Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP019704 | Polaribacter sp. BM10 chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas3,DEDDh | 0 | 0 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP019704_1 | 2004988-2005265 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019704_1
|
3 spacers
spacers of NZ_CP019704_1
>1.1|2005017|58|NZ_CP019704|CRISPRCasFinder TCCACCGTTTGCCATTGGTCCTGCTTGAGAAGGACATTTATCGTTTTTATTAACTACA >1.2|2005104|52|NZ_CP019704|CRISPRCasFinder GTTAGCTTTAGTTCCTTTTTCAGAAGGACACATGTCATCTTTATCAGCAACA >1.3|2005185|52|NZ_CP019704|CRISPRCasFinder CATAGAAGCTAAACCTGCAACATTAGGACAAGCATCATCAGAATCTTTGATT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019704_1
The CRISPR arrays of NZ_CP019704_1 >merge|NZ_CP019704|1|2004988-2005265|CRISPRCasFinder CCGTCACCGTCAGTATCTGGCCAAGGACATCCACCGTTTGCCATTGGTCCTGCTTGAGAAGGACATTTATCGTTTTTATTAACTACACCGTCACCATCTGAATCAGGACAACCTTTGTTAGCTTTAGTTCCTTTTTCAGAAGGACACATGTCATCTTTATCAGCAACACCGTCACCATCAGCATCAGGACAACCGTTCATAGAAGCTAAACCTGCAACATTAGGACAAGCATCATCAGAATCTTTGATTCCGTCACCATCAGCATCAGGACATCCGTT >NZ_CP019704|1|1|2004988-2005265|CRISPRCasFinder CCGTCACCGTCAGTATCTGGCCAAGGACA TCCACCGTTTGCCATTGGTCCTGCTTGAGAAGGACATTTATCGTTTTTATTAACTACA CCGTCACCATCTGAATCAGGACAACCTTT GTTAGCTTTAGTTCCTTTTTCAGAAGGACACATGTCATCTTTATCAGCAACA CCGTCACCATCAGCATCAGGACAACCGTT CATAGAAGCTAAACCTGCAACATTAGGACAAGCATCATCAGAATCTTTGATT CCGTCACCATCAGCATCAGGACATCCGTT
>NZ_CP019704.1|WP_077810317.1|2002860_2004372_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-beta MSTTTGKVSQIIGPVIDVEFNTENTELPKIYDSLEIKKADGSILVLEVQQHIGEDTVRTISMDATDGLSRGTEVLATGNPIQMPIGNDIYGRLFNVTGDAIDGLGDLKKDGEDGLSIHRSAPKFEELSVSTEVLFTGIKVIDLIEPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIQELINNIAKGHGGLSVFAGVGERTREGNDLLREMLESGIIKYGDDFMHSMEEGGWDLSKVDKPGMRDSKATFVFGQMNEPPGARARVALSGLTIAEYFRDGAGEAEGKDVLFFVDNIFRFTQAGSEVSALLGRMPSAVGYQPTLATEMGAMQERITSTKKGSITSVQAVYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRKIAELGIYPAVDPLDSTSRILSADILGEEHYNCAQNVKEILQRYKELQDIIAILGMEELSEEDKLVVHRARRVQRFLSQPFHVAEQFTGIPGVLVDIKDTIKGFNMIMNGELDKYPEAAFNLRGSIQDAIDAGEKMLAEV >NZ_CP019704.1|WP_077810316.1|2002525_2002819_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-epsilon MYLEIVTPEAILFSSEVDLFSAPGIDGEFQILNNHAPIVSNLVEGEIKIHVHNQDHLVLDDLHGKLESHIDDDKVLTLKINSGTLELNDNKAIILAD >NZ_CP019704.1|WP_077810315.1|2001561_2002197_-|hypothetical-protein MKKTNKLLFCLSITIVLMSCNNEKKQKKEIVHHAEAIVNSKRPSNAITYKEMASMFHEYDTGQKIVLDKYRENYTGDSNDAVETVSHFYEINQLKQYISYLERISKEKNIKLTGVRIFSAAYPEKHRDASKRGRQTLIFMPTAKIGNNNGVAFEPLYSEKGTPIKFTEFLNKFSSEETKKVMRASFLPALNLLQDDLKSSGTNRLEHTPPF >NZ_CP019704.1|WP_149025889.1|2000906_2001461_-|hypothetical-protein MAYLVSMLIFEIIAYFFGSFSKGRNTWVYNFLTLVEFNFLLFFLRDILLFTNTKKYINYFIIGFNAIYFLTSIFYLFNNTYLITYNSIASISGGVFITLSVFLFFKDFINSDKILNFKKSLPFWISVGLLIYYLGSIPATLMMNAFQSLKRADHSFILSINPFLALLMYSIFIFGALWSQKKEL >NZ_CP019704.1|WP_077810313.1|2000181_2000931_-|histidine-kinase MESEERVIILFVTTLIIVAFVVFIVLLFGLYQKRKNFLLEQKAADQKRFEREIAETQIEIREETLRNISWELHDNIGQLLTLAKIQLQNASPENINEVSETITKGLTEVRALSKLINPEAIKNINLREAIQLEIDRFNRLQFIESKLEIKGLEFDIEKKSSIIIFRILQEFFSNTIKHSKASKLTVSLNFKLDSLHILAKDNGVGFSKEIVSKGIGLDNIKNRAKLIGAEAVFESEIDKGTSLSIIYKL >NZ_CP019704.1|WP_077810312.1|1999540_2000185_-|response-regulator-transcription-factor MIKYSVVIVDDHTLLSQAIATMVNTFSKFKVLYTCKNGQELVEKFSASAKYIPDIVLMDINMPIMNGIETTDWITKNHESVNVMALSVEDEDTTILKMLKVGAIGYLLKDTEKSVLENALLEIAQNGFYHTKTVTNLLMKSLSGNSSEEITLKEREITFMKYACSEMTYKEIADVMCLSPKTIDGYRDVLFTKLNVKNRVGLVMYAIKNKIYTP >NZ_CP019704.1|WP_077810311.1|1999124_1999520_-|30S-ribosome-binding-factor-RbfA MEETNRQRKIAGVLQKDLVDVLQKAAQDGMKGVIISVSKVHVTSDLGVAKVYLSIFPSEKRDEMVKGIQSNTPLIRHEMAKRTRNQLRRMPELLFFGDDTLDYIEEIDKSLKGEDENPIQNPDLLPRRQKK >NZ_CP019704.1|WP_077810310.1|1997906_1999109_-|ABC-transporter-permease MSFPFYIAKRYLFSKTSNNAINIITIIASFGIIVGALALFVILSGFSGLKTFSYSLLDVSDPDIKITSVKGKSFLIDDTIQNKINSNLEISEFTKVIEERVFLEYNEKTEIAYIKGVEENYTNISNIDSSLSVGSWLYKEFENTAVIGRGISNKLSLGILNYGSPLKIMVPKPGKGFINPRNPFYKIETQIVGVYMGTEDFENKFVFTSIDQARGLLRFKENQISAIEIKLNDSNKAANVAESLSDALGNAFKVQTKAQLNEVFYKVINTENFVSYLIFTLIVIIALFNVIGAIIMMIIDKKQNLKTLFSIGATIKEIKKIFILQGFLLTFFGMCIGLFLGIILVFVQKKFELFMIVPNLAYPVEFRFLNLLIVFCTITVLGYIAAKIASSRISKEFIEK >NZ_CP019704.1|WP_077810309.1|1997353_1997899_-|hypothetical-protein MKKLIIILLIFIGCKSKENFNKETYYKEVSEKEVQKHYKSYTITIPDNWFSYKTDPGLMAHSPNEFKSIIKPNKNQTRFIIRNSFQSSKKIQKNLNQFISNKKKHYTNFEYKLHERNHKTYGKFYVVQYASNENNERVINIVCILKAKNKIYNIYFSGTPKKYDKYLDDAIEMINSFKLAS >NZ_CP019704.1|WP_077810308.1|1996193_1997195_+|tRNA-dihydrouridine-synthase-DusB MVKIGNIELPEFPLLLAPMEDVSDPPFRALCKENGADVVYTEFISSEGLIRDAAKSVMKLDIYEKERPVGIQIFGANLDSMLKTVEIVEKSNPDIIDINFGCPVKKVVSKGAGAGILKDIDLMVSLTEAMVKHTNLPVTVKTRLGWDHDSIRIVEVAERLQDVGCAAIAIHGRTRAQMYKGEADWKPIAEVKNNQRMHIPVFGNGDVTSPEKAMEMRDSYGLDGCMIGRAAIGYPWFFNEVKHYFKTGKYLEKPTIAQRVEMARRHLQMSIDWKGPVLGVFETRRHYTNYFKGIPHFKEYRMKMVTSDDAKDVFAAFDEVEAKFGNAIIPEIK >NZ_CP019704.1|WP_077810319.1|2006021_2007215_-|glycine-C-acetyltransferase MYGKIKDTLKKEIQDIIEAGLYKSERIITSSQDAVIKISTGEEVINFCANNYLGLSNNAEVIQAAKDVMDTHGFGMSSVRFICGTQDIHKKLEQKIADFYTTEDTILYAAAFDANGGVFEPLLTKEDAIISDSLNHASIIDGVRLCKAARYRYNNNDMASLEEQLIAANKENHRFKIIVTDGVFSMDGIVAKLDEICDLADKYDAMVMVDECHATGFIGKTGRGTVELKNVMDRVDIVTGTLGKALGGAMGGYTTGKKEIIEILRQRSRPYLFSNSLAPAIVGASLKVFDLIATDTTLRDQLEWNTNYFRTEMEKAGFDLVGADAAIVPVMLYDAKLSQIMANKLLEKGIYVIGFFFPVVPKEKARIRVQLSAAHTKEHLDKAISAFTEVGKELKVI >NZ_CP019704.1|WP_077810320.1|2007262_2010406_-|UvrD-helicase-domain-containing-protein MQQPSTFNVYNASAGSGKTFTLVKQYLKVLLTSDNIFTFQNVLAITFTNKAAGEMKERVLFNLEEFAAGKQNDVLKIIIDETSLDKTLIVERSKRILDAILQNYSAFSITTIDSFTHKIIKSFAYDLGLSLNFEVEMDAVSLLNEAVDVLISKIGTDKKLTKLLIDYSLDKTDDDKSWDISNDLNEFSRVLLNEDDVKHFRKLQDKSLDDFFELKEKLQQKNKKIEASFEKLGNKVLNFINQNGLNISDFAYTGEYFKHFKKFTKLRFLKSEELKFDGRLNTTIENEKNLFAGKTSADVKELIKDISPELRAFYYESKVLYENNFSGYLLNKIALKSIIPLAVLNNINSELNTIKEDNNIRLNAEFNQLISDNIKDQPAPYIYERIGQRFQNYFIDEMQDTSELQWQNLIPLIDNALAQENSNLLLVGDGKQAIYRWRGGKAEQFIDLGSENGNPFHIQKNVQNLETNYRSYSEVINFNNSFFQHTAKFIQNESYKKLFVEGNTQLENSKKGGYVSLNFLDKLEKDEEKLKYPKKVLEKINLLKEDFYLNEICVLTRTKKDGIAVADYLSENGISIISSETLLLKNNAKINFIIDVLKIIQNPKDEERRFEFLYFLHEHLQIEIPKHQFFQKHIKSDNATIFAELQQHNIVFDYNVFQQAPFYEKIEEIVRGFCLVNSSDAYIQFFLDVVLEQQRKGTEIGDFLEFWELKKDKLSIVASENSDAVQVMTIHKSKGLEFPVVIFPCDVELYRQIKPKVWFNDLPEDYNFKELLIDYKKDLSLINQRGLDIFNQQREELELDNFNLLYVALTRAVEQLHIITEKKISAKGVESVNYYSGIFINYLKEQNLWQDDLLEYEFGDVSRKVEKVKQASLSEVHQKFISNPWQEHNIVLLASASKLWNTEQGKAIDFGNLFHEILSKIKTKNDVDFIINQYHQQGFINTEQLEYILKSVNIIVNHKDLNSYFSDEVTIFNEREIVDFDNQIIIPDRLVVNSKNEAIIIDYKTGAPLNEHHQQLLKYGIVLESMHFNVSRKLLVYINDKIDVVEV >NZ_CP019704.1|WP_077810321.1|2010484_2011321_-|ZIP-family-metal-transporter MSTFDQLVDFGKEHPILAALYASLFTWGLTAAGAALVFFFKKANRAVLDGMLGFTGGVMVAASFWSLLAPAIENSPGEGFVKVLPAAVGFGLGALSLFGMDKILPHLHINFKESEAEGVKTEWHKTTLLVLAITLHNIPEGLAVGVLFGAASTLVGVEQTEMIIAAISLAIGIGIQNFPEGFAVAMPLRRQGVSRLKSFWYGQMSAIVEPIAGVLGALAVSFFTPILPYALAFAAGAMIFVVVEEVIPETQRDKYTDIATLGFIGGFIVMMSLDVGLG >NZ_CP019704.1|WP_077810322.1|2011317_2011974_-|metal-dependent-transcriptional-regulator MFTLSEENYLKAIYHLELDANKGISTNAIAEKLATKASSVTDMVKKLSEKEVVIYKKYKGVTLTELGKTIAANVVRKHRLWEVFLVEKLNFSWDEVHDVAEQLEHIKSAKLIDQLDSFLGFPTHDPHGDPIPDKDGNLKTIEKSLLATLSKNESGICVGVDDSSSEFLQFLDKKGITLGKKITIIDKEDFDNSLSILIEDKKLNISNKIANNLYIKKA >NZ_CP019704.1|WP_077810323.1|2012080_2014324_+|TonB-dependent-receptor 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>NZ_CP019704.1|WP_077810325.1|2014798_2015338_-|hypothetical-protein MKNITAIIVLLFVHTISINAQTEKQPWTAGIGFAGAKYSFEAAKIVGGQLAHQTPRFNVSKYIYKGLIADAAVATTVGDSQSYTTFDASLRYDFGTSYDKVVPYILVGGSFISAIRTTPTANFGAGSTFWFNQKYGLNFQLMYKFSESKFESQKSHLYPSVGLVYSFGYRSLNLRIWND >NZ_CP019704.1|WP_077810326.1|2015460_2018790_+|transcription-repair-coupling-factor MSKQNIVNQFQTSASVSQIVAQLKQEKNHFQISNLVGSSLSFVISETFKKADKPYLLIFNDKEEAAYYLNDLEQLLGDKNVLFYPGSYRRPYQIEETDNANVLLRSEVLNRINSRKKPAVIVTYPTALFEKVVTKKELDKNTLKVTVGENLSLDFVNEVLFEYKFKRVDFVTEPGDFSVRGGIIDVFSFSNDEPYRIEFFGDEIDSIRSFDVETQLSKEKLKKVSIMPNVENKTLQESRESFLKYIPSKTAIFTKNINLLSGNLDKFFSKAEDAFNDLSREINHAKPSELFCDGNFIKNQLQDFTLVDFGNQNKEEVAIEFNTIPQPSFNKQFNLLIDNLEEYHKADFTNYIFCANEQQAKRFHDIFADSDKEVHYETIVFPLYQGFVDVDNKLVCYTDHQIFERYHKFRLKNGYAKKQAITLQELNKLEIGDYVTHMDHGIGKFGGLQKIDVQGKKQEAIKLIYGERDILYVSIHSLHKISKFNGKDGKAPKIYKLGSGAWKKIKQKTKARVKHVAFNLIQLYAKRKLQKGFAFGPDTHIQHELEGSFMYEDTPDQFTATQDVKNDMEKEQPMDRLVCGDVGFGKTEVAVRAAFKAVDNGKQVAILVPTTILAFQHYKTFSERLKDFPVRIDYLNRFRTAKQKTEAINGVNDGSVDIIIGTHQLTNQRIKFKNLGLLIIDEEQKFGVAVKDKLKTLKENVDTLTLTATPIPRTLQFSLMAARDLSVIKTPPPNRHPIESHVIRFSEETIRDAISYEISRGGQVFFIHNRIENIKEVAGLLQRLIPSAKIGIGHGQMEGKKLEELMLGFMNGDFDVLVSTTIIESGLDVPNANTIFINNANNFGLSDLHQMRGRVGRSNKKAFCYFITPPYHMMTDDARKRIEALVLFSDLGSGINIAMKDLEIRGAGDLLGGEQSGFINEIGFDTYQKILQEAIEELKENEFRELYPTDASKPKEFVKEVQIDTDFEILFPDDYINSVTERLALYNKLSTLETEEELQNFETEIIDRFGEIPTQVEDLLDSVRIKWLAKDLGLEKIVLKQKRMIGYFVSDQQSDFYQTEAFSRMLKYVQQNPKSCVMKEKQTKNGLRLLITFIKIDTIQKAFGFLNKI >NZ_CP019704.1|WP_077810327.1|2018859_2019396_-|hypothetical-protein MKKSTQLLFLILCVIFFNCSSGEENIKVEKVNVENLNLQLPDLISLLEETQGKVKSLSKSLPGFDFYFTSESDMVSMDKGCFTVNVRVYFHDGITSQKTLVASENVKLGDCDEEQNKSTSKKYNDDCESFTLDNGDRFINNGIKTPYCMKQLMKYDIIKDLYTKSINKLIGKRGKSNI >NZ_CP019704.1|WP_077810328.1|2019678_2020536_+|EamA-family-transporter MQNNYTKNLSVLLLGTLFISTSGVLGRYIAMPAEAIILCRAFLASIFIYIFCKFKKISFKINSAKDKRSFLMGGFLMGAHWVTYFYALKLSNVALAMLSIYTYPIITVFIEPFFSKKKIDGVHILMAILVLVGVYNLIPEFSIENTYLQGVLLGILSAFFYALRNLMVKEDVKKYNGSMLMFYQMVIISVLLLPTLFFSDYSNIESQLPWLLLVALLTTAIGHTLMVNSLQHFSATTASIISSIQPIFGIIIAFIFVNEIPSSSTFIGGSLILLTIVIESVRSKK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
1163777 : 1173154
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP019704|1163777:1173154|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP019704|1163777:1173154|1163777_1164431_-|WP_077809630.1|DBSCAN-SWA MKFFIDTANLEQIKEAQALGILDGVTTNPSLMAKEGITGEDNIINHYKEICELVDGDVSAEVISTDFDGMVKEGEALAALNPQIVVKLPMIKDGVKACKYFSSKGIKTNVTLVFSAGQALLAAKAGATYVSPFIGRLDDISTDGLNLIAEIRHIYDNYGFETEILAASVRHTMHIIDCAKLGSDVMTGPLSAIEGLLRHPLTDSGLAKFLADYQKGN >NZ_CP019704|1163777:1173154|1171738_1173154_-|WP_077809637.1|DBSCAN-SWA MKYTEAISSEIFNIISKASKELQVESYVIGGFVRDFFLKRGTAKDIDVVAIGSGIDLALKVSSLLPNKPKVQVFKTYGTAMLRFKDVEIEFVGARKESYTEESRNPEVTEGSLQDDQNRRDFTINALALSLNESNFGELLDPFNGMDDLENGIIRTPLSPDITYSDDPLRMMRAIRFAAQLNFKIEHDSLSAITKNADRLHIITRERIVDELNKIMSSSKPSVGFLLLEKTKLLKQILPELIALKGVEEVEGQKHKDNFYHTLEVVDNISENTDDVWLRWAALLHDIGKAPTKRFSKKVGWTFHSHEFVGSKMVQKIFKRLKMPLNNKMKFVKKMVMLSSRPIVLASDVTDSAVRRLVFDAGDDINDLMTLCEADITTKNPKKFKRYHSNFEIVRAKIKEVEERDRVRNFQPPISGEEIIEAFNLQPCREIGQIKEAIKEAILDGKIPNEHDACYKFMIEKGKKLGLTLSV >NZ_CP019704|1163777:1173154|1167421_1169137_+|WP_077809634.1|DBSCAN-SWA MSEILEKAKQWLTPTFDKETQDQIQKLISENSSELTDSFYKDMEFGTGGMRGVMGAGTNRINKYTLGIATQGLSNYLIENVNKEQIKIVIAYDCRHNSKKFAKIVSDVLSANNIKVFLFEDLRPTPELSFAVRHLDCDAGIVLTASHNPPEYNGYKVYWADGGQIVPPHDGGIIGKVNALDFSEINFDANEDLIETIGKNVDDVFIEASVKNGSLAENINRDNLKIVFTSLHGTSIVSVPDALAKAGYTDVHIVEEQRVPNGDFPTVKSPNPEEPEALKMATDLANKIDADIVIGTDPDCDRLGVAVRDTNGKMKLLNGNQTMVLMTEFLLKKWKEEGKMNGKQFVGSTIVSTELVNDVAANYNVETKIGLTGFKWIAKMVKDFPELDFIGGGEESFGYMVGGFVRDKDAVTATLLACEIAAYAKQNGSSFYEELLNIYVDNKFYKEHLISIVKKGMDGAAEIQQMLSDMRNNPLSEIDGEKVESLSDYQASTKKNLITGEVSKINIPKSNVLIYQTANGTRIAARPSGTEPKIKFYFSVNSSLDTKENAEKVEAELDAKIQRIIKEMKLN >NZ_CP019704|1163777:1173154|1166422_1167379_+|WP_077809633.1|DBSCAN-SWA MDISVVIPLLNEEESLDELYNWIAKVMQSNCYLYEVIFIDDGSTDASWKTIEKLAKEHEPVKGIRFQKNYGKSQALDAGFELAKGAVVITMDADLQDNPEEIPELYNLITKEDFDLISGWKKKRYDNVVTKNIPSKLFNAAARKTSGLKLHDFNCGLKAYKNEVIKSVKVSGEMHRYIPVLAKNEGFTKIGEKVVQHQARKYGETKFGMDRFVNGFLDLITISFLSKFGKRPMHFFGLWGTFMFLFGTTTAFYIGAVKLYKVFNGIKTILVTDNPWFYIALTSMILGTLLFLAGFIGELIIKTKTNEKHYSIKEKLNF >NZ_CP019704|1163777:1173154|1164621_1165425_-|WP_077809631.1|DBSCAN-SWA MSKIVLVTGASSGIGKAIATFLSEKGYKVYGTSRNPKNEQDFSFELIALDVLKIETIKTAVSSIIEKEGSIDILVNNAGIGVTGPIEETPTDEMRNAFNTNFFGAIDVIKTVLPFMRKQKYGVIINTTSIAGYMGLPFRGIYSSSKGALELVTEATRMEVKRFGINIVNVAPGDFATDIISRRYHTPLFKDSVYKENYKANLDLMDAHVDTGKDPIEMAKKVYKIINTKNPKIHYKVGGTLEKFSIVLKRILPDTWFEKLLMNHYKL >NZ_CP019704|1163777:1173154|1169136_1170966_+|WP_077809635.1|DBSCAN-SWA MGYFKDILKYEKKYRKFTILNILFNILYAIFNVLSVLAFIPVLGILFSTNKEVVKKPTYQGITKIGDFLKESFYHFISEKIENEGNIKTLVFICLLAISLFFLKNLFRYLASYVITFLRTGVVKDLRDNLYHKIVELPVSYFSEKRKGDIIARMTSDVQEVENSILTSIETIVREPLTVIIAISLMLFMSVKLTLFVFILLPVSGFIISSISKKLKANSIKAQKETGNFLSFIEETLTGLRIIKGFNAENVIANKFKNSTLKFKELMTNVIHRQTLASPMSEFLGSATIIAILWYGGTEVLSNKSSLKPDEFMGYIVLFYTVLNPIKLITTTFYNIQKGEASAERIMSVLNTENNIKDIPNALQKNEFSSEIEFKNISFKYKDDYVLNNFSLTINKGETVALVGQSGSGKSTLANLITRFYDVNKGEVLLDNNNIKNITKKSLRDLMGIVSQDSILFNDTIANNIKLGTQDATDSAILEAAKIANADEFIQNLPEKYDTNIGDSGNTLSGGQKQRLSIARAVLKNPPIMILDEATSALDTESEQLVQLALEKMMQNRTSLVIAHRLSTIQKADKIVVLKKGEIVEQGKHEELLAKKGEYFKLVTMQSLS >NZ_CP019704|1163777:1173154|1165849_1166371_+|WP_077809632.1|DBSCAN-SWA MDNQANSKGFIVNNGVILGVVSVIFYLVLYATGNHLKPHWSTSIINAVIFIGALILGIKQFKAANGGFMSWGQGVKVGVGIAVLGGLIMVIYNYIFMNFIEPDFMNQMTEIQNQAFLDQGMTEEQIEAANAMGESFKGPFIMAALGIVSYAIGGFIVSAIAAAIMKKSEEETY >NZ_CP019704|1163777:1173154|1170966_1171734_-|WP_077809636.1|DBSCAN-SWA MKLFTEIRTLFLDLRLFFIDSKQELVIVTGSDSSHFKSLYQLLESLKVHEKNTKTIIYNLGLNSDEVLKIKSNFKNFELRDFDYAKYPEYFNVKVNAGEYAWKPVIIDTVLNEFKTSVCWLDGGNKVVKPLNSLRKIVELYGFYSPFSKGIVSEWTHEKSLDCLGISNDSKILNQRNLNGACVAANYNNVAARNVIKKWSDCAKKKACIAPEGSSRSNHRQDQAILSVLVYKNMFKIGRKMVYRKFGFKTHQDID |
8 | Synechococcus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
3166734 : 3178005
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP019704|3166734:3178005|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP019704|3166734:3178005|3169970_3170396_+|WP_077811229.1|DBSCAN-SWA MKKKAIIVSGYFNPIHKGHLEYFNNAKNLADELFVIVNSDLQRALKGSKEFQKEEERLFIVQNIKAVDKAFISIDKDRTVCASIKHLHDTYGDEYQLGFANGGDQNNNSIPEVPTCKELGIDLIDGLGDKIQSSSWLLNKK >NZ_CP019704|3166734:3178005|3175297_3175738_+|WP_077811235.1|DBSCAN-SWA MVTGISLVDVYSDNTSLIKEFLDGATESIKSFRYFENRPLSIVSNHIKTVIAIYDNQPVGYGHLDKDLNDIWFGIAISDNFKGKGIGKKIMSYLINYADCSEIIELKLSVDINNVIAINMYKKFGFIMDKKLNTNVLIMKRNKNEA >NZ_CP019704|3166734:3178005|3175727_3176591_+|WP_077811236.1|DBSCAN-SWA MKPNIYLSSLAFLGKPVEEIINICEKNNYNLEFSSGMPYKENMVEIYLNCSINRQPHNYFPDPIKPFVLNLASENEVIRNLSIEHCKNGLKLAKKSESPFYAAHAGFCIDPNPEELGQKIDIQYNFDKESNKKHFINSISKILQFADDLEVDFLIENNVLAPFNFNGENPLLCCEFSDIDWLFKKINHDRFGLLLDTAHLKVSCKTLSLDLLNEFNKIRPYIKAFHHSDNDGTKDNNQKLTKNYWFLDFLKDFENYVHVIEVKSLTPSEIENQIKIIQNNGTSKYNN >NZ_CP019704|3166734:3178005|3172164_3173124_+|WP_077811232.1|DBSCAN-SWA MNKHTKIYIAGHRGMVGSAVWRALEKKGYTNLIGKTSKELDLKNQVEVLEFLETEKPEAIIDAAARVGGILANNDFPYQFLMENMQIQNNLIDSALKCGINKFIFLGSSCIYPKLAPQPLKEEYLLTDSLEPTNEWYAIAKITGVKACQAIRKQFNKDFVSLMPTNLYGYSDNFDLETSHVLPAMLRKFHEAKLNDNADVTLWGSGTPMREFLFVDDMAEAVVYALENNLPEYLYNVGSGKDITIKELAETIQKVTGHEGGIIWDSHKPDGTPRKLMDVSKMKNIGWQYSTELLEGIEKTYQWFLENIENIKEVKLEAN >NZ_CP019704|3166734:3178005|3169001_3169937_+|WP_077811228.1|DBSCAN-SWA MKNFALIGAAGYIAPRHLKAIKDTNNNLVAALDKFDSVGVMDSFFPNADFFVEFERFDRHIEKLKRNQNTNLDYVSICTPNYLHDSHIRMALRRGADAICEKPIVLNPWNIDALAAIEKESQGKINTILQLRLHESIIQLKNKVDLANKKGKYDIDLTYITSRGKWYDISWKGDEAKSGGIATNIGVHFYDMLSWIFGNVQENFVHLREKNKAAGFLEFEKARVRWFLSIDENDLPKEIKEKSQRTYRSITIDDEELEFSNGFTELHTKSYQKILLNEGFGLDEVKNSIEIVHDIRNKAILQTGEKHPFVK >NZ_CP019704|3166734:3178005|3173130_3174258_+|WP_077811233.1|DBSCAN-SWA MKVALITGITGQDGSYLAELLLEKGYEVHGIKRRASLFNTDRIDHLYQDPHDPDQRLKLHYGDLTDSMNLTRIIQECQPDEIYNLGAMSHVKVSFDMPEYVGNVDGLGTLRILEAVRILGLEKKTRIYQASTSELFGGLPENKNERGFYDENSPLYPRSPYGVAKIYGFWITKNYREAYNIFACNGLLFNHESPRRGETFVTRKITRAVAKIALGLQEKVYLGNLEAKRDWGHAKDYVRMMWMILQADQPEDWVIATGVTTTVRDFVRMAFSEVGIELEFKGEGVEEKAFVTACNHKDFQVEIGKEVLSIDPSYFRPTEVDLLLGDPSKAKEKLGWVPEYDLSALVKDMMQGDIALMKKDVDLLKAGHEILKQVE >NZ_CP019704|3166734:3178005|3176565_3178005_+|WP_077811237.1|DBSCAN-SWA MELQNIIINKNNNLREALQLLDKNGLGTLFVVNDLNILIGVLTDGDVRRFLLRDVNLKVKVEILMNREFTSLSINTDNAKIIECLNDKIKYIPLLDEDGVIVDYASINRLRRISICSPLLEGNELLYLTECVKTNWISSQGKYVRLFEKKFKDYHEGFEALAVSNGTVALHLALEALGISEGDEVIVPNLTFAASINAVIYTGATPVLVDVEQDSFNIDVSKIEELITSKTKAIMPVHLYGQSCDMDAVVAIAKKHNLFIVEDCAEALGSLFKGRPVGVFGDAATFSFFGNKTITTGEGGMVLFKDSKIAHKASVLRDHGMSKEKRYWHDYVGFNYRLTNLQASVGVAQFERLEYFVQAKRNLAATYNETLNKYDFFQTPIEKEGTFNSYWLYTFLIKDNAPFSREDLMNYLSKKGIESRPVFYPLHVMPPYKGYGNKEYLETSTLISKSGVSLPSSVNLSEVEANYICNSISNFIKEL >NZ_CP019704|3166734:3178005|3170835_3172158_+|WP_077811231.1|DBSCAN-SWA MNIAVIGSGYVGLVSGTCFAEMGNKVTCVDIDQNKIQKLEQGIIPIFEPGLEQMVLKNVKNNNLFFTTQLGEAISDAEIVFIAVGTPMGDDGSADLQYVLAVAKSIGETMGKRLIVVDKSTVPIGTADKVKATIQSELDKRGERIEFHVVSNPEFLKEGAAIDDFMKPDRVVIGADSDYAFDKMKQLYSPFFRTHDRFITMDIRSAEMTKYAANTMLATKISFMNEIANICERVGADANKVRIGIGSDKRIGYSFIYPGAGYGGSCFPKDVKALKKIAEENGYKANLIESVENVNDAQKLVIANKIVKRFGEDLTGFTFGLWGLAFKPGTDDMREAPAIYIVKELEKRGAKVNAYDPKAIEESKEFYLKDAKNIKYCNSKYEVLQGADALILLTEWKEFRSPDFEEIKAQLKSPIIFDGRNQYNAFNLEDNGFEYFQIGK >NZ_CP019704|3166734:3178005|3174290_3175304_+|WP_077811234.1|DBSCAN-SWA MNNTYIIAEAGVNHNGDVKIARKLIEEAKSSGADCVKFQTFKASQIVTKTSPKAKYQLEVTDSSESQYTMLKKLELDFKAYEGLVSYCKEIGIDFLSTPYNLEDISFLERLGVSTFKVASGQLTELPFLRALARTNKTIILSTGMATLSDVFDAVETIRNEGNDDIIVLQCTTNYPSDIKDSNILAMQTIKEACGVRVGYSDHVENNYACFASVALGAEVVEKHFTLDKNMEGPDHTCSLTPIEFKELVEGIRNIELALGSKIKKPAPIEIENSKGMKRGLVIVKEIKKGDVLTEDHVGFKRPLKGIPINMLDNLIGKQVSKHMFVDQAIDYNCIVW >NZ_CP019704|3166734:3178005|3166734_3167715_+|WP_077811226.1|DBSCAN-SWA MDIDLSGKKILVTGGAGFIGSNLCEVLLAKENAVVCLDNFSTGKRENTLSFLENPNFTLIEGDIRNIETCLKASLNVDYVLHQAALGSVPRSIKDPVTSNEVNVGGFLNMLVAAKENKVKRFVYAASSSTYGDSDSLPKVESVIGKPLSPYAITKYVNELYADVFSKTYGIETIGLRYFNVFGKRQDANGAYAAVIPKFINQLLKLESPTINGDGLHSRDFTYIDNIIQINLLSLVADKNAINTVYNAAFGDRNSLNDLVSYLKEYLSEYNSEIKNIDVIHGPNRLGDIPHSHAEIKKAKEFLNYNPKYSLKEGLKESIKWYVENL >NZ_CP019704|3166734:3178005|3170400_3170832_+|WP_077811230.1|DBSCAN-SWA MKIGITFSAFDLLHAGHIKMLEDAKRECDYLICGLQTDPTLDRPEKNRPVQSVVERYIQLKGCKYVDEIVPYATEQDLEDILKSFKIDVRIIGDEYASKMFTGRQYCEEKGIELYFNKREHRFSSSGLRKEVQEKENLKVKDK >NZ_CP019704|3166734:3178005|3167715_3168999_+|WP_077811227.1|DBSCAN-SWA MSKIKITIIGLGYVGLPLARLFATKYAVVGFDINENRVADLKTGVDATLEVEEDILKEVLVDDNNHEKGLFFTTSKEDIKDSNYYIVTVPTPVDKNNRPVLTPLIKASELIGGVLKKDDIVIYESTVYPGATEEDCIPVLENISGLEFNKDFFAGYSPERINPGDKKHTVDKILKVTSGSNKETGIKVDKLYNSVITAGTHLASSIKVAEAAKVIENSQRDINIAFVNELAKIFNLMDINTQDVLAAAGTKWNFLPFKPGLVGGHCIGVDPYYLAQKAQEFGYHPEIILSGRRVNDSMGKYVASEVAKLMIKEGVEVKDAAVLVLGITFKENCPDVRNTKAVDVVNELVDFGTNVTIFDPCADPAQVKKEYNLESQTTLPNKKFDAIVLTVSHEEYKTINLNSLKNEKAVVYDVKNFFDSKVVDKSL |
12 | Synechococcus_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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