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NZ_CP021286 | Legionella pneumophila subsp. pneumophila strain Albuquerque 1 (D-7474) chromosome, complete genome | 3 crisprs | cas1,cas2,cas4,cas3,DEDDh,DinG,RT,WYL,csa3 | 0 | 8 | 6 | 0 |
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NZ_CP021286_1 | 189827-192944 | TypeII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP021286_1
|
43 spacers
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cas4,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP021286_1
The CRISPR arrays of NZ_CP021286_1 >merge|NZ_CP021286|1|189827-192944|CRISPRCasFinder,CRT 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>NZ_CP021286|1|1|189827-192944|CRISPRCasFinder CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TAGATATAAAAAGATTAAATCTTCTAGCGCACAT CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TCACTACTCCTGAAGGTTATAATTTTTGCTATAA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TTCGAATACAATCCTAGTGTCTCTGTGTGAATTAAG CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC CAGGCACTGGTTCACTAGACACTGTAACATCTAT CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC CAATAACAAGCGAGCCTTTTGTACTAGAAGGTTTA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC CTACCAGTTAATCGTAACTCAATCTCTTTTTCAA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC ATAGAATACATAAGTGCAAATTATTAAATGTTAC CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TGAATGTAGAAACCAGATGCCACGAATTATTAGA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TTTGTATAAACGTTCTGATATGACTTAGGTAATCT CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC CTAACCTGATTGCTCAACAAATAATGCTATTGGC CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TCACTTTAGGCCAACGCCGATCCTCCGCTTCGAA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC CTCACATCTTACCCTCAGGGCGGATATTGTGAATC CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC ATTAATAATATTTTAGAAGATTGGCACATAATA 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MESSQILSPIGIDLGGKFTGVCLSHLEAFAELPNHANTKYSVILIDHNNFQLSQAQRRATRHRVRNKKRNQFVKRVALQLFQHILSRDLNAKEETALCHYLNNRGYTYVDTDLDEYIKDETTINLLKELLPSESEHNFIDWFLQKMQSSEFRKILVSKVEEKKDDKELKNAVKNIKNFITGFEKNSVEGHRHRKVYFENIKSDITKDNQLDSIKKKIPSVCLSNLLGHLSNLQWKNLHRYLAKNPKQFDEQTFGNEFLRMLKNFRHLKGSQESLAVRNLIQQLEQSQDYISILEKTPPEITIPPYEARTNTGMEKDQSLLLNPEKLNNLYPNWRNLIPGIIDAHPFLEKDLEHTKLRDRKRIISPSKQDEKRDSYILQRYLDLNKKIDKFKIKKQLSFLGQGKQLPANLIETQKEMETHFNSSLVSVLIQIASAYNKEREDAAQGIWFDNAFSLCELSNINPPRKQKILPLLVGAILSEDFINNKDKWAKFKIFWNTHKIGRTSLKSKCKEIEEARKNSGNAFKIDYEEALNHPEHSNNKALIKIIQTIPDIIQAIQSHLGHNDSQALIYHNPFSLSQLYTILETKRDGFHKNCVAVTCENYWRSQKTEIDPEISYASRLPADSVRPFDGVLARMMQRLAYEIAMAKWEQIKHIPDNSSLLIPIYLEQNRFEFEESFKKIKGSSSDKTLEQAIEKQNIQWEEKFQRIINASMNICPYKGASIGGQGEIDHIYPRSLSKKHFGVIFNSEVNLIYCSSQGNREKKEEHYLLEHLSPLYLKHQFGTDNVSDIKNFISQNVANIKKYISFHLLTPEQQKAARHALFLDYDDEAFKTITKFLMSQQKARVNGTQKFLGKQIMEFLSTLADSKQLQLEFSIKQITAEEVHDHRELLSKQEPKLVKSRQQSFPSHAIDATLTMSIGLKEFPQFSQELDNSWFINHLMPDEVHLNPVRSKEKYNKPNISSTPLFKDSLYAERFIPVWVKGETFAIGFSEKDLFEIKPSNKEKLFTLLKTYSTKNPGESLQELQAKSKAKWLYFPINKTLALEFLHHYFHKEIVTPDDTTVCHFINSLRYYTKKESITVKILKEPMPVLSVKFESSKKNVLGSFKHTIALPATKDWERLFNHPNFLALKANPAPNPKEFNEFIRKYFLSDNNPNSDIPNNGHNIKPQKHKAVRKVFSLPVIPGNAGTMMRIRRKDNKGQPLYQLQTIDDTPSMGIQINEDRLVKQEVLMDAYKTRNLSTIDGINNSEGQAYATFDNWLTLPVSTFKPEIIKLEMKPHSKTRRYIRITQSLADFIKTIDEALMIKPSDSIDDPLNMPNEIVCKNKLFGNELKPRDGKMKIVSTGKIVTYEFESDSTPQWIQTLYVTQLKKQP >NZ_CP021286.1|WP_126297580.1|182827_183148_+|hypothetical-protein MMNDLAKILSLKNLLTKNNINPSENFENIYSQITDDGLKKEIESRIIDYFSKLSLPEHVTIYDQLLLSLREKDAISHSNGIYFYLTHIKEIVILFHCLRYFSCMVM >NZ_CP021286.1|WP_025519199.1|180005_182021_+|M3-family-metallopeptidase MSTTVGLPQFSHIKIEHFKSHLDALLKNHLEEIDRLLKENHHYTWDNLIYPLDSLADELERFWSPFAHMHAVMDSEAIRESYETCLPLLSAYDAAIGHNQDLYEAIKSIDQHSLNPAQKKIIEDSMQDFELSGVALSKANKKRFEAIQSRLAELSSKFENNVLDATHAYTIHITEAERVAGLPEHALNTAKELAHEKGLDGFVLTLEYPCFQAVITHAEDRALREEMYRAYITRASDQGPNAGTFDNTPLIDEILSLRHEKAELLGFNNFAELSLATKMAASTNQVTEFIYDLISRTRDKGKAEFRQLEVFAQDKWNLSPVNPWDVAYLSEKRRQDLYSLSQEELRPYFPQPKVMQGLFAIVKKLFGMSIEEIEGVDVWHKDVQCYCIVDESNQTRGYIYTDLFARPHKRNGAWMDSMQSRRKLEDGTVQLPIATLTCNFAKPSANRPAMLSHDEVVTLFHEFGHCLHHVLTQVDYLGGSGINGVEWDAVELPSQFFENWCWDEHALSLLTSHVDTGETLPSALYERLIAAKNFQSAMAMLRQMEFALFDFRIHQEYQIGKASYVANILADVRSKTSVVPIVPYNRFQHSFSHIFGGGYAAGYYSYMWAEVLSSDAFARFEEEGIFNPKTGHDFLKSILEAGGSRKAADAFAEFRGRPATIDALLRHNGIL >NZ_CP021286.1|WP_011212790.1|178571_179906_+|hypothetical-protein MTPIISHLLKIFPELNTQVKTDSLNWTFSTHLKQLGPDFYSKIARLHPILNMEYSVLCQRLRYNLSAPDYSSPEQIKEQLIDALKLAELLEYTYQHYLVVPREVVRLRRHKAIYRELLTELSGYSFALDNPEPESLKTSLSLTQAIREKTAQSNWYRIFISRSKRVINLLDNLDTGSKAFRDFVVLLDKYTNPFLAYLGWCFFAPRLFTNLFLILKHTIPGEWMGEKEKSLDWSDRFYAHLQRRWFELANDSVWFTVGILNCFVLVGALAPLSVYLSLFAFVFDVANTSLRAYIEIGRLQQLQKEYAELFDQEENEDQKKIIKEYQDSISYRIKFEILRSFLSVGGAVAVVIAMALSVPALGIINPVIPLIGAVLLLALWGVSLYLNNKLDEYRPVDNIEKPAPSVINKLSFFAPKNEKKESLHLSSKPEKDLEAEELIPTFTF >NZ_CP021286.1|WP_011212789.1|176307_178314_-|transketolase MNSFTELANAVRMLSIDAVNQAQSGHPGMPLGMADIATVLWKKFLKFNPKNPHWFNRDRFVLSNGHGSMLLYSLLHLTGYNLDINELKNFRQLHSKTPGHPEHGHTPGVETTTGPLGQGLANSVGMALAERVLASHFNHDHYNLVDHYTYTFAGDGCLMEGISHEACSLAGTLGLGKLIVFYDDNGISIDGKVESWFTDDTTSRFKAYNWQVIGPIDGHDADQIEQAISAARENTTQPSLIICKTVIGLGSSVAGSEKAHGSPLSAQDINNVREFFNWKHAPFEIPDSIYKQWDHREQGDKEEQQWLQLLHEYRLQYPSEHDEFLRRANGDLPDDWQEISAGFLKQCLNNEKAIATRKASQQCIEFFAPILPEMFGGSADLTGSNNTDWSGSKAITAHNFSGNYLYYGVREFAMAAIMNGLAVHGGFIPYGGTFLVFADYARNAIRLSALMKQRVIYVLTHDSIGLGEDGPTHQPIEHIAMLRMTPGMTVWRPADLMETAVAWQQSLEHHNGPSALLLSRQNLPALAHGTDAADLIKKGGYIIADCEGKPDAILIATGSEVQLAITAAEKAKARGLQVRVVSMPCAERFLAQSDAYKNQVLPGQVRTRIAIEAASSAYWHQFVGFDGAVIGLDCFGVSAPATDAFNYLGITVEKIINTLDTLTKQTMV >NZ_CP021286.1|WP_011212788.1|175234_176227_-|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MTIRVAINGYGRIGRCILRSIFEYNRQNEFEVVAINDLSGIDVTAHLTRYDSTHGPFRSDVSIEGNMLIVDGHGIQVIAERDPAKLPWKQLDIDIVFECTGFFTSRDAAMGHINAGAKKVLISAPAKGVDTTVVYGVNHSVIKASDVIVSNASCTTNCLAPVVKVLNDAIGIESGLVNTVHAYTKDQMLLDGSHKDLRRARSATQSIIPTKTGAAAAVGLVLPELAGKLDGFAMRVPVLNVSVVDLTFQAKRATSVEEVNDIMRKAKSRILQINEDPLVSCDFNHNPASAIFDTTETKVIGSLVKVVAWYDNEWGFSNRMIDTAHQMMNC >NZ_CP021286.1|WP_011212787.1|174033_175224_-|phosphoglycerate-kinase MNLIKMSDIDLSGKRVLIREDLNVPIKDGMITSDQRLQAALPTIKSALDNGAAVIVLSHLGRPEEGKYEKKFSLEPVADYLRKNLEYPVRFVKDYLSGVDVKPGELVVCENVRFNPGEKANDEALAKKLANLCDVFVMDAFGTAHRAQASTYGVAQYAPVAVAGPLLIRELEALNQVLKAPKKPIVAIVGGAKVSSKLSLLKQLVGMVDVLIPGGGIANTFLKAQGFEIGISLYEPDLLDEARHILILAKEKGCQIPLPTDVVVGKTFSETCPAFNKSLSNVAEDDMILDIGPETIRDYVDLIHEANTIIWNGPVGVFEFPQFAYGTRAIAIAIAESDAFSIAGGGDTLAAVDLYDLNQQISYISTGGGAFLECLEGKTLPAVAILQERAKHVKTN >NZ_CP021286.1|WP_021437110.1|193295_193733_+|DUF45-domain-containing-protein MIDDSKAKPQVKLVRGQLQIIASRNIEHRRQLLSDWYKQKAFEVFSKRLDQLLSTAPWIKECPSINLRAMRSRWGSCAVNGKITLNTHLIKAPIACIDYVILHELCHHFEHNHSDKFYRLLNQVSPNWKQVKQYLDKAANLYLMT >NZ_CP021286.1|WP_025519205.1|193722_194397_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MNIKKEIGKRILEARKAKGLTLKALGELAGGLKQTRLTNWEQGVRTPGPEEIKSLARALDVSPAYLMCLSDELQFKEAKNPSQLIPLLDYRQACEASLHTGAESSGDKVFISVSTSLQPELSTDAFALKITDDSMMPEIRINDVLVIEPSVLPEPGDFVAVKINGKPETIICQYKKLSYTSSEFELLTLNDNWPNIKVSDDINVKIIGVLVQNLRCYKSPKVKS >NZ_CP021286.1|WP_011212797.1|194558_195428_+|hypothetical-protein MMDFVINGDELEAMSGLPHFQQLTYLRGIRPYMDVKTGIVGIKRRISHQSISEQLYVEPHQGIKSQNFSRDQVRRSVSGLVRAGLIEVQSEGMHLILKCLLASSHYSAQNKAAINPPQKATIKPRGESLENTGLTEFEALKADTVESQKAAIPHKDNYYIYLLSQFEKFWSLYPEKKSKNNAQAVFEELKPNAELCHTIINALTAQINYRDTMKLQGTWVPPWKYPANWLAQRCWEDELPTDALQEKNHAEHTKNTRKRHATEDLFCPPCDVKDREHNNVIQLQRYLQS >NZ_CP021286.1|WP_021437111.1|195393_195756_+|hypothetical-protein MSSSSKDTFKAERRIDLLFSKFAAFYGHVWRSQFKDEVFLKFAKKEWQEALADFTDMVLTRAILNCREFYELPPTLPQLLYCCRQIRKQESFYVVKDVYQPANKAVVSSCLQKCKELLAK >NZ_CP021286.1|WP_011212799.1|195768_195972_+|carbon-storage-regulator MLVLTRKAGQQILIGKGLIQMKVLKVENDIISIGIKAPSHIDIDREEIYFRKLRQEQEAANDAEMAI >NZ_CP021286.1|WP_104411317.1|195986_196271_+|TrbC/VirB2-family-protein MSKRAFQKIRTLYWGTVCLCAPSVSSAQNIESIINRTINYLQGGLARTVGVFCIIIAGYLCLARQKFPKEYFVMILVGMGIIFGGSSLYSTLIG >NZ_CP021286.1|WP_011212801.1|196280_196562_+|VirB3-family-type-IV-secretion-system-protein MSDLEISPIFNALTRPAMTAGVTFEYHMLNLIVSMCAFIGFSPLYGIIFIPLHVFGWLVCRYDTHFFTICAKRFLLPQAPNTSLWRVRAYEPF >NZ_CP021286.1|WP_011212803.1|199024_199735_+|hypothetical-protein MKRTACFLIAVLGISGASHADILGVEDAQLIVLAMKQLGELQEQYRVLTDTYQTTRSQLDNLNQLKSMNSGHYGFGDFNNGLDTLQSWQSPVSTWQDALENLSGGNQQRYQALMDAYEKNHPSLDESSYARFTTPANVARFKEDKAVNRAVLVQTTESYNEINKHMEALHKLSQQIEKTPNTKGAIDLNSRLITEIGFIQLMSLRLQALISQQAAQENLSALQDRAEMAKFNRLPK >NZ_CP021286.1|WP_011212804.1|199749_199896_+|hypothetical-protein MKWLLSVLMIALLSGCSKPPDLDSPCHHFGQYCPQYPINDEPIMELTK >NZ_CP021286.1|WP_011212805.1|199892_200288_+|hypothetical-protein MNTLIKGLMVILIAATISACHHENPLKTQPAKASVRFLINASANAEKQLHFAIHKDAYGFAYLECMEGKQSPDIQCNALYQGMIAFAKEGHYAGFQMITQADLTDKKVFESLADEYAETAATSFPHFVSGS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP021286_2 | 2334334-2334462 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP021286_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP021286_2
>2.1|2334370|57|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder CAAATAGTCCATCTAAAGAGATAAAAAAATTTGATATGTCAGAAGCTCAATTATGGG |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP021286_2
The CRISPR arrays of NZ_CP021286_2 >merge|NZ_CP021286|2|2334334-2334462|CRISPRCasFinder CTATTCTTAATGCTCAACAGAATAAAAAACAACAGACAAATAGTCCATCTAAAGAGATAAAAAAATTTGATATGTCAGAAGCTCAATTATGGGCTATTCTTAATGCTCAACAGAATAAAAAACAACAGA >NZ_CP021286|2|2|2334334-2334462|CRISPRCasFinder CTATTCTTAATGCTCAACAGAATAAAAAACAACAGA CAAATAGTCCATCTAAAGAGATAAAAAAATTTGATATGTCAGAAGCTCAATTATGGG CTATTCTTAATGCTCAACAGAATAAAAAACAACAGA
>NZ_CP021286.1|WP_015961268.1|2331826_2333779_-|hypothetical-protein MPHSTNQSNVIENINQYLKWHNLPVRFGTGGVCNGLSTVHAQYVLQGREREFFELLRYVAGDKGILDANDSVKEKVNDFVWKVVASHMTSGHDKELNQLNSFKTLSINNKPLKSVFDLPLVTSDKNWENILESLNLKEDEVMLVRSINHAISITRKGNQYHVYDPNYEEGVKSFSSEQEVIKELHERVFHYNKGNMGLTLSIITTGDKEPRQDLPKPVDIYDQYLNKENVNSLATITVEHPLGGPWDLTKKTIDLASECGDENLINKLIELHQFDFNNMPIEQASQAVQYNNVRAAELLVNDMIRILSKQDPVAQDEFSDIPAEELPAEFLKQFEEIPDAPEGDEIKEAEVQNPKVVMPPSEKKIKDLLYPLILKAASYGRKEVFDTLCEMWNKNAGDFDKEDLKNFILLAAKGGNSVLLQELIDKYYESNMTLYDKDIQGKVDGIIHELISKGSPDSAVCIEVLLNTLSKEGKSIDDRQRADYISRAFEANKPHMIERFIKGISDEKRLEFLIRAIKKDQPHMVELFIKDLPKGLLNTISLSLPAIEKMNGETLKILEKNGMKFTEMEKAIIAKKSHQPVGLLLSIGVALAKFTDFCKEVLFKNESVTYDKNKFQAFKSQLNSIKTQNSLANNEPVEAQQNDQVAVYRP >NZ_CP021286.1|WP_015961266.1|2330335_2331085_-|IS5-family-transposase MHHNISEELWNKIYSYLRGLKGLHVKNEASLRRFIEGVWYVLRTGCQWRLLPYYYGHWRQIHRRYKVWSDRGIWSELMSVVSDVDIQTVMIDATIVRAHACASGYVKDGNETQALGRSKGGFTTKIHALVDGVGNPIKFILTGGHRNDITQAAELLKEQHDTIVLADKGYDSQELIDTLHHQRCSPVIPSRKNSKYPRKIDKQLYKERFLTEAFFSKLKHFRRIFSRFDKTTSAFSGFLHLAGALIWMR >NZ_CP021286.1|WP_015961265.1|2329219_2330302_-|acetamidase/formamidase-family-protein MDKTPVVKVHSGDSVSLETWNSCLHEMVFNKTTPAEIAKFYTKHDIQKRRGMHSLTGPVYVEGAEPGDVLEIRVLDIKLNDFGYNFLSPTQGILSEFTKPRIMYFKYDKEKNTTEFTKGICLHLKPFQGIIAVAPPLDWPDGWPVNLETQMGQPVPGQFNSVPPGPFGGNLDEPSLQVGSILYLPVFQKGALVWTGDSHAMQSNGEIDVTALETSFEGITLQFIVRKDLKAEGVFDKTKRNGNSLFTWPIVENSEEWILIGLHENLFEAMQLASKNAIEFLVRTQGLSSQESYQFLSMVGNFDIPEAVNVIKSLAVHIPKEIFKNTGKMTSLSSEGKFPLTTPRTNENTTCVPQEGKIIE >NZ_CP021286.1|WP_011946955.1|2328802_2329204_-|hypothetical-protein MNKILIYLCLYFMTSITLAGKIVIDNKTNYPVKDNSRKIAVQWVATVEATQKANKIIINGSKLDLSSLKIITQKGKTQLTLPNHSHYFRVVVWSTGKQQPDLLTNWVDIVPNKTYIINQDQLVPAILMSGTGC >NZ_CP021286.1|WP_015961264.1|2327619_2328531_+|cation-diffusion-facilitator-family-transporter MTIQKGLHERRALKISIAVTFLLAVVGILFGLLSGSLAIVFDGMFNMVDTVISILAFFVARLLTSKGNRRFQYGYWHIEPMVLVLNGSILILLCTYALVNAIGSLMSGGHELNFDWAFVFALLVFFLSTGMYFYLVKTNRKIKSEFLRLDIQSWLMSALISTSLLLAFGIAALLHGGAYGYFTPYIDPLILAILTAFLIFVPMAAVRDAMRDIFRMAPVDLDERIREFLDELIKQHDFKTYTSYVAKIGRAQFIEIHIVVPMDYPISSIETLDKIRNEIALAIGENTPQRWLTIAFTANENWI >NZ_CP021286.1|WP_015961263.1|2326056_2327463_+|ATP-dependent-RNA-helicase-DbpA MIQSEHNDQHLSFSQFPLRQELIKSLASSNYENMTPIQMQSLPIILRNEDIIAQAKTGSGKTAAFALCLLNNLKISFFAVQALVLCPTRELAEQVSQAIRRLACLMPNVKIINLSGGIPMQPQLDSLRHGAHIIVGTPGRILKHLKNASLDLSQVKALVLDEADRMLDMGFFDDIKNIISVCPKQRQTLLFSATYPEEIKRLSKQFMKDPKEVHVVTPPEEIDIEQHFYEVSRHAQKFPLLKSLLLHYRPVSVLIFCNTKQQTVEVTDQLINEGFSAIALNGDMEQVERDLAVLRFANQSCSILVATDVAARGLDIKELSAVINFDLAFDHDVHIHRIGRTGRAGSKGIALSIVTPADAQRICAIEDNYPHPIHWGNINALENHNTACLVPEMVTLCIASGKKDKIRPGDILGALTKDAGLAGNTIGKINITAMYSYVAIHHSQADKAYQYLQSGKLKGRKVNVRKIN >NZ_CP021286.1|WP_010947832.1|2325607_2325817_+|cold-shock-protein MSKTVNGVVKWFNEIKGFGFIEQEGGPDVFAHFKEISSSGFKTLTEGQRVQFIVTQGAKGLQAQNITAL >NZ_CP021286.1|WP_015961262.1|2324557_2324869_+|hypothetical-protein MKKINVLLYLLTMLTISFATISHGASEDTDTTNPTKYIYRGSSITLEELATVADLSTARDQKGNPVTLEEESYQIGSFTRGTVTIIPKSGQADDVITLDLKPN >NZ_CP021286.1|WP_011213396.1|2321240_2322416_-|ISL3-like-element-ISLpn11-family-transposase MPKKDCILNLPGYSIKKVSGENPVYIEVSYRRVVRCIHCGNKKLRKKDSFIRRIRHESIGLRRSYLCIKAHKYYCPACGRYFNQRFPGIGKYQRASESLRKQVFHYHSKGVSQKDLARDLKLGKSTVERWYHYGYELRYKKIATRSCPRVLGLDEHSFNRKVGYATTFCDLAKHKIFDVVEGRSEKDLEGYLNTLEGKDKVQVVCIDLSSSYRKLIRRYFPNAMIVADRFHVIRLLNQFCLQTYQQIDPEMKYQRGLLAALRTNPNNLTVKRLNRRERYLQQQPVIAAIYYFKQRLHRLLMRKHRTAKQCTRLIPLFLKLVASLKESPFDSLKTLGKTLYQWREEVVRMWRFTKNNGITEGFHRKMKLIQRRAYGFRNFENYRLRVKVLCS >NZ_CP021286.1|WP_010947828.1|2319732_2320686_-|Abi-family-protein MMRTTTGYFFMAEKSYTKPALTVSQQLEFLFSQGLQIEDQKLAIRALETVSYYRLSSYLLPFKQSHNAKNPRQFKENATFEQVWQLYQFDRELRLLVADAIEKIEVAFRAALTNVTSIRFNPFWYVERNYFKAKAGANRERDFFDDYLKTIKTISTNKQELFIQHYHKNYDKPYFPPIWMMVEALSFGVCSKMFNNIQSKDVRNEIASFLGQHTTVIESWIKSLTYTRNLCAHHSRLWNRWLVIPPLIPKNAPIKTHIDGNYRFQLIAFIIDQLLETIAPESNWKIKLFELFERNEQFSGIEMGFINNWRDDPIWHC >NZ_CP021286.1|WP_021437119.1|2335979_2336243_-|transposase MMMSFAGEGWGEGMSRMVIDDEMWSRLEELLPKPKGRHDKNERLSMEAICTMLCAGATWCDLPPYHGNWKSVYNRYNNWSKKGYITT >NZ_CP021286.1|WP_010946556.1|2336414_2336708_-|GIY-YIG-nuclease-family-protein MQVKQPAIYIMANKRNGTIYTGVTSDLIKRVYEHKYGDVPGFTQEHGCKFLVYYELIEDMISAIAREKQLKGGSRKKKLALIEKLNPYWEDLYEKLL >NZ_CP021286.1|WP_015961270.1|2336733_2337519_-|transposase MSITELADILNGYFSWNKSRIECFATILISLIKVRTVNLTEIACGFSSPAKQDSRYTRIKRFFREFKIDFSSVSAWVILRIKNNVITTNSRGLEVSIDALFYDLKSGEQRILQGLRKLWRQKIYLSALRLADGELLIVATDHLMDEPIEHYALRWEIETLFSCLKGRGFNFEDTHMTQPDRIEKLLVLLTIAFCWAHKTEEWRHVQKAIKIKKHGRKGVSFFRYGLDLLRDAALNGCQFIHHSFSDILGFLCISRVICAAE >NZ_CP021286.1|WP_015961271.1|2337700_2338453_-|hypothetical-protein MFSKILKSRPNFFKAISEICNPGIGDKILKLQKPSLLIRIDGRSPDSLHIQDGFQPRVSGERLKSVTASDVEDYQKFNVNPFGWGACQSLKEIMTFMQKNKSQTDKGWLYKFFGKATPLLILKQEVGADSHGHDDEKEVIITEHIPLKNFIASIAPEDREMFMDGREIPNAMYSYNSSLPKSLSKQDLLTEQDILAWLLRHDAEEPFTDLCQTVFTDMPQDILEYLFQENTGIVSAITSAIEKNMVLNLL >NZ_CP021286.1|WP_011946965.1|2338891_2340712_+|NADAR-family-protein MIVIPHEVFVSKPNTALISMRYIVTTGNDYTLESEIMNVKPNIQTTLQNGKPLPYQKIGNQKVASFKDPNKPPYGPFANTTNAGEFPLKQTVLIHGIEYSFTWPSSEHAFHAQKLIHLMNKLGINDPNQIHILNTLRKIEKTQNQAGKQFDPRENWDPIARELATNMGITGTDQDKKDKIDELCDSNYYSKALVKKGIVPGTKEPYTRRFMATVLRLKCDQNPELKELAMRCASEGILPIEASTKDVNWASGIDGSGRNMLGIEILKLGNQYLMEAGRGNEIKIADPDKAYEDLQRSHQKDLGHDAIIGKPWSNPLNNSLNIWYDSTRKQTVVESHRGSNLQLIYKDGEPPKAIWRKDENSPWQDGDFKRPAVQSLLQAYQDAGSPVPTVAKQQPHPAQLNDRWAKVHKQHHDNPVINLPLFKQELREGVKLELNKIEAELKKGINPLFSRNESHLERIVREYVNPAVLEASKILAAYSVKNAMHDLNTSVTVSMVDNNRAHDDKHPLHAMKIQFKDNAEAKQFAEKLLNEYGIHSHTFGKGIMKTPQNGAIYLTPKDLQMLSQLSGLAKDPLAGLQAFANMAKNYDKAKEVSIKEDLESHAGLSP >NZ_CP021286.1|WP_013101666.1|2340955_2341246_-|GIY-YIG-nuclease-family-protein MHPSYVYILASQRNGTLYIGSTSDIINRVWEHKNKVIPGFTAKYNVHMLVYYEMYDLYIDAARREKRFKNWPRQWKINLIEKFNPEWRDLYEEICQ >NZ_CP021286.1|WP_015961274.1|2342584_2344327_+|ankyrin-repeat-domain-containing-protein MSFSKISKTLENSATLIDEKAEQDASDLSHTLGSDSQLLISEESSDVLLENTGENLVQQACIDGNLEKLKELLRGDMWGMDEVSLNQVNNRGETLLMLAIKYGHKQMALFLARSLFHLHKIDNSGKSALSLAHEKGWEDIVQLILESINNREARIRELHYAAIHGYVESVSQLLGIIDKYGFKPHGFILVGDETPRFENIFHAACCGGSLEIVKLLIEHGADINSKSQFSENNYSHYPATPILVACRYGHANIVEYLLAQDGIEYDINELLHTAVGFGHFAVLDLLLRHSKENSTRNLNIVGEYPLTHFSATLLTRACYSGQVDIVDRLIAEDIDMSNADNRQAFWTAIFCAKTQGSPAIDIIDRLLAENDRQNIDIPLDGFKDLVLWAYRQPFVGILDRLIIRGVDFYRERDPGDYPLIEAAKNGYKDIVHRLIDLSVDINLRDRKGRTALFCAVMQGEKEIVELLINNGADPNIQDNEGVTPLMKVVPTDNSEMVEFLLNAGADTSIKDKRNRLAIDLAKHFPYHMKLLKDATEIQNANKSSSSSNQSANALYTLWYSNRGDLREEAQFKEKNTPHPF >NZ_CP021286.1|WP_015961275.1|2344824_2345904_+|hypothetical-protein MNALSLIRQMAEKPELNEFIQGIKEGNLTAEHVKLFCQATAQVGVEATRGLWDTNVEQNDFSNDKNREAIYSASLLHGAHNIGHVNNLLHNKNIGISDRSKEAIIGQMEDHSPIGSRRDLAWEKEIATGFLHDAINKFQEGRAKNAAKKGSGDKDFHDGVVDMVGFVMHSLFGVGKAMGRGFLDSQERFSNSAQSNEPTINEHGQLINERLASTPQEPYVQNIGSSKSSIGVSPQLNSTTQNSTIPNEIRKFVTGGLQFKNDDQQVVDNTIEDLKTEVISAFELHNMVQDLPTSKSVQGIEAFKVEQEPSRSNDVTHYFKSILQQLKTTDPQPHKGEIAAHNPGEDNESDISKSIRFRS >NZ_CP021286.1|WP_015961276.1|2346202_2347108_+|LysR-family-transcriptional-regulator MHMSDIKSFLAVVEFHSISLASKRMHISQPTMTRRIQKIEQELGTPLFFSSGIRTELTAKGKELLPYFRQMLDIYQQMYINVGNKTKNPLKLINVGTSVYVANSIIQDFMHSAEISSSNYFFNIKLLAEPHIIDSLNSGEYDLIIAPPVYDCSSSVVSIPLWKEKILAVVGASHPLARNKKAISITELMSHDVALMEKGFTLRKKLDSLSEGLHTPLKAIFESNSIYNNIALIEKGVGWCLIHERLLNPNLIPVELSDCNMEIEFHCSFLKRREDERLIWQFLEQIRKWILADYLKQYACP >NZ_CP021286.1|WP_015961277.1|2347322_2349077_-|ankyrin-repeat-domain-containing-protein MSFSKVNKILDSNSILKEEIDKPEVLGLAQSSGGEEPPMIPDEMLFALQDRVGVNRVQQACIDGNLHVLERMNCDEFDYVDSYGTTPLMLAIEHDHKAIAYYLLRSRMINLNLHKKDNAGRSALSMAKEKGWDDIVDLIRNTMENPVYNNMELYYATINGYLDSVTELLPKIDEPGFATKETWINTYPLFGNIFHAACCGGNLEIVKLLMEYGAEINSRSYNRERHNFYYATTPILVACRYGHAHLVEYLLTQDGVQYDIIELFHIAVEYGHYAVMDLLLRKIRAENIALDLNRGLEFHASWYGTPLDKACRSGQVDIVDRLIAEGIDMKEEDNISAITTAIWNADNPEYPAIDILDRLLAECDRQGISIPLTAPEIAIIACNRNRADILDRLIIRGFDFNLGNRHGEYPLITAAIKGHEAIVDRLLSLSVDVNQRDSEGKTALFQAARHNNLEIVKLLVNNGADINIPDNKGVTPLMRVAETCFTEVVKYLLNSGADTSLKDKGGRSALDYASSSSLYFMQENLALIRDADIQKNLYKSPSSSSQSVNNPYMLWSSNRANLPEEESVKSEIISEEKAFTFQSK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP021286_3 | 3083083-3083577 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP021286_3
|
10 spacers
spacers of NZ_CP021286_3
>3.1|3083110|18|NZ_CP021286|CRT CGAGGAGAGGCAGGGCCT >3.2|3083155|18|NZ_CP021286|CRT CAAGGGGAAGCAGGACCT >3.3|3083200|18|NZ_CP021286|CRT CAAGGGGAGGCAGGGCCG >3.4|3083245|18|NZ_CP021286|CRT CGAGGAGAGGCAGGACCT >3.5|3083290|18|NZ_CP021286|CRT CAAGGGGAGGCAGGGCCG >3.6|3083335|18|NZ_CP021286|CRT CGAGGGGAAGCAGGACCG >3.7|3083380|18|NZ_CP021286|CRT CGAGGGGAAGCAGGACCT >3.8|3083425|27|NZ_CP021286|CRT AAAGGAGAAACGGGAGCAGTAGGTCCA >3.9|3083479|18|NZ_CP021286|CRT CAAGGGGAAGCAGGACCT >3.10|3083524|27|NZ_CP021286|CRT AAAGGAGAAACGGGAGCAGTAGGTCCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP021286_3
The CRISPR arrays of NZ_CP021286_3 >merge|NZ_CP021286|3|3083083-3083577|CRT CAGGGATTACCAGGCCCTAAAGGAGACCGAGGAGAGGCAGGGCCTCAGGGATTACCCGGACCGAAAGGAGACCAAGGGGAAGCAGGACCTCAGGGATTACCAGGCCCGAAAGGAGACCAAGGGGAGGCAGGGCCGCAGGGATTACCAGGCCCTAAAGGAGACCGAGGAGAGGCAGGACCTCAGGGATTACCAGGCCCGAAAGGAGACCAAGGGGAGGCAGGGCCGCAGGGATTACCCGGCCCTAAAGGAGACCGAGGGGAAGCAGGACCGCAGGGATTACCAGGCCCTAAAGGAGACCGAGGGGAAGCAGGACCTCAGGGATTACCAGGCCCTAAAGGAGACAAAGGAGAAACGGGAGCAGTAGGTCCACAAGGTATGCCAGGCCCTAAAGGAGACCAAGGGGAAGCAGGACCTCAGGGATTACCAGGCCCTAAAGGAGACAAAGGAGAAACGGGAGCAGTAGGTCCACAAGGTATGCCAGGACCTAAAGGCGAA >NZ_CP021286|3|2|3083083-3083577|CRT CAGGGATTACCAGGCCCTAAAGGAGAC CGAGGAGAGGCAGGGCCT CAGGGATTACCCGGACCGAAAGGAGAC CAAGGGGAAGCAGGACCT CAGGGATTACCAGGCCCGAAAGGAGAC CAAGGGGAGGCAGGGCCG CAGGGATTACCAGGCCCTAAAGGAGAC CGAGGAGAGGCAGGACCT CAGGGATTACCAGGCCCGAAAGGAGAC CAAGGGGAGGCAGGGCCG CAGGGATTACCCGGCCCTAAAGGAGAC CGAGGGGAAGCAGGACCG CAGGGATTACCAGGCCCTAAAGGAGAC CGAGGGGAAGCAGGACCT CAGGGATTACCAGGCCCTAAAGGAGAC AAAGGAGAAACGGGAGCAGTAGGTCCA CAAGGTATGCCAGGCCCTAAAGGAGAC CAAGGGGAAGCAGGACCT CAGGGATTACCAGGCCCTAAAGGAGAC AAAGGAGAAACGGGAGCAGTAGGTCCA CAAGGTATGCCAGGACCTAAAGGCGAA
>NZ_CP021286.1|WP_015961724.1|3082090_3082750_+|hypothetical-protein MPFCFSNQPNILNNKLILKILVLILFFSNSSLAKTINYPWTVSASLGYVNYQYVHEGDHITATGRFAIGRDLLMKGPFLFGLELGLQSGNQMRLQMTEEEVDALGGLLVQTTLKPMVDALATIRITSEFTAPLFLQLKAGTAYRQWQMDRDTINDISQLAGEIMAGCGYTITPNASITLSYQGLFGDKPNFTIDLESGIGHVQKIPVQHAILLGIVLMI >NZ_CP021286.1|WP_015961723.1|3079314_3081822_+|EAL-domain-containing-protein MSPLKSKIKTKSFNKLTKTQDITNTIERLFANSQDSIIVFNQQGKIIAINEKAAALFKKSPDKLIDKPIWKLFKLNSFAIKRQFIQAKRCFLLANEGIAQQFTWLESKAQKPVLAYHILFNKTEIEDTSIIFTKLTDILKSKTIEWILWSLTKISNHQEINEIIDQILQLTSDVFAADYTSVSFINNQQIARTISYYKFGKKEENISFSLINTPCAKVIQKKAICYFNDVQKQFPNDKLLKKMKINTYLAGPITNPQDEVIGIMTILCKREVEFDTLNKTWFGLFLSRINSEIERLINLRKLEFLASIPQQNPNPIIRILLNGDVVFTNDEGKIILNYWIKLFKGLPVELLKEAQRIQKSNQNTRIEMEIEDKIYLFTLVWIDEFKQINIYGTDITQLKNTQNAMLNLTRRDTLTQIANRQYFEEKLIEKIYEHHLKEKSLALLLIDLDNFKIVNDTLGHPTGDKLLMAVTNRMTRCLRANDFIARLGGDEFIVLLDQCNTDTAVKVAEKIINVLDKPFQFDDYHMTITASIGIAIYPETSEIARDLLKYADIAMYQSKKTGKNKCTVFSKNLHYKENQRNEILKKDIELAALKRELYIDYQPQIDLSDNTIVGIEALLRWSHPTLGLILPTEFIPIAEQTGCIHIISQWFIEQTLLDYSQFQQLNSNIKLSINVSLSQLNDMRFTKILCDSLLQNNLSKSKIILDISERMIAPHFIQISKKLKQIHHIGINISLDNFCCPQISLPELLSLPLDYLKVDQRLLIGIEGKIKLRKLLSGIINLTKDLNIKIIQKGIETAEQHEVIKSLGCQYAQGYFYCKPVALNDLLPLIKKTIH >NZ_CP021286.1|WP_015961722.1|3078419_3079142_-|L,D-transpeptidase MKKILLTTFMMSMVTVLNAGHFYGTALCAYPQYECIKVTGGQSWEKLFPDPVQRDIVQRVNRTYNYLWSGREIAVPKNLANINIFDVSPFPLKIQSENEKQIIVDQEKLAWGAYDAQGNLVWWGPISSGSDKCSDSNKVCRTLTGIFRVFSKENVRCTSDVFPIGRGGAKMPYCMYFHKGFALHGSDDIPGVRASHGCVRMFIQDAKWLNENFVELSSERNNFMGTKVIVRPLNDSENKK >NZ_CP021286.1|WP_015961721.1|3077856_3078423_-|hypothetical-protein MNLKSRSSITAIVVILLTSALNISVFAAKSNKAATAEDKAEKKDNGKFPLGCTAVGYQQNLKVLTLLPGKEGALQSMYFIYNTLPETVSLYQMHDKESLYSYWLNHSIRGNSWAVLATGEKEVKFICTLGDGKKSYGKILDCADVIKVCEYVNVKFGLNNKGNFWIVDSNTRNGAVSQVVHYGIIPGV >NZ_CP021286.1|WP_015961720.1|3074227_3077830_-|SEL1-like-repeat-protein MKSLVPWVCVLVASAGQQAFANDAFNAYRLGNYNEAAEPLIIKSGQDAVAEYYLGRLYLYGYGQLKNNRVAMRYFTKSAEKGYLPAVLLMAKYSLLHEKNPEEAARWFKQAAAVGDVSAQMFMAAAYLYGVGVKKNTDIARRYYIDAAKNGNPIAQYTLAEYFLESKHAGNKKLGIIWLNKAAENGDPKALTELGRFYVAGQMVAKDTSKGVELLNKAASEQYAPAMLELGKLALMQNQYDEAIQWLNKAAKQSTEATLELAHIYLQDKSPVYDPKTGFLLVLKAAQNGSVQAQKELANLYQKGIGVAADEELSKQWTLKAAENEKKNAEPPVLAQAALWLSNDRTDKLEETAYQMNGIFSPWNNPSALRNNSYNQAPKLETISRQDIFKPQFELTQPNNIPISNYYDALISKQVEFQSNQWAYPTYRLNPFVEALERANSPVVQKLNLPVPYADANYDDSEVGSFDLMDIWTGDWKRTVNYMSVVNYLYFRAILGNAQTQFEIGQLFQYGIGLMQDDASAIIFYENAAEQKHLGAEYNLGILYLKRGKDENDYQQALNWLTDSAFKGNKRAQYVLARILRQGIVGPDGKEYIKANDEQAMAMLYLSAANDYGPAEYELAEYLARDYNNGLSVDVRKQKIALIRKLYQGAVKNKVAEALLPLAFYNAMDDNRQKQEQAFKVAEEQAETGNENAALLLGMLYDRGIGITADPAKAMYWYQQAGQNPVSQFILGTYITEGKGVAQDKEKGLDLLKQSADSQFSYADFNLAVLKQQSGEDFLPNLIESYKLGNSHAGIVLADYYLSQSSVPEQMNQAKEIYQGLADKGDQYAQLKLAYMLQKGLGAAPDLAGAQHWYTASAEQGNPEAQYLLGQFYQLGETGEPDYNLAKHWYQKAAKHLSKADVALGFIYETVDDNYAQALKAYENAAAKGDMLGAYNLALMYEYGKGVPVNYSKALSLFKEASEKGAPEAMSQLAGMYFYGLGQPRNEQQALVWYKKAASLGNGNALYALGLLSETGVGVKLDFPDALRYYQDASDKGNEKAMLALARMYHYGLGVEKDHKRSASIYQKLAQKQNAYAQYQLGTYYIEGTAGERLPEKGRELLQQASENGSLQARRVLQRLDAQTQGKVSYVEPVLFNNVPKFDGQSADMIYFDALNEWNHGEEVLSRMILQRLVTQYPNFIPAKRAYEQLNQAKLMNNLG >NZ_CP021286.1|WP_015961719.1|3072438_3073821_-|Dot/Icm-T4SS-effector-MavV MKYAVTFCTTDQEVGSNPLWHSCLLLSKMDETSKLLEVVDNWGFYGLPTTNRNNSWLDQLKIKMGLDVDLIGNHGMLRHEELRFLDQGCGLRGVTFELTKDDFELLQKKCLQMATDQETAINEFVETQGIKGKPPEKTRIYPHEQFSRLIYATENIKAEQQGREARLKPFELRLSWGLFGPSLALSQNCKTQALSLLSYVLSKEQIERLTEYGEHPTVPRRSGPMESIFLHSTGPLREHRKSSGDVVHYRDLKDPGVKLYWTVPPQELEALSEETIKLLQIDGEYCEEVKAIVRKLQRLEWLLINSNLPEKYRPYKDELINKVVGCYKAFSFIEPKQEEPKLGGWYGWALSLFSAPRSAEERTLQGKIKKAKSLFNSIYMAIVDNYQIDDNAPMENENILPYEETGENRFENMVEAVASYLSRKDKINLCKIIGRTYCEDHVELEDNEGKIALSPQPLAT >NZ_CP021286.1|WP_013101905.1|3070875_3072087_-|lpg2637-family-Dot/Icm-T4SS-effector MFLTINDLQSQIQLAKKRLYVLAKNWLDTQKEAINSKDKANWLNAFQASTKEAMQEQLKATGFPLIRNAILVNQSEGELPQHSLEQSSSLIHSENFPEQFNSRTVPRVIYVCHSGENNQVIKRLGQLTTLMEQLHTLEELTFEVQTNVHFRGLNLAYRMARSINKEWRDVEKGRETVEYYAERLQIAEKQYKLASDFCHECLGIYKEQLDARIMYFNESLNFFVECLAAAFSSVKDDRYWLTKFLLPSLPWHSMLNEVATWLFTTNGFTNPTIDSIEVNRSHLKAITEQFAKLMMAPFCSLEKELQGKIEKVENEQKIARENVYAMSSELDIVIHMQSQRKLAALLFPAQPLSMLGFFQGVAAAMGRDYFYSTFIKGNQSQEPRITDDEKPLIEASNYSNGLH >NZ_CP021286.1|WP_010948336.1|3070548_3070815_+|30S-ribosomal-protein-S20 MANIKSAIKRARQNVKLRQHNASARSMYRTYIKNVLKAVESGDQEAARAAYTKAQPVIDKAANKGLIHKNKAARIKGRLVARLKAMAA >NZ_CP021286.1|WP_015961718.1|3068619_3070191_-|murein-biosynthesis-integral-membrane-protein-MurJ MLTTDIMVPKKQSLIRSTSLVSLMTFISRIVGFARDMVLANFFGAQAGMDAFFVAFRIPNFMRRLFAEGAFSQAFVPVLAEYQKTRSAEDVRTFIARISGYLSSILTLVTVVGIVASPVIIFLFAPGFHHDSVRAELATQMLRITFPYLMLISLTAMAGAILNTYGYFGVPAFTPVLLNISMILAAVYLCPNLPQPVVGLAWGVLIAGIVQLLFQLPFLYQRHLLIRPRVVRDDPGVNKVLKLMIPALFGVSIAQLNLMIDSIFASFLKVGSVSWLYYTDRLTDFPLGVFGVAIATVILPHLSRKHTEQNINQYSRALDWGLRSILLIGIPAGLGLSFFALPLIASCFAYGKFTAYDLLQTQKSLITLAMGVPAFMVVKVLASGFYARQDISTPVKVGAIAMVVNTLLCFVFVWHLAHAGLTLASALAGYVNCVILLFLLIKRRLFKPSPGWLKYSMQLLIANFTIGVYLYFMSGTATYWLGFSPLMRLSLLLAHVFVTVVIYLLVLGIIGLRPSHFRGQIKD >NZ_CP021286.1|WP_015961717.1|3067250_3068615_-|leucyl-aminopeptidase-family-protein MQAEVFYKSCGDRIVPVHLISQSQWDEGIENLTPMERNCFSVRQFKGKLGDYCFILNADGVIEKAFIGSGTGNQESALANAALLLPPGNYQFQDKLSRESGVVWGLAQYRFDEYKKYELQPRVLIVEANDMDYILSLANSLFLVRDLINTPTCDMGPESLAHVVEELAKTHKAYFKQWIGEELIKDNFPAIHAVGRASALAPRLLSLHWGNEKHPRVTLIGKGVCFDSGGLDIKPSSGMRLMKKDMGGAAHVIGLAQWIMVQRLPIRLQVLIPAVENAIGPNAFRPGDVLTMRNGLTVEIENTDAEGRLILADALVKACEEKPDLIIDFATLTGAARVAVGTEIAAMFSNHDELAQDIVSASNKVSDPVWRLPLFSPYEELLNSNIADMSNSSSSSYAGAITAGLFLQRFVAKSIPWVHFDIMAWNTVSKPGKPEGGEAMGLRAVAEYLLQTYG >NZ_CP021286.1|WP_015961726.1|3084089_3085946_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrC MNDLQLSAELALFLTKLPSEPGIYRMLDEEGTVLYVGKAANLKKRVNSYFSKQNTGVKTRALVSQIKSIEISVTRSETEALLLESNLIKALRPKYNVLLRDDKSYPYIHLSNHPDFPRIELYRSKKKPPSGNFFGPYPGVAAVRETIVTIQKIFKIRNCRDSYFKARSRPCLQYQIKRCTAPCVHYISPENYKLSVEDAIRFLQGKCQIILDALAERMKQAVNQLNFEEAAVLRDQIKNLRLIQEQQGVVQLRGDADVIAIEVRPGFACIQCVTIREGQVLNSQSFFPTVPYAVLDEELDANSLWQQTFEAFIGFYYLDTTERIPDLIITNQSITESRSLEYILSQRRGKSCKIQVNPRGVKSRWMDFAVNNLRISVAEYVSKHSTIRSRYQALKQLLALDKNIERMECFDISHTQGEATVASCVVFDTEGPRPSEYRRFNIEGITPGDDYAAMEQAVTRRFKRLIDAQLLPDVLIIDGGKGQVSIVKRVLTSLGVEDITLLGVSKGPSRKAGWEKLILVNENREFVLPEDSKALHLLQHIRDEAHRFAITAHRKKRQKTRVESTLESIEGVGAKRRQALLQRFGGLRELAKAPLEEICKVQGISEQLAKRIHEHFHP >NZ_CP021286.1|WP_015961727.1|3086742_3087561_-|phenylalanine-4-monooxygenase MEFSSRYVAHVPDAQGLVDYSAQENRIWNILFERQLKLLPGRACDEFLSGLQTLGLNSSTIPQLPEVSERLKAKTGWQVAPVAALISAREFFELLAEKYFPAATFIRSEEELDYVQEPDIFHELFGHCPMLTDRVYAEFVHDYACKVLTFPEQDWPLLQRMFWFTVEFGLIKTPKGLRAYGGGILSSISETVYCVESDIPVRILFDPVVAFRMPYRIDQLQPVYFVIDSYQNLYDFVLSDMGKFMDRARELGEFPPYFDVDPENPNIHIRAC >NZ_CP021286.1|WP_015961728.1|3088000_3089098_+|competence/damage-inducible-protein-A MTIAILSTGDEIIHGDTLNTNAHYIAHALCSEGLPLGLQVACSDKENEIIDSLNFLTEHHDILILIGGLGPTKDDITRFALAKFTKEPLIQHADALAHIEKKANIAKISLNQGNLQQCLFPANARLFPNPYGTAMGCSYSWKGKVFILLPGPPRECLPMFNQDVLPLLLQTSRHSNKQILRWRVFGLAESEIAQILEEALEGLDCQTGYRLETPYLEFKVRCKRELIEKITSIIDPILAPHIISSLETKASDQLRSLILKNNEPITIIDEITGGLLQSLLVRPENYHLLNFHNLNRTKLYFHCSGLEDYWSQQAPQGTTKLIINYSNQMQEGRETHQIPYRSAMVVHYAAEWLSFRLFHLINQLH >NZ_CP021286.1|WP_015961729.1|3089056_3090082_-|GTPase-ObgE MKFVDEALIKVEAGKGGNGCLSFRREKFIPRGGPDGGDGGDGGSIYFEASSDLNTLIDFRYTRQYKAENGQSGMGGNCTGKKGEDLTIKVPVGTMVYDADTGELLADISQPGVPVLIAQGGFHGLGNTRYKSSVNRSPRQTTPGSPGESRNLRLELRVLADVGLLGLPNAGKSTLIRAVSSSKAKVADYPFTTLHPGLGVVRVSPYKSFVMADIPGLIEGAAQGAGLGHRFLKHLSRTCVLLHVIDIAPLDGSDPVADAKAILNELTQYNPDLLNKPRWLVLNKIDMLPDEKEREEKIQSIIKGLKWKDKVFSISAIESKGTQELCYALMQLIDEMKESEA >NZ_CP021286.1|WP_010948350.1|3090295_3090574_-|50S-ribosomal-protein-L27 MAHKKAGGSTRNGRDSNPKYLGVKRFGGQFVNAGEIIVRQRGTRFHPGPGVGCGRDHTLYALVEGLVQFTTKGEKNRKYVTILPEQREEAAS >NZ_CP021286.1|WP_010948351.1|3090586_3090898_-|50S-ribosomal-protein-L21 MYAVIKTGGKQYTVKEGDVLKIEMLPENVGNEIKFSEVLMLVDGDKVTCGTPFVAKATVKAEVLDHGRHKKVKIIKFRRRKHHMKQMGHRQYYSQVKITAIGK >NZ_CP021286.1|WP_010948352.1|3091140_3091800_+|50S-ribosomal-protein-L25/general-stress-protein-Ctc MSTIQLEAQSRTDMGKGASRRLRRLENKVPAVIYGGSKKPMAIHFSHNKVIKALETESIYSSVFDITVDGKVEHVILKALQRHPYKPIVLHMDLQRVSSKDILVKLVPVHFINEEQSPGIKAGGIVQHTMTQVEIRCQAKDLPEFIEVDMSKVGMDDVVHLSDLKLPKGVQLTVDVADGSHDAPVVSIHAAKVSSTELEETPEVPASAVPTTDQGESAE >NZ_CP021286.1|WP_015961730.1|3091916_3092486_+|aminoacyl-tRNA-hydrolase MAIKLIVGLRNPGSAYEQTRHNAGAWLVTALAQRHNSHFKIDKKMQAELTEIDINNHPCRLALPLTFMNHSGQTTRIISQFYKIEPGEILIVHDELDLPVGRIKLKTGGGHGGHNGLRDITAQLGTGEFHRLRIGIGHPGHKDLVHQYVLSRPSMHDRQQIYDAIDRGIAIIPIVLSGDMARAMNQVNA >NZ_CP021286.1|WP_015961731.1|3092504_3093596_+|redox-regulated-ATPase-YchF MGFKCGIVGLPNVGKSTLFNALTKAGIEAANYPFCTIEPNVGIVTVPDSRLDNLSNIVKPQQVVHATMQFVDIAGLVKGASSGEGLGNQFLANIRETDAIAHVVRCFDNSDVVHVEGRVDPLSDIEVINTELALADMETLEKSLLKVGKNSKSGNKEAIFELKTLEKIKAHLDAGYPVRTLELTPEEEQVSKRLFLLTAKPVLYIANVDDNGYENNPLLDKVQALASQENASIVALCAATEAELVELDEEDRQEFMVDLGLSEPGLNKVIRAGYELLGLQTYFTAGVKEVRAWTIRKGATAPQAAGVIHTDFEKGFIRAEVISYDDFIRFGGEQGAKEAGKLRLEGKEYIVCDGDVMHFRFNV >NZ_CP021286.1|WP_015961732.1|3093957_3095073_+|GGDEF-domain-containing-protein MSLLKKTREQDYSILVTTQDQQRKRHLLNVISIELLILGLLLIITNLCLLRAWLIISMLIVGIFILLGNLILIKKNFNLALSGHILNILVLSIIIGGNLIVGKTTMSYLGWFYVSPIVAFATLGLAGLVIYGLLAIGAMFLFVFEFYIPIYSISQEYVFFLDNTNHLFIFALIFTVLYHFLVQNSQYELLLKEQNYLLIADKEKFHYLSHHDSLTNLPNRSYFHAHLQTLLENTDTTKEAITLYFMDLDKFKPINDEYGHEFGDQLLLLTSKRLQSCFRKNDFIARLGGDEFTAIIVHKPHDQIAEALTLRIEQEFEQPFVINGQTIHCTISVGIANYPRNAKNAEDLLKWADKAMYYNKRKKYQTLKQTS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP021286_1 | 1.17|191003|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 191003-191036 | 34 | NZ_CP021285 | Legionella pneumophila subsp. pneumophila strain Allentown 1 (D-7475) plasmid unnamed2, complete sequence | 33767-33800 | 3 | 0.912 |
NZ_CP021286_1 | 1.17|191003|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 191003-191036 | 34 | NC_006366 | Legionella pneumophila str. Lens plasmid pLPL, complete sequence | 43841-43874 | 3 | 0.912 |
NZ_CP021286_3 | 3.8|3083425|27|NZ_CP021286|CRT | 3083425-3083451 | 27 | NZ_CP053936 | Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_794 plasmid unnamed4, complete sequence | 11652-11678 | 4 | 0.852 |
NZ_CP021286_3 | 3.8|3083425|27|NZ_CP021286|CRT | 3083425-3083451 | 27 | NZ_CP053933 | Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_794 plasmid unnamed2, complete sequence | 41502-41528 | 4 | 0.852 |
NZ_CP021286_3 | 3.8|3083425|27|NZ_CP021286|CRT | 3083425-3083451 | 27 | NZ_CP009718 | Bacillus thuringiensis strain HD682 plasmid pBGN_2, complete sequence | 15494-15520 | 4 | 0.852 |
NZ_CP021286_3 | 3.10|3083524|27|NZ_CP021286|CRT | 3083524-3083550 | 27 | NZ_CP053936 | Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_794 plasmid unnamed4, complete sequence | 11652-11678 | 4 | 0.852 |
NZ_CP021286_3 | 3.10|3083524|27|NZ_CP021286|CRT | 3083524-3083550 | 27 | NZ_CP053933 | Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_794 plasmid unnamed2, complete sequence | 41502-41528 | 4 | 0.852 |
NZ_CP021286_3 | 3.10|3083524|27|NZ_CP021286|CRT | 3083524-3083550 | 27 | NZ_CP009718 | Bacillus thuringiensis strain HD682 plasmid pBGN_2, complete sequence | 15494-15520 | 4 | 0.852 |
NZ_CP021286_1 | 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 189935-189968 | 34 | MN693625 | Marine virus AFVG_250M334, complete genome | 30638-30671 | 7 | 0.794 |
NZ_CP021286_1 | 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 189935-189968 | 34 | NZ_CP020506 | Serratia marcescens strain 95 plasmid unnamed1, complete sequence | 6512-6545 | 7 | 0.794 |
NZ_CP021286_1 | 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 189935-189968 | 34 | NZ_CP022274 | Citrobacter freundii strain 18-1 plasmid pA18-1, complete sequence | 85367-85400 | 7 | 0.794 |
NZ_CP021286_1 | 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 189935-189968 | 34 | NZ_CP026551 | Citrobacter sp. SL156 plasmid unnamed2 | 80071-80104 | 7 | 0.794 |
NZ_CP021286_1 | 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 189935-189968 | 34 | NZ_CP022697 | Citrobacter farmeri strain AUSMDU00008141 plasmid pAUSMDU8141-2, complete sequence | 56497-56530 | 7 | 0.794 |
NZ_CP021286_1 | 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 189935-189968 | 34 | NC_019013 | Escherichia coli strain G3/10 plasmid pSYM1, complete sequence | 9531-9564 | 7 | 0.794 |
NZ_CP021286_1 | 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 189935-189968 | 34 | CP052139 | Klebsiella pneumoniae strain F17KP0040 plasmid pF17KP0040-1, complete sequence | 96043-96076 | 7 | 0.794 |
NZ_CP021286_1 | 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 189935-189968 | 34 | MN699848 | Citrobacter pasteurii strain 175G8 plasmid pCfr-OXA-198, complete sequence | 136300-136333 | 7 | 0.794 |
NZ_CP021286_1 | 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 189935-189968 | 34 | NZ_KY416992 | Escherichia coli strain FAM21805 plasmid unnamed, complete sequence | 46142-46175 | 7 | 0.794 |
NZ_CP021286_1 | 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 189935-189968 | 34 | NZ_CP020508 | Serratia marcescens strain BWH-35 plasmid unnamed, complete sequence | 187130-187163 | 7 | 0.794 |
NZ_CP021286_1 | 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 189935-189968 | 34 | NZ_CP017222 | Escherichia coli strain FAM21845 plasmid pFAM21845_2, complete sequence | 38341-38374 | 7 | 0.794 |
NZ_CP021286_1 | 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 189935-189968 | 34 | NC_019254 | Shigella sp. MO17 plasmid pMO17_54, complete sequence | 16864-16897 | 7 | 0.794 |
NZ_CP021286_1 | 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 189935-189968 | 34 | NZ_CP049048 | Enterobacter hormaechei strain Y233 plasmid p233-142, complete sequence | 109547-109580 | 7 | 0.794 |
NZ_CP021286_1 | 1.13|190721|33|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 190721-190753 | 33 | NC_011245 | Borrelia duttonii Ly plasmid pl28, complete sequence | 27872-27904 | 8 | 0.758 |
NZ_CP021286_1 | 1.13|190721|33|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 190721-190753 | 33 | NC_011265 | Borrelia duttonii Ly plasmid pl27, complete sequence | 21445-21477 | 8 | 0.758 |
NZ_CP021286_1 | 1.15|190862|31|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 190862-190892 | 31 | NZ_AP014824 | Geminocystis sp. NIES-3709 plasmid pGM3709_03, complete sequence | 8512-8542 | 9 | 0.71 |
NZ_CP021286_1 | 1.13|190721|33|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 190721-190753 | 33 | NZ_CP041195 | Weissella cibaria strain CBA3612 plasmid pCBA3612-02, complete sequence | 6048-6080 | 10 | 0.697 |
NZ_CP021286_1 | 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 191580-191613 | 34 | NZ_CP040051 | Acinetobacter baumannii strain VB16141 plasmid unnamed1, complete sequence | 65151-65184 | 10 | 0.706 |
NZ_CP021286_1 | 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 191580-191613 | 34 | NZ_CP012007 | Acinetobacter baumannii strain Ab04-mff plasmid pAB04-1, complete sequence | 55277-55310 | 10 | 0.706 |
NZ_CP021286_1 | 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 191580-191613 | 34 | CP040054 | Acinetobacter baumannii strain VB35179 plasmid unnamed1, complete sequence | 51450-51483 | 10 | 0.706 |
NZ_CP021286_1 | 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 191580-191613 | 34 | NZ_CP012005 | Acinetobacter baumannii strain ATCC 17978-mff plasmid pAB3, complete sequence | 53921-53954 | 10 | 0.706 |
NZ_CP021286_1 | 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 191580-191613 | 34 | MF399199 | Acinetobacter baumannii strain D46 plasmid pD46-4, complete sequence | 177496-177529 | 10 | 0.706 |
NZ_CP021286_1 | 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 191580-191613 | 34 | NZ_AP014650 | Acinetobacter baumannii strain IOMTU433 plasmid pIOMTU433, complete sequence | 93937-93970 | 10 | 0.706 |
NZ_CP021286_1 | 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 191580-191613 | 34 | NZ_CP050433 | Acinetobacter baumannii strain PM194229 plasmid pPM194229_1, complete sequence | 119339-119372 | 10 | 0.706 |
NZ_CP021286_1 | 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 191580-191613 | 34 | LT605060 | Acinetobacter calcoaceticus strain NCTC7364 genome assembly, plasmid: 2 | 43536-43569 | 10 | 0.706 |
NZ_CP021286_1 | 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 191580-191613 | 34 | NZ_KU744946 | Acinetobacter baumannii strain A297 (RUH875) plasmid pA297-3 clone Global clone 1 (GC1), complete sequence | 171009-171042 | 10 | 0.706 |
NZ_CP021286_1 | 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 191580-191613 | 34 | NZ_KT779035 | Acinetobacter baumannii strain D4 plasmid pD4, complete sequence | 103008-103041 | 10 | 0.706 |
NZ_CP021286_1 | 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 191580-191613 | 34 | NZ_MK323043 | Acinetobacter baumannii strain Acb-45063 plasmid pAb45063_b, complete sequence | 4445-4478 | 10 | 0.706 |
NZ_CP021286_1 | 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 191580-191613 | 34 | CP033562 | Acinetobacter nosocomialis strain 2010S01-197 plasmid p2010S01-197-1, complete sequence | 61395-61428 | 10 | 0.706 |
NZ_CP021286_1 | 1.10|190507|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 190507-190540 | 34 | NC_019509 | Cronobacter phage ESP2949-1, complete genome | 8672-8705 | 12 | 0.647 |
NZ_CP021286_1 | 1.10|190507|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT | 190507-190540 | 34 | MH845412 | Cronobacter phage CS01, complete genome | 13237-13270 | 12 | 0.647 |
1. spacer 1.17|191003|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021285 (Legionella pneumophila subsp. pneumophila strain Allentown 1 (D-7475) plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
gaatttgtcggccgcatagaccgcttttatcaaa CRISPR spacer gaatttgtcggccgcatagaccgcttttatcgtt Protospacer *******************************.
2. spacer 1.17|191003|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_006366 (Legionella pneumophila str. Lens plasmid pLPL, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
gaatttgtcggccgcatagaccgcttttatcaaa CRISPR spacer gaatttgtcggccgcatagaccgcttttatcgtt Protospacer *******************************.
3. spacer 3.8|3083425|27|NZ_CP021286|CRT matches to NZ_CP053936 (Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_794 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
aaaggagaaacgggagcagtaggtcca CRISPR spacer acgggagaaacgggagcaacaggtcca Protospacer * .***************..*******
4. spacer 3.8|3083425|27|NZ_CP021286|CRT matches to NZ_CP053933 (Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_794 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
aaaggagaaacgggagcagtaggtcca CRISPR spacer acgggagaaacgggagcaacaggtcca Protospacer * .***************..*******
5. spacer 3.8|3083425|27|NZ_CP021286|CRT matches to NZ_CP009718 (Bacillus thuringiensis strain HD682 plasmid pBGN_2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
aaaggagaaacgggagcagtaggtcca CRISPR spacer acgggagaaacgggagcaacaggtcca Protospacer * .***************..*******
6. spacer 3.10|3083524|27|NZ_CP021286|CRT matches to NZ_CP053936 (Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_794 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
aaaggagaaacgggagcagtaggtcca CRISPR spacer acgggagaaacgggagcaacaggtcca Protospacer * .***************..*******
7. spacer 3.10|3083524|27|NZ_CP021286|CRT matches to NZ_CP053933 (Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_794 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
aaaggagaaacgggagcagtaggtcca CRISPR spacer acgggagaaacgggagcaacaggtcca Protospacer * .***************..*******
8. spacer 3.10|3083524|27|NZ_CP021286|CRT matches to NZ_CP009718 (Bacillus thuringiensis strain HD682 plasmid pBGN_2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
aaaggagaaacgggagcagtaggtcca CRISPR spacer acgggagaaacgggagcaacaggtcca Protospacer * .***************..*******
9. spacer 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693625 (Marine virus AFVG_250M334, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcctgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer tcactactcctgaaggttttaattggatatatga Protospacer ****************** ***** ***.*
10. spacer 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020506 (Serratia marcescens strain 95 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
11. spacer 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022274 (Citrobacter freundii strain 18-1 plasmid pA18-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
12. spacer 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026551 (Citrobacter sp. SL156 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
13. spacer 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022697 (Citrobacter farmeri strain AUSMDU00008141 plasmid pAUSMDU8141-2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
14. spacer 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019013 (Escherichia coli strain G3/10 plasmid pSYM1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
15. spacer 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP052139 (Klebsiella pneumoniae strain F17KP0040 plasmid pF17KP0040-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
16. spacer 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN699848 (Citrobacter pasteurii strain 175G8 plasmid pCfr-OXA-198, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
17. spacer 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KY416992 (Escherichia coli strain FAM21805 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
18. spacer 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020508 (Serratia marcescens strain BWH-35 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
19. spacer 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017222 (Escherichia coli strain FAM21845 plasmid pFAM21845_2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
20. spacer 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019254 (Shigella sp. MO17 plasmid pMO17_54, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
21. spacer 1.2|189935|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP049048 (Enterobacter hormaechei strain Y233 plasmid p233-142, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
22. spacer 1.13|190721|33|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011245 (Borrelia duttonii Ly plasmid pl28, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
attaataatattttagaagattggcacataata CRISPR spacer gaaaataatattttagaaggttggtacatgcaa Protospacer . ****************.****.****. *
23. spacer 1.13|190721|33|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011265 (Borrelia duttonii Ly plasmid pl27, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
attaataatattttagaagattggcacataata CRISPR spacer gaaaataatattttagaaggttggtacatgcaa Protospacer . ****************.****.****. *
24. spacer 1.15|190862|31|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP014824 (Geminocystis sp. NIES-3709 plasmid pGM3709_03, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
attttaccttttaacacatattgataggcgt CRISPR spacer attttaccctttaacacatcttggaaacgag Protospacer ********.********** ***. *. .
25. spacer 1.13|190721|33|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP041195 (Weissella cibaria strain CBA3612 plasmid pCBA3612-02, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
attaataatattttagaagattggcacataata CRISPR spacer gcatataatattttaaatgattggcacactagg Protospacer .. ***********.* **********. * .
26. spacer 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040051 (Acinetobacter baumannii strain VB16141 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttcttttttcagatttcatttccttttccttgtg CRISPR spacer cctgatcttcagattcgatttccttttccttttc Protospacer ... *.********. ************** *
27. spacer 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP012007 (Acinetobacter baumannii strain Ab04-mff plasmid pAB04-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttcttttttcagatttcatttccttttccttgtg CRISPR spacer cctgatcttcagattcgatttccttttccttttc Protospacer ... *.********. ************** *
28. spacer 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP040054 (Acinetobacter baumannii strain VB35179 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttcttttttcagatttcatttccttttccttgtg CRISPR spacer cctgatcttcagattcgatttccttttccttttc Protospacer ... *.********. ************** *
29. spacer 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP012005 (Acinetobacter baumannii strain ATCC 17978-mff plasmid pAB3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttcttttttcagatttcatttccttttccttgtg CRISPR spacer cctgatcttcagattcgatttccttttccttttc Protospacer ... *.********. ************** *
30. spacer 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to MF399199 (Acinetobacter baumannii strain D46 plasmid pD46-4, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttcttttttcagatttcatttccttttccttgtg CRISPR spacer cctgatcttcagattcgatttccttttccttttc Protospacer ... *.********. ************** *
31. spacer 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP014650 (Acinetobacter baumannii strain IOMTU433 plasmid pIOMTU433, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttcttttttcagatttcatttccttttccttgtg CRISPR spacer cctgatcttcagattcgatttccttttccttttc Protospacer ... *.********. ************** *
32. spacer 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP050433 (Acinetobacter baumannii strain PM194229 plasmid pPM194229_1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
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33. spacer 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to LT605060 (Acinetobacter calcoaceticus strain NCTC7364 genome assembly, plasmid: 2) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
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34. spacer 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KU744946 (Acinetobacter baumannii strain A297 (RUH875) plasmid pA297-3 clone Global clone 1 (GC1), complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
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35. spacer 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KT779035 (Acinetobacter baumannii strain D4 plasmid pD4, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
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36. spacer 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MK323043 (Acinetobacter baumannii strain Acb-45063 plasmid pAb45063_b, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
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37. spacer 1.25|191580|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP033562 (Acinetobacter nosocomialis strain 2010S01-197 plasmid p2010S01-197-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
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38. spacer 1.10|190507|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019509 (Cronobacter phage ESP2949-1, complete genome) position: , mismatch: 12, identity: 0.647
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39. spacer 1.10|190507|34|NZ_CP021286|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH845412 (Cronobacter phage CS01, complete genome) position: , mismatch: 12, identity: 0.647
ctaacctgattgctcaacaaataatgctattggc CRISPR spacer tacggttgattgcttaacaaaaaatgctatgatg Protospacer . . .********.****** ******** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
217217 : 270139
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP021286|217217:270139|DBSCAN-SWA 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43 | Pseudomonas_phage(66.67%) | integrase,transposase,protease | attL 226942:226958|attR 234627:234643 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1003512 : 1010352
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP021286|1003512:1010352|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP021286|1003512:1010352|1005293_1005872_-|WP_010946571.1|DBSCAN-SWA MLLIIDNYDSFTYNLVQYFQSLNQKVEVFKNDEIQIDTIRQSAPQYLVISPGPNSPDESGISIEVIKEFHKHIPILGICLGHQCIAQAFGGKIIPAPEIMHGKTSEITHHYQGLFTGIPNHFQATRYHSLAVDIMSLPNCFSIDAWADDTIMAISHRQFPLFGLQFHPEAILSQFGLQILENFLRYETQTSI >NZ_CP021286|1003512:1010352|1005905_1006631_-|WP_010946572.1|DBSCAN-SWA MSLLEAKQLKKSFKGRTVVNGVSIHIKQGECVGLLGPNGAGKTTCFYMIVGLQSCDEGHIILNGTDITQDAMHLRARHGISYLPQEASVFRKLTVAENIMAILELRKDLDDQKREEKLDLLLQEFHISHIENSLGMALSGGERRRVEIARALAIEPSFILLDEPFAGVDPISVIDIKKIILHLCDKGIGVLITDHNVRETLDICERAYIVSQGKILCEGTPKAILANQQVRQVYLGEEFAL >NZ_CP021286|1003512:1010352|1003512_1004289_-|WP_010946569.1|DBSCAN-SWA MNSILERIAKHKLEEVAVAKKNKPLHVLSKQQPGEMRDFITALKSNTSPAVIAEIKKASPSKGLIRKDFNVAEIAKIYTQNGARCLSVLTDIEFFQGHPDYLALAKSKTTLPVLRKDFIIDSYQIYESLVLGADCILLIVALLDDVQLMDFCQLAQELKMSVLVESHTQDELERALRLPTPLIGINNRSLHNFKTDIQLSIQLKQFVPKDKIIITESGINTREDIKLMQSHGINAFLIGESLMRADNIGKALQKLMTD >NZ_CP021286|1003512:1010352|1009554_1010352_+|WP_010946577.1|DBSCAN-SWA MPDNWVEIKNLFFSLDDRCIFDGIDMVVKQGKITAIMGPSGSGKTTLLRLIGAQLRPDSGQIYVNGQNIHQLSRKSLYETRRNMGLLFQSSALFTHLSVFENVAFPLREHTELNASMIRNIVLMKLEAVGLRGAAHLMPAQLSGGMCRRVALARTIALDPVLMMYDEPFTGQDPISMGVLVRLIQRLNQLLHTTTIIVSHDVEETCSIADYIYLISGGKIIGQGTPDELKRSIEPQIRQFMHGEADGVVPFHYPAKPYTEELLNA >NZ_CP021286|1003512:1010352|1007683_1008211_-|WP_011213328.1|DBSCAN-SWA MNELLEKAKKIKCLICDVDGVLSDGLLHIDNHGNELKSFHVQDGMGLKLLMAAGIQVAIITTAQNAVVDHRMEQLGITHYYKGQVDKRSAYQHLKKTLGLNDDEFAYIGDDLPDLPLIQQVGLGVAVSNAVPQVLEFADWRTERTGGRGAVRELCDLILNAQNKAELAITGYLKQ >NZ_CP021286|1003512:1010352|1004281_1005316_-|WP_010946570.1|DBSCAN-SWA MKPKLLFEQLLSRQDLSSDQMQEVIHACMTGEFSDVQIATFLALMRMKGETVNELTAAAQVMRQLAHKIDLGNPLIDIVGTGGDGRNTFNVSTACSFVVAAAGIKVAKHGNRSVSSRSGSADLLEQAGFILNLSDSQVQNCINQCQLAFLFAPHYHPAMQHARAARQQLGIRTLFNLLGPLINPAQVKRQVVGVFSTNWLKTIATVLANLGSERSLVISSQDGLDEISIAAKSEVVEYRDGNFKQWFISPEDYGLKHSSLDAIIVDSPEQSLHLIQSVLSGDSGPARDIVLLNSAAAIYCAKDGISFDAAIEEARIAIDSGKANLCFNKLRLLTQTLNKESNHE >NZ_CP021286|1003512:1010352|1008224_1009187_-|WP_010946576.1|DBSCAN-SWA MNFCTLGLAVIETEAQAVFELTQRIDEHFEKACELLLSCKGRIVVTGMGKSGHIANKLASTFSSTGSPAFFMHPGEASHGDLGMITRQDIVVAISNSGNTHEIVTLLPLLKRLEVPLITLTGNKQSTLAKSADVNLDVSIKQEACPLGLAPTTSTTVSLVMGDALAISLLQARGFSAEDFALSHPGGALGKKLLLKIDDLCHTGEQLPLANENATVSDALIEVTNKKLGMTCVVDNHGYLVGVYTDGDIRRTLTRQFNINTTLIKDVMTKNCRTISKGMLAAEALAIMQKYSITSLVVVENDNRPYAVLHLHDLLKAGVF >NZ_CP021286|1003512:1010352|1007117_1007687_-|WP_010946574.1|DBSCAN-SWA MNITKQAIWLFLTLLILAGSGWYYAHFNQAIINKKSLSNEVDTTISQLTVKQFNSEGVLINLLTTPQVEYIPNNNLHLLKNPHIIIKQDNQPAWEINSLRAKSFDGGKQITFIEQVVVHQNPGESTRESTLKTEEITYYPKEKKATTSLFVTFEQPGNIIQSTGMNAYLDEKRVELLHKARGSYDPAKG >NZ_CP021286|1003512:1010352|1006627_1007137_-|WP_010946573.1|DBSCAN-SWA MTQLKVKYIILLLLMLCSISGNALPFDKEKMVQVVSDSADLNQKNHQGVYIGNVEFVQGSTNLRAEKAITQGDAKNQLTLAVAEGSKDKQAHYWTTTAPDKPPFHAYADTIKYYPLKHLIELIGNARIEQGPNSLSAAKISYDTQEQHVLSHSDEKTRTTIIIYPEKKS |
9 | Acinetobacter_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1268434 : 1274371
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP021286|1268434:1274371|DBSCAN-SWA TATGCACGAACAGTTTCTGCTTGCAGCACTTGAACAAGCCAAACTGGGGAGAGGCTTTTGTGCCCCCAATCCCAGCGTTGGGGCGGTTGCTGTGCAAAATGGTAATATTATAGCACAGGCATGGCATAGAGGTGCAGGTACACCGCATGCAGAACAATTATTGTTATCACAAATTCTACCCCAAACGCCAGGGGTTACGCTTTATGTCACGCTGGAGCCTTGTAATCATTGGGGCAAAACTCCCCCTTGTGTTGATGCTATTATCAATCATGGTATAGAGGAGGTTGTTTTTTCCTATTTTGACCCAAACCCCATTGTTGCCAAAAGTAACTCATCAGAAAAATTACGTGAACATGGAATACAAGTCAGGCATATTCCTATAAAGGCAATTGATGTGTTCTATAAAAGCTATGCTTATTGGACTATGACCCATAAACCAAGAGTCACTGTTAAAATGGCACAAACTTTTGATGGTAAAATTGGAAAGTCTGAGGGAGCTCGAGTGGTTTTGTCCAATGCTTTATGCGAACAGTTCACTCATCAAATGCGTGCTGCCAGTGATGTCATATTAACCAGTGCCAAGACAGTTCAAATGGATAATCCAAGAATGAACGCAAGATTAGATAGTGGATTGGTAGCAAAGCCAGTTGCCATTGTTGACCGCAATTTAAGTTTGTCTGATGACACAATCATTTTTTCGACAGCAAAACATTGCCACATTTATCATCAACCACAAGCAAATCAGGCAAAGACTTATCCTAATAGCACTCATTATGCGATGCCTTTGCAAAATGGGTTGATGAACTTGGAGGCAATAATAACTCATCTTGGTCAACTGGGATACCATGATGTATGGGTTGAAGCGGGCGGAGCTATTTTTTCTGCGTTACATAGTAAGGGATTGGTGCATAGAACCTATTTGTATTTAGTTCCCGGCAGTTTAGGGCATCAAGCGATTTCAGCTTATCAACAACAGGGGATTTTTGAAAAAGCTCATACGGTGAGTTGGCAAGCTATGGGTGACAATATGATAGCATGTTTGGATTGGCAGGAGGATGAGTGTTTACCGGATTGATAGAAAATACAGGCAAAGTATTAATGAATAGACAAGGAGAAAATTCTAGTCGTTTAGTCGTTTCTTCAAGCTATCAGGATTTGAAACCTGGTGAGAGTATCGCTGTAAATGGGGTTTGTTTAACCCTTTTGCCAGCAGATTTTCCTGAACTGTGTTTTGATATTTCACCTGAAACTCTGCATGTTACCACATTGTCAAAATTATCATCTGGCGACATGGTTAATCTTGAAAGAGCTATGCTGGCATCAACCCGCTTTGGTGGTCATTATGTATCGGGCCATGTAGACACCAGGGCCAAAGTGAAATCCATTTGTGCTGTTAATGAATTTATCGCGATGGATTTGGATGGTTTTATCCCAGAACACAATCATTATTTAATACCCAAAGGTAGCATTACAGTAGATGGAGTTAGCTTGACTATTAATACTGTATCAGAACAAACCATCGGACTCATGCTGGTGCCACATACATTATCAATGACTAATCTCGGTTCATTGAGAGTGGGCCAGCAAGTCAATATTGAATTTGATTATCTTACCCGGATTGTGGCTCATCAGCTTCAAATTATCGGGAAATTGAACCAAGAGGAAGTGTCATGAAACATTCATTAGCAACAATAGAAGAGGCTGTGGCGACACTTAAAGCCGGTAAAATGATTATTCTAATGGATGATGAAGATAGAGAGAATGAAGGTGATTTGGTGATTGCTGCTGAGCACGCTACTCCCGAAGCTATTAATTTTATGTCGCGTCTTGGTTGTGGTTTAATTTGTTTGCCTATGGCTGAAGAATTGATAGATAAGCTTGAGTTGCCCATGATGGCTCGGCATAACAAATCGCCGTATGGAACGGCGTTTACGGTTTCAATTGAAGCAGCTAATGGTGTCTCCACAGGCATCTCAGCAAGAGACAGAGCTCGAACAATTCAAGTGGCTATTGATCCAAAAAGCGGGCCATCTGATATCATTTCACCTGGACATGTTTTTCCTTTACGGGCTAGAAAGAGAGGAGTTTTAGAAAGACCAGGTCAAACAGAAGGCAGTGTTGATTTGGTAAAACTTGCCGGATTGACCCCGGCCGCAGTGATTTGTGAAATCATTAATGAAGATGGAACAATGAGCAGACGTGATGAATTAGCTCTTTTTTCAAAAAAACATCAAATCCCTTTAGTCACCATTAAAGATTTAATTCAGTACAGAGTACGGCATGAAAATCTGATTCATCCCGTTGCAACCACACAAATTCCTCTGGAGGAGAACGGTGTTTTTACTATGACTGTTTTTGAGAATCAGATAGATTCCTGTGAACATTTTGTCTTGGTTAAACCCCCTTTGTATGGTAATCAAGTGCCTTTGGTTCGAATTCATTCTGAGTGCATAACAGGTGATGTTTTTGGCTCCAGAAAATGTGATTGTGGAAAGCAACTGGAGTTGTCTTTATCCCAGATCGGAGCTGAAGGCGGTATATTAATTTATTTGCGTCAGGAAGGCCGCGGAATAGGTTTGGCAAACAAATTAAAGGCGTATGCTTTGCAAGAGCAGGGGTTTGATACAGTCGATGCTAATCTGGAATTAGGATTGCCCGCTGACGATAGAGATTATGCCGTAGCATACCAAATACTGAAATATTTAGGGGTTGAAGCATTAAGGTTGCTGACAAATAATCCTTTAAAAATCGCTTCTCTTGAGCGTTATGGAATGAAGATTACTCAACGCATTCCTTTGGAAATTGAGCCCTCCAGAGAAAATCACAGTTATTTAAAAACCAAAAAAATAAAACTGGGGCATTTATTAGCCATTGATTAGGATAAACATGAGAGAGATAAAAACAATTGTTAGTGATGGTGTCACGTTTCCAATAGCGCTAGTTGTAAGTACTTTTAATGAACTGATAACCTCTGCATTAAAAAAAGGGGCGTTAGATAGATTGACTGAACTGGGTTTTAAATCGGAGGACATTACCTTAGTTGAGGTTCCTGGCGCAGTAGAGATTCCCTTTGTTGCACAGTTGCTAGCGAAAAAACAAAAAGTAGAAGTCATAGTGGCACTTGGAGCAGTTATCCGTGGTGAAACCTCTCATTATGATTACGTTTGTGATCAGGTCAGCCAGGGATGCCAAAGGGTTATGTTAGATTATAATATTCCGGTTATCTTTGGTGTATTAACTACTGAAAATGATGAGCAGGCTTTGGCAAGAGTGGGAGGAACTCACGGCCATAAAGGGAGAGATGCGATAGATTGTGCGGTTTCCATGCGTTCTATTAAACAACAATTGCAATAGTTCTATTAATTTTGCTCAAATTTCTGTTATTTATATCTTCATTTTGATAGAATTGAATCCCGTTTACATGCAAATTAAATTGAACACCAAATTGGTGGATTCGGCATTTTGAGCGGGGTCAAAAAATGACAAAATATATTTTTATTACTGGCGGGGTTGTGTCTTCTTTAGGAAAAGGCATAGCAGCCGCATCTCTTGCAGCTATTCTTGAAGCTCGTGGTCTTCGCGTTACGTTGATAAAGCTTGATCCCTACATTAACGTTGATCCTGGTACTATGAGTCCCTTTCAGCATGGCGAGGTTTTCGTAACGAATGACGGGGCGGAGACCGATTTGGATTTGGGACATTATGAGCGCTTTGTTAAAACAACAATGACCAAGCGTAATAATTTCACATCGGGAAAAATTTACGAAAATGTAATTAAGAAAGAAAGACGTGGTGATTATTTAGGAGGGACAGTTCAGGTTATTCCTCATATTACCAATGAAATCAAACGCTGTATCAAACTTGGTGCGGATGCATTCGATGTGGCTATGGTTGAAATAGGAGGAACTGTTGGTGATATTGAATCATTACCCTTTCTTGAAGCAATTAGGCAGATGCGTATTGAGTTAGGTTCACAACGAGCAATATTTATTCATCTTACTTTGGTTCCTTATATTGCTACTTCTGGGGAAACCAAAACCAAACCAACTCAACACTCGGTAAAGGAATTGCGTTCTATTGGTATCCAGCCAGATGTATTGATTTGCCGTTCAGAAAAACCATTATCCATGGCAGACAGGGCTAAAATCGCATTATTCACTAATGTTGAAAAAGAAGCTGTGATTTCTCTTGAGGATGCGAATAGTATTTATCAAATACCTATGATTCTACATGCGCAGCATTTAGACGAAATTGTTGTTAAGAAACTAAGCCTGGAAGCTAAGCAGGCTGATTTGAGCGAGTGGCAACGAGTAGTTGATATGCAAGCAGTTCAAACGATGACAGTGAAAATCGCTATGGTAGGTAAATATACGGAGCTGAATGATGCCTACAAGTCGATTAATGAAGCTTTATTGCATGCTGGAATTCATACGGAAACAAAAGTAGAAATTATCTATTTTGATGCTGAGATGATAGAAAAGCATGGCGCTTTATTACTTGAATCCATTGATGCTATTTTGGTACCTGGTGGTTTTGGTGAGAGAGGAGTCGAAGGCAAAATTAAGGCTATCCAATATGCTCGGGAGCATAAAGTTCCTTTTTTAGGGATATGTTTGGGTATGCAAACAGCTGTTATTGAGTTTGCGAGAAATGTAGTCGGTTTAACAGGAGCCAATTCGACTGAGTTCAATAAAGAAACATTGTATCCAGTGCTTGGTTTAATTAGTGAATGGATGGATGCCGATGGTAGCAAGCAGATCAGGGACGAAAATACTGACTTGGGTGGAACCATGCGTTTGGGCGGGCAATACTGTCATCTTGCTGAAGGCACTCTGGCAAGAAAAGTTTATGGCAAACCACAAATTATAGAGCGCCATCGACATCGATATGAAGTCAATAACAAGTATGTGGATAGTTTGGTAAAACATGGCTTAATTATTTCAGGACGATCAGCAGATAATTCACTGGTTGAGATGATAGAATTAGCAGACCACCCCTGGTTTTTAGCTTGTCAGTTTCATCCTGAGTTCACATCAAATCCAAGAGATAGTCATCCTCTATTTAAGGAATTTGTACTTGCAGCTCGTATTCACCATCAAGAGAAGGACAAAAAATGAGATTATGTGGTTTTGAAGCAGGCTTGGATAAGCCATTGTTTTTGATTGCCGGCCCTTGTGTTATTGAAAGTGAAGAACTGGCTTTAGAGACCGCAGGATATTTAAAGGAAATGTGCATTCAATTGAATATCCCTTTCATCTATAAGTCTTCTTTTGATAAAGCAAACCGTTCATCTATTTCCAGTTACAGGGGACCTGGCTTTGAAAAAGGGTTATCGATTCTGGAAAAGGTCAAATCACAAATAGGTGTTCCTGTTTTGACTGACGTTCATGAAGACACGCCCTTATTTGAAGTCTCCAGTGTGGTAGATGTATTACAAACGCCAGCCTTCCTATGCAGACAAACCAATTTTATCCAGAAAGTTGCTGCTATGAATAAGCCGGTTAATATTAAAAAGGGACAGTTTCTTGCTCCCTGGGAAATGAAACATGTTATTGCGAAAGCAAAGGCGCAAGGTAATGAGCAAATTATGGCTTGTGAGCGAGGAGTGAGCTTCGGCTACAATAATTTGGTTTCTGATATGCGTTCCCTCGTTATCATGCGTGAAACCGGCTGTCCAGTGGTTTATGATGCAACACATTCGGTTCAATTGCCCGGGGGCAATAATGGTGTATCCGGGGGGCAGAGAGAATTTATTCCGGCTCTTGCAAGAGCAGCTGTAGCTGTTGGAATATCAGGGTTATTTATGGAAACTCACCCTGATCCGGATAAAGCACTAAGTGATGGTCCCAATAGTTGGCCTCTAGATAAAATGAAACAACTTTTGGAGTCATTGAAAGCAGCGGATGAAGTGTATAAAAAGTACAGTACTGATTTCTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP021286|1268434:1274371|1268434_1269508_+|WP_038838075.1|DBSCAN-SWA MHEQFLLAALEQAKLGRGFCAPNPSVGAVAVQNGNIIAQAWHRGAGTPHAEQLLLSQILPQTPGVTLYVTLEPCNHWGKTPPCVDAIINHGIEEVVFSYFDPNPIVAKSNSSEKLREHGIQVRHIPIKAIDVFYKSYAYWTMTHKPRVTVKMAQTFDGKIGKSEGARVVLSNALCEQFTHQMRAASDVILTSAKTVQMDNPRMNARLDSGLVAKPVAIVDRNLSLSDDTIIFSTAKHCHIYHQPQANQAKTYPNSTHYAMPLQNGLMNLEAIITHLGQLGYHDVWVEAGGAIFSALHSKGLVHRTYLYLVPGSLGHQAISAYQQQGIFEKAHTVSWQAMGDNMIACLDWQEDECLPD >NZ_CP021286|1268434:1274371|1270103_1271312_+|WP_011215282.1|DBSCAN-SWA MKHSLATIEEAVATLKAGKMIILMDDEDRENEGDLVIAAEHATPEAINFMSRLGCGLICLPMAEELIDKLELPMMARHNKSPYGTAFTVSIEAANGVSTGISARDRARTIQVAIDPKSGPSDIISPGHVFPLRARKRGVLERPGQTEGSVDLVKLAGLTPAAVICEIINEDGTMSRRDELALFSKKHQIPLVTIKDLIQYRVRHENLIHPVATTQIPLEENGVFTMTVFENQIDSCEHFVLVKPPLYGNQVPLVRIHSECITGDVFGSRKCDCGKQLELSLSQIGAEGGILIYLRQEGRGIGLANKLKAYALQEQGFDTVDANLELGLPADDRDYAVAYQILKYLGVEALRLLTNNPLKIASLERYGMKITQRIPLEIEPSRENHSYLKTKKIKLGHLLAID >NZ_CP021286|1268434:1274371|1271319_1271787_+|WP_010946914.1|DBSCAN-SWA MREIKTIVSDGVTFPIALVVSTFNELITSALKKGALDRLTELGFKSEDITLVEVPGAVEIPFVAQLLAKKQKVEVIVALGAVIRGETSHYDYVCDQVSQGCQRVMLDYNIPVIFGVLTTENDEQALARVGGTHGHKGRDAIDCAVSMRSIKQQLQ >NZ_CP021286|1268434:1274371|1269492_1270107_+|WP_027265743.1|DBSCAN-SWA MFTGLIENTGKVLMNRQGENSSRLVVSSSYQDLKPGESIAVNGVCLTLLPADFPELCFDISPETLHVTTLSKLSSGDMVNLERAMLASTRFGGHYVSGHVDTRAKVKSICAVNEFIAMDLDGFIPEHNHYLIPKGSITVDGVSLTINTVSEQTIGLMLVPHTLSMTNLGSLRVGQQVNIEFDYLTRIVAHQLQIIGKLNQEEVS >NZ_CP021286|1268434:1274371|1273546_1274371_+|WP_027265741.1|DBSCAN-SWA MRLCGFEAGLDKPLFLIAGPCVIESEELALETAGYLKEMCIQLNIPFIYKSSFDKANRSSISSYRGPGFEKGLSILEKVKSQIGVPVLTDVHEDTPLFEVSSVVDVLQTPAFLCRQTNFIQKVAAMNKPVNIKKGQFLAPWEMKHVIAKAKAQGNEQIMACERGVSFGYNNLVSDMRSLVIMRETGCPVVYDATHSVQLPGGNNGVSGGQREFIPALARAAVAVGISGLFMETHPDPDKALSDGPNSWPLDKMKQLLESLKAADEVYKKYSTDF >NZ_CP021286|1268434:1274371|1271912_1273550_+|WP_010946915.1|DBSCAN-SWA MTKYIFITGGVVSSLGKGIAAASLAAILEARGLRVTLIKLDPYINVDPGTMSPFQHGEVFVTNDGAETDLDLGHYERFVKTTMTKRNNFTSGKIYENVIKKERRGDYLGGTVQVIPHITNEIKRCIKLGADAFDVAMVEIGGTVGDIESLPFLEAIRQMRIELGSQRAIFIHLTLVPYIATSGETKTKPTQHSVKELRSIGIQPDVLICRSEKPLSMADRAKIALFTNVEKEAVISLEDANSIYQIPMILHAQHLDEIVVKKLSLEAKQADLSEWQRVVDMQAVQTMTVKIAMVGKYTELNDAYKSINEALLHAGIHTETKVEIIYFDAEMIEKHGALLLESIDAILVPGGFGERGVEGKIKAIQYAREHKVPFLGICLGMQTAVIEFARNVVGLTGANSTEFNKETLYPVLGLISEWMDADGSKQIRDENTDLGGTMRLGGQYCHLAEGTLARKVYGKPQIIERHRHRYEVNNKYVDSLVKHGLIISGRSADNSLVEMIELADHPWFLACQFHPEFTSNPRDSHPLFKEFVLAARIHHQEKDKK |
6 | Staphylococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1997191 : 2068894
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP021286|1997191:2068894|DBSCAN-SWA CATGTTAACTGTATTACAAAGAGTAAAGGAAGCCAGGGTTGATATTGATGGTCAAACAGTTGGCAAAATAAATCATGGCTTGCTGATACTTTGTGGTTTTGAACCTAAGGATTCGCTAGAAAATATTAAACGAATGCTGGATAAATGCATTAATTATCGCATTTTTGAAGACCCGAGTGGCAAAATGAACTTGAGTTTAAAGGATGTAAATGGCGGTTTGCTATTAGTACCACAATTTACTCTCATGGCAGATACCCAAAAAGGATTGCGTCCAAGTTTTTCAAATGCAGCTTCTCCAGAACTCGGGCGTGAGCTTTTTGATAACTTATTAACTCTTGCTCAGAAATGCCACCAAAACACTCAAAGTGGTTGTTTTGGAGCGAACATGCAAGTTTATTTATGCAATGATGGGCCTGTGACATTTTTGTTACAATTTTAATCAGCTTTTACGGTATTAAATTTTTGTATAACCTGGATTGTCGAGCGAAGTATAATCAACATTCATTATTGGGATTCATTGCGACCAAAAAAAAAGCATGTTTGTTTCAGTTAAAAAGCAGCAATTTAAAAGGTCTATTCTTTACATCAAAGCATTTGTTTGCAAGAACCAAAAACTGGTGTAACATCATTTTAAGTATTTAATAAATAGAATAATTATGCGACTAATCTTAATGTTTGCTAGCATCATGGGATCCGTTATTTTAGCGAGCTGTGCAAGTAAAGGATCAAACCCGATCGATCCATTCGAACCCTTTAATCGTAAAGTGCACAATTTTAATATGGCATTTGATGCTACCGTATTAAGACCACCAGCAAAATTATATCAGGCTGTCGTACCAAAATTGGTAAGAAAAGGTGTGAATAATGCATTCAATAATCTGGATTTGTTCCCTACAATAGCCAGCGATATACTGCAAGCTGAAGGAAAATGGGTAATCAAAGACAGTTGGCGACTCTTCATTAACTCCACTATTGGGGTTGCTGGTCTGTTTGATGTAGCAGAAAAATTTGGTTTGCCACCGCATTACAACGATCTGGGCCTAACACTCGCCAAATGGGGCGATAAAAAATCGCCTTACCTTGTAATACCCTTTTTAGGCCCCAGTACTCTTCGTGATGGAGCCGGCTGGCTGTTCCAGTTTGCACTCTGGAGTCCTTATGTATATATTGATGATGCTGGTCTGGTTTATGGTTTAATTGGATTGCGCTACATTGATTTACGAACACAATTTTTCGACTCTGAGCCTTTACTGAATGAAGCATTAGACAAATACACATTCATCAGAGACGCTTACCTGCAACATAGAAATTATCTTATTGCAGGGACTGAGCAAGATACAGGCACGTCCTTCGTTGAGGATAAGAAAGCTAACAAAACTGCAATGCAAGAATCAACCGCTTCAAATAACCAACTAGGTTCTGACTATGTTGATGAATAAAATGATTAATTGAGACTTGCCAGGTCATGATAAGGGTTGCTGTTGAGCCAAATGCAAAACCAACCCTCTTTAAGCTCTGAACTTCAAAATCAAAATAATGACTGTTCTTTATTTTGATAAAGAAGTATGTAACTTTTCAAGGCAGCGCATATATTCACCTGCGATATCCAAACCAGTTTCAGTGCTAATTTCCCGAATACAAGTGGGACTAGTCACATTAATCTCTGTTAGATAATCACCTATCACGTCGATACCCACAAAATACAGACCTTTTTCTCTCAAAGCTGGAGCTATTTGTTCACATATCCATTTGTCTCTTTCAGTAATAGCTACCACTTCTCCCCTGGCTCCTGCGGCCAAATTTCCCCGCAAATCTCCTTTTGCAGGAATGCGAGCCAAAGCAAAAGGAACGGGTTCGCCATTGATCAATAAAATACGTTTGTCTCCGCTTACTGTAATATCCGGGATATAACGCTGAGCCATAATACATTTTGTCTGCCCTTTGGTTAATACCTCCAAAATGACCGATAAATTTTTACCCTCTTTGTCAACATAAAAAATGGAATTACCTCCCATTCCTTCAAGAGGTTTAAAAATAACTTGTTGATGAATTTGCCAGAACTCTTTTAATTGCCGAGCATCTCTGGATACAAAAGTAGGGGGACAGCAATGAGGAAAATTTAGGGTAAAAAATTTCTCATTCGCGTCACGTAAACTTTGCGGTTTATTTGCAACCAACACCCCTTCTTGTTCCGCTAAATCCAAAGCGTAAGTTGCATAAATATACTCCATATCAAACGGAGGATCCTTACGCATCAAAATAACATCAAAATCTCTCAATGGCTTATTACCCAAATCTATGGTTTTAACCCAACTCAGACTCTCTATATCTCCAATGTGAATTTCATGGACTCGTGCATAAGCGCTCCCATCACAACAATATAAGTCATTCTGGGTAAAGTAGGCGCAAGACCATCCCAATCCTTGTGCGCTTTTAATCATAGCTACTGTAGAGTCTTTATAGGGTTTTATTTGATCCAATGGATCCATAAGCACCGCAAGTTTCATCATTCGCCTCCAATTGCAGCAATTTCTCGAGCTGCAGCCAGTGCAGCCAAGCGAGCTATAACCCCATAAACATAAAAACGATTTGGGCAGTCAACTACCTTTAAATCATCACATGGCATATTACAAGCCTGTGCGAAAGCTAACGGCTCAAAATGCATGCCTGGAGCATTGAGGTTCTCATCAATTCCTCTGCCTTTATGAACGCGATAAAATCCACCAACAACAAATTGACCAATCATATAAACTACAGGTTCAGCAACAGAACCATCAGGCATCGTTTCAAAAGTATAAACACCTTCCTGAATAATGACTCTGTCTACCTTCCTGCTTCCTTTACTGGTAGACATCCTGGTACGCTGCTTTCTATTCAATTGTCGAATTTCATCTCCATTATGAACCATCATAACGCTCATGCCATAAGTACCATTATCTGCCTTTACTACTGCGAACGGTTTATTTTCTATTCCGTAAGTAGTGTATTTATCGTTTATTAACGATAATATCTTATCGACTTCTTGAGCTAAGATTTCAATCCCTTCCTGGGCCATAAAATCGACCCCCTCTATAGCGCTAAAATAGGGATTAATTAACCACGGATCAATACCGACTAATTCAGCAAACTCAATAGCTACTTCTTCAAAAAATTGAAAATGACTCGATTTTAATCGAGAAGCCCATCCTAATTTGGCTGTAGGTCTAATTCGCTGTTGCACATCCTGCAATATTTCAGGAACGCCTGAAGACAAATCGTTATTCAATAACAAAAGGCAAGGGCTGAAATTATCCAGTCCCACCTTATCACCTTGTCTTTGTAATGGTTCAATTAATAAAGTTTCACCTTGTTCGAGTATTATTTCTGTAGGCTCTTTAATGTCTGGATCTAAACTGCCTATTCGAACTATAAAACCAGCTTTTACAAAAATTGTTTTTAATACATTCAAACTCTGTAAATAATACTTATTCCGAGTATGGCTTTCTGGAAGAAGCAAAATTTTAGTACAATCAGGGATGTACTCTATCAAGGCAGATTGAGCAGCTTGTATACACAGGGGAAGGAACTCCGGGTTTAAATTATTAAAACCAGCTGGAAATAAATTGGTATCGACGGGAGCTAATTTAAAGCCAGCATGTCGCAAATCAACAGATGACGTTAGAGGTGCCGGTGTTTCCTGCCACTTTTTTCTGAACCAGGATTCTATTTCAGCAAGTTTATTTAATATAATTTTTTCCACATGATACAAAGGACCTGAATGAGCAGTAGTCAGATGTGGAACGGGGATTTCATGCTTATTCATTCATACTCCCTATTTTTTAAAATGGATCGATGTTACCTAGGTTATTCATAAAATAAAAGCATTTATCATTCTTAATCTCTGTACGGTACGATTTTTGGGACCGTCGTTGCGAGGAGCATAGCGACGAAGCAATCCAGTGACCTTAAAATTGCTAATCTTCACAACAGTTTTTCGTAAAGATCTTCCCAATAAGGGTTTAGCTTTTCAATTAAAGCCAATTTCTTTTTTCTTGACCCGCCTTTAAGTTGTTTTTCTCGAGCTATGGCACTTATCATGTCTTCAATGAGCTCATAGTAAACAAGAAACTTACATCCATGCTCTTGAGTAAACCCGGGTACATCCCCATATTTATGTTCATAGACACGTTTGATCAAATCGCTTGTGACACCCGTGTAGATCGTTCCATTGCGTTTATTCGCCATGATGTAAATGGCTGGTTGTTTCACTTGCATGCTTCTTCCTTGTTATTGGACCAATTCATTCAGCAGCGCATATCACGCGACTAATGCACAAAAACCCAAGTATATCGGAGAAAGAATGGCGAATAAACTGACAGCCATTAAGCGCAGCATCACGTAATAAATCAAGTCCATAACGAAAAAAACTTACCCCTTTGCGACCATGTTTTTTGATTTTAATTGCCTTCTGAACATGCCGCCACTCTCCAGTTTTATGGGCCCAACAAAAAGCAATGGTCAATAGCACCAGTAATTTTTCAATGCGATCCGGTTGAGTCATGTGTGTGTCTTCAAAGTTGAAGCCACGCCCTTTGAGACATGAAAACAACGTTTCTATTTCCCAACGCAAGGCATAATGTTCAATAGGTTCATCCATTAAATGATCGGTAGCTACAATCAATAATTCACCATCGGCAAGTCTCAGCGCACTTAAATATATCTTTTGTCTCCATAATTTTCTCAAGCCTTGTAAAATTCTTTGTTCTCCTGATTTCAAATCATAAAACAAGGCATCAATACTTACCTCTAAGCCTCGACTATTTGTAGTAATAACATTGTTTTTGATGCGAATACAAAATGGTATTTTTTCCGTCAACAACCATGCAAACCAGTTGTCACCAACAAATTCTCGGTCAGCAAGTAATCCAGCAATCATTGATTTTCCAAATTTCGTGATAAAACGCTGGACGATTTCAATTCTCTCTCTTGTATCACTATTTCCTCCTTTAGCTAACAATGTC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57 | Tupanvirus(10.0%) | tRNA,transposase,protease,integrase | attL 2002634:2002693|attR 2052343:2052405 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2216348 : 2226471
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP021286|2216348:2226471|DBSCAN-SWA 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ATGCTACGATAGAAGGAGTTGTTCTGTGACCTTCACTATTTTCAATTACCTTCGGTTTGTCACCTTCCATGACAGCAACACAAGAGTTCGTAGTACCCAGGTCTATACCTATTATTTTAGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP021286|2216348:2226471|2222000_2223113_-|WP_011214270.1|DBSCAN-SWA MINKSAILALADGTVYEGLSVGATGDSVGELVFNTSMTGYQEMLTDPSYARQIITLTTAHVGNTGCNMEDMESTKVWAAGLVMRNCTAIPSNYRAEQSFPDWLSKNGVVAISGIDTRALTLKLREKGSIGACISTNVEKPEIAVAKAKSFAGLQGADLALEVTRQTIERWHEGRGMWSLDKQPQQLHVVAYDFGVKHNILRILHDKGCHITIVPAKTSAEEVLAMNPNGVFLSNGPGDPQACDYAIKATQVFLDNNIPLFGICLGFQILALACGGITKKMKFGHHGSNHPVVETTGKKRVFITSQNHGFAVDEDSLPNCLEVTHRSLFDNSLQGIKHKTKPAFGFQGHPEASPGPHDIDILFNEFVNLMK >NZ_CP021286|2216348:2226471|2218168_2219176_-|WP_011214267.1|DBSCAN-SWA MDLVIAANYLSTLEKCLEQFGINHFLEKIGFDLIRVHDPDAYLTQDEFNQVILEAYKLSNCPELGLVFGQNLSIVNHGFLGYAAMSSPTFGTAIQTVLSYLNTRTNLLSLELRQFNNENRAYIKLLPHTKEMVLSRFITELAVTHLIKMRNFLISCNDPLLKIELNYDEPPYAKYYQTIFQTKIVFNTEATRVWFKAEELNYPIHFADDVSYQLAKRQLQELEKKMSLKEDMASKIKSILINQNLNHASMDEIASRLCMTSRTLRRHLQRLDVTYQELLDEVREQKAKTFLLNNNISMTEISFLLGFQDTSNFSKAFKRWTGVTPTEYREKHEVQ >NZ_CP021286|2216348:2226471|2223208_2224348_-|WP_010947740.1|DBSCAN-SWA MEQRDYYELLEVSRNASDAEIKKAYRRLAMKYHPDRNPGDTSAEEKFKEIQKAYNILSDKQKRAAYDQFGHAGVDPSMGGGPGGFGGFGGFGDVFEDIFENIFSGGRGHGRQSRGQRGADLQFNVQLTLEEAAIGKEVEITVPRHGTCTVCEGSGAKKGTSPKTCETCQGMGQVRIQQGFFSIQQTCPTCHGEGKIISDPCASCHGQGRVRESKKINVKIPAGVDNGDRVRLSGEGEAGVHGGGSGDLYVQISLKKHAIFERHENDLHCEVPISFATAALGGSIEVPTLEGRVTLKIPAETQTGKVFRLRSKGMKSVRGYGQGDLLCKVVVETPVNLSREQKELLNKLQDSLENAKGTHSPKTSSWFAGVKKFFEDMKF >NZ_CP021286|2216348:2226471|2220643_2221792_-|WP_011214269.1|DBSCAN-SWA MNEVYVFTSESVSEGHPDKIADQISDAILDAILAQDPKARVACEVLVKTGMVLVGGEITTKAWVDVEEITRHVIKDIGYNSSQMGFDWESCAVLSAIGKQSPDIAQGVDNQQTKILGAGDQGLMFGYASRETDVFMPAPIAYAHRLMEKLAKARKSGQLPWLRPDAKCQLTLKYEQGMPVEVDTVVFSTQHSPDIEHKDLVEAIREEIIKSVLPAEWLNDKTRYFINPTGRFVIGGPLGDCGLTGRKIIVDTYGGMARHGGGCFSGKDPSKVDRSAAYAARHVAKNIVAAGLADKCELQISYAIGVAEPTSIFVDTFGTGRLKNSEIIDLIHTHFDLTPQGIIDQHDLLRPIYRQTATYGHYGRENFPWERLDKVAELSKAL >NZ_CP021286|2216348:2226471|2216348_2218037_-|WP_011214266.1|DBSCAN-SWA MGLKSGILGLSLLSLACGSFAMTETETIRVIIKYKQQPATMASLKSQVIKSVQIPVKEMKPMANGAYSLIFDTSNSHAIVKAKEEDVTAKVLERLRKNPNVLYAVKDRIGHFKPLPDPVINQELSQLLSHESQWDEFERPAGIRLESKPGLRDGAWAYTTGKSRKPIVVAVLDTGIALNDSLVNNLVKDNEGNVFGWNFAGNNNDLSDETRSYHGTHVAGTIAGYGDVMNGVGEDLKILTVKIPAENGMFYESAVVNSIYWAVGGDVPGVPKNIHPAKVLNMSFGVDLEPGKEIDYCDEALQEALFFARKKGAVVAVAAGNDNVWEHYNAPAVCNGTIKVASTGPEGLRSYFSNYGPSITLAAPGGDKRYGTSGGILSTVNPGGGYNSSGFDFYQGTSMASPHVAGVAGLILAVSNKALKPEQVEQILYVTTHEFGQSNDTNKSCVGKKPCGHGILDADNAVQAALNAYDVLFSAPKMTDLATHECGENRLKPGKNIINDSTATWIQAKSSCETGASYQNPRIEKAKDGKIYAYYGSASYELDQSAYKECRVVGYDGVGCYL >NZ_CP021286|2216348:2226471|2219299_2220625_-|WP_011214268.1|DBSCAN-SWA MELVEEGVQKINTLQDYKVADISLADWGRKEIAIAETEMPGLMALREEFSARKPLQGARIAGCLHMTIQTAVLIETLVALGAEVRWSSCNIFSTQDHAASAIAAKGIPVFAWKGETEEEYWWCVEQTLSGPNGWTPNLLLDDGGDLTQVVHQKHPKLLTAIKGVSEETTTGVARLYEMAKHGQLKIPAINVNNAVTKSKFDNLYGCRESLLDGLKRATDVMIAGKVALILGYGDVGKGCAQALRGQGATVLVAEIDPICALQAAMEGYRVVTLDDVAEQVDIVVTATGNYHVVTHDHMKRMRNQAILCNIGHFDSEIDIQSLKQYQWENIKPQVDHVIFPDGKRIIILAEGRLVNLGCATGHPSFVMSASFTNQVLAQIELFQNSSQYQNQVYVLPKVLDEKVARLHLGRIGAKLTQLSNEQADYIGVDKNGPYKPDHYRY >NZ_CP021286|2216348:2226471|2224536_2226471_-|WP_011214271.1|DBSCAN-SWA MAKIIGIDLGTTNSCVAVMEGDKPKVIENSEGHRTTPSIVAFTDDNEILVGQSAKRQSVTNPEKTLFAIKRLIGRRFDDPIVQKDIKMVPYKIMKADNGDAWVRVKDQDKAPPQISAEVLRKMKKTAEDYLGEEVKEAVITVPAYFNDSQRQATKDAGRIAGLEVKRIINEPTAAALAYGMDKKRGDSVIAVYDLGGGTFDISIIEIAEVDGEHQFEVLATNGDTFLGGEDFDLALIEYLASEFKKDTGIDLHNDPLALQRLKEAAEKAKIELSSAQQTDVNLPYITADASGPKHLNIKLTRAKLESLVEKLVERTIEPCKTALKDAGLTVSQINEVILVGGQTRMPLVQKTVEEFFGKEPRKDVNPDEAVAVGAAIQAAVLSGEVKDILLLDVTPLSLGIETMGGVMTKLIEKNTTIPTKATQVFSTADDNQTAVTVHVLQGEREQASANKSLGRFDLRDIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAKDKATGKAQSIVIKASSGLSEEEVAAMVKDAQSHAEEDKKFKEMAELRNQADSLIHSCEKSMKDLADELSEDEKKGIETAISELKEAVQGTDKTRIEDKLKVLTDASAKMAERIYAKKSSEGQAAQGQTQSQESTKPVEEGVVDAEFEEVKEEDKK |
7 | Bacillus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2269877 : 2336243
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP021286|2269877:2336243|DBSCAN-SWA 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58 | Vibrio_phage(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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