Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013852 | Clostridium botulinum strain B305 plasmid pRSJ6_2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 3 | 0 |
NZ_CP013850 | Clostridium botulinum strain B305 chromosome, complete genome | 7 crisprs | DEDDh,csa3,DinG,WYL,casR,cas10,csm2gr11,csm3gr7,csm4gr5,csm5gr7,csx1,cas3 | 0 | 17 | 11 | 0 |
NZ_CP013851 | Clostridium botulinum strain B305 plasmid pRSJ6_1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
0 : 6017
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013852|0:6017|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013852|0:6017|3691_4177_-|WP_085321192.1|DBSCAN-SWA MILYHGSNVIVEDPKIIKATRTLDFGYGFYTTTSYDQALKWAKIKSRRENVEKGIIGIYEIEDTIFQEDRLNIKVFNGASKSWLEFVLDNRMNEGYTHNYDIVKGSVADDRVYTCLNAFENKFMDFDTAIKELRTYKLNDQISFHTKESLKYLNFIRYEEV >NZ_CP013852|0:6017|3174_3402_+|WP_085321191.1|DBSCAN-SWA MNITKYLNLVFKTAEDSTSTIKIPKVKEDVTEEEIKNCGKSIVDQNIFQTKNGDLSALKVARIITTETEEIKIEE >NZ_CP013852|0:6017|2933_3155_+|WP_011988285.1|DBSCAN-SWA MAVSKNMLEKNLVLEYQDGLDEKGKAIMKGATYKNVKLTADPEALMMVVDAINPLMPEGISEARVVENYVLLK >NZ_CP013852|0:6017|4625_6017_-|WP_085321193.1|DBSCAN-SWA MQPVKQLSIDDYTYNVLKNLPTIEVSLKALIKNVSKAQNQIELLHEKDDGFITIAVKKQDIWMQYHYSNDELRDNIGKILSIEGINVYLSANSFYKPFRRIENIRKLNSLYIDLDYYSLKNFKNLTTEQIIWQLEHDYFKDKVPEANFIVLTGRGIAIYWLIDPVPYKALPLWNVVQKHFLKELKEIGADEKSIDSSRVMRLAGSINQKSGKNADILVYSEDRYILREIQEEYLPELTPYIKNPYYKSKGRNSKIVNFFTLYSLHYARLRDIVALQKIREGYCRNEEGFLAKSGQREFMCFLYRYWSCCYEANKEKALENTLDFNKGFKVPLDYKEVENATKSAEKAYEAWLKDSPSGTYRRGGYNYKNETLIEKLNITDEEMKTFETIISKKEVRRRDNQKNKIRQKAKRRNEKGLTKRQQEKLNKESKIKELLSKGFGVREISRKLDINVSAVSRVKNNKY >NZ_CP013852|0:6017|1943_2588_-|WP_085321190.1|DBSCAN-SWA MAQFYLIMPGQTDYKTCYKKDLAPLSIKGISQALSMALDSRLKRADIIVSSSHTKATQTASIISQKTNINMIVDMDLEEYNTFDNLLELIDDFNYHNDNYSIEEIIRWKELKSLRTSVKSENRNIGIKAEMDLEESTFEEFLELTENYNYPSEEAEQWEDLSLLRNRVKKVTDKYSHYNKVIIVCNGMFIRRLTHVEKVAPGQIIEYYYEIEKN >NZ_CP013852|0:6017|3462_3690_-|WP_031942519.1|DBSCAN-SWA MTLPKITQDNVHIFIPLKASKVSQRFAKNHDISQKQALLEFYNSKTYADLEEEDTKLWYEGINYLYDELEREKNI >NZ_CP013852|0:6017|4173_4401_-|WP_061324436.1|DBSCAN-SWA MMNLTRDEKIFEFISFCIENFKVKFKMKGKEVANLFYESGVTDFLIESYDLLHTQGKDYILSEIEIFLKNRGYKL >NZ_CP013852|0:6017|794_1325_+|WP_085321188.1|DBSCAN-SWA MYHLVKRYKSGEDSILKDIIDKFVPIILKEAAKYKIKCYDYEDLVQHGYLSVIKAVNMYKGNGNSFKYYCIKAIKQNYRALLKGEIKHHREIPEGKDIYLYKFTLEDEILAYEKTKELYKVLDNLNKYERSIIEGFYFKNKTIESIAKENKKSYNNIRYEKDKIIKKLQKKLINHI >NZ_CP013852|0:6017|1547_1904_-|WP_085321189.1|DBSCAN-SWA MVILEVLRKVTRNNTIMAFLKLEDLSESILVIVFPKKLEKFNSSKVYIRVQDNEKVRTENKLLKAILEDHKGNTPIYIFSEKERQNFRLSKDLWISLDVDIISTLRRYFGDENIKVVN |
9 | Bacillus_virus(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_2 |
10114 : 15145
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013852|10114:15145|DBSCAN-SWA GTTAAATCACACTACTATCCCGTTCATAAATATTATACTGAATATCATATAAATTTTTATAATAGCCAGATTTATTCATTAACTCCCTATGACTACCTTCTTCAACGATTTCACCATCATTAAGTACAATAATTCTTGTAGCATATTTAGCATTTATAAATCTGTGCGTTATAAATAATCCTATTTTGTTGTATGTTAAATCTAAAAATTTATCAAACATCTCTCTTTCAGATAAAGGATCCAATGCGGAACTAGGCTCATCTAATATAAATAAATTAGCATCTCTTATAAATGCTCTTGATAATGCAATTTTTTGCCATTGTCCACCAGATAACTGTGTTCCCTCCTTAAACCATATTCCAAGTTGTGAATCTAATTTTTTAGGTAGTTTATTAATATCATCATATATTCCAGCATCTTTAATCACTCTTATAATTTCATTATCATCATTAATTAAGCTTAAATTTCCAAGTCCTATATTTTCTCTAACTGTCATTTCATACTTTGAAAAATCTTGAAAAACAGTAGCTATTTTTTTTCTTAAACTTACTATATTTATTTTCTTTATAGAAATACCATTTATTAGAATATCACCTGAAGTTATTTCATATAATCCACATAAAAGCTTTATTAAAGTTGTTTTTCCTGAACCATTTTTACCAACTAAAGCTATGTTTTCTCCATTTTTTATTTTAAAATTTATGTTCTTTAATGTGTAATCCTCTCTACTTGGATATTTAAAATAAAGATTTTTAAATTCTATAGTATCTATGCTTTCTATATTTTCACAATCATCTCTATCAATATCTATTTCAGATGATGGGACATCTAAGAATTCAAATAATTGTTCAATAAAAAGATTATTTTCATACATATTAAATGTTGTGGTAATAAAATTTTTTACATTGCTTTGAACTAAAGATACAGCACGTATAAGCCCTACTGTACTTCCTATTAATATCCTTCCCATAAATGCTGACCAAATAATAAATAGTAATGATATATCCCCTGCAATTTGTTCTATAAATTGTGAAAAGAACATCATCATTGTTTTTTTCTTTGTTATATATTTATCTTGCTTTAGAAATTCTTTGTTTATATTATTATATTTATTTAATATATATGATCCAGTATTATATAATTTAACTTCTTTAAAAGATTGATCAGTTGTTAATAAATATCCTAAATACCATGATTTCCTTTCAGTTCCCGTCCTTTTCCATTTAATCCAAAATTCAAGTTGTCCTATTTTAAAAGTATACAGTGATGATAATATTGGAAAAAACACCAATATGAGTAGAATCCATGGATTCCAGGCTAAAACAACTATCATAGAAGATATTAATGTGACTGTTGTACTTAAGACTGTAAGAATCGATGTAAGAATTTGATATGGTCTAAATGCTACTTCATTTTTTGCTCTTGTAAGCTTGTCATAAACCTCTGAATTTTCAAAATCTCTCAAACTTAAACTATTTGATTTTTCCATAATAATTAAATTTAATTTATATACTAATATCTTTTGGTATATAGCTTGATAATATGATAAAATACCACCTAGGAAATCACTTAAAAATGAGACCACTATAAATAAAATAAAAGCATTTAACACTTTTATAAAATTATTGTTCATATTGATCTGTACCTCATTAATAAGATGTTGTGATGCTAATAAAGAAATTGTAGGACTAAGGCCCAGTAATAATGTTAAAATCATTATCACTAGTAAATAAGTTTTATTTACTGTCCATAAAACCTTTAATAACCTTGGCCAATATTTAAATGAATCAATAATTTCTTTTAATTTAACCTTTTTTTGTGGCATTTCCATAATTCATTTCTCCTATTCAACTTTAAAATATTTTAATGCATATAATGTATGTCTTACAAAGGAAAGTATCTCTCTCTCTTTTTGTCTATCTGTTCCAAATAGACGATTGCAATGAAGATGTATAACACTAAGATAAATATTTTCTAATGTATTTGTTAAATCATTTTTTTTATTTAATTTTATTGCATACTCTTGAATCGCTTCGGTTCTACTTTTTAAAATATTATAAAGCTGTTCCCCATCCTGTGAACTCCTTAAGTTTTCCCAATTATTATTAGAATTTGCTATATGCATATATCTAGTTCTTTTTTTCTGAAACTCTTTTCTATTTTCAGATTGTTTTATAACAGCATCTAGTAGTTTTACTTGATCTAAGTATGGTATATTAAAATCCTCTAAATAACTAATAATACTGCATAGAGCTATTTCACTAAGATCCATATTAATTCTATTTAATCTAAATAGATACAATATATTTGAAACTGCTATACTATCATAAAAAAATACCTTTTCAACACAATCTATTAAATCCATACCACCATATCTTTCTATTTCTCTCTTATAAGTATCAATTCCTACCCTTGATAATAAACCATTGTTTTTTAGAGACTTAAACCATTTATTTAATTTAGGTAGAGCCTTAGAAAATAAATCCTCAGTAGTACTTTTAACTCTTAATCTAATATGGTTATCAGGATCAGCATATCTCATGAAGAAAAACTGCTCAATACATTTAGTCTCCATAAGTTCTCTACAAATATCATTAATTTCAAATGCTATTAGCTCTTCTTCTCGAGAATGATTACCATATAACTTCAAAAATAACCATTCATCACCAGGGAAAATAGTTCTTTTACTATCTAAGGTTGTAATATTTGAATTCTTCTTGCTAAAACTAATATTGTTACTTTCTTTATAGCTTGTATAAATATTTTCCTTAATTATTGGAACTACAAATTCCGAAACATATTTACCTCTTGAATTATTAATCCAAAAATTATTGAAGCTACATTCAACATCTGTAATCTTAATATTCTTCTTCTTTTTTAATATATTTAATAATTCATTAAGATGAACCTTATTATTTAAGTTAAACATCAATCTATTATCTGCTTCTACTTGATAAATAAAATTAGGCACATTCCATTCACTTTTCCATTTTTTTATTACATCTTCAAATTCTTTTTTTGAAATATTTTTTAATTTTGTATTTAATATATCCTCATTTAATATCCAAGTTTTTGGGTTTAGTATGACCTTACCAACTTTAATTTGTGGCACATATGGAAATTTAGATACTGTTTCTAATAGTCTCATTGGAAACCAATTAATTCTTTTATCCTCAGAAATATCTAATAAAAATCTACATATATTTGGCATAATTCTTCTATTAAGCATATGATTAGTTGTAACTATTACTTCTTTATTAAGTGAAATTGATTTCAAATACAATCTGTTTCTATTTATACCAACTACTAAATCTTGAATAGAAATAACTTTTTCTTTTTCAATGGAAGAAGATGTAGATAAGATTATCTCATAATCTCTAATATTGGGGCTCAAACAAATATTTCCAATGGAACCTTTAGTAGGTGCAAATATCAACTGAGTAAATATTTTACCTGAATCTAGTTGTTGTTTCTCAATATTATTAATTTTTTTAAACGCATCATAAATCTGTTTATCTAGAATATCTCCAAATCTGCCAAATGTTTTTCCTGCTGAATCTGAGCCAGCATTTGGACCTAAAAACAATTCATAATTTCCATTATCTATATCTTCCTTAGAATCAGCTCTTATAAATACATTTAGTTCTAAAGACCTTGGTATATTATTAAAACTTGATTTTTCAATTTGGATTTCTTTTATATCATCATGATTAAATTCAATTATAGATTCTTTATTATTGATTGCTTTAATAACCTTATATACAAAATGTTCTTGAATATTTAAAAAATTTTTATTTACTTCTCTTTGATGAAGTTGCTTATTACTAAATGGTACTGTATAATCAGCTGGAAAACCTAATCCCTTGTCAGGGTTTATAACTTCTAATAATGGAACTTCTTGTTCTTCTCCATATCTTTCAATAAAATCAGTTTTATATTGTTCTATGTTCTCAACATTATTTTCTACTGATGAAAGTCTAAATAACATCCCTGCAAATTCTGCTAGTTCATTTGCTATGCATTTATTTAATTCTATTTTATCCTCAAGTATTCTTAAATCTACTTGTAAATAGCTTTTACTCTTTGTAATATTTTTCATTTTACTTATTATATTTAAATATTGATTCTCACCATTTCCAATTGGTAAGCTATTGTAATATTTTATCATTTTTTCTATTTCACTTAAACTATCAAAATCCTCTTTAGCTAATTCAATATGTTCTAACTTCCCTAAAACATATCTATAAGGTTCAGTAATATCTAAAGGAGGTCTAAGTTCTGTTATTAAAATTTCTTTATTTATTAATTCCTTTAAGAAGTTATCTATTTTAATTGCATCAGTGTCTGGATATTTTTCAATAAGTAAATTGAGCAAATCATTATATTTTATTCCATTTAAAGATTTCTTAGCAACATACTTTACAGCTACTGATGCTCTTATTGAAATTTTATCACTACTATTAATATTATCATTACGTTCTTGTGCATATATACTTGTATAAACTAATTCAACTCTTGAACCAATGAATTCAGCAATGGAATTCCAAGTAACAACCAAATCTTTTAATATATGATCCTTTTTTTCTAAATCATTTATTACCTTAAATACCCATTCCATATCTGGACGTGCCCTTTTTCTATATTCAGAAATATCTTTTAAATTAATATTTGTTTCATTAGTAAATTTTCCTGATGTTACTCCAGAAAATATTCCAAATGGGGTTGTTCTTGTACTCATTCGTATAAAATATTTTAATAGAGAACTAAGAATTTTTTCTTTTTCCTTTTCATTAATTGATGTATTTAATTTATCCAATGATGACAGTAAATCTGGGCTAGCTACAGCAATAGTTTCTCTTATAATTGGATCTTTTGAAATATGTATAAGTTTCTCAATAATCTCAGAATTATTTAATTCATTATCAAATATATAGTTATAAGAATTAACAGGAAGAATAGGTGTTCTAACCATAAAAAAATCTAACGGCTTATATATTTTATCTAGTATGAAATTATTTTCATTATCATTCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013852|10114:15145|11956_15145_-|WP_085321198.1|DBSCAN-SWA MNDNENNFILDKIYKPLDFFMVRTPILPVNSYNYIFDNELNNSEIIEKLIHISKDPIIRETIAVASPDLLSSLDKLNTSINEKEKEKILSSLLKYFIRMSTRTTPFGIFSGVTSGKFTNETNINLKDISEYRKRARPDMEWVFKVINDLEKKDHILKDLVVTWNSIAEFIGSRVELVYTSIYAQERNDNINSSDKISIRASVAVKYVAKKSLNGIKYNDLLNLLIEKYPDTDAIKIDNFLKELINKEILITELRPPLDITEPYRYVLGKLEHIELAKEDFDSLSEIEKMIKYYNSLPIGNGENQYLNIISKMKNITKSKSYLQVDLRILEDKIELNKCIANELAEFAGMLFRLSSVENNVENIEQYKTDFIERYGEEQEVPLLEVINPDKGLGFPADYTVPFSNKQLHQREVNKNFLNIQEHFVYKVIKAINNKESIIEFNHDDIKEIQIEKSSFNNIPRSLELNVFIRADSKEDIDNGNYELFLGPNAGSDSAGKTFGRFGDILDKQIYDAFKKINNIEKQQLDSGKIFTQLIFAPTKGSIGNICLSPNIRDYEIILSTSSSIEKEKVISIQDLVVGINRNRLYLKSISLNKEVIVTTNHMLNRRIMPNICRFLLDISEDKRINWFPMRLLETVSKFPYVPQIKVGKVILNPKTWILNEDILNTKLKNISKKEFEDVIKKWKSEWNVPNFIYQVEADNRLMFNLNNKVHLNELLNILKKKKNIKITDVECSFNNFWINNSRGKYVSEFVVPIIKENIYTSYKESNNISFSKKNSNITTLDSKRTIFPGDEWLFLKLYGNHSREEELIAFEINDICRELMETKCIEQFFFMRYADPDNHIRLRVKSTTEDLFSKALPKLNKWFKSLKNNGLLSRVGIDTYKREIERYGGMDLIDCVEKVFFYDSIAVSNILYLFRLNRINMDLSEIALCSIISYLEDFNIPYLDQVKLLDAVIKQSENRKEFQKKRTRYMHIANSNNNWENLRSSQDGEQLYNILKSRTEAIQEYAIKLNKKNDLTNTLENIYLSVIHLHCNRLFGTDRQKEREILSFVRHTLYALKYFKVE >NZ_CP013852|10114:15145|10114_11944_-|WP_085321197.1|DBSCAN-SWA MEMPQKKVKLKEIIDSFKYWPRLLKVLWTVNKTYLLVIMILTLLLGLSPTISLLASQHLINEVQINMNNNFIKVLNAFILFIVVSFLSDFLGGILSYYQAIYQKILVYKLNLIIMEKSNSLSLRDFENSEVYDKLTRAKNEVAFRPYQILTSILTVLSTTVTLISSMIVVLAWNPWILLILVFFPILSSLYTFKIGQLEFWIKWKRTGTERKSWYLGYLLTTDQSFKEVKLYNTGSYILNKYNNINKEFLKQDKYITKKKTMMMFFSQFIEQIAGDISLLFIIWSAFMGRILIGSTVGLIRAVSLVQSNVKNFITTTFNMYENNLFIEQLFEFLDVPSSEIDIDRDDCENIESIDTIEFKNLYFKYPSREDYTLKNINFKIKNGENIALVGKNGSGKTTLIKLLCGLYEITSGDILINGISIKKINIVSLRKKIATVFQDFSKYEMTVRENIGLGNLSLINDDNEIIRVIKDAGIYDDINKLPKKLDSQLGIWFKEGTQLSGGQWQKIALSRAFIRDANLFILDEPSSALDPLSEREMFDKFLDLTYNKIGLFITHRFINAKYATRIIVLNDGEIVEEGSHRELMNKSGYYKNLYDIQYNIYERDSSVI |
2 | Organic_Lake_phycodnavirus(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_3 |
18288 : 21388
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP013852|18288:21388|DBSCAN-SWA TCTAATTAGCTGTCATTAACTTTACAAATACATCTTCAAGCCTATTTGTATCATTAACTTTACTTAATAATTCATTAGTAGTTCCACTCCAAACTAACGTACCCTCTTTTATAATTACTAGGTTCGTACAAATCTTTTGAAGCTCGTCTAAAATATGGCTAGATATAAAAAAGGTTATTTTATATTCTTTATTGAGTCTTAAAATTAAATTTCTTAATTCAATTATTCCCATAGGATCAACTCCATTAGTAGGCTCGTCTAATAAAATTATTTTAGGATTATTAAGTAATGCTTGGGCTATTCCAAGTCTTTGCTTCATTCCTAATGAATAAGTTTTTATTTTATCTTTCTCTCTTCCTTGGAGCCCAACAATTTCAATTACTTCCTTAACTTTTTTCTTTCTTTCTTCTTTACTCATATCATTATTTAACATAGCTAAATTTAAAAGAGCCTTTTCTCCTGTTAAATATTCAAAAAATATTGGATTTTCTACTATAGCTCCTATATATCTTAATGCCTTTTCTCTATTTTTTGTAACATCAAAGCTATTTATAAATACACTACCAGAAGATGGGTTAATAAGACCTGTTAAGAGTCTAATCATTGTAGTTTTTCCAGCCCCATTAGGACCTATAAATCCACAAATATCCCCTTCCTTAACCATAAATGATATATCATTTATAGCCTTTCTTTTTTTAAATGATTTAGTTAAATTTTGTACTACAAGCACTTCTTTATTCATCATTTCTACCTCTTTCTTTAATAGTAAATATACTTTCTATTGTATAGAATATTAAAAATATACGTCATAATTATACCCAAAATTCCATTTATATTCAAATAATTAAAATAAATGGAATTAATTAATAGGTTTAATATACTACTAAAATTATTAAAAGAATTATATTTTTAATAATATGATAATCACTTTATAAAATTTTCTTACATTCCTGTAGTATCATTTATAACTATATTATTTAAAAATTTTACTAATCTTTTAAATTTATATTTTCTGATAAAAAATAAAATATTTTTTATATTTTTACATACGATTAAATTTTATGGTATAATTATATTAATATTACATAATAAGTTATTATTTCCAAATACTATATAGAAAGGACTTACAAATTATATGAAAAAAAAATCAATTAAAACTTTAATAGTAGGATTAATTTCATTTATATTAATATCCTTTAATACTGTAACTGCTTTTGCAGCTAATTTATCTGATATTACTTACTCCTATTCACCTAAAGCAGTACATATAACTAATGATTATATTCTAAAAGATTATTTATCCAATTCTTCAAAGAACAGCTTAAATATTGCAGATTATGCAAAATCTAATTATCTTCTAAAATATTCAGAACCTATTGATGTTACACGAACATCAATGGCAATAGAAATACTAGGACATGTTTACCCTGATAAAATAGCTAGATATTTGCCTTTTGGACTAGGAAATATAATAACAAAACATACAAGTATTATAGATATTGGTGAAAAATCCATAGATAGCAATAGATGGATATGGGATAGTATTGCTGCTGTAATAGGTGATAATTTCGACAATTCTAGAAGCATAAACTCATTGAAATTTAAAATGAACACTGAACAACATGTAGATGAAATTATAAAGAATCCTAAAAATAAAAATTTAAAACTTAATAAAGATATAATGATTAAAGTACAAAAAGATATTGATAATAAAACTATTGATCCAATATTATTAAAAGCAATAGAAAATTAATTTTTTATATAAAGATGTACAACCTTGAAATGTATAATTTTAGTATTTCAAGGTTGTTTTAATATATGATAATTTTTATGAAAGGATATTTTTATGAATAAATGTAAAGATTTATTTTTATGTTTAATCTTATTTATTTTAGGACTTTCTATCTGGATATACAAAACACTAATCACAAGTGATATTCCAGTAAATATTTCTTTTAAACAATTTATCTTGTTATCTATTCTTATTTTTATATATACTCTAATTCAATCTTTTTATATAAGAAGATTTAAATCAAATCTACATTTACTTAATTTATTGCTTCTAATTATTTTATTATTACTGTGGATTGGAAGCTTAATTACAGCTCTTAAATATAATTATAATAAATATGATACGATAATAGATATTATAGGCTCTATTTCGTTAATAATAATTACTCTAGAAACTTTCATTTATAAACCTGTAAAAAAAATTTAGTTATTATAAGAATACTGCTTTAGTTTTATTAATATGTTATAAATACCCTTTCTTATTAAAAAGTAAATTTAAAAATTCCAATATATAAAAATTAGTAAAATATATAATAATTAATTATTGTATATTTTTTATATTTATATCAATTTTACTTAATATAGTTTTTGACAAACTCATAAAATAGGTCCTATCCATTGGCATAACTAGGTTTGATGAAATTATAGTGATTAAAATTTTTATTTTTCCCTTTTCAGTTTGTCATAACATCTATTATAATGTTATTATAGCAAACTTAACTAAGGAGGAAATTATGAATAACGTAGAACCTATTAGAGATAAAACTAAAATTCAAGATGTTAAACTTTATCTTAAAGGAAAAAACTTAAGATCCTATACTATGTTTATTGTAGGAATTAATGTGGCACTCAGAATTACAGATCTTTTAAGTTTAAAATGGAGAGATGTGCTTAAGGAAAATAAGAAAACTTTTAAAGACATAGAAATATACGAGGGAAAAACAAATAAACATAGGAAGATTAAACTAAATAAATCTGCAGGGAAGGCTTTAAAAGAGCTGATGGAAAGTCTTCCATATGTTAATATGAATGATTTTATATTTAAAAGTCGTGAAGGAGAAAATAAAGCTATAACAAGACAACAGGCTCTTAATATATTAAAGGAGGCTGCTAAATCCGTTGGAGTTGAAGAAAATATAGGAACCCATTCTTTAAGAAAAACTTGGGGGTATCACGCCTGGAAAGCTGGCTTTAATCCTGCAATTATAATGGAGACTTTAAATCATAGTAATTTAGCTATGACTAAAAGATATTTAGGTATTAGACAAGATGATGTAAATGAACTTTATACTAAACTAAATATTGATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP013852|18288:21388|19422_20040_+|WP_085321204.1|DBSCAN-SWA MKKKSIKTLIVGLISFILISFNTVTAFAANLSDITYSYSPKAVHITNDYILKDYLSNSSKNSLNIADYAKSNYLLKYSEPIDVTRTSMAIEILGHVYPDKIARYLPFGLGNIITKHTSIIDIGEKSIDSNRWIWDSIAAVIGDNFDNSRSINSLKFKMNTEQHVDEIIKNPKNKNLKLNKDIMIKVQKDIDNKTIDPILLKAIEN >NZ_CP013852|18288:21388|20812_21388_+|WP_085321186.1|integrase|DBSCAN-SWA MNNVEPIRDKTKIQDVKLYLKGKNLRSYTMFIVGINVALRITDLLSLKWRDVLKENKKTFKDIEIYEGKTNKHRKIKLNKSAGKALKELMESLPYVNMNDFIFKSREGENKAITRQQALNILKEAAKSVGVEENIGTHSLRKTWGYHAWKAGFNPAIIMETLNHSNLAMTKRYLGIRQDDVNELYTKLNID >NZ_CP013852|18288:21388|18288_19032_-|WP_169990723.1|DBSCAN-SWA MMNKEVLVVQNLTKSFKKRKAINDISFMVKEGDICGFIGPNGAGKTTMIRLLTGLINPSSGSVFINSFDVTKNREKALRYIGAIVENPIFFEYLTGEKALLNLAMLNNDMSKEERKKKVKEVIEIVGLQGREKDKIKTYSLGMKQRLGIAQALLNNPKIILLDEPTNGVDPMGIIELRNLILRLNKEYKITFFISSHILDELQKICTNLVIIKEGTLVWSGTTNELLSKVNDTNRLEDVFVKLMTAN |
3 | Staphylococcus_phage(50.0%) | integrase | attL 11286:11302|attR 22867:22883 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP013850_1 | 1037292-1037384 | Orphan |
III-B
Consensus repeat of NZ_CP013850_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP013850_1
>1.1|1037321|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder AAAACAATTCCTCTTGAAGGTTGTTTGTTTTTCTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013850_1
The CRISPR arrays of NZ_CP013850_1 >merge|NZ_CP013850|1|1037292-1037384|CRISPRCasFinder TTGAACAATAACATGAGATGTATTTAAATAAAACAATTCCTCTTGAAGGTTGTTTGTTTTTCTATTGAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT >NZ_CP013850|1|1|1037292-1037384|CRISPRCasFinder TTGAACAATAACATGAGATGTATTTAAAT AAAACAATTCCTCTTGAAGGTTGTTTGTTTTTCTA TTGAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
>NZ_CP013850.1|WP_024933688.1|1036512_1037070_+|bifunctional-adenosylcobinamide-kinase/adenosylcobinamide-phosphate-guanylyltransferase MSNKNKVVLITGGVRSGKSEFAESLLQKEKSVLYIATAKITDKEMEHRVEKHKERRNSTWKTYEGYKGLGKIIKYYDEKNILLDCVTVMTTNLMFHKEIDYENIKEEELDEILEGIKKEFHDLIISVKEENKNIILVTNEVGYSIVPAYKLGRIFRDFQGIINKFIASLSDEVYLVTCGIPLKIK >NZ_CP013850.1|WP_085320503.1|1034627_1036235_+|LexA-family-transcriptional-regulator MKLESGQNRIAKSKHLGYGLLRGSKGTGKTTAAIYRGIYLKNQYCMYDKDKVLILSKNEENLNYIKNIYNDAEKTGVQYITLFSYNEDKLHFSSIYKIINKYFWEYIENNNLQYELASEKEKLAIIEECINDIKNEYKNLKYIDIKYSKFFLEEIQWMKDCMYYDLEEYKKADRIGRKTKKGEGPQRIIKNSKIREAVFKIMLLYNEKLKYKNLVDYSDVVSMSLKEASKNKENKFNHIIVDEAQNFTKLELKFIEALGRKNIYSSILFIADKEKNLNPKGWITKGRKLNNLQLGFEFKRFNLNKKIGINVKEEVETYIDDCNLKRKASNINTKNEDVSNVDNSNSEDKGLDKNIKNEWHKDKVNYDMDKFEYVDMKHRRSYEFSRGLGSNEEIIVEDQGSKEEYKEDELTKLPVFNDIAAGEPILMNPCVEGEFNIPKYWVRGMKNCFILKVKGDSMIGANIEDGNHVVIKRQQMAENKDIVAVNLEGSATLKRLLIKKSGAVLMPENKKYKPIEILEEGASIIGIAVGIIKGK >NZ_CP013850.1|WP_021134442.1|1034003_1034549_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MGKIKQAKYNINGKTIIIRHAEVQDAEQLINVTKKVNQETDFLLKDPGEVCLTIKEEKEFIQSQIDSQVDLLIVPEVDGRIVGVCSLNGNTNKRIRHSAQFGLAVEKEYCGMGIGKNLMKSGIQWAKENGIFRITLEVDINNYRAISLYLKLGFEIEGTLRNDKMLSDGSYTSGYAMALLL >NZ_CP013850.1|WP_075143065.1|1031955_1033662_+|SEL1-like-repeat-protein MDRFSFLKIEWPEIYQIICNVEEKSKEDSNITLIELAQIAELITKYILKENHIEKNTELLDEINLLKDCHNLNADIVDFFYKIIIVSNKAIYEDYSDSIIAKSFLDKMFEILVWFAIEYGKTDYRKVDLSNMIPEDKDIFNKYIKSKSYNYTEKNIENETMIQPFTIENEEFFKEENNDDINRYEQDVFETNEEFHKRIRNHEIFTLGRIFIEKSNINETDEIVAFPFSVYKSIQIKIPIIDMLYIERAEFENLSIEEEEYILFSKLDIINDKICIDINNIYIEVSNNKCKVHAVVLDISYYESYEKYRNIIYSKKPIPIGMIKFNKNKYDINKNEMPVTINYYDWIQKYILNTKAYIEIHRYEAKTLCKENLYYILNGKLDIFDKKLLIREYYIQSKSLNKNFRINLHSSDPMNKLRCLVDKEEILAMNIIGEMYCKEQNYKEAMYWYKKAAEKGNSTSMNKIGVMYYEGKGVEQDYQKAMYWYKKSSQEGNFTAMSNIGSMYYNGQGVTEDYKKAMYWYKKSYKEGNFGVMRDIGSMYYEGKGVIKDYKKAMQCYKKASQIDNFIK >NZ_CP013850.1|WP_024933004.1|1031002_1031551_+|biotin-transporter-BioY MDKKLKVRDMIYSALFATIIGVSSYIIIPLPISPVPITAQSLAIMLAGCVLTPIQVVLSMVTFLLMGIIGIPVFSGGTAGFGIIVGKTGGYLIGFLVGAIIISLLVHKNKSLVNMLIACFIGGIIVVHILGSAWLGQVTSIGIKKAFLLGSAPFIPGDLIKAVVAVLIGRKLSKEMKRIGTQ >NZ_CP013850.1|WP_011986186.1|1029622_1030651_+|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MNNKISVKMVVAFSLIVFFIVTSAVVISGLVVVFLSRFNVFTQPNPLILLGWLGIISIMVSTAIAQIIGKKVLSPISDLNKATKEVAKGNFNTRLSENSWTDEIREMAHSFNIMTHELGNIETLRDDFISNVSHEFKTPISAIEGYATLLQDDELSDEERREYIHKILISTKRLSSLSGNILQITELENQKILPLEQKYYLDEQIRQTILLFEYEWTKKNIILDINLDNITYIGSKELLAQVWQNILGNAIKFSHQNGTIQVTLTQTNEEVLITIKDNGIGMSEEVKNRVFEKFYQGDSSHYSDGNGLGLALVKRIIDICEGTIEISSHEAVGTEFTVKLPK >NZ_CP013850.1|WP_003356702.1|1028951_1029623_+|response-regulator-transcription-factor MFKVLVVEDDPALRKLFCTVLNKNGYKSIEAKDGDSALDILYREYIDLIISDIMMPNMDGYTLTKLIRESNNNVPILMITAKETFSDKQEGFRVGTDDYMVKPIDVNEMILRVGALLRRSQIINERRIVIGETTFLYDFLSVKYNNKELVLPQKEFYLIYKLVSTPNKIFTRQQLMDEIWGIESETDPRTVDVHINRLRDRFKDNKDFNIITIRGLGYKVVKQ >NZ_CP013850.1|WP_024933003.1|1026431_1028792_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein/permease MLQIKDLKKVYTTGEFKQTALDGVSIDFRQSEFVAILGPSGSGKTTLLNMLGGLDQYDSGNMIINGLSTKKFGESDWDTYRNNSVGFIFQSYNLIPHLSIVDNVEMGMTLSGVPKSEKRQKATYVLEKVGLGNHIHKKPNQLSGGQMQRVAIARALANDPEIILADEPTGALDTQTSEQIMDLIKEIAKDKLVIMVTHNPELAEEYADRIVSFSDGKIVSDTNPFVSENNSNDYKPKKTSMNFLTALKLSGNNIVTKKWRTALTAFASSIGIIGVALVLSLSNGFNKQINEFEKDSLSNYPISIEQNSMSLGMSPSSKSKDKEKTEFPNKSMIYPYDSSENAAVHANAISTEYVDYIKKIDSSLINGISYTRNVNMNILKKQDGKVVSMNTSAAAFSTYPSKGDSFETDYLKSYYDVLAGSYPKNEKELVLVVDKYNQVDTNILEALGFSANSKNINFDSMIGTEYKLIYNDDYYTQSGKYFTVNGDTTNLENLYNNKNAVTLKISGIIRIKEDANVSNLSTGIVYSDQLAQDFIENAKNSQIVLAQKEAKYNVMNGNLLTEKTSTTTAAVHPTPSMATNTTSNVETKDDVLASLGATSSPTSISIYPVNFEAKDNITNYLDDWNKKLKEEDHIVYTDMASMITSLTGNIMDGITIVLVAFAGISLVVSMIMIGIIIYISVLERTKEIGVLRALGARKKDITRVFNAETFIIGFCSGGLGIAITYLLTIPVNSILYKFTDLNNVAQLNPLHAIALVITSIVLTMIGGAIPSKMAAKKDPVIALRSE >NZ_CP013850.1|WP_024933301.1|1024460_1026068_+|cell-shape-determining-protein MKKKIYSSFIVLSLIISMALIYFLMPVFSVKFYSFYIVFIIIALLLSINVSLNKGKESSKIYGIPVILIGLFIVMFIISLPIFRASSYKSLLPTPKYEEFSKNITPIDIKEIPTVNQKYAELLADKKLGEETSLGSKVELGTLTLQNVNGKLYYVAPLVHSGFMKWLLNDSTPGYITVSATDDKDVKLVTKLNGKDIKIRYQPKGFLNDDLKRHIYLKGTMNRGITDLTFELDDKGNPYYTATIYENKVGMSGQKAVGTAIVNPETGEVKKYTVENTPKWVDRIQPQSFVENNLKKWGKYIKGFFNFSGQDKLKTTEGTGVIYNNGKCYYYTGLTSVGKDESSIGFALVDTRTQQTRIFKIAGATETASMKSAEGKVQNLGYTSTFPILINVDNVPTYFTTLNDKNDLTKMFAMISVTDYNIIGTGESITECKSNYIKNLASKGNLINVGSTGKEENITDTIERINSYVVGNSTIYTFILKDHKDKIFNAGISISNELPITKEGDKVNIRYVDTKQDTINITSFDNIEFKQQSIK >NZ_CP013850.1|WP_024933300.1|1022603_1022813_-|acetyltransferase MDSTAELEKSKNFDERLSIVIDSSREEIVMDGIVPSSTYLAIRLVYNKLIGMIDIRHKLNDYLFQNDIL >NZ_CP013850.1|WP_024933687.1|1037495_1038260_-|MerR-family-transcriptional-regulator MHYKIKEVADMAGISVRMLHHYDKIGLLDPESVSDAGYRLYSDENLDRLQQILFFKELNFPLQEIKIILDSPNFNKKEALETHKQLLLEKKIRLEKIIQSVDKTISSIEGGIKMNKKEVLGAFDMTEIEEHQKKYSEEVKNKYGNTSAYKESNEKTSKYTKEDWNNIMKDWDIIYKKLANLMDKNPDDKEVQEYIHQFREHISKNFYDCTPEIFRGLGELYVNDERFTANIDKYKTGLSKFLREAINVYCDNIK >NZ_CP013850.1|WP_024933686.1|1038965_1040447_+|cobyric-acid-synthase MAKIMIQGTASSVGKSLIVAALCRIFKQDGYSVCPFKSQNMSLNSYITLDGKEMGRAQVLQAYAAGLEPEAYMNPILLKPTSDKKSQIIVNGKVYGNSTAMEYHNLKIKFKDMLKEQFEKLEEDFDIVVMEGAGSPAEINLRDRDIVNMGMAELVDAPVLLVGDIDKGGVFASLAGTMLLLNEGEKERVKGTIINKFRGDVEILKPGLDMLEDIIHIPCLGVVPYTRLQLEDEDGAVEFNKKAYAPIDIAVIKMPHISNFTDLDALKSEEDVSIRFVTSKEEFKEPDLLIIPGSKNTIEDLLYLRQCGLEERIKEYSREGKIIGICGGYQVLGSKIKDPYKVETDLGEIDGLNLLDMETIFEKEKVTTRVSAKLINEETENIVYGYEIHMGISKYSENIKPLFKIYDKNGEKVDYFDGAINEKGNVMGTYIHGVFDGVVFREKIINELRVKKGLKKKKSQMYEHMREKELDKLADIVRQSLDMEKIYSIIGMK >NZ_CP013850.1|WP_045539189.1|1040448_1041411_+|cobalamin-biosynthesis-protein MYLNITTNFIDIIIAVFIDWIVGDPYWFPHPVIYIGKLISFLEKKFRARVKNEENLKIYGEVIVMIVCFASFLIPFMILQAFKFNFYIYHGLNILIIWTTLAAKCLHEEAIKIYYALYKENIEEARLKLSYIVGRETKDLIGNEIMRADIETVAENASDGVIAPLFYAIIGGAPLAMMYKGINTMDSMLGYLNDKYRYIGFFPAKVDDIFNFIPARLTGILMCISAPIVGGNPFKSFKIMIRDRKNHKSPNCAYPEGATAAALKIQLGGTNVYFGQVVEKPTIGDKIKELAPIHIKESIKLMYASEALMIVMCTIIFKLF >NZ_CP013850.1|WP_024933685.1|1041629_1042718_+|aminotransferase-class-I/II-fold-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MHGGDIYTEGILKEKELIDFSSNINPLGLPDSFKDNLQEALNWVQVYPDIQYRNLKRNLIDYLSFSLGYFYKEKVEKPNIKEENLVLGNGAVEIIDLAISNLKSISILVPSFVEYELCAKKWNVQIDYCNLNEDMTYNYENIKKSLEKTEGIILGNPNNPNGSVIDKEKFIYILDYCEKNNKIIILDEAFIEFTGKNSFSFLNLCERYKCIFIIRALTKFFSMPGIRFGYGISFNNEFLNKIREKQNPWNINCFAEIAVKYVLKDEDFIEKSINYIEKEKIFMHENLKKCDLFHSVYSTYSNFVLCKLKDITGDELKNRLLEKGFVLRVCKDFKNLNNNYVRFAIKTRELNQALVNILKEIK >NZ_CP013850.1|WP_011948604.1|1042991_1043711_+|energy-coupling-factor-ABC-transporter-permease MKKKYLFLLTTALVLALSQSAYAMHIAEGFLPPKWAALYFVLSAPFIVIGVKHIRQKTKKNKDLKMLLAVVAAYAFILSAMKIPSVTGSCSHPTGTGLAAIIFGPFVASVVGVIVLLFQAILLAHGGITTLGANTFSMGIVGPIVSYLIYKGLKNKNQKLAVFLAASLGDLATYTVTSLQLALSFPAKTGGVMAAFAKFATIFSLTQIPLAIIEGLITIMIFEFMMKYSKEELKTLSEV >NZ_CP013850.1|WP_003492574.1|1043714_1044014_+|energy-coupling-factor-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKQNIIITIVSVVVILASLFIGGARGGEFAGADDQAEGIIEEMNKDYEPWFESIWEPPSGEIESLLFASQAALGAGVIGYYIGKKKNAKNNNASIKNQ >NZ_CP013850.1|WP_011948605.1|1043991_1044675_+|cobalt-ECF-transporter-T-component-CbiQ MLLSKTSKLSNIHPLEKVILSIIPIVILGFTQNYIIVFCNILFFLFMNLISKNNKKIFAKITLEVTAFAAISSITFAFDYGIVYTLTLIFKSVSAGLCLSFFSLTTPIDDMLYCLGKKEYLKDICDIAKGMERFLVVINDEYNILYSSIKSRGGFDTFKLTIRNTGKMAALLFINTLSRWKIIKEGLDSRGYVGYMPYLDRNFDFSYIRFLSILSYIILILLLVIFF >NZ_CP013850.1|WP_011986189.1|1045098_1045746_+|NAD(P)-dependent-oxidoreductase MQEKYNFIALKSKRIRILIIGGGRAAFIKGKAFLDRGCSLYILAPKFSKDVLDLKTYDNVEFIKNNYDEKYILDKHLVVIATEDEEVNNEIRNNCDALSKLYIDCSDKDKSLCFNSFQRESKTMVLALNNKIGCPKATYFIGEKIKKDLERYDNYIEYVTYIRSITKNNPMKDEIIDFICSNDFHFFFEKGYGNLILSMFYGGMDFEFCNSHTKK >NZ_CP013850.1|WP_024932745.1|1045714_1046587_+|hydroxymethylbilane-synthase MNFVIATRRSKLAQVQTEIIIDLLNKKHDIECEKLLIETVGDKILEVSLDKIGGKGLFVKDIEVAMLEQRADAAVHSMKDVPYEMPKGFEIIAIPEREDVRDAFISLDNIKFKDLRKGAKIGTSSRRRAAQLKLLRPDLDIVPIRGNVQTRIEKIKKENLDGIILAVAGLKRVNLDHLITDYFDTKEMVPAIGQGALGIEVMEEHPKKDLFKDLDHYNSKICVLAERAFMRELDGDCHSTIGAYASIKDNIMHIIGIFERKNKIIKKEITGTKDQYEKLGISLAEHILKD >NZ_CP013850.1|WP_085320504.1|1046722_1048183_+|uroporphyrinogen-III-C-methyltransferase MSKVYLIGAGPGDEELITLKAIRALKKCTAVMYDRLANGELLKYLAPNCEIYYCGKEPGCHYKSQDEINKMLVKLAKEGHIVGRIKGGDPYVFGRGGEEALDILEENIEFEVIPGVTSPVSVLNYAGIPITHRGISRGFHIFTAMTKDKLDIDWKSVVNIGGTLVFLMGLGRLELITKGLIENGMDKEGKVAVVMKGTTSKQKKVIGNLENIVEKVKEAKLESPVIIVVGEVVSFSDKLNWYEKKPLFGRNICITRTKEQAKELKVQLLDLGAEVTEINSIEIKNTEDNLKSYLSKLKEYDYIALTSVNAVKIFFDYLIKENIDIRNINAKFAAIGPATSEAIRIRGIMPSIKSKHFVAESLFEEMRKHIQKGDKILVPRSKDARPFLVDALRKEGCTVDEVHIYGTLCGQCTYTERFENADTVLFTSPSTVRNMISMVGIDSIKEKSIIAIGPITARELDKNNIECSICDEYSINGIIDKLLDLN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013850_2 | 2010118-2010212 | TypeIII |
III-B
Consensus repeat of NZ_CP013850_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP013850_2
>2.1|2010147|37|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder ATAATACAGTCCAAAGTATAAGTTCACCTTAAAATTG |
cas10,csm2gr11,csm3gr7 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013850_2
The CRISPR arrays of NZ_CP013850_2 >merge|NZ_CP013850|2|2010118-2010212|CRISPRCasFinder GGTTGAACATTAACATGAGATGTATTTAAATAATACAGTCCAAAGTATAAGTTCACCTTAAAATTGGGTTGAACATTAACATAAGATGTATTTAA >NZ_CP013850|2|2|2010118-2010212|CRISPRCasFinder GGTTGAACATTAACATGAGATGTATTTAA ATAATACAGTCCAAAGTATAAGTTCACCTTAAAATTG GGTTGAACATTAACATAAGATGTATTTAA
>NZ_CP013850.1|WP_024933308.1|2007828_2009826_+|FAD-dependent-oxidoreductase MKDKYKVLYDPIKIGKLEIKNRYVLAPMGPGGMCNADGSFNKRGIEFYVERAKGGTGLIMTGVTMVENNIEKCALPSMPCPTINPLNFITTGNEMTERVHAYGAKIFLQLSAGFGRVSIPSIVGKVAVAPSKIPHRFLPGVTCRELTTEEVKEYVKAFGESAEIAKKAGFDGVEIHAVHEGYLLDQFAISFFNHRTDEYGESLENRLRFACEVVQEIKKRCGQDFPVSLRYSIKSFIKDWCKGGLPDEEFEEKGRDIPEGIEAAKILVAAGYDALNGDVGSYDSWYWSHPPMYQKKGLYLPYNEILKKVVDVPIITAGRMEDPELSSDAILSGKTDMIALGRPLLADAEIPNKIFEDKYDKVRPCLSCQEGCMGRLQNFATVSCAVNPACGREKEYGLKKAEQIKKVLVVGGGVAGMEAARVAAVRGHKVTLIEKNGYLGGNIVPGGIPDFKDDDRALVKWYEGILKDLGVEIKLNVDASKENIKEFGADEVLLATGSSPRTLTIEGADKVYSAEDVLMERKNVGEKVIVIGGGLVGCETALWLKQQGKEVTIVEMQNDILQVGGPLCHANHDMLVDLIKFNKIDVKTSSYISKKTDEGFVLNTNGEESIINADSAVVAIGYLSEKDLYSEVRFDIPNARLIGDANKVQNIMYAIWSAYEVAKNI >NZ_CP013850.1|WP_024933309.1|2006934_2007732_+|MerR-family-transcriptional-regulator MRYSITDLAEILGCTTSAIHYFEKEHLIEVEKGKNGHRYYNVVDVFRLLSYTKYRSMEIPMKTIIAQFGGEENNYKLIEKRETMYQLEALKRAQYYMNLADAIEEHLVSIRRIEELLNKYEFAKSPEVTIMCDDECGWLSKKRSSQKIIHEWVKAMPTVQLGVFDSRMGMSNFGYLVKTKKREELELPLGLHAKELKSTSCIHTIVMADEDFTQQPQKVFKKASEFVIKKGLEIGEIAWGKILLVEVEKGAKLHPYIELWISIKM >NZ_CP013850.1|WP_024933310.1|2006593_2006887_+|hypothetical-protein MNFFTLNILIGAMAFIINKINNMSQDIDPFEAFNDIEENLDEIDNEKVTNFVNGLINASMSNPSIGYFFMFLVYMTPILNLLLLIKGIVNYFNREAG >NZ_CP013850.1|WP_024933311.1|2005969_2006419_+|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MKLDEIDVLILQELQKDSRLSIRELSKRINLSPPSVTERVRRLEDDGVIEKYTIKINKKKLGLSIDCIVKVTMKNGQYEKFKIFIKEYKRSEWCYRIAGDGCFLVKLLVKSLNDIEEFINDISSYAITETIIAFSEVTINNGINKFLGE >NZ_CP013850.1|WP_024933384.1|2005414_2005831_-|carboxymuconolactone-decarboxylase-family-protein MAKITFSQEGLTPFQQLLGHNKYIMEKWTSLEECFFNSNTFTHELKEEVRRTLAFNNGCQYCMSKGKPSNEITNSKILIATKIADIISKNQLIDNECFNRLKNEFSDNEVSELLALICFITASQKFGALLDLQPSCSI >NZ_CP013850.1|WP_024933385.1|2004182_2005103_+|PhzF-family-phenazine-biosynthesis-protein MRKFEYTLVDVFTNQVFGGNQLAVFKDAEKLSSEEMQSIARELNFSETTFVTDIGPNHKKLRIFTPKTELPMAGHPTIGTAFVLADEGVIETREGINKLIFEEGVGEIAVSIHVEGGRIRSIEMEQPMPVFGRVFGDIRTAAELLSLDIADIDTTSPIQTVSTGVPFLYIPLKSLDGISKIKLRLDTWEKFFSASEDTKHIFAFTRETLHAGSTIHSRMFAPAMGIVEDPATGGASGPLGAYLVEHGLVAHGYDGKYMIINEQGIEMGRPSFINITVSKTYNNFSEIKIGGTCVKFGAGVIELPTL >NZ_CP013850.1|WP_011986682.1|2002365_2003859_-|PLP-dependent-aminotransferase-family-protein MNIKIDKNSLITITQQLVHYFSDRIMSEFIKAGQKLPSIRNLAKELGISPMTIIKAYNNLEQNGLVTTIQGKGTYVNERNSTVKSNNITEKDSFQWQMSVPDYLSRSQFRYNPNLSYSNDYYNLSVASLNHKLLPTKTILKDSLSLIQNDIKLLSQYPPAQGDYEFRNIMSQYLRSKEIATSPENILVTSGSQQGISLIASTFIGPGDIVVMETPTYPGAIDLFKCRGAVILTVPVDSEGMRTDILMNLCDKHSPKLIYTIPNFHNPTGYSMSSNRKAELLDIARYNDILIVEDDPWNEISYKREKIKSIKSMDTDGHVVYIKSLSKILGPSYRLAVIISESSILSRLIAAKSNHDLGTSVLIQKTIINFIQSNKITYYIENLNKQLVKRRDKVISLLKSHAPSGMKWAIPEGGINIWVTLPKNFNVEKLLSYSITTKNISFLPGTICYPNEVEFNNLRICFTYLDEEFIEDTIIELCNLIKLLYTTKNITDYRPII >NZ_CP013850.1|WP_024933386.1|2001051_2001507_-|hypothetical-protein MSKLNPEKLSVEFRDGVTGTEPILGRRYTLTHSDITAELFLTIGLTYAYDKIDVMRDEVLGEWIEKEKNYLFHVYLHVDGNNPIVTGVRNHIFRRELHLALEAIRYGDRKFFISHPKLDNSPVIVHFISSYPSFDRIEKWGTFSDYSLKKR >NZ_CP013850.1|WP_024933387.1|2000504_2000972_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MSLGEKLLYLRKKEGLSQEDVAEKLSVSRQTVSKWETDQTVPELNKAKLLSELYNVSYDYLISENYISGDVTGIEMIVDEIDWTGAWSKKYSILASYPGIKGINTYSEKISELYDSFKNDFGFNDTDTVLVLKDILYQKYKMEKKKKVDNSKEKI >NZ_CP013850.1|WP_012047739.1|1999305_2000337_+|alpha/beta-hydrolase MKKVIKVVSVILVILVIAGFFIIKNLTETKDGKLNMYVAANLQLYKILNPKSLNNKSIEETRGALNKQSTRWSNKPIPFSNIKNLDIKMNNEKIPVRIYTPEKGSNFPIIIYSHGGFWIGGNVDTIDGVCRKLSQNTKAIVISVNYRLAPENPFPAGLNDVYNVLQWTYKNGKSINGDEKHIAVVGDSAGGNLSAAVSSMSRDKNGPSITCQVLIYPSTNIFKLNSKSWSHFSNSFNVSTEDMEKYISIYAPKKEDRKSPYASPLLSKDLRKLPDTLVVTAEIDPLRDEGEAYANKLKESGVKAEVTRYKGITHGFITMDKITNKADEALNQISLYIQKEFQK >NZ_CP013850.1|WP_075143158.1|2010407_2010929_-|DUF4825-domain-containing-protein MKNKLKVLIPLIIILSLNLVGCGMNSEKKSKENIKNSSKVETYDLIKYKGTYVGDNSSVGSIIKNLPANEYSAGFILQTSKEPYEITVNYKANENLGEENYNKFWKGNKVEKLLEKNAAVLLSLIPNAEIIKFNVENIGKESYKYDRKNLEQKYGNLKNLFKDNDSLNKFLNN >NZ_CP013850.1|WP_024933470.1|2011229_2012120_+|AraC-family-transcriptional-regulator MNYRKDIENCIDYIEEHIKEPLTLKEITQEIGYSSYHFCRVFSFLKGMPLMEYVRKRRLSLSTIDLLEGQKIIDVAFKWGFETPSSFARAFRKEFGCSPSQYIKKMKSYYKSEGILTVGNFMIDPYIIKKEAFKVAGYGIKTNVADSKYTKDVASFWSNYNGENLESKLYKILSPLKHGEVGLCIPCSDSGDITYLLGVIVEDFSKVTSDMITVEVPKAQYAVFTTNPVNTVDNKDQREFAKIIKESWKYIFDEWFKNNDYEYDEEKLDFEFYDERCHLRPDTVMDIYVPIKKLER >NZ_CP013850.1|WP_024933469.1|2012126_2012867_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MINYYGSLCTVMYELLHPHAPEDELQFYLQYAKKEIKILEPLCGSGRFLVPFLERGFNITGFDMSEEMLKELYKKAPKAKVFQSSIEEFSPKEKYDYIFITSGSFSLFLDEDIAFNVLVKMKEALAPKGKFVFAAETTANIIPDREEYLENCHVKTKEGYDIIFKSKSFYDKHKKILSTPSLYELYDGDNLLGKEEMDFRIKLYDSGELEELILKAGFKGSHVFSDFNRRESIDRNTEIFLYKCYI >NZ_CP013850.1|WP_024933468.1|2012969_2014376_-|peptide-MFS-transporter MSEKKQKHPIGLWLVNISIALQSYAAYAVVSILILFLTADVSKNGLGLSVSKAAAIIGLYQGINYMGSLVGGYITDKWLGIQKSLILGCFLTACGYLALFFAKPNIGSVWLGLIILIVAGAFFKAQISSLVGELYGKNELSKKDAAYSIFYMFINIGAFFGPIIAGLISDKWFAKVAADGEIAAYGYKYIFLMCTLIMIFIGIFIWIVSPKWLGEIGKYPVSKDKKTSTESVSTKSTEKAKAQPLTQLEKNRIKAMIVMFVFVIIFWSAWDQTATSFSLLANKLVNRTIGGFTMPVPWLTSINAIFCVVLSPIIANIWLKLGNSKKGDLSVPTKMGLGMILTGIAFLTLILGISTLGGVLDGSKQMNILFIIVAYFLLTVGELCLSPIGMAMFNKLAPAKYGSLAMGAWYLSFFFSSIISGKLAGFTDTLGYTQIFGLISGIVIVFGVILILLRNGLLKLMSLDELDK >NZ_CP013850.1|WP_024933467.1|2014708_2015062_-|aminopeptidase-P-family-N-terminal-domain-containing-protein MHLFINKNKLSDEIKSSLKKNAALFIHPYNKIYKEVKKFTNSDVVLVHPDRINYELYNNIDKEVITEISSSNKLDAFPAEQGRFICPSFEPISSFGEHVTIVTCIFLMENSFMVVTV >NZ_CP013850.1|WP_024933466.1|2015385_2016000_+|sugar-O-acetyltransferase MNQKDRMLAGLPYKACLDGLPEERMANKKKIYEYNHCFPDEHEKIHKLIRDILGKAGADVHIESPFYCDYGKNIQVGDNFFANYNCTILDVGKVIIGNNVQFAPNVSLYTAGHPIHPDSRNSGYEYGIGITIGDNVWLGGNVVVNPGVHIGNNVVIGSGSVVTKDIPDNVIAIGNPCKVIREITEEDRKYYYKNYEFDVDDYKE >NZ_CP013850.1|WP_024933465.1|2016042_2016537_+|hypothetical-protein MILAIECFIACVLFTLMILPSLYKEPMKHIMSYPTEIRKRVESLPQYKDAIQKKEKKHLTVKIIAVFMFAIIFAVVAYFSGAKSFSKAYIHVFTLFFVVNIYDMIVLDIGLFCHSKKTRIPGTEDMDKEYRNPWHHIKGAGIGTIIGAVVALLSGGMVHFISII >NZ_CP013850.1|WP_024933464.1|2016868_2019019_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 MHICYKSLLYSFLRYVESIDKAMYKENAFKLKDKLLNPILQESYELVTKNIKKKKCKDGTFRLMNIFSNINDSKRKKFNLLKEIDINRYDNILKENGEEIDKAYCINYVKSIIKKLLQNDNEKIYFLMSKYCSNVPFINSKNCDISLFDIAKVTAAIATCKEKNKEEYILIKGDFSGIQSFIFKTSSDGALKTLKGRSVYLTLLQEICAKYIVKELGLSLCNILYSGGGNFYILASKSDENKIKLLRKQLSKLILKAYNGEIYLALGYLSFKEEDFKNFNILWKNIGEEVGFLKSKRWSELNLKESFNEIFGPLDLGGRREHSCRLCGCINKNLKEGMCDLCISFKDFSMEMKKANFYCEKIIPKADISLHNNVKDIFHELGFEIKFSDKPLKGFKNYIINSCDFEAYDGFIFKSVKLSDESLDYMVQKQKGNNKVGVIKLDIDNLGKLFINGLGNEGSISKIISLSRNISMFFEGYIENILYKSKRLDKLKEYLKTSDWEKRVTIIFSGGDDTFIIGRYEEILEFALLIREVFEEFVGGEQLTFSAGIGIFDYNYPVINIAEDTERCLELAKNHIEGNEIYAKKNKVCIMGQVFTWNEFLEIIKLKNLIEEIYLLSSKKSIFEKINKSTLGFKAVVEGGKRLNYIKLHRLAYYLRDLNNASNKNLKNKVEELIEFYEELCLKAFMGNNKKNYNINNIMIIPVASKLAQYNYRIIN >NZ_CP013850.1|WP_024933463.1|2019037_2019436_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm2 MEKDYKTDKFREYEEYFKKNVLTLDKINYDQFIEKSKDYSRLLKNNGLTTSMIRKIYNEILKANEAIDLKRLRPILAYTYGRNRVKGLQSLFYTLDDLLKRLNLKTNYLEIENVKEFLEVIIAYMKFYGDRY >NZ_CP013850.1|WP_024933462.1|2019448_2020198_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 MNLLMGKIFIDGDIILKTGLRIGGGNNSIEIGGIDNNVIKNHRGEPYIPGSSLKGKLRSLLEISTNRLKDGRPCNCGECSICSIFGVGANENKQNLPTRIIVRDAFLNEDIKKQMYEKQGQFKRLELNYTESKYENTIDRLNSKATPRLIERVPEGASFRLQIIYSVFNNKDIDNFNDLIKGMKLLEDDYLGSNGSRGYGQVEFDNLNIKIKVIKDYKTKEVLNKSSLTDIDSVCLKEKLNELIEIKGV |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013850_3 | 2024554-2024650 | TypeIII |
III-B
Consensus repeat of NZ_CP013850_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP013850_3
>3.1|2024584|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder TTTTCTTAACTTCCTTAAATGCTTACATATTCTTTG |
csx1,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,csm2gr11,cas10 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013850_3
The CRISPR arrays of NZ_CP013850_3 >merge|NZ_CP013850|3|2024554-2024650|CRISPRCasFinder GTTGAACCTTAATATGGGATGTATTTAAATTTTTCTTAACTTCCTTAAATGCTTACATATTCTTTGATTGAATATTAACATAGGATGTATTTAAGCA >NZ_CP013850|3|3|2024554-2024650|CRISPRCasFinder GTTGAACCTTAATATGGGATGTATTTAAAT TTTTCTTAACTTCCTTAAATGCTTACATATTCTTTG ATTGAATATTAACATAGGATGTATTTAAGCA
>NZ_CP013850.1|WP_075143154.1|2023836_2024526_+|hypothetical-protein MHYYQLKIRVKLENNINYIQAPYLIGTFINNCMLKNDMLKNIHKKKIYKYVYDSFFPIEKDGIYKREKYYNIQLRTINLNLINKLAIALYNHKFNGIKTVNIDLEVMEPTKINQLYTLKPSIVTITGQPWIKNKHSIDVLIGNLNANLEKKYKQIFNEELENNKSFIKKIKVVNNIPIKYEYKNIILLGNKFEIIVNEDEVSQRKATIALGMGLGEKGSSLGAGFCIYR >NZ_CP013850.1|WP_075143155.1|2022338_2023820_+|hypothetical-protein MDNVLIINLGNSDIEKEGNKIEFGEFREKTKKIYEQLEGANKEEKQEIFKYLDFPIIKAIIDKVDGELKNEKLDKVILAYTNQKFNNNKDTVYLYEILKQKKHLVNNLETDNQDIWEKRLKETNFKQSYNIDFDPSDIDRMYNFYAEEINELNNKKIKKLFFSITGGASAMNFALLINAIEKFSGQLIPCYLSRGKKVAYKVNIAKNLRKQILKRDIKILINNKDYFAAIKMLENLEDGIVDDMSKLELKNIILALKYAEARIQFNFDKCKEYGEKCLDNTAEYREEFSQAVKDILIEKDDYINRLVELKNNAIYLYKKGSYTDFLGRVYRFQEAVYEHILGQYDLIIEKSNGVKINKEILKSRYSDKKEILDNIKIAGNKLEYEKNLTVDAMSKIISTLIDNDDVRNIVNRMEEIKDVKQLRNKSILAHGFEGISKEKIQGKLNCEEKDISKLLEEVMCKILVLFKIGTIEDMFYCENSRYDCILIEMIEKL >NZ_CP013850.1|WP_075143156.1|2021244_2022336_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm5 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MNLLMGKIFIDGDIILKTGLRIGGGNNSIEIGGIDNNVIKNHRGEPYIPGSSLKGKLRSLLEISTNRLKDGRPCNCGECSICSIFGVGANENKQNLPTRIIVRDAFLNEDIKKQMYEKQGQFKRLELNYTESKYENTIDRLNSKATPRLIERVPEGASFRLQIIYSVFNNKDIDNFNDLIKGMKLLEDDYLGSNGSRGYGQVEFDNLNIKIKVIKDYKTKEVLNKSSLTDIDSVCLKEKLNELIEIKGV >NZ_CP013850.1|WP_024933463.1|2019037_2019436_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm2 MEKDYKTDKFREYEEYFKKNVLTLDKINYDQFIEKSKDYSRLLKNNGLTTSMIRKIYNEILKANEAIDLKRLRPILAYTYGRNRVKGLQSLFYTLDDLLKRLNLKTNYLEIENVKEFLEVIIAYMKFYGDRY >NZ_CP013850.1|WP_024933464.1|2016868_2019019_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 MHICYKSLLYSFLRYVESIDKAMYKENAFKLKDKLLNPILQESYELVTKNIKKKKCKDGTFRLMNIFSNINDSKRKKFNLLKEIDINRYDNILKENGEEIDKAYCINYVKSIIKKLLQNDNEKIYFLMSKYCSNVPFINSKNCDISLFDIAKVTAAIATCKEKNKEEYILIKGDFSGIQSFIFKTSSDGALKTLKGRSVYLTLLQEICAKYIVKELGLSLCNILYSGGGNFYILASKSDENKIKLLRKQLSKLILKAYNGEIYLALGYLSFKEEDFKNFNILWKNIGEEVGFLKSKRWSELNLKESFNEIFGPLDLGGRREHSCRLCGCINKNLKEGMCDLCISFKDFSMEMKKANFYCEKIIPKADISLHNNVKDIFHELGFEIKFSDKPLKGFKNYIINSCDFEAYDGFIFKSVKLSDESLDYMVQKQKGNNKVGVIKLDIDNLGKLFINGLGNEGSISKIISLSRNISMFFEGYIENILYKSKRLDKLKEYLKTSDWEKRVTIIFSGGDDTFIIGRYEEILEFALLIREVFEEFVGGEQLTFSAGIGIFDYNYPVINIAEDTERCLELAKNHIEGNEIYAKKNKVCIMGQVFTWNEFLEIIKLKNLIEEIYLLSSKKSIFEKINKSTLGFKAVVEGGKRLNYIKLHRLAYYLRDLNNASNKNLKNKVEELIEFYEELCLKAFMGNNKKNYNINNIMIIPVASKLAQYNYRIIN >NZ_CP013850.1|WP_024933465.1|2016042_2016537_+|hypothetical-protein MILAIECFIACVLFTLMILPSLYKEPMKHIMSYPTEIRKRVESLPQYKDAIQKKEKKHLTVKIIAVFMFAIIFAVVAYFSGAKSFSKAYIHVFTLFFVVNIYDMIVLDIGLFCHSKKTRIPGTEDMDKEYRNPWHHIKGAGIGTIIGAVVALLSGGMVHFISII >NZ_CP013850.1|WP_024933466.1|2015385_2016000_+|sugar-O-acetyltransferase MNQKDRMLAGLPYKACLDGLPEERMANKKKIYEYNHCFPDEHEKIHKLIRDILGKAGADVHIESPFYCDYGKNIQVGDNFFANYNCTILDVGKVIIGNNVQFAPNVSLYTAGHPIHPDSRNSGYEYGIGITIGDNVWLGGNVVVNPGVHIGNNVVIGSGSVVTKDIPDNVIAIGNPCKVIREITEEDRKYYYKNYEFDVDDYKE >NZ_CP013850.1|WP_024933467.1|2014708_2015062_-|aminopeptidase-P-family-N-terminal-domain-containing-protein MHLFINKNKLSDEIKSSLKKNAALFIHPYNKIYKEVKKFTNSDVVLVHPDRINYELYNNIDKEVITEISSSNKLDAFPAEQGRFICPSFEPISSFGEHVTIVTCIFLMENSFMVVTV >NZ_CP013850.1|WP_024933145.1|2025805_2026294_-|hypothetical-protein MISKKIIAFIAMTIMMISLLIGCSNNTMDKVYNDNIKIASVYDTFGLDKSDEIIESGIYKGKLKLSGSGTIWTYESSSDFDLKVPYILSVKSGKAKIVLISPDNTVVNLVENTDKATMKGTTSLTLPIKKGNNRIKLVGYKKADIDIELHIEKGTFEKISFN >NZ_CP013850.1|WP_024933146.1|2027121_2027715_+|glycerol-3-phosphate-acyltransferase MIIIITSIISFLLGSIPTGYFITKKTCGIDIRTKGSGNIGSTNVKRIVGTKISIITQTIDVLKGIIPVVLGISLSKIVKLPVSIDTYLSIIAIAAILGHDYTPFLKFKGGKGVNTTLGVFIFIAPIPTLTGLAVYFILGLFIRIVSIRSISIGITIPIMCIITKLPIQIIISTTIACILMIIRHKDNLVRLIRGEEK >NZ_CP013850.1|WP_024933147.1|2028054_2028801_+|cell-envelope-integrity-protein-TolA MDKFRNMKKSHIALLVIMYMVLMGSLPRFTGWATIFSAIAVGGYFLKNKKDLKELTRKKKNFIFAGIIILAIIGSFNVAVGNNIQNEKLLAEKSKQEQQIKKEQEEKKLAEEQKRIQEEEARKKAEEEKRKQEEEAKKKTEEEAKKKALEEQKKQEELKRKQEEENKVKAENEQAQAAFAQSTGKGDSNSQSNESQNADDNQNYTVYKTRTGSKYHSSGCRYLKKSCYETTVSQARNEGLTPCRVCNP >NZ_CP013850.1|WP_024933148.1|2029138_2029540_+|membrane-protein MNILISTCNIGIPVLMIFIGILYKCNLYKKIDKTLDLIVPIAMFFTGFSERDREHLYKNTNKLALVNRKCSLIWSISGVCTLLLTIISLILNKSDIYNTSVILLEPEFLILVIVFITVEYVLKRNFYKKIQQS >NZ_CP013850.1|WP_011986655.1|2029775_2030492_+|transaldolase 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MLGLLQFLRDVLKQPALLMGIMALVGLVALKKPGHKVLTGTLKPILGYLMLGAGADFIVANLEPLGGMIQTGFNITGVVPNNEAIVAVAQKVLGVETMSILVVGLLINLVIARFTKYKYVFLTGHHSFFMACLLSAVLGTSGMKGTELILFGGFLLGAWSAISPAIGQKYTLKVTDGDEIAMGHFGSLAYYVSAWVGSKVGKPEESTENIEIPEKWGFLRDTTISTAITMMVFYIVAAVAAGPEYVSKLSDGMSPILFAIMSSLKFAVGVTIVYNGVRMILGDLIPAFQGIATKIIPDAIPAVDCAVFFPYAPTAVIIGFVSSFIGGIIGMVLLGVAGGVLIIPGLVPHFFCGSTAGIFGNATGGKKGAVIGSFVNGLLITFAPALLLPVLSTLGFKNTTFGDFDFGVLGIIIGKTSNLAGKTGIIIIAMLMLVALIVPNFIKTKSKALNNIEE >NZ_CP013850.1|WP_024933149.1|2032854_2034948_+|transcription-antiterminator 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You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013850_4 | 2024891-2025072 | TypeIII |
III-B
Consensus repeat of NZ_CP013850_4
|
2 spacers
spacers of NZ_CP013850_4
>4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR CATATAATCAATTTTCTTACCCTTTTCAGTA >4.2|2025028|21|NZ_CP013850|PILER-CR TTCCTGGATCTAATTTTTGTA >4.3|2024933|34|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder AGCATATAATCAATTTTCTTACCCTTTTCAGTAT >4.4|2024997|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder TAATAATTTCATTCCTGGATCTAATTTTTGTATTA |
csx1,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,csm2gr11,cas10 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013850_4
The CRISPR arrays of NZ_CP013850_4 >merge|NZ_CP013850|4|2024891-2025072|PILER-CR,CRISPRCasFinder TATTTTACTATGGTCGAACAGTAACATAAGATGTATTTAAATAGCATATAATCAATTTTCTTACCCTTTTCAGTATGTCGAACAGTAACATAAGATGTATTTAAATTAATAATTTCATTCCTGGATCTAATTTTTGTATTAGTTGAACAGTAACATAAGATGTATTTAAGCAGAGAACTTAA >NZ_CP013850|4|1|2024891-2025072|PILER-CR TATTTTACTATGGTCGAACAGTAACATAAGATGTATTTAAATAGCATATAATC AATTTTCTTACCCTTTTCAGTATGTCGAACA GTAACATAAGATGTATTTAAATTAATAATTTCATTCCTGGATCTAATTTTTGT ATTAGTTGAACAGTAACATAA GATGTATTTAAGCAGAGAACTTAA >NZ_CP013850|4|4|2024903-2025062|CRISPRCasFinder GTCGAACAGTAACATAAGATGTATTTAAAT AGCATATAATCAATTTTCTTACCCTTTTCAGTAT GTCGAACAGTAACATAAGATGTATTTAAAT TAATAATTTCATTCCTGGATCTAATTTTTGTATTA GTTGAACAGTAACATAAGATGTATTTAAGCA
>NZ_CP013850.1|WP_075143154.1|2023836_2024526_+|hypothetical-protein MHYYQLKIRVKLENNINYIQAPYLIGTFINNCMLKNDMLKNIHKKKIYKYVYDSFFPIEKDGIYKREKYYNIQLRTINLNLINKLAIALYNHKFNGIKTVNIDLEVMEPTKINQLYTLKPSIVTITGQPWIKNKHSIDVLIGNLNANLEKKYKQIFNEELENNKSFIKKIKVVNNIPIKYEYKNIILLGNKFEIIVNEDEVSQRKATIALGMGLGEKGSSLGAGFCIYR >NZ_CP013850.1|WP_075143155.1|2022338_2023820_+|hypothetical-protein MDNVLIINLGNSDIEKEGNKIEFGEFREKTKKIYEQLEGANKEEKQEIFKYLDFPIIKAIIDKVDGELKNEKLDKVILAYTNQKFNNNKDTVYLYEILKQKKHLVNNLETDNQDIWEKRLKETNFKQSYNIDFDPSDIDRMYNFYAEEINELNNKKIKKLFFSITGGASAMNFALLINAIEKFSGQLIPCYLSRGKKVAYKVNIAKNLRKQILKRDIKILINNKDYFAAIKMLENLEDGIVDDMSKLELKNIILALKYAEARIQFNFDKCKEYGEKCLDNTAEYREEFSQAVKDILIEKDDYINRLVELKNNAIYLYKKGSYTDFLGRVYRFQEAVYEHILGQYDLIIEKSNGVKINKEILKSRYSDKKEILDNIKIAGNKLEYEKNLTVDAMSKIISTLIDNDDVRNIVNRMEEIKDVKQLRNKSILAHGFEGISKEKIQGKLNCEEKDISKLLEEVMCKILVLFKIGTIEDMFYCENSRYDCILIEMIEKL >NZ_CP013850.1|WP_075143156.1|2021244_2022336_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm5 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MNLLMGKIFIDGDIILKTGLRIGGGNNSIEIGGIDNNVIKNHRGEPYIPGSSLKGKLRSLLEISTNRLKDGRPCNCGECSICSIFGVGANENKQNLPTRIIVRDAFLNEDIKKQMYEKQGQFKRLELNYTESKYENTIDRLNSKATPRLIERVPEGASFRLQIIYSVFNNKDIDNFNDLIKGMKLLEDDYLGSNGSRGYGQVEFDNLNIKIKVIKDYKTKEVLNKSSLTDIDSVCLKEKLNELIEIKGV >NZ_CP013850.1|WP_024933463.1|2019037_2019436_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm2 MEKDYKTDKFREYEEYFKKNVLTLDKINYDQFIEKSKDYSRLLKNNGLTTSMIRKIYNEILKANEAIDLKRLRPILAYTYGRNRVKGLQSLFYTLDDLLKRLNLKTNYLEIENVKEFLEVIIAYMKFYGDRY >NZ_CP013850.1|WP_024933464.1|2016868_2019019_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 MHICYKSLLYSFLRYVESIDKAMYKENAFKLKDKLLNPILQESYELVTKNIKKKKCKDGTFRLMNIFSNINDSKRKKFNLLKEIDINRYDNILKENGEEIDKAYCINYVKSIIKKLLQNDNEKIYFLMSKYCSNVPFINSKNCDISLFDIAKVTAAIATCKEKNKEEYILIKGDFSGIQSFIFKTSSDGALKTLKGRSVYLTLLQEICAKYIVKELGLSLCNILYSGGGNFYILASKSDENKIKLLRKQLSKLILKAYNGEIYLALGYLSFKEEDFKNFNILWKNIGEEVGFLKSKRWSELNLKESFNEIFGPLDLGGRREHSCRLCGCINKNLKEGMCDLCISFKDFSMEMKKANFYCEKIIPKADISLHNNVKDIFHELGFEIKFSDKPLKGFKNYIINSCDFEAYDGFIFKSVKLSDESLDYMVQKQKGNNKVGVIKLDIDNLGKLFINGLGNEGSISKIISLSRNISMFFEGYIENILYKSKRLDKLKEYLKTSDWEKRVTIIFSGGDDTFIIGRYEEILEFALLIREVFEEFVGGEQLTFSAGIGIFDYNYPVINIAEDTERCLELAKNHIEGNEIYAKKNKVCIMGQVFTWNEFLEIIKLKNLIEEIYLLSSKKSIFEKINKSTLGFKAVVEGGKRLNYIKLHRLAYYLRDLNNASNKNLKNKVEELIEFYEELCLKAFMGNNKKNYNINNIMIIPVASKLAQYNYRIIN >NZ_CP013850.1|WP_024933465.1|2016042_2016537_+|hypothetical-protein MILAIECFIACVLFTLMILPSLYKEPMKHIMSYPTEIRKRVESLPQYKDAIQKKEKKHLTVKIIAVFMFAIIFAVVAYFSGAKSFSKAYIHVFTLFFVVNIYDMIVLDIGLFCHSKKTRIPGTEDMDKEYRNPWHHIKGAGIGTIIGAVVALLSGGMVHFISII >NZ_CP013850.1|WP_024933466.1|2015385_2016000_+|sugar-O-acetyltransferase MNQKDRMLAGLPYKACLDGLPEERMANKKKIYEYNHCFPDEHEKIHKLIRDILGKAGADVHIESPFYCDYGKNIQVGDNFFANYNCTILDVGKVIIGNNVQFAPNVSLYTAGHPIHPDSRNSGYEYGIGITIGDNVWLGGNVVVNPGVHIGNNVVIGSGSVVTKDIPDNVIAIGNPCKVIREITEEDRKYYYKNYEFDVDDYKE >NZ_CP013850.1|WP_024933467.1|2014708_2015062_-|aminopeptidase-P-family-N-terminal-domain-containing-protein MHLFINKNKLSDEIKSSLKKNAALFIHPYNKIYKEVKKFTNSDVVLVHPDRINYELYNNIDKEVITEISSSNKLDAFPAEQGRFICPSFEPISSFGEHVTIVTCIFLMENSFMVVTV >NZ_CP013850.1|WP_024933145.1|2025805_2026294_-|hypothetical-protein MISKKIIAFIAMTIMMISLLIGCSNNTMDKVYNDNIKIASVYDTFGLDKSDEIIESGIYKGKLKLSGSGTIWTYESSSDFDLKVPYILSVKSGKAKIVLISPDNTVVNLVENTDKATMKGTTSLTLPIKKGNNRIKLVGYKKADIDIELHIEKGTFEKISFN >NZ_CP013850.1|WP_024933146.1|2027121_2027715_+|glycerol-3-phosphate-acyltransferase MIIIITSIISFLLGSIPTGYFITKKTCGIDIRTKGSGNIGSTNVKRIVGTKISIITQTIDVLKGIIPVVLGISLSKIVKLPVSIDTYLSIIAIAAILGHDYTPFLKFKGGKGVNTTLGVFIFIAPIPTLTGLAVYFILGLFIRIVSIRSISIGITIPIMCIITKLPIQIIISTTIACILMIIRHKDNLVRLIRGEEK >NZ_CP013850.1|WP_024933147.1|2028054_2028801_+|cell-envelope-integrity-protein-TolA MDKFRNMKKSHIALLVIMYMVLMGSLPRFTGWATIFSAIAVGGYFLKNKKDLKELTRKKKNFIFAGIIILAIIGSFNVAVGNNIQNEKLLAEKSKQEQQIKKEQEEKKLAEEQKRIQEEEARKKAEEEKRKQEEEAKKKTEEEAKKKALEEQKKQEELKRKQEEENKVKAENEQAQAAFAQSTGKGDSNSQSNESQNADDNQNYTVYKTRTGSKYHSSGCRYLKKSCYETTVSQARNEGLTPCRVCNP >NZ_CP013850.1|WP_024933148.1|2029138_2029540_+|membrane-protein MNILISTCNIGIPVLMIFIGILYKCNLYKKIDKTLDLIVPIAMFFTGFSERDREHLYKNTNKLALVNRKCSLIWSISGVCTLLLTIISLILNKSDIYNTSVILLEPEFLILVIVFITVEYVLKRNFYKKIQQS >NZ_CP013850.1|WP_011986655.1|2029775_2030492_+|transaldolase MKYNDLKIKIFADGADLNGMLDAYNKGIVKGFTTNPSLMKKAGITDYKEFAKEVLAKIKDMPVSFEVFSDDLETMEKEAEVLGNLGENVYIKIPVTNTKGESTAPLIKKLSEKGYHLNVTAIFTIDQVKEVVGALKSGVDSIVSVFAGRIADTGEDPVKIMKEASKICKTKEGVELLWASCREFYSIVEADKCGCEIITVTNDVLKKMPNMGKDLKEYSIETVRGFYKDASSLGFSIL >NZ_CP013850.1|WP_011986654.1|2030515_2030953_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MLKNYINDQVVEVNVEVKNWEEAVRLGGKLLEEDGAVEHSYIDAMVDTVKNMGPYIVIAPGIAMPHARPEAGAKNIRIGLLKLKNPVNFGNEEHDPVDMVIFLCAVDNKAHIEVLGELVQLIEDDDFLKIVRNASTKKEILDYIK >NZ_CP013850.1|WP_003361919.1|2030981_2031266_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIB MNILTVCGNGIGSSLMLAMKIEEICKENGIAANVESTDFNSAQGKKADLIVTVKELAEQFEGRDVAVVRSYINKKKITEDVLEIIKQKDEELKK >NZ_CP013850.1|WP_003358211.1|2031278_2032643_+|PTS-ascorbate-transporter-subunit-IIC MLGLLQFLRDVLKQPALLMGIMALVGLVALKKPGHKVLTGTLKPILGYLMLGAGADFIVANLEPLGGMIQTGFNITGVVPNNEAIVAVAQKVLGVETMSILVVGLLINLVIARFTKYKYVFLTGHHSFFMACLLSAVLGTSGMKGTELILFGGFLLGAWSAISPAIGQKYTLKVTDGDEIAMGHFGSLAYYVSAWVGSKVGKPEESTENIEIPEKWGFLRDTTISTAITMMVFYIVAAVAAGPEYVSKLSDGMSPILFAIMSSLKFAVGVTIVYNGVRMILGDLIPAFQGIATKIIPDAIPAVDCAVFFPYAPTAVIIGFVSSFIGGIIGMVLLGVAGGVLIIPGLVPHFFCGSTAGIFGNATGGKKGAVIGSFVNGLLITFAPALLLPVLSTLGFKNTTFGDFDFGVLGIIIGKTSNLAGKTGIIIIAMLMLVALIVPNFIKTKSKALNNIEE >NZ_CP013850.1|WP_024933149.1|2032854_2034948_+|transcription-antiterminator MLNKRCSNILQMIVNNEKPITIKEISKKVNKSPRTVRYDLDKIDDYLTEIEFPKLERKSNLGISLDLKDEEIKKLFKIIGKINNYDYVLSQKERVFYIIYELLNKSEFATINMLSDRMMVSRSTIINDLIEVKKWLSENKITLESSKGQGIKILGRERDLRRAAVKLFFQSMDSINFFNVTTLKLFNDIDIDFIRNTIKIAEEQMETSFSDDAFNNLVIHIAIAIKRIELSKDIIMDSEELKNLRKTAEYVIASGIAKMLEDRFKISIPEDEIGYITIHILGSNTSTLENIVKDDWIYLHLIVFKLIENVENITGINFSKDNKLFDSLAQHIRPAIYRLKHDIKVKNPLIEEIKEKYSYIFESIEEGVKFIEEDIGDSVNQEEIGYLTLHFMASIERSKNKKHRKPNVLIVCATGIGTSKFISNKLKSIFDINIIDTISSHTMEKILKYNKNIDLIVTTIPLKVKGIKCIEVNTFLTEKNISELGLYFAKFIRNNSEECNGSCKYEERDKVQEILNIVKENCTIHDYYKLRNKLALYLNIKDPTLTEDHKPSLKELLKPDFIKLNEEAENWEDAVRKSGEILMNNGCVKESYIDAMVNTVKNMGPYIVIAPGIAMPHAAPEDGVLKTGISMLTLKDPISFGNSEHDPVSVIISICSIDKVNHMKALKELMSIMDQEDFISKVKNIKASSEIDSILYS >NZ_CP013850.1|WP_021134329.1|2035273_2035627_+|zinc-ribbon-domain-containing-protein MIIWGWGKVTKKIIGAVFERTCNYCNTDEVWNLCVVRTWFTLFFIPIIPYKKQYCIACPKCWSYIELTQEEFEKIKIDITSSSNNINEKVVTDNIKYAGKTETQINYLKQMEEYSNK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013850_5 | 2025315-2025673 | TypeIII |
III-B
Consensus repeat of NZ_CP013850_5
|
5 spacers
spacers of NZ_CP013850_5
>5.1|2025346|35|NZ_CP013850|PILER-CR GATGAAAAATAATTATGCACCTGGATATTTAAGAA >5.2|2025412|34|NZ_CP013850|PILER-CR AATTTATGGATCTAATACTCATAAAGATGATTTT >5.3|2025345|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder,CRT TGATGAAAAATAATTATGCACCTGGATATTTAAGAA >5.4|2025411|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder,CRT AAATTTATGGATCTAATACTCATAAAGATGATTTT >5.5|2025476|37|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder,CRT TTTATTAGTGCCATTCCCGCTGGAGAGTATTGTGTCC >5.6|2025543|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder,CRT AATGTTAAAACAGTTACACCAGCTACAAGACCAAAG >5.7|2025609|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder,CRT TGGCTTCTTATTGCCTGTTGTATCTTTTCTGGTAG |
csx1,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,csm2gr11,cas10 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013850_5
The CRISPR arrays of NZ_CP013850_5 >merge|NZ_CP013850|5|2025315-2025673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGAACATTAACATGAGATGTATTTAAATTGATGAAAAATAATTATGCACCTGGATATTTAAGAAATTGAACATTAACATGAGATGTATTTAAATAAATTTATGGATCTAATACTCATAAAGATGATTTTATTGAACATTAACATGAGATGTATTTAAATTTTATTAGTGCCATTCCCGCTGGAGAGTATTGTGTCCATTGAACATTAACATGAGATGTATTTAAATAATGTTAAAACAGTTACACCAGCTACAAGACCAAAGGTTGAATAGTAACATGGGATGTATTTAAATTGGCTTCTTATTGCCTGTTGTATCTTTTCTGGTAGATTGAGCACTAAGATAGGATGTATTTAAAC >NZ_CP013850|5|2|2025315-2025476|PILER-CR ATTGAACATTAACATGAGATGTATTTAAATT GATGAAAAATAATTATGCACCTGGATATTTAAGAA ATTGAACATTAACATGAGATGTATTTAAATA AATTTATGGATCTAATACTCATAAAGATGATTTT ATTGAACATTAACATGAGATGTATTTAAATT >NZ_CP013850|5|5|2025315-2025673|CRISPRCasFinder ATTGAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TGATGAAAAATAATTATGCACCTGGATATTTAAGAA ATTGAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT AAATTTATGGATCTAATACTCATAAAGATGATTTT ATTGAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TTTATTAGTGCCATTCCCGCTGGAGAGTATTGTGTCC ATTGAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT AATGTTAAAACAGTTACACCAGCTACAAGACCAAAG GTTGAATAGTAACATGGGATGTATTTAAAT TGGCTTCTTATTGCCTGTTGTATCTTTTCTGGTAG ATTGAGCACTAAGATAGGATGTATTTAAAC >NZ_CP013850|5|1|2025315-2025673|CRT ATTGAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TGATGAAAAATAATTATGCACCTGGATATTTAAGAA ATTGAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT AAATTTATGGATCTAATACTCATAAAGATGATTTT ATTGAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TTTATTAGTGCCATTCCCGCTGGAGAGTATTGTGTCC ATTGAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT AATGTTAAAACAGTTACACCAGCTACAAGACCAAAG GTTGAATAGTAACATGGGATGTATTTAAAT TGGCTTCTTATTGCCTGTTGTATCTTTTCTGGTAG ATTGAGCACTAAGATAGGATGTATTTAAAC
>NZ_CP013850.1|WP_075143154.1|2023836_2024526_+|hypothetical-protein MHYYQLKIRVKLENNINYIQAPYLIGTFINNCMLKNDMLKNIHKKKIYKYVYDSFFPIEKDGIYKREKYYNIQLRTINLNLINKLAIALYNHKFNGIKTVNIDLEVMEPTKINQLYTLKPSIVTITGQPWIKNKHSIDVLIGNLNANLEKKYKQIFNEELENNKSFIKKIKVVNNIPIKYEYKNIILLGNKFEIIVNEDEVSQRKATIALGMGLGEKGSSLGAGFCIYR >NZ_CP013850.1|WP_075143155.1|2022338_2023820_+|hypothetical-protein MDNVLIINLGNSDIEKEGNKIEFGEFREKTKKIYEQLEGANKEEKQEIFKYLDFPIIKAIIDKVDGELKNEKLDKVILAYTNQKFNNNKDTVYLYEILKQKKHLVNNLETDNQDIWEKRLKETNFKQSYNIDFDPSDIDRMYNFYAEEINELNNKKIKKLFFSITGGASAMNFALLINAIEKFSGQLIPCYLSRGKKVAYKVNIAKNLRKQILKRDIKILINNKDYFAAIKMLENLEDGIVDDMSKLELKNIILALKYAEARIQFNFDKCKEYGEKCLDNTAEYREEFSQAVKDILIEKDDYINRLVELKNNAIYLYKKGSYTDFLGRVYRFQEAVYEHILGQYDLIIEKSNGVKINKEILKSRYSDKKEILDNIKIAGNKLEYEKNLTVDAMSKIISTLIDNDDVRNIVNRMEEIKDVKQLRNKSILAHGFEGISKEKIQGKLNCEEKDISKLLEEVMCKILVLFKIGTIEDMFYCENSRYDCILIEMIEKL >NZ_CP013850.1|WP_075143156.1|2021244_2022336_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm5 MNYDKIILNLKGQVLTPVHIGCGKKYSPYLDIIKNENKITVLDEEKIIEKLVLNDEIFEEYINILKNKSPNAIEKYNIINILKNNKIEIGEVKKYDLICGNSFNNLIDVNQSIKTKGIPYIPGSSIKGSIRTALIYNKLLKNGIDFGKIKEISNLKNKYYCYLGQDIFRQNDKLIYDDMMKNLLVRDTDIISNNKVKVYLCRAVNLYESIKNGNISTSVKSLNECIEEYTDFTFSIIIKNSLISKEELYNNINSFYEKILLKEIQEIEKLKLNIINSQYKLLLNEINEFRKYNNGFILRIGGMKGIFSNTIDSILSKKELEDIRNAHKNKRKKTGEFPTTKWCVMDEYENIKTTLGWIKIMEE >NZ_CP013850.1|WP_075143157.1|2020199_2021255_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm4 MKKVILKIDNETKFHIGNGQEILEYIPSDKLYSAIINSLALTYSKYELNKLIEIINEKLQISSAFMGIKIKNKNKGIEKSIDFLPRPYMYIGNNNIISTQLLNRKKFKKINYVSNNVFLDFNKHYDSKKNFINYDFQQGYIIGEKYYVTDREINFLSEDEKKYLEKYKPIINESVQRNYINRFSKESIGTYYDNFKVIVQEKYKDMQLIPYFYFYIKGDLEIDKIMYAIIEGGIGGKRSLGAGTIKDISIEECDDFKENGERFINISMIYPDKQELNYIESYALENRNGYIYSQGPTDLKKPWIRMIKEGGVFTKRIKGNINDINVKDIDYPIYTYGKAFFITLGGNLDEL >NZ_CP013850.1|WP_024933462.1|2019448_2020198_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 MNLLMGKIFIDGDIILKTGLRIGGGNNSIEIGGIDNNVIKNHRGEPYIPGSSLKGKLRSLLEISTNRLKDGRPCNCGECSICSIFGVGANENKQNLPTRIIVRDAFLNEDIKKQMYEKQGQFKRLELNYTESKYENTIDRLNSKATPRLIERVPEGASFRLQIIYSVFNNKDIDNFNDLIKGMKLLEDDYLGSNGSRGYGQVEFDNLNIKIKVIKDYKTKEVLNKSSLTDIDSVCLKEKLNELIEIKGV >NZ_CP013850.1|WP_024933463.1|2019037_2019436_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm2 MEKDYKTDKFREYEEYFKKNVLTLDKINYDQFIEKSKDYSRLLKNNGLTTSMIRKIYNEILKANEAIDLKRLRPILAYTYGRNRVKGLQSLFYTLDDLLKRLNLKTNYLEIENVKEFLEVIIAYMKFYGDRY >NZ_CP013850.1|WP_024933464.1|2016868_2019019_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 MHICYKSLLYSFLRYVESIDKAMYKENAFKLKDKLLNPILQESYELVTKNIKKKKCKDGTFRLMNIFSNINDSKRKKFNLLKEIDINRYDNILKENGEEIDKAYCINYVKSIIKKLLQNDNEKIYFLMSKYCSNVPFINSKNCDISLFDIAKVTAAIATCKEKNKEEYILIKGDFSGIQSFIFKTSSDGALKTLKGRSVYLTLLQEICAKYIVKELGLSLCNILYSGGGNFYILASKSDENKIKLLRKQLSKLILKAYNGEIYLALGYLSFKEEDFKNFNILWKNIGEEVGFLKSKRWSELNLKESFNEIFGPLDLGGRREHSCRLCGCINKNLKEGMCDLCISFKDFSMEMKKANFYCEKIIPKADISLHNNVKDIFHELGFEIKFSDKPLKGFKNYIINSCDFEAYDGFIFKSVKLSDESLDYMVQKQKGNNKVGVIKLDIDNLGKLFINGLGNEGSISKIISLSRNISMFFEGYIENILYKSKRLDKLKEYLKTSDWEKRVTIIFSGGDDTFIIGRYEEILEFALLIREVFEEFVGGEQLTFSAGIGIFDYNYPVINIAEDTERCLELAKNHIEGNEIYAKKNKVCIMGQVFTWNEFLEIIKLKNLIEEIYLLSSKKSIFEKINKSTLGFKAVVEGGKRLNYIKLHRLAYYLRDLNNASNKNLKNKVEELIEFYEELCLKAFMGNNKKNYNINNIMIIPVASKLAQYNYRIIN >NZ_CP013850.1|WP_024933465.1|2016042_2016537_+|hypothetical-protein MILAIECFIACVLFTLMILPSLYKEPMKHIMSYPTEIRKRVESLPQYKDAIQKKEKKHLTVKIIAVFMFAIIFAVVAYFSGAKSFSKAYIHVFTLFFVVNIYDMIVLDIGLFCHSKKTRIPGTEDMDKEYRNPWHHIKGAGIGTIIGAVVALLSGGMVHFISII >NZ_CP013850.1|WP_024933466.1|2015385_2016000_+|sugar-O-acetyltransferase MNQKDRMLAGLPYKACLDGLPEERMANKKKIYEYNHCFPDEHEKIHKLIRDILGKAGADVHIESPFYCDYGKNIQVGDNFFANYNCTILDVGKVIIGNNVQFAPNVSLYTAGHPIHPDSRNSGYEYGIGITIGDNVWLGGNVVVNPGVHIGNNVVIGSGSVVTKDIPDNVIAIGNPCKVIREITEEDRKYYYKNYEFDVDDYKE >NZ_CP013850.1|WP_024933467.1|2014708_2015062_-|aminopeptidase-P-family-N-terminal-domain-containing-protein MHLFINKNKLSDEIKSSLKKNAALFIHPYNKIYKEVKKFTNSDVVLVHPDRINYELYNNIDKEVITEISSSNKLDAFPAEQGRFICPSFEPISSFGEHVTIVTCIFLMENSFMVVTV >NZ_CP013850.1|WP_024933145.1|2025805_2026294_-|hypothetical-protein MISKKIIAFIAMTIMMISLLIGCSNNTMDKVYNDNIKIASVYDTFGLDKSDEIIESGIYKGKLKLSGSGTIWTYESSSDFDLKVPYILSVKSGKAKIVLISPDNTVVNLVENTDKATMKGTTSLTLPIKKGNNRIKLVGYKKADIDIELHIEKGTFEKISFN >NZ_CP013850.1|WP_024933146.1|2027121_2027715_+|glycerol-3-phosphate-acyltransferase MIIIITSIISFLLGSIPTGYFITKKTCGIDIRTKGSGNIGSTNVKRIVGTKISIITQTIDVLKGIIPVVLGISLSKIVKLPVSIDTYLSIIAIAAILGHDYTPFLKFKGGKGVNTTLGVFIFIAPIPTLTGLAVYFILGLFIRIVSIRSISIGITIPIMCIITKLPIQIIISTTIACILMIIRHKDNLVRLIRGEEK >NZ_CP013850.1|WP_024933147.1|2028054_2028801_+|cell-envelope-integrity-protein-TolA MDKFRNMKKSHIALLVIMYMVLMGSLPRFTGWATIFSAIAVGGYFLKNKKDLKELTRKKKNFIFAGIIILAIIGSFNVAVGNNIQNEKLLAEKSKQEQQIKKEQEEKKLAEEQKRIQEEEARKKAEEEKRKQEEEAKKKTEEEAKKKALEEQKKQEELKRKQEEENKVKAENEQAQAAFAQSTGKGDSNSQSNESQNADDNQNYTVYKTRTGSKYHSSGCRYLKKSCYETTVSQARNEGLTPCRVCNP >NZ_CP013850.1|WP_024933148.1|2029138_2029540_+|membrane-protein MNILISTCNIGIPVLMIFIGILYKCNLYKKIDKTLDLIVPIAMFFTGFSERDREHLYKNTNKLALVNRKCSLIWSISGVCTLLLTIISLILNKSDIYNTSVILLEPEFLILVIVFITVEYVLKRNFYKKIQQS >NZ_CP013850.1|WP_011986655.1|2029775_2030492_+|transaldolase MKYNDLKIKIFADGADLNGMLDAYNKGIVKGFTTNPSLMKKAGITDYKEFAKEVLAKIKDMPVSFEVFSDDLETMEKEAEVLGNLGENVYIKIPVTNTKGESTAPLIKKLSEKGYHLNVTAIFTIDQVKEVVGALKSGVDSIVSVFAGRIADTGEDPVKIMKEASKICKTKEGVELLWASCREFYSIVEADKCGCEIITVTNDVLKKMPNMGKDLKEYSIETVRGFYKDASSLGFSIL >NZ_CP013850.1|WP_011986654.1|2030515_2030953_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MLKNYINDQVVEVNVEVKNWEEAVRLGGKLLEEDGAVEHSYIDAMVDTVKNMGPYIVIAPGIAMPHARPEAGAKNIRIGLLKLKNPVNFGNEEHDPVDMVIFLCAVDNKAHIEVLGELVQLIEDDDFLKIVRNASTKKEILDYIK >NZ_CP013850.1|WP_003361919.1|2030981_2031266_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIB MNILTVCGNGIGSSLMLAMKIEEICKENGIAANVESTDFNSAQGKKADLIVTVKELAEQFEGRDVAVVRSYINKKKITEDVLEIIKQKDEELKK >NZ_CP013850.1|WP_003358211.1|2031278_2032643_+|PTS-ascorbate-transporter-subunit-IIC MLGLLQFLRDVLKQPALLMGIMALVGLVALKKPGHKVLTGTLKPILGYLMLGAGADFIVANLEPLGGMIQTGFNITGVVPNNEAIVAVAQKVLGVETMSILVVGLLINLVIARFTKYKYVFLTGHHSFFMACLLSAVLGTSGMKGTELILFGGFLLGAWSAISPAIGQKYTLKVTDGDEIAMGHFGSLAYYVSAWVGSKVGKPEESTENIEIPEKWGFLRDTTISTAITMMVFYIVAAVAAGPEYVSKLSDGMSPILFAIMSSLKFAVGVTIVYNGVRMILGDLIPAFQGIATKIIPDAIPAVDCAVFFPYAPTAVIIGFVSSFIGGIIGMVLLGVAGGVLIIPGLVPHFFCGSTAGIFGNATGGKKGAVIGSFVNGLLITFAPALLLPVLSTLGFKNTTFGDFDFGVLGIIIGKTSNLAGKTGIIIIAMLMLVALIVPNFIKTKSKALNNIEE >NZ_CP013850.1|WP_024933149.1|2032854_2034948_+|transcription-antiterminator MLNKRCSNILQMIVNNEKPITIKEISKKVNKSPRTVRYDLDKIDDYLTEIEFPKLERKSNLGISLDLKDEEIKKLFKIIGKINNYDYVLSQKERVFYIIYELLNKSEFATINMLSDRMMVSRSTIINDLIEVKKWLSENKITLESSKGQGIKILGRERDLRRAAVKLFFQSMDSINFFNVTTLKLFNDIDIDFIRNTIKIAEEQMETSFSDDAFNNLVIHIAIAIKRIELSKDIIMDSEELKNLRKTAEYVIASGIAKMLEDRFKISIPEDEIGYITIHILGSNTSTLENIVKDDWIYLHLIVFKLIENVENITGINFSKDNKLFDSLAQHIRPAIYRLKHDIKVKNPLIEEIKEKYSYIFESIEEGVKFIEEDIGDSVNQEEIGYLTLHFMASIERSKNKKHRKPNVLIVCATGIGTSKFISNKLKSIFDINIIDTISSHTMEKILKYNKNIDLIVTTIPLKVKGIKCIEVNTFLTEKNISELGLYFAKFIRNNSEECNGSCKYEERDKVQEILNIVKENCTIHDYYKLRNKLALYLNIKDPTLTEDHKPSLKELLKPDFIKLNEEAENWEDAVRKSGEILMNNGCVKESYIDAMVNTVKNMGPYIVIAPGIAMPHAAPEDGVLKTGISMLTLKDPISFGNSEHDPVSVIISICSIDKVNHMKALKELMSIMDQEDFISKVKNIKASSEIDSILYS >NZ_CP013850.1|WP_021134329.1|2035273_2035627_+|zinc-ribbon-domain-containing-protein MIIWGWGKVTKKIIGAVFERTCNYCNTDEVWNLCVVRTWFTLFFIPIIPYKKQYCIACPKCWSYIELTQEEFEKIKIDITSSSNNINEKVVTDNIKYAGKTETQINYLKQMEEYSNK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013850_6 | 2417747-2417964 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013850_6
|
3 spacers
spacers of NZ_CP013850_6
>6.1|2417770|40|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder CTCTTAGATCTAAATGATGTAAGTTTAAATCCTTTAAATA >6.2|2417833|43|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder TAGATAAATTTATATCCTTTAGTTTTTCCATATTATTAATAGG >6.3|2417899|43|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder TATATAAATTTAATAATTCTAAACTATCAAGTCCCTTTAAACA |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013850_6
The CRISPR arrays of NZ_CP013850_6 >merge|NZ_CP013850|6|2417747-2417964|CRISPRCasFinder TTCTATATTTTCTATTTTATTATCTCTTAGATCTAAATGATGTAAGTTTAAATCCTTTAAATAAGATATGTCTTTTACTTTATTTTTAGATAAATTTATATCCTTTAGTTTTTCCATATTATTAATAGGAGATATATCTTCTATATTATTATTATATAAATTTAATAATTCTAAACTATCAAGTCCCTTTAAACAAGATATATCTTTTATATTATTAT >NZ_CP013850|6|6|2417747-2417964|CRISPRCasFinder TTCTATATTTTCTATTTTATTAT CTCTTAGATCTAAATGATGTAAGTTTAAATCCTTTAAATA AGATATGTCTTTTACTTTATTTT TAGATAAATTTATATCCTTTAGTTTTTCCATATTATTAATAGG AGATATATCTTCTATATTATTAT TATATAAATTTAATAATTCTAAACTATCAAGTCCCTTTAAACA AGATATATCTTTTATATTATTAT
>NZ_CP013850.1|WP_085320776.1|2413122_2414052_-|glucosaminidase-domain-containing-protein MKKATGLILKLMILVLLAFTIFIIFNSLILNKTKERFLPESAMNIYIKAADEVSENKLQVNWKYIAALDGVKNKEDFSKANIEDSKVLGKKFLEISKSTKFKNTNYRLLTLDEVISKMSFTEEEKKNVHKYLDKLNNIYPITPDEYKRQFIDELIPISKELYDEYGILPSVTIGQAILESDWGRSELSKKGNNLFGIKATPSWQGKALNMETSENYNDKIKDNFRYYSSKGDSIKDYANFLVKNKRYRENKVFRATEYKTQAKAIEKAGYSTKKDKDGNLLYSSLLGKIIREYNLQLIDSKTQEEISKK >NZ_CP013850.1|WP_003403076.1|2412481_2412997_+|ferritin MLSEKLLEALNNQINFEFYSSYIYLAMASYAESEDLAGFANFFRVQAQEEIFHAMKFYDYVNQMGGRVILEKIDQPKAEYKNILECFEDGFNHEKIVTSRIYNLTDIATEEKEHATISLLKWFIDEQVEEENNFNTIIRKLRRAESNPAVLYMLDDELSARVFTPPTNTGA >NZ_CP013850.1|WP_003358991.1|2411234_2412089_-|response-regulator MKNTKVVIVDDSPFSISIIKDILEENELTVVGEAGNLEEVINVVKDKKPDIVTMDMTLPGTDGIECIKAINKINKNVKVIVISSMMDEEIVKKANKNKVCGYIQKPIDPEELIATIEKVVMKEELFLQLENDYFQIFKESFKDALNKFTKTTAEFSEDTKCTISETSRGMVVVIGIIGNFSGRMILDLSQETANSMVNFMLKREPKDMNEVLNVIGEFSNIVAGNACSMLNRKNKVFGLRIAPPSIFYGKSLNISQSLIESLSVESNTEFGQIYMNVGFKRGES >NZ_CP013850.1|WP_003358868.1|2410773_2411235_-|chemotaxis-protein-CheC MDAKYINPFIDSFYNVLPQIGFSNVTREDVAIKNNVESLGILINLGIVGDIRGNIVYNIQGENGKKIASKMMMGLPVEELNEMAQSALSELSNMLTANASINFSNIGVNVNISTPTLMYGQDIKIKLNTDKILNIKIVADNIPIDVNIAFEKI >NZ_CP013850.1|WP_085320778.1|2409242_2410601_+|YjiH-family-protein METQKNNKYSFSELFKFICPSLIGFILFIIPISYDGEITIPIAVLSKIVLAGLGSILPQLMAIIICITFICTAITKIFRPKAILENKFFNNLFNVSPVWVLARILGFIFIVSTFFKIGPEWMWSENTGGLLLYDLLPILFSVFIFAGMLLPLLLDFGLLEFVGALLTKVMRPIFNLPGRSSIDCMASWLGDGTIGVLLTSKQYEEGYYSEREAAVIGTTFSAVSITFSLVVISQVKLAHMFVPFYLTVCLAGIIAAILIPRIPPLSRKPDAYLNGGESKSSEALPEGYTPFTWGLEKAVAKAGSNDDPFNFIKQGLQNVLDMLLGVTPVVMAMGTSALILAEYTPLFKWLGLPFIPLLNLLKIPEAALASQTIVVGFADMFLPSVIAATIQSEMTRFIIACLSVTQLIYMSEVGGLLLGSKIPVSLKDLVIIFLERTLVTLPIITLIAHILF >NZ_CP013850.1|WP_003359090.1|2408301_2408505_-|alpha/beta-type-small-acid-soluble-spore-protein MPSNRNSNNLVVPEAQQGLNQLKMEVANEVGIANYDSMDKGNLTSRQNGYVGGNMVKKMVEAYERNL >NZ_CP013850.1|WP_003358886.1|2408039_2408240_-|alpha/beta-type-small-acid-soluble-spore-protein MANRNSNNLVVPEAQHGLNQLKMEVANEVGIANYDAVDKGNLTSRQNGYVGGNMVRKMVEAYERNL >NZ_CP013850.1|WP_078983311.1|2407518_2407848_+|HesB-like-protein MTPVNMSDLAYKEFKNFIKENNVNSNIFRIFLAGNGUGGPVFNIVLDEQTSEDLLSPIGELSFLVHKDLFSEFGGFIIKCAEENGKGGFTIDPIIHSENISCSTCSSCN >NZ_CP013850.1|WP_012099788.1|2405619_2406600_-|tyrosine-recombinase-XerC MKYNIQQLYDANFPQRLNDFLNYLRTIKGKSENTIESYKLDLIMFFRFLKLYKGMVPGETEFNDIEIKDISDEDIKNISLTDLFAFVSFVENYRNNGSYAKARKVATLKSFFRFLQGKVKIIKENPALELESPKISKRNPVYLTLDESKRLLSSIDGKFKERDLCIVTMFLNCGLRLSELCGINISNIKNDILTVVGKGNKERTVYLNKACIKTLNDYLSVRKEMGEKIVDKDALFLSKNYTRINKRSVEMLVKKYVKKAGLDGEKYSPHKLRHTAATLMYKHGGVDIRSLQMILGHENISTTQIYTHVDSDRLREAVKSNPLSDE >NZ_CP013850.1|WP_085320779.1|2404852_2405326_+|hypothetical-protein MNRETCIFNYTKKCTDCGECEICDLDQNKKCDNCGECLQREGIDTQAIKIDEIKEDKNFVDKEDLKKVLKEDEKELESLKEFEEGLENEILQETELIKDYDENFKEQGLYAIENVEGVQIEYIEDVDGLSELMEDESRLKKVAYEEFPGLIKIRENK >NZ_CP013850.1|WP_085320774.1|2418928_2423389_-|DUF5050-domain-containing-protein MIRGVFAIFSKKFVAKLLLYSSIAIIPMFNHNYVQAASSKQYETKYNVSLDKVWKIRFSREVDKSTLNPENIKILDNQGKEMPIDLSLDVDKHYVKIALKSGTYNGVHYIGKYEKDKKYSLIVKEGLMSEPYKNKKSKNLAYETMMEFNTIGDNEYPGLPIEDGLIVIGDKAYSVEYLSKHSSIANEITSNGNYYIAYISKEYGEKIKQVLGNNTTKGNQERANKILYYAPNGNQYEYEWNEAFGEYKIVLPKAYVDVTPGVINGVVNLAVKQVKAVPGAKYFKLAHSNTIKPIGESISYSMTYPTEKLTILSADETPLATALVDVYLPKTGYVSLSSVNETLGNTAGNISNNGSAAMDLDFYVYYVNSADKNSLYRKTLTGRMDTQISLDKAQYINVIGDWIYYSNYNDNGKIYKMKKDGTKKQILCDDTATYITVSGGVVYYANQSDKGRLYKINTDGTIDGGASNRDPAGKVHGMPVMDDYGNYNKATDQANFINVVGDWIYYSNFSDGHKIYTVNKDGNIRRKVNDEWADGIQIVGAWAYYCSGSGAISKVRVDGTGSVILLRGTTRKVDKGYHLNIVDGWLYYSNAEDGGKLYRIKEDGSGEKKKLADLATDYINIVGDTMYLISAGKTYTLPLNTDGTIKPTLVTKDNNGNTVVDVKDLAITVAYEDANKTIGELETKYLPQKVAVFMKDDTVQQLPVDWDIKNRKYNGQGIYTYTGTVLGHGKQIKCTLTIPSEMLNATSIIEVYNNGPKNGSIMIKERSFGPSKQDQELKEKLKLAKRVEIGDVIKVYDNPNSEKPLGNVKVDANNANGPLVKSLDLDMYGRSFWITITRKNKAESKPTEVRQLGAAVLSGDVLDEDGEALGVDGRDFTVKGWNNPSIRDDGFISDTTEIAAQGTKSIYVIPGTGKLNMENQGVIPAGITSANYWNGGNARALLTNYDLLTNDSLKNKLKEGNYSIYVVVGYDGKAEEDVNGFGSPLVIGKTASIPKAMKATEEKIPKAPSVTKQYVKAGDTIKISGVTNEDEIYLAPEGASYIAKDITNKPYKSHDNLFFEDQSKSKEEREKEYEKSGKPSIEDGYQCKLVDGKIPQGVRSGKYKVYMVNAIGSSSPASGEIVIDNEDPVVRLDSAKQEDVIKTVTNPDGTTRPETTGQKFKVNFAAFDNSFDNSIKEGITVSIARLDSPKSAIKAQEIKDKGNKTFEVIINDPNANLNDYAIYAQDKAGNIGQINLQDKNLPANINNISLAIRTSNEGVDLVKSRLVGRTKYMTKDLTRVSDNYEVTVDGVKYVLQEEALRNLGASPSIDAFMNALMQAKQWDIANNKPMEDKPKLSSKVSIYKVNDIIYIEGNDNTPIQIEDKTKIDADTAIVSNMIGLNSNENSTGENSKNQQYIINVTGTAQKNGKLKVCLAGKCFDIDILSTDDTTKIARKIKDAINDNTILDNYQYPGTNVESNGSKVTLTRKSPGAVVPTFTVEYFNYDN >NZ_CP013850.1|WP_085320773.1|2423542_2424988_-|DEAD/DEAH-box-helicase MNKLGFENYELSDEILKSLGRLGYKNPSEVQKQVIPLILKDKDIIVKSETGSGKTAAFSIPICEKIELEEKDPQVLVLTPTRELALQIKEEISSIALYKRLRCTAIFGKQPMSLQKRELKQRVHLVVGTPGRTLDHIERENLDLKKIKYFVLDEADEMLNMGFIDQVEAVIKRLPKNRVTMLFSATIPEKIENLCKKYMNNPKNININPENITTGTINQCYYEVEDKDKFSLLQKIIYKELVDNSIIFCNTREKVDEVLKHMKKKGFNAIALHGGMEQKDRLETMKKFKQGEFQFLVCTDVAARGIHIENISHVINYEMPYEKESYVHRIGRTGRAGKEGVAITFIEPNKVRFLKDIEDYIEKEIPKRKEPSLEEVDKGKKVFEENIKNRIKTKVPKNNKKQKDITKIYISAGRKKKIRPGDIVGAITSIEGINVDNIGIIDIQDNHSYVDILEGKGDIVLKASEDMKIKGKKVRIQRAVK >NZ_CP013850.1|WP_085320772.1|2425167_2426004_-|S1-RNA-binding-domain-containing-protein MIKLGEIQKLEIIREAPMGVYLNSKEDKSENDILLPGKQVPKDAKIGDEVEVFVYRDSEDRMIATINRPKITIGEIAPLKVIEKTKMGAFLDCGLERDLFLPFKEQTYGIQEGKECLVYLYIDKSDRLCASMNVYRVLSTESPYKENDEVKGFIYDIKREIGAFVAVDDEYHGLIPKNELYEKFRYGDIVEARVTKVKEDGKLDLSIRKKAYKQMDEDADTILEKLNSNGGKLYLNDNSDPVAIKELLSMSKNAFKRAVGRLLKEGKIEFIENGIKLK >NZ_CP013850.1|WP_085320771.1|2426326_2427592_-|DEAD/DEAH-box-helicase MNNSFDTLNLNPKLVQGLKKLNINIPTEIQAKAIPLAMENKDIIGQSETGTGKTLAYLLPIFEKITTEKREMQAIILAPTHELAMQINNEIKNISSNSNMDVKSMAIIGEANIKRQIEKLKEKPHIIVGSPGRILELIKKKKITAHTVKTIVIDEGDKLLDKNNLKVVKEVIKTTLRERQLMLFSATITESTLNIAKDLMKDSEVVKVKEKNTVNENIKHLYITGEHRERIEILRKLIAATNPKRAIVFINRNEEIELTTLKLQYHKIKAYGIYGAAEKEQRKKALEDFRSGKVQILVSSDLSARGLDVKDVTHIFNLDLPENPKEYLHRVGRTGRASKEGIAISIITEKEKALIRKYEKEFNINIEEKKIYKGTLISSKGERSSQPKSKNKSTSAHRDNNKKKRSSSINKSKNNHKKKKY >NZ_CP013850.1|WP_003359089.1|2427964_2428858_+|chemotaxis-protein-CheV METNILLESGTGEVEIIEFLVNNKHYAINVIKVKEVIEVDNVTKVPQSDPAIEGLILCREKIFPLIDLSYILGQKNTSKGKFKTIICEFNRVSVAFKIDEIVAVHRIGWDKILKPDDIAANPLVIGNILLKDKIILLLDFEKIVTDINPSTGISEERIVNVDYKDRSHIKVFLADDSSLIRKLLKDTLTKAGFKKLTIFDDGKQVLDKLLELVEKKGEDFTEDVQILITDIEMPQMDGHTLTRKVKEHPILKRLPVIIFSSLITKDLKHKGTSVGADEQLSKPDIGELVNIIDNYIE >NZ_CP013850.1|WP_003358979.1|2429066_2429921_-|4Fe-4S-binding-protein MKMISKNEIAKLKGEGFLAQKQEGYFSVRILSRAGNFTSKQIIKLAEIADNYGKGYLGVTTRLATEIPWIKYEDIEAVKKEIVSSGMGHGGTGKKVRPLVSCKGTVCVHGLYDTQKLCGELHDKYFGYELPSKFKITLVGCPNNCAKASINDIGIMGQAYVEFNEEKCKACGICTKSCRQKAVTVENNKIVYKKDLCVNCGKCATVCPFEAMTIKEQGLQVYLGGRFGREYRIGNRLKGLYKEEEIPALVQKIFDVYSEMGNPGERLAKMIERVGFDKVEEAIL >NZ_CP013850.1|WP_075143871.1|2430386_2431967_+|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MITVTNLSLRYGDKKLFEDVNLKFTPGNCYGVIGANGAGKSTFLKILSGEIEANTGDVSIQPGVRMSILKQDHFKYDEFPVLETVIMGNERLYQIMKEKDAIYAKTPFTDEDGIRASELEGEFAELNGWEAEAEASSLLQGLGIGTELHEKNMKDLSGSEKVKVLLAQALFGNPGVLILDEPTNHLDIKSVNWLEEFLINFEGTVIVVSHDRHFLNKVCTHMADVDFGKIKLYVGNYDFWYESSQLALQMAKDQNKKKEEKIKELQEFIARFSANASKSKQATSRKKLLDKIDLDNIQPSSRKYPYIAFKPEREVGNDILRVEGLTKTIDGTKVLDNISFIIGKDDKIAFVGDELSITTLFKIISGELKPDSGEYKWGITITNAYFPKDNSEYFNDVDLNLVDWLRQYSEEKSESYLRGFLGRMLFSGEEALKEVKVLSGGEKVRCMLSKMMLNNANVIILDQPTNHLDLESITALNNGLMDYKSNILFTSHDHQFIQTIANRIIEVSEAKFVDKKVTYDEYLESK >NZ_CP013850.1|WP_085320770.1|2432229_2434233_-|methyl-accepting-chemotaxis-protein MKFKTMKGKMLTYFLSLFLIICIAISFMAYFMSKRMIERKASSLMSEVSRQAVQNIEARLNGTLDSIETVANMPTIKDPKLGWDKKKTILDEEIKLHGHIKMGIVSKEGQSIQTDGTTVNVKDRPYFKKAMEGKSTISEPIVSKVDGKVVIIYTVPIKNGTIIMGALTAVRAGNDISNISNSIKVGESGGAYLIDSTGTVIAHKNKESVIKRENSIKDAQSNEELKPIAAIEKSMIEGKEGIGQYKYKGAEKYISYSPMKSTGWSLAIYAPKNEILKEVSEITRNIIIVSTLGIGIALVCIWFISTQISNNLISMRDSLNIVATGDLTTNVDSNIEKEKDEIGHMARALSKTVLSIGNMINSLKGSSFNIDDKANNLAAISEEFTATTENVSTAIQEVATGATNQAQALTEIVSMLNDFSDKINSTVNNIEEIDGMSKEIDEKANISNKDMKELLNSIENLTKVFENFETKIWTMESNVQKINEITNLINDIAEKTNLLALNAAIEAARAGESGKGFAVVAEEIRKLAEMSRKSSEDIYTIVNGVLEDTKDMVKSSNEVNEKLNGQRSTADEAMNSFMEISKSVTNMIPKIRNINNSANIIEKNKNEILNKSETIASISQEISASAEEISASSEEMSASSEEVANTAQSLNEMTQGMLNEMNKFKTE >NZ_CP013850.1|WP_061309457.1|2435459_2436095_+|SafA/ExsA-family-spore-coat-assembly-protein MKKSLLKKILFPVLLTSFLCLFKGIRVSAADYTSYIVVSGDSLWKISVKYQIELKEIIEANPQIKNTDLIYPEEKINIPNIDTIKALENEIISLVNIERENVGLPHLRTNWQLSKVARYKSQDMATKSYFSHISSTYGSPSTMLQNFNIRSITTGENIAYGQRIPQQVMTSLMDSIDDRQNILSNAYTEIGVGLYKSSSGVYYWTQLFIKP >NZ_CP013850.1|WP_061309456.1|2436238_2437198_-|bifunctional-hydroxymethylpyrimidine-kinase/phosphomethylpyrimidine-kinase MNYYCNNEPYVLVFGASVVDIFGFSCCDYRAYNSNPGKIKISFGGVCRNIAENLSRVGINTKFISILGEDENAKCMLEHSRKMGYDMGDSLILKGGTTPTYMAILDENGEMVSAVADMKSIDKMNCEFIDSKADIIKKAEYTVLDSDNPEILEYILKKFKGKTEFILDPVSAEKSKKIKHLIKYFHTIKPNIHEAEVLSGFKIETTEDLKKAGEYFRSLGVENVFISLDAEGIYYKNKFEEGRIKANDVTVKNVTGAGDAFVAGIAYSYMNKLSLEETVKFAIAMANLTIAHENTINPDLSYNIVENNIENIQWIEEYL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013850_7 | 2470639-2471853 | Orphan |
III-B
Consensus repeat of NZ_CP013850_7
|
18 spacers
spacers of NZ_CP013850_7
>7.1|2470669|37|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder TTGAAAATCAGATAGACAACATTAATCAAACAGTACA >7.2|2470736|37|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder CTGAAAGAGTTAATCTAAATCATATAGATAAAATTTG >7.3|2470803|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder AAAATGGTTAGTAGAACGTAATAAAGTGGATAAATA >7.4|2470869|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder ATATTTAAGAGGTAAAACTTTAGCAGGAGCTTATTG >7.5|2470935|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder CAAGAGATACAAGCTAGAAAATTGGTTCTTATAAA >7.6|2471000|37|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder GAAATGCCTTTGTTCTTTCAGAATTACAAAGAGAAGT >7.7|2471067|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder AACTACGCTTTGGAGTACACTACAGACATTACAGC >7.8|2471132|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder TGTTCAAAGTAGAAAAGTTTATATTAATAGATTAAA >7.9|2471198|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder CTTTGATGTAGACGGTATTACTAGATTAGGTGGAAA >7.10|2471264|37|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder TTAATACAATCGCTAGTAAATACGAATCAATAAGCTA >7.11|2471331|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder TGTTAAAGAACTTGATAAATATGTAATAGGTCAATG >7.12|2471397|34|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder CAAGAGAGTTTAAGATTAATAGATTCCCTAAAAA >7.13|2471461|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder TATATATATATTTGCAGAACTAAAACAACAAGTCGG >7.14|2471527|34|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder TTAGTTTTAGAAGCTCATAATAATATAAGACCAT >7.15|2471591|34|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder GATACAGAGTTTAGGGAACGTTATAAGGCTTCAG >7.16|2471655|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder TGATTATGATTCTAAAAAACAGATTAAAAGCTATAT >7.17|2471721|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder ATATACACCAATACAGCAGGGAGGGTGCGAAAGTGA >7.18|2471787|37|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder TGATATCGAGGTGATAAGCAATGGCGAATAATGAATC >7.19|2470668|38|NZ_CP013850|CRT CTTGAAAATCAGATAGACAACATTAATCAAACAGTACA >7.20|2470735|38|NZ_CP013850|CRT CCTGAAAGAGTTAATCTAAATCATATAGATAAAATTTG >7.21|2470802|37|NZ_CP013850|CRT CAAAATGGTTAGTAGAACGTAATAAAGTGGATAAATA >7.22|2470868|37|NZ_CP013850|CRT CATATTTAAGAGGTAAAACTTTAGCAGGAGCTTATTG >7.23|2470934|36|NZ_CP013850|CRT CCAAGAGATACAAGCTAGAAAATTGGTTCTTATAAA >7.24|2470999|38|NZ_CP013850|CRT CGAAATGCCTTTGTTCTTTCAGAATTACAAAGAGAAGT >7.25|2471066|36|NZ_CP013850|CRT CAACTACGCTTTGGAGTACACTACAGACATTACAGC >7.26|2471131|37|NZ_CP013850|CRT CTGTTCAAAGTAGAAAAGTTTATATTAATAGATTAAA >7.27|2471197|37|NZ_CP013850|CRT CCTTTGATGTAGACGGTATTACTAGATTAGGTGGAAA >7.28|2471263|38|NZ_CP013850|CRT CTTAATACAATCGCTAGTAAATACGAATCAATAAGCTA >7.29|2471330|37|NZ_CP013850|CRT CTGTTAAAGAACTTGATAAATATGTAATAGGTCAATG >7.30|2471396|35|NZ_CP013850|CRT CCAAGAGAGTTTAAGATTAATAGATTCCCTAAAAA >7.31|2471460|37|NZ_CP013850|CRT CTATATATATATTTGCAGAACTAAAACAACAAGTCGG >7.32|2471526|35|NZ_CP013850|CRT TTTAGTTTTAGAAGCTCATAATAATATAAGACCAT >7.33|2471590|35|NZ_CP013850|CRT TGATACAGAGTTTAGGGAACGTTATAAGGCTTCAG >7.34|2471654|37|NZ_CP013850|CRT TTGATTATGATTCTAAAAAACAGATTAAAAGCTATAT >7.35|2471720|37|NZ_CP013850|CRT TATATACACCAATACAGCAGGGAGGGTGCGAAAGTGA >7.36|2471786|38|NZ_CP013850|CRT TTGATATCGAGGTGATAAGCAATGGCGAATAATGAATC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013850_7
The CRISPR arrays of NZ_CP013850_7 >merge|NZ_CP013850|7|2470639-2471853|CRISPRCasFinder,CRT TTAATAATACATCTTATGTTATTGTTCAACTTGAAAATCAGATAGACAACATTAATCAAACAGTACAATTTAAATACATCTCATGTTATTGTTCAACCTGAAAGAGTTAATCTAAATCATATAGATAAAATTTGATTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAACAAAATGGTTAGTAGAACGTAATAAAGTGGATAAATAATTTAAATACATCCTATATTAATGTTCAACATATTTAAGAGGTAAAACTTTAGCAGGAGCTTATTGATTTAAATACATTCTATGTTAATGTTCAACCAAGAGATACAAGCTAGAAAATTGGTTCTTATAAAATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAACGAAATGCCTTTGTTCTTTCAGAATTACAAAGAGAAGTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACAACTACGCTTTGGAGTACACTACAGACATTACAGCATTTAAATACATCTCATGTTATTGTTCAACTGTTCAAAGTAGAAAAGTTTATATTAATAGATTAAAATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAACCTTTGATGTAGACGGTATTACTAGATTAGGTGGAAAATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAACTTAATACAATCGCTAGTAAATACGAATCAATAAGCTAATTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAACTGTTAAAGAACTTGATAAATATGTAATAGGTCAATGATTTAAATACATCTCATGTTAATGTCCAACCAAGAGAGTTTAAGATTAATAGATTCCCTAAAAAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACTATATATATATTTGCAGAACTAAAACAACAAGTCGGATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAATTTAGTTTTAGAAGCTCATAATAATATAAGACCATATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAATGATACAGAGTTTAGGGAACGTTATAAGGCTTCAGATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAATTGATTATGATTCTAAAAAACAGATTAAAAGCTATATATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAATATATACACCAATACAGCAGGGAGGGTGCGAAAGTGAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAATTGATATCGAGGTGATAAGCAATGGCGAATAATGAATCATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT >NZ_CP013850|7|7|2470639-2471853|CRISPRCasFinder TTAATAATACATCTTATGTTATTGTTCAAC TTGAAAATCAGATAGACAACATTAATCAAACAGTACA ATTTAAATACATCTCATGTTATTGTTCAAC CTGAAAGAGTTAATCTAAATCATATAGATAAAATTTG ATTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAAC AAAATGGTTAGTAGAACGTAATAAAGTGGATAAATA ATTTAAATACATCCTATATTAATGTTCAAC ATATTTAAGAGGTAAAACTTTAGCAGGAGCTTATTG ATTTAAATACATTCTATGTTAATGTTCAAC CAAGAGATACAAGCTAGAAAATTGGTTCTTATAAA ATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAAC GAAATGCCTTTGTTCTTTCAGAATTACAAAGAGAAGT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC AACTACGCTTTGGAGTACACTACAGACATTACAGC ATTTAAATACATCTCATGTTATTGTTCAAC TGTTCAAAGTAGAAAAGTTTATATTAATAGATTAAA ATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAAC CTTTGATGTAGACGGTATTACTAGATTAGGTGGAAA ATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAAC TTAATACAATCGCTAGTAAATACGAATCAATAAGCTA ATTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAAC TGTTAAAGAACTTGATAAATATGTAATAGGTCAATG ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTCCAAC CAAGAGAGTTTAAGATTAATAGATTCCCTAAAAA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC TATATATATATTTGCAGAACTAAAACAACAAGTCGG ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT TTAGTTTTAGAAGCTCATAATAATATAAGACCAT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT GATACAGAGTTTAGGGAACGTTATAAGGCTTCAG ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT TGATTATGATTCTAAAAAACAGATTAAAAGCTATAT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT ATATACACCAATACAGCAGGGAGGGTGCGAAAGTGA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT TGATATCGAGGTGATAAGCAATGGCGAATAATGAATC ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT >NZ_CP013850|7|2|2470639-2471852|CRT TTAATAATACATCTTATGTTATTGTTCAA CTTGAAAATCAGATAGACAACATTAATCAAACAGTACA ATTTAAATACATCTCATGTTATTGTTCAA CCTGAAAGAGTTAATCTAAATCATATAGATAAAATTTG ATTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAA CAAAATGGTTAGTAGAACGTAATAAAGTGGATAAATA ATTTAAATACATCCTATATTAATGTTCAA CATATTTAAGAGGTAAAACTTTAGCAGGAGCTTATTG ATTTAAATACATTCTATGTTAATGTTCAA CCAAGAGATACAAGCTAGAAAATTGGTTCTTATAAA ATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAA CGAAATGCCTTTGTTCTTTCAGAATTACAAAGAGAAGT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAA CAACTACGCTTTGGAGTACACTACAGACATTACAGC ATTTAAATACATCTCATGTTATTGTTCAA CTGTTCAAAGTAGAAAAGTTTATATTAATAGATTAAA ATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAA CCTTTGATGTAGACGGTATTACTAGATTAGGTGGAAA ATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAA CTTAATACAATCGCTAGTAAATACGAATCAATAAGCTA ATTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAA CTGTTAAAGAACTTGATAAATATGTAATAGGTCAATG ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTCCAA CCAAGAGAGTTTAAGATTAATAGATTCCCTAAAAA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAA CTATATATATATTTGCAGAACTAAAACAACAAGTCGG ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAA TTTAGTTTTAGAAGCTCATAATAATATAAGACCAT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAA TGATACAGAGTTTAGGGAACGTTATAAGGCTTCAG ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAA TTGATTATGATTCTAAAAAACAGATTAAAAGCTATAT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAA TATATACACCAATACAGCAGGGAGGGTGCGAAAGTGA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAA TTGATATCGAGGTGATAAGCAATGGCGAATAATGAATC ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAA
>NZ_CP013850.1|WP_012721426.1|2470005_2470200_-|hypothetical-protein MNDKKSPQTIANQNWEKKNREYASYLKSRSSARSFIRNKATLEDIEELRNLLKEREGNLKCERE >NZ_CP013850.1|WP_085320754.1|2469775_2470021_-|hypothetical-protein MRKGIRYLIVGLLLGASTRFVGVAKAIEPSEDNCPENGEYMYCLDKTTPLWISIYDVHQEEKFIYLRQPNSNKIIKLVELK >NZ_CP013850.1|WP_085320755.1|2469470_2469638_-|transcriptional-regulator MSSFYRAKEVAEILDVSTTKAYRIIRQLNKELKEMGYITIAGRVPIKYFKEKYYC >NZ_CP013850.1|WP_085320756.1|2468617_2469238_-|hypothetical-protein MGKVHYWLYNKITWFEELEKEIINFAEIKNLPVKQWKEEIISKYGVPTENKSLEEIIDTSNIHGWLQNKIHSAEARQAAWVTAILKEKKEYKKDLIDIFKSQGEKCALEYREKNHPIYAEDMYNALNDYILEGMPCDRINVILESNENEILWKANKCLHTPHWETVGGEVENFYSLREGWISAFINSLNNKFHFKSLGNYTYSIKK >NZ_CP013850.1|WP_012344341.1|2468030_2468585_-|hemerythrin-domain-containing-protein MNSIELMVNEHKNIKHMLVVIRKYCFKVLKNEQVDYNDFYKIIDFVRNYADKHHHGKEEDYLFNRMIEEIKGPTEKLVKQGMLVEHDLGRLYMQNLEKALKALENGEEEAKIDIIANAVSYTDLLYRHIEKEDDVVYKFAERNLSKETLKRLDEDCERIEKEAREKGIQDKYKNLIHELEEKVK >NZ_CP013850.1|WP_085320757.1|2466423_2467593_-|alanine-racemase MFRNHRPVWEEVNLDNLSYNMRNIKKKVNCKEIFAVVKANGYGHGALDIASTLLENGATRLSVACLSEATELRKGGITCPINILGITPPTLFEDIIDYNIEPVVFSYDYANQLSKAASLKNRIVKTHIAVDTGMGRLGFDPTVESLEEIKRIQDLSNIKIEGLCSHFSSSDEKDKSYSEYQFKIFQNFREKLIEMNMRIPIHHMSNSAAIIDLPSTYLDAVRAGIILYGYYPSMEVNKENLHIKQVMTLKANIVHIKTIDSGRYVGYNRKFKTKRKSKIAILPLGYGDGYTRFLSNRGKVIINGQYAPIVGNICMDQCMIDVTDIKEVKVGDEVIIIGKDNINNLRYDAEDIASKVGMTSGEIMSIISKRVPRVYIKNGNIVKVRNYIA >NZ_CP013850.1|WP_085320758.1|2464525_2465998_-|CZB-domain-containing-protein MRIFKNNAIEKEIIKISQDFQNQNVHALDEIEGSTSKNRMVRFTAGIAKIVQVISPKVKKLINGVLSITTRISTFSVNLDYSGEHLKKSADKLYNSSGVLNSSIKEVKEAMQQITLAIEEDVETVEHISSGNIELIKYMDENKKNLGLVKNVNKELEFKAQSMEKDMTELNSILENMKTIVTGMSEIASKTNLLALNASIEAARAGEAGKGFAVVAEEVRKLSESTSKQLEKMEEFVNNIGTCSTNSSKSVKDTIGSIGELGEYTQAISSSSSKVREAIDIEVKSIELLAASMQEINASSEEINSNMDIIGENVQEVSKEAAVLSEKSLEIKYLADEMDKIDDEVSNLAKLSGDITGENYFKITNKDFIVAIDNAIKAHENWVQQLQNMAMENKIKPIQTDGQKCGFGHFYNSVMPRNEKIKEIWIKIDNIHKELHKVGGIVKSNIKDGHTEKAKENSKKATQLSQTIISMLSHIKSIAIETDKEGNLVL >NZ_CP013850.1|WP_003385957.1|2463097_2464438_-|NCS2-family-permease MGGRGIKEKDEGEVENKFNSLFNIKKYNTTVKGEILAGFTSFFAIVYIIAVNASILSDAGLPLEGAIIATVLSSFVGCILVGVISNAPLILVPGMGVNALFSYTIVGSMGLSWQQALAAVFVSGVVFSIIAFTRFSKTLIESIPTSLKEAITVGIGVLITFIGLQKSGIVIGSTTTFVALGHFNNPLVYVTFINLIITLILFIKNVPGNFLISMIVGTIISYFFGLIDMAKLTFSNFSLGAYKEVFFKMDFSSATSITFWIAVFSLTLVLVFENLGLLHAHINVMLKEENKFKTSFKACSLSAITCGFFGTSPTVATIETAAGITAGGKTGLTSIFTGILFLLSLFLLPIIKIIPNSAISPILIVIGGLMIKNILSINFNDFSEGFPAFLIIVMIPLTFSIVDGMAFGFICYPIVKLAGKKSKEISYAMYIISLMFLLNFILHAVS >NZ_CP013850.1|WP_025776446.1|2462024_2462858_-|DUF975-family-protein MEEKTILSNSQIKSKAKEALKGNWGTAVIAFIIFNIVMYSVNYVYNINQISNYIHDPYLVRENAGFGASGILFFIKLLLAGPMTYGITKFSMNLVRDKSHKIENIFEGFKHFSGTFIMNIVLGIYSFLWSLLLFIPFFAIVFVMVIREFSKTNMNFYSTGNDFSGWMIAIFILLIIVLTVALSMILFRYAMTYYIYIDNPDMGAMEAIKESVSMMKGNKTRLLLLYLSFILWYLLGIVTVGIAFLWITPYIKSTEAVFYDELKKSNEHNADEAVSAL >NZ_CP013850.1|WP_076178048.1|2460924_2461809_+|SDR-family-oxidoreductase MNEDLNFINSFPKSVPGQEQSKQPGIEAIMNPKPIFDNPNYKASAKLMDRVALITGGDSGIGRAVAVTFAKEGADISIVYFDEHEDAKETQAIIEGLGRKCLLIPGDITDDNFCNNAINQTINTFNKLDILVNNAAVQYVQNSIEDITKEQLEKTFKTNIFSIFYLVKAALPYLNRGASIINTASITAYKGQKLLIDYSSSKGAIVSFTRSLALSLWGKGIRVNAVAPGPIWTPLIPASFDTNHVETFGSTTTMGRPGQPVELAPSYVYLASNECASFVSGEVIHINGGEIING >NZ_CP013850.1|WP_085320753.1|2472068_2472839_-|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MLFNLNPGHTLSGGDVGTRGIGELKEEVLTRQLVGEIDKELRGRGHSTNICRVDYASTLQESLNKQVALCNSVNADLNICIHFNTTVGGYGSEVYTYGGKYLVEADRVLKQLNNLGFRNRGIKDQPLALTKRTKAKTIYIEVCFIDSSGDVAILNKYGMNGIAKSIVNGVLGTSSNVTPAPSEPTNNNSWINLDGKTGTINTPSGVNIREKKSTSSKILGALPNGAKVNLYRKEGDWIHIYYPPHGGYVYAKYIRY >NZ_CP013850.1|WP_085320752.1|2472883_2473303_-|phage-holin-family-protein MEKQKIFNIIVATVGTWFTWLFGAWDTALIVLICFMVLDYCTGLLRGAVNKELSSDVGLKGIARKAVIFIVLIVAVLLDRLLNTGNWVFRSLVAYFYIANEGISLLENCAQLGVPIPDKLKDMLVQLKEGNKKEIKEQE >NZ_CP013850.1|WP_085320751.1|2473393_2473609_-|hypothetical-protein MILYDLLKNLINNNYYEKEDMNNKLNVFYTFNQINLEQYSELMATVNPAEKEDLGNRGLDVENTTEEVVTQ >NZ_CP013850.1|WP_012704076.1|2473624_2473930_-|hypothetical-protein MKRGSLIIYDNSGKVWVNTGDAEGCIPPHTPPDGLPYIITEFGEFNDKIIKGIDVTVTPHKLITEDIPHIETEEEKLKKELLKAQSEVVNLKYKEVLNNIK >NZ_CP013850.1|WP_085321034.1|2475193_2475820_-|DUF2313-domain-containing-protein MKKKLIDFLPPQISDIEEFKNIMATENIELELIEKCQERILKENFIDTATDYGIKHKEQLFKIRADLVNDTLEFRKLRIKNRKMDKMPITQRALEHKLKTLFGEGNYKVEVLNDEYVLKVEINTFDWSMFNEIIDNFRYIIPCNMMLSSTLVQKINTNIYFASAITSGEEITVYPWMPKDIASNGKVNIAMGSNTGVENITVYPRKEA >NZ_CP013850.1|WP_085321035.1|2475800_2476895_-|baseplate-J/gp47-family-protein MFEDQTEEAVLARMMNKISNDLDKREGSLLYNALAPAAQEVAKMYSDMDYFLKCTFASPDMPDELLDLRVAEEGLKREKATYAIKKGYFYNEENELIDIPLNSRFSIEDFNFIAIEKISTGLYKMQCETTGIEGNHVTGSLIPIEYIEDLSIATLGELIIPGEDVESNQSLYDRYIEHLNEKPYGGNIADYKIRTRVIEGVGTVKVFPIWNGGGTVKIVFLDSDYSVPTKELIDKVQTILDPVQNQGKGFGIAPVGHVVTVLGAKDIEITIETKLLLKRGLTIGQVQEDIEKVIKDYLLNLRKQWHEDDNTIVRISQIEARILNVEGVADLFNTKINGKEENLTLESEEVPILKEVVLSEKEIN >NZ_CP013850.1|WP_085321036.1|2476895_2477303_-|DUF2634-domain-containing-protein MSEVSILPQGAIIDEDIEVEEIIEPTKTYKIKDNRIVGFTDGKEALKQAIQLILGTERYEYLIYSWNYGSELNGLIGKQKDIAESEFKRRIKEALRQDDRINNVDNFIFNYDKDGVEVSFTVFSIYGEFTESVVR >NZ_CP013850.1|WP_085321037.1|2477306_2477651_-|DUF2577-domain-containing-protein MGIIDTIKKASMGAVGASNPVNISFGEIVSTNELKIKVDQKLILDRDFFIIPESLTRYEVDLKHSHTYINNSIESNLNTSLDKLLIREDLKQGDKVLLLRVQGGQQYVILDKVV >NZ_CP013850.1|WP_085321038.1|2477653_2478628_-|hypothetical-protein MNIQLLLDNKDGNVFDISELVNEVTWKTKRKDKPSSLNFEILKDKQITINNGDVISFKVDNNPVFYGYAFENGGSRNPITKITAYDQLRYLLFNDTYVFKNKKASQILMQIAKDIGLRVGTIEDTGYVIPQLLEDDKKLLDIIYSSLEKTLLNSKKTYTLYDDFGYLNLRNINNLRQEVVISDDNNLGDYDWKNSIDSDTYNRVKIVRDNKDTKGRDVYIAQDSRNIARWGRLQYFKKVDEKMNKAQIQEMVNAALKLKNRETKTLKLKDVISTDIAADLKLRAGSGVYVDIKEKGIKQYYLIEEATHKFQKGNLVMDFDLKVV >NZ_CP013850.1|WP_085321039.1|2478639_2479317_-|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MYKMYLGINDGEEGFILPVLTEKIEFDEDGNNKTYDIINLGEINTINKPKLMEISFESFFPKHKGPYVSSEQLFEPSFYIAKIREWRDKKQKIRFIFTGSPLEINDLFTIENFKPSEEGGEVGDVHYSIGLKRYKNYSAKKVVIVTPKTAAANQSVKKVIANPKTTRPNNTNKPKTHTVSGNDTLWHISKKYLGDGNKWPQIYNLNKDKIKDPNLIYTGQVLRLP |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013850_4 | 4.2|2025028|21|NZ_CP013850|PILER-CR | 2025028-2025048 | 21 | NZ_CP006909 | Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence | 5039-5059 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013850_4 | 4.2|2025028|21|NZ_CP013850|PILER-CR | 2025028-2025048 | 21 | NZ_CP013700 | Clostridium botulinum strain AM1195 plasmid pRSJ11_1, complete sequence | 84494-84514 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013850_7 | 7.18|2471787|37|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder | 2471787-2471823 | 37 | NZ_CP014173 | Clostridium botulinum strain B609 plasmid pRSJ22_2, complete sequence | 15264-15300 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013850_4 | 4.2|2025028|21|NZ_CP013850|PILER-CR | 2025028-2025048 | 21 | NZ_CP013700 | Clostridium botulinum strain AM1195 plasmid pRSJ11_1, complete sequence | 36495-36515 | 1 | 0.952 |
NZ_CP013850_4 | 4.2|2025028|21|NZ_CP013850|PILER-CR | 2025028-2025048 | 21 | NZ_CP013684 | Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence | 100925-100945 | 1 | 0.952 |
NZ_CP013850_4 | 4.2|2025028|21|NZ_CP013850|PILER-CR | 2025028-2025048 | 21 | NC_025146 | Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111 | 79775-79795 | 1 | 0.952 |
NZ_CP013850_4 | 4.2|2025028|21|NZ_CP013850|PILER-CR | 2025028-2025048 | 21 | NC_010418 | Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence | 83403-83423 | 1 | 0.952 |
NZ_CP013850_7 | 7.8|2471132|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder | 2471132-2471167 | 36 | NZ_CP014152 | Clostridium botulinum strain BrDura plasmid pRSJ20_1, complete sequence | 102193-102228 | 1 | 0.972 |
NZ_CP013850_7 | 7.8|2471132|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder | 2471132-2471167 | 36 | NZ_CP006909 | Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence | 188033-188068 | 1 | 0.972 |
NZ_CP013850_7 | 7.8|2471132|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder | 2471132-2471167 | 36 | NZ_CP013684 | Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence | 79741-79776 | 1 | 0.972 |
NZ_CP013850_7 | 7.8|2471132|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder | 2471132-2471167 | 36 | NZ_CP013710 | Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_3, complete sequence | 177157-177192 | 1 | 0.972 |
NZ_CP013850_7 | 7.8|2471132|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder | 2471132-2471167 | 36 | NC_010379 | Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD, complete sequence | 113600-113635 | 1 | 0.972 |
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NZ_CP013850_4 | 4.4|2024997|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder | 2024997-2025031 | 35 | NC_010418 | Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence | 169943-169977 | 6 | 0.829 |
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NZ_CP013850_4 | 4.4|2024997|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder | 2024997-2025031 | 35 | NC_010379 | Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD, complete sequence | 37038-37072 | 6 | 0.829 |
NZ_CP013850_4 | 4.4|2024997|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder | 2024997-2025031 | 35 | NZ_CP013684 | Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence | 88444-88478 | 7 | 0.8 |
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NZ_CP013850_4 | 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR | 2024944-2024974 | 31 | MK907238 | Escherichia phage vB_EcoM-12474IV, complete genome | 24428-24458 | 8 | 0.742 |
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NZ_CP013850_4 | 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR | 2024944-2024974 | 31 | MK907236 | Escherichia phage vB_EcoM-12474II, complete genome | 24407-24437 | 8 | 0.742 |
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NZ_CP013850_4 | 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR | 2024944-2024974 | 31 | NZ_CP038921 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-010b plasmid unnamed3, complete sequence | 12040-12070 | 8 | 0.742 |
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NZ_CP013850_4 | 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR | 2024944-2024974 | 31 | NZ_CP048054 | Piscirickettsia salmonis strain Ps-11091B plasmid Ps11091B-p2, complete sequence | 63020-63050 | 8 | 0.742 |
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NZ_CP013850_4 | 4.4|2024997|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder | 2024997-2025031 | 35 | NC_025146 | Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111 | 249579-249613 | 8 | 0.771 |
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NZ_CP013850_7 | 7.16|2471655|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder | 2471655-2471690 | 36 | NZ_CP053949 | Bacillus cereus strain FDAARGOS_799 plasmid unnamed1, complete sequence | 399137-399172 | 8 | 0.778 |
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NZ_CP013850_7 | 7.34|2471654|37|NZ_CP013850|CRT | 2471654-2471690 | 37 | NZ_CP053949 | Bacillus cereus strain FDAARGOS_799 plasmid unnamed1, complete sequence | 399137-399173 | 9 | 0.757 |
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NZ_CP013850_7 | 7.34|2471654|37|NZ_CP013850|CRT | 2471654-2471690 | 37 | NZ_CP050184 | Bacillus thuringiensis strain HER1410 plasmid pLUSID1, complete sequence | 269381-269417 | 10 | 0.73 |
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4. spacer 4.2|2025028|21|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP013700 (Clostridium botulinum strain AM1195 plasmid pRSJ11_1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.952
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5. spacer 4.2|2025028|21|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP013684 (Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.952
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6. spacer 4.2|2025028|21|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NC_025146 (Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111) position: , mismatch: 1, identity: 0.952
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7. spacer 4.2|2025028|21|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NC_010418 (Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.952
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9. spacer 7.8|2471132|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP006909 (Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
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10. spacer 7.8|2471132|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013684 (Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
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11. spacer 7.8|2471132|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013710 (Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_3, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
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12. spacer 7.8|2471132|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NC_010379 (Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
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15. spacer 7.33|2471590|35|NZ_CP013850|CRT matches to NZ_CP031100 (Clostridium botulinum strain CFSAN034202 plasmid p1_CFSAN034202, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
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16. spacer 7.33|2471590|35|NZ_CP013850|CRT matches to NZ_CP014173 (Clostridium botulinum strain B609 plasmid pRSJ22_2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
tgatacagagtttagggaacgttataaggcttcag CRISPR spacer tgatacagagtttagagaacgttataaggcttcag Protospacer ***************.*******************
17. spacer 7.36|2471786|38|NZ_CP013850|CRT matches to NZ_CP014173 (Clostridium botulinum strain B609 plasmid pRSJ22_2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
ttgatatcgaggtgataagcaatggcgaataatgaatc CRISPR spacer atgatatcgaggtgataagcaatggcgaataatgaatc Protospacer *************************************
18. spacer 4.4|2024997|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013700 (Clostridium botulinum strain AM1195 plasmid pRSJ11_1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
taataatttcattcctggatctaatttttgtatta CRISPR spacer taattatttcattcctggatctaatttttgtattg Protospacer **** *****************************.
19. spacer 4.4|2024997|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013710 (Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_3, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
taataatttcattcctggatctaatttttgtatta CRISPR spacer taataatttcattcctggatataatttttgaatta Protospacer ******************** ********* ****
20. spacer 4.4|2024997|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014152 (Clostridium botulinum strain BrDura plasmid pRSJ20_1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
taataatttcattcctggatctaatttttgtatta CRISPR spacer taataatttcattcctggatataatttttgaatta Protospacer ******************** ********* ****
21. spacer 7.8|2471132|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NC_010418 (Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
tgttcaaagtagaaaagtttatattaatagattaaa CRISPR spacer cgttcaaagcagaaaagtttatattaatagattaaa Protospacer .********.**************************
22. spacer 7.14|2471527|34|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013709 (Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
ttagttttagaagctcataataatataagaccat CRISPR spacer ttagttttagaagctcataacaatataaaaccat Protospacer ********************.*******.*****
23. spacer 7.26|2471131|37|NZ_CP013850|CRT matches to NZ_CP014152 (Clostridium botulinum strain BrDura plasmid pRSJ20_1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
ctgttcaaagtagaaaagtttatattaatagattaaa CRISPR spacer atgttcaaagcagaaaagtttatattaatagattaaa Protospacer *********.**************************
24. spacer 7.26|2471131|37|NZ_CP013850|CRT matches to NZ_CP006909 (Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
ctgttcaaagtagaaaagtttatattaatagattaaa CRISPR spacer atgttcaaagcagaaaagtttatattaatagattaaa Protospacer *********.**************************
25. spacer 7.26|2471131|37|NZ_CP013850|CRT matches to NZ_CP013684 (Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
ctgttcaaagtagaaaagtttatattaatagattaaa CRISPR spacer atgttcaaagcagaaaagtttatattaatagattaaa Protospacer *********.**************************
26. spacer 7.26|2471131|37|NZ_CP013850|CRT matches to NZ_CP013710 (Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_3, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
ctgttcaaagtagaaaagtttatattaatagattaaa CRISPR spacer atgttcaaagcagaaaagtttatattaatagattaaa Protospacer *********.**************************
27. spacer 7.26|2471131|37|NZ_CP013850|CRT matches to NC_010379 (Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
ctgttcaaagtagaaaagtttatattaatagattaaa CRISPR spacer atgttcaaagcagaaaagtttatattaatagattaaa Protospacer *********.**************************
28. spacer 4.4|2024997|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP006909 (Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
taataatttcattcctggatctaatttttgtatta CRISPR spacer cattaatttcattcctggatctaatttttgtattg Protospacer .* *******************************.
29. spacer 4.4|2024997|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NC_010418 (Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
taataatttc-attcctggatctaatttttgtatta CRISPR spacer -aataatttcaattcctggatcttattcttgtatta Protospacer ********* ************ ***.********
30. spacer 4.4|2024997|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NC_010379 (Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
taataatttc-attcctggatctaatttttgtatta CRISPR spacer -aataatttcaattcctggatcttattcttgtatta Protospacer ********* ************ ***.********
31. spacer 7.8|2471132|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP006909 (Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
tgttcaaagtagaaaagtttatattaatagattaaa CRISPR spacer tgttcaaagcagaaaagtttatattaatagactaga Protospacer *********.*********************.**.*
32. spacer 7.8|2471132|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NC_025146 (Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
tgttcaaagtagaaaagtttatattaatagattaaa CRISPR spacer tattcaaagcaaaaaagtttatattaatagattaaa Protospacer *.*******.*.************************
33. spacer 7.8|2471132|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NC_012654 (Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
tgttcaaagtagaaaagtttatattaatagattaaa CRISPR spacer tgttcaaagcagaaaagtttatattaatagactaga Protospacer *********.*********************.**.*
34. spacer 7.8|2471132|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP031095 (Clostridium botulinum strain CFSAN034200 plasmid p1_CDC51232, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
tgttcaaagtagaaaagtttatattaatagattaaa CRISPR spacer tgttcaaagcagaaaagtttatattaatagactaga Protospacer *********.*********************.**.*
35. spacer 7.26|2471131|37|NZ_CP013850|CRT matches to NC_010418 (Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
ctgttcaaagtagaaaagtttatattaatagattaaa CRISPR spacer acgttcaaagcagaaaagtttatattaatagattaaa Protospacer .********.**************************
36. spacer 7.32|2471526|35|NZ_CP013850|CRT matches to NZ_CP013709 (Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
tttagttttagaagctcataataatataagaccat CRISPR spacer attagttttagaagctcataacaatataaaaccat Protospacer ********************.*******.*****
37. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to MF370964 (Pseudoalteromonas phage SL20, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.871
-catataatcaattttcttacccttttcagta CRISPR spacer acttatgat-aatattcttacccttttcagta Protospacer * ***.** *** ******************
38. spacer 4.4|2024997|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NC_025146 (Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111) position: , mismatch: 4, identity: 0.886
taataatttcattcctggatctaatttttgtatta CRISPR spacer caataattttattcctggatctaatttttggattg Protospacer .********.******************** ***.
39. spacer 4.4|2024997|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NC_025146 (Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111) position: , mismatch: 4, identity: 0.886
taataatttcattcctggatctaatttttgtatta CRISPR spacer taataatttcattcctggatataatttttgaagtc Protospacer ******************** ********* * *
40. spacer 4.4|2024997|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NC_010418 (Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.886
taataatttcattcctggatctaatttttgtatta CRISPR spacer catttatttcattcctggatctaatatttgtatta Protospacer .* * ******************** *********
41. spacer 7.18|2471787|37|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014218 (Clostridium botulinum strain B515 plasmid pRSJ21_3, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.892
tgatatcgaggtgataagcaatggcgaataatgaatc CRISPR spacer tgatatcgaggtgataagcaatggcgaataatttaga Protospacer ******************************** *
42. spacer 7.26|2471131|37|NZ_CP013850|CRT matches to NZ_CP006909 (Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.892
ctgttcaaagtagaaaagtttatattaatagattaaa CRISPR spacer atgttcaaagcagaaaagtttatattaatagactaga Protospacer *********.*********************.**.*
43. spacer 7.26|2471131|37|NZ_CP013850|CRT matches to NC_025146 (Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111) position: , mismatch: 4, identity: 0.892
ctgttcaaagtagaaaagtttatattaatagattaaa CRISPR spacer atattcaaagcaaaaaagtttatattaatagattaaa Protospacer *.*******.*.************************
44. spacer 7.26|2471131|37|NZ_CP013850|CRT matches to NZ_CP031095 (Clostridium botulinum strain CFSAN034200 plasmid p1_CDC51232, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.892
ctgttcaaagtagaaaagtttatattaatagattaaa CRISPR spacer atgttcaaagcagaaaagtttatattaatagactaga Protospacer *********.*********************.**.*
45. spacer 7.26|2471131|37|NZ_CP013850|CRT matches to NC_012654 (Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.892
ctgttcaaagtagaaaagtttatattaatagattaaa CRISPR spacer atgttcaaagcagaaaagtttatattaatagactaga Protospacer *********.*********************.**.*
46. spacer 4.4|2024997|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NC_010418 (Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.857
taataatttcattcctggatctaatttttgtatta CRISPR spacer taataatttcattcctggatataatctttggactg Protospacer ******************** ****.**** *.*.
47. spacer 7.36|2471786|38|NZ_CP013850|CRT matches to NZ_CP014218 (Clostridium botulinum strain B515 plasmid pRSJ21_3, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.868
ttgatatcgaggtgataagcaatggcgaataatgaatc CRISPR spacer atgatatcgaggtgataagcaatggcgaataatttaga Protospacer ******************************** *
48. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP019203 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CFSAN003307 plasmid pCFSAN003307, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
catataatcaattttcttacc--cttttcagta CRISPR spacer cggataatcaattttcttaccgtctttccgg-- Protospacer *. ****************** ****.*.*
49. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP021835 (Klebsiella pneumoniae strain AR_0120 plasmid tig00000516_pilon, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
catataatcaattttcttacc--cttttcagta CRISPR spacer cggataatcaattttcttaccgtctttccgg-- Protospacer *. ****************** ****.*.*
50. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to MT374857 (Yersinia phage vB_YpM_46, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
catataatcaattttcttacc--cttttcagta CRISPR spacer cggataatcaattttcttaccgtctttccgg-- Protospacer *. ****************** ****.*.*
51. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to AF063097 (Bacteriophage P2, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
catataatcaattttcttacc--cttttcagta CRISPR spacer cggataatcaattttcttaccgtctttccgg-- Protospacer *. ****************** ****.*.*
52. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NC_049390 (Escherichia virus P2_4A7b genome assembly, chromosome: 1) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
catataatcaattttcttacc--cttttcagta CRISPR spacer cggataatcaattttcttaccgtctttccgg-- Protospacer *. ****************** ****.*.*
53. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NC_049386 (Escherichia virus P2_2H1 genome assembly, chromosome: 1) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
catataatcaattttcttacc--cttttcagta CRISPR spacer cggataatcaattttcttaccgtctttccgg-- Protospacer *. ****************** ****.*.*
54. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NC_001895 (Enterobacteria phage P2, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
catataatcaattttcttacc--cttttcagta CRISPR spacer cggataatcaattttcttaccgtctttccgg-- Protospacer *. ****************** ****.*.*
55. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NC_049387 (Escherichia virus P2_4B2 genome assembly, chromosome: 1) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
catataatcaattttcttacc--cttttcagta CRISPR spacer cggataatcaattttcttaccgtctttccgg-- Protospacer *. ****************** ****.*.*
56. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to MT374855 (Yersinia phage vB_YpM_22, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
catataatcaattttcttacc--cttttcagta CRISPR spacer cggataatcaattttcttaccgtctttccgg-- Protospacer *. ****************** ****.*.*
57. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to AY251033 (Bacteriophage L-413C, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
catataatcaattttcttacc--cttttcagta CRISPR spacer cggataatcaattttcttaccgtctttccgg-- Protospacer *. ****************** ****.*.*
58. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NC_004745 (Yersinia phage L-413C, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
catataatcaattttcttacc--cttttcagta CRISPR spacer cggataatcaattttcttaccgtctttccgg-- Protospacer *. ****************** ****.*.*
59. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NC_049388 (Escherichia virus P2_4C9 genome assembly, chromosome: 1) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
catataatcaattttcttacc--cttttcagta CRISPR spacer cggataatcaattttcttaccgtctttccgg-- Protospacer *. ****************** ****.*.*
60. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NC_049385 (Escherichia virus P2_2H4 genome assembly, chromosome: 1) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
catataatcaattttcttacc--cttttcagta CRISPR spacer cggataatcaattttcttaccgtctttccgg-- Protospacer *. ****************** ****.*.*
61. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to KF322032 (Enterobacteria phage fiAA91-ss, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
catataatcaattttcttacc--cttttcagta CRISPR spacer cggataatcaattttcttaccgtctttccgg-- Protospacer *. ****************** ****.*.*
62. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NC_028943 (Escherichia phage pro483, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
catataatcaattttcttacc--cttttcagta CRISPR spacer cggataatcaattttcttaccgtctttccgg-- Protospacer *. ****************** ****.*.*
63. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to MT374858 (Yersinia phage vB_YpM_50, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
catataatcaattttcttacc--cttttcagta CRISPR spacer cggataatcaattttcttaccgtctttccgg-- Protospacer *. ****************** ****.*.*
64. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP025141 (Klebsiella pneumoniae strain KP1768 plasmid KP1768_p1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
catataatcaattttcttacc--cttttcagta CRISPR spacer cggataatcaattttcttaccgtctttccgg-- Protospacer *. ****************** ****.*.*
65. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP025144 (Klebsiella pneumoniae strain NR5632 plasmid NR5632_p1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
catataatcaattttcttacc--cttttcagta CRISPR spacer cggataatcaattttcttaccgtctttccgg-- Protospacer *. ****************** ****.*.*
66. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP025147 (Klebsiella pneumoniae strain KP1766 plasmid KP1766_p1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
catataatcaattttcttacc--cttttcagta CRISPR spacer cggataatcaattttcttaccgtctttccgg-- Protospacer *. ****************** ****.*.*
67. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP018956 (Escherichia coli strain Ecol_316 plasmid pEC316_KPC, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
catataatcaattttcttacc--cttttcagta CRISPR spacer cggataatcaattttcttaccgtctttccgg-- Protospacer *. ****************** ****.*.*
68. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NC_028896 (Escherichia phage pro147, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
catataatcaattttcttacc--cttttcagta CRISPR spacer cggataatcaattttcttaccgtctttccgg-- Protospacer *. ****************** ****.*.*
69. spacer 4.4|2024997|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013710 (Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_3, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.829
taata-atttcattcctggatctaatttttgtatta CRISPR spacer -aatatatttcattcctggatctactatttgaaaga Protospacer **** ****************** * **** * *
70. spacer 4.4|2024997|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014152 (Clostridium botulinum strain BrDura plasmid pRSJ20_1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.829
taata-atttcattcctggatctaatttttgtatta CRISPR spacer -aatatatttcattcctggatctactatttgaaaga Protospacer **** ****************** * **** * *
71. spacer 4.4|2024997|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NC_010418 (Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.829
taata-atttcattcctggatctaatttttgtatta CRISPR spacer -aatatatttcattcctggatctactatttgaaaga Protospacer **** ****************** * **** * *
72. spacer 4.4|2024997|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NC_012654 (Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.829
taata-atttcattcctggatctaatttttgtatta CRISPR spacer -aatatatttcattcctggatctactatttgaaaga Protospacer **** ****************** * **** * *
73. spacer 4.4|2024997|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP031095 (Clostridium botulinum strain CFSAN034200 plasmid p1_CDC51232, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.829
taata-atttcattcctggatctaatttttgtatta CRISPR spacer -aatatatttcattcctggatctactatttgaaaga Protospacer **** ****************** * **** * *
74. spacer 4.4|2024997|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NC_010379 (Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.829
taata-atttcattcctggatctaatttttgtatta CRISPR spacer -aatatatttcattcctggatctactatttgaaaga Protospacer **** ****************** * **** * *
75. spacer 4.4|2024997|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013684 (Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
taataatttcattcctggatctaatttttgtatta CRISPR spacer ctttcatttcatttctggatctaatttttgaattg Protospacer . * ********.**************** ***.
76. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to MK907239 (Escherichia phage vB_EcoM-12474V, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta CRISPR spacer cggataatcaattttcttaccgtttttccgg Protospacer *. ****************** ****. .
77. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to MK907238 (Escherichia phage vB_EcoM-12474IV, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta CRISPR spacer cggataatcaattttcttaccgtttttccgg Protospacer *. ****************** ****. .
78. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to MK907237 (Escherichia phage vB_EcoM-12474III, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta CRISPR spacer cggataatcaattttcttaccgtttttccgg Protospacer *. ****************** ****. .
79. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to MK907236 (Escherichia phage vB_EcoM-12474II, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta CRISPR spacer cggataatcaattttcttaccgtttttccgg Protospacer *. ****************** ****. .
80. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP039115 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-135 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta- CRISPR spacer ttaatcatcaattttgttaccctttt-gctac Protospacer . ** ********* ********** . **
81. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP039063 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-099 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta- CRISPR spacer ttaatcatcaattttgttaccctttt-gctac Protospacer . ** ********* ********** . **
82. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP013976 (Piscirickettsia salmonis strain CGR02 plasmid pPSCRG02-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta- CRISPR spacer ttaatcatcaattttgttaccctttt-gctac Protospacer . ** ********* ********** . **
83. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP013788 (Piscirickettsia salmonis strain PM58386B plasmid p2PS7, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta- CRISPR spacer ttaatcatcaattttgttaccctttt-gctac Protospacer . ** ********* ********** . **
84. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP039110 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-134 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta- CRISPR spacer ttaatcatcaattttgttaccctttt-gctac Protospacer . ** ********* ********** . **
85. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP039084 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-110 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta- CRISPR spacer ttaatcatcaattttgttaccctttt-gctac Protospacer . ** ********* ********** . **
86. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP039047 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta- CRISPR spacer ttaatcatcaattttgttaccctttt-gctac Protospacer . ** ********* ********** . **
87. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP038902 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006b plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta- CRISPR spacer ttaatcatcaattttgttaccctttt-gctac Protospacer . ** ********* ********** . **
88. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP013808 (Piscirickettsia salmonis strain PM31429B plasmid p2PS12, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta- CRISPR spacer ttaatcatcaattttgttaccctttt-gctac Protospacer . ** ********* ********** . **
89. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP048061 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8942B plasmid Ps8942B-p5, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta- CRISPR spacer ttaatcatcaattttgttaccctttt-gctac Protospacer . ** ********* ********** . **
90. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP013783 (Piscirickettsia salmonis strain PM49811B plasmid p2PS6, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta- CRISPR spacer ttaatcatcaattttgttaccctttt-gctac Protospacer . ** ********* ********** . **
91. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NC_028982 (Bacillus phage JL, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta CRISPR spacer aacacctacaatttccttaccctttttagta Protospacer *.*. ******.***********.****
92. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP039090 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-111 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta- CRISPR spacer ttaatcatcaattttgttaccctttt-gctac Protospacer . ** ********* ********** . **
93. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP038906 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-008 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta- CRISPR spacer ttaatcatcaattttgttaccctttt-gctac Protospacer . ** ********* ********** . **
94. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP038929 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-013 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta- CRISPR spacer ttaatcatcaattttgttaccctttt-gctac Protospacer . ** ********* ********** . **
95. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP039174 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-138 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta- CRISPR spacer ttaatcatcaattttgttaccctttt-gctac Protospacer . ** ********* ********** . **
96. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP012510 (Piscirickettsia salmonis strain PM32597B1 plasmid pPSB1-2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta- CRISPR spacer ttaatcatcaattttgttaccctttt-gctac Protospacer . ** ********* ********** . **
97. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP013823 (Piscirickettsia salmonis strain PM25344B plasmid p2PS14, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta- CRISPR spacer ttaatcatcaattttgttaccctttt-gctac Protospacer . ** ********* ********** . **
98. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP013803 (Piscirickettsia salmonis strain PM22180B plasmid p2PS13, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta- CRISPR spacer ttaatcatcaattttgttaccctttt-gctac Protospacer . ** ********* ********** . **
99. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP011852 (Piscirickettsia salmonis LF-89 = ATCC VR-1361 plasmid pPSLF89-3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta- CRISPR spacer ttaatcatcaattttgttaccctttt-gctac Protospacer . ** ********* ********** . **
100. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP039073 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-108 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta- CRISPR spacer ttaatcatcaattttgttaccctttt-gctac Protospacer . ** ********* ********** . **
101. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP039100 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-117 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta- CRISPR spacer ttaatcatcaattttgttaccctttt-gctac Protospacer . ** ********* ********** . **
102. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP039105 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-118 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta- CRISPR spacer ttaatcatcaattttgttaccctttt-gctac Protospacer . ** ********* ********** . **
103. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP039179 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-139 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta- CRISPR spacer ttaatcatcaattttgttaccctttt-gctac Protospacer . ** ********* ********** . **
104. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP039053 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-081 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta- CRISPR spacer ttaatcatcaattttgttaccctttt-gctac Protospacer . ** ********* ********** . **
105. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP013948 (Piscirickettsia salmonis strain PSCGR01 plasmid pPsCRG01-3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta- CRISPR spacer ttaatcatcaattttgttaccctttt-gctac Protospacer . ** ********* ********** . **
106. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP039058 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-098 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta- CRISPR spacer ttaatcatcaattttgttaccctttt-gctac Protospacer . ** ********* ********** . **
107. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP039079 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-109 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta- CRISPR spacer ttaatcatcaattttgttaccctttt-gctac Protospacer . ** ********* ********** . **
108. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP038921 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010b plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta- CRISPR spacer ttaatcatcaattttgttaccctttt-gctac Protospacer . ** ********* ********** . **
109. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP048054 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-11091B plasmid Ps11091B-p2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta- CRISPR spacer ttaatcatcaattttgttaccctttt-gctac Protospacer . ** ********* ********** . **
110. spacer 4.1|2024944|31|NZ_CP013850|PILER-CR matches to NZ_CP048054 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-11091B plasmid Ps11091B-p2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
catataatcaattttcttacccttttcagta- CRISPR spacer ttaatcatcaattttgttaccctttt-gctac Protospacer . ** ********* ********** . **
111. spacer 4.4|2024997|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013700 (Clostridium botulinum strain AM1195 plasmid pRSJ11_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
taataatttcattcctggatctaatttttgtatta CRISPR spacer ccttcatttcattcctggatttaatttttgaaaga Protospacer . * ***************.********* * *
112. spacer 4.4|2024997|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NC_025146 (Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
taataatttcattcctggatctaatttttgtatta CRISPR spacer ccttcatttcattcctggatttaatttttgaaaga Protospacer . * ***************.********* * *
113. spacer 7.16|2471655|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053952 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_798 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
tgattatgattctaaaaaacagattaaaagctatat CRISPR spacer aaattaaaattctaaaaaacagattaaaaaccacct Protospacer .**** .*********************.*.*. *
114. spacer 7.16|2471655|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053949 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_799 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
tgattatgattctaaaaaacagattaaaagctatat CRISPR spacer aaattaaaattctaaaaaacagattaaaaaccacct Protospacer .**** .*********************.*.*. *
115. spacer 7.5|2470935|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009118 (Borreliella valaisiana Tom4006 plasmid cp26, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
caagagatacaagctagaaaattggttcttataaa CRISPR spacer aagcttattaaagctagaaaatttgttattataaa Protospacer *. ** ************* *** *******
116. spacer 7.5|2470935|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009060 (Borreliella afzelii K78 plasmid cp26, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
caagagatacaagctagaaaattggttcttataaa CRISPR spacer aagcttattaaagctagaaaatttgttattataaa Protospacer *. ** ************* *** *******
117. spacer 7.5|2470935|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018750 (Borreliella garinii strain CIP 103362 isolate 20047 plasmid cp26, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
caagagatacaagctagaaaattggttcttataaa CRISPR spacer aagcttattaaagctagaaaatttgttattataaa Protospacer *. ** ************* *** *******
118. spacer 7.5|2470935|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NC_017725 (Borreliella garinii BgVir plasmid cp26, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
caagagatacaagctagaaaattggttcttataaa CRISPR spacer aagcttattaaagctagaaaatttgttattataaa Protospacer *. ** ************* *** *******
119. spacer 7.5|2470935|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NC_006128 (Borreliella bavariensis PBi plasmid cp26, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
caagagatacaagctagaaaattggttcttataaa CRISPR spacer aagcttattaaagctagaaaatttgttattataaa Protospacer *. ** ************* *** *******
120. spacer 7.5|2470935|35|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028867 (Borreliella garinii strain 20047 plasmid cp26, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
caagagatacaagctagaaaattggttcttataaa CRISPR spacer aagcttattaaagctagaaaatttgttattataaa Protospacer *. ** ************* *** *******
121. spacer 7.11|2471331|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013615 (Clostridium perfringens strain JP838 plasmid pJFP838A, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tgttaaagaacttgataaatatgtaataggtcaatg CRISPR spacer aaaaaaagagcttgataaatatgtaatagggcagga Protospacer . *****.******************** **. .
122. spacer 7.16|2471655|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040783 (Bacillus thuringiensis strain HM-311 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tgattatgattctaaaaaacagattaaaagctatat CRISPR spacer aaattaaaattctaaaaaacagattaaaaaccacca Protospacer .**** .*********************.*.*.
123. spacer 7.16|2471655|36|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050184 (Bacillus thuringiensis strain HER1410 plasmid pLUSID1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tgattatgattctaaaaaacagattaaaagctatat CRISPR spacer aaattaaaattctaaaaaacagattaaaaaccacca Protospacer .**** .*********************.*.*.
124. spacer 7.34|2471654|37|NZ_CP013850|CRT matches to NZ_CP053952 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_798 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
ttgattatgattctaaaaaacagattaaaagctatat CRISPR spacer caaattaaaattctaaaaaacagattaaaaaccacct Protospacer . .**** .*********************.*.*. *
125. spacer 7.34|2471654|37|NZ_CP013850|CRT matches to NZ_CP053949 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_799 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
ttgattatgattctaaaaaacagattaaaagctatat CRISPR spacer caaattaaaattctaaaaaacagattaaaaaccacct Protospacer . .**** .*********************.*.*. *
126. spacer 7.29|2471330|37|NZ_CP013850|CRT matches to NZ_CP013615 (Clostridium perfringens strain JP838 plasmid pJFP838A, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
ctgttaaagaacttgataaatatgtaataggtcaatg CRISPR spacer taaaaaaagagcttgataaatatgtaatagggcagga Protospacer . . *****.******************** **. .
127. spacer 7.34|2471654|37|NZ_CP013850|CRT matches to NZ_CP040783 (Bacillus thuringiensis strain HM-311 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
ttgattatgattctaaaaaacagattaaaagctatat CRISPR spacer caaattaaaattctaaaaaacagattaaaaaccacca Protospacer . .**** .*********************.*.*.
128. spacer 7.34|2471654|37|NZ_CP013850|CRT matches to NZ_CP050184 (Bacillus thuringiensis strain HER1410 plasmid pLUSID1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
ttgattatgattctaaaaaacagattaaaagctatat CRISPR spacer caaattaaaattctaaaaaacagattaaaaaccacca Protospacer . .**** .*********************.*.*.
129. spacer 6.1|2417770|40|NZ_CP013850|CRISPRCasFinder matches to NC_018689 (Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC429, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.725
ctcttagatctaaatgatg---taagtttaaatcctttaaata CRISPR spacer ---gataacctatgtaatgaactaagtttaaatcctttaaata Protospacer .*.*** .*.*** *********************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
575251 : 584667
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013850|575251:584667|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013850|575251:584667|579583_579733_-|WP_011948235.1|DBSCAN-SWA MSNLNSLELQNLPHLIGAHETIADKLNKIRVKQSIIIYIRKEEVFFTSL >NZ_CP013850|575251:584667|579217_579565_+|WP_003356906.1|DBSCAN-SWA MTPIEIMEKIGACQRGLTKGNIELKALGVKKARAEHDYRIALRKEILRLRQLENQPATIINDLAKGKEDIAKLRLERDIAETNYSVYIESMRNLRLEIEAYRSFLTWERVELKNT >NZ_CP013850|575251:584667|583662_584667_+|WP_011948238.1|DBSCAN-SWA MENKEKKSKNKKFSFKIFLYFIIFELFFTAATAPFIIFHGPFKNVKKTMVGAAMTTLKHQYIAKTFLSDAKIKEILGEDSIQTIKQDKNSVLKFENKHDSTIERYDISYGKKFKGYMLVVHDPSRVKVGYSSKLPVQGELTSQIARNKRAVAAINAGGFTDKSANSKWTGTGGNVEGVIISKGEVKYNSNKQGEFTGDVAAITKKGALVVGKHSIQELKDLNVQEAITFGPALVVKGQGTITSGDGGWGMAPRTAIGQREDGAILMLVIDGRQASSLGATLKDVQDIMLQYDAYTATNLDGGSSTTMYHEGEVINNPANSLGERSVPSILYVEP >NZ_CP013850|575251:584667|578127_578337_+|WP_024933258.1|DBSCAN-SWA MLKAKEKALPKGFNEARFLQNCMTILKDTKNIEKCNEVSVVRTMLKGVFLGLDFFNKECYAIPVYLNLF >NZ_CP013850|575251:584667|575251_577480_+|WP_024933259.1|DBSCAN-SWA MIIKKKLLLKGLHCANCATKIERAVQKLNIIEEANYNFNNSTLIINLEETHKDSIIKTIQEIVDRIEPGVKVVDKENLKRTVVHAPVKNSSNLKMQNNKEENLKLDKKENSYEHNHDHSHGHSHDGEDSDELEKKTLIRIISGVVLLILATVLKSKETLSIGLYLTSYVLIGGKVILSSIRNISKGQVFDENFLMAVATVAAIGVKQYPEAVAVMLFYEVGEFLQDKAVNKSRKSITALMNIRPDYANLVKGEDIEVVSPEDINIDDIIMVKPGEKIPLDGIVVEGQSSVDTSAITGESLISEVSKDSNVLSGYINKNGVIKIKVTKTFGESTVSKILELTENASATKANTEKFITKFARYYTPVVVFAALALAVIPTLILKDPDISKWIYRAAVFLVVSCPCALVISIPLSFFAGIGGASKKGVLIKTGTALEALNDADTIVFDKTGTLTKGVFKVSKIDSEEGVNTEELIEYAAYVESYSNHPIAKSILKYYEKTIDNKRIEGYEEIVARGVTAYIDGKKVYAGNNKLMEELNINYKKAQEDGVILYIALEDKYIGYIVINDEIKKDSKETIKSLKDIGIKKAAMLTGDRKSTANNIGTFLGMDEIYSELLPQEKVEKMQSLKSKTSKDGKIVFVGDGVNDAPVLAMSDIGVSMGGLGSDAAIEASDLVLMSDEPSKLVDAIKIARKTHKIVWQNIIIVLIIKFAVLALAVMGKSTMWMAVFADVGVALIAVINALRILK >NZ_CP013850|575251:584667|580250_581060_+|WP_011948236.1|DBSCAN-SWA MKISNIKEITLFEHHFWLQILGDHSRFILNSLSPKEKSFIEEANRFKNLFDNLLKKSKQSLSEEELFALNNHAYNAAMKIREFKLDIIDRQITDKIVISLPPTFINHMVNEVDEYIFILTKLMKGNVSNIGPIHLHLLWLPDGAGHASNIASSLDITEKELIKKSNQYSKKFNNLYLRTIEYNGYTRTGICDFPALDSLNNNADETMSCFKEFLNELKKGVIEKKILGTIVPLVPDHMFREECYYLTKLSMVSNIKKPECDPTKSRVES >NZ_CP013850|575251:584667|582018_583395_+|WP_011948237.1|DBSCAN-SWA MKLTYVLDTNVILYSPGAIFSFADNDVVIPEVVLEELDSFKKNNYDLGANARHAARIIDKLRKDGSLIDGIVLPGGGTLRVEMNHYDVKLPPSWDKNKPDNRIIQVCKGLKEKGEEVVLITKDTFERIKADTINIDVEDFYEKVVPEYESQYKGRCDAFASHSTLESFYKNKYMDVESLFFYSEEKNDYYKADININEFILIKSMENPKQTALGRYNGEKVVPLFYKDVKPLGISPRNIGQKFMLEAFLTDSKNAPLVIVKGPAGTAKTLFSLATGLHKVMEEGEDGYRKILICRPNVTMDEDIGFLPGTEEEKIMPFMRPIFDNLEILVDSDEKERYKNEKELYDKIKELFDRRIITTEAVAYLRGRSIVKNWVIIDEAQNLTPKQVKAVITRVGQGTKLILVGDPDQIDQPFLDSRSNGLCYASEKMKGSKLCYQVTLKDHECERSPLAYEGAKRL |
7 | Bacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
920596 : 932297
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013850|920596:932297|DBSCAN-SWA ATTAATTAGTAATATCTATATGCAATCTTATATTATAGTTATTTAATTCTGTAACTTCTACTTTTAATATATAAATTGCACCATTTAATAAACGTATTGACTTGGTACTATTTAAGAGATTTAAATTTTGTTGTATATTAATTAAATTATAGCCGTCAATAGTTTCAGTGACTCTAAATAAAGTACCTATTCCTTGGTTATAACTAGTATAAAGCCTAATGTTAGATGTATCTTTATTATTAAAGTTACCAGGTATTGTAAATTCATATGAAATATAGTCATGGACATCAGGGCTTTGTCTTGTATAGTAATGTGCACCTGTTGAATTAAGATTATCTATTATATTAACTGAAGAATTCATTAAATTTCGGAGATCCCCTTCTTCTCTCTTGAATTTTATTTGATTTTCTATATTAGAAGAAGTTTGTGGTACTCTAATGTAGTAATTTTTATCCTTATTAAGCAAAACAACTAAATAACTTTTAGCATTAGGACTGTCAAACCCAGTAATATAATTTATTGCTTTAATATCATCATCACATAAATTCCCAGATTGGAAATTTCTATTACCAGAACCTATCGCTTCATATATTTTTAATGATGGTAGATTATTTTGAGCATTAATTTTATAAATTCCTGTAGTATTTACTGTAAATAATATATAAAATGGATTATTATTTACAATACCCGGAATGTTATATGTGTAATTATCTGAAATAGCAGTATTTATTTCTTGTATATTTTCAGATGGGTCTATGACACCTACTACGATTTCTTCCTCGGGGCCATTCTGTATAAATCCATCTTCAGCCACTTGCGTTTTAACTACTTCAGATTCAGGTGAAGGAGCATTAGTTACTTCACAATATCCTAAGGAAGGAAGGTAATACTCAGCTTTATTAACAATACTTCCATTTTGATAGTCTATTAATTCATACTTTTCATAGGTATTATAAGCCTTTATGCATATATTTTTATTTGAAGGAGCTTCTTCTACAAATTTAAATAACGATGTTGATGTATTAAATAATTGTACATTGAAAGCGTCTTTAAGTCTTTCTTCAGTATATTGTTGTGAGAATTTTGCATCATTACTTGTGGTGAATAATGGCCTAGTTGTATTTCTTAATCGAGGTTGTATAATACTTCCTGATGAACCTGCTTCGATTAATAATGTACCTATCAAATCTTTATCATTTGTTCTTATATATCCATCACCCTTATTAATAACATATAGTCCATTACTATAAGGCAATACTCGTTGTGTGCTACTAACTTTAGAATTAAAAATATTGTTAGTTGGTATATTTTTAGTAGTTTCTAAAATTTTTTTATATAGGAATTGTTCATTTAAAATGCACTTATCATTAGTTAAAAAGTAAAAATCTTTATTTATTTTTTCCCCTGGATTAAATTCTATAGACTTAACATATCCAAGAGATGGAACATATAAAACTGCTCTTTCTATAATTTCATGTTGCAAGACTTTTATTATTTCATATCTAATGTAGGTATATTGTAAATACATATATAAGTTTTTATTTGAGGGAGCGGTTTTACTAAATTCAAATCCTATTGGAATTTGATTAGCTTCAGTAAAGTTAGCAAATACAGTTTGTATATTATTTTTTATATATTCTTCATTGAAGGATGGTGTTGGATAATAATATGGTATCGCATTATCATTTACACGTAGGTCCCCAACTATTCCTGTTGATCCATTACTAATTACACTTCCACCTAGTATTTGATTTTGTCTAGATAATATCCATCCATCCCCTCTGCTAACTACATAATTACCATCAGCTAAATCAATAGTATCACTATAGTTTATAACTTTTTCTTGTATATGATTATAAATTTTTTTTATAGATGAATTCATACACTTTTCTCCTTTATATTTTTTCAAGTTTGAACATTTGATTTGAATTGTATATATCAAAATTAGGTAGTAGGAGTAGTGGCTGACTTAAAATATTTTCATTAGTATCATAAATGTCCCAGGCATAATCTAATTCATTCACTTTATTTAAACTTAACATAATATAAGTATTTACAGCGATTTTAATAGGAAACCAGTAGCATCTATTGGATAATGAATCTAAAGAAATAAATCCAAAGTTATCGTAACTTAAATACTTATTTGGTTCTGCTACATTAGAGATTTTAAAGCATCTATTTTCAGCCATATATTCTACATTCCATTTTTGATTATTTGCAGAAGATTCATTTGAAAATGTTAATGATTTCGATACAGGATTTAAATATAAAGAATCAGAAAAGATAGATTTTATATTGTAATTACCATTAGGTAGAAAAGTTCTTTCAACTGACATATAATTCACCTCTTTATAAATTAGATGATAGTACTCATATTGAGTCTTTGTTGATATTAATTTTATAGGTCACTCATAGTCCATATCTGATTATTACCTCCATTAGAATTAAATACTTGAATAGCAGTTCCGTCTGCTGTTTGGCCGTCATATAAATCTAGAACTTTAGTTTTATCGCGTAGATTAGTAATTGTATATCTGTCATAATTATCTGAAACAGGATTTATAAGCCAATATTGGGCATCATTATTTTGCGCACTAGAAGAAACTCTTACAGTATTACCATCTGAAAAAATCCATGTTAGAACTCCGTTTGAAAGTATTGTATTAAAAAACTGGTATGCTGCTTTTTCTTCATTATATATAATTGTCCATTTTTGATTGCGATCATTGTTCCAAGTATATAAATTAACAGCTAGATTTGTCACAGACACTTGTTGTACAACTTTATTAGCAGCTAATATTGGACTTATTTTACATGTGAAATTGTTAAGATCTGATATTATATAATCTTCTATGATAAATTTTATATAACTTGAATTATTAAGTGTGCTAAGTTTCAAATTATGAGCTACGGTATCGGCATATAATACTAAGTTAGGGTTTTTATAACTTGCAATAATAAATGAATTGTTACCAATGTCTTTTAATAATAACCAATATTGATTATCTGCATTTGAATCTTGTTGCGCTGATATATTATGTGTTGGTGCATTCCATGTTAAAACTAAATTAGTATTATGGATATTCATACTTTTTATTTTATAAGCAGCTTTATTAGAATCATATATAAGTCTCCATCTTTCAAGGTAATTTCTAGTTTGTAGAAATAAGCTAACGTTACTGGTACCGGCAGCTTGATAAAAAAATAAATTAGTATCGGCCTTACAGGAGATGGTAACGATTTTGTCATTTAATGAATTTTGGATTATTGAATGGTGTTCCATTATGATTCCTCCTTTATTTAATAATTAATCTTACATATAACATATAACATAATCAAATTATTTTTTGTAAACCTAAAATTTAAATATATCAAATTTTTATTAGTATGTTTACATAATTGATTATGGATATTTCGTAAAAATGGCTTATTAAAAATTTAAAGTCAATTAGTCCATTTATAGTATAATAAAACAATAATATGTATATTATGGAAGGATAGTGGTGAATATGAATAAGTTGTTTTTACAAATTAAAATGTTAAAAAATGACAATAGGGAGTTTCAAGAAATTTTTAAGCATTTTGAAAAAACTATAAATATATTTACTAGAAAATATAATATATATGATAATTACAATGATATTTTGTACCATTTATGGTATACACTTAAAAAAGTTGATTTGAGCAATTTCAATACACAAAATGATTTAGAGAGATATATTAGTAGGACTTTAAAAAGATATTGCTTAGATATTTGCAATAAAAGAAAGATTGATAAGAAAATAATATATAATTCAGAAATTGTAGATAAGAAATTAAGCTTAATAGCAAATAGTTATTCAAGTTATTCAGAATTTGAATTTAATGATTTAATATCCATATTACCTGATGATCAAAAGAAAATTATATATATGAAATTTGTTGAAGATATTAAGGAGATAGATATAGCTAAAAAACTTAATATAAGTCGTCAATCTGTATATAAAAATAAAATACTGGCTTTAGAGAGATTAGAACCCATATTGAAAAAATTAATTAATATGTAGTTTATATTTTTTAAAAATTTTAGGTTTACAAAAAATAGTGTGGCTATGTTATATATAAATGATAACAATATACTGAAAAATATATCCAAAATTTAAGGGGGCGTGTATAGTAAATAATTAAAAGTATGTGCGTTGAAATAAATTTAGGAGAGTGGTTAGATATGAATATAAATGACAACTTAAGTATAAATTCCCCGGTAGATAATAAAAATGTTGTAGTAGTTAGAGCTAGAAAAACTGATACGTTTTTTAAGGCTTTTAAGGTTGCTCCTAATATTTGGGTGGCGCCAGAGAGATATTATGGCGAATCTTTGAGTATAGATGAAGAATATAAAGTTGATGGGGGAATATATGATTCTAATTTTCTTTCACAAGATAGTGAAAAAGATAAGTTTTTACAAGCTATTATTACTTTGTTAAAAAGAATTAATAGTACTAACGCCGGGGAAAAATTATTATCCTTGATTTCTACAGCTATTCCATTTCCTTATGGATATATAGGTGGAGGGTATTATGCACCTAATATGATTACTTTTGGATCAGCACCAAAATCTAATAAAAAATTGAATTCTTTAATTTCAAGTACTATTCCATTTCCTTATGCAGGATATAGAGAAACAAATTATCTTTCATCTGAAGATAATAAAAGTTTCTATGCATCTAATATAGTTATTTTTGGTCCAGGAGCAAACATAGTAGAAAACAATACTGTTTTTTATAAAAAGGAAGATGCAGAAAATGGTATGGGAACAATGACTGAAATATGGTTCCAACCATTTCTAACCTATAAATATGACCAATTTTATATTGATCCTGCAATAGAATTAATGAAATGTTTAATAAAATCTCTTTATTTCTTATATGGGATAAAACCAAGTGATGATTTAGTTGTTCCATATAGATTAAGAAATGAATTAGAGAATATAGAATACTCACAGTTGGATATAGTTGATT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013850|920596:932297|924104_924641_+|WP_085320479.1|DBSCAN-SWA MNKLFLQIKMLKNDNREFQEIFKHFEKTINIFTRKYNIYDNYNDILYHLWYTLKKVDLSNFNTQNDLERYISRTLKRYCLDICNKRKIDKKIIYNSEIVDKKLSLIANSYSSYSEFEFNDLISILPDDQKKIIYMKFVEDIKEIDIAKKLNISRQSVYKNKILALERLEPILKKLINM >NZ_CP013850|920596:932297|924802_928396_+|WP_085320605.1|DBSCAN-SWA MNINDNLSINSPVDNKNVVVVRARKTDTFFKAFKVAPNIWVAPERYYGESLSIDEEYKVDGGIYDSNFLSQDSEKDKFLQAIITLLKRINSTNAGEKLLSLISTAIPFPYGYIGGGYYAPNMITFGSAPKSNKKLNSLISSTIPFPYAGYRETNYLSSEDNKSFYASNIVIFGPGANIVENNTVFYKKEDAENGMGTMTEIWFQPFLTYKYDQFYIDPAIELMKCLIKSLYFLYGIKPSDDLVVPYRLRNELENIEYSQLDIVDLLVSGGIDPKFINTDPYWFIDNYFSNAKKMFEDHRNIYETEIEGNNAIGNDIKLRLKQKFRININDIWELNLNYFSKEFNIMMPDRFNNALKHFYRKQYYKIDYPENYSINGFVNGQINAQLSLSDRNQDIINKPEEIINLLNENNVLLMRSNIYGDGLKSTVDDFYSNYKIPYNRAYEYHFNNSNDSSLDNVNVGVIDNIPEIIDVNPYRKNCDPFTPVYNITETKEINTTIPFSVNYLQAQNANNEKFSLSSDFVEVVSSKDKSLAYSFLSNVMFYLDSIKDNSPIDTDKEYYLWLREIFRNYSFDITATQEINTNCGINKVVTWFGKALNILNTSDSFVEEFQNLGPISLINKKENLSMPIIEIYEIPNDMLGLPLNDLNEKLFNIYLKNILYFKKVYFNFLDQWWTEYYSQYFDLICMAKQSILAQEKLIKQIIQNKLQDLSKADISMDKLNLMNLATEKTFIDLSNESQIAINNINDFLNKSAICVFDTNIYPKFISFMEQCINSVNSNVTAFIQKCTNITEDEKLQLIKLNTFMNIDFEFFDIQSIKDLITSETDLIKEEKESDYNLFLFTLQEDNNKVIEDISGKNTLVKYSDSISLVYGVNGDALYLKEPDESVSFSNKAFENGLTNSFSICFWLRNLGEDIITSKLIENKADNCGWEIYFQNNGLVFSIVDCNGNEENIYLSDVISKNWYYISISIDRLRNQLLIFINDKLIANQSIEQILNIYSSNTISLVNGNNPIYVEGLSILNRSITSEEVVNNYFSYLNNSYIRDISGERLEYNKTYELYNYVFPENSLYEVTENNNIYLSIKDTNNLNIQGAKFKLINIDTNKQYVQKWDEGVVYLLGDEEKYVDISSENNRIQLVSSKDTAKRIIFNNDIFRPNCLTFAYNNKYLSLSFRDRNYNWMICNNNDNIPKAAHLWALKGI >NZ_CP013850|920596:932297|922490_922931_-|WP_085320477.1|DBSCAN-SWA MSVERTFLPNGNYNIKSIFSDSLYLNPVSKSLTFSNESSANNQKWNVEYMAENRCFKISNVAEPNKYLSYDNFGFISLDSLSNRCYWFPIKIAVNTYIMLSLNKVNELDYAWDIYDTNENILSQPLLLLPNFDIYNSNQMFKLEKI >NZ_CP013850|920596:932297|922993_923878_-|WP_085320478.1|DBSCAN-SWA MEHHSIIQNSLNDKIVTISCKADTNLFFYQAAGTSNVSLFLQTRNYLERWRLIYDSNKAAYKIKSMNIHNTNLVLTWNAPTHNISAQQDSNADNQYWLLLKDIGNNSFIIASYKNPNLVLYADTVAHNLKLSTLNNSSYIKFIIEDYIISDLNNFTCKISPILAANKVVQQVSVTNLAVNLYTWNNDRNQKWTIIYNEEKAAYQFFNTILSNGVLTWIFSDGNTVRVSSSAQNNDAQYWLINPVSDNYDRYTITNLRDKTKVLDLYDGQTADGTAIQVFNSNGGNNQIWTMSDL >NZ_CP013850|920596:932297|928421_932297_+|WP_085320480.1|DBSCAN-SWA MPVTINNFNYNDPIDNNNIIMMEPPFARGTGRYYKAFKITDRIWIIPERYTFGYKPEDFNKSSGIFNRDVCEYYDPDYLNTNDKKNIFLQTMIKLFNRIKSKPLGEKLLEMIINGIPYLGDRRVLLEEFNTNIASVTVNKLISNPGEVERKKGIFANLIIFGPGPVLNENETIDIGIQNHFASREGFGGIMQMKFCPEYVSVFNNVQENKGASIFNRRGYFSDPALILMHELIHVLHGLYGIKVDDLPIVPNEKKFFMQSTDAIQAEELYTFGGQDPSIITPSTDKSIYDKVLQNFRGIVDRLNKVLVCISDPNININIYKNKFKDKYKFVEDSEGKYSIDVESFDKLYKSLMFGFTETNIAENYKIKTRASYFSDSLPPVKIKNLLDNEIYTIEEGFNISDKNMEKEYRGQNKAINKQAYEEISKEHLAVYKIQMCKSVRAPGICIDVDNEDLFFIADKNSFSDDLSKNERIKYDTQRNYIENRSSIDELILDTNLISKIELPSENTESLTDFNVDVPVYEKQPAIKKIFTDENTIFQYLYSQTFPLDIRDISLTSSFDDALLFSNKVYSFFSMDYIKTANKVVEAGLFAGWVKQIVDDFVIEANKSSTMDKIADISLIVPYIGLALNVGNETAKGNFENAFEIAGASILLEFIPELLIPVVGAFLLESYIDNKNKIIKTIDNALTKRYEKWIDMYGLIVAQWLSTVNTQFYTIKEGMYKALNYQAQALEEIIKYKYNIYSEKEKSNINIDFNDINSKLNEGINQAIDNINNFINECSVSYLMKKMIPLAVEKLLDFDNTLKKNLLNYIDENKLYLIGSAEYEKSKVDKHLKTIIPFDLSMYTNNTILIEIFNKYNSEILNNIILNLRYRDNNLIDLSGYGANVEVYDEVELNDKNQFKLTSSTNSEIRVTQNQNIIFNSMFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCIKNNSGWKISIRGNRIIWTLTDINGKTKSVFFEYSIREDISDYINRWFFVTITNNSDNAKIYINGKLESNIDIKDIGEVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIKEIYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSSVGEILTRSKYNQNSNYINYRNLYIGEKFIIRRKSNSQSINDDIVRKEDYIYLDFFNSNREWRVYAYKDFKEEEKKLFLANIYDSNEFYKTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVLKDYKNYFCISKWYLKEVKRKPYNPNLGCNWQFIPKDEGWIE >NZ_CP013850|920596:932297|920596_922477_-|WP_085320476.1|DBSCAN-SWA MNSSIKKIYNHIQEKVINYSDTIDLADGNYVVSRGDGWILSRQNQILGGSVISNGSTGIVGDLRVNDNAIPYYYPTPSFNEEYIKNNIQTVFANFTEANQIPIGFEFSKTAPSNKNLYMYLQYTYIRYEIIKVLQHEIIERAVLYVPSLGYVKSIEFNPGEKINKDFYFLTNDKCILNEQFLYKKILETTKNIPTNNIFNSKVSSTQRVLPYSNGLYVINKGDGYIRTNDKDLIGTLLIEAGSSGSIIQPRLRNTTRPLFTTSNDAKFSQQYTEERLKDAFNVQLFNTSTSLFKFVEEAPSNKNICIKAYNTYEKYELIDYQNGSIVNKAEYYLPSLGYCEVTNAPSPESEVVKTQVAEDGFIQNGPEEEIVVGVIDPSENIQEINTAISDNYTYNIPGIVNNNPFYILFTVNTTGIYKINAQNNLPSLKIYEAIGSGNRNFQSGNLCDDDIKAINYITGFDSPNAKSYLVVLLNKDKNYYIRVPQTSSNIENQIKFKREEGDLRNLMNSSVNIIDNLNSTGAHYYTRQSPDVHDYISYEFTIPGNFNNKDTSNIRLYTSYNQGIGTLFRVTETIDGYNLINIQQNLNLLNSTKSIRLLNGAIYILKVEVTELNNYNIRLHIDITN |
6 | Clostridium_botulinum_D_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1612423 : 1689442
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP013850|1612423:1689442|DBSCAN-SWA 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110 | Clostridium_phage(47.73%) | portal,tRNA,capsid,terminase,head,tail,integrase,protease | attL 1609377:1609394|attR 1635100:1635117 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1848278 : 1895665
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP013850|1848278:1895665|DBSCAN-SWA 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65 | Clostridium_phage(60.0%) | holin,integrase,capsid,tail,portal | attL 1865349:1865366|attR 1890187:1890204 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2435459 : 2512268
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP013850|2435459:2512268|DBSCAN-SWA 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83 | Clostridium_phage(68.63%) | plate,coat,holin,integrase,tRNA,capsid,terminase,head,tail,portal | attL 2434393:2434410|attR 2516941:2516958 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2622255 : 2629321
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP013850|2622255:2629321|DBSCAN-SWA CTTATTTTACATATTGAGCTATATGATATACACTTTTTTCTAATTTCTCATCTACTTTGTGTGCCTCATCTATATGCTTTATAATTTGCTCATTGGTTTCAGTAAGAATTTTATCTACTCCATTTATTCCGTTAAAAATTTTACTTATATCTTCTTTTTGAGTATTAATTGTTTTTATTAGGCTATCAGTGTCATCTTCAACTCTGTTAAATGAATCTAGAACTTCTTCTATTTTTTCAAGGGCTCCTTTAGAGGATTTTACTCCTTCTGTAACTACTAATGTACTCTTTTCAACACTATTTAAAACATTTTCAGTTTGTGAGTCTATGCCACTAATTAAATTAGTTATATTACTACTACTCTCTCCCGTCATTTCTGCCAATTTTCTAACTTCATCAGCAACTACTGCAAAGCCTTTGCCTTGTTCCCCTGCACGGGCTGCTTCTATGGCAGCATTAAGAGCAAGAAGATTTGTTTTTGAGGCTATTCCACTTATTAATTGAGCAATTTCTCCAATCTCCTTTAGTTTTTCGCCCAAAGCATTAATATTCTCGTATGTATCCTTTGTTTCTATGTCAAGATTTTCAATTACTTTAACCATACCCTCAATTGACTTTTTACCTTCTAAGGATTTATTTACAGTATCTTTTGTAATCTCTAACAGACTTTCTCCTTGACTAAAAAGCTTATCTGTTGATTCATTAGTCCTTTCAGTTAAATTTGATACTGTTACCATATGATTTTCAATCTGTTTTGCTAATTTTTCAAGCACTTCATGTTCACCATTAACTTTATTATGCTGCTGTATTATACCCTCTATCTGTATAGTCATTTCTTTTAGAAATTTCATAGTATCTATAGTTTCAACTTCATGTTTTTCTTCAACAATAACTTCCTGCTCAATAGTATCATTTTTATTATCCTTTTCACTATCTTTTTTACTAAAAATATTTATCATAGTATAATCCTCCTAATATTTCATACTTCTAATATTAAATTATCGACAAAATTTACAAAAACTAAATACGAAATATAAAAAGGAGGTATTGCTCAAGCAACACATATAAAATTACTATTTTAAATACTCTTTTTCAAACTCCCAATATCCCTTTTTTCTTAATTTACAAGCTGGACATTCCCCACATCCATCTGCTTTTATTCCATTGTAGCATGTTAAGGTTTCTTCTTTAACGATATCAAGAACTCCTAAATCATAAGCCATTTTCCACGTTTCTGCTTTATTAATCCACATTAGTGGTGTAATTATTTCAAATTCATAATCCATAGCTAAATTTAATGTAACATTTAAAGATTTTATAAATACATCTCTACAATCTGGATATCCACTAAAATCACTCTGTGACACACCAGTTATAATAGTGTTTATTCCTTTTTGTTTTGCAAATACTGCGACAAAGCTTAAAAACAATAGATTTCTTCCATCTACAAAGGAATTAGGCACCCCTTCTTTAGGTGCGCTTTTATCAACAGTTATATCCTGCCTAGTTAGTGAATTTGGTGCTAATTGATTTAACAAATTTAAATCTAAAATATGATGTTCAATATTATATTTTTTACATATATCCTTTGCACAGTCTAACTCTAATTTATGTTTTTGATTATAATCAAAGGATACTGCTATAACTTCTTTATATTTTTTCTTTGCCCAAAACAAACAGGTTGTACTATCTTGTCCACCACTAAATACTACTATTGCTTTTTCCTTATTCATCTACTACACATCCCTTTATTATTTTATTATCATCCTACAATCTACAAAAATCTTTGTTATAGTTATGCTTCTTTAATACACTCTCTTTGTATAAACTGTTCTACTCATGTGTAAGATTTTTTAATCTTGTACGAATTTAATATATTTATTTTAATAAAACTCTAACTAGAACTAAAAATTTCTTTATTTCGTATAAAGCATCATTAATTTATTGCTTACAATAGGATCTGTGTTAAACTTTCCTCTTAATGTAGTTGTTATAGTTTTAGTACCTGGCTTCTTTATTCCTCTAGTAGTCATACAGCCATGTTCTCCTTCTATAATAACAGCTACATCTTCTGAGTCAGTTATCTTCTGAAGTATTTCTGCTATATCACTTCCAATCCTCTCTTGAAGCTGTAGTCTACGTCCTACCATATCTGCTATTCGTGCTATTTTGCTTAAACCAATAATTTTTTTCTTAGGTATATATGCTATGGCTACTTTCATATTGTACATAAGTGCTAAATGATGTTCACAATGACTAAATATTTCTATTTCCTTCATAAAAACCATGTCATTTTCATTATCATTTATACATAAATCATCTTCAAAGGTTACATTAAACATTTCTGCAATTTCATCATTGCTATAACACATACCTTTGAATACTTCTTCATACATTTTAGCTACACGTTTTGGTGTGTTCTTTAGACCTTCTCTTTCTGGGTTGTCTCCTAAAGCTATCAAAATTCCCCTTATGTGTTCTTCAATTGCTTTAACATCAATTGCCATATGCTATACTCCTCTCTTACTAGGCTCCCATATAATCTTGTGAAGCTGCAGTTGTAAATTAACTCCATTCATTCTATTATTTTTCATAAATTCTACAATAGTATCTAAATTAATTTTTCCAAAAACAGGACTTATATACACATTAGTTTTATCTACTAAGTTATACTTATTTATTATTTCTCTAGCTTTTTCTAAATCCTCTATACTACCTGATACAAATTTTACTGTATCCTTCTTAGTTAAATATTTAAAGTTATCTAATGCCATTTTATTTTCCATATTGCTTAAAGGAAGTTTATAATCCATAGTAAAGCTTGGTGAATTTTCTATATTCAAAAATTCATCTAATAATATGCTGCCATTTGTCTCAATTTCCACATAAAGCTCTTTATCCTTAGACAAAAGTTTTAATAACTCCATTATTCCCTTTTGCAAAAGAGGTTCTCCTCCTGTTAAAGTTACATTTTTAACCTCTTTGGACTTAATATATTCATATATATCTTTGGAACTTAATACTTCATAGGGTACATCCTTTTCATTTGCCCAAAGTGTATCACAATAGCTACAGTTTAAATTACAACCCGCGAATCTTATGAATATAGCCAGTTGTCCACAACGCCTTCCTTCTCCATTTATGCTTACAAACCTTTCAACCACCTTAAAATCCATTCTAAATTACCCCACTTTCTTCATAGGTAGCACTATTATTAGGTGTTTCATAAACTGTAGTACTTTTTACATTATATCCTCTATCCTTCATAATTTTATAGAGAAAAGCTGCAAAATTTTCCGCTGTTGGTCTAAAATTAACTTCTATTATACGAAATCCATCCTCCTTTAATGAGCTTAATGATTGCCCCCTCATAGTTCCTTTCTCTATTATAAGTGCATGATCATAATAATCTACCATAGATTTAACATCTTTTTTTAAGTCTCCAAAGTCTATTATCATCCCGTCAAGTTGACCGCCTTGTACTAATGATTCTGCCTGAACCTGAATTTCAACCTTCCATCTGTGTCCATGAATATTTCCACATTTACCTTCATAACCTGCAAGAAAATGAGCACTATCAAAATTATGTTCTACTTTTAAAGTATACATGTTTTTTCCTCCTAAGTTTATTTTAAAAATTTGCTTCCGTAATAGCAACATCCAATAGCCCCATTAAACTGAGGATCTTTTACGGATACTATTTCTTCATAATCATTATTTAAATATTTTTTTATTGAATGGTTATTTGCAACACCACCGGTTATAACTAATTTCTTCCCCCTAAACTTACTTAAAAGAGGTTGTAGCCTTTTATACAAAGAGTAATTAACCCCAGCACATAACCTTTCTATGTGTACCCCTTCGGCTATTTTTCCAATTAATTCTGATTCAGAAAATACTGCACAGGTGGAATTTAAATCCACGGGATTTTCCGAGTACTGACTCATTTCATCTAGGGATATTTCAAGTACATTTGCCATATTTTCCAAGTATCTTCCACAGGAAGCAGCACATTTTTCATTAAGCTCCAAATCTGTTGCAACACCCTTTTCTACCTTTACCACCTTAACGTCCTGACCACCTACATCTAAAAGTATAAAATCCTTTAAATTACTTTGATAGATCCCACCATAAACATGGGCTTTTATCTCATTTATAGGTGTAAAAAATTCTAAATCCGTATTATTTTTTCCATAACCCGTTGATATCGCTTTATCTATTCCTTCTATATTAAGTTTTTCTAAATCTACTACAATCTTGCCATGAAAGCTACAGTAATCTCTATAAAATTTCATGGTACTTACTTTTTTCTTTTGAACTATAATATTGTTTTCCATTAAAACAATCTTAACTTCTCTACTTCCAAGGTCTATTCCTAACAATCTCATTAATTCCCCTCCTTCGCTAAATATAAAGAAAACATGAACTTCTTTTATATACCGTCTATTACTTTTGCTTTAAATCCAACAATATATTAAGATAAAAATTCTTACTAGATCACCTATTACTTCTGCTTTAAGTCCAGCAACATATCCAGAAAGGCTTCTAATCTTAGTTTAGTTCTTGCATCTAATGTATTTAACTTATCACCTTCAATATTTAATATAGGAATATTTAATTCTTCTTTTAATACTATATCTTCAACAGCTCTATGGCAAAAAGCCTGAGTGTAGTGAATTATAGCATCTATCTTTCTCTTTTCTATTTGCTTTTTCAACTCCTTAATTCTAAACTCATTATCATAAGGATAGGTGTAATTATAATACTGTTCAAATATATTTGCAGCTTCTATCCCCCTAGGAAAAGCAAATTCTCTTTGAACTTCGTTATATACAAAATGAGCATTTAATTTTTCACTAAACTCATATATATCTCCAATCATTGGAGGAACTCCTATATAGCCTAATCTTAATTTTTTATTTATTGGCTCTCTTTTCTCCATACCCTCAATGACTTTTTTAAGGTGTTCTTCAAATTCATCTATGTTTCCATTAAAGTCAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP013850|2622255:2629321|2623326_2623986_-|WP_011949102.1|DBSCAN-SWA MNKEKAIVVFSGGQDSTTCLFWAKKKYKEVIAVSFDYNQKHKLELDCAKDICKKYNIEHHILDLNLLNQLAPNSLTRQDITVDKSAPKEGVPNSFVDGRNLLFLSFVAVFAKQKGINTIITGVSQSDFSGYPDCRDVFIKSLNVTLNLAMDYEFEIITPLMWINKAETWKMAYDLGVLDIVKEETLTCYNGIKADGCGECPACKLRKKGYWEFEKEYLK >NZ_CP013850|2622255:2629321|2624169_2624760_-|WP_004451708.1|DBSCAN-SWA MAIDVKAIEEHIRGILIALGDNPEREGLKNTPKRVAKMYEEVFKGMCYSNDEIAEMFNVTFEDDLCINDNENDMVFMKEIEIFSHCEHHLALMYNMKVAIAYIPKKKIIGLSKIARIADMVGRRLQLQERIGSDIAEILQKITDSEDVAVIIEGEHGCMTTRGIKKPGTKTITTTLRGKFNTDPIVSNKLMMLYTK >NZ_CP013850|2622255:2629321|2622255_2623212_-|WP_011986260.1|DBSCAN-SWA MINIFSKKDSEKDNKNDTIEQEVIVEEKHEVETIDTMKFLKEMTIQIEGIIQQHNKVNGEHEVLEKLAKQIENHMVTVSNLTERTNESTDKLFSQGESLLEITKDTVNKSLEGKKSIEGMVKVIENLDIETKDTYENINALGEKLKEIGEIAQLISGIASKTNLLALNAAIEAARAGEQGKGFAVVADEVRKLAEMTGESSSNITNLISGIDSQTENVLNSVEKSTLVVTEGVKSSKGALEKIEEVLDSFNRVEDDTDSLIKTINTQKEDISKIFNGINGVDKILTETNEQIIKHIDEAHKVDEKLEKSVYHIAQYVK >NZ_CP013850|2622255:2629321|2625879_2626641_-|WP_003358645.1|DBSCAN-SWA MRLLGIDLGSREVKIVLMENNIIVQKKKVSTMKFYRDYCSFHGKIVVDLEKLNIEGIDKAISTGYGKNNTDLEFFTPINEIKAHVYGGIYQSNLKDFILLDVGGQDVKVVKVEKGVATDLELNEKCAASCGRYLENMANVLEISLDEMSQYSENPVDLNSTCAVFSESELIGKIAEGVHIERLCAGVNYSLYKRLQPLLSKFRGKKLVITGGVANNHSIKKYLNNDYEEIVSVKDPQFNGAIGCCYYGSKFLK >NZ_CP013850|2622255:2629321|2626757_2627753_-|WP_061320494.1|DBSCAN-SWA MKKIGLTTTVPVEVIVAAGYKPVDLNNMFITSENYLKYIDIAERDGFPKSLCAWIKGIYGACLENNIKEIVGVMEGDCSNTKALIEVFKLRGIKIYPFSFPHSHSLKDVEIEIRKFMDIFNVNEDKVEQVRKRLNRVRKLAKKIDEMTYIDNKVNGFENHLYQVSLSDFNGNIDEFEEHLKKVIEGMEKREPINKKLRLGYIGVPPMIGDIYEFSEKLNAHFVYNEVQREFAFPRGIEAANIFEQYYNYTYPYDNEFRIKELKKQIEKRKIDAIIHYTQAFCHRAVEDIVLKEELNIPILNIEGDKLNTLDARTKLRLEAFLDMLLDLKQK >NZ_CP013850|2622255:2629321|2624763_2625429_-|WP_011949101.1|DBSCAN-SWA MDFKVVERFVSINGEGRRCGQLAIFIRFAGCNLNCSYCDTLWANEKDVPYEVLSSKDIYEYIKSKEVKNVTLTGGEPLLQKGIMELLKLLSKDKELYVEIETNGSILLDEFLNIENSPSFTMDYKLPLSNMENKMALDNFKYLTKKDTVKFVSGSIEDLEKAREIINKYNLVDKTNVYISPVFGKINLDTIVEFMKNNRMNGVNLQLQLHKIIWEPSKRGV >NZ_CP013850|2622255:2629321|2625430_2625862_-|WP_085280233.1|DBSCAN-SWA MYTLKVEHNFDSAHFLAGYEGKCGNIHGHRWKVEIQVQAESLVQGGQLDGMIIDFGDLKKDVKSMVDYYDHALIIEKGTMRGQSLSSLKEDGFRIIEVNFRPTAENFAAFLYKIMKDRGYNVKSTTVYETPNNSATYEESGVI >NZ_CP013850|2622255:2629321|2628376_2629321_+|WP_011949098.1|DBSCAN-SWA MKINRLLAIVVMLLNREKISASELAEKFEVSVRTIYRDIEAINLAGIPIVSQIGNNGGFYIIDNYKINHQLLTLEDMISIIEALKNMNKFLDNKNVEMAIEKVKNIVPKEKKEVFDLHFEQMCIDTLPWGFKKCEEENLKYKIIYDAVDNKNCIAFDYRNSKGEYNWREIEPLTLVFKGFSWYLFSFCKLKNDYRLFKLSRMENLTVPHEKINENRISYKEYINISESEQVPTRVVLKFSERVRYRIDDCFDKDEIKFQEDGSVIVDTYLLEDDWIYSMILSYGECVEVLEPNHIREIIKDKCKKINDIYSNMT |
8 | uncultured_Caudovirales_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2736717 : 2752742
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP013850|2736717:2752742|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP013850|2736717:2752742|2746227_2746437_-|WP_021106485.1|DBSCAN-SWA MGEFELREWEKSQLIAKYEELKMEHEGIKRQLDEANDLIDQLHKVKSQCFEKMQCIRKILLEKYNYPVV >NZ_CP013850|2736717:2752742|2739549_2739981_-|WP_085321126.1|DBSCAN-SWA MANIYFSTLDRKQLYELPILPEEMPELSKSSKNEIFETFNNGEYNFLGEVSLISFSLESWLPAYPNKYRWAKSQINPYLLINMWNTAQNTKKPLRIVINRNKNNFLPQELLNWMVSIENISWHELTNGDVAYKLDLKQYREIK >NZ_CP013850|2736717:2752742|2749132_2750338_-|WP_085280364.1|portal|DBSCAN-SWA MSDEISLDDKKILEWLGINIEDINVQGKNSLKQATVFGCLRVLSDTVSKLPIKIYKKTDGIKKVTDHYLGPLLKLRPNPYMSASDFWKCVEVQRNIYGNAYVALNYNGRGQVTGLYPLDSSKMKIYVDDVGLLNSSNKIWYIYTDNLGHQHKFMPDELLHFKGLTTDGIVGLSVIDQLKHLIQNGKNSEEYINKFFKNGLQVKGLVQYVGDLNSKAEQTFIENFERMSSGLKNAHRIAMLPLGYQFQPISQSLVDAQFLENSQLTIRQIAAMFGVKMHQINDLDSATHTNITEQQKGFYIDTLQSILTMYEQELIYKLFLGTEIRQGYYIKFNVDAILRANLETRYNAYRTAIQSGFKTPNEVRELEEDEAKEGGDELICNGNMQYLKDIGAYYKNKGGDK >NZ_CP013850|2736717:2752742|2736717_2737827_-|WP_085321122.1|plate|DBSCAN-SWA 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MDRVTKYAKDVVEGRVTAGKYVKLACQRHLDDLEKSKLAVYKYEFDIEKSLKIIEFAETLTIAEGEEETPVKLEGFQDFILGSINGWVAKGTGYRRFRKSYVQLGRQNGKSFLNGILATFYGNFSGYNYGQIYCTATKMDQAKIVFKEIMKFINADNDLSELFNIKEYESTIDCLVTNSIIKALGKDTKSIDGFRPLLGIVDEYHAHRDNQMYKLLEGGTRKMKQCLISVITTAGFNLNGPCFKLWEYCKNILDGIFTNDKQFAYIAQMDEEDDIWDSKNWIKANPLVCKDKEDLENLISDGNSAKDMGGDDLRDFITKALNVWYKFSNNQYLKIDKWKQCASGLTLEDFRGMECGLGLDLSSGGDLTSGVLEFSFLENGETSYFFHQQSFMPKMRLEEHIETDSAPYDVWANDKLITLTETLGGIKTDYKYIISYFKKIIERYDLKLKFIAYDPHNADTFLSDLEEFGVDCIEITQSAKSLNSATEDFKLSVDSGQIKYNKKDGLFRFCGANAVTTKNSFGEIKIDKEHRTERIDPIDAAIDVHKIIISNKDKPIDINKYAKKDFLNKLWG >NZ_CP013850|2736717:2752742|2752289_2752742_-|WP_085321135.1|terminase|DBSCAN-SWA MARPRQPTDLVMLKGKKHLSKKEIEERKNSEVQAPTDKVEPPSYLPNNLKKEFNRIAQELMNIEIISNLDCEALARFIVSEYNYQKVTKKLLKTGIDNEKYIDLLLMQEKLFKMCRQSASDLGLTISSRCKLVVPKSKEEKPKNKFSKFM >NZ_CP013850|2736717:2752742|2745348_2745768_-|WP_085321149.1|DBSCAN-SWA 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MSKELRELLNELDQKNKAMGELLNKEGVTKGELENISNEIDVLQAKIEAQKRKDNIDNSLNEPKGTPLVTNNNDKVAYNGALFTKAVANSLLKQRGLQGLDLTEEQQNKISENVNEDGGFAVPEDIQTKINTRLKDITDLFNLVDSEKVFTRKGQRTYEKRADQTPLTNLDEYGTIQELDNPKLERMSFDLHDFAGLMTIPNDLLKFAGKELENFLINWLVDKVRITRNIKILYGTGTSKDAQGIMASTKYKEVTLPATAGLKDFKKCKNVELLNVFKPTAKWTVNQDGFNYLDSLEDKQGRPYLQPDPKQPTQYLFLGLPVVELLNTTLKTEEDNIPILLGDLKESYEYFYDDNYELLTTNIGAGAFETNTTKARVITRLDGGEKDTDAIIKIKLALPTTGA >NZ_CP013850|2736717:2752742|2738287_2738605_-|WP_085321124.1|DBSCAN-SWA MDYGIEFAQWLKKRNNKDRIGPTIGKVVKGGSDYRISIMDNQLYLDPNNSTLCNSLKDRVEERTIELNNTSYNAKITYSNMLKNNDKVLVIANESDQHFFIADKI |
19 | Clostridium_phage(77.78%) | plate,portal,capsid,terminase,head,tail,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2762149 : 2770639
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP013850|2762149:2770639|DBSCAN-SWA CTTATTTTTCAAGTAAATTAATAACCTTCCCTATAGGCTTATCTCCAATAACTTTCATACCATCACTTAAACACATTCCTATAGTTATATCTAACATTTCTAATTGTTCTTTACTCAATGCTACTGGATAAGCTACACTATCTTTTACATAAACTAATGCTAATCCATCTTTCTTACCATCTGTCATATTATTCATATTTATTTACCTCCTAAACAAATTTTCTCATTCTATAGTTATTTTCTAACCCATACTTGAAAATAACTATATTACTCTTTTCTAAGATTCTTCCTGCCAAAGCTTCGTCTAGATCCATTAACATATTTGGAGTGCATTCGCTGTTATATATAGTTGCCTTATTGTTTAAATACCTTTGATTTATGATTGGATATATATGTTTTAAATCAGATTCTTTTAATTCTCCTGTTAATTTGCCTTTCTTTACTTTATCTTTAAATAGATCATCTATTATAAGCAATTCACAATTTATATACTTGCTTATGAGCTTTATATAGTATTCATCATCCATAACGTTGGCTTTTAGTTCTCTTATAGCTTCTTGGTAGGGCATATAAACAATATTAGTACATATCCCCTTATTTATGAGGTTTGCTCCTATTCCTATCGCTAGGTGGCTTTTCCCACTTCCTGGTTGTCCTAAAAAAGCTAAATTATTTTCTTCTTTTGTTTTTATTGTGTTATAATTCCTTATATAGTCTGTAGCGACTTGTTTAGCTCTTTTAGTTATGTCGCTATAGTCTGCATATTGGCTTATTTTTTTAACTTTAGATGGGTCTATTCCAAAATGCGCCCATCTTCTTTTAGTTAAATCTTTTTTATAACATTCACATCTTTTAAAGCCATTTTCAGTTTTTATAAAAGTGGTATCTTGGCACTTATCGCATTTATAATTAGCCTTCGTATTTGGAGAAGTCGTATTCCTGTTTCTTATTTCCGCTAGAATCCTGTTTAGTCCCTCCATTAACTCCCTCCTTATCTGTGTAATTACCTTCTAAGACTTTTATAAAATTGTTAGGCTTTACAAACCAATCAAAGGTTATAGTCCATCCTTTTTTATTTTGTCCTTTTAAAAATGGTCTGGTTTCTATATTTTCAATAGCTTTCAAAATATTATCAATACCATACTCTTTTATCCTTGCATTTAATAATTTATATCTGATAGTACCCTTATTAATAGCAATTAACTTATTAAGGTTCAAAGAGTTCCATTTATCTACTATTGGTTGTAACTTGTTACTACTAACAACTTCAGTTGTATTATCTTTATCTTCTTCTATATCTATATCTATATCTTTATCTTCTTCTATATCTAGGGGGTTAACATTAGCTTTACTGTTAGTTTTACTGTTAACTTTACATTCCCCAGTAGCTAATAATTTTTGCTTTTCTCTGTACCCTTTCATATATTCCCTCATGTATTCCTTTCTTTCTTCTAATTGGTCTAAGGTTTGATGTTTACTCCAATTAGGAATAGTTATAACATTGTCTATTACTTCAATCATTCCGAATTGTTCAAATGTATTTATAGCAAGTCTTACAGTGTTTAAAGGTCTACGGAAAATTGTTGCTAACATTTCATCAGTATAGGGTATCTTATCATTTAACATAAACACCCCAGAATTATTATTTTTACCTGCGAGGCATAATAATTTAAACCAAATCACTATAATGCTGTCTGCTTCTGGCATATTTTCTATTAGTAATATTTTTTCATCATCAAATATATCTGTAACTATTTTTATCCATTTTACTTTCCATTTTACTTCCCCCATACAATCCCCCTTATCTTTGCAAAAATTCTATCCTGTCCTCTAGACTTTGTATTTGGCTTTCTGCTTGTTCTAGTAATAATTCTTTCTCTACTAGCCTTTCATATAGTTCATTTGTTGTTGTTTCATCATATAGATTTTTTTCTATCAGCTCTAATAGCTTTTCAAACACTTCTCTTTGTCCAACTATGCTCAAGTCATAATTAAATAGTTGGCTTAACTTTAAACAAAATCTATCATCTTGTTGATCCATAATTAATTGTGTTTCTTTATCTGCATATAATTCGGAAGTTAACATATTAACCCTCCTGCTTTTTCATGTTTTCATAACCCTCGCATACTTGGTCATATTGTGACTTGGTAAGCTTGGCTATATCTGTAGTTTTAAATTTAGTAAACACCTGGCTTTTAACTGTTTTATTATCTATTCCTACACTCTTTGCTATTGCAAACAATCTATTTATTTGTGCATCACTTAAACCTGTTTTATTACTTCTTCTTCCTGCTGTATCCTTTTTATCTGGGTCAAGTTCATCTGTAGGAGCTTGGAAAAATTTTAATATAAAGTATCTTTCTGAATAAGTAAGCCCACTCCCATAAGCTTTGCTTATATCATCTTGGGCGCCATAAAGTTTCCATGGTATTTCTAAAGTTTCTTCTGGCTTTTCTGCATTTAACCATACATAAAACATTTCACCTTTAACTATATGGTCCGTACATTCTTTACCTTTAGAAGTCACATAATCAAATGTATAATTATCAGTAGCGCCTATCTTAGGTATTAATAACACTCCTAAACTATCCATTTTTTCTCTAATTTTGGCTATAGCTTGGCTTCCACTTACATAATTATATCCGTGACCTTCCGTATCTTTTGAAAACTTAATAACTTCCTTTCGTATTTCTATTAACTTTTGATATAAATTCATTATTCCACCACTTTCACATTTATATTTTCTTCTTCTACAATGCTAATCTCTGGAATGACCTCCCCTGTATTTTTATCTAATACAATTCCATCTTTTATTAAAAATGATTCTTTAAGACCTGTTTTATTAATTTCCTGTTTGGTTCTAATTAGATTTTTATACCCGTTAGAATTTAGATATTTTAATAGTGTTTCTTCATTACCATAATTCCATTTTTTATTCTTTCTACTTGTTACTTGTCCATAAGGTGTTGTTATTTTAGCTTTAGGGTCACTCTGCTTTAATTCTTTATAATATTGCATTAATAGCCCATTAAAGTATTCAAGCGTGGTTAAATCGCTCTTGGATTCTTCTATAAGCCAGTTATCTATTCTTTCTTTTTCTGCTTTTGCTAGTTCTTCTTTTTCTAAAATACTTTCCTTATATTCTTTTATCTTTCTTAATGCCCAACTAGCACCTTTCAAATTCTCTATTTTAAAAGTTTCTTGGCTTTCCATTCTTCTTTTACCTCCTTCTTACATCTAATTGCCATACAACTAGGTTCATATAAAATTTGTTCTCCCCTATCTGTTTGGCAAATAACTTTTTGCAATGCAAAATGTATGCACCCTTTGCAATAATCATCCACTTTACAAAACCTCTAATCTTGTATAAAATATATTTAACGATTTTTAATTTAAGTTTATTGCTCCTGGCAGGGAGCTATTTTTTTCTCTATATAATTTTTCCAACATTCAAAACAACTGCTATCACTGTTAATATACCTACACAATTCAAAATCAATCTGTTCTGGGCAACTAAATTGCTCTACACAAAATCTAGTAAACCTTTCTAGCCCTACAGCTTGTACATTCTTTGTGCAAATATCTTTATCTATCATATTTGCCCTCCTTATATTTTGTCATTAGATGACATATACCTGTATCTGTCCTACCATATATTTTCCCTAGTTCAACATATGTCATTTCTTTTTTTAGTTTTATAGCATCTTCTAAATCTTCATTCTTCATTTTTGCTCTCTTATTTATTTTTCCAGCTTCATAGCATTCAAAAGCCTGTTCAATTGTGTAGACTTCTTTACGGAGAACTGCTACTGCTAGTACATACCAATTCTCATTCATTTTTTTATCCCTCCTTTTCTATGCACATCTTTTAAAGATACATGCACTCCTTGCTGCAATATCTAATGCGTAATCTAAGCTTGTACACTTATTGAAATTAAGTCTATTAAACTTAATATTATCTGTTGTTATTTCGCATATAATTGCAAACTCTGCTTTTGTTAGATTGATTCCCCTTTCTTCTAGTATTTTTTTAAACATTTCTATTCCTCCTTTTACTACTTATCCCCTTTATGGTAAAATTTCGTTGAAAGGGGATTGTTATATATGCGTTTAAATCATGATTGCATAAGAGATATACTCTTATATGTTGAAGAAAATATTACTTATGATATTGAATCTGTAGATGTTGAAAATTTAATTTCCAAATTTAGTTCAAAATATGATAAAGACACTATAAACTATCATATAAGACAAATTGGTAATGCTTCTTTAGTTGAAAAAGTTTTTTATTCTGAAGATTCTCCAAAATTTATTAGTGATCTTACTTGGGAAGGACATGAATATATTGACAATATTCGTGACCCTAAAGTCTGGACAAAACTTAAAGCTTCAACTAAAAACTTAGCTTCTGTTAGTTTACCTATTCTTATAGAAAAGGCTCCAGACATAGTTAAATTTTTCTTATCTAATCCTTAATCCATTCTTTATGCATCTATCACTTTTCTCACATACTTTTTGTTTATAGACCTGTAGTATTTCATTTGCAGGTCTTCCTTTTATGTCAATAAATTTCTTAACATCACCATGGTTTTTAACTGTATTTAAAATCTCAATCTCCGTATCTGAGAGAACAGCAATTACTATCTCACCAGTTTCTAAAATACCTGTAATTCCATAGTTTCCCTTTGCAATACCTTCTTTTATAATTTTGGTTGTCATTCTTTTAGCATCCATTTTTAAATCTCCTTTACTACCTCAACATTCTTAAATATCCAGTTTAGGGCAAATATTTTCAAATCATTATGATCTACAATGACCTCATCTTCTGGCAAATCAACTTCTTCAAGAAATTCATAATTCTCTCCATCGAGCATTTCAATAGTTAAGTTAAATATTTCTTCGTCATATAAAAATCTAAAGATATCTATATCTATATAAATCATTGTTCCTGTAGAAACATTTAAGTTTAAATCTGTTGTTTTTATTTTTTTACTCATCTTTAATCCTCCTAAGCTTTTATTCCATGTTTTATTGCCATTTGACTTACTATACTTATATAAATTTCTTTAAGCCTTACATCATTGGCTATAACATCTAAATTATTTAATTTATTAATTTGGCTTTGTGCCATTCCATTAAGCGCTGCTCTAGCTTGTAAGTTTTTAAGTCTTATACTTAATTTACATTTAGCCCTTTCTTCTAATGCTCTATAAATTTCATCCTTAGGTGTTTTGTAATCTTGTAACTTATAACAAATCTTCCCTATTAGCTTATTAGTTTCTTTCCTCCATTCTTCTTTTGGATTTATTGTTATTACATCCCTTATAGCTTGTACCTCTTCTTTGGTTTCTTGCACTGCTGCATTTAATTTTTTTTGTTCTAATTCTGTAGTTGCTAATGCTTTAAATAAATTATTAAACATTTGTAATTCTGGACTAAGTTGATTTACTTCTACTTTCTTTTCTTTAACTCTAAAGTAAGTTTCCTCCAAATTGTCAAACTGTTGCCATGCTCTATCTGTATCTAATATCTTACAATGTCTATTAGCTCCTCTTTCTGTCCACAACATTAATTCACTTGCATACTTAAGGTTACTATCTTTAAGATAGTCGGCTTTAAATTCTTTAAGTTCTTCACCTATTAATCTAAAATAATGTTTTCCTTTCTCAAATCTATCTTTGTTCCTAATAAATCCTTGTTGTATTCTTATAGGATTAACTTCATAAACTTCTGACAATTGATCTGTTGTTAAAACTCTTTTACCTTCAACTTCTACTGGTTGTATTTCTGTTATCACAGTTTGTCCGTTTTTTATGTTTAAAACTACTTTCCCCATGCTTTTACCTCCTTTTAATAAGTTCTATCTTATAAATTACACACATAGAATATAATGAGAAGTGTTTGCTTTCTTGCAAAAAGTTATATTTTTATAAGGCTATTCAGCCTTATTTATCTCTTGGTATATCAAATTTATGACCTGTTGTACCTTTTCCCAGTTTTCTTGATTCTCTTCGTCGGTGATATCCGGTTCAATTATTATCACTTCTGGCATGCTTATCACCTCTTAATAATCCTCTTAATAATTATATTTATCTTAAGCTTGTACTATTCTTTTTTTCTTCTTTACGTTTCTTCTGTAAATTATCAATTTTATCTATAAGCTCAAGTTGTCTATTTATAACATCTAAATTATTCATTTTTACCCTCCTCATACATTTCTTTTATTTTTTTAATATCAAGTTTATAAAAGATTGCTAACTTTGAAGCCATTTTATCTGTTAAATTAACTCGCCCGGCTTCAATGTCATTTAAATGCTTTCCGCTTATATTAATACGCGAAACCACAAATTTCCTTTGTAGCCCTTTACTATTGCGAAACTGTCTTAAATTCACTATTGTGTCACCTCCTGCATTTATATTCTCACAATTTGAAAGAAAAGTAAAAGGCTTATTTTTCCTGTTTTTTTAATTTAACTCTATAATGCTTAAAAATAATGCTATTTCCTTCTTTTCTCACATTTTGAAAGAAAAATTTGTCACATAAATTCTCTTGAAATGTGAGAAAATTTAATGTACTATAGTCAATGAGGTGTTAAATATGAGTAAAATATTTGCTGAAAAATTAAAAGAATATAGAAAAGAACTAAGTGAAAAAAGAAATAAAAAAGTTGGTCAAATTCAACTTGCTGAAGAACTTGGAATAAGTAAAGGAAATATAGGTAATTTAGAAGCTGGGAAAAGGCTTCCTTCCAAAACTGTGCTTATGAAGTTAGTAGACCATAGCGGTAAAGGCATCGACTATTGGCTAGATGGTGTTGAAGAATATGAAGCACCTAACACGCTTGATCTTGTATTAGATAAAATGATAGAAGAAGGATTAATAAAAGATACTAATATAGATAAAGAAGCATGGGATATAATAACAGAAGCAGTACTAGTAGAAGTTGAAAGAAAGCTTCAATAGGAGGTGTGACTGTGAGGATATGTATGTATCTTAGAAAATCACGTGCTGATGAAGAATTAGAAAAAACTTTAGGCGAAGGAGAAACACTATCTAAACATAGAAAAGCACTTTTAAAATTTGCTAAAGAAAAAAATCTTAATATAGTAGAAATAAAAGAGGAAATAGTAAGTGGAGAAAGTTTATTCTTTAGACCTAAGATGTTGGAATTATTAAAAGAAATTGAAAATAAACAATACAGCGGTGTGCTTGTAATGGATATGCAACGTCTAGGACGTGGCAATATGCAAGATCAAGGGGTTATTTTGGAAACATTTAAGAAATCTAATACTAAAATAATCACACCTATGAAAACGTACGATTTATCAAATGATTTTGACGAAGAGTATAGCGAATTTGAAGCTTTTATGTCCAGAAAAGAACTTAAAATGATAAATAGGCGTATGCAGGGCGGAAGAGTTAGAAGTGTTGAAGATGGCAATTACATTGCAACTAATGCACCATATGGATATGATATACATTGGATAAATAAAGCACGGACATTGAAACCCAATCAAAAAGAATCTGAAATAGTAAAATTAATTTTTAAACTTTATATTGAAGGTAATGGTGCTGGCACTATAGCTAAACATTTAAACAGCCTAGGTTACAAGACTAAATTTGGGAATAGCTTTAATAATAGTTCTATTATATTTATTCTTAAAAATCCAGTTTATATTGGGAAAATAACTTGGAAAAAGAAAGATATAAGAAAATCTAAAGATCCAAACAAAGTAAAAGATACACGTACTAGAGATAAAAGCGAATGGATAGTTGTAGATGGTAAACATGATCCTATTATAGACCAAATAACTTGGAAACAGGCGCAAGAAATATTAAACAACCGATATCACATTCCATACAAACTTGTTAATGGTCCTGCTAACCCACTCGCTGGACTAATCATATGTGCTACTTGTAAGTCTAAAATGGTTATGCGTAAATTAAGAGGTACAGATAGAATTTTATGTAAAAATAATAAGTGCAACAACATAAGTAATAGATTTGATGCTGTAGAAAAATCTGTTGTAGAATCATTAGAAAATTACCTGAAAACTTATAAAGTAAATCTCCCTGAATTAAACAAAACATCTAATTTTAAATTATATGAACGACAAATAAGCACTTTAAAAAAAGAGCTAAAAATTCTTAATGAACAAAAATTAAAACTATTTGATTTTTTAGAACGTGGAATATATGATGAAGATACTTTTCTTAAGAGATCTAAGAATTTAGATGAAAGAATAGAAATAACAAATGAAAGTCTGAGTAATTTAAATCAAATAATTGCAAAAGAAAATAAAGCAATAAAGAAAGAAGATATTATAAAATTTGAAAAAGTATTAGATTCCTATAAGAGTACAGCTGATATTAGATTAAAAAATGAACTCATGAAGACCTTGATTTTTAAAATAGAATATACTAAGAATAAAAAGGGGAATGACTTCAAAATCAAGGTATTTCCTAAATTAAAACCCTTAAACATATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP013850|2762149:2770639|2766885_2767146_-|WP_085320607.1|DBSCAN-SWA MSKKIKTTDLNLNVSTGTMIYIDIDIFRFLYDEEIFNLTIEMLDGENYEFLEEVDLPEDEVIVDHNDLKIFALNWIFKNVEVVKEI >NZ_CP013850|2762149:2770639|2767157_2767985_-|WP_085320608.1|DBSCAN-SWA MGKVVLNIKNGQTVITEIQPVEVEGKRVLTTDQLSEVYEVNPIRIQQGFIRNKDRFEKGKHYFRLIGEELKEFKADYLKDSNLKYASELMLWTERGANRHCKILDTDRAWQQFDNLEETYFRVKEKKVEVNQLSPELQMFNNLFKALATTELEQKKLNAAVQETKEEVQAIRDVITINPKEEWRKETNKLIGKICYKLQDYKTPKDEIYRALEERAKCKLSIRLKNLQARAALNGMAQSQINKLNNLDVIANDVRLKEIYISIVSQMAIKHGIKA >NZ_CP013850|2762149:2770639|2766610_2766883_-|WP_021106446.1|DBSCAN-SWA MDAKRMTTKIIKEGIAKGNYGITGILETGEIVIAVLSDTEIEILNTVKNHGDVKKFIDIKGRPANEILQVYKQKVCEKSDRCIKNGLRIR >NZ_CP013850|2762149:2770639|2763949_2764234_-|WP_021106453.1|DBSCAN-SWA MLTSELYADKETQLIMDQQDDRFCLKLSQLFNYDLSIVGQREVFEKLLELIEKNLYDETTTNELYERLVEKELLLEQAESQIQSLEDRIEFLQR >NZ_CP013850|2762149:2770639|2765334_2765493_-|WP_021106451.1|DBSCAN-SWA MDDYCKGCIHFALQKVICQTDRGEQILYEPSCMAIRCKKEVKEEWKAKKLLK >NZ_CP013850|2762149:2770639|2766253_2766625_+|WP_021106447.1|DBSCAN-SWA MRLNHDCIRDILLYVEENITYDIESVDVENLISKFSSKYDKDTINYHIRQIGNASLVEKVFYSEDSPKFISDLTWEGHEYIDNIRDPKVWTKLKASTKNLASVSLPILIEKAPDIVKFFLSNP >NZ_CP013850|2762149:2770639|2762357_2762921_-|WP_169990714.1|DBSCAN-SWA MSQYADYSDITKRAKQVATDYIRNYNTIKTKEENNLAFLGQPGSGKSHLAIGIGANLINKGICTNIVYMPYQEAIRELKANVMDDEYYIKLISKYINCELLIIDDLFKDKVKKGKLTGELKESDLKHIYPIINQRYLNNKATIYNSECTPNMLMDLDEALAGRILEKSNIVIFKYGLENNYRMRKFV >NZ_CP013850|2762149:2770639|2766004_2766187_-|WP_021106448.1|DBSCAN-SWA MFKKILEERGINLTKAEFAIICEITTDNIKFNRLNFNKCTSLDYALDIAARSACIFKRCA >NZ_CP013850|2762149:2770639|2764235_2764865_-|WP_012704670.1|DBSCAN-SWA MNLYQKLIEIRKEVIKFSKDTEGHGYNYVSGSQAIAKIREKMDSLGVLLIPKIGATDNYTFDYVTSKGKECTDHIVKGEMFYVWLNAEKPEETLEIPWKLYGAQDDISKAYGSGLTYSERYFILKFFQAPTDELDPDKKDTAGRRSNKTGLSDAQINRLFAIAKSVGIDNKTVKSQVFTKFKTTDIAKLTKSQYDQVCEGYENMKKQEG >NZ_CP013850|2762149:2770639|2768747_2769113_+|WP_085320609.1|DBSCAN-SWA MSKIFAEKLKEYRKELSEKRNKKVGQIQLAEELGISKGNIGNLEAGKRLPSKTVLMKLVDHSGKGIDYWLDGVEEYEAPNTLDLVLDKMIEEGLIKDTNIDKEAWDIITEAVLVEVERKLQ >NZ_CP013850|2762149:2770639|2762149_2762344_-|WP_053818994.1|DBSCAN-SWA MNNMTDGKKDGLALVYVKDSVAYPVALSKEQLEMLDITIGMCLSDGMKVIGDKPIGKVINLLEK >NZ_CP013850|2762149:2770639|2764864_2765362_-|WP_021106452.1|DBSCAN-SWA MESQETFKIENLKGASWALRKIKEYKESILEKEELAKAEKERIDNWLIEESKSDLTTLEYFNGLLMQYYKELKQSDPKAKITTPYGQVTSRKNKKWNYGNEETLLKYLNSNGYKNLIRTKQEINKTGLKESFLIKDGIVLDKNTGEVIPEISIVEEENINVKVVE >NZ_CP013850|2762149:2770639|2765547_2765745_-|WP_021106450.1|DBSCAN-SWA MIDKDICTKNVQAVGLERFTRFCVEQFSCPEQIDFELCRYINSDSSCFECWKNYIEKKIAPCQEQ >NZ_CP013850|2762149:2770639|2765734_2765986_-|WP_021106449.1|DBSCAN-SWA MNENWYVLAVAVLRKEVYTIEQAFECYEAGKINKRAKMKNEDLEDAIKLKKEMTYVELGKIYGRTDTGICHLMTKYKEGKYDR >NZ_CP013850|2762149:2770639|2763057_2763939_-|WP_085321215.1|DBSCAN-SWA MGEVKWKVKWIKIVTDIFDDEKILLIENMPEADSIIVIWFKLLCLAGKNNNSGVFMLNDKIPYTDEMLATIFRRPLNTVRLAINTFEQFGMIEVIDNVITIPNWSKHQTLDQLEERKEYMREYMKGYREKQKLLATGECKVNSKTNSKANVNPLDIEEDKDIDIDIEEDKDNTTEVVSSNKLQPIVDKWNSLNLNKLIAINKGTIRYKLLNARIKEYGIDNILKAIENIETRPFLKGQNKKGWTITFDWFVKPNNFIKVLEGNYTDKEGVNGGTKQDSSGNKKQEYDFSKYEG >NZ_CP013850|2762149:2770639|2768338_2768542_-|WP_003399954.1|DBSCAN-SWA MNLRQFRNSKGLQRKFVVSRINISGKHLNDIEAGRVNLTDKMASKLAIFYKLDIKKIKEMYEEGKNE >NZ_CP013850|2762149:2770639|2769124_2770639_+|WP_085320610.1|DBSCAN-SWA MRICMYLRKSRADEELEKTLGEGETLSKHRKALLKFAKEKNLNIVEIKEEIVSGESLFFRPKMLELLKEIENKQYSGVLVMDMQRLGRGNMQDQGVILETFKKSNTKIITPMKTYDLSNDFDEEYSEFEAFMSRKELKMINRRMQGGRVRSVEDGNYIATNAPYGYDIHWINKARTLKPNQKESEIVKLIFKLYIEGNGAGTIAKHLNSLGYKTKFGNSFNNSSIIFILKNPVYIGKITWKKKDIRKSKDPNKVKDTRTRDKSEWIVVDGKHDPIIDQITWKQAQEILNNRYHIPYKLVNGPANPLAGLIICATCKSKMVMRKLRGTDRILCKNNKCNNISNRFDAVEKSVVESLENYLKTYKVNLPELNKTSNFKLYERQISTLKKELKILNEQKLKLFDFLERGIYDEDTFLKRSKNLDERIEITNESLSNLNQIIAKENKAIKKEDIIKFEKVLDSYKSTADIRLKNELMKTLIFKIEYTKNKKGNDFKIKVFPKLKPLNI |
17 | Clostridium_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2847029 : 2870229
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP013850|2847029:2870229|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP013850|2847029:2870229|2866581_2868312_-|WP_085320641.1|terminase|DBSCAN-SWA MIYYDNKEFSQPEYNTFILYKYLSKHYSKDIAQQIIKQNQNNLSDIAIALGGKDIAFFCLHFLQDIFVVKDNNEARNLSPTHYEVWDLLNAIFIEDKIDKLNIVLSRGMAKTTICDLALSIWLICYRKSKFTLIGAKKDTDAQQFIDSIKKVFQENDKIIDNFGKLVDKKYKNNANEIEFSNGTYIRAVGSGTSVRGFNFKGIRPSVCVMDDFQSETDIITEDAREKKYDKWCKEIEKVGDTAVYRNGKKIKSATKIISIGTVLHSQCLISRLAGNNDYYTYLKQAVILKEGQHIEDILESDLWLECKKIYFNDKVDNPKYKAKEFYENNRGKMKFPILWEEKWDCFQDIAVAYWENRQAFMSEMMNDAISISEKWFKSNTPQTTEEIEEHTFTKTILSIDPAGIKNKKSGDYFAFVVESLADNDFKYVRKGEILHFSSFEEYIKHICKILNDFEDITHVCIEKNTYMGLDLDKLKEEISKDIELYNRDITFINEMQRKNKDEKISTVVDAINNGRIIFDKEKVMKEAIEQMMDFQGQLYTLHDDFIDCVAEASNKLDTIEIVGKLEILDIRKLGL >NZ_CP013850|2847029:2870229|2858610_2859102_-|WP_085320627.1|DBSCAN-SWA MIFSQKNKEGNRAVNLTYIDGIETYGRGTAVEVSINEANECLTVKSRAFKKADVHLKLNQIIGVKVVSEKEIIEKSKNTVGRAVVGGVLLGSLGAIVGGMSGIGSKQKSETHYFMVINYKSRSEEIKVLSFEIVGASLHWSSFVKELRSKINAETLENEEVYL 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29 | Clostridium_phage(47.37%) | plate,terminase,capsid,tail,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
3214160 : 3223629
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP013850|3214160:3223629|DBSCAN-SWA TCTAGTGTTTAAAATGTCTTATTCCTGTAAATACCATAGAAATCCCTTTTTCATTACATACCTTTATAGATTCTTCATCTCTTATAGAACCGCCTGGTTGAATTATAGCTTTTATTCCCCATTTTGCAGCTTCTTCTGCTACATCTCCAAATGGGAAAAAAGCATCTGAAGCTAAAACTACGCCATCTCCAGCTCTATCTAACGCTTCCTTTGCTGCCCATATTCTATTTACTTGGCCTCCCCCAATACCTTTTGCCATACCATCTTTAACTACTACAATAGCGTTGGATTTCACATATTTAACTACTTTCATACCAAATATAAGATCTTTCATTTCTTGCTCTGTTGGAGATTTTTCTGTAACTACTTTTGTATCTTCTAATAATTTATTATCACTCTTTTGTACTAATATTCCTCCATCTACCTTTGCCATATCTTTTCCTTCTGTAGATTTTTCTTCACATTTTATAACCCTTAAATTTTTCTTGTTTTTTAAGACTTCTAAAGCATCTTCATCAAAATCTGGTGCTACAACTATTTCTAAAAATATTTTTGCAAGATTTTCTGCTGTTTCCTTATCTACTTTTCTATTAAAAGCAACTATGCCACCAAATATAGATATAGGATCACATTCATAGGCCTTAGTATAAGCTTCCTGTACAGTATCCCCTATAGCCACACCACAAGGTGTATTATGTTTTAATGCACAACAAGCCACCTCTTCAAATTCACAAACGGTTTTCCACGCTATATCCATATCCTTTATATTATTGTAGGATAATTCTTTTCCATTTAACTTTTCAAAATTTTTCATAGGATATTTTCCAACAGTAGATGTGTAATAAGCTGCTGTTTGATGAGGATTTTCTCCATATCTTAAATCCATGTTCTTTTTATAGGATAGAGTTAAATATTCTGGATATTCCTCTTCTAATAAGAAATTACTTATAGCTGCATCATAGGCTGACATTAGATTGAAAACTTTTCCTGCTAATTTTTTTCTAGTTTGTATATTAACCTGATTATTTTCTTTTATCTCATTTATGACATTTTCATAATCCTTAGTATCTGTTAGTACTACTACATCTTTAAAATTTTTAGCTGCTGCTCTTATCATAGTAGGTCCACCAATGTCTATAAACTCTACTTTTTCATCAAAACTTAAATTTTCTTCTACTTTATTAAAGAAAGGATATAAATTCACTACTACCATATCTATAGGGTTTATGCCCTTTTCTTCTATTACCTTCATATGCTCTTCATTATCTCTTATAGCTAATATGCCTCCATGAATTAAAGGATTTAATGTTTTTACTCTTCCATCTAACATTTCTGGGAAACCTGTTACCTCTTCTATATCTATTACTTTTACTCCATTTTCTTTTAAATGTTTATAAGTTCCACCTGTAGATATTATTTCTACATCTCTACTTTCTAAAAACTTTGCCAAATCTAAAATTCCTGTTTTATCAAATACACTTATTAATGCTCTTTTTATCACTTAAACTCCCCCAGTTTCAATATTTTTTATTATCTTATTTATCTGTCATAAGTAACTGCCACCAATATACCTTCTTTCAAAGAAAACATATAAGTGGCACTATTTCAATTTACAAACTACAATTTTTTATATTTCAATAAATTTAATCTACTCTAAACACATTTTTCTATTAGTTTCATTTATATTAATAGTAATTTTTTCATTATTATAAATTTAGTATGTTTTAATAAAAACTTTTCTTCCTTGTAATTTTACTTTTTCTTCACTTATAAGTTTTATAGCTTCTGGTAATGCCTCATGTTCTTTTTCTAGAACTCTTTTTTGCAATATTTCTGCTGTATCTTCTGCAAAAACTGGTACAGATTTTTGTATTATTATAGGTCCACTGTCCGTACTCTCATCTACAAAATGAACAGTGCACCCAGATACTTTTACTCCGTATTCTAATGCTTTTTGGTGCACTTTTATACCATACATTCCATCTCCGCAAAAGCTTGGTATTAATGAAGGATGTATGTTTATTATCTTATTTTCAAATTTATTTACCAAATCCCCATTTAATATAGAAAGCCATCCTGCTAAAACTATTAAATCTACGTTTCCATATAAACACTCACATATTTTATTAGACAGATTGCTTTTATATATTTTTCTATCTAGAGTTAAAGTTTTAATTCCCTTTTTTTCTGCTCTTTCTATACCATAAATATTAGATCTATCCCCTATAACCATTTCTATCTTGCAATTTTTTATATATCCCTCTTCTATTTTATCTATTATAGATTGAAGATTGCTTCCTCCCCCTGAAACAAGTACTGCAATTTTAAACATCTTATTCTCCTTTAATTTAAAGAAAATTTTTCATATATACTCTATAAATAATTAATTCCCCAATCAATTATTTTAAAGATCTAACCTATGAACTAATTTTTATTATAAATTTATTTAATGCCTTTTTTTAAATTAGTTCAACAGACTTATCTCCTTTTTTAACATATCCTATTTTATAACCCTTTTCTCCCATTTCTATCAGGTCTTTTATTATATTTTCCCCATCTTTTTCATTTACACATAATACAAAACCAATCCCCATATTAAAAGTATTGTACATATGATCTTCTTCTATCCCTAAACTTATTAGATGGCTAAATATATTTGGTAATGGATAAGATTTTTTATTTATAACTGCTGTAAAATCCTCTTTAAACATTCTAGGAATATTTTCATAAAAACCTCCTCCAGTTACATGAGCCATACCTTTTATATTATATTTTTCTAAAAGTTTCATTACAGGTTTTACATATATTTTTGTAGGAGTTAAAAGAGTATTTCCTATTTTATTTCCTTCAAAATCTTTATGCAAATCTTCTACTAATTTTCTAATAAGAGAATATCCGTTGCTATGAGGTCCTGAAGATGCTATACCTATTAATATATCCCCATCTTCTATTTTACTTCCATCTATTATTTCATCTTTTTCTGCTATACCTACAGCAAAACCAGCTATATCATATTCCCCATCTCTATAAAAGCCTGGCATTTCTGCTGTTTCTCCACCTATTAGAGCACATTCACTTTGGATACAACCATTGCTAACCCCTTCTACAAGCTGAGCTGCAACTTCTGCTTCCAATTTCCCACAAGCTATATAATCTAAGAAAAATAACGGCTTAGCACCATGACATAATATATCATTTATGCACATAGCTACGCAGTCTATTCCCACTGTATTATATTTTTTCATTCTAAAGGCTATATCTAATTTAGTTCCAACTCCGTCAGTTCCTGATACTAATACGGGATTTTTATATTTAGGAAGTTCAAACATTCCTGCAAAACTTCCTAAATTATTTAATACTCCCTTTGTAAATGTCTTTGAAGCATGTTTTTTTATAAGATCTACTGATTTATAACCTTCCTCTATATTAACCCCAGCTTCTTTATAAGATACCATGAATAACATTCCCTTCTTTACATTATTAGTTATTCTCAAAATTTAAAAAACTTAAATTCCCTATTCCAAACTATCTTTAGGCATTTCTATAGGTGCAGATATAGGATATACGCCATTAAAACATCCCAAGCAAAAACCTTTATCTTTATTAAGTGTTTCTACTAAGTCTTCCATACTTATATAAGCTAGACTATCTGCTCCTATTTTTTCTCTTATTTCTTCTACTTCTGAGTGAGCACCTATTAAATCTTTTCTATAAGGAGTATCTATTCCAAAATAGCAAGGATATTTAACCACTGGAGATGATACTCTAAAATGAACTTCCTTAGCTCCAGCTTTTCTTAATATTTGTACTAATCTTTTACTAGTAGTTCCTCTTACTATGGAATCATCTATTATTACTACTCTTTTTCCTTCTACATTTATTTTAAGTGGATTTAATTTTACAGATACAGCTTTTTCTCTTAATTCTTGAGAAGGTGCTATAAAAGTTCTTCCCACATATTTATTTTTTATAAATCCTATACCATAAGGTATTCCTGAAGCTTCAGCATATCCTACCGCAGCTGGTATACCTGAGTCTGGGACTCCTATAACTATATCTGCCTCTACTGGGTATTCTTCATAAAGTTTTCTTCCCGCTCTAACCCTTGATTCATAAACATTTATACCATCCATAGTACTATCTGGTCTTGCAAAATATATATATTCAAAAGCACAGGTATGACATCTTGTTTTTTCTGTAAACTTAATTGAATTTATTCCACTTTCGTCTATAATAACTATTTCTCCAGGCTCTATATCCCTTATAAACTCTCCACCTACGCAATCAAAAGCACAACTTTCCGAGCTTAATAAATAATCATCCCCAATTTTTCCTAGGCACATAGGCCTTATACCATGAGGATCACGTGCTCCTATTAACTTATCTTCTGTAAGTATAACGATAGCATAGGAACCTTTAATTGCTTGTATTGCATCTACTACTGCTTTATCTATACCTTTTTTAGCGCTTCTTGCTATTAAGTTTAATAATACCTCTGTGTCTATAGAAGTTTGAAAAATACATCCGCCATCTTCTAAAAGTTCTCTTATAACTGCTGCATTAACTAAATTACCATTATGAGCTATAGCAATAGAACCTAACTTATAAGTACCTACTATAGGTTGTGCATTATCTGATTTACTCGCTCCTGTAGTTGAATATCTAACATGTCCTATAGCAGAATTTCCTATTAATCCTTCTATAGTTTCTTTGCTAAAAACATCCGATACAAGACCCATACCCTTATGATATTTAAATTTTTCTCCATCAGATACTACTATTCCTGCACTTTCTTGTCCCCTATGTTGAAGAGCATATAATCCGTAATAAGTTATTTCTGCTGACTTTGATTCATTATCTTTAGAAAATACTCCAAATACCCCACATTCTTCTTTAAACTTATCTCCTTCTAAATCAAAGGGCATATTTTCATTTAAATCATCTAACATATAGCACATACTCATTTTTACTCCCCACTTATTTTCTATTTTAAAAATTTAATCTTCTCTTAGATTATTTCCAGCTGCTGTAAAAATAATTTTAAACTATAACAATCTATTTATTGACTCTTTTTAATATTTCCATATAAGCTTCTTTTACATTTCCCATGTCTCTTCTAAATCTATCTTTATCTAACTTTTCTCCTGTGCTTTTATCCCATAATCTACAAGTATCTGGGGATATTTCATCTGCTAAAAGGAGCTCACCATTAAATCTTCCTATTTCTATTTTAAAATCAACTAGATTTATTCCTTGCTCATCAAAGAATTCTTTTAATGTATTATTTACTTTTTCTGCTATAGAATACATTTCTTTTAGTTCTTCAAAGGTTGTAAGTCCTATAGCCACTGCATGATAGTCATTTATAAGAGGGTCATTTAAATCATCATTTTTATAACTTATTTCAAATACAGTAGTATCTAATTTTCTTCCTTCTGAAAGACCTAATCTTTTTGCCATACTTCCTGCTGCTATATTTCTAACTATAACTTCTAGTGGAACTATTTCTACTTTTTTGCAAAGCTGTTCTCTTTCATTTATCTTTTCTATAAAATGTGTTTTTACGCCCTTTTTTTCTAAAAGTTCAAATAACATTGCCGTTATAGAGTTATTCATAACTCCCTTATCTTCAATAGTTCCTTTCTTTTCCCCATTAAAAGCTGTGGCATCATCCTTATAATACACAACAACTGTATCCTTATCATCCGTTCTGAATATTTTTTTAGCCTTTCCTTCATATAACATATCCTTCTTTTCCATTATAACTCCACTCCCTCTTTGTTATCATTTATAAATTTTTCTTTCATATCTTTTCTATATTCTATAAGTTTTTCTTTTAACTTTTCATACTTTAAAGATAATATTTGTACCGCAAGCATTCCTGCGTTATAACTATTATTTATACCCACTGTAGCTACAGGTATAGATTTAGGCATTTGAACTATAGATAAAAGTGAATCCATTCCTCCAACTGCGGCTTCTATAGGCACTCCTATAACCGGAAGAACCGTATGAGAAGCTATAACCCCAGGTAAATGTGCTGCAAGACCTGCCCCAGCAATTATACATTCATAACCTTCCTTTTCTAAATCTTCAATTGTTTCCATCAACTTTTCTGGTACTCTGTGCGCTGAAAGTATGTAAGCTTTATATTCTATACTAAACTCTTTTAAAGCTTTAGCCGCTCCCTTCATTTTATCAGTATCAGATTTACTTCCAAAAATAATAGCTACTTTCATGTACTAGACCTCCTTATATTTAAATATATAAAAAATTCCGCTAAGATTTCTATGGAGAATCCTAAAGCGGAACTTAAGCGCACTGCAAAAGCATAGCTAAGATTCATCCATAGACAGGGAATTTATGGTTCCCTCGTAGAGACTCTCAAACCTTATTATTGAGATTATATGGATGATATATTCATTTGTTTTATGTACTCATGGTAACATATAATTCTTAATAAATCAACATACTTTTATAAAAACATTCGTATTTTATTGGTATTTTATTTATTTTTTCATAATATTATTCGTAATGTAACGAACAATTAGTTAGGTGAAAAATTCACTGAAATATATATTATATTGTAATAGAAATAATTTATAATAGAAATTTATTTCTGAAAATAAAATAGATTTAATTTTCAGATATCAAGCAAAATAATATATGGTAATAAACATATGAATAAGCTTTAACATTTTCTAATCTTTTTAAATCGAGAGCTTTTGTTATTAATCAAAGAATGAAGGTAAAAAACCGATGGCCAAGCCACACATAGCTTTTCCACCGGGTAAAAAATTTTTAATGAAAAAATTTGAGATTCCTAGTCAAGTAAGTTATCTATCTATACATGTATTTTTTATATTTGCATGGTTAAAATTAAATCTATTTTAAAATATTACTATCTAAGATAATTATTTTTTTCTTCTATAAGCAGTATCCTCAAGTGGAAGCTTTTTTCTAAAGTTTCCATCAAATTTATAGTAAGCACCTTGAGCTGCTGGGGCTGTTGGTATGGTTGTAATTTCTCCTATTCCTTTTGCACCATAAGCTAAATCATTAGTATTCTTTTCAATTATTGTTGTTTCAATTTCTGGTATATCAGTAGCTCTAAACAAACCTAATGTGCCAAACTTAGCAGTTGGGATAGATTTATTTAATGGATAATCTTCTGTAAATGCATACCCAAGTCCCATAACTATTCCACCTTCAATTTGTCCTTCTACATTAGTTAAATTTATAGCTTTTCCCACATCATGTGCTGCAACTACTCTTTCTACTTTTCCATCATCATCAAGAATAACAACTTGTGTTGCATAGCCATAAGCCACGTGACTTACTGGATTCTTTTTATCAGAATTAATAGGATCTGTAATACTTTGATATTCCCCATAAAATTCTTCACCTTCACACTCTTCTAATGATGTAGTTAATAATTTTTCCTTAAGCTTTAATGATGCCATTCTTGTGGCTTCTCCAGTAAATACTGTTTGTCTTGATGCTGTAGTTGTCCCTGAATCTGGTGCAAATTTTGTATCTGGTAAATCTAAAATTATCTGTTCTGGTAATAAACCTATTGTTTCACATATTATTTGTGTAAGAATTGTTCCAAGACCTTGACCTATGCAAGCTGCACTAGTTCTTATATGAACCTTTCCATCTATTACTATTAAGTTACATCTTCCAATATCCGGTATTCCAACACCAACTCCTGAATTTTTCATACAACAGGCTATTCCTGCACATTTACTCTTTTTATATACATCTTTCACAGCTAATATAGTTTCTTTAATTGCAGTTCCTTTATCAGCAATTTGTCCATTAGGTAGTGCATCTCCAGGTTCTACTGCGTTTTTAAATCTTATTTCCCAAGGAGATATACCAACTTTTTCAGCTAAAAGATTTAAGTTGCACTCTGATCCAAAAACTGATTGTGTTACTCCAAATCCCCTAAAAGCTCCTCCTGGGGGATTGTTAGTATATACAGCGGTACCTTTTATTTTCACATTAGGACATTTATATGGGCCAGCTGCATGAGTACAAGCTCTTTGGAGTACAGGTCCTCCTAATGATGCATAGGCACCAGTATCTGATATAATATCTGCTTTAAAAGCAGTTAAATTTCCTTTTTCATCACATGCAGTAGTAATTGTCATTTCCATAGCATGTCTTTTAGGATGAATCTTTATACTTGCCTTACGACTTAAAGTTATTTTAACGGGCTTTTTAATAGTCCATGCAAGAAGAGCGGCATGATGTTGTACACTCATATCTTCTTTTCCACCAAAGCCTCCACCCACATATTTGCTAATAGTCCTTACTTTTTCTTTAGGAAGCCCTAAAAGCTCAGAAATCTCTCTCTGCTCATCATATATACCTTGGCTTCCTGTATAAATAATAACTCCATCCCCATCTGGCATAGCTAAAGCACTTTCAGGCTCTAAAAAAGCATGTTCAGTAAAGGGAGTAGAATAATGATTAGTAACCACATACTTAGAATTGGCTATTGCCTCATCTACATCTCCTCTATTAACTTTTTCCACTGTTAAAATATTTCCCTTAGGATGAATTTTAGGAGCATCTTCAGCTATTGCAATATTAGGATTAGAAATAGGTTCTAATTCTTCATATTCTACCTTTATTAAATTAAGTATTTCTTTTAAAGCCTTCTTGCTTTTTGCTGCCACTAAAGCCACTGCATCACCAACATACCTTGTTTCTTCTCCTACGGCTATCATTGCTGGCCAATCCTTTACAATATGTCCTATAAGCCTATTTCCTGGGACATCTTCTGCTGTAAGAATAGCTTCAACTTCTGGATGTTTTAAAGCTACACTTATATCAATGCTTTTTACTAAAGCTCTAGGATATTTTGATCTTAAAGCAGAACCATAAACCATTCCTTCTATCTTCATGTCATCTACATATTTTCCTATACCTAAAATTTTATCTTTTGCATCTATTCTTGGAATATTTTCACCTATTTTCCCTTTATATTCTTTCGCAAATGGAAGTTTACCATTTCTAAATGCCCCTGCTGCCATTTCAATGGCTTTTATTATTTTCACATATCCAGTACATCTACATACATTTCCTCTAATAGCAGTTTTAATTTCTTTCTTATTTGGATTTAGATTTTTATCTAAAAGTGCCTTTGCACTTATTATCATCCCTGGAATACAATATCCACACTGTACTGCTCCAGCTTTAGAAAAAGCCCAAGTAAAAACATCCTTTTCAAATTCTGTTAACCCCTCTACAGTCTTAACATCTTTTCCATTCACCTTTGCAGTTGTACATATACAGGCTCTAAGCGCCTTACCATTAACAAGTATCATACAGGCTCCACAGGCTCCTTCTGCACACCCATTTTTTACTGAAGTTAAATCCTCATTATCCCTCAAATATTCAAGTAAATTAATATCCTCTGAAACAGATACATTTCTTTCATTTAATATAAATTCATACAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP013850|3214160:3223629|3219214_3219919_-|WP_012047943.1|DBSCAN-SWA MEKKDMLYEGKAKKIFRTDDKDTVVVYYKDDATAFNGEKKGTIEDKGVMNNSITAMLFELLEKKGVKTHFIEKINEREQLCKKVEIVPLEVIVRNIAAGSMAKRLGLSEGRKLDTTVFEISYKNDDLNDPLINDYHAVAIGLTTFEELKEMYSIAEKVNNTLKEFFDEQGINLVDFKIEIGRFNGELLLADEISPDTCRLWDKSTGEKLDKDRFRRDMGNVKEAYMEILKRVNK >NZ_CP013850|3214160:3223629|3221073_3223629_-|WP_169990708.1|DBSCAN-SWA MYEFILNERNVSVSEDINLLEYLRDNEDLTSVKNGCAEGACGACMILVNGKALRACICTTAKVNGKDVKTVEGLTEFEKDVFTWAFSKAGAVQCGYCIPGMIISAKALLDKNLNPNKKEIKTAIRGNVCRCTGYVKIIKAIEMAAGAFRNGKLPFAKEYKGKIGENIPRIDAKDKILGIGKYVDDMKIEGMVYGSALRSKYPRALVKSIDISVALKHPEVEAILTAEDVPGNRLIGHIVKDWPAMIAVGEETRYVGDAVALVAAKSKKALKEILNLIKVEYEELEPISNPNIAIAEDAPKIHPKGNILTVEKVNRGDVDEAIANSKYVVTNHYSTPFTEHAFLEPESALAMPDGDGVIIYTGSQGIYDEQREISELLGLPKEKVRTISKYVGGGFGGKEDMSVQHHAALLAWTIKKPVKITLSRKASIKIHPKRHAMEMTITTACDEKGNLTAFKADIISDTGAYASLGGPVLQRACTHAAGPYKCPNVKIKGTAVYTNNPPGGAFRGFGVTQSVFGSECNLNLLAEKVGISPWEIRFKNAVEPGDALPNGQIADKGTAIKETILAVKDVYKKSKCAGIACCMKNSGVGVGIPDIGRCNLIVIDGKVHIRTSAACIGQGLGTILTQIICETIGLLPEQIILDLPDTKFAPDSGTTTASRQTVFTGEATRMASLKLKEKLLTTSLEECEGEEFYGEYQSITDPINSDKKNPVSHVAYGYATQVVILDDDGKVERVVAAHDVGKAINLTNVEGQIEGGIVMGLGYAFTEDYPLNKSIPTAKFGTLGLFRATDIPEIETTIIEKNTNDLAYGAKGIGEITTIPTAPAAQGAYYKFDGNFRKKLPLEDTAYRRKK >NZ_CP013850|3214160:3223629|3217674_3219117_-|WP_169990721.1|DBSCAN-SWA MCYMLDDLNENMPFDLEGDKFKEECGVFGVFSKDNESKSAEITYYGLYALQHRGQESAGIVVSDGEKFKYHKGMGLVSDVFSKETIEGLIGNSAIGHVRYSTTGASKSDNAQPIVGTYKLGSIAIAHNGNLVNAAVIRELLEDGGCIFQTSIDTEVLLNLIARSAKKGIDKAVVDAIQAIKGSYAIVILTEDKLIGARDPHGIRPMCLGKIGDDYLLSSESCAFDCVGGEFIRDIEPGEIVIIDESGINSIKFTEKTRCHTCAFEYIYFARPDSTMDGINVYESRVRAGRKLYEEYPVEADIVIGVPDSGIPAAVGYAEASGIPYGIGFIKNKYVGRTFIAPSQELREKAVSVKLNPLKINVEGKRVVIIDDSIVRGTTSKRLVQILRKAGAKEVHFRVSSPVVKYPCYFGIDTPYRKDLIGAHSEVEEIREKIGADSLAYISMEDLVETLNKDKGFCLGCFNGVYPISAPIEMPKDSLE >NZ_CP013850|3214160:3223629|3219918_3220398_-|WP_003357851.1|DBSCAN-SWA MKVAIIFGSKSDTDKMKGAAKALKEFSIEYKAYILSAHRVPEKLMETIEDLEKEGYECIIAGAGLAAHLPGVIASHTVLPVIGVPIEAAVGGMDSLLSIVQMPKSIPVATVGINNSYNAGMLAVQILSLKYEKLKEKLIEYRKDMKEKFINDNKEGVEL >NZ_CP013850|3214160:3223629|3214160_3215660_-|WP_003385254.1|DBSCAN-SWA MIKRALISVFDKTGILDLAKFLESRDVEIISTGGTYKHLKENGVKVIDIEEVTGFPEMLDGRVKTLNPLIHGGILAIRDNEEHMKVIEEKGINPIDMVVVNLYPFFNKVEENLSFDEKVEFIDIGGPTMIRAAAKNFKDVVVLTDTKDYENVINEIKENNQVNIQTRKKLAGKVFNLMSAYDAAISNFLLEEEYPEYLTLSYKKNMDLRYGENPHQTAAYYTSTVGKYPMKNFEKLNGKELSYNNIKDMDIAWKTVCEFEEVACCALKHNTPCGVAIGDTVQEAYTKAYECDPISIFGGIVAFNRKVDKETAENLAKIFLEIVVAPDFDEDALEVLKNKKNLRVIKCEEKSTEGKDMAKVDGGILVQKSDNKLLEDTKVVTEKSPTEQEMKDLIFGMKVVKYVKSNAIVVVKDGMAKGIGGGQVNRIWAAKEALDRAGDGVVLASDAFFPFGDVAEEAAKWGIKAIIQPGGSIRDEESIKVCNEKGISMVFTGIRHFKH >NZ_CP013850|3214160:3223629|3216618_3217614_-|WP_012099415.1|DBSCAN-SWA MVSYKEAGVNIEEGYKSVDLIKKHASKTFTKGVLNNLGSFAGMFELPKYKNPVLVSGTDGVGTKLDIAFRMKKYNTVGIDCVAMCINDILCHGAKPLFFLDYIACGKLEAEVAAQLVEGVSNGCIQSECALIGGETAEMPGFYRDGEYDIAGFAVGIAEKDEIIDGSKIEDGDILIGIASSGPHSNGYSLIRKLVEDLHKDFEGNKIGNTLLTPTKIYVKPVMKLLEKYNIKGMAHVTGGGFYENIPRMFKEDFTAVINKKSYPLPNIFSHLISLGIEEDHMYNTFNMGIGFVLCVNEKDGENIIKDLIEMGEKGYKIGYVKKGDKSVELI >NZ_CP013850|3214160:3223629|3215873_3216491_-|WP_012047940.1|DBSCAN-SWA MFKIAVLVSGGGSNLQSIIDKIEEGYIKNCKIEMVIGDRSNIYGIERAEKKGIKTLTLDRKIYKSNLSNKICECLYGNVDLIVLAGWLSILNGDLVNKFENKIINIHPSLIPSFCGDGMYGIKVHQKALEYGVKVSGCTVHFVDESTDSGPIIIQKSVPVFAEDTAEILQKRVLEKEHEALPEAIKLISEEKVKLQGRKVFIKTY |
7 | Synechococcus_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
3364192 : 3392285
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP013850|3364192:3392285|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP013850|3364192:3392285|3368940_3369720_-|WP_085320720.1|DBSCAN-SWA MVKYTENLIPKMTSNSINGITVSASSEYGNGYKAFHAFDRDSKEYWIAGNSISTGWLKIDFGTNNKRAISKYTIKHFNNQIYINSAPRNWTFEGGNDNINWNTLDARNNEINWKLNEQREYTFKNFNKYEYYRLNISRNNGDQYVSIDEIEMMESININKYLIKEKNQYYTINNIEIILSPSQTLDEDNFSNNGFNDIDIITKDLLLSKFKNLEEVKLLVYTDDSEKNKCEMTYNCYPFRPIDKLKKNSHFCNILFNEV >NZ_CP013850|3364192:3392285|3386014_3386335_-|WP_024932992.1|DBSCAN-SWA MSIVLVKEIENKVFEEIESFRKENAVLKILLKEYVKKSIDYEKLLKESINLLDKCQEELEFLRVAKNRWTDEVVKHYFTIKDLQKALDIVGKEIMIYELNKNNKEM >NZ_CP013850|3364192:3392285|3370503_3371589_-|WP_085320722.1|DBSCAN-SWA MSEFFNVTLDKDIILDDSVISNKTGWSSEKIQKEIIDKRITKFEELEDVDVTNKKNKQLVAYSEETGKFTTIDGIDAGEIVGAGMKQISKMGIVGSAETPRIVNIPVNTVDFKVPRVNVLRYDTENTQDLISVKNEFTNDESNDFIDDRMMTFDGKAHLETNHISDFEVVQDTESFTEYSVNVDKTLFKKIEGFETFEDGVIQKLKTKAIPFDRLLIPKGDMNLSNVDHIDYFRLTANGNNIRIVCSVDSGNTWKTFSGEKWVNVNLTVDDVRKSGMNIATFNAINDVFWNELITTKKIRFAYLFSMDSITDIEEIDKLDLQYDGVGRWKQVKEDLYEVTYASNTLLQVECKFSGDIKINY 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35 | Clostridium_phage(80.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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