Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP029079 | Staphylococcus aureus strain AR466 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NZ_CP029080 | Staphylococcus aureus strain AR466 chromosome, complete genome | 6 crisprs | DinG,WYL,cas3,DEDDh,csa3 | 2 | 0 | 8 | 0 |
1. NZ_CP029080
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP029080_1 | 129508-129601 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029080_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP029080_1
>1.1|129534|42|NZ_CP029080|CRISPRCasFinder CTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCAACTGCGTTCCTCCGTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029080_1
The CRISPR arrays of NZ_CP029080_1 >merge|NZ_CP029080|1|129508-129601|CRISPRCasFinder TTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGGCTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCAACTGCGTTCCTCCGTCTTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGG >NZ_CP029080|1|1|129508-129601|CRISPRCasFinder TTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGG CTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCAACTGCGTTCCTCCGTC TTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGG
>NZ_CP029080.1|WP_000019132.1|128500_129367_-|cation-transporter MSHNENLKLAQRGAYLSLIVYIILSIVKYVTGFVFNSAAVRADALNNMTDIIVSLAVIIGLKISIKPADRNHPYGHLKSENISSLLVSFVIMFVGIQVVIQNAPRLFKEDDVVPNEITIIVSLISGLVMLIVFAVNQRLAKRTKSSSLNSAAKDNLSDSLVSIGTAIGLIFTQIGFPIVDIILATLLGLLIVYTGFGIFKEAIFMLSDGFNETELEAYRNDILEVDEVQEVKSIKGRYHGSSVFIDVTIVVDANLSLVEAHQICDNVEHHLHKKGISSVYVHPEPDHL >NZ_CP029080.1|WP_001125208.1|127487_128174_-|2,3-diphosphoglycerate-dependent-phosphoglycerate-mutase MPKLILCRHGQSEWNAKNLFTGWEDVNLSEQGINEATRAGEKVRENNIAIDVAFTSLLTRALDTTHYILTESKQQWIPVYKSWRLNERHYGGLQGLNKDDARKEFGEEQVHIWRRSYDVKPPAETEEQREAYLADRRYNHLDKRMMPYSESLKDTLVRVIPFWTDHISQYLLDGQTVLVSAHGNSIRALIKYLEDVSDEDIINYEIKTGAPLVYELTDDLEVIDKYYL >NZ_CP029080.1|WP_000762708.1|127229_127334_+|putative-metal-homeostasis-protein MKLDLQTARRNLNSPNIKTRKRALKIIKQHKRAK >NZ_CP029080.1|WP_000038955.1|125616_127056_-|multidrug-efflux-MFS-transporter-MdeA MSKKQKLTMIITMLMGGFFGLLNETLLVTALPSIMKDFEISYTQVQWLTTAFLLTNGIVIPLSALVIQRYTTRQVFLVGISIFFLGTLLGGLSPHFATLLVARIIQALGAGIMMPLMMTTILDVFQPHERGKYMGIFGLVIGLAPAIGPTLSGYLVEYFNWRSLFHVVAPIAAVTFLIGFKTIKNVGTTIKVPIDFISVIFSVLGFGGLLYGTSSISEKGFDNPIVLVSMIGGIVLVALFVLRQYRLSTPLLNFAVFKNKQFTVGIIIMGVTMVSMIGSETILPIFVQNLLHRSALDSGLTLLPGAIVMAFMSMTSGALYEKFGPRKLALVGMAIVVITTAYFVVMDEQTSTIMLATVYAIRMVGIALGLIPVMTHTMNQLKPEMNAHGSSMTNTVQQIAGSIGTAALITILSHASKNFSPTMSDYNGMNKIEMMNQIKIDTMLHGYHAGFLFALLITVISFFCSFMLQGKKKEVDSHQ >NZ_CP029080.1|WP_000825936.1|124716_125496_-|transporter-substrate-binding-domain-containing-protein MKRLLFVVIAFVFILAACGNNSSKDKEASKDSKTINVGTEGTYAPFSFHDKDGKLTGYDIDVIKAVAKAEGLKLKFNETSWDSMFAGLDAGRFDVIANQVGINPDREKKYKFSKPYTFSSAVLVIRENEKDIKDFDDVKGKKLAQTFTSNYGKLAKDKGADITKVDGFNQSMDLLLSKRVDGTFNDSLSYLDYKKQKPNAKIKAIKGNAEQSKSAFAFSKKVDDETVQKFNDGLKKIEENGELAKIGKKWFGQDVSKSK >NZ_CP029080.1|WP_000479573.1|124016_124736_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MFLNLNSEQLHALDAAKQAFGPMLEGLVKYSIPITLVTFVLGLIIALFTALMRISTSKVLRSIARVYVSIIRGTPMIVQLFIIFYGIPELGRLLTNDADNQWTLAPVVAAIIGLSLNVGAYASEIIRGGIISIPKGQTEAAYSIGMTYRQTIQRIILPQAIRVSIPALGNTFLSLIKDTSLLGFILVAEMFRKAQEVASTTYEYLTIYVLVALMYWVVCFIISIIQGIYESYIERGYRS >NZ_CP029080.1|WP_000615468.1|123288_124020_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIQLNNIHKSFNDVEVIKGIDLSVGKGEVVTLIGRSGSGKTTLLRMINALEIPTEGTVYVNGKTYTSKDKKSQIEVRKQSGMVFQSYNLFPHKTALENVMEGLITVKKLKKDEARGKSLELLEKVGLTHVKDQRPHALSGGQQQRVAIARALAMNPKVMLFDEPTSALDPELVNDVLKVIKDLANEGMTMVIVTHEMRFAKEVSNNIVFIHEGMIGEQGAPEEIFNNPKTEELKRFLNVINEE >NZ_CP029080.1|WP_108703109.1|121941_123192_+|FemA/FemB-family-glycyltransferase-FmhA MNFVTLTSDEFNAFTTKHFSHYTQSAIHYNHRVDLKGDVHLVGVKDDNGQVIAGCLLTEARTLKFFKYFYTHRGPVMDYTNQSLVAFFFKALTSYLKKQNCLYVLIDPYLIENLRNAEGEIVKSYDNRAFVRTMDTLGYKHQGFPVGYDSMSQIRWLSVLDLKDKTEDQLLKEMDYQTRRNIKKTYDIGVKTKTLTIDETQTFFDLFHMAEEKHGFKFRELPYFEEMQKLYDDHAMLKLAYIDLNEYLKTLQLKQQQLTAELSGVEEALEESPNSKKNKTKRTQLEQQLNSNKRKIDNTIEQIEQDGAVLNLASALFIYNEHEVYYLSSGSNPKYNAYMGAYHLQWEMIKFAKAHHIDRYNFYGITGDFSESAEDCGVQQFKKGFNAHVEEYIGDFIKPIKPMLYKLQTYLKHKRR >NZ_CP029080.1|WP_000819842.1|121324_121687_-|DUF4467-domain-containing-protein MKRFVATVLLLLVFISGCGNDKYVKEIDEAVKIQNQKQEQLAKKGNGDRVDHFERKDANIYVYDKDKIIILAYKPLSNDDEVHYYAYDFSDERVSYKQDFDSRRYYQQHDADYHEENMTN >NZ_CP029080.1|WP_000162809.1|120706_121306_-|DsbA-family-protein MTKKLLTLFIVSMLILTACGKKESATTSSKNGKPLVVIYGDYKCPYCKELDEKVMPKLRKNYIDNHKVEYQFVNLAFLGKDSIVGSRASHAVLMYAPKSFLDFQKQLFAAQQDENKEWLTKELLDKHIKQLHLDKETENKIIKDYKTKDSKSWKAAEKDKKIAEDHHIKTTPTAFINGEKVEDPYDYESYEKLLKDKIK >NZ_CP029080.1|WP_001791249.1|129795_129900_-|hypothetical-protein MLTNRLTSVNYVKKRLIQNIQRILSKKVLYGEMQ >NZ_CP029080.1|WP_000792549.1|129994_131308_+|hypothetical-protein MKNKYISKLLVGAATITLATMISNGEAKASENTQQSSTKHQTTQNNYVTDQQKAFYQVLHLKGITEEQRNQYIKTLREHPERAQEVFSESLKDSKNPDRRVAQQNAFYNVLKNDNLTEQEKNNYIAQIKENPDRSQQVWVESVQSSKAKERQNIENADKAIKDFQDNKAPHDKSAAYEANSKLPKDLRDKNNRFVEKVSIEKAIVRHDERVKSANDAISKLNEKDSIENRRLAQREVNKAPMDVKEHLQKQLDALVAQKDAEKKVAPKVEAPQIQSPQIEKPKAESPKVEVPQIQSPKVEVPQSKLLGYYQSLKDSFNYGYKYLTDTYKSYKEKYDTAKYYYNKYYQYKGLIDKTVLTTIGSGYGSYIKPLEVSKESGNLAKSYAQVRNYVTESINTGKVLYAFYQKPELVKTAIKAQETATTFKNALTGIFKSFWK >NZ_CP029080.1|WP_000594516.1|131843_132773_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB-subunit-A MIKNKILTATLAVGLIAPLANPFIEISKAENKIEDIGQGAEIIKRTQDITSKRLAITQNIQFDFVKDKKYNKDALVVKMQGFISSRTTYSDLKKYPYIKRMIWPFQYNISLKTKDSNVDLINYLPKNKIDSADVSQKLGYNIGGNFQSAPSIGGSGSFNYSKTISYNQKNYVTEVESQNSKGVKWGVKANSFVTPNGQVSAYDQYLFAQDPTGPAARDYFVPDNQLPPLIQSGFNPSFITTLSHEKGKGDKSEFEITYGRNMDATYAYVTRHRLAVDRKHDAFKNRNVTVKYEVNWKTHEVKIKSITPK >NZ_CP029080.1|WP_000916696.1|133340_134288_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgCB-subunit-C MLKNKILATTLSVSLLAPLANPLLEKAKAANDTEDIGKGNDVEIIKRTEDKTSNKWGVTQNIQFDFVKDKKYNKDALILKMQGFISSRTTYYNYKNTNHIKSMRWPFQYNIGLKTNDPNVSLINYLPKNKIESTNVSQTLGYNIGGNFQSAPSLGGNGSFNYSKSISYTQQNYVSEVEQQNSKSVLWGVKANSFVTASGQKSAFDSDLFVGYKPHSKDPRDYFVPDSELPPLVQSGFNPSFIATVSHEKGSGDTSEFEITYGRNMDVTHAIKRSTHYGNSYLDGHRIHNAFKNRNYTVKYEVNWKTHEIKVKGQN >NZ_CP029080.1|WP_001056918.1|134289_135267_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB/HlgCB-subunit-B MNMNKLVKSSVATSMALLLLSNTANAEGKITPVSVKKVDDKVTLYKTTATADSDKFKISQILTFNFIKDKSYDKDTLVLKAAGNINSGYERPNPKDYDFSKIYWGAKYNVSISSQSNDSVNVVDYAPKNQNEEFQVQNTLGYTFGGDISISNGLSGGLNGNTAFSETINYKQESYRTTLSRNTNYKNVGWGVEAHKIMNNGWGPYGRDSFHPTYGNELFLAGRQSSAYAGQNFIAQHQMPLLSRSNFNPEFLSVLSHRQDGAKKSKITVTYQREMDLYQIRWNGFYWAGANYKNYKTRTFKSTYEIDWENHKVKLLDTKETEINK >NZ_CP029080.1|WP_000200952.1|135325_135793_-|QueT-transporter-family-protein MTSKDITQISVIAAILTILAVLKIPSIIPGLDFQLSAPAALLILAFFGIKKYFLGGLLSSVLLLIFGVFNPINVIISIIFRVIAIAVVYLLKINVLSLVLASVLGSLVSRLILSVILNLPVWVVLLNAIPGVIFTLIVAIPLYLTLRKRMAVLLR >NZ_CP029080.1|WP_000286884.1|135803_136496_-|6-carboxyhexanoate--CoA-ligase MYSIKMRSSNQDVHISGAETICEFDKIEQTVQRFYNKGFFHENGQPDFLNIKIQKIMEPIQQIKALQIIEDDKANLQNLTQECGVTEQALNQGMTYIKNETVYTGAIILSAISGKRLDSFGQRGIRATHFSFEDINNKGDLNERVTDALAIASCINAHPYVKGELCVSDDLTYTTGYFASAKIGYHRLFDIKPVNTRYGGRIIFVDDRIDLNHYISFLESTPKQVVYETV >NZ_CP029080.1|WP_000971558.1|136506_137622_-|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase-family-protein MMFQEQIDLLQQKGLYRSLKTVGYIDRQYIEVENQRCTNYTSNDYLGLGQIAFDKNDFEKFMRKYSYHLSSSRLISGSSAAYEEIETMLAGWLGYSACTILNSGYDANLTLFNIFKNTNCVVFSDQENHASIIDGIKLSGLEKVIYKHLDIADLEKRLAECPNQNIQKIIISDSVFSTNGDVVDIGQLVSLKHKYNATLILDVSHSFGIENYSNYQGVDILTSSLSKACGAYGGVILSSNDVKDMLINHGRPLIYSSSLPIYNLYFIKRNIEKLINADDRRTKLNSLSKYFNQKLKSLNVNYNSSNSPIKFIEFDDIEAAENIHQILLKHHVFTSYLRYPTVTKPMLRISLSYFHTEQDIDRLFEILHQED >NZ_CP029080.1|WP_001046647.1|137599_138607_-|biotin-synthase-BioB MNLAKRILQGEQLTKETVLKIYEDTNIDTLDLLNEAYILRKHYFGKKVKLNMILNAKSGICPENCGYCGQSRDIKQKQRYALIPEEQIIDGAKVAHDNHIGTYCIVMSGRGPSDKEVDHISNTVRTIKSQHPQLKICACLGLTNDEQAKKLKSAGVDRYNHNINTSENYHDNVVTTHSYKDRTDTIELMKANNISPCSGVICGMGESNQDIVDMAFALKEMDADSIPINFLHPIKGTKFGSMDDLTPMKCLRIVALFRLINPTKEIRIAGGREVNLRSLQPLALKAANSIFVGDYLITGGQPNQLDYDMINDLGFEIDYGTCENKENKNDVSRAN >NZ_CP029080.1|WP_001110067.1|138608_139967_-|adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate-transaminase MNYTQQLKQKDSEYVWHPFTQMGVYSKEEAIIIEKGKGSYLYDTNGNKYLDGYASLWVNVHGHNNKYLNKVIKKQLNKIAHSTLLGSSNIPSIELAEKLIEITPSNLRKVFYSDTGSASVEIAIKMAYQYWKNIDREKYAKKNKFITLNHGYHGDTIGAVSVGGIKTFHKIFKDLIFENIQVESPSFYRSNYDTENEMMTAILTNIEQILIERNDEIAGFILEPLIQGATGLFVHPKGFLKEVEKLCKKYDVLLICDEVAVGFGRTGKMFACNHEDVQPDIMCLGKAITGGYLPLAATLTSQKIYNAFLSDSHGVNTFFHGHTYTGNQIVCTVALENIRLYEKCKLLSHIETTSSTLEKQLHALKRHRNVGDVRGRGLMFGVELVTDKDSKTPLEIEKVERIVRNCKENGLMIRNLENVITFVPLLSMSNKEVKTMVRIFKKAVHNILDRKC |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NZ_CP029080_2 | 1177501-1177602 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029080_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP029080_2
>2.1|1177534|36|NZ_CP029080|CRISPRCasFinder ACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029080_2
The CRISPR arrays of NZ_CP029080_2 >merge|NZ_CP029080|2|1177501-1177602|CRISPRCasFinder CATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAACCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGG >NZ_CP029080|2|2|1177501-1177602|CRISPRCasFinder CATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGG ACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTG CATAAGAACCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGG
>NZ_CP029080.1|WP_000687415.1|1176460_1177327_+|LysR-family-transcriptional-regulator MKIEDYRLLITLDETKTLRKAAEILYISQPAVTQRLKAIENAFGVDIFIRTKKQLITTTEGTMIIEHARDMLKRERLFFDKMQAHIGEVNGTISIGCSSLIGQTLLPEVLSLYNAQFPNVEIQVQVGSTEQIKANHRDYHVMITRGNKVMNLANTHLFNDDHYFIFPKNRRDDVTKLPFIEFQADPIYINQIKQWYNDNLEQDYHATITVDQVATCKEMLISGVGVTILPEIMMKNISREQFEFEKVEIDNEPLIRSTFMSYDPSMLQLPQVDSFVNLMASFVERPKA >NZ_CP029080.1|WP_000865625.1|1175700_1176345_+|DUF402-domain-containing-protein MKVKYIDKRHWRRLIDREYTEVKVNNNRFKGIIGLVTMKKVRDPLEVTVVGQNIIVADDNYKWLQILPEKKRYSITVMFDNKGNPLEYYFDINIKNITQKGNARTVDLCLDVLALPSGEYELVDEDDLMFALESEQITKKQFHEAYMIAHQIMAELENDFKGFQKKIMYCFNKINAKAQKNRQKPQNKTNFEKSKQIKPKQYNQTKNHQQQKKN >NZ_CP029080.1|WP_001806154.1|1175439_1175556_+|hypothetical-protein MLQLFLMKLTLNGFENDKTIIFIFLKNHFYEEMCVLSN >NZ_CP029080.1|WP_108703154.1|1174874_1175348_+|cupin MKTAKQWINELQLESHPEGGFYRETIREVLKDGHRAPFSSIYFLPTDDNISHFHRIDADEVWYYHAGDSLTIHMINPDGAYTTATLGTDIQNGDVLQYVVPKGTIFASSIENLNSYSLVGCMCQPAFEFKQFELFKQSELFVQYPHLKSVIEKYALK >NZ_CP029080.1|WP_000532969.1|1174158_1174875_+|YebC/PmpR-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MGRKWNNIKEKKAQKDKNTSRIYAKFGKEIYVAAKSGEPNPESNQALRLVLERAKTYSVPNHIIEKAIDKAKGAGDENFDHLRYEGFGPSGSMLIVDALTNNVNRTASDVRAAFGKNGGNMGVSGSVAYMFDHVATFGIEGKTVDDILETLMEQDVDVNDVIDDNGLTIVYAEPDQFAVVQDALRAAGVEEFKVAEFEMLPQTDIELSEEDQVTFEKLIDALEDLEDVQNVFHNVDLK >NZ_CP029080.1|WP_001805574.1|1173609_1173969_+|HTH-type-transcriptional-regulator-SarX MNTEKLETLLGFYKQYKALSEYIDKKYKLSLNDLAVLDLTMKYCKDEKVLMQSFLKTAMDELDLSRTKLLVSIRRLIEKERLSKVRSSKDERKIYIYLNDDDISKFNALFEDVEQFLNI >NZ_CP029080.1|WP_001129741.1|1171313_1173464_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MAKSCLHILTNNEYATTRCQDGIVLFWPIDGEIELQKFRKSKIIEDDIYIINHLDVFSIKNNKKTIMLYLSSDWFAELGFTFFNYHYTAKLIKSSYNLKCLLLKLTYRYLDNQPINDADIRKLQDIIKIIAKEASMDKKIAQNQYRYAYYGDLRDELEYIYQNVNQRLTLKSVADKLFVSKSNLSSQFHLLMGMGFKKYIDTLKIGKSIEILLTTDSTISNISEHLGFSSSSTYSKMFKSYMDITPNEYRNLSKFNKCIMLNPEPLVGGMAQEVKEVILNYIDHYKNHLTDVIHIDEDKFEIPKLFQTVIQINTYTEMKLVFLEGIFKTLLNKNSQVVFFIMPSILKSKNTMSEEEKFTIIKTIIESDLKIAFNINDIETTYYVEEAFMNVIRQLSPNEINHHNNYEVHFVFDLSLMEIRTIYRMILKLHNIMLNVKLGLNITCLFDKPSVFKSLVSQIKRLKFDSLIIDNANLSSPYLMGESDELLLKNILHFKNLKQVINELDIEQEKLIFLNVENHKLLNNKERDLSNSAPLIYKTLSALYHNFDGFGLNIFDNHQTFNAMHLYDKNGFKTTLGLILEKFIEYVSKPKYENSYYSIFDIENYYCLVIYDWRVIESETIMSNFEDSQVYINFKNNVLNDKYLIVIETLDENSGNINHLISKELRDKYEWNPSLLSKIDNYLKPAIEIKEHNFSNNSLNINVTFNALYIIKIGKK >NZ_CP029080.1|WP_000081596.1|1169972_1170617_+|hypothetical-protein MSQNTNHSYFQQNQHAQSISKVWLYFMYYWIIFGIGCYLGQFLPLSWRQPLSFGLLIIILATLVFERARRFGLIISHIYAVVIGLLSYATFTTYLQNLGPDIFYKNIALAIFAFIAFGIIGYFFVGDASSIGKYLFVTLITLIIASLIGIFLQNPIFYTIITVVSLLLFLLYTLYDFNRLKRGDYSPREMGFNLFINLLNIIKDILYLANMFRR >NZ_CP029080.1|WP_000731644.1|1168814_1169612_-|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MKKLAFAITATSGAAAFLTHHDAQASTQHTVQSGESLWSIAQKYNTSVESIKQNNQLDNNLVFPGQVISVGGSDAQNTSNTSPQAGSASSHTVQAGESLNIIASRYGVSVDQLMAANNLRGYLIMPNQTLQIPNGGSGGTTPTATTGSNGNASSFNHQNLYTAGQCTWYVFDRRAQAGSPISTYWSDAKYWAGNAANDGYQVNNTPSVGSIMQSTPGPYGHVAYVERVNGDGSILISEMNYTYGPYNMNYRTIPASEVSSYAFIH >NZ_CP029080.1|WP_000120368.1|1167221_1168229_+|inorganic-phosphate-transporter MSYIIIVTIAVVIFSLIFDFINGFHDTANAVATAVSTRALTPKTAILMAAVMNFIGALTFTGVAGTITKDIVDPFKLENGLVVVLAAILAAIIWNLATWFYGIPSSSSHALIGSIAGAAIASEGSFGVLHYQGFTKIIIVLIVSPIIAFCVGFLMYSIFKVIFKNANLTRANRNFRFFQIFTAALQSFSHGTNDAQKSMGIITLALIVANVQNDGSVEPQLWVKFACATAMGLGTAIGGWKIIKTVGGNIMKIRPANGAAADLSSALTIFVASSLHFPLSTTHVVSSSILGVGASNRAKGVKWSTAQRMIITWVITLPISALLAGLLFYILNLFF >NZ_CP029080.1|WP_000367064.1|1177619_1178840_+|MFS-transporter MDMFAALLQIKNYKLFVANMFLLGMGIAVTVPYLVLFATKDLGMTTNQYGLLLASAAISQFTVNSIIARFSDTHHFNRKIIIILALLMGALGFSIYFFVDTIWLFILLYAIFQGLFAPAMPQLYASARESINVSSSKDRAQFANTVLRSMFSLGFLFGPFIGAQLIGLKGYAGLFGGTISIILFTLVLQVFFYKDLNIKHPISTQQHVEKIAPNMFKDKTLLLPFIAFILLHIGQWMYTMNMPLFVTDYLKENEQHVGYLASLCAGLEVPFMIILGVLSSRLQTRTLLIYGAIFGGLFYFSIGVFKNFYMMLAGQVFLAIFLAVLLGIGISYFQDILPDFPGYASTLFSNAMVIGQLGGNLLGGAMSHWVGLENVFFVSAASIMLGMILIFFTKNQKITKEDVIST >NZ_CP029080.1|WP_000152582.1|1178836_1179325_+|DUF456-domain-containing-protein MTIILWLLIIAAFMLAFVGLIKPIIPSVLVLWVGFLIYQFGFHNQHLSWVFYVSMALLTILILCADFLANKYFVNRFGGSKFGEYAALIGVVIGCFVLPPFGIIIIPFILVFIVELIQGYSFERAVKVSIGSIVAFLTSSIAQAIIMFIMIVWFFIDALLIN >NZ_CP029080.1|WP_000842865.1|1179423_1180113_-|DUF1129-family-protein MKSTAQLTKENNVKSLRLSNTDREIFENYMTYMRSDFRVNPHDTELIINRILKQLLSAEQHGLLALDFFNHDPKAHAIKELKAMPNETFKNIFKYIYQHIVLLIGIVSFLKGFLGFFMEKSGSNLYFVSFPFSVVVGFFIVFLFIWFSFKTIQLQCFNNSNWIWIFTYLAIILLIVGFFYVFFIPQSLLAFGPYIQVSNWVFIIFSFIVMPIGLRIERNISKKHSHTFL >NZ_CP029080.1|WP_001259685.1|1180240_1180684_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MRTLNKDEHNYIKQIASIHETLLSQSESNYKCTKLSIALRYEMICSRLEHTNDKIYIYENEGQLIAFIWGHFSNEKSMVNIELLYVEPQFRKLGIATQLKIALEKWAKTMNAKQISSTIHKSNLPMISLNKDLGYQVSHVKMYKDID >NZ_CP029080.1|WP_000733438.1|1180750_1181140_+|hypothetical-protein MKKLIISIMAVMLFLTGCGKSQEKATLEKDIDNLQKENKELKDKKEKLQQEKEKLADKQKDLEKEVKDLKPSKEDNKDDKKDNKKDEDKDKEASQDKQPKDQTKSSNKDNHKKPTSTDKDQKANDKHQP >NZ_CP029080.1|WP_000545116.1|1181277_1181577_+|hypothetical-protein MHEQDFRILEGQDITLPELGRELENITGRTIADSTGEIKRVIAHLPNFESDTDTFVATYRLNHQQDFIDATFTALKSDRARLKEVPVHVELISYISKSK >NZ_CP029080.1|WP_000638623.1|1181656_1182199_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MIYCETERLILRDWHEDDLLPFQKMNATYDVRKYFPSLLSYRRSELDMRTMDAVIKDYGIGLFAVEDKESHQWIGFIGLNYIPETSEYPFKELPLYEIGWRLLPEFWGKGLATEGANATLKLAEQHQIYDVYSFTAEANKASQRVMEKIGMTVYDHFELPNLSKYHLLKRQVRYYINLRK >NZ_CP029080.1|WP_000820900.1|1182293_1182860_-|TIGR00730-family-Rossman-fold-protein 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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP029080_3 | 1276299-1276382 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029080_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP029080_3
>3.1|1276324|34|NZ_CP029080|CRISPRCasFinder TTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCACATTATC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029080_3
The CRISPR arrays of NZ_CP029080_3 >merge|NZ_CP029080|3|1276299-1276382|CRISPRCasFinder GTAAGCTGACTTTACGTTAGCTTCTTTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCACATTATCGTAAGCTGACTTTACGTCAGCTTCT >NZ_CP029080|3|3|1276299-1276382|CRISPRCasFinder GTAAGCTGACTTTACGTTAGCTTCT TTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCACATTATC GTAAGCTGACTTTACGTCAGCTTCT
>NZ_CP029080.1|WP_000134963.1|1274867_1275803_+|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >NZ_CP029080.1|WP_000057562.1|1273361_1274801_+|tetratricopeptide-repeat-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMANQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYHNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >NZ_CP029080.1|WP_001224792.1|1272868_1273354_+|acetyltransferase MRKFLSKTHHHTNPLWHVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNISIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >NZ_CP029080.1|WP_000513299.1|1272021_1272861_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPGEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSFGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIIYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >NZ_CP029080.1|WP_000958224.1|1271083_1272016_+|HPr-kinase/phosphorylase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE 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>NZ_CP029080.1|WP_000229257.1|1265885_1267871_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrB MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVEGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKMKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDRGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >NZ_CP029080.1|WP_000638419.1|1265380_1265617_+|CsbA-family-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >NZ_CP029080.1|WP_000538142.1|1264733_1265384_+|HD-domain-containing-protein 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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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NA
Consensus repeat of NZ_CP029080_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP029080_4
>4.1|1282796|32|NZ_CP029080|CRISPRCasFinder AACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029080_4
The CRISPR arrays of NZ_CP029080_4 >merge|NZ_CP029080|4|1282772-1282851|CRISPRCasFinder CAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCC >NZ_CP029080|4|4|1282772-1282851|CRISPRCasFinder CAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCC AACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGC CAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCC
>NZ_CP029080.1|WP_000675904.1|1280921_1282556_+|NAD-dependent-malic-enzyme MKGIELLNNPFLNKGTAFTNEERKQLGLEGLLPANVRTLEQQAEQCYEQFKAKQTDFEKRLFLMAIFNRNRTLFYKLTSEHLVEFMPIIYDPVIAQSIEQYNENFSRPQDAVFLSVDRQDQIEQELRNVANDRDIRLIVVTDAEGILGIGDWGVDGVDIAIGKLIVYTGAAGINPSQVLPVSLDVGTNNEQLLNDDLYLGNRHKRVDDETYYAFVDKFVSAVRKEYPNALLHWEDFGRGHAKNILDKYEDTLPTFNDDIQGTGIVTLAGVLGALNISKVDYTNQTFLVYGGGTAGMGITNILKDELIKQGVSEEKANQHFYIMDKQGLLFDDMDDLTEAQQVFAKNRNEFSNTVNWKNLNEVIENIKPTVLIGTSTQTGAFTEDAVKEMFKHTERPVIFPLSNPTKLSEATAQDLLKWTNGKALIGTGIPYNDIEYNGVNYSIGQANNALMYPGLGLGLIASNAKKVNQQILSAASHALGGMVNPDEPGAAVLPPVEKIHQCSRAIAKAVAQSVIDQGLNAETIDDIDKAIEAEIWYPKYKSYI >NZ_CP029080.1|WP_001049165.1|1280152_1280740_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >NZ_CP029080.1|WP_000006551.1|1278645_1279590_+|DNA-binding-protein-WhiA MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >NZ_CP029080.1|WP_001248939.1|1277538_1278534_+|YvcK-family-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >NZ_CP029080.1|WP_000369722.1|1276630_1277542_+|RNase-adapter-RapZ MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >NZ_CP029080.1|WP_000134963.1|1274867_1275803_+|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >NZ_CP029080.1|WP_000057562.1|1273361_1274801_+|tetratricopeptide-repeat-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMANQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYHNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >NZ_CP029080.1|WP_001224792.1|1272868_1273354_+|acetyltransferase MRKFLSKTHHHTNPLWHVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNISIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >NZ_CP029080.1|WP_000513299.1|1272021_1272861_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPGEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSFGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIIYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >NZ_CP029080.1|WP_000958224.1|1271083_1272016_+|HPr-kinase/phosphorylase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >NZ_CP029080.1|WP_000816297.1|1283001_1283904_-|TIGR01777-family-protein MKQYLITGGTGMVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQNIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKVLFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGIILSNEGGALQTMKLPYEYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINKESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLISK >NZ_CP029080.1|WP_000070822.1|1284606_1285236_+|DUF4887-domain-containing-protein MSNQNYDYKTNEDGSKKKMSTTAKVVSIATVLLLLGGLVFAIFAYVDHSNKAKERMLNEQKQEQKEKRQKENAEKERKKKQQEEKEQNELDSQTNQYQQLPQQNQYQYVPPQQQAPTKQRPAKEENDDKASKDESKDKDDKASQDKSDDNQKKTDDNKQPAQPKPQPQQPTPKPNNNQQNNQSNQQAKPQASQQNSQSTTNKQNNANDK >NZ_CP029080.1|WP_000654030.1|1285844_1286858_+|sugar-binding-transcriptional-regulator MKDLLQAQQKLIPDLIDKMYKRFSILTTISKNQPVGRRSLSEHMDMTERVLRSETDMLKKQDLIKVKPTGMEITAEGEQLISQLKGYFDIYADDNRLSEGIKNKFQIKEVHVVPGDADNSQSVKTELGRQAGQLLEGILQEDAIVAVTGGSTMACVSEAIHLLPYNVFFVPARGGLGENVVFQANTIAASMAQQAGGYYTTMYVPDNVSETTYNTLLLEPSVINTLDKIKQANVILHGIGDALKMAHRRQSPEKVIEQLQHHQAVGEAFGYYFDTQGQIVHKVKTIGLQLEDLESKDFIFAVAGGKSKGEAIKAYLTIAPKNTVLITDEAAAKIILE >NZ_CP029080.1|WP_000279414.1|1286910_1287921_+|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MAVKVAINGFGRIGRLAFRRIQEVEGLEVVAVNDLTDDDMLAHLLKYDTMQGRFTGEVEVVDGGFRVNGKEVKSFSEPDASKLPWKDLNIDVVLECTGFYTDKDKAQAHIEAGAKKVLISAPATGDLKTIVFNTNHQELDGSETVVSGASCTTNSLAPVAKVLNDDFGLVEGLMTTIHAYTGDQNTQDAPHRKGDKRRARAAAENIIPNSTGAAKAIGKVIPEIDGKLDGGAQRVPVATGSLTELTVVLEKQDVTVEQVNEAMKNASNESFGYTEDEIVSSDVVGMTYGSLFDATQTRVMSVGDRQLVKVAAWYDNEMSYTAQLVRTLAYLAELSK >NZ_CP029080.1|WP_001074749.1|1288059_1289250_+|phosphoglycerate-kinase MAKKIVSDLDLKGKTVLVRADFNVPLKDGEITNDNRIVQALPTIQYIIEQGGKIVLFSHLGKVKEESDKAKLTLRPVAEDLSKKLDKEVVFVPETRGEKLEAAIKDLKEGDVLLVENTRYEDLDGKKESKNDPELGKYWASLGDVFVNDAFGTAHREHASNVGISTHLETAAGFLMDKEIKFIGGVVNDPHKPVVAILGGAKVSDKINVIKNLVNIADKIIIGGGMAYTFLKAQGKEIGISLLEEDKIDFAKDLLEKHGDKIVLPVDTKVAKEFSNDAKITVVPSDSIPADQEGMDIGPNTVKLFADELEGAHTVVWNGPMGVFEFSNFAQGTIGVCKAIANLKDAITIIGGGDSAAAAISLGFENDFTHISTGGGASLEYLEGKELPGIKAINNK >NZ_CP029080.1|WP_001260089.1|1289371_1290133_+|triose-phosphate-isomerase MRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTAVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGETSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHETDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETDEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSEDQLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGASLKVEDFVQLLEGAK >NZ_CP029080.1|WP_001085498.1|1290135_1291653_+|2,3-bisphosphoglycerate-independent-phosphoglycerate-mutase MAKKPTALIILDGFANRESEHGNAVKLANKPNFDRYYNKYPTTQIEASGLDVGLPEGQMGNSEVGHMNIGAGRIVYQSLTRINKSIEDGDFFENDVLNNAIAHVNSHDSALHIFGLLSDGGVHSHYKHLFALLELAKKQGVEKVYVHAFLDGRDVDQKSALKYIEETEAKFNELGIGQFASVSGRYYAMDRDKRWEREEKAYNAIRNFDAPTYATAKEGVEASYNEGLTDEFVVPFIVEDQNDGVNDGDAVIFYNFRPDRAAQLSEIFANRAFEGFKVEQVKDLFYATFTKYNDNIDAAIVFEKVDLNNTIGEIAQNNNLTQLRIAETEKYPHVTYFMSGGRNEEFKGERRRLIDSPKVATYDLKPEMSAYEVKDALLEELNKGDLDLIILNFANPDMVGHSGMLEPTIKAIEAVDECLGEVVDKILDMDGYAIITADHGNSDQVLTDDDQPMTTHTTNPVPVIVTKEGVTLRETGRLGDLAPTLLDLLNVEQPEDMTGESLIKH >NZ_CP029080.1|WP_001121760.1|1291782_1293087_+|phosphopyruvate-hydratase MPIITDVYAREVLDSRGNPTVEVEVLTESGAFGRALVPSGASTGEHEAVELRDGDKSRYLGKGVTKAVENVNEIIAPEIIEGEFSVLDQVSIDKMMIALDGTPNKGKLGANAILGVSIAVARAAADLLGQPLYKYLGGFNGKQLPVPMMNIVNGGSHSDAPIAFQEFMILPVGATTFKESLRWGTEIFHNLKSILSKRGLETAVGDEGGFAPKFEGTEDAVETIIQAIEAAGYKPGEEVFLGFDCASSEFYENGVYDYSKFEGEHGAKRTAAEQVDYLEQLVDKYPIITIEDGMDENDWDGWKQLTERIGDRVQLVGDDLFVTNTEILAKGIENGIGNSILIKVNQIGTLTETFDAIEMAQKAGYTAVVSHRSGETEDTTIADIAVATNAGQIKTGSLSRTDRIAKYNQLLRIEDELFETAKYDGIKSFYNLDK >NZ_CP029080.1|WP_000785252.1|1293425_1293884_+|hypothetical-protein MADRTNKEIKTGRFIATASIVFSILLIIHYFVSLDNATAKALLNLTNQNTSDKAIDYILNSFRFTGIMYILAYLAGFITFWNRHTYVWWFMFAVYVSNSLFTLINLSITIQAIKAAHGAYLTLPILIVIIGSVALAIYMLVVSIKRKSTFNR >NZ_CP029080.1|WP_000556760.1|1293950_1294184_+|preprotein-translocase-subunit-SecG MHTFLIVLLIIDCIALITVVLLQEGKSSGLSGAISGGAEQLFGKQKQRGVDLFLNRLTIILSILFFVLMICISYLGM |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NZ_CP029080_5 | 2724731-2724866 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029080_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP029080_5
>5.1|2724779|40|NZ_CP029080|CRISPRCasFinder AAAAGCTCACAAAACCCTTGATATCATTGGTTTCCCATGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029080_5
The CRISPR arrays of NZ_CP029080_5 >merge|NZ_CP029080|5|2724731-2724866|CRISPRCasFinder TTTTTAATATTTTTCTTTTGAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTCAAAAGCTCACAAAACCCTTGATATCATTGGTTTCCCATGATTTTTAATATTTTTCTTTTAAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTC >NZ_CP029080|5|5|2724731-2724866|CRISPRCasFinder TTTTTAATATTTTTCTTTTGAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTC AAAAGCTCACAAAACCCTTGATATCATTGGTTTCCCATGA TTTTTAATATTTTTCTTTTAAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTC
>NZ_CP029080.1|WP_000655242.1|2723586_2723769_-|hypothetical-protein MKDSIFWKKAFIPVYFIVAMLVFLLFRFYIKTDNFSIYLMIIFLICLGTASIIYNYKTNR >NZ_CP029080.1|WP_001622005.1|2723404_2723605_+|hypothetical-protein MSLSLVFSRWRFEIVVLWWNEFVVLWRYKNAVLWQFQNGVSIKKSQQDLELTVTYTFHTYIYRLVL >NZ_CP029080.1|WP_000130128.1|2721451_2723116_-|acetolactate-synthase-AlsS MTDKKYTAADIVIDTLKNNGVEYVFGIPGAKIDYLFNALIDDGPELIVTRHEQNAAMMAQGIGRLTGKPGIVLVTSGPGVSNLTTGLLTATSEGDPVLALGGQVKRNDLLRLTHQSIDNAALLKYSSKYSEEVQDPESLSEVMTNAIRIATSGKNGASFISIPQDVISSPVESKAISLCQKPNLGVPSEQDINDVIEAIKNASFPVLLAGMRSSSADETNAIRKLVERTNLPVVETFQGAGVISRELENHFFGRVGLFRNQVGDELLRKSDLVVTIGYDPIEYEASNWNKELETQIINIDEVQAEITNYMQPKKELIGNIAKTIEMISEKVDEPFINQQHLDELEQLRTHIDEETGIKATHEEGILHPVEIIESMQKVLTDDTTVTVDVGSHYIWMARNFRSYNPRHLLFSNGMQTLGVALPWAISAALVRPNTQVVSVAGDGGFLFSSQDLETAVRKNLNIIQLIWNDGKYNMVEFQEEMKYKRSSGVDFGPVDFVKYAESFGAKGLRVTNQEELEAAIKEGYETDGPVLIDIPVNYKDNIKLSTNMLPDVFN >NZ_CP029080.1|WP_000186132.1|2720710_2721415_-|acetolactate-decarboxylase MTNVLYQHGTLGTLMAGLLKGTASINELLQHGDLGIATLTGSNGEVIFLDGKAYHANEHKEFVELKGDELTPYATVTKFVADTSYETKDKSSEAVFAEIKEKMLSENLFSAVKISGLFKKMHIRMMPAQEPPYTRLIDSARRQPEQTETYVKGSVVGFFTPELFHGIGSAGFHVHFANDDRNFGGHVLDFEVEDVKVEIQNIETFEQHFPIHDEDFTNANIDYKDISDEIREAE >NZ_CP029080.1|WP_000769707.1|2719909_2720335_+|MAP-domain-containing-protein MKLKSFVTATLALGLLSTVGAALPSHEASADSNNGYKEMTMDGYHTVPYTISVDGITALHRTYFVFPENKKVLYQEIDSKVKNELASQRGVTTEKINNAQTATYTLTLNDGNKKVVNLKKNDDAKNLIDPSTIKQIQIVVK >NZ_CP029080.1|WP_000044372.1|2718800_2719616_-|HAD-IIB-family-hydrolase MSKRLLLFDFDETYFKHNTNEEDLSHLREMEKLLEKLTNNNEVMTAVLTGSTFQSVMDKMDQVNMTFKPLHIFSDLSSKMFTWNNGEYVESETYKKKVLSEPFLFEDIEDILRHISAQYNVEFIPQRAFEGNETHYNFYFHSIGNHNKDRRILESLVRYANDQNYTARFSRSNPLAGDPENAYDIDFTPSNAGKLYATQFLMKKYNIPVKSILGFGDSGNDEAYLSYLEHAYLMSNSRDEALKQKFRLTKYPYYQGITLHVKEFVEGKYDY >NZ_CP029080.1|WP_000214774.1|2717058_2718576_+|glycosyltransferase MTTYMLMYSIPEKAGGITSVMLNRSKLLAEKGYSCALLTLDDKNYDPLRAKLTNSGRLHKEVKIVNLYEELKMLYDVENTEIENKNMQTFEKLNLLNQEGFYIQKDEYEEKKYARYFKDNNYIMYKKWINGQLSHIDYFQNRKRIKRHVFQNKILRKEITFNDKNKMSEVKYLSNDGFCYLSYWYGDNENIVNIFYFDKNSKEVLNFKNNKMFHSYWLDKNLTSNDVLILDGIGTYPKVENMQNNDVKKIFTIHTNHFLSPYSYGAEIKPEFRNMLLNLKELDTLVVLTKEQKDDIIKQFGDYNNIKVIPNAVSFEENLTQNIREKNSIIVLQRFVAMKNITHIISAINIVRKKVKDVKLHIYGTGTQKENYTKLIKKLKLQDNVFIHDYAFDIRGLYTKASLSVLTSDYEGLPMSLLEAMSYGVPVISYPINYGPKSIIQNNINGIITKKKDNINELAKKIIHVLKKETLISQFSENARTTIKTNFSYEAVSKKWIELIDEKSK >NZ_CP029080.1|WP_000143638.1|2716770_2717049_+|hypothetical-protein MTFNEYNYNNELILKLNKIEVQKNNEKISEVFKDYEILKPKIVFNGSNPYLALNHIIVAEIENYSSLETFSKIYVDEDYYYNYGELIIKCKK >NZ_CP029080.1|WP_001044440.1|2715041_2715896_-|M23-family-metallopeptidase MNKTNFGDYLNKSKSRKIYKIFDQNLKREFSYWQFRKLFKSYTRQSDVHELKVCTQNDDTMEQIWIDKAKQFGVSVTWKDNSIIGFVMRPLINYDAIKNETTLKYAVPTTDCYEVFWGGDNELYNYHYLYPHQRYAIDLVIKENHKTYKKQGKVNTDYFCFGKDIIAPANGTVEKVVNGVQDNSIGSTNESQFLGNYIVIKHAENEYSLIAHLQQYSIIVNEGQNVKYGDIIGKVGNSGNSTEPHIHFQVMNDKNIEACTSLKIRFLNNRELIKGDVVCGLQGE >NZ_CP029080.1|WP_162561476.1|2714728_2714869_-|hypothetical-protein MSQARDFLAYLVNSKRTPDSLVVDAFLFVIEYPVIEILDSGMSTIF >NZ_CP029080.1|WP_000170975.1|2726645_2727044_-|30S-ribosomal-protein-S9 MTLAQVEYRGTGRRKNSVARVRLVPGEGNITVNNRDVREYLPFESLILDLNQPFDVTETKGNYDVLVNVHGGGFTGQAQAIRHGIARALLEADPEYRGSLKRAGLLTRDPRMKERKKPGLKAARRSPQFSKR >NZ_CP029080.1|WP_001250038.1|2727057_2727495_-|50S-ribosomal-protein-L13 MRQTFMANESNIERKWYVIDAEGQTLGRLSSEVASILRGKNKVTYTPHVDTGDYVIVINASKIEFTGNKETDKVYYRHSNHPGGIKSITAGELRRTNPERLIENSIKGMLPSTRLGEKQGKKLFVYGGAEHPHAAQQPENYELRG >NZ_CP029080.1|WP_001221849.1|2727734_2728538_-|tRNA-pseudouridine(38-40)-synthase-TruA MRILVEIAYQGNNFLGFQIQQNGRTVQQQFEKLLQRMHKRHVRIHPSSRTDRGVHAIQQYFHFDTELNIPMSQWQYAMNRTLPDDIYVNNVVTVDDDFHCRYDCVGKRYRYKVYQAQHRDPFQSGLKTFIPETLDLDKMNKAAQQFIGTHDFTGFCSQKTEVESKVRTLYQSEIVKTDDGFDYIVTGSGFLYNMVRVLVAFLIEVGKGRHEISDVPKLLESKNRKNVPFTAPAEGLYLEKIYLDENELLKDFGNDIKIHRKKSLQND >NZ_CP029080.1|WP_000791632.1|2728542_2729349_-|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT MKNKLIIGRYLPNDSYVHHLDPRAKLMFVFLFIILIFVCHSPLTYLWVFALILFFMRLAKIQLWFLIKGLTPIFFFLIFTLMMHIFLTKGGYVLVEWHGITIETNGILEGLYISLRLIGIVMIATIMTLSTSPIDLTDAFERLLAPLKMFKLPVHQLSMIMSIALRFIPTLMDELDKIILAQKSRGSEISSGNIATRIKSFIPLLVPLFISAFQRAEELAVAMEVRGYDANVQRTSYRQLKWQLRDTLSLIMIIPIAIILFVLKYSGV >NZ_CP029080.1|WP_000027572.1|2729338_2730199_-|energy-coupling-factor-transporter-ATPase MSIRFNDVSYTYQQGTPYEHQAIHDINTEFEQGKYYAIVGQTGSGKSTLIQNINALIKPTSGTVTIDDVTVTHKTKDKYIRPVRKRIGMVFQFPESQLFEDTVEREMIFGPKNFKMDLDEAKNYAHRLLMDLGFSRDVMSQSPFQMSGGQMRKIAIVSVLAMNPDIIVVDEPTAGLDPQSKRQVMRLLKSLQTDENKTIILISHDMNEVARYADEVIVMKEGSIVSQTSPKELFKEKEKLAGWHIGLPDIVQLQYDFEQKHQTKLKDIALTEEAFVSLYKEWQHEK >NZ_CP029080.1|WP_000389669.1|2730195_2731005_-|energy-coupling-factor-transporter-ATPase MEDKNSVIVFKNVSFQYQSDASFTLKDVSFNIPKGQWTSIVGHNGSGKSTIAKLMIGIENVKSGEIFYNNQTITDDNFEKLRKDIGIVFQNPDNQFVGSIVKYDVAFGLENHAVPHDEMHRRVSEALKQVDMLERADYEPNALSGGQKQRVAIASVLALNPSVIILDEATSMLDPDARQNLLDLVRIVKSEHNITIISITHDLSEAMEADHVIVMNKGTVYKEGTAIEIFDHAEELTTIGLDLPFPIKINQMLGHQTSFLTYEGLVNQL >NZ_CP029080.1|WP_000542274.1|2731542_2731911_-|50S-ribosomal-protein-L17 MGYRKLGRTSDQRKAMLRDLATSLIISERIETTEARAKEVRSVVEKLITLGKKGDLASRRNAAKTLRNVEILNEDETTQTALQKLFGEIAERYTERQGGYTRILKQGPRRGDGAESVIIELV >NZ_CP029080.1|WP_000569649.1|2731927_2732872_-|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-alpha MIEIEKPRIETIEISEDAKFGKFVVEPLERGYGTTLGNSLRRILLSSLPGAAVKYIEIEGVLHEFSAVDNVVEDVSTIIMNIKQLALKIYSEEDKTLEIDVRDEGEVTASDITHDSDVEILNPELKIATVSKGGHLKIRLVANKGRGYALAEQNNTSDLPIGVIPVDSLYSPVERVNYTVENTRVGQSSDFDKLTLDVWTNGSITPQESVSLAAKIMTEHLNIFVGLTDEAQNAEIMIEKEEDQKEKVLEMSIEELDLSVRSYNCLKRAGINSVQELADKSEADMMKVRNLGRKSLEEVKYKLEDLGLGLRKED >NZ_CP029080.1|WP_000101625.1|2732946_2733336_-|30S-ribosomal-protein-S11 MARKQVSRKRRVKKNIENGVAHIRSTFNNTIVTITDEFGNALSWSSAGALGFKGSKKSTPFAAQMASETASKSAMEHGLKTVEVTVKGPGPGRESAIRALQSAGLEVTAIRDVTPVPHNGCRPPKRRRV >NZ_CP029080.1|WP_000090796.1|2733359_2733725_-|30S-ribosomal-protein-S13 MARIAGVDIPREKRVVISLTYIYGIGTSTAQKILEEANVSADTRVKDLTDDELGRIREVVDGYKVEGDLRRETNLNIKRLMEISSYRGIRHRRGLPVRGQKTKNNARTRKGPVKTVANKKK |
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| NZ_CP029080_6 | 2763291-2763383 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029080_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP029080_6
>6.1|2763324|27|NZ_CP029080|CRISPRCasFinder GTGTTGGGGCCCCGTTCCCCAACTTGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029080_6
The CRISPR arrays of NZ_CP029080_6 >merge|NZ_CP029080|6|2763291-2763383|CRISPRCasFinder ACATTATTGTAAGCTGACTTTTCGTCACCTTCTGTGTTGGGGCCCCGTTCCCCAACTTGTACATTATTGTATGCTGACTTTTCGTCACCTTCT >NZ_CP029080|6|6|2763291-2763383|CRISPRCasFinder ACATTATTGTAAGCTGACTTTTCGTCACCTTCT GTGTTGGGGCCCCGTTCCCCAACTTGT ACATTATTGTATGCTGACTTTTCGTCACCTTCT
>NZ_CP029080.1|WP_031785427.1|2763034_2763205_+|hypothetical-protein MFRFISFGQLVVYSTTFIPKKDILQLNDMECDTNVKKPLKIYYVVILKSGIEMIFS >NZ_CP029080.1|WP_000066900.1|2762558_2762909_-|HTH-type-transcriptional-regulator-SarV MSNKVQRFIEAERELSQLKHWLKTTHKISIEEFVVLFKVYEAEKISGKELRDTLHFEMLWDTSKIDVIIRKIYKKELISKLRSETDERQVFYFYSTSQKKLLDKITKEIEVLSVTN >NZ_CP029080.1|WP_000184408.1|2761245_2762457_+|MFS-transporter MTNQGSLNKSPIFTKSFTINFFVNFIVYLCMYLLLVVIAGYSKQAFDASDSLAGLVVGLFIVGSLIGRFATGKFVNQIGPKRLLFIGLIALIITQLLYFIDGSLAFLIFVRLINGIATAVVTTATGTIAAYVTPVNRKSEGISLFSLSLVLGTAIGPFLGMLLITKYAIDLLFIICVILGILGLIISLFIKVDFEVTNSKTETNVIDKPRFSIHQFIAKEAIPVAVIMLLIGVTYASILTYLQAFALERHLVTAASYFFICYAIASLITRPIAGRLMDDKNENIIVYPAFIMLLLSFVCLISSYQSWLILLAGACLGLGYGNLSSAMQSIAIKVSPPIKYGIATSTFYVGLDAGIGFGPSFLGLFTHMFSYSEIFGFMAALAIITMLVYFLIHGRHVTRNAMN >NZ_CP029080.1|WP_000951056.1|2760812_2761253_+|winged-helix-DNA-binding-protein MLSQEFFNSFITIYRPYLKLAEPILEKHNIYYGQWLILRDIAKHQPTTLIEISHRRAIEKPTARKTLKALIENDLITAENSLEDKRQKFLTLTPKGHALYEIVCLDVQKLQQAVVAKTNISQDQMQETINVMNQIHEILLKEAHND >NZ_CP029080.1|WP_000600978.1|2759884_2760649_-|VOC-family-protein MILKFDHIIHYIDRLDRFSFPGDVIKLHSGGYHHKYGTFNKLGYINENYIELLDVENNEKLKKMAKTIEGGVAFATQIVQEKYEQGFKNICLRTNDIEAVKNKLQSEQVEVVGPIQMERDTHKDGKVKWQLLYIMNQDDDEIKPPFFIQWEESDSMRTKKLQKYFQKQFSIETVIVKSKNRSQTVSNWLKWFDMDIVEENDHYTDLILKNDDIYFRIEDGKVSKYHSVIIKDAQATSPYSIFIRGAIYRFEPLV >NZ_CP029080.1|WP_001621998.1|2759641_2759893_+|hypothetical-protein MRTIILSLFIIMNIVAIVMTLSQPLTVNYFSLRVILIFFTFILSIFFILIKSSRLNNILTILSIALAVIHMGILAHSTYVYLY >NZ_CP029080.1|WP_000413869.1|2757987_2759253_-|lipid-II:glycine-glycyltransferase-FemX MEKMHITNQEHDAFVKSHPNGDLLQLTKWAETKKLTGWYARRIAVGRDGEVQGVAQLLFKKVPKLPYTLCYISRGFVVDYSNKEALNALLDSTKEIAKAEKAYAIKIDPDVEVDKGTDALQNLKALGFKHKGFKEGLSKDYIQPRMTMITPIDKTDDELLNSFERRNRSKVRLALKRGTTVERSDREGLKTFAELMKITGERDGFLTRDISYFENIYDALHEDGDAELFLVKLDPKENIAKVNQELNELHAEIAKWQQKMETSEKQAKKAQNMINDAQNKIAKNEDLKRDLEALEKEHPEGIYLSGALLMFAGSKSYYLYGASSNEFRDFLPNHHMQYTMMKYAREHGATTYDFGGTDNDPDKDSEHYGLWAFKKVWGTYLSEKIGEFDYVLNQPLYQLIEQVKPRLTKAKIKISRKLKRK >NZ_CP029080.1|WP_000592293.1|2754703_2757871_-|efflux-RND-transporter-permease-subunit MIKKLLQFSLGNKFAIFLMVVLVVLGGVYASAKLKLELLPNVQNPVISVTTTMPGATPQSTQDEISSKIDNQVRSLAYVKNVKTQSIQNASIVTVEYENNTDMDKAEEQLKKEIDKIKFKDEVGQPELRRNSMDAFPILAYSFSNKENDLKKVTKVLNEQLIPKLQTVDGVQNAQLNGQTNREITLKFKQNELEKYGLTADDVENYLKTATRTTPLGLFQFGDKDKSIVVDGQYQSVDAFKNINIPLTLAGGQGQSQSQSDNKQNSAMSDVNQASPQQNSKASASNNISGMPTAKLGDLADITVGDVRTSISKTNGKDAVNLQITKAQDANTVQVAKDVQRKIDTFVDENKDFNVTKTMDTAKPVEKSLYTMVEKASLGTIVAIIVILLFLRNIRTTAISIISIPLSLLMALIALKLSDVSLNILTLGALTVAIGRVIDDSIVVVENIYRRLTDSEEQLKGENLIISATTEVFKPIMSSTLVTIIVFLPLVFVSGSVGEMFRPFALAIAFSLLASLLVSITLVPALAATLFKKGVKRRNKQHQEGLGVVSTTYKKVLHWSLNHKWIVIILSTLILVATIVFGGPRLGTSFISAGDDKFLAITYTPKPGETEQAVLNHAKDVEKYLKQKKHVKTIQYSVGGSSPVDPTGSTNSMAIMVEYDNDTPNFDVEADKVIKHADGFKHPGEWKNQDLGTGAGNKSVEVTVKGPSMDAIKSTVKDIEQKMKQVKGLANVKSDLSQTYDQYEIKVDQNKAAENGISASQLAMHLNENLPEKTVTTVKENGKTVDVKVKQNKQTDWSEDKLNNITLKKPTGGTIKLGDIATLVKTTTPSKLTQEQGDYATTVSAKVTNKDVGGTTRQVMSKINNLDKPNNVKVNIGGASDDINNAMTQLAFAMLAAIIIVYLILVITFKGGLAPFTILFSLPFTVIGVIIALLITGETISVPSLIGMLMLIGIVVTNAIVLIDRVINNEQQGMEMKEALIEAGGTRIRPILMTAIATIGALVPLLFGQDSSILISKGLAATVIGGLISSTLLTLVVVPVIYEILFTLKKRFTKR >NZ_CP029080.1|WP_001161089.1|2754202_2754520_+|hypothetical-protein MQFYLILLALLYLVVSFISIFKMEVIFTRILRIIMGVLLLFVVALTTMSFPKENWWVFIVLLLLVGNVEVTGFKMLKKDLKGVNILNLMSLFIFVIYFILTIALF >NZ_CP029080.1|WP_000051210.1|2753793_2753958_+|hypothetical-protein MSLENQLAELKYDYVRLQGDLEKRESLNLDTSALVRQLKDIENEIRNVRAQMQD >NZ_CP029080.1|WP_001621996.1|2763548_2764571_-|GTP-3',8-cyclase-MoaA MVEQIKDKLGRPIRDLRLSVTDRCNFRCDYCMPKEVFGDDFVFLPKNELLTFDEMARIAKVYAELGVKKIRITGGEPLMRRDLDVLIAKLNQIDGIEDIGLTTNGLLLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDDTLFQSINNRNIKATTILEQIDYATSIGLNVKVNVVIQKGINDDQIIPMLEYFKDKHIEIRFIEFMDVGNDNGWDFSKVVTKDEMLTMIEQHFEINPVEPKYFGEVAKYYRHKDNGVQFGLITSVSQSFCSTCTRARLSSDGKFYGCLFATVDGFNVKTFIRSGVTDEELKEQFKALWQIRDDRYSDERTAQTVANRQRKKINMNYIGG >NZ_CP029080.1|WP_000643987.1|2764590_2765190_-|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase-MobA MKAIILAGGHSVRFGKPKAFAEVNGETFYSRVIKTLESTNMFNEIIISTNAQLATQFKYPNVVIDDENHNDKGPLAGIYTIMKQHPEEELFFVVSVDTPMITGKAVSTLYQFLVSHLIENHLDVAAFKEDGRFIPTIAFYSPNALGAITKALHSDNYSFKNVYHELSTDYLDVRDVDAPPYWYKNINYQHDLDTLIQNL >NZ_CP029080.1|WP_000866968.1|2765196_2765430_-|molybdopterin-converting-factor-subunit-1 MKVLYFAEIKDILQKAQEDIVLEQALSVQQFEDLLFERYPQINNKKFQVAVNEEFVQKSDFIQPNDTVALIPPVSGG >NZ_CP029080.1|WP_000808500.1|2765435_2765882_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaE MKQFEIVTEPIQTEQYREFTINEYQGAVVVFTGHVREWTKGVKTEYLEYEAYIPMAEKKLAQIGDEINEKWPGTITSIVHRIGPLQISDIAVLIAVSSPHRKDAYRANEYAIERIKEIVPIWKKEIWEDGSKWQGHQKGNYEEAKREE >NZ_CP029080.1|WP_000602943.1|2765895_2766381_-|molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-protein-B MILQIVGYKKSGKTTLMRHIVSFLKSHGYTVATIKHHGHGKEDLQLQDSDVDHMKHFEAGADQSIVQGFQYQQTVTRVENQNLTQIIEKSVTIDTNIVLVEGFKNADFEKVVVYRDEEELQVLQQLLNVCYSINVREHEDFTAFEQWLLNKIKNDCDTQLI >NZ_CP029080.1|WP_000259727.1|2766377_2767637_-|molybdopterin-molybdotransferase-MoeA MVVEKRNPIPVKEAIQRIVNQQSSMPAITVALEKSLNHILAEDIVATYDIPRFDKSPYDGFAIRSVDSQGASGQNRIEFKVIDHIGAGSVSDKLVGDHEAVRIMTGAQIPNGADAVVMFEQTIELEDTFTIRKPFSKNENISLKGEETTTGDVVLKKGQVINPGAIAVLATYGYAEVKVIKQPSVAVIATGSELLDVNDVLEDGKIRNSNGPMIRALAEKLGLEVGIYKTQQDDLDSGIQVVKEAMEKHDIVITTGGVSVGDFDYLPEIYKSVKAEVLFNKVAMRPGSVTTVAFADGKYLFGLSGNPSACFTGFELFVKPAVKHMCGALEVFPQIIKATLMEDFTKANPFTRFIRAKATLTSAGATVVPSGFNKSGAVVAIAHANCMVMLPGGSRGFKAGHTVDIILTESDAAEEELLL >NZ_CP029080.1|WP_000134532.1|2767699_2768194_+|cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase-MoaC MTEFTHINQQGHAKMVDVSDKQITKRTAVAHSSITVNETIYKQISNNTNTKGNVLNTAQIAGIMAAKNTSTIIPMCHPLPLTGIDVHFSWDETNAPLYTLNIQTTVSTTGKTGVEMEALTAASATALTIYDMTKAVDKGMIIGETYLESKSGGKSGDFQRQLDQ >NZ_CP029080.1|WP_000503826.1|2768195_2768702_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaB MGEHQNVKLNRTVKAAVLTVSDTRNFDTDKGGQCVRQLLQADNVEVSDAHYTIVKDEKVAITTQVKKWLEEDIDVIITTGGTGIAKRDVTIEAVKPLLTKEIEGFGELFRYLSYVEDVGTRALLSRAVAGTVNNKLIFSIPGSTGAVKLALEKLIKPELNHLIHELTK >NZ_CP029080.1|WP_000076912.1|2768731_2769736_-|molybdopterin-biosynthesis-protein-MoeB MSQERYSRQILFKQIGEIGQNKINQKCALIIGMGALGTHVAEGLVRAGIAKLIIVDRDYIEFSNLQRQTLFTEEDALKMMPKVVAAKKHLLALRSDVDIDDYIAHVDYYFLETHGQDVDVIIDATDNFETRQLINDFAYKHRIPWIYGGVVQSTYTEAAFIPGKTPCFNCLVPQLPALNLTCDTVGVIQPAVTMATSLQLRDAMKVLTDQPIDTKITYGDIWEGSHYSFGFSKMQRSACTTCGDVPSYPYLNKNEQRYATLCGRDTVQYENASITHDILVQFLKQHQLNYRSNSYMVMFEFKGHRIVAFKGGRFLIHGMTRTSDATHLMNLLFG >NZ_CP029080.1|WP_000913006.1|2769903_2770509_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MLKINLKYQLKNTLIRINIDDTEPKIYAVRGPSGIGKTTVLNMIAGLRKADEAIIEVNGQLLTDTAKNVNVKIQQRRIGYLFQDYQLFPNMTVYKNITFMAEPSEHIDQLIQTLNIDHLMKQYPMTLSGGEAQRVALARALSTKPDLILLDEPFSSLDDTTKDESITLVKRIFNEWQIPIIFVTHSNYEAEQMAHEIITIG |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP029080_3 | 3.1|1276324|34|NZ_CP029080|CRISPRCasFinder | 1276324-1276357 | 34 | NZ_CP029080.1 | 1509565-1509598 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP029080_4 | 4.1|1282796|32|NZ_CP029080|CRISPRCasFinder | 1282796-1282827 | 32 | NZ_CP029080.1 | 11582-11613 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP029080_4 | 4.1|1282796|32|NZ_CP029080|CRISPRCasFinder | 1282796-1282827 | 32 | NZ_CP029080.1 | 11638-11669 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP029080_4 | 4.1|1282796|32|NZ_CP029080|CRISPRCasFinder | 1282796-1282827 | 32 | NZ_CP029080.1 | 170151-170182 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP029080_4 | 4.1|1282796|32|NZ_CP029080|CRISPRCasFinder | 1282796-1282827 | 32 | NZ_CP029080.1 | 719934-719965 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP029080_4 | 4.1|1282796|32|NZ_CP029080|CRISPRCasFinder | 1282796-1282827 | 32 | NZ_CP029080.1 | 1370134-1370165 | 1 | 0.969 |
| NZ_CP029080_4 | 4.1|1282796|32|NZ_CP029080|CRISPRCasFinder | 1282796-1282827 | 32 | NZ_CP029080.1 | 2371414-2371445 | 2 | 0.938 |
1. spacer 3.1|1276324|34|NZ_CP029080|CRISPRCasFinder matches to position: 1509565-1509598, mismatch: 0, identity: 1.0
ttgttggggcccacaccccaacttgcacattatc CRISPR spacer ttgttggggcccacaccccaacttgcacattatc Protospacer **********************************
2. spacer 4.1|1282796|32|NZ_CP029080|CRISPRCasFinder matches to position: 11582-11613, mismatch: 0, identity: 1.0
aacttgcacattattgtaagctgactttccgc CRISPR spacer aacttgcacattattgtaagctgactttccgc Protospacer ********************************
3. spacer 4.1|1282796|32|NZ_CP029080|CRISPRCasFinder matches to position: 11638-11669, mismatch: 0, identity: 1.0
aacttgcacattattgtaagctgactttccgc CRISPR spacer aacttgcacattattgtaagctgactttccgc Protospacer ********************************
4. spacer 4.1|1282796|32|NZ_CP029080|CRISPRCasFinder matches to position: 170151-170182, mismatch: 0, identity: 1.0
aacttgcacattattgtaagctgactttccgc CRISPR spacer aacttgcacattattgtaagctgactttccgc Protospacer ********************************
5. spacer 4.1|1282796|32|NZ_CP029080|CRISPRCasFinder matches to position: 719934-719965, mismatch: 0, identity: 1.0
aacttgcacattattgtaagctgactttccgc CRISPR spacer aacttgcacattattgtaagctgactttccgc Protospacer ********************************
6. spacer 4.1|1282796|32|NZ_CP029080|CRISPRCasFinder matches to position: 1370134-1370165, mismatch: 1, identity: 0.969
aacttgcacattattgtaagctgactttccgc CRISPR spacer aacttgcacattattgtaagctgacttttcgc Protospacer ****************************.***
7. spacer 4.1|1282796|32|NZ_CP029080|CRISPRCasFinder matches to position: 2371414-2371445, mismatch: 2, identity: 0.938
aacttgcacattattgtaagctgactttccgc CRISPR spacer aacttgcacgttattgaaagctgactttccgc Protospacer *********.****** ***************
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
1208570 : 1216389
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP029080|1208570:1216389|DBSCAN-SWA ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTTACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTTCGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTATTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTACGGTTTTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTTGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCATTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCGTGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAACGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCATAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAGTAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCGAGTGGGACAACAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCGATGACTGGTACTAAACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCATAGCCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGTGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTACAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAAGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGGTAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCAGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCGCCTAAAGTTAATACAGCGGCAGCAGCACCAACTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACGCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGTCAAAATAAGAGGAGGGCGGTTTTTTAAGTGAGAAAATATTTATCTAAACTAGTTATCACTATAAAACACTTCTGATATATCGAACTAAGAATATCAGAAGTGTTTTATAGTTTTGATATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTGTTATTATTTTCAGCAGTTTCATCTAAGTTATTAAATGTTGAAATAAACAACATAATACCACCAATGATGAAAATGGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATAGTTATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTACTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCCACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACGCATTGTGCAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCAGGCGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGCGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGGTTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCTTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACGACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGACTAAAGTTCACTAAAAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACACGGAATGTGATGTGCAGCTGAAAAATTAAAATCTTTATTTAATTCGAATTGATATGGATGCGTTGTACTAGGATAGATTTGTTGTAACAATTTAAAGCGCTCCTTTACTTTCAAGATATTGATTTAGTCCACGTTGACGTAAATGACAAGCTGGACATTCACCACAGCCATCCCCAATGATACCGTTATAGCATGTTAATGTTTTTGTACGAATATAATCTAAAACTTCGAGTTCATCACTTAATTTCCACGTTTCTGCTTTGTTTAACCACATTAAAGGAGTATGAATAACAAAATCTTTGTCCATAGCTAGGCTTAATGTTACGTTCATTGATTTTATAAAACTATCGCGACAGTCTGGGTAGCCTGAAAAGTCTGTTTCACATACGCCTGTAATAATATGCTTAGCCCCAATTTGATAAGCTAGAGCGCCTGCAAACGACAAGAAAAGTAAATTTCTAGCTGGAACAAATGTATTAGGTATACCATCTTCATTATTAGTAATTTCCATATCATGTTGTGTTAATGCGTTTGGAGTAAGTTGTGATAATAATGACATATCTAAAACGTGGTGTTTCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGTCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAATTGTTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAAGAGGTTAATGGCATTGATAAGCCCGTTTTTAATTTATAAAATAAAAAAAGCCTATCTCCATAAAAGATAGACGAAAGAAATGGGTTGCTCCTATAATATATATTAAAGGTTTACCAACGAATGTTTGAAATTTCAATGTCTAGTTTTTTATAGAGGGTTTCAGCTAGGAACCTCTGATATTCATTTATGTACGATGAATAGAATATACCATATATTAGTTAAAATCAAGGTCAGGATAATGACAATGCCTTTAAAGTTTTAGCTACATCCAATACATATTATAAAAATAAAACACATTTAGAACGGAGTATACAATGATTCTAGTCATAGATAATAATGATTCATTTACATATAATTTAATAGACTATATTAAGACTCAAACGAAACTAACAGTTCAAGTTGTTGGTATTGATAATCTGCTGATAGAAGACGTCATTAATATGAAGCCAAAAGCAATTGTTATTTCACCAGGGCCGGGTAATCCTGATGATTATCCAATCTTGAATGAAGTGTTAGAACAATTTTATCAGCGTGTACCTATACTAGGTGTATGTTTAGGATTTCAATGTATCGTGTCTTATTTTGGTGGAAATATCATTCACGGCTATCATCCTGTACACGGACATACTACACAGTTACGCCATACCAATGAAGGTATTTTTCAAGGACTGCCTCAAAATTTCAATGTAATGCGTTATCATTCATTAATTGCTGACGGAGCGACTTTTCCAAATTGCTTAAAGGTTACAGCAAAAAACGATGAAGCGATTATTATGGCATTTGAGCATATTACATTTCCGGTTTTTGGTGTGCAATATCATCCTGAATCTATTTTGAGTGAATACGGTTATCGACAGGTTGAATTATTTTTATCGAAGGTAGGTGATTATTGTGAGAATAGAATATAATTATCGCTACTATCTAACTGAAAATGAATATAAGCAATACCATATTCAATTAAAGGGATTTATAAAGAAGTATGTTGCCACTAAGTTGGCTGATGTGGGAGAAGTGATACACTTTGCACAAGCGCAGCAACGACAAGGTAGATATGTTTCGTTATATTTAAGTTACGAAGCGGCAAAGTATTTTAATCATGTTATGTGTACACATTCATTAGCTAAAGATGATATTTATGCAGTAGCTTATAGTTTTAAAAAAGCGGAAAACATAAATTCAATATATGAACATCAAACTTCTTATGTATCAAAACATCATTTTTCATTTGTTGAATCTTCTGAGGTTATGATGACTAATATTAAACGTGTCCAACAAGCAATTGTTGAAGGCGAAACGTATCAGGTGAACTATACGGCGCGCTTAACGGATAACATTTATTATCCTATTAGTACTTTATATGAACGATTAACTCAATTTAGTAATGGTAATTATACTGCGTTATTACAAACTGATGAAATCCAAGTAGCGTCTATCTCACCAGAATTATTTTTTCAAAAAGGACAATTTAACAATGTCGATAACGTTATCATAAGCAAACCGATGAAAGGGACAATGCCTAGAGGTAAAACGGAAGCTGAAGATCAACAGTATTATAAAACATTGCAAACTTCTTCGAAAGATCGTGCAGAAAATGTCATGATTGTTGATTTACTAAGAAACGATATAGGGAGAATATCACAGAGTGGCTCAATTAAGGTGTATAAACTATTTTTCATTGAGGCATATAAAACTGTATTTCAAATGACTTCGATGGTAAGTGGAACTTTAAAAACTAATACAGACTTAACTCAAATTTTAACATCGTTATTTCCTTGTGGTTCGATTACAGGTGCACCGAAACTGAATACAATGAAATATATTAAACAATTAGAAAGTTCACCTCGTGGAATATACTGCGGAGCAATTGGACTATTACTTCCAACTGAAGATGATAAAATGATTTTTAATATTCCGATTCGTACTATTGAGTATAAATATGGACAAGCGATTTATGGAGTCGGAGCAGGTATTACAATTGATTCTAAGCCAAAAGATGAAGTAAATGAATTTTACGCAAAAACCAAGATTTTGGAGATGTTATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP029080|1208570:1216389|1209625_1210312_-|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >NZ_CP029080|1208570:1216389|1214660_1215254_+|WP_000604517.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKVTAKNDEAIIMAFEHITFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NZ_CP029080|1208570:1216389|1215237_1216389_+|WP_001217805.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFKKAENINSIYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >NZ_CP029080|1208570:1216389|1210286_1210760_-|WP_001037807.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >NZ_CP029080|1208570:1216389|1212503_1213217_-|WP_001062976.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKSDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVIAQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_CP029080|1208570:1216389|1211100_1211541_-|WP_001093554.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAAAAVLTLGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >NZ_CP029080|1208570:1216389|1208570_1209626_-|WP_000244415.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NZ_CP029080|1208570:1216389|1213641_1214310_-|WP_000446726.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKQFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >NZ_CP029080|1208570:1216389|1211820_1212405_-|WP_000637683.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNNLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >NZ_CP029080|1208570:1216389|1213220_1213640_-|WP_000941336.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
1228365 : 1242641
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP029080|1228365:1242641|DBSCAN-SWA TATGAAAGAACAACTTAATCAACTATCAGCATATCAGCCTGGTTTATCTCCAAGGGCATTGAAAGAAAAGTATGGCATTGAAGGAGATTTATATAAACTTGCATCAAATGAAAACTTGTATGGACCATCGCCTAAAGTTAAAGAAGCGATATCAGCACACTTAGATGAGTTATATTATTATCCTGAAACAGGATCACCGACATTAAAAGCGGCGATTAGTAAACATTTAAATGTAGATCAATCACGCATTTTATTTGGTGCGGGATTAGATGAAGTTATATTAATGATTTCTAGAGCAGTATTAACGCCAGGGGATACTATTGTTACAAGTGAAGCGACATTCGGTCAATATTATCACAATGCGATTGTTGAATCAGCTAATGTGATACAGGTACCTTTAAAAGATGGTGGCTTCGACTTAGAAGGTATTTTAAAAGAAGTTAATGATGATACGTCATTGGTATGGTTATGTAATCCAAATAATCCTACAGGTACGTATTTTAATCATGAGAGCTTAGATTCGTTTTTATCTCAAGTACCATCACATGTTCCGGTACTCATAGATGAAGCTTATTTTGAATTTGTGACAGCAGAGGACTACCCGGATACACTTGCTTTGCAACAAAAATATGACAATGCATTCTTATTACGTACATTTTCAAAGGCGTATGGATTAGCGGGTTTACGTGTAGGATATGTGGTAGCAAGTGAACATGCGATTGAAAAATGGAACATCATTAGACCACCATTTAATGTGACACGTATATCTGAATACGCAGCAGTTGCAGCACTTGAAGATCAACAATATTTAAAAGAGGTAACACATAAAAATAGTGTTGAACGCGAAAGATTTTATCAATTACCTCAAAGTGAGCATTTCTTACCAAGTCAAACGAATTTTATATTTGTAAAAACAAAGCGGGTAAATGAACTTTATGAAGCACTTTTAAATGTAGGGTGTATTACGCGACCATTTCCAACTGGTGTTAGAATTACAATTGGTTTTAAAGAACAAAATGATAAAATGTTAGAAGTTTTATCAAACTTTAAATACGAATAGAAAAGGGCACCACATGGTATGAATATGTGCCAAAATGCGGTGTGAATGATGAGGTGAGAGCATTCAGTGTAAAAAGCAACAATAGATGATATTGTTTTGTATCAATTGCTTTTTTGCTATACTGAATTAATACTGATATTTTGAGGAGAAGATTAAAATGACCCGTAAATCAATCGCGATTGATATGGATGAAGTATTGGCAGATACATTAGGAGAAATCATTGATGCTGTCAATTTTAGAGCGGATTTAGGTATTAAAATGGAAGCTTTGAATGGTCAAAAACTTAAACATGTTATTCCTGAACATGATGGATTAATTACAGAAGTATTGAGAGAACCAGGCTTCTTCAGACATCTTAAAGTGATGCCGCATGCACAAGAAGTTGTGAAAAAATTAACTGAACATTATGATGTATATATTGCTACAGCAGCAATGGATGTACCAACATCATTTAGTGATAAATATGAATGGTTACTAGAGTTCTTTCCATTTTTAGATCCACAGCATTTTGTTTTTTGTGGTAGAAAAAACATCGTTAAAGCTGATTATTTAATAGATGACAATCCTAGACAGCTTGAAATTTTTACTGGTACACCGATTATGTTTACAGCAGTGCATAATATTAATGATGATCGATTTGAACGCGTAAATAGCTGGAAAGATGTAGAACAGTATTTTTTAGATAATATTGAGAAAGAAAAATAAATCACTTGAACCATTTTATGTAGCAAATAAAATGCATATACTGGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACATAAAGAAATACTTTTTCTTTAGAAATTAGTATTTCTTATGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCTCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACCCCGGCAAGGTTGACTAGAATTGAAAAAAGCTTGTTACAAGCGCATTTTCGTTCAGTCAACTACTGCCAATATAACTTCGTAGAGCATAGAACATTGATTTATGTTCCAGCCTGAATCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTAAGTCTATCTCATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGTCAGATTACATGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGGCGCATAAACCACTATGATTTAAATTACAACATCAATCATTTTAGTGGCATGCGCCAAAGTTATATCTCTGTTTTTGAAAAAAGGTAATAGCTTAAAGCTAATAACAGCGAATATAATGTAAGTTGAATCTTATGATTACACTTTAAACCTAATATAATATCCCATTAAGATCATTCCGGATGCTTACAAATCATTGACAGTAAGTAACTGAATGGCATTTGGTATAACCTCAATATCAATAGGTGTTTCTAATGAAATTTCGCCATCAATATCAACTTTCATTGCTGGATCTGTTGTAAGTGAAATCTTTTTACCAGGTATATGCTCAATACCTTGAGTAATTTCATTCCAATTCATGCTATCACGCTTTTTAAAAATATCATTTAAAATACTGAAACTTTGTTCATTAAAAATGAAAGTGTTCAGTTCACCATCTTGAGGAGACAAATCAGTCAATGGTATACGACTACCACCAATGAATGGACCATTTGCTGATAGTATCATGGTCGTTTCGCCAGAATATGTCTTATCATCAATTGTTAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATTAGACCTAAGCCAACAAAGTTGAGTGCATATTGATTATTTATTTTAATTACATCGTATGTACCAACTTGTGCAGAAATCATTTGTTCACTAGCTTGTTTATGATTAGGTGCTATATTTAGCGTTTTTGTAAAATCATTAAAAGTACCGCCTGGTAAAATTCCAATAGGGAGTTGAAGGTCATGTGTCATAACACCATTTATAAGTTCGTTAACCGTGCCATCACCGCCAAGAATAAATAATATATCTACATCTTTTGCATAGTTTTTAGTTTTGATTTCTTGGCAATATTTAATAATGTCACCTTCGTTTTCACTCAATTGAATAGAAAGATGCTTACAAATTGAACTTAATGCTGTTGTAACTTCCCCAATACCTTGATTAATATTTTTTAATCCACTGTGTTCATGGTAAAAGAGGACACCATGTGTATATTTATTTTCCATAGCTTAGCCTACTTTCTAAAAATTGGTTCATTAAATATATATACCCACTTTTAATTGTTAATACCAAAAATATGTTTTTAAATAGAGAAAATGATAATAACTGACATTGATGTCTATAGAGTGGGGCGAGAAAATATAGTTATAGTTGTCTATAACGAGCATATTAAGTTTTTATTTATATTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGAATGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAATTTGTTTGACCTAGTGGTTCTATTAACTTAACTAAAGTACCATTGATTGCTTGTGCAGATGCGTTAGTTAAATACCAAATACTCATCATTTGAGCATTGAATGCTTTAGGTGCTAACTTAACAGCAGCACTATTACCTGTTGGTGATAAGCAAAGCTCACCGATAACACAAATAATGTACGATAAAATAACCCAGTTAACTGAGAAGTTTGATGTACCTGATGCATAACCTACAATACCAATTAGTATGTATGACGCACCTGCTAAGAACGTACCAATTGCAAATTTTACTGGCAGACTAGGTTGTTTAGTTCCAAGCTTTTGCCATAAAAGTGAAATAATTGGTGCTAATAATAAAATAAATAATGGGTTAATTGATTGGAAAATCGCTTCACCAAAGTTTGTTTTCCAACCAAATAAGTTTAATTTCATATCTGAATGTTCAATACCATAAATGTTTAATACATTAGAACCTTGTTCTTGAATAGCCCAGAACACCATTCCAAGAATGAATAATGGAATAAATGCTTTAACACGAGAACGTTCAGTATCAGTGACATCTTTACTTCTAATAATTAAAGTGAAGTAAATGATTGGTAATGCAATACCTAATACTAAAACAGTATTACTAACTAAGTTAAATGATAATGAGTTAGTTAATGCACCAATTACAATAATTAATACAATTGCTAACACAACACTTCCGATGATAAGACCATATTTTTTCTTTTCTGCTGGAGTCAATGGATTAGTAGGTTTCATACCCACACTACCTAAGTTTTTACGATTGAAAAGTACATACCAAACTAAACCTAGCGCCATACCAACAGCTGCAATTAAGAATCCGCCATGGAAGTTTTTAACATTAACAAAGTGTTGCAAAATAATAGGTGATAATAATGCACCCATATTAACTGACATATAGAAAATAACAAAACCTGCATCCATACGTCTATCATTTTCAGGATATAAGCGGCCAACAATATTTGAAATATTTGGCTTCATTAAACCTGAACCAATAATAATGAAGAACATTGATGTGAATAAGCCGATTAACGCAAACGGTAAGCTTAAACAAATATGTCCGATAATAATAAAGACTGCACCTAGTAAAGTAGCGCCTCTAGTGCCTGTAATTCTGTCAGCAATCCATCCACCTGGTATTGATGTCATATAGATTAATGAACCGTAAACTGACATGATTGACATAGCTGTTGTTTTATCAATTCCAAGGCCATTATCTGTTACGGCGAAGTACATGTAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP029080|1228365:1242641|1240926_1241883_+|WP_001245581.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQSITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVIPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLVTMVLFALLLFQVIFKIGQFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVILVTLLIITIYLVPYLDVLLLGRAEAINLGISYEQLTRFLLVIVSILVSISTTLVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVKRRNAQ >NZ_CP029080|1228365:1242641|1234370_1235237_-|WP_001068497.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NZ_CP029080|1228365:1242641|1233850_1234351_-|WP_000930014.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_CP029080|1228365:1242641|1232004_1233510_-|WP_000193753.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGTSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NZ_CP029080|1228365:1242641|1241879_1242641_+|WP_000616861.1|DBSCAN-SWA MIQVGNLTKTIHNQTILEDISIVIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDEGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHEIVNDALDLLQLQDIRHRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLQMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGRLVKSDLKDNVIQSNVLSDLYDMDIQIEHIRNQRICLYFKD >NZ_CP029080|1228365:1242641|1236399_1238505_+|WP_000855505.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_CP029080|1228365:1242641|1236038_1236437_+|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_CP029080|1228365:1242641|1230817_1231735_-|WP_000429016.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLTIDDKTYSGETTMILSANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_CP029080|1228365:1242641|1238622_1239594_+|WP_000562500.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDVWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_CP029080|1228365:1242641|1228365_1229424_+|WP_000663021.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNDDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPSHVPVLIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEHFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_CP029080|1228365:1242641|1231825_1231927_+|WP_031785486.1|DBSCAN-SWA MIITDIDVYRVGRENIVIVVYNEHIKFLFILIS >NZ_CP029080|1228365:1242641|1229581_1230130_+|WP_000197263.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEKEK >NZ_CP029080|1228365:1242641|1239968_1240940_+|WP_000876313.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGKILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDIFHLSDSQQNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSISGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINVALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRVIVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ |
13 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1544963 : 1589525
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP029080|1544963:1589525|DBSCAN-SWA 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65 | Staphylococcus_phage(73.77%) | head,tail,plate,terminase,holin,capsid,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1790761 : 1805219
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP029080|1790761:1805219|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP029080|1790761:1805219|1799112_1799220_+|WP_025174108.1|DBSCAN-SWA MAQYLVTTFKASTGRKHTYITRAKSNQRFNEVLQK >NZ_CP029080|1790761:1805219|1797973_1798132_+|WP_000714365.1|DBSCAN-SWA MKKFNIQITYTGMIEETIEAESLDEAENEAHDIARMEVPFDCDEYEINVEEE >NZ_CP029080|1790761:1805219|1790761_1791469_-|WP_000146714.1|integrase|DBSCAN-SWA MASIRKRGNKYQARVNYYDLYTHERKPITKTFNTKSEARKWAASVEADTENFVLLDNNITLEAWIELYLATFRLNNIAYSTYQNEIYTKRRIIKFFKNVYIKDITPIMYQQFLNWMKSENYSRSTAKQTRQLLNNVIEKAVLQGALSNNPCLICNIPDYKPPKSIEWLEAHEVKEFLQLIKKRNIYQYFVCYTAIELGCRVGEALALRISDFDLKNQTVHIYKSYDQKRAKAKLL >NZ_CP029080|1790761:1805219|1793998_1794160_+|WP_000072840.1|DBSCAN-SWA MSNTYKSYIIAVMCITILAICLMPFLYFTTAWVIAASTGIAIFIFYDEYFFRE >NZ_CP029080|1790761:1805219|1796221_1796716_+|WP_076679818.1|DBSCAN-SWA MKGGEFLGAGEFTVKVANVEFNDRENRYFTIIFENNEGKQYKHNQFVPPFQQDFQEKQYIELLSRLGIKLNLPDLTFDTNQLINKIGTIVLKNKFNEEQGKYFVRLSYVKVWNKGDEVVNKPEPKTDEMKQIEQQVNGKQTPMSQQSNPFVNAPIEINDDDLPF 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23 | Staphylococcus_phage(57.14%) | integrase,terminase,capsid,portal | attL 1784584:1784601|attR 1808055:1808072 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
2076962 : 2085274
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP029080|2076962:2085274|DBSCAN-SWA ATTAATTACAACATTCTCGATTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCAATATCATGAGTAACTAAGATAATGGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTCGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCGAGCAATCATTACACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCATTATCTTTGCTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAATCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATTGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTTTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGCATTCAACTATACAACTCCTAGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAATTAGACAAAATAAAGAGATATGCCCCCTTCAAGTTTTATTTATCGCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATTTTATTGTTGCATAACCTTATTTTTTAATTCTGGGTCAAATTGCTGTTGTTTTAACATTTCAATTTCAAGCTTATATGGCGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGTGTTTCTAAGATTTTCGGAATATCTTTAAAACTATCATGATGCACAATGTAATTTAATGCATCAAAGCCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCGCCACGGTCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTAATTCTGTCGACTCCAATGATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAGTCCTCTTTCACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAGCATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATACGTGCTAACTCTTCAAACGAGCGACCAATCTCTGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCAGCTCCAACATGCGCACCTGGATGTAATACAATATCTTTAGCGCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGAACAACAATATTAGATAAGCCATATTTTTCCATCACTTCATGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTGTTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATAAATGTTGTTTCACCATATTCATGCGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAATTGTTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGTTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAAAACAAAACCGCGATCTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTAATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGGCCAGTTCGGCCGACTCTATGTGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCAATAACGTATTGGAATTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGTGGCGTTAAACCACCATGAATCATACCAACTTTAATACCAGCTTCATTTAGTGAACGTGCTAAATCATTTGCATTATCTCTACTATTACAGAAAATAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTCTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAAAAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTTAAAAATGGTTGTAACTGTTGTGGAATTGTAGCACTAAACACCGCAATATTTGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCAATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGATCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTTTAGCTAAATCATTAATTCTAGTAGGGGTGCCTATAATCAATTGTGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCTTTCTCTATATCTGTACCACCAATAAAAACTTCAACTGAAACACCAGCTTTAAATTGGCTTATATGGTTCGCTGCATCGTATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACTACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCAATTAACTGCATTAATGGTAATAAAAATGCATGAGATTTCCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTCTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTATATGTTCATCTTTACTATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCGAAATTTCAAAATTTAGAAATCCCGAGATTTTAGTTTAAATATATTGAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTATATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAATGTTTTTAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAGTTCACACCCTGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCGCCTTGTTGAACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCAATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACTCACCAACAAAACGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAATATCAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGAGATGTTTGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGATGGTATTGTTTAATTAATTGCTCAGCCCTTAACTTTTGACATGCATCTATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGCCCTCTTCCCTTACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGTGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATGGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACATCTTGTTGATTATTTATTATTGAAATGTTCTTCAATCCCATCGCCTTCGCCAACATCATATTGACACCATGAGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATCGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATAATCAAACCATAACCATTAGCTTTTAATGCTGTTACGCCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAGCCTTTTTCGATTGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTTCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTTCTAAATGGCACATGATGATCTAACAATGTCATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCTTCATTAATTTGAGCTAAACGTTGATGATGTTGTTCAGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTGTTCAGCAATTTTGGTCCGAATTTCAATTCATCAGATGATAGCTCTATTAATTGCGCAGAATATTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAACTTTCGGTTTGGATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCAATAAGTGGTCCGCCCATACCACAAATTGTGATATTATCGATTACGTCCTCAGGATGAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTCTATCTACTAATTGATTTGCAGCTACATTTTTCACAGCAGCTTGAAAAGGGCCTTGAATAACTTCTCCTGCAATACCGCAATCGCATAAATGGTTTTGAATTGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTACCTTGTTTTAAAAATCGACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTCTTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAACAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGTCTTTCAAACGTTTACTACGACTTGGATGTCTTAATTTTCTAAGTGCTTTTGCTTCGATTTGTCGAATACGTTCACGTGTAACACCGAAAACTTTACCAACTTCTTCAAGTGTTCTTGTTCTGCCGTCATCAAGACCAAATCTTAATCGTAATACATTTTCTTCTCTATCAGTTAATGTATCAAGTACATCTTCTAATTGCTCTTTTAATAATTCATAAGCAGCATGATCTGAAGGACTTTGTGCTTCCTGATCCTCAATAAAGTCTCCTAAATGACTATCATCTTCTTCACCAATTGGTGTTTCTAATGAAACAGGTTCTTGCGCAATTTTTAAAATTTCACGAACTTTTTCTGCTGGTAAATCCATTTCTTCACCAATTTCTTCTGGTGCTGGATCTCGACCTAAGTCCTGTAACAATTGACGTTGAACACGAATTAATTTATTAATTGTTTCTACCATATGCACAGGGATACGAATCGTACGTGCTTGGTCAGCAATTGCACGAGTGATTGCTTGTCTAATCCACCATGTTGCATATGTTGAAAATTTAAATCCTTTGTTAAAGTCAAATTTTTCAACAGCTTTAATAAGACCCATATTACCTTCTTGGATTAAATCAAGGAATAACATACCACGACCTACATATCTTTTAGCAATACTTACAACTAAACGTAAGTTCGCTTCTGCAAGTCTCGATTTTGCTACTTCATCACCTTGTTCAATACGTTTGGCTAATTCGATTTCTTCTTGTGCACTTAATAAGTTAACACGCCCAATTTCTTTAAGGTACATTCGAACTGGGTCATTTATTTTAACACCTGGAGGGGCACTAAGATCACTTGGATTCAGTTTCTCGTCAGTATCTGAACTATCTTTTTCATTAACTAGTGAAATATCATTATCATTTAATTGATCAAAGAAATCATCCATTTGATCAGAGTCGATATCGAAATTCTGAAGTTTTTCAGCAATTTCTTCATGACTTAAATGACCCTCTTTTTTACCTTTTTCAATTAATTGCTTCTTAACATCTTCTAATGTTAATGTCGGATCAATTGTTTGTTTTTTAATTTTAACTGTGTTATCAGACATGAAACGGCCTCCCGATTTTAAATATGAACATTCGAAATTTATTCAATATTGCTATTTTAAACTAAATTCTTAATTAATTCATCCATATTTTTAATTTTATTTTACAAATAGGAACTAATCCCAATATTTATTTTTCAATAGTGTTGTTTAAATGCGGTAACTATCATTTACCCTTATACATTTTGACATAATCATTATTCGTATTATTCTTTAATACCACATGCTACATGCGTTCTTTATTCTTAGCAACAATTTGCTGTAAATAGTATTTCTGTAATTCTACATCGCCAATCCTTGTAGCTTCCCTTAATTTATGATTCAATGACTCAATGGTTTCTTGTCCGTTTTCATTAATAACATTGACATAATCATCAATTTCATTTTCATATGGTTCGTCATTCAAACTATATTGTTCTAGGCTAATTAATGTTTCTCTCAACTCATTTGAATTAACATACTGTACAGCATCACTGATATTATATTGATCATTTTCCGCATAAAAATCATGTAAGACTTCGAATACATATTTAAAATGCTGATTTGTGAAGTTATCCTTATCAACACTTTCATAATAATTTAAAAATGTATCTTTATCTCTCATTAAATGTTTTAAAAATGCTCGCTCTGCTTTTTCTTGACGGCTCAAATTGTCAAATTGTGCCATACCAATTGGCTCAGGTTCAATATAACCGCCATACTCATCTTCTGGATAATAATTGGCTGGTGCTTGATTGAATTGTATTTCGTTAGCTAATTGCTCAGGACTAACATTGAAAAATGGCGCAACATCATTTATAGCCTTTTGTTGTAGAATTGATGACTTCATAAATGAAATGTCATGACTCAGTTCTTTCAAATAACGTTCATATGAAAGGTCATTATGTGCAATTTCATCTTTTAATATACTCACTTTATAATGTGCAAATGACTTTTTGTCATTTTTTACAAAAGCAGTAAATGCGTCGTTGCCATACTTACCAATGTATTCATCAGGATCCATGCCAGATGGCAATTGTATAACAAATACATTTAGCCCTTGCTGTAACAAATGTTGACCTGTTTTAAGTGTTGCTTCACTACCCGCAAAATCCCCATCAAACATTAATGTTATATTTGATGTTAACTTTCGTATAAAGGTAATATGTTCATCTGACAACTGTGTACCCATTGTTGCAACAACGTTTTTCAAGCCAGCAGTATCAGATTTTATAACATCCATAAAACCTTCTAGTAATACAATTTCATCTAATTTTCTAATTGATTTACGCGCTTTATCTAAGTTGTATAACAACTTTCTTTTTTGAAAAATAGGTGTTTCAGGACTATTTAGGTATTTTGGTTCTTGACCGGTATATGTTCGGCCTGAATATCCAACAATTCTTCCTTGCGCATTTTTCAAAGGAAACATAATACGATTTCGAAATCTATCGTAATAACTGAAGTTTTCTTCATTACGTGATAATAATCCGGCTTCATATGCTAATTCAATATCGTAACCCTTTTTTTGAAGAAAATCATGACAAAAATGTGAGCTATCGGGTGCAAAGCCAATGCATAGCTCTTTAATAAGCGCATCTGTAAAACCACGTTCTAGTAAGTATGTTAATGCTTTTTCGCCTTCGACTGTCTTTGTTAAAGCGTAATAGTAAAATTCTTGTATTAACTCATGCATTTCGATCATTTGTAAATCATCAGAAGCAATTTGAACATTTGAGTTAGATTGTGTTGCCTCAATATCTACAGCAACATTAACTCTATCACCTAATTCTTTAACCGCTTCAACAAATGATATGTCTTTAATTTCTTGAGTAAATTGAAAAACATTGCCACCTTTTTTACAACCAAAACAATGACAAATTTGTTTATCTTCAGAAACTGTAAATGAAGGTGTCTTTTCATCATGAAAAGGACACAAACCTATATAATTGCGTCCTCTCTTTTCTAATTTTACATATTCACTTACCAAGTCTAAAATGTCGGTTTTATCTTTTATTTCATTAATGATCGATTGATCTATTCGCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP029080|2076962:2085274|2083474_2085274_-|WP_108703198.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEKALTYLLERGFTDALIKELCIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISFMKSSILQQKAINDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYSLNDEPYENEIDDYVNVINENGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >NZ_CP029080|2076962:2085274|2077873_2078764_-|WP_000924214.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >NZ_CP029080|2076962:2085274|2076962_2077748_-|WP_001213908.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >NZ_CP029080|2076962:2085274|2082144_2083251_-|WP_001283055.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD >NZ_CP029080|2076962:2085274|2080233_2081334_-|WP_000683915.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFRTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTALKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPHGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESKGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDACQKLRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIQGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI >NZ_CP029080|2076962:2085274|2081336_2082014_-|WP_000624564.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCDCGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTESLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSAQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINEEIAVIERVL >NZ_CP029080|2076962:2085274|2078773_2080120_-|WP_001062169.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHISQFKAGVSVEVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG |
7 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
2154588 : 2163632
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP029080|2154588:2163632|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP029080|2154588:2163632|2161600_2162626_-|WP_001019180.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETANLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDYDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP029080|2154588:2163632|2160159_2160420_-|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >NZ_CP029080|2154588:2163632|2160438_2161578_-|WP_001112045.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NZ_CP029080|2154588:2163632|2162627_2163632_-|WP_001005764.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDDESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE >NZ_CP029080|2154588:2163632|2155128_2157402_-|WP_000594988.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDALQLSDMTKAIERIKRAIVNDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNNQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKNGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGTVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDKNIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDVFKKCYKALITKQETNIEKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >NZ_CP029080|2154588:2163632|2157605_2159885_-|WP_000749795.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >NZ_CP029080|2154588:2163632|2154588_2155107_-|WP_000364543.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATNKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
2299122 : 2331722
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP029080|2299122:2331722|DBSCAN-SWA 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36 | Staphylococcus_phage(93.1%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
2426861 : 2519397
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP029080|2426861:2519397|DBSCAN-SWA 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113 | Staphylococcus_phage(87.18%) | tRNA,head,protease,tail,integrase,terminase,holin,capsid,portal | attL 2486248:2486265|attR 2510595:2510612 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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