Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP011041 | Pseudoalteromonas tetraodonis strain GFC chromosome I, complete sequence | 0 crisprs | DEDDh,cas3,WYL,DinG,csa3,RT | 0 | 0 | 1 | 0 |
| NZ_CP011042 | Pseudoalteromonas tetraodonis strain GFC chromosome II, complete sequence | 0 crisprs | WYL,csa3,cas3,DinG | 0 | 0 | 1 | 0 |
1. NZ_CP011041
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
479349 : 488098
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP011041|479349:488098|DBSCAN-SWA TATGATCACTCCTATTATTATGGCTGGCGGGACTGGCTCTCGATTATGGCCACTTTCGCGTGAGTTATACCCAAAACAGTTTTTAAAAGTAATTGGGGAGCAATCGATGCTTCAACAAACAATAGCGCGTCTGTCAGGTTTAGAGCATAAAGCTCCTGTGTTAATCTGTAATGAAGAACACCGCTTTATTGCCGCTGAGCAAATGAGAATAGGTGGCTTTGAGCATAGCGGAATTATTTTGGAGCCCATAGGGCGAAATACAGCTCCTGCAATTGCATTAGCCGCTTTACAAGCTGTCAGTAATGCAGCAGAAGGGGAAGAGCCTATTCTATTAGTACTTGCAGCGGATCATGTTATTGAAAATATAACTGCTTTTGAGAGCGCAGTACAAAGAGCGCTACCTTATGCGTTAGAGGATCAACTAGTCACTTTTGGAATAGTACCTACAGCTCCAGAAACAGGTTACGGCTATATAAAAGCGGGTAAGCAAAATGGTAATGCATTTACAGTTAGTGAATTTGTTGAAAAGCCTAACTTAGCAACCGCCCAAAAGTATATATCAAATGGTAGTTATTATTGGAATAGTGGAATGTTTTTATTTAAAGCTAGTCGCTACCTTAAAGAGTTGGAAGTATTTTCACCTGAAATATTAAGTATTTGTAAGCAAGCAATAGCAAACCCTAAGCAAGACTTAGACTTAGACTTTGTAAGGGTAGATAAAGATATATTTGAAACCTGTCCTGATGACTCTATTGATTATGCGGTAATGGAAAAAAGTCAAAATGTAATGGTTGTTCCAATGGATGCAGGCTGGAGCGATGTCGGATCTTTTTCATCTTTATGGGAAGTATCAGCTAAAGATAATAATAAAAATGTTATAAAAGGCGATGTAATTTCTGTTGATTCGACTAATAACTATATTTACGCTGAAAATAAACTCGTTTCTACAGTTGGGGTTGATAACTTGGTCATTATTGAAACTAAAGATGCCATTTTAGTAGCAGATAAAGATCAAGTACAAAATGTTAAGACGATCGTAAAAAAATTAAAAGATGCGGGTCGGACTGAGCATAAATTACACCGTGAGGTTTATCGACCTTGGGGTAAGTATGACTCAATTGATTTTGGTAAACGAGATCAGGTGAAGCGAATTACGGTTAAGCCGGGTGAAAAGCTGTCTATTCAAAAACATCATCATCGTTCAGAACACTGGATTGTAGTATCAGGCACTGCAAGCGTATTAAATGGAGATAAAACTATTTTAGTAACTGAAGATGAGTCTACTTATATCCCTTTAGGTACAATACATGCGTTAGAAAACCCAGGTAAAATTCCTCTTGAAATGATAGAAGTTCAAACGGGTAGCTACTTAGGTGAAGATGATATTGTACGTTTTGAAGACCGCTATGGTCGAGTATAATAGGTCGATTCAGTTTAAATAAGTATGGATGATAATGAATAAGATATTGGTAAGCACAGATGTTTTAGAACAAAGTGGTGTTACTTTTGGTACCAGCGGTGCAAGAGGATTGGTGACCCAGCTAACATCTAATGTTTGTGCTGCATTCAGCGTTGCGTTTATTCAAAGTATGCAACAAAGCTTTAGCTTCAGTACAGTAGCACTTGCAATTGATAATAGGCCTAGTAGTTATGCAATGGCGCAAGCATGTGCAACAGCGTTACAACAGCGTAACATTCATGTTGTATATTACGGAGTAATACCCACCCCAGCTCTAGCATACAAAGCAATGCAAGATAATATACCTGCAATAATGGTAACGGGAAGTCATATTCCGTTTGATCGCAACGGGCTTAAGTTTTATCGACCTGATGGCGAAATTAGCAAAGTAGACGAACGAGCAATTATTACTGAACAAGTTGAGTTTTTTGAACTTACAGAGCTTGTTGAACTAACTGTAAGTAACCAAGCCACTGAAGAATATATTAATCGTTACACATCTTTATTTACTAAACAATGGCTTACTGGTAAGCAGATCGGTATATATGAACACTCTAGTGCTGGTCGTGACCTCTACTTTAGAATATTCGAAGCACTAGGCGCTGATGTTTTTCGTTTAGAGAGAAGTGATAAGTTTGTACCTATAGATACAGAGGCTGTTTCCGAGCAAGACACTATCAAAGCAATAAATTGGTCAAAAGAATATAATTTAGATATGGTGTTTTCAACAGACGGTGATGGTGATCGGCCCCTCGTATCCGATGAAAATGGAAACTGGTTACGTGGCGATATTTTAGGCTTATTATGTGCAGACATACTGGGTATTGAAGCCTTATCCGTACCTATTAGTTGTAACACTGCTATTGAAACTAGTCATAAATTTAAGCATGTTGAAAGAACGAAGATAGGATCGCCATACGTTATTGCTGAGTTTTCTAAGCTATCTAAAAGGTTTAACACTGTTGCGGGTTTTGAGGCTAATGGTGGTTTTTTATTAGGTAGTGACGTTCTATTAAATAATAAGCAATTAAAAACACTACCGACTCGCGATGCTATGTTACCAGCTATTATGCTTCTGCTTGCAGCCGATGATACTAAAATTTCAGCCTTAGTAAATGCACTTCCAGAACGATTTACCTACAGTGAGCGAGTTCAAAACTTTGCTACCCAAAAAAGCCAAGAAATTATTTCCCTAGTCAAAAAGAATCCTGAAAAGCTTCTAGTTAAACTCGGTTTAACCAACATTAAGGTTAATACTATCGATGAAACTGATGGATTAAGAATTGCGCTTAAAGATGGAGATATTATTCACTTACGGCCGTCTGGTAATGCGCCAGAGCTTCGGTGTTATGGAGAGTCAAATAACTTTCAATCGGCAAAGAAGATTGTTATGACCGCATTAAGCAAAATTAAAGAACTTAATACAAATTTAGATACGTAACTCTTGAATTTGGGTATTATCTAGAAAATTTCCAAATTTTAAGTAAAGGAATTAAAAATGACAGAAAAGAAAGTAGCATTAATCACGGGCGTTACAGGCCAAGACGGTTCATATTTAGCTGAGTTATTGTTAGAAAAAGGCTACGAAGTACATGGTATTAAGCGTCGTGCATCATCATTAAATACTGAGCGCGTTGATCATATCTATCAAGATAATCACGAGGAAAATCAAAGTTTTTTCCTGCACTATGGCGATTTAACCGACTCATCAAACTTAACGCGTATTATTAAAGATGTACAACCAGATGAAGTTTATAACTTGGGTGCGCAATCACACGTTGCTGTTTCGTTTGAATGCCCAGAGTATACAGCAGATGTAGATGCGATGGGCACACTGCGCTTACTTGAAGCAATTCGCTTTTTAGGGCTTGAGAAAAAAACTAAATTCTATCAGGCTTCAACTTCAGAGTTGTACGGCGAAGTACAAGAGATTCCTCAGAAAGAGACAACTCCGTTTCACCCTCGCTCCCCATATGCAGTCGCTAAAATGTATGCTTATTGGATAGTCGTCAATTATCGTGAATCGTATGGTATGTACGCATGTAATGGTATTTTGTTTAATCATGAATCGCCTCGACGTGGTGAAACCTTTGTAACACGTAAAATTACTCGTGGTATTGCTAATATTGCTCAAGGATTAGAAAGTTGTTTATACCTAGGTAATATGGATGCTTTACGTGATTGGGGCCATGCTAAAGATTATGTTCGTATGCAGTGGATGATGTTACAGCAAGAAGAAGCTGATGATTTTGTTATTGCAACAGGGAAGCAAATATCAGTGCGTGAGTTTGTAACACTCTCAGCTAAAGAAGCAGGCATTGAGCTTGAATTTAGTGGTGAAGGAGTTGATGAGGTAGCAACAGTTAAGTCGATTGCAGGTAATAACGCGCCAGCTCTTAGCGTTGGTGATGTTATTGTTAAAGTTGATCCTCGATACTTTAGGCCTGCTGAAGTTGAAACGCTCCTTGGTGATCCATCAAAAGCAAAGGCAAAATTAGGTTGGGTACCTCAAATTACTGTAGAGCAAATGTGTTCAGAAATGGTCGCAAATGACTTAGATAAAGCTAAGCAGCACGCAATTTTGAAAGAGCACGGTTACACAAATTCAGTAGCAGTTGAATAGGTTTAAACTAGATGAAAATTTTATTAACCGGTGCTAATGGCATGGTTGGCAGAAATATTTTAGAAGTAGCTAAACAGTACGACTATGATTTTTTGTCACCAAGTAGCAGTGAACTAAATTTACTTGATTCTAACTCAGTCAACCAGTATGTAAGCATACACAAGCCCGACATGGTAATACACGCTGCAGGTATTGTTGGTGGTATTCAAGCTAATATGGCACAGCCTGTAAAGTTTTTGGTTGAAAACATGCAAATGGGGCTTAATATTCTCACTGCAGCTAATAATTCAAATGTTAATACCTTTCTAAACTTGAGTAGCTCTTGTATGTATCCTCGTGATGCTGCAAACCCTTTAAGTGAAGATTTGATTTTAAAAGGTGAGTTGGAGCCAACGAATGAAGGTTATGCGCTTGCAAAAGTGACTAGTACACGGCTTTGTGAGTATATTATAAAAGAAAATCCAAACCGCCAATATAAAACAATTATTCCATGTAATTTATATGGGTGTTTTGATAAGTTCGATCCGAATCATTCACATATGATTCCTGCGGTTATTCGAAAAATAGATGAAGGGAAGAAAAATAATCTTCCTGAAATAGATATTTGGGGAGATGGCGAAGCTCGTCGTGAATTTATGTATGCAGAAGATCTAGCCGATTTTATTTTTTATGCAATAAGAAACTTTGAAAAAATGCCTCAAAACTTGAACGTTGGTTTAGGTACTGATTATTCAATTAATGATTATTACCAAACTATAGCAAAGGTAGTTGGTTTTAAAGGAAAATTTAAGCATGACTTAGATAAGCCTGTTGGTATGAAGCAAAAATTAATAGACGATAAAAAGTTAAAAGAATTTGGCTGGCACTATAAAACTAAATTAGAAGCCGGTATTAAGAAAACGTATGAATTTTATTTAAGAGAGTATTGTAATGACTAATTACGCACTAGCAAGCAGCACATGGGATGAGAACGAGTATTCTGCAATTCAAAGAGTAATAGATTCTGACATGTTTACCATGGGTAAAGAAGTTGCTCAATACGAAAAAGATTTCGCTGAGTTTTTTGGTTCGAAATATGCGCTAATGGTCAGTTCAGGTTCGACAGCTAATTTATTAATGATCGCCGCATTATTTTTTACCAAAAATGAGTCTTTAAAGTTAAAACGTGGTGATGAAGTAATTGTACCTGCCGTCTCTTGGTCGACTACTTACTTCCCATTGCAACAATATGGCTTAAAAGTTAAGTTTGTAGATATAGATCGCAATACTTTAAATATGGATCTAGACAAATTAGAAGCTGCTATTACAGATAAAACACGAGCTATTTTGTCGGTAAATTTATTAGGCAACCCTAATGACTTTAATCGCATGAACGAAATTATTGCAGATCGTAACATTTTTGTTTTAGAAGATAACTGTGAGTCAATGGGCGCAACCTTAAACGGTAAGCAAGCAGGTACATTTGGTGTTATGGGGACGTTTAGCTCATTCTTTTCTCATCATATCGCCACAATGGAAGGTGGTTGCGTAGTTACGGATGATGAAGAACTTTATCATATCCTTCTTTGTATTCGAGCCCATGGTTGGACGCGTAACTTACCTAAATTTAATAAAGTCAGTGGCGAGAAAAGTGATGACCCATTCGAAGAGTCATTTAAGTTTATGTTACCAGGCTACAATGTACGTCCACTTGAGATGAGTGGTGCACTAGGAATAGAGCAGCTTAAAAAATTACCTCGTTTTATTGAAATGCGTCGTGAAAATGCAAAGTTATTCCAATCATTATTTGCTAATCATCCTTATATTGATATTCAGCAAGAAACGGGCTTAAGTAGTTGGTTTGGTTTTTCATTAATTTTAAAGGAAAATGCACCATATACCCGTGCCGATTTAGTTAAATTACTAACTGAAAATGGTATTGAATGCAGACCAATTGTAACTGGTAATTTCTTAAAAAATAAAGAAGTACTTGAGTACTTTGACTATGAAGTCGCTGGTTCATTAGAAGCTGCCGAATATTTAGATGAAAATGGTTTATTTGTGGGTAATCATCAAAATAGTATTACTAAAGAAATTAAATTGTTAGCAGATAGCCTTAGCTAAAAACCAATTGTAACTATATTAGAACCTTTATTTTATATGGATTGTTAGTGTGTTATTAATATTAAAAAGTATTGCGAGTAAGCTTTATCGTCAAATTAGGTTGATCTTCTCCCAGCGAGATAACCGAATATTTAGTTATAATGTAAGCTTAAAGTCTCTTAACGGTAGTAGTATTGAAGTTAAAGAGGATACTTTTATAGATTCAAACTCAACTATTGGTTCGTATAGTTACATTGGACGGCATTGCTCTATTAGTAAATCATCAATTGGAAGATATTGCTCAATTGCAAATAATGTTTCAATAGGGCAAGGTGAGCACGACTTAAAGGAAATAAGTACAAGTAGTATCTTCTATCATTCGCCATACGATTTACTCACAAGTAAAAGTTGCAAAATAGAGGATGATGTTTGGATAGGAGTTGATGTTATCATCTTACGCGGTGTTACAATTGGCACTGGTGCTGTTGTAGGGGCAAACTCTGTTGTTACTAAAGATGTGCCACCATTTGCGGTGGTTGTAGGATCGCCAGCAAAACTAATTAAATATAGATTTGATGAAGATAAAATAACTGCAATTTTAAAAAGTAAATGGTGGAATGAGAAACCTGAAATGGCGAAAATAATATTTACTGAGTTAAATAAAAAATGAAAGCATCCTTAGTAATAGATTACCATTTAAATAATAAAATATTCGATGTGAGTGATAGATCTGTAAACAGAGATGATTATGCTTATAGCATTTGGTTATTAAAACAGAAGTGCAAGAGCGTGAATATTGAGCTTTCAACATGCGATATTAATAAATTATCAGATTCAGATATGGCCTTTTATTTTGACTTACCCAAGCATGAGGAAAAAGTTGAAACGGAAATAGCCTATCTTTTTTTATTTGAAAGCGAAGTAATTAAATTAAATAATTGGGAAAAACTAAATCATAATCAATACAGTAAAGTTTTCACCTGGAATGATGAGCTAGTTGATAATAAAAAATATTTTAAGATCAATTTCACTCATAAGTTTCCTGAGAGTCGAGAGGCTCATAGAAGTAATCAAAAAAAAATTGCATCTAAAAAGTTGTGCACATTAATTGCGGGTAATAAAAAAGTTAATCACCCACTAGAATTATACTCAGAAAGAGAGAAAACAATTCGTTGGTTTGAACAAAACACCAATAATGAGTTTGACTTTTATGGAATAGGGTGGCAAAAACATACGTCAAGTAATCGATTATTGCGCGCACTTCTATCTAAAATGAGTTTCTTAAACACACTTTTTCCTCCTAGCTATCCCTCTTATAAAGGGCCAGTGGATAGTAAAAAGGCGACATTAAACAATTATAAGTTTGCAATTTGCTATGAAAATGCTCAACTAATTCCAGGCTACATAACGGAAAAAATATTTGATTGTTTTTTCGCCGGATGCATTCCAATTTATTGGGGAGCGCCCAACGTTACTGACCATATCCCTGCTAATTGTTTTATAGATAGACGAAAATTTAACTCTCATGAGGAACTCTACCATTACATCAGTAACATGTCCGAAGTGGAATACAGCGTTATTCTATCAAACATAGAGGATTATCTGTTTTCAGAACAATCGACCCCCTACAGAGCTGAAACATTTGCAAAGACGATAGTTAAACATGTCTTAGCTGATTTGAAGTAAACAGCATTTTATATACAATTTATTAGGTTAATAATGATAAAAGTTAAAGCAATTGGAGGCTTAGGCAACCAACTTTTTCAATATGCGGCAGCCAGATCTATTGCTGAAAAGCGTAAAGATAAAGTCTTGGTCGATGTGTCTGCTTTTCAGTCTTATGAAACACATCCATTTTGTTTAAATAAGTTTAATTGTAAAGCTACTTTCGATAATCGGTTAAATCTTAAAAAAAAGTTACTAAGCAATAGTAGAATTAATAAAATACTTTTTAGTTTTGGTTTTTTAAAAAATCACTATATTGAGAAAAGTTTAAAATTTGATGACTCTTTATCGCAAAATACAAATATTACTCAAATTACTGGTTTTTTTCAGTCAGAAAAATACTTTTTAAGTATCCGTGATTGTTTGTTAGACGAGTTAACTTTGGTTAACGAGCTCAATGAGTATGAGCTGTCTGTTAGTAATGCAATTAGAAATGCTAAAAATAGTGTATCAATCCATATAAGGCGAGGTGACTATGTTTCTGATGAGGGGGCTAACAAAACGCATGGCGTCTGTGATAGTGAGTATTTTAAAAAGGCGCTAAGGTATCTTTCGACAAAAGAAATATTAGATAAAAACACGGAACTTTTTATTTTTTCTGATGATATAAAGTGGTGTCGTAACAATCTAAGTTTTGACTACAAAATGAATTTTGTCGATGGCTCGAGTGAACGACCTGAAGTAGACATGATATTGATGTCAGAGTGTGAGCATCAAATCATTTCAAATAGTACTTTTAGTTGGTGGGGAGCTTGGCTTAATCAAAATGAAGATAAAGTTATTATTGCGCCCAAGGTTTGGTTTCAATCAGCCGAGCTGGATTCTACAGATATAATTCCTGATAATTGGGTTAAGTTGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP011041|479349:488098|483441_484368_+|WP_096038138.1|DBSCAN-SWA MKILLTGANGMVGRNILEVAKQYDYDFLSPSSSELNLLDSNSVNQYVSIHKPDMVIHAAGIVGGIQANMAQPVKFLVENMQMGLNILTAANNSNVNTFLNLSSSCMYPRDAANPLSEDLILKGELEPTNEGYALAKVTSTRLCEYIIKENPNRQYKTIIPCNLYGCFDKFDPNHSHMIPAVIRKIDEGKKNNLPEIDIWGDGEARREFMYAEDLADFIFYAIRNFEKMPQNLNVGLGTDYSINDYYQTIAKVVGFKGKFKHDLDKPVGMKQKLIDDKKLKEFGWHYKTKLEAGIKKTYEFYLREYCND >NZ_CP011041|479349:488098|479349_480768_+|WP_096038135.1|DBSCAN-SWA MITPIIMAGGTGSRLWPLSRELYPKQFLKVIGEQSMLQQTIARLSGLEHKAPVLICNEEHRFIAAEQMRIGGFEHSGIILEPIGRNTAPAIALAALQAVSNAAEGEEPILLVLAADHVIENITAFESAVQRALPYALEDQLVTFGIVPTAPETGYGYIKAGKQNGNAFTVSEFVEKPNLATAQKYISNGSYYWNSGMFLFKASRYLKELEVFSPEILSICKQAIANPKQDLDLDFVRVDKDIFETCPDDSIDYAVMEKSQNVMVVPMDAGWSDVGSFSSLWEVSAKDNNKNVIKGDVISVDSTNNYIYAENKLVSTVGVDNLVIIETKDAILVADKDQVQNVKTIVKKLKDAGRTEHKLHREVYRPWGKYDSIDFGKRDQVKRITVKPGEKLSIQKHHHRSEHWIVVSGTASVLNGDKTILVTEDESTYIPLGTIHALENPGKIPLEMIEVQTGSYLGEDDIVRFEDRYGRV >NZ_CP011041|479349:488098|485582_486182_+|WP_096038140.1|DBSCAN-SWA MLLILKSIASKLYRQIRLIFSQRDNRIFSYNVSLKSLNGSSIEVKEDTFIDSNSTIGSYSYIGRHCSISKSSIGRYCSIANNVSIGQGEHDLKEISTSSIFYHSPYDLLTSKSCKIEDDVWIGVDVIILRGVTIGTGAVVGANSVVTKDVPPFAVVVGSPAKLIKYRFDEDKITAILKSKWWNEKPEMAKIIFTELNKK >NZ_CP011041|479349:488098|484360_485533_+|WP_096038139.1|DBSCAN-SWA MTNYALASSTWDENEYSAIQRVIDSDMFTMGKEVAQYEKDFAEFFGSKYALMVSSGSTANLLMIAALFFTKNESLKLKRGDEVIVPAVSWSTTYFPLQQYGLKVKFVDIDRNTLNMDLDKLEAAITDKTRAILSVNLLGNPNDFNRMNEIIADRNIFVLEDNCESMGATLNGKQAGTFGVMGTFSSFFSHHIATMEGGCVVTDDEELYHILLCIRAHGWTRNLPKFNKVSGEKSDDPFEESFKFMLPGYNVRPLEMSGALGIEQLKKLPRFIEMRRENAKLFQSLFANHPYIDIQQETGLSSWFGFSLILKENAPYTRADLVKLLTENGIECRPIVTGNFLKNKEVLEYFDYEVAGSLEAAEYLDENGLFVGNHQNSITKEIKLLADSLS >NZ_CP011041|479349:488098|486178_487198_+|WP_096038141.1|DBSCAN-SWA MKASLVIDYHLNNKIFDVSDRSVNRDDYAYSIWLLKQKCKSVNIELSTCDINKLSDSDMAFYFDLPKHEEKVETEIAYLFLFESEVIKLNNWEKLNHNQYSKVFTWNDELVDNKKYFKINFTHKFPESREAHRSNQKKIASKKLCTLIAGNKKVNHPLELYSEREKTIRWFEQNTNNEFDFYGIGWQKHTSSNRLLRALLSKMSFLNTLFPPSYPSYKGPVDSKKATLNNYKFAICYENAQLIPGYITEKIFDCFFAGCIPIYWGAPNVTDHIPANCFIDRRKFNSHEELYHYISNMSEVEYSVILSNIEDYLFSEQSTPYRAETFAKTIVKHVLADLK >NZ_CP011041|479349:488098|487231_488098_+|WP_096038142.1|DBSCAN-SWA MIKVKAIGGLGNQLFQYAAARSIAEKRKDKVLVDVSAFQSYETHPFCLNKFNCKATFDNRLNLKKKLLSNSRINKILFSFGFLKNHYIEKSLKFDDSLSQNTNITQITGFFQSEKYFLSIRDCLLDELTLVNELNEYELSVSNAIRNAKNSVSIHIRRGDYVSDEGANKTHGVCDSEYFKKALRYLSTKEILDKNTELFIFSDDIKWCRNNLSFDYKMNFVDGSSERPEVDMILMSECEHQIISNSTFSWWGAWLNQNEDKVIIAPKVWFQSAELDSTDIIPDNWVKL >NZ_CP011041|479349:488098|482305_483430_+|WP_096038137.1|DBSCAN-SWA MTEKKVALITGVTGQDGSYLAELLLEKGYEVHGIKRRASSLNTERVDHIYQDNHEENQSFFLHYGDLTDSSNLTRIIKDVQPDEVYNLGAQSHVAVSFECPEYTADVDAMGTLRLLEAIRFLGLEKKTKFYQASTSELYGEVQEIPQKETTPFHPRSPYAVAKMYAYWIVVNYRESYGMYACNGILFNHESPRRGETFVTRKITRGIANIAQGLESCLYLGNMDALRDWGHAKDYVRMQWMMLQQEEADDFVIATGKQISVREFVTLSAKEAGIELEFSGEGVDEVATVKSIAGNNAPALSVGDVIVKVDPRYFRPAEVETLLGDPSKAKAKLGWVPQITVEQMCSEMVANDLDKAKQHAILKEHGYTNSVAVE >NZ_CP011041|479349:488098|480802_482248_+|WP_147154770.1|DBSCAN-SWA MNKILVSTDVLEQSGVTFGTSGARGLVTQLTSNVCAAFSVAFIQSMQQSFSFSTVALAIDNRPSSYAMAQACATALQQRNIHVVYYGVIPTPALAYKAMQDNIPAIMVTGSHIPFDRNGLKFYRPDGEISKVDERAIITEQVEFFELTELVELTVSNQATEEYINRYTSLFTKQWLTGKQIGIYEHSSAGRDLYFRIFEALGADVFRLERSDKFVPIDTEAVSEQDTIKAINWSKEYNLDMVFSTDGDGDRPLVSDENGNWLRGDILGLLCADILGIEALSVPISCNTAIETSHKFKHVERTKIGSPYVIAEFSKLSKRFNTVAGFEANGGFLLGSDVLLNNKQLKTLPTRDAMLPAIMLLLAADDTKISALVNALPERFTYSERVQNFATQKSQEIISLVKKNPEKLLVKLGLTNIKVNTIDETDGLRIALKDGDIIHLRPSGNAPELRCYGESNNFQSAKKIVMTALSKIKELNTNLDT |
8 | Paramecium_bursaria_Chlorella_virus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
|---|
2. NZ_CP011042
Click the left colored region to show detailed information
0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
206684 : 217478
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP011042|206684:217478|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP011042|206684:217478|214157_217478_+|WP_096038997.1|DBSCAN-SWA MKFTEAKLEQAVVELLGEQGYPHLLGGELTRSNSEVLIKEDLRAFLTKRYAKNNITTGEVDSIIAKLEKLPASDLYESNKTFCKWLSDGFLLKREVLTHERGSLAGSKSQKDLYVQLLDYDNVEQGIKSSLIAGSAMAALDNVNEASVTYLQDDNIYRFVTQLEIESPTSYDNIELRIPDGILYVNGLPLVVFEFKSAIREQAPIFEAYEQLTVRYRRAIPQLFVFNTLCVISDGVNNKMGNLFAPYQFFYSWGKVTGQELTAQEGINSLHTLLQGLFDKARLRDVMRNFVFFPDSDNKSAGKKEIKIVPRYPQYYAANKLFENIKRHLKPQGDGKGGTYFGATGCGKSYTMQFLTRLLMKSVELKSPTIILITDRTDLDDQLSQQFGNAKTYIGDDTVKTVTSRTHLRELLEGRNSGGVFLTTIHKFTEDTQLLTDRTNVICISDEAHRSQVNLDQKITITEKGVKKTFGFAKYLHDSLPNATYVGFTGTPVDATLDVFGEVVDSYTMTESVKDEITVRIVYEGRAAKVCLNNSKLAEIEAYYKECADAGSNELQIEDSKKATANMNSILGDPDRIRVLARDFVEHYEKRVEEGSTIAGKAMFVCSSRGIAYQLYQELEELRPQWFDVVDTDDAQTLSDTERKRAISEGRIAAPSEKVKMVMTRGKDDVERLYNLLGSKDERKELDKQFKNKNSNFKIAIVVDMWLTGFDVPFLDTMYIDKPLQKHSLIQTISRVNRQFEGKDKGLVVDYIGIKSEMNKALAQYSKTDETNFEDITASVIEVKNHLALLAELFHKFDSSPYFTGEAVAQLNCLNHAAEFALITEKRQKRFMDLVKRLKAAYDVCCGSEKINENERNHIHFYLAIRSIIYKLTKGEAPDTAQMNAKVREMISEALQSDGVKEVFKLGNEDGGEIDIFNDDYIAKIEKIKLPNTKIKILQQMLAKAIGELKKVNQTQGIDFTKRFESLVQRYNERKEDDVLVSSVLDEFSDSMVDMIYSVRDEMNAGDELGIDIEEKGFYDALKMLAIKYDFDYPEDKLIELAQAVKVIVDDKVKFVDWNHRDDIKSALKVELILILAKFKYPPISRDEVYKEIFEQAQNVKANKEV >NZ_CP011042|206684:217478|207389_208715_+|WP_069439100.1|DBSCAN-SWA MFFNQSLKNQVADLQNKLLVREQVRQSLDSEMLVLELDMQGHVIRQNKNFERTFSYSNSQLLNQNIINFIPENARNNPDFNLFKQAISKREHYVGAIQLLHQNGQRDWLRCILHPIKNEQGQLEYLTLHCTVLTQIIESSRENEDLIKALHRSTAVIEFDTQGMVLRVNDNFLKSMGYSKQDVVGKHHSMFCDEQVASSKEYQAFWQRLRNGEFIASRFKRIDKHGHVVWLEASYNPIFNEANELYKVVKFATVITDQVKRELATEQAASIAHGTSIETDNNADKGAEVVQKTVQVMNELSVQMEQAAQEISALDKQSQLIASIVQSISSIADQTNLLALNAAIEAARAGEQGRGFAVVADEVRLLASRTSKATEEIVDVVQQNQNLTQSTVAVIEQGKNKAQQGLALSKESGDVMSDIKKGAQQVVDAVSQFSNQLSSKK >NZ_CP011042|206684:217478|209080_210469_+|WP_096038994.1|tRNA|DBSCAN-SWA MSAVSSSIPFIPELLCPAGSLKNMRYAFAYGADAVYAGQPRYSLRVRNNEFDLDTLQIGINEAHALNKKFYVVSNIAPHNAKVKSYLRDIEPVIAMKPDALIMSDPGLIMLVREKWPDMPIHLSVQANAVNYASVQFWAKQGIERVILSRELSLEEISEIRTLCPETELEVFVHGALCMAYSGRCLLSGYINKRDPNQGTCTNACRWEYDVKPGTENETGEMVHKIDPKTVIPTLGEGAPSNDVFMLEEQGRPGEYMPAFEDEHGTYIMNSKDLRAVQYVEQLTKMGVHSLKIEGRTKSFYYVARTAQVYRKAIDDAVAGKPFDADLFKTLENLAHRGYTEGFLKRHAHQDYQNYEYGHSVSTKQQFVGEVLGRNATGLVEIDVKNKFCVGHSLELMTPKGNISFVLERMENKKGESITDAKGSGHIVKIPLPDNIDLEHAILMRNLDENQDTRNPFKQAVS >NZ_CP011042|206684:217478|212534_214106_+|WP_167378576.1|DBSCAN-SWA MGSKTLPGMPNIPNGWYWAPLSDLCKKVSVGHVGETSSVFCGPEGVTFLRSQNVRPGRLDLNDVKYVTKAFHEKSKKSQLKTGDILVVRVGQNRGDCAVVPDNVGEINCANIVFAQPKDIRYSDYLGYFLNSSFGRTSLLAVSTGSAQGVLNTKSVAKVVVPVPPIDLAKNIGYRLKLIDNKIELNQKTNQTLEQMAQALFKSWFIDFDPVFDNLLASVNFNLENLETSLPDELKQKAQRRLAALNSLHNAAEVKTSLSALAHELQALSATQAAVQAAETPVKASLNANPKILAQHANTHAHFPNEFEHNEQLGWIPKGWGVGVSGDLVDVRDGTHDSPKKSEKGFPLVTSKHITSGRLDLSAAYLISELDYKKVNERSNVEYGDILLTMIGTVGVPYLVMDEPANYAIKNVGLFRTSQNLYLKNYLHILLKTAHMQAYLNARVAGTTQKYLSLKVLRNIDFLLPSNIVLEKFNSIVNNMLFKEKSNIDQINQLTKLRDTLLPKLISGELQIPDVITDEEVVD >NZ_CP011042|206684:217478|210483_210729_+|WP_083238652.1|DBSCAN-SWA MALLINSKCINCDMCDPECPNEAIYMGAKIYQIDPTKCTECVGHYDKPTCVSVCPIDCIKPDPNHRESLDELAEKYVKLTG >NZ_CP011042|206684:217478|206684_207116_-|WP_036983708.1|DBSCAN-SWA MALERTFSIIKPDAVAKNHIGAIYNRFETAGLKIVAAKMVHLSQEKAEGFYAEHSERPFFGALVSFMTSGPVMVTVLEGENAVLKNREIMGATNPAEALAGTLRADYADSIDENAVHGSDAVESAAREIAYFFADEELCPRTR >NZ_CP011042|206684:217478|210931_212545_+|WP_096038995.1|DBSCAN-SWA MDAASKKPATKKAAKKTQVGFEESLWDAANKLRGSVESAEYKHIVLSLIFLKFISDKFEARKKAIIAEYGDEYIDMVDFYAMDNVFYLPEDARWSYIQANAKQGDIAVKIDTALHAVEKNNKSLAGALPDNYFSRLGLDASKLSALIDTINNIDTIANQNEKTEEDLVGRVYEYFLGKFAASEGKGGGEFYTPKSIVTLIADMIEPFEGKIYDPCCGSGGMFVQSLKFINSHNGNQKNVSIYGQEYTNTTYKLAKMNLAVRGISGNLGDIAGDTFFKDQHPDLKADYIMANPPFNQKQWRADNELVDDARWAGYPTPPTGNANYAWIMHMISKLSEHGTAGFVLANGSMSSNTSGEGDIRQKIIENDLVDCMIALPGQLFYTTQIPVCLWFISKDKRGNNEKGLLKRRDRQGETLFIDAREMGSMVNRTLKELTNDDIAKITQTYHLWRGEELATDNEQKYEDIAGYCKSATLADIKANDYVLTPGRYVGAADIADDGIPFETKMSELSQTLYSQMNQSDELDKAIRKNLEALGYGE |
7 | Staphylococcus_phage(28.57%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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