Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP022606 | Weissella cibaria strain CMS1 chromosome, complete genome | 1 crisprs | DinG,csa3,cas3,DEDDh,WYL,csa5gr11 | 0 | 0 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP022606_1 | 1912779-1912886 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP022606_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP022606_1
>1.1|1912803|60|NZ_CP022606|CRISPRCasFinder GCCCGTGATAATGCTGAAACAGCAGCGAAGGCCGTGGATTCAAGTGGCTTTTCAACGGTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP022606_1
The CRISPR arrays of NZ_CP022606_1 >merge|NZ_CP022606|1|1912779-1912886|CRISPRCasFinder ACGGCGGTTTCGGATGCGCAAACGGCCCGTGATAATGCTGAAACAGCAGCGAAGGCCGTGGATTCAAGTGGCTTTTCAACGGTGACGGCAGTTTCGGATGCGCAAACG >NZ_CP022606|1|1|1912779-1912886|CRISPRCasFinder ACGGCGGTTTCGGATGCGCAAACG GCCCGTGATAATGCTGAAACAGCAGCGAAGGCCGTGGATTCAAGTGGCTTTTCAACGGTG ACGGCAGTTTCGGATGCGCAAACG
>NZ_CP022606.1|WP_010375188.1|1909404_1910016_+|stage-II-sporulation-protein-M MTKIGTIWRETFRRYWRTMVIFAIINVVIWFVVLALVKFNAFGLHDLALKSIKANFVNDASSHKINHSGAFGGFVQLTWHNYLGGLATVAISLIPIPFWWVTAVMNPASIGYLLGLSPIPVTTFFAGIFPHSIVEMPMQWLEFSIAWETFRLIWQNIRTKQGWWHGIDWRHIIIILIVVVLPMAILAGAIESFITPALLNMAK >NZ_CP022606.1|WP_010375189.1|1907809_1909324_+|glycosyltransferase MNYFVSENVFTFNSGTEHAQAKRVQLFTEQGQSAQYVTRNYNRFLARDAEAIGLHAEQVLNMYDFFQGVTDVPREEVSLRLLPQIPLDEYHIEGHGPNYSTINHAGRELARINVMPATVGLVNDIVYYDRYGNTTARENFDWRGFKSSVDYFHPDGNLAVQKMLNLAGETVIEISHMKVNGTLYPTMWKLLNYKGHDWRFNTEDQLFLFFLNEITAEHPGSILVSDRRSLDHVVADVQFAAKKFAVLHDIHTPDIKNPIRGKLYDAYLNVLERRVRDFDAILVPTPEQQADLQKRYSGVDFRVVPDTFVPQAQLAASRLRLPDRQAGNILFMGRLSPEKRPDQAIRALARVVKSVPSATLTFHGYPANAEILNELKALANQLGVTNSVIFGDYITGDALAAAYQRAQVIVQTSVAEGFGMNLVEAMSYGVPVVSYDITYGTRELIHDGVNGYVVANGAHGEMADRIVSILSDDGVWADLSAAAYDKAVTFNGQAMMAAWQQALQ >NZ_CP022606.1|WP_010375190.1|1906196_1907810_+|glycosyltransferase MNFFVNATMPKQKSGIEHAQLKRFELFNNHQVDSRIVLRDWDPVAHVNANAAGIPDNQLINMFDYFQEAVTVTPKTLHAQEIEFGVPNVQFADEPANNRYLVTAQNGQLVARVNYDATADKRVRSTELFDGYNNLFRVDHYDSRGFASLIQWYTTDNQIGTETWVTPSGRTVIETFNKKTMAGEFVKSGWRLIEHGGHVMQFDTIEELTKHFFDRLNDDFWSEEQPNVFVLDRSHLGDWGLLRLRKPAYVVMHLHNSHAGDAQDPMHAILNNHYEFAMNALDEYDAVVSATHKQTHDVNERFQPKTRLFTIPVGVVPDRLLQAERVPVARREFGKVIAFARIAWEKHLDDLVRAVGIVHKEFPQVTLDLYGYADPADNYKARTSVEEAIREYGLEGVVTMKGYTTEIDAVENNAMMYGLTSRMEGFNLAIMEAISHGLIAFSYDVNYGPNEIVEDDVNGNVVPYEDYEAMAQAMLKVLRDPDLAQRYSTGAYESSERYSEENVWHAWRELLDDAAAVWPAKLAAMPAHAHDLNKEAE >NZ_CP022606.1|WP_010375191.1|1903808_1906046_+|hypothetical-protein MAVSPASDTSTKTASGSTDELAVAAGNVGTATTSDAPTKVSGSLNKLYRFTGKQYLSLHTPDDSTGLKLTNISSYLDSSTFSVKVIYADGTISDVDSGGVDGYSTWYPTSNVQGIFYSVDPKTGALMVKHGTITVSKNKTTYNYSSPLAVATDGDWQNAAGSPATNIYVYSKVKVPALGQQLVLSGNVKMPTNGDMRQYSGDTRMFGAGSTTNTPVNYNVAGNIPETSSTSWYGSYEEGGFNILKHTDTGVITHDVSYTDGTGKSITSGSSDSYNQVIASDKITNTQSQDSTGTYTITTGSNNVTFAKQPAFVNANGDDVSTAVGLKDMTYYDATGAKTTDYAKAVKATMTVTIPATSSYTIKSVFQASKTESITSTTSMTGTDTNMAKIDLTKSFTWNGAAAVTGSINYVDANGNQVATGSYTKAPGSSTSDITAPTTTDGYRYKFVSVDKSTYDGSDIKVTVAKIATGNINYVYNGKTVSSTPFTDQDAGKTIANIAAPAGTVDGLRYKLADATKSYAYPDKDGDVNVDLAAIVSGTIEFVDADNNNALVQQQAFTDQTPGAQISPLTLPDGYVLAVGANGDVQSTYNYPTTDAQVVTVKVQKLTSGNRNDGMELTEVPSFSSDKNTIGASDTTTLTATKGGVLSYLNLKGQNADIYMSATDLKSNGSALPIKTLKANLSAGLADVYAANQTDGYGHMIVNDTTSKKGSLTIPDLQMTLSNNNFAAGTYSGTINYTMVSDDLN >NZ_CP022606.1|WP_010375192.1|1903326_1903752_+|hypothetical-protein MKNTRRLQAKVQHMALASIIIAGIVAPIVQLAPSLPGMSLQDVKAATGVVDKVDKGTASENYARDLLGGSYSGTTPAMLAGQTGVVDGSWKITPRDTSAAYAKRTNAKGDFPFNMLQRWLMVKIKFLMVARLAHMTQRQLS >NZ_CP022606.1|WP_010375193.1|1902400_1903171_+|hypothetical-protein MMKQFLMSVAVLGAAVTLAAPAVNADATFAGKTGTTDVTFQGDTTTKPGTTDPKDPDNGATVGGLTLTAVPSFSFKDAGATPKITEASTKVLTANGVSTQPTGDTTGTNNTSSSIYVRDTRGLTADAAGAGYSIYASASQLKAGDQVLPVASLNMTVADGTANSNGGLITGKSAVSVYQANNSVLKGGTAKTAGDATLGTVAGYGNLIAKGDGKTNGDNATGAVSAELNLSSNAVQAQKYTGTMYYTLVDSATSAN >NZ_CP022606.1|WP_010375194.1|1901109_1902168_+|DUF3324-domain-containing-protein MIGRKLWSSLAIVTAALGALGVAKPAAAADYSNNNPEMGVMLSSIEDDTDTNNSTWELNTKPGKVLQGSVSVQNASDAAAKFTVSMEQARTNDQVNIMYLSGGTNKSLDPNMKFSNLAKVDGKDNTTVTVPAKTTVQVPITLTMPAKEFDGYVLGAVVVNKELPKGYKVEGGVTNRFVYVKTVQITESIVNPTAVLTNDKKGLVKVSDGRQIFQLPIQNNVPSYIGNMSLKAKVTYKSTGDTVLTDSQKNRSVAPNSSFTYQIPSERVMKAGKYHYVVTMTNDKTKKSWTFSDDFTVSRASATSVGIGRSIAFVPTWIWQLLALFLVLIGFLFFLLWKRRKDDEDEDETTAK >NZ_CP022606.1|WP_010375196.1|1900733_1900976_+|hypothetical-protein MTIGRIYSDLKAMFELLAWITFIFVLFVLSSRYLYGMDYSIFLPLVVMLYAGVWVGLSVALVLTWIFSAGTAKQATQTTK >NZ_CP022606.1|WP_010375197.1|1899706_1900576_+|NAD(P)-dependent-oxidoreductase MKIGFIGTGVMGRGIINNLLQANYEVVVFNRTKAHAQSVLDNGATWADSPKEIAEAADLVITMVGYPKDVEEQYYGDNGLFAGSHAGQIFVDMTTSTPTLAEQLAVDGEKYDVKVLDAPVSGGDVGAKNGTLTIMAGGDEAAYDSLQPIFDVISKAANRFGVAGRGQHTKMANQIMIAATMLGMSEMMVYAKAADLDVAKVMATLSAGGAQNWSLDNYGPRVLAGDFEPGFYAKHLLKDLRIALDEAAKMNLSLPATDLAEALYTKLVEQKNLGDEGTQALVKLWAQFA >NZ_CP022606.1|WP_010375198.1|1898824_1899601_+|glucose-1-dehydrogenase MAEKVAIVTGGGQGIGEGIALRLAQDGYAVIVNGRTQTKLDNVVNKIVAAGGEATTFAGDVQQKSVNEEMVQLALTKYGRLDVFVANAGIDWVDTIEETPEEQVDNVFNINLKSQVWALQTAPAAMRKNGKQGGSIVLASSIAGMEGFEMLGIYSATKFATRGLVQAAAKELATDNIRVNAYNPGIVLTPMWDQIDARFAERKNVAIGETRQAFIDGILLGRGEEPDDIAKYVSFLVSDQADYITGQSLAVDGGVKFQ >NZ_CP022606.1|WP_010375186.1|1924403_1924718_-|hypothetical-protein MAKKLYWAYVSFVDQPGGKERPVLYVRENQDSYFVYRLTTKFANKSPQIQKNYFEILDWQAAGLPQKSWIDRGRINKLPRATTKLRHIGELTTHDIKRLAAFKS >NZ_CP022606.1|WP_010375185.1|1924717_1924999_-|hypothetical-protein MTHTIKRRVQFSVDEGVAEAVESLLAKAGLTTSTLLPLVYAQILNTGQIPITHELSDEDLAEAKIIADSYEVPTFEVNTDADVQAFFDDDGGY >NZ_CP022606.1|WP_137636368.1|1925706_1926531_+|hypothetical-protein MAWLLKINIARLGLFGFVIDNQKKIRFEGSGLGSFVVFRNAKPTVLNLGILYAGGAVANVLVVMLLPLKAGLGVETFTLMNGVIAAVTLLPLNNLATDGSMLLNLVMNPEETVLHYTVSYFLTNEYTEKFDALLPQVLSTLDGPLGKVQESHIIIYLSYLNYVCALKKGRLENEQKQLVKKVFNTVLSDKRMKSRYLSDYMVGEVMTQKLINGKNSVGDYKELHKLPILLKRRIAYLLDPEDTGKKADYYQEITTTAQGEATLMINGELSYLAL >NZ_CP022606.1|WP_010375182.1|1926604_1926832_+|hypothetical-protein MEKANAIRKTANHDILVLAAVVMPSLIFPRTFRGFVIVALCYLAFCIFIYAVYFVFLKYTKMGLSRVEKYYRLDE >NZ_CP022606.1|WP_010375180.1|1926943_1927948_+|alpha/beta-hydrolase MTTDEFTKRFRPGTTTSGYLDDRAKAEINAAGPSFDHQPTPAEIRAVMGWPAAHHEAVNELTVRAHKIVGVSVTEFVQQRYDDRVLPTVVFIHGGAFVGGSVANVTPILQQMADAGALRVFALDYSLAPEHPFPAGMLDVYRVVVALHQAAKQYGIDETQLSLAGDSAGGNLTYTVALLDQNLQSNYLHKLVAMYPAVYNGHDAEKEMDFSDIQAYGAQADQALIAQYIASFRESPLISDWYLQGVDDEQMAVSPINAPAAMLAELPASLLIIGEFDPLRLEGEAFFERVRDAGGTIAYIRYNGMVHAFVDKIGDYPQAKQAVLDLVDFVLAES >NZ_CP022606.1|WP_010375179.1|1928076_1928562_+|hypothetical-protein MAKRPEAIALENWLFARLNPRGKGRVSAYGATEVTLSTDASANKLGKGRKKAGYQGRVDFISIDTQRTVRAYEIKVSIQDFRTQAMKSWVGHYNYLVTTDELADKYRDEILAALPDGIGWLTPTQTVRRPKRHALQIDETWLVWLMMRRNAMVVRDSRLQD >NZ_CP022606.1|WP_010375178.1|1928629_1929292_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MGRQRNEETIKQIRRAVWQLFLAKGYGKTSFSDVAQTAQLNRSIVQYYFAKKEDFSNMLMAQVSDQVLVIVDQKFPDASRLERYYLASQLYFAVFWHPELRHLLKEILENRKLADESMYNQVIWSVNILTDAVDEAKFEAAYIDVVDAWGGFAEVMYYSLQHDRQVDLARGLKRLVPLIAMIAGYEADVCDQVIATHTLTSEQRDELRDRILQQINQENK >NZ_CP022606.1|WP_010375176.1|1929421_1930762_+|NAD(P)/FAD-dependent-oxidoreductase 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You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
179675 : 226300
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP022606|179675:226300|DBSCAN-SWA TATGCTATTTGAACAAATTGCCAAAAATAAGCGCAAAACGATTTTGCTCTTCTTTGGTTTCTTTCTGTTCATGGGCGTGGTTGGGGCAGCGTTAGGAACCTATATGTTTGGACGCTGGATGCCGGGTGTCGTGATTGCGTTAGTCGCAGGAATTGTGTATGCCGTCTTTATGTTTGGCCAATCAACTGATGTCGTGATGTCGATGAATCACGCGACAGAGGTGACGTCAGCAGATCAGGCGCCTGACTTGTGGCATATCGTGGAAGACATGGCGATGGTCGCACAAGTGCCGATGCCACGTGTCTTCATTATTGACGATCCCAGTCCCAATGCATTTGCAACCGGAAACGATCCGCAACACGCAGCCGTGGCAGCGACAACTGGCATTCTGCAACGCTTGAATCGTGAAGAACTTGAAGGCGTTATGGCCCACGAAATGACGCACGTGCGTAACTATGATATTCGCATTCAAACGATTGCTGTGGCGATGACCTCAGCGATCGCGTTGTTGGCGAATTTAGGCACGCACTTTTGGTACTTTGGTGGTGGTAACCGTGATCGGGATCGCGAAGGTGGTGGTAGTAATATCATCGGTATCGTCGTGTCGCTCTTGGTATTGCTATTAGCGCCAATGGCGGCAACCTTGGTTCAGTTGGCTATCTCACGAAATCGTGAATACCTGGCTGATGCAGGGGCCGTCGAATTGACCCGTAACCCACAAGGCCTGATTAATGCGTTGACGAAAATCTCGCAGAGTGAACCTATGTCAGAACAGAATGTTTCACCAGAGAGCGCAGCCTTATACATCGCGAACCCATTGAAGGGCGATAAGTTAGCAGGTTTATTTGCGACTCACCCACCGATGGATAAGCGAATTGAAGCATTGCGTAATTTGTAATGATATTAAAAATCCCACTCTTGATGCAGTTTGCATTAGGAGTGGGATTTTTTTATGCACGTGGAGTTTGGTTGTTGGTAATTCGTTCAATCTGGTTACCGGTAACTTGTTCGAATTTTTGGATAGTTAACGTGTGTACTTGATTGTACAACATCGTAATTTGTGGAATTGTTGGAATCTCCTGCCAGACAAACCCAGGCCGTGATTGATCAGCGGTCAGGGCAAAATCAGCGATATATAAATCACTTTGCGCCGTATAGTGGTTAGTGACTAAACTATTTGCACCAAAGATATCTGCTAAGAGACGTTTCGTGTACCGGGCTAGTGAGGCACGTGCTGGCAAATCAACGGTCACTGTTAGTAGCGGGAAGATTTGCTCACGCGGTAAGCGGTCGATGAACGTATTCAGATATTCCGTGAACAATGTTTTGTATACCGTTTCGAAGGAGAGCTTAAAACGGGTTGCAATCCGTCGTAATACGTGCAGTGTGTAAGCGGTATGTAGCGGATAAAATTGGTAGGCATTCAAAATGTTTGGGTGACTATCAATTGGGTGTTGATTGAAATGAAGTAAGCGCAGATGCAACGGGTATAAATCTTGGCCAATCGTGGCTAGTACCGTGGTTTCTAAACCCTCTTGTGGTTTGAAAAAACTCAGGTAACTTGATTGTATAATGTCAGTAAACACAGCCAATGTCGCTAATGTTTCTGTCGTCGCGCTATCAGCTGGCGTTGCCTCAGGAATAAATCCCATGGCTACCAAAGTTGTCATCGCGTAACGGATTTCGATGTCTAACGTATCGGCAGATAGACCGGTTTGCTTACACAGTAAATCAGTTAAAGCAGCGGTGTACTGTCGAACTGGACCAGTCAACGTTGCCGTTGGTCGAAACAAGGGATCCGTAACCGCGGCGTGTAATTGATGACCCTGAGCAATCCGAAAATGCCAAATCCCAAATTGATAATAGAAGGCTAGTTTAGCCGATTCGGGTAAGGGTTGTGGCAGAGTAGCTAAAAAGGTTTCAAAGATTGCTTTGAGTGGCGGACGGTCGGCAGCCGGGAAAGGTTCTTCTTGTGCCGCATAGTAGTGGTAGACGATTTGGAACCCAAGTTGACGAACGCCACGTTCGTTGCCAACTAATTTCAAATCATCACTAATACTAATATCGAATTGGGCTAAGTTTTTAGCCAGATAGAGTTTGATTTCGCGTGCCGTGGAAATGCTGGTATTATGTCGTTCAGCAAAATCTTCCAAACTTGTTAGGCGTTCAAAAAACAAATCGTTAAGGAACAAATTCCGCAAAGATTGGTGGAGATAGTGGAGACGTAGTGCATGCTCAGCGGTTTCCAAGGCGGCATTAATTGAAAATACTTTTTTATGCTCGTCATATGCAATCAGCGTTGGTGCGTCAGGTTGTAAGGCCTGTAAATCGCGCACTAAGTCAATGCCGTTACTTTGGACTAAGTAGCGCGACCAGCCCAATTCTTTTACAACTTGTTTAACGGCAACTGTGTCTGTATTCTGTTGTAGCAAATAGGTGTTTAACCAAAGTTTTTCACGTTCTTTTTTCTGTAGCATCCAGTCCATATTGATACCTGCTATATTGTTTTAATCATTAAGTTAATTATCGCAAGTCTCGTTTCTGAATACGAATTGTCTTTTTTTAGTTTTCATGAAATTTTCTAAATGCGGATTCTCACGGGGATTTCATTAAGTGAGTGTTCTGGTTATGCTATAATGTAAGTACATTTGGTCGTCGAAAAGGCCAACTAAAGGAGATTATGATGAAGAAAAAAGCGCCAGTGGTGAAGAACCAAGAATTTGACGCAACGGTCATCGACTTAACGTACGAAGGAAACGGAGTCGTTAAGGTTGATGATTTTCCAATCTTCGTAGCAAACGCTGTTCCGGGTGAAGAAATTCGGGTCGGTATTACGAAGGTTGCAGGAACGTATGCATTTGGTCGCGTTATTAAGACGTTGAAGGAATCTGCTGATCGTAATAAGGAAGTTGATGTTGCGACATTGACAACTGGAATTGCGCCTTTGGCTCACTTGAACTATGACGCCCAATTGCGTTTCAAGCAAAACCAAATCCAAGAATTGTTTAAGAAGCAACACGTTGATGTTGAAGTTTCTGAGACGCTTGGTATGGAAAACCCAACAGGATATCGTAATAAGGCACAAATTCCAACGCGTGAATTGCGTGGTGAATTGACGACAGGTTTCTTCCGTCGTGGTTCACACAACTTGATGCCAATTGAAGATTTCTATATTCAAGACCCTGAAATTGACAAGGCAATTGTGGTTATTCGTGATATCTTGCGTAAGTACCACATTCCTGCTTATAACGAATTTGAACACACTGGTGTTATCCGTAACATCATGGTTCGTCGCGGTTACTACAGCCACGAAATGATGGTTGTTTTGGTCACGCGTTCAAAGAAGGTGCCCGGGGCTGAAATGATTGTCGCGGATATTCGCGAGGCGTTGCCAGAAGTAAAGTCAATCATTCAAAACGTGAACCAAGAGAAGACGAATGTCATCTTGGGTGAAAAGAATAACACGCTTTGGGGTAAGGATGTGATTACCGACACGTTGTTCGGCAAGAAGTTCGTCATCGGACCAAACTCATTCTACCAAGTTAACCCACAAACGACGGAAACGCTGTACCAATTGGCTGCTGATAAGGCCGGCTTGACTGGTGATGAAGAAGTTATTGACGCCTACTCAGGTATCGGAACAATTTCATTGACCATCGCTGATCGTGTTAAGTCTGTCTTGGGTGTCGAAGTTGTACCTGGTGCCGTAGATGATGCCAAGCGTAACGCCGACATTAACGGGGTTAACAATGCTAAGTTTGAACTTGGTAAGGCTGAAGAGAAGATGGTTGAATGGCATGAAGCTGGTATGCGACCAGACGTCATCTTCGTTGATCCGCCACGTAAGGGCTTGACGCCAGAATTGATTGATGCTGCAACTGGTATGGAACCAGAAAAGTTCGTGTACATTAGTTGCAACCCAGCAACTTTGGCACGTGACACGGTTCAAATTTTGGAGAACGGTTACCACATTCAAGGGCCAGTTCAACCAATTGACCAATTCCCACAGACGACACACATTGAATCTGTCACTGTGTTCGTTAAGGACTAATTTTAAAAACTAAAAACTATCGATAACCCAATTAAGCTCATTAGTCATTTCAAATGATTGATGAGCTTTTTTGGCTTTTGATGGTACAATAGCATTATTGAAAGCGCTTTAAAGTGGGATATAGATTAACTAAGGAGTGAATGATGACGTTAAAGTTAGGAATTATTGGCACAAATTGGATTACGAAAATGTTGGTAGAAGCGGCGCATGAATCGCAAGCATACCAATTAACAGCGGTTTACTCACGACGGGCCGAGACTGGTGAGGCGTTTGCCAAAGACTTTGGGGAAGTTACGGTTTATACCGATTTAGCTGCCTTTTATGAGAGTGGCATTGAAGTTGTTTATATTGCATCACCAAATAGCTTGCATTATGAGCAAACCCTGCAGGCGATTGCACATGATCTCCATGTGATTGTTGAAAAGTCAGCCTTTTCAAATACGAAGGAATATGAAGCTGTTTACTCTGCCTTGCGTGAGCACCCCAATGTCCGCTTATTTGAAGCAGCTCGTCACGTGCATCAAGCTAATTTTAAAGCGATTGAAGCGAAAGTGGCGGAGATGGCGCATATTTCCGGGGCAACGTTAGTGTATGAAAAGTATTCGTCACGCTTTGACGATTATTTGGCAGGCAAAGAGCCCAATGTCTTAACCCGCGAGTTCAGTGCCGGTGCATTGACCGATTTAGGGGTTTATCCATTGTATGCAGCGATTAAGCTGTTTGGGATGCCCAAAGAAAGTCACTACTTTGCAACACCACTACGTAATGGGGCAGATGGCCGCGGAATTGCCATTTTGCGCTATGCTGACTTTGATGTGACGATCCAATTTGGTAAGGGAGCCAACAGTTATTTGCATTCGGAAATTTTGGGGATGCGTGACACGATTGTGATTGATTCAATCGCTGAATTGGGCGAAGTCATTTATAAAGATGGTGCTGGTAACGACAC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60 | Lactobacillus_phage(25.0%) | transposase,integrase,protease,portal,terminase | attL 183115:183131|attR 229470:229486 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
967417 : 976059
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP022606|967417:976059|DBSCAN-SWA GTCATTTTACAAATACTCCTTTTTTAATCAACATGGCAACCGTAGCTGGATACAATGTATGCTCCACCGCATGAATTTTAGTTGTTAACTGTGCCAAATCATCTGTTGCAGTAAGTTTGACCGCCTCTTGGGCAATAATTTCGCCCGAATCAACGCCATCATCGACGTAATGGATGGTCACACCGGTCACTTTAACACCAGCCTGCCACGCATCCGCAATCGCAGAATTGCCAGGGAAGCTGGGCAACAGTGCTGGATGAATATTAATAATGCGTTGGTGAAAGGCATTTACCAACTTAGGGGTCAAAATTCGCATATACCCCGCTAATAAGATACCCACCACACCATCCGCTGCTAAGACCGTTAACATGGCGTCTTCTGCCAATTCGCGTGTCGCGTAATCTTTATAGTTAATCCGTAACACCGGAATACCCGCCGTTTCAGCAAGTTGCTGGGCCCCGGTATGACGACGATCAACCACCACACGAACAATTTCGGCTGGCACCTCACCAGTCTGAGTCGCCTGAATAAGCGCGGCCAAATTAGTGCCAGTTCCTGATGCAAACACTGCTAACTTTGGACGGGTTATGACCATGGTTGCTTACCTCGCCAATTGAGTTGTGCTGACATGGCAGGCGTCACCGTGCCGACTTGATACGCGGCTTGACCTTCATCCGCTAGCATGGCCAACACACGCGCAACATGGGGTGGCTTCACAACCAGAATCATCCCCAACCCCAAATTAAACGTTGCCAGCATGTCTGCCAACGACAGCTGACCGAGGCGTTGCAATTCCATAAAAATCGGTAAAATTGGCCAACTGCCCCACTCTAAAGTGACCGAGGCATCCGCGGGTAGGGCACGGGGCAAGTTACCCACGATACCACCACCGGTAATGTGGGCCATGCTCACGACTAACTGTTCTGCTAGTAACGGTAAAACCGCCTGAGCATACAAGGTGGTCGGTGTTAACAGGGTTTCCTGTAGCGTTGTTGGTAACGCTGTAAAATCAGCCTCCTGCTCTAATCCCAACACCGTACGCACCAGTGAATACCCATTGGAATGGATACCACTAGACGCTAACCCAATCAACACATCGCCAGTCGCCACACGATCAACTGTCAGCATCTCATCCCGCTCAACAACACCAACACCAAATGCAGCGAGGTCATAATGGTCTGGCGCATACATGCCTGGCAATTCAGCGGATTCACCACCAATTAAGGCTGCCCCCGTCGCTTGGGTCGCTTGCGCAATCCCGCGAACAATCGTTGCTACCTGTTCGGGCACCATTTTGGCAATTGCTAAATAATCAAGTAAAAATAATGGTTTCGCCCCTTGCGCCACGATGTCATTCATCACCATAGCAACTAAGTCCTGGCCAATTGATTCGTGTCGTCCGGCCATGATGGCCAATAATAGTTTTGTGCCCACACCGTCAGTGCCTGAAATCAAGACCGGCTCTCGGTATTGCGTGCCTAATGCAAACGCTGCACCAAAACCGCCAACCCCAGCAAGAACGCCTGGTGTATAGGTAGCTGCCACATCGGCTTGCATCATGTCAACTGCCGTTTCACCGGCTAGGATATCTACACCAGCCCCCGCGTACGCATTTGCTTCTGTCATTTCTCCCCCTTTTAGCTCACCGTTTGATCGGTAGCTGGTTGTTGATCACTAATTGATGACACTTGACTCGGATGATAAGTTGTCGTTGGTTCGGTCTTAAAATCGACCTCACCCGCGGTTATCGCCGCCGTCAGCGTTTTTTCATAATCGTAAATTGGTGATGGGTAATGTCCATCAAAGTAAGCCGTCGTTAAGCCAGTCCCATTGCCCGTGTATGGCAAGTCAATCGCCTGTACCAAACCAGGGACGGATAGAAAGGCTAACGAATCAGCCCCTAACATGGCCGTCATTTCAGCCAATGTATGGTTCGCCGCTAAAAGTTCCGCCGTTGTTTGCATATCAACGCCATAAAATGACGGATACTTGAAAGCTGGTGACGCAATTCGCACGTGAACTTCCTTCGCACCGGCTTCGCGCAACATTTTGACAATGTAACTTGATGTTGTGCCACGCACGATTGAATCATCCACTAGCACAACGCGTTTACCGGCAACCACCGACGGTACTGCGCTTAGCTTCATACGCACCGCCCGCTCACGTCGCTCCTGTGTTGGCTCAATAAACGTCCGTGCAATATATTGATTTTTAACCAGCCCCATTTCATTAGGTAAGCCCGTTGCCTCGGCATATCCCATGGCAGCCGATAATGAAGAATTAGGCACACCAACCACCAAGTCGCCCGTTGCCGGTTGTTCAAGTGCTAATTGCCGGCCCATCCGTTTACGAGCAGTATGCACGTTAACACCATAAATGTCAGAGTCAGGTCGTGCAAAGTAGATATACTCCATCGCGTCGATATGTAAATCAGTTTTGCTCGTGTAGTGATCAATCCGTAAGCCGGCCTGGTCAATCGTTAATAACTCCCCCGGTTGGACATCCCGAATAAACGTTGCCCCAACCGCATGCAACGCGGCCGTCTCACTAGTCACCACATACTGACCATCAGGTAACTGGCCTACCACAAAGGGACGAAAACCGTGTGGATCAAGAGCTGCATACATTGCTGTTGGCGTCAGGAGCAAAAATGCGAAACCGCCCCGCACTTGCTGCAAAGCATCTTTTAAGCGGTCATAAAACGTCGTCGCCGTTGAACGCCGAATTAAATGCAGTAACACTTCTGTATCTGACGATGATTGAAAAATCGCCCCTTGCATCTCAAGACTTTGCCGCAAAGATTGTGCATTCGTGATGTTTCCGTTGTGCGCTAAGGATAATTGCATATCGGAAAAGTTCACCATCAGCGGTTGGATATTTTCAATGCCTGCTGAACCCGCCGTCGCATATCGAACGTGACCAATCGCTGCTTGTCCCTGCAAATGCGCTAAACGCGCTGGGTCACGAAAAACATCATGTAGCAAACCCAAACCACGTTCTTGCCATAAATGGCCTTGCTGATTGGCGACAATTCCGGCACCTTCTTGGCCCCGGTGCTGTAAAGCGTGTAAGCCATAGTAAGTCAAATTAGCCGCTGTTTGGTGGCCCCAGACCCCAAAAATACCGCATTCCTCATTTAATGACCGAGTTTGTTCAATTAACTGCGTTGCCATGTGATTGCTCCTTCATACGCTTCTTGCAGGCGTGCCTTATCTAAGTTGACAGTCCCATCAGCTGTTGTGACGACCAACCGATCATCATGTGTTACCGTACCCAGTCGCAGATATGTTGTATCCAGTCGTGTTTCAAAGGCGTCCACAGCGTTTGCTGGCACCGTTACCAAAAAGCGGCCTGGCGTCTCACTAAATAACCAGCTATCCGTCCAAGGTACCGTTACATCAAAACCAAATGGTGTGCCAAAGGTACTTTCTGCCAAGGACACCGCCAAACCGCCTTCTGCCAGGTCGTGGGCACTGGCAATCAGTCCCTGCTGAATCCCTGCTAACACACTTTGCTGGGTAGCTGACAATTTATCACGATTTAAACCGGGCAACCGGCCCGCAATGGCCCCGGTCTGTAGTTGTTGCAACTCAGAACCATTAAAGTCAGCCGTGGTATCACCCAGCAAATAGATGACATCATCCGGCTGTTTAAATGAAATCGTTGTGATATCAGCAGTATCAGTGTGTAACCCAACCATGCCAATCATTGGGGTCGGATAGATAGCAGCACCGTCGGTCTCGTTATACAACGACACATTACCGGAAATAATTGGCGTATTAATCTGTCGGGCCATCTCGTTAATGCCGGCGACTGATTGTGCCAATTCGTAATAAATTGCTGGATCATCCGGATTACCGAAGTTCAAGCAATCTGTAATACCAATTGGCAACGCGCCAGTGGCAATAATATTGCCAGCTGCCTCAGCGACTGCGCGTTGCCCACCAATATAAGGATCGAGGTAGGTAAATCGCGCGTTCACATCAGTTGTCATGGCCAATGCCTTTTTGGTGCCACGTAAACGAACAACAGCCGCATCGCCACCCGGCTTAATCACTGTATTAGTTCGGACCATACTATCGAAATGTCTAAACAAACTCGCTTTCGAAGCAACTGTTGGCTGTGCCAATATGTCCTGCCAAACCGTCGTCAAATCAGCCACATGCGGTGTAAAATCTGGTGCTGGGTCTTGCAGACGTGCTGGTTTCACCTGTTCCATGGTTTGTTTAGGGGACTGCGTCAAAAAATTGACGGGTAAATCAGCCACGGTCTCGCCATGCCAGGTTAATTCATAGCGCCCCGTTGCTGTAACTTCACCAATCACAACTGCCTCTAAATTAGCTTCCTGAAAGACGGCCTGTACGGCGGCTTCATGCCCTTTTGTCACAACTAATAACATGCGTTCTTGCGACTCAGATAACATGAGTTCATAAGGCGTCATCCCCGTCTCACGTTGTGGTACATTGTCTAATTGCAAGTGAATGCCCATTCCCGCTTTGCCAGCCATTTCGGCTGACGAGGATACCAAACCAGCTGCTCCCATGTCCTGCACCCCAACAATAGCCTCACCAAATTGCTGAATTGCTTTCAAAGTTGCATCCATCACTAGTTTTTCTAAAAAAGGGTCCCCCACTTGCACAGCTGAACGGTCTTGTTCGGCATCTGATGAAAATTCTGCGGACGCAAAAGTAGCACCATGAATGCCGTCACGACCAGTTTTTGCCCCAACATACAGAACCGTATTACCACTACCATCGGCACGTCCAACCTGCATTCGTTCTTGATCCAGTACGCCAACGGCCATCACGTTGACAAGCGGATTACCTTGATAAACCGGGTCAAAACCAATTTCGCCACCAACCGTCGGAATGCCAATCGCATTGCCATAGCCGGCAATTCCGTCAATCACCCCGTTTAACAGATGTTGGGTCCGTGCATCTGTTAACTCGCCGAAACGTAAACTATCAAGCACCGCGATTGGTTGCGCGCCCATCGAAAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP022606|967417:976059|969053_970589_-|WP_010372626.1|DBSCAN-SWA MATQLIEQTRSLNEECGIFGVWGHQTAANLTYYGLHALQHRGQEGAGIVANQQGHLWQERGLGLLHDVFRDPARLAHLQGQAAIGHVRYATAGSAGIENIQPLMVNFSDMQLSLAHNGNITNAQSLRQSLEMQGAIFQSSSDTEVLLHLIRRSTATTFYDRLKDALQQVRGGFAFLLLTPTAMYAALDPHGFRPFVVGQLPDGQYVVTSETAALHAVGATFIRDVQPGELLTIDQAGLRIDHYTSKTDLHIDAMEYIYFARPDSDIYGVNVHTARKRMGRQLALEQPATGDLVVGVPNSSLSAAMGYAEATGLPNEMGLVKNQYIARTFIEPTQERRERAVRMKLSAVPSVVAGKRVVLVDDSIVRGTTSSYIVKMLREAGAKEVHVRIASPAFKYPSFYGVDMQTTAELLAANHTLAEMTAMLGADSLAFLSVPGLVQAIDLPYTGNGTGLTTAYFDGHYPSPIYDYEKTLTAAITAGEVDFKTEPTTTYHPSQVSSISDQQPATDQTVS >NZ_CP022606|967417:976059|970573_972796_-|WP_010372622.1|DBSCAN-SWA MTALLATTHEPTPAEIAATKPYQAWGLTDEEYMLIKQTLGRLPNYTETGLFAAMWSEHVSYKKSKPVLRTFWSTNERVLQGPGEGAGILDIGDGQAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGILRDIFSMGAQPIAVLDSLRFGELTDARTQHLLNGVIDGIAGYGNAIGIPTVGGEIGFDPVYQGNPLVNVMAVGVLDQERMQVGRADGSGNTVLYVGAKTGRDGIHGATFASAEFSSDAEQDRSAVQVGDPFLEKLVMDATLKAIQQFGEAIVGVQDMGAAGLVSSSAEMAGKAGMGIHLQLDNVPQRETGMTPYELMLSESQERMLLVVTKGHEAAVQAVFQEANLEAVVIGEVTATGRYELTWHGETVADLPVNFLTQSPKQTMEQVKPARLQDPAPDFTPHVADLTTVWQDILAQPTVASKASLFRHFDSMVRTNTVIKPGGDAAVVRLRGTKKALAMTTDVNARFTYLDPYIGGQRAVAEAAGNIIATGALPIGITDCLNFGNPDDPAIYYELAQSVAGINEMARQINTPIISGNVSLYNETDGAAIYPTPMIGMVGLHTDTADITTISFKQPDDVIYLLGDTTADFNGSELQQLQTGAIAGRLPGLNRDKLSATQQSVLAGIQQGLIASAHDLAEGGLAVSLAESTFGTPFGFDVTVPWTDSWLFSETPGRFLVTVPANAVDAFETRLDTTYLRLGTVTHDDRLVVTTADGTVNLDKARLQEAYEGAITWQRS >NZ_CP022606|967417:976059|968001_969042_-|WP_010372628.1|DBSCAN-SWA MTEANAYAGAGVDILAGETAVDMMQADVAATYTPGVLAGVGGFGAAFALGTQYREPVLISGTDGVGTKLLLAIMAGRHESIGQDLVAMVMNDIVAQGAKPLFLLDYLAIAKMVPEQVATIVRGIAQATQATGAALIGGESAELPGMYAPDHYDLAAFGVGVVERDEMLTVDRVATGDVLIGLASSGIHSNGYSLVRTVLGLEQEADFTALPTTLQETLLTPTTLYAQAVLPLLAEQLVVSMAHITGGGIVGNLPRALPADASVTLEWGSWPILPIFMELQRLGQLSLADMLATFNLGLGMILVVKPPHVARVLAMLADEGQAAYQVGTVTPAMSAQLNWRGKQPWS >NZ_CP022606|967417:976059|973477_973735_-|WP_010372616.1|DBSCAN-SWA MYIAQITVTYKPSILDPQGEVIKDALARLDYQGVTSVTQGKYFEIKLTATDEQSAYEEATSLTEALLINPNTETYRITMLAEVEA >NZ_CP022606|967417:976059|972792_973476_-|WP_010372619.1|DBSCAN-SWA MKAAVIQFPGSNCDFDMYYALQDFGADVQFVTEKSTDLSAYDAVFLPGGFSYGDYLRTGAVARFAPVMTAVQKMAATGKLVVGVCNGFQILTEAGMLPGQLMMNQTPGFICDEVKLTITNRQTAFTNQYIDATTTIKLPIAHGEGRYVADDATVRMLHENGQVVLTYATDVNGSVDQIAGITNRSGNVIGLMPHPERAVETLLGNTDGRPFFESLLATIITKETVEA >NZ_CP022606|967417:976059|973737_974478_-|WP_038229105.1|DBSCAN-SWA MGDKVMTIVKGALLTTGKAKAVYATDDPNVLWLHSLNQATALNGKQKAEISDKGRLTTQISQQLFRFLKSQGIVTHFQQAVGERDVLVTALDMLPIEVVIRNYAAGHFATRYSVPMLTPLSPTVQEYYFKNDALDDPPLNQSQIFALDLATPSQLTQIEAVAQTVNRQLGQLFEAVGITLIDFKLEFGLDATGALTLGDELSPDNMRLIDQATGQSLDKDVFRQGTGDLRDGYTTVLHRLTTYLGE >NZ_CP022606|967417:976059|975570_976059_-|WP_010372607.1|DBSCAN-SWA MVRVAVVMGSISDWSTMKETVAVLQTFDVAVETHIISAHRMPEEMTTFARNARDNGLGVIIAGAGGAAHLPGMLAAQTTLPVIGVPIQSHALQGMDSLLSIVQMPAGVPVATVAIGTAGAKNASYLAMQMLGIAEQELADKIALFREGQRQQSIESEALLHD >NZ_CP022606|967417:976059|974459_975578_-|WP_010372610.1|DBSCAN-SWA MTKRILPPATIGIVGGGQLGQMLALAAKPMGYQVIVLDPQVDAPAALVADQQIVASYDDVSALRNLANQADVVTYEFENVDQTALQTAVPAEKLPQGVALLNITANRLREKQFLAALGLPVAPFAAVDNLVTLDARCHEVSLPAILKTATGGYDGHGQWDIPNTDALANLLAHWQQPTDIALVLEKKLAFDRELSVMVTRDGRGEIRTWPVTVNEHQHHILRVSAAPATLSPQIAKQIETIATTIANALQLVGILGIELFVVGERVYINELAPRPHNSAHLTIEATNVSQFEGHIRSITGLPIPVITQYAPAIMLNLLGDQIIQARQDIATHEGWHFHDYGKHDVKPGRKMGHITATGMAAMKDLREWGTRL >NZ_CP022606|967417:976059|967417_968011_-|WP_010372630.1|DBSCAN-SWA MVITRPKLAVFASGTGTNLAALIQATQTGEVPAEIVRVVVDRRHTGAQQLAETAGIPVLRINYKDYATRELAEDAMLTVLAADGVVGILLAGYMRILTPKLVNAFHQRIINIHPALLPSFPGNSAIADAWQAGVKVTGVTIHYVDDGVDSGEIIAQEAVKLTATDDLAQLTTKIHAVEHTLYPATVAMLIKKGVFVK |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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