CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP020564	Lactiplantibacillus plantarum strain GB-LP1 chromosome, complete genome	2 crisprs	csa3,DinG,cas3,DEDDh	0	1	7	0

1. NZ_CP020564

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP020564_1

• CRISPR_ID: NZ_CP020564_1
• CRISPR_location: 485226-485320
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP020564_1

Consensus_repeat	Method
CAAATGAACCACGATGACCACGT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP020564_1

>1.1|485249|49|NZ_CP020564|CRISPRCasFinder
ATGAACCAACAGCAAAGCAATAACAAACGTTGCTATACCGGCGTTTGAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020564_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP020564_1

>merge|NZ_CP020564|1|485226-485320|CRISPRCasFinder
CAAATGAACCACGATGACCACGTATGAACCAACAGCAAAGCAATAACAAACGTTGCTATACCGGCGTTTGAACCAATGAACCACGATGACCACGT

>NZ_CP020564|1|1|485226-485320|CRISPRCasFinder
CAAATGAACCACGATGACCACGT	ATGAACCAACAGCAAAGCAATAACAAACGTTGCTATACCGGCGTTTGAA
CCAATGAACCACGATGACCACGT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP020564.1|WP_027822220.1|485761_486175_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP020564.1|WP_027821474.1|492634_493456_-|nicotinamide-mononucleotide-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|377432
NZ_CP020564.1|WP_027822221.1|485385_485760_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP020564.1|WP_050340432.1|478806_479970_-|site-specific-integrase	unknown	unknown	gnl|CDD|271189
NZ_CP020564.1|WP_027822223.1|482890_483673_+|bifunctional-DNA-primase/polymerase	unknown	unknown	gnl|CDD|240129
NZ_CP020564.1|WP_011102137.1|482656_482878_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP020564.1|WP_027822218.1|487908_488163_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP020564.1|WP_003642090.1|468006_469506_+|lysine--tRNA-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|234778
NZ_CP020564.1|WP_003640891.1|489964_490300_+|cupin-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|380358
NZ_CP020564.1|WP_027822219.1|487238_487565_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP020564.1|WP_027822222.1|483684_485100_+|virulence-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|283041
NZ_CP020564.1|WP_015825157.1|488771_489230_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP020564.1|WP_015825159.1|491335_492442_-|anion-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|238537
NZ_CP020564.1|WP_027822224.1|480830_481520_+|Rha-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|226172
NZ_CP020564.1|WP_003643855.1|476054_477527_+|peptide-MFS-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|225646
NZ_CP020564.1|WP_011101053.1|490334_491177_+|metallophosphoesterase	unknown	unknown	gnl|CDD|277316
NZ_CP020564.1|WP_050480152.1|480005_480470_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|238045
NZ_CP020564.1|WP_016511679.1|482241_482664_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP020564.1|WP_003640888.1|477581_478424_+|metallophosphoesterase	unknown	unknown	gnl|CDD|163441
NZ_CP020564.1|WP_015825158.1|489409_489934_+|cupin-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|380388

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP020564.1|WP_027821474.1|492634_493456_-|nicotinamide-mononucleotide-transporter	gnl|CDD|377432	pfam04973, NMN_transporter, Nicotinamide mononucleotide transporter. Members of this family are integral membrane proteins that are involved in transport of nicotinamide mononucleotide.	3.62002e-26
NZ_CP020564.1|WP_003640888.1|477581_478424_+|metallophosphoesterase	gnl|CDD|163441	TIGR03729, acc_ester, putative phosphoesterase. Members of this protein family belong to the larger family pfam00149 (calcineurin-like phosphoesterase), a family largely defined by small motifs of metal-chelating residues. The subfamily in this model shows a good but imperfect co-occurrence in species with domain TIGR03715 that defines a novel class of signal peptide typical of the accessory secretory system.	6.8508e-124
NZ_CP020564.1|WP_027822223.1|482890_483673_+|bifunctional-DNA-primase/polymerase	gnl|CDD|240129	cd04859, Prim_Pol, Prim_Pol: Primase-polymerase (primpol) domain of the type found in bifunctional replicases from archaeal plasmids, including ORF904 protein of the crenarchaeal plasmid pRN1 from Sulfolobus islandicus (pRN1 primpol). These primpol domains belong to the archaeal/eukaryal primase (AEP) superfamily. This group includes archaeal plasmids and bacteriophage AEPs. The ORF904 protein is a multifunctional protein having ATPase, primase and DNA polymerase activity, and may play a role in the replication of the archaeal plasmid. The pRN1 primpol domain exhibits DNA polymerase and primase activities; a cluster of active site residues (three acidic residues, and a histidine) is required for both these activities. For pRN1 primpol, the primase activity prefers dNTPs to rNTPs; incorporation of dNTPs requires rNTP as cofactor. The pRN1 primpol contains an unusual zinc-binding stem, which is not conserved in other members of this group.	2.03481e-40
NZ_CP020564.1|WP_003642090.1|468006_469506_+|lysine--tRNA-ligase	gnl|CDD|234778	PRK00484, lysS, lysyl-tRNA synthetase; Reviewed.	0
NZ_CP020564.1|WP_015825159.1|491335_492442_-|anion-permease	gnl|CDD|238537	cd01117, YbiR_permease, Putative anion permease YbiR. Based on sequence similarity, YbiR proteins are predicted to function as anion translocating permeases in eubacteria, archaea and plants. They belong to ArsB/NhaD superfamily of permeases that have been shown to translocate sodium, sulfate, arsenite and organic anions. A typical ArsB/NhaD permease is composed of 8-13 transmembrane domains.	6.60237e-47
NZ_CP020564.1|WP_050340432.1|478806_479970_-|site-specific-integrase	gnl|CDD|271189	cd01189, INT_ICEBs1_C_like, C-terminal catalytic domain of integrases from bacterial phages and conjugate transposons. This family of tyrosine based site-specific integrases is has origins in bacterial phages and conjugate transposons. One member is the integrase from Bacillus subtilis conjugative transposon ICEBs1. ICEBs1 can be excised and transfered to various recipients in response to DNA damage or high concentrations of potential mating partners. The family belongs to the superfamily of DNA breaking-rejoining enzymes, which share the same fold in their catalytic domain and the overall reaction mechanism. The catalytic domain contains six conserved active site residues. Their overall reaction mechanism involves cleavage of a single strand of a DNA duplex by nucleophilic attack of a conserved tyrosine to give a 3' phosphotyrosyl protein-DNA adduct. In the second rejoining step, a terminal 5' hydroxyl attacks the covalent adduct to release the enzyme and generate duplex DNA.	1.05043e-43
NZ_CP020564.1|WP_015825158.1|489409_489934_+|cupin-domain-containing-protein	gnl|CDD|380388	cd06983, cupin_dsy2733, Desulfitobacterium hafniense dsy2733 and related proteins, cupin domain. This family includes bacterial proteins homologous to dsy2733, a Desulfitobacterium hafniense protein of unknown function. Proteins in this family belong to the cupin superfamily with a conserved "jelly roll-like" beta-barrel fold capable of homodimerization.	1.6051e-10
NZ_CP020564.1|WP_027822224.1|480830_481520_+|Rha-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|226172	COG3646, COG3646, Uncharacterized phage-encoded protein [Function unknown].	9.17588e-15
NZ_CP020564.1|WP_003643855.1|476054_477527_+|peptide-MFS-transporter	gnl|CDD|225646	COG3104, PTR2, Dipeptide/tripeptide permease [Amino acid transport and metabolism].	2.29819e-154
NZ_CP020564.1|WP_011101053.1|490334_491177_+|metallophosphoesterase	gnl|CDD|277316	cd00144, MPP_PPP_family, phosphoprotein phosphatases of the metallophosphatase superfamily, metallophosphatase domain. The PPP (phosphoprotein phosphatase) family is one of two known protein phosphatase families specific for serine and threonine. This family includes: PP1, PP2A, PP2B (calcineurin), PP4, PP5, PP6, PP7, Bsu1, RdgC, PrpE, PrpA/PrpB, and ApA4 hydrolase. The PPP catalytic domain is defined by three conserved motifs (-GDXHG-, -GDXVDRG- and -GNHE-). The PPP enzyme family is ancient with members found in all eukaryotes, and in most bacterial and archeal genomes. Dephosphorylation of phosphoserines and phosphothreonines on target proteins plays a central role in the regulation of many cellular processes. PPPs belong to the metallophosphatase (MPP) superfamily. MPPs are functionally diverse, but all share a conserved domain with an active site consisting of two metal ions (usually manganese, iron, or zinc) coordinated with octahedral geometry by a cage of histidine, aspartate, and asparagine residues. The MPP superfamily includes: Mre11/SbcD-like exonucleases, Dbr1-like RNA lariat debranching enzymes, YfcE-like phosphodiesterases, purple acid phosphatases (PAPs), YbbF-like UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolases, and acid sphingomyelinases (ASMases). The conserved domain is a double beta-sheet sandwich with a di-metal active site made up of residues located at the C-terminal side of the sheets. This domain is thought to allow for productive metal coordination.	6.95911e-12
NZ_CP020564.1|WP_050480152.1|480005_480470_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator	gnl|CDD|238045	cd00093, HTH_XRE, Helix-turn-helix XRE-family like proteins. Prokaryotic DNA binding proteins belonging to the xenobiotic response element family of transcriptional regulators.	1.43987e-13
NZ_CP020564.1|WP_027822222.1|483684_485100_+|virulence-protein	gnl|CDD|283041	pfam05272, VirE, Virulence-associated protein E. This family contains several bacterial virulence-associated protein E like proteins. These proteins contain a P-loop motif.	9.92254e-71
NZ_CP020564.1|WP_003640891.1|489964_490300_+|cupin-domain-containing-protein	gnl|CDD|380358	cd02230, cupin_HP0902-like, Helicobacter pylori HP0902 and related proteins, cupin domain. This family includes prokaryotic and archaeal proteins homologous to HP0902, a functionally uncharacterized protein from Helicobacter pylori and Spy1581, a protein of unknown function from Streptococcus pyogenes. These proteins demonstrate all-beta cupin folds that cannot bind metal ions due to the absence of a metal-binding histidine that is conserved in many metallo-cupins. HP0902 is able to bind bacterial endotoxin lipopolysaccharides (LPS) through its surface-exposed loops, where metal-binding sites are usually found in other metallo-cupins, and thus may have a putative role in H. pylori pathogenicity.	5.27051e-30

Protein sequences

>NZ_CP020564.1|WP_027822222.1|483684_485100_+|virulence-protein
MSEDKNLKQAIQEHDKRINNVTALKGDDWQDQLRLTTQGAIRRSSLYNILLFIENDPNLKGVLAYNEFSDRVVKLRSNDKTGLKKGDWRDTDDSLLRFYFDAQYNILLSKDNLLDSIVKASQEHGFDPMKERIETVKWDGQPRAETFFIDYLGAEDNHYTRMVTRKWLAGAIARVYLPGVKFDIIPILEGVQGLGKSTLVRQLAPDYFSDDMKSMKDKDDYQKLMGSWIIELAELSAMNKTDIESIKNFTSAQSDYYRNTYARRPEQHPRRNVFIGSTNHRDYLKDATGERRFYPIKCGVQPVTKNPLKAKQTDMLQILAEAKTWFDAGEQLYFDQQTLNEAKAYQQEAQVIDPMREAVNDYLTMMVPTNWEELTVSVKQSYFTAIENGNPIDSDSESWLHAKLAPTKEPIQRTTTREIMAVVFDHATNKYFSGRTNAEAKKIKLIMDNMEGWKYKRVHIGERYLRMYVRC
>NZ_CP020564.1|WP_027822223.1|482890_483673_+|bifunctional-DNA-primase/polymerase
MKANDRLMRALQLACDGVAVLPLSKYNSKVPLKGTQGYKDATTDVETIKGWFEHVPRANLGIRLDQAKLIVVDIDRHGDVDGTETLRKLNQQGKPLPSDTYIEQTPNDGLHYFFKLPVKLDMKRRTGLYPGIDVLADFVLVAPSVINGSAYRAIEPTNDIATVPQWLLDDLLPNQRMNKAPQHASQIQKTWAGRMLDDLVAGTGEGSRNSYLTSLLGKLLRTGCNGMTAYELLQYANERLQPPLPDKEVNTIFKSIIKRT
>NZ_CP020564.1|WP_011102137.1|482656_482878_+|hypothetical-protein
MNNAQTRLNHARTTLQGTLLQLDYLQELVNETAMQDSQRAKISQQIHNIEVNNQGALKQLASVYEVPLVGIAK
>NZ_CP020564.1|WP_016511679.1|482241_482664_+|hypothetical-protein
MGNPIYELSKLNDISAACKHAGILLERVNKANSSILAISDLVEPTLKHLISNAPDYFELDADRLRKTLENRETTIYSVMCVLTEMGTLAMNIDEETSGLSGVIDDINSTVNGINDGINSILDGGNSDYSDDNSQGAADHE
>NZ_CP020564.1|WP_027822224.1|480830_481520_+|Rha-family-transcriptional-regulator
MNDLVTLTSQRLDAEIYTTAEIISQYAEIGLRTVNNRINQYKDDLMEFGMLRFSTINVQNSSGGRPQKYYQLNEDQAMLLITYLGNTKPVRQFKKALIKQFSAMKRELILRQAKFELGKEFSKSLHEAIRESPALGEHGHLYVNINKLVYKQALGVNVNELRKARNIPKTEAITHYLSSSEADAVKRVKQQIRTLLEMKMDYQQVKQALQIQGVIYRIELQLPAKASVK
>NZ_CP020564.1|WP_050480152.1|480005_480470_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator
MSKDNDFVASLFKGQSDKIKQARKNANLTQTELADLYNQFLAEHNTKVKPVSYATISRWETGETSPKFETLRVLSAVLNVDEAYLIGVQKEPKSSRTTSIELIEGSANLKDLKYALTDVVADLYDTISLQSDEIEFLQHQIDSINHPEMDEDFD
>NZ_CP020564.1|WP_050340432.1|478806_479970_-|site-specific-integrase
MKGIINMATFKQYKTKSGAFWEAFTSVGKDTNGKAKRMHKRGFKTKKEAQLWTSNVQTDFTRKGYVSSNDITFNELYEKWFSEDYQSQVKESTWAKTADIFRLHILPALGSQRVKRITVAQCQSIVHSWLNQGLKQYRRFRTYVISVFDFGVRMELTTRNPMAKTSIPKQKKHQQAPHIDFYEKSELVHFLDCAYDYDNPQAFMLFRLLAFTGLRRGEALALQWRDINFETNEITVNKTQSLGKNWRIVTQTPKTNSSYRTITIDPKTLQWLHKWRMTQARQYFELGFNSKNPKQLIFASNDNQPLSPSMPDHWNRSICKRYDLRRIKIHAFRHTFCTLSFEAGATINEVSKTLGHADLKITQQIYLHVTKKQRNEAASKLARYMDI
>NZ_CP020564.1|WP_003640888.1|477581_478424_+|metallophosphoesterase
MEGLTIVRIAFSSDNHFDVNRVDATAMMRSQATYLLQNGVQIYLIAGDLFNDFQRSQQFVVDLQALLGAQTRVYWIAGNHDMVHGISFDELETGHFDGYLHNRYIDISGTDWRVIGHNGWYDYQYAAQVPDTTAADFLHWKNAFWIDRAIKQPMSDQERTDLMLNQVKAQLNLAAVDHKQVIFMTHFVPRIDYLRFSDDNRFWNMANALMGTPRLGQLLEQFNVAHVLFGHLHVHPQPRVFGQTTYYDQAVGYGLKRINEWQANNFMAEWYQDTQILDLK
>NZ_CP020564.1|WP_003643855.1|476054_477527_+|peptide-MFS-transporter
MDKEQKLDRSFFGQPRGLRTLFFTEMWERFSYYGMRALLIYYMYYSVAKGGLGFDQVTAASIMSIYSALVYVSSVLGGFLSDRVWGSRKTVFIGGVFIMLGHIVLSTPFGVGALFVSIALIVIGTGLLKPNVSDMVGQLYTVEDTRRDAGFSIFVFGINLGSLVAPALVGRIGLNVNFHLGFSLAAIGMFFGLLQYYFDGKKNLSSASLYPTDPLEPGDLKKIMRWTILGIVGIGLILLLMQLMNALTLANVISLISTLVILTPIVYFILMLTSDKTNATERSRVRAYIPLFIAAALFWAIEEQGSSVLALFAANRVNLDLGFTHLAASDFQMLNPLFIMIYTTPFVWLWTKWGKKQPSSPTKFAIGLLFAGASYLVMAVPGALFGTAGKVSPWWLVASWAVVEIAEMLISPIGLSVTTKLAPKAFASQMMSMWFLTDSVGSALNAQIVRFYSTQTEVPYFAITGIVSVVLGIILFMMVPMIKRSMQGIR
>NZ_CP020564.1|WP_003642090.1|468006_469506_+|lysine--tRNA-ligase
MARQEQTMNDQLKVRREKMDELREEGIDPFGHRFERTDLAQDLQDKYGDMDKDELDAKQVVATIAGRMLAKRGKGKVGFADIWDRSGKMQLYIRKDVVGEDTYHIFKRSDIGDFLGITGQVFKTDFGELTIKVTGLTFLSKALRPLPDKFHGLQNVEQIYRQRYLDLISNRDSFDRFLKRTKIISAIRHHLDDQGFTEVETPMLHNQAGGAAARPFVTHHNALNIDLYLRIALELHLKRLIVGGMEKVYEIGRVFRNEGMDREHNPEFTMMETYVAYFDFHDVMAETEGIFKAAAQAVTDDGIVTYHDQKVDFNQPFKQIHMVDAIKEKTGIDFWQPMSIEDAQKLADEHHVKYEPYWKVGHIINAFFEEFVEDTLNEPTFVYGHPVEISPLAKKNEEDPRFTDRFELFILGNEYANAFSELNDPIDQRQRFEAQAAERTAGNDEAEHIDEDFVEALEYGMPPTGGLGIGIDRLVMLMTDADSIRDVLLFPTMRPEEDK
>NZ_CP020564.1|WP_027822221.1|485385_485760_+|hypothetical-protein
MTLSMTEFKVLNMLPRGAGYPMTTPNICKVTGLKERDVREAISILINQHGVPIVANRSGHNTGMFIATDEAELNIGVTSFKNQVTTMNARIRAIEQADLNGWEKALRPDIKRLETQVSHDKEAN
>NZ_CP020564.1|WP_027822220.1|485761_486175_+|hypothetical-protein
MRVLYPKLVEEAYNYIAKAEPAVKNPPNAVKSEIYSKMVKDGIIDENGEPTQTAIDRGFIDGDSELEHEPDTLAEFKAMHPCYKEYDDNHFSHTEQGWVIDSYVMKSLSLKALHDPGSSEEQRAFARHALEEIERFS
>NZ_CP020564.1|WP_027822219.1|487238_487565_+|hypothetical-protein
MEQWYRNARQYLKQYRFYHGIVEQAVNDWEGAEKPRRLQQMELYCQRVTNAIDSIRDERQANLLRNEFIVADGSQRVAYELSGLSKSQYYVIRKQAMREWLQLINQHK
>NZ_CP020564.1|WP_027822218.1|487908_488163_-|hypothetical-protein
MTTKSIHVKFPSYEDAGVLLFKHTLSTGEVITGKAQFEFDFLNPLHPQIIILNSPFTQLNGTTIELGEIGGQYTLPNGDVLIAR
>NZ_CP020564.1|WP_015825157.1|488771_489230_+|hypothetical-protein
MTAIIIIMSRSYKSTPIFKAHMGYGKKRANHAVRNRMNRGEFDDLPANSHAWYKRCYEQYDVVDYCSRETYSQVQLELETMRLEITRNGGIIRRIPQHLVVTYTFDPVISDIVHMQRTEELIPAQDVQMFVGTFEQWCRERRNCWAKAYYRK
>NZ_CP020564.1|WP_015825158.1|489409_489934_+|cupin-domain-containing-protein
MAHIWMQRHLPARDDVVIKYMTSSQLFRIIRCLFNRTSKIEFVSVKLNLRNHTIMNNVSDHDDDQGGFEMAVTKIDLKTTMTYREHAITSKSFARKLGIELPFAMYAMAAGESISAEQSTLTRLFEVVDGTLTVRLATETDQEVHAGEMLVVPAHTVHTLVAEQPCQFIQLETK
>NZ_CP020564.1|WP_003640891.1|489964_490300_+|cupin-domain-containing-protein
MSLINKIDHAKVLNLTEQIPLDDDQVNSRTLVQRDDLSMTLFSVATDQEIGGHSAQGDAMVNILSGEAEITIEGTIYHLTAGQSIVIPKDARHALYAVQGFQMLLVVVKPD
>NZ_CP020564.1|WP_011101053.1|490334_491177_+|metallophosphoesterase
MPLYTFIGDIHSAADDLAVLLADPEVAATRLIFLGDYIDGTAARYFGHATESAPLAPLKVLTMVRKRVREYGDVALLGNHDEFWLRTAHGDDNATATWVLNGGHRTWRKLGIYSSNPNHVRRALNGALLKPDTDFLAHLPLMWQHGRLLAMHAGVNWQYPLTQQTTTDLLWIRDDYYDDFTTGSHRWHRNLFNKVIITGHTPVQTLTGSHTGYLKMQADAQDVPRYLIDAGSRSGLFDGGICALTLTVDGEFVRAKRVIKGHRYDGQQIVTPAMLVDQAH
>NZ_CP020564.1|WP_015825159.1|491335_492442_-|anion-permease
MVTVVRRTLHDKIFIIALICAGLSLFIGTPQLTAINWATIGTLFALMISVQLLRAMHLLDTLRDWLLVKSHDTRQMCQLFILLAFGGSMILTNDVAILTLIPIFLTLARRQHLAIAYPATLIIMAANLGSAFTPIGNPQNLFLVTFYHVNLFTFFKLSTPLMLASLALLVALSWRLPRLPLTVTPTKSTPISRSQIGLAGGLLSFIMLGIFNLVPISLVIIGTIVVGLMINRRVFQYVDYALLLTFICFFIFVSAISHNPAITHWLNQLTQTAPSVYITGLITSQVISNVPAAILLANFTPHLSALFLGVNIGGLGSLVASLANLLALKQLLPFNDEQPLHHFLIVFTALNGLGLFILGLGGWFYLHL
>NZ_CP020564.1|WP_027821474.1|492634_493456_-|nicotinamide-mononucleotide-transporter
MNQNNHFRLTLSTLLQQCQQDITSLPTAMRAVFSWQRGLNELKTLRRTTKLMMSTMLIVTIIGFILGRDYSLHGWIGLLTGITVVINLILVDQGRLTNYSWGIIACAAWLTTAITNRLIGDIASQSFYLIMQFVGITVWHRKMAAQPDASELTGRKLSKLAGCSWFALAILVYAIVLHFSKQLNGNQIYLDATLLPLGIVGSVLMVNGYRSQWVAWITLDVINVIIWFNQLKGFSPAAASMLALQLVMLANALYGAYLWFFGQNTQQDKLDTH

Crispr_ID: NZ_CP020564_2

• CRISPR_ID: NZ_CP020564_2
• CRISPR_location: 2669898-2670028
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 2 spacers

Consensus repeat of NZ_CP020564_2

Consensus_repeat	Method
CAACCGAGCCCGGCACCTCAACC	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP020564_2

>2.1|2669921|31|NZ_CP020564|CRISPRCasFinder
TGAACCAACGCTGCAACCGAGTCCTACACCT
>2.2|2669975|31|NZ_CP020564|CRISPRCasFinder
AAACCCAGCGCCACAACCAAACCCGGCGCCG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020564_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP020564_2

>merge|NZ_CP020564|2|2669898-2670028|CRISPRCasFinder
CAGCCGACACCAGCACCTCAGCCTGAACCAACGCTGCAACCGAGTCCTACACCTCAACCGAGCCCGGCACCTCAACCAAACCCAGCGCCACAACCAAACCCGGCGCCGCAACCGAGCCCGGCACCTCAACC

>NZ_CP020564|2|2|2669898-2670028|CRISPRCasFinder
CAGCCGACACCAGCACCTCAGCC	TGAACCAACGCTGCAACCGAGTCCTACACCT
CAACCGAGCCCGGCACCTCAACC	AAACCCAGCGCCACAACCAAACCCGGCGCCG
CAACCGAGCCCGGCACCTCAACC

Neighbor Proteins Overview

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rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP020564.1|WP_003643414.1|2671118_2671844_-|GntR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|225099	COG2188, PhnF, Transcriptional regulators [Transcription].	1.07931e-39
NZ_CP020564.1|WP_027822626.1|2664789_2666271_+|FAD-dependent-oxidoreductase	gnl|CDD|180854	PRK07121, PRK07121, FAD-binding protein.	3.26427e-64
NZ_CP020564.1|WP_003645357.1|2671923_2673357_-|6-phospho-beta-glucosidase	gnl|CDD|181973	PRK09589, celA, 6-phospho-beta-glucosidase; Reviewed.	0
NZ_CP020564.1|WP_003642361.1|2654027_2654600_-|WxL-domain-containing-protein	gnl|CDD|372694	pfam13731, WxL, WxL domain surface cell wall-binding. The WxL motif appears in two or three copies in these bacterial proteins and confers a cell surface localization function. It seems likely that this region is the cell wall-binding domain of gram-positive bacteria, and may interact with the peptidoglycan.	1.07332e-14
NZ_CP020564.1|WP_015380945.1|2644964_2645345_+|MerR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|133384	cd01109, HTH_YyaN, Helix-Turn-Helix DNA binding domain of the MerR-like transcription regulators YyaN and YraB. Putative helix-turn-helix (HTH) MerR-like transcription regulators of Bacillus subtilis, YyaN and YraB, and related proteins; N-terminal domain. Based on sequence similarity, these proteins are predicted to function as transcription regulators that mediate responses to stress in eubacteria. They belong to the MerR superfamily of transcription regulators that promote transcription of various stress regulons by reconfiguring the operator sequence located between the -35 and -10 promoter elements. A typical MerR regulator is comprised of distinct domains that harbor the regulatory (effector-binding) site and the active (DNA-binding) site. Their N-terminal domains are homologous and contain a DNA-binding winged HTH motif, while the C-terminal domains are often dissimilar and bind specific coactivator molecules such as metal ions, drugs, and organic substrates.	3.0203e-18
NZ_CP020564.1|WP_003645360.1|2663710_2664619_-|LysR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|223656	COG0583, LysR, Transcriptional regulator [Transcription].	1.32002e-30
NZ_CP020564.1|WP_054519304.1|2654652_2656905_-|BspA-family-leucine-rich-repeat-surface-protein	gnl|CDD|308794	pfam03382, DUF285, Mycoplasma protein of unknown function, DUF285. This region appears distantly related to leucine rich repeats.	1.99544e-23
NZ_CP020564.1|WP_016511881.1|2658507_2660295_+|elongation-factor-4	gnl|CDD|235462	PRK05433, PRK05433, GTP-binding protein LepA; Provisional.	0
NZ_CP020564.1|WP_003645353.1|2676019_2676406_-|carboxymuconolactone-decarboxylase-family-protein	gnl|CDD|223672	COG0599, COG0599, Uncharacterized homolog of gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit [Function unknown].	7.60413e-22
NZ_CP020564.1|WP_003587210.1|2670553_2671021_+|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein	gnl|CDD|153102	cd01043, DPS, DPS protein, ferritin-like diiron-binding domain. DPS (DNA Protecting protein under Starved conditions) domain is a member of a broad superfamily of ferritin-like diiron-carboxylate proteins. Some DPS proteins nonspecifically bind DNA, protecting it from cleavage caused by reactive oxygen species such as the hydroxyl radicals produced during oxidation of Fe(II) by hydrogen peroxide. These proteins assemble into dodecameric structures, some form DPS-DNA co-crystalline complexes, and possess iron and H2O2 detoxification capabilities. Expression of DPS is induced by oxidative or nutritional stress, including metal ion starvation. Members of the DPS family are homopolymers formed by 12 four-helix bundle subunits that assemble with 23 symmetry into a hollow shell. The DPS ferroxidase site is unusual in that it is not located in a four-helix bundle as in ferritin, but is shared by 2-fold symmetry-related subunits providing the iron ligands. Many DPS sequences (e.g., E. coli) display an N-terminal extension of variable length that contains two or three positively charged lysine residues that extends into the solvent and is thought to play an important role in the stabilization of the complex with DNA. DPS Listeria Flp, Bacillus anthracis Dlp-1 and Dlp-2, and Helicobacter pylori HP-NAP which lack the N-terminal extension, do not bind DNA. DPS proteins from Helicobacter pylori, Treponema pallidum, and Borrelia burgdorferi are highly immunogenic.	5.65789e-47
NZ_CP020564.1|WP_021357030.1|2673417_2674776_-|PTS-cellobiose-transporter-subunit-IIC	gnl|CDD|181976	PRK09592, celD, PTS cellobiose transporter subunit IIC.	0
NZ_CP020564.1|WP_003643419.1|2676494_2676863_+|MerR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|133384	cd01109, HTH_YyaN, Helix-Turn-Helix DNA binding domain of the MerR-like transcription regulators YyaN and YraB. Putative helix-turn-helix (HTH) MerR-like transcription regulators of Bacillus subtilis, YyaN and YraB, and related proteins; N-terminal domain. Based on sequence similarity, these proteins are predicted to function as transcription regulators that mediate responses to stress in eubacteria. They belong to the MerR superfamily of transcription regulators that promote transcription of various stress regulons by reconfiguring the operator sequence located between the -35 and -10 promoter elements. A typical MerR regulator is comprised of distinct domains that harbor the regulatory (effector-binding) site and the active (DNA-binding) site. Their N-terminal domains are homologous and contain a DNA-binding winged HTH motif, while the C-terminal domains are often dissimilar and bind specific coactivator molecules such as metal ions, drugs, and organic substrates.	4.63028e-41
NZ_CP020564.1|WP_161493410.1|2651778_2652426_-|KxYKxGKxW-signal-peptide-domain-containing-protein	gnl|CDD|274741	TIGR03715, cell_surface_protein_precursor, KxYKxGKxW signal peptide. This model describes a novel form of signal peptide that occurs as an N-terminal domain with a recognizable motif, reminiscent of the YSIRK and PEP-CTERM forms of signal peptide. This domain tends to occur on long, low-complexity (usually Serine-rich and heavily glycosylated) proteins of the Firmicutes, and (as with YSIRK) the majority of these proteins have the LPXTG cell wall-anchoring motif at the C-terminus.	0.000172963
NZ_CP020564.1|WP_015380951.1|2657848_2658511_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|224228	COG1309, AcrR, Transcriptional regulator [Transcription].	5.47313e-12
NZ_CP020564.1|WP_016526894.1|2679170_2680346_-|IS256-family-transposase	gnl|CDD|307151	pfam00872, Transposase_mut, Transposase, Mutator family.	6.12313e-110
NZ_CP020564.1|WP_003643420.1|2676985_2677354_+|YxeA-family-protein	gnl|CDD|377665	pfam06486, DUF1093, Protein of unknown function (DUF1093). This family consists of several hypothetical bacterial proteins of unknown function.	1.35547e-23
NZ_CP020564.1|WP_027822627.1|2660828_2662430_-|cation:proton-antiporter	gnl|CDD|223104	COG0025, NhaP, NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporters [Inorganic ion transport and metabolism].	1.06967e-40
NZ_CP020564.1|WP_003645361.1|2662731_2663556_-|NAD(+)-diphosphatase	gnl|CDD|234699	PRK00241, nudC, NAD(+) diphosphatase.	2.21998e-55
NZ_CP020564.1|WP_003645352.1|2677771_2679043_+|DUF805-domain-containing-protein	gnl|CDD|377540	pfam05656, DUF805, Protein of unknown function (DUF805). This family consists of several bacterial proteins of unknown function.	1.13968e-24

Protein sequences

>NZ_CP020564.1|WP_027822626.1|2664789_2666271_+|FAD-dependent-oxidoreductase
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>NZ_CP020564.1|WP_003645360.1|2663710_2664619_-|LysR-family-transcriptional-regulator
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>NZ_CP020564.1|WP_003645361.1|2662731_2663556_-|NAD(+)-diphosphatase
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>NZ_CP020564.1|WP_027822627.1|2660828_2662430_-|cation:proton-antiporter
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>NZ_CP020564.1|WP_003645352.1|2677771_2679043_+|DUF805-domain-containing-protein
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>NZ_CP020564.1|WP_016526894.1|2679170_2680346_-|IS256-family-transposase
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MGE targeting detection<

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NZ_CP020564_2	2.2|2669975|31|NZ_CP020564|CRISPRCasFinder	2669975-2670005	31	NZ_CP033143	Vibrio parahaemolyticus strain 160807 plasmid pVPWZ1, complete sequence	85109-85139	6	0.806
NZ_CP020564_2	2.2|2669975|31|NZ_CP020564|CRISPRCasFinder	2669975-2670005	31	NZ_CP034300	Vibrio parahaemolyticus strain 20160303005-1 plasmid pVPSD2016-1, complete sequence	82262-82292	6	0.806
NZ_CP020564_2	2.2|2669975|31|NZ_CP020564|CRISPRCasFinder	2669975-2670005	31	NZ_CP033139	Vibrio owensii strain 1700302 plasmid pVOWZ1, complete sequence	19890-19920	6	0.806
NZ_CP020564_2	2.2|2669975|31|NZ_CP020564|CRISPRCasFinder	2669975-2670005	31	NZ_CP040452	Halomonas sp. PA16-9 plasmid p_unnamed1, complete sequence	1245593-1245623	8	0.742

1. spacer 2.2|2669975|31|NZ_CP020564|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP034567 (Vibrio parahaemolyticus strain D3112 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.806

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 * *  ******** ******* ********

2. spacer 2.2|2669975|31|NZ_CP020564|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033143 (Vibrio parahaemolyticus strain 160807 plasmid pVPWZ1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.806

aaacccagcgccacaaccaaacccggcgccg	CRISPR spacer
catcaaagcgccactaccaaacgcggcgccg	Protospacer
 * *  ******** ******* ********

3. spacer 2.2|2669975|31|NZ_CP020564|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP034300 (Vibrio parahaemolyticus strain 20160303005-1 plasmid pVPSD2016-1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.806

aaacccagcgccacaaccaaacccggcgccg	CRISPR spacer
catcaaagcgccactaccaaacgcggcgccg	Protospacer
 * *  ******** ******* ********

4. spacer 2.2|2669975|31|NZ_CP020564|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033139 (Vibrio owensii strain 1700302 plasmid pVOWZ1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.806

aaacccagcgccacaaccaaacccggcgccg	CRISPR spacer
catcaaagcgccactaccaaacgcggcgccg	Protospacer
 * *  ******** ******* ********

5. spacer 2.2|2669975|31|NZ_CP020564|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040452 (Halomonas sp. PA16-9 plasmid p_unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

aaacccagcgccacaaccaaacccggcgccg	CRISPR spacer
ccgctgagcgacacaaccaaaccctgcgcct	Protospacer
  .*. **** ************* ***** 

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	318490 : 365561	40	Bacillus_virus(50.0%)	transposase,bacteriocin,protease	NA
DBSCAN-SWA_2	772703 : 839528	56	Moumouvirus(22.22%)	integrase,bacteriocin,transposase,tRNA,protease	attL 797708:797767|attR 801254:801313
DBSCAN-SWA_3	1180698 : 1188170	6	Lactobacillus_phage(100.0%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_4	1330560 : 1395048	54	Staphylococcus_phage(16.67%)	bacteriocin,transposase,holin,tRNA,protease	NA
DBSCAN-SWA_5	2058533 : 2067847	10	uncultured_Caudovirales_phage(50.0%)	tail,portal,terminase,capsid,head,transposase	NA
DBSCAN-SWA_6	2281743 : 2290254	9	Synechococcus_phage(33.33%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_7	2770219 : 2778507	7	Streptococcus_phage(16.67%)	bacteriocin	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP020564|318490:365561|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP020564|772703:839528|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_027822808.1|818714_819623_-	LysR family transcriptional regulator	A0A2P0ZL89	Lactobacillus_phage	4.6e-18	26.5
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WP_003641196.1|824680_825688_-	aspartate--ammonia ligase	A0A1C9C5F0	Heterosigma_akashiwo_virus	1.4e-63	43.0
WP_003641197.1|826140_827547_-	C69 family dipeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_003645742.1|827582_828815_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_003645740.1|831657_832539_+	RluA family pseudouridine synthase	NA	NA	NA	NA
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WP_003641210.1|839198_839528_-|bacteriocin	bacteriocin immunity protein	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP020564|1180698:1188170|DBSCAN-SWA
TGTGGCACGTGACGGGACCGTCACAGAGACAAATGATTTAAAATTGCACGCATTAGGGGAGATTATCGGGATGAACGAACAAGAAGCATATGTAACGACATTTTATTGGCTCGCGGATTGTTGGTTGGAAACTAGCTATCTGGGACTTGAGGATGAATTTGACGACGATGAAATCGATGACGCCGTCAAGTCACTACTAAATCGGATGCAAGCCGGGGCAATTTATGAGGTAACGGCGGATGATCCAATGTGGCAAGCATGGAAGCGGGCAGTTAGGGCCGTGCTTACGCCCAATGATCATGCTGAACATGAAGTTGATGAGACCGACGGAGAGGATGAATTAGTGCTGCCAGCTGGGGTACGACCAGAACGTCAATTAGAAGAAGTTCAAGCCTATGCAGCGATGAACGCGTTTTTGCAGGCACAAGATCAGGAATATCTGCAAGAAATTGGTAAACGGGCGGCCACTCAGGTCAGTGGTGCCGGGTGGCAAGTGTGGCGTGCACATCGCCAGAGCATGCATCCGGAGTTTGCCGCCCCGCTGACGTTGACTGCTGAACAATTACCAGCCATGATGTGGGCCTTTTTCGATAAGTACCAGGATACTGAGGACTCTTTTGAGATTTTTGAATTGGTTAACCAGCTTGAACAATGGCAAAAAAGTGCTGATCGAGATTTGGACGCGCAATGGTCACAGCTTGTGGCGAAAAGTCAGATTGATCCGGCCGCAATTACGCGCATGCAGGGCTTGTCGTTAGCGATTGAGTTATTTGATCAGCTTGAGTGGGACGGTGATTTGACTGCCAAGGCAACTTTGCAGAATAAATTGATGCAACGCACGCTCGATGACACGCTCAATGATGAGACGACAGCCAACTGGGCGGATGCCTGGCAACACTGGGATTTAGCAGATCCGTTGACAACTGAACAGTGGGCCCGACGGTTTGATCCGGCGGACGACTATGAAGACGAGAGTGAAGAAGATGGCGCGGCTCGGCCAGCTTGGCAACTTGGTGCGAGTTATAGTACCGTTTTGATTGCAATGCGCTTAGTCGCTTACGGTGTACTGCGGCCTGAGAGTGTGCCTGGTATGGCAACTGTGAAGATGGCGAACCGTGCACTGGCAGCTACCGTCAGTATTGGTATCGTGTTAGTTGCTTGGCTGGTCACAGCTATTCTGATTACAATTGTAATTTGGGGATGGCGGTGGCTGCGTAAGCTGATTTTTTAGTGCAGCTGAACGGCCAACTGAATCACAATAGTGCCGATTGACTAGGCTGAAGTTTGTGAATCTAGTAGTTGAAGCTGAAAGGACGGGGCGTCAGTGGTAGTGCTTCATGATGGTTCGTAACTCGGACAGAAAGTCGGCATCTAAGTGGGGCGGTTGTCCTAATTGTAATGGTGCCAATGGCTGATATAACGTTGGTATGTCTGGCTTTAACGGCTGGTTATTGAAGTATTGCTGACCATGGATTTTGACGGTCGCTTTGAGCGTTCCAATCGTCATGACGGCCACGGCGGTATTTAAAAAGACGCCACCATTGAGACTAGTATATCCAGCGGAAGAACGCCCAACTAAAGTAACGTGCGGGTTACGTTTTAGCGCCATGATGGTCACCTCCGCGGCACTCGCTGTCTGGTTACCAATAATGGCATAAATATGACGAAAGTGGGCCGCTGTTGGTTGCGAAAAGTTAAAGTCATCTTGACCGAGTCCACCAGTGATTCGGCCATGGTACATCATACGTGGCCGGTTGCGATGATGGTTCGTGATGCCGGTGTAGAGGGTGCCGTCTGGAATGATGGCGGCCAGGCCAGCAATCATCAGTGCCGAACTACCACCAGTATTTGCTGCGAAGTTTAAGATTAAATCGGCTGTCGGCTTAGTTTGTTTAATCAGGTGCTGGAGTTGTGTCCAATACTGTTTTTGTAATTGGTGCTGACTGCTGTAAAATGCTGGCACATTGATGATGGTGAGGCCGGCACTCATTGTCTTGGTCGGACGGGTGGCATGTTCGACTTGGCGGAGATTGGCGACGGCGAATGAATGTAAATTTGCAGCGCGCAGAATTTGATTGAGTTGGGTCAGTGACGTGATTTTGCGACCATGATCAGTCGCATGCAGCATGGCTTGCCATTGCGTGCGATGGTTGATAATGCCATATTTTGACATGTAGGTGATAGCCGGCATAGCGTTGAAGGACGCACGGAGCCGATTAGAAGCGGAAAGACCAAACGTTAGGACTATCGAAATTAGACCTACCAGTCCGTAACGGCATTTATTCGTTATCATGATAAGCCATCCTTACTTTTCGTGACTAGATTAGCATGTATTGGTTAGCTAAAGTGTAGGCGTGGCGTCAAAATTTCGCAACGAAAAGCATATCTTAACTGGTGCGTCTTTGAAATAATGGTTAATGTTAAAATACCCATCTACATTGGCCGTCTTAACGGCTAAGTAGATGGGTATTTGTTGTATCATGAAATTGTTGACGATTGTGCCAGATCGGCTTCTAACTGGGTTAAGAAGATCGTCACCAAGTCTTTTTCCACCTGGTTCAGTGAATGCTCGGCTGGAAAGGCAATGAAATAATTCAGGGACATTAACGCTTGGGGCAAAGGTAAGATGTTATAGCGTTCTGGATCAGGTTGGGTATGCACACTGTCTGGTAAAAAGGTAATACCCAGTCCAGCAGTGGCTAATTTGGTGATGGTGGCGGTATTCGTGCTCTCAATTACGATATTCGGTGTCACGTTGTGCTTTTGTAATAAGTAGTCAACTTGGCGTCGAATCGATGACCCGTGGGGAGACAAGACTAGAGGCGCTTGTAGCAGGTCGTTAAGGGGTAGCGCTCCCGGATTAATGAAGGCCTGATGGGGTTGGTACCAGTTGACGGTGTTCGGGATAATCGCGTAGTACCCGTCCCGACCGCGGTCATAACTTTCAAGCCCCGGCGCGATGGTTTCCGGATTTTGACCAATTAAGAAGTCCAGCTCACCGTGGAGCACGCGCTGTTCGTTGCGACTAGCGATATCTTCGGTTAATTCGATCTTAGTGGCCGGGTGGGCTTTCAAAAAAGCAGGTAAAAATAGGGGCAATAAGTAATAGCCGAGGCTAGATAAGACGCCCAGCCGAATTACTTGCTGGTTGGCATGCGTGTATTGCCTAATTTGCTTATTAAAGTGATCTTTCTCGTTTTCGAGCGCCGTCAAATATTGATAATAAGTCCGTCCAGCCGTGGTCAGTCGCAGTGGCGTGACTTCACGATTGATGATGGTGACGCCCAATTCTTTTTCAACATTGCGGATGCTTTGGGTGAGGTAAGGTTGTGAAATGTAGAGATCTTTAGCCGCCCGGGTAAAATTGCCGTGCTTGAGCAACACATCTAAAAACCGTCGCATTTCGCTAGAATCTGATTTTGGCATAAAGCGCCTTCCTCTCGCATTGTGATTAGGTGAGTATTCGTTTGATTGCTGATTTGGTCATGTTGAGTTAGTTGCATCGCCATAAGGACGTTCAAAACATGTTCAATAAGTTCTGTCAACATCCTGGCGATAGTGGCTAAATAGCATTATGACCAACCATTTTAACATGATTAATTTTAACGCGAATCGTCGACATAGTAAATTTGTTATCGGGGTATAGATAAATAAATATTTCACAAGCGGAGCGCTTTCACGTACACTAATCAGTATTAAGAGTGGCCAATCATTCAATAGCTACTCGTCGAAAACGACTGTTTAAATCATCCTGAAAGGATCTGAAATTATGAAATTTGTTGGGATTGTTGGGACGAATGCAACCAAATCGACCAACCGGCAGTTACTGCAATATATGCAACGGCATTTTCAACAACAAGCCACGATTGAAATTTGTGAAATAAAAGATTTACCGGCTTTTAATGAACCGGAAGACCGAACAGCACCAGTAGCAATTCAACAGCTCAGTGATAAGATCACCGCAGCAGATGGCGTGATCTTTGCCACGCCGGAGTATGATCATTCAATTCCGGCCGTACTAAAAAGTGCAATCGAATGGCTGTCATATACCACGCGGCCGTTAATTAATAAACCAGTTATGATTGTTGGGGCCTCGAACGGCTCACTGGGAACCTCACGCGCTCAAGCGCACTTACGCCAGATTTTAGAGGCGCCGGAATTAAAAGCACTGGTGATGCCAAATATTGAATACTTACTAGGCCGTTCACTACAAGCTTTTGATGATCAGGGCGACCTGACTTATCCGGATAAAGTTCAGGAATTAGACAATGCGTTTGGCGAATTCATTGATTTTGTAGATTTAACGAATAAAATCATTCCGTCGAGTCAGTTTTTCGAAAAGAGTAAGCAGTTCTCGTGGCGGCAAGTGACTGGGGAGGAATAAACATGAAATTTGTTGGAATTGTTGGAACGAATGCTCAGCATTCGTACAATCGGATGTTGCTGGAATTTATGCAACGACATTTTGCGACACAAGCCGAAATCGAAATTTTAGAATTGACTGATGTCCCGATGTTTGATGAATCGAATGATCAAACTGACAGTACCATCATTCAAAACTTTGCCACTAAAATTGCGGCGGCTGACGGGGTTATCATTGCCTCACCGGAACACAATCATTCCGTGCCTTCCGCGTTGAAAAGCATTATTGAATGGTTATCATTCAAAATTCACCCATTAGATGGTCAAGCAGTAATGATTGTTGGGGCTTCATACAGTGTCCAAGGATCGTCACGCGCGCAACTACACCTGCGCCAGATTTTAGACGCTCCCGGTGTTAACGCCAGTGTCATGCCCGGTTCAGAATTCTTATTAGGTCGTGCCCAAACGGCTTTTGACGATCAAGGTAATTTAAAGGTGCAAGGGACGGTTGATTTTCTGGACAGTTGTTTTGCAAAGTTTCAGAAGTTTGCGACCATCGTCGCCGAGATGCGGGCACCAGAAGCGCTTAGCTTTGCCCCGGGTACTTATCAGGTGACGGCCACTGGACATAATGGCGAATTGCCAATGCGAGTGACCCTCTCCGCTGACCGGATTGAAAATATTGAAATTGATACCAGTAGTGAAACGCAGGGGATTGCCGATGTGGCTTTTGAACGCATTCCCAAGGAGATTATTGCGGGTCAAACGCTCGCTGTTGATGCGATTTCCGGGGCTTCAATTACCAGTCATGGTGTTATCGATGGGGTCGCTCGTGCGGTCAAAGAAGCTGGTGCCAATCCTGATGATTTGAAGAAACGGCGTGCGACTAAGCAGGTCGCTCAACCTGCTGTCAAAGAAGTGACGACTGATGTCGTAGTGGTTGGTGCTGGTGGGGCTGGTATGACGGCAGCGGCCAAAGTGTTACAGGCTGGTCATCAAGCCGTTGTCCTAGAAAAATACCCAGCTGTCGGTGGTAATACCGTTCGCGCTGGGGGGCCCATGAATGCGGCTGATCCGGATTGGCAACGACAGTTTGTAGCTTTGCCAGGTGAAAAGCAAACGTTGAAGGATCTGAGTGAGCGTGATGAAAGTACAATTGCACCTGAATATCGGGCTGATTTCCGTAAATTGAAACAGCAGATTGACGCATACCTGACTGCCAATACCAATCAAAAGGGCACCTTATTTGATTCAACCTTGTTACATCGGATTCAAACTTATTTAGGTGGTCAACGGACTGATTTGAACGGTCAAGAGATTCACGGTCAGTATGATTTGGTAAAAGAATTGACGGATAACGCCCTGGATTCAGTCAAGTGGTTACAATCGATTGGTGTGAAATTTGATGAAAGCCAAGTAACAATGCCAGTTGGAGCCATCTGGCGGCGCGGGCATAAGCCAATGGGCGATCTAGGGTTTGCTTACATCAAGACTTTACGGGCCTTTGTTGAACAACAGGGTGGTACGATTATGACGGAAACGCCGGTAAAAGAATTACTGGTGACAGATGGGCAAGTTCGTGGCGTCATTGCGACTAATGCGGCTCATGAGAAAGTTATTGTCCATGCTGATGCGGTGATTTTAGCTTCTGGTGGTTTCGCAGCGAATACTAAAATGTTACAAAAGTACAATACGTACTGGACGGCCATCGACGATGATGTCAAGACGACTAATTCACCCGCAATGACTGGTGATGGAATTCGGCTAGGGACTAGTGTTGGTGCAGCATTAGTTGGGATGGGCTTCTCACAAATGATGCCGGTATCTGATCCGGAGACCGGCGAATTATTCAGTGGGCTCCAAGTGCCACCGGCAAACTTTGTGATGGTAAACCAGCAAGGAAAACGGTTCGTCAATGAGTACGGCAGTCGTGATGAGTTAACTCAGGCGGCCATTGATAATGGGAGTCTCTTCTATCTAATTGCCGATGATGAAATTAAAAAGACGGCTTACAACACGACACAAGCTAAAATTGACCAGCAGGTGGCGAATGGGACCTTGTTCCGTGCTGATACTTTGACAGATTTAGCGCACCAAATTGGCATGGACCCGGCAGCCCTGACCAAGACGATTGCGGACTACAATCGTTACGTTGATGCTGGCGAGGATCCTGAATTTCATAAGACGGCCTTTGATTTGAAAGTTGCCGTGGCACCATTTTACGCAACGCCGCGTAAACCAGCAACCCACCACACGATGGGGGGCTTGAAGATTGATTCGGATGCTCACGTTTTAAATACGGACGGCCAGGTTATCGACGGGCTATACGCGGCGGGAGAAGTAGCCGGTGGAATTCACGCGGGTAACCGGCTAGGTGGTAACTCGCTTAGTGATATCTTTACGTTCGGTCGAATCGCGGCGGCTCATGCTGTTGCTGAGCATGTTGATCCGGTGACGGCCTAAGGCAATTATTAAGTCGCTACGTTGGTTGAGTCGTGTTAGTGTATAATCGACCGTAGAGAGAAGCAGATCGACAAGGGAGATTATCACATGCAAAAACCAATGCCAGTCGCGGTGACGAACATTGCGGACAATATTACGCACCAACCAGCTTATATGACGATTGTTTTAAATGATCACAAGTATTCGACCGCGCGCAAAAAGACGCCGTTTATCTTGAAAGCGTTGAATGAGGGCGCGGCTGCTCATGGGCGTTTGACGATCACGCCTAGTCGGCTGAGTTTGGCCGATGAGCGCGGCACAGTCTTTCAAACCTTGGCGCCAATACCCACAGTCATCACGGACGTCGAGCTGGGATTGTATCGCTCAATCGTGCGGCAACTTGGTAATGGCGTACGAATGAAGGCCCGTTACACATTGGCGGTGACGTTGACCAGCGATACCGCTACTTATCAGATGTTAAATACCGATTTGTCAGTGTTGAAACCGCTGTTGGCTTGGATCACCGACTTTCATCTTCACTTAACCGATTCGTTACAATTGGCAACCAGTGACATCGACTGGCCCAATTTGACGGCTGATCAATTTGAAGCATTGACAAAGGGCACCCCGTACTTTGCTTGGCAACAGACGATTGGGGCCCACTGGTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP020564|1180698:1188170|1182018_1182990_-|WP_027822908.1|DBSCAN-SWA
MITNKCRYGLVGLISIVLTFGLSASNRLRASFNAMPAITYMSKYGIINHRTQWQAMLHATDHGRKITSLTQLNQILRAANLHSFAVANLRQVEHATRPTKTMSAGLTIINVPAFYSSQHQLQKQYWTQLQHLIKQTKPTADLILNFAANTGGSSALMIAGLAAIIPDGTLYTGITNHHRNRPRMMYHGRITGGLGQDDFNFSQPTAAHFRHIYAIIGNQTASAAEVTIMALKRNPHVTLVGRSSAGYTSLNGGVFLNTAVAVMTIGTLKATVKIHGQQYFNNQPLKPDIPTLYQPLAPLQLGQPPHLDADFLSELRTIMKHYH
>NZ_CP020564|1180698:1188170|1183175_1184123_-|WP_027822909.1|DBSCAN-SWA
MPKSDSSEMRRFLDVLLKHGNFTRAAKDLYISQPYLTQSIRNVEKELGVTIINREVTPLRLTTAGRTYYQYLTALENEKDHFNKQIRQYTHANQQVIRLGVLSSLGYYLLPLFLPAFLKAHPATKIELTEDIASRNEQRVLHGELDFLIGQNPETIAPGLESYDRGRDGYYAIIPNTVNWYQPHQAFINPGALPLNDLLQAPLVLSPHGSSIRRQVDYLLQKHNVTPNIVIESTNTATITKLATAGLGITFLPDSVHTQPDPERYNILPLPQALMSLNYFIAFPAEHSLNQVEKDLVTIFLTQLEADLAQSSTIS
>NZ_CP020564|1180698:1188170|1187609_1188170_+|WP_003643095.1|DBSCAN-SWA
MQKPMPVAVTNIADNITHQPAYMTIVLNDHKYSTARKKTPFILKALNEGAAAHGRLTITPSRLSLADERGTVFQTLAPIPTVITDVELGLYRSIVRQLGNGVRMKARYTLAVTLTSDTATYQMLNTDLSVLKPLLAWITDFHLHLTDSLQLATSDIDWPNLTADQFEALTKGTPYFAWQQTIGAHW
>NZ_CP020564|1180698:1188170|1185083_1187522_+|WP_021356348.1|DBSCAN-SWA
MKFVGIVGTNAQHSYNRMLLEFMQRHFATQAEIEILELTDVPMFDESNDQTDSTIIQNFATKIAAADGVIIASPEHNHSVPSALKSIIEWLSFKIHPLDGQAVMIVGASYSVQGSSRAQLHLRQILDAPGVNASVMPGSEFLLGRAQTAFDDQGNLKVQGTVDFLDSCFAKFQKFATIVAEMRAPEALSFAPGTYQVTATGHNGELPMRVTLSADRIENIEIDTSSETQGIADVAFERIPKEIIAGQTLAVDAISGASITSHGVIDGVARAVKEAGANPDDLKKRRATKQVAQPAVKEVTTDVVVVGAGGAGMTAAAKVLQAGHQAVVLEKYPAVGGNTVRAGGPMNAADPDWQRQFVALPGEKQTLKDLSERDESTIAPEYRADFRKLKQQIDAYLTANTNQKGTLFDSTLLHRIQTYLGGQRTDLNGQEIHGQYDLVKELTDNALDSVKWLQSIGVKFDESQVTMPVGAIWRRGHKPMGDLGFAYIKTLRAFVEQQGGTIMTETPVKELLVTDGQVRGVIATNAAHEKVIVHADAVILASGGFAANTKMLQKYNTYWTAIDDDVKTTNSPAMTGDGIRLGTSVGAALVGMGFSQMMPVSDPETGELFSGLQVPPANFVMVNQQGKRFVNEYGSRDELTQAAIDNGSLFYLIADDEIKKTAYNTTQAKIDQQVANGTLFRADTLTDLAHQIGMDPAALTKTIADYNRYVDAGEDPEFHKTAFDLKVAVAPFYATPRKPATHHTMGGLKIDSDAHVLNTDGQVIDGLYAAGEVAGGIHAGNRLGGNSLSDIFTFGRIAAAHAVAEHVDPVTA
>NZ_CP020564|1180698:1188170|1184466_1185081_+|WP_027822910.1|DBSCAN-SWA
MKFVGIVGTNATKSTNRQLLQYMQRHFQQQATIEICEIKDLPAFNEPEDRTAPVAIQQLSDKITAADGVIFATPEYDHSIPAVLKSAIEWLSYTTRPLINKPVMIVGASNGSLGTSRAQAHLRQILEAPELKALVMPNIEYLLGRSLQAFDDQGDLTYPDKVQELDNAFGEFIDFVDLTNKIIPSSQFFEKSKQFSWRQVTGEE
>NZ_CP020564|1180698:1188170|1180698_1181928_+|WP_027822907.1|DBSCAN-SWA
MARDGTVTETNDLKLHALGEIIGMNEQEAYVTTFYWLADCWLETSYLGLEDEFDDDEIDDAVKSLLNRMQAGAIYEVTADDPMWQAWKRAVRAVLTPNDHAEHEVDETDGEDELVLPAGVRPERQLEEVQAYAAMNAFLQAQDQEYLQEIGKRAATQVSGAGWQVWRAHRQSMHPEFAAPLTLTAEQLPAMMWAFFDKYQDTEDSFEIFELVNQLEQWQKSADRDLDAQWSQLVAKSQIDPAAITRMQGLSLAIELFDQLEWDGDLTAKATLQNKLMQRTLDDTLNDETTANWADAWQHWDLADPLTTEQWARRFDPADDYEDESEEDGAARPAWQLGASYSTVLIAMRLVAYGVLRPESVPGMATVKMANRALAATVSIGIVLVAWLVTAILITIVIWGWRWLRKLIF

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_027822907.1|1180698_1181928_+	hypothetical protein	A0A2P0ZL72	Lactobacillus_phage	7.9e-215	97.4
WP_027822908.1|1182018_1182990_-	peptidase S41	A0A2P0ZL68	Lactobacillus_phage	6.5e-180	98.5
WP_027822909.1|1183175_1184123_-	LysR family transcriptional regulator	A0A2P0ZL89	Lactobacillus_phage	1.0e-177	99.7
WP_027822910.1|1184466_1185081_+	NAD(P)H-dependent oxidoreductase	A0A2P0ZL77	Lactobacillus_phage	1.4e-111	99.5
WP_021356348.1|1185083_1187522_+	flavocytochrome c	A0A2P0ZL82	Lactobacillus_phage	0.0e+00	99.4
WP_003643095.1|1187609_1188170_+	hypothetical protein	A0A2P0ZL75	Lactobacillus_phage	2.7e-101	100.0

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP020564|1330560:1395048|DBSCAN-SWA
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MAFEGLTERLQKAMTNLRRKGKISESDLRATMREIRLALLEADVNFTVVKDFVKTVRERALGAKVLEGLNPAQQIVKIVDEELTKTMGEKAVPLNKSPKIPTVIMMAGLQGAGKTTTVGKLALKLKNEQDARPLMIAADVYRPAAIEQLQQVGRQIDVPVFQLGTDVDPVEIVRQGMAQAKENHNDYVFIDTAGRLQIDEQLMNELANIKDLVHPDEILLVIDAMTGQNAVNTAEGFNDKLDVTGVVLTKLDGDTRGGAALSIRAVTGKPIKFVGQGEKMTDLDVFHPDRMADRILGMGDMLTLIEKAQQQYDEKQAEEMNLKIQENTFDFNDFIDQLDQVDKMGNMEDIMKMIPGMANNPAMKNINMDPKDIAHIRAIVYSMTNAEKADPDLLNPSRRRRIAAGSGRPIHEVNRMIKQFNQTKKMMNQMSKGNFAGMEGLMGGANGGGGIGGKMQQMAMKRMVRQTKKKKQKRLAKAMRRRKR
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MSLTRHEIREKAFQALFALNANPDADENQLFQQLLNPEEADAVEIPAYLSTLVTGVREHQVELDAQIQPYLSQKWSLDRLAKTDLIILRIAFFELQFVDDVPTKVAVNEAIELTKAFSDDRSRKFVSGVLGKVVKNQAN
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MIQATISRNATGQVTAFKLTGHADSGAYGQDIVCAAVSVLAISTINGIEQVARLQPVVQSDETNGGLLIADFTKLDLANTQLQTLLESFTLGLNDVATNYGDYIRVREQTR
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MTPNYTLSGRYRIVRSLGEGGMANVYLAHDLILDRDVAVKLLRLDLRDDPKTIKRFQREALATTELVHPHIVSLYDIGEENGMQYLVMEYVKGMDLKNYIKENFPLPLQQVIDIMEQILSAVATAHAHNIIHRDLKPQNILIDEQGNAKITDFGIAVALSEHTMTQTNTILGSVHYLSPEQARGSMATKQSDIYSLGIILYEMLTGSVPFKGETAVSIALKHFQNAMPSVREFDADIPQALENVVLQATTKDPRERYATVEDMAADLLTVLASNRAGEKRFVPQDVGNDETKIMPSADIQAAIAANQNGKTQVVAHKSKQPTLQRPAETTESQTDADEEPLPTRSWSKRHPLRRRLLFWGGIILLLVVAVIVGLELSRPQMTTVPKVTGLSQRAATKVLKKHHLTVGTVQHAKSNQVAKNQVIKSTPSVKTRVQERARINLVISNGAKVMSFGNYVNDNYHDVRQTLKSAGFKVKETYSTSSVAAGQIISQDVVAGSRVMPTDTTVTFTVSAGSRYVELKDLTGESKSDILDYAEANDLNVNFKQGYSSEQKAGYSYDQDPDGGGNVRTGSTITVTMSRGSDNNVTTPQNFYVKLTVPYKALSATTAQANDVKIYLYDDTHMIETVYRDIAIMRSTKISLPFQLTGNTKGHYRIVRNGVTIMEKKNITSKNATK
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MAEQPTFEQNLSQLETIVNQLEQGDVPLEQALDQFQKGVALSKQLQATLEGAEKTLTKMMNENGDEVPFEQADANE
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MEIEKNYRINSLFEFYEPLLTNKQKAYIQLYYADDYSLGEIAAEFSVSRQAVYDNIKRTEKILEGYEAKLHLYHDFVERNHEVDAISDYIKQNYHGDTQLIKMIQQLVNLEADSE
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MKIGQIRQSLSGFYDVYADGQMYRTRARGNFRKRRITPLVGDNVEFDAATPQEGYVLNILDRQTQLVRPPVANVDLGIVVTATTEQEFSTNLLDRQLVALAVAGIEPLLYFAKTDLLTDEVYQQRLTLADAYRQIGYQVICERTAFSPAALAAVKTALTGHVAVVMGQTGAGKSTLLNHLQPGLALATGEISQALNRGKHTTRKVSLIPIADGLVADTPGFSSYEVFDIAANELTHYFPEFVRLSADCKYRGCVHINEPQCAVKQALAAGELLASRYDNYLQFYETIKNKKVIYNKKK
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>NZ_CP020564|1330560:1395048|1391074_1392103_+|WP_015474672.1|transposase|DBSCAN-SWA
MTQTKNIMPKHYQQLQSFERGQIESLTRLGFGVRQIASRLHRSPSTISRELKRGLTTQIDSQKHRSYQGYFAERGAAYYREQRAKCHPKGLLQRAAVFFKSLPKALKAKPRVFSVDTYVHYFKAHYPGFPCPSTATVYRYIEAGKLPELHNYDLPMKLRRRAKRPNHRHARLNKKRLGQSIEDRPAVVRKRQELGHWEGDLVKAKRVESEPALMTLTERVSRMEIIVKLPDYRAETCRQALQDTIDDYGAENFRTITFDNGSEFASLNQVQGTGIYFAHPYSPWERGTNENVNGQLRELFPKGHSFKNLSLVDLQLVQDTLNHRPRRCLSYSCPADVMPQLV

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_003640344.1|1330560_1330896_+|protease	ribosomal-processing cysteine protease Prp	NA	NA	NA	NA
WP_003638594.1|1330920_1331199_+	50S ribosomal protein L27	NA	NA	NA	NA
WP_027822371.1|1331393_1332455_+	aminopeptidase P family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003640346.1|1332525_1333083_+	elongation factor P	NA	NA	NA	NA
WP_003640347.1|1333132_1333591_+	Asp23/Gls24 family envelope stress response protein	NA	NA	NA	NA
WP_003645163.1|1333587_1334007_+	transcription antitermination factor NusB	NA	NA	NA	NA
WP_003645162.1|1334153_1335014_+	bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase	A0A249XZQ2	Enterococcus_phage	1.1e-32	40.1
WP_027822372.1|1335006_1336350_+	exodeoxyribonuclease VII large subunit	A0A160DEV2	Gordonia_phage	1.5e-25	30.4
WP_003640351.1|1336349_1336580_+	exodeoxyribonuclease VII small subunit	NA	NA	NA	NA
WP_027822373.1|1336572_1337463_+	polyprenyl synthetase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003640353.1|1337477_1338296_+	TlyA family rRNA (cytidine-2'-O)-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_003640354.1|1338379_1338838_+	arginine repressor	NA	NA	NA	NA
WP_027822374.1|1338940_1340635_+	DNA repair protein RecN	NA	NA	NA	NA
WP_003645157.1|1341012_1342197_+|holin	betaine/proline/choline family ABC transporter ATP-binding protein	Q6GZ03	Mycoplasma_phage	3.0e-17	46.2
WP_003644316.1|1342193_1342823_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_003640358.1|1342835_1343771_+	osmoprotectant ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_172436955.1|1343779_1344424_+	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_003645156.1|1344629_1344965_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003640361.1|1345157_1345778_+	guanylate kinase	A0A0M5KCK5	Mollivirus	1.4e-10	33.6
WP_003640362.1|1345774_1345987_+	DNA-directed RNA polymerase subunit omega	NA	NA	NA	NA
WP_027822375.1|1346039_1347377_+	bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase CoaBC	Q9HH70	Methanothermobacter_phage	2.4e-39	32.9
WP_089197914.1|1347399_1349817_+	primosomal protein N'	NA	NA	NA	NA
WP_011101475.1|1349840_1350794_+|tRNA	methionyl-tRNA formyltransferase	E3SNR5	Prochlorococcus_phage	1.7e-10	31.4
WP_003645153.1|1350790_1352134_+	16S rRNA (cytosine(967)-C(5))-methyltransferase RsmB	NA	NA	NA	NA
WP_003640367.1|1352151_1352898_+	Stp1/IreP family PP2C-type Ser/Thr phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_027822377.1|1352894_1354919_+	Stk1 family PASTA domain-containing Ser/Thr kinase	A0A1Q1PNS5	Noumeavirus	2.9e-20	30.5
WP_015825519.1|1355003_1355900_+	ribosome small subunit-dependent GTPase A	NA	NA	NA	NA
WP_089197915.1|1355909_1356563_+	ribulose-phosphate 3-epimerase	NA	NA	NA	NA
WP_003640371.1|1356562_1357222_+	thiamine diphosphokinase	NA	NA	NA	NA
WP_003638622.1|1357578_1357764_-	50S ribosomal protein L28	NA	NA	NA	NA
WP_003638623.1|1357999_1358362_+	Asp23/Gls24 family envelope stress response protein	NA	NA	NA	NA
WP_027822379.1|1358398_1360105_+	DAK2 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003645148.1|1360247_1362287_+	ATP-dependent DNA helicase RecG	NA	NA	NA	NA
WP_003644323.1|1362328_1363375_+	phosphate acyltransferase PlsX	NA	NA	NA	NA
WP_003640376.1|1363413_1363659_+	acyl carrier protein	NA	NA	NA	NA
WP_089197916.1|1364075_1364771_+	ribonuclease III	A0A1V0SDK0	Indivirus	2.7e-18	33.0
WP_027822380.1|1364801_1368359_+	chromosome segregation protein SMC	NA	NA	NA	NA
WP_089197917.1|1368377_1369916_+	signal recognition particle-docking protein FtsY	NA	NA	NA	NA
WP_003640380.1|1370093_1370441_+	putative DNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_011101484.1|1370463_1371918_+	signal recognition particle protein	NA	NA	NA	NA
WP_003638633.1|1372014_1372287_+	30S ribosomal protein S16	NA	NA	NA	NA
WP_027822382.1|1372304_1372562_+	KH domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_015825524.1|1372722_1373247_+	ribosome maturation factor RimM	NA	NA	NA	NA
WP_027822383.1|1373246_1373987_+|tRNA	tRNA (guanosine(37)-N1)-methyltransferase TrmD	NA	NA	NA	NA
WP_003640385.1|1374144_1374501_+	50S ribosomal protein L19	NA	NA	NA	NA
WP_003640386.1|1374935_1375256_+|bacteriocin	bacteriocin immunity protein	NA	NA	NA	NA
WP_027822384.1|1382907_1383672_+	ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	4.8e-21	27.7
WP_016511669.1|1383664_1385260_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_089197918.1|1387977_1388901_-|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	6.7e-33	31.9
WP_015474755.1|1389108_1390707_-	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_015474672.1|1391074_1392103_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.9e-36	32.0
WP_027822913.1|1392214_1392802_-	recombinase family protein	M4QQC6	Vibrio_phage	4.5e-19	42.4
WP_089197920.1|1392906_1393644_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_089197921.1|1393872_1395048_+|transposase	IS256 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP020564|2058533:2067847|DBSCAN-SWA
ACTACTTAAGTAAGATGCAAATTGAGGCAATGTAGACCGTAGCCAGATAAACATGAGCGAGCTTATCATAACGCGTTGCAATCCTACGAAAGTTCTTCAACTGATTGAAGAAGTTCTCAATCAAATGGCGCTCACAATAAACGTGGTAATCACAGGTCCACTTGTCTTTGGTATTTTCCTTTGGCGGAATGGTATAGACGCCTGCTTTATCTTCAATATACTGGCGAAGTTTCGCGGTGCCATAGGCTTTATCCGCGATAATATTTGATTGAGAAATATCGAAGCCTTCCAGCAACTCACTGGCAACTTGGCTATCATGTACTTGACCACCTGTTAGGCGAAAACCCAAGGGATTCCCTAATCCGTCAACGAGTGCGTGAATCTTGGTCGTTCGGCCACCTCGACTTAATCCAATAGCTTGATTTTCGACCATACATTCGGCATTTTTTTTGCCCCAGTGGCCTTTTGATGCGCTCGAACGATCGTTGAATCTAAGCTCAAGTTTTCCATGTCGGGATCGTCAATCAATTCGAGAAAAACCTGTTCGAACAAGCCTGAACTTACCCAGGCTCGGAAGCGACTATACACCGTTTTCCAAGAGCCATAGCGTTCAGGTAGATCACGCCAAGGAGCCCCGCTGCGCATGAGCCAGAGGATAGCGTTGAGGGCGGTACGGTTGTCTAGGCTTGATGGACGGCCAGTCCGGTATGGCGGGAAGTATCCTTTGATTCGGTCCCACTGAGCATCTTCCAGTTCGTATCGTTTAGGTGTTGTCATCGGAATGCCTCGATTCGTTTTTCCTCAGATTATACCTGAATTTTTAGTTTTCAGACAGTCCCTAATCAAATTCGAGTTTCCTTAAACATTAAGGAAATTATTTTAACAATACTTCAATAATTATCGCGCTTTACATGCTATTCTATTAGAATAGGAAGTAGTTTTTAAATCATGGGGGGATTTATCATGCACATGCGGGGTATCAACTTTGTATTAGGTCTCGGCGTCGCGCTCGGCCTGTTAGCAGGCTGTCAGGCGGCTTCACCGGCAACTAAACAAGCCAGCAGTCAATCATCTAAGACTAGCGCTAAAAGCGTTCACAGCTCGGCTAAACACCAAGCACAAGCACGGCCTTATCAACATTGGCATACCGTCAAAGATGTTCACTTGCCTATTTTGATGTATCACAGTATTTCTAGCGGGAACCAGTTACGTGTCCCCGCCAAAGAATTTCAAACTGAAATGACTTATCTAAAGGCACACGGCTACCGAACGCTGACTGCCAATGAAGCCGTATACGCGCTCAAACATCGGCGAATTCCACAAAAGAAGATTGTCTGGATCACACTCGACGATAGCTATAAAGATAACATGACAGCAGCTTGGCCAATTTTGAAACAGACGCACCAACACGCCACCATTAATTTTATTACCGGCTTTACCCATAAGAAAAACCACTTAACTTTAGCTGATGCTAAGCGGATGCAAGCATCCGGTAATATTGATTTTCAAAGTCACACCGTTCGCCATCTGGATTTAAATAATTTAACTTACCAGGTTCAACTTACGGAATTATCAAGTTCCAAAAAATGGCTCGATCATAATTTACAACAGAACACACAAGTTATTTGTTACCCAGCCGGCCGTGCTAATCAGCAGACCATTAAAGCCGATAAACAGGCTGGCTATCAGTATGCCCTATCAACGGCACCTGGCATCGCCACCAGCACACAGAACCCATACAATCTCACTCGACAACGGGTCGTACCTGGAATGTCGCTAACGGCCTTTCAGACACTATTAACGAGTAATAATTAATTCATAGGACCCTTACTTGTGACACGATCCCAAAACCCTTTTTTATGAGCGCTTAACAGTGCTGTTGTGATCACAACAGCCAAAACGCAAAATTGGGGTTTTAATTTGATACCAATTAGCAAAAGAGAAGCGTCATAATGCTGATATACCAGCATTATGACGCTTCTCTTTTTATCTACCGACGTCGACTTATCACCCGCACGGGGATCGAACCCGTAACTCCGCCTTGAGAGGGCGACGTCTTAACCAATTTGACCAGCGGGCACAAATTCATTTATTATCTTACCGAATGATAAGCGGCTTGTCAAATATAATTAAGATTTTTGCCACCTAAAAATCGTCATAACAACTAAACCAACAAATAAGAGCAAACAGTAGACCACACTACACCAAAAAACGAAAGTCAATAATTGCGGTAACAAAAAGCTGCGCATAACTGCTAATCCGATGGCCGTGACCGCCCATACGATCAATTGTTGTCGCAGATGATCGAATAAATGATCTAATTCTGACTTCGACATACACTCACCTTCCATTTAACTAGTTTAGCCACCAACTGATACGATATTCAAGCAAAAATGCAAAAAATAGACACAAAGTTTCAGCAAAGCCTTGACAGTATTTGCTGGAAAAGTTACTATTAAATAGTTGTTATTGGGTATTCGCCAAATTGGTAAGGCAGCGGACTCTGAATCCGTAATTTACTGGTTCGAGCCCAGTATACCCAATATTCGTTATCAGCTGTTATCATTGGTTGTCAAAAATACCGTGATTGCAGCTTTTTTATTACTTTAGTTTATCATTAATTGTCATCTCTTTTCACTAAAAGTCAGCCAAAAGGACAGCCAAAAATATAACAAAAAAGCCACTGTTTCCAGTGACTTAATACTTGCGCGGGGCAGTGACTGTTAGCCAACTTTGGTTAGCAGTTTTTTTCGTTAGGCCATTAGTCTAACGCTTATTATCAAGGCAATGACTGCAATAGTAATGTGTATCACAAAAATAACCTTTCTTATAGTTTTAGGTTCATGATAATCAAACGGCCACTGAATAAAGTCAAATACTGACAGAATCATAAAGTTAAACGCTAATAAATTTAGCCCATAAACAGTCACCGGCATAGACAAGCTGAAAGCCATGCGGCCATATTGTAATATACTACACGTTATCAAATATGCCGGAATAATCAACAATGTAATATTTACAGTAACTTCGAAAAACCATTTTTTAATGAAATAACTCATTTACAAGGACACTCCAGTAAATATTTAACTGCACATTATTAATTATACAGTAAAATTGTTGAAGTTGGGCTATAGTAGCATTCAAACCGTTAGATCACTGTAAAATTTTGCAAAAGCGTGTAATGCTTCATTCTTCATATAATTAAACTTGCTAACACTAACCGATAATTGGTTACAAGCTTCATTGCGGGTGAAATGCTTCTCAATAACGTAATCATGTAAAATAAATTGATATTGTGGATCATCAATTGCATTTAGGGCGTCTTCGACTTCTTTTAGCTGGTAAGACAGGTCAACATGGTTTATCAGGCGGCTTTCAGCGCCGTTTCGGCTGCTATGGCTTGACACTCCATCGAATGAGGGGCTGGAAACTTGATTAAAAGCCGTCAAATCACGTTTTAGTTTGGCATATTGCTTTAATAAATTACGAATTTTCTTAACATCTTGACGCATCGGAATCACACTTTCTGATCCCAGATATATGTATAAAAAAGAGGCTCGGGGGAGAGCCTCTCGCTATAGGATATGATAATCGCCGTTATTACGTGAAAGTAATATTAGGACAAATTACTACGTTAATTTTAGTACCAATCATTTCATATGTCAAACCTAAGCTTCAATTTTTCCACGCAGTTGTTGAATCATACTGACAACTTGATACGGTGTCTTTGTCATATCAGTTACTCTGTTTTGATACCAGAATTGTGTCAGCAAGGACACCGCAAAATCGTACTGTTTGTAGACAGTCAGATCTTCATTCTTGCTAACAGCCGTCTGCACGTAGTCCTTGGCGGCGTCTAAATAACTTTGAATCATTGGATCATCTTCAGTTACATCAATTCGCAGGCTTAGTTTAATGTCGTTTACAGTCACTGCCAACTAATCACTTCCTCATAAGTTTAACTTTACTCTCATAAAATTATATGGTATAAATATAGAGCACTCATTGCCCGGTAGTTCAGCGGTAGAATAATTGACTGTTAATCAAGAGGTCGCTGGTTCGATCCCAGCCCGGGCAGTCTCCAAAACACATATTTATCATAAAAGGGCCGTGACCTTGAAGTCACGGCCCTTTTATTACCAAGTCATAGCATAATAGATTACCTCAAACACTTTAAAAGCAACATATGCGGCGAATACATACGTGATGATAATACCACTGTATGCAAGGATAAATGTGTTCTTCATGGAATCACTCCTAAAATTATAACTGCACGTTCTATTAAAATCTGATAAGCGTTATCATCATACTATCACTTGTTGCTTGAAATCCCACTCATTTTGTCTTCCTATTTACCAGAAGTCGCAGTTCCTAACGCCACGTTGATTACAGCGGTCTTATCAATCACTTCATAATCATTCCGCACAATGACGGAAAGCCCTTGGCTGAACTGGTCGAACTTGTCCCATTGGGCGGTTACTTGGTTACGCCGGAAAACAGCCACGGCTTGTGATAAGTCCCCTACAATCATTGGGAACGTCCCGTTGGCGTTGTTGGCCAGTAACTTGTCACTAATCATGACGACTGGCGCCCCTAACAAGGTGAAGCCACTGGGTGCCGTTGGGTTCGGTTGTAATAAGTAACGCCCCTCGGAATCTTTCAAGGTATCAAGGTAGTTGAACCCGGACTGGTTCACTAACCACATTTTGCTCAAAGCGGGATCTAACGTCACATTGAAAATCTTTTTAAGATCATCAATATTGGTGGCCGTTTCTTTGGCGAAACTAGTTCCCGTTAACAGGCCCATAATTTGTGTATTGTCCGTGTTATCAACCAATTGTTGCAATTGCGTTTTAACTTCGCTGACAATATCTACTTCGGCGTCTTCTACTACTTCGTTAGATAAGGCAATCTTACCCGCCCGGGTCTTCACATCAAATGGCACTTCCGTAAACATGTTCGCGTCAACATCGGCAATGTCCGCTAGTTCGTCCTTAGTA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP020564|2281743:2290254|DBSCAN-SWA
CTTAAATTGCTCCTTCATTAATGAGTGTCTGTAATACATCTGGATAAAATTGGTGTTCACAATCATGAATCCGGGTCGCCAGGCTGGCTAGCGTATCGTCTGGTGCAACCGGAACGACCCGCTGGGCAATAATTTGCCCGGTATCGATTCCGGCATCGATATAGTGAATGGTAACGCCCGTCTCAGTCACACCAGCGGCAAAAGCATCCTCGATGCCGTGACGACCAGGAAACTTTGGTAACAATGCTGGGTGAATATTGATGATTTTATGAGCATACGCATTCAAGAGGGTCGGACCAATAATGCGCATGTACCCGGCCAATAATACCAGTTCAATTTGCCGTGCTTGCAAGGCCGTCAAAATGATTGCTTCCGCGGCCGCTTTATTCGCATAATCATGAAAATCAACAATTAATATCGGTACGTTAGCTGCCCGGGCCTTGTCAATTACCGGCGCTGTCGGTTGATCACACACAAGTAACCCAATCACTACCGGTAATTGTCGTTCAATAATCGCTTGGTGGAGTGCAACAAAGTTGGTGCCATTACCCGAAGCAAATACTGCAATTTTATTAGGCATGCTCAGCCTCCTCAAAAACAACGGGTGTCGTACCAGTTTGGACTGTTCCAACTCGATAATAGGACTGAGCGTTGGCCGTCAAATTAGCCGTCACAGCTGCCACTTGGTCGGAGTGAACGATCAGAACCATTCCCAAGCCCAAGTTAAAGGTCGACCGAAGATCCGTAGCAGTCAGCCCACCGAGTTCGGCCAATAACGTCATAATCGGCGGTGCCGGCCATTGACCCAATTCAAGGTGCGCACTCAAGCCCGCCGGTAACGCTCTGGCGACGTTCTCAATCAAGCCGCCCCCGGTAATGTGGGCGATACTCGTCACTAATTTCTGCTGTAATAATGGTTGAACTGCATCAACGTAAATGGTCGTTGGTCGTAAAAGTTCCGTTTGTAAATCATGACCAAGTTCGTCAAAAACCGTGGTCAATTGGTAGTCGTGTTGTTTGAATAAAATATCACGAACTAGACTAAACCCATTCGAGTGGAGGCCATTAGACGGCAACCCAATCAAGACGTCCCCAGCCCGAACATTTGCTGGTGATAACAGGTCCGCGCGGTTCGCAATTCCGACCGCAAAACCAGCGAGGTCGTAATGGTCCTGACCATACATATCGGGCATCTCCGCAGTCTCGCCACCAATCAACGCTGTATGGGCCTGCTGACAGCCCGTGACGACGCCAGTCAAAATGGCTTTGACCCGCTTCTGATCCGTATGTCCAAGACCTAAGTAATCTAAAAAGAACTGGGGGGTCGCGCCTTGTGCCAAAATATCATTCACACACATTGCGACCAAGTCAATTCCAATCGTGGTATGTTGATCAGCAGCGATTGCGACTAAGAGCTTAGTCCCCACACCATCCGTCCCCGCTACTAACACGGGATCGTTGGCAGTTGCATCCGGACTAAGTGGAAACGCCCCCCCAAACGCGCCTAATTGCTGATTGCCACTCATTTGTTTGACCGTCTTTAAGACGTCGTAACCAGCGTTGATATCAACGCCAGCCCGCTTATACGCATCGCTCACTTGATCACCCCTTCATGATTGGCTTGTAATTGCGCAATTTCCGCATCATACTCGGCTTGGTAATCATACAGGGCCGTTGGATAATCCCCATTAAAATAGGCCATGCATAGTCCACCATACGGTTCGGTGGTCGACAAGCCAACTGCATCAACGACGCCCTGTTCACTGAGAAAACCAAGTGAGTCCGCACCAAACGTCTGACACATCTCCCGAATCGTTTGCTGAGCCGCAATCAATTCATTAGTCGATTGAATATCGATACCGTAAAAACATGGATAGCGTAATGGTGGCGATGCAATTCGTAAATGAACTGACTTTGCACCCGCATCTTTCAATAATTTGACGATCCGCCGACTGGTGGTACCACGTACAATCGAATCATCGATTAAGACGACTCGTTTACCAGCGACAACACCTTTGACCGCTGAAAGCTTCATCCGAACCCCCTGTTCTCGCAATGCTTGGGTCGGCTGAATAAAGGTCCGTGACGAATATTGATTTTTAATTAATCCCATCTCGTAAGGCAGGCCACTCGCTTCCGCATAGCCGGTCGCCGCTGATAAAGATGAATTGGGTACCCCGACAACAATGTCGGCGTCCACGGGCTGTTCAACAGCGAGCTGAGCACCCATTCGTTTACGTGCAGAATGGACGTTGACGCCGTGAATATCAGAATCTGGACGTGCAAAGTAGATAAACTCCATTGAACAAATCGCCAACTGTGTATCAGTCGTATAATGGTCGATCGTCAAACCATGATCATCGATCGTTAACAATTCTCCCGGCTGAACATCTTGAACAAACGTCGCACCAATCGTATCAAGCGCGCAAGTTTCACTACAAACGACGTACCCGCCCGTGGGTAACTGACCGACGACTAATGGTCGTAACCCGTTAGGATCCAAAGCGGCAATCAAACAATCATTCGTTAGTAGTAAGTAAGCAAAGCCTCCGTGGACTTGACGTAAAGCATCCTTAACCTGTTCCGTTAACGTTGCTGCGGGGCTGCGTCGAATCAGATGCATTAAAATCTCACTATCAGAACTAGCATGAAAAATGGCACCATGCTGTTCCAACCGTCGCCGCAGTGTCACCGCGTTCGTCAAATTGCCGTTATGTGCGAGTGCAAACTGTGAGTCGCTAAAATTAAAACCCAAGGGTTGAATGTTTTCCAATCCATGATTACCAGCCGTGGCATAACGTACATGGCCGACTGCAGCTTGACCCGTCAAACGTGCCAACCGCCGTGGGTCCCGAAAGACATCAGCCAACAACCCTAGTCCGCGTTCCGTCTGCAGTTTGCCGTGATCATTCGCCGTGATACCGGCTCCTTCTTGCCCCCGGTGTTGTAACGCATGGAGCCCAAAGTACGTTAATTGGGCGGCGTCCGGCGAGCCCCAAACCCCAAAGACGCCACATTCTTCATTCAGACTTCTTACTTCAGTAGGCATGGTAAGGCCCCTTCCCACAACTGTTTGGCGAAACTAACCTTAATATCAAACGCCTGATCAGCAGTTTGAACGTGTAGCCGATCCGTTGCAGTTGTTCGTCCTAAATAGGTCACATATGGTTCCATTAAACTTTCAAACGCGGCTTGCTGTGCTGGTGTCACCGAGATAACAAATCGTGACTGCGTTTCCGCAAAGAAGTTGGCAGCGGGCAAGTCACTGGCCAGTTCCACCCCGATATTTTGTGGAAAACATGATTCGGCAATCGTCGTAATCAAGCCACCTTCAGAAACGTCGTGGGCACTAGCAACTAGTCCTTTTTGAATCGCAGTTAACAATAGACGCTGATTACGATTTTCAGTCACAAGGTCAAAATCAAACAGCTCGCCACTGATTGTTCCCGTCAACATCTTTTGCAGCTCACTACCATTGAAATCGGCTTCTGTGGTACCTAACACGTAGACTGCATCGCCAGCGTGTTTAAAATCGCTAGTCGTAATATCTTTCTGATGCTTAATTAACCCGACCATCCCAATCATTGGGGTGGGATAGATGGCTTCCCCGTTCGATTCATTGTTCAACGAGACATTGCCAGAAATCACGGGCGTATTGAATAATTGGCAGGCACGAGCGATGCCCATCGCCGATTCGTCCAAATCGTAAAATTGTTCAGGTTTCTCTGGATTACCATAGTTCAAGCAATCAGTGATGCCTAAAGGTTGACCACCGGAAGCGACAATGTTTCGAGCAGCTTCCGCAACGGCGATTTCTCCACCGACACGGGGGTTTAAGTATAAGTATCGCCCGTTAACATCGGTGGTGACCGCCAACGCCTTATCCGTATGTCGAATCCGTATGACCCCCGCATCGGAACCCGGCTTGACGACCGTATTCGTTTGGACCTGCGAGTCATACGTTCCATATAACGACGCTTTGGAAGCAATCGTTGGCTGTTGGAGCATCTTCTTCAATGTGCCAGTTGCATCAACTAGTCGTGGCATAAATTGATGATGGCTCTGATGGTTCAAGCGCGTTGGTCGTTTCTTTTCGCGTTCATAGACCGGCGCTTTGGTCGCAAGTGCATCGACGGGAACATCTGCAACTAACTTACCATGATGGAATAATTGATACTGGTGGCCGGCTGTCACTTTACCAATTGTGACAGCATCAAGACCGTACTTTTCAAAGACTTGATAAATTTCTGCTTCGGCACCAGCTTTGACACATAGTAACATCCGCTCCTGTGATTCAGAGAGCATCAGTTCAAACGGCGTCATGCCAGTTTCACGTTGTGGTACCAAGTCAAGATTCAGTGACAACCCACTGCCTGCTTTGGACGCCATTTCGGCTGAGGAGGAAACTAGGCCCGCCGCGCCCATATCTTGAATCCCGATTAAAACATCACGATGATCATGAATAACCTCGAGACACGCCTCCATCAATAATTTTTCCATAAAGGGATCACCAACTTGAACCGCGGAACGCTGGGTTTCATTGGCGTCATTAAATTCAGCAGAGGCGAAGGACGCACCGTTAATGCCGTCACGCCCCGTTTTTGCGCCGACATAAATAACGGCGTTGCCAATTCCTGTTGCTTGGCCCTTCTGAATATCAGCTTGATCCAAGATTCCAACACACATGGCGTTCACCAACGGGTTCTTCTGATAACTCGCATCAAATACCGTATCACCACCGATTGTCGGAATTCCAATACAGTTGCCATAACCGCCAATGCCGGCGACTACTTGCGAAATCAAGTATTTCGTATGAGCATCAGTCGGTTCCCCAAAGCGAAGACTGTCCAGCAGCGCAATCGGCCGGGCCCCCATCGAAAAGATGTCCCGTATGATACCACCCACACCCGTTGCCGCACCCTCATAAGGTTCAACTGCAGACGGATGATTATGACTTTCAGCTTTAAAGACCACGGCCTGACCATCACCGATGTCGATAATACCGGCGCCTTCACCAGGCCCTTCAAGTACCTGTTCACCCTGCGTCCAAAATTTTTTCAAGACTGGTTTTGAATTCTTGTAGGAGCAATGTTCGCTCCACATGCCGGAAAACAACCCGGTTTCAGTCTCGTTAGGTAAGCGTTGAAGGACCTTATCCGTTAATAATTGATACTCAGCATCGGTTAAGCCCCAATCCCGATAGACCTTAGAATCGCGAACATCTGTAGGTGATAATGGTTGCTTTTTAAGCATGGGTGACCTCCTCTTGACTCGCAATGACCGATTGAAAAATTCTGAGACCGTCCGTGGAACCTAAGATCATCTCCACGGCCCGTTCCGGATGGGGCATCATCCCAAGCACATTTCCCGCTTCATTTGTAATGCCAGCAATATTAGCCGTGCTGCCATTTGGATTCTCGACGTATTCGAAGATGATTTGATGATTAGCACGTAATTGCGCCAAGGTGGCCTCATCACAATAATAATTGCCTTCGCCGTGGGCAATCGGTAAACTAATTTGATCTGTCGATCCGTATGCGGTGGTAAAAATCGTCTCATGATTGGCAATTCGTAATGGGCTGTCCTGACAAATAAACTTCGCTGAGCGATTGGCCTGCAATGCACCAGGTAATAATCCGGCTTCGGTCAAGACTTGAAAGCCATTGCAGATTCCGATGACTGGTTTACCAGCGTTAGCAAATGCAATAACGGCCGGCATGATGGGCGCAAAGCGGGCAATCGCACCACTCCGTAAATAATCACCGTACGAAAAGCCACCAGGTAACACCACCGCGTCATAACCTGCTAATGAGGTCGCTGTCGCCGGAATCAAATCAGCCGTAACGTGTAAAATATCGCGCAAGGCATTCACCATGTCATGATCACAATTAGAACCAGGAAAGACTGGTACGGCAAATTTCATCATTACAAAGCCTCCATCTCAGTAATTTCGTAACGATAAGTTTCCATATTAACGTTGGCTAACAAGCGATCACACATCTCGTCGATTTCAGCGGCAACTGGCCGATCATCCGCGTGAATTTTCACCTCAAAATACTTACCTAATTCAACGGCATCGACATTCGTATATCCAAGTCGGTGTAAGGCATCATGAATCGCCTCACCCTTGGGGTCTAGAATTGATTGCTTATAAGTCACATAGATTTTAACTAAGTACATGTTAGGCCTCCTCAACGGTTGCTAGCCGCGTCAATACTTCCTGATAAACACTAGTCAAGTCGCCTAGATCCTTGCGGAAGACATCCTTATCAAGCGATGCACCGGTCTTTAGGTCGACTAACCGACAACTATCTGGTGAGATTTCATCAGCCAGCAAGACTTTACCGGTGGTCGTCAACCCAAATTCGATTTTAAAATCAACGAGCTGTACCCCCATCGCCGCAAAAATTGCCGTCAAACGCTGGTTAACCTGTAAGGCCTGCCGTTTAATTTCCGCCACGATTGCCGGTGTTGCAACATTTAGCGCGTGGATTTGTGAATCATTGATAAATGGATCATCCAGCTGATCACTCTTATAGAAAAATTCCAGTACTGGTTCTGCAAATTTGGTTAAGTGTGGCACGGCAAATTTACGCTCAAAACTACCCGAAGCCGCATTCCGAACAACTGTCTCCAAGGGAATCATGGTCACGCGACGGACAAGTTGCACGTAGTCTGAAGGTTGCTCAATAAAATGGTTGGCAATGCCGTGATTGGCTAAGTCTTTGAAAATCAAACTCGCGATGCGATTATTCAATCGGCCTTTCTGGTCAATGGGAACCTTCCGCTTACCATTTAGCGCTGTTGCTTGATCTAAGTATTCGACCCATAGAATTTCAGGATCATTAGTGGCATACATCGCTTTCGCTTTACCCGTGTAAAGCAAAGCTTGTTTCTCAATCGCTGCCGTCATTATTATTGTTCCCCTTTCAAATTTGCCACCGACGCTAATGCTGCGTCAATATCGTGATTTAATACGGTGACATGACCCATCTTGCGCTGGGGCTTAATGGCCGCCTTACCGTAGTCGTGAAAATGCCATTCTGGGTGTTCAACCAACTGTTGACGTGCCACTGTTAAGTCATCACCTAGCAGATTACGCATCACTGCCGGACTGGTCTGCGTAATGGCCGGAATCGGTAAGCCACAGATACTTCGAATATGGGCCTCAAACTGCGAGATGTTGCAGGCCTCAATCGTATAGTGACCAGAATTATGTGGGCGTGGTGCCAGTTCATTGACTAATAAAGTATCATCCGGTAAAACAAAGAATTCGATTCCTAGCACGCCGCGTAGTTCCAGGGATTCAGCAATCGAAACCGCAATTTTGCGGGCCGCACTATGAACACTGGGCTGAACATTAGCTGGGGCAATCGTTGTGTGTAAGATATGATGTTGATGCTGATTTTCAACTAACGGAAAAGTCGTAACAACACCAGCAGCACTACGCGTCACCATCATGGAAACTTCTGTTCGAAATTTCTGACGCGCCTCTAGAATGCACGGCTGTGTCAATAAGGCACTAGCGGATTTTGTCACCACTGCTGTGTCTAGATCCGTTTGTCCGTGACCATCGTAGCCACCTGCCGCCGTTTTGAGAATTGCCGGCGTACCAACACGGTTGAGGGCGTAATTTAATGACTGTAAATCCGTCACCGGTGCGAAAGATGTGACTGGGATGCCATGATCATGAAGAAATTGCTTCTCATTAAGACGATCTCCAGTAATATGCAGGAGTGCAGTGCCCTGCGGTAACTTTGCATAGGCTTGCGCAGCAATCAAAGCATTCTCATCAACGTTTTCAAACTCGTAGGTCAAGACATCACTACGGCGCGCTAGATCAAGTAAAGCCGCCTGATCATCATAAGCCGCAACAATCTGAAAATCTGCGACCTGGGCTGCCGGTGCTTTGGGTGTCGGGTCAAGGACACCTACCCGATAGCCCATCGCCTTCGCGCTAAGCGTCATCATCTGACCGAGTTGACCGCCACCAACGATTCCGATCGTTGCGGGTGGTAAGAGTGCTTCCTTAAAATTGGCGTTCACTTTGTTCAGCCTCCTGACGTTGACGAGCACGAAATTCTCCAATTGCATGTTGTACTTGTGGTTCCCGTAAACCGATAATTTGGGCGGCCATTAGCGCACCATTCTTAGCCCCCGCATCACCAATCGCCATCGTCGCCACGGGTACGCCAGCTGGCATCTGTACGATTGACAATAACGAATCAACTCCGTTCAACGTATGGGTCTTAATGGGCACCCCAATTACCGGGAGTAGTGTATTGGCAGCTAGCATCCCGGGTAAATGGGCAGCGCCCCCCGCACCCGCAATAATAACTTGAATTCCCCGTGACGCTGCTTCTTCACCATAGGATTGTAATGTCTGGGGCATTCGGTGGGCCGAAATAACGTGACGCTCATAAGAGACTCCCAGTGCCGTTAACTGTTCTGCCGCTAATTGCATGGTTGGCCAATCAGAAATTGACCCCATAATCAAACCAACTTTCGCCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP020564|2281743:2290254|2289771_2290254_-|WP_003645861.1|DBSCAN-SWA
MAKVGLIMGSISDWPTMQLAAEQLTALGVSYERHVISAHRMPQTLQSYGEEAASRGIQVIIAGAGGAAHLPGMLAANTLLPVIGVPIKTHTLNGVDSLLSIVQMPAGVPVATMAIGDAGAKNGALMAAQIIGLREPQVQHAIGEFRARQRQEAEQSERQF
>NZ_CP020564|2281743:2290254|2286987_2287668_-|WP_015380736.1|DBSCAN-SWA
MMKFAVPVFPGSNCDHDMVNALRDILHVTADLIPATATSLAGYDAVVLPGGFSYGDYLRSGAIARFAPIMPAVIAFANAGKPVIGICNGFQVLTEAGLLPGALQANRSAKFICQDSPLRIANHETIFTTAYGSTDQISLPIAHGEGNYYCDEATLAQLRANHQIIFEYVENPNGSTANIAGITNEAGNVLGMMPHPERAVEMILGSTDGLRIFQSVIASQEEVTHA
>NZ_CP020564|2281743:2290254|2281743_2282322_-|WP_003645867.1|DBSCAN-SWA
MPNKIAVFASGNGTNFVALHQAIIERQLPVVIGLLVCDQPTAPVIDKARAANVPILIVDFHDYANKAAAEAIILTALQARQIELVLLAGYMRIIGPTLLNAYAHKIINIHPALLPKFPGRHGIEDAFAAGVTETGVTIHYIDAGIDTGQIIAQRVVPVAPDDTLASLATRIHDCEHQFYPDVLQTLINEGAI
>NZ_CP020564|2281743:2290254|2282314_2283340_-|WP_015380733.1|DBSCAN-SWA
MSDAYKRAGVDINAGYDVLKTVKQMSGNQQLGAFGGAFPLSPDATANDPVLVAGTDGVGTKLLVAIAADQHTTIGIDLVAMCVNDILAQGATPQFFLDYLGLGHTDQKRVKAILTGVVTGCQQAHTALIGGETAEMPDMYGQDHYDLAGFAVGIANRADLLSPANVRAGDVLIGLPSNGLHSNGFSLVRDILFKQHDYQLTTVFDELGHDLQTELLRPTTIYVDAVQPLLQQKLVTSIAHITGGGLIENVARALPAGLSAHLELGQWPAPPIMTLLAELGGLTATDLRSTFNLGLGMVLIVHSDQVAAVTANLTANAQSYYRVGTVQTGTTPVVFEEAEHA
>NZ_CP020564|2281743:2290254|2288657_2289788_-|WP_027822323.1|DBSCAN-SWA
MNANFKEALLPPATIGIVGGGQLGQMMTLSAKAMGYRVGVLDPTPKAPAAQVADFQIVAAYDDQAALLDLARRSDVLTYEFENVDENALIAAQAYAKLPQGTALLHITGDRLNEKQFLHDHGIPVTSFAPVTDLQSLNYALNRVGTPAILKTAAGGYDGHGQTDLDTAVVTKSASALLTQPCILEARQKFRTEVSMMVTRSAAGVVTTFPLVENQHQHHILHTTIAPANVQPSVHSAARKIAVSIAESLELRGVLGIEFFVLPDDTLLVNELAPRPHNSGHYTIEACNISQFEAHIRSICGLPIPAITQTSPAVMRNLLGDDLTVARQQLVEHPEWHFHDYGKAAIKPQRKMGHVTVLNHDIDAALASVANLKGEQ
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MYLVKIYVTYKQSILDPKGEAIHDALHRLGYTNVDAVELGKYFEVKIHADDRPVAAEIDEMCDRLLANVNMETYRYEITEMEAL
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MPTEVRSLNEECGVFGVWGSPDAAQLTYFGLHALQHRGQEGAGITANDHGKLQTERGLGLLADVFRDPRRLARLTGQAAVGHVRYATAGNHGLENIQPLGFNFSDSQFALAHNGNLTNAVTLRRRLEQHGAIFHASSDSEILMHLIRRSPAATLTEQVKDALRQVHGGFAYLLLTNDCLIAALDPNGLRPLVVGQLPTGGYVVCSETCALDTIGATFVQDVQPGELLTIDDHGLTIDHYTTDTQLAICSMEFIYFARPDSDIHGVNVHSARKRMGAQLAVEQPVDADIVVGVPNSSLSAATGYAEASGLPYEMGLIKNQYSSRTFIQPTQALREQGVRMKLSAVKGVVAGKRVVLIDDSIVRGTTSRRIVKLLKDAGAKSVHLRIASPPLRYPCFYGIDIQSTNELIAAQQTIREMCQTFGADSLGFLSEQGVVDAVGLSTTEPYGGLCMAYFNGDYPTALYDYQAEYDAEIAQLQANHEGVIK
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MLKKQPLSPTDVRDSKVYRDWGLTDAEYQLLTDKVLQRLPNETETGLFSGMWSEHCSYKNSKPVLKKFWTQGEQVLEGPGEGAGIIDIGDGQAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGEPTDAHTKYLISQVVAGIGGYGNCIGIPTIGGDTVFDASYQKNPLVNAMCVGILDQADIQKGQATGIGNAVIYVGAKTGRDGINGASFASAEFNDANETQRSAVQVGDPFMEKLLMEACLEVIHDHRDVLIGIQDMGAAGLVSSSAEMASKAGSGLSLNLDLVPQRETGMTPFELMLSESQERMLLCVKAGAEAEIYQVFEKYGLDAVTIGKVTAGHQYQLFHHGKLVADVPVDALATKAPVYEREKKRPTRLNHQSHHQFMPRLVDATGTLKKMLQQPTIASKASLYGTYDSQVQTNTVVKPGSDAGVIRIRHTDKALAVTTDVNGRYLYLNPRVGGEIAVAEAARNIVASGGQPLGITDCLNYGNPEKPEQFYDLDESAMGIARACQLFNTPVISGNVSLNNESNGEAIYPTPMIGMVGLIKHQKDITTSDFKHAGDAVYVLGTTEADFNGSELQKMLTGTISGELFDFDLVTENRNQRLLLTAIQKGLVASAHDVSEGGLITTIAESCFPQNIGVELASDLPAANFFAETQSRFVISVTPAQQAAFESLMEPYVTYLGRTTATDRLHVQTADQAFDIKVSFAKQLWEGALPCLLK
>NZ_CP020564|2281743:2290254|2287923_2288655_-|WP_003642587.1|DBSCAN-SWA
MTAAIEKQALLYTGKAKAMYATNDPEILWVEYLDQATALNGKRKVPIDQKGRLNNRIASLIFKDLANHGIANHFIEQPSDYVQLVRRVTMIPLETVVRNAASGSFERKFAVPHLTKFAEPVLEFFYKSDQLDDPFINDSQIHALNVATPAIVAEIKRQALQVNQRLTAIFAAMGVQLVDFKIEFGLTTTGKVLLADEISPDSCRLVDLKTGASLDKDVFRKDLGDLTSVYQEVLTRLATVEEA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_003645867.1|2281743_2282322_-	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	1.3e-21	33.9
WP_015380733.1|2282314_2283340_-	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	A0A0E3F760	Synechococcus_phage	1.2e-59	41.0
WP_027822324.1|2283336_2284791_-	amidophosphoribosyltransferase	A0A0M3SGR2	Mollivirus	7.3e-50	33.8
WP_021356102.1|2284775_2286995_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurL	A6N228	Microbacterium_phage	3.5e-144	39.1
WP_015380736.1|2286987_2287668_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurQ	NA	NA	NA	NA
WP_003642588.1|2287667_2287922_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurS	NA	NA	NA	NA
WP_003642587.1|2287923_2288655_-	phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase	M4SM18	Cyanophage	1.6e-37	37.3
WP_027822323.1|2288657_2289788_-	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase	NA	NA	NA	NA
WP_003645861.1|2289771_2290254_-	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	2.3e-16	41.0

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP020564|2770219:2778507|DBSCAN-SWA
TTTATGACTGGCTAATGATTCGGGCTAAGCGGTCCGCCATCCGTTCCAGATTGGCTGGTCCCTGCGCCATGGCTTGATCTAAGGTCATGACTTGATCGACAATCGGTAAAACAGCCGTGACCCCCTGTTTGGCAAATGTTTCATTTGCACCTTTTTGCCGACCAACTAATAAATAGCAAGGCTTGCCGGCCGCTTGGGCTAACTGACTGAGCTGAATTGGTACCTTGCCCATAAAACTCTGATCGTCGACTTGGCCTTCACCAGAGATAACTAGATCCGCTTGGGCCACTTTCGTTTTAAGATTGCTCATTTCAGCTAACAATTGAAAACCAGAGCGAACGCGGGCGTGTAAAAAGTAACGTAATGCAAACCCAATACCACCGGCAGCCCCATCGCCTTCGTGGGCACTCACCGCACCAGCTGCGATCGTCATATAGTGAGCTAAAGCGGCATCGTGAACCTGAATTTGAGCAACCGGTAATCCTTTTTGTGGGCCAAAAATCTTAGCTGCGCCGTTCGGTCCCGTTAGCGGATTCGTCACATCCGCTGCACTAATGAACGAGACTTCAGCTAATTGTGGCAACACATGTCGATCGTCAATCTTAGTGACCCGACTTAAATCAGCGCCAGTCATGGCTAACTCTTGACCATCGGCAGCCCAAAAACGATAACCGAGCGCACGTAGGATTCCGGCACCACCGTCGACCGTTCCGCTACCGCCTAAGCCCAGAATAATCTGCCGGGCGCCACGCTCAATCGCATCTTTAATCAGTAGCCCGGTCCCATAGGTATTCGTTGCTAACGACGTCAAGGTCGTCGTGACAAACTGGATTCCGGATGCAGCCGCAACCTCAATCACTGCCATTTTTTCAGTGGCAAAGTAGCCATACGTTGCAGTCACTGGCCGTTGCGCCAGATCCACCGTTGATGCCGTAATAGCTTGTCCACCAGCATGGTTAGCCAGCCACGCCGCCACCGTTCCTTCACCACCATCGGCAATCGCAACTTGAGTAGCGGTGATTCCGTGAGCCGAAAATCGTTTAGCCACTATTCGGTTGGCCTGAATGCTCGTGATGGAATTTTTAAATGAATCAATTGCGATCAAAGCGTGCATATTAACGTCTCCCTATTGACATAATTACTTTCAGTATAATCATTACAGCGGGCGCGAGCAATTCATATCAGTTGTCAGGTTTCTTAAAACTCGTTAAGCTTAAGTTACCAAAATTTTAATGGAGGCTGATAAATCATGACAAACAAATACGATTACGATGTGTTATACATTGGTGCGGGTCACGCCACGTTTGATGGCGCCGCACCACTCGCCAAGACTGGTGTTCGCGTCGGTGTGATTGAGAGTGGTCTGATTGGGGGCACCTGCCCTAATCGTGGTTGTAACGCCAAAATCACTCTTGATGAACCTGTCAAATTAACGCGGGAAGCAGCACGCCTCAATGATATTTTGAGCAGTGCACCAACCATTAATTGGACGGCCAACGTGGCCCATAAACAAGAGATTATTGATCCCTTACCAGCAGGCCTGACAGCTCGTTTGGAAGATGGTGGCGCAACGATCATTCATGGTCATGCCACGTTCAAGGACGCTCACACCGTTGTCGTTGATGATCAGCAAACCATTACCGCTGAAAAAATCGTTATTGCGACTGGTTTAAAGCCCCATCGTTTAGATATTCCGGGGACCAAGCTCGCCCACGATAGTAGTGATTTTATGAACCTTAAACGGTTACCACAAAGTATCGTCATCATTGGCGCAGGCTATATTGGTATGGAATTTGCCACCATCGCTAACGCGGCCGGTGCCCAAGTGACAGTCATGTTACATGGCGACCAGGCCCTCCGTGATTTTTACCAACCATTCGTTGCACAAGTGGTTGACGACTTAACTGAACGTGGGGTAACCTTCATCAAAAATGCCAACGTGCAAGCATTTACCAAACAGGATGACCAGTTCCAAGTTAGTTATGGCGACCACCAGCAATTAACGACCGACTGGATCCTAGATGCGACTGGTCGAATTCCAAACTTAGATGGCTTAGGCTTAGACCGGATTGGCGTCAAATATGACCGCCACGGCATTTATGTCAACGACCACTTGCAAACCAACGTTCCTAACATCTATGCAGCCGGTGATGTCCTTGCCAATGACTTGCCAAAGGTCACACCTGCAGCCTACTTTGAGTCCAAATACTTGATGCGTTTGTTCTCTGGTCAAACCAGTGCTCCCATTGACTATCCGGTAATTCCATCGGTCGTCTTTACTTCACCACGAATTGCGCAAGCCGGCATGAAAATACCGGCTGCTGAAAAGGCCGGCTTAACCGTTAGTGATAACGATTTAGCAGATTACTGGTATTATCAAGTCTCCAAGGAACCGATTGCCGCTAGTAAACAGGTCCATGACCAAGACGGCCATCTCGTTGGCGTGACTGAAATCAGTGATCAAGCTGAAGATGCCGTCAACGCACTACTGCCAGCTATCGAATATCAATTAGACCGCGAACAAATCGACCGTTTGATTGGTATTTTCCCAACCATCGGCTACGCAGCTTGGCACCGGGCTTAAAACAGAAAACACTGCTGCGACCGCCGCTTGATTAATCCCTTATTAATAACCAGAGCCGCCAATGACCCCCACTCATTGGCGGCTCTGGTTATGTTCGTTCCATTACTTTAGAAACCAACTCGGGCCTGCACATCAAGCATACTGACCATGCTATAATTGCGCCTATCTCAACGATTGAAAGGTTGGTCCTAACAATGGATGTGGATGCTCAAAAATTATTTACCTTAGTAGATGCTGCTTATAATCAGCCGATTACCAATCAACCATCCGATTCCTACCGCCAAGCGCTACTGGCAGCTGCAATCGACCTGAATAACAACGTTTCGCCACAGCAAGTAACCATTCAGCTATATCAAGCCTATTATCGTAACTATATGGTCCCAACGACTCTACCACGCCAGCATCGTGACCTCTACCAATACGTTCACACCCAATTACAGCGCCTCACGCGCAAAGAACAGCGTCATATGGCACTTGGGTATGGTCTGATTGCGACGCACCTAACATTTGGTCCCTTGAACTGAAATCAAGGTACTTACACGCATTGCGCTAGTTATCGTTTAGTATGAAGCATGATTAAACCGTGCCATTATCAAGCTCAAAAATAGCCATTAATCGTCCCCAGCCCCGGAGGTCGAAATAGGACGCGCATCGGCTGACGAATAAACAGCCCATCTTTTTAGCACGTTTTAATCATAATAAAAGCCCCAGCGATTACTCATCGCTGGGGCTTCATCGTTTTTAAATTAATCGTCTAATCCCAATCGTTTGAAAATATCATCAACGTGGCGAAGATGGTAATGATAGTCAAACGCATCATCAATCGCAGCCTGGTCCAAATGTTCACGAATCTCGGCGTTACCTTCAATAAGTGGCTTGAATTGTAACTGTTCATCCCATGACTTAGCCGTCAGTGGTTGAACGAGGTCATAAGCACTTTCACGAGACATCCCCGTATCAATCAACTTGAGCAAGACACGTTGACTGTAGATCAACCCGTAAGTCGCATCCATGTTTTGCTTCATCCGTTCTGGGAACACCGTCAGCGTCTTAATAATCTTATTGATTCGAGTTAAGATACAATCCACTAAAATCGTGGTATCTGGTAAGATGATCCGCTCCGCAGAAGAGTGGGAAATATCCCGTTCATGCCACAACGGCACATCTTCATAGGCGGTCATCATGTGGCCGCGAATAACCCGTGCCAACCCCGTCACGTTCTCAGAACCGATGGGATTACGCTTGTGGGGCATTGCTGATGAGCCTTTCTGACCTTTATTAAAGAATTCTTCAACTTCATGAGTTTCAGATTTTTGCAAACCACGAATTTCGGTTGCAAACACTTCAACGCTTGTTGCAATCAAGGCCAAACTAGCAATGTATTCGGCATGTAAGTCCCGTGGTAAAACTTGCGTCGAAATTTCTTGTGCGCGCAATCCAAGTTGTTTGCAGACAAATTCTTCAACAAATGGTGGAATGTTCGCAAAAGTCCCAACGGCTCCACTGATTTTACCCGCTTCAACGCCCGCGGCCGCGTGTTCAAAACGCTCGATATCCCGATTAATTTCAGAATACCACCGGGCAATCTTCAATCCAAACGTGGTTGGTTCAGCGTGGACGCCGTGTGTCCGCCCCATTTCAACCGTATATTTATATTTTTTCGCTTGTTGTGCTAGTGTCGCCCGTAAATCTTGTAAGTCTTGGCGAATAATCGCGTTAGCCTGCTTCAACCGGTAACCTTGCGCCGTGTCGACAACGTCAGTACTGGTCAGCCCATAGTGAACCCACTTACGTTCTGCACCCAACGACTCGGAAACATCGCGCGTAAAAGCAACCACATCATGATGCGTTACGGCTTCAATCTCCGCGATCCGGTCAACATCAAACTTGGCATTCTCTCGAATTTTAGCAACATCACTTGCTGGAATCTTCCCTAATTCAGCCCAGGCCTCGTCGGCAGCAATCTCTACCTCCAACCATGCTTGGTACTGATTTTCTAACGACCATACTTTGCCCATCGCGGGACGCGTATAACGATCAATCATTGCTAATCCTCATTTCTTTTTAGGTATTCACTAACAAAACACGAACATTATTATAGCATACCCCTCGAGTAATTAATAGAGACGAACAATGAAAAAATACTGTTATTTTTCACTTCGTTTCCATATTAAGGACTTGTTTTCGAACTAATTCGCCTTAATTATGAACGATTATTTGTGCTCAAAACAATAACATTCGGTTTTTGGGTTGCGTTTTGACGTTAAAGTTGCTATACTCTTTCCTGTTGGAGTGGTGAACGTTTAACTACTCTTTAGGATTAATTATTCATAATTAAACTATTTAATGAGGTGGAAGAATATGGCATCAGTCGTAGTAGTAGGTAGCCAGTGGGGCGATGAAGGTAAAGGAAAGATCACGGACTTTTTGAGTCAGGAAGCAGATGTGGTATCACGTTACCAAGGCGGCGATAACGCCGGCCACACCATCGTATTTAATGGGCAAACTTTCAAATTACGGCTGATTCCATCAGGGATTTTCTTCCATGATAAGTTAGCTGTCATTGGGAACGGCGTGGTCTTAAATCCCAAGTCATTAGTTGAAGAATTACAATACTTGCGGGACAAGGGCGTTAATCCTGACAACCTTAGAATCTCTAACCGTGCACACGTCATCTTGCCTTACCACATCACATTAGATGGCGCTCAAGAAAAAGCTAAAGCCGGTGGCAAGATTGGGACGACTAATAAGGGAATCGGCCCAGCCTACATGGATAAGGCTGAACGAATTGGGATTCGCGTAGCCGACCTGCTTGATAAGGACACCTTTGCGGCGTTACTCAAGCGCAACTTAGCTGAAAAGAACCAAATTATTACCAAGCTTTATGACTTAGAACCACTGAAATTTGAAGATATTTTTGATGACTATTACGCTTATGGTCAAACTTTGAAACCATTCGTCACCGATACTTCCGTTGTCATTAATGATGCGTTAGATAACGGTCAACGCGTCCTATTTGAAGGTGCTCAGGGAGTCATGCTGGATATTGATCAAGGGACTTACCCTTACGTTACTTCATCTAACCCAGTTGCCGGTGGTGTTACTATTGGGAGCGGTGTTGGCCCATCTAAGATCGATAACTGTGTTGGGGTCTTAAAAGCCTACACTTCCCGCGTCGGTGACGGCCCATTCCCAACTGAACTCTTTGACGAAGTCGGTGATTTCATTCGTGAAACGGCCCATGAATATGGGACCGTTACTAAACGTCCTCGGCGGATTGGTTGGTTCGATAGCGTTGTATTACGGCATGCTAAACGAGTTTCTGGGTTTACTCATCTTAGTTTAAACTGCTTAGACGTCTTGACGGGCTTAAAGACCATCAAGGTATGTACCGCTTACGACTTAAACGGCGAAACCATCTATCACTACCCTGCTAGTCTGAAGGAATTAGAAGCTTGCAAACCTATCTATGAAGAAGTTCCTGGCTGGGACGAAGACATTACTGGCGTTAAAACCTTTGAGGAACTGCCAACTAATGCACAGAACTACTTGCGTAAATTAGAAGAACTCGTCGGCGTTAAAATTGCCACCTTCTCTGTTGGTCCCGATCGCGAACAAACTAACGTTATCGATCACAACATTTGGGGCTAATTGAACGCGACACCGTGAATTAACTTAAAGGAGTTTTGCATCATGGGCATGGAGATTTTTGATTACGAAGATATTCAACTAATTCCGAACAAGTGTGTCATTAATAGTCGTTCGGAAGCCGATACGACCGTAGAATTGGGTGGCCGTCGTTTTAAGATTCCAGTGGTGCCTGCCAATATGGCAACCGTCATCAACGACGAGATTGCCAAGTGGCTCGCCACTAACGACTACTTCTACATTATGCATCGCTTCGCCCCCGAGACCCGCCGTGCTTTTATTGAAACGATGCATGCCGCGCAACTGTACGCATCTATTTCGGTCGGTGTTAAGTCCAGCGAGTATGACTTTATCGACGACCTGGCTGCTAATCAAATCGTGCCAGAATATATCACGATTGATATCGCACATGGTCATGCTGACAGTGTCATTGCAATGATCAAACACATCAAAGACGTCCTTCCGGATAGTTTTGTAATTGCCGGAAATGTGGCCACACCAGCCGCCGTTCGCGACCTTGAAAATGCTGGTGCCGATGCAACTAAGGTTGGCGTTGGCCCGGGTAAGGCCTGCATTACTAAAGTCAAAACGGGCTTTGGTACTGGCGGCTGGCAATTAGCTGCTGTCCGGTGGTGTGCCAAGGCCGCTCGCAAACCAATCATCGCAGACGGTGGTGTCCGGACCAATGGTGACATCGCCAAGTCGATTCGGTTCGGCGCTACGATGGTCATGATTGGCTCAATGTTGGCCGGACACCAAGAATCACCCGGCAACATTTTAAAAATCGATGGTAAGACTTATAAGCAATACTACGGTTCCGCCAGTGAAACTCAAAAAGGCGAACATAAAAACGTTGAGGGTAAACAAATGCTGGTTCCTTACCGGGGCCGCTTAGTCGACACCTTAAACGAGATGCAAGAAGACTTACAATCATCCATCTCATATGCCGGTGGCCGGGATTTAAAGGCCATTACTAAGTGCGACTATGTGGTAGTTAAAAATTCGATTTACAACGGGGACTAATTAAAGAAGGACACAAGCCAAACTGGTTTGTGTCCTTCTTTTACGTTCACTTGCTAGATTTTAGTTCGAAGTACCTGTGACCAGCTTCGGCCTTACGTCATAGACAGTTGTTGACGGTAGGTGACCAGCTCCGATTGATTGGCATAGATAAAATGTCCCGGAACTAGTTCAACGAATTGAGCTGGATCAGTCGTATAATCGTGAACTGACTCGTGATAAGTCACGAGTTGCTTTTGCCGTGCCAACTGTGGATCAGGTATTGGAATGGCGGCTAATAACGATTGCGTATACAGATGTAGTGGATGGGTAAACAACTCCGCGGTCGGTGCAAGTTCCAGAATACGGCCGTTGTGAATGACGGCCACACGGTCTGCAATAAAGCGTACGACGGATAAATCATGGGCAATGAACAAGTATGATAATTGGCTCTCCTGTTGAAACTGCCGGAGCAGATTCAGAATCTGTGCTCGAATCGAGACATCCAGCGCTGAGATCGGTTCGTCGGCCACGACTAACTCGGGCCGCATAATAAGGGCGCGAGCAATCCCAATTCGTTGCCGTTGACCACCAGAGAATTCATGGGGGTACCGATAAAGATGTTCTGGTAGCAACCCCACCGCTTTAATCATCTGCTCAACTTGATCACGGCGATCCTGTTCAGAATGAAAGAGGTGAAAATTCAGCAACCCTTCCGAAATAATATATTCAATCGTCGCCCGTTCATTGAGTGACGCGGCTGGGTCTTGAAAGATCATTTGAATCTTGCGCATCACTTCCCGTTGCGCATCGATTGCTAAGTGCTGATTAATGAGTTGTTCATGGAACGCAATTGTCCCTTTCTTAGTCGGAATAACACCTAGAATTGCGCGGCCAATCGTCGTTTTTCCTGATCCTGATTCACCGACCAGTGCCAAGGTCTCCCCCCGATAAATGTCAAAATTAGCGTCCTTGACCGCCACGAATTCCCGCTTTCCTTGGCCAAAGGCAATCTCCAGATGCTTGGCGGCTAAGAGTGGCGTTCTTTCATTAGTCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP020564|2770219:2778507|2770219_2771332_-|WP_027822315.1|DBSCAN-SWA
MHALIAIDSFKNSITSIQANRIVAKRFSAHGITATQVAIADGGEGTVAAWLANHAGGQAITASTVDLAQRPVTATYGYFATEKMAVIEVAAASGIQFVTTTLTSLATNTYGTGLLIKDAIERGARQIILGLGGSGTVDGGAGILRALGYRFWAADGQELAMTGADLSRVTKIDDRHVLPQLAEVSFISAADVTNPLTGPNGAAKIFGPQKGLPVAQIQVHDAALAHYMTIAAGAVSAHEGDGAAGGIGFALRYFLHARVRSGFQLLAEMSNLKTKVAQADLVISGEGQVDDQSFMGKVPIQLSQLAQAAGKPCYLLVGRQKGANETFAKQGVTAVLPIVDQVMTLDQAMAQGPANLERMADRLARIISQS
>NZ_CP020564|2770219:2778507|2777565_2778507_-|WP_027822312.1|DBSCAN-SWA
MTNERTPLLAAKHLEIAFGQGKREFVAVKDANFDIYRGETLALVGESGSGKTTIGRAILGVIPTKKGTIAFHEQLINQHLAIDAQREVMRKIQMIFQDPAASLNERATIEYIISEGLLNFHLFHSEQDRRDQVEQMIKAVGLLPEHLYRYPHEFSGGQRQRIGIARALIMRPELVVADEPISALDVSIRAQILNLLRQFQQESQLSYLFIAHDLSVVRFIADRVAVIHNGRILELAPTAELFTHPLHLYTQSLLAAIPIPDPQLARQKQLVTYHESVHDYTTDPAQFVELVPGHFIYANQSELVTYRQQLSMT
>NZ_CP020564|2770219:2778507|2773548_2774847_-|WP_027822313.1|DBSCAN-SWA
MIDRYTRPAMGKVWSLENQYQAWLEVEIAADEAWAELGKIPASDVAKIRENAKFDVDRIAEIEAVTHHDVVAFTRDVSESLGAERKWVHYGLTSTDVVDTAQGYRLKQANAIIRQDLQDLRATLAQQAKKYKYTVEMGRTHGVHAEPTTFGLKIARWYSEINRDIERFEHAAAGVEAGKISGAVGTFANIPPFVEEFVCKQLGLRAQEISTQVLPRDLHAEYIASLALIATSVEVFATEIRGLQKSETHEVEEFFNKGQKGSSAMPHKRNPIGSENVTGLARVIRGHMMTAYEDVPLWHERDISHSSAERIILPDTTILVDCILTRINKIIKTLTVFPERMKQNMDATYGLIYSQRVLLKLIDTGMSRESAYDLVQPLTAKSWDEQLQFKPLIEGNAEIREHLDQAAIDDAFDYHYHLRHVDDIFKRLGLDD
>NZ_CP020564|2770219:2778507|2772996_2773326_+|WP_021357419.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA
MDVDAQKLFTLVDAAYNQPITNQPSDSYRQALLAAAIDLNNNVSPQQVTIQLYQAYYRNYMVPTTLPRQHRDLYQYVHTQLQRLTRKEQRHMALGYGLIATHLTFGPLN
>NZ_CP020564|2770219:2778507|2775163_2776453_+|WP_015381012.1|DBSCAN-SWA
MASVVVVGSQWGDEGKGKITDFLSQEADVVSRYQGGDNAGHTIVFNGQTFKLRLIPSGIFFHDKLAVIGNGVVLNPKSLVEELQYLRDKGVNPDNLRISNRAHVILPYHITLDGAQEKAKAGGKIGTTNKGIGPAYMDKAERIGIRVADLLDKDTFAALLKRNLAEKNQIITKLYDLEPLKFEDIFDDYYAYGQTLKPFVTDTSVVINDALDNGQRVLFEGAQGVMLDIDQGTYPYVTSSNPVAGGVTIGSGVGPSKIDNCVGVLKAYTSRVGDGPFPTELFDEVGDFIRETAHEYGTVTKRPRRIGWFDSVVLRHAKRVSGFTHLSLNCLDVLTGLKTIKVCTAYDLNGETIYHYPASLKELEACKPIYEEVPGWDEDITGVKTFEELPTNAQNYLRKLEELVGVKIATFSVGPDREQTNVIDHNIWG
>NZ_CP020564|2770219:2778507|2771467_2772802_+|WP_015381010.1|DBSCAN-SWA
MTNKYDYDVLYIGAGHATFDGAAPLAKTGVRVGVIESGLIGGTCPNRGCNAKITLDEPVKLTREAARLNDILSSAPTINWTANVAHKQEIIDPLPAGLTARLEDGGATIIHGHATFKDAHTVVVDDQQTITAEKIVIATGLKPHRLDIPGTKLAHDSSDFMNLKRLPQSIVIIGAGYIGMEFATIANAAGAQVTVMLHGDQALRDFYQPFVAQVVDDLTERGVTFIKNANVQAFTKQDDQFQVSYGDHQQLTTDWILDATGRIPNLDGLGLDRIGVKYDRHGIYVNDHLQTNVPNIYAAGDVLANDLPKVTPAAYFESKYLMRLFSGQTSAPIDYPVIPSVVFTSPRIAQAGMKIPAAEKAGLTVSDNDLADYWYYQVSKEPIAASKQVHDQDGHLVGVTEISDQAEDAVNALLPAIEYQLDREQIDRLIGIFPTIGYAAWHRA
>NZ_CP020564|2770219:2778507|2776501_2777473_+|WP_003645478.1|DBSCAN-SWA
MEIFDYEDIQLIPNKCVINSRSEADTTVELGGRRFKIPVVPANMATVINDEIAKWLATNDYFYIMHRFAPETRRAFIETMHAAQLYASISVGVKSSEYDFIDDLAANQIVPEYITIDIAHGHADSVIAMIKHIKDVLPDSFVIAGNVATPAAVRDLENAGADATKVGVGPGKACITKVKTGFGTGGWQLAAVRWCAKAARKPIIADGGVRTNGDIAKSIRFGATMVMIGSMLAGHQESPGNILKIDGKTYKQYYGSASETQKGEHKNVEGKQMLVPYRGRLVDTLNEMQEDLQSSISYAGGRDLKAITKCDYVVVKNSIYNGD

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_027822315.1|2770219_2771332_-	glycerate kinase	W6LM47	Streptococcus_phage	1.5e-34	35.0
WP_015381010.1|2771467_2772802_+	NAD(P)/FAD-dependent oxidoreductase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	7.9e-27	27.1
WP_021357419.1|2772996_2773326_+|bacteriocin	bacteriocin immunity protein	NA	NA	NA	NA
WP_027822313.1|2773548_2774847_-	adenylosuccinate lyase	A0A1B3B081	Gordonia_phage	5.0e-18	34.1
WP_015381012.1|2775163_2776453_+	adenylosuccinate synthase	L7Y4J5	Megavirus	3.5e-72	37.0
WP_003645478.1|2776501_2777473_+	GMP reductase	Q4ZCY7	Staphylococcus_virus	1.8e-137	71.2
WP_027822312.1|2777565_2778507_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	2.1e-18	30.5