Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020815 | Anoxybacillus flavithermus strain DSM 2641T chromosome, complete genome | 4 crisprs | cas3,c2c9_V-U4,c2c4_V-U1,RT,csa3,cas6,cas8b2,cas7,cas5,cas4,cas1,cas2,Cas14u_CAS-V,cas14j,DinG,DEDDh,WYL,c2c10_CAS-V-U3 | 0 | 4 | 5 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020815_1 | 240342-240438 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP020815_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP020815_1
>1.1|240369|43|NZ_CP020815|CRISPRCasFinder TCATTTCTTCTGAACAAACATGTTCAGCTAGTTTTTCATAGTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020815_1
The CRISPR arrays of NZ_CP020815_1 >merge|NZ_CP020815|1|240342-240438|CRISPRCasFinder TCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAACTCATTTCTTCTGAACAAACATGTTCAGCTAGTTTTTCATAGTTTCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC >NZ_CP020815|1|1|240342-240438|CRISPRCasFinder TCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC TCATTTCTTCTGAACAAACATGTTCAGCTAGTTTTTCATAGTT TCAATTCCTCATAGGTACGATAAAAAC
>NZ_CP020815.1|WP_094240185.1|238047_239529_-|TIGR02677-family-protein MDTSWLKPITEAKYLVVDNAYRYRAILRYFYTQHERMRQYLFPEEVYAFLKQFDEFQDYTEEELQQDLEQLVKWKNLIARQETGHIRTIEEFKKKRFRYQCSPYTVEIERMIRTLEQLGDTFGGSLEKTRFDRLYASLVRMEAIIHAGFVEKREEMNQVWEETFDYFRKIIQNSADYIAYLNGENMEERMMSDSFLVYKEQFTAYLRDFIVALQKTSMQIEKLLEDLPADGVRRFIEEVVAYQLAIPRFEGAVLSREQLTEEKLDTWRSLKEWFLGRNGHESELSFLQKQTNEAIRRMTRVVQRLGERHHHFRSRKKDYLHLAKWFSSLETVEEAHKLSAVVFGCFHTKHIVADNDATENMYRDIWEEQPTEWLVKPRVRHYREKKKPEAMTDRRKEKEETMTAYLAAKQQEEEALAQLITDGKIVLQELPVVASHIRKTLLGWIAKAMGREDRIVQTENGWKVKVVQREGTITLKAEDGMLMMPNYEIHLLD >NZ_CP020815.1|WP_094240184.1|236867_238034_-|TIGR02678-family-protein MEKEFDEKAKEALTALFEHFWIVREKDPELFQKIREREKVLKRYVQEKFGYRLIVHRYFAKLEKIPAEPEAWMGIESFQEPLDYALFCCLLAYLEGKAVEEKFLLSDVCEEIKAMYPGETALDWTNYQHRRALIRVLKTAEQIGIVHHVDGELEAFANQEDEEALYEVPVLSRYFMRSYPKDFIQYETMEQLLEEEWKVSPDDYRRHSIYRQLFLSPVVYRRQKDDPNFYYLRNFRHRLRDDIEAHADFRYELYKNAALLTIPERQHVYTLFPDQKGTSDMILHLAAVVRAHLDKYPPDEYGQIHVTMSDFHQLLNHCMEQYGEGWSKTYREMTTAQLASELLSALKAWKMAEHEQETGMVTLYPLLGRLVGRYPDDFTMKGRDDDDE >NZ_CP020815.1|WP_094241421.1|232741_236878_-|TIGR02680-family-protein MTNKWVLHRAGLINFWYYDEQYFEFADGKLLLRGTNGSGKSVTMQSLLPVLLDGKKTPDRLDPFGSRARRMEDYLLGEKEIVDRDERTGYLFLEYKRKQTEQYVTTGIGLRAKRQKNMDFWGFVIFDNRRIGRDLFLYKTEKSANGTEKIPLTKRELANLLGNGGTVVDSQKEYMELVNKHVFRFESMEAFQELIELLIQLRSPKLSKDFKPTVIYEILESSLPALTDDELRHLSETIENMDQTKQQLEQLERDEQSLKRLCTQYRAYNEYMIAEKASEWLKADKQVKRLAEEEKQWIAEKAEKQTHLVDLNEYIQTLASEQDVLHQRELELASHEVFQAAKEYERVQQDIRDIYEKQQKLLRQIDEKEQLERRYKRQLEEDEDRRYQVEKQLAQQLEDLRHDAMESSFSAHDLNETDFSRQRQTNFDFTVWKREGQEYVEKLEQIIALWRRHDEKKARYEETSKEVGDLQREVDGLRHEEAKWLELLENEKSRFQQEVFRWLEQCQDVSVQEASVQLFLQRLHELYETYHVDEMKQPFAEAYYDALNRKNEEKMKQKHACTLLEEKIAAKEAEWSQWKTQKDPELARDEQTMAARAELDEKGIAFVPFYAGVEFQDHVPEPLRERIESALYHAGLLDALITETNVDIKCDRVIVPRPVELAHTLADYLQPDVEEGCKVSTTRIKEVLQSIVFADGAMEGTFTLNEEGHYTLGVVKGHAPTREKALFIGRAARKRWRLEKIAALEAELLELRAQLHKQTDMLKQLEQTIAQINSWFRAFPTDRDMRAAFEEWEKTKRYIMSKQQEWERKNEKLAQLARDWQQAKQTLREQTEGLDLEFSKDGYEQALLLMKSYMRRLHELQMTHREFLHLLDMIHHRTEQLETLQQEIDETKGERYVLAKEQQKIELKRQEIERTLQLMGAEEIQAEIQRVRDRLAFLQREIPAKMNERVALEHALKTIREKCAQLSVKEAFAKRLAAAWKQSFEREVALELVELHGADLLEKAKEAMQRYGALAKETRTSLVNRLNSIFFQESASLTEYRLSQEPVAIEGTNPFADIELDEEMELKVAGWREKQDRIVLLLDYKGQRVSPFYVLHEIEHDIFLQREYMKEQDRELYEEIILKTIGRILRSRIQRAERWVKDMNERMQQLDTSSGLVLFIQWKPRTAETEEEMDTKELVELLRMNSRLLKDEDLQRVTKHFRSKINRARELLEERGQGNTLHQIIKEVLDYRKWFSFTLYYQKTNEPKRELTNQRFYQFSGGEKAMAMYIPLFAATYSRYQEAADDAPYIISLDEAFAGVDENNIRNMFGLVEQLGFNYVMNSQALWGDYDTVPALSICELVRPKNASFVTVIRYYWNGKVKQLITEVRKDELIEPVR >NZ_CP020815.1|WP_094240183.1|231522_232758_-|TIGR02679-family-protein MNRLDEAVQFFRGERSFHRLFCEMKKKYESLGRVGGTISVTSFSAEEKEAIASFFGKEMSRVSLAAFEQQLGNTKFAGISLVELLACYFGEPLVTKKEQQQEIEREKEAYFARLMNTYRAPRDWLVAVEKQRFVQLAYQQNPQALETAISIVCRALEQLPSTYVRLPMFAQQVANDPHALDLHTLAGKLLLSALQFYAEKEYDLSSVEDVNELLQSYRLLREDVLNFVTCAGVLADTDKGRHPVFVAACETNTALNVPLREVMPLVRAYPYLGSVIFVVENAGVFSTLLEANVPLVSTNGQLNLATIWLLDLLVKEGTTLYYSGDFDPEGLKMAQRLVERYGSSVRLWHYDKLDYLATNPTVPLSGERLAKLQSVTLRDLQPVKQEMIRQKKAGYQEAIVEELRRDTYLGG >NZ_CP020815.1|WP_094240182.1|230168_231518_-|aldehyde-dehydrogenase MNDHLQKQKRYFRTGATLSLSFRLAQLAHLKETIQVHEQAIIDTLAKELNKSPFEAYTTEIGVVYEEINFITKRLARWMKPKRVPTPLTHFGSKSYVYPEPYGVSLIIAPWNYPFQLAISPLIGAIAAGNCAVVKPSEYTPAMSALLKTIVSEAFPEEYITVVEGGADVSEQLLNLRFDHIFFTGSVPVGKIVMAAAAKHLTPVTLELGGKSPVIVDSSAHLELAAKRIVWGKFLNAGQTCIAPDYVLVHEAIKQPLLEKMKRYIDELYGNRDAYGRIVSKRHAERLVRFLTNGTIVHGGNYDIEQRWMEPTLIEDVTWDDAIMQEEIFGPLLPILTFQTMEEAIRTVQDHEKPLALYLFAEDEHVQRQVLARVSFGGGCINDTIMHIANPHLPFGGVGQSGIGAYHGKASFDAFSHDKSVVKQTTAFDIPIRYPNFPNAIKWVRKLLK >NZ_CP020815.1|WP_094240181.1|228836_229808_-|cytochrome-aa3-quinol-oxidase-subunit-II MKRLFSLLVVGLLPLLAGCEMVVFQPQGPAARSITELINWSIGWMLLVVVVVFALFAYIVWKYRDRPERQGEEPPEEHGSTVLEIVWTVIPILIVIALTIPTMRTLYDLEKPPKGYEDEKPLVIHVTSADWKWIFSYPEQNIETVNYVNIPAGRLVLFKMTSASTMQSFWVPALAGQKYTMNKMETELYVVADRPGSYEGRNTNFNGRGYAHMQFEVLAQTPKEFDKWVQEVKQTAPKLTKEKYEELLLPTHLGRLTFVDTHLQWVNHADPHSKTYTNPELYRGHGYQGKIFIREDNYKSSSICNDEQQKALESDSGGEHHGH >NZ_CP020815.1|WP_094240180.1|226870_228847_-|cytochrome-aa3-quinol-oxidase-subunit-I MGIKWNEIFVGGDPLLVGSQIAIVLTVVAIVVGLTYFKKWGWLWREWLTTVDHKKIGIMYILSGVLMFFRGGMDGLLMKAQTARPEMNFLDAQHYNEIFTTHGVIMILFMAMPFLIGLMNVVVPLQIGARDVAFPQLNALSFWLFFSGAMLFNISFVVGGSPDAGWTSYFPLAGKEFSPGIGNNYYAIALQIAGLGTLMTGINFIVTILKMRAPGMTLMKMPMFTWTTLITSIIIVAAFPIFTVALALMTFDRLYGTHFFTLSSGGSDMLWANLFWLWGHPEVYIVILPAFGIFSEVIATFSRKTLYGYTSMVISIVGIAFLSMIVWVHHFYTMDAGPAVNSFFSITTMLIAVPTGVKIFNWLFTMRKGRIQFTTAMLWALAFVPNFVIGGVTGVMLAMAAADYQYHNTLFLVAHFHYVLIPGVVFAVFAGLYYWWPKMFGFMLNEKLGKYHFWLFTIGFNVTFMPMFFLGLKGAVRRAYTYSAESGFAPLFLVSAIGSIILAIGFAVFCYNIYWSFRYAKRDVSHDPWDARTLEWMTASPVQFYNFAVVPEVKQLDAFWHMKKRGETLTLKESDIKKIHMPSNSGLPFYMAVVFGITGFFLVFEAHIAAAVAAIGIVIGLIIRSFDYNDGYYVSVDEIKQTERTWRTVEGGTENHVG >NZ_CP020815.1|WP_094240179.1|226275_226881_-|cytochrome-aa3-quinol-oxidase-subunit-III MSANVNHSLPLEYQTEQNRLNILGFWIFLGAEIVLFATLFAVYGVLGHRYAGGPTPSDIFKLNDVLIETLLLLTSSFTCGLAVFFMRQRDMKKLLVWFIITLLLGAGFLFMEIREFIHYVHEGATMQTSAFLSSFFVLLGTHGAHVTFGIIWAVMLIIQLLQRGLTPMTARKMFIISLYWHFLDVVWIFIFTFVYLKGMVG >NZ_CP020815.1|WP_012573996.1|225975_226275_-|cytochrome-aa3-quinol-oxidase-subunit-IV MEHKSKYPVSHVVGFLFSLILTFVAVFVALKMNVSYTIVMWIIGSLAVIQAGLQLFMFMHVTEGEDGKTNVINMAYAVFVAIVIVAGSIWVLTSGHAAH >NZ_CP020815.1|WP_094240178.1|224351_225860_-|HD-domain-containing-protein MRIYEETLKKLFINYTIGSVLAVVGVGSTLMVMALNIRQVDLLMLLLIQFFSFCVMLFIEYRAFRKDIHPIRRIFYETNVTEEQFYWGLVQAKRFPLLTVRRIALPHFLGLSVPAVALTLSLIFIDVLRIPYMYVAYALFGALLIAMLHAMIEFFLTLRTMRPLIRDMMQIGRMHRFHEAIRATNVVYVPMKIKIGLSVLFIGIFPVLLFVLATEVKLFAEGQNTFSGYWTWTIVVLVISVLFSLFAARVLSEDVERSIEDLLQYMNRVQRKEYELMCDNVYIDEFSELTNGFNHMVDAIVERDEKNKQLLNSFISVMTTALDARDEYTAGHSQRVAVYAVEIGKRLGMTNEQLARLYRSAILHDIGKIGIPDHILLKDGKLTDEEFAWIKKHPALGENIIRQVQPIEEVKDLLPGIRSHHERIDGKGYPDGLEGEDIPLFGRIIAVADAFDAMTSDRPYRKGMHVEKAVSILLEGRGTQWDAQMVDCFISFLKEREQEKVS >NZ_CP020815.1|WP_094240186.1|240725_240977_-|hypothetical-protein MKKRFFIGLDEELVEIRGLEFERLQDFFQTFFFMYKSSPPCKVTAVIETRILSQNELSKKRAKLKEYTNRPIILHPSKKLCTT >NZ_CP020815.1|WP_094240187.1|242833_243154_+|hypothetical-protein MNYSSSSPKVVLDYFRTRLLCTISKSDFSYTAAQENPLLSSTCCGDEPKSFVKRTDEVISCILSPYSNGKMEGTNNKIKLIKRRGYGYRNIHRFALRVCLETANIL >NZ_CP020815.1|WP_094240188.1|243140_243377_-|hypothetical-protein MEKQMQAWMKTIRQLFSPEKLAHLARKTGFIQRKRSLTAEAFLTLCAWGDGSLAQQSLQRLCTGSSPKDVLASDIRVC >NZ_CP020815.1|WP_094240189.1|243511_243823_-|AzlD-domain-containing-protein MWTNWILIGLLAITTYISRIIGIEVMKGRKTSSTLRLYFNYVPAGILSALVVSQLFISKDSQIQISFPIVIGGLVTALTIKISKSFLPSVIVGIVSGLLIRNL >NZ_CP020815.1|WP_012573984.1|243812_244508_-|branched-chain-amino-acid-ABC-transporter-permease MNMTIRTIRTGISEALPLAIAIAAYGLSYGVLGIQAGFGLVGTVLMSLLVFSGSVQMVTVAMITGGAGILSILVTATLLNLRNLLYGAALAEGIAPAKRWRWLLSFGVSDEPFVLGISRFKKYGPDPIYFATVAGTFYIAWVSSSLIGAIIGNQIIDPQKWGLDLAFPITFVALLVPNLTEKPIITTALTGAVITVILTVLFPGTPLNILVAGVLAPLVGIYLKEKNKNVD >NZ_CP020815.1|WP_094240190.1|245020_245509_-|hypothetical-protein MRKASASGGGLHPEEAYVIALRFDGLIPGLYHYRVQDHKLTLLTEGKFEEKLIELLYHQYFARGLSVGIFITARFDKAWWKYRHSCAYRNVLLDIGHASQTFQLCATSLGYQTWITGAFQDIAVDSFLGVNGSTEGTIFFVGAGTGELKAIDELTLRHLASR >NZ_CP020815.1|WP_094240191.1|245654_245927_-|winged-helix-family-transcriptional-regulator MREERNVEVVLYSRSYNQASLIKLLFKNSGCRFTADELIDYIDLTGHSSLYFPIKNLREKIEEDPSHPVVLTHRRGYGYGICTQEITKGE >NZ_CP020815.1|WP_041637689.1|246244_246820_+|Uma2-family-endonuclease MSLPNKKRLWTYADYANLHEEKRYEGIDGALFMTPSPTPRHQRIVTALSALFFDFLQHSSCEVFVSPIDVCLFATKDTPLHDIKDWYIPDLIVVCDKQKIGDERIYGAPDLIVEILSPSTAKHDRITKFHNYERAGVKEYWIVDPIHETVEIYALQDGQFRQVHMHYKDETICPYIFPSCFIALPKVFTPM >NZ_CP020815.1|WP_041637687.1|246836_248267_-|Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln)-amidotransferase-subunit-GatB MNFEIVIGLEVHVELKTKSKIFSSSPNAFGAPPNTQTSVIDLGYPGVLPVLNKQAVEYAMKAAMALNCEIATETKFDRKNYFYPDNPKAYQISQYDQPIGQNGWIEIEVNGKKKKIGITRIHLEEDAGKLTHTGDGYSLVDFNRQGTPLIEIVSEPDIRSPEEAYAYLEKLKSIIQYTGVSDCKMEEGSLRCDANISLRPIGSDKFGTKTELKNLNSFNFVRQGLEYEAKRQEKILLSGGVIQQETRRFDEATKTTILMRTKEGSEDYRYFPEPDLVMLYIDEEWKERVRASIPELPDARKKRYIEELGLPEYDAKVLTLTKEMADFFEATVANGADPKLASNWLMVEVSAYLNAEQKELHDIALTPESLAGMIKLIQNGTISSKIAKKIFKELVEKGGDPEQIVKDQGLVQISDEATLRKIVLEVLDANPQSIEDFKNGKDRAIGFLVGQIMKATKGQANPPLVNKLLLEEINKR >NZ_CP020815.1|WP_094240192.1|248281_249739_-|Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln)-amidotransferase-subunit-GatA MSLFDYRVSELHSLLHKKEISVSDLVDESFKRIHEVDEKVQAFLTLNEEQARAKAKELDEKLATEKEFGLLFGMPIGIKDNIVTKGLRTTCASKILYNFDPIYDATVVERLHKADAVTIGKLNMDEFAMGSSTENSGFQLTRNPWDLERVPGGSSGGSAAAVAAGEVPFALGSDTGGSIRQPAAFCGVVGLKPTYGRVSRYGLVAFASSLDQIGPITRTVEDNAYVLQVISGLDPMDSTSANVDVPDYVSALTGDIQGLKIAVPKEYLGEGVSEEVRQSVLDALKVLESLGATWEEVSLPHSKYALATYYLLASSEASANLARFDGVRYGYRTDHAKNLMEMYKQTRSEGFGNEVKRRIMLGTFALSSGYYDAYYKKAQKVRTLIKQDFENVFEKYDVIIGPTTPTPAFKIGEKTSDPLTMYANDILTIPVNLAGVPGISIPCGFVNGLPVGLQIIGKHFDESTIYRVAHAFEQATDYHKQKPTL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020815_2 | 584854-585004 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP020815_2
|
2 spacers
spacers of NZ_CP020815_2
>2.1|584879|38|NZ_CP020815|CRISPRCasFinder ATAATAACAACTCTAACTCCTTAAATAGTGAGTTTGAG >2.2|584942|38|NZ_CP020815|CRISPRCasFinder TAAATATTGAAATGAACCCCGTAAATAAAGGGCTTGAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020815_2
The CRISPR arrays of NZ_CP020815_2 >merge|NZ_CP020815|2|584854-585004|CRISPRCasFinder TCCATAAATAACGACCAAAACTCCTATAATAACAACTCTAACTCCTTAAATAGTGAGTTTGAGTCCGTAAATAACGACCAAAACTCCTTAAATATTGAAATGAACCCCGTAAATAAAGGGCTTGACTCCATAAATAAAAACGAAAGCTCCG >NZ_CP020815|2|2|584854-585004|CRISPRCasFinder TCCATAAATAACGACCAAAACTCCT ATAATAACAACTCTAACTCCTTAAATAGTGAGTTTGAG TCCGTAAATAACGACCAAAACTCCT TAAATATTGAAATGAACCCCGTAAATAAAGGGCTTGAC TCCATAAATAAAAACGAAAGCTCCG
>NZ_CP020815.1|WP_094240306.1|582388_583903_-|FAD-dependent-oxidoreductase MSLPKSSQSYWLQTTTIPSFPSLTQPLKTDVAIVGGGITGIMTAYLLAKQGVRVAVIEANRLCHGTTGHTTAKITAQHDLIYHELIAHFGEDSARQYYEANSEAIQFILQTIKENDIHCDLSLEDAYVYTTEETQLYKLEAEWKAYETIGIDGAYVDQLSLPFSVQGAIMMRNQAQFHPLHYLKTLVELAVKHGASFYEQTVAQHIETSTRPVVQTKNGATITCDTVVICTHFPFFDPAFYFARLHAERSYVIAVEAHERLQGMYLSANEPKRSLRYTMIDGKPLLFVGGESHKVGQGTNMIHHYEALQSFSKHIFGLSNVQYRWSAQDLVTLDNLPYIGPVRTSLPHILVATGYRKWGMTTSAVAAHLLADLALQKENRYAQLFAPSRFIADPSLNHLLTEGIDVAKHFLIGKLEYALRTPRDISPGEGAVVNVDGKRAGAYRDEQGTLYVVDTTCTHMGCELEWNNSERSWDCPCHGSRFCFTGKVLEGPATEPLRQLEGDE >NZ_CP020815.1|WP_094240305.1|580922_582392_-|spore-germination-protein MMNSIQQTLTHSLDMNEQTLRDYFTKTPDLVYCHLLIGEPKKRALLVYLNTLVDKNSINNNIIDPLLFETKQINTIVDIQLPIGAKSYSTKWEHVIQRIFQGETALLLDGDDHVLLLDTQGWPQRAIAEPQIESSLKGSHQGFIETCEKNIALIRRYLPHQQLKIEETTVGRRGHTSVALLYLEDVTHPEVLQELKDRIEQIDVDTVVNTGELMQHIEDNPFSPFPQFLLTERPDAAVSNLLQGRIVIIVDRSPSVMIGPMTFITFFQTVDDYSTRWMIASFLRLLRLLAFFMAIFLPSAYIATLSFHYEIIPLNLLLTVGESRERVPIPPLLEAVLMELAIEMLREAGLRLPAPIGQTVGIVGGVVIGQAAVEAGIVSNIMVVIVSLTAIASFIIPNPDMSESIRLLRFPMMIIASLFGLVGMAIGLMLIIGHLISLESLGTPEGSPFAPARLRDWKDTILRFPLWMMRTRPLSARPTQLTRQKKFRK >NZ_CP020815.1|WP_094240304.1|579812_580913_-|spore-gernimation-protein MKRYQFNEITTMQYIFLISGTQVGIGILSLPAQLADIANTDGWIAIVIGWVISIIASTIIIKTMEKHPQDTIFDLSRRYFGRILGTIIHLAFVGYALLASVTVVFTSIHITQVWILPNTSNYLVMVLFMLPGFLITRNGVRVLGRYAEVVFYLTLWMPILIAIPLQKGTVLHMLPVLKDGWTPIFQAVKTTVLSFLGFELAFVFYPFLKEKQHAVKAMVIANSISGFTFLLITVTCFIFFSPDEISSLIWPTLSLLKTIEFSFIERFEVIFLSFYLFVMSTTGIPYIFTTVFGISQLLGKKDHTIVLFIAVCIFICTSFLYNPSFVDIQTMGSWWERYGLWGAYIFPIILFIYVSVAQWFQGGKKK >NZ_CP020815.1|WP_094240303.1|578721_579816_-|Ger(x)C-family-spore-germination-protein MKRWTYMFLCLFFIVGCNAKTQLDELTLALTVGLDESQNGKLLVYSISPVFNKESENIYEVIRTSGVTTRDGRSKANAFASGKIVGGKVQNVIVSKTFAETHDMFSYLDVFYRDPKNSITANFIVFDGPLKKLMYIHLKDKPRLSVAIRDVILTAHTSKQTTKANMLLFHRLALDRAQTPFAPMLKVHKGDLVAGGIALFNEQRKYVGSLSQTESPYFSILQKNIKPSTFLTLAIKGLTKQKEYISISVEHGDFSYKPSFRNGTFHFDAHMRLGVVMTESTTYIDMKKEKKKLEKLLAKEIQKQLELVVKKLQTYEVDPIGFGLYARAYEYKQFQKQKSWAKAFAKAEINIHPTVEIISYGVLQ >NZ_CP020815.1|WP_041639197.1|577594_578650_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MDDRVIIRFNHVTKQYDDDFPVLDDVSFDIERGKFYTLLGPSGCGKTTILRLIAGFIEPTKGDIYFHGQRINHVPSNKRRVNTVFQDYALFPHLNVFENVAFGLRIKKIPEADIERKVKEALRFVNLEGYEQRAIHEMSGGQRQRVAIARAIVNEPDVLLLDEPLSALDLKLRTEMQYELRELQRRLGITFIFVTHDQEEALAMSDEIFVLNKGKIEQRGTPKDIYDEPVNRFVADFIGESNIITGMMIDDFVVEFANQQFTCVDRGFAKNERVDIVIRPEDLELTTVERGKLLVRVDSVLFRGVHYELCCYDAYGNEWLVHSTKKAEIGEEIGLHFEPEAIHVMKRSGGE >NZ_CP020815.1|WP_094240302.1|576795_577593_-|ABC-transporter-permease MRRYAYAVPYWLWIALFVIAPIILIIYYSFFDIEGHFSLVNYGTFFTPVYLRMTINSFWYAFVITAISLLIAYPTAYLLTKTKHKQLWLLLIILPTWVNLLLKAYAFLGLFGTYGAVNALLETIGIGTKQLLFTDFSFVFVSVYIFIPFMILPIFNALEKLNPSLIDAARDLGASEWTTFRRVIFPLTLDGVKAGCQAVFIPSLSLFMLTRLIAGNRVITLGTAVEQHFLVTQNWGMGATIAVFLMIAMASIMAITGNKKWGVRQ >NZ_CP020815.1|WP_094240301.1|576019_576814_-|ABC-transporter-permease MGGETMKISRLYLAFIFFVLYMPIFYLIYYSFNSGGTMHHFESFTLDWYKEVFDDTRLLIIVLHTIIIALLSSSLATIIGVFGAIAIYYAKHRWKQTLLTLNNILIVSPDVIIGASFLILFTIAGIQLGFTSVLLSHIAFSIPIVVLMVLPKLQEMSPTLIDAARDLGANEWNVLTRVVLPYVTPGIFAGFFMALTYSLDDFAVTFFVTGNGFSTLSVEIYSRARQGISLSVNALSTLLFLFTLFLVVVYYIMTQRASVKGGKK >NZ_CP020815.1|WP_094240300.1|574949_576023_-|spermidine/putrescine-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKVLSLFLLVWLIAFSLLYVTKTIESSEGYGGNNTLTIYNWGDYIDPALIKKFEKETGLKVIYQTFDSNEAMMTKISQGGATFDVAVPSEYAISKMKEEGLLLPIDHAKIPNLRYIDERFLNLSFDRGNQYSIPYFWGTVGIVYNRALLGGKEITSWNDLWDPAFKNEILLVDGAREIIGMALNSLHYSLNDTNKTHLQQAKQKLDALTPNVKAIVGDEIKMLLANEEAAIGIVWSGDAAEIMWENERLDYVIPKEGTNLWFDNMVIPKTAKNIEGAHQFINFMLDPKNAAQNAEYVGYSTPNKKALEYLPKEVVEDERFYPGEKLANKLEVYENLGKSMLAYYNELFLQFKMHRK >NZ_CP020815.1|WP_094240299.1|573282_574773_-|peptide-MFS-transporter MSQSKQRMIESVPQRGFFGHPKGLFTLFFTEFWERFSYYGMRAILVFYMYYEVSKGGLGLDETTALAIMSIYGSLVYMSGIIGGWVADRLFGTAKAVFYGGILIMLGHIALAVPGSVTMFFVSMVLIVLGTGLLKPNVSSVVGDLYAEGDHRRDAGFSIFYMGINLGAFLAPLVVGTVGMKYNFHLGFGIAAIGMFFGLLVFVATKKKNLGLAGTHVPNPLSADEKKKVFTWGAIGAAIIALLVFIGSWTNVLTIDLFVSLVGIFGIVIPTIYFVVMYRSPKTTDVERSRIIAYIPLFIASAMFWSIQEQGSTILATYADKRTQLHFAGIDLSPAWFQSLNPLFVITFAPIFAWLWVKLGDKQPSIPKKFSLALLFAGLSFVVILLPAYLGGNDSLVSPLWLVLSYLIVVFGELCLSPVGLSATTKLAPAAFSAQTMSLWFLSSAAAQAINAQIVKFYTPETEMAYFGTIGGIAIAFSVILFIISPKIESFMKGVK >NZ_CP020815.1|WP_094240298.1|572711_573260_+|23S-rRNA-(pseudouridine(1915)-N(3))-methyltransferase-RlmH MWICVVDMWINLVDIMFVKWGSLVNIYIIAVGKLKEKYLKQGIEEYTKRLSSYAKIDIIEVADEKAPEQLSEQQMELVKKKEGERILAKVTDDMHVIALAIDGKMMSSEQFAQTLDRLATYGKSKIAFIIGGSLGLSDDVMKRANESLSFSKMTFPHQLMRLILTEQIYRAFRINRGEPYHK >NZ_CP020815.1|WP_006321087.1|585426_585654_+|hypothetical-protein MLICEWRNFSTDAETYTLELFEEMIGDEFEAMMFEDDQEIPSYIWTVNYVVIVKRNTRMYNDISFTKIPRNPVCE >NZ_CP020815.1|WP_094240308.1|585828_588432_+|bifunctional-acetaldehyde-CoA/alcohol-dehydrogenase MAVDEKVLDQKKEVTKMIDTLVANAQKALKAFHDYDQETIDHIVKQMALAGLDKHMYLAKLAIEETKRGVYEDKIIKNIFATEYIYHNIKYDKTVGVIRENEQEGIIEIAEPVGVIAGVTPVTNPTSTTMFKALISIKTRNPIIFAFHPSAQKCSSEAARILRDAAIAAGAPEHCIQWIETPSVEATQQLMHHPGVSLILATGGAGMVKAAYSSGKPALGVGPGNVPCYIEKTANIKRAVNDLILSKTFDNGMICASEQAVIIDKEIYDAVKNEMIANKCYFLNEEEKKKVEKLVINENTCAVNPNIVGKPAYEIAKMAGIDVPVDTKILVAELKSVGPQEPLSREKLSPVLACYKVNSTEEGLKRAEEMLEFGGLGHSAVIHSENQEVILEFGKRMKAGRIISNAPSSQGAIGDIYNAYIPSLTLGCGTFGGNSVSTNVGATHLINIKKLARRNVNMQWFKVPPKIYFEKHATQYLAKMPNISRAFIVTDPGMVKLGYVDKVLYYLRKRPDYVHCEIFSEVEPDPSIETVMKGADMMHAFQPDVIIALGGGSAMDAAKAMWLFYEHPNTDFNGLKQKFLDIRKRVFKYPKLGQKAQFVAIPTTSGTGSEVTSFAVITDKKNNVKYPLADYELTPDVAIVDPQFVMTMPKHITADTGMDVLTHAIEAYVSNMANDYTDGLALKAIQLVFEYLPRAYKNGNDEVAREKMHNASTIAGMAFANAFLGINHSLAHKLGAEFHIPHGRANTILMPHVIRYNAQKPKKFTAFPKYEHFVADQRYAQIARLLGLPARTTEEGVESLVQAIIKLAKELDMPLSIAATGVSKEAFESKVDQLAELAFEDQCTTANPKLPLVSDLADIYRQAYKGV >NZ_CP020815.1|WP_094240309.1|588623_588902_+|hypothetical-protein MRIDVSPNHSQGGSCLMNGLAHHQGIHKFLTMLGLALYFSKYVYSMFESNSDFSDGLDLLRKRKGHSLVDFIYRAAKQNIPIDTVKKQLHVA >NZ_CP020815.1|WP_041639190.1|589143_589623_+|Cys-tRNA(Pro)-deacylase MKQAKTNAVRMLDRARVPYELFTYDYTDGQIDGISVAKKIGQREELVYKTLVTKGATAQLYVFVIPVAAELDLKKAANVVGEKSVHMLPVADIEKMTGYVRGGCSPIGMKKRYATYVDESALLHEQIVVSAGKIGVQMKLFVQDLLKLTNGKTAHIIKA >NZ_CP020815.1|WP_094240310.1|589637_590345_+|RNA-methyltransferase MRMTKEEELHIEEGLLTDDNRLLWEMILPSRLKRMYDVLSERTRYITILTEAVDDPHNQAAVLRSAEAFGIQDVHVVTGAAPFEPNKWVTRHADKWLNVHKHSSIEQAIRHLQQNGYQVYASYLGEGTIPLEQIDVSKPTVLLFGNEHRGVSEEALALADGKFVIPMNGFVQSFNISVAAAISLYEITKRAKQMAGERYHLSLAEKKEIYEHWMKLSLSPRLRKMVESQMGGSND >NZ_CP020815.1|WP_012576267.1|590337_591003_+|beta-phosphoglucomutase MIEAVIFDLDGVIADTVELYYIATKRVADEIGVPFDRQLNQKLQGMSRQAMVEALLGETVHEWTEEEKRALGDRRGQYYRELIEQLSPNDVLPGMLALLCDIQRDGVPMALASSSSNARTVVERLGVRSFFDVIVDVKTITRMKPDPEIFLTAAKELRVDPSCCIAIEDGEAGMKAIKQTNMFSVGIGAHLAPLSPDWLVQRTTQLTWGELKQRFMQRAGQ >NZ_CP020815.1|WP_094240311.1|591011_591740_-|pyruvate-formate-lyase-activating-protein MNGFIHSVESCGTVDGPGIRYVIFTQGCLLRCQYCHNADTWEIGKGKQMSVDEIIDDAETYLPFMQASGGGITVSGGEPLLQIDFLIELFRRCKQLGIHTTIDSSGGCYTTEASFQRKLDKLLQYTDLILLDVKHIDEKKHRKLTGKTNEHILAFARLLSERNVPVWIRHVLVPTVTDDEEDLHRLADFIRTLRNVEKIEVLPYHQLGVYKWKALGLTYPLEGIPTPSEESVEKAKQILGAK >NZ_CP020815.1|WP_094241432.1|591789_594018_-|formate-C-acetyltransferase MDAWRTFKGDKWKKEIDVRDFILNNVTVYTGDESFLEGPTEATKKLWEQVMELSKLERERGGVLNMDTEIVSTITSHGPGYLNKELEKVVGFQTDEPFKRALMPFGGIRMAEQACEAYGYEVSDEVKKIFTQYRKTHNQGVFDVYTDEMKAARKAGIITGLPDAYGRGRIIGDYRRVALYGVDRLIEEKKKDLRNTGARTMSEDIIRLREELAEQIRALQELKEMAASYGYDISKPARNAHEAFQWLYFAYLAAIKEQNGAAMSLGRVSTFLDIYIERDLQEGTLTEREAQELVDHFVMKLRLVKFARTPEYNELFSGDPTWVTESIGGVAIDGRPLVTKNSFRFLHTLDNLGPAPEPNLTVLWSTQLPEAFKKYCAKMSIQTSSIQYENDDLMRPEFGDDYGIACCVSAMRIGKQMQFFGARANLAKALLYAINGGVDEKLKVQIGPEFAPITSEYLDYEEVMRKFDSVMEWLAELYINTLNVIHYMHDKYCYERIEMALHDTHILRTMATGIAGLSVVADSLSAIKYAKVKTIRDENGLAVDFEIEGDFPKYGNNDDRVDAIAVDIVERFMTKLRKHKTYRDSKHTTSILTITSNVVYGKKTGNTPDGRRAGEPFAPGANPLHGRDTKGALASLSSVAKLPYEYALDGISNTFSIVPKALGKDDATRIQNLVAILDGYALKRGHHLNVNVFNRETLLDAMEHPEKYPQLTIRVSGYAVNFIKLTREQQIDVINRTFHETM >NZ_CP020815.1|WP_094240312.1|594320_595118_+|basic-amino-acid-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKGIIATLVFMLMFALVGCGSSTEKTATTEKKITVVTDAAFAPFEYMNKGEIVGFDVDLLKAVMKEAGLAYELKNMGWDPLFAAIQGKTADMAVSGITINDDRKQTYDFSIPYFESTHMILVKKGSSIKSAKDLQGKVVGVQNGTTGQEAVEKILGKENPNIKKFENTVVAIMDLLNGGVEAVVTDNAVANEYVKNNPDAKIVAFEDPEHFESEFYGFMFPKGSELKQKVDEALKKVIKDGTYAEIYKKWFGTEPNVESLQQQQ >NZ_CP020815.1|WP_094240313.1|595184_595838_+|amino-acid-ABC-transporter-permease MDFRFNIIVEYAPFFLKGVLWTIGLSLIGILFGTILGLAIGLGKMIQNRLVRLPFDWYVHFFRGTPLFVQILLIHFGVMPMFTAQPNPLVSGAISLSLNAAAYIAEIFRAGIQSIDRGQMEAARSLGMTHVQAMRYIILPQAIKRMIPPLGNEFVVLIKDSSLAAIIAAPELMYWGRAMQGQYYRVWEPYLTVALIYLVLTLSLSKLLHRLERRYDA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020815_3 | 1421442-1421811 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP020815_3
|
5 spacers
spacers of NZ_CP020815_3
>3.1|1421472|39|NZ_CP020815|PILER-CR TCAATTCGTTCGTTGTAGTAGTCTTCAGCGTCATAACCG >3.2|1421541|36|NZ_CP020815|PILER-CR AATGCAAGCGTCGTACTCGTTTCTCGGATCTTGACA >3.3|1421607|36|NZ_CP020815|PILER-CR AAATCACGCATTTGGACGGTTCGATTGAAGTTGTTG >3.4|1421673|39|NZ_CP020815|PILER-CR TATGCAAACACGCACAGGAGAATTTACGTATTCAAAAGT >3.5|1421472|43|NZ_CP020815|CRISPRCasFinder,CRT TCAATTCGTTCGTTGTAGTAGTCTTCAGCGTCATAACCGGTTT >3.6|1421541|40|NZ_CP020815|CRISPRCasFinder,CRT AATGCAAGCGTCGTACTCGTTTCTCGGATCTTGACAGTTT >3.7|1421607|40|NZ_CP020815|CRISPRCasFinder,CRT AAATCACGCATTTGGACGGTTCGATTGAAGTTGTTGGTTC >3.8|1421673|43|NZ_CP020815|CRISPRCasFinder,CRT TATGCAAACACGCACAGGAGAATTTACGTATTCAAAAGTGTTC >3.9|1421742|44|NZ_CP020815|CRISPRCasFinder,CRT ATCTCTTTTTTTTGGCATGGTTTAACATCTCCTTTGTTTTGTCT |
cas6,cas8b2,cas7,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020815_3
The CRISPR arrays of NZ_CP020815_3 >merge|NZ_CP020815|3|1421442-1421811|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTCAATTCGTTCGTTGTAGTAGTCTTCAGCGTCATAACCGGTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACAATGCAAGCGTCGTACTCGTTTCTCGGATCTTGACAGTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACAAATCACGCATTTGGACGGTTCGATTGAAGTTGTTGGTTCGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTATGCAAACACGCACAGGAGAATTTACGTATTCAAAAGTGTTCGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACATCTCTTTTTTTTGGCATGGTTTAACATCTCCTTTGTTTTGTCTGTATCGTACCTATAAGGATTAAAAAA >NZ_CP020815|3|1|1421442-1421741|PILER-CR GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC TCAATTCGTTCGTTGTAGTAGTCTTCAGCGTCATAACCG GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC AATGCAAGCGTCGTACTCGTTTCTCGGATCTTGACA GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC AAATCACGCATTTGGACGGTTCGATTGAAGTTGTTG GTTCGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC TATGCAAACACGCACAGGAGAATTTACGTATTCAAAAGT GTTCGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC >NZ_CP020815|3|3|1421446-1421811|CRISPRCasFinder GTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC TCAATTCGTTCGTTGTAGTAGTCTTCAGCGTCATAACCGGTTT GTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC AATGCAAGCGTCGTACTCGTTTCTCGGATCTTGACAGTTT GTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC AAATCACGCATTTGGACGGTTCGATTGAAGTTGTTGGTTC GTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC TATGCAAACACGCACAGGAGAATTTACGTATTCAAAAGTGTTC GTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC ATCTCTTTTTTTTGGCATGGTTTAACATCTCCTTTGTTTTGTCT GTATCGTACCTATAAGGATTAAAAAA >NZ_CP020815|3|1|1421446-1421811|CRT GTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC TCAATTCGTTCGTTGTAGTAGTCTTCAGCGTCATAACCGGTTT GTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC AATGCAAGCGTCGTACTCGTTTCTCGGATCTTGACAGTTT GTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC AAATCACGCATTTGGACGGTTCGATTGAAGTTGTTGGTTC GTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC TATGCAAACACGCACAGGAGAATTTACGTATTCAAAAGTGTTC GTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC ATCTCTTTTTTTTGGCATGGTTTAACATCTCCTTTGTTTTGTCT GTATCGTACCTATAAGGATTAAAAAA
>NZ_CP020815.1|WP_012574440.1|1420808_1421066_+|hypothetical-protein MKEGRGTVMLDEQKQHWLGKARDYKAYSLVLFALSAFLYIGTLIPSAIDEAKRPLALGAVFILMLASIFFSHRSHIYARKIEEEA >NZ_CP020815.1|WP_094240703.1|1419639_1420773_+|cystathionine-gamma-synthase MRRKTKLIHGGIAGDEHTGAVSVPIYQVSTYKQEAVGVHKGYEYSRTGNPTRHALEELIKDVEEGYAGFAFSSGMAAITAVMMLFNSGDHVILTDDVYGGTYRVMTKVLNRLGIASTFVDTSNLANIEAHIQPNTKAIYLETPTNPLLKITDIQEAAAIAKRHGLLTIVDNTFSTPYWQTPIALGAHIVIHSATKYLGGHSDVVAGLVVVNSEQLATDLHFIQNSTGGILGPQDSWLLMRGMKTLGIRMEEHEDNTRKIVEFLTNHPAVTRVYYPGLPSHPNHDVAKKQMRGFGGMVSFDVGSAEKAEQVLTRVRYFTLAESLGAVESLISLPAKMTHASIPKERRAELGITDGLIRISVGLEDADDLIEDLAQALA >NZ_CP020815.1|WP_094240702.1|1418714_1419638_+|cysteine-synthase-family-protein MKVAKNVHELIGHTPIVEITQFPLPKGVRLFAKLEYLNPGGSVKDRLGQELLNDALATGKLKEGGTIIEPTAGNTGIGLALAAIGKNIRVIFCVPEKFSIEKQQLMRALGATIINTPTHEGMQGAIRKAKELAAEIPNSYCPQQFENPANPRTYYKTLGPEIWEQLDGKIDVFVAGAGSGGTFMGTAQFLKEKNAQIKTVIVEPEGSILNGGKPGPHRTEGIGMEFVPPYMDTSYFDAIHTILDDDAFRRVKELAQKEGLLVGSSSGAAFHAALLEAEQAKEGTNIVVVFPDSSERYLSKNIYEGGM >NZ_CP020815.1|WP_094240701.1|1417970_1418669_+|5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine-nucleosidase MNIAIIGAMEEEVAILREKIANRTETTVANCSFYSGTLDGANVVLLKSGIGKVNAAMSTTILLERFAPDVVINTGSAGGFAPSLNVGDIVISTEVVHHDVDVTAFGYAYGQVPGMPARYAADERLIRAAETSAAHIRDIQVAKGLIATGDSFMHDPARVDFVRTQFPDLYAVEMEAAAIAQVCHQFNVPFVVIRALSDIAGKESNVSFEQFLQKAALHSSELVQLMVNELNK >NZ_CP020815.1|WP_094240700.1|1417313_1417952_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MGREFLDIFENWAQSYDSSVYGHDEQYRDVFDGYETILNTVVEKSGNVVLEFGVGTGNLTKKLIEANKTVYGIEPSAPMRELAKEKLGHVTIEDGDFLQFPLPNEPIDTIVSTYAFHHLTDQEKEEAIGKYSTLLRKGGKIVFADTAFINREAYEAMIAEAKQKGFVDLAEDLQREYYTTIPALEHMFTTHGFTVTFTPMNRFVWLMEAVKQ >NZ_CP020815.1|WP_035018511.1|1416973_1417177_-|DUF2536-domain-containing-protein MITFDLIQDKVEFFEATDLATLEKKINDQIEHNKAIMLEVHHVSYQMQLLENGQRLYSAMVHFKAKK >NZ_CP020815.1|WP_012574433.1|1416372_1416969_+|DUF1510-domain-containing-protein MSSRFAKRSKQRKVNRLLNTFIAIVFALILFFGWKWLFANDRPTKETNASPQPVEVETNEPPNDEQPSETETETNEQQSNDNVEETVVDDPNSNVIREIVNPSWQPIGTTQSEPHVTTYEKNSVDWKEMIDAISYATGISSSDLIVWFIGNGGSPNHAVATVSKKDKTEHYKVFIEWVTNEGWKPTKVQQLKEIERRP >NZ_CP020815.1|WP_094240699.1|1414627_1416376_+|penicillin-binding-protein-2 MVKKRMVIILTIIQLAIFGLIGRLVQLQLVSTESFHGINLIEASVAQRTEQLVIDDGRGVFVDRNGDPLTYEYIPTLVLFPFLKKMDWPIDEIAAIVSVPKETMKRQLEEAKGPIILHDGQQPIQLQSWQMERINDLRIPGVIAVHKQYELKQKYAQHVIGLLGENEKVLKERYADRNLSPKTKIGVSGLQSSFDEFLIPDEETKLLYHVDARGEPLFGMDVKYTEQANPFYPITVQTTIDRTLQQRVEQIVAQHGMEKGAVVLLDVETNDVVVLASAPTIDERDPYKDGAMENKALLPQVPGSVFKIVVAAAALEHGLIHGQTFNCDQKINGEQEEKKKGMRTFEDSFAISCNRTFGELGKQLIAIDENMFDVYARKLGLLPRVGWEGDVYHFQSFRPLREEKKGNIWGDERDKHIPLAVAQTSIGQKDVRVSPLAVANMMATIARGGEAKQVRITKKMMYKNGTTFFAFDEKRLTTDSLQKETIDKLQELLQLVVTHPEGTGRSFQSLPYAVAGKSGTAQTGKKDVVNKWFAGYFPADRPKYALVVVQLETTSSASVTNAIFADIVRATYELEQKGRYEE >NZ_CP020815.1|WP_035019996.1|1414103_1414580_+|transcription-elongation-factor-GreA MSMEKEYPMTKAGKEKLEQELEYLKTVKRKEVVERIQIARSFGDLSENSEYDAAKDEQAFVESRIQMLENMIRNAKIIEEDLESTDIVSLGRTVTFVELPDGEEESYTIVGSAEADPFEGKISNDSPIAKSLIGRRVGEEVTVHTPGGDMVVKIIAVK >NZ_CP020815.1|WP_006320548.1|1413374_1414010_+|uridine-kinase MRKKPVVIGVAGGSGSGKTTVTKAIYEHFQGHSILMLEQDFYYKDQSHLPFEERLKTNYDHPLAFDNDLLIEHIHKLLNYEPIDKPVYDYTLHTRSNEVIRVEPKDVIILEGILVLEDERLRNLMDIKVYVDTDADIRIIRRLLRDIKERGRTLESVIEQYVNVVRPMHNQFIEPTKRYADIIIPEGGHNHVAIDLMVTKIQTILEQNSIL >NZ_CP020815.1|WP_094240704.1|1421850_1422474_-|YHYH-domain-containing-protein MFRAIFSFLIAFTILFTSSAYAHPGKTDENGGHTCRTNCEKWGLKTGEYHYHDKNGNIIRQKSKETVVPSIRVNSKHIVKVIRVVDGDTIDVRFSNGATSRVRFIGVNTPETVHPQKPVEKYGKEASNYTKKRLTNKTVTLEFDVGVKDKYGRFLAYVWVGKELYNETLVKDGYARVMTIQPNVKYQQRFLEAERKARLQKKGLWKS >NZ_CP020815.1|WP_094240705.1|1422724_1423453_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRIICSFEVKKIPLHYRMMIVSILKESIRASSEEYYERLYAQENATKPFVFSPFLKNFRFKGDEIELDELRVIISSPDYEFLLHVYNGLQSKKRFEYKGYELIRGKTVMGDEKKITSSTVVFRTLSPLLVEDENKSPIAPDDKNYEKHINYLADTILYEYRGTGLCRPLTIRPIRFKKMVIKESNHQFTEKYGEEQHLYFTAYHGLFKVSGDPADLQLIYQLGLSKRRNQGFGMLEVEEVKG >NZ_CP020815.1|WP_094240706.1|1423449_1425225_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MKVKLHMGEWMINMGLVGLYRVFEYGRKNGIISDEYKDSVTVKPWGIELDTDVLPQLPKAYFLYLLEEYSVARRECERLDSYIEQVKKEENFKNVVSSIKKSINDTGKKVLKYFPYPSLEDVLEKLKDVKKAEHVSQLIGYINEFKTIINDQKVNEKLTLNYFKPAILRSFFGQVSFLNVAKNNLDFDGHIEEFYKSYIVPVLNDLIFEQAIETSRSSEEMNAFLETHNDYQPFKQLKREVRKKTIEEIREYVRTNINKCLLFNERVAFYNFEEMVFSPIGVAKDNAFNFSWHFDSQQPKPLSSLAKLVLLFAPIGSTIYYKSEGINEQTERRLYAGFVQTDATFAEILQKNNHFSQLKKKREPFNKIVSQLVQSVKKESEYTVDHLFFLEFFSDYDSKKTHLHYYHLPMYLAHYFKQHADKLDYIKPYDYREQFVQYVLRGADPVYVIYNYLRDCIKNERSTIGPYIAVQERHRILQFKKGVRDMSTTDKRVSALFMQGREIREAIIRSSSSEKKVTSIAYRLLNAAKAGNRKNFMDTLLRIYMSADRPISPIFLNALHERDLDFATVANAFIAGLLANQYKEEQEEVQA >NZ_CP020815.1|WP_094240707.1|1425221_1426109_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MKKALTMTVIFQANSLNYGEGIANISELKKFHRGDGEVYTYASRQSIRYDIVRLGNELFGWNLDTVDKASGVVQFKKDVTINDSVEMDLFGYLKTDKNSQKRPAVVRLSHAISLEPYKSDLEFLNNMGLASRIGQDANLANIEQHHSFYTYTLTIDLNRVGVDGEIELPNEEKANRVLQLLEVLKVLNRNIRGRQENLAPLFVIGGMYHVANPFFLGRVQLSTTANGWAVQTKPIKETMEQTFAGEAIGKDTRIGILSDVFANEGEFYDLFNEQVMTVEPFFRYVSKQIQSYYGV >NZ_CP020815.1|WP_094240708.1|1426111_1426813_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKALRLKLFQETACYKKPFASKVAETYPLPPYSTVKGMIHALLNADQFIPMRLSVQGTYEEKLLDYQRYYFFKKKELSSFPLVLDGLARMEFSYDKNEITTMPMYTHLLHNVHLLIHIEAEQHILKQIIHAIEYSMTHYSLGRWEDLVRIDEYKLVDVQELKEEKTLQWNAYIPSNLLDRETKSIPYQLNWKYEIVNGIRQWEKINVGYVQKEIEAPEGVWIDEDGELVFYHL >NZ_CP020815.1|WP_094240709.1|1426824_1429002_+|CRISPR-associated-helicase-Cas3' MVFYAKSEGKETIREHTDRLLYNLNLLKNSYSNKFMLMDGKMWKLLEIAVQYHDVGKANTVFQNKIRQAIRESMLETDIETDVPHNYLSVGCIPLKQLDLTKEEERLLIHAVGYHHEREQLPEKEKVRHVLENDIKKQLPQLSEHMRLPMTEKFSYRFVDRLLKRYTYHDGEEFWKYVMIKGLLHRLDHAASAHIDVESDVEKSIYINVNEYMKKQGFHKNDLQQFAEQHHDKHVIAIAQTGMGKTEAALLWIQHDKAFFTLPLRVSINAIYDRIKEKMGYDAVGLLHSTSVHYLVDKEENWEELKQQSEHYAKKLLLTTIDQILKFPFYYKGFEKELAAMANAKVVIDEIQAYEPRIAAMLIKSLEMIHRVGGKFMIMTATLPTLYLEELKQRNVINDDQIAIEEFIDTSVNRHRIRLRSEGIEEAIGEVLELGETSQVLVIVNTVRQAMSLYDKFLDCDTQVPIYLLHSQFTQEDRQLLEKHIKQFNEDNERGIWITTQLVEASIDIDFDYLFTEMSTLDSLFQRFGRCYRKRELEHDNCNIHIFTENISGIPRVYNEHLVNESIRLLEPYDHQIVDERAKVEMVKQLYDRKQLKGTSFLKEFEDALYMFDNLDPYGMDKRKAQQKLRDIQNIQIITRQMYDQIEHLFERYKEEKEWKKRLKLRMEIEKKTVSVQRYIAEKYVSERLPKPFDHIYIAEVEYDFNRERLKGKGILLDKPSSNQH >NZ_CP020815.1|WP_094240710.1|1429016_1429514_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MVSGVQMQYYKVCKRKLWLFSKGIAMEDEHERVIEGKILHERAYPRLEDREILVDDAFKLDALDGEYIREVKLSSKMSEADRFQMLYYLYELKKRGVQKKGLISYTKERKTEEIELTEKDEVAIEKAIKEIYAIVHSASPPKLKKLPYCTKCAYYEFCFALEGDD >NZ_CP020815.1|WP_012574448.1|1429513_1430497_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MLRDHYIFSNGRLKRKDNTLYFFDEEENKKSLPVHQTDNLYVFGEIDLNSSLLNLLSQHDVHLHVFNYYGFYAGTFCPRNKKVSGFTVVQQSAHYLDLEKRLYMAKAFLQSAVHHMLRNIRRYKEKTEQYVQVIEEEAKKMDSATTVQELMGIEGRIRQHYYQSFNAILKQDFIFEKRTKQPPQDPLNALISFGNSLCYTAVLSEIYKTQLDPTISFLHEPSTKRFSLCLDLAEIFKPLIVDVVIISCINNRIITQKHFDFLDGMVLLNEEGKKRFIKEWDEKLSTTVQHRKLKRKVSYRYFIRLECYKLIKHFIGDEPYKPLKAWW >NZ_CP020815.1|WP_012574449.1|1430498_1430762_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVIITYDVGEKRVNKVCKKLREYLTWTQNSVFEGEITKSLLMKCLNEIDQIIDEDEDSIYIYEVANPKNIKKQVFGQEKNFDELFL >NZ_CP020815.1|WP_094240711.1|1434557_1435319_+|DUF4405-domain-containing-protein MLKKNIVKIILDVSMAITFVLLMNPRVFNGLPFHEVAGLVIGVAVLVHIGLNYQWVVHTVKKIFDRSLSGKTRFSFLLNVLLLLSMTGIIVTGILISKVVFPHLLSGENHALREIHDVFSKLTLLLVGVHIALHWQWIMGVFRKMLKTKEGKWRKGAVVAVVFVLAMFIGSMQWLATNVKPDEAFQPKFEQKVAQASGTFSPPERFHERPHEEHHGNSHPLLVILGHFTFWAVVIVAVYYIEKRMRHKRQVRV |
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NZ_CP020815_4 | 1430952-1434476 | Unclear |
I-A
Consensus repeat of NZ_CP020815_4
|
53 spacers
spacers of NZ_CP020815_4
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cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020815_4
The CRISPR arrays of NZ_CP020815_4 >merge|NZ_CP020815|4|1430952-1434476|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT 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>NZ_CP020815.1|WP_012574449.1|1430498_1430762_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVIITYDVGEKRVNKVCKKLREYLTWTQNSVFEGEITKSLLMKCLNEIDQIIDEDEDSIYIYEVANPKNIKKQVFGQEKNFDELFL >NZ_CP020815.1|WP_012574448.1|1429513_1430497_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MLRDHYIFSNGRLKRKDNTLYFFDEEENKKSLPVHQTDNLYVFGEIDLNSSLLNLLSQHDVHLHVFNYYGFYAGTFCPRNKKVSGFTVVQQSAHYLDLEKRLYMAKAFLQSAVHHMLRNIRRYKEKTEQYVQVIEEEAKKMDSATTVQELMGIEGRIRQHYYQSFNAILKQDFIFEKRTKQPPQDPLNALISFGNSLCYTAVLSEIYKTQLDPTISFLHEPSTKRFSLCLDLAEIFKPLIVDVVIISCINNRIITQKHFDFLDGMVLLNEEGKKRFIKEWDEKLSTTVQHRKLKRKVSYRYFIRLECYKLIKHFIGDEPYKPLKAWW >NZ_CP020815.1|WP_094240710.1|1429016_1429514_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MVSGVQMQYYKVCKRKLWLFSKGIAMEDEHERVIEGKILHERAYPRLEDREILVDDAFKLDALDGEYIREVKLSSKMSEADRFQMLYYLYELKKRGVQKKGLISYTKERKTEEIELTEKDEVAIEKAIKEIYAIVHSASPPKLKKLPYCTKCAYYEFCFALEGDD >NZ_CP020815.1|WP_094240709.1|1426824_1429002_+|CRISPR-associated-helicase-Cas3' 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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1. spacer 4.8|1431447|37|NZ_CP020815|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019544 (Deep-sea thermophilic phage D6E, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
gtaattaattccgtcatcacacttgccgctccgtaaa CRISPR spacer gtcagcagttccgtcatcacactcgccgctccataga Protospacer ** * .*.***************.********.**.*
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ttatatcgcttcattatgaacacctttttttcttg CRISPR spacer ttaaaggtgttcattaggagcacctttttttcttt Protospacer *** * ******* **.**************
3. spacer 4.13|1431780|37|NZ_CP020815|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AB823818 (Phage phi OH2 DNA, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
tttcatgtgaaaaggttggatgaagaatgaacgcaga CRISPR spacer tttcatgtgcaaaggttggatgaggaatgattaagat Protospacer ********* *************.****** .. ..
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ttgacacatttaaaatgagtgcagatgcagatagt CRISPR spacer ttgacccatttaaaattagtgcagagtttcataag Protospacer ***** ********** ******** . ***.
6. spacer 4.52|1434346|35|NZ_CP020815|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693381 (Marine virus AFVG_25M224, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
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7. spacer 4.52|1434346|35|NZ_CP020815|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693277 (Marine virus AFVG_25M240, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
851728 : 908948
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP020815|851728:908948|DBSCAN-SWA 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50 | Streptococcus_phage(23.08%) | transposase,coat,protease,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
929964 : 965812
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP020815|929964:965812|DBSCAN-SWA 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23 | Brevibacillus_phage(20.0%) | transposase,integrase,tRNA | attL 951555:951572|attR 965258:965275 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
978570 : 1029656
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP020815|978570:1029656|DBSCAN-SWA CATGGATGATTATTTTCGTGTCGATCATATGGAAACAAAAAATGATCGTTTTATTGTTCGAAGTGGAAATGACATATATGTTGCGATACCGACGGATGAGAGAGAAAGCGACATACAGCAGTTATACTACATGGCGATGTATATGCGAACGCAAGGTGACGAAACGATTGCAACGTTGCTTCCGACGAAGACAGGTCGATTTGTTGGAAAGTTACAAGGGATGCAAGTCAGTGTGTGGAAAATGGAAAAGAGAAATGAAACAGACAATTTAGCACAACAGCTTGCATTATTTCATCAGCGCGGGCGCACGTATCCGTATGATGTTTCCACAAGAAACCGATTCGGACAATGGGGCGAGCTGTGGGGACAACGTATTGATCAATTAGAACAGTTTTGGCAATGGCAAGTGAGATCGTCTGAAAAAAGTGAAATGGACGAATTATTTATTGAGACATTTCCGTATTACTTAGGCTTAGCTGAAAATGCGATTCAGTATGTCGTAGATACGCAATTAGACGAAGTTCCCATGCGTAGCGATATGCGAACCATTTGTCATGAACAATTTGCGCCTGAAGCATGGGAGATGGGGAAAATACCGACGGATTGGGTGTGTGATCATGCAGGTCGCGATATAGCAGAATGGATACGAACGCAATGGCTTATGAAACAAGTAGACGGAACGATTACGCATTTTTTACGGACGTATGAACGGGTGCAAACACTTAGTCGTTTTGCTTGGCGGATGATTTATGCCCGCTTACTATTCCCGCTTCATTATTTTCAAGCAATTGAAAACTATTACGGAACAGCAGGAGACATAAGACAAGGCTATGAACAGCAATTGAGACAAGTGTTTGAAGAGAGTGATGTGTATGAACAAAAACTTCGCCATTTTCATGACATGACTACTGTTTCCATTCCTCGTCTTGACTGGTTATAAATGTGCTACAATAAAACGGAGGACAATGTGCGAAAGGGGTTAAAAAGATGGGAAGACCGTATGTGTTTATTACAAGAAAATTACCGGACGATATTGTTGCTCCGTTATACGACAAATATGATGTAAACATGTGGCCACATGAGCATCTTGTTGTTCCACGCGACATATTGCTTCAAGAAGCAAATCGGGCGGAAGCGCTGATTACGATGCTATCTGATCGCATTGATGAGGAGCTATTAAAAAACAGCCCTCATCTACGCGTTGTTGCGAATGTAGCAGTCGGTTACGACAATATTGATGTAAACGCAGCGACAAAACGCGGGATTATTGTTTGTAACACGCCCGATGTGTTGACAGAAACGACCGCGGATTTAACATTCGCTTTGTTGTTAGCAACAGCAAGGAGACTAGTTGAAGCAACGGAGTTTATAAAAAAGGGAGAATGGAAGAGTTGGAGCCCGCTGTTACTTGCAGGGACAGATGTTCACCATAAAACGATTGGAATTGTCGGTATGGGGAAAATCGGGCAAGCTGTTGCACATCGAGCAAAAGGATTTCATATGCGCGTGTTATATTATAATCGTTCGCGAAATATTGAAGCGGAACGAACGCTTGGTGCAACGTATTGTTCGTTTGATGAGTTGCTTGAACAAGCGGATTTTGTCGTCTGTTTAACTCCTTTAACGAACGAAACGTATCAATTGTTTAATCGTGAAGCATTTATAAAAATGAAATCATCGGCTATTTTCATTAATGCAGGACGTGGAGCGGTTGTCGATGAAAAAGCGCTGTATGATGCATTAATTGATCGACAGATTGCCGCAGCAGGATTAGATGTATTTGTAGAAGAACCGATTCGTGCGGATCATCCACTTTTACAATTACCAAATGTTGTTACACTACCACATATCGGAAGTGCAACGAAGGAGACGCGCTACGCAATGATGCAACTATGTTGTCGCAACGTGATCGCTGTCTTAGAAGGGAGAGAACCTTATACTCCTGTGTAGAGCCAAAGGGCTCTTTTTTTATTTTTTTAGAAAATTTTTAAACATAAAGCGTTTTCATATGGTACGATAATGAAAATAAGGATTGTAAAAGAAATAGACATCCTCTATAATGTCTACTATAAAAAAACAAATGTTCATTACAGAAGAACAAGAGGTGGGGAAGATGGTAAAAAGCGTATCAGTTGGATTGTTAGGATTAGGAACGGTTGGTAGTGGGGTAGTTAAAATTATTAAAAATCATCAAGATAAATTGATGCACCAAATTGGTTGCCCTGTTGAAATAAAAAAAGTTGCGGTGCGTGATCGTGATAAAAAAAGAGATGTCGTTTTGCCAGAGGCAGTATTAACAACACATGTAGAAGAAGTGATTAACGACCCGGACATTGATGTTGTCATTGAAGTCATGGGAGGCATTGAAGAAACGCGCCAATATATATTACAAGCATTAAAAAATGGAAAGCATGTCGTTACAGCGAATAAAGATTTAATGGCATTATACGGTACAGAGTTGCTCTCCGTTGCATCTGAGTACGGTTGTGACTTATTTTATGAAGCAAGTGTAGCAGGAGGCATTCCAATTTTACGCAGCCTTGTGGACGGATTAGCTTCTGACCGCATTACGAAAATGATGGGGATTGTCAACGGAACGACGAATTACATTTTAACAAAAATGAGCAAATTTAATCGGCCGTATGAAGAAGTATTAGCGGAGGCGCAAGCGCTTGGTTATGCCGAAGCAGATCCGACGTCAGACGTAGAAGGACTAGATGCAGCACGGAAAATGGCCATTTTAGCTCGGCTTGGCTTTTCGATGAATATTGATTTACAAGATGTATACGTAAAAGGGATTACTGGCATTACGGAAGAAGATTTAAACTATAGCAAACGGCTCGGTTATACAATGAAATTAATCGGTATTGCCCATCGAGATGGCGAAAAAGTAGAAGTGAGTGTACAACCGACATTGCTACCAGAAACGCATCCACTTGCGTCTGTAAACGATGAATATAATGCAGTTTACGTTTATGGGGAAGCAGTTGGGGAGACGATGTTTTACGGTCCGGGGGCAGGAAGTTTGCCGACAGCAACGTCTGTTGTGTCCGATTTAGTTGCCGTCATGAAAAACATGCGTCTTGGGGTGAATGGAAGAAGTGCAGTTACTCCGCAATACGATAAGCAGTTAAAAGACGATAGCGAAATATACTCGAAATATTTTTTACGTATTCATGTGAAAGATCAAGTGGGGGCCTTTGCGAAAATTACATCACTCTTTTCAGAACGGGGAGTAAGTTTCGAGAAAATTTTACAACTTCCTTTAAAACAAAAAGATTTAGCTGAAATTGTACTCGTTACACATCAAGCGTCCTTAAAAGATTATCGTGATGTATTGCAGCAATTGCGTGATTTAGAAGTTGTCGAAGAAGTGAAAAGCTCGTATCGCGTAGAAGGGGAAGGTGCATTGTAATGTGGAAAGGGTTGTTACATCATTATCGTGACTATTTGCCAGTGACCGATCAAACGCCGCTGTTATCGTTAAATGAAGGAAATACGCCACTCATTCCGCTTATTCATTTGTCTGAAAAACTCGGTATCGAGTTATATGTTAAAACAGAGGGGGCAAACCCAACAGGATCGTTTAAAGATCGCGGAATGGTGATGGCTGTCGCTAAGGCAAAGGAAGAAGGAAGCGATACGATCATTTGTGCTTCGACAGGTAACACGTCCGCTGCGGCCGCGGCGTATGCTGCGAGGGCGAATATGCGTTGCATCATCGTCATTCCTGATGGGAAAATTGCGCTTGGGAAGTTGGCACAAGCGGTTATGTATGGAGCAGAAATTGTTGCGATTCAAGGAAATTTCGATCATGCGCTAAAAATGGTGCGCCGTTTGAGCGAGCTGGCTCCAGTCACGCTTGTTAATTCGGTCAATCCGTATCGCATCGAAGGGCAAAAAACCGCAGCGTTTGAAATTTGCGAACAACTCGGGCAGGCGCCAGATGTTCTTGCCATACCAGTCGGAAATGCAGGAAATATTACAGCGTATTGGAAAGGGTTCAAGCAATTTCATGAAAAGCATGGCACAAAATTACCAGAAATGCGCGGATTTGAAGCGGAAGGGGCGGCAGCGATTGTACGTAATAAAGTGATCGAAAATCCTGAAACGATTGCAACAGCAATTCGAATTGGTAACCCAGCGAGTTGGGAATATGCTGTTCAAGCTGCGAATGAATCAGGTGGAAAAATTGATGAAGTAACAGACGAACAAATTTTACATGCGTATCGTCTACTTGCACGCGAAGAAGGAATATTTGCAGAACCTGCTTCGTGCGCATCTGTTGCAGGTGTAATGAAGCAAGTAGAAAGCGGGGAAATTGCAAAAGGAAGCCGTGTTGTTGCCGTTCTTACAGGAAATGGGTTGAAAGATCCGAATGTAGCGATGGAAGCGATGAAAGTTCACCCGATCGTCTTGCCGAATGATGAGGAAGCGGTGTTTGCGCACATTCAAGGAGCTGTTCTTCAATGAATGATGGGGAGATGTTAAAAATTGTCGTTCCAGGAAGCACAGCCAACCTCGGTCCTGGCTTTGACTCGATCGGATTAGCGGTATCGTTACATTTAACATTGGAAGTCGTGCGTGCAGAATCGTGGGAATTTATCCCAAAAACAGATGAAGTAAAAAGCATTCCAACCGATGAAAGTAATTTAATTTATCAAGTAGCAAGTAAATTAGCAAGCGAGTATGGTGTAACGTTGCCGCCTTGTCACGTATTTGTCTCAAGCAATATTCCGTTTACTCGTGGGCTTGGTAGCAGTGCTGCAGCCATTGTGGCTGCTATTGAGTTGGCGAATGAGTTAGGATGTCTTTGTTTGTCGCAAGAAGAGAAAATGCGGGCAGCGAGCGTATACGAAGGGCATCCTGATAATGTTGGCGCCTCTTTGTATGGAGGGCTAGTGATCGGTAGTCATTTAAATGAACGCACACATGTTGTGAACATCCCACATATACCGATTGATTTAATAGCTGTCATCCCAGCGTATGAACTGGAAACA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52 | Bacillus_phage(16.67%) | transposase,coat | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1622545 : 1628272
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP020815|1622545:1628272|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP020815|1622545:1628272|1625477_1625942_+|WP_006318211.1|DBSCAN-SWA MNVYEGNLVGTGLKIGIVVARFNEFITSKLLSGALDGLKRHGVEEQHIDVAWVPGAFEIPLVAKKMAESKKYDAVITLGAVIRGATSHYDYVCNEVAKGTSHAALSSGVPVIFGVLTTDTIEQAIERAGTKAGNKGWEAALSAIEMANVMRTFS >NZ_CP020815|1622545:1628272|1623627_1624266_+|WP_041639300.1|DBSCAN-SWA MFTGIIEEIGTIQQMKQTGEAIVFTIGAQKVLQDVQLGDSIAVNGVCLTVTSFTDRLFTVDVMPETVRATSLRTLTVGAKVNLERAMAANGRFGGHFVSGHVDGIGRIVRKQPVANAVYYDIEVPSHLRKYMILKGSVAVDGTSLTIFGLTDRTFTISLIPHTREATILGAKKVGDIVNIECDIIGKYVEQFVGGKREGLTMQFLQQHGYKE >NZ_CP020815|1622545:1628272|1624271_1625465_+|WP_094240802.1|DBSCAN-SWA MFHTIEEAIYDLMQGKIIIVCDDEDRENEGDFVALAEKATPEVINFMITHGRGLVCVPITEELADRLDLAPMVNHNTDAHGTAFTVSIDHKATTTGISAFERSLTIQEMLNPEAKASDFKRPGHIFPLVAKKGGVLRRAGHTEAAVDLARLCGAKPAGVICEIIKDDGTMARVPDLQKIAEQFDMKMITIKDLIAYRNRKEKLVKREVEITLPTDFGEFKVIGYSNTLDGKEHIAIVKGEIIPDEPVLVRVHSECLTGDVFGSHRCDCGPQLHAALAQIEEEGRGVLLYMRQEGRGIGLLNKLRAYKLQEQGYDTVEANEKLGFAPDLRDYGIGAQILKDLGVTKMRLLTNNPRKITGLKGYGLEVVERVPLQMPAKRHNERYLRTKYEKLGHMLHF >NZ_CP020815|1622545:1628272|1622545_1623622_+|WP_012574660.1|DBSCAN-SWA MDEQYMRFALQLAQSARGQTSPNPLVGAVVVKHGEIVGFGAHLKAGEPHAEVHALRMAGEKAEGATVYVTLEPCSHYGRTPPCADLLIEKKVKRVVVATTDPNPLVAGKGIEKLKRAGIDVTVGVLKEEADALNEMFFHYISTKTPYVTLKYAMSLDGKIATKTGESKWITSEDARRDVHRERRMHDAIVVGVGTILADDPSLTVRFGYEGKQPIRIVLDTHLRTPLHANVVTDQKAPTWIVVGQHVTEEQIKPYEHAGVHIIRMNENKIDIPFLLHELGKRNVMSIFVEGGAHVHGSFLHSRSVQQVIAYIAPMLIGGNEAPSAIGGEGFGRMMDALRLQVKHVERIGSDIKIVAKG >NZ_CP020815|1622545:1628272|1626930_1627692_+|WP_006318215.1|DBSCAN-SWA MNKGGINVHYHVKLDQFEGPLDLLLHLIHRYEIDIYDIPVAQITEQYMAYIHAMKQLQLDVASEYLVMAATLIEMKSKMLLPKHEETLEDDELFIEEDPREQLMQQLIEYKKFKEAAKQLREREEERALLFTKPPSDLTAYASNGAPLALDVDLYDMLGALAKLLRRKKLQKPLHTKVARQEIPIGRRMEEILHILKHGERMNFYDLFPYDDREQIVVTFLALLELIKRDEIIVEQENNFADLYIRRKGDRYE >NZ_CP020815|1622545:1628272|1627684_1628272_+|WP_080630414.1|DBSCAN-SWA MNELAIMEALLFAAGEEGLTYKQLADVLDIQEERVYELVQQLKHMYDVAERGIMVVEMAGTLQLVTKKQCAPYLQKLVESPTTSSLSQAALETLAIIAYRQPITRAEIEQIRGVKSDKPLQTLLGKALIKEVGRAEGTGRPILYGTTKEFLDYFGLKTLDELPPLPEWDEQEEEREADLFFERLNEQLQEAGEQR >NZ_CP020815|1622545:1628272|1626375_1626903_-|WP_012574663.1|DBSCAN-SWA MKKGGFRLYPRAYIEYLLHFHATRDYFECHEVLEEYWKQTGEHVWVGFIQLAVGMYHYRRGNMIGAKRMFTKALNACEREKQAYEALGIHVEQLIALIHTYVERINHGQPYESTCLPIIDASLLHICQQQCDQKGLVWGEKSDMTNEYTIHKHKLRDRSDVVAERERQKQKRQGR |
7 | Staphylococcus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2598198 : 2681425
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP020815|2598198:2681425|DBSCAN-SWA 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76 | Bacillus_phage(28.57%) | transposase,coat,holin,integrase | attL 2632082:2632141|attR 2679135:2680386 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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