTACTCG >1.128|1135926|38|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAAACGCCAGGACAAAAACGGTTACAACGGTGCGTTC >1.129|1135994|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTGATACATGTCCTCATACGTGCTGCTAAACCAAA >1.130|1136060|37|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTTCTCCAATGCGATCTCAGGCGCAGACTCATTTCA >1.131|1136127|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAGCATTTAAGATCAATCAATGACATGTAATCAC >1.132|1136191|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGGCTGAAGAAAAAGAGACCATTTACCATAACAA >1.133|1136255|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAAGAAAAGCACTCTGCCAAAAGTTGAAAAAGTCCA >1.134|1136321|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGGACTCATCAGGGCTTAAGTGTGTGTCTAAAAACT >1.135|1136387|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGGTTTTAGTGATGCAGAAATAGAGGCTATTCAAA >1.136|1136452|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTACTAAAAAGGATAAACATGTCTAGAGTACTCG >1.137|1136517|38|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAAACGCCAGGACAAAAACGGTTACAACGGTGCGTTC >1.138|1136585|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTGATACATGTCCTCATACGTGCTGCTAAACCAAA >1.139|1136651|37|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTTCTCCAATGCGATCTCAGGCGCAGACTCATTTCA >1.140|1136718|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGGCTGAAGAAAAAGAGACCATTTACCATAACAA >1.141|1136782|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAAGAAAAGCACTCTGCCAAAAGTTGAAAAAGTCCA >1.142|1136848|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGGACTCATCAGGGCTTAAGTGTGTGTCTAAAAACT >1.143|1136914|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT AGGTTTTAGTGATGCAGAAATAGAGGCTATTCAAA >1.144|1136979|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT 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cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7b,cas8b1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP042966_1
The CRISPR arrays of NZ_CP042966_1 >merge|NZ_CP042966|1|1127588-1137173|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR 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>NZ_CP042966.1|WP_025344303.1|1127110_1127422_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MKKDTTNYNYVFLFYDIADEFSEVGKYRVAKVFKICKKYLKHHQKSIFRGNITPANQIKLQSELKKVIDKEIDFVTIIKMLTSGSFSEETLGNPKKESEGIFI >NZ_CP042966.1|WP_025344302.1|1126109_1127114_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MAKNHTRYIFSMGELKRKDNSIAFSNEKGNFYLPIEETRELYCLNEVSFNTKFLDFIARAGITMHIFNYHGNYSGSFYPKEYLISGDLTIKQSLSFVNERLVIAKSIVSAIAQNIHEVLYHYYRHDKKELKPYIDWLKNDVPSLLHVTMKVEQILFVEGQIWSRFYDSFKYFLPEDFVMNKRVKRPPDNPINALISFGNTLLYTKTIASIYHTHLNQSISFLHSPREGRFSLSLDLSEAFKPVIVFKTIFDLVGRKKLQVLKHFDKSLNYALLNEEGKKIFIDAFEERMNETFLHVKLKRKVSYKHCLKLDGYKLIKTIVEGREFTPFLLKEKM >NZ_CP042966.1|WP_025344301.1|1125614_1126103_+|Dna2/Cas4-domain-containing-protein MITGTLINYYFHCRTQCWLHANRINLEDNSEDVRIGKVLHEISEEKAQKAEVKIDNVKIDKITKEYLVELKKSDSDPEAVKWQVLLYLYKLRGKGIERKGKVEYHEKNHNTKSEIIELDDANEKALLSVLEAITTLITSPTPPAPKFENKCKKCAYFDYCFI >NZ_CP042966.1|WP_025344300.1|1124805_1125618_+|antirepressor MEKIQLFESKKIRSHWDEENELWYFSVIDAIEVFTQSSNPRKYWSVLKIRLKNEGSQLATNCSQLKMQASDGKMRATDVATTEQLLRLIQSIPSPQVEPFKQWLAKIGYERIESMQDPEKSIDQAMQDYLKLGYTEKWINQRLKSIEVRKELTDEWKKRGLEEGKEFAFLTDIISQAWSGHTTQAYKKLKNLKKENLRDNMTNLELVLTMLAEATTAEISKEKKPKGFDESKKVAKQGGIIAGDTRKAIEKKTGKKVVTKQNARGLLEDK >NZ_CP042966.1|WP_084613084.1|1122343_1124791_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MKMSKMFYLVRATIMLLSDFGIDERFFAHTRGSDKEMLSTHLNLTCNYYQKIVTCKNLEPLIDSIIHTIDSANAVLIKEMFENAIFLHDLGKKNPCFQAKKMLNPLFKEHLNCGDSSHSRTGALEYISYYRPTINQIKDDTSFYRLTYILYNFAYHIDKHHGYLGNIESYCSKTTKEQNDHPDFNNIKNNIDEYLDNKFEFYILNKLLFSLLVSSDYYATTDYIAGLPIDDFGVFSSSAKQRLNELFSTFTCKLENPVGINKLRIELFQEAEQNLLKNLDKNIFYLEAPTGSGKTITSINLALKLLESNEHINKLFYIFPFNTLVEQTKNVFDEIFKNKLTIEVINSITPISTKDQEEEETKYEKSYINRLFFHAPAIITTHVALFNILFGTSKEDNFPLWQLANSVIILDEIQSYNNHLWHYMVEFFDQYAALLNIKIIIMSATLPKLDYFLKEKNNFVDLISKEKREYFFTHTLFKDRVQADFTFLNETMTFEHLEEILKAQPKSKKILFEFIKKKSAREFYTRIKATYKNVYELSGDDNKAYRQLIINKSKEDMPLIIIATQVIEAGVDIDMDIGFKDISTLDSEEQFMGRINRSCKREGKVYFFNMDEASEIYCNDHRLNFDLTHEIYRDILANKSFGVYYQEVLAEIKKSSDRFENGLLTNYDNFTTLLKKLNYKEIAKTMTLISSNNFTLYFPFKIDIAQYKGVQEFAPKNLEERFLSDGYLDGQKVWDAFLALNEIDGFAKKEVAKSRINALMQFFTFTIFKNHEGQRPSIGDEMYGYYFVQEYGNFITSEGKFDREQYNAIKNSHFL >NZ_CP042966.1|WP_025344298.1|1121637_1122399_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKALRFILSGKTACFRKPDVNVFAYFTYNNIHKPALLGMLGAIIGLGGHNQLSNKNRGLKKASSSYDDGFPEFYGKLKELKIAITPLAPNGYFSKKIQTFNNSVGYASFEQGGNLIVREQWLENPVWQILILDDESEVFQKISEYFLNGKSVFIPYLGKNDHPAKIDDVRIIELLPFIKEQKVSSLFEENKLQIVKSPPRGELSYYFKEVSPIRLNEQHHFYEYANLIFTNHKIENENVEDVLSCEGNNYAFI >NZ_CP042966.1|WP_038533088.1|1120728_1121634_+|CRISPR-associated-protein MTRVYGVIGIKAKMANWNADFTGRPKSTSNGDIFGSDKALKYPMKKMWENEGKKVLFIKSWKDEKGSIVPNQLGERYKLLFNDIDKKTETKEVMNNLFKAIDVKNFGATFAVEGQNISITGAVQFGQGFNKYDDTNIEIQDILSPFTDSKAEEKGKEAKQSTLGTKITVDEAHYFYGFSINPKNYDEYKTLLGSEFQGYTEADYAEFKKVALVSATAYSTNSKFGCENEFALFLTCKDEECYLPDLSDYIKFDSQKREIDLSDLEKLIEGKYASVEVYFNPFKLSLKTSLSRFNIFTQEKL >NZ_CP042966.1|WP_025344296.1|1118887_1120714_+|hypothetical-protein MINDVYLRFKELYIQTDGKILSSKFALEKEPAICIKIDEDANIVEKLIVDKNVKRDDLYDWFSIRSIKAKYLNNNKAVGSQMIFSNSNLALFGRFDTFPMVTLESFKKLFDVKPDPTNKKTTAKSQFYSKYQNNVIAIFQPSDTVYFVDEFIQKCDFLNESDVKFLSEECFITEVALSAYFKKLVEDYTCIEEQFFTKEKLLYILSQLKNEFKEYAHKQIKVKIFRNKSVQEYQESEIKYLSNSLFTVEDEGKKIGDLGLPFLDNTLNASKPFMLHLNTKYKISFPKSKDEALYIKYLDDYLSIDKGIFYLEIENFTTQEKPFLNADFGQFIIMKKKNYELFEFLPSFISEFKKNPFILKNHLLLLKDKIPIDNKQPFYEEYLLEDEINKLFFNKLKTNYLSEKIDKTEGKLVNLIFIVRGICFSYFRKGQITGKEFYAKIANFITDMILYHYEHADDSKIKFLVSEFLNLKISLNEYYKGEVMDIRSKLQTLKEKISVNDYEKLSKEDFLLLSGQMAYYLVSQSESSNRTFRLVEHYLKAKNIKMLKNHLRNDLEKYKHKLNLVSKNSKFKNAYSMLLAFEDNEKINHDDIDVLLIGLMTDNIFYTN >NZ_CP042966.1|WP_025344295.1|1118174_1118891_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MNYFELTCKVFIKKNIAFQASFELLSKYISFSMYQEGIGEVHQKEGFKYYVFGGLLPIEKEKVYKQGNLYSFTIRSLDETLIDTLKTTLRQNINNENLLVVEAHKKTISQFFITELYSATPVIVSVGNGKYWTMQESGDIIQLQKQLHENAEKKYQSFFGESLHVKENCIQMIKILNEKPQNIVIHKDGKAIRFFGNKVSLIINEDEVSQKLAFVALACGLSEKNSYGAGFMLGRGMK >NZ_CP042966.1|WP_025344294.1|1117571_1118051_-|Cys-tRNA(Pro)-deacylase MSLKKTNAARFLDTLKLPYEMTSYEVDEEDLSAVHAAASLGVDASCVFKTLVARDDAKRIVVACIPAADEIDLKALAKVAQAKRCELVAVKELLALTGYIRGGCSPLAMKKHYATFIDESIHQHEKVYVSAGLRGVQLRLSPLVLIEASKAMCASLTKH >NZ_CP042966.1|WP_025344304.1|1137254_1137611_+|hypothetical-protein MARSLSIDIWGLDWYIETGIKVENEASYDFPMIGNYNVVDGKIVHLHDYMLSDKLFKACKDFGGVLLEKCSFLYIPRDKEGELNPNDEQSFEGTFLDALVFIKKELEKEEKRRKYPYM >NZ_CP042966.1|WP_025344305.1|1137623_1138238_-|hypothetical-protein MFSKIKKFFEIKPDDTLDYMDPDKLLKNKKRVLKDPLNQADEDEFFRQMEEEEQFIDHLNAQEEEQTAPQNNASRESVLKKMRQCMQERDWNPKHHPKIMIALATLVLGIVILAIILHETPNPLIGKWRPQGKNVFLPVGDIEFAKDKFQALGISTMVKYDIDETKIQVIDVATDTGIIFYITGDKTIEVNLLGVKTSYKKMEK >NZ_CP042966.1|WP_148295327.1|1138293_1138341_+|hypothetical-protein MLMRGAKMVTCKAKA >NZ_CP042966.1|WP_025344306.1|1138397_1138847_+|hypothetical-protein MLPNAVNPKKTTKSLKPKTTAKKVASKARKTDAQKVPKRPSLLLNLLASCVVLLFIGFGIKYVIDHTINYNPLLGKWRAQTVLGIMEIEFDRSSISSFGTKNPVTYDILEDKVIVIDDTIKVGNTYKIVDENTISTEAGGFKTVYKKVK >NZ_CP042966.1|WP_025344307.1|1138882_1139245_+|hypothetical-protein MHHKEHNTLDLLEQFTHNTQTSSNKSDDNENRMFQELGQFMSKSDKKGSNSIFGIPNFIWYIIMLGMFGYLIKEIFFLNEINDVSTAVSTINQSVTKEISEIQNSAHKALENANAKKKER >NZ_CP042966.1|WP_025344308.1|1139385_1139643_+|BrnT-family-toxin MMFEYDETKSKANKEKHGIDFEEAQALWQNKQHAVFDSVYVNNEWRHLLVGLIGELCYVAIFTMREDHIRIISVRRCRKNEKEIL >NZ_CP042966.1|WP_025344309.1|1139648_1139921_+|hypothetical-protein MSAEEFDRKFDNGEDILPYIDLSSKRTLKEFEKEMLAVKKVNVDLPSWAIASLDQEAKRMGVTRQSIIKMWLIQKLDDLSLNRKSLKQVG >NZ_CP042966.1|WP_025344310.1|1139930_1140437_-|hypothetical-protein MFKDDDTLNLLDKYRKNKFQEKENGQFKTNYQNNNGVPHFVWIAVVVFIGYFIITNFMDRLEEQRIARKMEAVGEQFSRAVKEEIKQQEKAIKEITGTSLKIMESTPKIQITPNTVTPQMTPKVEQTKKNVTITLTPEQSSNQKQIQKTEETEEIKPGSSSSNVGYYR >NZ_CP042966.1|WP_025344311.1|1140453_1140768_-|hypothetical-protein MKKILILVGLLTSMYAIPPCELPNQMVCAYLYKGAMSSEIIIVNLSRDNILVKNISATLDGQSKSISDLQLSPGQSYTMLKSRYDDHLKKPYYYIGSMDYKTIK >NZ_CP042966.1|WP_025344312.1|1140777_1140993_-|hypothetical-protein MAQILIKNYNRLNEDFTQDQDKLLDLLKAPIEKIFDNPVHSVYGDTSGDKGLGIDQLENLKVNNINITQTN |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP042966_1 | 1.130|1136060|37|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1136060-1136096 | 37 | NZ_CP042966.1 | 184704-184740 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP042966_1 | 1.139|1136651|37|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1136651-1136687 | 37 | NZ_CP042966.1 | 184704-184740 | 0 | 1.0 |
1. spacer 1.130|1136060|37|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to position: 184704-184740, mismatch: 0, identity: 1.0
tcttctccaatgcgatctcaggcgcagactcatttca CRISPR spacer tcttctccaatgcgatctcaggcgcagactcatttca Protospacer *************************************
2. spacer 1.139|1136651|37|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to position: 184704-184740, mismatch: 0, identity: 1.0
tcttctccaatgcgatctcaggcgcagactcatttca CRISPR spacer tcttctccaatgcgatctcaggcgcagactcatttca Protospacer *************************************
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP042966_1 | 1.59|1131428|34|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1131428-1131461 | 34 | NC_022111 | Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence | 1322808-1322841 | 4 | 0.882 |
| NZ_CP042966_1 | 1.103|1134303|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134303-1134338 | 36 | MH992169 | Apis mellifera associated microvirus 6 isolate BeeNHemo_SP_302, complete genome | 1737-1772 | 6 | 0.833 |
| NZ_CP042966_1 | 1.126|1135797|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1135797-1135830 | 34 | MK573636 | Escherichia phage vB_EcoM_PHB13, partial genome | 29722-29755 | 6 | 0.824 |
| NZ_CP042966_1 | 1.100|1134110|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134110-1134143 | 34 | NZ_CP032824 | Arcobacter cryaerophilus ATCC 43158 plasmid pACRY43158, complete sequence | 10782-10815 | 7 | 0.794 |
| NZ_CP042966_1 | 1.103|1134303|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134303-1134338 | 36 | MK249146 | Blackfly microvirus SF02 isolate 036, complete genome | 273-308 | 7 | 0.806 |
| NZ_CP042966_1 | 1.135|1136387|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1136387-1136421 | 35 | MN693171 | Marine virus AFVG_25M555, complete genome | 21978-22012 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP042966_1 | 1.143|1136914|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT | 1136914-1136948 | 35 | MN693171 | Marine virus AFVG_25M555, complete genome | 21978-22012 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP042966_1 | 1.48|1130712|33|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1130712-1130744 | 33 | MK448793 | Streptococcus phage Javan523, complete genome | 39650-39682 | 8 | 0.758 |
| NZ_CP042966_1 | 1.48|1130712|33|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1130712-1130744 | 33 | MK448845 | Streptococcus phage Javan118, complete genome | 35214-35246 | 8 | 0.758 |
| NZ_CP042966_1 | 1.52|1130969|35|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1130969-1131003 | 35 | NZ_CP054613 | Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence | 495756-495790 | 8 | 0.771 |
| NZ_CP042966_1 | 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134498-1134531 | 34 | KY883636 | Vibrio phage JSF1, complete genome | 2173-2206 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP042966_1 | 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134498-1134531 | 34 | KY883640 | Vibrio phage JSF17, complete genome | 34545-34578 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP042966_1 | 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134498-1134531 | 34 | KY883637 | Vibrio phage JSF2, complete genome | 81049-81082 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP042966_1 | 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134498-1134531 | 34 | KY065147 | Vibrio phage JSF4, complete genome | 28563-28596 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP042966_1 | 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134498-1134531 | 34 | KY883639 | Vibrio phage JSF14, complete genome | 37224-37257 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP042966_1 | 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134498-1134531 | 34 | HQ641348 | Vibrio phage ICP1_2006_D, complete genome | 42451-42484 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP042966_1 | 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134498-1134531 | 34 | KY883634 | Vibrio phage JSF5, complete genome | 124975-125008 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP042966_1 | 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134498-1134531 | 34 | HQ641354 | Vibrio phage ICP1_2004_A, complete genome | 42588-42621 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP042966_1 | 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134498-1134531 | 34 | HQ641349 | Vibrio phage ICP1_2006_C, complete genome | 42451-42484 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP042966_1 | 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134498-1134531 | 34 | KY883635 | Vibrio phage JSF6, complete genome | 128047-128080 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP042966_1 | 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134498-1134531 | 34 | MH310934 | Vibrio phage ICP1_2006_E, complete genome | 42521-42554 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP042966_1 | 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134498-1134531 | 34 | HQ641353 | Vibrio phage ICP1_2001_A, complete genome | 43186-43219 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP042966_1 | 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134498-1134531 | 34 | HQ641352 | Vibrio phage ICP1_2005_A, complete genome | 42591-42624 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP042966_1 | 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134498-1134531 | 34 | MH310933 | Vibrio phage ICP1_2011_A, complete genome | 42402-42435 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP042966_1 | 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134498-1134531 | 34 | MN419153 | Vibrio phage ICP1_2017_F_Mathbaria, complete genome | 42472-42505 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP042966_1 | 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134498-1134531 | 34 | HQ641350 | Vibrio phage ICP1_2006_B, complete genome | 42604-42637 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP042966_1 | 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134498-1134531 | 34 | MN402506 | Vibrio phage VMJ710, complete genome | 10596-10629 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP042966_1 | 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134498-1134531 | 34 | HQ641351 | Vibrio phage ICP1_2006_A, complete genome | 42611-42644 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP042966_1 | 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134498-1134531 | 34 | MH310936 | Vibrio phage ICP1, complete genome | 41311-41344 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP042966_1 | 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134498-1134531 | 34 | KY883638 | Vibrio phage JSF13, complete genome | 109025-109058 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP042966_1 | 1.127|1135861|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1135861-1135895 | 35 | AP013632 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C28-MedDCM-OCT-S36-C291, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 399-433 | 8 | 0.771 |
| NZ_CP042966_1 | 1.136|1136452|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1136452-1136486 | 35 | AP013632 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C28-MedDCM-OCT-S36-C291, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 399-433 | 8 | 0.771 |
| NZ_CP042966_1 | 1.6|1127946|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1127946-1127981 | 36 | LC168164 | Tenacibaculum phage pT24 DNA, complete genome | 226519-226554 | 9 | 0.75 |
| NZ_CP042966_1 | 1.48|1130712|33|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1130712-1130744 | 33 | NZ_LR215026 | Mycoplasma ovipneumoniae strain NCTC10151 plasmid 2 | 2161-2193 | 9 | 0.727 |
| NZ_CP042966_1 | 1.100|1134110|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134110-1134143 | 34 | NZ_CP053838 | Aliiarcobacter faecis strain CCUG 66484 plasmid pAFAEC, complete sequence | 61286-61319 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP042966_1 | 1.100|1134110|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134110-1134143 | 34 | NZ_MK715471 | Arcobacter cryaerophilus strain M830MA plasmid pM830MA, complete sequence | 67755-67788 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP042966_1 | 1.109|1134692|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134692-1134725 | 34 | NZ_CP042616 | Escherichia coli strain NCYU-26-73 plasmid pNCYU-26-73-1, complete sequence | 151291-151324 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP042966_1 | 1.109|1134692|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134692-1134725 | 34 | MN693898 | Marine virus AFVG_250M937, complete genome | 51034-51067 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP042966_1 | 1.124|1135667|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1135667-1135700 | 34 | NZ_CP047124 | Lactobacillus hilgardii strain FLUB plasmid unnamed3 | 13136-13169 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP042966_1 | 1.124|1135667|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1135667-1135700 | 34 | NZ_CP047124 | Lactobacillus hilgardii strain FLUB plasmid unnamed3 | 27277-27310 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP042966_1 | 1.124|1135667|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1135667-1135700 | 34 | NC_014633 | Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence | 423475-423508 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP042966_1 | 1.124|1135667|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1135667-1135700 | 34 | MH321490 | Staphylococcus phage Quidividi, complete genome | 22361-22394 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP042966_1 | 1.124|1135667|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1135667-1135700 | 34 | MH321491 | Staphylococcus phage Twillingate, complete genome | 24506-24539 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP042966_1 | 1.35|1129859|34|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1129859-1129892 | 34 | MG592578 | Vibrio phage 1.208.B._10N.222.52.A7, partial genome | 30291-30324 | 10 | 0.706 |
| NZ_CP042966_1 | 1.63|1131689|35|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1131689-1131723 | 35 | NZ_CP040675 | Exiguobacterium mexicanum strain A-EM plasmid punnamed1, complete sequence | 67611-67645 | 10 | 0.714 |
| NZ_CP042966_1 | 1.74|1132405|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1132405-1132438 | 34 | MN692973 | Marine virus AFVG_117M33, complete genome | 22289-22322 | 10 | 0.706 |
| NZ_CP042966_1 | 1.84|1133056|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1133056-1133090 | 35 | NZ_CP014311 | Burkholderia sp. PAMC 26561 plasmid unnamed4, complete sequence | 87145-87179 | 10 | 0.714 |
| NZ_CP042966_1 | 1.100|1134110|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134110-1134143 | 34 | NC_018501 | Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p02, complete sequence | 154325-154358 | 10 | 0.706 |
| NZ_CP042966_1 | 1.41|1130253|34|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1130253-1130286 | 34 | NZ_AP017566 | Pseudanabaena sp. ABRG5-3 plasmid ABRG53f, complete sequence | 53709-53742 | 11 | 0.676 |
| NZ_CP042966_1 | 1.64|1131754|34|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1131754-1131787 | 34 | NZ_AP019636 | Enterobacter sp. 18A13 plasmid pECC18A13-2, complete sequence | 3861-3894 | 11 | 0.676 |
| NZ_CP042966_1 | 1.112|1134887|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134887-1134921 | 35 | AP019560 | Staphylococcus phage SP120 DNA, complete genome | 10643-10677 | 11 | 0.686 |
| NZ_CP042966_1 | 1.112|1134887|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134887-1134921 | 35 | KX827369 | Staphylococcus phage SpT152, complete genome | 36144-36178 | 11 | 0.686 |
| NZ_CP042966_1 | 1.112|1134887|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1134887-1134921 | 35 | MK075003 | Staphylococcus phage phiSP44-1, complete genome | 36024-36058 | 11 | 0.686 |
1. spacer 1.59|1131428|34|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_022111 (Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.882
--attattgcctgcttaaaatcaatcttcttttttt CRISPR spacer ttattatt--cttcctaaaatcaatcttcttttttt Protospacer ****** ** *.*********************
2. spacer 1.103|1134303|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH992169 (Apis mellifera associated microvirus 6 isolate BeeNHemo_SP_302, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
-tccaattttaaaagatttggaacaaaaaagaaaata CRISPR spacer gtccaa-actaaacgattaggaacaaaaaagaaaaaa Protospacer ***** .**** **** **************** *
3. spacer 1.126|1135797|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK573636 (Escherichia phage vB_EcoM_PHB13, partial genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.824
cctatctctgtttgtgttaatttaa-acagtttcc CRISPR spacer gctatctctgtttgtgttgattcaacatagtttt- Protospacer *****************.***.** *.*****.
4. spacer 1.100|1134110|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP032824 (Arcobacter cryaerophilus ATCC 43158 plasmid pACRY43158, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
gagtttgaaaatgcatataaacaaaca-atgctaa CRISPR spacer gagtttgaaaaagcatataaagaactagatggtg- Protospacer *********** ********* ** .* *** *.
5. spacer 1.103|1134303|36|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK249146 (Blackfly microvirus SF02 isolate 036, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
tccaattttaaaagatttggaacaaaaaagaaaata CRISPR spacer tcccaaactaaacgattaggaacaaaaaagaaaaaa Protospacer *** * .**** **** **************** *
6. spacer 1.135|1136387|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693171 (Marine virus AFVG_25M555, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
aggttttagtgatgcagaaatagaggctattcaaa CRISPR spacer aggtttaactgatgcagaaatagaggcattataat Protospacer ****** * ****************** * .**
7. spacer 1.143|1136914|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693171 (Marine virus AFVG_25M555, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
aggttttagtgatgcagaaatagaggctattcaaa CRISPR spacer aggtttaactgatgcagaaatagaggcattataat Protospacer ****** * ****************** * .**
8. spacer 1.48|1130712|33|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448793 (Streptococcus phage Javan523, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
ctgaacggtttgtttttttgcgttcttgctaag CRISPR spacer ctgaacggcttatttttttgcgttgacttttag Protospacer ********.**.************ . .* **
9. spacer 1.48|1130712|33|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448845 (Streptococcus phage Javan118, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
ctgaacggtttgtttttttgcgttcttgctaag CRISPR spacer ctgaacggcttatttttttgcgttgacttttag Protospacer ********.**.************ . .* **
10. spacer 1.52|1130969|35|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
-aagagtgccaatattagagacggtgctgatttctg CRISPR spacer tacgcatg-caatattagacacggtgctgatgtcgt Protospacer * * .** ********** *********** **
11. spacer 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY883636 (Vibrio phage JSF1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
12. spacer 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY883640 (Vibrio phage JSF17, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
13. spacer 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY883637 (Vibrio phage JSF2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
14. spacer 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY065147 (Vibrio phage JSF4, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
15. spacer 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY883639 (Vibrio phage JSF14, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
16. spacer 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to HQ641348 (Vibrio phage ICP1_2006_D, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
17. spacer 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY883634 (Vibrio phage JSF5, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
18. spacer 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to HQ641354 (Vibrio phage ICP1_2004_A, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
19. spacer 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to HQ641349 (Vibrio phage ICP1_2006_C, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
20. spacer 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY883635 (Vibrio phage JSF6, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
21. spacer 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH310934 (Vibrio phage ICP1_2006_E, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
22. spacer 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to HQ641353 (Vibrio phage ICP1_2001_A, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
23. spacer 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to HQ641352 (Vibrio phage ICP1_2005_A, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
24. spacer 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH310933 (Vibrio phage ICP1_2011_A, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
25. spacer 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN419153 (Vibrio phage ICP1_2017_F_Mathbaria, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
26. spacer 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to HQ641350 (Vibrio phage ICP1_2006_B, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
27. spacer 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN402506 (Vibrio phage VMJ710, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
28. spacer 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to HQ641351 (Vibrio phage ICP1_2006_A, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
29. spacer 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH310936 (Vibrio phage ICP1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
30. spacer 1.106|1134498|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY883638 (Vibrio phage JSF13, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
31. spacer 1.127|1135861|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AP013632 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C28-MedDCM-OCT-S36-C291, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tttactaaaaaggataaacatgtctagagtactcg- CRISPR spacer gttgctaaaaaggataaaaatgtcta-aatataaga Protospacer **.************** ******* *.**. *
32. spacer 1.136|1136452|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AP013632 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C28-MedDCM-OCT-S36-C291, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tttactaaaaaggataaacatgtctagagtactcg- CRISPR spacer gttgctaaaaaggataaaaatgtcta-aatataaga Protospacer **.************** ******* *.**. *
33. spacer 1.6|1127946|36|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LC168164 (Tenacibaculum phage pT24 DNA, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tgcaaagatgcaataacaaaaataataaaagatata CRISPR spacer gctaagaaagcaatcacaaaattaataaaagatatt Protospacer .**..* ***** ****** *************
34. spacer 1.48|1130712|33|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR215026 (Mycoplasma ovipneumoniae strain NCTC10151 plasmid 2) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
ctgaacggtttgtttttttgcgttcttgctaag CRISPR spacer tttttttgtttgtttttttgtgttcttactaat Protospacer .* . *************.******.****
35. spacer 1.100|1134110|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP053838 (Aliiarcobacter faecis strain CCUG 66484 plasmid pAFAEC, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gagtttgaaaatgcatataaacaa----acaatgctaa CRISPR spacer gagtttgaaaaagcatataaagaacttgatggtg---- Protospacer *********** ********* ** *...**
36. spacer 1.100|1134110|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_MK715471 (Arcobacter cryaerophilus strain M830MA plasmid pM830MA, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gagtttgaaaatgcatataaacaa----acaatgctaa CRISPR spacer gagtttgaaaaagcatataaagaacttgatggtg---- Protospacer *********** ********* ** *...**
37. spacer 1.109|1134692|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP042616 (Escherichia coli strain NCYU-26-73 plasmid pNCYU-26-73-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gttggttagtcattttccactccttgattttttc CRISPR spacer caagatatgacattttccgctccttgatttgttc Protospacer *.* * ********.*********** ***
38. spacer 1.109|1134692|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693898 (Marine virus AFVG_250M937, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gttggttagtcattttccactccttgattttttc CRISPR spacer cttgtttagtcattttcccctccttatgtctatt Protospacer *** ************* ******. *.* *.
39. spacer 1.124|1135667|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP047124 (Lactobacillus hilgardii strain FLUB plasmid unnamed3) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ttttgtcccaaaattctcctttaaaaaagacata CRISPR spacer ttaaagttttaaattctcctttataaaagacata Protospacer ** . ... ************* **********
40. spacer 1.124|1135667|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP047124 (Lactobacillus hilgardii strain FLUB plasmid unnamed3) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ttttgtcccaaaattctcctttaaaaaagacata CRISPR spacer ttaaagttttaaattctcctttataaaagacata Protospacer ** . ... ************* **********
41. spacer 1.124|1135667|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_014633 (Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ttttgtcccaaaattctcctttaaaaaagacata CRISPR spacer tatctcatcaaaattttcctttaaagaagacatt Protospacer * *. . .*******.*********.*******
42. spacer 1.124|1135667|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH321490 (Staphylococcus phage Quidividi, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ttttgtcccaaaattctcctttaaaaaagacata CRISPR spacer atatgtttcaaaattctcctttaaaaacagtcta Protospacer * ***..******************* ... **
43. spacer 1.124|1135667|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH321491 (Staphylococcus phage Twillingate, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ttttgtcccaaaattctcctttaaaaaagacata CRISPR spacer atatgtttcaaaattctcctttaaaaacagtcta Protospacer * ***..******************* ... **
44. spacer 1.35|1129859|34|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG592578 (Vibrio phage 1.208.B._10N.222.52.A7, partial genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
aagtcaagcatgatcgtattacattcttccaaaa CRISPR spacer tgctcaagcatgatagtattccattcttctccgt Protospacer . *********** ***** ********. .
45. spacer 1.63|1131689|35|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040675 (Exiguobacterium mexicanum strain A-EM plasmid punnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcgggacaagctacgacatgacg----aacgcctcc CRISPR spacer agagcgggaaaagctacgacctgacgacgaagcga---- Protospacer .******* ********** ***** *.**
46. spacer 1.74|1132405|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN692973 (Marine virus AFVG_117M33, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttaaatccacttactctgcttttttcttttgccc CRISPR spacer cttgtgcagctttctctgcttttttcgtttgcca Protospacer .* . * .*** ************* ******
47. spacer 1.84|1133056|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP014311 (Burkholderia sp. PAMC 26561 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
cttggcggttgtcgaacatgggagatgcggaagcg CRISPR spacer ttacggagttgtcgaacatggaagacgcggaaatt Protospacer .* * .**************.***.******..
48. spacer 1.100|1134110|34|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_018501 (Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p02, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gagtttgaaaatgcatataaacaaacaatgctaa CRISPR spacer gagtttgaaaaatcatataaacaaaatgcaacat Protospacer *********** ************ ... .*
49. spacer 1.41|1130253|34|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP017566 (Pseudanabaena sp. ABRG5-3 plasmid ABRG53f, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
ttgatagcttaactggtgatattcctttagcttc CRISPR spacer ttgatagcttaactgttgatcttcataggtgaca Protospacer *************** **** *** * . .
50. spacer 1.64|1131754|34|NZ_CP042966|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP019636 (Enterobacter sp. 18A13 plasmid pECC18A13-2, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
gatgaagcgatgacaatgcgggcattttttacga CRISPR spacer cgctatgcgctgacaatgcgggctttttttgatg Protospacer .. * *** ************* ******. .
51. spacer 1.112|1134887|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AP019560 (Staphylococcus phage SP120 DNA, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
tccctgcggatgagtgggtaaatatgcctgctaca CRISPR spacer gatttgcggttgagtgggtaaatattcctaacaac Protospacer ..***** *************** ***. .*
52. spacer 1.112|1134887|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KX827369 (Staphylococcus phage SpT152, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
tccctgcggatgagtgggtaaatatgcctgctaca CRISPR spacer gatttgcggttgagtgggtaaatattcctaacaac Protospacer ..***** *************** ***. .*
53. spacer 1.112|1134887|35|NZ_CP042966|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK075003 (Staphylococcus phage phiSP44-1, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
tccctgcggatgagtgggtaaatatgcctgctaca CRISPR spacer gatttgcggttgagtgggtaaatattcctaacaac Protospacer ..***** *************** ***. .*
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
25979 : 52664
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP042966|25979:52664|DBSCAN-SWA TTTAATTCTGCGAAGCCATATTTAATTTCTCATTATATCTTTTTTCAAATTCATTGGGTGAAATATAACCAAGATAACTATGCCTTCTAGTTGAATTATAAAACATTTCGATGTAGTAAAATATGTCTGATTGTGCTTCTTCTCGTGTAATATAAATCTGCTTTTTGACACATTCACGCTTAAATGTTTTAAAAAAGCTCTCAGCAACTGCATTATCATAACAATTTCCTCGCCTGCTCATACTAGGGATAAGGTTGTATTTTTGGAGAAGTGCTTGCCACTCGTATGAGCTATATTGTGAGCCTTGGTCTGAGTGTACAATCACTTCATGATGTGGTTTTTGTCTAAAGGTTGCCATTTCCAGGGCTTTTAGAGCCAACCCAGTTGTCATGCGATGACTTGTTGCCCATCCTGCTATTTTTCTGCTAAAAAGATCTAATACAACTGCTAAATAAAACCATCCTTCGTATGTTTTGATATAGGTTATATCTGTTACCCATGTGTGATTTGGCTCTTGAACATTGAAGCACTGTCCAAGATGGTTAGGATGCGCCACATGTCTTTTCCCTTTTTTGTAACGAGGTTTTCTCTGCTTTACACCTGCACCAAAGAGTTTGGCTTCACCCATCAATCTTGCAACGCGTTTTTTATTAACACCAATACCTGATGCCACAAGATCTTTTGTAACAGTTCGATATCCATAAATACGCCCACTATGCTCATAAGCCTCTTTAATGTGGTGCAACACAACTTTATTAGCTATGTCACGCTTTGACTCTGGTTGTTTAGCCCATGCGTAATAACCACTAAAATGAACTTGCAAAGTTTTGCACATTCTTCTCACAGGATAGAGTGGCTCATACTCTTTGATAAAGGCGTACTTTACTTTTGGTTTTTGGCAAAGTACGCTGCGGCCTTTTTTAGAATATCGCGCTCCTCTGTGACTCTTTTTAATTCTGCTTTGAGCTTTCTATTTTCCGATGACAAATCTTTGGAAGCTTGGTGTTGTGAGGTACTTTGCGGATTACTGTAGATTTTTATCCATGCTTTGAGCGAATCAGGATGCACTCCCAATCTTTGTGCAGTATCTTTAATGGGATAACCATTTTTGATAATTTGGTTGACAGCCTCTTGTTTGAACTCGTCTGTGTATAGTTTATTTGCCATGGAATGACTTTCTCCTCTTGGTATTTTATTTGGTCATTATCGACCAGATTAACAGTTTCAAGAGTGTCTAGTATTGTGGGGTCATTCCATTCATTAGCTCTAGTAAAACTATCTTCAGTTAATTTTGAACCGAATTTAGTTTCCATTCCTGCTTTAGCTTCCATTTGTCTAACGCCTTCTCTTCCTGCTCCGTAAGCTGTTTGAGAAGTTAAAAGCGAATTAGAACCCATCGTTCCTGCAAAATCTAAACTAGATTTCTTTCCTTCTTGGGAAAGAACATTAGATAAGCTCCCTACTTGAGACATTTTAGCGGACAACTCATTATAGGGTTTAGAACTGTCATAATTGAGCTTATTTTGAAAGTTCGCACCTTGATTAAGGTTAGTGCCTATCTCTATACCTTCTTTTGTTCCTGCTTGAATATTTTGATAATGTAAAGCTTCTGCATAACTCAAATCTTTACCAGTGGATTGAGATACAGATTCTTTTAATTGGAGAGCTTTAGAATCTGAAGATATACTCATTGCAGATAAATTTTTAGAGAGGCTTTGAGTCATATTTGAAGCGATACTACTTAACATAGTAAAAGAACCGCTCATTAAACCCCACGAGATCATAGGAACAGAAACATATAAATAACCTGCAACTCCTGCCATCGCAGCAGAATCAGAAAGCATTTGCATTGAGTTATATGCTGTTACATCTCCACCGAATGAATTTTCAGCGTATTTCAAAATAAAGAAGTTTAAAATAGAAGCGCAAACACCCCACATTTCTATCCATACTAAAGCTTTAGCATAGTTTTTGAAGATAGATATGCCATTAATCAAACCAATAACAACAATCAAAGGAAATAAAGCATATAAAAGACCTCTTAAAACAACTTGTAAGATCGGTAACATTTTAGACATATAATAGCCACTAGCTAAATTTGTTTGAATATATTCTGCTCTTGTTTTCCTTTCTGCATAAGCAATACCCGTAGGTAATTTTGAATTACTTAAAAAAGAATTGATTAACCCCGATTGTATTGCTAATTCTTCAAAATTAGATTTAGGTAATGAAGTTTGTTTTGTAATAACTTCGACATCTCTATCGTCAACGTTTTTAAAAACTTTTGACATCGTGTCTTTATAAGAAGTTAAATCATTAGAAGATAATTTAGTCCACAAAGCACCACATTCGTATACATCTCCATTAACTGAAGCAGTATAGGAATTAACAGGAATATTACCGACTGTAATAGATGAGGAATACCAGGAATCTAATGTACTTTTAATACTTGTTGAACTATATAATTCATCGATTCTTTTCTGACCTTCGTCTCCCTTCCCTGAAAATGGAACTAAAATACAATCAGCTACAAATCTTTCAACGTCATTACCGAAATTATGTGAAGAGTCATTAAACTTATGATTCAAAATATCAATCGAATCTCTTAGCGAAGAAACATAACCACCACTAGCAAGAGAATAATTACCACTTCCACTATAACTCATTGCTGTTTGAAATAAGTTTGTCAAACCATTACCAAAAGAATTAAAAAATGAATAAGAGTAAGCTAAAACAGTCGGAATGTTCGCAACTGCCGTTCCTGTTGTAATCGTTGTATTATTGTCATAATATAAAGGATAGTTATCTGTTTTAATATATACTGTAGAGCTTACAGAAAAAACAACTGAAAGAACACCAACCACAAAAATCTGATACATTGAAAAGCTTTTTAAACCCTCGGTTCCTAGTTTTCCAGTTATAGCATTGATGAAAACAAAAACACTACCAAACAACGCCACTAATTTTAAAAGAGATAAATAATCTTCACTATGAAATATCATAGCTACTGCATTTAAGATAGAAAACATACTATCAACTTCTTCAGCAGATGATACAGTTACTAAGTAATCGTCAGCTAAAGCACCCAAAGAAAATAAACATAAGATTGAAATTACCTTTATCATTTATATACTCCTGTATTGTTTTTGGGAACCCCTAAAAGGGAAGAAATAATAAGGGAGAGAGATAATAGGTGAGTTCATTAAACGCCATAAAAAGCAGCAATACGGGGAGTGAGCTTTTTAGCTCATTGCAGTTATAGAAACTTTTTTTAGCAAAAGTGCGATTCTAAAAAAAACCGTAAAAAACTTGCAAAATACTTAAATTCTATTTCCAATTAACAGAGAAGACAAAATATGATGTCATTGGCAATATTCGTAGTGACGCAATAAATGACAGATGACAAAATAGAAATAATCCCTTAAATAGGGGGTTAAAAGAGGTTTTATGACGCTGTGACACACAAATAGCTAAAAAAATTCTCTAAATTAAGAACACTTGTTCTTATGAATCAACAATATTTTAGATGGATTACGTCATAAATGCTTACAAAGCACGATACTATCGAGGTTTGAAGGTGTCATAGTAGCGTCATAACTGCGTCATTGTGCTGTCATCGTGTCATTTATCTTATTTATATATATTTCTTCTAAACTCCCTAAAATAGGGATAAATAAAAGAATATATAAGAGAAGAGTTAACAAATTTAGGGGAATTCTTCTATGACGCAGTAGTGTCATTGTGCTGTCATAGTGTCATTCCACTTTTAAAATTGAAATCGAGCGAAATTCATATTATTAAGACAACTTTTCATAAAATAATAACAATTACAAAAAGGGGTCATAGTATGAGGCTAATGTTATTGGTTTTATTTATGGTTGTTGGTTTATTTGCCAACGAGGTTAAAGTTGACGGAAAGTATAGTAATTTATTAGGCAATCCGTTTAAGAGTGTTTTAGAAACTAAATCACAAGATATTTCTATTGTTTCAAATGAATCAAAGTTAATCTCTTTAACTGTAGAAACAAATAGGAATGATTTTAGTTTTAGTAAACCATCGTTAGAGGTTTTAAACACTTCGTGCAACAATGTTTTAAAATCATTTGTATCAGAAGATTTTAACATCGTACAAACTGCTTCAAGAAAAATCTCGTGTGAAATTCTTCCAACAACAATCGTCAAAATTGATTATGTAATGAAAGACGATAAATTTATGGATCAAATTTCTGACATCGTTATTCACTTAGCAATTAGAGTAAATGATAATGGCAAGGTATATGAAGATAGTATAGATATGAACAAAGACCTTAATCTAAAAGGTGCTATGAAATATGATATCTTTGCAATTAGATCAGAATTGAATTTAGATAGAGAAACAATGGAAGAAAGTATCCAAAAAATTGTAGAAAATGCTATCTATTCAATTTTATCAAAAAATAAAAAAGGATAAGGAATGTTAAATATAATTAAAGGATTATGTATTATTTTATCTTTGACATTTTTAACTGGTTGTGGAACAAAAGGTTTATATCATGAAGATTATGTTTCTAAAGAAATCAAACCTAATTTAAACAAAGTTTCTAATACAAAAGTTTGTTTGAAGGATTATGCTAATGTAATTGCTGTTAGGTCTAATTCAAGACCTAATGTTCCTGCTACTGAAATTGCTCTCAATGCAGGAGAGATTAATACAAATATATTAAATCTTTTTACTAAACAATATTTTACTAAAGTGGAAAAAAATTGTGGTAATGAGTCTATTTATATAGATTCATATATTCAAAGTTTTAAATTTGATTTACATACTTTTGGGGGAGGTGAAATATTTGTCTTAAATAATATAAAAGTTTTCAAAGACAATAAAATTATTTTAGAAAAAACATATGATATTCAAGCTGATAACAAAATTGTATTAGGAATTTTTGCGATTAAAGACACTGCCTTTGATAGTGTAATTGAATTATATCATAGAGCACTTTTTGAATTTTATGAAACAGAAT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>NZ_CP042966|25979:52664|43035_44112_-|WP_025343257.1|DBSCAN-SWA MFGGKRISKLESENQALKDELQKIKTLNEQLQNANQHMEQKAKETSTDQTKEELLTILLASYEDGMNFLQNTVEESLTMLNEINTLNDASMQEGQNVENQTKEISASLEKVQELTQKFTHDVENLSSSVSAISDIINLIKDISDQTNLLALNAAIEAARAGEHGRGFAVVADEVRKLAERTQKATLEVESNISVLKQNTNSMADTSETFQSESKASMKILDDFYAQISTMLKNSVSITNKCDNVTNEISVSNGKIDHIMLKLKGYNAALGRKNVDILGHTACRFGKWFSGISQRLSQTVVNEVSDHHVKVHEGLKKAVDIFSNKGNLHEGVETFRAVENSSKVGFEKLIEGFKAIRKS >NZ_CP042966|25979:52664|49747_50956_+|WP_025343263.1|DBSCAN-SWA MEKTLNICTPILYKENFEGVFCGILKAKSLFEKIEKLTFPQNASYFISDDEGKILTPFKKGHFQEELEKFFLNKIDLNTKEPQKLIIDNAVITLSKFQRFNWYIGVVTDKEDILQESRQRVTSHAIWLLLCFILLLIVVNSAHEFLRRRVERKQKEYEFMLAHRSRISEIGELISGINHQLRQPINATALVVSSTLDLSERNLLDKQTLENNLKLCQKSISLMDKTIGIFRNFYRCSETVTEFSLLDCMKSVLHVNYIELTKSNINIEMDEKSFENIRVISIENFVQQILLVLIQNAKESLNASDLQGKEAFHKKIIHIAVILEYGKVLIDISDGGGGISKEVQETLFSEFKISKKYEGSGIGLYFAKKLAKEKLLGDLVLYNASSPTTFRLIFPQYISKKE >NZ_CP042966|25979:52664|36321_37128_+|WP_025343250.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP042966|25979:52664|40619_41507_+|WP_084613054.1|DBSCAN-SWA MTSLALRLTAFRGICRREFYYEEGNFSVRDFINTIDSTPDRRLFIVNTKEMAGAYTTYFSLFLNLFFKIGTTLSQPSNRRIFMLFDEIQSLGSDGNEALGRQIIGELCNFMAESRAYGYSVTVATQSLPQLERLIKKEGTRELFQHLSNKFLFQYNEPEGSEWLSKYLNEQEIDRLKESYTQSGDTDLNKDRFQESDEEKLKRIVLPSEFNSLKPLEAFAIVGEHPTSKIQFLYRLPPRICNNLIEKPLPFFDQATIEAMRTFYKSQAKEEQIKEALRMAQETKEIKESLKEELQ >NZ_CP042966|25979:52664|50959_51505_+|WP_025343264.1|DBSCAN-SWA MHITTLNLLKHLSILVVEDDDIARMMIAQGTKPYCESYYEAKDGLEGLEVFKEHRVDIIVTDIHMPGINGFEMMKEILTLKPSQLFIVMTSFDTDKNLISSIHEGACSFLRKPIEIKELQTALLMTSGRIEQTLKQLRPDITIDSRKEGPFRILCQSGKITNTQGHRYEDRNRRRAICSRY >NZ_CP042966|25979:52664|39408_40521_-|WP_025343254.1|transposase|DBSCAN-SWA 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25 | uncultured_virus(25.0%) | transposase,integrase | attL 30995:31054|attR 51400:52714 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
94090 : 104125
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP042966|94090:104125|DBSCAN-SWA 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AAGTGGCGTGGTATCTGGTCGCAGCGCTTAAAGAAGAACTCGGCGTTGAGTATGATCTCTCCAGCTTTTTAGACCTGCTGTGCATCGCCATTATGGCCGACATGATGGCACTGGTTGGCATGAACCGCGTGATGGTTAAAAAAGGGATTGTCGAGCTTAACCACTCCAAGCGTGCCGCCTTTGAAGCGATCAAGCAGTATTTTGGTAAAGCAACCTTAGAGGGCGATGATATTTCCTTTTTGATAGCACCTCTGATTAACAGCTCGGGACGCATGGAAGATGCGATTTTCTCCTATGAATTTTTGAAATCCAAAAATGTGAATGACGCACTGGTTAAACTCGATTACATTGTCTCATTGAATGAAGCGCGTAAAGAAGAAGAGCGGCTTTTATTTGAAGCCACGCTTCCGTACGTCAAAGAGGGTGAAAATATCATCGTGGCGTGGGGTGAAGAGTGGCATGAGGGCATCGTCGGGATCGTCGCCTCGCGGCTTTCTAAACGCTTTAAAAAGCCTGCGATTGTCTTTTCTATTCGCGATGAGAGAGCCAAAGGGAGTGCGAGAGGCATTGGTGATGTCGATATTTTAGAGCTCATTCGTTCTCAAGAGGCGATATTGCTAGGTTACGGTGGGCATAAAGGGGCTGCAGGTGTTTCGATTGAGATCAAACATTTGGAGCAGTTTCGTGCTAATTTGGAGCAAGCATCAAGCCATTTAAACAAAGAAACGTTAGAAGCGGATAATGATCTTTTAGGTGAAATCACTGCCGATCAGATCGATTTTGAGTTACTGGAAATTTTGGAAAACCAAGAGCCTTATGGGCAAAAAAACCCAAAACCGAGCTTTTTATTACGTAATATCGCTGTCAAAGTCGATCGTTTGATCGGCAAAGATGGGCAACATTTAAAGCTTATTTTGCAGGAGGGAAGTAATGCCCTTGAAGCACTGTTTTTCAATTACGATATGAAAGCCAAACAAGGCGATCACATCGACATTCTCTTTACCGTTTCGCGCAATGACTATCGAGGACTCGTGACGCCTCAGCTTTTAATCAAGCAGATTGTGAATAAATATTAGCAAAATGTACTAAAACTCACGACCATCTTGCACGGGCACAAAGAGGCAATCGCCGATTGTCTCTTTGTGTATGCCCTCTTCTGTTTTGATAAAACGGGTAATGATCTGTTTATTCCCTTTTTCAATGGGCGCAACCAAAATCCCCCCTACTTTTAACTGTTCAAAGAGTCTTGGCGGTACTTCAGGCGTTGAGGCTGAAAAGAGGATGCGATCGTAGGGAGCAAACTCTCTCCACCCATTTTGCCCGTCGTCAAAACGCGTGTGAATGTTAGAAATTCCCAAGAGTTTAAAACGCTCACGCGCCTCTTTAAGTAATCTTTCAATGCGCTCAATCGTAAAGACTCTGCGGATGATTTTACTGAGAATAAGCGCTTGGTAGCCACTACCACAGCCGATCTCCAAAACACTGTCCGCACCTTTACATGTAAGCGCTTCGGTCATTTTAGCAACCGTTAAAGGCGAGCTGATCCATTGATTCGCAGCCAAGGGCAGAGCGTCGAGTTTGTAAGCGTGCATGCTCATGCCTTGTGGCACAAAAAGCTCTCTCTCACTCTGACAAAACGCATCGTAGACGTTAGGGCTGATGGGACATATTTTGGCGATTTCATCTGCCATTTTCTTGTGTTTTTGAAAACTAATTTTCTCTTTAAAGTGAGCCGTTTGCGGCATTATGGTTTAATCCTATGTCAAGGTATCGTCGCATTTTTTTGATCTCGTTCGTATCAAAAGAGTGCAGTATTACAGTAGCGCTATCATCGCTCGTTACGTCGCCAAATGGGGAGATAATCGCACTTCCTTTTGCCATACTTTCATCCGCTCCATTGGCACACAGCACATAGGCTTGATTGGCAATGGCGAGCGCGGTTGTAAGTATTTCAAAGTGCTTTTTGCGAAGCGTGCCCCAGTAGGCTGGGACTAAAATAAGATCTGCCCCTTTGATTTGCTCCCACAGTTTTGGGAAGCGAAGTTCAAAGCAGATAAGTACAGCAATTTTTATTCCATCCACGTCGATGATGCCAATCTCTTCAGGGTTTCCTGCTTGAAAATAGTGCTCTTCTTCGCCTAAGGGGAACAATGTTGCCTTTGCGCGCGAGAAAATAAGCGCTCCGTGGTGAAACAGTTTGAAGTTATTCACATAGCCAGTCTCTGTTTTTTCAATTAAGGTGAGACCAACTGTTTTACATGTAGAAAGTTTTTCAAGTTTTGGAATGACCAAAGCCGAAAAGGCTGCGGCTTCTTCCATCGTGTCGTAACTGTACGCACTTAGACAAAGTTCTGGCGCTAACGCGATGCACTTCTCGGGTGTTTGCTCGAGAAGTGCTTGCAAGGTTGCAAAATTCTCCTCAAAGCTTCGGCCTTCATAGGCAAATTGTAAAGCGCAGAGCATGGGTTTAGAAGTCATCGAACGTCAGACTTCCTTTGCTGTAGTTGGAGACATTGCCTTCAAAAAAGTTCGTTTTTTGGTCATTAAATTTCGAGAAGTCATCGACCCATTTGATTGGATGTTTGGCATTGTAAAGCTTTTCAAAACCTACGGCGGTTAAACGATCATCAATGAGGTAGTGAATGTACGTCTCGATGATGTCATCGGTGAAGCCCATAATTTGATTTTGGGTGATGTATTTACCCCACTCAATCTCAAGATCGCCTGCTTTTTGGAACATATCGTAGACTTTGGCTTTGAGTTCCGTGGTGAAAAGATCAGGTCGCTCTTTTTGAACGGAATTAATCATATTTTGAAAGATCAGAAGGTGCGTAATTTCATCGCGTTGGATAAAACGAATCATCTGCGCACTGCCAAGCATTCTTCCCGCACGGGCAAGCGCGTAAATCGCCGTAAAACCAGAATAGAAGTAAATCCCCTCTAAGATTTGGTTGGCAAACATCGCTAACACAAGTTTTTCATCGGTCACATCACCGGCTAATTCTTCGTAAACACTGGAAATATAGTCATTTTTACGACGCAACACTTCATCGTGTTTTTCCATCTCGTAAATCAAATCGGTGTTATCGCAAATCGCTTCGACCATAACGGCATACGATTTTGAGTGGTTCGCCTCTTCGTAGGATTGACGTGAAAGACACGCGTTGATCTCGGGTGCGGTGATGTAAGGGTTGATGTTATCGGTTAAGTTATTGGTTTGGAAACTGTCCATGCTGATCAGTTGTGACCACACCAGATCGTACATCCGTTTTTCGGCATCGGTGAGGTTGCGGTTGTAGTCGATGACATCTTTAGTCGTATCGACCTCTTTAGGAAACCAGGTATTGGCCTCCATCATATCCCAAAGTTTGAGTGCCCATGTGTATTTTGCTTTGGTAAAATTTAAAATTCCGTGTGGATTTCCGCCAAAGACTCTGCGATCATTGATGCTCTCATCTGAGTTTGGGTTGTAGATTTTCTTGCGCTCCATTGCCATTCCTAATACGTTAATCTAGGAACTATTTTATCGAAAATTTCTTAATTCTATGGGCAGTGGAGGGTTTAGTTGGCTCACATCAAACTGATTTTGTTGCTCTTTTGTTGCTTTTACATGTAAATCATTTTAAAGATGCTAAACTCCCATAAATACAGTTTTTAACGCACTTTTTGGGAGAACGTCACATACGATGAAACAGCACGCAAAACCGCATAACGATGAAATCGACGCTTTATGGGAACAAGCGCTAAAATTTCATAAGCTTTCACACGACGACGAGGCTCAAAAACTGTATGAGAAACTCTTAACCATTCAGCCGCATGCGCACGCTTATTACAATTTAGGCACGATTTTTCAAAAACAAGAGAAGCTTGAAGAAGCCATCGAAATGTATGAAAAAGCCATCGCATTGCAACTGAATCATGCGAATGTTTACTACAATTTAGGCGTTATTTTGAAAACACAAAATAGATTTGAAGAAGCTGCTACATTCTATGAAAAAGCCATCGCATTGAGTCCAGATCATGCCAATGCCTACACCAATTTAGGCAATATTCGCAAAGAGCAAAACAGACTTGAAGAAGCCATGGCACTCTATGAAAAAGCCATTGCTTTAAATCCAAACAATACCAATGCGCACCTTAACAAATCGCTCATTCTTTTGGCAAAGGGCGATCTTTTAGAGGGGTTTGCGCTGTATGAAAAACGAAGGCCTGTAAGATCGTTTTCAAAGCCTGCTTGGACAGGTGCGGAATCGTTGGAGGGTAAAACCCTTTTGATCTATTCTGAGCAAGGATTTGGCGATACGATTCAGTTTTGCAGGTATATTGAGATGGTTGCAAAATTGGGTTGTACCGTCATTTTTGAAGTCGCCAAACCACTTTTGCCGCTTATGCGTCAATTACGCGGCGTTTCTTGCTTTGTGGAAAAAGGTGAAGCTTTACCCCCATTTGATCTTCATTGTTCCCTTTTAAGCCTTCCTTTTGCGTTTCAAACCACGTTGGAGAGTATTCCTTCAAAAGAGCGTTATTTGACTGCAGATCCTCAAAAAGTTGCTGATTGGCAGAAGGTATTAAATGGGACAAAACCCAAAGTCGGGTTGGTTTGGAGCGGTAGCGAGACCAATAAGGGTGATGTGTATCGAAGTATTTTTTTAGAAACATTGCTTGCATCTCTTCCCAAAGGTTTTGAGTATATTTGCTTGCAAAAAGAGGTGCGACAGAGTGATCACACTGCTTTAGAGAATTCTCCGATACGTTTTTTAGGAGAATCATTACATGATTTTAGCGATACCGCAGCGGTCTGTTCTCTTATGGATTTGGTTGTAAGTGTCGATACGAGTGTTGCGCATTTAGCCGCGGCTTTGGGTAAAAAAACTGTGGTGCTTCTGCCGTTTGCTCCTGATTGGAGGTGGCTGCTTGAGCGAAACGATAGCCCTTGGTATCCTACGATTCAGCTTTTAAGACAAGAGACAATGGATGATTGGGAACGTGTGTTACAAAAGCTCAGCCAAATATTGCTTAATTTCGAAAAGCAATAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP042966|94090:104125|100174_100834_-|WP_025343308.1|DBSCAN-SWA MPQTAHFKEKISFQKHKKMADEIAKICPISPNVYDAFCQSERELFVPQGMSMHAYKLDALPLAANQWISSPLTVAKMTEALTCKGADSVLEIGCGSGYQALILSKIIRRVFTIERIERLLKEARERFKLLGISNIHTRFDDGQNGWREFAPYDRILFSASTPEVPPRLFEQLKVGGILVAPIEKGNKQIITRFIKTEEGIHKETIGDCLFVPVQDGREF >NZ_CP042966|94090:104125|96948_98589_+|WP_025343306.1|DBSCAN-SWA MSNHETKYIFITGGVLSSLGKGIAAASISTLLKNVGFKVSILKADPYINVDPGTMSPLEHGEVFVTDDGAETDLDLGHYERFLDENLTQANNFTTGRVYSAVIEKERRGDYLGKTIQVIPHIVDEIANRIKEAGRGQDILIVEIGGTVGDIEGLPFLEAIRSLKSELGKRRAMNIHLTLVPFIKAAGELKTKPTQHSVQELRRIGITPDMLICRSEYPLPKELKNKLAFSCGVERNSVIECLDATTIYQVPLSFLKENILVPISEALNLGDLTPHMDEWDILVKRVIAPRDELMIAFVGKYLDLKESYKSLTESLIHAGANLNAKVKIRWVDSEMIEEKGCEEILSDVDGILVAGGFGERGVVGKMASIRYAREHNIPYLGICLGMQLAMIEFARNVLHIEDANSAEFDATCKNPIIYLIDSFMDASGQKQLRTFQSPLGGTMRLGGYECETKEGSLLRSVYDGAKVIRERHRHRYEANPAYREAFEKAGLIISGESEGLIEAVELKGHPWFLGVQFHPEFTSRLTNPNKTILGFAKAALLQRQNG >NZ_CP042966|94090:104125|101556_102579_-|WP_025343310.1|DBSCAN-SWA MERKKIYNPNSDESINDRRVFGGNPHGILNFTKAKYTWALKLWDMMEANTWFPKEVDTTKDVIDYNRNLTDAEKRMYDLVWSQLISMDSFQTNNLTDNINPYITAPEINACLSRQSYEEANHSKSYAVMVEAICDNTDLIYEMEKHDEVLRRKNDYISSVYEELAGDVTDEKLVLAMFANQILEGIYFYSGFTAIYALARAGRMLGSAQMIRFIQRDEITHLLIFQNMINSVQKERPDLFTTELKAKVYDMFQKAGDLEIEWGKYITQNQIMGFTDDIIETYIHYLIDDRLTAVGFEKLYNAKHPIKWVDDFSKFNDQKTNFFEGNVSNYSKGSLTFDDF >NZ_CP042966|94090:104125|100811_101552_-|WP_051492718.1|DBSCAN-SWA MLCALQFAYEGRSFEENFATLQALLEQTPEKCIALAPELCLSAYSYDTMEEAAAFSALVIPKLEKLSTCKTVGLTLIEKTETGYVNNFKLFHHGALIFSRAKATLFPLGEEEHYFQAGNPEEIGIIDVDGIKIAVLICFELRFPKLWEQIKGADLILVPAYWGTLRKKHFEILTTALAIANQAYVLCANGADESMAKGSAIISPFGDVTSDDSATVILHSFDTNEIKKMRRYLDIGLNHNAANGSL >NZ_CP042966|94090:104125|98581_100165_+|WP_025343307.1|DBSCAN-SWA MASLLTKEEIKRILQSRFENDECTRLNEIPKPSSLKDIARASKRIVHAMKNHERIAIVGDYDVDGVISSVILSQFFDDLGVDYSLIIPNRFTDGYGLNPDIVAKLDVHVIITVDNGISAIEAAHICKEQGIDLIITDHHSVPSILPDAYAIVNPKQDDCAFPHCEICGAQVAWYLVAALKEELGVEYDLSSFLDLLCIAIMADMMALVGMNRVMVKKGIVELNHSKRAAFEAIKQYFGKATLEGDDISFLIAPLINSSGRMEDAIFSYEFLKSKNVNDALVKLDYIVSLNEARKEEERLLFEATLPYVKEGENIIVAWGEEWHEGIVGIVASRLSKRFKKPAIVFSIRDERAKGSARGIGDVDILELIRSQEAILLGYGGHKGAAGVSIEIKHLEQFRANLEQASSHLNKETLEADNDLLGEITADQIDFELLEILENQEPYGQKNPKPSFLLRNIAVKVDRLIGKDGQHLKLILQEGSNALEALFFNYDMKAKQGDHIDILFTVSRNDYRGLVTPQLLIKQIVNKY >NZ_CP042966|94090:104125|94090_95761_-|WP_025343304.1|DBSCAN-SWA MLQRYFLKISAVMILLSIALFLVTWRVSEPFWVALFAVISLCVLLIIFFKIIIQPLSNALELLSQFDARDKTVREGYQKKFLHVTEQNTLLSTLFPRIYTLVTLLTYLSENYSQSAGKNSIATAQLMYSIDAMSKKLEEKAHSIAEISNATQNIFEHVHLVSSNAQEASSFAKLSMKESQQSIAELNDIITRMKHINAQSADASSKVNDLKEKSITIHNVTTVIDDIADQTNLLALNAAIEAARAGEHGRGFAVVADEVRNLAERTSQSTSEVTLIIKQIQHDTNEVYTSIETLRQEIEQASHTVQHVGDEIKHFISNAEKIEHQIGTIAQSSDYNSEQLLDIKEMILKMREQLESGTQEMKAISGQTQAIILGSEEAHENLSAFAMDEYHEKMYQRCLNAKTRVEALFENAIESGKLTLEAIFDTRFKPIPNTNPQKYTTAYDAFTDQTFPDIVDTLMKENTQTLFYAVAMHTSGYISTHNARAPLTGNYEKDLFGNRSKRIFTDSGIRGANHEKRVLLQTYRRENGDVMHDISIPIYIKGRHWGGFRIGYKPKA >NZ_CP042966|94090:104125|102775_104125_+|WP_025343311.1|DBSCAN-SWA MKQHAKPHNDEIDALWEQALKFHKLSHDDEAQKLYEKLLTIQPHAHAYYNLGTIFQKQEKLEEAIEMYEKAIALQLNHANVYYNLGVILKTQNRFEEAATFYEKAIALSPDHANAYTNLGNIRKEQNRLEEAMALYEKAIALNPNNTNAHLNKSLILLAKGDLLEGFALYEKRRPVRSFSKPAWTGAESLEGKTLLIYSEQGFGDTIQFCRYIEMVAKLGCTVIFEVAKPLLPLMRQLRGVSCFVEKGEALPPFDLHCSLLSLPFAFQTTLESIPSKERYLTADPQKVADWQKVLNGTKPKVGLVWSGSETNKGDVYRSIFLETLLASLPKGFEYICLQKEVRQSDHTALENSPIRFLGESLHDFSDTAAVCSLMDLVVSVDTSVAHLAAALGKKTVVLLPFAPDWRWLLERNDSPWYPTIQLLRQETMDDWERVLQKLSQILLNFEKQ >NZ_CP042966|94090:104125|95956_96799_+|WP_038533653.1|DBSCAN-SWA MNSLKSVKKCLFPAAGYGTRFLPATKAMPKEMLPVLTKPLIQYGVEEAVSAGIDTMAIVTGRGKRAIEDHFDVSYELEHQIKGTSKESYLTEIRNLIDNCTFSYTRQVEMKGLGHAILTGKTLIGDEPFAVILADDLCDNNDEDPVLKQMVEVYEKYRCCVVAIEEVPKEETNKYGVIDGKIVDGNESVLRVSNMVEKPDPKDAPTNLAIIGRYILTPDIFDVIENTKPGKGGEIQITDALLELAQQGKVIAYKFQGKRFDCGSIEGFVEATNYFHDKAK |
8 | Bacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
205542 : 252889
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP042966|205542:252889|DBSCAN-SWA 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55 | Shigella_phage(20.0%) | transposase,integrase,tRNA,protease | attL 247320:247379|attR 261360:263430 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
377519 : 406280
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP042966|377519:406280|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP042966|377519:406280|403859_404351_-|WP_025343611.1|DBSCAN-SWA MEITQEEIVPFDFENAEDNGSKNNRIEKIVRGIIKKELIKRLENQSSLFPISNKISIYYIDFYIIKKCYFNASSTTKRAIVLSTKAIHRKEIRRIQKALRTIESNVINELPRELEKRLLKKIILYVTYQWLKKEFYISKEEIRRLVYGFCIFYPELCPKSDPK >NZ_CP042966|377519:406280|405635_406280_-|WP_025343614.1|integrase|DBSCAN-SWA MTHELIEAEIIETLPIKRGKQEIVPIQQDDAEDDIKYLSVAELNTLLYISDSSYRLAWLVCYETASRISEALKLTFGDLNLETNRLKVINLKQRKKNSFRLIKISDRLKSLILQEQLSRNATKDGFILKNRDRTTYNYAFIKYATQANIERERAHPHTLRHSRAIHLLDSGANIVLVSNALGHKSIKSTLIYLKYSNQELDKALENANARLYGM >NZ_CP042966|377519:406280|383019_384048_+|WP_025343597.1|DBSCAN-SWA MKKYNVAIVGATGAVGEELCRVLEEVDFPVNNLVPLASSKSAGLEVEFKGKTYKVIELTEKAFDENDVEIAFFSAGGDISAHYAPFAAEAGAVVIDNTSHFRMDPDVPLVVPECNPGDIDQWQNRGIIANPNCSTIQMVQVLKPLDDLFNITRVDVATYQAVSGAGKSGMEELVNQMQDFFAFKLDQCEPKTFAHQIALNVIPHIDVFMDNDYTKEEMKMVNETQKILGKKMEISATCVRVPVMRSHSEAITIHFEKDVNLEKAIEALQNAENVVVLDNPAKKEYPMPIISTDTNETYVGRIRKDINRDNILHLWCVADQIRVGAATNAIRIAQKWIKREEA 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30 | uncultured_virus(33.33%) | transposase,integrase | attL 372325:372340|attR 412630:412645 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
976004 : 1037269
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP042966|976004:1037269|DBSCAN-SWA 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58 | uncultured_Caudovirales_phage(25.0%) | transposase,integrase,protease | attL 972980:972996|attR 1003234:1003250 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
1714384 : 1735849
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP042966|1714384:1735849|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP042966|1714384:1735849|1731903_1733139_+|WP_025344914.1|DBSCAN-SWA MTKISNNDAWTNIFDDLKILDKITIDSYFDISADEIKRRDGKEARLMTKIDHREHLPTVMQENGLSILAIQNGLYRIARTDPFINIEKEPQCHVKIIQQPTNGIITLDPLNIQSESAALDIANISNILDDVFGEKTLLTIRGRLRGELSFSLNSIPYDINGVQIEVDGGYEGAKSVNLIEAKLGYRGNINIRQLLYPELFWKNQLRGRRKEVKSFIFYYQDDIFRFIPFKYDGNIITASHEEEKAFAFSRVSTFQLSNIEQPTRLLVNDEIPFPQADDFEKIHAIFLNIQNEECPQKVNIIGNFDIELVERQYDYYFNVLRWMNLCTVWNGCIALTEQGKYLLSLNIEKRMEEFTRIIFSETICYKVLKGLPQNEADFARYHISGSTIKRRLSTIRSWIKYFNNFFEKKLF >NZ_CP042966|1714384:1735849|1724399_1724681_+|WP_025344904.1|DBSCAN-SWA MNKSEFIQTVAEKSGLTKKATGEAVDAILEVIEASLVAGQDVNFIGFGSFRVANKAARIARVPGTDNTIDVPATKAVKFKVGKALKDSVASAK >NZ_CP042966|1714384:1735849|1725223_1726774_-|WP_025344906.1|integrase|DBSCAN-SWA 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MKSLFFITFLMINALFAGEEIVVNGTVRLGVNTAMIGLQLDTKHPESVPVMIDVVRDGKSCLVLAQVERYGLISMSRDLAKVDSIICEGEKPKIETGWVFDENGNLGVLQMLSGTKVKVAFKPDNNSIYTFK >NZ_CP042966|1714384:1735849|1718612_1719236_-|WP_025344894.1|DBSCAN-SWA MERIDVNQLVAIWSDHNTKLCPIVENKDSFANEICNELSKRICAYAKAPDATMGQKSDIVIIGNVGTGITIFAKNLLRAIAKESHGNLAKVENELFVGKSLEIAEAYSLTIAGWFISFPIPGKSIRLQIARNVKDFASCEEAYNFFKGADHVICLELEAKSMNLKKDVTAFKLSKFTFDKKAPDIKPIDKKTKSNKRIENDYKNGNS >NZ_CP042966|1714384:1735849|1723482_1724031_+|WP_025344902.1|DBSCAN-SWA MKNTNRSPLKLFWTTLLLGVFAYLCLTYANIEHENMGMRLLAFFVIFFGGFAYFAFNFGIFSLLIISLSQSRFKGYFVRLLSLCWSPFIFFFKYGLNKINNYNDLQRLYQSLIEPRAAMNVLMFLTGFYATLPVFAIWYLVDQFYMNGYLMVTFFVAGFFLHEFGLEMIRNIVIQKIQSYKE >NZ_CP042966|1714384:1735849|1734222_1734690_-|WP_025344918.1|DBSCAN-SWA MIKYAYKNKFHYIVIEQEMFNLSRHSIHILKEISLQFNEWRYFVKLLHSKNLVLLEIAETIFDEKRSLKLEKVVWALLEIALQKDSKLVQVYLEYHAHVCFSQYWIHQYAYFEYHGFNVQNRDFFRGKIDKGITSFNQYIDNIIDNGFTDNSDIM >NZ_CP042966|1714384:1735849|1721023_1721254_-|WP_025344898.1|DBSCAN-SWA MAEENTIRQDGVDEDKSTSIRIALSDDIMKKINVIAPLKGFDGKKPEIVSKIISLAINHYYKEVTVPELQSLTTNE >NZ_CP042966|1714384:1735849|1715919_1716774_-|WP_025344889.1|DBSCAN-SWA MKTLILTLVAVFTAMGLYASETTVEASKTDNPLVKEVAKGLDEKVSKPTQEMKNLNEAVERLAKGKASEADKELIKNSDEPFIKMLQESTIYPFRVDIDDPIYHTLVIFYASIPSAASAMVDLYMMKHCTNDLSKMTVEESREASTTQEWGYLISMKYSSFKSSEDTYTKFVQAVRAFNCGDQNAFRDYFDSETVEATVLTNYDTQKLASQIMEFSFQNIKGIECHVFGETYKIDNGKFFIRVKKQKCGMGAEKEAEGSVWPLGDNTTFSSLNVGDKVKMYKTK >NZ_CP042966|1714384:1735849|1722510_1722819_+|WP_025344900.1|DBSCAN-SWA MQINRLNFTEQQLERIKFLTKEEQEKLSKICSALAIDGLYIFSESKEEYPLSDCLCDIADKLRVEASVTREEYCYLCGVMGAMDLDKIINFVIKKLNKKIKE >NZ_CP042966|1714384:1735849|1729573_1730590_-|WP_025344911.1|transposase|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP042966|1714384:1735849|1726757_1728662_-|WP_148512147.1|integrase|DBSCAN-SWA MNQGWRNITLDFHFSFSLHKNIHMTLKMIDGIKQVFRENGTLKSIAKEFNIGTSTPMMYAFAIFPKEMFALIKKSFRKQLLNNHEISLSKVLQIHIEQENNFLKKLRFYDENIYQKLIQLSLKYQQIQIRLSNIFNKIVITKFATQYRLGYIKNNKWQSFYLNLNIIAKDTVSSDIKTYALYIAANDKNKRLIQIAIEFFKYIKITSKINNLDIKQIKEQDIANWLNHSSNVKSLRTCKNAISAFYKFMSNQKAINHCTDFEEILVIYKKIARAFSIKNNIAQTPTMPLPEEVFLQISLHLDELSPEIKNSFLIMSATGCRPSELAYITPTSLAYDKKLDCYILNIFLNKQKKAYAKKGLKSIRKVPIYSEDVVNAFYRQVTLSENIRKESNSNSIFIRKTNNRAHQVKFHIPSSKEFIRAINSLIQKYDIKADLEDKLWNYTPYQMRSMLATTMVEKGHAPEEIKAFFGWLTNHTPERAYAFIREKKIEELNTDLFKRHFKISFDESYLKTYTRSEKEHLFVELYIHKRKMEYGDCIRHPIMGECGKLQTSDSCASCARLITDLPYLNTWTKFRDNQQIIFDALIHALENEGISKDEYTTWAEYTIQKHRLDAYKSIVDTLLSVQKAKNGSSC >NZ_CP042966|1714384:1735849|1729318_1729567_+|WP_025344910.1|DBSCAN-SWA MSESLLDKILSDETFEGLPLKLHKEGKNVILCADGIPNGGIYIVYPNKKACLISYDNTLKKSVLGRELTEAEYQIIGIEHYQ >NZ_CP042966|1714384:1735849|1733323_1733575_-|WP_038533238.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP042966|1714384:1735849|1718137_1718638_-|WP_025344893.1|DBSCAN-SWA MIIKMVTHDHDVKFQLHDKTVLEGHMGSGKTVQLEKIALKLHAEGTAFVLITTFHDAGTFLENPMRRPLQSSRDFEAMFIENKCDDALIVQSYCEEVSEKVLEQIEVILDKGAVLMIDETSYVLENEAIRTIFHTTLKKDHQGVIITCQSIDDLERYLENENKGIL >NZ_CP042966|1714384:1735849|1719961_1720927_-|WP_025344897.1|DBSCAN-SWA MFKRYMKLALKGLWYVVQGAVNYMKIFIKMLIMIPGILLYVSLYEGEVVINMTTEAFLTSPLFGIILILSFAISFLFFVDRCEELDTMVLGTSKVLGKKLTCELLWALNDKRRFNADESVNFLRTMKKFGFFMVVDLNSPLSKIERTTSYLKAALSLRGVDLSQFTKEDFNEIGEFLSPNCIEDTISIDEKKLKIMNDAFPLMEILRKEVENMSNEVPEENNHDTSLKEATTLLQNYHEDKKASMPLIIVAEQDVIVALRKEYATILDTFALVDKVELFQKSRAFGMKPFEICTEAEFEILDPRIVDCSCVVKLTKESTCL >NZ_CP042966|1714384:1735849|1728799_1729237_+|WP_025344909.1|DBSCAN-SWA MSTNPIISGLLDKKKEILGSIEGYEALIKKARLNLSVLNQTIALFDESYTKTSTRKMPHRYFETGEAKKLILDVLKSSDVPLKTNEIALRVAEKKGIPLDNEAQQHNFQKTIIASLSTIEASGLVQKVGKDGLMIIWKIKELDSK >NZ_CP042966|1714384:1735849|1724748_1725243_-|WP_025344905.1|DBSCAN-SWA MIKKRGNPNLNQHAHEKKENTISLIRQAILLLEENFEIKTIQAVSAKTKEIDPRKKGVSEAAFRNKELEHIQSLMIELRIGKYESLSVTSTELEIAEQLFQVKKEIKKKDEELQKIKDQKKKLSRKIETLTIENEELRVVIYEIEMKAKMKKNIQFENNINLLK >NZ_CP042966|1714384:1735849|1734682_1735849_-|WP_025344919.1|integrase|DBSCAN-SWA MYQLRYGRKTHNNGTITYFFFICSPNVPDFYSSLFVSNRSKNSLKYGKLVGHILVKFFNFLLERDTEYWNATDADIKAYILYIINFDSKSCEIVNEPNIGFTTIMRHKEMIIRFYKFLWQFTDHSVLEINNWHKGNFLQYKTTLSLRWDHVESITDATLDLFLTKFKTANKEYVMEYSDDEIKAIYSNFTNYRNRSIFLLTLHGMRIDEVLSVKLKDYNPRDNTIIPSRSKGKGRGKKRTIVLGDQTVKVIENYILHERNPAEIKALKYNDALFVNTRAIEKEVHFNEYSASSFRSALKIAAKKAGILGNVRTHSGRSDKATKLVKAMVNGELNLTDEIIRHIMGWKTIDSITPYVEHANAAIVKDFAKKHAEDINQRLLELQRKLDD >NZ_CP042966|1714384:1735849|1733135_1733327_+|WP_025344915.1|DBSCAN-SWA MSADIHTIEYDKQTGKITLNIYSSDNFLESQIDITEQVTTLVLEKLYDEYQLSIGDELVITKH >NZ_CP042966|1714384:1735849|1733672_1733942_-|WP_025344917.1|DBSCAN-SWA MEATAMQTQALNNLIHMRTECQKALDQLLTKKDEYRHFDTFHKIVELSQVLIDASAPEMNENIELDLLISRTDSLLNQNVVLLDLYEKF |
30 | uncultured_virus(33.33%) | transposase,integrase | attL 1713889:1713903|attR 1738299:1738313 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
2386616 : 2400127
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP042966|2386616:2400127|DBSCAN-SWA 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13 | Synechococcus_phage(18.18%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
2466296 : 2474312
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP042966|2466296:2474312|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP042966|2466296:2474312|2472423_2473311_-|WP_025345650.1|DBSCAN-SWA MKGIILAGGSGTRLYPITKGVSKQLVPVYDKPMIYYPLSVLMLAGIREVLIISTAQDLPRFQELLGDGKEIGMAFTYIVQPSPDGLAQAFILGEEFIGNDSVCLVLGDNIFYGQGLTGLLEKSVENAKQESKATVFGYYVSDPERYGVVAFDEEDNVLSLEEKPKDPKSNYAVVGLYFYPNSVIKIAKGVKPSERGELEITSVNQAYLAMGDLKVELMGRGYAWLDTGTHESLLDAGQFIQTIEHRQSLKVACLEEIAYEKGYITKEQLLILAEPLKKNQYGQYLIRRANQGKRR >NZ_CP042966|2466296:2474312|2469985_2470996_-|WP_025345647.1|DBSCAN-SWA MMRNILLTGTAGFIGSNFVPYFLEKYPEYTLINLDLLTYAGNLENLKECEGNSRYKFIKGDICNRELVEFIFREYDIQGVIHFAAESHVDNSIKNPGVFVQTNINGTFTLLDIAYKYWMDKPFTCKAKYQDARFHHISTDEVYGTLGETGFFTESTPYAPNSPYSASKASSDMIVRSYQETYGLNSVITNCSNNYGPKQHDEKLIPTIIRKALSNQSIPIYGDGKNIRDWLYVLDHCKGIDLVYHNGKSGQTYNIGGRNERTNLQIVDRICTILDEKVPTTKSYKELITFVEDRSGHDRRYAIDATKLENELGWKADENFDSGIVKTIEWYLRKYN >NZ_CP042966|2466296:2474312|2468295_2469180_-|WP_025345645.1|DBSCAN-SWA MHTIIPVESQSIQNKIYTIRDKQVMLDEDLAVLYGVEAKRLNEQVKRNIERFPEKFRFQLTENEYENLRSQFATLSFEKGWGTHRKYLPYVFTEQGVSMLSAVLKSQTAIEVSIKIIDTFVEMRKFISLNANIFQRFERVEQRLSLHDEQFNKIFEAIENNEVQQKQHIFYDGQIFDAYLFVSDIIKSAKTSIKLLDNYIDESTLVLFTKRDIKVTMKIYTKTISKQLQLDIQKHNAQYPKIEIETFDLSHDRFLIIDDMDVYHFGASLKDLGKKWFAVSKIDIDSFEMLRKLK >NZ_CP042966|2466296:2474312|2469179_2469989_-|WP_025345646.1|DBSCAN-SWA MRYIKAFYRFLRDIYQNRRLLKDLVKNDFKSRYLNNYLGILWAFIQPTISVLIFWFVFQVGFKAAPVQDVPFILWLVAGMIPWFFLSEALASATNAILDSTFLVKKIVFRVSLLPIVKITSAVIVHLFFMAFMMSMYIIYGYEPNLYWLQMFYYLFSAIILLLGISWITSSVVIFFRDLGQLVSMSIQFGFWLTPIFWSLSMVPKEYRWLFELNPAHYITQGYRDALINHVWFWEKPMEALQFWGITLVFFVLGAIVFRKLRPHFADVL >NZ_CP042966|2466296:2474312|2466296_2467577_-|WP_025345643.1|DBSCAN-SWA MNSTAIKVSHLTKIYKLYDKPVDRLKESLHPLKKQYHKEFYALDNINFEIKKGETVGIIGKNGAGKSTLLKIITGVLTPTNGSVHVHGRIASLLELGAGFNPEYTGVENIYFQGSLMGYTREEVAQKVDEIIAFADIGDFVYQPVKMYSSGMYARLAFAVAINVDPDILIVDEALSVGDFAFQFKCFQKFQAFQKAGKTILFVSHSTQQIIQYCNKAMLIHSGNLIKYSDDVKQTTYDYEVLIRKHDGFNIEELKEVEKTQVQNIELDFDITPNKEVNEHRFGTHEAIFAKVTLSHDEKATSTDAVLTAGKKVYLRFYILAKREFPSIVMGTSIKNRDGITIWGDNTIDTPITLTQGLNKISMEFDLNIVAGEYFIDCGMADISFTPRVELDQRWPFDKINIVTSHRTIQGFAYAPTDIILESIAK >NZ_CP042966|2466296:2474312|2471851_2472427_-|WP_025345649.1|DBSCAN-SWA MTFTRSAIPDVIIIEPKVHGDERGYFVETFRHDKFENFLGYKVNFCQDNESRSHHGVLRGLHYQLAPYAQSKLVRVIDGRVLDVAVDIRVGSPTFGKYVSVELNGKNKKQMFVPRGFAHGFVVLSETCTFTYKVDNYYAPECDRGISFNDSNLGIDWQITSELLHLSVKDTKQPKLEDTLDLFEYGRNYYA >NZ_CP042966|2466296:2474312|2467573_2468146_-|WP_025345644.1|DBSCAN-SWA MSIIKFETIESKLIKYKEQFVIVDSDLAQLYGVETREINQAVGNNPDKFPDEYIIELTKEEKTELIKNFDRFNNLKHSTVTPKVFTEKGLYMLATIIKSKIATETTLNIIETFAKVKELSRNINAIMKTEEEARQKELANKSNKILEEIIEIEPDILADDEDGEIVETTTKFEFNLGFAKVSRSIKKIKK >NZ_CP042966|2466296:2474312|2473307_2474312_-|WP_025345651.1|DBSCAN-SWA MKILVTGGAGYIGSHSCVELQNAGFDVVVYDNFSNSTFESLKRVMQITGKQLSFISGDVRDEVALEKALIGCDAVIHFAGLKAVGESVEKPLAYYDNNVHGTLCLLRVMQKLNIKKLVFSSSATVYGDPEFLPFTENHPLRTTNPYGQTKLVIEEILRDLFRSDPTWQIMILRYFNPVGAHESGLIGEDPQGIPNNLMPYIAQVAIGRRECVNVFGNDYPTRDGTGVRDYLHVVDLALGHVKALQALNKPQCTAINLGAGKGYSVLEVINAFSKVSGKEIPFEVMPRRAGDIAEFYSDPTLAQKLLGWEVEYDLDKICEDMWRFQIKNPKGYVL >NZ_CP042966|2466296:2474312|2470992_2471859_-|WP_025345648.1|DBSCAN-SWA MLNILVTGSHGQLGSEIHELSHEYPNTYFFTDKEELDITDAKTLRQYIEHNAINAILNCAAYTTVDKAESEEELADKINHLAVKYLATIAKEHNIKLIHISTDYVFDGTIYRPYLETDATNPQSIYGKTKLLGENALLHTKLPNSVIIRTSWVYSSYGANFVKTMLRLGKEKESIGVIFDQVGSPTYAKDLAKTILEILPKINNTQTEIYNYSNEGVASWYDFAQEIMKMAKLTCKVNPIETSQYPTPAKRPHYSLLNKSKIKNEYTIEIPYWKDSLEVCLRKMGERK |
9 | Enterobacteria_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
2893067 : 2920156
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP042966|2893067:2920156|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP042966|2893067:2920156|2908019_2909261_-|WP_025346080.1|DBSCAN-SWA MKLAKLSLVTIVVAGLTTSSFAADTLADAFKNGKINGEIKAYYFDREGSPNLSTAATEKINSDIFTTGIMLHYNTDAFYGFKLGATMQSSSSPFADGAIGTAGTAKDDFKNEMYGSGTVLSEAYIEYTLDKTSVKVGRQFINTPLVAGSPSRIILQSFEGAMLTNTDLPQTTIVAGVITKYQDRTDFAGNIADFQNLDSALGSYAYTLLAINKSLSNTTLTAQWLGINGNNTATGVGDFYYLEAAYANTLGEYRYGLALNHEYKVTEKLNEEDGKMYGAKASLGYGDFNTYVAYTTITKDGDIKGNSMGGGLGGGTQTVFAKGLQNKPGTFTKDTDAYSVDANYLFKNINFKLGARYTGVEDNANDKEYAYTDIYTTYTFVGALKGLSTDIMYQDWGKDADGHDFWFKANYKF >NZ_CP042966|2893067:2920156|2893067_2894180_+|WP_025346069.1|transposase|DBSCAN-SWA MLKKGEIKMIKKFLAEGFSKSAIARKLGISRETVRRYANLPDDYVPHINRPPVINSVDPYLPHIAKMLEMAEQQKSEIPLTVIYEEIKKLGYDGSLRWLQQVIGRYELRARAKSDEPIIRFETKPAQQMQVDWVEFPKDNLSAFVATMGYSRASYVEYVNNEKIETLIGCHMNAFAYFGGVPRDCLYDNMKTVILSRNDYGKGDHRFNPLFADFAKHCGFSIKVCKPYRAKTKGKVERFNHYLRYNFHNGLRVRLAMKHYTLTLDNANAEVLKWLDNTANKRIHQTTLQMPFELLAQEQLQLLPVPKAYQGIHPKALIESVAKKYSPINSHKDLEKLYIPNRDIQCYDEFIPMVANIILPVGFYGGALWS 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23 | Escherichia_phage(50.0%) | transposase,integrase | attL 2895460:2895476|attR 2929744:2929760 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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