Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP018630 | Clostridium chauvoei strain 12S0467 chromosome, complete genome | 4 crisprs | cas3,DinG,csa3,DEDDh,WYL,cas6,cas8b1,cas7b,cas5,cas4,cas1,cas2,cas3HD | 0 | 5 | 6 | 0 |
| NZ_CP018631 | Clostridium chauvoei strain 12S0467 plasmid unnamed, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
1. NZ_CP018630
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP018630_1 | 589021-589096 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP018630_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP018630_1
>1.1|589045|28|NZ_CP018630|CRISPRCasFinder TAGGCAACAGAAAAACCTAAAAGATTTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018630_1
The CRISPR arrays of NZ_CP018630_1 >merge|NZ_CP018630|1|589021-589096|CRISPRCasFinder CGTGATTTAATTGCACGTCGTTGGTAGGCAACAGAAAAACCTAAAAGATTTGCGTGATTTAATTGCACGCCGTTGG >NZ_CP018630|1|1|589021-589096|CRISPRCasFinder CGTGATTTAATTGCACGTCGTTGG TAGGCAACAGAAAAACCTAAAAGATTTG CGTGATTTAATTGCACGCCGTTGG
>NZ_CP018630.1|WP_021874740.1|588380_588767_-|hypothetical-protein MLIVASVLKIKETITASKIVAALSKPKWLGEECNRKAFKGAYEQDKYKTLTEFPVYTGTTSKSRRIDVLVAENLRVKEHFNLNLHGIEIKVSKSDLVNDMKYSEYAEFINYLWLELLSICLFLILIRL >NZ_CP018630.1|WP_079481078.1|587860_588166_-|hypothetical-protein MDIQGLLAYLDGIYPSLKLIVNNSTKRQKTTIYVERKLILKLLYQPLSTVKGLDTKLFELLCSQYTNVSKILELVNRFRSILKAKDITKLDLWNILSILDI >NZ_CP018630.1|WP_021874739.1|586637_587141_+|hypothetical-protein MLKVFKNEGTKKENIEFDIYTPINIEFGVWNISKEPTIYWRTGDFSSSLIEIGIGQYKKDIRSITLTICKNVYELDNYSENNFNIFKGSPILELENINDEIYTDEKGTLKVYIESKNVSIIFSENEISDCLQNDNVDFYLDANKSLVGLSVNNISEENKAILKEALV >NZ_CP018630.1|WP_021874737.1|585471_586236_+|hypothetical-protein MDSVKASANIFTRECQEYWVFSLDGAATHNNSITDEQDQLIENKLNLEKLGYGNLRNYNGQITAEWNEQFNKVVNQFISDFGLKDKYDKLGGNKKTQLYVWISQAVNGQIIKVQRDTGSQGTNNKTHKEVITLESIRENFYLGIGDALIGAVKGVFEFVSHPIDGVIGVANGIQFLNKVISNPNCEEAIILDKIIVEAVNNFIDSNLNEKSRVLGRIVGEILIIVATDGIAESIMEHLPQIANQVKNGGKVEKY >NZ_CP018630.1|WP_079481077.1|583858_585073_+|DDE-type-integrase/transposase/recombinase MDSIITYLITYNQYLIAIIGQLLLFISQHIPLNQMIFDDSNSPEYQKFKVDKLPTIIRFEKVDYILLLAYYKHKYNKTVKPAQRRNGKSIPKKTKCPKCGAPHEYIYDNNGSKGQFQCKVCGLTFKETNYTTKPIVFICPYCGATLTEQKQRKHFKIHKCNNSKCLYYQRNLKNLPKNIDPCDKYKYKLHYIYREFNINFLKLNPISKHATGFSFKKFSPHIMGLCLTYHVNCKMSILGYQVSDTRATDPCILTMRMAFDKFKDFSGKALNFVADGYSSYPLAKQQFELEKNKEFNLTQVIGLTNDDPVSEEFRWVEQVVERLNRTFKSSYRGTCGYGSDEGALYGFSLWVAYYNFLRPHPYNYWRPLNELKQLDGIDNMPAKWQILISLGQQTILHMQESQTS >NZ_CP018630.1|WP_021874736.1|583303_583591_-|hypothetical-protein MDGTGTVIGGSLYNTNGAKNSANASTANKSNNKYRAYVQLYAYKTNGVIDRNSTRTGAESGDVGVSSYAANVGIWESLHSTDQSIDQNCGLRLYM >NZ_CP018630.1|WP_161493077.1|582184_583213_-|FtsX-like-permease-family-protein MKKNINTLLTLGFSIALFTISFIISSNYINIKYVIDENKFNDTFSYLDIHLQTPLSLLESNKLLKSIGINKYATQPSLVVNRIGETDYANKLIGVSENFNIEDYFNIEWLSNGKNDFYNRTDVVIIGNSLMQALNKLNSSTEYIEIQGENRKIAGVLKDSQYASFMTFMPIEYLRKENELSNIIQCFVDKNTNIAFGNLKGAIHNSPAKNVLKFAIDKSMTIEGEIVDIILGILTIVIFSICYVQINKRKFSIMRLVGAKQKHILYEYIRCLLPMFSIAFFIAIYFSSITINYISNNIDDIFFKVDLINICMTGIIGFILILLTSLLCMINTLRFRILEDIR >NZ_CP018630.1|WP_131431558.1|580988_582182_-|ABC-transporter-permease MKDKLFFTFRKDKVINIILIIQLTLSIFCIYNFLTTFFFKTEYTKLYNSSYDIENGIIIKFTPANISGQNVNPLPILKSLEKNNIKGGIMLEMPDEKYSIPLKTLNISPKLLMNREEYIFGDNTAILPIKMNYTSLNRHSDKINGQIEENMWKIEGNTIPVVVGVNFSNKFKIGDIIKFNGNDFHIIGVMSESILYQTHYDSILTAKDTSGKFIIPIEDKDYTSSYNNDPIIISNSDITSVETALKDFSNLFEIRNYGEDYEWFSKEIKYDLFKKNIRTLILMLATIGSLFITLLIKILSSKDRFGILYSLGFKQKEINNIFILEFSPILYIIIITSFILTNTVGKFSFRRFLVQNKVCYWGVSISIVILLIIICFKFIFNKINKLSPKEMMEDFNK >NZ_CP018630.1|WP_079481076.1|580299_580992_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MITLLNIEKIYGKNENQTIALKNINLQINEGDFISIMGSSGCGKSTLLNILGMIDKPTKGDYIFENQKINFNNINSLSEIRNTKISFIFQNFALINDMTVLNNCLLPLKFRKGKKSDKHNLIDKYLSELGILNIKNKLIKELSGGQQQRVAIARALVQDTKIILADEPTGALDEENSIKILEIFKLLNEKYKKTIILVTHDLDVSKYAHTTYIIKDGKFISNSKDFILNE >NZ_CP018630.1|WP_079481687.1|578383_579823_-|DDE-type-integrase/transposase/recombinase MDSIITYLITYNQYLIAIIGQLLLFISKHIPLNQMIFDDSNSPEYQKFKVDKLPTIIRFEKVDYILLLAYYKHKYNKTVKPVQRRNGKSIPKKTKCPKCGAPHEYIYDNNGSKGQFQCKVCGLTFKETNHTTKPIVFICPYCGATLTEQKQRKHFKIHKCNNSKCLYYQRNLKNLPKNIDPCDKYKYKLHYIYREFNINFFKMDLYPISKHATGFSFKKFSPHIMGLCLTYHVNCKMSTRQTAHVLKEVHGIKISHRTVANYALTAAAVIKPFVDTFDYKPSKILSADETYIKVKGIKHYVWIVMDACKRSILGYQVSDTRNTGPCILAMRMAFDKFKDFPGKALNFVADGYSSYPLAKQQFELEKNKEFNLTQVIGLTNDDPVSEEFRWVKQVVERLNRTFKSSYRGTCGYGSDEGALYGFSLWVAYYNFLRPHPYNYWRPLNELKQLDGIDNMSAKWQILISLGQQTILHMQESQTS >NZ_CP018630.1|WP_021874741.1|589169_589451_+|hypothetical-protein MAKLNKKDVLKTIISSAKLYKKALSGKLSVNDFELRTDGTTELKLLVLPSLMDFKDHVRMIGEFEDCSPKLFTEVLAGNIQGALGFVHDNKGE >NZ_CP018630.1|WP_021874742.1|589735_590695_+|sugar-ABC-transporter-permease MLKKSKKEESTKKNRFKTFKSNKELLLLTIPGAIWFLIFAYLPMFGVVVAFKDWRIHGGFLESLVKSEWVGFDNFKFLFQSSDAWLITKNTIAYNVVFIVLGIVIPVTLAILLKELLNKRGSKFYQSSMFLPYFLSWVVVSYCLYAFLSPEKGYINGLLTSFGMDKISWYTEPKFWPFIIIFMSQWKGIGYGTVVYLAAICGIDKTYYEAAIIDGASKWQQIKHITIPLLKPVLIIMFITAVGGMFKSDFGLFYQLPKNSGALYPVTNVIDTYVYRGLMNLGNIGMSSAASLYQSIVGLVLILVTNGIVRKVDNENAFF >NZ_CP018630.1|WP_079481772.1|590723_591680_+|carbohydrate-ABC-transporter-permease MNRKTARFRGKKSKEPAEEISKFNSISKGTNVGFNILFMILAALCIIPFIFVVIISLTSEQALQANGYRFWPQEWSFAAYKYIFSSGSQIMRAYGVTIIVTVSGTLLGLAIMSMYGYALSRKSFAYRKFFTKLIFIPMLFSGGMVSSYLVVTKFLGLKNSILALILPMCVSSFNIIILRTFFKTTVPDAIVESAKIDGASEWKLFLKIVLPISLPGIATIALFLTLGYWNDWFNAMLYIDDNSLMPLQYLLIRIESSMEFLSNNAALMGANAIEASANMPKDTAKMAIVVITTLPIIFAYPFFQRYFVNGLTIGAVKE >NZ_CP018630.1|WP_021874744.1|591806_594938_+|alpha-mannosidase MHYLLERIEKTCGEIAKYVYRDQINLEDYKYIDGNYHNIDLIKEAPEEGWREFKTGDLWGGKDCHGWFKCSVEVPEHFKGQTIALNFHTFEEGWDATNPQFILYVNGEQIQGVDINHREIILTHDAVPGTRYDIDLHAYAGMLADKLATLHGKLVVIDMVARDLYFNLKVPVDVCKELDKEDKNRIDMITVLNDAINLIDLRRPKSKEYNESVIKANEFLNEKFYGELCGHEYVTATCVGHTHIDVAWLWTVAQTREKVARSFSTVLKLMEEYPEYIFMSSQPQLYKFLKEDHPKIYKKVKEKVKEGVWEAEGAMWLEADCNVTSGESLVRQILHGKRFFKEEFNVDNKVLWLPDVFGYSAALPQILKKSDVDYFMTTKIAWNQFNKIPNDTFMWRGIDGTEVLTHFITTTCPGQDRASHFTTYNGHIQPDAIMGAWRRYQNKNINDDVLISFGWGDGGGGATLEMLENGRRLAKGIPGAPRVKMGTALDYFKRLDEKTKNNSKLPKWVGELYLEYHRGTYTSMARNKRDNRACENLYTSAEKINSLSMLYGKNYPYRSITDSWETVLLNQFHDIIPGSSIKEVYDVTEVEYKELLENGSKLVNEGVDYIASKINLKDRSVVVSNTLGFERSDIATFEVPEDIKNPAVIDNNGEELVCQRIEENKAIFFAKNVPANGHKSFKIVESTKEVTLDTVLTDKEAENKFVKIKFDDKGQIVSFIDKASGREILKDGAIGNELQAFEDKPMCFDNWDIDIYYKEKMWKVDDVRSIEVVEKGPVRSTLRIERKFLESTIVQKIYIYNDLQRVDFDSYADWKEFDVLLKTAFPIEVNANEATYEIQYGNVTRSTHNNTSWDVAKFEVCGHKWADLSEGEFGVSMLNNSKYGHDIKDGNMRLTLIKSSTDPNPDADKEEHYFTYSIYPHLGTWKDAETTQKAYELNVPLYTKVEEAHEGELSDELSLVKVNKNNVMIEVIKKAEDTDHLVVRMYEFHNKRTTATLEFLSDIEEIFECNLMERNLEAIEAHGNKIEFTIKPYEIKTFKFKLK >NZ_CP018630.1|WP_079481079.1|594968_595352_-|hypothetical-protein MKISKGNKYLLTITILFCSFYTLMISPVKEDRLSMGFIVLFIPALTIFILLMENSKLKKVLLSILLVLTALFIIVVVYLIAISGNFYPINGDRFNFSMFLQVCLFTSPILICYILLLRSIFKEIVSI >NZ_CP018630.1|WP_021874746.1|595618_597064_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MRKVKKLLALATCAVLTTSLALTGCGNSSSSGSKGDETVNLTWYTIGQEPKDLQLVEDEINKYLKDKINATIDMKFADFGDYDQKLSVVINSGEAYDLAFTCSWAGNYVGNARKGAFLELDDYLETTGKDMKKEIDQRFWDGAKVEGKTYAVPNQKELGVQPMWVFTKELVDKYNIPYQDIHELEDLEPWLKVIKEKEPEVVPLYIDKNLSPPQYFDFFSEPFGVEYEDEGLTVKNIFDTDKFKSTLKTLRKYYEAGYINTDSSIAQYDKSIKRFVTKADGQPYAEGIWAKDVGYELVASPIMDTHITSASTTGSMIAVSKNSKNPEKAVEFLNLLNTDEHLRNLVNYGIEGTHYDKVADKQIKLLPRSVDYGVAYFSTGNLFKTYVLDTEPTTKWDEFEEFNKNSKVSPALGFKFNPEPVSTQIAGISNAYQEFRALIFSGSVDIDEYIEKLNTKLKEQGMDEVMKEMQKQLDEWKKENK >NZ_CP018630.1|WP_021874748.1|599673_600150_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MHQEQFIENNNDKILKVITAVKTLILVFAALTYIFESLTLAVLILLVYVIVHFLTLSFFVEYEYELTEDELDLSKIMSKKKRKLIKTINLRNAEFFKDASEFSPQRYSNVKVVKLYTKEYVNKEKQVILINESGDMRAYELSLKDDLKKAIERIKRRG >NZ_CP018630.1|WP_021874749.1|600156_602007_+|family-20-glycosylhydrolase MYLIPSPKKLVNSSGSFNIRRDTEIILNYNCNFNDFEGALILKKEIEDNLGFDIKINKAYIDEKSKNAIKLIKSEVVGNEECYELEINKDSITIIGYGDSGLFYGIQTLRQILRQEGAILSNVKINDEPYFKNRGFYHDVTRGRVPKLETLKKLVDKAALYKINQIQLYIEHTFAFKGMSEVWIDKDPLTAEEILILDKYCKSRHIELIPSLATFGHLYEVLRTKSYSNLCELENMEDDEYSFVDRMAHHTLDVSNAESLKLVENMLKQFIPLFTSDKFNICGDETFDLGKGKSKELGEKLGQGKLYTGFLNKIIDIVKGYNKEVMFWGDVILNHTEVIKDIPQDVICLNWNYGAEATEEGTRKIHEAGREQYVCPGVAGWSHLMNLMDNGFENITRMISYGVKHEAKGVLNTNWGDYGHINILEASIPGMAYGGALSWNPKGEKEFETIYKGLSLLEYGDTSLTVVSILRDLSKTQVVTWSDLVRWKELFDKNSEVREGIKNLNIEDIIEGYNNATEIEIKLTALLNKVKNKEALQEFIVCTRGIILINKFFISLLKAKFKQECIGFDFDNNTLAKELEEWFYDYSYIWKKDSKESELNRIREVIKYTSKELRTF >NZ_CP018630.1|WP_096177118.1|602158_603607_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKFKKLLALAACATLTTTTLLTGCGNSGAKAGNKGDEPVTLTWYTIGQEPKDLQMVEDEANKYLEEKINAKIDMKFIDYGDYNQKLSVIINSGESFDLAFTCSWAGDYLGNSRKGAFLELNDYLDTTGKDMKEAIDQRFWDGATIDGKIYAVPNQKEISTAPMWVFTKEYVDKYNIPYQDIHTIQDLEPWLKVIKENEPGVTPLYITKGFSAPQYFDQLVDPVGVEHNDDSLKIKNMFETDKMKEQLEVLRKYYQAGYINADAATAQDDKSVKRFVTKADGQPYAENLWSKDLKYDVVASTIMDTYITNASTTVSMIGISKNSKNPEKAVEFLNLLNTDEYLRNLINYGVEGTHYEKVGDKQIKLLPKEEDYRVGYYTVGNLFLTYVLDKEPLTKWDEFEDFNNKAKNSPALGFKFDPAAVSTEIAAVNNVLEEFKSTIYSGSMDIDEYLPKLNAKLKEQGVDKIIAEMQKQIDEWAKTNKQ >NZ_CP018630.1|WP_021874751.1|603705_605946_+|DUF4968-domain-containing-protein MKQLNYRETLDMKFKAVNGIENTFRNYEVKNNVIDIYFSSIDKIAISYLEEDIVKVFIGDKYEEQLKTGAVLDNLKPSNFIIDEDKKYIIIKGNKVVTLVNKATKEITFKDKKGNIVCKDFQPSFKDDEGNIYISKFNDCLAYYGLGEKGGNLNKKGYYTENYNTDDPETDDNSTMYYKTIPFYVGLKEENVYGLFFDNSYRSYFDMGKSYEDRIFFGSVGGNIEYYFMLGKDIKEVVRNYTSLTGRMEMPPLWSLGYQQCRFSYFTQEEVKDLVKTFEEKEIPLDVVYLDIDYMDGFRVMTFKTPHFDDAKGLITGLKEKGIKTITILDPGVKVDEEYGVYKRGKEGNHFTKKLDGEIFIGAVWPGDSAFPDFSNKDCREWWKEELKKFISEHNIDGIWNDMNEPCVFNNDHKTMLESCIHNGDYGVIEHKEFHNRYGFEMSRCSHEAQKELDENKREFSMTRATYAGGQRYSSVWTGDNMSLWSQMRMSLSMNSNLGISGFSFVGNDVSGFGLDSSEELFIRWMQIGSFLPIFRNHSNMYTRRQEPWAFGKKAEAIAKKSIKLRYELLPYIYDLYYISHKEGLPIFRPMIMEYPKDKNLLNIKEQFMLGENLLIAPVVYQGERTKVLYLPEGIWHNYFTNEKFIGRKSYKIKCELDEVLVFVKDGSIIPTYQEKFMNVENRPNKVTYKVFGENAKGFHYYDDGKTMDYTKGKYNLYLLKATNNIGEVEAIRKELEEEKFEFIFD |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP018630_2 | 1310877-1312942 | TypeI-B |
II-B
Consensus repeat of NZ_CP018630_2
|
31 spacers
spacers of NZ_CP018630_2
>2.1|1310907|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGATAACAACTGGAGAATAAAACCTATAGAAGAAG >2.2|1310972|37|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATTGTGTTCCGCCGGGTGCAAAATTCCCTTATATA >2.3|1311039|37|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGGAGTCGTTGTATTTGATGAAATACATGAATATGA >2.4|1311106|36|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGGAGAAATATATAGAGTTGATAAAAAAATATTT >2.5|1311172|36|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTCTCCTAAAGATGATAAGAATGAATCTTTTAATG >2.6|1311238|36|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGATAAGCTAGGTAGTGACCCTGCTGGAAAATTACA >2.7|1311304|36|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTGAATCTGGTGAGGACAATGTTGATATAACAATT >2.8|1311370|34|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCTTCTGATGATATAACATTTGCTATAAGTTGTG >2.9|1311434|36|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTAAAAATTTTCACCCACAAGGAACTTTTATACAA >2.10|1311500|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTGAAAAAGAAAAGGAAATTAGAAAGAAAATAAG >2.11|1311565|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGTCAGTTTATGTGTGGATTAATCCAAAAGCATT >2.12|1311630|36|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGACTTTCCTCCCAAGCTTATTATTTTTTAAAACA >2.13|1311696|36|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTTAGCTTTCTGTATTTGCAAATCGCATATAATT >2.14|1311762|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATTTGGAGGGATAATTTAAATGGGTATATTAAA >2.15|1311827|36|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTTAACATATCCCAATCCTTGATAACGAGAATAC >2.16|1311893|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATGCTTTGAAGAAGTTAAATGATGAAGAGAAGTT >2.17|1311958|36|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGATTGAATGAGCATAAAAGCTTTTACTGTTTAAC >2.18|1312024|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTACAAGTGCAAGAATAAAGAATAGTGGAAAGGAA >2.19|1312089|36|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATATTATTTCAGCTAAATCTAACATTCCCGTATCA >2.20|1312155|37|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTAAGTAGGAGGATAAAGAGAGCTATAAAACATTTAA >2.21|1312222|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAACTTACGAACTAGCTAACAAAATAAGCGGGGT >2.22|1312287|36|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAAAGTTTCGGTTAGCTACGTCCATATTTTCCCTG >2.23|1312353|36|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGAAAGAGGTGTATTAATATGCCTATTTTTTTAT >2.24|1312419|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAGCAAGAAGAATATAGTACATCAAAAAATAATGA >2.25|1312484|36|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACTTAGGGTTTTCCTCATAACACCCGATATGGTAT >2.26|1312550|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTCTTTGCTTTTATCTCTATATTTAACTATCTCT >2.27|1312615|36|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGAAAGGCTAGGAATTCTAATAAAGAGTACGATGA >2.28|1312681|36|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGTAAATCAAGTGAGACCTTTCCCAACACCGGCT >2.29|1312747|34|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAGGAGCTGATGGGAATCAAGGACCAATTGGA >2.30|1312811|36|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAGGAAATGTACAACAGTATAATTGGTAAAATGAA >2.31|1312877|36|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTAGAAAATAATGATGAAATAAAATATTGTTTTTA |
cas2,cas1,cas4,cas5,cas7b,cas8b1,cas6,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018630_2
The CRISPR arrays of NZ_CP018630_2 >merge|NZ_CP018630|2|1310877-1312942|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATAGATAACAACTGGAGAATAAAACCTATAGAAGAAGGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATAAATTGTGTTCCGCCGGGTGCAAAATTCCCTTATATAGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATCAGGAGTCGTTGTATTTGATGAAATACATGAATATGAGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATAAAGGAGAAATATATAGAGTTGATAAAAAAATATTTGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATATTCTCCTAAAGATGATAAGAATGAATCTTTTAATGGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATAGATAAGCTAGGTAGTGACCCTGCTGGAAAATTACAGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATGCTGAATCTGGTGAGGACAATGTTGATATAACAATTGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATCCTTCTGATGATATAACATTTGCTATAAGTTGTGGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATGTTAAAAATTTTCACCCACAAGGAACTTTTATACAAGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATAGTGAAAAAGAAAAGGAAATTAGAAAGAAAATAAGGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATAAGTCAGTTTATGTGTGGATTAATCCAAAAGCATTGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATTGGACTTTCCTCCCAAGCTTATTATTTTTTAAAACAGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATTTGTTAGCTTTCTGTATTTGCAAATCGCATATAATTGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATAAATTTGGAGGGATAATTTAAATGGGTATATTAAAGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATCTTTTAACATATCCCAATCCTTGATAACGAGAATACGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATGATGCTTTGAAGAAGTTAAATGATGAAGAGAAGTTGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATTAGATTGAATGAGCATAAAAGCTTTTACTGTTTAACGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATGTACAAGTGCAAGAATAAAGAATAGTGGAAAGGAAGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATTATATTATTTCAGCTAAATCTAACATTCCCGTATCAGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATGTAAGTAGGAGGATAAAGAGAGCTATAAAACATTTAAGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATACAACTTACGAACTAGCTAACAAAATAAGCGGGGTGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATTTAAAGTTTCGGTTAGCTACGTCCATATTTTCCCTGGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATTTTGAAAGAGGTGTATTAATATGCCTATTTTTTTATGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATGAGCAAGAAGAATATAGTACATCAAAAAATAATGAGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATTACTTAGGGTTTTCCTCATAACACCCGATATGGTATGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATATTCTTTGCTTTTATCTCTATATTTAACTATCTCTGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATCAGAAAGGCTAGGAATTCTAATAAAGAGTACGATGAGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATATTGTAAATCAAGTGAGACCTTTCCCAACACCGGCTGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATAAAAGGAGCTGATGGGAATCAAGGACCAATTGGAGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATTAAGGAAATGTACAACAGTATAATTGGTAAAATGAAGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATGGTAGAAAATAATGATGAAATAAAATATTGTTTTTAGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT >NZ_CP018630|2|1|1310877-1312942|PILER-CR GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT AGATAACAACTGGAGAATAAAACCTATAGAAGAAG GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT AAATTGTGTTCCGCCGGGTGCAAAATTCCCTTATATA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT CAGGAGTCGTTGTATTTGATGAAATACATGAATATGA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT AAAGGAGAAATATATAGAGTTGATAAAAAAATATTT GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT ATTCTCCTAAAGATGATAAGAATGAATCTTTTAATG GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT AGATAAGCTAGGTAGTGACCCTGCTGGAAAATTACA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT GCTGAATCTGGTGAGGACAATGTTGATATAACAATT GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT CCTTCTGATGATATAACATTTGCTATAAGTTGTG GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT GTTAAAAATTTTCACCCACAAGGAACTTTTATACAA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT AGTGAAAAAGAAAAGGAAATTAGAAAGAAAATAAG GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT AAGTCAGTTTATGTGTGGATTAATCCAAAAGCATT GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TGGACTTTCCTCCCAAGCTTATTATTTTTTAAAACA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TTGTTAGCTTTCTGTATTTGCAAATCGCATATAATT GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT AAATTTGGAGGGATAATTTAAATGGGTATATTAAA 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GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TGGACTTTCCTCCCAAGCTTATTATTTTTTAAAACA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TTGTTAGCTTTCTGTATTTGCAAATCGCATATAATT GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT AAATTTGGAGGGATAATTTAAATGGGTATATTAAA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT CTTTTAACATATCCCAATCCTTGATAACGAGAATAC GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT GATGCTTTGAAGAAGTTAAATGATGAAGAGAAGTT GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TAGATTGAATGAGCATAAAAGCTTTTACTGTTTAAC GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT GTACAAGTGCAAGAATAAAGAATAGTGGAAAGGAA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TATATTATTTCAGCTAAATCTAACATTCCCGTATCA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT GTAAGTAGGAGGATAAAGAGAGCTATAAAACATTTAA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT ACAACTTACGAACTAGCTAACAAAATAAGCGGGGT GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TTAAAGTTTCGGTTAGCTACGTCCATATTTTCCCTG GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TTTGAAAGAGGTGTATTAATATGCCTATTTTTTTAT GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT GAGCAAGAAGAATATAGTACATCAAAAAATAATGA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TACTTAGGGTTTTCCTCATAACACCCGATATGGTAT GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT 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>NZ_CP018630.1|WP_079481275.1|1310418_1310709_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MKKQINYNYVFIFYDIKEERVNKVFKVCKKYLSHFQKSVFRGGITPSKLILLKKDLNKVIEKEEDFICIIKLLNGDVFGEEIIGVQGQTTGESLII >NZ_CP018630.1|WP_021875392.1|1309418_1310417_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGSTKYITSMGELTRKDNSLCFRKDGKNVYIPVEGTSEIYCLNEISINTKLLDFISRNNITVHFFNYYEGYSGTFYPKNKYNSGKLLINQVKTFERNRIIIARSIVRGIGINIMEVLYHYYKHNKKEVKETIDWIKKDFLKKVDYIENINSLMALEGEVWQRFYSEFKNILPEDFIMNKRVKRPPDNPINAMISFGNSLLYTKTISAIYKTHLDQRISYLHEPSEGRFSLSLDISEVFKPIIVFKTIFELVNNRRIQVSKHFDKSVNYCLLNEDGRNIFIKAFEDRLESVFLHPKLKRKVTYRTAIKLDCYKLIKFIMEDKTFLPFNLKDGM >NZ_CP018630.1|WP_079481815.1|1308920_1309409_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKINGTLINYYFHCKRQCYLHGNRLNFEDNSENVKIGKALHEIKENKNTEIEIDNIKIDKLTKDYLTEIKKSDADPEAAKWQLIFYLNALNDKGIRRKGKLEFIEKNKTKNKIIYVELNSELIKELEKHIRDIKILINSNNVPDILNKSKCKRCAYYEYCYI >NZ_CP018630.1|WP_021875388.1|1305528_1306308_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MEAIKFTLRGRTAFFKKPEVNSYLYFTYGHIHKVALVGIFGAILGYKGYNQMKKDDQYPEFYQKLKDIKISIVPNNKNGIIDKKINIFNNSVGYASQEKGGNLIIKEQWLENPSWEIYLLLNDDESQKIANALMDRTYIYLPYLGKNDHLAEITNIKRINNIKTIDRFIKIDSFFKKNEFKYKELDLDDLDDLDDLDDLDDDNVTDEELIFKYEEMLPVGLDLQTNRYKLEGLVYTNKPIEKRLNCEVYEIEGKILTFI >NZ_CP018630.1|WP_021875387.1|1304578_1305526_+|type-I-CRISPR-associated-protein-Cas7 MNKRVYGLIGISSKMANWNADFSGYPKTTSKGEIFGSDKALKYPMKKLWDNSGEKVLYIKSMKLSKTKDSVVLVPRSLKERYEYIFGIEDLKKEKNTETVLKNLFDAVDVKNFGATFAEEGNNISITGAVQIGQGFNLYDETVADEQQILSPFRDASIKPGKEDKEEAKNSTLGTKIVTDEAHYCYPFTINPLSYKDYIDLGVTEGYTEKDYIKFKEVALNSATAFATNSKVGCENEFCIFIETEQTLYLPNLDNYISFEKSEDQNIIRFKATNILNEVKEKISNIEIYYNPYTTIVEADIEGAKYYNIITKKEV >NZ_CP018630.1|WP_021875386.1|1302842_1304576_+|hypothetical-protein MLSEIIDSFKRVFKDNLDEAILGSYVPTDGTYIFLKEDEHNNLKVIQKEEIKLNKKTKDVDRTINNFSLLAKADYYSKLTDMNKPIDSKKIIHSNNYLSFFVKKESLKNGKLTNEIIENYYNVLLNPISKYEKKSKAKELYIEIERELGEVNKDRIFKIKEWIKENIYKVEEDIEKKDYLKIFFIYDEDDFIKESKRYLIPNIYNNNDFNIKVDNEILGLPNDNMGLNSKKPYLENKTRKVKIPHLITQEEALFQKKVFDYLLNQSAQGFYNIYIGDEVIPLKDNETLNRDFNGYYIRLKKGKEAEIHNFDVISKYNPMLINPFEFINVLGINYETLYLNKKINWEYGFIDTRKEMQELINSIIFNNYLKTNYFSEDISIKENVLKRSILLSRAKLFDWFYKGNDYNIWPLLNKVSRDLMKSSIESGYSIKAMNQFNLRYSLKLYFEGGEEKMADILSKVKNDLREKIEVRDSSISNDNEYFFAIGQLANFFITRSKGKNKPLSLANPIINAKKDNIIKEKLKSLYKKYNYDINSSFIKFKNMYYMVLAYQVEGKINEDLIIAGYLSSSLLFEKKED >NZ_CP018630.1|WP_079481274.1|1302134_1302827_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MNNFEITVKVYLTKDILQEDCQQEISAILDRVLAENCDYLNFHKENYFKNYCFNSLYPLERDKVYKEDNIYSFQIRTNNIELAEYLSINLKNAFSNSIKILKVDIRKIPIKHIDKIFSITPLVIKTDNGYWKGLISLEDFERRIKENLIKKYNQITGEKIDEKFPLFVALELKNKKPIAIKFKGKTLLGDKISLKIADDELSQKIANLAIGSGLGEINARGYGYVNYRWL >NZ_CP018630.1|WP_021875384.1|1301889_1302090_+|HTH-domain-containing-protein MTGRVLIILRILSDKKIHTLEELSYKSEIPSSTIRRYINSFKDFGVEIESTRGPYGGYILKKFYYM >NZ_CP018630.1|WP_021875383.1|1300404_1301625_+|peptidase-T MKKVEERFLEYIKIDTKSDENTGLTPSTKGQLKLAEILAKELKEIGVDKVEISEHGYVYATVEKNCNKDIPTIGFIAHMDTAPDYCGSNVNPQIVKNYDGGDIKLNSEVTLSPKFSPELKNYIGKTLITTDGNTLLGADDKAGIAEIMTAIEYLLNNKEIKHGDIKIGFTPDEEIGEGADHFDVEGFKADFAYTLDGGAIGELEFENFNAAGVKVEINGVNVHPGYAKNKMINSIMVAHEFINKLPLNEVPEKTEKYEGFSHLTDIKGTIEKTTLDFIIRDFFADGFEDRKEKFKAIEKELNEVYGEGVVKVNIKEQYRNMKEKIEPIMHIVETAKKAMEEAGVAPKVKPIRGGTDGARLSYMGLPTPNLFAGGENFHGKYEYVPVESMEKAVDVILNIIRIYSER >NZ_CP018630.1|WP_079481272.1|1299274_1300297_+|polysaccharide-deacetylase MNNIERKSYNRKYKEKIKKCKTKHSNINKLKKQRKIRKLRNKIIFKLVMISLFTIMLIVIINNIGNYRNEKNNIVTTNFNDKKDTEFKQKEKKEIKKTHPREIMPNSNVTYEGMTYAMDASEVQSMIYGTYPGLKKYVFLTFDDGPSPNTEKVLDILKENNVKATFFVVGNRIEESAKAQETLKRIIKEGNAIANHTYTHNFSKLYPQNSINIDYFMEEVNKTNELIKKILGENFNTKVLRMPGGYISRKYYKDASLKAFDDRLNLEGIFSIDWNTLNGDAEGKDYTVEEMVNKVKEGSKDVNQSIVLMHDAYGKEKTVEALPEIINYFKSQGYQFRTIK >NZ_CP018630.1|WP_079481276.1|1313050_1314289_+|IS256-family-transposase MTRKIDTNFDYNEEIKRCKTIDDVMGKNGLIQRLVKDVLENILEGEMEEHLGRNKYERVEAVDQTKKNYRNGYSRKNLRSSFGDVDLDVPRDRNAEFEPQIIKKYETVCTELDKKIISLYAKGMSTSDIQAEIEDLYGITISPSMVSKITDKVLASAAEWQNRVLDKIYPIVYLDAMYFKVRSNGKIVNKAVYICLGYTMEGYKDILGIWVDEAEGAKFWLGICNDLKNRGVKEILIACMDGLKGIPQAIKTVFPSVNIQTCIVHQIRNSIKYIASKDKKAFMKDLKEVYKATTEELALAQLDNLKEIWGDKYGIVIDSWYNNWSNLSTFFDFSPTIRKMIYTTNILEGFNRQIRKFTKVRVIFPTDESLNKCVYLATMEILEKWTQPIHNWGATLAELSIIFEDQLKDELA >NZ_CP018630.1|WP_161493089.1|1315405_1315567_+|hypothetical-protein MYLATVIDLFDRRITGWAMDSTMTRRLVIDAFNTAVLKDVVMIMLVQNYSSYL >NZ_CP018630.1|WP_079481817.1|1315512_1315740_+|IS3-family-transposase MKGCCYDNACAELFFLSLKKHFLYGRKFKTRAESKQAIVEYIELFYNAKRLHSTLGYKSPREYRKNYYNNLNKAA >NZ_CP018630.1|WP_079481277.1|1315941_1316181_+|hypothetical-protein MTGDLITANIKIKSTEYPCFSVSENSDNTDLEGNALINPSETREIHYVAEVPKTDATGQIEVTLTINGKNYSNKFLLDC >NZ_CP018630.1|WP_079481278.1|1316483_1317020_+|DUF4825-domain-containing-protein 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MVKDVYLGASIGSTDFHYLQKNYNEIKLLNKTTWHDTAWIGDELNSKIVTWTKNSPVSNVTIASSDFVNKNGDIINSNNVEISWLKETLANIGRGNSSAPVELFPDIIHKSGSLNIEANKVSSAWVNISIPRDINTGIYNGTITVNAEGLEAPYVFDYSFEVLNLIQPLPKETNTQIEIWQHPYAVARYYDIPKEELFTERHFNYLRESLEEYRDMGGKGVIAHIVEEAWNHQSYDSDPSMVKWTKKSNGNFKFDYTDFDRWIQFNIDLGVINPKDGVGQIKCYSIVPWNNRIEYYNEVTGSKESISPTPGTSEWRIPWTEFLRDFMKHLEEKGWFKITYISMDERNMNDLRASVELIESIKNTNGESFKISSAMNYQSGSDYSFLDRIDDISIGLSHINHDLEDMRNMAKHRQERGLLTTIYTCTGDYPSSFTISDSSESAWTMWYSLSQNTDGFMRWSWDGWVENPLENVSYKYWEPGDPWFIYPAEKNSDSKTFYSTPRYERLKEGIRDINKAKYLMENSLELKRQVETLVQSLRRPNKGNNSYGSAVAATEMDRELTNNEVKRIRDGVNKLAKQYIKSK >NZ_CP018630.1|WP_096177130.1|1319869_1320745_+|hypothetical-protein MNNNLSRVRELKEIKKEPKTNLQILLAIILGVIVVFTTLKVIQKVVYPPEKIVEDFRAAMVNEDVEGVKNVIKVYDKRVEVNDENVKVLINYFKENKDELTSICNSLNNKNLRNKRENPIYLDKETGFSRLLGKHKVIINPIFIKVSSKINNTEIFINDKKQCTINKDETQEFGPLMPSKYDISAKYSTDYIETQDKVTIDRIKKFNDRSNYTMFKDIKKVILYTHLETAEIIVNGKDTGKTVKEINKILSPVNKDTKVQLKMMVDGKEVITDEEVVGDNDYIYFGELKNS >NZ_CP018630.1|WP_021875400.1|1320802_1321933_-|hypothetical-protein MFIKSYNSQTKELTLSIYNNDVALINEVRDISKAKLNSTIEYSDISKLIYENSVIIQGAEVSQINFNYKCYNDNNSKNKETICSKCLNTFIDAITIEAKSINSTDIRLYYLSGGIKWTSSYTLILKSQKLDLEAWINISNKSGISYNHANLKCIAGDVNISSSTSTPYSKTSYVASSSSENTSLENLEDYYIYNLKGLYNLENNSTKRIKSFLAEDISYSTLYDFGYYNNSADILIEFENTQSNNLGTPMPSGVINVYTTSGKTLAFLGSDSIKNTSIDENLSLNIGKAFDITCERKIIDYQKYDTYEFKEIELIISNAKNEEVPIKICYPIFAPWESTSSTENYSKDNNGNPCFMVNVSANDKKSIFFTYKVKIS >NZ_CP018630.1|WP_079481280.1|1322088_1322877_+|endonuclease/exonuclease/phosphatase-family-protein MKNNFMTFNLKYDFTDDKENRWEDRAKRIVTVIKENNPICFGTQEGLIHMLKDINELLEEYSWFGEGREGNEEGEFNAIFYKREALELIENGQFWLSETPNIKGSISWKSGCKRICTWGVFKEKQYGNIFRIYNTHLDNASDLAREEGIKVILDFAKEKYDKDKLPFIITGDFNSYMEENLFKIIRSYNNENFNIKNSYNEVSHNIKGTFHDFKGGYSGGIIDYILFSKEISCNKINIDDRLINGGYPSDHYAVTANLNIEN |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NZ_CP018630_3 | 1314506-1315196 | TypeI-B |
II-B
Consensus repeat of NZ_CP018630_3
|
10 spacers
spacers of NZ_CP018630_3
>3.1|1314536|36|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAATTGAAACTAGTATCACTGATTCTTTTTTTTCTT >3.2|1314602|36|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGGATTTCTTGTTCCGTATTTTTTAGATAAATTA >3.3|1314668|37|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGCACTTGGTAAAATATACCTTTTGCTTAAACTCTGC >3.4|1314735|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAAATACCACTCTTCTATTAATCTTTGGCTTGTA >3.5|1314800|37|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCTGCTTAGGATAGTCTTGTGTTTCTTCAAAGCTAG >3.6|1314867|36|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGATGGAATGGTTAATTGATTATAAGAGATTGAA >3.7|1314933|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTATCCATCTGCCCATACCAGTTATACCATTCCA >3.8|1314998|36|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACATATTTAACTTTCAAAAGCAACTGATTGCAATTC >3.9|1315064|37|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGGTAGGCAATATATTTGTTGGAACTTATACTAAAG >3.10|1315131|36|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATTTATAGTTTTGACTATGATGATGAGTATATATA |
cas2,cas1,cas4,cas5,cas7b,cas8b1,cas6,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018630_3
The CRISPR arrays of NZ_CP018630_3 >merge|NZ_CP018630|3|1314506-1315196|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATTAATTGAAACTAGTATCACTGATTCTTTTTTTTCTTGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATAAAGGATTTCTTGTTCCGTATTTTTTAGATAAATTAGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATGGCACTTGGTAAAATATACCTTTTGCTTAAACTCTGCGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATTAAAATACCACTCTTCTATTAATCTTTGGCTTGTAGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATATCTGCTTAGGATAGTCTTGTGTTTCTTCAAAGCTAGGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATATTGATGGAATGGTTAATTGATTATAAGAGATTGAAGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATCTTATCCATCTGCCCATACCAGTTATACCATTCCAGATTAACATTAACATGAGATGTAGTTAAATACATATTTAACTTTCAAAAGCAACTGATTGCAATTCGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATATGGTAGGCAATATATTTGTTGGAACTTATACTAAAGGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATGATTTATAGTTTTGACTATGATGATGAGTATATATAGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT >NZ_CP018630|3|2|1314506-1315196|PILER-CR GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TAATTGAAACTAGTATCACTGATTCTTTTTTTTCTT GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT AAAGGATTTCTTGTTCCGTATTTTTTAGATAAATTA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT GGCACTTGGTAAAATATACCTTTTGCTTAAACTCTGC GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TAAAATACCACTCTTCTATTAATCTTTGGCTTGTA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT ATCTGCTTAGGATAGTCTTGTGTTTCTTCAAAGCTAG GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT ATTGATGGAATGGTTAATTGATTATAAGAGATTGAA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT CTTATCCATCTGCCCATACCAGTTATACCATTCCA GATTAACATTAACATGAGATGTAGTTAAAT ACATATTTAACTTTCAAAAGCAACTGATTGCAATTC GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT ATGGTAGGCAATATATTTGTTGGAACTTATACTAAAG GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT GATTTATAGTTTTGACTATGATGATGAGTATATATA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT >NZ_CP018630|3|3|1314506-1315196|CRISPRCasFinder GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TAATTGAAACTAGTATCACTGATTCTTTTTTTTCTT GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT AAAGGATTTCTTGTTCCGTATTTTTTAGATAAATTA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT GGCACTTGGTAAAATATACCTTTTGCTTAAACTCTGC GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TAAAATACCACTCTTCTATTAATCTTTGGCTTGTA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT ATCTGCTTAGGATAGTCTTGTGTTTCTTCAAAGCTAG GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT ATTGATGGAATGGTTAATTGATTATAAGAGATTGAA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT CTTATCCATCTGCCCATACCAGTTATACCATTCCA GATTAACATTAACATGAGATGTAGTTAAAT ACATATTTAACTTTCAAAAGCAACTGATTGCAATTC GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT ATGGTAGGCAATATATTTGTTGGAACTTATACTAAAG GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT GATTTATAGTTTTGACTATGATGATGAGTATATATA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT >NZ_CP018630|3|2|1314506-1315196|CRT GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TAATTGAAACTAGTATCACTGATTCTTTTTTTTCTT GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT AAAGGATTTCTTGTTCCGTATTTTTTAGATAAATTA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT GGCACTTGGTAAAATATACCTTTTGCTTAAACTCTGC GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TAAAATACCACTCTTCTATTAATCTTTGGCTTGTA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT ATCTGCTTAGGATAGTCTTGTGTTTCTTCAAAGCTAG GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT ATTGATGGAATGGTTAATTGATTATAAGAGATTGAA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT CTTATCCATCTGCCCATACCAGTTATACCATTCCA GATTAACATTAACATGAGATGTAGTTAAAT ACATATTTAACTTTCAAAAGCAACTGATTGCAATTC GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT ATGGTAGGCAATATATTTGTTGGAACTTATACTAAAG GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT GATTTATAGTTTTGACTATGATGATGAGTATATATA GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT
>NZ_CP018630.1|WP_079481276.1|1313050_1314289_+|IS256-family-transposase MTRKIDTNFDYNEEIKRCKTIDDVMGKNGLIQRLVKDVLENILEGEMEEHLGRNKYERVEAVDQTKKNYRNGYSRKNLRSSFGDVDLDVPRDRNAEFEPQIIKKYETVCTELDKKIISLYAKGMSTSDIQAEIEDLYGITISPSMVSKITDKVLASAAEWQNRVLDKIYPIVYLDAMYFKVRSNGKIVNKAVYICLGYTMEGYKDILGIWVDEAEGAKFWLGICNDLKNRGVKEILIACMDGLKGIPQAIKTVFPSVNIQTCIVHQIRNSIKYIASKDKKAFMKDLKEVYKATTEELALAQLDNLKEIWGDKYGIVIDSWYNNWSNLSTFFDFSPTIRKMIYTTNILEGFNRQIRKFTKVRVIFPTDESLNKCVYLATMEILEKWTQPIHNWGATLAELSIIFEDQLKDELA >NZ_CP018630.1|WP_079481275.1|1310418_1310709_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MKKQINYNYVFIFYDIKEERVNKVFKVCKKYLSHFQKSVFRGGITPSKLILLKKDLNKVIEKEEDFICIIKLLNGDVFGEEIIGVQGQTTGESLII >NZ_CP018630.1|WP_021875392.1|1309418_1310417_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGSTKYITSMGELTRKDNSLCFRKDGKNVYIPVEGTSEIYCLNEISINTKLLDFISRNNITVHFFNYYEGYSGTFYPKNKYNSGKLLINQVKTFERNRIIIARSIVRGIGINIMEVLYHYYKHNKKEVKETIDWIKKDFLKKVDYIENINSLMALEGEVWQRFYSEFKNILPEDFIMNKRVKRPPDNPINAMISFGNSLLYTKTISAIYKTHLDQRISYLHEPSEGRFSLSLDISEVFKPIIVFKTIFELVNNRRIQVSKHFDKSVNYCLLNEDGRNIFIKAFEDRLESVFLHPKLKRKVTYRTAIKLDCYKLIKFIMEDKTFLPFNLKDGM >NZ_CP018630.1|WP_079481815.1|1308920_1309409_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKINGTLINYYFHCKRQCYLHGNRLNFEDNSENVKIGKALHEIKENKNTEIEIDNIKIDKLTKDYLTEIKKSDADPEAAKWQLIFYLNALNDKGIRRKGKLEFIEKNKTKNKIIYVELNSELIKELEKHIRDIKILINSNNVPDILNKSKCKRCAYYEYCYI >NZ_CP018630.1|WP_021875388.1|1305528_1306308_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MEAIKFTLRGRTAFFKKPEVNSYLYFTYGHIHKVALVGIFGAILGYKGYNQMKKDDQYPEFYQKLKDIKISIVPNNKNGIIDKKINIFNNSVGYASQEKGGNLIIKEQWLENPSWEIYLLLNDDESQKIANALMDRTYIYLPYLGKNDHLAEITNIKRINNIKTIDRFIKIDSFFKKNEFKYKELDLDDLDDLDDLDDLDDDNVTDEELIFKYEEMLPVGLDLQTNRYKLEGLVYTNKPIEKRLNCEVYEIEGKILTFI >NZ_CP018630.1|WP_021875387.1|1304578_1305526_+|type-I-CRISPR-associated-protein-Cas7 MNKRVYGLIGISSKMANWNADFSGYPKTTSKGEIFGSDKALKYPMKKLWDNSGEKVLYIKSMKLSKTKDSVVLVPRSLKERYEYIFGIEDLKKEKNTETVLKNLFDAVDVKNFGATFAEEGNNISITGAVQIGQGFNLYDETVADEQQILSPFRDASIKPGKEDKEEAKNSTLGTKIVTDEAHYCYPFTINPLSYKDYIDLGVTEGYTEKDYIKFKEVALNSATAFATNSKVGCENEFCIFIETEQTLYLPNLDNYISFEKSEDQNIIRFKATNILNEVKEKISNIEIYYNPYTTIVEADIEGAKYYNIITKKEV >NZ_CP018630.1|WP_021875386.1|1302842_1304576_+|hypothetical-protein MLSEIIDSFKRVFKDNLDEAILGSYVPTDGTYIFLKEDEHNNLKVIQKEEIKLNKKTKDVDRTINNFSLLAKADYYSKLTDMNKPIDSKKIIHSNNYLSFFVKKESLKNGKLTNEIIENYYNVLLNPISKYEKKSKAKELYIEIERELGEVNKDRIFKIKEWIKENIYKVEEDIEKKDYLKIFFIYDEDDFIKESKRYLIPNIYNNNDFNIKVDNEILGLPNDNMGLNSKKPYLENKTRKVKIPHLITQEEALFQKKVFDYLLNQSAQGFYNIYIGDEVIPLKDNETLNRDFNGYYIRLKKGKEAEIHNFDVISKYNPMLINPFEFINVLGINYETLYLNKKINWEYGFIDTRKEMQELINSIIFNNYLKTNYFSEDISIKENVLKRSILLSRAKLFDWFYKGNDYNIWPLLNKVSRDLMKSSIESGYSIKAMNQFNLRYSLKLYFEGGEEKMADILSKVKNDLREKIEVRDSSISNDNEYFFAIGQLANFFITRSKGKNKPLSLANPIINAKKDNIIKEKLKSLYKKYNYDINSSFIKFKNMYYMVLAYQVEGKINEDLIIAGYLSSSLLFEKKED >NZ_CP018630.1|WP_079481274.1|1302134_1302827_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MNNFEITVKVYLTKDILQEDCQQEISAILDRVLAENCDYLNFHKENYFKNYCFNSLYPLERDKVYKEDNIYSFQIRTNNIELAEYLSINLKNAFSNSIKILKVDIRKIPIKHIDKIFSITPLVIKTDNGYWKGLISLEDFERRIKENLIKKYNQITGEKIDEKFPLFVALELKNKKPIAIKFKGKTLLGDKISLKIADDELSQKIANLAIGSGLGEINARGYGYVNYRWL >NZ_CP018630.1|WP_021875384.1|1301889_1302090_+|HTH-domain-containing-protein MTGRVLIILRILSDKKIHTLEELSYKSEIPSSTIRRYINSFKDFGVEIESTRGPYGGYILKKFYYM >NZ_CP018630.1|WP_021875383.1|1300404_1301625_+|peptidase-T MKKVEERFLEYIKIDTKSDENTGLTPSTKGQLKLAEILAKELKEIGVDKVEISEHGYVYATVEKNCNKDIPTIGFIAHMDTAPDYCGSNVNPQIVKNYDGGDIKLNSEVTLSPKFSPELKNYIGKTLITTDGNTLLGADDKAGIAEIMTAIEYLLNNKEIKHGDIKIGFTPDEEIGEGADHFDVEGFKADFAYTLDGGAIGELEFENFNAAGVKVEINGVNVHPGYAKNKMINSIMVAHEFINKLPLNEVPEKTEKYEGFSHLTDIKGTIEKTTLDFIIRDFFADGFEDRKEKFKAIEKELNEVYGEGVVKVNIKEQYRNMKEKIEPIMHIVETAKKAMEEAGVAPKVKPIRGGTDGARLSYMGLPTPNLFAGGENFHGKYEYVPVESMEKAVDVILNIIRIYSER >NZ_CP018630.1|WP_161493089.1|1315405_1315567_+|hypothetical-protein MYLATVIDLFDRRITGWAMDSTMTRRLVIDAFNTAVLKDVVMIMLVQNYSSYL >NZ_CP018630.1|WP_079481817.1|1315512_1315740_+|IS3-family-transposase MKGCCYDNACAELFFLSLKKHFLYGRKFKTRAESKQAIVEYIELFYNAKRLHSTLGYKSPREYRKNYYNNLNKAA >NZ_CP018630.1|WP_079481277.1|1315941_1316181_+|hypothetical-protein MTGDLITANIKIKSTEYPCFSVSENSDNTDLEGNALINPSETREIHYVAEVPKTDATGQIEVTLTINGKNYSNKFLLDC >NZ_CP018630.1|WP_079481278.1|1316483_1317020_+|DUF4825-domain-containing-protein MRISNFKRLVILAVFMVLLGMVGCGKYIEQKEAINESKVNLTKVLKYKGSYVGDNSAIVNIINNLPANIYKEGVELQTTSKPYEITIQYKYFEDLDIRFEDGSFISSSLSQIMKNNALILLSLVKNVDIVNFNIDDGTIITYEGTDLINDNKDAFGNDLKEITKDKSSLENFIKTNKN >NZ_CP018630.1|WP_021875397.1|1317193_1317841_+|hypothetical-protein MYLIKNIKQIFDYKIKEFLALSGGLTLIFLLTRLDNPEFIDGYMIAILITISMIGRYNFVSEHIVKEDYIYLKKYKATLKYIISKNIVTLLLVISLVFIVFLLEFIITRATLSYEFYFESLILSILTIAFNNISFMFNNKTEKSTSDKFDEWTSIVLGFKSLINSLPSILIVFIILYFNKYLYNINLYDALIVEIMSIILLNFKLKNQFKVNLKN >NZ_CP018630.1|WP_079481819.1|1317905_1319657_+|DUF4091-domain-containing-protein MVKDVYLGASIGSTDFHYLQKNYNEIKLLNKTTWHDTAWIGDELNSKIVTWTKNSPVSNVTIASSDFVNKNGDIINSNNVEISWLKETLANIGRGNSSAPVELFPDIIHKSGSLNIEANKVSSAWVNISIPRDINTGIYNGTITVNAEGLEAPYVFDYSFEVLNLIQPLPKETNTQIEIWQHPYAVARYYDIPKEELFTERHFNYLRESLEEYRDMGGKGVIAHIVEEAWNHQSYDSDPSMVKWTKKSNGNFKFDYTDFDRWIQFNIDLGVINPKDGVGQIKCYSIVPWNNRIEYYNEVTGSKESISPTPGTSEWRIPWTEFLRDFMKHLEEKGWFKITYISMDERNMNDLRASVELIESIKNTNGESFKISSAMNYQSGSDYSFLDRIDDISIGLSHINHDLEDMRNMAKHRQERGLLTTIYTCTGDYPSSFTISDSSESAWTMWYSLSQNTDGFMRWSWDGWVENPLENVSYKYWEPGDPWFIYPAEKNSDSKTFYSTPRYERLKEGIRDINKAKYLMENSLELKRQVETLVQSLRRPNKGNNSYGSAVAATEMDRELTNNEVKRIRDGVNKLAKQYIKSK >NZ_CP018630.1|WP_096177130.1|1319869_1320745_+|hypothetical-protein MNNNLSRVRELKEIKKEPKTNLQILLAIILGVIVVFTTLKVIQKVVYPPEKIVEDFRAAMVNEDVEGVKNVIKVYDKRVEVNDENVKVLINYFKENKDELTSICNSLNNKNLRNKRENPIYLDKETGFSRLLGKHKVIINPIFIKVSSKINNTEIFINDKKQCTINKDETQEFGPLMPSKYDISAKYSTDYIETQDKVTIDRIKKFNDRSNYTMFKDIKKVILYTHLETAEIIVNGKDTGKTVKEINKILSPVNKDTKVQLKMMVDGKEVITDEEVVGDNDYIYFGELKNS >NZ_CP018630.1|WP_021875400.1|1320802_1321933_-|hypothetical-protein MFIKSYNSQTKELTLSIYNNDVALINEVRDISKAKLNSTIEYSDISKLIYENSVIIQGAEVSQINFNYKCYNDNNSKNKETICSKCLNTFIDAITIEAKSINSTDIRLYYLSGGIKWTSSYTLILKSQKLDLEAWINISNKSGISYNHANLKCIAGDVNISSSTSTPYSKTSYVASSSSENTSLENLEDYYIYNLKGLYNLENNSTKRIKSFLAEDISYSTLYDFGYYNNSADILIEFENTQSNNLGTPMPSGVINVYTTSGKTLAFLGSDSIKNTSIDENLSLNIGKAFDITCERKIIDYQKYDTYEFKEIELIISNAKNEEVPIKICYPIFAPWESTSSTENYSKDNNGNPCFMVNVSANDKKSIFFTYKVKIS >NZ_CP018630.1|WP_079481280.1|1322088_1322877_+|endonuclease/exonuclease/phosphatase-family-protein MKNNFMTFNLKYDFTDDKENRWEDRAKRIVTVIKENNPICFGTQEGLIHMLKDINELLEEYSWFGEGREGNEEGEFNAIFYKREALELIENGQFWLSETPNIKGSISWKSGCKRICTWGVFKEKQYGNIFRIYNTHLDNASDLAREEGIKVILDFAKEKYDKDKLPFIITGDFNSYMEENLFKIIRSYNNENFNIKNSYNEVSHNIKGTFHDFKGGYSGGIIDYILFSKEISCNKINIDDRLINGGYPSDHYAVTANLNIEN >NZ_CP018630.1|WP_021875402.1|1322931_1323270_+|hypothetical-protein MGSDKKNLEGIIFIGISTIAWCIAGNISYFFIRNGIYNSLVHLVDIESSIIMVSLPLIAMAIGTFANYKIEVTEEKLYEINKKMLSFKLLNIIFIGYIAFTLFAVRNGKIIL |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP018630_4 | 2613525-2613619 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP018630_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP018630_4
>4.1|2613548|49|NZ_CP018630|CRISPRCasFinder ACTTTCAATTAAGTTTGAATTTAAAGATAATGTCTTTAAATTAACTAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018630_4
The CRISPR arrays of NZ_CP018630_4 >merge|NZ_CP018630|4|2613525-2613619|CRISPRCasFinder TTATCAAATATTCCTTCTGGTAAACTTTCAATTAAGTTTGAATTTAAAGATAATGTCTTTAAATTAACTAAATTATCAAATATTCCTTCTGGTAA >NZ_CP018630|4|4|2613525-2613619|CRISPRCasFinder TTATCAAATATTCCTTCTGGTAA ACTTTCAATTAAGTTTGAATTTAAAGATAATGTCTTTAAATTAACTAAA TTATCAAATATTCCTTCTGGTAA
>NZ_CP018630.1|WP_021876577.1|2610932_2611562_-|iron-transporter MRHFRIIFSIFLIGILVSVFSTTNTKAVENNAIESGIYELENDVYHSSEIGRSMARTYLNNIMTLEARGGELFCTIGFSSSDYMENYKMIVDEQEVANEIVDKNEENKTVKIKFKINSLDSKINANMYVIPMGRDVSFDIIPKKDTLKLIEKIEEPKVESSDSKEKDVEEKDKEESMGKTSTITVGAIIIGLAAMVIIGSKVKNKYKQV >NZ_CP018630.1|WP_021876576.1|2609943_2610819_-|heme-ABC-transporter-substrate-binding-protein-IsdE MKRLLSAIIVGLVMTSFTGCYGPKEGNEESKSKQEGDVVVATSVAVTEILDKLGVSLAGVPTTAYTLPESTKDAVKVGNPMNPDLEKIKSLNPTVVVSVDTLGDDFKNTFIENNIPSEFVTLTSLKGLKEAIKTLGDKFNKETEADNLLNDISAKEGEIVKKNDGKEKENILIIFGAPGSIMIGTSKCYVGNLVDVVGGKNIVENNSTSFVQLNIEEVLKSNPDKVLVMTHGNPEESKAMVAKELKNNPMWQKLSAVKEDKVYYLDSKKFGMSANLKVTEALDELASILNN >NZ_CP018630.1|WP_079481627.1|2608935_2609925_-|iron-ABC-transporter-permease MKNNNIRKKYIYIGISIIALILLSLTSMKIGSIDITLRELLIGIFTNNGSETWEIIRDLRMPRVISAILVGASLAVSGVLLQAVIRNPLAEPSITGISSGASLFSILIMVFLPSLNPYRYLFGFLGGILACIIVYSLAFKNTLSPIRIVLSGIAVNAMLGGFISIMTIFNGNNASSVQMWLTGSLVAVTWKDVIPLLIYTTIGLVCALILCKTCNVIVLGDKTSKGLGFNADKTRIIISLVAVFLAGISTSIAGIISFVGLVVPHICRIIIGSDHKYLIPFSCTLGAILLLIADTLGRIVAKPYEIPVGIVMAILGAPFFLYLLRKSNV >NZ_CP018630.1|WP_021876574.1|2608125_2608902_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLAGEKLSFSYDDKEFINNLDIKVEKGKITTIIGPNGSGKSTLLSMLCSVNKIKKGSIYIDGKNIVNYKSKSLARIIATVYQQNNVPEDIIVEDLVGYGRIPHKGYFEKNNEDDNKIIEWAIKSTNVEHLKNKPISHLSGGERQRVFIALALAQKPKILFLDEPNTYLDIFNQIELLELVKKLNEENNITVVMVLHDINQAVKYSDNLVIMKNGKIIKVGKSDDVINAEIIESVYNVKGIVAEVESKEKYFIPLSVVH >NZ_CP018630.1|WP_021876573.1|2606678_2608022_+|Zn-dependent-exopeptidase-M28 MKKKVSYYLLLFIITIAFGFSIFFNITYSSFNSDNVKKNIASFSSQTYSGRLPGSDENNLVAEIIRKDFQDNKLVPLNDDYKESFNTICPVKTNTMPYMQISANGITLEELKYGVDFKDDMLNFKNNTISFSKADNVNIYKKSIDVITPNGKCLFYVNTKDGFSFRSSFCSEFPYDMVICITTDTYNKILDSVRKGLEVSVHVPFKNEEKTISNIVGVIEGSSGKLPPLVLTAHYDHLGKDGLENIYSGALDNASGTSFLLELQRSLSTYGKPKRDIIFVALNAEEFGLLGSKEFAEKNLDKLNGAEVINFDMIGSEGYPITLMQGLSFKDKDSKLLKSIEKIAKKKGVQTEVAYEDASDHASFNNAGIDSVSLCHSDTSKIHTPKDTVEFISTDAIDTAYQVVETKILDSSYGFLTKFFYDKVSIIFSSVLLILLIAYGIRKKKTA >NZ_CP018630.1|WP_021876572.1|2606251_2606593_+|hypothetical-protein MNKLASILNKTINILLIFFVVFLVLNEYYVVEFSATLRNVIAFLTMILILISAMKELLTNKSGLSRFINGVILFTSIVGGVFAIISKQLNLFLYTCILFSVVYGFVDLVYKKA >NZ_CP018630.1|WP_021876571.1|2603885_2606057_-|RNA-binding-transcriptional-accessory-protein MVKIEDRLAEELGIKLSQVNNVIGLLDEGNTVPFISRYRKEQTGGLTDELLRKFQERLTYLRNLEERKSDVSRLIEEQGKLTEEITNSLKKAMTLTEVEDIYRPYKQKKRTRATIALEKGLKPLSELIINGEFKGNLLEEASKFVNEEKGVKTNEEALSGALDIVAEMISDEAKYRKWIRELVLREGKIESKGGSDDTTQYEMYYEYSEDVNKIPPHRILAINRGEKEKILSVKIIVNEEKILNYLEREVLKGNKVTDDYLKLAVKDSLKRLIYPSIEREVRAELTNIGEEGAIKIFKENLKALLMQPPIKGKVVMGYDPGFRTGCKVAVLDSTGKFLEKATVFPTVPKRDIEGTKRILKDLVKKYNVDVISLGNGTASRESEEVISEMLSEIKNEMGKELAYVIVSEAGASVYSASELATKEYPDLDVTIRGAISIGRRLQDPMAELVKIDPKAIGVGQYQHDVTQKRLEESLAGVVEDSVNKVGVDLNTATPSLLNHIAGINTTIANNIVLYRDEVGGFKTRKELLKVKRLGQKAYEQCAGFLRVMESKEALDNTSVHPESYDIAKKLIGLLGYTKDDLQNKNLNDIEKRVNEKGLSNLVKELEVGEPTLRDIIKELQKPGRDPREEMPKPILKTGVIELKDLTPGMVLMGTVRNVSDFGAFVDIGVHQDGLVHKSQMANRFVKHPLDIVKVGDVIKVRIMEVDEKRNRISLSMKDIKEEE >NZ_CP018630.1|WP_079481626.1|2602948_2603545_-|ECF-transporter-S-component MNNQNKNLNKFVKISLLGAIAVVLMYLDFPVIPLFPWLKIDLSDVPALMGAFAFGPVAGIVIELIKNLLILIVKGTGTVFVGEIANFIVGISLVVPASWFYHRNKSKKTALIGMALGFIGIEIMGIIANVYFLLPAYGMHMESAQLLEYVTVGLLPFNGIKAVLVCGITYMLYKKVSMAIFKVDSHFEPNKDKNLTTV >NZ_CP018630.1|WP_079481625.1|2602439_2602889_+|ribosomal-protein-S18-alanine-N-acetyltransferase MKIAYNLMTSNDIDGVYEISNLCFSVPWSIESIKSELNNPLAKYIVAKEIASNRIIGFVGVWIIAGEGDITNIGVHPNYRKNHIATNLLQCLFKLCEDLNCNTINLEVRESNIPAQNLYTNFEFKNIGLRKGYYEDNKENAVLMQYNKF >NZ_CP018630.1|WP_079481624.1|2601739_2602456_+|tRNA-(adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase-complex-dimerization-subunit-type-1-TsaB MIVLSIDSSSKVATAAIVKDDSLIGEYTLNNKREHSILIMDMVEMLLKDNNLDIDDIDAFVVSKGPGSFTGLRIGMATVKGLSFGSNKPYISVSSLDALAYSLICFDGIICPIMDALRDSVYTCLYKNEDGNLKAITDYDALDLSDLVALLKEKNEKVIFTGDGLEKHKEFLKDNLPNAFFAPNHLSIIRASSLGELGLKMLLEGKSDDINSSPFYLKKPQAERELEKRLALKNENSL >NZ_CP018630.1|WP_096145305.1|2615298_2616397_-|peptide-chain-release-factor-2 MLIKLENELAKLSNIKNNIEEMGASLDKEALEKRVQELEMQMQEKGFWDNVKRAEEVTKETKQIKGKIERYELLKSRIEDVEVLSELMEEDDLESAEEIIAEIKSIEKTLDEYKVEILLSGEYDRNDAILTLHAGVGGSDANDWTDMLLRMYTRWCEKKGFKVEVIDLLQGDEAGIKSVTLKVKGEFAYGYLKAEKGVHRLVRISPFNANGKRQTSFASLEVLPELTEDQDIDIKSEDLKIDTYRASGAGGQHVNKTESAIRITHIPTGIVVQCQNERSQFSNKDTAMAMLKSKLIELKERAHKEKIEDLTGELKDMGWGSQIRSYVFHPYNMVKDHRTNEETSNLNAVMNGEIDNFIKAYLNNF >NZ_CP018630.1|WP_021876580.1|2616455_2618975_-|preprotein-translocase-subunit-SecA MGFLEKLFGSYSDREVKRLEKTANQIEALDADMQKLSDEELKSKTDEFKKRIQDGESLESILPEAFAVCREASWRVLGMKHYKVQLIGGMVLHQGRIAEMRTGEGKTLVATLPLYLNALTGKGVHLITVNDYLAKRDQEWMGQLYSFLGLTSGCIVHGLTAEQRREAYGSDITYGTNNEFGFDYLRDNMVIYKEERVQRGLNFAVVDEVDSILIDEARTPLIISGAGEKSTKFYNVADNFVKQLLAERDYTIDEKANAVMLTEEGVEKAERAFGIENYADAANLELQHYITQALKANYSMKRDKDYMVKDDQVVIVDEFTGRLMEGRRYSDGLHQAIEAKEGVKIERESKTLATITFQNYFRMYDKLSGMTGTALTEENEFREIYALDVIVVPTHRPIARIDNPDLIYKNTNGKYNAIIEDIIKSYEKKQPVLVGTVSIEKSEIISALLKRRGIKHQVLNAKYHEQEAEIISHAGELGMVTIATNMAGRGTDIKLGEGVLEVGGLKIIGTERHESRRIDNQLRGRAGRQGDKGESTFYISLEDDLMRIFGSERIQGLMEKLGLEDDEAIDHKMVSKALENAQKKVEGNNFDIRKNLIGYDDVMNMQREVIYKQRAEVLEGKNLKDQIQNMISEIVTSAVNSHLTGEEDDYETEINKLLKYLEDICLPHGVIALSDVVDLSNEEIINKINAILREIYTGKELEFGEEHFREIERVVLLRVVDQKWMAHIDNMDHLKQGIGLRAYKQVDPIQAYQMEGSAMFEEMIEGIKLDTVRFLFHIQVERPVERERVAQETSASHASTGDSAEVKKEPVRNEDKVGRNEVCPCGSGKKYKNCCGREA >NZ_CP018630.1|WP_021876581.1|2619113_2619638_-|ribosome-associated-translation-inhibitor-RaiA MKVTVVTRNTKLTPALKEMVERKISKMDRYFEPHVSAKATLTVQKNRHIVEVTIPFNGIILRAEEATDDMYKSIDLVEEKLERQIRKQRTKLARRNNESLRFSHIDEVAMEEDDGKVVKTKKFGLKPMSSEEAVLQMELLGHSFFVYQDADKNKLCVMYKRKDGDYGLLEPEYI >NZ_CP018630.1|WP_079481629.1|2620718_2621735_-|hypothetical-protein MGYEKIINHKEFTNCLTKINKWYLRKSKILNIITSPYNSTLIYSSIINEIARKGGNILYIWGNNSPNDELIKEIKLKDKGITYSYIEKGESEKTITFTSFKNMINVRGEYDLCIIDDISKFSLMNKDELIELIEAMYIYSKRIIVYSIERIVSMGEKVEISSLISNKPYVEPRILNTRIKLDDDIPYSLYDYLLWFRDNKSKVIIYAPTEEKARRVYKQYSNTIKISGAKFLLLLRDGPLKELESSLKIKDKGVFIITNYFGDYLKAITELNIVALFSDNRFYSYKKIIYLCAEAGKNPEKHGEILLVSRDISNDMEEAKKFSRNLNKKIWEKGLLRY >NZ_CP018630.1|WP_021876584.1|2621746_2623978_-|ATP-dependent-RecD-like-DNA-helicase MEILNGVIETIVFKSEDTGYVVSKVRVDKELINAVGVVPLLKEGQQVKIKGDWVLHKQFGRQFNINEYEEVLPSSVEGIEKYLSTGIIRGIGPVTAKKIVGKFGEKTLDILDNHIEMLQDIEGIGEKKYKIIYESYLEQKDLKDIIIYFQNNGMTTNQCIKIYKKYSNAAIDVVKENPYVLSDEISGIGFITADRIAKSLGIENTSPFRIQSGIRYVLNQFSAAGNTYMPKEMLIDETSKVLVVDKELVEENIYNASLDGKIKIEKIGEIEGVFLIPYYYCELGVTNKIITLGIENFRTINTDVEFEIKSFEKKNNIEFAQSQREAIIGAFDNGIEIITGGPGTGKTTIIKAIIEIYENNGMKVLLAAPTGRAAKRMTESTGREAKTIHRLLEMGVSDEENSFFGKGETSPLEGDVIIIDEASMIDIMLMHSLLKAVKLGTRLIIVGDVDQLPSVGPGNVLKDLIESEFIKVVRLKDIFRQGKESMIVTNAHKINNGEMPETNKKEGDFFFENKQELDDILNTIIDLINRRLPNFNKSWDKLRDMQVLTPTRKGILGVQNLNNKLQEVLNPKSPNKKEKESKEMVFREGDKVMQTKNNYSLKWFRINGDGDNEGVGVFNGDMGFIEKINESEKTITIIFDDERRVIYDYIYLDELELAYAITIHKSQGSEFKVIITPAFMGSPFLMNKNLLYTGITRAKELVVVVGIPKALKYMVSNVRSMDRYSSLKERILDVKSEEVFSEE >NZ_CP018630.1|WP_021876585.1|2624110_2625247_+|N-acetylglucosamine-6-phosphate-deacetylase 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MIKHKVFYESDLAYYEIANVLKNYISKNTVIVCIGTDKCIGDCLGPLVGTYLIDNQFKLPVYGTIEAPIHALNIEHRLSQIKKLHPNANIIGIDACLGDAKSIGEIHVRNYPIHPGKGVGKRLPDVGSTSIIGIVDSSDNAEFFTSRSIRLHLIMSMAKVIARGICKGYYLSNIDN >NZ_CP018630.1|WP_021876588.1|2628311_2629346_-|MreB/Mrl-family-cell-shape-determining-protein MWFWRNGTNLGIDLGTATVLVYAKGKGIILKEPSVVAINKSNNKVLAVGEEARKMIGRTPGNIVAVRPLRDGVISDYDITEKMLKEFIKKAYGKSKITAPKVMVCVPSQATEVEKRAVMDATRNSGAKRVHIIEEPLAAAIGAGLDITKPNGSMVVDIGGGTTDIAVISLGGVVVRASIKVAGDTFDDAIIKYVRNKYKIMIGEKTAEDLKITVGAAFVGSRDLTTTMKGRNLVTGLPDEVTVATSEIAEALKESVTLIVEQVKSVLEKTPPELAADIIEKGILMTGGGSLLDGLDKLIEKETGVGVSVANNPVEAVVEGTGKVLGYLDKLDSSLIGQEITLID >NZ_CP018630.1|WP_021876589.1|2629473_2629725_-|sporulation-transcriptional-regulator-SpoIIID MKDYIQERVLEVAQYIIDSKDTIRKTAKVFGVSKSTIHKDMTERLPKINPVIAEQTHTILELNKAERHIRGGKATKLKYKAVD |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP018630_1 | 1.1|589045|28|NZ_CP018630|CRISPRCasFinder | 589045-589072 | 28 | AP014333 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S36-C55, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 176-203 | 6 | 0.786 |
| NZ_CP018630_1 | 1.1|589045|28|NZ_CP018630|CRISPRCasFinder | 589045-589072 | 28 | NZ_AP018256 | Calothrix sp. NIES-4071 plasmid plasmid1 DNA, complete genome | 20366-20393 | 6 | 0.786 |
| NZ_CP018630_2 | 2.3|1311039|37|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1311039-1311075 | 37 | GU233956 | Bacillus phage 11143, partial sequence | 909-945 | 6 | 0.838 |
| NZ_CP018630_1 | 1.1|589045|28|NZ_CP018630|CRISPRCasFinder | 589045-589072 | 28 | CAJDKA010000002 | Enterococcus phage 163 genome assembly, contig: phage163-genome, whole genome shotgun sequence | 140826-140853 | 7 | 0.75 |
| NZ_CP018630_1 | 1.1|589045|28|NZ_CP018630|CRISPRCasFinder | 589045-589072 | 28 | MN241318 | Enterococcus phage PEf771, complete genome | 76284-76311 | 7 | 0.75 |
| NZ_CP018630_1 | 1.1|589045|28|NZ_CP018630|CRISPRCasFinder | 589045-589072 | 28 | NZ_CP006904 | Clostridium botulinum 202F plasmid pCBI, complete sequence | 23073-23100 | 7 | 0.75 |
| NZ_CP018630_2 | 2.26|1312550|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1312550-1312584 | 35 | NZ_LR214986 | Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13 | 208366-208400 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP018630_2 | 2.26|1312550|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1312550-1312584 | 35 | NZ_CP004872 | Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD-1 plasmid pBMB64, complete sequence | 49358-49392 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP018630_2 | 2.26|1312550|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1312550-1312584 | 35 | NC_017205 | Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT72, complete sequence | 52490-52524 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP018630_2 | 2.26|1312550|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1312550-1312584 | 35 | NZ_CP010581 | Bacillus thuringiensis serovar morrisoni strain BGSC 4AA1 plasmid pBMB68, complete sequence | 60071-60105 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP018630_2 | 2.26|1312550|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1312550-1312584 | 35 | NZ_CP015179 | Bacillus thuringiensis serovar alesti strain BGSC 4C1 plasmid pBMB57, complete sequence | 44583-44617 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP018630_2 | 2.26|1312550|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1312550-1312584 | 35 | NZ_CP015156 | Bacillus thuringiensis strain Bc601 plasmid pBTBC6, complete sequence | 57641-57675 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP018630_2 | 2.26|1312550|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1312550-1312584 | 35 | NZ_CP004869 | Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. YBT-1520 plasmid pBMB67, complete sequence | 13874-13908 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP018630_2 | 2.26|1312550|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1312550-1312584 | 35 | NZ_CP010093 | Bacillus thuringiensis serovar galleriae strain 4G5 plasmid pBMB71, complete sequence | 44424-44458 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP018630_2 | 2.26|1312550|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1312550-1312584 | 35 | NZ_CP021065 | Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh4, complete sequence | 21905-21939 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP018630_2 | 2.26|1312550|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1312550-1312584 | 35 | NC_018488 | Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p04, complete sequence | 34185-34219 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP018630_2 | 2.26|1312550|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1312550-1312584 | 35 | NZ_CP011358 | Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC2226, complete sequence | 45960-45994 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP018630_2 | 2.26|1312550|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1312550-1312584 | 35 | NC_018879 | Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_78p, complete sequence | 9313-9347 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP018630_2 | 2.26|1312550|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1312550-1312584 | 35 | NZ_CP013057 | Bacillus thuringiensis strain YWC2-8 plasmid pYWC2-8-2, complete sequence | 45135-45169 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP018630_2 | 2.26|1312550|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1312550-1312584 | 35 | NC_020382 | Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-68, complete sequence | 15049-15083 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP018630_2 | 2.3|1311039|37|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1311039-1311075 | 37 | NZ_CP026602 | Clostridiaceae bacterium 14S0207 plasmid unnamed2, complete sequence | 9474-9510 | 8 | 0.784 |
| NZ_CP018630_2 | 2.10|1311500|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1311500-1311534 | 35 | NZ_CP042875 | Bacillus cereus strain 09 plasmid unnamed1, complete sequence | 367216-367250 | 8 | 0.771 |
| NZ_CP018630_2 | 2.10|1311500|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1311500-1311534 | 35 | NC_010858 | Campylobacter fetus subsp. venerealis plasmid pCFV108, complete sequence | 1505-1539 | 9 | 0.743 |
| NZ_CP018630_2 | 2.29|1312747|34|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1312747-1312780 | 34 | MG788324 | Lactobacillus phage PM411, complete genome | 33624-33657 | 10 | 0.706 |
| NZ_CP018630_2 | 2.29|1312747|34|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1312747-1312780 | 34 | NZ_CP024415 | Lactobacillus plantarum strain ATCC 8014 plasmid pLP39, complete sequence | 15902-15935 | 11 | 0.676 |
| NZ_CP018630_2 | 2.29|1312747|34|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1312747-1312780 | 34 | NZ_CP018210 | Lactobacillus plantarum strain BLS41 plasmid pLPBLS41_1, complete sequence | 34470-34503 | 11 | 0.676 |
1. spacer 1.1|589045|28|NZ_CP018630|CRISPRCasFinder matches to AP014333 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S36-C55, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
taggcaacagaaaaacctaaaagatttg CRISPR spacer gatttaacagaaaaacctaaaagttttt Protospacer * .****************** ***
2. spacer 1.1|589045|28|NZ_CP018630|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP018256 (Calothrix sp. NIES-4071 plasmid plasmid1 DNA, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
taggcaacagaaaaacctaaaagatttg CRISPR spacer caaccaacagaacaacctaaaatatttc Protospacer .*. ******** ********* ****
3. spacer 2.3|1311039|37|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GU233956 (Bacillus phage 11143, partial sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.838
caggagtcgttgtatttgatgaaatacatgaatatga CRISPR spacer atggtgcagttgtatttgatgaaatacatcaatatga Protospacer ** *. ********************* *******
4. spacer 1.1|589045|28|NZ_CP018630|CRISPRCasFinder matches to CAJDKA010000002 (Enterococcus phage 163 genome assembly, contig: phage163-genome, whole genome shotgun sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
taggcaacagaaaaacctaaaagatttg CRISPR spacer taggcaacagaaaaacctaatattcaaa Protospacer ******************** * . .
5. spacer 1.1|589045|28|NZ_CP018630|CRISPRCasFinder matches to MN241318 (Enterococcus phage PEf771, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
taggcaacagaaaaacctaaaagatttg CRISPR spacer taggcaacagaaaaacctaatattcaaa Protospacer ******************** * . .
6. spacer 1.1|589045|28|NZ_CP018630|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP006904 (Clostridium botulinum 202F plasmid pCBI, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
taggcaacagaaaaacctaaaagatttg CRISPR spacer atggcaagagaaaaacctgaaagatcat Protospacer ***** **********.******.
7. spacer 2.26|1312550|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR214986 (Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
attctttg-----cttttatctctatatttaactatctct CRISPR spacer
-----ttgaaatttttttatctctatatttaaatatctct Protospacer
*** .****************** *******
8. spacer 2.26|1312550|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP004872 (Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD-1 plasmid pBMB64, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
attctttgcttttatctctatatttaactatctct CRISPR spacer tttgttattttttatctctatatttatctatatct Protospacer ** ** .***************** **** ***
9. spacer 2.26|1312550|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_017205 (Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT72, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
attctttgcttttatctctatatttaactatctct CRISPR spacer tttgttattttttatctctatatttatctatatct Protospacer ** ** .***************** **** ***
10. spacer 2.26|1312550|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010581 (Bacillus thuringiensis serovar morrisoni strain BGSC 4AA1 plasmid pBMB68, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
attctttgcttttatctctatatttaactatctct CRISPR spacer tttgttattttttatctctatatttatctatatct Protospacer ** ** .***************** **** ***
11. spacer 2.26|1312550|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015179 (Bacillus thuringiensis serovar alesti strain BGSC 4C1 plasmid pBMB57, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
attctttgcttttatctctatatttaactatctct CRISPR spacer tttgttattttttatctctatatttatctatatct Protospacer ** ** .***************** **** ***
12. spacer 2.26|1312550|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015156 (Bacillus thuringiensis strain Bc601 plasmid pBTBC6, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
attctttgcttttatctctatatttaactatctct CRISPR spacer tttgttattttttatctctatatttatctatatct Protospacer ** ** .***************** **** ***
13. spacer 2.26|1312550|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP004869 (Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. YBT-1520 plasmid pBMB67, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
attctttgcttttatctctatatttaactatctct CRISPR spacer tttgttattttttatctctatatttatctatatct Protospacer ** ** .***************** **** ***
14. spacer 2.26|1312550|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010093 (Bacillus thuringiensis serovar galleriae strain 4G5 plasmid pBMB71, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
attctttgcttttatctctatatttaactatctct CRISPR spacer tttgttattttttatctctatatttatctatatct Protospacer ** ** .***************** **** ***
15. spacer 2.26|1312550|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021065 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
attctttgcttttatctctatatttaactatctct CRISPR spacer tttgttattttttatctctatatttatctatatct Protospacer ** ** .***************** **** ***
16. spacer 2.26|1312550|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018488 (Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p04, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
attctttgcttttatctctatatttaactatctct CRISPR spacer tttgttattttttatctctatatttatctatatct Protospacer ** ** .***************** **** ***
17. spacer 2.26|1312550|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011358 (Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC2226, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
attctttgcttttatctctatatttaactatctct CRISPR spacer tttgttattttttatctctatatttatctatatct Protospacer ** ** .***************** **** ***
18. spacer 2.26|1312550|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018879 (Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_78p, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
attctttgcttttatctctatatttaactatctct CRISPR spacer tttgttattttttatctctatatttatctatatct Protospacer ** ** .***************** **** ***
19. spacer 2.26|1312550|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013057 (Bacillus thuringiensis strain YWC2-8 plasmid pYWC2-8-2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
attctttgcttttatctctatatttaactatctct CRISPR spacer tttgttattttttatctctatatttatctatatct Protospacer ** ** .***************** **** ***
20. spacer 2.26|1312550|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_020382 (Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-68, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
attctttgcttttatctctatatttaactatctct CRISPR spacer tttgttattttttatctctatatttatctatatct Protospacer ** ** .***************** **** ***
21. spacer 2.3|1311039|37|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026602 (Clostridiaceae bacterium 14S0207 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
caggagt-----cgttgtatttgatgaaatacatgaatatga CRISPR spacer
-----gtgcttgccttatttttgatgaaatacatgaatatga Protospacer
** * **.* ***********************
22. spacer 2.10|1311500|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP042875 (Bacillus cereus strain 09 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
agtgaaaaagaaaaggaaattagaaagaaaataag CRISPR spacer acagattttgaagaggaaattaaaaagaaaataag Protospacer * ** ***.*********.************
23. spacer 2.10|1311500|35|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010858 (Campylobacter fetus subsp. venerealis plasmid pCFV108, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
agtgaaaaagaaaaggaaattagaaagaaaataag CRISPR spacer agacaaaaataaaagaaaattagaaagaactatac Protospacer ** ***** *****.************* *
24. spacer 2.29|1312747|34|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG788324 (Lactobacillus phage PM411, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
aaaaggagctgatgggaatcaaggaccaattgga CRISPR spacer cttaactggtgatgggaatcaaaaaccaattggc Protospacer *. * *************..*********
25. spacer 2.29|1312747|34|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024415 (Lactobacillus plantarum strain ATCC 8014 plasmid pLP39, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
aaaaggagctgatgggaatcaaggaccaattgga CRISPR spacer cttgactggtgatgggaatcaaaaaccaattggc Protospacer .. * *************..*********
26. spacer 2.29|1312747|34|NZ_CP018630|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018210 (Lactobacillus plantarum strain BLS41 plasmid pLPBLS41_1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
aaaaggagctgatgggaatcaaggaccaattgga CRISPR spacer cttgactggtgatgggaatcaaaaaccaattggc Protospacer .. * *************..*********
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
522509 : 585073
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP018630|522509:585073|DBSCAN-SWA TATGACAAGAAAAATTGATACCAACTTTGATTACAATGAGGAAATTAAAAGATGTAAAACAATCGATGATGTAATGGGTAAAAACGGATTAATACAAAGATTAGTTAAAGATGTCCTTGAAAATATATTAGAAGGTGAAATGGAAGAACATCTAGGAAGAAATAAATATGAACGTGTAGAAGCAGTTGATCAAACTAAGAAGAACTACAGGAATGGTTATAGTCGCAAGAATTTAAGAAGTTCCTTCGGTGACGTCGACCTAGACGTACCCCGTGATAGAAATGCTGAATTTGAGCCACAAATTATAAAAAAATATGAAACTGTGTGTACTGAGTTAGATAAAAAGATTATATCTTTATATGCTAAAGGTATGTCAACATCTGATATTCAGGCTGAAATTGAAGACTTATATGGAATAACTATATCACCATCGATGGTATCTAAAATAACTGATAAAGTGCTTGCTAGCGCCGCCGAATGGCAAAATAGAGTATTAGATAAAATATATCCAATAGTTTATTTAGATGCTATGTACTTTAAAGTTAGAAGTAATGGAAAGATAGTTAACAAGGCTGTCTATATATGCTTAGGATACACTATGGAAGGATATAAAGATATTTTAGGTATATGGGTTGATGAAGCAGAAGGTGCTAAATTCTGGTTAGGAATTTGCAATGATTTAAAAAATAGAGGTGTAAAAGAAATTTTAATTGCTTGTATGGATGGATTAAAAGGTCTTCCACAAGCTATAAAAACAGTATTTCCATCAGTAAATATTCAAACATGTATTGTTCATCAAATAAGAAATTCAATAAAATACATAGCTTCAAAAGATAAAAAAGCATTTATGAAAGATTTGAAGGAGGTTTATAAGGCTACAACAGAGGAACTTGCGTTAGCACAGCTAGATAATTTAAAGGAGAGATGGGGAGATAAATATGGAATAGTAATAGATTCCTGGTATAACAATTGGAGTAACCTTTCAACATTTTTTGACTTCTCTCCAACTATAAGAAAGATGATTTATACTACAAATATCTTAGAGGGTTTTAATCGTCAAATACGTAAATTCACTAAAGTTAGAGTCATATTCCCAACTGATGAATCTTTAAATAAGTGTGTTTACTTAGCAACAATGGAGATACTAGAAAAATGGACTCAACCTATACATAATTGGGGTGCTACGCTAGCGGAGCTATCAATAATATTTGAAGATCAATTAAAAGATGAATTAGCTTAAAAGCTTGTACTTTTTATAAATTATATGCATACTATTAGATTTTTTTGAAATACTAAAAAAGGTAATAAGAAACATTATTAGTATTTCTTAAATATAAAAAAATATTACTGGAAATGAAAATTTCCAGTAATGTTAAAATAATAAAAATGATAATTACACAGAATTATCTATTCTCTCTATATATGAAATAATACTTTTTTTTAATTACTTATATGTTTTTTTAAATCATTTATTATATGTATGATTTTTGAAGAAATGCTTGTCATATTATTTAAGTGATTATAGCAACCAGTAATATTTTTTTGATTATAGCATATAACAGCATTACTAGCTTCTTTATGTAAATCTATATGTATATTCTCAAGCTTTTTAAATGAAGGCGAGTTTATGATATTAGGATCTGACTCATTATAATACCATTTACCTAAAGCACATTCTTTATAATTTGATGCATTATTCTCATTAATATTTTCTAAGCCTAAAATCATATTATATATTTTCCATCTCCAAAGAAGGTGGTCAACTATATAAGTATCTAATTTTTCAGCTAAAGTTAAATTAGTATTGTTAATTTGGTTTACTCTAATATTGTTAGAGAATTCACTAGTTTTATTAATTTTATCTGCAACATCTTTACACATATTATCTAAATTAATTTGGAACTCGGCAATTTTAGTTAATTTATCTGCCATTGTATTTGTAGTTGCACTTTGTTCTTCGGATATTGTAGCTATATTACAAAACTCCTCATCAATTTCTTTTATAGAGTCGATTATGTTATTCATATACTTTGGTATTGACTCCATTTTATTAATTCCAAAATTAAGATCTTCTATAGTACTGTTTGTACAACCTAGAGTTTCTTGAGTACTATCACTTAATTCTAAAATATTTTCAGATATTGTTTCTACAGAAGTTTTTGTGTATTCAGCTAGTTTTTTAATCTCATTTGCAACTACGCTGAAGCCTTTACCACTTTCCCCAGATCTAGCAGCTTCAATAGATGCATTAAGAGAAAGTAAAGAAGTTTGATTAGCGATTTGTTTTATTATTCTAATTATTTCGTTTATATCATTAACTTTATTTGCAACTAGATTAATATTTTCTTTTATTTGAAAAACGTTTGATGAAGAATTTATTATATTATCAATTATATTATTAATTGATTGCATACTATCTATAGCTTCATTTTTCACATCATTAGAGTGTTGGGAAACAGTTTGAATAGATGATGCTACGTTTTCTGAAGTAGATGCAAGTTCTTCGCTACTTGCTAACATAGTTTGTATTATGTCTTTTTGTTCAGCTGAATTAGCTAACATATCATCTACAGAATCGATTTCTATTATATTTTTTACTATATCATTGATACCCATAACAGCATTGTTATCGTAATATGAACTTAACAAAGTATTTAATGTATCAATTAAATTTGCATCGTAAAAATCATTATATGATAAGTATTTTCCCTCACTCATTCTTTTATTTAGAATGTTATTTAAATTATGATTAGATTCTGATTTCTCTAAGTTATTTTTCTTTTTGAAAATCATTTTCAATCATCTCCTTTGTTGAATAGATTTGAAATACTTATATATAATATAATTAAATTAAAAAAAATACAATAAAAATGAGAAAGATTTAAAAAAATTCTAAGAAATTAAACTATTTTTGAAAATATTTAATGAGCTTATTTAAAAATAAGCTCATTAAATATAACTAACTATTCATATTTATTTATTTTAGCAATTACATCATCATAAATTTTATTACCGATATCAAAGTTTATAGAGTCGATATAAAATGATTCTAAATCATCATGAAGTTCATGAGCTTCAGTTAAATAAGATAGACCTTTTGTTATTAAATCATAGAAAACTTTACTATCATATTCTATATCATCTTTATTTTTATTTAAGATATCAGCTTTGCAGAAATCTTCAATATTATATACCTTGCCAGAAAAAGCAGTTTGACTTATTTCATTTTCTGTAAGAATACAAGTTGATAGTTCTGGTATAAATATATGCTCTATTCTATCTGGAATAAATGGATCGTGTAAATATTCTACAAAGTATCCTTTCTTTTGAGCTGTCTTACCGATTTCTTTTAAAATATGACTCTTACCAAATCCAGGACCGCCTTTTAAAACGAATTTATTTTTAAATTCAGAAGATAAATCTTTTACAAAAGTAATTATTCCACTAGGAGTAAAGGAAGTTCCGAATAAATGTCTTTCATTACCATAACCAGTTTTTTGTGCTATAAATATTTCTTCTTTTAAACTTTCAGTTATTGTATCTATTTTATAGGTATCAATAGCTTCGGCATTTAACTTACACCAATCTTCGTGTATTGATTTTGCAGCTGCAAAAAAGCTATATGCTCTTTTAAATTTATTACTAATTACTTTACTAAGAGATATAATTTCTTTTTTATTTTTAGAAACGGATTCTACATCCATAGAATCACCCATATTTAAAACTTCATCGATGGCTATAGGATAAACTGGATCTACTATATGAGGTGCAGTACCATCCATTAATGCTACTTTTAATTCTTTAACAACTACAGCATCTAAAGATTTATCATCTGAAGAACAATGATGATATTCAACGGTATAGCCCTTTGCTTGATAGTGAGCGCCTATTTTTTTCATTAAATGAGATTTACCAGTTCCAGGACCACCTTTTATACAAAAAATTCTATTTGCTTCTTCTTTAGAAATTATATAGTCAAAAAATGAAAAAAAGCCTCCAGAAGTATTAGCTCCAGGGAAAAGATGTCTTTCTTTTAAGTTAGTCAATATTACCACTCCTACTACGTTTTGTTTTCAATAAATATTATATTTAAAAATTTTCAAAAAGTGCCTATGCATAAAGATAAAAGCATAAAAAATAAATATGCAGAAATATTGTATAAAAATTAAATGGAATTAATATATAAATATACATTTTAAATGAATATTAATTAGATTAAAAATTCTCAATATTATCATGAAAAACTTAATAAAAACATTAATTAAAAGATAGATTAGTATATATTGTTAAATAAATTAAGGCGTTTATAGAAGGAAAACTCTAAAGGAATACTAATGAGATGAATAAAAATTAAAAAAATACAAAAATATTTCAAAAAAGTATTGCATAAATATAAAGATATGATGTATAATTATGCTATGTTAAAGGAAGGAAATGAAAAATATAGATATTTTATTAGATAGTGTAAAGTTTCGTATGAAAAAATAGCTTATGGCTAATTTGGAATAATAGTTAAAAATATCTTTATAATATCTAAGAAAATTTTAAAATTGAATATGCTAAAAAGACCTTCGGTAACGGAGGCAAAAACTTAATCAATATTTGATTTTATGATTTATCAAGAAGTTTGTGATTCTTGCATATGTAATATGGTTTGTTGACCGAGACTGATAAGAATTTGCCACTTTGCAGACATATTGTCAATACCATCTAGTTGCTTTAATTCGTTTAAAGGACGCCAGTAATTGTAAGGATGCGGGCGTAAGAAGTTGTAATAAGCAACCCAAAGGGAGAAGCCATAAAGAGCACCTTCATCACTTCCATAACCACAGGTACCCCTGTAGGAAGATTTAAAGGTACGGTTTAAACGCTCTACAACTTGCTTAACCCAACGAAATTCTTCAGATACTGGATCATCGTTAGTAAGTCCGATAACTTGAGTTAGATTAAATTCTTTATTTTTTTCTAATTCAAATTGTTGCTTCGCTAACGGATATGAA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48 | Planktothrix_phage(25.0%) | integrase,transposase | attL 524208:524224|attR 586917:586933 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
707972 : 739957
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP018630|707972:739957|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP018630|707972:739957|739111_739957_-|WP_079481115.1|transposase|DBSCAN-SWA MGRRLLNPKVDFIFKKIFGSEKHPNILISFLNAVMKPADKIVSVVINNTEISKDFLEDKFSRLDVKATTNKGEVINIEIQIKNEYNMIKRSLYYWSKLYEEQLSEGDKYDKLSRTVCINILDFKYLDNDRFHNGYRLKEIETNEELTDIEEIHFIEIPKLKDLDDDANIDTIDMLTAWIEFLKDPESNVVRKLEFSKEEIKEAKDELYRLSRDKKELELYNLREKSFFDKISALSNAEEKGREEGKLLERINIAKNLLDVLDNETISLKTGLSVDEIEKLR >NZ_CP018630|707972:739957|708813_709284_+|WP_021874844.1|DBSCAN-SWA MKKLALIVISILCVLFIFSNSSKSGEESNIKSKSIVNKIVDKIEEKVENNSIKKININKNKLNLLLRKAAHALEFLMLAIVVALVLENFGIKGKNAIIYILFIVLLVGVLDEFYQLYIPGRTSSVRDVLIDFSGGILGTTIFFILRIPLSLKNFNK >NZ_CP018630|707972:739957|734393_734999_+|WP_021874871.1|DBSCAN-SWA MALNNKLQITDSVELARVEEKISKKKAIELFESGYLDSLEAGKYNTLAQLNRYLFEDIYEFAGVVRDVNIAKGNFRFAPIMYLKASLEHIESMSQSSFDEIIEKYVEMNIAHPFREGNGRSSRIWLDLILKKELGKVVNWSEVDKNDYLLAMERSPIKDIEIKHILKQALIDKINDREIYMKGIDTSYYYEGYTVYKTEDL >NZ_CP018630|707972:739957|737868_738159_-|WP_079481116.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP018630|707972:739957|726288_726855_+|WP_021874863.1|DBSCAN-SWA MAIFTIFAGVNGAGKTSIYKSIYYNENKDEKRINTDEMVARIGCWKDTNIQMKCAREAVKLIKHYILEGRSFNQETTLSGKTIIKNIKFAKENGFYIVMNYVGVKDPEVAKERVKIRVSKGGHGIPDKDIERRYYDSLNNLNNVIAICDEVNIYDNTEVLKEVIYLKNGEIIWKDKKIPNWANNILKK >NZ_CP018630|707972:739957|714326_715043_+|WP_096145424.1|DBSCAN-SWA MMVKDLKVKIFADGANLEGMLEEYKKGIVKGFTTNPSLMKAAGIKSYSEFAKLVLDNIKDMPISFEVFSDDIDEMEKEAREIASWGENIYIKIPVTNTKGEFTGKVIKNLSKDGIKVNVTAVFTVEQVKNILAVLDENTPSIISIFAGRIADTGFDPENLVKESVDFAKKNKNCEILWASCREVFNIVQADRCGCQIITVTNSNLNKLSLFGKDLKDYSLETVKGFFKDATSLGYKIL >NZ_CP018630|707972:739957|712944_713748_+|WP_021874848.1|DBSCAN-SWA MKKILGLLFIIFILSIHVVWADDKPLVNINVDGELKKGQDIVISLNIENVENLYSLSMDYTYNSDIIEIKSIVEGSLIEGNKFEELINEPKKDGDTASYKMTFKGMVEGVSGSGSIIKIKAKIIGDGTLDINDTNLTIKLVGIDSGNNVYNMPFDFKRGIKNEDNGNDKKEGIFLDSDENLTYDTTKVKSNFIDRVLGFLHLDKKNNKLEKNNIIRKDGDTSNDISNEEPDKLSINKGANNKVKDILILSGIIVIGMAGIFIFKNKK >NZ_CP018630|707972:739957|717308_719441_+|WP_021874854.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP018630|707972:739957|709460_711068_+|WP_021874845.1|DBSCAN-SWA MNNKVDGIREAVILAAGEKDFHKPACALEVEDITLIERAISILKENGIEKIVIVTGYNSSFLEELVKKESSVVLVNNEKYKWTGNMTSLALAKEFITDDFILIEGDLIFESQAISQIVNSKEKDCVLITNESGSGDEGFVQLKNGYLFKLSKDIHQFNRIDGEMIGISRISYSLYSKMLKEFENNINPYLHYEYMLLDLSREHRVAALKIDDLAWGEIDTLKQYDAIKNYLFSKIKRKDLKFEKDNIKSIIQRYLDIPAENVTTVIHAGGMTNKNYKVCINGEYFILRVPGAGTENMISRKNEMVNSKLASDLGLNVDIPCFDEERGIKISKFIEEAETLTGRAAKKEENMKLVTDILRTLHNSKIEMLNTFDVFSEMEKYEDLVKACKGSFYKDYFEVKNRVMRLKDIFKECDFNLVPSHNDTVPENFVKDKDGRLYLIDWEYSGLNDEMWDLAAHSIECKFSESDEELFLKLYFNGEASKNNRIKLLINKICQDFLWAVWTLIKEAKGDDFGTYGIDRYNRAKENLDKLEKLI >NZ_CP018630|707972:739957|720725_722057_+|WP_021874857.1|DBSCAN-SWA 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MRISKGKYILVKLLVNFISSGLAILLASSMMLVFLSILYGFTLNPKNALNITGVFSSGKYLYLIFIIFNSCIFYCIFSTLSLAVSTFIDNKYISLAIPFFYYIISGSIFVMFGLNKLNATALFTPKNGLNIYQFIFYELFLLSLGVITFIYGVLKSNEKIN >NZ_CP018630|707972:739957|722942_723593_-|WP_021874858.1|DBSCAN-SWA MDNTVVEIKNASKIINNIKILDNINVSFKSGHIYGIIGKNGSGKTMLFKAICGLINITSGEIKVFDKLIANGKFPDDTGIIIENPGFLPQYSGYKNLEILASIRNKITPSDIKDIIRKVGLNPDDNRPVKKYSLGMKQRLGIAQALMENPKLLILDEPMNALDEEAVNDIRKILLDLQKQSVTIILASHNKEDIYTLCDSIYTITNGVLKPSLVTT |
29 | Synechococcus_phage(25.0%) | holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1270705 : 1283786
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP018630|1270705:1283786|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP018630|1270705:1283786|1282283_1283786_+|WP_021875371.1|DBSCAN-SWA MIKRALISVFDKEGILDFSNFLSGKGVEIISTGGTFKHLKENGVKVTEVNEVTNFPEMLDGRVKTLHPILHAGILAIRDNEEHMNTIKERNIEPIDMVIVNLYPFFKKVREDLSFDEKVEFIDIGGPTMLRAAAKNFKDVVVISDKDDYKLVMEEIQSLGEVTLKLRKKLAGKVFNLMSAYDAAISNFLLGDEEYPEYLSVSYKKMQNLRYGENPHQSAAYYGRTEVNGAMNSFEILNGKELSYNNIKDLDIAWKVACEFEETACCGLKHNTPCGVAIGETPFEVYTKAYNADPTSIFGGIVAINRKIDKATAEEMVKIFLEVVIAPEFDEDALEVLKTKKNLRVIKCNNAPKDEKFMVTVDGGMLVQEEDKKLVEEIKVVTEKAPTEEEMKDLIFGMKVVKYVKSNAIVTIKDGVAVGIGGGQVNRIWPTEDALRRGKGATILASDAFFPFRDVVDTCAKYGVKAIIQPGGSMRDQESIDACNEHDIAMVFTGIRHFKH >NZ_CP018630|1270705:1283786|1270705_1271644_+|WP_021875361.1|DBSCAN-SWA MGMILMGVLLVFLLFIVLSTIKIVNTGYLYVVERFGQYHRILEPGWHFLIPFVDFVRKRISTKQQILDVPPQTVITKDNVKISVDNVIFYKLLNARDAVYNIEDYKAGIVYSATTNMRNIIGNMTLDEVLSGRDKINQDLLSIIDEVTDAYGIKILSVEIKNIVPPEEIQEAMEKQMKAERDKRAMILQAEGLRQSEIEKAEGEKQSQILRAEAEKQANIRRAEGLKESQLLEAEGKAKAIAKIAEAEAEAIRKVNEAIIQSGTNETVIALKQVEALKEMANNPANKLILPNETLSSLGSIAAIGEMLKGEK >NZ_CP018630|1270705:1283786|1279228_1280656_+|WP_021875368.1|DBSCAN-SWA MNSSLELILDPSNDKFKDECGVFGVYANREMDVASMTYYGLYALQHRGQESAGIAVANGNMVNLHKGMGLITEAFSQDDLSKLQGNSAIGHVRYSTSGDTRIENAQPLLSKTKLGSIAMAHNGTLVNAEVIRELLEDGGHVFHTSIDSEVIANLIARGAKKGIQRAVLDAIQAVRGSFAMVILTENKLIGVRDPHGIRPLCLGKFEDGYILSSESCALDAIGAELVRDIDPGEIVVIDESGISSYRYSENTQCQTCAFEYIYFARPDSTIDGLDVHESRVKAGQELFKQYPIEADVVVAVPDSGIPAAVGYAKASGIPYDTGFVKNRYVGRTFITPSQEIRERAVAVKLNPLKVNIKGKKVVLIDDSIVRGTTSKHLVDSLKRAGAKEVHFLVASPIVKFPCYFGIDTPYRSELIGTKGSVDEIREMIGCDTLGYLDIENMYKCFKENSGYCVGCFNGVYPVATPIETSKDHLER >NZ_CP018630|1270705:1283786|1281654_1282266_+|WP_079481269.1|DBSCAN-SWA MFKIAVLASGSGSNLQAIIDAIESKRLNCKIEMVIGSKEGIFALDRAKANNIETYIVSKKEYGNKTSDKILELTKSKVDLIVLAGYLSILQGDILKEFKDRIINIHPSLIPSFCGSNMYGIKVHEAVLKSGVKVTGCTVHFVNEEVDGGAIILQETVKIDFYDTKEEIQKKVLVLEHRLLPRAIDLIVKGNIKIINGRVKIVE >NZ_CP018630|1270705:1283786|1272869_1273025_+|WP_021875363.1|DBSCAN-SWA MEDKKIICKDCGNEFVFTVGEQEFYKEKGFDNEPVRCIDCRRARKAQNNRR >NZ_CP018630|1270705:1283786|1274233_1277980_+|WP_021875365.1|DBSCAN-SWA MLGTRCIFVEKKKGFNVEAKSLLQDFKSNLGVSGLESVRLINKYTLGEINEEFYKKALYTIFSEKTVDNVYENNLELKDGEIAFAVEYLPGQYDQRADSAAECYQILTAEDKVEVKSAKVIILNGTINDEEINKIKDYYINPVDSREVSLDSMELTSFFTEPKEVEFLTGFINKDNKELEAFHKELGLAMSLEDIKIIRDFFKKEERDPSITEIKVIDTYWSDHCRHTTFSTAIEKVNIEEGLYSKPVSKAYEAYLKSRDYVYGKTNRDETLMDIAVITMKEMRKRGMLEDLDVSEEINACSIKVNIETNNGIEEYLVMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCLGGAIRDPLSGRTYVYQAMRVTGSADPTTPVEETIKGKLPQRTITLGAAHGYSSYGNQIGLATGQVSEVYHPNYVAKRMEVGAVIAAAPKENVVREEPKAGDVVILLGGRTGRDGLGGATGSSKEHTEDSINECGAEVQKGNAPTERKIQRLFRNKEVCQMIKRCNDFGAGGVSVAIGELTRGLDIDLDRVPKKYEGLDGTELAISESQERMAVVVEKENADRFIALSKEENLEAVVVAKVTDKERLRMYFKGNKIVDLKREFLDTNGARQTTEVEVKAPTNYPFEVKDIDVKEKWINVLKNLNVASQKGLVERFDSTIGTGTVLMPFGGKYQNTEAEGMAAKIPVLNGESKDATLMSYGFNPYLGTWSPYHMAYYSVIEAVTKLAAMGGNYKKARLTLQEYFEKLGTNKEKWGKPFAALLGAYKAQMELGIPAIGGKDSMSGSFGNIDVPPSLVAFAVGVEKAANIISSEFKEVGSEIIFLMGQRKEDMTLDIESYKKNLEVLYKLILEGKVISASAIKFGGVSEALTKMALGNRIGVEFKNLTKEELFGLNYGSLVLEVKLGVNIKDEFEGCAYKAIGNTINSGAIISKEYDINFKIEKLSDVLEEKLSKVFKIKTEDKNEKVETVLYKEGTIKSPGIKVAKPRVFIPVFPGTNCEYDCARAFRNEGADVSELVLNNLNKDSLKESILKMEKTIRESQIIMLPGGFSAGDEPDGSGKFIATVFRNERIKDAVMDLLKNRDGLMLGICNGFQALIKLGLVPYGEIVDIEEDMATLTYNEINRHMSAMVRTKVVSNKSPWFSEVTPGDIHTIAISHGEGRFVASEKLISKLRENGQIATQYVDLNGDISMDMPYNPNGSVLGIEGITSEDGRILGKMGHSERIGENLYKNIPGDFDQKIFKSGVNYYK >NZ_CP018630|1270705:1283786|1278471_1279176_+|WP_021875367.1|DBSCAN-SWA MEKLEMMYEGKAKKIYATESKDEVIVYYKDDATAFNGEKKGEIEDKGVLNNAITSMLFEMLNKKGIKTHFVKKLSDREQLCKKVEIVPLEVIVRNVAAGSMAKRLGLEEGFELKTTVFELSYKDDFLGDPLINDYHAVGIGATTFEELQKIYDMTAKINELLKKFFKEQNIRLIDFKLEFGRYNGEIVLADEISPDTCRFWDAKTGEKLDKDRFRRDLGNVKDAYVEILNRISK >NZ_CP018630|1270705:1283786|1277992_1278472_+|WP_021875366.1|DBSCAN-SWA MKVAIFFGSKSDTDVMRGAANCLKEFGVSYEAYILSAHRVPEKLTETLKNAEKSGCEVVIAGAGLAAHLPGVIASQTIMPVIGVPIKGSVEGLDALFSIVQMPKSIPVATVGINNSYNAGMLAVQILAVKDKAIREKLNKFRENMKEKFIEENAEGVDL >NZ_CP018630|1270705:1283786|1272409_1272565_+|WP_008677523.1|DBSCAN-SWA MEDKKIICKDCGKEFVFTVGEQEFYKEKGFDNEPVRCIDCRRARKAQNNRR >NZ_CP018630|1270705:1283786|1271709_1272120_+|WP_079481268.1|DBSCAN-SWA MTLLENISYIFLGLSFLTYIFVGLAMYNIAKKDGFNKSWLSWIPIAQDYVVIKYGKGIPWALLLYIPFFFTTGLISSVIAFTIGIYLTIMAVKICKEFKVSYVWVILGLFIPGFSIISYYKLYKTTKNNELLLENK >NZ_CP018630|1270705:1283786|1273258_1273564_-|WP_161493087.1|DBSCAN-SWA MEVLNLVSVLIALLFSFIYDFKNETAFYENGILTCDGEAINYDDILKIEKFTFSTTIKYKIKVKNYYNKLELLMYIEDIDIVNNLFNEKFPNYVDLEKLNK >NZ_CP018630|1270705:1283786|1280665_1281667_+|WP_021875369.1|DBSCAN-SWA MITYKEAGVNIEEGYKSVKLIKEYASRTMSEYVLNGLGSFAGMVELPEGYKKPVLVSGTDGVGTKLDIAFKTKKYDTVGIDCVAMCVNDILCHGAKPLFFLDYIACGKLEAEVAADLVKGVSEGCVQGDCALVGGETAEMPGFYRDGEYDMAGFAVGIVDKDKIINGKNIKEGDKLIGISSSGLHSNGYSLVRKIFTDLNEDLNGEEVWKTLITPTKIYVKPILELLNNFEIKGMAHITGGGFIENVPRMFNGNNLTAVIKKDSYPLPAIFEKIIEKGVDKNHMYNTFNMGIGFVLCVKESDVEDIIKRLIELGEKAYEIGYVTAGGEGCCLK |
12 | Cyanophage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1727053 : 1735770
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP018630|1727053:1735770|DBSCAN-SWA ATTATTTTTTTTCATATTCCTTAATATCTATTTTAGTATTGCTTATAAGTGGAGACTTATAACGTTCTTTATTATTATCTTTTAGAACTATTTTCCCTAAAACATCTCCTTCTCTTATATCTAATACAGGTTTAAATACCTCTACTTCTAAATTATCATTCTCTTTATATCCATATTTAAATTCTTCATCTTGAATTACAGCACCTAAATCCATGAAACCTTCCTTTTCTACTAATTCTTTTTTAGATACTGTTTTTAAGGTGTTTGTTTCTATTACATAATTATAAATTTTTTCTGTTTGATTCCATCTATCAACACAATTTAATACTACTATTATTATATTTCTTCCATCGTGATTTACAGAAGAAACTAAACACTTTCCTGCTTGACCTGTATATCCAGTTTTTACGCCATTAGCTCCTGGAATTCTATATAATATTTTATTTATATTTTGATAATCCCTTGTAAAATTATATTTTTCTTTACCTATAGATTTTTCTCCAACTATTTCTCTAAAAACTTCACTTTCCATCCCTTTTGAAGCTAAAACAGCTAAATCATATGCAGATGAATAATGCTTTTGACTATCTAATCCATGAGGAGATTCAAAATGTGAATTTAAAACTCCTATACTTCTAGCAAAATCATTCATTATATTTGCAAATCCTTCTACTGATCCCCCTATGTCTTCGGCTATTGCTATTGCAGCATCATTTCCTGACCTAAACATAAGTCCAAATAGAAGTTCTCTCATAGTTATTTCTTCACCGGCCTTATACCCTACAGTTGATCCTCTAATTGATGAAGCATTTTTACTGATGGTTACTTTTCTATCTAAATCTCCATAATTAATGGCTATCAATGATGTAAGGATTTTTGTAGTACTTGCCATTGGAACTATTTCGTATCCTTTTTGATCCCAAAGTACTTGCTTTGATTCTGCATCAATTGCTATAGCATTTCTTGCACTTACTCTTAATGGCCCCTTAGTATCAACTTTAGTATTATCTACATCATAGCTATCTTCCTCATCTAAATTAATAATTTCATCGTCTGTATCTATATCTTCTTCTTTAATTACTGCTTTTGGAGAAAATATAATACATTGTGTTGTTAATAACAATGTTATTAATACTATTGGTATTTTTTTAATTTTTTTCATAAAATCACCCTCTAAATTAACCATCTATGACTAGTGTGTTCTAAAAGTAAAATTTTAAACCTGATAATCAAAAAAAATTTTAGTTTATTTTAATAATTTATGGTAATACTATAAGATAATCTCATTAGGAGGATATTAATGGTTATAATTATTATAGTTTCATGTATACTTTTATTATTTTTACTCCCTATTCCACTAAAAATAACAATATATAAAAATAAGGCTTACTTTCATATAAAGGTCTTCAACTTAGTTTTATTATCTCCTGAAAAAGGAATATTAAATGATTTATTAAAAAAACCTAACGAAAAAAAATCTTCAAATAAAAATATAAATACTAAAGTTAATAAGCATAATCTATTTTCAAAAAAAAATAAAAAGCTTTCCTTAATATCACTATATAGAAGTATTACAAATAATAAATTTAGACCTTGGTTTAAACTTAAAGGCGAGCTTGATTTCGCCTTTAATGATGCTGCATATACTGCTATAGGTTATGGATTATTATGTAATCTTAACCCTATACTTTTTGCTGTTTTTAATCAGATTTTTTCAGTAAAAAAATTCAAATTACAAATTAATCCTCATTTTAATGAAGATAAAATATTAAATTTTACTATCTCTAGTATAATTTACTTTAATCTTGCACATGCTATACGTATATTATATTTAATATATAATTCTTTTGAAAACATAGAGGAGGTGTCCCCTGTTTAGGGATATATTATGGCAAATGAACATCCAGTAGAAAATTTAATGAGAAGTACTATGGAAAATTTAAGAGATATGATAGATGTAAACACCGTTATTGGTGAAGCGGTAGAAACTAGAGATGGCAGTTATATCATCCCAATTTCAAAGGTTACATTTGGATTTGCTTCAGGAGGTAGTGAATTTGGAAATCAAAGTAAATCCTCACCTAATCAAGATGCAAAACATCCTTTTGGTGGTGGTTCTGGTGCAGGAGTTACTGTAAAACCTGTAGCATTTCTAGTAGTACGAGAAGATTCTGTTAGATTATTACCTGTAGATCAAGATAATGCTTGCGATAGAGTAGTTGATTCTATTCCTACTGTTTTAGAAATGTTTAAAGGCTTCTTTAATGATATAGGTAAACATAAAAAACATAAAGATAAGCATCAATCTGATAGTTGTAATATTTGTGATTCTTCAATTGATCAATGTAACTGTGATGATACTGATTCTTCATCTAATAATCTTCATTAATTTTCATAACATTTCAAATGTAAAAAGTACAGAAATAAATTCATTTCTGTACTTTTATATTATAACTCTTTCATTGCGTTATTTAAAATTTCCAAAGACTCATCTTGTTCTTTTTCAGAATATAAATCTAAAGATGGAAGGTCATTTAAAGCCTTAAGCCCGAATTGTCTTAAAAACTCTTCCGTTGTTCCAAACAAAATAGGTCTTCCTGGAACCTCTAATCTTCCAACTTCTTTTATCAACTCTTTTTCTATTAATCTTTGAATAGCACTTTCTGACTTTACCCCTCTAATTTCATCTATATCAACTCTTGTAATTGGTTGTTTATATGCTATAATAGCTAAACTTTCAAGAGAAGCTTGAGATAAGGATTGACGTTTGTTTTTCTTTAATAAACGTTGTACAAATTCACTATTTTGTGCTTTAGTTACTAATTGATATTCTCCATTTATAGAAATTAGTTTTATCCCTCTAGATTCCTCTTCATACTCATCCATCATCTCATCTAATATTTTTTCTAATACTTTAGGTGCAACTTCTACATTAGAACTCAATGTTTTTAAATTTAAAGGCTCTCCACTTACAAATAATAAGGATTCAATTGAAGATTTTATTCTATTCTTTTTAGATGCACCCTGAAACTCGAACTGATTTATTTCTATTTTATTCATTATTTCTCCTTTTTATTAATATGTTCCCAAAACTATTATCTTGAAAAACCTTAATCATTCTTAACTTTATAAGTTCTAATAAAGCTAAAAATGTTACAACTGTTTCCATTTTACATTCACTTTCTTTTATAAAATCATTAAATTCAAATACTTTAACACTATTAAGTTTATCTAATACATATTGCATTTTATCTTCAAGCTTATACCTATCTACAAATATCTTTTTTTGTATTACATTTTCTCGGTTTTGTTTAAGCCTATAATTCTCAAGTAATTCATTATATAACTTATATAAATCTAATAAAGTAACATTTTTTAACAAATCTTCTGTCTTTATTTTTTCTTCTTCCTCTTGGATTAATTCAGGCATTTTAGTGTATACATCACCTGAACTAATATATCTATCTTTAAAGAATCTAGAAACTCCTTTAAACTTCTTATATTCTATTAATTTAGTCATAAGATCTTTTTCTACATCTTCTTCGTTTTCTTCTTTAATAACTACTTTTGGAAGTAATTTTTTAGATTTTATTTCTATTAAAGTGGCTGCTACTACTATAAATTCTGATGTTATTTCTAGATCCATTTCTTTCATTTCTTCTAAGTACTTTAAATATTGATTAGTGATTTTATATATTTCTATATTATATATATCCATTTCATGCTTTTTTATTAAATGTAATAACAAGTCAAAAGGACCTTCAAAATCTGCCACTTTTATCTTAGGCATTTCCATTAAACTATCACCTCCATATTATAGAATATATGTACTTTATTATATATTCTATAATATCAACTTTCATAAAAAAGAACAAGAAAAAGTGAACCTATTAAGGTTCACTTCTATTATATCCCTTTTTTAAACATATTCTTCATATTAAACTTAAAGTTTTCAAAGAAACCACCTTTTTCTATATCTCTATCTGCATATAGTTCTACTTCTCCAACTTTTTCTTCTCCTAAGTAAACTTCACATCTACCTACTATTTCTCCAGCTTTGTATTCCTTTTTAACTTCATCCATAACAAGTCTCTTTTCTAGTTCACCATTGCTTCCTTTAGGTAATACAACTATTAAATCATCTTTTGCCTTAGCTATAAAGAATTTATCTGTTTGTTTACTTAAATAAACTGTATCAACATCTTCATCTTTTGCAACAAGCTTTTTACCCTCATATTTTGAAAATCCATAATTTAAAAGCATTCCTGCATCTCTATTTCTAATCTTATATGTAGGCGCCCCCATTATAACTGAAAGCATTCTAACACCATTTTTTGTTGCTGTTGCACTTATACAATACTTAGCCTCTTCTGTATAACCAGTTTTTAATCCATCACAACCATCAAAAAATCTAACTAATTTATTATGATTTACTAATTCTATAGGAGATTTACGACCTTCTGATATAGTTTCCATATATGTACCTGAGTATTTTAATATTTGAGGATGTTTTAATAATTCCATAGACATTAGAGAAATATCTCTTGCTGTTGATTCATGTCCTGCTGCTGGTAATCCATTACAATTTTTAAATGTTGTATTAGTCATTCCAAGCTCTTGTGCTCTTTTGTTCATCATACCAACAAATGCTTCTTCTGTACCTCCTAAATATTCAGCTAATGCCACTGCCGCATCATTTCCTGATGCAATTGCTACACCTTTTAATAACTCCTCTACAGTTCTAATTTCTCCTGTTTCAAGAAGCATAGTGCTACCACCCATTTTTTTAGCATTTTCGCTACATGTAACTTTATCTTGTAATGTTATCTTTCCGCTATCCACTTCTTCCATAGTTAATAGCATAGTCATTATTTTTGTAACTGATGCTGGCGCAAATTTTTCATCTATATTCTTTTCATAAATTAACTTTCCTGTGGTTGGTTCTATAAGTAAAGCTGACCTTGCTTCTACATCAATACCTTCATCATTAAAGACCTCAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP018630|1727053:1735770|1730104_1730848_-|WP_021875778.1|DBSCAN-SWA MEMPKIKVADFEGPFDLLLHLIKKHEMDIYNIEIYKITNQYLKYLEEMKEMDLEITSEFIVVAATLIEIKSKKLLPKVVIKEENEEDVEKDLMTKLIEYKKFKGVSRFFKDRYISSGDVYTKMPELIQEEEEKIKTEDLLKNVTLLDLYKLYNELLENYRLKQNRENVIQKKIFVDRYKLEDKMQYVLDKLNSVKVFEFNDFIKESECKMETVVTFLALLELIKLRMIKVFQDNSFGNILIKRRNNE >NZ_CP018630|1727053:1735770|1727053_1728214_-|WP_079481387.1|DBSCAN-SWA MKKIKKIPIVLITLLLTTQCIIFSPKAVIKEEDIDTDDEIINLDEEDSYDVDNTKVDTKGPLRVSARNAIAIDAESKQVLWDQKGYEIVPMASTTKILTSLIAINYGDLDRKVTISKNASSIRGSTVGYKAGEEITMRELLFGLMFRSGNDAAIAIAEDIGGSVEGFANIMNDFARSIGVLNSHFESPHGLDSQKHYSSAYDLAVLASKGMESEVFREIVGEKSIGKEKYNFTRDYQNINKILYRIPGANGVKTGYTGQAGKCLVSSVNHDGRNIIIVVLNCVDRWNQTEKIYNYVIETNTLKTVSKKELVEKEGFMDLGAVIQDEEFKYGYKENDNLEVEVFKPVLDIREGDVLGKIVLKDNNKERYKSPLISNTKIDIKEYEKK >NZ_CP018630|1727053:1735770|1733677_1734844_-|WP_021875781.1|DBSCAN-SWA MKRAILVVMDSLGVGALPDADLYGDAGSHTLDHVYKACGGLDIPNLESLGFGNIEGVTELKKVAKTTGAYGRLMERSKGKDTVTGHWEIGGVILEKPLNTYPDGFSDEIINEFLAKVNKKAVLGNCVASGTAIIEELGDEHVKTGNPIIYTSADSVFQIAAHEDVIPLEELYKMCQIAREMLVGEHAVGRVIARPFIGKSGEYKRTSNRRDYALDPFSKTMLEYLKEDGKEVAAVGKIEDIYNQKGVTSAIHTKNNMDGVDVTLKYMDTVKEGLIFTNLVDFDMLYGHRNNPEGYGKAIEDLDGRLKEIYAKMTDEDILILTADHGCDPTTESTDHSREYIPVLIHGKNIKPVNLGTRTGFTDIGKTILDYFNIENDIDGKSFLKEIL >NZ_CP018630|1727053:1735770|1728940_1729441_+|WP_021875776.1|DBSCAN-SWA MANEHPVENLMRSTMENLRDMIDVNTVIGEAVETRDGSYIIPISKVTFGFASGGSEFGNQSKSSPNQDAKHPFGGGSGAGVTVKPVAFLVVREDSVRLLPVDQDNACDRVVDSIPTVLEMFKGFFNDIGKHKKHKDKHQSDSCNICDSSIDQCNCDDTDSSSNNLH >NZ_CP018630|1727053:1735770|1729500_1730112_-|WP_079481388.1|DBSCAN-SWA MNKIEINQFEFQGASKKNRIKSSIESLLFVSGEPLNLKTLSSNVEVAPKVLEKILDEMMDEYEEESRGIKLISINGEYQLVTKAQNSEFVQRLLKKNKRQSLSQASLESLAIIAYKQPITRVDIDEIRGVKSESAIQRLIEKELIKEVGRLEVPGRPILFGTTEEFLRQFGLKALNDLPSLDLYSEKEQDESLEILNNAMKEL >NZ_CP018630|1727053:1735770|1732311_1733616_-|WP_021875780.1|DBSCAN-SWA MRMYDVILKKRIGEELSKEEIEFFVNGYTKGEIPDYQASALLMAIFFNKMNKRETADLTMAMVRSGDEIDLSSIKGVKVDKHSTGGVGDKTSICLTPLVASLGAPVSKMSGRGLGHTGGTIDKLESFPGFTVELTEEQFIKNSNDIGIAIMGQTGNITPADKKIYALRDVTATVDNRSLIAASIMSKKIASGSNAIVLDVKVGEGAFMKTPEDAKALAQAMVDIGTHCGRQTIGVISDMDQPLGYAIGNALEVKEAIELLKGNGPKDLLELVLTLGSNMLVCGKIAKDFEEGKKLLMQNIENGKGLAKLKEFVAAQGGDASYVDDVEKLPKAKHVVEVKCEEDGFVSKIHAEEFGLIAMELGAGRATKESEIDLAVGIVLNKKRGDKVSKGDVLAYIHSNDENNIAKTSKKIKENFVITEKFENNIPLIYDIVK >NZ_CP018630|1727053:1735770|1728352_1728931_+|WP_021875775.1|DBSCAN-SWA MVIIIIVSCILLLFLLPIPLKITIYKNKAYFHIKVFNLVLLSPEKGILNDLLKKPNEKKSSNKNINTKVNKHNLFSKKNKKLSLISLYRSITNNKFRPWFKLKGELDFAFNDAAYTAIGYGLLCNLNPILFAVFNQIFSVKKFKLQINPHFNEDKILNFTISSIIYFNLAHAIRILYLIYNSFENIEEVSPV >NZ_CP018630|1727053:1735770|1730958_1732212_-|WP_021875779.1|DBSCAN-SWA MKKSFIKRISIFALSLFCLTSLPIKAEERNYQNVEQTYENIDDGVEETYEEWTTEVFNDEGIDVEARSALLIEPTTGKLIYEKNIDEKFAPASVTKIMTMLLTMEEVDSGKITLQDKVTCSENAKKMGGSTMLLETGEIRTVEELLKGVAIASGNDAAVALAEYLGGTEEAFVGMMNKRAQELGMTNTTFKNCNGLPAAGHESTARDISLMSMELLKHPQILKYSGTYMETISEGRKSPIELVNHNKLVRFFDGCDGLKTGYTEEAKYCISATATKNGVRMLSVIMGAPTYKIRNRDAGMLLNYGFSKYEGKKLVAKDEDVDTVYLSKQTDKFFIAKAKDDLIVVLPKGSNGELEKRLVMDEVKKEYKAGEIVGRCEVYLGEEKVGEVELYADRDIEKGGFFENFKFNMKNMFKKGI >NZ_CP018630|1727053:1735770|1734891_1735770_-|WP_021875782.1|integrase|DBSCAN-SWA MKEIVNDYRESLLKSHKSENTVYAYVTDVNLYVKYLNSKNMDINETDNVSVLGYIQYLLGQGKSERSINRIVISLRSFYNYLKDQKVVQEIPKIYYKSTATAKKLPEILTVEEVDRIIKIVDKDCNKGIRDNALLELMYATGMKVSEIIGLKVWDVNLDLSFVKCHDNKNYERLIPIGRSALEALKEYFKVRDQIASAGVDNLFVNLNGNQLTRQGVWRIVKEYSHKAGIKKEVNLNTFRHSFAVHLLQNGANVRAVQKLLGNQVLTYMDTYYEIINNDKINLVYKNSHPRA |
9 | uncultured_Mediterranean_phage(33.33%) | integrase | attL 1733675:1733690|attR 1738175:1738190 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1991782 : 2018613
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP018630|1991782:2018613|DBSCAN-SWA AATGAAAGAAAAAGATATAATGAATGATTATTTAAGTATGATTAATAGCAGTTTGGTAAATTACGCTAATGTAATAGCTCAAACAGATAATCAAGAACTACGTCAAACTATACAACAAATGAGAAATGAAGATGAAATTCGTCAATATTCAATATACCAAAAAGCAAAAGAAAAAGGATATTATAAACCTGCTCAACCAGCAGCTCAAAATGATATTAATACAATTAAATCTGAATTAAATAGTGGCCAATAAAAAACTATTAATAATATAAATCCAATAAAAATAAAGGGATAGAGCAAGTTTTTTCTTACTCTATCCCTTTATATAACAATCTATACTTTATAGATATTTACTATCTATTCACACTCTGCAAACTTCTCTCCTGTCGCTCTATTTGTTATAGCGACATATCTTCTTACCCCTGTATAACTAATATAAGAAACCCATACGTAATTATCAGTTATAACTACATAATCATAGTTAAATGATTCTCCAGCTTCATAAGTTCCTATAGGCTCATTATTTATTGAAGGCTTATTTCTTATATTAAGTGTACATTTAACAGTACATACTCCTACTTCTTCATATTCCTTTACTATACTTTCTTTAATATCTACTTCATTTGATACTTCATCATTACTTCCATTTTCATATACTGGATAATCAGTAAATGTACTATCATTATCTTTTGGAGCATAAATCTGAACTGTTCCAAAACAACTTGTATTAATTACTTTTACATCTCCTCTATCTTCTATTATTCTATAACTAAGTCCTCCATATTGACTAGGTGCTAAATATGCAAATTCATTCCCCTTTATAGGCTTAACATTCATGTTATATATAGACCAGCTTTCCATATGTGGTTTTAAATTTAAATATAGTCCTGAAGCTAATTCTGATTGTTGTTGTGATTCTACTTTAACAACTGGAATTATGACTTCTCCATCTATCATCTTTTTAAATTCAATCCACTTTTCCCAATTGTTATCTGCAAATCCTGATGGACAACATTTATAAGATGCATCATAATGTCTAACAACTCTTTCATTTGGAATACCATATTTATGTTGTAATTCTTTTACTAACTCAATAGTATTTTTTACTGTTGCATCTGAATAAGTATAGTTAGTACAACACATTTCAATACCTATTGAATTTTGATTATTTATTCCATTTCTATTATATCCATCCCCACAATGCCAAGCTCCATTAAATTCTTCTACTACTTGAACTATATCATTATCATCTACAAAATAATGTGCTGAAGCTTGTCTATCACAAGCATTAAAATACTTTGCATTATTTATTGCTGTATCTGTTTTATTTCCTGTTCCATGTATAACTAAATATTTAATACTATTCCCTTCAAAATAATTGTACTCACTTATCATTCTTTTAATTTTTAACATAATTAAATCACCTTTCCTTTTTTTAATATTTCTATAATATAAAAAGCAGGATTACTCCTGCCATGTAAACTTAATTTATATTTATTTTAAAATCTTTCTTTAACAATACTTCTTTACCTTTGTTTACTTCTCCAGCTATAGCTTGTCTTAATTCTTCCACTTGATCTTTAGTTAAGTAAGGTATTTTTTCTAACAATATTTTGTCAAATTCATTTGCTTTAGAGGTCAACGTCTCTTTTAAAGTATCATTTATTCTATACTTTTCTTCTACTATGTTCCATACTTGCTTAGCCATAATTAATTCTTCTTTATACTTACTTAATTTTAGATTCTTTTCTGCTAATTCTTTTTGCTTATCTATATATAATATTGCAGCATCTCCAACAGTTTTTATTACCGCTACGAAGATTCCTGTTACTCCTATTGCTAGAGCACTTAAAACTGGTGGTAAAATTTGATTTATTAAAATTTCTTTCATAATTTTTATTCCTCCCTTTTTATTTCAATTTAATTAAAAAAGCAACTACTGTACTTATTAAAGTTCCAGCAATTGCTCTCCAAAGCCATTTGTTTGTATCTTCTAAATCCTTTATTCTGTTATTTGCTACCTTAATTTTTTCTTCTTGAACTTGGAATTTTAAATCTACATTCTGTACAATACTTGTTAGTGTAGCTTTTATTTCAACTACATTTTCTCTTATTTCATAAATAATAGGGTTTTCATCTGCCATATCACACCTCTTAAATTGATTTTATTTTTGAAGAAATAATTCTAGCAAAAATATCATGAAGTTTTTTGTTAGGATGTACATGATCATCGGCACTATTGAAAAAATATGATTGATTAAATTCGTTTAAGCCACATTCACTATATAAATTAACAACTGGTATTCCATAGTATCTACATGATTTTTCAACTGCGTCTACATATTCATAATAATAATGTTGTTCGGCTTTATTTTTTTTGTTAATTTTATTAAAGTAGTTATCATGCTGACCAGGATTATGAGGTATTACAAACATTAATCTTACATCAGGTTTTTGTTCTAATATTTTTTTAATAGCCATATATATACTGCCATAGAAAGTATCATCTGTTTTATCATTAATAGATCCTATTGGAGTATTTCCACCAAAATCATTCATACATACCATTATGCTTATTAAATCTGCATTATCGATTTGTTCACTTGTAACATTTGACATAAATTGTTTCAAATTAAAACCTGGGTTTGATTGTGTTACAACATTATTAAAGCCAATAATTTTTTTAATTTCATTTTGATACAGTTCTTGAGATGTTATAGAGTCTCCTATACATAATAAATTTTTACCTTCCCAATAATTATCTTTATTAATAACTTTTTTTTCAATGCAATACGCTCTATTGCTAATAATAAAACTATCTACGCCTGTAATATTAGGTATATTATCTAAATTTAATGTTATATCTGCATATATTCCACTCTTATTAAACTCATCTATTCTTATAGTTTCTATTCCATTTCTATTTAGGTTTTCAATCCAGTAATTACATACTATATTATTATCCTTAGTATCATAAATTATAATTTGTGTTGTTTTTCCAATTCCACCGCCACAAGTTATTGTATATTCTCTATTTTTTAATGCATTATATAATTTAATTTCATAAACATTATTAATTACATTTACTGTTTTATTATCTATTTTTCTTGGTTTAAAAGGATAAAATATTTTTTCAATACTAAAAAATTCTTTGTTTATTATGTTACTCCAATTTACACTATCCCTTTCAAAATCATTTTGCATAGATTTTTTAGTTTCAGTTGTAAAACTATCAATATAGTCATTAAACTTTTTTTTGAAATTTGAAAATGGAATTTCTATTTCACTTATAGCAACTATAGTTGTTTTCTTTTCACTTATCGGAGCTGTTATTATAATATAACTCACATTAGATGGGGTTTTAATAATTTTAGGTGTCGGAGTTTCTCCACCACTTATATATTTATTATTGCTATCAAAAAAAGAATAAGCATAAACAGAACTTTTGAAAATATTAACATTTGCTGGAATATAAATCTTACCACTAACAAAAAAACCATCATGGTCATAAATACTACCAATTTCCCCATAAATACATTTATTATCAGTTGCTTGTAAAGGGTTAAAAATATTAATATCATTTTTTATAAAAGTTGTTTTTTCTTCTGTTATTTGTTTATCAACTATATTTTCTGTTAATATAGTATCTTTACCAACTACAGATACACTCCCCCCTGTCATAGCTTCTTTAATATCTTGTCCCATATTTGCCATCGATAAAATATCATCTTTACTAAGCTTTAAGTTTTTCAAATTAATTACTTTCTGCTCTAATTCCAAATTGACTTGTTCATTTTCTTTATCTAGTCTTTCTTTTAAACTGCTATAAGAACTACCATCTTTACCTACTCTTGCTTGAACTATTTCGCTATTAGATGATCCAGCATTAATTACTTGCCTATCATAGTCCTCTCTTAATTTCTCTACAACTTCAATTCCTTCTGCTATGCTTTCTCTAACCTCTCCTCCAAATATAGCTTTTCTTATTTTATCTGCTATAACTCCCATATTAAACTCCTCCTAATTGTATTCCTGTAATATGAATATTTATCCCCTCTCCAATAGCTTTTAATGAATTAATCATTATTGTATTATTTATAATTCTAGTTTCCTTTTGTTCTAAAATAACAAAAAAAGCAACACCATCTATATTTAGCATTACTTCCTTTTTGATATCATTACTATTATGCAATATTATAGTTTTTACTACTGCTCCATTTATATTATTATAAATTTCAGATTCTATATCACTTAAAATTCCAGCCTTTATTCTTATAATTTCATCCATTTAATAATCACCTGTCATTAGTCTTATATTTATTTTATTTAATTTATTATTTATTTTATTTAATTTTTCATTAATATTTAAAATTGAATTACTATTTTCCTCTACTATTAAATTTACACTTTGAATATTATTGTTTAATGTATTGATATTTTCCACTAATTCCTTTGTGGTAGCAATATTAATAGCTACAGCTTCATTTATAGCCTTAACATTTCCATTGGTATTATCTAAAACCTTTATGGTATTAACTAACTCATCAGATATAGAGTTCATAGTTTTTATAGAGGTTTTAAGAGTTGTTTTTACATTATCAACTTCTTTTATGGTATTTAAATTTTTTAATTGATATGTTTTTATATCTTCAAATTTTTCACCAAATATTAAAGAAGATTCTTGTGGTTTATTAAAATTTATATTTTTTTCTATAATTCTTAAATCTTCATCTATATTCATAATCGGATTTATAATTCTATATATATTTCCTACTTCAAATTCTTCTATTTCTAATCCTATAATTGAAAGGTCCAATGCACTTATATTATATTTCTTTTTAACTCTATTTTTTTCTAACAAGTATTTTTTACCTTTTTTTAATAAATTACTGTCAATAGTAACATCATCCCATTTTATATATCCTTCTATTATTCCAAACCTGTTAATAGCCTCAATATCATCTATATATTTAATGCCACCATTTACAGATTCAATAGTT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>NZ_CP018630|1991782:2018613|2001276_2001579_-|WP_079481464.1|DBSCAN-SWA MVLDLDKYLKQSIDIKINGEVLEILQPTAKMTKEIGKLERDVTEDNYLEIKSKTTHLILNNNNSNKKLTLEDIDNIPYKLQDLIIKELTNMVYEANNDPN |
34 | Clostridium_phage(42.11%) | tail,capsid,integrase,coat,portal,terminase | attL 1996478:1996496|attR 2024772:2024790 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
2627723 : 2675763
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP018630|2627723:2675763|DBSCAN-SWA 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47 | Clostridium_phage(25.0%) | protease,transposase,coat,integrase | attL 2647300:2647359|attR 2669313:2669472 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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