Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017085 | Proteus mirabilis strain T18 chromosome, complete genome | 5 crisprs | c2c9_V-U4,TnsE_C,DEDDh,cas3,DinG,PD-DExK,csa3,cas2,cas1,cas6e,cas5,cas7,cse2gr11,cas8e,RT | 0 | 23 | 11 | 0 |
NZ_CP017086 | Proteus mirabilis strain T18 plasmid pT18, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP017085_1 | 319022-319161 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017085_1
|
2 spacers
spacers of NZ_CP017085_1
>1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR TTTTTAATTTTCGTATTAGCTTACGACGCTACA >1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR CTCTTCCCTAAATAATCCTTAAAAACTCCATTTCCACCCCT |
TnsE_C |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017085_1
The CRISPR arrays of NZ_CP017085_1 >merge|NZ_CP017085|1|319022-319161|PILER-CR AGTTCCAAACTATTTTGTCATTTTTAATTTTCGTATTAGCTTACGACGCTACACCCAGTTCCCATCTATTTTGTCACTCTTCCCTAAATAATCCTTAAAAACTCCATTTCCACCCCTCCCAGTTCCCAACTATTTTGTCC >NZ_CP017085|1|1|319022-319161|PILER-CR AGTTCCAAACTATTTTGTCATTT TTAATTTTCGTATTAGCTTACGACGCTACACCC AGTTCCCATCTATTTTGTCACTC TTCCCTAAATAATCCTTAAAAACTCCATTTCCACCCCTCCC AGTTCCCAACTATTTTGTCC
>NZ_CP017085.1|WP_001353740.1|318419_318659_-|DUF1819-family-protein MTPFRYNSDLTSGSLQTRECRIITGLLLQELDEAAWDKAMYKENVLQKRTQSTVRRISSALRKRLEHLSSDFWAFAFLC >NZ_CP017085.1|WP_000497519.1|317905_318232_+|tyrosine-type-recombinase/integrase MFVFPSSTLCNHPYNGKLCRHHLHDSVARKALKAAVQKAGIVSKRVTCHTFRHSFATHLLQAGRDIRTVQELLGHNDVKTTQIYTHVLGQHFAGTTSPADGLMLLINQ >NZ_CP017085.1|WP_096058085.1|317254_317791_+|tyrosine-type-recombinase/integrase MSNSPFLNSIRTDMRQKGYALKTEKTYLHWIKRFILFHKKRHPQTMGSEEVRLFLSSLANSRHVAINTQKIALNALAFLYNRFLQQPLGDIDYIPASKPRRLPSVISANEVQRILQVMDTRNQVIFTLLYGAGLRINECLRLRVKDFDFDNGCITVHDSKGGKSRNSLLPTRLIPAIK >NZ_CP017085.1|WP_000777554.1|316449_316923_-|trimethoprim-resistant-dihydrofolate-reductase-DfrA1 MKLSLMVAISKNGVIGNGPDIPWSAKGEQLLFKAITYNQWLLVGRKTFESMGALPNRKYAVVTRSSFTSDNENVLIFPSIKDALTNLKKITDHVIVSGGGEIYKSLIDQVDTLHISTIDIEPEGDVYFPEIPSNFRPVFTQDFASNINYSYQIWQKG >NZ_CP017085.1|WP_000704156.1|315830_316355_-|streptothricin-N-acetyltransferase-Sat2 MKISVIPEQVAETLDAENHFIVREVFDVHLSDQGFELSTRSVSPYRKDYISDDDSDEDSACYGAFIDQELVGKIELNSTWNDLASIEHIVVSHTHRGKGVAHSLIEFAKKWALSRQLLGIRLETQTNNVPACNLYAKCGFTLGGIDLFTYKTRPQVSNETAMYWYWFSGAQDDA >NZ_CP017085.1|WP_001206315.1|314984_315773_-|ANT(3'')-Ia-family-aminoglycoside-nucleotidyltransferase-AadA1 MREAVIAEVSTQLSEVVGVIERHLEPTLLAVHLYGSAVDGGLKPHSDIDLLVTVTVRLDETTRRALINDLLETSASPGESEILRAVEVTIVVHDDIIPWRYPAKRELQFGEWQRNDILAGIFEPATIDIDLAILLTKAREHSVALVGPAAEELFDPVPEQDLFEALNETLTLWNSPPDWAGDERNVVLTLSRIWYSAVTGKIAPKDVAADWAMERLPAQYQPVILEARQAYLGQEDRLASRADQLEEFVHYVKGEITKVVGK >NZ_CP017085.1|WP_000119696.1|313980_314352_-|hypothetical-protein MSYEPPRDGYTNGYIVDVMYDNRPSKYPAVFRTYVRIPDYVELDNAEELADAIIREVELKEAWLTRVLGNSADPDASVGKWDRRLAQCGGIDEMSSGVQATYFSPNGQLVGLVAYIDAEWMDE >NZ_CP017085.1|WP_001271300.1|313193_313571_-|hypothetical-protein MSAAKALAYALCDKLESKKVDEVVRNLVSSGWNIREVAWEASSFDHEMPYFDTGRDFDIGFPDTLSSKIEFLTANGSIVQARARLHFKQALIFAKASKHVAALKNSLDYYYGSSVIPPQNHGGYL >NZ_CP017085.1|WP_000251879.1|311346_312963_+|transposase MVRLATFNDNVQVVHIGHLFRNSGHKEWRIFVWFNPMQERKWTRFTHLPLLSRAKVVNSTTKQINKADRVIEFEASDLQRAKIIDFPNLSSFASVRNKDGAQSSFIYEAETPYSKTRYHIPQLELARSLFLINSYFCRSCLSSTALQQEFDVQYEVERDHLEIRILPSSSFPKGALEQSAVVQLLVWLFSDQDVMDSYESIFRHYQQNREIKNGVESWCFSFDPPPMQGWKLHVKGRSSNEDKDYLVEEIVGLEINAMLPSTTAISHASFQEKEAGDGSTQHIAVSTESVVDDEHLQLDDEETANIDTDTRVIEAEPTWISFSRPSRIEKSRRARKSSQTILEKEEATTSENSNLVSTDEPHLGGVLAAADVGGKQDATNYNSIFANRFAAFDELLSILKTKFACRVLFEETLVLPKVGRSRLHLCKDGSPRVIKAVGVQRNGSEFVLLEVDASDGVKMLSTKVLSGVDSETWRNDFEKIRRGVVKSSLNWPNSLFDQLYGQDGHRGVNHPKGLGELQVSREDMEGWAERVVREQFTH >NZ_CP017085.1|WP_001243518.1|309819_311346_+|transposase MRNFPVPYSNELIYSTIARAGVYQGIVSPKQLLDEVYGNRKVVATLGLPSHLGVIARHLHQTGRYAVQQLIYEHTLFPLYAPFVGKERRDEAIRLMEYQAQGAVHLMLGVAASRVKSDNRFRYCPDCVALQLNRYGEAFWQRDWYLPALPYCPKHGALVFFDRAVDDHRHQFWALGHTELLSDYPKDSLSQLTALAAYIAPLLDAPRAQELSPSLEQWTLFYQRLAQDLGLTKSKHIRHDLVAERVRQTFSDEALEKLDLKLAENKDTCWLKSIFRKHRKAFSYLQHSIVWQALLPKLTVIEALQQASALTEHSITTRPVSQSVQPNSEDLSVKHKDWQQLVHKYQGIKAARQSLEGGVLYAWLYRHDRDWLVHWNQQHQQERLAPAPRVDWNQRDRIAVRQLLRIIKRLDSSLDHPRATSSWLLKQTPNGTSLAKNLQKLPLVALCLKRYSESVEDYQIRRISQAFIKLKQEDVELRRWRLLRSATLSKERITEEAQRFLEMVYGEE >NZ_CP017085.1|WP_004249814.1|319587_320664_+|putative-2-aminoethylphosphonate-ABC-transporter-ATP-binding-protein MLQFNINSQNGSMPHIRVENIQKRFNQFIALDGVSLEIKQGELVCLLGPSGCGKTTLLRCIAGLETQDHGSIFNYDNNISHLPPQARDYGILFQSYALFPNLTVQQNIAYGLAGQPRNVIKDRVNEMLELVGLQDRKKKYPGELSGGQQQRVALARALAPAPSLLLLDEPMSALDAQVREHLCVELRNLQQSLNITTLMVTHNQDEAMLMADRIAVMNNGKVEQYGSSEEIYNHPQTPFVAEFVGKGNWLPFNRNQHGEAMIGSREVQLKHTAIPHNQGRLFCRPESIKINPIQNKHNQYDANIQNVVFLGSRCIMKFELDHLPGHLLQAEISAAELHSIQNGKVKVTLPANELHIFA >NZ_CP017085.1|WP_017628744.1|320676_322368_+|putative-2-aminoethylphosphonate-ABC-transporter-permease-subunit MSVIVPTKSINRLDSLFVAGGKLFIICLLTLGVLLPLLAIFWRGFTPDISQGGGFQAAIDLFTSANFLWLVGNSISVSLSVAVITVPLAYLFAYALHRTLIPFKSLWRGISLLPLLAPSMLPGIALVYLFGNQGLLRSLLTENIYGYWGLVLGEVIYTFPHALMILLSALSMSDARLFDAASSLGASSWRTFRSVTWSSSRHGIFAALCLVFTLTITDFGIPVVVGGDYQVLALEAYKAVLGQQQFGRGALIGMLLLLPALLTFGVDVWLRKRQRDAMSSRAQFYLPKANFQRDTLYLIFVMLICALFLLVFGTAVYSSFIQFWPYNLSFSLRHYNFEGLPGGWLAYTNSIILAFYTATIGCFLIFMGAYLIEKTASHSWLNNLLRMLSFVPMAVPGLVLGLGYVFFFNLPNNPLNFLYGSMVLLVLCSIAHFFTTAYMTASTALRQLDKEFEAASLSLKAPLYRHFWRITIPLCLPALLDIYRYLFVSAMTTVSAAIFLYSPDTILAAVAVLNMDDAGNIGGAAAMSTLILTTSAGVSILLSIASQGVLRRTQAWHQREAKQ >NZ_CP017085.1|WP_023843642.1|322416_323424_+|putative-2-aminoethylphosphonate-ABC-transporter-substrate-binding-protein MLKKLILATSLLFSAGTVFAATEITVYTAIESEQLQAYKQAFEAKYPDIKIKWVRDSTGIITAKLLAEKDRPQADVVWGLAASSLAILKAQNMLEPYAPAQLDDIDVKFRDSNNPPTWVGMDVWAATICYNTIEAQKLGLSKPTSWQDLTKPEYKGKIVMPNPASSGTGFLDVSAWLQIFGEQEGWAYMDKLHQNIGQYVHSGSKPCKMAASGEYPIGISFEYPALQLKRQGAPLDIILPQEGLGWDIEATAIIKGTNKRDAAQKLADFSASKEAMKLYSANFAVLANTSVPVSQTELPRDYAQRLIKNDFIWAAEKRDTILTEWRKRYDGKSAK >NZ_CP017085.1|WP_017628743.1|323488_324616_+|TIGR03364-family-FAD-dependent-oxidoreductase MKFDIAVIGAGIIGLSHAYAAAQRGLRVAIFERSYTPVGASVRNFGHGLILGQAPGKMLDLAKNSREIWATMAKQAKFLTRQKGTYLLARTQSEQAVLEAFVDGRAKTYGYDCELLSKTQLAMVYGGQLQHHKAALHGKEDQVLFSREAIPQLAAYLGSLANVTSYFSTLVRDIDVDTGTLITSNGTFSAEKIIVCSGHDYQTLLADEIKKLDPIVCRLQMLRVTAEQNIGLAHALMTGLSCTHYGAFADLPEAQALAKEIKMQSPLIEQYGIHLLITPTPYGDLIIGDSHEYSLDAQPFNSEEVDNLLIELAEHTLGCSVQVKERWQGVYGAKGKEPISILTPSEKVTAVLMRTGLGMSVGPGLGEQNIRQLFD >NZ_CP017085.1|WP_004249808.1|324690_325095_-|DUF1240-domain-containing-protein MVKINSLKMYLIAIFLFSLALFCFYDSIIYYKNYFMMKDRILFSFQTGLFFFAAPLIIYFSYLIFICGYTKKTQRMNNKVAGICTGIAIVGIVFSFFFSIYVALDLTSKGYFSCYKSSAFAPNEYVIAKEMCKK >NZ_CP017085.1|WP_017628742.1|325122_325410_-|YjeO-family-protein MKIILRTFIFLYFIFLLILINILSISDYEWMIGEGDIDNLCQLPLNGRYVIEPILILIPCILLLFLEKNKKLRWGYVTITVMYIIWSFYLRFNFC >NZ_CP017085.1|WP_012368613.1|325498_326311_-|phosphonoacetaldehyde-hydrolase MNKSVEAVILDWAGTVVDFGSFAPTQIFVDAFAQAFNFKISLSEARGPMGMGKIDHIRALLNEPNIRTRWTAQFGHPPSEEEAQHIYRTFMPLQIAQVVHFAKPIEGALEAISTIRAQGIKIGSCSGYPKAVMDVLVPKAAEYGYQPDCVVASDEIAAGSRPGPWMALKNVIELGVMSVAHCVKVDDAVTGIAEGLNAGMWTVGLSVSGNEFGATFEQYQTMEQAEIENRKRIAENKLRTAGAHYIIDTLANLPAVIEDINQRIANNQKP >NZ_CP017085.1|WP_063073812.1|327185_328319_+|M20-family-metallopeptidase MQHTINSQYDEMVDFLKELVNIDSGSYDKQGVDTVADLLIQRYQKLGFVVEVFENEQLGNNYRLVNKDATNPQIFIAAHLDTVFPKGTVAERPFSIDGSRAYGPGVIDMKASHVLTYYAINALKQSGDLSYQNVEILLNCDEEIGSKTSRHLIEKYAKNKAYALIMEPARANGAIVSARRGVGTYELLIEGKASHSGIAPEAGISAIQELSYKIQALHALSRHDEGLSVNVGLISGGTSVNTVAPHARAEIDVRISTDEQGIEIDKQVREVCSQPVLAGVKLTLKGGINRPPMVKTPESANLIEIIKQQADLIGLAIEDISTGGGSDASFTAGVGTPSVDGLGPIGGYQHSDKEYLDLPSLTERTVLFANVIKRLSQ >NZ_CP017085.1|WP_004246570.1|328328_329735_+|YfcC-family-protein MEKSKKIKWAMPDAFIIIFGIVILAAIATYLIPAGSYQRETVNGLNRVVPNSFNYVAQNPASLMDVFYAIPVGLKQSASIIFLIFMIGGAIAIYDRTRAIDSGINALIVKTKGNYQALIITVAFIFGMLSSLGLAANAVIAFIPIGIALSRSMKLDAITGVAVVYLGYYAGNAVGVLDPTILGTAQTLAEVPLFSGVIFRVVLFAILIVVTIAYIVWYARRIANDPTTSYMYGIAKDDPDYEQPHTQSLDSTFSLRQKLSLVVFIAFIGLFLYGAFEYKWGIEHLSAIFIMMSIVVAAMFKIAPNDYIKTFMKGAQSLVYGALVVGIARAVIVILDEGRVLDSIVQATLVPLQQTSHFWGAQLLYFFNLLFNLLVTSGTGQASIVMPIMVPILDILDLTRQTGVLILKLGDGFTNIITPTSGVLMAVLAVGKVPWTRWVKFVFPILMIWVVIGMAAIGIATAISYGPV >NZ_CP017085.1|WP_012368614.1|329827_330466_-|TetR-family-transcriptional-regulator MKSPKIDRLNVLDTALSLLEKEGIEGLTMRKLADALHIKAASLYWHFDNKQTLIEGMADRIVSEVAVDFHYSQDWKADLKRLATELREAFLQHRDGARVFAGTYVISENVLRINNTLITLIMQSGASAELASNMSMTLLYFILGCCIEQQAITLIDSEILMQKRLAFEQIVRDKYPQTWQVREILFADDFAMRFNFGLEQLVTGFEHQLKTP |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017085_2 | 2837880-2838035 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017085_2
|
2 spacers
spacers of NZ_CP017085_2
>2.1|2837904|42|NZ_CP017085|CRISPRCasFinder ACCATCTGACTCTGATTTAGAATAACTATAACCTGTCGCTAA >2.2|2837970|42|NZ_CP017085|CRISPRCasFinder ATTATCAGATTCCGTTTTCGTATAGGATGCACCCACTAATGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017085_2
The CRISPR arrays of NZ_CP017085_2 >merge|NZ_CP017085|2|2837880-2838035|CRISPRCasFinder ATAATTCCCCTTAGGCTGATATTTACCATCTGACTCTGATTTAGAATAACTATAACCTGTCGCTAAATAATTGCCTTTAGGTTGATATTTATTATCAGATTCCGTTTTCGTATAGGATGCACCCACTAATGCATAATTGCCTTTGGGTTGATAATT >NZ_CP017085|2|1|2837880-2838035|CRISPRCasFinder ATAATTCCCCTTAGGCTGATATTT ACCATCTGACTCTGATTTAGAATAACTATAACCTGTCGCTAA ATAATTGCCTTTAGGTTGATATTT ATTATCAGATTCCGTTTTCGTATAGGATGCACCCACTAATGC ATAATTGCCTTTGGGTTGATAATT
>NZ_CP017085.1|WP_017628013.1|2837281_2837461_+|GhoT/OrtT-family-toxin MSVIATIGIGYLIGAVLSFIITFFLTKDPSLAMRLLSAFLIAITWPLSFPMAIIFSIFG >NZ_CP017085.1|WP_004243612.1|2836170_2836713_-|DUF924-domain-containing-protein MVPYQPVLTFWFEECTPKQWFQKDSAFDKEIKDRFGELCISASRAELASWRESIEGRLGEIIILDQFSRNIWRDTPKAFAQDNMALILAQEAIRLPEYLTLTPVKRKFLIMPFMHSESQKIHQDAIALFSQLNDDDTYQYELRHKEIIDKYGRYPHRNEILGRTSTPEELAFLQQPGSSF >NZ_CP017085.1|WP_004243611.1|2835278_2836055_+|dimethyl-sulfoxide-reductase-anchor-subunit MHELPLVFFTVLGSSAAGLFLIAYISKKLGQIDEQQLRNANILALILMLVGLGIGGLHVGQPLRFFNMLLGVGRSPMSNEAFLSGVFTGFAFATVALTIMKKWRGLREICNLFTVIFGLAFVWSIPQVYHIPTIANWNTDYTTLQFWMTLLIGGGVLAMVSGARRLGALSFIIGAIITFAARSGYVSFLSFNGPELSAEQSLFWGFQLAVLALGIVVVGFSALKAQTSKVTLATCAAAVVIAELSGRIAFYNLWHITM >NZ_CP017085.1|WP_004243609.1|2834657_2835275_+|dimethylsulfoxide-reductase-subunit-B MKQYGFYFDSTKCTGCKTCQVSCKDEKDLDLGPKFRRVYEYGGGSWAKQDGIWTQNIYSYYLSISCNHCSNPTCVAGCPTGAMHKREEDGLVVVNQDVCVGCRYCELRCPYGAPQFDEKKKLMSKCDGCYERVAQGMKPVCVESCPQRALDFDDIEVIRAKHGTECGIAPMPDPSLTNPNIVIKAHKDAKPSGDKTGSVQNAAEV >NZ_CP017085.1|WP_012368081.1|2832207_2834646_+|molybdopterin-dependent-oxidoreductase MSMSKIKNNVSITEMSRRGFIQSAAVLSGAAAVAGTVSLPFSANAQTPQGIRPDETSETIKYSACLVNCGSRCPLKVHVKDGVIRRISNETMFDDSTFGLHQIRPCLRGRSVRWKTYNPDRLKYPMKRVGKRGEGKFERISWDEATSIIADKLKYTIDTYGNEAIYYQYGTGSTGANLHGRTACKRLLSTVGGFLSDYGTYSYSQLTGIVPYVYGDMLESLLTEIENSDLVVMFGHNLAETRMSGGGQFYETLNALDKSKSKVIIIDPRRTDSVTTLGAEWIPIYPGTDAALVAALGYVMIQEGITDEAFLREYCIGWDKQTLPASAPENGSYKDYILGNGPDGIAKTPEWASQLTGISVARIIQLAREIGNARAAWISQGWGIQRTSNGEQACRAIMMLPLMSGHIGRPGTNTGCWGGSIEYPVASFAIPNPVKTQIPTFMWSEAVARGEELTSKNAGVRNKDKLDTGIKFMWCYSSNVIGNQHADLNKTHELLQDESKCEFILVWDNHMTPSAKYADILLPDVTTVETNDLINNSYASGAYHYMVRLQNAIEPLWENRPNYDVLADIAEKLGVKEKFTEGRTYQEWIEYCYNQVKANNPALPSFAETNDMGIVDRKLPPRSAYVALEAFRQDPIANPLKTASGKIEIYSEKLMQDTEGWILPEGDRIPAIPEYCKNEEGVENVTLKEKFPLQMTGFHDKGHVHSTYFNVAMLREAIPHQFWLNPVDAAQRGLKSGDIAEIYNERGRLHIRVKVTDRVLPGVIAVPQGAWRSLDTTGVDTGGCINTLTSWHPSPFAKGNPQHTNLVEVKRA >NZ_CP017085.1|WP_004243606.1|2830598_2831855_+|mechanosensitive-ion-channel-family-protein MQQQLLTWIRQFNEEYAQITSLLLVLLIIFVVALVLHFILHKLVLPKLSKAISKYDQKWQLSFEINKLFSRFAFLIQGVVINIQALLWMGPGKTQEILTTTAQAWCLLFGLLMIFSIMDLCLQIMRNSPSFGRLPLRGIFQSLKLVASVLIGIMIVSLLIGKSPLILLSGLGAMTAVLMLVFKDPIMGLVAGIQLSANNMISLGDWLEMPKYGADGAVVDISLTTVKVRNWDNTVTTIPTYSLISDSFKNWQAMTQSGGRRIKRSLSLDINSIYFLDQENIDKLEKAQLLEPYIKSKVGEISSYNASLCHDHQMPLNQRGMTNVGTFRAYVEAYLKNHPKIHKQMTIMVRQLAPTSEGLPIEIYAFTNTTVWVEYEAIQSDIFDHIFAILPQFGLRIHQSPTGSDVRALKFPTNIDTP >NZ_CP017085.1|WP_017628014.1|2828361_2829999_-|hypothetical-protein MTIETKEERLQKILTAENCKDTAKTPPKPVHPQADEPDTDPDKNTVTEIKYNQIKSSPDEPGNEVKMNGIISYEVEVKDSDLRLAQWSTNPKGILILPNNKDVYTTIVDDHKTKISLTGNRSGVASLQLILRDEDNEDNAYYAPPLQIRVTPAIPNTDCSAANCERFDDLLTINSESMQWPSKWEEVSKSFVVHLQSQEGEDMQNKEVTLVYDKDNSTLLTQPEIYNSEGELSNISKTNKYGIANFKVRFKGTEPKQIAVFYAESENSEDIDNPLKSRNYYVEMTTEKLPSPKVPATLNGILSYHSENYCVNANLILGRDISESTQVGFYFNDQLKMLPCTDKSAVSVRLENQALTNGVHYISFFTVDIFNNICFSRRERIIVDNSLTGECGKQIKNIAPKPCISVTIPQICDRYFNSVNIRLVPSLCLQIKNRVAKLDIQKMVIIFNGYTKVNSSERTLVYRSTLEIYADDPRLGDFLQDTTPSNEPISMIEISEPALESILADALPNIEVGQLGIQVMVFEKNGNCYLCGENMYTVSLRLPCA >NZ_CP017085.1|WP_004243604.1|2827703_2828282_+|HdeD-family-acid-resistance-protein MLDINKNNLSQLTEKLVKKQCTLMSIIAMLGLLAGIICIINPFSSGVVVSVFLGVVFFACAITSIMAAFNSRISSGWSMLITLLAGFIYLFLGYIFITDPLNGMLSLAFIIGYLFIFAGILRLVLGFKQIKDSFYGWFNILVGFLDLVLAYFLLAFGPETSITLVMALIGIQLILSSITILSIASAIKRMTR >NZ_CP017085.1|WP_012368079.1|2826659_2827517_-|D-amino-acid-transaminase MSEIVYLNNQFVPKEQANISVFDRGFLFADAVYEVTAVINGQLIDFEGHFQRLQRSCKALSMPFSLTKEQLKEIHRQLIDKNHLHEGLIYLQVTRGADSSRFFDFPSSLVAPTLVLFVQHSTVVNHPNASKGISVVSVEDIRWQRCDIKTVALLAACLAKHHAHQQGADDAIFIKEGYITEGSSSNFFIVNQQDEIITRPLSQDILPGITRQAIIQLAKEQKLTIIERLFTLEEAKQAKEAFISSATTLIWPVISIDNEKINQGKVGALSQRLREIYLEKAGVKP >NZ_CP017085.1|WP_004250737.1|2826036_2826597_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MSSPSAPIEIISQSIARERKKAGLSLAEIARRAGIAKSTLSQLEAGQGNPSIETLWAICVALNIPFSQLISSPKPEVKVIRKGDGFKISAEKAYYHAFLLSSCPNGAKRDIYTVIAQPGKDRVSDPHSKNVTEHILIISGRAIVGTLDNQQELSPGDYICYPGDVTHVLRALEPDTTAVMIIEHHN >NZ_CP017085.1|WP_017628011.1|2838775_2839432_-|DUF2612-domain-containing-protein MNIQQFDYHSDLLQAILWQYENADKLKSLAHFKADYFHQSTVLFWQNWYRDIFNIDTANDFGLAVWGRILDVPLGIDISPSEKTKIGFGFGKKKANFNANFRRNTDYTLSLTLDQKRMLIRMRYFNLTQSPTVTNINQFLKRFFWRGESKVFVLDPFDMTYMYYVFNFNPDERLRLLLENFDLMPRPSGVGVKYRIITKKAFGYGSYRKNFLKSNFGE >NZ_CP017085.1|WP_017628010.1|2839428_2840616_-|hypothetical-protein MADYRYINNKGVIVPDTAALRKEVEDEFRTVFGQSINLSPETPQGVLATMEIENRDAIVRNNAELANQINPDIAGGIFLDAIWALMGGERINATHSYLSNVEFMGVPGTIIPKGSQALTINGAVFETLTSLIIADTGKITGDMRAKEYGPITCGIGQLNKVASSVLGWEKVNNTTHAIIGRYAESDIKARRRRKQTLAKNTISVAQAITSSLYELAGVNSLSFRENFTDKTLTIDGISLLPHSIYVCVEGGDSHEIANVLLRTKTIGAAFNGDIEINLLEPASGQEYPIKFSRPKEVTIFCKVTVKKSSFDAQTIIPDALEKWSHGEIEGDNGLVVGRDVSPFEISAAVNAVEPHLFVTKVELSTDGKNWHVALIPIAINQIARLPKGAIQVVMV >NZ_CP017085.1|WP_004243617.1|2840608_2840953_-|hypothetical-protein MRTFAINQHNDLVIDAKGDLQICDNDEAVKNLCQHFIKAVRGEMLHKKDKGIPYWSATFSRQVDIPLFEMAFRQRLAEIEEVVAISHFNAFLDNGVLKYQADIRTIYGGFTLHG >NZ_CP017085.1|WP_004243621.1|2840949_2841642_-|hypothetical-protein MSKPNNDIASVGSLAGAFSSAFRHLMMNTDDMLPATVIDYDEKSNRAVIKPLVMMLTTDNQTISRAPVANIPVFRFGGGGFFIRAPIKAGDFGWLKANDRDISLIFQRGGLEDRPNTTRLHTFSDAMFFPDTLKGWVIDGKNIDALVIQSMDGSVCFSLHNDKVVLETPKYEINARETIFTGNVTVNGNYAVNGNSDSQGGVMRHNGKDIGSTHRHSGVQAGKDNTGSPI >NZ_CP017085.1|WP_004243622.1|2841644_2842457_-|hypothetical-protein 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>NZ_CP017085.1|WP_012368088.1|2846153_2846606_-|hypothetical-protein MNDISATGLSLIIQASKTFPAGIPITTFSDEGDPLDLPTVNITQTAVDINGNLVSWSSPTPQTVTINVLAGSEEDENLAILFDANTARRGRRPASDVITLVASYGDGSITTARNGRITDGCRGNSVAGAGRLKSKQYTFIFQDFDRVRAR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017085_3 | 2915609-2916004 | TypeI-E |
I-E:NA
Consensus repeat of NZ_CP017085_3
|
6 spacers
spacers of NZ_CP017085_3
>3.1|2915638|32|NZ_CP017085|CRISPRCasFinder TAGAAACTGCTACCGGTGCGCGTCTGCAGTCT >3.2|2915699|33|NZ_CP017085|CRISPRCasFinder GCGTAGTTGCGGATCATTTTGGTACCAAACCCT >3.3|2915761|32|NZ_CP017085|CRISPRCasFinder TAAGCCAGAATGACAAAGTGAAAGCGATACAA >3.4|2915822|33|NZ_CP017085|CRISPRCasFinder GCGTAGTTGCGGATCATTTTGGTACCAGACCCT >3.5|2915884|32|NZ_CP017085|CRISPRCasFinder TAAGCCAGAATGACAAAGTGAAAGCGATACAA >3.6|2915945|31|NZ_CP017085|CRISPRCasFinder GTGGTCCATGGGGCGCTGCGATAGGTGGCGG >3.7|2915639|34|NZ_CP017085|PILER-CR TAGAAACTGCTACCGGTGCGCGTCTGCAGTCTCG >3.8|2915700|35|NZ_CP017085|PILER-CR GCGTAGTTGCGGATCATTTTGGTACCAAACCCTCG >3.9|2915762|34|NZ_CP017085|PILER-CR TAAGCCAGAATGACAAAGTGAAAGCGATACAACG >3.10|2915823|35|NZ_CP017085|PILER-CR GCGTAGTTGCGGATCATTTTGGTACCAGACCCTCG >3.11|2915885|34|NZ_CP017085|PILER-CR TAAGCCAGAATGACAAAGTGAAAGCGATACAACG >3.12|2915946|33|NZ_CP017085|PILER-CR GTGGTCCATGGGGCGCTGCGATAGGTGGCGGTC >3.13|2915638|41|NZ_CP017085|CRT TAGAAACTGCTACCGGTGCGCGTCTGCAGTCTCGGTTCATC >3.14|2915699|42|NZ_CP017085|CRT GCGTAGTTGCGGATCATTTTGGTACCAAACCCTCGGTTCATC >3.15|2915761|41|NZ_CP017085|CRT TAAGCCAGAATGACAAAGTGAAAGCGATACAACGGTTCATT >3.16|2915822|42|NZ_CP017085|CRT GCGTAGTTGCGGATCATTTTGGTACCAGACCCTCGGTTCATC >3.17|2915884|41|NZ_CP017085|CRT TAAGCCAGAATGACAAAGTGAAAGCGATACAACGGTTCATT >3.18|2915945|40|NZ_CP017085|CRT GTGGTCCATGGGGCGCTGCGATAGGTGGCGGTCGTTCATT |
cas2,cas1,cas6e,cas5,cas7,cse2gr11,cas8e,cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017085_3
The CRISPR arrays of NZ_CP017085_3 >merge|NZ_CP017085|3|2915609-2916004|CRISPRCasFinder,PILER-CR,CRT TAATTTATCCCCGTATACACGGGGAACACTAGAAACTGCTACCGGTGCGCGTCTGCAGTCTCGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACACGCGTAGTTGCGGATCATTTTGGTACCAAACCCTCGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACACTAAGCCAGAATGACAAAGTGAAAGCGATACAACGGTTCATTCCCGTATACACGGGGAACACGCGTAGTTGCGGATCATTTTGGTACCAGACCCTCGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACACTAAGCCAGAATGACAAAGTGAAAGCGATACAACGGTTCATTCCCGTATACACGGGGAACACGTGGTCCATGGGGCGCTGCGATAGGTGGCGGTCGTTCATTCCCGTATACACGGGGAACAC >NZ_CP017085|3|2|2915609-2916004|CRISPRCasFinder TAATTTATCCCCGTATACACGGGGAACAC TAGAAACTGCTACCGGTGCGCGTCTGCAGTCT CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC GCGTAGTTGCGGATCATTTTGGTACCAAACCCT CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC TAAGCCAGAATGACAAAGTGAAAGCGATACAA CGGTTCATTCCCGTATACACGGGGAACAC GCGTAGTTGCGGATCATTTTGGTACCAGACCCT CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC TAAGCCAGAATGACAAAGTGAAAGCGATACAA CGGTTCATTCCCGTATACACGGGGAACAC GTGGTCCATGGGGCGCTGCGATAGGTGGCGG TCGTTCATTCCCGTATACACGGGGAACAC >NZ_CP017085|3|2|2915612-2916004|PILER-CR TTTATCCCCGTATACACGGGGAACACT AGAAACTGCTACCGGTGCGCGTCTGCAGTCTCGG TTCATCCCCGTATACACGGGGAACACG CGTAGTTGCGGATCATTTTGGTACCAAACCCTCGG TTCATCCCCGTATACACGGGGAACACT AAGCCAGAATGACAAAGTGAAAGCGATACAACGG TTCATTCCCGTATACACGGGGAACACG CGTAGTTGCGGATCATTTTGGTACCAGACCCTCGG TTCATCCCCGTATACACGGGGAACACT AAGCCAGAATGACAAAGTGAAAGCGATACAACGG TTCATTCCCGTATACACGGGGAACACG TGGTCCATGGGGCGCTGCGATAGGTGGCGGTCG TTCATTCCCGTATACACGGGGAACAC >NZ_CP017085|3|1|2915618-2916004|CRT CCCGTATACACGGGGAACAC TAGAAACTGCTACCGGTGCGCGTCTGCAGTCTCGGTTCATC CCCGTATACACGGGGAACAC GCGTAGTTGCGGATCATTTTGGTACCAAACCCTCGGTTCATC CCCGTATACACGGGGAACAC TAAGCCAGAATGACAAAGTGAAAGCGATACAACGGTTCATT CCCGTATACACGGGGAACAC GCGTAGTTGCGGATCATTTTGGTACCAGACCCTCGGTTCATC CCCGTATACACGGGGAACAC TAAGCCAGAATGACAAAGTGAAAGCGATACAACGGTTCATT CCCGTATACACGGGGAACAC GTGGTCCATGGGGCGCTGCGATAGGTGGCGGTCGTTCATT CCCGTATACACGGGGAACAC
>NZ_CP017085.1|WP_017627994.1|2914216_2915440_-|alanine-racemase MSLAIRYLALLPLFVITACQQPVNYNPPATQVAQAQPAIVNNSWIEISRSALDFNVKKVQSLLGKQSSLCAVLKGDAYGHDLSLVAPIMIENNVQCIGVTNNQELKEVRDLGFKGRLMRVRNATEQEMAQATNYNVEELIGDLDMAKRLDAIAKQQNKVIPIHLALNSGGMSRNGLEVDNKSGLEKAKQISQLANLKVVGIMSHYPEEDANKVREDLARFKQQSQQVLEVMGLERNNVTLHMANTFATITVPESWLDMVRVGGIFYGDTIASTDYKRVMTFKSNIASINYYPKGNTVGYDRTYTLKRDSVLANIPVGYADGYRRVFSNAGHALIAGQRVPVLGKTSMNTVMVDITSLNNIKPGDEVVFFGKQGNSEITAEEIEDISGALFTEMSILWGATNQRVLVD >NZ_CP017085.1|WP_017627995.1|2911739_2914139_+|membrane-bound-PQQ-dependent-dehydrogenase,-glucose/quinate/shikimate-family MKISHFYRWIVFIILTILALYFTVLGGYLVSLAGSPFYLFTGVMLLIIAACFLSRKKSTLLLFNFLFLITIVWSIWESGFDFWALAPRLDIIFILGLLLIPFTLNNNVYTCRTNKIGLFTLLATTLIIILGSSLTDPHAINGQFTQQQPTNSISPIGVNDNDWPAYGRTQAGIRYSPLTQINSDNVDKLVEKWTFHTGDEKRANDAVEITNEVTPIKIEDNLFLCTPHQYLISLDPATGKEKWRFDSKLQYNKSFQHMTCRGVAYYNQNNSAEFAKSLDVRQPSISDECPEKVFLPVNDGRLIAVNAQTGNACRDFGQNGEINLLASMPYAYLGGYNPTSPPIVTGNTIIIGGSVTDNLSTQEPSGVIRGYDVNSGKLIWVFDTGAEDPNAMPGKETQFVHNSPNAWAPLAYDAQTDVVYIPTGVGTPDIWGGDRHPLKERYANSVLALKGSTGELLWHFQTTHHDLWDMDVPSQPSLVDIKTDKNETIPAIYIVTKTGNVFVLDRRDGTPIVPVTEKPVPTSVKYGPQTQGEHYSPTQPFSALNLAPKNKLQGSDMWGGTMADQLLCRIAFHQLNYEGIYTPPSENGTLVFPGNLGIFEWGGISVNQDRQVAVMNFITLPFISKLYLKDPQDNQAIDAGHGEQGLQPMTGTPYSVDIHPFLSPLGLPCKQPPWGFVAGVDLTKNELVWQQRFGTIRDSLPNLVELPPLKIGVPGLGGAISTAGNVMFVAASQDNYIRAFNVTNGKMLWEARLPAGGQATPMTYSIGGKQYVVIMAGGHGSFGTKMGDSLVAYGLPDNL >NZ_CP017085.1|WP_004247166.1|2911365_2911509_+|type-I-toxin-antitoxin-system-Hok-family-toxin MTKLALIGLITVCITVLCFTLLRHERLCSFNISSGNTLVQANLSCDK >NZ_CP017085.1|WP_004247166.1|2910825_2910969_+|type-I-toxin-antitoxin-system-Hok-family-toxin MTKLALIGLITVCITVLCFTLLRHERLCSFNISSGNTLVQANLSCDK >NZ_CP017085.1|WP_073969838.1|2910284_2910428_+|type-I-toxin-antitoxin-system-Hok-family-toxin MTKLALIRLITVCITVLCFTLLRHERLCSFNISSGNTLVQANLSCDK >NZ_CP017085.1|WP_017627996.1|2907803_2909948_+|phosphate-acetyltransferase MSRTIMLVPTDTRVGLTSVSLGVIRSMEQKGVRLSVFKPIAQPRVKGALDQTTAIIRSHSTIQSAEPLNMDYVESLLSSNKKDVLMEEIVARYHENTADAEVVLIEGLVPMRKHPFAQSLNYEIAKTLGAEIVFVTALGNNTAEQLKERIEFARAEFGGVKNQNITGVIVNKLNAPVDDQGRTRPDLSEIFDDSSKAIISNVDLNTIEKNSPLPLLGCIPWNFDLIATRATDMAKHLNATIINKGDIETRRIKSVTFCARSIPHMLEHFRPGSLLVTSADRPDVLVSACLAAMNGVEIGAILLTGGYQIDAPIKQLCERAFETGLPIFMVNSNTWQTSLNLQSFSLEVPADDHERIEKIQNYVAQHINNQWIDSLTANSERPNRLSPPAFRYQLTELARKAKKRIVLPEGDEPRTVKAASICAERGIATCVLLGDPEEIRRVAAAQGVELGTGIELVNPKEVREIYVPRLVELRKNKGMTEVVAREQLEDNVVLGTLMLEKGVVDGLVSGAVHTTANTIRPPLQLIKTAPGSSLVSSVFFMLLPEQVYVYGDCAINPDPTAEQLAEIAIQSADSAKAFGIDPRVAMISYSTGNSGAGSDVEKVREATRLAQEKRPDLIIDGPLQYDAAVMADVAKSKAPNSPVAGKATVFIFPDLNTGNTTYKAVQRSADLVSIGPMLQGMRKPVNDLSRGALVDDIVYTVALTAIQASQQENA >NZ_CP017085.1|WP_004243716.1|2906523_2907726_+|acetate-kinase MSSKLVLVLNCGSSSLKFAIINPENGEEFLSGLAECFNLPEARLKWKMDGQKHEAALGAGAAHSEALNFIVNTILAEKPELSQQIAAIGHRIVHGGEKFTKSVVITDEVIKGIEAAIPFAPLHNPAHLIGIEEARKAFPHLINKMVAVFDTAFHQTMPEEAYLYALPYSLYKDHSIRRYGAHGTSHFFVSREAAKMLNKPVDELNVITCHLGNGGSVSAIVNGKCVDTSMGLTPLEGLVMGTRSGDIDPAIVFHLHDTLGMSVEDINKLLTKESGLLGLTEVTSDCRYVEDNYETKADAKRAMDVYCHRLAKYIGSYCALMEGRLDAIIFTGGIGENAAMVRELSLKKLALLGFEVDHQRNLDARFGKSGTITTDNSRLAVVIPTNEELVIAQDASRLTA >NZ_CP017085.1|WP_004243712.1|2905676_2906132_-|DUF412-domain-containing-protein MNEPTVTPPGFFKKLRLGNEYLKTWPVEKQLAPVFPENRMIKATRFGIRYMPPIAIFTLTWQIALGGDLGPAITTALFACSLPMQGLWWLGKRAATPLPAVLLNWFYEIREKFEQAGIALAPVEKTPTYLSLAHLLKRAFKQLDRSFLDDV >NZ_CP017085.1|WP_023843594.1|2905041_2905536_-|YfbU-family-protein MEMTHAQRLILSNQYKMMTMMDPDNAERYRRYQTIIERGYGLQLRELDRDFDEMSEETCRTIINIMEMYHALQVSRENLKSPEMPDARRVAFMGFDAATESRYLSYVRFMVNTEGRYTHFDSGSHGFNSQTPMWEKYQRMLAVWLACPRQYHLSSVEIQQILNA >NZ_CP017085.1|WP_012368105.1|2904344_2905007_-|sugar-phosphatase 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MYLSRISIDYSADYLHSLLANKLPDGYTIHQLLWRLFTEEKERSFLYRLEIGKNGKPIFYILSSIAPTTKNNFFKIETKPFLPKLVKKMKLAFSLRANPTVCITDKEGKRQRHDVLMHAKKQAQLDGKDYSHDDIHHLMQQAALNWISSDDRLNKWGISLTQLPDIKAYTPERIKKPSGKIMSFSSVDYQGVLTIEEPHLFWQQYQQGFGRAKAFGCGLMLIRNI >NZ_CP017085.1|WP_017627990.1|2917959_2918697_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas5/CasD MAQYLVFRLYGPLASWGLPAVGGDRQTGIAPSRSAILGLLSASLGINRKDESKLLQLQQSVLVATKQLVPSMLLRDFHTAQVPSKRKNITHPTRRSELAEKDQNTILSSRDYRCDAIWIIAIKLTGHSQYTLEQLKNALLKPVYILSLGRKSCPLSLPMMPKIVEVEQLKEALDTQFPYITTSDKADSYWFHSDGWVTYFWEGNYQDIKGENIMTLYPWDDPINRQHWQFRQRKMYQMSVKRESE >NZ_CP017085.1|WP_017627989.1|2918709_2919744_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cse4/CasC MSQFIQLHILTSYAPSNLNRDDLGRPKTAIMGGFERLRISSQSLKRHWRTSELFNIALSGNIGIRTKKFGLQLYDALIEGGVSEKNAKKWVGLIIEQYGKIKKDSIETEQLVHISHLEKSLAFDLINLLIKEQREPTKQELESLKTINTSVDIALFGRMLASAPKYNIEAACQVAHAISVHSTVIEDDYFTAVDDLNNGETDTGSAHIGEAGFAAALFYSYICINKTQLIESLDGNEELANKAIQALTEVAIKVSPTGKQNSFASRAYASYVLAEKGSYQPRSLSVAFLKPIDDEDMENAAINALKFRMENFDKVYGTCAESRYQLNAVQGEGSLSGLLQFVAE >NZ_CP017085.1|WP_017627988.1|2919810_2920398_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse2/CasB MGSYKSKNITLYNYPELKINVLRWWESLFLSPNELSKKGILPAPNRYKSELKRCDSITAIMLTEGFRALWLSFPVDLINNATTEDIERWAIIVAILVYITQDSEKHFATIAGEKDESKKSCISESRFLQLQSSRTYDEFIRRLRRILIQIKGKSSVLSMCKDIEKWVLEKQRFSSIQTNKQIIIEWAMKYYQAAI >NZ_CP017085.1|WP_017627987.1|2920384_2921983_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse1/CasA MNIINQPWLPFRFRDGEIKTLPISAISHPDIIDFSLNRADFKGAAYQFAIGLLQTIFAPEDEDEWEEYFETPPSSKKLQSAFDKVAHAFNIMGDGPLFMQDFSTLEEQKNIPIAQLLIDAPGENGIKQNTDHFIKQGIADVMSLEMAVLALFTLQINAPSGGKGHLVSLRGGGPLTTLVYPAEENSTLWQKLWLNVINREFWEYDEPNFDDGSVFPWLIPLNLKEGKGEKVSPDDVHPLYMYWAMPRRIRLKVENKSVTCQISDMKSNFSVKYYVTKNYGLDYQEGWLHPLTPYYWDPKKPEMFPNSIKGRQGGIHYNLWDRLFLSSNENGQKSATVVSHYLKLYQLLEFTRKPRLLIFGYDMDNMKPRGWYNLEMPIFHVKDEYNNKIINEIKIIQKLTIDCLRSVKEQVKKAWFSSPKDMKGDISFIDLTFWQRSENIFFEVVQNIIVQIQKNDFLTHEQAKKWLNSIRKISISIFDEYALSALGTQKSVSGCIKARNGLIKDLYSNKRIKKFAEDFKITKENGEQYGIL >NZ_CP017085.1|WP_017627986.1|2921979_2924673_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MDKDYYSYWGKFKSENNHEYYHLLPYHSLDVAAVGMILFPENSKIIKDISTFLQIHPKEFSKLFLLLLSLHDVGKFSSSFQYINPNIIDKLKVPESRFSYDGNNYRHDRLGYYFWRKIKNTIFSSIIISNADYKERKISDGFWIIFETALGHHGKPINKNNIDESIENYIHKDNDKAAIDFTLDILKLFSPKLSVENFYDKGWKERLKQISWLLAGMVTLSDWIGSNRDYFPYYKKKIPLSEYWFLALNRAKKAVLSSGFNRNYQISPFISVEYHFGYKPTPLQQWAEKVTINEHPQLFILEDTTGSGKTEAALTLAHRLMEVDAADGFYFGLPTQATSNAMFLRIINHYKKIFDEKKEVPSIVLAHSASNMNEQFTKIIRDGNERYNISDNTASAQCYQWLSDSRKKALLATIGVGTLDQALLSMLPRRHQSLRLLGLNRKIIIFDEIHSADEFMFEIIEKLLSTHLHQGGSVILLTATLSLKQRKRIIDSWFNAFDQISPEIESKSFPLATHLTCFPKVIKKEYPLKSRNQVSRKVKVEIINKEEQCIDIIISAINNGNCVVWIRNTVNDAIKSYYDIKKRLSKDNNCLLFHSRFNLKDRKIREEQVLKYFGKNSTAQQRKGTVLIATQVFQESLDADADIMISDICPIDDLIQRSGRLHRHTRTKYGDYTSETIDKRRPPILYVHAPLFIETPSSCWLTEQFSSTEAVYRSPGRLWLTLRSLTRLGEINMPKDARKLIESVYSDNAYNEIPQSLIQKENNDIGEKKARVSKAKIQLLKITKGYSEESSEFWTEDHYDISTRYSDIEMVNILLLKKIKDNYVPWIEDSHFSIALSTVKISKKKYADKLVSVPQEVIDTINKQYPQARYLQLWIPDEDQYYQYDHLIGFCERQELS >NZ_CP017085.1|WP_004243721.1|2925991_2927248_-|PTS-ascorbate-transporter-subunit-IIC MDFFRFLMSDVLSEPAILVGLIALIGLIAQKKPATECIKGTVKTIMGFVILGAGAGLVINSLGDFSTIFQHAFGIQGVVPNNEAIVSIAQKSFGKEMALIMFFAMLINILIARLTPWKYIFLTGHHTLFMSMMVAVILATAGLEGAVLVAVGSLVVGVSMVFFPAIAHPYMKKITGSDDVALGHFSTISYVVSGFIGSKFGNKAHSTEEMNVPKSLLFLRDTPVAIAFTMGIIFIITCLFAGDTFVREVSGGKNWFMFSLMQSITFAAGVYIILQGVRMVIAEIVPAFKGISDKLVPNAKPALDCPVVFPYAPNAVLVGFLSSFAAGVIGMFILYALDWTVIIPGVVPHFFVGATAGVFGNATGGRRGAILGAFAQGLLITFLPVFLLPVLGDIGIANTTFSDADFGVIGILLGIIVR >NZ_CP017085.1|WP_012368108.1|2927258_2927546_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIB MKITVVCGNGLGSSLMMEMSIKSILKDLAVNADVDHVDLGSAKGTPSDIYVGTRDIAEQLNAQAVNGKIVSLDNMIDKVAMKEKLSTALRELGAL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP017085_4 | 2924918-2925861 | TypeI-E |
I-E
Consensus repeat of NZ_CP017085_4
|
15 spacers
spacers of NZ_CP017085_4
>4.1|2924947|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCATTGTTCATTGCCTCGTCCTCAGCCCATT >4.2|2925008|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGTGTGTACATGTGTTTGGTCATCACGTTCG >4.3|2925069|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAGCCATACAGTCAGAAAGTCTTTGAAGATG >4.4|2925130|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCCTCGGATATCATTGCGAACAATCATTTCAC >4.5|2925191|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGCAATCAATGCAACCTGTGAATATTCGATA >4.6|2925252|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGCAATCAATGCAACCTGTGAATATTCGATA >4.7|2925313|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCAAATAAGATGGCAAAGCGGAACGGTTCCC >4.8|2925374|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAACCAAGCCTTAAAAGGTCGTCTGCGCATT >4.9|2925435|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGAAATCCCTGAACAAGATGCGGTTTACAC >4.10|2925496|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTCGAACACCATTTAATAAAACATTGTAAAA >4.11|2925557|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAACGGTTATAAACATCTAAAGTCATTAACG >4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTCTGTTTTGCTGAGAGAAACGTAATCAA >4.13|2925679|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACAGAAATAACAGCTGCGATACGTTCTATTT >4.14|2925740|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCAGCAGGTAATGATTGAATTGCTAACATTG >4.15|2925801|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCTTACACTGTTGATGACGATGCTATTCGTA |
cas3,cas8e,cse2gr11,cas7,cas5,cas6e,cas1,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017085_4
The CRISPR arrays of NZ_CP017085_4 >merge|NZ_CP017085|4|2924918-2925861|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGATTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACCTCATTGTTCATTGCCTCGTCCTCAGCCCATTCGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACTGGTGTGTACATGTGTTTGGTCATCACGTTCGCGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACTCAGCCATACAGTCAGAAAGTCTTTGAAGATGCGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACGCCTCGGATATCATTGCGAACAATCATTTCACCGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACCTGCAATCAATGCAACCTGTGAATATTCGATACGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACCTGCAATCAATGCAACCTGTGAATATTCGATACGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACTGCAAATAAGATGGCAAAGCGGAACGGTTCCCCGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACATAACCAAGCCTTAAAAGGTCGTCTGCGCATTCGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACAAAGAAATCCCTGAACAAGATGCGGTTTACACCGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACAGTCGAACACCATTTAATAAAACATTGTAAAACGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACTAAACGGTTATAAACATCTAAAGTCATTAACGCGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACTTTTTCTGTTTTGCTGAGAGAAACGTAATCAACGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACAACAGAAATAACAGCTGCGATACGTTCTATTTCGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACTTCAGCAGGTAATGATTGAATTGCTAACATTGCGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACTTCTTACACTGTTGATGACGATGCTATTCGTACGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC >NZ_CP017085|4|3|2924918-2925861|PILER-CR CGATTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC CTCATTGTTCATTGCCTCGTCCTCAGCCCATT CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TGGTGTGTACATGTGTTTGGTCATCACGTTCG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TCAGCCATACAGTCAGAAAGTCTTTGAAGATG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GCCTCGGATATCATTGCGAACAATCATTTCAC CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC CTGCAATCAATGCAACCTGTGAATATTCGATA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC CTGCAATCAATGCAACCTGTGAATATTCGATA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TGCAAATAAGATGGCAAAGCGGAACGGTTCCC CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC ATAACCAAGCCTTAAAAGGTCGTCTGCGCATT CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC AAAGAAATCCCTGAACAAGATGCGGTTTACAC CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC AGTCGAACACCATTTAATAAAACATTGTAAAA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TAAACGGTTATAAACATCTAAAGTCATTAACG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TTTTTCTGTTTTGCTGAGAGAAACGTAATCAA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC AACAGAAATAACAGCTGCGATACGTTCTATTT CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TTCAGCAGGTAATGATTGAATTGCTAACATTG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TTCTTACACTGTTGATGACGATGCTATTCGTA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC >NZ_CP017085|4|3|2924918-2925861|CRISPRCasFinder CGATTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC CTCATTGTTCATTGCCTCGTCCTCAGCCCATT CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TGGTGTGTACATGTGTTTGGTCATCACGTTCG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TCAGCCATACAGTCAGAAAGTCTTTGAAGATG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GCCTCGGATATCATTGCGAACAATCATTTCAC CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC CTGCAATCAATGCAACCTGTGAATATTCGATA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC CTGCAATCAATGCAACCTGTGAATATTCGATA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TGCAAATAAGATGGCAAAGCGGAACGGTTCCC CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC ATAACCAAGCCTTAAAAGGTCGTCTGCGCATT CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC AAAGAAATCCCTGAACAAGATGCGGTTTACAC CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC AGTCGAACACCATTTAATAAAACATTGTAAAA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TAAACGGTTATAAACATCTAAAGTCATTAACG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TTTTTCTGTTTTGCTGAGAGAAACGTAATCAA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC AACAGAAATAACAGCTGCGATACGTTCTATTT CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TTCAGCAGGTAATGATTGAATTGCTAACATTG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TTCTTACACTGTTGATGACGATGCTATTCGTA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC >NZ_CP017085|4|2|2924918-2925861|CRT CGATTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC CTCATTGTTCATTGCCTCGTCCTCAGCCCATT CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TGGTGTGTACATGTGTTTGGTCATCACGTTCG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TCAGCCATACAGTCAGAAAGTCTTTGAAGATG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GCCTCGGATATCATTGCGAACAATCATTTCAC CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC CTGCAATCAATGCAACCTGTGAATATTCGATA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC CTGCAATCAATGCAACCTGTGAATATTCGATA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TGCAAATAAGATGGCAAAGCGGAACGGTTCCC CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC ATAACCAAGCCTTAAAAGGTCGTCTGCGCATT CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC AAAGAAATCCCTGAACAAGATGCGGTTTACAC CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC AGTCGAACACCATTTAATAAAACATTGTAAAA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TAAACGGTTATAAACATCTAAAGTCATTAACG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TTTTTCTGTTTTGCTGAGAGAAACGTAATCAA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC AACAGAAATAACAGCTGCGATACGTTCTATTT CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TTCAGCAGGTAATGATTGAATTGCTAACATTG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TTCTTACACTGTTGATGACGATGCTATTCGTA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC
>NZ_CP017085.1|WP_017627986.1|2921979_2924673_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MDKDYYSYWGKFKSENNHEYYHLLPYHSLDVAAVGMILFPENSKIIKDISTFLQIHPKEFSKLFLLLLSLHDVGKFSSSFQYINPNIIDKLKVPESRFSYDGNNYRHDRLGYYFWRKIKNTIFSSIIISNADYKERKISDGFWIIFETALGHHGKPINKNNIDESIENYIHKDNDKAAIDFTLDILKLFSPKLSVENFYDKGWKERLKQISWLLAGMVTLSDWIGSNRDYFPYYKKKIPLSEYWFLALNRAKKAVLSSGFNRNYQISPFISVEYHFGYKPTPLQQWAEKVTINEHPQLFILEDTTGSGKTEAALTLAHRLMEVDAADGFYFGLPTQATSNAMFLRIINHYKKIFDEKKEVPSIVLAHSASNMNEQFTKIIRDGNERYNISDNTASAQCYQWLSDSRKKALLATIGVGTLDQALLSMLPRRHQSLRLLGLNRKIIIFDEIHSADEFMFEIIEKLLSTHLHQGGSVILLTATLSLKQRKRIIDSWFNAFDQISPEIESKSFPLATHLTCFPKVIKKEYPLKSRNQVSRKVKVEIINKEEQCIDIIISAINNGNCVVWIRNTVNDAIKSYYDIKKRLSKDNNCLLFHSRFNLKDRKIREEQVLKYFGKNSTAQQRKGTVLIATQVFQESLDADADIMISDICPIDDLIQRSGRLHRHTRTKYGDYTSETIDKRRPPILYVHAPLFIETPSSCWLTEQFSSTEAVYRSPGRLWLTLRSLTRLGEINMPKDARKLIESVYSDNAYNEIPQSLIQKENNDIGEKKARVSKAKIQLLKITKGYSEESSEFWTEDHYDISTRYSDIEMVNILLLKKIKDNYVPWIEDSHFSIALSTVKISKKKYADKLVSVPQEVIDTINKQYPQARYLQLWIPDEDQYYQYDHLIGFCERQELS >NZ_CP017085.1|WP_017627987.1|2920384_2921983_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse1/CasA MNIINQPWLPFRFRDGEIKTLPISAISHPDIIDFSLNRADFKGAAYQFAIGLLQTIFAPEDEDEWEEYFETPPSSKKLQSAFDKVAHAFNIMGDGPLFMQDFSTLEEQKNIPIAQLLIDAPGENGIKQNTDHFIKQGIADVMSLEMAVLALFTLQINAPSGGKGHLVSLRGGGPLTTLVYPAEENSTLWQKLWLNVINREFWEYDEPNFDDGSVFPWLIPLNLKEGKGEKVSPDDVHPLYMYWAMPRRIRLKVENKSVTCQISDMKSNFSVKYYVTKNYGLDYQEGWLHPLTPYYWDPKKPEMFPNSIKGRQGGIHYNLWDRLFLSSNENGQKSATVVSHYLKLYQLLEFTRKPRLLIFGYDMDNMKPRGWYNLEMPIFHVKDEYNNKIINEIKIIQKLTIDCLRSVKEQVKKAWFSSPKDMKGDISFIDLTFWQRSENIFFEVVQNIIVQIQKNDFLTHEQAKKWLNSIRKISISIFDEYALSALGTQKSVSGCIKARNGLIKDLYSNKRIKKFAEDFKITKENGEQYGIL >NZ_CP017085.1|WP_017627988.1|2919810_2920398_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse2/CasB MGSYKSKNITLYNYPELKINVLRWWESLFLSPNELSKKGILPAPNRYKSELKRCDSITAIMLTEGFRALWLSFPVDLINNATTEDIERWAIIVAILVYITQDSEKHFATIAGEKDESKKSCISESRFLQLQSSRTYDEFIRRLRRILIQIKGKSSVLSMCKDIEKWVLEKQRFSSIQTNKQIIIEWAMKYYQAAI >NZ_CP017085.1|WP_017627989.1|2918709_2919744_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cse4/CasC MSQFIQLHILTSYAPSNLNRDDLGRPKTAIMGGFERLRISSQSLKRHWRTSELFNIALSGNIGIRTKKFGLQLYDALIEGGVSEKNAKKWVGLIIEQYGKIKKDSIETEQLVHISHLEKSLAFDLINLLIKEQREPTKQELESLKTINTSVDIALFGRMLASAPKYNIEAACQVAHAISVHSTVIEDDYFTAVDDLNNGETDTGSAHIGEAGFAAALFYSYICINKTQLIESLDGNEELANKAIQALTEVAIKVSPTGKQNSFASRAYASYVLAEKGSYQPRSLSVAFLKPIDDEDMENAAINALKFRMENFDKVYGTCAESRYQLNAVQGEGSLSGLLQFVAE >NZ_CP017085.1|WP_017627990.1|2917959_2918697_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas5/CasD MAQYLVFRLYGPLASWGLPAVGGDRQTGIAPSRSAILGLLSASLGINRKDESKLLQLQQSVLVATKQLVPSMLLRDFHTAQVPSKRKNITHPTRRSELAEKDQNTILSSRDYRCDAIWIIAIKLTGHSQYTLEQLKNALLKPVYILSLGRKSCPLSLPMMPKIVEVEQLKEALDTQFPYITTSDKADSYWFHSDGWVTYFWEGNYQDIKGENIMTLYPWDDPINRQHWQFRQRKMYQMSVKRESE >NZ_CP017085.1|WP_017627991.1|2917282_2917960_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas6/Cse3/CasE 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MKISHFYRWIVFIILTILALYFTVLGGYLVSLAGSPFYLFTGVMLLIIAACFLSRKKSTLLLFNFLFLITIVWSIWESGFDFWALAPRLDIIFILGLLLIPFTLNNNVYTCRTNKIGLFTLLATTLIIILGSSLTDPHAINGQFTQQQPTNSISPIGVNDNDWPAYGRTQAGIRYSPLTQINSDNVDKLVEKWTFHTGDEKRANDAVEITNEVTPIKIEDNLFLCTPHQYLISLDPATGKEKWRFDSKLQYNKSFQHMTCRGVAYYNQNNSAEFAKSLDVRQPSISDECPEKVFLPVNDGRLIAVNAQTGNACRDFGQNGEINLLASMPYAYLGGYNPTSPPIVTGNTIIIGGSVTDNLSTQEPSGVIRGYDVNSGKLIWVFDTGAEDPNAMPGKETQFVHNSPNAWAPLAYDAQTDVVYIPTGVGTPDIWGGDRHPLKERYANSVLALKGSTGELLWHFQTTHHDLWDMDVPSQPSLVDIKTDKNETIPAIYIVTKTGNVFVLDRRDGTPIVPVTEKPVPTSVKYGPQTQGEHYSPTQPFSALNLAPKNKLQGSDMWGGTMADQLLCRIAFHQLNYEGIYTPPSENGTLVFPGNLGIFEWGGISVNQDRQVAVMNFITLPFISKLYLKDPQDNQAIDAGHGEQGLQPMTGTPYSVDIHPFLSPLGLPCKQPPWGFVAGVDLTKNELVWQQRFGTIRDSLPNLVELPPLKIGVPGLGGAISTAGNVMFVAASQDNYIRAFNVTNGKMLWEARLPAGGQATPMTYSIGGKQYVVIMAGGHGSFGTKMGDSLVAYGLPDNL >NZ_CP017085.1|WP_004243721.1|2925991_2927248_-|PTS-ascorbate-transporter-subunit-IIC 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MIKTRKRRNTGRVTLQEVAKHAGVGSMTVSRALRTPELVSDKLREKVNQAVAELGYIPNASAGALASAQSHIIAVLLPSFTDKASADFMQSLQQILSRHHYQILVGCYEYQLHKATDVINMLLQSNPAALVAFGSQLSDVQFLHISNANVPVVSVASQSNEQSAISIDCGYEKAAFDLTHYLIQQGKRCVGYVGALQGQRLHHQQITGWSRALLKNYLNAEQSVTTPDPASMAYGRQALTEILLRQPELDAVICSHESIALGMMFECQRRLIKIPQDLAIACLEGSENSAQIAPSLTSIHFNYHKIGKEAGKHLIALLQHLRDEVDNAMFENTVINYAYRLELGQSTP >NZ_CP017085.1|WP_004243726.1|2929288_2929831_-|NUDIX-hydrolase-YfcD MEQENTAVVEWVDIVDEKNEVVAQATRQQMRAENLRHRATYIVVHDGMGKILAQRRTETKDFYPGWLDATAGGVVQQGENALESARREAEEELGIAGVPFAEHGQFYYDDESCRVWGSLFSCVSHGPFALQPEEIEEVCWLTPLEITERCDEFTPDSLKALSLWLTRNNSTRLDTKETTD >NZ_CP017085.1|WP_017627984.1|2930027_2930642_+|thiol:disulfide-oxidoreductase MIDLYYANTPNGQKITLFLEEVAMPYTLHHVDIGKGDQFKPEFLAISPNNKIPAIVDNAPADGGEPLSIFESGAILIYLAEKSGKLLSHDLREKMTQLQWLFWQVGGFGPILGQNHHFTRYAPEKVPYAINRYTKETERLYQVLESRLAQSPYLGGNDYSIADIATYTWARYHDTHHIDLADYPAVEKWLNTISQRPAAKKLFG >NZ_CP017085.1|WP_017627983.1|2930706_2931612_+|TIGR01777-family-protein MNILITGGTGLIGRALICQLALDKHNITVLSRSPQKVYSHFCNEMACWTHLDDKENLNQFDAVINLAGEPIADKRWTPEQKQTLVNSRCKLTQKLVDLIKASDSPPSVLISGSAVGFYGDQGENNVTEETPPKDEFTHQLCAKWENIALDAQTPLTRVCLLRTGIVLSTKGGALPKMSPPFKLGLGGKLGNGKQYMPWIHIDDMVNAIVFLLNNNNTQGAFNLTAPHPVQNKAFTTTLAHVLKRPAFMTIPATILKLMMGESATLVLGGQQAFPKKLLDAGFSFRYPQLEGALEDIIRHKK >NZ_CP017085.1|WP_004243729.1|2931631_2932213_-|UbiX-family-flavin-prenyltransferase MKKLIVGLTGASGAIYGIRLLEILKSVPTVETHLVISQAARRTISLETDYSLKDIHALADIIYDDRDIGATISSGSFRVNGMVILPCSIKSLSGIVHSYTDTLVTRAADVVLKEGRKLVLCVRETPLHLGHLRLMTQAAELGAIIMPPVPAFYFQPKTIDDIVNQTVNRVLDQFDIDLPDDLFQRWQGDKPAR >NZ_CP017085.1|WP_004243730.1|2932334_2933852_-|amidophosphoribosyltransferase MCGIVGIAGVNPVNQSIYDALTVLQHRGQDAAGIATIDENNGFRLRKANGLVKDVFETRHMLRLKGTIGIGHVRYPTAGSSSASEAQPFYVNSPFGITLAHNGNLTNAHLLRRQLFETARRHINTTSDSEILLNVLAYELDRFDHFPLEPDNIFTAVAAMHKKLRGAYACVALIIGHGLLAFRDPYGIRPLVLGKRTLEDGRSEYMVASESVALDTLGFEFLRDVAPGEAVYITEQGQLFTRQCAENPQLVPCLFEYVYFARPDSFIDKISVYNARLRMGQKLGAKIAKEWEDLQIDVVIPIPETSCDIALEIAHILNKPYRQGFVKNRYVGRTFIMPGQQERRKSVRRKLNANRAEFRDKNVLLIDDSIVRGTTSEQIVELAREAGAKKVYFASAAPEVRFPNVYGIDMPNANELIAHGREVDEIRKLIGADGLIFQDLSDLIAAVQEENPDINQFECSVFDGVYITKDIDQGYLDYLENLRRDDEHKIRDQHEAENLEIYNEG >NZ_CP017085.1|WP_004243731.1|2933882_2934374_-|colicin-V-production-protein MVWIDYAIIAIIGFSALVSLIRGFVREALSLITWGCGFFVASQFYPYLAVYFTRFEDELVRNGIAIVTLFIATLIVGAVINYVISSLVQRTGLSGTDRVLGICFGALRGVLIVSALLFVLGAFTPMADSADWQRSELIPQFNHIIRWFFDYLQNASSFVSEKM |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017085_5 | 3169782-3169924 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017085_5
|
2 spacers
spacers of NZ_CP017085_5
>5.1|3169805|37|NZ_CP017085|CRISPRCasFinder TGGCGCTGGTAATGTCATTAAATCTGATGTTACACAA >5.2|3169865|37|NZ_CP017085|CRISPRCasFinder CGGCATAGCAAATGTAATAAAACATAACTCTAATTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017085_5
The CRISPR arrays of NZ_CP017085_5 >merge|NZ_CP017085|5|3169782-3169924|CRISPRCasFinder GGTGATATCAATTTCACAGGTGGTGGCGCTGGTAATGTCATTAAATCTGATGTTACACAAGGTGATATCAATTTTACAGGTGGCGGCATAGCAAATGTAATAAAACATAACTCTAATTATGGTAATACCAACTTTACTGGTGG >NZ_CP017085|5|4|3169782-3169924|CRISPRCasFinder GGTGATATCAATTTCACAGGTGG TGGCGCTGGTAATGTCATTAAATCTGATGTTACACAA GGTGATATCAATTTTACAGGTGG CGGCATAGCAAATGTAATAAAACATAACTCTAATTAT GGTAATACCAACTTTACTGGTGG
>NZ_CP017085.1|WP_004244072.1|3167866_3168070_+|hypothetical-protein MIHIPASGFIYMASIIKSMLENPCINKEFEKLIAADLLPILQNETNMTENFTALHLIKKTNNRRIIL >NZ_CP017085.1|WP_004244067.1|3164448_3167046_-|bifunctional-aconitate-hydratase-2/2-methylisocitrate-dehydratase MLEEYRKHVAERAAEGVVPKPLDATQTAALVELLKSPPKGEEEFLLDLIVNRVPPGVDEAAYVKAGFLTALAKGETTSPLITPEKAVELLGTMQGGYNIHALIEALDNDKLAPIAAKALSHTLLMFDSFYDVEEKAKAGNVYAKQIMQSWADGEWFTERPELAEKITVTVFKVTGETNTDDLSPAPDAWSRPDIPLHALAMLKNAREGIEPDQPGSVGPIKQIEALNKKGFPLAYVGDVVGTGSSRKSATNSVLWFMGDDIPYVPNKRGGGVVLGGKIAPIFFNTMEDAGALPIEVDVSKLNMGDVIDIYPYKGEIRNHETNELLETFALKTEVLIDEVRAGGRIPLIIGRGLTSKARSALGLPPSTLFRHAKAVEQSDRGFSLAQKMVGRACGRDGIRPGEYCEPKMTSVGSQDTTGPMTRDELKDLACLGFSADLVMQSFCHTAAYPKPVDVTTHHTLPDFIMNRGGVSLRPGDGIIHSWLNRMLLPDTVGTGGDSHTRFPIGISFPAGSGLVAFAAATGVMPLDMPESVLVRFKGKMQPGVTLRDLVHAIPLYAIKEGLLTVEKKGKKNIFSGRILEIEGLPELKVEQAFELADASAERSAAGCTIKLDKAPIIEYLQSNIVLLKWMIAEGYGDRRTLERRITAMENWLADPQLLEADADAEYAAVIEIDLNEIKEPILCAPNDPDDARLLSEVANSKIDEVFIGSCMTNIGHFRAAGKLLDQHKGQLPTRLWVAPPTKMDAAQLTEEGYYSVFGKSGARIEVPGCSLCMGNQARVADGATVVSTSTRNFPNRLGTGANVYLASAELAAVASLLGRLPEPQEYLDFINKVDETAEDTYRYLNFDQLEQYTDKATQVIFQTTV >NZ_CP017085.1|WP_004244066.1|3163906_3164278_-|YacL-family-protein MDYEFQRDLTGGILARFSMDHEAIGYWLNDEIQGDISLIDQILTEMDEVKGSEKQWQLIGKEYSLSIDDEEIMVRANTLHFETDDLEEGMSYYDNESIAFCGLDDFATMLQKYRLFILENRRS >NZ_CP017085.1|WP_004248539.1|3162954_3163815_-|small-conductance-mechanosensitive-channel-MscS MNELPASLDEATGWFVANQELFIQYAVNIVAAFLILFIGLFVAKMVSKGVARILTLRHIDATVVTFLSVLVRYTVIAFTLIAVLGRLGVQTASVIAVLGAAGLAVGLALQGSLSNFAAGVLIVIFRPIRAGEYVMIGAVEGTVRDVQIFSTTLRSADDRIIVIPNSKIISSEVINLSREPNRRTQIIVGVAYDADIDKVKKVLGDVVAQDKRIQHNQGVTIRLHEMAPSSLNFVVRVWTTNDDAWPVYWDLMENFKRALDANNIGIPFPQMDVYMHQAQNTVMKAE >NZ_CP017085.1|WP_004244063.1|3162162_3162786_-|arginine-exporter-ArgO MLTTFFQGFLLSAAMILPIGAQNAFVLQQGSKKQYHLMSAFLCALSDVILISGGVFGGSALLSQSEYLLLLITWGGVAFLLWYGWNAFKTAFTKEIELSQHKNQVKSRWRVIVTLVAVTWLNPHVYLDTFVVLGSIGGQLSAELRPWFTFGAVFASISWFFALSLLAAWFSPILSQVTAQRIINLFVGCVMWFIALQLAAQGWKNLF >NZ_CP017085.1|WP_004248538.1|3161337_3162072_-|oxidative-stress-defense-protein MKVKAMVLASMLALGAPSIALAGAVPEGPHITTSGNATIKATPDMATLNIQVSEKAKDAAQAKKQVDERVAKYFAFLKENGVTKEDIDAANIRTQPNYEYDKKAERSVINGYTATRTVDVKIKKLDQLNTLLDGALAAGLNEINNVEFGVNDPEQYKAKAREVAIKNAIQQASSVAKGFGADLGAVYSVSYRAPEATPYPIARMKMDAMALSAPSPEAVKETYQQQSIEFKDYVDVVFELKTAK >NZ_CP017085.1|WP_004244061.1|3160741_3161170_+|hypothetical-protein MADIATLIAKWRNGLEVEIYTENYEFRYGRIKSSRFNASGEESVYYATYFHTRAKPKDNDPFLIITFDPVVGQDDFMFIETIIDHRTYFGSPGAGKTKSHIERRSSDLKRRIENGKKISSEPSSSVQNVNKNNNDSPDQENK >NZ_CP017085.1|WP_017627938.1|3160452_3160674_+|hypothetical-protein MSTFIRRSRNVALAIDAGRKSGSANIEGNTPADIQASLLKSLGEFTASIPTTKQQPYVKGSHGANHKKNYFGR >NZ_CP017085.1|WP_004244059.1|3159350_3160250_+|LysR-family-transcriptional-regulator-ArgP MKRPDYRALQALDAVIRERGFERAAQKLCITQSAVSQRIKQLENLFGQPLLVRTVPPQPTEQGQKLLALLHQVEMLEEQWLGDENSGSTPLLLSLAVNADSLATWLLPALHPVLTQLPIRLNIQVEDETRTQERLRRGEVVGAISIQPQALPSCLVDQLGALDYLFVASPDFAQRYFANGVTKSSLLKAPAVAFDHLDDMHQAFLQQNFGLSPGSVPCHIVNSSEAFVQLAKQGSTCCMIPHLQIADELKSGELIDLTPGLCQRRMLYWHRFAPESRTMRKVTDALLDYGRKVLKQDEE >NZ_CP017085.1|WP_004244058.1|3158533_3159190_-|ribose-5-phosphate-isomerase-RpiA MTQDELKKAVGWAALEYVKPGTIVGVGTGSTASHFIDALATMKGQIEGAVSSSEASTAKLKSYGIPVFDCNEVDSLDIYVDGADEINHQMQMIKGGGAALTREKIIAAVAKTFVCIVDESKQVDVLGKFPLPVEVIPMARSYVARELVKLGGLPEYRENVVTDNGNVILDVYNLTILNPIELENKINSIAGVVTVGLFANRGADIVLMGTSEGVKTIK >NZ_CP017085.1|WP_004244077.1|3182373_3183801_-|dihydrolipoyl-dehydrogenase MSTEIKAQVVVLGAGPAGYSAAFRCADLGLDTVLVERHSTLGGVCLNVGCIPSKALLHVAKVIEEAKALSEHGVVFDAPKTDIDKIRIWKDKVISQLTGGLAGMAKGRKVNVVNGEARFTGSHTLSVEGSEGTTTITFENAIVAAGSRPIELPFIPHEDPRVWDSTDALQLKTVPERLLVMGGGIIGLEMGTVYHALGSQIDVVEMFDQVIPAADKDVVKVFTKRISKKFNLMLETKVTAVEAKEDGIYVTMEGKKAPAEPQRYDAVLVAIGRVPNGKLLDAGKAGIEVDDRGFIHVDKQMRTNVPHIFAIGDIVGQPMLAHKGVHEGHVAAEVISGKKHYFDPKVIPSIAYTEPEVAWVGMTEKEAKEKGVSYEVATFPWAASGRAIASDCADGMTKLIFDKETNRVIGGAIVGSNGGELLGEIGLAIEMGCDAEDIALTIHAHPTLYESIGMAAEVFEGSITDLPNPKAKKKK >NZ_CP017085.1|WP_017627936.1|3184002_3185868_-|pyruvate-dehydrogenase-complex-dihydrolipoyllysine-residue-acetyltransferase MSIEIKVPDIGADEVEVTEVMVKVGDRIEEEQSLITVEGDKASMEVPSPQAGIVKEIKIAVGDKVETGSLIMIFDTEEGAQAPAQEAAPAPSAAAPAASELKEVHVPDIGGDEVEVTEVMVNVGDTISEEQSLITVEGDKASMEVPAPFAGVVKEIKIAVGDKVSTGSLIMVFEVAGSAPAPSASAPAPAASAPAASAIKDVNVPDIGGDEVEVTEVMVKVGDTIAEEQSLITVEGDKASMEVPAPFAGVVKEIKIAVGDKVKTGSLIMTFEVAGAAPAAQAPAAPATSTSAAPSAPAKAPASAPAAKEEFVENEAYVHATPVIRRLAREFGVNLAKVKGTGRKGRILREDVQSYVKELIKRAESAPANAGGGLPGMLPWPKVDFSKFGEIEEVELSRIQKISGANLSRNWVMIPHVNLFDEADITEVEEFRKQQNKEAEKKKLDVKITPLVFVMKAAAKALADMPRFNSSISEDGQKLILKKYINIGIAVDTPNGLVVPVFKDVNKKGILELSYELAEVSKKARAGKLTASDMQGGCFTISSLGGIGTTGFAPIVNAPEVAIMGLSRSSMKPVWNGKEFVPRLMLPMSLSFDHRVIDGADGARFITLINQYMSDLRRLVM >NZ_CP017085.1|WP_004244080.1|3185880_3188547_-|pyruvate-dehydrogenase-(acetyl-transferring),-homodimeric-type MSDMLKNDVDPIETRDWLQAIDSVIREEGVERAQFLIDQVLKQARNGGLDIALGGSVHSDYINTIPVEDEPAYPGNLELERRIRSAIRWNAVMMVLRASKKDLELGGHMASYQSSATLYEVCFNHFFRAHNDNDGGDLVYFQGHISPGIYARAFLEGRLTEEQLNNFRQEIGGKGLSSYPHPKLMPEFWQFPTVSMGLGPLSAIYQAKFLKYLDHRGLKDTTKQRVYAFLGDGEMDEPESKGAITIAVREKLDNLCFVVNCNLQRLDGPVTGNGKIVNELEGIFAGAGWNVIKVMWGDRWDALLRKDTSGKLIQLMNETLDGDYQTFKSRDGAYVREHFFNRYPETAALVKDMTDDEIWALNRGGHDPKKVFAAFQKAKETKDKPTVILAQTIKGYGMGETAEGKNIAHQVKKMNMDGVKHFRDRFNIPVSDEKVAELPYITFDKDSEEYKYLHARRQELEGYLPARRTRFDEKLEIPTLEDFSQLLEEQSKEISTTIAFVRALNVMLKNKSIKDRLVPIIADEARTFGMEGLFRQIGIYSPNGQQYTPQDREQVAYYKEDVKGQILQEGINELGAGASWLAAATSYSTNNLPMIPFYIYYSMFGFQRIGDLCWAAGDQQARGFLIGGTSGRTTLNGEGLQHEDGHSHIQSLTIPNCISYDPAFAYEVAVIMQDGLERMYGDKQENVYYYITTLNENYHMPAMPAGAEEGIRKGIYKLESLEGAKGKVQLLGSGSILRHVREAAQILSTEYGIGSDVYSVTSFTELARDGQDCERWNMLHPSEEPRVPYIAQIMNDAPAVASTDYMKLFAEQVRTYVPADDYRVLGTDGFGRSDSRENLRHHFEVDTSYVIVAALGELAKRGEIDVKVVEEAIKKYNINPEKVNPRLA >NZ_CP017085.1|WP_012368227.1|3188710_3189481_-|pyruvate-dehydrogenase-complex-transcriptional-repressor-PdhR MAYTKIRQPKLSDVIEQQLEHLILEGTLRPGEKLLPERELAKQFDVSRPSLREAIQKLEAKGFLLRRQGGGTFVQDNLWQSFSDPLAQLLSGHPESQFDLLETRHALEGIAAYYAALRGTDDDLERIKASHARIIDAHDKGDIAAESDAVLQYQLIVTEAAHNVVLLHLLRCMVPMLEQNIRQNFEFLYTRKEMLTAVSEHRTQIYQAIINREPEAAREASHRHLAFIEDVLLDMSREHTRRERSLRRLQQHPDLF >NZ_CP017085.1|WP_017627935.1|3189807_3190350_-|1,6-anhydro-N-acetylmuramyl-L-alanine-amidase-AmpD MEIKQGWLTGVKHVPSPNYDNRPEGEIPSLLIIHNISLPPGQFGGPYIDQLFTNTLAVDDHPFFNEIAHLRVSAHCLIRRDGEIVQYVPFTARAWHAGVSFYKGREKCNDFSIGIELEGTDECDFTPLQYQQLSTLTQQLIEHYPGIKENITGHSDVAPGRKTDPGPHFNWSYYRALLAK >NZ_CP017085.1|WP_004244084.1|3190560_3191004_+|prepilin-peptidase-dependent-pilin MNTLNYHSTENGFTLMELMIVIAIISILSSVAIPAYHGYIQKAALTDVLQTLSPYRSAVELCHYEHQYNQCHADASFMPQQFRSRYLTDIHVANGVISAKGKAQLEGLTIVMTPATNSKETLPHWQINCTSTNTALQTLCHKVFKSH >NZ_CP017085.1|WP_004250359.1|3191103_3192207_+|Flp-pilus-assembly-complex-ATPase-component MNNTIHTATEFIEQLLRHSLAQRVSDLHLEPQQNSLRIRARIDNHLVLFSPPDNQLANEILTRLKILANINIAEKRLPQDGQFNWSYQKNNYSIRVATLPTLYGEKIVLRLMNNLQQPQLAQLGFQTIHLTLLKKYLTQPQGMILVTGPTGSGKTLTLYSCLQYLNKDNRNINSIEDPIELPLHGINQTQITEKAGITFATILRALLRQDPDVIMIGEIRDQQTAEIAIKAAQTGHLVLSTLHTNSTQATLARLANLGIAKDLIDSCVKLIISQRLVRCLCSNCKYPSPEQKNFIINNQQIILPNWQATGCQFCYSGYKGRTAIYDCFELAKQSLPSPYALFNSGIELIKKGITSLDEVYQVVGDIE >NZ_CP017085.1|WP_012368229.1|3192203_3193403_+|transporter MKLHFIYRYNALTYQGKWLSGNVVAQSKHEVIDQLIQQQKLPVKIRLYRVIIFQNSDKQYRIQLLEQLALLLHSGLALLPALTLLKEECRYLHWQCVLNDIIFHLNQGGALSKQLSRYPLYFPANLTHFIYIGEESGKLDEVLLLQTTQLKNQRDLIKKIIKAFQYPLFLLLTLIVITISMLIYVLPEYQSLYSAFNTELPMLTLTLIRCSQWFSQYSLIILLFILIISYSYYTIKHHSAKFRDIEQRCWLNLPYLGVLLRYHQLHIIFQIMTITQQAGLPLLQGLKIITEQLTHSLYQRALTDMIAHITQGKSLSSFMRHNPLFPPICYQLISSAENSGQLQFFCQQLTHWFYHQLEERLDSVKTWLEPILMTLIALITGTLIIAMYLPVLQLGDTIH >NZ_CP017085.1|WP_004244087.1|3193680_3194295_+|dephospho-CoA-kinase MTYTVALTGGIGSGKTTIANGFASLGVPLVDADVIARLVVEPDSPGLKALQQHFGDTILLPDGKLNRAQLRHIIFQNQQEKAWVNQLLHPLIQQETQKQIQQIRAPYFIWVVPLLVENKLTHLADRILVVDVTEEEQITRTMQRDGVSRDHVLKILQAQAKREQRLAVADDIIENHDNSLNQDEQIKQLHQHYLELAQKSNTGQ >NZ_CP017085.1|WP_004244089.1|3194297_3195050_+|cell-division-protein-ZapD MSEETSTIIFEHPLNEKMRSWLRIENSLIQLNSFQSINSLSSALSFFRAVSEFIEVLDRGEIRAELLKELEKRQKKLQQWLSFPNVDKEIVSHIINELSESACALSKAPRIGQHLKQDKIISLVKQRLSIPGGCCSFDVPTLHLWLNLPQTVRTEKLTCWQEGLYPLQNALNALLTLIRQSDTFKPVLSHNGFYQDSTEEGELLRIKLLASQQIYPQVSGHKNRYAIRFLPLDSEHGTIPSELPFEISCC |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | NZ_KX774387 | Providencia rettgeri strain 30905 plasmid pC131, complete sequence | 10387-10419 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | NZ_CP053895 | Proteus mirabilis strain JPM24 plasmid pJPM24, complete sequence | 72648-72680 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | NZ_KU963389 | Escherichia coli strain ECO37 plasmid ECO37P1, complete sequence | 15133-15165 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | NZ_CP047288 | Proteus cibarius strain G11 plasmid p152, complete sequence | 62060-62092 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | NZ_CP044485 | Acinetobacter schindleri strain HZE30-1 plasmid pHZE30-1-2, complete sequence | 28402-28434 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | NZ_CP025853 | Escherichia coli strain 510016 plasmid p510016_36, complete sequence | 25816-25848 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | NZ_KT754165 | Shigella dysenteriae 1 strain 93-531-1 plasmid p93-531-1, complete sequence | 23240-23272 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | NZ_CP053372 | Proteus cibarius strain G32 plasmid pG32-177, complete sequence | 57315-57347 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | NZ_CP024247 | Escherichia coli O27:H7 strain B4103-1 plasmid unnamed2 | 64739-64771 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | NZ_CP053043 | Proteus cibarius strain HNCF44W plasmid pHNCF44W_NDM-1, complete sequence | 95158-95190 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | JX469830 | Uncultured bacterium plasmid pG527, complete sequence | 41349-41381 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | NZ_CP013819 | Piscirickettsia salmonis strain AY3800B plasmid p3PS10, complete sequence | 10767-10799 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | CP025925 | Escherichia coli strain 520873 plasmid p520873_36, complete sequence | 13633-13665 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | CP025875 | Escherichia coli strain 503458 plasmid p503458_37, complete sequence | 10830-10862 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | NZ_CP013795 | Piscirickettsia salmonis strain AY6297B plasmid p4PS8, complete sequence | 10767-10799 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | NZ_CP023380 | Escherichia coli strain 127 plasmid p43, complete sequence | 15396-15428 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | NZ_CP011314 | Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain 234-12 plasmid pKpn23412-362, complete sequence | 172056-172088 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP017085_3 | 3.5|2915884|32|NZ_CP017085|CRISPRCasFinder | 2915884-2915915 | 32 | MK047640 | Phage NV18, complete genome | 10207-10238 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP017085_4 | 4.14|2925740|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925740-2925771 | 32 | MG575420 | Proteus phage vB_PmiP_RS10pmA, complete genome | 13756-13787 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017085_4 | 4.15|2925801|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925801-2925832 | 32 | NC_041925 | Proteus phage VB_PmiS-Isfahan, complete genome | 16019-16050 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017085_4 | 4.15|2925801|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925801-2925832 | 32 | MG575420 | Proteus phage vB_PmiP_RS10pmA, complete genome | 14646-14677 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017085_3 | 3.9|2915762|34|NZ_CP017085|PILER-CR | 2915762-2915795 | 34 | MK047640 | Phage NV18, complete genome | 10205-10238 | 1 | 0.971 |
NZ_CP017085_3 | 3.11|2915885|34|NZ_CP017085|PILER-CR | 2915885-2915918 | 34 | MK047640 | Phage NV18, complete genome | 10205-10238 | 1 | 0.971 |
NZ_CP017085_4 | 4.5|2925191|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925191-2925222 | 32 | MK047640 | Phage NV18, complete genome | 5814-5845 | 1 | 0.969 |
NZ_CP017085_4 | 4.6|2925252|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925252-2925283 | 32 | MK047640 | Phage NV18, complete genome | 5814-5845 | 1 | 0.969 |
NZ_CP017085_4 | 4.11|2925557|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925557-2925588 | 32 | MN840487 | Proteus phage 2207-N35, complete genome | 30688-30719 | 1 | 0.969 |
NZ_CP017085_4 | 4.11|2925557|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925557-2925588 | 32 | NC_041925 | Proteus phage VB_PmiS-Isfahan, complete genome | 16342-16373 | 1 | 0.969 |
NZ_CP017085_4 | 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925618-2925649 | 32 | MK047640 | Phage NV18, complete genome | 38520-38551 | 1 | 0.969 |
NZ_CP017085_4 | 4.15|2925801|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925801-2925832 | 32 | MN840487 | Proteus phage 2207-N35, complete genome | 31011-31042 | 1 | 0.969 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | CP052804 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S973 plasmid pN17S0973, complete sequence | 113091-113123 | 2 | 0.939 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | CP038508 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain FARPER-219 plasmid p-F219, complete sequence | 228634-228666 | 2 | 0.939 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | CP052788 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N19S0611 plasmid pN19S0611, complete sequence | 321488-321520 | 2 | 0.939 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | CP052786 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N19S0641 plasmid pN19S0641, complete sequence | 10079-10111 | 2 | 0.939 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | CP052838 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N16S097 plasmid pN16S097, complete sequence | 13470-13502 | 2 | 0.939 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | CP051676 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1234 plasmid pN16S1234, complete sequence | 201786-201818 | 2 | 0.939 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | CP052779 | Salmonella enterica strain 19TN07GT06K-S plasmid pN19S1233, complete sequence | 212524-212556 | 2 | 0.939 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | CP052832 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1040 plasmid pN17S1040, complete sequence | 277011-277043 | 2 | 0.939 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | MN310378 | Klebsiella pneumoniae strain A2293 plasmid pA2293-Ct2, complete sequence | 73380-73412 | 2 | 0.939 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | CP052806 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S816 plasmid pN17S0816, complete sequence | 282696-282728 | 2 | 0.939 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | CP052818 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1509 plasmid pN17S1509, complete sequence | 1788-1820 | 2 | 0.939 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | NZ_MH476540 | Klebsiella pneumoniae strain KP1276 plasmid pIA/C-KLUC, complete sequence | 87104-87136 | 2 | 0.939 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | CP052795 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N19S0125 plasmid pN19S0125, complete sequence | 166287-166319 | 2 | 0.939 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | NZ_CP047882 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain 119944 plasmid pESI, complete sequence | 264306-264338 | 2 | 0.939 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | CP052802 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S976 plasmid pN17S0976, complete sequence | 197576-197608 | 2 | 0.939 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | CP052840 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N16S024 plasmid pN16S024, complete sequence | 9544-9576 | 2 | 0.939 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | CP052836 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N16S103 plasmid pN16S103, complete sequence | 222743-222775 | 2 | 0.939 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | CP052828 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1126 plasmid pN17S1126, complete sequence | 8856-8888 | 2 | 0.939 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | CP052826 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1245 plasmid pN17S0637, complete sequence | 292607-292639 | 2 | 0.939 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | NZ_CP016409 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain FSIS1502916 plasmid pFSIS1502916, complete sequence | 299316-299348 | 2 | 0.939 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | NZ_CP016407 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain FSIS1502169 plasmid pFSIS1502169, complete sequence | 299920-299952 | 2 | 0.939 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | NZ_CP016413 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM44454 plasmid pCVM44454, complete sequence | 295999-296031 | 2 | 0.939 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | NZ_CP016411 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain N55391 plasmid pN55391, complete sequence | 293612-293644 | 2 | 0.939 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | CP052814 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S349 plasmid pN17S0349, complete sequence | 281790-281822 | 2 | 0.939 |
NZ_CP017085_1 | 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR | 319045-319077 | 33 | NZ_MG764552 | Klebsiella pneumoniae strain A1763 plasmid pA1763-Ct2, complete sequence | 61314-61346 | 2 | 0.939 |
NZ_CP017085_1 | 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR | 319101-319141 | 41 | NZ_CP053897 | Providencia rettgeri strain YPR31 plasmid pYPR31, complete sequence | 75936-75976 | 2 | 0.951 |
NZ_CP017085_1 | 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR | 319101-319141 | 41 | MN310378 | Klebsiella pneumoniae strain A2293 plasmid pA2293-Ct2, complete sequence | 73436-73476 | 2 | 0.951 |
NZ_CP017085_1 | 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR | 319101-319141 | 41 | NZ_MH476540 | Klebsiella pneumoniae strain KP1276 plasmid pIA/C-KLUC, complete sequence | 87160-87200 | 2 | 0.951 |
NZ_CP017085_1 | 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR | 319101-319141 | 41 | NZ_MG764552 | Klebsiella pneumoniae strain A1763 plasmid pA1763-Ct2, complete sequence | 61250-61290 | 2 | 0.951 |
NZ_CP017085_3 | 3.1|2915638|32|NZ_CP017085|CRISPRCasFinder | 2915638-2915669 | 32 | KY420199 | Proteus phage vB_PvuS_Pm34, complete genome | 38267-38298 | 2 | 0.938 |
NZ_CP017085_4 | 4.3|2925069|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925069-2925100 | 32 | MW057862 | Providencia phage PSTCR7lys, complete genome | 14912-14943 | 2 | 0.938 |
NZ_CP017085_4 | 4.10|2925496|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925496-2925527 | 32 | MN840487 | Proteus phage 2207-N35, complete genome | 29623-29654 | 2 | 0.938 |
NZ_CP017085_4 | 4.10|2925496|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925496-2925527 | 32 | NC_041925 | Proteus phage VB_PmiS-Isfahan, complete genome | 17491-17522 | 2 | 0.938 |
NZ_CP017085_4 | 4.10|2925496|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925496-2925527 | 32 | MG575420 | Proteus phage vB_PmiP_RS10pmA, complete genome | 16116-16147 | 2 | 0.938 |
NZ_CP017085_4 | 4.11|2925557|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925557-2925588 | 32 | MG575420 | Proteus phage vB_PmiP_RS10pmA, complete genome | 14969-15000 | 2 | 0.938 |
NZ_CP017085_3 | 3.7|2915639|34|NZ_CP017085|PILER-CR | 2915639-2915672 | 34 | KY420199 | Proteus phage vB_PvuS_Pm34, complete genome | 38265-38298 | 3 | 0.912 |
NZ_CP017085_3 | 3.6|2915945|31|NZ_CP017085|CRISPRCasFinder | 2915945-2915975 | 31 | NC_047890 | Escherichia phage PGT2, complete genome | 28402-28432 | 4 | 0.871 |
NZ_CP017085_3 | 3.15|2915761|41|NZ_CP017085|CRT | 2915761-2915801 | 41 | MK047640 | Phage NV18, complete genome | 10198-10238 | 4 | 0.902 |
NZ_CP017085_3 | 3.17|2915884|41|NZ_CP017085|CRT | 2915884-2915924 | 41 | MK047640 | Phage NV18, complete genome | 10198-10238 | 4 | 0.902 |
NZ_CP017085_4 | 4.11|2925557|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925557-2925588 | 32 | NZ_CP034684 | Bacillus sp. BD59S plasmid pBTBD59S1, complete sequence | 63621-63652 | 5 | 0.844 |
NZ_CP017085_4 | 4.15|2925801|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925801-2925832 | 32 | MK552327 | Pseudomonas phage Psa21, complete genome | 79439-79470 | 5 | 0.844 |
NZ_CP017085_4 | 4.11|2925557|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925557-2925588 | 32 | NZ_CP038617 | Arsenophonus nasoniae strain FIN plasmid pArsFIN5, complete sequence | 108841-108872 | 6 | 0.812 |
NZ_CP017085_4 | 4.15|2925801|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925801-2925832 | 32 | MN480763 | Streptococcus salivarius strain YU10 plasmid pSsal-YU10, complete sequence | 43483-43514 | 6 | 0.812 |
NZ_CP017085_4 | 4.3|2925069|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925069-2925100 | 32 | MN018232 | Synechococcus phage S-B43, complete genome | 100212-100243 | 7 | 0.781 |
NZ_CP017085_4 | 4.3|2925069|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925069-2925100 | 32 | MK016663 | Synechococcus phage S-H68, complete genome | 34447-34478 | 7 | 0.781 |
NZ_CP017085_3 | 3.13|2915638|41|NZ_CP017085|CRT | 2915638-2915678 | 41 | KY420199 | Proteus phage vB_PvuS_Pm34, complete genome | 38258-38298 | 8 | 0.805 |
NZ_CP017085_4 | 4.10|2925496|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925496-2925527 | 32 | MH616823 | Phage sp. isolate ctbf364, complete genome | 482-513 | 8 | 0.75 |
NZ_CP017085_4 | 4.15|2925801|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925801-2925832 | 32 | NC_010821 | Pseudomonas phage 201phi2-1, complete genome | 179292-179323 | 8 | 0.75 |
NZ_CP017085_4 | 4.15|2925801|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925801-2925832 | 32 | MF042360 | Pseudomonas phage Phabio, complete genome | 175697-175728 | 8 | 0.75 |
NZ_CP017085_3 | 3.1|2915638|32|NZ_CP017085|CRISPRCasFinder | 2915638-2915669 | 32 | NZ_CP007054 | Opitutaceae bacterium TAV5 plasmid unnamed, complete sequence | 3726-3757 | 9 | 0.719 |
NZ_CP017085_3 | 3.1|2915638|32|NZ_CP017085|CRISPRCasFinder | 2915638-2915669 | 32 | NZ_AP022593 | Mycolicibacterium arabiense strain JCM 18538 plasmid pJCM18538, complete sequence | 5035602-5035633 | 9 | 0.719 |
NZ_CP017085_3 | 3.1|2915638|32|NZ_CP017085|CRISPRCasFinder | 2915638-2915669 | 32 | NZ_CP030074 | Streptomyces sp. ZFG47 plasmid unnamed1, complete sequence | 655666-655697 | 9 | 0.719 |
NZ_CP017085_4 | 4.15|2925801|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925801-2925832 | 32 | NZ_CP016890 | Pantoea agglomerans strain C410P1 plasmid unnamed1, complete sequence | 327581-327612 | 9 | 0.719 |
NZ_CP017085_3 | 3.3|2915761|32|NZ_CP017085|CRISPRCasFinder | 2915761-2915792 | 32 | MK416018 | Klebsiella phage ST147-VIM1phi7.1, complete genome | 7126-7157 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_3 | 3.5|2915884|32|NZ_CP017085|CRISPRCasFinder | 2915884-2915915 | 32 | MK416018 | Klebsiella phage ST147-VIM1phi7.1, complete genome | 7126-7157 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_4 | 4.4|2925130|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925130-2925161 | 32 | AX059140 | Sequence 1 from Patent WO0075335 | 67129-67160 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_4 | 4.4|2925130|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925130-2925161 | 32 | NC_004735 | Rhodothermus phage RM378, complete genome | 67129-67160 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_4 | 4.8|2925374|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925374-2925405 | 32 | LR721753 | Aliivibrio wodanis 06/09/160 plasmid 2 complete sequence | 145987-146018 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_4 | 4.11|2925557|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925557-2925588 | 32 | NC_009819 | Streptococcus phage P9, complete genome | 38290-38321 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_4 | 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925618-2925649 | 32 | NZ_KY020154 | Klebsiella pneumoniae strain Kpn-431cz plasmid pKpn-431cz, complete sequence | 140146-140177 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_4 | 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925618-2925649 | 32 | NZ_CP016763 | Citrobacter freundii strain B38 plasmid pOZ172, complete sequence | 64514-64545 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_4 | 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925618-2925649 | 32 | NZ_CP021328 | Raoultella ornithinolytica strain Ro24724 plasmid pRo24724, complete sequence | 226363-226394 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_4 | 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925618-2925649 | 32 | NZ_CP025467 | Klebsiella pneumoniae strain JS187 plasmid p187-1, complete sequence | 73407-73438 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_4 | 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925618-2925649 | 32 | NC_018107 | Klebsiella michiganensis E718 plasmid pKOX_R1, complete sequence | 300176-300207 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_4 | 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925618-2925649 | 32 | NZ_CP022441 | Klebsiella sp. LY plasmid unnamed3, complete sequence | 100165-100196 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_4 | 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925618-2925649 | 32 | KU318421 | Klebsiella pneumoniae strain KP04 plasmid pKP04VIM, complete sequence | 128822-128853 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_4 | 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925618-2925649 | 32 | NC_023911 | Raoultella planticola strain KpNDM1 plasmid pKpNDM1, complete sequence | 76769-76800 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_4 | 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925618-2925649 | 32 | NZ_CP025964 | Klebsiella pneumoniae strain WCHKP34 plasmid pIMP4_LL34, complete sequence | 3356-3387 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_4 | 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925618-2925649 | 32 | NZ_CP038277 | Raoultella ornithinolytica strain WLK218 plasmid pWLK-238550, complete sequence | 74106-74137 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_4 | 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925618-2925649 | 32 | NZ_CP046614 | Klebsiella pneumoniae strain WCGKP294 plasmid pWCGKP294-2, complete sequence | 129348-129379 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_4 | 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925618-2925649 | 32 | NZ_CP043515 | Enterobacter kobei strain EB_P8_L5_01.19 plasmid unnamed4, complete sequence | 100842-100873 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_4 | 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925618-2925649 | 32 | NZ_CP026014 | Klebsiella variicola strain 13450 plasmid p13450-1, complete sequence | 209150-209181 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_4 | 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925618-2925649 | 32 | NZ_CP026019 | Klebsiella pneumoniae strain 13190 plasmid p13190-1, complete sequence | 60850-60881 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_4 | 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925618-2925649 | 32 | NZ_CP026019 | Klebsiella pneumoniae strain 13190 plasmid p13190-1, complete sequence | 118203-118234 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_4 | 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925618-2925649 | 32 | NZ_MF344561 | Klebsiella pneumoniae strain 11219 plasmid p11219-IMP, complete sequence | 129894-129925 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_4 | 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925618-2925649 | 32 | NZ_MF344566 | Klebsiella pneumoniae strain A324 plasmid pA324-IMP, complete sequence | 126137-126168 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_4 | 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925618-2925649 | 32 | NZ_MF344565 | Klebsiella pneumoniae strain 19051 plasmid p19051-IMP, complete sequence | 87406-87437 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_4 | 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925618-2925649 | 32 | NZ_MF344562 | Klebsiella pneumoniae strain 12208 plasmid p12208-IMP, complete sequence | 134790-134821 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_4 | 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925618-2925649 | 32 | NZ_MF344563 | Klebsiella pneumoniae strain 13190 plasmid p13190-VIM, complete sequence | 128738-128769 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_4 | 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925618-2925649 | 32 | NZ_MF344564 | Klebsiella pneumoniae strain 13450 plasmid p13450-IMP, complete sequence | 129893-129924 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_4 | 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925618-2925649 | 32 | NZ_MF042354 | Klebsiella pneumoniae strain 6TM plasmid pNDM_6TM, complete sequence | 114817-114848 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_4 | 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925618-2925649 | 32 | NZ_MF042353 | Klebsiella pneumoniae strain 1TM plasmid pNDM_1TM, complete sequence | 114278-114309 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_4 | 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925618-2925649 | 32 | NZ_MF042351 | Serratia marcescens strain 12TM plasmid pNDM_12TM, complete sequence | 112901-112932 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_4 | 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925618-2925649 | 32 | NZ_MF042352 | Serratia marcescens strain 4TM plasmid pNDM_4TM, complete sequence | 112901-112932 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_4 | 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925618-2925649 | 32 | NZ_MG736312 | Klebsiella pneumoniae strain KP91 plasmid pKP91, complete sequence | 23551-23582 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017085_3 | 3.7|2915639|34|NZ_CP017085|PILER-CR | 2915639-2915672 | 34 | NZ_CP007054 | Opitutaceae bacterium TAV5 plasmid unnamed, complete sequence | 3726-3759 | 11 | 0.676 |
NZ_CP017085_3 | 3.9|2915762|34|NZ_CP017085|PILER-CR | 2915762-2915795 | 34 | MK416018 | Klebsiella phage ST147-VIM1phi7.1, complete genome | 7126-7159 | 11 | 0.676 |
NZ_CP017085_3 | 3.11|2915885|34|NZ_CP017085|PILER-CR | 2915885-2915918 | 34 | MK416018 | Klebsiella phage ST147-VIM1phi7.1, complete genome | 7126-7159 | 11 | 0.676 |
NZ_CP017085_4 | 4.4|2925130|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925130-2925161 | 32 | MN657098 | Psychrobacter sp. strain ANT_P42 plasmid pA42P5, complete sequence | 7907-7938 | 11 | 0.656 |
NZ_CP017085_4 | 4.13|2925679|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925679-2925710 | 32 | MN694201 | Marine virus AFVG_250M801, complete genome | 7954-7985 | 11 | 0.656 |
NZ_CP017085_4 | 4.13|2925679|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2925679-2925710 | 32 | MN694455 | Marine virus AFVG_250M805, complete genome | 8019-8050 | 11 | 0.656 |
1. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_KX774387 (Providencia rettgeri strain 30905 plasmid pC131, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP053895 (Proteus mirabilis strain JPM24 plasmid pJPM24, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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3. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_KU963389 (Escherichia coli strain ECO37 plasmid ECO37P1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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4. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP047288 (Proteus cibarius strain G11 plasmid p152, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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5. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP044485 (Acinetobacter schindleri strain HZE30-1 plasmid pHZE30-1-2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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6. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP025853 (Escherichia coli strain 510016 plasmid p510016_36, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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7. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_KT754165 (Shigella dysenteriae 1 strain 93-531-1 plasmid p93-531-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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8. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP053372 (Proteus cibarius strain G32 plasmid pG32-177, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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9. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP024247 (Escherichia coli O27:H7 strain B4103-1 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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10. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP053043 (Proteus cibarius strain HNCF44W plasmid pHNCF44W_NDM-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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11. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to JX469830 (Uncultured bacterium plasmid pG527, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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12. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP013819 (Piscirickettsia salmonis strain AY3800B plasmid p3PS10, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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13. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to CP025925 (Escherichia coli strain 520873 plasmid p520873_36, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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14. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to CP025875 (Escherichia coli strain 503458 plasmid p503458_37, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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15. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP013795 (Piscirickettsia salmonis strain AY6297B plasmid p4PS8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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16. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP023380 (Escherichia coli strain 127 plasmid p43, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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17. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP011314 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain 234-12 plasmid pKpn23412-362, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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18. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NC_008357 (Pseudomonas aeruginosa plasmid pBS228, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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19. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP027138 (Escherichia coli strain AR_0369 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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20. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP022673 (Shigella sonnei strain 866 plasmid p866, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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21. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP045128 (Acinetobacter indicus strain XG03 plasmid pXG03-X3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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22. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_LT985250 (Escherichia coli strain 170 plasmid RCS38_p, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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23. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_MK360096 (Salmonella enterica strain 13-SA02717 plasmid pSE13-SA02717, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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24. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP053897 (Providencia rettgeri strain YPR31 plasmid pYPR31, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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25. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_MF150120 (Klebsiella pneumoniae strain A64477 plasmid pKP64477d, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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26. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_KX756453 (Klebsiella pneumoniae strain 1194/11 plasmid pKP1194a, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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27. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NC_015472 (Escherichia coli plasmid pECTm80, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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28. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP013800 (Piscirickettsia salmonis strain AY6532B plasmid p4PS9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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29. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to MG516911 (Proteus mirabilis plasmid pPm60, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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30. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP003997 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae Kp13 plasmid pKP13d, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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31. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to CP054380 (Escherichia coli strain SCU-175 plasmid pSCU-175-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tttttaattttcgtattagcttacgacgctaca CRISPR spacer tttttaattttcgtattagcttacgacgctaca Protospacer *********************************
32. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NC_002525 (Escherichia coli K-12 plasmid R721, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tttttaattttcgtattagcttacgacgctaca CRISPR spacer tttttaattttcgtattagcttacgacgctaca Protospacer *********************************
33. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP048015 (Acinetobacter towneri strain 205 plasmid pAT205, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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34. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP034054 (Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2015_112126 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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35. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP047114 (Proteus mirabilis strain SCBX1.1 plasmid plas1.1.2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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36. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP034046 (Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2014_104014 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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37. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP027700 (Klebsiella pneumoniae strain KP30835 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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38. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP053899 (Proteus mirabilis strain YPM35 plasmid pJPM35-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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39. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_MK264770 (Klebsiella pneumoniae strain KP89 plasmid pKP89, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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40. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_KX774387 (Providencia rettgeri strain 30905 plasmid pC131, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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41. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_MF150120 (Klebsiella pneumoniae strain A64477 plasmid pKP64477d, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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42. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP053895 (Proteus mirabilis strain JPM24 plasmid pJPM24, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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43. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_KX756453 (Klebsiella pneumoniae strain 1194/11 plasmid pKP1194a, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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44. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_KU963389 (Escherichia coli strain ECO37 plasmid ECO37P1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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45. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP047288 (Proteus cibarius strain G11 plasmid p152, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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46. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NC_015472 (Escherichia coli plasmid pECTm80, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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47. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP044485 (Acinetobacter schindleri strain HZE30-1 plasmid pHZE30-1-2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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48. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP025853 (Escherichia coli strain 510016 plasmid p510016_36, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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49. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_KT754165 (Shigella dysenteriae 1 strain 93-531-1 plasmid p93-531-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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50. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP013800 (Piscirickettsia salmonis strain AY6532B plasmid p4PS9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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51. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP053372 (Proteus cibarius strain G32 plasmid pG32-177, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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52. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP024247 (Escherichia coli O27:H7 strain B4103-1 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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53. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP053043 (Proteus cibarius strain HNCF44W plasmid pHNCF44W_NDM-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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54. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to MG516911 (Proteus mirabilis plasmid pPm60, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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55. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to JX469830 (Uncultured bacterium plasmid pG527, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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56. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP013819 (Piscirickettsia salmonis strain AY3800B plasmid p3PS10, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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57. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP003997 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae Kp13 plasmid pKP13d, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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58. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to CP025925 (Escherichia coli strain 520873 plasmid p520873_36, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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59. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to CP025875 (Escherichia coli strain 503458 plasmid p503458_37, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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60. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP013795 (Piscirickettsia salmonis strain AY6297B plasmid p4PS8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct CRISPR spacer ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct Protospacer *****************************************
61. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to CP054380 (Escherichia coli strain SCU-175 plasmid pSCU-175-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct CRISPR spacer ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct Protospacer *****************************************
62. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NC_002525 (Escherichia coli K-12 plasmid R721, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct CRISPR spacer ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct Protospacer *****************************************
63. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP023380 (Escherichia coli strain 127 plasmid p43, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct CRISPR spacer ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct Protospacer *****************************************
64. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP011314 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain 234-12 plasmid pKpn23412-362, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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65. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NC_008357 (Pseudomonas aeruginosa plasmid pBS228, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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66. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP027138 (Escherichia coli strain AR_0369 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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67. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP022673 (Shigella sonnei strain 866 plasmid p866, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct CRISPR spacer ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct Protospacer *****************************************
68. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP048015 (Acinetobacter towneri strain 205 plasmid pAT205, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct CRISPR spacer ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct Protospacer *****************************************
69. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP034054 (Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2015_112126 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct CRISPR spacer ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct Protospacer *****************************************
70. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP047114 (Proteus mirabilis strain SCBX1.1 plasmid plas1.1.2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct CRISPR spacer ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct Protospacer *****************************************
71. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP034046 (Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2014_104014 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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72. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP045128 (Acinetobacter indicus strain XG03 plasmid pXG03-X3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct CRISPR spacer ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct Protospacer *****************************************
73. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP027700 (Klebsiella pneumoniae strain KP30835 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct CRISPR spacer ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct Protospacer *****************************************
74. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_LT985250 (Escherichia coli strain 170 plasmid RCS38_p, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct CRISPR spacer ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct Protospacer *****************************************
75. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_MK360096 (Salmonella enterica strain 13-SA02717 plasmid pSE13-SA02717, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct CRISPR spacer ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct Protospacer *****************************************
76. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP053899 (Proteus mirabilis strain YPM35 plasmid pJPM35-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct CRISPR spacer ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct Protospacer *****************************************
77. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_MK264770 (Klebsiella pneumoniae strain KP89 plasmid pKP89, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct CRISPR spacer ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct Protospacer *****************************************
78. spacer 3.3|2915761|32|NZ_CP017085|CRISPRCasFinder matches to MK047640 (Phage NV18, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
taagccagaatgacaaagtgaaagcgatacaa CRISPR spacer taagccagaatgacaaagtgaaagcgatacaa Protospacer ********************************
79. spacer 3.5|2915884|32|NZ_CP017085|CRISPRCasFinder matches to MK047640 (Phage NV18, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
taagccagaatgacaaagtgaaagcgatacaa CRISPR spacer taagccagaatgacaaagtgaaagcgatacaa Protospacer ********************************
80. spacer 4.4|2925130|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK047640 (Phage NV18, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcctcggatatcattgcgaacaatcatttcac CRISPR spacer gcctcggatatcattgcgaacaatcatttcac Protospacer ********************************
81. spacer 4.14|2925740|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN840487 (Proteus phage 2207-N35, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttcagcaggtaatgattgaattgctaacattg CRISPR spacer ttcagcaggtaatgattgaattgctaacattg Protospacer ********************************
82. spacer 4.14|2925740|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_041925 (Proteus phage VB_PmiS-Isfahan, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttcagcaggtaatgattgaattgctaacattg CRISPR spacer ttcagcaggtaatgattgaattgctaacattg Protospacer ********************************
83. spacer 4.14|2925740|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG575420 (Proteus phage vB_PmiP_RS10pmA, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttcagcaggtaatgattgaattgctaacattg CRISPR spacer ttcagcaggtaatgattgaattgctaacattg Protospacer ********************************
84. spacer 4.15|2925801|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_041925 (Proteus phage VB_PmiS-Isfahan, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttcttacactgttgatgacgatgctattcgta CRISPR spacer ttcttacactgttgatgacgatgctattcgta Protospacer ********************************
85. spacer 4.15|2925801|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG575420 (Proteus phage vB_PmiP_RS10pmA, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttcttacactgttgatgacgatgctattcgta CRISPR spacer ttcttacactgttgatgacgatgctattcgta Protospacer ********************************
86. spacer 3.9|2915762|34|NZ_CP017085|PILER-CR matches to MK047640 (Phage NV18, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
taagccagaatgacaaagtgaaagcgatacaacg CRISPR spacer taagccagaatgacaaagtgaaagcgatacaact Protospacer *********************************
87. spacer 3.11|2915885|34|NZ_CP017085|PILER-CR matches to MK047640 (Phage NV18, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
taagccagaatgacaaagtgaaagcgatacaacg CRISPR spacer taagccagaatgacaaagtgaaagcgatacaact Protospacer *********************************
88. spacer 4.5|2925191|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK047640 (Phage NV18, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.969
ctgcaatcaatgcaacctgtgaatattcgata CRISPR spacer ccgcaatcaatgcaacctgtgaatattcgata Protospacer *.******************************
89. spacer 4.6|2925252|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK047640 (Phage NV18, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.969
ctgcaatcaatgcaacctgtgaatattcgata CRISPR spacer ccgcaatcaatgcaacctgtgaatattcgata Protospacer *.******************************
90. spacer 4.11|2925557|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN840487 (Proteus phage 2207-N35, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.969
taaacggttataaacatctaaagtcattaacg CRISPR spacer taaacggttataaacatctaacgtcattaacg Protospacer ********************* **********
91. spacer 4.11|2925557|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_041925 (Proteus phage VB_PmiS-Isfahan, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.969
taaacggttataaacatctaaagtcattaacg CRISPR spacer taaacggttataaacatctaacgtcattaacg Protospacer ********************* **********
92. spacer 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK047640 (Phage NV18, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.969
tttttctgttttgctgagagaaacgtaatcaa CRISPR spacer tttttctgttttactgagagaaacgtaatcaa Protospacer ************.*******************
93. spacer 4.15|2925801|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN840487 (Proteus phage 2207-N35, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.969
ttcttacactgttgatgacgatgctattcgta CRISPR spacer ttcttacaccgttgatgacgatgctattcgta Protospacer *********.**********************
94. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to CP052804 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S973 plasmid pN17S0973, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tttttaattttcgtattagcttacgacgctaca CRISPR spacer tttttaattttcgcattagcttgcgacgctaca Protospacer *************.********.**********
95. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to CP038508 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain FARPER-219 plasmid p-F219, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tttttaattttcgtattagcttacgacgctaca CRISPR spacer tttttaattttcgcattagcttgcgacgctaca Protospacer *************.********.**********
96. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to CP052788 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N19S0611 plasmid pN19S0611, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tttttaattttcgtattagcttacgacgctaca CRISPR spacer tttttaattttcgcattagcttgcgacgctaca Protospacer *************.********.**********
97. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to CP052786 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N19S0641 plasmid pN19S0641, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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98. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to CP052838 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N16S097 plasmid pN16S097, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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99. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to CP051676 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1234 plasmid pN16S1234, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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100. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to CP052779 (Salmonella enterica strain 19TN07GT06K-S plasmid pN19S1233, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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101. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to CP052832 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1040 plasmid pN17S1040, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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102. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to MN310378 (Klebsiella pneumoniae strain A2293 plasmid pA2293-Ct2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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103. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to CP052806 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S816 plasmid pN17S0816, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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104. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to CP052818 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1509 plasmid pN17S1509, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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105. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_MH476540 (Klebsiella pneumoniae strain KP1276 plasmid pIA/C-KLUC, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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106. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to CP052795 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N19S0125 plasmid pN19S0125, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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107. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP047882 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain 119944 plasmid pESI, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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108. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to CP052802 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S976 plasmid pN17S0976, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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109. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to CP052840 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N16S024 plasmid pN16S024, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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110. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to CP052836 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N16S103 plasmid pN16S103, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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111. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to CP052828 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1126 plasmid pN17S1126, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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112. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to CP052826 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1245 plasmid pN17S0637, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tttttaattttcgtattagcttacgacgctaca CRISPR spacer tttttaattttcgcattagcttgcgacgctaca Protospacer *************.********.**********
113. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP016409 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain FSIS1502916 plasmid pFSIS1502916, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tttttaattttcgtattagcttacgacgctaca CRISPR spacer tttttaattttcgcattagcttgcgacgctaca Protospacer *************.********.**********
114. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP016407 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain FSIS1502169 plasmid pFSIS1502169, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tttttaattttcgtattagcttacgacgctaca CRISPR spacer tttttaattttcgcattagcttgcgacgctaca Protospacer *************.********.**********
115. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP016413 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM44454 plasmid pCVM44454, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tttttaattttcgtattagcttacgacgctaca CRISPR spacer tttttaattttcgcattagcttgcgacgctaca Protospacer *************.********.**********
116. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP016411 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain N55391 plasmid pN55391, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tttttaattttcgtattagcttacgacgctaca CRISPR spacer tttttaattttcgcattagcttgcgacgctaca Protospacer *************.********.**********
117. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to CP052814 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S349 plasmid pN17S0349, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tttttaattttcgtattagcttacgacgctaca CRISPR spacer tttttaattttcgcattagcttgcgacgctaca Protospacer *************.********.**********
118. spacer 1.1|319045|33|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_MG764552 (Klebsiella pneumoniae strain A1763 plasmid pA1763-Ct2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tttttaattttcgtattagcttacgacgctaca CRISPR spacer tttttaattttcgcattagcttgcgacgctaca Protospacer *************.********.**********
119. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP053897 (Providencia rettgeri strain YPR31 plasmid pYPR31, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.951
ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct CRISPR spacer ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccaccctc Protospacer ***************************************..
120. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to MN310378 (Klebsiella pneumoniae strain A2293 plasmid pA2293-Ct2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.951
ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct CRISPR spacer ctctcccctaaataatccttaaaaaccccatttccacccct Protospacer ****.*********************.**************
121. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_MH476540 (Klebsiella pneumoniae strain KP1276 plasmid pIA/C-KLUC, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.951
ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct CRISPR spacer ctctcccctaaataatccttaaaaaccccatttccacccct Protospacer ****.*********************.**************
122. spacer 1.2|319101|41|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_MG764552 (Klebsiella pneumoniae strain A1763 plasmid pA1763-Ct2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.951
ctcttccctaaataatccttaaaaactccatttccacccct CRISPR spacer ctctcccctaaataatccttaaaaaccccatttccacccct Protospacer ****.*********************.**************
123. spacer 3.1|2915638|32|NZ_CP017085|CRISPRCasFinder matches to KY420199 (Proteus phage vB_PvuS_Pm34, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
tagaaactgctaccggtgcgcgtctgcagtct CRISPR spacer tagaaaccgccaccggtgcgcgtctgcagtct Protospacer *******.**.*********************
124. spacer 4.3|2925069|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MW057862 (Providencia phage PSTCR7lys, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
tcagccatacagtcagaaagtctttgaagatg CRISPR spacer tcagccgtacagtcagaaagtatttgaagatg Protospacer ******.************** **********
125. spacer 4.10|2925496|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN840487 (Proteus phage 2207-N35, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
agtcgaacaccatttaataaaacattgtaaaa CRISPR spacer agtcgaacaccgtttaatgaaacattgtaaaa Protospacer ***********.******.*************
126. spacer 4.10|2925496|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_041925 (Proteus phage VB_PmiS-Isfahan, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
agtcgaacaccatttaataaaacattgtaaaa CRISPR spacer agtcgaacaccgtttaatgaaacattgtaaaa Protospacer ***********.******.*************
127. spacer 4.10|2925496|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG575420 (Proteus phage vB_PmiP_RS10pmA, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
agtcgaacaccatttaataaaacattgtaaaa CRISPR spacer agtcgaacaccgtttaatgaaacattgtaaaa Protospacer ***********.******.*************
128. spacer 4.11|2925557|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG575420 (Proteus phage vB_PmiP_RS10pmA, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
taaacggttataaacatctaaagtcattaacg CRISPR spacer taagcggttataaacatctaacgtcattaacg Protospacer ***.***************** **********
129. spacer 3.7|2915639|34|NZ_CP017085|PILER-CR matches to KY420199 (Proteus phage vB_PvuS_Pm34, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
tagaaactgctaccggtgcgcgtctgcagtctcg CRISPR spacer tagaaaccgccaccggtgcgcgtctgcagtctct Protospacer *******.**.**********************
130. spacer 3.6|2915945|31|NZ_CP017085|CRISPRCasFinder matches to NC_047890 (Escherichia phage PGT2, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.871
gtggtccatggggcgctgcgataggtggcgg CRISPR spacer ggggtccgtggggcgctgcgattggtggcgc Protospacer * *****.************** *******
131. spacer 3.15|2915761|41|NZ_CP017085|CRT matches to MK047640 (Phage NV18, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.902
taagccagaatgacaaagtgaaagcgatacaacggttcatt CRISPR spacer taagccagaatgacaaagtgaaagcgatacaacttttaact Protospacer ********************************* ** *.*
132. spacer 3.17|2915884|41|NZ_CP017085|CRT matches to MK047640 (Phage NV18, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.902
taagccagaatgacaaagtgaaagcgatacaacggttcatt CRISPR spacer taagccagaatgacaaagtgaaagcgatacaacttttaact Protospacer ********************************* ** *.*
133. spacer 4.11|2925557|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP034684 (Bacillus sp. BD59S plasmid pBTBD59S1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
taaacggttataaacatctaaagtcattaacg CRISPR spacer tgaacggttataaatatttaaagtcattaggg Protospacer *.************.**.***********. *
134. spacer 4.15|2925801|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK552327 (Pseudomonas phage Psa21, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
--ttcttacactgttgatgacgatgctattcgta CRISPR spacer aattctt--actgttgatgacgatgctgttcgat Protospacer ***** ******************.****
135. spacer 4.11|2925557|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP038617 (Arsenophonus nasoniae strain FIN plasmid pArsFIN5, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
--taaacggttataaacatctaaagtcattaacg CRISPR spacer acaaaacag--ataaacatctaaagtcttgaacg Protospacer ****.* **************** * ****
136. spacer 4.15|2925801|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN480763 (Streptococcus salivarius strain YU10 plasmid pSsal-YU10, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
ttcttacactgttgatgacgatgctattcgta CRISPR spacer tgcctacactgtagatgaagatgctattacta Protospacer * *.******** ***** ********* **
137. spacer 4.3|2925069|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN018232 (Synechococcus phage S-B43, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
-tcagccatacagtcagaaagtctttgaagatg CRISPR spacer atgcacca-gcagtcagtaagtttttgaagatg Protospacer * .*** .******* ****.**********
138. spacer 4.3|2925069|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK016663 (Synechococcus phage S-H68, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
-tcagccatacagtcagaaagtctttgaagatg CRISPR spacer atgcacca-gcagtcagtaagtttttgaagatg Protospacer * .*** .******* ****.**********
139. spacer 3.13|2915638|41|NZ_CP017085|CRT matches to KY420199 (Proteus phage vB_PvuS_Pm34, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.805
tagaaactgctaccggtgcgcgtctgcagtctcggttcatc CRISPR spacer tagaaaccgccaccggtgcgcgtctgcagtctcttcttttt Protospacer *******.**.********************** .*. *.
140. spacer 4.10|2925496|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH616823 (Phage sp. isolate ctbf364, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
agtcgaacaccatttaataaaacattgtaaaa CRISPR spacer tacaaaacaacatttaataaaacattttaaat Protospacer .. .**** **************** ****
141. spacer 4.15|2925801|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010821 (Pseudomonas phage 201phi2-1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ttcttacactgttgatgacgatgctattcgta CRISPR spacer ggttaaaacagttgttgacgatgctattcgtc Protospacer .* * ** **** ****************
142. spacer 4.15|2925801|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF042360 (Pseudomonas phage Phabio, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ttcttacactgttgatgacgatgctattcgta CRISPR spacer tgtaaaaactgttgttgatgatgctattcgtc Protospacer * . * ******* ***.************
143. spacer 3.1|2915638|32|NZ_CP017085|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP007054 (Opitutaceae bacterium TAV5 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tagaaactgctaccggtgcgcgtctgcagtct CRISPR spacer tgtcaaatgctaccggtgcgtgtctgcaaagc Protospacer *. ** *************.*******. .
144. spacer 3.1|2915638|32|NZ_CP017085|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP022593 (Mycolicibacterium arabiense strain JCM 18538 plasmid pJCM18538, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tagaaactgctaccggtgcgcgtctgcagtct CRISPR spacer agcaacctgataccggtgcgcgtctgtgggtt Protospacer . ** *** ****************..* .*
145. spacer 3.1|2915638|32|NZ_CP017085|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP030074 (Streptomyces sp. ZFG47 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tagaaactgctaccggtgcgcgtctgcagtct CRISPR spacer cggacgctgctaccggcgcgcgcctgcagagc Protospacer ..** .**********.*****.****** .
146. spacer 4.15|2925801|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016890 (Pantoea agglomerans strain C410P1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ttcttacactgttgatgacgatgctattcgta CRISPR spacer gccttacactcttgatgacaatgctgcgctca Protospacer .******** ********.*****.. * .*
147. spacer 3.3|2915761|32|NZ_CP017085|CRISPRCasFinder matches to MK416018 (Klebsiella phage ST147-VIM1phi7.1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
taagccagaatgacaaagtgaaagcgatacaa CRISPR spacer ccgccctgagtgacaaagtgaaagcgatcttc Protospacer . . ** **.****************** .
148. spacer 3.5|2915884|32|NZ_CP017085|CRISPRCasFinder matches to MK416018 (Klebsiella phage ST147-VIM1phi7.1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
taagccagaatgacaaagtgaaagcgatacaa CRISPR spacer ccgccctgagtgacaaagtgaaagcgatcttc Protospacer . . ** **.****************** .
149. spacer 4.4|2925130|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AX059140 (Sequence 1 from Patent WO0075335) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
gcctcggatatcattgcgaacaatcatttcac CRISPR spacer catatatatatcattgtgaacaatgatttctc Protospacer . .. *********.******* ***** *
150. spacer 4.4|2925130|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004735 (Rhodothermus phage RM378, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
gcctcggatatcattgcgaacaatcatttcac CRISPR spacer catatatatatcattgtgaacaatgatttctc Protospacer . .. *********.******* ***** *
151. spacer 4.8|2925374|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LR721753 (Aliivibrio wodanis 06/09/160 plasmid 2 complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ataaccaagccttaaaaggtcgtctgcgcatt CRISPR spacer ataaccaagtcttaaaaggtagttcagattta Protospacer *********.********** **... .. *
152. spacer 4.11|2925557|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009819 (Streptococcus phage P9, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
taaacggttataaacatctaaagtcattaacg CRISPR spacer ataacgataataaacatctaaagtcgattttt Protospacer ****.* ****************. * .
153. spacer 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KY020154 (Klebsiella pneumoniae strain Kpn-431cz plasmid pKpn-431cz, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tttttctgttttgctgagagaaacgtaatcaa CRISPR spacer ggtcattgttttgctcagataaacgtaattct Protospacer *. .********* *** *********.
154. spacer 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016763 (Citrobacter freundii strain B38 plasmid pOZ172, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tttttctgttttgctgagagaaacgtaatcaa CRISPR spacer ggtcattgttttgctcagataaacgtaattct Protospacer *. .********* *** *********.
155. spacer 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021328 (Raoultella ornithinolytica strain Ro24724 plasmid pRo24724, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tttttctgttttgctgagagaaacgtaatcaa CRISPR spacer ggtcattgttttgctcagataaacgtaattct Protospacer *. .********* *** *********.
156. spacer 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP025467 (Klebsiella pneumoniae strain JS187 plasmid p187-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tttttctgttttgctgagagaaacgtaatcaa CRISPR spacer ggtcattgttttgctcagataaacgtaattct Protospacer *. .********* *** *********.
157. spacer 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018107 (Klebsiella michiganensis E718 plasmid pKOX_R1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tttttctgttttgctgagagaaacgtaatcaa CRISPR spacer ggtcattgttttgctcagataaacgtaattct Protospacer *. .********* *** *********.
158. spacer 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022441 (Klebsiella sp. LY plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tttttctgttttgctgagagaaacgtaatcaa CRISPR spacer ggtcattgttttgctcagataaacgtaattct Protospacer *. .********* *** *********.
159. spacer 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU318421 (Klebsiella pneumoniae strain KP04 plasmid pKP04VIM, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tttttctgttttgctgagagaaacgtaatcaa CRISPR spacer ggtcattgttttgctcagataaacgtaattct Protospacer *. .********* *** *********.
160. spacer 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_023911 (Raoultella planticola strain KpNDM1 plasmid pKpNDM1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tttttctgttttgctgagagaaacgtaatcaa CRISPR spacer ggtcattgttttgctcagataaacgtaattct Protospacer *. .********* *** *********.
161. spacer 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP025964 (Klebsiella pneumoniae strain WCHKP34 plasmid pIMP4_LL34, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tttttctgttttgctgagagaaacgtaatcaa CRISPR spacer ggtcattgttttgctcagataaacgtaattct Protospacer *. .********* *** *********.
162. spacer 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP038277 (Raoultella ornithinolytica strain WLK218 plasmid pWLK-238550, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tttttctgttttgctgagagaaacgtaatcaa CRISPR spacer ggtcattgttttgctcagataaacgtaattct Protospacer *. .********* *** *********.
163. spacer 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP046614 (Klebsiella pneumoniae strain WCGKP294 plasmid pWCGKP294-2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tttttctgttttgctgagagaaacgtaatcaa CRISPR spacer ggtcattgttttgctcagataaacgtaattct Protospacer *. .********* *** *********.
164. spacer 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP043515 (Enterobacter kobei strain EB_P8_L5_01.19 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tttttctgttttgctgagagaaacgtaatcaa CRISPR spacer ggtcattgttttgctcagataaacgtaattct Protospacer *. .********* *** *********.
165. spacer 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026014 (Klebsiella variicola strain 13450 plasmid p13450-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tttttctgttttgctgagagaaacgtaatcaa CRISPR spacer ggtcattgttttgctcagataaacgtaattct Protospacer *. .********* *** *********.
166. spacer 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026019 (Klebsiella pneumoniae strain 13190 plasmid p13190-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tttttctgttttgctgagagaaacgtaatcaa CRISPR spacer ggtcattgttttgctcagataaacgtaattct Protospacer *. .********* *** *********.
167. spacer 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026019 (Klebsiella pneumoniae strain 13190 plasmid p13190-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tttttctgttttgctgagagaaacgtaatcaa CRISPR spacer ggtcattgttttgctcagataaacgtaattct Protospacer *. .********* *** *********.
168. spacer 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF344561 (Klebsiella pneumoniae strain 11219 plasmid p11219-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tttttctgttttgctgagagaaacgtaatcaa CRISPR spacer ggtcattgttttgctcagataaacgtaattct Protospacer *. .********* *** *********.
169. spacer 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF344566 (Klebsiella pneumoniae strain A324 plasmid pA324-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tttttctgttttgctgagagaaacgtaatcaa CRISPR spacer ggtcattgttttgctcagataaacgtaattct Protospacer *. .********* *** *********.
170. spacer 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF344565 (Klebsiella pneumoniae strain 19051 plasmid p19051-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tttttctgttttgctgagagaaacgtaatcaa CRISPR spacer ggtcattgttttgctcagataaacgtaattct Protospacer *. .********* *** *********.
171. spacer 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF344562 (Klebsiella pneumoniae strain 12208 plasmid p12208-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tttttctgttttgctgagagaaacgtaatcaa CRISPR spacer ggtcattgttttgctcagataaacgtaattct Protospacer *. .********* *** *********.
172. spacer 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF344563 (Klebsiella pneumoniae strain 13190 plasmid p13190-VIM, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tttttctgttttgctgagagaaacgtaatcaa CRISPR spacer ggtcattgttttgctcagataaacgtaattct Protospacer *. .********* *** *********.
173. spacer 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF344564 (Klebsiella pneumoniae strain 13450 plasmid p13450-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tttttctgttttgctgagagaaacgtaatcaa CRISPR spacer ggtcattgttttgctcagataaacgtaattct Protospacer *. .********* *** *********.
174. spacer 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF042354 (Klebsiella pneumoniae strain 6TM plasmid pNDM_6TM, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tttttctgttttgctgagagaaacgtaatcaa CRISPR spacer ggtcattgttttgctcagataaacgtaattct Protospacer *. .********* *** *********.
175. spacer 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF042353 (Klebsiella pneumoniae strain 1TM plasmid pNDM_1TM, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tttttctgttttgctgagagaaacgtaatcaa CRISPR spacer ggtcattgttttgctcagataaacgtaattct Protospacer *. .********* *** *********.
176. spacer 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF042351 (Serratia marcescens strain 12TM plasmid pNDM_12TM, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tttttctgttttgctgagagaaacgtaatcaa CRISPR spacer ggtcattgttttgctcagataaacgtaattct Protospacer *. .********* *** *********.
177. spacer 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF042352 (Serratia marcescens strain 4TM plasmid pNDM_4TM, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tttttctgttttgctgagagaaacgtaatcaa CRISPR spacer ggtcattgttttgctcagataaacgtaattct Protospacer *. .********* *** *********.
178. spacer 4.12|2925618|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG736312 (Klebsiella pneumoniae strain KP91 plasmid pKP91, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tttttctgttttgctgagagaaacgtaatcaa CRISPR spacer ggtcattgttttgctcagataaacgtaattct Protospacer *. .********* *** *********.
179. spacer 3.7|2915639|34|NZ_CP017085|PILER-CR matches to NZ_CP007054 (Opitutaceae bacterium TAV5 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
tagaaactgctaccggtgcgcgtctgcagtctcg CRISPR spacer tgtcaaatgctaccggtgcgtgtctgcaaagcac Protospacer *. ** *************.*******. .
180. spacer 3.9|2915762|34|NZ_CP017085|PILER-CR matches to MK416018 (Klebsiella phage ST147-VIM1phi7.1, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
taagccagaatgacaaagtgaaagcgatacaacg CRISPR spacer ccgccctgagtgacaaagtgaaagcgatcttcag Protospacer . . ** **.****************** . *
181. spacer 3.11|2915885|34|NZ_CP017085|PILER-CR matches to MK416018 (Klebsiella phage ST147-VIM1phi7.1, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
taagccagaatgacaaagtgaaagcgatacaacg CRISPR spacer ccgccctgagtgacaaagtgaaagcgatcttcag Protospacer . . ** **.****************** . *
182. spacer 4.4|2925130|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN657098 (Psychrobacter sp. strain ANT_P42 plasmid pA42P5, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
gcctcggatatcattgcgaacaatcatttcac CRISPR spacer aagatggataaaattgcgaacaatcattaatt Protospacer . .***** **************** .
183. spacer 4.13|2925679|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694201 (Marine virus AFVG_250M801, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
aacagaaataacagctgcgatacgttctattt CRISPR spacer gttctcgttaacagctgcgatatgttcaattg Protospacer . . . **************.**** ***
184. spacer 4.13|2925679|32|NZ_CP017085|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694455 (Marine virus AFVG_250M805, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
aacagaaataacagctgcgatacgttctattt CRISPR spacer gttctggttaacagctgcgatatgttcaattg Protospacer . . .. **************.**** ***
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
141738 : 230362
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017085|141738:230362|DBSCAN-SWA TTCAGACTGATGTCTGAATCACCTCGGCGGGTTCCTGCTTCGACGGGCGGTCTGACTGCACCCTCCCTCCACAGGCAAGCACGGCATGTCCTGCCGCTAAAATGTTACGTGCCGCATTGATATCAGCATTCGCTGTATATCCACATTCAAGGCACTCGAATTGACTTTGTGACTGGCGGTTTTCCTTTGCTGTATGACCACAGCAAGCGCACTTCTGACTGGTGTAGGCGGGTGGTATTGCCACTACCTGACCTCCTCGCCAGAGCTGCTTGTACTCAAGCTGACGGCGCATTTCATACCAGCCCTGCTCCAGTATTGAGCGGTTTAAACCAGATTTAGCTTTTACGTTCCGTCCAGGCCGTTCTGTCGTACCTTTGGCCGATTTAGACATGTTACTGACCTTTAAGTCCTCAATGACAATCATTGCGTGGTTTTTGCTGATTTCGCTGGTGACTTTGTGAAGGGAGTCTTTCCTGATATTGGCAATATGAGAATGCAGACGTTGAATTTTGTGCTTTTGTTTTTGCCAGTTGGCACTGAATTTGATTTTACGGCTTAATTTCCGTTGAAGCCTTGCCAGCTTTCGCTGGTTGACTTTAAAACTGCTGACGGGCGGGTATACCGTACCGTCTGAAAGCGTGGCCAGTTTTGTAACGCCTGCATCAAGCCCGACTATTGAGGTTGATTCATGTTGTGCTTCTGTCGCTTCATACTCAGTCTGAATGCTGACGTACCATTTACCGCATGACTGACTGACCGTGACGTTTCTCACTTCTCCGACGACTTCACGACTATTGCGGTACTGCATCCATCCCAACTTTGGCAATGATATACGACTATTGGATTGATCGAGCTTCACGCCCTGCGGGTAGCGAAAAGCGTCATTTTTACCGCGTTTCTTGAATCGAGGAAAAGCGGTACGCTTCTGGAAAAAATTCTTGTAAGCCCGTTCCAAATCTTTAAGTGACTGTTGTAACGGTTGTGATGGGGCTTCCTTCAACCATTGTGTCTCTGTGTCAGATTTCCACTCAATGAGCCATGAAGCCATTTTTGTATAGGGAATGTATTTATTCCCTGCTTCGTAATTCTCATTCTGACGTGCTAATGCCCGATTGAAAACAAAACGACAAGCCCCTGCAAAGCGTCTCATCTCACGCTCTTGCTGACCATTGGGTCTTAACTGGAATTTAAAGGCTTGTAGACGTTTCATATTACCTATTATACCTTGGTCTATGAAAAATGAAACTAATATTTGCCGTGGCAGACATTGTGTGTTCCTGATGCACATCAATTTGGTCTTTGTCACAAAATACCGGCGAAAAATATTTGATCAGGATGCAATTGAAAAATTGCGAGGCTACTTTGCCAGTGTTTGTGCTGATTTTGATGTTGAACTGGTTGAAATGGATGGGGAACGGGATCACGTTCATTTACTGATTAATTACCCGCCAAAACTGGCGATATCTAATCTGGTTAACAGCCTTAAAGGGGTATCGAGTCGATTACTTCGACGTGATCGTCCAGATATTGCCCAACGTTATTACTACAAGGGGGTTCTTTGGTCGCCAAGTTATTTCGCGGGGAGTTGTGGTGGCGCACCAATATCCCTTATCCGCCAGTACATTGAGCAACAGGAAACACCTAGTTAGTTAAAAAACCGCGCCTTATATCCCCGACCTGAAGGACGGGGTTTTACGGTGCTTTGGATAAATCAGATAGTGCAGTGTGTTAATCTATTATAGAACGTTAATACACTGCCAATAATTCATATCCCCCGCTACTCTATATATTAGTAAAACTATTATTTTTATCTTATCGATAACTGACTATCGCGCTATCAGAAATGTTGAAATTGTTTAAATTTAATATAGCCAATTAAAAAAAATATTATTTTTTCAATAGTTTTTATTGTTTCTATATGGAGTTAAATGGATTTCTCTCACTATAAAAACACTTTAAATTGGTCATATCACTTACAAACACGAAATATTAAAGATATTATTTTAAACAAGGCGATTATTTTAGATTAATAATCTAGAGAAATAATAACAATAAAAAGAAAAATGGTGAAATATTTATAAGAAATAGAATTAACACCATTAAATATCAAATAGTTACAAATTTCTAATTCGTTATAAAAGCACTAGCAAAAAATTTATTTTTTATGTACATAGTGTTTACTGGGCTGCGAGCAATTTGTCTATTTCTTCATCATATTTTATGCTAATAAACACTTTTTATGATTATTTTTTCAGCATGATATAGCGATATTTCAACCAGTTTACGCTAAGTGACTTATCCTAGAGAGATACAACAGCAAGGGGCGGTTTACAGCCTATTGATAAGCTTTTATTATCCTTTAATCAAGTCTTACCGTGCGCACTGGCTAAGATGACGGACATAACTAACGGATTGTTTTTAAGACAATCATTTAATTTAATTTGTCATTTTTAATAAAAGGATCTCATTATGCCAACTCCTTGCTATATTTCCATTGAAGGAAAAACTCAGGGCAACATCACTGCAGGCGCGTTTACTGCAGATTCTGTCGGCAACATTTATGTACAAGGTCATGAAGACCAAATGTTGGTACAAGCATTTTCTCACGTGGTGACGGTTCCGACCGATCCGCAATCAGGACAACCTTCCGGCCAACGTGCGCATAAACCATTTCGTTTTACCGTGGCATTAAATAAAGCGGTTCCCCTGCTGTATAACGCATTGGCTTCCGGCGAAATGTTGCCAAAAGTCGAGCTAAAATGGTATCGCACGTCTGTTGAAGGTAAACAAGAGCACTTCTTTACCACGACGCTAACTGACGCGACTATCGTGAACATCGATTGCCAAATGCCTCATTGCCAAGATCCGGCTAAAGCCGACTTCACGCAACTTATCGAAGTCTCCCTCTCTTACCGCAAAGTTGACTGGGAGCATACTGTTGCCGGGACTTCAGGTGCAGATGACTGGCGTGCACCACTCGAAGCATAAGTCATGGGTTAAACGAGTCCTTAGGGGCTCGTTTACCGTTTTAGTCTCCTACTTCCCGTGAAGGATTATTGGATGTCTATAACAAATTCAAAAAAATATCAAAGGCTGGGTGATAAGGATGGCAACCCACTGAATGGGGGTAAGACATTAACCCATGGCGGGGGCAGAACATACGCGCAAGATCTCGCTTTACAAGAGCAACATAGACAACTTATAGAGAAGATCTTAAGTGGCGACATGCAAAGTGGCTTAGTGTTTACTTGTCAGATTGGTGGATTACCCGAAGAGACTTTCCAAGTCACGCAATTCGATTTACAAGAAGGGATCTCACAACTTTTCACTCTCTCCATCCAAGCCGTCAGTCCACTCTCGGAAATTGATTTTAATGATGTGTTAGGCATGGCTTCCAGTTTGACAGTAAAGCGAGATGGTCACATTCTGCGTACAGTACAAGGTATCTTAGCGGCGGCAGAGCAAGGGAATACCGATGGGGTAAAAACCTGGTATCAATTTGTGATACGTCCTGAAATGTGGGTAATGACCCTCAAACAAGATAGTCGTATTTTTCAAGATACCACCGTTCCTCATATTCTTGAGACATTACTCAATGAGTCTCACATTAAATATGATAAACAGCTTTATCACCCAGAAGAGCATTTGCAGCGCGCCTATACCACTCAAAAACGAGAAACAATGTATGACTTTTGGTGCCGTTTAGCCGCAGAAGAAGGGATTAATTTTTGGTTTGAAGAAGGCCCACAGTTATTTTATAGCGACCGACATTTGGGCATGAGAGCGGGGATATCCTTAACCTATAACCCACAATCGGATACAGATATCACCGATAGCACCGCCACAACGTGGCGCTATGTTGAACAACTCTGTAGCGATATTCGCGTTGATAAAGATTACAATCAACTTAGACCTTCCTACCCCTTAAGCCATCAAGTCACAGGAGAGGTTCATCAACAACATGAAATATTTGAAAGTTATGGACGCTTTGAAGAAGATGCACAGGGACAACCCTTTAATCAGATACGTTATGAACAATCACAAAATCAGCGTCAAGTAGGCTCTGCGACCACAAACTGCATTGAATTAGCGCCGGGGCGTATTTTTACCTTGTCTAACCACCCCAGTGCACGCATGAACACCACATGGCAGGTGATTAGTATCTCACATCACGGTGTGCAACCTCTTGCCGACAACAGTGGCGGTGAAGGAACGCAATTGAGTAATCAGCTTTCCTTTGTGCCGAGTACTCAAGAGTGGCGCCCGCCTTACCGTTTTAAACCTACCGCCGATGGTGATGAATTAGCCACTGTCGTCGGCCCGCCGGGCGAAGAAATCTATACCAATGAGCAAGGTGCCGTTACGGTCTATTTTCATTGGGATAGGCGTGGTAAACCAGACCATAGCGCATCATGCTGGGTAAGAGTCGCTCAAGGTTGGAATGGGGACGGATTTGGCTTTATGGCTATTCCTCGTGTTGGGCAAGAAGTGATTATCTCTTATTTAAACAATGATATAGATAAACCGATTATCACCGGATGTACCTATAATGGTCGCAATCGTTCCCCCATTGATTTACCTAAACATAAAACCCGTACCACATTTCGCACCAAAACCCATAAAGGAGACGGGTTTAATGAATTGCGCTTTGAGGATAAAAATGGCGATGAGGAAATTTATCTTCATGCGCAACGCGATAATAATATTCATATTAATCATAATAAAACCCAATACGTTGGGCATGATGATAGCCATACTGTCGCCAATAATCGTAAGCATGAAGTGTGTCATGACGAATTTATCCACATCGTCAATGAGCAAACAGTACAGGTTGATGTCAATCAATTTGAACAAATAGGGAAAGACCGTATCACACGCATTGACAATAGTTGGAAAGAAGTTATCCACGCCAGTCACTTTCAGGAAATCGGGGAAAACAAGCAGTGTGATATCCAAAATGATTATACCCTGAAAGCCGCAGGGGGTATCCATACCCATAC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79 | Escherichia_phage(24.0%) | integrase,transposase | attL 187548:187561|attR 234160:234173 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
261409 : 318232
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017085|261409:318232|DBSCAN-SWA 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46 | Helicobacter_phage(15.38%) | integrase,tRNA,transposase | attL 284725:284739|attR 322558:322572 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1285130 : 1334932
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP017085|1285130:1334932|DBSCAN-SWA 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30 | Organic_Lake_phycodnavirus(50.0%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_4 |
1439259 : 1451220
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP017085|1439259:1451220|DBSCAN-SWA 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GCTTCAGTTTGTGTTTGATAAAGGAATATTGATAAAAAAACGACGTAGTGAGAAGGGGGATAGATGTGATTAACCAAGAAGAGCTTAATTGGCGATTAACCCCAATTAGGCTTTTATTTTAGTGAGACTTGCTAAAACTAGGTGACAAATCAATAACGAAATAATAAGAATTAATATAAGAAGTAAGGTGAAAGAGAAAGAGAAAGATAAAGAGAAGATACTGCGTAATATTGCTTCTTAAGTACGTCTAATGCCCCCTAATAGGGTAAGGGGGCAAATAGAAAAAAATTATAACACCATGCGAACAAGCTCTAATTCACCTAACTCTTTATAGAGGGTTTCTACTTGTTCAATATGCGTTGCGTTGATAGTCACAGAGACTGAGTGATAGTTACCTTTGCTACTTGGTTTTACTGAAGGTGTATAATCACCGGGTGCATGACGCTGGATCACTTCAACGACTTGGTCAACTAATTCAGGTTTAGCATGTCCCATGACTTTGTAAGTAAATGAGCAAGGGAACTCTAATAGTTCGTTTAATTTTGTTTTCATCATAATGTAATCCTTAAGACAACAGGCGATGTTGTTTTAATAATCTCTTTTACACCTCATCAGCACAAATAAAAAGCGCATTCCTCCTATAATGAGGAATGCGATACTGATAGTTAGGGTAAATATAGAATGGGTAAATGTGTTTATTCCAATATCGATATAATCTTTATATATGGACACATTTATCCTTTTCAAGCCTTAACCAAACCAACGTGAAAATAATAATTTGATGTAATCAATCAAGCGGCTGAAAATGCCACCTTCTTTCACTTCATTCATAACAACAAGTGGACGTTGTTCAATGACTTGCCCATCAAGTTGGAAATTAATGGTGCCAACCACTTGGTTTTTACTGACTGGGGCATGTAATTCAACATTATCTAATACATAGCTGGCCTTTAGATCTTTGAGTCGGCCACGGGGGATCGTGAGATAAACATCTTTATCAACCCCTAATTGCACTTTATCAGTATCACCATACCAGATAGGTTCAGCAGCAAATTCTTTACCCACTTGCAGTGGTTTTACCGTTTCAAAGAAGCGAAAACCCCAAGTAAGTAGTTTTTTACTTTCAGCATCACGGCCTTTAGATGAGTGTCCCCCCATCACGGCAGAAATCAAGCGCATATTTCCTTCTGTTGCAGAGGCAACAAGATTATAACCTGCAGCTTCAGTATGACCCGTTTTAATACCATCAACATTGAGGCTAGTATCCCAAAGTAAACCATTACGGTTAGTTTGACGGATATTATTGTAGGTAAACTCTTTTTCTTTATAAATGGCATATTCTTCTGGAACATCACGAATTAATGCGGCGCCAATCAATGCCATATCTCGTGCACTACTGTATTGCCCAGGTGCATCTAAACCATGTACAGTTTGAAATTGTGTGTTTTGTAAACCTAGACGCTTAACATAGTCATTCATCATAGTGACAAAAGTATCTTGGCTTCCCGCAACATAAGAGGCCATTGCTACACAGGCATCATTACCTGATTGTAGATTGATACCGCGTGTTAATTGTGAAACGGTGACTTTATCACCGGGTTTTAAAAACATTAATGATGAACCGCGAAAGACAGGGTTGCCCGTTGCCCATGCTTCTTCACCAATAGGAACAATATCGTTGTTTGATATTTTTCCTGCACGAATGGCTTGACCTATAACATAACTGGTCATCATTTTGGTTAAACTGGCTGGATCACGACGGACATCTGCATTTTTTTCCGCGAGGACTTTCCCAGAATTATAGTCGATAAGAATATAGGATTCGGCTTCGATATTAGGAACAGCGGGTATCATTGTTTTTAATGTGTCATCAGCAATAGCATGATGGCTAATAGCTAATAATATAAAGGTTGCACTAAATAGACGTGTTCTTAGTAATTTCACTGGGCGTGTCTGTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP017085|1439259:1451220|1444632_1444857_-|WP_004246071.1|DBSCAN-SWA MSVILYTKPNCVQCSATERALQQQKIPFTAVDLTQDTQALAKIVSMGYRQVPVVVNGDEHWSGFCPDKIRQIAR >NZ_CP017085|1439259:1451220|1441067_1442036_-|WP_012367584.1|DBSCAN-SWA MSASYLSRVNAINWNRIEDEKDLEVWNRLTMNFWLPEKIPLSNDIPSWNTLTQAEKQLTIRVFTGLTLLDTIQNTVGAPTLMPDAQTPHEEAVLSNICFMEAVHARSYSSIFSTLCLTTDVDDAYRWSEENTYLQKKSDIILRYYQDSDPLKKKIASVFLESFLFYSGFYLPMYWSSRGKLTNTADLIRLIIRDEAVHGYYIGYKFQNQLLNKSSLEKQNIKDFAFSLLLDLYDNEVKYTEDLYDSVGWTEDVKKFLHYNANKALMNLGYEALFPDEITNVSPAILSSLSPDANENHDFFSGSGSSYVIGKTINTEDDDWDF >NZ_CP017085|1439259:1451220|1445138_1445612_+|WP_004246069.1|DBSCAN-SWA MYQDYLNTPKGFPKPYISITADDDGITSLNFVSEKEALVNSNAIIDLCIKQLKEYFSGKRTLFSVPLAPKGTEFQIRVWQTLQSIPYGEIWSYKKLALTLGSVNYCRAVGMANSRNPISLIIPCHRVIGHNGKLVGYTGGLDIKRWLLHYEKVDIDE >NZ_CP017085|1439259:1451220|1445809_1446019_+|WP_004246068.1|DBSCAN-SWA MSKLKGNVKWFNETKGFGFITPEDGSKDVFVHFSAIVSEGFKTLAEGQKVEFEVTDGAKGPSAANVVAI >NZ_CP017085|1439259:1451220|1439259_1440459_-|WP_096043046.1|DBSCAN-SWA MAIKLEVKNLYKIFGEHPKRAFELLGSGMNKDQIFDKTGLTVGVQNANLAIEEGEIFVIMGLSGSGKSTLVRLLNRLIDPTKGEVLIDGENITTMSDKDLRQVRRKKISMVFQSFALMPHMNVLDNTAFGMELAGISKEERYEKAMAALEQVNLSSHAQSWPDELSGGMRQRIGLARALANDPDILLMDEAFSALDPLIRTEMQDELLSLQGDKQRTIVFISHDLDEAMRIGDRIAIMQGGVVVQIGTPDEILNNPANDYVRTFFRGVNISHVFSAKDIAKRRPETLLHIAPGFGPRSALKVLEDEDRNFGYLIERGRKFAGIVSVTSLEEALKAKQPIGSAILTEPCAINGDTPLNELISTVAQSPCAIPVIDEKNRYIGLISKGMLLQALDKETPNE >NZ_CP017085|1439259:1451220|1448544_1449189_-|WP_004246056.1|DBSCAN-SWA MKIFTVQDKTIIIRQLGMKPYLPVSDSMHQFTEKRESHTPDEIWLVQHEQVFTQGQAGKAEHLLNTGSIPVIQSDRGGQVTYHGPGQQVMYVLLDLKRNHIGVRQLVTVLENTVINTLAEFNVDAYARADAPGVYVNGDKICSLGLRIRKGCSFHGLALNVDMDLSPFTRINPCGYPDLKMTQLVDLAPNATSEQVASLLINHFCTQLGFQPQQ >NZ_CP017085|1439259:1451220|1444216_1444621_-|WP_004246072.1|DBSCAN-SWA MQSTAPLIYFSSRSENCHRFVQKLNLQATRIKEDEPLQATQPFVLLCPTYGGGGVKGAVPKAVIQFLNIPENRQLIRGVIASGNTNFGSAYGLAGDIIAQKCQVPFLYRFELLGTPEDVKRVKTGLSTFWSASK >NZ_CP017085|1439259:1451220|1449546_1449810_-|WP_026090527.1|DBSCAN-SWA MKTKLNELLEFPCSFTYKVMGHAKPELVDQVVEVIQRHAPGDYTPSVKPSSKGNYHSVSVTINATHIEQVETLYKELGELELVRMVL >NZ_CP017085|1439259:1451220|1447477_1448443_-|WP_004246057.1|DBSCAN-SWA MSKPIQMERGVKYRDADKMALIPVKTIVTEREELLRKPEWMKIKLPADSSKIQGIKAAMRKNGLHSVCEEASCPNLAECFNHGTATFMILGAICTRRCPFCDVAHGRPNAPDPQEPIKLAQTIKDMGLRYVVITSVDRDDLRDGGAQHFADCITAIREKNPNIRIETLVPDFRGRMDKALEILTDTPPDVFNHNLENVPRVYRQVRPGANYQWSLTLLERFKQAHPNIPTKSGLMVGLGETNEEIIDVMRDLRKHGVTMLTLGQYLQPSRHHLPVQRYVSPDEFEYMKEQALAMGFTHAACGPFVRSSYHADLQAQGIEVK >NZ_CP017085|1439259:1451220|1450008_1451220_-|WP_004246054.1|DBSCAN-SWA MKQTRPVKLLRTRLFSATFILLAISHHAIADDTLKTMIPAVPNIEAESYILIDYNSGKVLAEKNADVRRDPASLTKMMTSYVIGQAIRAGKISNNDIVPIGEEAWATGNPVFRGSSLMFLKPGDKVTVSQLTRGINLQSGNDACVAMASYVAGSQDTFVTMMNDYVKRLGLQNTQFQTVHGLDAPGQYSSARDMALIGAALIRDVPEEYAIYKEKEFTYNNIRQTNRNGLLWDTSLNVDGIKTGHTEAAGYNLVASATEGNMRLISAVMGGHSSKGRDAESKKLLTWGFRFFETVKPLQVGKEFAAEPIWYGDTDKVQLGVDKDVYLTIPRGRLKDLKASYVLDNVELHAPVSKNQVVGTINFQLDGQVIEQRPLVVMNEVKEGGIFSRLIDYIKLLFSRWFG >NZ_CP017085|1439259:1451220|1442061_1444188_-|WP_004252248.1|DBSCAN-SWA MTHSIEQLDYHALNAMLNLYDEQGNIQFDKDKLATHHFFRQHVNQNTVFFHDLKEKLDFLVQQHYYEAQVLEQYDFPFIKQLFKHAYSKKFRFQSFLGAFKYYTSYTLKTFDGERYLERYEDRVCMVALTLAQGNTKLATHLVDEIISGRFQPATPTFLNCGKKQRGELVSCFLLRIEDNMESIGRAVNSALQLSKRGGGVAFLLTNLREAGAPIKRIENQSSGVVPVMKMLEDAFSYANQLGARQGAGAVYLHAHHPDIYHFLDTKRENADEKIRIKTLSLGVVIPDITFELAKRNEDMYLFSPYDVERVYGVPMSEISISEKYTEMVNNAEIRKKKIKARAFFQTLAEIQFESGYPYIMFEDTVNRANPIAGRINMSNLCSEILQVNSASEYNPDLSYRQIGHDISCNLGSMNIAMAMDSPDFAHTVNVAIRALTSVAQMTKIESVPSIEKGNQASHAIGLGQMNLHGYLAREGIYYGSEEGLDFTNIYFYTVTYYALLASNQLAIETKQRFKGFEQSKYATGEYFDKYLSKQWLPKTQKVHQLFSQSNIHIPTQEDWQKLKLSIMTHGIYNQNLQAIPPTGSISYINHSTSSIHPIVAPIEIRKEGKIGRVYYPAPFMTNENRHFYQDAYEIGAEKIIDTYAQASQHIDQGLSLTLFFSDEATTRDVNKAQIYAWRKGIKTLYYIRIRQTALAGTEIKGCVSCAL >NZ_CP017085|1439259:1451220|1447087_1447462_-|WP_004246058.1|DBSCAN-SWA MLNIAIAVFIGGGLGSVLRWLISYRLNSLFPHFATGTLVANCIGAFIIAFGIAWFSKAPNIDPIWKIMLTTGFCGGLTTFSTFSVEVVALFNEGRIGWALGTMGANLAGSFLMTAFAFWLLREM |
12 | Mycobacterium_phage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1487125 : 1527095
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP017085|1487125:1527095|DBSCAN-SWA 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60 | Proteus_phage(19.51%) | integrase,lysis,tail | attL 1484766:1484781|attR 1494857:1494872 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1708928 : 1787998
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP017085|1708928:1787998|DBSCAN-SWA 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59 | Bacillus_phage(17.65%) | plate,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1948072 : 2026316
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP017085|1948072:2026316|DBSCAN-SWA 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98 | Enterobacteria_phage(20.63%) | capsid,tRNA,lysis,terminase,portal,integrase,tail,head,protease | attL 1969986:1970002|attR 2014076:2014092 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2610026 : 2643748
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP017085|2610026:2643748|DBSCAN-SWA 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39 | Escherichia_phage(22.22%) | holin,terminase,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2832207 : 2851010
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP017085|2832207:2851010|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP017085|2832207:2851010|2836170_2836713_-|WP_004243612.1|DBSCAN-SWA MVPYQPVLTFWFEECTPKQWFQKDSAFDKEIKDRFGELCISASRAELASWRESIEGRLGEIIILDQFSRNIWRDTPKAFAQDNMALILAQEAIRLPEYLTLTPVKRKFLIMPFMHSESQKIHQDAIALFSQLNDDDTYQYELRHKEIIDKYGRYPHRNEILGRTSTPEELAFLQQPGSSF >NZ_CP017085|2832207:2851010|2842758_2843247_-|WP_004250719.1|DBSCAN-SWA MITEVRIFDLASFTTLFDSVNPTQVTIDDSHQAITFTVENGESRSDHVVINPISISISLLLTGDIANAYATIKQLYDENTLVGIQTRVSTYQPMLLESLSHDEDPSKVDAIELKLKFIEWKSIEPEYNKKSAKSTKKPKQSSTINRGNVKSKKSMPIGKKQG >NZ_CP017085|2832207:2851010|2840949_2841642_-|WP_004243621.1|DBSCAN-SWA MSKPNNDIASVGSLAGAFSSAFRHLMMNTDDMLPATVIDYDEKSNRAVIKPLVMMLTTDNQTISRAPVANIPVFRFGGGGFFIRAPIKAGDFGWLKANDRDISLIFQRGGLEDRPNTTRLHTFSDAMFFPDTLKGWVIDGKNIDALVIQSMDGSVCFSLHNDKVVLETPKYEINARETIFTGNVTVNGNYAVNGNSDSQGGVMRHNGKDIGSTHRHSGVQAGKDNTGSPI >NZ_CP017085|2832207:2851010|2849514_2849814_-|WP_004248367.1|holin|DBSCAN-SWA 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21 | Escherichia_phage(21.43%) | holin,lysis | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
3327809 : 3398346
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP017085|3327809:3398346|DBSCAN-SWA 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95 | Salmonella_phage(17.81%) | tRNA,lysis,terminase,holin,integrase,tail,head | attL 3343623:3343669|attR 3393954:3394000 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
3666217 : 3675061
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP017085|3666217:3675061|DBSCAN-SWA TTTATTCTTGTTCATTGATTAACTCTTGTTTCTGCTCTGGCTCTTTTTCAAGATCGTCAATATTAAAGACTGCGACATTATCCATCAGCACTTGTGCTTTATCGTTTAACATCATGGTAGAAGAGGCGGCAAGATCGACCAAAGAGGCATTTTGTTGTACTACCGTATCCATTTGATTAATTGCTACTGCAATTTGTTCGACACCAAGACGTTGCTCTTCCGACGCTAAACTAATCCCTTGCATGATCTTGTTTACTTTTGAAATGGAAGAGACAATCTCTTGCATGCACTCACCGCTTTTATTAACTAAATTTGTACCATAGGTAACATCATTGATAGATGCTTTAAGAACTTGGCTAATCTCTTTTGCTGCTTCAGCACTTTTTGCGGCTAAGTTCCGTACCTCAGCGGCCACAACGGTGAACCCACGCCCTTGCTCGCCAGCTCTTGCTGCTTCTACGGCAGCATTTAAGGCCAAAATATTAGTTTGATTGGCTAATTTATTAATAACATCATTAATTTCCCCAACTTTCACTGCACCTTGTTCTATTTTCTTCATCGATAACACGGCTTCTTTCATGACATTAGCGCCATCCATAACAATGTCAGTAGATTGATTAATAATATTATTTGCTTCAATTGTGTTATCGGTATTGTTAGCAACGGCTATTTTGATCTGCTCCATACTGGCAGCGGTTTGTTGTAAAGCACTGGATTGTTCTTCTGTACGAGATGAAAGCTCTTGATTACCAGAAGCAATTTTAAATGCGCCCCCTTTTATATCCATAGCCTCTTTTTTGACAGAAAAGATTGTCGAGGTTAATGCTTTTTGCATATCACTGACACGGGAAAAAAGTTTACCAAACTCATCATTTTTTACTTGTGGTACAGAAAAAACCAAGTCAGCATTACCTACTTTATTTAATATCTCAGACAATGTATTAAGATTAGAGACAAAGGTTTTATTGATCCAATGAAGCACAAAGTACAAAACAATTAATAAAATAATTAATGAGATAATTGTTGAGTAGATAGAAAACTCAACCATTGAATCTTGTTTATGAGTAAGGTAGAGACTATTTTTATTTCTAGTCTGAATATATTTTTCAAATAATTGATCAAGATGTTCAAAATCTTGATCAAATTGATTAGCTTTTATCTTTATTGTCGCTAATTTATTAGGATCTAAAACTAATTTATCTATCAGATTATAAAATAACGTCGAAATATCATCAGCATTTTTTTGTGCTGCAACAGTCATTTTCTTCTCTTTCACCCATGTTTCCATGGTGTTTTTAGCCATGATAGCTAGCTTTTTATTTTGCTGAATAATTTTGTTACGATCTGCGACACGACTATCTTTGTCTTGTAATAGATAATTGACATTAGAACGCATAATAGCCAGTTGATAACGAGCCATCAACACATCGTCATAACGTGCAGATAAGACATCAACTTGAGTAAAATTGTTTTGCATTTTATAAATAAAAAATGAAGATAAGGCAGACGATAGAATAAAAATCAATAACAGTAAAGAAGAGCCTAATTTTACGGTTCGTTTAATACTCATGATAAAAATACCTATATGCGCATATCGATAAGATTTATTTTTTATCGACACAATGATATTTTTATTTAATTATTAGAGATAACACTAGGTCATTGATTTTTATTTTAAATAAATTTTTATATCATAAACAAAATAAGTTATTTTTAATAACTGCTATAATTATTAGTATATTATAAAATAAAACAAACCAATTCTTTTAAAACATAATTCGCTATCAATTAGTGCATTCTTCTTTATGCTCAATATCAATTTTCATTTTATATGACTAATATCATCAACGATTAAAAATAAAAACCTTATTTTTTCAATAAGATACTGATGATACTATCTCATTTTGAGAACAATGATATAATAGGCGCTTTACCTCATAAACTCTGATGATTTACGGAGCTCAATATTTATGCAACCACAATTTGAAAACGCAAAAAACACCGTAAAAACATTATCAGTGTTTGATTTTGATGGTACTTTAACCTATCACGATAGCTTTATCCCTTTTCTAAAGTTTGCCTTTGGGCGTCGTAAATTTGCTCGTCGTATTATCAAAATGGTATTCCCCACATTACGTTGTTTTAGACGTAAACTGACTCGTGATGAATTAAAAGAAGTGCTGATTAAAACTTTTTTAACCGATATCAAAGAAGAATGGCTCAAAGAAAAAGCCGAAGCCTTTTGTAAAGCTTACTGGAGTAAGTTAATGCGTCCTGCAGGTTTATTAGCCGTTGCTGAAGAGATTAACCGTCATGCTGAAGTGACCATTTGTTCAGCTTCTCCAGCTATGGTGTTGCAACCTTTTGCGGATCGACTTGGTATAAAGTTAATAGGAACAACACTTGAAGTGGTTGATGGTGTGCTGACAGGAAAAATCATTGGCAATAACTGCCGTTGTGGCGAAAAAATCAAACGATTAGAGCGTGTCTATGGCGATCTTACTCAATACCACTTAAGGGCGTGGGGCGATTCACGTGGTGATCATGAATTACTCTATGCTGCACAAGATCCACATTGGCGCTATTTCCACACAGGAAGTAATAAGTCAAAAAAATCACCTATTAAAATAACGCTTAAAAAAGACTCATAAGTGTTTATATAAAAATAAAGCGGGAAACGTATTTTCCCGCTTTATCCATAAACTAACTATTTATCTAGTCATCTTGGCGCTTTTATTAGCGAAAGATTAAATATTGACGCCATGTTGTGCGGCTAGTGCGCCTAAACCACCCGCAAAACCTTGGCCTACTGCTTTAAATTTCCAATCTGAACCATGACGATAGAGTTCACCAAAGATCATCGCCGTCTCCGTAGAGGCATCTTCAGAAAGATCAAAACGTGCAATTTCAGTGTTATTGTCGTTATTATAAACGCGCATAAAACTGTTGCTCACCATACCAAAGTTTTGTTTGCGGTTTTCAGCATCGTAAATAGTGACAGCAAAAACCAGTTTTTTCACTTCAGCAGGAACTTTGGATAAAGTGATTTTGACTTGTTCATCATCACCTTCGCCTTCTCCAGTACGATTATCGCCTTGGTGTTCAACACTACCACATTGGCTCACTTTATTATTAAAGAAGATAAAACTTGCATCTGAAAGCACTTTTCCATCTTCACCGACCATGAATACTGACGCATCTAAATCAAACTCAGCGCCATCTGTCACGCGGGCATCCCATCCTAAACCAACCATAGCCACCGTCATGGTTGGTGCTTCTTTAGTTAGCGAAACATTACCACCTTTAACAAGGGAAACAGCCATATCAAAGCTCCTACTGTGTTGAATAAACTGACAATTAGGAATAACTGCCAGTAATTTGTGATTTCATAACATACGATTAAGAGGCGTTAATACCATATTGCGCACATACTGAGCCTAAGCCCCCTGCATATCCTTGGCCTACAGCACGGAATTTCCACTCACCGTTATGACGATATAACTCACCAAATAACATCGCCGTTTCCGTTGATGCATCTTCCGTTAAATCATAACGAGCAACTTCAATTTGGTTGTCATCATTAACTAAACGAATAAACGCACCAGATACCTGACCAAAGCTTTGACGACGCGCTTGCGCTTCATGGATAGTCACTACAAAGATAATTTTTTCGACATCACTGGGGATGGTATCTAGTTTGATTTTTAGTGCTTCATCATCACCATCACCTTCACCTGTTCGGTTATCACCAGTGTGAACAACAGAGCCGTCGGCAGATCTTAAGTTGTTATAAAAAATGAAATCGGCATCGCTACGTACTTTTCCATTAGCGGCTAACAGAAATGCAGATGCATCTAAGTCAAAATCTTGACCATCTGTAGAACGGGCATCCCAACCAAGTCCGACTAGGACGTTTTTCATCGTTGGGGCTGCTTTGCTTAAAGAAACATTACCACCTTTAGAAAGAGAAACGCTCATCTTCAACCTCTTCAATTTATGTTGCGATATTCTAATTTCCCAAGAATATCGGTTATCATTATTTACCTTATTTATTCTTTTTTTCTGGGAATACAAAACTTGCCAGAATACCCAGAGCAAGAACACCAAGCACTACGAATAGGCTGGTTGTCGCGGAAATGCTATATCCATGCTGCCAAATATGATCTGTTGCATTAAGCCCCAGCTTTACAGCAATAAAGAACAGCAATGCAATAACCGCTTTTTCAAGGTGAATCAGATACTGTTTTAATGCCTCTAACACAAAGTAGAGAGTACGTAAGCCCAAAATAGCGAACATCATTGCACTATAAACAATCAGTGGCTCACGACTAACGGCAATGATTGCAGGCACCGAATCGAAAGCAAACATCACATCAGAAAGCTCTACCACCGCCACACACAACATAAGCGGTGTCGCATATAACGCAGCTTTTGTACCTCGCCCGATAGTTATGTCTTTGTTTTCCGGTTTTGCTAACTCTACATCAACCTCTTTTTGTGTTAATAAGAAGGCATGTCCAGTAATTTTTGGCCATATAGGGAAAAATCGTTTTACTAAGCGATAAGCAAGATGCTGTGAATAGTCTTCAATTTCTTCACTATCATTCCCACTTCTCAGCATCATTACGGCTGTCCAAGCAACAATCAGAGCAAAGACTATCTCAACGTAAGGCCCTAAACTTAATAAGCCGGTACCAATAGCAACAAAGATCGCACGGAATACAATGGCACCAATGATCCCCCAATACAGAATGCGGTGACGGAAACGATCAGGAACCGCAAACCAAGAGAAAATCGCCATCATGACAAATAGGTTATCGACAGACAGTACTTTCTCTAATGCATAACCCGTCACGAATAAGCTTGCAACTTCTGCACCATGGTGGACGTATAAAAAACCCGCGAATGCCATGGCAACGACTACCCAGAATATTGACCAAAAAACAGCATTCTTTAACGTTATCGGCTTATCTGCACGATGCATAAATAAATCGATAAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP017085|3666217:3675061|3673915_3675061_+|WP_017628546.1|DBSCAN-SWA MNSLIGSSVYRRQLTCGTLSVTPNCSLEHLDELFDIAERRNPKRAFLFVSKVLGRHIPVSPKKMRETYQQMAKQFPQSLEGPILFIGMAETAVGLGAGIFDEVRDRYPQALYLTSTRHPIADGELFCKFKENHSHATDHLLYLPHNLEQRQWILQAKTIVLIDDEATTGNTFLNLLSALREEGKLTQIKQIIAVTLTDWSGDALQKRSPLPITTFSLVQGKWQWQANPDAPLPVMPNVNITASGQVAITGKQSWGRLGMTTPANDLGLFIHVSEGEKILVLGSGEFVWEPFLLAERLEKQGAIVKYSSTTRSPIATNFAIQSAITFTDNYGLGIPNFVYNVAHQQFDRILLCCETPAESIDSQLIEALYKVAPIVEVISYD >NZ_CP017085|3666217:3675061|3672938_3673523_-|WP_004250201.1|DBSCAN-SWA MVSLRKDQTVSLSKQAPALSHLMFGLGWDPIKKKGFLGGLFGGNNSIDLDASCVLLDVNGKQIDTIWFRKLKSTCQSVIHSGDNLTGEGDGDDETIFVDLNRLPSLVEYLVFTVNSFRGQTFNEVENAFCRVVDKTTNKELAHYKLTEQGAHTGIVIAALQRNQGQWDFTAFGSPCKGLVIDEMMPDILATVVR >NZ_CP017085|3666217:3675061|3668186_3668867_+|WP_012368337.1|DBSCAN-SWA MQPQFENAKNTVKTLSVFDFDGTLTYHDSFIPFLKFAFGRRKFARRIIKMVFPTLRCFRRKLTRDELKEVLIKTFLTDIKEEWLKEKAEAFCKAYWSKLMRPAGLLAVAEEINRHAEVTICSASPAMVLQPFADRLGIKLIGTTLEVVDGVLTGKIIGNNCRCGEKIKRLERVYGDLTQYHLRAWGDSRGDHELLYAAQDPHWRYFHTGSNKSKKSPIKITLKKDS >NZ_CP017085|3666217:3675061|3669615_3670194_-|WP_004249446.1|DBSCAN-SWA MSVSLSKGGNVSLSKAAPTMKNVLVGLGWDARSTDGQDFDLDASAFLLAANGKVRSDADFIFYNNLRSADGSVVHTGDNRTGEGDGDDEALKIKLDTIPSDVEKIIFVVTIHEAQARRQSFGQVSGAFIRLVNDDNQIEVARYDLTEDASTETAMLFGELYRHNGEWKFRAVGQGYAGGLGSVCAQYGINAS >NZ_CP017085|3666217:3675061|3671801_3672938_-|WP_017628547.1|DBSCAN-SWA MTLTPGGNISVPDQTLMVRIHSGSPVDVSAFRLYASGKVNGDADMVFYGQTTNDDRTIIYATAGNSTSFTVDLTRLRPDVDRIAFTATCEGQQTIAHLQHLSIQVDANNNVVANGHVDINGRTEAALILGELYRRNGSWKFRFIAQGFNGGLKPLAEYFGVDIADPEPAPAPSSVNLSKVSLTKEKPAISLTKKDDFGKIRINLDWHRESKSGGSGLLGGLFGGNKGIDLDIGAFVELQDGYKSVIQALGNGFGDFNRMPYVELQGDDRTGDVAGGEWIFINGREWKNIKQVLIFTFIYEGVPNWSKTDGVVTIHVPEQPPIETRLTDGNNGRAMCAIARLINENGSIKVERLNEFFKGHRDMDNAYGWGFRWTAGSK >NZ_CP017085|3666217:3675061|3666217_3667786_-|WP_004245601.1|DBSCAN-SWA MSIKRTVKLGSSLLLLIFILSSALSSFFIYKMQNNFTQVDVLSARYDDVLMARYQLAIMRSNVNYLLQDKDSRVADRNKIIQQNKKLAIMAKNTMETWVKEKKMTVAAQKNADDISTLFYNLIDKLVLDPNKLATIKIKANQFDQDFEHLDQLFEKYIQTRNKNSLYLTHKQDSMVEFSIYSTIISLIILLIVLYFVLHWINKTFVSNLNTLSEILNKVGNADLVFSVPQVKNDEFGKLFSRVSDMQKALTSTIFSVKKEAMDIKGGAFKIASGNQELSSRTEEQSSALQQTAASMEQIKIAVANNTDNTIEANNIINQSTDIVMDGANVMKEAVLSMKKIEQGAVKVGEINDVINKLANQTNILALNAAVEAARAGEQGRGFTVVAAEVRNLAAKSAEAAKEISQVLKASINDVTYGTNLVNKSGECMQEIVSSISKVNKIMQGISLASEEQRLGVEQIAVAINQMDTVVQQNASLVDLAASSTMMLNDKAQVLMDNVAVFNIDDLEKEPEQKQELINEQE >NZ_CP017085|3666217:3675061|3671321_3671777_-|WP_004245607.1|DBSCAN-SWA MSFFNKLKEGFNSGRAELTKQVSRFKNKKFMQGTVAVCARIAIASDGVSSEEKQKMLGFLKASEELKVFDTSEVIEFFNKLISSFEFDTEVGKGETMKYILAMKDQPEAAQLAIRVGIAVAKSDGDFDNDEKEAVRAIAVALGFEPAEFDL >NZ_CP017085|3666217:3675061|3668963_3669539_-|WP_004245603.1|DBSCAN-SWA MAVSLVKGGNVSLTKEAPTMTVAMVGLGWDARVTDGAEFDLDASVFMVGEDGKVLSDASFIFFNNKVSQCGSVEHQGDNRTGEGEGDDEQVKITLSKVPAEVKKLVFAVTIYDAENRKQNFGMVSNSFMRVYNNDNNTEIARFDLSEDASTETAMIFGELYRHGSDWKFKAVGQGFAGGLGALAAQHGVNI >NZ_CP017085|3666217:3675061|3670261_3671287_-|WP_004245605.1|DBSCAN-SWA MVSTHIGFPTETVIVFVVLAIGAIFIDLFMHRADKPITLKNAVFWSIFWVVVAMAFAGFLYVHHGAEVASLFVTGYALEKVLSVDNLFVMMAIFSWFAVPDRFRHRILYWGIIGAIVFRAIFVAIGTGLLSLGPYVEIVFALIVAWTAVMMLRSGNDSEEIEDYSQHLAYRLVKRFFPIWPKITGHAFLLTQKEVDVELAKPENKDITIGRGTKAALYATPLMLCVAVVELSDVMFAFDSVPAIIAVSREPLIVYSAMMFAILGLRTLYFVLEALKQYLIHLEKAVIALLFFIAVKLGLNATDHIWQHGYSISATTSLFVVLGVLALGILASFVFPEKKNK |
9 | Caulobacter_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
319 : 56086
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017086|319:56086|DBSCAN-SWA 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58 | Escherichia_phage(30.77%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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