Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP040918 | Pasteurella multocida strain PM 8-6 chromosome, complete genome | 4 crisprs | cas1,cas6f,cas7f,cas5f,cas8f,DEDDh,cas3,DinG | 3 | 19 | 6 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP040918_1 | 209079-209946 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP040918_1
|
14 spacers
spacers of NZ_CP040918_1
>1.1|209107|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGCAATATCCGTTAGTTTCTTAGCTTTAACT >1.2|209167|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTCAAGCTTAGATGTGAAATTCGCACCAAC >1.3|209227|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTCAAGCTTAGATGTGAAATTCGCACCAAC >1.4|209287|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTCAAGCTTAGATGTGAAATTCGCACCAAC >1.5|209347|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTCAAGCTTAGATGTGAAATTCGCACCAAC >1.6|209407|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTAGTGAATCTTGCGGATAAACGTAGCTTAAA >1.7|209467|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAATTCATCTGTTCAAGCGCAAGGTGGGCTT >1.8|209527|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCCAGCGTCGCGCGGTGTTAAATGAGACTTT >1.9|209587|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCTCCACTTTGATTGCCTCTAACATCGGGTA >1.10|209647|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAAATCTCACGCACTTTCAGCACATGTTGTG >1.11|209707|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATTGTCAGCCGTTAGTTGAACACGTCATTAT >1.12|209767|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGGGCATGGATTTTCGGCACTGGAAATCGAAT >1.13|209827|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTCAATGACCGTTAAATCTTCTAGTGTTTC >1.14|209887|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGTATTTCTAATAAATCGGTCTTCAGCTAAT |
cas1,cas3-cas2,cas6f,cas7f,cas5f |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP040918_1
The CRISPR arrays of NZ_CP040918_1 >merge|NZ_CP040918|1|209079-209946|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTAAGCCATCTACACGATGGTGAACTCGCAATATCCGTTAGTTTCTTAGCTTTAACTTTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAACATTTCAAGCTTAGATGTGAAATTCGCACCAACTTTCTAAGCCATCTACACAATGGTGAACATTTCAAGCTTAGATGTGAAATTCGCACCAACTTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAACATTTCAAGCTTAGATGTGAAATTCGCACCAACTTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAACATTTCAAGCTTAGATGTGAAATTCGCACCAACTTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAACGTAGTGAATCTTGCGGATAAACGTAGCTTAAATTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAACTTAATTCATCTGTTCAAGCGCAAGGTGGGCTTTTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAACTTCCAGCGTCGCGCGGTGTTAAATGAGACTTTTTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAACAGCTCCACTTTGATTGCCTCTAACATCGGGTATTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAACTCAAATCTCACGCACTTTCAGCACATGTTGTGTTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAACGATTGTCAGCCGTTAGTTGAACACGTCATTATTTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAACAGGGCATGGATTTTCGGCACTGGAAATCGAATTTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAACTTTTCAATGACCGTTAAATCTTCTAGTGTTTCTTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAACCTGTATTTCTAATAAATCGGTCTTCAGCTAATTTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC >NZ_CP040918|1|1|209079-209946|PILER-CR TTTTTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC TCGCAATATCCGTTAGTTTCTTAGCTTTAACT TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC ATTTCAAGCTTAGATGTGAAATTCGCACCAAC TTTCTAAGCCATCTACACAATGGTGAAC ATTTCAAGCTTAGATGTGAAATTCGCACCAAC TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC ATTTCAAGCTTAGATGTGAAATTCGCACCAAC TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC ATTTCAAGCTTAGATGTGAAATTCGCACCAAC TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC GTAGTGAATCTTGCGGATAAACGTAGCTTAAA TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC TTAATTCATCTGTTCAAGCGCAAGGTGGGCTT TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC TTCCAGCGTCGCGCGGTGTTAAATGAGACTTT TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC AGCTCCACTTTGATTGCCTCTAACATCGGGTA TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC TCAAATCTCACGCACTTTCAGCACATGTTGTG TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC GATTGTCAGCCGTTAGTTGAACACGTCATTAT TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC AGGGCATGGATTTTCGGCACTGGAAATCGAAT TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC TTTTCAATGACCGTTAAATCTTCTAGTGTTTC TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC CTGTATTTCTAATAAATCGGTCTTCAGCTAAT TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC >NZ_CP040918|1|1|209079-209946|CRISPRCasFinder TTTTTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC TCGCAATATCCGTTAGTTTCTTAGCTTTAACT TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC ATTTCAAGCTTAGATGTGAAATTCGCACCAAC TTTCTAAGCCATCTACACAATGGTGAAC ATTTCAAGCTTAGATGTGAAATTCGCACCAAC TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC ATTTCAAGCTTAGATGTGAAATTCGCACCAAC TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC ATTTCAAGCTTAGATGTGAAATTCGCACCAAC TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC GTAGTGAATCTTGCGGATAAACGTAGCTTAAA TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC TTAATTCATCTGTTCAAGCGCAAGGTGGGCTT TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC TTCCAGCGTCGCGCGGTGTTAAATGAGACTTT TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC AGCTCCACTTTGATTGCCTCTAACATCGGGTA TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC TCAAATCTCACGCACTTTCAGCACATGTTGTG TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC GATTGTCAGCCGTTAGTTGAACACGTCATTAT TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC AGGGCATGGATTTTCGGCACTGGAAATCGAAT TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC TTTTCAATGACCGTTAAATCTTCTAGTGTTTC TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC CTGTATTTCTAATAAATCGGTCTTCAGCTAAT TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC >NZ_CP040918|1|1|209079-209946|CRT TTTTTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC TCGCAATATCCGTTAGTTTCTTAGCTTTAACT TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC ATTTCAAGCTTAGATGTGAAATTCGCACCAAC TTTCTAAGCCATCTACACAATGGTGAAC ATTTCAAGCTTAGATGTGAAATTCGCACCAAC TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC ATTTCAAGCTTAGATGTGAAATTCGCACCAAC TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC ATTTCAAGCTTAGATGTGAAATTCGCACCAAC TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC GTAGTGAATCTTGCGGATAAACGTAGCTTAAA TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC TTAATTCATCTGTTCAAGCGCAAGGTGGGCTT TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC TTCCAGCGTCGCGCGGTGTTAAATGAGACTTT TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC AGCTCCACTTTGATTGCCTCTAACATCGGGTA TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC TCAAATCTCACGCACTTTCAGCACATGTTGTG TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC GATTGTCAGCCGTTAGTTGAACACGTCATTAT TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC AGGGCATGGATTTTCGGCACTGGAAATCGAAT TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC TTTTCAATGACCGTTAAATCTTCTAGTGTTTC TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC CTGTATTTCTAATAAATCGGTCTTCAGCTAAT TTTCTAAGCCATCTACACGATGGTGAAC
>NZ_CP040918.1|WP_005753659.1|207928_208909_-|type-I-F-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MRKTPYIPSSDLKTIMHSKRANIYYLEHCRVLLNGGRVEYVTDEGRESLYWNIPIANTSCLLLGSGTSITQAAMRELSKAGVMVGFCSGGGTPLFNGTEAEIGCEFFSPQSEYRPVMYLQQWCKFWFDDEKRLAVAKALQQQRLALLEPIWSKLEWVYSCEKLTALVTQYQHEFAQAAHSQALLAAEGRLTTKLYALANQATMNEPDFKRSERGKSIDLVNQFLDHGNYLAYGLGATACWVLGLPHGLAVLHGKTRRGGLVFDAADIIKDSMILPQAFISAQNGDSEKEFRQACIQNLLRFGALDIIIERLQQLALQGASDEYFAG >NZ_CP040918.1|WP_014325848.1|204627_207948_-|type-I-F-CRISPR-associated-helicase-Cas3 MNILLVSQCQKNALTETRRILDQFAERCGDRVWQTAITQAGLETLYKMLRQTARKNTAVACYWTHRKNSAELLWIVGDRRQFNDQGRVPTNRTQRNILRAEEEIAWQDAYSLQILTALSALLHDVGKSSVGFQTKLDKTKNAPRVADSYRHEWISVRLFEAMIEGCQTDQAWLERLANWQVFEETNPTWFSKIIQDRPNENHFSDFAYLPPLARRVIWLITSHHRLPFTHDISRSQDCIKNLRKYAKLTFESLFKAYKPAVGWVSNGAEHPTPQAFWQFQRVATQSQAWQKHMARWAKKALNHPALFSVSENADPFLLLLARLCLMTGDHYYSAQDQNEKLGELNFPLLANTYRENHQPKQRLDEHLIGVCQTAVRFARLLPKFPRELPRIKQHKPFVQLAKDRFAWQNKAVNVARLLQKTSESQGFFGVNMASTGCGKTLANAKMMYALNDSKQGARFTIALGLRVLTLQTGSALKKRLHLSDQDLAVLVGGSAVKKLYALQQEKQNQLAQQGSESAEDWLEDMQVEGATYIESAVENEAVLSFLSKDDKTKKLLYAPIVSCTLDHLISASESVRGGHHIVPILRLLTSDLILDEPDDFAQEDLPALSRLVYLAGLFGSRVLLSSATLTPDFITGLFKAYQAGRKIYNQQKGIVAALPICCAWVDEFQQVQANCGQDEQFIQQHDEFVRKRAENLAKSPVRRQAEILSLPSLKPREGEDLHYGLLADTLLQKAMALHDLHGQTDPHSQKKVSVGLIRFSNIEPMIPLAKALFALQASEKFADYQVHLCCYHSRQLLLLRSYLEEKLDKILDRHTPEQLFQHEEIALPMSQYKAKNHLFIVLGSPVTEVGRDHDYDWAIVDPSSMRSIIQLAGRVWRHRAEKVAEQPNIALLPINWRGLKVRYQQKDVIYHRPGFESHQHKLATHKLDQLISQRDLAHIQATPRIVKPEVLQASTQLADLEHHAIASLLNHPSENLVNLYWDPRYCNYLLANLPLMSEFRKSMAELEVVCVPDEDSHWGFGFYRAQKRDEETLSALPEIQYEPIQQDKHAVVQPWLAAALDTVLSDLAEQLNVVSPEWIAPTYLCASLPQYDGKLDWHYNEVYGFW >NZ_CP040918.1|WP_005753664.1|202713_204570_-|response-regulator MKNIKYFTQKYVDWVIRLGRLRFSILGVIVLAILALCTQALLSLFIIGEVYWVDMIRSVVFGLISAPFVIYFFTVLVEKLERSRLGLAKMVENLRKEVSERVLAEKKLSIALDNIEKTSRDKTRLMATISHELRTPLNGIIGLSRILLDEKLTETQQNYLKTIHVSAISLGHIFSDIIDLEKIDARRIELNAKAVELNSFLNDISNVARLLAQQKKLAFQLVTDKNLPTWFMVDYARLSQILWNLIGNAVKFTQEGRITLNVKRVSEYQISFSVSDTGIGIPANELPRVFEMYYQVQSSGHKPLGSGIGLAISQTIAQLMGGDLYATSEMGKGSCFTLMLPVKEVEKPVRVQNQMPSTLNILLVEDIEVNVVVAKSVLEKLGYVVDVAMTGQQAIEKFEQQYYDLLLLDIQLPDMSGFAVAKYLREGYENGQYDFLPPLIALTANVMHDKKEYQAQGMDDVLRKPLSIEELTACLVEYFGHDVSLCLETPTTHQITQDATHFDVKMLSELVEMLGTDFVLKNLALFKETMPEYMQALMTAYSVYQQDESQKADVLSCAHKIKGAAASVGLKRIQQIAAQAQDPEQGEWTENIHDWVQQLAQYWLLDVEALERYLNKSV >NZ_CP040918.1|WP_005725867.1|201982_202573_-|hypothetical-protein MKIFAVLSAFLMPFVVPNTTVNGYKDLRFGMTIEQAKETKLCEDQWHLPADDDWRRVVRGYWVCDKFRFDDGYAVARLRFIGGQLKSIELKMPEYPKYPAELLLHVLEEKYGKTIEVEQRDLIEEDILQGKIRKRRKNESALLDTYQFAKGTVSLTLLTYNGIPQPAEIIYSAPELLLLEKKLEDRPQRRTLLRDL >NZ_CP040918.1|WP_014325849.1|201115_201919_+|inositol-1-monophosphatase MNPMLNIAIRAARKAGNVIAKGYERRDALQTTLKSTNDYVTNIDKASEEAIIEVIRKSYPDHTIITEESGALEGKDSDIQWVIDPLDGTTNFVKGLPHFSVSIAIRVKGRTEVGVVYDPIRNELFTAVRGEGAKINDMRLRVENKRDLAGTVLTTGFPFKQTRLMPMQFAMMNNLIQDCADFRRMGSAALDLCYVAAGRVDGYFEVGVKAWDIAAGDLIVREAGGLVCDFNGGHSYLTSGHLVAAAPRIVKEILNKIQPCLSDEFKK >NZ_CP040918.1|WP_014325850.1|200185_200902_-|tRNA-(cytosine(32)/uridine(32)-2'-O)-methyltransferase-TrmJ MLENIRIVLVETSHSGNIGSAARAMKTMGLNQLYLVAPKQPLDEHAIALSAGAEDVLKQAKIVASFDEAVADCALVIGTSARLRHLQNSLIEPRECGTHAIVYAKQAPVAIVFGRERIGLTNEELLKCRYHLTIPANPDYSSLNLAMAVQLICYELRLAFLSQQAMTESLSTIDNTYPTHTEIEHFFQHTERLYTALGFIQNQGVMPKLRRLYQRVQLEKNELNILRGMLTAVEKRLK >NZ_CP040918.1|WP_005721326.1|199642_200107_-|Fe-S-cluster-assembly-transcriptional-regulator-IscR MKLTSKGRYAVTAILDIALNSNRGPVSLSDISERQHISLSYLEQLFAKLRRHGLVKSVRGPGGGYQLGLPANRISVGMVINAVNENIDVTRCLGRGDCQEGTECLTHSLWKELSLRIEAFLNEITLEELVEKNRQKRATIEFRGDFDNLIILDN >NZ_CP040918.1|WP_005721328.1|198380_199595_-|IscS-subfamily-cysteine-desulfurase MKLPIYLDYAATCPVDERVAKKMMEYLTVEGNFGNPASRSHKFGWQAEEAVDVARNHIADLIGADSREIVFTSGATESDNLAIKGAAHFYQSKGKHIITCKTEHKAVLDTCRQLEREGFEVTYLNPKSDGLIDLEELKNAMRDDTILVSIMHVNNEIGVIQDIAAIGELCRARKILFHVDATQSVGKLPINLAELKVDLMSMSSHKLYGPKGIGALYVSRKPRVRLEAIIHGGGHERGMRSGTLPVHQIVGMGEAYRICKEEMASEMPRLKALRDRLYNGLKDIEETYVNGSMEHRLDSNLNISFNYVEGESLMMALRDIAVSSGSACTSASLEPSYVLRALGLNDELAHSSIRFTLGRYTTEEEIDYTIELVKNAVAKLRELSPLWDMFKEGIDLNTIEWTHH >NZ_CP040918.1|WP_005721377.1|197762_198149_-|Fe-S-cluster-assembly-scaffold-IscU MAYSNKVIDHYENPRNVGSLDKKDANVGTGMVGAPACGDVMQLQIKVSEEGIIEDAKFKTYGCGSAIASSSLITEWVKGKSLDEAQAIKNSQIAEELELPPVKVHCSILAEDAIKAAIADYKAKKEAK >NZ_CP040918.1|WP_005721379.1|197369_197693_-|iron-sulfur-cluster-assembly-protein-IscA MGISLTETAADRVRTFLANRGKGIGLRLGIKTSGCSGLAYVLEFVDELNPEDQVFEQHGVKIIVDAKSLVYLDGTELDFAKEGLNEGFKFNNPNVKDQCGCGESFHV >NZ_CP040918.1|WP_014325847.1|210086_210647_-|type-I-F-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6/Csy4 MTTHYIELKAIPQMDMLQSEVIGHCMQILHQFLPHFEGRVGVAFPAYGLGRTLGGIVRLFANQEDCNQLHQQLLRSGLSDYALISEVSKTPLSTECRSYSRVHRKGQSAIRRTEKRLKSQGRWDESIRADMQQRQQNVAFFPHCHLKSASTGQRFILAVKENRMPQSCVGVFNAYGLSNSATVPHF >NZ_CP040918.1|WP_014325846.1|210649_211657_-|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy3 MSKLSTPSVLAFERNLDISDAIFAQKDSKNDKDAPVPLRIREKSVRGTISNRLKNTITNDPAKLDAETEKANLQRVDVATLDDDKDTLVATFSVKVLPFTGRPNVCNDQDYQHQVMTTVAQYLSEQGMDELAKRYATNIANARWLWRNRMGAEKIKIEVTCGENTLHFDDAKQFSLNHFDHQDDKIHQIAKEIKQGLLGEKFVILYVTAYANMGYGQEVYPSQELVLDNSTNNRKSKILYEINQKAGMHSQKVGNAIRTIDTWYAEEVAFPIAAEPYGAVTTLGTAFRQPKTKKNDFYTLFDNWLLKGEVPPVEQQHYVMSVLIRGGVFGASGKE >NZ_CP040918.1|WP_116538850.1|211659_212622_-|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy2 MLFDHIKVQSANAISGPLSYGFPALTGLTGAMHALNRKLTHHPVQFGGVMVACHDYELQTYQNSAFSDRTFKQTRNPIKRNGETASIIEEGKIHLDLSLVVEVHVQDDRVFEALTDKTSQASQDFLQTCKNLLWQQRIAGGSVLEIGNVQLFNLEEDQDIPLALMPAFVLMDAKQELTNITEELKTGLRIGQLDEEGNVQKSCLPSCPDATALDALLEMATVHHIPEHANATASAWQTYSVKKGRGWLVPLPVGYQAISPLFAPGQLQHCRTQQYPSQYVETLYSLGKWVFPLSLPENLSQCFWRYTALQNNLYLISQGE >NZ_CP040918.1|WP_140012162.1|217805_219011_+|IS4-like-element-ISVsa5-family-transposase MCELDILHDSLYQFCPELHLKRLNSLTLACHALLDCKTLTLTELGRNLPTKARTKHNIKRIDRLLGNRHLHKERLAVYRWHASFICSGNTMPIVLVDWSDIREQKRLMVLRASVALHGRSVTLYESVPLSEQCSKKAHDQFLADLASILPSNTTPLIVSDAGFKVPWYKSVEKLGWYWLSRVRGKVQYADLGAENWKPISNLHDMSSSHSKTLGYKRLTKSNPISCQILLYKSRSKGRKNQRSTRTHCHHPSPKIYSASAKEPWVLATNLPVEIRTPKQLVNIYSKRMQIEETFRDLKSPAYGLGLRHSRTSSSERFDIMLLIALMLQLTCWLAGVHAQKQGWDKHFQANTVRNRNVLSTVRLGMEVLRHSGYTITREDLLVAATLLAQNLFTHGYALGKL >NZ_CP040918.1|WP_001089068.1|220227_221433_-|tetracycline-efflux-MFS-transporter-Tet(B) MNSSTKIALVITLLDAMGIGLIMPVLPTLLREFIASEDIANHFGVLLALYALMQVIFAPWLGKMSDRFGRRPVLLLSLIGASLDYLLLAFSSALWMLYLGRLLSGITGATGAVAASVIADTTSASQRVKWFGWLGASFGLGLIAGPIIGGFAGEISPHSPFFIAALLNIVAFLVVMFWFRETKNTRDNTDTEVGVETQSNSVYITLFKTMPILLIIYFSAQLIGQIPATVWVLFTENRFGWNSMMVGFSLAGLGLLHSVFQAFVAGRIATKWGEKTAVLLGFIADSSAFAFLAFISEGWLVFPVLILLAGGGIALPALQGVMSIQTKSHQQGALQGLLVSLTNATGVIGPLLFAVIYNHSLPIWDGWIWIIGLAFYCIIILLSMTFMLTPQAQGSKQETSA >NZ_CP040918.1|WP_140012163.1|222636_222951_+|hypothetical-protein MEPFCKLAFKYSTKDLLLVEPLDFNQIKEDIKGNAINFIYKLPISFEDKNELIRLYETPWNLMGSGGIKLDLDLHFHKVTAITTVTLKVGLALMRKETQTDCCW >NZ_CP040918.1|WP_140012164.1|222980_223223_+|hypothetical-protein MRNIIFVRQPEDQNNHYLQKLKHSGYWEVYCADDAYSVMAEFTGFNLKSWLENNADWANDMEQDFRRHLERNNLISYLTW >NZ_CP040918.1|WP_012478336.1|224901_225126_-|hypothetical-protein MNSTNNKSTLSLKQQFKLWLEQEQKDGDMIILVGIPDILKRFDRRLAIIKGNQLEKRYLREWREAFRIDRKLFN >NZ_CP040918.1|WP_012478337.1|225243_226701_-|hypothetical-protein MGTTKTTITNCSMKITKIRSQNSCSICGKTPVTRKFREEYYCANCYAQWFKKKTCKSCGQLTRIHREGELCLECEKLTDCVRCGKTSGTFEIGMISRYGAVCSSCTRYFREEIECSECGKMTRDRYRSPVTNESVCLQCYRRYTFATCKNCRRYRKVHNQEKQLCKKCDEKLLSTCPKCKGEMPSGYGNVCPDCARRSLLFNMIRLNGHILRNKAVKTAYKKFIFWYMRKCGISVALHKGADFMRFFIDCDEIWQQIPDYAELVTHFKPNGLRANLTVLRWLLDTNQIIVDEALKDDLAELERIQALFNKLKESVPCIASYYQKLQRRCDEGKTSLKSVRLALQPAIDLISTNEVTDYPTQDQLNQYLVKKSGQTAAITGFINHLKSEYHRELEIDRKLIQQIKTKQLKKHCSQRLIELYKKSELTDNEQMELIYVVLYSLHSVEIKKPKQDKILLLDGVAYYRSEDRDYFLPQDIYQRINPQFS >NZ_CP040918.1|WP_012478338.1|226661_227780_-|TniQ-family-protein MGTTNAGLPKNYRIKSGVIKTPLYSNESISSWLIRSALDCGTEPITFTGFYWNEWRLWTYDLDRGFEPISQHIYADINELSLNQQVNLVNHSLYSVLRPINGKNTLIKGQAKWVLSRGSRNRSFRVGQSYCPCCLEETPYLRNEWRFAWHFGCLKHKVLFESKCSCCGGLYQPHLLSAEKRQLNYCHQCGEKLQVITTPLNEVEIATMETLDNVFTTNSGECFGKCVDSQVYFAILRYFINFTRRAAIAKSTHSFSRFVEQCGISQVEICQTKTALAFEQLPVEERKNLLVNAGKILKLSSKDFIQAIKQSGITQKAFAFERYPTELDNLFKYAIEGKTTSRKTIINKPKTDSVLSLNRQWERLKRQLQIAV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP040918_2 | 231207-231359 | TypeI-F |
NA
Consensus repeat of NZ_CP040918_2
|
2 spacers
spacers of NZ_CP040918_2
>2.1|231232|27|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder AAATAATCTGACAGCTATTTCTAGTTT >2.2|231284|51|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder TGTCGTAAAAAATAGGATAAACCCTTATCCTTTCGTTGAATGAATAGCTAA |
cas5f,cas7f,cas8f |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP040918_2
The CRISPR arrays of NZ_CP040918_2 >merge|NZ_CP040918|2|231207-231359|CRISPRCasFinder ATTTGACACCTATTTCTTGTTTTCTAAATAATCTGACAGCTATTTCTAGTTTTTATGACATTTATTTCTGGTTTTTATGTCGTAAAAAATAGGATAAACCCTTATCCTTTCGTTGAATGAATAGCTAATTATGACATTTATTTCTAGTTTTTA >NZ_CP040918|2|2|231207-231359|CRISPRCasFinder ATTTGACACCTATTTCTTGTTTTCT AAATAATCTGACAGCTATTTCTAGTTT TTATGACATTTATTTCTGGTTTTTA TGTCGTAAAAAATAGGATAAACCCTTATCCTTTCGTTGAATGAATAGCTAA TTATGACATTTATTTCTAGTTTTTA
>NZ_CP040918.1|WP_012478339.1|227737_228625_-|AAA-family-ATPase MQYEHVHEKFRHLVTADNQERIAFLDEPRWLGYGVAKDIMDNLVSLMNKPKRPRMLNLLIVGDSNNGKTTLIRRFFDLYGQAYIDSDSNAIYPILLAEAPPSANEKELYISLLERFYVPYKPTDTIAKLRYQTIHLFREFRVKMLIIDEFHSLLVGTPRLQRQVMNAIKMLCNELQIPIVGVGTRDAIRVLHTDPQHASRFDVAELPTWKLDKDFQKLLFQFQGILPLKKCSNLQSPELATKIHTISGGNLGNVHRLLTACAVEAITSGTEQITLDIIEKNSWVQPTQGFRKIIG >NZ_CP040918.1|WP_012478338.1|226661_227780_-|TniQ-family-protein MGTTNAGLPKNYRIKSGVIKTPLYSNESISSWLIRSALDCGTEPITFTGFYWNEWRLWTYDLDRGFEPISQHIYADINELSLNQQVNLVNHSLYSVLRPINGKNTLIKGQAKWVLSRGSRNRSFRVGQSYCPCCLEETPYLRNEWRFAWHFGCLKHKVLFESKCSCCGGLYQPHLLSAEKRQLNYCHQCGEKLQVITTPLNEVEIATMETLDNVFTTNSGECFGKCVDSQVYFAILRYFINFTRRAAIAKSTHSFSRFVEQCGISQVEICQTKTALAFEQLPVEERKNLLVNAGKILKLSSKDFIQAIKQSGITQKAFAFERYPTELDNLFKYAIEGKTTSRKTIINKPKTDSVLSLNRQWERLKRQLQIAV >NZ_CP040918.1|WP_012478337.1|225243_226701_-|hypothetical-protein MGTTKTTITNCSMKITKIRSQNSCSICGKTPVTRKFREEYYCANCYAQWFKKKTCKSCGQLTRIHREGELCLECEKLTDCVRCGKTSGTFEIGMISRYGAVCSSCTRYFREEIECSECGKMTRDRYRSPVTNESVCLQCYRRYTFATCKNCRRYRKVHNQEKQLCKKCDEKLLSTCPKCKGEMPSGYGNVCPDCARRSLLFNMIRLNGHILRNKAVKTAYKKFIFWYMRKCGISVALHKGADFMRFFIDCDEIWQQIPDYAELVTHFKPNGLRANLTVLRWLLDTNQIIVDEALKDDLAELERIQALFNKLKESVPCIASYYQKLQRRCDEGKTSLKSVRLALQPAIDLISTNEVTDYPTQDQLNQYLVKKSGQTAAITGFINHLKSEYHRELEIDRKLIQQIKTKQLKKHCSQRLIELYKKSELTDNEQMELIYVVLYSLHSVEIKKPKQDKILLLDGVAYYRSEDRDYFLPQDIYQRINPQFS >NZ_CP040918.1|WP_012478336.1|224901_225126_-|hypothetical-protein MNSTNNKSTLSLKQQFKLWLEQEQKDGDMIILVGIPDILKRFDRRLAIIKGNQLEKRYLREWREAFRIDRKLFN >NZ_CP040918.1|WP_140012164.1|222980_223223_+|hypothetical-protein MRNIIFVRQPEDQNNHYLQKLKHSGYWEVYCADDAYSVMAEFTGFNLKSWLENNADWANDMEQDFRRHLERNNLISYLTW >NZ_CP040918.1|WP_140012163.1|222636_222951_+|hypothetical-protein MEPFCKLAFKYSTKDLLLVEPLDFNQIKEDIKGNAINFIYKLPISFEDKNELIRLYETPWNLMGSGGIKLDLDLHFHKVTAITTVTLKVGLALMRKETQTDCCW >NZ_CP040918.1|WP_001089068.1|220227_221433_-|tetracycline-efflux-MFS-transporter-Tet(B) MNSSTKIALVITLLDAMGIGLIMPVLPTLLREFIASEDIANHFGVLLALYALMQVIFAPWLGKMSDRFGRRPVLLLSLIGASLDYLLLAFSSALWMLYLGRLLSGITGATGAVAASVIADTTSASQRVKWFGWLGASFGLGLIAGPIIGGFAGEISPHSPFFIAALLNIVAFLVVMFWFRETKNTRDNTDTEVGVETQSNSVYITLFKTMPILLIIYFSAQLIGQIPATVWVLFTENRFGWNSMMVGFSLAGLGLLHSVFQAFVAGRIATKWGEKTAVLLGFIADSSAFAFLAFISEGWLVFPVLILLAGGGIALPALQGVMSIQTKSHQQGALQGLLVSLTNATGVIGPLLFAVIYNHSLPIWDGWIWIIGLAFYCIIILLSMTFMLTPQAQGSKQETSA >NZ_CP040918.1|WP_140012162.1|217805_219011_+|IS4-like-element-ISVsa5-family-transposase MCELDILHDSLYQFCPELHLKRLNSLTLACHALLDCKTLTLTELGRNLPTKARTKHNIKRIDRLLGNRHLHKERLAVYRWHASFICSGNTMPIVLVDWSDIREQKRLMVLRASVALHGRSVTLYESVPLSEQCSKKAHDQFLADLASILPSNTTPLIVSDAGFKVPWYKSVEKLGWYWLSRVRGKVQYADLGAENWKPISNLHDMSSSHSKTLGYKRLTKSNPISCQILLYKSRSKGRKNQRSTRTHCHHPSPKIYSASAKEPWVLATNLPVEIRTPKQLVNIYSKRMQIEETFRDLKSPAYGLGLRHSRTSSSERFDIMLLIALMLQLTCWLAGVHAQKQGWDKHFQANTVRNRNVLSTVRLGMEVLRHSGYTITREDLLVAATLLAQNLFTHGYALGKL >NZ_CP040918.1|WP_116538850.1|211659_212622_-|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy2 MLFDHIKVQSANAISGPLSYGFPALTGLTGAMHALNRKLTHHPVQFGGVMVACHDYELQTYQNSAFSDRTFKQTRNPIKRNGETASIIEEGKIHLDLSLVVEVHVQDDRVFEALTDKTSQASQDFLQTCKNLLWQQRIAGGSVLEIGNVQLFNLEEDQDIPLALMPAFVLMDAKQELTNITEELKTGLRIGQLDEEGNVQKSCLPSCPDATALDALLEMATVHHIPEHANATASAWQTYSVKKGRGWLVPLPVGYQAISPLFAPGQLQHCRTQQYPSQYVETLYSLGKWVFPLSLPENLSQCFWRYTALQNNLYLISQGE >NZ_CP040918.1|WP_014325846.1|210649_211657_-|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy3 MSKLSTPSVLAFERNLDISDAIFAQKDSKNDKDAPVPLRIREKSVRGTISNRLKNTITNDPAKLDAETEKANLQRVDVATLDDDKDTLVATFSVKVLPFTGRPNVCNDQDYQHQVMTTVAQYLSEQGMDELAKRYATNIANARWLWRNRMGAEKIKIEVTCGENTLHFDDAKQFSLNHFDHQDDKIHQIAKEIKQGLLGEKFVILYVTAYANMGYGQEVYPSQELVLDNSTNNRKSKILYEINQKAGMHSQKVGNAIRTIDTWYAEEVAFPIAAEPYGAVTTLGTAFRQPKTKKNDFYTLFDNWLLKGEVPPVEQQHYVMSVLIRGGVFGASGKE >NZ_CP040918.1|WP_016504385.1|231393_232728_-|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy1 MSHTFRKRIDLFLQEQNLKKSESDRKKLAKATDPTEIEQLTQLIQEFDQKYQFDTWIANAANVMAKQLKFGTHIAKGIHPDTKGDNVNFQPSDSLPPEYVGSQSVSHLVLDANGNAAALPLASFFNFIVDEEKQVKLRDLLLADDPRLAGCFSDDLALSDVYKKQFQQALTGDLTQPETHERNKQVFWANGENPIEDDDYTCLIPLYPSSLTHAFYQKVNNNRYSEQNKQARENRQKKTVEQTHYLSINQLATVVLGGSKPQNISQLMSAQGGRNYLLPSLPPIIPSSRYFRLSPLQTTIFNDRLAYACRYGLRQLFEVVEARKNVYQVRDSRIDALNNILRTFLFHANLLQKQPAGWSKDSQLEMCEKYWLDPKRVHLPDEEAFRAEYEKGEWVAEVERRFALWLNKRLQKRFPHIAKDFDDVEYHEWRRNIRRTLRYRLRHP >NZ_CP040918.1|WP_014325843.1|232958_235118_-|bifunctional-23S-rRNA-(guanine(2069)-N(7))-methyltransferase-RlmK/23S-rRNA-(guanine(2445)-N(2))-methyltransferase-RlmL MKQLFATTARGFEELLKVELTDLGAMDCQITQGGVHFHADEETQYRVLLWTRLASRILLPIVTCKVYSDLDLYSAVVGQNWLDYFDEKAHFMVDFNGTNREIRHTQFGAMRVKDGIVDYFERVGKPRPNVDKSQPDIRIHAYLNREELVISLDLSGDALHMRGYREDTGKAPLRETLAAAIVLRSGWQLGTPLVDPMCGSGTLLIEAAQMQANIAPQLHRLHWGFDFWKGHNQQAWDKVKGEAIELAEQTFNQNQKANFYGCDLDHRVLQKAKRNAQNAGVAHLIQWRQGDVAALKNPFVEAKGTVICNPPYGERLGTTPALIALYSVFGQRLKQQFADWNVSIFSGEPALLDCLRLRSHRQFKAKNGPLDCVQKNYHISARATASDENTQNLPEIDRTLSATQVAVDFANRLQKNSKKIEKWARQQGINAYRLYDADLPEYNLAVDRYDDHIVVQEYAAPKNIDENKARQRLLDAVTATLQVTGVETNKLILKVRQKQKGTNQYEKLANKGDYFYVNEYGAKLWVNLTDYLDTGLFLDHRLTRKMLGKMAKGKDVLNLFAYTGSATVHMALGGAKSTTTVDMSNTYLNWAEQNLLLNDLEGKQHKLIQADCLQWLARCDRQFDLIFVDPPTFSNSKRMEDSWDVQRDHIKLMTQLKRILRPNGTIVFSNNKRGFKMDVEGLETLGLSAVDITAKTLPLDFERNKQIHNCWVVRLKADL >NZ_CP040918.1|WP_116538853.1|235251_237300_-|methionine--tRNA-ligase MANSARNILVTCALPYANGAIHLGHLLEHIQADIWVRFQRMRGHKVHFICADDAHGTPIMLNADKLGITPEALIARSKADHVADFEGFNISYDNYHSTHSPENEALTAEMYKKLRANGFIKSRTISQLFDPEKGMFLPDRFVKGTCPKCKAEDQYGDNCEVCSSTYSPTELINPRSVVSGATPVLKESEHFFFDLPAFEGMLKAWIKSGSLQPEIANKMQEWFESGLQQWDISRDAPYFGFKIPDTEDKYFYVWLDAPIGYMASFKNLCDKTGLNFDDFWKKDSSAELYHFIGKDIVYFHSLFWPAMLDGCDLRKPTNVFAHGYVTVNGVKMSKSRGTFIQASTYLRHLAPEYLRYYYAAKLNNRIEDLDLNLEDFVQRLNADVVNKFVNLASRSAGFITKRFDGKLSAEIAEPELLAEFVEKAAQIATYYEEREFGKVVREVMQLADKANKYIDDKAPWVMAKEEGREAELQAVCSMALQLFRVLAIYLKPVIPQIIARAEAFLQDELTWESLNRPLLNHAILPFKALAQRLDLKQIEAIVNETKEQFVAQQALEQKNSAKAEPASQVEPIAETISIEDFAKLDLRVAKVMKCEAVPESNKLLRFELDLGDHTRQVFSGIKEAYNNPAELEGRFVVVIANLAPRKMRFGVSEGMILSAGTGGDDLFLLNADQGVKPGMQVK >NZ_CP040918.1|WP_014325841.1|237481_238594_+|iron-sulfur-cluster-carrier-protein-ApbC 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MRTTTIKFSAITLALLSYCGTILADSHQEATELDTITVSSQQDEMNIKEKKIGETVKTASQLKRQQVQDSRDLVRYETGVTVVEAGRFGSSGYAIRGVDENRVAITVDGLHQAETLSSQGFKELFEGYGNFNNTRNSVEIETLKVAKIAKGADSVKVGSGSLGGAVLFETKDARDFLTEKDWHIGYKAGYSTADNQGLNAVTLAGRYQMFDALIMHSKRHGHELENYDYKNGRDIQGKEREKADPYTITKESTLVKFSFSPTENHRFTVASDTYLQHSRGHDLSYNLVATTHIQLDEKESRHANDLTKRKNVSFTYENYTVTPFWDTLKLSYSQQRITTRARTEDYCDGNELCDSYKNPLGLQFKDGQILDPAGNKIKLQGSGLSTQIVDENGKPFPTTTGTNNAAFSNNLRLRPTGFWLDCSVFDCNKPFTVYNISNGTYQAREVLLSEEITVDGKLYKTAKEEGGLPNYLILPNSKGYLPYDYKERDLNTNTKQINLDLTKTFLTFNIENNLSYGGVYSRIEKEMINKAGYEGRNPTWWADRILGQSSYCGYNALKCPKHEPLTSFLIPVEATTQSLYFANILKVHNMISIDLGYRYDHIKYNPEYTPGVTPKIPDDMVKGLFIPMPKEPQLKDFYYNYAKFGEAYKKWKEYLPKNAEENIAYIAQDKTFKKHSYSLGATFDPLNFLRVQVKYSKGFRAPTSDELYFTFKHPDFTILPNPVLKPEEAKNQEIALTVHDNWGFVSTSVFQTKYRHFIDLAYLGSRNLSNSVGGQAQARDFQVYQNVNVDNAKVKGLEINARLNLGYFWHVLDGFNTSYKFTYQRGRLDGDRPMNAIQPKASVFGLGYDHKENKFGADLYITRVSEKKAKDTYNMFYKEQGYKDSAVRWRSDDYTLVDAVGYIKPIKNLTLQFGVYNLTDRKYLTWESARSIKPFGTSNLINQKTGAGINRFYSPGRNFKLSAEITF >NZ_CP040918.1|WP_025248430.1|242113_242629_-|heme-utilization-protein-HutZ MTTNRQEVLQNRLGPEIQELKAQCKTVMLATVGEDGNPNVSYAPFAINNGEYQVFISTIARHARNLQEVPKVSLMLIEDESQSRQIFARRRLSFDAVARVVERESEECHSGVEALKARHGALMDELSRMKDFHLFSFKPSQGLFVKGFGQAFQVSNDDLVSFVHLVEGHQE >NZ_CP040918.1|WP_014325839.1|242644_243136_-|heme-utilization-cystosolic-carrier-protein-HutX MMLKAQIADYITQNPLAITLDMASHFGKPEGEILCALPDEFVRVFPAERAEEVLAEISSWGIFTTIIEKEGSIFEIKDRFPTGMVGRGYYNLNMKDEEGTLHGHLKLDNISKIAFVSLPFRGKESYNIAFIANNGQTIFKVYLGRDAERQLFPEQVQKFKAFI >NZ_CP040918.1|WP_005751354.1|244200_244464_+|hypothetical-protein MDREYLSDLALSLTLKINNDTNQALDVTFISAYVNDSPVDFLPLTFKQGESIEVKLSNASSDMLWQYEASPSVSVMTKGFELDDILK >NZ_CP040918.1|WP_016504475.1|250349_251195_+|hypothetical-protein 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP040918_3 | 765709-767056 | Unclear |
I-F
Consensus repeat of NZ_CP040918_3
|
22 spacers
spacers of NZ_CP040918_3
>3.1|765737|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT ACCAATCTGATAATCGAGCCAAGATCGCTTTA >3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT AAGAGCAGAAAACAGAAGAATTGGAAGATGAC >3.3|765857|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT AGTGTAATTCCGCTCCGTTGCTTAAAATAATC >3.4|765917|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT GTATGAGTTCGGCATTTGCAGAGCTTAAAGCT >3.5|765977|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT TTGATCCTTTTACGCGTAAACAGAATGCTTTT >3.6|766037|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT TATTCAGAATCAAAACGAATACCCAAAATTGC >3.7|766097|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT CGGGTGCGCAAATGGTTTGCGACAAAAGGCGA >3.8|766157|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT AACTATAATAAAAAAGGCTGTTGCCATTGCTA >3.9|766217|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT ATGACTTTTGGGGAGCTATCGGCATAGTGCTT >3.10|766277|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT AAGAGCCACGATTCACTTGTAACGCTTGGATC >3.11|766337|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACGTGATGACGTGCTCATCTGCGCTGTGGCTT >3.12|766397|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCTTACGGGGATTAACGTGAGCGCGGACACTT >3.13|766457|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGTTTCTTCATTTCGCTTACGCTCCCGTTGAT >3.14|766517|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTGATCCATCAAGAAGTGATCATGTGTTCAT >3.15|766577|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAATACGCGGGGACAGCTTACAACCTTGCAAC >3.16|766637|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAGGCAATATGCGACAAATTCCAGAGATTTT >3.17|766697|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCTCGCGGAAATCTACCCCGATTTAGACACAT >3.18|766757|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTCGGGATAATCATCCACTGCTCACCTGAAAT >3.19|766817|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TACGCCATTATGGCGACTGACTTCCGCGATAA >3.20|766877|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACTTGTGCAAGGGTTGTGTGTTCATAGGCTTT >3.21|766937|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAAAATTAAAACTATCGTCGCTTGCTTGTAGC >3.22|766997|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACTAGCGGAGGCTCAACAATGACGGAAGGTAA |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP040918_3
The CRISPR arrays of NZ_CP040918_3 >merge|NZ_CP040918|3|765709-767056|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATTGAAACTGCCTATACGGCAGTTAACACCAATCTGATAATCGAGCCAAGATCGCTTTATTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACAAGAGCAGAAAACAGAAGAATTGGAAGATGACTTTCTAAGCTACCTACACGGCAGTTAACAGTGTAATTCCGCTCCGTTGCTTAAAATAATCTTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACGTATGAGTTCGGCATTTGCAGAGCTTAAAGCTTTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAACTTGATCCTTTTACGCGTAAACAGAATGCTTTTTTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAACTATTCAGAATCAAAACGAATACCCAAAATTGCTTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAACCGGGTGCGCAAATGGTTTGCGACAAAAGGCGATTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAACAACTATAATAAAAAAGGCTGTTGCCATTGCTATTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAACATGACTTTTGGGGAGCTATCGGCATAGTGCTTTTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAACAAGAGCCACGATTCACTTGTAACGCTTGGATCTTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAACACGTGATGACGTGCTCATCTGCGCTGTGGCTTTTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAACGCTTACGGGGATTAACGTGAGCGCGGACACTTTTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAACCGTTTCTTCATTTCGCTTACGCTCCCGTTGATTTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAACTTTGATCCATCAAGAAGTGATCATGTGTTCATTTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAACGAATACGCGGGGACAGCTTACAACCTTGCAACTTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAACAAAGGCAATATGCGACAAATTCCAGAGATTTTTTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAACGCTCGCGGAAATCTACCCCGATTTAGACACATTTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAACCTCGGGATAATCATCCACTGCTCACCTGAAATTTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAACTACGCCATTATGGCGACTGACTTCCGCGATAATTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAACACTTGTGCAAGGGTTGTGTGTTCATAGGCTTTTTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAACTAAAATTAAAACTATCGTCGCTTGCTTGTAGCTTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAACACTAGCGGAGGCTCAACAATGACGGAAGGTAATTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC >NZ_CP040918|3|3|765709-767056|CRISPRCasFinder AATTGAAACTGCCTATACGGCAGTTAAC ACCAATCTGATAATCGAGCCAAGATCGCTTTA TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC AAGAGCAGAAAACAGAAGAATTGGAAGATGAC TTTCTAAGCTACCTACACGGCAGTTAAC AGTGTAATTCCGCTCCGTTGCTTAAAATAATC TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC GTATGAGTTCGGCATTTGCAGAGCTTAAAGCT TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC TTGATCCTTTTACGCGTAAACAGAATGCTTTT TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC TATTCAGAATCAAAACGAATACCCAAAATTGC TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC CGGGTGCGCAAATGGTTTGCGACAAAAGGCGA TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC AACTATAATAAAAAAGGCTGTTGCCATTGCTA TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC ATGACTTTTGGGGAGCTATCGGCATAGTGCTT TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC AAGAGCCACGATTCACTTGTAACGCTTGGATC TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC ACGTGATGACGTGCTCATCTGCGCTGTGGCTT TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC GCTTACGGGGATTAACGTGAGCGCGGACACTT TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC CGTTTCTTCATTTCGCTTACGCTCCCGTTGAT TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC TTTGATCCATCAAGAAGTGATCATGTGTTCAT TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC GAATACGCGGGGACAGCTTACAACCTTGCAAC TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC AAAGGCAATATGCGACAAATTCCAGAGATTTT TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC GCTCGCGGAAATCTACCCCGATTTAGACACAT TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC CTCGGGATAATCATCCACTGCTCACCTGAAAT TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC TACGCCATTATGGCGACTGACTTCCGCGATAA TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC ACTTGTGCAAGGGTTGTGTGTTCATAGGCTTT TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC TAAAATTAAAACTATCGTCGCTTGCTTGTAGC TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC ACTAGCGGAGGCTCAACAATGACGGAAGGTAA TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC >NZ_CP040918|3|2|765709-767056|CRT AATTGAAACTGCCTATACGGCAGTTAAC ACCAATCTGATAATCGAGCCAAGATCGCTTTA TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC AAGAGCAGAAAACAGAAGAATTGGAAGATGAC TTTCTAAGCTACCTACACGGCAGTTAAC AGTGTAATTCCGCTCCGTTGCTTAAAATAATC TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC GTATGAGTTCGGCATTTGCAGAGCTTAAAGCT TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC TTGATCCTTTTACGCGTAAACAGAATGCTTTT TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC TATTCAGAATCAAAACGAATACCCAAAATTGC TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC CGGGTGCGCAAATGGTTTGCGACAAAAGGCGA TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC AACTATAATAAAAAAGGCTGTTGCCATTGCTA TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC ATGACTTTTGGGGAGCTATCGGCATAGTGCTT TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC AAGAGCCACGATTCACTTGTAACGCTTGGATC TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC ACGTGATGACGTGCTCATCTGCGCTGTGGCTT TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC GCTTACGGGGATTAACGTGAGCGCGGACACTT TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC CGTTTCTTCATTTCGCTTACGCTCCCGTTGAT TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC TTTGATCCATCAAGAAGTGATCATGTGTTCAT TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC GAATACGCGGGGACAGCTTACAACCTTGCAAC TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC AAAGGCAATATGCGACAAATTCCAGAGATTTT TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC GCTCGCGGAAATCTACCCCGATTTAGACACAT TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC CTCGGGATAATCATCCACTGCTCACCTGAAAT TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC TACGCCATTATGGCGACTGACTTCCGCGATAA TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC ACTTGTGCAAGGGTTGTGTGTTCATAGGCTTT TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC TAAAATTAAAACTATCGTCGCTTGCTTGTAGC TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC ACTAGCGGAGGCTCAACAATGACGGAAGGTAA TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC >NZ_CP040918|3|2|766309-767056|PILER-CR TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC ACGTGATGACGTGCTCATCTGCGCTGTGGCTT TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC GCTTACGGGGATTAACGTGAGCGCGGACACTT TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC CGTTTCTTCATTTCGCTTACGCTCCCGTTGAT TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC TTTGATCCATCAAGAAGTGATCATGTGTTCAT TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC GAATACGCGGGGACAGCTTACAACCTTGCAAC TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC AAAGGCAATATGCGACAAATTCCAGAGATTTT TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC GCTCGCGGAAATCTACCCCGATTTAGACACAT TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC CTCGGGATAATCATCCACTGCTCACCTGAAAT TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC TACGCCATTATGGCGACTGACTTCCGCGATAA TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC ACTTGTGCAAGGGTTGTGTGTTCATAGGCTTT TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC TAAAATTAAAACTATCGTCGCTTGCTTGTAGC TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC ACTAGCGGAGGCTCAACAATGACGGAAGGTAA TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
>NZ_CP040918.1|WP_014326414.1|764691_765657_+|lipopolysaccharide-heptosyltransferase-RfaC MKICLIKTSSMGDILHSLPALTDAQRALPNLQVDWVVEESFAEIPHWHSAVRQVIPIALRRWRKTPFTALTRKQWKTYRTLLQSEQYDAVIDAQGLLKSALFATRLARGTRHGYDRHSIREPIAACFYDKKYAISYQQHAVERIRQLFAQSLNYPLPHTQGDYGIARHFPQHAQTMPYVLFFHGTTRQDKFLPDKQWRTLAEKLTAQGIQIHVPWSNPQEKQRAERIAQGLDLVTILPKSTLSELAQQIVNASAVVSVDTGLAHLSAALDKTNLTLYGATDPKLIGSYGKNQHYLVAESMDKIEADEIFQKLTALLSLNTI >NZ_CP040918.1|WP_014326413.1|763648_764695_+|lipopolysaccharide-heptosyltransferase-II MHILIIGPSWVGDMMMSHSLYQTLKQQYPQCEIDVMAPNWCKPLLERMPEVRQAITMPLGHGAFALGDRYRLGKALRHQYDMAIVLPNSLKSAFIPFFAKIPLRRGWKGESRYLFLNDLRSNKKDYPMMVQRYIALAFEKGAVPKAEDLPRPVPYLTVDPITQQHTLKKFEKQTALISPRPSIGFCPGAEFGPAKRWPHYHYAKLAEMLIQQGYAIRLFGSAKDEAVGEEIRQALPETMRHFCINLAGQTSLNEAVDLIADCTAIVTNDSGLMHIAAAVQRPLVALYGPTSPTYTPPLSEKAVIIRLIEDGLIKVRKGKDSDEGYHQSLIDIQPELVFDKLTGLLANT >NZ_CP040918.1|WP_014326412.1|763172_763580_+|copper-chaperone-PCu(A)C MKSLTQLLFILTALLPTSLFAHIHVEQAQMFSAKAGEPSAIFMNIHNTGNEDVSLALVQSDIRADIVLHGTQHGKMIEVTGINLPAHQMTALKRGGLHIMVFNVEQDLNAGDSFPLRLLFDNGEIMHIEAKIIQY >NZ_CP040918.1|WP_014326411.1|761632_763057_+|PTS-sucrose-transporter-subunit-IIBC MNFSQIAQQVIDKLGGKDNISAAAHCATRLRIVVKNENLIDKKGIENIEGVKGQFAVAGQYQIIFGSGTVNKVYAELSKLLGIGDMTTSEVAAAGTEKQGLLQRLVKGLADIFVPIIPAIVAGGLLMGIHSMLTAKGFFVEEKNVVDLYPAIADLVDFINTIANAPFVFLPVLLGFSATRKFGGNPFLGAALGMLLVHPALSDGWNYALTLTKGNIQYWHIFGLEIERVGYQGTVIPVLVASWVLATLEKNLRKVVPSFLDNLITPLFALFITGLLAFTVIGPIGREAGSLISTGLTWLYDTLGFVGGAIFGTLYAPIVITGMHQTFIAVETQLLAEVARTGGTFIFPIAAMSNIAQGAACLGAAYVMKDAKVRGIGVPSGISALLGITEPAMFGVNLRYRYPFISAMIGAGISSAVIALFNVKAIALGAAGLPGIPSIKPDSLAMYCVGMLISASIAFTLTVILGKRAQLKAE >NZ_CP040918.1|WP_005752328.1|760384_761404_+|substrate-binding-domain-containing-protein MSITNKKRITLSDIAKCCGLSTTTVSMILNNRGEEFKIKAETCQRVKAIAEQQGYRANVYAKSLKMQRSNVIGFVIPDLTNYGFACTAKILEKQCRENGLQLIIACSDDNPQQEKLAIERLLDRQIDFLITAPTHQDPSYYQKIGQHTPILQLDRYVPDLALNYVISNDSEHITALICRLCDQYQLTEFMYFGGQRTLSPSESRLAGFLQGLKQANLNLKKEWILHRTYQPESGYQMLAETEAKLGRLPQAIFTASYTLLEGVLRYLTEQKKMDLLLNRQLHLATFDDHDILNALPFHIHSIKQNHPQLAQQIFQHIMRYFAGKKSPNQKIDCDVIYRD >NZ_CP040918.1|WP_016504356.1|758916_760359_+|glycoside-hydrolase-family-32-protein MYIFNQGKYKSLHAQEVGELAQIRQHVLRDTQFRPTYHLAPETGLLNDPNGLVFDGEKYHIFYQWFPYAAIHGMKHWKHFITYDFHHFQAADPLIPDELFESHGCYSGGALLWQDQIVAFYTGNTRNAENQRIPHQNIAIFKKDGTLLKKRCLLNQAPTGYTEHVRDPKPFITEEGKIRFILGAQREDLSGTALIYEMTDLDATPQLIGEFKLPDFDNQQVFMWECPDLLKLQEQDLFLWSPQGKAQKTYCFQNHYHATYALGQYANLHFSAQHIEELDYGFDFYAPQSIQGSEGIYYAWVGLPDLTYPTDEYQWHSMLSLPRQFSIQQGILYQRPIPQVYAQCLPAHKYWVEGKQQIPHLDRSYVAFDAENQPFTLRFFTNQRGQQLILRYQNGILTLDRTYTTQTALMQQFGEQRHCILPQLNHVEIFFDRSVVEIFLNQGEKVMTSRFFIADRENALDSSRPLCVSVAELKPIILTP >NZ_CP040918.1|WP_016504355.1|757952_758879_+|aminoimidazole-riboside-kinase MGKIWVLGDAVVDLIPEGENTYLRCAGGAPANVAVGIARLGATTGFIGRVGDDPLGRFMLNKLQQENVCTQYMHLDPKQLTSTVIVDLKEGERSFTFMVNPSADQFLELSDLPHFNPNDWLHCCSIALINEPSRSSTFAAIHRIKAEGGFFSFDPNLRESLWNSPAEMKTVVNQVVALADVLKFSEEELLFLTDSDTLSDATAKLTQHYPDKLIIVTLGKLGATYYLQGKSQLISSKKALIPVDTTGAGDAFVSGLLFGISQVKNWQNPTALVEIIKQANACGALATTAKGAMSALPNKQQLDAFLAE >NZ_CP040918.1|WP_014326407.1|757155_757767_-|high-frequency-lysogenization-protein-HflD MANYYDITLALAGVCQAAKLVQQFAHEGQADQAAFETSLNTLLQIYPEDTLAVFGGKAQNLKLGLETLLEQMHGTGSDLSRYWISLLALESKLNKDPHAKAELARRIQYLPTQLEHDDLLDEQMLSTLASIYVDVISPLGKKIQVTGSTLYLQQLAMHHRIRACLLAGIRSAVLWRQVGGTKWQVLFSRRKIIAMAKQIYSSL >NZ_CP040918.1|WP_005724904.1|755760_757128_-|adenylosuccinate-lyase MQLNALTALSPIDGRYQDKVSSLRSIFSEFGLLKFRVTVEVRWLQKLAATDQIQEVSLLSQEANDYLNHIVENFSVQDAERIKEIERTTNHDVKAVEYFLKEKSEALPELAKISEFIHFACTSEDINNLSHALMLKTAREEVILPEWQNLIADISALANEYKTIPLLSRTHGQPASPSTIGKEMANVVYRLQRQFKQLQQIDILGKINGAVGNYNAHLSAYPDIDWHQFSEEFVTSLGLTWNPYTTQIEPHDYIAEFFDNVARFNTIIIDFDRDLWGYIALNHFKQRTIAGEIGSSTMPHKVNPIDFENSEGNLGLANAVMAHLGAKLPVSRWQRDLTDSTVLRNLGVGLGYCLIAYAATRKGISKLEVNEQHLRDELDQNWEVLAEPIQTVMRRYGIEKPYEKLKALTRGKRVDAEAMREFIETLDIPAQEKIRLQQMTPATYIGAAVELVEKL >NZ_CP040918.1|WP_005758065.1|753817_755404_-|L-lactate-permease MVFFLSILPIVLLIYLMVKRNSLPSYIALPLIAVLTYLLQAFYFGTDLTRLNANVIAGLIATQTPITIIFGAILFNRMMEVSGSTDVLRKWLANINPNPVAQIMIIGWAFAFMIEGASGFGTPAAIAAPILMGLGFKPLQVAMLALVMNSVPVSFGAVGTPTWFGFGPLGLSEDVVLEVGQKTAFIHFIAAFVIPVLALRFLVSWQQIKQNLVFIYISILACTIPYFLLAQVNYEFPALVGGAIGLFISILVANKGIGVSKTAQAEIQLEKVEFGVLVKALFPTMMLIAILIVTRIHQLGIKQLLNDATTWFSVSLGAFGEFKVSQALILSLNNILGQGINESYKTLYVPSLIPFIVTVIISIFVFKLNGTKAKTIAVSTYQQTKKPFFALLGALVMVKLMLVGNENYDSMVITIGKTFADVTGDKWVYFSSYLGAIGAFFSGSNTVSNLTFGGIQLSIAETTGMSVPLILALQSVGGAMGNMVCLNNIIAVCTVLNVSNQEGSILKRTVVPMFLYGVIAALVAVVIY >NZ_CP040918.1|WP_005758057.1|767203_768532_-|ATP-dependent-RNA-helicase-SrmB MTLATFQDFDLAPALLKALAKKGYTRPTAIQQETIPAAMEQRDVLGSAPTGTGKTAAFLLPAIQHLLDYPRRKPGAPRILILTPTRELAMQVAEQAESFAEFTNLSIATITGGVAYQNHGEIFNSNQDIVVATPGRLLQYIKEENFDCRSVEILIFDEADRMLQMGFGQDAEKIAAETRWRKQTLLFSATLEGELLVDFASRLLTDPVQIDAEPSRRERKKIQQWYYHADSNEHKIKLLARFIDEEQVSRGIVFVRRREDVRELSETLRKRGIRSTYLEGEMAQTQRNNAIDKLKNGIVTVLVATDVAARGIDIEDVSHVMNFDLPYSADTYLHRIGRTARAGKKGVAVSFVEAHDYKLLGKIKRYTQELLKARIIEGLAPRTKAPKEGEVKTVSKKQKARIKAKREEKQKQEQKKKVKLRHKDTKNIGKRRKSNTPPANAE >NZ_CP040918.1|WP_014326415.1|768643_769357_+|tRNA1(Val)-(adenine(37)-N6)-methyltransferase MSAKQNGFTFKQFHIEHHRCAMKVGTDGILLGAWADVSQAERILDLGTGTGLIALMLAQRSTKESEIHAVELDQAAYLQAQANIHASPWAQRVHVYQQDAAEFCRNAVNKFDLIVANPPYFPQGVDCATPQRDLARYTATHRHVDWLNWASHCLSEQGKISMVLPFEAGETLLKQTALYCIARCEVITKKGKAPQRLLLTFSLQAQPLQPSQLIIYDESNRYHPDFIGLTKDFYLAF >NZ_CP040918.1|WP_005724867.1|769404_770109_-|nicotinamide-riboside-transporter-PnuC MNLQAVKNEFLGGWKPFEVAWLSLFLIAQIVIYIQNPDSILGMISGISGILCVVFVSKGKVSNYFFGLIFAYTYFYVAWQANYLGEMNTVLYVYIPAQFIGYFLWRENLQKGSEGAESVIAKSLTLKGWAIVLGTITIGTLLFVQALNAAGGSSTGLDGLTTVIVVVAQLLMILRYREQWLLWIALNVISIVLWTQAKEGSLAMVTMYSAYLLNSLYGYYNWTKLEKAHRQSVQ >NZ_CP040918.1|WP_014326416.1|770384_773288_+|RNA-polymerase-associated-protein-RapA MTFAVGQRWMSESENNLGLGLIVAIDMRTVTILFPASEEQRIYALNSAPLTRVLFQIGDEIVHHEGWKGNVLDILENNGVAFYLLKRQDNGEEITIQERDIAHQMTFSKPQDRLFTTQIDRNEHFTLRYQALTHQQAQFQSPLRGLRGIRAGLIPHQLHIAREVGQRTAPRVLLADEVGLGKTIEAGMILQQQLFAEKVERVLIIVPETLQHQWLVEMLRRFNLHFALFDEERCADFEDPASALWINPFSTESQIICALDWLCEKPKRVEQLLEAGFDMLIVDEAHHLGWSEHNPSLEYQLVEQLARQIPAVLLLTATPEQLGQESHFARLSLLDPDRFYDYQAFVQEQQQYQPVADAVQSLLADKPLSTVEKNHIADLLSEQDVEPMLKVIDSQAHDEQKALARQELIDNLIDRHGTSRVLFRNTRQGVKSFPHRTYNQITLELPKQYNNAANVLAMLGEKSENDSFYPEQMFQKLNPDARWWEFDPRLAWLITFLKNHREEKVLVICRHANTAIQLEQALREKEAIRAAVFHEKLSIVERDRAAAYFAQQEDGAQVLLSSSIGSEGRNFQFASHLVLFNLPDDPDLLEQCIGRLDRIGQSRDIQIHVPCFADTAQVVLARWYHEGLNAFEETCPMGMTLFETHQTQLNKFLQKPTALEGFAEFVSLTRKQQHELKQALEKGRDRLLELNSNGGEQAQQLATDIAEQDSTTELVNFTLNLFDIIGVDQEDLGEKSIVITPASNMLVPDFPGLKEEGATVTFDRQLSLAREDVEFMSWDHPLIRHGIDLITSGDIGKSAVSLLINKALPAGTLLLEMIYVVEAQAPKGLQLTRFLPPTPIRLLLDQKGNNLAEQVSFNALQKQLKPIGKNMANKVVKMVRPNIEQLVKLSEQKIVAQAQQIIHNTQQLADQTLSAELNRLTALQAVNKNIRQDEVDALENIRSQSLAQLQQATWRLDSLRVIVSNKE >NZ_CP040918.1|WP_005724855.1|773368_774028_+|bifunctional-tRNA-pseudouridine(32)-synthase/23S-rRNA-pseudouridine(746)-synthase-RluA MALISYTPPTDPYLDIVHYDDHFVVINKPSGLLSVPGNQPQYYDSAMSRVKEKYGFCEPAHRLDMSTSGLILFALSKAADRELKRQFREREPKKHYQALVWGHLEEDQGEVNLPLICDWENRPRQKICFERGKPALTLYEVLARYPNNTTRVKLTPITGRSHQLRLHMLALGHPILGDKFYAPPQAKALSPRLCLHAEQLAFRHPITQEWLSFSAPPAF >NZ_CP040918.1|WP_014326417.1|774091_774661_+|Der-GTPase-activating-protein-YihI MARKKKTRRVSDIMPARKVDKKVELPKGKPGKKLTRYELDAKAREDKKKKKRKGLASGSRHSATENNNKHQALEKKDPRIGSRKKVPLVVEFVNKPEKGMTIPPMKLEEKLPKQDPMLELELLESNECLNQLLDDLEAGKTLSAEDQQFVDDCLDRIAELMDELGISEDDDPEEDLLRTFEKIDINQFR >NZ_CP040918.1|WP_005719208.1|774666_775095_+|DUF2489-domain-containing-protein MWTNILLILAVLVIVAMASYAGYLLLALQKQKKAIANMRTARSQRLTESIVIIAKAMQNGDCNHSEGVIRLKMLLDPLGKKLKNYQAMYQLYEVVMEMPTHEKRRELKKNERMRLDLQRESAEAELEQKIRLELQQLLIDMK >NZ_CP040918.1|WP_025248519.1|775118_776486_+|oxygen-independent-coproporphyrinogen-III-oxidase MSDIVWDLALIQKYNQSGPRYTSYPTALEFNENYTNQDFIQATKRYPNRPLSLYVHIPFCHKLCYFCACNKTITRHQHKADIYLDFLEREIENRASLFKNRIATQVHWGGGTPTYLTEQQSARLMAMLRKHFTIAPDAEISIEMDPREIELNMLDHLRRIGFNRMSMGVQDFNKDVQKAINRVQDEDFIEALLKRARELGFQSTNLDLIYGLPLQNVDSFMFTLQKVIALNSDRLSVFNYAHLPSRFAGQAKIKNEQLPAPETKLTILQKMIETLGDAGYKFIGMDHFAKPDDELAIAQKQGVLHRNFQGYTTQEECDLLGLGVSAISLLGDTYAQNQKELKHYYTAIDNTGIALHKGFAMSEEDCLRRDVIKQLICNFKLDYQPIEQQYGIQFTSHFAEDLKLLAPLSEDGLLTIGEKDIQVSAKGRLLIRNICLCFDTYSREQAKRQQFSRII >NZ_CP040918.1|WP_014326419.1|776526_777195_+|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase MSISKTDILNAFHFRHACKAYDPSKKISEEDFRFILETGRLSPSSFGFEPWKFLVIENPDIKALIRDTAWGAKDKVMDCSHFVVVLVRQPETLLADGEYVQHMMRDIHHIPEEMRKIRQNFYRTFSEQDFALTENPKAFYDWACRQSYIALANMLTSAAMIGIDSTPIEGFPLEKMDHIFVEQGLYDPKTYKLSVMIAFGYRLNEPKAKTRQAFDDVVEWVR >NZ_CP040918.1|WP_005752888.1|777290_777626_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MQITRRNASTKGASVAEIDRKKVRNEIIQAMLMGELSQGEALRKLRIEMFGINQQHYIQLVKVSRQTLSNIENDKGNYSVETINKVFKPFGLELGLVPVSKALLKELFSTA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP040918_4 | 1100136-1100288 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP040918_4
|
2 spacers
spacers of NZ_CP040918_4
>4.1|1100161|27|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder AAATAATCTGACAGCTATTTCTAGTTT >4.2|1100213|51|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder TGTCGTAAAAAATAGGATAAACCCTTATCCTTTCGTTGAATGAATAGCTAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP040918_4
The CRISPR arrays of NZ_CP040918_4 >merge|NZ_CP040918|4|1100136-1100288|CRISPRCasFinder ATTTGACACCTATTTCTTGTTTTCTAAATAATCTGACAGCTATTTCTAGTTTTTATGACATTTATTTCTGGTTTTTATGTCGTAAAAAATAGGATAAACCCTTATCCTTTCGTTGAATGAATAGCTAATTATGACATTTATTTCTAGTTTTTA >NZ_CP040918|4|4|1100136-1100288|CRISPRCasFinder ATTTGACACCTATTTCTTGTTTTCT AAATAATCTGACAGCTATTTCTAGTTT TTATGACATTTATTTCTGGTTTTTA TGTCGTAAAAAATAGGATAAACCCTTATCCTTTCGTTGAATGAATAGCTAA TTATGACATTTATTTCTAGTTTTTA
>NZ_CP040918.1|WP_012478341.1|1099468_1100131_-|heteromeric-transposase-endonuclease-subunit-TnsA MRKTHSFQQVRKIKPTWMSVSGHIPFRNGVSIPYESTLERDFLMYFTYLPSVDEIVSQPTTLPFVKNGITYTYTPDFFLSFTDGRKPMLIEVKPKAKWQKHWKEWKEKWKAAIRFCQENGYVFHVYDEDRIRHLALFNLNYVQRYKRIQHEQEDIDVILAQVKLMGNTTIDYLLSRFFAGSLYRMKGLQIIYHLLATKQLHCNWFLPLNEFTEVWGNNDE >NZ_CP040918.1|WP_012478339.1|1096665_1097553_-|AAA-family-ATPase MQYEHVHEKFRHLVTADNQERIAFLDEPRWLGYGVAKDIMDNLVSLMNKPKRPRMLNLLIVGDSNNGKTTLIRRFFDLYGQAYIDSDSNAIYPILLAEAPPSANEKELYISLLERFYVPYKPTDTIAKLRYQTIHLFREFRVKMLIIDEFHSLLVGTPRLQRQVMNAIKMLCNELQIPIVGVGTRDAIRVLHTDPQHASRFDVAELPTWKLDKDFQKLLFQFQGILPLKKCSNLQSPELATKIHTISGGNLGNVHRLLTACAVEAITSGTEQITLDIIEKNSWVQPTQGFRKIIG >NZ_CP040918.1|WP_012478338.1|1095589_1096708_-|TniQ-family-protein MGTTNAGLPKNYRIKSGVIKTPLYSNESISSWLIRSALDCGTEPITFTGFYWNEWRLWTYDLDRGFEPISQHIYADINELSLNQQVNLVNHSLYSVLRPINGKNTLIKGQAKWVLSRGSRNRSFRVGQSYCPCCLEETPYLRNEWRFAWHFGCLKHKVLFESKCSCCGGLYQPHLLSAEKRQLNYCHQCGEKLQVITTPLNEVEIATMETLDNVFTTNSGECFGKCVDSQVYFAILRYFINFTRRAAIAKSTHSFSRFVEQCGISQVEICQTKTALAFEQLPVEERKNLLVNAGKILKLSSKDFIQAIKQSGITQKAFAFERYPTELDNLFKYAIEGKTTSRKTIINKPKTDSVLSLNRQWERLKRQLQIAV >NZ_CP040918.1|WP_140012166.1|1093804_1094059_-|tRNA-delta(2)-isopentenylpyrophosphate-transferase MNSTNNKSTLSLKQQFKLWLEQEQKDGDMIILVGIPDILKRFDRRLAIIKGNQLEKRYLREWREAFRIDRKLLIKATMAAHVKY >NZ_CP040918.1|WP_026042305.1|1091499_1092156_+|hypothetical-protein MLEYRNKVWAYEYMTFSRRIGELWEPFCKLAFKYSTKDLLLVEPLDFNQIKEDIKGNAINFIYKLPISFEDKNELIRLYETPWNLMGSGGIKLDLDLHFSQGNCYHNCDFKSGFSSNEKGNTNRLLLVGSIYNSLNQYMRNIIFVRQPEDQNNHYLQKLKHSGYWEVYCADDAYSVMAEFTGFNLKSWLENNADWANDMEQDFRRHLERNNLISYLTW >NZ_CP040918.1|WP_001089068.1|1089159_1090365_-|tetracycline-efflux-MFS-transporter-Tet(B) MNSSTKIALVITLLDAMGIGLIMPVLPTLLREFIASEDIANHFGVLLALYALMQVIFAPWLGKMSDRFGRRPVLLLSLIGASLDYLLLAFSSALWMLYLGRLLSGITGATGAVAASVIADTTSASQRVKWFGWLGASFGLGLIAGPIIGGFAGEISPHSPFFIAALLNIVAFLVVMFWFRETKNTRDNTDTEVGVETQSNSVYITLFKTMPILLIIYFSAQLIGQIPATVWVLFTENRFGWNSMMVGFSLAGLGLLHSVFQAFVAGRIATKWGEKTAVLLGFIADSSAFAFLAFISEGWLVFPVLILLAGGGIALPALQGVMSIQTKSHQQGALQGLLVSLTNATGVIGPLLFAVIYNHSLPIWDGWIWIIGLAFYCIIILLSMTFMLTPQAQGSKQETSA >NZ_CP040918.1|WP_000428546.1|1088453_1089047_+|tetracyline-resistance-associated-transcriptional-repressor-TetC MENKNHQQENFKSTYQSLVNSARILFVEKGYQAVSIDEISGKALVTKGAFYHHFKNKKQLLSACYKQQLIMIDAYITTKTDLTNGWSALESIFEHYLDYIIDNNKNLIPIQEVMPIIGWNELEKISLEYITGKVNAIVSKLIQENQLKAYDDDVLKNLLNGWFMHIAIHAKNLKELADKKGQFIAIYRGFLLSLKDK >NZ_CP040918.1|WP_025248539.1|1079160_1079778_+|YihA-family-ribosome-biogenesis-GTP-binding-protein MSDIKLNYHKTHFLTSAPDIRALPEDSGIEIAFAGRSNAGKSTALNALTNQKSLARTSKTPGRTQLINLFEVEPQCRLVDLPGYGYAAVPEQMKIQWQKALGEYLQKRQCLAGVVILMDIRHPLKDLDQQMIEWTVASELPVLLLLTKADKLSQSARSKQVKMVREAILPFQGDVQVEAFSALNKTGIDRLAAKLDSWFAPVLSE >NZ_CP040918.1|WP_014668443.1|1078180_1079050_-|VirK/YbjX-family-protein MTDNFYQWPDPMRLYPDQGKKSYRLKRFRFHLRSLLHQGNIKRFEQFINQHPTLAGLLNSRPSFSYPLAHRFLDKRFSTKQRFAAICENLRFLPEKFTALGLPQLWEKEMCFGEVIEDFELYLCLNYHQAMEGYWALELRYKPTGQLIYLLTFGKVEQSLLIAVIQGPNFEGSKELVKVLTKKCHGLRPAYLMVEAMKALTNALGYDKLLGIPHKYQNKSRLVQSKRYVVDYDAIFAESAGELKDYWELPVQFAMKDMDSIPSNKRSMYRKRYAMLEQLQANMKQTLQH >NZ_CP040918.1|WP_005755093.1|1077630_1078107_+|tRNA-(uridine(34)/cytosine(34)/5--carboxymethylaminomethyluridine(34)-2'-O)--methyltransferase-TrmL MLDIVLYEPEIPQNTGNIIRLCANTGFRLHLIEPLGFTWDDKKLRRSGLDYHEFAEIKRHKTFETFLATEQPKRLFALTTKGSPAHSQVQFELGDYLMFGPESRGIPMSILDSLPMAQKIRIPMTENSRSMNLSNSVAVAVYEAWRQLGYGGAVNLPR >NZ_CP040918.1|WP_025248534.1|1101464_1104026_+|TonB-dependent-receptor MNKSKKILGYILPLILPLYSYAESTELDVISVETEAFKEKDKVFLKQSASSTRTQFQTATQSLDSVLRSVPGSFTQIDKSSGTVSVNVRGGTGFGRVNTMIDGVSQTFYASSTDSGSRNSSTSQFGSLIDPGFLSRVEIDRGSFEGSHGANTLLGSAHFKTIGVKDLVAESRQLGFMGKYLWGSNATEPQVLGAVAFKQNFENERWLGLLYGFSERHLSQDYRIGGGRKVTESSIDLTGLDENDREQTDTSPFDATHVRQRPISHLAKLEYGDRYQQGTLSYRQYQTRVGGRSIRNNNYQFNYHLALPDISWLDFNLLLARNVSSQKYPEGTMIIGKTLLTPLIASNKADTFDVNNMFHFDLPFEATLKTRVGFHILKSRYFKNRDPSEELNINLEEGERTYDFDCLGLGCIRKSLGKATFQPNGKHNIITFYVDNHLSWKMFNLDYNINLSRYTLKGERLKYLPHYLSNMDNEINALTRKLRKGRSKDTKIQQQLLQLMSKRDDLKQHNCKEEEDGHEQCREVNFTLPDSSAGKMYNYSVTLSTHLHDLFTPFISYAKSHRAPNIREVFFSSVGDYGVNTNLKPETAKTIQFGINGYRDRLFSERDKLGYKVVYYNTHIKDFIYNSDNRQPLVAGKLIYLNDTNILHKNYSQRVKMTGIETEISYDMGNIYFNLTYAKQKNNQPVSFTDGSARTGGASNTNRLLQGFGASKISVLPESYGSLEIGTRFFDGKLDISTTAKYYGKSKRVLKQPLAIKSGDEKDTVKEQIRVTQDIPKQPIIFDLQISYEPIKNLVLKAEVQNVFDKRYINPLDANNDSASQSVFNIDLSDKTINVLNNFARGRTYVFTLSYQY >NZ_CP040918.1|WP_005757690.1|1104132_1104819_-|hypothetical-protein MKQKYLFIASMALAGCGSMSESNKYWIQYKDIDQSVKEVSFWSREQFHSPSDVKGTVYQRDNLTHLATSTPLGEIYHIYDVNHIPMNVIFLDTKTQRSLNPQNAQDMAQLSKATQFDFYEFGKGRIAHAVFSAKTGLCQDFKSKRGVALKMATNYYTDDSYKGYYVSVIHAIIRHNGQHTDFAYTPAFSIADTKALAMTQALEKQDGERVAQMNLKEKVTLLTNIVCQ >NZ_CP040918.1|WP_015702556.1|1104839_1105682_-|divergent-polysaccharide-deacetylase-family-protein MKTIGVKRVKSALLFGGFWISMALAQPAKLAIVIDDIGYHQKEDAQIYALPKEISVAIIPSAPHARQRNEQAYQQGRDILIHMPMQPLSHQRIEAGGLHVGMRQEDVQQRVQTAKAIVSHAIGMNNHMGSAATADAELMRKLMQELKVQDLFFLDSRTIGRSVAGKIAKEYGVQSLDRHIFLDDKDTYADVERQFQRAVHYAQKHGTAIAIGHPRKNTVAVLQAGLKHLPDNVQLVGMGRLWRSETGTAPKPLISLFNTMPAPTSSMPYQAVPMLRGIPQ >NZ_CP040918.1|WP_014668439.1|1105678_1106950_-|murein-hydrolase-activator-EnvC MLYLINVILTEGFAMWLRLNNVKTRRKLTALCCGLLCMSVNVFANDLSKIQQQIKQQEQKIAEQKKAQQKLQSHLKNQETQINQVITQLRQTETDLKESRKMISDTEKQIQRLEKQEREQKQKLAEQLDSAYRSAANPSALERMLSEEAKNADRLKQYYAHMNQARLALIDDLKATQTQLAQEKATMIAQQKAQQSQLSQQKKQQQDLQKVQQERQSTLKQLNRNLSRDETRLETLRANENALRQEIQRAEQAARQQEQREREAYAQKKQAEEKKTQKPYQPTAQEKQLMASSSGLGKPNKQYAYPVSGKLLNSFGATQMGELRWKGMVIGANAGTAVKSIADGRVILANWLQGYGLMVIIKHGENDLSLYGYNQSVVVKEGQFVKAGQKIAEVGSSGGQSQSSLYFEIRRKGVAVNPIGWLK >NZ_CP040918.1|WP_005718066.1|1107090_1107774_+|2,3-diphosphoglycerate-dependent-phosphoglycerate-mutase MELVFIRHGFSEWNAKNLFTGWRDVNLTERGIEEAKSAGKKLLEAGFEFDIAFTSVLTRAIKTCNIVLEESNQLWIPQVKNWRLNERHYGALQGLDKKATAEQYGDEQVHIWRRSYDISPPDLDPQDPHSAHNDRRYAHLPSDVVPDAENLKITLERVLPFWEDQIAPALLAGKRVLVTAHGNSLRALAKHIEGISDADIMDLEIPTGQPLVYKLDDNLKVVEKYYL >NZ_CP040918.1|WP_014325726.1|1107894_1108359_-|IS200/IS605-family-transposase MASKSNDDSSLSHTRWNCKYHIVFIPKYRRKAIYGKLRVDIGGILRQLCHYKNVEIIEAYAMKEHIHMLLRIPPKLAVSSFMGYLKGKSSLMIFERHANLKYKYGNRNFWAKGYYVSTVGLNTKIVEEYIRNQEKEDMIQDNLSKKEYMDPFKG >NZ_CP040918.1|WP_005717992.1|1108544_1109603_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSYIQLNHVMKKFGDVIAIPDLSLSIEKGECFSMLGPSGCGKTTTLRMIAGFEDLDGGEIRVGDRLLSSKITNFYLPPEKRNFGMVFQAFAVWPHMTVYDNVAFPLTLKNVSRQEIEKRTNDALKHTNLLNVAQKSPDDLSGGGKQRVALARALALNPDVMLLDEPLSSLDPHLREEMRFEIKALQRKFGFSIIYVTHDQAEAMALSDRILVMRKGLIEQIDTPLNVYNNPSNKFVFNFIGLSNQLQVNLSPQGVSFAGLDGTFHIQPSPPIALVQQGKAILATRPSEIDFVNEGGVTGVVKRRSYLGEVIDYNIVVGDQELRVQKGRRDPGPKEGESCQLVFTRLHWYPVE >NZ_CP040918.1|WP_005752033.1|1109624_1111319_-|iron-ABC-transporter-permease MAAVIQKSPFNVANAILALSIGILVIVVAVPVLLIFINSFWVNGQFNVTDVVNILKQKETYEALLNSLFIAVGVTIMSTIVGTFFAWLVTRTDLPYKGLMKVMFLVPFMLPSFIGALAWKMLLSPRAGYINRFFMDTFGLEEPIFNIYSYTGIMAVETMYLFPFVFIQVCGALERMDPTLEESARISGASLFTITRKITIPLVMPSIVSGALLIMLYSMAHFGTVAVLGVENGIFNIPTLIYERIHQSAGSFEAIRTGTVLATVLVVTAALIIWLQNKILNRGRFQIIAGKSFRPVEVKLRGLRMPLLFICVFYIAFTIVLPTVTIFIVGGLKTYGLPITWENLTFDNYKFILFDWQLTKDAIRNSVLLGLAAAVITMFAGVMISYVIVKMRVKGKGILEFLGMLPFSVPGSVIALGVILAWSGKFGINLYNTVWIILIAYIARYMAFSLKANSAALEQVHDSLVEAARACGASMWQSLKDIVVPLVRPGMIAAFFLIFLPALRELTVSVMLYGPSTRTIGVAIYTLNEDGETVYSAALAGIALIIIVFGQTVIKRYAEKKTQK >NZ_CP040918.1|WP_005755022.1|1111321_1112410_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MATITFEKVSKAFGSNEVLKDLSLVVKDGECFTLLGPSGCGKTVLLRLLAGFDVPDSGRILIDEHVVSDPAEGIDIPPDQRSLGVVFQDYAVWPHMTVFDNIAYPLKLKDLDKALIQQQVMEVVNLVNLTGLEKRLPSQLSGGQQQRVALARALVAKPSLMLLDEPLNNLDANLREEMRFEIKELQKKLGITILYVTHDQEIALAISDRLAIMDKNGDIQQIGTPWEIYEKSANEMVFKFMGLANFIHVRYEEGQHFIGQGKQALQWQNLPAESGKLGCRPSDIILSKSGEGLKGKVARASFLGAVMDYMINIDGVSLRTEISTNKALQHDLMFQEGEDCYVNFHDLLWFTDNQQHVQQTRG >NZ_CP040918.1|WP_005724123.1|1112424_1113414_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKTFSSALIALGLSMTIAGVAHANEKLIVYTSMKESLIGALKTKFNEKHPDIAMDYQSAGAGKLMAKIAAEKESGQIMADVIWTSEVPDFFKMKANGMLDAYVSPEVEHIVNPIPDFDGSFTPIRLGTLGIAYNTRFVKEPPTSWDDITGAKYKGAFGIANPALSGTAYMSVALLKSTFGWEFFEKIKANKGKVGKGSGQVVDDTASGDLLASLAVDYITNDKIKKGAQLKLVYPKEMLVIPSPAAIFKGTKNPAAAKKFIDFLLSEEAQHIIAHEGTLPVRKGVATLEGMPTVEDAISRAIPIDYQAILTEKEEIVKKFTQILQGRQ |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP040918_3 | 3.19|766817|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 766817-766848 | 32 | NZ_CP040918.1 | 999953-999984 | 0 | 1.0 |
NZ_CP040918_3 | 3.20|766877|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 766877-766908 | 32 | NZ_CP040918.1 | 889592-889623 | 0 | 1.0 |
NZ_CP040918_3 | 3.21|766937|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 766937-766968 | 32 | NZ_CP040918.1 | 1636319-1636350 | 2 | 0.938 |
1. spacer 3.19|766817|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to position: 999953-999984, mismatch: 0, identity: 1.0
tacgccattatggcgactgacttccgcgataa CRISPR spacer tacgccattatggcgactgacttccgcgataa Protospacer ********************************
2. spacer 3.20|766877|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to position: 889592-889623, mismatch: 0, identity: 1.0
acttgtgcaagggttgtgtgttcataggcttt CRISPR spacer acttgtgcaagggttgtgtgttcataggcttt Protospacer ********************************
3. spacer 3.21|766937|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to position: 1636319-1636350, mismatch: 2, identity: 0.938
taaaattaaaactatcgtcgcttgcttgtagc CRISPR spacer taaaattataactgtcgtcgcttgcttgtagc Protospacer ******** ****.******************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP040918_3 | 3.20|766877|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 766877-766908 | 32 | MH238466 | Pasteurella phage AFS-2018a, complete genome | 26881-26912 | 0 | 1.0 |
NZ_CP040918_3 | 3.22|766997|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 766997-767028 | 32 | MH238467 | Pasteurella phage Pm86, complete genome | 42524-42555 | 0 | 1.0 |
NZ_CP040918_3 | 3.1|765737|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 765737-765768 | 32 | MH238467 | Pasteurella phage Pm86, complete genome | 42601-42632 | 1 | 0.969 |
NZ_CP040918_3 | 3.4|765917|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 765917-765948 | 32 | MH238466 | Pasteurella phage AFS-2018a, complete genome | 23770-23801 | 1 | 0.969 |
NZ_CP040918_1 | 1.14|209887|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209887-209918 | 32 | NC_003315 | Haemophilus phage HP2, complete genome | 26899-26930 | 2 | 0.938 |
NZ_CP040918_1 | 1.14|209887|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209887-209918 | 32 | AY027935 | Haemophilus influenzae phage HP2, complete genome | 26899-26930 | 2 | 0.938 |
NZ_CP040918_3 | 3.3|765857|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 765857-765888 | 32 | NC_008193 | Pasteurella phage F108, complete genome | 11445-11476 | 2 | 0.938 |
NZ_CP040918_3 | 3.3|765857|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 765857-765888 | 32 | DQ114220 | Bacteriophage F108, complete genome | 11445-11476 | 2 | 0.938 |
NZ_CP040918_3 | 3.9|766217|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 766217-766248 | 32 | MH238467 | Pasteurella phage Pm86, complete genome | 42843-42874 | 2 | 0.938 |
NZ_CP040918_3 | 3.21|766937|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 766937-766968 | 32 | MH238467 | Pasteurella phage Pm86, complete genome | 48883-48914 | 2 | 0.938 |
NZ_CP040918_1 | 1.14|209887|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209887-209918 | 32 | U24159 | Bacteriophage HP1 strain HP1c1, complete genome | 27719-27750 | 3 | 0.906 |
NZ_CP040918_1 | 1.14|209887|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209887-209918 | 32 | NC_001697 | Haemophilus phage HP1, complete genome | 27719-27750 | 3 | 0.906 |
NZ_CP040918_1 | 1.12|209767|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209767-209798 | 32 | NZ_CP017756 | Cupriavidus malaysiensis strain USMAA1020 isolate pure plasmid unnamed1, complete sequence | 73488-73519 | 5 | 0.844 |
NZ_CP040918_3 | 3.7|766097|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 766097-766128 | 32 | HQ110084 | Erwinia phage ENT90, complete genome | 19091-19122 | 5 | 0.844 |
NZ_CP040918_3 | 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 765797-765828 | 32 | NZ_KX086582 | Staphylococcus aureus strain WBG1024 plasmid pWBG637, complete sequence | 25794-25825 | 6 | 0.812 |
NZ_CP040918_3 | 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 765797-765828 | 32 | NZ_KF831355 | Staphylococcus aureus strain A960649 plasmid pBU108a, complete sequence | 23170-23201 | 6 | 0.812 |
NZ_CP040918_3 | 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 765797-765828 | 32 | NZ_AP018563 | Staphylococcus argenteus strain 58113 plasmid p1, complete sequence | 18411-18442 | 6 | 0.812 |
NZ_CP040918_3 | 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 765797-765828 | 32 | NC_013327 | Staphylococcus aureus plasmid pWBG749, complete sequence | 26168-26199 | 6 | 0.812 |
NZ_CP040918_3 | 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 765797-765828 | 32 | CP030569 | Staphylococcus aureus strain ER01892.3 plasmid unnamed1, complete sequence | 12940-12971 | 6 | 0.812 |
NZ_CP040918_3 | 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 765797-765828 | 32 | CP030458 | Staphylococcus aureus strain ER04013.3 plasmid unnamed1, complete sequence | 15652-15683 | 6 | 0.812 |
NZ_CP040918_3 | 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 765797-765828 | 32 | NZ_AP017923 | Staphylococcus aureus strain JP02758 plasmid pJP080, complete sequence | 17835-17866 | 6 | 0.812 |
NZ_CP040918_3 | 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 765797-765828 | 32 | NC_013325 | Staphylococcus aureus plasmid pWBG745, complete sequence | 13088-13119 | 6 | 0.812 |
NZ_CP040918_3 | 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 765797-765828 | 32 | CP030696 | Staphylococcus aureus strain ER01532.3 plasmid unnamed1, complete sequence | 28191-28222 | 6 | 0.812 |
NZ_CP040918_3 | 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 765797-765828 | 32 | CP030710 | Staphylococcus aureus strain ER01174.3 plasmid unnamed1, complete sequence | 7547-7578 | 6 | 0.812 |
NZ_CP040918_3 | 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 765797-765828 | 32 | NZ_CP012757 | Staphylococcus aureus subsp. aureus strain JS395 plasmid, complete sequence | 37721-37752 | 6 | 0.812 |
NZ_CP040918_3 | 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 765797-765828 | 32 | NZ_CP042004 | Staphylococcus aureus strain B3-14B plasmid pSALNT46, complete sequence | 11471-11502 | 6 | 0.812 |
NZ_CP040918_3 | 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 765797-765828 | 32 | NZ_CP047857 | Staphylococcus aureus strain UP_1435 plasmid unnamed1, complete sequence | 26882-26913 | 6 | 0.812 |
NZ_CP040918_3 | 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 765797-765828 | 32 | NZ_CP012594 | Staphylococcus aureus strain HOU1444-VR plasmid pVR-MSSA_01, complete sequence | 9160-9191 | 6 | 0.812 |
NZ_CP040918_3 | 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 765797-765828 | 32 | NZ_MH587575 | Staphylococcus aureus strain WBG4880 plasmid pWBG637, complete sequence | 17922-17953 | 6 | 0.812 |
NZ_CP040918_3 | 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 765797-765828 | 32 | NZ_MH587574 | Staphylococcus aureus strain WBG10514 plasmid pWBG731, complete sequence | 17842-17873 | 6 | 0.812 |
NZ_CP040918_3 | 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 765797-765828 | 32 | CP030603 | Staphylococcus aureus strain ER00484.3 plasmid unnamed1, complete sequence | 34556-34587 | 6 | 0.812 |
NZ_CP040918_3 | 3.16|766637|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 766637-766668 | 32 | NZ_CP045351 | Vibrio sp. THAF100 plasmid pTHAF100_a, complete sequence | 521041-521072 | 6 | 0.812 |
NZ_CP040918_1 | 1.11|209707|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209707-209738 | 32 | NZ_CP046163 | Vibrio sp. THAF191c plasmid pTHAF191c_b, complete sequence | 465830-465861 | 7 | 0.781 |
NZ_CP040918_1 | 1.11|209707|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209707-209738 | 32 | NZ_CP046066 | Vibrio sp. THAF191d plasmid pTHAF191d_b, complete sequence | 650120-650151 | 7 | 0.781 |
NZ_CP040918_1 | 1.11|209707|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209707-209738 | 32 | NZ_CP045356 | Vibrio sp. THAF64 plasmid pTHAF64_a, complete sequence | 1110688-1110719 | 7 | 0.781 |
NZ_CP040918_1 | 1.14|209887|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209887-209918 | 32 | MN693155 | Marine virus AFVG_25M94, complete genome | 42117-42148 | 7 | 0.781 |
NZ_CP040918_1 | 1.13|209827|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209827-209858 | 32 | MN694758 | Marine virus AFVG_250M853, complete genome | 27038-27069 | 8 | 0.75 |
NZ_CP040918_1 | 1.13|209827|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209827-209858 | 32 | MN694774 | Marine virus AFVG_250M941, complete genome | 26488-26519 | 8 | 0.75 |
NZ_CP040918_1 | 1.13|209827|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209827-209858 | 32 | MN694077 | Marine virus AFVG_250M852, complete genome | 27041-27072 | 8 | 0.75 |
NZ_CP040918_1 | 1.13|209827|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209827-209858 | 32 | MN693487 | Marine virus AFVG_25M100, complete genome | 6473-6504 | 8 | 0.75 |
NZ_CP040918_1 | 1.13|209827|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209827-209858 | 32 | MN694586 | Marine virus AFVG_250M370, complete genome | 8206-8237 | 8 | 0.75 |
NZ_CP040918_3 | 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 765797-765828 | 32 | MK905543 | Vibrio phage USC-1, complete genome | 55483-55514 | 8 | 0.75 |
NZ_CP040918_3 | 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 765797-765828 | 32 | MK358448 | Vibrio phage 5, complete genome | 209261-209292 | 8 | 0.75 |
NZ_CP040918_3 | 3.21|766937|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 766937-766968 | 32 | AY328852 | Vibrio parahaemolyticus phage VP16T, partial sequence | 41690-41721 | 8 | 0.75 |
NZ_CP040918_1 | 1.7|209467|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209467-209498 | 32 | LN846932 | Carnobacterium maltaromaticum strain LMA28 LMA_pa plamid, complete genome | 1949-1980 | 9 | 0.719 |
NZ_CP040918_3 | 3.7|766097|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 766097-766128 | 32 | NZ_CP037949 | Erwinia sp. QL-Z3 plasmid unnamed1, complete sequence | 20626-20657 | 9 | 0.719 |
NZ_CP040918_3 | 3.7|766097|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 766097-766128 | 32 | NC_014305 | Erwinia billingiae Eb661 plasmid pEB170, complete sequence | 99511-99542 | 9 | 0.719 |
NZ_CP040918_3 | 3.8|766157|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 766157-766188 | 32 | NZ_CP039495 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000669 plasmid pCFSAN000669_2, complete sequence | 22879-22910 | 9 | 0.719 |
NZ_CP040918_3 | 3.8|766157|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 766157-766188 | 32 | NC_011802 | Salmonella enterica bacteriophage SE1, complete genome | 13842-13873 | 9 | 0.719 |
NZ_CP040918_3 | 3.8|766157|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 766157-766188 | 32 | CP051278 | Salmonella phage ST-87, complete genome | 24650-24681 | 9 | 0.719 |
NZ_CP040918_3 | 3.8|766157|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 766157-766188 | 32 | CP051288 | Salmonella phage ST-29, complete genome | 37493-37524 | 9 | 0.719 |
NZ_CP040918_3 | 3.8|766157|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 766157-766188 | 32 | CP051285 | Salmonella phage ST-32, complete genome | 30587-30618 | 9 | 0.719 |
NZ_CP040918_3 | 3.8|766157|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 766157-766188 | 32 | MH370387 | Salmonella phage S149, complete genome | 14295-14326 | 9 | 0.719 |
NZ_CP040918_3 | 3.8|766157|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 766157-766188 | 32 | MG407615 | Salmonella phage Bp96115, partial genome | 4214-4245 | 9 | 0.719 |
NZ_CP040918_3 | 3.8|766157|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 766157-766188 | 32 | NC_042346 | Salmonella virus BTP1 genome assembly, chromosome: BTP1 | 29932-29963 | 9 | 0.719 |
NZ_CP040918_3 | 3.8|766157|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 766157-766188 | 32 | NC_014900 | Salmonella phage ST160, complete genome | 13910-13941 | 9 | 0.719 |
NZ_CP040918_3 | 3.8|766157|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT | 766157-766188 | 32 | NC_005841 | Enterobacteria phage ST104 DNA, complete genome | 14296-14327 | 9 | 0.719 |
NZ_CP040918_3 | 3.18|766757|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 766757-766788 | 32 | JX094500 | Cronobacter phage CR5, complete genome | 210741-210772 | 9 | 0.719 |
NZ_CP040918_3 | 3.22|766997|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 766997-767028 | 32 | NZ_CP012702 | Sphingopyxis macrogoltabida strain EY-1 isolate activated sludge plasmid 2, complete sequence | 56918-56949 | 9 | 0.719 |
NZ_CP040918_3 | 3.22|766997|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 766997-767028 | 32 | NZ_CP033227 | Sphingobium yanoikuyae strain SJTF8 plasmid pF1, complete sequence | 447275-447306 | 9 | 0.719 |
NZ_CP040918_1 | 1.6|209407|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209407-209438 | 32 | CP011076 | Brevibacillus laterosporus strain B9 plasmid unnamed2, complete sequence | 505837-505868 | 10 | 0.688 |
NZ_CP040918_1 | 1.12|209767|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209767-209798 | 32 | NZ_CP025547 | Mycobacterium paragordonae strain 49061 plasmid unnamed1, complete sequence | 284092-284123 | 10 | 0.688 |
NZ_CP040918_1 | 1.13|209827|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209827-209858 | 32 | NZ_CP026928 | Agrobacterium tumefaciens strain 1D1609 plasmid pAt1D1609b, complete sequence | 5680-5711 | 10 | 0.688 |
NZ_CP040918_1 | 1.13|209827|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209827-209858 | 32 | GU943040 | Uncultured phage MedDCM-OCT-S09-C28 genomic sequence | 16896-16927 | 10 | 0.688 |
NZ_CP040918_3 | 3.11|766337|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 766337-766368 | 32 | MH271312 | Microbacterium phage RobsFeet, complete genome | 44909-44940 | 10 | 0.688 |
NZ_CP040918_3 | 3.11|766337|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 766337-766368 | 32 | MK524510 | Microbacterium phage Fireman, complete genome | 45329-45360 | 10 | 0.688 |
NZ_CP040918_3 | 3.22|766997|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 766997-767028 | 32 | NZ_CP023452 | Rhizorhabdus dicambivorans strain Ndbn-20 plasmid p3, complete sequence | 33336-33367 | 10 | 0.688 |
NZ_CP040918_3 | 3.22|766997|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 766997-767028 | 32 | NZ_CP009296 | Novosphingobium pentaromativorans US6-1 plasmid pLA2, complete sequence | 25608-25639 | 10 | 0.688 |
NZ_CP040918_3 | 3.22|766997|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 766997-767028 | 32 | NZ_CP022749 | Sphingobium hydrophobicum strain C1 plasmid p3, complete sequence | 36365-36396 | 10 | 0.688 |
NZ_CP040918_3 | 3.22|766997|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 766997-767028 | 32 | NZ_CP033229 | Sphingobium yanoikuyae strain SJTF8 plasmid pF3, complete sequence | 14157-14188 | 10 | 0.688 |
NZ_CP040918_3 | 3.22|766997|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 766997-767028 | 32 | NZ_CP015989 | Sphingobium sp. EP60837 plasmid pEP2, complete sequence | 154369-154400 | 10 | 0.688 |
1. spacer 3.20|766877|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH238466 (Pasteurella phage AFS-2018a, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
acttgtgcaagggttgtgtgttcataggcttt CRISPR spacer acttgtgcaagggttgtgtgttcataggcttt Protospacer ********************************
2. spacer 3.22|766997|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH238467 (Pasteurella phage Pm86, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
actagcggaggctcaacaatgacggaaggtaa CRISPR spacer actagcggaggctcaacaatgacggaaggtaa Protospacer ********************************
3. spacer 3.1|765737|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH238467 (Pasteurella phage Pm86, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.969
accaatctgataatcgagccaagatcgcttta CRISPR spacer accaatctgataatcgagccaaaatcgcttta Protospacer **********************.*********
4. spacer 3.4|765917|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH238466 (Pasteurella phage AFS-2018a, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.969
gtatgagttcggcatttgcagagcttaaagct CRISPR spacer gcatgagttcggcatttgcagagcttaaagct Protospacer *.******************************
5. spacer 1.14|209887|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_003315 (Haemophilus phage HP2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
ctgtatttctaataaatcggtcttcagctaat CRISPR spacer atgcatttctaataaatcggtcttcagctaat Protospacer **.****************************
6. spacer 1.14|209887|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY027935 (Haemophilus influenzae phage HP2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
ctgtatttctaataaatcggtcttcagctaat CRISPR spacer atgcatttctaataaatcggtcttcagctaat Protospacer **.****************************
7. spacer 3.3|765857|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_008193 (Pasteurella phage F108, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
agtgtaattccgctccgttgcttaaaataatc CRISPR spacer agtgtaattccgcgccattgcttaaaataatc Protospacer ************* **.***************
8. spacer 3.3|765857|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to DQ114220 (Bacteriophage F108, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
agtgtaattccgctccgttgcttaaaataatc CRISPR spacer agtgtaattccgcgccattgcttaaaataatc Protospacer ************* **.***************
9. spacer 3.9|766217|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH238467 (Pasteurella phage Pm86, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
atgacttttggggagctatcggcatagtgctt CRISPR spacer atgacttttggggtgctatcggtatagtgctt Protospacer ************* ********.*********
10. spacer 3.21|766937|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH238467 (Pasteurella phage Pm86, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
taaaattaaaactatcgtcgcttgcttgtagc CRISPR spacer taaaattaaaactgtcgtcgctagcttgtagc Protospacer *************.******** *********
11. spacer 1.14|209887|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to U24159 (Bacteriophage HP1 strain HP1c1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.906
ctgtatttctaataaatcggtcttcagctaat CRISPR spacer ctgtatttctaataaatcggtcttccgcaagt Protospacer ************************* ** *.*
12. spacer 1.14|209887|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_001697 (Haemophilus phage HP1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.906
ctgtatttctaataaatcggtcttcagctaat CRISPR spacer ctgtatttctaataaatcggtcttccgcaagt Protospacer ************************* ** *.*
13. spacer 1.12|209767|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017756 (Cupriavidus malaysiensis strain USMAA1020 isolate pure plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
agggcatg-gattttcggcactggaaatcgaat CRISPR spacer -gggcaagccattttcggcaccagaaatcgaat Protospacer ***** * ***********..**********
14. spacer 3.7|766097|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to HQ110084 (Erwinia phage ENT90, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
cgggtgcgcaaatggtttgcgacaaaaggcga CRISPR spacer cgcatccgcaaaaagtttgcgacaaaaggcga Protospacer ** .* ****** .******************
15. spacer 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KX086582 (Staphylococcus aureus strain WBG1024 plasmid pWBG637, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-aagagcagaaaacagaagaattggaagatgac CRISPR spacer taacggtag-aaacagaagaatttgaatatgac Protospacer ** .*.** ************* *** *****
16. spacer 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KF831355 (Staphylococcus aureus strain A960649 plasmid pBU108a, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-aagagcagaaaacagaagaattggaagatgac CRISPR spacer taacggtag-aaacagaagaatttgaatatgac Protospacer ** .*.** ************* *** *****
17. spacer 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP018563 (Staphylococcus argenteus strain 58113 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-aagagcagaaaacagaagaattggaagatgac CRISPR spacer taacggtag-aaacagaagaatttgaatatgac Protospacer ** .*.** ************* *** *****
18. spacer 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_013327 (Staphylococcus aureus plasmid pWBG749, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-aagagcagaaaacagaagaattggaagatgac CRISPR spacer taacggtag-aaacagaagaatttgaatatgac Protospacer ** .*.** ************* *** *****
19. spacer 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP030569 (Staphylococcus aureus strain ER01892.3 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-aagagcagaaaacagaagaattggaagatgac CRISPR spacer taacggtag-aaacagaagaatttgaatatgac Protospacer ** .*.** ************* *** *****
20. spacer 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP030458 (Staphylococcus aureus strain ER04013.3 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-aagagcagaaaacagaagaattggaagatgac CRISPR spacer taacggtag-aaacagaagaatttgaatatgac Protospacer ** .*.** ************* *** *****
21. spacer 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP017923 (Staphylococcus aureus strain JP02758 plasmid pJP080, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-aagagcagaaaacagaagaattggaagatgac CRISPR spacer taacggtag-aaacagaagaatttgaatatgac Protospacer ** .*.** ************* *** *****
22. spacer 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_013325 (Staphylococcus aureus plasmid pWBG745, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-aagagcagaaaacagaagaattggaagatgac CRISPR spacer taacggtag-aaacagaagaatttgaatatgac Protospacer ** .*.** ************* *** *****
23. spacer 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP030696 (Staphylococcus aureus strain ER01532.3 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-aagagcagaaaacagaagaattggaagatgac CRISPR spacer taacggtag-aaacagaagaatttgaatatgac Protospacer ** .*.** ************* *** *****
24. spacer 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP030710 (Staphylococcus aureus strain ER01174.3 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-aagagcagaaaacagaagaattggaagatgac CRISPR spacer taacggtag-aaacagaagaatttgaatatgac Protospacer ** .*.** ************* *** *****
25. spacer 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP012757 (Staphylococcus aureus subsp. aureus strain JS395 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-aagagcagaaaacagaagaattggaagatgac CRISPR spacer taacggtag-aaacagaagaatttgaatatgac Protospacer ** .*.** ************* *** *****
26. spacer 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP042004 (Staphylococcus aureus strain B3-14B plasmid pSALNT46, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-aagagcagaaaacagaagaattggaagatgac CRISPR spacer taacggtag-aaacagaagaatttgaatatgac Protospacer ** .*.** ************* *** *****
27. spacer 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP047857 (Staphylococcus aureus strain UP_1435 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-aagagcagaaaacagaagaattggaagatgac CRISPR spacer taacggtag-aaacagaagaatttgaatatgac Protospacer ** .*.** ************* *** *****
28. spacer 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP012594 (Staphylococcus aureus strain HOU1444-VR plasmid pVR-MSSA_01, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-aagagcagaaaacagaagaattggaagatgac CRISPR spacer taacggtag-aaacagaagaatttgaatatgac Protospacer ** .*.** ************* *** *****
29. spacer 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MH587575 (Staphylococcus aureus strain WBG4880 plasmid pWBG637, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-aagagcagaaaacagaagaattggaagatgac CRISPR spacer taacggtag-aaacagaagaatttgaatatgac Protospacer ** .*.** ************* *** *****
30. spacer 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MH587574 (Staphylococcus aureus strain WBG10514 plasmid pWBG731, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-aagagcagaaaacagaagaattggaagatgac CRISPR spacer taacggtag-aaacagaagaatttgaatatgac Protospacer ** .*.** ************* *** *****
31. spacer 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP030603 (Staphylococcus aureus strain ER00484.3 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-aagagcagaaaacagaagaattggaagatgac CRISPR spacer taacggtag-aaacagaagaatttgaatatgac Protospacer ** .*.** ************* *** *****
32. spacer 3.16|766637|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP045351 (Vibrio sp. THAF100 plasmid pTHAF100_a, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
aaaggcaatatgcgacaaattccag---agatttt CRISPR spacer aaatgcaatatgcgacaaatcccaagtcagat--- Protospacer *** ****************.***. ****
33. spacer 1.11|209707|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP046163 (Vibrio sp. THAF191c plasmid pTHAF191c_b, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
gattgtcagccgttagttgaacacgtcattat CRISPR spacer tatgttcagccgatagttgaacacgtcagaaa Protospacer ** ******* *************** *
34. spacer 1.11|209707|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP046066 (Vibrio sp. THAF191d plasmid pTHAF191d_b, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
gattgtcagccgttagttgaacacgtcattat CRISPR spacer tatgttcagccgatagttgaacacgtcagaaa Protospacer ** ******* *************** *
35. spacer 1.11|209707|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045356 (Vibrio sp. THAF64 plasmid pTHAF64_a, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
gattgtcagccgttagttgaacacgtcattat CRISPR spacer tatgttcagccgatagttgaacacgtcagaaa Protospacer ** ******* *************** *
36. spacer 1.14|209887|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693155 (Marine virus AFVG_25M94, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
ctgtatttctaataaatcggtct-tcagctaat CRISPR spacer ctgtatttcttataaattggtctaacaacgta- Protospacer ********** ******.***** **.* *
37. spacer 1.13|209827|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694758 (Marine virus AFVG_250M853, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ttttcaatgaccgttaaatcttctagtgtttc CRISPR spacer cctccctcgacctttaaatcttctagtgtttt Protospacer ..*.* .**** ******************.
38. spacer 1.13|209827|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694774 (Marine virus AFVG_250M941, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ttttcaatgaccgttaaatcttctagtgtttc CRISPR spacer cctccctcgacctttaaatcttctagtgtttt Protospacer ..*.* .**** ******************.
39. spacer 1.13|209827|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694077 (Marine virus AFVG_250M852, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ttttcaatgaccgttaaatcttctagtgtttc CRISPR spacer cctccctcgacctttaaatcttctagtgtttt Protospacer ..*.* .**** ******************.
40. spacer 1.13|209827|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693487 (Marine virus AFVG_25M100, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ttttcaatgaccgttaaatcttctagtgtttc CRISPR spacer cctccctcgacctttaaatcttctagtgtttt Protospacer ..*.* .**** ******************.
41. spacer 1.13|209827|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694586 (Marine virus AFVG_250M370, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ttttcaatgaccgttaaatcttctagtgtttc CRISPR spacer cctccctcgacctttaaatcttctagtgtttt Protospacer ..*.* .**** ******************.
42. spacer 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK905543 (Vibrio phage USC-1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aagagcagaaaacagaagaattggaagatgac CRISPR spacer agtctgaggaaacagaagaattggaagacgat Protospacer *. **.*******************.**.
43. spacer 3.2|765797|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK358448 (Vibrio phage 5, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aagagcagaaaacagaagaattggaagatgac CRISPR spacer agtctgaggaaacagaagaattggaagacgat Protospacer *. **.*******************.**.
44. spacer 3.21|766937|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AY328852 (Vibrio parahaemolyticus phage VP16T, partial sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taaaattaaaactatcgtcgcttgcttgtagc CRISPR spacer gttaagcacaaccatcgccgcttgcttgtagc Protospacer ** .* ***.****.**************
45. spacer 1.7|209467|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN846932 (Carnobacterium maltaromaticum strain LMA28 LMA_pa plamid, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ttaattcatctgttcaagcgcaaggtgggctt CRISPR spacer aaaatacatctgttaaagcgcaaggaaagcaa Protospacer *** ******** ********** ..**
46. spacer 3.7|766097|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP037949 (Erwinia sp. QL-Z3 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cgggtgcgcaaatggtttgcgacaaaaggcga CRISPR spacer atcattcgctgatggtttgcgacaaaaggccg Protospacer .* *** .******************* .
47. spacer 3.7|766097|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_014305 (Erwinia billingiae Eb661 plasmid pEB170, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cgggtgcgcaaatggtttgcgacaaaaggcga CRISPR spacer atcattcgctgatggtttgcgacaaaaggccg Protospacer .* *** .******************* .
48. spacer 3.8|766157|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP039495 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000669 plasmid pCFSAN000669_2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aactataataaaaaaggctgttgccattgcta CRISPR spacer caaagcaatacaaaaagctgttgccattgcag Protospacer * ..**** ****.************** .
49. spacer 3.8|766157|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011802 (Salmonella enterica bacteriophage SE1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aactataataaaaaaggctgttgccattgcta CRISPR spacer caaagcaatacaaaaagctgttgccattgcag Protospacer * ..**** ****.************** .
50. spacer 3.8|766157|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP051278 (Salmonella phage ST-87, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aactataataaaaaaggctgttgccattgcta CRISPR spacer caaagcaatacaaaaagctgttgccattgcag Protospacer * ..**** ****.************** .
51. spacer 3.8|766157|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP051288 (Salmonella phage ST-29, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aactataataaaaaaggctgttgccattgcta CRISPR spacer caaagcaatacaaaaagctgttgccattgcag Protospacer * ..**** ****.************** .
52. spacer 3.8|766157|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP051285 (Salmonella phage ST-32, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aactataataaaaaaggctgttgccattgcta CRISPR spacer caaagcaatacaaaaagctgttgccattgcag Protospacer * ..**** ****.************** .
53. spacer 3.8|766157|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH370387 (Salmonella phage S149, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aactataataaaaaaggctgttgccattgcta CRISPR spacer caaagcaatacaaaaagctgttgccattgcag Protospacer * ..**** ****.************** .
54. spacer 3.8|766157|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to MG407615 (Salmonella phage Bp96115, partial genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aactataataaaaaaggctgttgccattgcta CRISPR spacer caaagcaatacaaaaagctgttgccattgcag Protospacer * ..**** ****.************** .
55. spacer 3.8|766157|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_042346 (Salmonella virus BTP1 genome assembly, chromosome: BTP1) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aactataataaaaaaggctgttgccattgcta CRISPR spacer caaagcaatacaaaaagctgttgccattgcag Protospacer * ..**** ****.************** .
56. spacer 3.8|766157|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_014900 (Salmonella phage ST160, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aactataataaaaaaggctgttgccattgcta CRISPR spacer caaagcaatacaaaaagctgttgccattgcag Protospacer * ..**** ****.************** .
57. spacer 3.8|766157|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_005841 (Enterobacteria phage ST104 DNA, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aactataataaaaaaggctgttgccattgcta CRISPR spacer caaagcaatacaaaaagctgttgccattgcag Protospacer * ..**** ****.************** .
58. spacer 3.18|766757|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JX094500 (Cronobacter phage CR5, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ctcgggataatcatccactgctcacctgaaat CRISPR spacer agcgggataatcatcgacttctcaccgccggt Protospacer ************* *** ****** ..*
59. spacer 3.22|766997|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP012702 (Sphingopyxis macrogoltabida strain EY-1 isolate activated sludge plasmid 2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
actagcggaggctcaacaatgacggaaggtaa CRISPR spacer atcgtggcaggctcaaaactgacggaaggtag Protospacer *... * ******** * ************.
60. spacer 3.22|766997|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP033227 (Sphingobium yanoikuyae strain SJTF8 plasmid pF1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
actagcggaggctcaacaatgacggaaggtaa CRISPR spacer atcgtggcaggctcaaaactgacggaaggtag Protospacer *... * ******** * ************.
61. spacer 1.6|209407|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP011076 (Brevibacillus laterosporus strain B9 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
gtagtgaatcttgcggataaacgtagcttaaa CRISPR spacer ctctacaatcttgcggataaccgtggctttgt Protospacer * ************** ***.**** .
62. spacer 1.12|209767|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP025547 (Mycobacterium paragordonae strain 49061 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
agggcatggattttcggcactggaaatcgaat CRISPR spacer tcggcatggattttcggggctggaacagcagc Protospacer *************** .****** *..
63. spacer 1.13|209827|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026928 (Agrobacterium tumefaciens strain 1D1609 plasmid pAt1D1609b, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttttcaatgaccgttaaatcttctagtgtttc CRISPR spacer atttcgatgacggttaaatcttcttgccgcga Protospacer ****.***** ************ *. .
64. spacer 1.13|209827|32|NZ_CP040918|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GU943040 (Uncultured phage MedDCM-OCT-S09-C28 genomic sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttttcaatgaccgttaaatcttctagtgtttc CRISPR spacer accgcctgaaccgttaaaagttctagtgtttc Protospacer .. * .********* ************
65. spacer 3.11|766337|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH271312 (Microbacterium phage RobsFeet, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
acgtgatgacgtgctcatctgcgctgtggctt CRISPR spacer ctccgccaacgtgctcatctgggccgtggctc Protospacer . .* ..************* **.******.
66. spacer 3.11|766337|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK524510 (Microbacterium phage Fireman, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
acgtgatgacgtgctcatctgcgctgtggctt CRISPR spacer ctccgccaacgtgctcatctgggccgtggctc Protospacer . .* ..************* **.******.
67. spacer 3.22|766997|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP023452 (Rhizorhabdus dicambivorans strain Ndbn-20 plasmid p3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
actagcggaggctcaacaatgacggaaggtaa CRISPR spacer atcgtgacaggctcaaaactgacggaaggtag Protospacer *... . ******** * ************.
68. spacer 3.22|766997|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP009296 (Novosphingobium pentaromativorans US6-1 plasmid pLA2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
actagcggaggctcaacaatgacggaaggtaa CRISPR spacer atcgtgacaggctcaaaactgacggaaggtag Protospacer *... . ******** * ************.
69. spacer 3.22|766997|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP022749 (Sphingobium hydrophobicum strain C1 plasmid p3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
actagcggaggctcaacaatgacggaaggtaa CRISPR spacer atcgtgacaggctcaaaactgacggaaggtag Protospacer *... . ******** * ************.
70. spacer 3.22|766997|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP033229 (Sphingobium yanoikuyae strain SJTF8 plasmid pF3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
actagcggaggctcaacaatgacggaaggtaa CRISPR spacer atcgtgacaggctcaaaactgacggaaggtag Protospacer *... . ******** * ************.
71. spacer 3.22|766997|32|NZ_CP040918|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP015989 (Sphingobium sp. EP60837 plasmid pEP2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
actagcggaggctcaacaatgacggaaggtaa CRISPR spacer atcgtgacaggctcaaaactgacggaaggtag Protospacer *... . ******** * ************.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
99532 : 135273
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP040918|99532:135273|DBSCAN-SWA TTTAGAACTTATAAACTAAATTATCTTCATACTTGCCACTATAGTTTGTAGAAGTATTAATGCTTATCTTCTTATAATCTGTAAATGACTCCCAGTTATGTGTTTTCGTTTCAAGCATGAAATCCACAAACCGTATAAATTCAGATTTTGTTGAACTGAAAAAGATAAAAGGCGGTCTTGTCAGATTAATCAACCTTAAAAAATCAATCAAATCAAAGTACGTATCCATGCTATACGCAGCTTGATGTGTGCATAAGTAAGGTGGGTCTAACACAAATAACGTCTTTTGCTTGTCGACAAACCGAGGCAATAATGAATGAAATGACTCATTGGCAACTTCAAAACCATTAAAATAATCTTGTGCCTCACTATAATCAGACAGACGAATGCGATTATAAAATGACAAGCGATATAGTTCACTTAATGTCCTGACTTGCTGACCACTAAATAATAACCAAGTAGACAATACATGCGGATCTTTATAGCCAGTAAATGCCTCTATAGCTTGAATCACTTTGTATTTCATATCACAGCTTAACTGTTTGCTACGTGGCTCATTTTTAAGTAACTCAAGCAAGATACGACGCAGTTTATTCAGATCTCGAATGTGTTTCAATCGTTCACTATAGCCATCAAAATCATTATAAATAACGCGAGCTTTGGGCTTGATGTGTTTTGTGACATGACTTAGAAGTCCGCTACCGCCGAAAGCATCAATAATCGTCCATCCCTCACCGTCATCAGGAATGTGTTCGTTAATGATATTGATGTAATGATTTAAGAAGAGTCGTTTTTGTCCAACGAATGGGAGCGGCGCTTGTTTATAAAATGATTGATTGTTTTTCATATACTGTAAGCCTCTTTCACATACTGAAAAAATGCGCTAGACTTTACATGTCTTGGCTGAGACCGCGGGTCTAGCAATAGTTATTGCCTACAGGTGCGTTCTGTGGGTGATAAGGCGAGCACGCTGCGCAAAGTGTGCTCGCTACCCGTGTTTAACTGTTTTGATTTTCAAATAACTTTTGTTGCAATAAATAACCTTCTAAAGTCCAAACCTTACTTACTGCATTGTCGTATGCGATTTTCTCACCGATTTCTTTGACATAATTTGAAGAGTCAACACAAGCACTTTCTCCCGTCACTGTATAACCATTTTTTAGTGTTAACACGCAAGTGGTTAGCTTATCTGTTAAACGATGATATTCGGCTTTAACAATGACAGATTTGATATCTTCTAGCGTTAATTTATTCTTCATATTTGCTCCTTATTTTTATTAAAGTTAATGTGTGCTTATTAGATGTTTGATTTCGTCTTCTTTTCCTATTCACCTCCCTTCACAACAATATCTTTAAATGCAATCGCATTATTTCTTATTGTGCCGATTACGTTGATTTTGAACCTGATTTCTGTGACACCTTCCGGTAATTCACCTTCAACTTGCTTGACTCGCCATTCTGTTGTGTCAAATTCGCCAAGCTGTTCTGACACAAACGCTGACACAAACTCATCACCGCGATAAAGTTGCACTGAAACAACACAAAGCCCATTTCGCTTATCATATGTGCCGACTTTATATGAGAGTGCAAAACGCTTGTACACGCTTGAATCAACAGCAAACGATTTATAAATCGCAGAATGCTGATCTGCATTTGATGAAAGCATGATGTATTTTCCGCCGGGCATATCACTATCGTTATAGTGATAAATAAGCGACTCACCTTGCGTGAACTCCTCTGCGTAGTTCCAGCCATATAATAGTTGCATGGCGCCCGCAACGCTGAAAGTATAGTTAAACAAGCTTTTTAAGCCGTTTTTTACCGAGCAAAGCGTCATTTTATTAAACTCTTCGCCCACCACTTTTTGCGGGTCCGGATAGCTAAACTGGCTATCTGTTGTCGAGATAGTGCGCAAAACGGTGTCATCATTCAATAATGCGATTTCATAACTGACGCCATCACCCAAAATCGTGCTGTCTTCTGTGTGTGAAATCAGATTATCCGCTTGTACATCGCGGTCACGATGCGCCCAGCTGATGATAAATGCTGAACTATCTGCAATATTATTAATAAACGCACCATCTACTTTTACGTTGCCTGGCGGGTAAGGACGCGCTTGACGTTGCTGTGTCGTAATTGTAAGCACCTCGGCGTCATCTTCTGCGAGTGTTTCTTGTGCTGTTTTAGTTAAAAGTTTGACGTTTAACTGTTCATTGACCGTGTATTTCGTGTTGTCTTCGCCACTTGCGAGCAAATAGCACCACGCTCTAGCACCTGCGCTGTGTGCTTGCGGGACCGTATCCGCACAACCTCGTCCTACATTAATTGTCCGCGTTTTTAAATCCACTGATTCAATTTTCACGATTTCATCATCAATCATCAGCGCAACCGCGTTTTTCAACGCATAGCTGTGCGTGCTTTCATTAAATTTAAAGTGCGTTTGATATTTATTAATATCGTCAGATAGCAACACCGATGGCGTAAAATCGCCTTCACCTGTGTCATTAAAACCTGCGCCTGCATCAGTTAAAATCTCAAAACCAATGGATAGTGGTGTCGGTGCATCTGCCATTGCCGCGATAAAGCAATCCGTTGGTTTAATAAAGGCAAGCTCTGCATCACTAAACACAAGTGGAAAAACATGATAAGGGATTTCAAACACGTGGCTGTGAGTAATGGGTTTAGCACTATAATCTGGTGGCGTGTAAAGCGAGTCGGCTTTTTGAGTTGAATAGTTTGCCGCAGGCAAGCCAAAGACATCTTGCATGCAGGTGACAATAAACTCACCTTCGTTGCCGTTTTCGATGTGACTCACACGAAATACCGCGCTTTCAATGCCGCGGTCGGGAAGACTCACTTTAAATACATCGCCGTGTGTGAGTTCACTCGCACGCATGTCAAAGACGATTTTAAGCCGCGTCAAACTACTTGCCACAATCTCTAAATCGCGCTGTGCAACACGTGCGGCTAAATCAAACGTGGGAATACCTTTGTATTCCACGGTTTTTGTAATCACACTATGCATACGCACTGACGCGATGTTATTAGCAATGGCTTTATCTTCACGATTCGTCACCGGGTCGAGGTATTTCACCACCACTTGATTAGCCGCATTATCTGTTGCCGCATTGTCATCGTCTTGCACGCGTAAAATGCCGTTGTCGTAGTTAAAGGTGTGCAACTCATCGACTTTATAGTCGTTACGAATGAGTTTAACGGCGTATTTCCCCGTTTTAACATCTTCGTATTGCACCGCACCGATGTGGTCGATAATTTGTTGCACGAACTCTTTAACTGAGCCCTGACGATTATAGCGAATACACAGCCCAAAGCCTTCCTTGAAGAGTGTATCTGCCGCTTTCTTATAGCTTTCTATATCCAATTCCGTAATGTCTTTTTTCCCGCCCCAGCTCTTGTTTGTTGCACACTCAACCAAAATATGCGCAGGATTCATGGCGTGAATCTGACGCACGTTTTCTTCTTGCTCTGGTGTTAAGCCTGAAATCTTCAAATTGTCATTACGCAGTAAAATCCGGGCTTTTTCCGGATACCATGGTGCAACCGCGCCCCACTTGTGCGTGCGACGAACGCGGTAACTGTGCTTTTTCGGATACGCGTTATAGCAACTGATAAGTCCGCTAAATACGGTTGTGACGGTGCCACGAAAGCCTGGAATCACATCCTCGGGACTGACATTACCTGCGCTAATATCACCGTTTGAGAAAAAGGTGCTTTGCTCGACTTGTTGCTGCCTTGTTCTTTTTTTACGTCCTTTTCCACTTAATGCCGAATTAAGCGGAGGATTGTGTACATTTTTCAGTAAATTGATCAGCATTTGTGTCGGCTTTTGGTCCGGGTCACCCATTAAAATTTCCATTCTTCCCTGAATGCCGCCTTCACCGCCAGTCGCCTCGCCACCAAAAAGGTTAGGCTTGTCTATATAGATAGCTTTCGATTGTGTCAGCTCACCAGGCGTGCCTACATACGCGGTTTTATCATCTACACGGATTTCCACAATTTCATCCACCGGTCCGCGCCCAATGCCCGATTGAATATCCCAATAGTATCTGTAGCCAACTGTAACCGGACCGCCGCCACGTCTTTTACCACCCATTATTCACCTCTTGCTTTTTCAGCTTCTGCCACACATTTACGGGCAAACACACTGCCTGTATTTAATAGTGTCTGTGCCTCAATGCCGTTTTGTAAAAAGTCGTTAAAATCTAAGTTTTCGCGTTTAAAAAATGTTTCCACGCCCGATGCACAAAAACCGACGCGACGCATGTCTTGCATTGTAATGATCAACTTTTCCATTATTTACCCCTTCTTAATCGGGCTTGAACGGTAGTTACCGTAAGCTAATACTTGCCAGTCTTCTGTCCAGCAATCACCGAAAAACACGCATTGCGGAATACCTTCATCCACTTGCGGGAAGTTCCATTCCTCGCTTGATACTGCCTCGATGCTTTGCCCCGTGCGCGGACGTGGAGCGAGTGCGGTGTTGACTAAATAACTGATTGCCATGACGGCTACCGCACGAACAATCGCCCAACCAATTGCTGCAAACATATCAACCTCCTCTTATTTAAAATACTCTTGAACCGTCGTACGGGGATTTATTCGGCATGTGCGGGACGCCGCCAAAATTGAGCATATTGTTAAACTTTTTCAAACAAGTAACAGGTCTACCATCGCAACCGGGATACGCTTTAATCACTGTGCCGACAGAGAGTTTCTGTGTGCCACCAAGTAGTGTGAGCTGGTTGTTTTTATGTGTTTTAACCGCGCGCACTTCACGCACCCCGTCACTGTCAATCCACTCAATAAAACCGGCATTAAACCAGCCTTCCGGCAAATCATCGGGCACATTGACTACAATCATCACACCGTCCATCGCACTAATCGTAAGCCCTGCCACTGCGAAGTTTTTCGGATTTAACTGGCAGTCTTGGTCATACAATGTATATGGGCAGTTGCGCCCCCAAGTAAGGCGCAGTCCT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46 | Pseudomonas_phage(53.33%) | transposase,integrase,tail | attL 125240:125254|attR 134966:134980 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
309714 : 319072
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP040918|309714:319072|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP040918|309714:319072|316214_317000_+|WP_005724066.1|DBSCAN-SWA MFEILFPAWLTGMLLSLITAPLGAFVVWRKMAYFGDTLAHSALLGVALGIFLDINPYLSIVLLTLILAILMVWLEGKTQFSVDTLLGIIAHSCLSLGVVTVGLLQNVRVDLMAYLFGDLLAMNYEDLVVIGIGVVFVLVTLLYFWHPLLSTTVSPELAQVEGVNVQKMRFILMILTALTIALSMKFVGALIITSLLIIPSATARRFAKTPESMVFIAILISMLSISLGLLLSAYYDTAAGPSVVICASLLFLLSLMKKEHN >NZ_CP040918|309714:319072|311646_312534_+|WP_014326206.1|DBSCAN-SWA MQHYHFSHSLLAQQEKPYRFPCPAKLNLFLYINGKRQDGYHELQTLFQFVDFGDWLDIEVREDNEICLTPELPSLKNEDNLVYRAAKLLQQKTNCALGANLTLDKILPMGSGLGGGSSNAATALVALNYLWNTQLSTKQLAKLGLMLGADVPIFVHGHAAFAEGVGEKITYCEPKEKWYVVLKPNVSISTATVFSDPDLIRNTPKQSLEQLLNQKYTNDCEKVVLNHYPEVEEILHRLLQYAPSRLTGTGACVFAEFNDEESAQLAFQTIPKNYFGFVAQGLNKSPLHNMLAKIS >NZ_CP040918|309714:319072|312603_313551_+|WP_025248491.1|DBSCAN-SWA MPDIKLFTGNATPELAKRISERLYLSLGDATVGRFSDGEIQVQINENVRGSDVFIIQSTCAPTNDNLMELIVMVDALRRASAGRITAVIPYFGYARQDRRVRSARVPITAKVVADFLSSVGVDRVLTCDLHAEQIQGFFDVPVDNVFGSPVLVHDMLKKIDMQNPIVVSPDIGGVVRARAIAKLLNDTDMAIIDKRRPRANVAQVMHIIGDVAGRDCILVDDMIDTGGTLCKAAEALKERGAKRVFAYATHAVFSGSAAKNLASDALDEVVVTDTIPLSPEIKALNKIRVLTLSGMLAEAIRRISNEESISAMFT >NZ_CP040918|309714:319072|311029_311647_+|WP_005753554.1|DBSCAN-SWA MKKQHFLLPIIASFFLFACTLDTERPTDVKYISHTDPTWQQHLSQLKKIRDYTNQGQLGYISQKERFSTRFDWQYQNPTNYRLTLSSTLSPTTLSIEVRHNVMHLSDNKGPLRSAQDAKRLLKEIVGMDLPLDQFALWLKGQPDESREYRVAENHLLAHFSYPIDNQQWTADYLSYHQLPLPLPKDILLKTEGQTLKIRIDNWTY >NZ_CP040918|309714:319072|309714_310989_+|WP_014326205.1|DBSCAN-SWA MNNKIKIYLVGGAVRDQLLNLVVKDRDWVVVGATPDDLLSQGYQQVGKDFPVFLHPQTKEEYALARTERKAGSGYTGFICDFSPTISLEQDLSRRDLTINALAQDLDGKIYDFYGGLTDLKQRLLRHVSPAFAEDPLRVLRVARFAARYHTLGFTIASETCELMQQLSQSGELSNLTAERVWLETEKALLEPHPEVYFQTLQEVGALQVLFPELAALQGVPNPAKYHPEIDTFVHTMLVLQQAVLLTENTDSDKSAVRFAAICHDLGKALTPKEILPHHYGHEKAGVMPTRRLCQRFKLPHAIQDFAELCCEYHSHIHKAFELRAETILKLFNRLDVWRKPERFKALLLVCIADTRGRTGFEQVDYPQREFLWQLYQSALQVNVQDIIQQGFQQQAIRDELNRRRIIAIKQTRAEILPRFTNPC >NZ_CP040918|309714:319072|315414_316206_+|WP_010906540.1|DBSCAN-SWA MHIHSIKLPLVELKNINVVFEQKKALQNINLTLYPNSIITIVGPNGGGKSTLLKVLLKLLPPTSGQVIYHKNLRIGYVPQKIHLDHSLPITVERFLSLKKGISRQAIQDALSLLSISHLHKNSLQKLSGGEMQRVLLARAILNKPNLLVLDEPTQGVDINGQAELYQLIQQTQQQLNCAILMVSHDLNIVMADTNEVLCINQHICCAGTPETVSNDPTFIHFFGDQFAKNVALYTHKHNHKHDIHGDICCTSDFQSQQCTHKE >NZ_CP040918|309714:319072|317076_318057_-|WP_005724065.1|DBSCAN-SWA MQELERQAPLLDAVNLKKYYPVKKGILSKPKLVKAVDGVSFTLERGKTLAIVGESGCGKSTLGRMLTMIEAPTEGELFYKGQNFLENDTATQKLRRKKIQIVFQNPYASLNPRKKIGTILEEPLLINTDLNAKERKQQVLEMMEKVGLKPEFYDRYPHMFSGGQRQRIAIARGLMLRPDIVVADEPVSALDVSVRAQVLNLMMDLQEEMGLSYVFISHDLSVVEHIADEVMVMYLGRCVEQGETKAIFNHPRHPYTQALLSATPRLEAEHRRERIKLTGELPSPLSPPKGCAFHARCRFAMEKCALEKPALKQYEDGSKIACFMLD >NZ_CP040918|309714:319072|313626_315180_-|WP_005753553.1|DBSCAN-SWA MQIKIAIFFSIILFIVLVVSLGKKEEGQDSSADSQTQTETQIEKQPALSTATVESPSSVQADSTLSPPSSAESVEKQAITEHHTESSAVSMDEKNSDTQVDASSQETTAKPAENTLDATSFYDDLEAKDDEVDEIKPDMLDELAAFPEPVRHALSDLFDVMDQAMRIKNQFSHTVVKGDSLKDVLELSGLDASVSERLIKAYPEFKNLKPGQQFYWILDNQGELEYLNWLVSEREEKIYEKTADGQYQREILKKQSVWKKEVLKGRIDGSFNTALRTLGLDIRQINQLANALQWQINLKRLKKGDKFAVLVTREYIEGKLTGQGNVDGIHIISAGKSYYAIQASNGRYYNRQGETLGKGFARYPLQRQARVSSHFNPYRRHPVTGRIAPHKGVDFAMPVGTPVIAPADGIVEKVAYQANGAGRYIVVRHGREYQTVYMHLSRALVKAGQNVKRGQRIALSGNTGRSTGPHLHYEFHINGRAVNPLTVKLPGTSSGMGTAERKQFLVKAKEIERQLRL >NZ_CP040918|309714:319072|318073_319072_-|WP_014326208.1|DBSCAN-SWA MALLNVENLSVHFGDENAPFKAVDRLSYTVNEGEVLGIVGESGSGKSVSSLAIMGLIDYPGRVQAEQLLFNQSDLLALTEKQKQKIVGADVSMIFQDAMTSLNPSYTVGYQIMEALKVHQGGAKAWRKERAIELLTLVGIPDPRSRLDVYPHQLSGGMSQRVMIAMAIACNPKLLIADEPTTALDVTIQAQIIDLLLELQRKENMALILITHDLALVAEAAHRIIVMYAGQVVEEGRAEEIFKCPRHPYTQALLRALPEFAEGKSRLQSLPGVVPGKYDRPTGCLLNPRCPYATDRCREQEPETRLVNGHRVKCHTPLNAQGMPSYTEFAVS |
9 | Sinorhizobium_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
666305 : 675743
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP040918|666305:675743|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP040918|666305:675743|669530_670091_-|WP_038641419.1|DBSCAN-SWA MKKTVLALMFSCGMVASAFAHNHAVEHKHTGEMLEVKVELLDPVKGNQEIGKVVITESAYGLVFTPELKNLTAGLHGFHIHQNPSCDAKEKDGKLVAGLAAGGHWDPKNAGKHGYPWSDDAHLGDLPALVVNQDGTANNPVLAPRLKHLDDVKGRSLMIHEGGDNHDDHPAPLGGGGPRMACGVIK >NZ_CP040918|666305:675743|673847_674312_+|WP_014325726.1|transposase|DBSCAN-SWA MASKSNDDSSLSHTRWNCKYHIVFIPKYRRKAIYGKLRVDIGGILRQLCHYKNVEIIEAYAMKEHIHMLLRIPPKLAVSSFMGYLKGKSSLMIFERHANLKYKYGNRNFWAKGYYVSTVGLNTKIVEEYIRNQEKEDMIQDNLSKKEYMDPFKG >NZ_CP040918|666305:675743|668708_669446_+|WP_005725044.1|DBSCAN-SWA MSENIYGIHAVSAFLNNAPERLIEVYALKGRDDKRLQPLLNELHRLGITIQFVNRQTLDKKAEGEVHQGIMARVQPAKELNEADLDTLLQNQSNPLLLVLDGVTDPHNLGACLRTADAAGVCAVIVPKDKSAQLTAIARKVACGAAEVVPLIRVTNLARTLRELQQKHNIWVVGTAGEATNTLYQTQLTGGLALVMGAEGEGMRRLTREHCDQLISIPMAGSVSSLNVSVATGVCLFEIVRQRLA >NZ_CP040918|666305:675743|674888_675743_-|WP_005725034.1|DBSCAN-SWA MTAQVISGTELSKTIKSQVAQKIETYTQQGKRSPGLAVILVGADPASQVYVGSKRKSCAEIGIQSKSYDLPETTQESELLALIDELNADTTVDGILVQLPLPKHIDSTKVIERITPEKDVDGFHPYNVGRLCQRIPTLRACTPYGVMKLLETTGIDLHGKHAVIVGASNIVGRPMALELLLAGCTVTVTHRFTKDLAHHVRQADILVVAVGKPKFIPGDWIKAGAIVIDVGINRQEGKLVGDVEYDVALEKAGYITPVPGGVGPMTVAMLMFNTLSAYEMKIAS >NZ_CP040918|666305:675743|666305_668708_+|WP_010907422.1|DBSCAN-SWA MAKIKNNPHLQDPNYQEELAKYENPIPSREFILDTIRQHNAPISKEELLTTFAIQNEEQQEAMRRRLRAMENDGQLVFTKRKRYALPEKLDLLKGTVLGHRDGYGFLQVEGKDSDWFIPNSQMQRVMHGDYVLAQPSGFDRRGRQEVRIVRVLQQRKKQIVGRFFLEDGIGYVVPDDSRINRDILIPNEHRQGARMGQVVVVELKPRTATFSQPVGMISEILGENMAKGMEVEIAIRNHDIPHVFPDAVLKQVSKLSEEVPEEAKSGRIDLRHLPLVTIDGEDARDFDDAVFCQKKRGGGWKLWVAIADVSYYVRLRTALDTEAHARGNSVYFPNRVVPMLPEILSNGLCSLNPQVDRLCMVCELNVSAKGKITGYEFYEAVMNSHARLTYTKVARILEDDEELCTRYQALVPHLKELHVMYQALVEARHQRGAIDFETIESKFVFNEMGRIERIEPVIRNDAHKIIEECMILANIAAANFMEKHQEPALFRIHAGPSEEKVTGFRQFLSECGLSLEGGSKPSTADYAKLLEQIRERPDHELLQTMLLRSLSQAVYHPDNIGHFGLALEEYAHFTSPIRRYPDLTLHRGIKYLLAKLKGSKRRTTDTGGYHYTLDDMDVLGDHCSMTERRADDATRDVADWLKCEYMQDHVGEEFTGVISSVTGFGLFVRLDDLFIDGLVHISTLDNDYYQFDLARQRLIGENSGMIYRIGDKVKIRVEAVSLEQRQVDFSLVSSERKPLREGKTAKDKLKKNARYAESLEKQRHKRKPSTSKSAVRKTSVVKPSTTTKKASKKSAKKRK >NZ_CP040918|666305:675743|673164_673665_+|WP_005719438.1|DBSCAN-SWA MAGVNKVIIVGNLGNDPEIRTMPNGEAVANISVATSESWIDKNTNERREVTEWHRIVFYRRQAEVAGEYLRKGSKVYVEGRLKTRKWQDQNGQDRYTTEIQGDVLQMLDSRNERQQTGGYAPQTASPQYNAPTGGYGAQPSRPATKPAPQNEPPMDMGFEEDNIPF >NZ_CP040918|666305:675743|670161_672993_-|WP_010907420.1|DBSCAN-SWA MDKIEVRGARTHNLKNINLTIPRDKLIVITGLSGSGKSSLAFDTLYAEGQRRYVESLSAYARQFLSLMEKPDVDHIEGLSPAISIEQKSTSHNPRSTVGTVTEIHDYLRLLFARVGEPRCPNHDVPLAAQTISQMVDKVLSLPEESKMMLLAPVVKERKGEHVKLLEQIAAQGYIRARIDGEICDLSDAPKLELHKKHTIEVVVDRFKVRSDLATRLAESFETALELSGGTAVVASMDEPETEELVFSANFACPHCGYSVPELEPRLFSFNNPAGACPTCDGLGVQQYFDEKRVVQNPSISLASGAVKGWDRRNFYYYQMLTSLAKHYEFDIESPFEALPKKIQQIILNGSGKEEIEFQYMNDRGDVVVRHHAFEGILNNMARRYKETESLSVREELAKNISTCPCHDCGGSRLRQEARHVYIGTTTLPDVAEKSIGETLHFFSELHLSGQRAQIAEKILKEIKERLQFLVNVGLDYLSLSRSAETLSGGEAQRIRLASQIGAGLVGVMYVLDEPSIGLHQRDNERLLNTLLHLRNLGNTVIVVEHDEDAIMAADHIIDIGPGAGVHGGQIVAEGSAKAIMANPHSITGKFLSGVEKIEIPAKRTALDKKKMLKLEGATGNNLKSVNLAIPVGLFTCVTGVSGSGKSTLINDTLFPLAQNALNRAENTQFAPYQSISGLEFFDKVIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGLFTPIRELFAGVPESRARGYNPGRFSFNVRGGRCEACQGDGVIKVEMHFLPDVYVPCEQCKGKRYNRETLEIRYKGKTIHQVLEMTVEEAREFFDAIPQIARKLQTLMDVGLSYIRLGQSSTTLSGGEAQRVKLATELSKRDTGKTLYVLDEPTTGLHFADIKQLLTVLHRLRDQGNTIVVIEHNLDVIKTADWIIDLGPEGGNGGGQIIATGTPEQVAEVKGSHTARFLKTLLQKR |
7 | Lactococcus_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
853670 : 930765
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP040918|853670:930765|DBSCAN-SWA 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78 | Escherichia_phage(21.62%) | plate,protease,terminase,integrase,tRNA,tail | attL 848781:848796|attR 900419:900434 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1591886 : 1636160
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP040918|1591886:1636160|DBSCAN-SWA 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68 | Mannheimia_phage(50.0%) | head,terminase,coat,integrase,tail | attL 1591737:1591782|attR 1645893:1645938 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1660664 : 1741187
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP040918|1660664:1741187|DBSCAN-SWA 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84 | Shigella_phage(25.0%) | plate,head,transposase,tRNA,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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