Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NZ_CP021287 | Legionella pneumophila subsp. pneumophila strain Albuquerque 1 (D-7474) plasmid unnamed, complete sequence | 0 crisprs | PD-DExK,WYL | 0 | 0 | 0 | 0 |
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NZ_CP021286_1 | 189827-192944 | TypeII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP021286_1
|
43 spacers
spacers of NZ_CP021286_1
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cas4,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP021286_1
The CRISPR arrays of NZ_CP021286_1 >merge|NZ_CP021286|1|189827-192944|CRISPRCasFinder,CRT 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>NZ_CP021286|1|1|189827-192944|CRISPRCasFinder CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TAGATATAAAAAGATTAAATCTTCTAGCGCACAT CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TCACTACTCCTGAAGGTTATAATTTTTGCTATAA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TTCGAATACAATCCTAGTGTCTCTGTGTGAATTAAG CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC CAGGCACTGGTTCACTAGACACTGTAACATCTAT CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC CAATAACAAGCGAGCCTTTTGTACTAGAAGGTTTA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC CTACCAGTTAATCGTAACTCAATCTCTTTTTCAA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC ATAGAATACATAAGTGCAAATTATTAAATGTTAC CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TGAATGTAGAAACCAGATGCCACGAATTATTAGA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TTTGTATAAACGTTCTGATATGACTTAGGTAATCT CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC CTAACCTGATTGCTCAACAAATAATGCTATTGGC CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TCACTTTAGGCCAACGCCGATCCTCCGCTTCGAA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC CTCACATCTTACCCTCAGGGCGGATATTGTGAATC CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC ATTAATAATATTTTAGAAGATTGGCACATAATA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TGACGCAAAGGATTTATTAAAAACGCCTTGTAAT CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC ATTTTACCTTTTAACACATATTGATAGGCGT CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TCCATAACTGAAACGTCCTTATGCCTCAACATAATG CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC GAATTTGTCGGCCGCATAGACCGCTTTTATCAAA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC CTATTGCAAGCTAGTTTGATCGTGTTATTATAAGAA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TGACAAACGTTTGTTTTTTAGACACAACACTAAAAG CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC CCTGAAAACCCGCCACAACCCGCGCCAGACTTGAA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC ACCAAGTCGAAACAACATACCGAGACCGTGTTGA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TACATTGTTACGTTCATTTCACTCAGTTTTTCATA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC AGCAATAACCCAAAGTTTCGCGCGCGTGCGCGGG CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TTATAACATCGGGATGGCGGTTTATTGGTTAAGTAAC CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TTCTTTTTTCAGATTTCATTTCCTTTTCCTTGTG CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TTTTTATCGTAAGCTTGATTAACTAGACATCTACTA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC 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MESSQILSPIGIDLGGKFTGVCLSHLEAFAELPNHANTKYSVILIDHNNFQLSQAQRRATRHRVRNKKRNQFVKRVALQLFQHILSRDLNAKEETALCHYLNNRGYTYVDTDLDEYIKDETTINLLKELLPSESEHNFIDWFLQKMQSSEFRKILVSKVEEKKDDKELKNAVKNIKNFITGFEKNSVEGHRHRKVYFENIKSDITKDNQLDSIKKKIPSVCLSNLLGHLSNLQWKNLHRYLAKNPKQFDEQTFGNEFLRMLKNFRHLKGSQESLAVRNLIQQLEQSQDYISILEKTPPEITIPPYEARTNTGMEKDQSLLLNPEKLNNLYPNWRNLIPGIIDAHPFLEKDLEHTKLRDRKRIISPSKQDEKRDSYILQRYLDLNKKIDKFKIKKQLSFLGQGKQLPANLIETQKEMETHFNSSLVSVLIQIASAYNKEREDAAQGIWFDNAFSLCELSNINPPRKQKILPLLVGAILSEDFINNKDKWAKFKIFWNTHKIGRTSLKSKCKEIEEARKNSGNAFKIDYEEALNHPEHSNNKALIKIIQTIPDIIQAIQSHLGHNDSQALIYHNPFSLSQLYTILETKRDGFHKNCVAVTCENYWRSQKTEIDPEISYASRLPADSVRPFDGVLARMMQRLAYEIAMAKWEQIKHIPDNSSLLIPIYLEQNRFEFEESFKKIKGSSSDKTLEQAIEKQNIQWEEKFQRIINASMNICPYKGASIGGQGEIDHIYPRSLSKKHFGVIFNSEVNLIYCSSQGNREKKEEHYLLEHLSPLYLKHQFGTDNVSDIKNFISQNVANIKKYISFHLLTPEQQKAARHALFLDYDDEAFKTITKFLMSQQKARVNGTQKFLGKQIMEFLSTLADSKQLQLEFSIKQITAEEVHDHRELLSKQEPKLVKSRQQSFPSHAIDATLTMSIGLKEFPQFSQELDNSWFINHLMPDEVHLNPVRSKEKYNKPNISSTPLFKDSLYAERFIPVWVKGETFAIGFSEKDLFEIKPSNKEKLFTLLKTYSTKNPGESLQELQAKSKAKWLYFPINKTLALEFLHHYFHKEIVTPDDTTVCHFINSLRYYTKKESITVKILKEPMPVLSVKFESSKKNVLGSFKHTIALPATKDWERLFNHPNFLALKANPAPNPKEFNEFIRKYFLSDNNPNSDIPNNGHNIKPQKHKAVRKVFSLPVIPGNAGTMMRIRRKDNKGQPLYQLQTIDDTPSMGIQINEDRLVKQEVLMDAYKTRNLSTIDGINNSEGQAYATFDNWLTLPVSTFKPEIIKLEMKPHSKTRRYIRITQSLADFIKTIDEALMIKPSDSIDDPLNMPNEIVCKNKLFGNELKPRDGKMKIVSTGKIVTYEFESDSTPQWIQTLYVTQLKKQP >NZ_CP021286.1|WP_126297580.1|182827_183148_+|hypothetical-protein MMNDLAKILSLKNLLTKNNINPSENFENIYSQITDDGLKKEIESRIIDYFSKLSLPEHVTIYDQLLLSLREKDAISHSNGIYFYLTHIKEIVILFHCLRYFSCMVM >NZ_CP021286.1|WP_025519199.1|180005_182021_+|M3-family-metallopeptidase MSTTVGLPQFSHIKIEHFKSHLDALLKNHLEEIDRLLKENHHYTWDNLIYPLDSLADELERFWSPFAHMHAVMDSEAIRESYETCLPLLSAYDAAIGHNQDLYEAIKSIDQHSLNPAQKKIIEDSMQDFELSGVALSKANKKRFEAIQSRLAELSSKFENNVLDATHAYTIHITEAERVAGLPEHALNTAKELAHEKGLDGFVLTLEYPCFQAVITHAEDRALREEMYRAYITRASDQGPNAGTFDNTPLIDEILSLRHEKAELLGFNNFAELSLATKMAASTNQVTEFIYDLISRTRDKGKAEFRQLEVFAQDKWNLSPVNPWDVAYLSEKRRQDLYSLSQEELRPYFPQPKVMQGLFAIVKKLFGMSIEEIEGVDVWHKDVQCYCIVDESNQTRGYIYTDLFARPHKRNGAWMDSMQSRRKLEDGTVQLPIATLTCNFAKPSANRPAMLSHDEVVTLFHEFGHCLHHVLTQVDYLGGSGINGVEWDAVELPSQFFENWCWDEHALSLLTSHVDTGETLPSALYERLIAAKNFQSAMAMLRQMEFALFDFRIHQEYQIGKASYVANILADVRSKTSVVPIVPYNRFQHSFSHIFGGGYAAGYYSYMWAEVLSSDAFARFEEEGIFNPKTGHDFLKSILEAGGSRKAADAFAEFRGRPATIDALLRHNGIL >NZ_CP021286.1|WP_011212790.1|178571_179906_+|hypothetical-protein MTPIISHLLKIFPELNTQVKTDSLNWTFSTHLKQLGPDFYSKIARLHPILNMEYSVLCQRLRYNLSAPDYSSPEQIKEQLIDALKLAELLEYTYQHYLVVPREVVRLRRHKAIYRELLTELSGYSFALDNPEPESLKTSLSLTQAIREKTAQSNWYRIFISRSKRVINLLDNLDTGSKAFRDFVVLLDKYTNPFLAYLGWCFFAPRLFTNLFLILKHTIPGEWMGEKEKSLDWSDRFYAHLQRRWFELANDSVWFTVGILNCFVLVGALAPLSVYLSLFAFVFDVANTSLRAYIEIGRLQQLQKEYAELFDQEENEDQKKIIKEYQDSISYRIKFEILRSFLSVGGAVAVVIAMALSVPALGIINPVIPLIGAVLLLALWGVSLYLNNKLDEYRPVDNIEKPAPSVINKLSFFAPKNEKKESLHLSSKPEKDLEAEELIPTFTF >NZ_CP021286.1|WP_011212789.1|176307_178314_-|transketolase MNSFTELANAVRMLSIDAVNQAQSGHPGMPLGMADIATVLWKKFLKFNPKNPHWFNRDRFVLSNGHGSMLLYSLLHLTGYNLDINELKNFRQLHSKTPGHPEHGHTPGVETTTGPLGQGLANSVGMALAERVLASHFNHDHYNLVDHYTYTFAGDGCLMEGISHEACSLAGTLGLGKLIVFYDDNGISIDGKVESWFTDDTTSRFKAYNWQVIGPIDGHDADQIEQAISAARENTTQPSLIICKTVIGLGSSVAGSEKAHGSPLSAQDINNVREFFNWKHAPFEIPDSIYKQWDHREQGDKEEQQWLQLLHEYRLQYPSEHDEFLRRANGDLPDDWQEISAGFLKQCLNNEKAIATRKASQQCIEFFAPILPEMFGGSADLTGSNNTDWSGSKAITAHNFSGNYLYYGVREFAMAAIMNGLAVHGGFIPYGGTFLVFADYARNAIRLSALMKQRVIYVLTHDSIGLGEDGPTHQPIEHIAMLRMTPGMTVWRPADLMETAVAWQQSLEHHNGPSALLLSRQNLPALAHGTDAADLIKKGGYIIADCEGKPDAILIATGSEVQLAITAAEKAKARGLQVRVVSMPCAERFLAQSDAYKNQVLPGQVRTRIAIEAASSAYWHQFVGFDGAVIGLDCFGVSAPATDAFNYLGITVEKIINTLDTLTKQTMV >NZ_CP021286.1|WP_011212788.1|175234_176227_-|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MTIRVAINGYGRIGRCILRSIFEYNRQNEFEVVAINDLSGIDVTAHLTRYDSTHGPFRSDVSIEGNMLIVDGHGIQVIAERDPAKLPWKQLDIDIVFECTGFFTSRDAAMGHINAGAKKVLISAPAKGVDTTVVYGVNHSVIKASDVIVSNASCTTNCLAPVVKVLNDAIGIESGLVNTVHAYTKDQMLLDGSHKDLRRARSATQSIIPTKTGAAAAVGLVLPELAGKLDGFAMRVPVLNVSVVDLTFQAKRATSVEEVNDIMRKAKSRILQINEDPLVSCDFNHNPASAIFDTTETKVIGSLVKVVAWYDNEWGFSNRMIDTAHQMMNC >NZ_CP021286.1|WP_011212787.1|174033_175224_-|phosphoglycerate-kinase MNLIKMSDIDLSGKRVLIREDLNVPIKDGMITSDQRLQAALPTIKSALDNGAAVIVLSHLGRPEEGKYEKKFSLEPVADYLRKNLEYPVRFVKDYLSGVDVKPGELVVCENVRFNPGEKANDEALAKKLANLCDVFVMDAFGTAHRAQASTYGVAQYAPVAVAGPLLIRELEALNQVLKAPKKPIVAIVGGAKVSSKLSLLKQLVGMVDVLIPGGGIANTFLKAQGFEIGISLYEPDLLDEARHILILAKEKGCQIPLPTDVVVGKTFSETCPAFNKSLSNVAEDDMILDIGPETIRDYVDLIHEANTIIWNGPVGVFEFPQFAYGTRAIAIAIAESDAFSIAGGGDTLAAVDLYDLNQQISYISTGGGAFLECLEGKTLPAVAILQERAKHVKTN >NZ_CP021286.1|WP_021437110.1|193295_193733_+|DUF45-domain-containing-protein MIDDSKAKPQVKLVRGQLQIIASRNIEHRRQLLSDWYKQKAFEVFSKRLDQLLSTAPWIKECPSINLRAMRSRWGSCAVNGKITLNTHLIKAPIACIDYVILHELCHHFEHNHSDKFYRLLNQVSPNWKQVKQYLDKAANLYLMT >NZ_CP021286.1|WP_025519205.1|193722_194397_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MNIKKEIGKRILEARKAKGLTLKALGELAGGLKQTRLTNWEQGVRTPGPEEIKSLARALDVSPAYLMCLSDELQFKEAKNPSQLIPLLDYRQACEASLHTGAESSGDKVFISVSTSLQPELSTDAFALKITDDSMMPEIRINDVLVIEPSVLPEPGDFVAVKINGKPETIICQYKKLSYTSSEFELLTLNDNWPNIKVSDDINVKIIGVLVQNLRCYKSPKVKS >NZ_CP021286.1|WP_011212797.1|194558_195428_+|hypothetical-protein MMDFVINGDELEAMSGLPHFQQLTYLRGIRPYMDVKTGIVGIKRRISHQSISEQLYVEPHQGIKSQNFSRDQVRRSVSGLVRAGLIEVQSEGMHLILKCLLASSHYSAQNKAAINPPQKATIKPRGESLENTGLTEFEALKADTVESQKAAIPHKDNYYIYLLSQFEKFWSLYPEKKSKNNAQAVFEELKPNAELCHTIINALTAQINYRDTMKLQGTWVPPWKYPANWLAQRCWEDELPTDALQEKNHAEHTKNTRKRHATEDLFCPPCDVKDREHNNVIQLQRYLQS >NZ_CP021286.1|WP_021437111.1|195393_195756_+|hypothetical-protein MSSSSKDTFKAERRIDLLFSKFAAFYGHVWRSQFKDEVFLKFAKKEWQEALADFTDMVLTRAILNCREFYELPPTLPQLLYCCRQIRKQESFYVVKDVYQPANKAVVSSCLQKCKELLAK >NZ_CP021286.1|WP_011212799.1|195768_195972_+|carbon-storage-regulator MLVLTRKAGQQILIGKGLIQMKVLKVENDIISIGIKAPSHIDIDREEIYFRKLRQEQEAANDAEMAI >NZ_CP021286.1|WP_104411317.1|195986_196271_+|TrbC/VirB2-family-protein MSKRAFQKIRTLYWGTVCLCAPSVSSAQNIESIINRTINYLQGGLARTVGVFCIIIAGYLCLARQKFPKEYFVMILVGMGIIFGGSSLYSTLIG >NZ_CP021286.1|WP_011212801.1|196280_196562_+|VirB3-family-type-IV-secretion-system-protein MSDLEISPIFNALTRPAMTAGVTFEYHMLNLIVSMCAFIGFSPLYGIIFIPLHVFGWLVCRYDTHFFTICAKRFLLPQAPNTSLWRVRAYEPF >NZ_CP021286.1|WP_011212803.1|199024_199735_+|hypothetical-protein MKRTACFLIAVLGISGASHADILGVEDAQLIVLAMKQLGELQEQYRVLTDTYQTTRSQLDNLNQLKSMNSGHYGFGDFNNGLDTLQSWQSPVSTWQDALENLSGGNQQRYQALMDAYEKNHPSLDESSYARFTTPANVARFKEDKAVNRAVLVQTTESYNEINKHMEALHKLSQQIEKTPNTKGAIDLNSRLITEIGFIQLMSLRLQALISQQAAQENLSALQDRAEMAKFNRLPK >NZ_CP021286.1|WP_011212804.1|199749_199896_+|hypothetical-protein MKWLLSVLMIALLSGCSKPPDLDSPCHHFGQYCPQYPINDEPIMELTK >NZ_CP021286.1|WP_011212805.1|199892_200288_+|hypothetical-protein MNTLIKGLMVILIAATISACHHENPLKTQPAKASVRFLINASANAEKQLHFAIHKDAYGFAYLECMEGKQSPDIQCNALYQGMIAFAKEGHYAGFQMITQADLTDKKVFESLADEYAETAATSFPHFVSGS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP021286_2 | 2334334-2334462 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP021286_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP021286_2
>2.1|2334370|57|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder CAAATAGTCCATCTAAAGAGATAAAAAAATTTGATATGTCAGAAGCTCAATTATGGG |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP021286_2
The CRISPR arrays of NZ_CP021286_2 >merge|NZ_CP021286|2|2334334-2334462|CRISPRCasFinder CTATTCTTAATGCTCAACAGAATAAAAAACAACAGACAAATAGTCCATCTAAAGAGATAAAAAAATTTGATATGTCAGAAGCTCAATTATGGGCTATTCTTAATGCTCAACAGAATAAAAAACAACAGA >NZ_CP021286|2|2|2334334-2334462|CRISPRCasFinder CTATTCTTAATGCTCAACAGAATAAAAAACAACAGA CAAATAGTCCATCTAAAGAGATAAAAAAATTTGATATGTCAGAAGCTCAATTATGGG CTATTCTTAATGCTCAACAGAATAAAAAACAACAGA
>NZ_CP021286.1|WP_015961268.1|2331826_2333779_-|hypothetical-protein MPHSTNQSNVIENINQYLKWHNLPVRFGTGGVCNGLSTVHAQYVLQGREREFFELLRYVAGDKGILDANDSVKEKVNDFVWKVVASHMTSGHDKELNQLNSFKTLSINNKPLKSVFDLPLVTSDKNWENILESLNLKEDEVMLVRSINHAISITRKGNQYHVYDPNYEEGVKSFSSEQEVIKELHERVFHYNKGNMGLTLSIITTGDKEPRQDLPKPVDIYDQYLNKENVNSLATITVEHPLGGPWDLTKKTIDLASECGDENLINKLIELHQFDFNNMPIEQASQAVQYNNVRAAELLVNDMIRILSKQDPVAQDEFSDIPAEELPAEFLKQFEEIPDAPEGDEIKEAEVQNPKVVMPPSEKKIKDLLYPLILKAASYGRKEVFDTLCEMWNKNAGDFDKEDLKNFILLAAKGGNSVLLQELIDKYYESNMTLYDKDIQGKVDGIIHELISKGSPDSAVCIEVLLNTLSKEGKSIDDRQRADYISRAFEANKPHMIERFIKGISDEKRLEFLIRAIKKDQPHMVELFIKDLPKGLLNTISLSLPAIEKMNGETLKILEKNGMKFTEMEKAIIAKKSHQPVGLLLSIGVALAKFTDFCKEVLFKNESVTYDKNKFQAFKSQLNSIKTQNSLANNEPVEAQQNDQVAVYRP >NZ_CP021286.1|WP_015961266.1|2330335_2331085_-|IS5-family-transposase MHHNISEELWNKIYSYLRGLKGLHVKNEASLRRFIEGVWYVLRTGCQWRLLPYYYGHWRQIHRRYKVWSDRGIWSELMSVVSDVDIQTVMIDATIVRAHACASGYVKDGNETQALGRSKGGFTTKIHALVDGVGNPIKFILTGGHRNDITQAAELLKEQHDTIVLADKGYDSQELIDTLHHQRCSPVIPSRKNSKYPRKIDKQLYKERFLTEAFFSKLKHFRRIFSRFDKTTSAFSGFLHLAGALIWMR >NZ_CP021286.1|WP_015961265.1|2329219_2330302_-|acetamidase/formamidase-family-protein MDKTPVVKVHSGDSVSLETWNSCLHEMVFNKTTPAEIAKFYTKHDIQKRRGMHSLTGPVYVEGAEPGDVLEIRVLDIKLNDFGYNFLSPTQGILSEFTKPRIMYFKYDKEKNTTEFTKGICLHLKPFQGIIAVAPPLDWPDGWPVNLETQMGQPVPGQFNSVPPGPFGGNLDEPSLQVGSILYLPVFQKGALVWTGDSHAMQSNGEIDVTALETSFEGITLQFIVRKDLKAEGVFDKTKRNGNSLFTWPIVENSEEWILIGLHENLFEAMQLASKNAIEFLVRTQGLSSQESYQFLSMVGNFDIPEAVNVIKSLAVHIPKEIFKNTGKMTSLSSEGKFPLTTPRTNENTTCVPQEGKIIE >NZ_CP021286.1|WP_011946955.1|2328802_2329204_-|hypothetical-protein MNKILIYLCLYFMTSITLAGKIVIDNKTNYPVKDNSRKIAVQWVATVEATQKANKIIINGSKLDLSSLKIITQKGKTQLTLPNHSHYFRVVVWSTGKQQPDLLTNWVDIVPNKTYIINQDQLVPAILMSGTGC >NZ_CP021286.1|WP_015961264.1|2327619_2328531_+|cation-diffusion-facilitator-family-transporter MTIQKGLHERRALKISIAVTFLLAVVGILFGLLSGSLAIVFDGMFNMVDTVISILAFFVARLLTSKGNRRFQYGYWHIEPMVLVLNGSILILLCTYALVNAIGSLMSGGHELNFDWAFVFALLVFFLSTGMYFYLVKTNRKIKSEFLRLDIQSWLMSALISTSLLLAFGIAALLHGGAYGYFTPYIDPLILAILTAFLIFVPMAAVRDAMRDIFRMAPVDLDERIREFLDELIKQHDFKTYTSYVAKIGRAQFIEIHIVVPMDYPISSIETLDKIRNEIALAIGENTPQRWLTIAFTANENWI >NZ_CP021286.1|WP_015961263.1|2326056_2327463_+|ATP-dependent-RNA-helicase-DbpA MIQSEHNDQHLSFSQFPLRQELIKSLASSNYENMTPIQMQSLPIILRNEDIIAQAKTGSGKTAAFALCLLNNLKISFFAVQALVLCPTRELAEQVSQAIRRLACLMPNVKIINLSGGIPMQPQLDSLRHGAHIIVGTPGRILKHLKNASLDLSQVKALVLDEADRMLDMGFFDDIKNIISVCPKQRQTLLFSATYPEEIKRLSKQFMKDPKEVHVVTPPEEIDIEQHFYEVSRHAQKFPLLKSLLLHYRPVSVLIFCNTKQQTVEVTDQLINEGFSAIALNGDMEQVERDLAVLRFANQSCSILVATDVAARGLDIKELSAVINFDLAFDHDVHIHRIGRTGRAGSKGIALSIVTPADAQRICAIEDNYPHPIHWGNINALENHNTACLVPEMVTLCIASGKKDKIRPGDILGALTKDAGLAGNTIGKINITAMYSYVAIHHSQADKAYQYLQSGKLKGRKVNVRKIN >NZ_CP021286.1|WP_010947832.1|2325607_2325817_+|cold-shock-protein MSKTVNGVVKWFNEIKGFGFIEQEGGPDVFAHFKEISSSGFKTLTEGQRVQFIVTQGAKGLQAQNITAL >NZ_CP021286.1|WP_015961262.1|2324557_2324869_+|hypothetical-protein MKKINVLLYLLTMLTISFATISHGASEDTDTTNPTKYIYRGSSITLEELATVADLSTARDQKGNPVTLEEESYQIGSFTRGTVTIIPKSGQADDVITLDLKPN >NZ_CP021286.1|WP_011213396.1|2321240_2322416_-|ISL3-like-element-ISLpn11-family-transposase MPKKDCILNLPGYSIKKVSGENPVYIEVSYRRVVRCIHCGNKKLRKKDSFIRRIRHESIGLRRSYLCIKAHKYYCPACGRYFNQRFPGIGKYQRASESLRKQVFHYHSKGVSQKDLARDLKLGKSTVERWYHYGYELRYKKIATRSCPRVLGLDEHSFNRKVGYATTFCDLAKHKIFDVVEGRSEKDLEGYLNTLEGKDKVQVVCIDLSSSYRKLIRRYFPNAMIVADRFHVIRLLNQFCLQTYQQIDPEMKYQRGLLAALRTNPNNLTVKRLNRRERYLQQQPVIAAIYYFKQRLHRLLMRKHRTAKQCTRLIPLFLKLVASLKESPFDSLKTLGKTLYQWREEVVRMWRFTKNNGITEGFHRKMKLIQRRAYGFRNFENYRLRVKVLCS >NZ_CP021286.1|WP_010947828.1|2319732_2320686_-|Abi-family-protein MMRTTTGYFFMAEKSYTKPALTVSQQLEFLFSQGLQIEDQKLAIRALETVSYYRLSSYLLPFKQSHNAKNPRQFKENATFEQVWQLYQFDRELRLLVADAIEKIEVAFRAALTNVTSIRFNPFWYVERNYFKAKAGANRERDFFDDYLKTIKTISTNKQELFIQHYHKNYDKPYFPPIWMMVEALSFGVCSKMFNNIQSKDVRNEIASFLGQHTTVIESWIKSLTYTRNLCAHHSRLWNRWLVIPPLIPKNAPIKTHIDGNYRFQLIAFIIDQLLETIAPESNWKIKLFELFERNEQFSGIEMGFINNWRDDPIWHC >NZ_CP021286.1|WP_021437119.1|2335979_2336243_-|transposase MMMSFAGEGWGEGMSRMVIDDEMWSRLEELLPKPKGRHDKNERLSMEAICTMLCAGATWCDLPPYHGNWKSVYNRYNNWSKKGYITT >NZ_CP021286.1|WP_010946556.1|2336414_2336708_-|GIY-YIG-nuclease-family-protein MQVKQPAIYIMANKRNGTIYTGVTSDLIKRVYEHKYGDVPGFTQEHGCKFLVYYELIEDMISAIAREKQLKGGSRKKKLALIEKLNPYWEDLYEKLL >NZ_CP021286.1|WP_015961270.1|2336733_2337519_-|transposase MSITELADILNGYFSWNKSRIECFATILISLIKVRTVNLTEIACGFSSPAKQDSRYTRIKRFFREFKIDFSSVSAWVILRIKNNVITTNSRGLEVSIDALFYDLKSGEQRILQGLRKLWRQKIYLSALRLADGELLIVATDHLMDEPIEHYALRWEIETLFSCLKGRGFNFEDTHMTQPDRIEKLLVLLTIAFCWAHKTEEWRHVQKAIKIKKHGRKGVSFFRYGLDLLRDAALNGCQFIHHSFSDILGFLCISRVICAAE >NZ_CP021286.1|WP_015961271.1|2337700_2338453_-|hypothetical-protein MFSKILKSRPNFFKAISEICNPGIGDKILKLQKPSLLIRIDGRSPDSLHIQDGFQPRVSGERLKSVTASDVEDYQKFNVNPFGWGACQSLKEIMTFMQKNKSQTDKGWLYKFFGKATPLLILKQEVGADSHGHDDEKEVIITEHIPLKNFIASIAPEDREMFMDGREIPNAMYSYNSSLPKSLSKQDLLTEQDILAWLLRHDAEEPFTDLCQTVFTDMPQDILEYLFQENTGIVSAITSAIEKNMVLNLL >NZ_CP021286.1|WP_011946965.1|2338891_2340712_+|NADAR-family-protein MIVIPHEVFVSKPNTALISMRYIVTTGNDYTLESEIMNVKPNIQTTLQNGKPLPYQKIGNQKVASFKDPNKPPYGPFANTTNAGEFPLKQTVLIHGIEYSFTWPSSEHAFHAQKLIHLMNKLGINDPNQIHILNTLRKIEKTQNQAGKQFDPRENWDPIARELATNMGITGTDQDKKDKIDELCDSNYYSKALVKKGIVPGTKEPYTRRFMATVLRLKCDQNPELKELAMRCASEGILPIEASTKDVNWASGIDGSGRNMLGIEILKLGNQYLMEAGRGNEIKIADPDKAYEDLQRSHQKDLGHDAIIGKPWSNPLNNSLNIWYDSTRKQTVVESHRGSNLQLIYKDGEPPKAIWRKDENSPWQDGDFKRPAVQSLLQAYQDAGSPVPTVAKQQPHPAQLNDRWAKVHKQHHDNPVINLPLFKQELREGVKLELNKIEAELKKGINPLFSRNESHLERIVREYVNPAVLEASKILAAYSVKNAMHDLNTSVTVSMVDNNRAHDDKHPLHAMKIQFKDNAEAKQFAEKLLNEYGIHSHTFGKGIMKTPQNGAIYLTPKDLQMLSQLSGLAKDPLAGLQAFANMAKNYDKAKEVSIKEDLESHAGLSP >NZ_CP021286.1|WP_013101666.1|2340955_2341246_-|GIY-YIG-nuclease-family-protein MHPSYVYILASQRNGTLYIGSTSDIINRVWEHKNKVIPGFTAKYNVHMLVYYEMYDLYIDAARREKRFKNWPRQWKINLIEKFNPEWRDLYEEICQ >NZ_CP021286.1|WP_015961274.1|2342584_2344327_+|ankyrin-repeat-domain-containing-protein MSFSKISKTLENSATLIDEKAEQDASDLSHTLGSDSQLLISEESSDVLLENTGENLVQQACIDGNLEKLKELLRGDMWGMDEVSLNQVNNRGETLLMLAIKYGHKQMALFLARSLFHLHKIDNSGKSALSLAHEKGWEDIVQLILESINNREARIRELHYAAIHGYVESVSQLLGIIDKYGFKPHGFILVGDETPRFENIFHAACCGGSLEIVKLLIEHGADINSKSQFSENNYSHYPATPILVACRYGHANIVEYLLAQDGIEYDINELLHTAVGFGHFAVLDLLLRHSKENSTRNLNIVGEYPLTHFSATLLTRACYSGQVDIVDRLIAEDIDMSNADNRQAFWTAIFCAKTQGSPAIDIIDRLLAENDRQNIDIPLDGFKDLVLWAYRQPFVGILDRLIIRGVDFYRERDPGDYPLIEAAKNGYKDIVHRLIDLSVDINLRDRKGRTALFCAVMQGEKEIVELLINNGADPNIQDNEGVTPLMKVVPTDNSEMVEFLLNAGADTSIKDKRNRLAIDLAKHFPYHMKLLKDATEIQNANKSSSSSNQSANALYTLWYSNRGDLREEAQFKEKNTPHPF >NZ_CP021286.1|WP_015961275.1|2344824_2345904_+|hypothetical-protein MNALSLIRQMAEKPELNEFIQGIKEGNLTAEHVKLFCQATAQVGVEATRGLWDTNVEQNDFSNDKNREAIYSASLLHGAHNIGHVNNLLHNKNIGISDRSKEAIIGQMEDHSPIGSRRDLAWEKEIATGFLHDAINKFQEGRAKNAAKKGSGDKDFHDGVVDMVGFVMHSLFGVGKAMGRGFLDSQERFSNSAQSNEPTINEHGQLINERLASTPQEPYVQNIGSSKSSIGVSPQLNSTTQNSTIPNEIRKFVTGGLQFKNDDQQVVDNTIEDLKTEVISAFELHNMVQDLPTSKSVQGIEAFKVEQEPSRSNDVTHYFKSILQQLKTTDPQPHKGEIAAHNPGEDNESDISKSIRFRS >NZ_CP021286.1|WP_015961276.1|2346202_2347108_+|LysR-family-transcriptional-regulator MHMSDIKSFLAVVEFHSISLASKRMHISQPTMTRRIQKIEQELGTPLFFSSGIRTELTAKGKELLPYFRQMLDIYQQMYINVGNKTKNPLKLINVGTSVYVANSIIQDFMHSAEISSSNYFFNIKLLAEPHIIDSLNSGEYDLIIAPPVYDCSSSVVSIPLWKEKILAVVGASHPLARNKKAISITELMSHDVALMEKGFTLRKKLDSLSEGLHTPLKAIFESNSIYNNIALIEKGVGWCLIHERLLNPNLIPVELSDCNMEIEFHCSFLKRREDERLIWQFLEQIRKWILADYLKQYACP >NZ_CP021286.1|WP_015961277.1|2347322_2349077_-|ankyrin-repeat-domain-containing-protein MSFSKVNKILDSNSILKEEIDKPEVLGLAQSSGGEEPPMIPDEMLFALQDRVGVNRVQQACIDGNLHVLERMNCDEFDYVDSYGTTPLMLAIEHDHKAIAYYLLRSRMINLNLHKKDNAGRSALSMAKEKGWDDIVDLIRNTMENPVYNNMELYYATINGYLDSVTELLPKIDEPGFATKETWINTYPLFGNIFHAACCGGNLEIVKLLMEYGAEINSRSYNRERHNFYYATTPILVACRYGHAHLVEYLLTQDGVQYDIIELFHIAVEYGHYAVMDLLLRKIRAENIALDLNRGLEFHASWYGTPLDKACRSGQVDIVDRLIAEGIDMKEEDNISAITTAIWNADNPEYPAIDILDRLLAECDRQGISIPLTAPEIAIIACNRNRADILDRLIIRGFDFNLGNRHGEYPLITAAIKGHEAIVDRLLSLSVDVNQRDSEGKTALFQAARHNNLEIVKLLVNNGADINIPDNKGVTPLMRVAETCFTEVVKYLLNSGADTSLKDKGGRSALDYASSSSLYFMQENLALIRDADIQKNLYKSPSSSSQSVNNPYMLWSSNRANLPEEESVKSEIISEEKAFTFQSK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP021286_3 | 3083083-3083577 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP021286_3
|
10 spacers
spacers of NZ_CP021286_3
>3.1|3083110|18|NZ_CP021286|CRT CGAGGAGAGGCAGGGCCT >3.2|3083155|18|NZ_CP021286|CRT CAAGGGGAAGCAGGACCT >3.3|3083200|18|NZ_CP021286|CRT CAAGGGGAGGCAGGGCCG >3.4|3083245|18|NZ_CP021286|CRT CGAGGAGAGGCAGGACCT >3.5|3083290|18|NZ_CP021286|CRT CAAGGGGAGGCAGGGCCG >3.6|3083335|18|NZ_CP021286|CRT CGAGGGGAAGCAGGACCG >3.7|3083380|18|NZ_CP021286|CRT CGAGGGGAAGCAGGACCT >3.8|3083425|27|NZ_CP021286|CRT AAAGGAGAAACGGGAGCAGTAGGTCCA >3.9|3083479|18|NZ_CP021286|CRT CAAGGGGAAGCAGGACCT >3.10|3083524|27|NZ_CP021286|CRT AAAGGAGAAACGGGAGCAGTAGGTCCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP021286_3
The CRISPR arrays of NZ_CP021286_3 >merge|NZ_CP021286|3|3083083-3083577|CRT CAGGGATTACCAGGCCCTAAAGGAGACCGAGGAGAGGCAGGGCCTCAGGGATTACCCGGACCGAAAGGAGACCAAGGGGAAGCAGGACCTCAGGGATTACCAGGCCCGAAAGGAGACCAAGGGGAGGCAGGGCCGCAGGGATTACCAGGCCCTAAAGGAGACCGAGGAGAGGCAGGACCTCAGGGATTACCAGGCCCGAAAGGAGACCAAGGGGAGGCAGGGCCGCAGGGATTACCCGGCCCTAAAGGAGACCGAGGGGAAGCAGGACCGCAGGGATTACCAGGCCCTAAAGGAGACCGAGGGGAAGCAGGACCTCAGGGATTACCAGGCCCTAAAGGAGACAAAGGAGAAACGGGAGCAGTAGGTCCACAAGGTATGCCAGGCCCTAAAGGAGACCAAGGGGAAGCAGGACCTCAGGGATTACCAGGCCCTAAAGGAGACAAAGGAGAAACGGGAGCAGTAGGTCCACAAGGTATGCCAGGACCTAAAGGCGAA >NZ_CP021286|3|2|3083083-3083577|CRT CAGGGATTACCAGGCCCTAAAGGAGAC CGAGGAGAGGCAGGGCCT CAGGGATTACCCGGACCGAAAGGAGAC CAAGGGGAAGCAGGACCT CAGGGATTACCAGGCCCGAAAGGAGAC CAAGGGGAGGCAGGGCCG CAGGGATTACCAGGCCCTAAAGGAGAC CGAGGAGAGGCAGGACCT CAGGGATTACCAGGCCCGAAAGGAGAC CAAGGGGAGGCAGGGCCG CAGGGATTACCCGGCCCTAAAGGAGAC CGAGGGGAAGCAGGACCG CAGGGATTACCAGGCCCTAAAGGAGAC CGAGGGGAAGCAGGACCT CAGGGATTACCAGGCCCTAAAGGAGAC AAAGGAGAAACGGGAGCAGTAGGTCCA CAAGGTATGCCAGGCCCTAAAGGAGAC CAAGGGGAAGCAGGACCT CAGGGATTACCAGGCCCTAAAGGAGAC AAAGGAGAAACGGGAGCAGTAGGTCCA CAAGGTATGCCAGGACCTAAAGGCGAA
>NZ_CP021286.1|WP_015961724.1|3082090_3082750_+|hypothetical-protein MPFCFSNQPNILNNKLILKILVLILFFSNSSLAKTINYPWTVSASLGYVNYQYVHEGDHITATGRFAIGRDLLMKGPFLFGLELGLQSGNQMRLQMTEEEVDALGGLLVQTTLKPMVDALATIRITSEFTAPLFLQLKAGTAYRQWQMDRDTINDISQLAGEIMAGCGYTITPNASITLSYQGLFGDKPNFTIDLESGIGHVQKIPVQHAILLGIVLMI >NZ_CP021286.1|WP_015961723.1|3079314_3081822_+|EAL-domain-containing-protein MSPLKSKIKTKSFNKLTKTQDITNTIERLFANSQDSIIVFNQQGKIIAINEKAAALFKKSPDKLIDKPIWKLFKLNSFAIKRQFIQAKRCFLLANEGIAQQFTWLESKAQKPVLAYHILFNKTEIEDTSIIFTKLTDILKSKTIEWILWSLTKISNHQEINEIIDQILQLTSDVFAADYTSVSFINNQQIARTISYYKFGKKEENISFSLINTPCAKVIQKKAICYFNDVQKQFPNDKLLKKMKINTYLAGPITNPQDEVIGIMTILCKREVEFDTLNKTWFGLFLSRINSEIERLINLRKLEFLASIPQQNPNPIIRILLNGDVVFTNDEGKIILNYWIKLFKGLPVELLKEAQRIQKSNQNTRIEMEIEDKIYLFTLVWIDEFKQINIYGTDITQLKNTQNAMLNLTRRDTLTQIANRQYFEEKLIEKIYEHHLKEKSLALLLIDLDNFKIVNDTLGHPTGDKLLMAVTNRMTRCLRANDFIARLGGDEFIVLLDQCNTDTAVKVAEKIINVLDKPFQFDDYHMTITASIGIAIYPETSEIARDLLKYADIAMYQSKKTGKNKCTVFSKNLHYKENQRNEILKKDIELAALKRELYIDYQPQIDLSDNTIVGIEALLRWSHPTLGLILPTEFIPIAEQTGCIHIISQWFIEQTLLDYSQFQQLNSNIKLSINVSLSQLNDMRFTKILCDSLLQNNLSKSKIILDISERMIAPHFIQISKKLKQIHHIGINISLDNFCCPQISLPELLSLPLDYLKVDQRLLIGIEGKIKLRKLLSGIINLTKDLNIKIIQKGIETAEQHEVIKSLGCQYAQGYFYCKPVALNDLLPLIKKTIH >NZ_CP021286.1|WP_015961722.1|3078419_3079142_-|L,D-transpeptidase MKKILLTTFMMSMVTVLNAGHFYGTALCAYPQYECIKVTGGQSWEKLFPDPVQRDIVQRVNRTYNYLWSGREIAVPKNLANINIFDVSPFPLKIQSENEKQIIVDQEKLAWGAYDAQGNLVWWGPISSGSDKCSDSNKVCRTLTGIFRVFSKENVRCTSDVFPIGRGGAKMPYCMYFHKGFALHGSDDIPGVRASHGCVRMFIQDAKWLNENFVELSSERNNFMGTKVIVRPLNDSENKK >NZ_CP021286.1|WP_015961721.1|3077856_3078423_-|hypothetical-protein MNLKSRSSITAIVVILLTSALNISVFAAKSNKAATAEDKAEKKDNGKFPLGCTAVGYQQNLKVLTLLPGKEGALQSMYFIYNTLPETVSLYQMHDKESLYSYWLNHSIRGNSWAVLATGEKEVKFICTLGDGKKSYGKILDCADVIKVCEYVNVKFGLNNKGNFWIVDSNTRNGAVSQVVHYGIIPGV >NZ_CP021286.1|WP_015961720.1|3074227_3077830_-|SEL1-like-repeat-protein MKSLVPWVCVLVASAGQQAFANDAFNAYRLGNYNEAAEPLIIKSGQDAVAEYYLGRLYLYGYGQLKNNRVAMRYFTKSAEKGYLPAVLLMAKYSLLHEKNPEEAARWFKQAAAVGDVSAQMFMAAAYLYGVGVKKNTDIARRYYIDAAKNGNPIAQYTLAEYFLESKHAGNKKLGIIWLNKAAENGDPKALTELGRFYVAGQMVAKDTSKGVELLNKAASEQYAPAMLELGKLALMQNQYDEAIQWLNKAAKQSTEATLELAHIYLQDKSPVYDPKTGFLLVLKAAQNGSVQAQKELANLYQKGIGVAADEELSKQWTLKAAENEKKNAEPPVLAQAALWLSNDRTDKLEETAYQMNGIFSPWNNPSALRNNSYNQAPKLETISRQDIFKPQFELTQPNNIPISNYYDALISKQVEFQSNQWAYPTYRLNPFVEALERANSPVVQKLNLPVPYADANYDDSEVGSFDLMDIWTGDWKRTVNYMSVVNYLYFRAILGNAQTQFEIGQLFQYGIGLMQDDASAIIFYENAAEQKHLGAEYNLGILYLKRGKDENDYQQALNWLTDSAFKGNKRAQYVLARILRQGIVGPDGKEYIKANDEQAMAMLYLSAANDYGPAEYELAEYLARDYNNGLSVDVRKQKIALIRKLYQGAVKNKVAEALLPLAFYNAMDDNRQKQEQAFKVAEEQAETGNENAALLLGMLYDRGIGITADPAKAMYWYQQAGQNPVSQFILGTYITEGKGVAQDKEKGLDLLKQSADSQFSYADFNLAVLKQQSGEDFLPNLIESYKLGNSHAGIVLADYYLSQSSVPEQMNQAKEIYQGLADKGDQYAQLKLAYMLQKGLGAAPDLAGAQHWYTASAEQGNPEAQYLLGQFYQLGETGEPDYNLAKHWYQKAAKHLSKADVALGFIYETVDDNYAQALKAYENAAAKGDMLGAYNLALMYEYGKGVPVNYSKALSLFKEASEKGAPEAMSQLAGMYFYGLGQPRNEQQALVWYKKAASLGNGNALYALGLLSETGVGVKLDFPDALRYYQDASDKGNEKAMLALARMYHYGLGVEKDHKRSASIYQKLAQKQNAYAQYQLGTYYIEGTAGERLPEKGRELLQQASENGSLQARRVLQRLDAQTQGKVSYVEPVLFNNVPKFDGQSADMIYFDALNEWNHGEEVLSRMILQRLVTQYPNFIPAKRAYEQLNQAKLMNNLG >NZ_CP021286.1|WP_015961719.1|3072438_3073821_-|Dot/Icm-T4SS-effector-MavV MKYAVTFCTTDQEVGSNPLWHSCLLLSKMDETSKLLEVVDNWGFYGLPTTNRNNSWLDQLKIKMGLDVDLIGNHGMLRHEELRFLDQGCGLRGVTFELTKDDFELLQKKCLQMATDQETAINEFVETQGIKGKPPEKTRIYPHEQFSRLIYATENIKAEQQGREARLKPFELRLSWGLFGPSLALSQNCKTQALSLLSYVLSKEQIERLTEYGEHPTVPRRSGPMESIFLHSTGPLREHRKSSGDVVHYRDLKDPGVKLYWTVPPQELEALSEETIKLLQIDGEYCEEVKAIVRKLQRLEWLLINSNLPEKYRPYKDELINKVVGCYKAFSFIEPKQEEPKLGGWYGWALSLFSAPRSAEERTLQGKIKKAKSLFNSIYMAIVDNYQIDDNAPMENENILPYEETGENRFENMVEAVASYLSRKDKINLCKIIGRTYCEDHVELEDNEGKIALSPQPLAT >NZ_CP021286.1|WP_013101905.1|3070875_3072087_-|lpg2637-family-Dot/Icm-T4SS-effector MFLTINDLQSQIQLAKKRLYVLAKNWLDTQKEAINSKDKANWLNAFQASTKEAMQEQLKATGFPLIRNAILVNQSEGELPQHSLEQSSSLIHSENFPEQFNSRTVPRVIYVCHSGENNQVIKRLGQLTTLMEQLHTLEELTFEVQTNVHFRGLNLAYRMARSINKEWRDVEKGRETVEYYAERLQIAEKQYKLASDFCHECLGIYKEQLDARIMYFNESLNFFVECLAAAFSSVKDDRYWLTKFLLPSLPWHSMLNEVATWLFTTNGFTNPTIDSIEVNRSHLKAITEQFAKLMMAPFCSLEKELQGKIEKVENEQKIARENVYAMSSELDIVIHMQSQRKLAALLFPAQPLSMLGFFQGVAAAMGRDYFYSTFIKGNQSQEPRITDDEKPLIEASNYSNGLH >NZ_CP021286.1|WP_010948336.1|3070548_3070815_+|30S-ribosomal-protein-S20 MANIKSAIKRARQNVKLRQHNASARSMYRTYIKNVLKAVESGDQEAARAAYTKAQPVIDKAANKGLIHKNKAARIKGRLVARLKAMAA >NZ_CP021286.1|WP_015961718.1|3068619_3070191_-|murein-biosynthesis-integral-membrane-protein-MurJ MLTTDIMVPKKQSLIRSTSLVSLMTFISRIVGFARDMVLANFFGAQAGMDAFFVAFRIPNFMRRLFAEGAFSQAFVPVLAEYQKTRSAEDVRTFIARISGYLSSILTLVTVVGIVASPVIIFLFAPGFHHDSVRAELATQMLRITFPYLMLISLTAMAGAILNTYGYFGVPAFTPVLLNISMILAAVYLCPNLPQPVVGLAWGVLIAGIVQLLFQLPFLYQRHLLIRPRVVRDDPGVNKVLKLMIPALFGVSIAQLNLMIDSIFASFLKVGSVSWLYYTDRLTDFPLGVFGVAIATVILPHLSRKHTEQNINQYSRALDWGLRSILLIGIPAGLGLSFFALPLIASCFAYGKFTAYDLLQTQKSLITLAMGVPAFMVVKVLASGFYARQDISTPVKVGAIAMVVNTLLCFVFVWHLAHAGLTLASALAGYVNCVILLFLLIKRRLFKPSPGWLKYSMQLLIANFTIGVYLYFMSGTATYWLGFSPLMRLSLLLAHVFVTVVIYLLVLGIIGLRPSHFRGQIKD >NZ_CP021286.1|WP_015961717.1|3067250_3068615_-|leucyl-aminopeptidase-family-protein MQAEVFYKSCGDRIVPVHLISQSQWDEGIENLTPMERNCFSVRQFKGKLGDYCFILNADGVIEKAFIGSGTGNQESALANAALLLPPGNYQFQDKLSRESGVVWGLAQYRFDEYKKYELQPRVLIVEANDMDYILSLANSLFLVRDLINTPTCDMGPESLAHVVEELAKTHKAYFKQWIGEELIKDNFPAIHAVGRASALAPRLLSLHWGNEKHPRVTLIGKGVCFDSGGLDIKPSSGMRLMKKDMGGAAHVIGLAQWIMVQRLPIRLQVLIPAVENAIGPNAFRPGDVLTMRNGLTVEIENTDAEGRLILADALVKACEEKPDLIIDFATLTGAARVAVGTEIAAMFSNHDELAQDIVSASNKVSDPVWRLPLFSPYEELLNSNIADMSNSSSSSYAGAITAGLFLQRFVAKSIPWVHFDIMAWNTVSKPGKPEGGEAMGLRAVAEYLLQTYG >NZ_CP021286.1|WP_015961726.1|3084089_3085946_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrC MNDLQLSAELALFLTKLPSEPGIYRMLDEEGTVLYVGKAANLKKRVNSYFSKQNTGVKTRALVSQIKSIEISVTRSETEALLLESNLIKALRPKYNVLLRDDKSYPYIHLSNHPDFPRIELYRSKKKPPSGNFFGPYPGVAAVRETIVTIQKIFKIRNCRDSYFKARSRPCLQYQIKRCTAPCVHYISPENYKLSVEDAIRFLQGKCQIILDALAERMKQAVNQLNFEEAAVLRDQIKNLRLIQEQQGVVQLRGDADVIAIEVRPGFACIQCVTIREGQVLNSQSFFPTVPYAVLDEELDANSLWQQTFEAFIGFYYLDTTERIPDLIITNQSITESRSLEYILSQRRGKSCKIQVNPRGVKSRWMDFAVNNLRISVAEYVSKHSTIRSRYQALKQLLALDKNIERMECFDISHTQGEATVASCVVFDTEGPRPSEYRRFNIEGITPGDDYAAMEQAVTRRFKRLIDAQLLPDVLIIDGGKGQVSIVKRVLTSLGVEDITLLGVSKGPSRKAGWEKLILVNENREFVLPEDSKALHLLQHIRDEAHRFAITAHRKKRQKTRVESTLESIEGVGAKRRQALLQRFGGLRELAKAPLEEICKVQGISEQLAKRIHEHFHP >NZ_CP021286.1|WP_015961727.1|3086742_3087561_-|phenylalanine-4-monooxygenase MEFSSRYVAHVPDAQGLVDYSAQENRIWNILFERQLKLLPGRACDEFLSGLQTLGLNSSTIPQLPEVSERLKAKTGWQVAPVAALISAREFFELLAEKYFPAATFIRSEEELDYVQEPDIFHELFGHCPMLTDRVYAEFVHDYACKVLTFPEQDWPLLQRMFWFTVEFGLIKTPKGLRAYGGGILSSISETVYCVESDIPVRILFDPVVAFRMPYRIDQLQPVYFVIDSYQNLYDFVLSDMGKFMDRARELGEFPPYFDVDPENPNIHIRAC >NZ_CP021286.1|WP_015961728.1|3088000_3089098_+|competence/damage-inducible-protein-A MTIAILSTGDEIIHGDTLNTNAHYIAHALCSEGLPLGLQVACSDKENEIIDSLNFLTEHHDILILIGGLGPTKDDITRFALAKFTKEPLIQHADALAHIEKKANIAKISLNQGNLQQCLFPANARLFPNPYGTAMGCSYSWKGKVFILLPGPPRECLPMFNQDVLPLLLQTSRHSNKQILRWRVFGLAESEIAQILEEALEGLDCQTGYRLETPYLEFKVRCKRELIEKITSIIDPILAPHIISSLETKASDQLRSLILKNNEPITIIDEITGGLLQSLLVRPENYHLLNFHNLNRTKLYFHCSGLEDYWSQQAPQGTTKLIINYSNQMQEGRETHQIPYRSAMVVHYAAEWLSFRLFHLINQLH >NZ_CP021286.1|WP_015961729.1|3089056_3090082_-|GTPase-ObgE MKFVDEALIKVEAGKGGNGCLSFRREKFIPRGGPDGGDGGDGGSIYFEASSDLNTLIDFRYTRQYKAENGQSGMGGNCTGKKGEDLTIKVPVGTMVYDADTGELLADISQPGVPVLIAQGGFHGLGNTRYKSSVNRSPRQTTPGSPGESRNLRLELRVLADVGLLGLPNAGKSTLIRAVSSSKAKVADYPFTTLHPGLGVVRVSPYKSFVMADIPGLIEGAAQGAGLGHRFLKHLSRTCVLLHVIDIAPLDGSDPVADAKAILNELTQYNPDLLNKPRWLVLNKIDMLPDEKEREEKIQSIIKGLKWKDKVFSISAIESKGTQELCYALMQLIDEMKESEA >NZ_CP021286.1|WP_010948350.1|3090295_3090574_-|50S-ribosomal-protein-L27 MAHKKAGGSTRNGRDSNPKYLGVKRFGGQFVNAGEIIVRQRGTRFHPGPGVGCGRDHTLYALVEGLVQFTTKGEKNRKYVTILPEQREEAAS >NZ_CP021286.1|WP_010948351.1|3090586_3090898_-|50S-ribosomal-protein-L21 MYAVIKTGGKQYTVKEGDVLKIEMLPENVGNEIKFSEVLMLVDGDKVTCGTPFVAKATVKAEVLDHGRHKKVKIIKFRRRKHHMKQMGHRQYYSQVKITAIGK >NZ_CP021286.1|WP_010948352.1|3091140_3091800_+|50S-ribosomal-protein-L25/general-stress-protein-Ctc MSTIQLEAQSRTDMGKGASRRLRRLENKVPAVIYGGSKKPMAIHFSHNKVIKALETESIYSSVFDITVDGKVEHVILKALQRHPYKPIVLHMDLQRVSSKDILVKLVPVHFINEEQSPGIKAGGIVQHTMTQVEIRCQAKDLPEFIEVDMSKVGMDDVVHLSDLKLPKGVQLTVDVADGSHDAPVVSIHAAKVSSTELEETPEVPASAVPTTDQGESAE >NZ_CP021286.1|WP_015961730.1|3091916_3092486_+|aminoacyl-tRNA-hydrolase MAIKLIVGLRNPGSAYEQTRHNAGAWLVTALAQRHNSHFKIDKKMQAELTEIDINNHPCRLALPLTFMNHSGQTTRIISQFYKIEPGEILIVHDELDLPVGRIKLKTGGGHGGHNGLRDITAQLGTGEFHRLRIGIGHPGHKDLVHQYVLSRPSMHDRQQIYDAIDRGIAIIPIVLSGDMARAMNQVNA >NZ_CP021286.1|WP_015961731.1|3092504_3093596_+|redox-regulated-ATPase-YchF MGFKCGIVGLPNVGKSTLFNALTKAGIEAANYPFCTIEPNVGIVTVPDSRLDNLSNIVKPQQVVHATMQFVDIAGLVKGASSGEGLGNQFLANIRETDAIAHVVRCFDNSDVVHVEGRVDPLSDIEVINTELALADMETLEKSLLKVGKNSKSGNKEAIFELKTLEKIKAHLDAGYPVRTLELTPEEEQVSKRLFLLTAKPVLYIANVDDNGYENNPLLDKVQALASQENASIVALCAATEAELVELDEEDRQEFMVDLGLSEPGLNKVIRAGYELLGLQTYFTAGVKEVRAWTIRKGATAPQAAGVIHTDFEKGFIRAEVISYDDFIRFGGEQGAKEAGKLRLEGKEYIVCDGDVMHFRFNV >NZ_CP021286.1|WP_015961732.1|3093957_3095073_+|GGDEF-domain-containing-protein MSLLKKTREQDYSILVTTQDQQRKRHLLNVISIELLILGLLLIITNLCLLRAWLIISMLIVGIFILLGNLILIKKNFNLALSGHILNILVLSIIIGGNLIVGKTTMSYLGWFYVSPIVAFATLGLAGLVIYGLLAIGAMFLFVFEFYIPIYSISQEYVFFLDNTNHLFIFALIFTVLYHFLVQNSQYELLLKEQNYLLIADKEKFHYLSHHDSLTNLPNRSYFHAHLQTLLENTDTTKEAITLYFMDLDKFKPINDEYGHEFGDQLLLLTSKRLQSCFRKNDFIARLGGDEFTAIIVHKPHDQIAEALTLRIEQEFEQPFVINGQTIHCTISVGIANYPRNAKNAEDLLKWADKAMYYNKRKKYQTLKQTS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP021286_1 | 1.17|191003|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 191003-191036 | 34 | NZ_CP021285 | Legionella pneumophila subsp. pneumophila strain Allentown 1 (D-7475) plasmid unnamed2, complete sequence | 33767-33800 | 3 | 0.912 |
NZ_CP021286_1 | 1.17|191003|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 191003-191036 | 34 | NC_006366 | Legionella pneumophila str. Lens plasmid pLPL, complete sequence | 43841-43874 | 3 | 0.912 |
NZ_CP021286_3 | 3.8|3083425|27|NZ_CP021286|CRT | 3083425-3083451 | 27 | NZ_CP053936 | Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_794 plasmid unnamed4, complete sequence | 11652-11678 | 4 | 0.852 |
NZ_CP021286_3 | 3.8|3083425|27|NZ_CP021286|CRT | 3083425-3083451 | 27 | NZ_CP053933 | Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_794 plasmid unnamed2, complete sequence | 41502-41528 | 4 | 0.852 |
NZ_CP021286_3 | 3.8|3083425|27|NZ_CP021286|CRT | 3083425-3083451 | 27 | NZ_CP009718 | Bacillus thuringiensis strain HD682 plasmid pBGN_2, complete sequence | 15494-15520 | 4 | 0.852 |
NZ_CP021286_3 | 3.10|3083524|27|NZ_CP021286|CRT | 3083524-3083550 | 27 | NZ_CP053936 | Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_794 plasmid unnamed4, complete sequence | 11652-11678 | 4 | 0.852 |
NZ_CP021286_3 | 3.10|3083524|27|NZ_CP021286|CRT | 3083524-3083550 | 27 | NZ_CP053933 | Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_794 plasmid unnamed2, complete sequence | 41502-41528 | 4 | 0.852 |
NZ_CP021286_3 | 3.10|3083524|27|NZ_CP021286|CRT | 3083524-3083550 | 27 | NZ_CP009718 | Bacillus thuringiensis strain HD682 plasmid pBGN_2, complete sequence | 15494-15520 | 4 | 0.852 |
NZ_CP021286_1 | 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 189935-189968 | 34 | MN693625 | Marine virus AFVG_250M334, complete genome | 30638-30671 | 7 | 0.794 |
NZ_CP021286_1 | 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 189935-189968 | 34 | NZ_CP020506 | Serratia marcescens strain 95 plasmid unnamed1, complete sequence | 6512-6545 | 7 | 0.794 |
NZ_CP021286_1 | 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 189935-189968 | 34 | NZ_CP022274 | Citrobacter freundii strain 18-1 plasmid pA18-1, complete sequence | 85367-85400 | 7 | 0.794 |
NZ_CP021286_1 | 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 189935-189968 | 34 | NZ_CP026551 | Citrobacter sp. SL156 plasmid unnamed2 | 80071-80104 | 7 | 0.794 |
NZ_CP021286_1 | 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 189935-189968 | 34 | NZ_CP022697 | Citrobacter farmeri strain AUSMDU00008141 plasmid pAUSMDU8141-2, complete sequence | 56497-56530 | 7 | 0.794 |
NZ_CP021286_1 | 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 189935-189968 | 34 | NC_019013 | Escherichia coli strain G3/10 plasmid pSYM1, complete sequence | 9531-9564 | 7 | 0.794 |
NZ_CP021286_1 | 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 189935-189968 | 34 | CP052139 | Klebsiella pneumoniae strain F17KP0040 plasmid pF17KP0040-1, complete sequence | 96043-96076 | 7 | 0.794 |
NZ_CP021286_1 | 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 189935-189968 | 34 | MN699848 | Citrobacter pasteurii strain 175G8 plasmid pCfr-OXA-198, complete sequence | 136300-136333 | 7 | 0.794 |
NZ_CP021286_1 | 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 189935-189968 | 34 | NZ_KY416992 | Escherichia coli strain FAM21805 plasmid unnamed, complete sequence | 46142-46175 | 7 | 0.794 |
NZ_CP021286_1 | 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 189935-189968 | 34 | NZ_CP020508 | Serratia marcescens strain BWH-35 plasmid unnamed, complete sequence | 187130-187163 | 7 | 0.794 |
NZ_CP021286_1 | 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 189935-189968 | 34 | NZ_CP017222 | Escherichia coli strain FAM21845 plasmid pFAM21845_2, complete sequence | 38341-38374 | 7 | 0.794 |
NZ_CP021286_1 | 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 189935-189968 | 34 | NC_019254 | Shigella sp. MO17 plasmid pMO17_54, complete sequence | 16864-16897 | 7 | 0.794 |
NZ_CP021286_1 | 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 189935-189968 | 34 | NZ_CP049048 | Enterobacter hormaechei strain Y233 plasmid p233-142, complete sequence | 109547-109580 | 7 | 0.794 |
NZ_CP021286_1 | 1.13|190721|33|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 190721-190753 | 33 | NC_011245 | Borrelia duttonii Ly plasmid pl28, complete sequence | 27872-27904 | 8 | 0.758 |
NZ_CP021286_1 | 1.13|190721|33|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 190721-190753 | 33 | NC_011265 | Borrelia duttonii Ly plasmid pl27, complete sequence | 21445-21477 | 8 | 0.758 |
NZ_CP021286_1 | 1.15|190862|31|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 190862-190892 | 31 | NZ_AP014824 | Geminocystis sp. NIES-3709 plasmid pGM3709_03, complete sequence | 8512-8542 | 9 | 0.71 |
NZ_CP021286_1 | 1.13|190721|33|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 190721-190753 | 33 | NZ_CP041195 | Weissella cibaria strain CBA3612 plasmid pCBA3612-02, complete sequence | 6048-6080 | 10 | 0.697 |
NZ_CP021286_1 | 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 191580-191613 | 34 | NZ_CP040051 | Acinetobacter baumannii strain VB16141 plasmid unnamed1, complete sequence | 65151-65184 | 10 | 0.706 |
NZ_CP021286_1 | 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 191580-191613 | 34 | NZ_CP012007 | Acinetobacter baumannii strain Ab04-mff plasmid pAB04-1, complete sequence | 55277-55310 | 10 | 0.706 |
NZ_CP021286_1 | 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 191580-191613 | 34 | CP040054 | Acinetobacter baumannii strain VB35179 plasmid unnamed1, complete sequence | 51450-51483 | 10 | 0.706 |
NZ_CP021286_1 | 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 191580-191613 | 34 | NZ_CP012005 | Acinetobacter baumannii strain ATCC 17978-mff plasmid pAB3, complete sequence | 53921-53954 | 10 | 0.706 |
NZ_CP021286_1 | 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 191580-191613 | 34 | MF399199 | Acinetobacter baumannii strain D46 plasmid pD46-4, complete sequence | 177496-177529 | 10 | 0.706 |
NZ_CP021286_1 | 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 191580-191613 | 34 | NZ_AP014650 | Acinetobacter baumannii strain IOMTU433 plasmid pIOMTU433, complete sequence | 93937-93970 | 10 | 0.706 |
NZ_CP021286_1 | 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 191580-191613 | 34 | NZ_CP050433 | Acinetobacter baumannii strain PM194229 plasmid pPM194229_1, complete sequence | 119339-119372 | 10 | 0.706 |
NZ_CP021286_1 | 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 191580-191613 | 34 | LT605060 | Acinetobacter calcoaceticus strain NCTC7364 genome assembly, plasmid: 2 | 43536-43569 | 10 | 0.706 |
NZ_CP021286_1 | 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 191580-191613 | 34 | NZ_KU744946 | Acinetobacter baumannii strain A297 (RUH875) plasmid pA297-3 clone Global clone 1 (GC1), complete sequence | 171009-171042 | 10 | 0.706 |
NZ_CP021286_1 | 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 191580-191613 | 34 | NZ_KT779035 | Acinetobacter baumannii strain D4 plasmid pD4, complete sequence | 103008-103041 | 10 | 0.706 |
NZ_CP021286_1 | 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 191580-191613 | 34 | NZ_MK323043 | Acinetobacter baumannii strain Acb-45063 plasmid pAb45063_b, complete sequence | 4445-4478 | 10 | 0.706 |
NZ_CP021286_1 | 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 191580-191613 | 34 | CP033562 | Acinetobacter nosocomialis strain 2010S01-197 plasmid p2010S01-197-1, complete sequence | 61395-61428 | 10 | 0.706 |
NZ_CP021286_1 | 1.10|190507|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 190507-190540 | 34 | NC_019509 | Cronobacter phage ESP2949-1, complete genome | 8672-8705 | 12 | 0.647 |
NZ_CP021286_1 | 1.10|190507|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 190507-190540 | 34 | MH845412 | Cronobacter phage CS01, complete genome | 13237-13270 | 12 | 0.647 |
1. spacer 1.17|191003|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021285 (Legionella pneumophila subsp. pneumophila strain Allentown 1 (D-7475) plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
gaatttgtcggccgcatagaccgcttttatcaaa CRISPR spacer gaatttgtcggccgcatagaccgcttttatcgtt Protospacer *******************************.
2. spacer 1.17|191003|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_006366 (Legionella pneumophila str. Lens plasmid pLPL, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
gaatttgtcggccgcatagaccgcttttatcaaa CRISPR spacer gaatttgtcggccgcatagaccgcttttatcgtt Protospacer *******************************.
3. spacer 3.8|3083425|27|NZ_CP021286|CRT matches to NZ_CP053936 (Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_794 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
aaaggagaaacgggagcagtaggtcca CRISPR spacer acgggagaaacgggagcaacaggtcca Protospacer * .***************..*******
4. spacer 3.8|3083425|27|NZ_CP021286|CRT matches to NZ_CP053933 (Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_794 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
aaaggagaaacgggagcagtaggtcca CRISPR spacer acgggagaaacgggagcaacaggtcca Protospacer * .***************..*******
5. spacer 3.8|3083425|27|NZ_CP021286|CRT matches to NZ_CP009718 (Bacillus thuringiensis strain HD682 plasmid pBGN_2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
aaaggagaaacgggagcagtaggtcca CRISPR spacer acgggagaaacgggagcaacaggtcca Protospacer * .***************..*******
6. spacer 3.10|3083524|27|NZ_CP021286|CRT matches to NZ_CP053936 (Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_794 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
aaaggagaaacgggagcagtaggtcca CRISPR spacer acgggagaaacgggagcaacaggtcca Protospacer * .***************..*******
7. spacer 3.10|3083524|27|NZ_CP021286|CRT matches to NZ_CP053933 (Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_794 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
aaaggagaaacgggagcagtaggtcca CRISPR spacer acgggagaaacgggagcaacaggtcca Protospacer * .***************..*******
8. spacer 3.10|3083524|27|NZ_CP021286|CRT matches to NZ_CP009718 (Bacillus thuringiensis strain HD682 plasmid pBGN_2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
aaaggagaaacgggagcagtaggtcca CRISPR spacer acgggagaaacgggagcaacaggtcca Protospacer * .***************..*******
9. spacer 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693625 (Marine virus AFVG_250M334, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcctgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer tcactactcctgaaggttttaattggatatatga Protospacer ****************** ***** ***.*
10. spacer 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020506 (Serratia marcescens strain 95 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
11. spacer 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022274 (Citrobacter freundii strain 18-1 plasmid pA18-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
12. spacer 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026551 (Citrobacter sp. SL156 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
13. spacer 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022697 (Citrobacter farmeri strain AUSMDU00008141 plasmid pAUSMDU8141-2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
14. spacer 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019013 (Escherichia coli strain G3/10 plasmid pSYM1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
15. spacer 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP052139 (Klebsiella pneumoniae strain F17KP0040 plasmid pF17KP0040-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
16. spacer 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN699848 (Citrobacter pasteurii strain 175G8 plasmid pCfr-OXA-198, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
17. spacer 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KY416992 (Escherichia coli strain FAM21805 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
18. spacer 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020508 (Serratia marcescens strain BWH-35 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
19. spacer 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017222 (Escherichia coli strain FAM21845 plasmid pFAM21845_2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
20. spacer 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019254 (Shigella sp. MO17 plasmid pMO17_54, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
21. spacer 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP049048 (Enterobacter hormaechei strain Y233 plasmid p233-142, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
22. spacer 1.13|190721|33|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011245 (Borrelia duttonii Ly plasmid pl28, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
attaataatattttagaagattggcacataata CRISPR spacer gaaaataatattttagaaggttggtacatgcaa Protospacer . ****************.****.****. *
23. spacer 1.13|190721|33|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011265 (Borrelia duttonii Ly plasmid pl27, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
attaataatattttagaagattggcacataata CRISPR spacer gaaaataatattttagaaggttggtacatgcaa Protospacer . ****************.****.****. *
24. spacer 1.15|190862|31|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP014824 (Geminocystis sp. NIES-3709 plasmid pGM3709_03, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
attttaccttttaacacatattgataggcgt CRISPR spacer attttaccctttaacacatcttggaaacgag Protospacer ********.********** ***. *. .
25. spacer 1.13|190721|33|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP041195 (Weissella cibaria strain CBA3612 plasmid pCBA3612-02, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
attaataatattttagaagattggcacataata CRISPR spacer gcatataatattttaaatgattggcacactagg Protospacer .. ***********.* **********. * .
26. spacer 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040051 (Acinetobacter baumannii strain VB16141 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttcttttttcagatttcatttccttttccttgtg CRISPR spacer cctgatcttcagattcgatttccttttccttttc Protospacer ... *.********. ************** *
27. spacer 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP012007 (Acinetobacter baumannii strain Ab04-mff plasmid pAB04-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttcttttttcagatttcatttccttttccttgtg CRISPR spacer cctgatcttcagattcgatttccttttccttttc Protospacer ... *.********. ************** *
28. spacer 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP040054 (Acinetobacter baumannii strain VB35179 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttcttttttcagatttcatttccttttccttgtg CRISPR spacer cctgatcttcagattcgatttccttttccttttc Protospacer ... *.********. ************** *
29. spacer 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP012005 (Acinetobacter baumannii strain ATCC 17978-mff plasmid pAB3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttcttttttcagatttcatttccttttccttgtg CRISPR spacer cctgatcttcagattcgatttccttttccttttc Protospacer ... *.********. ************** *
30. spacer 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to MF399199 (Acinetobacter baumannii strain D46 plasmid pD46-4, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttcttttttcagatttcatttccttttccttgtg CRISPR spacer cctgatcttcagattcgatttccttttccttttc Protospacer ... *.********. ************** *
31. spacer 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP014650 (Acinetobacter baumannii strain IOMTU433 plasmid pIOMTU433, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttcttttttcagatttcatttccttttccttgtg CRISPR spacer cctgatcttcagattcgatttccttttccttttc Protospacer ... *.********. ************** *
32. spacer 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP050433 (Acinetobacter baumannii strain PM194229 plasmid pPM194229_1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
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33. spacer 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to LT605060 (Acinetobacter calcoaceticus strain NCTC7364 genome assembly, plasmid: 2) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
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34. spacer 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KU744946 (Acinetobacter baumannii strain A297 (RUH875) plasmid pA297-3 clone Global clone 1 (GC1), complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
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35. spacer 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KT779035 (Acinetobacter baumannii strain D4 plasmid pD4, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
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36. spacer 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MK323043 (Acinetobacter baumannii strain Acb-45063 plasmid pAb45063_b, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
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37. spacer 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP033562 (Acinetobacter nosocomialis strain 2010S01-197 plasmid p2010S01-197-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
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38. spacer 1.10|190507|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019509 (Cronobacter phage ESP2949-1, complete genome) position: , mismatch: 12, identity: 0.647
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39. spacer 1.10|190507|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH845412 (Cronobacter phage CS01, complete genome) position: , mismatch: 12, identity: 0.647
ctaacctgattgctcaacaaataatgctattggc CRISPR spacer tacggttgattgcttaacaaaaaatgctatgatg Protospacer . . .********.****** ******** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
217217 : 270139
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP021286|217217:270139|DBSCAN-SWA 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43 | Pseudomonas_phage(66.67%) | integrase,transposase,protease | attL 226942:226958|attR 234627:234643 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
1003512 : 1010352
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP021286|1003512:1010352|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP021286|1003512:1010352|1005905_1006631_-|WP_010946572.1|DBSCAN-SWA MSLLEAKQLKKSFKGRTVVNGVSIHIKQGECVGLLGPNGAGKTTCFYMIVGLQSCDEGHIILNGTDITQDAMHLRARHGISYLPQEASVFRKLTVAENIMAILELRKDLDDQKREEKLDLLLQEFHISHIENSLGMALSGGERRRVEIARALAIEPSFILLDEPFAGVDPISVIDIKKIILHLCDKGIGVLITDHNVRETLDICERAYIVSQGKILCEGTPKAILANQQVRQVYLGEEFAL >NZ_CP021286|1003512:1010352|1006627_1007137_-|WP_010946573.1|DBSCAN-SWA MTQLKVKYIILLLLMLCSISGNALPFDKEKMVQVVSDSADLNQKNHQGVYIGNVEFVQGSTNLRAEKAITQGDAKNQLTLAVAEGSKDKQAHYWTTTAPDKPPFHAYADTIKYYPLKHLIELIGNARIEQGPNSLSAAKISYDTQEQHVLSHSDEKTRTTIIIYPEKKS >NZ_CP021286|1003512:1010352|1007117_1007687_-|WP_010946574.1|DBSCAN-SWA MNITKQAIWLFLTLLILAGSGWYYAHFNQAIINKKSLSNEVDTTISQLTVKQFNSEGVLINLLTTPQVEYIPNNNLHLLKNPHIIIKQDNQPAWEINSLRAKSFDGGKQITFIEQVVVHQNPGESTRESTLKTEEITYYPKEKKATTSLFVTFEQPGNIIQSTGMNAYLDEKRVELLHKARGSYDPAKG >NZ_CP021286|1003512:1010352|1005293_1005872_-|WP_010946571.1|DBSCAN-SWA MLLIIDNYDSFTYNLVQYFQSLNQKVEVFKNDEIQIDTIRQSAPQYLVISPGPNSPDESGISIEVIKEFHKHIPILGICLGHQCIAQAFGGKIIPAPEIMHGKTSEITHHYQGLFTGIPNHFQATRYHSLAVDIMSLPNCFSIDAWADDTIMAISHRQFPLFGLQFHPEAILSQFGLQILENFLRYETQTSI >NZ_CP021286|1003512:1010352|1008224_1009187_-|WP_010946576.1|DBSCAN-SWA MNFCTLGLAVIETEAQAVFELTQRIDEHFEKACELLLSCKGRIVVTGMGKSGHIANKLASTFSSTGSPAFFMHPGEASHGDLGMITRQDIVVAISNSGNTHEIVTLLPLLKRLEVPLITLTGNKQSTLAKSADVNLDVSIKQEACPLGLAPTTSTTVSLVMGDALAISLLQARGFSAEDFALSHPGGALGKKLLLKIDDLCHTGEQLPLANENATVSDALIEVTNKKLGMTCVVDNHGYLVGVYTDGDIRRTLTRQFNINTTLIKDVMTKNCRTISKGMLAAEALAIMQKYSITSLVVVENDNRPYAVLHLHDLLKAGVF >NZ_CP021286|1003512:1010352|1007683_1008211_-|WP_011213328.1|DBSCAN-SWA MNELLEKAKKIKCLICDVDGVLSDGLLHIDNHGNELKSFHVQDGMGLKLLMAAGIQVAIITTAQNAVVDHRMEQLGITHYYKGQVDKRSAYQHLKKTLGLNDDEFAYIGDDLPDLPLIQQVGLGVAVSNAVPQVLEFADWRTERTGGRGAVRELCDLILNAQNKAELAITGYLKQ >NZ_CP021286|1003512:1010352|1009554_1010352_+|WP_010946577.1|DBSCAN-SWA MPDNWVEIKNLFFSLDDRCIFDGIDMVVKQGKITAIMGPSGSGKTTLLRLIGAQLRPDSGQIYVNGQNIHQLSRKSLYETRRNMGLLFQSSALFTHLSVFENVAFPLREHTELNASMIRNIVLMKLEAVGLRGAAHLMPAQLSGGMCRRVALARTIALDPVLMMYDEPFTGQDPISMGVLVRLIQRLNQLLHTTTIIVSHDVEETCSIADYIYLISGGKIIGQGTPDELKRSIEPQIRQFMHGEADGVVPFHYPAKPYTEELLNA >NZ_CP021286|1003512:1010352|1003512_1004289_-|WP_010946569.1|DBSCAN-SWA MNSILERIAKHKLEEVAVAKKNKPLHVLSKQQPGEMRDFITALKSNTSPAVIAEIKKASPSKGLIRKDFNVAEIAKIYTQNGARCLSVLTDIEFFQGHPDYLALAKSKTTLPVLRKDFIIDSYQIYESLVLGADCILLIVALLDDVQLMDFCQLAQELKMSVLVESHTQDELERALRLPTPLIGINNRSLHNFKTDIQLSIQLKQFVPKDKIIITESGINTREDIKLMQSHGINAFLIGESLMRADNIGKALQKLMTD >NZ_CP021286|1003512:1010352|1004281_1005316_-|WP_010946570.1|DBSCAN-SWA MKPKLLFEQLLSRQDLSSDQMQEVIHACMTGEFSDVQIATFLALMRMKGETVNELTAAAQVMRQLAHKIDLGNPLIDIVGTGGDGRNTFNVSTACSFVVAAAGIKVAKHGNRSVSSRSGSADLLEQAGFILNLSDSQVQNCINQCQLAFLFAPHYHPAMQHARAARQQLGIRTLFNLLGPLINPAQVKRQVVGVFSTNWLKTIATVLANLGSERSLVISSQDGLDEISIAAKSEVVEYRDGNFKQWFISPEDYGLKHSSLDAIIVDSPEQSLHLIQSVLSGDSGPARDIVLLNSAAAIYCAKDGISFDAAIEEARIAIDSGKANLCFNKLRLLTQTLNKESNHE |
9 | Acinetobacter_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1268434 : 1274371
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP021286|1268434:1274371|DBSCAN-SWA TATGCACGAACAGTTTCTGCTTGCAGCACTTGAACAAGCCAAACTGGGGAGAGGCTTTTGTGCCCCCAATCCCAGCGTTGGGGCGGTTGCTGTGCAAAATGGTAATATTATAGCACAGGCATGGCATAGAGGTGCAGGTACACCGCATGCAGAACAATTATTGTTATCACAAATTCTACCCCAAACGCCAGGGGTTACGCTTTATGTCACGCTGGAGCCTTGTAATCATTGGGGCAAAACTCCCCCTTGTGTTGATGCTATTATCAATCATGGTATAGAGGAGGTTGTTTTTTCCTATTTTGACCCAAACCCCATTGTTGCCAAAAGTAACTCATCAGAAAAATTACGTGAACATGGAATACAAGTCAGGCATATTCCTATAAAGGCAATTGATGTGTTCTATAAAAGCTATGCTTATTGGACTATGACCCATAAACCAAGAGTCACTGTTAAAATGGCACAAACTTTTGATGGTAAAATTGGAAAGTCTGAGGGAGCTCGAGTGGTTTTGTCCAATGCTTTATGCGAACAGTTCACTCATCAAATGCGTGCTGCCAGTGATGTCATATTAACCAGTGCCAAGACAGTTCAAATGGATAATCCAAGAATGAACGCAAGATTAGATAGTGGATTGGTAGCAAAGCCAGTTGCCATTGTTGACCGCAATTTAAGTTTGTCTGATGACACAATCATTTTTTCGACAGCAAAACATTGCCACATTTATCATCAACCACAAGCAAATCAGGCAAAGACTTATCCTAATAGCACTCATTATGCGATGCCTTTGCAAAATGGGTTGATGAACTTGGAGGCAATAATAACTCATCTTGGTCAACTGGGATACCATGATGTATGGGTTGAAGCGGGCGGAGCTATTTTTTCTGCGTTACATAGTAAGGGATTGGTGCATAGAACCTATTTGTATTTAGTTCCCGGCAGTTTAGGGCATCAAGCGATTTCAGCTTATCAACAACAGGGGATTTTTGAAAAAGCTCATACGGTGAGTTGGCAAGCTATGGGTGACAATATGATAGCATGTTTGGATTGGCAGGAGGATGAGTGTTTACCGGATTGATAGAAAATACAGGCAAAGTATTAATGAATAGACAAGGAGAAAATTCTAGTCGTTTAGTCGTTTCTTCAAGCTATCAGGATTTGAAACCTGGTGAGAGTATCGCTGTAAATGGGGTTTGTTTAACCCTTTTGCCAGCAGATTTTCCTGAACTGTGTTTTGATATTTCACCTGAAACTCTGCATGTTACCACATTGTCAAAATTATCATCTGGCGACATGGTTAATCTTGAAAGAGCTATGCTGGCATCAACCCGCTTTGGTGGTCATTATGTATCGGGCCATGTAGACACCAGGGCCAAAGTGAAATCCATTTGTGCTGTTAATGAATTTATCGCGATGGATTTGGATGGTTTTATCCCAGAACACAATCATTATTTAATACCCAAAGGTAGCATTACAGTAGATGGAGTTAGCTTGACTATTAATACTGTATCAGAACAAACCATCGGACTCATGCTGGTGCCACATACATTATCAATGACTAATCTCGGTTCATTGAGAGTGGGCCAGCAAGTCAATATTGAATTTGATTATCTTACCCGGATTGTGGCTCATCAGCTTCAAATTATCGGGAAATTGAACCAAGAGGAAGTGTCATGAAACATTCATTAGCAACAATAGAAGAGGCTGTGGCGACACTTAAAGCCGGTAAAATGATTATTCTAATGGATGATGAAGATAGAGAGAATGAAGGTGATTTGGTGATTGCTGCTGAGCACGCTACTCCCGAAGCTATTAATTTTATGTCGCGTCTTGGTTGTGGTTTAATTTGTTTGCCTATGGCTGAAGAATTGATAGATAAGCTTGAGTTGCCCATGATGGCTCGGCATAACAAATCGCCGTATGGAACGGCGTTTACGGTTTCAATTGAAGCAGCTAATGGTGTCTCCACAGGCATCTCAGCAAGAGACAGAGCTCGAACAATTCAAGTGGCTATTGATCCAAAAAGCGGGCCATCTGATATCATTTCACCTGGACATGTTTTTCCTTTACGGGCTAGAAAGAGAGGAGTTTTAGAAAGACCAGGTCAAACAGAAGGCAGTGTTGATTTGGTAAAACTTGCCGGATTGACCCCGGCCGCAGTGATTTGTGAAATCATTAATGAAGATGGAACAATGAGCAGACGTGATGAATTAGCTCTTTTTTCAAAAAAACATCAAATCCCTTTAGTCACCATTAAAGATTTAATTCAGTACAGAGTACGGCATGAAAATCTGATTCATCCCGTTGCAACCACACAAATTCCTCTGGAGGAGAACGGTGTTTTTACTATGACTGTTTTTGAGAATCAGATAGATTCCTGTGAACATTTTGTCTTGGTTAAACCCCCTTTGTATGGTAATCAAGTGCCTTTGGTTCGAATTCATTCTGAGTGCATAACAGGTGATGTTTTTGGCTCCAGAAAATGTGATTGTGGAAAGCAACTGGAGTTGTCTTTATCCCAGATCGGAGCTGAAGGCGGTATATTAATTTATTTGCGTCAGGAAGGCCGCGGAATAGGTTTGGCAAACAAATTAAAGGCGTATGCTTTGCAAGAGCAGGGGTTTGATACAGTCGATGCTAATCTGGAATTAGGATTGCCCGCTGACGATAGAGATTATGCCGTAGCATACCAAATACTGAAATATTTAGGGGTTGAAGCATTAAGGTTGCTGACAAATAATCCTTTAAAAATCGCTTCTCTTGAGCGTTATGGAATGAAGATTACTCAACGCATTCCTTTGGAAATTGAGCCCTCCAGAGAAAATCACAGTTATTTAAAAACCAAAAAAATAAAACTGGGGCATTTATTAGCCATTGATTAGGATAAACATGAGAGAGATAAAAACAATTGTTAGTGATGGTGTCACGTTTCCAATAGCGCTAGTTGTAAGTACTTTTAATGAACTGATAACCTCTGCATTAAAAAAAGGGGCGTTAGATAGATTGACTGAACTGGGTTTTAAATCGGAGGACATTACCTTAGTTGAGGTTCCTGGCGCAGTAGAGATTCCCTTTGTTGCACAGTTGCTAGCGAAAAAACAAAAAGTAGAAGTCATAGTGGCACTTGGAGCAGTTATCCGTGGTGAAACCTCTCATTATGATTACGTTTGTGATCAGGTCAGCCAGGGATGCCAAAGGGTTATGTTAGATTATAATATTCCGGTTATCTTTGGTGTATTAACTACTGAAAATGATGAGCAGGCTTTGGCAAGAGTGGGAGGAACTCACGGCCATAAAGGGAGAGATGCGATAGATTGTGCGGTTTCCATGCGTTCTATTAAACAACAATTGCAATAGTTCTATTAATTTTGCTCAAATTTCTGTTATTTATATCTTCATTTTGATAGAATTGAATCCCGTTTACATGCAAATTAAATTGAACACCAAATTGGTGGATTCGGCATTTTGAGCGGGGTCAAAAAATGACAAAATATATTTTTATTACTGGCGGGGTTGTGTCTTCTTTAGGAAAAGGCATAGCAGCCGCATCTCTTGCAGCTATTCTTGAAGCTCGTGGTCTTCGCGTTACGTTGATAAAGCTTGATCCCTACATTAACGTTGATCCTGGTACTATGAGTCCCTTTCAGCATGGCGAGGTTTTCGTAACGAATGACGGGGCGGAGACCGATTTGGATTTGGGACATTATGAGCGCTTTGTTAAAACAACAATGACCAAGCGTAATAATTTCACATCGGGAAAAATTTACGAAAATGTAATTAAGAAAGAAAGACGTGGTGATTATTTAGGAGGGACAGTTCAGGTTATTCCTCATATTACCAATGAAATCAAACGCTGTATCAAACTTGGTGCGGATGCATTCGATGTGGCTATGGTTGAAATAGGAGGAACTGTTGGTGATATTGAATCATTACCCTTTCTTGAAGCAATTAGGCAGATGCGTATTGAGTTAGGTTCACAACGAGCAATATTTATTCATCTTACTTTGGTTCCTTATATTGCTACTTCTGGGGAAACCAAAACCAAACCAACTCAACACTCGGTAAAGGAATTGCGTTCTATTGGTATCCAGCCAGATGTATTGATTTGCCGTTCAGAAAAACCATTATCCATGGCAGACAGGGCTAAAATCGCATTATTCACTAATGTTGAAAAAGAAGCTGTGATTTCTCTTGAGGATGCGAATAGTATTTATCAAATACCTATGATTCTACATGCGCAGCATTTAGACGAAATTGTTGTTAAGAAACTAAGCCTGGAAGCTAAGCAGGCTGATTTGAGCGAGTGGCAACGAGTAGTTGATATGCAAGCAGTTCAAACGATGACAGTGAAAATCGCTATGGTAGGTAAATATACGGAGCTGAATGATGCCTACAAGTCGATTAATGAAGCTTTATTGCATGCTGGAATTCATACGGAAACAAAAGTAGAAATTATCTATTTTGATGCTGAGATGATAGAAAAGCATGGCGCTTTATTACTTGAATCCATTGATGCTATTTTGGTACCTGGTGGTTTTGGTGAGAGAGGAGTCGAAGGCAAAATTAAGGCTATCCAATATGCTCGGGAGCATAAAGTTCCTTTTTTAGGGATATGTTTGGGTATGCAAACAGCTGTTATTGAGTTTGCGAGAAATGTAGTCGGTTTAACAGGAGCCAATTCGACTGAGTTCAATAAAGAAACATTGTATCCAGTGCTTGGTTTAATTAGTGAATGGATGGATGCCGATGGTAGCAAGCAGATCAGGGACGAAAATACTGACTTGGGTGGAACCATGCGTTTGGGCGGGCAATACTGTCATCTTGCTGAAGGCACTCTGGCAAGAAAAGTTTATGGCAAACCACAAATTATAGAGCGCCATCGACATCGATATGAAGTCAATAACAAGTATGTGGATAGTTTGGTAAAACATGGCTTAATTATTTCAGGACGATCAGCAGATAATTCACTGGTTGAGATGATAGAATTAGCAGACCACCCCTGGTTTTTAGCTTGTCAGTTTCATCCTGAGTTCACATCAAATCCAAGAGATAGTCATCCTCTATTTAAGGAATTTGTACTTGCAGCTCGTATTCACCATCAAGAGAAGGACAAAAAATGAGATTATGTGGTTTTGAAGCAGGCTTGGATAAGCCATTGTTTTTGATTGCCGGCCCTTGTGTTATTGAAAGTGAAGAACTGGCTTTAGAGACCGCAGGATATTTAAAGGAAATGTGCATTCAATTGAATATCCCTTTCATCTATAAGTCTTCTTTTGATAAAGCAAACCGTTCATCTATTTCCAGTTACAGGGGACCTGGCTTTGAAAAAGGGTTATCGATTCTGGAAAAGGTCAAATCACAAATAGGTGTTCCTGTTTTGACTGACGTTCATGAAGACACGCCCTTATTTGAAGTCTCCAGTGTGGTAGATGTATTACAAACGCCAGCCTTCCTATGCAGACAAACCAATTTTATCCAGAAAGTTGCTGCTATGAATAAGCCGGTTAATATTAAAAAGGGACAGTTTCTTGCTCCCTGGGAAATGAAACATGTTATTGCGAAAGCAAAGGCGCAAGGTAATGAGCAAATTATGGCTTGTGAGCGAGGAGTGAGCTTCGGCTACAATAATTTGGTTTCTGATATGCGTTCCCTCGTTATCATGCGTGAAACCGGCTGTCCAGTGGTTTATGATGCAACACATTCGGTTCAATTGCCCGGGGGCAATAATGGTGTATCCGGGGGGCAGAGAGAATTTATTCCGGCTCTTGCAAGAGCAGCTGTAGCTGTTGGAATATCAGGGTTATTTATGGAAACTCACCCTGATCCGGATAAAGCACTAAGTGATGGTCCCAATAGTTGGCCTCTAGATAAAATGAAACAACTTTTGGAGTCATTGAAAGCAGCGGATGAAGTGTATAAAAAGTACAGTACTGATTTCTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP021286|1268434:1274371|1271319_1271787_+|WP_010946914.1|DBSCAN-SWA MREIKTIVSDGVTFPIALVVSTFNELITSALKKGALDRLTELGFKSEDITLVEVPGAVEIPFVAQLLAKKQKVEVIVALGAVIRGETSHYDYVCDQVSQGCQRVMLDYNIPVIFGVLTTENDEQALARVGGTHGHKGRDAIDCAVSMRSIKQQLQ >NZ_CP021286|1268434:1274371|1268434_1269508_+|WP_038838075.1|DBSCAN-SWA MHEQFLLAALEQAKLGRGFCAPNPSVGAVAVQNGNIIAQAWHRGAGTPHAEQLLLSQILPQTPGVTLYVTLEPCNHWGKTPPCVDAIINHGIEEVVFSYFDPNPIVAKSNSSEKLREHGIQVRHIPIKAIDVFYKSYAYWTMTHKPRVTVKMAQTFDGKIGKSEGARVVLSNALCEQFTHQMRAASDVILTSAKTVQMDNPRMNARLDSGLVAKPVAIVDRNLSLSDDTIIFSTAKHCHIYHQPQANQAKTYPNSTHYAMPLQNGLMNLEAIITHLGQLGYHDVWVEAGGAIFSALHSKGLVHRTYLYLVPGSLGHQAISAYQQQGIFEKAHTVSWQAMGDNMIACLDWQEDECLPD >NZ_CP021286|1268434:1274371|1273546_1274371_+|WP_027265741.1|DBSCAN-SWA MRLCGFEAGLDKPLFLIAGPCVIESEELALETAGYLKEMCIQLNIPFIYKSSFDKANRSSISSYRGPGFEKGLSILEKVKSQIGVPVLTDVHEDTPLFEVSSVVDVLQTPAFLCRQTNFIQKVAAMNKPVNIKKGQFLAPWEMKHVIAKAKAQGNEQIMACERGVSFGYNNLVSDMRSLVIMRETGCPVVYDATHSVQLPGGNNGVSGGQREFIPALARAAVAVGISGLFMETHPDPDKALSDGPNSWPLDKMKQLLESLKAADEVYKKYSTDF >NZ_CP021286|1268434:1274371|1269492_1270107_+|WP_027265743.1|DBSCAN-SWA MFTGLIENTGKVLMNRQGENSSRLVVSSSYQDLKPGESIAVNGVCLTLLPADFPELCFDISPETLHVTTLSKLSSGDMVNLERAMLASTRFGGHYVSGHVDTRAKVKSICAVNEFIAMDLDGFIPEHNHYLIPKGSITVDGVSLTINTVSEQTIGLMLVPHTLSMTNLGSLRVGQQVNIEFDYLTRIVAHQLQIIGKLNQEEVS >NZ_CP021286|1268434:1274371|1270103_1271312_+|WP_011215282.1|DBSCAN-SWA MKHSLATIEEAVATLKAGKMIILMDDEDRENEGDLVIAAEHATPEAINFMSRLGCGLICLPMAEELIDKLELPMMARHNKSPYGTAFTVSIEAANGVSTGISARDRARTIQVAIDPKSGPSDIISPGHVFPLRARKRGVLERPGQTEGSVDLVKLAGLTPAAVICEIINEDGTMSRRDELALFSKKHQIPLVTIKDLIQYRVRHENLIHPVATTQIPLEENGVFTMTVFENQIDSCEHFVLVKPPLYGNQVPLVRIHSECITGDVFGSRKCDCGKQLELSLSQIGAEGGILIYLRQEGRGIGLANKLKAYALQEQGFDTVDANLELGLPADDRDYAVAYQILKYLGVEALRLLTNNPLKIASLERYGMKITQRIPLEIEPSRENHSYLKTKKIKLGHLLAID >NZ_CP021286|1268434:1274371|1271912_1273550_+|WP_010946915.1|DBSCAN-SWA MTKYIFITGGVVSSLGKGIAAASLAAILEARGLRVTLIKLDPYINVDPGTMSPFQHGEVFVTNDGAETDLDLGHYERFVKTTMTKRNNFTSGKIYENVIKKERRGDYLGGTVQVIPHITNEIKRCIKLGADAFDVAMVEIGGTVGDIESLPFLEAIRQMRIELGSQRAIFIHLTLVPYIATSGETKTKPTQHSVKELRSIGIQPDVLICRSEKPLSMADRAKIALFTNVEKEAVISLEDANSIYQIPMILHAQHLDEIVVKKLSLEAKQADLSEWQRVVDMQAVQTMTVKIAMVGKYTELNDAYKSINEALLHAGIHTETKVEIIYFDAEMIEKHGALLLESIDAILVPGGFGERGVEGKIKAIQYAREHKVPFLGICLGMQTAVIEFARNVVGLTGANSTEFNKETLYPVLGLISEWMDADGSKQIRDENTDLGGTMRLGGQYCHLAEGTLARKVYGKPQIIERHRHRYEVNNKYVDSLVKHGLIISGRSADNSLVEMIELADHPWFLACQFHPEFTSNPRDSHPLFKEFVLAARIHHQEKDKK |
6 | Staphylococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1997191 : 2068894
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP021286|1997191:2068894|DBSCAN-SWA 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57 | Tupanvirus(10.0%) | tRNA,transposase,protease,integrase | attL 2002634:2002693|attR 2052343:2052405 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2216348 : 2226471
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP021286|2216348:2226471|DBSCAN-SWA 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ATGCTACGATAGAAGGAGTTGTTCTGTGACCTTCACTATTTTCAATTACCTTCGGTTTGTCACCTTCCATGACAGCAACACAAGAGTTCGTAGTACCCAGGTCTATACCTATTATTTTAGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP021286|2216348:2226471|2218168_2219176_-|WP_011214267.1|DBSCAN-SWA MDLVIAANYLSTLEKCLEQFGINHFLEKIGFDLIRVHDPDAYLTQDEFNQVILEAYKLSNCPELGLVFGQNLSIVNHGFLGYAAMSSPTFGTAIQTVLSYLNTRTNLLSLELRQFNNENRAYIKLLPHTKEMVLSRFITELAVTHLIKMRNFLISCNDPLLKIELNYDEPPYAKYYQTIFQTKIVFNTEATRVWFKAEELNYPIHFADDVSYQLAKRQLQELEKKMSLKEDMASKIKSILINQNLNHASMDEIASRLCMTSRTLRRHLQRLDVTYQELLDEVREQKAKTFLLNNNISMTEISFLLGFQDTSNFSKAFKRWTGVTPTEYREKHEVQ >NZ_CP021286|2216348:2226471|2222000_2223113_-|WP_011214270.1|DBSCAN-SWA MINKSAILALADGTVYEGLSVGATGDSVGELVFNTSMTGYQEMLTDPSYARQIITLTTAHVGNTGCNMEDMESTKVWAAGLVMRNCTAIPSNYRAEQSFPDWLSKNGVVAISGIDTRALTLKLREKGSIGACISTNVEKPEIAVAKAKSFAGLQGADLALEVTRQTIERWHEGRGMWSLDKQPQQLHVVAYDFGVKHNILRILHDKGCHITIVPAKTSAEEVLAMNPNGVFLSNGPGDPQACDYAIKATQVFLDNNIPLFGICLGFQILALACGGITKKMKFGHHGSNHPVVETTGKKRVFITSQNHGFAVDEDSLPNCLEVTHRSLFDNSLQGIKHKTKPAFGFQGHPEASPGPHDIDILFNEFVNLMK >NZ_CP021286|2216348:2226471|2224536_2226471_-|WP_011214271.1|DBSCAN-SWA MAKIIGIDLGTTNSCVAVMEGDKPKVIENSEGHRTTPSIVAFTDDNEILVGQSAKRQSVTNPEKTLFAIKRLIGRRFDDPIVQKDIKMVPYKIMKADNGDAWVRVKDQDKAPPQISAEVLRKMKKTAEDYLGEEVKEAVITVPAYFNDSQRQATKDAGRIAGLEVKRIINEPTAAALAYGMDKKRGDSVIAVYDLGGGTFDISIIEIAEVDGEHQFEVLATNGDTFLGGEDFDLALIEYLASEFKKDTGIDLHNDPLALQRLKEAAEKAKIELSSAQQTDVNLPYITADASGPKHLNIKLTRAKLESLVEKLVERTIEPCKTALKDAGLTVSQINEVILVGGQTRMPLVQKTVEEFFGKEPRKDVNPDEAVAVGAAIQAAVLSGEVKDILLLDVTPLSLGIETMGGVMTKLIEKNTTIPTKATQVFSTADDNQTAVTVHVLQGEREQASANKSLGRFDLRDIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAKDKATGKAQSIVIKASSGLSEEEVAAMVKDAQSHAEEDKKFKEMAELRNQADSLIHSCEKSMKDLADELSEDEKKGIETAISELKEAVQGTDKTRIEDKLKVLTDASAKMAERIYAKKSSEGQAAQGQTQSQESTKPVEEGVVDAEFEEVKEEDKK >NZ_CP021286|2216348:2226471|2223208_2224348_-|WP_010947740.1|DBSCAN-SWA MEQRDYYELLEVSRNASDAEIKKAYRRLAMKYHPDRNPGDTSAEEKFKEIQKAYNILSDKQKRAAYDQFGHAGVDPSMGGGPGGFGGFGGFGDVFEDIFENIFSGGRGHGRQSRGQRGADLQFNVQLTLEEAAIGKEVEITVPRHGTCTVCEGSGAKKGTSPKTCETCQGMGQVRIQQGFFSIQQTCPTCHGEGKIISDPCASCHGQGRVRESKKINVKIPAGVDNGDRVRLSGEGEAGVHGGGSGDLYVQISLKKHAIFERHENDLHCEVPISFATAALGGSIEVPTLEGRVTLKIPAETQTGKVFRLRSKGMKSVRGYGQGDLLCKVVVETPVNLSREQKELLNKLQDSLENAKGTHSPKTSSWFAGVKKFFEDMKF >NZ_CP021286|2216348:2226471|2216348_2218037_-|WP_011214266.1|DBSCAN-SWA MGLKSGILGLSLLSLACGSFAMTETETIRVIIKYKQQPATMASLKSQVIKSVQIPVKEMKPMANGAYSLIFDTSNSHAIVKAKEEDVTAKVLERLRKNPNVLYAVKDRIGHFKPLPDPVINQELSQLLSHESQWDEFERPAGIRLESKPGLRDGAWAYTTGKSRKPIVVAVLDTGIALNDSLVNNLVKDNEGNVFGWNFAGNNNDLSDETRSYHGTHVAGTIAGYGDVMNGVGEDLKILTVKIPAENGMFYESAVVNSIYWAVGGDVPGVPKNIHPAKVLNMSFGVDLEPGKEIDYCDEALQEALFFARKKGAVVAVAAGNDNVWEHYNAPAVCNGTIKVASTGPEGLRSYFSNYGPSITLAAPGGDKRYGTSGGILSTVNPGGGYNSSGFDFYQGTSMASPHVAGVAGLILAVSNKALKPEQVEQILYVTTHEFGQSNDTNKSCVGKKPCGHGILDADNAVQAALNAYDVLFSAPKMTDLATHECGENRLKPGKNIINDSTATWIQAKSSCETGASYQNPRIEKAKDGKIYAYYGSASYELDQSAYKECRVVGYDGVGCYL >NZ_CP021286|2216348:2226471|2220643_2221792_-|WP_011214269.1|DBSCAN-SWA MNEVYVFTSESVSEGHPDKIADQISDAILDAILAQDPKARVACEVLVKTGMVLVGGEITTKAWVDVEEITRHVIKDIGYNSSQMGFDWESCAVLSAIGKQSPDIAQGVDNQQTKILGAGDQGLMFGYASRETDVFMPAPIAYAHRLMEKLAKARKSGQLPWLRPDAKCQLTLKYEQGMPVEVDTVVFSTQHSPDIEHKDLVEAIREEIIKSVLPAEWLNDKTRYFINPTGRFVIGGPLGDCGLTGRKIIVDTYGGMARHGGGCFSGKDPSKVDRSAAYAARHVAKNIVAAGLADKCELQISYAIGVAEPTSIFVDTFGTGRLKNSEIIDLIHTHFDLTPQGIIDQHDLLRPIYRQTATYGHYGRENFPWERLDKVAELSKAL >NZ_CP021286|2216348:2226471|2219299_2220625_-|WP_011214268.1|DBSCAN-SWA MELVEEGVQKINTLQDYKVADISLADWGRKEIAIAETEMPGLMALREEFSARKPLQGARIAGCLHMTIQTAVLIETLVALGAEVRWSSCNIFSTQDHAASAIAAKGIPVFAWKGETEEEYWWCVEQTLSGPNGWTPNLLLDDGGDLTQVVHQKHPKLLTAIKGVSEETTTGVARLYEMAKHGQLKIPAINVNNAVTKSKFDNLYGCRESLLDGLKRATDVMIAGKVALILGYGDVGKGCAQALRGQGATVLVAEIDPICALQAAMEGYRVVTLDDVAEQVDIVVTATGNYHVVTHDHMKRMRNQAILCNIGHFDSEIDIQSLKQYQWENIKPQVDHVIFPDGKRIIILAEGRLVNLGCATGHPSFVMSASFTNQVLAQIELFQNSSQYQNQVYVLPKVLDEKVARLHLGRIGAKLTQLSNEQADYIGVDKNGPYKPDHYRY |
7 | Bacillus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_6 |
2269877 : 2336243
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP021286|2269877:2336243|DBSCAN-SWA 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58 | Vibrio_phage(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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