CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP024731	Fusobacterium pseudoperiodonticum strain KCOM 1262 chromosome, complete genome	2 crisprs	cas14j,WYL,cas14k,DinG,cas3,cas4,csa3,DEDDh	0	0	7	0

1. NZ_CP024731

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP024731_1

• CRISPR_ID: NZ_CP024731_1
• CRISPR_location: 460046-460287
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 3 spacers

Consensus repeat of NZ_CP024731_1

Consensus_repeat	Method
TTATTATGAAAATGGTAATTTAA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP024731_1

>1.1|460069|49|NZ_CP024731|CRISPRCasFinder
AGTATAAAGGACTTCTTTGTAATGGAAAAAGGATAAAAGAATGGAAATA
>1.2|460141|52|NZ_CP024731|CRISPRCasFinder
ATTTTATAGGTTCCTATGATGAATATGGAGAACAAACAGGAGTTTGGAAAAC
>1.3|460216|49|NZ_CP024731|CRISPRCasFinder
AAAATATTGCTAATTATGATTTTGGAGGTTTAGTAGGACTTGTCAAAAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP024731_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP024731_1

>merge|NZ_CP024731|1|460046-460287|CRISPRCasFinder
TTATTATGAAAATGGTAATTTAAAGTATAAAGGACTTCTTTGTAATGGAAAAAGGATAAAAGAATGGAAATATTATTATGAAAATGGTAATCTTAATTTTATAGGTTCCTATGATGAATATGGAGAACAAACAGGAGTTTGGAAAACTTATTATGAAAATGGAATTATAAAAAATATTGCTAATTATGATTTTGGAGGTTTAGTAGGACTTGTCAAAAATTTTGATGAAGAAGGGAATTATA

>NZ_CP024731|1|1|460046-460287|CRISPRCasFinder
TTATTATGAAAATGGTAATTTAA	AGTATAAAGGACTTCTTTGTAATGGAAAAAGGATAAAAGAATGGAAATA
TTATTATGAAAATGGTAATCTTA	ATTTTATAGGTTCCTATGATGAATATGGAGAACAAACAGGAGTTTGGAAAAC
TTATTATGAAAATGGAATTATAA	AAAATATTGCTAATTATGATTTTGGAGGTTTAGTAGGACTTGTCAAAAA
TTTTGATGAAGAAGGGAATTATA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP024731.1|WP_099987991.1|458623_459223_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP024731.1|WP_099987985.1|464748_465513_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225405
NZ_CP024731.1|WP_099987989.1|460620_461799_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225405
NZ_CP024731.1|WP_153232646.1|466630_466771_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP024731.1|WP_099987993.1|455438_456161_-|complement-resistance-protein-TraT	unknown	unknown	gnl|CDD|377558
NZ_CP024731.1|WP_008793383.1|456983_457448_-|pyridoxamine-5'-phosphate-oxidase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225998
NZ_CP024731.1|WP_099987984.1|465919_466309_+|DUF5376-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|375143
NZ_CP024731.1|WP_099987994.1|453721_455410_-|phospho-sugar-mutase	unknown	unknown	gnl|CDD|100092
NZ_CP024731.1|WP_099987992.1|457564_458293_+|VWA-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|238119
NZ_CP024731.1|WP_099987996.1|451941_452613_-|YggS-family-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme	unknown	unknown	gnl|CDD|143483
NZ_CP024731.1|WP_099987986.1|463872_464415_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP024731.1|WP_099987997.1|450485_451490_-|DUF814-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223558
NZ_CP024731.1|WP_008793390.1|466745_466994_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP024731.1|WP_099987987.1|462879_463437_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP024731.1|WP_099987995.1|452634_453738_-|radical-SAM-family-heme-chaperone-HemW	unknown	unknown	gnl|CDD|223708
NZ_CP024731.1|WP_099987983.1|466998_467595_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP024731.1|WP_005968387.1|451473_451920_-|cell-division-protein-SepF	unknown	unknown	gnl|CDD|224712
NZ_CP024731.1|WP_008793382.1|456190_456907_-|complement-resistance-protein-TraT	unknown	unknown	gnl|CDD|377558
NZ_CP024731.1|WP_099988598.1|465584_465881_+|EndoU-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|373068
NZ_CP024731.1|WP_099987988.1|461973_462867_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|373949

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP024731.1|WP_099987985.1|464748_465513_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|225405	COG2849, COG2849, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	5.50379e-05
NZ_CP024731.1|WP_099987989.1|460620_461799_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|225405	COG2849, COG2849, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	1.93821e-08
NZ_CP024731.1|WP_099987993.1|455438_456161_-|complement-resistance-protein-TraT	gnl|CDD|377558	pfam05818, TraT, Enterobacterial TraT complement resistance protein. The traT gene is one of the F factor transfer genes and encodes an outer membrane protein which is involved in interactions between an Escherichia coli and its surroundings.	1.24172e-75
NZ_CP024731.1|WP_008793383.1|456983_457448_-|pyridoxamine-5'-phosphate-oxidase-family-protein	gnl|CDD|225998	COG3467, COG3467, Predicted flavin-nucleotide-binding protein [General function prediction only].	8.52002e-36
NZ_CP024731.1|WP_099987984.1|465919_466309_+|DUF5376-family-protein	gnl|CDD|375143	pfam17346, DUF5376, Family of unknown function (DUF5376). This is a family of unknown function found in Bacteria.	2.49351e-06
NZ_CP024731.1|WP_099987994.1|453721_455410_-|phospho-sugar-mutase	gnl|CDD|100092	cd05799, PGM2, This CD includes PGM2 (phosphoglucomutase 2) and PGM2L1 (phosphoglucomutase 2-like 1). The mammalian PGM2 is thought to be a phosphopentomutase that catalyzes the conversion of the nucleoside breakdown products, ribose-1-phosphate and deoxyribose-1-phosphate to the corresponding 5-phosphopentoses. PGM2L1 is thought to catalyze the 1,3-bisphosphoglycerate-dependent synthesis of glucose 1,6-bisphosphate and other aldose-bisphosphates that serve as cofactors for several sugar phosphomutases and possibly also as regulators of glycolytic enzymes. PGM2 and PGM2L1 belong to the alpha-D-phosphohexomutase superfamily which includes several related enzymes that catalyze a reversible intramolecular phosphoryl transfer on their sugar substrates. Other members of this superfamily include phosphoglucosamine mutase (PNGM), phosphoacetylglucosamine mutase (PAGM), the bacterial phosphomannomutase ManB, the bacterial phosphoglucosamine mutase GlmM, and the bifunctional phosphomannomutase/phosphoglucomutase (PMM/PGM). Each of these enzymes has four domains with a centrally located active site formed by four loops, one from each domain. All four domains are included in this alignment model.	0
NZ_CP024731.1|WP_099987992.1|457564_458293_+|VWA-domain-containing-protein	gnl|CDD|238119	cd00198, vWFA, Von Willebrand factor type A (vWA) domain was originally found in the blood coagulation protein von Willebrand factor (vWF). Typically, the vWA domain is made up of approximately 200 amino acid residues folded into a classic a/b para-rossmann type of fold. The vWA domain, since its discovery, has drawn great interest because of its widespread occurrence and its involvement in a wide variety of important cellular functions. These include basal membrane formation, cell migration, cell differentiation, adhesion, haemostasis, signaling, chromosomal stability, malignant transformation and in immune defenses In integrins these domains form heterodimers while in vWF it forms multimers. There are different interaction surfaces of this domain as seen by the various molecules it complexes with. Ligand binding in most cases is mediated by the presence of a metal ion dependent adhesion site termed as the MIDAS motif that is a characteristic feature of most, if not all A domains.	3.06099e-07
NZ_CP024731.1|WP_099987996.1|451941_452613_-|YggS-family-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme	gnl|CDD|143483	cd00635, PLPDE_III_YBL036c_like, Type III Pyridoxal 5-phosphate (PLP)-Dependent Enzymes, YBL036c-like proteins. This family contains mostly uncharacterized proteins, widely distributed among eukaryotes, bacteria and archaea, that bear similarity to the yeast hypothetical protein YBL036c, which is homologous to a Pseudomonas aeruginosa gene that is co-transcribed with a known proline biosynthetic gene. YBL036c is a single domain monomeric protein with a typical TIM barrel fold. It binds the PLP cofactor and has been shown to exhibit amino acid racemase activity. The YBL036c structure is similar to the N-terminal domain of the fold type III PLP-dependent enzymes, bacterial alanine racemase and eukaryotic ornithine decarboxylase, which are two-domain dimeric proteins. The lack of a second domain in YBL036c may explain limited D- to L-alanine racemase or non-specific racemase activity.	3.44663e-100
NZ_CP024731.1|WP_099987997.1|450485_451490_-|DUF814-domain-containing-protein	gnl|CDD|223558	COG0482, TrmU, Predicted tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) methyltransferase, contains the PP-loop ATPase domain [Translation, ribosomal structure and biogenesis].	1.73854e-70
NZ_CP024731.1|WP_099987995.1|452634_453738_-|radical-SAM-family-heme-chaperone-HemW	gnl|CDD|223708	COG0635, HemN, Coproporphyrinogen III oxidase and related Fe-S oxidoreductases [Coenzyme metabolism].	2.5222e-131
NZ_CP024731.1|WP_005968387.1|451473_451920_-|cell-division-protein-SepF	gnl|CDD|224712	COG1799, COG1799, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	1.67768e-32
NZ_CP024731.1|WP_008793382.1|456190_456907_-|complement-resistance-protein-TraT	gnl|CDD|377558	pfam05818, TraT, Enterobacterial TraT complement resistance protein. The traT gene is one of the F factor transfer genes and encodes an outer membrane protein which is involved in interactions between an Escherichia coli and its surroundings.	5.44809e-91
NZ_CP024731.1|WP_099988598.1|465584_465881_+|EndoU-domain-containing-protein	gnl|CDD|373068	pfam14436, EndoU_bacteria, Bacterial EndoU nuclease. This is a bacterial virion of EndoU nuclease. It is found at C-terminal region of polymorphic toxin proteins.	3.47234e-13
NZ_CP024731.1|WP_099987988.1|461973_462867_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|373949	pfam15575, Imm49, Immunity protein 49. A predicted immunity protein with an all alpha-helical fold and a conserved proline residue. Proteins containing this domain are present in bacterial polymorphic toxin systems as an immediate gene neighbor of the toxin gene, usually containing a domain of the Tox-REAse-1 or Tox-REase-6 families.	9.61068e-07

Protein sequences

>NZ_CP024731.1|WP_099987991.1|458623_459223_+|hypothetical-protein
MEYRYKNIYLEETIEEIFPELNNSNTEYEPSTFSLAYRPYEYVEVTIYLKFGEVLLIKIFDENFQIDNTLKVGIALTDEIINRYDLYYDDFEEVYLSKKYKELVVIVDLADNIIGFSFVKEDGKDFSFPKDKIKNYLECKNLLDIYGSLRNNDTLDVNIEKREIYGQLNNYKFTFDIITRDIKSIQNLETGEFIKTSLE
>NZ_CP024731.1|WP_099987992.1|457564_458293_+|VWA-domain-containing-protein
MKFLMALLVTVFAFSFSAEIQAKSVSKNKEVVDVIFILDRSGSMGGLESDTIGGFNSVLEKQRKEEGKAYITTVLFDDQYELLHDRVDITKVQNITEKEYYVRGSTALLDAIGKTIAKEKAIQDTLSKGEKATKVLFIIITDGLENASKEYNSAAVKKLIETQKAKDGWEFLFLGANIDAIETANTIGISAERAVNYNSDSVGTQLNYKSLNNAVSEVRSGKELKKEWKADIEADYQQRSKK
>NZ_CP024731.1|WP_008793383.1|456983_457448_-|pyridoxamine-5'-phosphate-oxidase-family-protein
MRKANREVKDRNEIIEIMKRCDVCRLVFNNGDYPYIVPLNFGLDADEEKVIIYFHSALEGTKVDIMKREMKATFEMDCNHELQYYEDRGYCTMAYESVIGRGKIRILSEDEKMEALKKLMAQYHKDKEAYFNPAAIPRTLVYCLEVEEMTAKRK
>NZ_CP024731.1|WP_008793382.1|456190_456907_-|complement-resistance-protein-TraT
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>NZ_CP024731.1|WP_099987993.1|455438_456161_-|complement-resistance-protein-TraT
MKKILKTVFVLAIILIIVLSSTIHTIISKRNLEVQTKMSNTIWLEPVDTDQKTIFVKISNTSDKDLDIESKVINALKTKGYKIVKEPSEAKYSLQVNILNVEKSNLNDADGSGFSEVFMAAGIGSILATQSAEDRSDIVGLGMASATLAKISSAFVKDVVYAMITDVLVSEKIGKNVQVTTINTVSQGISGTRTSSSNETSNIEKYSTRVLSTANKVNLKFENAMPVLEDELVKVITGIF
>NZ_CP024731.1|WP_099987994.1|453721_455410_-|phospho-sugar-mutase
MYLDEYKKWLDSTMLSEDEKEELRSIANDEKEIENRFYTNLSFGTAGMRGVRGIGKNRMNKYNIRKATQGLANYIIEATGETGKKKGVAIAYDSRLDSVENAINTAMTLAGNGIKVYLFEGIRSTPELSFAVRELKAQAGVMITASHNPKEYNGYKVYWEDGAQIVDPQATGIVSAVEAVDIFNGVKLMDEKEAIEKGLLVYVGEKLDDRFIEEVKKNAINPDVENKDKIKIVYSPLHGVAARPVERILKEMGYTSVYPVKEQEQPDGNFPTCDYANPEDTSVFKLSTELADKVGAEICIANDPDGDRVGLAVLDNNGKWFFPNGNQIGILFAEYILNHKKNIPANGTMITTVVSTPLFDTIVKKNGKKALRVLTGFKYIGEKIRQFENKDLDGTFLFGFEESIGYLVGTHVRDKDAVVASMIIAEMATTFKNNGSSIYNEIIKIYEKYGWRLETTIPITKKGKDGLEEIQKIMKSMREKTHTEIAGIKVKEYRDYQKGVEDLPKSDVIQIVLEDETYLTVRPSGTEPKIKFYISVVDSDKKVAEEKLAKLEKEFLNYAENL
>NZ_CP024731.1|WP_099987995.1|452634_453738_-|radical-SAM-family-heme-chaperone-HemW
MLKIYNTYIHIPFCERKCNYCDFTSLKGTDNQIEKYVNYLLKEIDIYSKNYDLSEKQDTIYFGGGTPSLLPIDSLKRILSKFSYDENTEITIEVNPKTVDINKLKEYRNLGINRLSIGIQTFNDENLKVLGRIHNSEEAIEVYNIAREVDFKNISLDIMFSLPNQTLEMLKVDLEKLILLNPEHISIYSLIWEEGTKFFRDLKAGKLKETDNDLEATMYEYIIDYLKSKGYEHYEISNFSKKDFEARHNSIYWENKNYLGLGLSAAGYLGNLRYKNFFHLKDYYDKLDKNILPVDEREELTEDDIEQYRYLVGFRLLNNPLIPSKEYLEKCEILEKEAYLIKKENGYILSSKGLMLFNDFIANFIDD
>NZ_CP024731.1|WP_099987996.1|451941_452613_-|YggS-family-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme
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>NZ_CP024731.1|WP_005968387.1|451473_451920_-|cell-division-protein-SepF
MGILKDIKELVGINTEEEYDEEEVIEETSRTLSKREQMEMDTVDDFRYDDYSTIFIDPKQFEDCKKIANYIEKEKMITINLENIGPNVAQRIMDFLAGAMEIKNASFAQIAKNVYTIVPENMKVYYEGKRREKKLIDLEKGERFEGEN
>NZ_CP024731.1|WP_099987997.1|450485_451490_-|DUF814-domain-containing-protein
MKEKIKALALFSGGLDSALAIKLVQDQGVEVIALNFVSHFFGGKNEKAEKMAEQLGIKLEYIDFKKRHMFVVEDPVYGRGKNMNPCIDCHSLMFKIAGELLEEYGAHFVISGEVLGQRPMSQNAQALEKVKKLSGMEDLVLRPLSAKLLPPSRAELMGWVDREKLLDINGRSRHRQMELMNSYGLVEYPSPGGGCLLTDPGYSSRLKVLEDDGLLKDEHSWLFKLIKEARFFRFSKGRYLFVGRDKESNMKIDEYRKEKNLKFYIHSAEVPGPHLIANTDLSDEEIEFAKNLFSRYSKVKGNEKINLNNSGNIETVDIVDLKKLDEEIKKYQQL
>NZ_CP024731.1|WP_099987989.1|460620_461799_+|hypothetical-protein
MKIYEIGFDYANYNVIFTFKINKDASFFFSKEELDRYFRKDRFYEEANLKRYVEGEAKILDVTLLDIYKDKYGTYEGLEKYVELIPDGKKSNVKDIISIPGFGMKVLLSRKAKEYIEKKYSGKLEYLKVSYDKKDFYIVTDIKNIEYCYSLKLPPNIIDVYDFSKVSGKNDIFKIGTIEKKDFLKERFFCIKKFKDYIEESDLKGYKFEEMKDINDIEIFKEEKQEETQFTEIEEKGYYKSGKLKYIGTIWKGFRIKQWKSWYENGNLESDGEFNMKGEEEGEWRYYHQNGKIKNVANYENGKLVGLVKNFDENGKFYSSTYYEKSSNLTKWQFFYKDGKSIKKEGMAYDMGEEAKKRWIATGEWKYYSKGGKLQKIETYENGEIIKVEKFK
>NZ_CP024731.1|WP_099987988.1|461973_462867_+|hypothetical-protein
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>NZ_CP024731.1|WP_099987987.1|462879_463437_+|hypothetical-protein
MADITDVYVRIKYKKNGKIYEDDLLEDIDMYDALSDMEYNGIYYEIDDKLIMRAYGRNYYALCFQNESKLKDYLFEISQEKGIENIYYIYCEYSYIMEVIRYGIINIDIVNKKVTVDIEKEEKYIEIFEKIAKKSYPKLLENYEKYIDDELEDDEVEEYEDKMDEIMGEYSLKEFEKFLNKVKLK
>NZ_CP024731.1|WP_099987986.1|463872_464415_+|hypothetical-protein
MIVEPDALAHLITDVKLWKKYGTGPNDSATREEREEIGDFIFGYKIQNNYDEIRNELKVRRKDKVSLNELTEILEKIKTEKMVEKALKRVKEIEDFAEPYIDEKTKEKIIRKIYPLQKEFLRILGRKNEKYKLGTGTMEGRFYIDIYIKDLKTNEIFIIKRDNIHIYYESAGSKVFLPSI
>NZ_CP024731.1|WP_099987985.1|464748_465513_+|hypothetical-protein
MSELQIVRKKIHGDFFLEKSYREGKLFYEVLRYKDDYIGINYGYLEDELREETYINDNRIGMIVVNEKDRIYICTLDEKRHEVGITVTYRNKSGRLAHEIDYLDDICMATNRIYKDSFIKNAPLIKKIEKRENIDKKYYKKYYEFKHKKNILRIEKIYCKKTGKRVDFKAYKNNKLYGFREVRDDNGNVILRGSYLNNKKIGIWHEYENNKVKIKVAFDENEKFSGIYREFFPNGDIKEEKYYFQGKEIKSSKK
>NZ_CP024731.1|WP_099988598.1|465584_465881_+|EndoU-domain-containing-protein
MEHLHSVSSNGVRTADISVFDQNTNQWKLKVKRDGITPQETTLFLESWTESRIIVEVDIAYKNRIISQTRRNIWKGTTPSGIKVEGYIALNTTVFPLQ
>NZ_CP024731.1|WP_099987984.1|465919_466309_+|DUF5376-family-protein
MKFKFCYEKIFKKTIHEEIDLICVSINETQNEDIISCYISDISVFEIYLDSICERLEKKEPSAMDGQVWGGDFIEDRVYIYWVFDPDNEEGKAEISRKGMLKLMKRWIEFRKKKIPENYEEYEEIIEVD
>NZ_CP024731.1|WP_153232646.1|466630_466771_+|hypothetical-protein
MIDEGIAKLKNMTTEEIKELFEKEGLNLKSFDKVNGKGSGQKFFNT
>NZ_CP024731.1|WP_008793390.1|466745_466994_+|hypothetical-protein
MVKNFSIPNNKFMIPADFEKGKRKMVTIGSVRTNSGGTHGSPYILFGTNDGKYKIVFGDPKDYKYNITNKENANIIFVNPKR
>NZ_CP024731.1|WP_099987983.1|466998_467595_+|hypothetical-protein
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Crispr_ID: NZ_CP024731_2

• CRISPR_ID: NZ_CP024731_2
• CRISPR_location: 1599685-1599761
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP024731_2

Consensus_repeat	Method
CGAACAGGGTAATAAAAAGAAATA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP024731_2

>2.1|1599709|29|NZ_CP024731|CRISPRCasFinder
CTGACCAAGAAGATATGTTCGTATGATAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP024731_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP024731_2

>merge|NZ_CP024731|2|1599685-1599761|CRISPRCasFinder
CGAACAGGGTAATAAAAAGAAATACTGACCAAGAAGATATGTTCGTATGATAACGAACAGGATAATAAAAAGAAATA

>NZ_CP024731|2|2|1599685-1599761|CRISPRCasFinder
CGAACAGGGTAATAAAAAGAAATA	CTGACCAAGAAGATATGTTCGTATGATAA
CGAACAGGATAATAAAAAGAAATA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP024731.1|WP_099986820.1|1605978_1606887_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|227160
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NZ_CP024731.1|WP_008794150.1|1595190_1595823_+|DUF421-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225205
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NZ_CP024731.1|WP_099986828.1|1600187_1602083_+|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223562
NZ_CP024731.1|WP_099986822.1|1604133_1605627_-|YifB-family-Mg-chelatase-like-AAA-ATPase	unknown	unknown	gnl|CDD|223679
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NZ_CP024731.1|WP_008794151.1|1594738_1595191_+|DUF3290-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378693
NZ_CP024731.1|WP_008794149.1|1595990_1596443_+|DUF3290-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378693
NZ_CP024731.1|WP_099986824.1|1603616_1604048_-|flavodoxin	unknown	unknown	gnl|CDD|235508
NZ_CP024731.1|WP_099986838.1|1591613_1592915_-|phosphomethylpyrimidine-synthase-ThiC	unknown	unknown	gnl|CDD|376689
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NZ_CP024731.1|WP_008794139.1|1607709_1609023_-|FTR1-family-iron-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223744

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP024731.1|WP_099986820.1|1605978_1606887_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|227160	COG4823, AbiF, Abortive infection bacteriophage resistance protein [Defense mechanisms].	2.61242e-47
NZ_CP024731.1|WP_099986834.1|1593561_1594395_-|bifunctional-hydroxymethylpyrimidine-kinase/phosphomethylpyrimidine-kinase	gnl|CDD|223428	COG0351, ThiD, Hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase [Coenzyme metabolism].	1.01785e-112
NZ_CP024731.1|WP_008794150.1|1595190_1595823_+|DUF421-domain-containing-protein	gnl|CDD|225205	COG2323, COG2323, Predicted membrane protein [Function unknown].	3.3235e-67
NZ_CP024731.1|WP_099986824.1|1603616_1604048_-|flavodoxin	gnl|CDD|235508	PRK05568, PRK05568, flavodoxin; Provisional.	4.53791e-30
NZ_CP024731.1|WP_099986828.1|1600187_1602083_+|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein	gnl|CDD|223562	COG0488, Uup, ATPase components of ABC transporters with duplicated ATPase domains [General function prediction only].	0
NZ_CP024731.1|WP_008794140.1|1606978_1607659_-|membrane-protein	gnl|CDD|226001	COG3470, Tpd, Uncharacterized protein probably involved in high-affinity Fe2+ transport [Inorganic ion transport and metabolism].	4.36232e-72
NZ_CP024731.1|WP_099986832.1|1597209_1598703_+|S8-family-peptidase	gnl|CDD|173793	cd04847, Peptidases_S8_Subtilisin_like_2, Peptidase S8 family domain in Subtilisin-like proteins. This family is a member of the Peptidases S8 or Subtilases serine endo- and exo-peptidase clan. They have an Asp/His/Ser catalytic triad similar to that found in trypsin-like proteases, but do not share their three-dimensional structure and are not homologous to trypsin. The stability of subtilases may be enhanced by calcium, some members have been shown to bind up to 4 ions via binding sites with different affinity. Some members of this clan contain disulfide bonds. These enzymes can be intra- and extracellular, some function at extreme temperatures and pH values.	7.91992e-63
NZ_CP024731.1|WP_099986830.1|1598712_1599618_+|EamA-family-transporter	gnl|CDD|273359	TIGR00950, Uncharacterized_inner_membrane_transporter_YicL, Carboxylate/Amino Acid/Amine Transporter. [Transport and binding proteins, Amino acids, peptides and amines].	4.77407e-27
NZ_CP024731.1|WP_099958036.1|1609990_1610485_-|PTS-glucose-transporter-subunit-IIA	gnl|CDD|225101	COG2190, NagE, Phosphotransferase system IIA components [Carbohydrate transport and metabolism].	4.74885e-61
NZ_CP024731.1|WP_099986836.1|1592931_1593552_-|thiamine-phosphate-synthase	gnl|CDD|223429	COG0352, ThiE, Thiamine monophosphate synthase [Coenzyme metabolism].	4.67796e-84
NZ_CP024731.1|WP_008794148.1|1596442_1597075_+|DUF421-domain-containing-protein	gnl|CDD|225205	COG2323, COG2323, Predicted membrane protein [Function unknown].	7.72644e-66
NZ_CP024731.1|WP_099986840.1|1591409_1591604_-|sulfur-carrier-protein-ThiS	gnl|CDD|273754	TIGR01683, thiamine_biosynthesis_protein_ThiS, thiamine biosynthesis protein ThiS. This model represents ThiS, a small, ubiquitin-like thiamine biosynthesis protein related to MoaD, a molybdenum cofactor biosynthesis protein. Both proteins are involved in sulfur transfer. ThiS has a conserved Gly-Gly C-terminus that is modified, in reactions requiring ThiI, ThiF, IscS, and a sulfur atom from Cys, into the thiocarboxylate that provides the sulfur for thiazole biosynthesis. [Biosynthesis of cofactors, prosthetic groups, and carriers, Thiamine].	3.92401e-15
NZ_CP024731.1|WP_008794151.1|1594738_1595191_+|DUF3290-domain-containing-protein	gnl|CDD|378693	pfam11694, DUF3290, Protein of unknown function (DUF3290). This family of proteins with unknown function appears to be restricted to Firmicutes.	5.84551e-44
NZ_CP024731.1|WP_008794149.1|1595990_1596443_+|DUF3290-domain-containing-protein	gnl|CDD|378693	pfam11694, DUF3290, Protein of unknown function (DUF3290). This family of proteins with unknown function appears to be restricted to Firmicutes.	1.41499e-44
NZ_CP024731.1|WP_099986822.1|1604133_1605627_-|YifB-family-Mg-chelatase-like-AAA-ATPase	gnl|CDD|223679	COG0606, COG0606, Predicted ATPase with chaperone activity [Posttranslational modification, protein turnover, chaperones].	0
NZ_CP024731.1|WP_099986838.1|1591613_1592915_-|phosphomethylpyrimidine-synthase-ThiC	gnl|CDD|376689	pfam01964, ThiC_Rad_SAM, Radical SAM ThiC family. ThiC is found within the thiamine biosynthesis operon. ThiC is involved in pyrimidine biosynthesis. ThiC participates in the formation of 4-Amino-5-hydroxymethyl-2-methylpyrimidine from AIR, an intermediate in the de novo pyrimidine biosynthesis. Thic is a member of the radical SAM superfamily.	0
NZ_CP024731.1|WP_099986818.1|1609250_1609973_-|murein-L,D-transpeptidase-catalytic-domain-family-protein	gnl|CDD|379310	pfam13645, YkuD_2, L,D-transpeptidase catalytic domain. This family is related to pfam03734.	4.89931e-79
NZ_CP024731.1|WP_008794139.1|1607709_1609023_-|FTR1-family-iron-permease	gnl|CDD|223744	COG0672, FTR1, High-affinity Fe2+/Pb2+ permease [Inorganic ion transport and metabolism].	3.57416e-80

Protein sequences

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>NZ_CP024731.1|WP_099986832.1|1597209_1598703_+|S8-family-peptidase
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>NZ_CP024731.1|WP_008794150.1|1595190_1595823_+|DUF421-domain-containing-protein
MGLSYLDIAIKLTMGLLSLVLVINISGKGNLAPSSAMDQVLNYVLGGIVGGVIYNPSITVLQYFIILMMWTIIVLLLKWLKTNSVIFKTILDGQPVILIKKGVLDVEACRRAGLTAYDIAFKLRTNGIYSIKKVKRAVLEQNGQLIVVLQDEENPKYPIITDGTVQTNILEAIDKDTEWLETVLKEMGHDNISDIFLAEYDNGKITVVTY
>NZ_CP024731.1|WP_008794151.1|1594738_1595191_+|DUF3290-domain-containing-protein
MRFYSYNYLLEQIAKFDWWGAVFTLFLIICLIFTLFKYNKGHKESKFRELAIIFTLTIIVVISIKITQYQESHINDNRYRQAVHFIEVVAEDLKTDKENIYINTSASIDGALVRIGTLYFRVISGDNGENYLLEKIDLENPKVELIEVRK
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>NZ_CP024731.1|WP_099986836.1|1592931_1593552_-|thiamine-phosphate-synthase
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>NZ_CP024731.1|WP_099986818.1|1609250_1609973_-|murein-L,D-transpeptidase-catalytic-domain-family-protein
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>NZ_CP024731.1|WP_099958036.1|1609990_1610485_-|PTS-glucose-transporter-subunit-IIA
MGLFDMFKKKEKTVVTIYSPMNGKVIELKDVPDEAFAQKMVGDGCAIEPDKGVICSPVDGQLMNIFPTNHALIFETVDGLEMIVHFGIDTVKLDGKGFQKLREAGTIKIGDEIIKYDLDQISSGVPSTRSPIIINNMEKVEKIEVLSLSKIVKIGEPIMKVTLK

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	55849 : 79671	35	Fusobacterium_phage(87.1%)	transposase,capsid,terminase	NA
DBSCAN-SWA_2	83677 : 93449	18	Fusobacterium_phage(70.0%)	integrase	attL 78788:78803|attR 91778:91793
DBSCAN-SWA_3	690371 : 696199	6	Synechococcus_phage(33.33%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_4	781349 : 842487	87	Fusobacterium_phage(85.42%)	holin,tail,tRNA,capsid,integrase,plate,portal,protease,terminase	attL 776780:776798|attR 836900:836918
DBSCAN-SWA_5	864170 : 924291	76	Fusobacterium_phage(24.24%)	tail,head,tRNA,capsid,integrase,plate,portal,protease,transposase,terminase	attL 885920:885979|attR 920745:920808
DBSCAN-SWA_6	1374642 : 1431097	87	Fusobacterium_phage(66.67%)	holin,tail,tRNA,capsid,integrase,plate,portal,protease,terminase	attL 1381486:1381512|attR 1429700:1429726
DBSCAN-SWA_7	1955465 : 2019494	43	Bacillus_virus(18.75%)	transposase,tRNA,protease	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP024731|55849:79671|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_099988278.1|75052_75658_-	7-carboxy-7-deazaguanine synthase QueE	S4TZT1	uncultured_phage	2.3e-18	31.9
WP_099988277.1|75660_76128_-	6-carboxytetrahydropterin synthase	J9PV91	Bacillus_phage	5.2e-10	29.3
WP_099988276.1|76130_76820_-	7-cyano-7-deazaguanine synthase QueC	A0A1U9WRB5	Streptococcus_virus	1.6e-52	48.9
WP_099988275.1|76816_77608_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_099988274.1|77604_78099_-	ParB N-terminal domain-containing protein	A0A0E3U266	Fusobacterium_phage	6.0e-65	84.1
WP_099988273.1|78095_78452_-	hypothetical protein	A0A0E3Y6I1	Fusobacterium_phage	9.7e-49	88.7
WP_153232647.1|78644_78809_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_099988272.1|78809_79163_-	RusA family crossover junction endodeoxyribonuclease	A0A0E3U267	Fusobacterium_phage	2.4e-39	65.5
WP_099988271.1|79167_79671_-	hypothetical protein	A0A0E3Y4W5	Fusobacterium_phage	5.4e-45	58.1

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP024731|83677:93449|DBSCAN-SWA
TTTACAAAGGTTTTCTTGTTGAAACTATTTTTATAACTCTACCATTAATTTTTAAATATTCTTGTTTTTCTTCACTGATTAAAATATCGTCATAATCTGTATTATCACTTTTTAAAATAACTATTCTTGTATTTTCATCTATAACTATTCTTTTAATAAAACTTTCATCATCATAAGTTACAACATATATTTTATTTTTTTGATATGCTGTATCATTGGGATCAACCAATGCAAACTCTCCCTCTATAATAGTTGGCTCCATACTATTGCCCTCTATTTTAACAAAAAAGCAATCATTTGGAAAGTCTTCATCTAATATTGGCATTTTATATATTTCTTGTTCTAAATTTAGATACCCATTTCCAGCACTTGCTTTGCCATATACAGGAAAATAAACTATTTTTCTCATTGAATTTTTAATTTCAAAACTTTCTTTTTTTGTATGTATTTCTATGTCATCATCTAAAAAGCCTACCATTTTAAATAATTCAATAACATCTAGTTTTAAAGCTTTTGCTAGTTTTTTTAAATAAATAGGATTAAGTTTTCTTTTCTTACCATTTTCTATCCTTGAAAGATCTGACTTGTCTATGTCTGTTTTTATCAACATTTGATTAGTGCTATATCCTAACTCTTCTCTTCTATTTTTTAAAAAATTCCCAATTTCTATAGCTTTTTCTTCTGTTAATTCATAATCTCTTTCTTTCATAGTGAAAACTCCTTTTTTCTTATATTTTAATACTTCCGTTGACATTTGACAACAAAAATAAAAAAATAATTAAAAAAACAGTTGACATTTGACAACTAACATATTATAATAACTATATAGAAATTAAGAAAACAAATTTTTTTTAAATATTAAGTTGTTAATTGTCAACTTAATTGAAAACGGAGGGGAATATGAAAATAAGAGAAATAAGAAAAATAAATACATTTAGAGTTATAGGAGTTCCTATAACTCTAAACGGAGAAACTTACTCAGTGTGGGCTAGAATACCTAGTCCAGCACTAATAGGAAGATGGGCAACTTTTAGCAAAAAAGAAACTCTTGATTTAAGAGTTTCAGACTTCCCACAATACGAAAGTGGAGAAGGGTGGGCAGAATAATGAAATTAAAAGAAGCATTAGAAAGATTAGATCAAGAGTTGTTTAACATAAATTATAACTTCAATTCTCAATATTGGGAATTAGTTATATTTACTCAAAATTATGACATAAAAGCTGAGTATAAAGAAAAATTCTTAGTTGATATATTAAAAGAACATTTTAAAGAAAAAATAGATTTTGATAATTGCAAGGAAGCGTATTATCAAGATGGATATAGAAATCTAAGTCTTAACTATGATAATACAGATTTTTCAGACAATTTTATAACTCTATCTTTAAATGACAGATATGAAGATCAGCACCAAAGAATTTTAAGATTAAAAGATGTAGAGGATCTAGCTGAAAAGCTAGAAAACTTAAATAACTTATTTACAGATTATGAAATTAATTTGACTGAAATATTTAAGGAGGCTAGATATTATGGCTTATATAGATAAAACAATAGGAGAATTAATAATTAAAAGAGTATACGAATTTGTTACTGATACCAATAAACATTATGGTGAAGTTATAAAAAAATACGCAGAATTAAATGCAGATCCGAGTTTCTTAATAGGAGTTAAGGAAGGACAAACAGGAGTTTTAAAAACTTTAATAAAAGAAATTAGAGAGTTGGAGGAGGAATAAAATGAAAGATTTATATTTTATATCAGAAGAAACAAAAATAATATTTGCTCTAGTAGAGCTAGATGGTAAAGCTCAATTAAATCTGCTAGGTGTTGATTATTATCATTATGCAGTAATTGAAGCTGGACAAAAATGGTATTACGAAACAAAGGATATTTTAGAAAAATCTAATCATCCAAAAGCTAAAGAAGCTATGAAACAATTAGAAAAGATTTTTAAAGGAATGGGACATCCAAACATTAAAAAATAAGGGAGGGTAAAGATGTTAAAAGGAACTATTTTAGATAAATATTGGGATAAAGAAGAACTAAAAGGGCTTTCATTAAAGAGAGCCCTAGCAATAATACAAGTCTTAGAGATGTGGGAGGGGAATATTGAATGATGATAAAAGATAATTATGCTCAAGCTTCTATTAAGGAAGTTTTGAGATATAAATTGAATTGGTTATATAAATTATATTTAAAATACGTTGAATTGTATGATTTCGACAATTTAATCTAGGAGGATAAAAATGAATATATATGAAAAACTTTTGAAGGTGCAAGTTGAGTTAAAAGCACCTAAGGGGCAATATAACAGTTTTGGTAAATACAAGTATAGAAGTTGCGAGGATATCCTTGAAGCTTTAAAACCTGTGTTAGACAAGTTAAAACTAACATTATTTATAAGTGATGAAATAGTTGAGGTTGGTGGAAGTTATAAAACAATTAAAAAAGATGAAACAGTTGAAAGTGAAGGAAGAAAATATGTAAAAGCTACAATTACTCTTGTAAATATAGAAAAGCCTGATGAAATTATAAAAATATCAGCACTTGCAAGAGAAGAAGAAACAAAAAAGGGACAAGATGGTTCGCAAATTACAGGGACTAGTTCAAGTTATGCAAGAAAATATGCTCTAAATGGCTTATTTTTAATAGATGATACTAAAGATAATGATACATCAGATTCTAAAATAGAAAGAGGTAATCGTGCAGAGGAAGAAAGAAAAAAAGTTGAAGAATATTTGAATAGTAGACCTGGAATGATTGAAAGATTAAAAGAAAATCTTTCAAGTGATAAATTAGAAAAAGTATTAAAAGCTTACAAGGTTGAAGAAATTTGGCAAATGTCAGATGAACAATTAAAAGAAGCTTGTGAAAAAATATTTAAAAAATAGGAGGATATCATGAATATAGTTATTTTAAAAGGTAGGCTTACTAAAAGTCCTACCTTACTATTTAGCAAGTCAGGTACAGGTTATACAATTATTAATGTAGCAGTTGATAGGTATAGTAAAGATAAAGATAGTAATGCTGATTTTATAAATTGCACAGCATTTGGCAAAACAGCTGAGTTAATAGCTGATAAGTTTAAAAAAGGTCAAGAGATATTGATACAAGGTAATTTGAAAGTAGATGTTTTTGAAAAAGATGACAAAAGAGAGTACAAAACATCTGTATTGATTGAAAGAGTTGAGTTTTGTGGAAGTAAAAAAGAAAATACAGAAACTAAGGAAGAGGCACAAGATAATGAGGAATTTCCTTGGTAAATGAGATAGGAGTAAATAAAAATGAATGAAGAAAAAAATTTAAAAGATGAAATTATAAAAGAAATAGTAGAAATGACTGAAAGTTTTACAAAAAATACAATGGAAGAAATTATAATTGATGAATTTTTTAAAATTGCTGAAGATTATGTTAATAACAAACCTTATAATCTTGAAAATAATTTAACTATGATTGGATTTGCAGTTGAAACAAATAGAATTTGTGATGCAATTCAAGATGAAAAGTTAAAAAATAAGTTGGAAGAAAAATGTCAAATGATATGGGATAAATGGTATCAAAAAATTCATAATACAATAGATGAATTTGATACTGTTAAAGCAATAAAGAAAAAAATTGAAGAAAAAAGCAAAAATTAAGGAGTAAATAAAATGGAGAAATTAGGATACACTAGGCAAACACAAAAATTAATATATTGGCTTTTAGATGACTTTGCTAACTTTTGGCAAGGTAACGAGGCTGGAGCAAGACCATCATTTATAGAATTAGCTTACACAAAAGAAGTAATGAAAGCTAAATTTGTAAAAATCTACGATGGTTTTGACACTGTTAAAAATGCTCAGGCGTTCCTAATTTCTTCTATCTACAATAAGGATAATCTAACAGTAGATGAATTGACTAACAATGTAATAAGAGCATTACAGAGCCTAGCAATTCAAAATGGGGGCTTTAGTCTATCGTTGAATGCTTTAACTCAAAAACAAGCTAATGATTTTGTCAAATGGTTGTTTGAAATGGCTATCTATTGGGAGATACCACTTAGAATGGAAATAAGAGATTTATTTGCTCAAGACTATCACGATACTTTTATATATACAACTTTAAAAAAGAAAATATGTTGTATATGTGGAAAGCCTGGAGAGTTGCAGCATTTTGATAGGGTAGGGAGTTCAGGCTATAAATCAGATACAGGTCTAAATTATAGGGTAATGTGCTTATGTAGAGAGCATCACGATGAAGCTGATAACTGCATATCAAGAATTGATTTTATTAAGAAATATCATTTGAATGGGATATACTTAACATCTGAACAAGTTAAGGAATTAAAGGGAGTATATAAAGGACACTTTCAAGCTTTTAAGGAGGAGTAATGCTGAACATAAATATTAATAAAGATGGAGTTTTTTTTGAATTAAACGGAGAAAGGGTAAAACTAGACGATAAAGTTGTTGATGATTTAGCTGAAAAAATAGTTAGCTATATTTGTTATAGAGATAAAAAAGAAATTATGATTTTTACAGATAAAGAAAAAACAGGTTTATAAACAAATGAATAACGACTATTTCTATTTTGGAAACAGTCGTAAAATCTAAAGTTGAACGATTTTGCTGACGTCGGGAAGATGTTCAAAGTATTGAAAATAGGAGGAAGTAATGAAGAAAGAAAAGGTATTAGAGATAGAAATTAAAAAAATAAATGATGAATATTCTGTCTTTTATCCTACAAAATTAAATATTAAAGAATTAGAAAAAGCTGGATATACAGTTACTGAATTTGATGTATTAGATGAAGTTAAAAAACCTGCAATTAATTTTTATTTTAATAATAAAAATGACTTTACTATTTTATTAAATGACACTTCTTTAAATGTACCTTTTATAATAGAAAATATTTATATAGAAGAATTAAAAAGAACAGTAGATGAATATAATGAAAAATACAGAATACTTAAGAGATGGAGAGCAGAAGAAGGAGAAATTTATTATTCTATTGCTGGTGTAGATGTAATAAAAATTGATTCAGAAAATTTAGTAGAATTAGATAACCGTAGATATGAATTAGGTAACTACTTCCAAAAAAAAGAAGAAGCACAAAAAATAATAGATAGCAAAGAGTGGCAAGACTTCTGGGCTAAGGTAAGATCAGGAGAGATTGGAAATGATTAAACTAATAAAAAATAGTGAAATAGACAAAACAACAAGATATAAATTTTATGGAATTAGATGCAATTGTTGTAATAGTACTAATAATGTAAATGTACTAGAAATTAGAGCAGAAAACTCTAGTGGAGGTACAATAATTGATATATGCGATAAGTGTCTAATTGAATTAAAAGAACAAATAGAGAAACTTGGAGGAGAAAATGAGAGAGATTAAATTTAGAGCTTGGGTAAAAGAAAAAAAAGCAATATTTGAAGTTATTTTAATTGATTATGTAACTAAAAAGGTAACTTATTTACTTGAAAGAGTTGGACATTTATTAAGTATAAGAGACGCTAAATTTAATGATGTTGAACTTATGCAATACACAGGGTTAAAAGATAAAAATAATAAAGAAATTTATGAGGGAGATATTCTTTTTGAAAGTTTTGGAGAAAGATATTACAAAGTTGTATTTGAAAATGGAGGCTTTAGAGCAGAGTTTAAGGGAGATTTTGATGAGCATTCTTTTGATTTAATTGATGTTGTTGCACAAGGTTGTGAAATAGTTGGAAATATTTATGAAAACTCAGAATTGATAAAGGAAGTGAGATAATGGAAAATAAAAACGATATATCTACAATGAAAAAAGAAGATCCTAAGATTCGATATAATATTGAAGTTATATACTTATCTAATGATGTAGAAGAAACTATCAATGTACATTATAATTCAGCTTTTTTATTAGATGAGGATCAACAAAATAAAGTCTTAGAAGATTTTTTAAGTATTGTAAAAGAGTATAAAGGTTTTAAAGGAATTATTTCTTCATGCATTTGGAAAGATGGAAAAAGTAAAGAAAGAATTAATTTAAATAAGTTGAAGAATTATAAATCTTTGGCTTATGGAGCTTCTAATATTGCCCAGCTAGGAAAAGTTAAAGAGGAGTACAAAGAGTTATTAGCTGAAGTTAGAGAAACAAGCACTTTTACAACAATTAAAAACATGGATAATTTTAAAGCTGAAGCTTTAGACTTAATAACTGCTACTGTGAATCTGTTACTGTTGAGTGGATTAACAGAGCAGGATTTTGATAAGCATATTGAAAAATTAGAATCTTATAAGAATGGGAAATATAAGAGATAAGGAGGAGAAACAATGCTGCACAGATATCAAATAGATTTGAGAGTTAAAGAAGAAAATACAGAAAAAACAATTAAAAAATCTATTTTTAGAAAAAATGAACTAACAGATGCTGAACTAGAAGAAGCACAGTTGGAGTTTATAAGAAGTACAAAAGCAATATACAAAGAAAAAGGGATAGAATTAGAAGTTTTGGAATGGGGAATTCAAAAATTTGAGTTAGTCAGCCATTTTCAATAAAATTTAGAGAGAATTGGGAAGGAGTGAGATTAATGAAAGAATTAAATCACAAGGAAGCAAGAGAATTAATATTACAAGGTAAAAAAATTGCTAGAAATTTTAATCTAAGAATTTATACTCGTTTTAAAGATGGAAAGCTTGTAAGAGAAGAAGACTGCGGGAGAGGTAGAACTCATATAAGAAAAGTTTATAATAATGGAATTTCAGAACTAGATGAAATGTTTAAAGGACTTGAAGAAAATGACAGTTATAAATTTGTAGAGGTGGAATAGATGGAAGAACTTACATACAATGCAAAAGAAGTTATGACAATGTTAAAATGTTCACGTGCTACAGCATATCGAACAATAGATAAAATCAATGGAATACATTGTAAAAAAAATAAACTAAATGAAAAAGCTATGATAAGGGGCAAGGTTAGTAAGAAAGTATTTCACGAATACTATCCAAGTAATTAAAGATGTTTACAAAAATCAAAAGGGGGAGTAATATTATATAAACTCCCTCTTTTTTAAAGGAGGATAAAATGAAAAATGAAAATGGTTCAGGTTCAGTATATAAGCAAAAAGGAAAAAGGAGGAAATGCTGGATAGCTAGAGTTACTATTGGCTTTGTAGATGGAAAGCAAAAAAGAAAGATTATAGGAACATATGAAACTAGAAAAGAAGCACAAGCTGAGTTATTAGGATATTTGAATAACCCTACTTTGTACAGTGGTAAAACTTTTAAAGATGTAAGAGATTTATGGTATCAAGGATATTCAAAAAACATTTCTAATGTAACACTTAAAACTTTAAATGCACAGTTAAAAAAACTAGATGAATTCGATGATATAAAAATTAAAGAAATTAAGTTACATTCATTACAAAAATTTTTTGATAATATAGAAGCTTCTTATGGAACTAAGTCTTATATAAAAAGCATTTTAAATATGATATTTGAATTTGCTTTAAAAAATGAATTTATTGAGACTAACAGAGTTAAATTTATTGAATTAGGTAAAAATGAAAAAATTATTGAAAGAAAAATATTTACATCAGAAGAAATAAAAATACTCTTTAATAACTTAGATTCTGATAATAAATTTGTAAAAAAAATGACATATGGAACTTTAATTTTAATTTATACAGGACTTAGAATAGGCGAATTCATAAACTTAAAAACTAAAGATATTAATTTAGAAAAAAATGTAATATATATTACAAAGAGCAAGACTTCTGCAGGGGTTAGAAAAATACCTATTTCAGATAAAATATTAAGTTTATTTAAAGATAATATAGATAATTCAAAAGAATATTTTTTCTTTAATAAAAAAGGTAATAATTATTTATACTATAATTTTTTAACACAATTTAATAAAATGCTGGAACTCTTAAACTTAGGAAAGCATACTATACACGACACAAGGCATACATTTGCGACTATGTTAAATAATGCTAATGCAAATAGTACATCTATAGTTAAATTAATAGGACATTCTGACTTTAAAACTACAGAAGAAATATACACTCATAAAGATATTGAAGAACTTAGAAAGGCAGTTAATTTATTAAATTGATTTTTGTTGACTACTTGTTGGCTACAGATGTAAGAATTATGATAAAAATAAGAATTATAAGAAAAATGAGAAAATTATAAAAATCAATTTTTTTTAAATCAAATATATATTGAGAAGTTCAAAAAAATTAGATAGAAACATAATCTATTTTGTGATATAATATCAAAAATTTAAAATTGTTAAAAAGGAAAATTCTATATAATTACTTAAAAACTAAGGAGAAAAAAATGATGAATGGAAAAATTTTAAAAGAAGGAATTACTTTCGATGATGTTCTACTAATCCCTGCAAAATCTGATGTGCTTCCTAATGAAGTAAGTTTAAAAACAAGACTTACAAAAAAAATCACATTAAATTTACCAATTTTAAGTGCTGCTATGGATACAGTTACAGAATCTGACTTAGCTATAGCCCTTGCAAGACAAGGAGGGATTGGTTTTATCCATAAAAATATGTCTATTGAAGAACAAGCTGCTGAAGTAGATAGAGTAAAAAGATCTGAAAGCGGAATGATTACTAACCCTATAACTCTTAATAAAGATAGTAGAGTATTCCAAGCTGAAGAACTTATGAGTAGATATAAAATTTCAGGATTGCCTGTTATTGAAAATGATGGGAAATTAATAGGAATTATAACAAACAGAGATATTAAATATCGTAAAGATTTAGATCAACCTGTTGGAGATATTATGACAAGTAAAGGTCTAATAACTGCTCCTGTTGGAACAACACTAGAACAAGCTAAAGAAATTTTACTTGCTAATAGAATTGAAAAATTACCTATCACAGATCAAAATGGATATTTAAAAGGTCTTATCACTATAAAAGATATAGATAATATAGTTCAATATCCAAATTCTTGTAAAGATGAACTTGGAAAATTAAGATGTGGAGCTGCTGTTGGTATTGCACCTGATACTTTAGATAGAGTTGCAGCCTTAGTTAAAGCTGGAGTAGATATCATAACTGTTGATTCTGCTCATGGACACTCTCAAGGTGTTATCAATATGATAAAAGAAATCAAAAAACATTATCCTGATTTAGATGTAATTGGTGGAAACATTGTTACTGCAGAAGCAGCAGCAGAATTAATTGAAGCTGGAGTATCAGCAGTAAAGGTTGGAATAGGACCAGGATCTATTTGTACAACAAGAGTTGTTGCAGGAGTTGGAGTTCCTCAATTAACAGCTGTAAATGATGTTTATGAATATTGTAAATCTAGAGATATTGGAGTTATTGCTGATGGTGGAATAAAACTATCAGGAGATATAGTTAAGGCTTTAGCTGCAGGTGCTGACTGTGTTATGTTAGGTGGATTACTTGCAGGAACAAAAGAAGCTCCAGGAGAAGAAATTATTCTTGAAGGAAGAAGATTTAAAATATATGTAGGTATGGGATCTATCGCTGCAATGAAGAGAGGATCTAAAGATAGATACTTCCAAGCAGGTGAAGTTGATAACTCTAAATTAGTTCCTGAAGGAATTGAAGGACGTATCGCATATAAAGGTTCAGTTAAAGATGTTATTTTCCAACTTGCAGGTGGTGTAAGAGCAGGTATGGGATATTGTGGAACTAAGACTATAAAAGATCTACAAATAAATGGGAAATTTGTTAAAATCACAGGTGCAGGTTTAATAGAAAGCCATCCTCATGATATAACAATCACAAAAGAAGCACCAAATTATTCTAAATAG

Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP024731|83677:93449|84576_84783_+|WP_099988265.1|DBSCAN-SWA
MKIREIRKINTFRVIGVPITLNGETYSVWARIPSPALIGRWATFSKKETLDLRVSDFPQYESGEGWAE
>NZ_CP024731|83677:93449|87460_88045_+|WP_099988616.1|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP024731|83677:93449|89678_89960_+|WP_099988615.1|DBSCAN-SWA
MNLNKLKNYKSLAYGASNIAQLGKVKEEYKELLAEVRETSTFTTIKNMDNFKAEALDLITATVNLLLLSGLTEQDFDKHIEKLESYKNGKYKR
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MAYIDKTIGELIIKRVYEFVTDTNKHYGEVIKKYAELNADPSFLIGVKEGQTGVLKTLIKEIRELEEE
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>NZ_CP024731|83677:93449|89972_90197_+|WP_099988255.1|DBSCAN-SWA
MLHRYQIDLRVKEENTEKTIKKSIFRKNELTDAELEEAQLEFIRSTKAIYKEKGIELEVLEWGIQKFELVSHFQ
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MNEEKNLKDEIIKEIVEMTESFTKNTMEEIIIDEFFKIAEDYVNNKPYNLENNLTMIGFAVETNRICDAIQDEKLKNKLEEKCQMIWDKWYQKIHNTIDEFDTVKAIKKKIEEKSKN
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MNIVILKGRLTKSPTLLFSKSGTGYTIINVAVDRYSKDKDSNADFINCTAFGKTAELIADKFKKGQEILIQGNLKVDVFEKDDKREYKTSVLIERVEFCGSKKENTETKEEAQDNEEFPW

Homologous phage analysis in the prophage region

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78788:78803	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_099988259.1|86959_87313_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_099988616.1|87460_88045_+	hypothetical protein	A0A0E3Y6J2	Fusobacterium_phage	1.4e-100	90.7
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WP_099988257.1|88832_89051_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_099988256.1|89037_89430_+	hypothetical protein	A0A0E3Y4X1	Fusobacterium_phage	6.7e-27	56.2
WP_099988615.1|89678_89960_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_099988255.1|89972_90197_+	co-chaperone HscB	NA	NA	NA	NA
WP_099988254.1|90229_90469_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_099988253.1|90469_90655_+	hypothetical protein	A0A0E3U274	Fusobacterium_phage	2.6e-21	78.7
WP_099988252.1|90723_91755_+|integrase	site-specific integrase	A0A0E3Y5J2	Fusobacterium_phage	8.0e-152	75.8
WP_099988614.1|91985_93449_+	IMP dehydrogenase	A0A1V0SHK8	Klosneuvirus	1.8e-101	41.5
91778:91793	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP024731|690371:696199|DBSCAN-SWA
TTTAATGTTTAAAGTGTCTTAATTTTGAGAATATCATAGAAATATTATTTTTATCACATTCTTCAATAGAATCTTTATCATTTACAGAACCACTAGGTTGAATTATAGCTTTAACTCCATTTTTAGCTGCTAATTCAACTACATCTTTAAATGGGAAGAATGCATCTGAAGAAAGTACAACATCAGTTGTATTAAATCTTTCTTTAGCTCTTTCTAAAGCTTTTTCAGCTGCCCAAATTCTACTTACTTCTCCTCCACCTATTCCTAATGTTTGTAAATTTTTAGCCACAACTATTGCATTTGACTTTACAAATTTTACCACTTTTAAAGCAAAAATTAAATCTTTTTCTTCTTGACTTGTAGGTTTAGCTTTAGTAACAACCTCTAAATCTTCATATAATCTATTATTTGCATCTTGAACTAAAATTCCACCATCAACTTTTATTAGCTCTTTTTTGTCACTTGGTTTATCTTTACATTCAATAAGTCTAATATTTTTCTTTTTACTTAATATTTCTAAAGCTGAGCTTGAAAAACTAGGTGCTATTATAATTTCTAAAAATATTTCATTTAATAATTTTGCACTTGCTTCATCAACTTCTCTATTGAAAGCTACTATTCCACCAAAAATAGATACGGGATCTGTTTCATAAGCTTTTCTATAAGCTTCTTCAACATTATCTCCTAAGGCAACTCCACAAGGCGTAGAATGTTTTACAGCACAACAACAAATTTCATCAAATTCAGAAACAACCTTCCAAGCAAGATCCATATCTCTGATATTATTGTATGAAAGCTCTTTTCCATTAAGTTGTTTAAAGTTTTTCATAGCACCATCAGACATATTATCTGTATAGTATGCAGCTTTTTGATGTGAATTTTCTCCATATCTCATTTCCATAGACTTTTTATATGAAATATTTAGATATTCTGGAAAGTCTTCATCCAATAAGAATTGTGATATAGCTGCATCATAGGCAGAAGTCAGATTAAATACTTTTCCTGCTAATTTTTTTCTAGTTTCATAAGAAACATCATCACTATTATTTATTTCTTCTTTTATAAGCTCATAATCTTTCACATCAGAAATGACAACCACATCTTTAAAAGATTTAGCAGCAGACCTAAGCATAGTAGGTCCACCTATATCAATAAATTCAATTTTTTCTTCAAAAGATAAATCTTCTTTTACTTTTTCAAAGAAAGGATATAAATTTACTATAACATAATCAATAGTATCTATATTTCTTTCTTTTAAAGTTCTCATATGTTCTTCATTATCTCTTAATGCTAAAATTCCACCATGTATATTTGGATGTAAAGTTTTAACTCTACCATCTAACATTTCTTCAAAATTTGTTATCTTACTAACTTCAATAACTTCAATATTATTTTCTTTTAAATATTTATATGTTCCACCAGTAGAAATAATTTCTATTCCTTTACTAACTAAAAATTTTGCAAAATCCAATATACCTGTCTTATCATATACTGAAATTAAAGCTCTTTTTTTCATCTCAATTCCCTTTCATATTTTTTATTTTTGAGTTTAGATTCTACAATATCTTTTTAATACCTTTAATCAATAATTTATGTTCTTGTTCCAAAACTCTTTTTTGTAATGTTTCAGGAGTATCATCTTCTAATACTGGAATTTTTACATTAGTTATAATTTCACCAGCATCTATTTCATTAGTGACGAAGTGGACAGTACATCCACTTTCTTTTTCACCAGCTTTTATAACTGCTTCATGGACTTTTATACCATACATACCTTTTCCACCAAATTTTGGTAATAAAGAAGGATGTATATTTATAACTCTTTTATCCCATTTTTTTATAAATTTTTCAGTCAAAATTGACAAATACCCTGCTAAAACAATATAATCAGTTTTACATCCTTCTAATGTAGAATCAATAATCTCATTAGCTAACTTATTATCAATAATTTTTCTATCTAATAATAATGTTTCAATACCATGTTTTTCAGCTCTTTGTAAGCCATAACACTCTCTGTCTGCGATAACATAAGTTATTTCACAATTCAAATTACCATTCTCTACATTATCAATAATTGACTGTAAATTTGATCCACTTCCTGATACAAGAACTGCTATCTTTTTTTTATTTATTTCAGACATAAATTATGATCTCCTTTTTCAATATGTCCTATTTCATAAGCAGTTTCCCCTAATGAAGTTAATAATTCAATAATAGGTTCAACATCTTTCTCTTCTACTACTAAAGTAAAACCTACTCCCATATTGAAAGTTCCAAATAATTCTTCTTCTTTTATTTTACTTCTTTCAGCAATTAATTTAAATATTTCAGGAACTCTTACTTTTTCTCTAAATACTACTGGAGATAAATCTTTTCCCATACAACGAGGTAAGTTTTCATATAGACCTCCACCTGTTATATGTGCCATACCATTTACATTAAATTTTTCTAAAACTTTTAAGATAGGTTTTACATAAATTTTTGTAGGAGTCAATAAAACATCTCCCATAGTTACATTTTCTCCATATTCTTTTAAAGAAACTTTTTCATTATAGTCAGTAAATATTTTTCTTACTAGTGAATATCCATTGCTATGGAAACCACTTGAAGCTACTGCTATTATTTTATTTCCTTCTTTTACTTTTGAACCATCTATTAAATTTTCTTTTTCAACTATTCCAACACAGAAACCTGCTATATCATAGTCTCCTTCTTGATAGAATCCTGGCATTTCAGCAGTTTCTCCACCTACTAAAGCAGCATAAGATTGTAAACAACCTTCTGTAACTCCTGAAACTAATTGTGCAGCCACTTCTGCATCAAGTTTACCACAAGCTAAATAATCTAGGAAAAATAATGGTTTTGCTCCATGGCATAGTACATCATTTACACACATAGCAACACAATCTATTCCTACTGTATCATATTTTTTTTGTTTCATTGCAATTTCTAATTTTGTTCCAACTCCATCAGTTCCTGAAATTAAAACAGGATTTTTATATTGTCCTAATTCATACATAGCTCCAAAGCTACCTAAGTTTGTTAGAACAGATTTATTATGAGTTTTTAAAACATTTTTCTTCATTAATTCAACTGCTTTGTATCCTTCTTCTTTATCAACACCTGAATCTTTATAAGAATTTATCATTATTCCTCCCATTTTTTGTTGTTAGTTTTGCTTTTACTTTTACTAAATTATTCCTCATCTTCTTTGAAGCAACCTGTATAGAAATCTTCTCCACCATTTAAAATTTTCTTTAAATTTTTTAATGATAGATAATCTAAAGTTGTTGCTCCTATTGCTTGTCTTATTTCTTCAATGCTCATATAGCTACCCATTAATTTATTGTTAGGATCTATATTAACTCCAAAATATGATTCTTCTATAACAACAGGAGAAGCTGATCTAAAATGCACTTCTTTTGCCCCTGCTTCAAATAAAACATCTATTAGTTTTTTAGATGTTGTTCCACGAACTATAGAGTCATCTATAACTACTACTCTTTTATCTTTAATTAATTCTTTTATTGGATTTAACTTAACTCTTACTGCTCTTTCTCTTAATTCTTGAACTGGAGCAATAAATGTTCTTCCAACATATTTATTTTTCAATAAAGCAGCTGAATAAGGTATTCCACTTGCTTCAGCATATCCTATTGCTGCTGGAACTCCTGAATCAGGAACACCTATAACTATATCAGCTTCTATTGGATTTTGTTCATACAAGCATTTTCCTGTTTGATGTCTAAAATCATAAACACTAATTCCATCTATAACACTATCTGGTCTTCCAAAATAGATATATTCAAATGAACTTGCTTTTTTAGTGCTTTCTTTGTATTTTATGCTTTCCACTCCATTATCATCTATGACTACCATTTCTCCAGCTTCAATATCTCTTACAAATTCTGCACCTATAGCATCTAATGCACAACTTTCAGAAGCTAGAACATACATATCATCTTCAGCTATTCTACCTAAACATAATGGTCTTAATCCTTCAGGATCACGTACTCCTATAAGTTTATCATTTATTATTATTCCAAGAGCAAAACAACCTTTTAATTTTTCAACAGTTTTTAAAACTGCTTCTTTATATCCATATTTACCATTAATACTTAAAAATTTTAGTATAATTTCTGTATCTATTGCTGTTTGAAATAAAGAACCGTTGTTTAATAATTCTTGTTTTAATTCTTCTCTATTTGATATATCACCATTATGTACAAGAGATATATACCCCATTGCAGACTCTCCACCTATAGGTTGACAGTTTCTAATAGAAACTGTATTTTTGCTACCATATCTTGTATGTGCTATTAAAATATTTCCAATATATTTTTGGAAGTCTTCAACTTTAAAAACATCTGAAACAAGTCCAACATTTTTAACTGTCTTTATTCTAACTTCATTATTAGTTTTAGAATCACAGATAGTATAACCTGCTCCTTCTTGTCCTCTGTGTTGTAAAGCATACATTCCATAATATGCAATTCCTACTAAGTCCTTTCTAACCTTTTTTGAGTGCAAAGCTAATATACCCATTTTTTTATTTCTCCTTTTTTATAAATAAATCCTTACTTTTAAATTTTATTTTGCTTCAGTCAATCTTTTTACAACTTCTATATATGCTTCTTCTATATTTCCTAAATCTCTTCTGAATCTATCTTTATCTAGTTTTTCTCCAGTTTCTTTATCCCATAATCTACAAGTATCAGGAGTGATTTCATCAGCAAGTAAGATTTCTCCTTTAGAGTTTTTACCAAATTCAATTTTGAAATCTACTAAAGTTATTCCAATTTTATCAAATTTTTCTTTTAAAAGATTGTTAATTTTAGCTGTAATATCATAGATTTCTTTTAATTCATCATAAGTAGCAAGTCCCATCGCTACTGCATGATGGTCATTTATTAAAGGATCTCCATATTCATCATTCTTATAGCATATTTCAAATATAGTGTTGTTTATTTTAGTTCCTTCTTTAATTCCAACTCTTTTAGCCATAGAACCAGCTATTATATTTCTAACTATTACTTCTAAAGGAAATATTTTTACTCTTTGACATAGTTGATCTCTATCATTTAATTTTTTTACAAAGTGAGTTTTTATTCCATGTTCTTCTAACATATTAAATATTAAAGTTGTGATTTCATTATTCATTACACCTTTATTGTGAATAGTTCCTTTTTTAGCACCATTTCCAGCAGTTGCATCATCTTTATAATGAACTATTACTAAATCCTTATCATCAGTTTCATATAATTGTTTTGCCTTTCCTTCATAAATAAATTTTCCTTTTTCCATCTCTATTTCCTCCTAGTTTTTAAATAAAATATTCATTTCAATTGGTTTTCTTTATAATTCTACATGTATATTTTTTTTGAAATCTTCTTTCATTTCTTTTCTAAATTCTAAAAGTTTTCCTCTTAAATCTTTATTTCCAACTGCTAATATTTCTACTGCTAACATTCCAGCATTATATGAATTATTTATTGCTACAGTCGCAACAGGAATTGATTTTGGCATTTGTACTATTGAGAATAGTGCATCTAAACCTTCTACTGCTGCTTTTATAGGTACTCCAATTACAGGTAAAACTGTTTTTGAAGCTATAACTCCTGGTAAATGTGCTGCAAGTCCTGCTCCTGCAATAATAACTCCATAATCTTCTTTTTCAAATTTTTCTAATGTTTCTTCTAAAAGTTCAGGAACTCTATGAGCTGATAGAACATGAGCTGTATATTCAATTCCAAACTTTTTCAAGCAGTCTGCTGCTCCTTTCATTACATCAACATCTGATTTACTTCCAAATATTATTCCTACTTTCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP024731|690371:696199|691926_692511_-|WP_099987821.1|DBSCAN-SWA
MSEINKKKIAVLVSGSGSNLQSIIDNVENGNLNCEITYVIADRECYGLQRAEKHGIETLLLDRKIIDNKLANEIIDSTLEGCKTDYIVLAGYLSILTEKFIKKWDKRVINIHPSLLPKFGGKGMYGIKVHEAVIKAGEKESGCTVHFVTNEIDAGEIITNVKIPVLEDDTPETLQKRVLEQEHKLLIKGIKKIL
>NZ_CP024731|690371:696199|695725_696199_-|WP_005968315.1|DBSCAN-SWA
MKVGIIFGSKSDVDVMKGAADCLKKFGIEYTAHVLSAHRVPELLEETLEKFEKEDYGVIIAGAGLAAHLPGVIASKTVLPVIGVPIKAAVEGLDALFSIVQMPKSIPVATVAINNSYNAGMLAVEILAVGNKDLRGKLLEFRKEMKEDFKKNIHVEL
>NZ_CP024731|690371:696199|693565_694915_-|WP_008793588.1|DBSCAN-SWA
MGILALHSKKVRKDLVGIAYYGMYALQHRGQEGAGYTICDSKTNNEVRIKTVKNVGLVSDVFKVEDFQKYIGNILIAHTRYGSKNTVSIRNCQPIGGESAMGYISLVHNGDISNREELKQELLNNGSLFQTAIDTEIILKFLSINGKYGYKEAVLKTVEKLKGCFALGIIINDKLIGVRDPEGLRPLCLGRIAEDDMYVLASESCALDAIGAEFVRDIEAGEMVVIDDNGVESIKYKESTKKASSFEYIYFGRPDSVIDGISVYDFRHQTGKCLYEQNPIEADIVIGVPDSGVPAAIGYAEASGIPYSAALLKNKYVGRTFIAPVQELRERAVRVKLNPIKELIKDKRVVVIDDSIVRGTTSKKLIDVLFEAGAKEVHFRSASPVVIEESYFGVNIDPNNKLMGSYMSIEEIRQAIGATTLDYLSLKNLKKILNGGEDFYTGCFKEDEE
>NZ_CP024731|690371:696199|690371_691886_-|WP_099987822.1|DBSCAN-SWA
MKKRALISVYDKTGILDFAKFLVSKGIEIISTGGTYKYLKENNIEVIEVSKITNFEEMLDGRVKTLHPNIHGGILALRDNEEHMRTLKERNIDTIDYVIVNLYPFFEKVKEDLSFEEKIEFIDIGGPTMLRSAAKSFKDVVVISDVKDYELIKEEINNSDDVSYETRKKLAGKVFNLTSAYDAAISQFLLDEDFPEYLNISYKKSMEMRYGENSHQKAAYYTDNMSDGAMKNFKQLNGKELSYNNIRDMDLAWKVVSEFDEICCCAVKHSTPCGVALGDNVEEAYRKAYETDPVSIFGGIVAFNREVDEASAKLLNEIFLEIIIAPSFSSSALEILSKKKNIRLIECKDKPSDKKELIKVDGGILVQDANNRLYEDLEVVTKAKPTSQEEKDLIFALKVVKFVKSNAIVVAKNLQTLGIGGGEVSRIWAAEKALERAKERFNTTDVVLSSDAFFPFKDVVELAAKNGVKAIIQPSGSVNDKDSIEECDKNNISMIFSKLRHFKH
>NZ_CP024731|690371:696199|692498_693518_-|WP_099987820.1|DBSCAN-SWA
MINSYKDSGVDKEEGYKAVELMKKNVLKTHNKSVLTNLGSFGAMYELGQYKNPVLISGTDGVGTKLEIAMKQKKYDTVGIDCVAMCVNDVLCHGAKPLFFLDYLACGKLDAEVAAQLVSGVTEGCLQSYAALVGGETAEMPGFYQEGDYDIAGFCVGIVEKENLIDGSKVKEGNKIIAVASSGFHSNGYSLVRKIFTDYNEKVSLKEYGENVTMGDVLLTPTKIYVKPILKVLEKFNVNGMAHITGGGLYENLPRCMGKDLSPVVFREKVRVPEIFKLIAERSKIKEEELFGTFNMGVGFTLVVEEKDVEPIIELLTSLGETAYEIGHIEKGDHNLCLK
>NZ_CP024731|690371:696199|694960_695674_-|WP_008793589.1|DBSCAN-SWA
MEKGKFIYEGKAKQLYETDDKDLVIVHYKDDATAGNGAKKGTIHNKGVMNNEITTLIFNMLEEHGIKTHFVKKLNDRDQLCQRVKIFPLEVIVRNIIAGSMAKRVGIKEGTKINNTIFEICYKNDEYGDPLINDHHAVAMGLATYDELKEIYDITAKINNLLKEKFDKIGITLVDFKIEFGKNSKGEILLADEITPDTCRLWDKETGEKLDKDRFRRDLGNIEEAYIEVVKRLTEAK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_099987822.1|690371_691886_-	bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase	Q58MG4	Prochlorococcus_phage	2.3e-59	43.2
WP_099987821.1|691926_692511_-	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	1.0e-23	38.0
WP_099987820.1|692498_693518_-	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	A0A127KMF9	Cyanophage	1.5e-65	44.1
WP_008793588.1|693565_694915_-	amidophosphoribosyltransferase	A0A1B1ISH6	uncultured_Mediterranean_phage	1.3e-48	30.9
WP_008793589.1|694960_695674_-	phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase	G8EYA2	Synechococcus_phage	2.5e-43	42.8
WP_005968315.1|695725_696199_-	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	9.0e-26	49.0

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP024731|781349:842487|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_099987748.1|798927_799251_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_099987744.1|801770_802046_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_099987738.1|805992_807099_-	phage late control D family protein	A0A0E3U253	Fusobacterium_phage	5.9e-137	68.5
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WP_099987736.1|807299_809936_-|tail	phage tail tape measure protein	A0A0E3U2N9	Fusobacterium_phage	2.9e-246	63.1
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WP_099987734.1|810433_810772_-	hypothetical protein	A0A0E3Y5E7	Fusobacterium_phage	3.4e-35	65.8
WP_099987733.1|810780_811314_-|tail	phage major tail tube protein	A0A0E3Y6F4	Fusobacterium_phage	1.2e-79	81.9
WP_099987732.1|811323_812724_-|tail	phage tail protein	A0A0E3U251	Fusobacterium_phage	4.9e-221	78.5
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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP024731|864170:924291|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_099987608.1|916748_917468_+	penicillin-binding protein	A0A0E3U2P7	Fusobacterium_phage	1.1e-59	50.8
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WP_099987604.1|918639_918939_+	histidine kinase	NA	NA	NA	NA
WP_099987603.1|919022_919463_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_099987602.1|919497_920445_-	DNA (cytosine-5-)-methyltransferase	V5URQ5	Oenococcus_phage	3.0e-89	55.0
WP_099987601.1|921045_922260_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
920745:920808	attR	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP024731|1374642:1431097|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_099987137.1|1405312_1406347_-|protease	Clp protease ClpP	A0A0E3Y6E9	Fusobacterium_phage	9.8e-33	35.2
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Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP024731|1955465:2019494|DBSCAN-SWA
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MKVRVHELAKKYELKNKEFLEILKKDIGVSVTSHLSNLDEDQVKKIDDYFAKMNMLKVETVEPVKMYKEKKEEKPIRKIIDEDEIEEGQKNNKKPKIQQKIKKNNNITFDEDGNSHKNKSKKKKGRRTDFVLKTVEATPDVVEEDGIKIIKFRGELTLGDFAEKLGVNSGEIIKKLFLKGQMLTINSPITLEMAEELAGEYDALVEEEQEVELDFGEKFALEIEDREADLKERPPVITIMGHVDHGKTSLLDAIRTTNVVEGEAGGITQKIGAYQVVKDGKRITFIDTPGHEAFTDMRARGAQVTDIAILVVAADDGVMPQTVEAISHAKVAKVPIIVAVNKIDKPEANPMKVKQELMEHGIVSVEWGGDVEFVEVSAKKKINLDGLLDTILITSEILELKGNVKKRAKGVVLESRLDPKIGPIADILVQEGTLKIGDVIVAGEVQGKVKALLNDKGERVNTAIVSQPVEVIGFNNVPDAGDTMYVIQNEQHAKRIVEEVRKERKIQETTKKTISLESLSDQLKHEDLKELNLILRADSKGSVDALRDSLLKLSNDEVAVNIIQAASGAITESDIKLAEAAGAIIIGFNVRPTTKALKEAETNKVEIRTSGIIYHIIEDIEKALAGMLDPEFKEEYQGRIEIKKVFKVSKVGNVAGCVVIDGKVKNDSNIRILRDNVVIYEGKLASLKRFKDDAKEVVAGQECGLGVENFNDIKEGDVVEAFEMVEIKRTLK
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MKRTFQPNQRKRKKDHGFRARMSTKNGRKVLKRRRVRGRAKLSA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_005965365.1|1956765_1957347_-	ATP-dependent Clp endopeptidase proteolytic subunit ClpP	A0A223W000	Agrobacterium_phage	9.0e-52	54.5
WP_099986475.1|1957519_1958809_-	trigger factor	NA	NA	NA	NA
WP_099986474.1|1958825_1960490_-	single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ	A7KV88	Bacillus_phage	3.4e-59	29.0
WP_008793929.1|1960497_1960860_-	30S ribosome-binding factor RbfA	NA	NA	NA	NA
WP_005965373.1|1960874_1963073_-	translation initiation factor IF-2	A0A2H4UTS4	Bodo_saltans_virus	3.2e-25	24.1
WP_099986473.1|1963086_1963617_-	DUF448 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_099986472.1|1963609_1964671_-	transcription termination/antitermination protein NusA	NA	NA	NA	NA
WP_035467822.1|1964697_1965168_-	ribosome maturation factor RimP	NA	NA	NA	NA
WP_099986471.1|1965373_1966534_-|transposase	transposase	Q331V1	Clostridium_botulinum_C_phage	1.2e-108	57.2
WP_099986470.1|1967730_1968834_-|transposase	IS200/IS605 family element transposase accessory protein TnpB	S6AND0	Bacillus_phage	3.3e-103	51.4
WP_005890045.1|1969807_1970065_-	30S ribosomal protein S15	NA	NA	NA	NA
WP_099986469.1|1970176_1972357_-|protease	ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH	E5ESM9	Bathycoccus_sp._RCC1105_virus	7.9e-117	49.3
WP_099986468.1|1972346_1973705_-|tRNA	tRNA lysidine(34) synthetase TilS	NA	NA	NA	NA
WP_099986467.1|1973742_1974678_-	endolytic transglycosylase MltG	NA	NA	NA	NA
WP_099986466.1|1974733_1976323_-	DEAD/DEAH box helicase	Q5GF26	Diachasmimorpha_longicaudata_entomopoxvirus	7.9e-58	35.9
WP_099986465.1|1981518_1990176_-	autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_099986464.1|1990369_1991089_-	toxin-antitoxin system YwqK family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_099986463.1|1991097_1993497_-|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit beta	A0A1L3IZU3	BeAn_58058_virus	1.3e-08	29.0
WP_099986462.1|1994428_1995532_-|transposase	IS200/IS605 family element transposase accessory protein TnpB	S6AND0	Bacillus_phage	4.7e-102	51.4
WP_099986461.1|1996450_1996918_-	metallophosphoesterase	NA	NA	NA	NA
WP_099986460.1|1996931_1999370_-	DNA gyrase subunit A	G3M9Z5	Bacillus_virus	6.8e-117	34.7
WP_035468064.1|1999595_2001515_-	DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing) subunit B	G3M9Z3	Bacillus_virus	7.6e-148	45.0
WP_099986459.1|2001537_2001813_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_099986458.1|2001790_2002900_-	DNA replication/repair protein RecF	NA	NA	NA	NA
WP_099986457.1|2002913_2003129_-	S4 domain-containing protein YaaA	NA	NA	NA	NA
WP_005966250.1|2003178_2005074_-	chromosomal replication initiator protein DnaA	NA	NA	NA	NA
WP_005895154.1|2005703_2005838_+	50S ribosomal protein L34	NA	NA	NA	NA
WP_099986456.1|2005892_2006228_+	ribonuclease P protein component	NA	NA	NA	NA
WP_005966253.1|2006236_2006485_+	membrane protein insertion efficiency factor YidD	A0A2H4PQM5	Staphylococcus_phage	5.2e-25	69.4
WP_099986455.1|2006481_2007102_+	membrane protein insertase YidC	NA	NA	NA	NA
WP_099986454.1|2007103_2007883_+	Jag protein	NA	NA	NA	NA
WP_099986453.1|2007901_2009269_+|tRNA	tRNA uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34) synthesis GTPase MnmE	NA	NA	NA	NA
WP_099986452.1|2009492_2011376_+|tRNA	tRNA uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34) synthesis enzyme MnmG	NA	NA	NA	NA
WP_099986451.1|2011391_2012003_+	LysE family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_099986449.1|2012384_2013281_+	quinolinate synthase NadA	NA	NA	NA	NA
WP_099986448.1|2013282_2014575_+	L-aspartate oxidase	M1GXT4	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	7.7e-27	30.6
WP_099986447.1|2014552_2015413_+	carboxylating nicotinate-nucleotide diphosphorylase	NA	NA	NA	NA
WP_005966268.1|2015405_2015915_+	transcription repressor NadR	NA	NA	NA	NA
WP_005966269.1|2016291_2016555_+	type II toxin-antitoxin system RelB/DinJ family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_099986446.1|2016625_2017123_-	AAA family ATPase	A0A097BYE2	Leuconostoc_phage	6.0e-12	29.3
WP_099986445.1|2017167_2017671_-	YfbM family protein	NA	NA	NA	NA
WP_099986444.1|2018066_2019494_-|transposase	transposase	A0A0H3UZK2	Geobacillus_virus	7.4e-124	52.3