CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP025586	Lactiplantibacillus plantarum strain KC3 chromosome, complete genome	1 crisprs	cas3,DinG,csa3,WYL,DEDDh	0	2	7	0
NZ_CP025588	Lactiplantibacillus plantarum strain KC3 plasmid unnamed2, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP025587	Lactiplantibacillus plantarum strain KC3 plasmid unnamed1, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP025589	Lactiplantibacillus plantarum strain KC3 plasmid unnamed3, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	2	0

1. NZ_CP025586

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP025586_1

• CRISPR_ID: NZ_CP025586_1
• CRISPR_location: 1079474-1079700
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 4 spacers

Consensus repeat of NZ_CP025586_1

Consensus_repeat	Method
CTTGGTTCACTCGGTTCACT	CRT

spacers of NZ_CP025586_1

>1.1|1079494|25|NZ_CP025586|CRT
CGGTTCACTCGGTTCACTCGGCTCA
>1.2|1079539|34|NZ_CP025586|CRT
TGGTTCGCTCGGTTCACTTGGTTCACCCGGTTCG
>1.3|1079593|25|NZ_CP025586|CRT
CGGTTCGCTTGGTTCACTCGGCTCA
>1.4|1079638|43|NZ_CP025586|CRT
CGGTTCACTCGGTTCGCTTGGTTCGCTTGGTTCGCTCGGTTCG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP025586_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP025586_1

>merge|NZ_CP025586|1|1079474-1079700|CRT
ACCGGTTCACTTGGTTCGCTCGGTTCACTCGGTTCACTCGGCTCACTTGGTTCACTCGGTTCACTTGGTTCGCTCGGTTCACTTGGTTCACCCGGTTCGCTTGGTTCACTCGGTTCACTCGGTTCGCTTGGTTCACTCGGCTCACTTGGTTCACTCGGTTCACTCGGTTCACTCGGTTCGCTTGGTTCGCTTGGTTCGCTCGGTTCGCTTGGTTCGCTCGGTTCACT

>NZ_CP025586|1|1|1079474-1079700|CRT
ACCGGTTCACTTGGTTCGCT	CGGTTCACTCGGTTCACTCGGCTCA
CTTGGTTCACTCGGTTCACT	TGGTTCGCTCGGTTCACTTGGTTCACCCGGTTCG
CTTGGTTCACTCGGTTCACT	CGGTTCGCTTGGTTCACTCGGCTCA
CTTGGTTCACTCGGTTCACT	CGGTTCACTCGGTTCGCTTGGTTCGCTTGGTTCGCTCGGTTCG
CTTGGTTCGCTCGGTTCACT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP025586.1|WP_003646362.1|1074323_1075985_+|peptide-ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|173869
NZ_CP025586.1|WP_102115649.1|1095498_1097658_+|alpha-galactosidase	unknown	unknown	gnl|CDD|307952
NZ_CP025586.1|WP_102115646.1|1076190_1077852_+|peptide-ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|173869
NZ_CP025586.1|WP_003643688.1|1083079_1083994_+|LysR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|223656
NZ_CP025586.1|WP_003646364.1|1070448_1071072_-|histidine-phosphatase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|366010
NZ_CP025586.1|WP_003646356.1|1091762_1093268_-|sucrose-6-phosphate-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|273554
NZ_CP025586.1|WP_027822622.1|1086412_1087813_+|Na+/H+-antiporter-NhaC	unknown	unknown	gnl|CDD|188097
NZ_CP025586.1|WP_003641783.1|1090801_1091782_-|LacI-family-DNA-binding-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|380514
NZ_CP025586.1|WP_003643686.1|1088033_1088948_+|NADP-dependent-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|176191
NZ_CP025586.1|WP_102115648.1|1084193_1085867_-|alpha-glucosidase	unknown	unknown	gnl|CDD|200472
NZ_CP025586.1|WP_102115644.1|1071455_1072529_+|3-phosphoserine/phosphohydroxythreonine-transaminase	unknown	unknown	gnl|CDD|235428
NZ_CP025586.1|WP_015825053.1|1078039_1078882_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|376540
NZ_CP025586.1|WP_003641800.1|1068122_1068473_+|DUF1801-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|227933
NZ_CP025586.1|WP_011100918.1|1067263_1068136_+|NFACT-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224212
NZ_CP025586.1|WP_015825048.1|1093523_1095479_+|PTS-beta-glucoside-transporter-subunit-IIBCA	unknown	unknown	gnl|CDD|131051
NZ_CP025586.1|WP_003641799.1|1068475_1068697_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|274224
NZ_CP025586.1|WP_003643690.1|1069198_1070188_-|aldo/keto-reductase	unknown	unknown	gnl|CDD|381315
NZ_CP025586.1|WP_015825049.1|1089104_1090781_-|alpha-glucosidase	unknown	unknown	gnl|CDD|200472
NZ_CP025586.1|WP_102115645.1|1072544_1073723_+|phosphoglycerate-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|240651
NZ_CP025586.1|WP_015825046.1|1097737_1098604_+|ROK-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|366120

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP025586.1|WP_003646362.1|1074323_1075985_+|peptide-ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|173869	cd08504, PBP2_OppA, The substrate-binding component of an ABC-type oligopetide import system contains the type 2 periplasmic binding fold. This family represents the periplasmic substrate-binding component of an ATP-binding cassette (ABC)-type oligopeptide transport system comprised of 5 subunits. The transport system OppABCDEF contains two homologous integral membrane proteins OppB and OppF that form the translocation pore; two homologous nucleotide-binding domains OppD and OppF that drive the transport process through binding and hydrolysis of ATP; and the substrate-binding protein or receptor OppA that determines the substrate specificity of the transport system. The dipeptide (DppA) and oligopeptide (OppA) binding proteins differ in several ways. The DppA binds dipeptides and some tripeptides and is involved in chemotaxis toward dipeptides, whereas the OppA binds peptides of a wide range of lengths (2-35 amino acid residues) and plays a role in recycling of cell wall peptides, which precludes any involvement in chemotaxis. Most of other periplasmic binding proteins are comprised of only two globular subdomains corresponding to domains I and III of the dipeptide/oligopeptide binding proteins. The structural topology of these domains is most similar to that of the type 2 periplasmic binding proteins (PBP2), which are responsible for the uptake of a variety of substrates such as phosphate, sulfate, polysaccharides, lysine/arginine/ornithine, and histidine. The PBP2 bind their ligand in the cleft between these domains in a manner resembling a Venus flytrap. After binding their specific ligand with high affinity, they can interact with a cognate membrane transport complex comprised of two integral membrane domains and two cytoplasmically located ATPase domains. This interaction triggers the ligand translocation across the cytoplasmic membrane energized by ATP hydrolysis. Besides transport proteins, the PBP2 superfamily includes the ligand-binding domains from ionotropic glutamate receptors, LysR-type transcriptional regulators, and unorthodox sensor proteins involved in signal transduction.	0
NZ_CP025586.1|WP_102115649.1|1095498_1097658_+|alpha-galactosidase	gnl|CDD|307952	pfam02065, Melibiase, Melibiase. Glycoside hydrolase families GH27, GH31 and GH36 form the glycoside hydrolase clan GH-D. Glycoside hydrolase family 36 can be split into 11 families, GH36A to GH36K. This family includes enzymes from GH36A-B and GH36D-K and from GH27.	0
NZ_CP025586.1|WP_102115646.1|1076190_1077852_+|peptide-ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|173869	cd08504, PBP2_OppA, The substrate-binding component of an ABC-type oligopetide import system contains the type 2 periplasmic binding fold. This family represents the periplasmic substrate-binding component of an ATP-binding cassette (ABC)-type oligopeptide transport system comprised of 5 subunits. The transport system OppABCDEF contains two homologous integral membrane proteins OppB and OppF that form the translocation pore; two homologous nucleotide-binding domains OppD and OppF that drive the transport process through binding and hydrolysis of ATP; and the substrate-binding protein or receptor OppA that determines the substrate specificity of the transport system. The dipeptide (DppA) and oligopeptide (OppA) binding proteins differ in several ways. The DppA binds dipeptides and some tripeptides and is involved in chemotaxis toward dipeptides, whereas the OppA binds peptides of a wide range of lengths (2-35 amino acid residues) and plays a role in recycling of cell wall peptides, which precludes any involvement in chemotaxis. Most of other periplasmic binding proteins are comprised of only two globular subdomains corresponding to domains I and III of the dipeptide/oligopeptide binding proteins. The structural topology of these domains is most similar to that of the type 2 periplasmic binding proteins (PBP2), which are responsible for the uptake of a variety of substrates such as phosphate, sulfate, polysaccharides, lysine/arginine/ornithine, and histidine. The PBP2 bind their ligand in the cleft between these domains in a manner resembling a Venus flytrap. After binding their specific ligand with high affinity, they can interact with a cognate membrane transport complex comprised of two integral membrane domains and two cytoplasmically located ATPase domains. This interaction triggers the ligand translocation across the cytoplasmic membrane energized by ATP hydrolysis. Besides transport proteins, the PBP2 superfamily includes the ligand-binding domains from ionotropic glutamate receptors, LysR-type transcriptional regulators, and unorthodox sensor proteins involved in signal transduction.	0
NZ_CP025586.1|WP_003643688.1|1083079_1083994_+|LysR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|223656	COG0583, LysR, Transcriptional regulator [Transcription].	1.7511e-35
NZ_CP025586.1|WP_003646364.1|1070448_1071072_-|histidine-phosphatase-family-protein	gnl|CDD|366010	pfam00300, His_Phos_1, Histidine phosphatase superfamily (branch 1). The histidine phosphatase superfamily is so named because catalysis centers on a conserved His residue that is transiently phosphorylated during the catalytic cycle. Other conserved residues contribute to a 'phosphate pocket' and interact with the phospho group of substrate before, during and after its transfer to the His residue. Structure and sequence analyses show that different families contribute different additional residues to the 'phosphate pocket' and, more surprisingly, differ in the position, in sequence and in three dimensions, of a catalytically essential acidic residue. The superfamily may be divided into two main branches. The larger branch 1 contains a wide variety of catalytic functions, the best known being fructose 2,6-bisphosphatase (found in a bifunctional protein with 2-phosphofructokinase) and cofactor-dependent phosphoglycerate mutase. The latter is an unusual example of a mutase activity in the superfamily: the vast majority of members appear to be phosphatases. The bacterial regulatory protein phosphatase SixA is also in branch 1 and has a minimal, and possible ancestral-like structure, lacking the large domain insertions that contribute to binding of small molecules in branch 1 members.	1.65537e-47
NZ_CP025586.1|WP_003646356.1|1091762_1093268_-|sucrose-6-phosphate-hydrolase	gnl|CDD|273554	TIGR01322, Sucrose-6-phosphate_hydrolase, sucrose-6-phosphate hydrolase. [Energy metabolism, Biosynthesis and degradation of polysaccharides].	0
NZ_CP025586.1|WP_027822622.1|1086412_1087813_+|Na+/H+-antiporter-NhaC	gnl|CDD|188097	TIGR00931, Uncharacterized_Na+/H+_antiporter_HI_1107, Na+/H+ antiporter NhaC. A single member of the NhaC family, a protein from Bacillus firmus, has been functionally characterized.It is involved in pH homeostasis and sodium extrusion. Members of the NhaC family are found in both Gram-negative bacteria and Gram-positive bacteria. Intriguingly, archaeal homolog ArcD (just outside boundaries of family) has been identified as an arginine/ornithine antiporter. [Transport and binding proteins, Cations and iron carrying compounds].	5.58614e-109
NZ_CP025586.1|WP_003641783.1|1090801_1091782_-|LacI-family-DNA-binding-transcriptional-regulator	gnl|CDD|380514	cd06291, PBP1_Qymf-like, ligand binding domain of the lacI-like transcription regulator from a novel metal-reducing bacterium Alkaliphilus Metalliredigens (strain Qymf) and its close homologs. This group includes the ligand binding domain of the lacI-like transcription regulator from a novel metal-reducing bacterium Alkaliphilus metalliredigens (strain Qymf) and its close homologs. Qymf is a strict anaerobe that could be grown in the presence of borax and its cells are straight rods that produce endospores. This group is a member of the LacI-GalR family repressors that are composed of two functional domains: an N-terminal HTH (helix-turn-helix) domain, which is responsible for the DNA-binding specificity, and a C-terminal ligand-binding domain, which is homologous to the sugar-binding domain of ABC-type transport systems that contain the type 1 periplasmic binding protein-like fold. As also observed in the periplasmic binding proteins, the C-terminal domain of the bacterial transcription repressor undergoes a conformational change upon ligand binding which in turn changes the DNA binding affinity of the repressor.	6.24177e-114
NZ_CP025586.1|WP_003643686.1|1088033_1088948_+|NADP-dependent-oxidoreductase	gnl|CDD|176191	cd05289, MDR_like_2, alcohol dehydrogenase and quinone reductase-like medium chain degydrogenases/reductases. Members identified as zinc-dependent alcohol dehydrogenases and quinone oxidoreductase. QOR catalyzes the conversion of a quinone + NAD(P)H to a hydroquinone + NAD(P)+. Quinones are cyclic diones derived from aromatic compounds. Membrane bound QOR actin the respiratory chains of bacteria and mitochondria, while soluble QOR acts to protect from toxic quinones (e.g. DT-diaphorase) or as a soluble eye-lens protein in some vertebrates (e.g. zeta-crystalin). QOR reduces quinones through a semi-quinone intermediate via a NAD(P)H-dependent single electron transfer. QOR is a member of the medium chain dehydrogenase/reductase family, but lacks the zinc-binding sites of the prototypical alcohol dehydrogenases of this group. NAD(P)(H)-dependent oxidoreductases are the major enzymes in the interconversion of alcohols and aldehydes, or ketones. Alcohol dehydrogenase in the liver converts ethanol and NAD+ to acetaldehyde and NADH, while in yeast and some other microorganisms ADH catalyzes the conversion acetaldehyde to ethanol in alcoholic fermentation. ADH is a member of the medium chain alcohol dehydrogenase family (MDR), which has a NAD(P)(H)-binding domain in a Rossmann fold of a beta-alpha form. The NAD(H)-binding region is comprised of 2 structurally similar halves, each of which contacts a mononucleotide. A GxGxxG motif after the first mononucleotide contact half allows the close contact of the coenzyme with the ADH backbone. The N-terminal catalytic domain has a distant homology to GroES. These proteins typically form dimers (typically higher plants, mammals) or tetramers (yeast, bacteria), and have 2 tightly bound zinc atoms per subunit, a catalytic zinc at the active site and a structural zinc in a lobe of the catalytic domain. NAD(H) binding occurs in the cleft between the catalytic and coenzyme-binding domains at the active site, and coenzyme binding induces a conformational closing of this cleft. Coenzyme binding typically precedes and contributes to substrate binding. In human ADH catalysis, the zinc ion helps coordinate the alcohol, followed by deprotonation of a histidine, the ribose of NAD, a serine, then the alcohol, which allows the transfer of a hydride to NAD+, creating NADH and a zinc-bound aldehyde or ketone. In yeast and some bacteria, the active site zinc binds an aldehyde, polarizing it, and leading to the reverse reaction.	1.36997e-64
NZ_CP025586.1|WP_102115648.1|1084193_1085867_-|alpha-glucosidase	gnl|CDD|200472	cd11333, AmyAc_SI_OligoGlu_DGase, Alpha amylase catalytic domain found in Sucrose isomerases, oligo-1,6-glucosidase (also called isomaltase; sucrase-isomaltase; alpha-limit dextrinase), dextran glucosidase (also called glucan 1,6-alpha-glucosidase), and related proteins. The sucrose isomerases (SIs) Isomaltulose synthase (EC 5.4.99.11) and Trehalose synthase (EC 5.4.99.16) catalyze the isomerization of sucrose and maltose to produce isomaltulose and trehalulose, respectively. Oligo-1,6-glucosidase (EC 3.2.1.10) hydrolyzes the alpha-1,6-glucosidic linkage of isomaltooligosaccharides, pannose, and dextran. Unlike alpha-1,4-glucosidases (EC 3.2.1.20), it fails to hydrolyze the alpha-1,4-glucosidic bonds of maltosaccharides. Dextran glucosidase (DGase, EC 3.2.1.70) hydrolyzes alpha-1,6-glucosidic linkages at the non-reducing end of panose, isomaltooligosaccharides and dextran to produce alpha-glucose.The common reaction chemistry of the alpha-amylase family enzymes is based on a two-step acid catalytic mechanism that requires two critical carboxylates: one acting as a general acid/base (Glu) and the other as a nucleophile (Asp). Both hydrolysis and transglycosylation proceed via the nucleophilic substitution reaction between the anomeric carbon, C1 and a nucleophile. Both enzymes contain the three catalytic residues (Asp, Glu and Asp) common to the alpha-amylase family as well as two histidine residues which are predicted to be critical to binding the glucose residue adjacent to the scissile bond in the substrates. The Alpha-amylase family comprises the largest family of glycoside hydrolases (GH), with the majority of enzymes acting on starch, glycogen, and related oligo- and polysaccharides. These proteins catalyze the transformation of alpha-1,4 and alpha-1,6 glucosidic linkages with retention of the anomeric center. The protein is described as having 3 domains: A, B, C. A is a (beta/alpha) 8-barrel; B is a loop between the beta 3 strand and alpha 3 helix of A; C is the C-terminal extension characterized by a Greek key. The majority of the enzymes have an active site cleft found between domains A and B where a triad of catalytic residues performs catalysis. Other members of this family have lost the catalytic activity as in the case of the human 4F2hc, or only have 2 residues that serve as the catalytic nucleophile and the acid/base, such as Thermus A4 beta-galactosidase with 2 Glu residues (GH42) and human alpha-galactosidase with 2 Asp residues (GH31). The family members are quite extensive and include: alpha amylase, maltosyltransferase, cyclodextrin glycotransferase, maltogenic amylase, neopullulanase, isoamylase, 1,4-alpha-D-glucan maltotetrahydrolase, 4-alpha-glucotransferase, oligo-1,6-glucosidase, amylosucrase, sucrose phosphorylase, and amylomaltase.	0
NZ_CP025586.1|WP_102115644.1|1071455_1072529_+|3-phosphoserine/phosphohydroxythreonine-transaminase	gnl|CDD|235428	PRK05355, PRK05355, 3-phosphoserine/phosphohydroxythreonine transaminase.	0
NZ_CP025586.1|WP_015825053.1|1078039_1078882_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator	gnl|CDD|376540	pfam01381, HTH_3, Helix-turn-helix. This large family of DNA binding helix-turn helix proteins includes Cro and CI. Within Neisseria gonorrhoeae NGO_0477, the full protein fold incorporates a helix-turn-helix motif, but the function of this member is unlikely to be that of a DNA-binding regulator, the function of most other members, so is not necessarily characteristic of the whole family.	2.11255e-07
NZ_CP025586.1|WP_003641800.1|1068122_1068473_+|DUF1801-domain-containing-protein	gnl|CDD|227933	COG5646, COG5646, Uncharacterized conserved protein [Function unknown].	3.76537e-22
NZ_CP025586.1|WP_011100918.1|1067263_1068136_+|NFACT-family-protein	gnl|CDD|224212	COG1293, COG1293, Predicted RNA-binding protein homologous to eukaryotic snRNP [Transcription].	4.95108e-35
NZ_CP025586.1|WP_015825048.1|1093523_1095479_+|PTS-beta-glucoside-transporter-subunit-IIBCA	gnl|CDD|131051	TIGR01996, Includes:_Phosphotransferase_enzyme_IIB_component, PTS system, sucrose-specific IIBC component. This model represents the fused enzyme II B and C components of the sucrose-specific PTS sugar transporter system. Sucrose is converted to sucrose-6-phosphate in the process of translocation into the cell. Some of these transporters lack their own IIA domains and instead use the glucose IIA protein (IIAglc or Crr). The exceptions to this rule are Staphylococci, Streptococci, Lactococci, Lactobacilli, etc. which contain their own A domain as a C-terminal fusion. This family is closely related to the trehalose transporting PTS IIBC enzymes and the B and C domains of each are described by subfamily-domain level TIGRFAMs models (TIGR00826 and TIGR00852, respectively).	0
NZ_CP025586.1|WP_003641799.1|1068475_1068697_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|274224	TIGR02603, CxxCH_TIGR02603, putative heme-binding domain, Pirellula/Verrucomicrobium type. This model represents a domain limited to very few species but expanded into large paralogous families in some species that conain it. We find it in over 20 copies each in Pirellula sp. strain 1 (phylum Planctomycetes) and Verrucomicrobium spinosum DSM 4136 (phylum Verrucomicrobia), and no matches above trusted cutoff an any other species so far. This domain, about 140 amino acids long, contains an absolutely conserved motif CxxCH, the cytochrome c family heme-binding site signature (PS00190).	0.00305722
NZ_CP025586.1|WP_003643690.1|1069198_1070188_-|aldo/keto-reductase	gnl|CDD|381315	cd19089, AKR_AKR14A1_2, AKR14A family of aldo-keto reductase (AKR). Escherichia coli L-glyceraldehyde 3-phosphate reductase (GPR/YghZ), also called GAP reductase, is a founding member of aldo-keto reductase family 14 member A1 (AKR14A1). It catalyzes the stereospecific, NADPH-dependent reduction of L-glyceraldehyde 3-phosphate (L-GAP). It is also involved in the stress response as a methylglyoxal reductase which converts the toxic metabolite methylglyoxal to acetol in vitro and in vivo. Salmonella enterica AKR is a founding member of aldo-keto reductase family 14 member A2 (AKR14A2). It catalyzes the conversion of 3-hydroxybutanal (3-HB) to 1,3-butanediol (1,3-BDO) by using NADPH as a cofactor.	1.58553e-151
NZ_CP025586.1|WP_015825049.1|1089104_1090781_-|alpha-glucosidase	gnl|CDD|200472	cd11333, AmyAc_SI_OligoGlu_DGase, Alpha amylase catalytic domain found in Sucrose isomerases, oligo-1,6-glucosidase (also called isomaltase; sucrase-isomaltase; alpha-limit dextrinase), dextran glucosidase (also called glucan 1,6-alpha-glucosidase), and related proteins. The sucrose isomerases (SIs) Isomaltulose synthase (EC 5.4.99.11) and Trehalose synthase (EC 5.4.99.16) catalyze the isomerization of sucrose and maltose to produce isomaltulose and trehalulose, respectively. Oligo-1,6-glucosidase (EC 3.2.1.10) hydrolyzes the alpha-1,6-glucosidic linkage of isomaltooligosaccharides, pannose, and dextran. Unlike alpha-1,4-glucosidases (EC 3.2.1.20), it fails to hydrolyze the alpha-1,4-glucosidic bonds of maltosaccharides. Dextran glucosidase (DGase, EC 3.2.1.70) hydrolyzes alpha-1,6-glucosidic linkages at the non-reducing end of panose, isomaltooligosaccharides and dextran to produce alpha-glucose.The common reaction chemistry of the alpha-amylase family enzymes is based on a two-step acid catalytic mechanism that requires two critical carboxylates: one acting as a general acid/base (Glu) and the other as a nucleophile (Asp). Both hydrolysis and transglycosylation proceed via the nucleophilic substitution reaction between the anomeric carbon, C1 and a nucleophile. Both enzymes contain the three catalytic residues (Asp, Glu and Asp) common to the alpha-amylase family as well as two histidine residues which are predicted to be critical to binding the glucose residue adjacent to the scissile bond in the substrates. The Alpha-amylase family comprises the largest family of glycoside hydrolases (GH), with the majority of enzymes acting on starch, glycogen, and related oligo- and polysaccharides. These proteins catalyze the transformation of alpha-1,4 and alpha-1,6 glucosidic linkages with retention of the anomeric center. The protein is described as having 3 domains: A, B, C. A is a (beta/alpha) 8-barrel; B is a loop between the beta 3 strand and alpha 3 helix of A; C is the C-terminal extension characterized by a Greek key. The majority of the enzymes have an active site cleft found between domains A and B where a triad of catalytic residues performs catalysis. Other members of this family have lost the catalytic activity as in the case of the human 4F2hc, or only have 2 residues that serve as the catalytic nucleophile and the acid/base, such as Thermus A4 beta-galactosidase with 2 Glu residues (GH42) and human alpha-galactosidase with 2 Asp residues (GH31). The family members are quite extensive and include: alpha amylase, maltosyltransferase, cyclodextrin glycotransferase, maltogenic amylase, neopullulanase, isoamylase, 1,4-alpha-D-glucan maltotetrahydrolase, 4-alpha-glucotransferase, oligo-1,6-glucosidase, amylosucrase, sucrose phosphorylase, and amylomaltase.	0
NZ_CP025586.1|WP_102115645.1|1072544_1073723_+|phosphoglycerate-dehydrogenase	gnl|CDD|240651	cd12174, PGDH_like_3, Putative D-3-Phosphoglycerate Dehydrogenases, NAD-binding and catalytic domains. Phosphoglycerate dehydrogenases (PGDHs) catalyze the initial step in the biosynthesis of L-serine from D-3-phosphoglycerate. PGDHs come in 3 distinct structural forms, with this first group being related to 2-hydroxy acid dehydrogenases, sharing structural similarity to formate and glycerate dehydrogenases of the D-specific 2-hydroxyacid dehydrogenase superfamily, which also include groups such as L-alanine dehydrogenase and S-adenosylhomocysteine hydrolase. Despite often low sequence identity, these proteins typically have a characteristic arrangement of 2 similar subdomains of the alpha/beta Rossmann fold NAD+ binding form. The NAD+ binding domain is inserted within the linear sequence of the mostly N-terminal catalytic domain, which has a similar domain structure to the internal NAD binding domain. Structurally, these domains are connected by extended alpha helices and create a cleft in which NAD is bound, primarily to the C-terminal portion of the 2nd (internal) domain. Some related proteins have similar structural subdomain but with a tandem arrangement of the catalytic and NAD-binding subdomains in the linear sequence. Many, not all, members of this family are dimeric.	5.82324e-136
NZ_CP025586.1|WP_015825046.1|1097737_1098604_+|ROK-family-protein	gnl|CDD|366120	pfam00480, ROK, ROK family.	3.78538e-110

Protein sequences

>NZ_CP025586.1|WP_015825053.1|1078039_1078882_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator
MNIELFIARRKALGLSQKALADGICTQATLSKFENNGKAPAIRIVAQLCQRLNLQLEDVFPTERVADAAVLKILEQVEFDLITTEYQDAEVQLEKAADMPRHDRETKLQYCYLKGYVAALNHHPISDVIFNFDQIITDLDEAHITIYTQLAYCGIGIAYQQNQDNDKAQYYFEKVRHALPNLPLETTASVWRVINLAYYTGAFYAKINDTPRSLQLLNYGIEICARFHVTYYAARIKFLQAQLSDEPDQIHEYLNDAAALARMNNNRQLLKNISSYSDSH
>NZ_CP025586.1|WP_102115646.1|1076190_1077852_+|peptide-ABC-transporter-substrate-binding-protein
MKWKVMLTTATAAASTGLLLAACSQGQSKSDNAGNLRAGMAQKQVLNWSENGSELTTLDTSLVTDSISADMINNTMEGLYRIGNNNKITPGIATHTVISKDKKTYTFTLRKDAKWSNGDPVTAQDFVYSWRRTIDPKTASQYAYLYSGIKNADQITNGKAKANSLGIKADGKYKLTVTLDKPMAYFKLLMGFAIFFPQNQHAVQKYGKDYGTTATKMVYDGPFTMKGWKGTNTTWSLNRNPKYWDKKHVYLEKINDQVVKSTTAGFNLFQSNKLDMATLSGEQVKNEKNNPKLVLRKTSRLNYLEFNQKKVPALANAKLRQAMSLTIDRHQLVTDVLADGSAVPKGFVTTGLATDPTTGEDFATENAVSAATTQDTAKAKKLWAEGLKETGKKSLTLTLTHDNIDQTKETAEYVQGQLEKELPGLKITDITLPFKNRLARETSGDFQLAISGWQADFADPISDLGILTSTNDYNFGKWKNADYDAAVKQAEQATDPTVRWTALGKAEKIIGTDEGVAPLTQTTLAQMVNPKLKGLIYNTSGTNYNFKDAYMAK
>NZ_CP025586.1|WP_003646362.1|1074323_1075985_+|peptide-ABC-transporter-substrate-binding-protein
MQWKLFATVATLTATTGVLLVGCGQSSSSSSNAGNTTAKMARTQVLNWSENGQDLTTLDPSLATDVISGTMISNSQEGLYRLGKNSKVTPGIATKTIVSKDKKTYTFTLRKNAKWSNGDQVTAQDFVYGWRRTVNPKTASQYAYLYSGIKNADKIVSGKAKTSTLGIKADGKYKLTVKLEKPMQYFKLLMGFVVFFPQNQHAVEKYGKDYGTSSSKMVYNGPFKMTGWKGTNSTWTLKRNPNYWDKKHVYLTKIKDQVVKSTTTAFNLFQSNKLDMATLSGQQVKNEKNNNKLVIRKSSRLNYLEFNQKKVKLLANKKIRQAMSLTLNRKQLVNDVLGDGSVTPKGFVTTGLATDPTTGKDFATENTVKSAVTQDTTKAKKLWKQGLKETGKKSVTLTLTHDDTDQMKALAEYVQGQLEKELPGLKVQSVTVPYKTRISREIAGNFQLVISAWQADFADPVSDLGIMTSTNDYNFGKWTNKTFDSAINTANSTTSTTKRWQALATAEKTMATDQGVAPLSQNVIAQMVNPKLKGLVYNTAGINYNFKSAYMAK
>NZ_CP025586.1|WP_102115645.1|1072544_1073723_+|phosphoglycerate-dehydrogenase
MYQVKTYNAIAPAGLNTFTADYTLNQSEHPDAYLIRSVNLHTETLPSSLKVIVRAGAGVNNIPIDQATANGTAVFNTPGSNANAVKELIIGLLIMASRNLIAATTYSAQHTEADISQRTEHDKTQFNGIELTGKTLAVIGLGHVGALVANAALSLGMNVIGYDPYLSADAAWNIAKQVQRAATLPDAVKQADFVTVHVPKNADTLHLINKDALAAMPTGVQLFNYSRLGIVDNTAVMNALATGQVAHYYTDFGEPQLANQSAVTVTPHIGGSTIEAEINGATQAARTIMTYLETGNVHAAINLPDLNVPFNAAYRFTVIHENVPNMVSQITAKLAAAKLNITTMANAAKHQIAYTIIDVDDLQQPQQADLIAELSKIPAVSRVRLLKRGSVE
>NZ_CP025586.1|WP_102115644.1|1071455_1072529_+|3-phosphoserine/phosphohydroxythreonine-transaminase
MPIYNFSAGPAVLPQPVITQIQAELPSFRDSGMSILEISHRSDLFAQVLQDAEQDLRDLMAIPDNYHVLFFQGGGTLQFTAAPLNLAPHHRIGLLDSGHWAQRAADEAKRVGTKVTILGSSAANHFNQLPTVVQPIDQSLDYIHLTTNNTIEGTMMTRLPVTGQVPLVADMSSNFLGEPYQVSDFGLIFAGAQKNLGPAGLTIVIVRDDLIGQVANLPSMLDYQLFAAKDSMFNTPPVFAIYAAGLVLKWLKAQGGLSTMTARNHAKAALLYDFLDQSQLFTNPVKTSDRSTMNVPFVTGQAELDAAVIQGAREHGLLNLKGHRLVGGMRASLYNAMPLAGVQALVDYLAAFEAHHR
>NZ_CP025586.1|WP_003646364.1|1070448_1071072_-|histidine-phosphatase-family-protein
MTTFYVVRHGQTVANAQNLKQGTINTAVTHLNSVGKQQAQTLHDTFDISFADRLICSPLDRTQATAAILNQGRQLPVSQDERLLEISYGQWDGQDNDQLLAAYPQYFDPLLQDVLPSYVEVATDGETFEHVQQRVAAFLKTTAQAHPDEQIIVVTHGFTVKAMALAILKPTDPMSLPEPANTSVTKVMVDAVHGRQYLAYYNRLPQF
>NZ_CP025586.1|WP_003643690.1|1069198_1070188_-|aldo/keto-reductase
MTYSAASTRYDELPIRRVGKTGLQLPVVSLGLWRNFGDEAPFANSRKVVLDAFDHGVFSFDLANNYGPSKGSAERTFGQIMQRDLKPYRDELVITTKAGYPAWSGPYGAFGSRKTLISSLDRSLKQMHLDYVDIFYSHRPDPNIDLYETAAALDQLVRQGKALYVGISNYDRDQTATMVKYFNEMHTPFTVNQYSYNMLNQQAQTTGLIDYLGQHNAGLVAYGPLAEGLLTQRYLQGIPADFPIHRTNKYLFDQGTAAVVNQLNALNRIAEQRGQTLAQMALAWLLRSQVVTSVIIGTTNVDHLHANLEATHNLTFSDDEVKAITAILK
>NZ_CP025586.1|WP_003641799.1|1068475_1068697_-|hypothetical-protein
MEQLKPIEASLLQAYELNCVVRLTLSDGHQPSGLIAAVDDQQLFLNQQAGVVKPIALSDVTAIDFLKQSWWQR
>NZ_CP025586.1|WP_003641800.1|1068122_1068473_+|DUF1801-domain-containing-protein
MTPIEAYIANTPQAYQSQLIALQQTIATVLPEAQEQLKYQMPTFYWHENVIHFALFKHHFGLYPTPSAIETFHDQLITYKTSKGAIQFPLDQPLPLELITAITEFRRHEIIAKYDL
>NZ_CP025586.1|WP_011100918.1|1067263_1068136_+|NFACT-family-protein
MTTTTDVDLVQTGLAHLIHHTRKQIESLTKALDHLPDVSDLQLKGTLLKTYASQIEGHHHFVELPDYQGHQLSIKLDIKKSIIENAEDYFHHYHKSKRGQATVQQNLTTAKTELYQQLATQAAFDPNDPQAVAALKQTLIAAGAIHTHVLHSSKAPTPAHPRRFYTHDHVLVEVGKNSRQNDHLTLTARKDYYWMHAGGEIPGSHVVIHSNHPSEQTLQEAAVLTAYYSKGRQMNRVPVDVLTVGQMRKPKGAKAGLVTFSGPARTITVVPDATLAAELRDQEDIHHDAD
>NZ_CP025586.1|WP_003643688.1|1083079_1083994_+|LysR-family-transcriptional-regulator
MNIKDLYYFQRLISTQSYTQTAADFHVSQPTISQAIKRLERHFQVTLFFRQAKTKALVLTPSGQQLLLAANDIINNWQHVNESISHLRQHTLRFGIEPSVSEHYLPALTKPIIEQDLLSSVHTVEMGANQLVKQVLAGQLDLAISGNLDQTLDERLAVTPLRPFKFRILANVAHPLAKAEHPTFAEALKSPFVLLNATYLNKLVFRQLAEQLSIEPQVLFESDSSTLIKGLVKENLALGFISDITTPNDGEDDGLVEIPFDDVQVPSVHINLIRRAHQFPIGLVKQVIDIIEKTFAADNAEQKS
>NZ_CP025586.1|WP_102115648.1|1084193_1085867_-|alpha-glucosidase
MANQWWQSAVVYQVYPRSFQDSNGDGIGDLPGITQRLDYIKQLGADVIWLNPIYRSPGVDNGYDISDYYDINPEFGTMADFDQLLTTAHAKGLKIMMDIVVNHSSDQNKWFTTSAQSKDNPYSDYYIWRDPVDGHEPNNWGGFFGGSAWKYVASRDQYYLHSFAVEQPDLNWDNPQLRQAVYDMMNFWVNKGVDGFRLDVINLISKPDSFADGQPEAGEPYAAIGGIIANGPHLHEYLQEMNQQVFAGHQLMTVGETPGATVADAKQLASGQGQELNMVFEFEHMGLDGNPDPALGKWNDQPVRLVDLKQSLSKWQMGLQGTAWNSLYWNNHDQPRIVSRFGDERPAYRERSAKMLATLLHFLQGTPYIYEGEEIGMTNAHFTKLTDYQDLESLNAYHHFVDDEQVVQPEQMLGYLAHMSRDNARTPMQWDDSQNAGFSTATPWLAVNANYPRINAQLAQRTPGSVLSYYQRLIKLRHHLPVITTGTYHLLSPDDAAVYAYVRHRGSQHLLVICNFTAATQTRHFAELPADAHLLISNYDEDHQDVLRAYEAKVYQF
>NZ_CP025586.1|WP_027822622.1|1086412_1087813_+|Na+/H+-antiporter-NhaC
MPNSKKWRSVQLPEALLVLLIMLAIMGLGVIKFGLSPQTPVILVIALIILWARIRGAHWDDIHGGIIDGIKTGIIPIFIFLLIGALISVWIAAGIIPSMMVFGFHLISAQWFVPSVFLVCAIIGTSIGSAFTIISTIGIALFGIGTTMGINPALIAGAIISGAIFGDKTSPLSDSTNLAAAIAEADLFDHIRNLMWSTIPAFVVSLVLYAVLGAGAATQSHLGKIQTTLTVLNNNFTISWWAALPLVVMFACALLKIPAIATLLMNIGLAIVMIFIEQPHIALTKIATMIETGFVAKTGNAGVDALLSRGGISAMMSTVSLILLTLSLGGLLMKFNLIQTAMVPLTKRLKGAGASVTAAILAGIGVNIFVGEQYLSVILPGKAFKTTFNQRGLANLALSRVLEDGGTVINYLIPWGVAGAFAANTLGVSTLAYLPFCFFSLLSPVFSIISGFTGWGLKHQPANEAG
>NZ_CP025586.1|WP_003643686.1|1088033_1088948_+|NADP-dependent-oxidoreductase
MLAYGYQKFGGPTVFEELPQSQLIPTDNQLLIKTLAVNLTEEDRLERLGTIQSVALPHIPGHDVIGKIIQVGAAVTDLDVGTVVAARTNHTYADQVCLDSDLAVTMPTNLDPVTAVSLVTPGIVAYKTVRYFADIQADQTVIVKGAGSPVGLLIIQLAKRLGAHVIAIASDRYANLIATLGVDQFVDYQHQNPVHVLADRGDVVINVAIDGVGGKDDLAMAKFDATIASFARHLPATSKSIRFQAIQPTEVISDQAALQLLFKLLDTGQLTTTINEQLPFNLTGFIQGHQRLDEPHVGQVVVAR
>NZ_CP025586.1|WP_015825049.1|1089104_1090781_-|alpha-glucosidase
MAATIKWWQQAVVYQVYPRSFQDTNHDGIGDLKGITAHLDYLKQLGIDVIWLNPIYRSPNDDNGYDISDYQQIAADFGTMADFDELLQAAHDRGLKLIMDLVVNHTSDEHPWFKRSRQDRTNQYRDFYFWRSGNGKKAPNNWDAAFGGSAWQYDEQTQQYYLHTFSTKQPDLNWENPTLRESVYTMMTWWLNKGVDGFRMDVINQISKLPGLPNGPLKPHSQFGDARVTNGPRVHEFLQEMNQEVLSQFDIMTVGETHGVTPADALKYAGADRHELDMVFEFQHLRLDNSQHGLGKWSTRKTPLVALKKVISDWQVGLEGRAWNSLFWNNHDTPRAVSRFGDDRPAYRVRSAKMLATCLHLLQGTPYIYQGEELGMTDAHFTELASYRDIESLNAYRDLVTERQLLSPADMMARLAARSRDNSRTPMQWDTEVNAGFSDAAPWLTVNPNYRQINAAAALADLDSVWYYYQHLIQLRHQYPLVTLGSFELLWADDPQVFLYERQWEGRTWLVCCNFTAETLSRPLDQYLTPTAKCLISNYGEQQPNKLRPYEAWVYQLA
>NZ_CP025586.1|WP_003641783.1|1090801_1091782_-|LacI-family-DNA-binding-transcriptional-regulator
MKPKLNDVAKLAGVSATTVSRVINNHGYLSSQTKEKVFAAMRELHYQPNNMARSLQGKNTRLIGVIFSDISNPFFGELVSRIEKILFAKNYKVILCNSADDPQKERDYLQMLMANQVDGIIAGAHNLGIEEYQQYGLPIISFDRYLSDNIPIVSSDNYQGGWLATQTLHQAGATNVAIFTGKSHAGSPTNGRREGYEAYLTAQQLTPHVHELPFELTPALKMMEIKTIMTQHQYDGIFCSDDLTALLVLNVARQLSLTVPEQLRVVGYDGTALIRDYHSELTTVEQPLADISTLLVSLLLQRIEDANCTLESKYTLPVKLIKGLTA
>NZ_CP025586.1|WP_003646356.1|1091762_1093268_-|sucrose-6-phosphate-hydrolase
MIWNRKTRYTPYEQWPATKLPQLVAQARQSKWRMQHHIQPTSGLLNDPNGFSYFDGQWHLFYQVFPFGPVHGLKSWQHVTSKNLVDWHDEGLAIRPDTPYDSHGAYTGTALPIDDQLFIMYTGNVRTADWQRESYQLGAWMDTDNHIKKLSRPLIAHAPAGYTSSFRDPDLIRTDHGYYALIGAQTTTEIGAILVYFSKDLTTWTCQGELNVPANARGYMIECPNLVWIDQQPVLLFCPQGLSQTTTPYQNIYPNMYLVADQLDLAQAQFTEPHALTQLDDGFDVYATQAINAPDGRALAVSWIGLPEIAYPTDRENWAHCLSLVKELTLKDGHLYQNPVAAVDDLRMTAHDLVFEQQRATVAALNGSFELLLTVPADKTVTVNIADQQESGQLQVTVDANHGQVMIDRRHTGNSFAEDYGQTRQVELTAHKTIKIRLIIDVSVFECYIDNGYSVMTGRFFLNATPSRLNVQGDTTAVTGKVWEWRQSEHTGVDNNETKIK
>NZ_CP025586.1|WP_015825048.1|1093523_1095479_+|PTS-beta-glucoside-transporter-subunit-IIBCA
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>NZ_CP025586.1|WP_102115649.1|1095498_1097658_+|alpha-galactosidase
MPVEYAPKTGLINLHNDQISYVIQILAHRYPVHRYFGRYFSKQPYFEPMPSGSHAFANDPTERFPYSVTSLPLEYSTIGSGDYRQPAYVIKDANNQLLPILEYTGFSVNDQPINSRQLPPTVSKHTPVTTLIIHLADSVTKLQMDLNYTIFENQPLILRSTTLRHHGTTNLQVTALSSAQLDLPTDQYTALTLSGTHAHEANPSFNRLHPGLQTVRSLRGTSGPQHQPFMALAEPNTTELAGTVIGCTLAWSGNFDSTVEVDQYQHSRLTIGLEPDTFEWQLKPNSSFQTPEAVLTWTNTGFNGMSQVFHDFSYQLMPSQTNIPSVLNTWETLTFAVSESKVQHLIEHAHQLGLQMLVLDDGWFVNRNGENGQLGDWYVDPIKFPNGLKPLAQQAHHHRMKFGLWVEPEMITTNSQLYQQHPDWVLQYVDRTPITARHQLVLDLSQAAVRDHLVTTLTNLVQNNQLDYFKWDMNRHLTQVGNTHLPAAQQGELYYRYVCGLYDILTRLKRACPKLIIENCSAGGGRFDFGMLPYTNQTWISDLTDPVDRATIENGFSYLFPPRIFSNHITASPNAQNGRITPFETRLQLACIGQLGLELNPKQLAPSEQQLLRGALIKYQQLKSTFIKAHFYRLPTTRHVVAWLLVTADKKQAICCYLNRLNSAVKTQHPLPLHYLDAELTYSDSSGNRYTGHQLNTMGIPLKPTNADFTSQLIYLRQS
>NZ_CP025586.1|WP_015825046.1|1097737_1098604_+|ROK-family-protein
MLLGAIEAGGTKFVCATGAENGQVSDRISIPTTTPAETMTAVDDYFTTHPVDAIGIGSFGPIGVNPDDPKYGYITTTPKPGWGDFDFLGHLKNRFNIPLYWTTDVNEAAYGESMIGIAKDVPNSIYMTIGTGVGAGVISQNHIFNGRTHTELGHMRLNRLPGDDFKSNCPYHDICLEGLAAGPAVGKRTGKAGKDIPVDDPVWPIIADYIAQACVNLTVAFAPDKIILNGGVMNQRQLFPMIREKFAAYLNGYEEVPPLDDYIVPAGLGNNSGIAGGLLLAQAALKNA

MGE targeting detection<

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NZ_CP025586_1	1.1|1079494|25|NZ_CP025586|CRT	1079494-1079518	25	NC_017575	Ralstonia solanacearum Po82 megaplasmid, complete sequence	1430840-1430864	3	0.88
NZ_CP025586_1	1.1|1079494|25|NZ_CP025586|CRT	1079494-1079518	25	NZ_CP026308	Ralstonia solanacearum strain IBSBF 2571 plasmid unnamed, complete sequence	1430784-1430808	3	0.88
NZ_CP025586_1	1.1|1079494|25|NZ_CP025586|CRT	1079494-1079518	25	NZ_CP051295	Ralstonia solanacearum strain CIAT_078 plasmid megaplasmid, complete sequence	918402-918426	3	0.88
NZ_CP025586_1	1.1|1079494|25|NZ_CP025586|CRT	1079494-1079518	25	NZ_CP012944	Ralstonia solanacearum strain IBSBF1503 plasmid unnamed, complete sequence	915557-915581	3	0.88
NZ_CP025586_1	1.3|1079593|25|NZ_CP025586|CRT	1079593-1079617	25	NZ_CP038867	Vagococcus sp. CF-49 plasmid punnamed2, complete sequence	24133-24157	3	0.88
NZ_CP025586_1	1.1|1079494|25|NZ_CP025586|CRT	1079494-1079518	25	NZ_CP016082	Streptomyces sp. SAT1 plasmid unnamed2, complete sequence	204374-204398	4	0.84
NZ_CP025586_1	1.1|1079494|25|NZ_CP025586|CRT	1079494-1079518	25	NZ_CP049158	Caballeronia sp. SBC1 plasmid pSBC1_2, complete sequence	646182-646206	4	0.84
NZ_CP025586_1	1.1|1079494|25|NZ_CP025586|CRT	1079494-1079518	25	NZ_CP049318	Caballeronia sp. SBC2 plasmid pSBC2-2, complete sequence	645393-645417	4	0.84
NZ_CP025586_1	1.3|1079593|25|NZ_CP025586|CRT	1079593-1079617	25	NZ_CP016082	Streptomyces sp. SAT1 plasmid unnamed2, complete sequence	204374-204398	4	0.84

1. spacer 1.1|1079494|25|NZ_CP025586|CRT matches to NZ_CP026091 (Ralstonia solanacearum strain IBSBF 2570 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.88

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cgcgtcactcgattcactcggctca	Protospacer
**  *******.*************

2. spacer 1.1|1079494|25|NZ_CP025586|CRT matches to NZ_CP026093 (Ralstonia solanacearum strain SFC plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.88

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**  *******.*************

3. spacer 1.1|1079494|25|NZ_CP025586|CRT matches to NZ_CP012940 (Ralstonia solanacearum strain UW163 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.88

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**  *******.*************

4. spacer 1.1|1079494|25|NZ_CP025586|CRT matches to NC_017575 (Ralstonia solanacearum Po82 megaplasmid, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.88

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5. spacer 1.1|1079494|25|NZ_CP025586|CRT matches to NZ_CP026308 (Ralstonia solanacearum strain IBSBF 2571 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.88

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6. spacer 1.1|1079494|25|NZ_CP025586|CRT matches to NZ_CP051295 (Ralstonia solanacearum strain CIAT_078 plasmid megaplasmid, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.88

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7. spacer 1.1|1079494|25|NZ_CP025586|CRT matches to NZ_CP012944 (Ralstonia solanacearum strain IBSBF1503 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.88

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8. spacer 1.3|1079593|25|NZ_CP025586|CRT matches to NZ_CP038867 (Vagococcus sp. CF-49 plasmid punnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.88

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9. spacer 1.1|1079494|25|NZ_CP025586|CRT matches to NZ_CP016082 (Streptomyces sp. SAT1 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.84

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10. spacer 1.1|1079494|25|NZ_CP025586|CRT matches to NZ_CP049158 (Caballeronia sp. SBC1 plasmid pSBC1_2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.84

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 .***** *************.***

11. spacer 1.1|1079494|25|NZ_CP025586|CRT matches to NZ_CP049318 (Caballeronia sp. SBC2 plasmid pSBC2-2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.84

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 .***** *************.***

12. spacer 1.3|1079593|25|NZ_CP025586|CRT matches to NZ_CP016082 (Streptomyces sp. SAT1 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.84

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	59075 : 120347	66	Lactobacillus_phage(91.49%)	tRNA,capsid,portal,integrase,protease,tail,terminase	attL 80589:80610|attR 120406:120427
DBSCAN-SWA_2	434836 : 477773	35	Lactobacillus_phage(50.0%)	bacteriocin,tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_3	846991 : 903747	52	uncultured_Mediterranean_phage(20.0%)	bacteriocin,tRNA,protease	NA
DBSCAN-SWA_4	1526337 : 1534625	7	Planktothrix_phage(16.67%)	bacteriocin	NA
DBSCAN-SWA_5	2012715 : 2021226	9	Synechococcus_phage(33.33%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_6	2183213 : 2275157	99	Lactobacillus_phage(52.5%)	transposase,head,capsid,holin,portal,integrase,tail,terminase	attL 2215049:2215070|attR 2273141:2273157
DBSCAN-SWA_7	2560864 : 2632390	83	Lactobacillus_phage(75.51%)	tRNA,transposase,head,capsid,holin,portal,integrase,protease,tail,terminase	attL 2553917:2553934|attR 2625360:2625377

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP025586|59075:120347|DBSCAN-SWA
ATTACATTTCATCGGGAGCCTTAACGCCAAGTAAGCGAAGGGCTTCCTTCAGGACGATGCTGACACTCTTGACCAAAGCCAGACGAGCGTTTAATTCATCATCTTCAACTAAGATTTTGGTGTTAGCATAATACTTGTTGTATGCCTTGGCTAAGTGGATCGCATACTTAGCAATAACGGATGGTTCGTATTCCGTGCTGGCACGTACTACAGTCGCTGGGAATTCACTCAATAACTTCAAGGTATCCCAAGCGGCTGGGTCGCTTAACGTTTGCTCGGTTGCCGCAATTTCTGGGCTACCAGCTTTACGTAAGATACTTTCAGCGCGTGCATGGGCGTACTGCACGTATGGCCCAGTCTCACCCTCGAAACGAACAACTTCTTCCAAGTTAAAGTCAAAACTGTTCATCCGTTCGTTCTTCAAATCATGGAAGACCACAGCGCCAATCCCAACCGCATCCGCAACTTCATCCTTGTTAGGCAAGTCCGGATTCTTGGCTTCGATTTGTTCATGAGCTAACGCAACCGCATCGTCCAAGACCTTATCAAGCAGGATGACCCGGCCACTCCGAGTTGACAACTTCTTACCACCAGAAGTAATCAAACCAAATGGAATGTGGTGGATCTGGTCAGCCCAGTCAAAGCCCATCTCGGTCAACACAGCCTTTAATTGCTTAAAGTGGTTGGTCTGTTCATTCCCAACGACGTAGAGGGACTGCACGAAATCATAAGTCCGTTTCCGGTAGATCGCAGCGGCCAAGTCCCGCGTGATGTATAAAGTCGCGCCATCTGATTTCTTAATCAATGCCGGATTCAAGTCATATTTGCTTAAGTCCACCACTTCGGCGCCTTGACTTTCTTGCAAGAGGTGCTTGTCTTCCAAGATGTCGACAACTTCTTGCATCTTATCATTGTAGAAGGCCTCACCCTTGAAGGAATCAAAGTCGATATCCAAGCGTTGGTAAATCTTCTTGAACGCTTTCAATGATTCTGAGCGGAACCATGACCACAGATGGGTGGCTTCTTCATCACCATTTTCCAATTTCTTGAACCATTCACGCGCCTCGTCATCCATTTCAGGATGATCGACGTCTTCTTTATGGAAACGTACATAGTATTTTAATAAGTTATTGATTGGATCAGCTTTGACCTCAGCTTCGCTTCCCCACATTTTGTAGGCCGTGATCAACTTACCGAACTGCGTGCCCCAGTCACCTAAGTGGTTGATCTTAACGGGTTGGTAATCCAACTTACTTAAAATATTTGCCAAAGAATTCCCAATCACTGTTGACCGCAAATGCCCCATTGAGATTGGTTTGGCAATGTTTGGCGATGACATATCGATGGGAACTTGACCCGCTTCACCGAGCTTAGCATCACCAAAATGGCCACCATTCGACAACACTTGATTTAAAATATCGGCTGCAAACGCATCCTTCTTGAAGAAGAAGTTAACGTACGGGCCCATTGCAACAACTTTTTCAAAGTCACTGCTATCGACTTTTTCGACGATGTCGCTGGCAATCATTTGAGGTGCCTTGTGTAACGTTTTGGCTAAGGTGAAGGTCGGAAAGGCCAAGTCCCCCTGCTTAGACGTCTTTGGTTGTTCGATCTTATCTAGAATCGCTTCCTGCGTTAAATCTGGTAGTGCTGGCGCTAAGGCCGCTGCGACGAGTTGTTTATAATCCATATTGTCCTCCTTGATTGTCTTACGGGACAAAAAAAGTCCCTCACATATTTAAAAACATGTAAGAGACGAGACGTGCCCGCGGTACCACTCTAATTGATATGACATCCACTTATTATCGAATTGTCGTCTTCAAAAGCGCGCTTCCAATAATGTTTAGATTCGGCTCCCATCATCCCGAACTCGCTGGTCTAAACGTTCATCGTACTATTCTTTCTCATTAGACGTATATATTTTTACCATGCGTTAGTATAACAGAATTCAGCCGTTTTGACTAGTTCAACGTTAAAATCATATTCTGATGTGGAATCCCATCTTCTAAATAAACGCCAGAGACTGGTTGAAAACCAAATCCACGGTAGAAGCGATCTAAGTAATGCTGGGCCTGAATATTGATTTGCGTCGTGGAAGGCCACAACGCTTGAATCTGCACAATCGCCTGTTGGAGCAACTGCTGACCGTAGCCGTGCCCCCGCACCGCCGGATTAGTGATCACCCGGCCGATACGGGCCTGCTGGTTGGCTTCACGCATTAATCGCGCATATACTAGCAGCTGTCCCGTTGAATCCAGCCCCCGTAAATGCCAAGCCATCAAGTCCGTATCGTCGACTTCTTGATACGGACAGGCCTGTTCGACGACAAAAACCGCCACTCGTAACTTGTAAATCTGTTGTAACTGCCGAACAGTTAACTCATCGAAAGATGTTGTTATAAATTGCATTTGCGCTCCTTAACGATTACTGTTGATCACCCATCCGGTCAACTATTTAGTCATCTTGATTTTTACTCAATAAAAAAGAACGGGTCATTGCTGACTAACGTTCTTGATTATCATCATCTATTGACGGTCCGTACGAGACTCGAACTCGTGATCTCCTGCGTGACAGGCAGGCGTCCTAAACCAACTAGACCAACGGACCATGCGCTCAAGGAGCTTGAGAATACAATGACTACTAACCGAAATGATTAATAGCAAAGCGGGTGACGGGAATCGGACCCGCGACGCAAGCTTGGGAAGCTTGAATTTTACCACTAAACTACACCCGCATTTGACAACAGAAATTAGTATAGCATACATTTTTTCTGTTGTCATGGTTATTTATAAATTTTTAGTCTTCTTTTTCTGGGACGACTTTCGGCTTTGGAGCCGCTTTAATGAGCTTAGCATCATCCTTACGAACAACTGCGCGGTGGTTATACTCGTTAACAATTGGTTCGTCAGCTTTTTGAAATTCCTTAATTAAGATCAAGACTGAATTTTCATACACTTTTTCAATTTCACCCTTGAAATCATGTTCCAACGAAGCAAACTTCTTACCAGCGACGTAATCGCCAATTTTTAATTCTACGGCCATTTGTAAACTCCTTAACGTTTTTCAATTCATGCCCCGTCCACAGGTGTCCGGGAGATTATATGAGTGACTTTAAAATAAAATTGATAACAAATACTATCAAATAATCCACTTGGTTGCAAGCCTTAATTACAATTTTTCCGAATCGTTTAATATTGGTTCGGCCCCTTCTGCGACCGTGTTTGTCATGCGGGCCTGTTGTCGTAAATCGTGGACTGATTTAATATAAGCAGGCAAAAGTACGGCACACGACCCTAACCAAGCTAACGGTTCCGAACTACAAGCACCGGCGTAATCGAAGATCCGAACTAAGATCAGCGCTGCAAACACCCGCATAAAGAGTTCCGCCGCGCCTGCCAAAGTTGGAATTGCGCTGCGTCCAAGCCCTTGCAAGGTATTACGCATAATAAATAACATTGATAATAGGATATACGTGCTCCCGATGACGTTAAAATACGTCTGGGATAAGTTCAATACCGCCATGTCCTGATGACCGACGAAGAATCCCACAAGCTGTTTACCCCAAATAATTTCAATCAAACCGGCAGCCACACTAAAGCTCCCCGACAGCCACATGGTCTGTTTGACTCCCGTGATAATCCGTTCATACTGATGAGCACCATAATTTTGAGCCGCGAAAGTCGCCATGGTGACCCCAAAAGACATTAATGGCTGAGTCGCGACTTGGTCGATTTTCTGAGCGGCAGTCGTCGCCGCCACTGAATTAGTGCCAAGACTATTCAGTGCCGCTTGTAACACAATCGTTCCAATCGCAATGATCGACATCTGAAAAGCCATGGGTAACCCAACATTCAGGTGAGCCTTCACTTCCGACCAAACTAACTTGAAGTGGCGCCGTCCAATGTGCAAGATGGGTACTTTGACGATGATGTAAACCACACACATGAGCGTTGCAATGGTTTGTGCTAAAATGGTTGCCCAGCTCGCCCCGGCAATGCCCCATTTGAAAACCAAAATGAATAACAATTCCAAGCCAATATTAATTAACGCGCTGATAATCAAAAACCATAAAGGCGTGCGACTATCACCGAGTGCGCGAATGATGTTTGACAACAGGTTGAACGCAATTGGTGCCAGCATCCCGCCAAGCATAATTTGTAAGAATGTCCGCGCATCCGCAATGATATCCGTTGGCGTTTGCATTAACAACAAGATATGGTCAACGAAGATCAACGACAGAATCGTCAAAATGATCCCAACAATTAGACTAACTACGATACTAATCGCAAAACTGCGCCGCACTGCTTTAAAATCACGTGCCCCAAAATGTTGGGCTGTTAATATGGATAAGCCAGCGGTTAACCCCTGCGCAAAGCCAATGATCAAAAACTGAACACTCCCAGTTGATCCAACCGCCGCTAGGGCTTTAACCCCTAACGTCTGACCAACGATCAACGTGTCCGATAAACTATAAAATTGCTGAAAAATGTTACCGATTAGTAACGGAATCGTAAACCAAAAAATTAATTTTAGCGGTTTTCCCTTTGTTAAATCGTTCATTTTCGCACTCCTTTCATTAATTAAGATGACGTACTTGTAATCGTTTTCTTGGCGCTTTGCCAGACAAGCAAACTTTGCTAGTATATCAACTTTAGATTTATAATACTAGTCCTTTGTTCGCAAATATTAAATATTTTATTTTAATTAGTGAATTGGCCGTCTTGATTTACTTTTTAAGGTTATTTCACTGTGCTAAGCTGTCACCGATTTACTAACCAACACAAAAAAACTTGTCAGCAGGCGCTCACAAGTCTTTTAGATTCGATTAAGTCACATCACAGCACCATATAATAGTAATAGGACACAAACACACAAACGACCATACAAATCAAATTTAACGGAATTCCGACTTTAAAGTAGTCCGTGAACTTATAATGTCCAGGGCCGTAAACAATCAAGTTTGTTTGGTACCCGATTGGCGTTGAAAAGTCTGCCGTCGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_015380163.1|111663_112143_-	siphovirus Gp157 family protein	A0A2P0ZLB3	Lactobacillus_phage	1.1e-79	93.7
WP_021730257.1|112245_112416_-	hypothetical protein	A0A2P0ZLA6	Lactobacillus_phage	5.5e-26	98.2
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WP_043993003.1|113118_113391_-	DUF771 domain-containing protein	E9LUT3	Lactobacillus_phage	4.5e-30	66.7
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WP_015380154.1|114179_114569_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A2P0ZLA1	Lactobacillus_phage	1.5e-66	97.6
WP_003643876.1|114578_115010_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLA0	Lactobacillus_phage	7.6e-80	100.0
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WP_102115509.1|116307_119046_+	SAM-dependent DNA methyltransferase	Q6NE04	Leptospira_phage	3.4e-141	34.6
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120406:120427	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP025586|434836:477773|DBSCAN-SWA
TGTGCTATACTCTTGGCATGGGGGGATTAACGTGAACAAAAATGATAAAGCCAAGCGTTTGATGCAACAAATCGACGTTGCCTATAATGATCCTGAAGTTAAACAAGACGCACAAGTTCGTGCTGACTTACTTCGCTATGCTATGGAACTTGACAAGAACGGTAACTATTTATTAATTGCCACTAAAGTTAACGGCATGGCAATGCGCGTCATGCGTGATCACATGCACCAACCACTCCAAGCAATTAACACACTCTACACCCAAACCGCCCGCACCTCCGAATATTATTGGGGCGTGGCGGCAGCTAGTATTTTTAGTGGGCTGTGGTAAAGCACTATCACGTGCGAGCGCTCACTATAAATCATATTAACAACAGTTTTGAACCGGAACACAGACAAATAACTTGAATCAACCGTTAATTTCAAAGGGTCGCTCCTGACAAACCATGCCAGAAGCGCCCCTTTACTAACTACTTAAAATTTTATCGATCAGAGTCAAGTTAACAGCTAAAGTAAGGCGTTGTACTTGGCTCAGCCATTTACTTCAAGTACCCGGTTTCATTCCAAGTCGTCAGTTCAAAATGCTGATTATCCGTCGTCGATAACACTGTCAGGCTATCATTATCCACGATTCCGTGGCCGACTGTCTTCATAACTTGCCCATCGACCACAAAAGGTGCTCGTAATTCTGCTACGGGGACACCCATTAACGCCTTGACAGTCATCGTCGTCACCAGGCCATGCGATACGATTAATAGTGGTTGCGTGCTAGCTACCCCAACTTGATCAATCAAACGATGTAGCGTCGAAGTCGTTCGGGTGACAAAATCCGCATAACTTTCGCCACCGCCAGCTAGTTCCGGTCGGTATTCGGCGGGTTTAGTAAAAATAACTTGGGCGTAGGACTGCGGCTGTACTTCCGCTTCCTGTTTGCCGTCCCAATCACCAAAATCAAACTCACGCAAGCCATCGTCGATTTGAATCGGCGGTTGCCACTGATTGGCAGCCACAATGTATTTCGCCGTATCCAGCGCTCGTTGCTGCGGACTGCTATATACTGCTGAAAATTGGGTGGTGCTTAAGTAATCACCAGCGGCTTTTGCCCCATCGATTCCGCTAGCAACCAGCGGGGAATCTGCTCGTCCACCTTGAAATCGGTGTTCTAAGTTATATTGTGTTCGACCGTGACGAATGAAATAAATCTGCATGGCACGTTCACCTTCCTAATCCGTTCAATAGTTTAATTCTAACTGTGTCATGCTCAATAGAAAAGTCTTCAGTGCCATAATGACGTAAAAAAATACCGTGGTCTAAGAAACACACCACGATATTTCAGTTATTATGATAAAGGCTTAACCAAGTGCTGGTACGGATGTGTGCCAATCATGAGCTGACCATCCGGGACAAAACCATGCCGGTGGTATAACTTAGCTGCCCGGGGATTGCCATCATCAACGTTTAAACTCAGTTTCGTGGCCCCCAGTTGACCAACGAGTCCTGGTAATGCTTCTAGTAAGGCACTACCAACTCCGTGACCCTGAGCTTGCGGATCAACTGCCAACATGCTTAAATACCACTCATTCGGCCGGGTCTCACCACCTAATTCCAGTGGTGCCTCAAACCCCGCATGATGACCTGAAGTCGTCCGCAACAAATCGTTTACAGCGACTTCATTCTTCGCTAAGTGCCCAAACGCGACACCGACGATTTTGTGATCCATGACCGCCACAAAAGTCTGCGCTAACCCATCTAAATTGGCCGGTCGCTGATACAACTCAGTCAACATTGCCAATAGGTCGGCCTCGCTAACATTTTTTAAGACTGGCATTTCCATATCACGGTAAATCATCGCAATCAATGGTGCAATTTGAGCACTATCTTGCGGTTGTGCCGTTCGAATTTCCATCATCACAACGCTCCCAACTGTTTTCTCAACCGTAGCAAATCCCGCGGTCATCGTCAATCGTTGTGCTTAATTTGTTGCCGATGTTGAATCGTCATCACCCACGTCGTGACGGGAACTACCAGGATAACGCCAATTAACGAGAATAATACCATTAATACTTCCGCAACAAATATTTTATTATTGATAACACTCCCGAAGGAATAATGTAAGCCCGCAAACCAGATAAATAGCGCCAAGAAGCCACCAAAAAAGCCGAAAAACAAGGTATTAAAAGTCGTCCCGATAATCTGCTTACCAATACTGATACCATCGATATAGAGTCGCTTAGTTGGCAACTGCGGATGCTGCGCCAGAATTTCACTCAGACCAGCCGCAATCGCAATAGCAGCTTCCGCAATGGCCCCTAGTGTACTTAAAATTGCTTCAGTTACTGCTACGCCAATAAAGGAGACCCCAATGGCTAACGACATACCTTCCAGATCTTCACTATCTTCTAAACTAAAGCCCTGCGCCATGATCCAATTTTCAACGGGAAAAATAATCAGCACTAACATGACCATAACAATCAATGCTGCAATATAAGCTGGCTTGGCCGCCACTTCGTTGTCCTCCCCAAAGAAAATCGTGAAGGCCAAGATGATTGTCCCAATGACCAACGACACCCCCATTGCTGGAAAGCCCCATGAAATCAAAACAACGGCTAAAAACAACAATCCAAAGTTAAATAACAAACTCAAAAAGGCCGTCGCTCCAGTCTTACCACCAATTAATGTCATCAAGCCTAGTAAGATCAATCCTAAAACGGTAATCGTGTTCATACCATCACCGCCTTAGGCATCAATCGACTGGCTAACCAACTGGCTACTGGAATCGCTAAAACGATACCGATACCAGAAATCAAACTTTGGACCATCCCCAACGACATATTCATTGTAAAAGTGTAACCCCAGCTATTGCCGTTACGGAAATAGAGCAAAGTCATCGCGAAAGTATCCGCCATGAAAATCAAAAATAGCACGTTGATCAAGGGCCCCATAATAGCCCGGCCAATTTGAATACCCGACTTAAATACTTGTCGTGGTGCAATGTCCGGGCGCTCCGTTTTCAATTGAAACAATGAAGCAACAATATCTGTTGATTCATCCATGACTGCTCCGAGTGAACCGAGGACTGTTTCGACTAAAAATAACGGTCGAGGAACCTGCGTCACGTACTGCATCGATTCATAAGTCACACCACGCTCATGGGTCACCGCAAAGACGATCAGACTAATAATGACAGCCAGTCCCGTGCCAACCACAGTCGCGCCCAATGTTACTAACATTTGACGACTAAAACCGAGCACTAGCAACAGTGTGAGCACGGCGAAGATTACGGCCAATACGCCAAAGAGCAGGTAAATGTGGCCACCATTAGTAGCTAAGTCGATCTGAATGGCGGCATAAAATAGTACAGCATTGAGTGCAACACTCAAAAAGGCCATCAGACCGCTGAAACGCATGATTAGCAAGAGCAGTGCTAGGGCTAACCACGCGACAAACGCCAATGCGGTATCTCGTTTTAACCCCTGAATCGTCACTGCACTACTATGATCACTAGGAATCCGTAAGAAAACTTGATTACGGACGTGATACGGCTGATCCATTGCGCCCGAGCGCGTATACGTATTCTTGATCTGGTAAGTTCGACCACGATGTGCCTTATTGAGCACCCGGACCGTTACCAACTGTGTCACCGTCGCATCCTTATTTTCAAATTCATCCGTCGTCGTACTTCGACTCTTAGTCTGCACGTGGGTCACTTGTGCAACTGTCTGCTGATAAAGTCCCGCATTAACCCGGGTCAATCCAACCCCGATTAGTCCTAAAACAATCACCAGCAGTGTTAACCACAACCCCCACCGTTGCTTGATTCGCTGTTTCACATTTTCACCTTTTTTCACTTCAATGGTCACCAGTTTACCACCCATTTTCCAATACAAACTTCGATTCTGGCAATCTTTAACAGAATCTAAGTTTCTACGGTAATCTAGGCCGTTACTTGAACGCGTAAAGCTTTCAGCCAAGCAATTTCTTCCTCATCGTGGAGGCGCTGAGCAATTTTTAGTCCCTTTTCAATCAATGCCAGGGCCTGTTCAGGTTGCTGATGGACCCGCCATTCATAAACGGCAGTTAACTTATAATGAGCCAAAGGTTGGTAACGACGTAATAACTGTTGAACACCATCATCTTGATACCAGGCTATGATCTGGGGGTCACGATGATTGGTGACCAAGTTCCAGTACAATGTCGCATCTAAATACTTCGCCAAATCAGCTGGCGGCAACGTATTGAAACTTGGCTCCAAGCGACTCAACCCCGCTAACAGTTCGGGGGTGTCCAGCCCATGTTGAAGTCCCCATTCCAGAATCAACCAGGCTTGCCGAACGACTAAATAATTCCGATTGCCACCATCGCGCGGCATAACAATCATACTCGCATCAAGGTCACGGACACTACCGGTCTGAACCTTAACGGCCGCAGCACACGCAGTGACATACGCGGCGGTCATCGCCGCCGTTGATTCGCGTGCCTGCCGAAATTCCTGGCCCGCCGTGGGATAACCGTGCAAGTTCATTGGTAATAATTGGGCGGCTTTCAACGTATTGACCCAGATCCAAATAATGAACGCAAACAACCATAAATCGAAACTAAACTTAAATTGATTCAGAGTTATTAAACTGAGCATGACCGTCAGTAAGTTGAACAGGCCACCACCAAAACAATAAATGGCGTGATTGAACCGTTTGGCATCCGCCGGGGGTGCTGCCACGATATGTGGATGACGCGTCAGCGGTCGTTCTAATTTCCAATGACCACGAACCCGACTTAATTGAAGTCGAAAACCGGTAATCCGGACAATTCGAGCACCAATTAATCGAAATCCGACCCACTGACCGAGCCAATGGATTAACGTCGCACCTAGTTCGCTGGCGACTAGTGCCAATCCTAGCCAACCGACTGTTGCAATAAATTGTCCAAAAACTTGCATGCTATTCCTCCTCGTACCTTGATTGACAGCCTTTATTTAACAAAATTAATTTTGAAATCAATAA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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

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MQPDIICANGVFCADGKVLLTRESKNTAYYFPGGKVGVGETLTQTLQRELKEELSLVVSPDRFKWAFTHRGTAYNQPGKIVELNCFLVAGSGALKVDSEVYDYKWCRPDDSRIAEVVREALARYSWVVE
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MSEQYFDPKLKIFALNSNKPLAEKIADAVGVKLGKTSVDRFSDGEIRINIEESIRGDQVYIIQSTSAPVNDNLMELLIMIDALRRASAKTINVVIPYYGYARQDRKARSREPITAKLVANMLETAGATRILALDLHAAQIQGFFDIPLDHLMGAPLLADYFLNHHLDENAVVVSPDHGGVTRARKLAEFLKAPIAIIDKRRPRANVAEVMNIIGDVKGKRAIMIDDMIDTAGTITLGAQALVDAGATEVYASCTHPVLSGPAIERIEKSPIKKLVVTDSIELPAAKRIDKIEQVSVGQLMGQAIKFIHENKPVSPLFKNRFHNEEN
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MKQSTKFGLKLAGVVGAATYAGTLLGGLAAYQVAMHVSDAQKQRGRERSRAENTEIENFWYFKQPKQQWMIQSFDGLNLVATYIPNPKTIGRLAILAHGLGHSREQMIPYARIFMSLGYDVLMPDARSFGDSQGHTIGYGWLDRLDYERWITMALSQLGLDIDIVLMGISMGAATVMATSGEPLPENVKAIVEDSGYADLYDEAKFRLTHKFHLPAYPIMPVANRLAHVRAGYGFKDGRILQRVIDGGLPILMIHGSKDQTVPVRNAHTLYDQLPQQKGLYIDPDAGHVEAIRTHPDRYQEVLDEFLHEQAGLA
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MTKKVFLTGDRPTGKLHIGHYVGSLRNRVALQDSGDYDSYIMIADNQALTDNAHDSEKIRKSLLQVAMDYLAVGIDPQKSTILVQSQIPALTDMMNQYLNLVTVARLNRNPTVKTEIKQKAFGESVPAGFFVYPVSQAADITAFKATTVPVGDDQEPMLEQTREIVRSFNKTYQTDTLVEPEGYFPPKGLGRIPGLDGNAKMSKSLGNAIYLSDDADTLKKKVMSMYTDPDHIHIEDPGKVEGNVVFTYLDIFDEDKTKVADLKAAYQHGGLGDVKIKRYLMDVLDGVLRPIRERRAIYEADPAQVLQILKDGTAKANVVADQTWREMQDAIGINYFK
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MTADFRHFYQKNWAERTAIVAQQAHLTPAEQALFKQYYLPQHHEIIENYLTDYPLPMGLAVNLVVDGVDHIVPMVTEEPSVIAAASNGAKIVKRAGGFTTVLNQREMIGQIVLEQLSDPAATAAVIEAHAAALLKVADAAHPSLKKRGGGARRLRTRVLGQGYLSIDLFVDVQAAMGANMLNSMLEAVAKSIGVMTKQDALMSILSNYATASLVKAICDIPVGLLQAGRYAGKLVAQKIASASTVAQLDPYRATTHNKGIMNGIDAVAIASGNDWRALESGAHAYAVKDGQYRGMSTWTSDGRMLHGELELPLPVGIVGGSIKINELAQLNQRILGIQTAGDLERIMVAIGLAQNLAALRALVTTGIQQGHMHLQLKSLAMAAGATPEELPVILQRLELASQQDLATTQQLIAELRQTKEETDD
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MMSRDLDIANPARTRAIMHTYGLQVKKSLGQNFLTDQNVLHNIVATADIGTNDNVIEIGPGIGALTEYLARAAHHVLAFEIDDRLLPILDETLADYDNVTVVNQDILKADLAAMISEHLDNERPLKLVANLPYYITTPILMNILAGDVAFENIVVMMQKEVADRLAAEPGTKAYGALTIAVQYRMAAEMAMVVPRTVFVPSPNVDSAIVKLTALPPRTHVPFDEAAFFKVVKAGFAHRRKNLWNNLQSLFGKQPETKTAIQQALDIATIDPKIRAERLTVDEFITLTDALHQADLL
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MTKYIFVTGGVVSSIGKGIVAASLGRLLKNRGLKVTIQKFDPYINVDPGTMSPYQHGEVFVTDDGTETDLDLGHYERFIDINLNKYSNVTTGKIYSEVLQKERRGDYLGATVQVIPHITNAIKEKIMRAGTTTDSDIVITEIGGTVGDIESLPFIEALRQMKSDLGSDNVFYIHTTLIPYLRAAGEMKTKPTQHSVKELRSYGIQPNMLVVRTEQPITREMRNKIASFCDVEPEAVIESLDVKTIYSIPLNVQKQNMDQIVLDHFDVQAPKADMSEWIDLEHHVQNLSRTIKIALVGKYVALQDAYISVTEALKHAGYTDDADIDLKKISAEDVTPENVEELLGDADGILVPGGFGDRGIEGKITAIKYARENDVPFLGICLGMQMASVEFARNVLGLKDANSAEIDPKTPDNIIDLMADQEDVEDMGGTQRLGAYPCKLKPGTVAAKAYHNEEVVMERHRHRYEFNNKYREAMAAKGMVFSGTSPDNRLVEVIELPKKRFFVASQYHPEFLSRPNRPEGLFKAFIDAANQTGKVKA
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MSNSASIGATVKMVQHAKRLSVNDVTNNKRIISKSTYYRFINGHSNISAVCFLQLLERLELTLQEFDFILHHYQIPPVEQLLQQIQNAVAKEDIGELWKLKKQIDKLFNATHAHRYQQLLTLTHLALHHLETPQQALDSTLRAALDGLIQDLLNLQLWSKYDLMLCRQIFTTLTPEQQIILLTSANKSFHKYQRLTDEALTFMTFLANQLFVTVHDKQPKLITKIYPIMTTINFPSDQLVPALLLKFCQGITDYVTKPNQPLNACSQALDIVHCLHIQYWDTIFQNVLLDLKTMPI
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MITIGLTTWTEHPSLLGGTEKLTLTEYSGVLPVVEVDTPFYGIPKVTTVAKWQKAVPDKFQFVLKANQVMTLHDTYDEGVSMDALKTAYREYRAMLKPLTQHQQLKAVLFQFPPFFERSNRNFHYLQRMVEWLPGVPIAVEFRNQSWYEESVKDAVFSFLKDLGITHVIVDEPHALNDGVSFESFVTNSKLALLRLHGRNQQGWSAKGANWRSQRTLYRYSDQELAEFKQTVEQLQQQADEVCVIFNNNSGGDAADNAMALKELLGVSFGDLGPHQLDLF

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_003646511.1|846991_848263_-|tRNA	serine--tRNA ligase	A0A1B1IVT2	uncultured_Mediterranean_phage	4.5e-96	43.7
WP_003642042.1|848729_850343_-	CTP synthase	A0A1J0FA14	Only_Syngen_Nebraska_virus	1.2e-143	49.9
WP_003642041.1|850515_851124_-	DNA-directed RNA polymerase subunit delta	NA	NA	NA	NA
WP_003642040.1|851168_851609_-	DUF1934 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_015825146.1|851971_852904_+	lipoate--protein ligase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_187346395.1|852912_854271_+	HD domain-containing protein	A0A1B1ISR1	uncultured_Mediterranean_phage	6.8e-26	32.5
WP_015379810.1|854290_855100_+	sugar-phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_015825144.1|855269_856256_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_015379808.1|856338_857361_-	YdcF family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003643830.1|857649_858630_-	ribose-phosphate diphosphokinase	A0A2K9L8D8	Tupanvirus	4.9e-42	36.3
WP_011101017.1|858995_859820_-	serine hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_003642031.1|860055_861438_-	bifunctional UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase/glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase GlmU	A0A2K9L140	Tupanvirus	5.7e-28	33.2
WP_003642030.1|861506_862343_-	pur operon repressor	NA	NA	NA	NA
WP_003646500.1|862698_863496_-	metal ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_003642023.1|863488_864187_-	ABC transporter ATP-binding protein	A0A1V0SGN0	Hokovirus	1.2e-15	27.8
WP_021356652.1|864453_865398_-	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_027822749.1|865707_866574_-	4-(cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol kinase	NA	NA	NA	NA
WP_003642020.1|866706_866958_-	Veg family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642019.1|867062_867953_-	16S rRNA (adenine(1518)-N(6)/adenine(1519)-N(6))- dimethyltransferase RsmA	NA	NA	NA	NA
WP_011101014.1|867949_868513_-	ribonuclease M5	NA	NA	NA	NA
WP_102115613.1|868499_869276_-	TatD family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_015825140.1|869527_870016_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_102115614.1|870578_871469_+	transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_003643823.1|872918_874970_-|tRNA	methionine--tRNA ligase	A0A1V0SHR2	Klosneuvirus	2.7e-90	35.8
WP_003646492.1|875291_875681_-	NUDIX domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_027822751.1|876275_877118_-	DUF72 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_027822752.1|877117_877822_-	NAD-dependent protein deacylase	NA	NA	NA	NA
WP_027821492.1|877843_878803_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642009.1|878795_880070_-	hydroxymethylglutaryl-CoA reductase, degradative	NA	NA	NA	NA
WP_003642008.1|880115_881033_-	Ppx/GppA family phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_102115615.1|881474_882488_-|tRNA	tRNA-dihydrouridine synthase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642004.1|882600_883347_-	MurR/RpiR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_102115616.1|883496_884393_-	ROK family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642002.1|884513_885950_-	6-phospho-beta-glucosidase	A0A0B5JD41	Pandoravirus	9.7e-31	25.5
WP_003643816.1|885967_887323_-	PTS sugar transporter subunit IIC	NA	NA	NA	NA
WP_003642000.1|887545_887968_-	DUF3284 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003641999.1|887957_888146_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_102115617.1|888152_889514_-	PTS sugar transporter subunit IIC	NA	NA	NA	NA
WP_027822756.1|889586_890297_-	GntR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_102115618.1|890702_891719_-|tRNA	tryptophan--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
WP_015825133.1|892157_892934_-	carbon-nitrogen family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_015825132.1|893192_895502_+	ATP-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003646479.1|895791_896085_-	HigA family addiction module antidote protein	M9MUN2	Rhodococcus_phage	9.9e-07	48.3
WP_076630434.1|896096_896384_-	type II toxin-antitoxin system RelE/ParE family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_027822759.1|896534_897209_-|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA
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WP_027822761.1|898069_898738_-|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA
WP_027821500.1|898805_899495_-|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA
WP_027821501.1|899584_900961_-	HlyD family secretion protein	NA	NA	NA	NA
WP_027821502.1|900977_903128_-	peptide cleavage/export ABC transporter	W8CYL7	Bacillus_phage	3.6e-45	27.9
WP_102115620.1|903393_903564_+|bacteriocin	two-peptide bacteriocin plantaricin EF subunit PlnE	NA	NA	NA	NA
WP_027822764.1|903588_903747_+|bacteriocin	two-peptide bacteriocin plantaricin EF subunit PlnF	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP025586|1526337:1534625|DBSCAN-SWA
CATGACTAATGAAAGAACGCCACTCTTAGCCGCCAAGCATCTGGAGATTGCCTTTGGCCAAGGAAAGCGGGAATTCGTGGCGGTCAAGGACGCTAATTTTGACATTTATCGGGGGGAAACCTTGGCACTGGTCGGTGAATCAGGATCAGGAAAAACGACGATTGGCCGCGCAATTCTAGGTGTTATTCCGACTAAGAAAGGGACAATTGCGTTCCATGAACAACTCATTAATCAGCACTTAGCAATCGATGCGCAACGGGAAGTGATGCGCAAGATTCAAATGATCTTTCAAGACCCAGCCGCGTCACTCAATGAACGGGCGACGATTGAATATATTATTTCGGAAGGGTTGCTGAATTTTCACCTCTTTCATTCTGAACAGGATCGCCGTGATCAAGTTGAGCAGATGATTAAAGCGGTGGGGTTGCTACCAGAACATCTTTATCGGTACCCCCATGAATTCTCTGGTGGTCAACGGCAACGAATTGGGATTGCTCGCGCCCTTATTATGCGGCCCGAGTTAGTCGTGGCCGACGAACCGATCTCAGCGCTGGATGTCTCGATTCGAGCACAGATTCTGAATCTGCTCCGGCAGTTTCAACAGGAGAGCCAATTATCATACTTGTTCATTGCCCATGATTTATCCGTCGTACGCTTTATTGCAGACCGTGTGGCCGTCATTCACAACGGCCGTATTCTGGAACTTGCACCGACCGCGGAGTTGTTTACCCATCCACTACATCTGTATACGCAATCGTTATTAGCCGCCATTCCAATACCTGATCCACAGTTGGCACGGCAAAAGCAACTCGTGACTTATCACGAGTCAGTTCACGATTATACGACTGATCCAGCTCAATTCGTTGAACTAGTTCCGGGACATTTTATCTATGCCAATCAATCGGAGCTGGTCACCTACCGTCAACAACTGTCTATGACGTAAGGCCGAAGCTGGTCACAGGTACTTCGAACTAAAATCTAGCAAGTGAACGTAAAAGAAGGACACAAACCAGTTTGGCTTGTGTCCTTCTTTAATTAGTCCCCGTTGTAAATCGAATTTTTAACTACCACATAGTCGCACTTAGTAATGGCCTTTAAATCCCGGCCACCGGCATATGAGATGGATGATTGTAAGTCTTCTTGCATCTCGTTTAAGGTGTCGACTAAGCGGCCCCGGTAAGGAACCAGCATTTGTTTACCCTCAACGTTTTTATGTTCGCCTTTTTGAGCTTCACTGGCGGAACCGTAGTATTGCTTATAAGTCTTACCATCGATTTTTAAAATGTTGCCGGGTGATTCTTGGTGTCCGGCCAACATTGAGCCAATCATGACCATCGTAGCGCCGAACCGAATCGACTTGGCGATGTCACCATTGGTCCGGACACCACCGTCTGCGATGATTGGTTTGCGAGCGGCCTTGGCACACCACCGGACAGCAGCTAATTGCCAGCCGCCAGTACCAAAGCCCGTTTTGACTTTAGTAATGCAGGCCTTACCCGGGCCAACGCCAACCTTAGTTGCATCGGCACCAGCATTTTCAAGGTCGCGAACGGCGGCTGGTGTGGCCACATTTCCGGCAATTACAAAACTATCCGGAAGGACGTCTTTGATGTGTTTGATCATTGCAATGACACTGTCAGCATGACCATGTGCGATATCAATCGTGATATATTCTGGCACGATTTGATTAGCAGCCAGGTCGTCGATAAAGTCATACTCGCTGGACTTAACACCGACCGAAATAGATGCGTACAGTTGCGCGGCATGCATCGTTTCAATAAAAGCACGGCGGGTCTCGGGGGCGAAGCGATGCATAATGTAGAAGTAGTCGTTAGTGGCGAGCCACTTGGCAATCTCGTCGTTGATGACGGTTGCCATATTGGCAGGCACCACTGGAATCTTAAAACGACGGCCACCCAATTCTACGGTCGTATCGGCTTCCGAACGACTATTAATGACACACTTGTTCGGAATTAGTTGAATATCTTCGTAATCAAAAATCTCCATGCCCATGATGCAAAACTCCTTTAAGTTAATTCACGGTGTCGCGTTCAATTAGCCCCAAATGTTGTGATCGATAACGTTAGTTTGTTCGCGATCGGGACCAACAGAGAAGGTGGCAATTTTAACGCCGACGAGTTCTTCTAATTTACGCAAGTAGTTCTGTGCATTAGTTGGCAGTTCCTCAAAGGTTTTAACGCCAGTAATGTCTTCGTCCCAGCCAGGAACTTCTTCATAGATAGGTTTGCAAGCTTCTAATTCCTTCAGACTAGCAGGGTAGTGATAGATGGTTTCGCCGTTTAAGTCGTAAGCGGTACATACCTTGATGGTCTTTAAGCCCGTCAAGACGTCTAAGCAGTTTAAACTAAGATGAGTAAACCCAGAAACTCGTTTAGCATGCCGTAATACAACGCTATCGAACCAACCAATCCGCCGAGGACGTTTAGTAACGGTCCCATATTCATGGGCCGTTTCACGAATGAAATCACCGACTTCGTCAAAGAGTTCAGTTGGGAATGGGCCGTCACCGACGCGGGAAGTGTAGGCTTTTAAGACCCCAACACAGTTATCGATCTTAGATGGGCCAACACCGCTCCCAATAGTAACACCACCGGCAACTGGGTTAGATGAAGTAACGTAAGGGTAAGTCCCTTGATCAATATCCAGCATGACTCCCTGAGCACCTTCAAATAGGACGCGTTGACCGTTATCTAACGCATCATTAATGACAACGGAAGTATCGGTGACGAATGGTTTCAAAGTTTGACCATAAGCGTAATAGTCATCAAAAATATCTTCAAATTTCAGTGGTTCTAAGTCATAAAGCTTGGTAATAATTTGGTTCTTTTCAGCTAAGTTGCGCTTGAGTAACGCCGCAAAGGTGTCCTTATCAAGCAGGTCGGCTACGCGAATCCCAATTCGTTCAGCCTTATCCATGTAGGCTGGGCCGATTCCCTTATTAGTCGTCCCAATCTTGCCACCGGCTTTAGCTTTTTCTTGAGCGCCATCTAATGTGATGTGGTAAGGCAAGATGACGTGTGCACGGTTAGAGATTCTAAGGTTGTCAGGATTAACGCCCTTGTCCCGCAAGTATTGTAATTCTTCAACTAATGACTTGGGATTTAAGACCACGCCGTTCCCAATGACAGCTAACTTATCATGGAAGAAAATCCCTGATGGAATCAGCCGTAATTTGAAAGTTTGCCCATTAAATACGATGGTGTGGCCGGCGTTATCGCCGCCTTGGTAACGTGATACCACATCTGCTTCCTGACTCAAAAAGTCCGTGATCTTTCCTTTACCTTCATCGCCCCACTGGCTACCTACTACTACGACTGATGCCATATTCTTCCACCTCATTAAATAGTTTAATTATGAATAATTAATCCTAAAGAGTAGTTAAACGTTCACCACTCCAACAGGAAAGAGTATAGCAACTTTAACGTCAAAACGCAACCCAAAAACCGAATGTTCTTGTTTTGAACACAAATGATCGTTCATAATTAAGGCGAATTAGTTCGAAAACAAGTCCTTAATATGGAAACGAAGTGAAAAATAACAGTATTTTTTCATTGTTCGTCTCTATTAATTACTCGAGGGGTATGCTATAATAATGTTCGTGTTTTGTTAGTGAATACCTAAAAAGAAATGAGGATTAGCAATGATTGATCGTTATACGCGTCCCGCGATGGGCAAAGTATGGTCGTTAGAAAATCAGTACCAAGCATGGTTGGAGGTAGAGATTGCTGCCGACGAGGCCTGGGCTGAATTAGGGAAGATTCCAGCAAGTGATGTTGCTAAAATTCGAGAGAATGCCAAGTTTGATGTTGACCGGATCGCGGAGATTGAAGCCGTAACGCATCATGATGTGGTTGCTTTTACGCGCGATGTTTCCGAGTCGTTGGGTGCAGAACGTAAGTGGGTTCACTATGGGCTGACCAGTACTGACGTTGTCGACACGGCGCAAGGTTACCGGTTGAAGCAGGCTAACGCGATTATTCGCCAAGACTTACAAGATTTACGGGCGACACTAGCACAACAAGCGAAAAAATATAAATATACGGTTGAAATGGGGCGGACACACGGCGTCCACGCTGAACCAACCACGTTTGGATTGAAGATTGCCCGGTGGTATTCTGAAATTAATCGGGATATCGAGCGTTTTGAACACGCGGCCGCGGGCGTTGAAGCGGGTAAAATCAGTGGAGCCGTTGGGACTTTTGCGAACATTCCACCATTTGTTGAAGAATTTGTCTGCAAACAACTTGGATTGCGCGCACAAGAAATTTCGACGCAAGTTTTACCACGGGACTTACATGCCGAATACATTGCTAGTTTGGCCTTGATTGCAACAAGCGTTGAAGTGTTTGCAACCGAAATTCGTGGTTTGCAAAAATCTGAAACTCATGAAGTTGAAGAATTCTTTAATAAAGGTCAGAAAGGCTCATCAGCAATGCCCCACAAGCGTAATCCCATCGGTTCTGAGAACGTGACGGGGTTGGCACGGGTTATTCGCGGCCACATGATGACCGCCTATGAAGATGTGCCGTTGTGGCATGAACGGGATATTTCCCACTCTTCTGCGGAGCGGATCATCTTACCAGATACCACGATTTTAGTGGATTATATCTTAACTCGAATCAATAAGATTATTAAGACGCTGACGGTGTTCCCAGAACGGATGAAGCAAAACATGGATGCGACTTACGGGTTGATCTACAGTCAACGTGTCTTGCTCAAGTTGATTGATACGGGGATGTCTCGTGAAAGTGCTTATGACCTCGTTCAACCACTGACGGCTAAGTCATGGGATGAACAGTTACAATTCAAGCCACTTATTGAAGGTAACGCCGAGATTCGTGAACATTTGGACCAGGCTGCGATTGATGATGCGTTTGACTATCATTACCATCTTCGCCACGTTGATGATATTTTCAAACGATTGGGATTAGACGATTAATTTAAAAACGATGAAGCCCCAGCGATGAGTAATCGCTGGGGCTTTTATTATGATTAAAACGTGCTAAAAAGATGGGCTGTTTATTCGTCAGCCGATGCGCGTCCTATTTCGACCTCCGGGGCTGGGGACGATTAATGGCTATTTTTGAGCTTGATAATGGCACGGTTTAATCATGCTTCATACTAAACGATAACTAGCGCAATGCGTGTAAGTACCTTGATTTCAGTTCAAGGTACCAAATGTTAGGTGCGTCGCAATCAGACCATACCCAAGTGCCATATGACGCTGTTCTTTGCGCGTGAGGCGCTGTAATTGGGTGTGAACGTATTGGTAGAGGTCACGATGCTGGCGTGGTAGAGTCGTTGGGACCATATAGTTACGATAATAGGCTTGATATAGCTGGATGGTTACTTGCTGTGGCGAAACGTTGTTATTCAGGTCGATTGCAGCTGCCAGTAGCGCTTGGCGGTAGGAATCGGATGGTTGATTGGTAATCGGCTGATTATAAGCAGCATCTACTAAGGTAAATAATTTTTGAGCATCCACATCCATTGTTAGGACCAACCTTTCAATCGTTGAGATAGGCGCAATTATAGCATGGTCAGTATGCTTGATGTGCAGGCCCGAGTTGGTTTCTAAAGTAATGGAACGAACATAACCAGAGCCGCCAATGAGTGGGGGTCATTGGCGGCTCTGGTTATTAATAAGGGATTAATCAAGCGGCGGTCGCAGCAGTGTTTTCTGTTTTAAGCCCGGTGCCAAGCTGCGTAGCCGATGGTTGGGAAAATACCAATCAAACGGTCGATTTGTTCGCGGTCTAATTGATATTCGATAGCTGGCAGTAGTGCGTTGACGGCATCTTCAGCTTGATCACTGATTTCAGTCACGCCAACGAGATGGCCGTCTTGGTCATGGACCTGTTTACTAGCGGCAATCGGTTCCTTGGAGACTTGATAATACCAGTAATCTGCTAAATCGTTATCACTAACGGTTAAGCCGGCCTTTTCAGCAGCCGGTATTTTCATGCCGGCTTGCGCAATTCGTGGTGAAGTAAAGACGACCGATGGAATTACCGGATAGTCAATGGGAGCACTGGTTTGACCAGAGAACAAACGCATCAAGTATTTGGACTCAAAGTAGGCTGCAGGTGTGACCTTTGGCAAGTCATTGGCAAGGACATCACCGGCTGCATAGATGTTAGGAACGTTGGTTTGCAAGTGGTCGTTGACATAAATGCCGTGGCGGTCATATTTGACGCCAATCCGGTCTAAGCCTAAGCCATCTAAGTTTGGAATTCGACCAGTCGCATCTAGGATCCAGTCGGTCGTTAATTGCTGGTGGTCGCCATAACTAACTTGGAACTGGTCATCCTGTTTGGTAAATGCTTGCACGTTGGCATTTTTGATGAAGGTTACCCCACGTTCAGTTAAGTCGTCAACCACTTGTGCAACGAATGGTTGGTAAAAATCACGGAGGGCCTGGTCGCCATGTAACATGACTGTCACTTGGGCACCGGCCGCGTTAGCGATGGTGGCAAATTCCATACCAATATAGCCTGCGCCAATGATGACGATACTTTGTGGTAACCGTTTAAGGTTCATAAAATCACTACTATCGTGGGCGAGCTTGGTCCCCGGAATATCTAAACGATGGGGCTTTAAACCAGTCGCAATAACGATTTTTTCAGCGGTAATGGTTTGCTGATCATCAACGACAACGGTGTGAGCGTCCTTGAACGTGGCATGACCATGAATGATCGTTGCGCCACCATCTTCCAAACGAGCTGTCAGGCCTGCTGGTAAGGGATCAATAATCTCTTGTTTATGGGCCACGTTGGCCGTCCAATTAATGGTTGGTGCACTGCTCAAAATATCATTGAGGCGTGCTGCTTCCCGCGTTAATTTGACAGGTTCATCAAGAGTGATTTTGGCGTTACAACCACGATTAGGGCAGGTGCCCCCAATCAGACCACTCTCAATCACACCGACGCGAACACCAGTCTTGGCGAGTGGTGCGGCGCCATCAAACGTGGCGTGACCCGCACCAATGTATAACACATCGTAATCGTATTTGTTTGTCATGATTTATCAGCCTCCATTAAAATTTTGGTAACTTAAGCTTAACGAGTTTTAAGAAACCTGACAACTGATATGAATTGCTCGCGCCCGCTGTAATGATTATACTGAAAGTAATTATGTCAATAGGGAGACGTTAATATGCACGCTTTGATCGCAATTGATTCATTTAAAAATTCCATCACGAGCATTCAGGCCAACCGAATAGTGGCTAAACGATTTTCGGCTCACGGAATCACCGCTACTCAAGTTGCGATTGCCGATGGTGGTGAAGGAACGGTGGCGGCGTGGCTGGCTAACCATGCTGGTGGACAAGCTATTACGGCATCAACGGTGGATCTGGCGCAACGGCCAGTGACTGCAACGTATGGCTACTTTGCCACTGAAAAAATGGCAGTGATTGAGGTTGCGGCTGCATCCGGAATCCAGTTTGTCACGACGACCTTGACGCCGTTAGCAACGAATACCTATGGGACCGGGCTACTGATTAAAGATGCGATTGAGCGTGGCGCCCGGCAGATTATTCTGGGCTTAGGCGGTAGCGGAACGGTCGACGGTGGTGCCGGAATCCTACGTGCGCTCGGTTATCGTTTTTGGGCTGCCGATGGTCAAGAGTTAGCCATGACTGGCGCTGATTTAAGTCGGGTCACTAAGATTGACGATCGACATGTGTTGCCACAATTAGCTGAAGTCTCGTTCATTAGTGCAGCGGATGTGACGAATCCGCTAACGGGACCGAACGGCGCAGCTAAGATTTTTGGCCCACAAAAAGGATTACCGGTTGCTCAAATTCAGGTTCACGATGCCGCTTTAGCTCACTATATGACGGTCGCAGCTGGTGCGGTGAGTGCCCACGAAGGCGATGGGGCTGCCGGTGGTATTGGGTTTGCATTACGTTACTTTTTACACGCCCGCGTTCGCTCTGGTTTTCAATTGTTAGCTGAAATGAGCAATCTTAAAACGAAAGTGGCCCAAGCGGATCTAGTTATCTCTGGTGAAGGCCAAGTCGACGATCAGAGTTTTATGGGCAAGGTACCAATTCAGCTCAGTCAGTTAGCCCAAGCGGCCGGCAAGCCTTGCTATTTATTAGTTGGTCGGCAAAAAGGTGCAAATGAAACATTTGCCAAACAGGGGGTCACGGCTGTTTTACCGATTGTCGATCAAGTCATGACCTTAGATCAAGCCATGGCGCAGGGACCAGCCAATCTGGAACGGATGGCGGACCGCTTAGCCCGAATCATTAGCCAGTCATAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP025586|1526337:1534625|1528391_1529681_-|WP_015381012.1|DBSCAN-SWA
MASVVVVGSQWGDEGKGKITDFLSQEADVVSRYQGGDNAGHTIVFNGQTFKLRLIPSGIFFHDKLAVIGNGVVLNPKSLVEELQYLRDKGVNPDNLRISNRAHVILPYHITLDGAQEKAKAGGKIGTTNKGIGPAYMDKAERIGIRVADLLDKDTFAALLKRNLAEKNQIITKLYDLEPLKFEDIFDDYYAYGQTLKPFVTDTSVVINDALDNGQRVLFEGAQGVMLDIDQGTYPYVTSSNPVAGGVTIGSGVGPSKIDNCVGVLKAYTSRVGDGPFPTELFDEVGDFIRETAHEYGTVTKRPRRIGWFDSVVLRHAKRVSGFTHLSLNCLDVLTGLKTIKVCTAYDLNGETIYHYPASLKELEACKPIYEEVPGWDEDITGVKTFEELPTNAQNYLRKLEELVGVKIATFSVGPDREQTNVIDHNIWG
>NZ_CP025586|1526337:1534625|1532042_1533377_-|WP_015381010.1|DBSCAN-SWA
MTNKYDYDVLYIGAGHATFDGAAPLAKTGVRVGVIESGLIGGTCPNRGCNAKITLDEPVKLTREAARLNDILSSAPTINWTANVAHKQEIIDPLPAGLTARLEDGGATIIHGHATFKDAHTVVVDDQQTITAEKIVIATGLKPHRLDIPGTKLAHDSSDFMNLKRLPQSIVIIGAGYIGMEFATIANAAGAQVTVMLHGDQALRDFYQPFVAQVVDDLTERGVTFIKNANVQAFTKQDDQFQVSYGDHQQLTTDWILDATGRIPNLDGLGLDRIGVKYDRHGIYVNDHLQTNVPNIYAAGDVLANDLPKVTPAAYFESKYLMRLFSGQTSAPIDYPVIPSVVFTSPRIAQAGMKIPAAEKAGLTVSDNDLADYWYYQVSKEPIAASKQVHDQDGHLVGVTEISDQAEDAVNALLPAIEYQLDREQIDRLIGIFPTIGYAAWHRA
>NZ_CP025586|1526337:1534625|1531518_1531848_-|WP_102115699.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA
MDVDAQKLFTLVDAAYNQPITNQPSDSYRQALLAAAIDLNNNVSPQQVTIQLYQAYYRNYMVPTTLPRQHRDLYQYVHTQLQRLTRKEQRHMALGYGLIATHLTFGTLN
>NZ_CP025586|1526337:1534625|1527371_1528343_-|WP_187346396.1|DBSCAN-SWA
MEIFDYEDIQLIPNKCVINSRSEADTTVELGGRRFKIPVVPANMATVINDEIAKWLATNDYFYIMHRFAPETRRAFIETMHAAQLYASISVGVKSSEYDFIDDLAANQIVPEYITIDIAHGHADSVIAMIKHIKDVLPDSFVIAGNVATPAAVRDLENAGADATKVGVGPGKACITKVKTGFGTGGWQLAAVRWCAKAARKPIIADGGVRTNGDIAKSIRFGATMVMIGSMLAGHQESPGNILKIDGKTYKQYYGSASEAQKGEHKNVEGKQMLVPYRGRLVDTLNEMQEDLQSSISYAGGRDLKAITKCDYVVVKNSIYNGD
>NZ_CP025586|1526337:1534625|1533512_1534625_+|WP_054519129.1|DBSCAN-SWA
MHALIAIDSFKNSITSIQANRIVAKRFSAHGITATQVAIADGGEGTVAAWLANHAGGQAITASTVDLAQRPVTATYGYFATEKMAVIEVAAASGIQFVTTTLTPLATNTYGTGLLIKDAIERGARQIILGLGGSGTVDGGAGILRALGYRFWAADGQELAMTGADLSRVTKIDDRHVLPQLAEVSFISAADVTNPLTGPNGAAKIFGPQKGLPVAQIQVHDAALAHYMTVAAGAVSAHEGDGAAGGIGFALRYFLHARVRSGFQLLAEMSNLKTKVAQADLVISGEGQVDDQSFMGKVPIQLSQLAQAAGKPCYLLVGRQKGANETFAKQGVTAVLPIVDQVMTLDQAMAQGPANLERMADRLARIISQS
>NZ_CP025586|1526337:1534625|1526337_1527279_+|WP_027822312.1|DBSCAN-SWA
MTNERTPLLAAKHLEIAFGQGKREFVAVKDANFDIYRGETLALVGESGSGKTTIGRAILGVIPTKKGTIAFHEQLINQHLAIDAQREVMRKIQMIFQDPAASLNERATIEYIISEGLLNFHLFHSEQDRRDQVEQMIKAVGLLPEHLYRYPHEFSGGQRQRIGIARALIMRPELVVADEPISALDVSIRAQILNLLRQFQQESQLSYLFIAHDLSVVRFIADRVAVIHNGRILELAPTAELFTHPLHLYTQSLLAAIPIPDPQLARQKQLVTYHESVHDYTTDPAQFVELVPGHFIYANQSELVTYRQQLSMT
>NZ_CP025586|1526337:1534625|1529997_1531296_+|WP_003645480.1|DBSCAN-SWA
MIDRYTRPAMGKVWSLENQYQAWLEVEIAADEAWAELGKIPASDVAKIRENAKFDVDRIAEIEAVTHHDVVAFTRDVSESLGAERKWVHYGLTSTDVVDTAQGYRLKQANAIIRQDLQDLRATLAQQAKKYKYTVEMGRTHGVHAEPTTFGLKIARWYSEINRDIERFEHAAAGVEAGKISGAVGTFANIPPFVEEFVCKQLGLRAQEISTQVLPRDLHAEYIASLALIATSVEVFATEIRGLQKSETHEVEEFFNKGQKGSSAMPHKRNPIGSENVTGLARVIRGHMMTAYEDVPLWHERDISHSSAERIILPDTTILVDYILTRINKIIKTLTVFPERMKQNMDATYGLIYSQRVLLKLIDTGMSRESAYDLVQPLTAKSWDEQLQFKPLIEGNAEIREHLDQAAIDDAFDYHYHLRHVDDIFKRLGLDD

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_027822312.1|1526337_1527279_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	2.1e-18	30.5
WP_187346396.1|1527371_1528343_-	GMP reductase	Q4ZCY7	Staphylococcus_virus	1.8e-137	71.2
WP_015381012.1|1528391_1529681_-	adenylosuccinate synthase	L7Y4J5	Megavirus	3.5e-72	37.0
WP_003645480.1|1529997_1531296_+	adenylosuccinate lyase	A0A1B3B081	Gordonia_phage	3.8e-18	33.6
WP_102115699.1|1531518_1531848_-|bacteriocin	bacteriocin immunity protein	NA	NA	NA	NA
WP_015381010.1|1532042_1533377_-	NAD(P)/FAD-dependent oxidoreductase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	7.9e-27	27.1
WP_054519129.1|1533512_1534625_+	glycerate kinase	W6LM47	Streptococcus_phage	1.3e-35	35.3

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP025586|2012715:2021226|DBSCAN-SWA
GATGGCGAAAGTTGGTTTGATTATGGGGTCAATTTCTGATTGGCCAACCATGCAATTAGCGGCAGAACAGTTAACGGCACTGGGAGTCTCTTATGAGCGTCACGTTATTTCGGCCCACCGAATGCCCCAGACATTACAATCCTATGGTGAAGAAGCAGCGTCACGGGGAATTCAAGTTATTATTGCGGGTGCGGGGGGCGCTGCCCATTTACCCGGGATGCTAGCTGCCAATACACTACTCCCGGTAATTGGGGTGCCCATTAAGACCCATACGTTGAACGGAGTTGATTCGTTATTGTCAATCGTACAGATGCCAGCTGGCGTACCCGTGGCGACGATGGCGATTGGTGATGCGGGGGCTAAGAATGGTGCGCTAATGGCCGCCCAAATTATCGGTTTACGGGAACCACAAGTACAACATGCAATTGGAGAATTTCGTGCTCGTCAACGTCAGGAGGCTGAACAAAGTGAACGCCAATTTTAAGGAAGCACTCTTACCACCCGCAACGATCGGAATCGTTGGTGGCGGTCAACTCGGTCAGATGATGACGCTTAGCGCGAAGGCGATGGGCTATCGGGTAGGTGTCCTTGACCCGACACCCAAAGCACCGGCAGCCCAGGTCGCAGATTTTCAGATTGTTGCGGCTTATGATGATCAGGCGGCTTTACTTGATCTAGCGCGCCGTAGTGATGTCTTGACCTACGAGTTTGAAAACGTTGATGAGAATGCTTTGATTGCTGCGCAAGCCTATGCAAAGTTACCGCAGGGCACTGCACTCCTGCATATTACTGGAGATCGTCTTAATGAGAAGCAATTTCTTCATGATCATGGCATCCCAGTCACATCTTTCGCACCGGTGACGGATTTACAGTCATTAAATTACGCCCTCAACCGTGTTGGTACGCCGGCAATTCTCAAAACGGCGGCAGGTGGCTACGATGGTCACGGACAAACGGATCTAGACACAGTAGTGGTGACAAAATCCGCTAGTGCCTTATTGACACAGCCGTGCATTCTAGAGGCGCGGCAGAAATTTCGAACAGAAGTTTCCATGATGGTGACGCGTAGTGCTGCTGGTGTTGTTACGACTTTTCCGTTAGTTGAAAATCAGCATCAACATCATATCTTACACACAACGATTGCCCCAGCTAATGTTCAGCCCAGTGTTCATAGTGCGGCCCGCAAAATTGCGGTTTCGATTGCTGAATCCCTGGAACTACGCGGCGTGCTAGGAATCGAATTCTTTGTTTTACCGGATGATACTTTATTAGTCAATGAACTGGCACCACGCCCACATAATTCTGGTCACTATACGATTGAGGCCTGCAACATCTCGCAGTTTGAGGCCCATATTCGAAGTATCTGTGGCTTACCGATTCCGGCCATTACGCAGACCAGTCCGGCAGTGATGCGTAATCTGCTAGGTGATGACTTAACAGTGGCACGTCAACAGTTGGTTGAACACCCAGAATGGCATTTTCACGACTACGGTAAGGCGGCCATTAAGCCCCAGCGCAAGATGGGTCATGTCACCGTATTAAATCACGATATTGACGCAGCATTAGCGTCGGTGGCAAATTTGAAAGGGGAACAATAATAATGACGGCAGCGATTGAGAAACAAGCTTTGCTTTACACGGGTAAAGCGAAAGCGATGTATGCCACTAATGATCCTGAAATTCTATGGGTCGAATACTTAGATCAAGCAACAGCGCTAAATGGTAAGCGGAAGGTTCCCATTGACCAGAAAGGCCGATTGAATAATCGCATCGCGAGTTTGATTTTCAAAGACTTAGCCAATCACGGCATTGCCAACCATTTTATTGAGCAACCTTCAGACTACGTGCAACTTGTCCGTCGCGTGACCATGATTCCCTTGGAGACAGTTGTTCGGAATGCGGCTTCGGGTAGTTTTGAGCGTAAATTTGCCGTGCCACACTTAACCAAATTTGCAGAACCAGTACTGGAATTTTTCTATAAGAGTGATCAGCTGGATGATCCATTTATCAATGATTCACAAATCCACGCGCTAAATGTTGCAACACCGGCAATCGTGGCGGAAATTAAACGGCAGGCCTTACAGGTTAACCAGCGTTTGACGGCAATTTTTGCGGCGATGGGGGTACAGCTCGTTGATTTTAAAATCGAATTTGGGTTGACGACCACCGGTAAAGTCTTGCTGGCTGATGAAATCTCACCAGATAGTTGTCGGTTAGTCGACCTAAAGACCGGTGCATCGCTTGATAAGGATGTCTTCCGCAAGGATCTAGGCGACTTGACTAGTGTTTATCAGGAAGTATTGACGCGGCTAGCAACCGTTGAGGAGGCCTAACATGTACTTAGTTAAAATCTATGTGACTTATAAGCAATCAATTCTAGACCCCAAGGGTGAGGCGATTCATGATGCCTTACACCGACTTGGATATACGAATGTCGATGCCGTTGAATTAGGTAAGTATTTTGAGGTGAAAATTCACGCGGATGATCGGCCAGTTGCCGCTGAAATCGACGAGATGTGTGATCGCTTGTTAGCCAACGTTAATATGGAAACTTATCGTTACGAAATTACTGAGATGGAGGCTTTGTAATGATGAAATTTGCCGTACCAGTCTTTCCTGGTTCTAATTGTGATCATGACATGGTGAATGCCTTGCGCGATATTTTACACGTTACGGCTGATTTGATTCCGGCGACAGCGACCTCATTAGCAGGTTATGACGCGGTGGTGTTACCTGGTGGCTTTTCGTACGGTGATTATTTACGGAGTGGTGCGATTGCCCGCTTTGCGCCCATCATGCCGGCCGTTATTGCATTTGCTAACGCTGGTAAACCAGTCATCGGAATCTGCAATGGCTTTCAAGTCTTGACCGAAGCCGGATTATTACCTGGTGCATTGCAGGCCAATCGCTCAGCGAAGTTTATTTGTCAGGACAGCCCATTACGAATTGCCAATCATGAGACGATTTTTACCACCGCATACGGATCGACAGATCAAATTAGTTTACCGATTGCCCACGGCGAAGGCAATTATTATTGTGATGAGGCCACCTTGGCGCAATTACGTGCTAATCATCAAATCATCTTCGAATACGTCGAGAATCCAAATGGCAGCACGGCTAATATTGCTGGCATTACAAATGAAGCGGGAAATGTGCTTGGGATGATGCCCCATCCGGAACGGGCCGTGGAGATGATCTTAGGTTCCACGGACGGTCTCAGAATTTTTCAATCGGTCATTGCGAGTCAAGAGGAGGTCACCCATGCTTAAAAAGCAACCATTATCACCTACAGATGTTCGCGATTCTAAGGTCTATCGGGATTGGGGCTTAACCGATGCTGAGTATCAATTATTAACGGATAAGGTCCTTCAACGCTTACCTAACGAGACTGAAACCGGGTTGTTTTCCGGCATGTGGAGCGAACATTGCTCCTACAAGAATTCAAAACCAGTCTTGAAAAAGTTTTGGACGCAGGGTGAACAGGTACTTGAAGGGCCTGGTGAAGGCGCCGGTATTATCGACATCGGTGATGGTCAGGCCGTGGTCTTTAAAGCTGAAAGTCATAATCATCCGTCTGCAGTTGAACCTTATGAGGGTGCGGCAACGGGTGTGGGTGGTATCATACGGGACATCTTTTCGATGGGGGCCCGGCCGATTGCGCTGCTGGACAGTCTTCGCTTTGGGGAACCGACTGATGCTCATACGAAATACTTGATTTCGCAAGTAGTCGCCGGCATTGGCGGTTATGGCAACTGTATTGGAATTCCGACAATCGGTGGTGATACGGTATTTGATGCGAGTTATCAGAAGAACCCGTTGGTGAACGCCATGTGTGTTGGAATCTTGGATCAAGCTGATATTCAGAAGGGCCAAGCAACAGGAATTGGCAACGCCGTTATTTATGTCGGCGCAAAAACGGGGCGTGACGGCATTAACGGTGCGTCCTTCGCCTCTGCTGAATTTAATGACGCCAATGAAACCCAGCGTTCCGCGGTTCAAGTTGGTGATCCCTTTATGGAAAAATTATTGATGGAGGCGTGTCTCGAGGTTATTCATGATCATCGTGATGTTTTAATCGGGATTCAAGATATGGGCGCGGCGGGCCTAGTTTCCTCCTCAGCCGAAATGGCGTCCAAAGCAGGCAGTGGGTTGTCACTGAATCTTGACTTGGTACCACAACGTGAAACTGGCATGACGCCGTTTGAACTGATGCTCTCTGAATCACAGGAGCGGATGTTACTATGTGTCAAAGCTGGTGCCGAAGCAGAAATTTATCAAGTCTTTGAAAAGTACGGTCTTGATGCTGTCACAATTGGTAAAGTGACAGCCGGCCACCAGTATCAATTATTCCATCATGGTAAGTTAGTTGCAGATGTTCCCGTCGATGCACTTGCGACCAAAGCGCCGGTCTATGAACGCGAAAAGAAACGACCAACGCGCTTGAACCATCAGAGCCATCATCAATTTATGCCACGACTAGTTGATGCAACTGGCACATTGAAGAAGATGCTCCAACAGCCAACGATTGCTTCCAAAGCGTCGTTATATGGAACGTATGACTCGCAGGTCCAAACGAATACGGTCGTCAAGCCGGGTTCCGATGCGGGGGTCATACGGATTCGACATACGGATAAGGCGTTGGCGGTCACCACCGATGTTAACGGGCGATACTTATACTTAAACCCCCGTGTCGGTGGAGAAATCGCCGTTGCGGAAGCTGCTCGAAACATTGTCGCTTCCGGTGGTCAACCTTTAGGCATCACTGATTGCTTGAACTATGGTAATCCAGAGAAACCTGAACAATTTTACGATTTGGACGAATCGGCGATGGGCATCGCTCGTGCCTGCCAATTATTCAATACGCCCGTGATTTCTGGCAATGTCTCGTTGAACAATGAATCGAACGGGGAAGCCATCTATCCCACCCCAATGATTGGGATGGTCGGGTTAATTAAGCATCAGAAAGATATTACGACTAGCGATTTTAAACACGCTGGCGATGCAGTCTACGTGTTAGGTACCACAGAAGCCGATTTCAATGGTAGTGAGCTGCAAAAGATGTTGACGGGAACAATCAGTGGCGAGCTGTTTGATTTTGACCTTGTGACTGAAAATCGTAATCAGCGTCTATTGTTAACTGCGATTCAAAAAGGACTAGTTGCTAGTGCCCACGACGTTTCTGAAGGTGGCTTGATTACGACGATTGCCGAATCATGTTTTCCACAAAATATCGGGGTGGAACTGGCCAGTGACTTGCCCGCTGCCAACTTCTTTGCGGAAACGCAGTCACGATTTGTTATCTCGGTGACACCAGCACAGCAAGCCGCGTTTGAAAGTTTAATGGAACCATATGTGACCTATTTAGGACGAACAACTGCAACGGATCGGCTACACGTTCAAACTGCTGATCAGGCGTTTGATATTAAGGTTAGTTTCGCCAAACAGTTGTGGGAAGGGGCCTTACCATGCCTACTGAAGTAAGAAGTCTGAATGAAGAATGTGGCGTCTTTGGGGTTTGGGGCTCGCCGGACGCCGCCCAATTAACGTACTTTGGGCTCCATGCGTTACAACACCGGGGGCAAGAAGGAGCCGGTATCACGGCGAATGATCACGGCAAACTGCAGACGGAACGCGGACTAGGGTTGTTGGCTGATGTCTTTCGGGACCCACGGCGGTTGGCACGTTTGACGGGTCAAGCTGCAGTCGGCCATGTACGTTATGCCACGGCTGGTAATCATGGATTGGAAAACATTCAACCCTTGGGTTTTAATTTTAGCGACTCACAGTTTGCACTCGCACATAACGGCAATTTGACGAACGCGGTGACACTGCGGCGACGGTTGGAACAGCATGGTGCCATTTTTCATGCTAGTTCTGATAGTGAGATTTTAATGCATCTGATTCGACGCAGCCCCGCAGCAACGTTAACGGAACAGGTTAAGGATGCTTTACGTCAAGTCCACGGAGGCTTTGCTTACTTACTACTAACGAATGATTGTTTGATTGCCGCTTTGGATCCTAACGGGTTACGACCATTAGTCGTCGGTCAGTTACCCACGGGCGGGTACGTCGTTTGTAGTGAAACTTGCGCGCTTGATACGATTGGTGCGACGTTTGTTCAAGATGTTCAGCCGGGAGAATTGTTAACGATCGATGATCATGGTTTGACGATCGACCATTATACGACTGATACACAGTTGGCGATTTGTTCAATGGAGTTTATCTACTTTGCACGTCCAGATTCTGATATTCACGGCGTCAACGTCCATTCTGCACGTAAACGAATGGGTGCTCAGCTCGCTGTTGAACAGCCCGTGGACGCCGACATTGTTGTCGGGGTACCCAATTCATCTTTATCAGCGGCGACCGGCTATGCGGAAGCGAGTGGCCTGCCTTACGAGATGGGATTAATTAAAAATCAATATTCGTCACGGACCTTTATTCAGCCGACCCAAGCATTGCGAGAACAGGGGGTTCGGATGAAGCTTTCAGCGGTCAAAGGTGTTGTCGCTGGTAAACGAGTCGTCTTAATTGATGATTCGATTGTACGTGGTACCACCAGTCGGCGGATCGTCAAATTATTGAAAGATGCGGGTGCAAAGTCAGTTCATTTACGAATTGCATCGCCACCATTACGCTATCCATGTTTTTACGGTATCGATATTCAATCGACTAATGAATTGATTGCGGCTCAGCAAACGATTCGGGAGATGTGTCAGACGTTTGGTGCGGACTCACTTGGTTTTCTCAGTGAACAGGGCGTCGTTGATGCAGTTGGCTTGTCGACCACCGAACCGTATGGTGGACTATGCATGGCCTATTTTAATGGGGATTATCCAACGGCCCTGTATGATTACCAAGCCGAGTATGATGCGGAAATTGCGCAATTACAAGCCAATCATGAAGGGGTGATCAAGTGAGCGATGCGTATAAGCGGGCTGGCGTTGATATCAACGCTGGTTACGACGTCTTAAAGACGGTCAAACAAATGAGTGGCAATCAGCAATTAGGCGCGTTTGGGGGGGCGTTTCCACTTAGTCCGGATGCAACTGCCAACGATCCCGTGTTAGTAGCGGGGACGGATGGTGTGGGGACTAAGCTCTTAGTCGCAATCGCTGCTGATCAACATACCACGATTGGAATTGACTTGGTCGCAATGTGTGTGAATGATATTTTGGCACAAGGCGCGACCCCCCAGTTCTTTTTAGATTACTTAGGTCTTGGACATACGGATCAGAAGCGGGTCAAAGCCATTTTGACTGGCGTCGTCACGGGCTGTCAGCAGGCCCATACAGCGTTGATTGGTGGCGAGACTGCGGAGATGCCCGATATGTATGGTCAGGACCATTACGACCTCGCTGGTTTTGCGGTCGGAATTGCGAACCGCGCGGACCTGTTATCACCAGCAAATGTTCGGGCTGGGGACGTCTTGATTGGGTTGCCGTCTAATGGCCTCCACTCGAATGGGTTTAGTCTAGTTCGTGATATTTTATTCAAACAACACGACTACCAATTGACCACGGTTTTTGACGAACTTGGTCATGATTTACAAACGGAACTTTTACGACCAACGACCATTTACGTTGATGCAGTTCAACCATTATTACAGCAGAAATTAGTGACGAGTATCGCCCACATTACCGGGGGCGGCTTGATTGAGAACGTCGCCAGAGCGTTACCGGCGGGCTTGAGTGCGCACCTTGAATTGGGTCAATGGCCGGCACCGCCGATTATGACGTTATTGGCCGAACTCGGTGGGCTGACTGCTACGGATCTTCGGTCGACCTTTAACTTGGGCTTGGGAATGGTTCTGATCGTTCACTCCGACCAAGTGGCAGCTGTGACGGCTAATTTGACGGCCAACGCTCAGTCCTATTATCGAGTTGGAACAGTCCAAACTGGTACGACACCCGTTGTTTTTGAGGAGGCTGAGCATGCCTAATAAAATTGCAGTATTTGCTTCGGGTAATGGCACCAACTTTGTTGCACTCCACCAAGCGATTATTGAACGACAATTACCGGTAGTGATTGGGTTACTTGTGTGTGATCAACCGACAGCGCCGGTAATTGACAAGGCCCGGGCAGCTAACGTACCGATATTAATTGTTGATTTTCATGATTATGCGAATAAAGCGGCCGCGGAAGCAATCATTTTGACGGCCTTGCAAGCACGGCAAATTGAACTGGTATTATTGGCCGGGTACATGCGCATTATTGGTCCGACCCTCTTGAATGCGTATGCTCATAAAATCATCAATATTCACCCAGCATTGTTACCAAAGTTTCCTGGTCGTCACGGCATCGAGGATGCTTTTGCCGCTGGTGTGACTGAGACGGGCGTTACCATTCACTATATCGATGCCGGAATCGATACCGGGCAAATTATTGCCCAGCGGGTCGTTCCGGTTGCACCAGACGATACGCTAGCCAGCCTGGCGACCCGGATTCATGATTGTGAACACCAATTTTATCCAGATGTATTACAGACACTCATTAATGAAGGAGCAATTTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_5

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MYLVKIYVTYKQSILDPKGEAIHDALHRLGYTNVDAVELGKYFEVKIHADDRPVAAEIDEMCDRLLANVNMETYRYEITEMEAL
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MAKVGLIMGSISDWPTMQLAAEQLTALGVSYERHVISAHRMPQTLQSYGEEAASRGIQVIIAGAGGAAHLPGMLAANTLLPVIGVPIKTHTLNGVDSLLSIVQMPAGVPVATMAIGDAGAKNGALMAAQIIGLREPQVQHAIGEFRARQRQEAEQSERQF
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MLKKQPLSPTDVRDSKVYRDWGLTDAEYQLLTDKVLQRLPNETETGLFSGMWSEHCSYKNSKPVLKKFWTQGEQVLEGPGEGAGIIDIGDGQAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGEPTDAHTKYLISQVVAGIGGYGNCIGIPTIGGDTVFDASYQKNPLVNAMCVGILDQADIQKGQATGIGNAVIYVGAKTGRDGINGASFASAEFNDANETQRSAVQVGDPFMEKLLMEACLEVIHDHRDVLIGIQDMGAAGLVSSSAEMASKAGSGLSLNLDLVPQRETGMTPFELMLSESQERMLLCVKAGAEAEIYQVFEKYGLDAVTIGKVTAGHQYQLFHHGKLVADVPVDALATKAPVYEREKKRPTRLNHQSHHQFMPRLVDATGTLKKMLQQPTIASKASLYGTYDSQVQTNTVVKPGSDAGVIRIRHTDKALAVTTDVNGRYLYLNPRVGGEIAVAEAARNIVASGGQPLGITDCLNYGNPEKPEQFYDLDESAMGIARACQLFNTPVISGNVSLNNESNGEAIYPTPMIGMVGLIKHQKDITTSDFKHAGDAVYVLGTTEADFNGSELQKMLTGTISGELFDFDLVTENRNQRLLLTAIQKGLVASAHDVSEGGLITTIAESCFPQNIGVELASDLPAANFFAETQSRFVISVTPAQQAAFESLMEPYVTYLGRTTATDRLHVQTADQAFDIKVSFAKQLWEGALPCLLK
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MNANFKEALLPPATIGIVGGGQLGQMMTLSAKAMGYRVGVLDPTPKAPAAQVADFQIVAAYDDQAALLDLARRSDVLTYEFENVDENALIAAQAYAKLPQGTALLHITGDRLNEKQFLHDHGIPVTSFAPVTDLQSLNYALNRVGTPAILKTAAGGYDGHGQTDLDTVVVTKSASALLTQPCILEARQKFRTEVSMMVTRSAAGVVTTFPLVENQHQHHILHTTIAPANVQPSVHSAARKIAVSIAESLELRGVLGIEFFVLPDDTLLVNELAPRPHNSGHYTIEACNISQFEAHIRSICGLPIPAITQTSPAVMRNLLGDDLTVARQQLVEHPEWHFHDYGKAAIKPQRKMGHVTVLNHDIDAALASVANLKGEQ
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MPNKIAVFASGNGTNFVALHQAIIERQLPVVIGLLVCDQPTAPVIDKARAANVPILIVDFHDYANKAAAEAIILTALQARQIELVLLAGYMRIIGPTLLNAYAHKIINIHPALLPKFPGRHGIEDAFAAGVTETGVTIHYIDAGIDTGQIIAQRVVPVAPDDTLASLATRIHDCEHQFYPDVLQTLINEGAI
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MSDAYKRAGVDINAGYDVLKTVKQMSGNQQLGAFGGAFPLSPDATANDPVLVAGTDGVGTKLLVAIAADQHTTIGIDLVAMCVNDILAQGATPQFFLDYLGLGHTDQKRVKAILTGVVTGCQQAHTALIGGETAEMPDMYGQDHYDLAGFAVGIANRADLLSPANVRAGDVLIGLPSNGLHSNGFSLVRDILFKQHDYQLTTVFDELGHDLQTELLRPTTIYVDAVQPLLQQKLVTSIAHITGGGLIENVARALPAGLSAHLELGQWPAPPIMTLLAELGGLTATDLRSTFNLGLGMVLIVHSDQVAAVTANLTANAQSYYRVGTVQTGTTPVVFEEAEHA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_003645861.1|2012715_2013198_+	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	2.3e-16	41.0
WP_102115770.1|2013181_2014312_+	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase	NA	NA	NA	NA
WP_003642587.1|2014314_2015046_+	phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase	M4SM18	Cyanophage	1.6e-37	37.3
WP_003642588.1|2015047_2015302_+	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurS	NA	NA	NA	NA
WP_015380736.1|2015301_2015982_+	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurQ	NA	NA	NA	NA
WP_021356102.1|2015974_2018194_+	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurL	A6N228	Microbacterium_phage	3.5e-144	39.1
WP_027822324.1|2018178_2019633_+	amidophosphoribosyltransferase	A0A0M3SGR2	Mollivirus	7.3e-50	33.8
WP_015380733.1|2019629_2020655_+	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	A0A0E3F760	Synechococcus_phage	1.2e-59	41.0
WP_003645867.1|2020647_2021226_+	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	1.3e-21	33.9

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP025586|2183213:2275157|DBSCAN-SWA
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MADETTVLDNLIDPQVMTAMISAKLPKAIRFSAIAPVDTTLEGRPGTDVTVPRYKYIGDATDVDEGGAIDYASLSTDTDMFTIKKAGKGVKITDGAALSGYGDPVGEGQRQITMAIASKIDNDILATAMKARLTLSTGVDVTSLDMVDAIEAAFNDDTSEYAVEDDSPTTGVLFMNPKDVNKLRKAAAENWTRATDLGDNILINGTFGELLGWQIVRSRKIKEGSALAVKPGAMRTYMKRDVLSEKGRDMDHKITKFNADEHYGVAIYDDTKLLVINPFDVEGGTVINQNVTSTKDATVKKSNKGKAVASDAPSK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_054519139.1|2207596_2209360_+	ABC transporter ATP-binding protein	W8CYL7	Bacillus_phage	6.2e-96	40.9
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2229104:2229125	attR	NA	NA	NA	NA
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2229104:2229125	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_024971536.1|2236357_2236870_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	D6PST4	Lactobacillus_phage	2.1e-28	43.5
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WP_102115805.1|2237762_2238662_+	recombinase RecT	E9LUM3	Lactobacillus_phage	7.9e-63	47.7
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WP_050339755.1|2240715_2241438_+	phage antirepressor KilAC domain-containing protein	Q8SDM9	Staphylococcus_phage	2.8e-50	45.6
WP_102115808.1|2241442_2241961_+	hypothetical protein	O03915	Lactobacillus_phage	4.7e-36	52.0
WP_046947681.1|2241957_2242338_+	endodeoxyribonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_003642805.1|2242549_2243011_+	transcriptional regulator	D6PSV8	Lactobacillus_phage	1.1e-39	57.0
WP_024971547.1|2243772_2244642_+	DNA adenine methylase	A0A1S5PRR3	Streptococcus_phage	8.9e-80	51.4
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WP_102115816.1|2253844_2254249_+	hypothetical protein	A5GYM1	Lactococcus_phage	5.7e-05	27.5
WP_065980405.1|2254249_2254639_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_102115817.1|2256215_2256734_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_102115818.1|2256730_2257372_+	hypothetical protein	O03936	Lactobacillus_phage	7.4e-07	25.9
WP_102115819.1|2257387_2263018_+|tail	phage tail tape measure protein	A0A1S5SFC1	Streptococcus_phage	1.6e-20	24.4
WP_063486497.1|2263018_2263837_+|tail	phage tail family protein	NA	NA	NA	NA
WP_102115820.1|2263848_2264976_+|tail	phage tail protein	O03938	Lactobacillus_phage	1.4e-72	41.9
WP_102115821.1|2264968_2265214_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_187346382.1|2265191_2265482_+	hypothetical protein	O03939	Lactobacillus_phage	2.7e-12	68.8
WP_187346383.1|2265482_2268035_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_102115822.1|2268057_2269437_+	hypothetical protein	A0A1I9KKB6	Lactobacillus_phage	1.7e-32	52.3
WP_102115823.1|2269426_2269672_+	hypothetical protein	A0A0A1ENR9	Lactobacillus_phage	7.9e-18	76.9
WP_102115824.1|2269683_2270886_+	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	E9LUR8	Lactobacillus_phage	7.8e-191	84.5
WP_102115825.1|2270886_2271183_+	hypothetical protein	A0A2K9VCD4	Lactobacillus_phage	4.6e-36	70.4
WP_102115826.1|2271169_2271544_+|holin	holin	A0A2K9VCG4	Lactobacillus_phage	2.2e-19	72.5
WP_102115827.1|2271672_2272647_+	acyltransferase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_102115828.1|2273344_2274196_-	polysaccharide deacetylase family protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP025586|2560864:2632390|DBSCAN-SWA
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MNIDAQALINKLTSNYAQEIALKDQQLAMAQVQIDQLNAKLAEKEADKNGENA

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_003641358.1|2563563_2563764_-	hypothetical protein	E9LUS6	Lactobacillus_phage	4.9e-26	100.0
WP_027822547.1|2563778_2564657_-	HIRAN domain-containing protein	A0A2H4J549	uncultured_Caudovirales_phage	2.3e-06	34.8
WP_102115950.1|2564719_2565109_-	ImmA/IrrE family metallo-endopeptidase	D6PSS8	Lactobacillus_phage	1.3e-35	53.5
WP_003641361.1|2565139_2565466_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A1B0Y2R0	Lactobacillus_phage	6.9e-17	44.1
WP_003644552.1|2565722_2565938_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027823017.1|2566808_2567060_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_187346385.1|2567125_2567833_+	Rha family transcriptional regulator	D2IYT0	Enterococcus_phage	3.6e-63	59.1
WP_102115951.1|2567863_2568049_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027823020.1|2568014_2568458_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027823021.1|2568516_2568777_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016058357.1|2568919_2569099_+	helix-turn-helix domain-containing protein	E9LUT5	Lactobacillus_phage	2.2e-25	100.0
WP_033608473.1|2569132_2569372_+	hypothetical protein	E9LUT6	Lactobacillus_phage	4.5e-34	83.5
WP_102115852.1|2569383_2569608_+	hypothetical protein	E9LUT8	Lactobacillus_phage	2.0e-28	87.7
WP_182995434.1|2569656_2569827_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027823029.1|2569926_2570337_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027823028.1|2570339_2570987_+	ERF family protein	D6PSU1	Lactobacillus_phage	3.3e-63	57.7
WP_027823027.1|2570983_2571388_+	single-stranded DNA-binding protein	D6PSU2	Lactobacillus_phage	3.1e-43	64.2
WP_102115853.1|2571402_2572095_+	hypothetical protein	E9LUU3	Lactobacillus_phage	1.2e-116	88.3
WP_050480189.1|2572118_2572676_+	HNH endonuclease	X2KXT0	Enterococcus_phage	1.4e-22	50.5
WP_102115854.1|2573453_2574239_+	ATP-binding protein	E9LUN6	Lactobacillus_phage	5.0e-130	89.7
WP_102115855.1|2574374_2574683_+	hypothetical protein	E9LUN7	Lactobacillus_phage	4.8e-44	87.3
WP_027822853.1|2574736_2574892_+	hypothetical protein	E9LUP4	Lactobacillus_phage	8.0e-08	81.1
WP_022638818.1|2575073_2575499_+	phage transcriptional activator RinA	E9LUP5	Lactobacillus_phage	3.1e-62	81.6
WP_102115857.1|2576408_2577590_+|transposase	IS256 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_158649193.1|2577706_2578057_+	DUF4145 domain-containing protein	Q20DE2	Lactobacillus_phage	1.8e-31	53.9
WP_102115859.1|2578128_2578443_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_187326329.1|2578426_2578582_+	hypothetical protein	E9LUP6	Lactobacillus_phage	1.7e-18	95.7
WP_027822818.1|2578565_2579108_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027822819.1|2579110_2579623_+	HNH endonuclease	A8YQN7	Lactobacillus_phage	2.4e-48	55.0
WP_033617798.1|2580020_2580488_+|terminase	phage terminase small subunit P27 family	Q6J1Y7	Lactobacillus_phage	4.5e-38	48.7
WP_102115861.1|2580474_2582361_+|terminase	terminase large subunit	Q6J1Y6	Lactobacillus_phage	6.1e-267	69.7
WP_027822822.1|2582375_2582561_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027822823.1|2582567_2583716_+|portal	phage portal protein	Q6J1Y4	Lactobacillus_phage	1.2e-145	65.7
WP_129142208.1|2583675_2584401_+|protease	Clp protease ClpP	Q6J1Y3	Lactobacillus_phage	1.4e-70	60.8
WP_102115862.1|2584403_2585546_+|capsid	phage major capsid protein	Q6J1Y2	Lactobacillus_phage	1.9e-117	61.1
WP_027822826.1|2585680_2586043_+|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	Q6J1Y1	Lactobacillus_phage	5.5e-23	53.2
WP_158649194.1|2586005_2586347_+|head	phage head closure protein	Q9AZM0	Lactococcus_phage	2.8e-13	39.6
WP_027822828.1|2586352_2586739_+	HK97 gp10 family phage protein	Q3L0S9	Lactobacillus_rhamnosus_Lc-Nu-like_prophage	2.6e-15	38.3
WP_027822829.1|2586740_2587115_+	DUF806 family protein	Q8LTK5	Lactococcus_phage	4.6e-17	41.4
WP_027822830.1|2587129_2587798_+|tail	phage tail protein	A0A2P0ZLH1	Lactobacillus_phage	2.8e-73	66.0
WP_027822831.1|2587870_2588251_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLH4	Lactobacillus_phage	1.8e-13	41.2
WP_027822832.1|2588268_2588478_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_102115864.1|2588505_2593911_+|tail	phage tail tape measure protein	A0A2H4PBB0	Lactobacillus_phage	3.5e-121	33.9
WP_102115865.1|2593986_2595759_+|tail	phage tail family protein	A0A2P0ZLH2	Lactobacillus_phage	3.2e-310	92.4
WP_102115866.1|2595824_2598239_+|tail	phage tail protein	A0A2P0ZLF8	Lactobacillus_phage	0.0e+00	92.9
WP_027822923.1|2598255_2600757_+	hypothetical protein	E9LUR4	Lactobacillus_phage	5.3e-250	69.8
WP_027822926.1|2600749_2600992_+	hypothetical protein	A0A2K9VDF6	Lactobacillus_phage	5.2e-30	91.2
WP_187326334.1|2600995_2601157_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLG1	Lactobacillus_phage	5.7e-17	90.6
WP_027822927.1|2601140_2602172_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLF6	Lactobacillus_phage	7.6e-62	87.1
WP_027822928.1|2602168_2602414_+	hypothetical protein	A0A0A1ENR9	Lactobacillus_phage	1.8e-17	70.5
WP_102115867.1|2602425_2603598_+	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	E9LUR8	Lactobacillus_phage	5.4e-197	88.7
WP_003644510.1|2603597_2603861_+	hemolysin XhlA family protein	E9LUR9	Lactobacillus_phage	2.0e-38	100.0
WP_064578172.1|2603873_2604251_+|holin	holin	A0A2K9VCG4	Lactobacillus_phage	3.7e-14	63.8
WP_102115868.1|2605494_2606706_+	FtsW/RodA/SpoVE family cell cycle protein	NA	NA	NA	NA
WP_102115869.1|2607184_2608927_+	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_003645638.1|2608945_2609737_+	ABC transporter ATP-binding protein	G3M9Y6	Bacillus_virus	4.5e-30	36.8
WP_003644505.1|2609717_2610902_+	LCP family protein	NA	NA	NA	NA
WP_013356280.1|2611125_2612352_-|transposase	IS110 family transposase	A0A1X9I619	Streptococcus_phage	1.1e-88	48.3
WP_003645636.1|2612711_2613284_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003645635.1|2613983_2614925_-	glycosyltransferase family 2 protein	V9QJB1	Oenococcus_phage	3.1e-78	48.7
WP_015640487.1|2615370_2615763_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003645633.1|2615926_2616319_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_064578176.1|2616354_2617524_+	hydroxymethylglutaryl-CoA synthase	NA	NA	NA	NA
WP_003645631.1|2617573_2618203_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_089197934.1|2618506_2618737_+	DNA alkylation repair protein	NA	NA	NA	NA
WP_003640747.1|2618826_2619459_-	transcriptional repressor LexA	A0A1B2APZ1	Phage_Wrath	2.3e-16	56.2
WP_003644501.1|2619610_2619850_+	DUF896 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003640745.1|2619947_2620184_+	YneF family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003645630.1|2620240_2620876_-	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_102115870.1|2620987_2621746_+|tRNA	tRNA1(Val) (adenine(37)-N6)-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_003645628.1|2621729_2622035_+	GIY-YIG nuclease family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003640741.1|2622119_2623118_+	D-2-hydroxyacid dehydrogenase	M1HKI4	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	2.3e-47	34.9
WP_003640740.1|2623407_2624130_-	HAD family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_003640739.1|2624354_2625158_+	30S ribosomal protein S2	NA	NA	NA	NA
WP_003644498.1|2625260_2626139_+	elongation factor Ts	NA	NA	NA	NA
2625360:2625377	attR	NA	NA	NA	NA
WP_003640737.1|2626338_2627061_+	UMP kinase	NA	NA	NA	NA
WP_003640736.1|2627062_2627626_+	ribosome recycling factor	NA	NA	NA	NA
WP_003640735.1|2627745_2628525_+	isoprenyl transferase	R9W0U9	Flavobacterium_phage	1.1e-23	43.1
WP_003640734.1|2628540_2629326_+	phosphatidate cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_003640733.1|2629363_2630641_+|protease	RIP metalloprotease RseP	NA	NA	NA	NA
WP_003640732.1|2630680_2632390_+|tRNA	proline--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA

2. NZ_CP025588

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	18608 : 26485	9	Enterobacteria_phage(50.0%)	transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP025588|18608:26485|DBSCAN-SWA
ATTAATTTCGACTTGCTTCACGTCGTTGCGCCCCTTCCCAATATTTGCTCAAACCCGCTTCTAACGACCACCTCGTCGTGTATCCCAACTTAATTAATTTACCAATGTTAGCCACCGAACGCTTAACTTCCCCTTCACGACCCGGTGCTTTCTTAACCTGTAATGAAGTCCCAGCAACTTTCTCGTACGTTTCGATAATGGCACTTAAACTGGTTTCATTACCATTGGCAATATTAAAGACTTCATGCTTCGTATTACTCTTAGTTATCAACCATAATGCTTGGATAACATCTTCAACATACACAAAATCTCGCGTCTGACTCCCGTCTCCGTACAAGGTAAATGGCTTCTTGTTATTGAGACAATCGGTCAAGATCGACAGCACCCCTGAATATGGCGAACTGGGATTTTGACCAGGGCCATAAACATTGAAGAAACGCACACAGACAGTTGGTAAATCATAAAGTTCACCATATGCTAGTACAAAACGTTCCGTAGCATACTTATCAATCGCATATGGTGATAATGGATCAACTCGTGAGTCTTCTTTCTTAGGTAATTCTGGCAGATTACCATAAACCGCTGCCGAAGACGTAAATAGGAACTGTTTAATTGGTAAATTAGTCTTCCGAATATATTCCAACATATTGAATACTGCAGTTTGATTCACTGAATGGGTTTCAGCTGGACGTTCAATCGAATCGGCAACACTAGCAACAGCTGCTAAAAAGTAAATATAATCAGGTTGTTCTTCCTGTAACAATTGTTGCATGAATTTTTCGTTGCGGACATCTGCAACATAAATATTGACTTCATCCTGATGCTTAATATTTTGTAAGTCCCCCATGGACAAGTTATCAACTACGACAACGTCCAAACCTTCTGATACCAAGTGATCCACAAGGTGGGAACCAATAAATCCCGCTCCTCCAGTTACTAATGCTTTCATTTAACTCGCTCCTTCTTTTAAAACAACCAGTGCTTTCGCTGTTTTCGTGGCATCTCAATTCCGCCAATATCAATCTGTTCACCATTCAACAAATCCCGAGCGTTGGTTGCAAAACGTTCAGGATATTTCGAATTCATTTCATTTAGTACTTCGTAAGCCTTCGTCATAGCAAAGCCCCGATTTTTCAGCGTATGCGCATCTGATGCGACCACTTGAACCAAACCACACTTAACGAATTCTTTTGCGGTTCGCTGGACTTGTTCCCCAAAAGTACCTACTAAACTGGTGGCCGTAACCTGTGCCAAGACCCCATTCTCGGCCAACTTGTATAATCGCTGCGGTTCGGCAATAATTTGAGCATTCCGTTCAGGGTGTGCAATGAGCGGGGTAATCCCCTCACAAGACAATTGAAAAATCATCTCATCCAAGTAACTTGGTACCATCTCGTGGGGAAGTTCTAACAGTAAATAGTGTCTACTGGTATCTATTCCCAACAAATCATCAATATTTTCCATCAGCTGACCATTCAGATGTACCTCTTGACCAGGAAAAATGGTTAACGGAATATCATTTGCATCTAGCTCTGCTTGAAATACCTTAACCGCCGCTGCCACATCACCGGCATGATTGAGGTATTGCCGATCCATATGATGTGGTGTCGCTAAAATATAGCGAATCCCGTCAGCCACCGCCTGCCGTGCCAATTCCAATGACGCTTCTAAGGAAGGTGAACCATCATCAATGGCTGGTAAGATATGGCAATGTAAGTCAACTAAATTATTTATCTTCATCGCTGTAGTACCCGTAGCCACTGTTATAGCCGTAGTATCCGTGATGAGAGCCATCACGAACATCGTTCAGCACCGCACCCAAAATGTTAGCTTGCGATTTCTTTAATGAATTAACAGCATCACGGACCGCTGCTTTTTGGGCCACACCTTGGCGAACAACTAAGACCGTGCCATCAACTTTATTAGCAAGCAACTGTGAGTCAGTCACTGGCAAAATTGGTGGTGCGTCAACGATCACCAAATCTAATTTACGCGTTGCCGAAGTCAAAAATTCGGTCATTTTATTACTACCCAATAGTTCAGCCGGATTAGGTGGCTTAGGACCACTCGTCATCACAAATAGATTGCCAATGACGGGATGAATTGCATCATTCACGTCGTCCAACTGATTAGCTAACCATGAGCTCAATCCCTTATGATTTTTAAGCCCAAACGTTTTATGAATCGTCGGTCGTCGCAAGTCAGCATCGACCAATAAAACTTGCATCCCTTCCTTGGCATACTCCACTGCTAAGTTACAACTTACTGTTGACTTACCTTCACCCATCATCGCTGAAGTCACCATTAAAGTTCGTAAATTTTTGTCAGTAGCCGCAAAATTGATATTGGTTCGAATTGTTTTAATCTGCTCAGTAATGACCGACGTGGGTTCATTAATCGTCGTGAGATTAATTGGTACCGTAGTCGTTATATTCTGTCCTTTACGTTTAAACATCTAGTACCTCCTAAACTCGCTTCATTGTTTGCGATGTTATTTGATTATCATGTGTGGGATGAGCAACAGTCAAATTTGAAGCTTGCTTTTTAATTGAGTATTGATTTTGATGATTGACTAAGCCTAAACTAGCTAACCCTAATTCATCAGTTAAGAAATCAGCGTCGTGAACGCGACGATCAGTGAGCCCCCGAATCGCTGCATAAGCAAATCCTAGTAACAATCCTGCAACTAACCCAACCAACATATTAAGAGGTTTTTTCGGTGATACCGCACCATTTGGCGTTTCGGCTGGAGCAACAATCGTGACGTTGTTAACTTTAATAATCTTTTGCACTTGGTTCTTAAAACTACGAGCAATCTGATTGGCAATTGTCGCACTAGCTTTTGCATCAGTGTCAGTAACTGCAATTGAGAAAACCTGTGAGTTGGTCGTGCTTGTCACACTAACTTCATTTTTCAATGTGTTCAGTGAGCGCTCAATACCATAACGCTCACTTAATTGTTGCTGAGTTGGTTTTAAAACCACTTGTCCAGAAATTAATTCCTTGTAGGTCGTAATCATCTGAACGTCAGCCTGCTGCCCAGCATACTCAGTAGCGGCATTAGTATCTTTACGGTTAACCAAAATCTGGACACTTGATTGGTACTTAGGTGTAATTACAAAGAATGTCAACCCTGCGGCAACTATCAATCCCACCAACGTAAAACTGACAATTGCGCGCCAGTATTTACGGACAAGCCGGATAAAAAAGTCAAAACTTACTGTTTGATCCATCATTCACTCTCCAAAATTAACAAAATATTTTACGCTCTCTTAATATTAGAAAAACGGGCGTTAATAAAAGAAGTGCTGAAATACTAGCAACTATATCAAATAGGCGTTTAATAAAGCGATAACTCAAATCATTCCTTTTGCTTCTAATATCTATAAAAATATGTTCTATTTTTTCTCTATCTTGCATAGGGTCACACAACCTTTACTCCGATAAAAGCTTTGCAACTGCACTCTTCCAGTCAGAAATTATAAATCCAGTTTTTTTGGCCTTGCTCAAGTTCATCACTGAATGCCGTGGCCGACAAGCCTTTTGTGGAAATTGTTCAGAAGTAACTGGTACTACTTCAACATCAGTGTTCTTCAAAATTTCTTTTGCAAAGTCATACCAGGTGGCTGTATTATCGTTGCTTAATTGATAAGTCCCTGAAGCGGCCTCAGTTTTCACTAGGTGAACCATAAATTCTGCTAATGTTCGCGTCCAGGTCGGCCGTCCAAGTTGATCATTAACGACTGTCAACTTATCATGTGTCTTCGCTAAATTCTGCATTGTGAAGACAAAGTTATGTCCAAATTCACCGAAAACCCAGCTAGTCCGAACAATGTAATAATCAGCACCACTGTGACGAACGGCTTCTTCACCAGCCCACTTAGCACGCCCGTACTCATTCTTGGGATTGGCTGGATCATCTTCTAAATATTCACCTTTATTGGTGCCATCAAAAATATAGTCAGTAGAAACATAAACCAATTTAACATCCTGTTCAGCTGCTACTTGGGCTAAATTTTTTGTTCCATCAACATTGACCAGCCAATTGAGGGCTTTGCCTTCATCTTCGGCCTTATCAACTGCTGTGTAAGCTGCGCAATCATATAAGACCACAGGTTGTAATTCCGCAACCTTAGCTTTGACTGCATCTAGGTTCGTGACATCCAATTCTTTTTTAGTCAGTGCATCAAATGCAATCCCTTGTTCATTTAATAGTCGTTGCAACTCATTCCCCAATTGACCATTGGCACCAACAATCATTACTTTTGACATTTAGAAACCTCCTCCTCTAGCATTTCACACTATTATTGCCCGTTCTTGGCGTAGTTTGATTCAACCTTGCTCTTATCTGCTTGCCACCAGTCTTGATGGTCAGTATACCAATCAATCGTTGCTTTCAAACCAGACCGGAAGTCAGTAAACTCTGGCTGCCAACCTAATTCCGTGCGCAACTTAGTTGAATCGATTGCATAACGTAAATCATGGCCGGGACGATCCTTAACAACATCATAAGCATCTTTAGGCTGACCCATTAATTCAAGAATCATTTCCAAGACGTTCTTATTGTTCATTTCGCCATCGGCACCAATCAGGTAGGTCTCACCAATCTTACCCTTGGTTAAAATATCCCAAACGGCCGCAGAATGGTCGTTCGTGTGAATCCAGTCACGAACGTTTTTACCACTACCATATAATTTCGGCCGAATACCACTTAGAATATTGGTAATTTGGCGTGGAATAAATTTCTCAATATATTGATAAGGGCCATAGTTATTTGAGCAGTTTGAAATGGTGGCTTGTAAGCCAAACGAACGCACCCAAGCCCGAACTAAGAGATCACTGCTGGCCTTAGATGAAGAGTATGGGCTGGAAGGCTTATAACGACTAGTTGGTGTAAACTTCTCGCCAACACCCTCACCATGGCCCGGTAAATCTTCCCGTAATGGCAAATCACCGTATACTTCATCAGTAGAAACATGGTGGAAGCGTTTGTTAAACTTATGTGCGGACTGGATCAGCGTATAAGTCCCAATAATATTCGTTTCGATGAATGGCCATGGATCCTTCAATGAATTATCATTATGGCTTTCAGCGGCATAATGGACAACCGCGTCAGTTTGTTGCATTAATTCATCAACTAAGGGCGCATCACAAATGTCACCCACAACTAATTTAACCCGGTCGCCTAGAATTTCTTCCAAGTTGGCCCGATTACCAGCATAAGTTAACTTATCTAACACGGTAATCTGGACTTCGGGATGATGATTATAAACATAGTGAACAAAGTTAGAACCAATAAAGCCGGCACCACCGGTAACTAATAAGTTTTCCATGACGTCTCCTTAAATTTCACCGTAAACAAACGGATTATTCTGTTCAAATTCTTTGAAAGTCTGTTGTTTAGCATCCTTATCAGAAGTAATAGCTTGATCGTAGTCAATAGGCCAATTAATGTTTAAATCTTTATCCATAAAGGTGATTCCACCATCAGCTTCAGCATTGTAGTAGTTATCACACTTGTATAAGAAATTAACATTATCAGTCAATGTCACAAATCCATGGGCAAAGCCACGGGGGACTAACAATTGACGGTGGTTACTTTCAGAGATAATGTAGCCTTCCCATTCACCGTACGTAGGTGAGCCAGCACGAACGTCCACAATAACATCAAGCACGGCACCAGTCACCACGCGAATTAATTTAGTTTGCGCTGCCTTGCCACGTTGAAAATGCAGTCCCCGCAAAACACCCGCTTCCGCTGACAATGATTGATTATCCTGAATGAAATCAAAATCAATTCCAGCTTCTTTGAAATCACGGTCAGAGTAAGTTTCCGTAAAGAACCCGCGCTTGTCACCAAAAACTGCTGGCTCAATAATCTTAACATCTTGTAACTTAGTCGTTGTTACCTTTAATTTGCCCAAAATTTAAGCCCTCCCAATTAATCTTAATAAGTATTGACCGTAATCATTCTTCTTCAATGGTTGCGCCAATTCATACACTTTATCAGCATCAATATAACCCATTCGATACGCCACTTCTTCTAAGCAAGCCACTTTTAAGTTCTGGCGTTTTTGCACGGTTGCGATAAAACTACTTGCTTCTTGTAATGAGTCATGGGTCCCAGTATCAAGCCAAGCAAAACCACGGCCCATGAGTTCAACATCTAACTCATTATGTTCTAAGTAAACTTTGTTGATATCCGTAATCTCCAATTCACCACGTGGTGATGGTTGAATATTCTTCGCAATATCAACGACTTGATTATCATAAAAATACATTCCCGTGACAGCATAATTACTAGCTGGGTGTACAGGCTTTTCAACAATGGACTTTGCATGCATATTTTCATCAAAGTCAACGACACCAAACCGTTCCGGATCATTGACATGGTAACCAAAGACCGTGGCCCCCTTCGGCTTAGCGCTAGCATGTTGAAGCATCTTGGATAAGCCGCCACCATAATAAATATTATCACCTAAAATAAGACAGACTGAATCATTTCCAATGAAATCAGCACCCAAAATAAAAGCTTCAGCTAAACCGTTCGGCTTTTCTTGGACAGCATAGGATAGATTCAAGCCCAAATCATGACCATCGCCTAACAGTTCTTTGAACCGTGGTGTATCAACAGGCGTTGAAATAACCAAAATATCTTGGATTCCTGCCAACATTAACGTCGATAACGGATAATAAATCATTGGCTTATCATAAATCGGAATCAATTGTTTTGAAATCGCCCGTGTAATCGGATAGAGTCGTGTACCAGATCCCCCTGCAAGAATAATTCCTTTCATTTAGAGCCCTCCTGAATAGTTGCTTATTTTAATTATATTTCTATTTTCAAAATATTACTACCTAATAATAGAAGAAAGGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACTGGCAAATTACAAGTTTAATCCGAACAAGCCCGGAATCTTTCAATGGCAGTCTGTTGATGATGTATTTTTAATGGTCGTTGATTAATTAGTTCAAGTGCTGCTAGGATCTCATCAGTCGTTACTTGGCTAAAATTGGTCTTTTTCGGGAAGAACCAGCGTAACCGTCTATTAAAATATTCATTGGAACCTCGCTCCCATGGTGAATATGGATGGCAAAAATAAACTTTGATCTGATAATCCTGTTCTAAGGCCTGATAATTGGCAAACTCTTTACCATGATCAACAGTAATGGATTTTACTTGGGGACCGAAGGCCCCCATAAACTTGCCAAAGGCGGTGTTTAGAGCCTTAGCCGTTCTATTAGGGGCTTTGATTGCCCATAGAAGTCGGGTCTTACGTTCTACGAATGTAACCAGACATGATCGTGACTCACTTCGACTAGAAAGCACCGTATCTACTTCCCAATGACCAAAAGCTAACCGTTGATTAACAGTTGTTGGCCGTTGTTCGATGGAAGTCCCACTTGTAAATTTCCCACGATTTTCGCTCACTCGGTGCTGGCGGACATTCCGATTGGGTAGATCAGTCAATTTGAAGGGGAGCCAGCCACGATTAAGCCAATTATAAATTGACGCAGTGCTCAAGTTATAAGCGGCCGCAATGGTTTCTGGTGACCAGGTTAATCGTAAGTGATTGGTAATTAAAGTCGCTAATGCTACCGTCAGCATCGAACGACGACCGCAATTCCGCCTTTTGCGATCTGCATCTTGCTGAGCTAATTCTGGATCATAAGGTTTAACCCGGTCCAACTCATAGCTAATCGTAGCTTTGGCGACGCCTAAGGCGTCAGCCATTACTTGGTAAGATTTATTCCCCTCATTGACCAGTTGTGCTAGTGCGCCACGTTGAAAACGGAGAGCGTAAAATATCTTGTGTAAATGCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP025588|18608:26485|20333_21062_-|WP_102115991.1|DBSCAN-SWA
MFKRKGQNITTTVPINLTTINEPTSVITEQIKTIRTNINFAATDKNLRTLMVTSAMMGEGKSTVSCNLAVEYAKEGMQVLLVDADLRRPTIHKTFGLKNHKGLSSWLANQLDDVNDAIHPVIGNLFVMTSGPKPPNPAELLGSNKMTEFLTSATRKLDLVIVDAPPILPVTDSQLLANKVDGTVLVVRQGVAQKAAVRDAVNSLKKSQANILGAVLNDVRDGSHHGYYGYNSGYGYYSDEDK
>NZ_CP025588|18608:26485|18608_19556_-|WP_102115989.1|DBSCAN-SWA
MKALVTGGAGFIGSHLVDHLVSEGLDVVVVDNLSMGDLQNIKHQDEVNIYVADVRNEKFMQQLLQEEQPDYIYFLAAVASVADSIERPAETHSVNQTAVFNMLEYIRKTNLPIKQFLFTSSAAVYGNLPELPKKEDSRVDPLSPYAIDKYATERFVLAYGELYDLPTVCVRFFNVYGPGQNPSSPYSGVLSILTDCLNNKKPFTLYGDGSQTRDFVYVEDVIQALWLITKSNTKHEVFNIANGNETSLSAIIETYEKVAGTSLQVKKAPGREGEVKRSVANIGKLIKLGYTTRWSLEAGLSKYWEGAQRREASRN
>NZ_CP025588|18608:26485|23949_24531_-|WP_003644155.1|DBSCAN-SWA
MGKLKVTTTKLQDVKIIEPAVFGDKRGFFTETYSDRDFKEAGIDFDFIQDNQSLSAEAGVLRGLHFQRGKAAQTKLIRVVTGAVLDVIVDVRAGSPTYGEWEGYIISESNHRQLLVPRGFAHGFVTLTDNVNFLYKCDNYYNAEADGGITFMDKDLNINWPIDYDQAITSDKDAKQQTFKEFEQNNPFVYGEI
>NZ_CP025588|18608:26485|22042_22879_-|WP_057785044.1|DBSCAN-SWA
MSKVMIVGANGQLGNELQRLLNEQGIAFDALTKKELDVTNLDAVKAKVAELQPVVLYDCAAYTAVDKAEDEGKALNWLVNVDGTKNLAQVAAEQDVKLVYVSTDYIFDGTNKGEYLEDDPANPKNEYGRAKWAGEEAVRHSGADYYIVRTSWVFGEFGHNFVFTMQNLAKTHDKLTVVNDQLGRPTWTRTLAEFMVHLVKTEAASGTYQLSNDNTATWYDFAKEILKNTDVEVVPVTSEQFPQKACRPRHSVMNLSKAKKTGFIISDWKSAVAKLLSE
>NZ_CP025588|18608:26485|19573_20347_-|WP_102115990.1|DBSCAN-SWA
MKINNLVDLHCHILPAIDDGSPSLEASLELARQAVADGIRYILATPHHMDRQYLNHAGDVAAAVKVFQAELDANDIPLTIFPGQEVHLNGQLMENIDDLLGIDTSRHYLLLELPHEMVPSYLDEMIFQLSCEGITPLIAHPERNAQIIAEPQRLYKLAENGVLAQVTATSLVGTFGEQVQRTAKEFVKCGLVQVVASDAHTLKNRGFAMTKAYEVLNEMNSKYPERFATNARDLLNGEQIDIGGIEMPRKQRKHWLF
>NZ_CP025588|18608:26485|25555_26485_-|WP_102115994.1|transposase|DBSCAN-SWA
MHLHKIFYALRFQRGALAQLVNEGNKSYQVMADALGVAKATISYELDRVKPYDPELAQQDADRKRRNCGRRSMLTVALATLITNHLRLTWSPETIAAAYNLSTASIYNWLNRGWLPFKLTDLPNRNVRQHRVSENRGKFTSGTSIEQRPTTVNQRLAFGHWEVDTVLSSRSESRSCLVTFVERKTRLLWAIKAPNRTAKALNTAFGKFMGAFGPQVKSITVDHGKEFANYQALEQDYQIKVYFCHPYSPWERGSNEYFNRRLRWFFPKKTNFSQVTTDEILAALELINQRPLKIHHQQTAIERFRACSD
>NZ_CP025588|18608:26485|22911_23940_-|WP_102115993.1|DBSCAN-SWA
MENLLVTGGAGFIGSNFVHYVYNHHPEVQITVLDKLTYAGNRANLEEILGDRVKLVVGDICDAPLVDELMQQTDAVVHYAAESHNDNSLKDPWPFIETNIIGTYTLIQSAHKFNKRFHHVSTDEVYGDLPLREDLPGHGEGVGEKFTPTSRYKPSSPYSSSKASSDLLVRAWVRSFGLQATISNCSNNYGPYQYIEKFIPRQITNILSGIRPKLYGSGKNVRDWIHTNDHSAAVWDILTKGKIGETYLIGADGEMNNKNVLEMILELMGQPKDAYDVVKDRPGHDLRYAIDSTKLRTELGWQPEFTDFRSGLKATIDWYTDHQDWWQADKSKVESNYAKNGQ
>NZ_CP025588|18608:26485|24534_25404_-|WP_021730701.1|DBSCAN-SWA
MKGIILAGGSGTRLYPITRAISKQLIPIYDKPMIYYPLSTLMLAGIQDILVISTPVDTPRFKELLGDGHDLGLNLSYAVQEKPNGLAEAFILGADFIGNDSVCLILGDNIYYGGGLSKMLQHASAKPKGATVFGYHVNDPERFGVVDFDENMHAKSIVEKPVHPASNYAVTGMYFYDNQVVDIAKNIQPSPRGELEITDINKVYLEHNELDVELMGRGFAWLDTGTHDSLQEASSFIATVQKRQNLKVACLEEVAYRMGYIDADKVYELAQPLKKNDYGQYLLRLIGRA
>NZ_CP025588|18608:26485|21072_21843_-|WP_102115992.1|DBSCAN-SWA
MMDQTVSFDFFIRLVRKYWRAIVSFTLVGLIVAAGLTFFVITPKYQSSVQILVNRKDTNAATEYAGQQADVQMITTYKELISGQVVLKPTQQQLSERYGIERSLNTLKNEVSVTSTTNSQVFSIAVTDTDAKASATIANQIARSFKNQVQKIIKVNNVTIVAPAETPNGAVSPKKPLNMLVGLVAGLLLGFAYAAIRGLTDRRVHDADFLTDELGLASLGLVNHQNQYSIKKQASNLTVAHPTHDNQITSQTMKRV

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_102115989.1|18608_19556_-	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	L7RCI0	Acanthamoeba_polyphaga_moumouvirus	8.9e-41	35.5
WP_102115990.1|19573_20347_-	tyrosine protein phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_102115991.1|20333_21062_-	CpsD/CapB family tyrosine-protein kinase	NA	NA	NA	NA
WP_102115992.1|21072_21843_-	polysaccharide biosynthesis protein	NA	NA	NA	NA
WP_057785044.1|22042_22879_-	dTDP-4-dehydrorhamnose reductase	A0A291LA50	Escherichia_phage	5.5e-34	36.8
WP_102115993.1|22911_23940_-	dTDP-glucose 4,6-dehydratase	I7HTA3	Enterobacteria_phage	1.2e-70	44.8
WP_003644155.1|23949_24531_-	dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase	I7HJC4	Enterobacteria_phage	4.3e-38	45.1
WP_021730701.1|24534_25404_-	glucose-1-phosphate thymidylyltransferase RfbA	I7I009	Enterobacteria_phage	1.7e-99	59.7
WP_102115994.1|25555_26485_-|transposase	IS30-like element ISLsa1 family transposase	Q9MBM9	Staphylococcus_prophage	5.5e-51	38.2

3. NZ_CP025589

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	6912 : 20215	10	Lactobacillus_phage(88.89%)	tail,holin	NA
DBSCAN-SWA_2	27905 : 54222	23	Lactobacillus_phage(85.0%)	portal,tail,terminase,holin,head,capsid	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP025589|6912:20215|DBSCAN-SWA
CGTGACCTTACAACGAGATGATTTTGAATATGCCGGTTTAAATAGCCGGGATGATTTACAGGTTGAGATGGGTAACGTGGTATTGCCTAGTGCCCCAGCCATGGCTGAACAAGTGACTGACATACCGGCCATGTATGGTAACCAATTTAATGGCACGGACTTTACGAGCCGGACGATTAGTATACCGGTATCCATTTACTGTGCTGATAATCAAGACAGATTTAATCAGATTATGCACAATTTAAGCGGTCTGCTATTAAGTGATGACCCTAAGGACAATAACAAGGAGTATCCATTAATCTTTGGTTTTGAACCTAAGGTGACTTATTGGGGGCATATTACCGCAATTAGTGACCCGGCCCCGATTAATACGGGTATGTATGACATGACACTTACTATTACCTTTGTGCAATCCGACCCACGGGCAACCCTGCCACAGGTTGAAACACCATTAAAGAACGGTTTAAACACGATTACCGTTGATGGCACCGCTAGAACAGAGCCAGTTATTCAGGTTATACCTAAGCGGGATTTAAAGCACATTGGCTTTACCCTAAATGGTGGTGAATATGGATTAGGGCCAGATAGCGATGAAGACCAAGCAGTGGCGGTACAGCCTTATACGCAGGTTGTGAACAGTGACGTGTTAAATACGATGGCTGAATGGACTAATGATGCCAATGCGATTGCTCAAATGAAGACCGCTGGTGACTACATTTATCAAGGTGAAGCTGATAGTAACCGAGATACCCAAGTATTAATGGTCAAGCTAGCTAATGGGGTTAAACAATATGGTAGTCATCAACCAGACTGGTATGGCCCCGGTGTTCGTTTTACTGGCATGACTAACAGCCTGACTAACTACCGAGTTAAAACTAGGATTCATCACATTAAACACTCAGGTACGCATAATGGGCGAGCAATGGGACGGGTAGAAGTCCTGCTTTTAGACCCTAACGGAGCCACAATAGGACGATTCGGGCTAGCAGACAGCTCTGGGGGTGGTACTCCAACGTGTTACTTACAAATCACTAAGCCGGGTGGTACTTTTGTCGGTGGTGACGGTAAACATGAGACTTTCTACAATGGTAAGGGCCCTTCAGGTAGCTCTAGCAATGGCCGTGACCAAAAGATTAAGATTAAGACTGGTACCACAACTAAGACAGTGGTTAAACGGTCACGCAACAAGAATGGAAAGGTGACAACTAAGACAATTAATGAAAAAGTTGACAAGTATATCACCGTTGTTAATAAAGAAGAAAAGTCGGCGCTAAGCACTAGTTGGCTAGAACTCGACTTGATTAAGAATGGTAAGGTGTTTAGCTGGTCAATCACCCAATACTACACCAGTGGTAGTCACAACGGTCAACCATGTAAAGACCCTAAACGGTTTCTAATTGTACATGGCACGTTTGTTGATAGGAACTCTAATTATCAGTCAGCCCTAGGTGGTATCGGCGGGGTATTCTTTAAGCACTCGATTGCTGAAGATGACGAAAATGTGGGCTATGAAAATCCTTATCTATCAATCACTCACCTAGACATTTACCAAGTTAATGACGTGGCTCAGGACGCACCTAAGTATATTGCTAGTGCTGGTCAAGAGATTGTCTTAAATTGTGAGACTGATAGCACAACCGTTGGCGGTAAGCTAGCTAGTCCCATCTGGTCAACGGACTATCCTAAGCTTAGTCCGGGGGTTAATAGTCTGACTATGATTGGTGACCTCGATGACGCTAAGATTACACTTAAATATTTACCCAGATTACTCTAGCAACACTTAAAGGCTTCCCTTAATTGGGTGGCCTTTTTACATAACTAAAATAAGGAGGTTAACAGATGGCTTTAAATAACCAGTATTTAATCCTAGATTCAAATTTAAAGCGGATTGGGACCCTGACCGTTGATGGGGCCACTAAGTTCTCTAATGACAGTGTGAAGATGCAACTAGCCGATTCAGACACAACTAGCACTAACTATGATGATGACGTTAATGTGGGAACCGCTGACACGTTTAATGGCACGATTAACCTAAACGCTCAATCTAAAAAGTTCGACCATCAAGGCTCTTTAGACGTGCTTCAAGGCCAGCCTGATTCAGACAAGGTGGTGGCTGGTAATAACTTAGCCTATTATGACGAGCTCTCAGGTCATTGGTATGTCATGCGTATATACAGTGTGGAAGAAAACAATACCGCTGCTGTTAAACATGTCACAACGGCTAACTTTACCAATTTATGCTTGTACAGTTTAGCTCATCATTATCCTATTGCTACTACAGCTAGTGCCAGCACGATTCAGACAGCCTTTAACGAGTGTTTTAACGCCACTGGTTGGACGCTAGACTATCAGACCACTAATGTCATGACCCCAACGATTGCCATTGATGGTAAAACTAAAGCTAGTACGCTGATTCAGACGCTAATCCAGACTTATAACGTTGAAATTGACCCCTATGTTGAGATTGATAGCCAAGGGAATATCACGAAAAAGGTGTGTGTCATTACCGACAAGCTCAATGCTGACGTGGTCTATAACGAGGCTGTATTCGGTAAGAACATGACTAGTATTAAACGGACAACCGTTTCAACACCTGTGACTAAGTTGATTCCCTATGGAGCTAACGGTAGCACGATTGCAGTGGTCAATGATGGTAAGCCCTATATCGTTGATGATGAGGCTAATCAGAAATATAACCCCGATTGGCAAGCCGGCCTATACTACGAAGCCATTGTTACTGCTAATCAGATTAGTAACTCAGCCGGTTTAAAGTCATGGGCTCAGGATATGCTCAAACTATATAATCACCCTAGAACGTATTATGAGGTGAATGTAACACCCAACTTTAATCCGCCTTTAGGAGCCACGATTAGGTTTAAAGATGAGTTAATTGAGCCCGTATTAGACGCTAGTGGCCGGGTTATTCAACGGACAATCAGTTTTGCTAACCCGTATGGCAACACAGTCGGCTTTGGTGAGTATACAACCGTTCAAGTTGCCACCCCGGCATGGATGGAACAGTACCAGAACGCACTCAGTAAGGCAGTTGACGCTGCTAAAAAAGACGCTAGTTCGATTAAACCGGTCGCTTTAACGCCTGACGGTAATAATTTCACTGATACCACCCAGACTAAGCGCTTAATCTTACAGGCTTGGGAAGGTAGCACCAATATTTCATCGTATATTGACAGCAAGGGCTTTATCTGGCGCCGTTATAATACCGATGGCACGGTTGACACCAGCTATCAGCAAACGGGCTACTTAATTAATGCGGCTAGTAACGCTGTTGGCACCTTACACGGCACAATTGAAGCTGACTATATCCAAGATGACCCTGAAATTAAGCTAGACACCACTGGGATTAGCTATTTAGGGGTCTATGGTCCCGATGATAATGGTGCCCACTCAGCTACTCAATACATGGCACGGTTAAGCAATGGGCAGTACCTAACTAGTCGGGCTCGTGATGACAGTGGCTCTAGTGATACCATGTTTGCTTTACAGGATAGCAAGTTTGCCGTGCAGTCGGTGATGTTACAAGTCCATGGGCAACATGGTGGGACATTCGGCGTGCAGGAAGTTAATAACACGGTCTATATCTGGAACATTGTGAGCTTGAAGAACGATGGCAATTACATTCTAGTTAGATTTCCATATGTAGCTGGGCTAACTTTACAGCCTACCGATAGTCGAGTTCAACAGATTATGGCGCTTAAAGGATATGGCCGCATTAACTATGACCGTCAACATGATATGGTCTCAATTGGCTATTCCGATGGCAGTACCGATATTATCAACGCTAGTGACCTGTTAGCCGGCAACTATAACGTGTTATACAACTTTAATATCACGGATTATGGGATTGATTTTAACCAGAACACTTACCAATCAGAATGTCTAGACTTCCCTTACTTCTACTTTGCGGCCGGTGGTGGTGAAGCTGAAACAACCGATGACCCGCATAAAGTATGGGCCTTAAATGTCGTCCATAAAGGGGCCGAATTTGAAGCTTACTTTGACAATGATATGGTAATGCCCAACCTAACCGATGAAAGTCGTGAAGTGGAAACTGTCAACGTGTTCTATCAGGATTCACAGGCGTATATGCTGGTGACCTTTAACACTCGGGTACTAGAAATTGACCCCTATTCAGCTGAAAAGGAAAAGGTGTACACAATACCCATTACGAAACGGTCAGCAGCTAGTGTGATTGATAAGGGGACGATAAATGACAATGTTAATACAGATGATTAAAGAAAGGGGGATTATAAATGGCTGAATCTAATCCAACTCAAGTCATCTTAACCGATGATGGTATTAAGATTATCAAGGCTCAAAATACGGCTGATAATGCCGCTAGTCAGGCAGAAAATGCTAATAGTGCCACTTTAATTGCACAGTCTACAGCTAATGCTGCTAAATCAGCCGCAGATAGCACCTATGACTATGCTAACTCTGAGATGGCCGTAAATTCAATGGCTACTGCTAAGGCTCAAAGTACAGCTGACAACGCCTTTATCCAAGCTCAAGCAGTTGGTAGTCAAGCTGATTCAGAAATAGCCGTAAATTCAATGGCTACTGCTAAGGCTCAAAGTACGGCTGATAATGCCTTTAGTCAAGCTCAATCGGTTGGTAGTCAAGCTAGTGCTGAGATAAACAGCAACTCTACAGCTACTGCTAAAGCTCAGTCTACAGCTGATAATGCCTTTAGCCAAGCAACTACAGCAATAGATACTGGTAAAGTAACTAGTCAAGCAGTGACAGACCTAAAAGACGGTTCCAAGCTAACGATTGCTGACCTAGAAAATGGACTAGCTACCAAGGTTGCTAACTCAGACTATGCTAGTTACAAAGAACAAACCGCTAGTCAAATAGGACAGATGGTTACTAATAGTGCTTTTTCAACCTATCAAACGCAGACGGCTAACTTGATAGCCCAAAAGGTAGCTACTAGCGACTTCTCAGCCTACCAAGCTACAACCGCTAAGTCAATTGATAGTAAAGTTGACAATGGAGACTTCTCAACCTACAAAACACAGACTGCTAACCTTATTGATGATAAGGTTTCGAGTTCAGAGTATGCTTCTGACAAAACGCAGACTGCTAGTGAGATAGCAGATAGAGTAAGTAATAGTGCATTTTCAACTTATCAAACACAAACCGCTAGCCAGATTGCTAGCAAGGTTGATAATGGTGATTTTTCAACCTACAAAACACAGACAGCTGGCTTAATAGCCCAGAAGGTAGCTACTAGTGACTTCTCAGCCTATCAAGCTACAACAGCTAAATCAATTGATAGTAAGGTGTCATCTAGTGACTTTAACACGTACAAGACACAAACTGCTGACTTAATTGATGACAAGGTTTCTAGTTCACAATATAGCTCTGACAAAACGCAGACTGCTAGTGAGATAGCGGATAGAGTAAGTAATAGTGCTTTCTCAACTTATCAAACACAAACTGCTAGTCAGATTGCTAGCAAGGTTGATAATGGTGATTTTTCAACCTACAAAACACAGACAGCTGGCTTAATAGCCCAGAAGGTAGCTACTAGTGACTTTTCAGCCTACCAAGCTACAACTGCTAAAGCAATATCTAGCAAGGTTGAATCTAGTGACTTTAACACGTACAAAACGCAGACTGCTACGGCGATTTCTAGCAAGGTTTCTAAATCCGATGCTAATAACGTCAATTTGATAGCATATTCAGCTTTACCAGAAGCTGATAATTTAAAATGGACTGAGACTGGAGGAGGCGGAACGCTAAGTGTAGCAAAGCATTCCTTCTATCACAATGGTGCTGATACCCTGTATGAATTGAGTACAGATGGTTCTAATGAAGTCTTTGCTATAAGCCCACGTTTTAAAATTAGTGCTAACACAACTTATACGTTCCAGCTAAAAGGCTTTGCTAGTTCTAATGTAAGCAGTATGGACGTTTATGTTTTGGGCCGGCCCAATGGTAGCACTTCAGATTACACAGTTGTCAAAGAAATAATTTCAGGGGCAGTATTATCTAAGTCAGCATTAGATTATCGGACGGTTACCTTTACAACTGGAGCGATTGATGAAGCTTATCTGCGCATTGATAATAATGGGTCTACCGATGGGAAAACTTCAGTATTAGGTTTTACCGAATTAAAATTAGAGCCCGGTGACACTGCGACACCTTACGTTTATAGCGGCCAAGATTCAATGATTGCTCAGATGGCAGACGATATTCTATTAAGAGTTACTAAGGGCGATTTAATTGATGAGATTAACCTTCAAGCTGGAAATACATTAATTTCATCTAGTGGTCAATTAACACTGTCTGGTAAAAATATCTACTTTGATACGGTTAACCCCGTGATTATTCCTAGTGCTAATATCACCGGGACTCTAAACGGTAAAACTATCAATGCTGGTACACAGCTAAATCAGTATGGCAACACTAGTTATCCGCTAACGCTTTCACCAGATGGTTCAGTTACTAGTACGTCATTTGAAACAATTTCTAACGAGACCGCCGCATTAAGAACGGTCATCAAAGACGGCACAGTTAAAACTAATTTACGTGGTATGACACAGTTTGCAACTGGCATGTATTCAGCGGCTGATGTTTCACTAGGTGCTGGTCAACTAGTATTACTAGAAGGCTATTCAACAGCACAAGACCCAAACTTTAATGCAACCGGCCTAAAGACAACTGGCTATGCAATATTAGACGCTAGCACTGGATTAAGCTTGCACGGTTCCACACAGGCGATTAACTTTAGTGGAACTGACCAAAGTCAAACCACTGGGATTACTATGAATAGCTACGGTAACATTATTGGTTACCCCAATGCGACTTGGTGGCGGATTGTTTCTAACTCGGGCTCAAACATAGCTAACTTTGGTATCGACAAGGCTGGCTCAAACGTCATTCAGTTTAACCGTGAGCTAGATATTGGCAATATTGGTATTAATACTGCTCATTCTATTATCTCGAAAGATGGTAACGGATTATATATCAACTCAGGTAAAGGTGGAAGAGCCGACTTAAATGTGGCTAGTCTAAACTACACTGGGTCCGTGTCTAAATCACTATTATCTGAGAAGAAGGACGTTAAAAAGGTTGATACTTCCTATTGGGCACAGCTAGTTAATTCAATCGACCTAGCAACCTACCAGTATAAAGATGATGATAATATCAGCAACCTTAGACTATCAGGGATTGTTGATGATGTTAACGAGGACAAACAATGGAATCTACCAGACATCTTTGTTGCTCGTGACGAGGATGGAAAACTAGCCGGTATTGAGAATATCGTACTTCAAAATGCCATGTTAGCAACTATACAGGAACAACAAAAGGAAATTGATAAGCTAAACGGACATTTATTAGAATTGGAGGCCAAATTAAATGGATAGCATTTTGATTACAAATTATAAACCAGATTACACGAACAACATTATGACAATCAGCATTCAAATTAATACACTTGGTATCAGTTCACAGGTCAGCATTACCATGGATGACTTTAACACTGCCATTGCTGGAGGTGCTGGTGGAGCAGATAGGGTTAAATTGAAGGTGTTAAACACGCTGATTGACAATCTGACCGCTTTAAAGCCAGTCACCACGACTACGACAACGACCACAAAGGAGGCTTAAATTATGAACATTGATGCACAGGCTTTGATTAACAAGCTGACTAGTAACTATGCCCAAGCGATTGCCCTTAAAGACCAGCAATTAGCGATGGCACAAGTTCAAATTGACCAGCTTAATGCCAAGTTGGCTGAAAAGGAGGCGCCTAAAGATGGCGAAAACGCTTAGTTTTACTGATACTTCACCACAGACGGTTAAAATTGGTGATACCACCACTAGCTTCACACTAGTATGTGGCAATGATAACGTGGCCACTGATTTAACTAATGTTACTTCAATTACTGTTAAATTAGGCAATACTAGTGGCTATCTTAAATCGGCCACAGTTGACCCAACTAGTTTAACCGACCCCACAACTGGTCAAGTTACCGTTAACTTTAATGCTGACTTGATGACTAGTTTAACCGCTGGTAGCTATGCCATTGAAGTATGGGTGGTTGATAGTACCGGGACGTCAATCTACCCTAGTGATGGGTCAACTGGTTTTACTATTACCAATAACATTCAAAGTGCCAATGGGGCCACGATTACGACCATTACTTTTGATGATTTTGTTAATAAATTTAATGATATTGTTGCCAATACTGTTAATGTAGTCACACAAGCACAATATGACGCACTAACCGACAAAACCGGCTTATATGTGATTCAGGGGTGATTTAAATGGCAGATATAACACATGGCACGTGGATTAAAGATGGTAAGGCAGTTGATAAGGCTTTTAGCAACGGCAAGCAAGTATATGGCAGGAACTTATTTTTGAACAGCGGTAAACTATTAAGCGTAACAGGTACAAATACTTCAAACCAAGCGGTTCGTCCTTATTTATTAGCTAATGGGTACAATGTTTCGTCTTTGGCTTCAGCACTTGGGACACGGTTTACAGTTAGTTTTGATTGGGAAGTTTCAGGTAGTTCACCTTCAGGCACATTCCTTGCTCAATGGAATGATGAACCATATAGTGTCACGCCATTTTTTACAGTTTCAAGTTCAAATACTTCAGGCCATATTTCCAATACTTTTAGTGCAAGCACTGATAGTAAAAATACAGCAAATATGTTTGGTTTTAGACTAGATAACTTTGTGGGAACTCTTACAGTTTATAACATGAAGCTGGAAAAAGGTAACACAGCCACACCACATTCCATAGCACCAGAAGACATATTAAATTAGGAGGTAGACAATTGAATAAGCACAAGTTAAAGGCACTCATCTTAATGGTGGGCGCCATTTTTATGGCCTTTTTAATGGTCAATTTAAACAGTCAGGCTTCAACTAGTCATGACCAAGGGGTTGATTGGTCTAAGTATAACGGTAATAGTGGTGTATTCGGCTACAGCACTGATAAGTTTGTGTTCTCACAGGCGGGTGGCTTTTATGGCGGGACTAATATCCCTCAGACCACTTATAACAGCCAAGTTAAATCAGCTCAACAGGCTGGTAAACGAGTGCACACCTATTTATGGGACGGTGTTGGTGGCAATATGACCAATGCCAAGGCGATGATGGCCTATTACTTGCCACGAGTTAAGACACCCAAAGGTAGTATTGTGGCGTTGGACTATGAGGACGGTGCTTCAACTAGTGTATCAGCCAACACCAGCGCTATTCTAGCTCAGATGAAGCTTATTAAAGACGCTGGCTATACCCCTATGTTGTATTCTAGCAAGGCCTATTTAAATGCTCATGTTAATACTAGCGCCATTGTTAAAGCCTATGGTAATTGCCTATGGCTAGCTGAATACCCAGACTACTTGGTTAGAACTAGCCCTGATTATAACTGGTTCCCTAGCATGGACGGAGTAGCTATCTTTCAGTTCACTAGCACGTATAAAGCCGGTGGATTAGATGGCAATGTCGATTTAACGGGCATTACTAAATCGGGTTATACAACTGCTAGCAAGAAACAAGCTCAAGCCAACGTTAAGAAAGCCACCTTTAAGGTCGTTAAATACAACCAGCGAGGAGTGTTCTATCCTAATCGGACACTAGCTGTTCGCTACACGGATTCAGACAAAGTACGTCAAGTGGCTACCTATTACAGGGGCGAGAGTGTGACTTACAATGCTGTCATTATCGAACATGACTATGTATGGGCACGTTACACCCGTTCAAATGGCCTATACGGCTTTATCAAGCTAGGGGTCACCAATGGACATGACTACGGGAAGCGGGTGGTCTACTAATGGCACAATATGACGATACGACCAAAATGTTAATAGACATTCAAAAGGATGTGGCGGCTACGAAGGCTAAAGTAGAAGACATCGAAAGCAAGCTTAATCAGGTTGACGATATTGGTGACAAAGCGGACAAGGCACTGGCCAAGTCCATCGAAGCTAGCCATCAAATTGACCGGGTTACTCAGATTCAAAATTGGCTGATAGGTGTCTTGGTTAGTGGTGTGGCTGTGACGTTGCTGGTATATGTTGCTGAGAAGTTCCTTTAGGAGGGGTTAAATTGAAAAAGATTAGTTTAAAGAACCCAGATGGGTCGTTAAATGGTAAGTTGATAGCCGGTATTATCAGTCTGTTAATCGTGCTAGTTCAGCAAGTTCTAGCGGTATTTGGCATTAAGTTTGCCGGTGATTGGACTAGTATTGTGGCGGTTATTAACACGGTTCTGACCATCCTAGGTATGCTGGGTGTAATTACAGATGTGCAGACGGTTACAGTCTCAGAGGACACGACAGGCACCCTAGAACGAGCTACTAATGATGTAGACTCAACTAGTGTGGCGGCTACTAATGTGACTGATACTAGTGCTGATGTTAAAGCAGATGACACTAAAACAGAATAAAGTAAAAAGGTCTATCCAATTGAGGGTAGGCCTTTTTATTGTGCTAATTTAGAGATAACTAATCTGCGTCAACTCAGACCAATTATACCCAGTTCAAATGAAAGTAGTGTGTCATGCCAATAACACAAAGCACAGTATAACATTGTCAGAAATAGACGCAACCACTAAAAAAGTGGGCACCCGGGTAAGTGCTCACTAAGAAGGCATTACTTTAAAGCGGAAACATCATTAGTCCTTAATAAGTAGGACAACTTCATTCTAGCTCATTCTCATTAAATTGCAATAAAAAGTGACTACCTTAAAAAGATAGCCACTTCCCTTATAAATGGCGCACACATTATTATAATAACATTAAAAAGAATAAAGTAAAAAGGTCTATCCAATTGAGGGTAGGCCTTTTTATTGTGCTCAGTCACTACAAGACTGTTAAATGATTGAAGGGTTACTAGGTAACTTGACTAAGCACATATCGAAGTAGGCATACTTAACGATGACTGAGACTAGCAAAACTTGTTAGGAGTGTTTGCAACTACCAGAGTCAGTTTTCATTATAGCACAATTTAAGCTAGTTAACATAACACATAGTATTCAAAGCTAAAGCTTGTGAAGTCTAATTAGACCTATTGTATCAGCCTTTGTAGACAACTCACTGTTTGATTTAGCCAGTTTAGCTGAGTTTGTGAAATTAGGCTGAATTATACTAGGTTATTTAAAGCCCGTTTTAATCACATTTTGACTTTGTGAAATTGCCTTAAACTGTCCTAGTTAGATGGCTTGTGATTTTGCTGTTTCTTTAATTTTTCTTGTTCTTCTAACTTTTCTTCGAAATTATCAATAATTTCTTTTCCAGATTCTAAAAGTTTAAAAGAAATTTTATCATCTTCTTTATAATACTTTAAATTGTAAAAATTATCTTCATCTTCAGTATAAGTAGAATCACCACTTAAACTTTCACCATCCATCAATGGAAGAACTAAAAGCCTATCAATGTAAAATCCTTCACCTGTTTCCTTATCATAAAAATTCACACAAGATATTTGAGCAGAATCAGTTCCAGGATTCAAAGTGAGCCTTTGTTCAATTTTAAATATTTCCCCACTAGCACTTTTAACTTTATACTGTGACATTCTACTGTTACCTAAATAGCACTTATGATATATCTTATACCCATAGCCATCTACCCCTATTAAAGGAACAACTTCATACGCATGCATATTATCCTTATTTTCACTCATAATTACTACCTCCATTTGGTTTATTTACTTGACTTTGGTCTTGAACTGTTACAGCTTAGAGCTGGTTGAGCAGAAGTGATACAGTTTTCCCAATAAATTTGAAAATGAAAGAAAACTGCTGTTATAGCTCGTCGCCGTATATCGCATCGCTCTAACACTCATACCGTTACCGTACCACTTGTTAAACAGCCTTGCCATTTAAACCCATTAAAAAAGCACCCTTAACAGGCGCTGGTCATCATATATTTTAATTTGTTTGGATAACCAGCCTCGTGATACAGCCCTGTACTATGTACTGCTTTACCACCCATCTCGTCCGTGAGATTAACGTTCAGCTACTATCTAGATATGAGAATAGCTAGTAGCCTAGTGGGATTTATTGCAGTGGCTCTCACTTGACCTGTCTACTTTTTATCATCAGCTACACTAACCGGCTGTCTAAACTTGACGGGTCTCTCAGTACCGCGCTAACATTTTTCATCAAGCTAAGGCTAGTTTGCTCGGGCGAACTATTGCTAGCTCACCAACAGGGATTGGCTCCCCTGTGGTCCAGAAGAAGCAATTGAACGTCAAGGCTTGCAATTTGAGAGCCTAGACCGTACAATTAAGCTATAAGTTATCTGTTGTTCCCGCGAAATTAAGAGGTCGCGGGGCTTCTTTTGTATATTAAGTTATTTTAGGCCTGGCAGAAATGCTAGGCCTTTTTTAATACAAGCTTATTGTAACGCATCAATAGCTACACGTCAAACCCAGAGAAAAATTATAAATAATAAATTATTTATTTTAAATTACTTATTTTTAATTATTAATTATTTGTGCTATACTGTTCTCAATGGAGGCGATAAAATGACTTGTAAAACCTTGCTACACTTCAATTTCAAAGGTGGCGTTGGTAAGACTACCCTCAGTGTGATGGACACATATCTGCTAGGCGAGCTAGGTCACAAGGTACTTTTAATTGACTTAGACCCGCAAGCTAATGCCACTGAGATTATGAGAACGACTTATAATGTCAAAACTGAACCAAATGTGGACTTATTCAATGGACTGTTAAAGCTAGATTTAACTCATTCAATCATTGAACTAACTGACAATGTTTCAATGATTCCAGCAGATTGGTCACTAAGTTTGTGGCCCGGTAAAGTTGAGAAAATTAGGAACCATGACCGCATGCTAATTCTCAAAACTTTGATTGAACAATTCAAATCACAATTTGAGTACATTATTATTGATGTCCCACCGACACTTTCCATTTTTACTAACAACGCTATTTTAGCTAGTGACTATGTATCGCTAGTGTTGCAGACACAGAAACAGGCTTATACGTCCGTCCTAAAAACAGCACAGTATATGTACCAGCTTAAAAACGACTATCATGCAACTTTTGATGTTTCAGGTGTCATACTATACCTAGTTAAACGGGACGCAAAAGTTGACCGTGAAATCACTAAGGCCGCCACTGAGTCGTTTGGTGATGCAGTATTCATAAATCGAATTTGGCAACAGGAACGTGTAAAGTTGTTCTCAAATGCTGGTATTAAAGATGAAGACTATTGGGATAAAAAGGCCATAAGCATGTATACGATGGTTTTAAAAGAGGAATTACACAGAATTGAGGAGATAGAAAATGGCTGA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP025589|6912:20215|14552_14714_+|WP_003641410.1|DBSCAN-SWA
MNIDAQALINKLTSNYAQAIALKDQQLAMAQVQIDQLNAKLAEKEAPKDGENA
>NZ_CP025589|6912:20215|14297_14549_+|WP_102116001.1|DBSCAN-SWA
MDSILITNYKPDYTNNIMTISIQINTLGISSQVSITMDDFNTAIAGGAGGADRVKLKVLNTLIDNLTALKPVTTTTTTTTKEA
>NZ_CP025589|6912:20215|15209_15719_+|WP_102116002.1|DBSCAN-SWA
MADITHGTWIKDGKAVDKAFSNGKQVYGRNLFLNSGKLLSVTGTNTSNQAVRPYLLANGYNVSSLASALGTRFTVSFDWEVSGSSPSGTFLAQWNDEPYSVTPFFTVSSSNTSGHISNTFSASTDSKNTANMFGFRLDNFVGTLTVYNMKLEKGNTATPHSIAPEDILN
>NZ_CP025589|6912:20215|11182_14305_+|WP_102116000.1|DBSCAN-SWA
MAESNPTQVILTDDGIKIIKAQNTADNAASQAENANSATLIAQSTANAAKSAADSTYDYANSEMAVNSMATAKAQSTADNAFIQAQAVGSQADSEIAVNSMATAKAQSTADNAFSQAQSVGSQASAEINSNSTATAKAQSTADNAFSQATTAIDTGKVTSQAVTDLKDGSKLTIADLENGLATKVANSDYASYKEQTASQIGQMVTNSAFSTYQTQTANLIAQKVATSDFSAYQATTAKSIDSKVDNGDFSTYKTQTANLIDDKVSSSEYASDKTQTASEIADRVSNSAFSTYQTQTASQIASKVDNGDFSTYKTQTAGLIAQKVATSDFSAYQATTAKSIDSKVSSSDFNTYKTQTADLIDDKVSSSQYSSDKTQTASEIADRVSNSAFSTYQTQTASQIASKVDNGDFSTYKTQTAGLIAQKVATSDFSAYQATTAKAISSKVESSDFNTYKTQTATAISSKVSKSDANNVNLIAYSALPEADNLKWTETGGGGTLSVAKHSFYHNGADTLYELSTDGSNEVFAISPRFKISANTTYTFQLKGFASSNVSSMDVYVLGRPNGSTSDYTVVKEIISGAVLSKSALDYRTVTFTTGAIDEAYLRIDNNGSTDGKTSVLGFTELKLEPGDTATPYVYSGQDSMIAQMADDILLRVTKGDLIDEINLQAGNTLISSSGQLTLSGKNIYFDTVNPVIIPSANITGTLNGKTINAGTQLNQYGNTSYPLTLSPDGSVTSTSFETISNETAALRTVIKDGTVKTNLRGMTQFATGMYSAADVSLGAGQLVLLEGYSTAQDPNFNATGLKTTGYAILDASTGLSLHGSTQAINFSGTDQSQTTGITMNSYGNIIGYPNATWWRIVSNSGSNIANFGIDKAGSNVIQFNRELDIGNIGINTAHSIISKDGNGLYINSGKGGRADLNVASLNYTGSVSKSLLSEKKDVKKVDTSYWAQLVNSIDLATYQYKDDDNISNLRLSGIVDDVNEDKQWNLPDIFVARDEDGKLAGIENIVLQNAMLATIQEQQKEIDKLNGHLLELEAKLNG
>NZ_CP025589|6912:20215|8750_11165_+|WP_102115999.1|DBSCAN-SWA
MALNNQYLILDSNLKRIGTLTVDGATKFSNDSVKMQLADSDTTSTNYDDDVNVGTADTFNGTINLNAQSKKFDHQGSLDVLQGQPDSDKVVAGNNLAYYDELSGHWYVMRIYSVEENNTAAVKHVTTANFTNLCLYSLAHHYPIATTASASTIQTAFNECFNATGWTLDYQTTNVMTPTIAIDGKTKASTLIQTLIQTYNVEIDPYVEIDSQGNITKKVCVITDKLNADVVYNEAVFGKNMTSIKRTTVSTPVTKLIPYGANGSTIAVVNDGKPYIVDDEANQKYNPDWQAGLYYEAIVTANQISNSAGLKSWAQDMLKLYNHPRTYYEVNVTPNFNPPLGATIRFKDELIEPVLDASGRVIQRTISFANPYGNTVGFGEYTTVQVATPAWMEQYQNALSKAVDAAKKDASSIKPVALTPDGNNFTDTTQTKRLILQAWEGSTNISSYIDSKGFIWRRYNTDGTVDTSYQQTGYLINAASNAVGTLHGTIEADYIQDDPEIKLDTTGISYLGVYGPDDNGAHSATQYMARLSNGQYLTSRARDDSGSSDTMFALQDSKFAVQSVMLQVHGQHGGTFGVQEVNNTVYIWNIVSLKNDGNYILVRFPYVAGLTLQPTDSRVQQIMALKGYGRINYDRQHDMVSIGYSDGSTDIINASDLLAGNYNVLYNFNITDYGIDFNQNTYQSECLDFPYFYFAAGGGEAETTDDPHKVWALNVVHKGAEFEAYFDNDMVMPNLTDESREVETVNVFYQDSQAYMLVTFNTRVLEIDPYSAEKEKVYTIPITKRSAASVIDKGTINDNVNTDD
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>NZ_CP025589|6912:20215|19426_20215_+|WP_054719880.1|DBSCAN-SWA
MTCKTLLHFNFKGGVGKTTLSVMDTYLLGELGHKVLLIDLDPQANATEIMRTTYNVKTEPNVDLFNGLLKLDLTHSIIELTDNVSMIPADWSLSLWPGKVEKIRNHDRMLILKTLIEQFKSQFEYIIIDVPPTLSIFTNNAILASDYVSLVLQTQKQAYTSVLKTAQYMYQLKNDYHATFDVSGVILYLVKRDAKVDREITKAATESFGDAVFINRIWQQERVKLFSNAGIKDEDYWDKKAISMYTMVLKEELHRIEEIENG

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_102115998.1|6912_8685_+|tail	phage tail family protein	A0A2P0ZLH2	Lactobacillus_phage	0.0e+00	96.1
WP_102115999.1|8750_11165_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLF8	Lactobacillus_phage	0.0e+00	92.3
WP_102116000.1|11182_14305_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLG5	Lactobacillus_phage	1.9e-26	80.9
WP_102116001.1|14297_14549_+	hypothetical protein	A0A2K9VDF6	Lactobacillus_phage	5.4e-30	95.8
WP_003641410.1|14552_14714_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLG1	Lactobacillus_phage	4.7e-19	96.2
WP_102116002.1|15209_15719_+	hypothetical protein	A0A0A7NQU6	Lactobacillus_phage	1.6e-44	66.4
WP_102116003.1|16731_16995_+	hemolysin XhlA family protein	E9LUR9	Lactobacillus_phage	1.3e-34	88.5
WP_102116004.1|17006_17345_+|holin	holin	A0A2P0ZLG6	Lactobacillus_phage	1.9e-30	78.3
WP_102116005.1|18106_18580_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054719880.1|19426_20215_+	AAA family ATPase	F0PIG8	Enterococcus_phage	4.7e-35	36.6

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP025589|27905:54222|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_102116018.1|30280_30466_+	DUF1056 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_102116027.1|30504_31629_+|portal	phage portal protein	Q9AZM4	Lactococcus_phage	4.9e-70	42.9
WP_102116019.1|31594_33442_+|capsid	phage major capsid protein	A0A2P0ZLF9	Lactobacillus_phage	5.3e-255	90.9
WP_102116020.1|33571_33862_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLF2	Lactobacillus_phage	1.5e-39	84.4
WP_102116021.1|33862_34210_+|head	phage head closure protein	A0A2P0ZLF0	Lactobacillus_phage	1.2e-56	96.5
WP_102116022.1|34212_34620_+	HK97 gp10 family phage protein	A0A2P0ZLE6	Lactobacillus_phage	5.9e-66	93.2
WP_102116023.1|34619_35000_+	DUF806 family protein	A0A2P0ZLF4	Lactobacillus_phage	3.4e-60	92.1
WP_102116024.1|35015_35666_+|tail	phage tail protein	A0A2P0ZLH1	Lactobacillus_phage	1.4e-106	91.9
WP_102115996.1|35740_36115_+|tail	phage tail assembly chaperone	A0A2P0ZLH4	Lactobacillus_phage	7.8e-57	92.7
WP_102115997.1|36159_36345_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_102116025.1|36385_40843_+	C40 family peptidase	A0A2P0ZLG0	Lactobacillus_phage	0.0e+00	73.3
WP_102115998.1|40919_42692_+|tail	phage tail family protein	A0A2P0ZLH2	Lactobacillus_phage	0.0e+00	96.1
WP_102115999.1|42757_45172_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLF8	Lactobacillus_phage	0.0e+00	92.3
WP_102116000.1|45189_48312_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLG5	Lactobacillus_phage	1.9e-26	80.9
WP_102116001.1|48304_48556_+	hypothetical protein	A0A2K9VDF6	Lactobacillus_phage	5.4e-30	95.8
WP_003641410.1|48559_48721_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLG1	Lactobacillus_phage	4.7e-19	96.2
WP_102116002.1|49216_49726_+	hypothetical protein	A0A0A7NQU6	Lactobacillus_phage	1.6e-44	66.4
WP_102116003.1|50738_51002_+	hemolysin XhlA family protein	E9LUR9	Lactobacillus_phage	1.3e-34	88.5
WP_102116004.1|51013_51352_+|holin	holin	A0A2P0ZLG6	Lactobacillus_phage	1.9e-30	78.3
WP_102116005.1|52113_52587_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054719880.1|53433_54222_+	AAA family ATPase	F0PIG8	Enterococcus_phage	4.7e-35	36.6