Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP028083 | Lysinibacillus sp. SGAir0095 chromosome, complete genome | 2 crisprs | csa3,RT,cas3,DEDDh,DinG | 0 | 0 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP028083_1 | 772018-772234 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP028083_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP028083_1
>1.1|772070|113|NZ_CP028083|CRISPRCasFinder AAAGTGAAGTCGCAGGTAAACAGAGTAAACCCGCAAGTAAAAAGAAACTCGCAAGTAAAAGAGCAAAAGTCGCAAGTAAGTGGAGCGAAGTCGCAAGTAAACAGAGTAAACTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP028083_1
The CRISPR arrays of NZ_CP028083_1 >merge|NZ_CP028083|1|772018-772234|CRISPRCasFinder CCGCAAGTAAAAAAGAAACTCGCAAGTAAAAGAGCAAAAGTCGCAAGTAAGTAAAGTGAAGTCGCAGGTAAACAGAGTAAACCCGCAAGTAAAAAGAAACTCGCAAGTAAAAGAGCAAAAGTCGCAAGTAAGTGGAGCGAAGTCGCAAGTAAACAGAGTAAACTCGCAAGTAAACAGAGTAAACTCGCAAGTAAAAGAGCAAAAGTCGCAAGTAAGC >NZ_CP028083|1|1|772018-772234|CRISPRCasFinder CCGCAAGTAAAAAAGAAACTCGCAAGTAAAAGAGCAAAAGTCGCAAGTAAGT AAAGTGAAGTCGCAGGTAAACAGAGTAAACCCGCAAGTAAAAAGAAACTCGCAAGTAAAAGAGCAAAAGTCGCAAGTAAGTGGAGCGAAGTCGCAAGTAAACAGAGTAAACTC GCAAGTAAACAGAGTAAACTCGCAAGTAAAAGAGCAAAAGTCGCAAGTAAGC
>NZ_CP028083.1|WP_137727600.1|771425_771965_+|hypothetical-protein MPVETSIIIVSDYTIIGAIPKGHSIFHASGLQTELEKLFNKHREPNISLNQFEMLKTDLMNHHQRKDWKAKVNPTKLRKGVLCKKCDYKNVMRFEYGSFKCERCGMKNKDAHLEALSDYRYLISEWITNRELREFLGIDSQFAAHRILKKLDWEYIGTYKNRKYKIPDFVEEVVVRRRT >NZ_CP028083.1|WP_137727599.1|770981_771284_+|NERD-domain-containing-protein MEILKRQKSSKLINLEALLRRLPENEQADYSFYMEQYIVQRKGYDGELWVDQLWNELTIPCRYNLFHSYETINSAGYSHQIDTLLLTPHFIWLIEIKNIG >NZ_CP028083.1|WP_137727598.1|770014_770812_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLKLEGINKIFNEGTPDEKIALDNINLHLAPGDFVTIIGSNGAGKSTMMNMISGALTPDFGAVTIEGKEVTKLPEYKRSQYIGRVFQDPMAGTAPSMTIEENLAIAYSRNAKRTFRKGVSRTRRDFFKSSLEKLGLGLENRFNAKVGMLSGGERQALSLLMATFTKPSILLLDEHTAALDPSRAELITRLTKQLVEEGNLTTLMVTHNMQQAIDLGNRLIMMDKGQIILSIDEAKKPTLTIPDLMSEFENIRGEKMNSDRALLGS >NZ_CP028083.1|WP_137727597.1|768987_770022_+|ABC-transporter-permease MFTAMFGSVEQGIIYAIMALGVYLTFRVLDFPDLTVDGSFVTGAATAAMMIALGYHPILATLMAIVAGFIAGCMTGLLHTKGKINPLLSGILMMIALYSINLRIMGLSAENAIVKPNIPLINADTIFSQFNSFWSNLGIDAALTNFIKNTLGFQSAPSTWGTILVVLIITLIIKFIADWFLKTEVGLAIRATGDNKRMIRSFSANTDGLIVLGLGLSNALVAFSGALIAQYSKFADANMGIGMIVIGLASVIIGEAIFGTKTIFRTTLAVVAGAIIYRIIYAVALRIDWLDTSDMKLITAIIVILALVIPQMVDKRREKKRKEKRRIERLNQQTEMMQGGNHLA >NZ_CP028083.1|WP_137727596.1|767950_768958_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKNSTKKISFLLFGLVLLLAACGGSETSTESTGDTSTGTTEEGKTFKVGITQIVEHPSLDAATEGFKAALEEAGLEVEFVEENAQNDQSMNTTIAQNLVNEGVDLIFANSTPSAQAVKGATSDIPILFTSVTDAVGAELIDSMEAPGGNVTGTVDLHPDTIANTVTFLKDELGAKKVGTVYNTGEQNSVAQIEQVKGLLEEAGLELVEAAVSTSAEVKQATESLLGKVDSLYIITDNTVVSALESVIEVASANQLPLMVGELDSVERGGLGAYGFEYYDIGYEAGEMAVKILNGEATPSEIPSAYPANLKLLINKGAADTLGLEIGESWNAEVYE >NZ_CP028083.1|WP_137727595.1|767046_767529_-|QueT-transporter-family-protein MKVKFLATTGIIAALYIAVTMLVAPFGFTEIQFRVSEMFNHLVAFNPRYMLGIVIGVFISNLFSPLGVYDLVFGVGHSIITLAIFILICKFVKNTLLRLIINTFLFTCTMFIIAFELNLALELPFLWTWVTCAIGEFVVLAIGVPIMHLLNKRLNFKDLI >NZ_CP028083.1|WP_137727594.1|765443_766478_-|anthranilate-phosphoribosyltransferase MTIHFFTRHVKENENLSYEEMLQAAELIFNEETPKEAIAELLIALSKKGETTDEIAALATVMKSYALPLDLPEGNYLDNCGTGGDGLQSFNISTTSAFVLAANDVSVVKHGNRKISSASGSSDVLQALGIHTDFTTQDSVDLLNQTGITFLYAPNVHPRLKRIGEIRRAIGKPTIFNLVGPLTNPAHLTSQLVGINRPEFVRHYAEVLRILGRKRSVVVSGTQGMDEASLDQDNTLALLENGEIKSFQVDIAALGLTPAPVTALRGGTPAENAIILRDLLNGKQSAYFDAVLLNAGLALFANGKVSSVADGVVLARESILSGKALEKLDAVVEYSQTVLKERVV >NZ_CP028083.1|WP_137727593.1|764646_765444_-|indole-3-glycerol-phosphate-synthase-TrpC MTILQKILDHKATLIPSLLAKEPTFEVEHKSRPSLYETLRKADALQVISEMKRASPSKGIINEGANPVELAKRYEQAGAACISVLTEEKFFMGSYQDLVAIANNVDIPILNKDFIVHEVQIDYAKAAGASVILLIVAALSDELLKAFYTYASVLGLDVLVEVHNEEELDRALAIHPKIIGVNNRDLKTFDLDLIQTEKLANKINAHEDIVFISESGIWNARDAERVAIAGARGVLVGESLMVSQNVEQALFSLQVPLPSLVKDVK >NZ_CP028083.1|WP_137727592.1|764023_764644_-|phosphoribosylanthranilate-isomerase MVKVKICGLREEEHVQAAVEAGATWIGFMFAKSKRRISIERASELAKLIPSHIKKVGVFVNPTEQEVQDAVETVGLDYVQYHGSEDPTFITHLGYPSIKAISIRSFEDVEKARLYNVDYYLFDAPGTDYAGGSGHVFDWSLLDQLSIPKNRVILAGGLNSENITRSISQVEPFGVDVSSGVEKNGMKDSELIRQFIKAATTASVMK >NZ_CP028083.1|WP_137727591.1|762787_763978_-|tryptophan-synthase-subunit-beta MTTEVKGRFGRFGGQFVPETLMTALQELDEAYDKVKNDETFQEELRYYLKNYVGRQTPLYFAERLTQECGGAKIYLKREDLNHTGAHKINNALGQALLAKRMGKKKIVAETGAGQHGVATATACALLNLECIVYMGAEDVKRQALNVFRMELLGTKVVAVDKGSATLKDAVNEALRHWVTNIEDTHYILGSAMGPHPFPTIVRDFQRVIGDETRAQVLELENRLPDAVVACIGGGSNSIGMFYPFVEDKDVALYGVEAAGKGIETGKHAAAIHVGQTGVLHGAFMYLLQDENGFVQEAHSISAGLDYPGVGPEHCYLHDIGRATYGNVTDEEALEGLKLLCRTEGILPALESAHAVFFASQLAKSMSPDDILVICLSGRGDKDVHTISEALGGDLG >NZ_CP028083.1|WP_137730530.1|772446_773709_-|threonine-ammonia-lyase-IlvA MEVVNSKSIAVENVLIAHQHLKDVVLHTPLQKNEYLSEKYKANIYIKREDLQHVRSFKLRGAFYKIKKIEEAARKSGVVCASAGNHAQGVAFACAHLNIKGRIFMPLTTPKQKIDQVRMFGRNNIEIILEGDTFDDSATAAKEYSSEHNMIFIHPFDDLDIIAGQGTVAVEVLNDIEEPLDYIFGGIGGGGLMAGISSYIKNISPNSKVIGVEPAGAASMKAAFDNGGPTTLAKIDKFCDGTAVQCVGTKTYEICNNYLDDIVVVPEGKVSTTILDLYNKHAIVAEPSGALPVSALDFYAEEIVGKSVVVVITGGNNDISRMQEIKEKSLLYEGLLYYFIVNFPQRAGALRQFLTVVLGPNDDITTFEYTKKNNKESGPALVGIEVTHPEDYQGLVNRMRINGFEFTEVNKDSQLFGLLV >NZ_CP028083.1|WP_137727601.1|773877_775230_-|YjiH-family-protein MTKKFSTYTWFLFIFLSLVGIILFITPINTEDGLKVPIAILANTLSANVTGFIHWFAYIVFIIAAVGALIIKFVPETDERTLLDSLFRVNWFWTTMRILAVIFASMYLFQVGPESFTSDITTGLLITPDGGLVTMMFSLFLFAGLLLPLLTDFGLLEFFGSMMVKIMRPLFKIPGRSAIDCLASFVGDGTIGVLLTSRQYEEGNYTAREAATIATTFSVVSITFCFVVLDTVSLNNYFLQFYGSVILVSIILALIMPRIFPLRGKPDTNFNGSTPLESSEIVPEGFNSFSFGLNSALSKADNNKNLGRVIGSGFKNVLEMWFAITPVIMAFGTIALVLAEYTSFFKILGMPFEPILALLQIPFADEAAQTMIVGFADMLLPSILGAGIESELTRFFIATVSVTQLIYMSEVGGLILGTKLPLKIWDLFLIFLIRTLISIPIIALLAHLIF >NZ_CP028083.1|WP_137727602.1|775472_776153_-|bacillithiol-biosynthesis-deacetylase-BshB2 MSLQPQRQILVVFPHPDDEAFSSAGTIRMYRNMGVPVTYACLTLGEMGRNLGNPPFATRESLPEIRREELKAACEVMGIEDLRMMGLRDKTVEFEDDEKMVSLVKGLIDELNPSLIITFLPGYAVHPDHEATARAVFETVRRMPKENRPTIYAVGFANNTIAEKGEPTLQIDVSSVKLEKVKALQAHASQTAWMIEENAKRTDDGRPMSDSWLHYERFYVINQDIL >NZ_CP028083.1|WP_137727603.1|776167_776518_-|YojF-family-protein MKEVQIDELQELLNSFANKDVYIHLETTNGAYASHFDERVFNAGAFIRNARIRYELAKIINDTPHRVGLKMDHGWVYAQGITHYELDEKGRLLMAGLDFTGKLAVALEISETPFSY >NZ_CP028083.1|WP_137727604.1|776640_777474_-|bifunctional-hydroxymethylpyrimidine-kinase/phosphomethylpyrimidine-kinase MALKKTLTIAGSDASGGAGLEADLKAFEEHDTYGMAAVTVIATMDPDNNWNHGVYTLPIDVLQAQLKTAFSTGIDALKTGMLSTEEVIQTTGEAISASGVKNVVIDPVMVCKGEDEVLNPGTVDAMIQYLLPNALVTTPNLFEAGQLAGTGTPKTIEEMKAAAEKIKALGAKNVIIKGGRALDTEKAVDLFYDGEKFYLLETPKVETTYNHGAGCTFAASVTANLANGLSVKDSVFEAKEFVAAGIKHGWKLNQFVGPVYHGAKPRLGAPEVTIKEV >NZ_CP028083.1|WP_137727605.1|777736_778417_+|uracil-DNA-glycosylase MKKIVNNDWEEILAPEFEKAYYTELRKFIEEQYSLSTVYPPKEEVMSAFYAVAYKDVKVVILGQDPYHGPAQAHGMSFSVKKGVPKPPSLRNIFKELESDLGCRIPEDGYLMNWAHQGVFLLNTVLTVRQGEANSHKGRGWEQFTDFVIENLARREEPIIFVLWGKPAQTKRTIIEKYGDHHFVLQAPHPSPLSAHRGFFGSKPFSKINNKLIEWGQVPIDWCLED >NZ_CP028083.1|WP_137727606.1|778623_778800_+|uracil-DNA-glycosylase MKVNCFKCRYFRVTWDARNPRSCTAYNFKTKQLPSVVVKQSSGLDCMQFSPKQTVGEP >NZ_CP028083.1|WP_137727607.1|778803_779121_+|YwdI-family-protein MISYQALLLEIEQLVAGTKNSTDEQYIREQLSAIRALCNVGLSNGNQNSTTKVQAYTSALITQPLQSFQSNPISTQSPNIVQNSNTLNGGKLKEDDANGESIFDF >NZ_CP028083.1|WP_137727608.1|779227_779608_+|DUF423-domain-containing-protein MKGSIISGAIHGFLVVALGAFGAHALDNVLDEYGIGIWEKAVQYQMFHTIAIVAIGILMSPKLFGSIKQLKIAAICMNLGIVFFSGSLYILALSGIGILGAITPIGGVLFLAGWILLLVATLQQKN >NZ_CP028083.1|WP_137727609.1|779824_781021_+|amidohydrolase MEQLLTLLESHYDEMVSIRRHLHENPELSFQEVHTPIYIANFHRKLGLEVREGVGGRGVVATLRGAKPGKTVALRADFDALAIHEQNDISYKSKVDGVMHACGHDGHTATLLVLAKALVEIKDDLQGNIVFIHQFAEEIAPGGAKPMIEDGCLDGVDVIFGTHLWAPTPLGDVLVRNGAIMAAADRLEITIQGKGGHGAEPHHSVDSIVVASQFITQLQTVVSRRIDPLKSAVVSIGHFEAINPFNVIAEKVELKGTVRTFDEQVRTQIEHEIELLLKSVCDGFHASYEYAFTRGYPPVVNHKKETQFLADVACQISEVKNVSECAPLMVGEDFAYYLEKVPGTFFITGAKDPAWEEAYPHHHAQFNFDERAMLIAAKTLGLATLKYLKQSKKISTSI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP028083_2 | 879807-879924 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP028083_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP028083_2
>2.1|879838|56|NZ_CP028083|CRISPRCasFinder AATGGACACTATAATAGCCAAGTTCGAATGTGAACTTGGCCTTTTAATTTGACTGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP028083_2
The CRISPR arrays of NZ_CP028083_2 >merge|NZ_CP028083|2|879807-879924|CRISPRCasFinder GTACCAGGTACACAAACGATTCTGATAATTGAATGGACACTATAATAGCCAAGTTCGAATGTGAACTTGGCCTTTTAATTTGACTGAGTACCAGGTACACAAACAATTCTGATAATTG >NZ_CP028083|2|2|879807-879924|CRISPRCasFinder GTACCAGGTACACAAACGATTCTGATAATTG AATGGACACTATAATAGCCAAGTTCGAATGTGAACTTGGCCTTTTAATTTGACTGA GTACCAGGTACACAAACAATTCTGATAATTG
>NZ_CP028083.1|WP_137727685.1|876552_879798_+|endonuclease MEKRNLKKSLNVFLATTLTASVALPMVPASVSAETVATDLIISEYIEGSSFNKAIEIYNGTGAAVDLSQYKIEGYFNGSSTPSQTLDLSGTLENGATYVIYHGSASEEIKAKGNLLNSSVINFNGDDAIVLKKNDEIIDSLGQVGVDPGTNWGTDVKTADMTLVRKSSIISGDTNPYDDFDPASQWTGYPTNTFSYLGSHILGDEENVTPVEGTITEVRTLPKGSTVTTTGIVTAVMGATTFIQDENSGIVLYGYDLNVEPGDKVRATGELTEYRSLLEINVTPESIEVLEKTTVPEPEVVTAAQLQEEKEGKLVTVQNVRIDSLTSGNFKATDGQGNSFELRPTDSSLLSVGTTYEAITGVLGSYNDIYQLIPRSIDDIVEDSSIVKPVVATPGEGLIKEGAGVTLTSRTEGATIHYTTDGSEPTTESSIYTGPITLSEDTTIKAIAVKEGLTASDVATFDYMIQLEDIRIHDIQGEGHYSKYDGLNVTDVEGIVTYVNGNEFYLQDLQPDDNSKTSEGILVYKGSHGVKVGDIISVDGNVKEYVMPGYAERFDTDLPVTEIAATTIDVIGTGELPKAIVLGEDVQLPTEVIDNDELSVFDPEEDGIDLFESLEGMLVEVNNPKVVALQKYGELTVIPGNMETNTSAGGLRISENDYNPERITINIDDEHYLAKMGDYFEGAIQGIVSYGYSYYQVLSNKDNLPELIDGGNERETTTITPEDDKLTVASYNVENFSTKTNSEKVTKLAEAVVANLKTPDIIGLTEVQDNDGETDSGTVDATQSAQVLIDKIVELGGPEYVYTDVAPVDKQDGGAPGGNIRVGFLYNPERVTLAEGTKGSATEAVAYENGQLTLNPGRIDPTNLAFNNSRKPLAAQFKFKGEEVIVVANHFNSKGGDQPLYGKNQPPVLGSEVQRMQIASIVNGFVKEILTDDPKANVVLLGDFNDFEFSNPLKTLKGNELTNMIESVPAEERYSYSYQGNAQVLDHILVNSKLASKTKVDIVHINSGFMEAQGRASDHDPVMVQIKLKKDNQGPGNGKPEKPEKPEKPEKPGKEEIKNKIEQLKKAIREKLEKLKKLFGF >NZ_CP028083.1|WP_168193801.1|875174_876170_+|acyltransferase MRIKEWDLLRVVACLSVLLLHTTTFNNQAKGATGNSDLVHFLRILLCYATPTFILLSIIILATIYRNQVPGKFWSKRIQFLILPFLFWGIVDAFVSFYVSENADLSSIIYENIFTGRFVGWFILVILQLYLLYWCMVKFKWNSIIVLPLAVLLYFLQQQFFALPIEFNYENGRFEKLYGTMWLIYFVAAYLIGVHYEKIRPVLKKYRFATIIFTALAALYIWTNFQQGQTDIHSRRMDLVPFVVGMTSMILAYGQLLPHFKIVQIISKYAFMIYLIHWNILNLTVGFYGDAVTSSPLRILLMFTVTLILSIQTAKILSYLPFGKWIVGKVR >NZ_CP028083.1|WP_137727683.1|872447_874997_+|S-layer-homology-domain-containing-protein MTTNKPFKYFNTAIAAAVVTSGVAVVAPQATEATELKFLDVKVGAYYYDAVMSLAERGIVNGYPDGTYGPEKSITRGQVAVILANALGLDTYDVTDPGFKDVPKSHDYYSAIAALANAGYINGYEDDTYKPSQPISRYHMALILAAAYNLEATDVDALPFTDVKNDYKAQVAALYENGVTAGKTTTTFGGNQKVTRGQMALFIAAAEEAAYPSITVSEIKDSKILTTDGEVYKFSEDLAGIFSEANDAALKDAEIGLIIENGVVVDVYYLILNASGTESAPVVFDGVDSLILGDLFVNADWMEVKNLTVIGDLYLTEEVVNSFSTDMVDVLGDVYVLETEESAVASLDHTFVVNASATAPKLNLVDSSVNSIEANRNNLVITSNTVIPEVRVAENVNSIELNAEVEAVTVNNAESVQISGTGTINNLTVKEAAQVTLNVPGQVKELVVANKDAKVSLGDNVTVGKLVVPAGSDFSTIIDNYNNLKENITEVVNEEGAEIDTTVVSVSTIEGFRVALADTHIKTINLTANLENVSERIVVDRAVTINGGEHTISFTNDINELAYGSRQGITVVADDVQINDLAVTLTEKAEWQGAYAVQVYNAQNVLLNNITTSGADAGLLVNAAEVELTGTTTVSGNEFGGIEVSKGTEEGLSNADLIVNGSIANETEAYGEPTIWLVHNQDPAKTAQGTVAGSGLDGTVVNYLDKVDGYQTQYFMQNAPVQIVSMEGKTTSLDSMNLASIEVIAQSEKELYELEVDHNITGLPEFSVYASEENPYGSEEAKAQFEALGVMVTYNAEAKKWTIEFGSEISNQLIAQEDVTFYVVIADQNKYTFGSMFNTTSQNTLKLQF >NZ_CP028083.1|WP_137727682.1|869325_871926_+|hypothetical-protein MANQPKKYKKFVATAATATLVASAIVPVASAATPSFPDIAGNDHASAIEAIAALGYISGKADGTFAPNEQVTRSQVVYILGNWAVDAGLKVPADYKTVQRFKDVPLTADDKFLQFTALLKDYGIFNGSNGNLNGGDKFQRQHMAVVLNSANKAITGTSLVDLAGDTSDVTIGDLDKVVADYRDDVLALKKLGITSPANFNPSGIVTRGQFATFLNATINAEAPEAKVASVNAINATQVVVKFTQAVDPATLFANDVNGAFEANTVSLTSIEATPVVPGTIAGELSADGKTLTITTQYPVEKRYNVVVENLSTTAGKALNKYDEVVSFTADKTAPSIVSTVKPTAGTVTVKFSEPMKSLGTVSFKLADGTVVADNSGNGVLYTFNAGDQEVTFTLGSDVPANATVTAQFIGAQDQNGNLLSPNPATTSLLKGAADGVAPTVTSIAQTGATTFAVKFSEELTGKPTITVAGSPVAAANVVQDKNDKTKYNVTAGVLDGATTIAVSSFTDLSGVAGTTTSRVVTFVKDAAAPKVVSSAVVADSTTKVEYLELTFDKDVVITGTPTVDGVGSFVKDYVTTSIETNNLSATAVDYKVSTNKKVIRVQLDTFLGTTFDVEGAAYNLTLSFADVKSAASVLAEDVVVKFTRGKDGVAANTDVVTVSNIAKGSDNSKVAVTFDKAVDGASATNPANYKIDGAIVESVTLQPAVTGATTTQVAIVNLKANSNGFTGTRNINISGVKALGSSKVMTPFFTNTLELAENVLPTVTSAKLTETNKVTLTFSEAVVNAAQSTNDFELYIGGVKVATNDEVTTALQAAPGSTTLVLTLEDDITASDISKGLVLKAVSTIDIQDSATNVLSVPTAGITVTQ >NZ_CP028083.1|WP_137727681.1|867792_868509_+|WecB/TagA/CpsF-family-glycosyltransferase MKETVLGIQVNTENYDELLKEIFSRIERKEKSLIVAINPEKIMKAKEDASLKKLLNEAEIQIPDGVGVIIASKIQKGQITERVTGVEMMMRLCEEAAKQQKPIFLYGGKPGVADTAAAKLKELYPGIIVAGTQDGYEKDNEVVKAKINEAKPDILFVAMGSPKQENWINANRDQLHPTIYQGVGGSFDVLAGTVKRAPEAFQKLGLEWFYRLMKEPKRFKRQLALPLFLVEVARSSKK >NZ_CP028083.1|WP_137727680.1|866413_867685_+|nucleotide-sugar-dehydrogenase MTKSICVVGLGYIGLPTAVMFANHGVKVHGVDVNPAAVKSIQEKTLHIEENGLQERLNKAVDEGFLTASTTPQEADVFIVAVPSPINADKTANLEYVRQATASIVPFVKKGDLVILESTVPPKTVERIMIPELIKTGLEIGTDIYVSHSPERVIPGRIFEELVNNDRIVGGINKKSSELTKELYETFVKGQIHLTDATTAELVKVMENTYRDVNIAFANELAKMADMLDVNIWEAIKFANYHPRVNVHFPGPGVGGHCIAVDPWFLVELGGESAQIINMSRNTNDSMPAFTAQKTQAILNRNKVAGGKVAVLGLAFKGNVDDMRESPSTEVIEELQHLGLEVVSYDPHIKENKHETQTQSLEEATKDADIILFLTDHNEFKAYNPLQISAKHKIVFDTKNCLNRDAWQEAGFQYHLLGDAKNK >NZ_CP028083.1|WP_137727679.1|865486_865960_+|IDEAL-domain-containing-protein MIQVQFMKPFYTKVNGKTLRLVFAYQYFSIVKDDELYHFVPVEGKEMIIDLETKQIENLSEIFVFQRGNRFIRLPLYQLLLISNVHEHLTPILNNATTAEESVNLVPKEKIESEMQKMIRELEEHNLERLIDQALENRDEKRFYELASEKSKLHEAK >NZ_CP028083.1|WP_137727678.1|863397_864984_-|hypothetical-protein MGISISTLAWEQATFIRNQLENIEQSLHPSVTEDEELVRRALFAVRNKSVNLDRYVPATTTLYATVQDVRLTHVTVHFRNNEINCDCPQAQWCRHKVSVILALFQYIGSVQDWAAKWRTKKSLNLHMLASNRTPENWLAMVEEVLTHLVPEGRIVEQQFIAGIVDTAHSKLRKHLPFEREWQPIYNLFMEIAILNRLWKQVDLKRAESSFGTDYFEYFFDRRFEIIQNTIHELSGKSRLFATDPFFDTLQILVREFLLERHYYIGRRLNIYLLFWDTVFIEKRRAEEELEILHGYQTSKISEDVPLSTVFNVFHILLKDYDSLKQNLKSITPDQMNVYFGLAKFAHSRNDEMATNSILKAMLPLLNEYISGYLKPSQRQMYVRRIHLLYDNIQLSEQEELMLYSAFGTYGVQPYSQYLLKEKRFGEWVALHQLYPSSISYLETCGLKDVIDEAPEMTLPLYHYYALEEVNQKSRMNYKQAVRIWKMMKSAAKKSGKTNFWDDYIQTVREQYKRLRALQEELEKGNLLV >NZ_CP028083.1|WP_137727677.1|860560_863401_-|DEAD/DEAH-box-helicase MIEIQQTPFTKNIRLSIEELQPAFFSVTAYSEDNTPLSPTLWTRQLFFRYEPNFFGLNANVSDTDLRLTTAELVDLLSPLYKHPFIQLTGADDRSDRLLAAMKAIQLLWNSSALWDYVITDENEDGDFSFSFQLPGSFIEDEYVKGITGDKNTILLEEFESLLKTAAYQKLAFAGLHSSDLPTLLPFFQNGGWPLNKDRNIGNLKVAIRLSEPEEGASEWLLETVLSSAKTTKLWTPAIRKKHLPVEKALPEKWLEYADEIVNHQEQILELMDLRAYHVAPDKFIHTTIEDGDVRKLLRNDFAKLSALGFEVVLPAWLRELKQTKMRVRVSASNQSQKSVAGLDDILAFKWQLSVNGEEINAEEFRKIVDENREFVRIGDEWFRMDVNWMNEIRELMDKAEEENWTVRELLFRELPNELAAPLEEEDSESDDPLFAFEMQRSLQDYIEQLTTKKGLPPIPKPIGLQAELRPYQQEGFEWLTFMREQKFGAVLADDMGLGKTVQLISYLLYTNEHLNETGPTLIICPTSVLGNWQKELDRFAPSLKVMTHYGSNRIKDDTFNSIIQREKPNVVLSSYGTISQDIEFLQIIDWGTVALDEAQNIKNMQTLQSRAIRRLNGKHHIALTGTPIENRLSELWAIFDFIHKGYLGSFGKFQEQFIIPIEREESERHKEILRTKIRPFLMRRTKNDPDLMLNLPEKQETKEFCALTSEQAALYEGYIEDTVAQLEVMTAFEKKGRILQMLSKLKQLCNHPALYLKEPLDDAKTLLNRSIKLKRIVELAADIVDNGEQCLIFTQYIGMGQLLQHCFSELYNIDIPFLTGSMPKQQRDNLVDSFQAGEFPIFLLSLKAGGTGLNLTAANHVLHADRWWNPAVENQATDRAYRIGQTQFVQVHKFITIGTIEEKIDKMIEIKSALSEELIQSSNWLTDLQEDELMDLLMLDTQAMR 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
2676506 : 2759287
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP028083|2676506:2759287|DBSCAN-SWA 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100 | Paenibacillus_phage(11.11%) | capsid,head,tail,transposase,holin,protease,portal,integrase,terminase | attL 2749411:2749427|attR 2759374:2759390 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
3611832 : 3620188
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP028083|3611832:3620188|DBSCAN-SWA 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TTGATAAGGCTCGATTGCAGAAGGATGATTGTGTGATTCCATTTTGAAAACGACCGCTTGTTCATCACCGATATCAACAATCCCTGCTCCTTCACCTGGACCTTGCAACACTTGAGGTCCTTTTGTCGGGAACTTGCGTAATACTGGTTTTGAATTTTTATAAGAACAGTGTTCAGACCACATTACAGAAAATAGACCCGTTTCAGTCCAGTTTGGAAGACGACCTAAGATACCTTCCACCATTGCAAATTCTTCATCTGACATCCCCATAGAAGCATATAGCTTTTGATTTTTAATTTGCTCCACTGTTGGTTCTAAACTAGCTGACATGTGATTCCCTCCACATTTTTACAATAGATTTAAATACCTTAAGACCATCGTCACTACCTAGTAATGCATCCACCGCACGTTCTGGGTGAGGCATCATGCCAAGTACATTTCCCTGTTCATTAATGATTCCGGCGATGTCTTCAAGACTGCCATTTGGATTTTCACCTGAATATGTAAATACGATTTGATTGTTTGCTTTTAGTTCTGCTAGCGTTTTGTCATCACAGAAGTAATTTCCTTCTCCGTGAGCGATTGGGATATTGATGATTTGGCCAACTTCATATTGATTTGTAAACAATGTATCGTTGTTTTCTACTTTTAACCCAACTGTACGACACATGAATTTCAAGTTTTTGTTTCGAAGTAAAGCTCCAGGAAGTAAGCCTGCTTCAGTTAAAATTTGGAATCCGTTACAGACACCTAGTACTGGTTTGCCTGATTCAGCAAACTTTTTCACTTCTGCCATTACGTTTGATTGGTTTGCCATTGCACCACAACGTAAATAGTCACCGTAAGAGAAACCGCCTGGTACTAATACGCCATCAAATTCGCTTAAATCTGTTGCGTCATGCCAAACGTATTCTACTTCTTCGCCTAGTTCATCTTTAATAGCATGATACATATCGATGTCACAGTTTGACCCAGGGAAAACGAGTACTGCGAATTTCATGATTAGTTAGCCTCCTCAACTTCATAGCGGTAATCTTCAATAACTGTATTTGCAAGAAGCTTTTCACACATTTCTTTTACCAAAGAATCAAGATCACGTTCTGTATCGCCAATTACAACCTCTAAATACTTACCGATACGGATGTCTTGCACCTCGTTGTAGCCCATTTTCGCCAAGGAACCTTGAACAGCTGAACCTTGTGGATCAAGTACACTTTCGCGTAATGTAACGTAAATTTTAACTTTAGTCATTTTTATTTTCCTCCAAGTCTAGCAAGAATAATTTCATATACATCTGTTAAATTTCCTAAATCACGTCGGAACACGTCTTTATCAAGCTTTTGTTTTGTTTCTGCATCCCAAAGACGGCAAGTATCTGGTGAGATTTCATCTGCCAGTAATACATTTCTGTCCTTATCGCGGCCAAATTCAAGCTTAAAGTCTACTAAAATAACGCCGACTTCTTCAAAGATTGGTTGAAGAACACTATTAACCTTTAAACCTTGTTGATAGAGAATTTCGACTTCTTCCTTCGTAGCAATCCCTAAAATGTCGATATGATCGTTATTGATCATAGGGTCACCAAGGGCATCATCTTTATAATAAAACTCTACAATCGTCCGGTTTAATGGAGTTCCTTCTTCAAGCCCAAGTCGTTTCGCAAGACTACCCGCAGCAATATTACGAACCACTACTTCGATTGGAATAATATCTACCTTACGAACTAGCTGTTCGTTTTCAGAGATACGTTCCACAAAGTGTGAATCAATTCCTAGCGTTTTTAATTTTTCGAAAATTACTGTTGTAATGCGGTTGTTTAGTATACCTTTTCCATCAATCTCTGCTTTCTTTTCACCGTTAAATGCAGTAGCACTATTTTTATACTCTACGAACAAAATATCCTCTTGTTCAGTTTGGTATAAACGTTTTGCTTTCCCTTCATATAAAAGCTGACCTTTATTCATGACGCGTGCCTCCAATTATTTATCACTCATCTCCCACAGCTGTGAGAGATGAGTGGTTATGTTCAATTGTTATTAGCGAAAATCATTTAATCAATTAGTCGTTTAGTCCAAGTCGTTCAAAGATCATATCTACATTTTTAATGTGATAGTTATAGTCGAAGCAATCATCAATCTCTTCTTTCGATAATAAAGAAGAAATTTTTTCATTTCCTTCTACTAATGGGCGGAATTGCTTTTGTTCATCCCATGCAATAGCAGTTAGTGGTTGAACCGTATCATAAGCTTCCTCACGTGCTAATCCTTTATCGATTAAAGCCAGTAAAATACGTTGTGAGTAAATTAAGCCGAATGTACGATCCATATTGCGTTTCATGTTCTCAGGGAATACCGTTAAGTTCTTCACGATGTTGCCAAAACGGTTTAACATATAATTTAAGCCGATTGTTGCATCTGGAATAATTACACGCTCTGCAGATGAATGTGAAATATCACGTTCATGCCATAACGATACGTTTTCATAAGCTGTTAGCATATAACCACGTAAAAGTCGTGCAATACCTGTCATATTTTCAGAACCGATTGGATTACGCTTATGTGGCATTGCAGAAGAGCCCTTTTGTCCTTTTGCAAATCCTTCTTCTACTTCTCGTGTTTCTGACTTTTGTAGACCGCGTACTTCTGTTGCAAATTTTTCTATAGACGTTGCGATTAATGCTAAAGTTGAGAAGTATTGAGCATGACGGTCACGTTGCAATGTTTGAGTTGAGATTGGTGCAGCTTGTAGACCTAATTTTTCACAAACATATTGTTCAACGAAAGGATCGATATTGGCATAAGTTCCAACTGCTCCTGACATTTTACCTGTTTCGATTACTTGTGCCGCTATATCGAAACGTTCCAGGTTACGTTTCATCTCTTCACGCCATAGAGCAAGCTTTAAACCGAATGTCGTTGGCTCAGCGTGTACACCATGGGTACGACCCATCATCACCGTGTATTTATATTCTTTTGCTTTTTCAGTCAAGATGTTGATGAAGTTCACGATATCTTGACGTAAAATATCGTTCGCTTGTTTGATTAAATAAGATAAAGCTGTATCCACTACATCTGTTGAAGTTAAACCGTAGTGAACCCATTTGCGTTCTTCTCCACAAGTTTCAGAAACAGCACGAGTGAATGCTACAACATCGTGGCGAGTTTCTTGCTCGATTTCATAGATACGGTTAATATCAAATGAAGCATTTTGGCGAAGTAATGCTACGTCTTCTTTCGGAATTTCGCCAAGTTCAGCCCATGCTTCACATGCTAAAATTTCAACCTCCAACCAAGCTTTAAATTTGTTTTCTTCTGTCCAAATTGCGCCCATTTCTGGACGTGTATAACGTTCGATCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP028083|3611832:3620188|3614932_3617161_-|WP_137730050.1|DBSCAN-SWA MSASLEPTVEQIKNQKLYASMGMSDEEFAMVEGILGRLPNWTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTKGPQVLQGPGEGAGIVDIGDEQAVVFKMESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPIAMLNSLRFGELQSKRGKYLFEEVVAGIAGYGNCIGIPTVGGEIQFDPCYEGNPLVNAMCVGLIDHKDIQRGIAAGVGNTVMYVGAKTGRDGIHGATFASEELSEASEEKRPAVQVGDPFMEKLLLEACLEVVKSDALVGIQDMGAAGLTSSSAEMASKAGSGVEMNLDLVPQRETGMTAYEMMLSESQERMLLVVKKGREDEIKSIFDKYGLDAVAIGRVTDDKMLRLVHKGEVVAEVPADALAEDAPVYNKPSKEPAYFAEFQALENSEPEVDNYKDTLLGLLKAPTVASKEWVYDQYDYQVRTNTIVAPGSDAAVLRVRGTNKGLAMTTDCNSRYIFLDPEMGGKIAVAEAARNIVASGGKPLAITDCLNFGNPEKPEIFWQIEKSADGISAACTALNAPVIGGNVSLYNERSGEAVYPTPTIGMVGLVEDLAHVTTQQVKTAGDVVYLVGETATEFGGSELQKLVFGKIFGKAPHIDLAVEAKRQEAILTAIREGLLQSAHDVSEGGVAVALAEKTFGAQGLGIDVSLEGSAVTALFSESQSRFVVTVNEENAAAFEKVIPEAKKIGIVTDDAKITINGHTGVLLEGTVEEFRSAWKGAIPCLVKSEA >NZ_CP028083|3611832:3620188|3618084_3618795_-|WP_137730053.1|DBSCAN-SWA MNKGQLLYEGKAKRLYQTEQEDILFVEYKNSATAFNGEKKAEIDGKGILNNRITTVIFEKLKTLGIDSHFVERISENEQLVRKVDIIPIEVVVRNIAAGSLAKRLGLEEGTPLNRTIVEFYYKDDALGDPMINNDHIDILGIATKEEVEILYQQGLKVNSVLQPIFEEVGVILVDFKLEFGRDKDRNVLLADEISPDTCRLWDAETKQKLDKDVFRRDLGNLTDVYEIILARLGGK >NZ_CP028083|3611832:3620188|3611832_3612417_-|WP_137730047.1|DBSCAN-SWA MTTKIAVFASGSGSNFQAIQEAIENGQLDAQIEIVVTDKPDAYVVKRAENFNIPVFSFVAKHYESKAHYEQEIVNILKKHEVKWVILAGYMRLIGNTLLSAFRNQIVNIHPSLLPSFPGKDAIGQAMEHGVKVTGVTVHFVDEGMDTGPILSQAAVEVVVGNRSATEARVHAVEHELYTRTLQKLFKKEIRIVH >NZ_CP028083|3611832:3620188|3612416_3613472_-|WP_137730048.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQAGVNIEAGYEAVNRMKSHVERTKRLGVMGTFGGFGGMFDLSSLNLKEPVLISGTDGVGTKLKLAFMVDKHDTIGVDCVAMCVNDIVAQGAEPLYFLDYVAVGKAEPAKIEQIVKGVADGCVQAGSALIGGETAEMPGLYEEDEYDLAGFAVGACEKANVVTGEEITEGDVLIGLASSGVHSNGYSLVRKIVFADNGFAVDEVVEGYEKLGPIGEALLVPTKIYARPVLEILKQAKIHGMAHVTGGGFYENLPRMMPEGLATEINLGSWPVLPIFEFLKDKGALADKDLYNVFNMGIGFVLSVPASEAEKVLAIAEENGEKAYKIGRVVKGEGVVFNGSHDGSLS >NZ_CP028083|3611832:3620188|3617833_3618082_-|WP_137730052.1|DBSCAN-SWA MTKVKIYVTLRESVLDPQGSAVQGSLAKMGYNEVQDIRIGKYLEVVIGDTERDLDSLVKEMCEKLLANTVIEDYRYEVEEAN >NZ_CP028083|3611832:3620188|3613532_3614957_-|WP_137730049.1|DBSCAN-SWA MLGEIRGLNEECGVFGIWGHPDAAQLSYYGLHALQHRGQEGAGIVVTDGHALRAVKGEGLVNDVFNESNLGTAKGYGAIAHARYTTAGGGGIENVQPLLFRSSTGTLAIAHNGNLVNANHLKQHLERSGSIFQSTSDTEVVVHLIKKSKKPGFRAQVKESLSLLKGAFSFLIITKEGMMVARDRNGLRPLSLGKLGEAYVVASETCAFDLIGAEFVREVEPGELLVITDQGIEEDRFVAMEKRAMCAMEYVYFARPDSNIDEINIHAARKRMGKQLAKECFGIEADVVTGVPDSSISAAIGFAEESGIPYELGLIKNRYTGRTFIQPTQELRERGVKMKLSPVVQVVKGKRVVMVDDSIVRGTTSRRIVNMLKEAGATEVHVVISSPPMKNPCFYGIDTSTSEELIASSKSVEDIREAIGADTLTFLSADGLIEATARAFDDETRGLCMACFTGDYPTEIFPDTVLPHVKELQH >NZ_CP028083|3611832:3620188|3617150_3617831_-|WP_137730051.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDIDMYHAIKDELGEEVEYVWHDATDLSEFDGVLVPGGFSYGDYLRCGAMANQSNVMAEVKKFAESGKPVLGVCNGFQILTEAGLLPGALLRNKNLKFMCRTVGLKVENNDTLFTNQYEVGQIINIPIAHGEGNYFCDDKTLAELKANNQIVFTYSGENPNGSLEDIAGIINEQGNVLGMMPHPERAVDALLGSDDGLKVFKSIVKMWRESHVS >NZ_CP028083|3611832:3620188|3618889_3620188_-|WP_137730054.1|DBSCAN-SWA MIERYTRPEMGAIWTEENKFKAWLEVEILACEAWAELGEIPKEDVALLRQNASFDINRIYEIEQETRHDVVAFTRAVSETCGEERKWVHYGLTSTDVVDTALSYLIKQANDILRQDIVNFINILTEKAKEYKYTVMMGRTHGVHAEPTTFGLKLALWREEMKRNLERFDIAAQVIETGKMSGAVGTYANIDPFVEQYVCEKLGLQAAPISTQTLQRDRHAQYFSTLALIATSIEKFATEVRGLQKSETREVEEGFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENMTGIARLLRGYMLTAYENVSLWHERDISHSSAERVIIPDATIGLNYMLNRFGNIVKNLTVFPENMKRNMDRTFGLIYSQRILLALIDKGLAREEAYDTVQPLTAIAWDEQKQFRPLVEGNEKISSLLSKEEIDDCFDYNYHIKNVDMIFERLGLND |
8 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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