Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP031237 | Haemophilus influenzae strain M12125 chromosome, complete genome | 1 crisprs | DinG,DEDDh,cas3,RT | 0 | 0 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP031237_1 | 620300-620448 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP031237_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP031237_1
>1.1|620349|51|NZ_CP031237|CRISPRCasFinder CGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCAATAATGCTTTTATAATGTGAAA |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP031237_1
The CRISPR arrays of NZ_CP031237_1 >merge|NZ_CP031237|1|620300-620448|CRISPRCasFinder TTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCGACCTTGGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCAATAATGCTTTTATAATGTGAAATTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGT >NZ_CP031237|1|1|620300-620448|CRISPRCasFinder TTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCGACCTTGGCAAGGT CGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCAATAATGCTTTTATAATGTGAAA TTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGT
>NZ_CP031237.1|WP_112095693.1|619100_620168_+|UDP-N-acetylglucosamine--undecaprenyl-phosphate-N-acetylglucosaminephosphotransferase MLSIFVTFLGAFLTLIVMRPLANWIGLVDKPNYRKRHQGTIPLIGGVSLFVGNLCYYLMEWDQLRLPYLYLFSIFVLLAIGILDDRFDISPFLRAGIQAILAILMIDLGNIYLDHLGQILGPFQLTLGSIGLIITVFATIAIINAFNMIDGIDGLLGGLSCVSFAAIGILMYRDGQMDMAHWSFALIVSILPYLMLNLGIPFGPKYKVFMGDAGSTLIGFTIIWILLLSTQGKGHPMNPVTALWIIAIPLIDMVAIIYRRIRKGKSPFRPDRLHVHHLMVRAGLTSRQAFLLITFVSAVCATIGILGEVYYVNEWAMFVGFFILFFLYVYSITHAWRITRWVRRMKRRAKRLKKA >NZ_CP031237.1|WP_114890238.1|616435_619027_+|bifunctional-uridylyltransferase/uridylyl-removing-protein-GlnD MLFSPTLSSPLTPSAVKIERENLKQFELENFSCYSIFELIENRSDFYDALLIQLWQEIELSGQQGISLIAVGGYGRREMFPLSDLDFLILVEQTPIPEIEEKITQFIQFLWDCGFEVGNSVRTLAQCESEGKQDITIATNLLEARFLTGNRPHFDALNELVKRADFWSKEDFFNAKVQEQIERYQRYHNTAYNLEPDIKYSPGGLRDLHLLYWVALRHSGALTLEAILQSGFIYPQEYQQLQESRAFLFKVRFALHLILKRYDNRLLFDRQIKVSELLGFRGEGNPAVEKMMKCFFQALHRISLISNLLIQHYRENVLSSNQTTVIDQLDDDFQLINQSLCLRNSRVFQEKPARMLDLFFYLTQYKQADIHSDTLRQLQISLDQLSQKLCEIPAAREKFLRLFNQPNAIKRAFMPMHQYGVLTAYLPQWQAIEGLMQFDLFHIYTVDEHTLRVMLKLESFLSQESAQEHPIAHRIFSQLSDRTLLYIAALFHDIAKGRGGDHAELGAEDVADFAQLHGLDRREIDTLAWLVKSHLLMSITAQRRDIHDPEVVMNFAEAVQNQVRLDYLTCLTVADICATNGNLWNSWKRSLFASLYEFTEQQFSQGMKELLDYSEKSAENRKLAQQILTQDYSDIAPISIEQLWTRCPEDYFVRNTPKQIAWHTSLLVDFVEALLVKISNRFSLGGTEVFIYCQDQPHLFNKVVSTIGAKKFSIHDAQIITTQDGYVFDSFIITELNGELVEFDRRRELEQALTVALQSEKLPALSIVPNRQLQHFTVQTDVRFLQENKKEHTQMELVALDKAGLLAQVSQIFTELNLNLLNAKITTVGEKAEDFFILTNQFGQPLDSQQREILSNVLYRNIG >NZ_CP031237.1|WP_005649958.1|615535_616342_+|type-I-methionyl-aminopeptidase MAIPIRTEKEIVKLREACKLASDVLVMIEPYVKAGVTTGELDRICHEYMVNEQKVIPACLNYHGFPKATCISINEVVCHGIPSDDKVLKNGDIVNIDVTVIKDGYFGDNSKMYIVGGETNIRSKKLVEAAQEALYVGIRTVKPDIRLNEIGKAVQKYTESQTFSVVREYCGHGVGTEFHCEPQVLHYYADDGGVILKPGMVFTIEPMINAGKKEVRVMGDGWTVKTKDRSHSAQYEHQLVVTETGCEVMTIRDEEIAEGRISRIMVNV >NZ_CP031237.1|WP_005670302.1|615054_615399_-|iron-sulfur-cluster-insertion-protein-ErpA MIDDMAVPLTFTDAAANKVKSLISEEENTNLKLRVYITGGGCSGFQYGFTFDEKVNDGDLTIEKSGVQLVIDPMSLQYLIGGTVDYTEGLEGSRFTVNNPNATSTCGCGSSFSI >NZ_CP031237.1|WP_005667113.1|614699_615053_-|YacL-family-protein MDFQFTHYQGNVSVKCSMEHIALANWFNTEVRSNSDKILTALSTAKSLIENQEKVLIGAEYTLFLNADEVMVRANNLAIETDEILEDDFHYYDEESLAFCGTQDFIHFLQSYVDFIA >NZ_CP031237.1|WP_112072030.1|612341_614693_-|penicillin-binding-protein-1B MTSQHSAKKSSKNTPKNNRTFKGFLLKFSFTALVLTIFYGGYLDWQIRSKMDGQIWHLPAEVYSRLESVKIADNLAFDEVIQILLDNEYRQTTMVAAPGDFKLEDDSIVVLRRAFPFPDKTEPQRVLRLRFSNNKLSRIEDLVTVKTVDEFRLAPKLIAMLQSDNEDRLAIPLQNYPRLLIDTLILTEDRRFYEHNGINPVGILRALIANIRAGQTVQGGSTLTQQLVKNLFLSRERTITRKANEALMSLVLDWRYDKNRILETYLNEIYLGQNGDTQIHGFELASQFYFGRSIREISLDQIALLVGMVKGPSLYNPWRNPQNALERRNIVLRLMLEHKMIGDELYQLLSQRPLGVQKKGQISRKYPAFIQTLQADLRRELGEHKISSLLGARIFSTMDLKQQAQAENAVVNTVSQLQLKTKNPHLEGAMIITDYRTGEIRAVVGGLQTQYAGFNRALMAKRQIGSLVKPSIYLTALSNPEQFRLNTPINNQPITINVKGSPPWQPRNYDKKYSDSVMLMDALARSLNIPTVNIGMKVGLSKVIDTQKAMGWDNVEIPKVPAMLLGSYTISPYDVTKLYQTLANQGGRIALTTVDSIADRQGNLIFQHDKSAKQVVPQEAAFQTLFAMQQTVERGTARSLQKDYADLHLAGKTGTTNESRDTWFVGIDGKNISTVWLGRDDNGETKLTGASGALQIYKDYLNHTNIEKLTITPPTTVKWVGINQYGDWDCESYRTIPVWLNNGQNFCGETSSPSLTPTTETETPPQESLWDVLDNPNPPVIKP >NZ_CP031237.1|WP_114890237.1|611308_612181_-|phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide-synthase MTQQLPILSLKKIYSGKVRDLYEIDGKRMLMVASDRLSAFDVILDDPIPRKGEILTQISNFWFNKLAHIMPNHFTGDSVYDVLPKKEADLIRDRAVVCKRLNPIKIESIVRGYLTGSGLKDYKQTGTICGLKLPEGLVEASKLPEAIFTPSSKEEVGNHDINISYAECEKLIGADLAAQVKEKAIALYTVAAEYALTKGIIICDTKFEFGLDENGTLTLMDEVLTPDSSRFWSVNTYQAGTNPPSFDKQFVRDWLENSGWNKQAPAPKVPENIIQKTVDKYQEALDLLTK >NZ_CP031237.1|WP_005649947.1|609818_611153_-|argininosuccinate-synthase MSNTILQNLPKGQKVGIAFSGGLDTSAALLWMRQKGAVPYAYTANLGQPDEDDYNAIPKKAMAYGAENARLIDCRSQLAHEGIAAIQCGAFHISTGGIPYFNTTPLGRAVTGTMLVAAMKEDDVNIWGDGSTFKGNDIERFYRYGLLTNPNLKIYKPWLDVQFIEELGGRLEMSQFLIENGFDYKMSVEKAYSTDSNMLGATHEAKDLEQLSTGMKIVKPIMGVAFWDEKVEIKPETVTVTFEDGVPVALNGKHFDNAVDLILEANRIGGRHGLGMSDQIENRIIEAKSRGIYEAPGMALLHIAYERLVTGIHNEDTIEQYRINGIRLGRLLYQGRWFDPQALMLRETAQRWVAKAITGTVTLELRRGNDFTILNTESPNLTYEAERLSMEKVEDAPFDPIDRIGQLTMRNLDVSDTRGKLGIYAQTGLLSAIKDSVLPQLGKK >NZ_CP031237.1|WP_005649945.1|608554_609748_+|divalent-metal-cation-transporter MASITHRRNAVLGAAFLMATSAIGPGFLTQTATFTNTLLASFGFVILLSILLDIGAQLNIWRIVIVSGKRAQDISNAVFPKAGYFLAALIVMGGLAFNIGNVGGAGLGLNSIFGIAPEMGAVISGIIAILIFLRKEAGVLMDRFAQLMGFIMVALTFYVMFKTEPPVAEAAYHSFIPEQIDPIAIVTLVGGTVGGYITFAGAHRLLDAGIQGEKAMAEVSRSSVSAILIASTMRVVLFLAVLGVVSKGVSLNPKNPAETPFEYVAGNFGQVLFGVVIWAASVTSVIGAAYTSVSFLTTLCPTIERNRNRWIIAFIVISTVVLVTVGKPAAVLVFVGTLNGLILPIALALILLAAYRSDIVGTYKHPVFLAFSGWFVVIIMAILSGKTIISYISSFFS >NZ_CP031237.1|WP_005688057.1|607773_608511_+|5-oxoprolinase-subunit-PxpA MKKIDLNADIAEGFPFDESLLQLLSSANIACGLHAGGAKEMQSAVKFAKENKVRIGAHPSFPDRENFGRTAMALSSQELIAHLRYQLGALKAICDGEGAVISYVKPHGALYNQAAKDEKIARVIAQTVYQFDPNLKLMGLAGSLMLRIAEEEKLQTISEVFADRHYMPDGSLVPRSQPNAMVESDKEAIQQVLQMVTKGQVNAIDGSLVPVKAESICLHGDNQHSLQFAKRIVEELEKNHIKITA >NZ_CP031237.1|WP_114890239.1|620569_621118_-|oligoribonuclease MPFDKQNLIWIDLEMTGLDPEKERIIEIATIVTDKNLNILAEGPVLAVHQSDELLNKMNDWCQKTHSENGLIERVKASKLTERAAELQTLDFLKKWVPKGASPICGNSIAQDKRFLVKYMPDLADYFHYRHLDVSTLKELATRWKPEILESFKKENTHLALDDIRESIKELAYYREHFMKLD >NZ_CP031237.1|WP_012054743.1|621188_622229_+|small-ribosomal-subunit-biogenesis-GTPase-RsgA MAKRKLTQNQTRRIQSNNAKTLHRHKKKDIEWSDEMLGESQEGVVVTRYSIHADVENEQGEIYRCNLRRTLSSLVVGDKVVWRKGNEQLQGVSGVIEAIHPRENEISRPDYYDGLKPIAANIDRIIIVSAVLPTLSLNIIDRYLVVCEIAEIKPLIVLNKVDLLAQEQRQEIEDQLKIYQDIGYEILMISAKSGENMEKLTALLAQGTAIFVGQSGVGKSSLINHILPSVNAQVGDVSETSGLGQHTTTSSRLYHLPQGGNLIDSPGIREFGLWHLDAEQITKGYREFQYVLGTCKFRDCKHLSDPGCALREAVEQGKISPVRYDNYHRLIESLSETKSQRHFSLV >NZ_CP031237.1|WP_006995779.1|622387_622645_+|phosphocarrier-protein-Hpr MYSKDVEIIAPNGLHTRPAAQFVKEAKAFSSEITVTSGGKSASAKSLFKLQTLALTQGTTLTISADGEDEQQAVEHLVALIPTLE >NZ_CP031237.1|WP_114890240.1|622724_624452_+|phosphoenolpyruvate-protein-phosphotransferase-PtsI MISGILASPGIAFGKALVLKEEKIVLDTQKITDDQIDAEVARFYEGRAAAVEQLNSIRERALISLGEEKAAIFEGHLMILEDEELEEEILDYLRSNKVNAGVAASKILDQQVTMLSEIDDEYLKERAGDIRDIANRLVKNILGMYIVDLGDIQEESILVAYDLTPSETAQLNLEKVLGVVTDIGGRTSHTSIMARSLELPAIVGTNKVTKLVNTGDYLILDAINNQVYINPTASQIDELKALEAKISEEKAELAKLKDLPAITLDGHKVDVVANIGTIRDCDGAERNGAEGIGLYRTEFLFMDREQLPTEEEQFIAYKQVVEAMNGRLTVIRTMDIGGDKELSYLDLPKEMNPFLGWRAIRIALDRREILNAQLRAVLRASAFGKLAVMFPMIISVEEIRELKAVIETLKAELRAEGRLFDNNIQVGVMVETPSAAVNAKFLAKEVDFFSIGTNDLTQYTLAVDRGNEFISHLYNPMHPSVLGLIKQVIDASHAEGKWTGMCGELAGDERATLLLLGMGLDEFSMSAISVPRIKKLIRNVNFQDAKVLADTALQKPTAAEIDQLIEEFLLENSLN >NZ_CP031237.1|WP_005654343.1|624511_625012_+|PTS-glucose-transporter-subunit-IIA MGLFDKLFGSKENKSVEVEIYAPISGEIVNIEDVPDVVFSEKIVGDGVAVRPIGNKIVAPVDGVIGKIFETNHAFSMESKEGVELFVHFGIDTVELKGEGFTRIAQEGQSVKRGDTVIEFDLALLESKAKSVLTPIVISNMDEISCIVKKSGEVVAGESVVLALKK >NZ_CP031237.1|WP_005654344.1|625196_625409_+|hypothetical-protein MQNIQYECGETHHLKAQSASILLVMKGQLNLRSETTALSLKQGEVAFITAGAAYEVEGLIEGYAVVAKLP >NZ_CP031237.1|WP_005654345.1|625523_625889_+|YgiW/YdeI-family-stress-tolerance-OB-fold-protein MKKFALATIFALATTSAFAGFNGNNSQGGFQQAAPAAISVKQALSAADNSMITLVGNITQQIDDDEFWFTDGTGQIKIEIKKRVWNGLNVDSKDKVKIYGKLDNEVFEKAELDVLRIEKVE >NZ_CP031237.1|WP_114890241.1|625952_626618_+|response-regulator MRILLIEDDNLIGNGLQIGLTKLGFAVDWFTDGKTGMAALTSAPYDAVVLDLTLPKLDGLDVLQQWRSNHQDVPVLILTARDTLDERVKGLQSGADDYLCKPFALAEVAARLQALIRRRYGYHHSVIEQAGVKLDQNQRSVWLNNQPISLTSREYKLLELFMLNKDRVLSRSSIEEKLSSWDEEISSGALDVHIYNLRQKLGKQFIRTVHGVGYALGQVEK >NZ_CP031237.1|WP_110426436.1|626614_627970_+|two-component-system-sensor-histidine-kinase-QseC MKNRSLTLRLISVLCLTALFVWLGSTLVAWWQVRHDVNKVFDAQQVLFAERLANSDLSTILLESSTTLNKNSQSVLKKSYDDDALAFAIFSKTGKLLFSDGRNGKDFIFNYKMGFYNANIYDDDDKWRIFWRMAANGELVIAVGQELDYREDLIEEMIFGQMWIWFASLPILIIVLGWLIHKELRPIKRLSQEVQTRKSGDVSLLNTEGLPVEILPLVKNLNQFFDRTSAMLQRERRFTSDAAHELRSPLAALRIQTEVAQLAGDDVALREQALLHLTQGIDRASQLIEQLLTLSRLDNLQALETLQLLDWEAIVQSLISERYFVAEKRKITLVFEKESEPKQKQGQSILVSLMLRNLLDNAIKYCPEDTIVSVKISSSQIIIEDNGGGVEPEDLKKLGQRFYRPAGQNEKGSGLGLSIVMRIAELHGFKVRLENVVKEGRRIGLKAIISL >NZ_CP031237.1|WP_005664890.1|628246_630274_+|BCCT-family-transporter MSLSQFMTKRTSFNPLVIGVTLFFILLLMAMIFIAPEQTQALLNQAKSGIFANFSWFYVLTFSVFLGFLLILSVSSLGNIKLGQDEEEPEFSFLSWLAMLFAAGMGVGLMFFGVAEPLTHYLSDITAGSAEHKQQEALLHTLFHWGIHAWAVYGTIALALAYFGFRYKLPLALRSCFYPLLKDRINGKIGDAIDVMALLATLFGIITTLGFGSSQLGAGLEQIGWISQNSFALQVSVIVVVMCLAVFSAISGVGKGVKILSEINLTLAFCLLLFVLIAGPTLYLLSAFSDNIGNYFSNLVQLSFKTYAYEQEHTSWFSGWTVLYWAWWCSWAPFVGLFIARISKGRTIREFIFGVLVIPSLFGILWFTVFGNTAVWLNDGIAAGGLGEFISSPEILLFKFLNYLPLPTITGFVSLLVISLFFITSADSGIYVLNNIASRDKSLASPAWQAIMWGTLMSVVAIVLMQSGGLANLQTMTLIVALPFALLMLVMCFSLWKGLIADKKYFSTKVNPTSIFWSGDKWKSHLEQMMNQTQEKDILRFLKNTALPAMRELRQELTGKYNLSVEINTLFEQEEPALELVIHKESMRDFMYGIKSVGREVSEQLINDENLPHIQHSVTYEPYTYFFDGRVGYDVQYMDQDELIADMLKQYERYLSLLDDVGQELMAHEQTELAE |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
840278 : 881920
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP031237|840278:881920|DBSCAN-SWA AATGGAACATAAATCTTCCCCTAAACGCCCTTATTTATTACGCGCCTATTATGATTGGCTAGTCGATAATAGTTTTACGCCTTATTTAGTTGTTGATGCGACTTACTTAGGTGTGAATGTTCCTGTCGAATATGTAAAAGATGGACAGATTGTATTAAACTTGTCTGCCAGTGCTACGGGCAATTTACAACTTACAAATGATTTCATCCAGTTTAATGCGCGTTTTAAAGGTGTCTCTCGTGAACTGTATATTCCAATGGGCGCAGCCCTTGCGATTTATGCTCGTGAGAATGGCGATGGCGTGATGTTTGAACCTGAGGAAATTTATGATGAACTTAACATCGAGCCAGATACTGAACAACCAACAGGTTTTTATGAAGCAGTAGATAAGCCTAAAAAACGAGAAGAAAAAAAGAAAACAAAATCAGTTTCCCATTTAAGAATTGTGGATTAAGAAAAAACGCGATGAAATTATCATCGCGTTTATTTTTATAAATTACCTTGTTTTGCAATAAAGTTGAGAATTTTTTCTTCAATGCCTTTTGTATCCAATCCTAAATCTGCCAATGCTTCTTGCTGTGTCGCTTGTGGAATAAAATAATCTGGCAAGCCAAGTTGTAAAAGTGCGGTTGATTTTCCTGATGAATTTAGTACTTCCGCAACAGCAGATCCCGCTCCACCTTGAATTGCATTTTCTTCCAATGTGACCAAATAATCGTGAGTTTGTGCAAGCACATTAATCATTTCAATATCAATCGGTTTCACAAAACGCATATCGACAACCGTTGCATTGAGTTTTTCTGATAACTCTAAAGCGGATGGTAATAGAGTACCAAAATTTAAAATCGCAATTTTTTGACCTTTTCGAATTAAACGTGATTTACCAATAGGAAGCATTTCTAAAGGAGTAAGTTTTACACCAACGGCATTTCCGCGAGGGTAGCGTACTGCCGCAGGTTTTCCACATTGATAACCTGTATAGAGCATTTGACGGCATTCATTTTCATCACTCGGCGTCATAATGATCATATTTGGAATGCAACGCATAAAGCTAATATCGAATGCACCTTGATGTGTAGCCCCATCTGCACCAACTATCCCTGCTCGATCAATTGCAAATAGCACAGGGAGATTTTGAATGGCAACATCGTGAATTAATTGATCGTAAGCACGTTGTAAAAATGTCGAGTAAATTGCGACGACAGGTTTATATCCGCCAATTGCAAGTCCTGTGGCAAACGTGACAGCGTGCTGTTCTGCAATCGCTACGTCAAAATATTGTTTTGGGAAGCGTTGGGAAAATTCTACCATACCTGAACCCTCACGCATTGCAGGTGTGATACCTATAATTTTGGCATCTTTTTCTGCCATTTCACATAGCCAATCGCCAAAAATTTTCGAATAAGTTGGTTTACTATTGTTTTTGGGCAATTCGCCACTGATTGGATCAAATTTAGGTACACCGTGGAAACCAATCGGATCTTTTTCTGCGGGTGCGTATCCTTTACCTTTTTTCGTTTTTATATGCAAAAATTGTGGGCCTTTCAGATTACGCATATTCGTAAGCGTTGCCACTAATTCATCAATGTTATGCCCATCCACAGGGCCAATATAGTTAAAACCGAGTTCTTCAAATAATGTACTTTCTGGCGAAAACATTACACCTTTCATATGTTCTTCGGTTTTTTTCATAAAGTTTTTGATTGGAGGAACTTTATCAAGGATTTTTTTACTGCCATCACGAAGCGTAGAGTAAAGAGAGCCAGAGAAAATACGCGCAAGATGATTATTTAATGCGCCAACGTTTTCTGAAATAGACATTTCGTTATCATTTAAAATAACTAACATATCTGTATGCAATGCCCCCGCGTGATTTAATGCCTCAAATGCCATTCCCGCAGTAATTGCGCCATCACCGATGACACATACTGTTTTTCTACCTGCATTTTCTCGTTCTGCGGCAACGGCAATGCCTAATCCCGCACTAATAGACGTAGAGGAGTGACCAACACTTAATACATCAAATTCACTTTCTTCACGCCAAGGAAAAGGATGAATACCGTCTTTTTGGCGAATTGTGGACATTTGCTCTCGGCGACCCGTTAGGATTTTATGTGGATAAGCTTGATGTCCCACATCCCAAATTAACTGATCAAATGGTGTTTTATACACGTAATGTAGTGCAACGGTTAGCTCTACAGTGCCTAAACCTGACGCTAAATGTCCGCTAGTTTGACTAACAGATTCTAAAAGATAAGCACGTAATTCTTGACAGAGTTGTGGTAGCTGATCTTTATTTAAAAGACGCAAATCTTCTGGAGAATTAATTAAAGATAAAAGAGGATAATTGTTCATATTGTTAGTCATTTTAAGAACGTGATAAATTTTGACCGCACTTTTGTGAGTGTTTAACTTTTTCTGGTAATAATGAATTCAGCTAATGCACGAAGTGCGGTCGTATCAAAAGGAATTTTTTCTAATTCAGACAAAGCACTTTGATATAGATCTTGCGCTTTTTGTTTTGCGCCACTTAATCCAAGTAATTTTGGATATGTACTTTTATCTAAATCAAGATCGGCGCCCACCTGTTTGCCAATTTCTGCACTATCGCCTTCAATATCTAAAATATCATCTTGAACTTGAAAGGCTAAACCAATGGCTTCCGCATATTGTGTTAAGGATTGTTCTAACCTTTTGTCGGTAAAATGTGGAGAACAAATGAAACCTAATTTTAATGCGGCAATTAGCAATGCACCCGTTTTGTTACGATGGATTAATTCTAATTCACTTAAACTAATTTGTTTATGCTCAGAAATAAGATCTAAACTTTGCCCTAAACACATCCCTTGCACACCAGCGCCTTGCGCTAAAATTTGAATTAAAGCCAGTTTTTGTTCAGCAGAAATATTCGGTGTTTTGGTTAATATTTCAAATGCGAAACTTTGCAGTGCATCGCCCGCAAGAATAGCTGTAGCTTCATCAAATTGGATATGACAAGTAGGATGTCCACGGCGTAGATTATCATCATCCATTGCAGGTAAATCATCGTGAATTAAGGAATAGGCGTGAATGGCTTCAATGGCAGCGGCAGCGTAATCTAAGGTTTGTTTCTCTGCACCAAGCATTTGACCTGTTGCGTAAACTAAGAAAGGGCGAACTCGCTTACCGCCAAGTAATAATGCGTATTTCATCGCCTCAAGCAAAGGCGCATTATGACTTTCAATGCCCTCAAATTGAGCTTCTAAAAAGCGATTGATACGAGTTTGAACCTGTTGTAATTCTTCAGAAAAGTGACCCATTAAGCATTCCCTTCATAATCATTCCCTTTATAATCATTCAGTGGCGCATCTTCTGTTTTTTGCAATAAGATCTGAATGCGTTGTTCTGCTTGTTGTAAACGTTCTTGCCCTAACTTAGCGAGTTGCACACCTTGTTCAAATTCTTTTAACGCTTCTTCTAACGGTAGATCGCCATTTTCTAAATGAGCAACAATATTTTCTAACTTCGCTAATGTTGTTTCAAAATCTTGTGAAGATGCGGGTTTACGCGCCATGGAATTATCCTTTTTCACGGTAAAAATTGTTTGCCATTGTACTGTATTTTACTTGAGTTGTTAAAAAATTATTTCAAGCTAGGACCAGTGGACTTTTCACTATCTTTGCGTAAAATACTCGCCACTTTAAATACCCAAGAAATACCTAAGCTATTTATATGAAATTTATCGTTAAACTTTTTCCTGAAATTATGATTAAAAGCGAAACTGTGCGTAAACGTTTCGCAAAAATTTTAACCTCTAATATCCGCAATATTTTACAGAAATATGATGAAGAAACCGCAGTTGTGCGTCACTGGGATTACATTGAAGTGTGGTCAAAAAATGAAGAGAATCGTGAAGAATTAATCGCCTTGTTACAACGTATTCCTGGTATTCATCATTTTTTAGAAGTTGAAGAAAAACCATTTACCGATTTGCATCATATTTTTGAATTGACGCTTGCTGATGTCGCACAACAACTTCAAGGCAAAACCTTTTGCGTTCGAGTAAAACGTAAAGGAAAACATAAATTTAGTTCGATTGAAGCAGAACGTTATATCGGCGGTGGATTAAATCAACACATTGAAAGTGCAAAAGTGCGGTTGAAAAATCCAGATGTGACTGTTCGTATTGATATTGAAGATGACAAAATGATGTTAGTTAAAGCACGTCACGCTGGTATTGGTGGTTATCCGATTGGTACGCAAGAAGATGTACTTTCTTTAATTTCGGGGGGATTTGATTCAGGCGTATCGAGTTATATGTTGATTCGTCGTGGTTCCCGAGTTCATTATTGTTTCTTTAATCTTGGCGGTGCAGCCCATGAAATTGGCGTTAAACAAATGGCTTATCATATTTGGCAACGCTATAGCTCTTCACATAAAGTACGCTTTATTGCGATTAACTTTGAGGGAGTTGTCGGTGAGATTTTAGAGAAAGTCGATAACGGACAAATGGGTGTGGTATTAAAACGGATGATGGTGCGAGCCGCAAGTAAAGTCGCTCAACGTTTTAATATTGAAGCGATTGTGACAGGGGAGGCATTAGGGCAAGTATCTAGCCAAACTTTAACCAATTTACGCTTGATTGATGAAGCCGCTGATGCCTTAGTATTACGTCCGTTAATTACCCATGATAAAGAACAAATTATCGCAATGGCGAAAGAAATTGGTACCGACGATATTGCAAAATCTATGCCGGAATTTTGTGGCGTGATTTCAAAAAATCCTACGATCAAAGCGGTTCGTGAAAAGATTCTTAAAGAAGAAGGGCATTTTAATTTTGAGATTCTTGAAAGTGCGGTACAAAATGCAAAATATTTAGATATTCGCCAGATTGCAGAAGAAACAGAAAAAGAAGTCGTGGAAGTCGAGGCAATTTCTGTATTAGGTGAAAATGAAGTGATTTTGGATATTCGTAGCCCAGAAGAAACGGATGAAAAGCCATTTGAATCAGGTACACATGA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49 | Aggregatibacter_phage(24.14%) | holin,protease,capsid,terminase,tRNA,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1106792 : 1115306
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP031237|1106792:1115306|DBSCAN-SWA 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CAGTTGGATTTCTCACACCGTTACAGCTGCATCGCTCACAGGTTATTCTATGCCGATTTTCTGGTGGGGTTTAATTTTAATTTTATATGTTTCGCCACAACTCGGTTTGCCACAAGGTGGGCGTTTAGATAATGAATTTTGGATCGATACACCAACAGGATTTATGCTTATTGACAGCTGGCTTTCTGGTATGCCAGGTGCCTTCGAAAATGCGGTGAAATCCTTAATTCTTCCAGCAATAGTCCTAGGCACCGTTCCTCTCGCCATTATTACGCGTATGACACGATCTGCGATGTTGGAAGTGTTAGGTGAAGATTACATTCGCACGGCTAAAGCAAAAGGTTTAAGCTATACTCGAATTGTTATTGTTCACGCATTGCGTAATGCGTTAATTCCTGTTGTCACTGTGGTCGGATTAATTGTAGGTCAATTGCTTTCTGGTGCAGTTCTCACAGAAACCATTTTCTCTTGGCCGGGAATTGGAAAATGGATTATTGATGCCATTCAAGCCCGTGATTATCCAGTGTTGCAAGGTTCTGTACTGATTATTGCGACGATTATTATTGTGGTAAATTTAACCGTCGATTTACTTTACGGCGTGGTCAATCCGCGTATCCGTCATTAATTGTAGGAGAAATTATGTCTGACACGCCTTTAACTTTCGCGCCAAAAACACCCTTACAAGAATTTTGGTTTTACTTTAAACAAAATCGTGGTGCGCTAATTGGTTTAATTTTTATTTTGATTGTTGCCTTAATCAGCATTCTCGCGCCTTATATTGCACCTTTTGATCCAACAGAACAAAATCGTACCGCACTTTTACTGCCACCCGCTTGGTATGAGGGCGGTAATCCTGCTTATTTACTCGGCACAGACGATATTGGGCGAGATATTCTTTCGCGTATTATTTATGGAACGCGAATTTCCGTCTTTGCGGGATTTGTCATTGTATTACTATCTTGCGCCTTTGGTACCAGCCTTGGCTTGATTTCTGGCTATTATGGCGGCGTGCTAGATACAATTATCATTCGCCTAATTGATATTATGCTCGCGATTCCAAACTTACTTTTGACGATTGTAGTCGTCTCTATTTTAGAGCCATCACTCGCCAATGCCACTTTAGCGATCGCCGTGGTATCGATTCCTAGCTATGTGCGTTTAACTCGAGCAGCGATGATGAATGAAAAAAATCGTGATTATGTGACTTCATCTAAAGTGGCAGGGGCAGGTATTTTACGCCTCATGTTTATTGTGATTTTACCAAACTGTTTAGCCCCTTTAATTGTGCAAATGACTATGGGAATATCCAATGCTATCTTAGAACTCGCGACACTTGGTTTCTTAGGCATTGGTGCAAAACCACCAACACCTGAACTTGGCACAATGCTTTCAGAAGCACGTGGTTTTATGCAAGCGGCAAACTGGTTGGTTACAATTCCTGGCTTAGTGATTTTATCTTTGGTGCTTGCTTTCAACTTAATGGGCGATGGCTTGCGTGATGCCCTTGATCCAAAACTCAAACAATAGGAAAACAGAATGGCATTATTAGACGTAAAAGAACTTTCTGTTCACTTTGGCGATAAAACAACGCCATTTAAAGCAGTGGATCGTATCAGCTATCAAGTCGCACAAGGCGAAGTGCTTGGCATTGTGGGAGAATCAGGTTCGGGTAAATCTGTGAGTTCTCTCGCAATTATGGGATTAATTGATCATCCTGGACGTGTATCTGCTGAATCCTTGCAATTTGAAAATACTGATTTACTCACTTTAGAGAGTAAAGCTAAACGCCAGCTTATTGGTGCTGATGTTGCGATGATTTTCCAAGATCCGATGACAAGTTTAAATCCTGCTTATACTGTGGGCTTCCAAATTATGGAGGCGTTAAAAACTCACGAGGGCGGCACAAAAAAGGCAAGAAAAGACCGCACTTTAGAGCTTTTAAAATTGGTCGGTATTCCTGATCCTGAATCTCGGATTGATGTTTATCCCCATCAGCTGTCTGGTGGAATGAGCCAGCGCGTGATGATTGCTATGGCAATTGCTTGCAGACCTAAATTATTGATTGCTGACGAACCAACCACGGCATTGGACGTGACTATCCAAGCTCAAATTATGGAACTCTTACTTGAATTGCAAAAGAAAGAATGTATGTCCCTAATTTTGATTACTCACGATCTAGCACTTGTGGCTGAAGCGGCAGAGCGAATTATCGTGATGTATGCTGGACAAATCGTTGAAGAAGGCGCCGCAAAAGATATTTTCCGCGAGCCAAAACACCCTTACACACAAGCCTTGTTACGTTCATTACCTGAATTTGCAGAGGGAAAATCTCGCTTAGAATCATTACAAGGGGTCGTCCCTGGAAAATACGATCGCCCAACAGGCTGTTTATTAAATCCTCGCTGCCCTTATGCCACCGAATATTGTCGCCAAGTTGAACCTCAATTGCATCATATCGGTTCGCATAAAGTAAAATGCCATACTCCGCTGAACGAGCAAGGCAATCCAGTTGAATATCAAGGAGCTTAATAATGACGAATGAAGTAAAAGAAAATACGCCATTATTAAATGCCATTGGCTTAAAAAAATATTACCCTGTAAAAAAAGGCTTGTTTGCAAAACCACAGCAAGTAAAAGCGTTGGATGGTGTCTCTTTTCAGCTTGAACGAGGTAAAACTTTAGCAGTCGTGGGTGAATCAGGTTGTGGAAAATCAACGCTAGGTCGTTTATTGACAATGATTGAAGAACCAACCAAAGGCGAACTTTATTACAAAGGGCATAATTTTTTAGAAAATGATTCTGAAACAAAAGCACTACGTCGTAAAAAAATTCAAATAGTTTTTCAAAATCCTTACGCATCGTTAAATCCACGCAAAAAGATTGGTTCAATTTTGGAAGAACCATTAATCATCAATACAAAACTTTCCGCCAAAGAACGTCGAGAAAAAGTTTTATCGATGATGGAAAAAGTGGGCTTGCGCGCTGAATTTTATGATCGTTATCCCCACATGTTCTCAGGCGGACAACGCCAACGTATTGCCATCGCTCGTGGTTTAATGTTAGATCCCGATGTCGTTGTTGCCGATGAGCCTGTTTCTGCATTGGATGTTTCCGTACGTGCGCAAGTACTGAATTTAATGATGGATTTACAAGATGAATTAGGCTTGTCTTACGTATTCATTTCACACGATCTTTCTGTGGTAGAACATATCGCTGATGAAGTGATGGTAATGTATCTAGGTCGTTGTATTGAAAAAGGGACGACAGAGCAGATTTTTTCTAATCCTCAGCATCCTTATACCAAAGCGTTACTTTCAGCGACACCACGTTTGTCGCCAAACTTGCGCCGTGAACGCATAAAACTGACAGGCGAATTGCCAAGCCCAATTAATCCGCCAAAAGGCTGTGCATTTAATCCTCGTTGTTGGAAAGCGACAGAAAAATGTCGTGAAAATCAACCGCACTTGGAACAATATACTGATGGAAAATTAATCGCTTGTTTCCATATTGATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP031237|1106792:1115306|1114322_1115306_+|WP_005663823.1|DBSCAN-SWA MTNEVKENTPLLNAIGLKKYYPVKKGLFAKPQQVKALDGVSFQLERGKTLAVVGESGCGKSTLGRLLTMIEEPTKGELYYKGHNFLENDSETKALRRKKIQIVFQNPYASLNPRKKIGSILEEPLIINTKLSAKERREKVLSMMEKVGLRAEFYDRYPHMFSGGQRQRIAIARGLMLDPDVVVADEPVSALDVSVRAQVLNLMMDLQDELGLSYVFISHDLSVVEHIADEVMVMYLGRCIEKGTTEQIFSNPQHPYTKALLSATPRLSPNLRRERIKLTGELPSPINPPKGCAFNPRCWKATEKCRENQPHLEQYTDGKLIACFHID >NZ_CP031237|1106792:1115306|1111414_1112416_+|WP_162691293.1|DBSCAN-SWA MFKFVFKRILMVIPTFIAITLITFALVHFIPGDPVEIMMGERGLTAEVHQQMMHQLGLDLPLYQQYFHYIGNVIQGDFGASFRTQQPVLSEFFTLFPATAELAFFALFWSLLGGIILGTIAAVKKDSWISHTVTAASLTGYSMPIFWWGLILILYVSPQLGLPQGGRLDNEFWIDTPTGFMLIDSWLSGMPGAFENAVKSLILPAIVLGTVPLAIITRMTRSAMLEVLGEDYIRTAKAKGLSYTRIVIVHALRNALIPVVTVVGLIVGQLLSGAVLTETIFSWPGIGKWIIDAIQARDYPVLQGSVLIIATIIIVVNLTVDLLYGVVNPRIRH >NZ_CP031237|1106792:1115306|1106792_1107476_+|WP_112071454.1|DBSCAN-SWA MNIFNPNHDRKAIVIFSGGQDSTTCLFQAIAEYGKENVEAITFQYGQRHAIELEKARTIAQDLGIKQTLIDTSVMKAITHNALMDEQAHIEQKESELPNTFVDGRNALFLLYAAIYAKGQGIQDIITGVCETDFSGYPDCRDVFIKSMNVTLNLAMDYQFNIKTPLMYLTKAQTWQLADELGVLDYVQKHTHTCYEGIEGGCGKCPSCILRNKGLKKYLTQKGRKNV >NZ_CP031237|1106792:1115306|1113327_1114320_+|WP_114890456.1|DBSCAN-SWA MALLDVKELSVHFGDKTTPFKAVDRISYQVAQGEVLGIVGESGSGKSVSSLAIMGLIDHPGRVSAESLQFENTDLLTLESKAKRQLIGADVAMIFQDPMTSLNPAYTVGFQIMEALKTHEGGTKKARKDRTLELLKLVGIPDPESRIDVYPHQLSGGMSQRVMIAMAIACRPKLLIADEPTTALDVTIQAQIMELLLELQKKECMSLILITHDLALVAEAAERIIVMYAGQIVEEGAAKDIFREPKHPYTQALLRSLPEFAEGKSRLESLQGVVPGKYDRPTGCLLNPRCPYATEYCRQVEPQLHHIGSHKVKCHTPLNEQGNPVEYQGA >NZ_CP031237|1106792:1115306|1107468_1107894_+|WP_005663812.1|DBSCAN-SWA MFKISKEFSFDMAHLLDGHDGKCQNLHGHTYKLQVEISGDLYKSGAKKAMVIDFSDLKSIVKKVILDPMDHAFIYDQTNERESQIATLLQKLNSKTFGVPFRTTAEEIARFIFNRLKHDEQLSISSIRLWETPTSFCEYQE >NZ_CP031237|1106792:1115306|1107894_1108530_+|WP_005686506.1|DBSCAN-SWA MLMEKYHDFEPNFNIVEIFESLQGEGFNTGMPSVFVRFGKCNLDCPWCDTPYNNFKRWSVSQILEKVRSFSSKNIIITGGEPTIVPKIEYLLEQFKSDGYFLAIETNGLKAIPAQIDYIATSPKSLYAHKYEKRCIPFANEVRIVMDSNMPSFCELIEQKIKAKNYYLSPCEIDGKMNLLETITLLGQLNQRSNKPKWQLSLQTHKLIGIE >NZ_CP031237|1106792:1115306|1109144_1111325_+|WP_162790543.1|DBSCAN-SWA MDISELLDGLNDKQREAVAAPLGNHLVLAGAGSGKTRVLTHRIAWLIAVENISEGSIMAVTFTNKAAAEMRHRIQSTLAKHAQHQLFGMWIGTFHSIAHRLLRAHHLDVGLPQDFQILDSEDQLRLIKRLLKLHNFDEKAFPPKQACWYINNKKDEGLRPNDIEDFNDRQEREWIKIYQIYQDTCDRAGLVDFAELLIRVYELFEKKPLILQRYQQRFQHILVDEFQDTNKIQYKWIKILAGKTGKVMIVGDDDQSIYGWRGAQIENIQKFLKDFKAETIRLEQNYRSTANILNSANELIANNSDRLGKNLWTEGEKGDPVGIYSAFNELDEAKFVASQIQDWVEHGGKLDDCAVLYRSNSQSRVIEEALIRCQIPYRIYGGMRFFERQEIKDALAYLRLINNRQDDAAFERVINTPTRGIGDRTLDILRNLTRERQITLWQAVQVATQENMLAGRASTALLRFQELINSLQLDTAEMPLFAQTDFVIKHSGLYEMYKQEKGEKGEVRIENLEELVTATREFIKPDDAEEMTELTAFLTHASLEAGEEQASPHQSCVEMMTLHSAKGLEFPRVFMVGVEEGLFPSFRSFEEPGRLEEERRLAYVGITRAQKKLTISYAESRRLYAKEERHLPSRFIAELPRECIQEIRLRGTVTRAMNLAKVGSLSNTSAVENEWKMGQKVKHEKFGFGTVINVEGSENNTRLQIAFQAQGIKWLIAHLAKLEKVR >NZ_CP031237|1106792:1115306|1112430_1113318_+|WP_015702107.1|DBSCAN-SWA MSDTPLTFAPKTPLQEFWFYFKQNRGALIGLIFILIVALISILAPYIAPFDPTEQNRTALLLPPAWYEGGNPAYLLGTDDIGRDILSRIIYGTRISVFAGFVIVLLSCAFGTSLGLISGYYGGVLDTIIIRLIDIMLAIPNLLLTIVVVSILEPSLANATLAIAVVSIPSYVRLTRAAMMNEKNRDYVTSSKVAGAGILRLMFIVILPNCLAPLIVQMTMGISNAILELATLGFLGIGAKPPTPELGTMLSEARGFMQAANWLVTIPGLVILSLVLAFNLMGDGLRDALDPKLKQ |
8 | uncultured_Caudovirales_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1245900 : 1254969
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP031237|1245900:1254969|DBSCAN-SWA TATGTTTAACAAAATTTTTTCGTGGTTTGAAAATCGTTTAAATCCCTATCCAGAAAGCAATCCAACAACACCTAAAAAAGGTTTGTTCCGTTTTATTTGGTCTAGTATTACAGGAATGAGAGGCTGGATTTTTTTGCTCGCAATTTTAACCGTAGGTACAGGTGTAATGGAAGCTGTATTATTCCAATTTATGGGAACGCTTGTAGATTGGTTAGGCACATTTACACCTGAAAGATTATGGCAAGAAAAAAGTCATTTATTAATTGGAATGGCTGCTCTATTACTTATTAGTATTGTGTGGGGATTTTTAGCTTCGGCCGTGCATTTACAAACCTTACAAGGCGTATTTCCAATGCGATTACGTTGGAATTTCCATCGTTTAATGCTTGGACAAAGTTTAAGTTTTTATCAAGACGAATTTGCAGGTAGAGTATCCGCAAAAGTAATGCAAACCGCCCTTGCAGTACGTGACACAGTACTTACACTTGCAGATATGTTCGTTTATGTATTGGTATATTTTATTACCTCTGGCGTAGTGCTAGTGGCATTAGATTCTTGGTTCTTATTACCATTTATTACTTGGATTATACTCTTCAGTTTGATCCTACGAACCCTAATTCCTAAACTATCAAAAACCGCACAACGACAAGCTGATGCTCGTTCTTTAATGACAGGACGCATTACAGATGCTTATTCTAATATTGCTACAGTAAAATTATTTTCTCACGGCTCACGCGAAGCTACTTATGCCAAGCGTTCTATGCAAGATTTTATGGTAACAGTACACGCCCAAATGCGCTTAGCAACATCACTAGATACACTCACTTACGCTACAAATATTCTACTTACGTTAAGTACTGCAATACTTGGTATTATTTTATGGAAAAATGGTCAAGTCGGCGTGGGTGCAATAGCAACGGCAACGGCAATGGCATTACGCGCAAATGGGCTTTCTCGCTGGATTATGTGGGAATCAGCCCGTTTGTTTGAGAATATCGGAACCGTAAACGACGGAATGAATACTTTAACCAAACCCCACACCATTGTGGATAAACCACAAGCGTCACCGTTACAAGTGAAACAAGGGGAAATTAAGTTTAACGATATTACCTTTGCTTACGATCCGACAAAACCATTACTCAATCATTTCAATCTCACTATCAAACCAGGGGAAAAGGTTGGGTTAATCGGTCGTTCTGGTGCAGGAAAATCTACGATTGTAAACTTATTGCTTCGCTTTTATGAAGCACAACAAGGCGAAATTACCATTGATGGGCAAAATGTACTCAATGTGCAACAAGAAAGCTTACGTCGCCAAATCGGTTTAGTCACTCAAGACACTTCCTTGCTACATCGTTCTGTACGTGACAATATTATTTATGGTCGCCCGAATGCTACTGATGAAGAAATGGTTTTAGCTGCTGAACGAGCGGAAGCCGCTGATTTCATCCCATTTCTTAGTGATTCTCAAGGTAGAAAAGGCTATGATGCCCATGTGGGAGAACGCGGGGTAAAACTTTCTGGTGGTCAGCGTCAGAGAATTGCCATTGCTCGTGTAATGTTAAAAGACGCACCAATTCTATTGTTAGATGAAGCCACAAGTGCATTGGATTCAGAAGTGGAAGTGGCAATACAAGAAAGTCTAGATAAGATGATGGAAAATAAAACTGTGATTGCCATTGCCCATCGTTTATCCACCATCGCAGCGATGGATCGCCTGATTGTGCTTGATAAAGGACAAATTGTCGAACAAGGTACGCACGCCGAATTACTAGAGCTCAATGGTCTGTACGCTAAACTTTGGAATCATCAAAGTGGCGGATTTTTAAGCGGAAGTGCTGAATAATATTGCGTTTATCATATTTAATTAATTGTACTGTAATCAAGCTAATTAAAAAATTAGTCTAATTTAATAGCTAAAGAAAAGTGCGGTGAATTTTCACCGCACTTTTTTGCTAGATATTTAGCGTTTAATTCACGACTTCAGCAGTATATTTCAGCTTGTGAATTGCATCGAATAATTGTTGGTTTGTGACTTTTGGATCTTCCACAACCGTCACTAAACCATCTTTAATAGATGCTTTTGTTAAAATAACGCCATCAATATTACGCAGTTCTTTATTGACTAAGTAAGCACAAAGCTGGCAATTCATTTCCTTTACTTTTAGCACAATTTGTTTGGTTTCATTCGCATGAGCGAAAGAAATTGCAAACAGCGAAAGCAAAAGTGCGGTACATAATTTCTTCATTTTTATTCCTAATTAGCTAATTCTAAAATCCAAGGTAAAATTGTTGGATAGGTTAAGAAAAAAATCATCACGATAAATACAATCCAATATAAAACGATAAGTTTTTTACGGGAAATATATTTGCTACAAATGATTTTTTTGGAAAACATCAACAGCCAAAATCCATAGGCAAAGGCACATAATGAAATGATAAGCATAGGAATACGCAAATAATCATATTCGCCTAAGCCAATCAACCAAGTGGACGACACACCAAATACTAAATAAATTAATGGTGCGATGCAGCACAAGGTTGATGCCACCGCAGCACTTAGTGCGGTGGCTATGGCAACCCAAAAGGATTTATTAGAGTTTTTTAGATACGTAGTCATATTTAAATTCTTTTGGGTCAAAGGAATTTAACGGATCGCCACCTACTTCTGCATATGGATAGCCGAAGTTATTGATTGGAGCCAGTTCTGGTTGTGGATATAAATCGAAGTCACGGGCATGATTAAATCCCACCCAGTTAGCTTCCCAGTTACCAAACAAATATTTTGCTACGGCTTGTGTATCTTTATCTTCAACAGATTTTTTCTCTGCTAAACGCATTTTGGCAACGTCTGCGGAATCAACTGGTACCCATCCAAATCCTGCAAGGTAGAATTCAGCGCGGCAGTGCTGACCGCCACTTACGTTTGCGATGCCTTGTTCATTCGCACTACCGAAGGCACCTTTTGAATATTTGCCCATTTTCTCTGCCGCACCTAAGCGAATACCAAAAATTTCACGAGCAGGGATGCCTGCAGCACGAGCAAGTGCCACAAATACAGAGTTAATATCGGTACATTTACCTTTTAACACGCCAGTGGTAAGAATTTTTTCTACATCGCCGTCACCACAACCTAATACAGAATTATCACGTTCCATATTTTTTACGATCCAGTGGTGAATAAGTTCTGCTTTCTTCAATGGATTAGTTTCTTTACCTAGGATTTTGTCAGCAAATTCTTTCACAATGCCATCAGTTTTAATATGTGGAGTAGCTTTTAAGTATTCTTGTACATCCACGGAATACTGAATATCTTTTGGCGGAGTATAATTCTCTAAAGCACCTTTCACCATCGGTTCACGGTCTTTTGTTTCAATGACCATAGTGACTTTTAAATCACGTTTTTGTGCATCTTTATCCCAAGTGGCAAATAAGGTTTTCGCTCCGTATTTATTGTTTTCTGTTACATAGGCATTCATGTAATTACCTTCAAAGTGAATCGATTTCACTTGTTGGTATTCCCCATTAAATGGTAATGGAACCCATAAATTGGTTTGTCCTTGCGAGCCTTTTGGCACAACTAAATCATAGGTTTGCGTGAATTCGTAAAGATGGGCGTCTGTATTGTAGTTTGGAATATTAGTGTTTGCATGAGCTAACGAGCCACATGCAGAAAGCACCGCAACTGCGATAAGTTTCTTCATGAAGAGATCCTCTAGTTAATAATAGTTAAACTTAACATATTAGATAAACTAATACGCCACTATGCTAACGGGTTTTTAAATCCATAGTCAATTTGTTATTCCAAAATTTATTAAAACATCAATCTACTAAAATACCCTATAAATAATATACCTATTAATGATTAATTGATTTGGCTCAAGTAAAACTTCTATACAAAGATTATAATTAACTCGTTTTAGTTATTTTTCAATCTGACTGTGGGGGAACGATATAATGAGTAACTTTAATCAAATAAGTCGCCGAGATTTTGTCAAGGCGTCATCTGCGGGAGCTGCACTGGCAGTTTCAAATCTTACTTTACCTTTCAATGTAATGGCTAAAGAGACACAACGCCTCAATGAAAATAATCAAGAACGTATTGTTTGGAGTGCTTGTACAGTAAACTGTGGTAGCCGTTGTCCATTACGAATGCACGTAAAAGATAACCGAATCACTTATGTGGAAACCGATAATACGGGGACAGAAACATATAATCTTGATCATCAGGTTCGTGCTTGTCTACGTGGACGTTCTATGCGTCGTCGAGTATATAACCCAGACCGTTTAAAATATCCAATGAAACGTATAGGTAAACGCGGAGAAGGCAAATTCAAACGAATCAGTTGGGATGAGGCTTTAACTGAAATTGCAGACGCATTGAAACGCAATATCAAAAAATATGGCAATGAATCAATTTATTTAAACTATGGTACGGGAACACTCGGTGGCACAATGGCTAAATCTTGGCCACCTGCATCCACTATGATCGCTCGTTTTATGAATTGTATTGGTGGATATTTAAACCATTATGGTGATTACAGCACCGCACAAATTGCTGTCGGTTTAGATTATACCTATGGTGGTGGTTGGGCATTGGGAAATGGAATGGCTGACATTGAAAACACCAAATTAATAGTGTTATTCGGTAATAATCCTGCAGAAACTCGTATGAGTGGAGGTGGTTTAACTTATTGTATTGAACAAGCCAAAGCTCGTTCCAATGCCAAAATGATTATCATCGATCCTCGTTATAATGATACTGGTGCAGGGCGTGAAGATGAGTGGATCCCAATTCGTCCAGGCACTGATGCAGCCCTCGTTTCTGCCCTTGCTTATGTAATGATTCAAGAAAATCTCGTGGATCAACCTTTCTTAGATAAATATTGTGTTGGTTATGATGAAAAAACATTACCTGCGGATGCCCCTAAAAATGGTCATTATAAAGCCTATATTTTAGGTTATAGTGATGATGGTATCGCTAAAACCCCAGAATGGGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP031237|1245900:1254969|1252287_1252905_+|WP_005647791.1|DBSCAN-SWA MEQYGFYFDSERCTGCKTCELACKDYKDLGTEVNFRRIYEYTGGQWNQQADGCWHQNIFAYYMSISCNHCADPACTKVCPTGAMHKNADGFVIVNEEICIGCRYCHMACPYDAPQYDAQKGHMTKCDGCYSRVKSGQKPICVDACPLRALDFAPIDELRTKYGTQASIAPLPPADITQPNLVVKPNKYARLSGDTSGFLGNPREV >NZ_CP031237|1245900:1254969|1248493_1249603_-|WP_042611482.1|DBSCAN-SWA MKKLIAVAVLSACGSLAHANTNIPNYNTDAHLYEFTQTYDLVVPKGSQGQTNLWVPLPFNGEYQQVKSIHFEGNYMNAYVTENNKYGAKTLFATWDKDAQKRDLKVTMVIETKDREPMVKGALENYTPPKDIQYSVDVQEYLKATPHIKTDGIVKEFADKILGKETNPLKKAELIHHWIVKNMERDNSVLGCGDGDVEKILTTGVLKGKCTDINSVFVALARAAGIPAREIFGIRLGAAEKMGKYSKGAFGSANEQGIANVSGGQHCRAEFYLAGFGWVPVDSADVAKMRLAEKKSVEDKDTQAVAKYLFGNWEANWVGFNHARDFDLYPQPELAPINNFGYPYAEVGGDPLNSFDPKEFKYDYVSKKL >NZ_CP031237|1245900:1254969|1253857_1254469_+|WP_114890503.1|DBSCAN-SWA MQNTLQQISIYGRLLGAVFYYEPNDARLTDILTFFRQPNWMQEWEISFDVKTHKKITALIEKGLQQNITEQYQYLFIGPNELPTPPWGSVYLDPECVIFGNSLLALRDFLQQHQIAFQTQQDKPEDHIGLMLMLAAYLAENRPHLLIKFLREHFLTWAYHFLEQLSKIENSDFYQALALLTIKTLQQWQVDLHINVPTVRFYR >NZ_CP031237|1245900:1254969|1247869_1248148_-|WP_015702037.1|DBSCAN-SWA MKKLCTALLLSLFAISFAHANETKQIVLKVKEMNCQLCAYLVNKELRNIDGVILTKASIKDGLVTVVEDPKVTNQQLFDAIHKLKYTAEVVN >NZ_CP031237|1245900:1254969|1254468_1254969_+|WP_005656004.1|DBSCAN-SWA MKNEAYYQAYLSHHHISRRGLLRHVFPATKSTIEKTQSRPPFSAREDLFSAVCNGCGECASACPNGLIQLKQQQATLEIDYAPCDLCGKCAEVCPTNALHPNFPADTLLRPQFSSACLILQNQTCPDCQTACPQQAISSTLEIDNERCNGCGECKITCFVAAITLK >NZ_CP031237|1245900:1254969|1245900_1247745_+|WP_114890501.1|DBSCAN-SWA MFNKIFSWFENRLNPYPESNPTTPKKGLFRFIWSSITGMRGWIFLLAILTVGTGVMEAVLFQFMGTLVDWLGTFTPERLWQEKSHLLIGMAALLLISIVWGFLASAVHLQTLQGVFPMRLRWNFHRLMLGQSLSFYQDEFAGRVSAKVMQTALAVRDTVLTLADMFVYVLVYFITSGVVLVALDSWFLLPFITWIILFSLILRTLIPKLSKTAQRQADARSLMTGRITDAYSNIATVKLFSHGSREATYAKRSMQDFMVTVHAQMRLATSLDTLTYATNILLTLSTAILGIILWKNGQVGVGAIATATAMALRANGLSRWIMWESARLFENIGTVNDGMNTLTKPHTIVDKPQASPLQVKQGEIKFNDITFAYDPTKPLLNHFNLTIKPGEKVGLIGRSGAGKSTIVNLLLRFYEAQQGEITIDGQNVLNVQQESLRRQIGLVTQDTSLLHRSVRDNIIYGRPNATDEEMVLAAERAEAADFIPFLSDSQGRKGYDAHVGERGVKLSGGQRQRIAIARVMLKDAPILLLDEATSALDSEVEVAIQESLDKMMENKTVIAIAHRLSTIAAMDRLIVLDKGQIVEQGTHAELLELNGLYAKLWNHQSGGFLSGSAE >NZ_CP031237|1245900:1254969|1249856_1252277_+|WP_114890502.1|DBSCAN-SWA MSNFNQISRRDFVKASSAGAALAVSNLTLPFNVMAKETQRLNENNQERIVWSACTVNCGSRCPLRMHVKDNRITYVETDNTGTETYNLDHQVRACLRGRSMRRRVYNPDRLKYPMKRIGKRGEGKFKRISWDEALTEIADALKRNIKKYGNESIYLNYGTGTLGGTMAKSWPPASTMIARFMNCIGGYLNHYGDYSTAQIAVGLDYTYGGGWALGNGMADIENTKLIVLFGNNPAETRMSGGGLTYCIEQAKARSNAKMIIIDPRYNDTGAGREDEWIPIRPGTDAALVSALAYVMIQENLVDQPFLDKYCVGYDEKTLPADAPKNGHYKAYILGYSDDGIAKTPEWAAKITGIPAERIIKLAREIGSTKPAFISQGWGPQRRSNGELISRAIAMLPILTGNVGIHGGNTGARESAYSIPFVRMPTLKNPVKASIPMFLWTDAIIRGTEMTALTDGIRGVDKLSSPIKVIWNYASNCLINQHAQINRTHDILQDDTQCEMIITIDNHMTSTAKYSDILLPDCTTSEQMDFALDAFVSNMAYVIFADQVIKPSFECRPIYDMLSDLAEKMGVTEKFTEGRTQEEWLRHIYKQSREKLPELPTFEEFRQQGIFKKVDPNGFKVAYKDFRDNPEAHPLKTPSGKIEIYSSRLAEIAKTWKLVEDDVIHPLPIHAQSFEHYGDPLMEKYPLQLSGFHYKARTHSTYGNVDVLKAANPQEVWMNPIDAKPRNIKNGDMIRIFNDRGEVHINVKITPRIIPGVVALSEGAWYAPDKDRIDHSGCINVLTTQRPSPLAKGNPQHSNLVQVERL >NZ_CP031237|1245900:1254969|1248156_1248519_-|WP_005651689.1|DBSCAN-SWA MTTYLKNSNKSFWVAIATALSAAVASTLCCIAPLIYLVFGVSSTWLIGLGEYDYLRIPMLIISLCAFAYGFWLLMFSKKIICSKYISRKKLIVLYWIVFIVMIFFLTYPTILPWILELAN >NZ_CP031237|1245900:1254969|1252906_1253746_+|WP_005690803.1|DBSCAN-SWA MNTGLYELPLVFFTVLAQSAVGAWLVFTFVLLNEKNTKSRTYIHKVMFVILALLGIGFIASIMHLGLPIRAFNSLNRVGSSMMSNEIAAGAIFFTLAGFYWLIAILGKMPVSLGNVWRIVTALIGILFMYVMNQVYHITSIPTWNNALTSWSFYLTVVLGGLTLSYALLIPNKQREYQLQHLPSLFAIGVSLVAIVAIYQGFNLHNIHSAIQNAADLVPNYAIMTVTRLCLLSIVAFLLFRVKNIGLLGISVLLTLVAEGIGRVLFYGLHMTYGMAIGG |
9 | Escherichia_phage(83.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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