Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP023410 | Clostridium perfringens strain LLY_N11 chromosome, complete genome | 3 crisprs | csa3,cas14j,DEDDh,cas3,DinG,cas2,cas5,cas7,cas8b2,cas6,WYL,RT,csx1 | 0 | 10 | 4 | 0 |
NZ_CP023411 | Clostridium perfringens strain LLY_N11 plasmid pLLY_N11_1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP023413 | Clostridium perfringens strain LLY_N11 plasmid pLLY_N11_3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 7 | 0 |
NZ_CP023412 | Clostridium perfringens strain LLY_N11 plasmid pLLY_N11_2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP023410_1 | 929988-930100 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP023410_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP023410_1
>1.1|930016|57|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder GAGAAGAAGAGGTCTCCAAAAAAGATTTATTATTTTAAAAATAATTAGAATAATTTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP023410_1
The CRISPR arrays of NZ_CP023410_1 >merge|NZ_CP023410|1|929988-930100|CRISPRCasFinder TTATGTAAAGTAATAAATTTAAATAGAAGAGAAGAAGAGGTCTCCAAAAAAGATTTATTATTTTAAAAATAATTAGAATAATTTCTTATGTAAAGTAATAGATTTAAATAGAA >NZ_CP023410|1|1|929988-930100|CRISPRCasFinder TTATGTAAAGTAATAAATTTAAATAGAA GAGAAGAAGAGGTCTCCAAAAAAGATTTATTATTTTAAAAATAATTAGAATAATTTC TTATGTAAAGTAATAGATTTAAATAGAA
>NZ_CP023410.1|WP_003458718.1|929555_929918_+|hypothetical-protein MKDIKNNISNLLKAMDKNTELDKEFKDSLLNVISSLVDKIEELQVNVETLDENVNLLNDDLSGVQDELFEELTLEELEEYDDEYCEVVCDKCHKPIYIEKDILNRSESIPCPYCGNEFEV >NZ_CP023410.1|WP_003451649.1|928884_929442_+|elongation-factor-P MISGSDLRKGTTFELDGQVYTVIDFLHVKPGKGAAFVRTKLRNVIMGGVTDRTFNPTDKLQEAIIERKEMQYLYSDGELYYFMDQETFEQIPLNHEKVEDAIKFLKENMNAVIKFYKGEAFSVEAPNFVELLITECEPSVKGNTATTAMKTAVVETGATVMVPMFVEEGNTIRIDTRTGEYMERV >NZ_CP023410.1|WP_011590962.1|928366_928714_+|hypothetical-protein MKKLKLDVTLATIFIVILLVQGIELFQLRNYEIPVLTNSIGEMDLNTVLKNIENKDCTVLQLEYKEGWIGKVLFTGSLEDLSNYVNLLKNNNINIKNYKIEKSEELRCFLDLKVV >NZ_CP023410.1|WP_003481876.1|927929_928370_+|hypothetical-protein MRLEVRRIYIKKYKNFLPIEYVEEYNRKIKKKLNIYILLLLLFNLFFYGKIKTENNKIKNYLSEIKGVNRERSLDKEFLEDINKLKEIIKDEKILNLSLERKSFEVEVNSIYKNSLINYINKINGRVYDISLNESNNTYRLKGELR >NZ_CP023410.1|WP_003458726.1|927358_927970_+|hypothetical-protein MLIKTLVINDTNDISKLKELKDKRVKIILLNEKIFIETLRVDKKCNIEEKIEQLIRDRFFNYTPLVHYEVLKYKKSLFLIVYFIGCDERFKSLLYERKDFALTFPELKNKNILSFKKATFELKNLKISIYIKGKLVLLKSVKDSNIIEVIEESLKGLEKDFGVSLKDFTFKIQKEYLKEEIKEWFKGLKLNEIRGEENLYQKI >NZ_CP023410.1|WP_011590964.1|926973_927384_+|hypothetical-protein MKRRKGFVSIEVMLVSLICSMIVTILMDNSFQRRKELDRSFKIISSNIDKNNSEEQFLKYMLKEKILNIDNINKLDFTLNNMNATYIEDKKAIHIKSKDKISGVFKDTYYGIDFRNDDIILSKRGNYEFVNKDLSN >NZ_CP023410.1|WP_003458668.1|926690_926987_+|hypothetical-protein MYLNHRFWDNMVENIKINKDKNYILVKFWRDGIVAEDKIEKIKNKLYVYYNYTGYGRNYSPALIEDVEKFDLMEKGNLFYIKLKVKNQEERIYCYEKA >NZ_CP023410.1|WP_003458656.1|926043_926556_+|type-II-secretion-system-protein MEDKINKKKGYLLVDMVLALALISILFLGIGKSYSTYIKNNYYIKEKIKVAEIINSLAMELKHNISFEDLRSINSGTYKISSLKINDLINSDIKEFLRKNLILHNKNHNDLGWTINISHFDQYESIINIIYKNEKPYISENKEVKIYKFLEKSFQNLENPPQKEEEKHIY >NZ_CP023410.1|WP_003458702.1|925595_926024_+|prepilin-type-N-terminal-cleavage/methylation-domain-containing-protein MYRKRKGFTLSEVIIYLAITSLILAIPTSFMIIKDRGYELKVEGEISKIHDFLMEAKQLSKKDNLYGEIIFDILDNKLIYENALRTTSLKLNEVKVSFNRDNLITINETGMISISGTITIIDKNNKRREITIVPGIWKINVK >NZ_CP023410.1|WP_003458694.1|924583_925603_+|type-II-secretion-system-F-family-protein MFGFKDEASYICLNLSTYVKSGMPIGRSLDLIKNTVKDKKYKESLKRIEKKVLNGEALSKAFKEEGNLYPDLMKDMMKIGEESGNLEEVLEKCARNILAEKEIKNKIIKSLRYPISLLIGLIIMIFGYVTYILPQFVDMYELRGIEGSKIMTLLNNYINFVEENPNVEVIVFCYFSCVLISLYLFFKVIPSEKILEKIEVYRMYYEIRILFLISMILNSGISLNNSLSVFGESLSDVKLRKYIKSINEELIKGTTLSSSIGKINVISHVSKGFLITGEESGLFSKNIEELLKIREKDFDRALNKTVGKIEPAMFIILGFVISAMMLLVLVPTFEGMKYV >NZ_CP023410.1|WP_057231743.1|930115_931000_+|stage-III-sporulation-protein-AA MKEIFDVLPDKINSCLKDKSNLNKLQEIRVKVGKPLNIVLDNTETIFNYVIRREDVKAIIQKISNYSLYAFEEDIRQGYITIQGGHRVGLAGQCVIEDNSIKTIRNITFLNIRVCREIVGCSNSLMNSLVENNRVNNTLIISPPKCGKTTLLRDITRNISNGISQIGFKGKRTVVIDERSEIAACYNGIPQMNVGMRTDVYDNCIKSEGMMMAVRGLSPEVIICDEIGTYKDMEGLMMAYNSGVSIIATLHGRNVEELYRRPVFREIVENNIINKVVVLSGKKGIGTIEGIYNV >NZ_CP023410.1|WP_003458670.1|931146_931662_+|stage-III-sporulation-protein-SpoAB MKVFFLLIIVLLSSLIGYLYGEGFRNRLSQLRELKRALIDFENDIVYTYTPLPESIESIALKAKSPIKELFNEISFKLKNNEVENVYMAFKESINEHKKEMNLRNKDFEILLDLSKSLGETNVEGQIKIFNLAKEKLDIELEIAEDECNKNTKVYRYLGVAVGAMIAIFLV >NZ_CP023410.1|WP_003451671.1|931737_931935_+|stage-III-sporulation-protein-AC MSDLSLIFQIAGVGIVLVILDKVLDQSGKKEYATLANIVGVVIILTMMIQLISRLFSSVKSMFLF >NZ_CP023410.1|WP_003451406.1|932022_932409_+|stage-III-sporulation-protein-AD MDVVIQVISFVLISLFLYLVLKDNKSTFAVFLLLGAGIVIFLFVMPYVNEIIAFMQDIARESGMDSSYIAIVMKIIAIAYLSTFCSYICNDAGVTVLGKKVEFTGKIMILLLAIPIMANILNSILSIM >NZ_CP023410.1|WP_003458684.1|932419_933592_+|stage-III-sporulation-protein-AE MKKLINIILLSLIFVFCFNLKVLANDNLESSKEKIDNDSRIERFYDYINNLETEEDILGNMSAKEYIMNYLESGEDPITLKKIGASILSYIFRELNIVLKFIASILVIALLSALLKNLQDAFNIEEGVTQIAFFACYALLIMLLTKSFFISLNLGKEVLTSIIDFMNVIVPVIVMLIATSGGVTSAVTIDPIVLGAVSITPRIYTYFLFPLILAYFTLQFVNNLSSEFKIDRMCKFIKQVVMISQGFILTIFVGILTLRGMTADTLDAVAVKTVKFAVDNFVPIVGKAFSDAITTVAGYSLAMKSVITSLGVIVIVVIVIYPIIKIGLMAICFKLTSAVIEPVVDSKISSSVETVGEALFMIMSCIISVSIMFFIMASMMATAGNFIVGG >NZ_CP023410.1|WP_003458682.1|933599_934157_+|stage-III-sporulation-protein-AF MELLKNWISTLCVVIVIISIAHIILPNSSIKKHVKFAFSLIILSVMLSPIIGLLTMNKDIDETVFQEKISDITRSDEEKKSLYDEEAILKSVEKNLEKSLKDEFYENEFEVNLIGKIDFDEVKFNIEKAEITVLDEKKVKKVDKVVVGKEKVNKEEKKDSFLEKIEKFVEKELEISHENIIVSYA >NZ_CP023410.1|WP_003451336.1|934171_934777_+|stage-III-sporulation-protein-AG MHELKEKIANLFKQKNITNLIILLLLVIMFYLVVSYFTGVNNITKSEKTNLEKVSKEDMNSNSQKDSEVLSYQEKQEKDLERILGKINGVGSVDVVINFQSSEVKVPAVDNSSQKSTTEETDSEGGTRVNSQETDGDKIVMSNSSNGSEPVILKTEKPEVLGVMVVAEGAEDSKIKYEITKAISSLYNISVDKVNVLAMKK >NZ_CP023410.1|WP_003451536.1|934802_935300_+|stage-III-sporulation-protein-AH MNRKQAGIILTLLALIVCTGVLATRVNNQIKESMGEVPTAFGENDDNATETSSNYFYESRNLREQKDSKTIDNLKAIVEDKNTSAEQKEEAEKELTEKTMARDYETRIELSIKSKGYEDVICFIDGDNAKVVVKTNEELTQEKMVEIQDIVMNVSKVYDVDIEKK >NZ_CP023410.1|WP_003451410.1|935384_935774_+|Asp23/Gls24-family-envelope-stress-response-protein MNEMNRDEANLGIVNISDEVIGVVAGIAASEIDGILEINHNNSTGIGHKFSKKSLGKGIKVNVENGEAVIEIGVTVQYGIKIPDVVSQVQENVRRTVEAITGLKVALVNIYVQNIIILKEEDKNEILKK >NZ_CP023410.1|WP_003451187.1|935892_936300_+|transcription-antitermination-factor-NusB MNRVKSREYLLQLAYQMEITSETALETFNSFMENEDISKDDLDLAYIKSGLLGIEENKEKLDSLIESQLVKWKLNRISKVNLSILRISTYEILFAEDVPGKVSINEAIELCKKYSDNKSVSFINGVLDKVYKNMQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP023410_2 | 2128521-2130759 | Unclear |
I-A
Consensus repeat of NZ_CP023410_2
|
34 spacers
spacers of NZ_CP023410_2
>2.1|2128550|37|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT GTAATCAATATATTATTTTAAGAGTTTTATCAGATGA >2.2|2128616|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT CGCTTAAATGGGAAGGCAAGGGTTAGAGCAAAAAAT >2.3|2128681|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGTTTCTTTAATATCTTATTAACTTTACCAAAACTA >2.4|2128746|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGAGATATATCCCTTAATTCTTGTTGATAACTTTT >2.5|2128811|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTACTTGTAAGTGCTTCAAAGCTAGTAATACCAA >2.6|2128876|37|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CATGGAAAAGAAAAGATATAAAGAAAAGTAAAACTCC >2.7|2128942|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAATTGTTGGGTGTCATAGTACATGTAGAGATTACA >2.8|2129007|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACGTTAGTTATTAGGAGGTATTTCAATGAAATTAGT >2.9|2129072|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAAAGGAGCATTTAGTAGAGATTGGACACAAACATT >2.10|2129137|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTAAAATCTTTAAGTGTTAAATGTACACCAATGTT >2.11|2129202|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGGCTTTCCAAATCATGAATGAAGATGATTTTAACA >2.12|2129267|35|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAATGGAAAAGTATTATTGTTCTTTTGGTTTCGT >2.13|2129331|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATAAAGTTTATAACATAGATATTCGTTCAGACAA >2.14|2129396|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTTCTCATTCTAATTCATCTCCTATACTATTAAAA >2.15|2129461|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATGCTACAAGTTCATCAGGTTCATCACCTATAAG >2.16|2129526|37|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGAAGAACTTTTAAGATTAAGAGAAAAATATGGTAAT >2.17|2129592|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCAAAGGAGAAACAAAAGTATCTGCCTTTACTCTTT >2.18|2129657|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACAGTTTAAGTTATCATCTAATCTATTATCATTACT >2.19|2129722|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATAGTTCCAAACTCTCTAAAATATCCTACTTTAACA >2.20|2129787|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGGAGTTATTAAAGCACCTATCAATGCAGCTATAAG >2.21|2129852|32|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGAATTGTCTTTTAAAGATTGTGATTTAGGAG >2.22|2129913|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTACTTGTAAGTGCTTCAAAGCTAGTAATACCAA >2.23|2129978|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATTTAGATATTGGAGATTATCCAGTTTTAGTACA >2.24|2130043|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCATTACAGGATATAAAATGTGGAAAGAAGAAGGGA >2.25|2130108|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTCTATCGTATAAGGATTATATTTAACAAATTTATA >2.26|2130173|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTGAAAGTATATTTAAACAATTATTAAATATTTA >2.27|2130238|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TACTTGTACCAATTATAGCATTTTCAAAGCTAACAT >2.28|2130303|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TACATTCTTCTCTTAATGCATTGTAAAGTTCTTCTT >2.29|2130368|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTAGCTTCAATTCCATCTTTACTCCAAATATCAACT >2.30|2130433|37|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCATAGCTTCCCTCTTTATTTTTAAGATTATAAATAA >2.31|2130499|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATACTTAGTATTTCTTAGTATTACTTTACAATAAT >2.32|2130564|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATTTAGATATTGGAGATTATCCAGTTTTAGTACA >2.33|2130629|37|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAGATTCAGAAAGCGTTCTAGCTGCATTATTTTCCTT >2.34|2130695|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAAAGAGTTAGAGATTGACAAAGATACAATTGAAA |
cas5,cas7,cas8b2,cas6,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP023410_2
The CRISPR arrays of NZ_CP023410_2 >merge|NZ_CP023410|2|2128521-2130759|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTACACCCATCATAATTAATATAAAACGTAATCAATATATTATTTTAAGAGTTTTATCAGATGAATTTACATTTCTCATAGTTAAGATAAAATCGCTTAAATGGGAAGGCAAGGGTTAGAGCAAAAAATATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACTGTTTCTTTAATATCTTATTAACTTTACCAAAACTAATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACTTGAGATATATCCCTTAATTCTTGTTGATAACTTTTATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACTTTTACTTGTAAGTGCTTCAAAGCTAGTAATACCAAATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACCATGGAAAAGAAAAGATATAAAGAAAAGTAAAACTCCATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACGAATTGTTGGGTGTCATAGTACATGTAGAGATTACAATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACACGTTAGTTATTAGGAGGTATTTCAATGAAATTAGTATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACCAAAGGAGCATTTAGTAGAGATTGGACACAAACATTATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACGTTAAAATCTTTAAGTGTTAAATGTACACCAATGTTATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACAGGCTTTCCAAATCATGAATGAAGATGATTTTAACAATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACAAAATGGAAAAGTATTATTGTTCTTTTGGTTTCGTATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACTAATAAAGTTTATAACATAGATATTCGTTCAGACAAATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACCTTTCTCATTCTAATTCATCTCCTATACTATTAAAAATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACTAATGCTACAAGTTCATCAGGTTCATCACCTATAAGATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACCGAAGAACTTTTAAGATTAAGAGAAAAATATGGTAATATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACGCAAAGGAGAAACAAAAGTATCTGCCTTTACTCTTTATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACACAGTTTAAGTTATCATCTAATCTATTATCATTACTATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACATAGTTCCAAACTCTCTAAAATATCCTACTTTAACAATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACAGGAGTTATTAAAGCACCTATCAATGCAGCTATAAGATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACGGAATTGTCTTTTAAAGATTGTGATTTAGGAGATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACTTTTACTTGTAAGTGCTTCAAAGCTAGTAATACCAAATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACTAATTTAGATATTGGAGATTATCCAGTTTTAGTACAATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACCCATTACAGGATATAAAATGTGGAAAGAAGAAGGGAATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACTTCTATCGTATAAGGATTATATTTAACAAATTTATAATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACTTTTGAAAGTATATTTAAACAATTATTAAATATTTAATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACTACTTGTACCAATTATAGCATTTTCAAAGCTAACATATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACTACATTCTTCTCTTAATGCATTGTAAAGTTCTTCTTATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACCTAGCTTCAATTCCATCTTTACTCCAAATATCAACTATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACCCATAGCTTCCCTCTTTATTTTTAAGATTATAAATAAATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACTATACTTAGTATTTCTTAGTATTACTTTACAATAATATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACTAATTTAGATATTGGAGATTATCCAGTTTTAGTACAATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACGAGATTCAGAAAGCGTTCTAGCTGCATTATTTTCCTTATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACAAAAAGAGTTAGAGATTGACAAAGATACAATTGAAAATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC >NZ_CP023410|2|2|2128521-2130759|CRISPRCasFinder TTTTACACCCATCATAATTAATATAAAAC GTAATCAATATATTATTTTAAGAGTTTTATCAGATGA ATTTACATTTCTCATAGTTAAGATAAAAT CGCTTAAATGGGAAGGCAAGGGTTAGAGCAAAAAAT ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC TGTTTCTTTAATATCTTATTAACTTTACCAAAACTA ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC TTGAGATATATCCCTTAATTCTTGTTGATAACTTTT ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC TTTTACTTGTAAGTGCTTCAAAGCTAGTAATACCAA ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC CATGGAAAAGAAAAGATATAAAGAAAAGTAAAACTCC ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC GAATTGTTGGGTGTCATAGTACATGTAGAGATTACA ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC ACGTTAGTTATTAGGAGGTATTTCAATGAAATTAGT ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC CAAAGGAGCATTTAGTAGAGATTGGACACAAACATT ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC GTTAAAATCTTTAAGTGTTAAATGTACACCAATGTT ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC AGGCTTTCCAAATCATGAATGAAGATGATTTTAACA ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC AAAATGGAAAAGTATTATTGTTCTTTTGGTTTCGT ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC TAATAAAGTTTATAACATAGATATTCGTTCAGACAA ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC CTTTCTCATTCTAATTCATCTCCTATACTATTAAAA 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AAAAAGAGTTAGAGATTGACAAAGATACAATTGAAA ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
>NZ_CP023410.1|WP_078233529.1|2127435_2128131_+|radical-SAM-protein MDNFTYKEVYIEDGKRVLEINVLPEKYCNFDCIFCPIGRSKNKIDNQKSFHNVDESLIELENMINDTKPDLIFINSKGEALINDKIEDIIDFIKSKRVPVRLLSNGYILGKDEYIKVANKCDEVIGEIKVITEEDFKKVQRPIEGYTLHEYISNMASFNKQYNGKFIFEITIVKGYNDDPESVNKLKEVIKAICPNEVIVARIDDDIFKKKLGISDERFEEISRELLAVNC >NZ_CP023410.1|WP_049040166.1|2126709_2127414_+|B3/4-domain-containing-protein MKKFIIEDDFWELFPNAKIGIITCNGIDNTIKDENQYKDMISQGEKEALNHLPNEEFSSNEVIKVWRDAFKKFKTKKGARSSIEALLKRVSTGKGLGTINPLVDIYNSISLKYAMPCGGEDMDKFIGDIRLTKATGDESFITLGSDKSEPPYEGEIVYKDDEGAICRCWNWRESVRTMLTEDTKNAFLCIELVDEKREKDFENALKELSQLVEENLGGKSEISILHINNKEAII >NZ_CP023410.1|WP_004456258.1|2125778_2126336_-|hypothetical-protein MKKRIERLIIFCMLITITIPNIAYAKTNMRYEQEKTNIVEPYGPKIEDLKSKDVIINNLQEIKRIRGNLTAVNISESSTPNELKDVYNRLDFYIQEFIEIKKNLDNNIKTYTNSFSDKFFSEQVLFIAESYIVSLRQQQNLIIALQEKKVDAKKLVYSSYLIPIYHYITLGDQMTAYVDTYFVVI >NZ_CP023410.1|WP_011590538.1|2124876_2125227_-|hypothetical-protein 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP023410_3 | 2208713-2208914 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP023410_3
|
3 spacers
spacers of NZ_CP023410_3
>3.1|2208738|23|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder GTAACTACTAAAAAGCTGTTAGC >3.2|2208786|41|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder GTATCTAGTTTAGATTTTATTTAATATTTGCTCGTAAATAG >3.3|2208852|38|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder TCATCTATTGTAATGCCAAAAGAAAAGATGGTTTGTGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP023410_3
The CRISPR arrays of NZ_CP023410_3 >merge|NZ_CP023410|3|2208713-2208914|CRISPRCasFinder ACCTAAAATCAATATTCTATTAATAGTAACTACTAAAAAGCTGTTAGCACCTAAAAACAAATATTGTTTAAAAGTATCTAGTTTAGATTTTATTTAATATTTGCTCGTAAATAGACCTAAAAGCAAATATTGTTTAAAATCATCTATTGTAATGCCAAAAGAAAAGATGGTTTGTGCACCTAAAAAATAAAGCTTGTTTAAA >NZ_CP023410|3|3|2208713-2208914|CRISPRCasFinder ACCTAAAATCAATATTCTATTAATA GTAACTACTAAAAAGCTGTTAGC ACCTAAAAACAAATATTGTTTAAAA GTATCTAGTTTAGATTTTATTTAATATTTGCTCGTAAATAG ACCTAAAAGCAAATATTGTTTAAAA TCATCTATTGTAATGCCAAAAGAAAAGATGGTTTGTGC ACCTAAAAAATAAAGCTTGTTTAAA
>NZ_CP023410.1|WP_003459864.1|2207961_2208507_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MNLKRINSNDNCFNKAMEIYNGSFPIFERRTMDDQIKALDDINYHFEVIYDKEEIVGILLYWDMGRYKYIEHFAIDSKLRGKNYGSRVLKEFCDHNKNVILEIDPPIDEISIKRLNFYLKLGFKLQDFDYTHPSYRKGCKRHSLKIMTFNHNMPKEDYDTFNILLKRDVMKYSEFKDRLNN >NZ_CP023410.1|WP_003459816.1|2207358_2207670_-|hypothetical-protein MKKVLIGVLVFLICIISVFLFFDREEESIVTDVVEKSQYGLLVNYEDGLIAVDTEDAEIIDRDGKENTLDCINEGDRIEIIYDGKIEETYPAQINNVYKIIIF >NZ_CP023410.1|WP_078233483.1|2205404_2207045_-|EAL-domain-containing-protein MKKRVFWVSIVFLIIITVLGITIKFDGKKVNCNRKTVKVGFYEYYPYYYLNKNSMPDGYYNEILELICNKLDLNYKYVDCNVTDALEKLKSGQIDLVFGISKTPDREKEYEFTDHYLNNDNFAIYTNKNIKNGDLKALNGLKMGFLKGEENNEWILRLLKDKGINVKPIDVSNYPEDEEYLHDNKVDFVVENTRSNINYENKNIKKIFEFSSGPVYITSRKGNEKLIEGIDSVLGELEEDGEQKDTNLYSKYFDEHLDKLKNEKLLVVIFLIIISLFIYKKRKNKIFAIRTKRKIRDYMKNDKYILYYQPIVDPKTNGVKGFESLLRLNKDGKILTPYSFIREIEDNNMSLEVSLWLLKKVILDYRIIKDYDMVKGRDFYISLNVSFKEIENPKFLRSLMKIAKDYKIDDCNICLEIVEKFGMEDIGRIQSAIRIIKEYGFLIAIDDFGVEYSNLDLLNKIDSDIVKLDKYFADNLDKSIINEKTVEFISEICIIANRTIVFEGIEEQYQVDIVKAFPYEKIYIQGYFYSKLVDIETLKDFKFKDS >NZ_CP023410.1|WP_078233484.1|2204702_2205323_-|flavodoxin-family-protein MKVLLVNGSPNKEGCTYTALKEVSKTLEENGIDTEIFQVGNKPIGGCIGCGSCKKTGECFMKDGVNEFVEKAKDADGFVFGSPVYYAAASGSITSFLDRAFYSGGKHMAFKPGAVICSARCAGTTSTLDQLSKYLTICNMPVVSSQYWNMVHGNTPEEVKKDLEGMQTMRVLGRNMAWLIKCIELGKNNNILKPELEERERTNFIR >NZ_CP023410.1|WP_078233485.1|2203834_2204260_-|hypothetical-protein 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>NZ_CP023410.1|WP_003477359.1|2198777_2199563_+|phosphorylase MYNFLIAGHTKYGLKKDTLCKSVLKCDDEAIKENVIIAPWWEPTIFKDIESELIVDTSIKIWNCKLFDKNITYIKTGIGASVCTDVILALGNSNCKKIIFIGSVGALDEKINIGDIIIPTLSVCGDGVCRYLEKDLTKDCFGEKYYPDTKLNKILIKNTEKICKDNNISYHIVPNFSVDTIFAQFAHLDYIMKLGCKSIEMETAAAFKACSICNIPIAAIFNVSDNSIKNKSIYNGKTESELKYRKKVRNEIIPKIIYSLL >NZ_CP023410.1|WP_003454005.1|2208939_2209416_-|glutathione-peroxidase MEIYDISVKDINGENVSLERYRGKVLLIVNTASKCGFTKQFDGLEELYEKYKDEGFEVLGFPCNQFKEQDPGSNSEIMNFCKLNFGVTFPMFEKIDVNGENESLLYSYLKEQKSGMFGSKIKWNFTKFLVDREGNVIKRFSPQTTPKSIEKDIEELLA >NZ_CP023410.1|WP_087327787.1|2209783_2210263_-|DUF861-domain-containing-protein MIMENISKELLEKLVRQIIEEKLAGAGNNDSVDFIRNKDKSGIMSIKLPTVKVDESNRLDTGNPRDVVYTKDLFTLEESPRLGAGIMEMKETTFDWTLNYDEIDYVIEGHLDIIIDGRKISADAGEIILIPKGSKIQFSVPDYARFIYVTYPADWASQA >NZ_CP023410.1|WP_060669957.1|2210259_2211357_-|ethanolamine-utilization-protein-EutH MSINEIIVYIMVACMALGAIDKCLGNKFGIGEQFEEGIMAMGSLALAMVGVICLAPVLASVLGPIVTPVFNALGADPAMFAGSILANDMGGAPLAASLAQDPQAGMFSGLIIGAMMGATIVFTIPVSLGIIEKKDHKFLATGILAGIITIPVGAFVGGLVAGFPAMMVLKNLVPIIIFAILIAIGLAFAEEAMIKGFNIFGKIVVIIITLALAAAIIEALTGIVIIPGMNPISEGIEIVGDIAIVLAGAFPLVYIITKVFKKPLMGLGKILGINEIAAAGMIASLANNIPMFGMLKDMDDRGKIINVAFAVSASFVLGDHLGFTAGFNPEMIFPMIVAKLVGGITAVILAMFIAKKTLGKIEEAK >NZ_CP023410.1|WP_003477263.1|2211407_2211962_-|BMC-domain-containing-protein MKKSIGALEFRSISKGIEVSNEVVKKAFVEVSYLKSICPGKFFLIVNGDAGEVKEAIEFGEKLGEKYLVGSFIINSIHHDIINALKGKYSQKNIEDKAIGIMETGKVSSGILALDKTLKSSEVNLVKLQLAFGIGGKLVYIVSGDLSSVENGMREGQAILQEKDIINVSIIPFVHSEIAKNLIK >NZ_CP023410.1|WP_003474302.1|2211963_2212236_-|EutN/CcmL-family-microcompartment-protein MEIGRVVGNVWATRKDEKLNGQKFLIVKLLISKDKEKEGLFVAADNAGAGIGDIVLITKGGAARQSIGNREVPIDAAIVGIVDSIDIEED >NZ_CP023410.1|WP_003455851.1|2212382_2213141_-|ethanolamine-utilization-protein MKGGKDNMDYEKLVEFLVDEIYKRIQEENSKSNSLEKRKSIVVIGESNVSFYREALKGFDINPLTSECKDCDILLISKLCIKGLSNIAQGTCTTKAENFALEMLLKGKKVYILEDGIEYRKYKNTAPKVLYNKYIKFEEELLAYGIEVIDDLNRISIESKDEKVSFSGIKEEISKNLCLCSENKVEGKKDLDTTAIADEFTINLSNKKLVSESDLRKPHINGVRTLIVDKKAIITPLAKDYIRINNLNVVLS >NZ_CP023410.1|WP_003455694.1|2213348_2213984_-|phosphate-propanoyltransferase MDNLLQDIIEEVVRRVKDEAFIEVEASGRHVHLTREHIEILFGEGHELTRIKDLSQPGQYACKERVTISGPRGKIDNVVVLGPPRNETQVEVSFTDALVLGSIPPVKLSGDLENTPEITISTERASIALNRGLMVAKRHIHMTPEDAIKFGVSNNESVKVKVLGKRPLIFDDVIVRVSKDYRTFMHIDYDEANACGFSKGTFALIVGKDEK >NZ_CP023410.1|WP_003453880.1|2213993_2214770_-|ethanolamine-utilization-cobalamin-adenosyltransferase MAVLTEGEVRKRLSREDLKALKEFKVVKGEIITPSAKSYLAEHNINLVYVNSEEEKLNKETEPKEIIREVVREKEYKYETVFGAKLDEKPEHMTHLTGNLLVFKDHKRIIFRGKIDSLEARIVETQVLCHKQGMNKLVEDLQEILNLIGRILRCEVLSEPLEGFSLQGMTEKDLREKSHNPKKYFGIGHEMPTYEMGEIVAALNILRTLTRETELSAYEAFKGEYGQVEREDLIRALNRLSSVFWIMIFKVRTGKYEK >NZ_CP023410.1|WP_003453976.1|2214847_2215138_-|ethanolamine-utilization-microcompartment-protein-EutM MANANALGMIETRGLVGAIEAADAMVKAANVQLVGKEQVGGGLVTVMVRGDVGAVKAATDAGAAAAERVGDLISVHVIPRPHFEVDAILPKAPKAE >NZ_CP023410.1|WP_025649037.1|2215492_2216971_-|acetaldehyde-dehydrogenase-(acetylating) MEFLDKDLVSIQETRGLIRKAKEAQSKLARMSQQDIDRIVKAISDAAYENSEKLAKMANEETGFGKWEDKVLKNVFAARTVYESIKDTKTVGIVEENVEKRAFKIMVPVGVVAGLIPSTNPTSTAIYKAMISIKARNAIVLSPHPSAKKCIIETAKIIAKAAERAGCPEGAIGCITVPSIEGTNELMKNKDTSLILATGGEAMVRAAYSSGTPAIGVGPGNGPAFIDKSADVKLAVKRILDSKTFDNGTICASEQSIVVEKAMEDEVVRELKEQGAYFLTEEQANQLSKFVMRANGTMNPQIVGKTPQDIAKLAGLEGIPSWARVLVPRECHVGHKYPFSREKLTTILTFFVEENVDAVLNRCREILLNEGAGHTFCMHANNEELVKRFALEMPVSRMVVNSPGALGGIGATINLVPALTLGCGAVGGSSTSHNIGPLDLMNTRNVAYGVRELEDIRELAVGATKEVASSLDLGDKEELINLLVKKIIEELK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP023410_2 | 2.30|2130433|37|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2130433-2130469 | 37 | JQ660954 | Clostridium phage PhiS63, complete genome | 15820-15856 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023410_2 | 2.6|2128876|37|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2128876-2128912 | 37 | JQ660954 | Clostridium phage PhiS63, complete genome | 24003-24039 | 1 | 0.973 |
NZ_CP023410_2 | 2.13|2129331|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2129331-2129366 | 36 | JQ660954 | Clostridium phage PhiS63, complete genome | 13947-13982 | 2 | 0.944 |
NZ_CP023410_2 | 2.26|2130173|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2130173-2130208 | 36 | NZ_CP013238 | Clostridium butyricum strain CDC_51208 plasmid pNPD4_2, complete sequence | 33147-33182 | 7 | 0.806 |
NZ_CP023410_2 | 2.27|2130238|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2130238-2130273 | 36 | GQ443085 | Clostridium phage CP26F, complete genome | 13130-13165 | 7 | 0.806 |
NZ_CP023410_2 | 2.27|2130238|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2130238-2130273 | 36 | JF767210 | Clostridium phage phi9O, complete genome | 13535-13570 | 7 | 0.806 |
NZ_CP023410_2 | 2.27|2130238|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2130238-2130273 | 36 | NC_019496 | Clostridium phage phiCP26F, complete genome | 13130-13165 | 7 | 0.806 |
NZ_CP023410_2 | 2.31|2130499|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2130499-2130534 | 36 | NZ_MK275620 | Clostridium perfringens strain JXJA17 plasmid p2, complete sequence | 26649-26684 | 7 | 0.806 |
NZ_CP023410_2 | 2.31|2130499|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2130499-2130534 | 36 | NZ_MK275623 | Clostridium perfringens strain JXJA17 plasmid p5, complete sequence | 1679-1714 | 7 | 0.806 |
NZ_CP023410_2 | 2.31|2130499|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2130499-2130534 | 36 | NC_008265 | Clostridium phage phiSM101, complete genome | 30846-30881 | 7 | 0.806 |
NZ_CP023410_2 | 2.26|2130173|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2130173-2130208 | 36 | MN694016 | Marine virus AFVG_250M811, complete genome | 27695-27730 | 8 | 0.778 |
NZ_CP023410_2 | 2.26|2130173|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2130173-2130208 | 36 | MN693920 | Marine virus AFVG_250M810, complete genome | 27308-27343 | 8 | 0.778 |
NZ_CP023410_2 | 2.26|2130173|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2130173-2130208 | 36 | MN693800 | Marine virus AFVG_250M813, complete genome | 27575-27610 | 8 | 0.778 |
NZ_CP023410_2 | 2.26|2130173|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2130173-2130208 | 36 | MN694453 | Marine virus AFVG_250M327, complete genome | 5479-5514 | 8 | 0.778 |
NZ_CP023410_2 | 2.26|2130173|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2130173-2130208 | 36 | MN694554 | Marine virus AFVG_250M812, complete genome | 27597-27632 | 8 | 0.778 |
NZ_CP023410_2 | 2.12|2129267|35|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2129267-2129301 | 35 | KU878088 | Bacillus phage AR9, complete genome | 99311-99345 | 9 | 0.743 |
NZ_CP023410_2 | 2.12|2129267|35|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2129267-2129301 | 35 | MF360957 | Bacillus virus PBS1, complete genome | 9614-9648 | 9 | 0.743 |
NZ_CP023410_2 | 2.29|2130368|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2130368-2130403 | 36 | NZ_CP045340 | Vibrio sp. THAF190c plasmid pTHAF190c_b, complete sequence | 447163-447198 | 9 | 0.75 |
NZ_CP023410_2 | 2.2|2128616|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT | 2128616-2128651 | 36 | NC_013862 | Allochromatium vinosum DSM 180 plasmid pALVIN02, complete sequence | 35332-35367 | 10 | 0.722 |
NZ_CP023410_2 | 2.6|2128876|37|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2128876-2128912 | 37 | NC_011253 | Borrelia recurrentis A1 plasmid pl33, complete sequence | 29932-29968 | 10 | 0.73 |
NZ_CP023410_2 | 2.6|2128876|37|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2128876-2128912 | 37 | NC_011258 | Borrelia recurrentis A1 plasmid pl37, complete sequence | 27319-27355 | 10 | 0.73 |
NZ_CP023410_2 | 2.6|2128876|37|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2128876-2128912 | 37 | NC_011260 | Borrelia recurrentis A1 plasmid pl53, complete sequence | 42935-42971 | 10 | 0.73 |
NZ_CP023410_2 | 2.24|2130043|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2130043-2130078 | 36 | NZ_CP046630 | Streptococcus equinus strain CNU G6 plasmid p1_CNU_G6, complete sequence | 2865-2900 | 10 | 0.722 |
NZ_CP023410_2 | 2.24|2130043|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2130043-2130078 | 36 | NZ_CP046920 | Streptococcus sp. CNU G2 plasmid p_CNU_G2, complete sequence | 6529-6564 | 10 | 0.722 |
1. spacer 2.30|2130433|37|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JQ660954 (Clostridium phage PhiS63, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ccatagcttccctctttatttttaagattataaataa CRISPR spacer ccatagcttccctctttatttttaagattataaataa Protospacer *************************************
2. spacer 2.6|2128876|37|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JQ660954 (Clostridium phage PhiS63, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
catggaaaagaaaagatataaagaaaagtaaaactcc CRISPR spacer catggaaacgaaaagatataaagaaaagtaaaactcc Protospacer ******** ****************************
3. spacer 2.13|2129331|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JQ660954 (Clostridium phage PhiS63, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
taataaagtttataacatagatattcgttcagacaa CRISPR spacer gaacaaagtttataacatagatattcgttcagacaa Protospacer **.********************************
4. spacer 2.26|2130173|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP013238 (Clostridium butyricum strain CDC_51208 plasmid pNPD4_2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
ttttgaaagtatatttaaacaattattaaatattta CRISPR spacer atttgaaagtatatttaagcaattattattttgtaa Protospacer *****************.********* * * *
5. spacer 2.27|2130238|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to GQ443085 (Clostridium phage CP26F, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
tacttgtaccaattatagcattttcaaagctaacat CRISPR spacer tacttgtaccacttaaagcattttcaaatgatatat Protospacer *********** *** ************ *.**
6. spacer 2.27|2130238|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JF767210 (Clostridium phage phi9O, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
tacttgtaccaattatagcattttcaaagctaacat CRISPR spacer tacttgtaccacttaaagcattttcaaatgatatat Protospacer *********** *** ************ *.**
7. spacer 2.27|2130238|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019496 (Clostridium phage phiCP26F, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
tacttgtaccaattatagcattttcaaagctaacat CRISPR spacer tacttgtaccacttaaagcattttcaaatgatatat Protospacer *********** *** ************ *.**
8. spacer 2.31|2130499|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_MK275620 (Clostridium perfringens strain JXJA17 plasmid p2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
tatacttagtatttcttagtattactttacaataat CRISPR spacer cattacaagtattacttagtatcactttacaataat Protospacer .** . ****** ********.*************
9. spacer 2.31|2130499|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_MK275623 (Clostridium perfringens strain JXJA17 plasmid p5, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
tatacttagtatttcttagtattactttacaataat CRISPR spacer aattacaagtatcacttagtattactttacaataat Protospacer ** . *****. **********************
10. spacer 2.31|2130499|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_008265 (Clostridium phage phiSM101, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
tatacttagtatttcttagtattactttacaataat CRISPR spacer cattacaagtattctttagtattactttacaataat Protospacer .** . ******..*********************
11. spacer 2.26|2130173|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694016 (Marine virus AFVG_250M811, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
---ttttgaaagtatatttaaacaattattaaatattta CRISPR spacer ataatttg---gtatatttaaataattattatatattgt Protospacer **** ***********.******** *****
12. spacer 2.26|2130173|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693920 (Marine virus AFVG_250M810, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
---ttttgaaagtatatttaaacaattattaaatattta CRISPR spacer ataatttg---gtatatttaaataattattatatattgt Protospacer **** ***********.******** *****
13. spacer 2.26|2130173|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693800 (Marine virus AFVG_250M813, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
---ttttgaaagtatatttaaacaattattaaatattta CRISPR spacer ataatttg---gtatatttaaataattattatatattgt Protospacer **** ***********.******** *****
14. spacer 2.26|2130173|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694453 (Marine virus AFVG_250M327, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
---ttttgaaagtatatttaaacaattattaaatattta CRISPR spacer ataatttg---gtatatttaaataattattatatattgt Protospacer **** ***********.******** *****
15. spacer 2.26|2130173|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694554 (Marine virus AFVG_250M812, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
---ttttgaaagtatatttaaacaattattaaatattta CRISPR spacer ataatttg---gtatatttaaataattattatatattgt Protospacer **** ***********.******** *****
16. spacer 2.12|2129267|35|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KU878088 (Bacillus phage AR9, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
aaaatggaaaagtattattgttcttttggtttcgt CRISPR spacer taaatgtaaaagtattattattctttaatttattt Protospacer ***** ************.****** . ** . *
17. spacer 2.12|2129267|35|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF360957 (Bacillus virus PBS1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
aaaatggaaaagtattattgttcttttggtttcgt CRISPR spacer taaatgtaaaagtattattattctttaatttattt Protospacer ***** ************.****** . ** . *
18. spacer 2.29|2130368|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP045340 (Vibrio sp. THAF190c plasmid pTHAF190c_b, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ctagcttcaattccatctttactccaaatatcaact CRISPR spacer ctagtttgaattccatctttactccattgacagaca Protospacer ****.** ****************** *. .**
19. spacer 2.2|2128616|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_013862 (Allochromatium vinosum DSM 180 plasmid pALVIN02, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
cgcttaaatgggaaggcaagggttagagcaaaaaat CRISPR spacer tattccgtttggaagccaaggcttagagcaaaaaat Protospacer ...*. . * ***** ***** **************
20. spacer 2.6|2128876|37|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_011253 (Borrelia recurrentis A1 plasmid pl33, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
catggaaaagaaaagatataaagaaaagtaaaactcc CRISPR spacer gtttttaaagaaaagctataaaaaaaagtaaaacaag Protospacer * ********* ******.***********
21. spacer 2.6|2128876|37|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_011258 (Borrelia recurrentis A1 plasmid pl37, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
catggaaaagaaaagatataaagaaaagtaaaactcc CRISPR spacer gtttttaaagaaaagctataaaaaaaagtaaaacaag Protospacer * ********* ******.***********
22. spacer 2.6|2128876|37|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_011260 (Borrelia recurrentis A1 plasmid pl53, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
catggaaaagaaaagatataaagaaaagtaaaactcc CRISPR spacer gtttttaaagaaaagctataaaaaaaagtaaaacaag Protospacer * ********* ******.***********
23. spacer 2.24|2130043|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP046630 (Streptococcus equinus strain CNU G6 plasmid p1_CNU_G6, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
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24. spacer 2.24|2130043|36|NZ_CP023410|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP046920 (Streptococcus sp. CNU G2 plasmid p_CNU_G2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
ccattacaggatataaaatgtggaaagaagaaggga CRISPR spacer atatggaagcatataaaatttggaaagaagaagtag Protospacer .** . ** ********* ************* ..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1287040 : 1300295
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP023410|1287040:1300295|DBSCAN-SWA ATTACTTAGTCTCTAAATATTCATCATATGTGCAAACTTTATCAAATTTAATTCCTTCTGGAGTTAATTCTATGATTCTGTTTGCTATAGTTTCAACAAATTGGTGGTCGTGACAAGCAAATAATAATACGCTCTTATAATCTGCTAAACCATTGTTTACTGCTGTTATTGATTCTAAGTCTAAGTGGTTAGTTGGTTGGTCTAAAGTTAAAACGTTAGCTGAGCTAAGCATTAATTTAGAAAGCATACATCTAACCTTTTCTCCTCCTGATAATACAGAAGCTTGTTTAAGAGCTTCTTCACCTGAGAATAACATTCTTCCTAAGAATCCTCTTAAGTAAGATTCAGATTTTTCATCAGAGAATTGTCTAAGCCAATCAACTAAGTTTAATTCGCAACCATCAAAGAATTCAGTATTATCTTTAGGGAAGTAAGCATTAGTTATAGTTACACCCCACTTATAATCTCCTGAATCTGGTTCCATTTCTCCATTTATTATTTTAAATAAAGTAGTTATTGATCTTTCATTTCCAACAAAGGCAATCTTATCATCTTTGTTAACTCTGAAACTTACATTGTCTAGAAGTTTAACTCCATCAACAGTTTTTGATATTCCATTAACCTCTAGAATGTCGTTTCCAACTTCTCTTTCAGGCTTAAATCCAACGAAAGGATATTTTCTGCTTGAAGGTTGAATATCATCTAAAGTAATCTTATCTAATAACTTCTTACGAGAAGTAGCTTGCTTAGATTTAGAAGCATTAGCACTGAATCTAGCAATGAAGTTTTGAAGTTCTTTAATTTTTTCTTCTTTTTTCTTGTTTTGGTCTTTAGCCATTTGAAGTGCAAGTTGACTTGATTCATACCAGAAATCATAGTTACCAACGTATAATTTGATTTTTCCAAAGTCAACATCACATATTTGTGTACAAACCATGTTTAAGAAATGTCTATCATGGGATACAACTATAACTGTACCTTCAAAGTTTCCTAAGAAGTTTTCAAGCCAAGTGATAGCTTTTATGTCTAAGTGGTTTGTAGGCTCGTCAAGGATAAGTACATCTGGCTTACCAAATAAAGCTTGAGCTAAAAGAACCTTAACTTTCTCATCACCTTTAAGGTCTCTAACATGGCTGTAGTGAAGCTCAGTACCTATTCCTAAGCCTTGAAGTAATGAAGAAGCCTCTGATTCTGCTTCCCATCCATCTAAATCTGCAAATTCTGCTTCAAGTTCAGCAGCTTTTATTCCATCTTCATCAGAAAAATCAGGCTTTGCATATAAAGCATCTTTTTCTTCCATTATTTCAAATAATCTTGGATTTCCCATTATAACTGTTTTTAAAACTTCACAATCATCATATTGATAATGATCCTGTTTTAAAACAGAAACTCTAGTTTTAGCAGGAATTGAAACTTCTCCTGTATTAGGTTCTATTTCACCAGCTAATATTTTTAAAAATGTAGATTTACCAGCACCATTTGCGCCAATAACCCCATAGCAATTTCCAGGAGTAAACTTTAAGTTAACATCTTCAAAAAGTTTTCTTCCACCAAATCTTAAGCTTACATTATTTACTGTAATCATTAAGTTCTGTCCTTTCTTCTTTAAATTTTAATAATTTGTTAATGCAAAAAAACTATTTTTATGCACATGAATACTTATTATAACATAAAATGCGACAAAAAAATATTGAATTATTATGAACGGTATGCTATATTTTATATAAACTTTTAATTTAGACCTGAGAGTCTAGAAAAGGGAGGATAATAATATGGCAGAATCTGTACAAAATAAAGAGGTAGAACTACTAGAAGTCATAGGAGTAGAGGACAAGTTACCTCTAAAAAAAGCAATTCCTTTAAGTGTCCAACATTTATTTGCAATGTTTGGATCATCAGTCTTAGTACCAATTCTTTTAAATATTGATCCAGCAACGGTCTTATTCTTTAATGGAATAGGAACTTTATTATATGCTTTCATAACAAAAAGAAAAATTCCAGCATATTTAGGATCAAGTTTTGCATTTATATCACCAGTATTACTTTTAATGGGAGAGGGATATTCCTTCACTGAAGTACAAAGTGGCTTTGTAGTATCAGGATTATTGTTTGCTACCATAGCAATCATTGTGGGTTTTGTAGGAACAGGATGGATTAGAAAATTATTTCCACCAGCTTCTATGGGGGCTATAGTAACAATAATAGGATTAGAGTTAGCACCAACAGCGGCAGATATGGCTGGTTTCCCAGTAGGATTATCAAATTCAAAGGTTTTAAATCCAACATGGGTATTAGTTTCAATGATTACAATAATAACTGTAATTTTAGCTTCAGTATTATTAAGAGGATTTTTAAAGGTAATACCTATATTAATAGGTATAGTTACTGGATATTTAGTTAGTTGTTTTTTAGGATTAGTAGATTTTACACAAGTAAAAGAGGCAAGCCTCTTTGTATTACCACAAATACATATAGCTAAACCAAGTTTAAATGCAATTTTAACAATTTTACCTGCAACCTTTGTAGTAGTTGCAGAGCATGTTGGCCATTTAGTAGTAACAAGTAGCATAGTTGGAAAAGATTTATCTAAAGATCCTGGACTTAATAGATCACTTTTAGGAGATGGCTTATCAACTATGATATCTGGATTTTTTGGATCAGTTCCTACTACAACTTATGGTGAAAATATCGGAGTAATGGCATTAACAAAGGTTTATAGTTCATACGTAATTTGTGGAGCTGGGGTTTTATCTGTAATCTTAGGATTTTCAGGAAGCTTATCAGCTTTAATAAGAAGCATACCAACACCGGTAATAGGGGGAGTTAGTTTGCTTTTATTTGGTACTATAGCTACTTCAGGATTAAGAACTTTCATAGAAGAGAAAGTTGATTATTCAAAATCAAAAAACTTAATATTAACATCAGTTACAATGATAGTTGGTTTAAGTAATATAGCAGTAAGATTTGGTGCAATAGAAATTAAAGGAATGGGACTTGCTACTATAGTTGCTATGATTTTAAGTATATCATTTATGATATTTGATAAATTAGGTTTAATGAATGAAAAATAAATATTAATTAAAAAGCTGGATTCTATTAAGAGATTTAAATGAAAGATAAAGTATTAAATTTTTATGAAAGTTTCTTTGGATTTTAATAGAATTTAGCTTATTTTTTTCTAAAAAAGCCTTTAAAATCATCCTGTTAAATTGTCTGAATTTTTAATTAATAGCATAAAACTATGCATTATTTGAAGGAAGAAGAAGTATAGTAGAGCATTTATGGACATAAATAAGGTTTTTGCAGCCTATATCTAAGAATTTATAGAAATAGTAAGAATATGAGTAAAATAGCTTGTTTGATTAATAATTACAAATAGGTTACAATAAGTAATGTATTTTACTTAAAAAGTGTAAAATCCCTTCTGACATACAGAAAAGCGTATAACTTTCGCATGGAAGCGTAAAACTTTTACTTGCCAGAAGGAGGAGATAATATGGTAAATATTAAAAAGTTGTTTTCAAAGGAAAATAGAAATAAAACTTTAGCCTTAGGACTGACGGGGTTAGTTCTAGTTGGAGGAATAGTAGTATTTTCAATGAGAAAAACTCTTAACGTAGTAGTTAATGGAGAGAGAACGGAGATTGTTACCTATAAAGGTACAGTACAAGGGGCTTTACACGATAATGGAATAACATTAGCACCTAAAGACAAAGTAACACCTTCATTAGAAAGTAAAATATCAAAAAATGAAACAATCACTATAAACAAGGCCGTTAATGTAAAAGTAAAAACAGAAGATGGCGAAAAAGAGATTGTTAGTGCGGAAGATAATGTAGAGAATATGTTAAAATCAGAAGGAATATCTTTTGATGATGATGATAAGATACTACCAGACAAAAAAGAAAGTTTAAAAGATGGAATGAACGTTGAAGTGGTAAAGGTTGATGTAAAAAAAGTTACAGAAGTTCATCCTATAGAGTTTACAACAGAGGTTAAAAAGGATGAAAGTAAACCACAAACGTATACTGAAGTATTAAATGATGGACAAGATGGAGAGAAAAAAGTAACTCGTGAACTTGTTTATGAAAATGGAAAAGAAGTAAGTAATAACGTTATACAGGAACTAGTTGTAAAAGAGCCTGTTAATAAGGAAGTTGTTAAAGGTACAAAGGAAACTCAAACTTTAAGTAGAGGCGGAGAAAGCATAAACTTTAAGAAAAAACTTAGTGTTAAATCCACAGCTTATAATCATCCATTAGGTTCTGCAGAAGCATATACTGCGTCAGGAATGCATGTTTTAAGAGATCCAAATGGATATAGTACAATAGCAGTTGACCCGAGTGTAATTCCTTTAGGAACAAAATTATATGTTGAAGGATATGGATATGCTATTGCAGCTGATACAGGTGGTGCTATAAAAGGAAATAGGGTAGATCTTTTCTTTAACACAGAGGCAGAAGCATCTAACTGGGGCGTTAGAAACTTAGACGTTTATATATTAAATTAACTACGATGAAAGGACAGGCTTTAGGCCTGTCTTTTTATTTTAAATTTTTATTGAAGTAAATTTTATATGCATATAAAATTTGAATTAAGATGGATTTAAAATATTAAATTGAATATTTATCTATATATTACTTATGATAAAATGAAATTATAAGCTTTAAAATAATAGTATTTTTATGTTTAAGGAATAAATTATAAATATTTTAAGATTAGGAGTGAAGAATATGGATACTTGTAATGTTAGTTTACAAATACTTCCCTCAGTAGAGGATTCAAGGCTTTATGAAGTTGTTGATAAGGTTATTGAATATATAGAATCAACAGGAGTAAAGTTTGAGGTTGGTCCTATGGAAACTACCATGGAAGGAAAAATTGATGATTTGCTAGAAATTGTGAAAAAATCTCAAGAAATATGCATAGAAGAAGGTGCTGGAAGAGTTATATCAATAGTTAAAATTGATTATAAAAAAGGCGGAGTAACCATGAATGAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP023410|1287040:1300295|1296705_1297209_+|WP_003457240.1|DBSCAN-SWA MTDKNIKRIVISALIAALYATLTIALAPISYLGVQFRISEIMVLLAFYKKDYIVGLTLGCFIANILGPNGTIDIVLGTFATFISVWGIYLTGKYIKGKKAIWIASIWPTIFNGIIIGWMLNYVYGLPLVLSMGQVALGEFVIITVIGVPVFNFINKKYFGKLNIITR >NZ_CP023410|1287040:1300295|1295505_1296381_+|WP_003457231.1|DBSCAN-SWA MFKKILAIISTVTVLSFAGCGAQKNNISKSSAESEYSGMSVTYLNVGQGDSELIQVNGINMLIDAGTNAGANDLVKDLKNRGIKTIDIAIATHPHEDHIGGMDEVLENFDVKSFYAPKVAHTTKTYENMLKAVKNEGLKIKQIKEGTKIDLGKDTEVQVYSPVKSQYEELNNYSPVMKISYGQNSFMFTGDAESLVEKEILNENKDLKADVLKLGHHGSHSSTSEEFLKAVDPSIAIVSCAKDNKYGHPHKETMSNLKKAGITVYETFRDGDITISSNGKKLDVKLHSENK >NZ_CP023410|1287040:1300295|1299257_1300295_+|WP_003457168.1|tRNA|DBSCAN-SWA MSGVAGEGCEILVPFNERRPLAEIERSLVKTYRKQVWSKFIKAIKDYKLVEEGDKIAIAISGGKDSLIMAKLFQELKKHGQINFELVFLAMDPGYHPQIRELLEDNCKYLDIPVHIYDSGIFQVVDKIAKDYPCYMCARMRRGSLYGKAKELGCNKLALGHHFNDVIETTMLNVLYAGNFKTMLPKLKAANFDGIELIRPLYYIEEKYIKRWIQRAGIWPLNCACMVAAKKIGNKRFEIKDMIEEFKEKFDGVDKSIFRAAQNVSVDSILGWDIDGEHYSYLDFYDEESLLNSTAELKQKGLVNEAVAYERQNIARNLIGLLDDEVIAEKTGLSLKEIKSMQIDN >NZ_CP023410|1287040:1300295|1288811_1290110_+|WP_003451999.1|DBSCAN-SWA MAESVQNKEVELLEVIGVEDKLPLKKAIPLSVQHLFAMFGSSVLVPILLNIDPATVLFFNGIGTLLYAFITKRKIPAYLGSSFAFISPVLLLMGEGYSFTEVQSGFVVSGLLFATIAIIVGFVGTGWIRKLFPPASMGAIVTIIGLELAPTAADMAGFPVGLSNSKVLNPTWVLVSMITIITVILASVLLRGFLKVIPILIGIVTGYLVSCFLGLVDFTQVKEASLFVLPQIHIAKPSLNAILTILPATFVVVAEHVGHLVVTSSIVGKDLSKDPGLNRSLLGDGLSTMISGFFGSVPTTTYGENIGVMALTKVYSSYVICGAGVLSVILGFSGSLSALIRSIPTPVIGGVSLLLFGTIATSGLRTFIEEKVDYSKSKNLILTSVTMIVGLSNIAVRFGAIEIKGMGLATIVAMILSISFMIFDKLGLMNEK >NZ_CP023410|1287040:1300295|1294012_1295335_+|WP_096071490.1|DBSCAN-SWA MLMNQMFWDFMENASMIIEWVSFYLIISQFSPKKRKNKQEVYSFIVIIIFSILLKVLNVYPNERIVICFFIGLIYYKFNFKVNNIKCIMISLIFWLFMLTVEALSISFIVKINSLVNVSELLGKNIYRMETMILSKVILISLIMVVRCLKFRVDIGKGDFIYILTPIATNIIIILVIFGYAFKGGREGFGDNVSIFFVSILLLLSNMSLMFIVSKIIKNNKLKLENEFIKDKLEMEYKYYSNLKDNQEKVKRLYHDIKNHIACIEGNNKETGIRKKYIDSLNSEIDKLNLGFNTGNEVLDVILNNKREKCIENNISLKVFIDFSKVNFIEYFDICTIFSNCIDNAIEACKKIKDNNRYISLKGNCVNNFYVIKIENSKTNKIKKLNGDFLTDKKDKFLHGIGLKNIRLALEKYNGEIIIEPLDDKFILKMLIPINQEKEA >NZ_CP023410|1287040:1300295|1287040_1288624_-|WP_003481618.1|DBSCAN-SWA MITVNNVSLRFGGRKLFEDVNLKFTPGNCYGVIGANGAGKSTFLKILAGEIEPNTGEVSIPAKTRVSVLKQDHYQYDDCEVLKTVIMGNPRLFEIMEEKDALYAKPDFSDEDGIKAAELEAEFADLDGWEAESEASSLLQGLGIGTELHYSHVRDLKGDEKVKVLLAQALFGKPDVLILDEPTNHLDIKAITWLENFLGNFEGTVIVVSHDRHFLNMVCTQICDVDFGKIKLYVGNYDFWYESSQLALQMAKDQNKKKEEKIKELQNFIARFSANASKSKQATSRKKLLDKITLDDIQPSSRKYPFVGFKPEREVGNDILEVNGISKTVDGVKLLDNVSFRVNKDDKIAFVGNERSITTLFKIINGEMEPDSGDYKWGVTITNAYFPKDNTEFFDGCELNLVDWLRQFSDEKSESYLRGFLGRMLFSGEEALKQASVLSGGEKVRCMLSKLMLSSANVLTLDQPTNHLDLESITAVNNGLADYKSVLLFACHDHQFVETIANRIIELTPEGIKFDKVCTYDEYLETK >NZ_CP023410|1287040:1300295|1293308_1294019_+|WP_003465542.1|DBSCAN-SWA MFSIALCEDNSLQREELKNNLSKVLDEMGVEYKLLTFETGEDLLREYPENLDMLFLDIQMGELTGMETARKVRKYDDKVEIIFITALWDYIQKGYEVRAFRYLIKPVKFKELQEQVTACVENILHKRYTYITIKDKNNVLKIRTEDILFLETFERKVIIHTNSQDYIVKMSMNKLEKELNNKGFFRCHTSYIVNLIKIEEIKKDYLLINKFTLPVSKHRMKNLKLRLTSLLGDLIC >NZ_CP023410|1287040:1300295|1290535_1291549_+|WP_003456055.1|DBSCAN-SWA MVNIKKLFSKENRNKTLALGLTGLVLVGGIVVFSMRKTLNVVVNGERTEIVTYKGTVQGALHDNGITLAPKDKVTPSLESKISKNETITINKAVNVKVKTEDGEKEIVSAEDNVENMLKSEGISFDDDDKILPDKKESLKDGMNVEVVKVDVKKVTEVHPIEFTTEVKKDESKPQTYTEVLNDGQDGEKKVTRELVYENGKEVSNNVIQELVVKEPVNKEVVKGTKETQTLSRGGESINFKKKLSVKSTAYNHPLGSAEAYTASGMHVLRDPNGYSTIAVDPSVIPLGTKLYVEGYGYAIAADTGGAIKGNRVDLFFNTEAEASNWGVRNLDVYILN >NZ_CP023410|1287040:1300295|1297420_1298773_-|WP_003474040.1|DBSCAN-SWA MLKNNEILETISMIKEQNLDVRTITLGLSLMDCACEDVKVLSEKIYDKITKTAENLVKTGEDIEKRFGIPIINKRISVTPISIVAASCNCNSYLDIAKAMDKAAKEVGVDFIGGFSALVHKGFTNSDLKLIKSLPESLANTDIVCSSVNIGSTRYGINMDAVKLMGETIKETSLITPDGFGCAKLVVFCNAVEDNPFMAGAFHGVGEAEKVINVGVSGPGVVKKALEEVRGKSFEEVAETIKKTSFKVTRMGQLVAKEASKLMDIPFGIVDLSLAPTPAVGDSVGRVLEEMGLSNCGTHGTTAALALLNDAVKKGGLMASSYVGGLSGAFIPVSEDECMIEQSKNGFLTIEKLEAMTCVCSVGLDMIAIPGKTSASTISGIIADEAAIGMINNKTTAVRIIPVPNKDIGDIVEFGGLLGSAPIMRVSPGNCDDFISRGGRIPAPVHSLKN >NZ_CP023410|1287040:1300295|1291772_1292060_+|WP_003468317.1|DBSCAN-SWA MDTCNVSLQILPSVEDSRLYEVVDKVIEYIESTGVKFEVGPMETTMEGKIDDLLEIVKKSQEICIEEGAGRVISIVKIDYKKGGVTMNEKVGKYR >NZ_CP023410|1287040:1300295|1292156_1293170_+|WP_057231623.1|DBSCAN-SWA MKIAVRGGHNFKAKGALGIIDETIENRKVYKALIKYLNIAGHNVIDVTPGDCDVNTDLYLGVQKAKENNSELFLSIHFDKAYDRYEGPLGTGTWIYGRGGKAEIYAKRIADNLSKGTGLKNRGVKENSKLYELRKTSMPAVLVEVCFCEATEDVRIYREKGPDLIGKLIAEAINEKEIEENIKPEGQEDSLKEKFLKSTNAKAIANLDPRDNPSSIYKDLGEIYKGERIRVLPEICDKKDYLPIIYWKDTTNIESQKVWVSAKQNYLKIDTNATVINVVTELDARYIKSQRSSKMGWVKNGERLYIHKIESGYALGTYFASNGYKTAWFTAKYISLD >NZ_CP023410|1287040:1300295|1298789_1299059_-|WP_003454568.1|DBSCAN-SWA MNAVITVVGKDKVGIIHGVSGILNDNNVNILNISQTIMDGYFTMIMLTDISNSTKDISSLKEIFKEFSLKNSLDISVQHEDIFNSMHRI |
12 | Clostridium_phage(22.22%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1938698 : 1974487
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP023410|1938698:1974487|DBSCAN-SWA 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49 | Clostridium_phage(86.67%) | capsid,terminase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2473441 : 2486031
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP023410|2473441:2486031|DBSCAN-SWA 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TTCGTTTTTTAGATGATTTTAGACGTATTTATATTGTTTTTATTAATTAAAGTTCGTATTTAAGAATAAAAATAGAGATATATTAAAAGTCTCGAATAATATTTTTTAATATATCTCTAATATTTTTAGTCTTCTCTTAAAAGATTTATATCCTTTCCTTCTAGAATCTTATTCATATTTCTTATAGAGCACATTTTTCCACACATTGTACAACTATCTTTATGTTCAGGAGTAGATTCTTTTCTATATCTAATGGCTTTTTCACTATCTATAGCTAAAGAAAACATCTCGTCCCAATCTAGTCTTTTCCTAGCATCACTCATTTTATTATCTATGTCCCTTGCCCCAGAAATTCCTTTTGCTATGTCAGCTGCATGAGCCGCTATCTTTGTGGCAACTATTCCTTCCCTTACATCCTCTAAATTAGGAAGTCTTAAATGTTCTGCTGGTGTTACATAACAAAGAAAATCTGCTCCATAAGAAGCTGCCATAGCCCCTCCTATAGCACTTGTTATATGATCATATCCTGGTGCAATATCAGTTACTATTGGTCCTAAAACATAAAATGGTGCTCCATGGCATAATTTTTTCTCTAATAAAACATTAGCTTCTATTTCATTCATTGCCATATGCCCTGGACCCTCTATTATTACTTGTACATTTCTTTCCCAAGCTCTTTTTGTTAGCTCTCCAAGAGTAATTAATTCTTTGATTTGTACAGCATCAGTTGCATCAGCTATTGAACCTGGTCTACAAGCATCCCCTAAACTTAAAGTTAAATCATACTTTTCACATATATCTAATAATCTATCAAAATATTCATAGAAAGGATTTTCTCTATTATTTAATTCCATCCATGCAAAAAGAAGAGATCCTCCTCTAGAAACTATATTAGTAAGTCTTTTATTTCTTCTAAAAGTTTCAATTGTTTCTCTATTTAATCCAGCATGTATAGTAACAAAGTCAACTCCATCCTTTGCATGTTTTTCTACAACTTCAAAAAATTCATCAACAGTTATATCTTTAAGCTCTTTATCATAGAAACCTACTACATCATACATTGGTACAGTTCCTATCATAGCCGTAGAAACTTCTACAAGTCTTTTTCTAAAATCATAAGTTTTACCATAATTACTTAAATCCATTATAGATTCTGCATTCATATCTATTGCTTTTTTAACTTTTTCTAACTCTAATTCTATATTGGCACAGTCCTTTGAAATTCCTAGGTTAACATTTATTTTAGTTCTTAACCCTTGTCCAACACCTTCTGCACTTATACTTTTATGATTTTTATTAGCTGGTATTACAATTTTTCCTTCAGCCATTAAATTCATTAAAGTTTCAATATTAATTCCTTCTTTTTCTGAAACTACTTGCATTTCCTTTGTTATTATTCCTTTTTTAGCAGCATCCATTTGAGTTGTATAATTCATATTAGTTCTCCTTATTTTAATTTTTTAACTGCGCAGTTAAATTAATATAGGATCCTATTTTTTTATAAAAAATAAAAGCTTGCCATAAGGCAAGCTTAATAAACACTTATATAGATACATTTATAACTTTTTAAAGTATAAATATAAATAAACAACAGTTTATGCTTCCCTACGGTAGTACTAACTACATCAGGTTTTAAGGGTTAGATAGATATTATCCTCTCAGCATATAAAATGCACCCCTAGCACTTACGATTAAATATTCACTTTTTTTAAATTATACTATCAATTTTTTTCAATTTCAAGTAAATTTATAAAAATAAGTAATAATATACTTAATAATTATTTAAGCTAAATATAAAAAATATACTAAATTAAAACCAAGTAAAATATAAGTAGAAATTAAAAAAGCTTTAGAATAAGTTCCTATCTCATTCTAAAACTTTCCTAACTATTCCGATTTATATATTATAATTTAAGTTTTCTCTACAAAACAATGGAATTTTAAAAGCCTGTATGACCAAATCCACCGCCTCTATTTACACTTTTAAGTTTAGAAACATCATCTGTTTTTATAAAATTAGCTTTATAATATTTTGCTAAAACCATCTGAGCAATTCTATTTCCTTTTTTTATGTATATAGTTCCATATGGATTTCCGTTCTTATCTAAATAAATATATGTTTTTAATAACTTTTTATAAGCTTTTTTTCCTTCATCCTCATAAGAACTTATATCATGTCCTTTAGATTCTAAATAGTCGCTTAATCTTACTTCAGTATAATTATTTTTTAAATCATCTAATATACTTATATCATTAGCTATCTCATAAGGAAGATTGGCTATATTATAATTATTTTCTAAAATTACTGATATATCACTAACTGAATCAGCATCAATAGTTCCTATTGAGTTTGAAATTTTTAAGTTTGTTCTTAAAGAAAGTCCACTTCTAGCCCTAATTTGAAGCTCCATATTATCAGGAATTGCAAACTTTAACCCTAGTGGAATTGCAACCTTTTCAAAAGGTCTTATAACCATATCCTCTGCTGCAAAAAGGTCTGCTCCTGCGGCTAATGGTGTTTCATATTTAGGTGTTTCTCCATTTTTATCATATTGAATATATACATCTCTCACTCTTTGTTCTCCCGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP023410|2473441:2486031|2476563_2478009_-|WP_011009969.1|DBSCAN-SWA MVKPNFDIMDPQNDKFKDECGVFGVFANKPIDVASINYYGLYALQHRGQESAGIAVANGEDIKVHKGLGVLTEAFEAEDLKRLREFNGYISIGHVRYSTAGAKTVENAQPLVSNTKLGPISTAHNGNLVNADVIRSLLEDGGQVFHTSVDSEVITSLVARGAKKGIERAVIDAISAVKGSFAMVIMTKDKLIGIRDPHGIRPLCLGKFEEGYILTSESCALDTIGAEFVRDIKPGEIVVIDNDGIKSYRYSENTVCQTCAFEYIYFARPDSVIDGLDVQTTRVKQGEILFKEYPIDADIVVAVPDSGIPAAMGYAKASGIPYEVGFVKNRYIGRTFISPSQEIRERAVAVKLNPLKVNVNGKRVILIDDSIVRGTTSKHLIESLRRAGAKEVHFLVASPMVKYPCYFGIDTPYRSQLIGASRSVEEIREMIGCDSLGYLSLEGMYESFEGRRNFCVGCFSGVYPVAAPMEALEDNLERVEN >NZ_CP023410|2473441:2486031|2478030_2478738_-|WP_003456948.1|DBSCAN-SWA MVNQLEMLYEGKAKKIYATDKEDMVIVHYKDDATAFNGEKKAQIESKGVLNNEITSLIFEMLNKEGIKTHFVEKLNDRDQLCKKVEIVPLEVIVRNVAAGSMAKRLGLEEGYELKTTVFELSYKDDSLGDPLINDYHAVGIGATTFEELNKIYEITAKVNEILKEAFKKQNINLIDFKLEFGRYNGEILLADEISPDTCRFWDATTGEKMDKDRFRRDMGNVINGYREVLNRLRN >NZ_CP023410|2473441:2486031|2479527_2483328_-|WP_003457110.1|DBSCAN-SWA MSGIRMVFVEKKAGFNVESQILLKDFKDNLGIEALEDVRVLNKYILGDMEEEQYVRTVNTILSEAPVDRVYEENFEIGQDEIAFGVEYLPGQYDQRADSASECIMLLTEEEKVPVKSSKVLILKGNLNQEEINKIKSYYINPVDSREVSPLSKVLEENLEEPNEVEILNGFLGLNEEGLKNFHREKSLAMSLEDLKLIRDYFKSEDRNPTITEIKVIDTYWSDHCRHTTFETIIKDVYIEEGKYSEPIKKAYEDYKNSRAYVYGENLNNKEVKLMDLATIAMKELRKRGKLDDLDVSEEINACSINIEIETDKGTEEYLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCLGGAIRDPLSGRSYVYQAMRVTGSADPTVEICETLKGKLPQRKITLGAAHGYSSYGNQIGLATGQVSEIYHPNYAAKRMEVGAVIAATPKENVIRLEPSKGDIVILLGGRTGRDGIGGATGSSKEHTEESINQCGAEVQKGNAPTERKIQRLFRNKEVAQMIKRCNDFGAGGVSVAIGELCRGIDIDLNKVPKKYEGLDGTELAISESQERMAVVISSENADRFIKLSEEENLEATIVAEVTDTDRLRMNWKDKTIVDIKRSFLDTNGAKQEISLKVKSPSVYPYEVKNFDVKEEWLKSLRNLNVCSQKGLIERFDSTIGGGTVLMPLGGKYQLTPAEGMAAKIPVLGGESKDASLMTYGFNPYLGVWSPFHMAFYSVIESVTKIAAMGGDYKKVRLTFQEYFEKLLRDEEKWGKPFAALLGAYKAQMDLGLPAIGGKDSMSGSFGELNVPPTLVSFAVGLEKASRIISPEFKNIGSTLVLMKGEKLEDGTLEMEGFKNNLEKLYELIGEEKVVSAYSLKFGGVSEGITKMSLGNRIGAILNNISKEELFGFNYGSLILEVKEGVNLEDEFKGTNYKVIGSTIKDGVIKCEEYDFEVSLEELEKAYEEKLEYVFKSKTEDKEECVSDLINNDKDGANILDNGQMHIEEKLKSKITRVEKPRVVIPVFPGTNCEYDCRRAFEKEGAEVSEVIIRNLNKEALIDSINMLKKEIDKSQIIMLPGGFSAGDEPDGSAKFIATIFRNPKIKDSVMKLLNERDGLILGICNGFQALIKLGLLPYGKIIDIEEDMATLTYNNINRHMSSIVRTKITSKKSPWFNEVSLGEVHSIPISHGEGRFVAPEALIKELVENDQIATQYVDLEGNMAMNMPYNPNGSSLAIEGIISRDGRILGKMGHSERIGDNLYKNIPGEFDQKLFKSGVDYFRK >NZ_CP023410|2473441:2486031|2474959_2475574_-|WP_003468450.1|DBSCAN-SWA MYKIAVLASGSGSNLQSILDNIDNGNINGEVSLVIGSKEGIFALERAEKQGIKTSVVSKKEFEDKTSDEILRLAKENNIDLIVLAGYLSILKGKLLEEYGNRIINIHPSLIPSFCGNKMYGINVHKAAIEKGVKFSGCTVHFVNDEVDGGAIIAQEIVEVNFEDTPESLQKKVLEKEHILLPRIVKYLCEEKIEIHNGKVKILN >NZ_CP023410|2473441:2486031|2475561_2476563_-|WP_003468449.1|DBSCAN-SWA MLTYKEAGVNIEEGYRSVKLIKEYAKKTMSEYVLNGLGSFAGMVELPEGYKKPVLVSGTDGVGTKLDIACKKRKFDTVGIDCVAMCVNDILCHGAKPLFFLDYIACGKLEAEVSSDLVKGVAEGCIESQCSLIGGETAEMPGMYKEGDYDIAGFAVGIVDKDKIINGKDIKSGDKLIGIASSGVHSNGYSLIRKVFKNLDEDFNGKAIWEELLTPTKIYVKPVLSLLEKFNIKGMAHVTGGGFYENLPRMLSKEGLSIVINKNSYEIPEIFKKLMELGVKEEEMYNTFNMGIGFVLCVEEDEVEEVLKELSKQGEKAFEIGYINAGGEGVCIK >NZ_CP023410|2473441:2486031|2485380_2486031_-|WP_003457021.1|DBSCAN-SWA MAGEQRVRDVYIQYDKNGETPKYETPLAAGADLFAAEDMVIRPFEKVAIPLGLKFAIPDNMELQIRARSGLSLRTNLKISNSIGTIDADSVSDISVILENNYNIANLPYEIANDISILDDLKNNYTEVRLSDYLESKGHDISSYEDEGKKAYKKLLKTYIYLDKNGNPYGTIYIKKGNRIAQMVLAKYYKANFIKTDDVSKLKSVNRGGGFGHTGF >NZ_CP023410|2473441:2486031|2478737_2479217_-|WP_003453078.1|DBSCAN-SWA MKVAIFFGSKSDIDVMKGAGNALKEFGIPYNAYILSAHRVPEKLIETLEKIEKEGCEVIIAGAGLAAHLPGVIASHTILPVIGVPVRAAVEGMDALLSIVQMPKSIPVATVGINNSYNAGMLAVQMLSLKYPELREKLIQFRIDMKHKFIAENGEGVEL >NZ_CP023410|2473441:2486031|2473441_2474947_-|WP_011590302.1|DBSCAN-SWA MKKRALISVFDKDGVLELAKFLRDRDVEIISSGGTYKYLKENNIEVKEISEITDFPEMLDGRVKTLHPLVHAGILAIRDNKEHMKTLEEREINTIDYVVVNLYPFFEKVRENLSFEEKVEFIDIGGPTMLRAAAKNFKDVVVLSDKKDYEKVMNEIKENNCVSFKLRKTLAGKVFNLMSAYDAAISNFLLEGEEEYPEYLSVSYKKIQDLRYGENPHQGAAYYSSTEFDGAMNSFEILNGKALSYNNIKDLDIAWKVACEFEETACCALKHNTPCGVAVGENSKEVYLKAYDADPVSIFGGIVAINRKIDKATAEEMVKIFLEVVAAPDFDEDALEVLRTKKNLRVIKCKNTPQAKNYMVTVDGGILVQGEDNKLANEYKVVTEKEPTEMELRDMIFGMKVVKYVKSNAIVVVKDGVATGIGGGQVNRIWATKEALERGKGGAVLASDAFFPFRDCVDEAAKNGIKAIIQPGGSIRDEESIEACNEHGISMVFTGVRHFKH >NZ_CP023410|2473441:2486031|2483565_2484876_-|WP_003456962.1|DBSCAN-SWA MNYTTQMDAAKKGIITKEMQVVSEKEGINIETLMNLMAEGKIVIPANKNHKSISAEGVGQGLRTKINVNLGISKDCANIELELEKVKKAIDMNAESIMDLSNYGKTYDFRKRLVEVSTAMIGTVPMYDVVGFYDKELKDITVDEFFEVVEKHAKDGVDFVTIHAGLNRETIETFRRNKRLTNIVSRGGSLLFAWMELNNRENPFYEYFDRLLDICEKYDLTLSLGDACRPGSIADATDAVQIKELITLGELTKRAWERNVQVIIEGPGHMAMNEIEANVLLEKKLCHGAPFYVLGPIVTDIAPGYDHITSAIGGAMAASYGADFLCYVTPAEHLRLPNLEDVREGIVATKIAAHAADIAKGISGARDIDNKMSDARKRLDWDEMFSLAIDSEKAIRYRKESTPEHKDSCTMCGKMCSIRNMNKILEGKDINLLRED |
9 | Synechococcus_phage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2521465 : 2549920
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP023410|2521465:2549920|DBSCAN-SWA 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MGFNYGYEKKKFDSRWKRLEVEYCDAGMSEEQIAAMKEYDWAWFCSQRVFQNHTQPIPCEQYDEVCGQSQLFRKFASLSYQWDVDKIDQTRYGWLASVENEQLLLRLKKLSKKDLELLTLLFVDGYRQIDVARLWHCSRSAVAQRFKKIKKFLNKTSYIF >NZ_CP023410|2521465:2549920|2539975_2540590_+|WP_002576325.1|DBSCAN-SWA MEFNEKLQQLRTGKNLTQEQLAEQLYVSRTAISKWESGKGYPNIESLKCISKFFSVTIDELLSGEELITLAETENRSNLKKIYSFIYGILDMMAVTFILLPLYGNLVDGYIYSVNLLSFTDTTPIYLAIYWIVFIVLIALGIAKLMCVCFEKESWSNIITKCSLVLSTLFICFFAAARQPYVTALMFLLFVAKIFVWIKQTQTK >NZ_CP023410|2521465:2549920|2537907_2538549_+|WP_010817906.1|DBSCAN-SWA MLFQLVKKDFLIVKKYVLIMFAVCILFPVFLLWRSPEYAGILGFVLITIFSIFMLLQYVSLKETQYPKASTLLCALPFSRKNIVLSKYIFCILIYLACCLIFGIETLIFPQLRSIGYKVPILLFMVVSLFLGVYLPAQYKLGYEKTKLFFVVLIMASPFIFAQSLKIENSFITNILDNINPVFLVTCSMIASFLILIVSSAISVRIYKKADLS >NZ_CP023410|2521465:2549920|2540770_2541688_+|WP_002576324.1|DBSCAN-SWA MDYIIETENLTKRYGTATVVDKVNLHVPKGKIYGLLGRNGAGKTTAMKMMLQLAFPTEGTVRLFGTNYKENIHTLYSKVGSIIETPGFYSNLTGYENLQILAKLRGGVSKSGVEKALEVVGLHKEKRKVFSDYSLGMKQRLGIAAAIMHEPELLILDEPINGLDPIGIVEIRSFLSELSHNHGITIFISSHVLSEIEQIADIIGVMHEGHLVEEVNISELHKRNRKYIQFDLSDSEIAGKILENHYHMTDFTVQDGTVRIYDFSQSVGEINREFARNGLLVTRINDSEENLEDYFSKLIGGGGIA |
42 | Streptococcus_phage(80.95%) | integrase,transposase | attL 2513217:2513233|attR 2554844:2554860 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
0 : 10014
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP023413|0:10014|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP023413|0:10014|790_1075_+|WP_004456826.1|DBSCAN-SWA MAVKLDKNSKELAQDLLKLQGVDYIEWLNKKHQELITKNTKIIRNCVKNEIKNSSKKDEVIEEINQESNENLESFEDENYNEDEVESERKELIY >NZ_CP023413|0:10014|2624_4214_+|WP_004456849.1|DBSCAN-SWA MSSDWEKKVNQEIENGANAIINEIANVLRIFFFRVGLGFKKSWKNKKLFIGFFLSFLIPIAARIKSDYFLVDTKFYFKIIYFSTFIAPLFYMAIISFVNRKGDKVEEEFKKAFEEMGFIDISGNAPKLINIKHDELTGIDQYFFKTFIPLDDWQPKARLMESRLNKTIFEIIQGIDKQTVQMNALEGSVKVSDKLLWSNDLIREEGVLNFGKSISSEIKIDLDEQPHVLVAGQTGSGKSVLMRCLLWQVYCQGADVYMIDFKAGVEFGLDYEKIGKVMTEVDETLKLLETLIVENTDRLKKFREAKVKNLKEYNKKFKTHLKRKVVFIDEMAQLMDSSGVDKETKAKLEKISYCIATLARTARASGINLVLGAQRPDANVMNGQIKNNVTVRVCGRFADGPVSEIVLGNNKAKKLPEIKGRFLFKVDANTIEFQAYYFNDDKDFKPEQVERQKSQYEFISIKSSDDDLIIEDAPVENISVVENKTFDDIKQEIDVNKDLKQEKQDVNKELKSKNKTDILSSKDWDASNF >NZ_CP023413|0:10014|1075_1387_+|WP_003465044.1|DBSCAN-SWA MKDLNKYALEYRKVVRYALKEGLAIYNNNLSELYINHEIVKKLLEKDNFDSVNGKLSIWRSLKWIEVYSKNRFIKKVKVEKKVINVIAINVEIFNTLNLLLED >NZ_CP023413|0:10014|5840_6209_+|WP_003453383.1|DBSCAN-SWA MEEDRKILRSYNKLKNFEIKIYRLGNTTIPFPVPITTTVYFVVALIIIAIIDATIGIHINFIYKYVALPLGIAYIAKNKKIDGKPLHKYLLRLIQFQNIKKSKIERFEIRENLESFRFIERF >NZ_CP023413|0:10014|1762_2563_+|WP_004456857.1|integrase|DBSCAN-SWA MNIYNLKKEMKNIIYSDSSLSKNSIRDRNSALNKIFENFNNLDDVSVITKDKILDNLNSIKFKTKLSAGVNAIRFLKEHNLDVDFPSEDELKEIIKNKKKNNRKPTAEKNLIDIERKVNRVRKKNYRLAYKLMLESGLRVHEVAALKKDDFSFDKNLITINLREAKGNKLCSIELENKYLSKNISEFIETKSEDERVFPHMRYLQEQATKIGIKCHDLRRGFAKRTYKEELENDSPRSEALDKTRIKLRHTRSDTTKIYLNSKIKV >NZ_CP023413|0:10014|5481_5829_+|WP_025648670.1|DBSCAN-SWA MKNFKILKEKAEEKVKLNKLRIQGFFVALLSFMTTYSTYAYAEINGESIKTNLISNILLPISFVVVGFLLIKELAKKSVAGILVVLIVGGFVIITIAQPDLIKSFGNFVKTILGL >NZ_CP023413|0:10014|6484_9010_+|WP_096071800.1|DBSCAN-SWA MKSNKFNFPINFVKENLIFNNKVCYAGFKLNGFEYSSCNNSEKIRILDSLTELIKEIPSEAQILLIPRAVDCERAIRPMINKIQKDDPLKEVSTILAEKTIEILEERAEDRYIFNPVTEENEFIAGDKTLEYDTYIFISLLKGDDKDFISKGGEIFEYMIKSPKKALNEFLGISQKTISERDFRIYKKKSTEFLEIQSMRFDIRPLRKSEIDSLSARVTKRGHQSADELVKWSDNCLEVEQDEEKVIIPLRNAYKNRVTGLIEQGDKILKIQNDGFTSYQTFLAINNIPSMEFPGVEYIKLIQDMNIGAEICIHIKKFSAEESKSKIKNKAAKINAQVINEALQGGHIPSDEEYEAKAAAESLEKEVKRNKHIIETSISICLASTKEKIVRNNTKVLMEYFNKSLKFELINPYTDQYRIFLDFIPANSNYNRDFIQLVPMETLAGGVFGASDHLGDSVGAYIGYTVNGNRKVYLYMGRATKLNKSPAMGIYGNLGGGKSFNANLIVVLHVLFGSSALIFDPKSERSHWAAKLDFMGDLISIVRLTPNDEDKGKLDPFNLYNDNIDEACDLAFNIIVEIANTNEEEKIILKETLNKMKDEKRPSMKRLIEMINDVSDSDAYKKEAERLARKLNASKDVGLSKLIFGDGTEKAINLDNRLNILQIDNLTIPDQGTKKEEYSEEEKLSSCLMMLMGSFTKKFAMKKRNTFDLILFDESWFLKNSAAGRKLYDFLARQGRSLNVGCIFNGHSVLDIPTEEIKNTITYKLCFKTNNRDEAKRMLEFMNKSITEENIKMLMELENRQAVFQDLDGRVGVIEFDAVFEQFIECFSTTPEDTLNYEDVS >NZ_CP023413|0:10014|9009_10014_+|WP_003464374.1|DBSCAN-SWA MKKLFIWSGIISLIFPLLFFFLIIGGSGEQPTPVNPNPNLTEEQLNFISQIVSGAKQSYEETGIFPSITLAQAILESGWGRSGLAIKANNLFGIKADSGWKGKVLEMPTQEHVNGGIITIIARWRVYESWNESVIDHGKFFVENSRYKENGVLDAKNYVEQAQCIQKAGYATDPNYANQLIQVINDFGLNLYDMNGDVVGNDVIEKAIEAGMKWVGKSPYVWGGGRNQADVDAGRFDCSSLVHYCYASAGIQLGPRESVTTWSLINMGKPVPASEMKRGDLIFFDTAGRNGHIGIYLGNGKFLNDSSTQGVSIGDLNSAYWSRYFNGNVRRVVE >NZ_CP023413|0:10014|4390_5470_+|WP_025648669.1|DBSCAN-SWA MFRKNKENTKPKKEKKEKKSFFKKKDKLNMDLEDSVANLDKQVNGVKEKKLVSVMPFRIARAFIWVLIGILCFRGGVSVFKGNQSEALKKENEKILNNMEKQSSLETQAFSFAEEFAWDYFSRYPINTQDFINRITKYTTEQLANEMNNGTYSDVIYTSAFYFEKYSENQVNVNVKARVRVYTPKAGQEQTPQDQLQYDTNLVDYYLEVPIVFDKDMNMAVDALPVMTAPPEKAYFKNKEFSGTSENDADKTKKITDSVSQFFKAYYEQNQTQIDYFLVDGADIKGAGQKFSFNKIDRINIYKLSDKEFLAIVDLNIDSFGNSIKQGFNLTVVQEGDKFLVKTLEPRTSNIDLNNKSNN |
9 | Bacillus_phage(33.33%) | integrase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_2 |
15147 : 16167
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP023413|15147:16167|DBSCAN-SWA TATGAAGGTATTAAGTTTATTTAGTGGAATAGGAGCTTTTGAAAGAGCTATTGAGAATAAAAATATTGAGCATGAGATAGTTAATTATTGTGAAAAGGATAGGTATGCAAGTTATGCCTATAGTAAACTTTTTAGGTTATCTGAAGCTAAGAATTTATGGGATGTTAATTGGGTTGATGGAACACATTTTAAAGATATAGATCTTGTAACCTATGGCTTCCCATGCACCGATATAAGCCTAGCTGGAAGCTGTAAGGGAATAATTAAAGGTGAAACAAAATCCGGGCTGCTATTTGAAGCACTAAGGATTATAGAAGAAGCTAGACCTAAGGTTGCCATAGCCGAAAATGTTAGAAATTTAGTAAGTAAAATGTTTATTTCTGATTTTCATAATTTAATTAATGAATTAGATAGGTTAGGATATAACTCCTACTGGAAAATACTAAGTGGAATTAACTATAATTCGGCCCATTCTAGAGAAAGAGTATTCATAGTCAGCATCAGGAAAGATATAGACAACGGGAGCTTTGAGTTTAAAGAAGGAAATAATAATTTAGTTACCCTAGAAAGCATTACTGAAAGCTTTGTAGATGAAAAATATTATTGTAAAGATAATTCTTATTTAAAAAGCTTCTTAAATAAGGTTAATAAAAGAGTTTGCAAGGATAAAGAGCCTAGTAAATTCGGATTAATGAGAGTTGGAACAATTAAAAATCCACATATGTTACAAATGAATAGAAGAGTTTTCTCAGAGCTAGGAGCTAGCCCAACCCTTGTAACTGGATCTGATAGTATTCCTAAGATTATTCAATGCAAGGTTAGAAAACTTACTCCTTTAGAGTGCTGGAGACTTGTGGGATTTTCGTCTGAAGATTACTGGCTAGTTAGAAAAGCTCTTGAAGAACAATTTTATAACGGGAAAGACTGTACTGATACGCAAATGTATAAGATGGCTGGGAATAGTATTGTAATCCAGGTAGCAGAAAGTATAATTGAAAGCTTAAAAGGAATATTATATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP023413|15147:16167|15147_16167_+|WP_003464366.1|DBSCAN-SWA MKVLSLFSGIGAFERAIENKNIEHEIVNYCEKDRYASYAYSKLFRLSEAKNLWDVNWVDGTHFKDIDLVTYGFPCTDISLAGSCKGIIKGETKSGLLFEALRIIEEARPKVAIAENVRNLVSKMFISDFHNLINELDRLGYNSYWKILSGINYNSAHSRERVFIVSIRKDIDNGSFEFKEGNNNLVTLESITESFVDEKYYCKDNSYLKSFLNKVNKRVCKDKEPSKFGLMRVGTIKNPHMLQMNRRVFSELGASPTLVTGSDSIPKIIQCKVRKLTPLECWRLVGFSSEDYWLVRKALEEQFYNGKDCTDTQMYKMAGNSIVIQVAESIIESLKGILY |
1 | Bacillus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_3 |
22347 : 29631
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP023413|22347:29631|DBSCAN-SWA AATGGTGTATAGAACATTACTAAATCCACAAATAGATTTTGTGTTTAAAAAGATATTTGGTACAGAAAAGAATAAACCTATATTAATTAACTTTTTAAACGCAGTAATAAAACCAACAACTCCCATAAAAGATGTAGAAATCAAAAATAACGATATAGATAAAGATTTTATAGAAGATAAATTTAGTAGATTAGATGTAAAGGCTACAACTAGCAATAAAGAGCATATAAATATTGAAATCCAGGTAAAGAATGAATATAACATGATACAAAGGACCTTATATTATTGGAGTAAAATGTATTCAGAACAAATACAAAATAGAGATAACTACAGTAAGTTAGAAAGAACTGTTTGTATAAATATCTTAAATTTCAAATATTTAAAGAATGATAAATATCATAATGCATATAGGCTAAAAGAAATAACTTCAAATGAAGAGCTGACAGATCTTCAAGAAATACATTTCATTGAATTACCTAAATTTAATGAAATCGGTAATAAAGAGTATGTTGAAAATGTTGAGAAAATGGATGCTTTAGAAAAATGGTTAGAATTCTTAGTTGAACCAGAAAGTAATACTGTAAGGCAGTTAGAATTAAGTAATGAAGAAATTAAACTAGCAAAATCTGAACTATATAGACTTAGTATGGATAGTAATGAAAGAGAACAGTATAATATGAGAGAAAAGGCAATATACGATAGAATATCTGCCTTAGAAAATGCTGAAGCTAAAGGAAAGATAGAAAGAGAATTAGAGTTAATAAAGGAGTCTTTAAATCAAGGATTAGAAATATCCTTAATTTCTAAAATAACGGGATTAAGTGAAGAAGAAATATTAAAAATAAAAAAAGATATTTAATAAAGGAGGAAATAGTATGAATATAATTATAATATGTGCTATTATAGGTGGATTAATGGGATACTTCTATATGAATAGAAAGCTTGAGAAAAAAACAAATAATTAGTAATATTTTTGTGATAACTAAAAAAGACTCTATAATTTAGAGTCTTTTTTGATTTTAATTAAATTTGGATAAATATAAATATAAAAATATTGAAAAAAAATAAAAAAAAATATATAATGTAGTTATGCTAAAATATAAACATGAAAAATATAAATGTAAAGGTGTTGTAAATATGCGCAAAGAGGTAATTTTTAATTAAATTAACTGAATAAGGATTATTTTTAAAAGTATATGAAAAATCTTGAATAACTCAAGGTTTATTTGTGGTGGAATCAATTATTTATAATATTGATATTACCATGTTTATTTGTGTACTCTAAAAATAATCAGTATTATAATGAGCATGTTACATCTTTATTTGCAGGATAGGAAAACCGTGTTCTAAACACGGTATTTTTATGTCTATTTTTGCTATATATAGATATGGTATAAGATTTTAATTTGAATAGCTTAATCATAAGTTATATAATTAAAGTTCTATATTTTATGTTTATATTTAGGTTATATGATTATGAGGCTGTAAGTGAATTATGTTCATTTGCAGCTTTTTTTTGTTTAAGGAGATTATTTTGATGATTTATATATTTAAATATGAAGATTATGAAAAACAAACAAATTTTTTAAGAAATACTAGGATGGTGATGATTAATGGTTAATAAACTTTCAGCATATAAAACTTATTTATTATTTTCAGCTATTGCAGCAATGTGTTTTTCGTTAGTAGCTACAGTTATGGTAGTGTATCACATTGAAATAGTTCATTTAAATCCACTTCAACTTATACTTGTTGGAACTACTTTGGAATTAGCATGCTTTATATTTGAAATTCCTACAGGTATAGTTGCAGATGTGTATAGTCGTAAACTATCTATTGTTATTGGGGGAGTTTTAACAGGAGTGGGATTTATTTTAGAAGGTTCTATTTCTAGTTTTGTTTTCGTACTTGTAGCACAGATTGTATGGGGATTAGGGTCTACTTTTATCAGTGGCTCGCTTGAAGCTTGGATTGCAGAAGAAGAGAAGAATAAAGATTTAGATGAAATTTATATAAAGGGAGCACAAGCAGGGCAGATAGGAGCATTTATTGGAATAGTACTAAGCACTGTAATAGCTAATTTCTCTGTAAGGCTTCCTATTATAGTTAGTGGAGTTTTATTTATAATTCTTGCATTATTTTTATGGTTATATATGCCAGAAAATAATTTTAAACCATCTGCTCCTGGGGATTTAAATACATTCAAAAAGATGGTATATACATTTAAATCTGGTCTTAAAATTGTAAAAAGTAAATCTATAATTATGATTTTACTTGCAGTAACTTTATTTTATGGATTATCAAGTGAAGGTTATGATAGACTTTCTAATGCACATTTTTTACAAGATACTACACTTCCTAAGCTTGGAAACCTTAGTTCAGTGACTTGGTTTGGAATTTTTGGAATTTTAGGAATGATATTGAGCTTCATAGTAATGCATTTTATGGCAAAGAATCTTAAGAATGAGGATAATAGGAAAAATGGAAAACTATTATTATGTATAAATATACTTTATATATCGTCTATGTTGATATTTGCTCTTACAAAAAACTTTAGTTTAATGTTAATAGCTTATTTGGCAACAAATACCTTTAGAATTATAAATGAACCTATATTCAGTGCGTGGTTAAATGGGCATATAGATGATAACTCTAGAGCTACTGTACTTTCTATAAATGGACAAATGAATTCCTTAGGTCAAATTTTAGGTGGACCAATTATAGGAATCATAGCTACAAATATTTCAGTAAGTATTGGTATAGCATGTACTTCGTTATTAGTAACACCGGTATTAGTGTTATATATTGTTGCTATGATAATTGATAAAAAGGTGGATGATAGAGTTGGAGGTATTGATTATGAAGAAAATAATTAATATAGGAATCGTAGCACACGTGGATGCAGGAAAAACAACTATAACAGAAAACTTATTATATTATAGTGGAGCTATAAAATCAGTTGGAAGAGTTGATTTAGGCAATACACAGACGGATTCTATGGAGCTTGAGCGTAAGAGAGGAATTACCATTAAATCGTCAACCATATCTTTTAATTGGAATAATGTTAAGGTGAATATTATTGATACTCCAGGACATGTGGATTTTATTTCGGAAGTTGAACGTTCATTAAATAGCTTAGATGGAGCAATACTAGTTATATCAGGAGTAGAGGGGATTCAGTCACAAACAAGAATATTATTTGACACATTAAAGGAGTTAAATATTCCAACAATAATTTTTGTAAATAAGCTAGATAGAATTGGGGCAAATTTCAACAAAGTATTTGAAGAAATAAAGAAGAATATGTCCAATAAAGTAGTTAGATTACAAGAAGTATATGATGTAGGAAGCAAAGCTGTTTATATAAAAAAACTATTTGATACATGCATAATAAATGATGATGCTATTAATGTTTTATCAGACTTAGACGAAGCATTTTTAGAAAGATATATTGGTGGAATAGAACCTGATAAAGAAGAAATACAAGAAAAGCTTTCATTATATGCAAGAGAAGGAAGTCTATATCCAGTATTTTGTGGTGCTGCAGCAATTGGACTTGGAATTGAAGATTTATTAGATGGAATTTGTAGTTATTTTCCATTTGCAAGTAATGATTGTGAAAGTGATTTATCTGGGGTAGTATTTAAAATCGAAAGAACAAGTAAAAATGAAAAGAAGGTTTATGTAAGATTATTTGGAGGAAAAATATCTGTAAGAGATAAAATTCAAGTACCTAATAAGGAGATAGCAGAAAAAGTAAAGAAAATTAATAGGTTAGAAAATGGGGGAGTTGTTGAAGCACAGAGGATAGAAGCAGGGGATATAGGTATTTTATATGGACTTACAAGTTTCCAAGTGGGAGATGTTATTGGAATTTCAAATGATAAAATTAAAAATATATCTATAGCTAAACCAGCATTAAAAACAACAATTTCTGCAATTGATAAAGAAAAAAATCCAGAGCTATTTAAAGCATTAACATTACTTGCAGAGGAAGATCCACTACTAGAATTAGAGATGAATGACATAGATAAAGAAATTTATGTCAACTTATTCGGTGAAGTTCAAATGGAAATACTAAGTTCCATGTTAGATGATTTATATGGAATAAAAGTAGAGTTTTCGAATATTGAGACTATCTATAAGGAAACACCTAAAGGTTTTGGAGCGTCAATAATGCATATGCAGGAAGACTTAAATCCATTTTGGGCGACAGTAGGCTTAGAAATAGAACCAGCAGGGAGAGGCGAAGGTCTTAGGTATATTTCTAATGTTTCAGTAGGGTCATTGCCAAAATCTTTTCAAAATGCAATTGAAGAAGCAGTTATTAAGACAAGTAAACAAGGATTATTTGGATGGGAGGTTACAGATGTAAAAGTCACTCTTAGCTGTGGTGAATTTTTTAGTCCAGCCAGCACTCCAGCAGATTTTAGAAATGTGACACCTATGGTATTCATGGAAGCATTATATAAAGCACAAACTGTTTTATTAGAGCCATTACATGAGTTTGAGTTAAAGATTCCTCAAAATGCTTTAAGCAAAGCGGTATGGGATTTAGAAACTATGAGGGCAACCTTTGATAATCCTATTGTTATAGGGGATGAATTCTCAATAAAGGGATTAATTCCAGTAGAAAATTCAAAAGAATATAAAATGAAAATAGCTTCATATACAGAAGGTAGAGGAATGTTTGTGACAAAATTTTATGGGTATAAGGAAGCTTCAGCTGAATTTTCAAAAGCACGCAAAAAAACAACGTATGATCCATTGAATAAAAAAGAGTATTTGCTTCATAAACTAAACGCAATTAGAGATTAAATTTAAATAGATAAGTTAAATTTTTATATGTAGGATTTAAATATAAGACATTCAAAGCCTAAAAGTAAAGGAAGGGTCGTCTGAAGAAGATGAAGACCCTTCCTTTTTTCATGTTACTATGCTTAATTGTAAGTGCTTGAAATTTGTAATATAATGTAAATAAAGTTTTTAATAATAAGGGGACGGCACAAATGAAAATCGACTTTAAAATAACAAAAGATGACTATATAAGCTTCAATTTAAATCATTTAGAAAACTCGAAATCACAGAAAAGTACATTTAACATACTTAGATATGCTGTACCCATAGTACTTTCTATACCAATCTACTTTACAGGAACGGGGATATTTAATCAACCGAGTATATATTGGATTATAGTAGCGATAGTTTTTTTAGTCATTTGGATTTTAACATATCCTAAGCAATACAAAAAATTAGTAGCTAAAGAAACTGATAAACTCATAAGTTAAGGAGATAATTCATCAATATTTGGAAGTAAGACTTTAGAAATTATTGATGGGACAATAGTAGTAAAAGGGGATTCTATATCAGAAACAGTATCGTTAGAAAGTATAAAAGATGTAAAAGTTTACGAAGATATGATCCTTATATATAAGTGGATTTGTAGCTCATATAATTCCAAGGAGATATTTAGATAAAGAAATAGAGAAAGAACTTATGAAAGAGCTTAAAAAATGTAAGGCTTTAGAACAATTAAAGTAAAACGTGCTCCTTTGGAGGTGTAACAGAGAACCGTATCACAAGTAAGTGCGAACTTTACCAAAATTGGATATATAAATGAAAGGTAGGTCTGCTTTAATTCTGCAATGAAACTCACAAAAATCTAAAATTTGAATTTTTGTAGGTTATTGTAGTTTTATTCATAGGTTCTTCGTTTTTCACCTATTTCAGCAAATTAGAATTTGTTTTTTCTAATCTATAGTATTGAAAAAAATAAAAGTTTATATATAATGTAATTATACTAAAATATAAACATGAAAAATATAAATGTAAAGGAGATGTAAATATGCGCAAAGAGTTAGTTTTTAACTAAACTAACTGAATAAGGATTATTTTAAAAAGTATATGAAAAAAATCTTGGATAACTCAAGGTTTATTTGTGGTAGAAACAATTATTAATAATATTGATATTACCATGTCTATTTGTGTACTCTAAAAATAATCAGTATTATAATGAGCATATTACATCTTTATTTGAAGAATAGGAAAACTGTGTTCTAAACACGGTATTTTTATGCCTATTTTTACTATATTTAAAAAAATATCAAGTTTAGATTATATATGTCTACCTAAGTACACTTAATAAGTTTAGAACAATTTATTGAATTATCAAAGTTTAATATAACTTACAATGTATCTATAAATCCAGAAATATTAACTCCTACAAATAGATTAAAAAAATTTATAGATTTGGTTAAAGATAAAAATATAAATTGTATAATGGTTCCTTAGTGTAATTCGTTATAAGAAAAAGGGATATTGTTAAAAAATTTCATTAAAAACAATAAATAAAAGTAAGTTTTTATATAATTTTTTTCTTACTTTCATTTTGTAGTTTATAAAAGTTCACCTTTATAAACTTTAGTTAATTTATTTATTTTTCGTTTTAAAATGTATATAAATTTCTTTTTAAACGTTTATTAAATTCTATTGATTTTAATAAACGTTTTTTCTATACTTAAAGTAATAATTTAAATATGGAGTGATAAAAATGCGTTATAAGTTGACTTATGTATATGGTGACTCAGATCAAAAATTTACTCAAACCTTTAGCAGTAAAGTTCTTATGGAAAGTTATATTGAAACAGGTAAGGATAAAGATTTACGGGTAATTAATATAGAAGGTAGTAAACTCTATGGATATGCAAGGGTAAGCTCTAAAGAGCAAAATTTAGATAGACAAATAGAAGCCTTAAAGGAGTATGGTGTAAATGAAAGAGACATAATAACTGATAAGCAAAGTGGAAAAGACTTTAATAGAGAAGGATATAAAACACTTAAAGAGCAGCTATTAAGAAGTGGTGATGTTTTAGTTATAAAAGAGCTAGATAGACTAGGTAGAAATATGGCACAAATTAAAGAAGAATGGAATGATCTGCAGGCAAAAGAGATAAATATAGTTGTTATTGATACACCTATACTAAATACTGAAGGTAAAAGTAATTTAGAAAAAACCTTAATATCAAATATAGTATTTGAATTATTAAGCTATATGGCTGAAAAAGAAAGAGTAAAGATTAAGCAAAGACAAGCAGAAGGTATTGCTAATGCAAAGGCTAAGGGAAAACATTTAGGTAGGCCAAGAGTAGAATATCCAGGTAATTTTAAAGAAGTATATGACAAATGGAAAGCTAAAAAAATCACTGGTGTAAAAGCTATGGAACTAATGAATTTAAAGAAAAATTCTTTTTATAACTTAATAAAAAAATATGAAATTGAAAAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP023413|22347:29631|25205_27164_+|WP_003479689.1|DBSCAN-SWA MKKIINIGIVAHVDAGKTTITENLLYYSGAIKSVGRVDLGNTQTDSMELERKRGITIKSSTISFNWNNVKVNIIDTPGHVDFISEVERSLNSLDGAILVISGVEGIQSQTRILFDTLKELNIPTIIFVNKLDRIGANFNKVFEEIKKNMSNKVVRLQEVYDVGSKAVYIKKLFDTCIINDDAINVLSDLDEAFLERYIGGIEPDKEEIQEKLSLYAREGSLYPVFCGAAAIGLGIEDLLDGICSYFPFASNDCESDLSGVVFKIERTSKNEKKVYVRLFGGKISVRDKIQVPNKEIAEKVKKINRLENGGVVEAQRIEAGDIGILYGLTSFQVGDVIGISNDKIKNISIAKPALKTTISAIDKEKNPELFKALTLLAEEDPLLELEMNDIDKEIYVNLFGEVQMEILSSMLDDLYGIKVEFSNIETIYKETPKGFGASIMHMQEDLNPFWATVGLEIEPAGRGEGLRYISNVSVGSLPKSFQNAIEEAVIKTSKQGLFGWEVTDVKVTLSCGEFFSPASTPADFRNVTPMVFMEALYKAQTVLLEPLHEFELKIPQNALSKAVWDLETMRATFDNPIVIGDEFSIKGLIPVENSKEYKMKIASYTEGRGMFVTKFYGYKEASAEFSKARKKTTYDPLNKKEYLLHKLNAIRD >NZ_CP023413|22347:29631|22347_23205_+|WP_003474254.1|transposase|DBSCAN-SWA MVYRTLLNPQIDFVFKKIFGTEKNKPILINFLNAVIKPTTPIKDVEIKNNDIDKDFIEDKFSRLDVKATTSNKEHINIEIQVKNEYNMIQRTLYYWSKMYSEQIQNRDNYSKLERTVCINILNFKYLKNDKYHNAYRLKEITSNEELTDLQEIHFIELPKFNEIGNKEYVENVEKMDALEKWLEFLVEPESNTVRQLELSNEEIKLAKSELYRLSMDSNEREQYNMREKAIYDRISALENAEAKGKIERELELIKESLNQGLEISLISKITGLSEEEILKIKKDI >NZ_CP023413|22347:29631|27355_27634_+|WP_003479688.1|DBSCAN-SWA MKIDFKITKDDYISFNLNHLENSKSQKSTFNILRYAVPIVLSIPIYFTGTGIFNQPSIYWIIVAIVFLVIWILTYPKQYKKLVAKETDKLIS >NZ_CP023413|22347:29631|28896_29631_+|WP_003479685.1|DBSCAN-SWA MRYKLTYVYGDSDQKFTQTFSSKVLMESYIETGKDKDLRVINIEGSKLYGYARVSSKEQNLDRQIEALKEYGVNERDIITDKQSGKDFNREGYKTLKEQLLRSGDVLVIKELDRLGRNMAQIKEEWNDLQAKEINIVVIDTPILNTEGKSNLEKTLISNIVFELLSYMAEKERVKIKQRQAEGIANAKAKGKHLGRPRVEYPGNFKEVYDKWKAKKITGVKAMELMNLKKNSFYNLIKKYEIEK >NZ_CP023413|22347:29631|23959_25222_+|WP_003479690.1|DBSCAN-SWA MVNKLSAYKTYLLFSAIAAMCFSLVATVMVVYHIEIVHLNPLQLILVGTTLELACFIFEIPTGIVADVYSRKLSIVIGGVLTGVGFILEGSISSFVFVLVAQIVWGLGSTFISGSLEAWIAEEEKNKDLDEIYIKGAQAGQIGAFIGIVLSTVIANFSVRLPIIVSGVLFIILALFLWLYMPENNFKPSAPGDLNTFKKMVYTFKSGLKIVKSKSIIMILLAVTLFYGLSSEGYDRLSNAHFLQDTTLPKLGNLSSVTWFGIFGILGMILSFIVMHFMAKNLKNEDNRKNGKLLLCINILYISSMLIFALTKNFSLMLIAYLATNTFRIINEPIFSAWLNGHIDDNSRATVLSINGQMNSLGQILGGPIIGIIATNISVSIGIACTSLLVTPVLVLYIVAMIIDKKVDDRVGGIDYEENN |
5 | Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_4 |
36775 : 37636
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP023413|36775:37636|DBSCAN-SWA AATGGTGTATAGAACATTACTAAATCCACAAATAGATTTTGTGTTTAAAAAGATATTTGGTACAGAAAAAAACAAACCTATACTAATTAACTTTTTAAATGCAGTAATAAAACCAACAACTCCAATAAAAGATGTAGAAATTAAGAATAACGATATAGATAAAGACTTTATAGAAGATAAATTTAGTAGATTAGATGTAAAAGCTACAACTAGCAATAAGGAACATATAAATATTGAAATCCAGGTAAAGAATGAATATAATATGATACAAAGGACCTTATATTATTGGAGTAAAATGTATTCAGAACAAATACAAAATAGAGATAACTATAGTAAGTTAGAAAGAACTGTCTGTATAAATATCTTGAATTTTAAATACTTAAAAAATGATAAATATCATAATGCATATAGACTAAAAGAAATAACTTCAAATGAAGAGCTGACAGATCTTCAAGAAATACATTTCATTGAATTACCTAAGTTTAATGAAATTGGCAATAAAGAATATGTTGAAAATGTTGAGGAAATGGATGCTCTAGAAAAATGGTTAGAGTTTTTAGTTGAGCCAGAAAGTAATACTGTAAGGCAATTAGAACTAAGTAATGAAGAAATTAAACTAGCAAAATCTGAACTATATAGGCTTAGTATGGATAGTAAGGAAAGAGAGCAGTACAACATGAGAGAAAAGGCTATATATGACAGAATTTCTGCCTTAGAGAATTCAAGAGAAAATGGAATAAAAGAAGGTATTGAAAAAGTTGTAAAAGAATCATTAAGTCAAGGATTAGAAATATCATTAATTTCAAAAATAACGGGATTAAATGAAGAAGAAATATTAAAAATTAAGAATACTATTAAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP023413|36775:37636|36775_37636_+|WP_015060558.1|transposase|DBSCAN-SWA MVYRTLLNPQIDFVFKKIFGTEKNKPILINFLNAVIKPTTPIKDVEIKNNDIDKDFIEDKFSRLDVKATTSNKEHINIEIQVKNEYNMIQRTLYYWSKMYSEQIQNRDNYSKLERTVCINILNFKYLKNDKYHNAYRLKEITSNEELTDLQEIHFIELPKFNEIGNKEYVENVEEMDALEKWLEFLVEPESNTVRQLELSNEEIKLAKSELYRLSMDSKEREQYNMREKAIYDRISALENSRENGIKEGIEKVVKESLSQGLEISLISKITGLNEEEILKIKNTIK |
1 | Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(100.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_5 |
45695 : 46466
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP023413|45695:46466|DBSCAN-SWA AATGTTGGAAGAAAGCTCATTGATAAGTTTACTTGATAATTTTATTCAAAAAAATAGAGAATCTATAGATAATAATCTTAAGAATTTGATATATAAGGATTATTTAACAGGATTATATAATAGAAGAAGCCTTATAAGATTATTTGATTTGATGAAATCAAGTGATTTACTAAAAAAACTTACATTATTCGTTATGGACTTAGATGAATTTAAAATTATAAATGATTCATTTGGACAATCTATAGGAGATTTAGTATTAAAAAAGGTATCAAAAGTTTTAACTGATACTTGTAAAGATGTCTATATTGCAAGAATTGCAGGCGACGAATTTATAATTATATATGAAAATTTAGAAAATATAGAAAAAATTAAAAGTATTTCTAATAGAATACTTTCACAAATAAATGAAATTTATTTAAGTGAAATAAATTTTAGAGAGATTTCTGTAAGCATTGGAGTTGTTATAGATAATTATAATAAAAAAGATCTAAATGATTTATTGATTAAAGGTGATTTAGCATTATGTAAGGCTAAAATGTTAGGTAAAAATACTAGTGTTATTTTTGAACCTTATTTAGAAGAAGAAAGAAAATTAAAAGTAGATATGATTAATGAATTAGTATATGATATAAAAAATAATAAAAATGTAGAATTATATTATCAGCCGCAATACACATATAATAATAAATTAATTGGATTTGAAGCTTTATTTAGATGGAATAATGAAAAATATCGGAATATATCTATAGAAAAAATAATTAAAATTATTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP023413|45695:46466|45695_46466_+|WP_096071807.1|DBSCAN-SWA MLEESSLISLLDNFIQKNRESIDNNLKNLIYKDYLTGLYNRRSLIRLFDLMKSSDLLKKLTLFVMDLDEFKIINDSFGQSIGDLVLKKVSKVLTDTCKDVYIARIAGDEFIIIYENLENIEKIKSISNRILSQINEIYLSEINFREISVSIGVVIDNYNKKDLNDLLIKGDLALCKAKMLGKNTSVIFEPYLEEERKLKVDMINELVYDIKNNKNVELYYQPQYTYNNKLIGFEALFRWNNEKYRNISIEKIIKII |
1 | Bacillus_virus(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
58348 : 62526
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP023413|58348:62526|DBSCAN-SWA TATGAAAAAAAGAGAACAAATATATACATTTTTAATAGATTTTATAAAAGAAAAAGGATATCAACCTACGGTTAGAGAAATTGCTCATGCAGTAAATTTAAAGTCATCGTCTTCTGTTTATAGACATTTAGAAATGTTAGAAAAAGATGGGCTCATAATACTCGGAAAAAGTGAGCAGAGAGGTAGAAAAAGAAGTATTCATATTATTGATTTAAACAAAAAGATTAAAAAAAATGTATCAGAAGAAACTATTAAAAATTTAATTAAATTTTCAAAAAAACAAGTTAATACTAATAATGATGTATTTCCCAAGAAAGTTACTAATGATTATATAGTAACTGTAGATAATATATTTCCTGATGACATTATTATTGTTGAGAAAGTAAATTCTCTAGAAAAGGATAGTATAGGATTATTATTATTTGAAAATCATACCTTTATAAAAAAAATATTTTCAGATTATGAAAAGGTATATGATACTGATCCTGTAGTTTTAGGGAAGATTATTGGTGTTTATAGAGATTTTTTCTGATATTACTTGAAAAAACATAAAAGAAACGTTAAAATAGGTTAACAATATTAAAATTTACTGTAATAATGTATTAGAAACTTTCGAGTTTATCAGTCACTAGTTAAACCAGTATTAACTATTAAATTAATTGCAAACTTAATTTGATCTGTATATCTATTAACACAAAAAAGATTATCTCTTTAATTTTAGAGATAATCTTTTTTGTGTTTAGAATTAACCAAGAATATCATACAATTTAATTATATCCTATACTCATAGTAATTATAAATTGGGGTGAGAAAATTTATGAGATTATCAGAAGAAGATAAGAAATGTATCAAAATTCTTTATAGAAATGGCTTAAATGTAAAAGAAATTGAAAAATTATTAAATAATGACTTTTCTAAAGATGCTATTCAAAAACATATATATAGACATTTAAATGAATTTAGGAATGAACATATTATAAATAGAGCCTTAAATAAAAATAAATTAAAGAAAGAATTTAAAAATATTATTAAGAATAATTTTTAATAAAGGATTTTCCATAATTTTCAAGAATATTATTTATATATTCTTAAATTAGGGGGAGTTAAGATATGAAAACAGCTCAAGAAGTAGCCAATGAATTAGATTTAACCAGGACTGAAGTTTATAATTTGCTTAGAAAAAAAAGATTTTCTCCATTAGTTAAAAAGAACGGTGGTCAAGTAGCTATAAGCAATGAACTTTTCAAATTATTAGAAGAAGAAATTAAAAGTAAAAGAAATAATATTAAACAAGAAGATAATAAAAATATAGATATAAAACAAGAAGATAAATTATTAGAAGAAAAAAATACTATATCTGATATAAAAACTGAAGAAAGTCCTGATTTTAATACTATAGAAGTTCTACAAAATCAAATAAAATTAAAAGATAATCAAATATCTATTCTAAATAATGTTATAACTAATAACTTAAAAAGAATAAAAGACCTTGAAGAAAAAAATCATGAATTTAAAGAGCTCCATGAAGAAGTCAATAATTTAAAACTTGTTATTGATTCAATACAAACTAAAAAAAAGAGAAAAAGACTTTTAGGAGTATTTTAAAAAAATATAACTGGAAATTTTATTTCCAGTTATAAAAATTACATATAGTATTAAATTTAATCTTCTAAATCACTTATATCAGGTAAAACCAAAGTTTCTTCTTTTTCCTTGTATTCTATAGAGTTAGTTTTCTGCGAAGATAAAATTTTATCACTTATATCAGAAGATGTTAAGTTATTCAAATATATTTCTTCCTTTTTTTTCTCCAACTTAGCTAAATCTTTTAAAAAAGCACTTGCACTACTTTTCTCTTGTATATAATCGTAAAGATCTGCTTCCTTTTCCTTAAATGTTATTCTTATTTCCCTTGGTTTTGCCATTTTGCAAGACCTACCTTTCTGAAACCTTTAGCATTTGCCTTTATGTCTGTTATTGCTTCTGCTTGAATATATACTTTTTTAAATACAGGTAATATTCTACCAGCCGCTCCACCACAAAGACATATTGCATATTGAGATATATTAGGATATAATCCCCTTAATTCATTTATTAAAAACTTAACCAACTTATTTAATGCTTCTGTTTTATAAGTATTTTCTACTTCAAACTTTTCATTCCTTATATCTAATTCTCCATCAAAATATTTTCTAGCATCTTCTAAACTTACACTTAATTTATATTTCAAGTCTAAAACTTCTTGAACATTTTTATATAAATCTAATAATCCAACTTTTATACTTTTTCCACCAATAAATCTTCCATTTTCATCAAATAAAGCAGCGTCGCTAGTTCCCCCACCAATATCAACCATTAATAGTTTCACTTTTTCTTTTTTAGATTGTAGTGCTTCTACTTTAGCACCATATCCTTCTGGAGCTATAAATATATCTTCTATATTAATTGTTCTTGATTCTCCATTTATTTTTATATTTTTACATTGATTATTTAAAATAACTTTCTTTAGTCTTTCTTTCTCTGAGTTATATTGCCCTGCTGGAACACCTATAACTATCTTGACATCATTTTCTTTACTATTTTCCTTATCTAAAGTTTTAGCAATAGTATAATATAATAAATTTATAAAATTTTCTTTTTCATGTTTTACTACATTATTTTCAAAATATCCCTCATTGAAAATAAATTTTTTATCATTTATTTCAACAATATCATTCCCACTAAAATCATCCAATTCTTCAAACTCTCTTAATCTACTTTCAGTTACAAAGTCTTCTTTGTCACCTACACCAATACTTGTAATATTACCAATATCTAATCCTAAAATCATTTTTATCAATCCTTTCTATTATGTAAAATTGTGATGTTTTTTACTTACAAAATCTAAATTACGTAAAATTGTGATGTTTATGTTTTAATATTATCATTTTTTTCAATCTAAATCAAGTATTTTCCGTAAAATTGTGATGTTTTTTCAATTTCAACAAACTGCCATTACGTAAAATTGTGATGTTTTTAATTGAAACTAAAATAAAAGAGAGTAAAATTTTCTATAATTTTACTCTCTTGAAAAATTATTTTTAACATGGTATTATTAACTCAATTAAATTAAATAGTACGGAAAAGGAAAAATCCATTAAGTTTTGCCTAGACGCCAATCAAAGTAAACTTAATGGATGAACTTAAATCCGAAATAGAACAAAGTTCTATTTGAAATATTCACTTTTCATAGCTTTATGATATCAAAGCTATTGAAAAAAGTCAATGATATCTATTGACTTTTTAATAGAAATGTAATATTAGCAAATTTTAACTTCTTTCTATTTAGGATTTAGTGTAATTTCCTAGATGAAAGGAGTTATTTTTATGGCACACATACACTTATTAACTAAAGAACAGTTAGAACAAGAGAAAATGTTTAATCTCGAAGAAAGAGATTTTCATGTCTTAAATCAAATCGAATATAAAGAGTCTAGAAGAAAAGCTCAAAGTATCCTAAGATTTATCAGAAAAGGTATTTTATTAAATAATGGATCTTGGAGCATCTCATTTTCTAAAATTCATAAAGATTATAATGATTGGGTAAATAAAAAGAAAAAGAAAAGACCGGAACTAAAAAATATAAGCTTAAAACAAATAAAAAATATAGTAAATAAACTAAAAGATTTAGGTTTACTTATTATTGAAAATGTAAAGAAAAGAAACTGTTATTTTCTGCCATTACCCAATAAATTACCCAATAATGAAAACATTACAACCCCTGATACAACAAATATAGAAGGTAATCAAACTACTCCTAGGTATATTAGGAATAATAATATAGATATAGATTCTAATAGTAACTCAAAAGAATTTAATGCAGACATGTATGAAAAATGTACAAGTCTTGTTGATGTTAGAAATAAAGTTAAAGAGTTACTTAAAGCTGCAAGAGTTAAGAGCTCTTGGATTAAGAATAAGGTTTTAACAAAATTAAGTGAAAACTATAGAAATATAACTGTTAAATTTTTAGAGAGTTATATTAATACAGTCATTGAGAACACTAGAAATACATATTATTCAAATTATAGAAAATATATCAAGAACAATGCGAACAACAGAGCTCTACCAAACTTTACAGAAAGAAATTATTCAAAAGATTACTGGAAATACCTAGAAGAAAATCTATGTTTTAATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP023413|58348:62526|60008_60272_-|WP_003448998.1|DBSCAN-SWA MAKPREIRITFKEKEADLYDYIQEKSSASAFLKDLAKLEKKKEEIYLNNLTSSDISDKILSSQKTNSIEYKEKEETLVLPDISDLED >NZ_CP023413|58348:62526|60250_61177_-|WP_096071811.1|DBSCAN-SWA MILGLDIGNITSIGVGDKEDFVTESRLREFEELDDFSGNDIVEINDKKFIFNEGYFENNVVKHEKENFINLLYYTIAKTLDKENSKENDVKIVIGVPAGQYNSEKERLKKVILNNQCKNIKINGESRTINIEDIFIAPEGYGAKVEALQSKKEKVKLLMVDIGGGTSDAALFDENGRFIGGKSIKVGLLDLYKNVQEVLDLKYKLSVSLEDARKYFDGELDIRNEKFEVENTYKTEALNKLVKFLINELRGLYPNISQYAICLCGGAAGRILPVFKKVYIQAEAITDIKANAKGFRKVGLAKWQNQGK >NZ_CP023413|58348:62526|61713_62526_+|WP_096071812.1|DBSCAN-SWA MAHIHLLTKEQLEQEKMFNLEERDFHVLNQIEYKESRRKAQSILRFIRKGILLNNGSWSISFSKIHKDYNDWVNKKKKKRPELKNISLKQIKNIVNKLKDLGLLIIENVKKRNCYFLPLPNKLPNNENITTPDTTNIEGNQTTPRYIRNNNIDIDSNSNSKEFNADMYEKCTSLVDVRNKVKELLKAARVKSSWIKNKVLTKLSENYRNITVKFLESYINTVIENTRNTYYSNYRKYIKNNANNRALPNFTERNYSKDYWKYLEENLCFN >NZ_CP023413|58348:62526|59164_59392_+|WP_003474956.1|DBSCAN-SWA MRLSEEDKKCIKILYRNGLNVKEIEKLLNNDFSKDAIQKHIYRHLNEFRNEHIINRALNKNKLKKEFKNIIKNNF >NZ_CP023413|58348:62526|59457_59952_+|WP_025648664.1|DBSCAN-SWA MKTAQEVANELDLTRTEVYNLLRKKRFSPLVKKNGGQVAISNELFKLLEEEIKSKRNNIKQEDNKNIDIKQEDKLLEEKNTISDIKTEESPDFNTIEVLQNQIKLKDNQISILNNVITNNLKRIKDLEEKNHEFKELHEEVNNLKLVIDSIQTKKKRKRLLGVF >NZ_CP023413|58348:62526|58348_58879_+|WP_015060513.1|DBSCAN-SWA MKKREQIYTFLIDFIKEKGYQPTVREIAHAVNLKSSSSVYRHLEMLEKDGLIILGKSEQRGRKRSIHIIDLNKKIKKNVSEETIKNLIKFSKKQVNTNNDVFPKKVTNDYIVTVDNIFPDDIIIVEKVNSLEKDSIGLLLFENHTFIKKIFSDYEKVYDTDPVVLGKIIGVYRDFF |
6 | Bacillus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
65876 : 66251
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP023413|65876:66251|DBSCAN-SWA TATGGGAAGAGTGAGGAAAGATTTTTATAAAGGAGAAGTCTATAGGGGTGATATTTTCTATGCAGACTTAGGAGACATAAAGAGTAAGTTTGGTTCAGTACAAGGTGGAATTAGGCCAGTTATTGTAATTCAAAATGATATTGGGAATAGGTATGGAGAAACTTTTGTAGTGACTTCTGTAACATCTCAACCTAAGAAAGAAATGCCCGTACATACTAAAATAATAAAAGAATGTTTAGAAAAGCCATCTACTATTTTATTAGAGCAAATAACAACTATTTCTAGGTATCAGATGAGAGAGAAAATAGGAAAGCTAAATGGATATGAAATAAAAGAACTAAATAGAGCATTAGGAATAAGTATTGGTTTAAGTTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP023413|65876:66251|65876_66251_+|WP_003474966.1|DBSCAN-SWA MGRVRKDFYKGEVYRGDIFYADLGDIKSKFGSVQGGIRPVIVIQNDIGNRYGETFVVTSVTSQPKKEMPVHTKIIKECLEKPSTILLEQITTISRYQMREKIGKLNGYEIKELNRALGISIGLS |
1 | Lactobacillus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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