Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP022905 | Staphylococcus aureus strain 628 chromosome, complete genome | 11 crisprs | cas3,DEDDh,csa3,DinG,RT,WYL | 10 | 3 | 11 | 2 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP022905_1 | 170181-170265 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP022905_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP022905_1
>1.1|170207|33|NZ_CP022905|CRISPRCasFinder TGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP022905_1
The CRISPR arrays of NZ_CP022905_1 >merge|NZ_CP022905|1|170181-170265|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTGTGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTG >NZ_CP022905|1|1|170181-170265|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTG TGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT TTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTG
>NZ_CP022905.1|WP_001013485.1|169072_170032_+|cation-transporter MNGKKANTINRYKYFHHVNHQKIQQSSKKTLWASLIITLLFTVIEFVGGLVSNSLALLSDSFHMLSDVLALGLSMLAIYFASKKPTARYTFGYLRFEILVAFLNGLALIVISIWILYEAIVRIIYPQPIESGIMFMIASIGLLVNIILTIILVRSLKQEDNINIQSALWHFMGDLLNSIGVIVAVVLIYFTGWRIIDPIISIVISLIILRGGYKITRNAWLILMESVPQHLDTDQIMADIKNIDGILDVHEFHLWSITTEHYSLSAHVVLDKKYEGDDYQAIDQVSSLLKEKYGIAHSTLQIENLQLNPLDEPYFDKLT >NZ_CP022905.1|WP_000290397.1|166938_168426_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein MAVNVRDYIAENYGLFINGEFVKGSSDETIEVTNPATGETLSHITRAKDKDVDHAVKVAQEAFESWSLTSKSERAQMLRDIGDKLMAQKDKIAMIETLNNGKPIRETTAIDIPFAARHFHYFASVIETEEGTVNDIDKDTMSIVRHEPIGVVGAVVAWNFPMLLAAWKIAPAIAAGNTIVIQPSSSTPLSLLEVAKIFQEVLPKGVVNILTGKGSESGNAIFNHDGVDKLSFTGSTDVGYQVAEAAAKHLVPATLELGGKSANIILDDANLDLAVEGIQLGILFNQGEVCSAGSRLLVHEKIYDQLVPRLQEAFSNIKVGDPQDEATQMGSQTGKDQLDKIQSYIDAAKESDAQILAGGHRLTENGLDKGFFFEPTLIAVPDNHHKLAQEEIFGPVLTVIKVKDDQEAIDIANDSEYGLAGGVFSQNITRALNIAKAVRTGRIWINTYNQVPEGAPFGGYKKSGIGRETYKGALSNYQQVKNIYIDTSNALKGLY >NZ_CP022905.1|WP_001237004.1|166128_166512_-|YbaN-family-protein MRLILIVIGLIFTALGIAGAVLPLLPTTPFLLVAVFCFARSSDRFYNWLINQKIYKEYVENFYLHRGYTLQQKIKILISLYIVIGFSIYMVDVLAVRVGLIIMVIIQTAVLFTFVKTLPKSNHKIEE >NZ_CP022905.1|WP_000480603.1|165795_166122_-|staphylobilin-forming-heme-oxygenase-IsdI MFMAENRLQLQKGSAEETIERFYNRQGIETIEGFQQMFVTKTLNTEDTDEVKILTIWESEDSFNNWLNSDVFKEAHKNVRLKSDDDGQQSPILSNKVFKYDIGYHYQK >NZ_CP022905.1|WP_000723436.1|164585_165731_+|UDP-N-acetylglucosamine-2-epimerase-(non-hydrolyzing) MKKIMVIFGTRPEAIKMAPLVKEIDHNGNFEANIVITAQHRDMLDSVLSIFDIQADHDLNIMQDQQTLADLTANALAKLDSIINEEQPDMILVHGDTTTTFVGSLAAFYHQIPVGHVEAGLRTHQKYSPFPEELNRVMVSNIAELNFAPTVIAAKNLLFENKDKERIFITGNTVIDALSTTVQNDFVSTIINKHKGKKVILLTAHRRENIGEPMHQIFKAVRDLADEYKDVVFIYPMHRNPKVRAIAEKYLSGRNRIELIEPLDAIEFHNFTNQSYLVLTDSGGIQEEAPTFGKPVLVLRNHTERPEGVEAGTSRVIGTDYDNIVRNVKQLIEDDEAYQRMSQANNPYGDGQASRRICEAIEYYFGLRSDKPDEFVPLRHK >NZ_CP022905.1|WP_000779504.1|163246_164509_+|nucleotide-sugar-dehydrogenase MKLTVVGLGYIGLPTSIMFAKHGVDVLGVDINQQTIDKLQSGQISIEEPGLQEVYEEVLSSGKLKVSTTPEASDVFIIAVPTPNNDDQYRSCDISLVMRALDSILPFLEKGNTIIVESTIAPKTMDDFVKPVIENLGFTIGEDICLVHCPERVLPGKILEELVHNNRIIGGVTKACIEAGKYVYRTFVQGEMIETDARTAEMSKLMENTYRDVNIALANELTKICNNLNINVLDVIEMANKHPRVNIHQPGPGVGGHCLAVDPYFIIAKDPENAKLIQTGREINNSMPAYVVDTTKQIIKALSGNKVTVFGLTYKGDVDDIRESPAFDIYELLNQEPDIEVCAYDPHVELDFVEHDMSHAVKDASLVLILSDHSEFKNLSDSHFDKMKHKVIFDTKNVVKSSFEDVSYYNYGNIFNFIDK >NZ_CP022905.1|WP_001230679.1|162305_163193_+|capsular-polysaccharide-type-5/8-biosynthesis-epimerase-CapN MRKNILITGVHGYIGNALKDKLIEQGHQVDQINVRNQLWKSTSFKDYDVLIHTAALVHNNSPQARLSDYMQVNMLLTKQLAQKAKAEDVKQFIFMSTMAVYGKEGQVGKSDQIDTQTPMNPTTNYGISKKFAEQALQELISDSFKVAIVRPPMIYGAHCPGNFQRLMQLSKRLPIIPNINNQRSALYIKHLTAFIDQLISLEVTGVYHPQDSFYFDTSSVMYEIRRQSHRKTVLINMPSVLNKYFNKLSVFRKLFGNLTYSNTLYENNNALEVIPGKMSLVIADIMDETTTKDKA >NZ_CP022905.1|WP_000825098.1|161748_162306_+|sugar-transferase MKRLFDVVSSIYGLVVLSPILLITALLIKMESPGPAIFKQKRPTINNELFNIYKFRSMKIDTPNVATDLMDSTSYITKTGKVIRKTSIDELPQLLNVLKGEMSIVGPRPALYNQYELIEKRTKANVHTIRPGVTGLAQVMGRDDITDDQKVAYDHYYLTHQSMMLDMYIIYKTIKNIVTSEGVHH >NZ_CP022905.1|WP_001291024.1|160532_161738_+|glycosyltransferase-family-4-protein MSEKKILILCQYFYPEYVSSATLPTQLAEDLIANHINVDVMCGWPYEYSNHKQVSKTEMHRGIRIRRLKYSRFNNKSKVGRIINFFSLFSKFVINIPKMLKYDQILVYSNPPILPLIPDVLHRLLKKKYSFVVYDIAPDNAIKTGATRPGSMIDKLMRYINRHVYKNAENVIVLGTEMKNYLLNHRISKNADNIHVIPNWYDMRQLQDNRIYNDTFKAYREQYDKILLYSGNMGQLQDMETLISFLKLNKDQPQTLTILCGHGKKFADVKTAIEDHRIENVKMFEFLTGTDYADVLKIADVCIASLIKEGVGLGVPSKNYGYLAAKKPLVLIMDKQSDIVQHVEQYDAGIQIDNGDAHAIYNFINTHSSKELHEMGERAHQLFKDKYTREINTMKYYNLLK >NZ_CP022905.1|WP_000239647.1|159326_160532_+|capsular-polysaccharide-biosynthesis-protein MVKKVFIMDSVKTIIGTLLIALGLQFLAYPIINQRVGNEAFGSILTIYTIITITSVVLGNTLNNIRLINMNLYKSNHYYWKFVSILLISILIESIALIIVFLYFFNLNTIDIIFLILLNILMCLRIYLNVFFRMTLKYNQILYIALIQFLGLLIGLFLYYLIQNWIVCFITSELFATIYTLVKLRGLTIGEYQSEDNNVVKDYVMLLSTNSLNNLNLYLDRLILLPIIGGTAVTISFLSTFIGKMLATFLYPINNVVLSYISVNESDNIKKQYLKTNLFAIAALCLVMIICYPITLIIVSLLYNIDSSLYSKFIILGNIGVLFNAVSIMIQTLNTKHASITLQANYMTLHTITFIFITILMTIAFGLNGFFWTTLFSNIIKYVILNIIGLKSKFINKKDVD >NZ_CP022905.1|WP_000356963.1|170326_170530_-|hypothetical-protein MDKESVVASLARNKKIAVETMAGQRYIIERILHTNDEKHIHILKPKDVVLDVDSIKEIDENHLNDAT >NZ_CP022905.1|WP_000171919.1|170708_171221_+|DUF4242-domain-containing-protein MTLFLLEANNLDFASTKEELEAKAASLSTKTIPTLIEVQATENLTHGYFIVEANDEAEAKQFLTEADISIQLVKEVRLVGKDLDEVKNGDAHVDYLVTWNIPEGITMDQYLARKKKNSVHYEEVPEVEFKRTYVCEDMSKCICLYNAPDEEAVRRARKAVDTPIDGIEKL >NZ_CP022905.1|WP_000590854.1|171562_172303_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKIQQLQHHFGSHKVIHNFNLDISKGEIVTFIGKSGCGKSTLLNVIGGFIHPSSGRVIIDNEIKQQPSPDCLMLFQHHNLLPWKTINDNIRIGFQQKISDEEINAQLKLVDLEDRGKHFPEQLSGGMKQRVALCRAHVHKPNVILMDEPLGALDAFTRYKLQDQLVQLKHKTQSTIILVTHDIDEAIYLSDRIVLLGEGCNIISQYEITASHPRSRNDSHLLKIRNEIMETFALNHHQVEPEYYL >NZ_CP022905.1|WP_000826669.1|172316_173288_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKRLSIIVIIGIFIITGCDWQRTSKEPSKNAQNQQVIKIGYLPITHSANLMMTKKLLSQYNHPKYKLELVKFNNWPDLMDALNSGRIDGASTLIELAMKSKQKGSNIKAVALGHHEGNVIMGQKGMHLNEFNNGDDYHFGIPHRYSTHYLLLEELRKQLKIKPGHFSYHEMSPAEMPAALSEHRITGYSVAEPFGALGEKLGKGKTLKHGDDVIPDAYCCVLVLRGELLDQHKDVAQAFVQDYKKSGFKMNDRKQSVDIMTHHFKQSRDVLTQSAAWTSYGDLTIKPSGYQEITTLVKQHHLFNPPAYDDFVEPSLYKEASRS >NZ_CP022905.1|WP_031767368.1|173284_174046_+|ABC-transporter-permease MTRPTNNKFILPIITFIIFLGIWEMVIIIGHYQPVLLPGPALVGKSIWTFIVTGEIFQHLAISLWRFVAGFVVALLVAIPLGFLLGRNRWLYNTIEPLFQLIRPISPIAWAPFVVLWFGIGSLPAIAIIFIAAFFPIVFNTIKGVRDIEPQYLKIAANLNLTGWSLYRNILFPGAFKQIMAGIHMAVGTSWIFLVSGEMIGAQSGLGFLIVDARNMLNLEDVLAAIFFIGLFGFIIDRFISYIEQFILRRFGE >NZ_CP022905.1|WP_000171645.1|174058_175090_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase MTLETLIKEQLDPHLVEVDEGTYYPRTFIQQLFVDGYFGEAALRKNAEVIEAVSQSCLTTGFCLWCQLAFSTYLENATQPHLNNDLQQQLLSGEILGATGLSNPMKSFNDLEKLNLEHTYVDGQLVVSGRMPAVSNIQEDHYFGAISKHESSDEFVMFILRANQDGITLVEKTNFLGVNGSATYQITLNQVVVPQSQIITHDAKQFAATIRPQFIAYQIPIGLGSIKSSLELIDAFSNAQNGINQYLEYDVEAFKKRYRQLREEYYAILDDGNLTSHLSELISLKKDIGYLLLDVNQASVVNGGSRAYTPYSPQVRKLKEGFFFAALTPTLRHLGKLEAELKG >NZ_CP022905.1|WP_001092004.1|175306_175666_+|DUF2294-domain-containing-protein MNTIDTHTKEQQFSNLVRSYRKEYVGKGPNSIRVSFKDNWAIAHMTGVLSKVESFYLNDKRNESMLHYTRTEKIKQMYKEIDVNEMESLVGAKFVKLFTDIDLNDDEVISIFVFDKSIE >NZ_CP022905.1|WP_000706135.1|175839_176865_+|NAD-dependent-formate-dehydrogenase MKIVALFPEAVEGQENQLLNTKKAIGLKTFLEERGHEFIILADNGEDLDKHLPDMDVIISAPFYPAYMTRERIEKAPNLKLAITAGVGSDHVDLAAASEHNIGVVEVTGSNTVSVAEHAVMDLLILLRNYEEGHRQSVEGEWNLSQVGNHAHELQHKTIGIFGFGRIGQLVAERLAPFNVTLQHYDPINQQDHKLSKFVSFDELVSSSDAITIHAPLTPETDNLFDKDVLSRMKKHSYLVNTARGKIVNRDALVEALASEHLQGYAGDVWYPQPAPADHPWRTMPRNAMTVHYSGMTLEAQKRIEDGVKDILERFFNHEPFQDKDIIVASGRIASKSYTAK >NZ_CP022905.1|WP_000826862.1|177250_178501_+|MFS-transporter MKRLSTTLKVRLISNFLQLIITTAFIPFIALYLTDMLSQSIVGIYLVGLVVLKFPLSIISGYLIEIFPKKLLVLIYQATMVIMLVFMGVFGSHQLWQIIGFCVAYAIFTIVWGLQFPVMDTLIMDAITEDVEHYIYKISYWMTNLSVAIGALLGGLMYGYSMLLLFLIAACIFLIVLFILYIWLPQDRNQVKQSDDKRHASRYQKLQIMNIFRSYKLVLKDRNYMLLISGFSIIMMGEFSISSYIAIRLKDQFETISIGSYDITGAKMLAILLMINTVVVILLTYSISKVVLKIDFKKALITGLLIYIVGYSGLTYLNQFGLLVVFMIIATVGEIIYSPIVSEQRFKIIPKAKRGTYSAVNALGIHFSETLARLGIVLGVFLTSLQMGLYMFIVLTIGASMLVAGVFGGQKQVNTN >NZ_CP022905.1|WP_000605281.1|178947_186123_+|non-ribosomal-peptide-synthetase MIMGNLRFQQEYFRIYKNNTESTTHRNAYWVKLAKNVEATKMMYALSTIVQQHASIRHFFDVTTDDNLTMILHEFLPFIEIKQVPSSSANYDLEAFFKQELSTYHFNDSPLFKVKLFQFADAAYILLDFHVSIFDDSQIDIFLDDLCNAYRGNTVINNTRQHAHINRNDDKDNQDASHIALDSNYFRLENNSDIHIDSYFPIKHPFEQALYQTYLIDDMTSIDMASLAVSVYLANHIMSQQHDVTLGIHVPSHLPNDLHGNIVPLTLTIDAKDVCQRFTTDFNKCVLQNMSQLQCAKSSLSLETIFHCYHHMMSCCNDVIEDVHQIHDAHTSLADIEIFPHQHGFKIIYNSAAYDLLSIETLSDLVRNIYLQITEENGNKRTTVDELNLMTERDIQLYDDINLSLPEIDDAQTVVTLFEQQVEATPNHVAVQFDGVFITYQTLNARANDLAHRLRNQYGVEPNDRVAVIAEKSIEMIIAMIGVLKAGGAYVPIDPNYPSDRQEYILKDATPKVVITYQALYENGKQNINHIDLNKIAWKNIDNLSKCNTLEDHAYVIYTSGTTGNPKGTLIPHRGIVRLVHRNHYVPLNEETTILLSGTIAFDAATFEIYGALLNGGKLIVAKKEQLLNPIAVEQLINENDVNTMWLTSSLFNQIASERIEVLVPLKYLLIGGEVLNAKWVDLLNQKPKHPQIINGYGPTENTTFTTTYNIPNKVPNRIPIGKPILGTHVYIMQGERRCGVGIPGELCTSGFGLAAGYLNQPELTADKFIKDSNINQLMYRSGDIVRLLPDGNIDYLYRKDKQVKIRGFRIELSEVEHALERIQGINKAVVIVQNHDQDQYIVAYYEAMHTLSHNKIKSQLRMTLPEYMIPVNFMHIEQIPITINGKLDKKALPIMDYVDTDAYVAPSTDTEHLLCQIFADILHVNQVGIHDNFFELGGHSLKATLVVNRIEASTGKRLQIGDLLQKPTVFELAQAIAKVQEQNYEVIPEAIVKDDYVLSSAQKRMYLLWKSNHKDTVYNVPFLWRLSSGLNVAQLQQAVQHLIARHEILRTQYIVVDDEVRQRIVADVVADFEEVNTHFTDEQEIMRQFVAPFNLEKPSQIRVRYIRSPLHAYLFIDTHHIINDGMSNIQLMNDLNALYQHKLLLPLKLQYKDYSEWMSHRDMTKHRQYWLSQFKDEVPILSLPTDYVRPNIKTTNGAMMSFTMNQQMRQLLQKYVEKHQITDFMFFMSVVMTLLSRYARKDDVVVGSVMSARMHKGTEQMLGMFANTLVYRGQPSPDKMWTQFLQEVKEMSLEAYEHQEYPFECLVNDLDQSHDASRNPLFDVMLVLQNNETNHAHFGHSKLTHIQPKSVTAKFDLSFIIEEDRDDYTINIEYNTDLYHSETVRHMGNQCMIMIDYILKHQDTLQICDIPNGTEELLNWVNTHVNDRMLNVPGNKSIISYFNEVVSRQGNHVALVMNDLTMTYETLRNYVDAIAHMLLSNGVGNGQRVALFTERSFEMIAAMLATVKVGASYIPIDIDFPNKRQGAILEDAKVTAVMSYGVEIETTLPVIQLENAKGFVESKENEQYDDLHGNQLENTAMLDNEMYAIYTSGTTGMPKGVAIRQRNLLNLVHAWSTELQLGDNEVFLQHANIVFDASVMEIYCCLLNGHTLVIPDREERVNPEQLQQLINKHRVTVASIPLQMCSIMEDFYIEKLITGGATSTASFVKYIEKHCGTYFNAYGPSESTVITSYWSHHCGDLIPETIPIGKPLSNIQVYIMSDGLLCGIGMPGELCIAGDSLAIGYINRPELMADKWQNNPFGKGKLYHSGDLARYTSDGQIEFLGRIDKQVKVNGYRIELDEIENVILAIRGISDCVVTVSHFDTHDILNAYYVGEQQVEQDLKQYLNDQLPKYMIPKTITHIDCMPLTTNDKVDTTRLPNPSPIQQSNKVYSEPSNEIEQTFVDVFGEVLKQNDVGVDDDFFELGGNSLEAMLVVSHLKRFGHHISMQTLYQYKTVRQIVNYMYQNQQSLVALPDNLSELQKIVMSRYNLGILEDSLSHRPLGNTLLTGATGFLGAYLIEALQGYSHRIYCFIRADNEEIAWYKLMTNLNDYFSEETVEMMLSNIEVIVGDFECMDDVVLPENMDTIIHAGARTDHFGDDDEFEKVNVQGTVDVIRLAQQHHARLIYVSTISVGTYFDIDTEDVTFSEADVYKGQLLTSPYTRSKFYSELKVLEAVNNGLDGRIVRVGNLTSPYNGRWHMRNIKTNRFSMVMNDLLQLDCIGVSMAEMPVDFSFVDTTARQIVALAQVNTPQIIYHVLSPNKMPVKSLLECVKRKEIELVSDESFNEILQKQDMYETIGLTSVDREQQLAMIDTTLTLKIMNHISEKWPTITNNWLYHWAQYIKTIFNK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP022905_2 | 429971-430072 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP022905_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP022905_2
>2.1|429994|56|NZ_CP022905|CRISPRCasFinder AAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP022905_2
The CRISPR arrays of NZ_CP022905_2 >merge|NZ_CP022905|2|429971-430072|CRISPRCasFinder TTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTATATATGAATTGAGTATTAAATTTG >NZ_CP022905|2|2|429971-430072|CRISPRCasFinder TTATGAATTGAGTATTAAATTTG AAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTAT ATATGAATTGAGTATTAAATTTG
>NZ_CP022905.1|WP_001792089.1|429195_429294_+|hypothetical-protein MQLNVNMMKFDRWHKGICKQIVLNLVEKGEKG >NZ_CP022905.1|WP_000991018.1|427722_429111_-|L-cystine-transporter MNAFLTLINIIVLVIFIVILHMMARKHISFAKRVFTALGIGIVFGVLLHLVYGTHSNVITSTSDWFNIVGQGYVALLQMIVMPLIFISIVAAFTKIQIGEKFAKIGSLIFIFLIGTVTIAAIVGVVYALVFGLDASTINLGNAEQARGSEIAKQAKDLTAHTLPQQILELLPKNPFLDFTGQRATSTIAVVIFASFIGFAYLRVARKQPDHGELLKRAIDAIYSLVMAIVTFVLRLTPYGVLAIMANTLSTSDFGAIWTLGKFLIASYAALITMYIIHLIILSLLGISPIRYVKKTLEVLIFAFTSRSSAGALPLNVQTQTRRLGVPEGIANFAATFGLSIGQNGCAGIYPAMLAIMVAPVANVEIDLQFIVTLIAVVIISSFGVAGVGGGATFASILVLSTLNLPVALAGVLISVEPLIDMGRTALNVNDSMLAGTGTAKLTKHWDKDTFESNDNAALTSH >NZ_CP022905.1|WP_001287099.1|426887_427643_+|NADPH-dependent-oxidoreductase MSDYVYNLVKKHHSVRKFKNKPLSEDVVKKLVEAGQSASTSSFLQAYSIIGIDDEKIKENLREVSGQPYVVENGYLFVFVIDYYRHHLVDQHAETDMENAYGSTEGLLVGAIDAALVAENIAVTAEDMGYGIVFLGSLRNDVERVREILDLPDYVFPVFGMAVGEPADDENGAAKPRLPFDHVFHHNKYHADKETQYAQMADYDQTISEYYDQRTNGNRKETWSQQIEMFLGNKARLDMLEQLQKSGLIQR >NZ_CP022905.1|WP_000052781.1|425826_426396_-|peroxiredoxin MSLINKEILPFTAQAFDPKKDQFKEVTQEDLKGSWSVVCFYPADFSFVCPTELEDLQNQYEELQKLGVNVFSVSTDTHFVHKAWHDHSDAISKITYTMIGDPSQTITRNFDVLDEATGLAQRGTFIIDPDGVVQASEINADGIGRDASTLAHKIKAAQYVRKNPGEVCPAKWEEGAKTLQPGLDLVGKI >NZ_CP022905.1|WP_000930514.1|424287_425811_-|alkyl-hydroperoxide-reductase-subunit-F MLNADLKQQLKQLLELMEGNVEFVASLGSDEKSKELKELLTEISDMSPRLSLSEKSLKRTPSFSVNRPGEETGVTFAGIPLGHEFNSLVLAILQVSGRAPKEKQSIIDQIKNLEGSFHFETFISLTCQKCPDVVQALNLMSVINPNITHSMIDGAVFREESENIMAVPAVFLNGEEFGNGRMTIQDILSKLGSTADASEFENKEPYDVLIVGGGPASGSAAIYTARKGLRTGIVADRIGGQVNDTAGIENFITVKETTGSEFSSNLAAHIDQYDIDAMTGIRATDIEKTDEAIKVTLENGAVLESKTVIIATGAGWRKLNIPGEEQLINKGVAFCPHCDGPLFENKDVAVIGGGNSGVEAAIDLAGIVNHVTLFEFASELKADNVLQDRLRSLSNVDIKTNAKTTEVVGEDHVTGIRYEDMSTGEEHLLNLDGIFVQIGLLPNTSWLKDAVELNERGEIVIDRNNNTNVPGIFAAGDVTDQKNKQIIISMGAGANAALNAFDYIIRN >NZ_CP022905.1|WP_000746679.1|423217_423844_-|NDxxF-motif-lipoprotein MKKRLLLSTFLASALILTGCASDQSDNEDHHTSTGIHAPKSAKKLETKDIFNSDKKNSDISDAEMKQAIEKYLSVNSDILDNKYIMQHKLDKQIDSQTKVTEKQAETLSHLSNLAVKNDLHFKKFVTENNIPKEYKKPVELMMNYFKALNSTIANVDEDIEKLSYQPQNKINVVDVPTKYAGDVNKKQQDKIKDFLKSKGIKSDVIDK >NZ_CP022905.1|WP_000868256.1|422564_422948_-|hypothetical-protein MKVRITFIILAILSTIVCLFLAAMHPTGPNTVTFEQPYLFTLNIILMVLVALPSLVLAIYDYMSFRISSAILQFLGAISWFFLSLILSLTQFTPFTLASFITSIILFISAIITLAIGGKSVDKNDSH >NZ_CP022905.1|WP_000158375.1|421917_422499_+|histidine-phosphatase-family-protein MTIYLVRHGESKSNYDNKHFRSYFCGQLDVPLTDTGTKSADDLCDYFKEKQIKHVYVSDLLRTQQTFEHIFPYDIASTTTPLLRERSLGVFEGEYKDEISANPKYEKYFNDPNFKDFRHSFSQKAPEGESYEDVYQRVEHFMNHVVNEDTQKDDIVIVAHQVVIRCLMVYFNKVSREEAVDLKVENCKPYIIE >NZ_CP022905.1|WP_000211677.1|421530_421740_-|hypothetical-protein MTTQSFIFMNIILLDGATQRHPFFICQILAFLFPKFPHINLLLFYPILSTFSNIIIHIDHFHANKKDDN >NZ_CP022905.1|WP_000466748.1|421240_421492_+|GlsB/YeaQ/YmgE-family-stress-response-membrane-protein MFGFIGMLIVGGLIGWAAGAIMGKDIPGGILGNIIAGIIGSWVGGKLFGQWGPELGSIYILPALIGSIILIAIVTLILRAMRK >NZ_CP022905.1|WP_000956137.1|430088_431045_-|hypothetical-protein MLTKEFAQRVELSEKQVRKIVQHLEERGYQLSKTEYRGREATDFKEEDIELFKDIADKVKQTNSYDLAFDELEKEKDFLQVIVKNDDKNLPTNQNVAQLVEDLRLEIQKMREERHLLGQMMNQVHQQQQELKELQNQLTSKIDSNSESLKAIQTSQEAIQEAQASQAKVLAESTNKVEKNAVTEDKADSKDSKVAGVNTSTDAKTDTKAENAGDGTATKVDKEDQISATEAIEKASVEQSKNENAAETSNKEATVDADAQHDAEQQVAEAHAEASKQATSNDSLEAKAENDSTASQSEMSEPKPQEEKKGFFARLFNL >NZ_CP022905.1|WP_000394698.1|431162_431825_-|hypothetical-protein MEFKTIQSVKDPHYNEALKLYDTKLNLSLTEDKRIIKRSLENNKTENDYVFIVGLENDVVVSLATAHYEATTNSAFLIYLFAKDLPNHDELMTQTLHQIEHELNLLSNLVHSRSINFLMMEVPKEPADLTQDNGLIIEHRRQFLYEHQFERQTEIDYIHPTNDGHTKKVDLFLKKNIKLTKDIYGTSVKSNYILKYVFANGIAREIIYALLEEMDLRKPF >NZ_CP022905.1|WP_000763767.1|431967_432375_-|hypothetical-protein MADITVVNDTGELYNVINQKKSEGYLESELTIISKSKLHLNDLHDSEISLISTSGTFSDRMTKLLTGEDGEHAVLSRYNLAPDELEKYKQLILDDKMLVVAVRDKSSHKEVQEHNSAYEEIDITHFAEASKGPKA >NZ_CP022905.1|WP_000421410.1|432887_433466_+|xanthine-phosphoribosyltransferase MELLGQKVKEDGVVIDEKILKVDGFLNHQIDAKLMNEVGRTFYEQFKDKGITKILTIEASGIAPAIMAALHFDVPCLFAKKAKPSTLTDGYYETSIHSFTKNKTSTVIVSKEFLSEEDTVLIIDDFLANGDASLGLYDIAQQANAKTAGIGIVVEKSFQNGHQRLEEAGLTVSSLCKVASLEGNKVTLVGEE >NZ_CP022905.1|WP_000793023.1|433465_434734_+|purine-permease MKNLILSVQHLLAMYAGAILVPIIVGTSLKFTPEQIAYLVTVDIFMCGVATFLQANKVTGTGLPIVLGCTFTAVAPMILIGQTKGIDVLYGSLFLSGILVIIIAPFFSHLVKFFPPVVTGSVVTIIGINLMPVAMNYLAGGQGAKDYGDVKNILLGLMTLIIILVLQRFTTGFIKSIAILIGLVLGTIGAGLLGMVDINQVNHAGWLGIPVPFRFSGFSFDVTSTLVFFIVAIVSLIESTGVYHALSEITGKKLERKDFRKGYTAEGLAIVLGSIFNSFPYTAYSQNVGLVSLSGAKKNNVIYGMVVLLLICGCIPKLGALANIIPLPVLGGAMIAMFGMVMAYGVSILGHIDFKNQNNLLIIAVSVGLGTGISAVPQAFKGLGEQFAWLTQNGIVLGAISAIILNFFFNGIKYKQTEENVK >NZ_CP022905.1|WP_000264071.1|434771_436238_+|IMP-dehydrogenase MWESKFAKESLTFDDVLLIPAQSDILPKDVDLSVQLSDKVKLNIPVISAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVIHKNMGVEEQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEESVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKIVDVMTQENLITAPVNTTLEEAEKILQKHKIEKLPLVKDGRLEGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEHGRLLVAAAIGISKDTDIRAQKLVEAGVDVLVIDTAHGHSKGVIDQVKHIKKTYPEITLVAGNVATAEATKDLFEAGADIVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATEARKHGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEIFQGRQYKVYRGMGSLGAMEKGSNDRYFQEDKAPKKFVPEGIEGRTAYKGALQDTIYQLMGGVRAGMGYTGSHDLRELREEAQFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSF >NZ_CP022905.1|WP_000424963.1|436262_437804_+|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISIEEIKKMNPKGIILSGGPNSVYEEGSFTIDPEIYNLGIPVLGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIINAKSDELFAGLPAEQTVWMSHSDKVIEIPEGFEVIADSPSTDYAAIEDKKRRIYGVQFHPEVRHTEYGNDLLNNFVRRVCDCKGQWTMENFIEIEIEKIRQRVGDRRVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVNAKDRFMNKLKGVSDPEQKRKIIGNEFVYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMEFELIEPINTLFKDEVRKLGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLEIVRESDAILRQVIREEGLEREIWQYFTVLPNIQSVGVMGDYRTYDHTVGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPSTIEWE >NZ_CP022905.1|WP_000551643.1|437916_438453_-|hypothetical-protein MHNKNEFNKKLKDFIGSDKRMALVKGYINEYKLTTVLRALNNSDYTKGTIHTRSIGNLKQIVDNRIIPKNITQNKIFKLSNLTLEVNLYERNTIYHGDFAIYYPVESALIIETDTPRLINHINNNPVQKIFIITTNDWSFNTLELEKIVDETIIYDLKQEDPKQYEILYKNKHGKLPY >NZ_CP022905.1|WP_000041880.1|438844_439549_-|type-II-toxin-antitoxin-system-PemK/MazF-family-toxin MSKNINQANSKLNTSNKKLKQAYSKSDSKNMKVIYMPHWLEFYSIAIHSDVTSNKKRYYKSFSRGTVVYVKLGSNIGSEFSGNHFCVILDNKDNKGKETVTIVPLSSKGNKNYLKLNESVLNLTATDLKKQIIDISSKVQALTQKYRDIDIKLSTEDKKLLSNLNQKANELYRVIGVYSKHKGKDTYVNISAITTISKRRISKINDSDPTGTIIISEDDMNEIEKQLKIKFFSN >NZ_CP022905.1|WP_000159787.1|439947_440220_-|transposase MTKERRTFSSEFKLQMVRLYKNGKLKNEIIRKYDLKPSIISNSIKQHQNTGPFNHQDNLKSDEKELIKLRKEVQHLKMEHDVLKQILKLI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP022905_3 | 787356-787438 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP022905_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP022905_3
>3.1|787383|29|NZ_CP022905|CRISPRCasFinder CGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGAACG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP022905_3
The CRISPR arrays of NZ_CP022905_3 >merge|NZ_CP022905|3|787356-787438|CRISPRCasFinder CCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGAACGCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGG >NZ_CP022905|3|3|787356-787438|CRISPRCasFinder CCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGG CGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGAACG CCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGG
>NZ_CP022905.1|WP_000197262.1|786664_787207_+|5'-3'-deoxyribonucleotidase MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >NZ_CP022905.1|WP_000663030.1|785267_786326_+|histidinol-phosphate-transaminase MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEYFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_CP022905.1|WP_000180991.1|783513_785028_+|ABC-transporter-permease/substrate-binding-protein MTNFFDILSERKGQLFSTMIEHIQISFIALLIATAIAVPLGILLTKTKTISEIVMNIAAILQTIPSLALLGLMIPLFGIGRVPAIIALVVYALLPILRNTYTGIKEVDPSLIEAAKGIGMKPFRRLTKVELPIAMPVIMAGVRTAMVLIIGTATLAALIGAGGLGDLILLGIDRNNASLILLGAIPAALLAIIFDLILRFMAKLSYKKLLMTLGVIVMIIILAIAIPMFAQKGDKITLAGKLGSEPSIITNMYKILIEEETKNTVEVKDGMGKTAFLFNALKSDDIDGYLEFTGTVLGELTKEPLKSKEEKKVYEQAKQSLEKKYQMTMLKPMKYNNTYALAVKRDFAKQHNIRTIGDLNKVKDQLKPGFTLEFNDRPDGYKAVQKAYNLNLDNIRTMEPKLRYQAINKGNINLIDAYSTDAELKQYDMVVLKDDKHVFPPYQGAPLFKESFLKKHPEIKKPLNKLENKISDEDMQMMNYKVTVKNEDPYTVAKDYLKAKGLIK >NZ_CP022905.1|WP_000589248.1|782543_783521_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKFKNVTKRYGKHVAVDNISFNINEGEFFVLIGPSGCGKTTTLKMINRLIHLSEGYIYFKDKPISDYPVYEMRWDIGYVLQQIALFPHMTIKENIAQVPQMKKWKEKDIDKRVDELLDMVGLEPEKYKNRKPDELSGGQRQRVGVIRALAADPPVILMDEPFSALDPISREKLQDDLIELQTKIKKTIIFVTHDIQEAMKLGDKICLLNEGHIEQIDTPEGFKNNPQSEFVKQFMGSHLEDDAPCVEENAIIRDLDIMKPIDEVTSMSAYPIVYDNQPIEVLYQHLSESERVIVMQEDSVGQYVIDRKDIFKYLSQKKEVAQHD >NZ_CP022905.1|WP_000983677.1|780540_782322_+|DNA-helicase-RecQ MMQQTLSHYFGYETFRPGQEEIISKVLDHRNVLGVLPTGGGKSICYQVPGLLLGGTTIVISPLISLMKDQVDQLKAMGIQAAFLNSSLTQKEQQRIEKALSNGEIQFLYVAPERFENRYFLNMLQRIKIHLVAFDEAHCISKWGHDFRPSYQNVISKVFTLPQDFTIIALTATATVEVQQDIREKLNIAQTDQIKTSTKRRNLIFKVNPTYQRQKFILDYIKTHDEDAGIIYCSTRKQVEELQEALESQKIESVIYHAGLSNKEREEAQNDFLFDRVKVVVATNAFGMGIDKSNVRFVIHYNMPGDLESYYQEAGRAGRDGLKSECILLFSERDINLHEYFITVSQADDDYKDKMGEKLTKMIQYTKTKKCLEATIVHYFEPNEKLEECEQCSNCVQQDKSYNMTQEAKMIISCIARMKQQESYSVIIQVLRGESTDYIKYKGYDQISTHGLMKGYTTSELSHLIDELRFKGFLNENDEILMCDTSIKKLLSNEVEVFTTPFKQKATEKVFINTVEGVDRVLFSQLVEVRKKLSDKLTIAPVSIFSDYTLEEFAKRKPASKQDMINIDGVGSYKLKHYCPAFLETIQNYKAKV >NZ_CP022905.1|WP_000525106.1|778645_780529_+|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MGMEAYKIEHLNKSYADKTIFDNLDLSISEGEKIGLVGINGTGKSTLLKVIGGIDDDFTANVMHPNQYRIRYSSQKQDLNEDMTVFDAVLSSDTTTLRIIKQYEQAVQAYADDQSDKLFKRMIDAQDAMDQHDAWDYNAEIKTILSKLGIHDTTKYIKELSGGQQKRVVLAKTLIEQPDLLLLDEPTNHLDFESISWLINYVKQYPHTVLFVTHDRYFLNEVSTRIIELNRGKLASYPGNYESYIEMRAEREVTLQKQQQKQRALYKEELAWMRAGAKARTTKQQARINRFNDLENEVNQQYKDDKGELNLAYSRLGKQVFELEDLSKAINDKVLFEHLTEIIQKGERIGVVGPNGAGKTTLLNILSGEDQQFEGKLKTGQTVKVAYFKQTDETLDRDIRMIDYLREESEVAKEKDGTSVSITQLLERFLFPSATHGKKVYKLSGGEQKRLYLLRLLVHQPNVLLLDEPTNDLDTETLTILEDYIHTFGGTVITVSHDRYFLNKVAQSYWFIHDGQMEKIIGTFEDYESYKKSLDKNKSTLKQQSKSYTTVRKKNGLSYKEKLEYEQLMKRIEQAEVRMEEIDVLMIEASADYGKIKELNEEKEQLEIQYDLDITRWSELEEIKEQQ >NZ_CP022905.1|WP_000098285.1|776435_778376_+|polyglycerol-phosphate-lipoteichoic-acid-synthase-LtaS MSSQKKKISLFAFFLLTVITITLKTYFSYYVDFSLGVKGLVQNLILLMNPYSLVALVLSVFLFFKGKKAFWFMFIGGFLLTFLLYANVVYFRFFSDFLTFSTLNQVGNVESMGGAVSASFKWYDFVYFIDTLVYLFILIFKTKWLDTKAFSKKFVPVVMAASVALFFLNLAFAETDRPELLTRTFDHKYLVKYLGPYNFTVYDGVKTIENNQQKALASEDDLTKVLNYTKQRQTEPNPEYYGVAKKKNIIKIHLESFQTFLINKKVNGKEVTPFLNKLSSGKEQFTYFPNFFHQTGQGKTSDSEFTMDNSLYGLPQGSAFSLKGDNTYQSLPAILDQKQGYKSDVMHGDYKTFWNRDQVYKHFGIDKFYDATYYDMSDKNVVNLGLKDKIFFKDSANYQAKMKSPFYSHLITLTNHYPFTLDEKDATIEKSNTGDATVDGYIQTARYLDEALEEYINDLKKKGLYDNSVIMIYGDHYGISENHNNAMEKLLGEKITPAKFTDLNRTGFWIKIPGKSGGINNEYAGQVDVMPTILHLAGIDTKNYLMFGTDLFSKGHNQVVPFRNGDFITKDYKYVNGKIYSNKNNELITTQPADFEKNKKQVEKDLEMSDNVLNGDLFRFYKNPDFKKVNPSKYKYETGPKANSKK >NZ_CP022905.1|WP_115276805.1|774957_775962_+|biotin-dependent-carboxyltransferase-family-protein MSIIIEKSGLFSSFQDFGRRGYEHDGVIPCGALDTLAHEIANRLVANDKNEATLEMTNKMATIRFTKPTLIALAGGNVKAYTEHMTISPYKLYLLDKGDVLKFRETSYTSRVYLAVGGGFELDAWLGSNSTDFNVKIGGFKGRTLQDGDEIKLKRDYTARHHKLFENLAHTKQTDWGIDGYALSFNYMSDVFHVVKNKGTEDFKEDAIQRFVKHDYKVTSKANRMGMMLEGEKIKAFYEDMPPYQTVKKGTIQIKRDGTPIILLNDHYTLGSYPQIGTIASYHLTKLAQKPQGSRLKFQFIDILTAEKNLVKYSNWLNQLFHGIEYRMQLEMMK >NZ_CP022905.1|WP_000708690.1|774263_774974_+|allophanate-hydrolase-subunit-1 MKIYSQGDQAIVVAIEKEVSKSLTEDLLTLRSYLIEQNYPFIIEIVPSESDMMIVYDARDMIKHHNIQSPFLYMKALIESIHLNIKHDFNQQDLIEIPIVYGSKYGPDIESLLKHYKIKLETFIELHSKTQYFVSMMGYSPGFPYLTGLNKKLYINHTSKQKKFIPAGSVVLEGKKCGIVTTDTINDWLVIGYTPLSLFNPKESDFARLKLGDNIKFRPINENELEVGAFKDVNHN >NZ_CP022905.1|WP_001797134.1|773969_774176_+|hypothetical-protein MIIVYIVLLLILVYVNYRLVNRLLSENRIYVVRLIVTITTVISFILVYALIHELMPFVVRAMDLMYHQ >NZ_CP022905.1|WP_000429006.1|788085_789003_-|diacylglycerol-kinase-family-lipid-kinase MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMSHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_CP022905.1|WP_031760357.1|789093_789195_+|hypothetical-protein MVITDIDVYRVGRENIVIAVYNEHIKLLFILIS >NZ_CP022905.1|WP_000284571.1|789381_790986_+|IS1182-like-element-IS1182-family-transposase MYQNYTINQLCLPIDLEIKLEENDFAHAIVQFVDSIPDEVFLPYYQSMGRPQYHPRMLLSIILCAYIQGVYSGRQIQNMLIDSIRMRYLSQEQFPNFRTINRFRVHPIMNDILDHSFVQFRELLVQSGLISGSALYIDGTKIEADANKYSFVWKKSILKYKDSLDQKALENYQQMVETKILPELIDDLKDELSIEEIERIRQSLEEKENQLIEAIDQTETVEERKLLRKEKSEVHKQKKRFDDFAQRKMSYEEQLVIMGVRNSFSKTDHDATFMRMKEDHMLNGQLKPGYNIQLATENQFALAYDCYPNPTDTRTFIPFLEKIESKIGLPENIVADAGYASEENYCYVLDETESTPIIPHQGYLKEKKRAHKQNQFHRDNWTYNELDDYYICPNQKRVVFSHYSQRKDRNGFIRNFKIYECEDCTGCPLREKCTKAKEGKNRRLNINPTWEYIKIKANEKIESKETASYYAQRKIDVETVFGNIKQNMKFKRFHVRGAEKIFKEMGLVFLAHNFRKLVTRVRKYEGKTIIQNQI >NZ_CP022905.1|WP_000193751.1|791112_792618_-|peptide-MFS-transporter MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NZ_CP022905.1|WP_000930014.1|792958_793459_-|NADPH-dependent-7-cyano-7-deazaguanine-reductase-QueF MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_CP022905.1|WP_001068501.1|793478_794345_-|DMT-family-transporter MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFLYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSSREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFVLFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NZ_CP022905.1|WP_000692521.1|795145_795544_+|class-Ib-ribonucleoside-diphosphate-reductase-assembly-flavoprotein-NrdI MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_CP022905.1|WP_000855514.1|795506_797612_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-alpha MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSISFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_CP022905.1|WP_000562498.1|797729_798701_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-beta MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_CP022905.1|WP_000499195.1|798881_799037_+|hypothetical-protein MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLWSKNATINEKYYQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP022905_4 | 830143-830221 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP022905_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP022905_4
>4.1|830167|31|NZ_CP022905|CRISPRCasFinder CTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP022905_4
The CRISPR arrays of NZ_CP022905_4 >merge|NZ_CP022905|4|830143-830221|CRISPRCasFinder TGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCT >NZ_CP022905|4|4|830143-830221|CRISPRCasFinder TGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCT CTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGCC TGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCT
>NZ_CP022905.1|WP_115276804.1|826969_829816_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNIDLSEQDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIDVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGIDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYGKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDK >NZ_CP022905.1|WP_000229241.1|824976_826962_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrB MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVDGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >NZ_CP022905.1|WP_000638419.1|824471_824708_+|CsbA-family-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >NZ_CP022905.1|WP_000538141.1|823824_824475_+|HD-domain-containing-protein MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENE >NZ_CP022905.1|WP_000753319.1|822811_823651_+|CHAP-domain-containing-protein MKKTLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQHGTQVKTPVQHNYVSNVQAQTQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKAVKSPVRKASQAKKVVKQPVQQASKKVVVKQAPKQAVAKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTPEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH >NZ_CP022905.1|WP_001792175.1|822556_822664_+|hypothetical-protein MCLLKQHMQCAFSNITYGDFQGIELIVENVLNYMV >NZ_CP022905.1|WP_010956549.1|821292_822403_+|peptide-chain-release-factor-2 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>NZ_CP022905.1|WP_001224793.1|832264_832750_+|acetyltransferase MRKFLSKTHHHTNPLWRVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >NZ_CP022905.1|WP_000057543.1|832757_834197_+|tetratricopeptide-repeat-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYQNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >NZ_CP022905.1|WP_000134963.1|834263_835199_+|thioredoxin-disulfide-reductase 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP022905_5 | 835598-835867 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP022905_5
|
4 spacers
spacers of NZ_CP022905_5
>5.1|835634|22|NZ_CP022905|CRT CCTGTAGAATTTCTTTTCGAAA >5.2|835692|23|NZ_CP022905|CRT TCTGTAGAAATTGGAAATCCAAT >5.3|835751|22|NZ_CP022905|CRT CCTGTAGAATTTCTTTTCGAAA >5.4|835809|23|NZ_CP022905|CRT TCTGTAGAAATTGGAAATCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP022905_5
The CRISPR arrays of NZ_CP022905_5 >merge|NZ_CP022905|5|835598-835867|CRT GCTTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTTTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGGAAATCCAATTTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGGAAATCCAATTTCTCTGTGTTGGGGCCCCTGACTAGAGTTGAAAAA >NZ_CP022905|5|1|835598-835867|CRT GCTTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATTG CCTGTAGAATTTCTTTTCGAAA TTCTCTTTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTG TCTGTAGAAATTGGAAATCCAAT TTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATTG CCTGTAGAATTTCTTTTCGAAA TTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTG TCTGTAGAAATTGGAAATCCAAT TTCTCTGTGTTGGGGCCCCTGACTAGAGTTGAAAAA
>NZ_CP022905.1|WP_000134963.1|834263_835199_+|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >NZ_CP022905.1|WP_000057543.1|832757_834197_+|tetratricopeptide-repeat-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYQNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >NZ_CP022905.1|WP_001224793.1|832264_832750_+|acetyltransferase MRKFLSKTHHHTNPLWRVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >NZ_CP022905.1|WP_000513305.1|831417_832257_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPSEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >NZ_CP022905.1|WP_000958224.1|830479_831412_+|HPr-kinase/phosphorylase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >NZ_CP022905.1|WP_115276804.1|826969_829816_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA 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>NZ_CP022905.1|WP_000229241.1|824976_826962_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrB MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVDGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >NZ_CP022905.1|WP_000638419.1|824471_824708_+|CsbA-family-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >NZ_CP022905.1|WP_000538141.1|823824_824475_+|HD-domain-containing-protein MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENE >NZ_CP022905.1|WP_000753319.1|822811_823651_+|CHAP-domain-containing-protein MKKTLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQHGTQVKTPVQHNYVSNVQAQTQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKAVKSPVRKASQAKKVVKQPVQQASKKVVVKQAPKQAVAKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTPEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH >NZ_CP022905.1|WP_000369722.1|836084_836996_+|RNase-adapter-RapZ MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >NZ_CP022905.1|WP_001248939.1|836992_837988_+|YvcK-family-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >NZ_CP022905.1|WP_000006551.1|838098_839043_+|DNA-binding-protein-WhiA MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >NZ_CP022905.1|WP_001049165.1|839606_840194_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >NZ_CP022905.1|WP_115276803.1|840436_841339_-|TIGR01777-family-protein MKQYLITGGTGMVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQNIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKVLFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGMILSNGGGALQTMKLPYKYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINNESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLIKE >NZ_CP022905.1|WP_000070831.1|842041_842671_+|DUF4887-domain-containing-protein MSNQNYDYNKNEDGSKKKMSTTAKVVSIATVLLLLGGLVFAIFAYVDHSNKAKERMLNEQKQEQKEKRQKENAEKERKKKQQEEKEQNELDSQANQYQQLPQQNQYQYVPPQQQAPTKQRPAKEENDDKASKDESKDKDDNASQDKSDDNQKKTDDNKQPAQPKPQPQQPTPKPNNNQQNNQSNQQAKPQAPQQNSQSTTNKQNNANDK >NZ_CP022905.1|WP_000654030.1|843371_844385_+|sugar-binding-transcriptional-regulator MKDLLQAQQKLIPDLIDKMYKRFSILTTISKNQPVGRRSLSEHMDMTERVLRSETDMLKKQDLIKVKPTGMEITAEGEQLISQLKGYFDIYADDNRLSEGIKNKFQIKEVHVVPGDADNSQSVKTELGRQAGQLLEGILQEDAIVAVTGGSTMACVSEAIHLLPYNVFFVPARGGLGENVVFQANTIAASMAQQAGGYYTTMYVPDNVSETTYNTLLLEPSVINTLDKIKQANVILHGIGDALKMAHRRQSPEKVIEQLQHHQAVGEAFGYYFDTQGQIVHKVKTIGLQLEDLESKDFIFAVAGGKSKGEAIKAYLTIAPKNTVLITDEAAAKIILE >NZ_CP022905.1|WP_000279414.1|844437_845448_+|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MAVKVAINGFGRIGRLAFRRIQEVEGLEVVAVNDLTDDDMLAHLLKYDTMQGRFTGEVEVVDGGFRVNGKEVKSFSEPDASKLPWKDLNIDVVLECTGFYTDKDKAQAHIEAGAKKVLISAPATGDLKTIVFNTNHQELDGSETVVSGASCTTNSLAPVAKVLNDDFGLVEGLMTTIHAYTGDQNTQDAPHRKGDKRRARAAAENIIPNSTGAAKAIGKVIPEIDGKLDGGAQRVPVATGSLTELTVVLEKQDVTVEQVNEAMKNASNESFGYTEDEIVSSDVVGMTYGSLFDATQTRVMSVGDRQLVKVAAWYDNEMSYTAQLVRTLAYLAELSK >NZ_CP022905.1|WP_001074749.1|845586_846777_+|phosphoglycerate-kinase MAKKIVSDLDLKGKTVLVRADFNVPLKDGEITNDNRIVQALPTIQYIIEQGGKIVLFSHLGKVKEESDKAKLTLRPVAEDLSKKLDKEVVFVPETRGEKLEAAIKDLKEGDVLLVENTRYEDLDGKKESKNDPELGKYWASLGDVFVNDAFGTAHREHASNVGISTHLETAAGFLMDKEIKFIGGVVNDPHKPVVAILGGAKVSDKINVIKNLVNIADKIIIGGGMAYTFLKAQGKEIGISLLEEDKIDFAKDLLEKHGDKIVLPVDTKVAKEFSNDAKITVVPSDSIPADQEGMDIGPNTVKLFADELEGAHTVVWNGPMGVFEFSNFAQGTIGVCKAIANLKDAITIIGGGDSAAAAISLGFENDFTHISTGGGASLEYLEGKELPGIKAINNK >NZ_CP022905.1|WP_031870313.1|846898_847660_+|triose-phosphate-isomerase MRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTAVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGETSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHETDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETEEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSEDQLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGASLKVEDFVQLLEGAK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP022905_6 | 897427-897508 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP022905_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP022905_6
>6.1|897451|34|NZ_CP022905|CRISPRCasFinder ATTGAGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP022905_6
The CRISPR arrays of NZ_CP022905_6 >merge|NZ_CP022905|6|897427-897508|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGAGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCATCCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA >NZ_CP022905|6|5|897427-897508|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAA ATTGAGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCAT CCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA
>NZ_CP022905.1|WP_000932225.1|896444_897323_+|DUF1963-domain-containing-protein MLNIQDVSHLSKKEQKAYNRFVESVENGNLPVLPCIEMDLKEMQEETLSQSKIGGMPFLKSFKDIPLDENNVPMVLLAQINLNDLPEQQELFPVNEGILQFWISSEDQMYGMSENLKGNNINSRLVYIKEPITDLSLENIQVHLKSLDADNEDIPFSGAFSIEFRLSKQTITCTDYKYDEDVLALWNKVNPSFALKSMFGGYDELMEPVCNTFTAKEPFNQLGGYPYFDQIDPRTNDQELKMYDRVLLQIDSTRDGNSSIIWGDLGIANILVKSTDLEAMKFDDYMYSWDCS >NZ_CP022905.1|WP_000662306.1|896329_896443_+|hypothetical-protein MKENLLGTIIWSIATFYYSRMMKIMNLAILKIKIGGS >NZ_CP022905.1|WP_000290491.1|895885_896266_+|glycine-cleavage-system-protein-GcvH MAVPNELKYSKEHEWVKVEGNVATIGITEYAQSELGDIVFVELPETDDEINEGDTFGSVESVKTVSELYAPISGKVVEVNEELEDSPEFVNESPYEKAWMVKVEISDESQLEALLTAEKYSEMIGE >NZ_CP022905.1|WP_000589549.1|895371_895728_+|arsenate-reductase-family-protein MIKFYQYKNCTTCKKAAKFLDEYGVSYEPIDIVQHTPTINEFKTIIANTGVEINKLFNTHGAKYRELDLKNKLQTLSDDEKLELLSSDGMLVKRPLAVMGDKITLGFKEDQYKETWLA >NZ_CP022905.1|WP_001147952.1|894907_895228_-|thioredoxin-family-protein MQAIKSNESFKSIINSDTPVIVKFEAGWCPDCRAMDLWIDPIVEQYNDYQWYTVNRDELEDVVVENEVMGIPSLLVFKNGDKIAHLHSANAKSPEQVESFLAETFK >NZ_CP022905.1|WP_000422908.1|894217_894757_+|nitroreductase MELQQAIANRRSVKKFKRDMHIDDALLYQAIEKAADAPNHGMREPWRVVHVPKDRLGDMSKDISKFAFPNELDKQQCHYDAVTKLGGMLLLILKTDPRQRQNDENYFAFGAYAQNLMLLLYEAGIGTCWKSPLYIYDPKVRKTLGIKKDEVLAGFLYLTDLEEDMPKAPRKNRNLITLY >NZ_CP022905.1|WP_000150011.1|893418_894135_+|type-I-3-dehydroquinate-dehydratase MTHVEVVATIAPQLSIEETLIQKINHRIDAIDVLELRIDQIENVTVDQVAEMITKLKVMQDSFKLLVTYRTKLQGGYGQFINDLYLNLISDLANINGIDMIDIEWQADIDIEKHQRIIKHLQQYNKEVVISHHNFESTPPLDELQFIFFKMQKFNPEYVKLAVMPHNKNDVLNLLQAMSTFSDTMDCKVVGISMSKLGLISRTAQGVFGGALTYGCIGEPQAPGQIDVTDLKAQVTLY >NZ_CP022905.1|WP_000974460.1|892848_893271_-|organic-hydroperoxide-resistance-protein MAIHYETKATNVGGRKGHVYTDDRALDIDIVPPAQADGKATNPEQLFAAGYASCFNGAFDLILKQNKVRDAHPEVTLTVRLEDDSDSESPKLSVSIDATIKNVISQEEAEKYLQMAHEFCPYSKATQGNINVDLNVNVVD >NZ_CP022905.1|WP_000569884.1|891955_892450_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MIEIKTLTNNDFNEYKRLVSTVNEEFTQDSHYSQTMTDTLIHDILNQGSPKCIVFGCYENETLIATAALEQIRYVGKEHKSLIKYNFVTNNDKSINSELINFIINYARQNNYESLLTSIVSNNIGAKVFYSALGFDILGFEKNAIKIGNTYFDEHWLFYDLINK >NZ_CP022905.1|WP_000255551.1|891183_891801_-|amino-acid-transporter MVTAIIHGFILAIGLILPLGAQNVFIFNQGANQPKYRYVLPAIITAGLSDSLLIIIAVVGVSIIIMSLPVLQAIIYIVGLIFLMYMAWTIWHDKPSTDGEAQIISPMKQVSFALSVSLLNPHAILDTIGVIGSSAALYSGSNKIAFTIACISVSWLWFFLLAILGKMVGSIDKTGKLLTIINKISSIIIIIVALMILQKLIQLLF >NZ_CP022905.1|WP_001018962.1|898118_898505_+|topiosmerase MAIVNKVIIVEGKSDKKRVQQVIAEPVNIICTHGTMSIDKLDDMIESLYDKQVFVLADSDDEGDRIRNWFKRYLSESEHIFIDKTYCQVANCPKQYLAHVLSKHGFTCKKETPLLPNINNERLVLVNE >NZ_CP022905.1|WP_001065801.1|898497_898794_+|thioredoxin-family-protein MNNSLDIKDVTTFYEEDKHLIFGYTPTCGTCKVSERMLDIANEILQLPLLKIDLNFYPQFCKDMQIMSTPILLLMNKDKEVKRIYAFKSVTDLLENLK >NZ_CP022905.1|WP_000571213.1|899043_900069_+|methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIELKEVVKEYRTKNKEVLAVDHVNLSIRAGSIYGVIGFSGAGKSTLIRMFNHLEAPTSGEVIIDGDHIGQLSKNGLRAKRQKVSMIFQHFNLLWSRTVLKNIMFPLEIAGVPRRRAKQKALELVELVGLKGREKAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPTVLLCDEATSALDPQTTDEILDLLLKIREQQNLTIVLITHEMHVIRRICDEVAVMESGKVIEHGPVTQVFENPQHTVTKRFVKEDLNDDFETSLTELEPLEKDAYIVRLVFAGSTTTEPIVSSLSTAYDIKINILEANIKNTKNGTVGFLVLHIPYISSVDFGKFEKELIERQVKMEVLRHG >NZ_CP022905.1|WP_000520231.1|900061_900757_+|ABC-transporter-permease MGKSFSEIINEMITMPNIQWPEVWTAIVETLYMTVVSTIFAFILGLILGVLLFLSAKGKSIGARLFYSIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSLILGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTWIVIRKVLLPEAMPALVSGITVTAIALVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWLTNKLDKR >NZ_CP022905.1|WP_000732324.1|900774_901596_+|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGNKSGSDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYDLDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGDVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFLPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK >NZ_CP022905.1|WP_000752917.1|901949_902144_+|CsbD-family-protein MADESKFEQAKGNVKETVGNVTDNKNLENEGKEDKASGKAKEFVENAKEKATDFIDKVKGNKGE >NZ_CP022905.1|WP_001183854.1|902377_903229_-|DUF368-domain-containing-protein MQQFKWINILKGFAMGTSDLVPGVSGGTIALLLGIYNQFIASISGIFSRRFWPSFTFLIPIIIGMLLAMGSLSNLFNYLLSQHHIPTMFFFGGLIIGIVPYLLKISNYKTSFTTKHYMMVIAGIAILIVITLMNNGDKHAGETLTLSTGLIIKYFIAGMCASSAMLLPGISGSFMLLVFGVYGTVMLAISEVVKLNFTGLPILLAVGFGVLAGFIISSKIIQYFLTHHKLMTFALIIGFVVGSLFAVFPGLPTNIVMWFVSLVVFIIGFIVSLTLGRITAENE >NZ_CP022905.1|WP_000168845.1|903556_904318_+|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC MASTLEIKDLHVSIEDKEILKGVNLTINTDEIHAIMGPNGTGKSTLSSAIMGHPSYEVTKGEVLLDGVNILELEVDERAKAGLFLAMQYPSEITGVTNADFMRSAINAKREEGQEINLMQFIKKLDKNMDFLDIDKDMAQRYLNEGFSGGEKKRNEILQLMMLEPKFAILDEIDSGLDIDALKVVSKGINQMRGENFGALMITHYQRLLNYITPDKVHVMYAGKVVKSGGPELAKRLEEEGYEWVKEEFGSAE >NZ_CP022905.1|WP_000205567.1|904415_905723_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MTTDILNISEEQLVDYSKAHNEPSWMTELRKKALKLTETLEMPKPDKTKLRKWDFDSFKQHDVKGDVYQSLSQLPESVREIIDVDHSKNLVIQHNNTIAYTQVDDNASKDGVIVEGLADALMNHSDLVQKHFMKDAVTVDEHRITALHTALVNGGVFVYVPKNVVVEHPVQYVVLHDDKNASFYNHVIIVTEESAEVTYVENYLSNASGEGNQLNIISEVIAGANSNITYGSVDYMDKGFTGHIIRRGITEADASINWALGLMNEGSQIIDNTTNLFGDRSTSSLKSVVVGTGEQKINLTSKIVQYGKETDGYILKHGVMKEHASSVFNGIGYIKHGGTKSIANQESRVLMLSEHARGDANPILLIDEDDVQAGHAASVGRVDPDQLYYLMSRGISQREAERLVIHGFLDPVVRELPIEDVKRQLREVIERKVSK >NZ_CP022905.1|WP_001006450.1|905828_907079_+|cysteine-desulfurase MNEVAEHSFDVNEVIKDFPILDQKVNGKRLAYLDSTATSQTPMQVLNVLEDYYKRYNSNVHRGVHTLGSLATDGYENARETVRRFINAKYFEEIIFTRGTTASINLVAHSYGDANVEEGDEIVVTEMEHHANIVPWQQLAKRKNATLKFIPMTADGELNIEDIKQTINDKTKIVAIAHISNVLGTINDVKTIAEIAHQHGAIISVDGAQAAPHMKLDMQEMNADFYSFSGHKMLGPTGIGVLFGKRELLQKMEPIEFGGDMIDFVSKYDATWADLPTKFEAGTPLIAQAIGLAEAIRYLERIGFDAIHKYEQELTIYAYEQMSAIEGIEIYGPPKDRRAGVITFNLQDVHPHDVATAVDTEGVAVRAGHHCAQPLMKWLNVSSTARASFYIYNTKEDIDQLINALKQTKEFFSYEF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP022905_7 | 984211-984292 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP022905_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP022905_7
>7.1|984235|34|NZ_CP022905|CRISPRCasFinder CCAACACAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP022905_7
The CRISPR arrays of NZ_CP022905_7 >merge|NZ_CP022905|7|984211-984292|CRISPRCasFinder ACAATGCAAGTTGGGGTGGGGGCCCCAACACAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGTAAGTTGGGGTGGGGGCC >NZ_CP022905|7|6|984211-984292|CRISPRCasFinder ACAATGCAAGTTGGGGTGGGGGCC CCAACACAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAA ACAATGTAAGTTGGGGTGGGGGCC
>NZ_CP022905.1|WP_001045079.1|982761_984069_-|TrkH-family-potassium-uptake-protein MNKVHKPLYFYLMLFFSTTIIGALLLYLPFTGKKPISFLDALFIASSAFTVTGLSPVDIGSQFNILGEIVILLLIQIGGLGIVTVTLLTLVFLNRKISMKNRFLIMVTWNIDEPGGVIKLIKHLAIYSLVTELIGMICLCLSFIPKFGIGKGLFLSLFTSVSAFNNAGFALFKNNLIDYSSDPIVIITISILIIFGGIGHFVVIDFINCKKLSKLSLHSKLVLTTTSILIIIGAITFFLLEQFNTMQHMGLVEKIGNSFFQSVTTRTAGFNSIDIASINKSTALMLMLLMFIGGAPLSAAGGIKITTFAVAFIFVLNYIRKENNVSVFNKEISDKHIKLSIVTINISFLFISIITFILSIINPNISLIKLLFEVVSAFGTVGLSMNLTTEYHGITKIIIIFVMLCGKVGLLTLLRTFIPPKSPKNYRYTKGQIYL >NZ_CP022905.1|WP_001557163.1|981364_982684_+|ISL3-like-element-IS1181-family-transposase MCNDTLELLRIKDENIKYINQEIDVIIKGKKATVVNAVLTYKPSACYCCGVKNEGQIHKHGKRVSRITLLKTQGYNTYLNLAKQRFKCLECNGTFTAKTSIVDESCFISRCVTQKVIEEATKVKTEIDTAEDNCISPSTVSRIRTKAANSLRIKPFNCLPEHIAMDEFKSVKNVTGSMSFIFIDNDTHDVIDILENRTTRFLRAYFERFDLKNRQQVKTVTIDMYEPYVRLFRDLFPNAAIIFDRFHIVQHLNRELNKYRVQVMNEYRNKKGPNYTIFKNNWKVLLMDTSKTIFSKYRWNKSFKAYKRSSDIVEFMLSKDDILRRSYELVQGLRKDLRLCNWPKFINRLNSVSKKSVSKGVWKVVKYYRKHQRMLRNTIYYPAFNNGAIEGINNKIKLIKRISFGYRNFNNFKARIMMIFSLYKGEKKKTTKPNNGLAA >NZ_CP022905.1|WP_000240642.1|979085_980702_+|chaperonin-GroEL MVKQLKFSEDARQAMLRGVDQLANAVKVTIGPKGRNVVLDKEFTAPLITNDGVTIAKEIELEDPYENMGAKLVQEVANKTNEIAGDGTTTATVLAQAMIQEGLKNVTSGANPVGLRQGIDKAVKVAVEALHENSQKVENKNEIAQVGAISAADEEIGRYISEAMEKVGNDGVITIEESNGLNTELEVVEGMQFDRGYQSPYMVTDSDKMVAELERPYILVTDKKISSFQDILPLLEQVVQSNRPILIVADEVEGDALTNIVLNRMRGTFTAVAVKAPGFGDRRKAMLEDLAILTGAQVITDDLGLDLKDASIDMLGTASKVEVTKDNTTVVDGDGDENSIDARVSQLKSQIEETESDFDREKLQERLAKLAGGVAVIKVGAASETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTALVNVYQKVSEIEAEGDIETGVNIVLKALTAPVRQIAENAGLEGSVIVERLKNAEPGVGFNAATNEWVNMLEAGIVDPTKVTRSALQHAASVAAMFLTTEAVVASIPEKNNDQPNMGGMPGMM >NZ_CP022905.1|WP_000917289.1|978725_979010_+|co-chaperone-GroES MLKPIGNRVIIEKKEQEQTTKSGIVLTDSAKEKSNEGVIVAVGTGRLLNDGTRVTPEVKEGDRVVFQQYAGTEVKRDNETYLVLNEEDILAVIE >NZ_CP022905.1|WP_000197635.1|977807_978551_-|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MTRLWASLLTVIIYILSQFLPLLIVKKLPFVQYSGIELTKAVIYIQLVLFLIAATTIILINLKIKNPTKLELEVKEPKKYIIPWALLGFALVMIYQMVVSIVLTQIYGGQQVSPNTEKLIIIARKIPIFIFFVSIIGPLLEEYVFRKVIFGELFNAIKGNRIVAFIIATTVSSLIFALAHNDFKFIPVYFGMGVIFSLAYVWTKRLAVPIIIHMLQNGFVVIFQLLNPEALKKATEQANFIYHIFIP >NZ_CP022905.1|WP_015445895.1|976574_977783_+|hypothetical-protein MSYHWFKKMLLSTSILILSSSSLGLATHTVEAKDNLNGEKPTTNLNHNITSPSVNSEMNNNETGTPHESNQTGNEGTGSNSRDANPDSNNVKPDSNNQNPSTDSKPDPNNQNPSPNPKPDPDNPKPKPDPKPDPDKPKPNLDPKPDPDNPKPKPDPDKPKPNPNPKPDPNKPNPNPSPDPDQPGDSNHSGGSKNGGTWNPNASDGSNQGQWQPNGNQGNSQNPTGNDFVSQRFLALANGAYKYNPYILNQINKLGKDYGEVTDEDIYNIIRKQNFSGNAYLNGLQQQSNYFRFQYFNPLKSERYYRNLDEQVLALITGEIGSMPDLKKPEDKPDSKQRSFEPHEKDDFTVVKKQEDNKKSASTAYSKSWLAIVCSMMVVFSIMLFLFVKRNKKKNKNESQRR >NZ_CP022905.1|WP_000522381.1|975751_976378_-|nitroreductase-family-protein MGLFKKDKKAMTFDNAMEERRSIYNLKDSISISDDELESMIAHAVKHVPSSFNSQSTRIVLLLNDNNNKFWDNTKAILKEVMGENRDFEPTEQKIDNFKHSYGTILFYEDQDVVSGLQEQMPNYYDNFAIWSTQTNAMHQFAIWTALATKGIGASLQHYNPLVDEMTSKEFNIPKSWKLIAQMPFGDIREAAGEKTFNPVEDRFVIKK >NZ_CP022905.1|WP_000867951.1|974605_975391_-|carbon-nitrogen-family-hydrolase MKVQIYQLPIIFGDSSKNETQITQWFEKNMNAEVDVVVLPEMWNNGYDLEHLNEKADNNLGQSFSFIKHLAEKYKVDIVAGSVSNIRNYQIFNTAFSVNKSGQLINEYDKVHLVPMLREHEFLTAGENVAEPFQLSDGTYVTQLICYDLRFPELLRYPARSGAKIAFYVAQWPMSRLQHWHSLLKARAIENNMFVIGTNSTGFDGNTEYAGHSIVINPNGDLVGELNESADILTVDLNLNEVEQQRENIPVFKSIKLDLYK >NZ_CP022905.1|WP_001549197.1|973871_974006_+|delta-lysin-family-phenol-soluble-modulin MSCLILRIFILIKEGVISMAQDIISTIGDLVKWIIDTVNKFTKK >NZ_CP022905.1|WP_001105696.1|973072_973636_-|accessory-gene-regulator-ArgB-like-protein MNYFDNKIDQFATYLQKRNNLDHIQFLQVRLGMQIIVGNFFKILVTYSISIFLSVFLFTLVTHLSYMLIRYNAHGAHAKSSILCYIQSILTFVFVPYFLINIDINFTYLLALSIIGLISVVIYAPAATKKQPIPIKLVKRKKYLSIIMYLLVLILSLIIHPFYAQFMLLGILVESITLLPIFFPKED >NZ_CP022905.1|WP_000206625.1|984512_985736_-|ArgE/DapE-family-deacylase MTTFSEKEKIQLLADIVELQTENNNEIDVCNYLKDLFDKYDIKSEILKVNEHRANIVAEIGNGSPILALSGHMDVVDAGNQDNWTYPPFQLTEKAGKLYGRGTTDMKGGLMALVITLIELKEQNQLPQGTIRLLATAGEEKEQEGAKLLADKGYLDDVDGLIIAEPTGSGIYYAHKGSMSCKVTATGKAVHSSVPFIGDNAIDTLLEFYNQFKEKYSELKKHDTKHELDVAPMFKSLIGKEISEEDANYASGLTAVCSIINGGKQFNSVPDEASLEFNVRPVPEYDNDFIESFFQNIINDVDSNKLSLDIPSNHRPVTSDKNSKLITTIKDVASSYVEQDEIFVSALVGATDASSFLGDNKDNVDLAIFGPGNPLMAHQIDEYIEKDMYLKYIDIFKEASIQYLKEK >NZ_CP022905.1|WP_000195429.1|986074_987247_+|IS256-like-element-IS256-family-transposase MTQVHFTLKSEEIQSIIEYSVKDDVSKNILTTVFNQLMENQRTEYIQAKEYERTENRQSQRNGYYERSFTTRVGTLELKVPRTRDGHFSPTVFERYQRNEKALMASMLEMYVSGVSTRKVSKIVEELCGKSVSKSFVSSLTEQLEPMVNEWQNRLLSEKNYPYLMTDVLYIKVREENRVLSKSCHIAIGITKDGDREIIGFMIQSGESEETWTTFFEYLKERGLQGTELVISDAHKGLVSAIRKSFTNVSWQRCQVHFLRNIFTTIPKKNSKSFREAVKGIFKFTDINLAREAKNRLIHDYIDQPKYSKACASLDDGFEDAFQYTVQGNSHNRLKSTNLIERLNQEVRRREKIIRIFPNQTSANRLIGAVLMDLHDEWIYSSRKYINFDK >NZ_CP022905.1|WP_000791411.1|987503_988559_+|bi-component-leukocidin-LukGH-subunit-H MKNKKRVLIASSLSCAILLLSAATTQANSAHKDSQDQNKKEHVDKSQQKDKRNVTNKDKNSTVPDDIGKNGKITKRTETVYDEKTNILQNLQFDFIDDPTYDKNVLLVKKQGSIHSNLKFESHKEEKNSNWLKYPSEYHVDFQVKRNRKTEILDQLPKNKISTAKVDSTFSYSSGGKFDSTKGIGRTSSNSYSKTISYNQQNYDTIASGKNNNWHVHWSVIANDLKYGGEVKNRNDELLFYRNTRIATVENPELSFASKYRYPALVRSGFNPEFLTYLSNEKSNEKTQFEVTYTRNQDILKNRPGIHYAPPILEKNKDGQRLIVTYEVDWKNKTVKVVDKYSDDNKPYKEG >NZ_CP022905.1|WP_000595392.1|988580_989597_+|bi-component-leukocidin-LukGH-subunit-G MIKQLYKNITICSLAISTALTVFPATSYAKINSEIKAVSEKNLDGDTKMYTRTATTSDSQKNITQSLQFNFLTEPNYDKETVFIKAKGTIGSGLRILDPNGYWNSTLRWPGSYSVSIQNVDDNNNTNVTDFAPKNQDESREVKYTYGYKTGGDFSINRGGLTGNITKESNYSETISYQQPSYRTLLDQSTSHKGVGWKVEAHLINNMGHDHTRQLTNDSDNRTKSEIFSLTRNGNLWAKDNFTPKDKMPVTVSEGFNPEFLAVMSHDKKDKGKSQFVVHYKRSMDEFKIDWNRHGFWGYWSGENHVDKKEEKLSALYEVDWKTHDVKFVKVLNDNEKK >NZ_CP022905.1|WP_000857198.1|990715_991753_-|site-specific-integrase MKTRCYDGKKWQYEFKYEGKRYRKKGFRTKREANSAGLDKLNELRSGFNIDNYITLEEYFENWIKTYKQPVVKENTYRHYRNALQHIQKHKIGKMELSKINRQVYQKFINDYSKEHAKETIRKTNGAIRSALDDALYDGLIFKNPAYKVNYKAGKPTKSEQEKFISVTEYEILKDHVRKKRTRSSLALFIMICTGCRVSGARNIKIEHINQVKNTIFIDERKTDTSPRYISIAKSDMKHIMDVISTFAISYDGYIFKEAGSIINLHAINNALKSACRVNNIPIITSHALRHTHCSYLLAKGVSIHYISKRLGHKNIAITTSVYSHLLEEKFNEEDKKTTKILESM >NZ_CP022905.1|WP_000440838.1|991946_992651_-|type-II-toxin-antitoxin-system-PemK/MazF-family-toxin MERNSTKKSSKDKILKAVNNFEEVCNSGKFKFKYLDDWLFTKSIIFKNETTLTNQKNFKVYPRGTIVYAKLGVNIGSEFSGNHFCVVLNKNDNKRNELITIVPLTSKDTKFSLKLQENLILKALEKMKTDHKTLRFDLDRIKEMHARSTKVKNLNPAIEKELDEIENNYMQLAKIIERYERFVGKQTYAIPSQVITISKKRISTLNDYDPTGHISFNEETLKIIEDFMKANILS >NZ_CP022905.1|WP_000705241.1|992790_992958_-|hypothetical-protein MKITNCKIKKETIVYEVLTSGNQPFTYELPKDLSSHNARKYLEFISQKIDGDRLN >NZ_CP022905.1|WP_000109189.1|993027_993213_-|hypothetical-protein MSTYKEIEHLHINTGGKELTQEQIEEAKAFIDSQEFKDMIREAKESHQRVMESKITDRTKL >NZ_CP022905.1|WP_001557601.1|993429_994284_-|restriction-endonuclease MKPRKQDEKILSDQYSYFEPIISDSCDIKFDENKRRMGSIFISHEEICFIRKEEDYIFKISLSEVIDYNTVVTIWKNQAFLTLNDNRKLTVYFVTNSPLTGFISILKTYMQLSKNKETIISNDCLPINDDEQTKVEIFDVVGLNYEGRRKELKKLIKKMKNNDDFFFLYSDLKGNELKEELLYEDKVYEISDYEVIPGVFLQKEPDNPYDENAIKVMISNEYSEFHVGYVPREYASRLVNHMDNIVSCNAYINGGKYKTLDYLEEKIVTKESDYGLRVHLEYKV >NZ_CP022905.1|WP_001083975.1|994295_995012_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MNSFKDRLKQIMSERKISQSELSRRTGIGRNSISDYLNGKYEAKQDKVFELAKALNVNEAWLMGFDISKNRKIENNDITSIYSKLTPPRQSNVLKYATNQLEEQNNDSDNLVDFNSYIQEKSEVDIYGCASAGIGERLYNEPISKEFVRGYVPAHDIALKVNGDSMEPLFKNGQIIFIEKSHTIKDGQIGVFIINGDAYVKKVYVEDNRLTLVSLNKKYKDLYFYDNESVRLVGKVIL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP022905_8 | 1420896-1420980 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP022905_8
|
1 spacers
spacers of NZ_CP022905_8
>8.1|1420922|33|NZ_CP022905|CRISPRCasFinder TGGGCCCCAACACAGAGAAATTGGATTCCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP022905_8
The CRISPR arrays of NZ_CP022905_8 >merge|NZ_CP022905|8|1420896-1420980|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTGTGGGCCCCAACACAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTG >NZ_CP022905|8|7|1420896-1420980|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTG TGGGCCCCAACACAGAGAAATTGGATTCCCAAT TTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTG
>NZ_CP022905.1|WP_000368338.1|1418899_1420723_+|elongation-factor-4 MDNEQRLKRRENIRNFSIIAHIDHGKSTLADRILENTKSVETRDMQDQLLDSMDLERERGITIKLNAVRLKYEAKDGNTYTFHLIDTPGHVDFTYEVSRSLAACEGAILVVDAAQGIEAQTLANVYLALDNELELLPVINKIDLPAAEPERVKQEIEDMIGLDQDDVVLASAKSNIGIEEILEKIVEVVPAPDGDPEAPLKALIFDSEYDPYRGVISSIRIVDGVVKAGDKIRMMATGKEFEVTEVGINTPKQLPVDELTVGDVGYIIASIKNVDDSRVGDTITLASRPASEPLQGYKKMNPMVYCGLFPIDNKNYNDLREALEKLQLNDASLEFEPESSQALGFGYRTGFLGMLHMEIIQERIEREFGIELIATAPSVIYQCILRDGSEVTVDNPAQMPDRDKIDKIFEPYVRATMMVPNDYVGAVMELCQRKRGQFINMDYLDDIRVNIVYELPLAEVVFDFFDQLKSNTKGYASFDYEFIENKESNLVKMDILLNGDKVDALSFIVHRDFAYERGKALVEKLKTLIPRQQFEVPVQAAIGQKIVARTNIKSMGKNVLAKCYGGDISRKRKLLEKQKAGKAKMKAVGNVEIPQDAFLAVLKMDDE >NZ_CP022905.1|WP_001274017.1|1418302_1418554_-|30S-ribosomal-protein-S20 MANIKSAIKRVKTTEKAEARNISQKSAMRTAVKNAKTAVSNNADNKNELVSLAVKLVDKAAQSNLIHSNKADRIKSQLMTANK >NZ_CP022905.1|WP_001282563.1|1417283_1418258_+|DNA-polymerase-III-subunit-delta MSDNIVAIYGDVPELVEKQSAEIISQFLKSDRDDFNFVKYNLYETEIAPIVEETLTLPFFSDKKAILVKNAYIFTGEKAPKDMAHNVDQLIEFIEKYDGENLIVFEIYQNKLDERKKLTKTLKKHARLKKIEQMSEEEIKKWIQSKLNENFKDIKRDALDLFIELTGINFNIVSQEIEKLILFLGDRPTINKQDVNQIINRSLEQNVFLLTEYIQKRKKEQAIHLVKDLITMKEEPIKLLALITSNYRLFYQCKILSQKGYSGQQIAKTIGVHPYRVKLALGQVRHYQLDELLNIVDACAETDYKLKSSYMDKQLILELFILSL >NZ_CP022905.1|WP_078092719.1|1415079_1417227_+|DNA-internalization-related-competence-protein-ComEC/Rec2 MLSTFLFILLLYITYRKNKIVYAPISLFLIIFSSWYLHYSQQAIFNYINYIERNSQFNERAQVIQIQRQGSDTYKGRLSLKNEIYPFFLTDKKNFDLKKIESRNCIVKGQFKVNENKFVTLKLQSIVVQSCLESNRSNLIEKHKQFIMNRIYDSGIKFPDRIMALITGDVKEINEQFKERVKEIGIYHLLAVSGSHIAAIVFLIYQPLKRLNLPLFVIKGITINVLTLYAQYTNYAPSAVRAIIMTTLVLLITKQIKIKGIQLLAFAFIIMFILNPLVVYDIGFQFSFIISFFIMLLFPFLQQLSKLQSLFIITFIAQLASFIVAIPNFHQLQWVGFLSNLIFVPYYSIILFPLSILFFITSHFIVGLTPLNYLVDLSFNFHDWLLDLFTRIKQSHFSVPKFNDWIFIIFIISVYYIFWLLAKRKYILVTFWTIIILTLLITFPTNSHHKITMLNVGQGDSILYEGGKNQNVLIDTGGKVIDDTKQPSYSISKYHILPTLNERGINELEYLILTHPHNDHIGEVEYIISHIKIKHIVIYNKGYSSNTLMLLSKLSHKYNIKLMDVRQVSSFKLGDSSFLFFDSFIPNSRDKNEYSIITMITYQNKKVLLMGDASKNNESLLLKKYNLPEIDILKVGHHGSKTSSSKEFIEMIKPKISLISSGKNNMYHLPNIEVVKRLQRIRSRIYNSQQNGQVTIDLDDNLKVDSNSYGNASGL >NZ_CP022905.1|WP_000439693.1|1414559_1415021_+|ComE-operon-protein-2 MERIKWEEYFMAQSHLLALRSTCQRLSVGATIVKDNRIIAGGYNGSVAGEVHCIDEGCLIEDGHCIRTIHAEMNALLQCAKQGVSTEGATIYVTHFPCLNCTKSIIQAGIKRIYYAEDYHNHEYATKLLKQSGIEFKKIPFSPEYVAKYLTKG >NZ_CP022905.1|WP_001802022.1|1413781_1414468_+|ComEA-family-DNA-binding-protein MVLLYQFLLRYKDFLTQWKLYIISAVVLIMVLIGFIFWRQDDYTSRNFENKDTALKQSTSENNSLSKLEDVQVKDGDNSKNKGPVYVDVKGAVKHPNVYKMTSKDRVVDLLDKAQLLDDADVSRINLSEKLTDQKMIFIPHKGQKNVEPQIEVNSVHVKNGNTNNTKVNLNTASVSELMSVPGVGQAKANAIVEYRNQQGAFQEIDDLKKVKGFGSKTFDKLKSYFTI >NZ_CP022905.1|WP_000084830.1|1413025_1413742_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MSQYAEMSLVYDQLTQDQPYEKWFEIVKNHCKDESNILDIGCGTGSLTVQLEALGNVTGMDLSVDMLTVAAQKSANVNWLEGDMTSFDLQQQFDIITIFCDSLNYLQDETAVIETFINVYHHLTDSGVFIFDVHTVYKMMTLFNNQSYIDDKGDIFLAWDAVQGDLPLSVYHDMTFFIRHEDETYSRFDESHFQRTFDEKTYLSWLAQVGFKHVETFTDFNIDEHNEDTERLFFIAKK >NZ_CP022905.1|WP_001088020.1|1412669_1413023_+|ribosome-silencing-factor MNSQELLAIAVDAIDNKKGEDTISLEMKGISDMTDYFVVTHGNNERQVQAIARAVKEVANEQNIEVKRMEGYNEARWILIDLADVVVHVFHKDERNYYNIEKLYQDAPLESYGQVAY >NZ_CP022905.1|WP_001019324.1|1412084_1412669_+|HD-domain-containing-protein MNIEKAKRLAKEKLPEKRYNHSLRVAETAIKLAEIYDGDTSKVELAGVLHDFCKYDDLGKMYQIVRQYELGNDLLSYGSEILHGPVCAAIMEHEYGINDEEVLMAIKYHTTGRQQMTKTEKLIFIADYIEPGRTIPGVDDIRDMAYNQGSLDKTIYEISKRTVLFLIQKDITVYNKTIDCLNYYNYSDERIKDD >NZ_CP022905.1|WP_000725167.1|1411525_1412095_+|nicotinate-(nicotinamide)-nucleotide-adenylyltransferase MKKIVLYGGQFNPIHTAHMIVASEVFHELQPDEFYFLPSFMSPLKKHNNFIDVQHRLTMIQMIIDELGFGDICDDEIKRGGQSYTYDTIKAFKEQHKDSELYFVIGTDQYNQLEKWYQIEYLKEMVTFVVVNRDKNSQNVENAMIAIQIPRVDISSTMIRQRVSEGKSIQVLVPKSVENYIKGEGLYEH >NZ_CP022905.1|WP_000218103.1|1421288_1422413_+|oxygen-independent-coproporphyrinogen-III-oxidase MTVQSAYIHIPFCVRICTYCDFNKYFIQNQPVDEYLDALITEMSTAKYRNLKTMYVGGGTPTALSINQLERLLKAIRDTFTITGEYTFEANPDELTKEKVQLLEKYGVNRISMGVQTFKPELLSVLGRTHNTEDIYTSVLNAKNAGIKSISLDLMYHLPKQTIEDFEQSLDLALDMDIQHISSYGLILEPKTQFYNMYRKGLLKLPNEDLGADMYQLLMSKIEQSPFHQYEISNFALDGHESEHNKVYWFNEEYYGFGAGASGYVDGVRYTNINPVNHYIKAINKESKAILVSNKPSLTERMEEEMFLGLRLNEGVSSSRFKKKFDQSIESVFGQTINNLKEKELIVEKNDAIALTKRGKVIGNEVFEAFLIND >NZ_CP022905.1|WP_000627144.1|1422513_1423491_+|heat-inducible-transcription-repressor-HrcA MITDRQLSILNAIVEDYVDFGQPVGSKTLIERHNLNVSPATIRNEMKQLEDLNYIEKTHSSSGRSPSQLGFRYYVNRLLEQTSHQKTNKLRRLNQLLVENQYDVSSALTYFADELSNISQYTTLVVHPNHKQDIINNVHLIRANPNLVIMVIVFSSGHVEHVHLASDIPFSNDKLNTISNFVTNKLTEFNQNLQDDIVSFVQSEQEEIFINKLINTMNNHISNQSNSIYMGGKVKLIDALNESNVSSIQPILQYIESNRIAELLQDISSPNINVKIGNEIDDSLSDISIVTSQYHFDETLKGQIAVIGPTAMHYQNVIQLLNRIW >NZ_CP022905.1|WP_000182211.1|1423522_1424149_+|nucleotide-exchange-factor-GrpE MTNKDESVEKNTESTVEETNIKQNIDDSVEQAEESKGHLQDEAIEETSDENVIEEIDPKDQKINELQQLADENEEKYLRLYAEFENYKRRIQKENEINKTYQAQRVLTDILPAIDNIERALQIEGDDETFKSLQKGVQMVHESLINALKDNGLEVIKTEGEAFDPNIHQAVVQDDNPDFESGEITQELQKGYKLKDRVLRPSMVKVNQ >NZ_CP022905.1|WP_000034716.1|1424217_1426050_+|molecular-chaperone-DnaK MSKIIGIDLGTTNSCVTVLEGDEPKVIQNPEGSRTTPSVVAFKNGETQVGEVAKRQAITNPNTVQSIKRHMGTDYKVDIEGKSYTPQEISAMILQNLKNTAESYLGEKVDKAVITVPAYFNDAERQATKDAGKIAGLEVERIINEPTAAALAYGLDKTDKDEKVLVFDLGGGTFDVSILELGDGVFEVLSTAGDNKLGGDDFDQVIIDYLVAEFKKENGVDLSQDKMALQRLKDAAEKAKKDLSGVSQTQISLPFISAGENGPLHLEVNLTRSKFEELSDSLIRRTMEPTRQAMKDAGLTNSDIDEVILVGGSTRIPAVQEAVKKEIGKEPNKGVNPDEVVAMGAAIQGGVITGDVKDVVLLDVTPLSLGIEILGGRMNTLIERNTTIPTSKSQIYSTAVDNQPSVDVHVLQGERPMAADNKTLGRFQLTDIPPAERGKPQIEVTFDIDKNGIVNVTAKDLGTNKEQRITIQSSSSLSDEEIDRMVKDAEVNAEADKKRREEVDLRNEADSLVFQVEKTLTDLGENIGEEDKKSAEEKKDALKTALEGQDIEDIKSKKEELEKVIQELSAKVYEQAAQQQQQAQGANAGQNNDSTVEDAEFKEVKDDDKK >NZ_CP022905.1|WP_001119021.1|1426185_1427325_+|molecular-chaperone-DnaJ MAKRDYYEVLGISKDASKDEIKKAYRKLSKKYHPDINKEEGADEKFKEISEAYEVLSDDNKRASYDQFGHDGPQGFGGQGFNGSDFGGFSGFGGGGFEDIFSSFFGGGRQRDPNAPQKGDDLQYTMTLTFEEAVFGTTKEISIRKDVTCETCHGDGAKPGTSKKTCSYCNGAGHVAVEQNTILGRVRTEQVCPKCNGSGQEFEEACPTCHGKGTENKTVKLEVKVPEGVDNEQQIRLAGEGSPGVNGGPAGDLYVVFRVKPSETFKRDGDDIYYKLNVSFPQAALGDEIKIPTLNNEVMLTIPAGTQTGKQFRLKEKGIKNVHGYGYGDLYVDIKVVTPTKLTDRQKELMKEFAQLNGEEINEQPSNFKDRAKRFFKGE >NZ_CP022905.1|WP_001104607.1|1427328_1428267_+|50S-ribosomal-protein-L11-methyltransferase MNWTELSIIINHEAVELATNILENHGSNGVVIEDSDDLINQPEDKYGEIYALKKEDYPDKGVRLKAYFNEMTYDDKLRQQIKDELLNLDELDQHNIQFSEQIIAETDWENEWKNYFHPFRASKKFTIVPSWETYAKEADEELCIELDPGMAFGTGDHPTTSMCLKAIETYVLPQHSVIDVGTGSGILSIASHLIGVKRIKALDIDEMAVSVAKENFRRNHCETLIEAVPGNLLKDETEKFDIVIANILAHIIDEMIEDAYNTLNEGGYFITSGIIKEKYEGIQSHMERVGFKIISEQHDNGWVCLVGQKVSE >NZ_CP022905.1|WP_001190121.1|1428268_1429021_+|16S-rRNA-(uracil(1498)-N(3))-methyltransferase MQRYFIDQNADVSQRFFITKKEDIHHITNVMRYDVGSKIILTFNDQTVYLCEIADITSDKIAVDLKEKQNINTELPVDVTICSGLIKADKYEWLLQKATELGASSFIAVSMERSIVKLNEAKVVKKIERWQKIIKEAAEQSYRLVIPSIQFESNLKLICDTIDNYDYILIAYEEEAKDGKLSNFKQTLQQFKAQDKVLMIFGPEGGLSENEISLFSNTSTVVGLGPRILRAETAPLYALSAISYEKELMG >NZ_CP022905.1|WP_000108667.1|1429027_1430374_+|tRNA-(N(6)-L-threonylcarbamoyladenosine(37)-C(2))--methylthiotransferase-MtaB MSTVAFHTLGCKVNHYETEAIWQLFKEANYERVDFEANADVFVINTCTVTNTGDKKSRQIIRRAIRQNPDAVICVTGCYAQTSSAEIMEIPGVDVVVGTQDRHKLLGYIDEFRKERQPINGVGNIMKNRKYEELDVPYFTDRTRASLKIQEGCNNFCTFCIIPWARGLMRSRDPEKVVEQATQLVNSGYKEIVLTGIHTGGYGQDLKDYNLAQLLRDLETINGLERIRISSIEASQLTDEVIDVLERSTKVVRHLHIPLQSGSDTVLKRMRRKYTMDRFSERLTKLHKALPDLAVTSDVIVGFPGETEAEFQETYDFIVKHKFSELHVFPYSPRIGTPAARMDDQIDEEIKNERVHKLITLSNQLGKLYASKFDQDVLEVIPEEQGDTEGTLVGYADNYMKVQFEGDESLIGQIVKVKITQANYPLNEGQAIKVVDFATNKSDREVLV >NZ_CP022905.1|WP_000048060.1|1430666_1430843_+|30S-ribosomal-protein-S21 MSKTVVRKNESLEDALRRFKRSVSKSGTIQEVRKREFYEKPSVKRKKKSEAARKRKFK >NZ_CP022905.1|WP_001802667.1|1431086_1431770_+|hypothetical-protein MTTILESTAGDTWVEQVSNIIVQPIFTLILTCLTFLGFVYQLYSKKINAAGIIATLSLLILFLGFLIQGNVNMHSILIFSIGVILVVIELFVVGAVIGIIGMILITISITTLGDNLLFMLANVIVALILTIVEWVILVKIFNRKIPFLDKVILKDSTNSESGYNSHDNRSHLVGKTAQTVTDLRPAGIIFCENERIDAVSDGNFILRNKTVKILEVEGTRVVVREVD |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP022905_9 | 2292165-2292245 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP022905_9
|
1 spacers
spacers of NZ_CP022905_9
>9.1|2292189|33|NZ_CP022905|CRISPRCasFinder ATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTT |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP022905_9
The CRISPR arrays of NZ_CP022905_9 >merge|NZ_CP022905|9|2292165-2292245|CRISPRCasFinder CAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTCAACTTTAGTTGTTAGGGGCTTCT >NZ_CP022905|9|8|2292165-2292245|CRISPRCasFinder CAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTT ATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTT CAACTTTAGTTGTTAGGGGCTTCT
>NZ_CP022905.1|WP_000495669.1|2291056_2292148_+|hypothetical-protein MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYAQTIAIYSQFGQKPPVDAYLKVIAVLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKDKKVVTEPKNTKVENGKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >NZ_CP022905.1|WP_000019734.1|2289813_2290791_+|CDF-family-zinc-efflux-transporter-CzrB MSHSHHHDHMHSHVTTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALVAFIYAEKNATTTKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH >NZ_CP022905.1|WP_000003759.1|2289491_2289812_+|Zn(II)-responsive-metalloregulatory-transcriptional-repressor-CzrA MSEQYSEINTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL >NZ_CP022905.1|WP_001024095.1|2288674_2289340_-|SDR-family-oxidoreductase MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFDGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNHQEFQIISGEQDIKDALTQFEIEKD >NZ_CP022905.1|WP_001127960.1|2287300_2288239_-|class-I-mannose-6-phosphate-isomerase MPLFLQPILKTKLWGGQRLSEFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGTSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIVIGTLAESREEVANHVQHGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDITYRLYDFNRQDNQYNDRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYV >NZ_CP022905.1|WP_000808817.1|2287039_2287270_-|hypothetical-protein MKQFLYIALVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQISASLKFSALLINVLPLCGTFVASN >NZ_CP022905.1|WP_000123398.1|2284994_2286368_-|EVE-domain-containing-protein MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRMSNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVKKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD >NZ_CP022905.1|WP_001123303.1|2284124_2284538_-|thiol-disulfide-oxidoreductase-DCC-family-protein MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYQFATLKGEVGQQFFKQHPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIKLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD >NZ_CP022905.1|WP_000070866.1|2283481_2283925_-|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLENAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS >NZ_CP022905.1|WP_000160304.1|2282650_2283361_+|purine-nucleoside-phosphorylase MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGTYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKAKNVADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNDAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE >NZ_CP022905.1|WP_001802298.1|2292580_2292685_-|hypothetical-protein MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISTQDHKK >NZ_CP022905.1|WP_001792292.1|2293201_2293372_+|transposase MSPKDTTRFETKPDHQAQFDWKESINFKTKDNQRIPLYIGVLLLYYSRFIIMHNNE >NZ_CP022905.1|WP_001792784.1|2293364_2293523_+|hypothetical-protein MSKSSDALFNSLTQSFELIEGVYNELVTDNLKIVMYKPRKESTSGRINRRFK >NZ_CP022905.1|WP_000370925.1|2294180_2295038_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase 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>NZ_CP022905.1|WP_000648723.1|2302756_2303863_+|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKAVHFGAGNIGRGFIGYILADNNVKVTFADVNEEIINALAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFAPFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVLDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFAGKATVLDAVKDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAGYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTADQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP022905_10 | 2304486-2304571 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP022905_10
|
1 spacers
spacers of NZ_CP022905_10
>10.1|2304512|34|NZ_CP022905|CRISPRCasFinder TTGCATATCTTTAGCTTTATTGTTTGCAACTGGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP022905_10
The CRISPR arrays of NZ_CP022905_10 >merge|NZ_CP022905|10|2304486-2304571|CRISPRCasFinder CCAACTGATTTTTGCGTATCATTAGTTTGCATATCTTTAGCTTTATTGTTTGCAACTGGGCCAACTGATTTTTGCGTATCATTAGT >NZ_CP022905|10|9|2304486-2304571|CRISPRCasFinder CCAACTGATTTTTGCGTATCATTAGT TTGCATATCTTTAGCTTTATTGTTTGCAACTGGG CCAACTGATTTTTGCGTATCATTAGT
>NZ_CP022905.1|WP_000648723.1|2302756_2303863_+|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKAVHFGAGNIGRGFIGYILADNNVKVTFADVNEEIINALAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFAPFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVLDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFAGKATVLDAVKDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAGYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTADQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS >NZ_CP022905.1|WP_001292149.1|2302322_2302757_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA >NZ_CP022905.1|WP_000927371.1|2300178_2302311_+|BglG-family-transcription-antiterminator MLLSTREKEMIALLIKYHSQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVEAYLTSFSLTLERANKKGLRIAGADSDLNDLKQSIAQHQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELDLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLGQIYDVTFNQAEIAFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVNKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFIVLHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLEQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIDSPYLTVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFQETHDKSSNMIDKDDVHVETKDVDGNTSFENEQTSYLTSVFEKHLSDEKSEQLLHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDVINDPTSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMILITVLEEPLTLPSIQNDNQTIKYMISMFIPDNDFMASLVSDLSEFLSLKLESIDTFMENPQELETLLRNKFLERIKKQFI >NZ_CP022905.1|WP_000083807.1|2298605_2300144_+|PTS-mannitol-transporter-subunit-IICB 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>NZ_CP022905.1|WP_000370925.1|2294180_2295038_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINQLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQITNLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAKHFLAD >NZ_CP022905.1|WP_001792784.1|2293364_2293523_+|hypothetical-protein MSKSSDALFNSLTQSFELIEGVYNELVTDNLKIVMYKPRKESTSGRINRRFK >NZ_CP022905.1|WP_001792292.1|2293201_2293372_+|transposase MSPKDTTRFETKPDHQAQFDWKESINFKTKDNQRIPLYIGVLLLYYSRFIIMHNNE >NZ_CP022905.1|WP_001802298.1|2292580_2292685_-|hypothetical-protein MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISTQDHKK >NZ_CP022905.1|WP_000521495.1|2311904_2313260_-|phosphoglucosamine-mutase MGKYFGTDGVRGVANQELTPELAFKLGRYGGYVLAHNKGEKHPRVLVGRDTRVSGEMLESALIAGLISIGAEVMRLGIISTPGVAYLTRDMGAELGVMISASHNPVADNGIKFFGSDGFKLSDEQENEIEALLDQENPELPRPVGNDIVHYSDYFEGAQKYLSYLKSTVDVNFEGLKIVLDGANGSTSSLAPFLFGDLEADTETIGCSPDGYNINEKCGSTHPEKLAEKVVETESDFGLAFDGDGDRIIAVDENGQIVDGDQIMFIIGQEMHKNQELNNDMIVSTVMSNLGFYKALEQEGIKSNKTKVGDRYVVEEMRRGNYNLGGEQSGHIVMMDYNTTGDGLLTGIQLASVIKMTGKSLSELAGQMKKYPQSLINVRVTDKYRVEENVDVKEVMTKVEVEMNGEGRILVRPSGTEPLVRVMVEAATDEDAERFAQQIADVVQDKMGLDK >NZ_CP022905.1|WP_000894032.1|2313286_2314219_-|YbbR-like-domain-containing-protein MLESKWGLRFIAFLLALFFFLSVNNVFGNIFNTGNLGQKSSKTIQDVPVEILYNTKDLHLTKAPETVNVTISGPQSKIIKIENPEDLRVVIDLSNAKAGKYQEKYQVKGLADDIHYSVKPKLANITLENKVTKKMTVQPDVSQSDIDPLYKITKQEVSPQTVKVTGGEEQLNDIAYLKATFKTNKKINGDTKDVAEVTAFDKKLNKLNVSIQPNEVNLQVKVEPFSKKVKVNVKQKGSLADDKELSSIDLEDKEIEIFGSRDDLQNISEVDAEVDLDGISESTEKTVKINLPEHVTKAQPSETKAYINVK >NZ_CP022905.1|WP_000347896.1|2314220_2315030_-|TIGR00159-family-protein MDFSNFFQNLSTLKIVTSILDLLIVWYVLYLLITVFKGTKAIQLLKGILVIVIGQQISMILNLTATSKLFDIVIQWGVLALIVIFQPEIRRALEQLGRGSFLKRYTSNTYSKDEEKLIQSVSKAVQYMAKRRIGALIVFEKETGLQDYIETGIAMDSNISQELLINVFIPNTPLHDGAMIIQGTKIAAAASYLPLSDSPKISKSLGTRHRAAVGISEVSDAFTVIVSEETGDISVTFDGKLRRDISNEIFEELLAEHWFGTRFQKKGVK >NZ_CP022905.1|WP_000167867.1|2315218_2316127_-|arginase MTKTKAIDIIGAPSTFGQRKLGVDLGPTAIRYAGLISRLKQLDLDVYDKGDIKVPAVNIEKFHSEQKGLRNYDEIIDVNQKLNKEVSASIENNRFPLVLGGDHSIAVGSVSAISKHYNNLGVIWYDAHGDLNIPEESPSGNIHGMPLRILTGEGPKELLELNSNVIKPENIVLIGMRDLDKGERQFIKDHNIKTFTMSDIDKLGIKEVIENTIEYLKSRNVDGVHLSLDVDALDPLETPGTGTRVLGGLSYRESHFALELLHQSHLISSMDLVEVNPLIDSNNHTAEQAVSLVGTFFGETLL >NZ_CP022905.1|WP_000958531.1|2322367_2323432_-|P-loop-NTPase MLTVDQVKELVGEIKDPIIDVPLKETEGIVEVSIKEEKEHVSVKLAMAQLGGAPQLDLQMAVVNALKENGAKTVGIRFETLPEEKVNQFKPKEENKPKTIEGLLSQNNPVEFIAIASGKGGVGKSTVAVNLAVALAREGKKVGLVDADIYGFSVPDMMGIDEKPGIKGKEVIPVERHGVKVISMAFFVEENAPVIWRGPMLGKMLTNFFTEVKWGDIEYLILDLPPGTGDVALDVHTMLPSSKEIIVTTPHPTAAFVAARAGAMAKHTDHSILGVIENMSYFESKETGNKEYVFGKGGGTKLADELNTQLLGELPLEQPSWNPKDFAPSIYQSDDRLGKIYSSIAQKVIAATNK >NZ_CP022905.1|WP_000636857.1|2325345_2325819_-|multidrug-efflux-transporter-SepA MIVNYLKHKFYNLLTTMIVLFIFVLSGAIFLTFLGFGLYGLSRILIYFRLGDFTYNRSMYDNLLYYGSYIIFGYFIIFAVEHLMDYFRKMLPENAYFRGATFHLISYTVATTLFYFIIHLNYVYINIDFWVIMVIIGFLYVCKLQFYPESKNLNNRK >NZ_CP022905.1|WP_001237506.1|2325917_2327261_-|MFS-transporter MRLKSIITVIALILIMFMSAIESSIISLALPTIKQDLNAGNLISLIFTAYFIALVIANPIVGELLSRFKIIYVAIAGLLLFSIGSFMCGLSTNFTMLIISRVIQGFGSGVLMSLSQIVPKLAFEIPLRYKIMGIVGSVWGISSIIGPLLGGGILEFATWHWLFYINIPIAIIAIILVIWTFHFPEEETVAKSKFDTKGLTLFYVFIGLIMFALLNQQLLLLNFLSFILAIVVAMCLFKVEKHVSSPFLPVVEFNRSITLVFITDLLTAICLMGFNLYIPVYLQEQLGLSPLQSGLVIFPLSVAWITLNFNLHRIEAKLSRKVIYLLSFTLLLVSSIIISFGIKLPVLIAFVLILAGLSFGYIYTKDSVIVQEETSPLQMKKMMSFYGLTKNLGASIGSTIMGYLYAIQSGIFGPNLHNVLSAVAVISIGLIVLWVVFFKEQSSQSKE >NZ_CP022905.1|WP_000047255.1|2327437_2328121_-|hemolysin-III-family-protein MSKSTKKSNDTIVETFKDIIPLSFGEEIGNAASHGVAALLTLLVLPYAAVHSYIAHGTLASVSMSIYVISIFMMFISSTIYHSMQNETPHKYILRIIDHSMIYVAISGTYTPILLTVVGGWIGWTVFILLWGTTLWGILYKSIAVKVNQKLSLIVYLVMGWVGIILLPIIFIRTSWIFILFIFLGGVSYTIGAWFYAQKNRPYFHMIWHIFIVIASLLHLIAILYFM >NZ_CP022905.1|WP_000884735.1|2328139_2329327_-|UDPGP-type-1-family-protein MLDKNQLAKYKQDHLCEYEKIMSNNEKEALEEKVASLDLDFIAKLYNDLYINKKTIDDVSAVSEVKYDIKSQMSDDEIKRLEEQGLQAIKEGQFAVLLMAGGQGTRLGYKGPKGSFEIEGVSLFELQANQLKTLNHQSGHTIQWYIMTSDINHEETLAYFEAHSYFGYDQEAIHFFKQDNIVALSEEGKLILNQQGRIMETPNGNGGVFKSLDKAGYLEEMSNNGVKYIFLNNIDNVLVKVLDPLFAGFTVEHDYDITSKTIQPKPGESVGRLVNVDCKDTVLEYSELDPEVANQFNNANIGIHAFKLGFILNAVNRELPYHLAIKNLKQLDENFGVIEQPTLKFELFYFDIFTYGTSFVTLQVPREEEFSPLKNKEGKDSVATATEDLRRMGLI >NZ_CP022905.1|WP_000147095.1|2329370_2329886_-|metal-dependent-hydrolase MTGKTHASCGMLVGALTTQYFQTDIFSSVTVIILATLASLLPDICHTQSKIGRRFKVISFFVRLIFGHRTFTHSILFIAIIAFLLQIIQTPNYYMAAIIIGLVSHVILDMITPRGVKLFYPLPFNVKTPIQFKTGGLVDLSLATALMVGTVYVLFQPFINDIISNWNTKFL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP022905_11 | 2412529-2412609 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP022905_11
|
1 spacers
spacers of NZ_CP022905_11
>11.1|2412554|31|NZ_CP022905|CRISPRCasFinder CACATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP022905_11
The CRISPR arrays of NZ_CP022905_11 >merge|NZ_CP022905|11|2412529-2412609|CRISPRCasFinder TCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTG >NZ_CP022905|11|10|2412529-2412609|CRISPRCasFinder TCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTG CACATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCT TCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTG
>NZ_CP022905.1|WP_001792132.1|2412301_2412487_+|hypothetical-protein MFRFISFGQLVVYSTTFIPKKDILQLNDLECDINVKEPLKINYVVIFGSGTEITFSQNLFR >NZ_CP022905.1|WP_000066900.1|2411825_2412176_-|HTH-type-transcriptional-regulator-SarV MSNKVQRFIEAERELSQLKHWLKTTHKISIEEFVVLFKVYEAEKISGKELRDTLHFEMLWDTSKIDVIIRKIYKKELISKLRSETDERQVFYFYSTSQKKLLDKITKEIEVLSVTN >NZ_CP022905.1|WP_000184404.1|2410512_2411724_+|MFS-transporter MTNQGSLNKSPIFTKSFTINFFVNFIVYLCMYLLLVVIAGYSKQAFDASDSLAGLVVGLFIVGSLIGRFATGKFVNQIGPKRLLFIGLIALIITQLLYFIDGSLAFLIFVRLINGIATAVVTTATGTIAAYVTPVNRKSEGISLFSLSLVLGTAIGPFLGMLLITKYAIDLLFIICVILGILGLIISLFIKVDFEVTNNKTETDVINKPRFSIHQFIAKEAIPVAVIMLLIGVTYASILTYLQAFALERHLVTAASYFFICYAIASLITRPIAGRLMDDKNENIIVYPAFIMLFLSFVCLISSYQSWLILLAGACLGLGYGNLSSAMQSIAIKVSPPIKYGIATSTFYVGLDAGVGFGPSFLGLFTHMFSYSEIFGFMAALAIITMLVYFLIHGRHVTRNAMN >NZ_CP022905.1|WP_000951058.1|2410079_2410520_+|winged-helix-DNA-binding-protein MLSQEFFNSFITIYRPYLKLAEPILEKHNIYYGQWLILRDIAKHQPTTLIEISHRRAIEKPTARKTLKALIENDLITVENSLEDKRQKFLTLTPKGHELYEIVCLDVQKLQQAVVAKTNISQDQMQETINVMNQIHEILLKEAHND >NZ_CP022905.1|WP_000600967.1|2409153_2409918_-|VOC-family-protein MILKFDHIIHYIDQLDRFSFPGDVIKLHSGGYHHKYGTFNKLGYINENYIELLDVENNEKLKKMAKTIEGGVAFATQIVQEKYEQGFKNICLRTNDIEAVKNKLQSEQVEVVGPIQMERDTHKDGKVKWQLLYIMNQDDDEIKPPFFIQWEESDSMRTKKLQKYFQKQFSIETVIVKSKNRSQTVSNWLKWFDMDIVEENDHYTDLILKNDDIYFRIEDGKVSKYHSVIIKDAQATSPYSIFIRGAIYRFEPLV >NZ_CP022905.1|WP_001549681.1|2408910_2409162_+|hypothetical-protein MRTIILSLFIIMNIVAIIMTLSQPLTVNYFSLRVILIFFTFILSIFFILIKSSRLNNILTILSIVLVIIHMGILAHSTYVYLY >NZ_CP022905.1|WP_000413862.1|2407256_2408522_-|lipid-II:glycine-glycyltransferase-FemX MEKMHITNQEHDAFVKSHPNGDLLQLTKWAETKKLTGWYARRIAVGRDGEVQGVAQLLFKKVPKLPYTLCYISRGFVVDYSNKEALNALLDSAKEIAKAEKAYAIKIDPDVEVDKGTDALQNLKALGFKHKGFKEGLSKDYIQPRMTMITPIDKNDDELLNSFERRNRSKVRLALKRGTTVERSDREGLKTFAELMKITGERDGFLTRDISYFENIYDALHEDGDAELFLVKLDPKENIAKVNQELNELHAEIAKWQQKMETSEKQAKKAQNMINDAQNKIAKNEDLKRDLEALEKEHPEGIYLSGALLMFAGSKSYYLYGASSNEFRDFLPNHHMQYTMMKYAREHGATTYDFGGTDNDPDKDSEHYGLWAFKKVWGTYLSEKIGEFDYILNQPLYQLIEQVKPRLTKAKIKISRKLKRK >NZ_CP022905.1|WP_000592307.1|2403972_2407140_-|efflux-RND-transporter-permease-subunit MIKKLLQFSLGNKFAIFLMVVLVVLGGVYASAKLKLELLPNVQNPVISVTTTMPGATPQSTQDEISSKIDNQVRSLAYVKNVKTQSIQNASIVTVEYENNTDMDKAEEQLKKEIDKIKFKDEVGQPELRRNSMDAFPVLAYSFSNKENDLKKVTKVLNEQLIPKLQTVDGVQNAQLNGQTNREITLKFKQNELEKYGLTADDVENYLKTATRTTPLGLFQFGDKDKSIVVDGQYQSVDAFKNINIPLTLAGGQGQSQSQSDNKQNSAMSDVNQASPQQNSKASAPNNISGMPTAKLGDLADITVGDVRTSISKTNGKDAVNLQITKAQDANTVQVAKDVQRKIDTFVDENKDFNVTKTMDTAKPVEKSLYTMVEKASLGTIVAIIVILLFLRNIRTTAISIISIPLSLLMALIALKLSDVSLNILTLGALTVAIGRVIDDSIVVVENIYRRLTDSEEQLKGENLIISATTEVFKPIMSSTLVTIIVFLPLVFVSGSVGEMFRPFALAIAFSLLASLLVSITLVPALAATLFKKGVKRRNKQHQEGLGVVSTTYKKVLHWSLNHKWIVIILSTLILVATIVFGGPRLGTSFISAGDDKFLAITYTPKPGETEQAVLNHAKDVEKYLKQKKHVKTIQYSVGGSSPVDPTGSTNSMAIMVEYDNDTPNFDVEADKVIKHVDGFKHPGEWKNQDLGTGAGNKSVEVTVKGPSMDAIKSTVKDIEQKMKQVKGLANVKSDLSQTYDQYEIKVDQNKAAENGISASQLAMHLNENLPEKTVTTVKENGKTVDVKVKQNKQTDWSEDKLNNITLKKPTGGTIKLGDIATLVKTTTPSKLTQEQGDYATTVSAKVTNKDVGGTTRQVMSKINNLDKPNNVKVNIGGASDDINNAMTQLAFAMLAAIIIVYLILVITFKGGLAPFTILFSLPFTVIGVIIALLITGETISVPSLIGMLMLIGIVVTNAIVLIDRVINNEQQGMEMKEALIEAGGTRIRPILMTAIATIGALVPLLFGQDSSILISKGLAATVIGGLISSTLLTLVVVPVIYEILFTLKKRFTKR >NZ_CP022905.1|WP_001161083.1|2403471_2403789_+|hypothetical-protein MQFYLILLAILYLIVSFISIFKMEVVFTRILRIIMGVLLLFVLALTTMSFPKDNWWVFIVLLLLVGNVEVTGFKMLKKDLKGVNILNLMSLFIFVIYFILTIVLF >NZ_CP022905.1|WP_000051210.1|2403062_2403227_+|hypothetical-protein MSLENQLAELKYDYVRLQGDLEKRESLNLDTSALVRQLKDIENEIRNVRAQMQD >NZ_CP022905.1|WP_000230173.1|2412752_2413775_-|GTP-3',8-cyclase-MoaA MVEQIKDKLGRPIRDLRLSVTDRCNFRCDYCMPKEVFGDDFVFLPKNELLTFDEMARIAKVYAELGVKKIRITGGEPLMRRDLDVLIAKLNQIDGIEDIGLTTNGLLLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDDTLFQSINNRNIKATTILEQIDYATSIGLNVKVNVVIQKGINDDQIIPMLEYFKDKHIEIRFIEFMDVGNDNGWDFSKVVTKDEMLTMIEQHFEIDPVEPKYFGEVAKYYRHKDNGVQFGLITSVSQSFCSTCTRARLSSDGKFYGCLFATVDGFNVKAFIRSGVTDEELKEQFKALWQIRDDRYSDERTAQTVANRQRKKINMNYIGG >NZ_CP022905.1|WP_000643986.1|2413794_2414394_-|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase-MobA MKAIILAGGHSVRFGKPKAFAEVNGETFYSRVIKTLESTNMFNEIIISTNAQLATQFKYPNVVIDDENHNDKGPLAGIYTIMKQHPEEELFFVVSVDTPMITGKAVSTLYQFLVSHLIENHLDVAAFKEDGRFIPTIAFYSPNALGAITKALHSDNYSFKNIYHELSTDYLDVRDVDAPSYWYKNINYQHDLDALIQKL >NZ_CP022905.1|WP_000866971.1|2414400_2414634_-|molybdopterin-converting-factor-subunit-1 MKVLYFAEIKDILQKAQEDIVLEQALTVQQFEDLLFERYPQINNKKFQVAVNEEFVQKSDFIQPNDTVALIPPVSGG >NZ_CP022905.1|WP_000808495.1|2414639_2415086_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaE MKQFEIVIEPIQTEQYREFTINEYQGAVVVFTGHVREWTKGVKTEYLEYEAYIPMAEKKLAQIGDEINEKWPGTITSIVHRIGPLQISDIAVLIAVSSPHRKDAYRANEYAIERIKEIVPIWKKEIWEDGSKWQGHQKGNYEEAKREE >NZ_CP022905.1|WP_000602950.1|2415099_2415585_-|molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-protein-B MILQIVGYKKSGKTTLMRHIVSFLKTHGYTVATIKHHGHAKEDIQLQDSDVDHMKHFEAGADQSIVQGFQYQQTVTRVDNQNLTQIIEKSVTIDTNIVLVEGFKNADFEKVVVYRDEEELQVLQQLSNVCYSINVREHEDFTAFEQWLLNKIKNDCDTQLT >NZ_CP022905.1|WP_000259717.1|2415581_2416841_-|molybdopterin-molybdotransferase-MoeA MVVEKRNPIPVKEAIQRIVNQQSSMPAITVALEKSLNHILAEDIVATYDIPRFDKSPYDGFAIRSVDSQGASGQNRIEFKVIDHIGAGSVSDKLVGDHEAVRIMTGAQIPNGADAVVMFEQTIELEDTFTIRKPFSKNENISLKGEETKTGDVVLKKGQVINPGAIAVLATYGYAEVKVIKQPSVAVIATGSELLDVNDVLEDGKIRNSNGPMIRALAEKLGLEVGIYKTQKDDLDSGIQVVKEAMEKHDIVITTGGVSVGDFDYLPEIYKAVKAEVLFNKVAMRPGSVTTVAFADGKYLFGLSGNPSACFTGFELFVKPAVKHMCGALEVFPQIIKATLMEDFTKANPFTRFIRAKATLTSAGATVVPSGFNKSGAVVAIAHANCMVMLPGGSRGFKAGHTVDIILTESDAAEEELLL >NZ_CP022905.1|WP_000134526.1|2416903_2417398_+|cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase-MoaC MTEFTHINQQGHAKMVDVSDKQITKRTAVAHSSITVNETIFKQISNNTNTKGNVLNTAQIAGIMAAKNTSTIIPMCHPLPLTGIDVHFSWDETNAPLYTLNIQTTVSTTGKTGVEMEALTAASATALTIYDMTKAVDKGMIIGETYLESKSGGKSGDFQRQSGQ >NZ_CP022905.1|WP_000503822.1|2417399_2417906_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaB MGEHQNVKLNRTVKAAVLTVSDTRDFVTDKGGQCVRQLLQADDVEVSDAHYTIVKDEKVAITTQVKKWLEEDIDVIITTGGTGIAQRDVTIEAVKPLLTKEIEGFGELFRYLSYVEDVGTRALLSRAVAGTVNNKLIFSIPGSTGAVKLALEKLIKPELNHLIHELTK >NZ_CP022905.1|WP_000076930.1|2417936_2418941_-|molybdopterin-biosynthesis-protein-MoeB MSQERYSRQILFKQIGEIGQSKINQKCALIIGMGALGTHVAEGLVRAGIAKLIIVDRDYIEFSNLQRQTLFTEEDALKMMPKVVAAKKHLLALRSDVDIDGCIAHVDYYFLETHGQDVDVIIDATDNFETRQLINDFAYKHRIPWIYGGVVQSTYTEAAFIPGKTPCFNCLVPQLPALNLTCDTVGVIQPAVTMATSLQLRDAMKVLTEQPIDTKITYGDIWEGSHYSFGFSKMQRSDCTTCGDVPSYPYLNKNEQRYATLCGRDTVQYENASITHDILVQFLKQHQLNYRSNSYMVMFEFKGHRIVAFKGGRFLIHGMTRTSDATHLMNLLFG >NZ_CP022905.1|WP_000913024.1|2419110_2419716_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MLKINVKYQLKNTLIRINIDDTEPKIYAVRGPSGIGKTTVLNMIAGLRKADEAIIEVNGQLLTDTTKNVNVKIQQRRIGYLFQDYQLFPNMTVYKNITFMAEPSKHIDQLIQTLNINHLMKQYPMTLSGGEAQRVALARALSTKPDLILLDEPFSSLDDTTKDESITLVKRIFNEWQIPIIFVTHSNYEAEQMAHEIITIG |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP022905_1 | 1.1|170207|33|NZ_CP022905|CRISPRCasFinder | 170207-170239 | 33 | NZ_CP022905.1 | 1693617-1693649 | 0 | 1.0 |
NZ_CP022905_4 | 4.1|830167|31|NZ_CP022905|CRISPRCasFinder | 830167-830197 | 31 | NZ_CP022905.1 | 295083-295113 | 0 | 1.0 |
NZ_CP022905_5 | 5.1|835634|22|NZ_CP022905|CRT | 835634-835655 | 22 | NZ_CP022905.1 | 170168-170189 | 0 | 1.0 |
NZ_CP022905_5 | 5.1|835634|22|NZ_CP022905|CRT | 835634-835655 | 22 | NZ_CP022905.1 | 295008-295029 | 0 | 1.0 |
NZ_CP022905_5 | 5.1|835634|22|NZ_CP022905|CRT | 835634-835655 | 22 | NZ_CP022905.1 | 295118-295139 | 0 | 1.0 |
NZ_CP022905_5 | 5.1|835634|22|NZ_CP022905|CRT | 835634-835655 | 22 | NZ_CP022905.1 | 660644-660665 | 0 | 1.0 |
NZ_CP022905_5 | 5.1|835634|22|NZ_CP022905|CRT | 835634-835655 | 22 | NZ_CP022905.1 | 786397-786418 | 0 | 1.0 |
NZ_CP022905_5 | 5.1|835634|22|NZ_CP022905|CRT | 835634-835655 | 22 | NZ_CP022905.1 | 897500-897521 | 0 | 1.0 |
NZ_CP022905_5 | 5.1|835634|22|NZ_CP022905|CRT | 835634-835655 | 22 | NZ_CP022905.1 | 1086559-1086580 | 0 | 1.0 |
NZ_CP022905_5 | 5.1|835634|22|NZ_CP022905|CRT | 835634-835655 | 22 | NZ_CP022905.1 | 1406349-1406370 | 0 | 1.0 |
NZ_CP022905_5 | 5.1|835634|22|NZ_CP022905|CRT | 835634-835655 | 22 | NZ_CP022905.1 | 1420883-1420904 | 0 | 1.0 |
NZ_CP022905_5 | 5.1|835634|22|NZ_CP022905|CRT | 835634-835655 | 22 | NZ_CP022905.1 | 1693725-1693746 | 0 | 1.0 |
NZ_CP022905_5 | 5.3|835751|22|NZ_CP022905|CRT | 835751-835772 | 22 | NZ_CP022905.1 | 170168-170189 | 0 | 1.0 |
NZ_CP022905_5 | 5.3|835751|22|NZ_CP022905|CRT | 835751-835772 | 22 | NZ_CP022905.1 | 295008-295029 | 0 | 1.0 |
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34. spacer 5.2|835692|23|NZ_CP022905|CRT matches to position: 2401700-2401722, mismatch: 1, identity: 0.957
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cctgtagaatttcttttcgaaa CRISPR spacer cctgtagaatttctttacgaaa Protospacer **************** *****
37. spacer 5.3|835751|22|NZ_CP022905|CRT matches to position: 2176840-2176861, mismatch: 1, identity: 0.955
cctgtagaatttcttttcgaaa CRISPR spacer cctgtagaatttcttttagaaa Protospacer ***************** ****
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40. spacer 5.4|835809|23|NZ_CP022905|CRT matches to position: 1086500-1086522, mismatch: 1, identity: 0.957
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ccaacacagagaatttcgaaaagaaattctacaa CRISPR spacer ccaacacaaagaatttcgaaaagaaattctacaa Protospacer ********.*************************
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tgggccccaacacagagaaattggattcccaat CRISPR spacer tgggccccaacaaagagaaattggattcccaat Protospacer ************ ********************
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tgggccccaacaaagagaaattggattcccaat CRISPR spacer tggaccccaacaaagagaaattgtattcccaat Protospacer ***.******************* *********
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tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer tctgtagaaattgggaatacaat Protospacer **************.*** ****
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ccaacacagagaatttcgaaaagaaattctacaa CRISPR spacer ccaacacagagaatttcgataagaaattccacaa Protospacer ******************* *********.****
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ccaacacagagaatttcgaaaagaaattctacaa CRISPR spacer ccaacaaaaagaatttcgaaaagaaattctacaa Protospacer ****** *.*************************
54. spacer 11.1|2412554|31|NZ_CP022905|CRISPRCasFinder matches to position: 70386-70416, mismatch: 2, identity: 0.935
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cacattattgtaagctgactttctgtcagct CRISPR spacer cacattattgtaagctgacttttcgtcagct Protospacer **********************..*******
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cacattattgtaagctgactttctgtcagct CRISPR spacer cacattattgtaagctgacttttcgtcagct Protospacer **********************..*******
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cacattattgtaagctgactttctgtcagct CRISPR spacer cacattattgtaagctgacttttcgtcagct Protospacer **********************..*******
62. spacer 11.1|2412554|31|NZ_CP022905|CRISPRCasFinder matches to position: 1899703-1899733, mismatch: 2, identity: 0.935
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63. spacer 11.1|2412554|31|NZ_CP022905|CRISPRCasFinder matches to position: 2401753-2401783, mismatch: 2, identity: 0.935
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64. spacer 11.1|2412554|31|NZ_CP022905|CRISPRCasFinder matches to position: 2577298-2577328, mismatch: 2, identity: 0.935
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP022905_5 | 5.2|835692|23|NZ_CP022905|CRT | 835692-835714 | 23 | AP014226 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S44-C3, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 28490-28512 | 3 | 0.87 |
NZ_CP022905_5 | 5.2|835692|23|NZ_CP022905|CRT | 835692-835714 | 23 | AP014225 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S41-C89, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 24653-24675 | 3 | 0.87 |
NZ_CP022905_5 | 5.4|835809|23|NZ_CP022905|CRT | 835809-835831 | 23 | AP014226 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S44-C3, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 28490-28512 | 3 | 0.87 |
NZ_CP022905_5 | 5.4|835809|23|NZ_CP022905|CRT | 835809-835831 | 23 | AP014225 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S41-C89, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 24653-24675 | 3 | 0.87 |
NZ_CP022905_10 | 10.1|2304512|34|NZ_CP022905|CRISPRCasFinder | 2304512-2304545 | 34 | JN882286 | Cronobacter phage vB_CsaP_GAP52, complete genome | 23034-23067 | 8 | 0.765 |
NZ_CP022905_10 | 10.1|2304512|34|NZ_CP022905|CRISPRCasFinder | 2304512-2304545 | 34 | CP030544 | Staphylococcus aureus strain ER04166.3 plasmid unnamed2, complete sequence | 7567-7600 | 8 | 0.765 |
1. spacer 5.2|835692|23|NZ_CP022905|CRT matches to AP014226 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S44-C3, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer actgtagaaaatggaaatccaac Protospacer ********* ***********.
2. spacer 5.2|835692|23|NZ_CP022905|CRT matches to AP014225 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S41-C89, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer actgtagaaaatggaaatccaac Protospacer ********* ***********.
3. spacer 5.4|835809|23|NZ_CP022905|CRT matches to AP014226 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S44-C3, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer actgtagaaaatggaaatccaac Protospacer ********* ***********.
4. spacer 5.4|835809|23|NZ_CP022905|CRT matches to AP014225 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S41-C89, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer actgtagaaaatggaaatccaac Protospacer ********* ***********.
5. spacer 10.1|2304512|34|NZ_CP022905|CRISPRCasFinder matches to JN882286 (Cronobacter phage vB_CsaP_GAP52, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ttgcatatctttagctttattgtttgcaactggg CRISPR spacer ttgcatatctttagctttatagcttttatatgct Protospacer ******************** *.** .* **
6. spacer 10.1|2304512|34|NZ_CP022905|CRISPRCasFinder matches to CP030544 (Staphylococcus aureus strain ER04166.3 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ttgcatatctttagctttattgtttgcaactggg CRISPR spacer ttgaataactttagctttattgttataaacagta Protospacer *** *** **************** *** * .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
398446 : 461407
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP022905|398446:461407|DBSCAN-SWA ATTAAAAGAATGGAATGATTTTACTCGCGTAAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCTTTGCACAATAAAGCCATTCAGGATGAATGCCACTATTAAGTATCTCTTGGAATTCTTGAAAATCTTTAGACCAATCAATATTTAAATTCATTCCTTACCACCTCACAACCATTATAGAACATGCGTTCGCTTTTGTGAAGTGTATTTTTAAAAATATCATAGAAAATTTCAAATGAATTAATGTCAAAAATGATATGAAGAGTAGTTTGAATTATTATTGTAAAAAGTAATGGCGCATGATATAATTCTTTATTGTGAGTAATGAAAATTATTCCTTGCTTATCTGTTTTAAGATTGATAAGCCGTATAGACCACAAGGAGGTGCAAATATAAAATGAGAACATATGAAGTTATGTACATCGTACGCCCAAACATTGAGGAAGATGCTAAAAAAGCGTTAGTTGAACGTTTCAACGGTATCTTAGCTACTGAAGGTGCAGAAGTTTTAGAAGCAAAAGACTGGGGTAAACGTCGCCTAGCTTATGAAATCAATGATTTCAAAGATGGCTTCTACAACATCGTACGTGTTAAATCTGATAACAACAAAGCTACTGACGAATTCCAACGTCTAGCTAAAATCAGTGACGATATCATTCGTTACATGGTTATTCGTGAAGACGAAGACAAGTAATAATTAGAGGGGGCGTTTAAATGCTAAATAGAGTTGTATTAGTAGGTCGTTTAACGAAAGATCCGGAATACAGAACCACTCCCTCAGGTGTGAGTGTAGCGACATTCACTCTTGCAGTAAATCGTACGTTCACGAATGCTCAAGGGGAGCGCGAAGCAGATTTTATTAACTGTGTTGTTTTTAGAAGACAAGCAGATAATGTAAATAACTATTTATCTAAAGGTAGTTTAGCTGGTGTAGATGGTCGCTTACAATCCCGTAATTATGAAAATCAAGAAGGTCGTCGTGTGTTTGTTACTGAAGTTGTGTGTGATAGCGTTCAATTCCTTGAACCTAAAAATGCGCAACAAAATGGTGGCCAACGTCAACAAAATGAATTCCAAGATTACGGTCAAGGATTCGGTGGTCAACAATCAGGACAAAACAATTCGTACAATAATTCATCAAACACGAAACAATCTGATAATCCATTTGCAAATGCAAACGGACCGATTGATATAAGTGATGATGACTTACCATTCTAATAAAAATTAACGAAATTAAAGCGAAAAAATTATCAAAGGAGGCACACAATCATGGCAGGTGGACCAAGAAGAGGCGGACGTCGTCGTAAAAAAGTATGCTATTTCACAGCAAATGGTATTACACATATCGACTACAAAGACACTGAATTATTAAAACGTTTTATCTCAGAACGCGGTAAAATTTTACCACGTCGTGTAACTGGTACTTCAGCTAAATATCAACGTATGTTGACTACAGCTATCAAACGTTCTCGTCATATGGCATTATTACCATATGTTAAAGAAGAACAATAATATATAACGTATAACAAAACCCTTTAGCAATCAGGCTAGAGGGTTGTTTTTGTGTTTATTTTTATAAAAATTTCGCAATTTTTTCGCAGAGTGTGAAAAGTTTGATGATTAAAATTAAAAAAACGGACAAATAATTGTCCGTCTTTGCGAGATATTAATCTCATATAATAGTTTGGTGAGGACTCGCCTCTATATATGTAAATGATAACTGATTATTATTTGTACGTCAATCTAATTGATTAGCTTATTTTTAATTTCATTATCTACTAATTTCATACTATCAAAATCGAGTTTCATTCTACCAGAAGGATCTTCAGCGTTAATTTTTAAAATTCTTAATTTGCTAATAGTTACTACATTCTGTGTGCAGGCAAATGTATTTTTATCAAATTTTTTATATTTATTAATAACTTCTCTAAGGTTATTAACTTTTGATTTTCTATCGTTTACATCAATTAGCAAATAATTAAACAAAGCAGAAAAATTTTTCGGGTCATTGTATAAATTAAATGATTCTACTATGTTTTTACTTTTATTAATTACTTCTCTTTCTGTAGGGAAGCGTGTTTTAATTGCAAAATCATCTAAATAATCTATAGTGTTTTGTTCCAAAGTGTTTTGTAAATTATTTTTATTAATAATTTCTATAACCGTAAAAATTACGTGATTTATAACGTCTAAATCAAATTCGATATTATCAACTGTCTTGTTCAAAATTGATAATGATGTTTTAAATACAATATTTTGTAATGGTAAATAGTGTTTTTTATTTTTTGAACTTAATGGTACAACTGTTACTAAAGAATTATATGGACTATCATTTTTGTTTAATACTATTCCAAAATGTCTGCCAGAAAATTCATGCCCAATATTGATGCCAAAATCTAAATATATAATAGATCCCCTTGAGAATTTTTTGTATTTTTTGTTTATATTGTTATTATGCTCCATATTAAACCAATATGATGTTGTCTCTAACCAATTTGGTAAAAATTTAAACTTTTTATTATCTGTGTTATATAACAGAATAAATACTCACAGCTTTATTTATTCTGTTATCCATCTAACTCCCTATCCCCTCTAATTTATTCATCATATCTTTTGCCATCTTATCAGTAACATGTGTGTATATCTCTAAGGTGGTTTTATAGTCCGAGTGACCTACACGCTCTTGTATCGCTTTTAGGTTAATTCCTAATTGCGCAAGTGTAGATATGTGTGTGTGACGTAATGTGTGCGTTGTCACACGCTTGTTAATTGAACTTATATCAGTAGCTTCTTTAATAATATTATTCACCTTATTTAAGTCAATAGGGCTACCAGCAGTGTTAGTAAATATATAACCTCTATCTATGAATTTATCATTCCACTGATTCTCTTTTTTATTTTCTAGCATGAGTTTTTTAAGTAAATTAATACTTTGAGCTGTGAGGCCTATTGTTCGATAACTCTTACTCGTCTTAGTCGTTTCTTTCACTCCAAATGCTCCAGTTACTACATCTGTAACCCAGTTAATTGTGCCATCAATCTCTAGTGTTTTATTCTCCACGTCTACATTGTCTGTCTTGATTGCTAGGAGTTCGCCAATGCGCATTCCATTGTTAATTTGAAATTCTACTAATGCTTTTACCATTTCATAGTTACGTTTACGCGTAGCATGACGCTTATGTTTAATTAGATAGTCGAAGCACTCTAGTAACTCCTTTACTTCGCTATCTTCTAAATAGTTATTACGTTTAGCTTGAAACTCGTTTCTGGTTTGGGCTTTCTTAGGTATATCTATTTTATCTAACACACTAATATCGTGCAGATCATAATATTTAAACGCATATTTGAAAACGGAACGAATAACAATAACAAGAGATTGAACATGGCCAATACTATGTGATTTAGCCCATTCATTAATGATGTTTTGTAAGTAGGTGTGCGTAATCTTGCTGATGAGTACTTTGCTATCAATAGCATTTTTAACTGTATTAGTATTACTTTTCTTTTCTTTAATAGTGGTTGGTTTCGAGCCTGAATGTGTCTTGTAATGCTCTAACCATTCATCGCACGCATCATGGAACGTTAAGTTTTCAAGTTGTTTCGTACTGTAATGTTTCAAACGTTGCTCAATTATTTTATTTAATTCTAATTGAGCGTCCTTTTGGCTACGTACATTATTCTTGTTACGTGTAACTGATACTGTTTTATACTTGCCAGTTAAAGGGTCTGTATAGCGCTCTAAATAGCGATAGGCCGTACTATTGTTTTTGGTGATTTCACGAACCCACATTTGTCATCCCTCCTTTAGATATTCTGTTTTTAAAATGTCTGAAATAAACAAGTAACTATCAAGTGTAGTACAAAATAGGCAAAGTTACGTATGTTTATAGGATTGTACGGTAGTAATATTTGTAGTATTAGCTTTAAGTATTTATTTTAGCGTGCTTTGTTCAGTTCTTTTTATCTAACTTATCATCTATATAATCGCTTAATTTTACTAATTGTTCCCAGTTTTCATTTTTATCTCTTAAAGTTTTTGTGTTCTCTTTTATAATAACTGATTTATTTTCGAAATAATTATTTAAAATTTTATCGATGTTATTTTTATCGTTATCCGTTAATCTAATGCCTTTGTAAAATTTATAATTATTAATATCTTGCAGATGAAAGTGCAAATCATTAATGCTAATGTTAAAAATTGTGAAACTCTTTTCGTTATTGTCATCAAAAGATATGAATTCTCTAGAATATGGTATATCCATCATTCTATCTATAATTTCCATTTTATTTGTTACATTAGAAACTTTGTTTAACTTAACTTTATTTTTCGTTATCTTAGCTATTTCATCAACATAAAAATTATACTCCTCATTAGTGTCTTTTATGTTCATTAAGTAACTTTCGATAAGTTTATTGCTTGGAAAAGATTTAACACCATTTTCAATGCCACTTATATGCCCTTGAGAATACTGCATTTGTTTACTTATTTCGCTTGCTGTCTTCCCTTTTTGTTTTCGGATAGACTTTAAAAATCTGCCTAATTCTTTTTTTAATTCATCATTTGATTCAACCATTGGCGACACCTCCGTATTTTTAATGATAAACCATGCATAAAAATAATACAATATTATTCTTGACATTCCTAAAAGAAGGTGCGATACTCTATTTATGCATAAAGGAATAAAAATAAATGCATATATTCTTAAGGTGAGGGGTGATTTTATGTTTATGACTGTAAAAGAAGTTGCTCAATTGTTACGTATAAGTGAACGCCATACTTATAAACTTCTTCAAAAAAACGTTATACCACATACTAAAATTGGCGGAAAGATATTAGTTAACAAAGAAAGGTTATTAGAAACTTTAGAAAAAAAGGAGGTTAAATAAATGCCTAGAACAAAGTTACAAGATTTTCCATCAAAAGAAAATACAGTTACAGAACCGGAACAAGTTGTAGTAAA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71 | Staphylococcus_phage(70.0%) | coat,terminase,transposase,integrase | attL 399982:399999|attR 416253:416270 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
765475 : 773296
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP022905|765475:773296|DBSCAN-SWA ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTTACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTACGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTGTTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTGCGGTTTTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTTGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCGTGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAACGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAGTAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCGAGTGGGACAACAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCGATGACTGGTACTAAACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAGCCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGCGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTTACTTATGTGCTCTACAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTATATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGGTAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCTGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCGCCTAAAGTTAATACAGAGGCAACAGCACCAACTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACTCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGTCAAAATAAGAGGAGGGCATTTTTTTAGGTGAGAAAATATTTATCTGAACTAGATAACACTATAAAACACTTCTGATATTTTGAACTAAGAATATCAGAAGTGTTTTATAGTTTTGGTATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTGTTATTATTTTCAGCAGTTTCATCTAAGCTATTAAATGTTGAAATAAACAACATAATACCACCAATGATGAAAATTGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATCGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATAAAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTACTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCCACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACGCATTGTGTAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCAGGTGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGTGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGATTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCCTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACAACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGGCTAAAGTTCACTAAGAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACAAGGAATGTGATGTGCAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP022905|765475:773296|769410_770124_-|WP_001062972.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_CP022905|765475:773296|770127_770547_-|WP_000941336.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NZ_CP022905|765475:773296|766530_767217_-|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >NZ_CP022905|765475:773296|767191_767665_-|WP_001037807.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >NZ_CP022905|765475:773296|768727_769312_-|WP_000604990.1|DBSCAN-SWA MILYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >NZ_CP022905|765475:773296|771567_772161_+|WP_000604514.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHIRFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NZ_CP022905|765475:773296|765475_766531_-|WP_000244415.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NZ_CP022905|765475:773296|772144_773296_+|WP_001217796.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQFESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >NZ_CP022905|765475:773296|768007_768448_-|WP_001093562.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAVASVLTLGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >NZ_CP022905|765475:773296|770548_771217_-|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
788085 : 801748
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP022905|788085:801748|DBSCAN-SWA CTTACAAATCATTGACAGTAAGTAACTGAATAGCATTTGGTATAACCTCAATATCAATAGGTGTTTCTAATGAAATTTCGCCATCAATATCAACTTTCATTGCTGGATCTGTTGTAAGTGAAATCTTTTTACCAGGTATATGCTCAATACCTTGAGTAATTTCATTCCAATTCATGCTATCACGCTTTTTAAAAATATCATTTAAAATACTGAAACTTTGTTCATTAAAAATGAAAGTGTTCAGTTCACCATCTTGAGGAGACAAATCAGTCAATGGTATACGACTACCACCAATGAATGGACCATTTGCTGTTAGTATCATGGTCGTTTCGCCAGAATATGTCTTATCATCTATTGATAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATGAGACCTAAGCCAACAAAGTTGAGTGCATATTGATTATTTATTTTAATTACATCGTATGTACCAACTTGTGCAGAAATCATTTGTTCACTAGCTTGTTTATGATTAGGTGCTATATTTAGCGTTTTTGTAAAATCATTAAAAGTACCGCCTGGTAAAATGCCAATAGGGAGTTGAAGGTCATGTGACATAACACCATTTATAAGTTCGTTAACCGTGCCATCACCGCCAAGAATAAATAATATATCTACATCTTTTGCATAGTTTTTAGTTTTGATTTCTTGGCAATATTTAATAATGTCACCTTCGTTTTCACTCAATTGAATAGAAAGATGCTTACAAATTGAACTTAATGCTGTTGTAACTTCCCCAATACCTTGATTAATATTTTTTAATCCACTGTGTTCATGGTAAAAGAGGACACCATGTGTATATTTATTTTCCATAGTTTAGCCTACTTTCTAAAAATTGGTTCATTAAATATATATACCCACTTTTAATTGTTAATACCAAAAATATGTTTTTAAATAGAGAAAATGGTAATAACTGACATTGATGTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAACGAGCATATTAAGCTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAAGGGGCTGACCCAAAAGTAGCTCCTATATGAAAAATAGAGGTCTTTCCATTTAGATAGTAGTGGAAAGACCTCTATTTATCTTTTGAAAGTGAATACAAAAATAAAGCACACTCTGCTATAATATAGGTGATTAATCCATTTGAGAGAGGTGCTTTATCATGTATCAAAATTATACCATAAACCAACTTTGTTTGCCTATAGATCTTGAAATTAAATTAGAAGAAAATGATTTTGCTCATGCCATTGTGCAGTTTGTTGACTCTATTCCCGATGAAGTCTTTCTTCCTTATTATCAATCTATGGGTAGACCCCAATATCATCCTCGTATGCTACTTTCCATTATTCTTTGTGCCTATATTCAAGGGGTTTATTCGGGCCGCCAAATACAAAATATGCTGATAGATAGTATTCGGATGCGCTACTTATCTCAAGAGCAATTCCCTAACTTTCGTACTATTAATCGTTTTCGCGTTCATCCGATTATGAACGATATTCTAGATCATTCATTTGTTCAATTTCGTGAGCTACTGGTTCAAAGTGGCTTAATCAGTGGCAGTGCTCTATACATTGATGGTACAAAAATTGAAGCGGATGCGAATAAATACTCTTTCGTTTGGAAAAAAAGTATTTTAAAGTATAAGGATAGCCTTGATCAAAAAGCCCTTGAAAACTACCAACAAATGGTGGAAACAAAAATCTTACCTGAGTTAATAGATGATTTAAAGGATGAACTTTCTATAGAAGAGATTGAAAGGATTCGTCAATCTTTGGAAGAAAAGGAAAATCAATTAATTGAAGCGATTGACCAAACCGAAACAGTAGAAGAACGAAAATTACTTCGTAAAGAAAAATCTGAAGTTCATAAGCAGAAGAAGCGATTCGATGATTTTGCCCAAAGAAAAATGAGCTACGAAGAACAATTAGTGATTATGGGTGTACGCAATAGTTTCTCAAAGACGGATCATGACGCTACTTTTATGCGAATGAAAGAAGATCACATGCTTAATGGCCAACTAAAACCAGGTTATAATATTCAACTTGCGACAGAAAATCAATTTGCTCTTGCTTATGATTGTTATCCAAATCCAACAGATACACGAACATTTATCCCATTTCTTGAAAAGATTGAATCAAAAATAGGTTTACCAGAAAATATTGTCGCAGATGCCGGTTATGCAAGTGAAGAAAATTATTGTTATGTGTTAGACGAAACAGAATCCACCCCCATCATTCCGCATCAAGGTTACTTAAAAGAGAAGAAACGCGCCCATAAACAAAATCAGTTTCATCGAGATAATTGGACTTACAACGAGTTGGATGATTACTATATTTGTCCCAATCAGAAAAGAGTAGTGTTCTCACATTATTCACAACGTAAAGATAGAAATGGATTTATTCGAAACTTCAAAATCTATGAATGTGAAGATTGTACAGGATGTCCATTGAGAGAGAAATGTACCAAAGCAAAAGAAGGAAAAAATCGACGTTTGAATATTAATCCAACCTGGGAATATATAAAAATAAAAGCGAATGAAAAGATAGAAAGCAAAGAAACAGCCTCATACTATGCGCAGCGAAAGATAGATGTCGAAACAGTTTTTGGAAACATTAAACAAAATATGAAATTTAAAAGATTCCATGTCCGAGGAGCTGAAAAAATTTTTAAGGAAATGGGACTTGTATTTCTTGCGCACAATTTTAGGAAATTAGTAACTAGAGTAAGGAAATATGAGGGAAAAACAATCATACAAAACCAAATATAGGGGGAAAATCCTCTATATTTCATCCAAAAAAAACAAAAATCGAAGACATCTTTCACGGGTGCCTTCGATTTTTTGGTTCAAAAGGGACTAATGGGTCAGCCCCTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGAATGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAATTTGTTTGACCTAGTGGTTCTATTAACTTAACTAAAGTACCATTGATTGCTTGTGCAGAAGCGTTAGTTAAGTACCAAATACTCATCATTTGGGCATTAAATGCTTTAGGTGCTAACTTAACAGCAGCACTATTACCCGTTGGTGATAAGCATAGCTCACCGATAACACAAATAATGTACGATAAAATAACCCAGTTAACTGAGAAGTTTGATGAACCTGATGCATAACCTACAATACCAATTAGTATGTATGACGCACCTGCTAAGAACGTACCAATTGCAAATTTTACTGGCAGGCTAGGTTGTTTAGTTCCAAGCTTTTGCCATAAAAGTGAAATAATTGGAGCTAATAATAAAATAAATAATGGGTTAATTGATTGGAAGATCGCTTCACCAAAGTTTGTTTTCCAACCAAATAAGTTTAATTTCATATCTGAATGTTCAATTCCATATATGTTTAATACATTAGACCCTTGTTCTTGAATAGCCCAGAACACCATTCCAAGAATAAATAATGGAATAAATGCTTTAACACGAGAACGTTCAGTATCAGTGACATCTTTACTTCTAATAATTAAAGTGAAGTAAATGATTGGTAATGCAATACCTAATACTAAAACAGTATTACTAACTAAGTTAAATGATAATGAGTTAGTTAATGCACCAATAACGATAATTAATACAATTGCTAAGACAACACTTCCGATAATAAGACCATACTTTTTCTTTTCAGCTGGTGTCAATGGGTTAGTAGGTTTCATACCAACGCTACCTAAGTTTTTGCGGTTGAAAAGTACATACCATACTAAACCTAATGCCATACCAACTGCTGCAATCAAGAATCCGCCGTGGAAGTTTTTAACATTAACAAAGTGTTGCAAAATAATAGGTGATAATAATGCACCCATATTAACTGACATATAGAAAATAACAAAACCTGCATCCATACGTCTATCATTTTCAGGATATAAACGGCCAACGATATTTGAAATGTTTGGCTTCATTAAACCTGAACCAATAATGATGAAGAACATTGATGTGAATAAGCCGATTAATGCAAATGGTAAGCTTAAACAAATATGTCCGATAATAATAAAGACTGCACCTAATAAAGTAGCGCCTCTAGTGCCTGTAATTCTGTCAGCAATCCATCCGCCTGGTATTGATGTCATATAGATTAATGAACCATAAACTGACATAATTGACATAGCTGTTGTTTTATCAATTCCAAGGCCATTATCTGTTACGGCAAAGTACATGTAGAAAATGAGTAGGGCACGCATGCCATAATAACTAAACCTTTCCCAGAACTCTACAAAGAAGAGTACGCCTAGTCCTCGAGGATGCCCGAAAAATCCTGTTTGAGGTATGTCTTGAATTTGATTTCCATGGGAGTTTTGTTGTGTCATGTATACATCCCATCCTTTCTTCCCCTAATACAATAGTTTAAGTAAATTTGATTGTGCCTTATCAACTAAATATTCCAACAAATCACAAAAAAATAAAAATATTGAGAATATTCTGTTATTAAGCGCGCACAATTAATTAGAGATAATATAAAAATATACTTATTGACGTTAAAGTGCAATAGGTTTCTATAAAAATGTTGTTTAATTCGTGTACTAATATTCTTTTGGTGTACTTTGGTATAAAATGTTATTTTAATGTAACCTATTATGTATGCTAAATGAAAAACACACCAATAAGTTAGGAAAATCAACTTATTGGTGTGTTTATTAAATGATACATTTAACGATTATCTATTTTTTCGGGATATAAATCATGATTCATCAAACGATGCTCAGCCATTTTTTCATATTTAGAATTTGGACGTCCATAGTTTGTATAAGGATCAATAGAAATTCCACCACGTGG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP022905|788085:801748|791112_792618_-|WP_000193751.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NZ_CP022905|788085:801748|795145_795544_+|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_CP022905|788085:801748|795506_797612_+|WP_000855514.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSISFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_CP022905|788085:801748|797729_798701_+|WP_000562498.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_CP022905|788085:801748|800033_800990_+|WP_001245577.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >NZ_CP022905|788085:801748|792958_793459_-|WP_000930014.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_CP022905|788085:801748|789381_790986_+|WP_000284571.1|transposase|DBSCAN-SWA MYQNYTINQLCLPIDLEIKLEENDFAHAIVQFVDSIPDEVFLPYYQSMGRPQYHPRMLLSIILCAYIQGVYSGRQIQNMLIDSIRMRYLSQEQFPNFRTINRFRVHPIMNDILDHSFVQFRELLVQSGLISGSALYIDGTKIEADANKYSFVWKKSILKYKDSLDQKALENYQQMVETKILPELIDDLKDELSIEEIERIRQSLEEKENQLIEAIDQTETVEERKLLRKEKSEVHKQKKRFDDFAQRKMSYEEQLVIMGVRNSFSKTDHDATFMRMKEDHMLNGQLKPGYNIQLATENQFALAYDCYPNPTDTRTFIPFLEKIESKIGLPENIVADAGYASEENYCYVLDETESTPIIPHQGYLKEKKRAHKQNQFHRDNWTYNELDDYYICPNQKRVVFSHYSQRKDRNGFIRNFKIYECEDCTGCPLREKCTKAKEGKNRRLNINPTWEYIKIKANEKIESKETASYYAQRKIDVETVFGNIKQNMKFKRFHVRGAEKIFKEMGLVFLAHNFRKLVTRVRKYEGKTIIQNQI >NZ_CP022905|788085:801748|800986_801748_+|WP_000616840.1|DBSCAN-SWA MIQVENLTKTINNQMILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDNGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMNIQIEHIRNQRICLYFKD >NZ_CP022905|788085:801748|798881_799037_+|WP_000499195.1|DBSCAN-SWA MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLWSKNATINEKYYQ >NZ_CP022905|788085:801748|789093_789195_+|WP_031760357.1|DBSCAN-SWA MVITDIDVYRVGRENIVIAVYNEHIKLLFILIS >NZ_CP022905|788085:801748|788085_789003_-|WP_000429006.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMSHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_CP022905|788085:801748|793478_794345_-|WP_001068501.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFLYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSSREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFVLFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NZ_CP022905|788085:801748|799075_800047_+|WP_000876318.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ |
13 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
852600 : 869562
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP022905|852600:869562|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP022905|852600:869562|857938_858145_+|WP_001060953.1|DBSCAN-SWA MNNKVSNYRRYIGLTQNQMANNLKISVTAYRNKERGITPFKDSEKVFIKNKLIENGIKDITIDDIFFN >NZ_CP022905|852600:869562|852600_854973_+|WP_115349518.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP022905|852600:869562|859501_861118_+|WP_115276802.1|DBSCAN-SWA MDEVSLYKKHFEFHSKLDYVSTINLSRIKEISKRINFASISTDRQVFNNKGNAYHREKDNVAGDYISNLTLDYTIKPKEIGLVYGTVNIKTVDKNGEEEKQSTFKTSHFHNYARFIADLISDRVIYSKQLDCFIIVKNNQYEVIDNTNFALTYPVDNKYYIDDFLDVMLELYREHLNVTHNFKIYPYCIAGNDWVYDCQNLTLTEQKLKSDELYSIKYDVDIKDINLEIPRNFFDLVTDNKKSKNNLMLTHAYTMYRKMKLIQAEKWFLLKDFGRSGKGLFMATFEKLMTVNKVNFDSLISGGFESANEWMNFYGADIAHANETGEITKQMMRILRKIATGETISGRGIGRNAFTFKNNAVLILDTNESVDTGEITANTTRTVKISLKDRPINETDEERYQIFKPYWDFIQPNGNTSVNASVSFLITSLEYLKENGREFKFKDVTLKYYFNEDELTETQITMIRLLSKQGFILAGDETLQRLIERDYSSLRYKNAKEDMRKIGISINNQKKIDGVNTKVHKVGNIELFNMALELISEH >NZ_CP022905|852600:869562|862083_862356_+|WP_001149387.1|DBSCAN-SWA MQAVKEDYNLDEQAQRIGLITGISNEIYYCSISYLSTVYLEYIDNTWTAWRESYIPKLNKRTSYKVIASGSFELVLARLKSYLNYIKRSK >NZ_CP022905|852600:869562|863801_864380_+|WP_000846280.1|DBSCAN-SWA MKTESYFKEYNQFVIDQQKAIQELEQERNALESKIKIDKSTYKQLIMDGQDDKADNLYQATDADEKKLKALNKRLETKKSVSKEVKYQKTIELLKHQSELSSLYESEKQSALGKLKKVVDAYNEIIDEIEDINDRYEDEHQQYASIYSQEQLYDDKEAREALNGYFRENIFTSYINGNDLPYEHNNKLFLKR >NZ_CP022905|852600:869562|868389_869562_+|WP_000195429.1|transposase|DBSCAN-SWA MTQVHFTLKSEEIQSIIEYSVKDDVSKNILTTVFNQLMENQRTEYIQAKEYERTENRQSQRNGYYERSFTTRVGTLELKVPRTRDGHFSPTVFERYQRNEKALMASMLEMYVSGVSTRKVSKIVEELCGKSVSKSFVSSLTEQLEPMVNEWQNRLLSEKNYPYLMTDVLYIKVREENRVLSKSCHIAIGITKDGDREIIGFMIQSGESEETWTTFFEYLKERGLQGTELVISDAHKGLVSAIRKSFTNVSWQRCQVHFLRNIFTTIPKKNSKSFREAVKGIFKFTDINLAREAKNRLIHDYIDQPKYSKACASLDDGFEDAFQYTVQGNSHNRLKSTNLIERLNQEVRRREKIIRIFPNQTSANRLIGAVLMDLHDEWIYSSRKYINFDK >NZ_CP022905|852600:869562|866911_867208_+|WP_000523349.1|DBSCAN-SWA MGLKLKEYINDSNRKLDKETVRKHLVDILNYTVEENSFLDQMTVGKRLYSNQYKNSPSVSLTVNHKIKINEVTSDFSYKFSDNETQTFNLSNELGVVA >NZ_CP022905|852600:869562|863448_863790_+|WP_001190606.1|DBSCAN-SWA MQSIAEKETYHLPTEHLQVFNVIKNTSNKYITKTKILNQLGYEYNSSNERWLRRVINSLVYDYGYPIGCSYKPSERGYYIFTTEQEKQQAMRSIKKLADGSMKRYEALKRIKV >NZ_CP022905|852600:869562|864397_864616_+|WP_000448770.1|DBSCAN-SWA METKYELNNTKKVANAFGLNEADTNLLINAVDLDIKNNMQEISSELQQSEQSKQKQYGTTLQNLAKQNRIIK >NZ_CP022905|852600:869562|864666_865194_+|WP_000771370.1|coat|DBSCAN-SWA MKLLKTKNCLYYRNGDNKLSEYQLLTQFNPAFINKKIKMCEFQIESMYHMSASTTTCDEIMGVVSVSYPIEKLVIKIIETKAGLQNYKNRSINNTALLKKVLNHYTEKEQKQVVKYMRSNGRYKPYNVIERLQVDLYQASIKQRSERQKQRNTAIENSKIARVNAYHQSSYVKVV >NZ_CP022905|852600:869562|862357_862999_+|WP_001019773.1|DBSCAN-SWA MNIETIVNQFETRAGTLLRYYTGLLEHSKVQPCCFKLYNDPFDMVYVMMNSKLFGHVYIKDCKVRQSFELASPKHTEGLIRSIEGHYVGYELHDGKHLSISDMMASHLFEDEYFMYGLQTYAESNNSDVFEYLENGFDTDTLEGIQSSNTDVIANIEMLYQLATGINEPEPELVEGLKLVTEFIQDENATQEDYKALERKLNDLKASYYSLSK >NZ_CP022905|852600:869562|858544_858748_+|WP_001231376.1|DBSCAN-SWA MRKQVIITKTVVGWYNIKDTQHNLMLNIPPKVFEQYFPDVSKDVQVACLEMDLSKITEIKNKKKVGS >NZ_CP022905|852600:869562|857133_857781_-|WP_072474260.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP022905|852600:869562|858180_858408_+|WP_000164237.1|DBSCAN-SWA MTKLTYPMLYITRKEKGDTQKKVASKLGISPQRYQLKESGKAIFNLNECQILSEMYDMPIDELFSSKIKVEGSRQ >NZ_CP022905|852600:869562|858749_859133_+|WP_000403833.1|DBSCAN-SWA MEIKQKYQLSKVVKILEVVLYEEDKFKSDKDYHYQDKAFYEYALKLVHNGLFNILAELDFEDEAFLILDEVTMTLSDVMKETQHVYRYSVIDEKGEHKHTTDRKGHVIGMLEWALDYIVGNIEVEEL >NZ_CP022905|852600:869562|858404_858578_+|WP_000784892.1|DBSCAN-SWA MKMYLTYICLVSLLTILLLAISNMYVAFSVYGMMVTYGFNLTGEITTCENKLLLQKQ >NZ_CP022905|852600:869562|856021_857128_-|WP_000121223.1|integrase|DBSCAN-SWA MSYNLNLSHNIYKDAKLGTYYFRITYYDKSNTRKYITRKGFKQRKDAVKKCNEMMDELEGVGHLNRLPFDKLVEEYIDWYSARRKTSSVKALKTHTNNHLLPYFKSMDVFKMTTQDVMKFQNKKLKEGHSGDYLKKMHVYLVSLLNHAMKFHELKQNVASLVGNFEIESQKRLNYWTLEQFNQFYEALATQQQKLFFKLLFYSGARKGEIRALTWRDINFDDDFIHINKTDYHGEVTAPKTKSAIRDIYLPTHMMYDIKDYLIWYKENNIYKDDYVLFGTFYKAYSESTIDRWFTNALKVLDEQLPNGQNFPRIVIHELRHSHASMLVNLGASVMIIAQRLGHSDTTEVYNRYGHLYPSTQKEIVKYL >NZ_CP022905|852600:869562|861293_862097_+|WP_000148368.1|DBSCAN-SWA MTGYHVAKHLLSKNIEVIPLNNHKKPTVSFADIDITDEFVEYHSNIYHQTNVLGVLTRGVWCIDIDVDHEDGKNGFDSLKQIPYYEELVTNAQNTLVQTTASGGKHIIFKKHDNIEYGQKIGYLPSVDIKAHPNNYFVLAGSQTAKGIYTHNGVNVTEYQGEFEKRIFSKAGNYKQQVLEPYSIRRALPNYSFSHVRVGKGGEGKRAYQRIIDGQSEYRNNDLYKAVSYAIQCNVDIEPLRVLIGDNKNGDVFTERDWEATVRSASR >NZ_CP022905|852600:869562|854994_855459_+|WP_001085183.1|DBSCAN-SWA MAKKKSPGTLAENRKARHDYNIEDTIEAGIVLQGTEIKSIRRGSANLKDSYAQVKNGEMYLNNMHIAPYEEGNRFNHDPLRSRKLLLHKREIFKLGEQTREIGYSIVPLKLYLKHGHCKVLLGVARGKKKYDKRQALKEKAVKRDVARDMKARY >NZ_CP022905|852600:869562|865196_865538_+|WP_000358778.1|DBSCAN-SWA MDKKQIKDFVCDYHKRTRSDVLIDDEINTDEFFSIGDENSNEWMADDNIDDHIVKNHLEMIVDQVANDKEFYIFDSLIQGRSFKDISNVLECSEQSVRLWYETLLDKIVEVIE |
24 | Staphylococcus_phage(81.25%) | coat,terminase,transposase,integrase | attL 853972:853987|attR 861370:861385 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
977807 : 1062492
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP022905|977807:1062492|DBSCAN-SWA ATTATGGAATAAAAATGTGATATATAAAATTCGCTTGTTCCGTGGCTTTTTTCAAAGCTTCAGGATTAAGTAATTGGAATATAACGACAAATCCGTTTTGTAACATATGGATAATAATTGGAACAGCAAGCCGTTTTGTCCATACATATGCTAATGAAAAAATGACGCCCATACCAAAATAAACTGGAATAAATTTGAAATCATTATGTGCTAATGCAAATATTAATGAACTTACTGTTGTAGCAATAATAAATGCTACGATACGATTACCTTTAATCGCATTAAATAATTCTCCAAAGATTACTTTTCTGAATACGTATTCTTCTAATAAAGGACCGATAATAGATACAAAGAAGATAAATATAGGTATTTTTCGAGCAATAATAATTAGCTTTTCTGTATTAGGACTTACTTGTTGTCCACCATAAATTTGCGTTAATACAATGCTCACTACCATTTGATAAATCATTACCAATGCAAATCCAAGCAATGCCCATGGAATGATATATTTTTTAGGTTCTTTAACTTCTAATTCTAATTTTGTTGGATTTTTAATTTTTAAATTAATTAAAATAATCGTCGTGGCGGCGATTAAAAATAGAACAAGTTGTATGTAAATGACTGCTTTAGTCAGTTCTATGCCACTATATTGTACAAATGGTAATTTTTTTACAATGAGAAGCGGTAAAAATTGAGACAATATATAAATAATAACAGTTAGCAATGATGCCCATAATCTTGTCATAATTTTCCTCCAAATATTTGTTTATAATTTATTTTATCGTAAATAACTTGAAGTTACAAAACTTAATTAAAAGGTTATGACTTGAAATTTTGACCAAATTTGATTATTATAAATGTATGTTAGCACTCTTTAATGTTAAGTGCTAAACTTTAGGTTTTTTAAGGAGGAACAATCATGCTAAAACCAATTGGAAATCGTGTGATTATTGAGAAAAAAGAACAAGAACAAACAACTAAAAGTGGTATTGTTTTAACTGATAGTGCTAAAGAAAAATCAAACGAAGGCGTTATCGTTGCAGTAGGAACTGGACGTCTATTAAATGATGGTACAAGAGTGACTCCTGAAGTGAAAGAAGGGGACCGTGTCGTGTTCCAACAATATGCTGGTACAGAAGTTAAACGAGATAATGAAACATATCTAGTATTAAATGAAGAAGATATTTTAGCGGTAATTGAATAATATAAAATTAAATTCATAGATAAATTGTAAAGAACGAAAATGAAATATGACTAAACAAATGGAGGTTTATCATTTATGGTTAAACAATTGAAATTCTCTGAAGATGCACGTCAAGCAATGTTACGTGGTGTAGACCAATTAGCAAATGCAGTTAAAGTAACGATTGGTCCTAAAGGACGTAATGTTGTATTAGATAAAGAGTTTACAGCACCTTTAATTACGAACGATGGTGTAACGATTGCTAAAGAAATCGAATTAGAAGATCCATATGAAAATATGGGGGCTAAACTAGTTCAAGAAGTTGCAAATAAGACAAATGAAATTGCTGGTGACGGTACGACAACTGCAACAGTATTAGCTCAAGCAATGATTCAAGAAGGCTTGAAAAATGTTACAAGTGGTGCGAACCCAGTTGGTTTACGTCAAGGTATCGACAAAGCAGTTAAAGTTGCTGTAGAAGCATTACATGAAAATTCTCAAAAAGTTGAAAATAAAAATGAAATAGCGCAAGTAGGTGCGATTTCAGCAGCAGATGAAGAAATTGGACGTTATATTTCTGAAGCTATGGAAAAAGTAGGTAACGATGGTGTCATTACAATTGAAGAATCAAATGGACTAAACACTGAACTAGAAGTGGTTGAAGGTATGCAATTTGATCGTGGTTATCAATCACCATATATGGTTACTGATTCAGATAAAATGGTTGCTGAATTAGAACGCCCATACATTTTAGTAACAGATAAGAAAATCTCGTCTTTCCAAGATATCTTACCTTTATTAGAACAAGTGGTTCAATCTAATCGTCCAATCTTAATTGTAGCTGATGAAGTTGAAGGCGATGCATTAACAAATATCGTGCTAAACCGAATGCGTGGCACATTTACAGCTGTTGCAGTAAAGGCGCCTGGTTTCGGTGATCGTCGTAAAGCAATGTTAGAAGATTTAGCTATTTTAACTGGTGCGCAAGTGATTACTGATGATTTAGGCTTAGATTTAAAAGATGCATCAATTGATATGTTAGGTACTGCAAGTAAAGTAGAAGTAACTAAAGATAATACCACTGTTGTTGATGGTGACGGTGACGAAAACAGCATTGATGCACGTGTAAGCCAATTGAAATCTCAAATTGAAGAAACTGAATCTGACTTTGATCGTGAAAAATTACAAGAGCGCTTAGCTAAATTAGCAGGTGGTGTTGCAGTTATTAAAGTAGGTGCAGCAAGTGAAACAGAGCTTAAAGAACGTAAATTACGTATTGAAGATGCATTAAATTCTACACGTGCAGCAGTTGAAGAAGGTATTGTTGCAGGTGGTGGTACTGCATTAGTAAATGTTTACCAAAAAGTAAGTGAAATTGAAGCAGAAGGTGACATTGAAACAGGTGTAAATATTGTACTTAAAGCACTAACTGCACCAGTTCGTCAAATTGCTGAAAATGCAGGATTAGAAGGTTCTGTTATTGTAGAACGTTTGAAAAACGCAGAGCCGGGTGTTGGTTTTAACGCTGCTACAAACGAGTGGGTTAATATGTTAGAAGCAGGTATCGTTGATCCAACTAAAGTAACACGCTCAGCATTACAACATGCTGCAAGTGTTGCAGCAATGTTCTTAACGACTGAAGCGGTTGTAGCATCAATTCCAGAAAAAAATAATGACCAACCTAACATGGGTGGCATGCCGGGAATGATGTAAAACAGTTTCTAGTTTTGACTAACTAGAACATTCCATGATAGACGAGTATGATTCGTTCCAAATAAATATTAGAGCGTATGAAAATATTTTAATTTAAGACACCTTCCATTAGTTGACTAAACTTATGAGAGGCGTCTTTTTTATGTGCTAATTTGTAATTGAGATTCATAATGGTATTTAAATCATTATGGTGCGGGAGTTATGGTATTGCCATAATATGAGAGTGCATCCACTTCTATAAGTAATGCATATTGCGAGTGCAGGAATGAATGAGTGCTTGATTAAAATCCTTATGGGTGGTTGACATAATTAAAAGAAACCACATTTAAAATTTCTTAATCACAAGCGGTTAACTAGGTATAGTTTAGTTTTGAGTAAATCTTTTTAAAGGTGTACTTGTGCATTTTACTTAATTAAAGAGATAAGACATTTAATGGGCCTAAAATAAATAAAAAACAAAAAACTACCTGTTTAGGTAGTTTTTTAAATGTAATAGATTAAAACACTAGTTCATTTCTTGTTAAAGATGGATAGTTATTTTATGGTTCTTCATCTTTTATGGTGGGAAGGTAAAACTTCCTGCTTTTTTTAATACACAAAAAGCGCAATTGCCTCTATAATTTAAAGTGACCAAACCCAAACTAAAGGAGACAAGTGCGCCTATGTGTAATGATACCTTAGAATTACTAAGAATAAAAGATGAAAATATAAAATATATAAACCAAGAAATTGACGTCATTATCAAAGGAAAAAAAGCAACAGTGGTTAATGCTGTACTAACGTATAAGCCTTCGGCCTGTTATTGTTGTGGAGTTAAAAATGAAGGACAAATTCATAAACATGGTAAGCGTGTTTCTCGTATTACTTTACTTAAAACTCAAGGGTATAACACATACCTCAACTTAGCTAAACAACGTTTTAAATGCTTAGAATGCAATGGCACTTTTACTGCTAAAACGTCAATTGTTGATGAGTCGTGTTTTATCTCAAGATGTGTTACTCAAAAAGTTATAGAAGAAGCTACTAAAGTTAAAACAGAGATTGATACTGCAGAAGATAACTGTATCTCTCCATCTACTGTAAGTCGTATTAGAACTAAAGCGGCTAATTCATTACGAATTAAACCGTTTAATTGTTTGCCAGAACACATCGCTATGGATGAATTTAAAAGCGTTAAAAATGTAACTGGATCAATGAGTTTCATTTTTATAGATAATGATACTCATGATGTTATAGATATTTTAGAAAATAGAACTACAAGATTCTTGCGTGCCTATTTCGAGCGATTCGATTTAAAAAATCGACAACAAGTTAAGACGGTTACTATTGACATGTATGAACCCTATGTCCGATTATTTCGCGACCTATTTCCTAATGCAGCTATTATTTTTGACAGATTCCATATCGTTCAACATTTAAATAGGGAACTTAATAAGTATCGTGTACAAGTTATGAATGAATACCGTAATAAAAAAGGACCTAATTATACAATTTTTAAGAATAACTGGAAAGTTCTATTGATGGATACTAGTAAAACCATATTTAGTAAATACAGATGGAATAAATCTTTTAAGGCTTATAAACGCTCATCTGACATTGTAGAATTCATGCTTTCAAAAGACGATATACTACGACGCTCCTACGAACTTGTCCAAGGATTAAGAAAAGATCTAAGGTTATGTAATTGGCCTAAATTTATTAATCGTTTAAATTCAGTTAGTAAAAAGTCTGTGAGTAAAGGTGTATGGAAAGTGGTTAAATATTATAGAAAACATCAAAGGATGTTAAGAAATACAATTTATTACCCAGCATTTAATAATGGTGCTATAGAAGGAATTAATAATAAGATAAAATTAATCAAGCGAATTTCTTTTGGTTACAGAAATTTCAACAACTTTAAAGCACGTATAATGATGATTTTCAGCTTATACAAAGGAGAAAAAAAGAAGACAACCAAGCCCAATAATGGACTGGCCGCCTAATAATAAAAACTCTAAAAGTTGTAATTTAAAATAGTTCTTTAAATTATATACCCACCACATTTGGTGGAGAACCTATTTTATAGATAAATTTGTCCTTTAGTGTAGCGGTAATTTTTAGGACT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107 | Staphylococcus_phage(90.79%) | tail,integrase,terminase,portal,protease,capsid,transposase,head,holin | attL 989503:989520|attR 1014041:1014058 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1122543 : 1232375
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP022905|1122543:1232375|DBSCAN-SWA 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102 | Staphylococcus_phage(92.86%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1362266 : 1371309
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP022905|1362266:1371309|DBSCAN-SWA CATGAATGAGCGTATGGTTGATCAATCAATGCATAGTGAAGAAACTGATTTCGAATTGTCGCTTAGACCTACGAGATTACGACAATATATTGGTCAAAATTCAATAAAAAGTAATTTAGAAGTATTTATTAAAGCGGCTAAACTTCGTCATGAACCATTAGATCATGTATTGCTTTTTGGCCCCCCTGGATTAGGTAAGACAACATTATCTAATATCATTGCCAATGAAATGGAAGTTAATATACGTACAGTATCAGGGCCTTCATTAGAAAGACCTGGTGATTTGGCTGCAATTTTATCAGGACTTCAACCTGGAGATGTATTGTTTATTGATGAAATACACAGACTGAGTAGTGTTGTTGAAGAAGTGTTATACCCTGCAATGGAAGATTTCTTTTTAGATATTATCATTGGTAAAGGCGATGAGGCTAGAAGTATCCGTATCGACTTACCTCCATTCACTTTGGTAGGTGCAACAACGCGAGCTGGCAGCTTAACAGGTCCACTAAGGGATCGATTTGGTGTGCACTTAAGATTAGAATATTATAATGAATCAGATTTAAAAGAAATCATTATTAGAACAGCTGAGGTTTTAGGCACAGGTATTGATGAAGAAAGTGCCATTGAACTTGCTAAACGTTCTAGAGGGACTCCAAGAGTAGCAAATCGACTATTGAAGCGGGTAAGAGACTTCCAGCAAGTGAATGAAGATGAACAAATATACATTGAAACAACGAAGCACGCATTAGGTTTACTTCAAGTTGATCAACACGGACTAGATTACATTGATCATAAAATGATGAACTGTATTATTAAGCAGTATAATGGTGGACCTGTTGGTTTAGATACGATTGCCGTAACAATTGGTGAAGAACGTATTACAATTGAGGACGTTTATGAGCCATTTCTTATTCAGAAAGGCTTTTTAGAACGTACGCCACGTGGCAGAAAAGCAACACCATTAGCTTATGAACATTTTGCAAAGTCGAATGAGGAGAGAGGATAACGTGAATATTGAAGAATTTGACTATGACTTACCAGAATCATTAATTGCTCAAACGCCTTTAAAAGATCGTGATCATAGTCGTTTATTAGTCATGGATAGAGAAACTGGTGAAATGAAACATTTACATTTCAAAGATATCATTGAGTATTTTAGACCTGGTGATACATTAGTGCTTAACGATACGCGAGTAATGCCAGCTAGACTTTTTGGTTTAAAAGAAGAAACTGGTGCAAAAGTTGAAATGTTAATGTTAACTCAAATTGAAGGTAATGATTGGGAAGTCTTACTGAAACCAGCTAAGCGTATTAAAGTTGGTAATAAATTGAATTTTGGTAATGGCAAAATTATAGCTGAGTGCATAAAAGAAATGGATCAAGGTGGACGCATCATGCGTTTACATTATGAAGGTATTTTACAAGAAAGATTAGATGAATTAGGGGAAATGCCACTGCCACCATACATCAAAGAACGTTTAGATGATCCAGATCGTTATCAAACAGTTTACGCTAAAGAAAGTGGTTCAGCGGCAGCACCAACAGCAGGATTACATTTTACTGATGAGTTATTAACTGAAATTAAAAATAAAGGCGTTAATATCGCATTTGTTACATTACATGTTGGGTTAGGTACGTTTAGACCGGTGAGCGTCGATGATGTGAATGACCACGAAATGCATAGTGAATATTATCAAATGACACAAGAAACAGCTGATTTATTAAATGATACTAAGTCCAAAGGACATCGCATTATATCAGTTGGTACAACTTCAACACGTACACTTGAAACAATTCGACGCGATCATGATAAATTTGTTGAAACGAGTGGCTGGACTAATATATTTATTTATCCAGGATTTGATTTTAAAGCAATTGATGGCCAGATTACTAATTTTCATTTACCAAAATCAACATTAGTTATGCTAGTATCAGCGTTTAGTACTCGTGAAAATGTTCTGAATGCTTATAAAACAGCAGTAAATTTAGAATATAGATTCTTTAGTTTTGGCGATGCAATGTTAATTATATAAAAAGAATGTGAGGATTTTGAATATGCCTGCAGTAACATACGAACACATTAAAACTTGTAAACAATCAGGTGCGCGTTTAGGTATCGTGCACACACCACACGGTTCATTTGAAACACCTATGTTTATGCCAGTTGGTACTAAAGCAACCGTTAAAACAATGAGTCCAGAAGAGTTAAGACAAATTGAAGCAAAAATCATTTTGGGCAACACATATCATTTGTGGTTACAACCCGGAAATGATATTATCAAACACGCTGGGGGATTACATAAATTCATGAATTGGGATGGTCCGATTCTTACAGATTCAGGCGGTTTCCAAGTGTTTAGTTTAAGTAATTTACGTAAAATTACAGAAGAAGGCGTGGAATTTAGACATCATACTAATGGGTCTAAATTATTTTTGAGTCCTGAGAAATCAATGCAAATTCAAAATGATTTAGGATCTGATATTATGATGGCATTTGATGAATGTCCACCGATGCCTGCTGAATATGATTATGTAAAAAAATCTATTGAACGTACAACACGTTGGGCGAAAAGATGTCTAGATGCACACCAAAGACCTGAAGATCAAGCATTGTTCGGCATTATACAAGGTGGCGAATATGAAGATTTAAGAGAACAAAGTGCAAAGGATTTAGTAGAATTAGATTTTCCTGGTTATGCAATCGGCGGTTTGTCAGTTGGTGAACCTAAACCGGTTATGTATAAAATGGTTGAACATACAGAGCAGTTTATGCCTAAAGATAAACCAAGATATTTAATGGGTGTAGGATCTCCAGATGCGTTAATCGAATGTAGTATTCGCGGCATGGATATGTTTGATTGTGTCTTACCGACACGTATTGCCAGAAATGGTACTTGTATGACATCGCAAGGTCGTTTAGTTATTAAAAATGCAAAATTTGCAGATGATTTAAGACCGTTAGATGAGAATTGTGACTGTTATACATGTCAAAACTATTCAAGAGCGTATATACGTCATTTAATCAAGGCAGAGGAAACTTTTGGTATTCGTCTTACTACTATTCATAATTTACATTTTCTGCTAAAATTAATGGAAGATATAAGACAAGCCATTCGAGAAGATCGTCTTTTAGATTTCAAAGAAGAATTCTTCGAGCAATATGGATTAAATGTTGAGAACCCAAAAAACTTTTAAGCAAGAGGAGCGTATAAAATGCAATTTTCATTACTAATATATATAGTCGTAATTTTTGCGGTTATGTATTTCTTGATGATCAGACCACAACAAAAACGTGCGAAACAGCATCGTGAGTTGATTAATAACATTCAATCTGGTCAAAGAATTACAACTATTGGTGGTATTAAAGGTACTGTTAAAGCAGTAGATGAAACAACTGTTGTTATTACAGTTAATGGTCATGGTACTGAATTAACTTTCGAAAAACCTGCTATTAAACAAGTTGACCCTTCATAACGAGAAGTGGTATTAAAAAGGATGAAACGAATAGCGTTTCATCCTTTTTAAGTTATAAGTAGTATGTAGAATAGCTTATTTTTATTCCAAAAAAAGAAATTGTGATACATAATAATTGTTAAATTTAAATTAAATATATCTATGACTATTTTTACTCCCTGCTCTAGTATGTTAATATGTATAAGGCTAATAAATTTTGTAAGAAAGATTTAACTTGCGTTATAAAATAGTATTCAAGTATTCTAAATACATACGTAAATAATGAGGTGTTCATGTGAAGAAAAGTAGTAGAATAATTGCGTTCTTGCTTTTAGTCGTATTGTTGTTTGCCGGAATGGCTGCAACTTATAAAAGTGTTATAAAGAATGTCAATTTAGGACTTGATTTGCAAGGTGGATTTGAGGTGCTTTATCAAGTCGATCCTTTAAATAAAGGCGACAAAATAGATAAAAAAGCCTTACAATCAACAGCGCAAACATTAGAAAATCGTGTTAACGTTTTAGGTGTTTCGGAACCTAAAATTCAAGTTGAAGAACCTAATAGAATTAGAGTTCAACTTGCTGGTGTAACAGACCAGAATGAAGCACGTAAAATTTTATCTTCTCAAGCTAATTTAACAATTCGCGATGCAGAAGATAAAGTAAAATTAAGCGGTTCTGATATTAAACAGGGATCTGCCAAACAAGAATTTAAACAGGAAACAAACCAGCCTACAGTTACTTTTAAAGTAAAAGACAAAAACAAATTTAAAAAAGTAACGGAAGAAATCTCTAAGAAACGTGATAATGTCATGGTTGTTTGGTTAGATTTCAAAAAAGGTGACAGCTATAAAAAAGAAGCACAAAAGAAAAACCCTAAATTTATTTCTGCAGCAAGTGTTGATCAACCAATCAATTCTGATAGCGTAGAAATCTCGGGTGGATTTAAAGGACAAGAAGGCGTTAAAAAAGCAAAACAAATCGCCGAATTGTTAAATGCAGGTTCTTTACCAGTTGACTTGAAAGAAATTTATTCAAACTCAGTAGGTGCCCAATTTGGTCAAGATGCATTAGATAAAACTGTGTTTGCATCGTTTATTGGTGTAGCATTAATTTATTTATTCATGCTTGGATTCTACCGATTACCTGGTTTAGTAGCGATTATTGCATTGACAACTTATATCTATCTAACGTTAGTAGCATTTAATTTCATTTCCGGGGTTCTAACTTTACCAGGATTAGCGGCGTTGGTATTAGGTGTAGGTATGGCTGTAGATGCCAATATTATCATGTATGAGCGTATTAAGGATGAACTTCGAATAGGTAGAACGATAAAGCAAGCCTTTTCTAAAGCAAACAAAAGTTCATTCCTAACAATTTTTGATTCTAACTTAACAACAGTTATCGCCGCAGCAGTATTATTCTTCTTCGGTGAAAGTTCAGTTAAAGGTTTCGCGACAATGTTATTATTAGGTATTCTAATGATCTTTGTTACAGCCGTGTTCTTATCAAGATTCTTATTATCATTACTTGTTTCATCAAATATAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP022905|1362266:1371309|1366013_1368293_+|WP_000749795.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >NZ_CP022905|1362266:1371309|1363272_1364298_+|WP_001019178.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP022905|1362266:1371309|1364320_1365460_+|WP_001112045.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NZ_CP022905|1362266:1371309|1365478_1365739_+|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >NZ_CP022905|1362266:1371309|1362266_1363271_+|WP_001005768.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERG >NZ_CP022905|1362266:1371309|1368495_1370769_+|WP_000595011.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDVNHDALQLSDMTKAIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKKGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >NZ_CP022905|1362266:1371309|1370790_1371309_+|WP_000364542.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1900612 : 1985535
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP022905|1900612:1985535|DBSCAN-SWA CATGACCCAAGTACATTTTACACTGAAAAGCGAAGAGATTCAAAGCATTATTGAATATTCTGTAAAGGATGACGTTTCTAAAAATATTTTAACAACGGTATTTAATCAACTAATGGAAAATCAACGAACAGAATATATTCAAGCAAAAGAATATGAACGAACAGAAAACCGACAAAGTCAACGAAATGGCTATTATGAGCGCAGCTTTACGACACGTGTAGGCACGCTAGAATTAAAAGTACCCAGAACACGTGATGGCCATTTTTCACCCACAGTGTTTGAACGTTATCAACGAAACGAAAAAGCCCTCATGGCTTCAATGTTGGAAATGTATGTATCAGGCGTTTCAACTCGTAAAGTATCAAAAATTGTGGAAGAACTTTGTGGTAAATCCGTCTCTAAGTCCTTCGTTTCTAGCTTAACAGAACAGCTAGAACCTATGGTTAACGAGTGGCAGAATCGTTTATTATCAGAAAAAAATTATCCTTACTTAATGACCGATGTACTCTATATAAAAGTACGAGAAGAAAATCGAGTACTCTCAAAAAGCTGTCATATAGCGATTGGAATAACCAAAGATGGCGACCGTGAAATTATCGGCTTCATGATTCAAAGTGGCGAAAGCGAAGAGACCTGGACAACATTTTTTGAATACCTAAAAGAACGCGGTTTACAAGGTACGGAACTCGTTATTTCTGATGCGCACAAAGGATTAGTCTCTGCCATTAGAAAATCCTTCACCAACGTAAGTTGGCAAAGATGCCAAGTTCACTTCCTAAGAAATATCTTTACCACCATTCCTAAAAAAAATTCAAAATCTTTCAGAGAAGCTGTTAAAGGAATTTTTAAGTTCACAGATATTAACTTAGCGCGTGAGGCTAAAAATCGATTGATTCATGATTATATCGATCAACCAAAATATTCAAAAGCTTGCGCATCATTGGATGATGGATTCGAAGACGCCTTTCAATATACCGTACAAGGAAATTCCCACAATCGACTAAAGAGTACCAATCTAATTGAACGACTGAATCAAGAAGTACGCAGAAGAGAAAAGATTATTCGCATCTTCCCCAATCAAACATCAGCCAATCGCTTAATTGGAGCCGTTCTTATGGACCTACATGATGAATGGATTTATTCTTCAAGAAAATACATCAATTTTGATAAGTAGAAATGGTAAAAACATTGTATAGCATTTTACACAGGAGTCTGGACTTGACTTTAATTTTTATTTAATAGTTAATTAATTGATTTAATTCTAAGATATTTGTATTTTTATATTGTAATCGATTACATTTTTAAATCAAACAAATCATTAGTTTTAAAGAAATTAATCAATAAAATTAGCTATGTCTTTTCCTTGTTTCATAAAGAATTTATTCAACTTTGACTAACCCTCGAAATTGAAATGCTTCCTTTCAAATTTTAAATAAAAGTTAAAAACATATTCTTAAAATAATCACTCATCATCACTCAGTAATTTATCAGTTGCTACATTAAATATACTAATATAAACGATTATAAATATTTGATATGTCTCAACTGCAATATTCTAAATTGACATATTGATTATTGTTTCCTCAAATCGTTAAAAAAAATAGAAGGATGATGAAAATGAAAACACGTATAGTCAGCTCAGTAACAACAACACTATTGCTAGGTTCCATATTAATGAATCCTGTCGCTAATGCCGCAGATTCTGATATTAATATTAAAACCGGTACTACAGATATTGGAAGCAATACTACAGTAAAAACAGGTGATTTAGTCACTTATGATAAAGAAAATGGCATGCACAAAAAAGTATTTTATAGTTTTATCGATGATAAAAATCACAATAAAAAACTGCTAGTTATTAGAACGAAAGGTACCATTGCTGGTCAATATAGAGTTTATAGCGAAGAAGGTGCTAACAAAAGTGGTTTAGCCTGGCCTTCAGCCTTTAAGGTACAGTTGCAACTACCTGATAATGAAGTAGCTCAAATATCTGATTACTATCCAAGAAATTCGATTGATACAAAAGAGTATATGAGTACTTTAACTTATGGATTCAACGGTAATGTTACTGGTGATGATACAGGAAAAATTGGCGGCCTTATTGGTGCAAATGTTTCGATTGGTCATACACTGAAATATGTTCAACCTGATTTCAAAACAATTTTAGAGAGCCCAACTGATAAAAAAGTAGGCTGGAAAGTGATATTTAACAATATGGTGAATCAAAATTGGGGACCATATGATAGAGATTCTTGGAACCCGGTATATGGCAATCAACTTTTCATGAAAACTAGAAATGGTTCTATGAAAGCAGCAGAGAACTTCCTTGATCCTAACAAAGCAAGTTCTCTATTATCTTCAGGGTTTTCACCAGACTTCGCTACAGTTATTACTATGGATAGAAAAGCATCCAAACAACAAACAAATATAGATGTAATATACGAACGAGTTCGTGATGACTACCAATTGCATTGGACTTCAACAAATTGGAAAGGTACCAATACTAAAGATAAATGGACAGATCGTTCTTCAGAAAGATATAAAATCGATTGGGAAAAAGAAGAAATGACAAATTAATGTAAATTATTTGTTCATGTACAAATAAATATAATTTATAACTTTAGCCGATAACTTCAGAAATGATGTTTTTCGGCTAATTTTTGGTTCTCCACCAAATGTGGTGGGTATATAATTTAAAGAACTATTTTAAATTACAACTTTTAGAGTTTTTATTATTAGGCGGCCAGTCCATTATTGGGCTTGGTTGTCTTCTTTTTTTCTCCTTTGTATAAGCTGAAAATCATCATTATACGTGCTTTAAAGTTGTTGAAATTTCTGTAACCAAAAGAAATTCGCTTGATTAATTTTATCTTATTATTAATTCCTTCTATAGCACCATTATTAAATGCTGGGTAATAAATTGTATTTCTTAACATCCTTTGATGTTTTCTATAATATTTAACCACTTTCCATACACCTTTACTCACAGACTTTTTACTAACTGAATTTAAACGATTAATAAATTTAGGCCAATTACATAACCTTAGATCTTTTCTTAATCCTTGGACAAGTTCGTAGGAGCGTCGTAGTATATCGTCTTTTGAAAGCATGAATTCTACAATGTCAGATGAGCGTTTATAAGCCTTAAAAGATTTATTCCATCTGTATTTACTAAATATGGTTTTACTAGTATCCATCAATAGAACTTTCCAGTTATTCTTAAAAATTGTATAATTAGGTCCTTTTTTATTACGGTATTCATTCATAACTTGTACACGATACTTATTAAGTTCCCTATTTAAATGTTGAACGATATGGAATCTGTCAAAAATAATAGCTGCATTAGGAAATAGGTCGCGAAATAATCGGACATAGGGTTCATACATGTCAATAGTAACCGTCTTAACTTGTTGTCGATTTTTTAAATCGAATCGCTCGAAATAGGCACGCAAGAATCTTGTAGTTCTATTTTCTAAAATATCTATAACATCATGAGTATCATTATCTATAAAAATGAAACTCATTGATCCAGTTACATTTTTAACGCTTTTAAATTCATCCATAGCGATGTGTTCTGGCAAACAATTAAACGGTTTAATTCGTAATGAATTAGCCGCTTTAGTTCTAATACGACTTACAGTAGATGGAGAGATACAGTTATCTTCTGCAGTATCAATCTCTGTTTTAACTTTAGTAGCTTCTTCTATAACTTTTTGAGTAACACATCTTGAGATAAAACACGACTCATCAACAATTGACGTTTTAGCAGTAAAAGTGCCATTGCATTCTAAGCATTTAAAACGTTGTTTAGCTAAGTTGAGGTATGTGTTATACCCTTGAGTTTTAAGTAAAGTAATACGAGAAACACGCTTACCATGTTTATGAATTTGTCCTTCATTTTTAACTCCACAACAATAACAGGCCGAAGGCTTATACGTTAGTACAGCATTAACCACTGTTGCTTTTTTTCCTTTGATAATGACGTCAATTTCTTGGTTTATATATTTTATATTTTCATCTTTTATTCTTAGTAATTCTAAGGTATCATTACACATAGGCGCACTTGTCTCCTTTAGTTTGGGTTTGGTCACTTTAAATTATAGAGGCAATTGCGCTTTTTGTGTATTAAAAAAAGCAGGAAGTTTTACCTTCCCACCATAAAAGATGAAGAACCTAATTTTTATACTTAATTTAGTTTAATTAACTTATGATATTTTTAATTTAAACTATGTACTTGATTTGCTTTCCTGACTTAAAAATTAGACTAAACATGACACTATATGAGGTGATTTTTAAAATAAGAAATTTGAATTCCATGTTGTCAAACCCTTTATATAAAAGTTTTGAAATTGTTCAAAACTTTTTGAACACATTATGTGTTAATATATTTGCAGAATTATTTTAAAATCGTTTTAAAACTATACTGAAATAAGAAATTTAAAAGTATAATTAGTACATATAATTGAAAAAGATTTCTAGAAATACAATTAATGTTCATCTAGATATTGTACGAAGTTGTATGAATAAGTTAAACTTAAGTTGAATCAATTTAAATGTTCAAGGAGGTTAACAAATGGTTTTTAATGATTGGGAAATTAACGTTGTATACTCAGGAGAGCATGAGGTTGTAACAAACGAAAAGAGTTTATTTGTCATTGACGAATTTTACGATGTTGCAATCGCAATCTATTATTTAGATGGAAAATTAAAAGTAGCTCATGTCAACTATGGTTCTGATTTTACAATTGACGTAGCTAATAAAGTTTTTGAATTGAATATTCAAAATCCAAATGTTGATGAGCATTAAATATTAAAAAGCATTTAGAATCATAAAGAGCATACTATATATAGCCTTTTACATGTAAAGCAAATGAAAATTAGATAATCTAATTATTTCAACATTAAACAATATATCATTATAAAGAAGTTTTTAAAATAGAAGTATAAGGTGGTGAACAAAAATTAACATTGTGTATAACATTATAGTATATATAGCATGC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108 | Staphylococcus_phage(71.23%) | tail,holin,tRNA,terminase,capsid,portal,transposase,head,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2037339 : 2045812
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP022905|2037339:2045812|DBSCAN-SWA CTTATTTTACAATTTTAGCAATAACACTTGGATATAACTCATATTCCAATTTTTTTACTTTCTCTTCTAATTGTTCTTTTGAATCGTCCGGTCTAATATCACATTGTCTCTGTTCAATAATTTCTCCCGTATCCATACCACAATCAACATAATGTACTGTCGAACCAGTAATAGTATCGCCACTATGATATGCTTGGCCTATTGCGTCAATCCCCTTATATTTCGGCAATAGAGATGGATGTATATTCAATATTTTACCTTCAAATGAAGCTAATAAATCTGGACCAATTAGACGCATGTAGCCAGCTAAAATAATCCACTCTACCTTATCTTTATTTAATAATGTTACTAAATGTTGTTCATACGCTGCTTTTGAATCAAATTGTTTTGGTTCATTAATATAAACAGGAATATCGTGCTTTTTTGCTCTATCTATACAAAACGCATTTTGATGATCCGTATATAGCGCCGTAACTTCAATATTTTCAAGTTTTCCTGATTCAACATGCTCAACTATATTTTCAAAGTTACTTCCTGAACCTGATGCAAAAATCGCAATTTTAACCATTGTTATACCCCCAACAATTCAATTGCAGTTGACTCATTTTTCACAATATGACCAATTTGATAAGCTTCCACATTTTGTTCTGCTAAAATCTTCAAAGCGCGTGATGCATCTTTTTCATCAACGATAACCGTATAGCCAATACCCATGTTAAAAATGTTATACATTTCATTTGTGTCTATATTGCCTTGTTGTTGTAACCAATCAAATATTTTTGGCGTTGGAAATGATGTAGTATCAATTCTAGCAGCATATCCGGCTGGCAATGCACGTGGAATATTTTCATAAAAACCTCCACCAGTAATATGATTCATTGCCTTAATAGAAACTTCTTTTTTTAAAGCAAGTACAGGTTTGACATATAATTTAGTTGGTTCTAAAAAGACATCTATAAATGGACGATTATCGAAGTTTGATGCCAAATCAATGCCTGATTCATTAATTAATTTGCGCACTAAACTGTATCCATTTGAATGAATGCCACTTGACGCAAGTCCTATAACAACTTGTCCCTCTTTCACTTCTGAACCATCTACATAGTCATCCTTTTCAACTGCTCCAACAGCAAATCCGGCTACATCATATTCACCTTCGTGATACATTTCACCCATTTCAGCAGTCTCTCCACCGATAAGTGCAGTATTCGTTTCAACGCATGCATCACTAATACCTTTAACAATTTGTTCAATAACTTCAGGAACAACTTTATTTGTAGCGATGTAATCTAAAAAATACAATGGTTCTGCACCTGTCGTTAAAATATCATTAACACACATTGCAACTGCATCGATACCTATCGAATCATGTTTCCCATAGTCGATAGCTAGTTTTAATTTCGTACCTACTCCGTCTGTTCCAGAAACTAAAACTGGCGCTGTCATATTTAATTGTGATAAATCAAATGTAGCACCGAATCCACCTAAACCACCGATAACTTCTTTACGCATCGTACGTTTAACATGACTAGACATTCTTTCTACAGCTTCATAACCAGCATGAATATTTACACCAGATTGTTCATATGCTTTAGACATTTAAATTTCCCTCGCTATCAAAAAAGTGTTTGTTTTTAGAAATATATTGCTTTTGTCGATGACTTAAATGTGCTTTATAATTTGCTTCATAATCATATAACCCTGCAGGATAATCTCCAGTGAAACTTTCTACACATAAGCCACTATATGGCGCGTCATAATCTAAACCAATTGATTCAATTAACCCATCTACAGATAGATATGCTAATGAATCAGCGCCAATATAATCTTTAATTTCTTCAGGTGATTTGCTTGCAGAAATTAATTCTGCCGTAGTTGAAACATCGATTCCATAAAAACTTGGGAACATAAATTCCGGTGATGCTATACGCACATGCACTTTATTTGCACCAGAATCTTTTAACATTTTCACAATGCGTCGAATTGTCGTACCGCGAACAATGGAATCATCAACAAGAATGATATTTTTCCCATCTACTATATCTTTTACCGCAGATAACTTCACTCTCACACCTTGCTCACGTAATTCTTGAGTTGGTTGAATAAATGTTCTTGCAACATATTGATTTTTAACTAGTCCCATTTCATATGGCAAACCTATTTCTTCAGCATAACCACTCGCAGCTGATAGCGATGAATTGGGTACACCGATGACCATATCAGCATTTACAGGGCTTTCTTGGGCTAATTTTTTACCAGAAGCTTTACGTACTGCATGGACATTTTTACCAGCTATTGTTGAGTCTGGTCTAGCAAAATAAATATATTCCATCGTAGAAATTGCAGTTGTCGTATGATGTGTATAAGATTTAACTGTAATACCTTTATCGTTAATCACGACATATTCACCTGCATGAATATCTTGAACAAATTCTGCACCTAACACATCTATTGCACATGTTTCACTTGCAAGGATGTATGTACCATCTTTCATTTTACCTACAACAAGTGGTCTGATAGCATTTGGATCTACTGCGCCATATAACGCATCTTTAGTTAATATCGCAAATGTAAAACCGCCTTTAACTTTTCGCAAACTTTCTTTCAATGCTTCCTCAAAAGTAGGAGCTTTACTTCGACGTATCAAATGCATAATGACTTCAGTATCTGAAGACGAATGGAAGATAGCACCTTGTTTTTCTAAATTCTGACGCAATGATTTAGCATTAATGAGGTTACCATTATGACAAATACCTACACTCATATCATAAAAGTGATACAGAAACGGTTGAATATTTTCAATACCTTTATTACCTGAAGTAGCATAACGGACGTGACCAATTGCATGTTGATATCCTTTTAATCGTTCCATTTGATCATCGTTAATCGCTTCAGTTAGTAAGCCTAATCCTCGCTCGCCTTTTAATTCATTTTGATCAGAAACAACTATACCTGCACCTTCTTGACCACGATGTTGCAAACTATGAAGTCCCATATATGTTAGTTGCGCTGCTTCAGGATGATTCCAAATACCAAACACGCCACATTCTTCGTTTAATCCTGAGTAGTTAAACATTGAGCAATTGCCCCTTCCCATATTTGTTTAATATCTGAAACATTTTCACTAATCTCTGTATATGGTGTTGTTACTTTGAAATTATCACTATCTGTTAAAAGTCCAATTTCTATTGCATTATCAATATTTAAAGTTTTACCTGATTTAACAGAAACAACATATCGGCCTTGTGTCTCACTAAACAATTGTGCATTTGTTATATCTATTGAAGATTTTAATCCTAAACCGTAATGCGCACTTAGTTTAGCTAAGGTAATCAGTAAGCCACCTTTACCAACTGTTTGAACATGTGATAATAGTCCTTCACGAATAGCGGTCTTGATTGATTCACCTTTTTCAACTTCTGAACTCAAATCTAATGACTCAAATTCATGATTAACTTTGCCATAAATTAACTTTTCAAGTTGACTACCACCAAAGTCGTCCTTAGTATCACCGATTAAATATAATTTATCTCCAACTTGAGGTTCAAAATCATTTAAATAATTTACATTTTCAATCAAACCTACCATTCCAACAACTGGTGTTGGGAAAATAGAAGTACCTTTCGTTTCGTTATATAAAGATACATTTCCAGAAACTACTGGTGTCTTAAGAATGTCGCATGCTTCTGCCATACCTTTCGTTGAATCTATCAACTGTTGATAGATTTCTTTCTTTTCAGGAGAACCATAATTTAAACAATCTGTCATTGCTAATGGTGTTGCACCCACGGCAATTAAATTTCGATAAGCTTCAGCTACTACCATCTTTCCACCTTCATATGGATTGTTATATACATAACGCGCTTCACCATCAATTGTTGAAGCAATTGCCTTATTTGTGCCTTCCACACGTACTACCGATGCTTGAAGTCCTGGCTTAATTATCGTATTGGCACCAACTTGTTGGTCGTATTGATCATATAAATAGTGTTTAGATGCTATAGTCGGATGCTTAAGTAATTTAAAGAAAGTATCTTTAACATCGATGTGTGTATAATCATTTTTAGAAGTATTATAATCTTTTTCTTCTCCTTCTAAAATATATACAGGTGCTTCATCAGCTAGTGGTTCAACTGGAATGTCAGCATAAACTTCATCATCATATGTTAAAACAAAACGATTTGTATCTGTAACTTCACCTATAACAGCACTATCCAATTCGTGCTTATCAAATAAATCTAAGAATTTTTGTTCATTACCTTTTTCAACAACTAGTAACATACGTTCTTGAGTTTCTGAAAGCATCATTTCATAAGGAGAAATACCTGGCTCACGTGTTGGCACTTGTTCTAATCTCAAATGTAACCCACTACCACCTTTTGCCGCCATTTCAGACGATGAAGATGTTAAACCAGCAGCACCCATATCTTGAATACCAACTAATTCATCAAATGTAATTGCTTCAAGTGTTGCTTCCATTAATTTTTTACCTACAAATGGATCACCGATTTGTACAGAAGGTCGTTTACTTTCGCTTTCTTCCGTCAATTCTTCAGATGCAAAAGTAGCACCATGAATACCATCTCGACCAGTTTTCAAACCAACATAAATGACCGAATTACCTACACCTTTTGCTGTGCCTTTTTGAATCATGTCGTGATTGATAACACCAACACACATTGCATTAACAAGTGGATTGCCATCATAACGTTCATCAAATTCGATTTCACCAGCAGTTGTTGGAATACCAATGCAGTTACCATAACCTCCGATACCCTTTACAACCCCTTTAAGTAATCTTTGGTTTTGTTTATTATCTAATTCTCCAAATCTAAGACTGTTTAACAAATTAATAGGTCTAGCCCCAATAGAAACAATGTCACGAATGATTCCACCAACGCCTGTAGCAGCCCCTTGATATGGTTCAATTGCTGATGGATGATTGTGAGACTCTACTTTAAATACTACGGCTTGATTATCACCTATATCGACTACCCCTGCACCTTCACCTGGACCCATAAGCACATGCTCACCTGACGTAGGAAATTGCTTTAAAAACGGTTTAGAATGTTTATAAGAGCAATGTTCACTCCACATAACAGAAAAGATACCTGTTTCTGTAAAGTTAGGTTGTCTGCCTAAAATATCGCAAACTTTTTCATATTCTTGATCACTTAATCCCATATCTTGATATACTTTTTCAAGTTTAATTTCTTCAACGCTTGGTTCGATAAATTTAGACATGTTGTTCCCTCCAACTTTTTACCATCGCTTCAAATAATTTCACACCACTATCAGTACCTAACAACGTTTCTAAAGCTCTTTCAGGATGTGGCATCATGCCACATACATTGCCTTTTTCGTTAACAATTCCTGCAATATCATCATATGAACCGTTCGGATTATTCACATATTTCAGAATAATTTGATTGTTAGCTTTTAATTGTTGATATATTTCATCAGTACAATAATAATGACCTTCACCGTGAGCTACAGGATATATAACTTTTTCACCTTGCTCATAAAGATTTGTAAATGCCGTTTGATTATTCACTATTTCTAACTCTTCATTTCTACTAATAAATAAATGTGAATCGTTATGCAATAATGCACCAGGTAATAAGCCTATTTCAGTTAAAATTTGAAACCCATTACAAACACCTAATACTGGCTTACCTTCAGTTGCAAGACGTTTAACTTCCGAAATAATCGGCGCTACACTAGCCATTGCCCCAGATCTTAAGTAATCCCCGAATGAAAATCCACCAGGAATAAGTACGCCATCAAATCCACTTAGTGATGTTTCTCTATAATCTACATATTCCGCTTCAACACCACTTTTAATAGCAGCATTAAACATGTCTCTATCACAATTCGAACCTGGAAAAACAAGAACCGCAAATTTCATTTTATGCATTCTCCTTTTCATCATCTAACACTTTATAGCTATATTCTTCAATCACTGTATTTGCAAACAATTTTTCACTTAGAGTTGTAATAATGTTGTGTACCTTTTCATCACTAACCTCATCCACTGTCATATATAATACTTTTCCTACACGAATATCATTCACTTGTGCATAACCTAAGTCATGTACAGCTCGAGTAAGCGTTTGTCCTTGCGTATCTAATACTTGTGGTTGTAATGTGATATGTAGTTCAATTGTTTTCATTATTTTAAATCCTCCAATTTGTTTAAAAATATTTGATATGTTTCAATCAGTGATCCAGTGTTATTTCTATATACATCTTTATCAAAGTTTGCATTGGTAGCTTTATCCCAAATTCGACATGTATCTGGAGATATTTCATCCGCTAACAAAATTTGACCAGTCTCAGTCTTTCCAAATTCGATTTTAAAATCTACTAATTTTAAATTCATAGCATCCATTAATTGTTTCAACACATTATTAATCTTTAATGCTTTGGATTTTAGTATTTCAATATCTTCATCTGATGCTATATTGAGCAATTTAACATGGTCATCCGTTATCAACGGATCATTTAACGCATCATTTTTATAGAAAAATTCTACAAGTGGTTCTCTAAAAACTTCACCATTTTCAAAACCTAAACGCTTTGTAATAGATCCACTAGCAATATTACGAACAACTACTTCTAATGGAATTATTTTCACAGGCTTAACTAATTGTTCTGTTTCAGATAATTGTTTAATAAAGTGACTTTCTATTCCATTTTCTTGTAAATATTTAAATATAATAGAAGTAATTTGATTATTTAATCGCCCCTTACCTGCCATTGTGTCTTTCTTAGCCCCGTTTCCAGCAGTAACTTCATCTTTATATTCAACTCTTAATTCATTTTCTTGATTTGTTGAGAAAATGCGCTTCGCTTTTCCTTCATATAATAATGTCATGCTTTAATTACTCCCCTCAAATTTAGCGTACATATCTTGTTCAGTTTGGTTTACATCATTCGTTAGTACAGTCATATGCCCCATTTTTCTGCTATCTTTACGCCCAGACTTACCATAAATATGTAAGTGCCACTCTGGATGTTCATTAAATTCATTTTCCAATAAATCTAAGTCTTTACCTAGTAAGTTCATCATGACTGCAGGCTTTAATAATTCAATTGAATTTGGTAATGATTGTCCGGTAACTGCTAAAATATGAGTATCAAATTGTGAATAATCACATGCTTCAATTGAATAATGTCCGGAATTGTGAGGCCTTGGTGCAATCTCGTTCACATACAATTGGTTGTTACTATCTATAAAAAATTCCACTGTAAATGTTCCAATGAAATGAATCGATTGGATAATTTTATTAACTTGCTCTTTCGCCTCAGCTGTTTTATCTATTCTCGCTGGAACAATTGTTTTGAAAAGTATTTGATTTCTATGCTCATTTTCTTGTAATGGGAAAAAAGTGATTTGATTGTTGTTTCCTCTTGTAACAGTAAGAGATACTTCTTTCTTGATATTCAAATATTTTTCAGCTACGCATTCACTAGTTTCAATTAATTTAAAACCTTCTTGTAAGTCTTTTTCGTTGTTAATTAAAACTTGACCTTTGCCATCGTAGCCACCAAATCTAGTTTTTACAATAAAAGGATATCCTAATGTTTCAATTGCTTTGTCAATATCTGTAGATTCTTTTACTGAAATGAACGGGACAACTTTGGTACCAGCACTTTTTAATGTTTCTTTTTCAGTTAAGCGGTCTTGTAATAACTGTATAGCTTGGTAACCTTGCGGAATATTGTACTTTTCACATAATAGTTTTAATTGTTGGGCTGAAATGTTTTCAAATTCATAAGTAATCACATCACATTTTTGTCCTAATTGATTGAGTGCCTTTTCATCGTCATACTTGGCTTGTATAAATTCGTGTGCAACGTATCTACATGGACAATCTTCAGAAGGATCCAATACAACCACTTTATAACCCATTTTTTGAGCTGATTGTGCCATCATCTTTCCAAGCTGACCACCACCAATAATGCCAATAGTCGCACCAAACTTTAATTTATTGAAGTTCATTTTGCATGTCCTCCACTTTTTGAATTAACGAAGATTCATACTGATTTAGTTTTTCAACTAAAGAAGGATTTTGAATACTTAACATTCTTGCTGCAAGTATACCTGCGTTTTTAGCACCTGCTGCACCAATTGCAGTCGTTGCAACCGGAATACCTCCTGGCATTTGAACAATTGATAATAAAGAATCTATACCCTTTAAACTTTTTGTTTCAATCGGCACACCAATAACTGGTAGCGTCGTTAATGATGCAACCATACCTGGTAAATGTGCCGCACCGCCAGCGCCTGCAATGATAATGTTTATACCTCTTTCTCTCGCTTCAGAAGCAAATTGAACCATCATTTTTGGCGTACGATGTGCGGATACTACTTGTTTTTCGTACGGAATTTCAAAATAATCCAACATGTTACAACTCTCTTGCATAATTTTCCAATCGGAAGAACTGCCCATAATGACTGCTACTTTCAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP022905|2037339:2045812|2043510_2044215_-|WP_000174053.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIASDEDIEILKSKALKINNVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >NZ_CP022905|2037339:2045812|2042574_2043246_-|WP_000666806.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLATEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NZ_CP022905|2037339:2045812|2044218_2045343_-|WP_001010413.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVVVLDPSEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITFFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSGRKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NZ_CP022905|2037339:2045812|2040392_2042582_-|WP_000032740.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGNEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NZ_CP022905|2037339:2045812|2037339_2037906_-|WP_000238669.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNKDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDCGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_CP022905|2037339:2045812|2043247_2043511_-|WP_000848350.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >NZ_CP022905|2037339:2045812|2045329_2045812_-|WP_000861572.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGINIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >NZ_CP022905|2037339:2045812|2037908_2038937_-|WP_000030811.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_CP022905|2037339:2045812|2038929_2040414_-|WP_000483721.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAINDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISTMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2065810 : 2119538
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP022905|2065810:2119538|DBSCAN-SWA 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54 | Streptococcus_phage(28.57%) | tRNA,bacteriocin,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2744984 : 2774133
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP022905|2744984:2774133|DBSCAN-SWA 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MAKMRISPELKKLIEKYRCVKDTEGMSPAKVYKLVGENENLYLKMTDSRYKGTTYDVEREKDMMLWLEGKLPVPKVLHFERHDGWSNLLMSEADGVLCSEEYEDEQSPEKIIELYAECIRLFHSIDISDCPYTNSLDSRLAELDYLLNNDLADVDCENWEEDTPFKDPRELYDFLKTEKPEEELVFSHGDLGDSNIFVKDGKVSGFIDLGRSGRADKWYDIAFCVRSIREDIGEEQYVELFFDLLGIKPDWEKIKYYILLDELF >NZ_CP022905|2744984:2774133|2766343_2766979_-|WP_000755982.1|DBSCAN-SWA MKKVISLFVAILSVLIFTDNANAENNKPEGVNENSNLIPVRQPDANYPGPVSDIARVKKLDNLIDGTKDPDVIKQLKDDNEVPNNAVKAKDSKIVSDCRHLLKHPDNLIDGTKDPNVINQLKNANGTSNNSAVNPSIKANDIHTKSNKQMAKQQSIHLDSKSKSVHKQQLKELPKTGVNNESNTAIMALFIGLILLVVSLVTRFIKLNSHQ >NZ_CP022905|2744984:2774133|2750222_2750420_+|WP_001835223.1|DBSCAN-SWA MRTGKGAVDRLALKGLGAYQLYIGAECRYFNTAASHELMLPLGHCPNRHFLKYAALILIFHSIAQ >NZ_CP022905|2744984:2774133|2769841_2770624_-|WP_000067268.1|DBSCAN-SWA MSNLINGKIPNQAIQTLKIVKDLFGSSIVGVYLFGSAVNGGLRINSDVDVLVVVNHSLPQLTRKKLTERLMTISGKIGNTDSVRPLEVTVINRSEVVPWQYPPKREFIYGEWLRGEFENGQIQEPSYDPDLAIVLAQARKNSISLFGPDSSSILVSVPLTDIRRAIKDSLPELIEGIKGDERNVILTLARMWQTVTTGEITSKDVAAEWAIPLLPKEHVTLLDIARKGYRGECDDKWEGLYSKVKALVKYMKNSIETSLN >NZ_CP022905|2744984:2774133|2756811_2758416_-|WP_000284571.1|transposase|DBSCAN-SWA MYQNYTINQLCLPIDLEIKLEENDFAHAIVQFVDSIPDEVFLPYYQSMGRPQYHPRMLLSIILCAYIQGVYSGRQIQNMLIDSIRMRYLSQEQFPNFRTINRFRVHPIMNDILDHSFVQFRELLVQSGLISGSALYIDGTKIEADANKYSFVWKKSILKYKDSLDQKALENYQQMVETKILPELIDDLKDELSIEEIERIRQSLEEKENQLIEAIDQTETVEERKLLRKEKSEVHKQKKRFDDFAQRKMSYEEQLVIMGVRNSFSKTDHDATFMRMKEDHMLNGQLKPGYNIQLATENQFALAYDCYPNPTDTRTFIPFLEKIESKIGLPENIVADAGYASEENYCYVLDETESTPIIPHQGYLKEKKRAHKQNQFHRDNWTYNELDDYYICPNQKRVVFSHYSQRKDRNGFIRNFKIYECEDCTGCPLREKCTKAKEGKNRRLNINPTWEYIKIKANEKIESKETASYYAQRKIDVETVFGNIKQNMKFKRFHVRGAEKIFKEMGLVFLAHNFRKLVTRVRKYEGKTIIQNQI >NZ_CP022905|2744984:2774133|2747197_2747779_+|WP_001124173.1|DBSCAN-SWA MPKIINHKEKKKQIIQYAFDSIVEKGVKGSTVRQIAKLADMTPGQIRYYFPNHSELLNAVMSTVELKVRRRIEAIFKSENLTTIDKAKASLLTVLPLDKERLADMEVWMAFRNDIHEYGQSTLDDGLDQLCNSILTLLKNDHLLKNNVNIHLNSMKLHALIDGLALHKLLNPNGVSNDDIQIIVDEEIVRLTK >NZ_CP022905|2744984:2774133|2754752_2755487_-|WP_000662263.1|DBSCAN-SWA MKENKYDDNIFFQKYSQMSRSQKGLAGAGEWETLKKMLPDFKGKRVLDLGCGYGWHCIYAMENGASSVVGVDISHKMLEVAKGKTHFPQIEYECCAIEDVDFPEESFDVILSSLAFHYVADYENLIKKIYRMLKAGGNLVFTVEHPVFTAHGTQDWYYNEKGEILHFPVDNYYYEGKRTAMFLEEKVTKYHRTLTTYLNTLLSNSFIINQIVEPQPPENMMDIPGMADEMRRPMMLIVSAKKKM >NZ_CP022905|2744984:2774133|2763303_2763753_+|WP_000125705.1|DBSCAN-SWA MTALFPYIAFENSKEALAYYEEVFGATDVKRLEVGEEQASHFGMTKEEAQEATMHAEFEVLGVKVLCSDSFGRADKINNGISLLIDYDVNNKEDADKVEAFYEKIKDHSSIEIELPFADQFWGGKMGVFTDKYGVRWMLHGQDYTAIQQ >NZ_CP022905|2744984:2774133|2750387_2751047_-|WP_000802831.1|DBSCAN-SWA MKPKIIMHTQISLDGRIKGFDNPEVYYQVAGGIHSDAVLFGSNTVFTAFEKYPAETEADFEKIITSPEDPRPIGVIPDSRGILRSLHCLRNLGYLKEIVILVSTATPKEYLNYLEERHYPYIVSGNDHVDYEKAFQILHEQYGCKYMRTDSGGGLTNKLLENGLIDEISLVISPCFVGNKEKQLFDNLLLSEKVNLELQGTENAEHGCLSLRYAVKNKD >NZ_CP022905|2744984:2774133|2748062_2749667_+|WP_000284571.1|transposase|DBSCAN-SWA MYQNYTINQLCLPIDLEIKLEENDFAHAIVQFVDSIPDEVFLPYYQSMGRPQYHPRMLLSIILCAYIQGVYSGRQIQNMLIDSIRMRYLSQEQFPNFRTINRFRVHPIMNDILDHSFVQFRELLVQSGLISGSALYIDGTKIEADANKYSFVWKKSILKYKDSLDQKALENYQQMVETKILPELIDDLKDELSIEEIERIRQSLEEKENQLIEAIDQTETVEERKLLRKEKSEVHKQKKRFDDFAQRKMSYEEQLVIMGVRNSFSKTDHDATFMRMKEDHMLNGQLKPGYNIQLATENQFALAYDCYPNPTDTRTFIPFLEKIESKIGLPENIVADAGYASEENYCYVLDETESTPIIPHQGYLKEKKRAHKQNQFHRDNWTYNELDDYYICPNQKRVVFSHYSQRKDRNGFIRNFKIYECEDCTGCPLREKCTKAKEGKNRRLNINPTWEYIKIKANEKIESKETASYYAQRKIDVETVFGNIKQNMKFKRFHVRGAEKIFKEMGLVFLAHNFRKLVTRVRKYEGKTIIQNQI |
29 | Streptococcus_phage(69.23%) | transposase,integrase | attL 2766936:2766955|attR 2774976:2774995 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP022905.1|WP_000642492.1|1978468_1978678_+|hypothetical-protein |
1978468_1978678_+
Protein sequences of NZ_CP022905.1|WP_000642492.1|1978468_1978678_+|hypothetical-protein>NZ_CP022905.1|WP_000642492.1|1978468_1978678_+|hypothetical-protein MKACLYLSNDKFVEIDNLEKVIKSGHRGTVEISKEKIKSSLFTNGSYTFVGDKIVAIASAKIEFIEFID |
69 aa aa | NA | NA | NA | 1900612-1985535 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 7.1|984235|34|NZ_CP022905|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022905 position: 1906666-1906633, mismatch: 0 ccaacacagagaatttcgaaaagaaattctacaa CRISPR spacer ccaacacagagaatttcgaaaagaaattctacaa Protospacer ********************************** |
||||||||||||||
NZ_CP022905.1|WP_023487065.1|1978825_1979269_-|hypothetical-protein |
1978825_1979269_-
Protein sequences of NZ_CP022905.1|WP_023487065.1|1978825_1979269_-|hypothetical-protein>NZ_CP022905.1|WP_023487065.1|1978825_1979269_-|hypothetical-protein MEQITLTKEELKEIIAKEVRNTIKGEKPISSGAIFSKVRINNDDLEEINKKLNFAKDLSLGRLRKLNHPIPLKKYQHGFESIHQKAYVQDVHDHIRKLTLSIFGVTLNSDLSESEYNLAAKVYREIKNYYLYIYEKRVSELTIDDFE |
147 aa aa | NA | NA | NA | 1900612-1985535 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 7.1|984235|34|NZ_CP022905|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022905 position: 1906666-1906633, mismatch: 0 ccaacacagagaatttcgaaaagaaattctacaa CRISPR spacer ccaacacagagaatttcgaaaagaaattctacaa Protospacer ********************************** |