Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP042929 | Bacillus cereus strain G1-1 chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas3,RT,csa3,WYL,DinG,Cas14u_CAS-V,c2c9_V-U4,DEDDh,cas14j,cas14k | 0 | 2 | 9 | 0 |
NZ_CP042928 | Bacillus cereus strain G1-1 plasmid unnamed, complete sequence | 0 crisprs | RT,csa3 | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP042929_1 | 5326014-5326147 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP042929_1
|
2 spacers
spacers of NZ_CP042929_1
>1.1|5326037|31|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder TTCTTCTTTTTTGTCACTAGTTGAACCGCTT >1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder CTTGTCTTCTGTTTTACTTTCTGGTTTCGTGCTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP042929_1
The CRISPR arrays of NZ_CP042929_1 >merge|NZ_CP042929|1|5326014-5326147|CRISPRCasFinder GTTGATTTTTCTTCTTTCTTCGGTTCTTCTTTTTTGTCACTAGTTGAACCGCTTGTTGATTTCTCTTCTTTTTGAGACTTGTCTTCTGTTTTACTTTCTGGTTTCGTGCTCGTTGACTTCTCTTCTTTTTGAGA >NZ_CP042929|1|1|5326014-5326147|CRISPRCasFinder GTTGATTTTTCTTCTTTCTTCGG TTCTTCTTTTTTGTCACTAGTTGAACCGCTT GTTGATTTCTCTTCTTTTTGAGA CTTGTCTTCTGTTTTACTTTCTGGTTTCGTGCTC GTTGACTTCTCTTCTTTTTGAGA
>NZ_CP042929.1|WP_000008901.1|5325691_5325826_-|hypothetical-protein MSFLFVLSTAIILLFVLFTLYYYIAGKKEVPHHQLLEEEFEREE >NZ_CP042929.1|WP_000544012.1|5325110_5325383_-|sporulation-transcriptional-regulator-SpoIIID MHDYIKERTIKIGKYIVETRKTVRVIAKEFGVSKSTVHKDLTERLPEINPELANEVKEILDYHKSIRHLRGGEATKQKYRKEDVEKPVRQ >NZ_CP042929.1|WP_000457978.1|5323948_5324950_-|rod-shape-determining-protein MFARDIGIDLGTANVLIHVKGKGIVLNEPSVVAIDRNSGKVLAVGEEARSMVGRTPGNIVAIRPLKDGVIADFEITEAMLKYFINKLDVKSFFSKPRILICCPTNITSVEQKAIREAAERSGGKTVFLEEEPKVAAVGAGMEIFQPSGNMVVDIGGGTTDIAVLSMGDIVTSSSIKMAGDKFDMEILNYIKRKYKLLIGERTSEDIKIKVGTVFPGARSEELEIRGRDMVTGLPRTITVCSEEITEALKENAAVIVQAAKGVLERTPPELSADIIDRGVILTGGGALLHGIDMLLAEELKVPVLIAENPMHCVAVGTGIMLENIDRLPKRALR >NZ_CP042929.1|WP_000931959.1|5323085_5323520_-|3-hydroxyacyl-ACP-dehydratase-FabZ MLNIEQIKEIIPHRYPFLLVDKILEVDEGKRAVGIKNVSANEEFFNGHFPDYAVMPGVLIVEALAQVGAVAVLKKEENRGRLAFFAGIDNCRFKKQVRPGDQLRLEVEMTRVRGPIGKGKAIATVDGEVACEAEITFAIGDKKE >NZ_CP042929.1|WP_140386988.1|5322061_5322739_-|CpsD/CapB-family-tyrosine-protein-kinase MFGRKRRKPLRQLITHKEPKSRITEQYRNIRTNIEFTSVDNHVRSIIVTSADPGDGKTTTISNLAVVFGQQGKKVLLIGADLRKPTIQNLFAIHSSNGLTNLLSGQAKLMQCIQKTDIENVYLMAAGPIPPNPAELLGSSAMDDALLEAYNMFDIILIDTPPVLAVTDAQILANKCDGIVLVVRSEKTEKDKIVKAKQILDKASGKILGVVLNDKREEKEQYGYY >NZ_CP042929.1|WP_088053757.1|5321056_5321800_-|capsular-biosynthesis-protein MEETISLKELFHILKKRLAMILVIAFGAAIVSAIISFFFMTPIYQSSTQILVNQKKQEGTAIQYNEVQTNIQLTNTYKVIIKSPVILDQVKEKLGLNITTQELNKKIEVANEKDSQVVAVTAQDKDPKLARDIANTTAEVFKGEVAKIMSVDNVTVLSKAELSEELSPIKPRPMLNVAIAFVVGLMAAVGLAFLLEYLDNTVKKEEDVESLLGLPVLGIVARMDEETMNVKSHAPSSRKVRGQTIGS >NZ_CP042929.1|WP_088053758.1|5320365_5321067_-|CpsD/CapB-family-tyrosine-protein-kinase MALNLFKKKKNHRQRRQLIAHQQPKSPISEQYRNIRTNIEFAAIDTNLHSLMVTSANPSEGKTTTTANMAVVFAQQGKKVLLIDADMRKPAMHQMFQVDNIFGLTNVLTHSERLEKCVQTTSVENLNFLACGPIPPNPAELLGSKSMKELLGQAYSMYDLVIFDMPPILAVTDAQIMANICDASILVVRSESTEKETAVKAKGLLQSAKGKLLGVVLNDREREEGLHYYYGVN >NZ_CP042929.1|WP_088053759.1|5319485_5320253_-|tyrosine-protein-phosphatase MIDLHCHILSGIDDGAQTVTDSLAMAQQAVSEGIHTIVATPHHQNGKYVNERTSIIHHVKQLNDELQQHNIPLTILPGQEVRLYGDLLEDYEAGKIVTLNETNKYIFIEFPSNHVPRYAEQLLYELRVKGMIPIIVHPERNAELIERPDKLYNIVNKGALTQVTAGSLLGKFGKKIKKFSLQLVEHNLTHMIASDAHNTTSRGFHLAESYELVEKEFGTSVMSDLKENPYLLISGKAIYKEDPEQIRRKKLFGIF >NZ_CP042929.1|WP_088053760.1|5318357_5319239_-|UTP--glucose-1-phosphate-uridylyltransferase-GalU MKKVRKAIIPAAGLGTRFLPATKAMPKEMLPIVDKPTIQYIVEEAIESGIEDIIIVTGKGKRAIEDHFDHSFELEQSLLEKGKYEMLEKVQASSKINIHYIRQKEPKGLGHAVWCARKFIGNEPFAVLLGDDIVQAETPCLRQLMDQYEGTQSSVIGVQTVPENETHRYGIIDPIEQNDRRYQVRQFVEKPAVGTAPSNLAIMGRYVLTPEIFMFLENQQTGAGGEIQLTDAIQRLNEIQRVFAYDFEGIRYDVGEKFGFIKTTIEMALQHESLREELMSYMNELVKKENVHI >NZ_CP042929.1|WP_088053761.1|5317659_5318340_-|sugar-transferase MALTKVSSGTVKEQRMLVAEEINQNGTYLFIKRFIDILASLFGLILLSPIFLIVALLIKLEDPRGPILFKQVRIGKSEKEFGMYKFRSMVTDAEDRLKDLLQHNEVSGAMFKMKDDPRVTKIGKFIRKTSIDELPQLLNVLKGDMSLVGPRPPLPREVKEYTSYDKQRLLVTPGCTGLWQVTDRNSVGFKEMVELDLTYIKNRSLGLDIKLILKTVLVLFGSKNAF >NZ_CP042929.1|WP_033696077.1|5327035_5327740_-|ABC-transporter-permease MTFSMRRVSAIFRKEIQDFKTNSQVLLMAFLPIILSFLFSRFGVGKEMLGITTITAFLFVAGFVQSMVIAEEKEKHTLRVLMLSPASSVEVLLGKSLLTSGLTMVICIANLFILDQLNINLPLVGLIFLCGTILFIVLGTMIGLLASSVPQTSIIGMPILMTMYLAVQFEPMVENKVIKTMIGYLPTSHIVKALKSLVGGAGFSSISGHVLNVAVWLIISLVVCLIVYKKKQLD >NZ_CP042929.1|WP_088053756.1|5327739_5328582_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MTLAIEMKDVMKSFSGKTALRNVNIEVKQGEIFGFLGPSGSGKTTTVKILTSQLLHSVGTVRVLGKDITGPSSIDYKRIGILTDNSGLYERLSIYDNLLLFCDLYDCKKERIDEVLTQVNLLDDKKTPVKKLSKGMKQRVTLARAILHKPDILFLDEPTSALDPVNVQNIHKILKDLNEEGTTIFLTTHNMDEAETLCNRIAFLCGGEIVALDTPENLRLQYAKDQIEVVLKGKRKEVVQKDELGANRISEWMKKGELLSIHSHEPTLSDIFIEVTGRGL >NZ_CP042929.1|WP_063220195.1|5328762_5329770_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MALLELKQLGKANQLPEMELKVEKGQCIVLQCNNHTAKVLHRIIIGQEEASTGNVLFEGEAIGKKNYSRIGFCFLKDEAYDRLKVKEYFKFLIGLYESKISIEEVVQSVGLLDKLNVKVEKLSFSEKRRLHIGRVMIHNPDLIILEEPEQNVDIESTVIIRKAIMKMKEQGKAIFITSSFLSDALSLTEDVYILNNDGVKKVEIEQEEVEEVDEEKVVQIIPQMKLERIPAKVNDKIILLDPMEIHFIETQNGVTHIHVREGDFVCALTLGELEARLTGFGFFRCHRSYLVNLQRVREVITWTRNSFSLILDDERKSSIPLSKGRMDELKGVIGL >NZ_CP042929.1|WP_000672663.1|5329870_5330890_-|stage-II-sporulation-protein-D MKFSKPLFITVALLIALVIIVPAALVIPFAKAKVGEETASKTPPAIESIPAPGKVDTAVQVAVYREKQKKVETLPVEEYVTGVVASEMNASFEIEALKAQALAARTFVVQRMLSGGKKNNADVTDTVKDQVYKSKDELKKQWGNNYENNLKKIEEAVSKTAGQVLTYDGKPISASFFSTSNGRTENAADYWGNDYPYLKSVDSPWDQASPKFTSEQTFTVADFQKRLGVKVLADGKVGNIKDLTEGKRVKDVAFQGKTLTGKEVREKLDLRSSDFTWKQQGDKIIVTTKGFGHGVGMSQYGANGMAAEGKKYTDIVAHYYKGVEIKTMNDYEGKLMVKK >NZ_CP042929.1|WP_000411274.1|5331096_5332401_-|UDP-N-acetylglucosamine-1-carboxyvinyltransferase MEKIIVRGGKRLNGTVRVEGAKNAVLPIIAAALLASDGKNVLSEVPVLSDVYTINEVLRHLNAEVVFENNQVTIDSSKELNIEAPFEYVRKMRASVQVMGPLLARNGRARIALPGGCAIGSRPIDQHLKGFEAMGAKVQVGNGFVEAYVEGELKGAKIYLDFPSVGATENIMSAATLAKGTTILENAAKEPEIVDLANFLNAMGAKVRGAGTGTIRIEGVDKLYGANHSIIPDRIEAGTFMVAAAITGGDILIENAVPEHLRSITAKMEEMGVKIIEENEGVRVIGPDKLKAVDIKTMPHPGFPTDMQSQMMALLLQADGTSMITETVFENRFMHVEEFRRMNADIKIEGRSVIMNGPNSLQGAEVAATDLRAAAALILAGLVSEGYTRVTELKHLDRGYVNFHKKLAALGATIERVNEKVEEVKEQEVSDLHA >NZ_CP042929.1|WP_002005985.1|5332440_5333151_-|YwmB-family-TATA-box-binding-protein MKLKLKAILIVALSVVLFLVGYREMKPISDEQKMESMIKALEKNDAKVEKWSWLARETKTISNIHTFQKLLNDVKEKANIQKWEVEQSPDGYKATSYKKLSSYEERVVVTWSKENTKENTFIIFEVSGAKWDPKYVQNMNKIFSEKPIIYTCVQGVLNDKIEGVLQNKTNQVLKDLSARAIEQVEERAFVSVSAYNKKWDDALSTNREKINVQIAIRSTDNKDTIVVGTPIITSEY >NZ_CP042929.1|WP_000057889.1|5333196_5333433_-|DUF1146-domain-containing-protein MAQLLGQQALIAIVSHLLFITITWWALQGIHIERLMKSGKVLQTRVLLILITIAIGTSVSNFFLDYLGYSKSLTYLVK >NZ_CP042929.1|WP_000367459.1|5333635_5335156_-|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-NuoN MDMNTLFSLSWHLMVPEFIILGAAILLSICDLFFKLNHRYVALGAIAAIVLAIVSLITLYSEPAGDILNGSFVLDGFSKGFKTLLLGASALILCTAMSDDKKNPIEDKGEYYYLFLMALLGAMFMASSVDFITLFVGLELLSLSSYILVGIRKKSRASNEAAMKYVISGGIGTAITLFGMSYLYGITGSTNIVDMQKVLTGELASGIQLLLALAFLLLLVGLSFKIATVPFHMWAPDVYEGAATPVTAFLGTISKIAGFLLIIRLFLMIFASVLIQGDMQSLYGHMSIYIAVLASITMIVGNVVALKQYNIKRLFAYSGIAHAGYLLVPLVALSPFTMDSMWFYMLAYMLMNIGAFAIIHGLILQNNEENITIFTGLYKRSPFTAIMMTIFILSLAGIPGTAGFIGKINIFLGALHVEPAHYVLASIMMGTTVVSFVYYFRILQQMFFRTGETEERIRLPLNIKVVMSLCAISIVILGIMPMIGYNFFYEYFPLMKDFFFLGNVVQ >NZ_CP042929.1|WP_000998925.1|5335157_5336660_-|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-M MNDLLLTFFIFSPLLGILLLVLTPKKELRTVRALGLFGTALPFGIAIVLACTYASGKNLSLFDEKMKWIKFGDFTAVDKRWFSIYYELGIDGLSLVMMVLTALLATLAAIAAFSIKRNLKAFYMLLLMLEIGMLGVFAAQNLMLFFIFFEITLPPMFLLIGKWGKLSSEKAAYSYLIYNGIGSAILLIVFSILFAKTGTTNIVELKEILRSVNAEGALVIPSSLQLSVFIAIMIAFAIKLPVFPLHRWMVNVHIEAHPAVVMLHAGVLLKIGAYGIIRFGKGLFPEYFHDVATLIAILGVINLLYGAFLALIQTDFRKVLAYSSISHMGIVLMGLASLNAPGTQGALFQVVSHGLIAALLFFLLGVIEQRFGTSDITALGGLAKSVPVLSGFFLAGGMASLGLPGMSGFVSEFLAFLGLFQGEPVIAAVGVIGIILTAVYVLRATLQVTFGKKEWEAKSDIHGWEYVPVLLLIFCIIAIGVMPEILGDPLQNTLKTLGVK >NZ_CP042929.1|WP_088053755.1|5336656_5338519_-|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-L MIDYAWLIPLFPLVSFLLLIIFGKKIREGSSVLSIFFVFLSFILAVLVLIERFSEASVKHKWVWLRAGDVDISFGFEVTALGALMLFIVTLVSLLVHVYSKGYMKGDERLPTFYAYLGLFTFAMLGLVISTNLLQLYIFWELVGLGSFLLIGFYFFKEEAKAAAKKAFIMTRIGDVGLFIGMILIFWCAGSFEYDAIFRAIYTGDLPPYMITITAILIFIGAMGKSGQFPLHTWLPDAMEGPTPVSALIHAATMVAAGVYLVATMFPLFSASTVAMQTVAIVGAFTAIFAASIGLVQTDIKRVLAYSTVSQLGYMMLALGSAGYVAGIFHLTTHAFFKALLFLAAGSVIHAVHTQNINKMGGLQKKMKVTGTLFLIGTLAISGVPLLSGFFSKDEILAATWMNGNYVLFTLAVIAAFLTAFYMFRLYFLVFTGETKTKEEVHESPRVMTYPMIVLGVLAVVAGYINTPWFGTFLGDWLTKDVGFKVEETHGPVWIMIVATLVSFAGIALAYFIYRKKSISRNWAGGTETSLYNLLKEKYYVDELYNMTVIPITKGIAHVLRLFEVYVVEGIAVLIASVVKGTSNLGSKLQNGNVQVYGTVTAVSLAVLVIILLYTGGDLR |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP042929_1 | 1.1|5326037|31|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder | 5326037-5326067 | 31 | JX238501 | Bacillus phage phiAGATE, complete genome | 124559-124589 | 8 | 0.742 |
NZ_CP042929_1 | 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder | 5326091-5326124 | 34 | MN812210 | Flavobacterium phage vB_FspS_hemulen9-1, complete genome | 22854-22887 | 9 | 0.735 |
NZ_CP042929_1 | 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder | 5326091-5326124 | 34 | MN812215 | Flavobacterium phage vB_FspS_lillamy9-4, complete genome | 22191-22224 | 9 | 0.735 |
NZ_CP042929_1 | 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder | 5326091-5326124 | 34 | MN812216 | Flavobacterium phage vB_FspS_lillamy9-5, complete genome | 22191-22224 | 9 | 0.735 |
NZ_CP042929_1 | 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder | 5326091-5326124 | 34 | NC_048835 | Flavobacterium phage vB_FspS_lillamy9-1, complete genome | 22191-22224 | 9 | 0.735 |
NZ_CP042929_1 | 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder | 5326091-5326124 | 34 | MN812213 | Flavobacterium phage vB_FspS_lillamy9-2, complete genome | 22191-22224 | 9 | 0.735 |
NZ_CP042929_1 | 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder | 5326091-5326124 | 34 | MN812230 | Flavobacterium phage vB_FspS_sniff9-2, complete genome | 21831-21864 | 9 | 0.735 |
NZ_CP042929_1 | 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder | 5326091-5326124 | 34 | MN812209 | Flavobacterium phage vB_FspS_hemulen6-2, complete genome | 22983-23016 | 9 | 0.735 |
NZ_CP042929_1 | 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder | 5326091-5326124 | 34 | MN812218 | Flavobacterium phage vB_FspS_lillamy9-7, complete genome | 21454-21487 | 9 | 0.735 |
NZ_CP042929_1 | 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder | 5326091-5326124 | 34 | MN812233 | Flavobacterium phage vB_FspS_snork9-1, complete genome | 22007-22040 | 9 | 0.735 |
NZ_CP042929_1 | 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder | 5326091-5326124 | 34 | MN812219 | Flavobacterium phage vB_FspS_morran9-1, complete genome | 22308-22341 | 9 | 0.735 |
NZ_CP042929_1 | 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder | 5326091-5326124 | 34 | MN812217 | Flavobacterium phage vB_FspS_lillamy9-6, complete genome | 21930-21963 | 9 | 0.735 |
NZ_CP042929_1 | 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder | 5326091-5326124 | 34 | NC_048840 | Flavobacterium phage vB_FspS_snork6-1, complete genome | 22137-22170 | 9 | 0.735 |
NZ_CP042929_1 | 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder | 5326091-5326124 | 34 | NC_048839 | Flavobacterium phage vB_FspS_sniff9-1, complete genome | 22057-22090 | 9 | 0.735 |
NZ_CP042929_1 | 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder | 5326091-5326124 | 34 | NC_048842 | Flavobacterium phage vB_FspS_stinky9-1, complete genome | 21673-21706 | 9 | 0.735 |
NZ_CP042929_1 | 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder | 5326091-5326124 | 34 | MN812232 | Flavobacterium phage vB_FspS_snork6-2, complete genome | 21655-21688 | 9 | 0.735 |
NZ_CP042929_1 | 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder | 5326091-5326124 | 34 | MN812208 | Flavobacterium phage vB_FspS_hemulen6-1, complete genome | 22983-23016 | 9 | 0.735 |
NZ_CP042929_1 | 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder | 5326091-5326124 | 34 | NZ_HG813246 | Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence | 47181-47214 | 11 | 0.676 |
NZ_CP042929_1 | 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder | 5326091-5326124 | 34 | NZ_HG813246 | Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence | 47565-47598 | 11 | 0.676 |
NZ_CP042929_1 | 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder | 5326091-5326124 | 34 | NZ_HG813246 | Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence | 47949-47982 | 11 | 0.676 |
NZ_CP042929_1 | 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder | 5326091-5326124 | 34 | NZ_HG813246 | Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence | 48333-48366 | 11 | 0.676 |
NZ_CP042929_1 | 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder | 5326091-5326124 | 34 | NZ_HG813246 | Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence | 48717-48750 | 11 | 0.676 |
NZ_CP042929_1 | 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder | 5326091-5326124 | 34 | NZ_HG813246 | Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence | 49101-49134 | 11 | 0.676 |
NZ_CP042929_1 | 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder | 5326091-5326124 | 34 | NZ_HG813246 | Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence | 49485-49518 | 11 | 0.676 |
1. spacer 1.1|5326037|31|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder matches to JX238501 (Bacillus phage phiAGATE, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
ttcttcttttttgtcactagttgaaccgctt CRISPR spacer ctaaccttttttgccactagttaaaccgccc Protospacer .* .********.********.******..
2. spacer 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder matches to MN812210 (Flavobacterium phage vB_FspS_hemulen9-1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
cttgtcttctgttttactttctggtttcgtgctc CRISPR spacer ttcggcttctgttttattttctggttgcgatatt Protospacer .*.* ***********.********* ** *.
3. spacer 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder matches to MN812215 (Flavobacterium phage vB_FspS_lillamy9-4, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
cttgtcttctgttttactttctggtttcgtgctc CRISPR spacer ttcggcttctgttttattttctggttgcgatatt Protospacer .*.* ***********.********* ** *.
4. spacer 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder matches to MN812216 (Flavobacterium phage vB_FspS_lillamy9-5, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
cttgtcttctgttttactttctggtttcgtgctc CRISPR spacer ttcggcttctgttttattttctggttgcgatatt Protospacer .*.* ***********.********* ** *.
5. spacer 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder matches to NC_048835 (Flavobacterium phage vB_FspS_lillamy9-1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
cttgtcttctgttttactttctggtttcgtgctc CRISPR spacer ttcggcttctgttttattttctggttgcgatatt Protospacer .*.* ***********.********* ** *.
6. spacer 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder matches to MN812213 (Flavobacterium phage vB_FspS_lillamy9-2, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
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7. spacer 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder matches to MN812230 (Flavobacterium phage vB_FspS_sniff9-2, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
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8. spacer 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder matches to MN812209 (Flavobacterium phage vB_FspS_hemulen6-2, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
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9. spacer 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder matches to MN812218 (Flavobacterium phage vB_FspS_lillamy9-7, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
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10. spacer 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder matches to MN812233 (Flavobacterium phage vB_FspS_snork9-1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
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11. spacer 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder matches to MN812219 (Flavobacterium phage vB_FspS_morran9-1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
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12. spacer 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder matches to MN812217 (Flavobacterium phage vB_FspS_lillamy9-6, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
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13. spacer 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder matches to NC_048840 (Flavobacterium phage vB_FspS_snork6-1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
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14. spacer 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder matches to NC_048839 (Flavobacterium phage vB_FspS_sniff9-1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
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15. spacer 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder matches to NC_048842 (Flavobacterium phage vB_FspS_stinky9-1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
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16. spacer 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder matches to MN812232 (Flavobacterium phage vB_FspS_snork6-2, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
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17. spacer 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder matches to MN812208 (Flavobacterium phage vB_FspS_hemulen6-1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
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18. spacer 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder matches to NZ_HG813246 (Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
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19. spacer 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder matches to NZ_HG813246 (Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
cttgtcttctgttttactttctggtttcgtgctc CRISPR spacer tatgtcttctgtttttgtttctggttccccagct Protospacer . ************* *********.* .. ..
20. spacer 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder matches to NZ_HG813246 (Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
cttgtcttctgttttactttctggtttcgtgctc CRISPR spacer tatgtcttctgtttttgtttctggttccccagct Protospacer . ************* *********.* .. ..
21. spacer 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder matches to NZ_HG813246 (Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
cttgtcttctgttttactttctggtttcgtgctc CRISPR spacer tatgtcttctgtttttgtttctggttccccagct Protospacer . ************* *********.* .. ..
22. spacer 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder matches to NZ_HG813246 (Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
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23. spacer 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder matches to NZ_HG813246 (Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
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24. spacer 1.2|5326091|34|NZ_CP042929|CRISPRCasFinder matches to NZ_HG813246 (Staphylococcus epidermidis PM221 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
315319 : 323695
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP042929|315319:323695|DBSCAN-SWA GATGATTAGTCGTTATACACGCCCTGAAATGGGTGCGATTTGGACGGAAGAGAACAAATTTAAAGCGTGGTTAGAAGTTGAGATTTTAGCTTGTGAAGCATGGGCTGAGCTTGGCGATATTCCAAAAGAAGATGTTAAAAAAATTCGTGAACATGCATCATTTGATATTGATCGTATTTATGAAATTGAAAAAGAAACACGTCATGACGTAGTTGCATTCACTCGTGCTGTATCAGAAACGCCAGCATTAGGCGAAGAACGTAAATGGGTTCATTACGGTTTAACATCTACAGATGTAGTAGATACAGCATTATCTTACATCTTAAAACAAGCGAATGAAATTATATTAAAAGACTTAGAGAACTTTGTAAGCATTTTAGCTAACAAAGCGAAAGAGCATAAATACACAATCATGATGGGAAGAACACACGGTGTTCATGCAGAACCAACGACATTTGGTTTAAAACTTGGTCTTTGGTATGAAGAGATGAAACGTAACGTAGAGCGTTTCAAACAAGCTGCTGATACAGTTCGTGTTGGTAAACTATCTGGTGCGGTTGGTACATATGCAAATATCGATCCATTCGTAGAAAAATATGTTTGTGAAAATTTAGGATTAGAAGCAGCACCAATTTCAACACAAACATTGCAACGTGATCGTCACGCACACTACATGTCAACACTTGCACTAATTGCAACATCTATCGAAAAGATGGCAGTTGAGATTCGTGGTTTACAAAAGAGTGAAACACGTGAAGTTGAAGAAGCTTTCGCAAAAGGTCAAAAGGGTTCTTCTGCAATGCCACATAAACGTAATCCAATTGGTTCTGAAAATATGACTGGTTTAGCTCGTGTTATCCGCGGTTATATGATGACAGCTTACGAAAATGTTCCATTATGGCATGAGCGTGACATTTCTCACTCTTCGGCAGAACGCGTAATTTTACCAGATGCTACAATCGCATTAAATTACATGTTAAATCGCTTTGGTAATATCGTTAAAAACTTAACTGTATACCCAGAGAATATGAAACGTAATATGACAAGAACATACGGCTTAATTTATTCTCAGCGCGTAATGCTTACACTAATCGACAAAGGTATGGTACGTGAAGAAGCTTATGATATCGTACAGCCTAAAGCGATGGAAGCTTGGGAAACACAAGTACAATTTAAAGAGCTTGTAGAAGCTGATGAGCGTATTACAAGCAAGTTAACACAAGAAGAAATTAATGAATGCTTCAACTATGAGCATCATATGCAACACGTTGATACAATCTTTGAACGCCTTGGATTAAACGAAGCGTAAAATTTCATATGGCACAGAATAGAGTCATTCTGTGCCATTCTTTATAAAAATATTATTCACATTTTTCAAACTACAGGGGGCTTGCGAAATGCAAAAGCTAGAATTGCTGTATGAAGGTAAGGCAAAAAGAATTTATCGTACAGAATCAGCAGATATGGTTTGGGTAGAGTACAAAGATAGTGCGACTGCTTTCAATGGGGAGAAAAAAGAGACGATTACAGGAAAAGGTCGTTTGAACAATGAAATTACAACTTTATTGTTCAGAAAGTTACAAGAAGTGGGAATTAAAACACATTTTGTTGAGAAGTTATCTGAAACAGAACAACTTGTTAAAAAAGTGAGTATTATTCCTTTAGAAGTTGTCACAAGAAATGTAATTGCAGGAAGTCTTTCAAAACGATTAGGAATGGAAGAGGGAACTGTACTTGCAGAACCAATCGTAGAATTTTACTTCAAAGATGATGATTTAGGAGATCCGCTTGTAACGGAAGATCATATTCGTGTATTAAACGTTGCATCGCCAGAGCAAGTAAGTGTATTACGAGATATGGCTCTACAAATCAATCAAGTGTTGATTGATCATTTCGCAAGCTGTCGTGTAAGATTAGTAGATTTCAAATTAGAGTTTGGTGTAACGGAAGAAGGAGAAATCATTTTAGCGGATGAAATTTCACCAGATACTTGCCGTTTATGGGATGAAACGAGCAATGAAAAGTTTGATAAAGACGTATTCCGTCGTGATCTTGGAAATTTAACAGATGCTTATGAAGAGATTTTAAAACGTTTAGGGGGAATTTCACATGTATAAAGTTAAGGTATATGTAACATTAAGAGAAAGCGTATTAGATCCACAAGGAACAGCAGTAAAAGGAGCACTTCATAGTCTTTCATTCACAGAAGTACAAGATGTTCGAATCGGAAAGTACATGGAACTAACAATTGATAAATCTGTATCTGATTTAGATAGCAAGGTAAAAGAAATGTGTGAAAAACTATTAGCGAACGTTGTAATGGAAGACTTCCGTTATGAAGTTGAGGAGGTTGTCGCACAGTGAAATTTGCCGTAATAGTATTTCCGGGTTCGAACTGTGATGTCGATATGTTCCATGCAATTAAAGATGAGCTTGGCGAAGAAGTAGATTACGTTTGGCACGATACAGAGAATTTAGATGAATATGACGCAATTCTACTACCAGGTGGATTTTCTTATGGTGACTACTTACGCTGCGGTGCTATCTCTCGCTTTGCTAATGCAATGAAAGCAGTGCAAAAAGCTGCTGAGCAAGGAAAGCCGATTTTAGGTGTATGTAATGGATTCCAGATTCTTGTTGAATCAGGATTACTACCAGGAGCGTTAATGAGAAACGAAAACTTAAAATTTATGTGTCGCACTGTTCAGTTACGTGTTGAAAATAATGAAACGATGTTTACATCACAATATGGAAAAGATGAAATAATTAATATTCCAATCGCGCATGGTGAGGGGAATTACTATTGTGATGAAGCGACTCTTAAACAATTAGAAGAGAACAATCAAATCGCATTCCGTTACGTAGAAAACCCTAACGGTAGCGTTTCAGATATTGCTGGTATTGTAAATGAAAAAGGAAATGTACTTGGTATGATGCCACACCCAGAGCGTGCTGTAGATGAATTACTTGGCGGTGCTGAAGGGTTAAAAGTCTTTCAATCTATCTTAAAACAGTGGAGGGAAACATATGTCGTTAATGCTTGAACCAAATCCAACACAAATTAAAGAAGAGCGTATATATGCGGAAATGGGGCTAACAGACGAAGAGTTTGCCATGGTTGAAAAGATTTTAGGTCGTCTGCCAAATTATACAGAAACAGGGTTATTCTCTGTAATGTGGTCTGAACATTGTAGTTATAAAAATTCAAAACCAGTGCTTCGAAAATTCCCAACAACAGGTGAGCGTGTTCTACAAGGGCCTGGGGAAGGTGCTGGAATTGTAGATATCGGTGATAATCAAGCAGTTGTATTTAAAATGGAAAGTCATAACCATCCTTCAGCTATTGAACCATATCAAGGAGCTGCAACAGGTGTTGGTGGTATTATTCGTGACGTATTCTCTATGGGAGCACGTCCGGTAGCTCTATTAAACTCACTTCGTTTCGGTGAATTACAGTCACCACGTGTGAAATATTTATTCGAAGAAGTAGTAGCAGGAATTGCAGGATACGGTAACTGCATCGGTATTCCGACTGTTGGCGGCGAAGTACAATTTGATCCATGTTACGAAGGAAATCCACTTGTAAATGCAATGTGCGTAGGTTTGATTAACCACGAAGACATTAAAAAAGGACAAGCACATGGTGCTGGTAACACAGTAATGTACGTAGGAGCATCAACTGGTCGTGACGGTATTCACGGTGCAACATTCGCGTCGGAAGAACTATCTGAAAGCTCAGAAGCGAAACGTCCAGCGGTTCAAGTAGGGGATCCATTTATGGAAAAACTTCTTATTGAAGCGTGTTTAGAATTAATTCAATCTGATGCACTTGTTGGAATTCAAGATATGGGTGCGGCTGGTTTAACATCATCATCTGCAGAAATGGCAAGTAAAGCAGGAATGGGTATTGAAATGTACTTAGATGATGTACCACAGCGTGAAACAGGAATGACACCATATGAAATGATGCTATCTGAATCACAAGAGCGTATGTTAATTGTCGTGAAAAAAGGTAGAGAACAAGAAATAGTAGATTTATTTGAGAAGTATGGTCTTGCAGCGGTTACGATGGGGAAAGTAACAGAAGATAAAATGCTTCGTTTATTCCATAAAGGTGAAAAGGTAGCTGAAGTTCCAGCAGATGCTTTAGCAGAAGAAGCACCAATTTATCATAAGCCATCAAAAGAAGCAGCATACTTTGCTGAATTCCAAGCAATGAAAATGGAAACGCCAAAAGTAGAAAATTATAAAGAAACGTTATTCGCTTTATTACAGCAACCAACAATTGCAAGTAAAGAGTGGGTATACGATCAATACGATTACCAAGTTCGCACAAGCACAGTTGTTACGCCAGGTTCAGATGCTGCAGTTGTACGTGTACGCGGTACAGAAAAAGGATTAGCAATGACGACAGATTGTAACTCTCGCTACATTTATCTAGACCCAGAGATGGGCGGTAAAATTGCAGTAGCAGAGGCAGCGCGTAATATCGTATGTTCTGGCGGAGAGCCACTTGCAATTACAGATTGCTTAAACTTCGGTAACCCAGAAAAACCAGAAATCTTCTGGCAAATTGAGAAATCAGTAGACGGTATGAGTGAAGCTTGTCGCACATTACAAACACCAGTTATCGGCGGAAACGTATCGATGTATAACGAGCGTAGTGGTGAAGCTGTATATCCAACACCAACTGTTGGGATGGTCGGACTTGTGCATGACTTAAAACATGTAACAACACAAGAGTTTAAGCAAGCTGGTGATTTAGTGTATGTAATTGGTGAGACGAAAGCTGAGTTTGGCGGAAGTGAATTACAGAAAATGATTCACGGCAAAATTTTCGGTCAATCACCAAGTATCGATTTAGATGTAGAATTAAAACGCCAAAAACAAGTATTAGAAGCAATTCAAGCTGGTCTTGTTCAATCTGCACATGATGTTGCTGAAGGTGGTTTAGCAGTTGCGATTTCAGAAAGTGCAATTGGTGCTAAAGGCTTAGGTGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP042929|315319:323695|318345_320565_+|WP_000055564.1|DBSCAN-SWA MSLMLEPNPTQIKEERIYAEMGLTDEEFAMVEKILGRLPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTTGERVLQGPGEGAGIVDIGDNQAVVFKMESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPVALLNSLRFGELQSPRVKYLFEEVVAGIAGYGNCIGIPTVGGEVQFDPCYEGNPLVNAMCVGLINHEDIKKGQAHGAGNTVMYVGASTGRDGIHGATFASEELSESSEAKRPAVQVGDPFMEKLLIEACLELIQSDALVGIQDMGAAGLTSSSAEMASKAGMGIEMYLDDVPQRETGMTPYEMMLSESQERMLIVVKKGREQEIVDLFEKYGLAAVTMGKVTEDKMLRLFHKGEKVAEVPADALAEEAPIYHKPSKEAAYFAEFQAMKMETPKVENYKETLFALLQQPTIASKEWVYDQYDYQVRTSTVVTPGSDAAVVRVRGTEKGLAMTTDCNSRYIYLDPEMGGKIAVAEAARNIVCSGGEPLAITDCLNFGNPEKPEIFWQIEKSVDGMSEACRTLQTPVIGGNVSMYNERSGEAVYPTPTVGMVGLVHDLKHVTTQEFKQAGDLVYVIGETKAEFGGSELQKMIHGKIFGQSPSIDLDVELKRQKQVLEAIQAGLVQSAHDVAEGGLAVAISESAIGAKGLGATVKLDGEATAALFAESQSRFVITVKRENKEAFEKVVEAIQVGEVTSTNEVTIHNEENEVLLTANVDEMRKAWKGAIPCLLK >NZ_CP042929|315319:323695|317427_317682_+|WP_000278823.1|DBSCAN-SWA MYKVKVYVTLRESVLDPQGTAVKGALHSLSFTEVQDVRIGKYMELTIDKSVSDLDSKVKEMCEKLLANVVMEDFRYEVEEVVAQ >NZ_CP042929|315319:323695|316715_317435_+|WP_001170544.1|DBSCAN-SWA MQKLELLYEGKAKRIYRTESADMVWVEYKDSATAFNGEKKETITGKGRLNNEITTLLFRKLQEVGIKTHFVEKLSETEQLVKKVSIIPLEVVTRNVIAGSLSKRLGMEEGTVLAEPIVEFYFKDDDLGDPLVTEDHIRVLNVASPEQVSVLRDMALQINQVLIDHFASCRVRLVDFKLEFGVTEEGEIILADEISPDTCRLWDETSNEKFDKDVFRRDLGNLTDAYEEILKRLGGISHV >NZ_CP042929|315319:323695|323107_323695_+|WP_000088589.1|DBSCAN-SWA MSRLAVFASGSGSNFQSLVNAVEEKRLDAEISLLVCDKPEARAVGRANYHHIPCFAFSAKAYESKEAFEKEILKKLEEYEIDYVILAGYMRLIGPTLLEAYGGKIINIHPSLLPSFPGKDAVGQALEAGVKVTGVTIHYVDAGMDTGPIIAQEAVVVSEGDTRESLQKKIQQVEHKLYVNTVNQIVQSVKESTVN >NZ_CP042929|315319:323695|317678_318362_+|WP_000666786.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDVDMFHAIKDELGEEVDYVWHDTENLDEYDAILLPGGFSYGDYLRCGAISRFANAMKAVQKAAEQGKPILGVCNGFQILVESGLLPGALMRNENLKFMCRTVQLRVENNETMFTSQYGKDEIINIPIAHGEGNYYCDEATLKQLEENNQIAFRYVENPNGSVSDIAGIVNEKGNVLGMMPHPERAVDELLGGAEGLKVFQSILKQWRETYVVNA >NZ_CP042929|315319:323695|320549_321965_+|WP_000879025.1|DBSCAN-SWA MLAEIKGLNEECGVFGIWGHENAAQVSYYGLHSLQHRGQEGAGIVVNNGEKIVGHKGLGLISEVFSRGELEGLNGKSAIGHVRYATAGGSEVANVQPLLFRFSDHSMALAHNGNLINAKMLRRELEAEGSIFQTSSDTEVLLHLIKRSTKDSLIESVKEALNKVKGAFAYLLLTGNEMIVALDPNGFRPLSIGKMGDAYVVASETCAFDVVGATYIRDVEPGELLIINDEGIHVDRFTNDVEHAICSMEYIYFARPDSNIAGVNVHAARKNMGKRLAAEAPIEADVVTGVPDSSISAAIGYAEATGIPYELGLIKNRYVGRTFIQPSQELREQGVKMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSKRIVRMLREAGATEVHVRIASPPLKYPCFYGIDIQTRKELIAANHTVEEIREMIGADSLTFLSEDGLVDAIGRPYEGKYGGLCMAYFNGDYPTALYDYEQELLESMK >NZ_CP042929|315319:323695|315319_316627_+|WP_000625682.1|DBSCAN-SWA MISRYTRPEMGAIWTEENKFKAWLEVEILACEAWAELGDIPKEDVKKIREHASFDIDRIYEIEKETRHDVVAFTRAVSETPALGEERKWVHYGLTSTDVVDTALSYILKQANEIILKDLENFVSILANKAKEHKYTIMMGRTHGVHAEPTTFGLKLGLWYEEMKRNVERFKQAADTVRVGKLSGAVGTYANIDPFVEKYVCENLGLEAAPISTQTLQRDRHAHYMSTLALIATSIEKMAVEIRGLQKSETREVEEAFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENMTGLARVIRGYMMTAYENVPLWHERDISHSSAERVILPDATIALNYMLNRFGNIVKNLTVYPENMKRNMTRTYGLIYSQRVMLTLIDKGMVREEAYDIVQPKAMEAWETQVQFKELVEADERITSKLTQEEINECFNYEHHMQHVDTIFERLGLNEA >NZ_CP042929|315319:323695|322070_323111_+|WP_001262439.1|DBSCAN-SWA MANAYKQAGVDIEAGYEAVSRMKKHVQTTMRKEVLGGLGGFGGMFDLSKFALEEPVLVSGTDGVGTKLMLAFMADKHDTIGIDAVAMCVNDIVVQGAEPLFFLDYIACGKAEPSKIENIVKGISEGCRQAGCALIGGETAEMPGMYSTEEYDLAGFTVGIVDKKKIVTGEKIEAGHVLIGLASSGIHSNGYSLVRKVLLEDGELSLERIYGRLELPLGEELLKPTKIYVKPILELLKKHEVYGMAHITGGGFIENIPRMLPEGIGAEIELGSWEIQPIFSLLQEVGKLEEKEMFNIFNMGIGMVVAVKEEDAKDVVRLLEEQGEMARIIGRTIQGAGVTFNGGTAL |
8 | Synechococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
344610 : 435228
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP042929|344610:435228|DBSCAN-SWA CGTGTCAAGAATTTCCGTTGAGAATGTAAAGCACGTAGCACATTTAGCACGTCTTGCAATTACTGATCAAGAAGCAGAAAAATTTCAAAAACAACTAGATGCAATTGTTACATTTGCAGAACAGTTAAATGAATTAGATACAACAGATGTAAAACCAACAACTCATGTATTAACTATGAAAAATGTTATGCGTGAAGATGTACCAGAAAAAGGTTTACCAGTTGAAGAAGTATTAAAAAATGCACCGGATCACAAAGATAATCAAATCCGTGTTCCAGCAGTATTAGAATAGAGGAGGGGAATTTCGATGTCATTATTTGATCATTCAGTATCAGAGTTACATAAGAAGTTAAACAACAAAGAAATTTCCGTTACGGATTTAGTAGAAGAATCTTACAAACGTATTGCGGATGTTGAAGATAACGTAAAAGCCTTTCTTACATTAGATGAAGAAAATGCACGCGCAAAAGCGAAAGAATTAGATGCAAAAATCGGCGCTGAAGATAATGGTTTATTATTCGGTATGCCAATTGGTGTAAAAGATAACATTGTAACTAACGGTCTTCGTACAACTTGTGCAAGCAAAATATTAGCAAACTTCGATCCAATTTATGATGCGACAGTTGTGCAAAAGCTAAAAGCTGCTGACACAATTACAATCGGTAAATTAAACATGGACGAGTTCGCAATGGGTTCTTCAAATGAAAACTCAGGATTCTACGCTACGAAAAACCCATGGAACTTAGATTACGTTCCAGGCGGATCTAGTGGTGGTTCTGCAGCAGCTGTAGCAGCAGGAGAAGTACTATTCTCTCTAGGTTCTGATACGGGTGGTTCTATCCGTCAGCCAGCTGCATATTGCGGTGTTGTAGGTTTAAAACCAACTTACGGACGCGTATCTCGTTACGGATTAGTAGCATTCGCATCTTCACTTGACCAAATCGGACCGATTACACGTACAGTAGAAGACAATGCATACTTATTACAAGCTATTTCAGGTATTGACCGCATGGATGCAACTTCTGCAAACGTTGAAGTTGGAAACTATTTAGCTGGTTTAACAGGCGATGTTAAAGGTTTACGCATTGCTGTACCGAAAGAATACTTAGGCGAAGGTGTTGGCGAAGAAGCTCGTGAGTCAGTACTAGCTGCTTTAAAAGTATTAGAAGGTATGGGCGCAACTTGGGAGGAAGTATCTCTTCCACACTCTAAATACGCTCTAGCAACGTATTACTTACTATCTTCTTCTGAAGCATCTGCTAACCTTTCACGCTTTGATGGCGTGCGTTACGGTGTTCGTTCTGATAATGTAAATAACTTATTAGATCTTTACAAAAACACACGTAGTGAAGGTTTCGGTGATGAAGTTAAACGTCGTATTATGCTTGGTACATTTGCTCTTAGCTCTGGTTACTATGATGCATATTACAAAAAAGCACAACAAGTACGTACATTAATTAAGAACGACTTTGAAAATGTATTTGCTAACTATGATGTTATTATTGGACCAACAACACCAACTCCGGCATTTAAAGTGGGAGAAAAAGTTGACGATCCAATGACAATGTATGCAAATGACATTTTAACAATCCCAGTAAACTTAGCGGGTGTTCCAGCGATTTCAGTTCCATGTGGATTCGGTGCTAACAACATGCCACTTGGTCTACAAATTATTGGTAAACACTTCGATGAAGCGACAATTTACCGCGTTGCACATGCGTTTGAGCAAGCAACAGACTATCATACAAAAAAAGCAAGTCTGTAAGGAGGCGAGCATAGATGAATTTAGAAACAATTATTGGTTTAGAGGTTCACGTTGAGTTAAAAACAAATTCGAAAATTTTCTCTGCGAGTCCAACAGAATTCGGAGCGGAGCCAAATACACAAACAAGTGTAATTGACTTAGGATACCCAGGGGTACTTCCTACTTTAAATAAAGAAGCAGTTAACTTTGCGATGAAAGCTGCAATGGCATTAAACTGTGAAATCGCAACGGAAACGAAGTTTGACCGTAAAAACTATTTCTATCCAGATAACCCGAAAGCTTACCAAATCTCTCAATTTGATAAGCCAATTGGTGAAAATGGTTGGATTGAAATCGAAGTAGACGGCAAAAAGAAACGTATCGGTATTACACGTCTTCATTTAGAAGAAGATGCTGGTAAATCAACGCATACAGCTGATGGTTCATTAGTAGACTACAACCGTCAAGGTATGCCTTTAATCGAGATCGTATCTGAGCCAGATATGCGTACGCCAGAAGAAGCATATGCATACTTAGAGAAGTTAAAATCAATCATTCAATACACTGGTGTATCTGATTGTAAGATGGAAGAAGGTTCCTTACGTTGTGATGCGAACATTTCTCTTCGTCCAGTTGGACAAGAGAAGTTCGGTACAAAAGCGGAACTGAAAAACTTAAACTCATTCACTTACGTACAAAAAGGTCTTGAGCACGAGCAAGTGCGTCAAGAAAAAGAACTGTTATCTGGTGGTATCATCCAACAAGAAACACGTCGTTATGATGAAGCAACGAAGAAAACAATCTTAATGCGTGTGAAAGAAGGATCTGACGATTACCGTTACTTCCCGGAGCCAGACTTAGTTGAACTTTACATTGATGATGAGTGGAAAGAAGCAGTTCGAGCTTCTATTCCAGAACTTCCAGATGCACGTAAAGCTCGCTACGTTGCAGAACTAGGCTTACCAGCTTATGATGCACACGTGTTAACATTAACGAAAGAGATGTCTGATTTCTTTGAAGCAACTGTTGCAGACGGTGCTGATGCGAAATTAACATCGAACTGGTTAATGGGTGAAGTACTTGCATACTTAAACAAACAACAAAAAGAATTAAAAGACGTTGCATTAACGCCTGCTGGTTTATCTAAAATGGTTCAATTAATTGAAAAAGGTACAATTTCTTCTAAAATCGCGAAGAAAGTATTTAATGAATTAATTGAAAAAGGTGGAGACCCAGAAGAAATCGTTAAAGCGAAAGGTCTTGTTCAAATTTCTGACGAGGGTACACTTCGTAAAGTTGTAACAGAAATTCTTGATAATAATGAGCAATCTATCGAAGACTTTAAAAACGGTAAAGACCGTGCAATTGGCTTCTTAGTTGGTCAAATTATGAAAGCTACAAAAGGACAAGCAAATCCACCGCTTGTTAACAAAATCTTACTTGAAGAGATTAATAAGCGATAATAGTAGTAACTTTTAAAGATTAAGCAGAAAAACACCCGTACATGGGTGTTTTTCTAGGTTAATCAAACGTTTGTTTAAATGAGACAAAATCGTTTAAACAAACGTTTGATTAACTGTCAAAAGTGGAAAAATGTTTGTATAGCAACTATGGTATGATAGTTGCAAAAAGGTGGGAATAATGATAAATCTAAACATAGAGGTTTTTTTCATCTCATGAAATAATAGATAGTTATTATTCGTTATATGTAAATTTTTATGGAAGAATGGATAGAAATAAAGTGAAACTTTAATCAGTGGGAGGTTCATCCAACACTGATTATTAGCCCTCACCAATCGGGCATTTACTGCCCGCAAATAGCGGGATAAATTTTGGGGTCAAATAAAAAACCATTGAAATGAATATTTACTTTTGATGGACTACACGAATCGGGTTCTTACTGCCTGTTTGAGCGGGATAAAAGAAGGATAGCAAGATGAGAGGAGGTAGGCATGGGAATACTGAATAGAAGTTCAGTATGTTCTTTTTCGATACATAAAGAAATTTCCTGTGCTAATAAATGATGAAGCGAGCAAGAATTATTTATAATCCTACTTCTGGGCGTGAGCTATTTAAGAAGAGCTTACCAGAAGTATTACAAAAATTAGAACAAGCTGGCTATGAGACATCTTGTCATGCGACAACGGGTCCTGGAGACGCTACTGTGGCGGCGAGGCAAGCTGCGGATCGTAAGTTTGATGTTGTTATTGCGGCTGGTGGCGACGGTACGTTAAATGAAGTAGTAAACGGTTTAGTTGGGCATGAATTCCGTCCGAAATTTGGAATTATTCCAGTTGGAACGACAAATGACTTTGCACGTGCAATTGGTGTACCTCGTTCTATTGAAGAGGCAGCAGATATTATTTGCGAAGGAAAAACAGTGCCATTAGACCTTGGTAGAGCGAACGATACATATTTTATTAACATCGCTGGTGGCGGTCGTATTACAGAATTAACATACGAAGTACCGAGTAAGTTAAAGACAGTATTAGGGCAGCTTGCTTATTACCTAAAAGGTATCGAGATGTTACCATCATTGCATCCGACATATGTTGAAATTGAGTATGATGGAAAGTTACTACAAGAAGAAATTACGATGTTTTTAATTACGAATACTCGTTCAGTAGGTGGATTTGAAAAGGTAGCACCGTATGCATCTATTAACGATGGGTTATTTGACCTATTAGTACTGAAAAAAGGTTCTATCGCTGATTTAATTAAAGCAGCAACACAAGCACAACGTGGTGAACATATTAATAATCCAAAAGTGTTATATACACAAGCGAACCGAATTAAAGTACATTCACCAGATAAACTAATGATTAATTTAGATGGTGAGTATGGTGGAGATGCACCGATGGAATTCGAAAATATATATCATTGTTTAGAACTATTTGTTCCTGAACATCAAGAGGATGCCCTGTAAAGGCATCCTTTTTTACTTTGTTAAAATGAATTGTAAATTGGGAGTTAGTTTGATTTTTATGGTATTTTTACAATTCTTTTATTTTACATCCATACTTTATTGATACACTGGAAGAGATAAGAAATGAGAGGTAGGATGCTATGGAGAAGGTAAAAGCAATACTATTTGATAAAGATGGGACATTAATGGATTTTCATTCAATTTGGATAAAAGTAGCTGAAGAACTTGTAGCTGAATGTATAAGTTTATATCATTTACCAAGTACAATAGGGCAGACCTTATTAGAAGAGATTGGTGTAGAGGGAGCATTTGTTAATCCAAGGAGTGCAA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94 | Erysipelothrix_phage(62.26%) | portal,terminase,tRNA,tail,protease,capsid,head,coat,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1912428 : 1921110
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP042929|1912428:1921110|DBSCAN-SWA 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TCATTTGGTCTATCGCATTTTATGTAGCAACTAGTTTATTGAATGCTTTTGACGTAAACGTATCGCCGTTTGTTGCCTTTCTAATTAGTGATATGGTCGGTTTTGTCTTTATTATTCTTATTTGGACATTGATTGGAATATTAATGAGACCAAAACGAGAGGCGATGATTTGGACTATTATTGAACCGATACAAAAAATTGCAAAAGGAGACTTCTCCGTAAAAATAAGAAATGAAGAAAAGTATGATGGTGAAATTGGCGTGCTCGTAAAAAGTATAAATGATATGACAGATGAACTGAATACGATGGAGAAAATGAGACAAGAGTTTGTATCGAATGTTTCTCATGAAATACAGTCACCGTTAACTTCTATAAAAGGATTTGCTAGAGCACTACAAGACGATAATCTTTCTGAGGAAAAAAGAAAGCATTATCTTACCATTATTGAAACTGAAACAACGAGATTATCTAAACTAAGTCAAAATTTACTAAAGCTAACTCTTTTAGAATCAGAAGAATATATACCAGAAAGAGTGAGCTATCGATTAGATCAACAATTAAAGCAAATTGTGTTAAATAGTGAACCACTCTGGGCTGAAAAAGAAATTGAGTTAGAACTAGATTTAGAAAAAGTACATGTTATTGCTGACCAAGAAAGTATGAGTCAAGTGTGGATTAATTTAATTCATAATAGTATTAAATTTACTCCAAGCGGTGGTACGATTACTATTCAGTTAAAGGAACATGAGACAGTAGTGGAAGTGCGTATCCGTGATTCAGGAATTGGTATATCAGAAGAACAGAAACAACATATTTTTGAGCGTTTTTATAAAGCGGATTCTTCACGAAATCGTGCCTATGGAGGAAGTGGCTTAGGTTTAGCTATTGTAAAGAAAGTACTCGACCTTCATCATGGGGAAATAAAAGTTGAGAGTGAGGAAGGAAAAGGTACTGAATTTATTGTGCGTATGCCAAATCATGAAGAGAAATAGTGTTAGAAGGAGAACCTTCTAACACTATTTCTCTTTAAAAATGCATTTACCGTTACTGCAATTATATTGATAAGCTTTTCCTTCGCTATTCATACGATATGAGTAATCGGATTCTTTATCTTTCTTAAAGTCAACGTATGCTTCCACACCGTTTTTATCGTCATCTATATCAATGAATTGAACGTGTCGTATAGAATAATCTTTCTTTTCTCTTAAACCTCTTCCTTGCAAGTTTGTATAAATACCATCTACTAACTGGTCAAACAACGACCAGTTTAAATTAAGATGTTCAAATGACTCAGTATGTCTTCCTAAAATACCGTTGTCTTGTATTATTTTTTTATTATCATCGTATGTATAAGAGTAGGTGAAATATGGTTCGTCTTTATATACTACTGTTGCATAATAGCCAATATTATAAAGGGGAGTATATTTTCCGGTTATGTTTTGTATTTCTTCTTGCTTATAACCTTTTTTAATATGGAGATAATGGCTAGTATCTTTTTCTATTACTTTATAATTTAGTGGGTTACCAAATATAAAGTACAGTGCAAACAATATGATACATAGTCCGACTGCAGTTAGTAACAAGAACCATTTTTTTCTTTTCATACTCATACACTCCCCTATGCTGGATTTGTTTTTATTTTACATGAATAATAGTAAAAAAATGAAACTTATAAATAAAAACTTTCTACAGTTACCTACAAGTAACCTACGCACATGAAAGTGCATCATTGCCTTTTTACATAAACATAGATACAATTTTAATATAATACATAACTGAGATGATTAAGGAGTGTTATACTTGGCAGAATTATTACAAGGTAAAAATGCTTTAATTACAGGAGCAGGTAGAGGGATTGGTCGCGCTGTAGCAATCGCATTAGCGAAAGAAGGCGTAAATGTAGGCTTATTAGCTCGTTCAGAAGAAAACTTAAAAGCTGTAGCGAAAGAAGTAGAAGCAGAAGGTGTAAAAGCTGTTATTGCAACTGCTGATGTTTCTTCATACGAAGAAGTAACAACTGCGATTGAAACGTTAAAAAATGGTTTAGGATCTATCGATATTTTAATTAATAACGCTGGTATTTCTAAATTCGGTAAGTTTTTAGAGCTAGACGTTGCTGATTGGGAAAAAATCATTCAAGTAAACTTAATGGGTGTATACTATGCAACTCGTGCAGCTTTACCGAGCATGATTGAACAACAATCTGGTGATATCATTAACATTTCATCTACAGCAGGACAAAAAGGTGCACCTGTAACAAGTGCATATAGTGCTTCTAAATTTGGTGTCCTTGGCTTAACAGAATCGTTAGCGATGGAAGTTCGCAAACATAACATTCGTGTAACAGCTTTAACTCCAAGTACAGTAGCAACTGATATGGCTGTAGATTTAGGATTAACTGATGGAAACCCTGATAAAGTAATGCAAGCAGAAGATATTGCAGAATTTATCGTAGCGCAGCTGAAATTAAATAAACGTACATTTATTAAATCTGCTGGGCTTTGGTCTACTAATCCATAGGAATTAAATTTAACTTTAAAAGAAGGGATATCTATTCTATAAGGGGTAGATGTCCCTTCTTTATTTTTTGTATTCAAGACAGAATTTTCGGTATAATTAAAAGTGAATGGTAGAAAGCATTGGTAAATTGAAAGGAATGGCAGTTGTAAAAGAGTGATGTAAGGAGGGAAAAGGAATGAAAAAGAAGTTTCAAAAATTATAACGTGTAGCGTGTATAACGAGACTAGCTCGTGGACCTCCAATATACATAACACTATATTGTATATTAAAAAATTGGAGGCTATAAGTAGATGAGAACTGAAAAAGAAATGTTAGATTTAATTATAAATACAGCAATAGAGGATGAAAGAATTCGAGCTGTCATCATGAATGGATCGCGTGTAAATCCAAATGTGAAAAGAGATTGTTTTCAAGACTATGATATTATGTATGTTGTAAATGATATACAATCTTTTACGTCTAATCATAATTGGATTCATAGATTTGGAGAAATAATGATTGTACAAATGCCAGAAGAAATGTTGTTAGTTCCACCAGATGAAGACGGGAAGTTTCCATATTTAATGCAGTTCATGGATGGGAATCGGATTGATTTAACGCTAGTTCCAGTTGAGTTAATAAAAAAGTTCGTTGGACAAGATAGTTTAAGTAAACTGCTTCTTGATAAAGATAATTGTCTGGAAGAATTCCCGCCAGCAAGCGATAAGGATTACTTAATAAAAAAGCCTACAGAAAAAGAGTTTTTAGATTGTTGTAATGAATTTTGGTGGTGTAGTACGAATATCGCAAAAGGGTTATGGCGAGAGGAACTTTCTTATGCAAAAGGAATGCTTGAAGGACCAGTGCGAGATATGTTCATCGTAATGCTAGAATGGCATATTGGTATGAAAACAGACTTTACAGTTAATACAGGGAAGTTTGGAAAGCATTTCGAGCAATATATTGAAGAAGATATGTGGGAGCAATTTAAAAGGACATTTTCTAATGCAGAATATGAAAATATATGGGAGTCATTCTTTGTTATGGGTGATTTATTTAGGGAAGTGGCGAACGAAATCGCTAACACATATGAATATCAATATCCGCAAGATGAGGATGATAAAGTGACGAACTATTTAAAACATGTGAAAGCTTTGCCAAAAGATAGTACATCAATTTATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP042929|1912428:1921110|1919227_1919947_+|WP_000818985.1|DBSCAN-SWA MAELLQGKNALITGAGRGIGRAVAIALAKEGVNVGLLARSEENLKAVAKEVEAEGVKAVIATADVSSYEEVTTAIETLKNGLGSIDILINNAGISKFGKFLELDVADWEKIIQVNLMGVYYATRAALPSMIEQQSGDIINISSTAGQKGAPVTSAYSASKFGVLGLTESLAMEVRKHNIRVTALTPSTVATDMAVDLGLTDGNPDKVMQAEDIAEFIVAQLKLNKRTFIKSAGLWSTNP >NZ_CP042929|1912428:1921110|1913820_1914585_-|WP_001194309.1|DBSCAN-SWA MQTNIHSEKETIIFIHGLVGNRRAFKKEQKRFSSSYNIITYDLLGHGDDKGEAIDFSLQRLVDQLLNLYEQEGIKKAHICALSYGCYISTIFAQMHPEKVLSICHIGGHYNNPSRLYNVFQNFWEKRGDEYSKWLSQYANTIFPSGILKANPFAVISRNIYYRFGLQLHSSIIAQSLRHRLEFDLKSKLKSLPHPILWVMGEHDHLYKSCLFDLKSILPNVLYKEIPLAGHAANLFRPNYFHDLYDRFLNGKLK >NZ_CP042929|1912428:1921110|1914825_1916586_+|WP_000453882.1|DBSCAN-SWA MEVRNEMKKKGSWRQFLRLIQDTNPPKGILVFALLMSLLSTGASLFIPMLTKGLVDNFSLSSISAGQIVGLVAFFVMQTIAAGLSIYLLNYIGQKIVAGLRERLWKKVLILPVSYYDQNRTGDTISRMTNDTGVVKTLISEHLSNLLTGGISIVGSLIVLFVLDWKMTALLLTVIPLSVLILVPLGRKMYKISKALQDETASFTSVLTQVLSEIRLVKSSNTEKREYETGNTGIQKLLQFGLKEGKVQALISPVMSFVLMALLVIIVGYGGMRVSSGALTTGELVAFILYLVQIVMPMSQLSMFFTQFQKAIGATERISTILEYEVEDHETGVKVTNAKQPIVLENVHFEYNEEEQVLKNIDFTIESGKVTAIVGPSGSGKTTLFSLLERFYEPTSGAIKLGEESITSYSLESWRRQIGYVSQDSPLIDGTIRDNICYGVEGEVTDEEIEKVAAMAYVDAFIHDLPNGYATEVGERGVKLSGGQRQRIAIARALLRNPQILMLDEATSSLDSKSESVVQKALNNLMKGRTTLVIAHRLSTVVDADKIIFIEKGNLTGSGTHDELLQTHDMYREFATQQLKIKEGAL >NZ_CP042929|1912428:1921110|1917345_1918419_+|WP_140387068.1|DBSCAN-SWA MRKRKRMSKLKMLKVFGAVLALFSILTIIWSIAFYVATSLLNAFDVNVSPFVAFLISDMVGFVFIILIWTLIGILMRPKREAMIWTIIEPIQKIAKGDFSVKIRNEEKYDGEIGVLVKSINDMTDELNTMEKMRQEFVSNVSHEIQSPLTSIKGFARALQDDNLSEEKRKHYLTIIETETTRLSKLSQNLLKLTLLESEEYIPERVSYRLDQQLKQIVLNSEPLWAEKEIELELDLEKVHVIADQESMSQVWINLIHNSIKFTPSGGTITIQLKEHETVVEVRIRDSGIGISEEQKQHIFERFYKADSSRNRAYGGSGLGLAIVKKVLDLHHGEIKVESEEGKGTEFIVRMPNHEEK >NZ_CP042929|1912428:1921110|1912428_1913721_+|WP_000755497.1|DBSCAN-SWA MKKVIAGLAAASVAGVAVPGMDSAHAQVSNEALKEINGQTQTQTQTQTTVTETKTVETTSELKYTVTADVLNVRSGAGTGHNVISKVKSGQVLQVVGQENGWFKVNVNGQTGYVSGDFVTTGGKTGTTVQQGTGTYTVNVSSLNVRTGPSTSHTVLGSVNKGKTVQVVGEVQDWFKINFNGGTGYVSKDFVTKGGSAVSNETKQPTTNNNTTTVQTGGSYVVNTGALKVRTGPATYNAVIGGVTNGKVLNVTGAENGWYKINHNGRTGYVSADFVKFVKGGVNNVTNNNNVTNNVQQPGKDVQKPTTGGDTSSIAGFARSLNGSPYRTAGTTPAGFDCSGFIHYVLNQTGHKGARQTVAGYWSSKTKTSNPQPGDLVYFQNTYKSGPSHMGVYLGNGQFISAETDATGVRISSVSNSYWSKHLLGYTKAY >NZ_CP042929|1912428:1921110|1918443_1919037_-|WP_088054335.1|DBSCAN-SWA MSMKRKKWFLLLTAVGLCIILFALYFIFGNPLNYKVIEKDTSHYLHIKKGYKQEEIQNITGKYTPLYNIGYYATVVYKDEPYFTYSYTYDDNKKIIQDNGILGRHTESFEHLNLNWSLFDQLVDGIYTNLQGRGLREKKDYSIRHVQFIDIDDDKNGVEAYVDFKKDKESDYSYRMNSEGKAYQYNCSNGKCIFKEK >NZ_CP042929|1912428:1921110|1920237_1921110_+|WP_001258500.1|DBSCAN-SWA MRTEKEMLDLIINTAIEDERIRAVIMNGSRVNPNVKRDCFQDYDIMYVVNDIQSFTSNHNWIHRFGEIMIVQMPEEMLLVPPDEDGKFPYLMQFMDGNRIDLTLVPVELIKKFVGQDSLSKLLLDKDNCLEEFPPASDKDYLIKKPTEKEFLDCCNEFWWCSTNIAKGLWREELSYAKGMLEGPVRDMFIVMLEWHIGMKTDFTVNTGKFGKHFEQYIEEDMWEQFKRTFSNAEYENIWESFFVMGDLFREVANEIANTYEYQYPQDEDDKVTNYLKHVKALPKDSTSIY >NZ_CP042929|1912428:1921110|1916671_1917349_+|WP_000612413.1|DBSCAN-SWA MIPKILIVDDDPHIRELVSVFLEREGFQTYEAIDGVDALQKMDDVKVDMVILDIMMPNMDGFDVCFELRKYYDIPVLMLTAKGETSQKVKGFHLGTDDYLVKPFDPIELVVRVKALLKRYQITVSQSIQVGNVLLNRKTFEVTSGEQTVTLPLKEFELLFTLGAKSGRTCSREQLIEEIWGYDFEGNERTLDVHINRLREKFQEEQSKFSIKTIRGLGYRLEVSK |
8 | Bacillus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2399220 : 2449300
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP042929|2399220:2449300|DBSCAN-SWA CATGGCATATATAGACGGTAAATGGTTAGCCCGTCAAGAACGTCAGGAGCGTATCAATCTTGTAGCAGAAAGAGCAAAGAAATTACAGGAGTTGTACGAAACTGGCGAGGCTACAGAATATTATATGGATACACTACTTGCTGACATCGATGAGCTAGAAAAGTTAAAAAGGGTACATCGTGGAGAACATGACATGTTGTACTTCATGTATGAGTATTTCTCGGAAGAAGGAAATCCCGGAAATCCTGATAACTTAATCCCGGCTGGAGTAACGATGGATGATGCGGCTGAATTTCACGAAACCTTATGTGGCTTGTTAGATGACATCACAACAGGTAGGGAGAAAAAGAAAAAAGTAGCCTGGAGTGTAGGTCGTGGCCATGCGAAAACCGCATACCTGAGTAATGGTTATTTGTGTCATCAAGTCGTGTATCGATTAAAGCAGTATATTGTTTTGATTTCTGAAACATCTGATGTAGCCGGTGACTTTATATCCTGGGCGCGTGATCAGTTAAAGTATAACGAAAAATTACGCGAGGATTTCGGTATCTTACTTCACGAACAAAAAAGCCGAAATGAAGTTGATAATGATAAAGAATTCGTTACTTTAACAAATACGAAAGTCGAAGCAAAAGGTATCGGGACACAGGTGCGTGGTTTGCGTCACGGTTCAAAAAGGGTTCAGCTCTACATTTTGGATGATTTGGAGAGTAAAGAAAATACCGCGACAGTTGATTTAATCGCAAAAAATAAACGCTGGTTCAAGGAAGAATTACTACCAGGTTTAAGTCGACAAGAGGGTGCCTGTATTTATATGGGTACTATCGTTTGTTACGACAGTTTATTGCATCACGTTATTAAGAACCGTCGTGATTTCGTATCAAGATCGTTCCCGGCAATTTTGAAATGGTCAGAGCGTGAAGATTTATGGCAAGAGTGGCGGGAGATTCGTCAGGTGGATGAAGAGGAGGCTTCTGATAAAGCTCGTGAATTTTATGAGCAGAACAAAGAAGAAATGCTCCGTGGTACAAAAACGTTATGGCCATCACATTTCCCATACATCGATTTGATGGAAATTAGAGAAGATGACGGTACCAAAGCGTTTAACCAGGAGTATCTATGTAACCCGACTGACGAGGAAAGACAGATATTTAAACCTAAATATTTCACGTACTGTACTGAAGATGATTTAAAAGACAAAAAACTTTTGTATTACGGTGCGGTTGATTTCGCAATGGGGAAAGAGAAAGGTGACTATAGCGTAGTAGTTACAATTGCGAAAAACGTGGAAACAGGAACTTGTTATGTTATCGATATTTTTATGGAGCGTGTTCATCCAAATACATTGCTAGAAAAAGCTGTAGAATACACGCTGGCATATCAATATGAATCAATCGCAGTAGAGGCACAACAAGCGCAGGAGTGGTTTGCGGATAAGGTTGGAGAGGAATTGCAGAAAAAAGGGTATCCTTCATCGACGCGCTTAAAACAAATTAAGCAACGTACACGAAAAGCACTACGTATTGAGTCATTATTACCTGATATACAGAGTGGTAAATTACGTTTTATGAAACATTTACGTGCTTTATTGGAGCAATTTGAAATGTATCCGATGCATCCACATGATGACGGTCCGGATGCGGTTCAAATGGCTTTTTCTATCGCATATAAACGTGCAAGACGTAAAGCAGGCACTACAGGGAATTCAAGATATTGAGGAAGGAGGGGCTTGAATGAGAGTACAAGGTGATCGTAATTTTATGAATCCAGTGGAAATTGTAATGCCAGTTCGTACCGCACTCGGCGATTCTGAGTGGACACGCATTATGTCTGAGGTTCGCTTGTATGAGCGTTATGAAGGAGACTTAAACGTATGGTCTGATTATAAAAAACCAGACAATCTCGACTACGAACCTACGAAAATACAACTTGATTATCCTCAAAAAATCGTAAACATGATTGCAGCGTGGCAATTTGAAAAAGAACCGAAAGTCACAGTTCCTCCTGATGTGATAGACGATCCAGCTCTTATGATTCAATCAGGATATGAACCTAGTGAGGAGCAACAAGCAGAAAACAGTAGAGCGAAGGCGAAGGAACGGTTATTAACATGGGTTTGGGATGACAACCGAATGCATGAGAAGTTATTAGCAGCAGCGAAAGACCGTGCTATTTCAAAAACTGGTGTGTATGCCCGTCTTCACTACGATAAACGTCGTGGTGAATTTAAGATTATTTGGCATCCATCAACAGAAGTTATTGCAAAGTATAGCGACTGGGATATAGACCAACTGGAAGAGATTCATTTTATTGCATGGCTTGATGAAGAACAAACGAAAATGTGGAAATTATCGTATTACTTAGTTTGGCATGAAGAAGCTGGTGAGTACGACTGTGAAATTGAAGAGGCTGTATACAACGGTGACTTAGAAAAACAAGAGGATAGGGTTGAGCGCTCATCAATGGGCATCGATTTTATTCCCGTTGTACCAGTGCCGACTGAAAAGCTCAGTAAGCGAACTACAGGTTATAGTGAGCTTGAAAAAACGATTAAGCTTTCTGACGAAATCGACAAAAAAATGTCTGATTACTCGGATGCGCTACGTTTTGAAATGTTCGCCATTACGTTACTAACGAATGTAGACGAGGATCCAAAGAATCCACTTCAAGTTGCACCAGGTGCGAAATGGGATTTAGGTGATGGTGCGGAAGATGCAGGTGAACCAAGCGCTAAAAAGCTAGAAAGTGGATTCCGATTTAAAGAAACCATTGAAGCGTATCTGGACCGATTGCAAAAACGCCTACATGAAAAAGCAGAAGTACCAATGGTGAATACGGCTGATATGAATACAGGTGGTATAAATGACATGGCCGTACAGCTTTTATTTAGTAATATCATTTCTAAAACACAACGCTCATGGGTGATATGGCAGTCCCGTCTACAAACCTTAAATGAGTATATTTTACGTTATATGAAAGCTAGGAAGGATGACTCCAAATTCAAATACGATAAAGAAATGTTAGCAAAAGTAGATAACTATTATGCTAGTAAGATTATTTTCGGTTTACCGTTACCGCAAGATCAAAAAGCACTTATCGAACAGTTAGGCGATGAAATTTCAAACGAAATCGAATCAATTAAAGGTGCGATTACGAGAAGTGGTAAAGAAAATGCGGAACAAAAGTTCATGGAGATTATGCAAGAGCGGATGTTGAAAAGACAGTCTCAGGATCCGTATAACGAAAAGTAATACTTGCCTTACGAAATGGCGCTATAAACTTTCGGAAATTATAGCCGACAGGCTCAAAATGGAGGATTTGCTAATGGAATACGCAAAACAAGCTACAGCATTAAAGTATTTTGTAGAAAAAGTACAAAAAACACCTAAGTTCCCACTTCGGTTAGACCTTCAGTTTTTCTCTGATGGTAGTTCGGGTGATGATCCTGACAAAAAGCCTGTTGGTACTGATGACCCACCAAAAACTTTTACGCAAGAGGAGTTAGATGAAATCGTTAAGAAACGCTTAGAGCGCGAGCGTAACAAGTCAGCAGAACAATACGGCGACTACGATGACGTAAAAGCAAAGTTAGCAGAATACGAAAAAGCTGAAGAAGAGCGTAAAAAGCAAGAAATGACGGAAATTGAACGTTTGCAGGCTGAAAAAGAAGAAGCTGATAAAAAGGCATTAGAGGCTTCCGAAGCGGCGCAAAAAGCACAAGAAAAAGCCAATACTCGTATTTTAAACACTGAAATTAAGAGCGTTGCACGTGCTTTTGATGCGAATGATCCAGGTGACGTATTGGCGCTTTTAGATAAGTCGACCATTCAACTTGATGAGAATGGAAATTATCAAGGAGTTGAAGAGGCTGTTAATGCGCTAAAGGAAAGCAAACCTTGGATGTTCAAGAAAGTTGTGGGAGCTGATGCAGCTGGTGGGGCGAATCCAGGAACAAATCCGAGAGCAAATGAAATTCTTGCTTTAGAAAAAGAGCTAGAAGAGGCGAAAACAAAGGCGTTAAAAAATTCAAAGTATGCGGGCGAGGTAACTCGTATTTATAACAAGTTGTTAGAAGCAAAATCTAAGAAATAACGGATCGTTGATTAAAAGTCAGCGATTTTTTAATTTAAAAAATTTGAGGGGGCTACAAATATGCCAGTACCAACTACGTACGAATTTCAACAACAAGTAAGACAAATGCAAGCGAATGTGGATTTAATTCTTACGAAAGCACCTGTTCTTTTCGGATTAATTGGTGTAGGAGACGCTTTAACACAAACTAAATTTGAATGGCAGAACGACTATTTAAACTCTGATACAGGTATTGTAAAAACTGCCGCAGCTGTTGGGGATACGGACCTAGTTTTAGAAAAAGGCGAGGCTCGTAAATTCACTGAAAATGCTCTGGTACAAAACGGATTAGAAGTGTTACGTGTAGTAAGTGTCGATGAAAACGCGGATAAAATCACTGTGCAACGTGGTTACGATAGTACGAAAGCGGAGGCAATTACAGCTGGTGGTGAATTAAAAGTCATAGCAAGACCGAGACCAGAAGGTGAAGATGCTTTCCGTAAGAATGAGATCAATGACCGTTTGGTGTCACATAACTTCTCACAAATCTTTTCAAGATACGCATCTGTTTCACGTACACAACAACAAGTGAACACATACGGCGTATCAAACGAATTAGATTATCAAGTAAACTTGCGTTTACAAGAGATGATTCGTGAAGCTAACACTTCTCTAATCTATGGTCGTAGAAATGTTGGCTCTCCAACACAACCACGTACTACAGGTGGTTTATTTGCATTTGCGGGTATTGAAGGTTCACATAAGCAAGACTTTAAAGGGAACGAAATTGCGGCAAAACCTTTAAATGACGCTGTAGAACAAGTATTTACTCGAGGTGGTTCAGCAAATACGATTCTATGTGGACCAAATATCGCGCGACAAATTACAAAGCTTGGTGGGGATACAATTCGTACTACACGCCAAGATAC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51 | Bacillus_phage(76.0%) | portal,terminase,integrase,tail | attL 2406994:2407009|attR 2457256:2457271 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2617130 : 2678496
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP042929|2617130:2678496|DBSCAN-SWA 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MHKQKSNVETNEALERIKEVTEAANECVEAFEKLEKIMGRFTNKGELKDVKVSVVLDRKVFAESIAKHTADSIQGRVIKRSEINEIN |
64 | Bacillus_phage(63.16%) | portal,terminase,tRNA,tail,protease,capsid,head,holin,bacteriocin,integrase | attL 2611436:2611453|attR 2656003:2656020 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
3794310 : 3806042
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP042929|3794310:3806042|DBSCAN-SWA CATGGAAAAGTTAACGAAACGCCAGCAAGACATTCTCGACTTTATTAAGCTAAAAGTACAAGAAAAAGGATATCCACCTTCCGTACGTGAAATTGGTCAAGCAGTCGGCCTCGCTTCTAGTTCTACAGTGCACGGACATTTATCACGATTAGAAGAAAAAGGATACATTCGACGCGATCCAACAAAACCACGTGCAATTGAAATTTTAGGTGAAGACCGAATGGATACGGAAACACAATCTGTTATTCAAGTTCCAATTGTCGGAAAAGTCACTGCTGGTTTACCAATTACAGCGGTCGAAAGCGTAGAAGAACATTTCCCACTTCCAGCTAGTATTGTTGCTGGAGCAGACCAAGTGTTCATGTTACGTATTTCTGGAGATAGTATGATTGAAGCTGGTATTTTCGATGGAGATTTAGTTGTTGTTCGCCAACAGCAGTCTGCATATAATGGTGAAATTGTAGTCGCTTTAACAGAGGATAACGAAGCAACAGTTAAACGTTTCTATAAAGAAAAAGACCATTTCCGTCTACAACCAGAAAACTCTTCATTAGAACCTATCATTTTAAAACAAGTGTCAGTTATCGGGAAAGTAATTGGCGTATATCGTGATTTACATTAAAAATAAAAAAAAGAAGATAATTACCTTATTTATATACGGTAATTATCTTCTTTTTGTATTTTGATAGATTTCCATGCATTCTATTTCTTATTAACGAGTTTCAATCGTCACATCTCCCGCAGCCGTTTTACCGCTAATCTTTTTACTGCCATTTCCAATTGTTACATTTTTATTTTCTTCATTAAAAATTGTTACATCTCCAGCAGCACTTTGCCCAGTAATTACCGCATCTTGTGGTTTTTCCGATAAAGTAATATCTATATCTCCCGCAGTTGAACTTGCTTCTAGATTATACTTAGAATCATGATCTTGAATATTTATTTCCCCACTTGTTGTTTTTGCGGTCACTTTCCCTAATACCTTCTTAAAGTTCACCTCACCAGCTTTTGTCGATCCCTCCACATTCTTAGCCGTTACTTGTTTCAACTCTACTTCTCCAGCAAGTGTTCTAACACTTACGCTATCACTTTTCACATCACTCATTTCGATTTGTCCAGCAGATGAATTTACTTTTACATCTTGGTAAGAGCGTTCGGGCACAAGGAGAGTCAATTTAGACGTTTGAAACCTAAAATCGTAAAAAGAAAAATCAAATGAAGCACCTTTTTCTCTTTCCCCAATAATTTTTAATGTGTCACCATCTTCTGCGATACGAATCTCTTGTTTACGTACATCTCCCGATTGCTTTACATAAAAAGAAGAGTCAGGAGATTTTTGGACAATAATATCCCCGGCATCTAACTTAACTTCTATATTTTTTAATGTTTCGTTTTTAATTACATTTTCTTTATCGCCTTTTTCAGCAGTTTGTACTGCTTTTTCATATGTTTGGGAAATTCCTATTACTCCAATAATGATACAAGCGATAGCGATTAAAAATAGTTTTTTCATCATTTACTCTCCTTTTATCATTTTGAAGTTCCATATTACATATCGTACACACAATCTCTTAAACCACTTTGTACTATAAAAAGCGATAATACATAACAATAAACCTACCCCAACAAACGTTATACTAACGAAAAGATCCAACCATATAAAAGTACCCATAAATACTTTTCCAATAATGAAAAATGGTGTTACTACACTAGCAATACCACCGATCCAAAAAGAAAATATAAAAGCAATAATTGCGACTAACGGGCCTAACACAATAATAAAATTAAACAAACTAAGTCCAATCGCTGCCATAACAGCTCTTGTCACATTTGAAGTCGATGGATTTTTTTTCATTTCATCGAAGCGATACATCGCAAGTAATTCTTTCGCGATTACTTTCGGAGAACCAAGGCTCTGTATTATTTCCGATTCAGTTTTCCCCTCTTCTAGTCCAAACTGAAAGTGCTCTTCATAATCCAATAAAATATCTTGCCTCTCTTCCTCTGGTAACTTTCTAAGATAACTTGATAATTCTTTAAGAAACCCTTCTTTACTCATCCCATTCCACCCCTTCAATAATTTCTTGTACCCCTTTCGCAAAATCACGCCATTCTGTTACTAACAAATGAAATTGCGTCTCCCCTTGCTCTGTTAATTGATAATATTTACGAGGTGGCCCTTCCGTAGATTCCTTTAAATACGTTTGAAAATACCCTTCTTTCGTCAAACGACGTAATAAAGGGTATACTGACCCTTCCGATATTAAAAATTTATTAGAAATTTGCTGAACAAGTTCATAACCGTAACTATCTTTACGTTTTACAAGTGCTAATACACAAAGTTCAAGCACACCTTTTTTAAACTGAACGTTCAAGTGCCATCCTCCTTTCCTATCTTAGTACTGTTCAATACACGGTACCTGTTTTATCCATAATATACCACTTGGTATTATTTATTGCAAGGTACTGTATTTTTCATTTTTATATTTAGCACTATTCACACTCACAACATCAAACGTCGAGCAAAACATACAATACAATTATTCTATATATGTTCACAGCTACCACGCATATTAAACACTTGTTCAACCACCTCTTCCTGAACTGCAAAATGATTAAACCTTTTACATTAAATTAAAAATATACGGTACCACCTCAAATAATCTCTTTGATTTTTTCAGACATTTCACAAGCGCCTCTTTTGCCCGCGAAAAGAAAAGTCCGGATACCATAGTATCAAAGCTTTTCTTTTCGTATAGGGACATATACCGACCGCGTTCCCATCGGTGAACTTATGTATGGAATATATCCTCTGAATTTAACAAGTTTTAAATTGCGCTAAAAATCCAAAATAAGTGGGAGCAAGTTTAAAGGTGGTGGATCCAGTTTTACTTCTACAAAATTGGCCTTTAAAATGGATTATCGATATACAAAAAGCACCAAATAAACACTTAAAATAGAGGTATTTAAATACTAATGCATGCTAAAAATATTACTGAATTAAAAAACAAATAAATAATATTATTAACATCTTGGAAAGAATGATTGATGATATAAATAAACATTACAAAGCAGCTGTCGTTATATTAGAAACTAAAGAACTTTCTTTACTATCCAGACTAGATTTCAAGATTTTTGATAGCGTTTGAGCACATCTCGACTCTTGTAGTTATTATGATAATCCTATATTAGGTGAAATGTGTAAGGTAGAACAGTCTCTTCAGTCTATATTAAATAGAAATAAATAATATTAGACCATCCTCAAAATAGAATCGATATATAGGAGTACAAACTCATTGGTACATAGACAAATTGATTGAACTTTGAAAATAGAAAAATCAATTGATTTAGAACTCATAGAAATTACGAATATAATAAATAAAAAAAGACCACCTATTACAGGCGGTCTTTTTTTATTTCACATATATATAAATTTCATTTGCTGTTAAATAGTATGTTTTCCCTTTGCTGTTGTGTACTTTATATTGTGGAGATCCATTTACACTTACTTTAGCATCAATAGTGAATCCTAATCCTATATTTACAGTACCAGCAACATCTTTATCCTGCCAAGATAGGGATTCATAGAATCGTAGATTGTCCACTTTGGAAATAACCTTTTTACCAACTAATGTAAAAGCATCCATCCCCTTGTAACGGATATATGAGGAATCATAATAAATCCACTGATTACTTCCAATATCTAACCAATCTCCTACCTTCTTACCTACTTTATATGTCTCACCCTTTTGTAGTTTACGAATGACTTTGTTCTTAGTTGATGGTCCAGAACGCAAGTTTACATTGTATCCCTCAATATTTACAACACCATTCGCCTCCACTATGCTAGGTAAATCATTTGACTCTTGTGGTTTAGCATCAACCGCAACTGAATCACTGTTATAGACATTTAACACATCCGCTCGAAATTTAGCCTCAGATACACCATGACTACGAAGATAATCAAGAGGGTCCTCATGATCTGTTCCACCTAATTTATAGGTAACATCCTTATGTGTCCATAGGCCCTTAGAAGGATGAATATTTCGTTCTCGCAAGATTTCTCCAATTAACTTTACATATCGCTCATAAGAACGTTTGAATTTGGATGAATCACTTGTCTCACACAATTCAACATGAACAAATCTAGTATTTGCTGCTGGACCTGCCCCCCATGCACGATATTTAATAGATGCTATTTGAATCTTTTCTTCCCAATCAACTGCATAATGAACAAATGCCGAACGCCATGTACGAGACTCATATTTTTGAATATTAATTGCTGGCGCCTCAGGGGTAGCTGTAGAATGTGCCACAACACCTTCAAAAGCACCAACACCATAACGGAAAGGTTGCTTAGGCAATTCAGGAATAAGTAGCGTTCTATCAGCAAATGCATTGGTTTCAATTGTTACTATTAAAATCATAGTAACAAATATGGATAAAATATATTTGCATTTCTTTTTCATTGCTTATTGTCATCCTTTTTCATAATTTTCGTATGATCAAATAATCCACTTGCTGATAATCCGATAATTATTCCTTGAAATATATTCATTTTGGTATCTTGAGACAAAAATAAAACGCCTAACGTAATGCCAAGCGTCAAATTAAATACTGGGATATATTTTGTTTGCAGTCCAGTTGTTTTTGCAATTTGTGAAATTCCTACAACAACCCCAATCATTGCCGTAATTTCAATCATTACATACCTCCCCCTTTCAAAAAGAAGGTAAGAGCAACTCCAATTATTCCACCGATAATAAGGCGTAAGATCCAAGTTGTATTAGCACTGATTTTATCTAATTGCTTATTGATATTAATAATATCTTTTTCATTACCTGTCGTCCGCATTTCTAAACTTCTAATCTCTAATCGTATATCCTTAATATCTTGCCTTATTTCCTGAACATTACTTTGCACCTCTTGTAAACCATCCATATTTCCACCTCTTTCCCACTTCTTATTTAATTTAAAATTAAAAATCCTATATTACATAT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TCTCGCAAACCCTTCACCTCAGACTTTATCTCTTGTATCTGCTGAGTATGTCCTTCTAACGCAGCAAATGTTAACTTTAAAACCCCCATTGGGTCCTTTGGCACATTTTGTTGATTTTGTATATATTGCTTCATTCGTTTGAACTCTTTCATAAATTTAATTTTCATTCCAACCGCTTCTCTACTGGTATATCCCATAACAAGTAACGTGAATGCTTCTTCTGTTAAATCATATTTAGGGATTCGCCTATTCTTTGAATTAAAATAAGTGGACTCGTGAAAATTTTCTCCTCCAAACTCTTCACCTACATATACAATTTGTTTTCGAACTTCCTTCAAAACGTCGAAGTGATTTTTTTTGAATATCTTCGCAATTACCAAACTATCCGTTACTACTTTGCCATTAACTTCAAATACTAATGAACTATGTACTGATGAGTCAATTAATTGCCCCATCCTCATCTCCTCCTCACTACTAATTTTGGACTATCTTTATTGCATTGAGATAATTTCGCACTACGCATAATTCTTTACTTTCTTTTTACAAATTAACTAGTTATCAGAATTTAAATTAAATACTTTGATATGAACCCTCTTATTAAATCATCATTCAATAATTCGATTATAGGGTTACATTTTAAGTAAATTTCCTCCGATTTCAATTCGCTTCATTTTCTTCAAATTCAAAAAGATATTCCAAACTATGTTCTGGAAAAAAAGTTTTCTTAATTTCAAAAGCTTCATCATAATAAAAACGAAATTTACCATTTATTTTGTCGCTCACTGTTGCGTGGCGAAGTTTCAGATGCGAAGAAATTTGTATAATCATAATTCTTTTTCTCGCCATCTCTGCACGCAAATTCGGATACATTTACTCACCACCTGTTCTTTTGTACGATATTGCGTTCATTTCCATTTAAATATAAACTCAATTTCGTATTTAGTCAACAAAAAAACGTATTTAAATACTCAATTTCGTATGATTTTCTATTTACTAACAATTTTAGTTAGGTTATGATATATACAGAAATACGCAATATCGTATACATTTTAATAAGAAAGATGGTGAAAGTAATGAAAAAAGCAGAGGTTGTAACACGCTTAATAAAAGAAGCTGGCTATAGTAAAAGAGCCTTCGCCGAAAAAATAGGTCTCCCCCCCACAACACTGCAATCCATGTTATCAAGAGGGATTGGTAAAGCATCTGTTGATAATGTCATAAAAGTTTGTAAGGGATTAGGAATCACTACTGATGATTTAGAAAGACTCGCAACTCAAGAGGACAATACTGTTAAAGAAGAAGTTTCTATTTATGAAACCATCCAAAACGATCAATCAAACATTATTTACATTCCTATCATTGGTTCTGTAGCAGCCGGTACACCCATACTCGCTGAAGAAAATATCGAAGGCTATTTACCCATGCTAAGTACATTTTTAAACAAGCGTAAAAAGTATTTTTATCTTACTGTAAAAGGCACTAGCATGAATCTCGAATTCCCTGATGGTTCTTATGTTTTAGTAGAGGAAACTCCTTATGTTGAAAACGGACAAATTGCTGTTGTAAAAGTCAATGGTTATGATGCTACCGTGAAAAAGATTTCAAAATCCGGAAGCATCATTACTTTAATACCATTGAGTAATGACCCTATCCACGAACCAAAAACTTACGACCTTTCAGCTGAAGATGTAAAAATAATTGGTCGCGTTGTACAGGCAGTAAAGAATTATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP042929|3794310:3806042|3799327_3799534_-|WP_002026207.1|DBSCAN-SWA MKNTKGEIDKTVTKMQQTNEEFNKSIEILTKKSEITNELNTVKIPTKVDGAGSIEGHIDETDKKEGTQ >NZ_CP042929|3794310:3806042|3801053_3802031_-|WP_025921790.1|DBSCAN-SWA MSLLAASVKTKNLPQQVLRWQSMVESECSAQGVPELVPYVLGIIMVESGGNSETTPDIMQSSESQGWAMNTIKNPKDSIYYGVKHLKGAFDDAKKNGITDLSAIVQSYNFGRAYLRWLASNNKQHSLPVADLYSKTVVAPSLGNTTGAMVKYSNPIAVAYNGGYRYKNGGNFFYSEIVKQYVDFDGGTGGGVPQPEGIGFAKSKYPEGFGVNYHDKPHGSFQGRFTTAAEVLYWGAYWGADGDVWLDLGRSRWVKAEHYNYWPFKAVSKYPEGWGVNYYDGIDGPYKGRISSKAPVMIYARKEGWIDVGRNSWAPEEHFDILDIR >NZ_CP042929|3794310:3806042|3803799_3803994_-|WP_001189065.1|DBSCAN-SWA MQRKILVITSSLAGLPTVSEFKTKEDAKEQVRKLIQKGMSQNVIRITQEIPMNIEIQVDVELEE >NZ_CP042929|3794310:3806042|3802269_3802656_-|WP_000464425.1|DBSCAN-SWA MFEWLKDYKKLEEEIAYLEYNLDKSKAELKRWISGDLQNVRLTAESEGAKVEGRIEAIEYELAHKMNEEYDLKLLINKFTGLDHQILKMKYVDGMTLEQIAFELHYSTGYIRRKHAEIRKIVKFLDGF >NZ_CP042929|3794310:3806042|3795021_3795825_-|WP_000976237.1|DBSCAN-SWA MMKKLFLIAIACIIIGVIGISQTYEKAVQTAEKGDKENVIKNETLKNIEVKLDAGDIIVQKSPDSSFYVKQSGDVRKQEIRIAEDGDTLKIIGEREKGASFDFSFYDFRFQTSKLTLLVPERSYQDVKVNSSAGQIEMSDVKSDSVSVRTLAGEVELKQVTAKNVEGSTKAGEVNFKKVLGKVTAKTTSGEINIQDHDSKYNLEASSTAGDIDITLSEKPQDAVITGQSAAGDVTIFNEENKNVTIGNGSKKISGKTAAGDVTIETR >NZ_CP042929|3794310:3806042|3796360_3796684_-|WP_001102628.1|DBSCAN-SWA MNVQFKKGVLELCVLALVKRKDSYGYELVQQISNKFLISEGSVYPLLRRLTKEGYFQTYLKESTEGPPRKYYQLTEQGETQFHLLVTEWRDFAKGVQEIIEGVEWDE >NZ_CP042929|3794310:3806042|3805370_3806042_+|WP_000241483.1|DBSCAN-SWA MVKVMKKAEVVTRLIKEAGYSKRAFAEKIGLPPTTLQSMLSRGIGKASVDNVIKVCKGLGITTDDLERLATQEDNTVKEEVSIYETIQNDQSNIIYIPIIGSVAAGTPILAEENIEGYLPMLSTFLNKRKKYFYLTVKGTSMNLEFPDGSYVLVEETPYVENGQIAVVKVNGYDATVKKISKSGSIITLIPLSNDPIHEPKTYDLSAEDVKIIGRVVQAVKNY >NZ_CP042929|3794310:3806042|3799013_3799250_-|WP_000348875.1|DBSCAN-SWA MDGLQEVQSNVQEIRQDIKDIRLEIRSLEMRTTGNEKDIININKQLDKISANTTWILRLIIGGIIGVALTFFLKGGGM >NZ_CP042929|3794310:3806042|3797722_3798778_-|WP_088054108.1|DBSCAN-SWA MKKKCKYILSIFVTMILIVTIETNAFADRTLLIPELPKQPFRYGVGAFEGVVAHSTATPEAPAINIQKYESRTWRSAFVHYAVDWEEKIQIASIKYRAWGAGPAANTRFVHVELCETSDSSKFKRSYERYVKLIGEILRERNIHPSKGLWTHKDVTYKLGGTDHEDPLDYLRSHGVSEAKFRADVLNVYNSDSVAVDAKPQESNDLPSIVEANGVVNIEGYNVNLRSGPSTKNKVIRKLQKGETYKVGKKVGDWLDIGSNQWIYYDSSYIRYKGMDAFTLVGKKVISKVDNLRFYESLSWQDKDVAGTVNIGLGFTIDAKVSVNGSPQYKVHNSKGKTYYLTANEIYIYVK >NZ_CP042929|3794310:3806042|3804966_3805179_-|WP_059303515.1|DBSCAN-SWA MYPNLRAEMARKRIMIIQISSHLKLRHATVSDKINGKFRFYYDEAFEIKKTFFPEHSLEYLFEFEENEAN >NZ_CP042929|3794310:3806042|3798774_3799014_-|WP_000570187.1|holin|DBSCAN-SWA MIEITAMIGVVVGISQIAKTTGLQTKYIPVFNLTLGITLGVLFLSQDTKMNIFQGIIIGLSASGLFDHTKIMKKDDNKQ >NZ_CP042929|3794310:3806042|3795825_3796368_-|WP_000031387.1|DBSCAN-SWA MSKEGFLKELSSYLRKLPEEERQDILLDYEEHFQFGLEEGKTESEIIQSLGSPKVIAKELLAMYRFDEMKKNPSTSNVTRAVMAAIGLSLFNFIIVLGPLVAIIAFIFSFWIGGIASVVTPFFIIGKVFMGTFIWLDLFVSITFVGVGLLLCIIAFYSTKWFKRLCVRYVIWNFKMIKGE >NZ_CP042929|3794310:3806042|3794310_3794931_+|WP_000413738.1|DBSCAN-SWA MEKLTKRQQDILDFIKLKVQEKGYPPSVREIGQAVGLASSSTVHGHLSRLEEKGYIRRDPTKPRAIEILGEDRMDTETQSVIQVPIVGKVTAGLPITAVESVEEHFPLPASIVAGADQVFMLRISGDSMIEAGIFDGDLVVVRQQQSAYNGEIVVALTEDNEATVKRFYKEKDHFRLQPENSSLEPIILKQVSVIGKVIGVYRDLH >NZ_CP042929|3794310:3806042|3802774_3803647_-|WP_000511414.1|DBSCAN-SWA MGIIRVKKDSNYSVINNTGLKDERLSWKAKGILAYALTLPDDWTFHISELARHAKDGEDSLRTGFKELKELGYVKRYPVRDGNTKKIARWDTEIYETPQRDMPQMENQDVVKPYEENQKLLNTNRLNTNKRNNNDYDDMDKLESRVFINERVKVSCNFIKGMGIPLSEIAIAELGSFCNLFSGELIQHAINKAVDENAPRWNYIKAILRNWKEQEVKTLVDVAILDRRFEMSKKKKYNGTGRKYSNRKEIVPDWLYKDDESTNLEEERKTVQSTDEERERLQEVLNKYRS >NZ_CP042929|3794310:3806042|3799882_3800704_-|WP_001051360.1|DBSCAN-SWA MAKFIYPTDTTRVTSGFRGDRPDHHGVDLAESGYHPIYAAASGQVSRSYLSSSYGECIMIVHTIDGVTWETVYAHMRSGSRTVKEGDYVIQGQTIGVMGETGQASGQHLHFELHKGRWNVSKSDAVNPLDYLGKGGGNGVPQPEGIGFAKSKYPEGFGVNYHDKPHGSFQGRFTTAAEVLYWGAYWGADGDVWLDLGRSRWVKAEHYNYWPFKAVSKYPEGWGVNYYDGIDGPYKGRISSKAPIMIYARKEGWIDVGRNSWAPEEHFDILDIR >NZ_CP042929|3794310:3806042|3804005_3804764_-|WP_000531225.1|DBSCAN-SWA MGQLIDSSVHSSLVFEVNGKVVTDSLVIAKIFKKNHFDVLKEVRKQIVYVGEEFGGENFHESTYFNSKNRRIPKYDLTEEAFTLLVMGYTSREAVGMKIKFMKEFKRMKQYIQNQQNVPKDPMGVLKLTFAALEGHTQQIQEIKSEVKGLRENTPLYAIECEEITRAVKSLGVMLLGGKNSNSYQDIGLRRKLYRDIYSQLHREFGVNSYKAIKRYHLDRAIQMINEEYSIPTVLNEEITVKNSQINMADIQ |
16 | Bacillus_phage(50.0%) | holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
4499852 : 4567857
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP042929|4499852:4567857|DBSCAN-SWA 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59 | Staphylococcus_phage(15.38%) | tRNA,transposase,protease,coat,integrase | attL 4495291:4495308|attR 4549834:4549851 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
4617029 : 4624716
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP042929|4617029:4624716|DBSCAN-SWA ATTAAGCATGAATACCTTCTCCATCCATTACATTTAAGAAATATTCCTCTAAAGAACTATGTTTCTTATTAATACTTTCAATTTCCACATCGTTCATAATAAGTGCTTTTGAAATGGCTTGCTGTGTCACCGCCACTTCATAAACCCGAATCATGTTTCCACTCATTATTTTGTAGTTTTTTATACCAAGTTTATCTTCTAAAATATAAGCTGCACGCTTCACATCAGGAACAGTAATTTCAATGTACTCTGTTTGTTTTCCGTTAATACTCTTCATTGAAACTTCTTTTATTAGTTTTCCATTTTGAATGACACCAATTGTATCCGCCATTAATTCCATCTCACCTAAAATATGGCTAGAAACTAATAATGTAATGCCATATTCTTTGCAGAGCATTTTAAATAAGTCTCTTAATTCTTTAATACCAATTGGATCTAAACCGTTAATTGGTTCATCTAAAATGAGTAATTCTGGCTTTGTTACGATTGCCCTTGCAATACCGAGTCGTTGTTTCATTCCTAATGAAAAATCTTTTACTTTTTTATTATCTATACCTTGCAGCTTCACTAAATGTAAAGCATGGTCAATTTCATTTCTATCGTAATAGCCCATATATTCACAATGTAATTCTAAGTTTTCTTTCGCCGTTAATTTATCATAAAAGATTGGGTATTCAATAATTGTCCCCATTCTCTTTAATACTTCATAAGATGTATCTGTTAACTTCTCACCGAAAATTTCAATCTCACCGCTCGTCGGTTTTATTAAATTTGTAATCATTTTCATAATCGTTGTTTTACCAGCACCGTTTGGTCCTAAGAAACCGTAAATTTCTCCTTTTTTCACATGCATGTTAACACCGGAAATAACTTCTTTCCCTTTAAACACTTTCGTTAACTGATTTGTTTTTAATATATATGTCATGTTACTTTCCCCTTTCGCAATACTCTATATTTCTATAATAGACAACGGAAATCTCTTTTTTCTTACCCGTTTCTTACAAATTCCTTACGCTGAAAAAAAAGCTTGTAGAATCTACTTCTCTACAAGCTAAAACTGCATCTTTTTTAATGCAACTGTAAAAATTGTTTTTTCATACGGCTTACTAGAAAGATGAATTTTTCCATCCATCGCTTCCACAAGCCTTTTCGTAATCGTTAACCCTAAACCGCTCCCTTGGTACAATCTATTTCTTGAATCTTCAAGTGTGTACATACGCTCGAACACTTTATCAATATGCGATTCATCAATTCCTTTTCCTGTATCCCATACGTCTATATACACATTCGTTTCATCATCTCTTAACGTCATACCAAGTGTCTTTCCATCGTCTCCATATGTAATCGCATTTGATATTAAATTGTTCAATACCCTGCCTAATACTTCTACATTTCCAAGTGCATATATATTTCTTTCCGGTATATCAATATGAACATGAAAACCTTTCGATGTTACTAAATCATAAAAAGATAAAATCTTCTCACGACAAACCTCATTCATATTTACTTTTGTCATCTCGATTGCCTTGTCACCAGATTCTAGTTTTGCTAAATCAAAAAACTTATGAATCAGTTCCATTACTTCTAGTGTTTTCACATGCACCTTTTCAAGTAATATTTGCTGTTCTTCTTTATTCATCGTTTTGTCCTTATTTAACATTTCTGTATATCCAAGAATAACTGTTAGTGGCGTCTTTAAATCATGTGAAATATTTGAAAGCATTTTTCTCATCGAAATTTCTACTTTTGCATGATCTGCATTCGTTTTCTGTTTTGCATCTAATAATTGATTAATTGCCACTAATAATTTTTGCAATTCTAGATCATCTGTCATAACGAGTAACTTCTCGCCCGTTTGTACATTTACAATATTTTCTAACTTTTCATATGTGTATCGTAAATTTTTACTACTATTTTTTCTCATTTTATATTGTATGTAAATGACACATAACAATATAAAAATAATACTTATTAACAAATTGACCATATTACATCACTTCCAACTTATAGCCGATACCCCATAACGTTTTAATATATTCTGGATTAGATGGATCACTTTCGATTTTCTCACGCAACCTTCTCATATGAACATTAATAACGTTATCGTCACCGTAATACTCTTCGTTCCAAATTAGTGTATATATTTGTGCTTTTGTAAATACACGATTTTGATTCTTTACAAACAATTTTAGAATCTCAAATTCTTTTAAAGTAAGTTTGAGAGGCTTCCCGTTTTTTTCTACAGTAAAATTAATTGGATCAATCGTTAAATCACCAATTTGAATCATCTTTTCTGTTGTTTCTGTAGCCGAATATTTCGTAGATCTTCGAATACCTGCCTTTACACGTGCAGCTAATTCAATCATAGAAAATGGCTTACAAATGTAATCATCTGCTCCAAGTCCTAATCCAACAGCTTTATCAACATCTGTATCTTTTGCCGACATCATTAAAATCGGAACAGCACTTTTTTCTCGAATGATTCGTACAACCTCTAAGCCATCTAGCTTCGGCATCATAATGTCGAGGATAATCAAATCAAATGAACCTTTTAAATATGTGTTCACGCCTTCTTCTCCATCAGACGCAATTGTTACTTGAAAGCCCTCTTTTATCAAATACTTTTCCACCATCTCTTGAATTGAGAGATCATCTTCAACTAATAAAATATGATGTGACATATGTCTATCCCCTTTTTACAAACGTTAACAACTCAATTGTATCGTAACTACTACAGACTGGAAACAAATATATGAATTTTCAAACCAACTTCCCTTCCTTCCTTAACAATGATATGATGAAATTCACTATGATTGTTCATAATTAACTTTATATAAAGGAGACTTATCATGTCAGAAAACAAAAAAGTAAGCTTAGCTGATTTAATGCGTGAACAACTTGCTAAGAAAAAGCAAGGAAATGGAAATGGTCAAAATGCAAAAAATCAAAGCCAAGAAACAAAAAAACTACAAAATCAACAAACGAAAAAGACAAACAACCAACGTAGACGTACAGGTGTGTAAATGAACGGACAAAAACGTTCTAATATCGCACCCGGTCTTGAAGTTGATATTGTATTAAAACAAGATCAACGAACAGGTAAATTAACACGTGGCATTGTAAAAGATATTTTAACAAACTCCCCTTCCCATCCGCATGGCATTAAAGTGCGATTGCAGGACGGACAAGTCGGTAGAGTACAAAATATCGTTCAATAAGAAAAGGAGCTCAAGTAAACTCGAGCTCCTTTTCTTTATTAACCTTTAATTTTCTCGATGAAAACTACTTTTAAATAGTCTCCTTCTTTAAATTGATCAATGGTACGGAAATCTTCTGGTAAAGAATGTTCTTCTAATATTTTATATTTGCCATTCATTTCTTTAAAGGCTGTATCGATAAAGCCTTTAAACTTTTTCATATCGAATGCGCTACAATTTGTAGAAGCAACGATAATTCCGTTATTTTCTGTAATGGCAATTGTTTCTTTTAATAAGTTTTTATAATCTTTCGCTGCACTAAATGTATATTTTTTTGATCGGGCGAAGCTTGGAGGATCAAGTACGACCATATCAAATTTCATCTTTTTCTTAGCTGCATATTTGAAGTAAAGAAATACATCTTCTACAATAATATCTTGTGCTTCATAATCAACTTCATTTACACTAAACTGCTCAATCGTTTTACTTAAACTACGATTTGCAAGGTCGACACTCGTCGTTTTGCTTGCTCCGCCAAGCGCTGCAAATACAGAAAAAGCACCTGTATAAGAGAACATATTTAACACGGTTCTTCCCTTCGCATATTTATCACGAATTTGTTTTCTCACGTTACGCTGATCTAAAAAGACACCAACCATCGCTCCGTCATTTAAATAAACAGCGAAGTTCACACCGTTCTCTTTTACGATAAGCGGGAACTCACCGCGTTCTCCTGCTACGAAATCATCACCTTCAATGTATTTCCCTTTCGTATCAAAACGCTTCTTCTCATAAATCCCTTTAAAGTTTGCTACTTTTTGAAGAGCTGCTATAATCTCATCTCTGAAAGTATAAATCCCTTCACTATACCAACTTACTACGTAGTAGCCATCATAATAATCGATAATTAGTCCTCCAAGACCATCACCTTCACCATTCACCACACGGAATGCTGTCGTATCACTTGATTTATAAAATTGCTTTCGTTTATGTAGGGCAGATTTGATTTTACTTTCAAAGAAAGATTGATTAATTGGTTCACTCTCTTTTCTCGTTAAAATCCAGCCGTATCCTTTATTTTGCTTTCCATAATAACCTTTTCCGACAAAGTTGTTCTTCTCATCTACTACTTTGATGATTGTTCCTTCTTCACGAACATCATTTAAATTTTGAATCGCATCTTTTAAAATAAGCGGATATCCACTTTTAATTTCTTTTATAAATTTCGGTTTTATTTTTACAGTTACTTCTAATCGCATATAATAACTTCCTTTCCATTTGCATGCTTTCTCTACAGGAAGCATTTGAAAAACGAGACTGAAAAAACAGCCTCGTTTCACTATACCATATTATTGCTTTGCTAGTACAACTAGCTCATTCTCGCACTTAACCGCCACATATTTACTACGTTTTGAAATGAAAATCTCACTGTCCAAAATAATAGAAAAAAACTTATATATTTCACATTTACCATTGACAATGATAATGATTTTCATTATCATTTGATGTATATGAGTTCTTGAAAATATAGCTACATTTATAGGAGGAATAAACATGATTATTGTTACAAATACAGCTAAAATTACAAAGGGAAATGGGCATAAATTAATTGAGCGTTTTAATAAAGTAGGTAAAGTTGAAACGATGCCAGGCTTTTTAGGTCTAGAAGTTCTTTTAACACAAAATACAGTTGATTATGATGAAGTAACAATTAGCACTCGCTGGAATGCAAAAGAAGATTTCCAAGGTTGGACAAAGAGCGCTGCATTTAAAGATGCTCACTCACATCAAGGCGGAATGCCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP042929|4617029:4624716|4617029_4617953_-|WP_000221071.1|DBSCAN-SWA MTYILKTNQLTKVFKGKEVISGVNMHVKKGEIYGFLGPNGAGKTTIMKMITNLIKPTSGEIEIFGEKLTDTSYEVLKRMGTIIEYPIFYDKLTAKENLELHCEYMGYYDRNEIDHALHLVKLQGIDNKKVKDFSLGMKQRLGIARAIVTKPELLILDEPINGLDPIGIKELRDLFKMLCKEYGITLLVSSHILGEMELMADTIGVIQNGKLIKEVSMKSINGKQTEYIEITVPDVKRAAYILEDKLGIKNYKIMSGNMIRVYEVAVTQQAISKALIMNDVEIESINKKHSSLEEYFLNVMDGEGIHA >NZ_CP042929|4617029:4624716|4620284_4621484_-|WP_088053820.1|DBSCAN-SWA MRLEVTVKIKPKFIKEIKSGYPLILKDAIQNLNDVREEGTIIKVVDEKNNFVGKGYYGKQNKGYGWILTRKESEPINQSFFESKIKSALHKRKQFYKSSDTTAFRVVNGEGDGLGGLIIDYYDGYYVVSWYSEGIYTFRDEIIAALQKVANFKGIYEKKRFDTKGKYIEGDDFVAGERGEFPLIVKENGVNFAVYLNDGAMVGVFLDQRNVRKQIRDKYAKGRTVLNMFSYTGAFSVFAALGGASKTTSVDLANRSLSKTIEQFSVNEVDYEAQDIIVEDVFLYFKYAAKKKMKFDMVVLDPPSFARSKKYTFSAAKDYKNLLKETIAITENNGIIVASTNCSAFDMKKFKGFIDTAFKEMNGKYKILEEHSLPEDFRTIDQFKEGDYLKVVFIEKIKG >NZ_CP042929|4617029:4624716|4622175_4622940_-|WP_001086126.1|DBSCAN-SWA MNSKKGRKKNSFFQRILTIVFLGIFFYSMYELGGIFMDYYENRKVMAEAQHIYKRSPMEEKSENGEVRKQFQDLQKINPEIVGWITMDDTQINYPIVQAKDNDYYLFRNYKGEDMRAGSIFMDHRNDVKSQNRNTILYGHRMKDGSMFGSLKKMLDEDFFMSHRKLYYDTLFEGYDVEVFSVYTTTTDFYYIETDFGNDAAYASFLKEIQEKSLYKTDTELTANDEIVTLSTCDYALDPEAGRLVVHAKLVKRN >NZ_CP042929|4617029:4624716|4619016_4619709_-|WP_000018056.1|DBSCAN-SWA MSHHILLVEDDLSIQEMVEKYLIKEGFQVTIASDGEEGVNTYLKGSFDLIILDIMMPKLDGLEVVRIIREKSAVPILMMSAKDTDVDKAVGLGLGADDYICKPFSMIELAARVKAGIRRSTKYSATETTEKMIQIGDLTIDPINFTVEKNGKPLKLTLKEFEILKLFVKNQNRVFTKAQIYTLIWNEEYYGDDNVINVHMRRLREKIESDPSNPEYIKTLWGIGYKLEVM >NZ_CP042929|4617029:4624716|4618079_4619015_-|WP_016125943.1|DBSCAN-SWA MVNLLISIIFILLCVIYIQYKMRKNSSKNLRYTYEKLENIVNVQTGEKLLVMTDDLELQKLLVAINQLLDAKQKTNADHAKVEISMRKMLSNISHDLKTPLTVILGYTEMLNKDKTMNKEEQQILLEKVHVKTLEVMELIHKFFDLAKLESGDKAIEMTKVNMNEVCREKILSFYDLVTSKGFHVHIDIPERNIYALGNVEVLGRVLNNLISNAITYGDDGKTLGMTLRDDETNVYIDVWDTGKGIDESHIDKVFERMYTLEDSRNRLYQGSGLGLTITKRLVEAMDGKIHLSSKPYEKTIFTVALKKMQF >NZ_CP042929|4617029:4624716|4620051_4620246_+|WP_001014310.1|DBSCAN-SWA MNGQKRSNIAPGLEVDIVLKQDQRTGKLTRGIVKDILTNSPSHPHGIKVRLQDGQVGRVQNIVQ >NZ_CP042929|4617029:4624716|4622972_4623743_-|WP_000403758.1|DBSCAN-SWA MEIKNVTFSYDNVTNRLKSVSSEIEIGKITTIIGPNGCGKSTLLSVMSRNHAPSSGEVILDGKAIGEYKPKEFARKLAVVHQQNEAPADITVEKLISFGRMPYKNIFSPQTDEDREAIERALVCTNLQSKRDKPIYALSGGERQRVWIAMTLAQNTPMLFLDEPTTYLDIYYQLEILELVKELNEVHGLTIVMVLHDINQAIRYSDHIIVMKDGEIITKGIPNDVITEEMVKAIYGVDVIVKQDEDTGLYMVPMGI >NZ_CP042929|4617029:4624716|4623732_4624716_-|WP_088053822.1|DBSCAN-SWA MNKKTWSFLIVTVLLIVMTSLSAMKGSLEVGIVELVQGIFTGGNEDVEVIKDLRFPRIIIALFTGAALAVSGVLFQAVMKNPLADAGVIGISSGASFMTLVIITLFPQFFFWTPVFAFLGGALACYLVYSFSWKSGLSPLRIILIGIAINAMFTGLNESFVTICGYFIKSIKQTTTSNITMKTWGDVEIMVTYGTIGLILALFVGAWCNLLSLQDKTAKNLGLHVTRVRLIISAIAVLLAAVSTAIAGVIAFVGLLVPHISRQLVGSDHKVLIPFSALAGALLILTADTIGRLIVPPNEIPAATIMAVIGGPFLIFLLRKSDKVHGN >NZ_CP042929|4617029:4624716|4621779_4622103_+|WP_000587818.1|DBSCAN-SWA MIIVTNTAKITKGNGHKLIERFNKVGKVETMPGFLGLEVLLTQNTVDYDEVTISTRWNAKEDFQGWTKSAAFKDAHSHQGGMPEYILDNKIAYYDVKVVRMPMAAAQ |
9 | Staphylococcus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
5009090 : 5050332
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP042929|5009090:5050332|DBSCAN-SWA TTTAAGATAACCAATCTAATTTTCTAATCCCAAGCTTATCTACTGGTAAACGAAGTGAGCCATAAAAGTGCTTCATAAATTGCTCTGAGCGGTTTACATCGTGTAAAATGGCTTCTAAGCGATCTCTATATATGCTTTTTTGTTCTTCGTTTCCAGTTTGGTAATATCGTTCGACCGTTTCAAAATAGTGAAGCGGGAACAGGAGCCTTGCAAATAATAAGCGCCAACCAAATGAGGACAGCGAGTAATTTCGTTCATAATCTGTAACAAATTGAACGATTGTTTGATCCCAGTCTTTCTTTTTTTCAATCATCATATAGCGAATCCATTCTGCTATATCTCGAGTTGGGTGATCATACACCCAATCAAAAGGAAGTTTGAGACGCTTCGTTTGATGCCATAATAAAGGTGTGAATCGTTCTTGGCAAATTGTCGCTGCATCCGTTAGTTGCGGCGTATCATCCATTTCTGTATCAACAACATATTGAATGGCATTTTCTGCAACTCCTAAGTAATACGGGAAGGATTCAATAAACAATTGATCGAATACGTCTGTAGGGTGGTTCATCACTTGTGATTGCCAAAACTTTTCTAGCTGATCGAGTCTCTTTTCCCATAACGCTTTCCATTCACCAATGCGGCTTAATTGCTCGATTTCTTCTGGAAAGAATGCACCTCGTTTATGGAATATAGAAAGTTCACTTCCTAATGACGTAGCATGTCGTTCTAACGCTCGCATACCTTTTAATAAGCAGTAATTTTGTTCTTCTATCTCACTTACATAGTAGCCGTGTATAGTTGGAACGAAAGTCGCTACAGTTATATCCCCTTGCTGGTTCATATAGTCACTGAGCTTTTTCATCTCTACAAGTACTTCTTCCTCCATTTCTCCAATTGGAACAAGTACATAAATTTTGTTGCGAATCCAAAAGCTTTTATAGGGGCCAAGGGGGATTAATTCTTTAACATGCATGTGATAATGCTCATAAATATGCTGAATCATCGCAGTCGCCACCTATGGTTTTTCTTTATATATATGAGCTTGTGCTCGCCTTTCATTCCTATGCACATGATAAAGCAACGAAACGTATACAAATACTAAAAAGAAAAAAAGGTGATAAACATGAAAGAATCAAATCAACTACAAGAAAGAGCATTACAACTATTACAAGAACGTGGTGTAACAATTGACGATATTGCTGAACTTGTTCATTTTCTTCAAAAAAAATATCATCCAAATTTAGAGATGTCAGAATGCCGTTACAATGTAGAACGTGTACTATCAAAACGTGAAGTACAAAACGCACTGATTACTGGTATCGAGCTTGATGTCCTTGCTGAAAAGGGAATGCTAAGTGAACCGTTACAAGATATTGTAAAACGTGATGAAGGCTTATACGGAATTGATGAAGTTATCGCACTTTCTATCGTAAACGTGTACGGCTCTATCGGTTTCACGAACTTTGGATATATTGATAAATTAAAACCTGGTATTTTAGAATACTTAAATGATAAATCAACTGGAAAGGTGCATACATTCCTTGATGATATCGTTGGCGGAATCGCTGCCGCTGCTTCAAGCCGTTTAGCGCACCGAGCTGAGCACTCAGAATAATAATGTTTTCTAGGCCGTCAGTTTCATGCTGACGGCCTTTCGTATTCCATAAGCATAAATTCTCTTCCGCGGCTCAAAAAAATAATCCCTTGTTTAAATCCGATATTTTTATATAACGTAATCGCTCTTGTATTAAATGTTGCTACGCTTAATCGAAACATTTTTGCATTAAACTCTTTCGTGGCAAACGCTATTCCAGCTTGGAAGAATTCTTTCCCTATTCCCTTCCCAGTTAACGCCGGCTTCATGCCAAGTCCGATATCAATCACATCTTCTCCACCATATAAATTAGCATCTCTTCCACCTGGCACTTGTGCATTTGCTCCAAAACAAAAATAACCGATGAGGTCTCCTTGATCGTCACAACAGCCATAATACGTTCCATCTAATAGCTCTTCTATTACTTCTTTCTCGCCTGAAAAACTATATAAACTATAAGGTTCCTCGTACGTCCAAGTATTTATCTCATTTGCTTCTTCCTCTGTTAACTTATGTATATCCACTTTCTCTTTCCCCCTATTATATTTCTATTAACAATATTCGATATTCATCTTATAATTCATCTTTCTCAATATATTTTTTAATTTCTCGCTTTATTTTTATGGAAGATTTTTCTTATTATGTTACGATTAAACAGAATCATTACAAATAAGGTGGTGACAATTTGAATTACTTTTCTTATCTCTCCTCGGAAGAACGGCAAAATTTTTTCTATAAAGAACCTCTTAGTTTTTCAAAAAATATAGGGAAAGAACAACTAGCTTACGCACTAGGTGCCACACTATATACTCCCGGCACGAAAGAAACGATTGCGGAAGATATAATTAGAAAGAAACATGTGGATGCTACCTCAATTATTCTTTGTCTAGAGGACGCTATCAGCGATGAGGAAGTAAAACTTGCAGAGCAAAACATCGTCGTTCAAATACAGCAAATCGCTAACTTAGTCAGTGCCAATATACTAAACCAAGCAGACATCCCACTTCTTTTTATTAGAGTTCGACAGCCAAGTCAAATGAAGACAATTGTTACTGAATTAGGTAGTGCTGTTCATTGTTTATGTGGTTTTGTCTTTCCAAAATTCACACCGATTAACGGAAAGACTTATATCGATCAGCTTGCATATATAAACGAGTTATACTCATTATCGCTATATGGCATGCCGATTTTAGAATCACCCGAAATTATATATAAGGAAACACGGGCAGAATCATTATTACAAATAAAGGATTTACTAGATTCTTATCACGATTACATCTTAAATGTACGTATTGGTGCTACTGATTTTTCAAGTATATTTAGTATTCGGCGCAATAAATACACACCTATCTATCATATTACTGTTGTCCGTGATTGTATTTCAGACATTATTAACGTTTTCTCAAGGGCAACAAATGAATATATTATTTCAGGATGTGTATGGGAATATTTTTCTAATGATCATGAAGAAGGGCTTATTCAAGAGGTATCACTTGACCATGCAAATGGCTTAATCGGAAAGACAGTTATTCACCCATCTCATATTAAAGTTGTACAGGCAATGCACATTGTCACAATGGAAGATTATTTAGATGCGAGATCAATTTTACAAAATGCAGATACGTATAATGGAGTGCTAAAAAGCAGTTTTTCTAACAAAATGAATGAAGTAAAACCTCATTATAGCTGGGCTCGCAAAACCATTTTAAAATCTAATATTTACGGGGTGCTACATGAAAACAAACAATTCACCGATCTCCTTATTACAAACGCAAAGCAACACGTATAACGTTTTAAATAATATACAAGTCCATGTAGAAGTACGTGATAATCCATATAATTTAGCGCTAGACAATCTTTTTCAAATGGCTGCGAGAATAAATAAGAAACGTAGTTTTTTATTTGTGAGTACAATCCTTGGAAAGCATCTTCCTATTAAACCTGCAGTCTCTCTATCAAGTGGAGTTGCTCTCGCTGCAAGATATTTGGAAATACTACATAATATTTCTCATCCATTTCAAAAAGAAATTTTAAATCTCATTTCATTAGAAATTGATGAAATCCCAGAGGAAGTATTTCGTTATCAATATCCTCTGCAAGAAGAAGTTTTGTTCATCGGATTCGCTGAAACAGCGACAGCACTTGGTCATTCTATGTTTCAATGCTTTCAAAATGCAAAGTATGTGCATACAACTAGGGAATCGATACCCTACCTAGAATCTGTCATTACATTTGAGGAAGAACATTCTCATGCAACATCGCACCGTTGTTATGTAGATGAAAGCTTTTTTCAAAACAACAACCCGATTGTTCTCGTAGATGATGAGATAACAACAGGAAAAACAGCATTAAATATTATTAGATCTATTCAAAATAAATTCCCACGAGAAGAATATATAATTGCTTCTTTATTAGACTGGCGTTCTCATACTAATAGAAAACAATTTAAACAATTAGAAGAAGAACTTCAAATTAAGATTCATGTTATTTCTTTATTAGAAGGCAGTATTCATACAACTGGCCAACCATTAAATATTGCAAAAACAGATATTCAAATTAAAGAAACAAAACCTGATTTCAAAAAGCATACCCTTACCTGTCCAAAATCACCCTATACATCAAATTATATAAAATATACTGGGCGATTTGGCATTTCAGCATATGAACAAAAGCACATTCATTCTTTCGCTCAAGAAGCAGGAAAAACTTTAAAAAGAGAAAGAATGGGAAAACGAACACTCTGTCTCGGAACGGGTGAATTTATGTATATCCCAATGAAAATTGCTGCTGAAATGGGTGAAAATATTTTATATCAATCTACAACAAGAAGCCCTATCCATCCTGTTTCAAATGATGTAAACTACGCCATTCATAATCATTTCTCATATCCAAGTCCTGAAAATTCTACTATTACAAATTACTTTTATAATATTTCACCTCATGATTACGATGAAGTATTTGTTTTTATTGAGCGTGATTTAGGAGAAGAAGCCCTGTTTCCTCTTCTACAGCAGTTACAAACAGTTATTCCTTTTATTCATATCGTCTCATTTTCAAATAGCATAGAAAAGGAAGGTTGATAATTATGGTAAAAGTAAATTCTCATATTAGTAGTTACAATCCAAATGATGCTATTTTTCTATTAAAAGATATTAGTGATTTAATGAAAGAAAGTTCCACGGAAACTAGAGAACAAGCAATTCAAGCTGGCACACATTATTCCGAAATGTTACCAATGGAATATAAACCATCTAAAGCGTATATGGATTTATTCTTTTCTTCCCTGCAACAATATAAACACAAACTAGCCATCGCTGTTGGAGTTGTCGCCGAACAGATTATACAAACTAAAGGAACTAACCTTGTCCTCGTTTCATTAGCTCGTGCTGGTACACCTATTGGCATT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49 | Bacillus_virus(37.5%) | coat,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
111604 : 142549
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP042928|111604:142549|DBSCAN-SWA 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25 | Bacillus_phage(50.0%) | integrase,transposase,protease | attL 106685:106701|attR 148816:148832 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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