Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP023311 | Vibrio anguillarum strain VIB12 isolate Sea bass chromosome 2, complete sequence | 1 crisprs | RT,csa3,cas3,cas5f,cas7f,cas6f | 0 | 0 | 10 | 0 |
NZ_CP023312 | Vibrio anguillarum strain VIB12 isolate Sea bass plasmid p292, complete sequence | 0 crisprs | RT,cas14j | 0 | 0 | 4 | 0 |
NZ_CP023310 | Vibrio anguillarum strain VIB12 isolate Sea bass chromosome 1, complete sequence | 1 crisprs | DEDDh,TnsE_C,WYL,cas3,csa3,RT,DinG,csx1 | 0 | 0 | 20 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP023311_1 | 1154925-1155008 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP023311_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP023311_1
>1.1|1154949|36|NZ_CP023311|CRISPRCasFinder CTGATAATGTACCACCTACAATATTAAATACATCCA |
cas6f,cas7f,cas5f |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP023311_1
The CRISPR arrays of NZ_CP023311_1 >merge|NZ_CP023311|1|1154925-1155008|CRISPRCasFinder AACAGTGTACTGCCGAGTAGGTAGCTGATAATGTACCACCTACAATATTAAATACATCCAAACAGTGTACTGCCGAGTAGGTAG >NZ_CP023311|1|1|1154925-1155008|CRISPRCasFinder AACAGTGTACTGCCGAGTAGGTAG CTGATAATGTACCACCTACAATATTAAATACATCCA AACAGTGTACTGCCGAGTAGGTAG
>NZ_CP023311.1|WP_019283234.1|1154199_1154799_+|type-I-F-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6/Csy4 MNWYNKTITFLPERCDNEVLAAKCLSTLHAFNYKYDTRSIGISFPGWCEDTVGKKLTFISTSKVELDLLLKHQYFIQMRKLSYFDISATAQIPDGCEYVSFVRNQSIDKSSAAGQTRKLRRLEKRATARGESFNPALIKQRESIILPHYHSLEIDSQSKKCIFPLNIQMKSEQSFEGDSIFSSYGLSNTDNSFQPVPLI >NZ_CP023311.1|WP_019283233.1|1153138_1154197_+|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy3 MKLPTSLAYERSIDPSDVCFFVVWPDDKKTPLTYTSRTLLGQMETASLAYDASGQPIKSATAEALAQGNPHQVDICRVPFGASHVECCFSVSFSCELRKPYKCNSSSVKQTLVQLIELYEMKIGWTELATRYLINICNGAWLWENTRKAYCWNIELAPWPWNGNKVKFEDIRSSYRSRQDFESHKDWSAITKMIKTAFSSSNGLAIFEVKATLHLPTNAMVRPSQAFTEKESGSKSKSKSQNSRVFQSTTIDGERSPILGAFKTGAAIATIDDWYPGATESLRVGRFGVHREDVTCYRHPSTGKDLFSILQQAEHYIEVLNANKTPDQETINDMHFLLANLIKGGMFQHKGD >NZ_CP023311.1|WP_019283232.1|1151244_1153167_+|hypothetical-protein MQTLKELIESTPDDLTTVLKRAFRPLTPHIAIDGNELDALTILVNLTDKTDDQKDLLDRAKCKQKLRDEKWWASCLNCVNYRQSHNPKFPDIRSEGIIRTEALGELPSFLLSSSKIPPYHWSYAHDSKYVNKSALLTNEFCWNGVISCLAELLKNVDHPLWKTLTKLGCYQKTRKAMAKKLASIAHITISMPLAPNYLTQISLPNSDTSYISLSPVASLSMQSHFYQGLQDEYRHASTTRFSRATNMGVTAMTCGGAFRMLKSNTKFSITPHHRLNSKRSWLTSENVQSLKQYQRLNKRLIPENARKALRRKYKIEIQNMVSVWLAMQDHTLDSIILVQHLNHDLSCLGATKRFAYNPVMTKLFTELLKRALSNSLNDSTHYSNGSFLVLPNIRVCGATALSSPVTVGIPSLTAFFGFVHAFERKLNRLNPTFRVESFAICVHQLHVEKRGLTAEFVEKGNGTISAPATRDDWQCDVVFSLILNTNFAQRIDQSTLITLLPKRFARGSAKIAIDDFKHINSFSTLEAAIQSLPIEAGRWLSLYAQPNNNLGDLLAAMKEDHQLMASCVGYHLLEEPKDKPNSLRSYKHAFAECIIGLINSITFSSETDANTIFWSLNNHQNYLVVQPRIINDETTDKSSL >NZ_CP023311.1|WP_019283231.1|1150059_1151244_+|TniQ-family-protein MFLQRPKPYSDESLESFFIRVANKNGYDDVHRFLEATKRFLQDIDHHGYQTFPTDITRINPCSANNSSRARTASLLKLAQLTFNEQPELLGLALNRTNLQYSPSTSAVIRGAEVLPRSLLRTNSISSCPLCLQENGYASYLWHFKGYDHCHIHNIPLINACSCGAEFDYRVCGLKGICNNCKEPITTKNQENSYEATSTVSNWLAGNGSQDLPDIPRSYRWGLIHWWMNLNDNEFDHLSFTHFFSNWPRSFHSMIDDEIEFNLEHAVVSTSELRLKDLLGRLFFHSIRLPERNLQHNIILGELLSHLEKRLWRDKGLIANLKMNALEASVMLNCSLEQIASMVEQRILKPNRRTKPNSPIETTDYLFHFGDIFCLWLAEFQTDEFNRSFYVSRW >NZ_CP023311.1|WP_019283230.1|1148384_1149869_-|sigma-54-interacting-transcriptional-regulator MATLLSWLGRTDLDQMKQDNPASIATIALKGKALDSIIILASTWEDEWCDYKEWLERKLACAGRSKTSVTIQRVRLASPIDYSAITKVMQKQLSKISAGSEHIYLNLTSGTPAMTVVSVLLGKSIAKCQLLQTSPKGELIEVDIPVDFATEYTKSSTSAIQSLTSDIPQLSSAFEAITAKSTIMQLLVKKAHRLALSDLPVLVLGESGSGKEVMATAIHNASSRAEMPFRAVNCGALPENLVDSILFGHVKGAFTGADKDHSGLFEQANGGTLFLDEVGELPLNVQVKLLRALQQKEITRVGDVKSKVVDVRIIAATHQDLFQMTSQGAFREDLFYRLAVGVIEVPPLRARAEDIPELISILMSDINQQAEKHPLFESKKISADAINFSKSYPWPGNIRELWNTLNRAVLWSESNTISVEDLQSSVLSAGRNQSSQGEFSVPGDIQQYIDNIKKDAVESALEYSRNNKSKAAEALGLKSHQTLSGWMTKLGIEE >NZ_CP023311.1|WP_019283229.1|1144880_1148312_-|DEAD/DEAH-box-helicase-family-protein MKTSVNFEYLRKDWPELAELGAFAEAYAVSDPQSALVKLRCYVEKIVGYLYYELRLPVAPNASMHDKLISGSFTSIVDKSIADKFHAIRRGGNKAAHDGNVTQHDAIWLLKESYFIGCWLYIAYGEGKREECPDFTTPENVQGVEESKGEFKRKNRQLQEKLKQNDEVLKQAIKELEDVKQAQLAAQKEAASLKQQVNQAKANNLKQNTLSLKNSFDFNEAETRKRLIDAELRSQGWDVALDDESTEQVSKEYQVDGQPTPTGKGYCDYVLWDDNGKPLAVIEAKRTRTDAKAGREQAKLYANALAKQTGQHPVIFYTNGYEIYIWDDAQGYAPRSIFGYYSKDSLQYLIQQRELKQDLNETPIDTKVAGRMYQMESITRICERFSDKHRKALVVQATGTGKTRVSIALAKRLLEAGWAKRILFLCDRKELRKQAGGAFNEYTNEPLYIKGKSKKAAAAKARIVIATYPGMIQNFEEYDVGHFDLIIADESHRSIYNKYGELFKYFDALQVGLTATPVEMISRSTSQLFGCDYKMPTANYPLEQAIEEKNLVPFKVVAHTTQFLRDGIKASELSDEQIAELEEQGIDPNTLDFDSELIDKAIFNKDTNRAIIRNLMEKGLKDADNQLPGKSIIFARSIAHADLLADLFHEMYPDLGGNFCRVIHSKYERAEDLIDNFKSTEGREDDITIAVSVDMLDTGIDVPECVNLVFAKPIKSKVKFWQMVGRGTRLCENLYGAGLDKKHFLIFDHWGNFEYFKMNPEEDEGSQSKSLPQKVFEAKLILAVEALKKAEMAIFADVVQQIKADIDALNDKTIAVREKWQLKAQLSEEKRLMQMAPDTKTRLFEEMAPLMQWKKTTGESEALRLDLQFLQLQLTKLQQPSKVEIEAQPILDKVTSLSMHLNEVRSKASTIKQIQQPSYLSDADYFVVESCRQNLRSIIHLRDKGIAPAPMATPIIDVREDRGLYQSQEIKTNITTVDYEIYRQEVEKTLSPLFESNEVLQKIRSGQTVTEADLATLSALVHTQNPNVDLQTLKEFFPESSAGLDQILRTIVGMDAQQIEKEFTTFVQQVHTHLNARQQRFIGMLKNHLCRYGSVDIEQLYDAPFNQIDDAGLDGVFPNPAQADVVEQFVRRFSVDLGNKQPS >NZ_CP023311.1|WP_019283228.1|1143122_1144718_-|N-6-DNA-methylase MITSGALKSQIDKLWEEFWTGGITNPLTVVEQITYLMYARMLDMNERNDEKRSARTGKPFTRRFPVSEDKSKDKQHIRWENFRHLGAEKLYPLVKDELFPFFKELTNDDTLFAEFMKDAQLMIQKKSLLVKAVELVSELPLENKDVKGDLYEYLLSKLTTAGINGQFRTPRHIIRAMIEMLDVEGTHRVCDPACGTGGFLSSTYEYLLEKYSSPEGVEKEQAFDIEGKPVLDVHGKPVFNYLYAGDLLENRAHIDYDMFHGFDFDSTMLRVAAMNLVMHGVKQPGIHYQDTLSQSFIERFPSEAKNGFDIILANPPFKGSLDEEDVDPAILKVVKTKKTELLFVALIQRMLKVGGRSATIVPDGVLFGSSNAHQMLRQHLIEDNQLEAVISLPSGVFKPYAGVSTAILIFTKGGSTDKVWFYDVENDGYSLDDKRTPIKDNDLPDLVKQYKTYQAAIMAGESTEQWSDKTQKAFLVAKDDIKANKYDLSINRYQKKHYKPETYEEPKVILGKLKVLENEILADLNELESML >NZ_CP023311.1|WP_019283227.1|1141893_1143126_-|restriction-endonuclease-subunit-S MIKLGCNTSLPSGWQWAEAGKVIDIRDGTHDSPKPVEVGIPLVTSKNLKNGKIDFSICTNISAEDHEQISKRSVVDDGDILYAMIGTIGNPVIVQGDRDFSIKNVALFKFSKSQVYNRYFYHLLGSSLVTQQLEKNARGGTQKFVSLGNIRALQIPLPPLEEQKRIAAILDKADAIRQKRKQAIDLADEFLHSVFLDMFGDPVTNPKGWEQVPLSTLSDKILNGTTPKGGSDVYVEKGIAFLRSQNVWKKRIDLDDIVYLDDVTHAKMSKSSLKYKDILITKTGRINTDNSSLGRAAIYYGKDDEANINGHVYLVRLKPDNVHEFIEFILTTKEYRDHIRSVCVGGIDKRQLNKNHIEEFPIICPPSSQQQRFVKVLHQSQKVMDNYKEQLVEAQNNFSALTQKAFSGQL >NZ_CP023311.1|WP_076612072.1|1140252_1141521_+|IS4-like-element-ISVa14-family-transposase MTIISLQKQFKQFFNADTLQKMAKSTGLMKRCRAILPEQLVISLVAALSKGNCTSIADLQRQFNGMCLSPEDAVAYKPYHNQLRKIEFPNFMRQLVMRAIAQFARQQNVGLPDKLDTFDDVLLQDGSSFHIHRDLADVYPSRFKRNPAAVECHMTMSLKSFSPVAMSISADTASERDFLPEPKTMNNKLLLADAGYPDFHFFRELEQHGGFYIVRGAKSLNPMIIEARNGRGRLLPKLEGRRLKDITRGTNRSQVLDLKVRRGKQEFRVVRRWFAEEKRFCIWITNLPSDTYTADDIMAIYRCRWQVELLFKELKSHTNWQRFVTAQKAIVDGLIWASLLALIIRRSIALQIMPSVSLFKAAKNVDVWLLPIFECISHRAWSEISNKLEWAASYISMNAQKSAQRKSKENITLDGIYAGLNA >NZ_CP023311.1|WP_096037180.1|1136806_1140115_-|hypothetical-protein MDTTSPSVLEPASAILGSTSVYGCLRAILTKRELSQPTGQPLFTYQLTEPEYHHLRTSLKNQKLPTRLHGDSSWCAAFCLFSAEWYRRQYQGGWSWSGISSSLGFELDANQRSKVIKIGFKYWQRTVSQYNDDRHSFLGSVFREGGLPYGLLASEGGRFQSIFKRILRVFDDAQAYGQSPFQLVSEGLEHLPEAFRQETTVDLITNMAELLLRLTDEYNLQQQEQPANHLDNQLPNWRDLFPIPLDTDTGSEFLTGLLTSASVQRQSKSQQTKRIICWQRLSNNEDLGFVTQIKLMKAIPMPFKREALINSRVELFIQEGNRVIAELGIGHATFEGEATKVILRTPACEFRRQTIEQDLYLVVLQAGVELHREEIPNSDLAINEMPIVLRSDGEHDWVVGQGSVSTKADQLKAILLKDAAYTAEFPELCSTVTTDHYQLVEFSGEIKVDYSTEEDEHDTYVISTRQSAVLADQVSVRGTKLQYYSSTGQPIYLGLPTITSQEPNTELWLGNKRLGDAHQAGLFGIQSVRLKASGNRTMLRKRLAILPQSFHLELKPSKQANSGFVDLHCERNLFVSIEGEQVSYKQTNIEGGKRIKVIAEGSPPADIILSISANLMADPIKVRVPFPASGALTFDKHGNGLAKRITIDDLLGARIQFFPRVDVAASYYIELKGPMRSRDASYYWEYKVTDKVLEVSLYEFRHRIRELLAASGELDDEVRMVIGGAGCREQQTIIGRYATEAQQFNETVSFNVKLENDLVIKPELINLADPAEKPHALQQRYSNGVATGVFELNTKLSQPALIVPSNNTQLAFRAKFIPSSEPIERSNDVKTLNKAVALFHPVTNPNAIADVLPMLANDFNHSSWRFINDLFANYSHLPMATFEVWKALVKHTACLSALAFKADNPVQLMERLKVEFNVIWELIPLSIWRSHIVKFRQMLLDIGLPEKVVDNKVKSKLETLSEFSPLFEKQCCSLIDDQFIQQEANLPAVFQYCLPEWSQDLVRVHLSDREWPAAFSFELETWCKKHCESLIHFEVIRGFHKSVLYFPVFAAAVACGKVHLEELTPTLYPLDYFHLRQIVEFDRHWFNPVFQSALCVFAQEEA >NZ_CP023311.1|WP_076611988.1|1156005_1157175_+|ISL3-like-element-ISVa10-family-transposase MSQGVLVRCRRDRRYKVKEPISGTSCTVDHYVKRRLQDLPVSGRPCTIEVELAKTRDKEGRRLIEETEYVAKGGRYTARFCKFISGLCRHMSIHAVSQHLGIRWETVKNIDREYLRSSLPALDPEKLNNLVHIGVDEVARAKRHDYMTVVYDLVSGHLIWVEHGRKAEVLISFFEQLSEETKSGIKAVSMDMGQSYQSAVRKMLPNADIVFDRFHVMQNYCILIKKERAKAFRNGSHDEKKMLKGTLFLLLKNAHKLDDRQSDRLDDLLESNKTLCVVYMLKEQLQAIWDEPDYETMVAALEAWCRLAKSTRILSLINFADALLERKVGICNYGKYKLTNARVEAGNVSIGLLRRRARGVRDTDYFKLKIRQTSVPDTHSTFYPNIKLT >NZ_CP023311.1|WP_026028891.1|1157486_1158761_-|carbohydrate-porin MKKVSVIAAAVAATLAAGSAFAAETDVLKDGWEVHGYASMNFRMVDGETVDTEFGKPDYKTAGTHGKSTNQVEFVIKKHTEHENGVWSNFTVRSEYGNGNSYAYSSSGSQKANDTAQFEVKETFVEIGGLSYLGEDTSIWAGQRFLNRAAGILSGEFWKQSSGVGAGVQTKLAGNTAGFAVVVADPDAGAATTNPERTTLSSYDLYYYGVDVGFGSLDFDFKYMEQANKDSKSDDGFGASITLNSSYYGLDGWAQSAIAYGKGVAQNRGVNFGGWSGGDDKQESIFLTSYGVLNISENWQMGSEITYFGALDELFGAKDLKRYIAAVRPSYKVNDNLRLEMTGSYAHEEGAEGYWGRTGEALESDIFNVELAAAFTVNADYFGRPQIKPYISYISADDEASASQIGIKDGKNETVIGVHTEIWF >NZ_CP023311.1|WP_096035882.1|1158838_1160265_-|IS66-like-element-ISVa8-family-transposase MKKKKSKFAEAPPVASDINEANALIEELWEQLRHYEDKLKTSCSNSSKPPSSDGPKERAERKKPQSSGDRNPRGAKQGHSGSQRQLSKLKKTDTVIDCLPDPTCPCCGQSDIFVHNNPFYRHQVHEIPKPAVDISEYRLFSGQCRHCNEVVRGKKPENVSQGIIGPNLLSYIAVLAGQYHLSIRKICSLLKEQLGTTFSVGAISEAQTKVASMLTPLHHAIRDSIQTAPLVHVDETSHPRNGEESLRWCWLVASEDLVYEKILFSRSTHSAKTMLGKNYSGLVVTDQCPSYNWLKPEQHQLCWSHVRRNLQQIADYTGGGYTALVGQRLTLLANMVFRIRHRLENTEIQYEQYIRRMNRLRKSFDHWLQKGSGIVVQRYKGRCKKLQSHRQSLWLFLTDTSIPLTNNEAERRIRGSVIQRKISFGTTSDAGDKFRGRMHSLVETCNKRGISSLSALMEIVQAVTLRKPYPNVFSL >NZ_CP023311.1|WP_157733297.1|1160287_1160434_+|hypothetical-protein MITQEEKVDQVRSVTLDCQWGTGERLQNFNYGQHLKLSLFSYWNLQGS >NZ_CP023311.1|WP_096037182.1|1160806_1162768_+|glycogen-debranching-protein-GlgX MKCTISSPYPLGATLDNTGCNFAIHAPANKQLLLALFDQQGSFTTHELENEYAGVKYTHVPNIKAGQKYGYLILNGDEPHYISDPYAKAIDKNLGYKTPFSSKKSFELPKCVVVDDQFDWQSTKKPHIPRDKTILFETHVKGVTKLNPRVPKAEQGTYLGLISEEMLEFYRKQNINTLQLLPIAACMHEPHLLDMGKVNYWGYNPYLFMVPDPRYAQKDAVTELKTAIRELHRHGIEVILDVVYNHSAEGGEDGPIFNLKALDPKYYLKHGQHYANFTGCGNTIDLSYQPALNLVMDTLRYWVSEYQIDGFRFDLAATLGRNGDNFSPDAAFFKAVAQDPTLKRVKLIAEPWDIGPNGYQVGNFPFGWNECNDKLRDITRSFWRGDQGYLKEFATRLMGSRDLYSAANWPYKLTVNYITYHDGFTMQDLVSYKHKHNEANGEQNRDGHGDNRSDNYGVEGETENMVIKATREKQKRNMMASLLFAFGIPHILTADVLSHTQQGNNNAYCQDNEISWLDWNMTERKSYFKHWLSQMVAARHLYMVPFIRAFSGEERNANRVFWRRVDGTLMEHDDWNRLSSVALQMGIGSDGAEMLYLINQTNAPARFTLPKNRNQNWEVICDTNLRNVQPGHAEGELLQSPISMTILHYQPEV >NZ_CP023311.1|WP_013868344.1|1162869_1163937_-|L-ascorbate-6-phosphate-lactonase MSKIDEITRDSWVLSTFPEWGTWLNEEIEKTEVEANTFAMWWLGCTGIWLKSAGNTNLSIDFWCGTGKKTQKNALMNQQHQMMRMGGVRELQPNLRTSPFVLDPFGIKEIDAVLATHDHADHIDINVAAAVLQNCGEHVKFIGPQACVDLWQGWGVPSERCIVAKVGDCIEVGDISIRVLDSFDRTALITLPKGVSSYDKGILDGMDDRAVNYLLETSGGSIYHSGDSHYSNYYAKHGNDYKIDVALLSYGENPRGITDKLTASDILRAGEALDCEVVIPFHHDIWANFQNDPREIEVLWQMKKDRLQYGFAPFFWQVGGKYTYPTDKGRMHYQHFRGFKDIFVDEPELPFKAFL >NZ_CP023311.1|WP_026027147.1|1164060_1164816_-|HTH-type-transcriptional-regulator-UlaR MNEVQRHNEILSLLDNMRTINVTHIIEKFNVSPATARRDISKLDELGKLKKVRNGAERLEIRKRAWTPLNIDSTDHFHEKSQIAMAAAKLCNPGDSVVINCGSTAFLLGKELCGQDVQIVTNYFPLASYLINEDHDDVIIIGGQYNKAQNIFLNPAPDSLGGYAGHWMFTSGKGLTENGLYKTDMLTAVAEQQMLEQIGKLVVVVDSSKVGQRTGMLFCPASKVDIVITGKAADPQVIQALQQQGTEVILV >NZ_CP023311.1|WP_096037183.1|1165206_1166967_+|PTS-ascorbate-specific-subunit-IIBC MQFIYDIFYIFYSQVMTKAPLLLGLVTLIGYWLLRRDTTTIIKGSIKTIVGFMLVQVGAGTLVAGFKPVIEKLSEYHGLTGSVIDPYTSMMATMEIMGDDYSWVGYTVLLALAINILLVLLRRYTGIRTIMLTGHIMFQQAGLIAVFYLVLGASMWETILYSAVLMALYWSISSNIMFKPTEAVTGGAGFSIGHQQQVASWIAVKIAPKLGDKNESVDHLELPKWLHIFHDSIAATAIVMTLFFGIILLSFGLDNLQAMAGKTHWSIYILETGLKFAVAIQVIVAGVRMFVAELSEAFKGISERVIPNAVLAIDCAAIYAFSPNAMVFGFMWGAIGQFTAVLAMLAFDAPIMIIPGFIPMFFSNATIGVFANHFGGWRAVMKICFVMGIIEVAGSAWAIHIFNQYGTEFSGWMGMADWALVFPPIMQGLSASKLFFFVLIALAGVYMFFASKKLREEEDAQGLVNISDEPDVIAAVEQALKVSDGVRPVSILAVCGNGQGSSMMMKMKIGKYLEKKGIPHVMDSCAVSDYKSKLATTDIIVSSKHLSGEMEPGEGKFVLGVQNMLNPNSFGDELLDIIDKNFVTLK >NZ_CP023311.1|WP_019282359.1|1167044_1167527_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MGLKQSLIDNDSIQLNAQASTWQEAIKIGTDRLIKSGAIHPCYHDAIISSVEQLGPYIVIAPNLALPHARPENGVIRTAFALVTLQTPVYFDGEDEPVDVLITLAGSSSDQHMEGLMEVTQVLDDEESETGVDLDKLRRCHTAQDVYQVIDEALAAQLVE >NZ_CP023311.1|WP_096037184.1|1167534_1168227_+|L-ribulose-5-phosphate-4-epimerase MYSELKQRVFAANLKLPQYGLVTFTWGNVSEIDREKGVIAIKPSGVEYDVMKVDDMVIVDLNGAIVEGTLNPSSDTATHLELYKAYPEIGGVVHTHSRSATIWAQAGIDIPALGTTHADYFYGDIPCTRKLSCDEIAGQYEKNTGLVIIEEFKHRRIDPMAVPSVMVAGHAPFSWGKDANDAVHNAVVLEEISAMALATRSLNSGIKIQPELSDKHYQRKHGDNAYYGQR |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
9078 : 158713
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP023311|9078:158713|DBSCAN-SWA 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111 | Clostridium_phage(14.29%) | transposase,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
166583 : 248185
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP023311|166583:248185|DBSCAN-SWA CATGGCTACCATTCAAGTTCAATGTCGATTTTGCAACCAAACTGAACATGTTCGTAAACACGGAACTGGAGTAACAGGCTTTCAGCGCTTTCGTTGCATTGAGTGCAAGCGTTCTTTTCAGCTTGATTATGTATATGAGGCATATAAGCCTAATGTCAAAGAACAAATCATTGATATGGCAATGAATAGCTCTGGTGTAAGAGAAACAAGCCGTGTCTTAAAAGTTGGCTATAACACAGTGCTACGCACTTTAAAAAACTCTCACCAAGGCAAGTGACCTCGATTCCATTCGATAAAGCAAATCTCTCTCTCATCTGTGAAGTTGATGAGCAATGGTCATTCGTCGGTAAAAAGAAAAATCGCCGCTGGCTTTGGTATGCTTGGGAGCCTCGCTATAAACGCATCATTGCTCACGCATTTGGTAAACGAAATACGGATGCTCTTCGATCGTTACTCACTTTGCTAAAGCCGTTCGACATCAGCTTCTTTTTTACCGATGACTTCAGCGTTTACGCAAAAGAATTACCAAAGGAAAAGCATGTTGTAGGCAAAAGGTTCACTCAGCGGATTGAGCGAACCAATCTGACCTTACGTTCCAGATTAAAACGTTTAGTGCGTAGAACTATCGGCTTTTCTAGATCGGAGGAGATGCACGATAAGGTGATCGGAACATTCATTGAACGGGAATTCTATTTTTAAATCAACCGATTGGAGTCATGACCCACTCTCCGCACTATAGTGGGCATCTAAGCTGATATTTTGCGCGACATACGGAACAGGGTAAGCCTGTATATCTCCCATTGGGAAAGCAGTCTGCGAAGATTGCCGATAGGTGTGCAGGTAAAGGAGGTTAGAAAAAGCAAAGGCCGCTTTGTAATGAAGTGGATACAGGTTTATATCTGGCGCGAAAGCGAGCTGACTTCTAACTGGTCTCCCGTTGCAAGATGATTTGAAGAACTTTATTTAAGGAGAAACGCAAATGGTGGCTTCATCAGAAGTTAGTGCTTCTCCTAATGGCACTCAATGGCAATCCATCGATTGGAAAGCTGTCGAGTCGCACGTGTTAAAGCTTCAAATGCGCATTGCAAAAGCAACTCGAGAGGGAAAACACAGTAAAGCGAAGTCTTTGCAGTGGATCTTAACGCACTCCAGATCAGCGAAATTACTTGCTGTGAAGCGGGTGTCCCAAAACAAAGGCAGTAACACTCCAGGAATCGATGGTGTCATTTGGAATACGGATGCCCGTCGAATGACCGCAGTGGATCAATTGAATCGCAAAGGCTACCGAGCTAAACCGCTCAGACGTATCTACATTCCGAAAAAGAATGGCAAACTTAGACCCCTCGGCATTCCATGCATGATAGACCGAGCGCAACAAGCGCTTTATCTGCTTGCTTTGGAACCGATATCGGAAACGATAGCAGATCCAAATAGCTACGGTTTTCGCCCTAATCGCAGTACGGCTGACGCAATAGCACAATGCTTCAAATGCTTGTGTCTTAAGCGCTCAGGTCGCTGGGTTTTGGAGGGGGATATTAAAGCTTGCTTTGACAAGATTGGGCATGAATGGCTACTTGAACATGTTCAAATAGACAAAAGGATGCTGAAGCAGTGGTTAGGCTCTGGCTATATCGATAAGGGCTTGTTCTACCGAACGTCAGAGGGAACTCCGCAAGGAGGAATTATCTCTCCAACGCTTATGTTACTGACGCTTGCGGGCCTAGAAAAGCTCGTGAAAGAAGTCGCTAAGAAATCGGGAGAACGAGTTAACTTTATCGGTTATGCGGATGATTTTGTGATAACAGGTTCGTCAAAAGATGTGCTTGTTAACGAAGTCAAACCAAGGGTGATTGATTTTCTAAAAGAAAGAGGGTTGACACTCTCTGAAGAGAAAACACACATTACTCATATAGATGATGGCTTTGATTTTCTGGGCTTTAACCTCAGGAAGTACAAAGGCAAACTACTCATCAAACCGAGTAAGAGCAACGTTCTCTCTTTCTTGGGTAACTTGCGTGAACTCATCAAGAAGCACGCAACAATGCCAGTCAATGATCTCATTAGATTACTGAACCCTAAGCTGAAAGGTTGGGCGAACTATTATCGCCACTGCGTTGCAAAACGCACTTTCGGTTACCTCGGTCATCAAATCTTCTGGTTACTGTGGCGATGGGCGGTAAGACGTCATCCCACTAAACCAAAAGACTGGGTAAGGCGCAAATACTACATGAACAGAAGTGGTGGATGGCAATTTCACGGTTGGCAGAAAATCGCCAATATGGACTGTCACTACAACCTAATTCAAATAGCGAAAACGCCGATCAAAAGGCATGTGAAAATTAGAAGTGCAGCAACCCCATTCGATCCGCTTTACCAAGATTACTTGGCAAAGAGGAAGCCGAAAAAGGAAAGTCGTCACTCTTGGTTTGACCCTGCCTTAACTGCTATCTAGGTTGCTGGGTAACGTAATACGCCTTAGCGGAGGCTTGAGCCGTATGCAGTGAAAGTTGCACGTACGGTTCTTAGGAGGGCGGCACTTGGTAACAAGTGTCGCCTATCCGACAAAAATCGTTTTACAGCATAACAAAAAGGCGAACTTCTCAGTTCGCCTTTATTATTGAATATTGATAACAAAGTCAGTCACAACCTAAAAGATGATCATAAACTGTGACGACGCGCCATCAACATCAGCACCTACTCTTGGTAGTTATCGATACTTGGGCATGAGCAGACAAGGTTACGGTCACCGTATACGTTATCGACACGGCTCACGGTTGGCCAGTATTTTGATGCCTTAGTATGAGCGGATGGGAAGCAAGCCGTTTCACGAGAATATGGGTGAGCCCATGCTTCACTCGCGAGATCCGATTGTGTATGCGGCGCATTCACTAACGGGTTATCGGCTAATGGCCATTCGCCTGATTGAACTTTCTCCATTTCGGCGCGAATCGCAATCATCGCCTCGCAGAAGCGATCCAATTCGGCTAAGTCTTCCGATTCGGTTGGTTCAATCATCAAGGTTCCAGCAACAGGGAATGACATCGTCGGTGCGTGGAAGCCGTAATCCATCAAACGTTTAGCAATGTCTTCTTCGCTGATACCGGTCGCTTCTTTAAGCGGACGAATGTCAATAATGCATTCGTGCGCTACGCGGCCGTTACTACCACGGTAAAGAATAGGGTAGTGTGGGCGCAGTCTTTCCATCACGTAGTTGGCATTTAAAATAGCGACTTGAGTCGCCGTGGTTAAGCCTTCTGCACCCATCATAGCAATATAAGCCCATGAGATAGGTAAAATAGAAGCGCTGCCTAAATCGGCCGCAGATACTGCGTGATCGCTGCCTTCAACTCCCCCTTCAATATGTCCCGGTAGGAAAGGCGCTAGGTGAGATTTTACACCAATCGGTCCCATACCTGGGCCGCCACCGCCATGAGGAATACAGAATGTTTTGTGCAGATTGAGGTGAGAAACATCAGAGCCAATAAAGCCCGGATTGGTTAAACCAACTTGCGCGTTCATGTTGGCGCCATCAAGGTAAACTTGGCCGCCCGCGGCGTGAACCATGTTACACACTTCTTTAACTTGTTCTTCGTAAACGCCGTGTGTTGAAGGATAAGTGATCATGATGCTAGAGAGGTGCTCTTTATGCTTCTCAATTTTGTCTGCGAGGTCTGCGATATCAACGTTGCCGTTATTATCACATTTCACGACCACTACTTTCATCGAAACCATTGAAGCGGTTGCAGGGTTGGTACCGTGTGCTGAGCTCGGAATTAAGCAGACGTTACGGTGCCCTTCACCACGGCTTTTGTGGTAGCGCTGAATCGCTACAAGTCCTGCATATTCGCCAGAAGCACCGGAATTTGGTTGTAGCGAGAAGGCATCATAGCCTGTGATTTCACAGAGCTTTTCTTTTAAATCCTTAGCGAGAGCGGCGTAACCTGCGGCTTGCTCTTTCGGTGCAAATGGGTGGATTGAACCAAATTCAGGCCAAGTGACAGGGATCATCTCGGCTGCGGCGTTCAGTTTCATGGTGCAACTGCCAAGCGGGATCATGCCGTGAGTTAATGAAAAGTCTTTATTCTCAAGTTTTTTCAAATAACGCATCATTTGCGTTTCGCTGTGATAGGTGTTGAACACAGGATGCGTTAGGAAGCGAGATTGACGGCGGCACTGTTCTGGAATCGCTGCAAATTCGTTGGCGGCAATTTCTGCCGACAGCGCGCTTACCGATTGCTTAATATCGAAAACCGCAAACAGGGTTTCAAGATCAGTTGTGGTGGTGGTTTCATCCAAACTGATGCCCAATTGGTCATCAAATCGGCGTAAGTTGATGTCGGCTTGCTGCGCTTTTGCGTACAGAGCTTGAGTTTGAGCGGCGCTCTTTAAGGTAATCGTGTCAAAGAAGCTGTTATGCACCAATTCGTAACCCGCTTGAGTTAAGCCTGCCGCTAGAATTGCTGTCATATGATGAGTACGGCGCGCAATGGTGCGCAACCCTTCTGCGCCATGATAGACCGCATAAAACGAGGCCATATTAGCCAGCAGAGCTTGCGCGGTACAGATGTTCGAGGTCGCTTTTTCGCGGCGAATGTGCTGCTCGCGAGTTTGCATTGCCATGCGCAGTGCTGGGTTACCTTTGGCGTCAATCGACACTCCGATCACGCGGCCGGGCATAGTGCGTTTGTGCGCTTCACGCGTGGCCATAAAGGCGGCGTGTGGGCCGCCGTAACCCATAGGGACACCGAAACGTTGAGCTGAGCCAATCACGACATCCGCGCCCATTTCACCTGCTGGTTTCAGCAAGGTGCTTGCCAGTAAATCCGTGGCAACAGTAACCAAGATTTTATTGGCTTGCGCTTTAGCAATTATATCGCTTAAATCACGCACTTCACCTGTGGTGCTTGGGTATTGCAGCAGCGCGCCAAACACATCTTGTTCAGGCAATGAGTCGAGTGCGCCGATTTGTACCTCAAAACCGATAAATTCAGCGCGAGTTT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54 | Escherichia_phage(15.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
329758 : 390394
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP023311|329758:390394|DBSCAN-SWA 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35 | Hokovirus(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
399497 : 596925
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP023311|399497:596925|DBSCAN-SWA 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183 | Vibrio_phage(15.91%) | tRNA,transposase,integrase | attL 488752:488767|attR 586906:586919 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
600481 : 773700
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP023311|600481:773700|DBSCAN-SWA 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182 | Vibrio_phage(32.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
786653 : 839673
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP023311|786653:839673|DBSCAN-SWA TATGTTAAATCACTTTGATTACATTATCGTCGGTGCAGGCTCAGCAGGTTGTGTTCTTGCCGATCGCTTAACCGAGTCTGGCGAGCATCAGGTTTTACTGCTCGAAGCTGGCGGAAGCGATAAAAGCATTTTCATTCAAATGCCAACCGCCCTTTCTTACCCGATGAACAGCGAAAAATACGCATGGCAATTTGAAACCGAATCAGAATCCGATCTTGACGGGCGTCAGTTACATTGCCCACGGGGAAAAGTACTCGGTGGCAGTTCTTCGATCAATGGCATGGTATACGTACGTGGCCACGCTTGCGATTTTGATGAATGGGAATCACTGGGCGCTAAAGGTTGGAATTATCAAAATTGTTTACCCTATTTTCGCCGCGCTGAATCTTGGATAGGTGGCGAGAACGCTTATCGTGGTGGCAACGGGCCCGTCGGTACTTGTAACGGTAACGACATGCAATTGAACCCACTTTATCAAGCCTTCATCGATGCGGGCAAAGAAGCCGGTTATCCAGAAACTGACGATTACAATGCTTATCAGCAGGAAGGTTTCGGACCAATGCATATGACGGTAGATTCTGGAGTTCGCGCCTCAACGTCCAATGCCTATTTACGCCGCGCGGTGAAGCGCCCGAACCTCACCGTAAAAACAGGAATTGTGGCACATAAGATCTTGATTGAAGAGCAAAAGGCCATCGGCGTTGAGTTTGAAAAATCAGGCAAGATCCAACAAGCGTTTTGCTTGCGAGAAGTGATATCAAGTGCTGGTTCTATTGGCTCTCCTCAACTTTTGCAACTTTCAGGTATTGGCCCTAAAGCGCTGCTTGAACAAGTTGGTGTGAAACTGGAGCAAGACCTGCATGGCGTGGGTCAAAACCTGCAAGATCACTTAGAGATCTATTTTCAATACCACTGCAAACAGCCGATCACACTAAACAGTAAACTCGGTTTAATCAGCAAAGGGCTTATCGGCACTGAATGGATCTTAACTCGTAAAGGATTAGGGGCAACCAACCACTTCGAGTCGTGCGCGTTTATTCGCTCTCGCGCAGGGCTCAAATGGCCAAATATTCAATACCACTTTTTACCTGCTGCGATGCGGTACGACGGCCAAGCGGCCTTTGATGGTCACGGCTTCCAAGTTCATGTGGGACCCAATAAGCCAGAAAGCCGAGGACAAGTACAAATTGTCTCTCGCGATCCAACGGTTTCACCCTCTATCGCATTTAATTACCTATCAACCGAACAAGATCGTCAAGATTGGCGCGATTGCATTCGTCTCACCCGCGAAATTCTAGCGCAACCAGCATTGGATAGTTATCGGGGTGAAGAAATTCAACCGGGGGAAGAGATCCAAAGCGATGACGATATTGATTCATGGGTCAAACAGAATGTGGAAAGCGCTTATCACCCCTCTTGCAGCTGCAAAATGGGCGCAGATGACGACCCAATGGCCGTAGTGAATGACCAATGCCAAGTGCGCGGAATTCAAGCTTTACGCGTGGTGGATTCCTCGATATTCCCAAGCATTCCCAACGGGAACCTGAATGCGCCAACCATCATGGTCGCAGAGCGCGCCGCCGATCTTATTTTAGGCAAACCGCTATTAGCCAGTACTGAAGCTCCAGTATGGATTGCACCAGATTGGCAAACCAAACAAAGAATAAAACCACCAATGAGAAAGCCGGACGCTTACTCATAAAATTTATAAAGTCAGTCAAAAATACAAGGAAATAACATGTCTATTACTAAAAAAACCGTGCTCACACTTACAATGACGACTCTGCTCAGCGCCAACGCTTACGCCAATCAATGCGATACGGTGCGCTTTGCTGATGTGGGTTGGACAGACATTACCGCCACGACAGCAATAACCACAGAGCTGCTCAAAGGGTTAGGCTATCAGACAAAAATCGATTTACTCTCAGTACCCGTGACCTACTCATCTATGGCAAACGGTGACATTGATGTATTCCTCGGTAATTGGATGCCAACCATGGAAGGCGATATTGCCAAATACCGTGAAGCTGGAACGGTTGAAACTCTGCGCGCTAACTTGGAAGGAGCAAAATACACACTCGCTGTGCCTAAGTACGTTTATGATGCCGGTGTCCAATCGTTTGCTGATATCGCTCAATTTTCAGATAAATTTCGCGGCAAAATCTATGGTATTGAACCGGGCAATGACGGTAATCGCTTGATCCAATCGATGGTTGATGAAAACGCTTTTGAGCTGAAAGATTTTAGCGTTGTTGAGTCAAGTGAAGCGGGCATGGTGTCACAAGTGGCACGCTCAGTACGTCGTAATCAGTGGATTGTGTTTCTAGGTTGGGCTCCGCACCCAATGAACAGCAATGTTGAAATGGAATACCTTGATGGCGGTGACGATTACTTTGGCCCAAACTACGGTGGTGCAAATGTCTACACCAATGTTCGTCAGAACTACCTAGCACAATGCCCAAATGTCGGTAATTTATTAAAAAACCTATCCTTCTCGCTTGAAATGGAAAACCAACTGATGGAATCCATTCTCAACCAAGGCGTGTTACCAGAACAAGCCGCTCGCCAATGGTTAGCCAAACATCCAGAAAGTATTGTTCCATGGCTAAAGAATGTAAAAACCAAAGCTGGAACACCTGCACAACAAGCTATCAGCAACTATTTAGCGCCATTTAAAGCATAAATTAATTTAAAGGAGGAGGTGAGCATTTCACCTTCCAAAAGGCTATACCGTGAATTTTATTACAGAGAACAAAATCCCCTTAGGTCGTTGGATGGAAAGTGGCGTTGACTGGCTGACCATCCATGCAGCCACATTTTTTGATACTGTTTCCTACTTACTTGAGACCATCATTTTATCTTTAGTTGATGTGTTTAAATGGATGCCCCCTGCCGTGCCGATTTTAGTCACCGCAGCCATTGCATGGTATCTGCATCGTCAGATTTCATTGGTGATATTTGTCATTGCGGCTCTACTGCTTATTCTAAACCTTGGCTACTGGCAAGAAATGCTGGAAACCTTTGTCTTGGTGTTTGCCGCGACAACGATTTCCGTATTAATTGGCGTACCATTAGGCATTATCGCCGCGCATCGACCATGGCTTTATACGATAATGCGCCCAATTCTTGACTTAATGCAAACGGTACCAACCTTTGTTTACCTCATTCCAACACTAGTCCTGTTCGGTTTGGGTATTGTTCCGGGGCTCATTTCGACCATTATCTTTGCTATCGCCGCCCCCATTCGCCTCACCTATCTTGGGATTACTAAAGTACCGGAAGAGTTAGTTGAAGCGGGTAAAGCGTTCGGCTCTAGCCGTATGAACTTACTGCTTAAAGTAGAGTTACCAGCGGCTCTGCCTAGTATCATGGCGGGGATAACACAATGCATTATGTTATCACTTTCCATGGTTGTGATTGCAGCCTTAGTTGGGGCTGACGGCCTTGGCAAACCCGTGATTCGTGCACTAAACACCGTCAATATTTCTCAAGGTTTTGAAGCAGGCTTAGCCATTGTTTTAGTCGCCATCATTCTTGATCGTTTATGCAAAACCCCACATCAAAATAATAAGGACGCATAATCATGGACGCAATTACCATTAAAAACCTCGATGTTATCTTTGGTCAGAACCCAAATGAAGCACTGCAACGACTCGATGCGGGTGAATCTCGCCAAGAGATTATCGATACCTGCGGTCAAGTCGTAGGGGTAAACAATGTCAGCCTTACTGTTAAAGAAGGCGAGATTTGCGTCTTGATGGGGCTGTCTGGTTCAGGGAAATCGAGCTTGCTACGCGCGGTGAATGGCTTGAATACCATCAGCCGGGGATCATTAGAATTAAAAGATGGCAAACGCTTTGTTGACCTTGCCAGCTGTGATAAAGCAACGCTTCAGCATTTAAGGACAAATCGTGTCTCGATGGTGTTTCAAAAGTTTGCCCTTATGCCTTGGTTATCGGTTTTAGATAACGTGGCCTTTGGCTTAGAAATGCAAGGAATGAGTAAGAAAAAACGCCACCAACGTGCTCGTGAACAGCTAACAATGGTTGGCCTTGCTGAATGGGAAGATAAATTCCCCCACGAACTTTCTGGCGGCATGCAGCAACGTGTCGGTTTAGCGCGTGCTTTTGCAATGGACAGTGACATCCTGTTAATGGACGAGCCATTCTCAGCACTTGATCCGCTGATTCGTGCGCAACTGCAAGATGAGTTATTAGATCTACAAAGCAAACTCAACAAAACCATCTTATTTGTTAGCCACGACTTAGATGAAGCACTAAAAATAGGTAATAACATCGCGATTATGGAGTCAGGAAAACTGATTCAGCACGGTAAACCAGAAGAAATTGTCCTTACACCCAAAACGGACTACGTTAAAGAGTTTGTGGCACACACTAACCCTCTTAACGTACTAAAAGGACGTTCGTTAATGCAGCCCATCGAACAGTTAAAGCAACAAGACGAACGTTGGCAGGTCTGCAAAAAACAGGATGTTTGGGTCGCACAACATGATAAAACTCTGACGCTATATGGAGCAACGTCGACCGCTCTTATCCACTGGGATACCCAAGTCAGCGATATGTCGAACATTGATTCATCGATGATGATTATTACAACACCTGATATTGATATGCGTAGCGCGATTGAGTTGAAACATCGAACTCAAAATCCGATTCTTCTGATGGAAAATAATCAGCTCGTCGGCGTCTTAAGCGACCAAGAAATTTACAGTGCCCTACTGGGAAATTATCAAACCGAAAAGGCGGCTTAACACTCACCTCTGTACATTGCTGTCAATGTCATGTTAACGCCATCATACCGATGGCGTTATTTTCTAAGCAGGCTGTTGATTCTTAATCACATAGATCAAAAAAAGACGCTAAAAAGCGTCTTTTTTTGTTTTTGGAGGCGCGACCCGGAATCGAACCGAGGTCCACGGATTTGCAATCCGCTGCATAACCAGTCTGCCATCGCGCCTTTAATTTTTTGTTGCTCTTAAT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38 | Bacillus_virus(25.0%) | holin,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
863684 : 913571
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP023311|863684:913571|DBSCAN-SWA AATGTCCCAAGGCGTACTCGTTCGCTGTCGTCGAGATCGTAGGTATAAAGTCAAAGAGCCAATATCAGGGACTTCCTGCACCGTCGATCACTACGTTAAAAGACGTCTTCAAGATTTACCTGTGAGTGGGCGACCTTGTACGATTGAGGTTGAGCTGGCTAAAACTAGAGACAAAGAAGGACGACGGTTGATCGAAGAGACTGAATATGTGGCTAAAGGTGGTCGTTATACCGCTCGCTTTTGCAAGTTCATCAGTGGGTTATGTCGCCATATGAGCATACATGCCGTCTCTCAACATTTAGGAATCCGTTGGGAAACAGTAAAAAATATCGATAGGGAATACTTGCGTTCAAGCTTACCAGCATTAGACCCCGAGAAACTGAATAACTTGGTTCATATTGGCGTCGATGAAGTTGCCAGAGCCAAGAGACACGATTATATGACGGTTGTTTATGACCTCGTCTCTGGGCATTTAATTTGGGTTGAACATGGCCGAAAAGCAGAAGTTCTGATCTCCTTCTTTGAGCAACTATCAGAAGAAACCAAATCAGGAATCAAAGCAGTATCAATGGATATGGGCCAGTCTTACCAGTCGGCGGTCAGGAAAATGCTTCCCAATGCTGATATTGTTTTTGACCGATTTCATGTCATGCAGAACTACTGCATCTTAATCAAAAAAGAGAGAGCAAAAGCTTTTAGAAATGGCTCTCACGACGAAAAAAAAATGTTGAAAGGAACGCTCTTCCTCCTACTGAAAAACGCTCACAAATTGGATGATAGACAGTCTGACAGACTTGATGACTTACTTGAGAGCAACAAGACTTTGTGCGTTGTTTACATGCTCAAAGAGCAGCTACAAGCCATATGGGATGAACCCGATTACGAAACAATGGTGGCAGCTCTAGAAGCTTGGTGTCGTCTTGCCAAATCGACCAGAATACTTTCCTTAATTAATTTTGCCGATGCTTTATTGGAAAGAAAAGTGGGTATTTGTAACTACGGAAAATACAAACTGACTAACGCTCGGGTAGAAGCAGGTAATGTCTCGATTGGCTTACTCAGACGAAGGGCAAGAGGGGTGAGAGATACAGACTATTTCAAATTGAAGATCAGACAAACATCGGTTCCCGATACACACTCAACTTTTTACCCAAATATCAAGCTCACCTAAGCGGAGAAGAGCCCAAATTCTATGGGAATCAACAAAATAAAAGTTCCACTATTGTGTCACGATAATGCATGTAATTTATATTTTTGCGTTCATTGATATACGCTTCATTTAATCCTAACATTCTAATTAAACATACTAATAATTACATTTTCATCAATTATTGTCATTTTACTTAGGTGTATAATCTCATGAGTATCAAACAAAAATTATATTCACTGGGTGCTATTGCGGTTATCGGGGTTCTGGTAATGTTAGCCACTACCACACATTTTTCCCAAACCACCGAAACGCTCAATCAAGCCATTAACTTAGTCGATAAACTTGAAATTAGACTGCTCAATTTGCGGCGCAATGAGAAAGATTTTCTTCTGCGAAGCGACGTGAAATACCTTGAAACCTTTAAAAAAAACAGCACTCTTTTTTTAGATCTGGAACAGCAACTTTCCCTCATCCTGTTAGATCGAGATCTCCCCTCTAGTAGCCAACTCCGACAAGATCTTTTGGCTTATAAACAAGGTTTTGAAAAATTGGTGCAGGCTTATAGCCTATACGGATTAAATGAAAAATCCGGCCTTTTAGCCACTTATTTACAAGCATTGGAAACCATAAAACCTAATGCTGATGATGCATTACTTTTAGAGCTAATGGCGTTTGATCAAAGCGTGCAGGTTGGAGAGCTGCAAAACAGCACAGTGACCAACCGTTTTCCGGCATTAGCACAGGCCGCCCAACAGCTTGTCGATCAGAAAAAAGTGATTGGTTTGAAATATAATCAAGGGCTACTTGGTGAAGTACGTAACCTTTCTCATAATGTTGAACAACAGTTTGTCACCTTTTCTGAAGTGTTAAATAAAGAGATTACAAGTATTGAGCAAGAACTTAACTATGTGAAGCAAGGGCTCAGTGCGTTAGTGATCGTGCTAATCCTTGGATTTATTCTCCAAATAGCGCGCTCCATTAACGTGCAAGTGAGTAAGTTGTTGTCAGTAATGCAAATGATTTCAAACAGCAACAACATCAGTTTGCGTGTTGAGCTGACTGGCCGCAACGAGTTGGTATCGATCGCAACTTATTTTAATACCTTACTCGATAAGTTCGAAACTCTTATCGCTGGCTCTCAAACAAAGTCTCACCAGCTATCGAACAGTACATCAAGTATGCATAACGAATTAGAAGATGTGATTGAACAGTTTCACGTTCAGGCTGACCACACCACGACAATGGCAACGGCCGTTCAAGAAATGGTGTCCACCATCAGCGAAATTTCAGAAAGTACTAGTGTAGCAGTAGAAGGTGTACACAAAGCCGCGCACAATGCTCAGCAAGGGCGTTTAGTGGTGGAATCAACGGTAAAAAATGTCGATGAACTCTCACGAACATTGGAAAAAAGTCAAATCTCCATCGCCTCATTGAACAAGCATGTCGAACAAATTGGCGGTGCTGTTAACATCATTCAAGGTATCGCAGAGCAGACCAATTTACTGGCATTAAATGCCGCGATTGAAGCCGCTCGCGCCGGAGAACAAGGAAGAGGCTTTGCTGTGGTCGCCGATGAAGTCCGCGCACTTGCCAGCCGCACGCATCAGTCAACGGAAGAGATCACCAATGTCGTTTCTGCAATTCAAAGCCAAATGAGCACCGTTGTCACTGATATTGCACAATGCAACACTCAAGGCCATGCGACGCTAACGGCTTCAGGAGAACTGGATAATAGTTTACGTCAGATTCTCTCTGACATGGAAATGATACAAAGTAACTCTGAGCGAATCGCCTCTGCAATTGAAGAACAAGGCATTGTGATGAACCAAGTCAGTGAATCGATCACCGAACTTAACTCTATCTCTGATAATAATATGCACTCAGCTAAACAGTGTTTGATTGAAGTCGATATCGTTTCCAAGCAAGCAAACGACATGGACAACGCGGTCGCCGAATTCCAGACTCAGAAATCCGTCAGTTAGCCAATGTATAGAGATAAAATATAGCGAGAGTTAGTGAAAAGGGTCTAGAGTTAGACCCTTTTATTCATGTTTGCTTAAAGCATAACAAGATGTGGATTACTTTTGTATTCCTTCAACATAGAGTTCCATATCGACGTAGCTTGAAGCGCCCATTACTGCAATATTGAAATCCGCGAGTTCGATACGTGTTGTCCCCGAAAAACCAGCGCGTTGGCCACCCCATGGGTCTTTACCTGCACCAATAAATTCTGCATCAATAGTAATGGGTTTGGTTTGACCATGCAGAGTAAGATCACCGAGCACTTCTAGTTTACCATTCCCTTTATCAACCACTTGAGTACTGGTAAACGTGGCTTGTGAATATTTTGATGCATCAATGAAATCAGCACTACGAATATGTTTATCACGTTCAGCATGGTTACTGTCCAAGCTGCGAGTATCCACATTAACTTTCACTTTTGAGCTTGCAAGGTCGTTAGGATCGTAGGAAAATTCACCATCAAACTTGTTAAAGCGGCCCTTGGTAAAGCTATAACCAAGATGGCTGACTTTAAAGTTAATTGAAGCATGCGCACCTTTGGTATCTATAACATAGTCAGCAGCGTTTGCACCTAGCGGCATGAGTGTTGCGAAAGCCAATCCAGTAGCAAGTAACGTTTTCTTCATTTAGAAGCTCCTATCATTTTTCGTAGCGTATCGTCTTTATCAATAAAATGGTGCTTGAGTGCGGCAACAGCGTGCACGCCTGCTAAAATAATCAGCGTCCAAGCTGCGTAAAAGTGAACCGTACCAGAGAGATCGGCTTGTCCTTCAAACAACAAGCCCATACTTGGTACAGTAAACCAATTGAAAACATCAATCCCTCGGCCATCTTCTGTTGAGATCAAATAGCCTGATACAAACAGCGTCATCAATAATAAATACATTAATCCGTGCGCCGCTTTAGCCGCAATGCGCTCATAGTGGCCGCCACCAATGGCAGGAGAGACACTCACCAACTTCCATAGTATGCGGAACAGGGTGACCGCGAGCAGCAACAAACCGACAGATTTATGCCAATGTGGCCCGGTGTTATACCATTGACTGTAATAGGTTAACTCAACCATCCAGATCCCAGCACCAAGCATACCGATGATAACGAGTGCGGATAACCAATGGATAAGACGCGTGACTAAGTTGTAATTTTTAACTTCAGTTGTCATAAATTTTCTAAACCAGCAAGTGAAACAGCAACAAAGTGAATTGAATCTATATTCTAGCCTAAATTATTAACACAGTATTTACCATACTTTACATTGTGGACATACTTTAGTACTGATTGAGTTATTCGAAAAAACTGAAGGAACTTATTGTGAATATAGATAACCACGACTTAGGCTCAAACAACTTGAAACAACGGTAGCTTCAAATCATAAGGGTTTAACACCTGTAGAATGCTCGTATTAGAAGAATAGTGTGAAAGATCAAGAACTCGCCATTTGCTGCTCGTGCTTGTTGATAACTGTGGTAATCTTGCTTGGCTTTATTAAAGGAGAACAACGAGTTGCTACTGGACATACTCACGCAAAGCGTCAACGAATTTCAAGCTGACTGTCTAAAACTTTGTGAAAAGCACTACCCCACCATACACAACCAAGGAATGAGTGAACATCACTTAGGACTGGCTTTTGCTCGCAGGTTGGCTCGTACACTCAGTGAATTTGGGCACCCATGCCACTATTCTGTTATTGAATCAATCCCTCAGCGAGACATGCCACACCATTACCGAGTGAGCAGTGATGCCGGAACGGTATGGATCCTGACTCACCATATGGTCAGTGCAGGTAAAACCTGTCGAGAAAAGTTGATGCAAGACATTGCGCAGTGGA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39 | Planktothrix_phage(18.18%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
944509 : 1071375
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP023311|944509:1071375|DBSCAN-SWA 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105 | Escherichia_phage(17.39%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1074782 : 1171954
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP023311|1074782:1171954|DBSCAN-SWA 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54 | uncultured_Caudovirales_phage(15.79%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1180540 : 1235898
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP023311|1180540:1235898|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP023311|1180540:1235898|1231388_1232921_+|WP_096036126.1|transposase|DBSCAN-SWA MKKTPNINPESQDVAELQAMVKALLASETQLKQERQSLLEQLKLAFDRQFAKRSEALKPYDESQGDLFNEAECEAAKEEEVEVVTTTITKKKRGKRKPLPKTLPREVIELDLNDDEKQCTCCQHNLHKIGEDRSEKLEFTPAVLKVLEYVRPKYACRQCEQTEDKNHVVQKPAPQSIIPKSFATESLLANIILGKYQYAMPLYRQESLFTQSGIELSRTTMARWIIQVSEKFAPLYAALKTHLLEQVVIQADETPLNVLKEDKQCYMWLYCSGADSPEAALPNVRNIVLYDYQNSRARACPVAFLGDYSGYLQTDGYGVYDGLHLVTNVGCLAHARRKFMEAKKLQGKGKSGKADSALAKIQKLYGIESRLKGACAEKRKAERQEHAKPILDELYEWMTTQKVLESSPLGKAIKYTLGQWPKLSRYIDDGHLSIDNNRAERAIKPLVIGRKNWLFSTNPNGAEASAMLYSIVETAKANGLILYDYMVKCMKELAKSEPDIDALLPWNFQH >NZ_CP023311|1180540:1235898|1184730_1185714_+|WP_013868174.1|DBSCAN-SWA MSSNSMSNSTQTNRRKWISKEWLIEQKSLIALLFLVVVVSFLNPNFFTVDNILNILRQTSVNAIIAVGMTLVILTAGIDLSVGSVLALCGAFAATMIGLEIPVIIAVPTALLAGAALGAISGIIIAKGKVQAFIATLVTMTLLRGVTMVYTDGRPISTGFTDTADAFAWFGTGYALGIPVPVWMMVVVFAAVWYLLNHTRFGRYVYALGGNESATRLSGINVDRVKIGVYAICGLLAALAGIIVTSRLSSAQPTAGMGYELDAIAAVVLGGTSLMGGKGRIMGTLIGALIIGFLNNALNLLDVSSYYQMIAKAVVILLAVLVDNKNK >NZ_CP023311|1180540:1235898|1193116_1193833_-|WP_017046895.1|DBSCAN-SWA MINHKIFQTPEQVVETLANEMQRYSEQGQPVHISLSGGSTPKMLFKLLASEPYAQAIAWQNLHFWWGDERCVAPDDAESNFGEANTLLFSQVNIPPQNIHRIRGEDDPQTEAKRFADEMAKVIPSVNGTPVFDWILLGVGADGHTASLFPNVTDYEDENLSLVATHPESGQLRVSKTAKVLEAAKRISYLVLGAGKAEIVHEIHTTKAEDLPYPAAKVKSTTGETEWFLDSDAATKIA >NZ_CP023311|1180540:1235898|1203190_1204759_-|WP_172859086.1|DBSCAN-SWA MRLSISRLVVASASLLSVVSLIAISYALWSKSATVMYSLSAQTYQQMAASLAENVATSVRFNKVESLEERVKVAVDSSNKELKHIAVFLADGSLFYQLNEKSVSPSGVNIKNALTQASTNAIIIEQSTQHVIIINPLTSGKEAKLVGYLVTQWQFDKVNAISKELGLWAISIGITFVLITFIGLFFILRSALLHPLNQLKNLCESLASGRCDLKQRIPFNKDNELGDLATAINMFIEKVEHTFHPIEQNICNVTDVTKAVERQVKQLEHNINGQQREIAQSVQIGEGARQSIASVTENINTASLSLQQAVISGQESQQQLKHALSENENLAEKSQVTAKTAESLNAQVEKVTDILQIIRTIADQTNLLALNAAIEAARAGENGRGFAVVADEVRNLAEKTSSSTNQVEEILTVLSNFSKDLIGYMGESVNASMSCVEAIESSNELVSQAIKDVNQANNANHLAVNSSDEQLSHVEDLLTQLSNLNQHSLELLNDSKVMSDCSKELFQTAQATSLSLSKFSAH |
41 | uncultured_Caudovirales_phage(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP023310_1 | 2489257-2489423 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP023310_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP023310_1
>1.1|2489311|59|NZ_CP023310|CRISPRCasFinder TGTGGTCGGTGAAGAGCCAGATAATGAAAGAGGCGACCCCCTTTCTCTTTGGTAACGAA |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP023310_1
The CRISPR arrays of NZ_CP023310_1 >merge|NZ_CP023310|1|2489257-2489423|CRISPRCasFinder AAAACTTACCACTTCCAAATGTAACAAAGCCCCGCATTACTGCGAGGCTTTTAATGTGGTCGGTGAAGAGCCAGATAATGAAAGAGGCGACCCCCTTTCTCTTTGGTAACGAAAAAACTTACCACTTCCAAATGTAACAAAGCCCCGCATTACTGCGAGGCTTTTAA >NZ_CP023310|1|1|2489257-2489423|CRISPRCasFinder AAAACTTACCACTTCCAAATGTAACAAAGCCCCGCATTACTGCGAGGCTTTTAA TGTGGTCGGTGAAGAGCCAGATAATGAAAGAGGCGACCCCCTTTCTCTTTGGTAACGAA AAAACTTACCACTTCCAAATGTAACAAAGCCCCGCATTACTGCGAGGCTTTTAA
>NZ_CP023310.1|WP_096036615.1|2486059_2488711_-|carbohydate-binding-domain-containing-protein MLKPSLIAVSVIATLSGCSLLQSPEQKVVDALAENLDIHYTVLTNHGADEGLACQALEAEWASCNKVNMTLVNQGEAVNSKQWAIYFHSIRLILDVENDQFKITRLTGDLHKLEPTDKFDGFAAGEEVVLPLVAEYWQLFETDFMPRAFVAAPNTEPKLIVSLNTEDTSSFVRGLEGDNIKRTTSDNNVFATAISRFERNSDVSLQDVSTALLPTPLKTTLGQGVVDITRGLKLDVKDFATDQFSALQARAKTIGLKLDGELAVGVAITPSEFSDQMATSGAYELEIAPNAISIRAFDEAGAFYAVQSILGLVDSQNVTALPVIHIEDAPRFDYRGVMVEVARNFHSKQAILATLDQMAAYKMNKLHLHLTDDEGWRLEIPGLPELTDIGGQRCFDLDEKNCLLPQLGSGPNSDNFGSGYFSRADYIEILKHAKARNIEVIPEIDMPAHARSAVVSMEARFDRLSQEGKTEQASQYRLMDPQDSSNVTTVQFYDKQSFINPCLDSSKRFVDKVITEVALMHIEAGMPLSTWHFGGDEAKNIKLGAGFQDINATEKVSWKGNLDLSQQDKPFAKSPQCQALVSQGVVSDFAHLPSYFAEQVSEIVADKGIENFQAWQDGLKYSEGESAFSTRNTRVNFWDVLYWGGTSSVYEWAKQGYDVIVSNPDYVYMDMPYEADPKERGYYWATRATDTRKMFGFAPENMPQNAETSLDRDGNGFVGKGEVTSKPFYGLSAQLWSETVRNDEQYEYMVFPRVLAAAERAWHKAEWENDYKVGVEYSQQTNLVNKSALNQDWTRFANIVGQRELAKLEKAGIDYRLPIPGAKIEAGKLSMNSSFPGVELQYSLDGQQWLTYSSIEQPKVSGEVWIRSISASGERVSRVTSVK >NZ_CP023310.1|WP_172859048.1|2485564_2485993_+|DUF411-domain-containing-protein MLSTLSLMSYSAFATVTEMTNYKSPYCGCCTEWSTHMQQAGFKVNEQLQEDMTAIKQQLGITPKLASCHTAVIDGYVFEGHIPATDIQAFLANPPKNAKGLAAPGMPIGSPGMESGDKKEAYSVFAFNEQGQVFEFAHHEGN >NZ_CP023310.1|WP_172859020.1|2483004_2485530_+|copper-translocating-P-type-ATPase MKRFQLPLSGLKCMGCAKKLEQHLKQEFEVQIHQLSPTFIELSTSASLNELIAAIESLGYQALLSTNNAPLSSLQPTTLVSDIQPLAQETEASITGLVSTHLLIQGMTCASCVSSVEKALLSVNGVQKAQINLVEQSALVLSQADIADLELQLLNAITHAGYRAERVDDPAQQQEKQKQQSRDLQKQHKTNALLGLMMGIPLMLWGLLGGSMMIVSTQQQIYWGVIGIVCLALLATAGRHFFSHAWLALTHKRATMDSLVALGTGAAWAYSMLVVIYPTWFPIASRHVYFEASAMIIGLISLGHYIEAKAKAKTTQSLQALINLQPQQATRITAQGDQQIAVELVQLGMQLRIKPGEKVPIDGKVISGESYVDESMLTGEPIPVLKVAGDAIAAGTINHDGSLVIEATGVGAQTMLSRIIQMVRQAQSSKPAIAKLADQISAIFVPTVVMIALFSALIWYFVGPEPKASYMLVVATTVLIIACPCALGLATPLSVTVGVGKAAEMGILIRDANVLQSASKITTVVFDKTGTLTQGKPTVQNLVTWGIEDSKLLTLVYALELRSEHPLGKAICHYAQPLVSTSAEVEQFTNLRGKGLMANIGGDSVVVASLSHLESLGVPLTQAQTTIEHYAEQAWTPVAVAINGELKGLIAIADPIKPNAAQAISTLNKMNIRTVMLTGDNQSVATAIAKQLGIQQVIAQVLPDQKAQKIVQLQEKGQIVAMVGDGINDAPALAQADIGIAMGSGSDVAIESAQMTLLNSSPLAVVNAIALSKATVKNMKQNLLGAFIYNTFGIPIAAGVLYPAFGFLLSPVVAGAAMALSSITVVSNANRLRLFKSPFHS >NZ_CP023310.1|WP_013856240.1|2481338_2482766_-|glutamate--tRNA-ligase MTVKTRFAPSPTGYLHVGGARTALYSWLYAKSQGGEFVLRIEDTDLERSTQEAVDAILEGMTWLGLNWDEGPYFQTKHFDRYNEVVDKLLAEDKAYKCYASKELLDEVRAEQEANKEMPRYDADHPKIKAVNDAAKEGDPCVIRFRNPKEGSVIFDDQIRGRIEISNSQMDDLIIRRTDGSPTYNFCVVVDDWDMGITHVVRGEDHINNTPRQINIYEALGAPVPVFAHCAMILGDDGAKLSKRHGAVSVMQYRDEGYLPEALNNYLVRLGWSHGDQEIFSREEMIQFFSLNAISKSASAFNTDKLLWLNNHYIKTSEPEYVAKHLEWHFEQQGINKDNGPALAEIVKLVGERCNTLVELAAQSRYFFEDFAEFDADAAKKHLRGVAKEPLALALSKLEALSDWTTENLHAVIAQVCEELEIGMGKIGMPLRVAVTGGGQSPSVDAVMQLIGKERVIARINMALAFIAEREANAQ >NZ_CP023310.1|WP_026029039.1|2480091_2481078_-|OmpA-family-protein MKKLAAAVSMALVFASSAAMAEVYVGAKVGKSWLDDACRAGDVCEDESSTVGAYLGYQAFNWLSLEAGYDYLGKFSGAGLNDEKVTAITLAPKVSLPLTDAIALYAKVGGAYVDYGNKDDYSYLGAAGIEFNTDNNVTLRLEYQSLTDINNDLVRAAGNSATLGVSYKFGGSKAEPAPVIVQEVFVEEVAQPVVEPVVIPQEPETVVKHVPFQRLDSSSFAHNSTKLTAESTNQLDKLVKYLQAYPQADAEIIGHTDSTGAAAYNQKLSEKRAQVVADVVIAKGVDANRLTVKGEGENSPIASNDTVEGRKQNRRVDIVIPSFDYEVK >NZ_CP023310.1|WP_029189872.1|2479480_2479987_+|Fe3+-citrate-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKSNLITNTGHRFISKAKTAYKIHIHTPDDTVLHRSVGYIRIGEKKGLKKAIKLRNELGSEMWGKHWRRLLKDPYLMTRLPHSLEPKIIYKPRPTLDNPEARDPCYIAAWRHYDEKGNCIFQSVVCSINKHGKLAAYTKTKKALLEAYKEDLDILVYMGRLNSIDLK >NZ_CP023310.1|WP_096036613.1|2478052_2479186_+|flagella-assembly-protein-FlgT MKKIISVLFSICCTITFSQAVNAAWYEVTGSSAIVSSEEVARLNALEDAIYKAVNFAGADIGSISNLRPLLESDRKEYQFTNHEVRYVLVEENKTRRGVMYVKARIDIYPSATGCHVSQYKKTFLVGNIDLASPQQAVMGQIYSVGDDFAQVLNRQLDQESRSFVSVGTTDYAIEKQHPGRLTMIAEDTGAQYILGGTITDLTATIEQKLLADDVINRQFAMQIQVFDGKTGQEVMTRHYREVAKWPFAKTSQIDTSSARFWASTFGSMMLRVSRNIMLDLESELSCKITLPEVVAKYGNTITMDLGRVHGVKTGDKLQLWHTGSFIDQKGLPRNKVTQSDITLTVTRVYENEAELSVDQENLASSIQIGDVMHKQL >NZ_CP023310.1|WP_013856244.1|2477255_2477891_-|membrane-protein MKKWLSIVPAVLLTACAYAPIYNGKEPYNGSQFMLMESPRHTLDFFVESMTEDLMVSNTSVSARTPIAVTSFVDLQSMDATNWLGNSVSEGFIHQFQRRGFKVVDFKTTGSIQVTQQGDFAFSRDWKDLAQEQEIQYILTGTMLRQEGGVLVNARVVGMQSRVVVATAQGFLPADRIGRDLDTLNSIRTQDGVLIRSDPTIKQPYTVILRP >NZ_CP023310.1|WP_017043110.1|2476814_2477246_-|flagellar-assembly-lipoprotein-FlgP MKKWLLLLVTIMMVGCQPLQTMRADEWLTAVGYANISEQTGRSVDEKQVRAMRASKIDAYRELAEQVYGMRVSGRAELQDQRLGTELTSGAVDGVIRGAEVVRSYKVGDSYVTELRLDIRKMDKLRDYGEVQQVPEKRQQTLF >NZ_CP023310.1|WP_013856246.1|2476291_2476717_+|flagellar-protein-FlgN MAVLKDLVDFQLKNALELSSLLEQEKLAITSRSSSEIEAIAKQKMTLVGQLQQTDLRIAKHPHVVSLAEDVLLSQIVDQIRSIVHDCQQANLVNGEALQRAQLSFNKLNNLMQQSHGKIGMTYNAGGQTHTVSTLGTNIKA >NZ_CP023310.1|WP_010319399.1|2489778_2489919_+|DUF3149-domain-containing-protein MDFWLDLLFGNAVGLSSMIVIFGAFGLMLFYGGFFIYKVMNDKSPH >NZ_CP023310.1|WP_094132453.1|2490310_2491288_+|23S-rRNA-pseudouridine(2604)-synthase-RluF MSQQATIRLNKYISETGFCSRREADKLIEQGRVTINGLLPEMGTKVTPNDEVCIDGNPLKSKEKPIYIALNKPTGITCTTERDIPGNIVDFIGHHKRIFPIGRLDKPSDGLIFLTNDGDIVNKILRAGNNHEKEYVVRVDRPITDEFLHKMASGVEILDTVTLPCKVTQETKFSFRIVLTQGLNRQIRRMCEALGYEVFKLRRVRIMNISLDGIPNGEWRYLSDEEVAEILAMCESSCGTEGASKLDVTGKRIRKATDAKLFDSREQNQTSTARRNQKPKTFQGRNADEFRHAPNTKRAPRRPTNSSQGAPANSHRKSSTLSLKK >NZ_CP023310.1|WP_026027908.1|2491426_2492053_-|uracil-phosphoribosyltransferase MKVVEVKHPLVKHKLGLMREGDISTKRFRELATEVGSLLTYEATSDFETEKVTIEGWNGPVEIDQVKGKKVTVVPILRAGLGMMDGVLEHIPSARISVVGIYRDEETLEPVPYFNKLASNIEERIALVVDPMLATGGSMIATIDLLKERGCNQFKILVLVAAPEGIAALEKAHPDVELYTAAIDEKLNDKGYIVPGLGDAGDKIFGTK >NZ_CP023310.1|WP_010320092.1|2492221_2493262_+|phosphoribosylformylglycinamidine-cyclo-ligase MSGNNTSLSYKDAGVDIDAGNALVERIKGAVKRTRRPEVMGGIGGFGALCELPTKYKHPVLVSGTDGVGTKLRLALDMNKHDTIGIDLVAMCVNDLIVQGAEPLFFLDYYATGKLDVDTAADVVSGIADGCVQAGCALIGGETAEMPGMYEGEDYDVAGFCVGVVEKEEIIDGSKVAAGDALIAVGSSGPHSNGYSLVRKILEVSGADKNEDLAGKTIGEHLLTPTKIYIKSALKMIAEHDIHAISHITGGGFWENIPRVLPQGTKAVIDGNSWEWPIIFQWLQEKGNVTTHEMYRTFNCGVGLIVALPMDQAQAAVQLLQAEGENAWVIGHIAEAQLDEEQVEIK >NZ_CP023310.1|WP_096036616.1|2493265_2493907_+|phosphoribosylglycinamide-formyltransferase MKSIVVLVSGNGTNLQAILDACETKIKDGKVTAVFSNKATAYGLERAKKAGAAAVHIDPNAFDTRDAFDAVLMEQIDQYAPDLIILAGYMRILSGEFVRHYLGRMLNIHPSLLPKYPGLNTYQRAIHAGDEEHGTSVHFVTEQLDGGPLILQAKVPIFDEDTVEILTQRVQAQEYRIYPLVAQWFVEGRLEMREGKAYLDGQLLGMHGYAFDE >NZ_CP023310.1|WP_096036617.1|2494017_2494851_-|class-II-glutamine-amidotransferase MCELLGMSANVPTDICFSFTGLIQRGGNTGPHRDGWGITFYEGKGFRTFKDPNPSFQSKIAELVQSYPIKSRAVVSHIRQANRGGVNLENTHPFTRELWGRYWTFAHNGQLADHQQLETGRYRPVGETDSEQAFCWLLKQLEARYPEPLQDMLSMFQFVAKCCDQLKQQGVFNMLLSDGEFVVTYCTNHLYWITRRAPFGKASLLDEDVEINFQEETTPDDVVSVIATQPLTGNETWQRMKPGEYAIFHYGEYVDGNAQFLADIPFAAAKPSCQAPI >NZ_CP023310.1|WP_094132455.1|2494914_2495490_-|D-sedoheptulose-7-phosphate-isomerase MYQDLIKSELTEAADVLNKFLNDEHNIAQIEAAAKLIANSFKQGGKVLSCGNGGSHCDAMHFAEELTGRYRENRPGYPGIAISDPSHLSCVSNDFGYDFVFSRYVEAVGSKGDVLFGLSTSGNSGNILKAIEAAQAKGMKTIALTGKDGGKMAGLADIEIRVPHFGYADRIQEIHIKIIHIVIQLIEKEMA >NZ_CP023310.1|WP_096036618.1|2495837_2498282_+|acyl-CoA-dehydrogenase 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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DBSCAN-SWA_1 |
845 : 59061
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP023310|845:59061|DBSCAN-SWA 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51 | Burkholderia_phage(18.18%) | tRNA,integrase,transposase | attL 2348:2363|attR 41752:41767 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
225365 : 305813
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP023310|225365:305813|DBSCAN-SWA 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56 | Vibrio_phage(18.18%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
385101 : 450499
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP023310|385101:450499|DBSCAN-SWA AATGAGTGAAGTAACCACCAACGAATATACCGAAGAAGGCAAAATACTGCGTCGAATCCGTAGTTTCGTTCGTCGTGAGGGTCGATTAACCAAAGGCCAAGAAGCGGCAATGAATGAATGTTGGCCAACAATGGGTATTGATTTCCAGCCACAATTGCTCGATTGGGCGGCGGTTTTTGGTAACGATAACCCGGTGGTTTTAGAAATCGGTTTTGGTATGGGCGCTTCATTAGTTGAAATGGCTAAAAATGCACCGCAAAAAAACTTCTTTGGTATTGAAGTGCATAGCCCAGGTGTTGGCGCCTGTTTGTCAGCCGCTCGTGATGCTGGCGTGACTAATTTACGCGTGATGTGCCATGATGCAGTGGAAGTATTTGAACACATGATCCCTGATGGTAGCCTGCATACACTGCAACTGTTCTTCCCTGATCCTTGGCACAAAAAACGTCACCATAAGCGCCGTATTGTGCAGTTAGAATTTGCGGAAATGGTGCGTCAAAAACTAAAAATGGAAGAGGGCATCTTTCATATGGCGACCGATTGGGAAAACTACGCTGAGCATATGATTGAAGTGATGAATCAAGCGCCGGGCTTTGCCAATATTGCCGCAGAAGGTGACTATATTCCTCGTCCAGAAGAGCGTCCTTTGACTAAATTTGAAGCGCGTGGTCACCGTTTAGGTCATGGTGTGTGGGATATAAAATATAAACGCACTGCGTAACGACTCACTTTTGTTGCTGCAACAAAATTAGCGATTAAAGAAAAGCCAACATTGTTATAATGTTGGCTTTTTCGGCCTTAGCGCCCTACGAAAATCATTATAAAAATAGAGAAAAACATTTCTCACCCGAGGTAAGGTCACCCATGAAGCTAACACCCAATCTACTTGCTGATATTTTGTGTGAGGTTCGCCCACTGATCGGCAAAGGAAAAGTCGCCGATTACATTCCTGCTTTAGCTAAAGTACCGAATAACAAGCTGGCGATCGCGGTTTACACCAATCAAGGTGAAGTGATTTCGGCTGGAGATGCCACGGAAGGATTCTCAATTCAATCCATCTCTAAAGCTTTGAGCTTAACGCTTGCTATGATGCTTTATAAACCAGAAGAGCTATGGCTTCGTGTCGGAAAAGAGCCTTCAGGCCAAGCGTTTAATTCGATGATCCAGCTTGAAATGGAGCAGGGCATTCCGCGTAACCCTTTTATCAATGCTGGAGCTATTGTGGTGGCGGATATGCTGCATAGCCGTTTATCAGCCCCTCGGCAGCGCTTACTGGAGTTTGTACGTCAGTTGTCGGGTGAAGAGGGCATCGTATACGACAAAGTGGTAGCGGCTTCAGAAATGATGCACAGCGATCGCAATGCTGCCATCGCCTATCTGATGCGATCGTTTGGTAATTTCGATAATGACGTTATCCCGGTACTGCACAACTATTTTCACGCTTGTTCACTTAAAATGAGCTGTGTTCAATTAGCGAAAACCTTCAGTTATCTGGCGAATAAAGGGGTGTCCGTGCATACCAAGGAAGCGATAGTAACGCCAACACAAAGCAAGCAGATCAATGCCTTATTGGCGACTTACGGTTTGTATGATGGCGCAGGAGAGTTCGCTTATCGTGTTGGCATGCCGGGTAAATCGGGCGTAGGTGGCGGTATTATTGCTGTTGTTCCTGGGGAGATGACGATTGCGGTTTGGTCGCCAGAGCTTGATGCGTCAGGTAATTCTTTAGCGGGCACTAAGATGTTAGAACTCTTGGCTGAGCGTATTGGTCGCTCTATCTTTTAAGTTCAATATTTTCTGACAGCCCGTGCTTTTGGCAAAAGATTGGCTACCGATTAGGTTAGCCAATCTCTTGGGTTTATCTTTTTAGTCGTCAGCCATAAAGGCTTCGAGCAAGTCATTAAGAAACAGTTTTCCTTTTTCTGTGACTTGCCAGTGACTTTCGGTTTGCGTTAAATAGTGTTCGGCTAGTGCCCAATCTATCGTTGGCTGAATCACGCTTAAACTTAATCCAGTTGTTTCAACAAAGTCTTGTTTCGGACAAGCTTCCATCAAGCGAAAGCGGTTCATGAAGAATTCAAAAGGGCGATCCGCAGCGGCGACTTCAAATTCGTCATCCAAGTAAGGTTTGAGTAAATTGAGATAGCCACGCGGATGCTTCACCTTAGTGGTGCGTACAATACGCCCATCGTTAAAGCTGAGCTTGCCATGCGCGCCACAACCAATCCCCAGATAATCACCAAAGCGCCAGTAATTTAAGTTGTGTTGGCATTGATAGCCGGGCTTGCTATAGCCAGAAATTTCATACTGCACGTACCCAGCGGCGGCCAATTTTTGGTGACCCAGCTCAAAAATATCCCACAGTGCGTCATCATCTGGCAAAGTAGGCGGTTTAAAGTAGAAAACCGTATTAGGTTCAATGGTCAGTTGATACCAAGAAAGATGAGGTGGGTTTAGTGCAATCGCTTTGTCTAAATCGGCCAGCGCTTGTTCACAGTTTTGATCGGGTAAGCCATGCATCAAATCTAAGTTGAAGCTGTTTAAGCCAATTTGATGAGCTAATTGAGCGGCATTAACCGCTTCTTGCTGACCATGAATTCGCCCTAAACGTGCCAGTTTTTGTGGCTCAAAACTTTGTACACCAATCGAGATGCGCGTCACCCCTGCTTGTCGATATCCAACAAAACGGTCAGCCTCTACCGTGCCCGGGTTAGCTTCCATGGTGATTTCAATCTCAGGCTGAAACGCAATACGCGCTTCAATGCCTTGCAGAAGGCGAGCAATACCTTCAGCAGAAAAAAGACTCGGTGTACCACCGCCAATAAAAATGGAATGCAATGGGCGAGGATGGTCTGCAAGGCGGTATTTGGCGATATCGGTATCGAGATCCTCCAATAGCGCATCAATGTATTCACGTTCAGGAATATCGTGCTTTAGCGCGTGAGAGTTAAAATCACAATAGGGGCATTTTTGTACACACCACGGGATGTGCACGTACAAACTCAGCGCGGGTGGTTGCAACATTATGAATTTTGCTCGCTTAAGGTTTTAAATAGCATTTTTAGCGCTTTGCCACGATGTGAAAGCTGCTTTTTACGTGCAGGTAGCAGTTCAGCTGAAGCGCAGTTATCTTCAGGGACAAAGAAGATCGGATCATAACCAAAACCGTTACTGCCGTGAGCTTGGTGCAAGATGCGACCTTGCCACGTACCATGGCAGACCAATGGTGTTGGGTCATTTTCGTGACGCATGAAAACCAGCACGCAATGAAAACGAGCGGTGCGTTGTTCGTCTGGTACACCTTCCATTGCCGCTAATAATTTTTCTAGGTTTTGTTGGTCACTGGCATTTTCACCAGCGTAGCGCGCCGAGTAAATTCCCGGAGCACCTTGCAGATAATCCACTTCTAAGCCGGAGTCATCGGCAATCGCAGGTAAGCCAGTGATTTTGGCAGCATGTCGTGCTTTGATGATCGCATTTTCAATAAAGGTGGTGCCAGTCTCTTCGGCTTCTGGGACGTTTAATTCTGTTTGCGCCACTACATCAAAACCGAAATCAACCAGCAGATCAGCCATTTCGCGCACTTTGCCTTGGTTTCCTGTGGCTAATACTATTTTTTTCATTGCACTATTTCTCTATTCTTCGACGTAGAATTTTTGGGTGAATTTAAGCTTACCGGTGCCTTTTAAGCCCGCATCAACCTCAATGTCAAAACTCAAATTCTCTTCATTGGTAATGGGGAATTCAGCGAGGTAATAAATCGCGTTGCCCTCTTTGAATTGTTTAAATTCAAGTTCACGTACCTGACCGATTAGGTTTTTCGCATTGCCTTTGAGTGTCGCTTCCATAGCTGGTTTACCTAAGGCCGAGTTATCTAATACGCTGATGTTTAAAATAGCCGAGTAACCATTACGTTTTAACTGATAACTGCGCGCCACTTGTGGCGTTAAAAATGTTGAGTTGAAAGCTGAGTAGTGAACTTCAACATTCTTGATGGTTTGAAACTGCTCGGCGAGTGTGGGTAGCGAAATAAAGGCTATAACAAACGCTATCATCCATTTACGCATGTGGTGCTCCTTACAAAACAGAGTGGGCTAAATAAAAAGCCATCACAAGATGGCTTCAATCGGCTGTGGTATCACTTGAGGTGAATGAATTCGGACTTGTTTATGACGTCCCAATTCCCCTTTTTCTATCTCGATTAAACCTTTGGCGACTTTAAATTGTTTGGCCAAGAATTTGGTTAAATGCGCGTTGGCTTTGCCATCAACAGGCGGTGCGGTGATGGCAATTTTGAGTTCCTCACCATGCAAGCCGACGATACTATCGCGGCTTGCTTTGGGTTGGATGTAGAGCTTGAGGATTAGATCCTCTCCCTCTTGCCAAACAGCAGATGACATTACAACTGATACCATACTGGGCCAATAAAATCGCCCATTAGGAAGTTAGCAAACTGCAGCACAATAAACAGCACCAATACACTTAAATCAAAACCACCCATCGCTGGTAGGATACGGCGGATCGGCGCAAGCATCGGCTCGGTTAATTGATGAAATACGTATTCAATCGGGCTGCGGCCTTGGCTAACCCAACTAAGAATAGCGCGGATCAACAGCACCCAGAACAGTAAACCGCCAGCGGCTTTGACTAACGAGAGTAAGCCTAAGAATAAAAAGTAGACGCTAAAACTAACTGCACCACCTGATGCCACCAGCATTAAGGCAATAAATTTCAATACGCACAGCACGTACGCAAAGAGAACCGTGGCCAAATCTAGGCTGCCAATGGATGGAATCGCTCGGCGCAGTGGGCCAACCACAGGTTGTGTTGCTTTGACGATAAACTGGGAGAATGGGTTATAGAAATCGGCACGCGCTGCTTGTAACCAGATACGTAAAATTACGACCATGATGTACAGATCAAACAGGGTGGAGATCAAAAAACTCATTGAATTCATAGCTAGCCCTTAATATGAGTAGAGTGTCGTTTGCGCTTTTGCG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49 | Staphylococcus_phage(16.67%) | integrase,tRNA,protease,transposase | attL 421261:421320|attR 452195:452981 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
467446 : 475943
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP023310|467446:475943|DBSCAN-SWA 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TTTTGCAGCGCATTTTTCTCCGACATCAACGCTTTCACCATAGCTTGAAGCTCGGCGATGTCTTGGCTTTCTGGGTTAATATCGGGCGTCTTTTTCATGGCATTGATTATACTGAAAACACCACGCCAAGGCTTGGTATAACTCACTTTTATCGGGTTCAACTCATTGTGAAATTGTCTATTTTTATCGGTTTATGGCCGATTATCGTGAAGCCAGATAACAGTCTATCTAAGTCAAATTGAGTCAGAGTGTAGACCTGCTTTTTCTCTTGAGTGGGCCATTTGAATTTGGCTTTTTCGAGCCGTTTGTACCACAGGGCAAAGCCCGTTTTATCCCAGTACAACACTTTGATTTTATCGCGTTGTTTATTGGTAAATAGGAACAGTGCGCCTGTGCCGAGCGGCAAATCGGTTTCGGACTCGATAATCGCGGCTAATCCATTGATGGACTTTCTAAAGTCCACGAACTCTCGATACAGGTAAACATTCGGGGCGCTCAACATTCGTTTCATGACAGTGCTCCGATTAACTCTGCCAGATACGAGGCAGGTGTACCCTGTGGAATGCTGAGTTCAGCGTCATTAATAAATAATGTCATGTTGGCGACGGGTGTTTGAGTTACTTGGTAGCGAGTCGTTTTTTCAACGACTTCCGCTTTAACAAAGCCACTGATATTGGCTGACTCCGTAGTTTGTAACTGCTGGCGCTTGGCATAAAAAGTAGAAAGACTTAACCCATTACGCTCACAGAAGACCCGTTGTGATAGATGACTGGATTGGTATTGCTCGAACAAGGTTTGCCATTCTTGGTTGGTGCGTCGTTTTGCCATTTCAAATCTCCTTGAGGTTGGAGATTTGATCTTAGGACGTACCGATATTGATTAGAATGTGGGGTTTATGACGCGCTTACGTTACATTAGCTTCTTCAAGCGATAAAGCGCTTCTAATGCTTGGCGAGGCGTTAGATCGTCAGGATCAATAGCTGCTAATGCCTGTTCGACTTCGCTTGGGTCTGGGATCAAACTGAGTTGATTAGCAATATCTACAGTTGAGCTTTTACTGCTATTAGGTTGTTGCTGGCTTAGTAATTCAAGCTGCGACAGTTTAGCGCGCGCGTTTTTGATCACTGTTTTAGGCACGCCAGCAAGACCTGCCACTGCTAGGCCGTAAGATTTACTTGCCGCCCCTTCTTGAACCGCATGCATAAAGGCAATGCTATCGCCATGTTCCACGGCATCTAAATGCACGTTGGCTAAGTGAGGTAGCTGGTTTGGCAGCTCGGTCAGTTCAAAATAATGAGTGGCAAATAGCGTTAGCGCGCCAATTTGGCTTGCGAGCCATTGTGCACTTGCCCAAGCCAGTGATAACCCATCATAGGTACTGGTGCCGCGGCCAATTTCATCCATCAATACCAAGCTATTTTGTGTCGCATTATGCAAAATGTTGGCAGTTTCGGTCATTTCAACCATGAAAGTAGAGCGACCAGAGGCGAGATCGTCCGATGCACCAATGCGGGTGAAGATGCGGTCAATCGAACCGATGTGTGCTGCTTCTGCTGGCACATAACAACCGATATGCGCTAATAAAGTAATCAATGCAGTTTGGCGCATGTAGGTCGATTTACCGCCCATGTTAGGCCCGGTAATGATCAACATTTTTCGTTGCGGATTGAGCTCAATTGGGTTGGCAATGAAGGGGTCATTCATCACTTGCTCAACGACAGGGTGACGGCCCGCTTGGATATGGATCGCTGGCTCTTTACTTAAGGTCGGGCGACAGTAATCTAAGCTTTCAGCGCGCTCGGCAAGGTTTTGCAACACATCGAGCTGCGATAGCGAAGATGCAAGGTTTTGCATCTGCTCTAAATGAGGCAACAATAAGTCAAATAACTCTTCCCAAAGCTGCTTTTCCACTGCTAGTGCTTTTGATTTCGAGTTGAGCACTTTATCTTCATGCGCTTTTAGCTCGGCAATAATATACCGCTCGGCATTTTTCAGCGTTTGGCGGCGCACATAGTGGGGAGGAACAAGGTGACTTTGGCCACGGCTGACTTGAATGTAGAAACCGTGAATCGCGTTGTAGCCGACTTTGAGCGTATCAATGCCGTGACGTTCGCGCTCTTCAGCTTCTAATTTATTCAAGTATTCGGTTGCGCCGTTGGCTAAATCACGCCATTCATCCAGTTCGGCGCTGTAGCCATCGGCAATCACGCCACCATCACGAATCACAACTGGTGGGTTGTCTTTGATCGCTCGCTCAAGCCGTGTGCACAGCTCATCCAATGGCTGTACATGATGAGTTAACTGAACTAAGTGGGGTTGCGACAAGGGTTGCAGTATTTCACTGAGCTGCGGCAATTGCTGCATCGCATGTCGCAGGCGTGCTAAGTCTCTTGGGCGAGCGGAACGCAATGCCAAACGAGCAAGAATACGTTCAATATCGCCAATCTGTTTCAGCACAGGTTGTAATTCACTAAACAGAGCAAGCTGTTTCAACTCGCCGATCGCATCAAGGCGTTGATTCAGCGTATCAATACAGCGCATAGGTTGGTGTAACCAGCGTTTGAGCATGCGGCTGCCCATTGGGGTGGCGCAGTGATCGAGCACTTCCGCTAAGGTGTTATCAAAGCCACCGGACAAGTTCTGCGTGATCTCTAAATTACGGCGCGTGGCGGCATCTAAGATCACCGAGTGATCTTGGCGATCAAACGTCAGTGAACGAATATGAGGCAGTGCAGTGCGCTGCGTATCTTTCACGTATTGAATCAAGCAGCCAGCGGCGCATAAGCCCAGTTTTGCCTGTTCTACGCCAAAACCGACCAAATCACGCGTACCAAATTGTTGGTTCAACTGCTGTTTTGCTGTCTCTAACTCAAATTCCCAAATAGGGCGGCGACGGTTGCCTTTGCGATTGCCCATTAAAGTGACTGGCGTGAAATCTTCAGGGAAGAGCAGTTCGCGCGGTGCGGTGCGTTGCAGTTCGGCGGCCATCGCCTCTTCGGTTTCTGGCTCGCTCAGTTGGAAGCGCCCTGAAGTGATGTCTAAGGTTGCGTAGCCAAAGCGACCATCGTGGTGGTAGATGGCGGCAATTAAGTTATCGATTCGCTCAGAGAGTAAGGCTTCATCCGTGACCGTGCCGGGCGTGACAATCCGCACCACTTTACGCTCAACGGGGCCTTTGCTGGTGGCAGGATCGCCAATTTGTTCACAAATCGCGACGGATTCGCCCTGCTGTACCAATTTCGCTAAGTAACCTTCCACGGCGTGATAGGGAACGCCCGCCATTGGAATAGGCTCACCCGCAGAAGCACCGCGTTTGGTGAGTGATATTTCCAGCAATTGCGATGCGCGTTTAGCGTCATCGTAAAACAGCTCGTAGAAATCGCCCATCCGATAAAAGAGCAGAATATCGGGATTTTCGGCTTTCAATTGCAGATATTGCCGCATCATCGGGGTGTGCTGTGGTGAAGACTCGGCGGAAGATGCGCTGGATTTGCTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP023310|467446:475943|472952_473273_-|WP_094499630.1|DBSCAN-SWA MAKRRTNQEWQTLFEQYQSSHLSQRVFCERNGLSLSTFYAKRQQLQTTESANISGFVKAEVVEKTTRYQVTQTPVANMTLFINDAELSIPQGTPASYLAELIGALS >NZ_CP023310|467446:475943|468824_469757_+|WP_172859039.1|DBSCAN-SWA MSNLRNRVIMVLMSSVLIGCAAHTPAPVSGLNKDYNAIPRGSYRGSFYEVQKGDTLYFISYVTDKNVNDLIRFNNLKKPYTIHPGQKLKLWIPNYTPPAYGGNGVTEVIVAATPASTMAGLVSPPMVVDGVSKNSNQNSGSNAASPSTKVAKKDPPKVVEQSKSKEYVDSKGKQNVNANVTFAKPKDDKVSKWLWPTQGRIIKNFSAGDQGNKGIDIAGQRGQSILSTAAGTVVYSGNALRGYGNLVIVKHNDNYLSAYAHNDRLLVKEGQSVKAGQKIATMGSSGTSSVRLHFEIRYQGKSLNPKRYLP >NZ_CP023310|467446:475943|468192_468819_+|WP_013857716.1|DBSCAN-SWA MANPHADRLIEFLIANGIQDQTVLDAIHCLPRESFVSQAMMHQAYDNNALPIGQGQTISQPYIVAKMTQLLELEPQSKVLEIGTGSGYQTAVLAQLVEHVYSIERIKSLQWDAKRRLKQLDIYNVSTKHGDGWLGWDAKAPFDAIIVTAAAEFVPNALLDQLAEGGRLVIPVGSSEQQLLKIVRQGDDFISNTIEMVRFVPLVAGDLA >NZ_CP023310|467446:475943|469829_470831_+|WP_096035986.1|DBSCAN-SWA MSISNAVTKVEEFEDQEIMDSIEVDEELTTTKSQSDDDVQIEDAKEGFDASTKSLDATQMYLSEIGFSPLLTAQEEVLYARRSLRGDEAARKRMIESNLRLVVKISRRYGNRGLALLDLIEEGNLGLIRAVEKFDPERGFRFSTYATWWIRQTIERALMNQTRTIRLPIHVVKELNIYLRTARELSQKLDHEPTAEEIAFQLDKPVEDVSKMLRLNERISSVDTPIGGDGDKALLDIIPDVNNSDPEISTQDDDIRESLLNWLDELNPKQKEVLARRFGLLGYEPSTLEEVGREINLTRERVRQIQVEGLRRLREILVKQGLNMEALFNVEYD >NZ_CP023310|467446:475943|473354_475943_-|WP_096035988.1|DBSCAN-SWA MSKSSASSAESSPQHTPMMRQYLQLKAENPDILLFYRMGDFYELFYDDAKRASQLLEISLTKRGASAGEPIPMAGVPYHAVEGYLAKLVQQGESVAICEQIGDPATSKGPVERKVVRIVTPGTVTDEALLSERIDNLIAAIYHHDGRFGYATLDITSGRFQLSEPETEEAMAAELQRTAPRELLFPEDFTPVTLMGNRKGNRRRPIWEFELETAKQQLNQQFGTRDLVGFGVEQAKLGLCAAGCLIQYVKDTQRTALPHIRSLTFDRQDHSVILDAATRRNLEITQNLSGGFDNTLAEVLDHCATPMGSRMLKRWLHQPMRCIDTLNQRLDAIGELKQLALFSELQPVLKQIGDIERILARLALRSARPRDLARLRHAMQQLPQLSEILQPLSQPHLVQLTHHVQPLDELCTRLERAIKDNPPVVIRDGGVIADGYSAELDEWRDLANGATEYLNKLEAEERERHGIDTLKVGYNAIHGFYIQVSRGQSHLVPPHYVRRQTLKNAERYIIAELKAHEDKVLNSKSKALAVEKQLWEELFDLLLPHLEQMQNLASSLSQLDVLQNLAERAESLDYCRPTLSKEPAIHIQAGRHPVVEQVMNDPFIANPIELNPQRKMLIITGPNMGGKSTYMRQTALITLLAHIGCYVPAEAAHIGSIDRIFTRIGASDDLASGRSTFMVEMTETANILHNATQNSLVLMDEIGRGTSTYDGLSLAWASAQWLASQIGALTLFATHYFELTELPNQLPHLANVHLDAVEHGDSIAFMHAVQEGAASKSYGLAVAGLAGVPKTVIKNARAKLSQLELLSQQQPNSSKSSTVDIANQLSLIPDPSEVEQALAAIDPDDLTPRQALEALYRLKKLM >NZ_CP023310|467446:475943|472602_472956_-|WP_096035987.1|DBSCAN-SWA MKRMLSAPNVYLYREFVDFRKSINGLAAIIESETDLPLGTGALFLFTNKQRDKIKVLYWDKTGFALWYKRLEKAKFKWPTQEKKQVYTLTQFDLDRLLSGFTIIGHKPIKIDNFTMS >NZ_CP023310|467446:475943|467446_468193_+|WP_010320454.1|DBSCAN-SWA MKILLSNDDGVYAQGLNTLARALADLAEIVIVAPDRNRSGASNSLTLEQPLRVDLIAPNTYSVQGTPTDCVHFALNELLKDDLPDLVLTGINHGANLGDDVLYSGTVAAAMEGHFLGVQAIAFSLVGTANFTTAAQIARQLVEQHLNAPIPTNRLLNVNVPDRPFEELAGIQVTRLGARHHAESMIKQKDPRGHDIYWLGPPGKEQDAGQGTDFYAIEHGYVSLTPLQVDLTAHESLPSMDNWLKEKG >NZ_CP023310|467446:475943|470989_472543_-|WP_096036778.1|transposase|DBSCAN-SWA MKKTPDINPESQDIAELQAMVKALMSEKNALQKKEAQWQQERQSLIEQFKLALDRQFAKRSEALKPYNEAQGDLFNEAECEAAKSEDEVITTTTTTIKRRGKRQPLPKDLPRETLVLDLDEHDKQCSCCQHALHKIGEDRSEKLEFTPAVLKVLEVVRPKYACRQCEQQAEKSHIHQQPAPISIIPKSFATESLLANIILGKYQYALPLYRQETLFTQSGIELSRTTMARWVIQVSEKFKPLYQALKTHLLEQVVVQADETPLNVLKEDKQCYMWLYCSGADSPEAKLPDMKNIVLFDYQNSRARVCPVNFLGDYSGYLQSDGYAAYDGLTKVTNVGCFAHARRKFMEAKKLQGKGKTGKADVALAKIQKLYALESRLKLASVEERWSERQSRAKPLLDDLYDWLTTQKVITSSPLGKAIKYTLSQWPKLIRYVEDGHLSIDNNRAERAIKSLVIGRKNWLFANNPNGADASALLYSIIETAKANGLILYNYLVKCMKELAKPEPDINSLLPWNFSH |
8 | uncultured_Mediterranean_phage(28.57%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
639064 : 703922
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP023310|639064:703922|DBSCAN-SWA GTCAAGTAAAATTGGCCACGGTTTTAGAGTCATTCCAATATAAACGTTCTGACTCATTTGGTGTTAACCCACCATTATATTGATGGGGTCTGGTTTCACTGTAATATCCAGTGATGTAGTTTGTTATTTCTTTATCTGCTTCTGTAAAATTACCATAACCATTTGCTGGCACCCATTCAGATTTTAAACTTCTAAAGAAACGCTCCATTGGGGCATTATCCCAACAATTCCCGCGACGACTCATGCTTTGCTCAATCTGAAGACGCCATAATAATTGCCGGAATTTCAAGCTAGTATAATGTGAACCTTGGTCGCTGTGATACATCACATTCTCAGGTTGTGCCCTTAACTCAAATGCCATTTTCAAGGCCTTACACGTCAGCTCACTGTCAGGCGATAATGACAACGCCCATCCCACAGGTTTGCGGGAAAATAAGTCTAGAACAACCGCTAAATATGCCCAACGACTGCCGACCCAAACATACGTCACGTCGCCACACCAGACTTGATCTGGTTGGGTAACAGCAAACTGTCGATTAAGCGTATTTGGGATAGCGACATGTTCTTGCGTTGCTTTCCTATAAGCATGCTTAGGCTGCTGACAACTAACTAACCCAAGCTTTAGCATGAGATTACGAGCTCGATAACGACTGAGTTTAATCCCTTTGTTAGTCACTAATTGCGCTATCGTTCGAGCACCGGCAGAGCCATTACTAATACGATGCGCGGCCTTCACTTCACTGCATAGAATTGTAAAATCAGCATCGATATGGTCTTTTCTTTTTAGCCAATATTTATAGCTACTTCGATGCACTTTGAATGCATTACAAATTGTAAGAATAGAGTGGCTCTGCTTGAGTTGGCTGATTAGCGCAAATTGTTCATCGAGTCTGACATCAAGAGAGCGGTAGCCTTTTTTAGGATTAGATTATGCTCCTCAAGACGGGCTACCTGTTTCTTCAGTTCACGGATTTCAATTTGTTCAGGGGTAATCGGAGATGCTTTGGGAGTGCCACCCTGGCGTTCTAATTTTAACTGTCTCACCCACTTATCCATAGTCGATTTACCCACGTTCATCGCTTTTGCAGCTTGAATGATTGTGTGGTTTTTATCGAGGAGTAATTGGGCTGCTTCTAGTTTGAATTCAGCGCTAAATGTTTTTCTGGTTGTCGATCTCATGTGTTCACCTAAAGTTATCTACGAGGCAATAATATCACCTCTATTTAGGTGGCCAAAATTAGTGTGCCACTACAGGAAATATATCAGAGTGTCATAAGGGTCTTCGCTGTAGGTTTTCGAGAGGCGTTCGAGTGCTCGAAGAAAGGTAATTCCGTCAGTTTCTCCAACAGTGTCGCGCTTATCGATGTCAGCGACAATAAACCCAGCCTCCTCATCTTTGGCTTCGGGGTGAGAGCTTTCTTCTAAGCCTGAAAATAACGCTTTTACGTCCTTTGATGCACGACCTTTGTAAGCGCGAACTTGAGCAACTTTTGATGTCCGACCATCTTTATTTGACGTAACCATTTTAATGGGGTGGCGAACCTGTCTAATCACTGTGTCGTTAAATGCAGTGTAATAGGCAAACAAAGTGTAAGCTGCCGCCATGCATTGATTAAAAGGACTCGCTAAGCCTTCTGAAGCTGAACCATTTTTTCTCCCAAGTGTAATCGTGATGTCACGATTACCTATTCTTTCAACCACAATGTTTTCTAAGTATTGAGGTGGGGGCGATTCGGGGTTTTCTTCTTTAAACGCAATAAGTTGAGTTACCAAAGAGAAAAAGAGAAGCTGAGTGCGTCTAACTAGTGCATACCATTCGCTTGATGTATAAGGTAGTGTAGCAAAATCTGTTATCTCACCAGTAAAGCTCTTGAGCGTGGCTTGCATGTCTGACACATCAAAATCAAGCACTGGAAGCATCGAGTCGAGATTCATCTTTTTTTGAAGAGCTGAGGATTCCAACAAACCAAACTCTTCACCATTATGATACTGAAATTGGTATTTTTTAGGCTCACTAGCAATGTCAACTAAGCGCCGTAACTCACCTGAGTTACCAGCGTAATAAAGATATCCAGCCTGACTAAAAGGGTCGAACTTCTTAATGTCGCAAAATGCAATGTAAGTCTTTAAGGCGCTTAATTTAACCACTAGAGACCATGCATTGGTTTCATTTTTCTTCTCTTGATCAACCCATCTTTTTAGCTTTTGCATTCTTTCCAGTCGAGAGGGTTTAGCTAATGGATTTTTGGGATCACACTGTTCATGACACCAATAAATAAAATTGTGTCTTGTGCCGTTTAGCACCCCTTCTGGCCGTATATCAACGATCAAATCTAATGAAGTAACATTTTTCTTAGTAATCGGCGGAGCGGGTGATTTATTTTGATTTCTCGATGCTGCTAATCGACTTTTTGCCATGTCATCACCTCAGCGATTGTTGTGCGAATTGATTTTTACGCTGAGCGAATTCCAACCATGTTTTATTGTCATTCATGTAGTTAACGTATTTTTGAGTGGTAGAGGTGCTTTCATGCCCCATCAAATCAGCCAGCTCCTGTAACAAAGCCTCGAAGGGCTTACCTGTTTCCATATGTTTGCTGTACAGCCAGTCGGTTGCGAAAGTGGCTCGTAAATCATGAGGGGCAAAATAAATATCAAGCCCACAGTGTGTCAAATCATTGCGGATAGTTTCCACATACTTTTGAATGGTGTTTGGAGCGTAGATATTGCCATTCGATTTAACGAATAAGTGGTTATGGCGAAGTAATCCTTTTTCAATAGCCTTCTTCCTCGCCTTACTTAACTTGTACTCGTACAACAGTTCCATGACACTGACTGGGATTTCAATTGTTCTGTTTTTTTTGAACTTGGTTAAGCAACCGTTAATATTCTCACCAATTTGCACCTTAACTACTTTAGCTTTTGGCTTGTCCACGACAGAGGCAGGAAATGTTATTAATTCCTCCAATCTCAATCCCGTTTCAGTTTTTAAGTACAGCATTAGGGCTTTAGTGTCAGATGAATTTTCAATATCAAGGTGTTTATAAAGCTCTTGTTTTTCATCTTCACGAAGTGGGTTAAGCTCTCGAATATCAGCATCTTGAGGTTTTTTTATGTTCTTAAATGGTCTAGTGAGACCTGTGGTGTATACAATAATTTCCTTACTGTGACTGCGATTGAGATGTGAGAGCATTGCATGTTGTGCTTTGTTTCCTTTGTTGCTTATGCGAACAGTCTTTGCCTTAAACTCAAATGGTCGAAAGGTTTTGCTGATTGAAATGATCCGCTGGCGATGAAGGAAGATGAAGTAATTGACAACTTTCAAAACATAGTTAGAGGCTGTACTTGGAGAACCACCGACTTTTCCAGTTTCATCCTTGGTATAAAGGTTTTCCAATAAATAGTCTCGATATCTCACGATTGGACTTTCCTCTACCTTCTCGGTGCAGTCATATATTGTTAACGGAGATTTTTCATCAACCAGAAGGCCAGTCCTTGGGTGAGTATGTTCGGGGATTTCCGTGCTCAACCACCGATAGAAGCTCAATAACGCAACTGCATGGGATTGAATCGTCTTATCGGAGGATATATCTGGGTCTGCCAACAAAGAGTGAAGATATAGATTCACTGGCACCACATTGATACCATCGGGGTCTATTAAAATTGGAAGTTTATGAGCAAATGGTTTTGAGTTGTCCCTAACGTCATGGATGATCTCGCCACTGTCAGGGTGTGGCCTACTTATAAATGAGGGATATTTCTCCGTACTAATCCACATAAGACAATAGTCAAAGCCGAAGTCATCTGGAAACGACCTATTCTGTTCAATCACATTAACACCTAAATCATCCGTTATTCACACTGCTAAGCCTTCCCCCAGGGGGTTACGCGTTCATACATCTACTTTTTCAAGATATTCTTAACCAATAGTAAGAATTGTAACCACCCCTCCTTTCAACGTCTAATTTATACAACCTGTAACATTGCAACATGTTATGTCTAAAATATTTCCCAACTGTAAGCGCATAGTTGGATGAAAAAGCCAAAATGCCATGACGCTGCATTTCAGCTTTGATCTGAAAGACGGGTACACCCATTTTAATACCGAGTGACTTGGCTTCACGTGACCGTGCAACCACGCAGCCGTCGTTATTGGACAGCACCACAACCGGCGTATCTTTTAAATCAGGACGAAACAGCTTCTCACAACTGGCGTAAAAGTTGTTGCAGTCCACCAAGGCAAATACTGGCATGGGCTAGTCACGACTTGCGGCGCATGTTTCGCACCACATTGGTAACCACACCAAATATCTCTAACTCTGTCCCTTCAGGAATATGGATGGGCTCATACGCTTGGTTTCTTGGGATCAGCTTGACGCACGGCCTGAGTTGAAGCTCCTTTACCGTGAGTTCACCATGGATGCCAGCGATGACAATGTCACCGTGTTCGGCTTGGACAGAGCGATCAACCACCAAAATATCATCTGGGTGAATCCCGGCATCAATCATTGAATCACCTTCAACACGCACAAAGAACGTTGCAGCCGGTCGCTTGATGCACAGCTCGTTGAGGTCGAGCGTTTGCTCAACATAATCCTGCGCTGGTGAAGGAAAACCAGCAGAAACACGTTCCATGAACAATGGAATACGAAGGCGCTTGGCTTTGATGAAGGCAAGTGCGCCGCTACGGCCTATCAGCGAGACACTCATGACGAACCTCGAAAAATTACAACTGATACTGTTTGTTTATGGCTATGTTGTCTTTCGGTGTTGGTGAACTATAGTTAATGTACTGAAACCCAACAACGGCAGGTGCAATATGGCTTCCAAGCAGTTTCAAAATATACTACATCACATTACCAACTTAAATTACGCTCAACTTAAAAAGCTTCGCCACGAAGTTGAATCAAATATTGCCACTAACCAAGTAGGTCAAGCTATTGCCGACCATGAGGAATCAATATCTCATTGCCCCCATTGTGATTCACATAATCTAAATC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53 | uncultured_virus(18.75%) | transposase,integrase | attL 632243:632257|attR 643069:643083 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
718394 : 785222
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP023310|718394:785222|DBSCAN-SWA 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41 | Vibrio_phage(20.0%) | tRNA,integrase,transposase | attL 736297:736356|attR 758362:759459 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
855900 : 925630
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP023310|855900:925630|DBSCAN-SWA 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60 | Leptospira_phage(18.75%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1027784 : 1091478
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP023310|1027784:1091478|DBSCAN-SWA 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57 | Burkholderia_phage(14.29%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1145947 : 1192599
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP023310|1145947:1192599|DBSCAN-SWA 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42 | Leptospira_phage(18.18%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1358481 : 1409816
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP023310|1358481:1409816|DBSCAN-SWA 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43 | Escherichia_phage(16.67%) | tRNA,plate,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1473796 : 1539806
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP023310|1473796:1539806|DBSCAN-SWA 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49 | Bacillus_virus(14.29%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1547198 : 1643051
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP023310|1547198:1643051|DBSCAN-SWA 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54 | uncultured_Caudovirales_phage(28.57%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1672261 : 1718144
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP023310|1672261:1718144|DBSCAN-SWA TTTAAAAATAGAATTCCCGTTCAATGAATGTTCCGATCACCTTATCGTGCATCTCCTCCGATCTAGAAAAGCCGATAGTTCTACGCACTAAACGTTTTAATCTGGAACGTAAGGTCAGATTGGTTCGCTCAATCCGCTGAGTGAACCTTTTGCCTACAACATGCTTTTCCTTTGGTAATTCTTTTGCGTAAACGCTGAAGTCATCGGTAAAAAAGAAGCTGATGTCGAACGGCTTTAGCAAAGTGAGTAACGATCGAAGAGCATCCGTATTTCGTTTACCAAATGCGTGAGCAATGATGCGTTTATAGCGAGGCTCCCAAGCATACCAAAGCCAGCGGCGATTTTTCTTTTTACCGACGAATGACCATTGCTCATCAACTTCACAGATGAGAGAGAGATTTGCTTTATCGAATGGAATCGAGGTCACTTGCCTTGGTGAGAGTTTTTTAAAGTGCGTAGCACTGTGTTATAGCCAACTTTTAAGACACGGCTTGTTTCTCTTACACCAGAGCTATTCATTGCCATATCAATGATTTGTTCTTTGACATTAGGCTTATATGCCTCATATACATAATCAAGCTGAAAAGAACGCTTGCACTCAATGCAACGAAAGCGCTGAAAGCCTGTTACTCCAGTTCCGTGTTTACGAACATGTTCAGTTTGGTTGCAAAATCGACATTGAACTTGAATGGTAGCCATGATTTCTAATTTGAGGGTGAAAAGGCTACCATTTTAACACAACATCTCCATGTTGGAGTCACGACCCGATTTAAAGGTATTTACTCAGAAAAATAAAAAGTGACTGGGTCAAAGTAAGAGGGAATGAGTTATTCATTTCCTCTTTTTTTTTATATTTCTGTTCTTAAAATTACATTCACTAGCTGGCAAAGGTAATTAAGCGTTTTACCTAATAGTTTGATAATTCATTAAAATTAGAGAGTGGAACGATGCTTAAACCAAGTGACAAATGGAGTTGGTATTATTCAGATAGCGAAAGCTGCCTGATGTTGTACCTTGGTGATGAGATGGTTTTTAAGACCAATCTTTACCGTAATCTGCTCGTCGATTGTGCTTTTGCTGAGAATCATTTTTCAGTCGATGATGCGAGTGCTTTCCAAACCTACAAAGAGCAAATTGCCTATTTAGGTTTAAGTGAGCCAAGACAAGCCGAATTAGCACTCTATTGTGTTGCCGCTAAGCGTTTTCATAAACCTGTCCAGCCTAAAAGTTGGTTTTTTGATCATCAAGGCTACGGTTTTGAACCGAGTGAAGGTGACATTGTTCGGTTGGTCAACGGCTACAGCCAAGGTTATTTCATCGTACTTGAGGTAGGGGACTGCGCTAGTCTTTGCGCCTTAGTCGATTTGGATGCGTTCATACTGAATGGTTCCAAACAGCTGGAATTCGGACAGGTCATTAAGGTTATGCATGACCGTATGGCTTGCGCCAATCATATTTTGCTCGAAGAGCACGTTGCTCTTGTGAGTTAACTTTTCCCTAATAGCACAACGTTTCGTTCCTTTGTTTCATTTCCCATCGGCTTAATAGCCGATTTTTTTTGCCTAGAGCTTTTCCCCAACTCAATCCTATCCGTCTGAATTCGATCTTAAATGTGAGATTTGTTCAGGATTCTGATGTTTTTTTCTTCAAAAGTGACGTTATAAACAGTGTCTACATTGCTAGAAATGGCCGACATATTCCCATTTTTAGCTCATTTGTAATTAATTTACACTACAAAAATCAATCTGGTATAGTCCAATTATGCAGTGAATAAATACTCACTTATCCCGTAGGTCTTGCTATATCTAGTGAGATGTTTTTGCAATGCTCGAAGCTTGTCTATTTGTAAAATTGGCGAGTAGTTAAGCAATTGAATGGTTGAGAAGGTGAAAGAGACACTTTGTTTTACTCAAGCGTGGGATTGTCAGGTATAATGCGTGGTCATTTTTATCAGTAAAAGAGCAGTATGAATCAATATCTAGCGGTTACCTCAAACGGTCTTGAGAACCTATTAGTTGAAGAACTAACCAAATTAGGGATTACGGACGCAAAACCCGTGCAGGCCGGGGTAAAATTTAAAGCGTCGAAAGAGCAGATTTATCGCTGTTGTTTGTGGAGCCGTCTAGCATCAAGATTTGTTCGCGTCCTCTCTGAATTTACCTGCCAAAATGATATGGATCTTTACTTGTCAGCAAGTTCAGTGAACTGGGTTAATCATTTTCATAGTTCGAAAAAGTTTGTTGTCGACTTCAACGGCACAAATAACGAAATCCGCAACAGTCGGTACGGCGCGATGAAAGTAAAGGATGCGGTTGTCGACTGTTTCACCAAAAAGAACTTACCGCGCCCTTCGATCGATAAAGATCATGCAGATCTTCGTGTCCATGTACGCTTGCATAAAGATAAAGCCATTTTAGGGATTGATATGGTGGGCGGTGGTTTACATCAGCGCGGTTACCGTACCGAAGCGGGGCGAGCACCACTTCGTGAAACATTAGCAGCGGCTATTATTTTGCGTAGTGGATGGAGTGAAGCGAAGCCACTGCTCGACCCAATGTGTGGTTCTGGTACTTTGCTCATTGAGGCGGCCATGATAGCTGCTGGTATGGCCCCCAGTCTCAAGCGTCCAAAGTGGAGTTTCGAAGCTTTAGAGGATTTTGATGCAGAACTGTGGGCGCAAATAAAATCAGAGGCCAATGTTCAAGCAAGACGTGGTGTCAAGAAAGTTGACTGTAAGTTCTTTGGTTTTGATAACGATGCACGAGTGCTGCAAACCGCGAAAGATAACGCTCGCCGCGCAGGGGTTGAAGAACTGATTACCTTCCAGCTAGGTGATGCGGCACTGATCAAACGTCCTGAAGGGTTTGAGGATGGTGTAGTTATCTGTAATCCACCCTATGGTGAACGTTTAGGTACACATCCTGGTTTGATTGCTTTATACACGGCATTTGGTGGGCAATTAAAGGCTGAATTTGGCGGTTGCCAAGCGTCGATTTTCTCAAGCTCTGACGAATTACTCAGTTGTTTGCGTATGCGCGCTGAAAAGCAGTTTAAGTTAAATAACGGTGCGTTACCTTGTCACCAAAAGAACTACTCAATTTCATTGCGCACGGTAGAGCCGGGAGCGTCTATTTCTCAAGAATCGGTGATTGCTCCTGATTTTTCGAATCGTTTAAAGAAAAATATTGCGAAAATTGGTAAGTGGGCGAAACGTGAATCACTCGATTGCTATCGTATTTATGACGCTGATTTGCCTGAATACAATGTTGCGATCGATGTTTATCTCGACCACCTAGTGATCCAAGAATACGCCGCACCTAAGGATATTCCAGAAGAAAAGGCGAAACGCCGTTTAACAGATATCATTCGTGCCGCGATTCAAGTCACCGGAACAGAAGCAAATAAAGTGGTACTCAAAGTTCGTGAAAAACAGAAAGGGCGCTCTCAATATCAAAAATTAGGGCAAATTTCTGAGACAATGGAAGTGAACGAGTATGGCGTTAAACTGATTGTCAATTTACATGATTATCTCGATACGGGTTTATTCCTTGATCATAAATTGACGCGTCGTCGCTTAGGGCAAATGGCAAAGGGTAAAGACTTCCTCAATCTATTTGCTTACACTGGCTCTGCAACCGTTCATGCCGCTTGCGGTGGAGCAAAATCAACCATGACGGTTGATATGTCTAAAACCTATTTAGAATGGGCTAAAGACAACTTAAAGCTCAACGATCAAGTTGGACACCAGCATCGCTTTGAACAAGCTGACTGTGTGCAATGGCTAGAGACTGCAAAAGAACAATTTGATTTGATATTTATCGATCCGCCGACATTCTCAAATTCCAAACGTATGGAACACACATTTGATGTACAACGCGATCATATTAAGTTGATGGAAAATTTAAAACGTATCCTACGTTCAGAAGGTACGATTGTGTTTTCAAACAATAAACGACATTTTAAAATGGATTTAGAAGCGTTAGCTGAGCTTGGTTTAGTTGCTCAAAATATTTCAGCGCAAACATTGCCACTGGATTTTGAACGCAATAAGCAGATCCACAACTGCTGGACCATTTCCCATGCACGCAGTGAATAGGGAATGAAGTTGTTCACGCTTTACAGTACTGAAGGATGCCATCTCTGTGAGATGGCATTTCAGCTTGTTCAGCAGGCAAACATTGCTGAACAAGTACAACTTGTTGATATTGCATTTGATGATGCGCTCTTCTCTCGTTACGGGGTCACCATTCCGGTTCTTAAATACCAAGAATCCGAACTGAGCTGGCCCTTTGACCAACAAACATTACTTCATTGGTTAGAAAATAATGGCATTAATTACCATCCATAACGGTCAATTAGCATTTGGTGACCACCCATTACTCGATCATGCAGATTTCGCATTACAAGAAAATGAACGAGTTTGTCTCGTCGGCCGAAACGGTGCAGGCAAGTCGACTATGATGAAAGTTCTTGCGAGAGAAATCATCATGGACGACGGAAAAATGCAGATAGAACAAGATGTTGTTGTTTCTCGATTAGAACAAGATCCGCCTAGAGATGAAGCTGGCACCGTTTTTGATTATGTTGCTGGTGGATTAGCGGAAGTTGGTGAGTATCTAAAGATCTATCAAGATCTTTTAGATCTCATCGTTATCGATCCAAGTGAAAGTAATATCAATAAGTTATCTCGTATTCAAGAGCAGCTAGAGCATACAGGGGCATGGCGTTTTGAAGAACGTATCCAAAATGTTCTGGCGGCGTTAAAACTGGATGGCCACACTAAACTAACGGATTTATCCGGTGGATGGCAGCGTAAAGCGGCCCTTGCAAGAGCACTAGTGTGTGATCCTGATGTCCTTTTGCTTGATGAACCGACTAACCACCTTGATGTAACCACCATCGAATGGCTCGAAGGCTTTTTGAAAGATTTTAGAGGCTCGATCATCTTTGTATCGCATGACCGGACGTTCATCCACTCAATGGCGACACGCATTGTTGAT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53 | Vibrio_phage(56.25%) | integrase,transposase,protease | attL 1675431:1675446|attR 1709552:1709567 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1721676 : 1778785
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP023310|1721676:1778785|DBSCAN-SWA 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53 | Leptospira_phage(26.67%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
2057929 : 2120708
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP023310|2057929:2120708|DBSCAN-SWA 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54 | Leptospira_phage(25.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
2209823 : 2270722
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_CP023310|2209823:2270722|DBSCAN-SWA 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50 | Leptospira_phage(22.22%) | transposase,integrase,protease | attL 2217281:2217298|attR 2268760:2268777 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
2372874 : 2425464
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_CP023310|2372874:2425464|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP023310|2372874:2425464|2411036_2411324_-|WP_010318729.1|DBSCAN-SWA MELSPVFARRLYLALLVESLERPNVPKLIEKTGWPRRTIQDVLKALPGIGIELMFVQDGRRHNDGYYQLSDWGPFDSQWVLDRRCDIATSLGFSA >NZ_CP023310|2372874:2425464|2383545_2384676_-|WP_096036586.1|DBSCAN-SWA MAESDGQERTEDATPKRLDEARKKGQVARSKELASVSVLVVGAIALMWFGESLARSLYALMGRIFNLSREEVFDLGKLFDIAAGSLATLILPLSLILITLFIAALIGAAGIGGINFSVEAAMPKPSKMNPLSGLKRMFGLQSWVELFKSILKVLLVSGVAFYLINASKEDLFQLSMDVYPQNIFHALDILLNFVLLISCSLLVVVAIDIPFQIWQHADQLKMTKQEVKDEYKDTEGKPEVKGRIRMLQREAAQRRMMAEVPQADVIITNPEHFSVALRYKQNTDKAPIVVAKGVDHMAMKIREVARAHDIHIIPAPPLARALYHTTDLEQEIPDGLFVAVAQVLAYVFQLKQYRKRGGQRPKLDENNMPIPPDLRH >NZ_CP023310|2372874:2425464|2401814_2402120_-|WP_013856304.1|DBSCAN-SWA MEQQLDLLSDLDHQIRAMLVIDEINTEEINHLVDKRERILQNLLTHASENPQFAMSSQWREAIDETKHLVELMQSKTVEIGRTLQKYRHGNKSVQQYKKFL >NZ_CP023310|2372874:2425464|2372874_2374902_+|WP_096036583.1|tRNA|DBSCAN-SWA 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MMHDAFTKHFISLEDPRQSAKVSYPLFDVLFLTVCAVITGAEGWEDIEDFGRAHLDWLQDKGLFKEGLPVHDTIARLISRLDAEQFQRCFVRWVNSLCEATEGQLIAIDGKVLRGSYDRNSRQSTIHMVSAFCTQNKLVLGQVKTDAKSNEITAIPELLKLLEIKGCLISIDAIACQKSIAETIVEGGGDYLLAVKGNQENLYKAVKSELNSADGETVKSQTETKHGRIEVREYRVLPAPKSEPFSDWFGIKSIGEAISFRYDKSGKKCSLEYRYYISSRELSAQEFAIGVRDHWGIENSLHWVLDTAFSEDDCQIYRENAPQVLAAIRHMAINMLRNDTSRKASIRRKTKMAAMEISYLEQILAENLGTD |
50 | Burkholderia_phage(33.33%) | tRNA,integrase,transposase | attL 2376580:2376639|attR 2433012:2434361 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_18 |
2506524 : 2559846
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NZ_CP023310|2506524:2559846|DBSCAN-SWA 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47 | Staphylococcus_phage(28.57%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_19 |
3055177 : 3159717
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_CP023310|3055177:3159717|DBSCAN-SWA 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96 | Leptospira_phage(23.53%) | tRNA,bacteriocin,transposase,integrase | attL 3102970:3103029|attR 3148354:3150729 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_20 |
3187510 : 3237091
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >NZ_CP023310|3187510:3237091|DBSCAN-SWA 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33 | Bacillus_phage(25.0%) | transposase,integrase | attL 3187451:3187510|attR 3212768:3213868 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
3310 : 53762
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP023312|3310:53762|DBSCAN-SWA 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46 | Leptospira_phage(38.46%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
62784 : 145603
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP023312|62784:145603|DBSCAN-SWA 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60 | Mycobacterium_phage(29.41%) | transposase,integrase | attL 64889:64948|attR 125770:127137 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
161501 : 197471
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP023312|161501:197471|DBSCAN-SWA 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48 | Leptospira_phage(28.57%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
208793 : 227985
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP023312|208793:227985|DBSCAN-SWA 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29 | Leptospira_phage(20.0%) | transposase,integrase | attL 200605:200618|attR 217294:217307 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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